View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2208_low_7 (Length: 245)

Name: NF2208_low_7
Description: NF2208
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2208_low_7
NF2208_low_7
[»] chr4 (119 HSPs)
chr4 (12-228)||(8631475-8631691)
chr4 (13-225)||(5637524-5637736)
chr4 (12-228)||(22044447-22044662)
chr4 (12-228)||(22046742-22046957)
chr4 (12-228)||(24348279-24348495)
chr4 (12-228)||(38409266-38409481)
chr4 (12-228)||(2484929-2485144)
chr4 (11-227)||(3824627-3824843)
chr4 (12-228)||(11435016-11435231)
chr4 (12-228)||(51015307-51015522)
chr4 (4-227)||(9148306-9148528)
chr4 (12-227)||(47868462-47868677)
chr4 (12-228)||(11006293-11006509)
chr4 (12-228)||(22132448-22132662)
chr4 (12-228)||(7941382-7941600)
chr4 (12-227)||(22802791-22803006)
chr4 (12-227)||(40637135-40637350)
chr4 (8-225)||(14633376-14633592)
chr4 (12-228)||(11008624-11008838)
chr4 (12-227)||(22800919-22801134)
chr4 (12-227)||(37089429-37089643)
chr4 (12-228)||(6764900-6765121)
chr4 (15-227)||(36921550-36921763)
chr4 (12-228)||(18847214-18847430)
chr4 (12-228)||(22782794-22783010)
chr4 (12-228)||(31849655-31849871)
chr4 (12-228)||(22134673-22134887)
chr4 (12-227)||(24888857-24889072)
chr4 (12-228)||(22780429-22780645)
chr4 (12-225)||(40091474-40091687)
chr4 (12-228)||(44599894-44600110)
chr4 (12-225)||(47274788-47275000)
chr4 (12-225)||(48486380-48486593)
chr4 (12-228)||(18709220-18709435)
chr4 (12-227)||(36919641-36919857)
chr4 (12-225)||(24880512-24880726)
chr4 (12-228)||(5198481-5198697)
chr4 (14-225)||(12395904-12396115)
chr4 (24-228)||(26086033-26086236)
chr4 (13-224)||(38928237-38928449)
chr4 (14-225)||(12400866-12401077)
chr4 (12-228)||(47210808-47211012)
chr4 (12-225)||(24879050-24879264)
chr4 (12-228)||(9176530-9176746)
chr4 (12-228)||(16934199-16934415)
chr4 (12-228)||(16931845-16932061)
chr4 (12-225)||(33415547-33415759)
chr4 (12-219)||(16453370-16453577)
chr4 (12-228)||(17662301-17662506)
chr4 (12-228)||(9174202-9174418)
chr4 (12-225)||(14787490-14787703)
chr4 (12-227)||(36378353-36378569)
chr4 (24-225)||(13544032-13544233)
chr4 (12-227)||(37313122-37313338)
chr4 (12-225)||(19095943-19096157)
chr4 (12-225)||(619506-619719)
chr4 (12-221)||(56030505-56030714)
chr4 (17-219)||(41997558-41997760)
chr4 (12-227)||(53405191-53405411)
chr4 (24-227)||(19322769-19322970)
chr4 (27-227)||(36380425-36380626)
chr4 (12-219)||(18409413-18409619)
chr4 (12-206)||(52942537-52942718)
chr4 (12-177)||(3937316-3937481)
chr4 (32-227)||(18537531-18537724)
chr4 (64-219)||(16455354-16455509)
chr4 (12-165)||(6132933-6133086)
chr4 (32-206)||(18534911-18535082)
chr4 (31-227)||(38890282-38890476)
chr4 (93-219)||(2891433-2891559)
chr4 (34-219)||(27499128-27499310)
chr4 (24-227)||(8756308-8756510)
chr4 (12-108)||(38270162-38270258)
chr4 (102-225)||(13547305-13547428)
chr4 (146-228)||(5635532-5635614)
chr4 (128-227)||(4215483-4215582)
chr4 (31-227)||(28453767-28453959)
chr4 (145-228)||(11437557-11437639)
chr4 (86-227)||(12102221-12102364)
chr4 (39-219)||(30136640-30136817)
chr4 (8-87)||(5101054-5101133)
chr4 (24-217)||(40999017-40999208)
chr4 (85-219)||(15032614-15032748)
chr4 (87-227)||(47150950-47151092)
chr4 (12-108)||(24446760-24446851)
chr4 (12-68)||(2891378-2891434)
chr4 (86-227)||(31983584-31983727)
chr4 (87-227)||(16185892-16186035)
chr4 (152-224)||(5101130-5101202)
chr4 (31-219)||(9863791-9863974)
chr4 (90-227)||(3982233-3982374)
chr4 (87-164)||(7050378-7050456)
chr4 (87-164)||(11853532-11853610)
chr4 (87-219)||(25357772-25357909)
chr4 (87-164)||(8529250-8529328)
chr4 (87-164)||(16689061-16689139)
chr4 (87-164)||(18586949-18587027)
chr4 (87-164)||(31300407-31300485)
chr4 (87-164)||(55822248-55822326)
chr4 (105-164)||(4556180-4556238)
chr4 (105-164)||(4558314-4558372)
chr4 (101-164)||(5336903-5336965)
chr4 (31-163)||(10112952-10113080)
chr4 (105-164)||(15316961-15317019)
chr4 (171-225)||(24446700-24446754)
chr4 (87-164)||(4570077-4570155)
chr4 (87-164)||(13072102-13072180)
chr4 (87-164)||(15831124-15831202)
chr4 (87-164)||(16489332-16489410)
chr4 (87-164)||(25699732-25699810)
chr4 (24-164)||(9022380-9022516)
chr4 (31-129)||(10114412-10114505)
chr4 (87-164)||(36771379-36771457)
chr4 (101-140)||(16638826-16638865)
chr4 (105-164)||(47566496-47566554)
chr4 (87-150)||(4884857-4884922)
chr4 (87-140)||(54906722-54906776)
chr4 (32-164)||(36769406-36769540)
chr4 (87-164)||(15312299-15312377)
[»] chr1 (100 HSPs)
chr1 (12-228)||(51750046-51750262)
chr1 (12-228)||(28840687-28840902)
chr1 (12-227)||(21948247-21948461)
chr1 (12-228)||(31735579-31735795)
chr1 (12-228)||(2617523-2617739)
chr1 (10-245)||(24325668-24325906)
chr1 (12-228)||(46431766-46431981)
chr1 (12-227)||(28842502-28842716)
chr1 (12-227)||(15823553-15823768)
chr1 (12-227)||(48665184-48665400)
chr1 (12-227)||(13761844-13762058)
chr1 (12-225)||(15294895-15295108)
chr1 (12-228)||(10399886-10400102)
chr1 (17-220)||(38925544-38925747)
chr1 (12-228)||(20302466-20302681)
chr1 (12-228)||(27336998-27337212)
chr1 (12-227)||(39932080-39932295)
chr1 (12-228)||(16226174-16226390)
chr1 (12-225)||(17324697-17324910)
chr1 (15-228)||(27339189-27339401)
chr1 (12-225)||(47906277-47906490)
chr1 (12-228)||(6823022-6823237)
chr1 (12-228)||(20291464-20291679)
chr1 (12-219)||(16428660-16428867)
chr1 (12-225)||(50307607-50307821)
chr1 (12-228)||(9463302-9463518)
chr1 (12-225)||(12302566-12302779)
chr1 (12-228)||(47177369-47177585)
chr1 (12-228)||(47179720-47179936)
chr1 (12-227)||(13215088-13215308)
chr1 (10-227)||(9241144-9241362)
chr1 (12-228)||(9459475-9459691)
chr1 (12-225)||(41646927-41647140)
chr1 (13-228)||(51752373-51752586)
chr1 (14-227)||(50076730-50076944)
chr1 (12-225)||(2510386-2510598)
chr1 (12-225)||(6995761-6995974)
chr1 (8-225)||(39462522-39462739)
chr1 (12-227)||(50078879-50079095)
chr1 (12-219)||(18307116-18307323)
chr1 (12-219)||(18839594-18839801)
chr1 (12-225)||(14098030-14098244)
chr1 (14-227)||(4131434-4131651)
chr1 (12-219)||(17186195-17186402)
chr1 (12-219)||(31425082-31425293)
chr1 (8-225)||(50248633-50248850)
chr1 (12-219)||(25127879-25128086)
chr1 (8-219)||(25251342-25251553)
chr1 (15-219)||(6756537-6756740)
chr1 (12-204)||(6823892-6824091)
chr1 (12-225)||(11457536-11457749)
chr1 (12-221)||(28998318-28998527)
chr1 (12-221)||(29004034-29004243)
chr1 (12-219)||(3579683-3579890)
chr1 (12-225)||(2949292-2949505)
chr1 (12-219)||(31422940-31423148)
chr1 (12-221)||(31489922-31490129)
chr1 (12-220)||(28207132-28207340)
chr1 (12-219)||(17318900-17319101)
chr1 (12-219)||(17324072-17324277)
chr1 (12-225)||(47451655-47451862)
chr1 (12-219)||(40133951-40134158)
chr1 (24-219)||(42922252-42922444)
chr1 (72-228)||(16231630-16231786)
chr1 (29-227)||(15669452-15669648)
chr1 (32-227)||(14183650-14183843)
chr1 (72-216)||(25248622-25248766)
chr1 (3-219)||(16432403-16432608)
chr1 (24-216)||(8347343-8347532)
chr1 (102-228)||(23785936-23786062)
chr1 (97-228)||(51757623-51757753)
chr1 (8-219)||(18800640-18800847)
chr1 (90-219)||(16429042-16429171)
chr1 (85-219)||(6115170-6115304)
chr1 (24-227)||(8349110-8349311)
chr1 (32-219)||(49495278-49495461)
chr1 (32-227)||(13125516-13125711)
chr1 (87-221)||(30738695-30738830)
chr1 (146-228)||(23816027-23816109)
chr1 (85-227)||(30790459-30790602)
chr1 (83-219)||(16561544-16561681)
chr1 (24-193)||(26520206-26520379)
chr1 (87-227)||(26613298-26613440)
chr1 (28-227)||(28279292-28279489)
chr1 (31-164)||(27916525-27916653)
chr1 (87-164)||(155788-155865)
chr1 (87-164)||(2232580-2232658)
chr1 (101-164)||(14997039-14997101)
chr1 (87-164)||(2401342-2401420)
chr1 (87-164)||(4144804-4144882)
chr1 (87-164)||(9526449-9526527)
chr1 (87-164)||(21353467-21353545)
chr1 (87-164)||(25134054-25134132)
chr1 (91-227)||(43104245-43104384)
chr1 (87-164)||(9521698-9521776)
chr1 (29-129)||(26332719-26332814)
chr1 (12-44)||(25248756-25248788)
chr1 (87-163)||(2393404-2393481)
chr1 (87-164)||(14353047-14353126)
chr1 (87-162)||(26332613-26332688)
[»] chr5 (95 HSPs)
chr5 (13-228)||(4236637-4236852)
chr5 (12-228)||(38882113-38882328)
chr5 (12-228)||(2174926-2175141)
chr5 (12-227)||(25921530-25921745)
chr5 (12-228)||(16776165-16776380)
chr5 (13-228)||(6745077-6745291)
chr5 (12-227)||(18469018-18469233)
chr5 (12-227)||(25804032-25804247)
chr5 (12-225)||(10529158-10529371)
chr5 (12-225)||(21948033-21948246)
chr5 (10-227)||(27910455-27910672)
chr5 (12-228)||(39854490-39854706)
chr5 (12-227)||(18466691-18466906)
chr5 (12-227)||(27912543-27912758)
chr5 (12-228)||(31545087-31545303)
chr5 (12-228)||(34477109-34477326)
chr5 (27-225)||(658412-658610)
chr5 (9-227)||(26097737-26097954)
chr5 (12-228)||(34479474-34479691)
chr5 (12-225)||(18511271-18511484)
chr5 (12-228)||(31179427-31179643)
chr5 (12-228)||(31542742-31542957)
chr5 (12-228)||(21684508-21684723)
chr5 (12-227)||(40221529-40221745)
chr5 (12-225)||(2818394-2818608)
chr5 (12-228)||(15552252-15552468)
chr5 (12-225)||(18509377-18509590)
chr5 (19-227)||(18596659-18596868)
chr5 (12-219)||(16092265-16092472)
chr5 (12-228)||(6747313-6747527)
chr5 (13-216)||(1189677-1189880)
chr5 (14-225)||(10474382-10474593)
chr5 (12-225)||(25904110-25904323)
chr5 (32-225)||(36402387-36402580)
chr5 (12-212)||(39398065-39398265)
chr5 (9-225)||(37705839-37706055)
chr5 (12-219)||(17072890-17073097)
chr5 (12-219)||(31472678-31472885)
chr5 (13-227)||(17818547-17818761)
chr5 (12-219)||(6756501-6756706)
chr5 (13-227)||(34530722-34530937)
chr5 (13-225)||(24126864-24127076)
chr5 (8-223)||(31466040-31466254)
chr5 (72-228)||(4410090-4410245)
chr5 (12-225)||(2954423-2954636)
chr5 (12-219)||(695896-696091)
chr5 (13-163)||(20043058-20043208)
chr5 (47-228)||(10586873-10587054)
chr5 (12-165)||(20045017-20045170)
chr5 (12-217)||(12555990-12556195)
chr5 (84-225)||(20505900-20506041)
chr5 (72-225)||(41585803-41585956)
chr5 (81-228)||(39798123-39798270)
chr5 (24-216)||(6661254-6661443)
chr5 (12-132)||(26098403-26098523)
chr5 (102-228)||(10749797-10749923)
chr5 (29-228)||(9020246-9020442)
chr5 (12-225)||(21288771-21288981)
chr5 (102-228)||(3373193-3373319)
chr5 (102-228)||(10757274-10757399)
chr5 (102-228)||(23665141-23665266)
chr5 (102-228)||(23793321-23793446)
chr5 (102-228)||(15354631-15354756)
chr5 (102-228)||(15356907-15357032)
chr5 (102-228)||(38960188-38960313)
chr5 (67-225)||(2723964-2724113)
chr5 (31-227)||(17413223-17413416)
chr5 (87-227)||(15143547-15143689)
chr5 (86-219)||(36208656-36208790)
chr5 (20-219)||(20053861-20054049)
chr5 (110-228)||(23741915-23742032)
chr5 (146-220)||(42770951-42771025)
chr5 (12-81)||(20507665-20507734)
chr5 (105-219)||(4897828-4897943)
chr5 (87-164)||(1170794-1170872)
chr5 (34-164)||(4754187-4754312)
chr5 (87-164)||(35385573-35385651)
chr5 (87-164)||(2298122-2298200)
chr5 (87-164)||(25452478-25452556)
chr5 (110-164)||(25445504-25445557)
chr5 (87-164)||(1240411-1240489)
chr5 (87-164)||(28786387-28786465)
chr5 (87-164)||(31782578-31782656)
chr5 (12-45)||(4410068-4410101)
chr5 (101-227)||(15445323-15445454)
chr5 (87-163)||(16093413-16093489)
chr5 (87-140)||(10627347-10627402)
chr5 (87-164)||(17841370-17841448)
chr5 (87-164)||(22672817-22672895)
chr5 (105-164)||(11962554-11962612)
chr5 (31-129)||(2144720-2144815)
chr5 (39-163)||(42770805-42770924)
chr5 (87-140)||(26406617-26406672)
chr5 (24-159)||(29748370-29748502)
chr5 (110-162)||(40222771-40222822)
[»] chr7 (100 HSPs)
chr7 (12-228)||(38394003-38394219)
chr7 (12-228)||(1046981-1047196)
chr7 (12-228)||(1849998-1850214)
chr7 (12-228)||(7470078-7470294)
chr7 (12-228)||(40836799-40837014)
chr7 (12-227)||(44724596-44724811)
chr7 (12-227)||(48457670-48457885)
chr7 (12-245)||(7472016-7472252)
chr7 (12-228)||(1049352-1049567)
chr7 (12-228)||(3878594-3878810)
chr7 (12-228)||(20626055-20626271)
chr7 (12-228)||(20629946-20630162)
chr7 (12-228)||(20642365-20642581)
chr7 (12-228)||(40946345-40946561)
chr7 (12-228)||(11757246-11757463)
chr7 (12-228)||(20299476-20299693)
chr7 (12-228)||(3035738-3035957)
chr7 (8-228)||(25542543-25542761)
chr7 (12-227)||(35646-35861)
chr7 (12-228)||(18345558-18345774)
chr7 (12-227)||(27306287-27306501)
chr7 (12-225)||(28487570-28487783)
chr7 (12-227)||(31435103-31435319)
chr7 (12-227)||(44581-44796)
chr7 (12-225)||(443612-443825)
chr7 (12-228)||(7349329-7349545)
chr7 (12-228)||(7351708-7351924)
chr7 (12-228)||(20297379-20297595)
chr7 (12-227)||(11355275-11355490)
chr7 (12-222)||(28485583-28485793)
chr7 (14-228)||(43253573-43253786)
chr7 (12-225)||(21680044-21680257)
chr7 (12-228)||(31155967-31156183)
chr7 (12-219)||(20137174-20137381)
chr7 (12-219)||(24748611-24748818)
chr7 (12-225)||(4295993-4296207)
chr7 (14-227)||(25276160-25276374)
chr7 (12-227)||(37412182-37412400)
chr7 (8-225)||(21592202-21592419)
chr7 (12-225)||(42331056-42331271)
chr7 (12-219)||(39146052-39146259)
chr7 (12-225)||(42223174-42223388)
chr7 (12-225)||(21678083-21678296)
chr7 (12-219)||(13099540-13099748)
chr7 (24-225)||(9679088-9679289)
chr7 (12-225)||(9680836-9681050)
chr7 (12-227)||(21990167-21990382)
chr7 (12-219)||(24258480-24258687)
chr7 (12-219)||(27832698-27832905)
chr7 (12-188)||(26804586-26804765)
chr7 (73-228)||(38396713-38396867)
chr7 (65-225)||(7092271-7092431)
chr7 (13-216)||(22828701-22828904)
chr7 (13-227)||(22251602-22251813)
chr7 (24-227)||(24817410-24817610)
chr7 (65-225)||(7094519-7094678)
chr7 (24-227)||(24813555-24813755)
chr7 (29-220)||(20091609-20091797)
chr7 (24-227)||(7188571-7188772)
chr7 (102-228)||(2935375-2935501)
chr7 (12-113)||(18567630-18567731)
chr7 (102-228)||(1606487-1606612)
chr7 (102-228)||(9027250-9027375)
chr7 (102-228)||(22137185-22137310)
chr7 (102-228)||(40552212-40552337)
chr7 (32-219)||(24465578-24465760)
chr7 (102-228)||(22108174-22108299)
chr7 (102-228)||(40549934-40550059)
chr7 (146-219)||(6348933-6349006)
chr7 (87-227)||(6332311-6332453)
chr7 (32-140)||(22392502-22392606)
chr7 (149-219)||(22393876-22393946)
chr7 (146-219)||(26295598-26295671)
chr7 (87-163)||(16297146-16297222)
chr7 (86-164)||(2120881-2120960)
chr7 (87-164)||(3320171-3320249)
chr7 (87-164)||(3324919-3324997)
chr7 (87-164)||(7069763-7069841)
chr7 (87-164)||(7074770-7074848)
chr7 (87-164)||(25351336-25351414)
chr7 (87-164)||(25357030-25357108)
chr7 (87-164)||(25405376-25405454)
chr7 (87-164)||(25410113-25410191)
chr7 (87-164)||(42006646-42006724)
chr7 (87-164)||(8378625-8378703)
chr7 (24-217)||(11081540-11081731)
chr7 (87-164)||(15541116-15541194)
chr7 (87-164)||(30246953-30247031)
chr7 (12-56)||(38396333-38396377)
chr7 (87-164)||(44512646-44512724)
chr7 (90-195)||(40281466-40281572)
chr7 (87-153)||(44143997-44144065)
chr7 (24-164)||(6048903-6049039)
chr7 (105-164)||(34546984-34547042)
chr7 (87-164)||(11084467-11084544)
chr7 (65-140)||(12310160-12310234)
chr7 (87-164)||(21369625-21369703)
chr7 (87-164)||(26210631-26210710)
chr7 (143-227)||(6046641-6046726)
chr7 (86-129)||(2990786-2990830)
[»] chr6 (83 HSPs)
chr6 (12-228)||(4816287-4816503)
chr6 (8-228)||(11983085-11983305)
chr6 (12-227)||(1230306-1230521)
chr6 (12-225)||(28241380-28241593)
chr6 (12-228)||(14458823-14459037)
chr6 (12-225)||(14507235-14507447)
chr6 (12-228)||(30034659-30034875)
chr6 (12-228)||(30967243-30967459)
chr6 (12-228)||(19704623-19704841)
chr6 (12-225)||(9019968-9020181)
chr6 (12-228)||(20915412-20915628)
chr6 (12-219)||(13057236-13057443)
chr6 (12-219)||(3390421-3390628)
chr6 (4-227)||(15530180-15530402)
chr6 (12-219)||(3632003-3632210)
chr6 (12-214)||(25477316-25477518)
chr6 (12-228)||(26065028-26065240)
chr6 (12-228)||(26084997-26085209)
chr6 (12-228)||(2628942-2629157)
chr6 (12-225)||(3629923-3630136)
chr6 (12-219)||(13039796-13040003)
chr6 (12-228)||(12195571-12195787)
chr6 (12-225)||(15532740-15532953)
chr6 (12-225)||(15541199-15541412)
chr6 (12-217)||(32280038-32280243)
chr6 (15-228)||(26932618-26932831)
chr6 (12-177)||(19227515-19227680)
chr6 (18-227)||(30728881-30729094)
chr6 (14-225)||(3233789-3234001)
chr6 (12-224)||(12161617-12161827)
chr6 (12-219)||(24338512-24338720)
chr6 (32-219)||(15719708-15719891)
chr6 (18-219)||(22490688-22490889)
chr6 (20-227)||(3027910-3028114)
chr6 (69-228)||(5273272-5273431)
chr6 (90-219)||(1069784-1069913)
chr6 (31-227)||(16455482-16455676)
chr6 (47-219)||(14466399-14466572)
chr6 (102-228)||(26066180-26066306)
chr6 (102-228)||(33308989-33309114)
chr6 (102-228)||(33311258-33311383)
chr6 (102-228)||(29754765-29754891)
chr6 (12-94)||(1072067-1072149)
chr6 (32-217)||(17012105-17012287)
chr6 (86-227)||(12186128-12186271)
chr6 (36-225)||(15367101-15367286)
chr6 (102-228)||(26068451-26068577)
chr6 (85-219)||(26945258-26945393)
chr6 (12-98)||(13870608-13870694)
chr6 (36-227)||(19696508-19696698)
chr6 (12-97)||(32447502-32447588)
chr6 (12-69)||(8995521-8995578)
chr6 (88-220)||(28037794-28037927)
chr6 (12-78)||(17852584-17852650)
chr6 (87-164)||(13878710-13878788)
chr6 (87-164)||(13883458-13883536)
chr6 (87-164)||(16785902-16785980)
chr6 (87-164)||(26887345-26887423)
chr6 (87-164)||(31248835-31248913)
chr6 (87-164)||(35201447-35201525)
chr6 (87-227)||(20526922-20527063)
chr6 (87-164)||(3577636-3577713)
chr6 (8-61)||(10584159-10584212)
chr6 (87-219)||(25078623-25078755)
chr6 (145-225)||(15346522-15346602)
chr6 (87-164)||(17036038-17036116)
chr6 (87-164)||(17694972-17695050)
chr6 (110-164)||(12166267-12166320)
chr6 (32-115)||(15346445-15346524)
chr6 (87-162)||(11138423-11138499)
chr6 (105-164)||(22351973-22352031)
chr6 (31-164)||(22858075-22858203)
chr6 (110-164)||(25941652-25941704)
chr6 (105-164)||(26643179-26643237)
chr6 (105-164)||(26749145-26749203)
chr6 (146-227)||(30445699-30445782)
chr6 (87-162)||(19701985-19702061)
chr6 (87-164)||(13467585-13467662)
chr6 (101-164)||(5165936-5165999)
chr6 (87-164)||(33215810-33215888)
chr6 (105-164)||(22342922-22342980)
chr6 (21-80)||(4595046-4595102)
chr6 (169-228)||(28078251-28078310)
[»] chr3 (135 HSPs)
chr3 (13-228)||(43228279-43228494)
chr3 (12-228)||(38890027-38890243)
chr3 (12-227)||(4308336-4308551)
chr3 (12-228)||(4103950-4104165)
chr3 (12-228)||(5191640-5191855)
chr3 (12-227)||(18099225-18099440)
chr3 (12-222)||(22114365-22114575)
chr3 (12-228)||(10084443-10084659)
chr3 (12-228)||(25533429-25533645)
chr3 (12-228)||(43226073-43226288)
chr3 (12-227)||(11170391-11170606)
chr3 (12-227)||(18096955-18097170)
chr3 (12-227)||(30005828-30006043)
chr3 (12-245)||(3859515-3859750)
chr3 (29-228)||(1321483-1321682)
chr3 (12-221)||(42990291-42990500)
chr3 (12-227)||(10956082-10956297)
chr3 (12-227)||(51727062-51727276)
chr3 (12-245)||(6065830-6066066)
chr3 (12-227)||(27101236-27101451)
chr3 (12-227)||(45882926-45883141)
chr3 (10-228)||(9604661-9604879)
chr3 (12-228)||(746744-746960)
chr3 (12-228)||(25388893-25389108)
chr3 (12-225)||(43423520-43423733)
chr3 (12-228)||(10191364-10191579)
chr3 (10-225)||(1313394-1313609)
chr3 (12-227)||(10958378-10958593)
chr3 (12-227)||(28102057-28102272)
chr3 (15-228)||(28413086-28413299)
chr3 (12-228)||(455894-456110)
chr3 (12-228)||(458271-458487)
chr3 (12-225)||(1626740-1626953)
chr3 (12-228)||(10621584-10621800)
chr3 (12-225)||(53917721-53917934)
chr3 (12-227)||(29956673-29956888)
chr3 (12-228)||(6063500-6063716)
chr3 (12-228)||(50493986-50494202)
chr3 (12-227)||(26720535-26720749)
chr3 (12-225)||(18162650-18162864)
chr3 (12-227)||(6561797-6562014)
chr3 (12-227)||(32264092-32264309)
chr3 (12-228)||(38210357-38210573)
chr3 (12-225)||(43421472-43421685)
chr3 (8-225)||(51943354-51943570)
chr3 (12-219)||(3314671-3314878)
chr3 (12-220)||(39715456-39715664)
chr3 (12-228)||(5522681-5522885)
chr3 (12-222)||(5926824-5927034)
chr3 (12-225)||(24979694-24979908)
chr3 (12-225)||(47148952-47149165)
chr3 (12-190)||(35777408-35777587)
chr3 (12-227)||(35917998-35918219)
chr3 (47-228)||(7606642-7606822)
chr3 (24-225)||(53915553-53915754)
chr3 (13-224)||(880509-880721)
chr3 (14-227)||(36011816-36012029)
chr3 (12-219)||(28761492-28761698)
chr3 (12-219)||(53468519-53468725)
chr3 (10-224)||(48361729-48361943)
chr3 (12-177)||(28100146-28100311)
chr3 (12-225)||(889830-890041)
chr3 (14-224)||(54691632-54691842)
chr3 (13-225)||(12268032-12268235)
chr3 (51-222)||(51674826-51674997)
chr3 (12-227)||(15780847-15781078)
chr3 (76-225)||(25688217-25688367)
chr3 (38-225)||(6484372-6484560)
chr3 (47-225)||(32219106-32219285)
chr3 (11-177)||(28181008-28181174)
chr3 (12-227)||(54884144-54884357)
chr3 (89-227)||(11168165-11168303)
chr3 (32-216)||(13420252-13420432)
chr3 (12-245)||(42992273-42992493)
chr3 (24-216)||(31151347-31151534)
chr3 (51-225)||(53591210-53591384)
chr3 (32-219)||(25635391-25635575)
chr3 (86-228)||(5886261-5886401)
chr3 (86-228)||(5899734-5899874)
chr3 (73-219)||(6231849-6231994)
chr3 (46-219)||(4666535-4666710)
chr3 (24-202)||(23637025-23637200)
chr3 (32-227)||(561831-562024)
chr3 (32-219)||(17795269-17795452)
chr3 (32-219)||(19103709-19103892)
chr3 (24-219)||(23633458-23633647)
chr3 (24-227)||(53597238-53597439)
chr3 (47-165)||(28137423-28137541)
chr3 (25-213)||(1673975-1674160)
chr3 (12-93)||(11163137-11163218)
chr3 (24-117)||(41849151-41849244)
chr3 (24-227)||(36871356-36871557)
chr3 (69-219)||(4560355-4560497)
chr3 (24-134)||(24177278-24177385)
chr3 (103-219)||(3306839-3306955)
chr3 (152-225)||(47701728-47701801)
chr3 (14-78)||(6231438-6231502)
chr3 (12-79)||(47701798-47701865)
chr3 (143-227)||(24181498-24181583)
chr3 (12-79)||(27635830-27635897)
chr3 (148-225)||(27635715-27635792)
chr3 (87-220)||(14634504-14634638)
chr3 (87-164)||(1620580-1620657)
chr3 (87-164)||(10094195-10094273)
chr3 (87-164)||(10201075-10201153)
chr3 (87-164)||(16462186-16462264)
chr3 (87-164)||(22626105-22626183)
chr3 (87-164)||(47883003-47883081)
chr3 (8-129)||(13419868-13419983)
chr3 (32-129)||(25633930-25634024)
chr3 (87-164)||(10100212-10100290)
chr3 (87-164)||(10208121-10208199)
chr3 (87-164)||(29914074-29914152)
chr3 (87-164)||(47878292-47878370)
chr3 (87-164)||(54193209-54193287)
chr3 (101-164)||(4535613-4535675)
chr3 (87-150)||(6303293-6303358)
chr3 (12-68)||(3306786-3306842)
chr3 (87-127)||(7768632-7768672)
chr3 (87-164)||(10896988-10897066)
chr3 (87-164)||(20031439-20031517)
chr3 (87-164)||(54188492-54188570)
chr3 (168-219)||(25634030-25634081)
chr3 (105-164)||(27762107-27762165)
chr3 (87-162)||(38002852-38002928)
chr3 (87-164)||(5858529-5858605)
chr3 (87-164)||(10612899-10612977)
chr3 (87-164)||(27544256-27544334)
chr3 (65-127)||(31021300-31021361)
chr3 (105-164)||(10595155-10595213)
chr3 (87-164)||(11066652-11066731)
chr3 (101-164)||(11079516-11079578)
chr3 (101-164)||(16996874-16996936)
chr3 (110-164)||(10949381-10949434)
chr3 (114-164)||(11007633-11007683)
[»] chr8 (74 HSPs)
chr8 (12-227)||(14807814-14808029)
chr8 (12-228)||(3874073-3874289)
chr8 (12-228)||(15809282-15809497)
chr8 (12-228)||(608797-609013)
chr8 (12-228)||(27827049-27827264)
chr8 (12-228)||(27829360-27829575)
chr8 (12-228)||(28251623-28251839)
chr8 (12-228)||(32339372-32339588)
chr8 (12-228)||(44720906-44721122)
chr8 (12-228)||(18810771-18810986)
chr8 (12-228)||(43079665-43079881)
chr8 (12-227)||(22684710-22684928)
chr8 (12-225)||(27106956-27107169)
chr8 (12-227)||(15072773-15072989)
chr8 (14-228)||(4424083-4424297)
chr8 (12-227)||(15068044-15068259)
chr8 (12-225)||(30480562-30480775)
chr8 (12-228)||(43082036-43082252)
chr8 (12-228)||(24873237-24873453)
chr8 (20-225)||(27911085-27911290)
chr8 (20-225)||(27957504-27957709)
chr8 (12-228)||(28283276-28283491)
chr8 (12-225)||(1225229-1225443)
chr8 (47-228)||(18812980-18813160)
chr8 (12-219)||(14419256-14419463)
chr8 (47-228)||(43530213-43530394)
chr8 (12-219)||(36865601-36865805)
chr8 (12-219)||(13858550-13858756)
chr8 (12-193)||(14477339-14477520)
chr8 (12-219)||(5372243-5372450)
chr8 (12-225)||(41384807-41385020)
chr8 (12-227)||(25952584-25952799)
chr8 (12-166)||(33541506-33541660)
chr8 (39-219)||(15956051-15956227)
chr8 (12-225)||(41382736-41382938)
chr8 (32-219)||(21482397-21482580)
chr8 (32-219)||(21480589-21480772)
chr8 (12-219)||(15185780-15185982)
chr8 (32-227)||(3005688-3005880)
chr8 (12-126)||(26775264-26775378)
chr8 (12-140)||(5622882-5623010)
chr8 (40-227)||(31162303-31162488)
chr8 (72-220)||(181622-181772)
chr8 (37-165)||(37214319-37214438)
chr8 (8-216)||(31573794-31573997)
chr8 (87-227)||(31578334-31578476)
chr8 (84-227)||(31035252-31035396)
chr8 (12-108)||(35872559-35872650)
chr8 (12-60)||(12517248-12517296)
chr8 (24-121)||(31035144-31035238)
chr8 (87-164)||(9021228-9021306)
chr8 (87-164)||(16752643-16752721)
chr8 (87-164)||(16757388-16757466)
chr8 (87-164)||(28327891-28327969)
chr8 (87-164)||(28895485-28895563)
chr8 (87-164)||(590777-590855)
chr8 (155-219)||(2468195-2468259)
chr8 (87-164)||(4812608-4812686)
chr8 (87-164)||(28332614-28332692)
chr8 (87-164)||(33032637-33032715)
chr8 (87-164)||(13985199-13985278)
chr8 (45-129)||(2468261-2468341)
chr8 (87-162)||(29554908-29554984)
chr8 (171-225)||(35872499-35872553)
chr8 (12-49)||(3886153-3886190)
chr8 (105-164)||(3276347-3276405)
chr8 (87-150)||(17799558-17799623)
chr8 (87-153)||(23179692-23179760)
chr8 (87-164)||(17847661-17847740)
chr8 (87-164)||(21033853-21033930)
chr8 (87-164)||(30423195-30423274)
chr8 (101-164)||(2267144-2267206)
chr8 (187-225)||(33541469-33541507)
chr8 (87-227)||(6376124-6376267)
[»] chr2 (80 HSPs)
chr2 (13-228)||(19502067-19502282)
chr2 (12-228)||(19504402-19504617)
chr2 (12-228)||(23452293-23452509)
chr2 (12-228)||(42064498-42064713)
chr2 (12-228)||(27104782-27104996)
chr2 (12-245)||(13910081-13910316)
chr2 (12-225)||(21520752-21520965)
chr2 (12-228)||(42452766-42452980)
chr2 (23-228)||(45280040-45280245)
chr2 (12-225)||(42923568-42923781)
chr2 (12-245)||(24162259-24162484)
chr2 (12-219)||(40032119-40032330)
chr2 (12-225)||(19007623-19007836)
chr2 (12-228)||(35215642-35215858)
chr2 (8-225)||(28196616-28196833)
chr2 (12-228)||(35218019-35218235)
chr2 (12-227)||(43623637-43623840)
chr2 (12-225)||(22287395-22287608)
chr2 (13-216)||(6258885-6259086)
chr2 (13-227)||(34979635-34979850)
chr2 (12-206)||(15539553-15539747)
chr2 (12-227)||(11739616-11739832)
chr2 (12-225)||(17848426-17848636)
chr2 (12-219)||(17849100-17849307)
chr2 (8-219)||(44289133-44289344)
chr2 (14-225)||(45239036-45239246)
chr2 (8-219)||(6264214-6264421)
chr2 (12-219)||(31732842-31733037)
chr2 (12-219)||(3022146-3022352)
chr2 (79-227)||(5375403-5375550)
chr2 (19-219)||(14837263-14837457)
chr2 (24-219)||(11578174-11578365)
chr2 (35-219)||(18800379-18800559)
chr2 (32-219)||(22874137-22874320)
chr2 (39-219)||(28459255-28459435)
chr2 (12-186)||(38020185-38020349)
chr2 (14-126)||(22163106-22163217)
chr2 (102-228)||(36558920-36559046)
chr2 (102-228)||(36561197-36561323)
chr2 (24-227)||(20146665-20146866)
chr2 (24-219)||(17897311-17897502)
chr2 (12-100)||(22407593-22407681)
chr2 (102-225)||(45332240-45332363)
chr2 (85-227)||(40699429-40699573)
chr2 (39-214)||(27136195-27136368)
chr2 (101-219)||(20589762-20589881)
chr2 (143-225)||(22407513-22407595)
chr2 (12-82)||(5377631-5377701)
chr2 (24-227)||(35107294-35107493)
chr2 (155-228)||(7463004-7463077)
chr2 (72-171)||(38414194-38414291)
chr2 (31-219)||(43139381-43139564)
chr2 (167-225)||(22707812-22707870)
chr2 (86-219)||(15693958-15694094)
chr2 (87-164)||(17462419-17462497)
chr2 (87-164)||(20054886-20054964)
chr2 (87-164)||(22712637-22712715)
chr2 (87-164)||(22717346-22717424)
chr2 (87-164)||(39686966-39687044)
chr2 (87-164)||(45567392-45567470)
chr2 (101-164)||(2736204-2736266)
chr2 (87-164)||(17921754-17921833)
chr2 (87-164)||(17932617-17932695)
chr2 (87-164)||(17943520-17943598)
chr2 (87-164)||(27517760-27517838)
chr2 (88-140)||(27583483-27583535)
chr2 (101-164)||(2740940-2741002)
chr2 (105-164)||(12781342-12781400)
chr2 (86-219)||(37963007-37963137)
chr2 (169-225)||(23870956-23871012)
chr2 (87-164)||(28458949-28459028)
chr2 (87-164)||(39680028-39680106)
chr2 (105-164)||(37170873-37170931)
chr2 (87-150)||(38190980-38191045)
chr2 (86-162)||(26345661-26345738)
chr2 (87-164)||(30478977-30479055)
chr2 (12-43)||(38020126-38020157)
chr2 (87-150)||(20050156-20050221)
chr2 (195-225)||(22163081-22163111)
chr2 (15-44)||(38414281-38414310)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (12-225)||(41542-41755)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (12-228)||(2896-3111)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (12-228)||(69348-69563)
scaffold0025 (12-104)||(73203-73295)
scaffold0025 (63-108)||(73163-73208)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (12-227)||(79201-79416)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (8-225)||(183700-183916)
scaffold0005 (12-225)||(52027-52240)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (12-227)||(14439-14654)
scaffold0131 (14-227)||(15037-15250)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (12-225)||(2058-2270)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (12-228)||(6215-6431)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (12-225)||(4013-4225)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (14-228)||(11529-11743)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (12-228)||(29187-29402)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (12-228)||(57-273)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (63-228)||(1509-1673)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (12-176)||(35655-35819)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (12-225)||(79875-80088)
scaffold0004 (87-164)||(188363-188441)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-227)||(85235-85462)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (24-219)||(15887-16079)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (29-219)||(16716-16903)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (24-227)||(1699-1892)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (102-228)||(22222-22347)
scaffold0140 (102-228)||(24497-24622)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (12-117)||(993-1103)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (87-227)||(4901-5043)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (87-164)||(224802-224880)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (87-164)||(16308-16386)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (101-216)||(57497-57614)
[»] scaffold0209 (1 HSPs)
scaffold0209 (105-164)||(17107-17165)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 119)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8631691 - 8631475
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  8631691 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 8631592  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631591 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 8631492  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  8631491 ctcatcatatagtggat 8631475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 5637736 - 5637524
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  5637736 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 5637637  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5637636 ggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 5637537  T
Q  213 tcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||    
T  5637536 tcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22044662 - 22044447
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  22044662 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacactatt 22044563  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22044562 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 22044464  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  22044463 ctcatcatatagtggat 22044447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22046957 - 22046742
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22046957 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 22046858  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22046857 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 22046759  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  22046758 ctcatcatatagtggat 22046742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 24348279 - 24348495
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24348279 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 24348378  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348379 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 24348478  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  24348479 ctcatcatatagtggat 24348495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 38409266 - 38409481
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  38409266 ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 38409365  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  38409366 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgata 38409464  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  38409465 ctcatcatatagtggat 38409481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2485144 - 2484929
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2485144 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacactatt 2485045  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2485044 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 2484946  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  2484945 ctcatcatatagtggat 2484929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3824843 - 3824627
Alignment:
Q  11 aggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  3824843 aggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 3824744  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3824743 taggattgagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 3824644  T
Q  211 actcatcatatagtgga 227  Q
    |||||||||||||||||    
T  3824643 actcatcatatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 11435016 - 11435231
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11435016 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 11435115  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11435116 aggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 11435214  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  11435215 ctcatcatatagtggat 11435231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 51015307 - 51015522
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  51015307 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 51015406  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  51015407 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaata 51015505  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  51015506 ctcatcatatagtggat 51015522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 9148306 - 9148528
Alignment:
Q  4 gaagcaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9148306 gaagcaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 9148405  T
Q  104 acactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttg 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9148406 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttg 9148504  T
Q  204 taacgttactcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9148505 taacgttactcatcatatagtgga 9148528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 47868462 - 47868677
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47868462 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 47868561  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47868562 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgata 47868661  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  47868662 ctcatcatatagtgga 47868677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11006509 - 11006293
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11006509 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 11006410  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  11006409 aggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatggt 11006311  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11006310 actcatcatatagtggat 11006293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22132662 - 22132448
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22132662 ggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 22132564  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22132563 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggta 22132465  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  22132464 ctcatcatatagtggat 22132448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 7941382 - 7941600
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa--cactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactg 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  7941382 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacacta 7941481  T
Q  110 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7941482 ttaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacga 7941581  T
Q  210 tactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  7941582 tactcatcatatagtggat 7941600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22803006 - 22802791
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22803006 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 22802907  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22802906 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgtta 22802807  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  22802806 ctcatcatatagtgga 22802791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 40637135 - 40637350
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40637135 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 40637234  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40637235 aggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 40637334  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  40637335 ctcatcatatagtgga 40637350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Original strand, 14633376 - 14633592
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14633376 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 14633475  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  14633476 tattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaat 14633574  T
Q  208 gttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14633575 gttactcatcatatagtg 14633592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11008838 - 11008624
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11008838 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 11008739  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||| | |    
T  11008738 aggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc---tttgtaatggt 11008642  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11008641 actcatcatatagtggat 11008624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22801134 - 22800919
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22801134 ggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 22801035  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22801034 aggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtta 22800935  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  22800934 ctcatcatatagtgga 22800919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37089643 - 37089429
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  37089643 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 37089544  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37089543 aggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 37089445  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  37089444 ctcatcatatagtgga 37089429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 6764900 - 6765121
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttc-----ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaaca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6764900 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaaca 6764999  T
Q  107 ctgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765000 ctgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 6765099  T
Q  207 cgttactcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6765100 cgttactcatcatatagtggat 6765121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36921763 - 36921550
Alignment:
Q  15 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  36921763 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 36921664  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  36921663 gattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttact 36921564  T
Q  214 catcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||    
T  36921563 catcatatagtgga 36921550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 18847214 - 18847430
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18847214 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 18847313  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18847314 agcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggt 18847412  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18847413 actcatcatatagtggat 18847430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22783010 - 22782794
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22783010 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgtt 22782911  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22782910 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgat 22782812  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22782811 actcatcatatagtggat 22782794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31849871 - 31849655
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  31849871 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactat 31849772  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31849771 taggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgat 31849673  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31849672 actcatcatatagtggat 31849655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22134887 - 22134673
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22134887 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 22134789  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  22134788 aggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggta 22134690  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  22134689 ctcatcatatagtggat 22134673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 24888857 - 24889072
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24888857 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 24888956  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24888957 aggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaacgtta 24889056  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    || |||||||||||||    
T  24889057 cttatcatatagtgga 24889072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22780645 - 22780429
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22780645 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgtt 22780546  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22780545 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgat 22780447  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22780446 actcatcatatagtggat 22780429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40091687 - 40091474
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40091687 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 40091588  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40091587 atgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgtta 40091488  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  40091487 ctcatcatatagtg 40091474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 44600110 - 44599894
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44600110 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 44600011  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||      
