View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2258_2D_low_17 (Length: 259)

Name: NF2258_2D_low_17
Description: NF2258_2D
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2258_2D_low_17
NF2258_2D_low_17
[»] chr3 (108 HSPs)
chr3 (20-259)||(1313563-1313800)
chr3 (19-259)||(43421280-43421518)
chr3 (22-250)||(43423331-43423557)
chr3 (19-250)||(27635518-27635752)
chr3 (19-259)||(53917526-53917767)
chr3 (19-259)||(880316-880554)
chr3 (21-259)||(3314838-3315078)
chr3 (19-250)||(45883102-45883337)
chr3 (19-259)||(6484514-6484753)
chr3 (35-243)||(51943540-51943753)
chr3 (19-259)||(53915358-53915599)
chr3 (19-259)||(4308143-4308384)
chr3 (21-259)||(1626548-1626786)
chr3 (22-242)||(12267842-12268061)
chr3 (19-259)||(51674629-51674869)
chr3 (19-259)||(36011981-36012223)
chr3 (19-259)||(32219238-32219482)
chr3 (19-259)||(43228445-43228685)
chr3 (19-259)||(17795412-17795649)
chr3 (19-259)||(19103852-19104089)
chr3 (21-259)||(3306915-3307154)
chr3 (19-259)||(32263901-32264142)
chr3 (19-259)||(27101043-27101284)
chr3 (19-259)||(4666670-4666908)
chr3 (22-259)||(18096763-18097003)
chr3 (19-229)||(41849243-41849451)
chr3 (19-259)||(18099030-18099273)
chr3 (21-251)||(24979869-24980104)
chr3 (21-259)||(53468318-53468559)
chr3 (19-259)||(9604467-9604710)
chr3 (19-250)||(42990467-42990698)
chr3 (19-259)||(43226239-43226475)
chr3 (62-259)||(47701578-47701774)
chr3 (20-259)||(25688021-25688264)
chr3 (62-259)||(6231954-6232152)
chr3 (19-259)||(18162817-18163060)
chr3 (62-250)||(48361572-48361765)
chr3 (19-259)||(1321633-1321878)
chr3 (19-250)||(10955886-10956121)
chr3 (21-243)||(15781045-15781271)
chr3 (45-248)||(23633619-23633819)
chr3 (19-259)||(5899826-5900069)
chr3 (57-259)||(47148794-47148998)
chr3 (19-230)||(5886381-5886596)
chr3 (19-250)||(10958182-10958417)
chr3 (39-256)||(53591341-53591559)
chr3 (33-259)||(28101880-28102105)
chr3 (19-259)||(51726866-51727110)
chr3 (19-259)||(25533596-25533822)
chr3 (45-250)||(54691460-54691668)
chr3 (20-259)||(5926630-5926867)
chr3 (19-249)||(10084248-10084482)
chr3 (19-259)||(28761307-28761532)
chr3 (19-259)||(11168255-11168500)
chr3 (19-174)||(28181242-28181397)
chr3 (20-166)||(880106-880251)
chr3 (19-259)||(38890194-38890439)
chr3 (37-248)||(31151508-31151719)
chr3 (72-250)||(39715632-39715809)
chr3 (19-259)||(5522485-5522729)
chr3 (19-243)||(10191171-10191397)
chr3 (19-259)||(5191807-5192049)
chr3 (88-259)||(25634041-25634212)
chr3 (39-249)||(26720711-26720928)
chr3 (36-238)||(7606476-7606670)
chr3 (79-250)||(42992433-42992606)
chr3 (20-228)||(3859712-3859908)
chr3 (36-259)||(25389060-25389291)
chr3 (118-250)||(30006004-30006137)
chr3 (19-250)||(561643-561871)
chr3 (138-259)||(11170558-11170678)
chr3 (19-259)||(4103755-4103998)
chr3 (57-175)||(8183035-8183154)
chr3 (37-238)||(36871185-36871384)
chr3 (36-259)||(22114176-22114408)
chr3 (19-259)||(746912-747157)
chr3 (19-203)||(53893913-53894105)
chr3 (138-218)||(35919098-35919178)
chr3 (163-248)||(889781-889865)
chr3 (37-259)||(25635535-25635754)
chr3 (19-203)||(50494208-50494397)
chr3 (19-203)||(458493-458683)
chr3 (19-249)||(1620332-1620554)
chr3 (19-203)||(456116-456306)
chr3 (19-259)||(10621386-10621632)
chr3 (19-188)||(42992610-42992780)
chr3 (21-203)||(28412892-28413080)
chr3 (93-249)||(53597400-53597557)
chr3 (133-259)||(24181534-24181660)
chr3 (200-259)||(54884308-54884367)
chr3 (19-203)||(6065653-6065844)
chr3 (163-259)||(35917952-35918046)
chr3 (19-202)||(38210580-38210769)
chr3 (36-121)||(11170671-11170755)
chr3 (36-203)||(6063317-6063494)
chr3 (108-249)||(14634393-14634535)
chr3 (191-250)||(29956849-29956907)
chr3 (192-250)||(13420222-13420280)
chr3 (88-241)||(27420822-27420973)
chr3 (169-215)||(28181185-28181230)
chr3 (62-174)||(26763205-26763313)
chr3 (86-210)||(1674166-1674292)
chr3 (177-249)||(11007545-11007617)
chr3 (147-197)||(30236249-30236299)
chr3 (153-202)||(16264354-16264403)
chr3 (153-202)||(25795785-25795834)
chr3 (153-202)||(32143325-32143374)
chr3 (196-259)||(6561964-6562028)
[»] chr4 (104 HSPs)
chr4 (19-250)||(38928044-38928273)
chr4 (19-259)||(33415354-33415593)
chr4 (19-259)||(16453537-16453776)
chr4 (19-259)||(22800725-22800967)
chr4 (19-259)||(36921358-36921598)
chr4 (19-259)||(22802597-22802839)
chr4 (20-259)||(40091281-40091520)
chr4 (36-259)||(4215534-4215756)
chr4 (19-259)||(17662111-17662350)
chr4 (19-259)||(40637302-40637545)
chr4 (21-239)||(47563009-47563225)
chr4 (19-259)||(36919449-36919689)
chr4 (19-250)||(24889033-24889265)
chr4 (19-259)||(2891519-2891760)
chr4 (35-259)||(47274954-47275178)
chr4 (19-250)||(36378529-36378758)
chr4 (62-259)||(24879217-24879419)
chr4 (21-259)||(12395712-12395950)
chr4 (21-259)||(12400674-12400912)
chr4 (19-259)||(14633546-14633790)
chr4 (19-259)||(37312944-37313171)
chr4 (21-250)||(13547391-13547621)
chr4 (19-250)||(14787294-14787527)
chr4 (19-250)||(16455478-16455694)
chr4 (21-259)||(5101157-5101382)
chr4 (62-259)||(24880679-24880883)
chr4 (21-250)||(48486556-48486787)
chr4 (19-259)||(5635337-5635581)
chr4 (73-250)||(36380586-36380764)
chr4 (19-259)||(37089232-37089476)
chr4 (22-225)||(6133098-6133302)
chr4 (19-259)||(18409213-18409452)
chr4 (19-246)||(27499283-27499516)
chr4 (19-218)||(14789293-14789495)
chr4 (19-259)||(22046547-22046790)
chr4 (19-259)||(8631279-8631524)
chr4 (36-259)||(22044266-22044495)
chr4 (21-259)||(24446524-24446746)
chr4 (33-259)||(19096111-19096338)
chr4 (21-246)||(41997733-41997953)
chr4 (19-259)||(19322921-19323158)
chr4 (19-238)||(26085837-26086061)
chr4 (19-259)||(6765072-6765315)
chr4 (19-259)||(24348446-24348673)
chr4 (21-250)||(619320-619543)
chr4 (21-228)||(51015504-51015715)
chr4 (21-259)||(9148481-9148705)
chr4 (19-259)||(31849459-31849703)
chr4 (19-259)||(11435183-11435427)
chr4 (19-259)||(2484734-2484977)
chr4 (19-259)||(38890094-38890331)
chr4 (37-259)||(18537360-18537580)
chr4 (37-248)||(12102326-12102531)
chr4 (19-188)||(52942350-52942523)
chr4 (21-238)||(11008430-11008652)
chr4 (19-195)||(3937146-3937316)
chr4 (36-259)||(7941551-7941781)
chr4 (19-259)||(11437591-11437835)
chr4 (86-249)||(25357879-25358042)
chr4 (39-247)||(30136789-30136996)
chr4 (21-259)||(11006116-11006341)
chr4 (20-259)||(18534703-18534938)
chr4 (36-259)||(5198648-5198862)
chr4 (62-249)||(3982087-3982272)
chr4 (21-259)||(38409433-38409674)
chr4 (19-259)||(47868629-47868874)
chr4 (19-241)||(49088816-49089024)
chr4 (19-173)||(3824469-3824630)
chr4 (19-259)||(53405363-53405606)
chr4 (37-250)||(8756138-8756348)
chr4 (19-134)||(56030815-56030925)
chr4 (19-259)||(18847382-18847624)
chr4 (19-259)||(9176334-9176578)
chr4 (19-259)||(22134477-22134721)
chr4 (36-238)||(9174020-9174230)
chr4 (89-238)||(16185770-16185920)
chr4 (19-203)||(16931651-16931839)
chr4 (19-121)||(47210657-47210754)
chr4 (19-259)||(15032413-15032654)
chr4 (62-249)||(28453920-28454109)
chr4 (21-201)||(18709026-18709212)
chr4 (19-259)||(22132249-22132496)
chr4 (37-249)||(9863945-9864160)
chr4 (19-121)||(5664605-5664703)
chr4 (150-249)||(26557823-26557922)
chr4 (86-239)||(22295412-22295565)
chr4 (19-259)||(22782597-22782842)
chr4 (19-203)||(44599700-44599888)
chr4 (173-259)||(13544187-13544272)
chr4 (64-238)||(10114565-10114737)
chr4 (86-249)||(47150826-47150989)
chr4 (163-259)||(47210762-47210857)
chr4 (129-203)||(16934118-16934193)
chr4 (19-259)||(22780232-22780477)
chr4 (190-249)||(31983564-31983623)
chr4 (205-246)||(54928700-54928741)
chr4 (21-98)||(38270016-38270088)
chr4 (190-250)||(9022543-9022602)
chr4 (19-249)||(10113108-10113331)
chr4 (194-249)||(40998990-40999045)
chr4 (108-249)||(3578632-3578766)
chr4 (153-203)||(5269234-5269284)
chr4 (89-142)||(52043497-52043550)
chr4 (153-202)||(5143263-5143312)
[»] chr7 (90 HSPs)
chr7 (21-259)||(44724763-44725000)
chr7 (19-259)||(13099337-13099581)
chr7 (19-259)||(31434913-31435152)
chr7 (33-259)||(42330878-42331102)
chr7 (20-259)||(443779-444021)
chr7 (44-259)||(22393906-22394120)
chr7 (35-250)||(21592023-21592239)
chr7 (19-250)||(27306096-27306326)
chr7 (21-259)||(24748778-24749012)
chr7 (33-250)||(21990343-21990563)
chr7 (19-250)||(4295801-4296030)
chr7 (21-259)||(9679243-9679482)
chr7 (19-259)||(20626222-20626461)
chr7 (19-259)||(20630113-20630352)
chr7 (19-259)||(20642532-20642771)
chr7 (20-250)||(37411988-37412223)
chr7 (21-250)||(42223351-42223578)
chr7 (106-259)||(20137061-20137214)
chr7 (21-250)||(9681013-9681243)
chr7 (19-259)||(21678250-21678486)
chr7 (19-259)||(48457837-48458081)
chr7 (35-250)||(39145865-39146083)
chr7 (19-259)||(38394170-38394414)
chr7 (21-248)||(21680222-21680450)
chr7 (19-259)||(20299644-20299888)
chr7 (19-259)||(7471841-7472085)
chr7 (19-259)||(7092073-7092317)
chr7 (19-259)||(27832508-27832738)
chr7 (19-250)||(11355451-11355684)
chr7 (36-259)||(18345725-18345955)
chr7 (19-188)||(26804764-26804935)
chr7 (19-259)||(44748-44992)
chr7 (19-259)||(20297546-20297790)
chr7 (37-259)||(26295631-26295850)
chr7 (19-259)||(7094320-7094565)
chr7 (19-259)||(1850165-1850409)
chr7 (19-259)||(28485750-28485993)
chr7 (19-250)||(43253377-43253613)
chr7 (19-259)||(3035908-3036152)
chr7 (37-250)||(7188732-7188942)
chr7 (19-259)||(40836604-40836847)
chr7 (19-250)||(24465730-24465955)
chr7 (19-259)||(28487737-28487981)
chr7 (19-259)||(35813-36057)
chr7 (21-173)||(22251452-22251605)
chr7 (19-200)||(11759369-11759555)
chr7 (19-259)||(7469884-7470127)
chr7 (36-259)||(40946512-40946744)
chr7 (36-259)||(3878761-3878993)
chr7 (19-259)||(38396819-38397067)
chr7 (19-259)||(25542713-25542956)
chr7 (129-259)||(24258647-24258781)
chr7 (87-246)||(6332417-6332574)
chr7 (107-259)||(24813450-24813604)
chr7 (112-249)||(11081703-11081842)
chr7 (140-259)||(1049283-1049400)
chr7 (19-259)||(1606564-1606807)
chr7 (62-246)||(16296934-16297115)
chr7 (19-259)||(1046778-1047029)
chr7 (19-121)||(9027054-9027151)
chr7 (19-259)||(2935453-2935697)
chr7 (19-203)||(7351512-7351702)
chr7 (88-250)||(24817287-24817450)
chr7 (108-259)||(25276325-25276465)
chr7 (138-259)||(22108251-22108370)
chr7 (138-259)||(22137262-22137381)
chr7 (138-259)||(40550011-40550130)
chr7 (138-259)||(40552289-40552408)
chr7 (47-143)||(6349097-6349191)
chr7 (138-259)||(31155896-31156015)
chr7 (190-259)||(20091584-20091650)
chr7 (193-259)||(22828672-22828738)
chr7 (20-111)||(1049151-1049239)
chr7 (138-259)||(9027179-9027298)
chr7 (194-249)||(22280379-22280434)
chr7 (19-114)||(7349138-7349228)
chr7 (165-249)||(6046688-6046772)
chr7 (133-249)||(13290454-13290569)
chr7 (19-89)||(22137439-22137507)
chr7 (19-89)||(40552466-40552534)
chr7 (138-248)||(6067183-6067294)
chr7 (204-259)||(6348966-6349021)
chr7 (33-75)||(20137024-20137066)
chr7 (88-238)||(40281316-40281468)
chr7 (19-70)||(1502835-1502883)
chr7 (147-223)||(2075226-2075303)
chr7 (153-202)||(9190052-9190101)
chr7 (19-89)||(40550189-40550257)
chr7 (153-197)||(12097867-12097911)
chr7 (37-131)||(20091041-20091132)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (48-259)||(22407346-22407559)
chr2 (19-259)||(19007790-19008030)
chr2 (19-250)||(14837426-14837659)
chr2 (35-259)||(6258696-6258922)
chr2 (35-259)||(6264027-6264254)
chr2 (21-259)||(42923373-42923614)
chr2 (19-259)||(28196787-28197025)
chr2 (37-259)||(28459073-28459295)
chr2 (21-249)||(22287203-22287431)
chr2 (19-259)||(17849267-17849507)
chr2 (39-243)||(22162907-22163111)
chr2 (19-259)||(43623443-43623685)
chr2 (21-259)||(21520556-21520798)
chr2 (19-218)||(3022362-3022562)
chr2 (35-259)||(5375224-5375451)
chr2 (21-259)||(22707618-22707858)
chr2 (36-250)||(17848599-17848814)
chr2 (39-259)||(31732666-31732882)
chr2 (71-249)||(44288982-44289163)
chr2 (19-259)||(45279862-45280089)
chr2 (72-243)||(40031968-40032143)
chr2 (19-259)||(27104948-27105192)
chr2 (35-250)||(7462824-7463044)
chr2 (19-255)||(11739441-11739661)
chr2 (68-259)||(23870966-23871161)
chr2 (19-259)||(23452097-23452342)
chr2 (19-259)||(45238862-45239082)
chr2 (21-259)||(34979456-34979684)
chr2 (20-228)||(13909907-13910119)
chr2 (20-177)||(15539396-15539553)
chr2 (35-250)||(11577991-11578205)
chr2 (91-259)||(18800251-18800419)
chr2 (19-259)||(22874280-22874499)
chr2 (37-249)||(17897134-17897341)
chr2 (19-259)||(24162084-24162327)
chr2 (36-228)||(42064695-42064878)
chr2 (138-259)||(42452931-42453050)
chr2 (129-259)||(19501986-19502116)
chr2 (129-259)||(19504321-19504451)
chr2 (86-249)||(20146540-20146704)
chr2 (19-131)||(38020360-38020470)
chr2 (87-259)||(40699524-40699697)
chr2 (19-203)||(35217830-35218013)
chr2 (36-259)||(36558755-36558968)
chr2 (19-259)||(36561001-36561245)
chr2 (19-198)||(20592288-20592463)
chr2 (116-245)||(35107458-35107590)
chr2 (19-119)||(19501862-19501958)
chr2 (19-203)||(35215453-35215636)
chr2 (19-117)||(19504197-19504291)
chr2 (19-259)||(45332040-45332285)
chr2 (33-239)||(37962823-37963027)
chr2 (19-91)||(42453802-42453871)
chr2 (45-129)||(38414071-38414155)
chr2 (108-234)||(17921871-17921996)
chr2 (205-250)||(20589850-20589895)
chr2 (205-249)||(15694064-15694108)
chr2 (190-238)||(33604092-33604140)
chr2 (141-239)||(39287262-39287361)
chr2 (150-249)||(13828338-13828438)
chr2 (153-197)||(17057369-17057413)
chr2 (153-197)||(17085352-17085396)
chr2 (147-238)||(17943631-17943723)
[»] chr5 (87 HSPs)
chr5 (19-259)||(2724067-2724307)
chr5 (19-249)||(18511076-18511307)
chr5 (19-259)||(40221696-40221943)
chr5 (33-259)||(36208750-36208975)
chr5 (33-259)||(10474200-10474428)
chr5 (40-249)||(18509201-18509413)
chr5 (19-250)||(41585600-41585840)
chr5 (37-259)||(696051-696273)
chr5 (19-241)||(21288953-21289173)
chr5 (19-259)||(39854657-39854901)
chr5 (39-250)||(26097915-26098127)
chr5 (35-259)||(1189486-1189714)
chr5 (21-250)||(6756675-6756905)
chr5 (19-250)||(18596828-18597059)
chr5 (33-250)||(25904286-25904505)
chr5 (19-259)||(36402190-36402433)
chr5 (19-259)||(658223-658458)
chr5 (21-250)||(2818199-2818431)
chr5 (21-259)||(17818357-17818595)
chr5 (21-250)||(20505709-20505937)
chr5 (21-249)||(21948210-21948446)
chr5 (21-259)||(6745242-6745485)
chr5 (23-259)||(16092069-16092305)
chr5 (21-259)||(2954591-2954827)
chr5 (35-245)||(26098165-26098380)
chr5 (33-250)||(17073066-17073289)
chr5 (19-250)||(24127039-24127271)
chr5 (21-259)||(37705649-37705885)
chr5 (35-250)||(31472493-31472709)
chr5 (35-216)||(20043206-20043390)
chr5 (21-239)||(6747498-6747721)
chr5 (19-259)||(25804199-25804442)
chr5 (19-259)||(25921334-25921578)
chr5 (19-259)||(31465853-31466084)
chr5 (19-250)||(16776340-16776574)
chr5 (19-259)||(38882280-38882506)
chr5 (19-259)||(10528958-10529204)
chr5 (19-259)||(18466858-18467103)
chr5 (39-259)||(6661074-6661291)
chr5 (19-259)||(4236803-4237046)
chr5 (19-259)||(34476913-34477157)
chr5 (19-259)||(34479278-34479522)
chr5 (19-238)||(10587026-10587233)
chr5 (23-259)||(27912710-27912951)
chr5 (20-259)||(2175093-2175318)
chr5 (37-247)||(20054021-20054231)
chr5 (67-259)||(39397916-39398098)
chr5 (20-239)||(12555779-12556008)
chr5 (19-259)||(18469185-18469428)
chr5 (19-228)||(21684313-21684526)
chr5 (19-259)||(39798221-39798448)
chr5 (19-259)||(27910624-27910852)
chr5 (19-259)||(4410197-4410439)
chr5 (19-259)||(38959992-38960236)
chr5 (19-259)||(10749875-10750118)
chr5 (35-131)||(20045290-20045386)
chr5 (19-134)||(34530579-34530692)
chr5 (21-249)||(15445140-15445362)
chr5 (19-228)||(31542939-31543152)
chr5 (19-238)||(10757371-10757594)
chr5 (39-259)||(9020392-9020612)
chr5 (19-200)||(3372997-3373184)
chr5 (93-259)||(4897903-4898068)
chr5 (19-203)||(31179233-31179421)
chr5 (85-249)||(15143650-15143817)
chr5 (138-259)||(15354560-15354679)
chr5 (138-259)||(23665218-23665337)
chr5 (138-259)||(23741844-23741963)
chr5 (138-259)||(23793250-23793369)
chr5 (88-238)||(2144504-2144647)
chr5 (138-259)||(15356836-15356955)
chr5 (185-249)||(17413198-17413262)
chr5 (19-203)||(15552474-15552664)
chr5 (138-228)||(31545285-31545374)
chr5 (108-249)||(35430365-35430506)
chr5 (220-259)||(42770984-42771023)
chr5 (212-250)||(34530724-34530762)
chr5 (38-145)||(42771064-42771167)
chr5 (153-202)||(10281755-10281804)
chr5 (19-89)||(15354434-15354502)
chr5 (19-89)||(15356710-15356778)
chr5 (205-250)||(20045223-20045268)
chr5 (19-89)||(23665396-23665464)
chr5 (19-89)||(23741717-23741785)
chr5 (19-89)||(23793123-23793191)
chr5 (153-198)||(31300644-31300689)
chr5 (19-121)||(31545404-31545501)
[»] chr1 (100 HSPs)
chr1 (19-259)||(11457342-11457582)
chr1 (19-259)||(47906444-47906684)
chr1 (19-259)||(17185999-17186235)
chr1 (20-243)||(4131243-4131467)
chr1 (19-250)||(31424882-31425113)
chr1 (19-259)||(16429131-16429367)
chr1 (19-259)||(25251141-25251382)
chr1 (19-250)||(2949099-2949329)
chr1 (19-250)||(9240954-9241184)
chr1 (35-250)||(18307292-18307509)
chr1 (21-259)||(14097837-14098077)
chr1 (21-243)||(13215275-13215496)
chr1 (23-250)||(17319070-17319297)
chr1 (20-250)||(17324500-17324734)
chr1 (19-250)||(40134127-40134358)
chr1 (19-250)||(6995560-6995798)
chr1 (19-259)||(18839761-18840002)
chr1 (21-250)||(28206934-28207164)
chr1 (21-250)||(12302373-12302603)
chr1 (37-259)||(6114989-6115210)
chr1 (45-259)||(16428827-16429040)
chr1 (19-249)||(39462703-39462936)
chr1 (64-259)||(50076583-50076779)
chr1 (19-250)||(50307409-50307644)
chr1 (21-259)||(38925350-38925585)
chr1 (35-250)||(31490096-31490312)
chr1 (19-259)||(25248418-25248659)
chr1 (19-259)||(27336804-27337046)
chr1 (19-259)||(15294697-15294941)
chr1 (21-250)||(41647103-41647333)
chr1 (19-259)||(23816060-23816303)
chr1 (19-259)||(27338995-27339237)
chr1 (84-259)||(6756700-6756877)
chr1 (19-259)||(50248437-50248679)
chr1 (19-259)||(15823720-15823964)
chr1 (19-259)||(51750213-51750457)
chr1 (19-259)||(2510205-2510432)
chr1 (19-259)||(10399690-10399935)
chr1 (37-259)||(15916564-15916786)
chr1 (36-259)||(31735399-31735628)
chr1 (35-250)||(28998128-28998351)
chr1 (35-250)||(29003844-29004067)
chr1 (23-259)||(17324237-17324484)
chr1 (35-259)||(25128046-25128273)
chr1 (19-259)||(16432568-16432801)
chr1 (19-259)||(39932247-39932494)
chr1 (36-259)||(28840854-28841083)
chr1 (19-259)||(13762011-13762254)
chr1 (21-259)||(2617690-2617934)
chr1 (124-259)||(50078793-50078928)
chr1 (36-259)||(28842669-28842898)
chr1 (19-218)||(13358787-13358992)
chr1 (19-250)||(14183474-14183690)
chr1 (19-259)||(46431568-46431814)
chr1 (19-250)||(47451825-47452045)
chr1 (19-179)||(13447136-13447301)
chr1 (19-214)||(31422726-31422923)
chr1 (124-259)||(3579589-3579723)
chr1 (76-259)||(49495137-49495318)
chr1 (19-134)||(50078656-50078769)
chr1 (37-250)||(18800458-18800671)
chr1 (36-203)||(51757759-51757939)
chr1 (19-259)||(9459297-9459523)
chr1 (19-259)||(9463124-9463350)
chr1 (140-250)||(6823197-6823306)
chr1 (21-129)||(3579452-3579558)
chr1 (37-249)||(13125346-13125555)
chr1 (19-259)||(20302633-20302860)
chr1 (19-259)||(24325837-24326081)
chr1 (19-259)||(30790269-30790508)
chr1 (37-259)||(8347161-8347380)
chr1 (19-259)||(20291631-20291875)
chr1 (62-259)||(15669304-15669501)
chr1 (107-259)||(42922404-42922557)
chr1 (87-249)||(16561651-16561813)
chr1 (19-259)||(23786014-23786258)
chr1 (129-203)||(51752592-51752667)
chr1 (35-121)||(25860287-25860369)
chr1 (19-250)||(8348925-8349150)
chr1 (19-203)||(16226396-16226587)
chr1 (37-246)||(13127576-13127782)
chr1 (89-249)||(27916681-27916840)
chr1 (108-249)||(26613194-26613337)
chr1 (19-203)||(16231792-16231982)
chr1 (20-120)||(30780361-30780461)
chr1 (190-259)||(21948227-21948295)
chr1 (19-121)||(47177683-47177781)
chr1 (190-238)||(155901-155949)
chr1 (133-249)||(30738609-30738727)
chr1 (205-249)||(43104345-43104389)
chr1 (19-203)||(47179942-47180132)
chr1 (45-115)||(51752696-51752764)
chr1 (147-238)||(21353342-21353434)
chr1 (94-145)||(26520061-26520114)
chr1 (209-259)||(31422930-31422980)
chr1 (206-259)||(48665352-48665404)
chr1 (153-197)||(4552637-4552681)
chr1 (205-241)||(8213579-8213615)
chr1 (212-244)||(28279455-28279487)
chr1 (153-197)||(31659362-31659406)
[»] chr8 (56 HSPs)
chr8 (19-259)||(15072941-15073182)
chr8 (21-250)||(41382901-41383132)
chr8 (21-259)||(14419057-14419296)
chr8 (22-259)||(30480371-30480608)
chr8 (21-250)||(25952759-25952988)
chr8 (19-250)||(33541275-33541506)
chr8 (19-246)||(13858354-13858577)
chr8 (35-259)||(36865765-36865995)
chr8 (19-259)||(15956187-15956423)
chr8 (19-250)||(28251431-28251663)
chr8 (19-259)||(15068211-15068452)
chr8 (19-259)||(15185584-15185820)
chr8 (21-247)||(27106769-27106990)
chr8 (19-259)||(14807981-14808231)
chr8 (19-250)||(2467998-2468226)
chr8 (46-250)||(41384983-41385192)
chr8 (88-239)||(1225417-1225568)
chr8 (19-259)||(21482540-21482778)
chr8 (19-259)||(3874240-3874467)
chr8 (21-208)||(37214131-37214319)
chr8 (21-259)||(35872323-35872545)
chr8 (19-250)||(43530354-43530589)
chr8 (19-250)||(5372046-5372274)
chr8 (19-228)||(27827246-27827460)
chr8 (19-228)||(27829557-27829771)
chr8 (19-259)||(15809448-15809692)
chr8 (19-250)||(22684513-22684749)
chr8 (33-259)||(21480732-21480958)
chr8 (19-259)||(4424248-4424493)
chr8 (19-259)||(32339539-32339784)
chr8 (19-238)||(28283082-28283304)
chr8 (19-218)||(14477520-14477720)
chr8 (19-250)||(31162448-31162680)
chr8 (36-259)||(608964-609197)
chr8 (19-259)||(3005505-3005737)
chr8 (19-228)||(18810968-18811182)
chr8 (19-228)||(18813142-18813356)
chr8 (67-169)||(181798-181901)
chr8 (134-250)||(27911253-27911367)
chr8 (134-250)||(27957672-27957786)
chr8 (19-259)||(44721074-44721317)
chr8 (86-249)||(31035358-31035522)
chr8 (88-249)||(31578216-31578373)
chr8 (124-249)||(6376229-6376354)
chr8 (19-203)||(43082258-43082447)
chr8 (19-203)||(43079887-43080076)
chr8 (184-259)||(16833779-16833854)
chr8 (36-121)||(3883470-3883553)
chr8 (19-129)||(27911441-27911547)
chr8 (19-129)||(27957860-27957966)
chr8 (190-248)||(3896063-3896121)
chr8 (192-246)||(14419732-14419786)
chr8 (19-121)||(24873059-24873158)
chr8 (88-174)||(31566493-31566578)
chr8 (153-202)||(19752438-19752487)
chr8 (138-182)||(28228669-28228714)
[»] chr6 (69 HSPs)
chr6 (19-259)||(9020135-9020378)
chr6 (19-259)||(24338315-24338552)
chr6 (19-243)||(30728689-30728913)
chr6 (21-259)||(3629733-3629969)
chr6 (21-259)||(3631806-3632043)
chr6 (19-259)||(11982892-11983134)
chr6 (19-259)||(15346556-15346793)
chr6 (47-259)||(1069609-1069824)
chr6 (19-259)||(15367240-15367478)
chr6 (19-259)||(13057403-13057639)
chr6 (83-250)||(12186000-12186168)
chr6 (19-259)||(28241182-28241426)
chr6 (19-259)||(15541010-15541245)
chr6 (19-250)||(14466541-14466771)
chr6 (107-259)||(13039963-13040117)
chr6 (19-259)||(14507037-14507280)
chr6 (19-259)||(32280205-32280443)
chr6 (19-218)||(26065231-26065435)
chr6 (19-218)||(26085200-26085404)
chr6 (19-259)||(1230109-1230354)
chr6 (19-259)||(4816091-4816336)
chr6 (19-259)||(30967410-30967654)
chr6 (19-259)||(2628746-2628990)
chr6 (39-250)||(3233605-3233826)
chr6 (38-259)||(14458643-14458872)
chr6 (134-259)||(3390588-3390713)
chr6 (33-259)||(15719851-15720074)
chr6 (39-259)||(3027740-3027959)
chr6 (19-259)||(19704424-19704673)
chr6 (145-259)||(15532674-15532786)
chr6 (124-236)||(10584227-10584340)
chr6 (19-259)||(19696649-19696884)
chr6 (100-259)||(12161502-12161662)
chr6 (19-259)||(30034466-30034708)
chr6 (91-238)||(22857891-22858038)
chr6 (19-259)||(29754569-29754813)
chr6 (73-250)||(26945362-26945539)
chr6 (86-249)||(25465524-25465686)
chr6 (133-230)||(25477519-25477616)
chr6 (19-259)||(26068255-26068499)
chr6 (19-259)||(33309066-33309310)
chr6 (38-129)||(3394708-3394800)
chr6 (39-131)||(25480217-25480309)
chr6 (19-259)||(33311335-33311579)
chr6 (19-200)||(26932423-26932609)
chr6 (19-165)||(22490917-22491059)
chr6 (19-259)||(26065981-26066228)
chr6 (37-250)||(17012258-17012466)
chr6 (36-259)||(20915231-20915460)
chr6 (19-249)||(28078067-28078291)
chr6 (19-203)||(5273076-5273266)
chr6 (86-259)||(12937126-12937298)
chr6 (150-249)||(16455421-16455521)
chr6 (86-249)||(28037659-28037825)
chr6 (19-203)||(12195374-12195565)
chr6 (124-249)||(25078529-25078653)
chr6 (178-259)||(12911471-12911551)
chr6 (19-86)||(18322482-18322546)
chr6 (191-249)||(30445743-30445801)
chr6 (78-146)||(15530084-15530156)
chr6 (196-250)||(15530166-15530219)
chr6 (89-172)||(17904287-17904368)
chr6 (204-249)||(3833495-3833541)
chr6 (19-75)||(8717215-8717268)
chr6 (107-223)||(30443532-30443652)
chr6 (133-249)||(11262678-11262793)
chr6 (192-249)||(20527025-20527081)
chr6 (153-202)||(31936591-31936640)
chr6 (19-145)||(22610999-22611119)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (19-259)||(14250-14487)
scaffold0131 (89-259)||(15202-15369)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (19-259)||(85413-85653)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (19-259)||(79368-79611)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (35-259)||(4179-4403)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (19-259)||(183502-183746)
scaffold0005 (19-250)||(52203-52436)
scaffold0005 (19-218)||(50235-50437)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (21-250)||(80051-80283)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (19-259)||(41344-41588)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (19-259)||(11335-11578)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (22-218)||(35817-36016)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (19-259)||(69152-69396)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (19-259)||(1313-1557)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (39-259)||(1529-1748)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (19-228)||(29384-29597)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (19-187)||(1312-1485)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (37-259)||(16536-16756)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (107-259)||(15774-15927)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (19-259)||(6383-6626)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (19-203)||(279-453)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (138-238)||(22319-22418)
scaffold0140 (138-238)||(24594-24693)
scaffold0140 (19-89)||(24751-24819)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (36-121)||(12749-12832)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (19-203)||(3117-3306)
[»] scaffold0891 (2 HSPs)
scaffold0891 (140-203)||(4666-4729)
scaffold0891 (19-121)||(4538-4635)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (91-249)||(57367-57524)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 108)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1313800 - 1313563
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  1313800 tcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaa 1313703  T
Q  120 cagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1313702 caacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata 1313603  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1313602 -tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaa 1313563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 43421280 - 43421518
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  43421280 atcacaccaataaca--aagttgatgtgtggagcaagatatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtataaa 43421377  T
Q  119 acagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  43421378 acagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactat 43421477  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43421478 a-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 43421518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 250
Target Start/End: Original strand, 43423331 - 43423557
Alignment:
Q  22 acaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 121  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43423331 acaccaataaca--aagttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaaca 43423428  T
Q  122 gcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagt 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||||| |    
T  43423429 gcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctcagggagagagcagctctcagtttcactata-t 43423527  T
Q  221 gatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43423528 gatgagtaacgttacaaaagagatatcaat 43423557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 27635518 - 27635752
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27635518 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 27635615  T
Q  119 acagcgagagaa------agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  27635616 acagcgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttc 27635715  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27635716 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 27635752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 53917526 - 53917767
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa- 117  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  53917526 atcacactaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 53917623  T
Q  118 --aacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  53917624 acaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcac 53917723  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  53917724 tata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 53917767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 880316 - 880554
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  880316 atcacacccataaca--aacttgatgtgtggagcaaggattaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaaaccaaaagtagaaa 880413  T
Q  119 acagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  880414 acagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccattttactat 880513  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  880514 a-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 880554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3315078 - 3314838
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3315078 cacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaagcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaacgtagaaaa 3314981  T
Q  120 cagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    |||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  3314980 cagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcacta 3314881  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3314880 taatgatgaataattttacaaaagagatatcaatgggttacaa 3314838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 45883337 - 45883102
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  45883337 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccagaagtagaaa 45883240  T
Q  119 acagcgagagaa------agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgttt 211  Q
    ||||| ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||     
T  45883239 acagcaagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctagggggagagagcagccctccgttc 45883140  T
Q  212 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45883139 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaat 45883102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6484753 - 6484514
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    ||||||| |||||||  || ||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  6484753 atcacactaataaca--aatttgatgtgtggagcaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaa 6484656  T
Q  118 aacagcgagaga-aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6484655 aacagcgagagagaataagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcacta 6484556  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  6484555 ta-tgatgagtaactttacaaaaaagatatcaatgggttacaa 6484514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 51943753 - 51943540
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa---- 130  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||        
T  51943753 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtttggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaaga 51943654  T
Q  131 --agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 228  Q
      |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  51943653 agagaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagta 51943555  T
Q  229 actttacaaaagaga 243  Q
    || ||||||||||||    
T  51943554 acgttacaaaagaga 51943540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 53915358 - 53915599
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  53915358 atcacaccaataaca--aacttgatgtatggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaccaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 53915455  T
Q  119 aca---gcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  53915456 acaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtcaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcac 53915555  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  53915556 ta-aatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaa 53915599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 4308143 - 4308384
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4308143 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatccaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaa 4308239  T
Q  119 aca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    |||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||    
T  4308240 acaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttcca 4308339  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  4308340 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 4308384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 1626548 - 1626786
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||  |||||    
T  1626548 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaacaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtgaaaaac 1626645  T
Q  121 agcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    | ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  1626646 aacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatcgacctagtctgggcgagagagcagccctccgtttcactat 1626745  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  1626746 a-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 1626786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 242
Target Start/End: Original strand, 12267842 - 12268061
Alignment:
Q  22 acaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 121  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12267842 acaccaataaca--aatttgatgtgtggagcagggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaaca 12267939  T
Q  122 gcgaga--gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatag 219  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| || |||||||||||     
T  12267940 acgagagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctctgtttcactata- 12268038  T
Q  220 tgatgagtaactttacaaaagag 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  12268039 tgatgagtaacgttacaaaagag 12268061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 51674629 - 51674869
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||  |  | ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  51674629 atcacaccaataaca--aacttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaacaagtgggtatggaacaaatataaacacaagccaaaagtagaaa 51674726  T
Q  119 acagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| |    
T  51674727 acagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctggtatgggggagagagcagccctccatttcagt 51674826  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51674827 ata-tgatgagtaacattacaaaagagatatcaatggattacaa 51674869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36012223 - 36011981
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  36012223 atcacaccaataaca--aacttgatgtatggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcgaaaagtagaaa 36012126  T
Q  119 aca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    |||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||| ||    
T  36012125 acaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgaagaagagagcagccctctgttcca 36012026  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  36012025 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 36011981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32219482 - 32219238
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  32219482 atcacacaaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 32219385  T
Q  118 aaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    ||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| | |||||||||||| ||||||||    
