View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2219_high_1 (Length: 925)

Name: NF2219_high_1
Description: NF2219
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2219_high_1
NF2219_high_1
[»] chr5 (158 HSPs)
chr5 (37-886)||(3601356-3602209)
chr5 (14-886)||(1971357-1972228)
chr5 (14-808)||(19400355-19401152)
chr5 (14-854)||(8575516-8576356)
chr5 (14-854)||(6604-7444)
chr5 (34-830)||(30709610-30710403)
chr5 (14-854)||(38854150-38854989)
chr5 (14-831)||(11346701-11347518)
chr5 (14-854)||(27660752-27661592)
chr5 (172-815)||(3458940-3459583)
chr5 (14-854)||(19036050-19036889)
chr5 (14-830)||(28880983-28881796)
chr5 (235-808)||(40011830-40012402)
chr5 (14-678)||(8537946-8538607)
chr5 (14-886)||(18308252-18309125)
chr5 (14-886)||(1399646-1400517)
chr5 (155-831)||(22283704-22284377)
chr5 (37-886)||(4723420-4724266)
chr5 (137-565)||(7082336-7082763)
chr5 (92-886)||(1694859-1695651)
chr5 (512-886)||(6792817-6793194)
chr5 (253-603)||(3169766-3170114)
chr5 (344-886)||(35565592-35566137)
chr5 (14-266)||(541598-541850)
chr5 (14-293)||(11027769-11028046)
chr5 (512-886)||(20196567-20196942)
chr5 (563-831)||(7082815-7083083)
chr5 (512-886)||(34683271-34683644)
chr5 (570-854)||(11027996-11028282)
chr5 (573-878)||(25498635-25498940)
chr5 (344-886)||(36349679-36350211)
chr5 (14-240)||(40009520-40009746)
chr5 (14-227)||(35565264-35565476)
chr5 (14-219)||(33370646-33370851)
chr5 (563-831)||(1171730-1171998)
chr5 (14-227)||(36350316-36350520)
chr5 (14-227)||(6793388-6793601)
chr5 (14-185)||(3169596-3169766)
chr5 (14-196)||(35927470-35927652)
chr5 (14-230)||(17366735-17366950)
chr5 (344-644)||(33370950-33371250)
chr5 (14-190)||(2599211-2599387)
chr5 (538-649)||(41202413-41202524)
chr5 (238-570)||(1971581-1971913)
chr5 (305-570)||(11346925-11347188)
chr5 (14-127)||(3458828-3458941)
chr5 (235-570)||(3601557-3601892)
chr5 (570-640)||(541553-541623)
chr5 (344-465)||(12743007-12743129)
chr5 (344-465)||(12805825-12805947)
chr5 (238-570)||(19400579-19400911)
chr5 (305-570)||(8538170-8538433)
chr5 (572-805)||(11027998-11028231)
chr5 (305-570)||(30709814-30710077)
chr5 (350-464)||(12806168-12806282)
chr5 (338-563)||(10398105-10398330)
chr5 (627-815)||(19036157-19036343)
chr5 (561-814)||(1171730-1171983)
chr5 (336-563)||(17366398-17366625)
chr5 (243-570)||(7082437-7082763)
chr5 (22-100)||(1693381-1693459)
chr5 (572-815)||(38854694-38854938)
chr5 (572-814)||(7082815-7083057)
chr5 (489-570)||(22283787-22283866)
chr5 (489-570)||(27661289-27661368)
chr5 (238-570)||(40011833-40012164)
chr5 (14-106)||(12742707-12742799)
chr5 (572-815)||(30710135-30710378)
chr5 (572-767)||(1971951-1972147)
chr5 (238-555)||(3169766-3170081)
chr5 (489-570)||(8576053-8576132)
chr5 (14-111)||(12805525-12805622)
chr5 (489-570)||(28881207-28881286)
chr5 (608-767)||(8575605-8575764)
chr5 (563-804)||(25498635-25498876)
chr5 (442-570)||(38854373-38854500)
chr5 (563-767)||(1399718-1399924)
chr5 (751-830)||(17366371-17366450)
chr5 (572-804)||(35565824-35566056)
chr5 (492-562)||(1171616-1171685)
chr5 (572-815)||(27660803-27661046)
chr5 (336-465)||(33371267-33371397)
chr5 (489-570)||(7141-7220)
chr5 (302-570)||(3459006-3459275)
chr5 (350-446)||(12743349-12743445)
chr5 (489-570)||(19036586-19036665)
chr5 (569-767)||(22284154-22284354)
chr5 (751-840)||(33371442-33371531)
chr5 (562-723)||(18308891-18309054)
chr5 (123-266)||(18920835-18920977)
chr5 (751-830)||(10398278-10398357)
chr5 (168-227)||(12742818-12742877)
chr5 (516-595)||(40012136-40012213)
chr5 (696-815)||(40012156-40012273)
chr5 (572-815)||(28881528-28881771)
chr5 (542-595)||(19400883-19400936)
chr5 (756-805)||(33371122-33371171)
chr5 (563-804)||(6792889-6793130)
chr5 (165-268)||(17195321-17195423)
chr5 (755-815)||(19400856-19400916)
chr5 (494-574)||(25498796-25498876)
chr5 (516-595)||(6841-6918)
chr5 (561-678)||(3602020-3602139)
chr5 (663-714)||(10398147-10398198)
chr5 (663-718)||(12743043-12743098)
chr5 (663-718)||(12805861-12805916)
chr5 (663-718)||(33370986-33371041)
chr5 (563-767)||(34683338-34683544)
chr5 (516-595)||(38854674-38854752)
chr5 (752-854)||(8538627-8538724)
chr5 (563-678)||(1695467-1695584)
chr5 (546-595)||(1971885-1971934)
chr5 (542-595)||(3459310-3459363)
chr5 (542-595)||(8538471-8538524)
chr5 (493-561)||(12805974-12806043)
chr5 (493-561)||(12806310-12806379)
chr5 (165-270)||(13131038-13131142)
chr5 (608-767)||(6693-6852)
chr5 (787-831)||(6428233-6428277)
chr5 (696-815)||(19400903-19401020)
chr5 (494-574)||(34683338-34683418)
chr5 (755-815)||(40012109-40012169)
chr5 (14-65)||(7082284-7082335)
chr5 (663-718)||(12743379-12743433)
chr5 (168-227)||(12805636-12805695)
chr5 (663-718)||(12806198-12806252)
chr5 (663-714)||(33371311-33371362)
chr5 (755-805)||(3170026-3170076)
chr5 (515-565)||(7083007-7083057)
chr5 (697-767)||(8538537-8538607)
chr5 (511-565)||(18308484-18308536)
chr5 (541-595)||(27661012-27661066)
chr5 (542-595)||(3170053-3170106)
chr5 (542-595)||(3601861-3601914)
chr5 (493-561)||(12743489-12743558)
chr5 (734-811)||(20196549-20196626)
chr5 (562-678)||(20196755-20196872)
chr5 (515-564)||(25498499-25498547)
chr5 (516-576)||(1171923-1171983)
chr5 (696-804)||(4723622-4723728)
chr5 (516-564)||(4723682-4723728)
chr5 (506-561)||(12743169-12743225)
chr5 (123-266)||(25360547-25360690)
chr5 (355-465)||(6793240-6793351)
chr5 (756-811)||(7082714-7082769)
chr5 (564-623)||(10398006-10398065)
chr5 (663-714)||(17366530-17366581)
chr5 (512-595)||(19036282-19036363)
chr5 (512-595)||(28881508-28881589)
chr5 (541-588)||(30710122-30710169)
chr5 (511-565)||(1400233-1400285)
chr5 (562-623)||(12805717-12805779)
chr5 (535-565)||(17195316-17195346)
chr5 (305-385)||(22283969-22284051)
chr5 (511-565)||(33371442-33371496)
chr5 (734-811)||(34683584-34683662)
chr5 (516-565)||(1171739-1171786)
chr5 (542-595)||(8575777-8575830)
[»] chr8 (110 HSPs)
chr8 (14-886)||(38033265-38034136)
chr8 (14-886)||(42168309-42169171)
chr8 (14-808)||(28705559-28706353)
chr8 (34-854)||(15031695-15032515)
chr8 (5-808)||(40415251-40416052)
chr8 (14-831)||(24861346-24862161)
chr8 (14-854)||(484629-485469)
chr8 (161-854)||(22549232-22549922)
chr8 (14-741)||(26452328-26453040)
chr8 (14-557)||(40414613-40415153)
chr8 (14-498)||(34614956-34615440)
chr8 (14-831)||(41856365-41857185)
chr8 (351-808)||(43637183-43637638)
chr8 (384-831)||(44050812-44051258)
chr8 (34-854)||(40702383-40703206)
chr8 (16-527)||(2416920-2417428)
chr8 (14-390)||(43693140-43693516)
chr8 (23-344)||(33799432-33799753)
chr8 (23-353)||(43638549-43638879)
chr8 (344-886)||(18439642-18440177)
chr8 (512-854)||(42603951-42604296)
chr8 (14-264)||(41363659-41363909)
chr8 (367-687)||(41017288-41017608)
chr8 (14-266)||(41275397-41275649)
chr8 (14-227)||(44943079-44943292)
chr8 (14-227)||(18440293-18440506)
chr8 (545-747)||(33799230-33799432)
chr8 (14-227)||(19242160-19242373)
chr8 (14-227)||(19315344-19315557)
chr8 (34-227)||(42603477-42603670)
chr8 (570-854)||(41275624-41275915)
chr8 (489-705)||(2417449-2417665)
chr8 (14-190)||(26484580-26484756)
chr8 (666-886)||(28167439-28167659)
chr8 (14-438)||(3589053-3589477)
chr8 (14-298)||(31171744-31172027)
chr8 (730-886)||(26487151-26487307)
chr8 (14-156)||(16575695-16575837)
chr8 (238-566)||(22549310-22549636)
chr8 (346-644)||(16575990-16576288)
chr8 (14-128)||(22548266-22548380)
chr8 (238-569)||(42168615-42168946)
chr8 (442-570)||(24861570-24861698)
chr8 (239-566)||(26452556-26452881)
chr8 (442-570)||(2417142-2417269)
chr8 (572-815)||(484680-484923)
chr8 (246-570)||(28705805-28706129)
chr8 (489-570)||(485166-485245)
chr8 (489-570)||(15032232-15032311)
chr8 (512-565)||(28167338-28167391)
chr8 (479-570)||(43638572-43638664)
chr8 (344-575)||(26487005-26487236)
chr8 (344-465)||(44942841-44942963)
chr8 (755-808)||(16576159-16576212)
chr8 (374-619)||(37780506-37780754)
chr8 (442-570)||(43693364-43693493)
chr8 (542-595)||(22549608-22549661)
chr8 (734-811)||(28167320-28167397)
chr8 (487-570)||(33799454-33799538)
chr8 (487-570)||(34615180-34615264)
chr8 (542-595)||(38033556-38033609)
chr8 (565-805)||(28705555-28705795)
chr8 (565-767)||(40415853-40416056)
chr8 (562-767)||(44051035-44051242)
chr8 (516-595)||(2417502-2417579)
chr8 (663-718)||(16576024-16576079)
chr8 (339-465)||(16576308-16576435)
chr8 (732-811)||(42603931-42604010)
chr8 (572-767)||(15031746-15031943)
chr8 (493-595)||(16576186-16576286)
chr8 (305-570)||(40414835-40415100)
chr8 (572-767)||(41275662-41275859)
chr8 (542-595)||(15031956-15032009)
chr8 (542-595)||(40415787-40415840)
chr8 (716-805)||(41363888-41363976)
chr8 (562-767)||(18439703-18439910)
chr8 (663-714)||(16576349-16576400)
chr8 (756-815)||(28705792-28705851)
chr8 (663-718)||(37780512-37780567)
chr8 (512-555)||(44942751-44942794)
chr8 (663-718)||(44942872-44942927)
chr8 (542-592)||(33799382-33799432)
chr8 (562-678)||(40703049-40703167)
chr8 (344-465)||(42603783-42603905)
chr8 (542-595)||(24861872-24861925)
chr8 (494-575)||(28167507-28167588)
chr8 (542-595)||(28705772-28705825)
chr8 (570-646)||(41363886-41363963)
chr8 (562-804)||(42604015-42604257)
chr8 (542-595)||(44050969-44051022)
chr8 (563-619)||(19242094-19242150)
chr8 (563-619)||(19315278-19315334)
chr8 (628-767)||(33799230-33799369)
chr8 (511-559)||(40702602-40702648)
chr8 (511-559)||(41856901-41856947)
chr8 (511-559)||(42603695-42603741)
chr8 (535-570)||(38033877-38033912)
chr8 (696-767)||(41017296-41017367)
chr8 (500-575)||(42604182-42604257)
chr8 (541-595)||(484889-484943)
chr8 (511-565)||(16575912-16575964)
chr8 (664-718)||(19241953-19242007)
chr8 (664-718)||(19315137-19315191)
chr8 (500-570)||(41363883-41363952)
chr8 (751-807)||(31171477-31171534)
chr8 (542-595)||(41017380-41017433)
chr8 (500-565)||(41275794-41275859)
chr8 (542-591)||(42168590-42168639)
chr8 (542-595)||(43637395-43637448)
chr8 (305-385)||(44050851-44050931)
[»] chr3 (257 HSPs)
chr3 (14-854)||(13895256-13896082)
chr3 (14-854)||(44927470-44928309)
chr3 (14-831)||(25575987-25576803)
chr3 (14-831)||(34692686-34693502)
chr3 (14-831)||(24701668-24702483)
chr3 (23-808)||(42383067-42383851)
chr3 (14-808)||(47065694-47066486)
chr3 (14-831)||(39416343-39417160)
chr3 (14-808)||(44834906-44835699)
chr3 (14-831)||(2267891-2268706)
chr3 (14-854)||(54390449-54391289)
chr3 (72-837)||(50997453-50998216)
chr3 (14-854)||(34049734-34050574)
chr3 (14-854)||(49139426-49140266)
chr3 (14-854)||(2646248-2647088)
chr3 (14-831)||(36135015-36135829)
chr3 (14-854)||(3494396-3495241)
chr3 (14-831)||(49218132-49218948)
chr3 (14-854)||(43477064-43477885)
chr3 (14-695)||(4003620-4004299)
chr3 (14-724)||(46403010-46403718)
chr3 (23-470)||(19452985-19453432)
chr3 (23-886)||(41577922-41578785)
chr3 (14-827)||(34471473-34472288)
chr3 (14-858)||(2428494-2429340)
chr3 (14-470)||(48087308-48087764)
chr3 (14-886)||(46413659-46414546)
chr3 (369-854)||(11378350-11378835)
chr3 (14-854)||(51012657-51013490)
chr3 (37-859)||(7246124-7246947)
chr3 (24-438)||(42949808-42950222)
chr3 (34-565)||(37281479-37282010)
chr3 (14-886)||(30192545-30193411)
chr3 (14-562)||(36721053-36721601)
chr3 (50-827)||(42322795-42323565)
chr3 (14-323)||(53826599-53826908)
chr3 (512-886)||(49273907-49274283)
chr3 (348-886)||(46345950-46346491)
chr3 (512-886)||(45099813-45100190)
chr3 (42-470)||(774098-774522)
chr3 (512-886)||(10052724-10053101)
chr3 (491-854)||(19452517-19452883)
chr3 (14-465)||(6754211-6754660)
chr3 (14-227)||(55206883-55207096)
chr3 (512-886)||(14631949-14632316)
chr3 (14-266)||(49610496-49610748)
chr3 (15-465)||(6464108-6464556)
chr3 (14-293)||(51695541-51695818)
chr3 (14-227)||(34647266-34647479)
chr3 (14-227)||(51015284-51015497)
chr3 (570-854)||(51695312-51695591)
chr3 (344-854)||(41804238-41804751)
chr3 (344-831)||(52568806-52569292)
chr3 (23-265)||(42382287-42382529)
chr3 (14-227)||(41803909-41804122)
chr3 (14-227)||(45100464-45100677)
chr3 (575-831)||(36720730-36720986)
chr3 (570-831)||(49610723-49610984)
chr3 (14-222)||(43569917-43570125)
chr3 (14-227)||(10053274-10053483)
chr3 (14-227)||(14631452-14631665)
chr3 (14-227)||(47759890-47760103)
chr3 (512-827)||(55206281-55206599)
chr3 (37-227)||(52569408-52569597)
chr3 (531-854)||(55268431-55268758)
chr3 (14-595)||(8632997-8633571)
chr3 (14-465)||(33448916-33449351)
chr3 (14-227)||(49273406-49273619)
chr3 (344-827)||(51015613-51016091)
chr3 (563-883)||(34646566-34646877)
chr3 (14-458)||(7954210-7954655)
chr3 (14-227)||(50458690-50458903)
chr3 (31-465)||(20375646-20376077)
chr3 (703-886)||(43570558-43570741)
chr3 (14-227)||(27186955-27187168)
chr3 (106-226)||(46346612-46346732)
chr3 (135-465)||(18440873-18441200)
chr3 (135-465)||(19485947-19486274)
chr3 (570-808)||(53826439-53826681)
chr3 (40-292)||(25887543-25887796)
chr3 (302-573)||(43477285-43477555)
chr3 (344-658)||(43570246-43570563)
chr3 (14-227)||(14265415-14265625)
chr3 (733-827)||(27187798-27187892)
chr3 (238-570)||(24701929-24702260)
chr3 (238-570)||(25576248-25576580)
chr3 (238-570)||(44835144-44835475)
chr3 (729-854)||(46405725-46405852)
chr3 (305-570)||(49218460-49218724)
chr3 (345-575)||(27187650-27187880)
chr3 (572-815)||(54390995-54391238)
chr3 (238-570)||(13895527-13895858)
chr3 (608-815)||(34050280-34050485)
chr3 (334-570)||(48087303-48087540)
chr3 (572-815)||(3494452-3494695)
chr3 (489-570)||(2268403-2268482)
chr3 (489-570)||(4003996-4004075)
chr3 (345-565)||(34646929-34647149)
chr3 (627-815)||(42383605-42383791)
chr3 (562-767)||(13895295-13895502)
chr3 (489-569)||(36135239-36135317)
chr3 (608-815)||(49139515-49139720)
chr3 (14-101)||(15637031-15637118)
chr3 (344-465)||(7954988-7955110)
chr3 (608-767)||(51015880-51016031)
chr3 (489-570)||(3494938-3495017)
chr3 (254-323)||(11378840-11378909)
chr3 (762-831)||(33448791-33448860)
chr3 (489-570)||(34049958-34050037)
chr3 (563-668)||(37282062-37282167)
chr3 (238-570)||(39416604-39416936)
chr3 (565-815)||(44834902-44835152)
chr3 (489-570)||(49139963-49140042)
chr3 (489-570)||(54390673-54390752)
chr3 (572-767)||(2646299-2646496)
chr3 (489-570)||(2646785-2646864)
chr3 (661-718)||(7954574-7954631)
chr3 (238-570)||(42383282-42383613)
chr3 (696-808)||(42949660-42949773)
chr3 (238-570)||(44927694-44928025)
chr3 (489-570)||(46403234-46403313)
chr3 (489-570)||(50997619-50997698)
chr3 (238-385)||(11378634-11378781)
chr3 (696-808)||(36720882-36720992)
chr3 (562-767)||(46413730-46413937)
chr3 (563-748)||(51695347-51695534)
chr3 (663-718)||(8633157-8633212)
chr3 (500-575)||(14632180-14632255)
chr3 (572-767)||(11378399-11378596)
chr3 (336-465)||(25887373-25887502)
chr3 (562-644)||(33449063-33449145)
chr3 (572-767)||(39416369-39416566)
chr3 (489-570)||(42949926-42950008)
chr3 (542-595)||(25576223-25576276)
chr3 (751-807)||(25887271-25887328)
chr3 (238-570)||(34692947-34693278)
chr3 (305-385)||(36721111-36721192)
chr3 (542-595)||(44835119-44835172)
chr3 (572-746)||(44928084-44928260)
chr3 (730-811)||(49273885-49273966)
chr3 (562-804)||(55268470-55268713)
chr3 (608-767)||(34692750-34692909)
chr3 (608-767)||(36135606-36135765)
chr3 (542-594)||(42383586-42383638)
chr3 (344-427)||(55206683-55206767)
chr3 (663-714)||(27187685-27187736)
chr3 (663-718)||(34647059-34647114)
chr3 (243-385)||(37281868-37282010)
chr3 (542-619)||(44927971-44928050)
chr3 (645-815)||(46403556-46403724)
chr3 (500-575)||(55206293-55206368)
chr3 (562-678)||(14632137-14632255)
chr3 (563-766)||(34471486-34471691)
chr3 (515-573)||(36720748-36720806)
chr3 (562-678)||(55206293-55206411)
chr3 (664-717)||(15637361-15637414)
chr3 (334-570)||(19452980-19453217)
chr3 (563-644)||(27187543-27187624)
chr3 (697-814)||(34646761-34646877)
chr3 (544-619)||(34692924-34693001)
chr3 (563-678)||(42322808-42322925)
chr3 (562-804)||(45099884-45100126)
chr3 (494-575)||(45099884-45099965)
chr3 (542-595)||(47066220-47066273)
chr3 (565-767)||(47066286-47066490)
chr3 (663-712)||(49273771-49273820)
chr3 (487-570)||(53826600-53826684)
chr3 (728-808)||(8633024-8633104)
chr3 (574-646)||(8633271-8633343)
chr3 (670-718)||(10053178-10053226)
chr3 (696-815)||(25576139-25576256)
chr3 (572-678)||(46346031-46346139)
chr3 (511-570)||(47065918-47065977)
chr3 (608-767)||(49218196-49218355)
chr3 (344-427)||(49273735-49273819)
chr3 (572-678)||(51012706-51012814)
chr3 (500-564)||(55268650-55268713)
chr3 (344-458)||(8632809-8632924)
chr3 (542-593)||(11378609-11378660)
chr3 (730-809)||(14631927-14632006)
chr3 (663-718)||(18441114-18441169)
chr3 (663-718)||(19486188-19486243)
chr3 (663-710)||(20375685-20375732)
chr3 (756-811)||(34646923-34646978)
chr3 (663-710)||(45100265-45100312)
chr3 (664-718)||(6754575-6754629)
chr3 (541-595)||(8632996-8633050)
chr3 (14-64)||(11378906-11378956)
chr3 (336-465)||(15637316-15637445)
chr3 (761-811)||(36721044-36721094)
chr3 (664-718)||(43570283-43570337)
chr3 (734-796)||(43570396-43570458)
chr3 (757-815)||(44835139-44835197)
chr3 (344-465)||(45100226-45100348)
chr3 (511-565)||(51013206-51013258)
chr3 (515-565)||(53826442-53826492)
chr3 (542-595)||(2268127-2268180)
chr3 (542-595)||(4003720-4003773)
chr3 (517-561)||(6464012-6464057)
chr3 (563-678)||(10052796-10052913)
chr3 (542-595)||(24701904-24701957)
chr3 (664-717)||(25887404-25887457)
chr3 (522-575)||(33448807-33448860)
chr3 (664-717)||(33448948-33449001)
chr3 (758-811)||(37281963-37282016)
chr3 (516-565)||(42949663-42949712)
chr3 (542-595)||(43477572-43477625)
chr3 (573-767)||(43477638-43477834)
chr3 (542-595)||(50997921-50997974)
chr3 (730-811)||(55206540-55206621)
chr3 (572-678)||(2267917-2268025)
chr3 (564-623)||(6754432-6754492)
chr3 (663-711)||(7955024-7955072)
chr3 (515-562)||(20375556-20375604)
chr3 (842-886)||(34471429-34471473)
chr3 (500-556)||(34646643-34646699)
chr3 (544-618)||(39416581-39416657)
chr3 (511-559)||(41804147-41804193)
chr3 (842-886)||(42322751-42322795)
chr3 (842-886)||(51016091-51016135)
chr3 (511-559)||(52569337-52569383)
chr3 (696-767)||(4003636-4003707)
chr3 (663-718)||(6464139-6464194)
chr3 (510-565)||(7246333-7246386)
chr3 (511-558)||(7954707-7954754)
chr3 (511-574)||(34472004-34472065)
chr3 (500-575)||(55268470-55268545)
chr3 (541-595)||(3494661-3494715)
chr3 (302-363)||(4003808-4003870)
chr3 (728-814)||(7954434-7954518)
chr3 (511-561)||(7954447-7954495)
chr3 (728-798)||(7954684-7954754)
chr3 (493-563)||(8633275-8633343)
chr3 (730-811)||(10053042-10053123)
chr3 (562-623)||(20375814-20375876)
chr3 (753-815)||(25887540-25887602)
chr3 (515-565)||(25887542-25887592)
chr3 (541-595)||(34050260-34050314)
chr3 (543-573)||(42382499-42382529)
chr3 (662-708)||(42949756-42949802)
chr3 (511-565)||(43570149-43570201)
chr3 (511-565)||(46346540-46346592)
chr3 (541-595)||(46403536-46403590)
chr3 (541-595)||(49139686-49139740)
chr3 (541-595)||(54390975-54391029)
chr3 (562-595)||(774299-774332)
chr3 (302-385)||(3494750-3494835)
chr3 (563-623)||(18440971-18441032)
chr3 (505-565)||(18441239-18441299)
chr3 (563-623)||(19486045-19486106)
chr3 (505-565)||(19486313-19486373)
chr3 (542-595)||(36135540-36135593)
chr3 (562-672)||(43570558-43570670)
chr3 (494-575)||(43570589-43570670)
chr3 (14-59)||(46346747-46346792)
chr3 (542-595)||(49218368-49218421)
chr3 (567-678)||(53826437-53826550)
[»] chr4 (232 HSPs)
chr4 (14-886)||(45939518-45940380)
chr4 (68-831)||(27759374-27760137)
chr4 (14-886)||(51427542-51428406)
chr4 (14-854)||(21016551-21017391)
chr4 (41-831)||(1042769-1043557)
chr4 (40-808)||(21711549-21712316)
chr4 (14-854)||(6176689-6177529)
chr4 (14-658)||(51027337-51027981)
chr4 (14-800)||(46815953-46816737)
chr4 (14-854)||(40353147-40353987)
chr4 (14-831)||(56138903-56139718)
chr4 (14-831)||(28082231-28083045)
chr4 (14-672)||(25762591-25763249)
chr4 (14-854)||(49094738-49095578)
chr4 (16-854)||(55796738-55797576)
chr4 (14-678)||(20901229-20901882)
chr4 (14-636)||(37866399-37867022)
chr4 (23-552)||(31824305-31824834)
chr4 (14-678)||(39588922-39589584)
chr4 (14-814)||(241849-242630)
chr4 (14-565)||(49063972-49064523)
chr4 (14-565)||(14330358-14330908)
chr4 (14-886)||(36775859-36776733)
chr4 (14-883)||(956798-957669)
chr4 (14-831)||(22436904-22437723)
chr4 (14-886)||(21169444-21170317)
chr4 (14-465)||(33163307-33163758)
chr4 (14-886)||(49423097-49423972)
chr4 (14-886)||(34152627-34153500)
chr4 (14-886)||(49791286-49792150)
chr4 (14-565)||(41794227-41794776)
chr4 (23-402)||(1226161-1226539)
chr4 (14-886)||(42886256-42887137)
chr4 (479-836)||(38132513-38132869)
chr4 (14-410)||(9489672-9490066)
chr4 (24-264)||(20778833-20779073)
chr4 (344-886)||(2773331-2773871)
chr4 (14-465)||(17211259-17211708)
chr4 (530-808)||(885315-885593)
chr4 (14-299)||(32937833-32938116)
chr4 (344-831)||(34529191-34529681)
chr4 (14-299)||(43889427-43889713)
chr4 (14-230)||(6282321-6282537)
chr4 (14-227)||(34529797-34530010)
chr4 (14-227)||(47657356-47657569)
chr4 (582-854)||(6281877-6282149)
chr4 (564-831)||(14330038-14330305)
chr4 (512-886)||(49571599-49571966)
chr4 (14-227)||(26591686-26591899)
chr4 (14-227)||(49817645-49817858)
chr4 (607-831)||(31824085-31824309)
chr4 (14-224)||(2773002-2773212)
chr4 (14-465)||(3393297-3393743)
chr4 (14-227)||(44560181-44560394)
chr4 (14-465)||(18412588-18413034)
chr4 (530-854)||(37867021-37867326)
chr4 (14-264)||(24606745-24606995)
chr4 (512-886)||(43888856-43889218)
chr4 (617-854)||(9490076-9490320)
chr4 (14-226)||(11288288-11288499)
chr4 (14-227)||(4785423-4785636)
chr4 (14-446)||(10312265-10312692)
chr4 (563-886)||(4784721-4785036)
chr4 (752-886)||(25763301-25763435)
chr4 (667-831)||(14289838-14290002)
chr4 (707-886)||(20901048-20901226)
chr4 (14-292)||(31324167-31324444)
chr4 (738-886)||(44559668-44559816)
chr4 (14-275)||(13850742-13851002)
chr4 (345-644)||(24607051-24607350)
chr4 (703-886)||(51027160-51027342)
chr4 (14-227)||(13866256-13866469)
chr4 (512-644)||(26591493-26591632)
chr4 (563-768)||(49064575-49064780)
chr4 (238-570)||(39589146-39589476)
chr4 (642-785)||(47870717-47870857)
chr4 (238-570)||(27759544-27759876)
chr4 (238-567)||(1042969-1043296)
chr4 (442-570)||(28082455-28082582)
chr4 (491-570)||(9489895-9489974)
chr4 (572-815)||(6176740-6176983)
chr4 (572-815)||(21016602-21016845)
chr4 (505-595)||(32937559-32937649)
chr4 (142-465)||(49816964-49817283)
chr4 (238-570)||(21711747-21712078)
chr4 (561-767)||(31824100-31824308)
chr4 (489-570)||(55796960-55797039)
chr4 (14-106)||(21412647-21412739)
chr4 (572-767)||(34152708-34152903)
chr4 (585-644)||(1226606-1226665)
chr4 (754-840)||(24607545-24607631)
chr4 (245-570)||(51427858-51428182)
chr4 (489-570)||(21017088-21017167)
chr4 (489-570)||(40353684-40353763)
chr4 (661-718)||(49817437-49817494)
chr4 (243-570)||(14330358-14330684)
chr4 (239-385)||(20901335-20901481)
chr4 (572-815)||(40353198-40353441)
chr4 (759-854)||(41794176-41794273)
chr4 (572-815)||(49095284-49095527)
chr4 (663-721)||(49816992-49817050)
chr4 (511-565)||(49817307-49817361)
chr4 (489-570)||(6177226-6177305)
chr4 (730-811)||(26591573-26591654)
chr4 (489-570)||(41794473-41794552)
chr4 (561-767)||(45940112-45940320)
chr4 (479-570)||(49064196-49064288)
chr4 (489-570)||(49094962-49095041)
chr4 (489-570)||(56139127-56139206)
chr4 (567-815)||(885347-885595)
chr4 (562-767)||(21170039-21170246)
chr4 (515-595)||(37867033-37867112)
chr4 (563-767)||(1043334-1043540)
chr4 (663-718)||(10312625-10312680)
chr4 (238-570)||(45939742-45940074)
chr4 (562-678)||(6281916-6282034)
chr4 (562-678)||(9490156-9490274)
chr4 (344-465)||(24607375-24607497)
chr4 (238-363)||(25763023-25763147)
chr4 (572-767)||(27759914-27760111)
chr4 (777-831)||(36172399-36172453)
chr4 (516-620)||(37866900-37867005)
chr4 (573-667)||(44559845-44559939)
chr4 (696-814)||(49064575-49064691)
chr4 (542-595)||(885327-885380)
chr4 (542-595)||(1043268-1043321)
chr4 (520-565)||(4785088-4785133)
chr4 (493-561)||(17211760-17211829)
chr4 (505-570)||(20778795-20778859)
chr4 (755-808)||(24607221-24607274)
chr4 (755-804)||(32937590-32937639)
chr4 (563-678)||(37867169-37867286)
chr4 (344-400)||(44560008-44560065)
chr4 (479-570)||(46816423-46816515)
chr4 (821-886)||(47870854-47870918)
chr4 (730-811)||(49571577-49571658)
chr4 (730-811)||(49817301-49817382)
chr4 (563-658)||(20901120-20901216)
chr4 (562-767)||(22437500-22437707)
chr4 (488-547)||(1226544-1226603)
chr4 (562-766)||(4784782-4784988)
chr4 (663-718)||(4785216-4785271)
chr4 (500-575)||(14289854-14289929)
chr4 (663-718)||(17211622-17211677)
chr4 (346-400)||(20778720-20778775)
chr4 (663-718)||(24607086-24607141)
chr4 (663-718)||(32937719-32937774)
chr4 (708-815)||(37867053-37867159)
chr4 (562-623)||(18412806-18412868)
chr4 (511-565)||(21169676-21169728)
chr4 (500-574)||(37867212-37867286)
chr4 (696-813)||(14330190-14330305)
chr4 (758-811)||(14330352-14330405)
chr4 (165-226)||(17292106-17292167)
chr4 (542-595)||(20901309-20901362)
chr4 (542-595)||(28082756-28082809)
chr4 (346-465)||(32937688-32937809)
chr4 (563-678)||(43888913-43889030)
chr4 (542-595)||(46816158-46816211)
chr4 (563-619)||(51027232-51027289)
chr4 (511-570)||(1226376-1226435)
chr4 (339-450)||(4785200-4785312)
chr4 (730-814)||(21169667-21169749)
chr4 (608-743)||(38132581-38132716)
chr4 (755-815)||(46816178-46816238)
chr4 (755-811)||(49064473-49064529)
chr4 (498-574)||(51027232-51027307)
chr4 (489-570)||(242324-242406)
chr4 (500-575)||(14330054-14330129)
chr4 (305-356)||(31824353-31824404)
chr4 (344-458)||(32937371-32937486)
chr4 (511-570)||(32937835-32937892)
chr4 (542-619)||(39589422-39589501)
chr4 (561-678)||(51427602-51427721)
chr4 (751-808)||(18413079-18413137)
chr4 (755-805)||(20901339-20901389)
chr4 (511-573)||(24606966-24607026)
chr4 (515-565)||(24607546-24607596)
chr4 (576-767)||(28082822-28083015)
chr4 (493-558)||(31324690-31324756)
chr4 (442-570)||(33163405-33163534)
chr4 (511-565)||(36776449-36776501)
chr4 (511-565)||(44560110-44560162)
chr4 (563-637)||(47657272-47657346)
chr4 (608-678)||(49791395-49791465)
chr4 (500-562)||(49817563-49817623)
chr4 (572-767)||(56139495-56139692)
chr4 (494-575)||(6281916-6281997)
chr4 (344-385)||(6282167-6282208)
chr4 (751-815)||(31324385-31324449)
chr4 (479-570)||(37866624-37866716)
chr4 (544-619)||(38132755-38132832)
chr4 (734-811)||(43889159-43889236)
chr4 (500-565)||(43889418-43889481)
chr4 (542-595)||(45940046-45940099)
chr4 (479-570)||(51027665-51027757)
chr4 (542-595)||(56139429-56139482)
chr4 (511-570)||(20901599-20901658)
chr4 (696-815)||(21712070-21712187)
chr4 (572-674)||(25763250-25763354)
chr4 (493-565)||(31324395-31324467)
chr4 (500-576)||(31824100-31824176)
chr4 (511-570)||(31824560-31824619)
chr4 (562-767)||(36775930-36776137)
chr4 (238-298)||(37866895-37866955)
chr4 (238-349)||(38132778-38132887)
chr4 (563-619)||(43889434-43889490)
chr4 (581-814)||(46815957-46816190)
chr4 (563-767)||(956867-957073)
chr4 (663-718)||(3393657-3393712)
chr4 (663-714)||(24607411-24607462)
chr4 (336-458)||(49817413-49817535)
chr4 (515-565)||(885540-885590)
chr4 (511-565)||(957385-957437)
chr4 (541-595)||(6176949-6177003)
chr4 (781-815)||(13850960-13850994)
chr4 (500-574)||(20901120-20901193)
chr4 (541-595)||(21016811-21016865)
chr4 (541-595)||(32937558-32937612)
chr4 (511-565)||(34153216-34153268)
chr4 (494-564)||(44559871-44559939)
chr4 (541-595)||(49095264-49095318)
chr4 (527-565)||(49423702-49423740)
chr4 (728-814)||(49817551-49817635)
chr4 (302-363)||(242158-242218)
chr4 (842-887)||(13866713-13866758)
chr4 (849-886)||(17054795-17054832)
chr4 (542-595)||(21712050-21712103)
chr4 (546-595)||(24607248-24607297)
chr4 (546-595)||(27759848-27759897)
chr4 (244-301)||(34529394-34529449)
chr4 (542-595)||(51027400-51027453)
[»] scaffold0176 (5 HSPs)
scaffold0176 (14-831)||(1785-2601)
scaffold0176 (305-363)||(2216-2274)
scaffold0176 (542-595)||(2312-2365)
scaffold0176 (572-678)||(2467-2575)
scaffold0176 (511-570)||(2009-2068)
[»] chr7 (153 HSPs)
chr7 (14-831)||(34140860-34141676)
chr7 (26-831)||(18237571-18238376)
chr7 (14-837)||(17183207-17184028)
chr7 (16-808)||(39476660-39477450)
chr7 (14-830)||(41217609-41218423)
chr7 (14-808)||(30360512-30361304)
chr7 (23-713)||(48220258-48220945)
chr7 (14-831)||(45362649-45363455)
chr7 (14-854)||(20564754-20565594)
chr7 (14-831)||(40588544-40589347)
chr7 (14-831)||(17839318-17840120)
chr7 (103-854)||(9366491-9367243)
chr7 (14-831)||(10523063-10523879)
chr7 (165-724)||(26601281-26601839)
chr7 (147-854)||(13920434-13921146)
chr7 (14-886)||(48270643-48271517)
chr7 (327-854)||(34157113-34157631)
chr7 (18-883)||(28113745-28114601)
chr7 (14-886)||(46861537-46862406)
chr7 (14-470)||(2356284-2356737)
chr7 (336-886)||(20877400-20877943)
chr7 (344-886)||(21186637-21187182)
chr7 (345-886)||(36393163-36393707)
chr7 (14-341)||(47268894-47269220)
chr7 (14-293)||(20378638-20378915)
chr7 (14-227)||(21187298-21187511)
chr7 (34-227)||(41048798-41048991)
chr7 (512-886)||(10224559-10224935)
chr7 (344-831)||(30354208-30354698)
chr7 (23-227)||(48315179-48315383)
chr7 (498-831)||(28978598-28978944)
chr7 (14-227)||(36393823-36394036)
chr7 (111-323)||(2205940-2206152)
chr7 (14-465)||(1642353-1642799)
chr7 (14-458)||(15337673-15338117)
chr7 (14-227)||(43351099-43351311)
chr7 (34-227)||(30354814-30355007)
chr7 (14-227)||(42735258-42735470)
chr7 (570-808)||(20378450-20378688)
chr7 (14-264)||(21614722-21614972)
chr7 (680-886)||(41622741-41622947)
chr7 (14-230)||(21650519-21650735)
chr7 (14-188)||(28979060-28979234)
chr7 (665-886)||(42683058-42683269)
chr7 (14-166)||(26603265-26603417)
chr7 (663-854)||(43350756-43350947)
chr7 (346-623)||(21614389-21614666)
chr7 (733-886)||(22291544-22291697)
chr7 (663-827)||(42735622-42735786)
chr7 (661-831)||(34353270-34353440)
chr7 (155-295)||(17320134-17320272)
chr7 (213-335)||(28978943-28979065)
chr7 (14-135)||(13916828-13916949)
chr7 (442-570)||(40588768-40588896)
chr7 (185-264)||(34139332-34139411)
chr7 (14-115)||(42682951-42683052)
chr7 (442-570)||(17839543-17839670)
chr7 (442-570)||(45363112-45363240)
chr7 (737-840)||(21614087-21614190)
chr7 (235-575)||(21614112-21614448)
chr7 (572-815)||(9366542-9366786)
chr7 (572-815)||(20565300-20565543)
chr7 (489-569)||(13920526-13920604)
chr7 (238-570)||(41217833-41218163)
chr7 (240-385)||(30360919-30361064)
chr7 (489-570)||(9367029-9367108)
chr7 (282-564)||(34157032-34157311)
chr7 (565-815)||(39476656-39476906)
chr7 (123-227)||(28066359-28066463)
chr7 (696-815)||(26601326-26601443)
chr7 (560-744)||(41218224-41218410)
chr7 (608-801)||(21186756-21186947)
chr7 (344-409)||(48314997-48315063)
chr7 (489-566)||(10523292-10523367)
chr7 (734-811)||(15337561-15337638)
chr7 (500-565)||(15337567-15337632)
chr7 (238-570)||(17183434-17183766)
chr7 (562-815)||(18238107-18238360)
chr7 (489-570)||(20564978-20565057)
chr7 (562-685)||(40589206-40589331)
chr7 (238-570)||(18237783-18238115)
chr7 (608-767)||(20378491-20378650)
chr7 (756-808)||(21614444-21614496)
chr7 (562-767)||(28113803-28114009)
chr7 (481-570)||(2205935-2206025)
chr7 (663-718)||(21614577-21614632)
chr7 (498-565)||(21651001-21651068)
chr7 (479-570)||(34139385-34139475)
chr7 (640-805)||(28978695-28978858)
chr7 (344-433)||(42735586-42735676)
chr7 (734-811)||(10224541-10224618)
chr7 (565-767)||(30361104-30361308)
chr7 (572-767)||(34157392-34157587)
chr7 (494-567)||(42735693-42735766)
chr7 (737-808)||(26500363-26500434)
chr7 (737-808)||(26592279-26592350)
chr7 (489-570)||(28978958-28979040)
chr7 (544-595)||(41218135-41218186)
chr7 (344-426)||(43350900-43350983)
chr7 (542-619)||(48220376-48220455)
chr7 (664-718)||(1642384-1642438)
chr7 (165-227)||(11824839-11824901)
chr7 (572-767)||(17839897-17840094)
chr7 (442-570)||(39477099-39477228)
chr7 (569-767)||(13920893-13921093)
chr7 (546-595)||(18238087-18238136)
chr7 (542-595)||(26601410-26601463)
chr7 (542-595)||(39476873-39476926)
chr7 (500-565)||(42683133-42683198)
chr7 (542-595)||(45362885-45362938)
chr7 (670-718)||(15337697-15337745)
chr7 (238-298)||(28978872-28978932)
chr7 (544-595)||(21614419-21614470)
chr7 (500-575)||(34353349-34353424)
chr7 (569-678)||(42735656-42735767)
chr7 (319-565)||(2356513-2356757)
chr7 (516-570)||(17320137-17320189)
chr7 (305-363)||(34141291-34141349)
chr7 (562-678)||(42683090-42683208)
chr7 (14-107)||(8726337-8726430)
chr7 (542-595)||(10523590-10523643)
chr7 (542-595)||(13920827-13920880)
chr7 (542-595)||(17183738-17183791)
chr7 (542-595)||(17839831-17839884)
chr7 (561-767)||(20877460-20877668)
chr7 (730-811)||(21650993-21651074)
chr7 (542-595)||(30361038-30361091)
chr7 (542-595)||(34141387-34141440)
chr7 (336-400)||(41049099-41049164)
chr7 (518-561)||(1642257-1642301)
chr7 (493-558)||(4230279-4230346)
chr7 (511-570)||(26601707-26601766)
chr7 (572-678)||(34141542-34141650)
chr7 (842-886)||(42735786-42735830)
chr7 (730-814)||(43351007-43351089)
chr7 (755-815)||(48220396-48220456)
chr7 (516-595)||(9366728-9366806)
chr7 (130-221)||(18149638-18149729)
chr7 (512-595)||(20565280-20565361)
chr7 (663-710)||(21614260-21614307)
chr7 (663-714)||(21650883-21650934)
chr7 (511-570)||(34141084-34141143)
chr7 (756-815)||(39476893-39476952)
chr7 (511-569)||(47269118-47269176)
chr7 (511-561)||(15337833-15337881)
chr7 (572-767)||(17183804-17184001)
chr7 (562-678)||(30354224-30354342)
chr7 (542-588)||(34157333-34157379)
chr7 (511-565)||(36393752-36393804)
chr7 (515-565)||(41049010-41049058)
chr7 (511-565)||(42735489-42735541)
chr7 (511-565)||(43351028-43351080)
chr7 (513-567)||(48270873-48270925)
[»] chr2 (161 HSPs)
chr2 (23-808)||(42120018-42120803)
chr2 (16-886)||(10359553-10360406)
chr2 (14-854)||(16581819-16582660)
chr2 (14-805)||(22493268-22494059)
chr2 (14-854)||(17424786-17425626)
chr2 (34-854)||(22001851-22002662)
chr2 (14-886)||(19470964-19471843)
chr2 (14-664)||(3936624-3937273)
chr2 (154-730)||(18393486-18394062)
chr2 (206-854)||(39799239-39799886)
chr2 (23-451)||(29906588-29907016)
chr2 (14-561)||(32734644-32735191)
chr2 (14-426)||(12968099-12968511)
chr2 (14-453)||(42240869-42241308)
chr2 (14-830)||(6976835-6977651)
chr2 (9-886)||(2918708-2919579)
chr2 (14-695)||(10364163-10364846)
chr2 (14-470)||(43982853-43983306)
chr2 (14-441)||(29067726-29068150)
chr2 (349-806)||(8557144-8557596)
chr2 (167-886)||(43491600-43492320)
chr2 (14-620)||(35491632-35492239)
chr2 (14-575)||(33404012-33404568)
chr2 (14-357)||(39393888-39394231)
chr2 (14-293)||(5420466-5420743)
chr2 (14-266)||(3941734-3941986)
chr2 (570-854)||(5420693-5420977)
chr2 (71-804)||(40676803-40677527)
chr2 (344-831)||(41498483-41498974)
chr2 (14-227)||(27130505-27130718)
chr2 (563-831)||(29073588-29073856)
chr2 (14-663)||(37312053-37312704)
chr2 (14-227)||(34521680-34521893)
chr2 (570-831)||(3941961-3942222)
chr2 (14-299)||(29111155-29111438)
chr2 (583-886)||(17538283-17538586)
chr2 (14-227)||(41499090-41499303)
chr2 (610-886)||(23408306-23408582)
chr2 (512-886)||(34521096-34521458)
chr2 (687-886)||(24108137-24108336)
chr2 (14-219)||(6901963-6902168)
chr2 (14-264)||(17796066-17796313)
chr2 (14-227)||(20148115-20148328)
chr2 (668-854)||(35492239-35492425)
chr2 (14-170)||(39799895-39800051)
chr2 (35-159)||(18392055-18392179)
chr2 (37-145)||(34638985-34639093)
chr2 (652-854)||(28476138-28476342)
chr2 (686-831)||(24936434-24936579)
chr2 (697-831)||(25685101-25685235)
chr2 (752-858)||(10364057-10364163)
chr2 (706-854)||(43983412-43983562)
chr2 (15-135)||(16253474-16253594)
chr2 (649-808)||(32736718-32736877)
chr2 (442-573)||(39799727-39799857)
chr2 (238-570)||(42120233-42120565)
chr2 (608-815)||(39799328-39799533)
chr2 (344-465)||(16253778-16253900)
chr2 (572-815)||(17425332-17425575)
chr2 (352-463)||(29111468-29111580)
chr2 (123-270)||(27650381-27650527)
chr2 (247-570)||(32734868-32735191)
chr2 (344-465)||(6902304-6902426)
chr2 (336-465)||(20148448-20148577)
chr2 (505-595)||(29111600-29111690)
chr2 (492-570)||(39394112-39394190)
chr2 (489-570)||(3936970-3937049)
chr2 (730-811)||(10364290-10364371)
chr2 (489-570)||(17425010-17425089)
chr2 (489-570)||(29067950-29068029)
chr2 (489-570)||(43983077-43983156)
chr2 (562-767)||(5420731-5420938)
chr2 (489-569)||(22002056-22002134)
chr2 (751-831)||(33404504-33404584)
chr2 (239-354)||(10359854-10359968)
chr2 (572-804)||(41498510-41498742)
chr2 (572-678)||(43492132-43492239)
chr2 (572-815)||(22002377-22002620)
chr2 (572-678)||(17538364-17538472)
chr2 (238-385)||(22493677-22493824)
chr2 (442-570)||(18393570-18393700)
chr2 (500-575)||(24108208-24108283)
chr2 (511-578)||(29111696-29111763)
chr2 (728-811)||(35492104-35492187)
chr2 (446-570)||(12968162-12968287)
chr2 (165-299)||(16253603-16253735)
chr2 (664-718)||(20148492-20148546)
chr2 (542-619)||(22493771-22493849)
chr2 (165-275)||(31991885-31991994)
chr2 (562-678)||(35492268-35492386)
chr2 (442-570)||(42240955-42241084)
chr2 (238-570)||(16582045-16582376)
chr2 (542-595)||(42120537-42120590)
chr2 (565-815)||(42120557-42120807)
chr2 (562-747)||(3942019-3942206)
chr2 (487-570)||(10360101-10360184)
chr2 (120-172)||(17112399-17112451)
chr2 (562-767)||(19471035-19471242)
chr2 (564-678)||(23408393-23408509)
chr2 (494-574)||(34521153-34521233)
chr2 (734-810)||(34521400-34521476)
chr2 (755-815)||(42120510-42120570)
chr2 (572-678)||(10359619-10359726)
chr2 (663-718)||(16253814-16253869)
chr2 (663-718)||(29111496-29111551)
chr2 (14-81)||(31770360-31770427)
chr2 (590-637)||(32735191-32735238)
chr2 (562-678)||(24108208-24108326)
chr2 (446-570)||(29906803-29906928)
chr2 (542-595)||(18393874-18393927)
chr2 (696-805)||(18393904-18394011)
chr2 (494-575)||(35492305-35492386)
chr2 (501-565)||(17538364-17538428)
chr2 (755-815)||(22493770-22493829)
chr2 (663-718)||(6902340-6902395)
chr2 (572-748)||(8557145-8557323)
chr2 (663-718)||(10364426-10364481)
chr2 (494-573)||(23408430-23408509)
chr2 (758-805)||(29111613-29111660)
chr2 (758-805)||(29111709-29111756)
chr2 (663-710)||(33404373-33404420)
chr2 (663-718)||(35491997-35492052)
chr2 (843-886)||(40676761-40676804)
chr2 (572-669)||(43983412-43983511)
chr2 (165-227)||(15891643-15891705)
chr2 (782-840)||(16708390-16708447)
chr2 (511-565)||(17796035-17796087)
chr2 (562-678)||(24936445-24936563)
chr2 (562-678)||(25685101-25685219)
chr2 (511-565)||(34521609-34521661)
chr2 (511-565)||(35491864-35491916)
chr2 (511-565)||(43491679-43491731)
chr2 (542-595)||(8557355-8557408)
chr2 (542-595)||(10359828-10359881)
chr2 (493-565)||(15891555-15891628)
chr2 (542-595)||(16582348-16582401)
chr2 (756-805)||(18393848-18393897)
chr2 (562-635)||(33404230-33404303)
chr2 (563-678)||(34521153-34521270)
chr2 (837-886)||(37312008-37312057)
chr2 (734-811)||(40677028-40677105)
chr2 (515-575)||(3942146-3942206)
chr2 (515-575)||(5420878-5420938)
chr2 (515-575)||(24936503-24936563)
chr2 (515-575)||(25685159-25685219)
chr2 (511-569)||(22493493-22493551)
chr2 (663-718)||(27130298-27130353)
chr2 (569-678)||(29073722-29073833)
chr2 (511-570)||(29111379-29111436)
chr2 (663-718)||(37312284-37312339)
chr2 (511-565)||(2919290-2919342)
chr2 (511-565)||(6977065-6977117)
chr2 (511-565)||(10364563-10364615)
chr2 (562-623)||(16253670-16253732)
chr2 (541-595)||(17425312-17425366)
chr2 (14-56)||(27650603-27650645)
chr2 (757-811)||(37312148-37312202)
chr2 (541-595)||(39799499-39799553)
chr2 (729-814)||(34521587-34521670)
chr2 (14-75)||(40678763-40678824)
chr2 (244-301)||(41498687-41498742)
[»] chr1 (243 HSPs)
chr1 (23-808)||(47487456-47488241)
chr1 (14-808)||(45689114-45689905)
chr1 (14-808)||(50067678-50068472)
chr1 (14-854)||(29435966-29436804)
chr1 (14-827)||(49262398-49263201)
chr1 (14-836)||(49598279-49599087)
chr1 (14-886)||(12790622-12791486)
chr1 (43-831)||(46179700-46180465)
chr1 (34-831)||(49427400-49428194)
chr1 (34-854)||(19160330-19161150)
chr1 (14-854)||(13634670-13635510)
chr1 (14-808)||(39223618-39224410)
chr1 (14-883)||(42571134-42571989)
chr1 (14-831)||(48567802-48568617)
chr1 (37-854)||(27486073-27486880)
chr1 (14-710)||(51269795-51270489)
chr1 (14-831)||(41874288-41875097)
chr1 (22-644)||(3658474-3659095)
chr1 (14-806)||(30309269-30310039)
chr1 (14-612)||(27034933-27035531)
chr1 (14-886)||(13972917-13973791)
chr1 (145-700)||(29707066-29707623)
chr1 (14-886)||(14173097-14173971)
chr1 (14-886)||(17685698-17686574)
chr1 (14-886)||(36909554-36910417)
chr1 (194-831)||(22527680-22528315)
chr1 (14-831)||(24269760-24270576)
chr1 (14-575)||(44336973-44337532)
chr1 (327-831)||(48226843-48227346)
chr1 (5-886)||(35184954-35185840)
chr1 (14-527)||(29761924-29762434)
chr1 (14-385)||(35576332-35576704)
chr1 (14-565)||(18170018-18170569)
chr1 (344-886)||(35525536-35526081)
chr1 (14-418)||(44597694-44598097)
chr1 (512-886)||(23343130-23343507)
chr1 (14-293)||(39856842-39857119)
chr1 (14-264)||(21484606-21484856)
chr1 (512-886)||(49397134-49397511)
chr1 (489-854)||(29761520-29761903)
chr1 (51-598)||(37778109-37778658)
chr1 (14-228)||(35586928-35587142)
chr1 (14-402)||(17697039-17697424)
chr1 (573-882)||(35586266-35586571)
chr1 (344-854)||(49925752-49926264)
chr1 (14-227)||(6435765-6435978)
chr1 (14-227)||(38046434-38046647)
chr1 (25-227)||(49926380-49926582)
chr1 (14-227)||(49396697-49396910)
chr1 (512-831)||(38044586-38044908)
chr1 (11-231)||(48215188-48215408)
chr1 (14-227)||(23342634-23342847)
chr1 (14-575)||(13283698-13284254)
chr1 (570-854)||(39856613-39856892)
chr1 (14-464)||(17372720-17373167)
chr1 (563-831)||(18170770-18171038)
chr1 (18-465)||(5765203-5765645)
chr1 (14-215)||(35526189-35526390)
chr1 (24-565)||(24363475-24364003)
chr1 (14-220)||(18842432-18842638)
chr1 (14-227)||(41780686-41780899)
chr1 (601-831)||(37778688-37778917)
chr1 (14-465)||(16531856-16532303)
chr1 (344-658)||(6436094-6436411)
chr1 (740-886)||(15356156-15356301)
chr1 (703-886)||(6436406-6436579)
chr1 (137-646)||(40532865-40533376)
chr1 (31-465)||(16081295-16081727)
chr1 (668-831)||(27034769-27034932)
chr1 (238-570)||(51270019-51270349)
chr1 (662-808)||(46924693-46924839)
chr1 (238-570)||(47487694-47488026)
chr1 (696-854)||(51270505-51270665)
chr1 (581-685)||(46924853-46924957)
chr1 (67-152)||(13148365-13148450)
chr1 (429-565)||(17697427-17697563)
chr1 (336-563)||(18842767-18842994)
chr1 (305-570)||(29761947-29762210)
chr1 (737-827)||(41801722-41801812)
chr1 (751-831)||(13284190-13284270)
chr1 (631-767)||(39223682-39223818)
chr1 (574-718)||(41781221-41781366)
chr1 (238-570)||(30309490-30309821)
chr1 (306-570)||(27486416-27486679)
chr1 (442-570)||(44597918-44598046)
chr1 (442-570)||(49427604-49427731)
chr1 (322-465)||(16097853-16097994)
chr1 (731-884)||(17373193-17373336)
chr1 (505-591)||(21484414-21484500)
chr1 (489-570)||(19160534-19160613)
chr1 (489-570)||(22527724-22527803)
chr1 (489-570)||(44337227-44337308)
chr1 (238-570)||(46179937-46180269)
chr1 (822-887)||(49261045-49261110)
chr1 (479-570)||(29436190-29436281)
chr1 (241-570)||(3658690-3659018)
chr1 (238-570)||(29707196-29707530)
chr1 (422-570)||(35576556-35576705)
chr1 (238-363)||(50067916-50068040)
chr1 (238-570)||(39223856-39224186)
chr1 (442-570)||(13635159-13635286)
chr1 (731-831)||(24363449-24363549)
chr1 (563-767)||(29436558-29436764)
chr1 (491-550)||(46924958-46925017)
chr1 (238-570)||(48568063-48568393)
chr1 (572-815)||(19160856-19161099)
chr1 (572-767)||(22528092-22528289)
chr1 (575-805)||(39856660-39856890)
chr1 (565-767)||(47487452-47487656)
chr1 (562-767)||(12790683-12790890)
chr1 (562-767)||(23343229-23343436)
chr1 (238-385)||(49262654-49262801)
chr1 (663-718)||(5765559-5765614)
chr1 (14-81)||(16098078-16098145)
chr1 (506-565)||(18170669-18170728)
chr1 (751-830)||(18842942-18843021)
chr1 (489-570)||(27035225-27035307)
chr1 (542-619)||(50067891-50067970)
chr1 (243-570)||(12790936-12791262)
chr1 (572-767)||(13973513-13973710)
chr1 (238-363)||(27034975-27035099)
chr1 (572-767)||(30309270-30309467)
chr1 (828-886)||(40532754-40532812)
chr1 (344-433)||(41781015-41781105)
chr1 (500-565)||(15356236-15356301)
chr1 (572-814)||(18170770-18171012)
chr1 (246-570)||(42571442-42571765)
chr1 (562-804)||(49397198-49397440)
chr1 (494-575)||(49397359-49397440)
chr1 (563-635)||(13283917-13283989)
chr1 (562-767)||(27486119-27486326)
chr1 (608-815)||(49598348-49598553)
chr1 (663-718)||(16531887-16531942)
chr1 (243-385)||(18170427-18170569)
chr1 (562-766)||(35525607-35525813)
chr1 (663-718)||(37778437-37778492)
chr1 (494-565)||(38044612-38044683)
chr1 (544-595)||(48568040-48568091)
chr1 (572-767)||(13634721-13634918)
chr1 (344-465)||(35586694-35586816)
chr1 (698-808)||(41781216-41781325)
chr1 (844-886)||(46142794-46142836)
chr1 (572-767)||(48227123-48227320)
chr1 (542-595)||(3658993-3659046)
chr1 (696-804)||(17685905-17686010)
chr1 (302-363)||(17697444-17697505)
chr1 (542-595)||(27034950-27035003)
chr1 (734-811)||(37778551-37778628)
chr1 (451-570)||(41874753-41874873)
chr1 (542-595)||(45689640-45689693)
chr1 (542-595)||(46179912-46179965)
chr1 (542-595)||(47487669-47487722)
chr1 (755-815)||(3658966-3659026)
chr1 (564-644)||(17372941-17373021)
chr1 (751-815)||(29707191-29707255)
chr1 (487-570)||(45689336-45689420)
chr1 (238-362)||(45689545-45689668)
chr1 (751-815)||(45689609-45689673)
chr1 (511-570)||(49262918-49262977)
chr1 (542-590)||(49598520-49598568)
chr1 (608-815)||(50067719-50067924)
chr1 (755-815)||(50067911-50067971)
chr1 (737-808)||(3659274-3659345)
chr1 (663-710)||(17373082-17373129)
chr1 (758-841)||(17697516-17697599)
chr1 (663-714)||(18842811-18842862)
chr1 (123-210)||(19262430-19262517)
chr1 (511-570)||(21484575-21484632)
chr1 (344-458)||(23342963-23343078)
chr1 (696-767)||(24269911-24269982)
chr1 (542-619)||(29707171-29707250)
chr1 (663-718)||(41781051-41781106)
chr1 (500-575)||(41801725-41801800)
chr1 (696-767)||(41874438-41874509)
chr1 (544-595)||(41874520-41874571)
chr1 (575-767)||(42571198-42571393)
chr1 (696-767)||(46924859-46924930)
chr1 (542-619)||(51270295-51270374)
chr1 (517-575)||(6436460-6436518)
chr1 (511-565)||(13973149-13973201)
chr1 (511-565)||(14173687-14173739)
chr1 (14-124)||(14772644-14772754)
chr1 (663-709)||(16081641-16081687)
chr1 (500-574)||(35586330-35586404)
chr1 (14-207)||(48706929-48707131)
chr1 (511-565)||(49396929-49396981)
chr1 (730-811)||(6436240-6436321)
chr1 (516-565)||(13283926-13283973)
chr1 (500-565)||(17373202-17373267)
chr1 (516-565)||(18170963-18171012)
chr1 (542-595)||(22528026-22528079)
chr1 (734-811)||(23343112-23343189)
chr1 (494-575)||(23343355-23343436)
chr1 (542-595)||(29436492-29436545)
chr1 (524-565)||(35586595-35586636)
chr1 (663-712)||(40533085-40533134)
chr1 (542-595)||(48227057-48227110)
chr1 (542-595)||(49427905-49427958)
chr1 (730-814)||(6435988-6436070)
chr1 (670-718)||(21484246-21484294)
chr1 (509-565)||(24270290-24270344)
chr1 (562-767)||(35185572-35185779)
chr1 (696-804)||(35586465-35586571)
chr1 (511-559)||(38046363-38046409)
chr1 (511-559)||(41780924-41780970)
chr1 (222-258)||(48226760-48226796)
chr1 (302-385)||(49598611-49598695)
chr1 (511-570)||(49598821-49598880)
chr1 (731-814)||(13283917-13283998)
chr1 (663-718)||(24363606-24363661)
chr1 (562-621)||(24363736-24363795)
chr1 (663-718)||(35586725-35586780)
chr1 (696-767)||(36910149-36910220)
chr1 (756-811)||(40532943-40532998)
chr1 (516-563)||(41781221-41781267)
chr1 (696-767)||(48567954-48568025)
chr1 (696-767)||(51270387-51270458)
chr1 (515-565)||(3659292-3659342)
chr1 (511-565)||(6435997-6436049)
chr1 (731-813)||(17372941-17373021)
chr1 (541-595)||(19160836-19160890)
chr1 (352-465)||(21484215-21484329)
chr1 (541-595)||(21484409-21484463)
chr1 (755-805)||(21484440-21484490)
chr1 (511-565)||(23342866-23342918)
chr1 (608-678)||(29761609-29761679)
chr1 (511-565)||(36909786-36909838)
chr1 (344-465)||(38046196-38046318)
chr1 (515-565)||(46924696-46924746)
chr1 (755-805)||(51270294-51270344)
chr1 (665-718)||(6436132-6436185)
chr1 (336-385)||(14772341-14772390)
chr1 (516-565)||(17372949-17372996)
chr1 (758-811)||(18170522-18170575)
chr1 (758-811)||(18170681-18170734)
chr1 (235-268)||(21484432-21484465)
chr1 (516-565)||(24363738-24363785)
chr1 (520-565)||(27034795-27034840)
chr1 (305-385)||(29436374-29436454)
chr1 (849-886)||(37778951-37778988)
chr1 (542-595)||(39223831-39223884)
chr1 (542-595)||(49262629-49262682)
chr1 (510-559)||(49926308-49926355)
[»] chr6 (93 HSPs)
chr6 (31-831)||(35058134-35058930)
chr6 (14-854)||(6205481-6206321)
chr6 (14-854)||(11692448-11693288)
chr6 (14-854)||(27640177-27641013)
chr6 (14-614)||(29066550-29067149)
chr6 (14-614)||(29108137-29108736)
chr6 (155-831)||(24020499-24021168)
chr6 (14-886)||(32026966-32027840)
chr6 (14-565)||(801163-801710)
chr6 (155-831)||(2192535-2193203)
chr6 (34-886)||(12396793-12397647)
chr6 (14-886)||(32037025-32037899)
chr6 (14-408)||(29075563-29075956)
chr6 (37-408)||(29110558-29110928)
chr6 (344-854)||(35020607-35021120)
chr6 (516-886)||(13403313-13403676)
chr6 (14-227)||(13402530-13402743)
chr6 (14-227)||(34802895-34803108)
chr6 (76-465)||(30257340-30257729)
chr6 (147-358)||(3765655-3765867)
chr6 (611-886)||(13617242-13617517)
chr6 (14-301)||(14115034-14115318)
chr6 (14-201)||(22305793-22305980)
chr6 (336-643)||(14122919-14123226)
chr6 (663-880)||(34802536-34802743)
chr6 (666-831)||(29067144-29067309)
chr6 (666-831)||(29108731-29108896)
chr6 (738-886)||(4495604-4495752)
chr6 (601-886)||(7821171-7821443)
chr6 (305-570)||(29066774-29067038)
chr6 (305-570)||(29108361-29108625)
chr6 (344-465)||(23911076-23911197)
chr6 (442-570)||(29075787-29075915)
chr6 (442-570)||(29110759-29110887)
chr6 (697-886)||(30256936-30257109)
chr6 (572-767)||(6206073-6206270)
chr6 (627-767)||(2192980-2193120)
chr6 (489-570)||(24021006-24021085)
chr6 (243-570)||(801386-801710)
chr6 (344-458)||(4495230-4495345)
chr6 (572-767)||(11693040-11693237)
chr6 (489-570)||(2192618-2192697)
chr6 (489-570)||(27640401-27640480)
chr6 (608-767)||(24020558-24020717)
chr6 (489-570)||(6205705-6205784)
chr6 (730-811)||(13403287-13403368)
chr6 (147-275)||(17465287-17465414)
chr6 (752-831)||(14123418-14123496)
chr6 (572-748)||(27640784-27640962)
chr6 (179-226)||(35021237-35021284)
chr6 (492-570)||(11692672-11692748)
chr6 (336-465)||(13402851-13402981)
chr6 (494-575)||(4495600-4495681)
chr6 (542-595)||(29067076-29067129)
chr6 (542-595)||(29108663-29108716)
chr6 (758-811)||(801663-801716)
chr6 (500-561)||(4495385-4495446)
chr6 (562-736)||(13403439-13403615)
chr6 (565-815)||(35058150-35058400)
chr6 (542-595)||(35058367-35058420)
chr6 (344-427)||(34802695-34802779)
chr6 (663-718)||(4495266-4495321)
chr6 (663-718)||(14122963-14123018)
chr6 (663-718)||(23911112-23911166)
chr6 (512-559)||(30257247-30257294)
chr6 (663-718)||(30257371-30257426)
chr6 (511-565)||(13402762-13402814)
chr6 (515-565)||(13617323-13617373)
chr6 (663-712)||(801526-801575)
chr6 (479-570)||(3765683-3765775)
chr6 (542-595)||(6206007-6206060)
chr6 (542-595)||(14123125-14123178)
chr6 (752-808)||(34132108-34132164)
chr6 (344-394)||(23911146-23911197)
chr6 (696-767)||(32027173-32027244)
chr6 (696-767)||(32037232-32037303)
chr6 (562-675)||(35020646-35020761)
chr6 (123-189)||(2402306-2402372)
chr6 (562-678)||(12397458-12397576)
chr6 (515-565)||(14123421-14123470)
chr6 (14-124)||(28051355-28051465)
chr6 (608-678)||(29067175-29067245)
chr6 (608-678)||(29108762-29108832)
chr6 (511-565)||(32027556-32027608)
chr6 (515-565)||(34132111-34132161)
chr6 (238-567)||(35058392-35058720)
chr6 (734-811)||(4495379-4495456)
chr6 (512-565)||(14115262-14115313)
chr6 (493-565)||(20192543-20192616)
chr6 (493-565)||(20242038-20242111)
chr6 (493-565)||(22136022-22136095)
chr6 (493-565)||(22143375-22143448)
chr6 (542-595)||(27640702-27640755)
[»] scaffold0192 (3 HSPs)
scaffold0192 (23-827)||(17343-18119)
scaffold0192 (302-570)||(17637-17905)
scaffold0192 (847-886)||(17299-17338)
[»] scaffold0589 (6 HSPs)
scaffold0589 (14-389)||(2262-2637)
scaffold0589 (516-886)||(4781-5141)
scaffold0589 (562-767)||(4873-5080)
scaffold0589 (487-570)||(2486-2570)
scaffold0589 (542-595)||(4807-4860)
scaffold0589 (515-575)||(5020-5080)
[»] scaffold0268 (3 HSPs)
scaffold0268 (155-831)||(14604-15280)
scaffold0268 (489-570)||(14687-14766)
scaffold0268 (627-815)||(15009-15197)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (391-831)||(11159-11598)
scaffold0199 (542-595)||(11395-11448)
[»] scaffold0861 (5 HSPs)
scaffold0861 (327-644)||(2260-2578)
scaffold0861 (238-363)||(2380-2504)
scaffold0861 (542-595)||(2476-2529)
scaffold0861 (755-815)||(2449-2509)
scaffold0861 (737-808)||(2757-2828)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (155-407)||(85462-85711)
scaffold0031 (489-570)||(85545-85624)
scaffold0031 (570-620)||(85548-85598)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (14-190)||(24900-25076)
[»] scaffold0618 (1 HSPs)
scaffold0618 (738-886)||(4907-5055)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (14-139)||(63971-64095)
scaffold0004 (168-264)||(64098-64194)
scaffold0004 (511-567)||(64171-64225)
scaffold0004 (346-400)||(64251-64306)
[»] scaffold1700 (5 HSPs)
scaffold1700 (423-547)||(1-125)
scaffold1700 (587-643)||(130-186)
scaffold1700 (305-385)||(1-82)
scaffold1700 (515-567)||(384-436)
scaffold1700 (753-805)||(382-434)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (731-840)||(107977-108086)
scaffold0039 (515-565)||(108012-108062)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (123-220)||(5453-5550)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (130-215)||(36775-36860)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 617; Significance: 0; HSPs: 158)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 617; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 886
Target Start/End: Original strand, 3601356 - 3602209
Alignment:
Q  37 ttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3601356 ttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttaagagcacaa 3601455  T
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaa 236  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3601456 catgttccagtgtttcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgtcagaagatcgtcattagttagagtaa 3601555  T
Q  237 ggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttt 336  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  3601556 ggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaatggccatgactcaaacatttcgcccagcgttcatgtttt 3601655  T
Q  337 tcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatcta 436  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3601656 tcctttgaaaagattaaattcttgctatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatcta 3601755  T
Q  437 aagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccatt 536  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||    
T  3601756 aagcaagcctaataaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcggggcaaaatgcttgagtcatattgtttggcaaatttgaatttaccccatt 3601855  T
Q  537 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactcc 636  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||     
T  3601856 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttactctagatgggacaattcaaacttgttaatcggcaggactct 3601955  T
Q  637 agcat----tcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcg 732  Q
    |||||    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  3601956 agcattcgatcgataagcctcttgaacaatgatattcaagtgccaatgaatgcaccttattcttttgacatttgaatatcatcattcaagatgctgatcg 3602055  T
Q  733 aatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgc 832  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  3602056 aatactggagtcctgctatttaacaattttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccagaatgtaatgtaatac 3602155  T
Q  833 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3602156 aatgtaatgtgataatatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 3602209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 597; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Original strand, 1971357 - 1972228
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1971357 agacacaaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttcggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 1971456  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  1971457 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccag 1971556  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    || ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  1971557 aaaatcatcattagttatggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttgcctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaatggccatgactcaagc 1971656  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  1971657 atttcgcccagctttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgccaaggaatgaacctcatttcgt 1971756  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  1971757 tggcacttgaatatcatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcggtgcaaaatgcttgagtcctgttgttt 1971856  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1971857 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcatactctggatggggcaattca 1971956  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  1971957 aacttgttaatcgggaggactccaacattcgataagcctcttgaatattggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacagttaaatacca 1972056  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| || || || || |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  1972057 tcattcaagatgctgatcggatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgcccca-tccagagtaagacaattgttgtagttggaagatacatt 1972155  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1972156 ctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 1972228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 508; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 808
Target Start/End: Original strand, 19400355 - 19401152
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19400355 agacacaaggatggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtgtcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 19400454  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  19400455 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 19400554  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  19400555 aatatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaatttgccaaacgaccatgactcaagc 19400654  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  19400655 atttcgcccaacattcatgattttcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcct 19400754  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  19400755 tggcatttgaatatcatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgaggggcgaaatgcttgagtcttgttgttt 19400854  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19400855 ggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattca 19400954  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19400955 aacttgttaatcgaaaggactccaacattcgataagcatcttgaacgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 19401054  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgt---tgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||| ||  |||||| || |||||| | |||   |||||||||| |||||| || ||||||  || |||| ||||||   ||||||||||||||    
T  19401055 tcattcaatatgttgatcgtatgttggagccatgctgcttagcaagttagaatttgccccattcagaggcaagacaattgttgttgtagttggaaggt 19401152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 8576356 - 8575516
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8576356 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgaagaaaacgtg 8576257  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8576256 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccggtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 8576157  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| |||    
T  8576156 aagattgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgtcaaacaacaa-gactcgagc 8576060  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||       
T  8576059 atttcgcgagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattctg 8575960  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  8575959 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaagtgctcggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 8575860  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8575859 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 8575760  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8575759 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgatgagcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 8575660  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||    
T  8575659 agcgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaat 8575560  T
Q  813 tccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    |  ||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8575559 tttggaatctaatgtgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 8575516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 477; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 7444 - 6604
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7444 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 7345  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7344 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 7245  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||| |||||||||  | ||||||| |||    
T  7244 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaatttgtcaaacaac-atgactcgagc 7148  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  7147 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaattcttgttatggtggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 7048  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaat-gcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  7047 tggcacttgaatatcatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaattgcttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 6948  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6947 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgcagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactttggatggggcaattc 6848  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6847 aaacttgttaatcggcaggactccagcattcgatgagcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 6748  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | ||||| ||  |||||||||| ||| |||||||   ||| ||||||||||||| ||  |||||  |||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  6747 agcgttcaaaatgttgatcgaatactggggtcctgctgcttaacaagtttgaatttgccctattcagtggtaagatgattgttgaagttggaaggaaaat 6648  T
Q  813 tccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6647 ttcggaatgtaatgtgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 6604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 830
Target Start/End: Original strand, 30709610 - 30710403
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30709610 acgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagca 30709709  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  30709710 cagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccggaagatcgtcattagttaggg 30709809  T
Q  234 taaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||   |  |||||||||| || |||||  | | ||||| ||||||| || |  | ||||| |    
T  30709810 taaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagatcaattcaaacctgccaaacaac-aggactcgagcatttcgctcggcattcattt 30709907  T
Q  334 ttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcat 433  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  30709908 ttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctgatttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcat 30710007  T
Q  434 ctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||    
T  30710008 ctaaagcacgcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatgccgggtgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatccc 30710106  T
Q  534 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggac 633  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30710107 attcaaaggtaacataattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgctaatcggcaggac 30710206  T
Q  634 tccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcga 733  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |||||    
T  30710207 tccagtattcgatgagcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattctgttgacacttgaataccagcgttcaagatgctaatcga 30710306  T
Q  734 atattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaat 830  Q
    ||| ||| ||| |||   || |||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30710307 atactggtgtcatgctgcttggcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtaaatttcggaatgtaatgtaat 30710403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Original strand, 38854150 - 38854989
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38854150 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 38854249  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38854250 acgaccatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 38854349  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||   |  |||||||||| || |||||  | ||||||| |||    
T  38854350 aagaccgtcattagttag-gtaaggtgcattccaaccacaacaattgtctt-cctttgaatgagatcaattcaaacctgccaaacaac-atgactcgagc 38854446  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||    
T  38854447 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaggtgtgaaggaatgaacctcatttcgt 38854546  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  38854547 tggcacttgaataccagcgtctaaagcacacctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatgccgggtgaaatgcttgagtcctgttgttt 38854645  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactct-ggatggggcaattc 612  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  38854646 tgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgcggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttacccttggatggggcaattc 38854745  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38854746 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgataagcctctcgaacactggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 38854845  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| | ||    
T  38854846 agcgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggaaaat 38854945  T
Q  813 tccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | | |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38854946 ttcagaatctaatgtgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 38854989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Original strand, 11346701 - 11347518
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11346701 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgaaattaatgaacgacgaaaacgtg 11346800  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11346801 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 11346900  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||   |   ||||||||| || |||||   || ||||| |||    
T  11346901 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaac-aacaggactcgagc 11346998  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  11346999 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 11347098  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||        ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  11347099 tggcacttgaataccatcatctaaagcacgcctaacaaaaatttaatcttttcaaag-gaaaacatgaatgtcgggtgaaatgcttgagtcctgttgttt 11347197  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaat 610  Q
    | || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11347198 gacaggtttaaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaaaaattgtcttcctctgaatggggcaat 11347297  T
Q  611 tcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaata 710  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11347298 tcaaacttgttaaacggcaggaatccagcatgcgatgagcatcttgaacaatagtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaata 11347397  T
Q  711 ccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtac 810  Q
    ||||| ||  | || || |||| || ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11347398 ccatcgttgcatatgctcatcggatgttggagttctgctgtttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtac 11347497  T
Q  811 attccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  11347498 attccggaatgtaatgtaatg 11347518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 433; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 27661592 - 27660752
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || |||||  |||||||| ||||  |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27661592 agacacaaggatggtggaacacgtttagtataaacttccattgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 27661493  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27661492 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 27661393  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| |||    
T  27661392 aagattgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcgagc 27661296  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||       
T  27661295 atttcgcgagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattctg 27661196  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||        |||| |||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  27661195 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagtctcacaaaaatttattcttttgaaagggaaaacatgaagtgctcggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 27661096  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27661095 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgcggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattc 27660996  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27660995 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgatgaacatcttcaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 27660896  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || |||||| || ||    
T  27660895 agcgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaagataaat 27660796  T
Q  813 tccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | | |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27660795 ttcagaatctaatgtgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 27660752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 172 - 815
Target Start/End: Original strand, 3458940 - 3459583
Alignment:
Q  172 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctc 271  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  3458940 tgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctg 3459039  T
Q  272 aaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtt 371  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3459040 aaatgaggtaattcaaacttgccaaacgaccatgactcaagtattaagcccagcgttcatatttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtt 3459139  T
Q  372 tagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagn 471  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  3459140 tagatgaaggtattaagtgtcaatgaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattattttcaaaga 3459239  T
Q  472 nnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca 571  Q
           |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3459240 aaaaacatgaacgcggggcgaaatgcttgagtcatgttgtttggccagtttaaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttagaatgcaca 3459339  T
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaa 671  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3459340 ttccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcgacaggactccaacattcgataagcctcttgaacactggtattcaa 3459439  T
Q  672 gtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcc 771  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||    
T  3459440 gtgtcaaggaatgcacttcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgttgatcgtatattggagtcctgctgcttagcaaaattgaatttgcc 3459539  T
Q  772 tcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3459540 ccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacattcc 3459583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 417; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 19036889 - 19036050
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19036889 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 19036790  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  19036789 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 19036690  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  19036689 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtatt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagc 19036593  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  19036592 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 19036493  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  19036492 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattatttttaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 19036393  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19036392 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattc 19036293  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19036292 aaacttgccaatttgcaggactccagtattcgatgagcatcttgaataatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattctgttgacacttgaatacc 19036193  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | |||||||| ||||||||||  ||| |||||||   || |||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || || |||||| ||    
T  19036192 agcgttcaagatgctgatcgaatgctggtgtcctgctgcttggcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctgtaaggtaaat 19036093  T
Q  813 tccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19036092 ttcggaatgtaatgtaaaatgcaatg-aatgtgataacatatat 19036050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 830
Target Start/End: Original strand, 28880983 - 28881796
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28880983 agacacaaggatggtggaaaacatttggtacaaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 28881082  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  28881083 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 28881182  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    ||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| |||    
T  28881183 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctttctttg--aatggggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcgagc 28881279  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||   |   || ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  28881280 atttcgcaagaacctcgtgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 28881379  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||  | |  |||||||||||||||||||||| ||    
T  28881380 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaggttcttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 28881479  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28881480 ttgcaggtttgaatttatcccattcaa-ggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattc 28881578  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28881579 aaacttgccaatcggcaggactccagtattcgatgagcatcttgaacaatggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattctgttgacacttgaatacc 28881678  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    |   || ||||| || |||||||| ||| |||||||   || |||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  28881679 aaggtttaagatgctaatcgaatactggtgtcctgctgcttggcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtaaat 28881778  T
Q  813 tccggaatgtaatgtaat 830  Q
    | ||||||||||||||||    
T  28881779 ttcggaatgtaatgtaat 28881796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 235 - 808
Target Start/End: Original strand, 40011830 - 40012402
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40011830 aaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggccataactcaagcatttcgcccaacgttcatgtt 40011929  T
Q  335 tttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| |     
T  40011930 tttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaagaatgaacatcatttcgttggcacttgaataccatcgta 40012029  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40012030 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcggg-cgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttacccca 40012128  T
Q  535 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggact 634  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40012129 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactttggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggact 40012228  T
Q  635 ccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaa 734  Q
    ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  40012229 ccaacattcgataagcctcttgaatgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccgtcattcaagatgttgatcgaa 40012328  T
Q  735 tattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||  ||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40012329 tattggagtcctactgcttagcaagtttgaatttgcccaatttaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 40012402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 678
Target Start/End: Original strand, 8537946 - 8538607
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8537946 agacacaaggatggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatg 8538045  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8538046 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 8538145  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||   |   ||||||||| || |||||   || ||||| |||    
T  8538146 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaac-aacaggactcgagc 8538243  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  8538244 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaatattaaattcttgttgggttggtttagatgaaggtattaagtgtcaagaaatgaacctcatttcgt 8538343  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||        ||||||  ||| |||||||||||||||| || |||    
T  8538344 tggcacttgaataccatcatctaaagcacacctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgtcgggtgaaatgcttgagtcctattgttt 8538442  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    | || |||||||| || | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8538443 gacaggtttgaatctatctcgttcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 8538542  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaa 678  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  8538543 aacttgttaatcggcaggactccaacattcgataagcatcttgaacgctggtattcaagtgtcaa 8538607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Original strand, 18308252 - 18309125
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18308252 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatg 18308351  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  18308352 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccag 18308451  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
     |||| | |||||| ||  | | |  ||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||| |||||||  | | |||     
T  18308452 tagattgacattaggtatggaatgaatgcaccttccacctacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacggg-aggtctcc 18308548  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |  |||  | || || |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||    
T  18308549 aatattc-gaccgacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaagctggtttaaatgaaggtattgaagtttcaaggaatggacctcatt 18308647  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
     | ||| || |||||||||||||| |||  | |||||||||| |||||| | |||| || |         |||||  || |||| |  | ||||| ||||    
T  18308648 cttttgacatttgaatactatcatttaatcccagcctaacaagaatttaatattttgaatgaaaaattgggaatgtcggtcgaa-tattggagtcttgtt 18308746  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg 606  Q
      |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    || |||| ||||||||||||| ||| | ||| ||    
T  18308747 gcttggcatgtttgaatttaccc-attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacaaaagtctaactacaacaattgtcttcctcagaatgagg 18308845  T
Q  607 caattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
     ||||||||||||||||   |||||| |  |||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18308846 taattcaaacttgttaaacagcaggaatatagcattcgatgagcctcttgaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcatctcattcttttgacacttg 18308945  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  18308946 aataccataattcaagatgctgatcggatgttggagtcctactacttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 18309045  T
Q  807 gtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18309046 gtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 18309125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 1400517 - 1399646
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1400517 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 1400418  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1400417 acgaccatgttttgggagcacatcatgttccagtggatccatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 1400318  T
Q  214 aagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  |||| || |  | ||||| |||||||||| ||||| | | |  ||||||| |||||||||||| ||||| |  | | |||     
T  1400317 aagatcgtcattaggtacggagtgaatgcaccttccagctacaacaattgtcttcctttt--aatggggtaattcaaacttgccaaac-gataggtctct 1400221  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |  | || | || || |||   || ||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1400220 aata-ttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaggattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcatt 1400122  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
     | ||| || |||||||| ||||| |||    |||||||||| |||||| |||||| || |         |||||  || || |||  | ||||| ||      
T  1400121 cttttgacatttgaataccatcatttaatctcagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcg-aatattggagtcatg-- 1400025  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg 606  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  1400024 -cttgacaagtttgaatttaccccattcaaagttaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattttcttcctctgaatgggg 1399926  T
Q  607 caattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
     ||||||||||||||||  |||||||  ||| |||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1399925 taattcaaacttgttaaacggcaggaagccaacattcgatgagcattttgaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcaccacattcttttgacacttg 1399826  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    |||| ||||||||||||| || |||| ||  | |||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1399825 aatatcatcattcaagatgctcatcgcatgctagagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagttggaag 1399726  T
Q  807 gtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1399725 gtacattctggaatgtaatgtaaagcaatataatgtgataacatatatagttgaatatgcataattcattttgttttgaa 1399646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 155 - 831
Target Start/End: Original strand, 22283704 - 22284377
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaa 254  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | || |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22283704 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccaccataaaatcgtccttagttaggataaggtgcattccaactacaa 22283803  T
Q  255 caatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaa 354  Q
    |||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| ||       |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22283804 caattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcgagcatttcgcaagtacctcatgtttctcctttgaaaatattaaa 22283900  T
Q  355 ttcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaa 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22283901 ttcttgttatgctggtttagatgaaggtattaattgtcaaggattgaacctcaattcggtggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaa 22284000  T
Q  455 tttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattg 553  Q
    ||||||||||||||||        |||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  22284001 tttattcttttcaaagggaaaacatgaagtgcttggcaaaatgcttgagtcctgttgtttt-caagtttgaatttatctcattcaaaggtaacacaattg 22284099  T
Q  554 ttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctc 653  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| |||  ||||||| ||| ||    
T  22284100 ttgtggttgaaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgccaatcagcaggaccccaatattcgatcagcatc 22284199  T
Q  654 ttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgattt 753  Q
    ||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  22284200 ttgaacgccagtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccaccgttcaagatcctgatcgaatactggagtcctgctgctt 22284299  T
Q  754 agcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||    
T  22284300 agcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttgaaatgtaaatttcggaatgtaatgtaatg 22284377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 37 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 4724266 - 4723420
Alignment:
Q  37 ttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4724266 ttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 4724167  T
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagtt---agag 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   | |     
T  4724166 catgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccaaat 4724067  T
Q  234 taaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgt 333  Q
     || |  | || || |||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |  | || | || || |||   |    
T  4724066 gaatgcaccttgcagctacaacaattgtctt-cctct-gaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-caggactccaata-ttcgaccgacattctcat 4723971  T
Q  334 ttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatca 432  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| || |||||||| || |    
T  4723970 tgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggccagtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgacatttgaataccatta 4723871  T
Q  433 tctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccc 532  Q
    | |||  | | |||||||| |||||| |||||| || |         ||| || || ||  ||  | ||||| |  |  ||||||||||||||||||| |    
T  4723870 tttaatcccaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaacgccggtcg-tatattggagtcttactgcttggcaagtttgaatttactc 4723772  T
Q  533 cattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggca 629  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  | | |||    ||||||| ||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  4723771 cattcaaaggtaacacaattgttgtagttgcgaggtacaaacgtccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggca 4723672  T
Q  630 ggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctga 729  Q
    ||| ||||||||||||| ||| | |||||  ||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| || || || |    
T  4723671 ggaatccagcattcgatgagcattttgaatgatgatatttaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacgcttaaataccatcatttaaaatgctca 4723572  T
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaa 829  Q
    ||| ||  || |||| |||  ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  4723571 tcgcatgctgcagtcatgctgtttagaaagtttgaatttgccctattcaagggtaagataattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatgt-- 4723474  T
Q  830 tgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
       ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4723473 ---aatctaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 4723420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 137 - 565
Target Start/End: Original strand, 7082336 - 7082763
Alignment:
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaa 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  7082336 catgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttatggtaa 7082435  T
Q  237 ggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttt 336  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||  |  |||||||||||| || |  | ||||||||||    
T  7082436 ggtgcattccaactacaacaattctcttacctctgaaaaggggtaattcaaacttgccaaacggatagaactcaagcatttcgctcggcattcatgtttt 7082535  T
Q  337 tcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatcta 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  7082536 tcctttgaaaagattaaattcttgttaggctgatttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatcta 7082635  T
Q  437 aagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccatt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  ||| |||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||    
T  7082636 aagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgtcgggtgaaatgcttgagtcatgttgtatgacaagtttgaatttaccccatt 7082734  T
Q  537 caaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7082735 caaaggtaacacaatttttgtagttggaa 7082763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 92 - 886
Target Start/End: Original strand, 1694859 - 1695651
Alignment:
Q  92 attaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatc 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1694859 attaacgaacaacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgtttcactggaacgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatc 1694958  T
Q  192 atcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaa 288  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | | |  ||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||    
T  1694959 atcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctctgaattgggt-aattcaaa 1695056  T
Q  289 cttgtcaaacggccatgactcaagcatttt-gcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgct-ggtttagatgaaggtatt- 385  Q
    |||  |||||||| ||||| | |  || || |  |  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||     
T  1695057 ctttccaaacggc-atgacacca--atgttcgatcggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggtttggtttaaatgaaggtattg 1695153  T
Q  386 aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgc 485  Q
    ||||||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| || |         |||||     
T  1695154 aagtgtcaatgaatggacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaaccaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgt 1695253  T
Q  486 ggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgca 582  Q
     || ||||  | | ||||| || |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||    
T  1695254 cggtcgaac-gttcgagtcatgctgctatgcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgca 1695352  T
Q  583 acaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaa 682  Q
    ||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||  || |||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  1695353 acaattgtcttcctctaaattgggtaattcaaacttgttaaacggtaggaatccagcattcaacaagcatcttgaataatggtatccaagtgtcaaggaa 1695452  T
Q  683 tgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaaggg 782  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| |  ||    
T  1695453 tgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatgatggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagagg 1695552  T
Q  783 taagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttt 882  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||     ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1695553 taagaaaattgttgcagttggaaggtacattcgagagtgtaatgt-----aatataatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttt 1695647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 512 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 6793194 - 6792817
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| || || ||| |  |    
T  6793194 ttggtaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgagata 6793095  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6793094 attcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcgataagcatcttgaatactggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaa 6792995  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||   |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6792994 taccatcattcaagatgctgatcggatgttggagtcatgttgtttagcaaatttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaaggt 6792895  T
Q  809 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6792894 acattctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 6792817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 253 - 603
Target Start/End: Original strand, 3169766 - 3170114
Alignment:
Q  253 aacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagatta 352  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  3169766 aacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaagactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagatta 3169865  T
Q  353 aattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaa 452  Q
    ||||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||    
T  3169866 aattcttgttaggttgatttagatgaatgtattaagtgtcaatgaatgaacctta-tttgttggcacttgaatatcatcatctaaaacaagcgtagcaaa 3169964  T
Q  453 aatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaatt 552  Q
    ||||||||||||||||||        ||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3169965 aatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgtcgggtgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaatt 3170063  T
Q  553 gttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatg 603  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3170064 gttgtagttggaatgcacatttcaactgcaacaattgtcttactctggatg 3170114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 344 - 886
Target Start/End: Original strand, 35565592 - 35566137
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||||||| |||| |||| |||    
T  35565592 aaaagattaaattcttgttagaccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattcttttgacacttgaatactgtcatttaaaccaa 35565691  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaa--atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaa 540  Q
     |||||||| |||||| |||||| || |         |||||  |  ||||  |||   |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35565692 acctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgtcgatcgaacaatg---gagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaa 35565788  T
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactcca 637  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| | | |    ||||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  35565789 ggtaacacaattattgtagttggaaggtataaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatcca 35565888  T
Q  638 gcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatat 737  Q
     |||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || || |||  || |    
T  35565889 acattcgataagcattttgaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatttaaaatgctcatcacatgt 35565988  T
Q  738 tggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgt 837  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  35565989 tggagtcgtgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagaggtaagataattgttgcagttggaaggtacatttcataatgtaatgtaatgcaatgt 35566088  T
Q  838 aatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35566089 aatgtgataacatatatagttgaatatgcataacacatgttgttttgaa 35566137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 541850 - 541598
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  541850 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacggg 541751  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| ||| ||    
T  541750 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactggagatatcatcaacaacttgatttcgccag 541651  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttac 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  541650 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttac 541598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 293
Target Start/End: Original strand, 11027769 - 11028046
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11027769 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 11027868  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  11027869 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcgaaagtttgattccgccag 11027968  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgt 293  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||    
T  11027969 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaaccacaacaattgtcttacc-ct-ggatggggcaattcaaacttgt 11028046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 512 - 886
Target Start/End: Original strand, 20196567 - 20196942
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| | |||    || |||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  20196567 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacggtttttgtagttggaaggtacaaacgtctaactgcaacaattgtctttctctgaatggggta 20196666  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    ||||||| |||||||  |||| || ||||||||| ||| ||||||||||    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20196667 attcaaatttgttaaacggcatgaatccagcatttgatgagcctcttgattgctggtatttaagtgtcaaggaatgtacctcattcttttgacacttgaa 20196766  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||||||||||||||||  || ||| || ||||||| ||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20196767 taccatcattcaagatgttggtcggatgttggagtactgctgcttagcaagtttgaatttccc-cattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggt 20196865  T
Q  809 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20196866 acattccgaaatgtaatgtaatgcaatgtaatatgatatcatatatagttgaatatgc-taatacatttttttttgaa 20196942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 563 - 831
Target Start/End: Original strand, 7082815 - 7083083
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || | | || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||    
T  7082815 gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaacgtggtaattcaaacttgttaaacggcaggactccagcattcgatgagcatcttgaatgat 7082914  T
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagttt 762  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7082915 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattctttagacacttgaataccgtcatttaaaatgctcatcgaatattggagtcctgcagtttagcaagttt 7083014  T
Q  763 gaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7083015 gaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaaggtacatttcggaatgtaatgtaatg 7083083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 512 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 34683644 - 34683271
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaattta-ccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc---caactgcaacaattgtcttactctggatggggc 607  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||  |   ||||||||||||||||||| || || ||||||     
T  34683644 ttggcaagtttgaatttatccccattcaaaggtaacacaattggtgtagttgggaggtacaaacgttcaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggt 34683545  T
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttga 707  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |||| |||| ||| | | ||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  34683544 aattcaaacttgttaaacggcagaaatccaacatttgatgatcatctagaataatggtatccaagtgtcaaggaatgcacttcattcttttgacacttga 34683445  T
Q  708 ataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaagg 807  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||  |||||| ||||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  34683444 ataccatcattcaagatgttcatcgcatgctggagtgctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagagtaagataattgttgcagttggaagg 34683345  T
Q  808 tacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||| |||||| |||||     |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34683344 tacattcgggaatgaaatgt-----aatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 34683271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 570 - 854
Target Start/End: Original strand, 11027996 - 11028282
Alignment:
Q  570 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  11027996 cattccaaccacaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagtattcgatgagcatcttggacaatggtattc 11028095  T
Q  670 aagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatttt 769  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||     
T  11028096 aagtgtcaaagaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttg 11028195  T
Q  770 cctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||| | ||| | |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11028196 ccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggaaaatttcagaatctaatgtgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 11028282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 573 - 878
Target Start/End: Original strand, 25498635 - 25498940
Alignment:
Q  573 tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaag 672  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| ||| |||||||  |||||||| |||    
T  25498635 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcgatgagcatcttgaatgatggtattgaag 25498734  T
Q  673 tgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcct 772  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || || || |||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||| ||     
T  25498735 tgtcaaggaatgcacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaaaatgctcatcggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccc 25498834  T
Q  773 cattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataata 872  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25498835 cattcaggggtaagataattgttgcagttggaaggtacattctaaaatgtaatgtcatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatggataata 25498934  T
Q  873 catttt 878  Q
    ||||||    
T  25498935 catttt 25498940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 344 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 36350211 - 36349679
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||| |||    
T  36350211 aaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattcttttgacacttgaataccatcatttaaaccaa 36350112  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaa-atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
     |||||||| |||||| |||||| || |         |||||  || |||| ||  | ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36350111 acctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgtcggtcgaacat--tggagtcatgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 36350014  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccag 638  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||| |||||| | || ||||  |||||| ||||||||||||||||  || |||| |||||    
T  36350013 gtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgctacaattat-ttcctctaaatggggtaattcaaacttgttaaacggtaggaatccag 36349915  T
Q  639 cattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca---tcattcaagatcctgatcgaat 735  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| || |||| ||    
T  36349914 cattcaataagcatcttgaataatggtatccaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgatacttgaataccatcatcattcaagatgctcatcgcat 36349815  T
Q  736 attggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaat 835  Q
      |||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||             
T  36349814 gctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagatgattgttgtagttggaaggtacatttgggaatgtaatg--------- 36349724  T
Q  836 gtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
          ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36349723 ------tgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 36349679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 40009520 - 40009746
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40009520 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 40009619  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||    
T  40009620 acgagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagacatcatcaacagcttgattccacaag 40009719  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtg 240  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40009720 aagatcgtcattagttagggtaaggtg 40009746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 35565264 - 35565476
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  35565264 agacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaa-cgtg 35565362  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  35565363 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcagaagtttgattccgccag 35565462  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  35565463 aagatcgtcattag 35565476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 33370646 - 33370851
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370646 agacacaaggagggtggaatacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 33370745  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  33370746 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccag 33370845  T
Q  214 aagatc 219  Q
    ||||||    
T  33370846 aagatc 33370851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 563 - 831
Target Start/End: Original strand, 1171730 - 1171998
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  ||    
T  1171730 gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcagaactccagcattcgatgagcatcttgaatgat 1171829  T
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagttt 762  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || || |||||||  ||||||| |||  |||| |||||||    
T  1171830 ggtattcaagtgtcaaggaatgtacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaaatgctcatcgaatcctggagtcatgcagtttaacaagttt 1171929  T
Q  763 gaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1171930 gaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcggttggaaggtacattccagaatgtaatgtaatg 1171998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36350520 - 36350316
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36350520 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtg 36350421  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||         ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  36350420 acgagcat---------gcacaacatgttccagtggatcgatatgtaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccag 36350330  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  36350329 aagatcgtcattag 36350316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6793601 - 6793388
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||| || || || ||||||||||||| | ||||||| || ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6793601 agacacaaggaggatggaacacattcggtataaacgcctaacgctcgacgaggagtgagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 6793502  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  6793501 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtgaatcgatatgcggatgaggttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattcagccag 6793402  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  6793401 aagatcgtcattag 6793388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 185
Target Start/End: Original strand, 3169596 - 3169766
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3169596 agacataaagagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 3169694  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaa 185  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3169695 acgagcatattttaagagcacaacatgttccagtggatcggtatgcgggtgacgttgctgagatcagctgaa 3169766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35927652 - 35927470
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35927652 agacacaattagggtgtaacacgttcgttataaacgtccaatgctcgacgagggaagagtatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 35927553  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaa 196  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35927552 acgaacatgttttgggagcacatcatctttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaa 35927470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17366950 - 17366735
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||| |  |||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17366950 agacacaaggagggtggaata-gttcgatataaacgtccaaccctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 17366852  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| || ||    
T  17366851 acaaacatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtaccgttgttgagatcaactaaagatattatcaagagtctgattctgccag 17366752  T
Q  214 aagatcgtcattagtta 230  Q
    || ||||| ||||||||    
T  17366751 aatatcgtgattagtta 17366735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 344 - 644
Target Start/End: Original strand, 33370950 - 33371250
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaa-gtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| | ||| ||||||||||  ||||| |||| |||    
T  33370950 aaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattaaagtgtcaaagaatgcacctcattcttttgacacttgaatatcatcatttaaaccaa 33371049  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
    | ||||||| |||||| |||||| || |          | | | | | ||| ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33371050 ggctaacaataatttaatcttttgaatgaaacaataaaacttccgagtgaa-tgcttgagagctgttgtttgacaagtttgaatttacctcattcaaagg 33371148  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcatt 642  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| || |  ||  || ||||||||||||||||  |||| ||||| | ||||    
T  33371149 taagataattgttgtagttggaatgcacctttcaactacaacaattgtcttcctttaaattaggtaattcaaacttgttaaacggcacgactcaaacatt 33371248  T
Q  643 cg 644  Q
    ||    
T  33371249 cg 33371250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 2599211 - 2599387
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || | | |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||   || ||    
T  2599211 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacattcgacgatgagagaatatcattcagttgggtggaattagcgaacaacggcgacatg 2599310  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatat 190  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | || ||||||||||||| |||||| |||||    
T  2599311 aagagcatgttttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagattaactgatgatat 2599387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 538 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 41202524 - 41202413
Alignment:
Q  538 aaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactcca 637  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41202524 aaaggtaagataattgttgtagttggaatgcatattccaactgcaacaattgttttattttggatagggtaattcaaacttgttaatcggcaggactcca 41202425  T
Q  638 gcattcgataag 649  Q
     |||||||||||    
T  41202424 acattcgataag 41202413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 1971913 - 1971581
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||| |  | |||||||||||    
T  1971913 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-aggactcaagcattttgcaccgcattcatgttttt 1971815  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| | |||| ||||| ||| | ||||| | ||| ||  ||||||||| |||||  |||||    
T  1971814 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttggcactt-aataccttcatc 1971717  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttatttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||        |||| || |||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||||    
T  1971716 taaa-ccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaaagctgggcgaaatgcttgagtcatggccatttggcaagtttgaa-ttacccc 1971619  T
Q  534 a-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1971618 atttcagaggcaagacaattgttgtagttggaatgcac 1971581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 305 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 11347188 - 11346925
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tga 401  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||    
T  11347188 gactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagattaaatttttgttaggcgtgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatga 11347090  T
Q  402 agctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttga 501  Q
     | |||||   ||| ||||| |||||  ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||| ||    
T  11347089 ggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatctaaacca-gcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcga 11346993  T
Q  502 gtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11346992 gtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 11346925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 127
Target Start/End: Original strand, 3458828 - 3458941
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  3458828 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggttgagttaaagaacgacgaaaacgtg 3458927  T
Q  114 acgagcatgttttg 127  Q
    ||||| ||||||||    
T  3458928 acgagtatgttttg 3458941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 235 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 3601892 - 3601557
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtt 334  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||| ||| |||||    ||||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  3601892 aaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaatttgccaaacaat-atgactcaagcattttgccccgcattcatgtt 3601794  T
Q  335 tttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatc 431  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  ||    
T  3601793 tttcctttgaaaagaataaatttttattaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttc 3601696  T
Q  432 atctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt-atttggcaagtttgaatttac 530  Q
    ||||||| || || || ||| |||||| |||||||||||        |||| || |||||||||| ||||||| ||   |||||||||||||||||| ||    
T  3601695 atctaaacca-gcatagcaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgtttgagtcatggccatttggcaagtttgaatt-ac 3601598  T
Q  531 cccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3601597 cccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 3601557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 570 - 640
Target Start/End: Complemental strand, 541623 - 541553
Alignment:
Q  570 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagca 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  541623 cattccaactgcaacaattgtcttactatggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagca 541553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 344 - 465
Target Start/End: Original strand, 12743007 - 12743129
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||| |||    
T  12743007 aaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacgtcattcttttgacacttgaataccatcatttaaaccaa 12743106  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    | ||||||| |||||| ||||||    
T  12743107 gtctaacaagaatttaatctttt 12743129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 344 - 465
Target Start/End: Original strand, 12805825 - 12805947
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||| |||    
T  12805825 aaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacgtcattcttttgacacttgaataccatcatttaaaccaa 12805924  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    | ||||||| |||||| ||||||    
T  12805925 gtctaacaagaatttaatctttt 12805947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 19400911 - 19400579
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||   ||  |||||||||||| |||||  | | ||||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  19400911 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacttgccaaacaacaa-gactcaagcatttcgcccctcattcatgttttt 19400813  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| | |||| || || ||||||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  |||||    
T  19400812 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaaatgccaaggaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatc 19400715  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| || || |||||| |||||| | |||||||||        ||||||  |||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||| |||||    
T  19400714 taaacca-gcataacaagaatttaatattttcaaaggaaaatcatgaatgttgggcgaaatgcttgagtcatggtcgtttggcaaatttgaatt-acccc 19400617  T
Q  534 att-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19400616 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 19400579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 8538433 - 8538170
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tga 401  Q
    |||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |  || ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||    
T  8538433 gactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggtgtgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatga 8538335  T
Q  402 agctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttga 501  Q
     | ||||||  ||| ||||| |||||  ||||||||| ||| || ||||| |||||| | |||||||||        ||||||| | |||||||||| ||    
T  8538334 ggttcatttc-ttgacactt-aataccttcatctaaaccaaccc-aacaagaatttaatattttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcga 8538238  T
Q  502 gtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8538237 gtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 8538170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 572 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 11028231 - 11027998
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11028231 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgataagcatcttgaacgatggtattc 11028132  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    ||||||| || |||||     |||||| ||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||| ||    
T  11028131 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattct-ttgacacttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccaattaacaagtttgaa-tt 11028034  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
     || || || ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11028033 gcccca-tccagggtaagacaattgttgtggttggaa 11027998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 30710077 - 30709814
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tga 401  Q
    |||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||    
T  30710077 gactcaagcatttcacccggcattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcgtgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatga 30709979  T
Q  402 agctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttga 501  Q
     | |||||   ||| ||||| |||||  ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||| ||    
T  30709978 ggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatctaaatca-gcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaaaatgaatgccgagcgaaatgctcga 30709882  T
Q  502 gtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30709881 gtcctgttgtttggcaggtttgaattgatctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 30709814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 350 - 464
Target Start/End: Original strand, 12806168 - 12806282
Alignment:
Q  350 ttaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaa 448  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| || || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  12806168 ttaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattctg-tgacacttgaataccatcatttaaaccaagcctaa 12806266  T
Q  449 caaaaatttattcttt 464  Q
    ||| |||||| |||||    
T  12806267 caagaatttaatcttt 12806282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 338 - 563
Target Start/End: Original strand, 10398105 - 10398330
Alignment:
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatcta 436  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| ||||||||| | || || ||    
T  10398105 cctttcaaaagattaaattcttgttagattggtttagatgaaggtattgaagtgtcaatgaatgcacctcattcttttgacacttgaatgccattattta 10398204  T
Q  437 aagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccatt 536  Q
    || |||||||||||| |||||| | |||| || |          ||||  ||| | ||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  10398205 aaccaagcctaacaagaatttaatgttttgaatggaacaatagaaatgtcgggtg-aatgcttgagagatgttgtttagcaagtttgaatttaccccatt 10398303  T
Q  537 caaaggtaagacaattgttgtagttgg 563  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||    
T  10398304 caggggtaagacaattgttgtagttgg 10398330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 627 - 815
Target Start/End: Original strand, 19036157 - 19036343
Alignment:
Q  627 gcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatc 725  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
T  19036157 gcaggacaccagcattcgatcagcatcttgaacgctggtattcaagtgtcaacagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattattcaagatg 19036255  T
Q  726 ctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    || |||||||| ||||||||||| | || ||||||||||| || || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  19036256 ctcatcgaatactggagtcctgcaaattggcaagtttgaa-ttgcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 19036343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 561 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 1171983 - 1171730
Alignment:
Q  561 tggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaa 658  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||| ||| | || ||    
T  1171983 tggaatgtaccttccaaccgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgttaaactgcatgactccaggattcgatgagcattttaaa 1171884  T
Q  659 caatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagca 757  Q
      | ||||||||||||||||  |||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| ||||  |||| ||    
T  1171883 tgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattc-cttgacacttgaataccatcattcaagatgctcatcgaatgctggagttctgccgtttaaca 1171785  T
Q  758 agtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattc 814  Q
    |||||||| || || ||||||| || |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  1171784 agtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgcagttggaaggtgcattc 1171730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 17366625 - 17366398
Alignment:
Q  336 ttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| | | | ||||||||||| || ||     
T  17366625 ttcctttcaaaagattaaattcttgttaagctggtttagatgaaggtattgaattgtcaaggaatgcacctcattctttagacacttgaataccattatt 17366526  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca 534  Q
    |||| ||| |||| ||| |||||| | |||| || |          ||||  ||| | ||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||| ||    
T  17366525 taaaccaaacctagcaagaatttaatgttttgaatggaacaatagaaatgtcgggtg-aatgcttgagagctgatgtttagcaagtttgaatttacctca 17366427  T
Q  535 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 563  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17366426 ttcagaggtaagataattgttgtagttgg 17366398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 243 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 7082763 - 7082437
Alignment:
Q  243 ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttccttt 342  Q
    |||||||||||| ||| || |||||| | ||  |||  ||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||  ||| || |||||||||| |||||    
T  7082763 ttccaactacaaaaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgtcatacaac-atgactcaagcatttcacccgacattcatgtttt-ccttt 7082666  T
Q  343 gaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaag 439  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  |||||||||     
T  7082665 gaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatctaaat 7082568  T
Q  440 caagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccattca 538  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | ||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||  |||  ||||    
T  7082567 ca-gcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagttctatccgtttggcaagtttgaattaccccttttca 7082469  T
Q  539 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7082468 gaggtaagagaattgttgtagttggaatgcac 7082437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 100
Target Start/End: Original strand, 1693381 - 1693459
Alignment:
Q  22 agagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaa 100  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1693381 agagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcactcacttgggtggaattaacgaa 1693459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 38854938 - 38854694
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  38854938 ttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaacgctggtattc 38854839  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    ||||||| || |||||     ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||  || |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  38854838 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagtgttcgagaggcttatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-tt 38854741  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || ||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  38854740 gccccatccaagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 38854694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 572 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 7083057 - 7082815
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||| |||   |||||||||||  ||||||| ||| | || ||  | |||||||    
T  7083057 ttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaactgcaggactccaatattcgatgagcattttaaatgacggtattc 7082958  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    ||||||| || |||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||     
T  7082957 aagtgtctaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccatcattcaagatgctcatcgaatgctggagtcctgccgtttaacaagtttgaatta 7082859  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattc 814  Q
     || | ||||| || |||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  7082858 -ccacgttcaaagg-aagacaattgttgcagttggaaggtgcattc 7082815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22283866 - 22283787
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22283866 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 22283787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 27661289 - 27661368
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27661289 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 27661368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 40012164 - 40011833
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||||| |||||  | | ||||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  40012164 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-aggactcaagcatttcgcccg-cattcatgttttt 40012067  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| || || |||| | || |||||| ||||| ||| | ||||| | ||||| | ||| ||||| |||||  |||||    
T  40012066 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttatacgatggtattcaagtgccaacgaaatgatgttcattct-ttgacactt-aataccttcatc 40011969  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttatttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||        |||| |  |||||||||||||||||  | |   |||| |||||||||| |||||||    
T  40011968 taaa-ccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgttgggcgaaatgcttgagttatggccgtttgacaagtttgaa-ttacccc 40011871  T
Q  534 a-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40011870 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 40011833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Original strand, 12742707 - 12742799
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacga 106  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12742707 agacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacga 12742799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 30710378 - 30710135
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||  ||   ||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  30710378 ttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgccaagcagcatgacaccagtattcgattagcatcttgaacgctggtattc 30710279  T
Q  670 aagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    |||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  30710278 aagtgtcaacagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgttcaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattagcaagtttgaa-tt 30710181  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  30710180 gcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 30710135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 1972147 - 1971951
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggc-aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattca 670  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||  |||||||| |    
T  1972147 ttccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacatccgatcagcatcttgaatgatggtattta 1972048  T
Q  671 agtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    | |||| || |||||     ||||| |||||||||| |||||||  ||||||||  || ||||||| |||||||||| |   ||| ||||||||||||    
T  1972047 actgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttcaataccaatattcaagaggcttatcgaatgttggagtcctcccgattaacaagtttgaatt 1971951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 3170081 - 3169766
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||    
T  3170081 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaac-aacatgactcaagcatttcacccgacattcatg-tttt 3169984  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatct 435  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || || || ||||||||| | |||| ||||| |||  ||| | | ||| ||  ||| ||||| |||||  ||||||    
T  3169983 cctttgaaaagaataaatttttgctacgcttgttttagatgatgatattcaagtgccaacaaataaggttca-ttcattgacactt-aatacattcatct 3169886  T
Q  436 aaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttatttggcaagtttgaatttacccca 534  Q
    ||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| ||||||||    
T  3169885 aaatcaa-cctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcttggccgtttggcaagtttgaa-ttacccca 3169788  T
Q  535 -ttcaaaggtaagacaattgtt 555  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  3169787 tttcagaggtaagacaattgtt 3169766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 8576053 - 8576132
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8576053 gcgaaatgctcgagtcttgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 8576132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 111
Target Start/End: Original strand, 12805525 - 12805622
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacg 111  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | | || | ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  12805525 agacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaatgatgagataatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacg 12805622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 28881286 - 28881207
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28881286 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaaga-aagacaattgttgtagttggaatgcac 28881207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 608 - 767
Target Start/End: Original strand, 8575605 - 8575764
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||    
T  8575605 aattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaacgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttg 8575703  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  8575704 aataccattgttcaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 8575764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 563 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 25498876 - 25498635
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||| | || |||||| || |||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| ||| | || ||      
T  25498876 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcatccgatgagcattttaaatg 25498777  T
Q  661 atggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaag 759  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||  |||| ||||    
T  25498776 atggtattcaaatgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttcaataccatcattcaagatgctcatcgaatgttggattcctgccgtttaacaag 25498678  T
Q  760 tttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    |||||| || || ||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  25498677 tttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgcagttgga 25498635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 38854500 - 38854373
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| | | |||||||||    
T  38854500 agcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcatgttgtttggcaggtttgaattgatctcattcaaag 38854401  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  38854400 g-aagacaattgttgtggttggaatgcac 38854373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 563 - 767
Target Start/End: Original strand, 1399718 - 1399924
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||| | || |||||| || |||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||      
T  1399718 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactctagcatgcgatgagcatcttgaatg 1399817  T
Q  661 atggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaag 759  Q
    ||| ||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||  ||||||  |||| ||||    
T  1399818 atgatattcaagtgtcaaaagaatgtggtgcattc-cttgacacttgaataccatcattcaaaatgctcatcgaatgttggcttcctgccgtttaacaag 1399916  T
Q  760 tttgaatt 767  Q
    ||||||||    
T  1399917 tttgaatt 1399924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 751 - 830
Target Start/End: Complemental strand, 17366450 - 17366371
Alignment:
Q  751 tttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaat 830  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||    
T  17366450 tttagcaagtttgaatttacctcattcagaggtaagataattgttgtagttggtagatgcatttctgaatgtaatgtaat 17366371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 572 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 35566056 - 35565824
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttac-tctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||| |||   ||| ||||||| |||  ||| ||| | || ||  |||||||||    
T  35566056 ttccaactgcaacaattatcttacctctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcacgactccaacatgtgatgagcattttaaatgatggtattc 35565957  T
Q  670 aagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    |||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||| ||    
T  35565956 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccatcattcaaaatgcttatcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaa-tt 35565859  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
     |||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  35565858 acctcattcaaagg-aagacaattgttgcagttgga 35565824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 492 - 562
