View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2229_low_7 (Length: 323)

Name: NF2229_low_7
Description: NF2229
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2229_low_7
NF2229_low_7
[»] chr6 (6 HSPs)
chr6 (1-304)||(16646958-16647261)
chr6 (16-296)||(16379377-16379657)
chr6 (5-302)||(16101006-16101303)
chr6 (5-304)||(21412519-21412818)
chr6 (5-304)||(14149396-14149686)
chr6 (5-137)||(22365357-22365489)
[»] chr3 (8 HSPs)
chr3 (1-304)||(13964438-13964741)
chr3 (1-304)||(8271482-8271785)
chr3 (16-296)||(30150119-30150399)
chr3 (5-304)||(15943682-15943981)
chr3 (5-304)||(6149940-6150239)
chr3 (5-304)||(22149833-22150123)
chr3 (212-304)||(17201390-17201482)
chr3 (5-176)||(17201518-17201689)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (1-304)||(21847624-21847927)
chr8 (5-304)||(21193843-21194142)
chr8 (5-304)||(16415277-16415576)
chr8 (5-304)||(20649646-20649945)
chr8 (205-304)||(22437481-22437580)
[»] chr5 (2 HSPs)
chr5 (1-304)||(24584249-24584542)
chr5 (5-303)||(23508715-23509013)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (16-296)||(24125-24405)
[»] chr7 (6 HSPs)
chr7 (16-296)||(7827022-7827302)
chr7 (16-296)||(27104642-27104922)
chr7 (16-296)||(27173403-27173683)
chr7 (209-304)||(4443041-4443136)
chr7 (213-304)||(13459147-13459238)
chr7 (238-299)||(17142392-17142453)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (16-304)||(14999771-15000059)
chr4 (1-304)||(15290002-15290305)
chr4 (208-302)||(12339916-12340010)
chr4 (22-137)||(12339739-12339854)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (16-296)||(20828323-20828603)
chr1 (5-304)||(20528193-20528492)
chr1 (5-304)||(20928194-20928493)
chr1 (5-304)||(22129359-22129658)
chr1 (5-120)||(23312739-23312854)
chr1 (17-304)||(41214792-41215079)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (16-296)||(4668-4947)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (5-304)||(26550-26849)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (5-304)||(22280861-22281160)
chr2 (34-304)||(22739071-22739341)
chr2 (5-177)||(25131342-25131514)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (5-304)||(1365-1664)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (5-304)||(472-771)
scaffold0467 (5-302)||(13182-13479)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (10-304)||(131345-131639)
scaffold0008 (5-304)||(26930-27229)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (5-304)||(12476-12775)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (10-298)||(6716-7006)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (5-296)||(25551-25842)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (5-304)||(25333-25632)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (5-304)||(2857-3156)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (5-304)||(182144-182443)
scaffold0011 (16-298)||(73459-73741)
scaffold0011 (16-298)||(77840-78122)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (16-304)||(813-1102)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (5-304)||(90656-90955)
scaffold0021 (6-302)||(8313-8609)
scaffold0021 (5-304)||(20727-21026)
scaffold0021 (5-304)||(30303-30602)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (5-304)||(96680-96980)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (113-304)||(3862-4053)
scaffold0610 (5-91)||(3777-3863)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (22-298)||(9249-9516)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (5-304)||(5864-6154)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (5-129)||(5221-5345)
scaffold0673 (213-304)||(5363-5454)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (27-297)||(16071-16332)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (22-299)||(35244-35512)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (4-177)||(36022-36195)
[»] scaffold0962 (2 HSPs)
scaffold0962 (252-304)||(2725-2777)
scaffold0962 (91-175)||(2854-2938)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (5-48)||(1-44)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 16646958 - 16647261
Alignment:
Q  1 ggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16646958 ggctatggagttgggaaaccttacagcaaagataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagt 16647057  T
Q  101 gtagagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgc 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16647058 gtggagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgttgc 16647157  T
Q  201 aagagagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16647158 aagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcg 16647257  T
Q  301 gagg 304  Q
    ||||    
T  16647258 gagg 16647261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 296
Target Start/End: Original strand, 16379377 - 16379657
Alignment:
Q  16 aaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtc 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16379377 aaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaggccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtggagctatgggtc 16379476  T
Q  116 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16379477 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttg 16379576  T
Q  216 ttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16379577 ttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 16379657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16101303 - 16101006
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| || || |||| |    
T  16101303 atggagttggaaaaccttacaacaaagacaaaggaaagaagagagaagctggtgggggctataagccgagtttggcggatgtcaagtactataggtgtgg 16101204  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | |  ||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |  || ||||  ||  |||| |||    
T  16101203 aaccttgggtcattatgccaatgattgtaagaatgacattagttgtcataagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgttgaatgcaagggaattgcgaga 16101104  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgga 302  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16101103 gatgttacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgga 16101006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 21412519 - 21412818
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||| |    
T  21412519 atggagttgggaaaccgtacaacaaggacaaggggaagaagagagaagctggtgggggctctaagccaaatttagcggatgtcaagtgctacaagtgtgg 21412618  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | |||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |    || || |  |||||||| |      
T  21412619 aactataggtcattatgccaatgattgtaagaaggacattagttgtcataagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttttgaatgtaagggtgttgcgaag 21412718  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||  ||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  21412719 gatgttacttgatacaattgtggagagaagggttatattagtactaagtgtatcaagtcgaagaaggcggcgggaacagtgtttgctttgaatacggagg 21412818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 14149686 - 14149396
