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Alignment Overview

Query: NF2220_low_44 (Length: 218)

Name: NF2220_low_44
Description: NF2220
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2220_low_44
NF2220_low_44
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (38-190)||(35668246-35668398)
chr7 (38-193)||(8296446-8296601)
chr7 (38-193)||(38184394-38184549)
chr7 (38-193)||(39880231-39880386)
chr7 (44-193)||(48343788-48343937)
chr7 (39-193)||(12231338-12231491)
chr7 (52-193)||(34345696-34345837)
chr7 (38-190)||(37710761-37710917)
chr7 (38-193)||(39767043-39767197)
chr7 (39-193)||(28293590-28293743)
chr7 (38-193)||(14313115-14313270)
chr7 (38-193)||(40259785-40259939)
chr7 (41-190)||(16083207-16083356)
chr7 (38-193)||(19071920-19072069)
chr7 (38-193)||(21366462-21366616)
chr7 (38-190)||(28295006-28295157)
chr7 (38-193)||(38450030-38450182)
chr7 (38-184)||(35434609-35434754)
chr7 (38-193)||(33210482-33210636)
chr7 (38-193)||(4236345-4236499)
chr7 (91-193)||(28312304-28312406)
chr7 (38-99)||(28311987-28312048)
chr7 (161-190)||(21387084-21387113)
chr7 (161-190)||(24212532-24212561)
chr7 (161-193)||(21386600-21386632)
chr7 (161-193)||(29644805-29644837)
chr7 (161-193)||(33696711-33696743)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (38-193)||(16894632-16894787)
chr6 (39-189)||(15192012-15192162)
chr6 (39-189)||(15468389-15468539)
chr6 (38-193)||(1798733-1798887)
chr6 (39-193)||(26582921-26583072)
chr6 (38-193)||(8590414-8590568)
chr6 (91-193)||(29723293-29723395)
chr6 (38-193)||(32596951-32597100)
chr6 (105-193)||(29212973-29213060)
chr6 (38-99)||(11641320-11641381)
chr6 (42-99)||(29723651-29723708)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (38-193)||(27500653-27500808)
chr5 (38-190)||(36498689-36498841)
chr5 (38-193)||(5380644-5380799)
chr5 (38-190)||(4000342-4000494)
chr5 (38-193)||(10623216-10623371)
chr5 (41-193)||(39047521-39047672)
chr5 (38-193)||(25751926-25752080)
chr5 (38-193)||(29835810-29835964)
chr5 (38-193)||(38090546-38090700)
chr5 (41-193)||(29235675-29235830)
chr5 (41-193)||(26394634-26394785)
chr5 (38-193)||(746559-746713)
chr5 (38-188)||(33159036-33159185)
chr5 (38-189)||(13968545-13968693)
chr5 (38-193)||(2745246-2745388)
chr5 (38-189)||(25525704-25525847)
chr5 (91-190)||(730148-730247)
chr5 (38-103)||(40988665-40988730)
chr5 (41-99)||(729834-729892)
chr5 (118-193)||(40988703-40988776)
chr5 (161-193)||(42273085-42273117)
chr5 (161-190)||(11276779-11276808)
chr5 (161-193)||(6835226-6835258)
chr5 (161-193)||(7951331-7951363)
chr5 (161-193)||(13545265-13545297)
chr5 (161-193)||(25455772-25455804)
chr5 (161-189)||(38424804-38424832)
[»] chr3 (32 HSPs)
chr3 (38-193)||(3021281-3021436)
chr3 (38-193)||(13268655-13268810)
chr3 (38-193)||(40278332-40278487)
chr3 (38-190)||(14899179-14899331)
chr3 (38-193)||(33981615-33981770)
chr3 (38-190)||(3937790-3937942)
chr3 (38-193)||(23336237-23336392)
chr3 (38-193)||(45970467-45970621)
chr3 (38-180)||(27655476-27655618)
chr3 (38-193)||(4070242-4070396)
chr3 (39-193)||(1587049-1587202)
chr3 (41-193)||(22847638-22847788)
chr3 (38-193)||(29492219-29492373)
chr3 (38-193)||(33778337-33778491)
chr3 (38-189)||(21576761-21576910)
chr3 (38-193)||(17754028-17754182)
chr3 (46-193)||(43914444-43914590)
chr3 (44-189)||(39285121-39285267)
chr3 (38-193)||(19055348-19055502)
chr3 (46-193)||(37089677-37089823)
chr3 (38-193)||(45149003-45149158)
chr3 (38-193)||(49316255-49316411)
chr3 (68-193)||(38667332-38667456)
chr3 (91-193)||(21414538-21414640)
chr3 (38-187)||(33236977-33237126)
chr3 (91-193)||(43353753-43353856)
chr3 (38-99)||(43354112-43354173)
chr3 (64-122)||(30924855-30924913)
chr3 (161-190)||(2444605-2444634)
chr3 (161-190)||(50314267-50314296)
chr3 (141-193)||(10473636-10473687)
chr3 (161-193)||(54493498-54493530)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (16-193)||(37261970-37262147)
chr8 (38-193)||(3178002-3178157)
chr8 (38-193)||(38256626-38256781)
chr8 (38-193)||(44868862-44869017)
chr8 (38-193)||(42994271-42994426)
chr8 (38-193)||(31204092-31204247)
chr8 (44-193)||(4488584-4488732)
chr8 (38-193)||(41392751-41392905)
chr8 (38-193)||(41575139-41575293)
chr8 (38-193)||(30728849-30729003)
chr8 (38-193)||(42355736-42355890)
chr8 (38-188)||(12764308-12764457)
chr8 (39-189)||(34055267-34055416)
chr8 (38-193)||(41542989-41543143)
chr8 (91-193)||(1143784-1143886)
chr8 (91-193)||(44671208-44671310)
chr8 (38-124)||(39584363-39584449)
chr8 (38-98)||(1143467-1143527)
chr8 (39-99)||(44671566-44671626)
chr8 (161-190)||(23565852-23565881)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (41-193)||(42987776-42987928)
chr4 (38-193)||(41904452-41904607)
chr4 (41-190)||(34017285-34017434)
chr4 (38-189)||(39633308-39633459)
chr4 (38-189)||(40278469-40278620)
chr4 (38-193)||(54283815-54283970)
chr4 (44-193)||(19538211-19538360)
chr4 (38-193)||(40034090-40034245)
chr4 (38-189)||(54444756-54444906)
chr4 (38-193)||(36927640-36927794)
chr4 (38-193)||(36076753-36076907)
chr4 (39-193)||(1565666-1565819)
chr4 (40-193)||(38035515-38035668)
chr4 (38-193)||(42341917-42342069)
chr4 (47-189)||(220563-220704)
chr4 (39-193)||(38392246-38392399)
chr4 (38-193)||(6956005-6956160)
chr4 (91-193)||(6450314-6450416)
chr4 (91-193)||(19169517-19169619)
chr4 (91-180)||(204964-205053)
chr4 (75-182)||(46614480-46614586)
chr4 (38-99)||(19169875-19169936)
chr4 (38-99)||(204648-204709)
chr4 (160-190)||(21857836-21857866)
chr4 (160-190)||(21913699-21913729)
chr4 (161-190)||(35194722-35194751)
chr4 (161-190)||(40220704-40220733)
chr4 (161-190)||(43419803-43419832)
chr4 (161-193)||(12594796-12594828)
chr4 (161-189)||(21858322-21858350)
chr4 (161-189)||(21914185-21914213)
chr4 (161-189)||(23161324-23161352)
chr4 (161-189)||(25490065-25490093)
chr4 (161-193)||(35194238-35194270)
[»] chr1 (28 HSPs)
chr1 (44-193)||(11707229-11707378)
chr1 (38-193)||(44432518-44432673)
chr1 (44-190)||(36723772-36723918)
chr1 (39-193)||(46584978-46585132)
chr1 (39-193)||(38623567-38623719)
chr1 (38-193)||(43505739-43505892)
chr1 (39-193)||(44744344-44744496)
chr1 (38-193)||(45217515-45217669)
chr1 (38-193)||(27326753-27326911)
chr1 (41-193)||(52580360-52580511)
chr1 (38-193)||(33740674-33740826)
chr1 (38-193)||(32536390-32536543)
chr1 (38-190)||(44156646-44156799)
chr1 (38-190)||(9680757-9680900)
chr1 (44-193)||(8742367-8742513)
chr1 (38-193)||(9034334-9034486)
chr1 (38-193)||(10373759-10373913)
chr1 (91-193)||(24482161-24482263)
chr1 (38-145)||(27134529-27134636)
chr1 (39-109)||(35392743-35392813)
chr1 (38-99)||(24482519-24482580)
chr1 (118-193)||(35392702-35392776)
chr1 (118-193)||(37327711-37327787)
chr1 (39-109)||(37327753-37327824)
chr1 (161-190)||(10613693-10613722)
chr1 (161-190)||(22389038-22389067)
chr1 (161-190)||(43214696-43214725)
chr1 (161-193)||(43215179-43215211)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (38-190)||(29366020-29366172)
chr2 (38-190)||(45159809-45159961)
chr2 (38-190)||(17540106-17540258)
chr2 (38-190)||(28587035-28587187)
chr2 (39-193)||(5438238-5438391)
chr2 (38-193)||(18060241-18060395)
chr2 (38-186)||(43207077-43207224)
chr2 (38-193)||(6082033-6082187)
chr2 (39-193)||(41726839-41726992)
chr2 (38-193)||(27482018-27482168)
chr2 (38-189)||(10574821-10574967)
chr2 (91-193)||(28637236-28637338)
chr2 (91-189)||(41286505-41286603)
chr2 (91-193)||(28150084-28150186)
chr2 (38-99)||(28636919-28636980)
chr2 (44-99)||(41286858-41286913)
chr2 (38-99)||(28150442-28150503)
chr2 (161-193)||(10316018-10316050)
chr2 (161-193)||(10316382-10316414)
chr2 (161-193)||(10316707-10316739)
chr2 (161-193)||(10317064-10317096)
chr2 (161-190)||(7338691-7338720)
chr2 (161-190)||(14252087-14252116)
chr2 (161-189)||(9758971-9758999)
chr2 (161-189)||(10315658-10315686)
chr2 (161-193)||(23849174-23849206)
chr2 (161-193)||(41425638-41425670)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (38-193)||(131104-131259)
[»] scaffold0214 (3 HSPs)
scaffold0214 (38-193)||(16336-16491)
scaffold0214 (145-193)||(16044-16092)
scaffold0214 (145-193)||(28540-28588)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (91-193)||(42288-42390)
scaffold0015 (40-99)||(41973-42032)
[»] scaffold0672 (2 HSPs)
scaffold0672 (91-193)||(6090-6192)
scaffold0672 (38-100)||(5777-5839)
[»] scaffold0474 (1 HSPs)
scaffold0474 (41-189)||(12351-12497)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Original strand, 35668246 - 35668398
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35668246 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatat 35668345  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35668346 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 35668398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8296601 - 8296446
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8296601 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattacatacatat 8296502  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8296501 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 8296446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38184549 - 38184394
