View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2248_low_4 (Length: 308)

Name: NF2248_low_4
Description: NF2248
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2248_low_4
NF2248_low_4
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (11-308)||(2677026-2677322)
chr3 (11-308)||(2672870-2673166)
chr3 (11-308)||(8512066-8512363)
chr3 (11-308)||(8516946-8517243)
chr3 (11-308)||(24967958-24968253)
chr3 (11-308)||(32475335-32475629)
chr3 (108-308)||(10207784-10207983)
chr3 (11-308)||(32480193-32480487)
chr3 (11-308)||(18656282-18656579)
chr3 (11-308)||(22173134-22173429)
chr3 (60-308)||(7167097-7167341)
chr3 (60-308)||(2671586-2671831)
chr3 (11-156)||(28503814-28503960)
chr3 (60-167)||(8739063-8739169)
chr3 (60-167)||(9091301-9091407)
chr3 (60-167)||(40372795-40372901)
chr3 (60-165)||(8477355-8477459)
chr3 (60-157)||(18552872-18552971)
chr3 (60-179)||(1736294-1736413)
chr3 (60-179)||(36029072-36029191)
chr3 (60-156)||(26928591-26928687)
chr3 (60-156)||(8370476-8370573)
chr3 (60-179)||(21711202-21711320)
chr3 (60-156)||(27974942-27975039)
chr3 (60-156)||(30709779-30709877)
chr3 (60-156)||(1305949-1306045)
chr3 (60-179)||(16264327-16264447)
chr3 (60-177)||(48438195-48438312)
chr3 (60-157)||(3715991-3716090)
chr3 (60-157)||(40592771-40592870)
chr3 (74-156)||(27986449-27986533)
chr3 (60-157)||(26298987-26299086)
chr3 (60-179)||(6794703-6794821)
chr3 (60-156)||(25795781-25795879)
chr3 (11-113)||(28501647-28501750)
chr3 (60-156)||(32143321-32143418)
chr3 (74-156)||(33386669-33386753)
chr3 (60-157)||(47923895-47923994)
chr3 (60-156)||(27452958-27453055)
chr3 (60-157)||(40844651-40844749)
chr3 (60-179)||(24695153-24695272)
chr3 (60-179)||(37466270-37466388)
chr3 (93-157)||(1417513-1417578)
chr3 (202-308)||(28503995-28504099)
chr3 (90-126)||(4386947-4386983)
chr3 (93-152)||(38210569-38210629)
chr3 (74-156)||(39039995-39040079)
chr3 (93-152)||(50494198-50494258)
chr3 (89-152)||(53894055-53894119)
chr3 (60-157)||(3328346-3328444)
chr3 (93-152)||(458483-458543)
chr3 (93-152)||(6063444-6063504)
chr3 (93-152)||(10621528-10621588)
chr3 (109-156)||(39153357-39153405)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (11-308)||(33330384-33330681)
chr6 (11-308)||(33335881-33336178)
chr6 (11-308)||(6005268-6005563)
chr6 (11-308)||(16838595-16838890)
chr6 (11-308)||(28155510-28155805)
chr6 (11-308)||(6438351-6438645)
chr6 (111-308)||(5343331-5343527)
chr6 (11-308)||(14737516-14737811)
chr6 (11-308)||(14742376-14742670)
chr6 (11-308)||(11856822-11857120)
chr6 (11-308)||(22010636-22010931)
chr6 (11-308)||(28184353-28184650)
chr6 (60-155)||(5674770-5674865)
chr6 (60-179)||(5572240-5572359)
chr6 (60-156)||(5757478-5757575)
chr6 (60-179)||(10077164-10077283)
chr6 (60-179)||(31086472-31086591)
chr6 (60-157)||(31979512-31979611)
chr6 (60-156)||(4629954-4630052)
chr6 (60-156)||(21356036-21356133)
chr6 (60-179)||(22963679-22963797)
chr6 (60-179)||(23824596-23824714)
chr6 (60-144)||(21801343-21801429)
chr6 (60-135)||(18232867-18232943)
chr6 (74-125)||(22709050-22709102)
chr6 (93-157)||(31936586-31936651)
chr6 (74-179)||(5017482-5017587)
chr6 (93-152)||(12195515-12195575)
chr6 (93-152)||(4816231-4816291)
chr6 (93-152)||(5273216-5273276)
chr6 (93-152)||(19704567-19704627)
chr6 (93-152)||(20915356-20915416)
chr6 (93-152)||(26932562-26932622)
chr6 (93-152)||(29754709-29754769)
chr6 (209-308)||(30125940-30126039)
chr6 (93-152)||(33309110-33309170)
[»] chr1 (37 HSPs)
chr1 (11-308)||(43988401-43988700)
chr1 (11-308)||(39445350-39445644)
chr1 (11-308)||(44023814-44024107)
chr1 (11-308)||(25445029-25445324)
chr1 (11-308)||(1054952-1055246)
chr1 (11-156)||(41390582-41390726)
chr1 (11-156)||(41398237-41398381)
chr1 (60-259)||(24787365-24787559)
chr1 (60-156)||(24202769-24202865)
chr1 (60-157)||(47703935-47704034)
chr1 (60-156)||(19072928-19073026)
chr1 (60-156)||(19120818-19120916)
chr1 (60-157)||(16124515-16124614)
chr1 (60-157)||(27104371-27104470)
chr1 (60-179)||(9476240-9476359)
chr1 (60-179)||(13598377-13598496)
chr1 (60-156)||(26644897-26644994)
chr1 (60-179)||(29651790-29651909)
chr1 (60-156)||(19358843-19358939)
chr1 (60-156)||(19361432-19361528)
chr1 (60-156)||(19380072-19380168)
chr1 (60-156)||(3281708-3281805)
chr1 (71-179)||(775651-775759)
chr1 (63-156)||(37069770-37069864)
chr1 (60-179)||(47098824-47098942)
chr1 (60-126)||(21536569-21536635)
chr1 (60-156)||(13604623-13604720)
chr1 (60-183)||(32889414-32889536)
chr1 (93-152)||(9459419-9459479)
chr1 (93-152)||(9463246-9463306)
chr1 (93-152)||(16226386-16226446)
chr1 (93-179)||(47102874-47102959)
chr1 (261-308)||(41386599-41386646)
chr1 (242-308)||(41398088-41398157)
chr1 (11-57)||(25439836-25439882)
chr1 (93-152)||(23786058-23786118)
chr1 (93-152)||(51752582-51752642)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (11-308)||(35745242-35745537)
chr8 (11-308)||(10684203-10684499)
chr8 (11-308)||(39784763-39785058)
chr8 (11-308)||(6311148-6311443)
chr8 (11-306)||(25328218-25328510)
chr8 (11-308)||(7289865-7290161)
chr8 (60-308)||(33037807-33038051)
chr8 (60-308)||(36979230-36979474)
chr8 (60-167)||(18853167-18853274)
chr8 (60-167)||(18870561-18870668)
chr8 (60-308)||(30655493-30655743)
chr8 (60-308)||(4760075-4760320)
chr8 (75-167)||(10689157-10689249)
chr8 (74-156)||(26287902-26287985)
chr8 (74-156)||(26301159-26301242)
chr8 (74-156)||(26313153-26313236)
chr8 (60-156)||(1261954-1262050)
chr8 (66-157)||(26403235-26403328)
chr8 (60-179)||(23799576-23799695)
chr8 (60-156)||(4456028-4456125)
chr8 (60-179)||(19175754-19175874)
chr8 (60-157)||(5702482-5702581)
chr8 (60-153)||(6127224-6127319)
chr8 (60-153)||(7412344-7412438)
chr8 (60-156)||(31071229-31071326)
chr8 (88-179)||(4696624-4696714)
chr8 (93-154)||(9765852-9765914)
chr8 (60-157)||(19752394-19752492)
chr8 (93-152)||(43079877-43079937)
chr8 (93-152)||(43082248-43082308)
chr8 (93-126)||(18810982-18811015)
chr8 (93-152)||(44721118-44721178)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (11-308)||(2785226-2785521)
chr5 (11-308)||(33791167-33791462)
chr5 (11-308)||(31396930-31397227)
chr5 (11-308)||(31401787-31402084)
chr5 (12-308)||(33768030-33768324)
chr5 (11-308)||(37556562-37556858)
chr5 (11-308)||(37561384-37561680)
chr5 (11-308)||(28807514-28807809)
chr5 (11-308)||(1457101-1457396)
chr5 (11-305)||(15044540-15044831)
chr5 (11-308)||(43592129-43592425)
chr5 (11-308)||(27449664-27449960)
chr5 (11-308)||(43598574-43598870)
chr5 (11-308)||(43604066-43604362)
chr5 (11-308)||(43609558-43609854)
chr5 (11-308)||(27444820-27445116)
chr5 (11-308)||(30631258-30631553)
chr5 (11-232)||(31180141-31180360)
chr5 (60-156)||(38192174-38192270)
chr5 (60-156)||(38219399-38219495)
chr5 (60-156)||(10281751-10281849)
chr5 (60-156)||(35387663-35387759)
chr5 (60-156)||(9353332-9353429)
chr5 (60-165)||(24135841-24135945)
chr5 (60-156)||(36932350-36932447)
chr5 (60-155)||(11916971-11917068)
chr5 (63-179)||(17003962-17004078)
chr5 (60-156)||(15464532-15464629)
chr5 (60-157)||(3880298-3880397)
chr5 (60-156)||(19588746-19588844)
chr5 (60-156)||(14520230-14520327)
chr5 (60-153)||(12084175-12084269)
chr5 (60-157)||(28832258-28832356)
chr5 (60-179)||(42127410-42127528)
chr5 (93-152)||(4410241-4410301)
chr5 (93-152)||(15552464-15552524)
chr5 (93-152)||(31179371-31179431)
chr5 (93-152)||(31542953-31543013)
chr5 (93-152)||(31545299-31545359)
chr5 (99-152)||(27910675-27910729)
chr5 (49-179)||(24553496-24553624)
chr5 (93-157)||(31300629-31300694)
chr5 (93-152)||(3373137-3373197)
chr5 (93-152)||(10749919-10749979)
chr5 (93-152)||(15354575-15354635)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (11-308)||(19104-19399)
scaffold0197 (11-308)||(14248-14544)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (11-308)||(148895-149190)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (11-308)||(2190-2485)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (11-308)||(19344271-19344567)
chr2 (11-308)||(19349129-19349425)
chr2 (21-308)||(32246635-32246922)
chr2 (11-308)||(44312563-44312858)
chr2 (11-308)||(39811928-39812222)
chr2 (60-308)||(14291340-14291585)
chr2 (60-275)||(9296401-9296614)
chr2 (60-308)||(11098927-11099171)
chr2 (60-156)||(3491751-3491847)
chr2 (60-179)||(21629923-21630041)
chr2 (60-156)||(25398496-25398592)
chr2 (60-153)||(13569331-13569426)
chr2 (69-157)||(8040059-8040149)
chr2 (60-156)||(25403634-25403730)
chr2 (60-157)||(10445443-10445542)
chr2 (60-157)||(17865202-17865301)
chr2 (60-157)||(34682333-34682432)
chr2 (60-179)||(14699007-14699125)
chr2 (60-179)||(20522199-20522318)
chr2 (60-179)||(34388837-34388956)
chr2 (74-156)||(40738844-40738926)
chr2 (60-179)||(8390149-8390268)
chr2 (60-156)||(28259177-28259274)
chr2 (60-155)||(10707251-10707348)
chr2 (60-179)||(33528620-33528739)
chr2 (63-156)||(31056044-31056139)
chr2 (60-157)||(39482930-39483029)
chr2 (60-179)||(16940208-16940327)
chr2 (60-179)||(17010873-17010992)
chr2 (60-179)||(33118115-33118234)
chr2 (60-126)||(25407653-25407719)
chr2 (60-156)||(23078470-23078567)
chr2 (60-156)||(42039669-42039766)
chr2 (93-152)||(35215586-35215646)
chr2 (93-152)||(35217963-35218023)
chr2 (60-153)||(2838029-2838124)
chr2 (60-153)||(2869692-2869787)
chr2 (60-156)||(36757762-36757859)
chr2 (93-153)||(1345574-1345635)
chr2 (96-152)||(45332181-45332238)
chr2 (93-152)||(23452237-23452297)
chr2 (93-152)||(36558864-36558924)
chr2 (93-152)||(36561141-36561201)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (11-308)||(24261262-24261558)
chr7 (11-308)||(24266141-24266437)
chr7 (11-308)||(16879923-16880218)
chr7 (11-308)||(16884779-16885074)
chr7 (11-308)||(19992163-19992458)
chr7 (11-308)||(21812178-21812473)
chr7 (11-308)||(24024266-24024562)
chr7 (11-304)||(31109523-31109813)
chr7 (11-308)||(12406182-12406477)
chr7 (11-308)||(12396762-12397057)
chr7 (60-308)||(20357548-20357792)
chr7 (71-308)||(4866580-4866816)
chr7 (60-167)||(2057956-2058062)
chr7 (60-156)||(1533444-1533540)
chr7 (60-156)||(18408764-18408860)
chr7 (60-156)||(21639809-21639905)
chr7 (60-157)||(29159802-29159901)
chr7 (60-179)||(46516309-46516428)
chr7 (60-156)||(18413641-18413736)
chr7 (60-156)||(21646007-21646103)
chr7 (60-157)||(49091660-49091759)
chr7 (60-179)||(2647695-2647814)
chr7 (60-155)||(21983285-21983383)
chr7 (60-179)||(33332449-33332568)
chr7 (60-157)||(55947-56045)
chr7 (60-156)||(44848684-44848781)
chr7 (93-179)||(20284068-20284153)
chr7 (60-157)||(9190008-9190106)
chr7 (60-177)||(4796666-4796783)
chr7 (60-157)||(2580389-2580487)
chr7 (60-157)||(35960815-35960914)
chr7 (93-157)||(9185198-9185263)
chr7 (93-153)||(28617258-28617319)
chr7 (93-152)||(31155911-31155971)
chr7 (60-155)||(21988909-21989005)
chr7 (60-156)||(2479337-2479433)
chr7 (88-156)||(47263678-47263745)
chr7 (93-152)||(1049296-1049356)
chr7 (93-152)||(2935497-2935557)
chr7 (93-152)||(3035953-3036013)
chr7 (93-152)||(7351652-7351712)
chr7 (109-156)||(8153466-8153514)
chr7 (93-152)||(9027194-9027254)
chr7 (93-152)||(22108295-22108355)
chr7 (93-152)||(22137306-22137366)
chr7 (93-152)||(40550055-40550115)
chr7 (93-152)||(40552333-40552393)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (11-308)||(18855577-18855871)
chr4 (11-308)||(3813874-3814168)
chr4 (11-308)||(5732512-5732809)
chr4 (11-308)||(9224346-9224641)
chr4 (11-308)||(9229133-9229428)
chr4 (11-308)||(51520307-51520603)
chr4 (11-308)||(45357236-45357531)
chr4 (24-308)||(56146664-56146946)
chr4 (11-308)||(45347756-45348052)
chr4 (60-308)||(24741793-24742037)
chr4 (60-308)||(29760495-29760738)
chr4 (60-179)||(10047358-10047477)
chr4 (60-179)||(39245973-39246092)
chr4 (60-179)||(38152438-38152557)
chr4 (60-157)||(16623292-16623391)
chr4 (74-156)||(28468542-28468625)
chr4 (60-179)||(36315229-36315347)
chr4 (60-179)||(36329438-36329556)
chr4 (60-156)||(3796518-3796616)
chr4 (60-179)||(5147656-5147775)
chr4 (60-156)||(5396671-5396768)
chr4 (60-155)||(5143260-5143357)
chr4 (66-157)||(24333808-24333901)
chr4 (74-179)||(5269204-5269309)
chr4 (60-157)||(16630679-16630778)
chr4 (60-156)||(31985634-31985730)
chr4 (60-179)||(3777528-3777646)
chr4 (63-151)||(6743417-6743507)
chr4 (93-152)||(16931789-16931849)
chr4 (93-152)||(16934143-16934203)
chr4 (93-152)||(22780373-22780433)
chr4 (93-152)||(44599838-44599898)
chr4 (60-179)||(54867163-54867281)
chr4 (74-157)||(25862035-25862120)
chr4 (60-119)||(5112275-5112335)
chr4 (93-152)||(6765117-6765177)
chr4 (93-152)||(7941596-7941656)
chr4 (93-152)||(18709164-18709224)
chr4 (93-152)||(22782738-22782798)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (11-308)||(213-507)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (81-308)||(181973-182199)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (11-308)||(9583-9874)
scaffold0355 (188-291)||(3-104)
scaffold0355 (11-69)||(3788-3845)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (11-308)||(35001-35296)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (60-156)||(17952-18048)
scaffold0188 (60-156)||(24045-24141)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (60-156)||(8419-8516)
scaffold0140 (93-152)||(22343-22403)
scaffold0140 (93-152)||(24618-24678)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (60-179)||(85662-85780)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (60-179)||(5662-5781)
scaffold0006 (60-179)||(2471-2590)
scaffold0006 (60-156)||(133280-133377)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (60-157)||(10728-10827)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (60-156)||(43961-44058)
scaffold0087 (60-156)||(36832-36929)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (88-156)||(45253-45322)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (60-153)||(17266-17361)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (93-152)||(269-329)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (261-308)||(34136-34183)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (93-126)||(11500-11533)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (93-152)||(69292-69352)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 2677026 - 2677322
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677026 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 2677125  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2677126 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatgg-tttatcttgttatgcttgttagct 2677224  T
Q  211 cttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2677225 cttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccac 2677322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 2672870 - 2673166
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2672870 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 2672969  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2672970 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatgg-tttatcttgttatgcttgttagct 2673068  T
Q  211 cttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2673069 cttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttactctcatagattatctctatcacttgctccac 2673166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8512363 - 8512066
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512363 caaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 8512264  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  8512263 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgttt-atcgttttatcttg-tatgcttgttaa 8512166  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8512165 ctcttagtgtggttgtgctacacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccac 8512066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 8517243 - 8516946
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8517243 caaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 8517144  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||     
T  8517143 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcgttttcgttt-atcgttttatcttg-tatgcttgttaa 8517046  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8517045 ctcttagtgtggttgtgctacacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctccac 8516946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24968253 - 24967958
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24968253 caaagggtagatctcgggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactc 24968154  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagc 209  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  24968153 tctccccaaaattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttctttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttagc 24968057  T
Q  210 tcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24968056 tcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 24967958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32475629 - 32475335
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32475629 caaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttt-gtaa-acattcacatattggattggagagctgctc 32475532  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  32475531 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttag 32475435  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttg-ttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  32475434 ctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctcca 32475336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 108 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 10207983 - 10207784
Alignment:
Q  108 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgtta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10207983 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggttt-atcttgttatgcttgtta 10207885  T
Q  208 gctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10207884 gctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcca 10207785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32480487 - 32480193
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32480487 caaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttt-gtaa-acattcacatattggattggagagctgctc 32480390  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  32480389 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttggttggtgttttgttcgttttctttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttag 32480293  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttg-ttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  32480292 ctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagtttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctcca 32480194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18656579 - 18656282
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18656579 caaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaat-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 18656482  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcat--ggttttatcttgttatgc-ttgtta 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || | |||||| | |     ||||||||||| ||| ||||||    
T  18656481 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtt-tgctttgtta 18656383  T
Q  208 gctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||    
T  18656382 gctctttgtgtggtttttctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcacttgctcc 18656284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 22173134 - 22173429