Target Start/End: Original strand, 1171616 - 1171685
Alignment:
Q  492 aaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttg 562  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  1171616 aaatgcttgagtcctgttgtttggccagtttgaatttaccccattcagaggtaaca-aattgttgtagttg 1171685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Original strand, 27660803 - 27661046
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  27660803 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaacgctggtattc 27660902  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  || |||||  | |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  27660903 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgttgaagatgttcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-tt 27661000  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  27661001 gcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 27661046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 336 - 465
Target Start/End: Original strand, 33371267 - 33371397
Alignment:
Q  336 ttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| ||||||||||| || ||     
T  33371267 ttcctttcaaaagattaaattcatgttaggccagtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatgcaactcattattttgacacttgaataccattatt 33371366  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    |||| |||||||||||  |||||| ||||||    
T  33371367 taaaccaagcctaacatgaatttaatctttt 33371397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 7141 - 7220
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7141 gcgaaatgctcgagtcatgttgtttgacaaatttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 7220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 3459275 - 3459006
Alignment:
Q  302 catgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa- 398  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| |||     
T  3459275 catgactcaagcatttcgccccgcgttcatgttttttctttgaaaataataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaa 3459176  T
Q  399 tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgct 498  Q
    ||| | |||||   ||| ||||| |||||  ||||||||| || || |||||| |||||| |||||||||||        |||| || ||||  ||| ||    
T  3459175 tgaggttcattca-ttgacactt-aataccttcatctaaacca-gcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaatatgaacgctgggcttaatact 3459079  T
Q  499 tgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||| || |  ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3459078 tgagtcatggtcgtttggcaagtttgaatt-acctcatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 3459006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 350 - 446
Target Start/End: Original strand, 12743349 - 12743445
Alignment:
Q  350 ttaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcct 446  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| || || ||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  12743349 ttaaattcttgttaggctggtttagatggaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattctg-tgacacttgaataccatcatttaaaccaagcct 12743445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 19036586 - 19036665
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  19036586 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcac 19036665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 569 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 22284354 - 22284154
Alignment:
Q  569 acattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggta 666  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||  |||||    
T  22284354 acatttcaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgatcaggatcttgaacggtggta 22284255  T
Q  667 ttcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaa 765  Q
    |||||||||| || |||||     ||||| ||||||||||||||||   | |||||||| ||||||||||||||| |||||||   || |||||||||||    
T  22284254 ttcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaatactggcgttcaagatgctgatcgaatattggggtcctgctgattggcaagtttgaa 22284156  T
Q  766 tt 767  Q
    ||    
T  22284155 tt 22284154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 751 - 840
Target Start/End: Original strand, 33371442 - 33371531
Alignment:
Q  751 tttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaat 840  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||| ||||    
T  33371442 tttagcaagcttgaatttacctcattcagaggtaaaataattgttgtagttggaaggtaaattcccgattgtaatgtgatgtaatataat 33371531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 562 - 723
Target Start/End: Complemental strand, 18309054 - 18308891
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||| |||||||||| ||| | | ||||||||| ||| |||| ||| |||||||     
T  18309054 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatgaggcaaattcaaacttgctaagtagtaggactccaacatccgatcagcatcttgaat 18308955  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaaga 723  Q
     |||||||||||||||| || |||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18308954 tatggtattcaagtgtcaaaagaatgagatgcattc-cttgacacttgaataccatcattcaaga 18308891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 266
Target Start/End: Original strand, 18920835 - 18920977
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatg-ttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgt 221  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18920835 ttttggcagcacaacatggttccgatg-atcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgt 18920933  T
Q  222 cattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttac 266  Q
     ||||| ||| | || |  | |||||||||||||||| |||||||    
T  18920934 gattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttac 18920977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 751 - 830
Target Start/End: Original strand, 10398278 - 10398357
Alignment:
Q  751 tttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaat 830  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||    
T  10398278 tttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagacaattgttgtagttggtagatgcatttccgaatgtaatgtaat 10398357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Original strand, 12742818 - 12742877
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  12742818 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattccgccagaagatcgtgattag 12742877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 516 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 40012213 - 40012136
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  40012213 caagtttgaattg-ccccatccaaag-taagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 40012136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 696 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 40012273 - 40012156
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgtt 795  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| || || ||| |||  |||||| |||||||    
T  40012273 cttgacacttgaataccagcattcaagaggcttatcgaatgttggagtcctgccaattaacaagtttgaa-ttgccccatccaa-agtaagacaattgtt 40012176  T
Q  796 gtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||| || ||||||    
T  40012175 gtagttggaatgtgcattcc 40012156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 28881771 - 28881528
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||  ||   ||||||| |||| ||||||| ||| |||| |||  ||||||||    
T  28881771 ttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgccaagcagcaggacaccagtattcgattagcatcttaaaccttggtattc 28881672  T
Q  670 aagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    |||||||||  |||||     ||||| |||||||||| ||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||    
T  28881671 aagtgtcaacagaatgaggtgcattc-cttgacacttcaataccattgttcaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattggcaagtttgaa-tt 28881574  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  28881573 gcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 28881528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 19400936 - 19400883
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  19400936 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 19400883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 756 - 805
Target Start/End: Original strand, 33371122 - 33371171
Alignment:
Q  756 caagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33371122 caagtttgaatttacctcattcaaaggtaagataattgttgtagttggaa 33371171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 563 - 804
Target Start/End: Original strand, 6792889 - 6793130
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||| ||| |||    || ||||||| ||| |||| ||| |||||||      
T  6792889 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaatttgctaaacaacatgactccaacatccgatcagcatcttgaatg 6792988  T
Q  661 atggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaag 759  Q
    ||||||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| || |||||||  |||| ||||||  |||| ||||    
T  6792989 atggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttcaataccagtattcaagatgcttatcgaatgctggattcctgccgtttaacaag 6793087  T
Q  760 tttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    |||||||| | ||||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  6793088 tttgaattat-ctcattcaaagg-aagacaattgttgcagttgga 6793130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 165 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17195423 - 17195321
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgca--ttccaactacaacaatcgtc 262  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| | |   ||||  |||||||||||||||| |||    
T  17195423 acgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtagggaa---tgcatcttccaactacaacaattgtc 17195327  T
Q  263 ttacct 268  Q
    ||||||    
T  17195326 ttacct 17195321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 755 - 815
Target Start/End: Original strand, 19400856 - 19400916
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  19400856 gcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 19400916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 574
Target Start/End: Original strand, 25498796 - 25498876
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc 574  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||    
T  25498796 atgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagttggaaggtacattc 25498876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 516 - 595
Target Start/End: Original strand, 6841 - 6918
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6841 caagtttgaattg-ccccatccaaag-taagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactgcaacaattgtgttac 6918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 561 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 3602139 - 3602020
Alignment:
Q  561 tggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaa 658  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| |||||| || || |||||||| |||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  3602139 tggaatgtaccttccaactacaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaaattgttaaatagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaa 3602040  T
Q  659 caatggtattcaagtgtcaa 678  Q
      ||| ||||||| ||||||    
T  3602039 tgatgatattcaaatgtcaa 3602020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 714
Target Start/End: Original strand, 10398147 - 10398198
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccat 714  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  10398147 ggtattgaagtgtcaatgaatgcacctcattcttttgacacttgaatgccat 10398198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 12743043 - 12743098
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12743043 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacgtcattcttttgacacttgaataccatcatt 12743098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 12805861 - 12805916
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12805861 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacgtcattcttttgacacttgaataccatcatt 12805916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 33370986 - 33371041
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  33370986 ggtattaaagtgtcaaagaatgcacctcattcttttgacacttgaatatcatcatt 33371041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 563 - 767
Target Start/End: Original strand, 34683338 - 34683544
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||| |||   |||| |||||||||| |||| | | |||||||      
T  34683338 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttactcttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcagcactccagcatgcgatgaacatcttgaatg 34683437  T
Q  661 atggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaag 759  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |   ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  | ||| ||| ||||| | ||||  |||| ||||    
T  34683438 atggtattcaagtgtcaaaagaatgaagtgcattc-cttgacacttggataccattattctagatgatcatcaaatgttggatttctgccgtttaacaag 34683536  T
Q  760 tttgaatt 767  Q
    ||||||||    
T  34683537 tttgaatt 34683544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 516 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 38854752 - 38854674
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  38854752 caagtttgaattg-ccccatccaagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccgcaacaattgtgttac 38854674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 854
Target Start/End: Original strand, 8538627 - 8538724
Alignment:
Q  752 ttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacata 851  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||| ||| | |     |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8538627 ttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagtttgaaggtaaatttcag-----aatgtaatgcaatgtaatgtgataacata 8538721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 563 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 1695584 - 1695467
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac-tctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| || |||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||      
T  1695584 gaatgtaccttccaactgcaacaattttcttacctctaaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccatcatgcgatgagcatcttgaatg 1695485  T
Q  661 atggtattcaagtgtcaa 678  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1695484 atggtattcaagtgtcaa 1695467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 546 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 1971934 - 1971885
Alignment:
Q  546 gacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  1971934 gacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 1971885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 3459363 - 3459310
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  3459363 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattctaactacaacaattgtcttac 3459310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 8538524 - 8538471
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  8538524 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtcttac 8538471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 493 - 561
Target Start/End: Original strand, 12805974 - 12806043
Alignment:
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagtt 561  Q
    ||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12805974 aatgcttgagagctgttgtttagcaagtttgaatttaccacatttcagaggtaagacaattgttgtagtt 12806043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 493 - 561
Target Start/End: Original strand, 12806310 - 12806379
Alignment:
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagtt 561  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12806310 aatgcttgagagctgctatttagcaagtttgaattcaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagtt 12806379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 13131142 - 13131038
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtctt 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| | |||||||  || |||||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||||| |||||    
T  13131142 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacattttgattttgctagaagatcgtgattagctagag-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt 13131044  T
Q  265 acctct 270  Q
    ||||||    
T  13131043 acctct 13131038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 767
Target Start/End: Original strand, 6693 - 6852
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||| | | | ||||||  |||||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||    
T  6693 aattcaaacttgttaagcagcaggaccccagtattcgatcaacattttgaacgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttg 6791  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  6792 aataccattgttcaagatgctcatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 6852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 787 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 6428277 - 6428233
Alignment:
Q  787 ataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6428277 ataattgttgcagttggaagatacattccggaatgtaatgtaatg 6428233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 19401020 - 19400903
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcc-tgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgt 794  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||||||| || || || || || |||||| ||||||    
T  19401020 cttgacacttgaataccatcgttcaagatgcttatcgaatgttggagtcctttcga-ttaacaagtttgaa-ttgcccca-tccagagtaagacaattgt 19400924  T
Q  795 tgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    ||||||||||| || ||||||    
T  19400923 tgtagttggaatgtgcattcc 19400903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 34683418 - 34683338
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc 574  Q
    ||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| | ||||||    
T  34683418 atgctggagtgctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagagtaagataattgttgcagttggaaggtacattc 34683338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 755 - 815
Target Start/End: Original strand, 40012109 - 40012169
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  40012109 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 40012169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 65
Target Start/End: Original strand, 7082284 - 7082335
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaag 65  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7082284 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaag 7082335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 12743379 - 12743433
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12743379 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattct-gtgacacttgaataccatcatt 12743433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 168 - 227
Target Start/End: Original strand, 12805636 - 12805695
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  || |||||||||| |||||    
T  12805636 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtctgattatgccagaagatcgtgattag 12805695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 12806198 - 12806252
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12806198 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattct-gtgacacttgaataccatcatt 12806252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 714
Target Start/End: Original strand, 33371311 - 33371362
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccat 714  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  33371311 ggtattgaagtgtcaatgaatgcaactcattattttgacacttgaataccat 33371362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 755 - 805
Target Start/End: Original strand, 3170026 - 3170076
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  3170026 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 3170076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 515 - 565
Target Start/End: Original strand, 7083007 - 7083057
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  7083007 gcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaa 7083057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 697 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 8538607 - 8538537
Alignment:
Q  697 ttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  8538607 ttgacacttgaataccagcgttcaagatgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 8538537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 18308536 - 18308484
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  18308536 tttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtaggtggaa 18308484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Original strand, 27661012 - 27661066
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27661012 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccgcaacaattgtgttac 27661066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 3170106 - 3170053
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  3170106 gtaagacaattgttgcagttgaaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 3170053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 3601914 - 3601861
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  3601914 gtaagacaattgttgcagttggaaggtgcattccaactacaacaattgtcttac 3601861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 561
Target Start/End: Original strand, 12743489 - 12743558
Alignment:
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagtt 561  Q
    ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12743489 aatgcttgagagctgctatttagcaagtttgaattcacgccatttcagaggtaagacaattgttgtagtt 12743558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 734 - 811
Target Start/End: Original strand, 20196549 - 20196626
Alignment:
Q  734 atattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||||||| || ||||||| |||||||   || ||||||||||||||||||    
T  20196549 atattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacggtttttgtagttggaaggtaca 20196626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 20196872 - 20196755
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||   |||| |||||| ||| |||  | | |||||||      
T  20196872 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggaaattcaaacttgctaagcagcagtactccaacatccgaccaacatcttgaatg 20196773  T
Q  661 atggtattcaagtgtcaa 678  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20196772 atggtattcaagtgtcaa 20196755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 564
Target Start/End: Original strand, 25498499 - 25498547
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgga 564  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  25498499 gcaagtttgaatttacctcattcaaagg-aagacaattgttgcagttgga 25498547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 516 - 576
Target Start/End: Original strand, 1171923 - 1171983
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcca 576  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  1171923 caagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcggttggaaggtacattcca 1171983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 696 - 804
Target Start/End: Original strand, 4723622 - 4723728
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgtt 795  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| || || |||||||  |||| ||||||  |||| |||||||||| || || ||||||| || |||| |||||||    
T  4723622 cttgacacttaaatatcatcattcaaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgtt 4723719  T
Q  796 gtagttgga 804  Q
    |||||||||    
T  4723720 gtagttgga 4723728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 516 - 564
Target Start/End: Original strand, 4723682 - 4723728
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgga 564  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4723682 caagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttgga 4723728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 506 - 561
Target Start/End: Original strand, 12743169 - 12743225
Alignment:
Q  506 tgttatttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagtt 561  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12743169 tgttgtttagcaagtttgaatttaccacatttcagaggtaagacaattgttgtagtt 12743225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 123 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25360690 - 25360547
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgtt-gctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgt 221  Q
    |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||   || ||||| |||||||||  |||||||| |  |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  25360690 ttttggcagcacaacatgttctcgtggatcgatatgtttgtcacgtttgctgagatcgcctgaagatgttttcaacagtttgattccgtcagaagatcgt 25360591  T
Q  222 cattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttac 266  Q
     ||||| ||||| || |  | || ||||||||||||| |||||||    
T  25360590 gattaggtagag-aatgcacctttcaactacaacaattgtcttac 25360547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 355 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 6793351 - 6793240
Alignment:
Q  355 ttcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaa 453  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | || ||| | ||| || ||||||||| |||| |||| ||| ||||| || |    
T  6793351 ttcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatggaccttattcttttgacagttgaatactgtcatttaaaccaaacctaaaaaga 6793252  T
Q  454 atttattctttt 465  Q
    ||||| ||||||    
T  6793251 atttaatctttt 6793240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 756 - 811
Target Start/End: Original strand, 7082714 - 7082769
Alignment:
Q  756 caagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  7082714 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaatttttgtagttggaaggtaca 7082769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 623
Target Start/End: Original strand, 10398006 - 10398065
Alignment:
Q  564 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaa 623  Q
    ||||||| |||||||| ||  ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  10398006 aatgcaccttccaactacacaaattgtcttcctttggatggggtaattcaaacttgttaa 10398065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 663 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 17366581 - 17366530
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccat 714  Q
    |||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  17366581 ggtattgaattgtcaaggaatgcacctcattctttagacacttgaataccat 17366530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 595
Target Start/End: Original strand, 19036282 - 19036363
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  19036282 ttggcaagtttgaattg-ccccatccag-ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 19036363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 28881589 - 28881508
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  28881589 ttggcaagtttgaattg-ccccatccag-ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 28881508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 541 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 30710169 - 30710122
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaatt 588  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  30710169 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaatt 30710122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 1400233 - 1400285
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  1400233 tttggcaagtttgaatt-accccattaaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 1400285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Original strand, 12805717 - 12805779
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaattcaaacttgttaa 623  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |   |||||| ||||||||||||||||    
T  12805717 ggaatgcatcttccaactgcaacaattgtcttactacgaaatggggtaattcaaacttgttaa 12805779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 535 - 565
Target Start/End: Original strand, 17195316 - 17195346
Alignment:
Q  535 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17195316 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 17195346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 305 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 22284051 - 22283969
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacg-ttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    ||||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  22284051 gactcaagcattttgccaagcacttcatgttttccctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 22283969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 33371442 - 33371496
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  33371442 tttagcaagcttgaatttacctcattcagaggtaaaataattgttgtagttggaa 33371496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 734 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 34683662 - 34683584
Alignment:
Q  734 atattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt-tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||| |||||||    
T  34683662 atattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttatccccattcaaaggtaacacaattggtgtagttgggaggtaca 34683584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 516 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 1171786 - 1171739
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1171786 caagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgcagttggaa 1171739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 8575777 - 8575830
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  8575777 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 8575830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 577; Significance: 0; HSPs: 110)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 577; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 38034136 - 38033265
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38034136 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctctacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 38034037  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  38034036 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgccgg 38033937  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38033936 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaattgggtaattcaaacttgataaacggccatgactcaagc 38033837  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  38033836 atttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttattatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 38033737  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||        |||||||| | ||||||| |||||||||||| |||    
T  38033736 tggcacttgaatatcatcatttaaagtaagcctaac-aaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcgagacgaaatgtttgagtcctgttgttt 38033638  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38033637 ggtaagtttgaatttactacattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattca 38033538  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38033537 aacttgttaatcgaaaggactccaacattcgataagcatcttgaaaaatggtattaaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 38033438  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
    |||||||||||  |||||| || |||||||| ||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38033437 tcattcaagatgatgatcggatgttggagtcttgttgtttagcaagtttgaatttgcctccttcaagggtaagataattgttgcagttggaaggtacatt 38033338  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38033337 ctcgaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgacaacatatatggttgaatatgcataatatattttgttttgaa 38033265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 42169171 - 42168309
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||| | ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42169171 agacacgaggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcccttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgtg 42169072  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  42169071 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgcagagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccag 42168972  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42168971 aagatcgtcattagttaggataagatgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaagc 42168872  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||    
T  42168871 atttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtggcaatgaatgaacctcatttcgt 42168772  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42168771 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaccaaaaatttattattttcaaaggaaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttgttt 42168672  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    ||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42168671 ggcaagtttgactgtaccccattcgaaggtaggacaattgttgtagttggaatgcacatcccaactgcaacaattgtcttactctagatggggcaattca 42168572  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42168571 aacttgttaatcggcagaactccagcatttgataagcgtcttgaacgctgatattcaattgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 42168472  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
     | ||||| || ||||||||||| | ||||| |||   ||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42168471 gcgttcaaaatgctgatcgaatactagagtcttgctgcttagcaagtttgaatttgcctcattcggtggtaaaataattgttgcagttggaaggtacatt 42168372  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    | ||||||||||||||||          ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42168371 ctggaatgtaatgtaatg----------tgataacatatatggttgaatatgcataatacattttgttttgaa 42168309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 28706353 - 28705559
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  28706353 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgagtggagttaaagaacaacgaaaacgtg 28706254  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||    
T  28706253 acgagcatgttttgggagcacaacatgttttagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaccgcttgattccgccag 28706154  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  28706153 aagattgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacttgtgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaatgactcaagc 28706054  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  28706053 atttcgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattatttttatgctggtttagatgaaggtattaaatgtcaaggaatgaacctcatttcgt 28705954  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  28705953 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacacgaatgtggggcgaaatgcttgagtcctgttgttt 28705854  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28705853 gacaagtttgaattttccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaaagcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattca 28705754  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28705753 aacttgtaaatcggcaggactccaacattcgacaagcgtcttgaacgctgatattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 28705654  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
     | |||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28705653 gcgttcaagatgctgatcgaatattggagtcttgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcaagggcaagacaattgttgtagttggaaggt 28705559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 15032515 - 15031695
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15032515 acgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 15032416  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  15032415 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagttaggg 15032316  T
Q  234 taaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgt-tcatg 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| ||  | ||  |||||    
T  15032315 taaggtgcattccaactacaacatttgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcgagcatttcgca-agcgcctcatg 15032220  T
Q  333 tttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatca 432  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||| ||||    
T  15032219 tttctcctttgaaaatattaaattcttgttatgttggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcggtggcacttgaataccatca 15032120  T
Q  433 tctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacc 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| |||  || |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |    
T  15032119 tctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaagtgcttggtgaaatgcttgagtcgtgttgttttgcaggtttgaatttatc 15032020  T
Q  532 ccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcagg 631  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15032019 ccattcaaaggtaacacaattgttgcagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcagg 15031920  T
Q  632 actccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatc 731  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  15031919 actccagcattcaatgagcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaagatgctgatc 15031820  T
Q  732 gaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaa--tgtaa 829  Q
    ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| |||  |||||    
T  15031819 gaatactggggtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccacattcagtggtaagataattgttgcagctggaaggtaaatttcggaatctaatgtgtaa 15031720  T
Q  830 tgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15031719 tgctatgtaatgtgataacatatat 15031695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 475; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 808
Target Start/End: Original strand, 40415251 - 40416052
Alignment:
Q  5 cagcaccacagacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgac 104  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40415251 cagcaccagagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgac 40415350  T
Q  105 gaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttga 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  40415351 gaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttcccgtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaacttaagatatcatcaacagcttga 40415450  T
Q  205 ttccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccat 304  Q
    |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  40415451 ttccgtcagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcatttcaactacaacaattctcttacctatgaaatggggtaattcaaacttaccaaacggccat 40415550  T
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagc 404  Q
     ||| |||||||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  40415551 aacttaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttagactggtttagatgaaggtattaagtgtcaaagaatgaacc 40415650  T
Q  405 tcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtc 504  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||| | | |||||| ||||||     
T  40415651 tcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaagccttacaaaaatttattcttttcaaag-aaaaacatgaatgccgagtgaaatgtttgagtg 40415749  T
Q  505 ctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatgg 604  Q
     |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40415750 atgttgtttggcaggtttgaatttaccctattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaagtacaacaattgtcttactctggatgg 40415849  T
Q  605 ggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacact 704  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||   || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  40415850 ggcaattcaaacttgttaatcggcaggagtccaacattcgataagcatcttgaattctgatattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacact 40415949  T
Q  705 tgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||   |||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  40415950 tgaataccatcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcctgctgcttagcaagtttgaa-tttcccaattcaggggcaagacaattgttgtagttgga 40416048  T
Q  805 aggt 808  Q
    ||||    
T  40416049 aggt 40416052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 469; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Original strand, 24861346 - 24862161
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24861346 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtg 24861445  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||    
T  24861446 acgagcatgttttgggagcacaacatgttcaattggattgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattctgccag 24861545  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||| || |||||  | |||||||||||    
T  24861546 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccatctgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaac-atgactcaagc 24861644  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24861645 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 24861744  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  | ||||||||||||||||||||| |||    
T  24861745 tggcaattgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatggcgagcgaaatgcttgagtcctgttgttt 24861843  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    || | ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24861844 ggaaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattttcttactctggatggggcaattca 24861943  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24861944 aacttgttaatcggcaggactccaacattcgataatcgtcttgaacgctagtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 24862043  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
     | |||||||| |||||||||||  ||||| |||    ||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24862044 gcgttcaagatgctgatcgaatacaggagtactgttggttagcaagtttgaatttgcctcatttagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtacatt 24862143  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24862144 ccggaatgtaatgtaatg 24862161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 485469 - 484629
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  485469 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 485370  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  485369 acgaccatgttttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcggatgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 485270  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  485269 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtatt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagc 485173  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  485172 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 485073  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  485072 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 484973  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  484972 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattc 484873  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  484872 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgatgagcatcttggacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 484773  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||| ||    
T  484772 atcgttcaagatgcttatcgaatactggagttctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcaggggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaat 484673  T
Q  813 tccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  484672 ttcggaatgtaatgtaaaatgcaatgtaatgtgataacatatat 484629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 386; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 161 - 854
Target Start/End: Original strand, 22549232 - 22549922
Alignment:
Q  161 ggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcg 260  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |    
T  22549232 ggtgacgttgctgacatcaactgaagatatcatcaac---ttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgtattccaacttcaacaattg 22549328  T
Q  261 tcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttg 360  Q
    |||||||| | ||   |   ||||||||| || |||||  | | ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22549329 tcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaac-aggactcaagcatttcgctcagcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttg 22549427  T
Q  361 ttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttatt 460  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22549428 ttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttatt 22549527  T
Q  461 cttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagt 560  Q
    ||||||||||        ||||||| ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  22549528 cttttcaaaggaaaaca-tgaatgccgggtgaaatgtttgagtcctgctgtttggcaagtttgaattgaccccatttaaaggtaagacaattgttgcagt 22549626  T
Q  561 tggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||     
T  22549627 tggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagcattcgataagtgtcttgaacg 22549726  T
Q  661 atggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagt 760  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||| ||||||| ||    |||||||||    
T  22549727 ctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttgaagacgctgatcgaatactggagtcatgttggttagcaagt 22549826  T
Q  761 ttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    ||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22549827 ttgaactttccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtaaattccggaatgtaatgtgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 22549922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 741
Target Start/End: Original strand, 26452328 - 26453040
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26452328 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 26452427  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  26452428 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgctag 26452527  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||   |   ||||||||| || |||||   || ||||||| |    
T  26452528 aagatcgtcattagttagggtaaggtgtattccaactgcaacaattgtcatacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaac-aacaggactcaaac 26452626  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||    
T  26452627 atttcgctcgacatttatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctagtttagatgaaggtattaagtgtcaagaaatggacctcatttcgt 26452726  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    |||||||||||||||| |||| |||    
T  26452727 tggcacttgaatatcatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgtcaagcgaaatgcttgagtcatgttgttt 26452825  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    | || ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||             |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26452826 gacaggtttgaatttatctcattaaaaggtaagacaattgttgcagttggaa-------------tgcaacaactgtcttactctggatggggcaattca 26452912  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26452913 aacttgttaatcggcaggactccagcattcgataagcgtcttgaacgctgatattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 26453012  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattgga 741  Q
     | |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  26453013 gcgttcaagatgctgatagaatactgga 26453040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 557
Target Start/End: Original strand, 40414613 - 40415153
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40414613 agacacaaggaaggtggaacacgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 40414712  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||    
T  40414713 acgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccag 40414812  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40414813 aagatcgtcattag--agggtaaggtgcattccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaacttatcaaacggccaggactcaagc 40414910  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40414911 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 40415010  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  ||| |||||| |||||||||||| |||    
T  40415011 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgtcgggtgaaatgattgagtcctgttgttt 40415109  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgt 557  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40415110 ggcaggtttgaatttaccctattcaaaggtaagacaattgttgt 40415153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 498
Target Start/End: Original strand, 34614956 - 34615440
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34614956 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggaaagtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgtg 34615055  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  34615056 acgaacatgttttgggagcacaacatgatccagtggattgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccag 34615155  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34615156 aagatagtaattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctcttaaatggggtaattcaaacttgacaaacgaccatgactcaagc 34615255  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  34615256 atttcgcccaacgttcatgtttttcatttgaaaagattaaattcttgttatgctgatttagatgaaggtattaagtgtaaaggaatgaacctcatttcgt 34615355  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgct 498  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||    
T  34615356 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaagaaaaacatgaatgcggggcgaaatgct 34615440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 41857185 - 41856365
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41857185 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 41857086  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41857085 acgagcatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 41856986  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg--tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactc 309  Q
    |||||||||||||| ||  | || |  ||||  ||  | |||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||| |||||||| | | |||    
T  41856985 aagatcgtcattaggtac-gaaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacggc-aggtctc 41856890  T
Q  310 aagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt---aagtgtcaaggaatgaagctc 406  Q
     |  |||  | || || |||   || ||||| | ||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||   ||||||||| ||||| | |||    
T  41856889 caatattc-gaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattattgttaggctgatttaaatgaaggtattttgaagtgtcaacgaatggacctc 41856791  T
Q  407 attttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct 506  Q
    ||| | ||| || ||||||||  |||| |||  | | |||||||| |||||| |||||| || |         |||||| ||  | |||  | |||||||    
T  41856790 attcttttgacatttgaataccgtcatttaatcccaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggttg-aatattagagtcct 41856692  T
Q  507 gttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatg 603  Q
    | |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| || || |||    
T  41856691 gctgcttggtaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctatgaatg 41856592  T
Q  604 gggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacac 703  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  41856591 gggtaattcaaacttgttaaacggcagga-tccagcatgcgatgtgcatcttgaacaatgacattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacac 41856493  T
Q  704 ttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgg 803  Q
    |||||||||||||||||| || || |||  ||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  41856492 ttgaataccatcattcaatatactcatcagatgctggagtcctgttgtttagcaagtttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagttgg 41856393  T
Q  804 aaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41856392 aaggtacattccggaatgtaatgtaatg 41856365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 351 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 43637638 - 43637183
Alignment:
Q  351 taaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaaca 450  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43637638 taaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaatgaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaaca 43637539  T
Q  451 aaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaa 550  Q
    ||||||||||||||||||||        ||||||| ||| |||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  43637538 aaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatgccgggtgaaatgtttgagtcttgttgtttggcaggtttgaatttaccgcattcaaaggtaaggcaa 43637440  T
Q  551 ttgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagc 650  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||    
T  43637439 ttgttatagttgaaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcgacagaactccaacattcgataagc 43637340  T
Q  651 ctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcga 750  Q
    ||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||      
T  43637339 ctcttgaatgctgatattcaagtgtcaagaaatgcacctcattct-ttgacactagaataccgtcattcaagatgctcatcgaatattggagtcctgcag 43637241  T
Q  751 tttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43637240 tttagcaagtttgaatttgccactttcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 43637183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 384 - 831
Target Start/End: Original strand, 44050812 - 44051258
Alignment:
Q  384 ttaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaat 483  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||    
T  44050812 ttaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaat 44050910  T
Q  484 gcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaa 583  Q
    |  | |||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  44050911 gtcgagcgaaatgcttgagtcttgttgtttgacaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgtggcagttggaatgcacatttcaactgcaa 44051010  T
Q  584 caattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaat 683  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  44051011 caattgtcttactctggattgggcaattcaaacttgttaatcagcagaactccagcattcgataagcgtcttgaacgctggtattcaagtgtcaaggaat 44051110  T
Q  684 gcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggt 783  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||    
T  44051111 gcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggt 44051210  T
Q  784 aagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44051211 aagatgattgttgcagttgaaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 44051258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 34 - 854
Target Start/End: Original strand, 40702383 - 40703206
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    |||||| |||||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40702383 acgttcagtataaacgtccaacgttcgacgaagggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggaaca 40702482  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatc-gtcattagtta-- 230  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||      
T  40702483 aaacatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcggtcattaggtacg 40702582  T
Q  231 gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttc 329  Q
    || | || |  ||||  | |||||||||| ||||| ||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || | ||| |  | || | || || |||    
T  40702583 gaatgaatgcacattttagctacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-caggtctccaata-ttcgaccgacattc 40702678  T
Q  330 atgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatact 428  Q
       || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| || ||||||||     
T  40702679 ccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattcttttgacatttgaatacc 40702778  T
Q  429 atcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaattt 528  Q
     |||| |||  | |||||||  | |||||| || ||| || |         |||||| || || |||  | ||||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  40702779 gtcatttaatcccagcctaaagagaatttaatcctttgaatgtaacattgggaatgccggtcg-aatattggagtcatgttgcttggaaagtttgaattt 40702877  T
Q  529 accccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatt 625  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||      
T  40702878 accccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaatttcaacaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttgttaaac 40702977  T
Q  626 ggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatc 725  Q
    ||||||| |||||||| ||||  || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||     
T  40702978 ggcaggaatccagcatgcgatgtgcatcttaaacaatggtatttaagtgtcaatgaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcgttgcatatg 40703077  T
Q  726 ctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaat 825  Q
    || || | ||  |||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40703078 ctcattggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttagaatgtacattccggaatgtaat 40703177  T
Q  826 gtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  40703178 gtaatgcaatgtaacgtgataacatatat 40703206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 16 - 527
Target Start/End: Original strand, 2416920 - 2417428
Alignment:
Q  16 acacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 115  Q
    |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2416920 acacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacattcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 2417019  T
Q  116 gagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||| | ||||    
T  2417020 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccaccagaa 2417119  T
Q  216 gatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcat 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  |||| |  || | |||| || |||||    | |||||||||||    
T  2417120 gatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtcttacct-ttgaatgagataaattaaacctgccaaac-aataggactcaagcat 2417217  T
Q  316 tttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttg 415  Q
    || || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2417218 ttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttg 2417317  T
Q  416 gcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttgg 515  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||        ||||||  | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  2417318 gcacttgaataccatcatctaaagtaagtctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaatatgaatgtcgagcgaaatgcttgagtcctgttgtttgg 2417416  T
Q  516 caagtttgaatt 527  Q
    || | |||||||    
T  2417417 caggcttgaatt 2417428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 390
Target Start/End: Original strand, 43693140 - 43693516
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43693140 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcggcgaggggaggatatcattcatttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 43693239  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  43693240 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccag 43693339  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  43693340 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattttcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggcaaggactcaagc 43693439  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtg 390  Q
    |||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43693440 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgctaggctggtttagatgaaggtattaagtg 43693516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33799753 - 33799432
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33799753 gagggtggaatatgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg 33799654  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  33799653 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggataacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtc 33799554  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccc 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33799553 attagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgccc 33799454  T
Q  323 aacgttcatgtttttcctttga 344  Q
    | ||||||||||||||| ||||    
T  33799453 agcgttcatgtttttccattga 33799432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 23 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 43638879 - 43638549
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  43638879 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatccttcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatg 43638780  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||    
T  43638779 ttttgggagcacaacatgttccagtgcatcgatatgcgcgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccagaagatcgtc 43638680  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccc 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| || |    
T  43638679 attagttagggtaaggtgcattccaactacaataattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaatagccaggactcaagcatttcgctc 43638580  T
Q  323 aacgttcatgtttttcctttgaaaagattaa 353  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||    
T  43638579 ggcattcatgtttttcctttgaaaagattaa 43638549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 344 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 18440177 - 18439642
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| || |||||||| ||||| |||    |    
T  18440177 aaaagattaaattattgttaggctagtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatcaca 18440078  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || |        ||||||  || |||| |  | |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||     
T  18440077 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgtgaatgtcggtcgaa-tattagagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaaga 18439979  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagc 639  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    || |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||   |||||| |||| |    
T  18439978 taagacaattgttgtagttggaaggcacaaacgtctaactgcaacaattgtctttctctgaatggggtaattcaaacttgttaaacagcaggaatccaac 18439879  T
Q  640 attcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattg 739  Q
    ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||    
T  18439878 attcgatgagcctcttgaatgttggtattcaagtgtcaaataatgtacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgttgatcggatgttg 18439779  T
Q  740 gagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaa 839  Q
     |||| |||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  18439778 cagtcttgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg-------- 18439687  T
Q  840 tttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18439686 --tgataacatatatagttgaatatgcataataaattttgttttgaa 18439642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 512 - 854
Target Start/End: Original strand, 42603951 - 42604296
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  42603951 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgggaca 42604050  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    |||||||||||||||  | ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42604051 attcaaacttgttaaacgacaggaatccagcatgcgatgtgcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaa 42604150  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||||||| ||  |||| || |||| || | |||||||||   |||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42604151 taccatcgttgcagatgctcatcggatgtcggagtcctgtcgtttagcaagtttgaatttgccccatttagtggtaagataattgttgcagttggaaggt 42604250  T
Q  809 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42604251 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 42604296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Original strand, 41363659 - 41363909
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41363659 agacacaaggagggtggaacacgttcggtatacacgtctaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 41363758  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  41363759 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccag 41363858  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtctt 264  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41363859 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 41363909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 367 - 687
Target Start/End: Complemental strand, 41017608 - 41017288
Alignment:
Q  367 tggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttgg-cacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41017608 tggtttagatgaaggtattaagtatcaaggaatgaacctcatttcgttagacacttgaataccatcatctaaagcacgcctaacaaaaatttattctttt 41017509  T
Q  466 caaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||| |        ||||| | ||| |||||||| |||||||||| |||| || | |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41017508 caatggaaaaca-tgaatactgggtgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaggattgaatctatctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaa 41017410  T
Q  566 tgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggt 665  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||    
T  41017409 tgcacattcaaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcgataagcgtcttgaacgctggt 41017310  T
Q  666 attcaagtgtcaatgaatgcac 687  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  41017309 attcaagtgtcaaggaatgcac 41017288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 41275397 - 41275649
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41275397 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 41275496  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  41275497 acgagcatgttttgagagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 41275596  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttac 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  41275597 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaataattgtcttac 41275649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44943292 - 44943079
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44943292 agacacaaggatggtgtaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 44943193  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44943192 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 44943093  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||| ||||||||    
T  44943092 aagattgtcattag 44943079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18440506 - 18440293
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18440506 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgaacgatgaaaacgtg 18440407  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18440406 acgagcatgttttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgcgag 18440307  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  18440306 aagatcgtcattag 18440293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 545 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 33799432 - 33799230
Alignment:
Q  545 agacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcg 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  33799432 agacaattgttgtagttggaatgcacatttcaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcg 33799333  T
Q  645 ataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtc 744  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33799332 ataagcctcttgaatgctggtattcaagtgttaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccgtcattcaagatgctgatcgaatattggagtc 33799233  T
Q  745 ctg 747  Q
    |||    
T  33799232 ctg 33799230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19242373 - 19242160
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19242373 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacgtg 19242274  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19242273 acgagcatgttttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacgag 19242174  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||| ||||||||    
T  19242173 aagattgtcattag 19242160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19315557 - 19315344
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19315557 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtgtaattaaggaacgacaaaaacgtg 19315458  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19315457 acgagcatgttttgggaatacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctacgag 19315358  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||| ||||||||    
T  19315357 aagattgtcattag 19315344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 42603477 - 42603670
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42603477 acgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 42603576  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42603577 catcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgaaatcaaccgaatatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcgtcattag 42603670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 570 - 854
Target Start/End: Original strand, 41275624 - 41275915
Alignment:
Q  570 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  41275624 cattccaactgcaataattgtcttactctggatgaggcaattcaaacttgttaatcagcaggactctagtattcgataagcgtcttgaacgctggtattc 41275723  T
Q  670 aagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatttt 769  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||     
T  41275724 aagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaagatgttgatcgaatactggagtcctgttggttagcaagtttgaatttg 41275823  T
Q  770 cctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaa-------tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    || ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||       |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41275824 ccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtacattttgaaatgtaatgtaatttgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 41275915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 489 - 705
Target Start/End: Original strand, 2417449 - 2417665
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaatt 588  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2417449 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagttttaatttatctcattcaaaggtaagacaattgtggcagttggaatgcacattccaactgcaacaatt 2417548  T
Q  589 gtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacc 688  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || |||| ||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2417549 gtcttcctctgaatggggcaattcaaacttgttaaacggcatgaatccaacatgcgatgtgcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacc 2417648  T
Q  689 tcattctcttgacactt 705  Q
    ||||||| |||||||||    
T  2417649 tcattcttttgacactt 2417665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 26484580 - 26484756
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26484580 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 26484679  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatat 190  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  26484680 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgcataacattgctgagatcaactgaagatat 26484756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 666 - 886
Target Start/End: Original strand, 28167439 - 28167659
Alignment:
Q  666 attcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaa 765  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  | |||  ||  ||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  28167439 attcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatttaaaatgttcatcacatgctggagtcctactatttaacaagtttgaa 28167538  T
Q  766 ttttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatg 865  Q
    ||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28167539 tttaccccattcaggggtaagataattgttgcagttagaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatg 28167638  T
Q  866 cataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||| || |||||||    
T  28167639 cataatacatgttattttgaa 28167659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 3589477 - 3589053
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |   | | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3589477 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtcaaacgattgtctatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgataacgtg 3589378  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | | ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||    
T  3589377 atgggcatgttttgggagcacaggatgttccagtggatcgatatgcgtgtaacattgttgagatcaactgaagacattatcaacagtttgattccgccag 3589278  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctc--aaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaa 311  Q
    |||||||| ||||| ||| | || |  | ||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||  ||||   ||   |||||    
T  3589277 aagatcgtgattaggtag-ggaatgcaccttcaaactacaacaattgtcttacctctctgaaatgagataattcaaacttgctaaac-aacagttctcaa 3589180  T
Q  312 gcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattt 410  Q
    |||||   ||  |  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||||  |||||     
T  3589179 gcattcacccggaaattc-tgttgttcctttcaaaagattaaattcttgttattttggtgtagatgttggtattgaagtgtcacggaatgaacatcattc 3589081  T
Q  411 tgttggcacttgaatactatcatctaaa 438  Q
    | |||  |||| ||||| ||||||||||    
T  3589080 ttttgaaacttcaataccatcatctaaa 3589053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 31172027 - 31171744
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||  || ||    
T  31172027 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgacgacatg 31171928  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || | ||| |||  | |||||| |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  31171927 acaaacatttttcagaagcacagcatgttaccgtggatcgatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaaaatattatcaacagtttgattccgccag 31171828  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaac 298  Q
    |||||||| ||||| ||  | || |  | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||    
T  31171827 aagatcgtgattaggta-tggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgagataattcaaacttgttaaac 31171744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 730 - 886
Target Start/End: Original strand, 26487151 - 26487307
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaa 829  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26487151 tcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacccaattcaaaggtaagataaatgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaa 26487250  T
Q  830 tgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26487251 tgcaatgtagtgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 26487307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 156
Target Start/End: Original strand, 16575695 - 16575837
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16575695 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtttcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaacggg 16575794  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgata 156  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  16575795 atgagcatgttttgggaccacaacatgttccagtgcatcgata 16575837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 238 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 22549636 - 22549310
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatgggg-caattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttt 336  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||  |||  | ||||||||||    
T  22549636 gtgcattccaactgcaacaattgtcttaccttt-aaatggggtcaattcaaacttgccaaacagc-aggactcaaacatttcacccggcattcatgtttt 22549539  T
Q  337 tcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcat 433  Q
     |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  ||||    
T  22549538 -cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcat 22549442  T
Q  434 ctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |    
T  22549441 ctaaacca-gcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgctgagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctc 22549343  T
Q  534 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaat 566  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22549342 attcaaaggtaagacaattgttgaagttggaat 22549310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 346 - 644
Target Start/End: Original strand, 16575990 - 16576288
Alignment:
Q  346 aagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagc 444  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||| | ||| |||| |||||    
T  16575990 aagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccaccatttaaaccaagc 16576089  T
Q  445 ctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggta 544  Q
    ||||||| ||||||  ||||| || |          | |   ||| ||| | |||||   || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16576090 ctaacaagaatttaaacttttgaatgaaacaataaaactttcgggtgaa-tacttgatagctattgtttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggta 16576188  T
Q  545 agacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcg 644  Q
    ||| ||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||| | ||||||    
T  16576189 agataattgttgtagttggaaggtgccttccaactacaacaattgtcttcctctggatggggtaatccaaacttgctaaacggcaggactcaaacattcg 16576288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 128
Target Start/End: Original strand, 22548266 - 22548380
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22548266 agacacaaggagggtggaacacattcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaacgtg 22548365  T
Q  114 acgagcatgttttgg 128  Q
    |||||||||||||||    
T  22548366 acgagcatgttttgg 22548380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 238 - 569
Target Start/End: Original strand, 42168615 - 42168946
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggca-attcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttt 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||| | | ||||||||| |||||  | | ||||||||||||| ||||  | ||||||||||    
T  42168615 gtgcattccaactacaacaattgtcctacct-tcgaatggggtacagtcaaacttgccaaacaac-aggactcaagcatttcgccccgcattcatgtttt 42168712  T
Q  337 tcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcat 433  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| || ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  ||||    
T  42168713 tcctttgaaaataataaatttttggtaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattca-ttgccactt-aataccttcat 42168810  T
Q  434 ctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccc 532  Q
    ||||| || || |||||| |||||| |||||||||||        |||| || |||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||||    
T  42168811 ctaaacca-gcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaa-ttaccc 42168908  T
Q  533 ca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 569  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42168909 catttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 42168946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 24861698 - 24861570
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  24861698 agcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaag 24861599  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24861598 gtaagacaattgttgcagatggaatgcac 24861570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 239 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 26452881 - 26452556
Alignment:
Q  239 tgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttc 338  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||   || |||||||||| |    
T  26452881 tgcattccaactgcaacaattgtcttaccttttaatgagataaattcaaacctgtcaaacaac-atgactcaagcatttcgcttgacattcatgtttt-c 26452784  T
Q  339 ctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatcta 436  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| | |||| ||||| ||| |||   || ||  ||| ||| ||||| |||||  |||||||    
T  26452783 ctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggtccatttcttgacactt-aataccttcatcta 26452685  T
Q  437 aagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccatt 536  Q
    || | |||||||||| |||||| |||||||||||        | ||||  | |||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||    
T  26452684 aa-ctagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacataaatgtcgagcgaaatgtttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcatt 26452586  T
Q  537 caaaggtaagacaattgttgtagttggaat 566  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  26452585 caaaggtatgacaattgttgcagttggaat 26452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 2417269 - 2417142
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||| | |||||||||    
T  2417269 agcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctattgtttggcaggttt-aatttatctcattcaaag 2417171  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2417170 gtaagacaattgttgaagttggaatgcac 2417142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Original strand, 484680 - 484923
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  |||||| | || ||||||||| |||||||||| |||   |||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  484680 ttccagctgcaacaatcatcttacccctgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcagaactccagtattcgataagcatcttgaacgatggtattc 484779  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  484780 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-tt 484877  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  484878 gcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 484923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 570
Target Start/End: Original strand, 28705805 - 28706129
Alignment:
Q  246 caactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaa 345  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||    
T  28705805 caactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagcatttcgccccacattcgtgtttttcctttgaa 28705903  T
Q  346 aagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||| | ||| ||  ||| || || |||||  ||||||||| | |    
T  28705904 aagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgaca-tttaataccttcatctaaa-cca 28706000  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtc-ctgttatttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaa 540  Q
    || ||| || |||||| |||||||||||        |||| |  ||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  28706001 gcataaaaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgttgggcgaaatgcttgagtcattgccgtttggcaagtttgaa-ttaccccatttcaca 28706099  T
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28706100 agtaagacaattgttgtagttggaatgcac 28706129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 485166 - 485245
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  485166 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcac 485245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 15032232 - 15032311
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15032232 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaaatgttgtagttggaatgcac 15032311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 512 - 565
Target Start/End: Original strand, 28167338 - 28167391
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28167338 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 28167391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 479 - 570
Target Start/End: Original strand, 43638572 - 43638664
Alignment:
Q  479 tgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgt-tatttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43638572 tgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggctatttggcaagtttgaa-ttaccccatttcagaggtaagacaattattgtagttggaatgcac 43638664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 575
Target Start/End: Original strand, 26487005 - 26487236
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||| | ||| || ||||||||  |||| |||  | |    
T  26487005 aaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtttcaaagaatggacctcattattttgacatttgaataccgtcatttaatccta 26487104  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || |         ||||||  | || |||  | |||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26487105 gcctaacaataatttaatcttttgaatggaacattgggaatgcctgtcg-aatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacccaattcaaagg 26487203  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    ||||| || ||||| |||||||| | |||||||    
T  26487204 taagataaatgttgcagttggaaggtacattcc 26487236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 44942963 - 44942841
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| || |||||||| ||||| |||  | |    
T  44942963 aaaagattaaattcttgttcggctgttttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatccca 44942864  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||||||||| |||||| ||||||    
T  44942863 gcctaacaacaatttaatctttt 44942841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 755 - 808
Target Start/End: Original strand, 16576159 - 16576212
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16576159 gcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagataattgttgtagttggaaggt 16576212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 374 - 619
Target Start/End: Original strand, 37780506 - 37780754
Alignment:
Q  374 gatgaaggtattaa-gtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnn 472  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| | ||| || |||||||| ||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||| || |      
T  37780506 gatgaaggtattaaagtgtcaacgaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatcccagcctaacaagaatttattcttttgaatgga 37780605  T
Q  473 nnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca- 571  Q
           |||||| || |||| |  | |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | | | | |     
T  37780606 acattgagaatgccggtcgaa-tattggagtcctgctgcttggcaaatttgaatttaccccattcaaatgtaacacaatttttgtagttaggaagtagaa 37780704  T
Q  572 --ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 619  Q
       | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  37780705 acgttcaactgcaacaattgtcttcctctgaattgggcaattcaaacttg 37780754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 43693493 - 43693364
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttatttggcaagtttgaatttaccccatt-caa 539  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  43693493 agcctagcaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtccttgccgtttggcaagtttgaatt-accccatttcag 43693395  T
Q  540 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43693394 aggtaagaaaattgttgtagttggaatgcac 43693364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 22549661 - 22549608
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22549661 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactgcaacaattgtcttac 22549608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 734 - 811
Target Start/End: Original strand, 28167320 - 28167397
Alignment:
Q  734 atattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28167320 atattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtaca 28167397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 570
Target Start/End: Original strand, 33799454 - 33799538
Alignment:
Q  487 gggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33799454 gggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaa-ttaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 33799538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 34615264 - 34615180
Alignment:
Q  487 gggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccattcaa-aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34615264 gggcgaaatgcttgagtcatggtcgtttgtcaagtttgaatt-accccatttaagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 34615180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 38033556 - 38033609
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  38033556 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 38033609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 565 - 805
Target Start/End: Original strand, 28705555 - 28705795
Alignment:
Q  565 atgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| | || || |||||||| |||||||||| |||   ||| |||||||  ||||||| ||| ||||||||  |    
T  28705555 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccttgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaagactccaatattcgatcagcatcttgaacgct 28705654  T
Q  663 ggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctg-cgatttagcaagt 760  Q
    |||||||||||||| || |||||     ||||| ||||||||||||||| || | |||||||  ||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  28705655 ggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaatatcagcgttcaagacgcttgtcgaatgttggagtcctgccgattta-caagt 28705752  T
Q  761 ttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    ||||| || || || || || |||||| |||||||||||||||||    
T  28705753 ttgaa-ttgcccca-tccagagtaagacaattgttgtagttggaa 28705795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 565 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 40416056 - 40415853
Alignment:
Q  565 atgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatg 663  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| | | || || ||| |||||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||| | | |||||||  |||    
T  40416056 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaattgggaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaacatacgatcaacatcttgaatgatg 40415957  T
Q  664 gtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagttt 762  Q
    ||||||||||||| || |||||     ||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||   ||| |||||||    
T  40415956 gtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaatatcagaattcaagatgcttatcgaatgttggactcctgccgattaacaagttt 40415858  T
Q  763 gaatt 767  Q
    |||||    
T  40415857 gaatt 40415853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 44051242 - 44051035
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || || |||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  44051242 ggaatgtacctttcaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaac 44051143  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
      ||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||  |||||| ||||   ||| |||    
T  44051142 gctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgctggagttctgctgattaacaa 44051044  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  44051043 gtttgaatt 44051035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 516 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 2417579 - 2417502
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  2417579 caagtttgaattg-ccccattcagagg-aagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactgccacaattgtcttac 2417502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 16576024 - 16576079
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16576024 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccaccatt 16576079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 465
Target Start/End: Original strand, 16576308 - 16576435
Alignment:
Q  339 ctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaa 437  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||| || | |||| ||||||||||| ||||||||||||||  | ||| || | ||| ||||||||||| || || |||    
T  16576308 cttttaaaaggttaaattcttcttaggccgatttaaatgaaggtattcaagtgtcaaggaattcacctcgttcttttgacacttgaataccattatataa 16576407  T
Q  438 agcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||    
T  16576408 accaagcctaacaagaatttaatctttt 16576435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 732 - 811
Target Start/End: Original strand, 42603931 - 42604010
Alignment:
Q  732 gaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||||||||||||||||   || |||||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  42603931 gaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtaca 42604010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Original strand, 15031746 - 15031943
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||| |||||||||| |||   ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  15031746 ttccagctgcaacaattatcttaccactgaatgtggcaaattcaaacttgctaagcagcaggaccccagtattcgatcagcatcttgaacgctggtattc 15031845  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || || ||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  15031846 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgttcaagatgctcattgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 15031943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 16576286 - 16576186
Alignment:
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtct 592  Q
    |||| ||||||||||   ||| ||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||    
T  16576286 aatgtttgagtcctgccgtttagcaagtttggatt-accccatccagagg-aagacaattgttgtagttggaaggcaccttccaactacaacaattatct 16576189  T
Q  593 tac 595  Q
    |||    
T  16576188 tac 16576186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 40415100 - 40414835
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tga 401  Q
    ||||||| |||||  ||| || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||    
T  40415100 gactcaatcatttcacccgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatga 40415002  T
Q  402 agctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttga 501  Q
     | |||||   ||| ||||| |||||  ||||||||| || || |||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||    
T  40415001 ggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatctaaacca-gcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttga 40414905  T
Q  502 gtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||    ||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40414904 gtcctggccgtttgataagtttgaatt-accccatttcagaggtaagagaattgttgtagttggaatgcac 40414835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 41275859 - 41275662
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||    ||||||||||| ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  41275859 ttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccaacaggactccagtattcgatcaacatcttgaacgctggtattc 41275760  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||| | |||||||||   ||| ||||||||||||    
T  41275759 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatactagagtcctgctgattaacaagtttgaatt 41275662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 15031956 - 15032009
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  15031956 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactgcaacaattgtgttac 15032009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 40415840 - 40415787
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  40415840 gtaagacaattgttgtacttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 40415787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 716 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 41363976 - 41363888
Alignment:
Q  716 attcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    |||||||||  |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| || || | |||| |||||||||||||||||    
T  41363976 attcaagatgttgatcggatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgcctca-tccagagaaagacaattgttgtagttggaa 41363888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Original strand, 18439703 - 18439910
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || |||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   ||| |||| || ||| |||| | | |||||||     
T  18439703 ggaatgtaccttccaactacaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaagactgcaacatccgatcaacatcttgaat 18439802  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     ||||||||||||||||||  |||||     |||| | ||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||| ||||||  |||| |||    
T  18439803 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattat-ttgacacttgaataccaacattcaagaggctcatcgaatgttggattcctgctgtttaacaa 18439901  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  18439902 gtttgaatt 18439910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 714
Target Start/End: Original strand, 16576349 - 16576400
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccat 714  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16576349 ggtattcaagtgtcaaggaattcacctcgttcttttgacacttgaataccat 16576400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 756 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 28705851 - 28705792
Alignment:
Q  756 caagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| || | |||||||    
T  28705851 caagtttgaattttccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaaagcacattcc 28705792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 37780512 - 37780567
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  37780512 ggtattaaagtgtcaacgaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatt 37780567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 512 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 44942794 - 44942751
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgtt 555  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44942794 ttggcaaatttgaatttactccattcaaaggtaagacaattgtt 44942751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 44942927 - 44942872
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  44942927 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatt 44942872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 592
Target Start/End: Original strand, 33799382 - 33799432
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtct 592  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  33799382 gtaagacaattgttgtagttgaaatgtgcattccaactacaacaattgtct 33799432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 562 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 40703167 - 40703049
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggc-aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||||||| | || ||| | |  |||    
T  40703167 ggaatgtacattctaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcatccaatgagcatatgcaac 40703068  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaa 678  Q
     ||||||||||||||||||    
T  40703067 gatggtattcaagtgtcaa 40703049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 465
Target Start/End: Original strand, 42603783 - 42603905
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||  |||| ||||| | |||||| | ||| || ||||||||  |||| |||  | |    
T  42603783 aaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaaggatcaacgaatggacctcattcttttgacatttgaataccgtcatttaatccca 42603882  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
     |||||||| |||||| ||||||    
T  42603883 acctaacaagaatttaatctttt 42603905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 24861925 - 24861872
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  24861925 gtaagaaaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 24861872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 494 - 575
Target Start/End: Original strand, 28167507 - 28167588
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    ||||| |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||    
T  28167507 atgctggagtcctactatttaacaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagttagaaggtacattcc 28167588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 28705772 - 28705825
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||| |||||||||||||||    
T  28705772 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcttttcaactacaacaattgtcttac 28705825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 570 - 646
Target Start/End: Original strand, 41363886 - 41363963
Alignment:
Q  570 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggc-aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgat 646  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||   ||||||||||| ||| ||||    
T  41363886 cattccaactacaacaattgtctttctctggatgaggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacatccgat 41363963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 42604257 - 42604015
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||| |||||||||| |||  | |||||||||  ||| |||| ||| |||  |||    
T  42604257 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactaaatggggcaaattcaaacttgctaaacgacaggactccgacatccgatgagcatctgcaac 42604158  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     |||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |  |||| ||  |||| |||||   |||| |||    
T  42604157 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgttcaagatgcacatcgcatgctggattcctgtcgtttaacaa 42604059  T
Q  759 gtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    ||||||||| ||| ||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  42604058 gtttgaattgtcc-cattcaaagg-aagacaattgttgcagttgga 42604015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 44051022 - 44050969
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  44051022 gtaagacaattgttgcagttgaaatgtgcattccaactgccacaattgtcttac 44050969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 563 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 19242150 - 19242094
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 619  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||    
T  19242150 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctttctctgaatggggtagttcaaacttg 19242094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 563 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 19315334 - 19315278
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 619  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||    
T  19315334 gaatgcaccttccaactacaacaattgtctttctctgaatggggtagttcaaacttg 19315278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 628 - 767
Target Start/End: Original strand, 33799230 - 33799369
Alignment:
Q  628 caggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcc 726  Q
    ||||||||||  ||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||  |||||     ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||  |    
T  33799230 caggactccaatattcgatcagcatcttgaatgacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttaacacttgaataccagcattcaagaggc 33799328  T
Q  727 tgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    | ||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  33799329 ttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 33799369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 40702648 - 40702602
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtag 559  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40702648 tttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtag 40702602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 559
Target Start/End: Original strand, 41856901 - 41856947
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtag 559  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41856901 tttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtag 41856947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 42603741 - 42603695
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtag 559  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42603741 tttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtag 42603695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 535 - 570
Target Start/End: Original strand, 38033877 - 38033912
Alignment:
Q  535 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38033877 ttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 38033912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 767
Target Start/End: Original strand, 41017296 - 41017367
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  41017296 cttgacacttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 41017367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Original strand, 42604182 - 42604257
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  42604182 gagtcctgtcgtttagcaagtttgaatttgccccatttagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacattcc 42604257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Original strand, 484889 - 484943
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  484889 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 484943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 16575964 - 16575912
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16575964 tttggcaagtatgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 16575912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 664 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 19242007 - 19241953
Alignment:
Q  664 gtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  19242007 gtattgaagtgtcaataaatgaacctcattcttttgaaacttgaataccgtcatt 19241953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 664 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 19315191 - 19315137
Alignment:
Q  664 gtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  19315191 gtattgaagtgtcaataaatgaacctcattcttttgaaacttgaataccgtcatt 19315137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 500 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 41363952 - 41363883
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| || ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41363952 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgcctcatccagaga-aagacaattgttgtagttggaatgcac 41363883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 751 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 31171534 - 31171477
Alignment:
Q  751 tttagcaagtttgaattttcctcattcaag-ggtaagataattgttgtagttggaagg 807  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31171534 tttagcaagtttgaattaacctcattttagaggttagataattgttgtagttggaagg 31171477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 41017380 - 41017433
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  41017380 gtaagacaattgttgcagtttgaatgtgcatttcaactacaacaattgtcttac 41017433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 500 - 565
Target Start/End: Original strand, 41275794 - 41275859
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||    
T  41275794 gagtcctgttggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaa 41275859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 591
Target Start/End: Original strand, 42168590 - 42168639
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtc 591  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||    
T  42168590 gtaagacaattgttgcagttgggatgtgcattccaactacaacaattgtc 42168639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 43637395 - 43637448
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||||||| |||||    
T  43637395 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcatttcaactataacaattgccttac 43637448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 44050931 - 44050851
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    ||||||||||||| || | || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  44050931 gactcaagcatttcgctcgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 44050851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 544; Significance: 0; HSPs: 257)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 13896082 - 13895256
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13896082 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacgtg 13895983  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  13895982 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgctag 13895883  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13895882 aagatcgtcattagttaaggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggccaggactcaagc 13895783  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  13895782 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacttcatttcgt 13895683  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||    
T  13895682 tggcaattgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttatttttttcaaag-gaaaacatgaatgccgggtgaaatgtttgagtcctgttgttt 13895584  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             |||||||||||||||||||    
T  13895583 ggcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgc-------------ctctggatggggcaattca 13895497  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13895496 aacttgttaatcggcaggacttcaacattcgataagtgtcttgaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 13895397  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
     | |||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13895396 gcgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacatt 13895297  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13895296 ccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatatgataacatatat 13895256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 544; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Original strand, 44927470 - 44928309
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44927470 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 44927569  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44927570 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 44927669  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  44927670 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctaaaaaatggggtaattcaaacttgccaaacggtcaggactcaagc 44927769  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44927770 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaatattaaattcttgttaggatggtttagatgaatgtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 44927869  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| |||||| ||||||||||||  ||    
T  44927870 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgccgggtgaaatgtttgagtcctgttgctt 44927968  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44927969 ggcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcagttca 44928068  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44928069 aacttgttaatcggaaggactccaacattcgataagcatcttgaacgctggtattcaagtgtcgaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatatca 44928168  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
     | |||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| || || || ||||||  || |||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  44928169 gcgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttaaagttgccccattcagaggcaagacaattattgcagttggaaggtacatt 44928268  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44928269 tcggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 44928309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 542; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 25576803 - 25575987
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25576803 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagattatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 25576704  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||    
T  25576703 acgagcatgttttgggagcacagcatgttcca-tggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgattccgtcag 25576605  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25576604 aagatcgtcattatttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaagc 25576505  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  25576504 atttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 25576405  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25576404 tggcaattgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttaaaaggaaaaacatgaacacggggcgaaatgcttgagtcctgttgttt 25576305  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25576304 ggccagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggattgggcaattca 25576205  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  25576204 aacttgttaatcggcatgactccaacattcgataagcctcttgaatgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcaatcttttgacacttgaatatca 25576105  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
    |||||||||||  |||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||| ||||| | ||||||  ||||||    
T  25576104 tcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccatttagtggtaagataactgttgcacttggaaaatacatt 25576005  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25576004 ccggaatgtaatgtaatg 25575987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 34693502 - 34692686
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34693502 agacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagggttgagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 34693403  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  34693402 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaactttgattccgccag 34693303  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  34693302 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaagactcaagc 34693203  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34693202 atttcgcgcgacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttagactggtttatatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 34693103  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||    
T  34693102 tggtacttgaataccatcatctaaagcacgcttaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgccgggtgaaatgtttgagtcctgttgttt 34693004  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34693003 ggcaagtttgaattgaccccattcacaggtaagacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttcctctggatggggcaattca 34692904  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34692903 aacttgttaattggcaggactccaacattcgataagcgtcttggacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 34692804  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
     | ||||||||  |||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  34692803 gcgttcaagatgttgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttttccaattcaatggtaagatgattgttgcagttggaaggtacatt 34692704  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||  ||||||||||||||    
T  34692703 ccataatgtaatgtaatg 34692686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 529; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 24702483 - 24701668
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24702483 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaatta-cgaacgacgaaaacgtg 24702385  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  24702384 acggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgccag 24702285  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  24702284 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggactcaagc 24702185  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  24702184 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 24702085  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| ||||||||||||||  ||| |||    
T  24702084 tggcacttgaataccatcatctaaagcacacctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgccgggtgaaatgcttgagtcaggttgttt 24701986  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24701985 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattatcttactctggatggggcaattca 24701886  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24701885 aacttgttaatcggcaggactccagcattcaataagcgtcttcaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 24701786  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
     | |||||||| ||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||| || | ||||  | |||||  ||||||| |||||||||||| |||    
T  24701785 gcgttcaagatgctgatcgaaaaatggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcccctttcagtgttaagaagattgttgcagttggaaggtaaatt 24701686  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24701685 ccggaatgtaatgtaatg 24701668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 509; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 808
Target Start/End: Original strand, 42383067 - 42383851
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| | ||||||| |||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42383067 gagggtggactacgttcagtataaacttccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg 42383166  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  42383167 ttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgccagaagatcgtc 42383266  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccc 322  Q
    ||||||| |   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  | |    
T  42383267 attagttgggacaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctaaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaaacatttcactc 42383366  T
Q  323 aacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttg 422  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  42383367 ggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggcttgtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttg 42383466  T
Q  423 aatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagttt 522  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||        ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42383467 aataccatcatttaaagcaagcgtaacacaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgccgggtgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagttt 42383565  T
Q  523 gaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgtta 622  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42383566 gaatttatccaattcaaagataagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgtta 42383665  T
Q  623 attggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaag 722  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42383666 attggcaggactccaacattcgataagcctcttgaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaag 42383765  T
Q  723 atcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    || ||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||  ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  42383766 atgctgatcgaatattggagtcctgcggcttagcatgtttgaatttgccctattcaggggcaagacaattcttgtagttggaaggt 42383851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 491; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 808
Target Start/End: Original strand, 47065694 - 47066486
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||    
T  47065694 agacacaaggagggtggaatacgttcagtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgaggaaaatgtg 47065793  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||    
T  47065794 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgccag 47065893  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  47065894 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaacttgccaaacggccataactcgagc 47065993  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  47065994 atttcgtccagcgttcatatttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcgtttcgt 47066093  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  47066094 tggcacttgaatatcatcatctaaagcaagcctaccaaaaatttattcttttcaaaggaaaagcatgaatgcgggacgaaatgcttgagtcctgtt-gtt 47066192  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47066193 ggcatgtttaaattta-cccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccgactacaacaattgtcttactctggatggggcaattca 47066291  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47066292 aacttgttaatcggcaggactccaacattcgataagcatcttgaatgttggtattcaagtgtgaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 47066391  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||||  |||||| || |||||||| |||   || |||||||||||||| ||  ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47066392 tcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcttgctgcttcgcaagtttgaatttgccctattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 47066486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 486; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 39417160 - 39416343
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39417160 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 39417061  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||    
T  39417060 atgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatagcttgatttcgccag 39416961  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  39416960 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctaaaatgggataattcaaacttgccaaacggccaggactcaagc 39416861  T
Q  314 atttt-gcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    ||||| || || | || |||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |    
T  39416860 attttcgctcagcattaatgtttttcctttgaaaagaataaatttttgctaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatggacctcatttcg 39416761  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||    
T  39416760 ttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgcggggtgaaatgtttgagtcatgttgtt 39416662  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39416661 tgggaagtttgaatttgccccattcaaaggtaagataattgttgtagttggaatgcacatttcaactacaacaattgtcttgctctggatggggtaattc 39416562  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    ||||||||||||  ||| | ||||| |||| ||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39416561 aaacttgttaatcagcatgtctccaacatttgataagcatcttgaatgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 39416462  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||||||| |   ||| ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39416461 atcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcctactgcttaacaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacat 39416362  T
Q  813 tccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |   |||||||||||||||    
T  39416361 tttagaatgtaatgtaatg 39416343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 482; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 44835699 - 44834906
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44835699 agacgcaaggagggtggaatacgttcgatataaacattcaacgttcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 44835600  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||  ||    
T  44835599 acgagcatgttttgggagcatagaatgttccagtggatggatatgcgggtaaggttgttgagatcaactgaaaatatcatcaacagcttgattccgtcag 44835500  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44835499 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggccaggactcaagc 44835400  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    | || || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44835399 acttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 44835300  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  44835299 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgccgggcgaaatgtttgagtcctgttgttt 44835201  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44835200 ggtaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaattca 44835101  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  44835100 aactcgttaatccgcaggactccaacattcgataagcatcttgaacgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatatca 44835001  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||||  |||||| || |||||||| ||    ||||||||||||||||| || |||||| | | |||| ||||||||||||||||||||    
T  44835000 tcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcttgttgcttagcaagtttgaatttgccccattcaggagcaagacaattgttgtagttggaaggt 44834906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 467; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 2268706 - 2267891
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || | ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2268706 agacacaaggatggtggaacaagtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 2268607  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2268606 acgggcatgttttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 2268507  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| |||    
T  2268506 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcgagc 2268410  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  2268409 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaattcttgttatgttggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 2268310  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| |||  ||||||||| |||||||||||| ||    
T  2268309 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaagtgcttggcgaaatgtttgagtcctgttgtt 2268210  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2268209 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaagacaattgtcgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 2268110  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2268109 aaacttgttaatcggcagaactccaacattcgataagcctcttaaacactggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 2268010  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | |||||||| ||||||||||| ||| ||||||    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  2268009 agcgttcaagatgctgatcgaatactggtgtcctgttgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtaaat 2267910  T
Q  813 tccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    | |||||||||||||||||    
T  2267909 ttcggaatgtaatgtaatg 2267891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Original strand, 54390449 - 54391289
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54390449 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 54390548  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  54390549 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 54390648  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  54390649 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtatt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagc 54390745  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  54390746 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 54390845  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  54390846 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 54390945  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54390946 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattc 54391045  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54391046 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgatgagcatcttggacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 54391145  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||    
T  54391146 atcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaat 54391245  T
Q  813 tccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  54391246 ttcggaatgtaatgtaaaatgcaatgtaatgtgataacatatat 54391289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 837
Target Start/End: Original strand, 50997453 - 50998216
Alignment:
Q  72 gtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgc 171  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  50997453 gtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagttgatcgatatgcgggtgaagttgc 50997552  T
Q  172 tgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctc 271  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||  || |     
T  50997553 ttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtatt--ctttt 50997650  T
Q  272 aaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtt 371  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50997651 gaatggggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcgagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtt 50997749  T
Q  372 tagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagn 471  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50997750 tagatgaaggtattaagtgtcaatgattgaacctcaattcggtggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagg 50997849  T
Q  472 nnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
           |||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50997850 gaaaacatgaagtgcttggcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcac 50997949  T
Q  571 attccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattca 670  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  50997950 attccaactgcagcaattgtcttactctagatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagcattcgataagcgtcttgaacactggtattca 50998049  T
Q  671 agtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttc 770  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||| |    
T  50998050 agtgtcaaggaatgcacctcattattttgacacttgaataccaacattcaagatgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgc 50998149  T
Q  771 ctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgt 837  Q
    | ||||||  ||||| || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  50998150 cccattcagtggtaaaatgattgttgcagttggaaggtaaatttcggaatgtaatgtaatgtaatgt 50998216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 446; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Original strand, 34049734 - 34050574
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || ||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34049734 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34049833  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  34049834 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 34049933  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  34049934 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtatt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagc 34050030  T
Q  314 attttgcccaacgt-tcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    |||| ||  | ||  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |    
T  34050031 atttcgca-agcgcctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcg 34050129  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttat 511  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||| |    
T  34050130 gtggcacttgagtaccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgt 34050229  T
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaatt 611  Q
    || ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34050230 tttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaatt 34050329  T
Q  612 caaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatac 711  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34050330 caaacttgttaatcggcaggactccagtattcgatgagcatcttggacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatac 34050429  T
Q  712 catcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| |    
T  34050430 catcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgaagctggaaggtaaa 34050529  T
Q  812 ttccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34050530 tttcggaatgtaatgtaaaatgcaatgtaatgtgataacatatat 34050574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 49140266 - 49139426
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49140266 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 49140167  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  49140166 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 49140067  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  49140066 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtatt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagc 49139970  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  49139969 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 49139870  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||| ||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  49139869 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaagtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 49139770  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49139769 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattc 49139670  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49139669 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgatgagcatcttagacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 49139570  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||  ||||||| || ||||||||| ||    
T  49139569 atcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccctattcagtggtaagaagattgttgcagctggaaggtaaat 49139470  T
Q  813 tccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49139469 ttcagaatgtaatgtaaaatgcaatgtaatgtgataacatatat 49139426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 438; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 2647088 - 2646248
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2647088 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 2646989  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2646988 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctag 2646889  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  |  |  ||||||| ||||||||| ||||||||  | | ||||| |||    
T  2646888 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt--catttgaatggggtaattcaaacctgtcaaacaac-aggactcgagc 2646792  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||       
T  2646791 atttcgcgagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattctg 2646692  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        |||| |||  |||||||||| |||||| |||| ||    
T  2646691 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcataaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaagtgctcggcgaaatgcgtgagtcatgttgtt 2646592  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2646591 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttggggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttgccctggatggggcaattc 2646492  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2646491 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgatgagcatcttggacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 2646392  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | |||||||| || |||||||| |||| ||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||    
T  2646391 agcgttcaagatgcttatcgaatactggattcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaat 2646292  T
Q  813 tccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | | |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2646291 ttcagaatctaatgtgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 2646248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Original strand, 36135015 - 36135829
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36135015 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgagggga-agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 36135113  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36135114 acgagcatgttttgggagcacatcatgtttcagtagatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 36135213  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| |||    