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38184549 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattacatacatat 38184450  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38184449 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 38184394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39880386 - 39880231
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39880386 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacatttcatacatat 39880287  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39880286 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgtctttaatatcttttgagtcaaggat 39880231  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 48343937 - 48343788
Alignment:
Q  44 tatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48343937 tatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacatttcatacatatttatat 48343838  T
Q  144 gatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48343837 gatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 48343788  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12231491 - 12231338
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12231491 tcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagatt 12231392  T
Q  139 tatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12231391 tatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 12231338  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 52 - 193
Target Start/End: Original strand, 34345696 - 34345837
Alignment:
Q  52 tatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaata 151  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34345696 tatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgatcaatagctgcataaaaatacattccatacagatttatatgatcaata 34345795  T
Q  152 attattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34345796 attgttaatttgtttgtctttaatatcttttgagtcaaggat 34345837  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 37710917 - 37710761
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatg----agagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatac 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37710917 gtcttttatatatgtatatatttaaaacacatgcatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatac 37710818  T
Q  134 atatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37710817 atatttatatgatcaataattgttaatttgtttgcttttaatatcttttgagtcaag 37710761  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39767197 - 39767043
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39767197 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacattagagtaacatacgttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaa-atacattccatacatat 39767099  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39767098 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgtctttaatatcttttaagtcaaggat 39767043  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28293743 - 28293590
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28293743 tcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagatt 28293644  T
Q  139 tatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28293643 tatatgatcaataattgtcaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 28293590  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14313270 - 14313115
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||  ||||| ||    
T  14313270 gtcttttatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatatgaccaacagctgcataaacatatattttatacagat 14313171  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14313170 ttatatgatcaataatttttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 14313115  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40259939 - 40259785
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || | ||    
T  40259939 gtcttctaaatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataacttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccgtaaagat 40259840  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40259839 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 40259785  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16083356 - 16083207
Alignment:
Q  41 ttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatattta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  16083356 ttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaagatttatatgaccaatagctacataaacatacattccctacaaattta 16083257  T
Q  141 tatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16083256 tatgatgaataattgttgatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 16083207  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 19071920 - 19072069
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19071920 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacat------aacataccttccataaagatttatatgaccaataactgcataaacatacattccatacatat 19072013  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19072014 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcatttgagtcaaggat 19072069  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21366616 - 21366462
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  21366616 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttcgataaagatttatatgaccaatagctccataaacatacattccataaagat 21366517  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21366516 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcttttaatatcttttgaatcaaggat 21366462  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Original strand, 28295006 - 28295157
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | | ||    
T  28295006 gtcttttatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccacaaagat 28295105  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28295106 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcttttaatatcttttgagtcaag 28295157  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38450182 - 38450030
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | |     
T  38450182 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgag--taacataccttccataaagatttatatgaccaatagttgcataaacatacattccataaagac 38450085  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38450084 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 38450030  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 38 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35434754 - 35434609
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35434754 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 35434655  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttga 184  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  35434654 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttattatctgttga 35434609  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33210636 - 33210482
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||||| |||| | ||    
T  33210636 gtcttctatatatgtatatatttagaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatgttaccaatagctgtataaacatacatttcataaagat 33210537  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33210536 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 33210482  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4236499 - 4236345
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  4236499 gtcttctatatatgtctatatttaaaacacatgagattaacataccttccaaaaagatttatatgaccaatagttgcataaacatacattccataaagat 4236400  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  4236399 ttatacgatcaataattgttaa-ttgtttatttttaatatcttttaagtcaaggat 4236345  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Original strand, 28312304 - 28312406
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28312304 aagatttatatgaccaatagttgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattgttaatttgtttgtctttaatatcttttaagtcaag 28312403  T
Q  191 gat 193  Q
    |||    
T  28312404 gat 28312406  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Original strand, 28311987 - 28312048
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 99  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28311987 gtcttttatacatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 28312048  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 190
Target Start/End: Original strand, 21387084 - 21387113
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21387084 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 21387113  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 24212561 - 24212532
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24212561 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 24212532  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21386632 - 21386600
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21386632 ttgtttacctttaatatcttttgagtcaaggat 21386600  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Original strand, 29644805 - 29644837
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29644805 ttgtttggctttaatatcttttgagtcaaggat 29644837  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33696743 - 33696711
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33696743 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcatggat 33696711  T