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| || ||||||   ||||| || || ||||  ||||||| |||| |    
T  14149686 atggatttgggaaaccgtacaacaaggataagggaaagaagagtgaaactggtggaggttctaaggtgagtttagctgatgtcagatgctttaggtgtgg 14149587  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | || |||||||||||||||  ||||||||||| |||   |  |||  |||||||||  ||||||||| || | |||| || |||| ||        ||     
T  14149586 aactttgggtcattatgctaacgattgcaagaaggatgagaaatgtttcaagtgtggacaagcgggtcccaggtcggctgagtgca-ag--------agg 14149496  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  14149495 gagattacttgttacaattgtggtgagaagggtcatatcagtactaattgtaccaagccgaagaaggcggcagggaaggtgtttgcattgaatgcggagg 14149396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 137
Target Start/End: Original strand, 22365357 - 22365489
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |  ||  || |||||||||||||||||| |    
T  22365357 atggagttggaaaaccgtacaacaaggacaaagggaagaagagagaagctggtggaggctctaagactaataagggtgatgtcaagtgctttaagtgtgg 22365456  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaa 137  Q
      | |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  22365457 cacgatgggtcattatgctaatgagtgcaagaa 22365489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 8)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 13964438 - 13964741
Alignment:
Q  1 ggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13964438 ggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaagtgctttaagt 13964537  T
Q  101 gtagagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgc 200  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13964538 gtggatctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgttgc 13964637  T
Q  201 aagagagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964638 aagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcg 13964737  T
Q  301 gagg 304  Q
    ||||    
T  13964738 gagg 13964741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 8271482 - 8271785
Alignment:
Q  1 ggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8271482 ggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaagtgctttaagt 8271581  T
Q  101 gtagagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgc 200  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8271582 gtggagctatgggtcattatgttagtgattgcaagaacgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgttgc 8271681  T
Q  201 aagagagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8271682 aagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcg 8271781  T
Q  301 gagg 304  Q
    ||||    
T  8271782 gagg 8271785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 30150399 - 30150119
Alignment:
Q  16 aaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtc 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30150399 aaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaggccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtggagctatgggtc 30150300  T
Q  116 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30150299 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttg 30150200  T
Q  216 ttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30150199 ttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 30150119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 15943682 - 15943981
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||| |    
T  15943682 atggagttggaaaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtgg 15943781  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | || ||||||||||||| | |||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||    
T  15943782 aactttgggtcattatgccaatgattgcaagcatgatgtgaattgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaaggcggctgattgcaagagtgttgcaaga 15943881  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15943882 gagattacttgttacaattgcggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttaaatgcggagg 15943981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 6149940 - 6150239
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || |||||||| || |||||| |    
T  6149940 atggagttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccgaatttgtcagatgtcaagtgtttcaagtgtgg 6150039  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    |  ||||||||||||||| | | |||| || || ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |    || ||||   |||||| ||      
T  6150040 aaatatgggtcattatgccaattattgtaaaaaggatatcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttatgaatgcaagagtgttgtaaag 6150139  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6150140 gagattacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 6150239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 22149833 - 22150123
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||||||||  |||||||| || ||||||      
T  22149833 atggagttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaagttggtggggcctctaagccgaatttggcggctgtcaagtgtttcaagtgtgt 22149932  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | | |||||||||||||| | |||||| ||||  ||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||| |    || ||||  |||||||||| |    
T  22149933 aaccatgggtcattatgccaatgattgtaagatggatatcagttgtcacaagtgtgggaaagcgagtcacaaggcttttgaatgcatgggtgttgcaaaa 22150032  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||         |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  22150033 gagattacttgctacaattgtggagagaagggtcacatta---------gtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaagtgtttgctttgaatgctgagg 22150123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 212 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 17201482 - 17201390
Alignment:
Q  212 cttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17201482 cttgttacaattgtggagagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcattgaatgcggagg 17201390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 17201689 - 17201518
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| | ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |  ||  |  ||||||| |||||||||| |    
T  17201689 atggagttggaaaaccgtacaacaaggacagagagaagaagagagaagctggtggaggctctaagactaataagggtgctgtcaagttctttaagtgtgg 17201590  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaa 176  Q
        |||||||||||||||| ||| | |||||| |    || |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  17201589 catgatgggtcattatgctaatgagtccaagaagggcgatagttgctacaagtgtgggaaagcgggtcacaa 17201518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 21847624 - 21847927
Alignment:
Q  1 ggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21847624 ggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaagtgctttaagt 21847723  T
Q  101 gtagagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21847724 ttagagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtggaaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgttgc 21847823  T