T  44600010 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaa 44599912  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44599911 actcatcatatagtggat 44599894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 47274788 - 47275000
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  47274788 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactatt 47274886  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  47274887 aggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 47274986  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  47274987 ctcatcatatagtg 47275000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 48486380 - 48486593
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  48486380 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 48486479  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  48486480 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaacgtta 48486579  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  48486580 ctcatcatatagtg 48486593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18709435 - 18709220
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18709435 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaacactatt 18709336  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  18709335 agggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaa 18709237  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  18709236 ctcatcatatagtggat 18709220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36919857 - 36919641
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  36919857 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 36919758  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36919757 taggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgtt 36919658  T
Q  211 actcatcatatagtgga 227  Q
    | |||||||||||||||    
T  36919657 attcatcatatagtgga 36919641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 24880512 - 24880726
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  24880512 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacactatt 24880611  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgt-aacgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24880612 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgtt 24880711  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    || ||||||||||||    
T  24880712 acgcatcatatagtg 24880726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 5198481 - 5198697
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  5198481 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacactatt 5198580  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5198581 aggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgata 5198680  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  5198681 ctcatcatatagtggat 5198697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12396115 - 12395904
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12396115 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 12396016  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12396015 gattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttact 12395916  T
Q  214 catcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||    
T  12395915 catcatatagtg 12395904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26086236 - 26086033
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26086236 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 26086137  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 223  Q
    ||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26086136 cttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctc-tttgtaacgatactcatcatatag 26086038  T
Q  224 tggat 228  Q
    |||||    
T  26086037 tggat 26086033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 38928449 - 38928237
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  38928449 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 38928350  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  38928349 aggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtta 38928250  T
Q  212 ctcatcatatagt 224  Q
    |||||||||||||    
T  38928249 ctcatcatatagt 38928237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12401077 - 12400866
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||     
T  12401077 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaa 12400978  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12400977 gattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttact 12400878  T
Q  214 catcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||    
T  12400877 catcatatagtg 12400866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47211012 - 47210808
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||| ||||||| ||    
T  47211012 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacactatt 47210925  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47210924 aggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgata 47210825  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  47210824 ctcatcatatagtggat 47210808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 24879050 - 24879264
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24879050 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 24879149  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgt-aacgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |    
T  24879150 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgat 24879249  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    || ||||||||||||    
T  24879250 acacatcatatagtg 24879264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9176746 - 9176530
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9176746 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 9176647  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  9176646 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggt 9176548  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9176547 actcatcatatagtggat 9176530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16934415 - 16934199
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  16934415 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactatt 16934316  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  16934315 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 16934217  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16934216 actcatcatatagtggat 16934199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16932061 - 16931845
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  16932061 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactatt 16931962  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  16931961 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 16931863  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16931862 actcatcatatagtggat 16931845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33415759 - 33415547
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  33415759 ggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 33415661  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | ||| ||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33415660 aagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 33415561  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  33415560 ctcatcatatagtg 33415547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 16453370 - 16453577
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16453370 ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 16453469  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16453470 aggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 16453569  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  16453570 ctcatcat 16453577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17662506 - 17662301
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17662506 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 17662418  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17662417 aggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 17662318  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  17662317 ctcatcatatagtggat 17662301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9174418 - 9174202
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9174418 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacactatt 9174319  T
Q  112 aggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  9174318 aggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacggt 9174220  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9174219 actcatcatatagtggat 9174202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14787703 - 14787490
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||    
T  14787703 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactatt 14787604  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  14787603 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtta 14787504  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  14787503 ctcatcatatagtg 14787490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 36378353 - 36378569
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  36378353 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactatt 36378452  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||| | ||||    
T  36378453 aggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttgtgaagtta 36378552  T
Q  212 ctcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||||| |||||||||    
T  36378553 ctcatcattatagtgga 36378569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 13544032 - 13544233
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  13544032 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 13544130  T
Q  123 tcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 222  Q
    ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13544131 tcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 13544230  T
Q  223 gtg 225  Q
    |||    
T  13544231 gtg 13544233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37313338 - 37313122
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||    
T  37313338 ggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacactatt 37313239  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  37313238 aggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagtta 37313139  T
Q  212 ctcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||||| |||||||||    
T  37313138 ctcatcattatagtgga 37313122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 19095943 - 19096157
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |    
T  19095943 ggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactat 19096042  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  | |  |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19096043 taggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtt 19096142  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    ||| |||||||||||    
T  19096143 acttatcatatagtg 19096157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 619719 - 619506
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  619719 ggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactatt 619620  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  619619 aggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaacgtta 619520  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  619519 ctcatcatatagtg 619506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 56030505 - 56030714
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  56030505 ggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 56030604  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||  | |||||||||||||||    
T  56030605 aggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttgtaacgtta 56030704  T
Q  212 ctcatcatat 221  Q
     |||||||||    
T  56030705 ttcatcatat 56030714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 17 - 219
Target Start/End: Original strand, 41997558 - 41997760
Alignment:
Q  17 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggat 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41997558 agaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggat 41997657  T
Q  117 tgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 216  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||  || || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||| |||||||||    
T  41997658 tgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttgtaaagttactcat 41997757  T
Q  217 cat 219  Q
    |||    
T  41997758 cat 41997760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 53405191 - 53405411
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  53405191 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactatt 53405289  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga------cttattattgtaacccattgatttctcttttgta 205  Q
    | ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| || |||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  53405290 aagattgagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttttgaa 53405389  T
Q  206 acgttactcatcatatagtgga 227  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  53405390 acgatactcatcatatagtgga 53405411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Original strand, 19322769 - 19322970
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19322769 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 19322865  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tata 222  Q
    |||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19322866 cttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 19322965  T
Q  223 gtgga 227  Q
    |||||    
T  19322966 gtgga 19322970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380626
Alignment:
Q  27 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctctt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  127 ggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtg 225  Q
    |||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  226 ga 227  Q
    ||    
T  36380625 ga 36380626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18409619 - 18409413
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||||| ||    
T  18409619 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacactatt 18409520  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||| ||||  |||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18409519 aggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa-gtta 18409421  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    | ||||||    
T  18409420 cccatcat 18409413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 52942718 - 52942537
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||    
T  52942718 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactatt 52942619  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||             ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52942618 aggattgagtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 52942537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3937481 - 3937316
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3937481 ggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 3937382  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 177  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3937381 ggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttatt 3937316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18537724 - 18537531
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18537724 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggtca 18537628  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    | |||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18537627 cgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 18537531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 219
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455509
Alignment:
Q  64 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattag 163  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattag 16455453  T
Q  164 gcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  16455454 gcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcat 16455509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 6132933 - 6133086
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||| ||    
T  6132933 ggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacactatt 6133032  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 165  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  6133033 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggc 6133086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 18535082 - 18534911
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18535082 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtca 18534986  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaa 206  Q
    |  ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18534985 cgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 18534911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890282
Alignment:
Q  31 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||| |     
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatc 38890380  T
Q  131 actggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    || |||||||  || ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38890379 acgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 38890282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 93 - 219
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891559
Alignment:
Q  93 caccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattga 192  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  193 tttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcat 2891559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 219
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499310
Alignment:
Q  34 actagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttact 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacg 27499227  T
Q  134 ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
      |||||  || | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||   | || |||||||||||| ||||||||||||    
T  27499228 ataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcat 27499310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8756510 - 8756308
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  8756510 caacaagaaaattaggatttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattgagtct 8756414  T
Q  124 ctt-ggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tat 221  Q
    ||| ||| || |||||||  || ||||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||| |||    
T  8756413 ctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactaatcattat 8756314  T
Q  222 agtgga 227  Q
    ||||||    
T  8756313 agtgga 8756308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 38270258 - 38270162
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacact 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38270258 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 38270162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Original strand, 13547305 - 13547428
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttt 201  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||    
T  13547305 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttt 13547404  T
Q  202 tgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  13547405 tgtaaagttactcatcatatagtg 13547428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635532
Alignment:
Q  146 gactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 5635532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 128 - 227
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215582
Alignment:
Q  128 gttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 227  Q
    ||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Original strand, 28453767 - 28453959
Alignment:
Q  31 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt 130  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28453767 aaaactagggtttgca--gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtt 28453861  T
Q  131 actggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    || |||||||  | |||| |||||||||||||||  | ||||| ||| |||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28453862 acgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 28453959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 145 - 228
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437639
Alignment:
Q  145 ggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 11437639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102364
Alignment:
Q  86 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaa 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaa 12102320  T
Q  185 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12102321 cccactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 12102364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136817
Alignment:
Q  39 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaag 138  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||  || ||||| |||||||||| ||  ||||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  139 aggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    |   || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| || ||| ||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcat 30136817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 87
Target Start/End: Original strand, 5101054 - 5101133
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 87  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5101054 caaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40999208 - 40999017
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||    | ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  40999208 caacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggattga--gattgattcacctaggaaaacattattaggattgagtct 40999112  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatc 217  Q
    |||||| || |||||||   | |||||||||||||||||||   |||||||   | ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40999111 cttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatc 40999017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15032748 - 15032614
Alignment:
Q  85 ggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaa 184  Q
    ||||||||||  || | ||||||| |||||||||||||||||||  ||  ||| ||  | ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15032748 ggttgattcatatttggaaacactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaa 15032649  T
Q  185 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15032648 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15032614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150950
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaac 185  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  || || ||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 47150993  T
Q  186 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    || ||||| |||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||    
T  47150992 cctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtgga 47150950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24446851 - 24446760
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacact 108  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24446851 ggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 24446760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Original strand, 2891378 - 2891434
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaca 68  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2891378 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983584
Alignment:
Q  86 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaa 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||| |  |||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaa 31983628  T
Q  185 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    ||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  31983627 ccctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtgga 31983584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16186035 - 16185892
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgta 183  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| ||||||||||||||||||   | ||||||||| ||| |    
T  16186035 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgca 16185936  T
Q  184 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |||| ||||| | || ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16185935 accctttgatatatc-tttgtaaagttactcatcattatagtgga 16185892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 152 - 224
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101202
Alignment:
Q  152 gggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagt 224  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagt 5101202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 219
Target Start/End: Original strand, 9863791 - 9863974
Alignment:
Q  31 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt 130  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||     
T  9863791 aaaactagggtttgta--gagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattgagtcttttggtc 9863885  T
Q  131 actggaagaggctgggactttgggtagaatt-aggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    || |||||||  || |||||||||||||||| ||   | ||||| ||| ||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  9863886 acgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcat 9863974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982233
Alignment:
Q  90 attcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag-gctgggactttgggtagaatt-aggcaggagacttattattgtaacc 186  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||   ||||||||||||||||||| ||   | ||||| ||| |||||||     
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  187 cattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    | ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 3982233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7050456 - 7050378
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7050456 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7050378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 11853532 - 11853610
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11853532 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 11853610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 219
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357909
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgg----gtagaatt-aggcaggagacttattattg 181  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||     ||||||| ||   | ||||||||| |||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttg 25357871  T
Q  182 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25357872 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 25357909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 8529250 - 8529328
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8529250 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8529328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16689139 - 16689061
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16689139 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacaggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16689061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 18586949 - 18587027
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18586949 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 18587027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 31300407 - 31300485
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31300407 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31300485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 55822248 - 55822326
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  55822248 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 55822326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5336965 - 5336903
Alignment:
Q  101 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  5336965 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5336903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 163
Target Start/End: Original strand, 10112952 - 10113080
Alignment:
Q  31 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt 130  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | |||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  10112952 aaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttaggaaacactattatgattgagtctcttggtc 10113046  T
Q  131 ac-tggaagaggctgggactttgggtagaattag 163  Q
    ||  |||||||  | |||||||||||||||||||    
T  10113047 acggggaagagattaggactttgggtagaattag 10113080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317019
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 15317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446700
Alignment:
Q  171 acttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtg 24446700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 4570077 - 4570155
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4570077 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 4570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13072180 - 13072102
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  13072180 ttgattcaccttgaacaaatcactattatgattgagtctcttggtcactggaagaggctgtga-tttgggtagaattagg 13072102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 15831124 - 15831202
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15831124 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgcgtagaattagg 15831202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 16489332 - 16489410
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  16489332 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 25699732 - 25699810
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25699732 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 164
Target Start/End: Original strand, 9022380 - 9022516
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtc 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |   |||||| | ||||||||||| ||||   || ||||||||||||||| ||||| | ||||||| || |     
T  9022380 caacatcaaaactagggtttgtagagaat---tctcttggcaacaaacactatggtt--gggattgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatt 9022474  T
Q  123 tcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||| || |||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  9022475 tcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattagg 9022516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 129
Target Start/End: Original strand, 10114412 - 10114505
Alignment:
Q  31 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggt 129  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10114412 aaaactagggtttgta--gagtctg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggt 10114505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 36771379 - 36771457
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36771379 ttgattcaccttgaacaaaacactattatgattgagtctcttggtcatgggaagaggctgtgac-ttgggtagaattagg 36771457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 140
Target Start/End: Original strand, 16638826 - 16638865
Alignment:
Q  101 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16638826 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacaggaagag 16638865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Original strand, 47566496 - 47566554
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  47566496 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagact-ggaatttgggtagaattagg 47566554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 150
Target Start/End: Original strand, 4884857 - 4884922
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactt 150  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  4884857 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 4884922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 140
Target Start/End: Original strand, 54906722 - 54906776
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 140  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  54906722 ttgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagag 54906776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 32 - 164
Target Start/End: Original strand, 36769406 - 36769540
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttg---tgggttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctctt 126  Q
    ||||||||||||| | ||| |||  ||||| | |||||||||||||||| |   ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||| ||||    
T  36769406 aaactagggtttgaagagaattt--ctcttggcaacaaacactagggttgggattgttttgattcaccttgaacaaaacactattaggatcgagtttctt 36769503  T
Q  127 ggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  36769504 ggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtaaaattagg 36769540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 15312299 - 15312377
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||| |||||| || |||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  15312299 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtcgcttggtcacgggaagatgctgtgac-ttgggtagaattagg 15312377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 100)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 51750046 - 51750262
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  51750046 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 51750145  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51750146 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 51750245  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  51750246 ctcatcatatagtggat 51750262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 28840687 - 28840902
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  28840687 ggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 28840786  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28840787 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 28840885  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  28840886 ctcatcatatagtggat 28840902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21948461 - 21948247
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  21948461 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa-cactatt 21948363  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948362 aggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 21948263  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  21948262 ctcatcatatagtgga 21948247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31735795 - 31735579
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31735795 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 31735696  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  31735695 aaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgata 31735596  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  31735595 ctcatcatatagtggat 31735579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 2617523 - 2617739
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2617523 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 2617622  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2617623 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 2617722  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  2617723 ctcatcatatagtggat 2617739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 245
Target Start/End: Original strand, 24325668 - 24325906
Alignment:
Q  10 aaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactg 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||     
T  24325668 aagggttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacacta 24325767  T
Q  110 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24325768 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgt 24325867  T
Q  210 tactcatcatatagtggat---gtggctgctctctcccc 245  Q
    |||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||    
T  24325868 tactcatcatatagtgaatcgaatggctgctctctcccc 24325906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 46431981 - 46431766
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  46431981 ggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 46431882  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  46431881 aggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgata 46431783  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  46431782 ctcatcatatagtggat 46431766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 28842502 - 28842716
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  28842502 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacactatt 28842601  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28842602 aggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 28842700  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  28842701 ctcatcatatagtgga 28842716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 15823553 - 15823768
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15823553 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 15823652  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15823653 aatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaacgtta 15823752  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  15823753 ctcatcatatagtgga 15823768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 48665184 - 48665400
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  48665184 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactatt 48665283  T
Q  112 aggattgagtctcttggtta-ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48665284 aggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtt 48665383  T
Q  211 actcatcatatagtgga 227  Q
    |||||||||||||||||    
T  48665384 actcatcatatagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 13761844 - 13762058
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  13761844 ggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacactatt 13761943  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13761944 aggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 13762042  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  13762043 ctcatcatatagtgga 13762058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15295108 - 15294895
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15295108 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 15295009  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15295008 aggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 15294909  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  15294908 ctcatcatatagtg 15294895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10400102 - 10399886
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10400102 ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatt 10400003  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10400002 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 10399903  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  10399902 ctcatcatatagtggat 10399886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 38925747 - 38925544
Alignment:
Q  17 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggat 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38925747 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggat 38925648  T
Q  117 tgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 216  Q
    |||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38925647 tgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcat 38925548  T
Q  217 cata 220  Q
    ||||    
T  38925547 cata 38925544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 20302466 - 20302681
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20302466 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 20302565  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  20302566 aggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgata 20302664  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||| |||||||||    
T  20302665 ctcatcagatagtggat 20302681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27337212 - 27336998
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27337212 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 27337114  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27337113 aggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 27337015  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  27337014 ctcatcatatagtggat 27336998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 39932080 - 39932295
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  39932080 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacactatt 39932179  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39932180 aggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgata 39932279  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  39932280 ctcatcatatagtgga 39932295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 16226174 - 16226390
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16226174 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 16226273  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  16226274 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 16226372  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16226373 actcatcatatagtggat 16226390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 17324910 - 17324697
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17324910 ggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 17324811  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  17324810 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgtta 17324711  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  17324710 ctcatcatatagtg 17324697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27339401 - 27339189
Alignment:
Q  15 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttagg 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |    
T  27339401 ttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactattacg 27339302  T
Q  115 attgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactc 214  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27339301 attgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgttactc 27339203  T
Q  215 atcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||    
T  27339202 atcatatagtggat 27339189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 47906277 - 47906490
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  47906277 ggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactatt 47906376  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47906377 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 47906476  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  47906477 ctcatcatatagtg 47906490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 6823022 - 6823237
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  6823022 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatactatt 6823120  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  6823121 aggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgata 6823220  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  6823221 ctcatcatatagtggat 6823237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 20291464 - 20291679