T  36135214 aagattgtcattagttagagtaagatgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcgagc 36135310  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||      ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| || |     
T  36135311 atttcgcaagcacttcatgtttctcctttgaaaatattaaactcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtgaaggattgaacctcaattcgg 36135410  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||   | ||||||| ||||||| |||| ||    
T  36135411 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaagtgtttgacgaaatgtttgagtcttgttgtt 36135510  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    || || |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36135511 tgacaggtttgaatctatctcattcaaaggtaacacaattgttggagttggaatgcacatttcaactgcaacaattgtcttactctggatgaggcaattc 36135610  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  36135611 aaacttgttaatcggcagaactccagcattcgatgagcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcagctcattcttttgacacttgaatacc 36135710  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | |||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  36135711 agcgttcaagatgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtacgatgattgttgcagttggaaggtaaat 36135810  T
Q  813 tccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    | |||||||||||||||||    
T  36135811 ttcggaatgtaatgtaatg 36135829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 3495241 - 3494396
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3495241 agacacaaggatggtggaacacgtttgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 3495142  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  3495141 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgtttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 3495042  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||||| ||||||  | | ||||| |||    
T  3495041 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttttcaaacaac-aggactcgagc 3494945  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| || |     
T  3494944 atttcgcgagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgttaaggattgaacctcaattcgg 3494845  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        |||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||    
T  3494844 cggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaagtgctcggcgaaatgcttgagtcatgttgtt 3494745  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3494744 ttgcaagtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgttgttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattc 3494645  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3494644 aaacttgctaatcggcaggactccagtattcgatgatcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattctgttgacacttgaatacc 3494545  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    |   || ||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||  ||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  3494544 agtgtttaagatgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttgacaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtaaat 3494445  T
Q  813 tccggaatgta-------atgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    |  ||||||||       ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3494444 tttggaatgtaatgtaatatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 3494396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 49218948 - 49218132
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  49218948 agacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacaaacggcgaaaacgtg 49218849  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||    
T  49218848 acgaacatgttttgggagcgcaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacaacttgattccgccag 49218749  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||| ||||||||  | | ||||| |||    
T  49218748 aagatcgtcattagttagggtaaagtgcattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacatgtcaaacaac-aggactcgagc 49218650  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  49218649 atttcgctcggcattcatgtttttcttttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 49218550  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgt-tatt 512  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  | ||||||||||||||||| || | ||    
T  49218549 tggcaattgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatgtcgagcgaaatgcttgagtccagtatgtt 49218451  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    ||| | ||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49218450 tggtaggtttgaatttatcacattcaaatgtaagataattgttggagttggaatgaacattccaagtgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 49218351  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49218350 aaacttgttaatcggtaggactccaacattcgataagcgtcttcaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 49218251  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||||||||  | ||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  49218250 agcgttcaagatgctgatcgaatactggagtcccgctgtttaacaagtttgaatttgtcccattcagtggtaagatgattgttgcaattggaaggtacat 49218151  T
Q  813 tccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    || ||||||||||||||||    
T  49218150 tctggaatgtaatgtaatg 49218132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Original strand, 43477064 - 43477885
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43477064 agacacaaggagggtggaacacctttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 43477163  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  43477164 acgaacatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgatgagatcaaccgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 43477263  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| | ||   |   ||||||||| || |||||  | | || ||||||    
T  43477264 aagatcgtcattaattagggtaatgtgcattccaacttcaacaactgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaac-aggagtcaagc 43477362  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43477363 atttcgctcggcattcatgttttttctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 43477462  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| |||||||||||||| ||||        
T  43477463 tgtcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatgccgggtgaaatgcttgagtcatgtt---- 43477557  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
                  || | |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43477558 --------------tatctcattcaaaggtaagacaactgtggcagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 43477643  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43477644 aacttgttaatcggcaggactccagcattcgataagcgtcttgaacgctggtattcaagtctcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 43477743  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||| || ||||||   ||||||| ||||||| |||||||  |||||||    
T  43477744 gcattcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaaatttgaatttgccccattcagttgtaagatgattgttgcagttggagcgtacatt 43477843  T
Q  814 ccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43477844 ccggaatgtaatgtgtaatgcaatgtaa-tggataacatatat 43477885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 4004299 - 4003620
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| ||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4004299 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacgtgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtg 4004200  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4004199 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 4004100  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||| ||||||||||||||||||   || ||||| |||    
T  4004099 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac-aacaggactcgagc 4004003  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||      ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  4004002 atttcgcaagcacttcatgtttctcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 4003903  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||| ||   ||||||||||||||||| |||| ||    
T  4003902 tggcacttgaataccatcacctaaagcaagtctaacaaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaagtgtttggcgaaatgcttgagtcatgttgtt 4003803  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    || || |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4003802 tgacaggtttgaatctatctcattcaaaggtaacacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 4003703  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattct 695  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4003702 aaacttgttaatcggcaggactccagcattcgatgagcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattct 4003620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 724
Target Start/End: Original strand, 46403010 - 46403718
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46403010 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 46403109  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  46403110 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 46403209  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  46403210 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtatt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagc 46403306  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  46403307 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 46403406  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  46403407 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttatt 46403506  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46403507 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgaggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattc 46403606  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46403607 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgatgagcatcttggacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 46403706  T
Q  713 atcattcaagat 724  Q
    ||| ||||||||    
T  46403707 atcgttcaagat 46403718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19453432 - 19452985
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19453432 gagggtggaacacgttcgatataaacgtccaatgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 19453333  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  19453332 ttatgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcatc 19453233  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccc 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19453232 attagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcatttcgctc 19453133  T
Q  323 aacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttg 422  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||     
T  19453132 gacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaagaatgaacctcatttcgttggcacttc 19453033  T
Q  423 aatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19453032 aataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttatttttttcaaag 19452985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 886
Target Start/End: Original strand, 41577922 - 41578785
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41577922 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 41578021  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  41578022 ttttgggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcatc 41578121  T
Q  223 attagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttg 319  Q
    ||||| ||  | | |  ||||  || || |||||||||| ||||| ||| | || || || |||||||||||| |||||||| | | ||| |  |||  |    
T  41578122 attaggtacggaatgaatgcacctttcagctacaacaattgtctt-cctttgaa-tgtggtaattcaaacttgccaaacggc-aggtctccaatattc-g 41578217  T
Q  320 cccaacgt-tcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggc 417  Q
     ||||| | ||||  | ||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| |    
T  41578218 accaacatctcat--tattcctgtcaaaatattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaagaatggacctcattcttttgac 41578315  T
Q  418 acttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggca 517  Q
    | |||||||| ||||| |||  | |||||||||| |||||| |||||| || |          ||||| |  |||| |  | |||||||| |  ||||||    
T  41578316 atttgaataccatcatttaatcccagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattggaaatgccgatcgaa-tattggagtcctgctgcttggca 41578414  T
Q  518 agtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc---aactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaa 614  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||   ||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  41578415 agtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacaaacctcgaactgcaacaattgtgttcctctgaatggggtaattcaa 41578514  T
Q  615 acttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccat 714  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41578515 acttgttaaacggcaggaatccagcattcgatgagcctcttgaatgctgggattcaagtgtcaatgaatgcacctcattcttttgacacttgaataccat 41578614  T
Q  715 cattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattc 814  Q
    ||||||||||  |||||  || |||||||| |||   |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41578615 cattcaagatgttgatcagatgttggagtcatgctgcttagcaagtttgaattttcgccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacattc 41578714  T
Q  815 cggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
     ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41578715 tggaatgtaatgtaatgctatg-aatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 41578785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 34472288 - 34471473
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34472288 agacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34472189  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  34472188 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttttattccgccag 34472089  T
Q  214 aagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  || | || || | ||||| |||||| ||| ||||| ||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  34472088 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgttccttccagctacaaaaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-catgactcc 34471992  T
Q  311 agcat-tttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcat 408  Q
    |  || || | || || |||   || ||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||    
T  34471991 a--atgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaagttcttgttaggccggtttaaatgaatgtattgaagtgtcaatgaatggacctcat 34471894  T
Q  409 tttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaa-atgcttgagtcctg 507  Q
    | | ||| |||||||||||  |||| ||||  || |||||||| |||||| ||||||||| |         |||||  || |||| ||  | ||||| ||    
T  34471893 tcttttgacacttgaataccgtcatttaaacaaaacctaacaagaatttaatcttttcaatggaactatgagaatgtcggtcgaacat--tggagtcatg 34471796  T
Q  508 ttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatgg 604  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||    ||||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  34471795 ttgcttgacaagtttgaatttaccccattcaaaggaaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaattgcaacaattgtcttcctttgaatgg 34471696  T
Q  605 ggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacact 704  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  34471695 ggtgattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcgataagcatcttgaatactagtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacact 34471596  T
Q  705 tgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34471595 tgaataccatcattcaagatgttgatcggatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttgga 34471496  T
Q  805 aggtacattccggaatgtaatgt 827  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  34471495 aggtacattctggaatgtaatgt 34471473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 14 - 858
Target Start/End: Original strand, 2428494 - 2429340
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2428494 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 2428593  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2428594 acgaacatgttttgggagcacaacattttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctag 2428693  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg--tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactc 309  Q
    |||||||||||||| || | ||| |  ||||  || || |||||||||| || || ||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || | |||    
T  2428694 aagatcgtcattaggtaca-taatgaatgcacctttcagctacaacaattgtgtt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-caggtctc 2428789  T
Q  310 aagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcat 408  Q
     |  | || | || || |||   || ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  2428790 caata-ttcgaccgacattcccattgttcatgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 2428888  T
Q  409 tttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgt 508  Q
    | | ||| || |||||||| ||||| |||  | |||||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || || |||  | |||||||      
T  2428889 tcttttgacatttgaataccatcatttaatcccagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggtcg-aatattggagtcctac 2428987  T
Q  509 tatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggg 605  Q
    |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2428988 tgcttggtaaatttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggg 2429087  T
Q  606 gcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacactt 705  Q
    | |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||    
T  2429088 gtaatttaaacttgttaaacggcaggaatccagcatgcgatgagcctcttgaatgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgagcctt 2429187  T
Q  706 gaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||| |   |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||||| ||||||||    
T  2429188 gaatatcatcattcaagatgctcatcggacgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgcctcattctgtggtaagagaattgttgcagttggaa 2429287  T
Q  806 ggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagtt 858  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  2429288 ggtacattccagaatgtaatgtaatgcaatgtgatgtgataacatatatagtt 2429340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 14 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 48087764 - 48087308
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| |||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  48087764 agacacaaggatggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 48087665  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||    
T  48087664 acgagcatgttttgggagcacaacatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccag 48087565  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  48087564 aagatcgtcattaattagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctaaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggactcaagc 48087465  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || || | ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  48087464 atttcgctcagcattcatgttttttctttgaaaagaataaatttttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatggacctcatttcgt 48087365  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag 470  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48087364 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag 48087308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 46414546 - 46413659
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46414546 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 46414447  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46414446 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 46414347  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  | | |  ||||  ||| | |||||||||| ||||| ||| | || || || | |||||||||| |||||||| |||||||     
T  46414346 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttctagctacaacaattgtctt-cctttgaa-tgtggtagttcaaacttgccaaacggc-atgactcc 46414250  T
Q  311 agcatttt-gcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcat 408  Q
    |  || || | || || |||   || ||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||| | ||||| | |||||    
T  46414249 a--atgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaagttcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcgatgaatggacctcat 46414152  T
Q  409 tttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaa-atgcttgagtcctg 507  Q
    | | ||| || ||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| || |         |||||  || |||| ||  |  ||| |||    
T  46414151 tcttttgacatttgaataccgtcatttaaaccaaacctaacaagaatttaatcttttaaatggaactatgggaatgtcggtcgaacat--tgaagttctg 46414054  T
Q  508 ttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca----------------ttccaactgcaacaattgtc 591  Q
     |  || ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||                 |||||||||||||||||||    
T  46414053 ctgctttgcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttgtaaggtacaaacgttcggtataaacgtccaactgcaacaattgtc 46413954  T
Q  592 ttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctca 691  Q
    ||  | || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  46413953 ttcatttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcgataagcatcttgaataatggtatccaagtgtcaaggaatgcacctca 46413854  T
Q  692 ttctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataat 791  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||  | |||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  46413853 ttcttttgacacttgaataccatcattgaagatattcatcgcatgctggagtcctgcggtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataat 46413754  T
Q  792 tgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  46413753 tgttgcagttgcaaggtacattccgtaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 46413659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 369 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 11378835 - 11378350
Alignment:
Q  369 gtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaa 468  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11378835 gtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcggtggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaa 11378736  T
Q  469 agnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgc 568  Q
    ||        |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11378735 aggaaaaacatgaatgcgaggcaaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggcaagacaattgttggagttggaatgc 11378636  T
Q  569 acattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtatt 668  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  11378635 acattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagaattcgataagcgtcttgaacgctggtatt 11378536  T
Q  669 caagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||| | |||||||||   |||||||||||||||||    
T  11378535 caagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaagatgataatcgaatactagagtcctgctggttagcaagtttgaattt 11378436  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
     || ||||||  |  |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| ||| | |||||||||||    
T  11378435 gccccattcagagacaagacaattgttgtagttggaaggtacattatggaatgtaatgtaatgtaatgcaatgtaataacatatat 11378350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 51013490 - 51012657
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51013490 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 51013391  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51013390 acgagcatgttttgggaacacaacatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 51013291  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  | | |  ||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||| |||||||| | | |||     
T  51013290 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacggc-aggtctcc 51013194  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |  |||  | ||  | ||| | || ||| | | ||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||    
T  51013193 aatattc-gaccggcattcctattgttcttgtcaaaagattaaatttttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcatt 51013095  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
     | ||| || ||||||||  |||| |||    |||||||||| |||||| | |||| || |         |||||| || || |||  | |||||||       
T  51013094 cttttgacatttgaatac-gtcatttaatctcagcctaacaagaatttaattttttgaatggaacattcggaatgccggtcg-aatattggagtcct--- 51013000  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg 606  Q
         ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51012999 -----gcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggacgtacaaacgtccaagtgcaacaattgtcttcctctgaatgggg 51012905  T
Q  607 caattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
     |||||||| |||||||  |||| || ||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  51012904 taattcaaatttgttaaacggcaagaatccagcatgtgatgtgcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcgttcttttgacacttg 51012805  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    ||| |||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  51012804 aatgccatcattcaagatgctcatcggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 51012705  T
Q  807 gtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  51012704 atacatttcggaatgtaatgtaatgcaatgcaatgtaataacatatat 51012657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 37 - 859
Target Start/End: Original strand, 7246124 - 7246947
Alignment:
Q  37 ttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||    
T  7246124 ttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggattataa 7246223  T
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagtta--gagt 234  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || |    
T  7246224 catgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtatggaat 7246323  T
Q  235 aaggtgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatg 332  Q
    ||  ||||  ||||| ||||||| || ||||| ||| |  ||||||| |||||||||||| |||| || || | ||| |  | || | ||  | |||       
T  7246324 aa-atgcaccttccagctacaacgattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaatgg-caggtctccaata-ttcgaccggcattccca 7246418  T
Q  333 tttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatc 431  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| | ||| || |||||||  |||    
T  7246419 ttgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgttaaggaatggacctcattcttttgacatttgaatatcatc 7246518  T
Q  432 atctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacc 531  Q
    || |||  | | |||||||| |||||| | |||| || |         |||||| || || |||  | |||||||| |  || |||||||||||||||||    
T  7246519 atttaatcccaccctaacaagaatttaattttttgaatggaacattgggaatgccggtcg-aatattggagtcctgctgcttcgcaagtttgaatttacc 7246617  T
Q  532 ccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggc 628  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    || ||| |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||  |||    
T  7246618 ccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtctaacagcaacaattgtcttccactgaatggggtaattcaaacttgttaaacggc 7246717  T
Q  629 aggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctg 728  Q
    || | ||||||||||| | |||||||||||   | |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7246718 agaaatccagcattcgttgagcctcttgaatgctagtattcaactgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgttg 7246817  T
Q  729 atcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgta 828  Q
    |||| || ||| | | ||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7246818 atcggatgttgtaattctgctgcttagcaagtttgaatttgcc-cattcagtggtatgataattgttgcagttggaaggtacattccgaaatgtaatgta 7246916  T
Q  829 atgcaatgtaatttgataacatatatagtta 859  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7246917 atgcaatgtaatttgataacatatatagtta 7246947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 24 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 42950222 - 42949808
Alignment:
Q  24 agggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  42950222 agggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagggaagagtatcattcacttggatggagttaaagaatgacgaaaacgtgacgagcatgt 42950123  T
Q  124 tttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtca 223  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||    
T  42950122 tttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggtttacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtca 42950023  T
Q  224 ttagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccca 323  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||| || ||    
T  42950022 ttagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgggataattcaaacttgccaaacgcctaggactcaagcatttcgctca 42949923  T
Q  324 acgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttga 423  Q
     | || || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42949922 gcatttatatttttcctttgaaaagattaaattcttgctaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttga 42949823  T
Q  424 atactatcatctaaa 438  Q
    |||| ||||||||||    
T  42949822 ataccatcatctaaa 42949808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 34 - 565
Target Start/End: Original strand, 37281479 - 37282010
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37281479 acgttcggtataaacgtccaacactcgacgagggtagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 37281578  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagtta--g 231  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |    
T  37281579 caacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaacggaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcattaggtaccg 37281678  T
Q  232 agt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttca 330  Q
    | | || |  | ||| |||||||||||| || || ||| |   ||| || |||||||||||||||||| | || | |   |||| || |||| || ||||    
T  37281679 aatgaatgcaccttcaaactacaacaattgtgtt-cctat-ggatgaggtaattcaaacttgtcaaac-gacaagtcatcagca-ttcgcccgacattca 37281774  T
Q  331 tgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatacta 429  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  37281775 tatttttcctttgaaaagattaaattattgttaagctgatttagatgaaggtattgaaatgtcaagaaatgaacctcattttgttggcacttgaatacca 37281874  T
Q  430 tcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaattta 529  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  37281875 tcatctaaagcaagcataacaaaaatttattattttcaaaggaaaaacatgaatgccgggcgaaatgcttgagtcctgttgtttggccagtttgaattta 37281974  T
Q  530 ccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37281975 ccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 37282010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Original strand, 30192545 - 30193411
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30192545 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 30192644  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
     | ||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30192645 tctagcatgttttgggagtacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 30192744  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  | | |  ||||  ||||||||||||||||  |||| ||| | || || || | |||||||||| |||||||| | || ||     
T  30192745 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattttctt-cctttgaa-tgaggtatttcaaacttgccaaacggc-aggagtcc 30192841  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |  || | | || || |||   || ||||| | ||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || |||    
T  30192842 aatatct-gaccgacattctcattgttcctatcaaaggattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggaccttatt 30192940  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
       ||| || || ||||  ||||| |||    |||||||||| |||||| |||||| || |         |||||  || ||  ||  | ||||||||||    
T  30192941 cgtttgacatttaaatatcatcatttaatcacagcctaacaataatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcg-tatattggagtcctgtt 30193039  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg 606  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||| | | |||    |||||||||||||||||||||  | || ||||||    
T  30193040 gcttggcaagtttgaatttaccacattcaaatgtaacacaattgttggagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcttttgaatgggg 30193139  T
Q  607 caattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
     |||||| |||| ||||  | || || |||||||||| || | | | |||||  |||||||||||||||||        | |||||||| |||||||||     
T  30193140 taattcatacttcttaaacgacaagaatccagcattcaatgaacattttgaatgatggtattcaagtgtca--------agctcattcttttgacactta 30193231  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    |||| |||||||||| || || |||  || ||||||||||||  ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30193232 aatagcatcattcaaaattctcatcacatgttggagtcctgctgtttagcacgtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttagaag 30193331  T
Q  807 gtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30193332 gtacattccggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatacataatacattttgttttgaa 30193411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 14 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 36721601 - 36721053
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  36721601 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgattggaataaacgaacgacgaaaacgtg 36721502  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36721501 acgagcaatgtttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 36721402  T
Q  214 aagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||| | ||  || | || |  | ||||| |||||||||| || || |||||   ||| || |||||||||| | |||||| | |   |||     
T  36721401 aagatcgtcatttggtatcgaatgaatgcaccttccacctacaacaattgtgtt-cctct-ggatgaggtaattcaaactagccaaacgacaagtcctc- 36721305  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  36721304 agca-ttcgcccatcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaagctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcatt 36721206  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
    | || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  36721205 tcgtcggcacttgaataccatcatctaaagcaagcataacaaaaatttattcttttcaaagaaaaaacatgaatgtcgggcgaaatgcttgagtcctgtt 36721106  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttg 562  Q
     |||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36721105 gtttgggcagattgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttg 36721053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 50 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 42323565 - 42322795
Alignment:
Q  50 tccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatgg 149  Q
    |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||    
T  42323565 tccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagctcaaaatgtttcagtgg 42323466  T
Q  150 atcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattcc 246  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||  || | || |  | ||||    
T  42323465 atcgatatgctggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccactggaagatcgtcattaggtactgaatgaatgcaccttcc 42323366  T
Q  247 aactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcat-tttgcccaacgttcatgtttttcctttgaa 345  Q
    | |||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| |  || || | ||  | |||   || || || | ||    
T  42323365 agctacaacaattgtctt-cctct-gaatggggtaattcaaacttggcaaac-gacatgactcca--atgttcgaccggcattcccattgttactgtcaa 42323271  T
Q  346 aagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagc 444  Q
    || |||||||| |||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||||||  |||| |||| ||| |    
T  42323270 aa-attaaatttttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatgtacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaaccaaac 42323172  T
Q  445 ctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaa-atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggt 543  Q
    ||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || |||| ||  | ||||| || |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42323171 ctaacaataatttaatcttttgaatggaactatgggaatgccggtcgaacat--tggagtcatgctgcttggcaagtttgaatttactccattcaaaggt 42323074  T
Q  544 aagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagca 640  Q
    || |||||||||| |||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||||    
T  42323073 aacacaattgttggagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatctagca 42322974  T
Q  641 ttcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattgg 740  Q
    |||||| ||| ||||||        || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |||    
T  42322973 ttcgatgagcatcttga--------atccaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatgctgg 42322882  T
Q  741 agtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgt 827  Q
    |||| |||  |||| ||||||||||||| || |||| |  ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  42322881 agtcgtgctgtttaacaagtttgaatttaccccatttagaggtaagaaaattgttgcagtaggaaggtacattcaggaatgtaatgt 42322795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 53826908 - 53826599
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||    
T  53826908 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaatgtg 53826809  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  53826808 atgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 53826709  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53826708 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 53826609  T
Q  314 attttgccca 323  Q
    |||| |||||    
T  53826608 atttcgccca 53826599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 512 - 886
Target Start/End: Original strand, 49273907 - 49274283
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| || || ||| || |    
T  49273907 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacatccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggta 49274006  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49274007 attcaaacttgttaatcgacaggaatccaacattcgataaacatcttgaatactggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaa 49274106  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||||  |||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  49274107 taccatcattcaagatgctgataggatgttggagttctgctgtttagcaagtttgaatttgcc-cattcatggataagataattgttgcagttggaaggt 49274205  T
Q  809 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49274206 acattctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 49274283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 348 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 46346491 - 46345950
Alignment:
Q  348 gattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcct 446  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||   ||| || |||||||| ||||| |||  | |||||    
T  46346491 gattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcgtttgacatttgaataccatcatttaatcccagcct 46346392  T
Q  447 aacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaag 546  Q
    ||||| |||||| |||||| || |         |||||| |  | ||||  | ||||| || |  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46346391 aacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccgatc-aaatattggagtcatgctgcttggtaagtttgaatttacctcattcaaaggtaag 46346293  T
Q  547 acaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattc 643  Q
    |||||||||| |||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||    
T  46346292 acaattgttggagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcagaaattcagcattc 46346193  T
Q  644 gataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagt 743  Q
    ||| ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||    
T  46346192 gatgagccttttgaatactgatattcaagtgtcaatgaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgttgatcggatgctggagt 46346093  T
Q  744 cctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttg 843  Q
    |||||   ||||||||||||||||| || ||||||    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  46346092 cctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcactaataagataattgttgcagttggaagttacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtg 46345993  T
Q  844 ataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  46345992 ataacatatatagttgaataagcataatacattttgttttgaa 46345950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 512 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 45100190 - 45099813
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| || || |||||| |    
T  45100190 ttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggta 45100091  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| | || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45100090 attcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcgatgagcatttttaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaa 45099991  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||| |||||| || || || |||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45099990 tacaatcatttaaaatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttatcccattcaggggtaagataattgttgcagttggaaggt 45099891  T
Q  809 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  45099890 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacacgttgttttgaa 45099813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 42 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 774522 - 774098
Alignment:
Q  42 tataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgt 141  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||  |||||    
T  774522 tataaacgtccaacgctcgacgacgggagaatatcattcagttggatggaattaacgaacgatgaaaacgtgaagaacatgttttcggagcactgcatgt 774423  T
Q  142 tccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgc 241  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||| ||| | || |  |    
T  774422 tccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattccaccagaagatcgtgattaggtaggg-aatgcac 774324  T
Q  242 attccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctt 341  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||||||||  ||| | ||| | | | | ||||  ||||||| |||||||||||| ||    
T  774323 cttccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatgga--aattcaaacttgctaaatg-ccaggtccccaacattc-gcccaacattcatgtttttcttt 774228  T
Q  342 tgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagc 440  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  774227 tgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcgtttcgttggcacttgaataacatcatctaaagc 774128  T
Q  441 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaag 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  774127 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaag 774098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 512 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 10053101 - 10052724
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| || || || ||| |    
T  10053101 ttggcaagtttgaatttatcctattgaaaggtaacaaaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaattgggta 10053002  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||| ||||    
T  10053001 attcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcaataagcatcttgaatactggtattgaagtgtcaaggaatgcatctcgttcttttgacacctgaa 10052902  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||| |||||||||  |||||| || ||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10052901 taccataattcaagatgttgatcggatgttggagtcctgctgtttaacaagtttgaatttgcctcattcaagggtaagataattgttgcagttggaaggt 10052802  T
Q  809 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  10052801 acattctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatgtatagttgaatgtgcataatacattttgttttgaa 10052724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 491 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 19452883 - 19452517
Alignment:
Q  491 gaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaat 587  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    ||||  |||||||||    
T  19452883 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccatttgcaacaat 19452784  T
Q  588 tgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcac 687  Q
    |||||| ||||| | |  | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19452783 tgtcttcctctgaaagatgtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcatgtgatgtgcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcac 19452684  T
Q  688 ctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaaga 787  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||  || ||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||    
T  19452683 ctcattcttttgacactttaataccatcattcaagatgctcattggattatgcagtcctgctgtttagcaagtctgaatttgcctcattcagtggtaaga 19452584  T
Q  788 taattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19452583 taattgttgtagttggaaggtacattctagaatataatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 19452517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 465
Target Start/End: Original strand, 6754211 - 6754660
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6754211 agacacaaagagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 6754310  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || ||    
T  6754311 acgatcatgttttgggagtacaacatgttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgctag 6754410  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||| ||||  ||| | || |  | |||||||||||||||  |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| | ||    |||| |    
T  6754411 aagatcgtgattatgtagggaaatgcaccttccaactacaacaactgtctta-ctctgaaatggggtaattcaaacttgttaaac-gacagttttcaaac 6754508  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    | ||  ||  || | | | || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||| |     
T  6754509 a-ttcaccagacatgcctattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaatgtattgaagtgttaaggaatgaacctcattctt 6754607  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  6754608 ttgacacttgaataccatcatttaaaccaagcctaacaataatttaatctttt 6754660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 55207096 - 55206883
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  55207096 agacagaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 55206997  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  55206996 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 55206897  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  55206896 aagatcgtcattag 55206883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 512 - 886
Target Start/End: Original strand, 14631949 - 14632316
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |    |||||   ||||||||||||| || || |||||| |    
T  14631949 ttggcatgtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtataaacgtccaaaaacaacaattgtcttcctttgaatggggta 14632048  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    |||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  14632049 attcaaacttgttaaacggaaggaatccagcattcgataaacatcttgaatactggtattgaagtgtcaaggaatgcaccccattcttttgacaattgaa 14632148  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  14632149 taccatcattcaagatgctcatcgcaagttggagtcctgctatttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaaagt 14632248  T
Q  809 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||| ||||||||||||||          ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14632249 acattccgaaatgtaatgtaatg----------tgataacgtatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 14632316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 49610496 - 49610748
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49610496 agacacaaggagggtggaacaccttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 49610595  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  49610596 acgagcatgttttgggagcacagtatgttccagtgggtcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 49610695  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttac 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  49610696 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttac 49610748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 6464556 - 6464108
Alignment:
Q  15 gacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtga 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6464556 gacacaaagagggtggaatacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtga 6464457  T
Q  115 cgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgaga 214  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| || |||    
T  6464456 caatcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattctgcaaga 6464357  T
Q  215 agatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagca 314  Q
    ||||||| ||||  ||| | || |  | |||||||||||||||   ||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||| | ||    || | ||    
T  6464356 agatcgtgattatatagggaaatgcaccttccaactacaacaactctctta-ctctgaaatggggtaattcaaacttgttaaacag-cagttttctaaca 6464259  T
Q  315 ttttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
     ||   || || ||  | || ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | |    
T  6464258 -ttcatccgacatttctattgttcctttcaaaagattaaattctttttaggctagtttagatgaaggtattaaagtgttaaggaatgaacctcattcttt 6464160  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    || ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  6464159 tgtcacttgaataccatcatttaaaccaagcctaacaataatttaatctttt 6464108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 51695818 - 51695541
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  51695818 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaaaagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaatacgtg 51695719  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  51695718 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 51695619  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgt 293  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  51695618 aagatcatcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaataattgtctta-ctctc-gatggggcaattcaaacttgt 51695541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34647479 - 34647266
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34647479 agacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34647380  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  34647379 acgagcatgtttcgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattacgctag 34647280  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  34647279 aagatcgtcattag 34647266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 51015284 - 51015497
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51015284 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagtgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 51015383  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51015384 acgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggaaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 51015483  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  51015484 aagatcgtcattag 51015497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 570 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 51695591 - 51695312
Alignment:
Q  570 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||    
T  51695591 cattccaactgcaataattgtcttactctcgatggggcaattcaaacttgttgatcggcaggactccagcattcgataagtgtcttgaacgctggtattc 51695492  T
Q  670 aagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatttt 769  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||     
T  51695491 aagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttg 51695392  T
Q  770 cctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    || ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||     ||||||||||||| |||||||||||||    
T  51695391 ccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtacattctggaatgt-----aatgcaatgtaatgtgataacatatat 51695312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 344 - 854
Target Start/End: Original strand, 41804238 - 41804751
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| || ||||||||  |||| |||  | |    
T  41804238 aaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattcttttgacatttgaataccgtcatttaacccca 41804337  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
     | |||||| |||||| |||||| || |         |||||| || |||| |  | |||||||  |  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41804338 acttaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggtcgaa-tattggagtcctactgcttgacaagtttgaatttaccccattcaaagg 41804436  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatg---cacat-tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccag 638  Q
    ||| ||||||||||||||||| | |   || |  ||||||| ||||  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||    
T  41804437 taacacaattgttgtagttgggaggtttcaaacgtccaactccaacg-ttgttttcctctgaatggggcaattcaaacttgttaaacggcagaaatccag 41804535  T
Q  639 cattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatatt 738  Q
    ||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||  |    
T  41804536 catgcgatgtgcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgctcctcattcttttgacacttgaataccgtcattcaagatgctcatcggatgct 41804635  T
Q  739 ggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgta 838  Q
    |||||  |||  |||| |||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41804636 ggagttatgctgtttaacaagtttgaatttgtctcattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgta 41804735  T
Q  839 atttgataacatatat 854  Q
    || |||||||||||||    
T  41804736 atgtgataacatatat 41804751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 344 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 52569292 - 52568806
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| || | ||| || ||||||||  |||| |||  | |    
T  52569292 aaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcgttcttttgacatttgaatacagtcatttaatccca 52569193  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || |         |||||| |  |||| |  | |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  52569192 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccgaacgaa-tattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcacagg 52569094  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagc 639  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||  |||||||    |||    
T  52569093 taagacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcagga----agc 52568998  T
Q  640 attcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattg 739  Q
    || ||||   | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||    
T  52568997 atgcgatgtccatcttaaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgctcatcgaatgttg 52568898  T
Q  740 gagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||| ||   ||||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  52568897 gagtcatgttgtttagcaagtttgaatttgtcacattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtatattccgaaatgtaatgtaatg 52568806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 23 - 265
Target Start/End: Original strand, 42382287 - 42382529
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42382287 gagggtggactacgttcagtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg 42382386  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  42382387 ttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaagttgattccgccagaagatcgtc 42382486  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtctta 265  Q
    ||||||| |   || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42382487 attagttgggacaatgtgcattccaactacaacaattgtctta 42382529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 41803909 - 41804122
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41803909 agacaaaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 41804008  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  41804009 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgagagtgacgttgatgagatcaaatgaagatataatcaaaagtttgattccgccag 41804108  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  41804109 aagatcgtcattag 41804122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45100677 - 45100464
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||    
T  45100677 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaatgtg 45100578  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  45100577 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccat 45100478  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    || |||||||||||    
T  45100477 aatatcgtcattag 45100464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 575 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 36720986 - 36720730
Alignment:
Q  575 caactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtg 674  Q
    ||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  36720986 caactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggactccaacattcgataagcatcttgaataattgtattcaagtg 36720887  T
Q  675 tcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctca 774  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||    
T  36720886 tcaaggaatgcacctcattcttttgacacttaaatatcatcattcaagatgttgatcgaatattggagtcctacagtttagcaagtttgaatttacctca 36720787  T
Q  775 ttcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  36720786 ttcaagggtaagataattgttgcagttggaatgtacatttcgaaatgtaatgtaatg 36720730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 570 - 831
Target Start/End: Original strand, 49610723 - 49610984
Alignment:
Q  570 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||    
T  49610723 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatgggacaattcaaacttgttaatcggcaggactccagcatccgataagcgtcttgaacgctggtattc 49610822  T
Q  670 aagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatttt 769  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||   |||||||||    ||||||||||||||||     
T  49610823 aagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcattcaagatgctgattgaataccagagtcctgctggatagcaagtttgaatttg 49610922  T
Q  770 cctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    || ||||||  |||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49610923 ccccattcagtggtaagattactattgcagttggaaggtacattccgaaatgtaatgtaatg 49610984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 222
Target Start/End: Original strand, 43569917 - 43570125
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43569917 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttacttgggtggaactaacgaacgacgaaaacgtg 43570016  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  43570017 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccag 43570116  T
Q  214 aagatcgtc 222  Q
    |||||||||    
T  43570117 aagatcgtc 43570125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10053483 - 10053274
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10053483 agacacaaggagggtggaatacattcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 10053384  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  10053383 atgagcatgttttgggagc---acatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaa-atatcatcaaaagtttgattccgccag 10053288  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  10053287 aagatcgtcattag 10053274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 14631452 - 14631665
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14631452 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagtaaagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacaacgaaaacgtg 14631551  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  14631552 acgagcatgttttgggagcaaaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 14631651  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  14631652 aagatcgtcattag 14631665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47760103 - 47759890
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47760103 agacacaaggagggtggaacacgttccgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 47760004  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || | |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47760003 acaaacatgttttgggaacacagcatgttccagtggatcgatgtacgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 47759904  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  47759903 aagatcgtcattag 47759890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 512 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 55206599 - 55206281
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  55206599 ttggcaagtttgaatttaccccattaaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacatccaactgcagcaattgtcttcctctgaatggggca 55206500  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||  || | |||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  55206499 attcaaacttgttaaacggcaggaatccagcatgtgatgtgcatattgaacaatgatattcaagtgacaaggaatgcatctcattcttttgacacttgaa 55206400  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||||||| ||  |||| || |||| ||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  55206399 taccatcgttgcagatgctcatcggatgcaggagtcctgctgtttagcaagtttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaatgt 55206300  T
Q  809 acattccggaatgtaatgt 827  Q
    |||||||||||||||||||    
T  55206299 acattccggaatgtaatgt 55206281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52569597 - 52569408
Alignment:
Q  37 ttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52569597 ttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaa-gtgacgagcatgttttgggagcacaa 52569499  T
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52569498 catgttccggtgaatcgatatgcgggtgacattgctgagatcaactgaagatatcatcaagagtttgattccgccagaagatcgtcattag 52569408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 531 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 55268758 - 55268431
Alignment:
Q  531 cccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattg 626  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||       
T  55268758 cccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacatccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggcaaattcaaacttgctaaaca 55268659  T
Q  627 gcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcc 726  Q
     |||||||||  ||| |||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  55268658 acaggactccgacatccgatgagcatctgcaacgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcgttgcagatgc 55268559  T
Q  727 tgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatg 826  Q
    | |||| || | ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  55268558 tcatcggatgtcggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtatgataattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatt 55268459  T
Q  827 taatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  55268458 taatgcaatgtaatgtgataacatatat 55268431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 8633571 - 8632997
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8633571 agacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 8633472  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||  || ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  8633471 acgaatattttttgggatgacaacgtgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgcgatcatctgaagatattatcaacagtctgattccgccag 8633372  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||| ||  | |   ||||  |||||||||||||| ||||| ||| |  |||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  8633371 aagatcgtcattaggtaccgaa---tgcaccccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacgg-caggactccagc 8633278  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    | || |  |  | ||  | || ||||||| ||||||||||||| ||||||  |  ||||| || |||||||| ||||||||| || || | |||||| |     
T  8633277 a-ttcgatcggcatttctattgttcctttcaaaagattaaatttttgttagaccagtttaaataaaggtattgaagtgtcaatgattgcacctcattctt 8633179  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||| ||||||  ||||| || |          ||||| |  || |||| | ||||| || |  |    
T  8633178 ttgacacttgaataccatcatttaatccaaacctaacaagaatttaaacttttgaatggaacaatggaaatgccgatcg-aatgttggagtcttgctgct 8633080  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    |||||||| |||||||||||||||    
T  8633079 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtgtcttccaactacaacaattgtcttac 8632997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 33449351 - 33448916
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33449351 agacacaaggagggtgaaatacgttcgatataaacgtcaaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 33449252  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||            |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  33449251 aagaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgata------------tgctgagatcaactgaagatatcatccaaagtttgattccgccag 33449164  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||| ||||| ||| | || |  | |||||||||||||||| || || |||||   |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  33449163 aagatcgtaattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgt-tttcctct-ggatggggtaattcaaacttgtcaaacgg-caggactcaaac 33449068  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    | || | |  || ||    || ||||||| ||||||||||||| |||||| | || |||||||||  ||||| |||||||||  |||| | || ||| |     
T  33449067 a-ttcgtcagacatttccattgttcctttcaaaagattaaattgttgttaggttgatttagatgacagtattgaagtgtcaataaatggaccttattctt 33448969  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  33448968 ttgacacttgaataccatcatctaaaccaatcctaacaacaatttaatctttt 33448916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 49273406 - 49273619
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49273406 agacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgagggcagagtatcattcacttgggtggaattaatgaacgacgaaaacgtg 49273505  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||    
T  49273506 acgagcatgttctgggagcacaacatgttccagttgatcaatatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattcttccag 49273605  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    || |||||||||||    
T  49273606 aatatcgtcattag 49273619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 344 - 827
Target Start/End: Original strand, 51015613 - 51016091
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||| |||||  |||| |||| |||    
T  51015613 aaaagattaaattcttgttagtccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttcacacttaaataccgtcatttaaaccaa 51015712  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
     |||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || || | |  | |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51015713 acctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggtcgta-tattggagtcctgctgcttggcaaatttgaatttaccccattcaaagg 51015811  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagc 639  Q
    ||| |||||||||| |||||| | | |||    |||||||||||||||||||||  | || |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  51015812 taacacaattgttggagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcatttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggactccaac 51015911  T
Q  640 attcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattg 739  Q
    || |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||   |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||    
T  51015912 atgcgatgagcatcttgaatgatggtattcaagtgtcaaaaga--------attcttttgacacttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatgctg 51016003  T
Q  740 gagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgt 827  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  51016004 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagatgattgttgcagttgtaaggtacattcgggaatgtaatgt 51016091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 563 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 34646877 - 34646566
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggc-aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaa 661  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||||| || | |||||||  |    
T  34646877 gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctctaaatgggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcgaaaaacatcttgaatga 34646778  T
Q  662 tggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtt 761  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |  |||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  34646777 tggtattcaagtgtcaacgaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatttaaaatgcgcatcgaatactggagtcctgctgtttagcaagtt 34646678  T
Q  762 tgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaa 861  Q
    ||||||| || |||| |  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||          ||||||||||||||||| ||    
T  34646677 tgaatttaccccatttagaggtaagataattgttgctattggaaggtacattccgtaatgtaatgtaatg----------tgataacatatatagttgaa 34646588  T
Q  862 tatgcataatacattttgtttt 883  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  34646587 tatgcataatacatgttgtttt 34646566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 458
Target Start/End: Original strand, 7954210 - 7954655
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaagggg-agagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgt 112  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7954210 agacacaaggagggtggaatacgttcggcataaacgtccaacactcgatgagggggagggtatcatttagttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgt 7954309  T
Q  113 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||| |    
T  7954310 gacgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaaagttgctaagatcaactgaagatattatcaacaatctgattccgcta 7954409  T
Q  213 gaagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactc 309  Q
    ||||||||||||||| ||  || | || |  | ||| |||||||||||| ||||| ||| |  |||| || |||||||||||| ||||||| || |||||    
T  7954410 gaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttctaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatgaggtaattcaaacttgccaaacgg-caagactc 7954506  T
Q  310 aagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggt-attaagtgtcaaggaatgaagctcat 408  Q
     | || || |  | || ||  | || ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||| || ||||||||||||||| | |||||    
T  7954507 caaca-ttcgatcgacatttctattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgatggtaatcaagtgtcaaggaatgcacctcat 7954605  T
Q  409 tttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaattta 458  Q
    | | ||| ||||||||||| ||||| |||    |||||||||| ||||||    
T  7954606 tcttttgacacttgaataccatcatttaatctcagcctaacaagaattta 7954655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 50458903 - 50458690
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||||||  | ||| ||| |||||  ||||||||||| || ||||||||||||| || | |||||||||||  ||||||||||||||| ||    
T  50458903 agacacaaggagggtgggacacggtcgatataagtgtccaacgctcgacgaggggagagtatcgtttaattgggtggaatctacgaacgacgaaaacttg 50458804  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  50458803 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatagatatgcgggtgacgttgttgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcctg 50458704  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  50458703 aagatcgtcattag 50458690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 20376077 - 20375646
Alignment:
Q  31 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 130  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||| || | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||    
T  20376077 aatatgttcggtataaacgtctaatgctcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtgaggagtatgttttgaga 20375978  T
Q  131 gcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagtta 230  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||  | |||  |||||||||||| | || ||||| ||||| ||    
T  20375977 gcacaacatgttcaagtagatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaatttaagataataacaactgtttgattccgccaaaatatcgtgattaggta 20375878  T
Q  231 gagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttca 330  Q
    | | || |  | |||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||   | ||||| |||  |||  | ||      
T  20375877 g-ggaatgcaccttccaactacaaaaattgtctta-ctctgaaatgggttaattcaaacttgttaaacgg-cagttcccaagc-tttcacccggcatttt 20375782  T
Q  331 tgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatacta 429  Q
    | || ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||||||| ||    
T  20375781 tattgttcctttcaaaagattaaatacttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatatta 20375682  T
Q  430 tcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    |||| |||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  20375681 tcatttaaatcaagtctaacaataatttaatctttt 20375646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 703 - 886
Target Start/End: Original strand, 43570558 - 43570741
Alignment:
Q  703 cttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttg 802  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43570558 cttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcatgctgtttagcaagtttgaatttgcccaattcaagggtaagataattgttgcagttg 43570657  T
Q  803 gaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43570658 aaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 43570741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 27186955 - 27187168
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||  ||||||| |||||| ||||    |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27186955 agacacaaggagggtggaatacgtttagtataaatgtccaatgctcgtagaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatg 27187054  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | | ||||||||| |     
T  27187055 acgaacatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacaatctgattccgccat 27187154  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    || ||||| |||||    
T  27187155 aatatcgtgattag 27187168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 106 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 46346732 - 46346612
Alignment:
Q  106 aaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46346732 aaaacgtgacgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgat 46346633  T
Q  206 tccgcgagaagatcgtcatta 226  Q
    ||||| ||||||| |||||||    
T  46346632 tccgccagaagattgtcatta 46346612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 135 - 465
Target Start/End: Original strand, 18440873 - 18441200
Alignment:
Q  135 aacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagt 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||     
T  18440873 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagag- 18440971  T
Q  235 aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtt 334  Q
    || |  | |||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |  | ||||| ||   ||    |||| | ||    
T  18440972 aatgcaccttccaactacaacaattgtctta-ctctgaaattgggtaattcaagcttgttaaacggccgt-tcccaagccttcacccggtggttc-tatt 18441068  T
Q  335 tttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcat 433  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  18441069 gttcctttcaaaagattaaattcttgttaggttggtttagatgaaggtattgaagtgtcaagggatgcacctcattattttgacacttgaataccatcat 18441168  T
Q  434 ctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
     |||| |||||||||||| | |||| ||||||    
T  18441169 ttaaaccaagcctaacaagagtttaatctttt 18441200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 135 - 465
Target Start/End: Original strand, 19485947 - 19486274
Alignment:
Q  135 aacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagt 234  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||     
T  19485947 aacatgttccagtggatcgatatgtgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtagag- 19486045  T
Q  235 aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtt 334  Q
    || |  | |||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |  | ||||| ||   ||    |||| | ||    
T  19486046 aatgcaccttccaactacaacaattgtctta-ctctgaaattgggtaattcaagcttgttaaacggccgt-tcccaagccttcacccggtggttc-tatt 19486142  T
Q  335 tttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcat 433  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  19486143 gttcctttcaaaagattaaattcttgttaggttggtttagatgaaggtattgaagtgtcaagggatgcacctcattattttgacacttgaataccatcat 19486242  T
Q  434 ctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
     |||| |||||||||||| | |||| ||||||    
T  19486243 ttaaaccaagcctaacaagagtttaatctttt 19486274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 570 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 53826681 - 53826439
Alignment:
Q  570 cattccaactgcaacaattgtcttac-tctgga-tggggcaattcaaacttgttaattggc-aggactccagcatt-cgataagcctcttgaacaatggt 665  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||| ||  ||| | ||||| |||||| ||   ||| ||||||||| ||||    
T  53826681 cattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcatttcgcccagcgtcttgaacactggt 53826582  T
Q  666 attcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaa 765  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||     
T  53826581 attcaagtgtcaagtaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaaaatgctgatcgaatattggagtcttgctgcttagcaagtttgag 53826482  T
Q  766 ttttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53826481 tttgccccattcatgggtaagacaattgttgtagttggaaggt 53826439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 25887796 - 25887543
Alignment:
Q  40 ggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacat 139  Q
    ||||||||||||||||| || || | |||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||| || |||||||||||||||||||||    
T  25887796 ggtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatatcactcagttgggtggaattaacaaacgacgaggatgtgaggaccatgttttgggagcacaacat 25887697  T
Q  140 gttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaagg- 238  Q
    ||||   |||||| ||||| | |  |||||| |||||||||||||||||||  || | ||||||||||||| |||| ||||| |||| |||| ||| ||     
T  25887696 gttctcgtggatc-atatgtgtggaacgttgttgagatcaactgaagatattctccacagtttgattccgctagaatatcgtgatta-ttag-gtaggga 25887600  T
Q  239 -tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttg 292  Q
     ||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  25887599 atgcaccttccaactacaacaattgtcttacctatgaaatgggataattcaaacttg 25887543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 302 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 43477555 - 43477285
Alignment:
Q  302 catgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa- 398  Q
    ||||||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| |||     
T  43477555 catgactcaagcatttcacccggcattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgacaacgaaa 43477457  T
Q  399 tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgct 498  Q
    ||| | |||||   ||| ||||| |||||  ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | ||||||||||    
T  43477456 tgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatctaaacca-gcctaacaagaatttaatcttttcaaagaaaaaacatgaatgccgagcgaaatgct 43477360  T
Q  499 tgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatt 573  Q
    ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43477359 tgactcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacagttgttgaagttggaatgcacatt 43477285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 344 - 658
Target Start/End: Original strand, 43570246 - 43570563
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||| ||||| |||  | |    
T  43570246 aaaagattaaattcttgttaggcttgtttaaatgaaagtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatccca 43570345  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
    | | ||||| |||||| |||||| || |         |||||| || ||  ||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43570346 gtccaacaacaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggtcg-tatattggagtcctgctaattggcaagtttgaatttacctcattcaaagg 43570444  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagc 639  Q
     |||||||||||||  ||||| |   |||    ||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||    
T  43570445 caagacaattgttgctgttgggagatacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaagaatccagc 43570544  T
Q  640 attcgataagcctcttgaa 658  Q
    || |||| ||| |||||||    
T  43570545 atgcgatgagcatcttgaa 43570563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 14265415 - 14265625
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||| || || | ||| || ||||||||| |||| || |||||| |||||||||   ||||    
T  14265415 agacacaaggaaggtggaatacgttcggtataaacatccaacgttcgacgatgggtgaatatcattcagttggatgaaattaaggaacgacga---cgtg 14265511  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| || | || ||||| ||||||| |||| |||||||  || | |||||||||||||  |    
T  14265512 acgaacatgttttgggaccacaacatgttaccgtggatcgatttgtgtgtaacgttactgagattaactaaagatattctccagagtttgattccgcctg 14265611  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  14265612 aagatcgtgattag 14265625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 733 - 827
Target Start/End: Original strand, 27187798 - 27187892
Alignment:
Q  733 aatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgt 827  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27187798 aatatttgagtcctgctatttagcaagtttgaatttacctcattcagaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacattcccgaatgtaatgt 27187892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Original strand, 24701929 - 24702260
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||||| |||||  || ||||||||||||||  |||  | |||||| ||||    
T  24701929 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaacc-tgactcaagcatttcacccggcattcatg-tttt 24702026  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatg-ctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |  || ||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||| | ||| ||  ||| ||||| |||||  |||||    
T  24702027 cctttgaaaagaataaatttttgttaggtgtgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aataccttcatc 24702124  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttatttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| | |||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |||||||    
T  24702125 taaa-ccagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaa-ttacccc 24702222  T
Q  534 a-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24702223 atttcagaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 24702260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Original strand, 25576248 - 25576580
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||| | |||||  | | ||||||||||||| ||||   ||||||||||||    
T  25576248 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaacaac-aggactcaagcatttcgccccgtgttcatgttttt 25576346  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| || || ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  |||||    
T  25576347 ccttttaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatc 25576444  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| || || |||||| |||||| |||||||||||        |||| || |||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||| |||||||    
T  25576445 taaacca-gcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaa-ttacccc 25576542  T
Q  534 a-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25576543 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 25576580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Original strand, 44835144 - 44835475
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||||  |||||  | | ||||||| ||||| ||||  | ||||||||||     
T  44835144 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttaccaaacaac-aggactcaaacatttcgcccggcattcatgtttt- 44835241  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  |||||    
T  44835242 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatc 44835339  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| || ||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||| |||||||    
T  44835340 taaacca-gcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaagtgcttgagtcctggccgtttgacaagtttgaa-ttacccc 44835437  T
Q  534 a-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44835438 atttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 44835475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 729 - 854
Target Start/End: Original strand, 46405725 - 46405852
Alignment:
Q  729 atcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgt- 827  Q
    |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||     
T  46405725 atcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaatttcggaatgtaatgta 46405824  T
Q  828 -aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||    
T  46405825 aaatgcaatgtaatgtgataacatatat 46405852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 570
Target Start/End: Original strand, 49218460 - 49218724
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tga 401  Q
    ||||||||||||| || | || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| || || ||| ||| |||    
T  49218460 gactcaagcatttcgctcgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatga 49218558  T
Q  402 agctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttga 501  Q
     | |||||   ||| ||||| |||||  ||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||         ||||||| | |||||||||| ||    
T  49218559 ggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatctaaacca-gcctaacaagaatttaatcttttcaaaagaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcga 49218655  T
Q  502 gtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49218656 gtcctgttgtttgacatgtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 49218724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 345 - 575
Target Start/End: Original strand, 27187650 - 27187880
Alignment:
Q  345 aaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaag 443  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||| || || || | ||||    
T  27187650 aaagattaaattcttgttaggccgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccattatttataccaag 27187749  T
Q  444 cctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggt 543  Q
    |||||||| |||||| |||||  || |          ||||  || | || |  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27187750 cctaacaagaatttaatctttggaatggaacaatagaaatgtcggactaa-tatttgagtcctgctatttagcaagtttgaatttacctcattcagaggt 27187848  T
Q  544 aagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  27187849 aagacaattgttgtagttggaaggtacattcc 27187880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 54391238 - 54390995
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  54391238 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgataagcatcttgaacgatggtattc 54391139  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  54391138 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-tt 54391041  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  54391040 gcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 54390995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Original strand, 13895527 - 13895858
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||||||||||| |||||  | | ||||||| |||||  |||  | ||||||||||     
T  13895527 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaac-aggactcaaacatttcacccggcattcatgtttt- 13895624  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||| | |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| || || ||| ||| ||||| |||||   ||| ||||| |||||  |||||    
T  13895625 cctttgaaaaaaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaagttcattcc-ttgacactt-aataccttcatc 13895722  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| || ||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||||    |||| |||||||||| |||||||    
T  13895723 taaacca-gcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttgacaagtttgaa-ttacccc 13895820  T
Q  534 a-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13895821 atttcagaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 13895858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 608 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 34050485 - 34050280
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||    
T  34050485 aattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgataagcatcttgaacgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttg 34050387  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    ||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| || || || || ||||||||| |||||||| ||||||||     
T  34050386 aataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaat 34050289  T
Q  807 gtacattcc 815  Q
    || ||||||    
T  34050288 gtgcattcc 34050280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 334 - 570
Target Start/End: Original strand, 48087303 - 48087540
Alignment:
Q  334 ttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatc 431  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| |||   || ||  ||  ||| ||||| |||||  ||    
T  48087303 ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggtccattccttgacactt-aataccttc 48087401  T
Q  432 atctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttac 530  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||    
T  48087402 atctaaacca-gcctaacaaaaatttattcttttcaaagaaaaaacatgaatgctgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-ac 48087499  T
Q  531 cccattcaa-aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48087500 cccattttagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 48087540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Original strand, 3494452 - 3494695
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||   ||||||| |||| ||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  3494452 ttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgtcaagcagcaggacaccagtattcgatcagcatcttaaacactggtattc 3494551  T
Q  670 aagtgtcaa-tgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    |||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  3494552 aagtgtcaacagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgttcaagatgatcatcgaatactggagtcctgccgattagcaagtttgaa-tt 3494649  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  3494650 gcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 3494695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 2268403 - 2268482
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2268403 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 2268482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 4003996 - 4004075
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4003996 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 4004075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 345 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 34647149 - 34646929
Alignment:
Q  345 aaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaag 443  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||||||  |||| |||| |||     
T  34647149 aaagattaaattcttgttagggcggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaaccaaa 34647050  T
Q  444 cctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggt 543  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||           |||||  ||   |||   | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34647049 cctaacaaaaatttaatcttttgaatagaactatgggaatgtcggtt-aaacattggagtcatgttgtttgacaagtttgaatttaccccattcaaaggt 34646951  T
Q  544 aagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  34646950 aacacaattgttgtagttggaa 34646929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 627 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 42383791 - 42383605
Alignment:
Q  627 gcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatc 725  Q
    |||||||||||  ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  42383791 gcaggactccaatattcgatcagcatcttgaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccatcattcaagagg 42383693  T
Q  726 ctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    || ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| || || || || || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  42383692 cttatcgaatgttggagtcctgccaattaacaagtttgaa-ttgcccca-tccagagtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattcc 42383605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Original strand, 13895295 - 13895502
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  13895295 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaac 13895394  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
      ||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||| ||| ||||||||   ||| |||    
T  13895395 gctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcgttcaagacacttatcgaatgttgaagtcctgccgattaacaa 13895493  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  13895494 gtttgaatt 13895502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 36135317 - 36135239
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 569  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36135317 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgca 36135239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 608 - 815
Target Start/End: Original strand, 49139515 - 49139720
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||    
T  49139515 aattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgataagcatcttgaacgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttg 49139613  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    ||||||||  |  ||||| || |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| || || || || ||||||||| |||||||| ||||||||     
T  49139614 aataccattgtctaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaat 49139711  T
Q  807 gtacattcc 815  Q
    || ||||||    
T  49139712 gtgcattcc 49139720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 101
Target Start/End: Original strand, 15637031 - 15637118
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaac 101  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15637031 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacactcgacgatgggagaatatcattcagttgggtggaattaatgaac 15637118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 465
Target Start/End: Original strand, 7954988 - 7955110
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| |||||||||||||| || |||| |||    
T  7954988 aaaatattaaattcatgttacgctggtttaaataaaggtattgaagtgtcaaggaatgtacctcattcttttgacacttgaatactattatttaaaccaa 7955087  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||||||||  |||||| ||||||    
T  7955088 gcctaacactaatttaatctttt 7955110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 608 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 51016031 - 51015880
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttga 707  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||   |        ||||| |||||||||||    
T  51016031 aattcaaacttgctaaacagcaggactccagcatgcgatgagcatcttgaatgatggtattcaagtgtcaaaaga--------attcttttgacacttga 51015940  T
Q  708 ataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||||||||||||| || |||| || ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  51015939 ataccatcattcaagatgctcatcgcatgttggagtcctgccgtttaacaagtttgaatt 51015880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 3494938 - 3495017
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3494938 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgaaaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 3495017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 11378909 - 11378840
Alignment:
Q  254 acaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccca 323  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11378909 acaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacgaccatgactcaagcatttcgccca 11378840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 762 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 33448860 - 33448791
Alignment:
Q  762 tgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  33448860 tgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgtagttggaaggaacattcccgaatgtaatgtaatg 33448791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 34050037 - 34049958
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  34050037 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcac 34049958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 563 - 668
Target Start/End: Original strand, 37282062 - 37282167
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || || || |||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||  ||||||| ||||||| |||    
T  37282062 gaatgcaccttccaactgcaacaattgttttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcatgactccaacatctgataagcatcttgaataat 37282161  T
Q  663 ggtatt 668  Q
    ||||||    
T  37282162 ggtatt 37282167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Original strand, 39416604 - 39416936
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaa-ttcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttt 336  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| | || |||||||| |||||||||  |||||  | ||||||||| |||||  |||  | ||||||||||    
T  39416604 gtgcattccaactacaacaattatcttacctttgaa-tggggcaaattcaaacttcccaaacaac-atgactcaaacatttcaccccgcattcatgtttt 39416701  T
Q  337 tcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
     |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| |||   || ||  ||  ||| ||||| |||||  |||||    
T  39416702 -cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggtccattccttgacactt-aataccttcatc 39416799  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaa-tgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccc 532  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||        | ||||| | |||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||  |||    
T  39416800 taaacca-gcctagcaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacattaatgctgagcgaaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattatccc 39416898  T
Q  533 cattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
      || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39416899 attttagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 39416936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 565 - 815
Target Start/End: Original strand, 44834902 - 44835152
Alignment:
Q  565 atgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||| |||    || ||||||| ||| |||| | | |||||||  ||    
T  44834902 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgctcctgaatggggcaaattcaaacttgctaagcaacaagactccaacatacgatcaacatcttgaatgat 44835001  T
Q  663 ggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtt 761  Q
    | ||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||| | ||||    
T  44835002 gatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccatcgttcaagatgcttatcgaatgttggagtcctgcggattaacgagtt 44835100  T
Q  762 tgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||| || || || || || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  44835101 tgaa-ttgcccca-tctagagtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattcc 44835152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 49139963 - 49140042
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  49139963 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcac 49140042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 54390752 - 54390673
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  54390752 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcac 54390673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Original strand, 2646299 - 2646496
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  2646299 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggaatccagtattcgataagcatcttgaacgctggtattc 2646398  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  2646399 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 2646496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 2646785 - 2646864
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2646785 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaggtttgaatt-accccattcaaatg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 2646864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 661 - 718
Target Start/End: Original strand, 7954574 - 7954631
Alignment:
Q  661 atggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7954574 atggtaatcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 7954631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 42383613 - 42383282
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| || | || |||   |||||||||||| |||||  | | |||||||||||||  |||  | ||||||||||     
T  42383613 gtgcattccaactacaacaattgtcttatctttgaattggataaattcaaacttgccaaacaac-aggactcaagcatttcacccggcattcatgtttt- 42383516  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| ||||||  ||||| ||| | |||| |||| |||||| ||||| ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  |||||    
T  42383515 cctttgaaaagaataaatttgtgttacgcttgctttaaatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatc 42383418  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | | |||||| ||||||| ||    ||||||||||||||||| |||||    
T  42383417 taaa-caagcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagtgaaatgtttgagtcatggccgtttggcaagtttgaatt-acccc 42383320  T
Q  534 attcaa-aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42383319 attttagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 42383282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 696 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 42949773 - 42949660
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagc-aagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgt 794  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | || |||||||||||    ||||| |||||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||    
T  42949773 cttgacacttgaataccagcattcaagatgttgattgtatgttggagtcctgttgcttagccaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgt 42949674  T
Q  795 tgtagttggaaggt 808  Q
    ||||||||||||||    
T  42949673 tgtagttggaaggt 42949660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 44928025 - 44927694
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||||||||||| ||| |   || ||||||| |||||  |||  | |||||| ||||    
T  44928025 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaagc-aacaggactcaaacatttcacccggcattcatg-tttt 44927928  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||| | ||| ||  ||| ||||| |||||  |||||    
T  44927927 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aatacattcatc 44927830  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctg-ttatttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| | | |||||||| |||||| | |||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||    
T  44927829 taaa-ccatcctaacaagaatttaatattttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctgaccgtttggcaagtttgaa-ttacccc 44927732  T
Q  534 a-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | ||   ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44927731 attttttaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 44927694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 46403313 - 46403234
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  46403313 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcac 46403234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 50997698 - 50997619
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  50997698 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttaccccattcaaaag-aatacaattgttgtagttggaatgcac 50997619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 385
Target Start/End: Original strand, 11378634 - 11378781
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||  |||  |||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  11378634 gtgcattccaactccaacaattgtcttgcctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-aggactcaagcattttgcctcgcattcatgttttt 11378732  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  11378733 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 11378781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 696 - 808
Target Start/End: Original strand, 36720882 - 36720992
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgtt 795  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||    
T  36720882 cttgacacttgaatacaattattcaagatgcttatcgaatgttggagtcctgccgtttaacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aagacaattgtt 36720979  T
Q  796 gtagttggaaggt 808  Q
    | ||||| |||||    
T  36720980 gcagttgaaaggt 36720992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Original strand, 46413730 - 46413937
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || || |||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| |   |||| ||     
T  46413730 ggaatgtaccttgcaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaaccgcaggactccagcatgcgatgaatatcttcaat 46413829  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     ||||||||||||||||||  |||||     ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| ||||||  |||| |||    
T  46413830 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttggataccattattcaagatgcttatcgaatgttggattcctgccgtttaacaa 46413928  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  46413929 gtttgaatt 46413937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 563 - 748
Target Start/End: Original strand, 51695347 - 51695534
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||     
T  51695347 gaatgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaacg 51695446  T
Q  661 atggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgc 748  Q
     ||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||  |||||||||||    
T  51695447 ctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcgttcaagacacttatcgaatgctggagtcctgc 51695534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 8633212 - 8633157
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8633212 ggtattgaagtgtcaatgattgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 8633157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Original strand, 14632180 - 14632255
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  14632180 gagtcctgctatttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaaagtacattcc 14632255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Original strand, 11378399 - 11378596
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||   ||||||||| || ||||||| | | ||||||||  ||||||||    
T  11378399 ttccaactacaacaattgtcttgtctctgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactctagtattcgattatcatcttgaacgctggtattc 11378498  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  11378499 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaattctggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 11378596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 25887502 - 25887373
Alignment:
Q  336 ttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| | |||||| | ||| ||||| ||||| ||||||    
T  25887502 ttcctttcaaaagattaaattcttgttagtttggtttatatgaaagtattgaagtgtcaagaaatgcacctcattcttttgacacttcaataccatcatc 25887403  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    |||| ||| | |||||| |||||| ||||||    
T  25887402 taaaccaaac-taacaagaatttaatctttt 25887373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 562 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 33449145 - 33449063
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcg 644  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||    
T  33449145 ggaatgcaccttccaactacaacaattgttttcctctggatggggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactcaaacattcg 33449063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Original strand, 39416369 - 39416566
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||| | | |||||||  |||||||||    
T  39416369 ttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgttaagcagtaggactccaacatacgatcaacatcttgaatgatggtattc 39416468  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||| |||||| | |||   ||| ||||||||||||    
T  39416469 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcattcaagatgcttatcaaatgttggagacatgctgattaacaagtttgaatt 39416566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 42949926 - 42950008
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcct-gttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42949926 gcgaaatgcttgagtcctaggcgtttggcaagtttgaattatcccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 42950008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 25576223 - 25576276
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  25576223 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 25576276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 807
Target Start/End: Complemental strand, 25887328 - 25887271
Alignment:
Q  751 tttagcaagtttgaattttcctcatt-caagggtaagataattgttgtagttggaagg 807  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25887328 tttagcaagtttgaatttacctcatttcaaaggtaagataattgttgtagttggaagg 25887271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Original strand, 34692947 - 34693278
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||||||||||| |||||  | | ||||||| |||||  |||  | ||||||||||     
T  34692947 gtgcattccaactccaacaattgtcttacctgtgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaac-aggactcaaacatttcacccggcattcatgtttt- 34693044  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| ||||  ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  ||||     
T  34693045 cctttgaaaagaataaatttttgttaagcgtgctttagatgatggtattcaagtaccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcata 34693142  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| || | ||||||| |||||| |||||||||||        ||||||  | |||||||||||||||| ||    ||||||||||||||| |||||||    
T  34693143 taaacca-gtctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgcgcgaaatgcttgagtcttggccgtttggcaagtttgaa-ttacccc 34693240  T
Q  534 a-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34693241 atttcagaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 34693278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 385
Target Start/End: Original strand, 36721111 - 36721192
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  36721111 gactcaagcatttcgcccgacattcatgttttttctttgaaaagaataaatttttgttatgcttgctttagatgatggtatt 36721192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 44835119 - 44835172
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  44835119 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 44835172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 572 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 44928260 - 44928084
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttac-tctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||| || ||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  || |||||    
T  44928260 ttccaactgcaataattgtcttgcctctgaatggggcaactttaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaacgctgatattc 44928161  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcct 746  Q
    ||||||| || |||||     ||||| || ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  44928160 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-ctcgacacttgaataccagcgttcaagatgcttatcgaatgttggagtcct 44928084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 730 - 811
Target Start/End: Original strand, 49273885 - 49273966
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||| |||||||||||||   || |||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  49273885 tcgaacattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtaca 49273966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 804
Target Start/End: Original strand, 55268470 - 55268713
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || |||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||  ||| |||| ||| |||  |||    
T  55268470 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcataccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccgacatccgatgagcatctgcaac 55268569  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     ||||||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| || |||| || | |||||||||   ||||||||    
T  55268570 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccatcgttgcagatgctcatcggatgtcggagtcctgttgtttagcaa 55268668  T
Q  759 gtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    |||||||||| || ||||| || | |||| |||||||| |||||||    
T  55268669 gtttgaatttgccccattc-agaggaagacaattgttgcagttgga 55268713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 608 - 767
Target Start/End: Original strand, 34692750 - 34692909
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||    
T  34692750 aattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatcaacatcttgaacgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttg 34692848  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||| | | |||||  || ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  34692849 aataccagcgtccaagacgcttatcgaatgttggagtcctgccaattaacaagtttgaatt 34692909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 608 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 36135765 - 36135606
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    |||||||||||| |||   ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| || |||||  |  ||||| |||||||||||    
T  36135765 aattcaaacttgctaagcagcaggacaccagtattcgatcagcatcttgaacgctggtattcaagtgtcaaaagaatgagctgcattc-cttgacacttg 36135667  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||||  |||||| ||||   ||| ||||||||||||    
T  36135666 aataccattgttcaagatgctcatcgaatgctggagttctgccgattaacaagtttgaatt 36135606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 542 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 42383638 - 42383586
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  42383638 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtctta 42383586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 55206767 - 55206683
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatac 427  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| || ||||||||    
T  55206767 aaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattcttttgacatttgaatac 55206683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 714
Target Start/End: Original strand, 27187685 - 27187736
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccat 714  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27187685 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccat 27187736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 34647114 - 34647059
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  34647114 ggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattcttttgacacttgaataccgtcatt 34647059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 37282010 - 37281868
Alignment:
Q  243 ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttccttt 342  Q
    |||||||||||||||| || |||||| | ||  |||  |||||||||| | |||||  | | ||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  37282010 ttccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaacaac-aggactcaagcatttcgcccggcattcatgtttttccttt 37281912  T
Q  343 gaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    ||||| | |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  37281911 gaaaataataaatttttgttatgcttgctttagatgatggtatt 37281868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 542 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 44928050 - 44927971
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatgggg-caattcaaacttg 619  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||    
T  44928050 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttg 44927971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 645 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 46403724 - 46403556
Alignment:
Q  645 ataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagt 743  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| ||||||    
T  46403724 ataagcatcttgaacgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagt 46403626  T
Q  744 cctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||   ||| |||||||||| || || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  46403625 cctgccgattaacaagtttgaa-ttgcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 46403556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 55206368 - 55206293
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||    
T  55206368 gagtcctgctgtttagcaagtttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaatgtacattcc 55206293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 14632255 - 14632137
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| | | |||| ||| |||||||     
T  14632255 ggaatgtactttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaatagcaggactccaacttgcgatgagcatcttgaat 14632156  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaa 678  Q
     ||||||||||| ||||||    
T  14632155 gatggtattcaattgtcaa 14632137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 563 - 766
Target Start/End: Original strand, 34471486 - 34471691
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||| | | |||||||      
T  34471486 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacatccgatcaacatcttgaatg 34471585  T
Q  661 atggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaag 759  Q
    |||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||| ||||| |  ||||||||| || |||||||  |||| ||||||  |||| ||||    
T  34471586 atggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttcaatactagtattcaagatgcttatcgaatgctggattcctgccgtttaacaag 34471684  T
Q  760 tttgaat 766  Q
    |||||||    
T  34471685 tttgaat 34471691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 36720806 - 36720748
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatt 573  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  36720806 gcaagtttgaatttacctcattcaagggtaagataattgttgcagttggaatgtacatt 36720748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 678
Target Start/End: Original strand, 55206293 - 55206411
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| || |||||||||| |||   |||||||||| |||| |||| ||| |||  |||    
T  55206293 ggaatgtacattccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggaaaattcaaacttgctaaacagcaggactcctgcatccgatgagcatctgcaac 55206392  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaa 678  Q
     ||||||||||||||||||    
T  55206393 gatggtattcaagtgtcaa 55206411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 664 - 717
Target Start/End: Original strand, 15637361 - 15637414
Alignment:
Q  664 gtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcat 717  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  15637361 gtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttcaataccatcat 15637414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 570
Target Start/End: Original strand, 19452980 - 19453217
Alignment:
Q  334 ttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactat 430  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||| | ||||| | ||| ||||| |||||  |    
T  19452980 ttttcctttgaaaaaaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattgaagtgccaacgaaatgaggttcattct-ttgacactt-aatacctt 19453077  T
Q  431 catctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaattta 529  Q
    |||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||  | |||||||||||||||| ||    |||| |||||||||| |||    
T  19453078 catctaaacca-gcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgagcgaaatgcttgagtcatggccgtttgacaagtttgaa-tta 19453175  T
Q  530 cccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19453176 ccccatttcagaggtaagagaattgttgtagttggaatgcac 19453217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 563 - 644
Target Start/End: Original strand, 27187543 - 27187624
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcg 644  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||    
T  27187543 gaatgcacattgcaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggactcaaacattcg 27187624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 697 - 814
Target Start/End: Original strand, 34646761 - 34646877
Alignment:
Q  697 ttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttg 796  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||  || ||||  || | |||| ||||||||    
T  34646761 ttgacacttgaataccatcattcaagatgtttttcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaattacccccatt-tagaggaagacaattgttg 34646859  T
Q  797 tagttggaaggtacattc 814  Q
     ||||||||||| |||||    
T  34646860 cagttggaaggtgcattc 34646877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 544 - 619
Target Start/End: Original strand, 34692924 - 34693001
Alignment:
Q  544 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatgggg-caattcaaacttg 619  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||    
T  34692924 aagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtcttacctgtgaatggggtcaattcaaacttg 34693001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 563 - 678
Target Start/End: Original strand, 42322808 - 42322925
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac-tctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||  |||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||      
T  42322808 gaatgtaccttcctactgcaacaattttcttacctctaaatggggtaaattcaaacttgttaaacagcacgactccagcatgcgatgagcatcttgaatg 42322907  T
Q  661 atggtattcaagtgtcaa 678  Q
    ||||||||||||||||||    
T  42322908 atggtattcaagtgtcaa 42322925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 562 - 804
Target Start/End: Original strand, 45099884 - 45100126
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||| | || |||||  || |||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| ||| | || ||     
T  45099884 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccctgaatgggataaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcatgcgatgagcattttaaat 45099983  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     || |||||||||||||||  |||||     ||||| ||||||||||||||||||||||| || || || |||||||  |||| ||||||  |||| |||    
T  45099984 gattgtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccatcattaaaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaa 45100082  T
Q  759 gtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    ||||||| || || ||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  45100083 gtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgcagttgga 45100126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 45099965 - 45099884
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  45099965 atgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttatcccattcaggggtaagataattgttgcagttggaaggtacattcc 45099884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 47066273 - 47066220
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  47066273 gtaagacaattgttgtagtcggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 47066220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 565 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 47066490 - 47066286
Alignment:
Q  565 atgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| | | || || |||||| ||||||||||  ||   ||| ||||||| ||| |||| | | |||||||  ||    
T  47066490 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatagggcaaattcaaacttgcgaagcagcaagactccaacatacgatcaacatcttgaatgat 47066391  T
Q  663 ggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtt 761  Q
    ||||||||||||||||  |||||     ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||||||   ||| ||||||    
T  47066390 ggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttcacacttgaataccaacattcaagatgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtt 47066292  T
Q  762 tgaatt 767  Q
    ||||||    
T  47066291 tgaatt 47066286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 663 - 712
Target Start/End: Original strand, 49273771 - 49273820
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  49273771 ggtattaaagtgtcaatgaatggacctcattcttttgacacttgaatacc 49273820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 487 - 570
Target Start/End: Original strand, 53826600 - 53826684
Alignment:
Q  487 gggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||||||||| ||    |||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53826600 gggcgaaatgcttgagtcatggccgtttgacaagtttgaa-ttaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 53826684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 728 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 8633104 - 8633024
Alignment:
Q  728 gatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||| |||||||| |||   || |||||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8633104 gatcgaatgttggagtcttgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggt 8633024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 574 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 8633343 - 8633271
Alignment:
Q  574 ccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgat 646  Q
    |||||| ||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  8633343 ccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactccagcattcgat 8633271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 670 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 10053226 - 10053178
Alignment:
Q  670 aagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10053226 aagtgtcaatgaatggacctcattcttttgacacttgaataccgtcatt 10053178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 815
Target Start/End: Original strand, 25576139 - 25576256
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgtt 795  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| |||||||| |||   ||| ||||||||||||  ||  | || || |||||| |||||||    
T  25576139 cttgacacttgaataccagcattcaagaggcttatcgaatgttggagtcatgccgattaacaagtttgaattgccc--aatccagagtaagacaattgtt 25576236  T
Q  796 gtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||| || ||||||    
T  25576237 gtagttggaatgtgcattcc 25576256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 572 - 678
Target Start/End: Original strand, 46346031 - 46346139
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |  || ||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | | |||||||  |||||||||    
T  46346031 ttccaactgcaacaattatcttattagtgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagcatccgatcaacatcttgaatgatggtattc 46346130  T
Q  670 aagtgtcaa 678  Q
    |||||||||    
T  46346131 aagtgtcaa 46346139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 47065977 - 47065918
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47065977 tttggcaagtttgaatt-acctcatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 47065918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 767
Target Start/End: Original strand, 49218196 - 49218355
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||    
T  49218196 aattcaaacttgttaaacagcgggactccagtattcgatcagcatcttgaacgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttg 49218294  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||| | || ||||  || ||||||| |||||||||| |   ||| ||||||||||||    
T  49218295 aataccagcgttgaagacgcttatcgaatgttggagtcctaccgattaacaagtttgaatt 49218355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 427
Target Start/End: Original strand, 49273735 - 49273819
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatac 427  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||||||    
T  49273735 aaaagattaagttcttgttaggccggtttaaatgaaggtattaaagtgtcaatgaatggacctcattcttttgacacttgaatac 49273819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 572 - 678
Target Start/End: Original strand, 51012706 - 51012814
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| || |||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| ||| |||||||  |||| ||||    
T  51012706 ttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggaaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcatccgatgagcatcttgaatgatggcattc 51012805  T
Q  670 aagtgtcaa 678  Q
    |||||||||    
T  51012806 aagtgtcaa 51012814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 564
Target Start/End: Original strand, 55268650 - 55268713
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgga 564  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  55268650 gagtcctgttgtttagcaagtttgaatttgccccattcagagg-aagacaattgttgcagttgga 55268713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 8632924 - 8632809
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||| |||||  |||| ||||  ||    
T  8632924 aaaagattaaattcaggttaggctggtttagatgaaaatattgaagtgtcaaggaatgtacctcattcttttgacacttcaataccctcatttaaacaaa 8632825  T
Q  443 gcctaacaaaaattta 458  Q
    | ||||||| ||||||    
T  8632824 gtctaacaagaattta 8632809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 542 - 593
Target Start/End: Original strand, 11378609 - 11378660
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctt 593  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  11378609 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtctt 11378660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 730 - 809
Target Start/End: Original strand, 14631927 - 14632006
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggta 809  Q
    ||||| |||||||||||||   || ||| |||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14631927 tcgaacattggagtcctgctgcttggcatgtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggta 14632006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 18441114 - 18441169
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  18441114 ggtattgaagtgtcaagggatgcacctcattattttgacacttgaataccatcatt 18441169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 19486188 - 19486243
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19486188 ggtattgaagtgtcaagggatgcacctcattattttgacacttgaataccatcatt 19486243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 20375732 - 20375685
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaata 710  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20375732 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaata 20375685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 756 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 34646978 - 34646923
Alignment:
Q  756 caagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34646978 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtaca 34646923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 45100312 - 45100265
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaata 710  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  45100312 ggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattcttttgacacttgaata 45100265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 664 - 718
Target Start/End: Original strand, 6754575 - 6754629
Alignment:
Q  664 gtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    ||||| |||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6754575 gtattgaagtgttaaggaatgaacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 6754629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Original strand, 8632996 - 8633050
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  8632996 ggtaagacaattgttgtagttggaagacaccttccaactacaacaattgtgttac 8633050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 11378956 - 11378906
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaa 64  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11378956 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaa 11378906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 465
Target Start/End: Original strand, 15637316 - 15637445
Alignment:
Q  336 ttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||||   |||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||| ||||| ||||||    
T  15637316 ttcctttcaaaagattaagttctagttagtttggttttgatgatcgtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttcaataccatcatc 15637415  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    |||| |||  ||||||| |||||| ||||||    
T  15637416 taaaccaa-actaacaagaatttaatctttt 15637445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 761 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 36721094 - 36721044
Alignment:
Q  761 ttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  36721094 ttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaaggtaca 36721044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 664 - 718
Target Start/End: Original strand, 43570283 - 43570337
Alignment:
Q  664 gtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43570283 gtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttgacatttgaataccatcatt 43570337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 734 - 796
Target Start/End: Original strand, 43570396 - 43570458
Alignment:
Q  734 atattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttg 796  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||    
T  43570396 atattggagtcctgctaattggcaagtttgaatttacctcattcaaaggcaagacaattgttg 43570458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 757 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 44835197 - 44835139
Alignment:
Q  757 aagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  44835197 aagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 44835139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 344 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 45100348 - 45100226
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||||| || |||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| ||||||||||   |||| |||  | |    
T  45100348 aaaagattaaattcttattaggccggtttaaataaaggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattcttttgacacttgaatatcgtcatttaatccca 45100249  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||||||||| |||||| ||||||    
T  45100248 gcctaacaagaatttaatctttt 45100226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 51013206 - 51013258
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  51013206 tttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 51013258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 515 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 53826492 - 53826442