Q  201 aagagagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcg 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21847824 aagacagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccatgccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaacgcg 21847923  T
Q  301 gagg 304  Q
    ||||    
T  21847924 gagg 21847927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 21193843 - 21194142
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| || |||| |    
T  21193843 atggagttgggaaaccgtacaacaaggacaaaagaaagaagagagaagttggtgggggctctaagccgagtttagcggatatcaagtgctataggtgtgg 21193942  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | || ||||||||||||| | |||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||  | |||||||||     
T  21193943 aactttgggtcattatgccaatgattgtaagaaggacattagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgctgaatgcaaggatgttgcaagg 21194042  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21194043 gatgttacttgttacaattgtggagagaagggccatatcagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcattgaatgcggagg 21194142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16415576 - 16415277
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  16415576 atggagttggaaaaccgtacaacaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccgaatttggcggatgtcaaatgcttcaagtgtgg 16415477  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||| |    || ||||   |||||||||      
T  16415476 aaatatgggtcattatgctaatgattgtaagaaggatatcagttgtcacaagtgtgagaaagcgggtcacaaggcttatgaatgcaagagtgttgcaaag 16415377  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16415376 gagattacttgctacaattatggagagaaaggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggtggtgggaaaggtgtttgccttgaatgcggagg 16415277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 20649646 - 20649945
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |  |||||| |    
T  20649646 atggagttgggaaaccttacaacaaagacaaaggaaagaagagggaagctggtgggggctctaagccgaattttgcggatgtcaagtgttacaagtgtgg 20649745  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | | |||||||||||||| | |||||| ||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||      || ||||  |||| ||||| |    
T  20649746 aaccatgggtcattatgccaatgattgtaagaaggatatcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggattttgaatgcaagggtgatgcaaaa 20649845  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20649846 gagattacttgctacaattgtggggagaagggtcatattagtactaagtgtaccaggccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 20649945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 205 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22437580 - 22437481
Alignment:
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||    
T  22437580 gagatcacttgttacaattgtggtgagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtggaaaaggtgtttgcattgaatgtggagg 22437481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 24584542 - 24584249
Alignment:
Q  1 ggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24584542 ggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaa-aagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagt 24584444  T
Q  101 gtagagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgc 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  24584443 gtggagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgtttc 24584344  T
Q  201 aagagagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcg 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24584343 aagagagattacttgttacaattgtggagagaagggtcatatta---------gtaccaagccgaagaaggcagcgggaaaggtgtttgctttgaatgcg 24584253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 5 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 23509013 - 23508715
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  | || |||| ||| || |||||| |    
T  23509013 atggagttggaaaaccttacaacaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccgaatctctcagacgtcaggtgtttcaagtgtgg 23508914  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||      || |||||  ||| |||||      
T  23508913 aaatatgggtcattatgctaatgattgcaagaaggatatcaattttcacaagtgtgggaaagcgggccacaagggttttgaatgcaggagtgatgcaaag 23508814  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggag 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23508813 gagattacttgctacaattgtggagagaagagtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcagcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggag 23508715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24405 - 24125
Alignment:
Q  16 aaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtc 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24405 aaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggtggctctaagccaagtttggcggatgtcaagtgctttaagtgtggatctatgggtc 24306  T
Q  116 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttg 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24305 actatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttg 24206  T
Q  216 ttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24205 ttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 24125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 6)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7827302 - 7827022
Alignment:
Q  16 aaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtc 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7827302 aaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaggccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtggagctatgggtc 7827203  T
Q  116 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7827202 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttg 7827103  T
Q  216 ttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7827102 ttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 7827022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 296
Target Start/End: Original strand, 27104642 - 27104922
Alignment:
Q  16 aaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtc 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27104642 aaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaggccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtggagctatgggtc 27104741  T
Q  116 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27104742 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttg 27104841  T
Q  216 ttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27104842 ttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 27104922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27173683 - 27173403
Alignment:
Q  16 aaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtc 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27173683 aaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaggccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtggagctatgggtc 27173584  T
Q  116 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27173583 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttg 27173484  T
Q  216 ttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27173483 ttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 27173403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4443136 - 4443041