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20291464 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 20291563  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  20291564 aggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatt 20291662  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  20291663 ctcatcatatagtggat 20291679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 16428660 - 16428867
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16428660 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 16428759  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  16428760 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 16428859  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  16428860 ctcatcat 16428867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50307821 - 50307607
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  50307821 ggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 50307722  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  50307721 taggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtt 50307622  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  50307621 actcatcatatagtg 50307607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9463518 - 9463302
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9463518 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 9463419  T
Q  112 aggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  9463418 aggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggt 9463320  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9463319 actcatcatatagtggat 9463302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12302779 - 12302566
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12302779 ggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 12302680  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  12302679 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaacgtta 12302580  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  12302579 ctcatcatatagtg 12302566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 47177369 - 47177585
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  47177369 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 47177468  T
Q  112 aggat-tgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||  ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  47177469 aggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 47177567  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  47177568 actcatcatatagtggat 47177585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 47179720 - 47179936
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  47179720 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 47179819  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  47179820 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 47179918  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  47179919 actcatcatatagtggat 47179936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 13215088 - 13215308
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  13215088 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 13215187  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattga----tttctcttttgtaac 207  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||||||     
T  13215188 atgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctcttttgtaaa 13215287  T
Q  208 gttactcatca-tatagtgga 227  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  13215288 tttactcatcattatagtgga 13215308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9241362 - 9241144
Alignment:
Q  10 aaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  9241362 aaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacatta 9241263  T
Q  110 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  9241262 ttaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagt 9241163  T
Q  210 tactcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  9241162 tactcatcattatagtgga 9241144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9459691 - 9459475
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9459691 ggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 9459592  T
Q  112 aggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  9459591 aggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggt 9459493  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  9459492 actcatcatatagtggat 9459475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 41646927 - 41647140
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||   |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  41646927 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacactatt 41647026  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  41647027 aggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgtta 41647126  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  41647127 ctcatcatatagtg 41647140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 51752373 - 51752586
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  51752373 gtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta 51752472  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 212  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  51752473 g-attgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatac 51752570  T
Q  213 tcatcatatagtggat 228  Q
    ||| ||||||||||||    
T  51752571 tcaccatatagtggat 51752586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 50076944 - 50076730
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  50076944 tttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 50076845  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  50076844 gattgagtctcttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttact 50076745  T
Q  214 catca-tatagtgga 227  Q
    ||||| |||||||||    
T  50076744 catcattatagtgga 50076730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2510598 - 2510386
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  2510598 ggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacactatt 2510499  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2510498 aggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggca-gagacttattcttgtaacccattgatttctctcttgtaaagtta 2510400  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  2510399 ctcatcatatagtg 2510386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6995974 - 6995761
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6995974 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactatt 6995875  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  6995874 aagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgtta 6995775  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  6995774 ctcatcatatagtg 6995761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Original strand, 39462522 - 39462739
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  39462522 caaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacac 39462621  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||     
T  39462622 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttgaaaa 39462721  T
Q  208 gttactcatcatatagtg 225  Q
    |||| |||||||||||||    
T  39462722 gttattcatcatatagtg 39462739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 50079095 - 50078879
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50079095 ggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 50078996  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  50078995 aggattaagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 50078896  T
Q  212 ctcatca-tatagtgga 227  Q
     |||||| |||||||||    
T  50078895 ttcatcattatagtgga 50078879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 18307116 - 18307323
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||    
T  18307116 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactatt 18307215  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| ||||    
T  18307216 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttgtaaagtta 18307315  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  18307316 ctcatcat 18307323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 18839594 - 18839801
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18839594 ggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacactatt 18839693  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18839694 aggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 18839793  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  18839794 ctcatcat 18839801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14098244 - 14098030
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14098244 ggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 14098145  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgt-aacgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | |  |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14098144 aggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgtt 14098045  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  14098044 actcatcatatagtg 14098030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4131651 - 4131434
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  4131651 tttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacactattag 4131552  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattga----tttctcttttgtaacgt 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||    
T  4131551 gattgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaagt 4131453  T
Q  210 tactcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  4131452 tactcatcattatagtgga 4131434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17186402 - 17186195
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |     
T  17186402 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatc 17186303  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  17186302 aggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagtta 17186203  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  17186202 ctcatcat 17186195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31425293 - 31425082
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  31425293 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactat 31425194  T
Q  111 taggattgagt---ctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    |||||||||||   ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  31425193 taggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaag 31425094  T
Q  208 gttactcatcat 219  Q
    ||||||||||||    
T  31425093 gttactcatcat 31425082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 50248850 - 50248633
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  50248850 caaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacac 50248751  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||     
T  50248750 tattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaag 50248651  T
Q  208 gttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50248650 gttactcatcatatagtg 50248633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 25127879 - 25128086
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  25127879 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacactatt 25127978  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  25127979 tggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttgtaaggtta 25128078  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  25128079 ctcatcat 25128086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25251553 - 25251342
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  25251553 caaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataacgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacac 25251454  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    | |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||     
T  25251453 tattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaag 25251354  T
Q  208 gttactcatcat 219  Q
    |||||| |||||    
T  25251353 gttacttatcat 25251342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Original strand, 6756537 - 6756740
Alignment:
Q  15 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  6756537 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 6756636  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    ||||||||||  || ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  6756637 gattgagtct--tgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttact 6756734  T
Q  214 catcat 219  Q
    ||||||    
T  6756735 catcat 6756740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 204
Target Start/End: Original strand, 6823892 - 6824091
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6823892 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 6823991  T
Q  112 aggattgagtctctt-------ggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgt 204  Q
    | |||||| ||||||       |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6823992 acgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 6824091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11457749 - 11457536
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11457749 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 11457650  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  11457649 atgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 11457550  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  11457549 ctcatcatatagtg 11457536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28998527 - 28998318
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  28998527 ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 28998428  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  28998427 aggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgtta 28998328  T
Q  212 ctcatcatat 221  Q
    ||||||||||    
T  28998327 ctcatcatat 28998318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29004243 - 29004034
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29004243 ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 29004144  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  29004143 aggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgtta 29004044  T
Q  212 ctcatcatat 221  Q
    ||||||||||    
T  29004043 ctcatcatat 29004034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3579890 - 3579683
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||  ||    
T  3579890 ggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacacaatt 3579791  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||  |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3579790 aggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 3579691  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  3579690 ctcatcat 3579683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2949505 - 2949292
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2949505 ggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacactatt 2949406  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||| ||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  2949405 aggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtta 2949306  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  2949305 ctcatcatatagtg 2949292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31423148 - 31422940
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaac-aaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| |    
T  31423148 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacactat 31423049  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  31423048 tagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctcttttgtaaggtt 31422949  T
Q  211 actcatcat 219  Q
    |||||||||    
T  31422948 actcatcat 31422940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 31489922 - 31490129
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31489922 ggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactatt 31490019  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  31490020 aggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggtta 31490119  T
Q  212 ctcatcatat 221  Q
     |||||||||    
T  31490120 ttcatcatat 31490129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28207340 - 28207132
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  28207340 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacactatt 28207241  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||||  || ||||| || |||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  28207240 aggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtta 28207141  T
Q  212 ctcatcata 220  Q
    |||||||||    
T  28207140 ctcatcata 28207132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 17318900 - 17319101
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||          
T  17318900 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaac------ 17318993  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||| |||||||||| | ||||    
T  17318994 aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttgttaagtta 17319093  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  17319094 ctcatcat 17319101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 17324072 - 17324277
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17324072 ggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 17324169  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||  ||  |||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17324170 aggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 17324269  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
     |||||||    
T  17324270 ttcatcat 17324277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 47451655 - 47451862
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactg-t 110  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||       | || |    
T  47451655 ggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacatt-------agtgtt 47451747  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  47451748 taggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtt 47451847  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  47451848 actcatcatatagtg 47451862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 40133951 - 40134158
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  |    
T  40133951 ggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactact 40134050  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  || |  |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  40134051 aggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaagtta 40134150  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  40134151 ctcatcat 40134158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 42922252 - 42922444
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||    |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  42922252 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtct 42922348  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    |||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42922349 cttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 42922444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231786
Alignment:
Q  72 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggag 170  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||| ||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  171 acttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcatatagtggat 16231786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15669648 - 15669452
Alignment:
Q  29 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttgg 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15669648 acaaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 15669552  T
Q  129 ttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    | || |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| | ||||||||| |||||||||    
T  15669551 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtgga 15669452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14183843 - 14183650
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  14183843 aaactagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattgagtctcttggtta 14183747  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    | |||||||  | | | ||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14183746 cgggaagagattagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 14183650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 72 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248622
Alignment:
Q  72 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga 171  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  172 cttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 216  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcat 25248622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 219
Target Start/End: Original strand, 16432403 - 16432608
Alignment:
Q  3 agaagcaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaa 102  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  16432403 agaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-----------gtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 16432491  T
Q  103 aacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctttt 202  Q
    |||| | |||||||||| |||||||||||  |||||||  ||  |||||||||||||||| || ||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  16432492 aacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctctttt 16432591  T
Q  203 gtaacgttactcatcat 219  Q
    |||| ||||||||||||    
T  16432592 gtaatgttactcatcat 16432608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8347532 - 8347343
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| | |||| |  |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||    
T  8347532 caacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggttag--ggttgattcaccttaggaaacactattatgattgagtct 8347436  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 216  Q
    |||| | || |||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  8347435 cttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcat 8347343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 23785936 - 23786062
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  23785936 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 23786034  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 23786062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 97 - 228
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757753
Alignment:
Q  97 ttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttc 196  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  197 tcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    || ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  51757723 tc-tttgtaacgatactcaccatatagtggat 51757753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18800847 - 18800640
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||  ||||||    
T  18800847 caaaggtttagaa-gtcaacaagaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacac 18800752  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    | |||||||||||||||| ||| || || ||||  | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||     
T  18800751 tattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttgtaaa 18800652  T
Q  208 gttactcatcat 219  Q
    ||||||||||||    
T  18800651 gttactcatcat 18800640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 90 - 219
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429171
Alignment:
Q  90 attcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccat 189  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  190 tgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcat 16429171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115170
Alignment:
Q  85 ggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaa 184  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaa 6115205  T
Q  185 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    || |||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  6115204 ccaattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6115170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8349311 - 8349110
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  8349311 caacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattgagttt 8349215  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tata 222  Q
      |||| || |||||||  | ||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  8349214 gatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttgttaagttactcatcattata 8349115  T
Q  223 gtgga 227  Q
    |||||    
T  8349114 gtgga 8349110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 49495461 - 49495278
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||||   | ||||||||||||||| |||||||  ||  ||||||||| ||||| |    
T  49495461 aaactagggtttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtca 49495366  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    | | |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  49495365 cggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 49495278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13125711 - 13125516
Alignment:
Q  32 aaactagggtttg-tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||    ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||     
T  13125711 aaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaacactagggttga--ggttgattcacattgggaaacgctgttaggattgaggctcttggtc 13125615  T
Q  131 actggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |  |||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13125614 aagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 13125516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738695
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaac 185  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 30738731  T
Q  186 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatat 221  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30738730 cctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatat 30738695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 228
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816109
Alignment:
Q  146 gactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggat 23816109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790459
Alignment:
Q  85 ggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggca-ggagacttattattgta 183  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||   | ||||||| |||||||||||   ||||||||||| |||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgta 30790504  T
Q  184 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30790503 acccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 30790459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 219
Target Start/End: Original strand, 16561544 - 16561681
Alignment:
Q  83 tgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattattg 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  || | || ||  || |||||||||||||| ||||   || |||||||| |||    
T  16561544 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttg 16561643  T
Q  182 taacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16561644 taaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 16561681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26520379 - 26520206
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  26520379 caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattga--ggttgattcaccttgggaaacactattatgattgagtct 26520283  T
Q  124 cttg------gttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgat 193  Q
    ||||      || || |||||||  ||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26520282 cttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613298
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaac 185  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||| || |||||||  || | |||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 26613341  T
Q  186 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    || ||||| ||||||||| || |||||| |||| |||||||||    
T  26613340 cctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtgga 26613298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 227
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279489
Alignment:
Q  28 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctctt 126  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||||| |  | ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||  ||||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttctt 28279386  T
Q  127 ggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagt 224  Q
    ||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||| ||||||| |||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28279387 ggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagt 28279486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 164
Target Start/End: Original strand, 27916525 - 27916653
Alignment:
Q  31 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt 130  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  27916525 aaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattgagtctcttggtc 27916619  T
Q  131 actggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||  ||||||  || |||||||||| ||||||||    
T  27916620 acatgaagagattgtgactttgggtggaattagg 27916653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155865
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattagg 155865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 2232580 - 2232658
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2232580 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Original strand, 14997039 - 14997101
Alignment:
Q  101 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  14997039 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2401420 - 2401342
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2401420 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2401342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 4144882 - 4144804
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4144882 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 9526449 - 9526527
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9526449 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 21353545 - 21353467
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaac--actgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | |||  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21353545 ttgattcaccttgaacaacgcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 21353467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 25134054 - 25134132
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25134054 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 227
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104384
Alignment:
Q  91 ttcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggaga-cttattattgtaaccca 188  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||   ||  ||||||||||||||||||   | |||  || || |||||||||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  189 ttgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 43104384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 9521698 - 9521776
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9521698 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9521776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26332814 - 26332719
Alignment:
Q  29 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttgg 128  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26332814 acaaaaatagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttgg 26332720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 25248788 - 25248756
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25248788 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2393481 - 2393404
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattag 163  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  2393481 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagtctgggac-ttgggtagaattag 2393404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || | |||||  | | |||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaatta 162  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||||  || ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 95)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 4236637 - 4236852
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4236637 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactatta 4236736  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4236737 ggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 4236836  T
Q  213 tcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  4236837 tcatcatatagtggat 4236852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 38882113 - 38882328
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  38882113 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 38882212  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38882213 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 38882311  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  38882312 ctcatcatatagtggat 38882328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 2174926 - 2175141
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2174926 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 2175025  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2175026 atgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 2175124  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    || ||||||||||||||    
T  2175125 cttatcatatagtggat 2175141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25921745 - 25921530
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  25921745 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactatt 25921646  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25921645 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 25921546  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  25921545 ctcatcatatagtgga 25921530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 16776165 - 16776380
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16776165 ggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 16776264  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16776265 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaacgtta 16776363  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    || ||||||||||||||    
T  16776364 cttatcatatagtggat 16776380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 6745077 - 6745291
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6745077 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 6745175  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745176 ggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 6745275  T
Q  213 tcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  6745276 tcatcatatagtggat 6745291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 18469018 - 18469233
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18469018 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 18469117  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18469118 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgata 18469217  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    |||||||| |||||||    
T  18469218 ctcatcatctagtgga 18469233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 25804032 - 25804247
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25804032 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 25804131  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804132 aggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 25804231  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  25804232 ctcatcatatagtgga 25804247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10529371 - 10529158
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10529371 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 10529272  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10529271 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 10529172  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  10529171 ctcatcatatagtg 10529158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 21948033 - 21948246
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21948033 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 21948132  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21948133 aggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaacgtta 21948232  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  21948233 ctcatcatatagtg 21948246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Original strand, 27910455 - 27910672
Alignment:
Q  10 aaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactg 109  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  27910455 aaggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacacta 27910554  T
Q  110 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 209  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27910555 ttaggattgaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacga 27910654  T
Q  210 tactcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  27910655 tactcatcatataatgga 27910672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 39854490 - 39854706
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  39854490 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 39854589  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  39854590 aggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgcta 39854689  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  39854690 ctcatcatatagtggat 39854706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 18466691 - 18466906
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18466691 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 18466790  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18466791 aggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgata 18466890  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||| ||||    
T  18466891 ctcatcatataatgga 18466906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 27912543 - 27912758
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27912543 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 27912642  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27912643 aggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgata 27912742  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  27912743 ctcatcatatagtgga 27912758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 31545087 - 31545303
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31545087 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 31545186  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  31545187 aggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacagt 31545285  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31545286 actcatcatatagtggat 31545303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34477326 - 34477109
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34477326 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 34477227  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 209  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34477226 atgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgt 34477128  T
Q  210 tactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34477127 tactcatcatatagtggat 34477109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658412
Alignment:
Q  27 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctctt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  127 ggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 658412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 227
Target Start/End: Original strand, 26097737 - 26097954
Alignment:
Q  9 aaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacact 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  26097737 aaaggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttggaaa-cact 26097835  T
Q  109 gttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacg 208  Q
     |||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  26097836 attaggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacg 26097935  T
Q  209 ttactcatcatatagtgga 227  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26097936 ttactcatcatatagtgga 26097954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34479691 - 34479474
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34479691 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 34479592  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 209  Q
    | |||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34479591 atgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgt 34479493  T
Q  210 tactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  34479492 tactcatcatatagtggat 34479474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18511484 - 18511271
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18511484 ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 18511385  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18511384 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaagtta 18511285  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  18511284 ctcatcatatagtg 18511271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31179643 - 31179427
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31179643 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 31179544  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||      
T  31179543 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctc-tttgtaacgaa 31179445  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31179444 actcatcatatagtggat 31179427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 31542742 - 31542957
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31542742 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 31542841  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||  |    
T  31542842 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctc-tttgtaacagt 31542939  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31542940 actcatcatatagtggat 31542957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21684723 - 21684508
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||    
T  21684723 ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactatt 21684624  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||    
T  21684623 aggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacaata 21684525  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  21684524 ctcatcatatagtggat 21684508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 40221529 - 40221745
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40221529 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 40221628  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40221629 aggattgagtctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 40221728  T
Q  212 ctcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||||| |||||||||    
T  40221729 ctcatcattatagtgga 40221745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 2818608 - 2818394