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  53826492 gcaagtttgagtttgccccattcatgggtaagacaattgttgtagttggaa 53826442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 2268127 - 2268180
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||    
T  2268127 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacgacaattgtcttac 2268180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 4003720 - 4003773
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  4003720 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtgttac 4003773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 517 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 6464057 - 6464012
Alignment:
Q  517 aagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagtt 561  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  6464057 aagtttgaatttaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagtt 6464012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 563 - 678
Target Start/End: Original strand, 10052796 - 10052913
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||| || || || ||||| ||||||||||||||   ||||||||||| ||| |||| | | |||||||      
T  10052796 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatgaggcaaattcaaacttgttaaacagcaggactccaacatccgatcaacatcttgaatt 10052895  T
Q  661 atggtattcaagtgtcaa 678  Q
    |||||||||| |||||||    
T  10052896 atggtattcaggtgtcaa 10052913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 24701904 - 24701957
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  24701904 gtaagataattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 24701957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 664 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 25887457 - 25887404
Alignment:
Q  664 gtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcat 717  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25887457 gtattgaagtgtcaagaaatgcacctcattcttttgacacttcaataccatcat 25887404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 522 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33448860 - 33448807
Alignment:
Q  522 tgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  33448860 tgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgtagttggaaggaacattcc 33448807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 664 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 33449001 - 33448948
Alignment:
Q  664 gtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcat 717  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  33449001 gtattgaagtgtcaataaatggaccttattcttttgacacttgaataccatcat 33448948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 758 - 811
Target Start/End: Original strand, 37281963 - 37282016
Alignment:
Q  758 agtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  37281963 agtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtaca 37282016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 516 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 42949712 - 42949663
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  42949712 caagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaa 42949663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 43477625 - 43477572
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  43477625 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactgccacagttgtcttac 43477572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 573 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 43477834 - 43477638
Alignment:
Q  573 tccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattca 670  Q
    |||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||| ||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| |||||||   |||||||||    
T  43477834 tccaactgcaacaatcatcttacaactgaatggggcaaattcaaatttgctaaccagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaatgctggtattca 43477735  T
Q  671 agtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||||| || |||||     ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||  || |||||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  43477734 agtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgagacttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 43477638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 50997974 - 50997921
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||| || ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  50997974 gtaagacaattgctgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtcttac 50997921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 730 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 55206621 - 55206540
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||||||||||||| ||||   || |||||||||||||| || |||| || ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  55206621 tcgaatattggagttctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattaaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtaca 55206540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 572 - 678
Target Start/End: Original strand, 2267917 - 2268025
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||    |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  2267917 ttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcaacaggacaccagtattcgatcagcatcttgaacgctggtattc 2268016  T
Q  670 aagtgtcaa 678  Q
    |||||||||    
T  2268017 aagtgtcaa 2268025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 564 - 623
Target Start/End: Original strand, 6754432 - 6754492
Alignment:
Q  564 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggcaattcaaacttgttaa 623  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  6754432 aatgcaccttccaactacaacaactgtcttactctgaaatggggtaattcaaacttgttaa 6754492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 663 - 711
Target Start/End: Original strand, 7955024 - 7955072
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatac 711  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  7955024 ggtattgaagtgtcaaggaatgtacctcattcttttgacacttgaatac 7955072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 515 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 20375604 - 20375556
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttg 562  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20375604 gcaagtttgaatttaccccatttcagaggtaagacaattattgtagttg 20375556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 842 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 34471473 - 34471429
Alignment:
Q  842 tgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  34471473 tgataacatatacagttgaatatgcgtaatacattttgttttgaa 34471429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 500 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 34646699 - 34646643
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttg 556  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  34646699 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagataattgttg 34646643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 544 - 618
Target Start/End: Original strand, 39416581 - 39416657
Alignment:
Q  544 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggc-aattcaaactt 618  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||| ||||| || || ||||||| |||||||||||    
T  39416581 aagacaattgttgtagttgaaatgtgcattccaactacaacaattatcttacctttgaatggggcaaattcaaactt 39416657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 41804193 - 41804147
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtag 559  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41804193 tttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtag 41804147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 842 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 42322795 - 42322751
Alignment:
Q  842 tgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  42322795 tgataacatatatagttgaatatgcatgatacatgttgttttgaa 42322751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 842 - 886
Target Start/End: Original strand, 51016091 - 51016135
Alignment:
Q  842 tgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||    
T  51016091 tgataacatatatagttgaatatgcataatacaagttgttttgaa 51016135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 559
Target Start/End: Original strand, 52569337 - 52569383
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtag 559  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52569337 tttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtag 52569383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 767
Target Start/End: Original strand, 4003636 - 4003707
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  4003636 cttgacacttgaataccattgttcaagatgctcatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 4003707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 6464194 - 6464139
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| |||||| || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  6464194 ggtattaaagtgttaaggaatgaacctcattcttttgtcacttgaataccatcatt 6464139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 510 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 7246386 - 7246333
Alignment:
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  7246386 atttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaatcgttgtagctggaa 7246333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 558
Target Start/End: Original strand, 7954707 - 7954754
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgta 558  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||    
T  7954707 tttggcaagtttgaatttaccctattcaggggtaagaaaattgttgta 7954754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 574
Target Start/End: Original strand, 34472004 - 34472065
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc 574  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| | ||||||    
T  34472004 tttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaatttttgtagctggaaggaacattc 34472065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 55268545 - 55268470
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||  |||| || |||||||| |||||||| | |||||||    
T  55268545 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtatgataattgttgcagttggaaggtacattcc 55268470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Original strand, 3494661 - 3494715
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  3494661 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaacaacaacaattgtgttac 3494715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 363
Target Start/End: Original strand, 4003808 - 4003870
Alignment:
Q  302 catgactcaagcattttgcccaacg-ttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgtta 363  Q
    |||||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  4003808 catgactcaagcatttcgccaaacacttcatgttttccctttgaaaagaataaatttttgtta 4003870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 728 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 7954518 - 7954434
Alignment:
Q  728 gatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattc 814  Q
    |||||||| |||||||| |||  ||| ||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||| |||||    
T  7954518 gatcgaatgttggagtcttgccgtttggcaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttagaaggtgcattc 7954434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 7954495 - 7954447
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagtt 561  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7954495 tttggcaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagtt 7954447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 728 - 798
Target Start/End: Original strand, 7954684 - 7954754
Alignment:
Q  728 gatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgta 798  Q
    |||||||| |||||||| |||  ||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||| ||||||||||    
T  7954684 gatcgaatgttggagtcttgctgtttggcaagtttgaatttaccctattcaggggtaagaaaattgttgta 7954754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 493 - 563
Target Start/End: Original strand, 8633275 - 8633343
Alignment:
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 563  Q
    |||||| ||||||||   |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8633275 aatgctggagtcctgccgtttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttgg 8633343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 730 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 10053123 - 10053042
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt-tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||| |||||||||||||   || |||||||||||||| |||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10053123 tcgaacattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttatcct-attgaaaggtaacaaaattgttgtagttggaaggtaca 10053042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 20375876 - 20375814
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggcaattcaaacttgttaa 623  Q
    ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  20375876 ggaatgcaccttccaactacaaaaattgtcttactctgaaatgggttaattcaaacttgttaa 20375814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 753 - 815
Target Start/End: Original strand, 25887540 - 25887602
Alignment:
Q  753 tagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    ||||||||||||||| |||   ||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  25887540 tagcaagtttgaattatcccatttcataggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcc 25887602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #237
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 515 - 565
Target Start/End: Original strand, 25887542 - 25887592
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25887542 gcaagtttgaattatcccatttcataggtaagacaattgttgtagttggaa 25887592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #238
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 34050314 - 34050260
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  34050314 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 34050260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #239
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 543 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 42382529 - 42382499
Alignment:
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcacatt 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42382529 taagacaattgttgtagttggaatgcacatt 42382499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #240
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 662 - 708
Target Start/End: Original strand, 42949756 - 42949802
Alignment:
Q  662 tggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||    
T  42949756 tggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattttgttaacacttgaa 42949802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #241
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 43570201 - 43570149
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43570201 tttggcaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 43570149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #242
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 46346540 - 46346592
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  46346540 tttggcaagtttgaatt-acccaattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 46346592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #243
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 46403590 - 46403536
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  46403590 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaacctcaacaattgtgttac 46403536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #244
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Original strand, 49139686 - 49139740
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  49139686 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 49139740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #245
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 54391029 - 54390975
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  54391029 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 54390975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #246
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 562 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 774332 - 774299
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  774332 ggaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttac 774299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #247
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 385
Target Start/End: Original strand, 3494750 - 3494835
Alignment:
Q  302 catgactcaagcattttgcccaacg-ttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    |||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | || || ||||||||| ||||||    
T  3494750 catgactcaagcatttcgccgagcacttcatgtttttcctttgaaaagaataaatttttgtgaggcttgctttagatgatggtatt 3494835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #248
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 563 - 623
Target Start/End: Original strand, 18440971 - 18441032
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggcaattcaaacttgttaa 623  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||    
T  18440971 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaattgggtaattcaagcttgttaa 18441032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #249
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 505 - 565
Target Start/End: Original strand, 18441239 - 18441299
Alignment:
Q  505 ctgttatttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18441239 ctgctatttagcaagtttgaatttatcccatttcagaggtaa-acaattgttgtagttggaa 18441299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #250
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 563 - 623
Target Start/End: Original strand, 19486045 - 19486106
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggcaattcaaacttgttaa 623  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||    
T  19486045 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaattgggtaattcaagcttgttaa 19486106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #251
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 505 - 565
Target Start/End: Original strand, 19486313 - 19486373
Alignment:
Q  505 ctgttatttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19486313 ctgctatttagcaagtttgaatttatcccatttcagaggtaa-acaattgttgtagttggaa 19486373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #252
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 36135593 - 36135540
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  36135593 gtaagacaattgttgcagttgaaatgtgcattccaactccaacaattgtgttac 36135540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #253
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 562 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 43570670 - 43570558
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga--tggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || || |||||||||||||| |||||| || ||  ||||  |||||||||||| |||   ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||     
T  43570670 ggaatgtacctttcaactgcaacaattatcttacccttgaattgggcaaattcaaacttgctaaacagcatgactccagcatgcgatgagcatcttgaat 43570571  T
Q  660 aatggtattcaag 672  Q
     ||||||||||||    
T  43570570 gatggtattcaag 43570558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #254
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 494 - 575
Target Start/End: Original strand, 43570589 - 43570670
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    ||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||| || | |||||||    
T  43570589 atgctggagtcatgctgtttagcaagtttgaatttgcccaattcaagggtaagataattgttgcagttgaaaggtacattcc 43570670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #255
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 46346792 - 46346747
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctc 59  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  46346792 agacacaaggagggtggaacacgttccgtataaacgtccaacgctc 46346747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #256
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 49218368 - 49218421
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||    
T  49218368 gtaagacaattgttgcacttggaatgttcattccaactccaacaattatcttac 49218421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #257
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 567 - 678
Target Start/End: Original strand, 53826437 - 53826550
Alignment:
Q  567 gcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggc-aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatgg 664  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||| |||   ||| |||||||  ||||||| ||| | ||||||  |||    
T  53826437 gcaccttccaactacaacaattgtcttacccatgaatggggcaaactcaaacttgctaagcagcaagactccaatattcgatcagcattttgaacgctgg 53826536  T
Q  665 tattcaagtgtcaa 678  Q
    ||||||||||||||    
T  53826537 tattcaagtgtcaa 53826550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 539; Significance: 0; HSPs: 232)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 539; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Original strand, 45939518 - 45940380
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  45939518 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagaggagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgataatgtg 45939617  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  | |     
T  45939618 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcttccat 45939717  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaac-aatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaag 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  45939718 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaactaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgaccatgactcaag 45939817  T
Q  313 cattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  45939818 cattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacatcatttca 45939917  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45939918 ttggcacttgaataccaccatctaaagcaagtctaac-aaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 45940016  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45940017 tggcaagtttgactttacctcattcgaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatcccaactgcaacaattgtcttactctggatggagcaattc 45940116  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45940117 aaacttgttaatcggcatgactccatcattcgataagcgtcttgaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 45940216  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | |||||||| ||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45940217 agcgttcaagatgctgatcgaatactagagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacat 45940316  T
Q  813 tccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||  ||||||||||||||          ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45940317 tccataatgtaatgtaatg----------tgataacatttatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 45940380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 536; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 68 - 831
Target Start/End: Original strand, 27759374 - 27760137
Alignment:
Q  68 gagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacg 167  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||    
T  27759374 gagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacg 27759473  T
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacc 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  27759474 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcatttcaactacaacaattgtcttacc 27759573  T
Q  268 tctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgct 367  Q
    ||| |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27759574 tctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggctatgactcaagcatttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgct 27759673  T
Q  368 ggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttca 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27759674 ggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaataaaaatttattcttttca 27759773  T
Q  468 aagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 567  Q
    |||        |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27759774 aaggaaaaacatgaacgcggggcgaaatgcttgagtcctgttgtttggccagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgctgtagttggaatg 27759873  T
Q  568 cacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtat 667  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||    
T  27759874 cacatttcaactacaacaattgtcctactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcgataagcctcttgaatgttggtat 27759973  T
Q  668 tcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||   ||||||||||||||||    
T  27759974 tcaaatgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagattctgatcgtatgtttgagtcctgctggttagcaagtttgaatt 27760073  T
Q  768 ttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    | || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27760074 tgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacatttcagaatgtaatgtaatg 27760137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 51428406 - 51427542
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  51428406 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgtgtggagttaacgaacgacgaaaacgtg 51428307  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  51428306 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgcaag 51428207  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  51428206 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttggcaaacggccaggactcaagc 51428107  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  51428106 atttcgatcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttagtctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 51428007  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  51428006 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattattttcaaag-gaaaacatgaatgtcgggcgaaatgcttgagtcctgttgttt 51427908  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaat 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |||    
T  51427907 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttccttttaatggggtaat 51427808  T
Q  611 tcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaata 710  Q
    ||||| |||||||  | ||||| || ||||||| || | | | |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51427807 tcaaatttgttaaacgacaggaatcgagcattcaatgaacattttgaatgatgatattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaata 51427708  T
Q  711 ccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtac 810  Q
    |||||||| || || || |||  ||  |||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51427707 ccatcatttaaaatgctcatctcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaaggtac 51427608  T
Q  811 attccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||| |||||||||||||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  51427607 attccagaatgtaatgtaatg----------tgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 51427542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 473; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 21017391 - 21016551
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21017391 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 21017292  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21017291 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 21017192  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | ||||| |||    
T  21017191 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcgagc 21017095  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  21017094 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 21016995  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  21016994 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 21016895  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21016894 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattc 21016795  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21016794 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgatgagcatcttggacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 21016695  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||    
T  21016694 atcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaat 21016595  T
Q  813 tccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21016594 ttcggaatgtaatgtaaaatgcaatgtaatgtgataacatatat 21016551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 470; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 41 - 831
Target Start/End: Original strand, 1042769 - 1043557
Alignment:
Q  41 gtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatg 140  Q
    ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1042769 gtataaacgtccaacgctagacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaacatgttttgggagcacagcatg 1042868  T
Q  141 ttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtg 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  1042869 ttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatataatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggta 1042968  T
Q  241 cattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcct 340  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||   | |||||  | ||||||||||||||| || |  | ||||||||||||||    
T  1042969 cattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaatcggccaaacaac-atgactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcct 1043067  T
Q  341 ttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagc 440  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1043068 ttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaatc 1043167  T
Q  441 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaa 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  1043168 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatgtcgagcgaaattcttgagtcctgttgtttgacaggtttgaatttatctcattcaaa 1043266  T
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagca 640  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1043267 ggtaagacaattgttgcagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagca 1043366  T
Q  641 ttcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattgg 740  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| |||    
T  1043367 ttcgataagcgtcttgaacgttggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaagatgttgatcgaatactgg 1043466  T
Q  741 agtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1043467 agtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtacattctggaatgtaatgtaatg 1043557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 464; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 40 - 808
Target Start/End: Original strand, 21711549 - 21712316
Alignment:
Q  40 ggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacat 139  Q
    ||||||||| || ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21711549 ggtataaacatctaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacat 21711648  T
Q  140 gttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggt 239  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21711649 gttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggt 21711748  T
Q  240 gcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcc 339  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |  | |||||||||||||    
T  21711749 gcattccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcc 21711848  T
Q  340 tttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaag 439  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21711849 tttgaaaagattaaatttttgttagggtgatttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaatctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaag 21711948  T
Q  440 caagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaa 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  ||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  21711949 caagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgtcgggtgaaatgcttgagtactgttgtttggcacgtttgaatttacctcattcaa 21712047  T
Q  540 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagc 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |    
T  21712048 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatttcaagtacaacaattatcttactctggatagggcaattcaaacttgttaatcggcagaagtccaac 21712147  T
Q  640 attcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattg 739  Q
    ||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || |||    
T  21712148 attcgataagcatcttgaatgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccgtcattcaagatgttgatcgtatgttg 21712247  T
Q  740 gagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||   |||| |||||||||||| || |||| | ||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  21712248 gagtcctgctgcttaggaagtttgaatttgccccatttaggggcaagacaattgttgtagttgaaaggt 21712316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 6177529 - 6176689
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6177529 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 6177430  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  6177429 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 6177330  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  6177329 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtatt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagc 6177233  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  6177232 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 6177133  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  6177132 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 6177033  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6177032 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattc 6176933  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6176932 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgatgagcatcttggacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 6176833  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||    
T  6176832 atcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaat 6176733  T
Q  813 tccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6176732 ttcggaatgtaatgtaaaatgcaatgtaatgtgataacatatat 6176689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 658
Target Start/End: Complemental strand, 51027981 - 51027337
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51027981 agacacaaggagagtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 51027882  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | |     
T  51027881 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccat 51027782  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  51027781 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcactccaactacaacaattgtcgtacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaagcggccatgactcaagc 51027682  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  51027681 atttcgcccagcattcatgtttttcctttaaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgccaaagaatgaacctcattttgt 51027582  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    ||| |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  51027581 tggaacttgaatatcatcatctaaagcaagcctaaaaaaaagttattcttttcaaaggaaaaatatgaatgcggggtgaaatgcttgagtcctgttgttt 51027482  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51027481 tgcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtaattagagtgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattca 51027382  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaa 658  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51027381 aacttgttaattggcaagactccaacattcgataagcctcttgaa 51027337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 800
Target Start/End: Complemental strand, 46816737 - 46815953
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  46816737 agacgcaaggagggtggaatacgttcagtatacacgtccaatgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacaaaaacgtg 46816638  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  46816637 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgttgagatca--tgaagatatcatcaatagcttgattccgccag 46816540  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  46816539 aagatcgtcattagttagggcaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgagatggggtaattcaaacttgccaaacggccaagactcaagc 46816440  T
Q  314 attttgcccaacgttcatg-tttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    |||| || |  | |||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |    
T  46816439 atttcgctcggcattcatgtttttttctttgaaaaggttaaatttttgttaggccggtttagatgaaggtattaggtgtcaaagaatgaacctcatttcg 46816340  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||| ||| ||| |||||||||||||| |||| ||    
T  46816339 ttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgattgccgggtgaaatgcttgagtcttgttgtt 46816241  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46816240 tcgcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttagaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattc 46816141  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46816140 aaacttgttaatcggcaagaatccaacattcgataagcctcttcaatgttggtattcaagtgtcatggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 46816041  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagt 800  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  46816040 gtcattcaagatgcttatcgaatattggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcatgggcaagacaattgttgtagt 46815953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 40353987 - 40353147
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40353987 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 40353888  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40353887 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 40353788  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||| ||||||||  | | ||||| |||    
T  40353787 aagattgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacctgtcaaacaac-aggactcgagc 40353691  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||       
T  40353690 atttcgcgagcacctcatgtttctcctttaaaaatattaaattcttgttatgctggttttgatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattctg 40353591  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||        |||| |||   ||| |||||||||| |||||| ||    
T  40353590 tggcacttgaataccataatctaaaccaagcctcacaaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaagtgcttagcgtaatgcttgagccctgttgtt 40353491  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  40353490 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaaaaattgtcttaccctggatggggaaattc 40353391  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40353390 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgataagcctcttgaacactggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 40353291  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||    
T  40353290 agcgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaat 40353191  T
Q  813 tccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | || ||| |||  |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40353190 ttcgaaatctaatgtgtaatgcaatgtaatgtcataacatatat 40353147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Original strand, 56138903 - 56139718
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56138903 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 56139002  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  56139003 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 56139102  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  56139103 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtatt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagc 56139199  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  56139200 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 56139299  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  56139300 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 56139399  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56139400 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 56139499  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56139500 aaacttgttaatcggcaggactccaacattcgataagcgtcttgaacgctggtattcaagtgtcaaagaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 56139599  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | ||  |||| ||||||||||| |||||| |||    ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  56139600 agcgttatagatgctgatcgaatactggagttctgttggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtaaat 56139699  T
Q  813 tccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||||||||||||||    
T  56139700 tccggaatgtaatgtaatg 56139718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Original strand, 28082231 - 28083045
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28082231 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatg 28082330  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  28082331 acgagcatgttttgggagcacatcatgtttcagtggatcaatatgcaggtgaagttacttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccag 28082430  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||   |   ||||||||| || |||||  | | ||||| |||    
T  28082431 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaac-aggactcgagc 28082528  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  28082529 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacatcatttcgt 28082628  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  28082629 tggcacttgaataccatcatccaaagcacgcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaagaca-tgaatgtcgggtgaaatgcttgagtcctgttgttt 28082727  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    | || |||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28082728 gacaggtttgaatctatctcattcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactgtggatggggcaattca 28082827  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  28082828 aacttgttaatcggcaggactccagcattcgataaacgtcttgaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacta 28082927  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
       |||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||    
T  28082928 gtgttcaagatgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagtttgaaggtaaatt 28083027  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatg 831  Q
     |||||||||||||||||    
T  28083028 tcggaatgtaatgtaatg 28083045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 672
Target Start/End: Original strand, 25762591 - 25763249
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25762591 agacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 25762690  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  25762691 acgaacatgttttgggagcacaacatgttctggtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 25762790  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25762791 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctctaaaatggggtaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 25762890  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||    
T  25762891 atttcgccaagcattcatgtttttcctttgaaaatattaaattcttattatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaagaaataaacctcatttcgt 25762990  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25762991 tggcacttgaatatcatcatctaaagcaagtctaacaaaaaattattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagtcttgttgttt 25763090  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  25763091 gacaagtttgactttaccccattcgaaggtaagacaattgttggagttggaatgcacatcccaactgcaacaattatcctactctggattgggcaattca 25763190  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaag 672  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||    
T  25763191 aacttgttaatcggcatgactccagcattcgataagcgtcttgaacgctcgtattcaag 25763249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 429; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Original strand, 49094738 - 49095578
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49094738 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtg 49094837  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |     
T  49094838 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcgtcaaaagtttgattccgccac 49094937  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  49094938 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtatt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagc 49095034  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||       
T  49095035 atttcgcgagcacctcatgtttctcctttaaaaatattaaattcttgttatgctggttttgatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattctg 49095134  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   ||||||||||||||||| |||| ||    
T  49095135 tggcacttgaataccataatctaaaccaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcttgttgtt 49095234  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49095235 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttggggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattc 49095334  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49095335 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgataagcctcttgaacactggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 49095434  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||    
T  49095435 agcgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaat 49095534  T
Q  813 tccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49095535 ttcggaatgtaatgtaaaatgcaatgtaatgtgataacatatat 49095578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 854
Target Start/End: Original strand, 55796738 - 55797576
Alignment:
Q  16 acacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 115  Q
    |||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55796738 acacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 55796837  T
Q  116 gagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaa 215  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  55796838 gaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccacaa 55796937  T
Q  216 gatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcat 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||  ||||||||||||||||||  | | |||||||||||    
T  55796938 gatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tgggctaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagcat 55797034  T
Q  316 tttgcccaacgt-tcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgtt 414  Q
    || ||  | ||  |||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || | |    
T  55797035 ttcgca-agcgcctcatgtttctcctttgaaagtattaaatttttgttatgctggtttagatgaatgtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcggt 55797133  T
Q  415 ggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||| |||    
T  55797134 ggcacttgaataccatcatccaaagctagcctcacagaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgttt 55797233  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55797234 tgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaattcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattca 55797333  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    |||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55797334 aacttactaatcggcaggactccagtattcgataagcctcttgaacactggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctgttgacacttgaatacca 55797433  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
     | |||||||| || |||||| | ||| |||||||   || |||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| ||  |||||||| |||    
T  55797434 gcgttcaagatgctaatcgaacactggtgtcctgctgcttggcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagccggaaggtaaatt 55797533  T
Q  814 ccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
     ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55797534 tcggaatgtaatgtgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 55797576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 20901882 - 20901229
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901882 agacacaaggagggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagtggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 20901783  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |  |    
T  20901782 acgagcatgttttgggagcacagcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacactgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccacctg 20901683  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||        |||    
T  20901682 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaactttccaaacggcc--------agc 20901591  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
     ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  20901590 gtttcgcctagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtagtaagtgccaaggaatgaacctcatttcgt 20901491  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  20901490 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattattttcaaaggaaaaacatgaatgcgggacgaaatgcttgagtcatgttgttt 20901391  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20901390 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcagattccaactacaacaattgtcttactctggatgaggcaattca 20901291  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaa 678  Q
    |||   ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||    
T  20901290 aac---ttaatcggcaggactccaacattcgataagcctcttgaatactggtattgaagtgtcaa 20901229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 636
Target Start/End: Original strand, 37866399 - 37867022
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| || || |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37866399 agacacaagaagggtggaacacattcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaacgtg 37866498  T
Q  114 acgagcatgtttt-gggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcga 212  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |    
T  37866499 atgagcatgttttcgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaatatcttgattccgcta 37866598  T
Q  213 gaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaag 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37866599 gaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacagtcgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggactcaag 37866698  T
Q  313 cattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    ||||| || |  | |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||      
T  37866699 catttcgctcggcattcatgtttttcctgtgaaaatattaaattattgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctaatttca 37866798  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||| ||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||    
T  37866799 ttggcagttgaatgtcatcatctaaagcaagcccaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgccgggtgaaatgtctgagtcctgttgtt 37866897  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg-caatt 611  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  37866898 tgacaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcacattccaactgcaataattctcttactcttgatggggtcaatt 37866997  T
Q  612 caaacttgttaattggcaggactcc 636  Q
    ||||||||||||| |||||||||||    
T  37866998 caaacttgttaatcggcaggactcc 37867022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 370; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 552
Target Start/End: Complemental strand, 31824834 - 31824305
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31824834 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg 31824735  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  31824734 ttttgggagcacaacatgttctagtggatcaatatgcgggtaacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgctagaagatcgtc 31824635  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccc 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31824634 attagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacatttgaaatagggtaatttaaacttgccaaacggccattactcaagcatttcgccc 31824535  T
Q  323 aacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttg 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31824534 aacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaaatcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttg 31824435  T
Q  423 aatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagttt 522  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31824434 aataccatcatctaaagcaagcctgataaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaacgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggccagttt 31824335  T
Q  523 gaatttaccccattcaaaggtaagacaatt 552  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31824334 gaatttacctcattcaaaggtaagacaatt 31824305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 678
Target Start/End: Original strand, 39588922 - 39589584
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  39588922 agacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacggggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtg 39589021  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  39589022 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcggatgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgctag 39589121  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||| || |||||   || |||||||||    
T  39589122 aagatcgtcattagttggggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaac-aacaggactcaagc 39589220  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    ||||  | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||    
T  39589221 atttcactcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacataatttcgt 39589320  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  | | |||||| ||||||| |||| |||    
T  39589321 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgtcgtgtgaaatgtttgagtcttgttgttt 39589419  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39589420 ggcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcacatttcaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 39589519  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaa 678  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||| ||||||    
T  39589520 aacttgttaaccggtaggactccagcattcgataagcgtcttcaacgctggtattcaattgtcaa 39589584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 242630 - 241849
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||    
T  242630 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagcatcattcacttaggtggagttaaagaacgatgaaaacgtg 242531  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  242530 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccag 242431  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  242430 aagatcgtcattagttaaagtaaggtgcattccaactataacaattgtcttacctctgaaatagggtaattcaaacttgccaaacgggcaggactcaagc 242331  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||                    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  242330 atttcgc--------------------tcgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 242251  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||        | ||||  || | ||||||||||||| |||| |||    
T  242250 tggcacttggataccatcatctaaaacaagtctaacaaaaatttattcttttcaaag-aaaaacataaatgtcggacaaaatgcttgagtcatgttgttt 242152  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaat 610  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | | |||    | |||||||||||| |||||| || || || ||| |||    
T  242151 ggcaagtttgaaattacccc-ttcaaaggtaacacaattgttgtagttcggaggtacaaacgttcaactgcaacaactgtcttcctttgaattgggtaat 242053  T
Q  611 tcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaata 710  Q
    |||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||| | |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  242052 tcaaacttgttaaacggcagaaatccagcattcgatgagcattttgaaagatgatattcaagtgtcaaagaatgcacctcattcttttgacatttgaata 241953  T
Q  711 ccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtac 810  Q
    |||||||| || ||  | |||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  241952 ccatcatttaaaatgttcatcgcatgctggagtcctgcggtttagcaagtttgaatttgccacattcaagggtaagataattattgcagttgaaaggtac 241853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 565
Target Start/End: Original strand, 49063972 - 49064523
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49063972 agacacaaggagagtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtgtcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 49064071  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  49064072 acgagcatgtttttggagcacaacatgtttccgtggatcgatatgcgggtgacgttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 49064171  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  49064172 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctcttaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggactcaagc 49064271  T
Q  314 attttgcccaacgttcatg-tttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    |||| || |  | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  49064272 atttcgctcggcattcatgttttttcctttgaaaatattaaattcttattaggttggtttagatgatggtattaagtttcaaggaatgaacctcatttcg 49064371  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  ||| |||| |||||||||||||| ||    
T  49064372 ttggcacttaaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgtcgggtgaaacgcttgagtcctgttgtt 49064470  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49064471 tggcaagtttgaatttatctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 49064523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 14330908 - 14330358
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14330908 agacacaaggagggtggaacactttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 14330809  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14330808 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 14330709  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | || | ||  |||    
T  14330708 aagatcgtcattagttaaggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttatcaaac-gacaagtcttcagc 14330610  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    | || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||| |    
T  14330609 a-ttcgcccatcattcatgtttttcctttgaaaagattaaactcttgttaggctggtttagatgaaagtattgaagtgtcagggaatgaacctcatttcg 14330511  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||        ||||||  |||||||||||||||||||| || ||    
T  14330510 ttggcacttgaataccatcatctaaaccaaccctaacaaaaatatattcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgggcgaaatgcttgagtcctattgtt 14330411  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    || | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330410 tgaccagtttgaattaacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 14330358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 36776733 - 36775859
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36776733 agacacaaggagggtggaacacgttaggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtattattcacttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtg 36776634  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  36776633 acgagcatggtttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctga 36776534  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  | | |  ||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||     
T  36776533 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacggc-atgactcc 36776437  T
Q  311 agcatttt-gcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcat 408  Q
    |  || || | || || |||   || ||| | | |||||||||| |||||||||  | |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  36776436 a--atgttcgaccgacattcccattgttcttgtcaaaagattaagttcttgttagaccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatgaacctcat 36776339  T
Q  409 tttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgt 508  Q
    |   ||| |||||||||||  |||| ||||  || |||||||| |||||| |||||| || |         ||||||  | | |||   | ||||||||     
T  36776338 tcatttgacacttgaataccgtcatttaaacaaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgccagtc-aaacattagagtcctgc 36776240  T
Q  509 tatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggg 605  Q
    || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    |||||||| |||||||||||| || || |||||    
T  36776239 taattgacaaatttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaatgtccaactgaaacaattgtcttcctttgaatggg 36776140  T
Q  606 gcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacactt 705  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| | ||||||| | | ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36776139 gtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcgataaacatcttgaatacttgtattgaagtgtcaaagaatgcacctcattcttttgacactt 36776040  T
Q  706 gaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    ||| |||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36776039 gaacaccatcattcaagatgttgatcggatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgcctcattcaagggtaagataattgttgcagttggaa 36775940  T
Q  806 ggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36775939 ggtacattccggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatgtatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 36775859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 14 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 957669 - 956798
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  957669 agacataaggagggtggaatatgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 957570  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  957569 acgagcatgttttaggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 957470  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  | | |  ||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||| ||||||| |||||||| | | |||     
T  957469 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattgaaacttgccaaacggc-aggtctcc 957373  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |  |||  | ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  957372 aatattc-gaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctagtttaaataaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcatt 957274  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
     | ||| || ||||| || ||||| |||    |||||||||| |||||| |||||| || |         |||||  || |||| |  | |||||||| |    
T  957273 cttttgacatttgaacaccatcatttaatcacagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcgaa-tattggagtcctgct 957175  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg 606  Q
      ||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||| | || || ||||||    
T  957174 gctttacaagtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaatttttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcatcctttgaatgggg 957075  T
Q  607 caattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
     ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  957074 taattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcatttgataagcatcttgaatactggtattgaagtgtcaaggaatgcacatcattcttttgacacttg 956975  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  956974 aatatcatcattcaagatgttgatcggatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcacttggaag 956875  T
Q  807 gtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgtttt 883  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  956874 gtacattctgaaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgtttt 956798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Original strand, 22436904 - 22437723
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22436904 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtg 22437003  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22437004 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccgg 22437103  T
Q  214 aagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  || | || |  | ||  | |||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| || | |||     
T  22437104 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cct-tcaaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-caggtctcc 22437200  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |  | || | ||  | |||   || ||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||      
T  22437201 aata-ttcgaccggcattcccattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcaga 22437299  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
     | ||| || ||||||||  |||| |||  | |||||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || || |||  | |||||||| |    
T  22437300 attttgtcatttgaataccgtcatttaatcccagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaatgggaatgccggtcg-aatattggagtcctgct 22437398  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg 606  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||||||||||||  |||| || |||    
T  22437399 gcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcatctgaattggg 22437498  T
Q  607 caattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
     ||||||||||||||||  | ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22437499 taattcaaacttgttaaacgacaggaatccagcatgcgatgagcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttg 22437598  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |   |||||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  22437599 aataccatcattcaagatgctcatcggaggctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgctccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 22437698  T
Q  807 gtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  22437699 gtacattccggaatgtaatgtaatg 22437723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Original strand, 21169444 - 21170317
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| |    
T  21169444 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtcgaattaacggacgatgaatacgcg 21169543  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21169544 acgagcatgttttgggagcacagcatgtaccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccag 21169643  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  | | |  ||||  |||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||| |||||||| | |||||     
T  21169644 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacggc-aggactcc 21169740  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |  |||  | ||  | |||   || ||| | | |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21169741 aatattc-gaccggcattcccattgttcatgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcatt 21169839  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
     | ||| || |||||||| ||||| |||  |  ||||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || || | |  | |||||||| |    
T  21169840 cttttgacatttgaataccatcatttaatccccgcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggtcgta-tattggagtcctgct 21169938  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg 606  Q
      |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    |||||||||||||||||| || || || |||||     
T  21169939 gcttggaaagtttaaatttacctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgttttcctttgaatgggt 21170038  T
Q  607 caattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
     ||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  21170039 -aattcaaacttcttaaacggcaggaatccagcattcgatgagcattttgaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacagttg 21170137  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    |||||||||||| || || || |||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21170138 aataccatcatttaaaatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaag 21170237  T
Q  807 gtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21170238 gtacattccggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatatattttgttttgaa 21170317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 14 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 33163758 - 33163307
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  33163758 agacgcaatgagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtaacattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaatgtg 33163659  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||    
T  33163658 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccag 33163559  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  33163558 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttgcctcttaaatggggtatttcaaacttgccaaacggccaggactcaaac 33163459  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  33163458 atttcgctcgacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctgatttagatgaaggtattaagtgtcaaggaataaacctcatttcgt 33163359  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33163358 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcataacaaaaatttattctttt 33163307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 49423972 - 49423097
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49423972 agacacaaggagggtggaacatgttcggtataaatgtccagcgctcgacgaggggagattatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 49423873  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |     
T  49423872 acgagcatgttctgggagcacggcatgttcaagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagaaatcatcaaaagtttgattctgccat 49423773  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  | | |  ||||  ||||| |||||||||| || |||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||     
T  49423772 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtgttacctttgaa-tggggtaattcaaatttgtcaaacggc-aggactcc 49423675  T
Q  311 agcatttt-gcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcat 408  Q
    |  || || | || || |||   || ||| | | |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  49423674 a--atcttcgaccgacattcccattgttcttgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 49423577  T
Q  409 tttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaa-atgcttgagtcctg 507  Q
    | | ||| |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| || |         |||||  || |||| ||  | ||||| ||    
T  49423576 tcttttgacacttgaataccgtcatttaaaccaaacctaacaagaatttaatcttttgaatgaaactatgggaatgtcggtcgaacat--tggagtcgtg 49423479  T
Q  508 ttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatgg 604  Q
       ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  49423478 ccgtttggcaagtttgaatttaccacattcaaaggtaacacaattgttgtagtttgaaggtacaaacgtccaactacaacaattgtcttcctctgaatgg 49423379  T
Q  605 ggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacact 704  Q
    || ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| || ||| | |||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  49423378 ggtaattcaaacttgttaaacagcaggaatccagcattcaatgagcattttgaatgacggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacaat 49423279  T
Q  705 tgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    |||||| | ||||||||||| || |||| ||  ||||||||||   |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  49423278 tgaatatcctcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcctgttgtttatcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttacagttgga 49423179  T
Q  805 aggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49423178 aggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 49423097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 34153500 - 34152627
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34153500 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34153401  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  34153400 acgatcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcggatgacgttggtgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 34153301  T
Q  214 aagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||  ||  || | || |  | ||||| |||||||| | ||||| ||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||     
T  34153300 aagatcgtcattatgtacggaatgaatgcaccttccagctacaacagttgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-catgtctcc 34153204  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |  | || | || || |||   || ||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||    
T  34153203 aata-ttcgaccgacattcccattgttcccgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaacggacctcatt 34153105  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
     | ||| || |||||||| ||||| |||    |||||||||| |||||| |||||| || |         |||||  ||  |  ||  | |||||||| |    
T  34153104 cttttgacatttgaataccatcatttaatctcagcctaacaacaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggttg-tatattggagtcctgct 34153006  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattg-tcttactctggatggg 605  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||    ||||||||||||||||| |||| || || |||||    
T  34153005 gcttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgttgttggaagatacaaacgtccaactgcaacaattgatcttcctttgaatggg 34152906  T
Q  606 gcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacact 704  Q
    | ||||||||||||||||  | ||||| |||| ||| |||| ||| |||||||  |||||||||||||||| || |||||   | |||||| ||||||||    
T  34152905 gtaattcaaacttgttaaacgacaggaatccaacatgcgatgagcatcttgaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatg---cgcattcttttgacact 34152809  T
Q  705 tgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||| ||  ||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34152808 tgaataccatcattcaagatgttcatcgcatgctggagtcatgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagataattgttgcagttgga 34152709  T
Q  805 aggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34152708 aggtacatttcggaatgtaatgtaatgcaatataatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 34152627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 49792150 - 49791286
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49792150 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtattattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtg 49792051  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |     
T  49792050 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccaa 49791951  T
Q  214 aagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||| ||||||| ||  || | || |  | ||  | |||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||| || | |||     
T  49791950 aagatcatcattaggtacggaatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cct-ttaaatggggtaattcaaacttgtcaaacgg-caggtctcc 49791854  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |  | || | ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||    
T  49791853 aata-ttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgtagtgtcaacgaatggacctcatt 49791755  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
     | ||| || |||||||| ||||| |||    |||||||||| |||||| |||||| || |         |||||| |  || |||  | ||||| || |    
T  49791754 cttttgacatttgaataccatcatttaatcacagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccgatcg-aatattggagtcatgct 49791656  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg 606  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  49791655 gcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagccaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgggg 49791556  T
Q  607 caattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
     ||||||||||||||||  ||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49791555 taattcaaacttgttaaacggcagaaatccagcatgcgatgtgcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttg 49791456  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    |||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||  || || |||||||||| |||| ||||    
T  49791455 aataccatcattcaagatgctcatcggatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagtgggaatataattgttggagttagaag 49791356  T
Q  807 gtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||| ||||||||          ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  49791355 gtacatttcggaatgt----------aatataatatgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 49791286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 41794776 - 41794227
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41794776 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 41794677  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  41794676 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 41794577  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||| |  |||| || ||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  41794576 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtatt-cct-ttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac-aacaggactcaagc 41794480  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  41794479 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaattttttttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 41794380  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntga-atgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  41794379 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 41794280  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||| || |||||    
T  41794279 ttgcaggtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaa 41794227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 23 - 402
Target Start/End: Original strand, 1226161 - 1226539
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1226161 gagggtggaatacgtttgctataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgtgtggaattaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatg 1226260  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1226261 ttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtc 1226360  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccc 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| | |   ||| |||| || ||||    
T  1226361 attagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctcataaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaagtcctc-agca-ttcgccc 1226458  T
Q  323 aacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaa 402  Q
     || || |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1226459 gacattaatgttttttctttgaaaagattaaatttttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaa 1226539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Original strand, 42886256 - 42887137
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagta---tcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 110  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42886256 agacacaaggagggtggaacacgttcgttataaacttccaacgctcgacgaggggagagtactatcattcacttgggtggaattaaccaacgacgaaaac 42886355  T
Q  111 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  42886356 atgacgagcatgctttgagagcacaacattttctagtggatcgatacgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgc 42886455  T
Q  211 gagaagatcgtcattagttagag---taaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgac 307  Q
     |||||||| ||||||| ||  |   ||| || | ||||| |||||||||| || || |||||   |||||| |||| ||||||  ||||||| || |||    
T  42886456 cagaagatcatcattaggtaccgatttaatgtaccttccagctacaacaattgtatt-cctct-ggatggggtaatttaaacttaccaaacgg-caggac 42886552  T
Q  308 tcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctc 406  Q
    || |||| |  | || || ||    || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||    
T  42886553 tccagca-tacgtccgacattaccattattcctttcaaaagattaaattcatgttaggcgggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatatacctc 42886651  T
Q  407 attttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct 506  Q
    ||| | ||| |||||||||||  |||| ||||  || |||||||| |||||| |||||| || |         || ||| || ||  ||||| ||||| |    
T  42886652 attcttttgacacttgaataccgtcatttaaactaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaatgggagtgccggacg-tatgctggagtcat 42886750  T
Q  507 gttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca----------------ttccaactgcaacaattgt 590  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||                 ||||||||||||  ||||    
T  42886751 gctgtttggcaagtttgaatttaccccattcagaggtaacacaattgttggagttggaaggtacaaacgttcagtataaacgtccaactgcaacggttgt 42886850  T
Q  591 cttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctc 690  Q
    ||| || || ||| || ||||||||||| ||||  |||| ||||||| |||||||| ||| | || ||  ||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  42886851 cttcctttgaatgaggtaattcaaacttattaaacggcatgactccaacattcgatgagcattttaaatgatggtattcaagtgttaagaaatgcacctc 42886950  T
Q  691 attctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataa 790  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| || || |  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||    
T  42886951 attcttctgacacttgaataccatcatttaaaatgccaatcgaatattggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagaggtaagataa 42887050  T
Q  791 ttgttgta-gttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||  ||||||||||||||||          ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  42887051 ttgttgtatgttagaagatacattttggaatgtaatgtaatg----------tgataacatatatagttgaatatgcataacacatgttgttttgaa 42887137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 479 - 836
Target Start/End: Complemental strand, 38132869 - 38132513
Alignment:
Q  479 tgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaac 578  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38132869 tgaatgcggggtgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaagtttgaatttgccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcacattccaac 38132770  T
Q  579 tgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaa 678  Q
    | ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||| |||||| |||||||    ||||||||||||||||    
T  38132769 tacaacagttgtcttgctatggatggggcaattcaaacttgttaatcgacattactccaacattctataagcatcttgaatgccggtattcaagtgtcaa 38132670  T
Q  679 tgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattca 778  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||  |||||||||||   ||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  38132669 ggaatgcacatcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgttaatcgtatgctggagtcctgctgcttaacaagtttgaatttgcct-attca 38132571  T
Q  779 agggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatg 836  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38132570 atggtaagataattattgcagttggaaggtacattctggaatgtaatgtaatgtaatg 38132513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 410
Target Start/End: Original strand, 9489672 - 9490066
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  9489672 agacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtg 9489771  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  9489772 acgagcatgttttgg-agcacagcatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttattgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 9489870  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||| || |||||   || |||||||||    
T  9489871 aagatcgtcattagttagggtaaagtgcattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaac-aacaggactcaagc 9489969  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattt 410  Q
    ||||  | | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  9489970 atttcactcgacattcatgtttttcctttgaaaaaattaaattcttgttaggttggtttatatgaaggtataaagtgtcaaggaatgaacctcattt 9490066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 24 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 20779073 - 20778833
Alignment:
Q  24 agggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 123  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20779073 agggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 20778974  T
Q  124 tttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtca 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20778973 tttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtttcgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccaaaagatcgtca 20778874  T
Q  224 ttagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtctt 264  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  20778873 ttaggtagggtaaggtgcattccaaccacaacaattgtctt 20778833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 344 - 886
Target Start/End: Original strand, 2773331 - 2773871
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| || ||||||||   ||| |||  | |    
T  2773331 aaaagattaaattcttgttaggttggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattcttttgacatttgaataccgccatttaatccca 2773430  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || |         || ||| || |||| |  | ||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  2773431 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggagtgctggtcgaa-tattggagtcatgatgcttggcaagtttaaatttacctcattcaaagg 2773529  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagc 639  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||    
T  2773530 taagacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaagaatccagc 2773629  T
Q  640 attcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattg 739  Q
    || ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||||| ||  | |||| || |||    
T  2773630 atgcgatgtgcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattctttttacagttgaataccaacattcaaaatgttcatcggatgttg 2773729  T
Q  740 gagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaa 839  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||       
T  2773730 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgctccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtatattccagaatgtaatgtaatgcaatg--- 2773826  T
Q  840 tttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2773827 --tgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 2773871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 465
Target Start/End: Original strand, 17211259 - 17211708
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  17211259 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgttcgacgagggaagaatatcattcatttgagtcgaattaacgaacgataaaaacgtg 17211358  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  17211359 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatattatcaacagtctgattccgccag 17211458  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||| ||||| ||| | || |    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||||||| |||| | ||   ||||| |    
T  17211459 aagatcgtgattaggtagggaaatgcatcttccaactacaacaattgtctta-ctctgaaatgaggtaattcaaacttgttaaactg-cagttctcaatc 17211556  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    | ||  ||| || ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |     
T  17211557 a-ttcacccgacattcctattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggctggtttagataaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattctt 17211655  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||| | ||||||    
T  17211656 ttgacacttgaataccatcatttaaatcaagcctaacaataattaaatctttt 17211708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 530 - 808
Target Start/End: Original strand, 885315 - 885593
Alignment:
Q  530 ccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggca 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  885315 ccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggagcaattcaaacttgttaattggca 885414  T
Q  630 ggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctga 729  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  |||    
T  885415 ggactccaacattcgataagcgtcttgaacgctgatattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccaacgttcaagatgttga 885514  T
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||| |  || |||  ||||||||||||||||||||    
T  885515 tcgaatattggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccatttagaggcaaggcaattgttgtagttggaaggt 885593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32938116 - 32937833
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32938116 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 32938017  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  32938016 acgagcatgtttcgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccag 32937917  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacg 299  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||| || |||||||||||||||||||    
T  32937916 aagatcgtcattagatagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacg 32937833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 344 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 34529681 - 34529191
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| || || |||||  |||| |||  | |    
T  34529681 aaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattcttttgacatttcaataccgtcatttaatccca 34529582  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || |         |||||  |  |||| |  | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34529581 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcgatcgaa-tattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaagg 34529483  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagc 639  Q
    ||| |||||||||| |||||||| | |||    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  |||| || || |||    
T  34529482 taacacaattgttggagttggaaggtacaaacgtccaactacaacaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttgttaaacggcatgaatctagc 34529383  T
Q  640 attcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattg 739  Q
    || |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| || |||| || |||    
T  34529382 atgcgatgagcatcttgaacaatggtattcaagtgttaaggaatgcacatcattcttttgacacttgaataccatcgttgcagatgctcatcggatgttg 34529283  T
Q  740 gagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34529282 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgcctcatttagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 34529191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 43889713 - 43889427
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43889713 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 43889614  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  43889613 acgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatataatcaaaagtttgattccgccag 43889514  T
Q  214 aagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacg 299  Q
    |||||||||||||| ||  || | || |  | |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  43889513 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cctct-aaatggggtaattcaaacttgccaaacg 43889427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6282537 - 6282321
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6282537 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacaaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtg 6282438  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  6282437 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 6282338  T
Q  214 aagatcgtcattagtta 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  6282337 aagatcgtcattagtta 6282321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34530010 - 34529797
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  34530010 agacacaagaagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaatgtg 34529911  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34529910 acgagcattttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 34529811  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  34529810 aagatcgtcattag 34529797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47657569 - 47657356
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| | ||||| || ||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  47657569 agacacaaggtgggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgaccaaaacgtg 47657470  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  47657469 acgagcatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccag 47657370  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  47657369 aagatcgtcattag 47657356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 582 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 6282149 - 6281877
Alignment:
Q  582 aacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatga 681  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||| |||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6282149 aacaattgtcttcctctgaatgagacaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcacgcgatgtgcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaatga 6282050  T
Q  682 atgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagg 781  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||  |    
T  6282049 atgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgctcatcggatgctggagtcttgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtg 6281950  T
Q  782 gtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6281949 gtaagataattgttgcagttggaaggtacattccggaataaaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 6281877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 564 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 14330305 - 14330038
Alignment:
Q  564 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatg 663  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||| || || ||| || ||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14330305 aatgcaccttccaactgtaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggtaagactccagcattcgataagcatcttgaataatg 14330206  T
Q  664 gtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttg 763  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  14330205 gtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattattttgacacttgaataccatcattcaagatgttgatagaatattagagtcctgctgtttaggaagtttg 14330106  T
Q  764 aattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14330105 aatttaccccattaaagggtaagataattgttgcagttggaaggtacattccgaaatgtaatgtaatg 14330038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 512 - 886
Target Start/End: Original strand, 49571599 - 49571966
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||    ||  ||||||||||||||||| || || ||| || |    
T  49571599 ttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttgggaggtacaaacgtcacactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggta 49571698  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    |||||||||||||||  || |||| ||||||||| ||| ||| ||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  49571699 attcaaacttgttaaacggtaggaatccagcatttgattagcatcttgaatactaatattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaa 49571798  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| |||   ||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49571799 taccatcattaaagatgctgatcggatgttggagtcatgctgcttagcaagtttgaatttgccctatttaagggtaagataattgttgcagttggaaggt 49571898  T
Q  809 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||          | ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  49571899 acattc----------tctaatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 49571966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26591899 - 26591686
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26591899 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtg 26591800  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  26591799 acgaacatattttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 26591700  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  26591699 aagatcgtcattag 26591686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 49817858 - 49817645
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  49817858 agacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctctacgaggggagagtaacattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtt 49817759  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  49817758 acgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccag 49817659  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  49817658 aagatcgtcattag 49817645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 607 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 31824309 - 31824085
Alignment:
Q  607 caattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31824309 caattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcgataagcctcttgaatgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttg 31824210  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| ||||| |||    
T  31824209 aataccatcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcctgctacttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttgaaag 31824110  T
Q  807 gtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  31824109 gtacattccagaatgtaatgtaatg 31824085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 2773002 - 2773212
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2773002 agacacaaggatggtggaacacgttcgttataaacgtccaacgctctacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 2773101  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| ||    
T  2773102 acgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttattgagatcaactgaagataccatcaacaacttgattccgccag 2773201  T
Q  214 aagatcgtcat 224  Q
    |||||||||||    
T  2773202 aagatcgtcat 2773212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 465
Target Start/End: Original strand, 3393297 - 3393743
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  | |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3393297 agacacaaggagggtggaatacgttcgatataaacgtccaacgctcgaggatgggagattatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 3393396  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  3393397 aggagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccag 3393496  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||| | ||||| ||| | || |  | |||||||||||||| | || ||||| || |||||||  ||||||||||||| ||||  |  |  | |||||    
T  3393497 aagatcatgattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacatttgtattacc-ctgaaatggg--aattcaaacttgttaaacaacagtttc-caagc 3393591  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
     ||  ||  |  |||| | || |||| || |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |  | ||| |     
T  3393592 tttcggctgacagttc-tattgttccattcaaaagattaaattcttgttaggctcatttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcatttaattctt 3393690  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  3393691 ttgacacttgaataccatcatttaaaccaagtctaacaagaatttaatctttt 3393743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44560394 - 44560181
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44560394 agacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 44560295  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || ||||||||||||||||| | ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |       
T  44560294 acaagcatgttttgggagcaaagcatgttccagtgtattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttctcctt 44560195  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  44560194 aagatcgtcattag 44560181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 465
Target Start/End: Original strand, 18412588 - 18413034
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18412588 agacacaagaagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttcggtggaattaatgaacgacgataacgtg 18412687  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||| || ||    
T  18412688 aggagcatgttttgggagcacaccatgtttcagtggatcgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacaatttgattctgccag 18412787  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||| ||||| ||| | || |  | |||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||  |  | ||| |    
T  18412788 aagatcgtgattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtctta-ctctgaaatggggtaattcaaacttgttaaacggcagtttc-caaac 18412884  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    |||   || |  |||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||| |     
T  18412885 attcacccgacagttc-tatttttcctttcaaaagattaaattattgttagcttggtttagatgaaggtattgcagtctcaaggaatgcacctcattctt 18412983  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||| ||||||| ||  ||| | |||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  18412984 ttgacacttgattatcatc-tttaaaccaag-ctaacaaaaatttaatctttt 18413034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 530 - 854
Target Start/End: Original strand, 37867021 - 37867326
Alignment:
Q  530 ccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg-caattcaaacttgttaattggc 628  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||   ||    
T  37867021 ccccattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgtacattccaactgcaataattctcttactcttgatggggtcaattcaaacttgctaaccagc 37867120  T
Q  629 aggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctg 728  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||                    |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  37867121 aggactccagtattcgatcagcatcttgaacgctggtat--------------------ctcattcctttgacacttgaataccagcgttcaagatgctg 37867200  T
Q  729 atcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgta 828  Q
    |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37867201 atcgaatactggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaatggtaagataattgttgcagttggaaggtacattctggaatgtaatgta 37867300  T
Q  829 atgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    |||||||||| | |||||||||||||    
T  37867301 atgcaatgtagtgtgataacatatat 37867326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Original strand, 24606745 - 24606995
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24606745 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaatgtccaacgctcgacaagcggagagtattattcagttgggtagaattaacgaacgacgaaaacgtg 24606844  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  24606845 acgagcatgtattgggagcacatcatgttcccgtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgccag 24606944  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtctt 264  Q
    |||||||| ||||| |||   || || |||||||||||||||||| |||||    
T  24606945 aagatcgtgattaggtaggtaaatgtacattccaactacaacaattgtctt 24606995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 512 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 43889218 - 43888856
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc---caactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| | |||  |   |||||||||||||| |||| ||||| |||||| |    
T  43889218 ttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacacgattgttggagttggaaggtacaaacgttcaactgcaacaattttcttcctctgaatggggta 43889119  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    |||||||| ||||||  | || || |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43889118 attcaaacatgttaaacgacatgaatccaacattcgatgagcatcttgaataatggtatccaagtgccaaggaatgcatctcattcttttgacacttgaa 43889019  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||||||| |||||||| || |||| || |||||||| |||  |||| ||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  43889018 taccatctttcaagatgctcatcgcatgttggagtcttgctgtttaacaagtttgaatttaccccatttagaggtaagataattgttgcagttggaaggt 43888919  T
Q  809 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||| |||||||||||               ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43888918 acattcgggaatgtaatg---------------tgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 43888856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 617 - 854
Target Start/End: Original strand, 9490076 - 9490320
Alignment:
Q  617 ttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatca 716  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  9490076 ttgttaatcgggaggactccagcattcgataagcgtcttgaacgctgatattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcg 9490175  T
Q  717 ttcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccg 816  Q
    |||||||| ||||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9490176 ttcaagatgctgatcgaattctggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtacattccg 9490275  T
Q  817 gaatgtaa-------tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    ||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9490276 gaatgtaatgtattttgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 9490320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 11288288 - 11288499
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11288288 agacacaaggagggtggaatacgttccgtataaacgtccaacggtcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 11288387  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||| |  ||    
T  11288388 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgagtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcacaa-tttgattctgttag 11288486  T
Q  214 aagatcgtcatta 226  Q
    |||||||| ||||    
T  11288487 aagatcgtgatta 11288499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4785636 - 4785423
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||| ||| ||  || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4785636 agacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtcaaacccttgacgaggggagagcatcattcactttggtggaattaacgaacgacaaaaacgtg 4785537  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |     
T  4785536 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcggggaacgttgctgatatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgccac 4785437  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  4785436 aagatcgtcattag 4785423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 446
Target Start/End: Original strand, 10312265 - 10312692
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||| | |||| ||| || | |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10312265 agacacaaggagtgtggaatatgttcggtataaacatacaacactcgacgatgggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 10312364  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||| | | | |||||||  |    
T  10312365 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttaagatcaactgaagatattatcaacaatctaattccgctgg 10312464  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||| ||||| ||| | ||    | |||||||||||||||| |||||||| || ||||  || ||||||||||||| | || || |   | ||| |    
T  10312465 aagatcgtgattaggtag-ggaattcaccttccaactacaacaattgtcttacc-ctaaaat--ggaaattcaaacttgttatac-gctagttcccaaac 10312559  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    |||   |  |  |||| | || |||| || |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |     
T  10312560 attcacctgacagttc-tattgttccattcaaaagattaaatttatgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattctt 10312658  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcct 446  Q
    ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  10312659 ttgacacttgaataccatcatttaaaccaagcct 10312692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 563 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 4785036 - 4784721
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactct--ggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||  |||  | ||||||  |||||||||||||||  | || ||||||| |||||||| | | | || ||      
T  4785036 gaatgcatcttccaagtgcaacaattgtctttttctttgaatggggtgattcaaacttgttaaacgacatgactccaacattcgatgaacattttaaatg 4784937  T
Q  661 atggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagt 760  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||  |||||||||||  |||| |||||    
T  4784936 atggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatttaaaatgttgatcgaatgctggagtcctgcagtttaacaagt 4784837  T
Q  761 ttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaa 860  Q
    |||||||| |||||||||  | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||| ||||| || |    
T  4784836 ttgaatttacctcattcagagataagatgattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg----------tgataacacatataattga 4784747  T
Q  861 atatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4784746 atatgcataatacatgttgttttgaa 4784721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 752 - 886
Target Start/End: Original strand, 25763301 - 25763435
Alignment:
Q  752 ttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacata 851  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25763301 ttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagataattgttgcagttggaagttacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacata 25763400  T
Q  852 tatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25763401 tatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 25763435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 667 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 14290002 - 14289838
Alignment:
Q  667 ttcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaat 766  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||    
T  14290002 ttcaagtgtcaaggaatgcacctcattattttgacacttgaataccatcattcaagatgttgatagaatattagagtcctgttgtttaggaagtttgaat 14289903  T
Q  767 tttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    || || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14289902 ttaccccattaaagggtaagataattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 14289838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 707 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 20901226 - 20901048
Alignment:
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||| | || |||||| ||||||||||||||||||    
T  20901226 aataccttcattcaagatgctgatcggatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccat-ctagagtaagacaattgttgtagttggaag 20901128  T
Q  807 gtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  20901127 gtacattctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaacgtgcataatacattttgttttgaa 20901048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 292
Target Start/End: Original strand, 31324167 - 31324444
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||| || |||| |||| |||||||||||||||| || || | |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  31324167 agacacaatgaggatggaataggttcagtataaacgtccaacgttcgacgatgggagaatattattcagttgggtggaattaacgaacgacaatgacgtg 31324266  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||| ||    
T  31324267 acgagcatgtttttggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtgtgtaaagttgctgagatcaactgaagacattctcaacagtttgattccgctag 31324366  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttg 292  Q
    |||||| | ||||| ||| | || |  | |||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |  ||||||||||||    
T  31324367 aagatcatgattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacctttgaaatgagataattcaaacttg 31324444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 738 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 44559816 - 44559668
Alignment:
Q  738 tggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgt 837  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  44559816 tggagtcatgctgtttaacaagtttgaatttgcctcattcaagggtaagataattgttgcagttgaaaggtacattctaaaatgtaatgtaatgcaatgt 44559717  T
Q  838 aatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44559716 aatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 44559668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 275
Target Start/End: Original strand, 13850742 - 13851002
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || | |||||| ||||||||| |||| || ||||||| ||||||||  |||||    
T  13850742 agacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgtccaacgtttgacgatgggagaatatcattcagttggatgaaattaacaaacgacgacgacgtg 13850841  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||   || || ||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||| ||    
T  13850842 acgaacatgttttgggagcacaacatgttaccgtggatcgatatgtatgtaacattgctgagatcaactaaagatattctcaacagtttgattccgccag 13850941  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaat 275  Q
    |||| ||| ||||| ||| | || |  | ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  13850942 aagaccgtgattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattatcttacctctaaaat 13851002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 345 - 644
Target Start/End: Original strand, 24607051 - 24607350
Alignment:
Q  345 aaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaag 443  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| | ||||||||| ||||| |||| ||||    
T  24607051 aaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgactcttgaataccatcatttaaaccaag 24607150  T
Q  444 cctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggt 543  Q
    |||||||| |||||| |||||| || |          | |   ||| ||| |||||||    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24607151 cctaacaagaatttaatcttttgaatgaaacaataaaactttcgggtgaa-tgcttgatagttgttgtttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggt 24607249  T
Q  544 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattc 643  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |  | |||||||| ||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||    
T  24607250 aagataattgttttagttggaaggtgccttccaactacaacaattgtcctcctctggatggagtaattcaaacttgttaaacggcaggactccaacattc 24607349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 703 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 51027342 - 51027160
Alignment:
Q  703 cttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttg 802  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  || || ||||| ||   |||||||||||||||||| || ||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  51027342 cttgaataccatcattcaagatgctgatcagatgtttgagtcatgttgtttagcaagtttgaatttgccccatcca-gagtaagacaattgttgtagttg 51027244  T
Q  803 gaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  51027243 gaaggtacattctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgtgtagtacattttgttttgaa 51027160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 13866256 - 13866469
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  |  || | |||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||    
T  13866256 agacacaaggagggtggaatgcgtttggtataaacgtccaacatttgacgatgggagaatatcattcagttggatggaattaacaaacgacgacgacgtg 13866355  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||   || ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||    
T  13866356 acgaacatgttttgggagcacaacatgttaccgtggattgatatgtatgtaacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccag 13866455  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||| ||| |||||    
T  13866456 aagaccgtgattag 13866469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 512 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 26591632 - 26591493
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat-------tccaactgcaacaattgtcttactctggatgg 604  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||        || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26591632 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggtacaaacaaacgtctaactgcaacaattgtcttactctggatgg 26591533  T
Q  605 ggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcg 644  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26591532 ggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagcattcg 26591493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 563 - 768
Target Start/End: Original strand, 49064575 - 49064780
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||||||  | ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||  ||    
T  49064575 gaatgcaccttccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacgacaggagtccagcatttgatgagcatcttgaatgat 49064674  T
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagttt 762  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| || ||  | ||||||||   |||||||||  ||||| ||||||    
T  49064675 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttggcacttgaatgtcgtcatttaaaatgttcatcgaataccagagtcctgcagtttagaaagttt 49064774  T
Q  763 gaattt 768  Q
    ||||||    
T  49064775 gaattt 49064780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 39589476 - 39589146
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||||||||||| |||||  | | ||||||| |||||  | | || ||||||||||     
T  39589476 gtgcattccaacttcaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaacaa-gactcaaacatttcacacgacattcatgtttt- 39589379  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| | | | |||||   ||| ||||| |||||  |||||    
T  39589378 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaattatgttcattcc-ttgacactt-aataccttcatc 39589281  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca 534  Q
    |||| || ||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | ||    
T  39589280 taaacca-gcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagtgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctca 39589182  T
Q  535 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39589181 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 39589146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 642 - 785
Target Start/End: Original strand, 47870717 - 47870857
Alignment:
Q  642 tcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattgga 741  Q
    ||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||| ||||    
T  47870717 tcgataagcatcttgaacgctgatattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccaacgttcaaga---tgatcgaatactgga 47870813  T
Q  742 gtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaa 785  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  47870814 gtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaatggtaa 47870857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 27759876 - 27759544
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||| | |||||  | | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  27759876 gtgcattccaactacagcaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactggccaaacaac-aggactcaagcatttcgccccgcgttcatgttttt 27759778  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| || ||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||| | ||| ||  ||| ||||| |||||  |||||    
T  27759777 cctttgaaaagaataaatttttattaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aataccttcatc 27759680  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttatttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||        |||| || |||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| |||||||    
T  27759679 taaa-ccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatagccgtttggcaagtttgaa-ttacccc 27759582  T
Q  534 a-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27759581 atttcagaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcac 27759544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 1043296 - 1042969
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||| ||||||||  | | |||||||| |||| || | || ||||||||||     
T  1043296 gtgcattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaac-aggactcaagaatttcgctcgacattcatgtttt- 1043199  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  |||||    
T  1043198 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgatttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatc 1043101  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca 534  Q
    |||| || ||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||||| | ||    
T  1043100 taaacca-gcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggccgatttgaatttatctca 1043002  T
Q  535 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 567  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1043001 ttcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatg 1042969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 28082582 - 28082455
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  28082582 agcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaag 28082483  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28082482 g-aagacaattgttgtagttggaatgcac 28082455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 491 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 9489974 - 9489895
Alignment:
Q  491 gaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9489974 gaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 9489895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Original strand, 6176740 - 6176983
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6176740 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgataagcatcttgaacgatggtattc 6176839  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  6176840 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-tt 6176937  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  6176938 gcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 6176983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Original strand, 21016602 - 21016845
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21016602 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgataagcatcttgaacgatggtattc 21016701  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  21016702 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-tt 21016799  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  21016800 gcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 21016845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 505 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 32937649 - 32937559
Alignment:
Q  505 ctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32937649 ctgttgtttggcaagtttgaatttgcctcattcaacggtaagataattgttgtagttggagtgcaccttccaactacaacaattgtcttac 32937559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 49817283 - 49816964
Alignment:
Q  142 tccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgc 241  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||| || | |||||||| ||||| ||| | || |  |    
T  49817283 tccagtggatcgatatgcgtgtaacgttgatgagatcaaatgaagatattatcaacagtctgattctgccaaaagatcgtgattaggtaggg-aatgcac 49817185  T
Q  242 attccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccca-acgttcatgtttttcct 340  Q
     |||||||||||| ||| |||||||| || ||||||   ||||||||||||| ||||| | | | ||| ||||||  ||||  | |||| | || ||||     
T  49817184 cttccaactacaataattgtcttacc-ctgaaatgga--aattcaaacttgttaaacg-ctaggtctctagcattcggcccggaagttc-tattgttcca 49817090  T
Q  341 ttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaag 439  Q
    || ||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||| |||||  |||     
T  49817089 ttcaaaagataaaattcatgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaaac 49816990  T
Q  440 caagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||| |||||||| | |||| ||||||    
T  49816989 caaacctaacaagattttaatctttt 49816964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 21712078 - 21711747
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||   ||  ||||||||| || |||||  |  | ||||||||||||  ||| || ||||||||||     
T  21712078 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaacgtgccaaacaacagt-actcaagcatttcacccgacattcatgtttt- 21711981  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||   |||||   ||| ||||| |||||  |||||    
T  21711980 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgagattcattcc-ttgacactt-aataccttcatc 21711883  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||    
T  21711882 taaatcac-cctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-acccc 21711785  T
Q  534 att-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21711784 atttcagaggtaagagaattgttgtagttggaatgcac 21711747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 561 - 767
Target Start/End: Original strand, 31824100 - 31824308
Alignment:
Q  561 tggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaa 658  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |||| | | |||||||    
T  31824100 tggaatgtacctttcaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagtagcaggactccaacatacgatcaacatcttgaa 31824199  T
Q  659 caatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagca 757  Q
      |||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||||||   ||| ||    
T  31824200 tgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcattcaagaggcttatcgaatgttggagtcctgccgattaaca 31824298  T
Q  758 agtttgaatt 767  Q
    ||||||||||    
T  31824299 agtttgaatt 31824308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 55797039 - 55796960
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  55797039 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttagcccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 55796960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21412739 - 21412647
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacga 106  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  21412739 agacacaaggagggtggaatacgtccggtataaacgtccaatgttcaacgaggggagaatatcatttagttggatggaattaacgaacgacga 21412647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Original strand, 34152708 - 34152903
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || |||||||||| |||   ||| ||||||||||| |||| | | |||||||  |||||||||    
T  34152708 ttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcatgactccagcatgcgatgaacatcttgaatgatggtattc 34152807  T
Q  670 aagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||||||||  |||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| |||||   |||| ||||||||||||    
T  34152808 aagtgtcaaaagaatgcgc---attcttttgacacttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatgttggattcctgtcgtttaacaagtttgaatt 34152903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 585 - 644
Target Start/End: Original strand, 1226606 - 1226665
Alignment:
Q  585 aattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcg 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1226606 aattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcg 1226665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 754 - 840
Target Start/End: Original strand, 24607545 - 24607631
Alignment:
Q  754 agcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaat 840  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  24607545 agcaactttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgtagttggaaggtacatttccgaatgtaatgtgatgtaatataat 24607631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 570
Target Start/End: Original strand, 51427858 - 51428182
Alignment:
Q  245 ccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttga 344  Q
    |||||||||||||| || |||||| | ||  |||  |||||||||||| |||||  | | ||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||    
T  51427858 ccaactacaacaattgtgttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-aggactcaagcatttcgcccgacattcatgtttt-cctttga 51427955  T
Q  345 aaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagca 441  Q
    ||| | |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  ||||||||| ||    
T  51427956 aaataataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatctaaacca 51428053  T
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccca-ttcaa 539  Q
     | ||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| |  ||||||||||||||||||    |||| |||||||||| |||||||| ||||     
T  51428054 -gactaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgatcgaaatgcttgagtcctggccgtttgccaagtttgaa-ttaccccatttcag 51428151  T
Q  540 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51428152 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 51428182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 21017088 - 21017167
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21017088 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 21017167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 40353684 - 40353763
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40353684 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaggtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 40353763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 661 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 49817494 - 49817437
Alignment:
Q  661 atggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49817494 atggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 49817437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 570
Target Start/End: Original strand, 14330358 - 14330684
Alignment:
Q  243 ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttccttt 342  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||   ||  |||||||||| |||||||    | ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  14330358 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggttaattcaaactggtcaaacaat-aggactcaagcatttcgcccgacattcatgtttttccttt 14330456  T
Q  343 gaaaagattaaattcttgtta-tgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaag 439  Q
    ||||||| || ||| ||||||  | |||||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||| | ||| ||   || ||||| |||||| |||||||||     
T  14330457 gaaaagaatatatttttgttagggttggtttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccctgacacttcaatactttcatctaaa- 14330554  T
Q  440 caagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca-ttca 538  Q
    | |||||||||| | |||| |||||||||||        ||||||  ||||| ||||||  || | |||  ||||  ||||||||| |||||||| ||||    
T  14330555 ccagcctaacaagagtttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgatgggcg-aatgctgaagacttgtcgtttgataagtttgaa-ttaccccatttca 14330652  T
Q  539 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14330653 gaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 14330684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 385
Target Start/End: Original strand, 20901335 - 20901481
Alignment:
Q  239 tgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttc 338  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| | ||  | ||||||||||||    
T  20901335 tgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcatttcgtcccgcattcatgtttttc 20901433  T
Q  339 ctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    ||||||||| | |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  20901434 ctttgaaaataataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 20901481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Original strand, 40353198 - 40353441
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  40353198 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaacgctggtattc 40353297  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    ||||||| || |||||     ||||| ||||||||||||||||||   |||||||  || |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  40353298 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagtgttcaagaggcttatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-tt 40353395  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    ||| || || ||||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||    
T  40353396 tcccca-tccagggtaagacaatttttgcagttggaatgtgcattcc 40353441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 759 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 41794273 - 41794176
Alignment:
Q  759 gtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    |||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  41794273 gtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaatttcggaatgtaatgtaaaatgcaatgtaatgtgataacatatat 41794176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 49095527 - 49095284
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  49095527 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaacgctggtattc 49095428  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    ||||||| || |||||     ||||| ||||||||||||||||||   |||||||  || |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  49095427 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagtgttcaagaggcttatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-tt 49095330  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  49095329 gcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 49095284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 663 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 49817050 - 49816992
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaa 721  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49817050 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaa 49816992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 49817361 - 49817307
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  49817361 tttggcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagacaattgttgtagttggaa 49817307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 6177226 - 6177305
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  6177226 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcac 6177305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 730 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 26591654 - 26591573
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||||||||||||||||||   || |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26591654 tcgaatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggtaca 26591573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 41794473 - 41794552
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  41794473 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcac 41794552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 561 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 45940320 - 45940112
Alignment:
Q  561 tggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaa 658  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   ||||||||| || ||||||| ||| |||||||    
T  45940320 tggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactctagtattcgatcagcatcttgaa 45940221  T
Q  659 caatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagca 757  Q
    |  ||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||  ||||||| |||   ||| ||    
T  45940220 cgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgatggagtcatgccgattaaca 45940122  T
Q  758 agtttgaatt 767  Q
    ||||||||||    
T  45940121 agtttgaatt 45940112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 479 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 49064288 - 49064196
Alignment:
Q  479 tgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccattcaa-aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49064288 tgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-accccatttaagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 49064196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 49095041 - 49094962