Alignment:
Q  209 ttacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| | | | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  4443136 ttacttgttacaattgtggtgagaaaggtcatatcagttctaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgtatgtggagg 4443041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 213 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13459238 - 13459147
Alignment:
Q  213 ttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| | ||||||||||  |||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13459238 ttgttacaattgtggcgagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagttgaagaaggtgacgggaaaagtgtttgcattgaatgcggagg 13459147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 299
Target Start/End: Original strand, 17142392 - 17142453
Alignment:
Q  238 catattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgc 299  Q
    |||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  17142392 catattagcaccaagtgtaccaaaccgaagaaggcgggaggaaaggtctttgcattgaatgc 17142453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15000059 - 14999771
Alignment:
Q  16 aaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtc 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||    
T  15000059 aaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctttaagtgtggaactttgggtc 14999960  T
Q  116 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttg 215  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999959 actatgctaatgattgcaagaatgatttgaattgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttg 14999860  T
Q  216 ttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999859 ttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 14999771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 304
Target Start/End: Original strand, 15290002 - 15290305
Alignment:
Q  1 ggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15290002 ggctatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaagccaagtttggaggatgtcaagtgctttaagt 15290101  T
Q  101 gtagagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgc 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||||||||||||| ||||||||||      || |||||  ||| |||    
T  15290102 gtggagctatgggtcattatgctagtgattgcaagactgatatcaagtgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaagggttttgaatgcaggagtgctgc 15290201  T
Q  201 aagagagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcg 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    
T  15290202 aagagagattacttgctacaattatggagagaagggtcatattagtaccaagtgtacccaaccgaagaaggcggcgagaaaggtgttttctttgaacgcg 15290301  T
Q  301 gagg 304  Q
    ||||    
T  15290302 gagg 15290305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 302
Target Start/End: Original strand, 12339916 - 12340010
Alignment:
Q  208 attacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgga 302  Q
    |||||||||||||| || ||||||    ||||||| | ||| | ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12339916 attacttgttacaactgcggagagtcaggtcatatcagtactaagtgtaccaaaccgaagaaggcgtcgggtaaggtgtttgatttgaatgcgga 12340010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 137
Target Start/End: Original strand, 12339739 - 12339854
Alignment:
Q  22 tacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtcattatg 121  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||   |||||| ||||||||||| ||| | || || ||||  |||||||||||| |  || ||||||||||      
T  12339739 tacaacaaggataaagggaagaagaaagaggttggtggaggctctaagccgagtgtagctgatgtcagatgctttaagtgtgggactttgggtcattact 12339838  T
Q  122 ctagtgattgcaagaa 137  Q
    |||||||||| |||||    
T  12339839 ctagtgattgtaagaa 12339854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 16 - 296
Target Start/End: Original strand, 20828323 - 20828603
Alignment:
Q  16 aaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtc 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20828323 aaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaggccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtggagctatgggtc 20828422  T
Q  116 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttg 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20828423 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggtcgattgcagaggtgttgcaagagagactacttg 20828522  T
Q  216 ttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20828523 ttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 20828603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20528492 - 20528193
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||| |    
T  20528492 atggagttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagggaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaggtgctataggtgtgg 20528393  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | |  ||||||||||||| | |||||| |||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||   |||||||| ||    
T  20528392 aaccttgggtcattatgccaatgattgtaagaatgacttgagttgtcataagtgtgggaaagcgggtcacaaggcgactaattgcaacagtgttgcatga 20528293  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20528292 gagattacttgttacaattgtggagagaaaggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcagcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 20528193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 20928493 - 20928194
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || |||| |    
T  20928493 atggagttggaaaacctttcagcaaggacaaaagtaagaagagagaatctggtgggggctctaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtgg 20928394  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | |  |  ||||||||||    ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||    
T  20928393 aaccttaagtcattatgcccacgattgtaagaatgattggaattgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaagtcggctgattgcaagagtgttgcaaga 20928294  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20928293 gagatttcttgttacaattgtggagagaaaggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgaatgcagagg 20928194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 22129359 - 22129658
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||   |||||| |||| |||||| | ||| || || |||| |||||  |||||| |    
T  22129359 atggagttgggaaaccgtacaacaaggataaaggaaagaagaaagagaatggtggaggctttaagccgaatttagctgatgtcaggtgctacaagtgtgg 22129458  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | || ||||||||||||| | |||||| ||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    || || |  | ||||   |      
T  22129459 aactttgggtcattatgccaatgattgtaagaaagacattagttgccacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcctatgagtgtaaggatgttttgaag 22129558  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22129559 gatattacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgaatgcagagg 22129658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 120
Target Start/End: Original strand, 23312739 - 23312854
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||  ||| |    
