View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2226R-Insertion-14 (Length: 199)

Name: NF2226R-Insertion-14
Description: NF2226R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2226R-Insertion-14
NF2226R-Insertion-14
[»] chr6 (14 HSPs)
chr6 (12-199)||(26830507-26830694)
chr6 (10-199)||(17762585-17762774)
chr6 (8-199)||(3809087-3809279)
chr6 (8-199)||(21593264-21593455)
chr6 (8-176)||(2973318-2973487)
chr6 (8-176)||(5043249-5043417)
chr6 (25-161)||(22425223-22425358)
chr6 (25-165)||(25072817-25072958)
chr6 (12-129)||(26800438-26800556)
chr6 (8-99)||(603459-603550)
chr6 (125-166)||(26661580-26661621)
chr6 (125-166)||(26767551-26767592)
chr6 (8-82)||(17757797-17757871)
chr6 (143-199)||(603553-603609)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (8-199)||(27417330-27417521)
chr4 (8-199)||(26363863-26364054)
chr4 (8-176)||(8665027-8665196)
chr4 (8-199)||(6655554-6655745)
chr4 (12-176)||(8653220-8653385)
chr4 (10-199)||(46569927-46570116)
chr4 (8-179)||(2209326-2209497)
chr4 (8-199)||(40630582-40630773)
chr4 (8-176)||(10071505-10071674)
chr4 (20-199)||(50674237-50674416)
chr4 (8-199)||(54882618-54882809)
chr4 (8-199)||(50263077-50263268)
chr4 (8-165)||(55085744-55085902)
chr4 (8-176)||(41964037-41964206)
chr4 (8-172)||(46703126-46703290)
chr4 (12-148)||(12073042-12073177)
chr4 (15-186)||(22883138-22883310)
chr4 (15-186)||(22934802-22934974)
chr4 (10-158)||(33989501-33989650)
chr4 (8-145)||(35662094-35662231)
chr4 (8-147)||(379028-379168)
chr4 (15-165)||(35370722-35370874)
chr4 (13-140)||(38811463-38811590)
chr4 (15-165)||(35369824-35369971)
chr4 (8-186)||(3785701-3785879)
chr4 (8-105)||(10071963-10072060)
chr4 (43-160)||(26699861-26699979)
chr4 (42-144)||(32091222-32091326)
chr4 (13-187)||(47514885-47515060)
chr4 (8-70)||(8647865-8647927)
chr4 (15-114)||(33089582-33089681)
chr4 (17-165)||(25723604-25723752)
chr4 (31-139)||(22629290-22629399)
chr4 (147-199)||(41639163-41639215)
chr4 (4-59)||(6719324-6719379)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (8-199)||(29135846-29136037)
chr1 (10-193)||(11348302-11348485)
chr1 (7-185)||(47255712-47255890)
chr1 (8-176)||(34603197-34603365)
chr1 (8-176)||(19754112-19754280)
chr1 (8-176)||(34602718-34602886)
chr1 (16-199)||(193210-193393)
chr1 (8-199)||(37033452-37033639)
chr1 (8-165)||(13547468-13547625)
chr1 (8-165)||(13549379-13549536)
chr1 (12-199)||(37879294-37879481)
chr1 (8-172)||(42298354-42298518)
chr1 (8-176)||(7482609-7482778)
chr1 (10-176)||(19752307-19752473)
chr1 (8-176)||(28242010-28242178)
chr1 (8-176)||(37167917-37168086)
chr1 (8-144)||(47114825-47114961)
chr1 (27-186)||(41135431-41135591)
chr1 (29-160)||(6808083-6808216)
chr1 (24-176)||(31928203-31928348)
chr1 (15-186)||(9109787-9109959)
chr1 (25-186)||(22078952-22079107)
chr1 (13-58)||(3331283-3331328)
[»] chr7 (16 HSPs)
chr7 (8-199)||(32358215-32358406)
chr7 (8-176)||(6431592-6431760)
chr7 (8-199)||(29608339-29608530)
chr7 (13-176)||(4512773-4512936)
chr7 (10-199)||(6360293-6360482)
chr7 (8-176)||(34311095-34311264)
chr7 (8-145)||(2389934-2390071)
chr7 (13-185)||(22269586-22269758)
chr7 (47-163)||(48599742-48599858)
chr7 (8-199)||(2361350-2361541)
chr7 (48-176)||(4509116-4509244)
chr7 (48-176)||(4510958-4511086)
chr7 (8-176)||(3258616-3258785)
chr7 (57-165)||(30814397-30814505)
chr7 (15-141)||(5116290-5116417)
chr7 (11-160)||(22328781-22328931)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (13-199)||(45726528-45726714)
chr2 (8-176)||(1632111-1632279)
chr2 (13-185)||(17450203-17450375)
chr2 (8-199)||(35447263-35447454)
chr2 (8-176)||(7450921-7451089)
chr2 (8-176)||(42288488-42288655)
chr2 (19-192)||(42261999-42262173)
chr2 (8-148)||(33647817-33647958)
chr2 (8-199)||(24397662-24397846)
chr2 (31-165)||(30218435-30218570)
chr2 (117-150)||(44750240-44750273)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (8-199)||(11383584-11383775)
chr8 (12-199)||(42435374-42435561)
chr8 (8-199)||(22976132-22976323)
chr8 (13-199)||(4283144-4283330)
chr8 (8-176)||(44353416-44353581)
chr8 (8-199)||(40221342-40221534)
chr8 (15-145)||(2999906-3000037)
chr8 (28-158)||(20686456-20686586)
chr8 (19-186)||(40585335-40585503)
chr8 (8-84)||(40328492-40328568)
chr8 (103-186)||(10239699-10239782)
chr8 (13-86)||(10020151-10020224)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (8-199)||(55302344-55302535)
chr3 (13-176)||(28074238-28074401)
chr3 (8-199)||(49199850-49200041)
chr3 (9-185)||(4569563-4569739)
chr3 (8-199)||(34490810-34491002)
chr3 (8-199)||(40912935-40913127)
chr3 (8-176)||(30235745-30235914)
chr3 (8-199)||(54593302-54593494)
chr3 (8-165)||(43402169-43402326)
chr3 (8-165)||(43404112-43404269)
chr3 (8-176)||(47303872-47304041)
chr3 (8-158)||(6095978-6096128)
chr3 (8-199)||(36018448-36018640)
chr3 (8-148)||(41819900-41820040)
chr3 (8-147)||(46860120-46860260)
chr3 (8-160)||(5434257-5434410)
chr3 (25-185)||(34795481-34795642)
chr3 (89-199)||(31340501-31340611)
chr3 (13-158)||(26323896-26324042)
chr3 (50-186)||(35139134-35139271)
chr3 (17-165)||(39127191-39127339)
chr3 (12-56)||(31340459-31340503)
chr3 (132-186)||(20937354-20937408)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (12-199)||(40146857-40147046)
chr5 (8-176)||(213089-213258)
chr5 (8-199)||(38746603-38746794)
chr5 (13-176)||(16642262-16642424)
chr5 (12-199)||(5057647-5057832)
chr5 (8-185)||(28277925-28278105)
chr5 (8-199)||(27015130-27015321)
chr5 (8-176)||(27637994-27638161)
chr5 (4-176)||(35615792-35615965)
chr5 (15-186)||(316370-316548)
chr5 (13-186)||(30802552-30802725)
chr5 (29-163)||(14689807-14689942)
chr5 (31-176)||(30792861-30793006)
chr5 (13-160)||(10055090-10055238)
chr5 (76-186)||(33906578-33906688)
chr5 (15-176)||(4160255-4160416)
chr5 (15-92)||(33906414-33906491)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (8-165)||(6960-7117)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (8-199)||(11156-11347)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (8-199)||(80662-80853)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (8-176)||(18380-18547)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (19-192)||(490834-491008)
[»] scaffold0197 (1 HSPs)
scaffold0197 (16-186)||(1792-1963)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 14)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 26830507 - 26830694
Alignment:
Q  12 ttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaa 111  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830507 ttttcccaagagactcctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttaaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaa 26830606  T
Q  112 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26830607 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatggatcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 26830694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17762774 - 17762585
Alignment:
Q  10 ccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaa 109  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| | || |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17762774 ccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagccttgaacttcacccaaagatcctcaacctttagtatctaaaaccctaa 17762675  T
Q  110 aagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  17762674 aagttctctccttttgtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggccatggagtgcttacatagtgttcagatccggacaaa 17762585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Original strand, 3809087 - 3809279
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccc-tcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccc 106  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3809087 acccttttcacaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccc 3809186  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  || ||||||||   |||| |||||||||||||    
T  3809187 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgctcaacaaatgggtcaaagaatgcttataatgtgttcagatccggacaaa 3809279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21593455 - 21593264
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| || |||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  21593455 accctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaatctttgaacctcacccaaagaccctcaacatttagtatctaaaaccct 21593356  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| | |||||||||||    
T  21593355 aaaagttctaacctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggttatggagtgcttacatagtgttcatatccggacaaa 21593264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 2973318 - 2973487
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatcta-aaaccc 106  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||||| ||||||    
T  2973318 acccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatctacaaaccc 2973417  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||||  ||||||||    
T  2973418 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaaggtctcttaacaaatgggtcataaagtgctta 2973487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5043417 - 5043249
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  5043417 acccttttcccaagagccctctcttttggttctccaagattctcatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaaaccct 5043318  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     || ||||||||||| |||||||||    
T  5043317 aaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaagctcctttaataaatgggtcatagagtgctta 5043249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 161
Target Start/End: Original strand, 22425223 - 22425358
Alignment:
Q  25 cccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  || |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22425223 cccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctctgaaccacacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct-aaagttccctcctttg 22425321  T
Q  125 gtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgg 161  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22425322 gtttccatgagattcaccaagcttatccaacaaatgg 22425358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25072958 - 25072817
Alignment:
Q  25 cccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagttccctccttt 123  Q
    |||| |||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  25072958 cccccctttgggttctcaaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaataccctaaaagttcacttcttt 25072859  T