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggtt-gattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  2818608 ggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacactat 2818509  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  2818508 tacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtt 2818409  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  2818408 actcatcatatagtg 2818394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 15552252 - 15552468
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15552252 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 15552351  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  15552352 aggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 15552450  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15552451 actcatcatatagtggat 15552468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18509590 - 18509377
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18509590 ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 18509491  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| | ||||| ||| |||||||| ||||    
T  18509490 aggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttgtaaagtta 18509391  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  18509390 ctcatcatatagtg 18509377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Original strand, 18596659 - 18596868
Alignment:
Q  19 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattg 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18596659 aaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattg 18596758  T
Q  119 agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca 218  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  18596759 agtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatca 18596858  T
Q  219 -tatagtgga 227  Q
     |||||||||    
T  18596859 ttatagtgga 18596868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16092472 - 16092265
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  16092472 ggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 16092373  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  16092372 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttgtaaggtta 16092273  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  16092272 ctcatcat 16092265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 6747313 - 6747527
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6747313 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 6747411  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6747412 aggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttct-ttttgtaacgtta 6747510  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    ||| |||||||||||||    
T  6747511 ctcgtcatatagtggat 6747527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1189880 - 1189677
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  1189880 gtttagaaaggcaacaacaaaactacggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactatta 1189781  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 212  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  1189780 tgattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttac 1189681  T
Q  213 tcat 216  Q
    ||||    
T  1189680 tcat 1189677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10474593 - 10474382
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||     
T  10474593 tttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacactattaa 10474494  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  10474493 gattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttctaaggttact 10474394  T
Q  214 catcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||    
T  10474393 catcatatagtg 10474382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 25904110 - 25904323
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25904110 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 25904209  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  25904210 aggattgagtctcttggttacgggaagagattagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattgtaacgtta 25904309  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    || |||||||||||    
T  25904310 cttatcatatagtg 25904323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 32 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 36402580 - 36402387
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  36402580 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggattgaatctcttggtta 36402481  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    | ||| |||  ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36402480 cgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 36402387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39398265 - 39398065
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  39398265 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactat 39398167  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39398166 taggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtgacgtt 39398067  T
Q  211 ac 212  Q
    ||    
T  39398066 ac 39398065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37706055 - 37705839
Alignment:
Q  9 aaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacact 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  37706055 aaaggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 37705956  T
Q  109 gttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacg 208  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||  | ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  37705955 attaggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagg 37705856  T
Q  209 ttactcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||||    
T  37705855 ttactcatcatatagtg 37705839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 17072890 - 17073097
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  17072890 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 17072989  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||  |||| |||| | ||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  17072990 aggattgaatctcttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggtta 17073089  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  17073090 ctcatcat 17073097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31472885 - 31472678
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31472885 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 31472786  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||  | | || || |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31472785 aggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgtaaagtta 31472686  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  31472685 ctcatcat 31472678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17818761 - 17818547
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||    
T  17818761 gtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactatta 17818662  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 212  Q
     || |||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17818661 agactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 17818562  T
Q  213 tcatcatatagtgga 227  Q
    |||||||| ||||||    
T  17818561 tcatcatacagtgga 17818547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 6756501 - 6756706
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  6756501 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactatt 6756600  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  6756601 aggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa--cattgatatcttttttgtaaggtta 6756698  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    | ||||||    
T  6756699 cacatcat 6756706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34530937 - 34530722
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  34530937 gtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatta 34530838  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 212  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||  | |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |    
T  34530837 ggattgagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttgc 34530738  T
Q  213 tcatca-tatagtgga 227  Q
    |||||| |||||||||    
T  34530737 tcatcattatagtgga 34530722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 24126864 - 24127076
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||  | |||||| ||||||| ||||||| |||    
T  24126864 gtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactatta 24126963  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 212  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  24126964 ggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttac 24127063  T
Q  213 tcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||    
T  24127064 tcatcatatagtg 24127076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31466254 - 31466040
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    |||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  |||||     
T  31466254 caaaggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacag 31466155  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  31466154 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaa 31466056  T
Q  208 gttactcatcatatag 223  Q
    ||||||||||||||||    
T  31466055 gttactcatcatatag 31466040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410245
Alignment:
Q  72 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  172 cttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 4410245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 2954423 - 2954636
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |    
T  2954423 ggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacactat 2954522  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||    
T  2954523 taggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagtt 2954621  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  2954622 actcatcatatagtg 2954636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 695896 - 696091
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||    
T  695896 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat-----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa-cactatt 695983  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  695984 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 696083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Original strand, 20043058 - 20043208
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20043058 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 20043157  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattag 163  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||    
T  20043158 ggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Original strand, 10586873 - 10587054
Alignment:
Q  47 tagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgg 145  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||||  ||     
T  10586873 tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattga 10586972  T
Q  146 gactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10586973 gactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctc-tttgtaacgttactcatcatatagtggat 10587054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 165
Target Start/End: Original strand, 20045017 - 20045170
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20045017 ggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 20045116  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggc 165  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20045117 atgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 20045170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12556195 - 12555990
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12556195 ggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 12556096  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgtt 210  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||| | | ||| ||| ||||||||||| || ||||||| || ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  12556095 aggattgtgtctcttggctacgggaaga-gattggagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgtt 12555997  T
Q  211 actcatc 217  Q
    |||||||    
T  12555996 actcatc 12555990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 84 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505900
Alignment:
Q  84 gggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgta 183  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20506041 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 20505942  T
Q  184 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20505941 acacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 20505900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585803
Alignment:
Q  72 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga 171  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  172 cttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtg 41585803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 81 - 228
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798270
Alignment:
Q  81 tgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattatt 180  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 39798222  T
Q  181 gtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||    
T  39798223 gtaacccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggat 39798270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6661443 - 6661254
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6661443 caacaagaaaattagggtatgtatagagtttgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattgagtct 6661347  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 216  Q
    |||||| || ||||||   || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  6661346 cttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttgctcat 6661254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26098523 - 26098403
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  26098523 ggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacactatt 26098424  T
Q  112 aggattgagtctcttggttac 132  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  26098423 atgattgagtctcttggttac 26098403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 10749797 - 10749923
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10749797 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 10749895  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 10749923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 228
Target Start/End: Original strand, 9020246 - 9020442
Alignment:
Q  29 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttgg 128  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  9020246 acaaaagtagggtttgtatagagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttgg 9020341  T
Q  129 ttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    | || |||||||  |||  |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  9020342 tcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgga 9020441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 21288771 - 21288981
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt------tgtgggttgattcaccttggaaaac 105  Q
    |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      || |||||||||||||||| |||||    
T  21288771 ggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttg-aaaac 21288869  T
Q  106 actgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgta 205  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||  | ||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||| ||        |||||||||    
T  21288870 actattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactca--------tcttttgta 21288961  T
Q  206 acgttactcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  21288962 acgttactcatcttatagtg 21288981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3373319 - 3373193
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattga-gtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  3373319 aaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 3373221  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggat 3373193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 10757274 - 10757399
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  10757274 aaacactattaggattggagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttc-t 10757371  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 10757399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 23665141 - 23665266
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  23665141 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 23665238  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 23665266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23793446 - 23793321
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  23793446 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 23793349  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 23793321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15354756 - 15354631
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  15354756 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 15354659  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtggat 15354631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15357032 - 15356907
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  15357032 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 15356935  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggat 15356907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38960313 - 38960188
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  38960313 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 38960216  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 38960188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 225
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724113
Alignment:
Q  67 caaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggca 166  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||          | |||||||||||||     
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagag---------attggtagaattaggcg 2724054  T
Q  167 ggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    || || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtg 2724113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17413416 - 17413223
Alignment:
Q  31 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt 130  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||     
T  17413416 aaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtc 17413322  T
Q  131 actggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |  |||||||  || |||||| ||||||||||||   | | ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17413321 aagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 17413223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143689
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaac 185  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || |||||||  | ||| ||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 15143646  T
Q  186 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15143647 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 15143689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 219
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208790
Alignment:
Q  86 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaa 184  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaa 36208755  T
Q  185 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36208756 cccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 36208790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 219
Target Start/End: Original strand, 20053861 - 20054049
Alignment:
Q  20 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattga 119  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20053861 aaggcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 20053957  T
Q  120 gtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    |||||||||||  ||   |||  |||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20053958 gtctcttggtt--tg---gagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc---gatatctcttttgtaaagttactcatcat 20054049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23742032 - 23741915
Alignment:
Q  110 ttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacg 208  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23742032 ttaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacg 23741935  T
Q  209 ttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  23741934 ttactcatcaaatagtggat 23741915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 146 - 220
Target Start/End: Original strand, 42770951 - 42771025
Alignment:
Q  146 gactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 220  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  42770951 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 20507734 - 20507665
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 81  Q
    |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20507734 ggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaagggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 219
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897943
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-aggagacttattattgtaacccattgatttctcttttg 203  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||| |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  204 taacgttactcatcat 219  Q
    ||| ||||||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcat 4897943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 1170794 - 1170872
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1170794 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 1170872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Original strand, 4754187 - 4754312
Alignment:
Q  34 actagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttact 133  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| |||    
T  4754187 actagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcact 4754281  T
Q  134 ggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||||||  || |||||||| ||||||||||    
T  4754282 ggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 35385651 - 35385573
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35385651 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 35385573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2298200 - 2298122
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2298200 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 2298122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 25452478 - 25452556
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25452478 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 164
Target Start/End: Original strand, 25445504 - 25445557
Alignment:
Q  110 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25445504 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25445557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 1240411 - 1240489
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1240411 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttaggcacgggaagaggctggga-tttgggtagaattagg 1240489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 28786387 - 28786465
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28786387 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggcagaattagg 28786465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31782656 - 31782578
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||  |||||||||||||||    
T  31782656 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 45
Target Start/End: Original strand, 4410068 - 4410101
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410068 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15445454 - 15445323
Alignment:
Q  101 aaaacactgttaggattgagtctcttggtt---actggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattattgtaacccattgatttc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     ||  ||||||  || ||||||| |||||||||||   || || | ||| ||||||||| ||||| ||    
T  15445454 aaaacactgttaggattgagtctcttggcggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatc 15445355  T
Q  197 tcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15445354 tcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 15445323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16093489 - 16093413
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa-cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattag 163  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| || |||| || ||||||| || |||||||||||    
T  16093489 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 140
Target Start/End: Original strand, 10627347 - 10627402
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 140  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  10627347 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10627402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17841448 - 17841370
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  17841448 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctctaggtcacgggaagaggctggaac-ttgggtagaattagg 17841370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 22672817 - 22672895
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22672817 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 22672895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11962612 - 11962554
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11962612 cactattaggattgtgtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 11962554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2144815 - 2144720
Alignment:
Q  31 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa-acactagggtttgtgggttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttgg 128  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  2144815 aaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttgg 2144721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 163
Target Start/End: Original strand, 42770805 - 42770924
Alignment:
Q  39 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaag 138  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||| ||||||| ||| ||||  | |||||| ||||||||||||| || |||||    
T  42770805 ggtttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactgagtctcttggtcacgggaag 42770899  T
Q  139 aggctgggactttgggtagaattag 163  Q
    ||  || ||||||||||||||||||    
T  42770900 agattgagactttgggtagaattag 42770924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26406672 - 26406617
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 140  Q
    ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  26406672 ttgattcaccttgaacaaaacattgttaggattgagtctcttggtcacaggaagag 26406617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Original strand, 29748370 - 29748502
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtc 122  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||   ||||| | |||||||| ||||||| |  | |||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||    
T  29748370 caacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggttag--gattgattcgtcttggagaaacactaataggattgagtc 29748464  T
Q  123 tcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaa 159  Q
    ||||||| || |||| ||  | ||||||||||||||||    
T  29748465 tcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 162
Target Start/End: Original strand, 40222771 - 40222822
Alignment:
Q  110 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaatta 162  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||| || |||||||||||||    
T  40222771 ttaggattgagtctcttgatcacgggaagaggctggaac-ttgggtagaatta 40222822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 100)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 38394003 - 38394219
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  38394003 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 38394102  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38394103 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 38394202  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  38394203 ctcatcatatagtggat 38394219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1047196 - 1046981
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1047196 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 1047097  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1047096 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgata 1046998  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  1046997 ctcatcatatagtggat 1046981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 1849998 - 1850214
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1849998 ggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactatt 1850097  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1850098 aggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 1850197  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  1850198 ctcatcatatagtggat 1850214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7470294 - 7470078
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  7470294 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacactatt 7470195  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7470194 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 7470095  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  7470094 ctcatcatatagtggat 7470078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40837014 - 40836799
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40837014 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 40836915  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  40836914 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgata 40836816  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  40836815 ctcatcatatagtggat 40836799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 44724596 - 44724811
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44724596 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 44724695  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44724696 aggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtta 44724795  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  44724796 ctcatcatatagtgga 44724811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 48457670 - 48457885
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||    
T  48457670 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacactatt 48457769  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457770 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 48457869  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  48457870 ctcatcatatagtgga 48457885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7472252 - 7472016
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  7472252 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 7472153  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7472152 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 7472053  T
Q  212 ctcatcatatagtggat---gtggctgctctctcccc 245  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  7472052 ctcatcatatagtggatcggatggctgctctctcccc 7472016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1049567 - 1049352
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  1049567 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatc 1049468  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  1049467 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgata 1049369  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  1049368 ctcatcatatagtggat 1049352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 3878594 - 3878810
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3878594 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacactatt 3878693  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3878694 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 3878793  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  3878794 ctcatcatatagtggat 3878810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 20626055 - 20626271
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20626055 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 20626154  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20626155 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 20626254  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  20626255 ctcatcatatagtggat 20626271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 20629946 - 20630162
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20629946 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 20630045  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20630046 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 20630145  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  20630146 ctcatcatatagtggat 20630162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 20642365 - 20642581
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20642365 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 20642464  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20642465 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 20642564  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  20642565 ctcatcatatagtggat 20642581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 40946345 - 40946561
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  40946345 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacactatt 40946444  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40946445 aggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaacgtta 40946544  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  40946545 ctcatcatatagtggat 40946561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 11757246 - 11757463
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  11757246 ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactat 11757345  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11757346 taggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 11757445  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11757446 actcatcatatagtggat 11757463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 20299476 - 20299693
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  20299476 ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacactat 20299575  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299576 taggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 20299675  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20299676 actcatcatatagtggat 20299693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 3035738 - 3035957
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3035738 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 3035837  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactg---gaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3035838 aggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgcaacg 3035937  T
Q  209 ttactcatcatatagtggat 228  Q
     |||||||||||||||||||    
T  3035938 atactcatcatatagtggat 3035957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Original strand, 25542543 - 25542761
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25542543 caaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagac 25542641  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25542642 tattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaac 25542740  T
Q  208 gttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25542741 gttactcatcatatagtggat 25542761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 35646 - 35861
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  35646 ggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 35745  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35746 atgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 35845  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  35846 ctcatcatatagtgga 35861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 18345558 - 18345774
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18345558 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 18345657  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18345658 aggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgata 18345757  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  18345758 ctcatcatatagtggat 18345774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27306501 - 27306287
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27306501 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 27306403  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27306402 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaacgtta 27306303  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  27306302 ctcatcatatagtgga 27306287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 28487570 - 28487783
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  28487570 ggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacactatt 28487669  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28487670 aggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 28487769  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  28487770 ctcatcatatagtg 28487783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31435319 - 31435103
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31435319 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 31435220  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31435219 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 31435120  T
Q  212 ctcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||||| |||||||||    
T  31435119 ctcatcattatagtgga 31435103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 44581 - 44796
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  44581 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacactatt 44680  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44681 atgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 44780  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  44781 ctcatcatatagtgga 44796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 443612 - 443825
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  443612 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 443711  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  443712 aggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttataacgtta 443811  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  443812 ctcatcatatagtg 443825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7349545 - 7349329
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  7349545 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 7349446  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  7349445 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 7349347  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7349346 actcatcatatagtggat 7349329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7351924 - 7351708
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  7351924 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 7351825  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  7351824 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 7351726  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  7351725 actcatcatatagtggat 7351708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 20297379 - 20297595
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20297379 ggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 20297478  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20297479 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgata 20297578  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  20297579 ctcatcatatagtggat 20297595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 11355275 - 11355490
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11355275 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 11355374  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||     
T  11355375 aggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaacgttt 11355474  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  11355475 ctcatcatatagtgga 11355490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 28485583 - 28485793
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  28485583 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacactatt 28485682  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28485683 aggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaacgtta 28485782  T
Q  212 ctcatcatata 222  Q
    |||||||||||    
T  28485783 ctcatcatata 28485793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 43253786 - 43253573
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43253786 tttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 43253688  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43253687 gattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttact 43253588  T
Q  214 catcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||    
T  43253587 catcatatagtggat 43253573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 21680044 - 21680257
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  21680044 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactatt 21680143  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  21680144 aggattgagtctcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttgtaaggtta 21680243  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  21680244 ctcatcatatagtg 21680257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31156183 - 31155967
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31156183 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 31156084  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31156083 aggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggt 31155985  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  31155984 actcatcctatagtggat 31155967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20137381 - 20137174
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20137381 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 20137282  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20137281 aagattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 20137182  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  20137181 ctcatcat 20137174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 24748611 - 24748818
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  24748611 ggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacactatt 24748710  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | ||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24748711 acgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 24748810  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  24748811 ctcatcat 24748818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 4296207 - 4295993
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |    
T  4296207 ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactat 4296108  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  4296107 taggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtt 4296008  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  4296007 actcatcatatagtg 4295993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 25276160 - 25276374