T  32219384 aacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggagagagagcagccatccgtttc 32219285  T
Q  213 actatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  32219284 actata-tgatgagtaacgtttacaaaaaagatatcaatgggttacaa 32219238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43228685 - 43228445
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  43228685 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattaaaat-acaagccaaaattagaaa 43228590  T
Q  119 aca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    |||   ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||    
T  43228589 acaacagcgagagtaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 43228490  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  43228489 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 43228445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17795649 - 17795412
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  17795649 atcacaccaataa--taaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaataaaatgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaa 17795555  T
Q  119 acagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    ||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17795554 acaacgagagaaaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcatta 17795455  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17795454 taatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 17795412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19104089 - 19103852
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  19104089 atcacaccaataa--taaatttgatgtgtggagcaactgatagtcaagcaaccaaaataaaatgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaa 19103995  T
Q  119 acagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    ||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  19103994 acaacgagagaaaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacctaattcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagccttccgtttcatta 19103895  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19103894 taatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 19103852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3307154 - 3306915
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || |||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3307154 cacaccaataaca-aaacttgatgtatgaagcaagggataatcaaacaatcaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaa 3307056  T
Q  120 cagcga--gagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| || ||| ||||||||    
T  3307055 cagcgaaagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtct--aggagagagcaaccatccttttcacta 3306958  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3306957 taatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 3306915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 32263901 - 32264142
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  32263901 atcacactaataaca--aatttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 32263998  T
Q  119 acagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  32263999 acagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaa-ttgttgatccagtttggtccaaatagacctagtctgggggagagagcagccctccgttccact 32264097  T
Q  216 atagtgatgagtaactttac-aaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  32264098 ataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaa 32264142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 27101043 - 27101284
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27101043 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaatgaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagcaaaaagtagaaa 27101139  T
Q  119 aca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    |||   || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  27101140 acaacagcaagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctattctgggggagagagcagccatccgttcca 27101239  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||| | ||||||    
T  27101240 ctata-tgatgagtaacgttgcaaaagagatatcaatgggttacaa 27101284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4666908 - 4666670
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| |||  ||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||  |||| ||||||||| |||    
T  4666908 atcacaccaataa--taaatttgatgtgtggagtaagtgattatcatgcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaaaacaaaccaaaagtataaa 4666811  T
Q  119 acagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||| |||||||||||    
T  4666810 acagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggg---agagcagccctccgtttcact 4666714  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4666713 ataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatggattacaa 4666670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 259
Target Start/End: Original strand, 18096763 - 18097003
Alignment:
Q  22 acaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18096763 acaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaac 18096860  T
Q  121 agc-----gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    | |     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  |||||| ||||    
T  18096861 aacagcgagagagaaagaagagagaacacaaaagaattcgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagctctccgttccact 18096960  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||    
T  18096961 ata-tgatgagtaacgttacaaaagggaaatcaataggttacaa 18097003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41849451 - 41849243
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  41849451 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaa 41849357  T
Q  119 acagcgagaga----aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    ||| |||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  41849356 acaacgagagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcac 41849257  T
Q  215 tatagtgatgagtaa 229  Q
    |||| ||||||||||    
T  41849256 tata-tgatgagtaa 41849243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 18099030 - 18099273
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  18099030 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaacaaaaatcaaagtgtatggaacaattgtaaacacaagccaaaagtagaa 18099127  T
Q  118 aacagc-----gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    |||| |     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |    
T  18099128 aacaacagcgagagagaaagaaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccatattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttcc 18099227  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  18099228 actata-tgatgagtaatgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 18099273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24980104 - 24979869
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa-- 117  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||      
T  24980104 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaa 24980007  T
Q  118 --aacagcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
      |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||    
T  24980006 acaacaacgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttca 24979907  T
Q  214 ctatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaatt 251  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  24979906 ctata-tgatgagtaacgtttacaaaaaagatattaatt 24979869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 53468318 - 53468559
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||   ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||     
T  53468318 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaatgaataatggagcagccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaat 53468415  T
Q  121 agcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacct--ggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||  ||||||||| |||||||||||    
T  53468416 agcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtctggggggtagagcagccctccgtttcact 53468515  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  53468516 ataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 53468559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 9604467 - 9604710
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9604467 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaaccaaaccaaagtgtatgaaacaattataatcacaggccaaaaatagaaa 9604563  T
Q  119 aca---gcgagagaaa----gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgttt 211  Q
    |||   ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |     
T  9604564 acaacagcgagagaaaagaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatc 9604663  T
Q  212 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  9604664 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 9604710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42990698 - 42990467
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  42990698 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgtaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaa 42990603  T
Q  119 aca---gcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    |||   ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  42990602 acaacggcgagaagaaaaggagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgattca 42990503  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  42990502 ccata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 42990467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43226475 - 43226239
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43226475 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaa-gtgtatggaacaattaaaat-acaagccaaaagtagaaa 43226381  T
Q  119 --acagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
      |||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | |||    
T  43226380 caacagcgagagaaaaggaagagagaacacaa--gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccac 43226283  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  43226282 tata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 43226239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 62 - 259
Target Start/End: Original strand, 47701578 - 47701774
Alignment:
Q  62 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 161  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    
T  47701578 tcaagcaacgaaaacaaagtgtatggaacaattatgaacacaagccaaaagtagaaaacaatgagagaaaggaaagagaacgcaaaagaatttgttgatc 47701677  T
Q  162 tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     |||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  47701678 cagttcgatccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 47701774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Original strand, 25688021 - 25688264
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  25688021 tcacaccaataaca--aactttatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattgtaaacacaagccaaaagtagaaa 25688118  T
Q  119 acagc---gagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    ||| |   ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25688119 acatcaacgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaactttttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttca 25688218  T
Q  214 ctatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25688219 ctata-tgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaa 25688264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6232152 - 6231954
Alignment:
Q  62 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--aagaagagagaacacaaaagaatttgttga 159  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6232152 tcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaaataaaaaacagcgagagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttga 6232053  T
Q  160 cctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||||||||||||||||  || | |||||| ||||||| |||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6232052 cccagttcggtccaaattgacctaatcggggggagacagcagccctccg-ttcactgtaatgatgagtagctttacaaaagagatatcaatgggttacaa 6231954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18163060 - 18162817
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18163060 atcacaccaataa--taaatttgatgtgtggagtaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 18162963  T
Q  118 aac---agcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    |||   |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18162962 aactgcagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcg-tccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttc 18162864  T
Q  213 actatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| | ||||||    
T  18162863 actata-tgatgagtaacgtttacaaaataaatatcaatgggttacaa 18162817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 62 - 250
Target Start/End: Original strand, 48361572 - 48361765
Alignment:
Q  62 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa------agaagagagaacacaaaagaatttg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||      |||||||||||||||||||||||||    
T  48361572 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttg 48361671  T
Q  156 ttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||    
T  48361672 ttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgttttactata-ttatgagtaacgttgcaaaagagatgtcaat 48361765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1321878 - 1321633
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1321878 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 1321783  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1321782 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 1321683  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  1321682 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 1321633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 10955886 - 10956121
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10955886 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 10955980  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  10955981 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggtggagagagcagccctccg 10956080  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10956081 ttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 10956121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15781271 - 15781045
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15781271 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaggcaaaataaagtgtatggaacagttataaacacaagtcaaaagtagaaaac 15781174  T
Q  121 agcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca---gccttccgtttcac 214  Q
    | ||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||   ||| | |||| |||    
T  15781173 aacgagagagaaaagaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagcaggcgcccttcgttccac 15781074  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagaga 243  Q
    |||| |||| | |||||||||||||||||    
T  15781073 tataatgataaataactttacaaaagaga 15781045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23633819 - 23633619
Alignment:
Q  45 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaaca 143  Q
    |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  23633819 tgtgaagcaagtgaaaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaat--ttataaacacaagccacaagtagaaaacatcgagagaaagaaagagagaaca 23633722  T
Q  144 caaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 243  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23633721 caaaagaatttgtttacccatttcggtctaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccttttcactataatgatgagtaactttac-aaagaga 23633624  T
Q  244 tatca 248  Q
    |||||    
T  23633623 tatca 23633619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5900069 - 5899826
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5900069 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 5899974  T
Q  119 acagcg---------agagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 209  Q
    ||| |          ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  5899973 acaacagcagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccga 5899874  T
Q  210 ttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||| ||||||||||| || | ||||||| |||||| | ||||||    
T  5899873 tccactata-tgatgagtaacgttgc-aaagagaaatcaatgggttacaa 5899826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 57 - 259
Target Start/End: Original strand, 47148794 - 47148998
Alignment:
Q  57 gatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatt 153  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||| || ||||    
T  47148794 gataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagagaaaggaagagagaacacagaataatt 47148893  T
Q  154 tgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattga 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |     
T  47148894 tgttgacctagttcgggccaaattgacatagtctgggggagagagcagtcctctgtttcactata-tgatgagtaacgatacaaaagagatatcaatggg 47148992  T
Q  254 ttacaa 259  Q
    ||||||    
T  47148993 ttacaa 47148998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5886596 - 5886381
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886596 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataaacaagcaaccaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 5886501  T
Q  119 acagcgagagaaagaaga---------gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 209  Q
    ||| | | || |||||||         ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  5886500 acaacaacagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccga 5886401  T
Q  210 ttcactatagtgatgagtaac 230  Q
    | ||||||| |||||||||||    
T  5886400 tccactata-tgatgagtaac 5886381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 10958182 - 10958417
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10958182 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 10958276  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  10958277 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 10958376  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||    
T  10958377 ttccactata-tgaagagtaacgttacaaaagagaaatcaat 10958417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 53591559 - 53591341
Alignment:
Q  39 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagag 137  Q
    ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  53591559 ttgatgtgtggaacaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaacaattataaacataagtcaaaagcagaaaacagcgagagaaaagaagag 53591460  T
Q  138 aga--acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 235  Q
    |||  ||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  53591459 agaatacaaaaaaaaaattgttgacctagttcgatccaaattgacctagtctg-gggagagagcatcccttcgtttcactata-tgatgagtaacgttac 53591362  T
Q  236 aaaagagatatcaattgatta 256  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  53591361 aaatgagatatcaatggatta 53591341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 28101880 - 28102105
Alignment:
Q  33 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || |  || ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  28101880 ataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtggatag--caattaaa--cacaacccaaaagtagaaaacagcgagagaga 28101975  T
Q  132 ---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 228  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |  |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||    
T  28101976 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtttggtccaaattgacctagctttggggagagagcagccatccgttccactata-tgataagta 28102074  T
Q  229 actttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28102075 actttacaaaagagatatcaatgggttacaa 28102105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 51726866 - 51727110
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  51726866 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggggcaaga-ataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 51726959  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  51726960 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatcc 51727059  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  51727060 gttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 51727110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25533822 - 25533596
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25533822 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagata-tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 25533729  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    ||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  25533728 acaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgatccactata 25533636  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  25533635 -tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 25533596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 250
Target Start/End: Original strand, 54691460 - 54691668
Alignment:
Q  45 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaagagaga 140  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||| ||||||| |    
T  54691460 tgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaaatgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaaccgagagagaaaggaagagaaa 54691559  T
Q  141 acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaag 240  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  54691560 acataaaagaatttgtcgacctagttcagttcaaattgacatagtctaggggagagagcagccctccgtttaactata-tgatgggtaacgttacaaaag 54691658  T
Q  241 agatatcaat 250  Q
    ||||||||||    
T  54691659 agatatcaat 54691668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Original strand, 5926630 - 5926867
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||| || |||  ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5926630 tcacaccaataaca--aacttcatgtgtgaagtaaggaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtaaggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaa 5926726  T
Q  120 cagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    || ||||||| |   ||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||| ||    
T  5926727 caacgagagagaaaggaaaagagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagtcatccgtttcatta 5926825  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||    
T  5926826 ta-tgatgagtaaccttacaaaagatatataaatgggttacaa 5926867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 249
Target Start/End: Original strand, 10084248 - 10084482
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10084248 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgggacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 10084342  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  10084343 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctccg 10084442  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10084443 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaa 10084482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 28761307 - 28761532
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||    
T  28761307 atcacaccaataa--taatcttgatgtgtggagcaagtgataatcaaacaaccaaaataaagtgtatggaaa--ttataatcacaagc-aaaagtagaaa 28761401  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||| |||||||||           ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  28761402 acaacgagagaaa-----------acaaaagaatttgtttacccagttcgatccaaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcactat 28761490  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28761491 aatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 28761532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11168500 - 11168255
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  11168500 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 11168406  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  11168405 aacaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgaccaagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 11168306  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| || |||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  11168305 gttccaatata-tgataagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 11168255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28181397 - 28181242
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28181397 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaag-gacaatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 28181301  T
Q  119 acagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa 174  Q
    ||||||| ||   |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  28181300 acagcgacagagaaaagaagagagaacacaggagaatttgttgacctagttcggtccaa 28181242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 20 - 166
Target Start/End: Original strand, 880106 - 880251
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||  ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  880106 tcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaagaaaacaaagtgtatgaaacagttataatcacaaaccaaaagtagaaaa 880203  T
Q  120 cagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 166  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  880204 caacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 880251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38890439 - 38890194
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  38890439 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 38890345  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| |||    
T  38890344 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctcc 38890245  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  38890244 gatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 38890194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31151719 - 31151508
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagagaaa-gaa 134  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||  || ||||||||| |||||||||||| |||    
T  31151719 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagt-aagagtagaaaaacagcgagagaaaagaa 31151623  T
Q  135 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 233  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| ||||| | |||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||    
T  31151622 gagagaacacatgagaatttgtttacccagttcagcccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataacaatgagtaacttt 31151523  T
Q  234 acaaaagagatatca 248  Q
    |||||||||||||||    
T  31151522 acaaaagagatatca 31151508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 72 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39715809 - 39715632
Alignment:
Q  72 aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga--gagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttc 167  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39715809 aaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttt 39715710  T
Q  168 ggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||||| ||| || || |  ||| ||||||| || || |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39715709 ggtccaaaatgatctagtat--gggggagagcaaccatctgtttcacta---tgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 39715632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 5522485 - 5522729
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  5522485 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtaagaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaa 5522579  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  5522580 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccctcc 5522679  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  5522680 gatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 5522729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Original strand, 10191171 - 10191397
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10191171 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgggacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 10191265  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  10191266 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaata--atttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttagggagagagcagccctccg 10191363  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 243  Q
     | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10191364 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagaga 10191397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5192049 - 5191807
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5192049 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 5191955  T
Q  119 aca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   |||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || |    
T  5191954 acaatggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagaacagccctctg 5191856  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  5191855 atccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 5191807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25634212 - 25634041
Alignment:
Q  88 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa--gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggt 185  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||    
T  25634212 aacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacaagagtaagaaaggagagaacacacaa-aatttgtttacctagttcggtgcaaattgtcctagt 25634115  T
Q  186 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||  ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25634114 ctggtggagagagcagccattcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaa 25634041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26720928 - 26720711
Alignment:
Q  39 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga-gagaa------- 130  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||           
T  26720928 ttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaagaacgacgagaagaacaca 26720831  T
Q  131 -agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 228  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||    
T  26720830 aagaagagaagaacacaaaagaatttggtgacccagttcggtccaaattgacctaatctaggggagagagcagtcatccgttccactata-tgatgagta 26720732  T
Q  229 actttacaaaagagatatcaa 249  Q
     | |||||||||||| |||||    
T  26720731 tcgttacaaaagagaaatcaa 26720711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Original strand, 7606476 - 7606670
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaacagcgagagaaaga 133  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||||||| |   ||  |||    
T  7606476 aacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaggccaaaaagtagaaaacaac---agcgaga 7606570  T
Q  134 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 233  Q
    |||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||||| ||    
T  7606571 aga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgacgagtaacgtt 7606665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42992606 - 42992433
Alignment:
Q  79 agtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcca 173  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  42992606 agtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaaaaggagagagaacacaaaaaaatttgttgacccagttcggtcca 42992509  T
Q  174 aattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  42992508 aattgacctagtctgggggagagagcagccccccgattcactata-tgatgactaacgttacaaaagagaaatcaat 42992433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3859908 - 3859712
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3859908 tcacaccaataaca---acttgatgtgtggaataagggatagttaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattaaaat-acaagccaaaagtagaaaa 3859813  T
Q  120 cagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatag 219  Q
    || ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || | |||||||     
T  3859812 caacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctacgatccactata- 3859721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25389291 - 25389060
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaaca---gcgagag--- 128  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||   ||||||        
T  25389291 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta-aat-acaagccaaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 25389194  T
Q  129 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 223  Q
        |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  25389193 tacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgat 25389095  T
Q  224 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  25389094 gagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 25389060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 118 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30006137 - 30006004
Alignment:
Q  118 aacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  30006137 aacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctaatctaggggagagagcagccctccgttccact 30006038  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  30006037 ata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 30006004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 561643 - 561871
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| ||||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  561643 atcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagtaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagtagaaa 561736  T
Q  119 acagcgagagaa-agaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctg-agggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    ||| |||||||| |||| ||||||||||   | |||||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| |||    
T  561737 acatcgagagaagagaaagagagaacacgtga-aatttgtttacccggttcggtccaaaactgacctagtctggagggagagagcagcccttcgttccac 561835  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  561836 tataatgatgagtaactttacaaaaaagatatcaat 561871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11170678 - 11170558
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11170678 agaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaa 11170580  T
Q  238 aagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||||| | ||||||    
T  11170579 aagagaaatcaatgggttacaa 11170558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 4103755 - 4103998
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||  |||||||  ||| | |||||||| |||    
T  4103755 atcacaccaataaca--aacttgatgcgtggagcaag-gatagtcaaacaaccgaaaaaaagtgtatggaa--gttataaatacatgtcaaaagtaaaaa 4103849  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  4103850 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccg 4103949  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  4103950 atccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 4103998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 175
Target Start/End: Original strand, 8183035 - 8183154
Alignment:
Q  57 gatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttg 155  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8183035 gatagtcaagcaaccaaaataaggtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaactgcaagagaaaaaaagagagaacacaaaagaatttg 8183134  T
Q  156 ttgacctagttcggtccaaa 175  Q
    |||||| | ||||| |||||    
T  8183135 ttgacccaattcggcccaaa 8183154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 238
Target Start/End: Original strand, 36871185 - 36871384
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aa 134  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||   ||    
T  36871185 acttgatgtgtggagcaaga-ataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagcaaaagatagaaaacagcgagagaaaataaa 36871280  T
Q  135 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 233  Q
    |||||||||||  | |||| ||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  36871281 gagagaacacacga-aattcgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgattaacttt 36871379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Original strand, 22114176 - 22114408
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca----gcgagag-- 128  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||| |    ||||||       
T  22114176 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaaaaaacggcgagaaga 22114273  T
Q  129 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 223  Q
        ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | || || |||||||| || || |||| |||| |||| ||||    