Q  124 ggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 165  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  25072858 gatttccatgagattcatcaagcttactcaacaaatgagtca 25072817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 26800556 - 26800438
Alignment:
Q  12 ttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatcta-aaaccctaaa 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| | ||||||||    
T  26800556 ttttcccaagagccccctcttttggttatccatgatccacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaa 26800457  T
Q  111 agttccctcctttggtttc 129  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  26800456 agttttctcctttggtttc 26800438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 99
Target Start/End: Original strand, 603459 - 603550
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatct 99  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||    
T  603459 accctttcctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacctttactatct 603550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26661621 - 26661580
Alignment:
Q  125 gtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26661621 gtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaattggtcat 26661580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26767592 - 26767551
Alignment:
Q  125 gtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcat 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26767592 gtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaattggtcat 26767551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 8 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17757871 - 17757797
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagacc 82  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| || || ||||||||    
T  17757871 acccttttcacaagagccccctattttggttctccaacattcacatcttcaagctttgaatctcacccaaagacc 17757797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 199
Target Start/End: Original strand, 603553 - 603609
Alignment:
Q  143 aagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  603553 aagcttactcaacaaatgggtcaaagaatgcttatattgtgttcagatccggacaaa 603609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 144; Significance: 6e-76; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Original strand, 27417330 - 27417521
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27417330 acccctttcccaagagccccttcttttggttctccaagattcacatcttaaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 27417429  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27417430 aaaagttccctcctttggttttcatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatagtgtttagatccggacaaa 27417521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 26364054 - 26363863
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  26364054 acccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaggccctcaacctttagtatctaaaaccct 26363955  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  26363954 aaaagttccctcccttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttacatagtgttcagatccggacaaa 26363863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8665196 - 8665027
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8665196 acccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 8665097  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaac-aaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8665096 aaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacctaacaaaatgggtcatggagtgctta 8665027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 6655745 - 6655554
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6655745 accctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 6655646  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||  |||| ||| |||||||||    
T  6655645 aaaagttccctcctttggtttccatgagatttaccaagcttacccaacaaatgggtcaaagaatgcatatattgtgttcagaaccggacaaa 6655554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8653385 - 8653220
Alignment:
Q  12 ttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8653385 ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaa 8653286  T
Q  112 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaac-aaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  8653285 gttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacctaacaaaatgggtcatggagtgctta 8653220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 199
Target Start/End: Original strand, 46569927 - 46570116
Alignment:
Q  10 ccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaa 109  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||| | |||| |||||||||||||||    
T  46569927 ccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacctaaagaccttcaacatttagtatctaaaaccctaa 46570026  T
Q  110 aagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  46570027 aatttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatggtgtgcttacatagtgttcagatccagacaaa 46570116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2209497 - 2209326
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2209497 acccttttcccaagagtcccctcgtttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaaaccct 2209398  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatat 179  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  2209397 aaaagttccctcatttgctttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcaaagaatgcttatat 2209326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40630773 - 40630582
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| ||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  40630773 acccttttcacaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 40630674  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  40630673 aaaagtttcatcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcaaagaatgcatatattatgttcagatccggacaaa 40630582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10071674 - 10071505
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  10071674 acccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttaaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaacctt 10071575  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaac-aaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10071574 aaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaagattacccaacaaaatgggtcatggagtgctta 10071505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 20 - 199
Target Start/End: Original strand, 50674237 - 50674416
Alignment:
Q  20 agagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaagttccctc 119  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||| | | |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  50674237 agagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagacccttaacatttagtatttaaaaccctaaaagttccctc 50674336  T
Q  120 ctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  50674337 ctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcaaagaatgcatatattgtgttcagatccggacaaa 50674416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 54882809 - 54882618
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  54882809 acccttttcataagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 54882710  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  || ||| ||| || |||| |||||||| ||||    
T  54882709 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcactaagcttacccaacaaatgagtcaaagaatgcatatgtagtgttcagatccgggcaaa 54882618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Original strand, 50263077 - 50263268
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||| |||||| | |||||||||||    
T  50263077 accctttttccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagactctcaacctttagtgtctaaaaccct 50263176  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||||||||||  |||||||||||   |||| |||||| ||||||    
T  50263177 aaaagttccctcctttggttttcatgagattcaccaaactttttcaacaaatgggtcaaagagtgcttataatgtgttcagatccagacaaa 50263268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 55085744 - 55085902
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaa-gttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccc 106  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  55085744 accctttccccaagagccccctcttttggttctccaagatttacatcttgaaagcttttaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccc 55085843  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 165  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55085844 taaaagttccctcctttggtttcattgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 55085902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 41964206 - 41964037
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatcta-aaaccc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| | ||||    
T  41964206 acccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccc 41964107  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||    
T  41964106 taaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaaactttctcaccaaatgggtcatagagtgctta 41964037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 46703290 - 46703126
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  46703290 acccttttcccaagagccccctcttttgattctcgaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 46703191  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtg 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||| || |||||    
T  46703190 aaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcctcctcagcaaatgggttatagagtg 46703126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 12073177 - 12073042
Alignment:
Q  12 ttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  12073177 ttttcccaagag-cccctcttttggttctccaagatttacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaa 12073079  T
Q  112 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 148  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12073078 gttccatcctttggtttccatgagattcaccaagctt 12073042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 186
Target Start/End: Original strand, 22883138 - 22883310
Alignment:
Q  15 tcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagt 113  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||| |||||| |||||||| ||||||||| |    
T  22883138 tcccaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaatagtctcaacctttagtatctaaataccctaaaatt 22883237  T
Q  114 tccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgttt 186  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  22883238 tccctcatttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatgggttaaggagtgcttaaatagtgttt 22883310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 186
Target Start/End: Original strand, 22934802 - 22934974