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22173134 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 22173231  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgtt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| || |||||   |   ||||||| || ||| ||| |    
T  22173232 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttccttttaccg--cttatcttattttgctttggt 22173327  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  22173328 atctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctcc 22173427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 60 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 7167341 - 7167097
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7167341 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 7167244  T
Q  159 ttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgt 255  Q
    |||||| |||||||  ||| |||| ||   |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  7167243 ttggtgttttgttc--ttcctttcttg--cttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttgttgt 7167148  T
Q  256 tgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||| |||||||| ||||||   ||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  7167147 tgtt-gcttggaaaccattt-tgctcatagattaccactatctcttgctccac 7167097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 308
Target Start/End: Original strand, 2671586 - 2671831
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  2671586 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 2671683  T
Q  159 ttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctg-ttttgttgt 255  Q
    |||||| |||||||  ||| |||| ||   |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||| || |||| ||| ||  ||||| |||||||||    
T  2671684 ttggtgttttgttc--ttcctttcttg--cttatcttgttttgctttgttatctctttgtgtggtttttctctacactagactagggctgtttttgttgt 2671779  T
Q  256 tgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||| |||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  2671780 tgtttgcttggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccac 2671831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Original strand, 28503814 - 28503960
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  28503814 caaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctg 28503911  T
Q  108 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28503912 ctctcttccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 28503960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 167
Target Start/End: Original strand, 8739063 - 8739169
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8739063 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 8739160  T
Q  159 ttggtgttt 167  Q
    |||||||||    
T  8739161 ttggtgttt 8739169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 167
Target Start/End: Original strand, 9091301 - 9091407
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9091301 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 9091398  T
Q  159 ttggtgttt 167  Q
    |||||||||    
T  9091399 ttggtgttt 9091407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 167
Target Start/End: Original strand, 40372795 - 40372901
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  40372795 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 40372892  T
Q  159 ttggtgttt 167  Q
    |||||||||    
T  40372893 ttggtgttt 40372901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 60 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 8477459 - 8477355
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8477459 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 8477362  T
Q  159 ttggtgt 165  Q
    |||||||    
T  8477361 ttggtgt 8477355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 18552872 - 18552971
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18552872 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 18552971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 1736294 - 1736413
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||| |||    
T  1736294 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatattg 1736393  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  1736394 gt--gtgtttgttcctttcttt 1736413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 36029191 - 36029072
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |    
T  36029191 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctttctcccccagattaggtcatattggacagaactgggtcaacaatctcg 36029092  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  36029091 gt--gtgtttgttcctttcttt 36029072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 26928591 - 26928687
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26928591 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 26928687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 8370476 - 8370573
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  8370476 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8370573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21711320 - 21711202
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21711320 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 21711222  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  21711221 gt--gtgtttgttcctttcttt 21711202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 27974942 - 27975039
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  27974942 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27975039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 30709779 - 30709877
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  30709779 ttcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 30709877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1306045 - 1305949
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1306045 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcgtagtggattggagagctgctatctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 1305949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16264447 - 16264327
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||     
T  16264447 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttt 16264349  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  16264348 ttgtgtgtttgttcctttcttt 16264327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 48438312 - 48438195
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  48438312 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaataatcttg 48438213  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttct 177  Q
     |  |||||||||| |||||    
T  48438212 gt--gtgtttgttcctttct 48438195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 3715991 - 3716090
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  3715991 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctctcctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 3716090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 40592771 - 40592870
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  40592771 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtcgattggagagcttctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 40592870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 156
Target Start/End: Original strand, 27986449 - 27986533
Alignment:
Q  74 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  27986449 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 27986533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26299086 - 26298987
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  26299086 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtagattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 26298987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 6794703 - 6794821
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |  ||| |||||||||||||||    
T  6794703 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggacctaaccgggtcaacaatcttg 6794801  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  6794802 gt--gtgtttgttcctttcttt 6794821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25795879 - 25795781
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||    
T  25795879 ttcttgtaactctttcgtaacactttcatcttagtagattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 25795781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 113
Target Start/End: Original strand, 28501647 - 28501750
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||  || |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  28501647 caaagggtagaatctagggtttattcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctg 28501744  T
Q  108 ctctct 113  Q
    ||||||    
T  28501745 ctctct 28501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 32143418 - 32143321
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||    
T  32143418 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 32143321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 156
Target Start/End: Original strand, 33386669 - 33386753
Alignment:
Q  74 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  33386669 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 33386753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 47923895 - 47923994
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct-gaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| | ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47923895 ttcttgtaactcttttgtagcactttcatcatagtagattgaagggctgctctctcccctagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttg 47923994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 27453055 - 27452958
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  27453055 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccggattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatctt 27452958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40844749 - 40844651
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  40844749 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggatttgagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgaatcaacaatcttg 40844651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 24695153 - 24695272
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||| | |||||||||||  |||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  24695153 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagcggattagagggttgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 24695252  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  24695253 gt--gtgtttgttcatttcttt 24695272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 37466388 - 37466270
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  37466388 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggagggctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 37466290  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  37466289 gt--gtgtttgttcatttcttt 37466270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Original strand, 1417513 - 1417578
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1417513 tggattggagggatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 1417578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 308
Target Start/End: Original strand, 28503995 - 28504099
Alignment:
Q  202 ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcactt 301  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||| |  ||    
T  28503995 ttgttatctctttgtgtggttttgctatacactagtcaagggctgttttgttgttgtt-gcttggaaaccattt-ttctcatagattatcactacctttt 28504092  T
Q  302 gctccac 308  Q
    |||||||    
T  28504093 gctccac 28504099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 126
Target Start/End: Original strand, 4386947 - 4386983
Alignment:
Q  90 tattggattggagagctgctctctcccccagattagg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4386947 tattggattggagagctgctctctcccccagagtagg 4386983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 38210569 - 38210629
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  38210569 tggattggagagctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 38210629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 156
Target Start/End: Original strand, 39039995 - 39040079
Alignment:
Q  74 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||    
T  39039995 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctcttccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatctt 39040079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 50494198 - 50494258
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  50494198 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 50494258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 53894119 - 53894055
Alignment:
Q  89 atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  53894119 atattggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 53894055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 3328346 - 3328444
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggc-tgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || ||||||| || |||||||||||| | |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  3328346 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattgaagggctgctctctcctctagattaggtcatattggaatgaactgggtcaacaatcttg 3328444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 458483 - 458543
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  458483 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaggttggaccgaactgggtcaacaa 458543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 6063504 - 6063444
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||| ||||    
T  6063504 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtccacaa 6063444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 10621588 - 10621528
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||  || ||||| | |||||||||||||||    
T  10621588 tggattggagggctgctctctcccccagactagctcagattggaccgaactgggtcaacaa 10621528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 39153405 - 39153357
Alignment:
Q  109 tctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  39153405 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctt 39153357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 33330384 - 33330681
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330384 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 33330483  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33330484 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatgg-tttatcttgttatgcttgttagct 33330582  T
Q  211 cttagtgtgg-ttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33330583 cttagtgtggtttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 33330681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 33335881 - 33336178
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33335881 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 33335980  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagct 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33335981 tctcccccagattaggtcacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatgg-tttatcttgttatgcttgttagct 33336079  T
Q  211 cttagtgtgg-ttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33336080 cttagtgtggtttttactatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagtttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 33336178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6005563 - 6005268
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005563 caaagggtaggtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 6005464  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  6005463 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcttttccttttatcg-tttatcttg-tatgcttgttagct 6005366  T
Q  211 cttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6005365 cttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 6005268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16838890 - 16838595
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838890 caaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaatagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 16838791  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagc 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  16838790 tctcccccagattaagccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttctttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttagc 16838694  T
Q  210 tcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16838693 tcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttgaaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 16838595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 28155510 - 28155805
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28155510 caaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaa-gctaaattcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 28155607  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | |||   |  ||||||||| |||||||||||||    
T  28155608 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttctttccatttaccg--tttatcttgtttatgcttgttag 28155705  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28155706 ctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctccac 28155805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6438645 - 6438351
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6438645 caaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggagagctgctc 6438548  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   |  ||||||||| |||||||||||||    
T  6438547 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggacaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccg--tttatcttgtttatgcttgttag 6438450  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6438449 ctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccattggttctcattgattaccactatcacttgctcca 6438352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 111 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5343527 - 5343331
Alignment:
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagc 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  5343527 tctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttccttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttagc 5343431  T
Q  210 tcttagtgtgg-ttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5343430 tcttagtgtggtttttgctatactttaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 5343331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 14737516 - 14737811
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14737516 caaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 14737613  T
Q  110 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgtta 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||   |   |||||||||| ||| ||| ||    
T  14737614 ctctcccccagattaggccatattggctgaactggatcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-tttcttttaccg--cttatcttgttttgctttggta 14737709  T
Q  208 gctc-ttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
     ||| || |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14737710 tctcttttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 14737809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 14742376 - 14742670
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14742376 caaagggtagaatctagggtttgttcatatgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 14742473  T
Q  110 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgtta 207  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||   |   |||||||||| ||| ||| ||    