T  22114274 acacaaaaaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttactttgtttgggggagagatcatccctccgattcattata-tgat 22114372  T
Q  224 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  22114373 gagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 22114408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 747157 - 746912
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  747157 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaa 747063  T
Q  118 aaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 206  Q
    ||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||| | ||    
T  747062 aacaactgcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctc 746963  T
Q  207 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  746962 cgatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 746912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 53893913 - 53894105
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  || ||||||||||||||||    
T  53893913 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataattaaataca-aagccaaaagtagaaa 53894008  T
Q  119 a----cagcgagag------aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |    | ||||||       ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  53894009 aacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 53894105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 138 - 218
Target Start/End: Original strand, 35919098 - 35919178
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35919098 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 35919178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 248
Target Start/End: Original strand, 889781 - 889865
Alignment:
Q  163 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 248  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  889781 agttcggtccaaattgacctagtctgcgggagaaatcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatca 889865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25635754 - 25635535
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag- 135  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||| ||||   ||  | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||      
T  25635754 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagtgaaagaaag 25635659  T
Q  136 -agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 234  Q
     ||||||||||  | |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||| | |   ||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  25635658 aagagaacacacga-aatttgtttacgcagtttggtccaaattggcctagccgaggggagagagcaaccctctgtttcaccataatgatgagtaacttta 25635560  T
Q  235 caaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||    
T  25635559 caaaatagatatcaatgggttacaa 25635535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 50494397 - 50494208
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  50494397 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 50494303  T
Q  119 aca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |||   ||||||      ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  50494302 acaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 50494208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 458683 - 458493
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  458683 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaa 458589  T
Q  119 aca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |||   |||||      | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  458588 acaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagcc 458493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 249
Target Start/End: Original strand, 1620332 - 1620554
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||| ||    || ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1620332 atcacaccaataa---aaacttgatatgtggagaaaat--taatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtagaaa 1620422  T
Q  119 acagcgagagaaa-gaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||  ||||| ||| ||| ||||||||||| || | |||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  1620423 accacgagataaaagaatgagagaacacacaa-agtttgttcacctagtttggtccaatactgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccact 1620521  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  1620522 ataatgatgagtaagtttac-aaagagatatcaa 1620554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 456306 - 456116
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  456306 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaa 456212  T
Q  119 aca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |||   |||||      | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  456211 acaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaacccgacctagtctgggggagagagcagcc 456116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 10621386 - 10621632
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtaga 116  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||    
T  10621386 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaaccaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtaga 10621480  T
Q  117 aaaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcctt 205  Q
    |||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  10621481 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccct 10621580  T
Q  206 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  10621581 ccaatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 10621632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 42992780 - 42992610
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||  | | | |||||| |||||    
T  42992780 atcacactaataaca--aacttgatgtgtagagcaagggataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatatatgtcaaaagcagaaa 42992685  T
Q  119 aca---gcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 188  Q
    |||   ||||||   |||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  42992684 acaatggcgagaagaaaaggagagagaatacaaaagaattttttgactcagttcggtccaaattgacctagtctg 42992610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Original strand, 28412892 - 28413080
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||| ||  |||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28412892 cacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagtaaccaaaacaa-gtgtatgaaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaaaac 28412985  T
Q  121 a---gcgagag------aaagaagag--agaacacaaaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |   ||||||       ||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28412986 aacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaaagaaatttgttgacctaattcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 28413080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 53597557 - 53597400
Alignment:
Q  93 ttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa--gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctga 189  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||  | |||| | | ||| | |||||||||| | |||||| || ||     
T  53597557 ttataaacacaagcaaaaa-tagaaaacaacgagagaaagaaaggagagaacacacga-aattagcttacccaattcggtccaatactgacctagtttgt 53597460  T
Q  190 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    ||||||||||| || ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53597459 gggagagagcaaccctccattccactataatgatgagtaactttacaaaagaaatatcaa 53597400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24181660 - 24181534
Alignment:
Q  133 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 231  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||| | |||||||||||  |||||| || ||  ||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24181660 aagagagaacacacga-aatttgtttacccaattcggtccaaaactgacctagtttggaggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaact 24181562  T
Q  232 ttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||    
T  24181561 ttacaaaagaaatatcaatgggttacaa 24181534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 54884367 - 54884308
Alignment:
Q  200 agccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54884367 agccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatagattacaa 54884308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 6065653 - 6065844
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  6065653 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaa 6065747  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaag-aga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    ||||   ||||||       ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||    
T  6065748 aacaacggcgagaagaacacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttctgtccaatctgacctagtctaggggagagagcagcc 6065844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 259
Target Start/End: Original strand, 35917952 - 35918046
Alignment:
Q  163 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  35917952 agttcggtctaaattgaccag-tctgagggagagagcagctctccgttccactata-taatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 35918046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38210769 - 38210580
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||  |||| ||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38210769 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggattatcaaacaaacaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 38210675  T
Q  119 aca---gcgag------agaaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 202  Q
    |||   |||||      | |||||||||  ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||    
T  38210674 acaacggcgagaagaacacaaagaagaggaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagc 38210580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 11170755 - 11170671
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 121  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11170755 aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaca 11170671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 203
Target Start/End: Original strand, 6063317 - 6063494
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag--- 128  Q
    |||||||| |||||| |||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||        
T  6063317 aacttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaa 6063414  T
Q  129 ---aaagaag-aga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
       ||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6063415 cacaaagaaggagaagaacacaaagaaatttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 6063494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 249
Target Start/End: Original strand, 14634393 - 14634535
Alignment:
Q  108 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcctt 205  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | |  | |||||||| ||||||||||||| || | | |||| |||||  |  ||||  |||| |    
T  14634393 aaaagtagaaaat-gcgagagaaagaaagagagaaaatacgaaaatttgtttacctagttcggtctaatactaacctagtctgctgatgagattagccat 14634491  T
Q  206 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14634492 ccgttccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 14634535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29956907 - 29956849
Alignment:
Q  191 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29956907 ggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 29956849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Original strand, 13420222 - 13420280
Alignment:
Q  192 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||||||||  |||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13420222 gagagagcagctctccgttccattataataatgagtaactttacaaaagagatatcaat 13420280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 27420973 - 27420822
Alignment:
Q  88 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtc 186  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| ||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||  |     
T  27420973 aacaattataaacacaagc-aaaagtataaaacaatgagaaaaaga-gagagaacacatg-gaatttgtttacctagttcggtccaaaactgacctacta 27420877  T
Q  187 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaaga 241  Q
    || ||||||||||| |  |  ||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27420876 tgggggagagagcaactctatgttccattataatgatgagtaactttacaaaaga 27420822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 169 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 28181230 - 28181185
Alignment:
Q  169 gtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28181230 gtccaaattgacctagtct-agggagagagcagccttccgtttcact 28181185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 26763313 - 26763205
Alignment:
Q  62 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 161  Q
    |||||||||||||||||  || |||  ||| |||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||  |||    
T  26763313 tcaagcaaccaaaacaatatggatg--acacttataaacataagcaaaaaatagaaaacagcgagagaaag-agagagaacacacaa-aatttgtctacc 26763218  T
Q  162 tagttcggtccaa 174  Q
     |||||| |||||    
T  26763217 cagttcgatccaa 26763205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1674292 - 1674166
Alignment:
Q  86 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacct 182  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||| |||||||||   ||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||||| || | ||||||    
T  1674292 ggaacaattataaacacaagaaaaaattagaaaacatcgagagaaaagaaagagagaatacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaatactgacct 1674194  T
Q  183 ggtctgagggagagagcagccttccgtt 210  Q
     |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  1674193 agtctggtggagagagcagccatccgtt 1674166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 249
Target Start/End: Original strand, 11007545 - 11007617
Alignment:
Q  177 tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||||| ||||  ||||||||| ||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11007545 tgacctagtctaggggagagaggagccccccattccactataatgatgagtaactttacaaaagagatgtcaa 11007617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30236299 - 30236249
Alignment:
Q  147 aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 197  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  30236299 aagaaattgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 30236249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Original strand, 16264354 - 16264403
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  16264354 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 16264403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Original strand, 25795785 - 25795834
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  25795785 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 25795834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Original strand, 32143325 - 32143374
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  32143325 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 32143374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6562028 - 6561964
Alignment:
Q  196 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa-gagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||| |||| | ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6562028 gagcagccctccgctccactataatgatgagttaccttacaaaaagagatatcaatggattacaa 6561964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 104)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 38928044 - 38928273
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38928044 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 38928141  T
Q  119 acagcgaga-gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  38928142 acaacgagataaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttactat 38928241  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38928242 a-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 38928273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 33415354 - 33415593
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33415354 atcacacaaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgggacaattataaacacaagccaaaagtagaa 33415451  T
Q  118 aacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33415452 aacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagcctgagggagagagcagccctccgtttcacta 33415551  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  33415552 ta-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 33415593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16453776 - 16453537
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16453776 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatgaaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 16453679  T
Q  119 acagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||    
T  16453678 acagtgagagaaaagaagagagaacacaaaagaattttttggcgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccatctgtttcactat 16453579  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16453578 aatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 16453537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 22800725 - 22800967
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22800725 atcacaccaataaca--aacttgatgtggggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 22800822  T
Q  119 ---acagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
       |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||    
T  22800823 gcaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttcca 22800922  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22800923 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 22800967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 36921358 - 36921598
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  36921358 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 36921455  T
Q  119 acagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  36921456 acagcaagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttaactagtctgggggagagagcagccatccgttccact 36921555  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36921556 ata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaa 36921598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 22802597 - 22802839
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa- 117  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  22802597 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 22802694  T
Q  118 --aacagcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
      |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | || |||||| ||    
T  22802695 gcaacagcgagagaaaaagaagatagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagaaaccctccgttcca 22802794  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22802795 ctata-tgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaa 22802839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Original strand, 40091281 - 40091520
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40091281 tcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaaagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaataattataaacacaagccaaaagtagaaaa 40091378  T
Q  120 cagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
     ||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||    
T  40091379 tagcaagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcacta 40091478  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40091479 ta-tgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaa 40091520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4215756 - 4215534
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 135  Q
    |||||||| |||| ||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |     
T  4215756 aacttgatgtgtgaagcaaggaataatcaagcaacaaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaactgcgagagaaaagaa 4215657  T
Q  136 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  4215656 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactata-tgatgagtaacgttac 4215558  T
Q  236 aaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  4215557 aaaagagatatcaatgggttacaa 4215534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 17662111 - 17662350
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  17662111 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaccaaagtgtatggaacaattataatcacatgccaaaagtagaaa 17662207  T
Q  119 aca---gcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||    
T  17662208 acaacagcgagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccact 17662307  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  17662308 ata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 17662350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40637545 - 40637302
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtaga 116  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40637545 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtaga 40637449  T
Q  117 aaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgttt 211  Q
    |||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  40637448 aaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgttc 40637349  T
Q  212 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  40637348 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 40637302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 47563225 - 47563009
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  47563225 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacataagccaaaagtagaaaac 47563128  T
Q  121 agcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatag 219  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  47563127 agcgagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcaaggggagagagcagccctccgtttcactata- 47563029  T
Q  220 tgatgagtaactttacaaaa 239  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  47563028 agatgagtaaccttacaaaa 47563009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 36919449 - 36919689
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  36919449 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaa 36919546  T
Q  119 acagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||  || ||||    
T  36919547 acagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccatctattccact 36919646  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36919647 ata-tgatgaataacgttacaaaagagatatcaatggattacaa 36919689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24889265 - 24889033
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24889265 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatctaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaa 24889169  T
Q  119 aca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    |||   ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  24889168 acaacagcgagagaaaaagaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttcca 24889069  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24889068 ctata-tgataagtaacgttacaaaagagatatcaat 24889033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2891760 - 2891519
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  2891760 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaagaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 2891663  T
Q  119 acagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||| ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  || ||||| |||||||||||| | || ||||||||    
T  2891662 acaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaagttgtactagtctgggggagagagcagtcatctgtttcact 2891563  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2891562 ataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 2891519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47275178 - 47274954
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 133  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||  |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  47275178 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaatgaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaatca 47275079  T
Q  134 agag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47275078 agagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactt 47274981  T
Q  233 tacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    
T  47274980 tacaaaagagatatcaatgggttacaa 47274954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36378758 - 36378529
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  36378758 atcacaccaataaaata--cttgatatgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaacaattataaacacaaacgaaaagtagaaa 36378662  T
Q  119 acagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  36378661 acagcaggagaaaagaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 36378562  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36378561 aatgatgagtaacttcacaagagagatatcaat 36378529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 62 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24879419 - 24879217
Alignment:
Q  62 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  24879419 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaagagaatttgt 24879320  T
Q  157 tgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattgatt 255  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||| | ||    
T  24879319 tgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgtgtatcgtttacaaaagagatatcaatgggtt 24879221  T
Q  256 acaa 259  Q
    ||||    
T  24879220 acaa 24879217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 12395712 - 12395950
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  12395712 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagagtatcgaaaaattataaacacatgccaaaagtagaagac 12395809  T
Q  121 agcgaga--gaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    | |||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12395810 aacgagacagaaaggaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactat 12395909  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12395910 a-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 12395950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 12400674 - 12400912
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |||| ||| | |||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  12400674 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagagtatcgaaaaattataaacacatgccaaaagtagaagac 12400771  T
Q  121 agcgaga--gaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    | |||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  12400772 aacgagacagaaaggaagagagaacacaaaagagtttgttgaccctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccccccgtttcactat 12400871  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12400872 a-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 12400912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14633790 - 14633546
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14633790 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaacaaaatgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 14633696  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14633695 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccg 14633596  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  14633595 tttcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaa 14633546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 37312944 - 37313171
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  37312944 atcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcataagccaaaagtagaaa 37313041  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    |||||||||||||           ||||||||||||||||| | | || ||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  37313042 acagcgagagaaa-----------acaaaagaatttgttgatccaatttggtccaaattgacatagtctgggggaaagagcagccctccgttccactata 37313130  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  37313131 atgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaa 37313171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13547621 - 13547391
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13547621 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaa 13547524  T
Q  120 cagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
     | ||||||| |   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13547523 gatcgagagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcacta 13547424  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13547423 ta-tgatgagtaactttacaaaagatatatcaat 13547391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 14787294 - 14787527
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14787294 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 14787391  T
Q  119 ac----agcgagagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg--gagagagcagccttccgttt 211  Q
    ||    || |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  14787392 acaactagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgttt 14787489  T
Q  212 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  14787490 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 14787527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16455694 - 16455478
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  16455694 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcataagctaaaactagaaa 16455597  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    ||||||||||||             || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16455596 acagcgagagaa-------------cacaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactata 16455510  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
     ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16455509 atgacgagtaaccttacaaaagagatatcaat 16455478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5101382 - 5101157
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||    
T  5101382 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggatcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaagggagaaaac 5101285  T
Q  121 agcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagt 220  Q
    | |||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||| |    
T  5101284 accgagaga---------gaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagatagcagccctccgttttactata-t 5101196  T
Q  221 gatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  5101195 gatgagtaaatttacaaaagacatatcaatgggttacaa 5101157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24880883 - 24880679
Alignment:
Q  62 tcaagcaaccaaaaca--aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaattt 154  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  24880883 tcaagcaaccaaaacacaaagtgtacggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaagagaattt 24880784  T
Q  155 gttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattga 253  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |     
T  24880783 gttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgcgtaacgtttacaaaagagatatcaatggg 24880685  T
Q  254 ttacaa 259  Q
    ||||||    
T  24880684 ttacaa 24880679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 48486787 - 48486556
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  || |||||  ||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  48486787 cacaccaataaca--aatttgatgcgtggaacaagcgataatcaagcaactaaaacaaagtgaatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaac 48486690  T
Q  121 agc-----gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    | |     |||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  48486689 aacatcaagagaaaaggaagagaaaacacaaaataatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcact 48486590  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  48486589 ata-tgatgagtaacgttacaaaagagatttcaat 48486556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 5635337 - 5635581
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5635337 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 5635431  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  5635432 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 5635531  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  5635532 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 5635581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36380764 - 36380586
Alignment:
Q  73 aaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtc 171  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
T  36380764 aaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagaaggagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcgctc 36380665  T
Q  172 caaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36380664 caaattgacctagtctgggggagagagcagcactcagttccactataatgatgagtaactttacaaaagatatatcaat 36380586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 37089232 - 37089476
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37089232 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 37089327  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  37089328 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 37089427  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  37089428 ttccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 37089476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 6133302 - 6133098
Alignment:
Q  22 acaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 121  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  6133302 acaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccgaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaaca 6133205  T
Q  122 gcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
     |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| | |||||| |||||||    
T  6133204 acgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcgatccaaattgacctagtctgggtgagagagcagtcatccgttccactata 6133105  T
Q  219 gtgatga 225  Q
     ||||||    
T  6133104 atgatga 6133098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 18409213 - 18409452
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18409213 atcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatcacaagacaaaagtagaaa 18409308  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaa----gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    | ||||||||||| || | | || | ||||     |||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||    
T  18409309 atagcgagagaaaaaaaaaaaaaaaaaaaacacgaaatttgtttacccagttcaatccaaattgacctagtctgagggagagagcaactctctgtttcac 18409408  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18409409 tataatgatgggtaac-ttacaaaagagatatcaatgggttacaa 18409452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27499516 - 27499283
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||   |||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  27499516 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaatgaataaccaagcaaccaaaacaaagtttatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaa 27499419  T
Q  119 acagcgagagaaaga---------agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 209  Q
    ||| ||||||| |||         |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||    
T  27499418 acaacgagagagagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctg-gggaaagagcagcccttcgt 27499320  T
Q  210 ttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 246  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27499319 ttcaatataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 27499283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Original strand, 14789293 - 14789495
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14789293 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 14789390  T
Q  119 ac----agcgagagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg--gagagagcagccttccgttt 211  Q
    ||    || |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  14789391 acaactagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgttt 14789488  T
Q  212 cactata 218  Q
    |||||||    
T  14789489 cactata 14789495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 22046547 - 22046790
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  22046547 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaa 22046641  T