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  25276160 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattag 25276259  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25276260 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttact 25276359  T
Q  214 catca-tatagtgga 227  Q
    ||||| |||||||||    
T  25276360 catcattatagtgga 25276374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37412400 - 37412182
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  37412400 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 37412301  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgt 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||| ||    
T  37412300 taggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttttgtaaggt 37412201  T
Q  210 tactcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  37412200 tactcatcattatagtgga 37412182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21592419 - 21592202
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  21592419 caaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcac 21592320  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    | |||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  21592319 tattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 21592220  T
Q  208 gttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  21592219 gttactcatcatatagtg 21592202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42331271 - 42331056
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  42331271 ggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 42331172  T
Q  112 aggattgagtctcttggtt--actggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 209  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  42331171 aggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagt 42331072  T
Q  210 tactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||| ||||||||    
T  42331071 tactcattatatagtg 42331056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39146259 - 39146052
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  39146259 ggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactatt 39146160  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  39146159 atgattgagtctcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttgtaaggtta 39146060  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  39146059 ctcatcat 39146052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 42223174 - 42223388
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  42223174 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactat 42223273  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||| ||||||||||| | | ||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  42223274 taggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaacgtt 42223373  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  42223374 actcatcatatagtg 42223388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 21678083 - 21678296
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  21678083 ggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 21678182  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  21678183 aggattgagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttgtaaggtta 21678282  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    || |||||||||||    
T  21678283 cttatcatatagtg 21678296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13099748 - 13099540
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  13099748 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 13099649  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgtt 210  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  13099648 aagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagtt 13099549  T
Q  211 actcatcat 219  Q
    |||||||||    
T  13099548 actcatcat 13099540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Original strand, 9679088 - 9679289
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  9679088 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 9679186  T
Q  123 tcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 222  Q
    ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9679187 tcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 9679286  T
Q  223 gtg 225  Q
    |||    
T  9679287 gtg 9679289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 9680836 - 9681050
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |    
T  9680836 ggtttagaagggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacactat 9680935  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| |||    
T  9680936 taggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagtt 9681035  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  9681036 actcatcatatagtg 9681050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 21990167 - 21990382
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  21990167 ggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactatt 21990266  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||  || | ||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  21990267 agaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgtta 21990366  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  21990367 ctcatcatatagtgga 21990382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 24258480 - 24258687
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24258480 ggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 24258579  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||  || |||||||| ||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24258580 aggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 24258679  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  24258680 ctcatcat 24258687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27832905 - 27832698
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27832905 ggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 27832806  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  27832805 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctgtaaagtta 27832706  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  27832705 ctcatcat 27832698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 188
Target Start/End: Original strand, 26804586 - 26804765
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag---ggtttgtgggttgattcaccttggaaaacact 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  26804586 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 26804685  T
Q  109 gttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 188  Q
     |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  26804686 attaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 73 - 228
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396867
Alignment:
Q  73 ctagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagac 172  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  173 ttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctc-tttgtaactttactcatcatatagtggat 38396867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 65 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092271
Alignment:
Q  65 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7092332  T
Q  165 caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7092331 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtg 7092271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22828904 - 22828701
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||  ||||||||||  || ||||||||| |||    
T  22828904 gtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactatta 22828805  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 212  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||    
T  22828804 ggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattac 22828705  T
Q  213 tcat 216  Q
    ||||    
T  22828704 tcat 22828701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22251813 - 22251602
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||        | ||    
T  22251813 gtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgg--------gata 22251722  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattga----tttctcttttgtaacg 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| |    
T  22251721 ggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgtaaag 22251622  T
Q  209 ttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  22251621 ttactcatcattatagtgga 22251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24817610 - 24817410
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  24817610 caacaagagaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattgagtct 24817515  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tata 222  Q
    |||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24817514 cttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttgtaaagttactcatcattata 24817415  T
Q  223 gtgga 227  Q
    |||||    
T  24817414 gtgga 24817410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094519
Alignment:
Q  65 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattagg 7094580  T
Q  165 caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7094579 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtg 7094519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813555
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tata 222  Q
    |||||| || ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  223 gtgga 227  Q
    |||||    
T  24813559 gtgga 24813555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 29 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 20091797 - 20091609
Alignment:
Q  29 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttgg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| | ||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||    
T  20091797 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttgg 20091701  T
Q  129 ttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 220  Q
    | || |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  20091700 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 20091609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Original strand, 7188571 - 7188772
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7188571 caacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtct 7188667  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tata 222  Q
    |||||| || |||| ||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  7188668 cttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttgtaaagttattcatcattata 7188767  T
Q  223 gtgga 227  Q
    |||||    
T  7188768 gtgga 7188772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 2935375 - 2935501
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  2935375 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 2935473  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 2935501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 113
Target Start/End: Original strand, 18567630 - 18567731
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18567630 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 18567729  T
Q  112 ag 113  Q
    ||    
T  18567730 ag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 1606487 - 1606612
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  1606487 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 1606584  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 1606612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9027375 - 9027250
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  9027375 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 9027278  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 9027250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 22137185 - 22137310
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  22137185 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 22137282  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 22137310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 40552212 - 40552337
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  40552212 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 40552309  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 40552337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 219
Target Start/End: Original strand, 24465578 - 24465760
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  24465578 aaactagggtttgtatagcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gaattgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtca 24465673  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
      |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||| ||||||| | |||||||||| | ||||||||||    
T  24465674 tgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgatatgtcttttgtaaag-tactcatcat 24465760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 22108174 - 22108299
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  22108174 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 22108271  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 22108299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 40549934 - 40550059
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  40549934 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 40550031  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 40550059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 219
Target Start/End: Original strand, 6348933 - 6349006
Alignment:
Q  146 gactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  6348933 gactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcat 6349006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Original strand, 6332311 - 6332453
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-aggagacttattattgtaac 185  Q
    ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || |||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  6332311 ttgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaac 6332410  T
Q  186 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    || || || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6332411 cctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 6332453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 140
Target Start/End: Original strand, 22392502 - 22392606
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22392502 aaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 22392597  T
Q  132 ctggaagag 140  Q
    | |||||||    
T  22392598 cgggaagag 22392606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 219
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22393946
Alignment:
Q  149 tttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 22393946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 146 - 219
Target Start/End: Original strand, 26295598 - 26295671
Alignment:
Q  146 gactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26295598 gactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 26295671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297146
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattag 163  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 16297146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 164
Target Start/End: Original strand, 2120881 - 2120960
Alignment:
Q  86 gttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2120881 gttgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2120960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3320249 - 3320171
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3320249 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3320171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3324997 - 3324919
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3324997 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3324919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 7069763 - 7069841
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7069763 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7069841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 7074770 - 7074848
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7074770 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7074848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 25351336 - 25351414
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25351336 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25351414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 25357030 - 25357108
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25357030 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25357108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 25405376 - 25405454
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25405376 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25405454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 25410113 - 25410191
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25410113 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25410191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 42006646 - 42006724
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42006646 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 8378703 - 8378625
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8378703 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8378625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 217
Target Start/End: Original strand, 11081540 - 11081731
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  11081540 caacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcactttgggaaacactattaggattgagtct 11081634  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaaccc--attgatttctcttttgtaacgttactcatc 217  Q
    |||| | || |||||||  | ||| |||| ||| |||||||   | ||||| ||| |||||||||   ||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  11081635 cttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttttgatatctcttgtgtaaagttactcatc 11081731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15541194 - 15541116
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  15541194 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtataattagg 15541116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 30246953 - 30247031
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30246953 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Original strand, 38396333 - 38396377
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396333 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44512724 - 44512646
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44512724 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 90 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281466
Alignment:
Q  90 attcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaaccca 188  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||  || |||||| ||| ||||||||   | ||||||||| |||||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  189 ttgattt 195  Q
    |||||||    
T  40281472 ttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44144065 - 44143997
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgg 153  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  44144065 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactttgg 44143997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 164
Target Start/End: Original strand, 6048903 - 6049039
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtc 122  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |   |||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||    
T  6048903 caacatcaaaactagggtttgtaaagaat---tctcttggcaacaaacacta-ggtttg-ggattgattcaccttgaagaaacactattaggattgaatc 6048997  T
Q  123 tcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||| ||  |||||   || |||||||| ||||||||||    
T  6048998 tcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattagg 6049039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 34547042 - 34546984
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  34547042 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 34546984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  | | |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 12310234 - 12310160
Alignment:
Q  65 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 140  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  12310234 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 12310160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 21369625 - 21369703
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  21369625 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || | |||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 227
Target Start/End: Original strand, 6046641 - 6046726
Alignment:
Q  143 tgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||| || ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6046641 tgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgga 6046726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2990830 - 2990786
Alignment:
Q  86 gttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggt 129  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2990830 gttgattcaccttgaataaacactgttaggattgagtatcttggt 2990786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 83)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4816503 - 4816287
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4816503 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactatt 4816404  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4816403 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacggta 4816304  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  4816303 ctcatcatatagtggat 4816287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 8 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11983305 - 11983085
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11983305 caaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacac 11983206  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11983205 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 11983106  T
Q  208 gttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11983105 gttactcatcatatagtggat 11983085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1230521 - 1230306
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1230521 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 1230422  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1230421 aggattgactctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 1230322  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  1230321 ctcatcatatagtgga 1230306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 28241593 - 28241380
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  28241593 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 28241494  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28241493 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 28241394  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  28241393 ctcatcatatagtg 28241380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14459037 - 14458823
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||| ||    
T  14459037 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaaacactatt 14458940  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14458939 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 14458840  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  14458839 ctcatcatatagtggat 14458823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 14507447 - 14507235
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  14507447 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 14507348  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14507347 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgata 14507249  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    || |||||||||||    
T  14507248 cttatcatatagtg 14507235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30034875 - 30034659
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  30034875 ggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 30034776  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30034775 aggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 30034676  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||| ||||    
T  30034675 ctcatcatatagcggat 30034659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 30967243 - 30967459
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  30967243 ggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 30967342  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30967343 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 30967442  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  30967443 ctcatcatatagtggat 30967459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19704841 - 19704623
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19704841 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 19704742  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctct-tttgtaacgt 209  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  19704741 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaacgg 19704642  T
Q  210 tactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19704641 tactcatcatatagtggat 19704623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 9019968 - 9020181
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9019968 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 9020067  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  9020068 aggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 9020167  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  9020168 ctcatcatatagtg 9020181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20915628 - 20915412
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  20915628 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 20915529  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20915528 aggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggt 20915430  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20915429 actcatcatatagtggat 20915412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 13057236 - 13057443
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  13057236 ggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 13057335  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13057336 aggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 13057435  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  13057436 ctcatcat 13057443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 3390421 - 3390628
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3390421 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 3390520  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3390521 aggattgagtctcttggttacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 3390620  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  3390621 ctcatcat 3390628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15530402 - 15530180
Alignment:
Q  4 gaagcaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 103  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15530402 gaagcaagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 15530303  T
Q  104 acactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttg 203  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  15530302 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttg 15530204  T
Q  204 taacgttactcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  15530203 taacgttactcatcatatagtgga 15530180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3632210 - 3632003
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  3632210 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacactatt 3632111  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3632110 aggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 3632011  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  3632010 ctcatcat 3632003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 214
Target Start/End: Original strand, 25477316 - 25477518
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25477316 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 25477415  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25477416 aggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtta 25477515  T
Q  212 ctc 214  Q
    |||    
T  25477516 ctc 25477518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 26065028 - 26065240
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  26065028 ggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 26065124  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26065125 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgtta 26065223  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    ||| | |||||||||||    
T  26065224 ctcgttatatagtggat 26065240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 26084997 - 26085209
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  26084997 ggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 26085093  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26085094 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctc-tttgtaacgtta 26085192  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    ||| | |||||||||||    
T  26085193 ctcgttatatagtggat 26085209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2629157 - 2628942
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2629157 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacactatt 2629058  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggag-acttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2629057 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-ggagaatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggt 2628960  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2628959 actcatcatatagtggat 2628942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3630136 - 3629923
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3630136 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 3630037  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3630036 aggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 3629937  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    || || ||||||||    
T  3629936 ctaataatatagtg 3629923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 13039796 - 13040003
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13039796 ggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 13039895  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13039896 aggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 13039995  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  13039996 ctcatcat 13040003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12195787 - 12195571
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12195787 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 12195688  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  12195687 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 12195589  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12195588 actcatcatatagtggat 12195571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15532953 - 15532740
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15532953 ggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 15532854  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15532853 aggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 15532754  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  15532753 ctcatcatatagtg 15532740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15541412 - 15541199
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15541412 ggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 15541313  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    || ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15541312 agaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 15541213  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
     |||||||||||||    
T  15541212 ttcatcatatagtg 15541199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 217
Target Start/End: Original strand, 32280038 - 32280243
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  32280038 ggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 32280137  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  32280138 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 32280237  T
Q  212 ctcatc 217  Q
    ||||||    
T  32280238 ctcatc 32280243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26932831 - 26932618
Alignment:
Q  15 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttagg 114  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  26932831 ttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactattagg 26932732  T
Q  115 att-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  26932731 attggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaact 26932633  T
Q  214 catcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||    
T  26932632 catcatatagtggat 26932618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19227680 - 19227515
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19227680 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 19227581  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 177  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19227580 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttatt 19227515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30729094 - 30728881
Alignment:
Q  18 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt 117  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  30729094 gaaagacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt 30728995  T
Q  118 gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattga----tttctcttttgtaacgttact 213  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||| ||||||    
T  30728994 gactctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctcttttgtaaagttact 30728895  T
Q  214 catcatatagtgga 227  Q
    |||  |||||||||    
T  30728894 catattatagtgga 30728881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 3234001 - 3233789
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3234001 tttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 3233902  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || | ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  3233901 ggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttac 3233802  T
Q  213 tcatcatatagtg 225  Q
    ||| | |||||||    
T  3233801 tcaccgtatagtg 3233789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12161827 - 12161617
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| ||    
T  12161827 ggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacactatt 12161730  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | ||| |||||| |||||||| |||||||  || |||||| |||| ||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  12161729 aagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 12161630  T
Q  212 ctcatcatatagt 224  Q
    |||||||||||||    
T  12161629 ctcatcatatagt 12161617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24338720 - 24338512
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg-tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |    
T  24338720 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacactat 24338621  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    || |||||||||| |||||||  | |||||  |  |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  24338620 taagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtt 24338521  T
Q  211 actcatcat 219  Q
    |||||||||    
T  24338520 actcatcat 24338512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 219
Target Start/End: Original strand, 15719708 - 15719891
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15719708 aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtca 15719803  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
      |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15719804 tgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15719891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 219
Target Start/End: Original strand, 22490688 - 22490889
Alignment:
Q  18 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    || |||||||  ||||||| ||||||||    
T  22490688 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggatt 22490787  T
Q  118 gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatc 217  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  22490788 gagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatc 22490887  T
Q  218 at 219  Q
    ||    
T  22490888 at 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 20 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3028114 - 3027910
Alignment:
Q  20 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattga 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3028114 aaggcaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 3028019  T
Q  120 gtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca- 218  Q
    |||||||||| ||  ||||||  || ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  3028018 gtctcttggtcacgtgaagagattgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 3027919  T
Q  219 tatagtgga 227  Q
    |||||||||    
T  3027918 tatagtgga 3027910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 69 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273272
Alignment:
Q  69 aacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcag 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  168 gagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaactcatcttatagtggat 5273272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 90 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069784
Alignment:
Q  90 attcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccat 189  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  190 tgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcat 1069784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16455676 - 16455482
Alignment:
Q  31 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |     
T  16455676 aaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacactgttaggattaagtctcttgctc 16455580  T
Q  131 actggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    || | |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  16455579 acggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgga 16455482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 219
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466572
Alignment:
Q  47 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgg 145  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||  |||    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  146 gactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    || |||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcat 14466572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26066306 - 26066180
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  26066306 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 26066208  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggat 26066180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 33308989 - 33309114
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  33308989 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 33309086  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 33309114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 33311258 - 33311383
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |    
T  33311258 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctc-t 33311355  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 33311383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29754891 - 29754765
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  29754891 aaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 29754793  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 29754765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 1072149 - 1072067
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattca 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1072149 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 217
Target Start/End: Original strand, 17012105 - 17012287
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  17012105 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtca 17012201  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatc 217  Q
    |  ||||||  ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17012202 cgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186128
Alignment:
Q  86 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaa 184  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||  || ||||||||||| |||||||   ||||||||||| ||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaa 12186172  T
Q  185 cccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12186171 ctcattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 12186128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 36 - 225
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367286
Alignment:
Q  36 tagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactgg 135  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcggg 15367196  T
Q  136 aagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    |||||  ||  |||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  15367197 aagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtg 15367286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26068577 - 26068451
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  26068577 aaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 26068479  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggat 26068451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 219
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945393
Alignment:
Q  85 ggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgta 183  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgta 26945357  T
Q  184 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26945358 actcattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 26945393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 13870694 - 13870608
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13870694 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 36 - 227
Target Start/End: Original strand, 19696508 - 19696698
Alignment:
Q  36 tagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactgg 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  19696508 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctctttgtcactga 19696604  T
Q  136 aagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |||||  || |||||||| ||||||||||   | ||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  19696605 aagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgtaaagttattcatcattatagtgga 19696698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 32447588 - 32447502
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag-ggtttgtgggttgattcacct 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  32447588 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 69
Target Start/End: Original strand, 8995521 - 8995578
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8995521 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037794
Alignment:
Q  88 tgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga-cttattattgtaacc 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | || | || ||  || |||||||||||||||||||    | | |||||| ||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  187 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 220  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 28037794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Original strand, 17852584 - 17852650
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 78  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17852584 ggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 13878710 - 13878788
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13878710 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13878788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 13883458 - 13883536
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13883458 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13883536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 16785902 - 16785980
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16785902 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16785980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26887423 - 26887345
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26887423 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 31248913 - 31248835
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31248913 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 35201525 - 35201447
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35201525 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20527063
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaac 185  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  |  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||| |||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 20527021  T
Q  186 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |  ||||| |||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  20527022 cttttgatatctc-tttgtaaagttattcatcattatagtgga 20527063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 3577713 - 3577636
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  3577713 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 8 - 61
Target Start/End: Original strand, 10584159 - 10584212
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 61  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10584159 caaaggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 25078755 - 25078623
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagga-gacttattattgtaac 185  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || | |||||  || || |||  |||||||||||   || |||||||| |||||||    
T  25078755 ttgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgaga-tttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaac 25078657  T
Q  186 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  25078656 cctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcat 25078623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 225
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346602
Alignment:
Q  145 ggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    |||||||| ||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtg 15346602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 17036038 - 17036116
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17036038 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17695050 - 17694972
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17695050 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17694972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12166320 - 12166267
Alignment:
Q  110 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12166320 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12166267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 115
Target Start/End: Original strand, 15346445 - 15346524
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttagga 115  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15346445 aaactagggtttgtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 162
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaatta 162  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||   |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22352031 - 22351973
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  22352031 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgaga-tttgggtagaattagg 22351973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22858203 - 22858075
Alignment:
Q  31 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt 130  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||| | ||||||||||||||||    | |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||     
T  22858203 aaaactagggtttgta--gaattt-tctcttggtaacaaacactagggttga--gattgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtc 22858109  T
Q  131 actggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||  ||||||  || |||||| |||||| |||||    
T  22858108 acaagaagagattgagactttaggtagatttagg 22858075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 164
Target Start/End: Original strand, 25941652 - 25941704
Alignment:
Q  110 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25941652 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 25941704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Original strand, 26643179 - 26643237
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26643179 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattagg 26643237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Original strand, 26749145 - 26749203
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26749145 cactattaggattgagtctcttggtcacaggaagatgctgggac-ttgggtagaattagg 26749203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 227
Target Start/End: Original strand, 30445699 - 30445782
Alignment:
Q  146 gactttgggtagaattaggcagga-gacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30445699 gactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 30445782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 19702061 - 19701985
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaatta 162  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19702061 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaatta 19701985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13467662 - 13467585
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  13467662 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgtgactt--ggtagaattagg 13467585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 5165999 - 5165936
Alignment:
Q  101 aaaacactgtt-aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  5165999 aaaacactgtttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 33215810 - 33215888
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33215810 ttgattcaccttgaataaagcactattaggattgagtctcttggtcacggcaagaggctgggac-ttggatagaattagg 33215888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22342980 - 22342922
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22342980 cactattaggattgcgtctcttggtcacgggaagaggctggga-tttgggtagtattagg 22342922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 80
Target Start/End: Original strand, 4595046 - 4595102
Alignment:
Q  21 aggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  4595046 aggcaacaacaaaactagggtttg--tagagttt-tcacttggcaacaaacactagggtt 4595102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28078310 - 28078251
Alignment:
Q  169 agacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtggat 228  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28078310 agacttattcttgtaacct-ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggat 28078251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 135)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 43228279 - 43228494
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  43228279 gtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 43228378  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43228379 ggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 43228478  T
Q  213 tcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  43228479 tcatcatatagtggat 43228494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 38890027 - 38890243
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  38890027 ggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 38890126  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38890127 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 38890226  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  38890227 ctcatcatatagtggat 38890243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4308551 - 4308336
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4308551 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 4308452  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308451 aggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 4308352  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  4308351 ctcatcatatagtgga 4308336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4104165 - 4103950
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  4104165 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 4104066  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4104065 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgata 4103967  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  4103966 ctcatcatatagtggat 4103950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 5191640 - 5191855
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  5191640 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 5191739  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5191740 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgata 5191838  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  5191839 ctcatcatatagtggat 5191855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18099440 - 18099225
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18099440 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 18099341  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18099340 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacatta 18099241  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  18099240 ctcatcatatagtgga 18099225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 22114575 - 22114365
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22114575 ggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 22114476  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114475 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 22114376  T
Q  212 ctcatcatata 222  Q
    |||||||||||    
T  22114375 ctcatcatata 22114365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10084659 - 10084443
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10084659 ggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 10084560  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10084559 aggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaacgtta 10084460  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  10084459 ctcatcatatagtggat 10084443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 25533429 - 25533645
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25533429 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 25533528  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25533529 aggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 25533628  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  25533629 ctcatcatatagtggat 25533645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 43226073 - 43226288
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43226073 ggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 43226171  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43226172 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 43226271  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  43226272 ctcatcatatagtggat 43226288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 11170391 - 11170606
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||    
T  11170391 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacactatt 11170490  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170491 aggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 11170590  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  11170591 ctcatcatatagtgga 11170606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18097170 - 18096955
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18097170 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 18097071  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18097070 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaacgtta 18096971  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  18096970 ctcatcatatagtgga 18096955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 30005828 - 30006043
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  30005828 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 30005927  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30005928 aggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgtta 30006027  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  30006028 ctcatcatatagtgga 30006043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 3859515 - 3859750
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3859515 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 3859614  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||    
T  3859615 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctc-tttgtaacaata 3859713  T
Q  212 ctcatcatatagtggat-gt--ggctgctctctcccc 245  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  3859714 ctcatcatatagtggatcgtagggctgctctctcccc 3859750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 228
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321682
Alignment:
Q  29 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttgg 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 1321582  T
Q  129 ttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1321583 ttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 1321682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 42990291 - 42990500
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  42990291 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 42990390  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42990391 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgtta 42990490  T
Q  212 ctcatcatat 221  Q
    ||||||||||    
T  42990491 ctcatcatat 42990500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10956297 - 10956082
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | ||    
T  10956297 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacattatt 10956198  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10956197 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgtta 10956098  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  10956097 ctcatcatatagtgga 10956082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 51727276 - 51727062
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  51727276 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtatagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 51727178  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51727177 aggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 51727078  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  51727077 ctcatcatatagtgga 51727062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6066066 - 6065830
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6066066 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 6065967  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  6065966 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 6065868  T
Q  211 actcatcatatagtggat---gtggctgctctctcccc 245  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  6065867 actcatcatatagtggattggatggctgctctctcccc 6065830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27101451 - 27101236
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27101451 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 27101352  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  27101351 aggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaacgtta 27101252  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  27101251 ctcatcatatagtgga 27101236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 45882926 - 45883141
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  45882926 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 45883025  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  45883026 aggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgtta 45883125  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  45883126 ctcatcatatagtgga 45883141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9604879 - 9604661
Alignment:
Q  10 aaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  9604879 aaggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacacta 9604780  T
Q  110 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9604779 ttaggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 9604680  T
Q  210 tactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  9604679 tactcatcatatagtggat 9604661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 746744 - 746960
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  746744 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 746843  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  746844 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtt 746942  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  746943 actcatcatatagtggat 746960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 25388893 - 25389108
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25388893 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacactatt 25388991  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25388992 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtt 25389090  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25389091 actcatcatatagtggat 25389108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43423733 - 43423520
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43423733 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 43423634  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  43423633 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgtta 43423534  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  43423533 ctcatcatatagtg 43423520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10191579 - 10191364
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10191579 ggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 10191480  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10191479 aggatcgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaacgtta 10191381  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  10191380 ctcatcatatagtggat 10191364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 225
Target Start/End: Original strand, 1313394 - 1313609
Alignment:
Q  10 aaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactg 109  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  1313394 aaggtttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacacta 1313493  T
Q  110 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1313494 ttaggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgt 1313593  T
Q  210 tactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||||    
T  1313594 tactcatcatatagtg 1313609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10958593 - 10958378
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10958593 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatt 10958494  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10958493 aggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgtta 10958394  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||| ||||||||||||    
T  10958393 ctcttcatatagtgga 10958378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28102272 - 28102057
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||    
T  28102272 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctatt 28102173  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28102172 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 28102073  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    || |||||||||||||    
T  28102072 cttatcatatagtgga 28102057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413086
Alignment:
Q  15 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttagg 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  115 attg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaact 28413101  T
Q  214 catcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||    
T  28413100 catcatatagtggat 28413086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 455894 - 456110
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  455894 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 455993  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  455994 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 456092  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  456093 actcatcatatagtggat 456110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 458271 - 458487
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  458271 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 458370  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  458371 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 458469  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  458470 actcatcatatagtggat 458487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1626953 - 1626740
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1626953 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacactatt 1626854  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1626853 aggattgagtctcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 1626754  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  1626753 ctcatcatatagtg 1626740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10621800 - 10621584
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  10621800 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 10621701  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  10621700 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggt 10621602  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10621601 actcatcatatagtggat 10621584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 53917934 - 53917721
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  53917934 ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 53917835  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  53917834 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 53917735  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  53917734 ctcatcatatagtg 53917721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 29956673 - 29956888
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29956673 ggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 29956772  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29956773 aggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgtta 29956872  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  29956873 ctcatcatatagtgga 29956888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6063716 - 6063500
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6063716 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 6063617  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  6063616 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 6063518  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6063517 actcatcatatagtggat 6063500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 50493986 - 50494202
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  50493986 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 50494085  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  50494086 aggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 50494184  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  50494185 actcatcatatagtggat 50494202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 26720535 - 26720749
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||| ||    
T  26720535 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-actatt 26720633  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  26720634 aggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaacgata 26720733  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  26720734 ctcatcatatagtgga 26720749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 18162650 - 18162864
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||    
T  18162650 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactatt 18162749  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgt-aacgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  18162750 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttgtaaacgtt 18162849  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  18162850 actcatcatatagtg 18162864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 6561797 - 6562014
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6561797 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 6561896  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| ||     
T  6561897 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttttgtaaggta 6561996  T
Q  211 actcatca-tatagtgga 227  Q
    |||||||| |||||||||    
T  6561997 actcatcattatagtgga 6562014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32264309 - 32264092
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  32264309 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 32264210  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |||    
T  32264209 aggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttgtaaagtt 32264110  T
Q  211 actcatca-tatagtgga 227  Q
    |||||||| |||||||||    
T  32264109 actcatcattatagtgga 32264092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 38210357 - 38210573
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  38210357 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 38210456  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||      
T  38210457 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaa 38210555  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38210556 actcatcatatagtggat 38210573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 43421685 - 43421472
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43421685 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 43421586  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    || |||||||||||||||||| |||| ||  ||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43421585 agaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtta 43421486  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  43421485 ctcatcatatagtg 43421472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Original strand, 51943354 - 51943570
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  51943354 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 51943453  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  51943454 tattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaac 51943552  T
Q  208 gttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  51943553 gttactcatcatatagtg 51943570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 3314671 - 3314878
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3314671 ggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 3314770  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||    
T  3314771 aggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaatta 3314870  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
     |||||||    
T  3314871 ttcatcat 3314878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 220
Target Start/End: Original strand, 39715456 - 39715664
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  39715456 ggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactatt 39715555  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  39715556 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaaagtta 39715655  T
Q  212 ctcatcata 220  Q
    |||||||||    
T  39715656 ctcatcata 39715664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5522885 - 5522681
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||    
T  5522885 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt-----------ctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacactatt 5522797  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  5522796 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgata 5522698  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  5522697 ctcatcatatagtggat 5522681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5927034 - 5926824
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  5927034 ggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacactatt 5926935  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  5926934 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttgtaaggtta 5926835  T
Q  212 ctcatcatata 222  Q
    |||||||||||    
T  5926834 ctcatcatata 5926824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 24979694 - 24979908
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  24979694 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactatt 24979793  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgt-aacgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| || ||| |||||| ||||||    
T  24979794 aggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttgtaaacgtt 24979893  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  24979894 actcatcatatagtg 24979908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47149165 - 47148952
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaa-caaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| |||| |    
T  47149165 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttggaaa-cactat 47149067  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  47149066 tatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtatcgtt 47148967  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  47148966 actcatcatatagtg 47148952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 190
Target Start/End: Original strand, 35777408 - 35777587
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  35777408 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 35777507  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccatt 190  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  35777508 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35918219 - 35917998
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacac------tagggtttgtgggttgattcaccttggaaaac 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  35918219 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcgaaac 35918120  T
Q  106 actgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgta 205  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35918119 actattagaattgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgta 35918020  T
Q  206 acgttactcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  35918019 acgttactcattatatagtgga 35917998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606642
Alignment:
Q  47 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctggg 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  147 actttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttct-atttgtaacgttactcgtcatatagtggat 7606642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 53915754 - 53915553
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  53915754 caacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattgagtct 53915655  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 223  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  53915654 cttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatttag 53915555  T
Q  224 tg 225  Q
    ||    
T  53915554 tg 53915553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 880721 - 880509
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  880721 gtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 880622  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    || |||||||||||||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  880621 agcattgagtctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 880522  T
Q  212 ctcatcatatagt 224  Q
    |||||||||||||    
T  880521 ctcatcatatagt 880509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 36011816 - 36012029
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  36011816 tttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacactattag 36011915  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36011916 gattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttact 36012015  T
Q  214 catcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||    
T  36012016 catcatatagtgga 36012029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28761698 - 28761492
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28761698 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacactatt 28761600  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||   || |||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28761599 aggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 28761500  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  28761499 ctcatcat 28761492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 53468725 - 53468519
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||    
T  53468725 ggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacactatt 53468627  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  53468626 aggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 53468527  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  53468526 ctcatcat 53468519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 48361943 - 48361729
Alignment:
Q  10 aaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactg 109  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||     
T  48361943 aaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacacta 48361844  T
Q  110 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 209  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| |||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  48361843 ttaggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgt 48361744  T
Q  210 tactcatcatatagt 224  Q
    ||||||| |||||||    
T  48361743 tactcataatatagt 48361729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28100311 - 28100146
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  28100311 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgctatt 28100212  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 177  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28100211 aggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttatt 28100146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 890041 - 889830
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||| |    
T  890041 ggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacactat 889944  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  889943 taggattgagtctcttggttacgggaagagt-tggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctcttttgtaaagtt 889845  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  889844 actcatcatatagtg 889830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 54691842 - 54691632
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  54691842 tttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 54691743  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    |||||| | | |||||||  |||||||  | || ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||     
T  54691742 gattgaattttttggttatgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgtaacgttacc 54691643  T
Q  214 catcatatagt 224  Q
    |||||||||||    
T  54691642 catcatatagt 54691632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12268235 - 12268032
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaa-ctagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |    
T  12268235 gtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactat 12268136  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||           |||||||||||||||    
T  12268135 taggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-----------ctcttttgtaacgtt 12268047  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  12268046 actcatcatatagtg 12268032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 51 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 51674997 - 51674826
Alignment:
Q  51 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactt 150  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||    
T  51674997 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattt 51674898  T
Q  151 tgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 222  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  51674897 tggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatata 51674826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 15780847 - 15781078
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtt-----------tgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15780847 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 15780946  T
Q  101 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattg----atttc 196  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    |||||    
T  15780947 gaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatatttc 15781046  T
Q  197 tcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |||||||||| |||| | |||| |||||||||    
T  15781047 tcttttgtaaagttatttatcattatagtgga 15781078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 76 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688217
Alignment:
Q  76 gggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagactta 175  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  176 ttattgtaacccattgatttctcttttgt-aacgttactcatcatatagtg 225  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtg 25688217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 225
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484560
Alignment:
Q  38 gggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactgga 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacggga 6484471  T
Q  137 agaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||  ||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6484472 agagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtg 6484560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 225
Target Start/End: Original strand, 32219106 - 32219285
Alignment:
Q  47 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctggg 146  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||  ||||    
T  32219106 tagagtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattggg 32219205  T
Q  147 actttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgt-aacgttactcatcatatagtg 225  Q
    |||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32219206 actttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtg 32219285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Original strand, 28181008 - 28181174
Alignment:
Q  11 aggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||  |    
T  28181008 aggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccat 28181107  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatt 177  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  28181108 taggattgagtctattggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacgtatt 28181174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 54884144 - 54884357
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  54884144 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacactatt 54884241  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||  ||  ||||||  ||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  54884242 aggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaaagtta 54884340  T
Q  212 ctcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||||| |||||||||    
T  54884341 ctcatcattatagtgga 54884357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 89 - 227
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168303
Alignment:
Q  89 gattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccca 188  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  189 ttgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattgga 11168303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 32 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420252
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtca 13420337  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 216  Q
    | |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13420336 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcat 13420252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Original strand, 42992273 - 42992493
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  42992273 ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacactatt 42992372  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||               ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42992373 aggattgagtctcttggttatgggaagagagt-ggactttgggtag---------------ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgtta 42992456  T
Q  212 ctcatcatatagtggat---gtggctgctctctcccc 245  Q
     ||||||||||||| ||   | |||||||||||||||    
T  42992457 gtcatcatatagtgaatcggggggctgctctctcccc 42992493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 24 - 216
Target Start/End: Original strand, 31151347 - 31151534
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31151347 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 31151443  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcat 216  Q
    |||||| || |||| ||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||    
T  31151444 cttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgtaaagttactcat 31151534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 225
Target Start/End: Original strand, 53591210 - 53591384
Alignment:
Q  51 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactt 150  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||  ||| ||  | ||| ||    
T  53591210 gtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattt 53591309  T
Q  151 tgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  53591310 tgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtg 53591384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 219
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635575
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 25635487  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    | |||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  25635488 cgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcat 25635575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886401
Alignment:
Q  86 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaac 185  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5886261 gttgattcaccttggaaa-cactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5886359  T