T  14742474 ctctcccccaaattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-tttcttttaccg--cttatcttgttttgctttgata 14742569  T
Q  208 gctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
     ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14742570 tctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtatgcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcca 14742669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11857120 - 11856822
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11857120 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 11857023  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgtt--cttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgt 205  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   | ||| ||| || |  || ||||||| ||| |||     
T  11857022 tctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgtttttttgttcttccttttatcg-cttgtcttgttttgctttgg 11856925  T
Q  206 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  11856924 tatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctc 11856825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 22010636 - 22010931
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22010636 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 22010733  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgtt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| || |  |||||||||| ||| ||| |    
T  22010734 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttatcg-cttatcttgttttgctttggt 22010829  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| | | ||  ||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22010830 atctctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcc 22010929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 28184650 - 28184353
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  28184650 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtgttgtaac-cttttgtaacactttctcatattagattggagagctgct 28184553  T
Q  110 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgtt 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||| |  |  |||||||| |||||| |||      
T  28184552 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-tttctttttaccg-cttatcttgtttatgctttgga 28184456  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagcca--tttgctctcattgattatctctatcacttgct 304  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  |||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  28184455 atctctt-gtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttttgttctcattgattatcactatcacttgct 28184357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 155
Target Start/End: Original strand, 5674770 - 5674865
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatct 155  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5674770 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatct 5674865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 5572240 - 5572359
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  5572240 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 5572339  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  5572340 gt--gtgtttgttcatttcttt 5572359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 5757478 - 5757575
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  5757478 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5757575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 10077164 - 10077283
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  10077164 ttcttgtaacttttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 10077263  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  10077264 gt--gtgtttgttcctttcttt 10077283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 31086472 - 31086591
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31086472 ttcttgtaactcctttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccctagattagatcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 31086571  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  31086572 gt--gtgtttgttcctttcttt 31086591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31979611 - 31979512
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31979611 ttcttgtaactcttttgcaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31979512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4630052 - 4629954
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4630052 ttcttgtaactattttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctcttccctagattaggtcatattggactgaactgagtcaacaatctt 4629954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21356133 - 21356036
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  21356133 ttcttgtaactctta-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 21356036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22963797 - 22963679
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  22963797 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 22963699  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  22963698 gt--gtgtttgttcctttcttt 22963679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 23824596 - 23824714
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  23824596 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagatttggtcatattgcaccgaactgggtcaacaatcttg 23824694  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  23824695 gt--gtgtttgttcctttcttt 23824714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 144
Target Start/End: Original strand, 21801343 - 21801429
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgg 144  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  21801343 ttcttgtaactcttttgtaacacttttatcttagtggattggagagctgctcgctcccccagattaggtcatattggactgaactgg 21801429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 18232943 - 18232867
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg 135  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18232943 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtgaattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattgg 18232867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 74 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22709102 - 22709050
Alignment:
Q  74 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattag 125  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22709102 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattag 22709050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31936651 - 31936586
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  31936651 tggattggagagctgctctctctcccagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 31936586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 179
Target Start/End: Original strand, 5017482 - 5017587
Alignment:
Q  74 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccaca-ttggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttc 171  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||| | |||||||||||| |||||||| || | ||| | |||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  5017482 ttgtaacactttcatcatagtagattggagggttgctctctcccctagattaggtcatatttgaccgaactgggtcaacaatcttggt--gtgtttgttc 5017579  T
Q  172 ttttcttt 179  Q
     |||||||    
T  5017580 ctttcttt 5017587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 12195575 - 12195515
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  12195575 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 12195515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 4816291 - 4816231
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  4816291 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 4816231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5273276 - 5273216
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  5273276 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 5273216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19704627 - 19704567
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  19704627 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 19704567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20915416 - 20915356
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  20915416 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 20915356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 26932622 - 26932562
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  26932622 tggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 26932562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 29754769 - 29754709
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  29754769 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 29754709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 308
Target Start/End: Original strand, 30125940 - 30126039
Alignment:
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctg-ttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  30125940 ctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtagttagcttggagaccatttg-gctcatagattatcactacctcttgctcca 30126038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 33309110 - 33309170
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  33309110 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 33309170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 37)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 43988401 - 43988700
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggtttt--gtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43988401 caaagggtagatctagggttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 43988500  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgtta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43988501 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtaaacaatcttgcttggtgttttgttcttttcttttcatggttttatcttg-tatgcttgtta 43988599  T
Q  208 gctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43988600 gctcttagtgtggttgtgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattatctctatcacttgctcca 43988699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 39445644 - 39445350
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39445644 caaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggagagctgctc 39445547  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   |  ||||||||| |||||||||||||    
T  39445546 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccg--tttatcttgtttatgcttgttag 39445449  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39445448 ctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttcacattgattatcactatcacttgctcca 39445351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 44023814 - 44024107
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44023814 caaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgacaagctagagtcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggagagctgctc 44023911  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |     ||||||||| |||||||||||||    
T  44023912 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttcctttac---catttatcttgtttatgcttgttag 44024008  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  44024009 ctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcagttgctcca 44024106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 25445029 - 25445324
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25445029 caaagggtagctctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 25445127  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   |  ||||||||| ||| |||||||||    
T  25445128 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccg--tttatcttgtttacgcttgttag 25445225  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  25445226 ctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcgcttgctcca 25445323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 1054952 - 1055246
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1054952 caaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggagagttgctc 1055049  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   |  ||||||||| |||||||||||||    
T  1055050 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccg--tttatcttgtttatgcttgttag 1055147  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1055148 ctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagacatttgttcacattgattatcactatcacttgctcca 1055245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41390726 - 41390582
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41390726 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 41390629  T
Q  110 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41390628 ctctcccccagattaggccatattggctgatctgggtcaacaatctt 41390582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41398381 - 41398237
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  41398381 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 41398284  T
Q  110 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  41398283 ctctcccccagattaggccatattggctgacctgggtcaacaatctt 41398237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 259
Target Start/End: Original strand, 24787365 - 24787559
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgct 159  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24787365 ttcttgtaacccttt-gtaacactttctcatattggattggagagctgctctcccccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ct 24787462  T
Q  160 tggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttg 257  Q
    ||||| ||||||| || |||||| ||   |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| || ||  ||||||||| ||||||    
T  24787463 tggtgttttgttc-ttccttttcttg--cttatcttgtt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacataagtctagggctgtttt-ttgttg 24787557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 24202769 - 24202865
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24202769 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 24202865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 47703935 - 47704034
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47703935 ttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47704034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19073026 - 19072928
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  19073026 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19072928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19120916 - 19120818
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  19120916 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19120818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 16124515 - 16124614
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  16124515 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 16124614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 27104371 - 27104470
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  27104371 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggttatattggaccgaactgtgtcaacaatcttg 27104470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 9476359 - 9476240
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9476359 ttcttataactcttttgtaatactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9476260  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  9476259 gt--gtgtttgttcctttcttt 9476240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 13598496 - 13598377
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13598496 ttcttgtatctcttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 13598397  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  13598396 gt--gtgtttgttcctttcttt 13598377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 26644897 - 26644994
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  26644897 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcataatggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 26644994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 29651909 - 29651790
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  29651909 ttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagtgctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaaaatcttg 29651810  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  29651809 gt--gtgtttgttcctttcttt 29651790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 19358843 - 19358939
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  19358843 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19358939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 19361432 - 19361528
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  19361432 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19361528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 19380072 - 19380168
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  19380072 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgactgaactgggtcaacaatctt 19380168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3281805 - 3281708
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||    
T  3281805 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatcgtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatctt 3281708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 71 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 775759 - 775651
Alignment:
Q  71 cttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttg 168  Q
    |||||||||||| |||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||| |  |||||||    
T  775759 cttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttgat--gtgtttg 775662  T
Q  169 ttcttttcttt 179  Q
    ||| |||||||    
T  775661 ttcctttcttt 775651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 37069864 - 37069770
Alignment:
Q  63 ttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  37069864 ttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggatcggagagatgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 37069770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 47098824 - 47098942
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  47098824 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattcggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 47098922  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  47098923 gt--gtgtttgttcctttcttt 47098942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 126
Target Start/End: Original strand, 21536569 - 21536635
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattagg 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536569 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 21536635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 13604623 - 13604720
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  13604623 ttcttgtaactcttt-gtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 13604720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 32889536 - 32889414
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  32889536 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctatcccccagactaggtcatattggaccgaactagatcaacaatcttg 32889438  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttttcat 183  Q
     |  |||||||||| | |||||||||    
T  32889437 gt--gtgtttgttcctctcttttcat 32889414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9459479 - 9459419
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9459479 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9459419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9463306 - 9463246