T  23312739 atggagttgggaaaccgtacaacaaggacaaaggaaagaagagagaagatggtggaggctctaagccgagtttagcggatgtcaaatgctatagatgtgg 23312838  T
Q  105 agctatgggtcattat 120  Q
    | || |||||||||||    
T  23312839 aactttgggtcattat 23312854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 304
Target Start/End: Original strand, 41214792 - 41215079
Alignment:
Q  17 aaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtca 116  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || |||| |||||  | |||| || |  | |||||    
T  41214792 aaccatacaacaaggacaaaggaaagaagaaagagactggtgggggctctaagccaagtttagctgatgtcaggtgctacaggtgtggaaccttcggtca 41214891  T
Q  117 ttatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgt 216  Q
    |||| | | |||||| ||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |    || || |    ||||||||  ||  ||||||||    
T  41214892 ttattccaatgattgtaagaaggacattagttgccacaagtgtgggaaggcaggtcacaaggcttttgagtgtaagattgttgcaaaggatgttacttgt 41214991  T
Q  217 tacaattgtggag-agaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||| | || || |||||   | ||  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  41214992 tacaattgtggtgaagcag-gtcattacagtaatatgtgtaccaagccaaagaaggcgacgggaaaggtgtttgcattgaatgccgagg 41215079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 16 - 296
Target Start/End: Original strand, 4668 - 4947
Alignment:
Q  16 aaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtc 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  4668 aaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaagctggtggaggctctaagccacgtttggcggatgtcaagtgctttaagtgtggatctatgggtc 4767  T
Q  116 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttg 215  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4768 actatgctagtgattgcaagaatgattt-acttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttg 4866  T
Q  216 ttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4867 ttacaattgtggagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 4947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 26849 - 26550
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| || |||| |    
T  26849 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctcaaggccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtgg 26750  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | |  | ||||| ||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  26749 aaccttaggtcactatgctaatgattgcaagaatgatgtgaattgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggctgatttcagaggtgttgcaaga 26650  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26649 gagattacttgctacaattgtcgagagaagggtcatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 26550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22281160 - 22280861
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| |    
T  22281160 atggagttgtaaaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgttaggtgctttaggtgtgg 22281061  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | || ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||    
T  22281060 aactttgggtcattatgccaatgattgtaagaatgatttgagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggctgattgcaagagtgttgcaaga 22280961  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22280960 gagattacttgttacaattgtggagagaaatgtcatattagtactaagtgtacaaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 22280861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 34 - 304
Target Start/End: Original strand, 22739071 - 22739341
Alignment:
Q  34 aaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtcattatgctagtgattgca 133  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||||||||  |||||| || || ||||||||||||| | |||||| |    
T  22739071 aaaggaaagaagagagaagttggtggggcctctaagccgaatttagcggatgtcaagtgctacaagtgtggaactttgggtcattatgccaatgattgta 22739170  T
Q  134 agaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtggagagaa 233  Q
    |||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |    || || |  |||||||| |  ||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  22739171 agaaggacattaattgccacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttttgaatgtaagggtgttgcgaaggatgttacttgctacaattgtggagagaa 22739270  T
Q  234 gagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    | ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22739271 gggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 22739341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25131514 - 25131342
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    ||||| ||| |||||| || | |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| | | |  ||| || |||| ||||||||||||| |    
T  25131514 atggatttgtgaaaccgtataacaaggataaaggaaggaagaaagaagctggtggaggctctaagtctaatacggctgatgtcaggtgctttaagtgtgg 25131415  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaag 177  Q
      |  ||||| ||| ||||| ||| |||||||| | |  || |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  25131414 cacgttgggtgattttgctaatgagtgcaagaagggtgatagttgctacaagtgtgggaaagtgggtcacaag 25131342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 1664 - 1365
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||| |    
T  1664 atggggttggaaaactttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaggccaaatttggcggaagtcaagtgctataggtgtgg 1565  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | |  | ||||| ||||| | |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1564 aaccttaggtcactatgccaatgattgtaagaatgatgtgaattgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcggctgattgcagaggtgttgcaaga 1465  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1464 gagattacttgttacaattgtggagagaaaggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcagcggcaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 1365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 472 - 771
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |    
T  472 atggagttggtaaaccttacagcaaggacaagggaaagaagagataatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtgg 571  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | |  ||||||||||||||| |||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||   ||||||||||     
T  572 aaccttgggtcattatgctaatgattgtaagaatgacatgagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacagggcggctgattgcaagagtgttgcaagg 671  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  672 gagatcacttgttataattgtggagagaaaggtcatattagtaccaagtgtaccaaaccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 302
Target Start/End: Original strand, 13182 - 13479
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |    
T  13182 atggagttggtaaaccttacagcaaggacaagggaaagaagagataatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtgg 13281  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | |  ||||||||||||||| |||||| ||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||   ||||||||||     