Alignment:
Q  15 tcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagt 113  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |  |||| |||||| |||||||| ||||||||| |    
T  22934802 tcccaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaatagtctcaacctttagtatctaaataccctaaaatt 22934901  T
Q  114 tccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgttt 186  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  22934902 tccctcatttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatgggttaaggagtgcttaaatagtgttt 22934974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33989650 - 33989501
Alignment:
Q  10 ccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-acccta 108  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||    
T  33989650 ccttctcccaagagccccctattttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaactttagtatctaaatacccta 33989551  T
Q  109 aaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaa 158  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33989550 aaagttatctgctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaa 33989501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 35662231 - 35662094
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||||||||| |||    
T  35662231 acccttttcctaagagccccctcttttggttctccaagattcacatattgaagctttgaacctcacccaaagactctcaacctttagtatctaaaatcct 35662132  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaag 145  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  35662131 aaaagttctctcatttggtgtccatgagattcaccaag 35662094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 379168 - 379028
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatcta-aaaccc 106  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||    
T  379168 acccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagtccctcaacctttagtatctacaaatcc 379069  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagct 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  379068 taaaagttctctcctttggtttccacgagattcaccaagct 379028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 165
Target Start/End: Original strand, 35370722 - 35370874
Alignment:
Q  15 tcccaagagacccctctttt-ggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaag 112  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||    
T  35370722 tcccaagaaccccctcttttaggttctccaagattcacatcttaaagctttgaacctctcccaaagaccctcaacctttagtatctaaataccttaaaag 35370821  T
Q  113 ttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||    
T  35370822 ttccctcctttgatttccatgagattcatcaagcttactcaatagatgggtca 35370874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Original strand, 38811463 - 38811590
Alignment:
Q  13 tttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaa-aaccctaaaa 111  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||    
T  38811463 tttcccaagag-cccctctttgggttctccaagattcacatcttaaagctttgaacctcacccaaataccctcaacctttagtatctaagtaccctaaaa 38811561  T
Q  112 gttccctcctttggtttccatgagattca 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38811562 gttccctcctttagtttccatgagattca 38811590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 165
Target Start/End: Original strand, 35369824 - 35369971
Alignment:
Q  15 tcccaagagacccctctttt-ggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaagt 113  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||    |||||||    
T  35369824 tcccaagaaccccctcttttaggttctccaagattcacatcttaaatctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaa----taaaagt 35369919  T
Q  114 tccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 165  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  35369920 tccctcctttaatttccatgagattcatcaagcttactcaacagatgggtca 35369971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3785879 - 3785701
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accc 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||  |  |||||| |||| |||||| |||| |   | ||    
T  3785879 acccttttcc-aagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgaatctcgcctaaagactctcaacctttagtatccatgtatcc 3785781  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgttt 186  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||| ||| |||||    
T  3785780 taaaagttccatcctttgatttccatgagatccaccaaacttactcaacaaatgggtcaagtagtgcttaaatagtgttt 3785701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 10072060 - 10071963
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaacc 105  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10072060 acccttttcacaagagccccctcttttagttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaacc 10071963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 43 - 160
Target Start/End: Original strand, 26699861 - 26699979
Alignment:
Q  43 aagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaa-ccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcac 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | ||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26699861 aagattcacatcttgaagttttgaacctcaaccaaagatcttcaacctttagtatctaaatgccctacaagttccctcatttggtttccatgagattcac 26699960  T
Q  142 caagcttacccaacaaatg 160  Q
     |||||| | |||||||||    
T  26699961 aaagcttgctcaacaaatg 26699979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 32091326 - 32091222
Alignment:
Q  42 caagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa--accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattc 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||| |||  ||| ||||| ||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  32091326 caagattcacatcttgaagttttgaacctcactcaaagaccctcaacatttagtatccaaaataccttaaaaattccctcttttagtttccatgaaattc 32091227  T
Q  140 accaa 144  Q
    |||||    
T  32091226 accaa 32091222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 47514885 - 47515060
Alignment:
Q  13 tttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaa-aaccctaaaa 111  Q
    ||||||||||| || |||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||| | || | |||||| ||| |||||| | | |||  |||||||||    
T  47514885 tttcccaagagtccactcttttggttcaccaagattcatatcttgaagctttgaacttcacccgaagaccttcaacctttagtgtttaagtaccctaaaa 47514984  T
Q  112 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgttta 187  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||  |||| ||||  || |||||| ||| ||||||    
T  47514985 gttcactcatttggtttccatgagattccacaagcttacacaatcaatgagtcaaagaatgcttaaatagtgttta 47515060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 8647927 - 8647865
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaacct 70  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8647927 acccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacct 8647865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 33089681 - 33089582
Alignment:
Q  15 tcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaagtt 114  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  33089681 tcccaagagccccctcttttgattctccaagattcacatcttcaaactttgaacctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaatacctaaaagtt 33089582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Original strand, 25723604 - 25723752
Alignment:
Q  17 ccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactc-aaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagtt 114  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| ||||||  ||| | |||| |||  ||  ||||||| ||||    
T  25723604 ccaagagctccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctccctccaaagac--tcaacatttagtattgaagtaccctaagagtt 25723701  T
Q  115 ccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 165  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  25723702 cactcatttggtttccatgaaattcaccaagcttacttaacaaataggtca 25723752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 22629290 - 22629399
Alignment:
Q  31 ttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| || || || || |||| || | |||||| | ||||||   ||||||||||| ||| |||||||||    
T  22629290 ttttggttctccaagattcacatcttgaacttttaaatctcacccagagacactgaacctttagtttctaaatttcctaaaagttcactcatttggtttc 22629389  T
Q  130 catgagattc 139  Q
     |||||||||    
T  22629390 tatgagattc 22629399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 41639215 - 41639163
Alignment:
Q  147 ttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  41639215 ttacccaacaaatgggtcatgaagtgcttacatagtgttcagatccagacaaa 41639163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 6719379 - 6719324
Alignment:
Q  4 catcacccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaa 59  Q
    ||||| || ||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6719379 catcaaccctttcccaagaatccactcttttagttttccaagattcacatcttgaa 6719324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29136037 - 29135846
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  29136037 acccttttcccaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 29135938  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  29135937 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatgggtcaaagaatgcttatattgtgttcagatccggacaaa 29135846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11348485 - 11348302
Alignment:
Q  10 ccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaa 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  11348485 ccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacccttagtatctaaaaccctaa 11348386  T
Q  110 aagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccg 193  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11348385 aagttccatcctttggtttccatgagattcactaagcttacccaacaaatgggtcatggagtacttatatagtgtttagatccg 11348302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 185
Target Start/End: Original strand, 47255712 - 47255890
Alignment:
Q  7 cacccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccc 106  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  47255712 caccattttcccaagagccccatcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccc 47255811  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  47255812 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatgaagtgcttaaatagtgtt 47255890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34603365 - 34603197
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  34603365 acccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagaccttcaacctttaatatctaaaaccct 34603266  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  34603265 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttttccaacaaatgggtcatagagtgctta 34603197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19754280 - 19754112