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  49095041 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcac 49094962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 56139206 - 56139127
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  56139206 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcac 56139127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 567 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 885595 - 885347
Alignment:
Q  567 gcacattccaactgcaacaattgtcttac-tctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatgg 664  Q
    |||| |||||||| ||||||||| ||| | |||  ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||  ||||||| | | ||||||||  |||    
T  885595 gcaccttccaactacaacaattgccttgcctctaaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaatattcgatcaacatcttgaacgttgg 885496  T
Q  665 tattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttg 763  Q
    ||||||||||||||  |||||     ||||| ||||||||||||||| || | |||||||  || ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||    
T  885495 tattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaatatcagcgttcaagacgcttatcgaatgttggagtcctgccaattaacaagtttg 885397  T
Q  764 aattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    ||||   |||  || || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  885396 aattg--ctccatccagagtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattcc 885347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 21170246 - 21170039
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| ||| | || ||     
T  21170246 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcatgcgatgagcattttaaat 21170147  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     ||||||||||| |||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||| ||||||  ||||  ||    
T  21170146 gatggtattcaactgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccatcattcaaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaagaa 21170048  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  21170047 gtttgaatt 21170039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 515 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 37867112 - 37867033
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37867112 gcaagtttgaattgaccccat-caagagtaagagaattattgcagttggaatgtacattccaactgcaacaattgtcttac 37867033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 563 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 1043540 - 1043334
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| | | ||||||||     
T  1043540 gaatgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatcaacatcttgaacg 1043441  T
Q  661 atggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaag 759  Q
     ||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||  |||||||||||   ||| ||||    
T  1043440 ctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccaacgttcaagacgcttatcgaatgctggagtcctgccgattaacaag 1043342  T
Q  760 tttgaatt 767  Q
    ||||||||    
T  1043341 tttgaatt 1043334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 10312625 - 10312680
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10312625 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 10312680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 45940074 - 45939742
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaat-tcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttt 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| || ||  ||||||||| |||||  | | ||||||||||||| ||||  | ||||||||||    
T  45940074 gtgcattccaactacaacaattgtcttacct-tcgaatgaggtaaagtcaaacttgccaaacaac-aggactcaagcatttcgccccgcattcatgtttt 45939977  T
Q  337 tcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcat 433  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  || | ||||||||  |||||| ||||| ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  ||||    
T  45939976 tcctttgaaaagaataaatt-ttgttagacttgctttagatggtggtattcaagtgccaatgaaatgatgttcattcc-ttgacactt-aataccttcat 45939880  T
Q  434 ctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccc 532  Q
    ||||| || || |||||| |||||| |||||||||||        |||| |  |||| ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| ||||    
T  45939879 ctaaacca-gcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgttgggcaaaatgcttgagtcatggtcgtttggcaagtttgaatt-accc 45939782  T
Q  533 catt-caaaggtaagacaatt-gttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45939781 catttcagaggtaagacaattagttgtagttggaatgcac 45939742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 562 - 678
Target Start/End: Original strand, 6281916 - 6282034
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||     
T  6281916 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaagactccagcatccgatgagcatcttgaat 6282015  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaa 678  Q
     ||||||||||||||||||    
T  6282016 gatggtattcaagtgtcaa 6282034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 562 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 9490274 - 9490156
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  9490274 ggaatgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactccagaattcgatcagcatcttgaac 9490175  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaa 678  Q
      |||||||||||||||||    
T  9490174 gctggtattcaagtgtcaa 9490156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 465
Target Start/End: Original strand, 24607375 - 24607497
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| | ||| ||||||||||| || || |||| |||    
T  24607375 aaaagattaaattcttgtttggccggtttaaatgaaggtattaaagtgtcaaggaacggacctcattcttttgacacttgaataccattatttaaaccaa 24607474  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
     |||||||  |||||| ||||||    
T  24607475 acctaacatgaatttaatctttt 24607497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 25763147 - 25763023
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaat-tcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttt 336  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| ||  |||||||||||||||  | | ||||||||||||| ||||  | ||||||||||    
T  25763147 gtgcattccaactccaacaattgtcttacct-tcgaatggggtaaagtcaaacttgtcaaacaacaa-gactcaagcatttcgccccgcattcatgtttt 25763050  T
Q  337 tcctttgaaaagattaaattcttgtta 363  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  25763049 tcctttgaaaagaataattttttgtta 25763023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 27760111 - 27759914
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   ||||||||| | ||| |||| ||  |||||||  |||||||||    
T  27760111 ttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactcaaacatacgatcagaatcttgaatgatggtattc 27760012  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||| || |||||     ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  27760011 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacatttgaataccaacattcaagaggcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 27759914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 777 - 831
Target Start/End: Original strand, 36172399 - 36172453
Alignment:
Q  777 caagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  36172399 caagggtaagataattgttgcagttggaagataaattccggaatgtaatgtaatg 36172453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 516 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 37867005 - 37866900
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatgggg-caattca 613  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||    
T  37867005 caagtttgaattgaccccat-caagagtaagagaattattgcagttggaatgtgcattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattca 37866907  T
Q  614 aacttgt 620  Q
    |||||||    
T  37866906 aacttgt 37866900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 573 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 44559939 - 44559845
Alignment:
Q  573 tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtat 667  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||    ||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||    
T  44559939 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacaacaggaatccagcatgcgatgagcatcttgaataatggtat 44559845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 696 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 49064691 - 49064575
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgtt 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  |||| |||||   |||| |||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||    
T  49064691 cttgacacttgaataccatcattcaagatgctcatcaaatgctggactcctgtcgtttaacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aagacaattgtt 49064594  T
Q  796 gtagttggaaggtacattc 814  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  49064593 gcagttggaaggtgcattc 49064575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 885380 - 885327
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  885380 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 885327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 1043321 - 1043268
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  1043321 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactgcaacaattgtcttac 1043268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 520 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 4785133 - 4785088
Alignment:
Q  520 tttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4785133 tttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 4785088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 561
Target Start/End: Original strand, 17211760 - 17211829
Alignment:
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagtt 561  Q
    |||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17211760 aatgtttgagtcatgttgtttagcaagtttgaatttaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagtt 17211829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 570
Target Start/End: Original strand, 20778795 - 20778859
Alignment:
Q  505 ctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  20778795 ctgttgtttggcaagtttgaatttgcctcattcaaagg-aagacaattgttgtggttggaatgcac 20778859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 755 - 808
Target Start/End: Original strand, 24607221 - 24607274
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24607221 gcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagataattgttttagttggaaggt 24607274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 755 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 32937639 - 32937590
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32937639 gcaagtttgaatttgcctcattcaacggtaagataattgttgtagttgga 32937590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 563 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 37867286 - 37867169
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||     
T  37867286 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccattgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaacg 37867187  T
Q  661 atggtattcaagtgtcaa 678  Q
     |||||||||||||||||    
T  37867186 ctggtattcaagtgtcaa 37867169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 44560065 - 44560008
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatg 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  44560065 aaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatg 44560008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 479 - 570
Target Start/End: Original strand, 46816423 - 46816515
Alignment:
Q  479 tgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccat-tcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46816423 tgaatgccgagcgaaatgcttgagtcttggccgtttggcaagtttgaatt-accccatctcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 46816515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 821 - 886
Target Start/End: Original strand, 47870854 - 47870918
Alignment:
Q  821 gtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  47870854 gtaatgtaatgcaatgtaacgtgataacatatata-ttgaatatgcataatacaatttgttttgaa 47870918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 730 - 811
Target Start/End: Original strand, 49571577 - 49571658
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||||||| |||   || |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  49571577 tcgaatattggagtcatgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttgggaggtaca 49571658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 730 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 49817382 - 49817301
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||| |||| |||| |||  ||| |||||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49817382 tcgaacattgtagtcatgctgtttggcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagacaattgttgtagttggaaggtaca 49817301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 563 - 658
Target Start/End: Original strand, 20901120 - 20901216
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggc-aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaa 658  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  20901120 gaatgtaccttccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacatccgatcagcatcttgaa 20901216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 22437707 - 22437500
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||| |||| |||||||||| |||   ||||||||||||| | |||| ||| |||||||     
T  22437707 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggagcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcctccgatgagcatcttgaat 22437608  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     |||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||  |||| |||||   |||| |||    
T  22437607 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgttcaagatgctcatcgcatgctggattcctgtcgtttaacaa 22437509  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  22437508 gtttgaatt 22437500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 488 - 547
Target Start/End: Original strand, 1226544 - 1226603
Alignment:
Q  488 ggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaaga 547  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1226544 ggcgaaatgcttgagtcatgttgtttgaccagtttgaatttacctcattcaaaggtaaga 1226603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 766
Target Start/End: Original strand, 4784782 - 4784988
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| || || ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| | | | || ||     
T  4784782 ggaatgtaccttccaactgcaacaatcatcttatctctgaatgaggtaaattcaaacttgttaaactgcaggactccagcattcgatcaacattttaaat 4784881  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     |||||||||||||||| || |||||     ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||| |||||||| ||   |||| |||    
T  4784882 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccatcatttaaaatgttcatcgaatgttggagtcatgtcgtttaacaa 4784980  T
Q  759 gtttgaat 766  Q
    ||||||||    
T  4784981 gtttgaat 4784988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 4785271 - 4785216
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  4785271 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttaacacttgaataccatcatt 4785216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14289929 - 14289854
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  14289929 gagtcctgttgtttaggaagtttgaatttaccccattaaagggtaagataattgttgcagttggaaggtacattcc 14289854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 17211622 - 17211677
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17211622 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 17211677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 20778775 - 20778720
Alignment:
Q  346 aagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatg 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20778775 aagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatg 20778720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 24607086 - 24607141
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24607086 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgactcttgaataccatcatt 24607141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 32937774 - 32937719
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32937774 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttaaataccatcatt 32937719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 708 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 37867159 - 37867053
Alignment:
Q  708 ataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaagg 807  Q
    |||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||  || || ||||| |||||| |||| ||| |||||||| |    
T  37867159 ataccagcgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaattgacccca-tcaagagtaagagaattattgcagttggaatg 37867061  T
Q  808 tacattcc 815  Q
    ||||||||    
T  37867060 tacattcc 37867053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Original strand, 18412806 - 18412868
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggcaattcaaacttgttaa 623  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  18412806 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaatggggtaattcaaacttgttaa 18412868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 21169728 - 21169676
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21169728 tttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 21169676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 574
Target Start/End: Original strand, 37867212 - 37867286
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc 574  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||    
T  37867212 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaatggtaagataattgttgcagttggaaggtacattc 37867286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 696 - 813
Target Start/End: Original strand, 14330190 - 14330305
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgtt 795  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  ||||||| | |  |||| |||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||    
T  14330190 cttgacacttgaataccattattcaagatgcttatcgaatgctggagtcttaccgtttaacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aagacaattgtt 14330287  T
Q  796 gtagttggaaggtacatt 813  Q
      ||||||||||| ||||    
T  14330288 acagttggaaggtgcatt 14330305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 758 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 14330405 - 14330352
Alignment:
Q  758 agtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14330405 agtttgaattaacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtaca 14330352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 226
Target Start/End: Original strand, 17292106 - 17292167
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcatta 226  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  17292106 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtgatta 17292167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 20901309 - 20901362
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  20901309 gtaagacaattgttgtagttggaatctgcattccaactacaacaattgtcttac 20901362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 28082809 - 28082756
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  28082809 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtcttac 28082756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 346 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 32937809 - 32937688
Alignment:
Q  346 aagattaaattcttgttatgctggtttagatgaa-ggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaag 443  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||| || || |||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||| | ||    
T  32937809 aagattaaattcttattcggctggtttaaattaaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttaaataccatcatttaaacccag 32937710  T
Q  444 cctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    |||||||| |||||| ||||||    
T  32937709 cctaacaagaatttaatctttt 32937688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 563 - 678
Target Start/End: Original strand, 43888913 - 43889030
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac-tctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| || ||||||||||||||   ||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||      
T  43888913 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacctctaaatggggtaaattcaaacttgttaaacagcaagactccaacatgcgatgagcatcttgaaag 43889012  T
Q  661 atggtattcaagtgtcaa 678  Q
    ||||||||||||||||||    
T  43889013 atggtattcaagtgtcaa 43889030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 46816158 - 46816211
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  46816158 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattctaactacaacaattgtcttac 46816211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 563 - 619
Target Start/End: Original strand, 51027232 - 51027289
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggc-aattcaaacttg 619  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51027232 gaatgtaccttccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaaattcaaacttg 51027289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 1226435 - 1226376
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaa-aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1226435 tttggcaagtttgaatt-accccatttatgaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 1226376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 450
Target Start/End: Complemental strand, 4785312 - 4785200
Alignment:
Q  339 ctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaa 437  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||  ||||||||||| ||||| |||    
T  4785312 ctttcaaaatattaaattcatgttagacaggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttaacacttgaataccatcatttaa 4785213  T
Q  438 agcaagcctaaca 450  Q
      | |||||||||    
T  4785212 tcccagcctaaca 4785200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 730 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 21169749 - 21169667
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattc 814  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || || ||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21169749 tcgaatattggagtcctgccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 21169667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 743
Target Start/End: Original strand, 38132581 - 38132716
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||| | | |||||||  |||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||    
T  38132581 aattcaaacttgttaagcagcaggactccagcatacgattaacatcttgaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgatgtgcattc-cttgacacttg 38132679  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagt 743  Q
    ||||||  |||||||||| || || |||| |||||||    
T  38132680 aataccggcattcaagatgcttatagaatgttggagt 38132716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 755 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 46816238 - 46816178
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||    
T  46816238 gcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttagaatgcacattcc 46816178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 755 - 811
Target Start/End: Original strand, 49064473 - 49064529
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  49064473 gcaagtttgaatttatctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtaca 49064529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 51027307 - 51027232
Alignment:
Q  498 ttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc 574  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  51027307 ttgagtcatgttgtttagcaagtttgaatttgccccatccagag-taagacaattgttgtagttggaaggtacattc 51027232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 242324 - 242406
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  242324 gcgaaatgcttgagtcctgcccgtttggcaagtttgaatt-accctatttcagaggtaagacaattgttatagttggaatgcac 242406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14330129 - 14330054
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  14330129 gagtcctgctgtttaggaagtttgaatttaccccattaaagggtaagataattgttgcagttggaaggtacattcc 14330054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 305 - 356
Target Start/End: Original strand, 31824353 - 31824404
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaatt 356  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31824353 gactcaagcatttcgccccgcgttcatgtttttcctttgaaaagaataaatt 31824404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 32937486 - 32937371
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||| ||  | ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||| |||||  |||| |||| | |    
T  32937486 aaaagattaattttatattaagctggtttagatggaggtattgaagtgtcaaggaatgtacctcattcttttgacacttcaataccctcatttaaaccga 32937387  T
Q  443 gcctaacaaaaattta 458  Q
    ||||||||| ||||||    
T  32937386 gcctaacaagaattta 32937371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Original strand, 32937835 - 32937892
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32937835 tttgacaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 32937892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 542 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 39589501 - 39589422
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatgggg-caattcaaacttg 619  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||    
T  39589501 gtaagacaattgttgcagttgaaatgtgcattccaacttcaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttg 39589422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 561 - 678
Target Start/End: Original strand, 51427602 - 51427721
Alignment:
Q  561 tggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggc-aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaa 658  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | || ||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||  ||| ||| | || ||    
T  51427602 tggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcatgagatgagcattttaaa 51427701  T
Q  659 caatggtattcaagtgtcaa 678  Q
      ||||||||||||||||||    
T  51427702 tgatggtattcaagtgtcaa 51427721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 751 - 808
Target Start/End: Original strand, 18413079 - 18413137
Alignment:
Q  751 tttagcaagtttgaattttcctcattcaag-ggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18413079 tttagcaagtttgaatttacctaatttcagaggtaagataattgttgtagttggaaggt 18413137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 755 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 20901389 - 20901339
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  20901389 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 20901339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 24607026 - 24606966
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatt 573  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24607026 tttggaaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgtacatt 24606966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 515 - 565
Target Start/End: Original strand, 24607546 - 24607596
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  24607546 gcaactttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgtagttggaa 24607596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 576 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 28083015 - 28082822
Alignment:
Q  576 aactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagt 673  Q
    ||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||    
T  28083015 aactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggacaccagtattcgatcagcatcttgaacactagtattcaagt 28082916  T
Q  674 gtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||   | |||||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  28082915 gtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcgttcaagacgtttatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 28082822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 558
Target Start/End: Original strand, 31324690 - 31324756
Alignment:
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgta 558  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  31324690 aatgcttgagagctgttatttagcaagtttgaatttatcccatttcagaggtaacacaattgttgta 31324756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Original strand, 33163405 - 33163534
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccattcaa- 539  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||  | |||||||| ||||||||||    ||||||||||||||| | |||||||| ||     
T  33163405 agcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgagcgaaatgtttgagtcctggccgtttggcaagtttgaaat-accccatttaag 33163503  T
Q  540 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33163504 aggcaagacaattgttgtagttggaatgcac 33163534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 36776449 - 36776501
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  36776449 tttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 36776501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 44560110 - 44560162
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  44560110 tttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 44560162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 563 - 637
Target Start/End: Complemental strand, 47657346 - 47657272
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactcca 637  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  47657346 gaatgcacattccagctacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggcaggactcca 47657272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 608 - 678
Target Start/End: Original strand, 49791395 - 49791465
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaa 678  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  49791395 aattcaaacttgctaaacagcaggactccagcatccgatgagcatcttgaatgatggtattcaagtgtcaa 49791465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 500 - 562
Target Start/End: Original strand, 49817563 - 49817623
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttg 562  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  49817563 gagtcctgctgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaatg-aagacaattgttgtagttg 49817623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 56139692 - 56139495
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||    ||| ||||||| ||||||| ||| |||  |||  ||||||||    
T  56139692 ttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccaacagaactccagtattcgatcagcatctataacgctggtattc 56139593  T
Q  670 aagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||||||||  |||||     |||||| ||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  56139592 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattct-ttgacacttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 56139495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 494 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6281997 - 6281916
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    ||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  6281997 atgctggagtcttgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacattcc 6281916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6282208 - 6282167
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt 385  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  6282208 aaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtatt 6282167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 751 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 31324449 - 31324385
Alignment:
Q  751 tttagcaagtttgaattttcctcatt-caagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  31324449 tttagcaagtttgaattatc-tcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcc 31324385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 479 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 37866716 - 37866624
Alignment:
Q  479 tgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  37866716 tgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-accccatttcagaggtaagacgactgttgcagttggaatgcac 37866624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 544 - 619
Target Start/End: Original strand, 38132755 - 38132832
Alignment:
Q  544 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggc-aattcaaacttg 619  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  38132755 aagacaactgttgtagttggaatgtgcatttcaactacaacaattgtcttacctttgaatggggcaaattcaaacttg 38132832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 734 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 43889236 - 43889159
Alignment:
Q  734 atattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||||| |   || |||||||||||||| |||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||    
T  43889236 atattggagtcctactgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacacgattgttggagttggaaggtaca 43889159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 565
Target Start/End: Original strand, 43889418 - 43889481
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  43889418 gagtcctgtcgtttggcaagtttgaatt-accccatttagagg-aagacaattgttgtagttggaa 43889481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 45940099 - 45940046
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  45940099 gtaagacaattgttgcagttgggatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 45940046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 479 - 570
Target Start/End: Original strand, 51027665 - 51027757
Alignment:
Q  479 tgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttat-ttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||     |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51027665 tgaatgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgcttggcaagtttgaa-ttaccccatttcagaggtacgacaattgttgtagttggagtgcac 51027757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 56139482 - 56139429
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  56139482 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtgttac 56139429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Original strand, 20901599 - 20901658
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901599 tttggaaagtttgaatt-acctcatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 20901658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 696 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 21712187 - 21712070
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgtt 795  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||| | ||||   ||| ||||||||||||  |||   || || ||||||||||||||    
T  21712187 cttgacacttgaataccagcattcaagatgcttatcgaatgttggacttctgccgattaacaagtttgaattgccct--atccagagtaagataattgtt 21712090  T
Q  796 gtagttggaaggtacattcc 815  Q
    ||| ||| || || ||||||    
T  21712089 gtacttgaaatgtgcattcc 21712070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 572 - 674
Target Start/End: Complemental strand, 25763354 - 25763250
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||| |||||||||| |||   ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  | ||||||    
T  25763354 ttccaactgcaacaattatcttaccactgaatgaggcaaattcaaacttgctaagcagcatgactccagcattcggtaagcgtcttgaacgctcgtattc 25763255  T
Q  670 aagtg 674  Q
    |||||    
T  25763254 aagtg 25763250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 493 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 31324467 - 31324395
Alignment:
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||  ||||  ||| |||||||||||||  | |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31324467 aatgcttgagagctgtcgtttagcaagtttgaattatctcatttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 31324395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 500 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 31824176 - 31824100
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcca 576  Q
    |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||    
T  31824176 gagtcctgctacttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttgaaaggtacattcca 31824100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Original strand, 31824560 - 31824619
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31824560 tttggcaagtttaaatt-accctatttcaaatgtaagacaattgttgtagttggaatgcac 31824619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Original strand, 36775930 - 36776137
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||| || || || ||||| |||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||| | | |||||||     
T  36775930 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatgaggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacatccgatcaacatcttgaat 36776029  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     ||||| |||||||||| || |||||     |||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||  | ||||||| ||||| ||||||  |||| |||    
T  36776030 gatggtgttcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattct-ttgacacttcaatacaagtattcaagatgtttatcgaatgttggattcctgccgtttaacaa 36776128  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  36776129 gtttgaatt 36776137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 37866955 - 37866895
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaac 298  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  37866955 gtgcattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgtcaaac 37866895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 238 - 349
Target Start/End: Original strand, 38132778 - 38132887
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggc-aattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttt 336  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||  |||  | |||||| |||    
T  38132778 gtgcatttcaactacaacaattgtcttacct-ttgaatggggcaaattcaaacttgccaaac-aacatgactcaagcatttcaccccgcattcatg-ttt 38132874  T
Q  337 tcctttgaaaaga 349  Q
    |||||||||||||    
T  38132875 tcctttgaaaaga 38132887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 563 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 43889490 - 43889434
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 619  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||    
T  43889490 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctctaaatggggtaattcaaacttg 43889434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 581 - 814
Target Start/End: Original strand, 46815957 - 46816190
Alignment:
Q  581 caacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtc-a 677  Q
    ||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||  ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| |    
T  46815957 caacaattgtcttgcccatgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaatattcgataagcatcttgaatgacggtattcaagtgtcaa 46816056  T
Q  678 atgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattc 777  Q
    | |||||     ||||| | |||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||| ||||| || |||   ||| |||||||||| || || || ||    
T  46816057 aagaatgaggtgcattc-catgacacttgaataccaacattgaagaggcttatcgaatgttggattcttgccgattaacaagtttgaa-ttgcccca-tc 46816153  T
Q  778 aagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattc 814  Q
     || |||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  46816154 cagagtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattc 46816190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 563 - 767
Target Start/End: Original strand, 956867 - 957073
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || |||||| |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||| | | |||||||      
T  956867 gaatgtaccttccaagtgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacatccgatcaacatcttgaatg 956966  T
Q  661 atggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaag 759  Q
    ||| |||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||| |||||||  ||||||||| || ||| |||  |||| ||||||  |||| ||||    
T  956967 atgatattcaagtgtcaaaagaatgatgtgcattc-cttgacacttcaataccagtattcaagatgcttatcaaatgctggattcctgccgtttaacaag 957065  T
Q  760 tttgaatt 767  Q
    ||||||||    
T  957066 tttgaatt 957073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 3393657 - 3393712
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3393657 ggtattgaagtgtcaaggaatgcatttaattcttttgacacttgaataccatcatt 3393712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 663 - 714
Target Start/End: Original strand, 24607411 - 24607462
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccat 714  Q
    |||||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24607411 ggtattaaagtgtcaaggaacggacctcattcttttgacacttgaataccat 24607462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 336 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 49817535 - 49817413
Alignment:
Q  336 ttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | || | |||| | || |||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||| |||||     
T  49817535 ttcctttcaaaagattaaattcttgt-aggccgatttaaaagatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 49817437  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaattta 458  Q
    |||    |||||||||| ||||||    
T  49817436 taatctcagcctaacaagaattta 49817413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 515 - 565
Target Start/End: Original strand, 885540 - 885590
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  885540 gcaagtttgaatttgccccatttagaggcaaggcaattgttgtagttggaa 885590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 957385 - 957437
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  957385 tttggcaagtttcaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 957437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Original strand, 6176949 - 6177003
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  6176949 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 6177003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 781 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 13850994 - 13850960
Alignment:
Q  781 ggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13850994 ggtaagataattgttgtagttggaaggtgcattcc 13850960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 500 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 20901193 - 20901120
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc 574  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20901193 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccatctagag-taagacaattgttgtagttggaaggtacattc 20901120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Original strand, 21016811 - 21016865
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  21016811 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 21016865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Original strand, 32937558 - 32937612
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||| ||||||    
T  32937558 ggtaagacaattgttgtagttggaaggtgcactccaactacaacaattatcttac 32937612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 34153216 - 34153268
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  34153216 tttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaactgttgtagctggaa 34153268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 494 - 564
Target Start/End: Original strand, 44559871 - 44559939
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgga 564  Q
    ||||| || ||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  44559871 atgctggattcctgttgtttaacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgcagttgga 44559939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 49095318 - 49095264
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  49095318 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccccaacaattgtgttac 49095264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 527 - 565
Target Start/End: Original strand, 49423702 - 49423740
Alignment:
Q  527 ttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  49423702 ttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagctggaa 49423740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 728 - 814
Target Start/End: Original strand, 49817551 - 49817635
Alignment:
Q  728 gatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattc 814  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||  || |||||||  | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  49817551 gatcgaatactggagtcctgctgtttggcaagtttgaattaccc-cattcaaatg-aagacaattgttgtagttgaaaggtacattc 49817635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 363
Target Start/End: Original strand, 242158 - 242218
Alignment:
Q  302 catgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgtta 363  Q
    |||||||||||||||||| || || || |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  242158 catgactcaagcattttgtccgacatttatgttttt-ctttgaaaagaataaatttttgtta 242218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 842 - 887
Target Start/End: Original strand, 13866713 - 13866758
Alignment:
Q  842 tgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaaa 887  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||||||    
T  13866713 tgataacatatatagttgattctgcataatacatgttgttttgaaa 13866758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 849 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 17054832 - 17054795
Alignment:
Q  849 atatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17054832 atatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 17054795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 21712103 - 21712050
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  21712103 gtaagataattgttgtacttgaaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 21712050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 546 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 24607297 - 24607248
Alignment:
Q  546 gacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||| ||||||    
T  24607297 gacaattgttgtagttggaaggcaccttccaactaaaacaattatcttac 24607248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 546 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 27759897 - 27759848
Alignment:
Q  546 gacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| || ||||||||||||    
T  27759897 gacaattgttgtagttgaaatgtgcattccaactacagcaattgtcttac 27759848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #231
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 34529449 - 34529394
Alignment:
Q  244 tccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggc 301  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  34529449 tccaactacaacaattgtctt-cctctgaa-tggggcaattcaaacttgttaaacggc 34529394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #232
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 51027400 - 51027453
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || || | |||||||||||||||    
T  51027400 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcactctaattacaacaattgtcttac 51027453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 538; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Original strand, 1785 - 2601
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1785 agacacaaggagggtggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 1884  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  1885 acggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccat 1984  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1985 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattctcttacctctgaattggggtaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 2084  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2085 atttcg-ccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaagcaatgaacctcattttgt 2183  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  2184 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagtctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaacgcggggcgaaatacttgagtcctgttgtta 2283  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2284 ggccagtttgaatttactccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 2383  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  2384 aacttgttaatcggtaggactccagcattcgataaacgtcttgaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatatca 2483  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
     | ||||||||  |||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  2484 gcgttcaagatgttgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtacata 2583  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatg 831  Q
     |||||| ||||||||||    
T  2584 tcggaatataatgtaatg 2601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2274 - 2216
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgtta 363  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2274 gactcaagtatttcgccccgcgttcatgtttttcctttgaaaagaataaatttttgtta 2216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 2365 - 2312
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  2365 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcatttcaactacaacaattgtcttac 2312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 572 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 2575 - 2467
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| | | ||||||||  || |||||    
T  2575 ttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatcaacatcttgaacgctgatattc 2476  T
Q  670 aagtgtcaa 678  Q
    |||||||||    
T  2475 aagtgtcaa 2467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 2068 - 2009
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  2068 tttgacaagtttgaattaccccaattcagaggtaagagaattgttgcagttggaatgcac 2009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 538; Significance: 0; HSPs: 153)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Original strand, 34140860 - 34141676
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34140860 agacacaaggagggtggaacaatttcggtataaacatccaacgctcgacgaggggagagtatcattcatttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 34140959  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  34140960 acggacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccat 34141059  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34141060 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattctcttacctctgaattggggtaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 34141159  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34141160 atttcg-ccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaagcaatgaacctcattttgt 34141258  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||     
T  34141259 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagtctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaacgcggggcgaaatacttgagtcctgttgtta 34141358  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34141359 ggccagtttgaatttactccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 34141458  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  34141459 aacttgttaatcggtaggactccagcattcgataaacgtcttgaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatatca 34141558  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
     | ||||||||  |||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||     
T  34141559 gcgttcaagatgttgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtacata 34141658  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatg 831  Q
     |||||| ||||||||||    
T  34141659 tcggaatataatgtaatg 34141676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 26 - 831
Target Start/End: Original strand, 18237571 - 18238376
Alignment:
Q  26 ggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttt 125  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  18237571 ggtggaatacgttcggtataaacgtctaacgctcgacaaggggagaggatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacatgacgagcatattt 18237670  T
Q  126 tgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcatt 225  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18237671 tgggagcacatcatgttccagtggatcggtatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagtttgattccgccagaagatcgtcatt 18237770  T
Q  226 agttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaac 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18237771 agttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaattggggtaactcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttggcccatc 18237870  T
Q  326 gttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaat 425  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18237871 gttcatatttttcctttcaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaacgaatgaacctcatttcgttggcacttgaat 18237970  T
Q  426 actatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaa 525  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||        |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  18237971 atcatcatctaaagaaagcctaacaaaaatttataattttcaaaggaaaaacatgaacgcgaggcgaaatgcttgagtcctgttgtttggctagtttgaa 18238070  T
Q  526 tttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatt 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  18238071 tttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcctactctggattgggcaattcaaacttgttaatc 18238170  T
Q  626 ggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatc 725  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||     
T  18238171 agcaggactccaacattcaataagcctcttgaatgttggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatatcattattcaagatg 18238270  T
Q  726 ctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaat 825  Q
    |||| || || ||||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18238271 ctgaacgtatgttggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcaatggtaagataattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaat 18238370  T
Q  826 gtaatg 831  Q
    ||||||    
T  18238371 gtaatg 18238376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 533; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 837
Target Start/End: Original strand, 17183207 - 17184028
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17183207 agacacaaggagggtgtaacacgtttggtataaacgtccaacactcgacgagggaagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 17183306  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17183307 acgaacatgttttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 17183406  T
Q  214 aagatc---gtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    ||||||   |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17183407 aagatcatcgtcattagttagggtgaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgactca 17183506  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattt 410  Q
    ||||||| | |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17183507 agcatttcgtccagtgttcatgtttttcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcattt 17183606  T
Q  411 tgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta 510  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||        |||||||| ||| ||||||||||||||||||     
T  17183607 cggtggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaagtttattattttcaaaggaaaaacatgaatgcgaggcaaaatgcttgagtcctgttg 17183706  T
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaat 610  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17183707 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattctaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaat 17183806  T
Q  611 tcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaata 710  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17183807 tcaaacttgttaatcggcaggactccagcattcgataatcttcttgaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttcacacttgaata 17183906  T
Q  711 ccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtac 810  Q
    ||| | ||||| ||  |||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17183907 ccagcgttcaaaatgatgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcaaaggcaagacaattgttgtagttggaaggtac 17184006  T
Q  811 attccggaatgtaatgtaatgcaatgt 837  Q
    |||     |||||||||||||||||||    
T  17184007 att-----atgtaatgtaatgcaatgt 17184028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 476; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 39477450 - 39476660
Alignment:
Q  16 acacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 115  Q
    |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  39477450 acacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggaggatatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacatgac 39477351  T
Q  116 gagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||| ||||    
T  39477350 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcattaacaacttgattccgccagaa 39477251  T
Q  216 gatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcat 315  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39477250 gatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattatcttaccgctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggactcaagcat 39477151  T
Q  316 tttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttg 415  Q
    || || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39477150 ttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattctttttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcattttgttg 39477051  T
Q  416 gcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttgg 515  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||        |||| || ||| |||||| || ||||||| | ||||     
T  39477050 gcacttgaataccatcatctaaagcaaacctaacaaaaattta-tcttttcaaag-gaaaacatgaaagccgggtgaaatgttttagtcctgctgtttga 39476953  T
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaa 615  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39476952 caagtttgaatttacatcattcaaaggtaagacaattgttatagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaa 39476853  T
Q  616 cttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatc 715  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39476852 cttgttaatcggtaggactccaacattcgataagcatcttgaatgttggtattcaagtgtcaaggaatgtacctcattcttttgacacttgaataccatc 39476753  T
Q  716 attcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||| |||||  |||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39476752 atttaagatgttgatcgtatgttggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 39476660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 468; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 830
Target Start/End: Original strand, 41217609 - 41218423
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||  | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  41217609 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaaaattcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaaagtg 41217708  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  41217709 aagaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccaccag 41217808  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||  |||| ||||  |||||||||    
T  41217809 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacagcaattgtcttacctctgatatggggtaattcaaacttaccaaagggcctggactcaagc 41217908  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || || | |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  41217909 atttcgctcagcattcatg-ttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatggacctcatttcgt 41218007  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  ||| |||||||||||||| ||||  ||    
T  41218008 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgacgggggaaatgcttgagtcatgttgctt 41218106  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  41218107 ggcaagtttaaatttggcccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttgctctggatggggcaattta 41218206  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41218207 aacttgttaatcggcatgactccaacattcgataagcatcttgaatgctggtattcaagtgtcaagaaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 41218306  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
    |||||||||||  |||||| || ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41218307 tcattcaagatgatgatcgtatgttggagtcctgctgcttagcaagtttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacatt 41218406  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaat 830  Q
    ||  |||||||||||||    
T  41218407 ccaaaatgtaatgtaat 41218423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 808
Target Start/End: Original strand, 30360512 - 30361304
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  30360512 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaatgtacaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaaaacgacgaaaacgta 30360611  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  30360612 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtg-cgttgctgagatcaactgaagatatcataaaaagtttgattccgccag 30360710  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| || ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| |||||| | |   ||||| |    
T  30360711 aagatcgtcattagttagggtaatgtgcattccaactataactattgtcttacatctgaaattgggtaattcaaacttgccaaacgacaagtcctcaa-c 30360809  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |    
T  30360810 attc-gcccaacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtaaaggaatgaacctcatttcg 30360908  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||        ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||    
T  30360909 ttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcataacaaaaatttattcttttcataggaaaaacatgaatgtcgggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 30361008  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30361009 tggcgaatttgaatttacccaattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcccattccaagaacaacaattgtcttactctggatggggcaattc 30361108  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| || |||||||||  |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30361109 aaacttgttaatcggtaggactccaatatttaataagcatcttgaacgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 30361208  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  30361209 atcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcttgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 30361304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 460; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 48220945 - 48220258
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48220945 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg 48220846  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | | |||||||||    
T  48220845 tt--gggagcacagcatgttccagtggatcaatatgcaggtgacggtgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccaccataagatcgtc 48220748  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccc 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  48220747 attagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattatcttagctctgaaatgggctaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcatttcgtcc 48220648  T
Q  323 aacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttg 422  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  48220647 aacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttg 48220548  T
Q  423 aatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagttt 522  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  48220547 aataccatcatctaaagtaagcctaacaaaaatttattc-tttcaaaggaaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagtcttattgtttggcaagttt 48220449  T
Q  523 gaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgtta 622  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  48220448 gaatttgccccattcaaaggtgagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactttggatggagcaattcaaacttgtta 48220349  T
Q  623 attggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    || |||| ||||||| |||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48220348 atcggcaagactccaacatttgataagtgtcttgaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 48220258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 45363455 - 45362649
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| || ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  45363455 agacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgagcagagagtttcattcacttgggtggaattaacaaatgacgaaaacgtg 45363356  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  45363355 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgata---------cgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 45363265  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||| ||||||||  | | |||||||||    
T  45363264 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgtcaaacaac-aggactcaagc 45363166  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  45363165 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattgaattcttgttaggctggtttagaagaaggtattaagtgtcaaggaatcaacctcatttcgt 45363066  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  | |||||||| |||||||||||| |||    
T  45363065 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatgtcgagcgaaatgtttgagtcctgttgttt 45362967  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
      |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45362966 aacaagtttgaatttatctcatttaaaggtaagacaattgttgcagttagaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggattgggcaattca 45362867  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45362866 aacttgttaatcggcaggtctccagcattcgataagcgtatggaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 45362767  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
     |  ||||||| ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  45362766 gcgctcaagatactgatcgaatattggagtcttgctggttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtacatt 45362667  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  45362666 ccgtaatgtaatgtaatg 45362649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Original strand, 20564754 - 20565594
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20564754 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 20564853  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  20564854 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 20564953  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  20564954 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtatt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagc 20565050  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  20565051 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 20565150  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  20565151 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 20565250  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20565251 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattc 20565350  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||  |||  |||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20565351 aaacttgccaatctgcaggactccagtattcgatgagcatcttgaataatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattctgttgacacttgaatacc 20565450  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | |||||||| ||||||||||  ||| |||||||   || |||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||    
T  20565451 agcgttcaagatgctgatcgaatgctggtgtcctgctgcttggcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaat 20565550  T
Q  813 tccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | | |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20565551 ttcagaatgtaatgtaaaatgcaatgtaatgtgataacatatat 20565594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 415; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Original strand, 40588544 - 40589347
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40588544 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcgcttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatg 40588643  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||    
T  40588644 atgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcggccag 40588743  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||| || |||||   || |||||||||    
T  40588744 aagatcgtcattagtcagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaac-aacaggactcaagc 40588842  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  40588843 atttcgctcggcattcatatttttcctttgaaaagattaaattcatgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 40588942  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  | ||||||| ||||||||||||| |||    
T  40588943 tggcaattgaatatcatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgtcgagcgaaatacttgagtcctgttgttt 40589041  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    | || ||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40589042 gacaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaaaatttgaagttggaatgcacattccaactgcaacaactgtcttactctggatgaggcaattca 40589141  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||           || ||||| ||||||||||||||||||    
T  40589142 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcgtcttgaacgctggtattcaagtgt-----------ccgcattc-cttgacacttgaatacca 40589229  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
     | |||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  40589230 ccgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtacatt 40589329  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||||||||||||||    
T  40589330 ccggaatgtaatgtaatg 40589347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Original strand, 17839318 - 17840120
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17839318 agacacaaggatggtggaagacgtttggaataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 17839417  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  17839418 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccaa 17839517  T
Q  214 aa-gatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaag 312  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||   |   ||||||||| || |||||  | | ||||| ||    
T  17839518 aaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaac-aggactcgag 17839615  T
Q  313 cattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    ||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |            
T  17839616 catttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaataaacca------- 17839708  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
       |||   |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17839709 ---gca---gaataccatcatctaaaacacgcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatgcggggtgaaatgcttgagtcctgttgtt 17839801  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    || || |||||||| || | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17839802 tgacaggtttgaatctatctcattcaaaggtaacacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 17839901  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  17839902 aaacttgttaatcggcaggactccagcattcgatgaacatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgaaacttgaatacc 17840001  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | |||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||    
T  17840002 agcgttcaagatgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtaaat 17840101  T
Q  813 tccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    | || ||||||||||||||    
T  17840102 ttcgaaatgtaatgtaatg 17840120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 393; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 103 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 9367243 - 9366491
Alignment:
Q  103 acgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagttt 202  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9367243 acgaaaacgtgacgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagttt 9367144  T
Q  203 gattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggcc 302  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| | || || || ||||||||||||||||||  |     
T  9367143 gattccgccacaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtatt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac- 9367047  T
Q  303 atgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaa 402  Q
    | ||||||||||||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9367046 aggactcaagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaa 9366947  T
Q  403 gctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttga 501  Q
     |||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   ||||||||||||||    
T  9366946 cctcaattcggtggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttga 9366847  T
Q  502 gtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgg- 600  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  9366846 gtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggt 9366747  T
Q  601 atggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttga 700  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  9366746 atggggcaattcaaacttgttaatcggcaagactccagtattcgatgagcatcttggacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttga 9366647  T
Q  701 cacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagt 800  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| ||     
T  9366646 cacttgaataccatcgttcaagatgctcatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagc 9366547  T
Q  801 tggaaggtacattccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9366546 tggaaggtaaatttcggaatgtaatgtaaaatgcaatgtaatgtgataacatatat 9366491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Original strand, 10523063 - 10523879
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10523063 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgttggaattaacgaacgacgaaaacgtg 10523162  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaa-tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcga 212  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  10523163 acgagcatgttttgggagcaccacatgtttcttgtggatcgatatgcgggtgaagtttcttagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgattccgcct 10523262  T
Q  213 gaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaag 312  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| | || || || ||||||||||||||||||    | ||||||||    
T  10523263 gaaaatcgtcattagttagggtaaggtgtattccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tgtggtaattcaaacttgtcaaacaaa-aggactcaag 10523359  T
Q  313 cattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    ||||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |    
T  10523360 catttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaattttttttatgttggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcg 10523459  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttat 511  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||        |||| |||  || | ||||||||||||||||| |    
T  10523460 gtggcacttgaataccatcatctaaagcaagtcttacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaagtgcttggtgtaatgcttgagtcctgttgt 10523559  T
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaatt 611  Q
    || ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10523560 tttgcaggtttgaatttatcacattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaatt 10523659  T
Q  612 caaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatac 711  Q
     ||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10523660 taaacttggtaatcggtaggactccagcattcgataagcgtcttgaacacttgtattcaagtgtcaagtaatgcacctcattcttttgacacttgaatac 10523759  T
Q  712 catcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    || | |||||||| ||||||||||| ||| |||||||   || |||| ||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  10523760 cagcgttcaagatgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttggcaattttgaatttgccacattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtaaa 10523859  T
Q  812 ttccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||  ||||||||||||||||    
T  10523860 ttttggaatgtaatgtaatg 10523879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 165 - 724
Target Start/End: Complemental strand, 26601839 - 26601281
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtctt 264  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  26601839 acgttgttgagatcaactgaagatatcatcaatagtttgattccgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattatctt 26601740  T
Q  265 acctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttat 364  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||   |   ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26601739 acctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacgaaaagtcctcaa-cattc-gcccaacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttag 26601642  T
Q  365 gctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctt 463  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26601641 gctggtttatattaaggtattgaagtgtcaaggaatgaatctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctt 26601542  T
Q  464 ttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 563  Q
    ||||||         |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26601541 ttcaaaagaaaaacatgaatgcggggcgaaccgcttgagtcctgttgtttggcaagtttgaatttaccccattaaaaggtaagacaattgttgtacttgg 26601442  T
Q  564 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatg 663  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||    
T  26601441 aatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggaaggactccaacattcgataagcatcttgaatgatg 26601342  T
Q  664 gtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagat 724  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26601341 gtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagat 26601281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 147 - 854
Target Start/End: Original strand, 13920434 - 13921146
Alignment:
Q  147 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13920434 tggatcgatatgcaggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgatttcgccataagatcgtcattagttagggtaagatgcattcc 13920533  T
Q  247 aactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaa 346  Q
    |||||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| ||   |   |||||||| ||||||||||    
T  13920534 aactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcgagcatttcgcaagaacctcatgtttctcctttgaaa 13920630  T
Q  347 agattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcct 446  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||   |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13920631 atattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcagtggcacttgaataccatcatctaaagcaggcct 13920730  T
Q  447 aacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaa 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||        |||| | |  | |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13920731 aacaaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaagttcttgacgaaatgcttgagtcctgtagttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaa 13920830  T
Q  546 gacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcga 645  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13920831 cacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcga 13920930  T
Q  646 taagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcc 745  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  13920931 taagcctcttgaacactggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaagattctgatcgaatactggggtcc 13921030  T
Q  746 tgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatg-------taatgcaatgta 838  Q
    |||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||       ||||||||||||    
T  13921031 tgctgcttagcaagtttgaatttgccacattcagtggtaagatgattgttgcagttggaatgtaaatttcggaatgtaatgttatgtctaatgcaatgta 13921130  T
Q  839 atttgataacatatat 854  Q
    || |||||||||||||    
T  13921131 atgtgataacatatat 13921146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Original strand, 48270643 - 48271517
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48270643 agacaaaaggagggtggaacacgttcggtatagacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 48270742  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48270743 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 48270842  T
Q  214 aagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    ||||||||| |||| ||  || | || |  |||||||||||||||||| ||||| | | |  ||||||| |||||||||||| || ||||| | | ||||    
T  48270843 aagatcgtcgttaggtacggaatgaatgcacattccaactacaacaattgtctttctttt--aatggggtaattcaaacttgccagacggc-aggtctca 48270939  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |  |||  |   ||| |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||    
T  48270940 aatattc-gatgaacattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacatcatt 48271038  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
     | ||| || |||||||| ||||| |||  | |||||||||| |||||| | |||| || |         ||||   || |||| |  | ||||| || |    
T  48271039 cttttgacatttgaataccatcatgtaatcccagcctaacaagaatttaatattttgaatggaacattgggaatatcggtcgaa-tattagagtcatgct 48271137  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg 606  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    || | |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  48271138 gcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtctagctgcaacaattgtcttcctctgaatgggg 48271237  T
Q  607 caattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
      ||||||| |||||||   |||||| ||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  48271238 tgattcaaatttgttaaacagcaggaatccagcattcgatgagcctcttgaatgttggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttg 48271337  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||  |||||  |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  48271338 aataccatcattcaagatgctgatcggatgttggacccctgctgtttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 48271437  T
Q  807 gtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  48271438 gtacattatggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttctgaa 48271517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 327 - 854
Target Start/End: Original strand, 34157113 - 34157631
Alignment:
Q  327 ttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaata 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  34157113 ttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaaatgtcaaggaatgaacctcatttcgttgacacttgaata 34157212  T
Q  427 ctatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaat 526  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  34157213 ccatcatctaaagcacgcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatgccgggtgaaatgcttgagtcttgttgtttgacaagtttgaat 34157311  T
Q  527 ttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattg 626  Q
     || | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34157312 ctatctcattcaaaggtaaca-aattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcg 34157410  T
Q  627 gcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcc 726  Q
     |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  34157411 -caggactccaacattcgatgagcatcttgaacaatggtattcaagtgttaaggaatgcaccttattcttttgacacttgaataccagcgttcaagatgc 34157509  T
Q  727 tgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatg 826  Q
    |||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||| || |||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||     ||||    
T  34157510 tgatcgaatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcc-cattaagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtaaatttcgg-----aatg 34157603  T
Q  827 taatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  34157604 taatgcaatgtaatgtgataacatatat 34157631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 18 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 28114601 - 28113745
Alignment:
Q  18 acaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacga 117  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28114601 acaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgcccgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacga 28114502  T
Q  118 gcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaaga 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  | ||||    
T  28114501 gcatgttttaggagcacaacatgttccaatggatcgaaatgtgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattctgtcaaaaga 28114402  T
Q  218 tcgtcattagtta--gagtaaggtgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    | |||||||| ||  || |||  ||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| | || || || |||||||||||  |||||||| | ||||| |      
T  28114401 ttgtcattaggtaccgaataaa-tgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaa-tgtggtaattcaaactttccaaacggc-acgactcca-- 28114308  T
Q  314 atttt-gcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatttt 411  Q
    || || | ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||  | |||||| |    
T  28114307 atgttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaatgtattgaagtgtcaatgaattgacctcattct 28114208  T
Q  412 gttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaa-atgcttgagtcctgtta 510  Q
     ||| |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || |||| ||  | ||||| ||||     
T  28114207 tttgacacttgaatacagtcatttaaatcaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgagaatgccggtcgaacat--tggagtcatgttg 28114110  T
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggc 607  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||     
T  28114109 cttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttggagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctaaatggggt 28114010  T
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttga 707  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | || |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28114009 aattcaaacttgttaaatggcaggaattcaacatttgataagcatcttgaataatggtattcaagtgtcaaataatgcacctcattcttttgacacttga 28113910  T
Q  708 ataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaagg 807  Q
    |||||||  ||||||||  |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  28113909 ataccat-tttcaagatgttgatcggatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagataattgttgcagttggaagg 28113811  T
Q  808 tacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgtttt 883  Q
    ||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||    
T  28113810 tacattccggaatgtaatgtaatg----------tgataacatatatagttgaatatgtataatacatgttgtttt 28113745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 46862406 - 46861537
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46862406 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacgaaaacgtg 46862307  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  46862306 acgagcttgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagattaactgaagatatgatcaaaagtttgattccgccag 46862207  T
Q  214 aagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    ||||||||||| || ||  || | || |  | |||||  ||||||||| |||||  || |  ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||     
T  46862206 aagatcgtcataaggtacggaatgaatgcaccttccagatacaacaattgtctt--cttttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-catgtctcc 46862110  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |  | || | ||  | |||   ||  |||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||    
T  46862109 aata-ttcgaccggcattctcattgctcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaagaaatggacctcatt 46862011  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
     | ||| || |||||||| ||||| |||    |||||||||| |||||| |||||| || |         |||||  || || |||  | |||||||| |    
T  46862010 cttttgacatttgaataccatcatttaatctcagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcg-aatattggagtcctgct 46861912  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg 606  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    || |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  46861911 gcttggaaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaaggtacaagcatctaactgcaacaattgtcttcctctgaatgggg 46861812  T
Q  607 caattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
     ||||||||||||||||   ||| || || | |||||||| ||||| |||||   | ||||||||||||||| ||    |||||||||| |||||| |||    
T  46861811 taattcaaacttgttaaacagcatgaatctaacattcgatgagcctgttgaa-tgttgtattcaagtgtcaagga----acctcattcttttgacatttg 46861717  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    |||| || ||||||||||  |||| | || |||||||| |||   ||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  46861716 aatatcaccattcaagatgttgattggatgttggagtcttgctgcttagcaagtttgaatttgcccaattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 46861617  T
Q  807 gtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  46861616 gtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagatgaatatgcattatacattttgttttgaa 46861537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 14 - 470
Target Start/End: Original strand, 2356284 - 2356737
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  2356284 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacatccaacgctcgaagaggggagagtatcattcacttggatggaattaacgaacgacaaaaatgtg 2356383  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  2356384 acgagcatgttttgggagaacagcatgttccaatggatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgctat 2356483  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||| ||| ||||| ||| | || |    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||||||||||  |||| |||| | | | |||    
T  2356484 aagaccgtgattaggtagggaaatgcatcttccaactacaacaattgtcttacctctgaaat--ggaaattcaaacttgctaaac-gccaggtccccagc 2356580  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    | || ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||      
T  2356581 a-ttcgcccatcattcatttttttcctttgaaaaaattaaattcttgttaggctggtttagatgaatgtattaaagtgacaaggaatgaacctcatttca 2356679  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag 470  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2356680 ttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag 2356737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 336 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 20877943 - 20877400
Alignment:
Q  336 ttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||| |||||     
T  20877943 ttccttttaaaagattaaattcatgttaggcaggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcatttttttgacacttcaataccatcatt 20877844  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca 534  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || || |  ||| ||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  20877843 taaaccaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgccggacgtac-gctggagtcgtgctgcttggcaagtttgaatttacccca 20877745  T
Q  535 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcagg 631  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||||||||  |||| |    
T  20877744 tgcagaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctaaattgggtaattcaaacttgttaaacggcatg 20877645  T
Q  632 actccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatc 731  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20877644 aatccagcattcgataagcatcttgaataacggtattcaaatgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgctgatc 20877545  T
Q  732 gaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    | || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20877544 gtatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacctcatttagaggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccagaatgtaatgtaatg 20877445  T
Q  832 caatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
              ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  20877444 ----------tgataccatatatagttgaatatgcataatacatgctgttttgaa 20877400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 344 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 21187182 - 21186637
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| || |||||||| ||||| |||    |    
T  21187182 aaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaatgtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatctca 21187083  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || |||| |  | |||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21187082 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggatcattgggaatgccggtcgaa-tattggagtcctgctgcttgggaagtttgaatttaccccattcaaagg 21186984  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagc 639  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||    || ||||||||||||| |||| || || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  21186983 taagacaattgttgtagttggaagttacaaacgtctaactgcaacaattatcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagc 21186884  T
Q  640 attcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattg 739  Q
    ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||    
T  21186883 attcgatgagcctcttgaatgctggtattcaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgctgatcggatgttg 21186784  T
Q  740 gagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttg--tagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgt 837  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21186783 gagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgtcccattcattggtaagataattgttgctgagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgt 21186684  T
Q  838 aatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    | | ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21186683 actatg--aacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 21186637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 345 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 36393707 - 36393163
Alignment:
Q  345 aaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaag 443  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| || |||||||| ||||| |||  | ||    
T  36393707 aaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatcccag 36393608  T
Q  444 cctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggt 543  Q
    |||||||| |||||| |||||| || |         |||||  || |||| |  | |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36393607 cctaacaagaatttaatcttttgaatggaacactgggaatgtcggtcgaa-tattggagtcctacatcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggt 36393509  T
Q  544 aagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagca 640  Q
    || |||||||||| |||||| |   |||    ||||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||| ||    
T  36393508 aacacaattgttggagttgggagttacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacggcagaaatccaaca 36393409  T
Q  641 ttcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattgg 740  Q
    |||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||  |||    
T  36393408 ttcgataagcatcttgaatactggcattgaagtgtccaggaatgcaccttattcttttgacacttgaataccatcatgcaagatgttgatcggatggtgg 36393309  T
Q  741 agtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaat 840  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36393308 agtcctgctgtttagcaagtttgaatttgtcccatttaagggtaagataattgttgcagttggaaggtacattctggaatgtaatgtaatacaatgtaat 36393209  T
Q  841 ttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
      |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36393208 gcgataacatatatagttgaatatgtataatacattttgttttgaa 36393163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 341
Target Start/End: Original strand, 47268894 - 47269220
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  47268894 agacgcaaggagggtggaatacgttcg-tataaacgtccagcgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 47268992  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||| | ||||||||||| |     
T  47268993 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagattaactaaaaatatcatcaacaatttgattccgccaa 47269092  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| || | | |||||     
T  47269093 aagatcgtcattaattagggtaagatgcattccaactacaacaattagcttacctgtgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgaccctaattcaagt 47269192  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctt 341  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47269193 atttcgccaaacgttcatgtttttcctt 47269220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 20378915 - 20378638
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20378915 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgcacaacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 20378816  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |  |||||||||| ||    
T  20378815 acgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggacagatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatataattaacaacttgattccgccag 20378716  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgt 293  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||   ||||||||||||||||||||    
T  20378715 aagatcatcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctct-ggatggggcaattcaaacttgt 20378638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21187511 - 21187298
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  21187511 agacacaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtagaattaacgattgacgaaaacgtg 21187412  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  21187411 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgtcag 21187312  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  21187311 aagatcgtcattag 21187298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Original strand, 41048798 - 41048991
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41048798 acgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggtgagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgcgacgagcatgttttgggagca 41048897  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41048898 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattag 41048991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 512 - 886
Target Start/End: Original strand, 10224559 - 10224935
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| || |  |||||| |    
T  10224559 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttaaatggggta 10224658  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    ||||||| |||||||  || |||| |||||||||| || | | | || ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10224659 attcaaatttgttaaacggaaggaatccagcattcaatgaacattttcaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaa 10224758  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||| || ||  | |||  ||  ||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||| | |||||||||| |||||  |||||||||||    
T  10224759 taccatcatttaa-atgatcatcacatgctggagtcttgctgtttagcaagtttgaatttaccccattaaggggtaagatatttgttacagttggaaggt 10224857  T
Q  809 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10224858 acattccgcaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatattgatttgaa 10224935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 344 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 30354698 - 30354208
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| || ||||||||  |||| |||  | |    
T  30354698 aaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattcttttgacatttgaataccgtcatttaatccca 30354599  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||           |||||  || |||| |  | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30354598 acctaacaaaaatttaatcttttgaatagaacattgggaatgtcggtcgaa-tattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaagg 30354500  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagc 639  Q
    ||| ||| ||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||   |||||| |||| |    
T  30354499 taacacagttgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtctttctctgaatggggcaattcaaacttattaaacagcaggaatccaac 30354400  T
Q  640 attcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattg 739  Q
    ||  |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||| | |    
T  30354399 atgtgatgtgcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcgttgcagatgctcatcgaatgtcg 30354300  T
Q  740 gagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30354299 gagtcctcctgtttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagaaaattgttgcagttggaaggtacattccggaatgcaatgtaatg 30354208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 23 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48315383 - 48315179
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48315383 gagggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcaacgagaggagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 48315284  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  48315283 ttttgggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccataagatcgtc 48315184  T
Q  223 attag 227  Q
    |||||    
T  48315183 attag 48315179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 498 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 28978944 - 28978598
Alignment:
Q  498 ttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaac------------tgcaaca 585  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||            | |||||    
T  28978944 ttgagtcctattgtttgacaagtttgaattgacccaattcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcacattccaacgtgcattccaactccaaca 28978845  T
Q  586 attgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgc 685  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||| |||||     
T  28978844 attatcttactctgaatgggacaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcgataagcgtcttgcacgctggtattcaagtgtcaaggaatga 28978745  T
Q  686 acctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaa-tattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggta 784  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| || | ||||||||    ||||||| ||||||||| || ||||||| ||||    
T  28978744 acctcattcttttgacacttgaataccaccgttcaagatgctgatcgaattactagagtcctgttggttagcaaatttgaatttgccccattcaatggta 28978645  T
Q  785 agataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28978644 agataattgttgcagttggaaggcacattccggaatgtaatgtaatg 28978598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36394036 - 36393823
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36394036 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggggagaatatcattcacttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 36393937  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  36393936 acgagcatgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccat 36393837  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||| |||||||    
T  36393836 aagatcttcattag 36393823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 111 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 2206152 - 2205940
Alignment:
Q  111 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2206152 gtgacgagcatgttttgggagcacaatatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgc 2206053  T
Q  211 gagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
     ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2206052 cagaagatcgtcattagttaggataaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacgaccatgactca 2205953  T
Q  311 agcattttgccca 323  Q
    ||||||| |||||    
T  2205952 agcatttcgccca 2205940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 1642799 - 1642353
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1642799 agacacaaggagggtggaatacgtttgatataaacgttcaacactcgacgaggggagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtg 1642700  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  1642699 aggagcatgttttgggagcacaacatgttcaagtggatcgatatgcgtgtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtttgattccgccag 1642600  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||| ||||| ||| | || |  | |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||||||||||| |||| | ||   | |||||    
T  1642599 aagatcgtgattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttacct-tgaaatggg--aattcaaacttgttaaac-gacagttcccaagc 1642505  T
Q  314 attttgcccaac-gttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatttt 411  Q
     |||  ||| || |||| | || |||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||| | |||||| |    
T  1642504 -tttcacccgacagttc-tattgttccattcaaaagattaaattcttgttaggctcgtttagataaaagtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattct 1642407  T
Q  412 gttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
     ||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1642406 tttgacactcgaataccatcatttaaaccaagcctaacaaaaatttaatctttt 1642353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 15338117 - 15337673
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15338117 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaatgttcaacgctcaacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 15338018  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||    
T  15338017 atgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattataaacagtctgattccgccag 15337918  T
Q  214 aagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  || | || |  | ||| ||||| |||||| ||||| ||| |  ||||||| |||||||||||| ||||| | |||| |||     
T  15337917 aagatcgtcattaggtatggaatgaatgcaccttctaactaaaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaac-gacatgtctcc 15337821  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    || | || |  |  | ||  | ||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||    
T  15337820 agta-ttcgatcggcatttctatttttccattcaaaagattaaattcatgttaggccggtttagatgaaggttttgaagtgtcaaggaatgtacctcatt 15337722  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaattta 458  Q
     | ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  15337721 cttttgacacttgaataccatcatttaaaccaagcctaacaagaattta 15337673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43351311 - 43351099
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43351311 agacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacatg 43351212  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||    
T  43351211 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatg-gggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaatgtctgattccaccag 43351113  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  43351112 aagatcgtcattag 43351099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30355007 - 30354814
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30355007 acgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagcgtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 30354908  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  30354907 caacatgttccagtggatcgatatgtggatgacgttgctgagatcagctgaagatatcatcaaaagtttgattctgccaaaagatcgtcattag 30354814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 42735258 - 42735470
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42735258 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatg-gggaagattatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 42735356  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42735357 acgagcatgttttgggagcacaacatattctagtgaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcaag 42735456  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  42735457 aagatcgtcattag 42735470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 570 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 20378688 - 20378450
Alignment:
Q  570 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20378688 cattccaactacaacaattgtcttcctctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcgataagcatcttgaacgatggtattc 20378589  T
Q  670 aagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatttt 769  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| ||||   |||||||||||||||||     
T  20378588 aagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatccttcaagatgctgatcgtatgttggagttctgctgcttagcaagtttgaatttg 20378489  T
Q  770 cctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    || | || | ||| |||| || |||||||||||||||||    
T  20378488 ccccgttaaggggcaagacaaatgttgtagttggaaggt 20378450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21614972 - 21614722
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21614972 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgttcaacgctcgacgagggaagagtatcattcatttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgcg 21614873  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21614872 acgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaattttgattccgccag 21614773  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtctt 264  Q
    ||| |||| ||||| ||| | || |  | || ||||||||||||| |||||    
T  21614772 aagttcgtgattaggtagggaaatgcacctttcaactacaacaattgtctt 21614722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 680 - 886
Target Start/End: Original strand, 41622741 - 41622947
Alignment:
Q  680 gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaa 779  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||  ||||||| |||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  41622741 gaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgttgatcggatgctggagtcttgctgtttagcaagtttgaattttctccattcaa 41622840  T
Q  780 gggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttg 879  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41622841 gggtaagatcattgttgcagttgaaaggtacattctggaatgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttg 41622940  T
Q  880 ttttgaa 886  Q
    |||||||    
T  41622941 ttttgaa 41622947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 21650519 - 21650735
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  21650519 agacacaaggagggtggaacacgttcattataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggaggaattaacgaacgacgaaaatgtg 21650618  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |     
T  21650619 acgagcatgttatgggatcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgccat 21650718  T
Q  214 aagatcgtcattagtta 230  Q
    |||||| ||||||||||    
T  21650719 aagatcatcattagtta 21650735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 28979234 - 28979060
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  28979234 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggagagtatcattcacttgggtgaaattaacgagcgacaaaaacgtg 28979135  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagat 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28979134 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagat 28979060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 665 - 886
Target Start/End: Original strand, 42683058 - 42683269
Alignment:
Q  665 tattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttga 764  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  42683058 tattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaagatgctgatagaatactggagtcctgttgtttagcaagtttga 42683157  T
Q  765 attttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatat 864  Q
    |||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| |||||    
T  42683158 atttgccccatttagtggtaagataattgttgtagttggaaggtgcattccggaatgtaatgtaatg----------tgataacatatatagttgaatat 42683247  T
Q  865 gcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  42683248 gcatgatacattttgttttgaa 42683269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26603417 - 26603265
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  26603417 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaagggagggtatcattcacttgggtggaattaaagagcgacgaaaacgtg 26603318  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgac 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  26603317 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgggtgac 26603265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 663 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 43350947 - 43350756
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagttt 762  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||  |||| ||| |||    
T  43350947 ggtattgaagtgtcaaagaatggacctcattcttttgacatttgaatatcatcattcaagatgcttatcgtattctggagtcctgctttttatcaatttt 43350848  T
Q  763 gaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    ||||||||| ||||||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43350847 gaattttccccattcatttttaagataattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 43350756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 346 - 623
Target Start/End: Complemental strand, 21614666 - 21614389
Alignment:
Q  346 aagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagc 444  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  21614666 aagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatttaaaccaagc 21614567  T
Q  445 ctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggta 544  Q
    ||||||| |||||| |||||| || |          | | |  |  ||| |||||||   ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21614566 ctaacaagaatttaatcttttgaatgaaacaataaaacttccagatgaa-tgcttgatagctgttgtttgacaagtttgaatttacctcattcaaaggta 21614468  T
Q  545 agacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaa 623  Q
    ||| ||||||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21614467 agataattgttgtagttggaaggtgccttccaactacaacaattgtcttcctctagatggggtaattcaaacttgttaa 21614389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 733 - 886
Target Start/End: Original strand, 22291544 - 22291697
Alignment:
Q  733 aatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgc 832  Q
    |||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||  | |||| |  | |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22291544 aatactggagttctgctgtttagcaagtttgaatttgtcccatttagtgataagataattgttcgagttggaatgtacattccggaatgtaatgtaatgc 22291643  T
Q  833 aatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22291644 aatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 22291697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 663 - 827
Target Start/End: Original strand, 42735622 - 42735786
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagttt 762  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||| |||  ||| ||||||||    
T  42735622 ggtattgaagtgtcaaagaatggacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatgctggagtcatgctgttttgcaagttt 42735721  T
Q  763 gaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgt 827  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  42735722 gaatttaccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaatgtatattcgggaatgtaatgt 42735786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 661 - 831
Target Start/End: Original strand, 34353270 - 34353440
Alignment:
Q  661 atggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagt 760  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| || ||||| |||||| ||||||||||||||| || ||  |||||| || ||||||||||||  ||||||||||    
T  34353270 atggtattcaagtgtcaagaaatgcatcttattcttttgacatttgaataccatcatttaaaatgttgatcgtatgttggagtcctgctgtttagcaagt 34353369  T
Q  761 ttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||| || |||||||  ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34353370 ttgaatttaccccattcaaatgtaagataattattgcagttgaaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 34353440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 155 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17320272 - 17320134
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaa 254  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17320272 tatgcggttgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattctgccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaa 17320173  T
Q  255 caatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtca 295  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  17320172 caattgtctt-cct-ttaaatggggtaattcaaacttgtca 17320134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28979065 - 28978943
Alignment:
Q  213 gaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaag 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||| |||    
T  28979065 gaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacagccaggactaaag 28978966  T
Q  313 cattttgcccaacgttcatgttt 335  Q
    ||||| || | || |||||||||    
T  28978965 catttcgctcgacattcatgttt 28978943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 135
Target Start/End: Original strand, 13916828 - 13916949
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||    
T  13916828 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacaaaaatgtg 13916927  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcaca 135  Q
    | || |||||||||||||||||    
T  13916928 atgaccatgttttgggagcaca 13916949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 40588896 - 40588768
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||        ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  40588896 agcctaacatgaatttaatcttttcaaaggaaaaatatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaag 40588797  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40588796 gtaagacaattgttgcagttggaatgcac 40588768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 185 - 264
Target Start/End: Original strand, 34139332 - 34139411
Alignment:
Q  185 agatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtctt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34139332 agatatcatcaaaagtttgattctgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 34139411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 115
Target Start/End: Original strand, 42682951 - 42683052
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  42682951 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgaacgacgaggggagaatatcattcactttggtggaattaacgaacaacgaaaacgtg 42683050  T
Q  114 ac 115  Q
    ||    
T  42683051 ac 42683052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 17839670 - 17839543
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  17839670 agcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaag 17839571  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17839570 g-aagacaattgttgtagttggaatgcac 17839543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Original strand, 45363112 - 45363240
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    |||||||||| |||| | |||||||||||        ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  45363112 agcctaacaagaattcaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaggtttgaatttatctcattcaaag 45363211  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45363212 gtaagacaattgttgcagttggaatgcac 45363240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 737 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 21614190 - 21614087
Alignment:
Q  737 ttggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatg 836  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||     
T  21614190 ttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaaaggtatgataattgttgtaggtggaaggtacattcccgaatgtaatgtgatgtaata 21614091  T
Q  837 taat 840  Q
    ||||    
T  21614090 taat 21614087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 235 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21614448 - 21614112
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtt 334  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||   || |   ||| | ||    
T  21614448 aaggtgccttccaactacaacaattgtctt-cctct-agatggggtaattcaaacttgttaaacggcaa-gactcaaacattcatccgacatttc-tatt 21614353  T
Q  335 tttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcat 433  Q
     ||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||   ||||    
T  21614352 gttcctttcaagagatcaaattcttgttatgccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgacacttgaatatcgtcat 21614253  T
Q  434 ctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
     | || ||| | |||||| |||||| |||||| || |         |||||  || || | || | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  21614252 ttgaaccaaacttaacaataatttaatcttttgaatggaacaatgggaatgtcggacgca-tgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacccc 21614154  T
Q  534 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||    
T  21614153 attcaaaggtatgataattgttgtaggtggaaggtacattcc 21614112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Original strand, 9366542 - 9366786
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  9366542 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgatgagcatcttgaacgatggtattc 9366641  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| ||||||| |||   ||| |||||||||| ||    
T  9366642 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcttgccgattaacaagtttgaa-tt 9366739  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || ||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  9366740 gccccataccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 9366786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 20565543 - 20565300
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||  ||   ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  20565543 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgccaagcagcaggacaccagcattcgatcagcatcttgaacgctggtattc 20565444  T
Q  670 aagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    |||||||||  |||||     ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||   || ||||||||||| ||    
T  20565443 aagtgtcaacagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattattcaagatgctcatcgaatactggagtcctgcagattggcaagtttgaa-tt 20565346  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  20565345 gcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 20565300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 13920604 - 13920526
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 569  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13920604 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgca 13920526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 41218163 - 41217833
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaa-ttcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttt 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||| || ||||||| ||| |  | |||||||||||||||  |||  | ||||||||||    
T  41218163 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaa-tgggccaaatttaaacttgccaagcaac-atgactcaagcatttcccccgtcattcatgtttt 41218066  T
Q  337 tcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
     |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| |||   || ||  ||  ||| ||||| |||||  |||||    
T  41218065 -cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggtccattccttgacactt-aataccttcatc 41217968  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| | ||||||||||||||||| |    ||||| ||||||||||| |||||    
T  41217967 taaacca-gcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatgctgagcgaaatgcttgagtccaggccctttggtaagtttgaatt-acccc 41217871  T
Q  534 at-tcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41217870 atatcagaggtaagacaattgctgtagttggaatgcac 41217833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 30361064 - 30360919
Alignment:
Q  240 gcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcc 339  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||  |||||||| | | |||||  | | ||||||||||||| |||| || |||||||||||||    
T  30361064 gcattccaactacaacaattgtcttacctttgaattgggtaaattcaaattcgccaaacaac-aggactcaagcatttcgcccgacattcatgtttttcc 30360966  T
Q  340 tttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  30360965 tatgaaaagaataaatttttgttatgcttgctttagatgatggtatt 30360919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 9367029 - 9367108
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  9367029 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcac 9367108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 282 - 564
Target Start/End: Complemental strand, 34157311 - 34157032
Alignment:
Q  282 attcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaag 380  Q
    |||||||||||||||||  | | |||||||||||||  |||  | |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| |    
T  34157311 attcaaacttgtcaaacaacaa-gactcaagcatttcacccggcattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcgtgctttagatgatg 34157214  T
Q  381 gtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnn 478  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||| | |||||   ||| || || |||||  ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||            
T  34157213 gtattcaagtgtcaacgaaatgaggttcattcc-ttgacattt-aataccttcatctaaacca-gcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaaca 34157117  T
Q  479 tgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgga 564  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||| ||  ||| || ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34157116 tgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctattgcttgacaggtttgaatttatctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttgga 34157032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 565 - 815
Target Start/End: Original strand, 39476656 - 39476906
Alignment:
Q  565 atgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||| | | |||| ||  ||    
T  39476656 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaacatacgatcaacatcttaaatgat 39476755  T
Q  663 ggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtt 761  Q
    ||||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||| |   ||| ||||||    
T  39476756 ggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtacattc-cttgacacttgaataccaacattcaagatgcttatcgaatgttggagtcctaccgattaacaagtt 39476854  T
Q  762 tgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||| || || || || || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  39476855 tgaa-ttgcccca-tccagagtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattcc 39476906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Original strand, 28066359 - 28066463
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||     
T  28066359 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgtctgaagatattctcaaaagtttgattccgccagaacatcgtg 28066458  T
Q  223 attag 227  Q
    |||||    
T  28066459 attag 28066463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 696 - 815
Target Start/End: Original strand, 26601326 - 26601443
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgtt 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| | | ||| |||||||||| || || || || || |||||| |||||||    
T  26601326 cttgacacttgaataccatcattcaagatgcttatcgaatgttggagtccttccaattaacaagtttgaa-ttgcccca-tccagagtaagacaattgtt 26601423  T
Q  796 gtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||| || ||||||    
T  26601424 gtagttggaatgtgcattcc 26601443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 560 - 744
Target Start/End: Complemental strand, 41218410 - 41218224
Alignment:
Q  560 ttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttga 657  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| || |||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||| | | ||||||    
T  41218410 ttggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggaaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaacatacgatcatcatcttga 41218311  T
Q  658 acaatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtc 744  Q
    |  |||||||||||||||| || |||||     |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  41218310 atgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcatt-tcttgacacttgaataccagcattcaagatgcttatcgaatgttggagtc 41218224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 608 - 801
Target Start/End: Original strand, 21186756 - 21186947
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||    |||||| |||||||||||    
T  21186756 aattcaaacttgctaagcagcaggactccaacatccgatcagcatcttgaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattc-cttgacacttg 21186854  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagtt 801  Q
    ||||||| |||||||||  || |||||||  |||| ||||||  |||| |||||||||| || || ||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  21186855 aataccagcattcaagaggctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagataattgttgcagtt 21186947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 344 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 48315063 - 48314997
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  48315063 aaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcatt 48314997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 10523367 - 10523292
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaat 566  Q
    |||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10523367 gcgaaatgcttgagtccttttgtttgacaagtttgaa-ttaccacattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaat 10523292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 734 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 15337638 - 15337561
Alignment:
Q  734 atattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15337638 atattggagtcctgctgtttggcaagtttaaatttacctcattcagaggtaagacaattgttgtagttggaaggtaca 15337561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 500 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 15337632 - 15337567
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15337632 gagtcctgctgtttggcaagtttaaatttacctcattcagaggtaagacaattgttgtagttggaa 15337567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 17183766 - 17183434
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||   | |||||||||||    
T  17183766 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-aggactcaagcattttgcctcgcattcatgttttt 17183668  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtca-aggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||| | |||| | |||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||  | ||||| | ||| ||  ||| ||||| |||||  |||||    
T  17183667 cctttgaaaataataaacttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaccgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aataccttcatc 17183570  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttatttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| | ||| |||||| |||||| | |||||||||        ||||  | || ||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| |||||||    
T  17183569 taaa-ccagcataacaagaatttaatattttcaaaggaaaaacatgaacactggacgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaa-ttacccc 17183472  T
Q  534 a-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17183471 atttcagaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 17183434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 562 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 18238360 - 18238107
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||  | || |||||||| |||||||||| |||   ||||||||||| ||| || | ||| |||||||     
T  18238360 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccattgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccaacatacgttcagcatcttgaat 18238261  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
    |||| |||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || || |||| ||||||||||||   ||| |||    
T  18238260 aatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccaacattcaagaggcttattgaatgttggagtcctgctgattaacaa 18238162  T
Q  759 gtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||  || | || || || ||| || ||||||||||||||||| || ||||||    
T  18238161 gtttgaa--ttgcccaatccagagtaggacaattgttgtagttggaatgtgcattcc 18238107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 20565057 - 20564978
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  20565057 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcac 20564978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 562 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 40589331 - 40589206
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  40589331 ggaatgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaac 40589232  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaatgaatgc 685  Q
      ||||||||||||||||| ||||||    
T  40589231 ggtggtattcaagtgtcaaggaatgc 40589206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 18238115 - 18237783
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||| | |||||  | | ||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  18238115 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactagccaaacaac-aggactcaagcatttcgcctcgcgttcatgttttt 18238017  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    ||||||||||   |||||| |||||| |||   ||||||||| | |||| ||||| ||| ||| ||| | |||||  |||| ||||| |||||  |||||    
T  18238016 cctttgaaaattataaatttttgttaggctttctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggttcattc-gttgacactt-aataccttcatc 18237919  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| || || |||||| |||||| |||||| ||||        |||| |  |||| ||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||  |||     
T  18237918 taaacca-gcataacaagaatttaatcttttgaaaggaaaaatatgaacgatgggccaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgagttacccca 18237820  T
Q  534 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18237819 attcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 18237783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 608 - 767
Target Start/End: Original strand, 20378491 - 20378650
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    |||||||||||| |||   |||| |||||| ||| |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||    
T  20378491 aattcaaacttgctaagcagcagaactccaacatacgatcagcatcttgaaggatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttg 20378589  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  20378590 aataccatcgttcaagatgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 20378650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 756 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 21614496 - 21614444
Alignment:
Q  756 caagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21614496 caagtttgaatttacctcattcaaaggtaagataattgttgtagttggaaggt 21614444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Original strand, 28113803 - 28114009