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Target: chr6 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16894787 - 16894632
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894787 gtcttctaaatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgacaaatagctgcataaacatacattccatacatat 16894688  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894687 ttatatgatcaataattgttaatttatttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 16894632  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15192162 - 15192012
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15192162 tcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatctttcttaaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatatt 15192063  T
Q  139 tatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15192062 tatacaatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 15192012  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Original strand, 15468389 - 15468539
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15468389 tcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatctttcttaaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatatt 15468488  T
Q  139 tatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15468489 tatacaatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 15468539  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1798887 - 1798733
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  1798887 gtcttatatatatgtatatatttaaaatacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatggctgcataaacatacattccataaagat 1798788  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1798787 ttatataatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 1798733  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 26582921 - 26583072
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatt 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26582921 tcttttatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatataaccaatagctgcataaacatacattccataaagatt 26583020  T
Q  139 tatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26583021 tatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatc--ttgagtcaaggat 26583072  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 8590414 - 8590568
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||| | ||    
T  8590414 gtcttctatatatgtatatatttaaaacatatgagactaacataccttccataaagatttatatgaccaataactgcataaacttacattccataaagat 8590513  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  8590514 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgtctttaatatcttttaagtcaaggat 8590568  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29723395 - 29723293
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  29723395 aagatttatataaccaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattgttaatttgtttgtctttaatatcttttgagacaag 29723296  T
Q  191 gat 193  Q
    |||    
T  29723295 gat 29723293  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 32596951 - 32597100
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||   ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  32596951 gtcttctatacatgtatatatttaaaacacatgag--taa---acctttcataaagatttatattaccaatagctgcataaacatacatttcataaagat 32597045  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32597046 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagttaaggat 32597100  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29213060 - 29212973
Alignment:
Q  105 aaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29213060 aaatagatgcataaacatacattccataaagatttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 29212973  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Original strand, 11641320 - 11641381
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11641320 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacgttccataaagatttat 11641381  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 29723708 - 29723651
Alignment:
Q  42 tctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29723708 tctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 29723651  T