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| || |||||||||| | |||||| |||||| ||||||    
T  19754280 acccttttcacaagagccccctctcttggttttccaagattcaaatcatggtgctttgaacctcacccaaagacccttaacctttagtatctagaaccct 19754181  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19754180 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 19754112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 34602718 - 34602886
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  34602718 acccttttaccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagaccttcaacctttaatatctaaaaccct 34602817  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  34602818 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttttccaacaaatgggtcatagagtgctta 34602886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 16 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 193393 - 193210
Alignment:
Q  16 cccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaagttc 115  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  193393 cccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcaccgaaagaccctcaacctttaatatctaaaaccctaaaagtta 193294  T
Q  116 cctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||  |||| |||||||||||||    
T  193293 tctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcaaagaatacttatattgtgttcagatccggacaaa 193210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Original strand, 37033452 - 37033639
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||     |||||||||    
T  37033452 acccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttta----gtaaaaccct 37033547  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||  || |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  37033548 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcacccagcttactcaacaaaagggtcaaagaatgcttatattgtgttcagatccggacaaa 37033639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 13547468 - 13547625
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  13547468 acccttttcacaagagctccctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaactct 13547567  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13547568 aaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttaccaaacaaatgggtca 13547625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 13549379 - 13549536
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  13549379 acccttttcacaagagctccctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaactct 13549478  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 165  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13549479 aaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttaccaaacaaatgggtca 13549536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 37879294 - 37879481
Alignment:
Q  12 ttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| |    
T  37879294 ttttcacaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagatcctcaacatttagtatctaaaaccctaaca 37879393  T
Q  112 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  37879394 gttccttcctttgatttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcaaagaatgcatatattgtgttcagatccggacaaa 37879481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 172
Target Start/End: Original strand, 42298354 - 42298518
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  42298354 acccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 42298453  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtg 172  Q
    ||||||| | ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42298454 aaaagtttcatcctttggttgttatgggattcaccaagcttacccaacaaatggatcagggagtg 42298518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 7482609 - 7482778
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccc-tcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccc 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  7482609 acccttttcccaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccgttagtatctaaaaccc 7482708  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||| | |||||||    
T  7482709 taaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaaacttattcactaaatgggtcatagtgtgctta 7482778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19752473 - 19752307
Alignment:
Q  10 ccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaa 109  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| | || |||||| || |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  19752473 ccttttcataagagccccatcttttggttctccaagattcacattatgacgcttagaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatctaaaaccctaa 19752374  T
Q  110 aagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19752373 aaattccctcatttggttttcatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 19752307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28242178 - 28242010
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatcta-aaaccc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| | ||||    
T  28242178 acccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccc 28242079  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    |||||||||||||| |||||||||    
T  28242078 taaaagttccctcctttggttttcatgagattcaccaaactt-tttaacaaatgggtcatagagtgctta 28242010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 37168086 - 37167917
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||||||||||  |    
T  37168086 acccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatctaaaactgt 37167987  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctta-cccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||   || |||||||||||| |||||||||    
T  37167986 aaaagttccctcctttgatttccatgagattccccaagcctatttcaccaaatgggtcatagagtgctta 37167917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 47114961 - 47114825
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||| || |    
T  47114961 accctgttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacagcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaatctttaatatctaaagcctt 47114862  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaa 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47114861 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaa 47114825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 41135591 - 41135431
Alignment:
Q  27 cctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagttccctcctttgg 125  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  41135591 cctcttttggttctccaagatccacatcttgaaggtttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaatacattaaaatttccctcctttgg 41135492  T
Q  126 tttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgttt 186  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| | || ||||| ||| |||||    
T  41135491 tttccatgagattaaccaagcttattcaacaaatgggtcaagcagcgcttaaatagtgttt 41135431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6808216 - 6808083
Alignment:
Q  29 tcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccc-tcagcctttattatctaaaacc-ctaaaagttccctcctttggt 126  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| |||||| |||||||||   ||||||||| |||||||||||    
T  6808216 tcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacctaaagacccctcaacctttagtatctaaaaaatctaaaagtttcctcctttggt 6808117  T
Q  127 ttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatg 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6808116 ttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatg 6808083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 24 - 176
Target Start/End: Original strand, 31928203 - 31928348
Alignment:
Q  24 acccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaagttccctccttt 123  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||| |||||| |||||||        ||||||||||||||    
T  31928203 acccatcttttggttttctaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagactctcaacctttagtatctaa--------aagttccctccttt 31928294  T
Q  124 ggtttccatgagattcaccaagcttacccaa-caaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31928295 ggtttccatgaaattcaccaagcttacccaatcaaatgggtcatggagtgctta 31928348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 186
Target Start/End: Original strand, 9109787 - 9109959
Alignment:
Q  15 tcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatcta-aaaccctaaaagt 113  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||| ||| || | |||| ||||||    
T  9109787 tcccatgagtccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaataccctcaacctttagtatttatataccccaaaagt 9109886  T
Q  114 tccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgttt 186  Q
    | | || |||| ||||||||| |||||||||| |  | ||| |||||||||| ||| |||||| ||| |||||    
T  9109887 ttcatcatttgatttccatgacattcaccaagttgtctcaataaatgggtcaaggattgcttaaatagtgttt 9109959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 25 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22079107 - 22078952
Alignment:
Q  25 cccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaagttccctcctttg 124  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  |||       ||| |||||||||||||| || |||     
T  22079107 cccctcttttggttctttaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaactt-------taataccctaaaagttccatcattta 22079015  T
Q  125 gtttccatgagattcaccaagc-ttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgttt 186  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||  || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  22079014 gtttccataagattcaccaaactttaatcatcaaatgggtcaaggagtgcttaaatagtgttt 22078952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 3331328 - 3331283
Alignment:
Q  13 tttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttga 58  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  3331328 tttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttga 3331283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 16)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Original strand, 32358215 - 32358406
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  32358215 acccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 32358314  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  32358315 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctttttcaacaaatgggtcatggagtgcttacatagtgttcagatccggacaaa 32358406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6431760 - 6431592