T  13282 aaccttgggtcattatgctaatgattgtaagaatgacatgagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacagggcggctgattgcaagagtgttgcaagg 13381  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgga 302  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13382 gagatcacttgttataattgtggagagaaaggtcatattagtaccaagtgtaccaaaccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgga 13479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 304
Target Start/End: Original strand, 131345 - 131639
Alignment:
Q  10 gttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagcta 109  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||        
T  131345 gttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaaact 131444  T
Q  110 tgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagat 209  Q
    | ||||| ||||| |  ||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  131445 taggtcactatgcaaaagattgtaagaatgattggaattgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaagtcggctgattgcaagagtgttgcaagagagat 131544  T
Q  210 tacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131545 tacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 131639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27229 - 26930
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | || |||||||| || ||| || |    
T  27229 atggagttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaatttggtgggggctctaagccgaatttgtcagatgtcaagtgtttcaagagttg 27130  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |    || || |   |||||||||      
T  27129 aaatatgggtcattatgctagtgattgtaagaaggatatcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttatgaatgtaagagtgttgcaaag 27030  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27029 gagattacttgctacaattgtggagagaaaggtcatattagtactaagtttaccaagccgaagaagggggcggaaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 26930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 12476 - 12775
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||| || |||| |    
T  12476 atggagttggaaaaccttacagcaaggacaaaggaaataagagaaaatctggtgggggctctaggccaagtttggtggatgtcaagggctataggtgtgg 12575  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | |  | ||||||||||| | |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||   |||||||||||    
T  12576 aaccttaggtcattatgccaatgattgtaagcatgatttgaattgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaagtcggctgattgcaagagtgttgcaaga 12675  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12676 gagattacttgttacaattctggagagaaagttcatattagtaccaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgattgctttgaatgcggagg 12775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 298
Target Start/End: Original strand, 6716 - 7006
Alignment:
Q  10 gttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagcta 109  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||        
T  6716 gttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtggaaact 6815  T
Q  110 tgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagat 209  Q
    | ||||| ||||| | |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||   ||||||||||||||||    
T  6816 taggtcactatgccaatgattgtaagaatgattggaattgtcacaagtgtgggaaaacgggtcacaagtcggctgattgcaagagtgttgcaagagagat 6915  T
Q  210 tacttgttacaattgtggagagaagagtc--atattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatg 298  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6916 tacttgctataattgtggagagaagggtcatatattagtaccaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttactttgaatg 7006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 296
Target Start/End: Original strand, 25551 - 25842
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| || |||| |    
T  25551 atggagtttggaaaccgtacaacaaggacaaagggaagaagagagaagctggttggggctctaagccgagtttagcggatgtcaagtgctataggtgtgg 25650  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | || ||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||  |||||||||||     
T  25651 aactttgggtcattatgccaatgattgtaagaatgacattagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctactgattgcaagggtgttgcaagg 25750  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 296  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25751 gatgttacttgttacaattgtggagagaaaggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaa 25842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 25632 - 25333
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || |||| |    
T  25632 atggagttggaaaaccttacaacaaagacaaaggaaagaagagagaagctggtgggggctctaagccgagtttggcggatgtcaagtgctataggtgtgg 25533  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | || ||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||   || ||||||      
T  25532 aactttgggtcattatgccaatgattgtaagaatgacattagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgctgagtgcaagagttttgcaaag 25433  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25432 gagattacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtactaagtgtacaaagccggagaaggcggcaagaaaggcgtttgctttgaatgcggagg 25333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3156 - 2857
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| ||||||| || ||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||| || |||| |    
T  3156 atggagttggaaaaccttgcaacaaagacaaagggaagaagagagaagctggtgggggctctaagtcgagttcggcggatgtcaagtgctataggtgtgg 3057  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | || ||||||||||||| | |||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| | || || ||||   |||||| ||      
T  3056 aactttgggtcattatgccaatgattgtaagaatgacattagttgtcacaagtgcgggaaagcgggtcataaggctgctgagtgcaagagtgttggaaag 2957  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2956 gagattacttgctacaattgtggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgagaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 2857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 182443 - 182144
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || |||| ||| || |||||| |    
T  182443 atggagttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccgaatttgtcagacgtcaggtgtttcaagtgtgg 182344  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    |  ||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| |   |||||||||||||||||||| |||||||||       || ||||  ||||||||||      
T  182343 aaatatgggtcattatgccaatgattgtaagaaggatatcggttgtcacaagtgtgggaaagtgggtcacaaaggttatgaatgcaagggtgttgcaaag 182244  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  182243 gagattacttgctacaattgtggagagaagggtcagattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgtgaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 182144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 298
Target Start/End: Original strand, 73459 - 73741
Alignment:
Q  16 aaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtc 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || |||| ||| || |||||| ||  ||||||||    
T  73459 aaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccgaatttgtcagacgtcaggtgtttcaagtgtggaaatatgggtc 73558  T