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Target: chr5 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 27500653 - 27500808
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27500653 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagttgcataaacatacattccatacatat 27500752  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27500753 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 27500808  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 36498841 - 36498689
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36498841 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatttgaccaatagctgcataaacatacattccatacatat 36498742  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36498741 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcttttaatatcttttgagtcaag 36498689  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5380799 - 5380644
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  5380799 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccagaaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatatagat 5380700  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5380699 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 5380644  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Original strand, 4000342 - 4000494
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4000342 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatttgaccaatagctgcataaacatacattccatacatat 4000441  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4000442 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcttttaatatcttttgagtcaag 4000494  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 10623216 - 10623371
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10623216 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaagatttatattaccaatagctgcataaacatacatttcatacatat 10623315  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623316 ttatacgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 10623371  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39047672 - 39047521
Alignment:
Q  41 ttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatattta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39047672 ttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaatattta 39047573  T
Q  141 tatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39047572 tatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgggtcaaggat 39047521  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25752080 - 25751926
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  25752080 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttacataaagatttatatgatcaatagctgcataaacatacattccataaagat 25751981  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25751980 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 25751926  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 29835810 - 29835964
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  29835810 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 29835909  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29835910 ttatatcatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 29835964  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38090700 - 38090546
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  38090700 gtcttctaaatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagttgcataaacatacattccataaagat 38090601  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38090600 ttatatgatcaataattattaa-ttgtttgcctttaatatcttttgaatcaaggat 38090546  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29235830 - 29235675
Alignment:
Q  41 ttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat--- 137  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  29235830 ttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatataaccaatagctgcataaacatacattccatacatattta 29235731  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  29235730 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatattttttgagtgaaggat 29235675  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Original strand, 26394634 - 26394785
Alignment:
Q  41 ttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatattta 140  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  26394634 ttctaaatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatactttccataaagatttatgtgacaaatagctgcataaacatacatttcataaagattta 26394733  T
Q  141 tatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26394734 tatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 26394785  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 746713 - 746559
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  746713 gtcttctaaatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 746614  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||    
T  746613 ttatatgatcaataattattaa-ttgtttgtctttaatacattttgagtaaaggat 746559  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 33159185 - 33159036
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  33159185 gtcttctatatatgtttttatttaaaacacatgagagtaacatactttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 33159086  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtca 188  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33159085 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtca 33159036  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Original strand, 13968545 - 13968693
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||| | |     
T  13968545 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgag--taacataccttccataaagatttacatgaccaatagctgcctaaacatacattccataaagac 13968642  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13968643 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 13968693  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 2745246 - 2745388
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||             |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2745246 gtcttctatatatgtatgtatttaaaacacatgagaataacatacctt-------------tatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatat 2745332  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2745333 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 2745388  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Original strand, 25525704 - 25525847
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  25525704 gtcttctatatacgtatatgtttaaaacacatgagactagcataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 25525803  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    ||||| |||||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25525804 ttatacgatcaataa--------ttgtttgcctttaatatcttttaagtcaa 25525847  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 91 - 190
Target Start/End: Original strand, 730148 - 730247
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  730148 aagatttatatgactaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattgttcatttgtttgtctttaataccttttgagtcaag 730247  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 103
Target Start/End: Original strand, 40988665 - 40988730
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatga 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40988665 gtcttctaaatatgtatatatttaaaacacatgacagtaacataccttccataaagatttatatga 40988730  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 99
Target Start/End: Original strand, 729834 - 729892
Alignment:
Q  41 ttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  729834 ttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaagatttat 729892  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 118 - 193
Target Start/End: Original strand, 40988703 - 40988776
Alignment:
Q  118 aacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40988703 aacataccttccataaagatttatatga-caataattgttaatt-gtttgcttttaatatcttttgagtcaaggat 40988776  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42273117 - 42273085
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42273117 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 42273085  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11276808 - 11276779
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11276808 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 11276779  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Original strand, 6835226 - 6835258
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6835226 ttgtttgcctttaatatcttttgagttaaggat 6835258  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Original strand, 7951331 - 7951363
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7951331 ttgtttgtctttaatatcttttgagtcaaggat 7951363  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Original strand, 13545265 - 13545297
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13545265 ttgtttgtctttaatatcttttgagtcaaggat 13545297  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25455804 - 25455772
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25455804 ttgtttgccttaaatatcttttgagtcaaggat 25455772  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 189
Target Start/End: Original strand, 38424804 - 38424832
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38424804 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 38424832  T