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatgggg-caattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||  |||||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||| | | |||||||     
T  28113803 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacctctaaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacatccgatcaacatcttgaa- 28113901  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
    ||||||||||||||||| || |||||     |||| | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||| ||| ||| | |||||| ||||| |||    
T  28113902 aatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattat-ttgacacttgaataccattattcaagatgcttatcaaatgttgaattcctgccatttaacaa 28114000  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  28114001 gtttgaatt 28114009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 481 - 570
Target Start/End: Original strand, 2205935 - 2206025
Alignment:
Q  481 aatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |  |||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2205935 aatgctgggcgaaatgcttgagtcatggtcgtttgacaagtttgaa-ttaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 2206025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 21614632 - 21614577
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21614632 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 21614577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 565
Target Start/End: Original strand, 21651001 - 21651068
Alignment:
Q  498 ttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21651001 ttgagtcctgctgcttggcaagtttgaatttatcccattcagaggtaacacaattgttgtagttggaa 21651068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 479 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 34139475 - 34139385
Alignment:
Q  479 tgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||| ||  ||| || ||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34139475 tgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctattgcttgacaggtttgaatttatctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 34139385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 640 - 805
Target Start/End: Original strand, 28978695 - 28978858
Alignment:
Q  640 attcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatatt 738  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||    |||||| |||||||||||||||||| | | |||||  || ||||||| ||    
T  28978695 attcgatcagcatcttgaacggtggtattcaagtgtcaaaagaatgaggttcattc-cttgacacttgaataccagcgtgcaagacgcttatcgaatgtt 28978793  T
Q  739 ggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    ||||||||||   ||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  28978794 ggagtcctgccgattaacaagtttgaattgtcc-cattc-agagtaagataattgttggagttggaa 28978858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 433
Target Start/End: Original strand, 42735586 - 42735676
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcat 433  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  42735586 aaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaagaatggacctcattcttttgacacttgaataccatcat 42735676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 734 - 811
Target Start/End: Original strand, 10224541 - 10224618
Alignment:
Q  734 atattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  10224541 atattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtaca 10224618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 30361308 - 30361104
Alignment:
Q  565 atgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||| |||   ||| ||||||| ||| |||| | | |||||||  ||    
T  30361308 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaagactccaacatacgatcaacatcttgaatgat 30361209  T
Q  663 ggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtt 761  Q
    ||||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||| |   ||| ||||||    
T  30361208 ggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccatcgttcaagatgcttattaaatattggagtcctaccgattaacaagtt 30361110  T
Q  762 tgaatt 767  Q
    ||||||    
T  30361109 tgaatt 30361104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 34157587 - 34157392
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattca 670  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||  |||||  |||||||||||| |||   ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||  |||||||||    
T  34157587 ttccaactgcaacaatcatcttaccacttaatgggcaaattcaaacttgctaagcagcaggacaccagtattcgatcagcatcttgaacgctggtattca 34157488  T
Q  671 agtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||||  ||||      ||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34157487 agtgtcaaaagaataaggtgcattc-cttaacacttgaataccattgttcaagatgctcatcgaatgttggagtcctgcga-ttaacaagtttgaatt 34157392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 567
Target Start/End: Original strand, 42735693 - 42735766
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 567  Q
    ||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||    
T  42735693 atgctggagtcatgctgttttgcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaatg 42735766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 737 - 808
Target Start/End: Original strand, 26500363 - 26500434
Alignment:
Q  737 ttggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26500363 ttggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcctcatttaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 26500434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 737 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 26592350 - 26592279
Alignment:
Q  737 ttggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  26592350 ttggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcctcatttaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 26592279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 28978958 - 28979040
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgt-tatttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28978958 gcgaaatgctttagtcctggctgtttggcaagtttgaa-ttaccccatttcagaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 28979040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 544 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 41218186 - 41218135
Alignment:
Q  544 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  41218186 aagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 41218135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 344 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 43350983 - 43350900
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaata 426  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| || |||||||    
T  43350983 aaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaagaatggacctcattcttttgacatttgaata 43350900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 542 - 619
Target Start/End: Original strand, 48220376 - 48220455
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggc-aattcaaacttg 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | || || ||||||| ||||||||||||    
T  48220376 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtctcacctttgaatggggcaaattcaaacttg 48220455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 664 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 1642438 - 1642384
Alignment:
Q  664 gtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1642438 gtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacactcgaataccatcatt 1642384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Original strand, 11824839 - 11824901
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11824839 acgttgcagagatcaactgaagatattttcaacagtttgattccgctagaagatcgtgattag 11824901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 17840094 - 17839897
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  17840094 ttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggacaccagtattcgatcagcatcttgaacgctggtattc 17839995  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||| || || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  17839994 aagtttcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgttcaagatgttcatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 17839897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Original strand, 39477099 - 39477228
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccca-ttcaa 539  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  39477099 agcctaaaaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaa-ttaccccatttcag 39477197  T
Q  540 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39477198 cggtaagataattgttgtagttggaatgcac 39477228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 569 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 13921093 - 13920893
Alignment:
Q  569 acattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggta 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||| ||||| |||||||||| |||   ||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||  |||||    
T  13921093 acattccaactgcaacaatcatcttaccactgaatgtggcaaattcaaacttgctaagcagcaggaccccagtattcgatcagaatcttgaacgctggta 13920994  T
Q  667 ttcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaa 765  Q
    |||||||||| || |||||     ||||| ||||||||||||||||||   |||||||  || |||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||    
T  13920993 ttcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagtgttcaagaggcttatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa 13920895  T
Q  766 tt 767  Q
    ||    
T  13920894 tt 13920893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 546 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 18238136 - 18238087
Alignment:
Q  546 gacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  18238136 gacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 18238087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 26601410 - 26601463
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||    
T  26601410 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaagtacaacaattgtcttac 26601463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 39476873 - 39476926
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  39476873 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactataacaattgtcttac 39476926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 500 - 565
Target Start/End: Original strand, 42683133 - 42683198
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||    
T  42683133 gagtcctgttgtttagcaagtttgaatttgccccatttagtggtaagataattgttgtagttggaa 42683198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 45362885 - 45362938
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  45362885 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattctaactgcaacaattgtcttac 45362938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 670 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 15337745 - 15337697
Alignment:
Q  670 aagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15337745 aagtgtcaaggaatgtacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 15337697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 298
Target Start/End: Original strand, 28978872 - 28978932
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaac 298  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||    
T  28978872 gtgcattccaactccaacaattgtcttacctttgaattgggtcaattcaaacttgtcaaac 28978932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 544 - 595
Target Start/End: Original strand, 21614419 - 21614470
Alignment:
Q  544 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  21614419 aagacaattgttgtagttggaaggcaccttccaactacaacaattatcttac 21614470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Original strand, 34353349 - 34353424
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||| || | |||||||    
T  34353349 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaaatgtaagataattattgcagttgaaaggtacattcc 34353424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 569 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 42735767 - 42735656
Alignment:
Q  569 acattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggta 666  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||||  ||   ||| ||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||    
T  42735767 acattccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggtaaattcaaacttgcaaaacagcatgactccagcatgcgatgagcatcttgaatgatggta 42735668  T
Q  667 ttcaagtgtcaa 678  Q
    ||||||||||||    
T  42735667 ttcaagtgtcaa 42735656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 2356757 - 2356513
Alignment:
Q  319 gcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaagctcattttgttg 415  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||| | ||| ||  |||    
T  2356757 gcccaacactcatgtttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaatgaaatgaggttca-ttccttg 2356659  T
Q  416 gcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttgg 515  Q
     ||||| |||||  ||||||||| | |||||||||| |||||| | |||||||||        ||||||  ||||| |||||| | | ||||   ||| |    
T  2356658 tcactttaatacattcatctaaa-ccagcctaacaagaatttaattttttcaaaggaaaaaaatgaatgatgggcg-aatgctggggacctggcgtttag 2356561  T
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||||  ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2356560 caagtttgaattt--ccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaa 2356513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 516 - 570
Target Start/End: Original strand, 17320137 - 17320189
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17320137 caagtttgaatt-accccatttaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 17320189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 34141349 - 34141291
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgtta 363  Q
    |||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34141349 gactcaagtatttcgccccgcgttcatgtttttcctttgaaaagaataaatttttgtta 34141291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 562 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 42683208 - 42683090
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||  ||||||||| |||||||||| |||    ||||||||||| |||| || ||| ||||||||    
T  42683208 ggaatgcaccttccaactacaacaattatcttaccactaaatggggcaaattcaaacttgctaaacaacaggactccagtattctatcagcatcttgaac 42683109  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaa 678  Q
      |||||||||||||||||    
T  42683108 gctggtattcaagtgtcaa 42683090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 8726430 - 8726337
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaa 107  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| || || |||  | |||| ||  ||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  8726430 agacacaaggagggtggaataagttcggtataaacgtccatcgttcgacactgagagaatactattcagttaggtggaattaacaaacgacgaa 8726337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 10523643 - 10523590
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  10523643 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtgttac 10523590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 13920880 - 13920827
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  13920880 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtgttac 13920827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 17183791 - 17183738
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  17183791 gtaagacaattgttgcagttagaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 17183738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 17839884 - 17839831
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  17839884 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtgttac 17839831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 561 - 767
Target Start/End: Original strand, 20877460 - 20877668
Alignment:
Q  561 tggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac-tctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaa 658  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| |||||| |||  ||| || || |||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  20877460 tggaatgtaccttccaactacaacaattatcttacctctaaatgaggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacatacgatcagcatcttgaa 20877559  T
Q  659 caatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagca 757  Q
      |||||||||||||||| || |||||     ||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| || |||||||  |||| || |||  |||| ||    
T  20877560 tgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacatttgaataccgttattcaagatgcttatcgaatgctggattcatgccgtttaaca 20877658  T
Q  758 agtttgaatt 767  Q
    ||||||||||    
T  20877659 agtttgaatt 20877668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 730 - 811
Target Start/End: Original strand, 21650993 - 21651074
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||| |||||||||   || ||||||||||||||  | ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  21650993 tcgaatatttgagtcctgctgcttggcaagtttgaatttatcccattcagaggtaacacaattgttgtagttggaaggtaca 21651074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 30361091 - 30361038
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  30361091 gtaagacaattgttgttcttggaatgggcattccaactacaacaattgtcttac 30361038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 34141440 - 34141387
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  34141440 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcatttcaactacaacaattgtcttac 34141387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 400
Target Start/End: Original strand, 41049099 - 41049164
Alignment:
Q  336 ttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatg 400  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41049099 ttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggtcggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatg 41049164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 518 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 1642301 - 1642257
Alignment:
Q  518 agtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagtt 561  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  1642301 agtttgaatttaccccatttcataggtaagacaattgttgtagtt 1642257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 493 - 558
Target Start/End: Original strand, 4230279 - 4230346
Alignment:
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccc--attcaaaggtaagacaattgttgta 558  Q
    ||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  4230279 aatgcttgagggttgttgtttagcaagtttgaatttaccccaaattcagaggtaagacaattgttgta 4230346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Original strand, 26601707 - 26601766
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26601707 tttgacaagtttgaa-ttaccccatttcagaggtaagataattgttgtagttggaatgcac 26601766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 572 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 34141650 - 34141542
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| | | ||||||||  || |||||    
T  34141650 ttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatcaacatcttgaacgctgatattc 34141551  T
Q  670 aagtgtcaa 678  Q
    |||||||||    
T  34141550 aagtgtcaa 34141542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 842 - 886
Target Start/End: Original strand, 42735786 - 42735830
Alignment:
Q  842 tgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  42735786 tgataaaatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 42735830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 730 - 814
Target Start/End: Original strand, 43351007 - 43351089
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattc 814  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  43351007 tcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattc 43351089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 755 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 48220456 - 48220396
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  48220456 gcaagtttgaatttgccccattcaaaggtgagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 48220396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 595
Target Start/End: Original strand, 9366728 - 9366806
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||  |||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  9366728 caagtttgaattg-ccccataccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 9366806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 130 - 221
Target Start/End: Original strand, 18149638 - 18149729
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgt 221  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||    | | ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  18149638 agcacaacatgttcccgtggatcgatttgtttttcaagttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattgcgccagaagatcgt 18149729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 512 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 20565361 - 20565280
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  20565361 ttggcaagtttgaattg-ccccatccag-ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 20565280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 663 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 21614307 - 21614260
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaata 710  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21614307 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgacacttgaata 21614260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 663 - 714
Target Start/End: Original strand, 21650883 - 21650934
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccat 714  Q
    |||||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21650883 ggtattgaactgtcaaagaatgtacctcattcttttgacacttgaataccat 21650934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 34141143 - 34141084
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||| ||||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  34141143 tttgacaagtttgaattaccccaattcagaggtaagagaattgttgcagttggaatgcac 34141084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 756 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 39476952 - 39476893
Alignment:
Q  756 caagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||    
T  39476952 caagtttgaatttacatcattcaaaggtaagacaattgttatagttggaatgcacattcc 39476893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 47269176 - 47269118
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 569  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  47269176 tttggcaagtttgaatt-accccatttcacaggtaagctaattgttgtagttggaatgca 47269118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 561
Target Start/End: Original strand, 15337833 - 15337881
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagtt 561  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  15337833 tttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttttagtt 15337881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 17184001 - 17183804
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttac-tctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    |||||||| ||||||||||||| | | || ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| | | | ||||||  ||||||||    
T  17184001 ttccaactacaacaattgtcttgcctttgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatcatcattttgaacgctggtattc 17183902  T
Q  670 aagtgt-caatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||  || |||||     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||   | |||||||  |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  17183901 aagtgtgaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcgttcaagaagattatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 17183804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 562 - 678
Target Start/End: Original strand, 30354224 - 30354342
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||||| |||||||||| |||   | ||||||||  |||||||| ||| |||  |||    
T  30354224 ggaatgtaccttccaactgcaacaattttcttaccactgaatgaggcaaattcaaacttgctaaacaggaggactccgacattcgatgagcatctgcaac 30354323  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaa 678  Q
     ||||||||||||||||||    
T  30354324 gatggtattcaagtgtcaa 30354342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 542 - 588
Target Start/End: Complemental strand, 34157379 - 34157333
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaatt 588  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  34157379 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaatt 34157333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 36393752 - 36393804
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  36393752 tttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgtcgtagctggaa 36393804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 515 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 41049058 - 41049010
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41049058 gcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 41049010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 42735541 - 42735489
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  42735541 tttggcaagtttgaatt-accacattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 42735489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 43351028 - 43351080
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  43351028 tttggcaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 43351080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 513 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 48270925 - 48270873
Alignment:
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 567  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48270925 tggcaagtttgaatt-accccattaaaaga-aagacaattgttgtagttggaatg 48270873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 538; Significance: 0; HSPs: 161)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 808
Target Start/End: Original strand, 42120018 - 42120803
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42120018 gagggtggaatacgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggagttaaagaacgacgaaaatgtgacgagcatg 42120117  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  42120118 ttttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgtgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtc 42120217  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccc 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  42120218 attagttagggtaaggtgcattccaactacaacgattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgtcaaacgaccatgaatcaagcatttcgccc 42120317  T
Q  323 aacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttg 422  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  42120318 agcgttcatgttttttctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttg 42120417  T
Q  423 aatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagttt 522  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  42120418 aatatcatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcggggtgcaatgcttgagtcatgttgtttggcaagttt 42120517  T
Q  523 gaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgtta 622  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  42120518 gaattttccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttatta 42120617  T
Q  623 attggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaag 722  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  42120618 attggcaggactccaacattcgataaacgtcttgaacgttggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccaacgttcaag 42120717  T
Q  723 atcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    || |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||  | |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  42120718 atgctgatcgaatattggattcctgctgcttagcaagtttgaatttgtcccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 42120803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 521; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 10360406 - 10359553
Alignment:
Q  16 acacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgac 115  Q
    |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10360406 acacaaggagggtggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgatgaaaacgtgac 10360307  T
Q  116 gagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaa 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| ||||    
T  10360306 gagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactgaagatttcatcaacagcttgattccgccagaa 10360207  T
Q  216 gatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcat 315  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10360206 gatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctc-aaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaagcat 10360108  T
Q  316 tttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttg 415  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  10360107 ttcgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctagtttagatgaaggtaataagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttg 10360008  T
Q  416 gcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttgg 515  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||        |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  10360007 gcacttgaatatcatcatctaaagcaagcctaaattttttttattctttttaaaggaaaaacatgaatgcggggcaaaatgcttgagtcatgttgtttgg 10359908  T
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaa 615  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10359907 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcatattcgaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaa 10359808  T
Q  616 cttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatc 715  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10359807 cttgttaatcggcatgactccaacattcgataagcctcttgaatactggcattgaagtgtcaaggaatgcaccttattcttttgacacttgaataccatc 10359708  T
Q  716 attcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||  |||||| || |||||||||| |  |||||||||||||||||| || || || || |||| | |||||||||||||||||| |||||||     
T  10359707 attcaagatgttgatcggatgttggagtcctactgtttagcaagtttgaatttgcccca-tctagagtaaaacaattgttgtagttggaagatacattct 10359609  T
Q  816 ggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||               ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10359608 ggaatgtaatg---------------tgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 10359553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 511; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Original strand, 16581819 - 16582660
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  16581819 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgagcgacgaaaatgtg 16581918  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcga--tatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcg 211  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  16581919 tcgagcatgttttgggagcacatcatgttccattggatcgagatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagcttgattccgct 16582018  T
Q  212 agaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaa 311  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16582019 agaagatcttcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattggcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggactcaa 16582118  T
Q  312 gcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcatttt 411  Q
    | |||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16582119 gtatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttagaatggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttc 16582218  T
Q  412 gttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttat 511  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| | | |||||| ||||||| |||| |    
T  16582219 gttggcaattgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgccgagtgaaatgtttgagtcatgttgt 16582317  T
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaatt 611  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16582318 ttggcaagtttgaactgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattatcttactctggatggggcaatt 16582417  T
Q  612 caaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatac 711  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16582418 caaacttgttaatcagcaggacttcagcattcgataagtgtcttgaacgctagtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatac 16582517  T
Q  712 catcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    || | ||||||||  |||| ||||| ||||||| |||   ||||||||| ||||||| || | ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16582518 cagcgttcaagatgttgattgaatactggagtcatgctggttagcaagtatgaatttgccccgttcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtaca 16582617  T
Q  812 ttccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16582618 ttccgaaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 16582660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 805
Target Start/End: Original strand, 22493268 - 22494059
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  22493268 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacggcgaaaacgtg 22493367  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  22493368 acgagcatgttttgggagtacagaatgttccagtggattgatatgcgggtaacgttcctgagatcaactaaagatatcatcaacaacttgattccgccag 22493467  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22493468 aagatcgtcattagttagggtaagatgcattccaactacaacaactgtcttacttctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaggc 22493567  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  22493568 atttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcat 22493667  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttat-t 512  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  22493668 tggaacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaaattattcttttcaaatgaaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagtcatgttgtgt 22493767  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22493768 tggcaagtttgaattt-tcccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaattc 22493866  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  22493867 aaacttgttaatcggcaggactccaacatttgataagcgtcttgaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataac 22493966  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    | | |||||||| |||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  22493967 aacgttcaagatgctgatcaaatattggagtcctgttgcttagcaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaatttttgtagttggaa 22494059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 445; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Original strand, 17424786 - 17425626
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17424786 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 17424885  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  17424886 acgaccatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 17424985  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  17424986 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtctt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagc 17425082  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  17425083 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 17425182  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  17425183 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 17425282  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17425283 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattc 17425382  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17425383 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgatgagcatcttggacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 17425482  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||| | ||    
T  17425483 atcattcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggaaaat 17425582  T
Q  813 tccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | | |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17425583 ttcagaatctaatgtgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 17425626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 854
Target Start/End: Original strand, 22001851 - 22002662
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  22001851 acgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggaggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgaccatgttttgggagct 22001950  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |    
T  22001951 cagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattagttattg 22002050  T
Q  234 taaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgt 333  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| ||       ||||||    
T  22002051 taagttgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcgagcatttcgcgagcacctcatgt 22002147  T
Q  334 ttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcat 433  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||   |||||||||||||| |||||    
T  22002148 ttctcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaagtattgaacctcaattctgtggcacttgaataccatcat 22002247  T
Q  434 ctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccc 532  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||        |||| |||  ||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |     
T  22002248 ctaaagcaagccttacaaaactttattcttttcaaagggaaaacatgaagtgctcggcgaaatgcttgagtcatgttgttttgcaggtttgaatttatct 22002347  T
Q  533 cattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcagga 632  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22002348 cattcaaaggtaacacaattgttgtgattggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatctgcagga 22002447  T
Q  633 ctccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcg 732  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   || |||||||| |||||||    
T  22002448 ctccagtattcgatgagcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatattttcgttcaagatgctgatcg 22002547  T
Q  733 aatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgc 832  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||| |||||       ||||||    
T  22002548 aatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaatttcggaa-------taatgc 22002640  T
Q  833 aatgtaatttgataacatatat 854  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  22002641 aatgtaatgtgataacatatat 22002662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 19471843 - 19470964
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19471843 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 19471744  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19471743 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtgtatcgatatgcgggtgacgttgctaagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 19471644  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  | | |  ||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||| | | |||     
T  19471643 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctctgaattgggt-aattcaaacttgtcaaatggc-agggctcc 19471547  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |  |||  | ||| | |||   || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  19471546 aatattc-gaccagcattcccattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 19471448  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
     | ||| || |||||||| ||||| |||  | |||||||||| |||||| |||||| || |          ||||| || |||| |  | |||||||| |    
T  19471447 cttttgccatttgaataccatcatttaatcccagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattggaaatgccggtcgaa-tattggagtcctgct 19471349  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagtt-----ggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctgga 601  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     || | | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19471348 gcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttacgttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaa 19471249  T
Q  602 tggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgac 701  Q
    ||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19471248 tggagtaattcaaacttgttaaacggcaggattccagcattcgatgagcattttgaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgac 19471149  T
Q  702 acttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagtt 801  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||| ||  ||||||||||   |||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19471148 acttgaatatcatcattcaagatgatcatcgcatgctggagtcctgttgtttagcaagtttgaatttactccattcaggggtaagataattgttgcagtt 19471049  T
Q  802 ggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  19471048 ggaaggtacattccggaatgtaatgtaaagcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataataaattttgttttgaa 19470964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 3937273 - 3936624
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3937273 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 3937174  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  3937173 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 3937074  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |  |||| || ||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  3937073 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtatt-cct-ttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac-aacaggactcaagc 3936977  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  3936976 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 3936877  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntga-atgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  3936876 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 3936777  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggcaatt 611  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  3936776 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacagaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctgcgatggggcaatt 3936677  T
Q  612 caaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatgg 664  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  3936676 caaacttgttaatcggcaggactccagtattcgatgagcatcttgaacgatgg 3936624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 154 - 730
Target Start/End: Original strand, 18393486 - 18394062
Alignment:
Q  154 atatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactaca 253  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  18393486 atatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatatcataaacaacttgattctgccagaagatcgtcattagtgagggtaaggtgcattccaactaca 18393585  T
Q  254 acaatcgtcttacctctcaaat-ggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagatta 352  Q
    | ||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||| | | |||||||| |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18393586 aaaattgtcttacctctgaaatnggggtaattcaaacttgccaaacgactaggactcaagtatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagatta 18393685  T
Q  353 aattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaa 452  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||    
T  18393686 aattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaaggttaataaa 18393785  T
Q  453 aa-tttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaat 551  Q
    || |||||||||| |||||        ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18393786 aaatttattcttt-caaaggaaaaca-tgaatgccgggggaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaat 18393883  T
Q  552 tgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcc 651  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18393884 tgttgtagttggaattcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcgataagcc 18393983  T
Q  652 tcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgat 730  Q
    |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18393984 tcttgaatgctggtattcaagtgtcaaggaatgcaccttattcttttgatacttgaataccgtcattcaagatgctgat 18394062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 206 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 39799886 - 39799239
Alignment:
Q  206 tccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatg 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||   |   ||||||||| || |||||  | | |    
T  39799886 tccgccagaagatcgtcattagttagggtaatgtgcattccaaccacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaac-agg 39799789  T
Q  306 actcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagct 405  Q
    |||| ||||||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  39799788 actcgagcatttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgtaggtattaagtgtgaaggaatgaacct 39799689  T
Q  406 cattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcc 505  Q
    ||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39799688 catttcgttggcacttgaataccagcgtctaaagcacgcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatgccgggtgaaatgcttgagtcc 39799590  T
Q  506 tgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggg 605  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39799589 tgttgttttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggg 39799490  T
Q  606 gcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacactt 705  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39799489 gcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagtattcgatgagcatcttggacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacactt 39799390  T
Q  706 gaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| || |||||    
T  39799389 gaataccatcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagatgattgttgcagctggaa 39799290  T
Q  806 ggtacattccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    || | ||| | |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39799289 ggaaaatttcagaatctaatgtgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 39799239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 309; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 23 - 451
Target Start/End: Original strand, 29906588 - 29907016
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  29906588 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgtggggagagtatcattcacttgggtgaagttaaagaacgacgaaaacgtgacaaacatg 29906687  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||| || ||||||||  |    
T  29906688 ttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattctgccagaagatcagc 29906787  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccc 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29906788 attagttagggtaaggtgcattccaactacaacaactgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgccc 29906887  T
Q  323 aacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttg 422  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  29906888 agcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttg 29906987  T
Q  423 aatactatcatctaaagcaagcctaacaa 451  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29906988 aataccatcatctaaagcaagcctaacaa 29907016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 561
Target Start/End: Original strand, 32734644 - 32735191
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||    
T  32734644 agacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggagttaaagaactacgaaaatgtg 32734743  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |     
T  32734744 acaagcatgttttgggagcacaacatgttacagtggatcgatatgcgggtaacgttgttgatatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccaa 32734843  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  32734844 aagatagtcattagttaaggtaaggtgcattccaactacaacaacagtcttacctctaaaatgggataattcaaacttgccaaacggccaggactcaagc 32734943  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  32734944 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaatattaaattattgttaggttggtttagattaaggtattaagtgtcaaggaatggacctcatttcgt 32735043  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  32735044 tagcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgtcgggggaaatgcttgagtcatgttgttt 32735142  T
Q  514 ggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagtt 561  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  32735143 ggcaagtttgaatttaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagtt 32735191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 14 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 12968511 - 12968099
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  12968511 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtt 12968412  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  12968411 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccattggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattcctccag 12968312  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  12968311 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcactccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgaccatgactcaagc 12968212  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  12968211 atttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctaatttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 12968112  T
Q  414 tggcacttgaata 426  Q
    |||||||||||||    
T  12968111 tggcacttgaata 12968099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 14 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 42241308 - 42240869
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  42241308 agacacaaggagggtgaaacacattcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacaacgaaaacgtg 42241209  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |     
T  42241208 acgagcatgttttgggagcacaacatgtttcagttgatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaccaaaagtttgattctgccat 42241109  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42241108 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaacttgtcaaacggccaggactcaagc 42241009  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||    
T  42241008 atttcgctcggcattcatgttttttctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgacaaggaatgaacctcatttcgt 42240909  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaa 453  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  42240908 tggaacttgaataccatcatctaaagcaaacccaacaaaa 42240869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 14 - 830
Target Start/End: Original strand, 6976835 - 6977651
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||| || |||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6976835 agacacaaggagggtggaacatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagg--agtgtatcattcacttgggtgaaattaacgaacgacgaaaacgtg 6976932  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6976933 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 6977032  T
Q  214 aagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  || | || |  | ||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||     
T  6977033 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctct-gaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-caggactcc 6977129  T
Q  311 agcat-tttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcat 408  Q
    |  || || | |   | |||   ||  |||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  6977130 a--atgttcgactggcattcccattaatcctttcaaaatattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatgaacctcat 6977227  T
Q  409 tttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgt 508  Q
    | | ||| |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| || |         |||||  |  | | ||  | ||||||||     
T  6977228 tcttttgacacttgaataccgtcatttaaaccaaacctaacaagaatttaatcttttaaatggagctgtgggaatgtcgatc-atatattggagtcctgc 6977326  T
Q  509 tatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggg 605  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  6977327 tgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgtttgagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggg 6977426  T
Q  606 gcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacactt 705  Q
    | ||||||||||||||||  || |||| | || |||||||| | | | |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6977427 gtaattcaaacttgttaaacggtaggaattcaacattcgatgaacattttgaatgatgatattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacactt 6977526  T
Q  706 gaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    |||||| |||||| || || || |||| || |||||||||||   |||||||||||| ||||| ||||||| |   ||||||||||||||| ||||||||    
T  6977527 gaatactatcatttaaaatgctcatcgcatgttggagtcctgttgtttagcaagtttaaatttgcctcatttagatgtaagataattgttgcagttggaa 6977626  T
Q  806 ggtacattccggaatgtaatgtaat 830  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  6977627 ggtacattccagaatgtaatgtaat 6977651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 9 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 2919579 - 2918708
Alignment:
Q  9 accacagacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaa 108  Q
    |||| |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2919579 accagagacacaaggagggtggaacacgttctgtataaacgtccaacgctcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaa 2919480  T
Q  109 acgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2919479 acgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttacagtagatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaaaagtttgattcc 2919380  T
Q  209 gcgagaagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatg 305  Q
    || | |||||||||||||| ||  | | |  ||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| | || || || |||||||||||| |||||| | |||    
T  2919379 gccaaaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaa-tgtggtaattcaaacttgccaaacgac-atg 2919283  T
Q  306 actcaagcat-tttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaag 403  Q
    |||| |  || |||  || || |||   ||  || | | |||||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |     
T  2919282 actcca--atgtttaaccgacattctcattgatcgtgtcaaaagagtaaattcttgttagaccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatggac 2919185  T
Q  404 ctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaa-atgcttgag 502  Q
    |||||| | ||| | |||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || |||| ||  | |||    
T  2919184 ctcattcttttgacgcttgaataccgtcatttaaaccaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgagaatgctggtcgaacat--tggag 2919087  T
Q  503 tcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctg 599  Q
    || |  |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||     |||| ||||||| | |||     |||||||||||||||||||| || ||    
T  2919086 tcttactgcttggcaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacac-----ttgtggttggaaggtacaaacgcccaactgcaacaattgtcttcctttg 2918992  T
Q  600 gatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttg 699  Q
     |||||| ||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||| ||| | |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  2918991 aatggggtaattcaaacttgttaaacggcag---tccagcattcgatgagcattttgaatgatgatattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttg 2918895  T
Q  700 acacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtag 799  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |||| || ||   |||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  2918894 acacttgaataccatcattcaagatgctcatcgcatggtggaatcatgttgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggcaagataattgttgcag 2918795  T
Q  800 ttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||| ||||  |||| ||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  2918794 ttggaaggtatattctagaatataatgtaaaacaatgcaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 2918708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 695
Target Start/End: Complemental strand, 10364846 - 10364163
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10364846 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 10364747  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10364746 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 10364647  T
Q  214 aagatcgtcattagttag--agtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaa 311  Q
    |||||||||||||  |||  |  || |  | ||||| |||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||| ||||||| || | ||| |    
T  10364646 aagatcgtcattacgtaggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cct-ttaaatggggtaattcaaacttgccaaacgggcaggtctcca 10364549  T
Q  312 gcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattt 410  Q
      | || | ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  10364548 ata-ttcgaccggcattctcattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattc 10364450  T
Q  411 tgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta 510  Q
    | ||| || |||||||| ||||| |||  | |||||||||| |||||| |||||| || |         ||||||  | || |||  | ||||| || |     
T  10364449 ttttgacatttgaataccatcatttaatcccagcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccagtcg-aatattggagtcatgctg 10364351  T
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggc 607  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    || |||||||||||||||||| ||||  ||||||     
T  10364350 cttggcaagtttgaattttccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtctaactgcaacaattgtctttctctaaatggggt 10364251  T
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattct 695  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | | | |||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10364250 aattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcgatgaacattttgaatgttggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattct 10364163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 14 - 470
Target Start/End: Original strand, 43982853 - 43983306
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43982853 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 43982952  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  43982953 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 43983052  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||| |  |||| || ||||||||||||||||||   || |||||||||    
T  43983053 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtatt-cct-ttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaac-aacaggactcaagc 43983149  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  43983150 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 43983249  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag 470  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  43983250 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaag 43983306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 441
Target Start/End: Original strand, 29067726 - 29068150
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  29067726 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtgcaattaacgaatgacgaaaatgtg 29067825  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29067826 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 29067925  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |  ||||||| ||||||||||||||||||   || ||||| |||    
T  29067926 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccagctacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac-aacaggactcgagc 29068022  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||   |   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||       
T  29068023 atttcgcaagaacctcatgtttctcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcag 29068122  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagca 441  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  29068123 tggcacttgaataccatcatctaaagca 29068150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 349 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 8557596 - 8557144
Alignment:
Q  349 attaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaa 448  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  8557596 attaaattcttgttaggctagtttagatgaatgtattaagtgtcaaggaact----tcatttcgttggcacttgaataccattatttaaagcaagcctaa 8557501  T
Q  449 caaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagac 548  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||| | ||| |||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8557500 caaaaatttattcttttcaaagaaaaaca-tgaattccgggtgaaatgtttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaagac 8557402  T
Q  549 aattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataa 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  8557401 aattgttgtagttggaatgcacatttcaagtacaacaattgtcttactctggatggggcaaatcaaacttgttaatcggcaggagtccaacattcgataa 8557302  T
Q  649 gcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgc 748  Q
    || |||||||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||  |||| ||||||    
T  8557301 gcatcttgaatgttggtattcaagtgtcaaggaatgcgcctcattcttttgacaattgaataccatcattcaagatgttgatcgtatggtggactcctgc 8557202  T
Q  749 gatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
       ||||||||||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  8557201 tgcttagcaagtttgaatttaccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaag 8557144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 167 - 886
Target Start/End: Original strand, 43491600 - 43492320
Alignment:
Q  167 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtct 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  | |||  ||||  |||||||||||||||| | ||    
T  43491600 gttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtacggaaagaatgcaccttccaactacaacaattgcct 43491699  T
Q  264 tacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgtta 363  Q
    | ||| | || ||||| |||||||||||| |||||||| |   ||| |  ||||  ||  |  |||    | ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  43491700 t-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacggc-agatctccaatatttgaccggaa-ttcccactgttcctgtcaaaagattaaattcttgtta 43491795  T
Q  364 tgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattct 462  Q
     |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||  || |||||||| ||||| |||  | | |||||||| |||||| |||    
T  43491796 ggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttcacatttgaataccatcatttaatcccaacctaacaagaatttaatct 43491895  T
Q  463 tttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttg 562  Q
    ||| || |         |||||| || |||| |  | |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43491896 tttgaatggaacattgggaatgccggtcgaa-tattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttg 43491994  T
Q  563 gaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    | | | |||    ||||||||||| ||||||||| || || ||| || ||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||| |||||||     
T  43491995 ggaggtacaaacgtccaactgcaataattgtctttctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcagaaatccagcattcgataagcatcttgaat 43492094  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaag 759  Q
    | ||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  |||||||||||  |||||||||    
T  43492095 actggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattattttgacacttgaataccatcattcaagatgctcatcggatgctggagtcctgctgtttagcaag 43492194  T
Q  760 tttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagtta 859  Q
    ||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  43492195 tttaaattttcc-catccaggagtaagataattgttgcagttggaaggtacatttcagaatgtaatgtaatgcaatgtagtttgataacatatatagttg 43492293  T
Q  860 aatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43492294 aatatgcataatacatgttgttttgaa 43492320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 620
Target Start/End: Original strand, 35491632 - 35492239
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35491632 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 35491731  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35491732 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 35491831  T
Q  214 aagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  || | || |  | ||||| |||||||||| ||||| ||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || | |||     
T  35491832 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-caggtctcc 35491928  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |  | || | ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  35491929 aata-ttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 35492027  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
     | ||| || |||||||| ||||| | || |  ||||||||| |||||| |||||| || |         |||||| |  || |||  |||||||||| |    
T  35492028 cttttgacatttgaataccatcat-ttaatcccgcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccgatcg-aatatttgagtcctgct 35492125  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg 606  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  35492126 gcttggcaagtttgaatttaccacattcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaatttgg 35492225  T
Q  607 caattcaaacttgt 620  Q
     |||||||||||||    
T  35492226 taattcaaacttgt 35492239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 575
Target Start/End: Original strand, 33404012 - 33404568
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33404012 agacacaaagagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagggaatagtatcattcagttgtgtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 33404111  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||| ||    
T  33404112 acgagcatgttttgggagcacaagatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaacagtctgatgtcgccag 33404211  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||| ||||| ||| | || |  | |||||||||||||||| ||||| ||| |  |||| || ||||||||||| | |||||| || ||||||| |    
T  33404212 aagatcgtgattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatgaggtaattcaaactttttaaacgg-caggactcaaac 33404307  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    | |||| ||  | ||  | || ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |     
T  33404308 a-tttgtccggcatttctattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattctt 33404406  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    ||| ||||||||||  || || |||| |||| ||||||| |||||| |||||| || |          ||||  || | ||||| |||||||||| | ||    
T  33404407 ttgacacttgaatatcattatttaaaccaagtctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaatagaaatgtcggac-aaatgtttgagtcctgatgtt 33404505  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  33404506 tagcaagtttgaatttacccaattcagaggtaagacaattgttgtatttggaaggtacattcc 33404568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 357
Target Start/End: Original strand, 39393888 - 39394231
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39393888 agacacaaggagggtgtaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaatcaacaaacgacgaaaacgtg 39393987  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||  ||    
T  39393988 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcattaacaacttgattccgtcag 39394087  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  39394088 aagatcgtcattagttaggataaggtgcattccaactgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacatgtcaaac-aacatgactcaagc 39394186  T
Q  314 atttt-gcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattc 357  Q
    ||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39394187 attttcgctcagcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattc 39394231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 293
Target Start/End: Original strand, 5420466 - 5420743
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5420466 agacacaaggagggtggaacacgttcgatataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 5420565  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |    
T  5420566 acgaacatgttttgtgagcacagcatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgatatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccacctg 5420665  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgt 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  5420666 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattgtctta-ctct-ggatggggcaattcaaacttgt 5420743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 266
Target Start/End: Original strand, 3941734 - 3941986
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3941734 agacacaaggagggtggaacaccttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 3941833  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  3941834 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 3941933  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttac 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3941934 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtcttac 3941986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 570 - 854
Target Start/End: Original strand, 5420693 - 5420977
Alignment:
Q  570 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||  || |||||    
T  5420693 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaataggcaggactccaacattcgataaacgtcttgaacgttgatattc 5420792  T
Q  670 aagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatttt 769  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||     
T  5420793 aagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatatcagtgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttg 5420892  T
Q  770 cctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    |||||||||  || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5420893 cctcattcagaggcaagacaattgttgcagttggaaggtacattccgaaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 5420977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 71 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 40677527 - 40676803
Alignment:
Q  71 agtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttg 170  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40677527 agtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttctgggagcacgacatgttctagtggatcgatatgcgggtgacgttg 40677428  T
Q  171 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacc 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || | || |  | || || ||||| |||| || || ||    
T  40677427 ctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttgcagctacaccaattgtatt-cc 40677329  T
Q  268 tctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcat-tttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc 366  Q
    | |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||| |  || || | || || |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  40677328 t-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-caggactcca--atgttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggc 40677233  T
Q  367 tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
     |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| || |||||||| ||||| |||  | |||||||||| |||||| ||||||    
T  40677232 cggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaatcccagcctaacaagaatttaatctttt 40677133  T
Q  466 caaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
     || |         |||||  || ||  ||  | ||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |    
T  40677132 gaatggaacattgggaatgtcggtcg-tatattggagtcttgctgcttggcaagtttgaatttaccacattcaagggtaacacaattgttgtagttgaga 40677034  T
Q  566 tgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
     | |||    |||||||||||||||||||||  | || ||| || ||||| ||||||||||  | ||||| |||||||||           || ||| ||    
T  40677033 ggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcatttgaatgaggtaattccaacttgttaaacgacaggaatccagcatt-----------ttaaacgat 40676945  T
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagttt 762  Q
    |  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || || |||| ||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  40676944 gtcattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatttaaaatgctcatcgcatgctggagttctgctgtttagcaagttt 40676845  T
Q  763 gaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40676844 aaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttgga 40676803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 344 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 41498974 - 41498483
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | |||||| |||| ||| || || |||    |    
T  41498974 aaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattcttttggcatttgagtaccattatttaatcaca 41498875  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || |||| |  | ||||| || |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  41498874 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgctggtcgaa-tattggagtcttgctgcttgacaagtttgaatttatcccattcaaagg 41498776  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagc 639  Q
    ||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  41498775 taacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactacaacaattgtcttcctctgaatggggcaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagc 41498676  T
Q  640 attcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattg 739  Q
    || ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||    
T  41498675 atgcgatgtgcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgctcatcggatgctg 41498576  T
Q  740 gagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca-ttccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41498575 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacattttcggaatgtaatgtaatg 41498483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 178; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27130718 - 27130505
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27130718 agacacaaggagggtggaacacattcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 27130619  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27130618 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 27130519  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||| ||||||||    
T  27130518 aagatagtcattag 27130505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 563 - 831
Target Start/End: Original strand, 29073588 - 29073856
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  29073588 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaagactccagcatttgataagcctcttgaacact 29073687  T
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagttt 762  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | | |||||||   |||||||||||    
T  29073688 ggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcattcaagatgctgatcgaatactagggtcctgctgcttagcaagttt 29073787  T
Q  763 gaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  29073788 gaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaatgtaaatttcggaatgtaatgtaatg 29073856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 663
Target Start/End: Complemental strand, 37312704 - 37312053
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37312704 agacacaaggaggatggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagattatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 37312605  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  37312604 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 37312505  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  | | |  ||||  || || |||||||||| | ||| ||| | || ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||      
T  37312504 aagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttacagctacaacaattgactt-cctatgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacggc-atgactac 37312408  T
Q  311 agcatttt-gcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcat 408  Q
    |  || || | || || |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||   |||| | |||||    
T  37312407 a--atgttcgaccgacattcccattgttcctctcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcagtaaatggacctcat 37312310  T
Q  409 tttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaa-atgcttgagtcctg 507  Q
    | | ||| |||||||||||  |||| ||||  || |||||||  || ||| |||||| ||           |||||  || |||| ||  | ||||| ||    
T  37312309 tcttttgacacttgaataccgtcatttaaactaaacctaacaggaaattaatcttttgaattgaactatgggaatgtcggtcgaacat--tggagtcatg 37312212  T
Q  508 ttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatgg 604  Q
     |  |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||    |||||||||||||||||| || ||||  ||||    
T  37312211 ctgcttgaaaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttatagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgttttcctctaaatgg 37312112  T
Q  605 ggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatg 663  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||| ||||||| ||||    
T  37312111 ggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacatttgataagcatcttgaataatg 37312053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34521893 - 34521680
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34521893 agacacaaggagggtgaaacacgttcggtataaacgtcaaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34521794  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |     
T  34521793 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccctcat 34521694  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  34521693 aagatcgtcattag 34521680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 570 - 831
Target Start/End: Original strand, 3941961 - 3942222
Alignment:
Q  570 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  3941961 cattccaacttcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacatgttaatcgacaggactccaacattcgataagcgtcttgaacgctggtattc 3942060  T
Q  670 aagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatttt 769  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||     
T  3942061 aagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgagacttgaataccagcgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttg 3942160  T
Q  770 cctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3942161 ccccattcaatggtaagatgattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 3942222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Original strand, 29111155 - 29111438
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29111155 agacacaaggagggtggaacacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 29111254  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  29111255 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaccgaagatatcatcaaaaatttaattccgccag 29111354  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacg 299  Q
    || | ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| ||| |  |||| || |||||||||||||||||||    
T  29111355 aataacgtcactaggtagggtaaagtgcattccaactacaacaattatctt-cct-ttgaatgtggtaattcaaacttgtcaaacg 29111438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 583 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 17538586 - 17538283
Alignment:
Q  583 acaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaa 682  Q
    ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  | ||| | | || |||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||| |||    
T  17538586 acaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaacgacagaaattcaacattcgataagcatcttgaataatggcattgaagtgtcaaggaa 17538487  T
Q  683 tgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaaggg 782  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||||||    
T  17538486 tgcatctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgctgatcgaatgttgaagtcctgctatttagcaagtttgaattcgctccattcaaggg 17538387  T
Q  783 taagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttt 882  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17538386 taagacaattgttgcagttggaaggtacaatctggattgtaatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttt 17538287  T
Q  883 tgaa 886  Q
    ||||    
T  17538286 tgaa 17538283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41499303 - 41499090
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41499303 agacagaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattaacctgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 41499204  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41499203 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgagggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 41499104  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  41499103 aagatcgtcattag 41499090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 610 - 886
Target Start/End: Original strand, 23408306 - 23408582
Alignment:
Q  610 ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaat 709  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  23408306 ttcaaacttgttaaacggcaggaatccagcatgtgatgagcatcttgaataatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattattttgacacttgaat 23408405  T
Q  710 accatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggta 809  Q
    ||||||||| ||||| || |||| ||  | |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23408406 accatcattgaagatgctcatcgcatgctagagtcctgctgtttaacaagtttgaattttccccattcatgggtaagataattgttgcagttggaatgta 23408505  T
Q  810 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23408506 catttcggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 23408582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 512 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 34521458 - 34521096
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | | ||     |||||||||||||||||||||  | || |||||| |    
T  34521458 ttggcaagtttcaatttacctcattcaaaggtaacataattgttgtagttgggaggtactaacgtccaactgcaacaattgtcttcatttgaatggggta 34521359  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||| | | ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34521358 attcaaacttgttaaacggcaggaatccagcatgtgatgatcatcttgaataatggtatccaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaa 34521259  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||  | |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34521258 taccatcattcaagatgctcatcgcatgctcgagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacctcattcaagggtaagataattgttgcagttggaaggt 34521159  T
Q  809 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||| |||||||||||               ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  34521158 acattcaggaatgtaatg---------------tgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 34521096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 687 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 24108336 - 24108137
Alignment:
Q  687 cctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaag 786  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24108336 cctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgctgatcgagtactggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagggtaag 24108237  T
Q  787 ataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24108236 ataattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 24108137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 219
Target Start/End: Original strand, 6901963 - 6902168
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||  || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6901963 agacacaaggagggttgaacacattcggcataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 6902062  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  6902063 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtgaatcgatatgcgagtaacgttgttgagatcaactgaagatattatcaacagtctgattccgcgag 6902162  T
Q  214 aagatc 219  Q
    ||||||    
T  6902163 aagatc 6902168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 17796313 - 17796066
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||  ||||||| || |||||  |||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17796313 agacacagggagggtggaacacgttaagtataaacatccaacgctcgacgagtggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 17796214  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  17796213 aagagcatgttttgggagc---acatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttggttccgtcag 17796117  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtctt 264  Q
    ||| |||||||||| ||| | || |||  |||||||||||||||| |||||    
T  17796116 aagctcgtcattaggtagggaaatgtgtcttccaactacaacaattgtctt 17796066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 20148115 - 20148328
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  20148115 agacacaaggagggtgaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagaatatcatttagttggggggaattaaagaacgacgaaaacatg 20148214  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||| ||||||||| ||    
T  20148215 actagcatgttttaggagcacaacatgttccagtagatcgatatgcgggtaacgttgctgagattagctgaagatattttcaacagtctgattccgccag 20148314  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    |||||||| |||||    
T  20148315 aagatcgtgattag 20148328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 668 - 854
Target Start/End: Original strand, 35492239 - 35492425
Alignment:
Q  668 tcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||  ||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  35492239 tcaagtgtcaaggattgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgcttatcggatgctggagtcttgttgtttagcaagtttgaatt 35492338  T
Q  768 ttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35492339 tgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 35492425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 39800051 - 39799895
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39800051 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 39799952  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttg 170  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  39799951 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttg 39799895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 159
Target Start/End: Original strand, 18392055 - 18392179
Alignment:
Q  35 cgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392055 cgttcggtataaacgtccaacgcttgacgaggggagagtatcatttacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcac 18392154  T
Q  135 aacatgttccaatggatcgatatgc 159  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  18392155 atcatgttccagtggatcgatatgc 18392179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 145
Target Start/End: Original strand, 34638985 - 34639093
Alignment:
Q  37 ttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34638985 ttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacag 34639084  T
Q  137 catgttcca 145  Q
    |||||||||    
T  34639085 catgttcca 34639093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 652 - 854
Target Start/End: Original strand, 28476138 - 28476342
Alignment:
Q  652 tcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgat 751  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||| | | || ||||       
T  28476138 tcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcattcaagatacacatcgaatactagggttctgctgc 28476237  T
Q  752 ttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataaca 849  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||| ||||||| |  || |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  28476238 ttagcaagtttgaatttgctccattcagtggtaagatgattgttgcaactgcaaggtaaatttcggaatgtaatgtgtaatgcaatgtaatgtgataaca 28476337  T
Q  850 tatat 854  Q
    |||||    
T  28476338 tatat 28476342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 686 - 831
Target Start/End: Original strand, 24936434 - 24936579
Alignment:
Q  686 acctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaa 785  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || |||| |||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||    
T  24936434 acctcattcttttgacacttgaataccattattcaagatgctgaacgtatgttggcgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcactggtaa 24936533  T
Q  786 gataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24936534 gataattgttgcagttggaaggtacattccggaatttaatgtaatg 24936579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 697 - 831
Target Start/End: Original strand, 25685101 - 25685235
Alignment:
Q  697 ttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttg 796  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||| || || |||| |||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||    
T  25685101 ttgacacttgaataccattattcaagatgctgaacgtatgttggcgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcactggtaagataattgttg 25685200  T
Q  797 tagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25685201 cagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 25685235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 752 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 10364163 - 10364057
Alignment:
Q  752 ttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacata 851  Q
    |||||||||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10364163 ttagcaagtttgaatttgtccaattcaatggtaagataattgttgcagttggaaggtacattccgaaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacata 10364064  T
Q  852 tatagtt 858  Q
    |||||||    
T  10364063 tatagtt 10364057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 706 - 854
Target Start/End: Original strand, 43983412 - 43983562
Alignment:
Q  706 gaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || |||||    
T  43983412 gaataccatcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaa 43983511  T
Q  806 ggtacattccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  43983512 ggtaaatttcggaatgtaatgtaaaatgcaatgtaatgtgataacatatat 43983562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 16253474 - 16253594
Alignment:
Q  15 gacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtga 114  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||| ||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16253474 gacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgcccaacacttaacgatgggagaatatcattaagttgggtggaattaaagaacgacgataacgtga 16253573  T
Q  115 cgagcatgttttgggagcaca 135  Q
      |||||||||||||||||||    
T  16253574 gcagcatgttttgggagcaca 16253594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 649 - 808
Target Start/End: Original strand, 32736718 - 32736877
Alignment:
Q  649 gcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgc 748  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||  |||||| || || ||||| |||    
T  32736718 gcctcttgaatgatggtattcaagtgtcaaggaatacacctcattcttttgacacttgaatatcttcattcaagatgttgatcgtatgttagagtcttgc 32736817  T
Q  749 gatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
       ||||| ||||||||||| || ||||||   | |||| ||||||||||||||||||||    
T  32736818 tgcttagccagtttgaatttgccccattcagcagcaagacaattgttgtagttggaaggt 32736877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 442 - 573
Target Start/End: Original strand, 39799727 - 39799857
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  39799727 agcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaag 39799826  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacatt 573  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39799827 g-aagacaattgttgtggttggaatgcacatt 39799857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 42120565 - 42120233
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||   |||  | |||||||||||    
T  42120565 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggaaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcattgcaccccgcattcatgttttt 42120467  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| | |||| ||||| ||| | ||||| | ||| ||  ||| ||||| |||||  |||||    
T  42120466 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aataccttcatc 42120369  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttatttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||        |||| || ||||||||||||||| || | ||  |||| |||||||||| |||||||    
T  42120368 taaa-ccagcataacaagaatttaatcttttcaaagaaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgattcatggtcgtttgacaagtttgaa-ttacccc 42120271  T
Q  534 a-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42120270 atttcagaggtaagacaatcgttgtagttggaatgcac 42120233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 608 - 815
Target Start/End: Original strand, 39799328 - 39799533
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||    
T  39799328 aattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgataagcatcttgaacgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttg 39799426  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    ||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| || || || || ||||||||| |||||||| ||||||||     
T  39799427 aataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaat 39799524  T
Q  807 gtacattcc 815  Q
    || ||||||    
T  39799525 gtgcattcc 39799533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 344 - 465
Target Start/End: Original strand, 16253778 - 16253900
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| || |||||||| ||||| |||| |||    
T  16253778 aaaatattaaattcttgttagactggcttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacatttgaataccatcatttaaaccaa 16253877  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||||||||| |||||| ||||||    
T  16253878 gcctaacaagaatttaatctttt 16253900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 17425575 - 17425332
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  17425575 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgataagcatcttgaatgatggtattc 17425476  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  17425475 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaa-tt 17425378  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  17425377 gcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 17425332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 352 - 463
Target Start/End: Original strand, 29111468 - 29111580
Alignment:
Q  352 aaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaaca 450  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  29111468 aaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtatttaagtgtcaaggaatacacctcattcttttgacacttgaataccatcatttaaaccaagcctaaca 29111567  T
Q  451 aaaatttattctt 463  Q
    | |||||| ||||    
T  29111568 agaatttaatctt 29111580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27650527 - 27650381
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    |||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||     
T  27650527 ttttggcaacacaacatgttaccgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccagaagatcgtg 27650428  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctct 270  Q
    ||||| ||| | || |  | |||||||||||||||| | |||||||||    
T  27650427 attaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgacttacctct 27650381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 32735191 - 32734868
Alignment:
Q  247 aactacaacaatcgtcttacctctcaaatgggg-caattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaa 345  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||    
T  32735191 aactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaaattcaaacttgccaaac-aacatgactcaagcatttcccccgacattcatg-ttttcctttgaa 32735094  T
Q  346 aagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaag 443  Q
    |||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| |||||  || |||   || ||  ||  ||| ||||| |||||  | ||||||| |||     
T  32735093 aagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgctaacgaaatgaggtccattccttgacactt-aataccttaatctaaaccaa- 32734996  T
Q  444 cctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||  |||  || | |||    
T  32734995 cctaacaataatttaatattttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaattatcccattttagagg 32734896  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32734895 taagactgttgttgtagttggaatgcac 32734868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 344 - 465
Target Start/End: Original strand, 6902304 - 6902426
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||| |||||  |||| |||  | |    
T  6902304 aaaagattaaattcttgttagtctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttcaataccctcatttaagtcga 6902403  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||||||||| |||||| ||||||    
T  6902404 gcctaacaagaatttaatctttt 6902426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 336 - 465
Target Start/End: Original strand, 20148448 - 20148577
Alignment:
Q  336 ttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||| |||||     
T  20148448 ttcctttcaaaatattaaattcttgttaggcttgtttaaatgaa-gtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 20148546  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    |||| ||||||||| || |||||| ||||||    
T  20148547 taaaccaagcctaaaaagaatttaatctttt 20148577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 505 - 595
Target Start/End: Original strand, 29111600 - 29111690
Alignment:
Q  505 ctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  29111600 ctgttgtttggcgagtttgaatttgcctcatttaaaggtaagataattgttgtagttggaatgcactttccaaccacatcaattgtcttac 29111690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 492 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 39394190 - 39394112
Alignment:
Q  492 aaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39394190 aaatgcttgagtcatgttgtttgacatgtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 39394112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 3936970 - 3937049
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  3936970 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcac 3937049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 730 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 10364371 - 10364290
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10364371 tcgaatattggagtcatgctgcttggcaagtttgaattttccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtaca 10364290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 17425089 - 17425010
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  17425089 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aagacaaatgttgtagttggaatgcac 17425010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 29068029 - 29067950
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29068029 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaatgcac 29067950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 43983156 - 43983077
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  43983156 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaattgttgtagttggaatgcac 43983077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 5420938 - 5420731
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac-tctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  5420938 ggaatgtaccttccaactgcaacaattgtcttgcctctgaatgaggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaac 5420839  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
    | || |||||||||||| || |||||     ||||| ||||||||||||||| || | |||||||   | ||||||| ||||||||||||   ||| |||    
T  5420838 actgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaatatcaacgttcaagacgtttatcgaatgttggagtcctgcctattaacaa 5420740  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  5420739 gtttgaatt 5420731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 489 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 22002134 - 22002056
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 569  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22002134 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgca 22002056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 751 - 831
Target Start/End: Original strand, 33404504 - 33404584
Alignment:
Q  751 tttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33404504 tttagcaagtttgaatttacccaattcagaggtaagacaattgttgtatttggaaggtacattcccgaatgtaatgtaatg 33404584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 354
Target Start/End: Original strand, 10359854 - 10359968
Alignment:
Q  239 tgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttc 338  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  10359854 tgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-atgactcaagcattttgccccgcattcatgtttttc 10359952  T
Q  339 ctttgaaaagattaaa 354  Q
    |||| |||||| ||||    
T  10359953 ctttaaaaagaataaa 10359968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 572 - 804
Target Start/End: Original strand, 41498510 - 41498742
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| ||| |||||||  |||||||||    
T  41498510 ttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcatccgatgagcatcttgaatgatggtattc 41498609  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |  |||| ||  |||| ||||||  |||| |||||||||| ||    
T  41498610 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgttcaagatgcacatcgcatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaa-tt 41498707  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
     || ||||| || | |||| ||||||||||||||||    
T  41498708 gccccattc-agaggaagacaattgttgtagttgga 41498742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 572 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 43492239 - 43492132
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattca 670  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| ||||||| |||   ||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||    
T  43492239 ttccaactgcaacaattatcttactcctggatgggaaaatttaaacttgctaaacagcaggactccagcatccgatgagcatcttgaatgatggtattca 43492140  T
Q  671 agtgtcaa 678  Q
    ||||||||    
T  43492139 agtgtcaa 43492132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 22002620 - 22002377
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |   |||||    
T  22002620 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaacgaaaatattc 22002521  T
Q  670 aagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    |||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  22002520 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgttcaagatgctcatcgaatactggagtcctgcagattaacaagtttgaa-tt 22002423  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  22002422 gcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 22002377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 572 - 678
Target Start/End: Original strand, 17538364 - 17538472
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggc-aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||| || |||||||||||| ||| | |||||||| || |||||||| ||| |||||||  |||||||||    
T  17538364 ttccaactgcaacaattgtcttacccttgaatggagcgaattcaaacttgctaaatagcaggacttcaacattcgatcagcatcttgaatgatggtattc 17538463  T
Q  670 aagtgtcaa 678  Q
    |||||||||    
T  17538464 aagtgtcaa 17538472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 22493824 - 22493677
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||  |||||||||||| |||     |||||||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  22493824 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaa-tgggaaaattcaaacttgccaacacaacatgactcaagcatttcgccccgcattcatgttttt 22493726  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    | |||||||||| ||| || |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  22493725 catttgaaaagaataattttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 22493677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 18393700 - 18393570
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttatttggcaagtttgaatttaccccatt-caa 539  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | ||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||  ||| ||| ||     
T  18393700 agcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatacttgagtcctagtcgtttggcaagtttgaattaccccnatttcag 18393601  T
Q  540 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18393600 aggtaagacaatttttgtagttggaatgcac 18393570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24108283 - 24108208
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  24108283 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaaggtacattcc 24108208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 511 - 578
Target Start/End: Complemental strand, 29111763 - 29111696
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaac 578  Q
    |||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29111763 tttggccagtttgaatttgcctcatttaaaggtaagataattgttgtagttggaatgcactttccaac 29111696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 728 - 811
Target Start/End: Original strand, 35492104 - 35492187
Alignment:
Q  728 gatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||| |||||||||   || |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  35492104 gatcgaatatttgagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccacattcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggtaca 35492187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 446 - 570
Target Start/End: Original strand, 12968162 - 12968287
Alignment:
Q  446 taacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggt 543  Q
    |||||| |||||| |||||||||||        |||| || |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  12968162 taacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggtcgtttggcaagtttgaa-ttaccccatttcagaggt 12968260  T
Q  544 aagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  12968261 aagacaattgttgtagttggagtgcac 12968287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 299
Target Start/End: Original strand, 16253603 - 16253735
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtctt 264  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| | |||||||||| ||||| ||| | ||    | |||||||||||||||| |||||    
T  16253603 acgttgctgagatcaactaaagatattatcgacagtttgattccaccagaagatcgtgattaggtag-ggaatacaccttccaactacaacaattgtctt 16253701  T
Q  265 acctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacg 299  Q
    | |||| ||||| || ||||||||||||| |||||    
T  16253702 a-ctctgaaatgaggtaattcaaacttgttaaacg 16253735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 664 - 718
Target Start/End: Original strand, 20148492 - 20148546
Alignment:
Q  664 gtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20148492 gtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 20148546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 22493849 - 22493771
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggcaattcaaacttg 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||||||||||    
T  22493849 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatgggaaaattcaaacttg 22493771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31991994 - 31991885
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtctt 264  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| ||| | || |  | |||||||||||||||| |||||    
T  31991994 acgttgcagagatcaactgaagatattctcaacaatttgattccgccagaagatcgtgattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt 31991896  T
Q  265 acctctcaaat 275  Q
    |||||| ||||    
T  31991895 acctctgaaat 31991885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 562 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 35492386 - 35492268
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||    || ||||||||||| |||||||| |||||||     
T  35492386 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaacaacaagactccagcatccgataagcatcttgaat 35492287  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaa 678  Q
     ||||||||||||||||||    
T  35492286 gatggtattcaagtgtcaa 35492268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Original strand, 42240955 - 42241084
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccatt-caa 539  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||||    |||| |||||||||||| ||| |||| ||     
T  42240955 agcctaacaagaatttaatcttttcaaagaaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttgacaagtttgaatt-acctcatttcag 42241053  T
Q  540 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42241054 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 42241084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 16582376 - 16582045
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||| || |||||||||| |||||  | ||||||||| |||||  | |  | ||||||||||     
T  16582376 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcagttcaaacttgccaaacaac-atgactcaaacatttcactcggcattcatgtttt- 16582279  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| || || ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  |||||    
T  16582278 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatc 16582181  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| ||  | |||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | ||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| |||||    
T  16582180 taaaccattc-taacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatacttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-acccc 16582083  T
Q  534 att-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16582082 atttcagaggtaagccaattgttgcagttggaatgcac 16582045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 42120590 - 42120537
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  42120590 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 42120537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 42120807 - 42120557
Alignment:
Q  565 atgcacattccaactgcaacaattgtctt-actctggatggggc-aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||  | ||| ||||| | |||||||||||| |||   |||||| ||||  ||||||| ||| ||||||||  |    
T  42120807 atgcaccttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatgggacaaattcaaacttgctaagcagcaggaatccaatattcgatcagcatcttgaacgtt 42120708  T
Q  663 ggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtt 761  Q
    |||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||   | ||||||| |||||||||||| | |||  |||||    
T  42120707 ggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccaacgttcaagacgtttatcgaatgttggagtcctgccaattaataagtt 42120609  T
Q  762 tgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||| || || || || || |||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  42120608 tgaa-ttgcccca-tccagagtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattcc 42120557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 3942206 - 3942019
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  ||||||  | || |||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  3942206 ggaatgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccattgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaac 3942107  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctg 747  Q
      |||||||||||| || || |||||     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||| |||||||||||    
T  3942106 gctggtattcaagtctcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgttggagtcctg 3942019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 487 - 570
Target Start/End: Original strand, 10360101 - 10360184
Alignment:
Q  487 gggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10360101 gggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaatt-accccattttgaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 10360184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 120 - 172
Target Start/End: Original strand, 17112399 - 17112451
Alignment:
Q  120 atgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgct 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17112399 atgttttgggagcacaatatgttctaatggattgatatgcgggtgacgttgct 17112451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Original strand, 19471035 - 19471242
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||| | || |||| | || |||||||||| |||    |||||||||||||| |||| | | |||||||     
T  19471035 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccctgaatggagtaaattcaaacttgctaaacaacaggactccagcatgcgatgatcatcttgaat 19471134  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||| ||||||  |||| |||    
T  19471135 gatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccatcattcaaaatgctcatcgaatgctggaatcctgccgtttaacaa 19471233  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  19471234 gtttgaatt 19471242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 564 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 23408509 - 23408393
Alignment:
Q  564 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaa 661  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| || ||||||||||||||   ||||||||| ||||| |||| ||| |||| ||  |    
T  23408509 aatgtacattccaactgcaacaattatcttacccatgaatggggaaaattcaaacttgttaaacagcaggactctagcatgcgatgagcatcttcaatga 23408410  T
Q  662 tggtattcaagtgtcaa 678  Q
    |||||||||||||||||    
T  23408409 tggtattcaagtgtcaa 23408393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 34521233 - 34521153
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc 574  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||    
T  34521233 atgctcgagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacctcattcaagggtaagataattgttgcagttggaaggtacattc 34521153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 734 - 810
Target Start/End: Complemental strand, 34521476 - 34521400
Alignment:
Q  734 atattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtac 810  Q
    |||||||||||||||   || |||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  34521476 atattggagtcctgctgcttggcaagtttcaatttacctcattcaaaggtaacataattgttgtagttgggaggtac 34521400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 755 - 815
Target Start/End: Original strand, 42120510 - 42120570
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  42120510 gcaagtttgaattttccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 42120570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 572 - 678
Target Start/End: Original strand, 10359619 - 10359726
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattca 670  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||   | ||||||||| ||| |||| | | |||||||  ||||||||||    
T  10359619 ttccaactacaacaattgttttactctagatggggcaaattcaaacttgctaaacagtaggactccaacatccgatcaacatcttgaatgatggtattca 10359718  T
Q  671 agtgtcaa 678  Q
    ||||||||    
T  10359719 agtgtcaa 10359726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 16253814 - 16253869
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16253814 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacatttgaataccatcatt 16253869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 29111496 - 29111551
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29111496 ggtatttaagtgtcaaggaatacacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 29111551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 31770360 - 31770427
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattca 81  Q
    |||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  31770360 agacacaaggaggatgtaatatgttcggtataaacgtccaacgttcgacgaggggagagtatcattca 31770427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 590 - 637
Target Start/End: Original strand, 32735191 - 32735238
Alignment:
Q  590 tcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactcca 637  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  32735191 tcttactctggatggggcaattcaagcttgttaatcggcaggactcca 32735238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 678
Target Start/End: Original strand, 24108208 - 24108326
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || |||||||||| |||   |||||||||||| | ||||| ||| |||||||     
T  24108208 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagtactcgatcagcatcttgaat 24108307  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaa 678  Q
     ||||||||||||||||||    
T  24108308 gatggtattcaagtgtcaa 24108326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 446 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 29906928 - 29906803
Alignment:
Q  446 taacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggt 543  Q
    |||||| |||||| |||||||||||        |||| || |||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  29906928 taacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaatt-accccatttcagaggt 29906830  T
Q  544 aagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29906829 aagacagttgttgtagttggaatgcac 29906803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 18393927 - 18393874
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  18393927 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgaattccaactacaacaattgtcttac 18393874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 696 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 18394011 - 18393904
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgtt 795  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||| || || || || || |||||| |||||||    
T  18394011 cttgacacttgaataccagcattcaagaggcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgcccca-tccagagtaagacaattgtt 18393914  T
Q  796 gtagttggaa 805  Q
    ||||||||||    
T  18393913 gtagttggaa 18393904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 494 - 575
Target Start/End: Original strand, 35492305 - 35492386
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    ||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  35492305 atgctggagtcttgttgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacattcc 35492386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 17538428 - 17538364
Alignment:
Q  501 agtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  17538428 agtcctgctatttagcaagtttgaattcgctccattcaagggtaagacaattgttgcagttggaa 17538364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 755 - 815
Target Start/End: Original strand, 22493770 - 22493829
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  22493770 gcaagtttgaattttcc-cattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 22493829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 6902340 - 6902395
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  6902340 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttcaataccctcatt 6902395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 572 - 748
Target Start/End: Original strand, 8557145 - 8557323
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    |||||||| ||||||||||||| | | || |||||| || |||||||||| |||   |||||| |||| ||| |||| | | |||||||  |||||||||    
T  8557145 ttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatggggtaaattcaaacttgctaagcagcaggagtccaccatacgatcaacatcttgaatgatggtattc 8557244  T
Q  670 aagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgc 748  Q
    || ||||||  |||||   | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||    
T  8557245 aattgtcaaaagaatgaggcgcattc-cttgacacttgaataccaacattcaagatgcttatcgaatgttggactcctgc 8557323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 10364481 - 10364426
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10364481 ggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttgacatttgaataccatcatt 10364426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 494 - 573
Target Start/End: Original strand, 23408430 - 23408509
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatt 573  Q
    ||||| |||||||| | |||  ||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  23408430 atgctagagtcctgctgtttaacaagtttgaattttccccattcatgggtaagataattgttgcagttggaatgtacatt 23408509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 758 - 805
Target Start/End: Original strand, 29111613 - 29111660
Alignment:
Q  758 agtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29111613 agtttgaatttgcctcatttaaaggtaagataattgttgtagttggaa 29111660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 758 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 29111756 - 29111709
Alignment:
Q  758 agtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29111756 agtttgaatttgcctcatttaaaggtaagataattgttgtagttggaa 29111709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 710
Target Start/End: Original strand, 33404373 - 33404420
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaata 710  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33404373 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaata 33404420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 35491997 - 35492052
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35491997 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatt 35492052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 843 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 40676804 - 40676761
Alignment:
Q  843 gataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40676804 gataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 40676761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 572 - 669
Target Start/End: Complemental strand, 43983511 - 43983412
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  43983511 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgataagcatcttgaacgatggtattc 43983412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15891705 - 15891643
Alignment:
Q  165 acgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattag 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||    
T  15891705 acgttgcggagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgctagaatatcgtgattag 15891643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 782 - 840
Target Start/End: Original strand, 16708390 - 16708447
Alignment:
Q  782 gtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaat 840  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16708390 gtaagataattgttgtagtttgaaggtgcaacccg-aatgtaatgtaatgcaatgtaat 16708447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 17796035 - 17796087
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17796035 tttggcaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 17796087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 562 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 24936563 - 24936445
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||| |||||||||| |||   ||||||| ||| ||| || | ||| |||||||     
T  24936563 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccagtgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggacgccaacatacgttcagcatcttgaat 24936464  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaa 678  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24936463 aatggtattcaagtgtcaa 24936445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 562 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 25685219 - 25685101
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||   || ||||||||| |||||||||| |||   ||||||| ||| ||| || | ||| |||||||     
T  25685219 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccagtgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggacgccaacatacgttcagcatcttgaat 25685120  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaa 678  Q
    |||||||||||||||||||    
T  25685119 aatggtattcaagtgtcaa 25685101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 34521609 - 34521661
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  34521609 tttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 34521661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 35491916 - 35491864
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35491916 tttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 35491864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 43491731 - 43491679
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43491731 tttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aaggcaattgttgtagttggaa 43491679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 8557355 - 8557408
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  8557355 gtaagacaattgttgtacttgaaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 8557408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 10359828 - 10359881
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  10359828 gtaagacaattgttgtagttcgaatatgcattccaactacaacaattgtcttac 10359881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 493 - 565
Target Start/End: Original strand, 15891555 - 15891628
Alignment:
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaa-aggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  15891555 aatgcttgagaactgttatttagcaagtttgaatttatccaatttaagaagtatgacaattgttgtagttggaa 15891628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 16582401 - 16582348
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  16582401 gtaagataattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 16582348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 756 - 805
Target Start/End: Original strand, 18393848 - 18393897
Alignment:
Q  756 caagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18393848 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 18393897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 562 - 635
Target Start/End: Original strand, 33404230 - 33404303
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactc 635  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||| || ||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  33404230 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaactttttaaacggcaggactc 33404303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 563 - 678
Target Start/End: Original strand, 34521153 - 34521270
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| |||||| || || || || || |||||||||| |||   ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||      
T  34521153 gaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatgaggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactcgagcatgcgatgagcatcttgaatg 34521252  T
Q  661 atggtattcaagtgtcaa 678  Q
    ||||||||||||||||||    
T  34521253 atggtattcaagtgtcaa 34521270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 837 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 37312057 - 37312008
Alignment:
Q  837 taatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37312057 taatgtgataacatatatagttgaatatgcatgatacatgttgttttgaa 37312008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 734 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 40677105 - 40677028
Alignment:
Q  734 atattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||| |||   || |||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  40677105 atattggagtcttgctgcttggcaagtttgaatttaccacattcaagggtaacacaattgttgtagttgagaggtaca 40677028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 515 - 575
Target Start/End: Original strand, 3942146 - 3942206
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| | |||||||    
T  3942146 gcaagtttgaatttgccccattcaatggtaagatgattgttgcagttggaaggtacattcc 3942206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 515 - 575
Target Start/End: Original strand, 5420878 - 5420938
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  5420878 gcaagtttgaatttgcctcattcagaggcaagacaattgttgcagttggaaggtacattcc 5420938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 515 - 575
Target Start/End: Original strand, 24936503 - 24936563
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  24936503 gcaagtttgaatttgccccattcactggtaagataattgttgcagttggaaggtacattcc 24936563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 515 - 575
Target Start/End: Original strand, 25685159 - 25685219
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  25685159 gcaagtttgaatttgccccattcactggtaagataattgttgcagttggaaggtacattcc 25685219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 22493551 - 22493493
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgca 569  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22493551 tttggcaagtttgaatt-accccatttcagaagtaagacagttgttgtagttggaatgca 22493493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 27130353 - 27130298
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  27130353 ggtattgaagtgtcaatgaatagacctcattcttttaacacttgaataccgtcatt 27130298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 569 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 29073833 - 29073722
Alignment:
Q  569 acattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggta 666  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   ||||||| | || ||||||| ||| |||||||   |||||    
T  29073833 acattccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggaccctagtattcgatcagcatcttgaatgctggta 29073734  T
Q  667 ttcaagtgtcaa 678  Q
    ||||||||||||    
T  29073733 ttcaagtgtcaa 29073722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 29111436 - 29111379
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29111436 tttgacaagtttgaatt-accacattcaaagg-aagataattgttgtagttggaatgcac 29111379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 37312339 - 37312284
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37312339 ggtattgaagtgtcagtaaatggacctcattcttttgacacttgaataccgtcatt 37312284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 2919290 - 2919342
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  2919290 tttggcaagtttgaatt-accacattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 2919342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 6977117 - 6977065
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  6977117 tttggcaagtttgaatt-accccattcagagg-aagacaattgttgtagctggaa 6977065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 10364563 - 10364615
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10364563 tttggcaagtttgaatt-accccatttaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 10364615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 562 - 623
Target Start/End: Original strand, 16253670 - 16253732
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctg-gatggggcaattcaaacttgttaa 623  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  16253670 ggaatacaccttccaactacaacaattgtcttactctgaaatgaggtaattcaaacttgttaa 16253732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 17425366 - 17425312
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  17425366 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 17425312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 27650645 - 27650603
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacg 56  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  27650645 agacacaaagagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacg 27650603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 757 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 37312202 - 37312148
Alignment:
Q  757 aagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  37312202 aagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttatagttggaaggtaca 37312148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Original strand, 39799499 - 39799553
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  39799499 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 39799553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 729 - 814
Target Start/End: Original strand, 34521587 - 34521670
Alignment:
Q  729 atcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattc 814  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| || || ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  34521587 atcgaatattggagtcctaccgtttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattc 34521670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 40678824 - 40678763
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtat 75  Q
    |||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||    
T  40678824 agacacaaggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacactcgacgaagggagagtat 40678763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 244 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 41498742 - 41498687
Alignment:
Q  244 tccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggc 301  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41498742 tccaactacaacaattgtctt-cctctgaa-tggggcaattcaaacttgttaaacggc 41498687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 538; Significance: 0; HSPs: 243)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 47488241 - 47487456
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47488241 gagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatg 47488142  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    |||||||||||||| || ||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| |||||||||||    
T  47488141 ttttgggagcacaatattttctagttgatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatgtcatcaacagcttgatttcgccagaagatcgtc 47488042  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccc 322  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47488041 attagttatggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgccc 47487942  T
Q  323 aacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttg 422  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  47487941 agcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgagggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcattggcacttg 47487842  T
Q  423 aatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagttt 522  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47487841 aataccatcatctaaagcaagcttaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagttt 47487742  T
Q  523 gaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgtta 622  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47487741 gaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatttcaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgtta 47487642  T
Q  623 attggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaag 722  Q
    || |||| |||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  47487641 atcggcatgactccaatattcgataagcctcttgaatgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccgtcattcaag 47487542  T
Q  723 atcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    || ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||| ||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  47487541 atgctgatggaatattggagtcctgcttcttaacaagtttaaatttgccccattcacgggtaagacaattgttgtagttgaaaggt 47487456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 512; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 808
Target Start/End: Original strand, 45689114 - 45689905