Q  116 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttg 215  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||       || || |   |||||||||  |||||||||||    
T  73559 attatgctaatgattgtaagaaggatatcagttgtcacaagtgtggaaaagcgggtcacaaatgatatgaatgaaagagtgttgcaaaggagattacttg 73658  T
Q  216 ttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatg 298  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  73659 ctacaattgcggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatg 73741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 298
Target Start/End: Original strand, 77840 - 78122
Alignment:
Q  16 aaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtc 115  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || |||| ||| || |||||| ||  ||||||||    
T  77840 aaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccgaatttgtcagacgtcaggtgtttcaagtgtggaaatatgggtc 77939  T
Q  116 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttg 215  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||       || || |   |||||||||  |||||||||||    
T  77940 attatgctaatgattgtaagaaggatatcagttgtcacaagtgtggaaaagcgggtcacaaatgatatgaatgaaagagtgttgcaaaggagattacttg 78039  T
Q  216 ttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatg 298  Q
     |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  78040 ctacaattgcggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatg 78122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 304
Target Start/End: Original strand, 813 - 1102
Alignment:
Q  16 aaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtc 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | || || | ||| || |||||| ||  ||||||||    
T  813 aaaccttacagcaaggacaaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccgaatttgtcagacgttaggtgtttcaagtgtggaaatatgggtc 912  T
Q  116 attatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcaga-ggtgttgcaagagagattactt 214  Q
    ||||||| | |||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||      || |||| | |||| |||||  ||||||||||    
T  913 attatgccaatgattgtaagaaggatatcagttgtcacaagtgtggaaaagcaggtcacaagggttatgaatgcaaagggtggtgcaaaggagattactt 1012  T
Q  215 gttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    | |||||||||||||||||| |||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1013 gctacaattgtggagagaagggtcacattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggtgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 90955 - 90656
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||| | || |||||||| || |||||| |    
T  90955 atggagttggaaagccgtacaacaaggacaaaggaaagaatagagagtctggtggcggctctaagccgaatttgtcagatgtcaagtgtttcaagtgtgg 90856  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |    || ||||   |||||| ||      
T  90855 aaatatgggtcattatgctaatgattgtaagaaggacatcagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggcttatgaatgcaagagtgttgaaaag 90756  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  || |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  90755 gagattacttgatacaattgtggagagaaaggttatattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtatgctttgaatgcggagg 90656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 8609 - 8313
Alignment:
Q  6 tggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtaga 105  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||| | ||    
T  8609 tggagttgggaagtcgtacaacaaggacaagggaaagaagagagaagccggtgggggctctaagccgaatttggcggatgtcaagtgctacaagtatgga 8510  T
Q  106 gctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagag 205  Q
     || |||||| |||||| | |||||| || || ||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |     | ||||  ||||||||||  |    
T  8509 actttgggtctttatgccaatgattgtaaaaaggatatcagttgtcacaagtgtgggaaagcggatcacaaggcttttaaatgcaagggtgttgcaaagg 8410  T
Q  206 agattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgga 302  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8409 agattacttgctacaattctggagagaagggtcatattagtactaagtgtaccaatccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcgga 8313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 20727 - 21026
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    ||||| ||| |||||| || | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| | | |  |||||| |||||||||||| ||||| |    
T  20727 atggatttgtgaaaccgtataacaaggataaaggaaggaagaaagaatctggtggaggctctaagtctaataaggcggatgtcaagtgctttgagtgtgg 20826  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
      |  ||||||||| ||||| ||| |||||||| |    || |||  || ||||||  |||| |||||||||| |  |||| ||      |||||| |      
T  20827 cacgttgggtcattttgctaatgagtgcaagaagggcgatagttgctaccagtgtgaaaaagagggtcacaaggcttccgagtgttcgaatgttgcgaag 20926  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||  | ||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20927 gagattacttgttacaattgttgtgagaaaggacatatcagtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgattgcggagg 21026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 30303 - 30602
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    ||||| ||| |||||| || | |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| | | |  |||||| |||||||||||| ||||| |    
T  30303 atggatttgtgaaaccgtataacaaggataaaggaaggaagaaagaatctggtggaggctctaagtctaataaggcggatgtcaagtgctttgagtgtgg 30402  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
      |  ||||||||| ||||| ||| |||||||| |    || |||  || ||||||  |||| |||||||||| |  |||| ||      |||||| |      
T  30403 cacgttgggtcattttgctaatgagtgcaagaagggcgatagttgctaccagtgtgaaaaagagggtcacaaggcttccgagtgttcgaatgttgcgaag 30502  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||  | ||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30503 gagattacttgttacaattgttgtgagaaaggacatatcagtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcaggaaaggtgtttgctttgattgcggagg 30602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 96980 - 96680
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||  |||||| |    
T  96980 atggagttggaaaaccgtacaacaaggacaaaggaaataagagagaagccggtgggggctctaagccgaatttggcggatgtcaagtgctacaagtgtgg 96881  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcac-aagacggccgattgcagaggtgttgcaag 203  Q
    | |||||||  ||||||| | |||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    || ||||  ||||||||||     
T  96880 aactatgggctattatgccaatgattgtaagaaggacattaattgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaaggcttttgaatgcaagggtgttgcaaa 96781  T
Q  204 agagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggag 303  Q
     ||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||||    
T  96780 tgatgttacttgctacaattgtggagagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaaatgttttctttgaatacggag 96681  T
Q  304 g 304  Q
    |    
T  96680 g 96680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 304
Target Start/End: Original strand, 3862 - 4053
Alignment:
Q  113 gtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattac 212  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||   || |||| || ||  ||||    