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Target: chr3 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 32)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3021436 - 3021281
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3021436 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgagcaatagctgcataaacatacattccatacaaat 3021337  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3021336 ttatatgatcaataattattaatttgtttgtctttaatatcttttgagtcaaggat 3021281  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13268810 - 13268655
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13268810 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacatcccataaagatttatatgacaaatagctgcataaacatacattccatacatat 13268711  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13268710 ttatatgatcaataattgtttatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 13268655  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40278487 - 40278332
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40278487 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatattaccaatagctgcataaacatacattccatacagat 40278388  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40278387 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 40278332  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Original strand, 14899179 - 14899331
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14899179 gtcttctatatatgtatatgtttaagacacatgagagtaacatatcttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatat 14899278  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14899279 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 14899331  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33981770 - 33981615
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33981770 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacatttcatacatat 33981671  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33981670 ttatatgattaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 33981615  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3937942 - 3937790
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937942 gtcttatatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttgtatgaccaatagctgcataaacatgcattccatacatat 3937843  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3937842 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 3937790  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23336392 - 23336237
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23336392 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaatatttatatgacaaatagctgcataaacatacatttcatacaaat 23336293  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23336292 ttatatgatcaataatcgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 23336237  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 45970467 - 45970621
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  45970467 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgatcaatagctgcataaacatacattccataaagat 45970566  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45970567 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatattttttgagtcaaggat 45970621  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 27655618 - 27655476
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27655618 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacctcccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatat 27655519  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatctt 180  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27655518 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatctt 27655476  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 4070242 - 4070396
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  4070242 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 4070341  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4070342 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 4070396  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1587202 - 1587049
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatt 138  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1587202 tcttatatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagatt 1587103  T
Q  139 tatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1587102 tatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatattttttgagtcaaggat 1587049  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Original strand, 22847638 - 22847788
Alignment:
Q  41 ttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatattta 140  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22847638 ttctacatatgtatatatttaaaacacttgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaataactgcataaacatacattccatacagattta 22847737  T
Q  141 tatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22847738 tatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatc--ttgagtcaaggat 22847788  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29492373 - 29492219
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  29492373 gtcttttatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatactttccataaagatttatatgactaatagctgcataaacatacattccataaagat 29492274  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29492273 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgaatcaaggat 29492219  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 33778337 - 33778491
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  33778337 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatatgaccaatagatgcataaacatacattccataaagat 33778436  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33778437 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatctttcgagtcaaggat 33778491  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 21576910 - 21576761
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21576910 gtcttctatatatgtatatatttaaaacac--gagagtaacatactttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatactttccatacatat 21576813  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21576812 ttatatgatcaataattgttaatttatttgcttttaatatcttttgagtcaa 21576761  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17754182 - 17754028
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17754182 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 17754083  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17754082 ttatatgatcaatacttgttaa-ttgtttgcctttaatatgttttgactcaaggat 17754028  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 46 - 193
Target Start/End: Original strand, 43914444 - 43914590
Alignment:
Q  46 tatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatga 145  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  43914444 tatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttctatacagatttatatgactaatagctgcataaacatacattccataaagatttatatga 43914543  T
Q  146 tcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43914544 tcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 43914590  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 44 - 189
Target Start/End: Original strand, 39285121 - 39285267
Alignment:
Q  44 tatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaa-catacattccatacatatttata 142  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  39285121 tatatatgtatatatttaaaacacaagagagtaacatacattccacaaagatttatatgaccaatagctgcataaaacatatattccatacatatttata 39285220  T
Q  143 tgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39285221 tgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 39285267  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19055502 - 19055348
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19055502 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatattttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 19055403  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19055402 ttatatgatcaatacttgttaa-ttgtttgcctttaatatgttttgactcaaggat 19055348  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37089823 - 37089677
Alignment:
Q  46 tatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatga 145  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  37089823 tatatatatatatttaaaacacatgagagtaatatatcttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagatttatatga 37089724  T
Q  146 tcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089723 tcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 37089677  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45149158 - 45149003
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| || ||    
T  45149158 gtcttctatatatgtatacatttaaaccacttgagagtaacataccttccataaatatttatatgaccaatagctacataaacatacatttcatgcagat 45149059  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45149058 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttctgagtcaaggat 45149003  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 49316411 - 49316255
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatga---gagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccataca 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |    
T  49316411 gtcttctatatatgtatacatttaaaacacatgatgagagtaacataccttctataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatgta 49316312  T
Q  135 tatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  49316311 tatttatatgatcaataattcttaatttttttgcctttaatatc--ttgagtcaaggat 49316255  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38667456 - 38667332
Alignment:
Q  68 atgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttg 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38667456 atgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagttgcataaacatacattccataaagatttatatgatcaataattgttaa-ttgtttg 38667358  T
Q  168 cctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  38667357 cctttaatatctttcgagtcaaggat 38667332  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Original strand, 21414538 - 21414640
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21414538 aagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattgttaatttgtttgtctttaatatcttttgagtcaag 21414637  T
Q  191 gat 193  Q
    |||    
T  21414638 gat 21414640  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33237126 - 33236977
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaa-gatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacata 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||| | |    
T  33237126 gtcttctaaatatgtatatatttaaaacacttgagagcaacatatcttccataaaagatttatatgaccaatatctacataaacatacattccataaaga 33237027  T
Q  137 tttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtc 187  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33237026 tttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtc 33236977  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43353856 - 43353753
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatc-ttttgagtcaa 189  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  43353856 aagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattgttaatttgtttgtctttaatatctttttgagtcaa 43353757  T
Q  190 ggat 193  Q
    ||||    
T  43353756 ggat 43353753  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 43354173 - 43354112
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43354173 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 43354112  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 122
Target Start/End: Original strand, 30924855 - 30924913
Alignment:
Q  64 acacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacat 122  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  30924855 acacgtgagagtaacataccttccataacgatttatatggtcaatagctgcataaacat 30924913  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2444634 - 2444605
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2444634 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 2444605  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 190
Target Start/End: Original strand, 50314267 - 50314296
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50314267 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 50314296  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 193
Target Start/End: Original strand, 10473636 - 10473687
Alignment:
Q  141 tatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  10473636 tatgatcaatatttattaa-ttgtttgtctttaatatgttttcagtcaaggat 10473687  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Original strand, 54493498 - 54493530
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54493498 ttgtttgcctttaatatattttgagtcaaggat 54493530  T

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Target: chr8 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37262147 - 37261970
Alignment:
Q  16 attaccaacttgagtnnnnnnngtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgca 115  Q
    |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37262147 attaccaacttgagtaaaaaaagtcttctatatatgtatatatttaaaacatatgagagtaacatacattccataaagatttatatgacaaatagctgca 37262048  T
Q  116 taaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37262047 taaacatacattccatacagatttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 37261970  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3178157 - 3178002
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3178157 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagatgcataaacatacattccatacatat 3178058  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3178057 ttgtatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 3178002  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38256781 - 38256626
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38256781 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacatttcatacatat 38256682  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38256681 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 38256626  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 44868862 - 44869017
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44868862 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatag 44868961  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44868962 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 44869017  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 42994271 - 42994426
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42994271 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccctaaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatatatat 42994370  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42994371 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatctttcgagtcaaggat 42994426  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31204247 - 31204092
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31204247 gtcttctatatatgtatatatgtaaaacacatgagaataacatactttccataaagatttatatgatcaattgctgcataaacatacattccatacagat 31204148  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31204147 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgaatcaaggat 31204092  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Original strand, 4488584 - 4488732
Alignment:
Q  44 tatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatat 143  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4488584 tatatatatatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagatttatat 4488683  T
Q  144 gatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4488684 gatcaataattattaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 4488732  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41392905 - 41392751
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  41392905 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 41392806  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41392805 ttatatgataaataattgttaa-ttgtttgcatttaatatcttttgagtcaaggat 41392751  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41575293 - 41575139
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  41575293 gtcttctaaatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 41575194  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41575193 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcttttaatatcttttgagtgaaggat 41575139  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 30728849 - 30729003
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  30728849 gtcttctatatatgtatatatttcaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctacataaacatacattccataaagat 30728948  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30728949 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgaatctaggat 30729003  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42355890 - 42355736
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||    
T  42355890 gtcttcaatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatatgatcaatagttgcataaatatacattccataaagat 42355791  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42355790 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgtctttaatatcttttgagtcaaggat 42355736  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12764457 - 12764308
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  12764457 gtcttctatgtatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataatgat 12764358  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtca 188  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12764357 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttaagtca 12764308  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34055416 - 34055267
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  34055416 tcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaatatacattccataaagatttatatgaccaatagttgcataaacatacattccataaatatt 34055317  T
Q  139 tatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34055316 tatatgatcaataattgttaa-ttgtttgtctttaatatcttttgagtcaa 34055267  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 41542989 - 41543143
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  41542989 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 41543088  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||||    
T  41543089 ttatatgataaataattgttaa-ttgttcgtatttaatattttttgagttaaggat 41543143  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Original strand, 1143784 - 1143886
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1143784 aagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgtctttaatatcttttgagccaag 1143883  T
Q  191 gat 193  Q
    |||    
T  1143884 gat 1143886  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44671310 - 44671208
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  44671310 aagatttatatgacaaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattgttaatttgtttgtctttgatattttttgagtcaag 44671211  T
Q  191 gat 193  Q
    |||    
T  44671210 gat 44671208  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 38 - 124
Target Start/End: Original strand, 39584363 - 39584449
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39584363 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaatatttatatgaccaatagctgcataaacatac 39584449  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 98
Target Start/End: Original strand, 1143467 - 1143527
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagattta 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1143467 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagattta 1143527  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 44671626 - 44671566
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44671626 tcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 44671566  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 190
Target Start/End: Original strand, 23565852 - 23565881
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23565852 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 23565881  T