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||| ||| |||   |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45689114 agacacaaggagggtggaatatgtttggtt--aacgtccaacgctcgacggggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 45689211  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |     
T  45689212 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatggatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccat 45689311  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45689312 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaattggataattcaaacttgccaaacggccatgactcaagc 45689411  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  45689412 atttcgcccaacgttcatgtttttccttcgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 45689511  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45689512 tggcacttgaatatcatcatctaaagcaaaccgaacaaaaatttatttttttcaaaggaaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttgttt 45689611  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45689612 agcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagtaggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctagatggggcaattca 45689711  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||| | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  45689712 aacttgttaatcggcaagactccaacattag-taagcatcttgaacgatgatattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatatca 45689810  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||||  |||||| || ||||||||||||   |||||||||| |||||| || ||||||  || ||||||||| |||||||||||||||    
T  45689811 tcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcctgctgcttagcaagttcgaatttgccccattcagaggcaagataattattgtagttggaaggt 45689905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 503; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 50068472 - 50067678
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||| ||||||||| || ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||    
T  50068472 agacgcaaggagggtggaatatgttcggtatgaaggtccaacactcgacgagtggagagtatcattcacttgggtggatttaaagaacgacaaaaatgtg 50068373  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||    
T  50068372 acgaacatgttttgggagcacatcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcgtcaacagcttgattccgccag 50068273  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50068272 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttagctctgaaatggggtaatgcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 50068173  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  50068172 atttcgcccatcgttcatgtttttcctttgaaaatattaaattcttgttatgctagttttgatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 50068073  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||         |||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  50068072 tggcacttgaataccatcatctaatgcaagcttaacaaaaatttattcttttcaaatgaaaaacatgaatgaggggcaaaatgcttgagtcctgttgttt 50067973  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50067972 ggcaagtttgaatttgccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattca 50067873  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||||||||| | |||| |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50067872 aacttgttaaccggcaggactccaacattcgataaacgtcttaaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 50067773  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
     | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| | ||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  50067772 gcgttcaagatgttgatcgaatgttggagtcctgctgcttagcaagtttgaattttccccatttaggggcaagacaattattgtagttggaaggt 50067678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 500; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Original strand, 29435966 - 29436804
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29435966 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 29436065  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  || ||    
T  29436066 acgagcatgttttgggagtacagcatgttccagtggatcgatacgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattaagccag 29436165  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||       ||||||||| || |||||  | |||||||||||    
T  29436166 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattttcttacctttgaatgaaataaattcaaacctgccaaacaac-atgactcaagc 29436264  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  29436265 atttcgctcggcattcatgtttttccattgaaaagattaaattcttgtcaggctggtttagatgaaggtattaagtgtctaggaatgaacctcatttcgt 29436364  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  29436365 tggcaattgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatgtcgagcgaaatgcttgagtcctgttattt 29436463  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29436464 ggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaaaacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 29436563  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29436564 aacttgttaatcggcaggactccaacattcgataagcgtcttgaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacca 29436663  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
     | ||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29436664 gcgttcaagatgttgatcgaatactggagtcctgctagttagcaagtttgaatttgccccattcagtgataagataactgttgtagttggaaggtacatt 29436763  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29436764 ctggaatgtgatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 29436804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 49263201 - 49262398
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  49263201 agacacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacaaaagacgaaaacgtg 49263102  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  49263101 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatctatatgctggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaacatcttgattcctctag 49263002  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    || ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  49263001 aatatcttcattagttatggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtgattcaaacttgccaaacggccatgactccagc 49262902  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  49262901 atttcgcccagcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttat---------gatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 49262811  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49262810 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttgttt 49262711  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49262710 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattcttgtagttggaatgcacgtttcaactacaacaattgtcttactctggatgaggcaattca 49262611  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  49262610 aacttgttaatcgacaggactccagcattcgataagcctcttgaatactggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataaca 49262511  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
    ||||||||||| ||| ||  || || ||||| ||   |||||||||||||||||| ||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49262510 tcattcaagatgctgttcagatgttagagtcatgatgtttagcaagtttgaatttgcctca-tccatagtaagacaattgttgtagttggaaggtacatt 49262412  T
Q  814 ccggaatgtaatgt 827  Q
      ||||||||||||    
T  49262411 atggaatgtaatgt 49262398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 479; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 836
Target Start/End: Complemental strand, 49599087 - 49598279
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||||    
T  49599087 agacgcaaggagggtggaatacgttcggtataaacgttcaacactcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggagttaaagaatgacgaaa-cgtg 49598989  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||                |  |||||||||| ||    
T  49598988 acaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaac----------------aacttgattccgccag 49598905  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  49598904 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctgaaatcgggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaagg 49598805  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  49598804 attttgcccatcgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttaaatgaaggtattaagtgttaaggaatgaacctcatttcgt 49598705  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        | || ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  49598704 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcctttcaaagaaaaaacataaacgcggggcgaaatgcttgagtcatgttgttt 49598605  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaa---ttgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaat 610  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49598604 ggccagtttgaatttacctcattcaaaggtaagacaacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatgaggcaat 49598505  T
Q  611 tcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaata 710  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49598504 tcaaactcgttaatcggcatgactccaacattcgataagcctcttgaatgatggtattcatgtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaata 49598405  T
Q  711 ccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtac 810  Q
    ||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| | || |||||||     
T  49598404 ccatcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagataattgttgcaattagaaggtaa 49598305  T
Q  811 attccggaatgtaatgtaatgcaatg 836  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  49598304 attccggaatgtaatgtaatgtaatg 49598279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 472; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 12791486 - 12790622
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12791486 agacacaagtagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 12791387  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12791386 acgagcatttttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgtttttgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 12791287  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| | || | |   |||    
T  12791286 aagatcgtcattagttaggataaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaac-gacaagtccttagc 12791188  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    | || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||      
T  12791187 a-ttcgcccgacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattctttttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaattaacctcatttca 12791089  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||        ||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12791088 ttggcacttaaataccatcatctaaagcaatcctaacaaaaaattattcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgggcgaaattcttgagtcctgttgtt 12790989  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaa 609  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||    
T  12790988 tggtaagtttgaatttaccccattcagaggtaacacaattgttggagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctaaatggggtaa 12790889  T
Q  610 ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaat 709  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12790888 ttcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcgataaccatcttgaataatggtattcaagtgtcaaggaatgcaactcattcttttgacacttgaat 12790789  T
Q  710 accatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggta 809  Q
    || ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12790788 acgatcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccatttagaggtaagataattgttgcagttggaaggta 12790689  T
Q  810 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12790688 cattccggaatgtaatgtaatg----------tgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 12790622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 463; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 43 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 46180465 - 46179700
Alignment:
Q  43 ataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcact-tgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgt 141  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46180465 ataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactctgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacagcatgt 46180366  T
Q  142 tccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgc 241  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46180365 tccagtggatcgatatgtgggtaacgttgttgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattctgccagaagatcgtcattagttagggtaaggtgc 46180266  T
Q  242 attccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctt 341  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  46180265 attccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaagcatttcgcccagcgttcatgtttttcctt 46180166  T
Q  342 tgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagca 441  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  46180165 tgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaagtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcaactaaagta 46180066  T
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||        |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  46180065 agcctaacaaaaattcattattttcaaaggaaaaacgtgaacgcggggcgaaatgcttgagtcatgttgtttggccagtttgaatttacctcattcaaag 46179966  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcat 641  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    |||    
T  46179965 gtaagacaattgttgtagttgaaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcgggaggact---acat 46179869  T
Q  642 tcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattgga 741  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||                    ||||||    
T  46179868 tcgataagcctcttgaatgttggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatc--------------------attgga 46179789  T
Q  742 gtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46179788 gtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaa-ataattgttgcagttggaaggtacattccgaaatgtaatgtaatg 46179700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 831
Target Start/End: Original strand, 49427400 - 49428194
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49427400 acgttcggtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggcggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 49427499  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  49427500 caacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattagttaggg 49427599  T
Q  234 taaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||   |   ||||||||| || |||||  | | ||||| ||||||| || |  | |||||||    
T  49427600 taaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaatgagataaattcaaacctgccaaacaac-aggactcgagcatttcgctcggcattcatgt 49427697  T
Q  334 ttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcat 433  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  49427698 ttttcgtttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccatcat 49427797  T
Q  434 ctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||        ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| || | |    
T  49427798 ctaaagcacgcctaacaaaaatttattattttcaaaggaaaaca-tgaatgccgggggaaatgcttgagtcctgttgtttgacaggtttgaatctatctc 49427896  T
Q  534 attcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggac 633  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  49427897 attcaaaggtaagacaattgttggagttgtaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggtaggac 49427996  T
Q  634 tccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcga 733  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  |||| ||    
T  49427997 tccaacattcgataagcgtcttgaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaagatgttgattga 49428096  T
Q  734 atattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  49428097 atattggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgctccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtaaatttcagaatgtaatgtaatg 49428194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 854
Target Start/End: Original strand, 19160330 - 19161150
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||    
T  19160330 acgtttggtataaacgtccaacgcttgacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgactatgttttgggaaca 19160429  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |    
T  19160430 cagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagattgtcattagttaggg 19160529  T
Q  234 taaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgt 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| ||       ||||||    
T  19160530 taaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcgagcatttcgcgagcacctcatgt 19160626  T
Q  334 ttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcat 433  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||   |||||||||||||| |||||    
T  19160627 ttctcctttgaaaatattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattctgtggcacttgaataccatcat 19160726  T
Q  434 ctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccc 532  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |        |||| |||  |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||    
T  19160727 ctaaagcaagcctcacaaaaatttattcttttcaacgggaaaacatgaagtgctcggcgaaatgcttgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttatcc 19160826  T
Q  533 cattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcagga 632  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19160827 cattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttaccctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcagga 19160926  T
Q  633 ctccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcg 732  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  19160927 ctccagcattcgatgagcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaagatgctgatcg 19161026  T
Q  733 aatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaa--tgtaat 830  Q
    |||| ||| |||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||| | ||||||||  ||||||    
T  19161027 aatactggggtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaatttcagaatgtaatgtgtaat 19161126  T
Q  831 gcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    |||||||||| ||||| |||||||    
T  19161127 gcaatgtaatgtgatagcatatat 19161150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 448; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 13635510 - 13634670
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13635510 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 13635411  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13635410 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 13635311  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| | ||   |  ||||| |||| || |||||  | | ||||| |||    
T  13635310 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaaccacaacaattgtctt-cctttgaatgagatcaatttaaacctgccaaacaac-aggactcgagc 13635213  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||    
T  13635212 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaggcgtgaaggaatgaacctcatttcgt 13635113  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| |||||||||||| ||| || |||    
T  13635112 tggcacttgaataccaacgtctaaagcacgcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatgccgggtgaaatgcttgagccctattgttt 13635014  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaatt-gttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
     ||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635013 tgcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaacacaatttgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 13634914  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13634913 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgataagcctcttgaacactggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 13634814  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| ||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||| | ||    
T  13634813 agcgttcaagatgctgatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttaaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggaaaat 13634714  T
Q  813 tccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | | |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13634713 ttcagaatctaatgtgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 13634670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 39224410 - 39223618
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  39224410 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtctaacgctcaacgaggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaatgacgaaaacgtg 39224311  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  |||||||||| ||    
T  39224310 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaatatatcatcaacaacttgattccgccag 39224211  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  39224210 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattctcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggactcaagc 39224111  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||    
T  39224110 atttcgctcggcattcatgtttttccgttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaagatattaagtgtcgaggaatgaacctcttttcgt 39224011  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  39224010 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgccgggtgaaatgcttgagtcatgttgttt 39223912  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    | || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39223911 gacaggtttgaattta-cccattcaaatgtaagacaattgttgtagttggaatgcacatttccattacaacaattgtcttactctggatggggcaattca 39223813  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||    
T  39223812 aacttgttaatcggcaggagtccaacattcgataagcatcttgaatgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaatacc 39223714  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||||||||||||  |||||| || |||||||| |||   ||||   |||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39223713 atcattcaagatgttgatcggatgttggagtcgtgctgcttagggtgtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 39223618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 883
Target Start/End: Complemental strand, 42571989 - 42571134
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42571989 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 42571890  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  42571889 aagagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 42571790  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  42571789 aagatcgtcattacttaaggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaagactcaaac 42571690  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  42571689 atttcgctcgacattcatgtttttcatttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 42571590  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| || ||||||| ||||||| | || |||    
T  42571589 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgccggacgaaatgtttgagtcatattgttt 42571491  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaat 610  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  | | |||    ||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||    
T  42571490 ggcaagtttgaatttacccaattcaaaggtaacacaattgttgtagttgagaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgagtggggtaat 42571391  T
Q  611 tcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaat 709  Q
    |||||||||||||  |||||||  |||||||||||| ||| | |||||  ||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42571390 tcaaacttgttaaacggcaggaaaccagcattcgatgagcattttgaatgatgatattcaagtgtcaaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaat 42571291  T
Q  710 accatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggta 809  Q
    ||||||||| || || || |||| ||  | ||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  42571290 accatcatttaaaatgctcatcgcatgctagagtcctgctatttagcaagtatgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttgaaaggta 42571191  T
Q  810 cattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgtttt 883  Q
                     ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  42571190 -----------------taatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatattgtttt 42571134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 48568617 - 48567802
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||    
T  48568617 agacacaaggagggtggaattagttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcattcacttgggtggagttaaagaatgatgaaaacgtg 48568518  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||| ||    
T  48568517 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgatttcgccag 48568418  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || ||||||||| |||| ||||| || ||||||    
T  48568417 aagattgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaattgggtaactcaaacttgccaaatggccaggattcaagc 48568318  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || || | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||    
T  48568317 atttcgctcagcattcatgtttttcctttgaaaagaataaatttttgtttggctgatttagctgaaggtattaagtgtcaa-gaatgaacctcgtttcgt 48568219  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||        ||||||| ||| ||||||||||| || |||| |||    
T  48568218 tggaacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattattttcaaag-gaaaacatgaatgccgggtgaaatgcttgattcatgttgttt 48568120  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
      ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  48568119 cacaagtttgaatttgcctcattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttgctctagatggggcaattca 48568020  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  48568019 aacttgttaatcggcatgactccaacattcaataagcatcttgaatgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacta 48567920  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
    |||||||||||  |||| | || |||||||| |     ||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48567919 tcattcaagatgttgattgtatgttggagtctttttgcttatcaattttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacatt 48567820  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  48567819 ccggaatataatgtaatg 48567802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 27486880 - 27486073
Alignment:
Q  37 ttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27486880 ttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttaattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 27486781  T
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaa 236  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  27486780 catgttccattggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgcctgaagatcgtcattagttagggtaa 27486681  T
Q  237 ggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttt 336  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||| || |||||   ||  |||||||||||  || |  | ||||||||||    
T  27486680 ggtgcattccaactacaacaattgtcttaccttttaatgagataaattcaaacctgccaaac-aacagaactcaagcattccgctcggcattcatgtttt 27486582  T
Q  337 tcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatcta 436  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  27486581 tcctttgaaaagattaaattcttgctaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcaattgaataccatcatcta 27486482  T
Q  437 aagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccatt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||    
T  27486481 aagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgtcgagcgaaatgcttgagttctgttgtttggcaggtttgaatttatctcatt 27486383  T
Q  537 caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactcc 636  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||               ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  27486382 caaaggtaagacaattgttggagttgga---------------gcaacaattgttttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggtaggactcc 27486298  T
Q  637 agcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaata 736  Q
    | |||| ||||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||    
T  27486297 aacatttgataagcatcttgaacgctgatattcaagtgtcaaagaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaagatgttgatcgaata 27486198  T
Q  737 ttggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaat-------gtaa 829  Q
     |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||    
T  27486197 ctggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatgtatttggtaa 27486098  T
Q  830 tgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  27486097 tgcaatgtaatgtgataacatatat 27486073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 416; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 710
Target Start/End: Original strand, 51269795 - 51270489
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51269795 agacacaaggagggtggaacaccttctgtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcagttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 51269894  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||    
T  51269895 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgggatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccag 51269994  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||| ||  ||||   || |||||||||    
T  51269995 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgctaaac-aacaggactcaagc 51270093  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  51270094 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattattgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 51270193  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| |||||| ||||||| |||| |||    
T  51270194 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgctgggtgaaatgtttgagtcttgttgttt 51270292  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51270293 ggcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatttcaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 51270392  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaata 710  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| ||   ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  51270393 aacttgttaatcggcaggactccaacattcgataagcgtcttcaatgttggtattcaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttgacacttgaata 51270489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 41875097 - 41874288
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||  ||||||||| ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||    
T  41875097 agacacaaggagggtggaattagttcggtatcaacgtccaatgctcgaagaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaataacgacgaaaatgtg 41874998  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |  |  |||||||||| ||    
T  41874997 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaatgttgctgagatcaactaaagatatcattagcaacttgattccgccag 41874898  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41874897 aagatcgttattagttagggtaaggtgcattcaaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggactcaagc 41874798  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  41874797 attttgctcagcattcgtgtttttcctttgaaaagaataaatt-ttgttaggatgatttagacgaaggtattaagtgtcaaggaatggacctcatttcgt 41874699  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        ||||||| | | |||||||||||||| |||| |||    
T  41874698 tggcacttgaataccatcgtctaaagcaagcctaacaaagatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgccgagtgaaatgcttgagtcatgttgttt 41874600  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
     |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||    ||||||||||||    
T  41874599 agcaagtttgaatttgctccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatttcaactacaacaattgtcttgctc----tggggcaattca 41874504  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||     
T  41874503 aacttgttaatcggcatgactccaacattcgataagcatcttgaatgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacactt--ataccc 41874406  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
    |||||||||||  |||||| || |||||||||||    ||| ||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  41874405 tcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcctgttgcttaacaagtttgaatttgccccattgagtggtaagataattgttgcagctggaaggtacatt 41874306  T
Q  814 ccggaatgtaatgtaatg 831  Q
     |||||||||||||||||    
T  41874305 tcggaatgtaatgtaatg 41874288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 644
Target Start/End: Original strand, 3658474 - 3659095
Alignment:
Q  22 agagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcat 121  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  3658474 agagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacaaaaacgtgacgaacgt 3658573  T
Q  122 gttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgt 221  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3658574 gttttgggagcacaacatgttctagtggatcgatatgcaagtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgt 3658673  T
Q  222 cattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcc 321  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| | |   ||||| || || |||    
T  3658674 cattaggtagggtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacgacaagtcctcaa-ca-ttcgcc 3658771  T
Q  322 caacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcact 420  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3658772 cgacattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggatggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcact 3658871  T
Q  421 tgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagt 520  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3658872 tgaataccatcatctaaggcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgggcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaagt 3658971  T
Q  521 ttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgt 620  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3658972 ttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgtaatgtacattccaagtacaacaattgtcttactctggatgggacaattcaaacttgt 3659071  T
Q  621 taattggcaggactccagcattcg 644  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  3659072 taatcggcaggactccaacattcg 3659095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 806
Target Start/End: Complemental strand, 30310039 - 30309269
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30310039 agacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacggggggagggtatcattcacttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtg 30309940  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||||||||      |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| ||    
T  30309939 acgagcatgttttgggagcacaggacgtttcagtggatcgatatgcgggtgacg------agatcaactgaatatatcatcaacagcttgattccgccag 30309846  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  30309845 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattatcttacctccgaaatggggtaattcaaacttgccaaatggccaggactcaagc 30309746  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    ||||  | |  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||    
T  30309745 atttcactcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattattgttagactggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaaccttatttcgt 30309646  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||  ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  30309645 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaataatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgatgggtgaaatgcttgagtcatgttgttt 30309547  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattca 613  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||               ||||||||||    
T  30309546 ggcaggtttgaatttaccccattcacaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatttcaagtacagcaatt---------------gggcaattca 30309462  T
Q  614 aacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacca 713  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  30309461 aacttgttaatcggcaggagtccaacattcgataagcatcttgaatgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcgttcttttgacacttgaatacca 30309362  T
Q  714 tcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    |||||||||||  |||||| || |||||||| |||   ||| ||||||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  30309361 tcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcatgctgcttaacaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaag 30309269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 612
Target Start/End: Complemental strand, 27035531 - 27034933
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  27035531 agacacaaggagggtggaatacgtccggtataaacgtccaacgctcgacgagggaagggtatcattcacttgggtggagttaaagaatgacgaaaacgtg 27035432  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| | ||    
T  27035431 acgagtatgttttgggagaacaccatattccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaacttaagatatcatcaacaacttgattccaccag 27035332  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||| |    
T  27035331 aagatcgtcattagttaggataaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacagccaggactcaaac 27035232  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  27035231 atttcgctcgacattcatgtttttcctttgaacaaattaaattctttttaggctggtttaaataaaggtattaagtgtcaaggaatggacctcatttcgt 27035132  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||    
T  27035131 tggcacttgaatactatcatctaatgcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgccgggtgaaatgcttgagtcatgttgttt 27035033  T
Q  514 ggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27035032 ggcaagtttgaatttaccccatttcaaaggtaagacaattattgtagttggaatgcacattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattc 27034933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 335; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Original strand, 13972917 - 13973791
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13972917 agacgcaaggagggtggaatacgttcagtataaacgtccaacactcgactaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 13973016  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  13973017 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtgacattgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccat 13973116  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  | | |  ||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||| |||||||| | | |||     
T  13973117 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgccaaacggc-aggtctcc 13973213  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
    |  |||  | || || |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  13973214 aatattc-gaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcatt 13973312  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
     | ||| || |||||||| ||||| |||  | || ||||||| |||||| |||||| || |         |||||  || |||| |  | ||||| || |    
T  13973313 cttttgacatttgaataccatcatttaatcccagactaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcgaa-tattggagtcatgct 13973411  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc---aactgcaacaattgtcttactctggatgggg 606  Q
      |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  ||   |||| ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13973412 gcttggcaagtttgaatttactacattcaaaggtaaaacaattgttgtagttggaaggtacaaacctctaactacaacaattgtcttcctctgaatgggg 13973511  T
Q  607 caattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
     ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  13973512 taattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcatttgatgagcctcttgaatgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttg 13973611  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||| |||   ||| ||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  13973612 aataccatcattcaagatgctgattggatgttggagtcttgctgcttaacaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaag 13973711  T
Q  807 gtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13973712 gtatattccagaatgtaatataatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 13973791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 145 - 700
Target Start/End: Complemental strand, 29707623 - 29707066
Alignment:
Q  145 aatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcatt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  29707623 aatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcataagttagggcaaggtgcatt 29707524  T
Q  245 ccaactacaacaatcgtctt---acctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctt 341  Q
     ||||| ||||||| |||||   |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| || |  | |||||||||||||||    
T  29707523 acaactgcaacaattgtcttcttacctctgaaatggggtaattcaaacttgccaaacggtcaggactcaagcatttcgctcggcattcatgtttttcctt 29707424  T
Q  342 tgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagca 441  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  29707423 tgaaaagattaaattcttgttagactggtttagatgaatgtattaagtgtcaaggaatgaacttcattccgttggcaattaaataccatcatctaaagca 29707324  T
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||  ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29707323 agcctaacaaaaatttattcttttcaaa-cgaaaacatgaatggcgggtgaaatgcttgagtcatgttgtttagcaagtttgaattgaccccattcaaag 29707225  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcat 641  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  29707224 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactccaacaattatcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggacttcaacat 29707125  T
Q  642 tcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttga 700  Q
    || |||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  29707124 tcaataagcgtcttgaacgttggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttga 29707066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 14173971 - 14173097
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14173971 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 14173872  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14173871 acgagcatgttttgggaggacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 14173772  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaag-gtgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  ||| |  ||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||     
T  14173771 aagatcgtcattaggtacggtatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-caggactct 14173675  T
Q  311 agcat-tttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcat 408  Q
    |  || ||   ||  | ||    || ||| | | |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  14173674 a--atgttcaaccggcatttccattgttcatgtcaaaagattaaattcttgttaggtcggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 14173577  T
Q  409 tttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaa-atgcttgagtcctg 507  Q
    | | ||| |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || |||| ||  | ||||||||    
T  14173576 tcttttgacacttgaataccgtcatttaaaccaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgccggtcgaacat--tggagtcctg 14173479  T
Q  508 ttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatgg 604  Q
     |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||||||||| ||||  |||     
T  14173478 ctgcttggcaagtttgaatttactgcattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctaaatgc 14173379  T
Q  605 ggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacact 704  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||  | |||||  ||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||     
T  14173378 ggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcgatgagaattttgaattatgatattcatgtgtcaaggaatgcatctcattcttttgacaca 14173279  T
Q  705 tgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    |||||| ||||||| || || || |||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  14173278 tgaatatcatcatttaaaatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagatgattgttgcagttgga 14173179  T
Q  805 aggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14173178 agttacattctggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcatgatacatgttgttttgaa 14173097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 17686574 - 17685698
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17686574 agacacaaggagggtagaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaatgacgaaaacgtg 17686475  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17686474 aagagcatgttttgggagcacaacatcttccagtggatcgatatgcgggtgacgtagctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 17686375  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  | | |  ||||  ||||| |||||||||| || || |||||  | | ||| |||||||||||| |||||||| | |||||     
T  17686374 aagatcgtcattaggtatcgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtgtt-cctctgga-tagggtaattcaaacttgccaaacggc-aggactcc 17686278  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggt---ttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctc 406  Q
    |||||   | ||  | |||  ||| ||||||| |||||| ||||||| ||||| ||  ||   ||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||    
T  17686277 agcatac-gtccggcattcccgttgttccttttaaaagaataaattcatgttaggcgtgtaatttagatgaaggtattgaagtttcaaggaatgcacctc 17686179  T
Q  407 attttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct 506  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||  ||| |||||||| |||||| |||||| || |         |||| | || || |  ||| |||||||    
T  17686178 atttttttgacacttgaataccatcatttaatccaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaacaacgggaataccggacgtac-gctggagtcct 17686080  T
Q  507 gttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa--tgcacat-tccaactgcaacaattgtcttactctggatg 603  Q
    | |  |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||| || || |||    
T  17686079 gatgcttggcaagtttgaatttacctcattcagaggtaacacaattgttgtagttggaaggtgcaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatg 17685980  T
Q  604 gggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacac 703  Q
     |  |||||||| |||||||  || |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17685979 agt-aattcaaatttgttaaacggaaggactccagtattcgatgagcctcttgaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacac 17685881  T
Q  704 ttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgg 803  Q
    |||| |||||||||| || || || |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||||||  | ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17685880 ttgattaccatcatttaaaatgctcatcgaacattggagttctgctgtttagcaagtttgaatttatcccattcagaggtaagataattgttgtagttgg 17685781  T
Q  804 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||    
T  17685780 aaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtgatgtgataacatatatagttgaatatgtacaaaacatattgttttgaa 17685698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Original strand, 36909554 - 36910417
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36909554 agacataaggagggtggaatacgttcggtgtaaacgtccaacgctcgacgagggaagagcatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 36909653  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36909654 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 36909753  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaag-gtgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgact-c 309  Q
    |||||||||||||| || || | |  ||||  ||||| |||||||| | ||||| ||| |  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || | |    
T  36909754 aagatcgtcattaggtacagaatgaatgcaccttccagctacaacagttgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-caggattcc 36909850  T
Q  310 aagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcat 408  Q
    |||   || | || || |||   || ||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  36909851 aag--gttcgaccgacattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttattaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcat 36909948  T
Q  409 tttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaa-atgcttgagtcctg 507  Q
    | | ||| |||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| || |         |||||  |  |||| ||  | ||||||||    
T  36909949 tcttttgacacttgaatactgtcatttaaatcaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatg-gaatgtcgatcgaacat--tggagtcctg 36910045  T
Q  508 ttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatgg 604  Q
     |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  36910046 ctgcttggcaattttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactgcaacaatcgtcttcctctgaatgg 36910145  T
Q  605 ggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacact 704  Q
    || ||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  36910146 ggtaattcaaacttgttaaacggtaggaatccagcattcgatgagcattttgaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacact 36910245  T
Q  705 tgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    |||||||||||||| || ||    |||| || |||||||||||   |||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  36910246 tgaataccatcatttaaaatgtcaatcgcatgttggagtcctgttgtttagcaagtttcaatttactccattcaggggtaagataattgttgcagtttga 36910345  T
Q  805 aggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36910346 aggtacattcaagaatgtaatgtaatg----------tgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 36910417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 194 - 831
Target Start/End: Original strand, 22527680 - 22528315
Alignment:
Q  194 caaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgt 293  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||    
T  22527680 caaaagtttgatttcgccagaagatcatcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgt 22527777  T
Q  294 caaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtca 393  Q
    |||||  | | ||||| ||||||| ||       |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22527778 caaacaac-aggactcgagcatttcgcaagcacatcatgtttctcctttgaaaatataaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtca 22527876  T
Q  394 aggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcga 492  Q
    |||| |||| |||| || | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        |||| ||   |||||    
T  22527877 aggattgaacctcaattcggtggcacttgaataccatcaactaaagcaagactaacaaaaatttattcttttcaaagggaaaacatgaagtgtttggcga 22527976  T
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtct 592  Q
    ||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22527977 aattcttgagtcttgttgttttgcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtct 22528076  T
Q  593 tactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcat 692  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22528077 tactctagatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagcatttgatgagcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcat 22528176  T
Q  693 tctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataatt 792  Q
    |||  ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||| || ||||   ||| ||||||||||||| || ||||||  |||||||| |||    
T  22528177 tcttgtgacacttgaataccagtgttcaagatgctgatcgaatactggtgttctgctgcttaacaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgatt 22528276  T
Q  793 gttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  22528277 gttgcagttggaaagtaaatttcggaatgtaatgtaatg 22528315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 14 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 24270576 - 24269760
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24270576 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgatgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 24270477  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24270476 acgagcatgttttaggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 24270377  T
Q  214 aagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||| ||| ||| ||  || | || |  | ||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||  | || | |  |    
T  24270376 aagatcatcaataggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctct-gaatggggtaattcaaacttgccaaatag-cacgtccaa 24270280  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
     |   |||| ||  | |||   || ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||    
T  24270279 tg---tttgaccggcattcccattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaaatgtcaatgaatgaacctcatt 24270183  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
     | ||| |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || ||  ||  | |||||||| |    
T  24270182 cttttgacacttgaatacagtcatttaaaccaaacctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgccggtcg-tatattggagtcctgct 24270084  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatgggg 606  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||    || ||||||||||||||||||  | || ||| ||    
T  24270083 gcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattggtgtagttggaaggtacaaacgtcaaactgcaacaattgtcttcttttgaatgagg 24269984  T
Q  607 caattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
     ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  24269983 taattcaaacttgttaaacggcaggaatccaacattcgatgagcattttgaattatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttg 24269884  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    |||||||||||| || ||  | |||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24269883 aataccatcatttaaaatgttcatcgcat-ctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgcccaattcaaaggtaagataattgttgaagttggaag 24269785  T
Q  807 gtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24269784 gtacattccggaatgtaatgtaatg 24269760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 14 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 44337532 - 44336973
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44337532 agacacaaggatggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattcacaaacgacgaaaacgtg 44337433  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||    
T  44337432 acgagcatgttttgggtgcacaacatgtttcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacaatatgattccgccag 44337333  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||| || |||||   || |||||||||    
T  44337332 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcatttcaaatgcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaac-aacaggactcaagc 44337234  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || | || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  44337233 atttcgctcgacattcatgtttttcctttgaaaatactaaattcttgttaggttggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcat 44337134  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||    
T  44337133 tggcaattgaataccattatctaaagcacacctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgccgggcgaaatgcgtgactcatgttgttt 44337035  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44337034 ggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcagttggaatgcacattcc 44336973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 327 - 831
Target Start/End: Original strand, 48226843 - 48227346
Alignment:
Q  327 ttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaata 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  48226843 ttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctagtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttgaata 48226942  T
Q  427 ctatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaat 526  Q
    | ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||| |||||| | |||||||||| |||| || ||||||||    
T  48226943 ccatcatttaaagcacgtctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatgccgggtgaaatgttggagtcctgttgtttgacaggtttgaat 48227041  T
Q  527 ttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattg 626  Q
     || | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48227042 ctatctcattcaaaggtaagacaattgttggagtttgaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactatggatggggcaattcaaacttgttaatcg 48227141  T
Q  627 gcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcc 726  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||      
T  48227142 gcaggacttcagtattcgataagcgtcttgaacgctggtattcaagtgtcaagaaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagtgttccagatga 48227241  T
Q  727 tgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatg 826  Q
    |||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||    
T  48227242 tgatcgaatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtaaattttggaatgtaatg 48227341  T
Q  827 taatg 831  Q
    |||||    
T  48227342 taatg 48227346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 5 - 886
Target Start/End: Original strand, 35184954 - 35185840
Alignment:
Q  5 cagcaccacagacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgac 104  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  35184954 cagccccaaagacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcactttgatggaattaacgaacgac 35185053  T
Q  105 gaaaacgtgacgagcatgtttt-gggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttg 203  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35185054 gaaaacgtgacgaacatgttttggggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgaaatcaattgaagatatcatcaaaagtttg 35185153  T
Q  204 attccgcgagaagatcgtcattagttagagtaagg--tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacg 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | | | || |  ||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| |  |||| || |||||||||||||||||||    
T  35185154 attccgccagaagatcgtcattaggt-gcggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cct-ttgaatgaggtaattcaaacttgtcaaacg 35185250  T
Q  300 gccatgactcaagcat-tttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaagga 397  Q
    | |||||||| |  || || | ||||  |||   || ||| | | |||| ||||  |||||||||||  |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||    
T  35185251 g-catgactcca--atgttcgaccaagattccgattgttcttgtcaaaatattatgttcttgttatggcggtttaaatgaaagtattgaagtgtcaatga 35185347  T
Q  398 atgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgc 497  Q
    ||| | |||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||| || |         |||||  || || || |     
T  35185348 atggatctcattcttttgacacttgaataccatcatttaaaccaaacctaacaataatttaatcttttgaatggaactatgggaatgttggtcg-aacgt 35185446  T
Q  498 ttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---------------ttccaactgca 582  Q
    | ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||                || |||||||    
T  35185447 tggagtcttgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtgacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtcggtataaacgtcaaactgca 35185546  T
Q  583 acaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaa 682  Q
    ||||||||||| || |  ||| || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||    
T  35185547 acaattgtcttcctttaaatgtggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcgatgagcatcttgaataatggtatccaagtgtcaaggaa 35185646  T
Q  683 tgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaaggg 782  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  35185647 tgcacctcattcttttgacacttgaatatcatcattcaagatgctcatcgcaaaatggagtcctactgtttagcaagtttgaatttgtcccattcaaggg 35185746  T
Q  783 taagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttt 882  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  35185747 taagataattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg----------tgacaacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttt 35185836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 14 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 29762434 - 29761924
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29762434 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 29762335  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||    
T  29762334 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatacgggtgacgttgatgagatcaactgaaaatatcatcaacaacttgattccgccag 29762235  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||| || |||||   || |||||||||    
T  29762234 aagatcatcattagttagggtaaggtgcattccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaac-aacaggactcaagc 29762136  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |    
T  29762135 atttcgctcggaattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctca-ttcat 29762037  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||        ||||||  | ||||||||||||||||||||| |||    
T  29762036 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatgtattattttcaaag-gaaaatatgaatgtcgagcgaaatgcttgagtcctgttgttt 29761938  T
Q  514 ggcaagtttgaatt 527  Q
    |||| | |||||||    
T  29761937 ggcaggcttgaatt 29761924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 14 - 385
Target Start/End: Original strand, 35576332 - 35576704
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35576332 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgaggggagaatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 35576431  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35576432 acgagcatgttttgggagcacagcatgttccggtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 35576531  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35576532 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatgaggtaattcaaacttgccaaacggccatgactcaagc 35576631  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    |||| ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  35576632 atttcgcctagcgttcatgttttccctttgaaaatattaaattcttgttaggcttgctttagatgatggtatt 35576704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 565
Target Start/End: Original strand, 18170018 - 18170569
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18170018 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtg 18170117  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  18170118 acgagcatgttttgggagcacatcatgttccagtagatcgatatgcgggtgacattgctgagctcaactgaagatatcatcaaaggtttgattccgccag 18170217  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaag-gtgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  | | |  ||||  ||||||||| |||  | || || |||||   ||| || |||||||||||| |||||| | |   |||     
T  18170218 aagatcgtcattaggtaccgaatgcatgcaccttccaactaaaacttttgtgtt-cctct-ggatgaggtaattcaaacttgccaaacgacaagtcctc- 18170314  T
Q  311 agcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
     ||| || ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||    
T  18170315 cgca-ttcgcccaacattcatgttttttctttgaaaggattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcatgaaatgaacctcatt 18170413  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt 509  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||| || |||||||||| ||||||| ||||    
T  18170414 tcgttggcacttgaataccatcatctaaagcaagcataacaaaaatttattcttttcaaaggaaaagcaagaacgccgggcgaaatgtttgagtcttgtt 18170513  T
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18170514 gtttggccagtttgaatttaccccattcagaggtaacacaattgttgtagttggaa 18170569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 344 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 35526081 - 35525536
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||| || |||||||||||  | |||||| | ||| |||||||||||  |||| |||| |||    
T  35526081 aaaagattaaattcttgttagtccggtttaaatgaaggtattgaattgtcaaggaatagacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaaccaa 35525982  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
     |||||||| |||||| |||||| || |         |||||  || | |||   | |||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35525981 acctaacaagaatttaatcttttgaatggaactatgggaatgtcggtc-aaacattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttatcccattcaaagg 35525883  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagc 639  Q
    ||| ||||||||||||||||||| | |||    |||||| |||||| ||||||| || || ||||||  |||||||||||||||  ||||||| | ||||    
T  35525882 taacacaattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaacggcaacagttgtcttcctttgaatggggtgattcaaacttgttaaacggcaggaattcagc 35525783  T
Q  640 attcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattg 739  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||  ||    
T  35525782 attcgatgagcatcttgaataatggtatccaagtgtcaatgaatgcacctcattcttttgacacttgaatatcatcattcaagatgctcatcgcatgctg 35525683  T
Q  740 gagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaa 839  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35525682 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagataattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaaagcaatgtaa 35525583  T
Q  840 tttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  35525582 tgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttattttgaa 35525536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 418
Target Start/End: Original strand, 44597694 - 44598097
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44597694 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 44597793  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |    
T  44597794 atgagtatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgtgggtgacgttgatgagatcaactgaagatatcatcaacaacttgattccgccgg 44597893  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||   |   ||||||||| || |||||   || ||||   ||    
T  44597894 aagatcgtcattagttagggtaaagtgcattccaacttcaacaattgtcttacctttgaatgagataaattcaaacctgccaaac-aacaggacttttgc 44597992  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  44597993 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 44598092  T
Q  414 tggca 418  Q
    |||||    
T  44598093 tggca 44598097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 512 - 886
Target Start/End: Original strand, 23343130 - 23343507
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||||||||| || || || |||||| |    
T  23343130 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgttttcctttgaatggggta 23343229  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    |||||||||||||||  | ||||| |||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  23343230 attcaaacttgttaaacgacaggaatccaacattcgatgagcatcttgaataatggtatccaagtgtcaaggaatgcagctcagtcttttgacacttgaa 23343329  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||||||||||||||||  | |||| ||  |||||||||||  |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23343330 taccatcattcaagatgttcatcgcatgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgctccattcaagggtaagataattgttgcaattggaaggt 23343429  T
Q  809 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  23343430 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 23343507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 39857119 - 39856842
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| || | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39857119 agacacaagaagggtggaacatgttcggtataaacgtccaatgctcgacgaggggagagtatcatccacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 39857020  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  39857019 acgatcatgttttgggagcacgacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattctgccag 39856920  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgt 293  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||||||    
T  39856919 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctta-ctct-ggatggggcaattcaaacttgt 39856842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 21484856 - 21484606
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21484856 agacacaaggagggtgaaacttgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 21484757  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  21484756 acgagcatgtttttggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgagtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcaccag 21484657  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtctt 264  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21484656 aagatcgtcattaggtagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt 21484606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 512 - 886
Target Start/End: Original strand, 49397134 - 49397511
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||    ||||||||||||||||||||| || || |||||| |    
T  49397134 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttggagttggaagatacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctttgaatggggta 49397233  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    |||||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  49397234 attcaaacttgttaaacggtaggaatccagcattcgatgagcattttgaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcgttcttttgatacttgaa 49397333  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||| || || || |||| ||  |||||||||||  |||  ||||||||||||| || ||||||  | |||||||||||||| |||||||||||    
T  49397334 taccatcatttaaaatgctcatcgcatgctggagtcctgctgtttgacaagtttgaatttaccccattcagagataagataattgttgcagttggaaggt 49397433  T
Q  809 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  49397434 acattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatacatagttgaatatgaatagtacatgttgttttgaa 49397511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 175; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 489 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 29761903 - 29761520
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgt-------------tgt---agttggaatgcacat 572  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||             |||   |||||||||||||||    
T  29761903 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggcttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgtggcagttggaatttgtggcagttggaatgcacat 29761804  T
Q  573 tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaag 672  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||| |||| |||  |||||||||||    
T  29761803 tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcgggactccaacatatgataagcgtcttcaacgctggtattcaag 29761704  T
Q  673 tgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcct 772  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| ||     
T  29761703 tgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttgaagacgctgatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaatttgcca 29761604  T
Q  773 cattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgta--atgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
     |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  29761603 aattcagtggtaagatgattgttgtagttggaaggtacatttcagaatgtaatatgtaatgcaatataatgtgataacatatat 29761520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 51 - 598
Target Start/End: Original strand, 37778109 - 37778658
Alignment:
Q  51 ccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatgga 150  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  37778109 ccaacgcttgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaaaggacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagaacaacatgttccagttga 37778208  T
Q  151 tcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattcca 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || | || |  | ||||     
T  37778209 tcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccg 37778308  T
Q  248 actacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaa 347  Q
     ||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||||||| ||||||| || || || |  | || | || || ||| | || |||| || ||||    
T  37778309 cctacaacaattttctt-cctct-gaatggggtaattcaaacttgccaaacgg-caggattccaata-ttcgaccgacattcctattgttccattcaaaa 37778404  T
Q  348 gattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcct 446  Q
    |||||| ||| ||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  37778405 gattaagttcatgttaggatggtttagattaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttgacacttgaataccatcatttaaaccaagcct 37778504  T
Q  447 aacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaag 546  Q
    ||||| |||||| |||||| || |         |||||  || ||  ||  | |||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  37778505 aacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgtcggtcg-tatattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccacattcagaggtaac 37778603  T
Q  547 acaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactct 598  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  37778604 acaattgttgtagttggaaggtacaaacttccaactgcaacaattgtcttcctct 37778658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35587142 - 35586928
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35587142 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 35587043  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35587042 acgaacatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaccttgctgagatcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 35586943  T
Q  214 aagatcgtcattagt 228  Q
    |||||||||||||||    
T  35586942 aagatcgtcattagt 35586928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 170; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 14 - 402
Target Start/End: Original strand, 17697039 - 17697424
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  17697039 agacataaggagggtggaacacgtttggtataaacgtccaatgctcgacaagggtagggtatcattcacttgggtggagttaaagtacgacgaaaacgtg 17697138  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  17697139 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatattatcaagagtctgattccgccag 17697238  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||| ||||| || || || |  | |||||||||||||| | ||||| ||| | ||  |||| |||||||||||||||||| | || | ||  | |    
T  17697239 aagatcgtgattaggta-aggaatgcaccttccaactacaacagttgtctt-cctttaaatgggggtaattcaaacttgtcaaac-gacaagtcttcatc 17697335  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaa 402  Q
    | || || ||   ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17697336 a-ttcgctcatgattcatgttttttctttgaaaagattaaatttttgttaggctggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaa 17697424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 573 - 882
Target Start/End: Complemental strand, 35586571 - 35586266
Alignment:
Q  573 tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaag 672  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||    
T  35586571 tccaactgcaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcgatgagcatcttaaataatggtatccaag 35586472  T
Q  673 tgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcct 772  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || |||||||| ||   ||||||||||||||||||||      
T  35586471 tgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttaaataccatcattcaagatgctcatcgcatgttggagtcttgttgtttagcaagtttgaattttctc 35586372  T
Q  773 cattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataata 872  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35586371 cattcaagggtaagataattgttgcagttggaaggtacattc----atgtaatgtaatgcaatgcaatgtgataacatatatagttgaatatgcataata 35586276  T
Q  873 cattttgttt 882  Q
    ||| ||||||    
T  35586275 catgttgttt 35586266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 344 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 49926264 - 49925752
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  | |||||| | ||| || ||| ||||| |||| |||  | |    
T  49926264 aaaagattaaattattgttgtgctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatagacctcattcttttgacatttgtatactgtcatttaatccca 49926165  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || |          ||||  || |||| |  | |||||||| |  ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  49926164 gcctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattggaaatgtcggtcgaa-tattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttactc-attcaaagg 49926067  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaa--tgcacat-tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagc 639  Q
    ||| ||||||||||||||||| |  |||| |  || |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  49926066 taacacaattgttgtagttgggaggtgcaaacgtcaaactgcaacaattgtcttcctctaaatggggcaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagc 49925967  T
Q  640 attcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattg 739  Q
    || ||||  || |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||| || |||| || |||    
T  49925966 atgcgatgtgcatcttgaacaatggtattcaagtgtcaagaaatgcacctcattcttttgaaacttgaataccatcgttgcagatgctcatcggatgttg 49925867  T
Q  740 gagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaa 839  Q
    ||| |||||  |||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  49925866 gagccctgctgtttagcaaatttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacattccagaatgtaatgtaatgcaatgtaa 49925767  T
Q  840 tttgataacatatat 854  Q
    | |||||||||||||    
T  49925766 tgtgataacatatat 49925752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 6435765 - 6435978
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6435765 agacacaaggagggtggaaaacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 6435864  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6435865 acgagcaagttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgtgagtgacgttgttgagatcaagtgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 6435964  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  6435965 aagatcgtcattag 6435978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38046647 - 38046434
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38046647 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 38046548  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  38046547 acaagcatgttttgggagcacaacatgttccagtcgatcaatatgccggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccag 38046448  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  38046447 aagatcgtcattag 38046434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 25 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 49926582 - 49926380
Alignment:
Q  25 gggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgtt 124  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49926582 gggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtgtcattcacttgtgcggaattaacgaacgacgaaaacgtgaggagcatgtt 49926483  T
Q  125 ttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcat 224  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49926482 ttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcaggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcat 49926383  T
Q  225 tag 227  Q
    |||    
T  49926382 tag 49926380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 49396697 - 49396910
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  49396697 agacataaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgatttacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacaacgaaaacgtg 49396796  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  49396797 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcaacaaaagtttgattccgccag 49396896  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  49396897 aagatcgtcattag 49396910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 512 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 38044908 - 38044586
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggca 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |    
T  38044908 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaatggggta 38044809  T
Q  609 attcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaa 708  Q
    |||||||||||||||  |||| || | || ||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38044808 attcaaacttgttaaacggcaagaatacaacatgcgatgagcatcttgaacaatgctattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaa 38044709  T
Q  709 taccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||||||||| || |||  ||  | ||||||||   |||||||||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38044708 taccatcattcaagatgctcatcagatgctagagtcctgttgtttagcaagtttgaatttgcccaattcagtggtaagataattgttgtagttggaaggt 38044609  T
Q  809 acattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||| | ||| ||||||||||||    
T  38044608 acatactggagtgtaatgtaatg 38044586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 231
Target Start/End: Original strand, 48215188 - 48215408
Alignment:
Q  11 cacagacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaac 110  Q
    ||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48215188 cacagacacaaggatggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaac 48215287  T
Q  111 gtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
     |||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48215288 atgacgagcatatttttggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 48215387  T
Q  211 gagaagatcgtcattagttag 231  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  48215388 cagaagatagtcattagttag 48215408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 23342634 - 23342847
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23342634 agacacaaggaaggtgaaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggttgaattaacgaacgacgaaaacgtg 23342733  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||  |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23342734 acgagcatgtttttggagcacattatgttcgagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagataaactgaagatatcatcaaaagtttgattcctccag 23342833  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  23342834 aagatcgtcattag 23342847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 575
Target Start/End: Original strand, 13283698 - 13284254
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  13283698 agacacgaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcatttagttgggtgaaattaacgaacgatgaaaacatg 13283797  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||| ||    
T  13283798 acgagcatgttttgggagcgcagcatgttctagtggatcgatatgcaggtaacgttgctgagatcaactgaatatattatcaacagtctgattccgccag 13283897  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  | |||||||||||||||| ||||| ||| |  ||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||| |      
T  13283898 aagatcgtgattaggtagag-aatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgttaaatgg-caagactcgaat 13283993  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    | || | || || |||   || ||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||   | |||||| |     
T  13283994 a-ttcgtccgacattcccattgttcctttcaaacgattaaattcttgttagactggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaaatgacctcattctt 13284092  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    ||| || |||||||| ||||| |||| |||||| || || || | | |||||| || |         |||||| || ||  ||  ||||||  || | ||    
T  13284093 ttgacatttgaataccatcatttaaaccaagcccaaaaataactgaatcttttgaatggaacaatgagaatgccggacg-gatatttgagtgatgctgtt 13284191  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13284192 tagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagacaattgttgtagttggaaggtacattcc 13284254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 570 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 39856892 - 39856613
Alignment:
Q  570 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  39856892 cattccaactacaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattcgataagcgtcttgaacgctggtattc 39856793  T
Q  670 aagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatttt 769  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||     
T  39856792 aagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaagatgttgatcgaatactggagtcctgctggttagcaaatttgaatttg 39856693  T
Q  770 cctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    |  ||||||  || |||| |||||||| ||||| |||||||||||     |  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39856692 ctccattcagaggcaagacaattgttgcagttgaaaggtacattc-----tagaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatatat 39856613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 464
Target Start/End: Original strand, 17372720 - 17373167
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17372720 agacgcaaagagggtgaaatatgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatataatccacttaggtggaattagcgaacgacgaaaatgtg 17372819  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | || ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||    
T  17372820 aagaacatgttttgggagcacaccatattccagtggatcgatatacgtgtaacgttgatgagatcaactgaagatatcatcgaaagtttaatttcgccag 17372919  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||| ||  | || |  | |||||||||||||||| ||||| ||| |  |||| || ||||||||||||| |||||| || ||||||| |    
T  17372920 aagatcgtcattaggtatggaaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacgg-caggactcaaac 17373016  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    | || |||| || ||    || ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |     
T  17373017 a-ttcgcccgacatttcaattgttcctttcacaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaagaatgcacctcattctt 17373115  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttt 464  Q
    ||| ||||||||||  || || ||||  ||| ||||||| |||||| |||||    
T  17373116 ttgacacttgaatatcattatttaaacgaagtctaacaagaatttaatcttt 17373167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 563 - 831
Target Start/End: Original strand, 18170770 - 18171038
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| || || ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | |||| ||  ||    
T  18170770 gaatgcaccttccaacagcaacaattgtctttctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaatggaaggactccagcattcgatgaacatcttaaatgat 18170869  T
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagttt 762  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| || || || |||||||||||||||| |||  |||| |||||||    
T  18170870 ggtattcaagtgtcaaagaatgcacctcattcttttgacacttgaatatcgtcatttaaaatgctcatcgaatattggagtcttgcagtttaacaagttt 18170969  T
Q  763 gaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18170970 gaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaagatacattccggaatgtaatgtaatg 18171038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 18 - 465
Target Start/End: Original strand, 5765203 - 5765645
Alignment:
Q  18 acaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacga 117  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  5765203 acaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatggaagaatatcattcagttgggtggaattaacgaacgacaaaaacttgatga 5765302  T
Q  118 gcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaaga 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||||||| ||||||    
T  5765303 gcatgttttgggagcagaacatgttctagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaaatgaagatattatcaaccgtctgattccgccagaaga 5765402  T
Q  218 tcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattt 317  Q
    |||| ||||| ||| | || |  | |||||||||||||||| |||||| | || ||||  |  ||||||||||||| |||| ||||   |  || ||||     
T  5765403 tcgtgattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttatc-ctgaaat--gaaaattcaaacttgttaaac-gccagttcctaaacattc 5765497  T
Q  318 tgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttgg 416  Q
      ||    |||| | || |||| || |||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | |||     
T  5765498 acccggcagttc-tattgttccattcaaaagattaaatttcttttaggctgatttagatgaaggtattaaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttga 5765596  T
Q  417 cacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  5765597 cacttgaataccatcatttaaaccaagcctaacaagaatttaatctttt 5765645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35526390 - 35526189
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||  ||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  35526390 agacacagggagggtggaacgcgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggagagagtatcattcacctgggtggaattaacgaacgtcgaaaacgag 35526291  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35526290 acgaccatgttttgggagcacagaatgttgcagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgctag 35526191  T
Q  214 aa 215  Q
    ||    
T  35526190 aa 35526189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 24364003 - 24363475
Alignment:
Q  24 agggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgt 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  24364003 agggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagaatatcaatcacttgggtagaattaatgaacgacgaaaacgtgaagaacatgt 24363904  T
Q  124 tttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtca 223  Q
    |||||| |||||  |||||| | ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| |    
T  24363903 tttgggggcacagtatgttctagtggatcgatatgcggttaacgttgttgagagcaactgaagatattatcaagagtttgattccgttagaagatcgtga 24363804  T
Q  224 ttagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccca 323  Q
    |||| ||| | || |  | |||||||||||||||| ||||| ||| |  |||| || |||||||||||||          ||||||||  | || ||||     
T  24363803 ttaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatgaggtaattcaaacttgt----------tgactcaaata-ttcgcccg 24363718  T
Q  324 acgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttg 422  Q
    || |||   || ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| | |||||| ||||| ||| |     
T  24363717 acattcccattgttcctttcaaaagattaaattcttgtgaggctggtataaatgaaggtattgaagtgttaaggaatgcacctcattctgttgacacgtc 24363618  T
Q  423 aatactatcatct-aaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtt 521  Q
    ||||| ||||| | ||| |||||||||||| |||||| |||||| || |         |||||  || || |||  ||| |||||| | ||| |||||||    
T  24363617 aataccatcatttaaaaccaagcctaacaataatttaatcttttgaatgaaacaatgggaatgtcggacg-aatatttgtgtcctgctgtttagcaagtt 24363519  T
Q  522 tgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24363518 tgaatttaccccattcagagataagacaattgttgtagttggaa 24363475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Original strand, 18842432 - 18842638
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18842432 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgatgagggaagaatatcatttagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 18842531  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| |||| ||    
T  18842532 acgagcatgttttgggagcacggcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatattgtcaagagtctgatcccgccag 18842631  T
Q  214 aagatcg 220  Q
    |||||||    
T  18842632 aagatcg 18842638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 41780686 - 41780899
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41780686 agacacaagaagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgagaggataatatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 41780785  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||  || ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  41780786 acgaatatattttgggagcacagcatgttccagtagatagatatgcaggtgacgttgctaagatcaactgaatatatcatcaaaagtttgatttcgccag 41780885  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||| ||||||||||    
T  41780886 aagttcgtcattag 41780899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 601 - 831
Target Start/End: Original strand, 37778688 - 37778917
Alignment:
Q  601 atggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttga 700  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  37778688 atggggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcgatgagcctcttgaataatggtatccaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttga 37778787  T
Q  701 cacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagt 800  Q
    || |||||||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||||| ||    
T  37778788 cagttgaataccatcattcaagatgatcatcgcatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacct-atttagaggtaagataattgttgtggt 37778886  T
Q  801 tggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||| |||||   ||||||||||||||    
T  37778887 tggaaggtgcattcgaaaatgtaatgtaatg 37778917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16532303 - 16531856
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| |||| || |||||||||| ||||||||| |||||||| |  ||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16532303 agacacaaggaggatggaatacgttcgatataaacgtacaacgctcgatgaggagagaatatcattaagttgggtggaattaacgaacgacgaaaatgtg 16532204  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||| || |||||||| | |||| || ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||    
T  16532203 atgagcatattatgggagcagagcatgctctaatggattgatatgcgtgtaacgttgctgagatcaactgaagatattatcaatagtctgatttcgctag 16532104  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaa 311  Q
    |||||||| ||||| ||  | |   ||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||  || ||||||||||||| ||||  |||   | |||    
T  16532103 aagatcgtgattaggtatggaa---tgcatcttccaactacaacaattgtcttacc-ctgaaat--ggaaattcaaacttgttaaac-accagttcccaa 16532011  T
Q  312 gcattttgcccaac-gttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcatt 409  Q
     | |||  |||| | |||| | || |||| || |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  16532010 acttttcacccagcagttc-tattgttccattcaaaagattaaattcattttaggctagtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcatt 16531912  T
Q  410 ttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
     | ||| ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  16531911 cttttgacacttgaatatcatcatttaaaccaagcctaacaagaatttaatctttt 16531856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 344 - 658
Target Start/End: Original strand, 6436094 - 6436411
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||| ||||| |||    |    
T  6436094 aaaagattaaattcttattaggctggtttaaatgaagatattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttggcatttgaataccatcatttaatctca 6436193  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
    |||||||||||||||| |||| | || |         |||||| || |||| |  | |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6436194 gcctaacaaaaatttaatcttatgaatgaaacattgggaatgccggtcgaattt-tagagtcctcctacttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 6436292  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagc 639  Q
    ||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  6436293 taaaacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctctgaatgtggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagc 6436392  T
Q  640 attcgataagcctcttgaa 658  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  6436393 attcgatgagcctcttgaa 6436411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 740 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 15356301 - 15356156
Alignment:
Q  740 gagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaa 839  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  15356301 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattttggaatgtaatgtaatacaatgtaa 15356202  T
Q  840 tttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  15356201 -ttgataacatatatagttgaatatgcataatatattttcttttgaa 15356156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 703 - 886
Target Start/End: Original strand, 6436406 - 6436579
Alignment:
Q  703 cttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttg 802  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||| ||||   |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6436406 cttgaataccagcattcaagatgctgatcggatgttggagttctgctgcttaggaagtttgaattttccccattcaatggtaagataattgttgcagttg 6436505  T
Q  803 gaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6436506 gaaggtacattccggaatgtaacgtaatg----------tgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 6436579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 137 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 40533376 - 40532865
Alignment:
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagtta--gagt 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  || |    
T  40533376 catgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgccgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaattccgccagaagatcgtcattaggtaccgaat 40533277  T
Q  235 -aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcat-tttgcccaacgttcatg 332  Q
     || |  | ||||| |||||||||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |  || || | ||  | |||       
T  40533276 gaatgcaccttccagctacaacaattgt-tttcctct-aactggggtaattcaaacttgtcaaacgg-catgactcca--atgttcgaccggcattctca 40533182  T
Q  333 tttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatc 431  Q
    || ||||| | ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||||||  |     
T  40533181 ttgttcctgtcaaaagattaaattcttgataggccgatttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattcttttgacacttgaataccgtt 40533082  T
Q  432 atctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacc 531  Q
    || |||  ||| |||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || ||  ||  | ||||| || |  ||| ||||||||||||||||    
T  40533081 atttaatccaaacctaacaagaatttaatcttttgaacggaattatgagaatgccggtcg-tatattggagtcgtgctgcttgacaagtttgaatttacc 40532983  T
Q  532 ccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggc 628  Q
     |||||| |||||| || |||||||||||||||| | |||    ||||||| ||||||||||||| ||||  ||| || ||||||||||||||||  |||    
T  40532982 tcattcagaggtaacacgattgttgtagttggaaggtacaaacgtccaactacaacaattgtcttcctctaaatgaggtaattcaaacttgttaaacggc 40532883  T
Q  629 aggactccagcattcgat 646  Q
    |||| |||||||||||||    
T  40532882 aggaatccagcattcgat 40532865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 465
Target Start/End: Original strand, 16081295 - 16081727
Alignment:
Q  31 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 130  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||    
T  16081295 aatacgttcggtataaacgttcaacgctcgacgaggggaggatatcattcagttaggtggaattaacgaacgacgataacatgaggagcatgtttttgga 16081394  T
Q  131 gcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagtta 230  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||| || |||||||||  |||||||||  ||||  | || ||||| |||| ||  ||||||||| ||||| ||    
T  16081395 gcacaacatgttctagttgatcgatatgcgtgtaacgttgctgcaatcaactgagaatatactgaagagtttaattctgccggaagatcgtgattaggta 16081494  T
Q  231 gagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatgggg-caattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttc 329  Q
    | | || |  | ||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||  | ||   | ||| || ||  || |    ||    
T  16081495 g-ggaatgcaccttccagctacaacaattgtctta-ctctaaaatggggtaaatttaaacttgtcaaa-tgacagttcccaaaca-ttcacctagaagtc 16081590  T
Q  330 atgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatact 428  Q
     | || ||||||| |||| |||||||| || ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||||       
T  16081591 ctattgttcctttcaaaaaattaaattttttttaggttggtttagatgaaggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattcttttgacacttgaatgtc 16081690  T
Q  429 atcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16081691 atcatctaaatcaatcctaacaaaaatttaatctttt 16081727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 668 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 27034932 - 27034769
Alignment:
Q  668 tcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||   ||||  | ||||||||    
T  27034932 tcaagtgtcaaagaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcctgctgcttagtcattttgaatt 27034833  T
Q  768 ttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    | || |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27034832 tgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcccgaatgtaatgtaatg 27034769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 51270349 - 51270019
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||||||||||| |||||  | | ||||||| |||||  |||| | ||||||||||     
T  51270349 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgccaaacaacaa-gactcaaacatttcacccagcattcatgtttt- 51270252  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  |||||    
T  51270251 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatc 51270154  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca 534  Q
    |||| || ||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| | ||    
T  51270153 taaacca-gcctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctgttgtttagcaggtttgaatttatctca 51270055  T
Q  535 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51270054 ttcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 51270019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 662 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 46924839 - 46924693
Alignment:
Q  662 tggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtt 761  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| || |||||||| |||   ||||||||||    
T  46924839 tggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatatcatcattcaagatgttgatcgtatgttggagtcatgctgcttagcaagtt 46924740  T
Q  762 tgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  46924739 tgaatttgccacattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 46924693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Original strand, 47487694 - 47488026
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||||| |||||  | | ||||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  47487694 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-aggactcaagcatttcgccccgcattcatgttttt 47487792  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| | ||||| | ||| ||  ||| ||||| |||||  |||||    
T  47487793 cctttgaaaagaataaatttttgttaagcttgctttagatgatggtattcaagtgccaatgaaatgaggttca-ttccttgacactt-aataccctcatc 47487890  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttatttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| | ||| |||||| |||||| |||||||||||        |||| || |||||||||||||||||| | |   ||||||||||||||| |||||||    
T  47487891 taaa-ccagcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaa-ttacccc 47487988  T
Q  534 a-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47487989 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 47488026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 696 - 854
Target Start/End: Original strand, 51270505 - 51270665
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgtt 795  Q
    ||||||||||||||| || | || ||||  ||||||||||| | ||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  51270505 cttgacacttgaatatcagcgttgaagacgctgatcgaatactagagtcatgctggttagcaagtttgaatttgcctcattcagtggtaagatgattgtt 51270604  T
Q  796 gtagttggaaggtacattccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  51270605 gcagttggaaggtatattccggaatgtaatgtgcaatgcaatgtaatgtgataacatatat 51270665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 581 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 46924957 - 46924853
Alignment:
Q  581 caacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatg 680  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |    
T  46924957 caacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggagtccaacattcgataagcatcttgaatgctggtattcaagtgtcaagg 46924858  T
Q  681 aatgc 685  Q
    |||||    
T  46924857 aatgc 46924853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 67 - 152
Target Start/End: Original strand, 13148365 - 13148450
Alignment:
Q  67 ggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatc 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13148365 ggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgaagaacatgttttgagagcacaacatgttccagtggatc 13148450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 429 - 565
Target Start/End: Original strand, 17697427 - 17697563
Alignment:
Q  429 atcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaattt 528  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||        | ||||  |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  17697427 atcatctaaagcaagactaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacataaatgtcgggcgaaatgcttgagtcatgttgtttggcgagtttgaattt 17697526  T
Q  529 accccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    | ||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  17697527 atcccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaa 17697563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 336 - 563
Target Start/End: Original strand, 18842767 - 18842994
Alignment:
Q  336 ttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |  || ||||||||||| || |||    
T  18842767 ttcctttcaaaagattaaattcttgttaggctggtttagataaaggtattgaagtgtcaaagaatgcacctcattcttgtgacacttgaataccattatc 18842866  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca 534  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | |||| || |          ||||  ||| | ||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18842867 taaaccaagcctaacaagaatttaatattttgaatggaacaatagaaatgtcgggtg-aatgcttgagagatgttgtttagcaagtttgaatttacccca 18842965  T
Q  535 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 563  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18842966 ttcaggggtaagacaattgttgtagttgg 18842994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 305 - 570
Target Start/End: Original strand, 29761947 - 29762210
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaa 402  Q
    ||||||||||||| || | || ||||| |||| |||||||||| | || ||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||     
T  29761947 gactcaagcatttcgctcgacattcatatttt-cctttgaaaataatacatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaatgaatgag 29762045  T
Q  403 gctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgag 502  Q
    | |||||   ||| ||||| |||||  ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||        ||||| | | ||||||||||||||    
T  29762046 gttcattcc-ttgacactt-aataccttcatctaaacca-gcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaattccgagcgaaatgcttgag 29762142  T
Q  503 tcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29762143 tcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgaagttggaatgcac 29762210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 737 - 827
Target Start/End: Original strand, 41801722 - 41801812
Alignment:
Q  737 ttggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgt 827  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41801722 ttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttagaaggtacattccggaatgtaatgt 41801812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 751 - 831
Target Start/End: Original strand, 13284190 - 13284270
Alignment:
Q  751 tttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13284190 tttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagacaattgttgtagttggaaggtacattcctgaatgtaatgtaatg 13284270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 631 - 767
Target Start/End: Original strand, 39223682 - 39223818
Alignment:
Q  631 gactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgat 730  Q
    ||||||| ||| |||| | | |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  39223682 gactccaacatccgatcaacatcttgaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcattcaagatgcttat 39223781  T
Q  731 cgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||||    
T  39223782 cgaatgttggactcctgccgattaacaagtttgaatt 39223818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 574 - 718
Target Start/End: Original strand, 41781221 - 41781366
Alignment:
Q  574 ccaactgcaacaattgtcttac-tctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaag 672  Q
    |||||| |||||||||| |||| | || | |||| ||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||| ||| | |||||  ||||||||||||    
T  41781221 ccaactacaacaattgtgttacctttgaacggggtaattcaaacttgttaaacggcacgaatccaacattcgatgagcattttgaatgatggtattcaag 41781320  T
Q  673 tgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41781321 tgtcatggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 41781366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Original strand, 30309490 - 30309821
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  ||||||||| || |||||   ||||||||||||||||  |||| | |||||| ||||    
T  30309490 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctgtgaatggggtaaattcaaacctgccaaac-aacatgactcaagcatttcacccatcattcatg-tttt 30309587  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatct 435  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||||| ||||| ||| |||  ||| |   ||  ||| ||||| |||||  ||||||    
T  30309588 cctttgaaaagaataaattattgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaataaggttcattccttgacactt-aataccttcatct 30309686  T
Q  436 aaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcct-gttatttggcaagtttgaatttacccca 534  Q
    ||| | || ||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | | |||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||    
T  30309687 aaa-ccagtctaacaataatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagtgaaatgcttgagtcctggccatttggcaagtttgaa-ttacccca 30309784  T
Q  535 -ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
     |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30309785 tttcggaggtaagataattgttgtagttggaatgcac 30309821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 306 - 570
Target Start/End: Original strand, 27486416 - 27486679
Alignment:
Q  306 actcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaa 402  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| || || ||| ||| |||     
T  27486416 actcaagcatttcgctcgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaattgccaacgaaatgag 27486514  T
Q  403 gctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgag 502  Q
    | |||||   ||| ||||| |||||  ||||||||| || ||||| ||| |||||| |||||||||||        ||||||| | ||| ||||||||||    
T  27486515 gttcattcc-ttgacactt-aataccttcatctaaacca-gcctagcaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcggaatgcttgag 27486611  T
Q  503 tcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | ||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27486612 ttctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattaaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 27486679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 44598046 - 44597918
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  44598046 agcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcaaaagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaag 44597947  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44597946 gtaagacaattgttgaagttggaatgcac 44597918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 49427731 - 49427604
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||         ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  49427731 agcctaacaagaatttaatcttttcaaacgaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaag 49427632  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  49427631 g-aagacaattgttgtagttggaatgcac 49427604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 322 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 16097994 - 16097853
Alignment:
Q  322 caacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcact 420  Q
    |||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||    
T  16097994 caacattcatgttgttcttttcaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgaaagtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacact 16097895  T
Q  421 tgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
       |||| ||||| |||| |||||||||||| |||| | ||||||    
T  16097894 ---ataccatcatttaaaccaagcctaacaataattcaatctttt 16097853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 731 - 884
Target Start/End: Original strand, 17373193 - 17373336
Alignment:
Q  731 cgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaat 830  Q
    ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  17373193 cgaatgttggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacctcattcaggggttagacaattattgtagttggaaggtacattttcaaatgtaatgtaat 17373292  T
Q  831 gcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttg 884  Q
    |          ||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||    
T  17373293 g----------tgataacatatatagtagattatgcataatacatgttgttttg 17373336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 505 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 21484500 - 21484414
Alignment:
Q  505 ctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtc 591  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  21484500 ctgttgtttggcaattttgaatttgcctcatttaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaccttccaactacatcaattgtc 21484414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 19160613 - 19160534
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19160613 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 19160534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 22527803 - 22527724
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22527803 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 22527724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 44337227 - 44337308
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  44337227 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaaaggtaagacaattgttgcatttgaaatgcac 44337308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Original strand, 46179937 - 46180269
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||   ||  |||||||||| | |||||  | ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  46179937 gtgcatttcaactacaacaattgtcttacctttgaatgaggtaaattcaaactggccaaacaac-atgactcaagcatttcgccccgcgttcacgttttt 46180035  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||| | | |||| |||||| |||   ||||| ||| |||||| ||||| ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||| |||||    
T  46180036 cctttgaaaataatgaatttttgttaggcttactttagttgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aatactttcatc 46180133  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| || || |||||| |||||| |||||||||||        |||| || |||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||| |||||||    
T  46180134 taaacca-gcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaacgctgggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaa-ttacccc 46180231  T
Q  534 a-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46180232 atttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 46180269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 822 - 887
Target Start/End: Complemental strand, 49261110 - 49261045
Alignment:
Q  822 taatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaaa 887  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49261110 taatgtaatacaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaaa 49261045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 479 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 29436281 - 29436190
Alignment:
Q  479 tgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29436281 tgaatgccgagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttatttcattcaaaggtaagaaaattgttgcagttggaatgcac 29436190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 241 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 3659018 - 3658690
Alignment:
Q  241 cattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcct 340  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||||| |||||  | | ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  3659018 cattacaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-aggactcaagcatttcgcccgacattcatgtttttcct 3658920  T
Q  341 ttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaa-ggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaa 437  Q
    ||||||||| |||||| |||||| || ||  |||||||| |||||| ||||| ||| | ||||| | ||| ||  ||| ||||| |||||  ||||||||    
T  3658919 ttgaaaagaataaatttttgttaggcttgccttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttca-ttccttgacacttcaataccttcatctaa 3658821  T
Q  438 agcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttga-gtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca-t 535  Q
    | | | |||||||| |||||| |||||||||||        ||||||  ||||| |||| |||| | | |||  ||||||||||||||| |||||||| |    
T  3658820 a-ccatcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgggcg-aatg-ttgaggacttgtcgtttggcaagtttgaa-ttaccccatt 3658725  T
Q  536 tcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3658724 tcagaggtaagacgattgttgtagttggaatgcac 3658690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Original strand, 29707196 - 29707530
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||| |||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||  |||  | |||||| ||||    
T  29707196 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttgctaaac-aacatgactcaagcatttcacccgccattcatg-tttt 29707293  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggta-ttaagtgtcaa-ggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    | |||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| |||| |||| || ||| ||||||||| ||| ||  ||| ||||| |||||  |||||    
T  29707294 cgtttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatttaattgccaacggaatgaagttca-ttccttgacactt-aatacattcatc 29707391  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctg-ttatttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| | || ||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||    
T  29707392 taaa-ccagtctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctgaccgtttggcaagtttgaa-ttacccc 29707489  T
Q  534 a-ttcaaaggt---aagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||| ||||   ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29707490 atttcagaggtaagaagacaattgttgcagttgtaatgcac 29707530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 422 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 35576705 - 35576556
Alignment:
Q  422 gaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagt 520  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||        |||| ||  ||||||||||||||||| ||    ||||||||||    
T  35576705 gaataccatcatctaaagcaagcctaacaagaatttaatattttcaaagggaaaacatgaacgctaggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagt 35576606  T
Q  521 ttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35576605 ttgaatt-acctcatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 35576556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 363
Target Start/End: Original strand, 50067916 - 50068040
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaa-ttcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttt 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||||| |||||||||| |||||  | | ||||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  50067916 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaa-tggggcaaattcaaacttgccaaacaac-aggactcaagcattttgcccctcattcatgtttt 50068013  T
Q  337 tcctttgaaaagattaaattcttgtta 363  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||    
T  50068014 tcatttgaaaagaataaatttttgtta 50068040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Original strand, 39223856 - 39224186
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||  ||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||  |||  | ||||||||||     
T  39223856 gtgcattccaactacaacaattgtcttacatttgaa-tgggtaaattcaaacctgtcaaacaac-atgactcaagcatttcacccggcattcatgtttt- 39223952  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaat-gaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| |||  || | |||||   | | ||||| ||||   |||||    
T  39223953 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaaagaggttcattcc-tcgacactt-aatatcttcatc 39224050  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| || ||||||||| |||||| ||||||||| |        ||||||| | |||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||    
T  39224051 taaacca-gcctaacaagaatttaatcttttcaacggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaa-ttacccc 39224148  T
Q  534 a-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39224149 atttcagaggtaagagaattgttgtagttggaatgcac 39224186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Original strand, 13635159 - 13635286
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||| | | |||||||||    
T  13635159 agcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgctcgagtcctgttgtttggcaggtttaaattgatctcattcaaag 13635258  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  13635259 g-aagacaattgttgtggttggaatgcac 13635286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 731 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 24363549 - 24363449
Alignment:
Q  731 cgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaat 830  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||| || ||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  24363549 cgaatatttgtgtcctgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagagataagacaattgttgtagttggaaggtatattcttgaatgtaatgtaat 24363450  T
Q  831 g 831  Q
    |    
T  24363449 g 24363449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 563 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 29436764 - 29436558
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaaca 660  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || ||||| | ||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| | | ||||||||     
T  29436764 gaatgtaccttccaactacaacagttatcttatcactgaatggggcaaattcaaacttgctaactagcaggactccagtattcgatcaacatcttgaacg 29436665  T
Q  661 atggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaag 759  Q
     ||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||| ||||||||||||   ||| ||||    
T  29436664 ctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaag 29436566  T
Q  760 tttgaatt 767  Q
    ||||||||    
T  29436565 tttgaatt 29436558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 491 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 46925017 - 46924958
Alignment:
Q  491 gaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaa 550  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46925017 gaaatgtttgagtcctgttgtttggcaggtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaa 46924958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 238 - 570
Target Start/End: Original strand, 48568063 - 48568393
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaa-ttcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttt 336  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || || ||||| ||||||||||| ||||  | |||| ||||||||||  |||  | ||||||||||    
T  48568063 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaa-tgaggcaaattcaaacttgtgaaacaac-atgaatcaagcatttcacccggcattcatgtttt 48568160  T
Q  337 tcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaat-gaagctcattttgttggcacttgaatactatcat 433  Q
     |||||||||| | |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||  ||| |||  || | ||||| |  || ||||| |||||  |||     
T  48568161 -cctttgaaaataataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagttccaacgaaacgaggttcattct--tgacactt-aataccttcag 48568256  T
Q  434 ctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtt-atttggcaagtttgaatttaccc 532  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||| | ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| || ||||    
T  48568257 ctaaatca-gccaaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgctgagcgaaatgcttgaatcctggccatttggcaagtttgagtt-accc 48568354  T
Q  533 catt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
     ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48568355 aatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 48568393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 572 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 19161099 - 19160856
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   ||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  19161099 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggaccccagtattcgatcagcatcttgaacgctggtattc 19161000  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||  |||||||||||   ||| |||||||||| ||    
T  19160999 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgttcaagatgctcatcgaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaa-tt 19160902  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     || || || ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  19160901 gcccca-tccagggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcc 19160856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 22528289 - 22528092
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||   |||| || |||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  22528289 ttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgttaagcagcagaacaccagtattcgatcagcatcttgaacactggtattc 22528190  T
Q  670 aagtgtca-atgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||||||| | |||||     ||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||  |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  22528189 aagtgtcacaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgttcaagatgctcatcaaatgctggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 22528092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 575 - 805
Target Start/End: Original strand, 39856660 - 39856890
Alignment:
Q  575 caactgcaacaattgtcttac-tctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaag 672  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| |||| |||||| ||| |||   |||||||||||| ||||||| | | ||||||||  |||||||||||    
T  39856660 caactgcaacaattgtcttgcctctgaatggagcaaattcaaatttgctaaccagcaggactccagtattcgatcaacatcttgaacgctggtattcaag 39856759  T
Q  673 tgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcc 771  Q
    |||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||| || ||    
T  39856760 tgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaa-ttgcc 39856857  T
Q  772 tcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
     || || || |||||| |||||||||||||||||    
T  39856858 cca-tccagagtaagacaattgttgtagttggaa 39856890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 565 - 767
Target Start/End: Original strand, 47487452 - 47487656
Alignment:
Q  565 atgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||| || |||||||||||   |||||||||||  |||| || ||| |||||||  |     
T  47487452 atgcacctttcaactacaacaattgtcttacccgtgaatggggcaaatttaaacttgttaagaagcaggactccaatattccatcagcatcttgaatgac 47487551  T
Q  663 ggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtt 761  Q
    ||||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| |||   ||| ||||||    
T  47487552 ggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcattcaagaggcttatcgaatattggagtcatgccgattaacaagtt 47487650  T
Q  762 tgaatt 767  Q
    ||||||    
T  47487651 tgaatt 47487656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Original strand, 12790683 - 12790890
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac-tctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| || |||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||| | | |||||||     
T  12790683 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacctctaaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccaacatacgatcaacatcttgaat 12790782  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     || |||||||||||||||  |||||     ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||| ||||||  |||| |||    
T  12790783 gatcgtattcaagtgtcaaaagaatgagttgcattc-cttgacacttgaataccattattcaagatggttatcgaatgttggattcctgccgtttaacaa 12790881  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  12790882 gtttgaatt 12790890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 23343436 - 23343229
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || |||||| |||||||||| |||||| || || ||| |||| |||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| | | |||||||     
T  23343436 ggaatgtaccttccaattgcaacaattatcttacccttgaatggagcaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcatgcgatgaacatcttgaat 23343337  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     |||||||||||||||| || || ||  |  ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||   |||| |||    
T  23343336 gatggtattcaagtgtcaaaagactgagctgcattc-cttgacacttggataccattattcaagatgctcatcgaatgttggattcctgtcgtttaacaa 23343238  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  23343237 gtttgaatt 23343229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 238 - 385
Target Start/End: Original strand, 49262654 - 49262801
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||||| |||||  | | ||||||||||||| ||||  | ||||||||||     
T  49262654 gtgcattccaactacaagaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaacaac-aggactcaagcatttcgccccgcattcatgttttc 49262752  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  49262753 cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 49262801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 5765559 - 5765614
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5765559 ggtattaaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 5765614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16098145 - 16098078
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattca 81  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  16098145 agacacaaggagggtggaatacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgatgggagaatatcattca 16098078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 506 - 565
Target Start/End: Original strand, 18170669 - 18170728
Alignment:
Q  506 tgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18170669 tgttgtttggccagtttgaatttaccccattcagaggtaacacaattgttgtagttggaa 18170728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 751 - 830
Target Start/End: Original strand, 18842942 - 18843021
Alignment:
Q  751 tttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaat 830  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| || | |||| | ||||||||||||||    
T  18842942 tttagcaagtttgaatttaccccattcaggggtaagacaattgttgtagttggtagatgcatttccgaatgtaatgtaat 18843021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 27035225 - 27035307
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgt-tatttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27035225 gcgaaatgtttgagtcctggctgtttggcaagtttgaa-ttaccccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 27035307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 619
Target Start/End: Original strand, 50067891 - 50067970
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggc-aattcaaacttg 619  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  50067891 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggcaaattcaaacttg 50067970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 243 - 570
Target Start/End: Original strand, 12790936 - 12791262
Alignment:
Q  243 ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttccttt 342  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||| ||  |||  |||||||||||  |||||  | | |||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||    
T  12790936 ttccaactccaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaacttaccaaacaac-aggactcaagaatttcgcccgacattcatgtttttccttt 12791034  T
Q  343 gaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagc 440  Q
    ||||||| ||| || |||||| | | | ||||||||| |||||| ||||| ||| |||   || | | ||  ||| ||||| |||||  ||||||||| |    
T  12791035 gaaaagaataattttttgttaggattgctttagatgatggtatttaagtgccaatgaaatgaggttaattccttgacacttcaataccttcatctaaacc 12791134  T
Q  441 aagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca-ttcaa 539  Q
    | |||||| || |||||| |||||||||||        ||||||  ||||||| ||||   | | |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||     
T  12791135 a-gcctaaaaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgggcgaa-tgctaaggacttgtcgtttggcaagtttgaa-ttaccccatttcag 12791231  T
Q  540 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12791232 aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 12791262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 13973710 - 13973513
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||| ||| | || ||| |||||||  |||||||||    
T  13973710 ttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgttaagcagcaagactccaacatccaatcagcatcttgaatgatggtattc 13973611  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||  |||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  13973610 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcattcaagaggctcatcaaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaatt 13973513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 238 - 363
Target Start/End: Original strand, 27034975 - 27035099
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatgggg-caattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttt 336  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||  |||  | |||||| |||    
T  27034975 gtgcattccaactacaataattgtcttacctttgaaatggggtaaattcaaacttgccaaac-aacatgactcaagcatttcacccggcattcatg-ttt 27035072  T
Q  337 tcctttgaaaagattaaattcttgtta 363  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27035073 tcctttgaaaagaataaatttttgtta 27035099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Original strand, 30309270 - 30309467
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    |||||||| ||||||||||||| | | || ||||||||| ||||||||||||||   ||| ||||||| ||| |||| | | |||||||  |||||||||    
T  30309270 ttccaactacaacaattgtcttgcccctgaatggggcaaattcaaacttgttaagcagcatgactccaacatacgatcaacatcttgaatgatggtattc 30309369  T
Q  670 aagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||||||||  ||| |     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||||    
T  30309370 aagtgtcaaaagaacgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcattcaagatgcttatcgaatgttggactcctgccgattaacaagtttgaatt 30309467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 828 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 40532812 - 40532754
Alignment:
Q  828 aatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  40532812 aatgtaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 40532754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 344 - 433
Target Start/End: Original strand, 41781015 - 41781105
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcat 433  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| || |||||||| |||||    
T  41781015 aaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcat 41781105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 15356301 - 15356236
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15356301 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 15356236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 572 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 18171012 - 18170770
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||||||||||||||   ||| |||||||  ||||||| ||| | || ||  | | |||||    
T  18171012 ttccaactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcaaacttgttaaactgcaagactccaatattcgatgagcattttaaatgacgatattc 18170913  T