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9463306 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9463246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 16226386 - 16226446
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16226386 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16226446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Original strand, 47102874 - 47102959
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||| ||| |  |||||||||| |||||||    
T  47102874 tggattggatggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaattttggt--gtgtttgttcctttcttt 47102959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41386646 - 41386599
Alignment:
Q  261 gcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41386646 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccac 41386599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 242 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 41398157 - 41398088
Alignment:
Q  242 ggctgttttgttgttgtta---gcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||||||||||||||||||    |||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41398157 ggctgttttgttgttgttgtttgcttggagaccatatgttctcattgattatcactatcacttgctccac 41398088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 57
Target Start/End: Original strand, 25439836 - 25439882
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagcta 57  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  25439836 caaagggtagctctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagcta 25439882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 23786058 - 23786118
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  23786058 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 23786118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 51752582 - 51752642
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  51752582 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 51752642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 35745537 - 35745242
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745537 caaagggtaggtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 35745438  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  35745437 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcttttccttttatcg-tttatcttg-tatgcttgttagct 35745340  T
Q  211 cttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35745339 cttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 35745242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 10684203 - 10684499
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684203 caaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 10684302  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  10684303 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttag 10684399  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttg-ttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  10684400 ctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctcca 10684498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 39784763 - 39785058
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39784763 caaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggagagctgctc 39784860  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgtta 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   |   |||||||| || ||| |||  |    
T  39784861 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccg--cttatcttgtttgtgctttggaa 39784958  T
Q  208 gctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39784959 tctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttattggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcc 39785056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 6311443 - 6311148
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6311443 caaagggtagaatctagggttt-gtcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctg 6311347  T
Q  108 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| |||| ||   |||||||| |||||| |||    
T  6311346 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcctttcttg--cttatcttgtttatgctttg 6311252  T
Q  205 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgct 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  6311251 ttatctcttagtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggaaaccatttgttctcattgattaccactatcacttgct 6311152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 306
Target Start/End: Original strand, 25328218 - 25328510
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25328218 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 25328315  T
Q  110 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatg-cttgtt 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||   |  ||||||| | |||||  ||| |    
T  25328316 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttttcctttaccg--tttatctcgtttatgttttggt 25328412  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||  ||| || ||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25328413 atctctt-gtgtggttttgctatacactag--ttagggttgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctc 25328509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 7289865 - 7290161
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7289865 caaagggtagaatatagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 7289962  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttat-gcttgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| ||    |||||||| |||| | ||||    
T  7289963 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttat-cacttatcttgtttatggtttgt 7290058  T
Q  206 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  7290059 tatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgtttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctc 7290158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 60 - 308
Target Start/End: Original strand, 33037807 - 33038051
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgct 159  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33037807 ttcttgtaacccttt-gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ct 33037904  T
Q  160 tggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgtt--ttgttgt 255  Q
    ||||| |||||||  |||||||| ||   |||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  |||||||  |||||||    
T  33037905 tggtgttttgttc--ttcttttcttg--cttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttattgttgt 33038000  T
Q  256 tgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||| |||||||| ||||||  | |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  33038001 tgtt-gcttggaaaccattttgt-tcattgattaccactatctcttgctccac 33038051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 36979474 - 36979230
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  36979474 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 36979377  T
Q  159 ttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctg-ttttgttgt 255  Q
    |||||| |||||||  ||| |||| ||   |||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| |||||||||    
T  36979376 ttggtgttttgttc--ttcctttcttg--cttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgt 36979281  T
Q  256 tgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||| |||||||| ||||||  | |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  36979280 tgtt-gcttggaaaccattttgt-tcattgattaccactatctcttgctccac 36979230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 60 - 167
Target Start/End: Original strand, 18853167 - 18853274
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  18853167 ttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 18853265  T
Q  159 ttggtgttt 167  Q
    |||||||||    
T  18853266 ttggtgttt 18853274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 167
Target Start/End: Original strand, 18870561 - 18870668
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  18870561 ttcttgtaacccttttgtaacactttcattatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggatgaactgggtcaacaatctt-c 18870659  T
Q  159 ttggtgttt 167  Q
    |||||||||    
T  18870660 ttggtgttt 18870668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30655743 - 30655493
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  30655743 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 30655646  T
Q  159 ttggtgtttgttcttttct---tttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctg--ttttg 251  Q
    ||||||||| || | ||||   |||| ||   |||||||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||||| |||| ||| ||  |||||  |||||    
T  30655645 ttggtgttttttttgttcttcctttcttg--cttatcttgtttatgctttgttatctctatgtgtggttttgctctacactagtctagggctgttttttg 30655548  T
Q  252 ttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  | |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  30655547 ttgttgtt-gcttggaaaccattttgt-tcattgattaccactatctcttgctccac 30655493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 308
Target Start/End: Original strand, 4760075 - 4760320
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4760075 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 4760172  T
Q  159 ttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctg-ttttgttg 254  Q
    ||| || |||||||  ||| |||| ||   |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||    
T  4760173 ttgatgttttgttc--ttcctttcttg--cttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttg 4760268  T
Q  255 ttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||||| |||||||| ||||||   ||||||||||| | ||||| || |||||||    
T  4760269 ttgtt-gcttggaaaccattt-tgctcattgattaccactatctctagctccac 4760320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 167
Target Start/End: Original strand, 10689157 - 10689249
Alignment:
Q  75 tgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttt 167  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10689157 tgtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttt 10689249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26287985 - 26287902
Alignment:
Q  74 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26287985 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26287902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26301242 - 26301159
Alignment:
Q  74 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26301242 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26301159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26313236 - 26313153
Alignment:
Q  74 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26313236 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 26313153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 1261954 - 1262050
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1261954 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggttgaactgggtcaacaatctt 1262050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 157
Target Start/End: Original strand, 26403235 - 26403328
Alignment:
Q  66 taactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  26403235 taactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 26403328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 23799576 - 23799695
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23799576 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcctccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 23799675  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  23799676 gt--gtgtttgttcctttcttt 23799695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 4456125 - 4456028
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||| |||||||    
T  4456125 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggaccgaaccgggtcagcaatctt 4456028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 19175754 - 19175874
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||     
T  19175754 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttt 19175852  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  19175853 ttgtgtgtttgttcctttcttt 19175874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 5702482 - 5702581
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||| | |||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5702482 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcataggggattggagggatgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5702581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6127319 - 6127224
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||| |||||||||    
T  6127319 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccccaaattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaat 6127224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7412438 - 7412344
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||    
T  7412438 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 7412344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 31071229 - 31071326
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||||||    
T  31071229 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactcggtcaacaatctt 31071326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 179
Target Start/End: Original strand, 4696624 - 4696714
Alignment:
Q  88 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct-gaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  4696624 catagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggatcgaactgggtcaacaatcttggt--gtgtttgttcatttcttt 4696714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 154
Target Start/End: Original strand, 9765852 - 9765914
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatc 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||    
T  9765852 tggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatc 9765914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 19752394 - 19752492
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  19752394 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagactaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 19752492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 43079877 - 43079937
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43079877 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43079937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 43082248 - 43082308
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  43082248 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 43082308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 126
Target Start/End: Original strand, 18810982 - 18811015
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18810982 tggattggagggctgctctctcccccagattagg 18811015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 44721118 - 44721178
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  44721118 tggattggagagctgctctctcccgcagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 44721178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 238; Significance: 1e-132; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2785521 - 2785226
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785521 caaagggtaggtctagggtttgttcatgagtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 2785422  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  2785421 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcttttccttttatcg-tttatcttg-tatgcttgttagct 2785324  T
Q  211 cttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2785323 cttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 2785226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33791462 - 33791167
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33791462 caaagggtaggtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 33791363  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagct 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||||    
T  33791362 tttcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcttttccttttatcg-tttatcttg-tatgcttgttagct 33791265  T
Q  211 cttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33791264 ctatatgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 33791167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 31396930 - 31397227
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggtttt--gtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31396930 caaagggtagatctagggttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 31397029  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttg-ttcttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgtta 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||    
T  31397030 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgtttgttttctttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgtta 31397126  T
Q  208 gctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31397127 gctcttagtgtggttttgctttacattaggcttaggatgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcca 31397226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 31401787 - 31402084
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggtttt--gtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31401787 caaagggtagatctagagttttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 31401886  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgtta 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||    
T  31401887 tctctcccccatattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttctttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgtta 31401983  T
Q  208 gctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31401984 gctcttagtgtggttttgctttacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctcca 31402083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 12 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 33768324 - 33768030
Alignment:
Q  12 aaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctct 111  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33768324 aaagggtaggtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctct 33768225  T
Q  112 ctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagctc 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || | |||||| || |||||||||||||||    
T  33768224 cccccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcttttccttttatcg-tttatcctg-tatgcttgttagctc 33768127  T
Q  212 ttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33768126 tatatgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggtcatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 33768030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 37556562 - 37556858
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37556562 caaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagatacttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 37556660  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||   |  ||||||||| |||||||||||||    
T  37556661 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccatttaccg--tttatcttgtttatgcttgttag 37556758  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37556759 ctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcacttgctccac 37556858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 37561384 - 37561680
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37561384 caaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagatacttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 37561482  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||   |  ||||||||| |||||||||||||    