T  3862 gtcattatgccaatgattgtaagaatgacattagttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaaggctgctgagtgcaagagtattgcgagggatgttac 3961  T
Q  213 ttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  3962 ttgttacaattgtggtgagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaagtgtcttctttgaacgcggagg 4053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 91
Target Start/End: Original strand, 3777 - 3863
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagt 91  Q
    |||||| ||| ||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  3777 atggagatggaaaatcgtacaacaaggacaaaggaaagaagagagaagttggtgggggctctaagccgagtttagcggatgtcaagt 3863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 22 - 298
Target Start/End: Original strand, 9249 - 9516
Alignment:
Q  22 tacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtcattatg 121  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| | ||| |||| ||||||||||| | || || ||||||||||||    
T  9249 tacaacaaggataagggaaagaagagggaatctggtggaggctctaaggcgagtttagaggatgtcaggtgctttaagtttggaactttgggtcattatg 9348  T
Q  122 ctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||   |   |  |||  |||||||||   ||||||||| ||  |||| ||||||| ||        || ||||| ||||| |||||    
T  9349 ctaatgattgcaagaagagtcagaaatgtttcaagtgtggactagcgggtcataaagcggctgattgca-ag--------agggagatcacttgctacaa 9439  T
Q  222 ttgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatg 298  Q
    |||||| ||||||  |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9440 ttgtggggagaaggatcatattagtaccaattgtaccaagccgaagaaggcggcggggaaggtgtttgctttgaatg 9516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 304
Target Start/End: Original strand, 5864 - 6154
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||| || || ||||  |||||||||||| |    
T  5864 atggatttgggaaaccgtacaacaaggacaaagggaagaagagagaagctggtggaggctctaaggcgagtttagctgatgtcagatgctttaagtgtgg 5963  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaaga 204  Q
    | || ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||  || |||   |||||||||  ||| ||||||||||  |   || |||| ||       |||     
T  5964 aactttgggtcattactctagtaattgcaagaagaatgatagttgcttcaagtgtggacaagagggtcacaagtagtttgagtgca-ag-------aag- 6054  T
Q  205 gagattacttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6055 gagatcacttgttacaattgtggtaagaagggtcatatcagtactaagtgtaccaagccaaagaaggcggcgggaaaggtgtttgcattgaatgcggagg 6154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 129
Target Start/End: Original strand, 5221 - 5345
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtag 104  Q
    |||| ||||| ||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||| |    
T  5221 atggggttggaaaaccatacaacaaagacaaagggaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaaatttggcggatgtcaaatgcttcaagtgtgg 5320  T
Q  105 agctatgggtcattatgctagtgat 129  Q
    | |||||||||||||||||| ||||    
T  5321 atctatgggtcattatgctaatgat 5345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 304
Target Start/End: Original strand, 5363 - 5454
Alignment:
Q  213 ttgttacaattgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    |||| |||| || ||||||||  |||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5363 ttgtcacaagtgcggagagaaaggtcaaattagtactaagtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaagtgtttgctttgaatgcggagg 5454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16332 - 16071
Alignment:
Q  27 caaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtcattatgctagt 126  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||| ||| ||||  | ||| |||||| |  || ||||||||||||||| |    
T  16332 caaggataagggaaagaagagagaatctggtggagactctaaggcgagtttggaggatgtcagattcttcaagtgtgggactttgggtcattatgctaat 16233  T
Q  127 gattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaattgtg 226  Q
    ||||||||||| | |  ||  |||  || ||||||  |||| ||||||||| |||| ||||||| ||       ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  16232 gattgcaagaagggtgataaatgtttcaggtgtggacaagcaggtcacaagtcggctgattgca-ag-------aag-gagatcacttgttataattgtg 16142  T
Q  227 gagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaat 297  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||||    
T  16141 gagagaagggccatattagtaccaagtgtaccaagccgaataaggtaacgggaaaagtgtttgctttgaat 16071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 35512 - 35244
Alignment:
Q  22 tacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgtagagctatgggtcattatg 121  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||| | ||||||||| ||||||||  | ||||| | ||| |||| |||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  35512 tacaacaaggataaggtaaagaagagggtatctggtggaggctctaaagcgagtttagaggatgtcaggtgcttcaagtgtggaactttgggtcattatg 35413  T
Q  122 ctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaagacggccgattgcagaggtgttgcaagagagattacttgttacaa 221  Q
    ||| ||||||||||||   |   |  |||  |||||||||   ||||||||| ||  |||| ||||||| ||        || ||||| ||||| || ||    
T  35412 ctaatgattgcaagaagagtgagaaatgtttcaagtgtggactagcgggtcataaagcggctgattgca-ag--------agggagatcacttgctataa 35322  T
Q  222 ttgtggagagaagagtcatattaataccatgtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgc 299  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  35321 ttgtggagagaagggtcatattagtaccaattgtaccaagccaaagaaggcggtggggaaagtgtttgctttgaatgc 35244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Original strand, 36022 - 36195
Alignment:
Q  4 tatggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagagagaatctggtgggggctctaagccaagtttggcggaagtcaagtgctttaagtgta 103  Q
    |||||| |||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| | ||||| || || ||||  | ||||||||||     
T  36022 tatggatttgggaaaccgtataacaaggacaaagggaagaagagagacgctggtggaggctctaaggcgagtttagctgatgtcagatcctttaagtgtg 36121  T
Q  104 gagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcacaag 177  Q
    || || ||||||||||  ||||||||||||| || ||    | ||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  36122 gaactttgggtcattactctagtgattgcaaaaaggacgagagttgtttcaagtgtgggaaggcgggtcacaag 36195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 2777 - 2725
Alignment:
Q  252 gtgtaccaagccgaagaaggcggcgggaaaggtgtttgctttgaatgcggagg 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  2777 gtgtaccaagctgaagaaggcggcgggaaaagtgtttgcattgaatgcagagg 2725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 2938 - 2854
Alignment:
Q  91 tgctttaagtgtagagctatgggtcattatgctagtgattgcaagaatgattttacttgtcacaagtgtgggaaagcgggtcaca 175  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||| || ||   || ||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  2938 tgctttaagtgtggaactttgggtcattactctagtgattgcaaaaaggacgatagttgtttcaagtgtgggaaggcgggtcaca 2854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 44 - 1
Alignment:
Q  5 atggagttgggaaaccttacagcaaggataaaggaaagaagaga 48  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  44 atggagttggaaaaccttacaacaaggacaaaggaaagaagaga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University