Q  119 acagcga-gagaa--------agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||| ||| |||||        |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22046642 acaacgacgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccg 22046741  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  22046742 atccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 22046790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 8631279 - 8631524
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8631279 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 8631373  T
Q  119 a----cagcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    |    | ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  8631374 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 8631473  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  8631474 gatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 8631524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Original strand, 22044266 - 22044495
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 128  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  22044266 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 22044363  T
Q  129 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 225  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  22044364 aaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 22044462  T
Q  226 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  22044463 gtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 22044495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 24446524 - 24446746
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24446524 cacaccaataaca--aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaac 24446621  T
Q  121 -agcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatag 219  Q
     || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  24446622 aagagaga-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggagagagcagccctccgtttcactata- 24446706  T
Q  220 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24446707 tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaa 24446746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19096338 - 19096111
Alignment:
Q  33 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 132  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||   ||  | ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||     
T  19096338 ataaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacagttataatcacaaac-aaaagtagaaaacaacgagagaaaa 19096243  T
Q  133 ------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 226  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||    
T  19096242 taaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactata-tgataag 19096144  T
Q  227 taactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19096143 taacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 19096111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 41997953 - 41997733
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  41997953 cacaccaataa--taaacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatcacaa-acaaaagtagaaaac 41997859  T
Q  121 agcgagag-aaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    |||||||| |||| ||||||||||  |  | |||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||     
T  41997858 agcgagagcaaagaaagagagaacttatga-aatttgtttatccagttcggtccaaattaacctagtctg-gggagagagcggccctccgtttcactatg 41997761  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatat 246  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  41997760 atgatgagtaactttacaaaagagatat 41997733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19323158 - 19322921
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||| |||    
T  19323158 atcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaactaaaataaagtgtatggaa--gttataaacacgagc-aaaagtataaa 19323064  T
Q  119 acagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||||    
T  19323063 acacctggagaaagaaagagagaacactaaagaatttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcatccctccgttccacta 19322964  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19322963 taatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 19322921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 26085837 - 26086061
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  26085837 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaa 26085931  T
Q  118 aaca---gcgagagaaa------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   |||||| |||      ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26085932 aacaacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccttcc 26086031  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 238  Q
    | | ||||||| ||||||||| | |||||||    
T  26086032 gatccactata-tgatgagtatcgttacaaa 26086061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6765315 - 6765072
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||| |||||||    
T  6765315 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa---ttataaatacaagccaaa-gtagaaa 6765222  T
Q  119 aca---gcgaga-gaa-----agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   |||||| |||     |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||     
T  6765221 acaacggcgagaagaacaccaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcca 6765122  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  6765121 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 6765072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24348673 - 24348446
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||    
T  24348673 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaacta-aat-acaagccaaaaatagaaa 24348579  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    ||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  24348578 acaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatccactata 24348486  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  24348485 -tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 24348446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Original strand, 619320 - 619543
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  619320 cacaccaataa--taaatttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaatacaa-gtggatc--acagttataatcacaagc-aaaagtagaaaac 619413  T
Q  121 agcg--agagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    | |   ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  619414 aacagcagagaagaaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagt-taggggagagagcagtcatccgtttcactata 619512  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  619513 -tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaat 619543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51015715 - 51015504
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  51015715 cacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaac 51015621  T
Q  121 a---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtt 210  Q
    |   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |    
T  51015620 aacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagacctccgat 51015521  T
Q  211 tcactatagtgatgagta 228  Q
     ||||||| |||||||||    
T  51015520 ccactata-tgatgagta 51015504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9148705 - 9148481
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9148705 cacaccaataaca---acttgatgtgtggaacaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaac 9148611  T
Q  121 agcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagt 220  Q
    | ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  9148610 aacg---gtgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-t 9148519  T
Q  221 gatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  9148518 gatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 9148481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 31849459 - 31849703
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  31849459 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 31849553  T
Q  119 a----cagcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    |    | ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  31849554 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 31849653  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  31849654 gatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 31849703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11435427 - 11435183
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  11435427 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 11435333  T
Q  118 aaca---gcgagagaaa------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||  ||      ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||    
T  11435332 aacaatggcgagaagaacacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcc 11435233  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  11435232 gatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 11435183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 2484734 - 2484977
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  2484734 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 2484828  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  2484829 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 2484928  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  2484929 atccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 2484977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 38890094 - 38890331
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||  ||| || |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  38890094 atcacaccaataaaatat--ttgatatgtggagcaaggaataatctagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacacaaggcaaaattagaaa 38890188  T
Q  119 acagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||  |||  |||||||||||||| || ||| ||||    
T  38890189 acagcgagagaaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctaatcttggggagagagcagccctctgttccact 38890287  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38890288 ataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 38890331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 259
Target Start/End: Original strand, 18537360 - 18537580
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 135  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  18537360 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaaac-aaaagtataaaacaacgagagaaagaaag 18537456  T
Q  136 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 234  Q
    ||||||| || || |||||||| ||| ||||||||| |||  ||||||  | || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18537457 agagaacgcacaa-aatttgtttacccagttcggtcaaaaaatgacctattatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaacttta 18537555  T
Q  235 caaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  18537556 caaaagagatatcaatgggttacaa 18537580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12102531 - 12102326
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 136  Q
    ||||||| |||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  12102531 acttgatgtgtggagcaagtaataaccgagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagtaaaaaacagtgagagaaaga-ga 12102436  T
Q  137 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 235  Q
    ||| | || |||   |||||| |||||||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12102435 gagcatacgaaa---tttgtttacctagttcggtccaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac 12102339  T
Q  236 aaaagagatatca 248  Q
    |||||||||||||    
T  12102338 aaaagagatatca 12102326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Original strand, 52942350 - 52942523
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    ||||||| |||||||  || ||||| ||||||| |||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  52942350 atcacacaaataaca--aatttgatgtgtggagtaagagataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 52942447  T
Q  118 aaca---gcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 188  Q
    ||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  52942448 aacaacagcgagaggaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctg 52942523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 238
Target Start/End: Original strand, 11008430 - 11008652
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa- 119  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||     
T  11008430 cacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagcaaaaagtagaaaaa 11008524  T
Q  120 ---cagcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 209  Q
       | ||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||      
T  11008525 caacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaa 11008624  T
Q  210 ttcactatagtgatgagtaactttacaaa 238  Q
    | ||||||| ||||||||| | |||||||    
T  11008625 tccactata-tgatgagtaccattacaaa 11008652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 195
Target Start/End: Original strand, 3937146 - 3937316
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |  || |||||||| | |||||||||||    
T  3937146 atcacaccaataaca---acttgatgtgaggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaaga--taaaatcacaaac-aaaagtagaaa 3937238  T
Q  119 acagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggaga 195  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  3937239 acaacgagagaaagaaagagagaacacaaatgaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtctgagggaga 3937316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7941781 - 7941551
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 128  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||||||||||||   ||||||         
T  7941781 aacttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatga-aat-acaaggcaaaagtagaaaacaatggcgagaagaac 7941684  T
Q  129 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 225  Q
      |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||    
T  7941683 acaaagaagaaaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatga 7941585  T
Q  226 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  7941584 gtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 7941551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11437835 - 11437591
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  11437835 atcacaccaataaca---acttgatgtatggagcaagagataatcaagcagccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 11437741  T
Q  118 aaca---gcgagagaaa------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||  ||      ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||    
T  11437740 aacaacggcgagaagaacacaaggaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcc 11437641  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  11437640 gatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 11437591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 86 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25358042 - 25357879
Alignment:
Q  86 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctgg 184  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||| | |||||| |    
T  25358042 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaagagagaacacacaaaaatttgtttacccagttaggtccaatactgacctag 25357944  T
Q  185 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25357943 tctaggggagagagcagctatccgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 25357879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30136996 - 30136789
Alignment:
Q  39 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aaga 136  Q
    |||||||||||| ||||  ||| |||| ||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||   ||||    
T  30136996 ttgatatgtggaacaagtaataatcaaacaaccaaat-aaagtgtatagaa--gttataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacaagagaaaagaaaga 30136900  T
Q  137 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 236  Q
    ||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||| || |   ||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30136899 gagaacacaaaagaatttgtttatccaattcggtccaaattgacctagtattgaggagagagcagccatctgtttcactataatgatgattaactttaca 30136800  T
Q  237 aaagagatatc 247  Q
    |||||||||||    
T  30136799 aaagagatatc 30136789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 11006116 - 11006341
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||     
T  11006116 cacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagcaaaaagtagaaaa- 11006209  T
Q  121 agcgagagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatag 219  Q
          | || |  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||     
T  11006210 ------acaacggcgagaagaacacaaaagaatttgttaacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata- 11006302  T
Q  220 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  11006303 tgatgagtaccattac-aaagagaaatcaatgggttacaa 11006341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Original strand, 18534703 - 18534938
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  18534703 tcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaacacaa-acaaaagtagaaaa 18534797  T
Q  120 cagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc-aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
     |||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||| ||| | |||| ||||| ||| ||||||| || |||||| ||||||    
T  18534798 tagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttaccctgttcggtccaaaacttacctagtctgggggggagagcacccctccgttccactat 18534896  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | |||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18534897 aattatgagtagttttacaaaagagatatcaatgggttacaa 18534938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5198862 - 5198648
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 135  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||       | || |  |    
T  5198862 aacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaa-------acaacggcg 5198772  T
Q  136 aga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||    
T  5198771 agaagaacacaaaagaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgtta 5198673  T
Q  235 caaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||    
T  5198672 caaaagagaaatcaatgggttacaa 5198648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 62 - 249
Target Start/End: Original strand, 3982087 - 3982272
Alignment:
Q  62 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 161  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||  |||||||||| ||||| | ||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||| |||    
T  3982087 tcaagcaaccaaaaaaaagtgggtg--acagttataaacacaaacaaacgatagaaaacagcgagagaaaga-gagagaacacatgaaaaattgtttacc 3982183  T
Q  162 tagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    | ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3982184 ttgttcggtccaatagtgacctagtatgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 3982272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38409674 - 38409433
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  38409674 cacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaactaaaacaaattgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaac 38409580  T
Q  121 a---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtt 210  Q
    |   ||||||       |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| |    
T  38409579 aacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaactcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgat 38409480  T
Q  211 tcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  38409479 ccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 38409433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47868874 - 47868629
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  47868874 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaataa-aat-acaagccaaaagtagaa 47868780  T
Q  118 aacagcg---------agagaaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    |||| ||         | | ||||||||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||    
T  47868779 aacaacggtgagaagaacacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatcc 47868680  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  47868679 gttccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 47868629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 49089024 - 49088816
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  49089024 atcacaccaataaca--aacttgatgtgttgagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 49088927  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||| |||||||| |             |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||   || ||||||||||    
T  49088926 acaacgagagaacg------------caaagaatttgttgacccagttcggcccaaattgacctagtctggggggagagagtagttctctgtttcactat 49088839  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaaga 241  Q
    | |||||| |||| ||||||||||    
T  49088838 a-tgatgactaacattacaaaaga 49088816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 173
Target Start/End: Original strand, 3824469 - 3824630
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagcc-aaaagtag- 115  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  3824469 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaaatgtatggaacagttataaacacaagccaaaaagtaga 3824566  T
Q  116 aaaacagc------gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcca 173  Q
    ||||||||       ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3824567 aaaacagcagcaagaagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 3824630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 53405606 - 53405363
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  53405606 atcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaaa 53405511  T
Q  119 acagcg---------agagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||| ||         | | ||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||  || |    
T  53405510 acatcggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtct--gggggagagcagctctctg 53405413  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||| | ||||||    
T  53405412 ttccactata-tgatgagtatcgtttcaaaagagaaatcaatgggttacaa 53405363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 250
Target Start/End: Original strand, 8756138 - 8756348
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 135  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  8756138 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtaaaaaacaacgagagaaagaaag 8756233  T
Q  136 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 234  Q
    |||||||||| || |||||||| ||| |||||| ||||||   ||||| |||||  |||||||||| || |||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  8756234 agagaacacacaa-aatttgtttacccagttcgctccaaaaccgacctagtctggaggagagagcaaccatccgttccactataatgattagtaacttta 8756332  T
Q  235 caaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||||||||||||    
T  8756333 caaaagagatatcaat 8756348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 56030925 - 56030815
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  56030925 atcacaccaataa--taaacttgatatgtggagcaagagatagtcacgcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaatacaa-acaaaagtagaaa 56030831  T
Q  119 acagcgagagaaagaa 134  Q
    ||||||||||||||||    
T  56030830 acagcgagagaaagaa 56030815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18847624 - 18847382
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  18847624 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaataatta-aat-acaagccaaaaagtagaa 18847531  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||       |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  18847530 aacaacggcgagaagaacacaaagaacagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctcc 18847432  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
      | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  18847431 aatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 18847382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 9176334 - 9176578
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa- 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||     
T  9176334 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 9176428  T
Q  118 ---aacagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
       ||| |||||      | ||||||||| | ||||||||  |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  9176429 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaataacacaaagaaatttgttgactctgttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 9176528  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
      | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  9176529 aatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 9176578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 22134477 - 22134721
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagt-agaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  22134477 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtaagaa 22134571  T
Q  118 ----aacagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 206  Q
        ||| |||||      | ||||||||| |||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  22134572 aaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaagacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctc 22134670  T
Q  207 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  22134671 caatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 22134721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 36 - 238
Target Start/End: Original strand, 9174020 - 9174230
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa----aacagcgag----- 126  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| |||||||||||||||||    ||| |||||         
T  9174020 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacggcgagaagaa 9174117  T
Q  127 -agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 224  Q
     | ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||  | ||||||| |||||    
T  9174118 cacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggcagagaacagccctccaatccactata-tgatg 9174216  T
Q  225 agtaactttacaaa 238  Q
    |||| | |||||||    
T  9174217 agtaccgttacaaa 9174230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Original strand, 16185770 - 16185920
Alignment:
Q  89 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga--aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggt 185  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||    
T  16185770 acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagaaacaaaaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagt 16185867  T
Q  186 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 238  Q
    ||| |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16185868 ctgggggagagagcagccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaa 16185920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 16931651 - 16931839
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   |||| || ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16931651 atcacaccaataaca---acttaatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 16931745  T
Q  119 aca---gcgaga-----gaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |||   ||||||      ||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16931746 acaacggcgagaagaacaaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 16931839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Original strand, 47210657 - 47210754
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47210657 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataataaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 47210751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 15032413 - 15032654
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| || ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || || | |||||||||||    
T  15032413 atcacaccaataaaata--cttgatgtgcggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacataaac-aaaagtagaaa 15032506  T
Q  119 a-cagcgagagaaagaa-----gagagaacacaaaagaatttgttgacc-tagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtt 210  Q
    | |||||||||||||||     || ||||||||  | |||||||  ||| ||||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||  | ||||    
T  15032507 aacagcgagagaaagaaagaaagaaagaacacacga-aatttgtataccctagttcggtccaatactgacctagtttgggggagagagcagctcttcgtt 15032605  T
Q  211 tcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15032606 ccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 15032654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 28454109 - 28453920
Alignment:
Q  62 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-----gagagaacacaaaagaatttgt 156  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||     |||||||||||  | |||||||    
T  28454109 tcaagaaaccaaaacaaagtggatg--acaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaaccggagaaagaaagaaagagagaacacacga-aatttgt 28454014  T
Q  157 tgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    | ||| |||||||||||| | | |||| ||||| ||||||||| ||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28454013 ttacccagttcggtccaatactaacctagtctgggggagagagtagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 28453920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Original strand, 18709026 - 18709212
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18709026 cacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggcataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaatagtagaaaac 18709120  T
Q  121 a---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcag 201  Q
    |   |||||      | ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||    
T  18709121 aacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcag 18709212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 22132249 - 22132496
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagt-aga 116  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||    
T  22132249 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtaaga 22132343  T
Q  117 a----aacagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaag-aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 204  Q
    |    ||| |||||      | ||||||||| |||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||     
T  22132344 aaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaagaccaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccc 22132443  T
Q  205 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  22132444 tccaatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 22132496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 37 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 9864160 - 9863945
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa--tcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-a 133  Q
    ||||||| ||||||  || | ||| ||||| |||||||| ||||||   |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  9864160 acttgatgtgtggaagaaaaaataatcaagaaaccaaaataaagtg---ggaacagttataaaatcacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 9864065  T
Q  134 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtct--gagggagagagcagccttccgtttcactata---gtgatgagt 227  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||| | ||||  | |||||||||||||  |||||| |||||||    ||||||||    
T  9864064 agagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacttagtctgggggggagagagcagctctccgttccactataatgatgatgagt 9863966  T
Q  228 aactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  9863965 aactttac-aaagagatatcaa 9863945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 5664703 - 5664605
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| ||||||| | |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5664703 atcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagaaggtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatgacaaaccaaaagtagaaa 5664608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 26557922 - 26557823
Alignment:
Q  150 aatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 248  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26557922 aatttgtttacctagttcggtccaatactgacttagtctgggggagagagcagctctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatca 26557824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 86 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 22295565 - 22295412
Alignment:
Q  86 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 183  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| ||||| |||||| | || |||     
T  22295565 ggaacaattataaacacaagc-aaaggtagaaaacagcgagagaaaggaagagagaacacatga-aatttgtttacccagttcagtccaatactgcccta 22295468  T
Q  184 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 239  Q
    || || |||||||||||    ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22295467 gtgtgggggagagagcaattctccattccactataatgatgagtaactttacaaaa 22295412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 22782597 - 22782842
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  22782597 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaa 22782691  T
Q  118 aaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 206  Q
    ||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  22782692 aacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 22782791  T
Q  207 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  22782792 caatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 22782842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 44599700 - 44599888
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  44599700 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaag-gataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaaggcaaaagtagaaa 44599793  T
Q  119 aca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |||   ||||||      ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44599794 acaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 44599888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 173 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13544272 - 13544187
Alignment:
Q  173 aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||| ||||| |  |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13544272 aaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 13544187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10114737 - 10114565
Alignment:
Q  64 aagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacct 162  Q
    |||||||||||||||||||  ||  | |||||||| ||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||    
T  10114737 aagcaaccaaaacaaagtgggtg--atagttataaacacaaga-aaaggtagataacaacgagagaaagaaagagagaacacatga-aatttgtttacct 10114642  T
Q  163 agttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 238  Q
    | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  | ||||  |||||| |||||||| | ||||||||    
T  10114641 aattcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcgttcaactataatgatgagttaatttacaaa 10114565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 249
Target Start/End: Original strand, 47150826 - 47150989
Alignment:
Q  86 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 183  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| | |||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||     
T  47150826 ggaacaattataaacacaaac-aaaagtagaagacaacgagagaaagaaagagagaacacaaga-aattagtttacccaattcggtccaatattgaccta 47150923  T
Q  184 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    ||||  |||||| | || |  || ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47150924 gtctaggggagataacatctatctgttccactataatgatgagcaactttagaaaagagatatcaa 47150989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 259
Target Start/End: Original strand, 47210762 - 47210857
Alignment:
Q  163 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  47210762 agttcggtccaaattgatctagtttgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 47210857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 203
Target Start/End: Original strand, 16934118 - 16934193
Alignment:
Q  129 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16934118 aaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 16934193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 22780232 - 22780477
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||  ||  |||||||  | |||||||||||||||    