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Target: chr4 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Original strand, 42987776 - 42987928
Alignment:
Q  41 ttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatattta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42987776 ttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatattta 42987875  T
Q  141 tatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42987876 tataatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 42987928  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 41904452 - 41904607
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  41904452 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccgtatatat 41904551  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41904552 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 41904607  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 41 - 190
Target Start/End: Original strand, 34017285 - 34017434
Alignment:
Q  41 ttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatattta 140  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34017285 ttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatattta 34017384  T
Q  141 tatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34017385 tatgatcaataattgttaatgtgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 34017434  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Original strand, 39633308 - 39633459
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  39633308 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctacataaacatacattccatacagat 39633407  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39633408 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 39633459  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 40278620 - 40278469
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  40278620 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaataactgcataaacatacattccatacagat 40278521  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40278520 ctatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 40278469  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 54283815 - 54283970
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54283815 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatat 54283914  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54283915 ttataggatcaataattgttaatttgtttgccattaatatcttttgagtcaaggat 54283970  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Original strand, 19538211 - 19538360
Alignment:
Q  44 tatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatat 143  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19538211 tatatatgtatatatttaaaactcatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacatttcatacatatttatat 19538310  T
Q  144 gatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19538311 gatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcagggat 19538360  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 40034090 - 40034245
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  40034090 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatatagat 40034189  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40034190 ttatatgatcaacaattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagttaaggat 40034245  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 54444906 - 54444756
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54444906 gtcttctatatatgtatatatttgaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaatat 54444807  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54444806 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 54444756  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36927794 - 36927640
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  36927794 gtcttctaaatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctacataaacatacattccataaagat 36927695  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36927694 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 36927640  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36076907 - 36076753
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  36076907 gtcttctatatatgtatatatttaaaatacatgagagtaacatactttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 36076808  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36076807 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatattttgagtcaaggat 36076753  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 1565666 - 1565819
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | |||    
T  1565666 tcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatatgaccaatagatgcataaacatacattccataaagatt 1565765  T
Q  139 tatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1565766 tatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatattttttgagtcaaggat 1565819  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 40 - 193
Target Start/End: Original strand, 38035515 - 38035668
Alignment:
Q  40 cttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatattt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  38035515 cttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttctataaagatttatatgaccaatagctccataaacatacattacatacatattt 38035614  T
Q  140 atatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  38035615 atatgatcaataattgttaatttgtttacctttaatatatttttagtcaaggat 38035668  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42342069 - 42341917
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42342069 gtcttctatatatttatatatttaaaacacatgag--taacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaatat 42341972  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42341971 ttatatgattaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 42341917  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 189
Target Start/End: Original strand, 220563 - 220704
Alignment:
Q  47 atatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgat 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  220563 atatgtatatatttaaaacacatgagactaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagatttatatgat 220662  T
Q  147 caataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  220663 caataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttaagtcaa 220704  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38392399 - 38392246
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  38392399 tcttctatatatgtatatatttcaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctacataaacatacattccataaagatt 38392300  T
Q  139 tatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38392299 tatatgattaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgaatctaggat 38392246  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 6956005 - 6956160
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  6956005 gtcttttatatatgtatttattcaaaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatatgaccaatagttgcataaacatacattccatatagat 6956104  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  6956105 ttatatgatcaataattgttaatttgtttacatttaatatgttttgagtcaaggat 6956160  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6450416 - 6450314
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6450416 aagatttatatgaccaatagctgtataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattgttaatttgtttgtctttaatatcttttgagtcaag 6450317  T
Q  191 gat 193  Q
    |||    
T  6450316 gat 6450314  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19169619 - 19169517
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  19169619 aagatttatatgaccaatagctgcataaacatgcattccatacatatttatatgatcaataattgttaatttttttgtttttaatatcttttgagtcaag 19169520  T
Q  191 gat 193  Q
    |||    
T  19169519 gat 19169517  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 180
Target Start/End: Original strand, 204964 - 205053
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatctt 180  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  204964 aagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaatagttgttaatttgtttgcctttaatatctt 205053  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 182
Target Start/End: Original strand, 46614480 - 46614586
Alignment:
Q  75 taacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaa 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  46614480 taacataccttccataaagatttatatgatcaatagctgcatgaacatacatttcataaagatttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgtctttaa 46614578  T
Q  175 tatctttt 182  Q
    ||||||||    
T  46614579 tatctttt 46614586  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 19169936 - 19169875
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19169936 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaagatttat 19169875  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Original strand, 204648 - 204709
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 99  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  204648 gtcttttatacatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 204709  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21857866 - 21857836
Alignment:
Q  160 tttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21857866 tttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 21857836  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21913729 - 21913699
Alignment:
Q  160 tttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21913729 tttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 21913699  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 190
Target Start/End: Original strand, 35194722 - 35194751
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35194722 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 35194751  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 190
Target Start/End: Original strand, 40220704 - 40220733
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40220704 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 40220733  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43419832 - 43419803
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43419832 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 43419803  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12594828 - 12594796
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12594828 ttgtctgcctttaatatcttttgagtcaaggat 12594796  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 189
Target Start/End: Original strand, 21858322 - 21858350
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21858322 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 21858350  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 189
Target Start/End: Original strand, 21914185 - 21914213
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21914185 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 21914213  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23161352 - 23161324
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23161352 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 23161324  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 189
Target Start/End: Original strand, 25490065 - 25490093
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25490065 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 25490093  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35194270 - 35194238
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35194270 ttgtttgcctttaatatattttgagtcaaggat 35194238  T