T  37561483 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccatttaccg--tttatcttgtttatgcttgttag 37561580  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37561581 ctcttagtgtggttttgctatacacaagtcataggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattatcactatcacttgctccac 37561680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 28807514 - 28807809
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28807514 caaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagattcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggagagctgctc 28807610  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   |  ||||||||| |||||||||||||    
T  28807611 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccg--tttatcttgtttatgcttgttag 28807708  T
Q  209 ctcttagtgtgg--ttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
    ||||| | ||||  |||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28807709 ctctttgagtggttttttgctatacacta-gcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacttgctc 28807806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 1457101 - 1457396
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1457101 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 1457198  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgt 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| |||| |  | |||||||| |||||| ||||    
T  1457199 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcctttctt--tcttatcttgtttatgctttgt 1457293  T
Q  206 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  1457294 tatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctc 1457393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 15044831 - 15044540
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15044831 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 15044734  T
Q  110 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgtt 206  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||| ||   |||||||| |||||| |||      
T  15044733 ctctcccccatattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttc-ttccttttcttg--cttatcttgtttatgctttgga 15044638  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  15044637 atctctt-gtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgttggtttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctc 15044540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43592425 - 43592129
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43592425 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 43592328  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| ||    |||||||| |||||| ||||    
T  43592327 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttat-cacttatcttgtttatgctttgt 43592232  T
Q  206 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  43592231 tatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctc 43592132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27449960 - 27449664
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27449960 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 27449863  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgt 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| ||    |||||||| |||||| ||||    
T  27449862 tctctcccccagattaggctatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttat-cacttatcttgtttatgctttgt 27449767  T
Q  206 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| | |||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||    
T  27449766 tatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattaccactatctcttgctc 27449667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43598870 - 43598574
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43598870 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 43598773  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| ||    |||||||| |||||| ||||    
T  43598772 tctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttat-cacttatcttgtttatgctttgt 43598677  T
Q  206 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  43598676 tatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctc 43598577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43604362 - 43604066
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43604362 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 43604265  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| ||    |||||||| |||||| ||||    
T  43604264 tctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttat-cacttatcttgtttatgctttgt 43604169  T
Q  206 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  43604168 tatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctc 43604069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 43609854 - 43609558
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  43609854 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 43609757  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| ||    |||||||| |||||| ||||    
T  43609756 tctctcccccagattaggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttat-cacttatcttgtttatgctttgt 43609661  T
Q  206 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  43609660 tatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctc 43609561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27445116 - 27444820
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27445116 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 27445019  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgt 205  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| ||    |||||||| |||||| ||||    
T  27445018 tctctcccccagattaggctatattgcctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttat-cacttatcttgtttatgctttgt 27444923  T
Q  206 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| | |||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||| | ||||| |||||||    
T  27444922 tatctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctatgttgttgtttgcttggagaccatttgtactcattgattaccactatctcttgctc 27444823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 30631553 - 30631258
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctg 107  Q
    ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30631553 caaagggtagaatctatggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaacccttt-gtaacactttctcatattggattggagagctg 30631456  T
Q  108 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  ||| |||| |    |||||||| |||||| |||    
T  30631455 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgagtcaacaatctt-cttggtgttttgttc--ttcctttctt--acttatcttgtttatgctttg 30631361  T
Q  205 ttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgct 304  Q
    ||| || |   |||| |||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  30631360 ttatctatatatgtgattttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtt-gcttgaaaaccatttgttctcatagattaccactatctcttgct 30631262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31180360 - 31180141
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga--ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctg 107  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31180360 caaagggtagaatctagggttt-gtcttgtgtaaagcttgaag-gctagagtttcttgtaacccttt-gtaacactttctcatattggattggagagctg 31180264  T
Q  108 ctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttg 204  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||| |  | |||||||| |||||| |||    
T  31180263 ctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-cttggtgttttgttcttt--ctttctt--tcttatcttgtttatgctttg 31180169  T
Q  205 ttagctcttagtgtggttttgctataca 232  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  31180168 ttatctctttgtgtggttttgctataca 31180141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38192270 - 38192174
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38192270 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 38192174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38219495 - 38219399
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38219495 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 38219399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 10281849 - 10281751
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  10281849 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagatcaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 10281751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 35387759 - 35387663
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35387759 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtagattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaattgggtcaacaatctt 35387663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 9353332 - 9353429
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  9353332 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 9353429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 24135945 - 24135841
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| | || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24135945 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcttagtgcattggatagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 24135848  T
Q  159 ttggtgt 165  Q
    |||||||    
T  24135847 ttggtgt 24135841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 36932350 - 36932447
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  36932350 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36932447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 155
Target Start/End: Original strand, 11916971 - 11917068
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatct 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  11916971 ttcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 11917068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 179
Target Start/End: Original strand, 17003962 - 17004078
Alignment:
Q  63 ttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgctt 160  Q
    |||||||||||||| || || |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |     
T  17003962 ttgtaactcttttgaaatactttcatcatagtggattgaagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggt- 17004060  T
Q  161 ggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |||||||||| |||||||    
T  17004061 -gtgtttgttcctttcttt 17004078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15464629 - 15464532
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  15464629 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 15464532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3880397 - 3880298
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  3880397 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgcctcagattaggtcatattggacagaactgaatcaacaatcttg 3880298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 19588844 - 19588746
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||  || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  19588844 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctccctaagattagttcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 19588746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 14520327 - 14520230
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  14520327 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattgaagagctgctctcccccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 14520230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 153
Target Start/End: Original strand, 12084175 - 12084269
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 153  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||| | ||||||||||||||||    
T  12084175 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctgccccatattaggtcatagtggaccgaactgggtcaacaat 12084269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28832356 - 28832258
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||| |||||||||||||||    
T  28832356 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaaccgggtcaacaatcttg 28832258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 42127410 - 42127528
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct-gaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || |||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  42127410 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggggggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 42127508  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  42127509 gt--gtgtttgttcctttcttt 42127528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 4410241 - 4410301
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  4410241 tggattggagagctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 4410301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 15552464 - 15552524
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15552464 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15552524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31179431 - 31179371
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31179431 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31179371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 31542953 - 31543013
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31542953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31543013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 31545299 - 31545359
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31545299 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31545359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 152
Target Start/End: Original strand, 27910675 - 27910729
Alignment:
Q  99 ggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  27910675 ggagagctgctctctcccccagattaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 27910729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 179
Target Start/End: Original strand, 24553496 - 24553624
Alignment:
Q  49 gaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggt 146  Q
    |||||||||  |||||||||||| || ||||||| |||| | || |||| ||||| |||||||||||||  |||||||| || ||||| | ||||||| |    
T  24553496 gaaaagctaatttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggagtggag-gctgctctctcccatagattaggtcatattggaccgaactggat 24553593  T
Q  147 caacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  24553594 caacaatcttggt--gtgtttgttcctttcttt 24553624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Original strand, 31300629 - 31300694
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31300629 tggattggagagtttctctctccctcagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 31300694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 3373197 - 3373137
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  3373197 tggattggagggttgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 3373137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 10749919 - 10749979
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  10749919 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 10749979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15354635 - 15354575
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  15354635 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 15354575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 19104 - 19399
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  19104 caaagggtagatctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacactcacatattgtattggagagctgctc 19203  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagc 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  19204 tctcccccagattaggccacaatggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttctttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttagc 19300  T
Q  210 tcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19301 tcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 19399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 14248 - 14544
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14248 caaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 14347  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  14348 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttag 14444  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttg-ttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  14445 ctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctcca 14543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 148895 - 149190
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  148895 caaagggtagatctatggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactc 148994  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  148995 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttccttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttagc 149091  T
Q  210 tcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  149092 tcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatagattatctctatcacttgctccac 149190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 2190 - 2485
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2190 caaagggtagatctatggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctactc 2289  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagc 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  2290 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgtttgttcgttttccttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttagc 2386  T
Q  210 tcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2387 tcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgcactcatggattatctttatcacttgctccac 2485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19344567 - 19344271
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19344567 caaagggtaggtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 19344468  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagc 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  19344467 tctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcg-tttatcttg-tatgcttgttagc 19344370  T
Q  210 tcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  19344369 tcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccac 19344271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19349425 - 19349129
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19349425 caaagggtaggtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 19349326  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttagc 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || | ||||||||| |||||||||||||    
T  19349325 tctcccctagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttccttttatcg-tttatcttg-tatgcttgttagc 19349228  T
Q  210 tcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  19349227 tcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaggccatttgctctcatagattaccactatctcttgctccac 19349129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 32246922 - 32246635
Alignment:
Q  21 atctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccag 120  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246922 atctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccag 32246825  T
Q  121 attaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttctt--ttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttag 215  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||||||  || ||||| ||   |||||||| |||||| |||  | ||||| |    