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6431760 accctttccccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 6431661  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  6431660 aaaagttccctcctttggtttctatgagattcaccaagcttacccaataaatgggtcatggagcgctta 6431592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29608530 - 29608339
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  29608530 acccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 29608431  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||  || |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  29608430 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctttatcaacatatgggtcaaagaatgcttatattgtgttcagatccggacaaa 29608339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 4512773 - 4512936
Alignment:
Q  13 tttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaag 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  4512773 tttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagaatctaaaaccctaaaag 4512872  T
Q  113 ttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4512873 ttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccattaaatgggtcatggagtgctta 4512936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 199
Target Start/End: Original strand, 6360293 - 6360482
Alignment:
Q  10 ccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaa 109  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  6360293 ccttttctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaacttttaacctcacccaaagaccctcaacctttaatatctaaaaccctaa 6360392  T
Q  110 aagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||   |||| |||||||||||||    
T  6360393 aagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcaaagaatgcttataatgtgttcagatccggacaaa 6360482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 34311095 - 34311264
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatcta-aaaccc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||| |||||| |||||| | ||||    
T  34311095 acccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaggaccctcaacctttagtatctacataccc 34311194  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  34311195 taaaagttccttcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaaaaaattggtcatggagtactta 34311264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2390071 - 2389934
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2390071 acccttttcgcaatagccccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 2389972  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaag 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2389971 aaaagtttcctcctttggtttccatgagattcaccaag 2389934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22269758 - 22269586
Alignment:
Q  13 tttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaa 111  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||| | ||||||||     
T  22269758 tttcccaagag-cccctcttttggttctccaagattcacatcttgtagctttgaacctcacccaaagaccctcaaactttagtatctacataccctaaat 22269660  T
Q  112 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  22269659 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcccaacaaatgggtcatgaagtgcttaaatagtgtt 22269586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 163
Target Start/End: Original strand, 48599742 - 48599858
Alignment:
Q  47 ttcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagc 146  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48599742 ttcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagc 48599841  T
Q  147 ttacccaacaaatgggt 163  Q
    |||||||||||||||||    
T  48599842 ttacccaacaaatgggt 48599858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Original strand, 2361350 - 2361541
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||  ||||| || || ||||||||||||  ||||| ||||||||| |||    
T  2361350 acccttttcacaagagccccctcttttgattcttcaagattcacatcttgaaggattgaatctcacccaaagaccctcaatctttagtatctaaaatcct 2361449  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  || ||||||||   |||| ||||| |||||||    
T  2361450 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcactaagcttgcccaacaaatgggtcaaagaatgcttataatgtgttcagatctggacaaa 2361541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 176
Target Start/End: Original strand, 4509116 - 4509244
Alignment:
Q  48 tcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagct 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4509116 tcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccatcctttggtttccatgagattaaccaagct 4509215  T
Q  148 tacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4509216 tacccaacaaatgggtcatagagtgctta 4509244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 48 - 176
Target Start/End: Original strand, 4510958 - 4511086
Alignment:
Q  48 tcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagct 147  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4510958 tcacatcttgaagctttgaacctcacccaaaaaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaagttccatcctttggtttccatgagattaaccaagct 4511057  T
Q  148 tacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4511058 tacccaacaaatgggtcatagagtgctta 4511086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 3258785 - 3258616
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatcta-aaaccc 106  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| | ||||    
T  3258785 acccttttcccaagagccccatctttttgttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccc 3258686  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||   || |||||||||||| |||||||||    
T  3258685 taaaagttccctcctctggtttccatgagattcaccaagttttttcaccaaatgggtcatagagtgctta 3258616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30814505 - 30814397
Alignment:
Q  57 gaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaaca 156  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30814505 gaagctttgaacctcacccaaagaccctcaaccttaagtatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaaca 30814406  T
Q  157 aatgggtca 165  Q
    |||||||||    
T  30814405 aatgggtca 30814397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 5116417 - 5116290
Alignment:
Q  15 tcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagt 113  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||    
T  5116417 tcccaagagccccctcttttggttctcaaagattcacatcttgaagttttgaacatcacctaaagaccctcaacctttagtatttaaataccctaaaagt 5116318  T
Q  114 tccctcctttggtttccatgagattcac 141  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5116317 cccctcctttggtatccatgagattcac 5116290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Original strand, 22328781 - 22328931
Alignment:
Q  11 cttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaa 109  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||    |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||    
T  22328781 cttttcctaagagccccctcttttggttctccaagatttacatcttgaagcttttaacctccaccaaagatcctcaacctttagtatctaaataccctaa 22328880  T
Q  110 aagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatg 160  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  22328881 aagttttctcctttggtttccatgagattcactaagcttacttaacaaatg 22328931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 45726714 - 45726528
Alignment:
Q  13 tttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaag 112  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  45726714 tttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagactctcaacctttagtatctaaaaccctaaaag 45726615  T
Q  113 ttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| |||||    
T  45726614 ttccctcatttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttacatagtgttcagatccgaacaaa 45726528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 1632111 - 1632279
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  1632111 acccttttcacaagagccccctcttttggttccccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 1632210  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  1632211 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacacaacaaataggtcatggagtgctta 1632279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17450375 - 17450203
Alignment:
Q  13 tttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaag 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  17450375 tttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaag 17450276  T
Q  113 ttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  17450275 ttccctcctttggtttccatgagattctctaagtttgcccaacaaatgggtcatgaagtgcttaaatagtgtt 17450203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Original strand, 35447263 - 35447454
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttc-caagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccc 106  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| || |||| |||||| ||||||||||||    
T  35447263 acccttttcacaagag-cccctcttttggttctctcaagactcacatcttgaagctttgaacctcacacaaatactctcaacctttagtatctaaaaccc 35447361  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  35447362 taaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttacatagtgttcagatccggacaaa 35447454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7451089 - 7450921
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||| | || |||||| |||||||||||||    
T  7451089 accctttaccaaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcctgaagctttgaacctcacccaaagacgc-caacctttagtatctaaaaccct 7450991  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaac-aaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7450990 aaaagttccctccttttgtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaaatgggtcatggagtgctta 7450921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 42288488 - 42288655
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  42288488 acccttttcccaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagttttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 42288587  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||| |||||||||    
T  42288588 aaaagttctctcatttggtttccatgagattcacctagctt-tttaacaaatgggtcatagagtgctta 42288655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 42261999 - 42262173
Alignment:
Q  19 aagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatcta-aaaccctaaaagttccc 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  42261999 aagagcccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagctccc 42262098  T
Q  118 tcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatcc 192  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||| |||| ||||||    
T  42262099 tcctttggttctcatgagattcaccaagcttgctcaacaaatgggtcaaaggatgcttatatagtgttcagatcc 42262173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 33647958 - 33647817