Q  670 aagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattt 768  Q
    |||||||||  |||||     |||||| |||||||||||||||||||||| |||||  | |||||||  ||||||||| | ||||| |||||||||| ||    
T  18170912 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattct-ttgacacttgaataccatcatttaagatgttcatcgaatgctggagtccttccatttaacaagtttgaa-tt 18170815  T
Q  769 tcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattc 814  Q
     ||||||||||  | |||| ||||||||  |||||||||| |||||    
T  18170814 acctcattcaa-agaaagacaattgttgctgttggaaggtgcattc 18170770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 570
Target Start/End: Original strand, 42571442 - 42571765
Alignment:
Q  246 caactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaa 345  Q
    ||||||||||||| || |||||| | || ||||  |||||||||||| |||||    ||||||||| ||||| | ||  | |||||||||| ||||||||    
T  42571442 caactacaacaattgtgttacctttgaattgggtaaattcaaacttgccaaacaat-atgactcaaacatttcgtccggcattcatgtttt-cctttgaa 42571539  T
Q  346 aagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  ||||||||| ||     
T  42571540 aagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatctaaacca- 42571636  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaa 540  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||         ||||||  | |||||||| ||||||| ||    ||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  42571637 gcctaacaagaatttaatcttttcaaatgaaaaacatgaatgtcgagcgaaatgtttgagtcttggccgtttggcaagtttgaa-ttaccccatttcaga 42571735  T
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42571736 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 42571765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 49397440 - 49397198
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||| ||| | || ||     
T  49397440 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttatctctgaatggggtaaattcaaacttgtcaaacagcaggactccagcatgcgatgagcattttaaat 49397341  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     ||||||||||||| || || ||| |     ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||| |||| |  |||| |||    
T  49397340 gatggtattcaagtatcaaaagaacgaggtgcattc-cttgacacttgaataccatcattcaaaatgctcatcgaatgctggattcctaccgtttaacaa 49397242  T
Q  759 gtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    ||||||| || || ||||||| || |||| |||||||| |||||||    
T  49397241 gtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgcagttgga 49397198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 575
Target Start/End: Original strand, 49397359 - 49397440
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    ||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  49397359 atgctggagtcctgctgtttgacaagtttgaatttaccccattcagagataagataattgttgcagttggaaggtacattcc 49397440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 563 - 635
Target Start/End: Original strand, 13283917 - 13283989
Alignment:
Q  563 gaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactc 635  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  13283917 gaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgttaaatggcaagactc 13283989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Original strand, 27486119 - 27486326
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| | | ||||||||    
T  27486119 ggaatgtaccttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatcaacatcttgaac 27486218  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
      ||||||||||||||| || |||||     |||||| |||||||||||||| || | |||||||| || ||| ||| |||||||||| |   ||| |||    
T  27486219 gctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattct-ttgacacttgaatatcagcgttcaagatgcttatcaaatgttggagtcctaccgattaacaa 27486317  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  27486318 gtttgaatt 27486326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 608 - 815
Target Start/End: Original strand, 49598348 - 49598553
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||| ||| |||| | | |||||||  ||||||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||| ||    
T  49598348 aattcaaacttgctaagcagcaggactccaacatacgatcaacatcttgaatgatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacatg 49598446  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| |||||||| |||   ||| | |||||||| || ||||| || || |||||| |||||||||||||||||     
T  49598447 aataccatcattcaagaggcttatcgaatgttggagtcatgccgattaacgagtttgaa-ttgcctca-tccagagtaagacaattgttgtagttggaat 49598544  T
Q  807 gtacattcc 815  Q
    || ||||||    
T  49598545 gtgcattcc 49598553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 16531942 - 16531887
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16531942 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatatcatcatt 16531887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18170569 - 18170427
Alignment:
Q  243 ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttccttt 342  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||  |||  |||||||||| | |||||  | | ||||||| ||||| ||||  ||||| || |||||||||    
T  18170569 ttccaactacaacaattgtgttacctctgaatggggtaaattcaaactggccaaacaacaa-gactcaaacatttcgcccggcgttcttgcttttccttt 18170471  T
Q  343 gaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  18170470 gaaaagaataaatttttgttatgcttgctttagatgatggtatt 18170427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 562 - 766
Target Start/End: Original strand, 35525607 - 35525813
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||| | || |||||| || |||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| ||| |||||||     
T  35525607 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccctgaatggggtaaattcaaacttgctaaacagcaggactccagcatgcgatgagcatcttgaat 35525706  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     ||| |||||||||||| || |||||     |||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||  || | ||||||  |||| |||    
T  35525707 gatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-attgacacttggataccattattcaagatgctcatcgaatgctgaattcctgccgtttaacaa 35525805  T
Q  759 gtttgaat 766  Q
    ||||||||    
T  35525806 gtttgaat 35525813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 37778437 - 37778492
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37778437 ggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttgacacttgaataccatcatt 37778492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 494 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 38044683 - 38044612
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  38044683 atgctagagtcctgttgtttagcaagtttgaatttgcccaattcagtggtaagataattgttgtagttggaa 38044612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 544 - 595
Target Start/End: Original strand, 48568040 - 48568091
Alignment:
Q  544 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  48568040 aagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 48568091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Original strand, 13634721 - 13634918
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| || ||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||||||    
T  13634721 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaatttaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgatcagcatcttgaacgctggtattc 13634820  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||| || |||||     ||||| ||||||||||||||||||   |||||||  || |||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  13634821 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagtgttcaagaggcttatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 13634918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 35586816 - 35586694
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| | ||| |  ||||||||  |||| |||| |||    
T  35586816 aaaagattaagttcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattcttttgacttttgaataccgtcatttaaaccaa 35586717  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
     |||||||| |||||| ||||||    
T  35586716 acctaacaagaatttaatctttt 35586694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 698 - 808
Target Start/End: Complemental strand, 41781325 - 41781216
Alignment:
Q  698 tgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgt 797  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||||| || |||  |||| |||||||||| || || | ||||| ||||| | |||||||||    
T  41781325 tgacacttgaataccatcattcaaaatgctcatcgaatgttggattcgtgccgtttaacaagtttgaa-ttaccccgttcaaaggtaacacaattgttgt 41781227  T
Q  798 agttggaaggt 808  Q
    |||||| ||||    
T  41781226 agttgggaggt 41781216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 844 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 46142836 - 46142794
Alignment:
Q  844 ataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46142836 ataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 46142794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 48227320 - 48227123
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   ||||||| |||| ||||||| | | ||| ||||| ||||||||    
T  48227320 ttccaactgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggacaccagtattcgatcatcatctggaacactggtattc 48227221  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||| || |||||     |||| ||||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||| || ||||||||   ||| ||||||||||||    
T  48227220 aagtgtcaaaagaatgaggtgcatt-tcttgacacttgaataccagcgttcaagacgcttatcgaatactgaagtcctgccgattaacaagtttgaatt 48227123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 3659046 - 3658993
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  3659046 gtaagacaattgttgtacttggaatgtacattacaactacaacaattgtcttac 3658993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 696 - 804
Target Start/End: Original strand, 17685905 - 17686010
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgtt 795  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||| |  |||| ||| ||||||  || ||||||||| || |||| |||||||    
T  17685905 cttgacacttgaataccatcattcaagaggctcatcgaatactggagtccttccgtttaacaaatttgaa--ttactcattcaaagg-aagacaattgtt 17686001  T
Q  796 gtagttgga 804  Q
    | |||||||    
T  17686002 gcagttgga 17686010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17697505 - 17697444
Alignment:
Q  302 catgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgtta 363  Q
    |||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17697505 catgactcaagcatttcgcccgacatttatgtttttcctttgaaaagaataaatttttgtta 17697444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 27034950 - 27035003
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  27034950 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaataattgtcttac 27035003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 734 - 811
Target Start/End: Original strand, 37778551 - 37778628
Alignment:
Q  734 atattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||||||| || ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  37778551 atattggagtcctgctgcttggcaagtttgaatttaccacattcagaggtaacacaattgttgtagttggaaggtaca 37778628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 451 - 570
Target Start/End: Original strand, 41874753 - 41874873
Alignment:
Q  451 aaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccca-ttcaaaggtaagac 548  Q
    ||||||||||||||||||||         |||||| | || ||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  41874753 aaaatttattcttttcaaaggaaaaacacgaatgctgagcaaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaa-ttaccccatttcagaggtaagac 41874851  T
Q  549 aattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  41874852 aattgttgtagtttgaatgcac 41874873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 45689693 - 45689640
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||    
T  45689693 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattcctactacaacaattgtcttac 45689640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 46179912 - 46179965
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  46179912 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcatttcaactacaacaattgtcttac 46179965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 47487669 - 47487722
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  47487669 gtaagacaattgttgtagttgaaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 47487722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 755 - 815
Target Start/End: Original strand, 3658966 - 3659026
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  3658966 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgtaatgtacattcc 3659026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 564 - 644
Target Start/End: Original strand, 17372941 - 17373021
Alignment:
Q  564 aatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcg 644  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||    
T  17372941 aatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgttaaacggcaggactcaaacattcg 17373021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 29707255 - 29707191
Alignment:
Q  751 tttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  29707255 tttagcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 29707191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 487 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 45689420 - 45689336
Alignment:
Q  487 gggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||  ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45689420 gggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggcaagtttgaattatccaatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 45689336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 238 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 45689668 - 45689545
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||  |||  ||||||||||||  ||||  | | ||||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  45689668 gtgcattcctactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgctaaacaac-aggactcaagcatttcgccccgcattcatgttttt 45689570  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgtt 362  Q
    |||||||||| | |||||| |||||    
T  45689569 cctttgaaaaaaataaatttttgtt 45689545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 751 - 815
Target Start/End: Original strand, 45689609 - 45689673
Alignment:
Q  751 tttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | |||||||    
T  45689609 tttagcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagtaggaatgcacattcc 45689673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Original strand, 49262918 - 49262977
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49262918 tttggcaagtttgaatc-accccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 49262977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 590
Target Start/End: Original strand, 49598520 - 49598568
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgt 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  49598520 gtaagacaattgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgt 49598568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 608 - 815
Target Start/End: Original strand, 50067719 - 50067924
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    |||||||||||| |||   ||||||||||| |||||||| | | ||||||||  ||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||    
T  50067719 aattcaaacttgctaagcagcaggactccaacattcgatcaacatcttgaacgctggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttg 50067817  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaag 806  Q
    ||||||| | || ||||   | ||||||| ||||||||||||   ||| |||||||||| || || || || || |||||| |||||||||||||||||     
T  50067818 aataccagcgtttaagacgtttatcgaatgttggagtcctgccggttaacaagtttgaa-ttgcccca-tccagagtaagacaattgttgtagttggaat 50067915  T
Q  807 gtacattcc 815  Q
    || ||||||    
T  50067916 gtgcattcc 50067924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 755 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 50067971 - 50067911
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  50067971 gcaagtttgaatttgccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 50067911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 737 - 808
Target Start/End: Original strand, 3659274 - 3659345
Alignment:
Q  737 ttggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| |||||  | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  3659274 ttggagtcctgctgcttagcaagtttaaatttgtcccattcaagggcaagacaattgttgtagttggaaggt 3659345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 710
Target Start/End: Original strand, 17373082 - 17373129
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaata 710  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17373082 ggtattgaagtgtcaaagaatgcacctcattcttttgacacttgaata 17373129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 758 - 841
Target Start/End: Original strand, 17697516 - 17697599
Alignment:
Q  758 agtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatt 841  Q
    |||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  17697516 agtttgaatttatcccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcgttatcgaatgtaatgtaatgtaatgtaatt 17697599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 714
Target Start/End: Original strand, 18842811 - 18842862
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccat 714  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18842811 ggtattgaagtgtcaaagaatgcacctcattcttgtgacacttgaataccat 18842862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 19262517 - 19262430
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgc 210  Q
    |||||| |||||| ||||||||   ||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  19262517 ttttggcagcacatcatgttcccgaggatcaatatgtttgtcacgttgctgagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgc 19262430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Original strand, 21484575 - 21484632
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21484575 tttggcaagtttgaatt-accatattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 21484632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 344 - 458
Target Start/End: Original strand, 23342963 - 23343078
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    ||||||||||| |||||||| || | |||| |||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||| |||||||  |||| |||| |||    
T  23342963 aaaagattaaagtcttgttaggccgatttaaatgaagatattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgacacctgaataccgtcatttaaaccaa 23343062  T
Q  443 gcctaacaaaaattta 458  Q
     |||||||| ||||||    
T  23343063 acctaacaagaattta 23343078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 696 - 767
Target Start/End: Original strand, 24269911 - 24269982
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||| ||||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  24269911 cttgacacttgaataccataattcaaaatgctcatcgaatgttggattcctgccgtttaacaagtttgaatt 24269982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 542 - 619
Target Start/End: Original strand, 29707171 - 29707250
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatgggg-caattcaaacttg 619  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||    
T  29707171 gtaagataattgttggagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttg 29707250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 41781051 - 41781106
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  41781051 ggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttgacatttgaataccatcatt 41781106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Original strand, 41801725 - 41801800
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| | |||||||    
T  41801725 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttagaaggtacattcc 41801800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 696 - 767
Target Start/End: Original strand, 41874438 - 41874509
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||| |||   ||| ||||||||||||    
T  41874438 cttgacacttgaataccagcattcaagatgcttatcgaatgttggagtcatgccgattaacaagtttgaatt 41874509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 544 - 595
Target Start/End: Original strand, 41874520 - 41874571
Alignment:
Q  544 aagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  41874520 aagacaattgttgtagttgaaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 41874571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 575 - 767
Target Start/End: Original strand, 42571198 - 42571393
Alignment:
Q  575 caactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaag 672  Q
    |||||||||||||| |||||| || || |||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||| ||||| |||| ||| | || ||  ||||||||||||    
T  42571198 caactgcaacaattatcttacccttgaatggggcaaattcatacttgctaaatagcaggactctagcatgcgatgagcattttaaatgatggtattcaag 42571297  T
Q  673 tgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||| || |||||     |||||  |||||||||||||| |||||||||| || || |||||||  |||  ||||||  |||| ||||||||||||    
T  42571298 tgtcaaaagaatgaggtgcattcctttgacacttgaatatcatcattcaaaatgctcatcgaatgctggtttcctgccgtttaacaagtttgaatt 42571393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 696 - 767
Target Start/End: Original strand, 46924859 - 46924930
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||||    
T  46924859 cttgacacttgaataccagcattcaagatgcttatcgaatgttggactcctgccgattaacaagtttgaatt 46924930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 542 - 619
Target Start/End: Complemental strand, 51270374 - 51270295
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatgggg-caattcaaacttg 619  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||    
T  51270374 gtaagacaattgttgcagttgaaatgtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtcaattcaaacttg 51270295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 517 - 575
Target Start/End: Original strand, 6436460 - 6436518
Alignment:
Q  517 aagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  6436460 aagtttgaattttccccattcaatggtaagataattgttgcagttggaaggtacattcc 6436518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 13973201 - 13973149
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13973201 tttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 13973149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 14173687 - 14173739
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14173687 tttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 14173739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 14772754 - 14772644
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  |||| |||||| |||| |||| | || | ||||||| |||||||||  | |||    
T  14772754 agacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacaacgggagaatatcgttcagtcggctagaattaaagaacgacgacgatgtg 14772655  T
Q  114 acgagcatgtt 124  Q
    | |||||||||    
T  14772654 aggagcatgtt 14772644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 663 - 709
Target Start/End: Original strand, 16081641 - 16081687
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaat 709  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16081641 ggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattcttttgacacttgaat 16081687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 500 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 35586404 - 35586330
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc 574  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||    
T  35586404 gagtcttgttgtttagcaagtttgaattttctccattcaagggtaagataattgttgcagttggaaggtacattc 35586330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 48707131 - 48706929
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  | ||| |||||| |||||| |||| | || | ||||||| ||||||| |  || ||    
T  48707131 agacacaaggagggtggaatacgtttggtatgaacgtccaacattgaacgaggggaaagtatcgttcagtcggctagaattaatgaacgacaacgacatg 48707032  T
Q  114 acgagcatgtt---------ttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttga 204  Q
    | ||| |||||         |||| ||||| || |||||| |||||||||||||   || ||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  48707031 aagagtatgttctcgattttttggcagcaccacttgttcccatggatcgatatgtatgttacgttgctgagatcgtctgaagatattctcaagagtttga 48706932  T
Q  205 ttc 207  Q
    |||    
T  48706931 ttc 48706929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 49396981 - 49396929
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  49396981 tttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 49396929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 730 - 811
Target Start/End: Original strand, 6436240 - 6436321
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||||| || ||||||| | | || |||||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  6436240 tcgaattttagagtcctcctacttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaaaacaattgttgtagttgggaggtaca 6436321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 516 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 13283973 - 13283926
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13283973 caagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 13283926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 565
Target Start/End: Original strand, 17373202 - 17373267
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||| ||||||||||||    
T  17373202 gagtcctgctgtttagcaagtttgaatttacctcattcaggggttagacaattattgtagttggaa 17373267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 516 - 565
Target Start/End: Original strand, 18170963 - 18171012
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  18170963 caagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgcagttggaa 18171012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 22528079 - 22528026
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  22528079 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtgttac 22528026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 734 - 811
Target Start/End: Original strand, 23343112 - 23343189
Alignment:
Q  734 atattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||| |||   || |||||||||||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  23343112 atattggagtcgtgctgcttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaacacaattgttgtagttgggaggtaca 23343189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 494 - 575
Target Start/End: Original strand, 23343355 - 23343436
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||| | |||||| | |||||||    
T  23343355 atgctggagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgctccattcaagggtaagataattgttgcaattggaaggtacattcc 23343436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 29436545 - 29436492
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  29436545 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgttttac 29436492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 524 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 35586636 - 35586595
Alignment:
Q  524 aatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35586636 aatttactccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaa 35586595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 663 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 40533134 - 40533085
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  40533134 ggtattgaagtgtcaacgaatggacctcattcttttgacacttgaatacc 40533085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 48227110 - 48227057
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||    
T  48227110 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattcaaactccaacaattgtcttac 48227057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 49427958 - 49427905
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||    
T  49427958 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattacaactccaacaattgtcttac 49427905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 730 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 6436070 - 6435988
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattc 814  Q
    ||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| || |||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  6436070 tcgaatattggagacctgccgtttggcaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaaggtgcattc 6435988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 670 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 21484294 - 21484246
Alignment:
Q  670 aagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  21484294 aagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttcaataccctcatt 21484246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 509 - 565
Target Start/End: Original strand, 24270290 - 24270344
Alignment:
Q  509 tatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||    
T  24270290 tatttggcaagtttgaa-ttaccccattcagagg-aagacaattgttgtagctggaa 24270344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 35185779 - 35185572
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctgga-tggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||| || || |||| ||| |||||||||| |||   | |||||||||   | |||| ||| |||||||     
T  35185779 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttacccttgaatgggacaaattcaaacttgctaaacagtaggactccattttgcgatgagcatcttgaat 35185680  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
     ||| ||||||||||||||  |||||     ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||  |||| ||||||  |||| |||    
T  35185679 gatgatattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttggataccattattcaagatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaa 35185581  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  35185580 gtttgaatt 35185572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 696 - 804
Target Start/End: Original strand, 35586465 - 35586571
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgtt 795  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||| || |||||||  |||| ||||||  |||| |||||||||| || |||||||||| || |||| |||||||    
T  35586465 cttgacacttggataccattatttaagatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aagacaattgtt 35586562  T
Q  796 gtagttgga 804  Q
    | |||||||    
T  35586563 gcagttgga 35586571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 559
Target Start/End: Original strand, 38046363 - 38046409
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtag 559  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38046363 tttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtag 38046409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 41780970 - 41780924
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtag 559  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41780970 tttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtag 41780924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 222 - 258
Target Start/End: Original strand, 48226760 - 48226796
Alignment:
Q  222 cattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaat 258  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48226760 cattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaat 48226796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 385
Target Start/End: Original strand, 49598611 - 49598695
Alignment:
Q  302 catgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||||||| || |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  49598611 catgactcaagcatttcgccccgcgtttatgttttttctttgaaaggaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 49598695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 570
Target Start/End: Original strand, 49598821 - 49598880
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49598821 tttggcaagtttgaatt-acccgatttcagaggtaagacgattgttgtagttggaatgcac 49598880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 731 - 814
Target Start/End: Complemental strand, 13283998 - 13283917
Alignment:
Q  731 cgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattc 814  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||  || ||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  13283998 cgaatattcgagtcttgccatttaacaagtttgaattaccc-cattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcattc 13283917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 24363661 - 24363606
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  24363661 ggtattgaagtgttaaggaatgcacctcattctgttgacacgtcaataccatcatt 24363606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 621
Target Start/End: Complemental strand, 24363795 - 24363736
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgtt 621  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || || ||| || ||||||||||||||    
T  24363795 ggaatgcaccttccaactacaacaattgtcttcctttgaatgaggtaattcaaacttgtt 24363736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 35586780 - 35586725
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||||    
T  35586780 ggtattgaagtgtcaatgaatggacctcattcttttgacttttgaataccgtcatt 35586725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 36910220 - 36910149
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||  |||| |||| |  |||| ||||||||||||    
T  36910220 cttgacacttgaataccatcattcaaaatgctcatcgaatgctggattcctaccgtttaacaagtttgaatt 36910149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 756 - 811
Target Start/End: Complemental strand, 40532998 - 40532943
Alignment:
Q  756 caagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||||| |||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  40532998 caagtttgaatttacctcattcagaggtaacacgattgttgtagttggaaggtaca 40532943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 516 - 563
Target Start/End: Complemental strand, 41781267 - 41781221
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgg 563  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41781267 caagtttgaatt-accccgttcaaaggtaacacaattgttgtagttgg 41781221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 767
Target Start/End: Original strand, 48567954 - 48568025
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| || || |||| |||||||| |||   ||| ||||||||||||    
T  48567954 cttgacacttgaataccagcattcaagatgcttattgaatgttggagtcatgccgattaacaagtttgaatt 48568025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 51270458 - 51270387
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||||| ||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  51270458 cttgacacttgaataccaacattgaagacgcttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 51270387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #218
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 515 - 565
Target Start/End: Original strand, 3659292 - 3659342
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||| |||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  3659292 gcaagtttaaatttgtcccattcaagggcaagacaattgttgtagttggaa 3659342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 6436049 - 6435997
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  6436049 tttggcaagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 6435997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 731 - 813
Target Start/End: Complemental strand, 17373021 - 17372941
Alignment:
Q  731 cgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacatt 813  Q
    ||||| || |||||||||  |||| ||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17373021 cgaatgtttgagtcctgccgtttaacaagtttgaatta-cctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaaggtgcatt 17372941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #221
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 19160890 - 19160836
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  19160890 ggtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 19160836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 352 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21484329 - 21484215
Alignment:
Q  352 aaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaa-gtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaaca 450  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| | |||||| | ||| ||||| |||||  |||| |||| | || ||||||    
T  21484329 aaattcatgttaggttggtttagatgaaggcaataaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttcaataccctcatttaaaccgagtctaaca 21484230  T
Q  451 aaaatttattctttt 465  Q
    | |||||| ||||||    
T  21484229 agaatttaatctttt 21484215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 541 - 595
Target Start/End: Original strand, 21484409 - 21484463
Alignment:
Q  541 ggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  21484409 ggtatgacaattgatgtagttggaaggtgcattccaactacaacaattgtcttac 21484463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 755 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 21484490 - 21484440
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    |||| ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||    
T  21484490 gcaattttgaatttgcctcatttaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 21484440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #225
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 23342918 - 23342866
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  23342918 tttggcaagtttgaatt-acccaattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 23342866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #226
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 608 - 678
Target Start/End: Original strand, 29761609 - 29761679
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaa 678  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||| |||| |||  |||||||||||||||||    
T  29761609 aattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatcagcgtcttcaacgctggtattcaagtgtcaa 29761679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #227
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 36909838 - 36909786
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  36909838 tttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaactgttgtagctggaa 36909786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #228
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 344 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 38046318 - 38046196
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    ||||||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||| | |||||| | ||| || ||||||||  |||| |||  | |    
T  38046318 aaaagattatactcttgttagtctggtttaaatgaaggtattaaaatgtcaacgaatggacctcattcttttgacatttgaataccgtcatttaatccga 38046219  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||||||||| |||||| ||||||    
T  38046218 gcctaacaagaatttaatctttt 38046196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #229
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 515 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 46924746 - 46924696
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  46924746 gcaagtttgaatttgccacattcaggggcaagacaattgttgtagttggaa 46924696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #230
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 755 - 805
Target Start/End: Original strand, 51270294 - 51270344
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    |||||||||||||  || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  51270294 gcaagtttgaattgaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 51270344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #231
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 665 - 718
Target Start/End: Original strand, 6436132 - 6436185
Alignment:
Q  665 tattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  6436132 tattgaagtgtcaaggaatggacctcattcttttggcatttgaataccatcatt 6436185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #232
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 385
Target Start/End: Original strand, 14772341 - 14772390
Alignment:
Q  336 ttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt 385  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  14772341 ttcctttcaaaagattaaattcttgttagtttggtttagatgatggtatt 14772390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #233
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 516 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 17372996 - 17372949
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17372996 caagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 17372949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #234
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 758 - 811
Target Start/End: Original strand, 18170522 - 18170575
Alignment:
Q  758 agtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||| || ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18170522 agtttgaatttaccccattcagaggtaacacaattgttgtagttggaaggtaca 18170575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #235
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 758 - 811
Target Start/End: Original strand, 18170681 - 18170734
Alignment:
Q  758 agtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||| || ||||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18170681 agtttgaatttaccccattcagaggtaacacaattgttgtagttggaaggtaca 18170734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #236
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 268
Target Start/End: Original strand, 21484432 - 21484465
Alignment:
Q  235 aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacct 268  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21484432 aaggtgcattccaactacaacaattgtcttacct 21484465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #237
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 516 - 565
Target Start/End: Original strand, 24363738 - 24363785
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24363738 caagtttgaatt-acctcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 24363785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #238
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 520 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 27034840 - 27034795
Alignment:
Q  520 tttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  27034840 tttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaa 27034795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #239
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 29436454 - 29436374
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    ||||||||||||| || | || |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  29436454 gactcaagcatttcgctcgacattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 29436374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #240
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 849 - 886
Target Start/End: Original strand, 37778951 - 37778988
Alignment:
Q  849 atatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  37778951 atatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 37778988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #241
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 39223831 - 39223884
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  39223831 gtaagacaattgttgtaatggaaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 39223884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #242
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 49262629 - 49262682
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  49262629 gtaagacaattgttgtagttgaaacgtgcattccaactacaagaattgtcttac 49262682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #243
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 510 - 559
Target Start/End: Original strand, 49926308 - 49926355
Alignment:
Q  510 atttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtag 559  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  49926308 atttggcaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaatggttgtag 49926355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 494; Significance: 0; HSPs: 93)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 494; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 31 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 35058930 - 35058134
Alignment:
Q  31 aatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttggga 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35058930 aatacgttcgttataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgttacgagcatgttttggga 35058831  T
Q  131 gcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagtta 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  35058830 gcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactaaagatatcatcaacatcttaattccacaagaagatcgtcattagtta 35058731  T
Q  231 gagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttca 330  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||| || | || ||||    
T  35058730 gggtaaggtacattccaactacaacaattgtcttacctctcaaattgggtaattcaaacttgccaaacggccagggctctagcatttcgctcgacattca 35058631  T
Q  331 tgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactat 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  35058630 tgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttgaataccat 35058531  T
Q  431 catctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttac 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  35058530 catctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-aaaaacatgaatgcggggtgaaatgcctgagtcctgttgtttggagagtttgaatttac 35058432  T
Q  531 cccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcag 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||     
T  35058431 cccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactacaacaaatgtcttactctggatgaggcaattcaaacttgttactcggcaa 35058332  T
Q  631 gactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgat 730  Q
    ||||| | |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35058331 gactctaacattcgataagcatcttgaatgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacatcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgctgat 35058232  T
Q  731 cgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaat 830  Q
    || || |||||||| |||   |||||||||||||||||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||    
T  35058231 cgtatgttggagtcgtgctgcttagcaagtttgaatttgtcccattcaggggcaagaaaattgttgtagttggaaggtgcat---gtaatgtaatgtaat 35058135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 457; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Original strand, 6205481 - 6206321
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205481 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 6205580  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  6205581 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 6205680  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  6205681 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtatt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagc 6205777  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  6205778 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 6205877  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  6205878 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 6205977  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205978 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 6206077  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6206078 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcgatgagcatcttggacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 6206177  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||    
T  6206178 atcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaat 6206277  T
Q  813 tccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6206278 ttcggaatgtaatgtaaaatgcaatgtaatgtgataacatatat 6206321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 437; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Original strand, 11692448 - 11693288
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692448 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacactcgacaaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 11692547  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  11692548 acgaacatgttttggaagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 11692647  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || || ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  11692648 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtatt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagc 11692744  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  11692745 atttagcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaagatattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 11692844  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   |||||||||||||||||||||| ||    
T  11692845 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgcttgagtcctgttgtt 11692944  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  11692945 ttgcaggtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgacttacaatggatggggcaattc 11693044  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11693045 aaacttgttaatcggcaggactccagtattcaatgagcatcttggacaatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 11693144  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||||| ||    
T  11693145 atcgttcaagatgcttatcgaatactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggtaaat 11693244  T
Q  813 tccggaatgtaatgt--aatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11693245 ttcggaatgtaatgtaaaatgcaatgtaatgtgataacatatat 11693288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 403; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 14 - 854
Target Start/End: Original strand, 27640177 - 27641013
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27640177 agacacaaggatggtggaacacatttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcagttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 27640276  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  27640277 acgaccatgttttggaagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttgcttagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccac 27640376  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | || || || ||||||||||||||||||  | | |||||||||    
T  27640377 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacatttgtctt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcaagc 27640473  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| ||       |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |     
T  27640474 atttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaatttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcgg 27640573  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||        |||  ||   ||||||||| |||||||||||| ||    
T  27640574 tggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaatttattattttcaaagggaaaacatgaggtgtttggcgaaatgtttgagtcctgttgtt 27640673  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    | ||| ||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27640674 ttgcaggtttgaatt-atctcattcaaaggtaacacaattgttgtggttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 27640772  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    ||||||||||   |||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  27640773 aaacttgtta---ggcaggactctagtattcgatgagcatcttgaataatggtattcaagtgtcaagaaatgcacctcattcttttcacacttgaatacc 27640869  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    ||| |||||||| || |||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| ||||||| || ||||||| | ||    
T  27640870 atcgttcaagatgctaatcgaacactggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagctggaaggaaaat 27640969  T
Q  813 tccggaatgtaa--tgtaatgcaatgtaatttgataacatatat 854  Q
    | |||||| |||  ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27640970 ttcggaatctaatgtgtaaggcaatgtaatgtgataacatatat 27641013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 14 - 614
Target Start/End: Original strand, 29066550 - 29067149
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29066550 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 29066649  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||    
T  29066650 aagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccag 29066749  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||| || | ||       ||||||||| || |||||   ||||||||||||    
T  29066750 tagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattttcttatctttgaatgatataaattcaaacctgccaaac-aacatgactcaagc 29066848  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29066849 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaatttttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 29066948  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| |  | ||||||||||||||||||||| |||    
T  29066949 tgtcacttgaatatcatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaacgtcgagcgaaatgcttgagtcctgttgttt 29067047  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggat-ggggcaattc 612  Q
    | || ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29067048 gacaggtttgaatttatctcattcaaatgtaagacaattgttgcagttggaatgcacattccaacttcaacaattgtcttactctggatgggggcaattc 29067147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 14 - 614
Target Start/End: Original strand, 29108137 - 29108736
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || |  |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29108137 agacacaaggagggtggaacacctgtggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 29108236  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||    
T  29108237 aagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccag 29108336  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||| |  | ||   |   ||||||||| || |||||   ||||||||||||    
T  29108337 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaac-aacatgactcaagc 29108435  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgt 413  Q
    |||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  29108436 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaatttttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgt 29108535  T
Q  414 tggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttattt 513  Q
    || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| |  | ||||||||||||||||||||| |||    
T  29108536 tgtcacttgaatatcatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaacgtcgagcgaaatgcttgagtcctgttgttt 29108634  T
Q  514 ggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggat-ggggcaattc 612  Q
    | || ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29108635 gacaggtttgaatttatctcattcaaatgtaagacaattgttgcagttggaatgcacattccaacttcaacaattgtcttactctggatgggggcaattc 29108734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 314; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 155 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 24021168 - 24020499
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaa 254  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24021168 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattccgccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaa 24021069  T
Q  255 caatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaa 354  Q
    |||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| ||       |||||||| ||||||||||| || |||    
T  24021068 caattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcgagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatatcaaa 24020972  T
Q  355 ttcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaa 454  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24020971 ttcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcggtggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaa 24020872  T
Q  455 tttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattg 553  Q
    ||||||||||||||||        |||| |||  |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  24020871 tttattcttttcaaagggaaaacatgaagtgcttggcgaagtgcttgagtcctgttgttttccaagtttgaatttatcccattcaaaggtaacacaattg 24020772  T
Q  554 ttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctc 653  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||  ||||||| ||| ||    
T  24020771 ttgtggttgaaatgcacattccaactgcaacaattgtcttacgctggatggggcaattcaaacttgctaatcagcaggaccccaatattcgatcagcatc 24020672  T
Q  654 ttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgattt 753  Q
    ||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||    
T  24020671 ttgaacgttgatattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccaccgttcaagatcctgatcgaatactggagtcctgctgctt 24020572  T
Q  754 agcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||||||||||| ||     ||  |||||||| ||||||| ||||| || ||| ||| |||||| ||||||||||    
T  24020571 agcaagtttgaatttgcc-----cagtggtaagatgattgttgcagttgaaatgtaaatttcggaatataatgtaatg 24020499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 32027840 - 32026966
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32027840 agacacaaggagggttgaacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtg 32027741  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32027740 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 32027641  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  | | |  ||||  ||||| |||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||| || |||||||| | |||||     
T  32027640 aagatcgtcattaggtacggaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacatgccaaacggc-aggactcc 32027544  T
Q  311 agcatttt-gcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcat 408  Q
    |  || || | ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  32027543 a--atgttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggccagttaaaatgaaggtattgaagtgccaatgaatgaacctcat 32027446  T
Q  409 tttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaa-atgcttgagtcctg 507  Q
    | | ||| |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||| | |||| || |         |||||  || |||| ||  | ||||| ||    
T  32027445 tcttttgacacttgaataccgtcatttaaaccaaacctaacaagaatttaatattttgaatggaactatgggaatgtcggtcgaacat--tggagtcatg 32027348  T
Q  508 ttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc---caactgcaacaattgtcttactctggatgg 604  Q
    ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||  |   ||| |||||||| |||||| || || ||||    
T  32027347 ttgcttgacaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacataattgttgtagttggaaggtacaaacgttcaagtgcaacaactgtcttcctttgaatgg 32027248  T
Q  605 ggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacact 704  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| | | |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32027247 ggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcgatgagcatttcgaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacact 32027148  T
Q  705 tgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  32027147 tgaataccatcatttaaaattatcatcgcatactggagtcctgttgtttagcaagtttgaatttaccacattcaggggtaagataattgttgcagttgga 32027048  T
Q  805 aggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32027047 agttacattccggaatgtaatgttatgcaatgtaatgttataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 32026966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 14 - 565
Target Start/End: Original strand, 801163 - 801710
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  801163 agacacaaggagggtggaatacgtttggtataaacgtccaaagctcgacgaggggag-gtgtcattcacttgggtagagttaaagaacgacgaaaacgtg 801261  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  801262 acgaccatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 801361  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |  |||| || ||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  801362 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtctt-cct-ttgaatgaggtaattcaaacttgcgaaacggccaagactcaagc 801459  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttg 412  Q
    |||| || |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| | |||||| |     
T  801460 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttaggctggtttagatgacggtattgaagtgtcgaggaatgcacctcattctt 801559  T
Q  413 ttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatt 512  Q
    ||| |||||||||||  | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  801560 ttgacacttgaataccgttatctaaaccaagcctaacaagaattt-ttcttttcaaag-gaaaacatgaatgccgggcgaaatgcttgagtcctgtcgtt 801657  T
Q  513 tggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  801658 ttgccagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 801710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 155 - 831
Target Start/End: Original strand, 2192535 - 2193203
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaa 254  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2192535 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaattttgattccgccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaa 2192634  T
Q  255 caatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgt-tcatgtttttcctttgaaaagattaa 353  Q
    |||| ||||| ||| | || ||||| |||||||||||||| |||  | | ||||| ||||||| ||  | ||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  2192635 caattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgtcgaacaac-aggactcgagcatttcgca-agcgcctcatgtttctcctttgaaaatattaa 2192730  T
Q  354 attcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaa 453  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  2192731 attcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcggtggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctgacaaaa 2192830  T
Q  454 atttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaatt 552  Q
    |||||||||||||||||        |||| |||  |||||||||||||||||||||| |||      |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2192831 atttattcttttcaaagggaaaacatgaagtgcttggcgaaatgcttgagtcctgttgttt------tttgaatttatcccattcaaaggtaacacaatt 2192924  T
Q  553 gttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcct 652  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||  ||||||| ||| |    
T  2192925 gttgtggttgaaatgcacattccaactgcaaaaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgctaatcagcaggaccccaatattcgatcagcat 2193024  T
Q  653 cttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatt 752  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||   |    
T  2193025 cttgaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccactgttcaagatcctgatcgaatactggagtcctgctgct 2193124  T
Q  753 tagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    | |||||||||||||| || |||| |  |||||||| ||||||| ||||| || ||| ||| |  ||||||||||||||    
T  2193125 tggcaagtttgaatttgccccatttagtggtaagatgattgttgcagttgaaatgtaaatttcaaaatgtaatgtaatg 2193203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 34 - 886
Target Start/End: Original strand, 12396793 - 12397647
Alignment:
Q  34 acgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagca 133  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12396793 acgttcggtataaacgtctaacactcgacgaggggagagtatcattcaattgggtggaattaacgaacgacgaaaacatgacgagcatgttttgggagca 12396892  T
Q  134 caacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagag 233  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||| || ||    
T  12396893 cagcatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatctactgaagatatcatcaacaacttgattccgccaaaagatcgtcattaggtacag 12396992  T
Q  234 taagg-tgca--ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttca 330  Q
     | |  ||||  ||  | |||||||||| ||||| ||| | || || || ||||||||||||||||||||| | | ||| |  |||  | || || |||     
T  12396993 aatgaatgcaccttttagctacaacaattgtctt-cctttgaa-tgaggtaattcaaacttgtcaaacggc-aggtctccaatattc-gaccgacattcc 12397088  T
Q  331 tgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatacta 429  Q
      || ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||| | ||| || ||||||||      
T  12397089 cattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacatcattcttttgacatttgaataccg 12397188  T
Q  430 tcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaattta 529  Q
    | || |||  | |||||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || |||| |  | |||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  12397189 ttatttaatcccagcctaacaagaatttaatcttttgaatggatcattgggaatgccggtcgaa-tattggagtcctgctgcttggcaagtttgaattta 12397287  T
Q  530 ccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattg 626  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||    |||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||||||||||||       
T  12397288 ccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttgggaggtacaaacatccaactgcaacaattatcttcctctaaatggggtaattcaaacttgttaaact 12397387  T
Q  627 gcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcc 726  Q
     ||| | ||||||||  |||  || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||      
T  12397388 acagaaatccagcatgtgatgtgcatcttgaacaatgatattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccatcattcaagatgt 12397487  T
Q  727 tgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatg 826  Q
    | || | || ||| ||||||||  |||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12397488 tcataggatgttgtagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcagcggtaagataattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatg 12397587  T
Q  827 taatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12397588 caatgcaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 12397647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 14 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 32037899 - 32037025
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32037899 agacacaaggagggttgaacacgttcggtataaacgtccaacattcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaatgacgaaaacgtg 32037800  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32037799 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggattgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccag 32037700  T
Q  214 aagatcgtcattagtta--gagtaag-gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactca 310  Q
    |||||||||||||| ||  || |||  |  ||||  | |||||||||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||| || |||||||| | |||||     
T  32037699 aagatcgtcattaggtaaggaataaatgcacattaaagctacaacaattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacatgccaaacggc-aggactcc 32037603  T
Q  311 agcatttt-gcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcat 408  Q
    |  || || | ||  | |||   || ||||| | |||||||||||||||||||| ||  ||| | ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  32037602 a--atgttcgaccggcattcccattgttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggccagttaaaatgaaggtattgaagtgccaatgaatgaacctcat 32037505  T
Q  409 tttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaa-atgcttgagtcctg 507  Q
    | | ||| |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||| | |||| || |         |||||  || |||| ||  | ||||| ||    
T  32037504 tcttttgacacttgaataccgtcatttaaaccaaacctaacaagaatttaatattttgaatggaactatgggaatgtcggtcgaacat--tggagtcatg 32037407  T
Q  508 ttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattc---caactgcaacaattgtcttactctggatgg 604  Q
    ||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||  |   ||| |||||||| |||||| || || ||||    
T  32037406 ttgcttgacaagtttgaatttacctcattcaaaggtaacataattgttgtagttggaaggtacaaacgttcaagtgcaacaactgtcttcctttgaatgg 32037307  T
Q  605 ggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacact 704  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||| | | |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  32037306 ggtaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagcattcgatgagcatttcgaatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacact 32037207  T
Q  705 tgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttgga 804  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  32037206 tgaataccatcatttaaaattatcatcgcatactggagtcctgttgtttagcaagtttgaatttaccacattcaggggtaagataattgttgcagttgga 32037107  T
Q  805 aggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  32037106 agttacattccggaatgtaatgttatgcaatgtaatgttataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 32037025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 408
Target Start/End: Original strand, 29075563 - 29075956
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29075563 agacacaaggagggtggaacaccttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtg 29075662  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| ||    
T  29075663 aagagcatgttttgggagcacagcatgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccag 29075762  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||| |  | ||   |   ||||||||| || |||||   ||||||||||||    
T  29075763 cagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaac-aacatgactcaagc 29075861  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcat 408  Q
    |||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29075862 atttcgctcggcattcatgtttttcctttgaaaagattaaatttttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcat 29075956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 37 - 408
Target Start/End: Original strand, 29110558 - 29110928
Alignment:
Q  37 ttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaa 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  29110558 ttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgggtggaattaacaaacgacgaaaacgtgaagagcatgttttgggagcacag 29110657  T
Q  137 catgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaa 236  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  29110658 catgttccagtggatcgatatgcgggtgatgttgctgagatcaactgaagatatgatcaacaacttgattccgccagcagatcgtcattagttagggtaa 29110757  T
Q  237 ggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttt 336  Q
    |||||||||||||| |||||||  ||||| |  | ||   |   ||||||||| || |||||   |||||||||||||||| || |  | ||||||||||    
T  29110758 ggtgcattccaactgcaacaattttcttatcgttgaatgagataaattcaaacctgccaaac-aacatgactcaagcatttcgctcggcattcatgtttt 29110856  T
Q  337 tcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcat 408  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29110857 tcctttgaaaagattaaatttttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcat 29110928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 344 - 854
Target Start/End: Complemental strand, 35021120 - 35020607
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||| || | ||| || ||||||||  | || |||  | |    
T  35021120 aaaagattaaattcttgttaggctggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaacgaatggacctctttcttttgacatttgaataccgtaatttaatccca 35021021  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaagg 542  Q
     |||||||| |||||| |||||| || |         |||||| || |||| |  | |||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35021020 acctaacaagaatttaatcttttgaatggaacattgggaatgccggtcgaa-tattggagtcctgctgcttgtcaagtttgaatttaccccattcaaagg 35020922  T
Q  543 taagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagc 639  Q
    ||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  35020921 taacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcctcagaatggggcaattcaaacttgttaaacggcaggaatccagc 35020822  T
Q  640 attcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattg 739  Q
    || ||||  || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  |||| || |||| ||   |    
T  35020821 atgcgatgtgcatcttgaacaatggtattcaagcgtcaaggaatgcacctcattcttttaacacttgaataccatcgttgcagatgctcatcggatgccg 35020722  T
Q  740 gagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaa 839  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35020721 gagtcctgctgtttagcaagtttgaattttccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaa 35020622  T
Q  840 tttgataacatatat 854  Q
    | |||||||||||||    
T  35020621 tgtgataacatatat 35020607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 516 - 886
Target Start/End: Original strand, 13403313 - 13403676
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacat---tccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattc 612  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    ||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||    
T  13403313 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtacaaatgtccaattgcaacaatcgtctttctctgaatggggtaattc 13403412  T
Q  613 aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||||||||  | ||  | | ||| ||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13403413 aaacttgttaaacgacaaaaattcagtattcgatgagcgtcttgaatgttggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 13403512  T
Q  713 atcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacat 812  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||| |   ||||||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13403513 atcattcaagatgctgatcggatgttggagtcctactgcttagcaaatttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaggtacat 13403612  T
Q  813 tccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||| || |||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13403613 tccgaaaggtaatgtaatg----------tgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 13403676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Original strand, 13402530 - 13402743
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13402530 agacacaaggagggtggaacacgttctgtataaatgtccaacgctcgacgaggggagagtttcattcacttgagtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 13402629  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  13402630 acgagcatgttttgggagcccaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaaatttgattccgccag 13402729  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  13402730 aagatcgtcattag 13402743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34803108 - 34802895
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34803108 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattgacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 34803009  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |     
T  34803008 atgagcatgttcagggagcacaacatgttccagtaaatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgatttcgccaa 34802909  T
Q  214 aagatcgtcattag 227  Q
    ||||||||||||||    
T  34802908 aagatcgtcattag 34802895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 76 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 30257729 - 30257340
Alignment:
Q  76 cattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgag 175  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30257729 cattcagttgggtggaattaaagaacgacgaaaacgtgacgagcatgttttgggagcacatcatgttctagtggatcgatatgtgggtgacgttgctgag 30257630  T
Q  176 atcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagtta--gagt-aaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctca 272  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || | || |  | ||||| |||||||||| ||||| ||||| |    
T  30257629 atcaattgaagatatcatcaaaagtttgattccgctagaagatcgtcattaggtaccgaatgaatgcaccttccagctacaacaattgtctt-cctct-a 30257532  T
Q  273 aatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcat-tttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtt 371  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |  || || | ||  | |||   || ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||    
T  30257531 aatggggtaattcaaacttgccaaacgg-catgactcca--atgttcgaccggcattcccattgttcctttcaaaagattaaattcttgttaggccggtt 30257435  T
Q  372 tagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    || ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||||    
T  30257434 taaatgaaggtattgaagtgtcaatgaatgaacctcatttttttgacacttgaataccgtcatttaaaccaaacctaacaagaatttaatctttt 30257340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 3765867 - 3765655
Alignment:
Q  147 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttga-ttccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattc 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  3765867 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttaaattccaccagaagatcatcattagttagggtaaggtgcattc 3765768  T
Q  246 caactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaa 345  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |  | |||||||||||||||||||    
T  3765767 caactgcaacaattgtcttacctctcaaatggggtaattcaaacttgccaaacggccaggactcaagcatttggctcggcattcatgtttttcctttgaa 3765668  T
Q  346 aagattaaattct 358  Q
    |||||||||||||    
T  3765667 aagattaaattct 3765655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 611 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 13617517 - 13617242
Alignment:
Q  611 tcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaata 710  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  13617517 tcaaacttgttaatcggcaggactcaagcattcgataagcgtcttgaacgctggtattcaagtgtcaaggaatgcactccattcttttgacacttgaata 13617418  T
Q  711 ccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtac 810  Q
    ||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||| |||| ||||||||| |||    
T  13617417 ccaacgttcaagatgctgatagaatattggagtcatgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcaaaggcaagacaatcgttgcagttggaagttac 13617318  T
Q  811 attccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  13617317 attcttaaatgtaatgtaatgcaatgtaatgtgataacatacatagttgaatatgaatagtacatgttgttttgaa 13617242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 301
Target Start/End: Original strand, 14115034 - 14115318
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14115034 agacacaaggagggtgcaaaacgttcagtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaagtaaagaacgacgaaaacgtg 14115133  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||    
T  14115134 acgagcatgttctgggagcacaacatgttccagtggatcaatatgcgggtaacgttgttgagatcaactgaagatatcatcaagagtctgattctgccag 14115233  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggc 301  Q
    ||||| || ||||| ||| | || |  | |||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||| |||||||||||| ||| ||||    
T  14115234 aagatagtgattaggtag-ggaatgcaccttccaactacaacaattgtctt-cct-ttaaatagggtaattcaaacttgccaagcggc 14115318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 201
Target Start/End: Original strand, 22305793 - 22305980
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22305793 agacacaaggatggtggaacacgtttggtataaacgtccaacgctcgacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtc 22305892  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtt 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22305893 acgaccatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtgaagttggttagatcaactgaagatatcatcaaaagtt 22305980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 336 - 643
Target Start/End: Original strand, 14122919 - 14123226
Alignment:
Q  336 ttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||| | ||| ||||||||||| |||||     
T  14122919 ttcctttcaaaagattaaatttttgttaggcttgtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggaccttattcttttgacacttgaataccatcatt 14123018  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttacccca 534  Q
    ||||  ||||||||||  |||||| |||||| || |         |||||| || || | | || ||||| || |  ||| |||||||||||||||||||    
T  14123019 taaacaaagcctaacatgaatttaatcttttgaatggaacaatgggaatgccggacgga-tactggagtcttgctgcttgccaagtttgaatttacccca 14123117  T
Q  535 ttcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggact 634  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14123118 tttaaaggtaagacaatttttgtagttggaatgcacatttcaactacaacaattgtcttactatggatggggcaatttaaacttgttaatcggcaggact 14123217  T
Q  635 ccagcattc 643  Q
    |||||||||    
T  14123218 ccagcattc 14123226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 663 - 880
Target Start/End: Complemental strand, 34802743 - 34802536
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagttt 762  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| || ||  | |||| ||  |||| ||||||  ||||||||||||    
T  34802743 ggtattgaagtgtcaaagaatgcacctcattcatttgacacttgaataccattatttaaaatgatcatcgcatgctggaatcctgctgtttagcaagttt 34802644  T
Q  763 gaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaat 862  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||| |||    
T  34802643 aaatttacctcattcaggggtaagataattgttgcaattggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg----------tgataacatatatagttgaat 34802554  T
Q  863 atgcataatacattttgt 880  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  34802553 atgcataatacatgttgt 34802536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 666 - 831
Target Start/End: Original strand, 29067144 - 29067309
Alignment:
Q  666 attcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaa 765  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  29067144 attcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaagatgcagatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaa 29067243  T
Q  766 ttttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||  | |||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29067244 tttgtcccatttagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtacattctggaatataatgtaatg 29067309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 666 - 831
Target Start/End: Original strand, 29108731 - 29108896
Alignment:
Q  666 attcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaa 765  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  29108731 attcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacacttgaataccagcgttcaagatgcagatcgaatactggagtcctgctggttagcaagtttgaa 29108830  T
Q  766 ttttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||  | |||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  29108831 tttgtcccatttagtggtaagatgattgttgcagttggaaggtacattctggaatataatgtaatg 29108896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 738 - 886
Target Start/End: Original strand, 4495604 - 4495752
Alignment:
Q  738 tggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgt 837  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| || ||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4495604 tggagtcatgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagaggtaagacaattattgcagttggaaggtacattccggaatgtagtgtaatgtaatgt 4495703  T
Q  838 aatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4495704 gatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 4495752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 601 - 886
Target Start/End: Original strand, 7821171 - 7821443
Alignment:
Q  601 atggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttga 700  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||   | | |  ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  7821171 atggggtaattcaaacttgttaaacgacaggactccagcattcgatcgacatttataatgatggtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttga 7821270  T
Q  701 cacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagt 800  Q
    |||||||||||||||||| || ||   |||||||| |||||||| |||   ||||  ||||||||||| || |||||  || ||||| |||||||| ||     
T  7821271 cacttgaataccatcatttaaaatgtcgatcgaatgttggagtcatgc---ttaggtagtttgaatttaccccattccgggataagacaattgttgcagg 7821367  T
Q  801 tggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||||||          ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7821368 ttgaagatacattccggaatataatgtaatg----------tgacaacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 7821443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 29067038 - 29066774
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tga 401  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| | |||| ||||| ||| ||| |||    
T  29067038 gactcaagcatttcgctcgacgttcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaagtgacaacgaaatga 29066940  T
Q  402 agctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttga 501  Q
     | |||||   ||| ||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||    
T  29066939 ggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatctaaacca-gcctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttga 29066843  T
Q  502 gtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||| |||| ||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29066842 gtcatgttgtttggcaggtttgaatttatatcattcaaagataagaaaattgttgcagttggaatgcac 29066774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 305 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 29108625 - 29108361
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tga 401  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| | |||| ||||| ||| ||| |||    
T  29108625 gactcaagcatttcgctcgacgttcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatgatattcaagtgacaacgaaatga 29108527  T
Q  402 agctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttga 501  Q
     | |||||   ||| ||||| |||||  ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||    
T  29108526 ggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatctaaacca-gcctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttga 29108430  T
Q  502 gtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29108429 gtcatgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaacgataagaaaattgttgcagttggaatgcac 29108361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 344 - 465
Target Start/End: Original strand, 23911076 - 23911197
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |||| |||    
T  23911076 aaaagattaaattcttgttaggttggtttagatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacactt-aataccatcatttaaaccaa 23911174  T
Q  443 gcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    ||||||||| |||||| ||||||    
T  23911175 gcctaacaagaatttaatctttt 23911197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 29075915 - 29075787
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |    
T  29075915 agcctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaacg 29075816  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29075815 ataagaaaattgttgcagttggaatgcac 29075787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 29110887 - 29110759
Alignment:
Q  442 agcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaag 541  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |    
T  29110887 agcctaacaaaaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcatgttgtttggcaggtttgaatttatctcattcaacg 29110788  T
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29110787 ataagaaaattgttgcagttggaatgcac 29110759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 697 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 30257109 - 30256936
Alignment:
Q  697 ttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttg 796  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||  |||||| || |||||||| |||  |||||||||||||||||| || |||| |   |||||||||||||||    
T  30257109 ttgacacttgaataccatcatttaaaatgttgatcgcatgttggagtc-tgctgtttagcaagtttgaatttaccacatttagaagtaagataattgttg 30257011  T
Q  797 tagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
     |||||||||||||||||               || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30257010 cagttggaaggtacattc---------------tgaaatgtaatgtgataacatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 30256936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 6206270 - 6206073
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6206270 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgataagcatcttgaacgatggtattc 6206171  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || |||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  6206170 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgtccaagatgctcatcgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 6206073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 627 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 2193120 - 2192980
Alignment:
Q  627 gcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatc 725  Q
    |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||     
T  2193120 gcaggactccagtattcgatcaggatcttgaacagtggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccagcgttcaagatg 2193022  T
Q  726 ctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  2193021 ctgatcgaatattggggtcctgctgattagcaagtttgaatt 2192980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Original strand, 24021006 - 24021085
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24021006 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttaccccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 24021085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 801710 - 801386
Alignment:
Q  243 ttccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttccttt 342  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||| |  ||||| | | ||||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||    
T  801710 ttccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactggcaaaacgac-aggactcaagcatttcgcccggcattcatgtttt-ccttt 801613  T
Q  343 gaaaagattaaattcttgttatgct-ggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaag-gaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaag 439  Q
    |||||||  |||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||  |||||| |  ||||   | | ||||| |||||  |||||||||     
T  801612 gaaaagaa-aaattcttgttaggcttggtttagataacggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattcc-tcgacacttcaataccgtcatctaaac 801515  T
Q  440 caagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccattca 538  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||        ||||||| | |||||||||||||||| ||    ||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  801514 ca-gcctaacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgcttgagtcttggccgtttcgcaagtttgaatt-acctcattca 801417  T
Q  539 aaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  801416 aagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 801386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 344 - 458
Target Start/End: Original strand, 4495230 - 4495345
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaa 442  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||  |||| |||| |||    
T  4495230 aaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttgacacttgaataccgtcatttaaaccaa 4495329  T
Q  443 gcctaacaaaaattta 458  Q
      ||||||| ||||||    
T  4495330 atctaacaagaattta 4495345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 572 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 11693237 - 11693040
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11693237 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgataagcatcttgaacgatggtattc 11693138  T
Q  670 aagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    ||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||||  | |||||| || || ||||| |||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  11693137 aagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccattgtccaagatgctcattgaatactggagtcctgccgattaacaagtttgaatt 11693040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 2192697 - 2192618
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| || | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2192697 gcgaaatgctcgagtcctgttgttcgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 2192618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 27640480 - 27640401
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  27640480 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aagacaaatgttgtagttggaatgcac 27640401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 608 - 767
Target Start/End: Original strand, 24020558 - 24020717
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttg 706  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||    
T  24020558 aattcaaacttgctaagcagcaggactccagtattcgatcaggatcttgaacggtggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttg 24020656  T
Q  707 aataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  24020657 aatatcaacgttcaagatgctgatcgaatattggggtcctgctgattagcaagtttgaatt 24020717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 6205784 - 6205705
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  6205784 gcgaaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcac 6205705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 730 - 811
Target Start/End: Original strand, 13403287 - 13403368
Alignment:
Q  730 tcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13403287 tcgaatattggagtcctgctgcttgacaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtaca 13403368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 147 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17465414 - 17465287
Alignment:
Q  147 tggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattcc 246  Q
    ||||||||||||   || ||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||| ||    | ||||    
T  17465414 tggatcgatatgtttgtcacgttgcagagatcaactgaagatattctcaacagtttgattccgccaaaagatcgtgattaggtagag-aatacaccttcc 17465316  T
Q  247 aactacaacaatcgtcttacctctcaaat 275  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  17465315 aactacaacaattgtcttacctctgaaat 17465287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 752 - 831
Target Start/End: Original strand, 14123418 - 14123496
Alignment:
Q  752 ttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  || |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14123418 ttagcaagtttgaatttgcc-cattcagaggcaagacaattgttgtagttggaaggtgcattcccgaatgtaatgtaatg 14123496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 572 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 27640962 - 27640784
Alignment:
Q  572 ttccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattc 669  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   ||||||||||||  |||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  27640962 ttccagctgcaacaatcatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaggactccagtgttcgattagcatcttgaacgatggtattc 27640863  T
Q  670 aagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgc 748  Q
    |||||| ||  |||||     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  27640862 aagtgtgaaaagaatgaggtgcatt-tcttgacacttgaataccattattcaagatgctcatcgaatactagagtcctgc 27640784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 35021284 - 35021237
Alignment:
Q  179 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcatta 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35021284 aactgaagatatcatcaaaagtttgattccgccagaagatcgtcatta 35021237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 492 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 11692748 - 11692672
Alignment:
Q  492 aaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  11692748 aaatgcttgagtcctgttgtttgacaagtttgaa-ttacctcattcaaagg-aatacaaatgttgtagttggaatgcac 11692672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 336 - 465
Target Start/End: Original strand, 13402851 - 13402981
Alignment:
Q  336 ttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| | ||| || |||||||| || ||     
T  13402851 ttcctgtcaaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatggacctcattattttgacatttgaataccattatt 13402950  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattctttt 465  Q
    |||    |||||||||| |||||| ||||||    
T  13402951 taatcacagcctaacaagaatttaatctttt 13402981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 494 - 575
Target Start/End: Original strand, 4495600 - 4495681
Alignment:
Q  494 atgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    ||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||    
T  4495600 atgctggagtcatgctgtttagcaagtttgaatttaccccattcagaggtaagacaattattgcagttggaaggtacattcc 4495681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 29067129 - 29067076
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29067129 gtaagacaattgttgaagttggaatgtgcattccaactgcaacaattgtcttac 29067076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 29108716 - 29108663
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  29108716 gtaagacaattgttgaagttggaatgtgcattccaactgcaacaattgtcttac 29108663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 758 - 811
Target Start/End: Original strand, 801663 - 801716
Alignment:
Q  758 agtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  801663 agtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaaggtaca 801716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 500 - 561
Target Start/End: Original strand, 4495385 - 4495446
Alignment:
Q  500 gagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagtt 561  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4495385 gagtcctgctgcttggcaagtttgaattgaccccattcagaggtaacacaattgttgtagtt 4495446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 562 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 13403615 - 13403439
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||| ||| |||   | ||||||||| ||| |||| ||| |||||||     
T  13403615 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaatttgctaagcagtaggactccaacatccgatcagcatcttgaat 13403516  T
Q  660 aatggtattcaagtgtc-aatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaata 736  Q
     |||||||||||||||| || |||||     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||    
T  13403515 gatggtattcaagtgtcaaaagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaataccaacattcaagacgctcatcgaata 13403439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 565 - 815
Target Start/End: Original strand, 35058150 - 35058400
Alignment:
Q  565 atgcacattccaactgcaacaattgtcttactc-tggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaat 662  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||| | | || ||||| ||| |||||||||| |||   ||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||  ||    
T  35058150 atgcaccttccaactacaacaattttcttgcccctgaatgggacaaattcaaacttgctaagcagcacgactccaacatacgatcagcatcttgaatgat 35058249  T
Q  663 ggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtt 761  Q
    ||||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| || ||||| |||    || ||||||    
T  35058250 ggtattcaagtgtcaaaagaatgatgtgcattc-cttgacacttgaataccagcattcaagatgcttatcgaatgttagagtcttgccgagtaacaagtt 35058348  T
Q  762 tgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||| || ||||| || || |||||| | ||||||||||||||| || ||||||    
T  35058349 tgaa-ttgcctca-tccagagtaagacatttgttgtagttggaatgtgcattcc 35058400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 35058367 - 35058420
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  35058367 gtaagacatttgttgtagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 35058420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 34802779 - 34802695
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatac 427  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||   ||| |||||||||||    
T  34802779 aaaagattaaattcttgttaggccggtttaaatgaaggtattgaagtgtcaaagaatgcacctcattcatttgacacttgaatac 34802695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 4495266 - 4495321
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4495266 ggtattgaagtgtcaaggaatgaacctcattcttttgacacttgaataccgtcatt 4495321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 14122963 - 14123018
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14122963 ggtattgaagtgtcaaggaatggaccttattcttttgacacttgaataccatcatt 14123018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Original strand, 23911112 - 23911166
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23911112 ggtattgaagtgtcaaggaatgcacctcattcttttgacactt-aataccatcatt 23911166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 512 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 30257294 - 30257247
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtag 559  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||    
T  30257294 ttggcaagtttgaatttaccctattcaaagataacacaattgttgtag 30257247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 663 - 718
Target Start/End: Complemental strand, 30257426 - 30257371
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcatt 718  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  30257426 ggtattgaagtgtcaatgaatgaacctcatttttttgacacttgaataccgtcatt 30257371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 13402814 - 13402762
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  13402814 tttggcaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 13402762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 515 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 13617373 - 13617323
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  13617373 gcaagtttgaatttgccccattcaaaggcaagacaatcgttgcagttggaa 13617323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 663 - 712
Target Start/End: Original strand, 801526 - 801575
Alignment:
Q  663 ggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaatacc 712  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  801526 ggtattgaagtgtcgaggaatgcacctcattcttttgacacttgaatacc 801575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 479 - 570
Target Start/End: Original strand, 3765683 - 3765775
Alignment:
Q  479 tgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccattcaa-aggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3765683 tgaatgccgagccaaatgcttgagtcctggccgtttggcaagtttgaatt-accccatttgagaggtaagacaattgttgcagttggaatgcac 3765775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 6206060 - 6206007
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||    
T  6206060 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactacaacaattgtgttac 6206007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 14123178 - 14123125
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |||||||||||    
T  14123178 gtaagacaattgttgtagttgaaatgtgcattccaactacaaaaattgtcttac 14123125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 752 - 808
Target Start/End: Original strand, 34132108 - 34132164
Alignment:
Q  752 ttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    |||||||||| |||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  34132108 ttagcaagttggaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaaggt 34132164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 344 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 23911197 - 23911146
Alignment:
Q  344 aaaagattaaattcttgttatgct-ggtttagatgaaggtattaagtgtcaa 394  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  23911197 aaaagattaaattcttgttaggcttggtttaaatgatggtattaagtgtcaa 23911146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 767
Target Start/End: Original strand, 32027173 - 32027244
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||  |||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  32027173 cttgacacttgaataccatcattcgaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaatt 32027244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 696 - 767
Target Start/End: Original strand, 32037232 - 32037303
Alignment:
Q  696 cttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaatt 767  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||  |||| ||||||  |||| ||||||||||||    
T  32037232 cttgacacttgaataccatcattcgaaatgctcatcgaatgctggattcctgccgtttaacaagtttgaatt 32037303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 562 - 675
Target Start/End: Original strand, 35020646 - 35020761
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||| || |||||||||| |||   |||||||||| |||| |||| ||| |||  |||    
T  35020646 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggaaaattcaaacttgctaaacagcaggactccggcatccgatgagcatctgcaac 35020745  T
Q  660 aatggtattcaagtgt 675  Q
     |||||||||||||||    
T  35020746 gatggtattcaagtgt 35020761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 123 - 189
Target Start/End: Original strand, 2402306 - 2402372
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagata 189  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||   || ||||||||||||||  |||||||||    
T  2402306 ttttggcagcacaacatgttcctgtggatcgatatgtttgtcacgttgctgagatcgcctgaagata 2402372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 562 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 12397576 - 12397458
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtctta-ctctggatggggc-aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||||| |||   |||||||| || ||| | || | | |||||||     
T  12397576 ggaatgtaccttccaactgcaacaattatcttaccgctgaatggggcaaattcaaacttgctaaacagcaggactacaacatcctatgaacatcttgaat 12397477  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaa 678  Q
     ||||||||||||||||||    
T  12397476 gatggtattcaagtgtcaa 12397458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 515 - 565
Target Start/End: Original strand, 14123421 - 14123470
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14123421 gcaagtttgaatttgccc-attcagaggcaagacaattgttgtagttggaa 14123470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 124
Target Start/End: Original strand, 28051355 - 28051465
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  || | |||||| || | |||| | || | ||||||| ||||||||| |||||     
T  28051355 agacacaaggagggtgaaatacatttggtatgaacgtccaacgttggacgacgggagaataacgttcagtcggctagaattaaagaacgacgacaacgtc 28051454  T
Q  114 acgagcatgtt 124  Q
    | |||||||||    
T  28051455 aggagcatgtt 28051465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 608 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 29067245 - 29067175
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaa 678  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  29067245 aattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatctgcatcttgaacgctggtattcaagtgtcaa 29067175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 608 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 29108832 - 29108762
Alignment:
Q  608 aattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaa 678  Q
    |||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||    
T  29108832 aattcaaacttgctaaccagcaggactccagtattcgatctgcatcttgaacgctggtattcaagtgtcaa 29108762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 511 - 565
Target Start/End: Original strand, 32027556 - 32027608
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32027556 tttggcatgtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagctggaa 32027608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 515 - 565
Target Start/End: Original strand, 34132111 - 34132161
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  34132111 gcaagttggaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaa 34132161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 238 - 567
Target Start/End: Original strand, 35058392 - 35058720
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  ||||||||||   |||||  | | |||||| ||||||  |||  | |||||||||||    
T  35058392 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaactctccaaacaac-aggactcaggcatttcaccccgcattcatgttttt 35058490  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa-tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatc 434  Q
    | |||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| ||| ||| | |||||   ||| ||||| |||||  |||||    
T  35058491 c-tttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaatgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatc 35058587  T
Q  435 taaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttacccc 533  Q
    |||| || || |||||| |||||| |||||||||||        ||||||  | |||||||||| ||| ||||    ||||||||||||||||| ||||     
T  35058588 taaacca-gcataacaagaatttaatcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgagcgaaatgctagagccctggccgtttggcaagtttgaatt-accca 35058685  T
Q  534 attcaa-aggtaagacaattgttgtagttggaatg 567  Q
    |||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35058686 atttgagaggtaagacaattgttgtagttggaatg 35058720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 734 - 811
Target Start/End: Original strand, 4495379 - 4495456
Alignment:
Q  734 atattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtaca 811  Q
    |||||||||||||||   || |||||||||||||  || ||||||  ||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  4495379 atattggagtcctgctgcttggcaagtttgaattgaccccattcagaggtaacacaattgttgtagtttgaaggtaca 4495456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 512 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 14115313 - 14115262
Alignment:
Q  512 ttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14115313 ttggcaagtttgaatt-accctatttaaagg-aagacaattgttgtagttggaa 14115262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 20192616 - 20192543
Alignment:
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaa-aggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20192616 aatgcttgagaattgttgtttagcaagtttgaatttatccaatttaagaggtaggacaattgttgtagttggaa 20192543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 565
Target Start/End: Original strand, 20242038 - 20242111
Alignment:
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaa-aggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  20242038 aatgcttgagaattgttgtttagcaagtttgaatttatccaatttaagaggtaggacaattgttgtagttggaa 20242111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 565
Target Start/End: Original strand, 22136022 - 22136095
Alignment:
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaa-aggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22136022 aatgcttgagaattgttgtttagcaagtttgaatttatccaatttaagaggtaggacaattgttgtagttggaa 22136095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 493 - 565
Target Start/End: Original strand, 22143375 - 22143448
Alignment:
Q  493 aatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaa-aggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22143375 aatgcttgagaattgttgtttagcaagtttgaatttatccaatttaagaggtaggacaattgttgtagttggaa 22143448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 27640755 - 27640702
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||  |||||||||| ||||    
T  27640755 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaaccacaacaattgtgttac 27640702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 360; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 23 - 827
Target Start/End: Complemental strand, 18119 - 17343
Alignment:
Q  23 gagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtgacgagcatg 122  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  18119 gagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacactcgacgaggg-agagtatcattcacttgggtggagttaaagaacgacgaaaacgtgatgagcatg 18021  T
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtc 222  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  18020 ttttgggagcacaacatgttatagtggatcgatatgcgggtaacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaacagcttgattccgccagaagatcgtc 17921  T
Q  223 attagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgccc 322  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| || |    
T  17920 attagttagggtaaggtgcatttcaactacaacaattgtcttacctctgaaatgggataattcaaacttgccaaacggttaggactcaagcatttcgctc 17821  T
Q  323 aacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttg 422  Q
      | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17820 ggcattcatgtttttcctttggaaaaattaaattcttgttaggctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttg 17721  T
Q  423 aatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagttt 522  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||    
T  17720 aataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaag-gaaaacatgaatgccgggcgaaatgcttaagtcatgttgtttggaaagttt 17622  T
Q  523 gaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcaca---ttccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttg 619  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||    ||||||||||||||||||||| ||        || ||||||||||||    
T  17621 aaatttaccccattcaaaagtaacacaattgttgtagttgggaggtacaaacgtccaactgcaacaattgtcttcct--------ggtaattcaaacttg 17530  T
Q  620 ttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattc 719  Q
    ||||  ||||||| || ||||||| || ||| | |||||  |||||||                     ||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17529 ttaaacggcaggaatctagcattcaatgagcattttgaatgatggtat---------------------tcattcttttgacacttgaataccatcattt 17451  T
Q  720 aagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaa 819  Q
    || || || |||| ||  || ||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17450 aaaatgctcatcgcatgctgcagtcctgctgtttagcaagtttgaatttgccccattcaagggtaagataattgttgtacttggaaggtacattccgaaa 17351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 570
Target Start/End: Original strand, 17637 - 17905
Alignment:
Q  302 catgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctgg-tttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaa- 398  Q
    ||||||| |||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||| ||| |||     
T  17637 catgacttaagcatttcgcccggcattcatgtttt-cctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtattcaagtgccaacgaaa 17735  T
Q  399 tgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgct 498  Q
    ||| | |||||   ||| ||||| |||||  ||||||||| || ||||||||| |||||| | ||| |||||        ||||||| | ||||||||||    
T  17736 tgaggttcattcc-ttgacactt-aataccttcatctaaacca-gcctaacaagaatttaatttttccaaaggaaaaacatgaatgccgagcgaaatgct 17832  T
Q  499 tgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    ||||||||     |||||||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17833 tgagtcctaaccgtttggcaagtttgaattatcccatttcagaggtaagacaattgttgtagttgaaatgcac 17905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 847 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 17338 - 17299
Alignment:
Q  847 acatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  17338 acatatatagttgaatatgcataatacatgttgttttgaa 17299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 6)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 14 - 389
Target Start/End: Original strand, 2262 - 2637
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2262 agacacaaggagggtggaacacgttcggtataaacgtccaacgctcaacgaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 2361  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| |     
T  2362 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccagtggatcgatatgcgggtaacgttgatgagatcaattgaagatatcatcaacagcttgattccgccaa 2461  T
Q  214 aagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagc 313  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  2462 aagatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaacaattgtcttacctctgaaatggggtaattcaaaattaccaaacggccatgactcaagc 2561  T
Q  314 attttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagt 389  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2562 atttcgcccaatgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagt 2637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 516 - 886
Target Start/End: Original strand, 4781 - 5141
Alignment:
Q  516 caagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaa 615  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4781 caagtttgactttaccccattctaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacatcccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaa 4880  T
Q  616 cttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatc 715  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| |||||  | |    
T  4881 cttgttaatcggcaggactccaacattcgataagtgtcttgaacgctggtattcaagtgtcaaggaatacgcctcattcttttgacactcgaatatgagc 4980  T
Q  716 attcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||||| |||   ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4981 gttcaagatgctgatcgaatactggagtcttgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaagtacattcc 5080  T
Q  816 ggaatgtaatgtaatgcaatgtaatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||||||||||||||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5081 ggaatgtaatgtaatg----------tgataacatatatagttgaatatgcataatacattttgttttgaa 5141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 562 - 767
Target Start/End: Complemental strand, 5080 - 4873
Alignment:
Q  562 ggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaa-ttcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaac 659  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||||| |||   ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  5080 ggaatgtactttccaactgcaacaattatcttaccactgaatggggcaaattcaaacttgctaagcagcaagactccagtattcgatcagcatcttgaac 4981  T
Q  660 aatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaa 758  Q
      |  ||||| ||||||||  |||||   |  |||| |||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||| ||||||||||||   ||| |||    
T  4980 gctcatattcgagtgtcaaaagaatgaggcgtattc-cttgacacttgaataccagcgttcaagacacttatcgaatgttggagtcctgccgattaacaa 4882  T
Q  759 gtttgaatt 767  Q
    |||||||||    
T  4881 gtttgaatt 4873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 487 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 2570 - 2486
Alignment:
Q  487 gggcgaaatgcttgagtcctgtta-tttggcaagtttgaatttaccccatt-caaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||||||||||| ||    ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2570 gggcgaaatgcttgagtcatggccgtttggtaattttgaatt-accccatttcagaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 2486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 4860 - 4807
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  4860 gtaagacaattgttgcagttgggatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 4807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 515 - 575
Target Start/End: Original strand, 5020 - 5080
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 575  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| | |||||||    
T  5020 gcaagtttgaatttgccccattcagtggtaagataattgttgcagttggaaagtacattcc 5080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 3)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 155 - 831
Target Start/End: Original strand, 14604 - 15280
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaa 254  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14604 tatgtgggtgaagttgcttagatcaacttaagatttcatcaaaagtatgataccgccataagatcgtcgttagttagggtaacgtgcattccaactacaa 14703  T
Q  255 caatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaa 354  Q
    |||| ||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||  | | ||||| ||||||| ||       |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14704 caattgtctt-cctttgaa-tggggtaattcaaacttgtcaaacaac-aggactcgagcatttcgcaagcacctcatgtttctcctttgaaaatattaaa 14800  T
Q  355 ttcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaa 454  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  14801 tttttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctcaattcggtggcacttgaataccatcatctaaagcaagcctcacaaaaa 14900  T
Q  455 tttattcttttcaaagnnnnnnnntgaa-tgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattg 553  Q
    ||||||||||||||||        |||  |||  ||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  14901 tttattcttttcaaagggaaaacatgaggtgcttggcgaaatgctcgagtcctgttgttttgcaggtttgaatttaacccattcaaaggtaacacaattg 15000  T
Q  554 ttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttact-ctggatggggcaattc-aaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcc 651  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||| ||||||||| || |||||||  ||   |||||||||||| ||||||||||||    
T  15001 ttgtggttggaatgcacattccaactgcaaaaatcatcttaccactgaatggggcaaatccaaacttgcaaagcagcaggactccagtattcgataagcc 15100  T
Q  652 tcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgat 751  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||  ||||||||||  ||| |||||||       
T  15101 tcttgaacgcttgtattcaagtgtcaaggaatgcacctcattctgttgacacttgaatacaagcgttcaagaggctgatcgaatgctggtgtcctgctgc 15200  T
Q  752 ttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    || ||||||||| |||| || ||||||  |||||||| ||||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||    
T  15201 ttggcaagtttggatttgccccattcagtggtaagatgattgttgcagttgaaatgtaaatttcggaatgtaatgtaatg 15280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 14766 - 14687
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14766 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 14687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 627 - 815
Target Start/End: Complemental strand, 15197 - 15009
Alignment:
Q  627 gcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaat-gaatgcacctcattctcttgacacttgaataccatcattcaagatc 725  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||  |||||     ||||| |||||||||||||||| | | |||||||      
T  15197 gcaggacaccagcattcgatcagcctcttgaacgcttgtattcaagtgtcaacagaatgaggtgcattc-cttgacacttgaatacaagcgttcaagagg 15099  T
Q  726 ctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    || |||||||| |||||||||||   || ||||||||| |||| || ||||||  |||||||| ||| ||| |||||||| || ||||||    
T  15098 cttatcgaatactggagtcctgctgctttgcaagtttggatttgccccattcagtggtaagatgatttttgcagttggaatgtgcattcc 15009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 391 - 831
Target Start/End: Complemental strand, 11598 - 11159
Alignment:
Q  391 tcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggc 490  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  |||     
T  11598 tcaaggaatgaacctgatttcgttggcacttgaatcccatcatctaaagcacgcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaca-tgaatggcgggt 11500  T
Q  491 gaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgt 590  Q
    ||||||||||||||||| | |||| || |||||||| || |   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11499 gaaatgcttgagtcctgctgtttgacaggtttgaatctatcttgttcaaaggtaagacaattgttggagttggaatgcacattccaactgcaacaattgt 11400  T
Q  591 cttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattcgataagcctcttgaacaatggtattcaagtgtcaatgaatgcacctc 690  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||    
T  11399 cttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccagcattcgataagcgtcttgaacgctgatattcaagtgtcaaggaatgcacctc 11300  T
Q  691 attctcttgacacttgaataccatcattcaagatcctgatcgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataa 790  Q
    ||||| ||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||| || ||||||   ||||||| |    
T  11299 attcttttgacacttgaatactagcgttcaagatgctgatcgaatactggtgtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcagttgtaagatga 11200  T
Q  791 ttgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatg 831  Q
    |||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11199 ttgttgcagtttgaaggtacatttcagaatgtaatgtaatg 11159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Original strand, 11395 - 11448
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  11395 gtaagacaattgttgcagttggaatgtgcattccaactccaacaattgtcttac 11448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 5)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 327 - 644
Target Start/End: Original strand, 2260 - 2578
Alignment:
Q  327 ttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatgaagctcattttgttggcacttgaat 425  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2260 ttcatgtttttcgtttgaaaatattaaattcttgttaggatggttcagatgaaggtattgaagtatcaaggaatgaacctcatttcgttggcacttgaat 2359  T
Q  426 actatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaa 525  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2360 accatcatctaaagaaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgccgggcgaaatgcttgagtcttgttttttggcaagtttgaa 2459  T
Q  526 tttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatt 625  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  2460 tttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaagtacaacaattgtcttactcttgatggggcaattcaaacttgttaatc 2559  T
Q  626 ggcaggactccagcattcg 644  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  2560 ggcaggactccaacattcg 2578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2504 - 2380
Alignment:
Q  238 gtgcattccaactacaacaatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgttttt 337  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||  |||||||||||| ||||   | | ||||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  2504 gtgcattccaactacaacaattgtcttacctttgaatggggtaaattcaaacttgccaaaaaacaa-gactcaagcatttcgcccggcattcatgttttt 2406  T
Q  338 cctttgaaaagattaaattcttgtta 363  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||    
T  2405 cctttgaaaagaataaatttttgtta 2380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 542 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 2529 - 2476
Alignment:
Q  542 gtaagacaattgttgtagttggaatgcacattccaactgcaacaattgtcttac 595  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  2529 gtaagacaattgttgtacttggaatgtgcattccaactacaacaattgtcttac 2476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 755 - 815
Target Start/End: Original strand, 2449 - 2509
Alignment:
Q  755 gcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattcc 815  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  2449 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcacattcc 2509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 737 - 808
Target Start/End: Original strand, 2757 - 2828
Alignment:
Q  737 ttggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggt 808  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||||| || |||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||    
T  2757 ttggagtcctgctggttagtaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtcgttggaaggt 2828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 155 - 407
Target Start/End: Original strand, 85462 - 85711
Alignment:
Q  155 tatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaa 254  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  85462 tatgcgggtgaagttgcttagatcaacttaagatatcatcaaaagtttgattcagccataaaatcgtcattagttagggtaaggtgcattccaactacaa 85561  T
Q  255 caatcgtcttacctctcaaatggggcaattcaaacttgtcaaacggccatgactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaa 354  Q
    |||| ||||| ||| |  ||||||| ||||||||||||||||||   || ||||| ||||||| ||       |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  85562 caattgtctt-cct-ttgaatggggtaattcaaacttgtcaaac-aacaggactcgagcatttcgcaagtacctcatgtttctcctttgaaaatattaaa 85658  T
Q  355 ttcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggaatgaagctca 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  85659 ttcttgttatgctggtttagatgaaggtattaagtgtcaaggattgaacctca 85711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 489 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 85624 - 85545
Alignment:
Q  489 gcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatgcac 570  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  85624 gcgaaatgctcgagtcctgttgtttgacaagtttgaatt-accccattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatgcac 85545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 570 - 620
Target Start/End: Original strand, 85548 - 85598
Alignment:
Q  570 cattccaactgcaacaattgtcttactctggatggggcaattcaaacttgt 620  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||    
T  85548 cattccaactacaacaattgtcttcctttgaatggggtaattcaaacttgt 85598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 101; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Original strand, 24900 - 25076
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24900 agacacaaggagggtggaatacgttcggtatagacgtacaacgctcgaggaggggagagtagcattcagttgggtggaattaacgaacaacgaaaatgtg 24999  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatat 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||| | || ||||| |||||||||||||||||    
T  25000 acgagcatgttttgggagcacaacatgttctagtggatctatttgcggataacattgctaagatcaactgaagatat 25076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0618 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0618
Description:

Target: scaffold0618; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 738 - 886
Target Start/End: Complemental strand, 5055 - 4907
Alignment:
Q  738 tggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaatgcaatgt 837  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||||    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5055 tggagtcctgctgcttagcaagtttgaatttgccccattcactaataagataattgttgcagttggaagttacattccggaatgtaatgtaatgcaatgt 4956  T
Q  838 aatttgataacatatatagttaaatatgcataatacattttgttttgaa 886  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  4955 aatgtgataacatatatagttgaataagcataatacattttgttttgaa 4907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 78; Significance: 8e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Original strand, 63971 - 64095
Alignment:
Q  14 agacacaaagagggtgaaatacgttcggtataaacgtccaacgctcaacaaggggagagtatcattcacttgggtggaattaacgaacgacgaaaacgtg 113  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  63971 agacacaaggagggtggagcacgttcggtataaatgtccaacgctcgacaaggg-agagtatcattcagttgagtggaatcaatgaacgacgaaaacgtg 64069  T
Q  114 acgagcatgttttgggagcacaacat 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  64070 acgagcatgttttgggagcacaacat 64095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 264
Target Start/End: Original strand, 64098 - 64194
Alignment:
Q  168 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcgtcattagttagagtaaggtgcattccaactacaacaatcgtctt 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  64098 ttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccaccagaagatcgtcattaggtagggtaaggtacattccaactacaacaattgtctt 64194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 511 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 64225 - 64171
Alignment:
Q  511 tttggcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 567  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  64225 tttggcaagtttgaatt-acttcattcaaagg-aagacaattgttgtagttggaatg 64171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 400
Target Start/End: Original strand, 64251 - 64306
Alignment:
Q  346 aagattaaattcttgttatgctggtttagatgaaggtatt-aagtgtcaaggaatg 400  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  64251 aagattaaattcttgttaggctgatttcaatgaaggtattgaagtgtcaaggaatg 64306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1700 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 5)
Name: scaffold1700
Description:

Target: scaffold1700; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 423 - 547
Target Start/End: Original strand, 1 - 125
Alignment:
Q  423 aatactatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaagnnnnnnnntgaatgcggggcgaaatgcttgagtcctgttatttggcaagttt 522  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  1 aataccatcatctaaagcaagcctaacaaaaatttattcttttcaaaggaaaaacatgaatgtcgggcgaaatgcttgagtcctgttgtttcgccagttt 100  T
Q  523 gaatttaccccattcaaaggtaaga 547  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  101 gaatttaccccattcaaaggtaaga 125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1700; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 587 - 643
Target Start/End: Original strand, 130 - 186
Alignment:
Q  587 ttgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaattggcaggactccagcattc 643  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  130 ttgtcttactctggatggggcaattcaaacttgttaatcggcaggactccaacattc 186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1700; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 82 - 1
Alignment:
Q  305 gactcaagcattttgcccaacgttcatgtttttcctttgaaaagattaaattcttgttatgc-tggtttagatgaaggtatt 385  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||    
T  82 gactcaagcatttcgcccgacattcatgtttttcctttgaaaagaataaatttttgttaggcttgctttagatgatggtatt 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1700; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 515 - 567
Target Start/End: Original strand, 384 - 436
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaatg 567  Q
    |||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  384 gcaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaatg 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1700; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 753 - 805
Target Start/End: Original strand, 382 - 434
Alignment:
Q  753 tagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaa 805  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  382 tagcaagtttgaatttgccccattcaggggcaagacaattgttgtagttggaa 434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 731 - 840
Target Start/End: Complemental strand, 108086 - 107977
Alignment:
Q  731 cgaatattggagtcctgcgatttagcaagtttgaattttcctcattcaagggtaagataattgttgtagttggaaggtacattccggaatgtaatgtaat 830  Q
    |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  108086 cgaatattggagtcttgctgcttagcaagtttgaatttacttcatttaaaggtaagataattgttgtagttggaaggtgcattcccgaatgtaatgtaat 107987  T
Q  831 gcaatgtaat 840  Q
      ||||||||    
T  107986 ctaatgtaat 107977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 515 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 108062 - 108012
Alignment:
Q  515 gcaagtttgaatttaccccattcaaaggtaagacaattgttgtagttggaa 565  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  108062 gcaagtttgaatttacttcatttaaaggtaagataattgttgtagttggaa 108012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 220
Target Start/End: Original strand, 5453 - 5550
Alignment:
Q  123 ttttgggagcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaagatcg 220  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||   || |||||| |||||||  ||||||||||  |||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  5453 ttttggcagcacaacatgttcccatggatcaatatgtttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaacagtttgatttcgccagaagatcg 5550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 215
Target Start/End: Original strand, 36775 - 36860
Alignment:
Q  130 agcacaacatgttccaatggatcgatatgcgggtgacgttgctgagatcaactgaagatatcatcaaaagtttgattccgcgagaa 215  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||  || |||||| |||||||  ||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||||    
T  36775 agcacatcatgttcccgtggatcgatatgcttgtcacgttgttgagatcgcctgaagatattctcaagagtttaattccgctagaa 36860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University