T  22780232 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagcgtatcaaa--gttataaatataagccaaaagtagaa 22780326  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 206  Q
    ||||   ||||||       ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  22780327 aacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 22780426  T
Q  207 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  22780427 caatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 22780477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 249
Target Start/End: Original strand, 31983564 - 31983623
Alignment:
Q  190 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  31983564 gggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaaaagatatcaa 31983623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 246
Target Start/End: Original strand, 54928700 - 54928741
Alignment:
Q  205 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 246  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54928700 tccgttccactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 54928741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 98
Target Start/End: Original strand, 38270016 - 38270088
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataa 98  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  38270016 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaa---gtatggaacaattataa 38270088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9022602 - 9022543
Alignment:
Q  190 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9022602 gggagagagcagccctttgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaat 9022543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10113331 - 10113108
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||   ||||| |||||||||| |  || |||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| ||||||| ||||||||| |    
T  10113331 atcacaccaataaaatat--ttgatgtgtggagcaaaa--taatcaagcaaccaaaacaaagtgggtg--acatttataaacacaagc-aaaagtagata 10113239  T
Q  119 acagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    |||  |||||| |||| || ||||||||  | | ||| || ||| |||||||||||| | | |||| ||||  |||||||||||||  ||| || |||||    
T  10113238 acattgagagagagaaagaaagaacacatga-attttttttacccagttcggtccaatactaacctagtcttggggagagagcagctctccattccacta 10113140  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    || |||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  10113139 taatgattagtaacattac-aaagagatatcaa 10113108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 249
Target Start/End: Original strand, 40998990 - 40999045
Alignment:
Q  194 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    ||||||| || || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40998990 gagagcatccctctgttccactataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 40999045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 249
Target Start/End: Original strand, 3578632 - 3578766
Alignment:
Q  108 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttc 206  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   ||| |||| |||   |||||| ||| ||||||||| || | || ||| ||||| |||||||| ||||  ||    
T  3578632 aaaagtagaaaacaacgagagaaaga---gagtacacgaaa---tttgtttacccagttcggtctaatactggcctagtctgggggagaga-cagctctc 3578724  T
Q  207 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3578725 cattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 3578766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5269284 - 5269234
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  5269284 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcc 5269234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 142
Target Start/End: Original strand, 52043497 - 52043550
Alignment:
Q  89 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaac 142  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52043497 acagttataaacacaagc-aaacgtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaac 52043550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Original strand, 5143263 - 5143312
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||||||||||||    
T  5143263 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagc 5143312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 90)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 44725000 - 44724763
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacag-ttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44725000 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacatattataaacacaagccaaaagtagaaaa 44724903  T
Q  120 cagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44724902 caacgagagaaatgaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 44724803  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  44724802 -tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 44724763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 13099337 - 13099581
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13099337 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatcgtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 13099434  T
Q  119 aca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    |||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  13099435 acaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttca 13099534  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttac-aaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  13099535 ctataatgatgagtaactttacaaaaagagatatcaatgggttacaa 13099581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 31434913 - 31435152
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31434913 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaatcaaaataaagtgtaaggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 31435010  T
Q  119 acagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  31435011 acaacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttccactat 31435110  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  31435111 aatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 31435152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 42330878 - 42331102
Alignment:
Q  33 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 132  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  42330878 ataaacttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaga- 42330976  T
Q  133 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||||||    
T  42330977 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagaatagccctccgtttcactata-taatgagtaactt 42331075  T
Q  233 tacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    
T  42331076 tacaaaagagatatcaatgggttacaa 42331102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 444021 - 443779
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  444021 tcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtattgaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaa 443924  T
Q  120 cagcgagag-----aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc-tgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    |||||||||     || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| | |||||||    
T  443923 cagcgagagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcgggggggagagagcagcccttcgtttca 443824  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  443823 ctata-tgatgagtaacgttataaaagagatatcaatggattacaa 443779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22394120 - 22393906
Alignment:
Q  44 atgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaac 142  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22394120 atgtggagcaagtgatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaaccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaaagagagaac 22394023  T
Q  143 acaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagag 242  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22394022 acaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagaacaaccctccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagag 22393923  T
Q  243 atatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||| | ||||||    
T  22393922 atatcaatgggttacaa 22393906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Original strand, 21592023 - 21592239
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aa 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  21592023 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaa-aaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaaa 21592121  T
Q  132 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  21592122 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacg 21592220  T
Q  232 ttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  21592221 ttacaaaagagatgtcaat 21592239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 27306096 - 27306326
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa- 117  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  27306096 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagaagaaa 27306193  T
Q  118 --aacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||    
T  27306194 acaacagcgagagaaaagaagagagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccac 27306291  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27306292 tata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaat 27306326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24749012 - 24748778
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  24749012 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaaac 24748918  T
Q  121 agcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatag 219  Q
    | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||     
T  24748917 aacgagagaaataaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctaatctggaggagagagcagccctccgtttcactataa 24748818  T
Q  220 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24748817 tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 24748778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21990563 - 21990343
Alignment:
Q  33 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 131  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  21990563 ataaacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagcaaacagcgagagaga 21990464  T
Q  132 ---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 228  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||    
T  21990463 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtcttggggagagagcagccctctgttccactata-tgatgagta 21990365  T
Q  229 actttacaaaagagatatcaat 250  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  21990364 acgttacaaaagagatatcaat 21990343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 4295801 - 4296030
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  4295801 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaatcatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaataataaacacaagccaaaagtagaaa 4295898  T
Q  119 acagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| || ||||||||||    
T  4295899 atggcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttcacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagatagcagccctctgtttcactat 4295998  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  4295999 a-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 4296030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9679482 - 9679243
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  9679482 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaa 9679385  T
Q  120 cagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    |||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |  |||||||||   ||||||||||||    
T  9679384 cagcgagagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtctggtccaaattgacctagtctgggaaagagagcagtactccgtttcacta 9679285  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9679284 ta-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 9679243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20626461 - 20626222
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||    
T  20626461 atcacaccaataaca---acctgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaatataagccaaaagtagaaa 20626367  T
Q  119 aca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    |||   ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||    
T  20626366 acaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 20626267  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  20626266 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 20626222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20630352 - 20630113
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||    
T  20630352 atcacaccaataaca---acctgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaatataagccaaaagtagaaa 20630258  T
Q  119 aca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    |||   ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||    
T  20630257 acaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 20630158  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  20630157 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 20630113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20642771 - 20642532
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||    
T  20642771 atcacaccaataaca---acctgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaatataagccaaaagtagaaa 20642677  T
Q  119 aca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    |||   ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||    
T  20642676 acaacagcgagagaaaaagatgagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 20642577  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  20642576 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 20642532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 20 - 250
Target Start/End: Original strand, 37411988 - 37412223
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37411988 tcacaccaataaca--aacttgatgtgtggaacaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaactagaaaa 37412085  T
Q  120 cagcgagagaa------agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    || ||||||||      ||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||| ||    
T  37412086 caacgagagaaaagaagagaagggagaacacaaaagaatttattgatccagttcggtccaaattgacccagtctaggggagagagcagccatccgttcca 37412185  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttac-aaaagagatatcaat 250  Q
    ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  37412186 ctataatgatgagtaaccttacaaaaagagatatcaat 37412223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42223578 - 42223351
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  42223578 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtataaaacaattataaacacaaggcaaaagtagaaaac 42223481  T
Q  121 agcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatag 219  Q
    |  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| || || |||||||||||||| ||| ||||||||||     
T  42223480 aatgagagaaaagaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcgatcaaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccatttcactata- 42223382  T
Q  220 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42223381 tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaat 42223351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 106 - 259
Target Start/End: Original strand, 20137061 - 20137214
Alignment:
Q  106 ccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  20137061 ccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccc 20137159  T
Q  205 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20137160 tccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 20137214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9681243 - 9681013
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||| | |  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9681243 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggaacaagtgataattagacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaa 9681146  T
Q  120 cagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
     | ||||||| |   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  9681145 gatcgagagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttattgacctagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccatttcacta 9681046  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9681045 ta-tgatgagtaactttacaaaagatatatcaat 9681013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21678486 - 21678250
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21678486 atcacaccgataaca--aacttgatttgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtaaggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 21678389  T
Q  119 acagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  21678388 acagcgggagaaaagaagagagaacac--aagaatttgttgtcccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagcccactgtttcactat 21678291  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | |||| |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||    
T  21678290 a-tgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaa 21678250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 48458081 - 48457837
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  48458081 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaa 48457987  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  48457986 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 48457887  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  48457886 ttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 48457837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Original strand, 39145865 - 39146083
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 131  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||   ||     
T  39145865 aaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaagcaaccaaaacaaattgtattaaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacgagagagaaag 39145964  T
Q  132 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |  || | |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||     
T  39145965 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtacaaattgacctagtttagggaaaagagcagccccccgtttcactataatgatgagtaacc 39146064  T
Q  232 ttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39146065 ttacaaaagagatatcaat 39146083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38394414 - 38394170
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38394414 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 38394320  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  38394319 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 38394220  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  38394219 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 38394170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21680450 - 21680222
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  | |||||| |||| ||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21680450 cacaccaataaca--agcttgatgtgtgaagcaaggaataatcatgcaacaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaac 21680353  T
Q  121 agcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc---tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  || |||||||||    
T  21680352 aacgagagaaaagaagagagaacaaaaaagtatttgttgacccagcagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagctctctgtttcacta 21680253  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 248  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21680252 ta-tgatgagtaaccttacaaaagagatatca 21680222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20299888 - 20299644
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20299888 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 20299794  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  20299793 acaactgcgagaagaacacaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctccg 20299694  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  20299693 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 20299644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 7471841 - 7472085
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7471841 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 7471935  T
Q  119 acagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||| ||         | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7471936 acaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccg 7472035  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  7472036 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 7472085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 7092073 - 7092317
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  7092073 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaataaagtgtgtggaacaatta-aat-ataagtcaaaagtagaaa 7092168  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7092169 acaatggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccg 7092267  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  7092268 attcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaa 7092317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 27832508 - 27832738
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || ||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27832508 atcataccaataaca--aacttaatgtgtggagcaggaaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaaccaaaagtagaaa 27832603  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||| |||||     |||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  27832604 acagtgagagaaagaa-agagataacacaagaatttgtttacccagttc-----aaattgacctagtctgggggagagagaagccctccatttcactata 27832697  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  27832698 atgatgagtaactttacagaagagatatcaatgggttacaa 27832738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11355684 - 11355451
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  11355684 atcacaccaataa--taaatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 11355587  T
Q  118 aacagcgagagaaagaag----agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    |||| | ||||| |||||    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||  || ||| ||    
T  11355586 aacaacaagagagagaagtaagagagaacataaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctaggggagagagcagctctctgttcca 11355487  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  11355486 ctata-tgatgagaaacgttacaaaaaagatatcaat 11355451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18345955 - 18345725
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 128  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  18345955 aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 18345858  T
Q  129 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 225  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  18345857 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacagccctccgatccactata-tgatga 18345759  T
Q  226 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  18345758 gtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 18345725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 26804935 - 26804764
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa- 117  Q
    |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||     
T  26804935 atcacaccaataaca--aatttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaa 26804838  T
Q  118 --aacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctg 188  Q
      |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  26804837 acaacatcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctg 26804764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 44992 - 44748
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||    
T  44992 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaatggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagcaaaaagtagaaa 44898  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||  ||||    
T  44897 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagaaagcagctatccg 44798  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  44797 ttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 44748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20297790 - 20297546
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20297790 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 20297696  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       ||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||     
T  20297695 acaacggcgagaagaacacaaagaggagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcca 20297596  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  20297595 atccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 20297546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 26295850 - 26295631
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 136  Q
    ||||||| | ||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  26295850 acttgatgtatggagcacgtgataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatgaaaa--ttataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgaaagaaagaa-a 26295754  T
Q  137 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 236  Q
    ||||  ||| ||||||||||| | | ||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26295753 gagataacacaagaatttgtttatccagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagcagtcatctgtttcactataatgatgagtaactttaca 26295654  T
Q  237 aaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||| | ||||||    
T  26295653 aaagagatatcaatgggttacaa 26295631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 7094320 - 7094565
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  7094320 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggcatagtcaagcaaccaaaataaagtgtgtggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaa 7094415  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  7094416 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 7094515  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  7094516 attcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaa 7094565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1850409 - 1850165
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1850409 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 1850315  T
Q  119 acagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||| |          | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  1850314 acaacagtgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccg 1850215  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  1850214 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 1850165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28485993 - 28485750
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28485993 atcacaccaataaca---acttgatatgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaaatgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 28485899  T
Q  119 acagcg---------agagaaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||| ||         | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || |    
T  28485898 acaacggatagaagaacacaaagaagagaataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctga-ggagagagcaaccctctg 28485800  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  28485799 attcattata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatggattacaa 28485750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 43253377 - 43253613
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  43253377 atcacaccaataaca---atttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaa 43253471  T
Q  119 a----cagcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    |    ||||||||       |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  43253472 aacaacagcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtctaaattgacctagtctgagggagagagcagccctct 43253571  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  43253572 gatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaat 43253613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3036152 - 3035908
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3036152 atcacaccaataaca---atttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 3036058  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||     
T  3036057 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaggaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcca 3035958  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||| | ||||||    
T  3035957 atccactata-tgatgagtatcgttgcaaaagagaaatcaatgggttacaa 3035908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7188942 - 7188732
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaga 136  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |    
T  7188942 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaa 7188846  T
Q  137 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 235  Q
    ||||||||  || |||||||| ||||||||| |||||||  |||| | | ||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  7188845 gagaacacgcaa-aatttgtttacctagttcagtccaaaactgacatagactggggaagagagcagccttccgttccactataatgatgaataactttac 7188747  T
Q  236 aaaagagatatcaat 250  Q
    |||||| ||||||||    
T  7188746 aaaagaaatatcaat 7188732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 40836604 - 40836847
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40836604 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 40836698  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  40836699 acaacggcgagaagaacaaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 40836798  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  40836799 atccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 40836847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24465955 - 24465730
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24465955 atcacaccaataa--taaatttgatgtgtggaacaagtgatattcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaaccaaaagtagaaa 24465860  T
Q  119 acagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| |   |||||||| ||  |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||| |  |||||||| ||    
T  24465859 acagcgagagaaaagaaagagagaacacga---aatttgtttactcagttcggttcatattgatctagtctgggggagagagcagtcacccgtttcatta 24465763  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    || |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24465762 taatgatgagt-actttacaaaagacatatcaat 24465730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28487981 - 28487737
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  28487981 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaa 28487887  T
Q  119 acagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||| ||         | | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || || |    
T  28487886 acaacggctagaagaacacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcaaccctctg 28487787  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  28487786 attcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 28487737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36057 - 35813
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||    
T  36057 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaaaccaaaagtagaaa 35963  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||  ||||    
T  35962 acaatggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaaaaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagaaagcagctctccg 35863  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  35862 ttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 35813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 22251452 - 22251605
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22251452 cacaccaataaca--aacttgatgtgttgagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaac 22251549  T
Q  121 agc--gagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcca 173  Q
    |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22251550 agcaagagagaaaggaagatagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcca 22251605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11759555 - 11759369
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11759555 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 11759461  T
Q  119 aca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca 200  Q
    |||   |||||      | |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11759460 acaacggcgagaagaacacaaaggagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagca 11759369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 7469884 - 7470127
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   | ||||| ||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7469884 atcacaccaataaca---atttgatgtgtggagcagg-gataatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 7469977  T
Q  119 acagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||| ||         | | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  7469978 acaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagggagcagccctccg 7470077  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  7470078 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 7470127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40946744 - 40946512
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca-----gcgagag-- 128  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||| |     ||||||       
T  40946744 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaaatagaaaaaaaaacggcgagaaga 40946647  T
Q  129 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 223  Q
        |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || | ||||||| ||||    
T  40946646 acacaaagaaaagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactata-tgat 40946548  T
Q  224 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  40946547 gagtaacgttacaaaagagaaatcaataggttacaa 40946512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3878993 - 3878761
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaag-tgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa----cagcgagag-- 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||    | ||||||       
T  3878993 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaaaatgtatggaacaatta-aat-acaaaccaaaagtagaaaaacaacggcgagaaga 3878896  T
Q  129 ----aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 223  Q
        |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||    
T  3878895 acacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacatagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgat 3878797  T
Q  224 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  3878796 gagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 3878761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38397067 - 38396819
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38397067 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataataaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 38396973  T
Q  119 aca--------gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    | |        ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38396972 aaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagaagcc 38396873  T
Q  204 ttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     |||| | ||||||| ||||||||||  |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  38396872 ctccgatccactata-tgatgagtaaagttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 38396819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25542956 - 25542713
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25542956 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaaatgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 25542862  T
Q  119 acagcg---------agagaaagaagagagaa-cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||| ||         | | |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||  ||||    
T  25542861 acaacggtgagaagaacacaaagaagagaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattaacctagtctaggggagagagcagctctccg 25542762  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  25542761 atccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 25542713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24258781 - 24258647
Alignment:
Q  129 aaagaagagagaacacaaaagaattt-gttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact---atagtgatg 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||| ||||   ||| |||||    
T  24258781 aaagaagagagaacacaaaagaattttgttcatctaattcggtccaaattgacctagtctgaaagagagagcagccctccgttccactataataatgatg 24258682  T
Q  225 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24258681 agtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 24258647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6332574 - 6332417
Alignment:
Q  87 gaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggt 185  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||    
T  6332574 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaatagcgacagaaaga-gagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagt 6332478  T
Q  186 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 246  Q
    ||  |||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6332477 ctaggggagagaacagtcttccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatat 6332417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 107 - 259
Target Start/End: Original strand, 24813450 - 24813604
Alignment:
Q  107 caaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||||    
T  24813450 caaaagtagaaaacaacgagagaaaaggaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagaaagcagcc 24813548  T
Q  204 ttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     |||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||    
T  24813549 atccgctccactataatgatgagtaactttacaaaggagatataaatgggttacaa 24813604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11081842 - 11081703
Alignment:
Q  112 gtagaaaacagcgagag--aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||    
T  11081842 gtagaaaacagcgagaggaaaaaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatattgacctagtctgggggagagagcaaccatccg 11081744  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    || || | ||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11081743 ttccattttaaagatgagtaactttacacaagagatatcaa 11081703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 140 - 259
Target Start/End: Original strand, 1049283 - 1049400
Alignment:
Q  140 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| |||    
T  1049283 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagtatcgttac-aaa 1049380  T
Q  240 gagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| |||||| | ||||||    
T  1049381 gagaaatcaatgggttacaa 1049400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1606807 - 1606564
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1606807 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 1606713  T
Q  119 aca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||      ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1606712 acaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgatctagtctgggggagagagcagccctccg 1606613  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  1606612 atccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 1606564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 246
Target Start/End: Original strand, 16296934 - 16297115
Alignment:
Q  62 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 161  Q
    |||||||||||||||||||||  ||  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||     
T  16296934 tcaagcaaccaaaacaaagtggctg--acaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacgacgagagaaaga-gagagaacacacggaaatttgtttaca 16297029  T
Q  162 tagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 246  Q
     |||||||||||| | |||| | ||||  |||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  16297030 cagttcggtccaatactgacatagtctaggggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaactttgcaaaagagatat 16297115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 1046778 - 1047029
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgta-tggaacagttataatcacaagccaaaa--gt 113  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||  ||    
T  1046778 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtaatggaa--gttataaatacaagccaaaaaggt 1046872  T
Q  114 agaaaaca-----gcgagag------aaagaagagagaa--cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca 200  Q
    |||||| |     ||||||       |||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  1046873 agaaaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaaaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtgtgggggagagagca 1046972  T
Q  201 gccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| |||  | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  1046973 gccctccaatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 1047029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Original strand, 9027054 - 9027151
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9027054 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaa 9027148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2935697 - 2935453
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||| |||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  2935697 atcacaccaataaca---acttgatgtgtgaagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaaagtagaa 2935603  T
Q  118 aaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||      ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  2935602 aacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcc 2935503  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  2935502 gatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 2935453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 7351512 - 7351702
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7351512 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaa 7351606  T
Q  119 aca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |||   |||||      | ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| || || ||||||||||||||    
T  7351607 acaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagcc 7351702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 88 - 250
Target Start/End: Original strand, 24817287 - 24817450
Alignment:
Q  88 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctgg 184  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||||   |||| ||||||||  | || | ||| ||| |||||||||||||  |||||| |    
T  24817287 aacagttataaacacaaac-aaaattagaaaacaacgagagaaaagaaagacagaacacacga-aactcgtttaccaagttcggtccaaaactgacctag 24817384  T
Q  185 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    | || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24817385 tatgggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagacatcaat 24817450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 108 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25276465 - 25276325
Alignment:
Q  108 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 206  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||| | ||||| |||||           |    
T  25276465 aaaagtagaaaacaacgagagaaaaaaagagagaacacaaaagaatttgtttaaccagttcggtccatattgacttagtctg-gggag-----------c 25276378  T
Q  207 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25276377 cgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggtttacaa 25276325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22108370 - 22108251
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  22108370 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 22108273  T
Q  238 aagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||||| | ||||||    
T  22108272 aagagaaatcaatgggttacaa 22108251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22137381 - 22137262
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  22137381 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 22137284  T
Q  238 aagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||||| | ||||||    
T  22137283 aagagaaatcaatgggttacaa 22137262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40550130 - 40550011
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  40550130 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 40550033  T
Q  238 aagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||||| | ||||||    
T  40550032 aagagaaatcaatgggttacaa 40550011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40552408 - 40552289
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  40552408 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 40552311  T
Q  238 aagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||||| | ||||||    
T  40552310 aagagaaatcaatgggttacaa 40552289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6349191 - 6349097
Alignment:
Q  47 tggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaaca 143  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6349191 tggagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtacgga--agttataaacacaag-caaaagtagaaaatagcgagagaaagaaagagagaaca 6349097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Original strand, 31155896 - 31156015
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | |||||||| |||||||| | |||| |    
T  31155896 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactatag-gatgagtaccgttac-a 31155993  T
Q  238 aagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||||| | ||||||    
T  31155994 aagagaaatcaatgggttacaa 31156015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 259
Target Start/End: Original strand, 20091584 - 20091650
Alignment:
Q  190 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20091584 gggagagagcagccctccgttccactat---gatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 20091650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 22828672 - 22828738
Alignment:
Q  193 agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22828672 agagagcagccctctgtttcactataataatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaa 22828738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 111
Target Start/End: Original strand, 1049151 - 1049239
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc--aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa 111  Q
    ||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||    
T  1049151 tcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaa 1049239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Original strand, 9027179 - 9027298
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  9027179 agaacacatagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 9027276  T
Q  238 aagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||||| | ||||||    
T  9027277 aagagaaatcaatgggttacaa 9027298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 249
Target Start/End: Original strand, 22280379 - 22280434
Alignment:
Q  194 gagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  22280379 gagagcagctttctgtttcactataatgatcaataactttacaaaagagatatcaa 22280434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Original strand, 7349138 - 7349228
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagta 114  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  7349138 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaagggataattaagcaaccaaaataaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagta 7349228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6046772 - 6046688
Alignment:
Q  165 ttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  | | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6046772 ttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagctcttcattccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 6046688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 249
Target Start/End: Original strand, 13290454 - 13290569
Alignment:
Q  133 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 231  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||  ||||||||||||| | |||  || ||| | ||||| ||||||||||||    
T  13290454 aagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgaccaagtctgagggagagtgtagctctctgttccgctataatgatgagtaact 13290552  T
Q  232 ttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||| |||||||||||||    
T  13290553 ttac-aaagagatatcaa 13290569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22137507 - 22137439
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 89  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22137507 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 22137439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 40552534 - 40552466
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 89  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40552534 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 40552466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 248
Target Start/End: Original strand, 6067183 - 6067294
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttaca 236  Q
    ||||||| | |||||||||| ||| ||| |||||||| | |||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  ||||       
T  6067183 agaacacgagagaatttgtttacccagtccggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagctctccgtttcactataatgacgagttccttttac 6067282  T
Q  237 aaagagatatca 248  Q
    ||||||||||||    
T  6067283 aaagagatatca 6067294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6349021 - 6348966
Alignment:
Q  204 ttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6349021 ttccgttccactgtaatgatgagtaattttacaaaagagatatcaatgggttacaa 6348966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 75
Target Start/End: Original strand, 20137024 - 20137066
Alignment:
Q  33 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa 75  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20137024 ataaatttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaa 20137066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Original strand, 40281316 - 40281468
Alignment:
Q  88 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctgg 184  Q
    |||| ||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||||   ||||||||||||| || |||||||| ||  ||||| |||||| | ||| || |    
T  40281316 aacaattataaatacaagcaaaaattagaaaacagctagagaaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacacagttctgtccaatactgaactag 40281414  T
Q  185 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 238  Q
    |||| ||||||||||| || | |||| ||| | |  ||||||||||||||||||    
T  40281415 tctgggggagagagcatcccttcgttccacaacaacgatgagtaactttacaaa 40281468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 1502835 - 1502883
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaac 70  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1502835 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaac 1502883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 147 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2075303 - 2075226
Alignment:
Q  147 aagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 223  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||   |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  2075303 aagaatttgtttacccagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctttccgttccactataatgat 2075226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9190101 - 9190052
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  9190101 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagc 9190052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 40550257 - 40550189
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 89  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  40550257 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 40550189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 197
Target Start/End: Original strand, 12097867 - 12097911
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  12097867 ttgttgacctagttcggtccaacttgacctaatctgggggagaga 12097911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 131
Target Start/End: Original strand, 20091041 - 20091132
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaa-acaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 131  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  20091041 acttgatgtgttgagcaagtaataatcaagcaaccagatacaaagtgtatggaa--gttataa-cacaagt-aaaagtagaaaacaacgagagaaa 20091132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 48 - 259
Target Start/End: Original strand, 22407346 - 22407559
Alignment:
Q  48 ggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacac 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |   |||||||||||||    
T  22407346 ggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacatcgagagagaaaggaagagagaacac 22407445  T
Q  145 aaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagat 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22407446 aaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagat 22407544  T
Q  245 atcaattgattacaa 259  Q
    |||||| | ||||||    
T  22407545 atcaatgggttacaa 22407559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19008030 - 19007790
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19008030 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 19007933  T
Q  119 acagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||| ||||||| |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  19007932 acaacgagagagaaatgaatagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgtttcact 19007833  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  19007832 ata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 19007790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14837659 - 14837426
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  14837659 atcacatcaataaca-atacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataaacacaagccaaaagtataaa 14837561  T
Q  119 acagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  14837560 acagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcatccatccgtttcact 14837461  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14837460 ataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 14837426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Original strand, 6258696 - 6258922
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||   ||     
T  6258696 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtctggaacaattataaacacaagctaaaagtagaaaacagcgagagagaaag 6258795  T
Q  132 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  6258796 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggagagagcagccctccgtttcactataataatgagtaact 6258894  T
Q  232 ttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6258895 ttacaaaagagatatcaatgggttacaa 6258922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Original strand, 6264027 - 6264254
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| |       
T  6264027 aaacttgatgtgtggagcaagtgactatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattattaacacaagccgaaagtagaaaacaacgagagagaaag 6264126  T
Q  132 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6264127 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgagtaact 6264226  T
Q  232 ttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6264227 ttacaaaagagatatcaatgggttacaa 6264254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 42923373 - 42923614
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  42923373 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaa 42923470  T
Q  120 cagcgagaga-----aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    || |||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||||    
T  42923471 caacgagagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtataggggagagagcagccctccgtttcac 42923570  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42923571 tata-tgacgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaa 42923614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28197025 - 28196787
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28197025 atcacaccaataaca--aatttgatgtgtggagcaagggatagtccagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 28196928  T
Q  119 acagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  28196927 acagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtc--aattgacctagtctgggggagagagcagccattcgtttcact 28196830  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  28196829 ata-tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 28196787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 259
Target Start/End: Original strand, 28459073 - 28459295
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aag 135  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  28459073 acttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacagggagagaaagaaag 28459172  T
Q  136 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 235  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||     
T  28459173 agagaacacaaaagaatttgtttatctagttcgatccaaattgacctagtct-aggtagagagaagccctccgtttcactataatgatgagtaactttaa 28459271  T
Q  236 aaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  28459272 aaaagagatatcaatgggttacaa 28459295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 22287203 - 22287431
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||| |||| |||||||||    
T  22287203 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacatagtgtatggaacaattataaaaacaagtcaaacgtagaaaac 22287300  T
Q  121 agcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22287301 agcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccatttcactat 22287400  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22287401 a-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaa 22287431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17849507 - 17849267
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  17849507 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattttaaacacaagccaaaagtagaaa 17849410  T
Q  119 aca--gcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    |||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||||||    
T  17849409 acaacgggagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagtcttgtccaaattgacctagtatgtgggagagagcagcc-cccgtttcact 17849311  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17849310 ataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 17849267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 39 - 243
Target Start/End: Original strand, 22162907 - 22163111
Alignment:
Q  39 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagag 137  Q
    ||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22162907 ttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaattgtatggaacagttataagcacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagag 22163006  T
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22163007 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaa 22163105  T
Q  238 aagaga 243  Q
    ||||||    
T  22163106 aagaga 22163111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 43623443 - 43623685
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  43623443 atcacaccaataact--aacttgatgtgtggagcaatagataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaattataatcataagccaaaagtagaa 43623540  T
Q  118 aaca---gcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    ||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||    
T  43623541 aacaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgttcca 43623640  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  43623641 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 43623685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 21520556 - 21520798
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21520556 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaattaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaa 21520653  T
Q  120 cagc-----gagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    || |     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21520654 caacagcgagagagaaacgaagagagaacacaaaagaatttgttgacaaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttca 21520753  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21520754 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 21520798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3022562 - 3022362
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  3022562 atcacacaaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagcagaaa 3022465  T
Q  119 acagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  3022464 acaacgagagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcatt 3022365  T
Q  216 ata 218  Q
    |||    
T  3022364 ata 3022362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Original strand, 5375224 - 5375451
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagaga---a 130  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| |||| |||| |||||   |    
T  5375224 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagtcaaaagtaaaaaaacagcaagagagaaa 5375323  T
Q  131 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||     
T  5375324 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaat 5375422  T
Q  231 tttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  5375423 gttacaaaagagatatcaatgggttacaa 5375451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 22707618 - 22707858
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  || ||||| ||||||| |||  | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||||||||||    
T  22707618 cacaccaataaca--aatttgatgtgtggagtaaggaacaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaggcagaagtagaaaac 22707715  T
Q  121 agcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagg-gagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  22707716 agcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcagtccaaattgacctagtctggaggagagagagcagccctctgtttcact 22707815  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22707816 ata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 22707858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 36 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17848814 - 17848599
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 133  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17848814 aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaatcgcagtgtatgaaacaattataaacgcaaacaaaaagtagaaaacagcgagagaaaaga 17848715  T
Q  134 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  17848714 agagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgatgagtaacgtt 17848616  T
Q  234 acaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  17848615 acaaaagagatatcaat 17848599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 259
Target Start/End: Original strand, 31732666 - 31732882
Alignment:
Q  39 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga 138  Q
    ||||| |||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  31732666 ttgatgtgtgaagcaagttataatcaagcaaccaaaacagagtgtatggaa--gttataatcacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagataga 31732763  T
Q  139 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 238  Q
    |||||||   ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  31732764 gaacacac--gaatttgtttacccagctcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcacaataatgatgagtaactttacaaa 31732861  T
Q  239 agagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||| | ||||||    
T  31732862 agagatatcaatgggttacaa 31732882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 71 - 249
Target Start/End: Original strand, 44288982 - 44289163
Alignment:
Q  71 caaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttc 167  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44288982 caaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaacagtagaaaacagcgagagagaaatgaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttc 44289081  T
Q  168 ggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    ||||||||||||||| || || |||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44289082 ggtccaaattgacctagtttgggggaaagagcaaccatctgtttcactataatgatgagtaatcttacaaaagagatatcaa 44289163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 45279862 - 45280089
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  45279862 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 45279956  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    ||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  45279957 acaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata 45280049  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  45280050 -tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 45280089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 243
Target Start/End: Original strand, 40031968 - 40032143
Alignment:
Q  72 aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 166  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40031968 aaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagc-aaatgtagaaaacaacagcgagagaaaaggaagagagaatacaaaagaatttgttgacccagtt 40032066  T
Q  167 cggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40032067 cggtccaaattgacctagtctgagggagagagcggccctccgtttcactataatgatgagtaactttgcaaaagaga 40032143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27105192 - 27104948
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||    
T  27105192 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aatg-caagccaaaagtagaaa 27105097  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27105096 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 27104997  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||  |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  27104996 atccactata-tgatgagtaatgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 27104948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Original strand, 7462824 - 7463044
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa---aacagcgagagaa- 130  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||     
T  7462824 aaacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaa 7462923  T
Q  131 -agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc-aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 228  Q
     ||||||||||||||||     ||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| | ||| |||    
T  7462924 gagaagagagaacacaatttttttttttgacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-taatgggta 7463022  T
Q  229 actttacaaaagagatatcaat 250  Q
    || |||||||||||| ||||||    
T  7463023 acgttacaaaagagaaatcaat 7463044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 255
Target Start/End: Original strand, 11739441 - 11739661
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||||||          
T  11739441 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtagagcaagggatagtcaagaaataaaaacaaagtgtatgaaacaattataaatacaagtcaaaagg----- 11739533  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||    
T  11739534 ---------gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccactata 11739624  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgatt 255  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  11739625 atgatgagtaacctttcaaaagagatatcaatggatt 11739661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 68 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23871161 - 23870966
Alignment:
Q  68 aaccaaaacaaagtgtatggaa--cagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg--agagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacct 162  Q
    ||||||||||||||||||| ||  || |||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23871161 aaccaaaacaaagtgtatgaaaaacaattataaacacaaggcaaaagtagaaaacagcgggagagaaatgaagagagaactcaaaagaatttgttgacct 23871062  T
Q  163 agttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| | |||||||||||||  ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||||||    
T  23871061 agtttgatccaaattgacctaatctaagggagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaaccttactaaagagatattaatgggttacaa 23870966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 23452097 - 23452342
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||    
T  23452097 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagctaaaagtagaa 23452191  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  23452192 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 23452291  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
      | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  23452292 aatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 23452342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 45238862 - 45239082
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatgg-aacagttataatcacaagccaaaagtaga 116  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45238862 atcacaccaataa--taaacttgatgtgtggaccaagcgatagtcaagcaaccaaaatcgaagtggatatcaacagttataatcacaagccaaaagtaga 45238959  T
Q  117 aaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||                    ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45238960 aaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaaaaatttgttgaccta--------------------gtctgggggagagagcagccctccgtttcact 45239039  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  45239040 ata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 45239082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 34979456 - 34979684
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||    
T  34979456 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaaggaataataaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacataagtcaaaagtagaaaac 34979553  T
Q  121 agcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatag 219  Q
    ||||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || | | ||| ||||| |||| | |||| |||||||     
T  34979554 agcgagag---------agaacacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacctagtttggggggggagagtagcccttcgttccactataa 34979644  T
Q  220 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34979645 tgatgaggaaccttacaaaagagatataaatggattacaa 34979684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 228
Target Start/End: Original strand, 13909907 - 13910119
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13909907 tcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaa 13910001  T
Q  120 ca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 209  Q
    ||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |     
T  13910002 caacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctga 13910101  T
Q  210 ttcactatagtgatgagta 228  Q
    | ||||||| |||||||||    
T  13910102 tccactata-tgatgagta 13910119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Original strand, 15539396 - 15539553
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15539396 tcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaag-gattatcaagcaatcaaaacaaagtgtattgaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaaa 15539492  T
Q  120 cagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt 177  Q
    || ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15539493 caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatt 15539553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Original strand, 11577991 - 11578205
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 134  Q
    ||||||||| |||||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11577991 aaacttgatgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaaataaagtatatggaa--gtt-taaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 11578087  T
Q  135 gagagaacacaaaagaa-tttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 232  Q
     |||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||  ||| || ||||| |||| ||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||| |    
T  11578088 aagagaaaacacacgaaatttgtttacctagttcggtctaaaactgatctagtctgggggaaagagcagccctccgttcgactataatgatgagtaacct 11578187  T
Q  233 tacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11578188 tacaaaagagatatcaat 11578205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 91 - 259
Target Start/End: Original strand, 18800251 - 18800419
Alignment:
Q  91 agttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctg 188  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  ||||||||||||    
T  18800251 agttataatcgcaagc-aaaagtagaaaacagcagaagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagtttggtccaaaactgacctggtctg 18800349  T