Q  186 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5886360 ccattgatttgtc-tttgaaacgttactcatcatatagtggat 5886401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 86 - 228
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899874
Alignment:
Q  86 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaac 185  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5899734 gttgattcaccttggaaa-cactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 5899832  T
Q  186 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5899833 ccattgatttctc-tttgcaacgttactcatcatatagtggat 5899874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 73 - 219
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6231994
Alignment:
Q  73 ctagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagac 172  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  173 ttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcat 6231994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 46 - 219
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666710
Alignment:
Q  46 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgg 145  Q
    |||| |||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||     
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  146 gactttgggtagaattaggcaggaga--cttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 4666710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 202
Target Start/End: Original strand, 23637025 - 23637200
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  23637025 caacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattgagtct 23637121  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctttt 202  Q
    |||| | |  ||||||   | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  23637122 cttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 23637200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561831
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |    
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtca 561928  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |  ||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  561927 cgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtgga 561831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 219
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795452
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 17795364  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    | | |||||  || | |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17795365 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 17795452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 219
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103892
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtca 19103804  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    | | |||||  || | |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19103805 cggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 19103892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Original strand, 23633458 - 23633647
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||    
T  23633458 caacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattgagtct 23633552  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    |||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  23633553 cttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctc-tttgtaaagttactcatcat 23633647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Original strand, 53597238 - 53597439
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  53597238 caacaagaaaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 53597334  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tata 222  Q
    |||||| |   ||| ||  || || |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  53597335 cttggtcatgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttgtaaagttactcatcattata 53597434  T
Q  223 gtgga 227  Q
    |||||    
T  53597435 gtgga 53597439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 28137541 - 28137423
Alignment:
Q  47 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctggg 146  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  28137541 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggg 28137442  T
Q  147 actttgggtagaattaggc 165  Q
     ||||||||||||||||||    
T  28137441 gctttgggtagaattaggc 28137423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674160
Alignment:
Q  25 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctc 124  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  125 ttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    ||| | || |||||||  ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||    
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgatatgtcttttgtaaagttact 1674160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 93
Target Start/End: Original strand, 11163137 - 11163218
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11163137 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 117
Target Start/End: Original strand, 41849151 - 41849244
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  41849151 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaactctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36871557 - 36871356
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36871557 caacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttag--gattgattcaccttggaaaacactgttaagattgagtct 36871461  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tat 221  Q
    |||||| || | |||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||| |||| |||||| |||    
T  36871460 cttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctc-tttgtaaagttaatcatcattat 36871362  T
Q  222 agtgga 227  Q
    ||||||    
T  36871361 agtgga 36871356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 69 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560355
Alignment:
Q  69 aacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagg 168  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||  |||  ||||||||||||||||||||     
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggcag- 4560399  T
Q  169 agacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
       |||    |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||    
T  4560398 ---ctt----ttgtaacccattaatatctcttttgcaaagttactcatcat 4560355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 134
Target Start/End: Original strand, 24177278 - 24177385
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24177278 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtct 24177374  T
Q  124 cttggttactg 134  Q
    |||||| ||||    
T  24177375 cttggtcactg 24177385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 103 - 219
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3306955
Alignment:
Q  103 aacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctttt 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||   |||   ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  203 gtaacgttactcatcat 219  Q
    |||| ||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcat 3306955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701728
Alignment:
Q  152 gggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg 47701728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Original strand, 6231438 - 6231502
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231438 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 47701865 - 47701798
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 79  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  47701865 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 227
Target Start/End: Original strand, 24181498 - 24181583
Alignment:
Q  143 tgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24181498 tgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 24181583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 27635897 - 27635830
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 79  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27635897 ggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27635792 - 27635715
Alignment:
Q  148 ctttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27635792 ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 27635715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634504
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaac 185  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||  ||||||  || |||||||||||| ||||||   | ||||| ||| ||||||     
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaa 14634539  T
Q  186 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 220  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14634538 cctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 14634504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620580
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattagg 1620580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10094273 - 10094195
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10094273 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10094195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10201153 - 10201075
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10201153 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10201075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 16462186 - 16462264
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16462186 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22626183 - 22626105
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22626183 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 47883081 - 47883003
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47883081 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 129
Target Start/End: Original strand, 13419868 - 13419983
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| ||||||    
T  13419868 caaaggttta-aaagccaacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacac 13419961  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggt 129  Q
    | |||||||  |||||||||||    
T  13419962 tattaggatcaagtctcttggt 13419983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 129
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggt 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | |  | |||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10100290 - 10100212
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10100290 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 10100212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10208199 - 10208121
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10208199 ttgattcaccttgaacaaaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10208121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 29914152 - 29914074
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29914152 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 29914074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 47878370 - 47878292
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47878370 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47878292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 54193209 - 54193287
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54193209 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54193287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Original strand, 4535613 - 4535675
Alignment:
Q  101 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  4535613 aaaacaccgttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggga-attgggtagaattagg 4535675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 150
Target Start/End: Original strand, 6303293 - 6303358
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactt 150  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6303293 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 6303358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Original strand, 3306786 - 3306842
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaca 68  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3306786 ggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatagagtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 127
Target Start/End: Original strand, 7768632 - 7768672
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttg 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7768632 ttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttg 7768672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 10896988 - 10897066
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10896988 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgattctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10897066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20031517 - 20031439
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20031517 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtaaaattagg 20031439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 54188492 - 54188570
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54188492 ttgattcaccttgaacaaagcactattagaattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54188570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634081
Alignment:
Q  168 gagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    |||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 25634081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 162
Target Start/End: Original strand, 38002852 - 38002928
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaatta 162  Q
    ||||||||||||| |  ||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38002852 ttgattcaccttgaacaaaacaccattaggtttgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 38002928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 5858529 - 5858605
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5858529 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtct--tggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 5858605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10612977 - 10612899
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| ||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10612977 ttgattcaccttgaacaaagcactattaagattgagtttcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10612899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 27544256 - 27544334
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  27544256 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagcgtggaac-ttgggtagaattagg 27544334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 31021361 - 31021300
Alignment:
Q  65 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttg 127  Q
    |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31021361 aacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10595213 - 10595155
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  10595213 cactattaggattaagtctcttggtcacgggaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 10595155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||| | || |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Original strand, 11079516 - 11079578
Alignment:
Q  101 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  11079516 aaaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattagg 11079578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Original strand, 16996874 - 16996936
Alignment:
Q  101 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  16996874 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaattggga-tttgggtagaattagg 16996936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 10949434 - 10949381
Alignment:
Q  110 ttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||| ||||||||    
T  10949434 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctggaac-ttgggttgaattagg 10949381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 11007683 - 11007633
Alignment:
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  11007683 gattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 11007633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 74)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 14807814 - 14808029
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  14807814 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 14807913  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14807914 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 14808013  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  14808014 ctcatcatatagtgga 14808029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 3874073 - 3874289
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  3874073 ggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 3874172  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3874173 aggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 3874272  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  3874273 ctcatcatatagtggat 3874289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 15809282 - 15809497
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15809282 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttt-ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactatt 15809380  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15809381 aggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 15809480  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  15809481 ctcatcatatagtggat 15809497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 608797 - 609013
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  608797 ggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactatt 608896  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  608897 aggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 608996  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  608997 ctcatcatatagtggat 609013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 27827049 - 27827264
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27827049 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 27827148  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  27827149 aggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaata 27827247  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  27827248 ctcatcatatagtggat 27827264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 27829360 - 27829575
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27829360 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 27829459  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  27829460 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaata 27829558  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  27829559 ctcatcatatagtggat 27829575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28251839 - 28251623
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  28251839 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 28251740  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28251739 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaatgtta 28251640  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  28251639 ctcatcatatagtggat 28251623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 32339372 - 32339588
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  32339372 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacactatt 32339471  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  32339472 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgata 32339571  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  32339572 ctcatcatatagtggat 32339588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 44720906 - 44721122
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaaacactgt 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  44720906 ggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacactat 44721005  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  44721006 taggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacggt 44721104  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  44721105 actcatcatatagtggat 44721122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 18810771 - 18810986
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18810771 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 18810870  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  18810871 aggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaata 18810969  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  18810970 ctcatcatatagtggat 18810986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 43079665 - 43079881
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43079665 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 43079764  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  43079765 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 43079863  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43079864 actcatcatatagtggat 43079881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22684928 - 22684710
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  22684928 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatt 22684829  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaaccc---attgatttctcttttgtaacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||    
T  22684828 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgtaacg 22684729  T
Q  209 ttactcatcatatagtgga 227  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22684728 ttactcatcatatagtgga 22684710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 27107169 - 27106956
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27107169 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 27107070  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||  ||||    
T  27107069 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttgtagggtta 27106970  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  27106969 ctcatcatatagtg 27106956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 15072773 - 15072989
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15072773 ggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacactatt 15072872  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaaga-ggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15072873 aggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtt 15072972  T
Q  211 actcatcatatagtgga 227  Q
    |||||||||| ||||||    
T  15072973 actcatcatacagtgga 15072989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Original strand, 4424083 - 4424297
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  4424083 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacactattag 4424182  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4424183 gattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaacattact 4424282  T
Q  214 catcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||    
T  4424283 catcatatagtggat 4424297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 15068044 - 15068259
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||    
T  15068044 ggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatactatt 15068143  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15068144 aggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtta 15068243  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||| ||||    
T  15068244 ctcatcatataatgga 15068259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 30480775 - 30480562
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  30480775 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 30480676  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||  || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30480675 aggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtta 30480576  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
     |||||||||||||    
T  30480575 gtcatcatatagtg 30480562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 43082036 - 43082252
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |     
T  43082036 ggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatc 43082135  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  43082136 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 43082234  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43082235 actcatcatatagtggat 43082252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24873453 - 24873237
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  24873453 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacactatt 24873354  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||      
T  24873353 aggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctc-tttgtaacgaa 24873255  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24873254 actcatcatatagtggat 24873237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 27911085 - 27911290
Alignment:
Q  20 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27911085 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 27911184  T
Q  120 gtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  27911185 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcat 27911284  T
Q  220 atagtg 225  Q
    ||||||    
T  27911285 atagtg 27911290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 20 - 225
Target Start/End: Original strand, 27957504 - 27957709
Alignment:
Q  20 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  27957504 aaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattga 27957603  T
Q  120 gtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  27957604 gtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattgtaaagttactcatcat 27957703  T
Q  220 atagtg 225  Q
    ||||||    
T  27957704 atagtg 27957709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28283491 - 28283276
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  28283491 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactatt 28283392  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||  | ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28283391 aggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 28283293  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  28283292 ctcatcatatagtggat 28283276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 1225229 - 1225443
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  1225229 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 1225328  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctc-ttttgtaacgtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  1225329 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttttgtaacgtt 1225428  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  1225429 actcatcatatagtg 1225443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Original strand, 18812980 - 18813160
Alignment:
Q  47 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctggg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  18812980 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtg 18813079  T
Q  147 actttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18813080 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaatactcatcatatagtggat 18813160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14419463 - 14419256
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  14419463 ggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 14419364  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  14419363 aagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttgtaaggtta 14419264  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  14419263 ctcatcat 14419256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 47 - 228
Target Start/End: Original strand, 43530213 - 43530394
Alignment:
Q  47 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctggg 146  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43530213 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctggg 43530312  T
Q  147 actttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43530313 actttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggat 43530394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 36865601 - 36865805
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  36865601 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 36865700  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||   | || |||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  36865701 aggattgagtctct---tcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttgtaaagtta 36865797  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  36865798 ctcatcat 36865805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13858756 - 13858550
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  13858756 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 13858657  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||| || |||||||||||| ||||    
T  13858656 aggattgagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttgtaaagtta 13858558  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  13858557 ctcatcat 13858550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 14477339 - 14477520
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || ||    
T  14477339 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgctatt 14477438  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgat 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  14477439 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5372450 - 5372243
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  5372450 ggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacactatt 5372351  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||| ||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  5372350 aggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttgtaaggtta 5372251  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  5372250 ctcatcat 5372243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 41384807 - 41385020
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||    
T  41384807 ggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacaccatt 41384906  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||  |||| ||||||||||||  ||||| || || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  41384907 aggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtta 41385006  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  41385007 ctcatcatatagtg 41385020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 25952584 - 25952799
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  25952584 ggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaatatt 25952682  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||   || ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||    
T  25952683 aggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaatta 25952782  T
Q  212 ctcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||||| |||||||||    
T  25952783 ctcatcattatagtgga 25952799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 33541660 - 33541506
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||    
T  33541660 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactatt 33541561  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggca 166  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  33541560 aggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggca 33541506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956227
Alignment:
Q  39 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaag 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  139 aggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15956227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 41382736 - 41382938
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||            ||    
T  41382736 ggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcaccta-----------tt 41382824  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  41382825 atgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtta 41382924  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  41382925 ctcatcatatagtg 41382938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 219
Target Start/End: Original strand, 21482397 - 21482580
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21482397 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggtta 21482492  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
      |||||||  |||| ||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21482493 tgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 21482580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 219
Target Start/End: Original strand, 21480589 - 21480772
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  21480589 aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggtta 21480684  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    | ||||||   ||||  ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21480685 cgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 21480772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15185982 - 15185780
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||  || |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15185982 ggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacactatt 15185883  T
Q  112 aggattgagt--ctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 209  Q
    || |||||||  ||||||||||| |||||||        |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||    
T  15185882 agaattgagtctctcttggttacgggaagag-------atttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttttttaaggt 15185790  T
Q  210 tactcatcat 219  Q
    ||||||||||    
T  15185789 tactcatcat 15185780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3005880 - 3005688
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||   || ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  3005880 aaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggtt---ggattgattcactttggaaaacactattagcattgagtctcttggtca 3005785  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    | | |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  3005784 cggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttgctcatcattatagtgga 3005688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 126
Target Start/End: Original strand, 26775264 - 26775378
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26775264 ggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacactatt 26775363  T
Q  112 aggattgagtctctt 126  Q
    || ||||||||||||    
T  26775364 agaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 5623010 - 5622882
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||| | ||    
T  5623010 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacattatt 5622911  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagag 140  Q
     ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  5622910 tggattgagtctcttgattacgggaagag 5622882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 40 - 227
Target Start/End: Original strand, 31162303 - 31162488
Alignment:
Q  40 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaaga 139  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||  ||| |  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  31162303 gtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgttag--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaaga 31162399  T
Q  140 ggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  31162400 gattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgga 31162488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 220
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181772
Alignment:
Q  72 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt-aggattgagtctcttggttact--ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcagg 168  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| |||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||| |     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  169 agacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcata 220  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctc-tttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 37214438 - 37214319
Alignment:
Q  37 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactgga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||         |||||||||||||||||| |||    
T  37214438 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacggga 37214348  T
Q  137 agaggctgggactttgggtagaattaggc 165  Q
    || |  ||| |||||||||||||||||||    
T  37214347 agcgattggaactttgggtagaattaggc 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31573997 - 31573794
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||||||| ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| ||||||    
T  31573997 caaaggtttagaa-gccaacacgaaaactaggatttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacac 31573904  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaa 206  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||   | ||||| ||| ||||||  | ||||| ||||||||||||    
T  31573903 tgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttgtaa 31573804  T
Q  207 cgttactcat 216  Q
     |||||||||    
T  31573803 agttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578334
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaac 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||| ||| |||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 31578377  T
Q  186 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |  ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31578376 cttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 31578334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 227
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035396
Alignment:
Q  84 gggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgt 182  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||  || |||||| ||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgt 31035351  T
Q  183 aacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31035352 aaccctttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgga 31035396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 35872650 - 35872559
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacact 108  Q
    |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  35872650 ggtttagaaaggcaacaac-----tagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 35872559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 12517296 - 12517248
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 60  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517296 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 121
Target Start/End: Original strand, 31035144 - 31035238
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagt 121  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  31035144 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaacaccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 9021306 - 9021228
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9021306 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9021228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16752721 - 16752643
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16752721 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 16757466 - 16757388
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16757466 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16757388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 28327891 - 28327969
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28327891 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28327969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 28895485 - 28895563
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28895485 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 590777 - 590855
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  590777 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468195
Alignment:
Q  155 tagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 2468195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 4812686 - 4812608
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4812686 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4812608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 28332614 - 28332692
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28332614 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28332692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 33032637 - 33032715
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33032637 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 13985278 - 13985199
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa-cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  13985278 ttgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 13985199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 2468341 - 2468261
Alignment:
Q  45 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggt 129  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2468341 tatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 29554984 - 29554908
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaatta 162  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29554984 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaatta 29554908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872499
Alignment:
Q  171 acttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtg 35872499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 3886190 - 3886153
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3886190 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 17799623 - 17799558
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactt 150  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  17799623 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgagactt 17799558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 23179760 - 23179692
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgg 153  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  23179760 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcaccggaagaggctgtgactttgg 23179692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 17847661 - 17847740
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||| | || |||||||  || |||||||||||||||||||    
T  17847661 ttgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 17847740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 21033853 - 21033930
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  21033853 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag-ggctgggac-ttgggtagaaatagg 21033930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 30423195 - 30423274
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||  ||| ||||||| ||||||||||    
T  30423195 ttgattcaccttgaacaaaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 2267206 - 2267144
Alignment:
Q  101 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  2267206 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattaggac-ttgggtagaattagg 2267144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 33541507 - 33541469
Alignment:
Q  187 cattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33541507 cattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg 33541469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Original strand, 6376124 - 6376267
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgta 183  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||  |||||||||||   | ||||| ||| ||||     
T  6376124 ttgattcaccttgaacaaaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgtt 6376223  T
Q  184 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    |||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6376224 accttttgatatctc-tttgtaaagttactcatcattatagtgga 6376267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 80)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19502282 - 19502067
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  19502282 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 19502183  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19502182 ggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatac 19502083  T
Q  213 tcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||    
T  19502082 tcatcatatagtggat 19502067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19504617 - 19504402
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19504617 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacactatt 19504518  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19504517 aggattgagtctcttggttac-ggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgata 19504419  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  19504418 ctcatcatatagtggat 19504402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23452509 - 23452293
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  23452509 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacactatt 23452410  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23452409 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgata 23452310  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  23452309 ctcatcatatagtggat 23452293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 42064498 - 42064713
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  42064498 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 42064597  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  42064598 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaata 42064696  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  42064697 ctcatcatatagtggat 42064713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 27104782 - 27104996
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  27104782 ggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 27104880  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27104881 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacatta 27104979  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  27104980 ctcatcatatagtggat 27104996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 13910316 - 13910081
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  13910316 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaatatt 13910217  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  13910216 aggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacaata 13910118  T
Q  212 ctcatcatatagtggat---gtggctgctctctcccc 245  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  13910117 ctcatcatatagtggatcagatggctgctctctcccc 13910081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21520965 - 21520752
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  21520965 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactatt 21520866  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21520865 aggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtta 21520766  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  21520765 ctcatcatatagtg 21520752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 42452766 - 42452980
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  42452766 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 42452863  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42452864 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 42452963  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  42452964 ctcatcatatagtggat 42452980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 23 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 45280245 - 45280040
Alignment:
Q  23 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  45280245 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacactattaggattgagtc 45280146  T
Q  123 tcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 222  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45280145 tcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 45280046  T
Q  223 gtggat 228  Q
    ||||||    
T  45280045 gtggat 45280040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 42923781 - 42923568
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42923781 ggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 42923682  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  42923681 aggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagtta 42923582  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||| ||||||||||    
T  42923581 ctcgtcatatagtg 42923568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24162484 - 24162259
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24162484 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 24162385  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | |||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||    
T  24162384 aagattgagtctcttggtt----------gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaatgcta 24162296  T
Q  212 ctcatcatatagtggat---gtggctgctctctcccc 245  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  24162295 ctcatcatatagtggattggatggctgctctctcccc 24162259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40032330 - 40032119
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40032330 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 40032231  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattga----tttctcttttgtaac 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    ||||||||||| ||     
T  40032230 aggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctcttttgcaaa 40032131  T
Q  208 gttactcatcat 219  Q
    ||||||||||||    
T  40032130 gttactcatcat 40032119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 19007623 - 19007836
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  19007623 ggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactatt 19007722  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    || ||||||| |||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19007723 agaattgagtttcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtta 19007822  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  19007823 ctcatcatatagtg 19007836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35215858 - 35215642
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  35215858 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 35215759  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||      
T  35215758 aggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacgaa 35215660  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35215659 actcatcatatagtggat 35215642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Original strand, 28196616 - 28196833
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  28196616 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacac 28196715  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28196716 tattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 28196815  T
Q  208 gttactcatcatatagtg 225  Q
     |||||||||||||||||    
T  28196816 attactcatcatatagtg 28196833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35218235 - 35218019
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  35218235 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 35218136  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||      
T  35218135 aggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctc-tttgtaacgaa 35218037  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  35218036 actcatcatatagtggat 35218019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43623840 - 43623637
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  43623840 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatatt 43623753  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43623752 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtta 43623653  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  43623652 ctcatcatatagtgga 43623637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22287608 - 22287395
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||    
T  22287608 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggtatt 22287509  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||  ||  |||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22287508 aggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaacgtta 22287409  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  22287408 ctcatcatatagtg 22287395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6259086 - 6258885
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6259086 gtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 6258987  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 212  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6258986 ggattgagtctcttggttacgggaaga--ttggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 6258889  T
Q  213 tcat 216  Q
    ||||    
T  6258888 tcat 6258885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34979850 - 34979635
Alignment:
Q  13 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtta 112  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  34979850 gtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 34979751  T
Q  113 ggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttac 212  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||| ||| |    
T  34979750 agattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttgtaaggttcc 34979651  T
Q  213 tcatca-tatagtgga 227  Q
    |||||| |||||||||    
T  34979650 tcatcattatagtgga 34979635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15539747 - 15539553
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15539747 ggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 15539648  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaa 206  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  15539647 aggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatatcttttgtaa 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11739832 - 11739616
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11739832 ggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 11739733  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| || |||||||| ||||||||| || ||||    
T  11739732 aggattgattctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaaaggtta 11739633  T
Q  212 ctcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||||| |||||||||    
T  11739632 ctcatcattatagtgga 11739616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 17848426 - 17848636
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |    
T  17848426 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacactat 17848525  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  || | |||||||||||   |||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  17848526 taggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaacgtt 17848621  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  17848622 actcatcatatagtg 17848636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 17849100 - 17849307
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  17849100 ggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactatt 17849199  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    | ||||||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17849200 aagattgagtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 17849299  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  17849300 ctcatcat 17849307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 44289344 - 44289133
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44289344 caaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 44289245  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    | ||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |  | | ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  44289244 tattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaag 44289145  T
Q  208 gttactcatcat 219  Q
     |||||||||||    
T  44289144 attactcatcat 44289133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 45239246 - 45239036
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45239246 tttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 45239148  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||  ||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  45239147 gattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttact 45239048  T
Q  214 catcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||    
T  45239047 catcatatagtg 45239036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6264421 - 6264214
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6264421 caaaggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 6264326  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    | |||||||| ||||||||||||||   || ||  |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||     
T  6264325 tattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 6264226  T
Q  208 gttactcatcat 219  Q
    ||||||||||||    
T  6264225 gttactcatcat 6264214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31733037 - 31732842
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31733037 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacactgtt 31732938  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31732937 aggattgagtctcttggtt------------tgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 31732850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 219
Target Start/End: Original strand, 3022146 - 3022352
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  3022146 ggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacactatt 3022245  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || |  ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| ||| ||||    
T  3022246 aggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctc-tttataaagtta 3022344  T
Q  212 ctcatcat 219  Q
    ||||||||    
T  3022345 ctcatcat 3022352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375403
Alignment:
Q  79 tttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttatta 178  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttattc 5375452  T
Q  179 ttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgga 5375403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 219
Target Start/End: Original strand, 14837263 - 14837457
Alignment:
Q  19 aaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattg 118  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14837263 aaagacaacaacaaaactagggtttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg 14837362  T
Q  119 agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca 218  Q
    |||||||||      |||||||  || ||||||  |||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14837363 agtctcttg------ggaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatca 14837456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11578365 - 11578174
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||  ||||||| |  ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  11578365 caacaaaaaaactagggtttgtatagaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattgagtct 11578270  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11578269 cttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcatcat 11578174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18800559 - 18800379
Alignment:
Q  35 ctagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactg 134  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |    
T  18800559 ctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacag 18800464  T
Q  135 gaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  18800463 gaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcat 18800379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 219
Target Start/End: Original strand, 22874137 - 22874320
Alignment:
Q  32 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtta 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |    
T  22874137 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtca 22874232  T
Q  132 ctggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    | |||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22874233 cgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 22874320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459255
Alignment:
Q  39 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaag 138  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaag 28459336  T
Q  139 aggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    ||  |||| |||  |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  28459335 agtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcat 28459255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 186
Target Start/End: Original strand, 38020185 - 38020349
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  38020185 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccatggtaaacactatt 38020284  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacc 186  Q
    ||||||||||||||||| || ||         ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  38020285 aggattgagtctcttgg-tattg---------ggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22163217 - 22163106
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22163217 tttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattag 22163118  T
Q  114 gattgagtctctt 126  Q
    | |||||||||||    
T  22163117 g-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36559046 - 36558920
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  36559046 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 36558948  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 36558920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36561323 - 36561197
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  36561323 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-t 36561225  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 36561197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20146866 - 20146665
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||| |  | |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  20146866 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattgagtct 20146770  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tata 222  Q
    |||||| || |||| ||  || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  20146769 cttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 20146670  T
Q  223 gtgga 227  Q
    |||||    
T  20146669 gtgga 20146665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17897502 - 17897311
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17897502 caacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 17897407  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    |||||| |   ||| ||  || || |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  17897406 cttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgtaaagttactcatcat 17897311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 22407681 - 22407593
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22407681 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 22407593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 102 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 45332363 - 45332240
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45332363 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctc-t 45332265  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    |||||| | ||||||||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtg 45332240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 227
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699573
Alignment:
Q  85 ggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgta 183  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 40699528  T
Q  184 acccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    | || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40699529 atcctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 40699573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136195
Alignment:
Q  39 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaag 138  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || | |||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaag 27136272  T
Q  139 aggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactc 214  Q
    |   |||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  27136271 aaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 219
Target Start/End: Original strand, 20589762 - 20589881
Alignment:
Q  101 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctct 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || |||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  20589762 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctct 20589861  T
Q  200 tttgtaacgttactcatcat 219  Q
    ||||| | ||||||||||||    
T  20589862 tttgtgaagttactcatcat 20589881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22407595 - 22407513
Alignment:
Q  143 tgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22407595 tgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 22407513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 5377701 - 5377631
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttg 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5377701 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttg 5377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Original strand, 35107294 - 35107493
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    || ||| || |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  35107294 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtct 35107387  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattag--gcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-ta 220  Q
    |||||| || |||||||  || ||||||||||||||||||     | ||||||||| |||||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  35107388 cttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcatta 35107486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7463004
Alignment:
Q  155 tagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggat 7463004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  72 actagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggaga 171  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcac-ggaaaagattgggacttttggtagaattaggcgggaga 38414194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 219
Target Start/End: Original strand, 43139381 - 43139564
Alignment:
Q  31 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggtt 130  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | |||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||     
T  43139381 aaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcatcttgggaaacattattaggattgagtctcttggtc 43139475  T
Q  131 actggaagaggctgggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    || ||||||   || |||||| |||||||||||| |   ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43139476 acgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctc-tttgtaaagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22707870 - 22707812
Alignment:
Q  167 ggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22707870 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtg 22707812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 86 - 219
Target Start/End: Original strand, 15693958 - 15694094
Alignment:
Q  86 gttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaattaggcagga-gacttattattgt 182  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||  ||||||||||| || |||||||  | |||||||||||||||||||||   || |||| ||| ||||    
T  15693958 gttgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgt 15694057  T
Q  183 aacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    ||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15694058 aaccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 17462419 - 17462497
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17462419 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17462497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20054964 - 20054886
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20054964 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 20054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22712715 - 22712637
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22712715 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 22717424 - 22717346
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22717424 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 39686966 - 39687044
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39686966 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 39687044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 45567392 - 45567470
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45567392 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Original strand, 2736204 - 2736266
Alignment:
Q  101 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2736204 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 2736266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 17921754 - 17921833
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga-aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  17921754 ttgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 17932617 - 17932695
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17932617 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 17943520 - 17943598
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17943520 ttgattcaccttgaacaaatcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17943598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 27517838 - 27517760
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27517838 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 27517760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583483
Alignment:
Q  88 tgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagag 140  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27583483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 164
Target Start/End: Original strand, 2740940 - 2741002
Alignment:
Q  101 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2740940 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 2741002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37963137 - 37963007
Alignment:
Q  86 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaac 185  Q
    |||||||| |||| ||||||| | ||  |||||||||||||||| ||  ||||||  || | |||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||     
T  37963137 gttgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaat 37963038  T
Q  186 ccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    ||||||||||   |||||||| |||| |||||||    
T  37963037 ccattgattt---ttttgtaaagttattcatcat 37963007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 225
Target Start/End: Original strand, 23870956 - 23871012
Alignment:
Q  169 agacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  23870956 agacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtg 23871012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 28459028 - 28458949
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || | ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  28459028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 39680028 - 39680106
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39680028 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgagac-ttgggtagaattagg 39680106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattgagtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 150
Target Start/End: Original strand, 38190980 - 38191045
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactt 150  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  38190980 ttgattcaccttgaacaaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt 38191045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 162
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  86 gttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaatta 162  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||  | | |||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 30478977 - 30479055
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||| | || ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30478977 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 30479055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 43
Target Start/End: Original strand, 38020126 - 38020157
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38020126 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 20050221 - 20050156
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactt 150  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||    
T  20050221 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagaggctaggactt 20050156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22163111 - 22163081
Alignment:
Q  195 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22163111 tctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 22163081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 15 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 38414310 - 38414281
Alignment:
Q  15 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38414310 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 38414281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 41755 - 41542
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  41755 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 41656  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41655 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 41556  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  41555 ctcatcatatagtg 41542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 2896 - 3111
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2896 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactatt 2995  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  2996 aggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaaa 3094  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  3095 ctcatcatatagtggat 3111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 69563 - 69348
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  69563 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 69464  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  69463 aggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtta 69365  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  69364 ctcatcatatagtggat 69348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 73295 - 73203
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  73295 ggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 73203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 73208 - 73163
Alignment:
Q  63 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacact 108  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  73208 ggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 73163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 79201 - 79416
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  79201 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactatt 79300  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79301 aggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 79400  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  79401 ctcatcatatagtgga 79416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 183916 - 183700
Alignment:
Q  8 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  183916 caaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 183817  T
Q  108 tgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaac 207  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  183816 tattaggattgagtctcttggttac-ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaat 183718  T
Q  208 gttactcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||||||    
T  183717 gttactcatcatatagtg 183700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 52027 - 52240
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||    
T  52027 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactatt 52126  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  52127 aggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtta 52226  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  52227 ctcatcatatagtg 52240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14654 - 14439
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  14654 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 14555  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14554 aggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtta 14455  T
Q  212 ctcatcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  14454 ctcatcatatagtgga 14439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 15037 - 15250
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15037 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 15136  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  |  ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15137 gattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttact 15236  T
Q  214 catcatatagtgga 227  Q
    ||||||||||||||    
T  15237 catcatatagtgga 15250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 162; Significance: 1e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 2058 - 2270
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  2058 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 2156  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  2157 aggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaacgttc 2256  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  2257 ctcatcatatagtg 2270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 6215 - 6431
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6215 ggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 6314  T
Q  112 aggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6315 aggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgtt 6413  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||| |||||||||    
T  6414 actcatcaaatagtggat 6431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 158; Significance: 3e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 4013 - 4225
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  4013 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactatt 4111  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4112 aggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 4211  T
Q  212 ctcatcatatagtg 225  Q
    ||||||||||||||    
T  4212 ctcatcatatagtg 4225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11743 - 11529
Alignment:
Q  14 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttag 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||    
T  11743 tttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattag 11644  T
Q  114 gattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11643 gattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 11544  T
Q  214 catcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||    
T  11543 catcatatagtggat 11529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 29187 - 29402
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||    
T  29187 ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacactatt 29286  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||    
T  29287 aggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctc-tttgtaacaata 29385  T
Q  212 ctcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||    
T  29386 ctcatcatatagtggat 29402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Original strand, 57 - 273
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  57 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 156  T
Q  112 aggatt-gagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||      
T  157 aggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgaa 255  T
Q  211 actcatcatatagtggat 228  Q
    ||||||||||||||||||    
T  256 actcatcatatagtggat 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 63 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1509
Alignment:
Q  63 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaatta 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatta 1574  T
Q  163 ggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1573 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tttgtaacgatactcatcatatagtggat 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Original strand, 35655 - 35819
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgtt 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||    
T  35655 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacactatt 35754  T
Q  112 aggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttat 176  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35755 aggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Original strand, 79875 - 80088
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgt 110  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |    
T  79875 ggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactat 79974  T
Q  111 taggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  79975 taggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaacgtt 80073  T
Q  211 actcatcatatagtg 225  Q
    |||||||||||||||    
T  80074 actcatcatatagtg 80088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 188441 - 188363
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  188441 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 85235 - 85462
Alignment:
Q  1 ggagaagcaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg 100  Q
    |||||| ||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  85235 ggagaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttgg 85334  T
Q  101 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||  || ||||||| ||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  85335 aaaacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 85434  T
Q  201 ttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    | |||| ||||||||||| |||||||||    
T  85435 tcgtaaagttactcatcattatagtgga 85462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 24 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16079 - 15887
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||    |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  16079 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattgagtct 15983  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    |||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15982 cttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 29 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16903 - 16716
Alignment:
Q  29 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttgg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  16903 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattgagtcacttgg 16807  T
Q  129 ttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcat 219  Q
    | || |||||||  || ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16806 tgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 16716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1892 - 1699
Alignment:
Q  24 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtct 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |    
T  1892 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttc---------aacaaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacacaattaggattgagttt 1804  T
Q  124 cttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatca-tata 222  Q
    |||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  1803 cttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattata 1704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 22222 - 22347
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||| |    
T  22222 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc-t 22319  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 22347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 228
Target Start/End: Original strand, 24497 - 24622
Alignment:
Q  102 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacccattgatttctctt 200  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||||| |    
T  24497 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctc-t 24594  T
Q  201 ttgtaacgttactcatcatatagtggat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtggat 24622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 1103 - 993
Alignment:
Q  12 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc-----ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaaca 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||||| | || | |||||||| |||||||  ||| |    
T  1103 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaaata 1004  T
Q  107 ctgttaggatt 117  Q
    || ||||||||    
T  1003 cttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 227
Target Start/End: Original strand, 4901 - 5043
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattattgtaacc 186  Q
    ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |   ||||||  ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4901 ttgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 5000  T
Q  187 cattgatttctc-ttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 227  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  5001 cattgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtgga 5043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 224802 - 224880
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttgga--aaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  224802 ttgattcaccttgaacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Original strand, 16308 - 16386
Alignment:
Q  87 ttgattcaccttggaaaa--cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    ||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16308 ttgattcaccttgaacaaagcactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 57614 - 57497
Alignment:
Q  101 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggct-gggactttgggtagaattagg-caggagacttattattgtaacccattgatttctc 198  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||  | |||||||||||| ||||||||   | |||  |||| ||||||||| ||||| |||     
T  57614 aaaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatcta 57515  T
Q  199 ttttgtaacgttactcat 216  Q
    |||||||| |||||||||    
T  57514 ttttgtaaagttactcat 57497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0209 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0209
Description:

Target: scaffold0209; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 105 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 17165 - 17107
Alignment:
Q  105 cactgttaggattgagtctcttggttactggaagaggctgggactttgggtagaattagg 164  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  17165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaagctaggac-ttgggtagaattagg 17107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University