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accc 106  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||||||| || |    
T  33647958 acccttttcccaagagcctcctcttttgattctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccttcaacctttagtatctaaatactc 33647859  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 148  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33647858 taaaagttctctcctttggtttccatgaaattcaccaagctt 33647817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 24397846 - 24397662
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  24397846 acccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacacaaagaccgtcaacctttagtatctaaataccc 24397747  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||  |  |||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  24397746 taaaag--------tttggtttccatgagattcaccaagcttttccaacaaatgagccaaaggatgcttatatagtgttcagatccagacaaa 24397662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 165
Target Start/End: Original strand, 30218435 - 30218570
Alignment:
Q  31 ttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttc 129  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||| | | || |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  30218435 ttttggttgtccaagattcacattttgatgttttgaacctcacccaaagaccctcaacatatagtatctaaataccctaaaagttccctcctttgagttc 30218534  T
Q  130 catgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 165  Q
    ||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  30218535 cataatattcaccaagattacccaacgaataggtca 30218570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 44750273 - 44750240
Alignment:
Q  117 ctcctttggtttccatgagattcaccaagcttac 150  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44750273 ctcctttggtttctatgagattcaccaagcttac 44750240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11383775 - 11383584
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11383775 acccttttcacaatagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 11383676  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||    
T  11383675 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttgcctaacaaatgggacatggagtgcttacatagtattcagatccggacaaa 11383584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 42435374 - 42435561
Alignment:
Q  12 ttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  42435374 ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaa 42435473  T
Q  112 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| |||||  |||| ||| |||||||||    
T  42435474 gtttcctcctttggtttccatgagattcaccaagcttaccgaacaaatgggtcaaagaatgcatatattgtgttcagaaccggacaaa 42435561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 22976323 - 22976132
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  22976323 accctttttccaagagcctcctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaactct 22976224  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||    
T  22976223 aaaagttcactcctttggtttcgaagagattcactaagcttacccaacaaatgggttatggagtgcttacatagtgttcagatccagacaaa 22976132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 4283330 - 4283144
Alignment:
Q  13 tttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaag 112  Q
    |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4283330 tttcccaaaagccccctcttttggttctccaagatccacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaag 4283231  T
Q  113 ttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| |||  |||| ||||||| |||||    
T  4283230 ttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacacaacaaatgggtcaaagaatgcttgtattgtgttcagatccgaacaaa 4283144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44353581 - 44353416
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||   |||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  44353581 accctcttcacaagagccccctcttttagttctccaagattc---tcttgaagttttaaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 44353485  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44353484 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgagtcatggattgctta 44353416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40221534 - 40221342
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||| ||  |||||| |||| ||||||||    
T  40221534 acccctttcccaagagccccctattttggttctcgaagattcacatcttgaagttctaaacctcatccaaagaccttccacctttagtatcaaaaaccct 40221435  T
Q  108 aaaagtt-ccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||  |||| ||||||| |||||    
T  40221434 aaaagttcccctcctatggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatgggtcaaagaatgcttatattgtgttcagatccgaacaaa 40221342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 145
Target Start/End: Original strand, 2999906 - 3000037
Alignment:
Q  15 tcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagt 113  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||    
T  2999906 tcccaagaaccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacatcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaattccctaaaagt 3000005  T
Q  114 tccctcctttggtttccatgagattcaccaag 145  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3000006 tctctcctttggtttctatgagattcaccaag 3000037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 158
Target Start/End: Original strand, 20686456 - 20686586
Alignment:
Q  28 ctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagttccctcctttggt 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||| ||||| | |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  20686456 ctcttttggttatccaagattcacatcttgaagctttgaacttcac-caaagatcctcaacatttagtatctaagtaccctgaaagttccctcctttggt 20686554  T
Q  127 ttccatgagattcaccaagcttacccaacaaa 158  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20686555 ttcaatgagattcaccgagcttacccaacaaa 20686586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40585503 - 40585335
Alignment:
Q  19 aagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagttccc 117  Q
    ||||| || |||||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| || | |||||| |||||||| || |||||||||       
T  40585503 aagagcccactcttttgattctcaaatattcacatcttgaagctttgaacctcaaccaaagactcttaacctttagtatctaaatactctaaaagttatt 40585404  T
Q  118 tcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgttt 186  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||||| || ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||    
T  40585403 tcctttggttttcatgagattaatcaagctcacgcaacaaatgggtcaatgagtgcttaaataatgttt 40585335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 40328568 - 40328492
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccct 84  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  40328568 acccttttcccaagaaccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccct 40328492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 10239782 - 10239699
Alignment:
Q  103 accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgttt 186  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  10239782 accctaaaagttccctctattgatttccatgagattcgtcaagcttactcaacaaaagggtcaaggagttcttaaatagtgttt 10239699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 10020224 - 10020151
Alignment:
Q  13 tttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctca 86  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||   |||||| || ||  |||||||||||    
T  10020224 tttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatattgatcatttgaatctcacctaaagaccctca 10020151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Original strand, 55302344 - 55302535
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  55302344 acccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacttttagtatctaaaaccct 55302443  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  55302444 aaaagtttcctcctttggtttcaatgaaattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttacatagtgttcagatccggacaaa 55302535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 28074401 - 28074238
Alignment:
Q  13 tttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaag 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28074401 tttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaag 28074302  T
Q  113 ttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28074301 tttcctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatgaagtgctta 28074238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Original strand, 49199850 - 49200041
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  49199850 acccttttcacaatagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 49199949  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  49199950 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcaaagaatgcatatattgtgttcagatccggacaaa 49200041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 4569739 - 4569563
Alignment:
Q  9 cccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaacccta 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  4569739 cccttttcccaagagccccctcttttgattctccaagatttacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaacccta 4569640  T
Q  109 aaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtt 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||| |||||    
T  4569639 aaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatgggtcaaagaatgcttatattttgtt 4569563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 34491002 - 34490810
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  34491002 acccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 34490903  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaa-caaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  34490902 aaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagctttcacaataaaatgggtgatggagtgcttatatagtgttcagatccagacaaa 34490810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40913127 - 40912935
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  40913127 acccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacattttgaagctttgaacctcacccaaagaccctaaacctttagtatctaaaaccct 40913028  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagc-ttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  40913027 aaaagtcccctcctttggtttccatgagattcaccaagctttacccaacaaatgggtcaaagaatgcttacatagtgttcagatccggacaaa 40912935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30235914 - 30235745