T  32246824 attaggccatattggctgaacaaggtcaacaatcttgttcggtgttttgttcttcctttttttcttg--cttatcttgtttatgctttggaatctctt-g 32246728  T
Q  216 tgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  32246727 tgtggttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctccac 32246635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 44312563 - 44312858
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  44312563 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 44312660  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgtt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| || |  |||||||||| ||| ||| |    
T  44312661 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttatcg-cttatcttgttttgctttggt 44312756  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| | | ||  ||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  44312757 atctctttgtgtggttttgctatacacttgtctagggcggctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcc 44312856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 39811928 - 39812222
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  39811928 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 39812025  T
Q  110 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgtt 206  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||   |   |||||||| || ||| |||      
T  39812026 ctctcccccagattaggccatattggctgaactggttcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-tttcttttaccg--cttatcttgtttgtgctttgga 39812121  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  39812122 atctctt-gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctc 39812219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 60 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 14291585 - 14291340
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14291585 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 14291488  T
Q  159 ttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctg-ttttgttgt 255  Q
    |||||| |||||||  ||| |||| ||   |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||    
T  14291487 ttggtgttttgttc--ttcctttcttg--cttatcttgttttgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacattagtctagggctgtttttgttgt 14291392  T
Q  256 tgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||| |||||||| ||||||   | ||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  14291391 tgtttgcttggaaaccattt-tgcccattgattaccactatctcttgctccac 14291340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 275
Target Start/End: Original strand, 9296401 - 9296614
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9296401 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 9296498  T
Q  159 ttggtgttt-gttcttttcttttcatggttttatcttgttatgctt-gttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctg-ttttgttgt 255  Q
    ||||||||| ||||||  | |||| || ||||  |||||| ||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| |||||||||    
T  9296499 ttggtgttttgttctt--cctttcttgctttt--cttgttttgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagactagggctgtttttgttgt 9296594  T
Q  256 tgttagcttggaagccattt 275  Q
    |||| |||||||| ||||||    
T  9296595 tgtttgcttggaaaccattt 9296614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 308
Target Start/End: Original strand, 11098927 - 11099171
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  11098927 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 11099024  T
Q  159 ttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctg-ttttgttgt 255  Q
    |||||| |||||||  ||| |||| |    |||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| |||||||||    
T  11099025 ttggtgttttgttc--ttcctttctt--ccttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgt 11099120  T
Q  256 tgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||| |||||||| ||||||  | |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  11099121 tgtt-gcttggaaaccattttgt-tcattgattaccactatctcttgctccac 11099171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3491847 - 3491751
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3491847 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 3491751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21630041 - 21629923
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21630041 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 21629943  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  21629942 gt--gtgtttgttcctttcttt 21629923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25398592 - 25398496
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25398592 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 25398496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13569426 - 13569331
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||    
T  13569426 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 13569331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8040149 - 8040059
Alignment:
Q  69 ctcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8040149 ctcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatcttg 8040059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25403730 - 25403634
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25403730 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggctgaactgagtcaacaatctt 25403634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 10445443 - 10445542
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattcaca-tattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  10445443 ttcttgtaactcttttgtaacactttcataatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactggatcaacaatcttg 10445542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17865301 - 17865202
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacatt-ggctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17865301 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattcgactgaactgggtcaacaatcttg 17865202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 34682333 - 34682432
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34682333 ttcttgtaactcttttgtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 34682432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 14699007 - 14699125
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  14699007 ttcttgtaactcttttgtaac-ctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 14699105  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  14699106 gt--gtgtttgttcctttcttt 14699125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20522318 - 20522199
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20522318 ttcttgtaacccttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 20522219  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  20522218 gt--gtgtttgttcctttcttt 20522199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34388956 - 34388837
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||| |    
T  34388956 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctcg 34388857  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  34388856 gt--gtgtttgttcctttcttt 34388837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40738926 - 40738844
Alignment:
Q  74 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  40738926 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctc-cccccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 40738844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 8390149 - 8390268
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| | |||||||||||||||| |||    
T  8390149 ttcttgtaactcttttttaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcattttggaccgaactgggtcaacaattttg 8390248  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  8390249 gt--gtgtttgttcatttcttt 8390268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 28259177 - 28259274
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  28259177 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 28259274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 60 - 155
Target Start/End: Original strand, 10707251 - 10707348
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatct 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  10707251 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 10707348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 33528620 - 33528739
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  33528620 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 33528719  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  33528720 gt--gtgtttgttcctttcttt 33528739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 63 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31056139 - 31056044
Alignment:
Q  63 ttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||  | ||||| |||||||||||||    
T  31056139 ttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattgaaccgaactaggtcaacaatctt 31056044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 39483029 - 39482930
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  39483029 ttcttgtaactcttttgtaacattttcatcatagtggattggaggcctgctctctcccccatattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg 39482930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 16940208 - 16940327
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  16940208 ttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 16940307  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  16940308 gt--gtgtttgttcctttcttt 16940327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 17010873 - 17010992
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  17010873 ttcttgtaattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgatctttcccccagattatgtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 17010972  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  17010973 gt--gtgtttgttcctttcttt 17010992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33118234 - 33118115
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||| | |||||||||||    
T  33118234 ttcttgtaactattttgtaactctttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagccaacaatcttg 33118135  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  33118134 gt--gtgtttgttcctttcttt 33118115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25407719 - 25407653
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattagg 126  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25407719 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattagg 25407653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 23078470 - 23078567
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct-gaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  23078470 ttcttgtaactctttc-taacactttcatcatagtggattggagagttgttctctcccccatattaggtcatattggatcgaactgggtcaacattctt 23078567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 42039669 - 42039766
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| | ||||| | |||||||||||    
T  42039669 ttcttgtaactcttc-gtaacactttcatcatagtggattagagagctgctctctcccacagattaggtcatattggaccgaactagatcaacaatctt 42039766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 35215646 - 35215586
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35215646 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35215586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 35218023 - 35217963
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  35218023 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 35217963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 153
Target Start/End: Original strand, 2838029 - 2838124
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattcacat-attggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 153  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||||  | | |||||||||||  |||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||    
T  2838029 ttcttgtaactcatttgtatcactttcattttagtggattggagatgtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 2838124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 153
Target Start/End: Original strand, 2869692 - 2869787
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 153  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||| | || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||| || ||||| | ||||||||| ||||||    
T  2869692 ttcttgtaactcctttgtatcactttcatcttagtggattggagagctactctctcccctagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaat 2869787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 36757762 - 36757859
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||| ||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36757762 ttcttataactcttt-gaaacactttcatcatactggattggagagctgttatcccccccagattaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatctt 36757859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 153
Target Start/End: Original strand, 1345574 - 1345635
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 153  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||    
T  1345574 tggatcggagaggtgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtcaacaat 1345635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 45332238 - 45332181
Alignment:
Q  96 attggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  45332238 attggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 45332181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23452297 - 23452237
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  23452297 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 23452237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 36558924 - 36558864
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  36558924 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 36558864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 36561201 - 36561141
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  36561201 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 36561141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 24261262 - 24261558
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261262 caaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 24261361  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  24261362 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttag 24261458  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttg-ttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  24261459 ctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctcca 24261557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 24266141 - 24266437
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266141 caaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 24266240  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  24266241 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttccttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttag 24266337  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttg-ttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  24266338 ctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctcca 24266436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16880218 - 16879923
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16880218 caaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttt-gtaaaacattcacatattggattggagagctgctc 16880120  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  16880119 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttag 16880023  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttg-ttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  16880022 ctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctcca 16879924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 16885074 - 16884779
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16885074 caaagggtaggtctagggttttgtcttgtgtaaagcttgataagctagattcttgtaactcttt-gtaaaacattcacatattggattggagagctgctc 16884976  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttc-ttttcttttcatggttttatcttgttatgcttgttag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||||||||||    
T  16884975 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctttt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttag 16884879  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttg-ttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  16884878 ctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgcactcatagattacctctatctcttgctcca 16884780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 19992458 - 19992163
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19992458 caaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 19992360  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   |  ||||||||| |||||||||||||    
T  19992359 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccg--tttatcttgtttatgcttgttag 19992262  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  19992261 ctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctg-tttgttgttgtaagcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacctgctcca 19992164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 21812178 - 21812473
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagctt-gaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 109  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  21812178 caaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagctttgacaagctagagtcttggaac-cttttgtaagac-ttcacatattggattggaaagctgct 21812275  T
Q  110 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgtta 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |  ||||||||| ||||||||||||    
T  21812276 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttcttttcttttaccg--tttatcttgtttatgcttgtta 21812373  T
Q  208 gctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
     ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||    
T  21812374 actctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctg-tttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcatagattaccactatctcttgctcc 21812471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 24024266 - 24024562
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24024266 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaaca-ttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 24024363  T
Q  110 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg--tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgtt 206  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| || |||||| ||   |||||||| |||||||||||    
T  24024364 ctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgtttttgttc-ttccttttcttg--cttatcttgtttatgcttgtt 24024460  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24024461 agctctttgtgtggttttgctatatactagtcataggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatcacttgctcc 24024560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Original strand, 31109523 - 31109813
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31109523 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgcaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 31109620  T
Q  110 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgtt 206  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| || |||||| ||  ||||||||| |||||| |||      