Q  189 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18800350 -gggagagagtagccctccgtttcactataatgacgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 18800419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22874499 - 22874280
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||                   |    
T  22874499 atcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaactaaaacaaagtgtatggaa--gttataa-------------------a 22874423  T
Q  119 acagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    ||| |||||||||   |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  || |||||||||    
T  22874422 acaacgagagaaaagaaagagagaacacaagagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtatgagggagagagcagctctcagtttcacta 22874323  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  22874322 taatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 22874280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 37 - 249
Target Start/End: Original strand, 17897134 - 17897341
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 135  Q
    ||||||| |||||||||| |  || ||||||||||||||||||||  |||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |    
T  17897134 acttgatgtgtggagcaaaa--taatcaagcaaccaaaacaaagttgatg--acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaaag 17897228  T
Q  136 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 234  Q
    ||||||||||  | |||||||| ||| ||||||| |||| | |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17897229 agagaacacacga-aatttgtttacccagttcggaccaatactgacctagtctg-gggagagagcagccatccgttctactataatgatgagtaacttta 17897326  T
Q  235 caaaagagatatcaa 249  Q
    ||||| |||||||||    
T  17897327 caaaatagatatcaa 17897341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 24162084 - 24162327
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24162084 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagaaagagataatcaagcaaccaaaaaaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 24162178  T
Q  119 aca---gcgagagaaa------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   |||||| |||      ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||     
T  24162179 acaacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtccgggggagagagcagccatcca 24162278  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  24162279 atccactata-tgatgagtagcattac-aaagagaaatcaatgggttacaa 24162327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 42064878 - 42064695
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaag 135  Q
    |||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||| ||   | ||||||    
T  42064878 aacttgatgtgtggagcaagggatgatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagcaaaaagtagaaaacaacg---gcaagaag 42064784  T
Q  136 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 228  Q
    |    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||    
T  42064783 a----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaatttgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagta 42064695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 42453050 - 42452931
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  42453050 agaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtaacgttacaa 42452953  T
Q  238 aagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||||| | ||||||    
T  42452952 aagagaaatcaatgggttacaa 42452931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 259
Target Start/End: Original strand, 19501986 - 19502116
Alignment:
Q  129 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | || | ||||||| ||||||||    
T  19501986 aaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcccttcgatccactata-tgatgagt 19502084  T
Q  228 aactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  19502085 atcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 19502116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 259
Target Start/End: Original strand, 19504321 - 19504451
Alignment:
Q  129 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||| ||||||||    
T  19504321 aaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagatagcagccctccgatccactata-tgatgagt 19504419  T
Q  228 aactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  19504420 atcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 19504451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 86 - 249
Target Start/End: Original strand, 20146540 - 20146704
Alignment:
Q  86 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacct 182  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||||||| ||||  | |||| ||| ||| |||||||||||| | |||| |    
T  20146540 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagagagatcacacga-aattcgtttacccagttcggtccaatactgactt 20146637  T
Q  183 ggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20146638 agtctgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 20146704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38020470 - 38020360
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  || ||||| | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  38020470 atcacaccaataaca--aatttgatgtatggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagctaaaagtagaaa 38020373  T
Q  119 acagcgagagaaa 131  Q
    ||||||| |||||    
T  38020372 acagcgaaagaaa 38020360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40699697 - 40699524
Alignment:
Q  87 gaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac-agcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 183  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| || | ||||||     
T  40699697 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaaatagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacctagttcggtctaatactgaccta 40699600  T
Q  184 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| |||| |||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  40699599 gtctgggggaaagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaaaggattacaa 40699524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 35217830 - 35218013
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  35217830 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaataatta-aat-acaagtcaaaagtagaaa 35217924  T
Q  119 aca---gcgagagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |||   ||||||  || || || ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35217925 acaacggcgagaagaacaaaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 35218013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Original strand, 36558755 - 36558968
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaaaacagc-gagagaaaga 133  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||| |||||||||| | | |||||       
T  36558755 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acgagccaaaaagtagaaaacaactgcgagaa--- 36558849  T
Q  134 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 233  Q
         ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| ||    
T  36558850 -----gaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgtt 36558943  T
Q  234 acaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||| |||||| | ||||||    
T  36558944 ac-aaagagaaatcaatgggttacaa 36558968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 36561001 - 36561245
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||||    
T  36561001 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acgagccaaaaagtagaa 36561095  T
Q  118 aaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  36561096 aacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcc 36561195  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  36561196 gatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 36561245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20592463 - 20592288
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||  | |||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20592463 atcacaccaataaaata--cgtgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataatcacaag-caaaagtagaaa 20592369  T
Q  119 acagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagag 198  Q
    | | | |||||||| |||||||||||||  | |||||||| | | | |||||||||| | |||||| ||||| |||||||||    
T  20592368 atatcaagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttatccaattcggtccaatactgacctagtctgggggagagag 20592288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35107590 - 35107458
Alignment:
Q  116 aaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||||| |  ||||| || || |||||| |    
T  35107590 aaaacagcgagagaaaagaaagagagaacacaaaaatatttgtttacctatttcggtccaatactgacctagtctgggaaagagaacaaccatccgttcc 35107491  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaagagata 245  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35107490 actataatgatgagtaacattacaaaagagata 35107458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 119
Target Start/End: Original strand, 19501862 - 19501958
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  19501862 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaa 19501956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 35215453 - 35215636
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||| || | ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  35215453 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcatatgaaataatta-aat-acaagtcaaaagtagaaa 35215547  T
Q  119 aca---gcgagagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |||   ||||||  || || ||| |||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35215548 acaacggcgagaagaacaaaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 35215636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Original strand, 19504197 - 19504291
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  19504197 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaa 19504291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 45332040 - 45332285
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  45332040 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggaacaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtttgtaacaatta-aat-acaagccaaaaagtagaa 45332134  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 206  Q
    ||||   ||||||       ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  45332135 aacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctc 45332234  T
Q  207 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |  ||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  45332235 caattcactata-tgatgagtacctttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 45332285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 239
Target Start/End: Original strand, 37962823 - 37963027
Alignment:
Q  33 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 132  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||| | ||| || ||||||| ||||||| |||  |||||||||||||   |||||||||||||| |  ||||||     
T  37962823 ataaacttgatgtgtggagtaagtgataattaagtaatcaaaacagagtgtatagaa--gttataatcacaaat-aaaagtagaaaacaacttgagaaaa 37962919  T
Q  133 --aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 230  Q
      || ||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||||||||| |||| || || | |||||| ||| |  | ||||||||||| |||||| ||||    
T  37962920 gaaaaagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattaacctagtgtgggagagagatcagtccactgtttcactataatgatgaataac 37963018  T
Q  231 tttacaaaa 239  Q
    |||||||||    
T  37963019 tttacaaaa 37963027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 42453871 - 42453802
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaaca 91  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  42453871 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaaatgtatggaaca 42453802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 129
Target Start/End: Original strand, 38414071 - 38414155
Alignment:
Q  45 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 129  Q
    ||||||||| | |||| | | ||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  38414071 tgtggagcacgtgataattaggcaacgaaaacaaagtgtatggaataattataaacacaaggtaaaagtagaaaacaacgagaga 38414155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17921996 - 17921871
Alignment:
Q  108 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttc 206  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |  | |||||||| || || ||||||| || | |||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  17921996 aaaagtaaaaaacagtgagagaaaga-gagagaacatacgaaaatttgtttacttaattcggtcaaatactgacctagtctg-ggtagagagcagccctc 17921899  T
Q  207 cgtttcactatagtgatgagtaacttta 234  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  17921898 cgttccactataatgatgactaacttta 17921871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20589895 - 20589850
Alignment:
Q  205 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20589895 tccgttacactataatgatgagtaacttcacaaaagagatatcaat 20589850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15694108 - 15694064
Alignment:
Q  205 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15694108 tccgttccactaaaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 15694064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 33604140 - 33604092
Alignment:
Q  190 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 238  Q
    |||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33604140 gggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 33604092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 39287361 - 39287262
Alignment:
Q  141 acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 239  Q
    |||||||| || ||||| | | |||| ||||||| | |||||| || ||||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  39287361 acacaaaataacttgtttaacaagtttggtccaacactgacctagtatgagggagagagcagctcttcgttccactataatgatgagtaattttacaaaa 39287262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 249
Target Start/End: Original strand, 13828338 - 13828438
Alignment:
Q  150 aatttgttgacctagttcggtcca-aattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 248  Q
    |||||||| | | ||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||   | ||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13828338 aatttgtttatccagttcggtccagaactgacctagtctaggggagagagtagctaactgttccactataattatgagtaattttacaaaagagatatca 13828437  T
Q  249 a 249  Q
    |    
T  13828438 a 13828438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 197
Target Start/End: Original strand, 17057369 - 17057413
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 197  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  17057369 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17057413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 197
Target Start/End: Original strand, 17085352 - 17085396
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 197  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  17085352 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctagtctgggggagaga 17085396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17943723 - 17943631
Alignment:
Q  147 aagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||   |||||| ||||| |||||||||||||  || | | ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  17943723 aagaatttgtttacctagttcggtctaatgatgacctagtctgggggagagagcagctctctgatccactataatgatgagtttctttacaaa 17943631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 87)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2724307 - 2724067
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  2724307 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtatagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 2724210  T
Q  119 acagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  2724209 acagcgaaagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcact 2724110  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  2724109 ata-tgatgagtaatcttacaaaagagatatcaatgggttacaa 2724067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 249
Target Start/End: Original strand, 18511076 - 18511307
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  18511076 atcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaactaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaa 18511173  T
Q  119 aca---gcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18511174 acaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgtttcac 18511273  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18511274 tata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 18511307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 40221943 - 40221696
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  40221943 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaaggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 40221846  T
Q  119 acagcgagagaaaga---------agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 209  Q
    ||||||||||| |||         ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  40221845 acagcgagagagagagagaaaggaagagagagcacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgt 40221746  T
Q  210 ttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40221745 tccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 40221696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36208975 - 36208750
Alignment:
Q  33 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag 132  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36208975 ataaacttgatgtgtagagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaag 36208876  T
Q  133 -aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 231  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  36208875 aaagagagaa-acaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggaaagagcagcccgccgtttcactataatgatgagtaact 36208778  T
Q  232 ttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  36208777 ttacaaaagagatatcaatgggttacaa 36208750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 10474200 - 10474428
Alignment:
Q  33 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa- 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| |     
T  10474200 ataaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcgaaaagtagaaattagcgagagagaa 10474299  T
Q  132 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 229  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10474300 aggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccatccgtttcactata-tgatgagtaa 10474398  T
Q  230 ctttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  10474399 ccttagaaaagagatatcaatgggttacaa 10474428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 249
Target Start/End: Original strand, 18509201 - 18509413
Alignment:
Q  40 tgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa-gaag 135  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  18509201 tgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagaag 18509300  T
Q  136 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18509301 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggttcaaattgacctagtctaggggagagagcagcccaccgtttcactata-tgatgagtaactttac 18509399  T
Q  236 aaaagagatatcaa 249  Q
    |||| |||||||||    
T  18509400 aaaatagatatcaa 18509413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 41585600 - 41585840
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41585600 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggggcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 41585697  T
Q  119 acagcgagaga------aaga------agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 206  Q
    ||| |||||||      ||||      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  41585698 acaacgagagagaaaagaagatagaacagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctc 41585797  T
Q  207 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41585798 cgtttcactata-tgatgagtaacattacaaaagagatatcaat 41585840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 37 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 696273 - 696051
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaa-ccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa- 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||||||||     
T  696273 acttgatgtgtggagcaagagataatcaagaaaaccaaaataaagtgtatggaacagttataaacacaaac-aaaagtagaaaacaac-agagaaagaaa 696176  T
Q  135 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  696175 gagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgtttcactataatgatgaataacttta 696076  T
Q  235 caaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  696075 caaaagagatatcaatgggttacaa 696051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21289173 - 21288953
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||    
T  21289173 atcacaccaatatca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaagaataataaacacaagccaaaagtagaaa 21289076  T
Q  119 acagcgagagaa-agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21289075 acaacgagagaacaaaagagagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcactat 21288976  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaaga 241  Q
    |  |||||||||| ||||||||||    
T  21288975 a-agatgagtaacgttacaaaaga 21288953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39854901 - 39854657
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  39854901 atcacaccaataa--taaacttgatatgtggagcaagggatagttaagcaaccaaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaaaa 39854804  T
Q  118 aaca---gcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgttt 211  Q
    ||||   ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |     
T  39854803 aacaacagcgagagaaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgatctagtctgggggagagagcagccctccgatc 39854704  T
Q  212 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  39854703 cactata-tgatgagtagcgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 39854657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26098127 - 26097915
Alignment:
Q  39 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgag--agaaa-gaag 135  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  26098127 ttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacactagccaaaagtagaaaacagcgagatagaaaggaag 26098028  T
Q  136 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  26098027 agagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctagtctggaggagagagcagcc-tctgttccactata-tgatgagtaacgttac 26097930  T
Q  236 aaaagagatatcaat 250  Q
    |||||||||||||||    
T  26097929 aaaagagatatcaat 26097915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Original strand, 1189486 - 1189714
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 131  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||     
T  1189486 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagccaccaaaacaaaatgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaactgcgagagagaaag 1189585  T
Q  132 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgag-ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || |||||| ||||||| | |||||||||    
T  1189586 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggaggagagagcatccctccgttccactataattatgagtaac 1189685  T
Q  231 tttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1189686 cttacaaaagagatatcaatggattacaa 1189714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6756905 - 6756675
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6756905 cacaccaataaca-aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaatcaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaac 6756807  T
Q  121 agcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | |||||||||||    
T  6756806 agcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccct-cgtttcactat 6756708  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    
T  6756707 aatgatgtgtaaccttacaaaaaagatatcaat 6756675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18597059 - 18596828
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||| |||  || |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  18597059 atcacaccaataaca--aacttgatgtatggagcaagtgataatcagacatccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaa 18596962  T
Q  119 acagcgagagaaa-gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||||    
T  18596961 acagcgagagaaaagaagagtcgaacacaaaagaatctgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccatccgttccacta 18596862  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18596861 taatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 18596828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 33 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25904505 - 25904286
Alignment:
Q  33 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa- 131  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |     
T  25904505 ataaatttgatgtgtggtgcaagggatagtcaagcaatgaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacagcgagagagaa 25904406  T
Q  132 --gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaa 229  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||    
T  25904405 aggaagagagaacacaaaataatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgtttcactata-tgataagtaa 25904307  T
Q  230 ctttacaaaagagatatcaat 250  Q
    | |||||| ||||||||||||    
T  25904306 cgttacaatagagatatcaat 25904286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 36402190 - 36402433
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  36402190 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatagaacaattataaacacaagctaaaagtagaa 36402287  T
Q  118 aaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    ||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||    
T  36402288 aacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcgatctaaattgacctagtctgggggagagagcagacatctgtttc 36402387  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36402388 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatggattacaa 36402433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 658223 - 658458
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| | |||| || ||||||||||||||||    
T  658223 atcacaccaataaca--aatttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtacggaacaataataaacataagccaaaagtagaaa 658320  T
Q  119 acagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||    
T  658321 acagcaagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct---ggggagagcagccatccgtttcactat 658417  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  658418 a-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 658458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Original strand, 2818199 - 2818431
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2818199 cacaccaataaca--aacttgatgtatggagcaagggataatcaggcatccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaa 2818296  T
Q  120 ca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    ||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  2818297 caacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagtcctccgtttcac 2818396  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  2818397 tata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 2818431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 17818357 - 17818595
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  17818357 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaac 17818454  T
Q  121 agcgagagaaagaag-----agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||| || ||| ||||    
T  17818455 agcgagagagagaaaggaaaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagaga--agccctctgttccact 17818552  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17818553 gta-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 17818595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Original strand, 20505709 - 20505937
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  20505709 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaaccaaaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaactagaa 20505806  T
Q  118 aacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20505807 aacaacgagagaaaataagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--gggggagagcagccctccgtttcacta 20505904  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20505905 ta-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaat 20505937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21948446 - 21948210
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaaca--aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  21948446 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 21948349  T
Q  119 acagcgagagaaag---------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 209  Q
    | ||||||||| ||         ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  21948348 atagcgagagagagggagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgt 21948249  T
Q  210 ttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21948248 ttcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaa 21948210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6745485 - 6745242
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  6745485 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcagccaaaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtcgaa 6745388  T
Q  118 aaca---gcgagagaaa-gaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    ||||   |||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |    
T  6745387 aacaacagcgagagaaaagaataagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccttgtctgggggagagagcagccctccgatcc 6745288  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  6745287 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 6745242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Original strand, 16092069 - 16092305
Alignment:
Q  23 caccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacag 122  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||||    
T  16092069 caccaataaca--aacttgatatgtggagcaatggatagtcaagcaaccaaa-caaagtatatggaacaattgtaaacgcaagccaaaagtagaaaacag 16092165  T
Q  123 cgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatag 219  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||| ||||   |||||||||| || ||||||||||||||     
T  16092166 cgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgatccagttcagtctaaattgacctagtctagaggagagagcaaccctccgtttcactataa 16092265  T
Q  220 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  16092266 tgatgagtaaccttacaaaagagatctcaatgggttacaa 16092305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2954827 - 2954591
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttata-atcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||  || ||||| ||||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||    
T  2954827 cacaccaataaca--aatttgatgtgtggagtaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattatgtaacacaagccaaaagtagaaaa 2954730  T
Q  120 cagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  2954729 cagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacctagtttgggggagagagcatccctccgcttcactata 2954630  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  2954629 -tgatgagtaactttac-aaagagatatcaatgggttacaa 2954591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Original strand, 26098165 - 26098380
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-----a 129  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||     |    
T  26098165 aaacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagagaa 26098264  T
Q  130 aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 228  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  26098265 aggaagagagaacataaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtatggggggagagagcagccctccgtttcaccata-tgatgagta 26098363  T
Q  229 actttacaaaagagata 245  Q
    || ||||||||||||||    
T  26098364 acgttacaaaagagata 26098380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 33 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17073289 - 17073066
Alignment:
Q  33 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagaga 129  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||    
T  17073289 ataaatttgatgtgtggagcaagtgatgatcaagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacaacagcgagaga 17073190  T
Q  130 aaga---agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 226  Q
    || |   ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  17073189 aaaataaagagagaaagcaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccgagtctgggggagagagcagccctccgttttactataatgatgag 17073090  T
Q  227 taactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  17073089 taaccttacaaaagagatatcaat 17073066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24127271 - 24127039
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    ||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||| |||| |||  |||| |||| ||||||||||| |||| |||||| || ||| |||||||||||    
T  24127271 atcacacaaataaca--aacttaatgtgtggagcaagggataatcagacaacaaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacataagtcaaaagtagaa 24127174  T
Q  118 aacagcgagaga--aagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  24127173 aacaacgagagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcac 24127074  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24127073 tata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 24127039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 37705649 - 37705885
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||    
T  37705649 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataaccaagcaaccaaaacaaagtatatggaataattaaaaacacaagccaaaagtagaaaac 37705746  T
Q  121 agcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||||||||   || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| | |||||||||||    
T  37705747 agcgagagagaaaggaagagagaacgc--aagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaatagccattcgtttcactat 37705844  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  37705845 a-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 37705885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Original strand, 31472493 - 31472709
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--- 131  Q
    ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| ||||   ||  | |||||||||||| |||| |||||| |||||||||  ||||||||       
T  31472493 aaacttgatgtgtgaagtaagagatactcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacagttataattacaaaccaaaattagaaaacaatgagagaaaaga 31472589  T
Q  132 -gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 230  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  31472590 agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcaaccctccgtttcactataatgatgagtaac 31472689  T
Q  231 tttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31472690 tttacaaaagagatatcaat 31472709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 35 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20043390 - 20043206
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatag-tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-- 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20043390 aaacttgatttgtggagcaagtgataaatcaagcagccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaag 20043291  T
Q  132 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||||||||    
T  20043290 aaagagagaacacaaaagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcaaccattcgtttcacta 20043206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 6747721 - 6747498
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||    
T  6747721 cacaccaataaca--aacttgatgtgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaaacacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtcgaa 6747624  T
Q  118 aaca---gcgagagaaa-gaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    ||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| | |    
T  6747623 aacaacagcgagagaaaagaagaagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagagagagagcagccctccgatcc 6747524  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaa 239  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  6747523 actata-tgacgagtaacgttacaaaa 6747498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25804442 - 25804199