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  30235914 acccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 30235815  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaac-aaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30235814 aaaagttctctcctttggtttcattgagattcaccaagcttacccaacaaaatgggtcatggagtgctta 30235745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 54593494 - 54593302
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||| |||||| |||||| | ||||    
T  54593494 acccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaggaccctcaacctttagtatctacataccc 54593395  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  54593394 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttttcgaacaaatgggtcatggagtgcttacatagtgttcagattcgggcaaa 54593302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 43402169 - 43402326
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43402169 acccttttctcaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 43402268  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43402269 aaaagttccctcctttggtttccataagattcaccaagctcacccaacaaatgagtca 43402326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 43404112 - 43404269
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  43404112 acccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacttttagtatctaaaaccct 43404211  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 165  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43404212 aaaagttccctcatttggtttccatgagattcaccaagctcacccaacaaatgggtca 43404269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 47304041 - 47303872
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||| | |||| ||||||||||| |    
T  47304041 acccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccttcaacatttagtatctaaaaccat 47303942  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaac-aaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  47303941 aaaagttctctcctttgatttccatgagattcaccaagcttacccaacaaaatgggtcgtggagtgctta 47303872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 158
Target Start/End: Original strand, 6095978 - 6096128
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  6095978 acccttttcaaaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 6096077  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaa 158  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6096078 aaaagttctctcctctgatttccatgagattcaccaagctttcccaacaaa 6096128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 36018640 - 36018448
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accc 106  Q
    ||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||| |||||| | ||||    
T  36018640 acccttttcccaaaagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacctttagtatctacataccc 36018541  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||| ||| || |||| |||||||| ||||    
T  36018540 tgaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttatccaacaaatgggtcaaagaatgcatatgtagtgttcagatccgggcaaa 36018448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 148
Target Start/End: Original strand, 41819900 - 41820040
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  41819900 acccttttcccaagagccccctcttttggttctctaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaacct 41819999  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 148  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41820000 aaaagttatctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 41820040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 46860260 - 46860120
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatcta-aaaccc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| | ||||    
T  46860260 acccttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcatgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccc 46860161  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagct 147  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46860160 taaaagttctctcatttggtttccatgagattcaccaagct 46860120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 160
Target Start/End: Original strand, 5434257 - 5434410
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||||||| | | |||  |||||||| | ||    
T  5434257 acccttttcccaagagccccctcttttggttctataagatttacatcttgaagctttaaacctccctcaaagacccttaacttttggtatctaaatatcc 5434356  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatg 160  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5434357 taaaagttccctcctttgatttccatgagattcaccaagcttactcaacaaatg 5434410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 34795642 - 34795481
Alignment:
Q  25 cccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagttccctccttt 123  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| | || ||| |||| ||| |||||| |||||||| |||||||||| || |||||||    
T  34795642 cccctcttctggttctccaagattcagatcttgaagctttgaacatcacccaacgaccatcaacctttagtatctaaataccctaaaagatctctccttt 34795543  T
Q  124 ggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtt 185  Q
    ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||    
T  34795542 ggttttcataggattcaccaaacttacccaacaaataagtcatagagtgcttatatactgtt 34795481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 89 - 199
Target Start/End: Original strand, 31340501 - 31340611
Alignment:
Q  89 ctttattatctaaaaccctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttag 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||  |||| ||    
T  31340501 ctttagtatctaaaaccctaaaagttctctcctttggtttccataagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcaaagaatgcatatattgtgttcag 31340600  T
Q  189 atccggacaaa 199  Q
    ||| |||||||    
T  31340601 atctggacaaa 31340611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Original strand, 26323896 - 26324042
Alignment:
Q  13 tttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaa 111  Q
    |||||||| || || |||||||| || | ||||||| ||||||||||| ||||||| | || ||| |||||||| |||||| |||||||| | | |||||    
T  26323896 tttcccaatagccctctcttttgattcttcaagatttacatcttgaagctttgaacttcacccaatgaccctcaacctttagtatctaaatatcttaaaa 26323995  T
Q  112 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaa 158  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26323996 gtttcctcctttggtttccatgagattcaccaaacttactcaacaaa 26324042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 50 - 186
Target Start/End: Original strand, 35139134 - 35139271
Alignment:
Q  50 acatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctt 148  Q
    ||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35139134 acatcttaaagttttgaacctcatctaaagaccctcaacgtttagtatctaaatacccaaaaagtaccctcctttggtttccatgaaattcaccaagctt 35139233  T
Q  149 acccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgttt 186  Q
    ||  |||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||    
T  35139234 acttaacaaatgggtcaaagagtgtttaaatagtgttt 35139271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39127339 - 39127191
Alignment:
Q  17 ccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagttc 115  Q
    ||||||| ||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| |||  | |||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  39127339 ccaagagtcccctattttagttctctaagattcatatcttgaagctttgaacctcac-caaaggccccaaacctttagtatgtaaataccctaaaagttc 39127241  T
Q  116 cctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 165  Q
     |||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  39127240 tctccgttgatttccatgagattcactaagcttactcaacaaatgagtca 39127191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 56
Target Start/End: Original strand, 31340459 - 31340503
Alignment:
Q  12 ttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatctt 56  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31340459 ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatctt 31340503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20937408 - 20937354
Alignment:
Q  132 tgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgttt 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||| |||||    
T  20937408 tgagattcaccaagcttacccaactaatgggtcaatgggtgcttaaatagtgttt 20937354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 127; Significance: 9e-66; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 40147046 - 40146857
Alignment:
Q  12 ttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40147046 ttttcccaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaa 40146947  T
Q  112 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctt--atatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||    
T  40146946 gtttcatcctttggtttccatgagattcaccaagcttaaccaacaaatgggtcatggagtgcttacatatagtgttcagatccagacaaa 40146857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 213258 - 213089
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttcc-aagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccc 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  213258 acccttttcccaagagccccctcttttggttctcccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccc 213159  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  213158 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcatcaagcttacccaaaaaatgggtcatggagtactta 213089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38746794 - 38746603
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  38746794 acccttttcttaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaaactttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 38746695  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||||  |||| ||||||| |||||    
T  38746694 aaaagttctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgagtcaaagaatgcatatattgtgttcagatccgaacaaa 38746603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 16642262 - 16642424
Alignment:
Q  13 tttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaa 111  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  16642262 tttcccaagag--ccctcttttggttcttcaagattcacttcttgaagctttgaacctcacccaaagaccatcaacctttagtatctaaataccctaaaa 16642359  T
Q  112 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16642360 gtgctctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 16642424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5057832 - 5057647
Alignment:
Q  12 ttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccctaaaa 111  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5057832 ttttcccaaaag-cccctcttttggttctcaaagattcacatcttgaagctttgatcctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccctaaaa 5057734  T
Q  112 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  5057733 gttctctcctttggtttccatgagattcacccagc-tctttaacaaatgggtcatggagtgcttacatagtgttcagatccggacaaa 5057647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28278105 - 28277925