T  31109621 ctctcccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcggtgttttgttc-ttccttttcttg--tttatcttgtttatgctttgga 31109717  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgct 304  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31109718 atctctt-gtgtggttttgctatacactag--ttagggctgttttgttgttgttggcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgct 31109813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12406477 - 12406182
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||      
T  12406477 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctat 12406380  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgtt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||   |   |||||||||| ||| ||| |    
T  12406379 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-tttcttttaccg--cttatcttgttttgctttggt 12406284  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  12406283 atctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctcc 12406184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 12397057 - 12396762
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || ||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||     
T  12397057 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagatt-aaaggctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgt 12396960  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgtt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||  |||| |      |||||||||| ||| ||| |    
T  12396959 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttcttccctttac---cgcttatcttgttttgctttggt 12396864  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  12396863 atctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctcc 12396764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 60 - 308
Target Start/End: Original strand, 20357548 - 20357792
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgct 159  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20357548 ttcttgtaacccttt-gtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccaaattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ct 20357645  T
Q  160 tggt-gtttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctg-ttttgttgtt 256  Q
    ||||  ||||||| || |||||| ||   |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||||    
T  20357646 tggtattttgttc-ttccttttcttg--cttatcttgtt-tgctttgttatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgtt 20357741  T
Q  257 gttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||||||  |||||||  ||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  20357742 gttagcttggagaccatttg-gctcatagattaccactatctcttgctccac 20357792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 71 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 4866816 - 4866580
Alignment:
Q  71 cttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgt 169  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  4866816 cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgt 4866718  T
Q  170 tcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgttagctcttagtgtgg-ttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttgga 267  Q
    || || |||||   |   |||||||||| ||| ||| || || || |||||| |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| |||||||    
T  4866717 tc-ttccttttaccg--cttatcttgttttgctttggtatctttttgtgtggtttttgctatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttgga 4866621  T
Q  268 agccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
      |||||||  ||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  4866620 gaccatttgtcctcattgattaccactatctcttgctccac 4866580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 60 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2058062 - 2057956
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  2058062 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 2057965  T
Q  159 ttggtgttt 167  Q
    |||||||||    
T  2057964 ttggtgttt 2057956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 1533444 - 1533540
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1533444 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagatgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 1533540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18408860 - 18408764
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18408860 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatactggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 18408764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21639905 - 21639809
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21639905 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcattatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 21639809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29159901 - 29159802
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  29159901 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 29159802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 46516309 - 46516428
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46516309 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 46516408  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  46516409 gt--gtgtttgttcctttcttt 46516428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18413736 - 18413641
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18413736 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccc-agattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 18413641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21646103 - 21646007
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21646103 ttcttgtaaccctttt-taacactttcatcatagtggattggagagctgctctcttccctagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 21646007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 49091759 - 49091660
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||    
T  49091759 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagttgctctcttccccagattaggtcatattggactaaactgggtcaacaatcttg 49091660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 2647695 - 2647814
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacatt-ggctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  2647695 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagaataggtcatattgggccgaattgggtcaacaatcttg 2647794  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  2647795 at--gtgtttgttcctttcttt 2647814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21983383 - 21983285
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactctttt-gtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatct 155  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  21983383 ttcttgtaactctttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21983285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 33332449 - 33332568
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggct-gaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  33332449 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattagatcgaactgggtcaacaatcttg 33332548  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  33332549 gt--gtgtttgttcctttcttt 33332568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 56045 - 55947
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  56045 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 55947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 44848684 - 44848781
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||  | |||||||||||||||||||    
T  44848684 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaggttaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 44848781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20284153 - 20284068
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  20284153 tggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttggt--gtgtttgttcctttcttt 20284068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 9190008 - 9190106
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9190008 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9190106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 177
Target Start/End: Original strand, 4796666 - 4796783
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||  |||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4796666 ttcttgtaactcttttgtaacaatttcatcatagtggatttgagggctgctttctcccccagattaggtcattttggaccgaactgggttaacaatcttg 4796765  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttct 177  Q
     |  |||||||||| |||||    
T  4796766 gt--gtgtttgttcctttct 4796783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2580487 - 2580389
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  2580487 ttcttgtaactcatt-gtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccagactaggtcatattggaccgaattgggtcaacaatcttg 2580389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 35960914 - 35960815
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  35960914 ttcttctaactcatttgtaacactttcatcatagtggtttggagggctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactcggtcaacaatcttg 35960815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Original strand, 9185198 - 9185263
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9185198 tggattggagagcttctctctcccccagactaggttatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 9185263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 153
Target Start/End: Original strand, 28617258 - 28617319
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| ||||||    
T  28617258 tggattggagagctgctctctcccccagagtaggtcatattggaccgaactgggtaaacaat 28617319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31155971 - 31155911
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  31155971 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 31155911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21989005 - 21988909
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactctttt-gtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatct 155  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||  | |||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||    
T  21989005 ttcttgtaactctttttgtaacactttcatcaaagtggattggagagttgctctc--ctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatct 21988909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 2479433 - 2479337
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| || ||||  | |||||||||||||||||||    
T  2479433 ttcttataactcttt-gtaacactttcatcatagtggatttgagagctgctctc-cccctagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatctt 2479337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 47263745 - 47263678
Alignment:
Q  88 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  47263745 catagtggattggagagctgc--tctcccccatattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 47263678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1049356 - 1049296
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  1049356 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 1049296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 2935497 - 2935557
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  2935497 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 2935557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 3035953 - 3036013
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  3035953 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 3036013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 7351712 - 7351652
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  7351712 tggattggagggctgctctctcccccatactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 7351652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 109 - 156
Target Start/End: Original strand, 8153466 - 8153514
Alignment:
Q  109 tctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  8153466 tctctcccccagattaggtcaagttggactgaactgggtcaacaatctt 8153514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9027254 - 9027194
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  9027254 tggataggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 9027194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 22108295 - 22108355
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22108295 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22108355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 22137306 - 22137366
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22137306 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22137366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 40550055 - 40550115
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  40550055 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 40550115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 40552333 - 40552393
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  40552333 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 40552393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 18855871 - 18855577
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18855871 caaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggagagctgctc 18855774  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   |  ||||||||| |||||||||||||    
T  18855773 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccg--tttatcttgtttatgcttgttag 18855676  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18855675 ctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcactatcacttgctcca 18855578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 3814168 - 3813874
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3814168 caaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttcacatattggattggagagctgctc 3814071  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||| |||| ||   |||||||| |||||||||||||    
T  3814070 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgcatggtgttttgttc--ttcctttcttg--cttatcttgtttatgcttgttag 3813975  T
Q  209 ctcttagtgtgg-ttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  3813974 ctctttgtgtggtttttgcgatacactagtctaggactgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgctctcattgattaccactatcacttgctcca 3813875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 5732809 - 5732512
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  5732809 caaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 5732712  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttcttttcttttcat--ggttttatcttgttatgc-ttgtta 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| || | |||||| | |     ||||||||||| ||| ||||||    
T  5732711 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgttcagtgttttttttgttctttcctttaccgtttatcttgtt-tgctttgtta 5732613  T
Q  208 gctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||    
T  5732612 gctctttgtgtggttttactatacacta-gcttagggctgttttgttgttgttagcttggagaccatttgttctcattgattaccaccatcacttgctcc 5732514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 9224346 - 9224641
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9224346 caaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttctaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 9224443  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgtt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| || |||||   |   |||||||||| ||| ||| |    
T  9224444 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttccttttaccg--cttatcttgttttgctttggt 9224539  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  9224540 atctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctcc 9224639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 9229133 - 9229428
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9229133 caaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttctaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 9229230  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgtt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| || |||||   |   |||||||||| ||| ||| |    
T  9229231 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttccttttaccg--cttatcttgttttgctttggt 9229326  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  9229327 atctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctcc 9229426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 51520603 - 51520307
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  51520603 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 51520506  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgt 205  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| ||    |||||||| |||||| ||||    
T  51520505 tctctcccccagattaggccatattggcagaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttat-cacttatcttgtttatgctttgt 51520410  T
Q  206 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
    || ||||| || ||||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||    
T  51520409 tatctctttgtatggttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctc 51520310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 45357236 - 45357531
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgct 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  45357236 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaaa-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgct 45357333  T
Q  110 ctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgtt 206  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||   |   |||||||| || ||| |||      
T  45357334 ctctcccccagattatgccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttccttttaccg--cttatcttgtttgtgctttgga 45357430  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
    | ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  45357431 atctctt-gtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctcc 45357529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 24 - 308
Target Start/End: Original strand, 56146664 - 56146946
Alignment:
Q  24 tagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctctctcccccagat 122  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146664 tagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctctctcccccagat 56146761  T
Q  123 taggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgttagctcttagtgtg 219  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||  ||| ||| ||    |||||||| |||||| |||||| ||||| |||||    
T  56146762 taggccatattggctgaactggaccaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttccttttat-cacttatcttgtttatgctttgttatctctttgtgtg 56146857  T
Q  220 gttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||||||||||||| ||| ||  ||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  56146858 gttttgctatacactagtctagggctgctttgttgttgtttgcttggagaccaattgttctcattgattaccactatctcttgctccac 56146946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 45347756 - 45348052
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagat-tcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45347756 caaagggtagaatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagaggtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 45347853  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgc-ttgt 205  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||   |   |||||||| || ||| |||     
T  45347854 tctctcccccagattaagccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttctttccttttaccg--cttatcttgtttgtgctttgg 45347950  T
Q  206 tagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctc 305  Q
     | ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||    