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Target: chr1 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 28)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Original strand, 11707229 - 11707378
Alignment:
Q  44 tatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatat 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11707229 tatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacagatttatat 11707328  T
Q  144 gatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11707329 gatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 11707378  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 44432518 - 44432673
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44432518 gtcttatatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttctataacgatttatatgaccaatagttgcataaacatacattccatacatat 44432617  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44432618 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 44432673  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 44 - 190
Target Start/End: Original strand, 36723772 - 36723918
Alignment:
Q  44 tatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatat 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36723772 tatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatgcattccatacatatttatat 36723871  T
Q  144 gatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36723872 gttcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 36723918  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 46585132 - 46584978
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatt 138  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46585132 tcttctatatatgtacatatttaaaacacatgagagtagcatacctttcataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacatttcatacatatt 46585033  T
Q  139 tatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46585032 tatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 46584978  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 38623567 - 38623719
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38623567 tcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaataactgcataaacatacattccatacatatt 38623666  T
Q  139 tatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  38623667 tatatgatcaataattgttaatttgtttgcttttaatatc--ttgagtcaaggat 38623719  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 43505739 - 43505892
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43505739 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacctttcataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacagat 43505838  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  43505839 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcatttaatatc--ttgagtcaaggat 43505892  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 44744344 - 44744496
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  44744344 tcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaataactgcataaacatacattccatgcagatt 44744443  T
Q  139 tatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  44744444 tatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatc--ttgagtcaaggat 44744496  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 45217515 - 45217669
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  45217515 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatactttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 45217614  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  45217615 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcttttaatatcttttgagttaaggat 45217669  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 27326753 - 27326911
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagta----acataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatac 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27326753 gtcttctatatatgt-tatatttaaaacacatgagagtaagtaacatacctttcataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacatttcatac 27326851  T
Q  134 atatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27326852 atatttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttagtatcttttgagtcaaggat 27326911  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Original strand, 52580360 - 52580511
Alignment:
Q  41 ttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatattta 140  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||    
T  52580360 ttctatatatgtatatatttcaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctacataaacatacattccataaagattta 52580459  T
Q  141 tatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  52580460 tatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgaatctaggat 52580511  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 33740674 - 33740826
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  33740674 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgag--taatgtaccttccataaagatttatatgatcaatagttgcataaacatacattccataaagat 33740771  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33740772 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgaatcaaggat 33740826  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32536543 - 32536390
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| |||| | ||    
T  32536543 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgatagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagccgtataaacatacatttcataaagat 32536444  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32536443 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatat-ttttgagtcaaggat 32536390  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 44156799 - 44156646
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgata-aatagctgcataaacatacattccatacata 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |   ||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  44156799 gtcttatatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttaaaaaaaccaatagttgcataaacatgcattccgtacata 44156700  T
Q  137 tttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44156699 tttatacgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 44156646  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Original strand, 9680757 - 9680900
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||         |||||||||    
T  9680757 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaataactgcataaa---------catacatat 9680847  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9680848 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgtctttaatatcttttgagtcaag 9680900  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Original strand, 8742367 - 8742513
Alignment:
Q  44 tatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatat 143  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  8742367 tatatatgtatatatttaaaacacatgag--taacataccttccataaagatttatatgaccaatagttgcataaacatacattccataaagacttatat 8742464  T
Q  144 gatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8742465 gatcaataattgttaa-ttgtttgtctttaatatcttttgagtcaaggat 8742513  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 9034334 - 9034486
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  9034334 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagactaa--taccttccataaaaatttatatgactaatagctgcgtaaacataaattccataaaaat 9034431  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9034432 ttatatgatcaataattgttaa-ttgttttcctttaatatcttttaagtcaaggat 9034486  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10373913 - 10373759
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagattt--atatgataaatagctgcataaacatacattccatacat 135  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |     
T  10373913 gtcttttatatatgtatatatttaaaacacatgag--taacataccttccataaagatttttatatgaccaatagctacataaacatacatttcataaag 10373816  T
Q  136 atttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10373815 acttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 10373759  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24482263 - 24482161
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24482263 aagatttatataaccaaaagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattgttaatttgtttgtctttaatatcttttgagtcaag 24482164  T
Q  191 gat 193  Q
    |||    
T  24482163 gat 24482161  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 27134636 - 27134529
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  27134636 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagactaacatacctttcataaagatttatatgaccaatagttgcatgaacatacattccataaagat 27134537  T
Q  138 ttatatga 145  Q
    ||||||||    
T  27134536 ttatatga 27134529  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 35392813 - 35392743
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35392813 tcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacattccataaagatttatatgatcaata 35392743  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 24482580 - 24482519
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24482580 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 24482519  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 35392776 - 35392702
Alignment:
Q  118 aacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35392776 aacatacattccataaagatttatatgatcaataattgttaatt-gtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 35392702  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37327787 - 37327711
Alignment:
Q  118 aacatacattccatacata-tttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37327787 aacataccttccataaataatttatatgatcaataattgttaatttgtttgccttcaatatctcttgagtcaaggat 37327711  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 37327824 - 37327753
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaa-gatttatatgataaata 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  37327824 tcttctatatatgtatatatttaaaacacatgggagtaacataccttccataaataatttatatgatcaata 37327753  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 190
Target Start/End: Original strand, 10613693 - 10613722
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10613693 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 10613722  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 190
Target Start/End: Original strand, 22389038 - 22389067
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22389038 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 22389067  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 43214725 - 43214696
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43214725 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 43214696  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Original strand, 43215179 - 43215211
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43215179 ttgtttgcctttaatatcttttaagtcaaggat 43215211  T