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccc-tcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccc 106  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  28278105 acccttttcccaagagcccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcatccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccc 28278006  T
Q  107 taaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagctta--cccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtt 185  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  28278005 taaaagtttcctcctttagtttccttgagattcaccaagcttattttcaacaaatgggtcatgaagtgcttaaatagtgtt 28277925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 27015321 - 27015130
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27015321 acccttttcacaagagccccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttgatcctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 27015222  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatggg-tcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||| |||| || ||| |||||  |||| |||||||||||||    
T  27015221 aaaagttccctcctttgatttccattagattcgccaagcataccca-caaatggggtcatagaatgcatatattgtgttcagatccggacaaa 27015130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 27637994 - 27638161
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||  |||| |||||| ||||||||||| |    
T  27637994 acccttttcccaagagctccctcttttggttctccaagattcacatcttgaacttt-gaacctcacccaaagattctcaacctttagtatctaaaacctt 27638092  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||| |||||||||    
T  27638093 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcctttttaacaaatgggtcatagagtgctta 27638161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 35615965 - 35615792
Alignment:
Q  4 catcacccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa- 102  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  35615965 catcacccctttcccaagagtcccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcactcaaagaccctcaacctttagtatctaaat 35615866  T
Q  103 accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    || |||||||||   || ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||    
T  35615865 actctaaaagttttttcatttggtttcaaggagattcaccaagcttacgcaacaaattaatcaaggagtgctta 35615792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 316548 - 316370
Alignment:
Q  15 tcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaa-aaccctaaaagt 113  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||  ||  |||||||    
T  316548 tcccaagagcccccccttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaagtacaataaaagt 316449  T
Q  114 tccctcctttggtttccatgagattc------accaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgttt 186  Q
    || ||||||| |||||||||||||||      ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  316448 tctctcctttagtttccatgagattcaccattaccaagcttactcaacaaatgggtcaaggagtgcttaaataatgttt 316370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30802725 - 30802552
Alignment:
Q  13 tttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaa 111  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| || |||||  ||||| ||||| ||||||||| ||  ||||||||||| |||  | |||||||| |||||||||    
T  30802725 tttcccaagagcctcctcttttggttctctaagata-acatcatgaagctttgaacctcacctaaagaccctcaacctagaatatctaaataccctaaaa 30802627  T
Q  112 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgttt 186  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||| ||||| |||| ||| |||||    
T  30802626 gttccctcatttggtttccatgagattcaccaagcgtactcaacaaatcgatcaaggagtacttaaatagtgttt 30802552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 163
Target Start/End: Original strand, 14689807 - 14689942
Alignment:
Q  29 tcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaa-ccctaaaagttccctcctttggtt 127  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||| | |||| | ||||||||  |||||||||||  ||||||| |||    
T  14689807 tcttttggttctccaaaattcacatcttgaaactttgaacatcactcaaagacccttaaccttcactatctaaatgccctaaaagttttctcctttagtt 14689906  T
Q  128 tccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggt 163  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14689907 tccatgagattcaccaagcctactcaacaaatgggt 14689942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 30793006 - 30792861
Alignment:
Q  31 ttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttc 129  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||  ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||    
T  30793006 ttttggttctccaagata-acatcttgaagctttgaacatcacctaaagaccctcaacctttagtatctaattaccctaaaagtttactcatttggtttc 30792908  T
Q  130 catgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||    
T  30792907 catgagattcaccaagcttacttaacaaatgggtcaagaagtgctta 30792861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Original strand, 10055090 - 10055238
Alignment:
Q  13 tttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaa-aaccctaaaa 111  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || || |||| ||| |||  ||||| |||| ||  || |||||     
T  10055090 tttcccaagagccctctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaatctcacccaaaaaccttcaatctttagtatccaagtactctaaat 10055189  T
Q  112 gttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatg 160  Q
    ||||| || |||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10055190 gttccatcatttgatttctatgagattcaccaaacttactcaacaaatg 10055238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 186
Target Start/End: Original strand, 33906578 - 33906688
Alignment:
Q  76 aaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgct 174  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||    
T  33906578 aaagaacctcaacctttaatatctaaataccctaaaagttctcttctttggtttc-atgagattcaccaagcttgttcaacaaatgggttaaggagtgct 33906676  T
Q  175 tatatattgttt 186  Q
    || ||| |||||    
T  33906677 taaatagtgttt 33906688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4160416 - 4160255
Alignment:
Q  15 tcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagt 113  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||| |||| ||  ||||||| | || |||| |||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||    
T  4160416 tcccaagagccccctcttttagttctccaggattcacttctttaaactttgaacatcacccaaa-accctcaaactttagtatctaaataccctaaatgt 4160318  T
Q  114 tccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||| |  |||||||||    
T  4160317 tctctcatttggtttccatgagattcaccgagctcactcaaaaaataggttaaagagtgctta 4160255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Original strand, 33906414 - 33906491
Alignment:
Q  15 tcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagccttt 92  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  33906414 tcccaagagcccccttttttggttctacaagattcacattttgaggcttcgaacctcactcaaagaccctcaaccttt 33906491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 126; Significance: 3e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7117 - 6960
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7117 acccttttcacaagagccccctcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 7018  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7017 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtca 6960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 11347 - 11156
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  11347 accctttccccaagagccccatcttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctaaaaccct 11248  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||  |||| ||| |||||||||    
T  11247 aaaagttccctcctttggtttccatgagatttaccaagcttacccaacaaatgggtcaaagaatgcatatattgtgttcagaaccggacaaa 11156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 199
Target Start/End: Original strand, 80662 - 80853
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  80662 acccttttcataagagccccctcttttggttctccaagattcaaatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctctagtatctaaaaccct 80761  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatccggacaaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |  || |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  80762 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagattttccaacaaatgggtgaaagaatgcttatattgtgttcagatccggacaaa 80853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 97; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 176
Target Start/End: Original strand, 18380 - 18547
Alignment:
Q  8 acccttttcccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaaaccct 107  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || |||||| ||||||||| |||    
T  18380 acccttttcacaagagccccctctttttgttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagacccgcaacctttagtatctaaaa-cct 18478  T
Q  108 aaaagttccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgctta 176  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18479 ataagttttctcctttggtttccatgagattcacccagcttacccaacaaatgtgtcatggactgctta 18547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 87; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 490834 - 491008
Alignment:
Q  19 aagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatcta-aaaccctaaaagttccc 117  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  490834 aagagcccccttttttggttctccaagattcacatcttgaagctttgaacctcacccaaagaccctcaacctttagtatctacataccctaaaagctccc 490933  T
Q  118 tcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgtttagatcc 192  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||| |||| ||||||    
T  490934 tcctttggttctcatgagattcaccaagcttgctcaacaaatgggtcaaaggatgcttatatagtgttcagatcc 491008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 76; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Original strand, 1792 - 1963
Alignment:
Q  16 cccaagagacccctcttttggttttccaagattcacatcttgaagttttgaaccttactcaaagaccctcagcctttattatctaaa-accctaaaagtt 114  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | || || |||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1792 cccaagagtcccctcttttggttcttcaagattcacatcttgaagctttggagctcacccaaagaccttcaacctttagtatctaaataccctaaaagtt 1891  T
Q  115 ccctcctttggtttccatgagattcaccaagcttacccaacaaatgggtcatggagtgcttatatattgttt 186  Q
    | ||| |||||||||||| | |||||||||| ||||  ||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||    
T  1892 ctctcatttggtttccataaaattcaccaagtttacttaacaaataggtcaaggagtgcttaaatagtgttt 1963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University