T  45347951 aatctctt-gtgtggttttgctttacactagtctaggactgttttgttgttgttagcttgaagaccatttgttctcatagattaccactatcacttgctc 45348049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 60 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 24742037 - 24741793
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  24742037 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 24741940  T
Q  159 ttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctg-ttttgttgt 255  Q
    |||||| |||||||  ||| |||| ||   |||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| |||||||||    
T  24741939 ttggtgttttgttc--ttcctttcttg--cttatcttgttttgctttggtatctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggctgtttttgttgt 24741844  T
Q  256 tgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||| |||||||| ||||||  | |||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  24741843 tgtt-gcttggaaaccattttgt-tcattgattaccactatctcttgctccac 24741793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 60 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29760738 - 29760495
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgc 158  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  29760738 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-c 29760641  T
Q  159 ttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgtt 256  Q
    |||||| |||||||  ||| |||| ||   |||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||||||||    
T  29760640 ttggtgttttgttc--ttcctttcttg--cttatcttgttttgctttgttctctctttgtgtggttttgctctacactagtctagggttgttttgttgtt 29760545  T
Q  257 gttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    ||| |||||||| ||||||  | | |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  29760544 gtt-gcttggaaaccattttgt-ttattgattaccactatctcttgctccac 29760495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10047477 - 10047358
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10047477 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 10047378  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  10047377 gt--gtgtttgttcctttcttt 10047358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 39246092 - 39245973
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  39246092 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 39245993  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  39245992 gt--gtgtttgttcctttcttt 39245973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 38152438 - 38152557
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattcac-atattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  38152438 ttcttataactcttttgtaacactttcaccatagtggattggagagctgctctctcccccagattatgtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 38152537  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  38152538 gt--gtgtttgttcctttcttt 38152557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 16623292 - 16623391
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  16623292 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaatcttg 16623391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 74 - 156
Target Start/End: Original strand, 28468542 - 28468625
Alignment:
Q  74 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28468542 ttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggctgaactgggtcaacaatctt 28468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 36315229 - 36315347
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  36315229 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36315327  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  36315328 gt--gtgtttgttcctttcttt 36315347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Original strand, 36329438 - 36329556
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  36329438 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacattcttg 36329536  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  36329537 gt--gtgtttgttcctttcttt 36329556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 3796518 - 3796616
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  3796518 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattagagagttgctctctcccccatattaggtcatattggacggaactgggtcaacaatctt 3796616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5147775 - 5147656
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||||||||| |    
T  5147775 ttcttgtaactattttgtaacactttcatcataatggactggagagctgctccctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctcg 5147676  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  5147675 gt--gtgtttgttcctttcttt 5147656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 5396671 - 5396768
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  5396671 ttcttgtaactcttt-gcaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcctccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 5396768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5143357 - 5143260
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatct 155  Q
    ||||||||| | ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  5143357 ttcttgtaaattttttgtaacactttcatcatagtgggttggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatct 5143260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24333901 - 24333808
Alignment:
Q  66 taactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||| || ||||||||||    
T  24333901 taactcttttgtaacacgttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgagttaacaatcttg 24333808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 74 - 179
Target Start/End: Original strand, 5269204 - 5269309
Alignment:
Q  74 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgtttgttc 171  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  5269204 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactaggtcaacaatcttg--ttgtgtttgttc 5269301  T
Q  172 ttttcttt 179  Q
     |||||||    
T  5269302 ctttcttt 5269309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Original strand, 16630679 - 16630778
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | || ||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  16630679 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcatagtggattggagagctgttctctcctccagattatgtcatattggaccgaactaggtcaacaaccttg 16630778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 31985634 - 31985730
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  31985634 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctct-ccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 31985730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3777646 - 3777528
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||| | |||||||||||||||||| |    
T  3777646 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctactctctcctctagattaggttatattggaccgaactgggtcaacaatctcg 3777548  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  3777547 gt--gtgtttgttcctttcttt 3777528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 151
Target Start/End: Original strand, 6743417 - 6743507
Alignment:
Q  63 ttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaaca 151  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| || ||||| | ||||||||||||||    
T  6743417 ttgtagctcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctctctcccgtagattaggtcatattggaccgaactgggtcaaca 6743507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16931849 - 16931789
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16931849 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16931789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16934203 - 16934143
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  16934203 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 16934143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22780433 - 22780373
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22780433 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22780373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 44599898 - 44599838
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  44599898 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 44599838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 54867281 - 54867163
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||| |||| | ||||| || |||||||||||||| ||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  54867281 ttcttataactattttgtaacattttcatcatagttgattgaagggctgctctctcccc-agactaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 54867183  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  54867182 gt--gtgtttgttcctttcttt 54867163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 157
Target Start/End: Original strand, 25862035 - 25862120
Alignment:
Q  74 ttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||| || ||||||| ||||| |||||| || ||||| | |||||| |||||||||||||    
T  25862035 ttgtaacactttcatcatagtggattggagggccgctctcttccccatattaggtcatattggaccgaactgagtcaacaatcttg 25862120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 5112335 - 5112275
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattcacat-attggattggagagctgctctctccccca 119  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  5112335 ttcttgtaacccatttgtaacactttcatattagtggattggagagctgctctcaccccca 5112275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 6765117 - 6765177
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  6765117 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 6765177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 7941596 - 7941656
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  7941596 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 7941656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18709224 - 18709164
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  18709224 tggattggaggactgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 18709164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22782798 - 22782738
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||| |||||||    
T  22782798 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactggatcaacaa 22782738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 507 - 213
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  507 caaagggtagttctagggtttgttcatgtgtaaagcttgataagctagagtcttgtaac-cttttgtaacac-ttcacatattggattggagagctgctc 410  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||   |  ||||||||| |||||||||||||    
T  409 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatcttgctcggtgttttgttctttccttttaccg--tttatcttgtttatgcttgttag 312  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  311 ctctttgtgtggttttgctatacacta-gcttagggctg-tttgttgttgtttgcttggaagccatttgttctcattgattatcaccatcacttgctcca 214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 81 - 308
Target Start/End: Original strand, 181973 - 182199
Alignment:
Q  81 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttc-ttttctt 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  181973 acattcacatattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtgttttgttcgttttctt 182072  T
Q  179 ttcatggttttatcttgttatgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttg-ttagcttggaagccatttgc 277  Q
    || || | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  182073 tt-atcg-tttatcttg-tatgcttgttagctcttagtgtggatttgct-tacattaggcttaggctgttttgttgttgattagcttggaggccatttgc 182168  T
Q  278 tctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  182169 actcatagattacctctatctcttgctccac 182199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 9583 - 9874
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgctc 110  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  9583 caaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagtcttgtaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgctc 9680  T
Q  111 tctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttg-ttatgcttgttag 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||  ||| |||| ||   |||||||| |||||||||||||    
T  9681 tctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt-ctcggtgttttgttc--ttcctttcttg--cttatcttgtttatgcttgttag 9775  T
Q  209 ctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcca 307  Q
    ||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9776 ctctt-gtgtggttttgctatatacta-gcttagggctgttttgttgttgtttggttggagaccatttgctctcattgattatcactatcacttgctcca 9873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 291
Target Start/End: Original strand, 3 - 104
Alignment:
Q  188 ttatcttgtt-atgcttgttagctcttagtgtggttttgctatacattaggctta-ggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattg 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  3 ttatcttgtttatgcttgttagctc---gtgtggttttgctatacacta-gcttagggctgttttgttgttgtttacttggagaccatttgctctcattg 98  T
Q  286 attatc 291  Q
    ||||||    
T  99 attatc 104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 69
Target Start/End: Original strand, 3788 - 3845
Alignment:
Q  11 caaagggtagatctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctagattcttgtaac 69  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  3788 caaagggtagatctagggtttgttcatgtgtaaagcttg-aaggctagagtcttgtaac 3845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 308
Target Start/End: Original strand, 35001 - 35296
Alignment:
Q  11 caaagggtaga-tctagggttttgtcatgtgtaaagcttgaaaagctaga-ttcttgtaactcttttgtaacacattcacatattggattggagagctgc 108  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  35001 caaagggtagagtctagggtttgttcatgtgtaaagcttgaag-gctagagttcttctaac-cttttgtaacactttctcatattggattggagagctgc 35098  T
Q  109 tctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatcttgcttggtg-tttgttcttttcttttcatggttttatcttgttatgc-ttgtt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||| || |||||   |   |||||||||| ||| ||| |    
T  35099 tctctcccccagattaggccatattggctgaactgggttaacaatctt-ctcggtgttttgttc-ttccttttaccg--cttatcttgttttgctttggt 35194  T
Q  207 agctcttagtgtggttttgctatacattaggcttaggctgttttgttgttgttagcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctcc 306  Q
    | ||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||    
T  35195 atctctttgtgtggttttgctatacactagtctagggctgttttgttgttgtttgcttggagaccatttgttctcattgattaccactatctcttgctcc 35294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 17952 - 18048
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17952 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 18048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 24045 - 24141
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattggctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24045 ttcttgtaacccttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggccatattggctgaactgggtcaacaatctt 24141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 8419 - 8516
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  8419 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 8516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 22343 - 22403
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  22343 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 22403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 24618 - 24678
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  24618 tggatcggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 24678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 85780 - 85662
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  85780 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatggtggattggagagccgctctctcccccagattaggtcatattggactgaactgggtcaacaatctag 85682  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  ||||||||||||||||||    
T  85681 at--gtgtttgttcttttcttt 85662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5781 - 5662
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5781 ttcttgtatctcttttgtaacactttcatcatagtggattgaagggctgctctctcccccagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatcttg 5682  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  5681 gt--gtgtttgttcctttcttt 5662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 2590 - 2471
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||    
T  2590 ttcttataattcttttgtaacactttcatcatagtggattggagggctgctgtctcccccagattaggtcatattggagcgaactgggtcaacaatcttg 2491  T
Q  158 cttggtgtttgttcttttcttt 179  Q
     |  |||||||||| |||||||    
T  2490 gt--gtgtttgttcctttcttt 2471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 133280 - 133377
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |  ||||||||||||||||||    
T  133280 ttcttgtaactcttt-gtaacattttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccatattaggtcatattgaacctaactgggtcaacaatctt 133377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10827 - 10728
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatcttg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  10827 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcttagtggattggagagctgctctctcccccaaattaggtcatattggaccgaactgggtcaataatcttg 10728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 43961 - 44058
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  43961 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtggattggagagctgctctctcccccagaatagatcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 44058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 36832 - 36929
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||| |||||||||||| ||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||    
T  36832 ttcttgtaactcttt-gtaacactttcatcatagtgggttggcgagctgctctcttccctagattaggtcatattggaccgaactgggtcaacaatctt 36929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 45322 - 45253
Alignment:
Q  88 catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaatctt 156  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  | |||||| ||||||||||||    
T  45322 catagtggattggagagctgctctctcccccagattaggtcatattgaaccgaactgagtcaacaatctt 45253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 17361 - 17266
Alignment:
Q  60 ttcttgtaactcttttgtaacacattca-catattggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattg-gctgaactgggtcaacaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||  |||| |||||| || ||||  | ||||||||||||||||    
T  17361 ttcttgtaactcttttgtaacactttcatcataatggattggagggttgctctctttcccatattaggtcatattgaaccgaactgggtcaacaat 17266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Original strand, 269 - 329
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  269 tggattggagggctgctctctcccccagactaggtcagattggaccgaactgggtcaacaa 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 308
Target Start/End: Original strand, 34136 - 34183
Alignment:
Q  261 gcttggaagccatttgctctcattgattatctctatcacttgctccac 308  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34136 gcttggagaccatttgttctcattgattatcactatcacttgctccac 34183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11533 - 11500
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattagg 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11533 tggattggagagctgctctctcccccagactagg 11500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 69352 - 69292
Alignment:
Q  93 tggattggagagctgctctctcccccagattaggccacattgg-ctgaactgggtcaacaa 152  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||| | |||||||||||||||    
T  69352 tggatcggagagctgctctctcccccagactaggtcaatttggaccgaactgggtcaacaa 69292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University