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Target: chr2 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29366172 - 29366020
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29366172 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaatataccttccataaggatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatat 29366073  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29366072 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 29366020  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 45159961 - 45159809
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45159961 gtcttctatatatgaatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatat 45159862  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45159861 ttatatgatcaataattgttaatttgtttgtctttaatatcttttgagtcaag 45159809  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Original strand, 17540106 - 17540258
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540106 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatat 17540205  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17540206 taatatgatcaataactgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 17540258  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28587187 - 28587035
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  28587187 gtcttctacatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatataaccaatagctgcataaacatacatttcatacagat 28587088  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28587087 ttatatgatcaataattgttaatctgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 28587035  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5438391 - 5438238
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5438391 tcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataatgatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagatt 5438292  T
Q  139 tatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5438291 tatttgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 5438238  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 18060241 - 18060395
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18060241 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatattttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 18060340  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18060341 ttatatgattaataattgttaa-ttgtttgcttttaatatcttttgagtcaaggat 18060395  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43207224 - 43207077
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||| | ||    
T  43207224 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttataggaccaatagctgcataaacatatatttcataaagat 43207125  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagt 186  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43207124 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagt 43207077  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 6082033 - 6082187
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| | | ||    
T  6082033 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttctataaagatttatatgaccaatagctccataaagatacattccacaaagat 6082132  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6082133 ttatatgatcaataattattaa-ttgtttgcctttaatatcttttggatcaaggat 6082187  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 41726839 - 41726992
Alignment:
Q  39 tcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatt 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  41726839 tcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagaggaacatacattccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattgcataaagatt 41726938  T
Q  139 tatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41726939 tatataatcaataattgttaa-ttgttcgcctttaatatattttgagtcaaggat 41726992  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 27482018 - 27482168
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27482018 gtcttctatatgtgtatatatttaaaacacatgagagtaac----cttcgataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatatagat 27482113  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27482114 ttatatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcgaggat 27482168  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 189
Target Start/End: Original strand, 10574821 - 10574967
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  10574821 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacatacattctataaacatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccataaagat 10574920  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||||    ||||||||||||||||    
T  10574921 ttatatgatcaataatcgttaa-ttgtttgcc----atatcttttgagtcaa 10574967  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Original strand, 28637236 - 28637338
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28637236 aagatttatatgaccaatagctgcataaatatacattccatacatatttatatgatcaataattgttaatttgtttgtctttaatatcttttgagtcaag 28637335  T
Q  191 gat 193  Q
    |||    
T  28637336 gat 28637338  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 41286603 - 41286505
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41286603 aagatttatatgaccaacagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 41286505  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28150186 - 28150084
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  28150186 aagatttatatgaccaataactgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaatagttgttaatttgtttgtctttaatatcttttgagttaag 28150087  T
Q  191 gat 193  Q
    |||    
T  28150086 gat 28150084  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Original strand, 28636919 - 28636980
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28636919 gtcttctatataagtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 28636980  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 41286913 - 41286858
Alignment:
Q  44 tatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 99  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41286913 tatatatatatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 41286858  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 38 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 28150503 - 28150442
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  28150503 gtcttctatatatttatatatttaaaacacatgagagtaacatacctttcataaaaatttat 28150442  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10316050 - 10316018
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10316050 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 10316018  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10316414 - 10316382
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10316414 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 10316382  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10316739 - 10316707
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10316739 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 10316707  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10317096 - 10317064
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10317096 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 10317064  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 190
Target Start/End: Original strand, 7338691 - 7338720
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7338691 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 7338720  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 14252116 - 14252087
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14252116 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 14252087  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 189
Target Start/End: Original strand, 9758971 - 9758999
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9758971 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 9758999  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 10315686 - 10315658
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10315686 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 10315658  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23849206 - 23849174
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23849206 ttgtttgcctttaatatcttttaagtcaaggat 23849174  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 41425670 - 41425638
Alignment:
Q  161 ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41425670 ttgtttgcctttaatatcttttgaatcaaggat 41425638  T

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Target: scaffold0004 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 131259 - 131104
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131259 gtcttctatatatgcatatatttaaaacacatgagagtaacatatcttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatat 131160  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131159 ttatatgaccaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 131104  T

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Target: scaffold0214 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 16336 - 16491
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatat 137  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16336 gtcttctatatatgtatatattcaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattgcatacagat 16435  T
Q  138 ttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16436 ttatatgatcaataattgttaatttgtttacctttaatagcttttgagtcaaggat 16491  T

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Target: scaffold0214; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 193
Target Start/End: Original strand, 16044 - 16092
Alignment:
Q  145 atcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16044 atcaataattgttaatttgtttacctttaatatcttttgagtcaaggat 16092  T

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Target: scaffold0214; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 193
Target Start/End: Original strand, 28540 - 28588
Alignment:
Q  145 atcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaaggat 193  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28540 atcaataattgttaatttgtttacctttaatatcttttgagtcaaggat 28588  T

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Target: scaffold0015 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Original strand, 42288 - 42390
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42288 aagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattgttaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 42387  T
Q  191 gat 193  Q
    |||    
T  42388 gat 42390  T

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Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 40 - 99
Target Start/End: Original strand, 41973 - 42032
Alignment:
Q  40 cttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41973 cttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttat 42032  T

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Target: scaffold0672 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 193
Target Start/End: Original strand, 6090 - 6192
Alignment:
Q  91 aagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatatttatatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaag 190  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6090 aagatttatatgaccaatagctgcataaacatacattccatatatatttatatgatcaataattgttaatttgtttgtctttaatatcttttgagtcaag 6189  T
Q  191 gat 193  Q
    |||    
T  6190 gat 6192  T

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Target: scaffold0672; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 100
Target Start/End: Original strand, 5777 - 5839
Alignment:
Q  38 gtcttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttata 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5777 gtcttctatatatgtatatatttaaaacacatgagagtaacataccttccataaagatttata 5839  T

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Target: scaffold0474 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0474
Description:

Target: scaffold0474; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 41 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12497 - 12351
Alignment:
Q  41 ttctatatatgtatatatttaatacacatgagagtaacataccttccataaagatttatatgataaatagctgcataaacatacattccatacatattta 140  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||| | |||||    
T  12497 ttctaaatatgtatatatttaaaatacatgatagtaacatatcgtccaaaaagatttatatgaccaaaa-ctgcataaacatacattccataaagattta 12399  T
Q  141 tatgatcaataattattaatttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 189  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12398 tatgatcaataattgttaa-ttgtttgcctttaatatcttttgagtcaa 12351  T

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