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25804442 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 25804348  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  25804347 acaacggcgagaagaacacaaagaagacaagaacacaaaagaatttattgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccg 25804249  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  25804248 ttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 25804199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 25921334 - 25921578
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25921334 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 25921428  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||    
T  25921429 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccg 25921528  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  25921529 ttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 25921578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 31465853 - 31466084
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||  || ||||| |||||| ||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31465853 atcacaccaataaca--aatttgatgtgtggaacaaggaataattaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 31465950  T
Q  118 aacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    ||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||          |    
T  31465951 aacagcgagagagaaaagaagagagaatacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgaactagtctgggggtgagagcagcc----------c 31466040  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  31466041 tata-tgatgagtaactttacaaaatagatatcaatgggttacaa 31466084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16776574 - 16776340
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16776574 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaatcaaaacaaagtgtatgaaacaattataat-acaagccaaaagtagaaa 16776478  T
Q  119 aca---gcgagagaaa--gaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgttt 211  Q
    |||   ||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| |||||| ||||||| |||| |     
T  16776477 acaacagcgagagaaaaagaagagcgagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattggcatagtctgggggagatagcagccctccgatc 16776378  T
Q  212 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  16776377 cactata-tgataagtaacgttacaaaagagaaatcaat 16776340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38882506 - 38882280
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38882506 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 38882412  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    ||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  38882411 acaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgatccactata 38882319  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  38882318 -tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 38882280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 10528958 - 10529204
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  10528958 atcacaccaataaca---acttgatgtgtgaagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 10529052  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 206  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10529053 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttc 10529152  T
Q  207 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  10529153 cgattcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 10529204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18467103 - 18466858
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  18467103 atcacactaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaa 18467008  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||    
T  18467007 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaaaacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccg 18466908  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || || |||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  18466907 ttccattata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 18466858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 259
Target Start/End: Original strand, 6661074 - 6661291
Alignment:
Q  39 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagaga 138  Q
    ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  | |||    
T  6661074 ttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaaga 6661170  T
Q  139 gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||  | |||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | ||||| ||||||||||    
T  6661171 gaacacacga-aatttgtttatccagttcggtccaaatctgacctagtctgagggagagagcagtcatccgttccactataattatgagcaactttacaa 6661269  T
Q  238 aagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  6661270 aagagatatcaatgggttacaa 6661291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4237046 - 4236803
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4237046 atcacaccaataaca---acttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 4236952  T
Q  119 acagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||| ||         | | ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  4236951 acaacggtgagaagaacacaaataagagaagaacacaaaagaatttattgacc-agttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccg 4236853  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  4236852 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 4236803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 34476913 - 34477157
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  34476913 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 34477007  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  34477008 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 34477107  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  34477108 gatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 34477157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 34479278 - 34479522
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||    
T  34479278 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aatg-caagccaaaagtagaa 34479372  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  34479373 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 34479472  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  34479473 gatccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 34479522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10587233 - 10587026
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  10587233 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaag-gataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaaa 10587139  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||| ||   |  ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||| | ||||||    
T  10587138 acaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagcagccctccgatccactat 10587046  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaa 238  Q
    | ||||||||||| |||||||    
T  10587045 a-tgatgagtaacgttacaaa 10587026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27912951 - 27912710
Alignment:
Q  23 caccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca- 121  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||     
T  27912951 caccaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagctaaaagtagaaaacaa 27912856  T
Q  122 --gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
      ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||   || ||| |    
T  27912855 cggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagttctctgttcc 27912756  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  27912755 actata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 27912710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2175318 - 2175093
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    ||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2175318 tcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaa 2175224  T
Q  120 cagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatag 219  Q
    || ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||     
T  2175223 caacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata- 2175132  T
Q  220 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  2175131 tgataagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 2175093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20054231 - 20054021
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aa 134  Q
    ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||| | |||||||||||||   ||||||||   ||    
T  20054231 acttgatgtgtagagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaacacaaac-aaaagtagaaaacgaagagagaaaagaaa 20054135  T
Q  135 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 233  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||| || ||  ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  20054134 gagagaacacaaaagaatttgtttacgcagttcggtccaaaactgacctagtatggaggagagagcagccttccgttctactataatgatgagtaacttt 20054035  T
Q  234 acaaaagagatatc 247  Q
    ||||||||||||||    
T  20054034 acaaaagagatatc 20054021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 259
Target Start/End: Original strand, 39397916 - 39398098
Alignment:
Q  67 caaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagtt 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||         ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  39397916 caaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaactcaagccaaaagtagaaaacagtgagag---------agaacacaaaagaatgttttgacctagtt 39398006  T
Q  167 cggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||  ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||    
T  39398007 cggtccaaattgacctagtctgtgggagagagcagccatccgttttactata-taattggtaacgtcacaaaagagatatcaatgggttacaa 39398098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Original strand, 12555779 - 12556008
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    ||||||||||||||  || ||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12555779 tcacaccaataaca--aatttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaaa 12555876  T
Q  120 cagcgagag-------------aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 206  Q
    || ||||||             | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| || || || |||||| ||||||| ||    
T  12555877 caacgagagagaaaagaagagaagagaagagagaacacaaaagaatttattgacccagttcagtccaaattgaactagtatgggggagatagcagccctc 12555976  T
Q  207 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 239  Q
    |||||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  12555977 cgtttcgcttta-agatgagtaacgttacaaaa 12556008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18469428 - 18469185
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18469428 atcataccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaaa 18469333  T
Q  119 aca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   |||||      | ||||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  | ||    
T  18469332 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacgcaaaagaatttgttaatccagttcggtccaaattgacctagtct--gggagagagcagctcttcg 18469235  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  18469234 ttccactaga-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 18469185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Original strand, 21684313 - 21684526
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  21684313 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aataa-aagccaaaagtagaaa 21684407  T
Q  119 acagcg-agagaa--------agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||| || ||||||        | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  21684408 acaacggagagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 21684507  T
Q  209 tttcactatagtgatgagta 228  Q
     | ||||||| |||||||||    
T  21684508 atccactata-tgatgagta 21684526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39798448 - 39798221
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  39798448 atcacaccaataaca---atttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaa 39798354  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    ||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  39798353 acaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcgatccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactata 39798261  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
      |||||||| | ||| |||||||| |||||| | ||||||    
T  39798260 -cgatgagtatcattataaaagagaaatcaatgggttacaa 39798221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27910852 - 27910624
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||| |||    
T  27910852 atcacaccaataaca--aatttgatgtgtggagcaagggataatcaatcaaccaaaataaagtgtatggaa--gttataaatacaagctaaaagtataaa 27910757  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    ||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||  |||||| || ||||    
T  27910756 acaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctccgttccattata 27910664  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  27910663 -tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 27910624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4410439 - 4410197
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4410439 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa-aaggtgtatgga--agttataaatacaagccaaaagtagaaa 4410346  T
Q  119 acagcg------agag---aaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||||||      ||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||  |||     
T  4410345 acagcggcgaaaagagcacaaagtagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctcca 4410246  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  4410245 atccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaataggttacaa 4410197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 38959992 - 38960236
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38959992 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaa 38960086  T
Q  119 acagcg------------agagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttc 206  Q
    ||| ||            | ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| || || |||||||||||||| ||    
T  38960087 acaacgacaagaagaacaaaagaaaaaaga-agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtttgggggagagagcagccctc 38960185  T
Q  207 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  38960186 cgatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 38960236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10750118 - 10749875
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  10750118 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 10750024  T
Q  118 aaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  10750023 aacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaa-gaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcc 10749925  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  10749924 gatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 10749875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 35 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20045386 - 20045290
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 131  Q
    ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20045386 aaacttgatgtgtgaagcaaatgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtaaaaaacaacgagagaaa 20045290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 34530579 - 34530692
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |    
T  34530579 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtcgagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaca 34530676  T
Q  119 acagcgagagaaagaa 134  Q
    ||||| | ||||||||    
T  34530677 acagcaacagaaagaa 34530692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 15445140 - 15445362
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    ||||||||||| |||  |||||| |||||||||| |  || |||||||| |||||||| ||| ||| ||   |||||| ||||||| |||  ||||||||    
T  15445140 cacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaaaa--taatcaagcaatcaaaacaacgtggatgaaaa--ttataaacacaagcaaaagatagaaaac 15445233  T
Q  121 agcgagagaaagaagagagaacacaaaagaa-tttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    | |||||||||||| |||||| ||| | ||| |||||| ||| ||||| |||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||||||    
T  15445234 atcgagagaaagaa-agagaaaacacacgaaatttgtttacccagttcagtccaatactgacctagtctg-ggaagagagcagcccttcgttccactata 15445331  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15445332 atgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 15445362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31543152 - 31542939
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  31543152 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggttaatcaagcaaccaaaacaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaa 31543058  T
Q  119 aca---gcga-gag----aaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   |||| |||    ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||     
T  31543057 acaacggcgaggagaacaaaagaagaacaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcca 31542958  T
Q  209 tttcactatagtgatgagta 228  Q
     | ||||||| |||||||||    
T  31542957 atccactata-tgatgagta 31542939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 10757594 - 10757371
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  10757594 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 10757500  T
Q  118 aaca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||      ||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  10757499 aacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacac-aaagaatttgttgacccagttcggtctaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcc 10757401  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 238  Q
    | | ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  10757400 gatccactat-ttgatgagtaacgttacaaa 10757371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9020612 - 9020392
Alignment:
Q  39 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagag 137  Q
    ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||||    
T  9020612 ttgatctgtggagcaattaataatcaagcaaccaaat-aaagtgtattgaa--gttataaacacaagc-aaaagtagaaaataacgatagaaaagaagag 9020517  T
Q  138 aga--acacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 234  Q
    |||  ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||   |||||  | ||  ||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| ||||    
T  9020516 agagaacacaaaagaattggtttatccagttcggtccaaaacagacctaatttggaggagagagcagccatccgatccactataatgatgagtaatttta 9020417  T
Q  235 caaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  9020416 caaaagagatatcaatgggttacaa 9020392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Original strand, 3372997 - 3373184
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  3372997 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 3373091  T
Q  118 aaca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca 200  Q
    ||||   ||||||      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  3373092 aacaacggcgagaagagcaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagca 3373184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4898068 - 4897903
Alignment:
Q  93 ttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgag 190  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| || | |||||| || || |    
T  4898068 ttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaa-agaggaacacaaaa-aatttgtttacccagttcagtcgaatactgacctagtatggg 4897972  T
Q  191 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| |||||||  | ||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  4897971 ggagaaagcagcccactgttccgctataatgatgagtaactttacaatagagatatcaaatggttacaa 4897903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 31179233 - 31179421
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa- 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| | ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||     
T  31179233 atcacaccaataaca---acttgatgtatggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataat--taaacacaagccaaaagtagaag 31179327  T
Q  118 ---aacagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
       ||| |||||      | ||||||||| |||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31179328 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaga--aatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 31179421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15143817 - 15143650
Alignment:
Q  85 tggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca--gcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgac 180  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||  | |||||||| ||| | ||||||| || | ||||    
T  15143817 tggaacaattataaacacaaacaaaaagtagaaaaaatagcgagagaaaagtagagagaacacacga-aatttgtttacccatttcggtcaaatactgac 15143719  T
Q  181 ctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    || ||||  |||||| ||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15143718 ctagtctaggggagaaagcagctccccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 15143650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Original strand, 15354560 - 15354679
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  | ||||||||| |||| |    
T  15354560 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttaatgagtaacgttac-a 15354657  T
Q  238 aagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||||| | ||||||    
T  15354658 aagagaaatcaatgggttacaa 15354679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23665337 - 23665218
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  23665337 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 23665240  T
Q  238 aagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||||| | ||||||    
T  23665239 aagagaaatcaatgggttacaa 23665218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Original strand, 23741844 - 23741963
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  23741844 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 23741941  T
Q  238 aagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||||| | ||||||    
T  23741942 aagagaaatcaatgggttacaa 23741963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Original strand, 23793250 - 23793369
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| |||| |    
T  23793250 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctggggaagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttac-a 23793347  T
Q  238 aagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||||| | ||||||    
T  23793348 aagagaaatcaatgggttacaa 23793369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Original strand, 2144504 - 2144647
Alignment:
Q  88 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggt 185  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||        |||||||||||| | ||   | ||    
T  2144504 aacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttc-------agttcggtccaatactggtttagt 2144594  T
Q  186 ctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 238  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2144595 ttgagggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 2144647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Original strand, 15356836 - 15356955
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| |||| | ||||||  | ||||||||| |||| |    
T  15356836 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtccgggggagagagcagccctccgatccactat-ttaatgagtaacgttac-a 15356933  T
Q  238 aagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||||| | ||||||    
T  15356934 aagagaaatcaatgggttacaa 15356955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 249
Target Start/End: Original strand, 17413198 - 17413262
Alignment:
Q  185 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||| ||||||||||| || || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17413198 tctgggggagagagcatccctctgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 17413262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15552664 - 15552474
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   |||||||  ||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||  |||||| |||||||||||    
T  15552664 atcacaccaataaca---acttgatgcgtgaagtaagggataatcaagcaactaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagctaaaagtagaaa 15552570  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    | |   ||||||       ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15552569 ataatggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 15552474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31545374 - 31545285
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 228  Q
    ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||||    
T  31545374 agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatgagta 31545285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 35430506 - 35430365
Alignment:
Q  108 aaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttc 206  Q
    |||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||| |||||||||| | | ||||| |||||| | ||||||  ||| | ||||| || ||| |||    
T  35430506 aaaattagaaaacaacgagggagaagagaaagaacacaagagaatttgtttatccagttcagtccaatactgacctactctaaaggagataggagctttc 35430407  T
Q  207 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35430406 cgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 35430365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 220 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 42771023 - 42770984
Alignment:
Q  220 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42771023 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaa 42770984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 250
Target Start/End: Original strand, 34530724 - 34530762
Alignment:
Q  212 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34530724 cactataatgatgagcaactttacaaaagagatatcaat 34530762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 42771167 - 42771064
Alignment:
Q  38 cttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaaga 136  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||  ||  |||||||||  ||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  42771167 cttgatgtgtggagcaagtaataatcaagtaaccaaataaa--tgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaggtagaaaacagcaagagaaatgaaga 42771073  T
Q  137 gagaacaca 145  Q
    |||||||||    
T  42771072 gagaacaca 42771064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Original strand, 10281755 - 10281804
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 202  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||    
T  10281755 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagc 10281804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 15354434 - 15354502
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 89  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15354434 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 15354502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 15356710 - 15356778
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 89  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15356710 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 15356778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20045268 - 20045223
Alignment:
Q  205 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20045268 tccgtttctctataatgataagtaactttacaaaaaagatatcaat 20045223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 23665464 - 23665396
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 89  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23665464 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 23665396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 23741717 - 23741785
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 89  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23741717 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 23741785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Original strand, 23793123 - 23793191
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 89  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23793123 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 23793191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 31300689 - 31300644
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31300689 ttgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagag 31300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 31545501 - 31545404
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| | || ||||||||  |||| |||| ||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  31545501 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaagggttaatcaagcaattaaaataaagcgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaa 31545407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 100)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 11457342 - 11457582
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  11457342 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtgaagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtatatggaacaattttaaacacaagccaaaagtagaaa 11457439  T
Q  119 acagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  11457440 acagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagacatccgtttcact 11457539  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11457540 ata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 11457582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47906684 - 47906444
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa- 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  47906684 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaccaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaaa 47906588  T
Q  118 --aacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  47906587 acaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgaccaagtctgggggagagagcagccctccgattcac 47906488  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  47906487 tata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 47906444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 17185999 - 17186235
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  17185999 atcacaccaataa--taaacttgatatgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaa 17186093  T
Q  119 acagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||| || |||    
T  17186094 acagcgagagaaagaaagagagaacacaaaagaatttgtttacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcactccgttccattat 17186193  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  17186194 aatgatgagtaactttacaaaagagatattaatgggttacaa 17186235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 20 - 243
Target Start/End: Original strand, 4131243 - 4131467
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    ||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  4131243 tcacaccaataaca--aacttgatgtgcggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaaatagaaaa 4131340  T
Q  120 cagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    || |||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||    
T  4131341 caacgagagagaaaagaacagagaacacaaaagaatttgttgacatagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccacta 4131440  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagaga 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  4131441 taatgatgagtaactttacaaaagaga 4131467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 31424882 - 31425113
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  31424882 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaatactcaagcaaccataacaaaatgtatgggacaattataaacacaagtcaaaagtagaaa 31424979  T
Q  119 acagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  31424980 acagcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggagagagcagccttccgtttcact 31425078  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31425079 ataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 31425113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16429367 - 16429131
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  16429367 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaaaccaaaagt-gaaa 16429273  T
Q  119 acagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16429272 acagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcgctat 16429173  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16429172 aatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 16429131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 25251141 - 25251382
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25251141 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataatcacaagccaaaagtagaaa 25251238  T
Q  119 acagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||| || || ||||||||    
T  25251239 acaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtattggggagagagcaaccctctgtttcact 25251338  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||    
T  25251339 ataatgataagtaaccttacaaaagatatatcaatgggttacaa 25251382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 2949099 - 2949329
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  2949099 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 2949196  T
Q  119 acagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||||||||    
T  2949197 acagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtc-gggggagagagcagccctctgtttcact 2949295  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  2949296 ata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 2949329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 9240954 - 9241184
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| |||||||||||||    
T  9240954 atcacaccaataaca--aacttgaagtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaatacaaaccaaaagtagaaa 9241051  T
Q  119 acagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9241052 acagcgagagaaagaaagagagaacaaaaaagaatttgtttccccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactat 9241151  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9241152 aatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 9241184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18307509 - 18307292
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 131  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  18307509 aaacttgatgtgtggagcaaatgataattaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagagaaag 18307410  T
Q  132 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18307409 gaagagagaacacaaaagaatttgttgactccgttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccatccgtttcactataatgatgagtaact 18307311  T
Q  232 ttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18307310 ttacaaaagagatatcaat 18307292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 14097837 - 14098077
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  14097837 cacaccaataaca--aacttgatgtgtgaagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaa 14097934  T
Q  120 cagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    || ||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  14097935 caacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgtgggagagagcagccctccgtttcacta 14098034  T
Q  217 tagtgatgagtaac-tttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14098035 ta-tgatgagtaacgtttacaaaagagatatcaatgggttacaa 14098077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13215496 - 13215275
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13215496 cacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaac 13215399  T
Q  121 agcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||||||||   || |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13215398 agcgagagagaaaggaagagaga--acaaaagaatttgttgacgcagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactat 13215301  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagaga 243  Q
    | |||||||||| |||||||||||||    
T  13215300 aatgatgagtaaatttacaaaagaga 13215275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17319297 - 17319070
Alignment:
Q  23 caccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacag 122  Q
    |||||||||||  || ||||| ||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  17319297 caccaataaca--aatttgatgtgtggagtaaggaataatcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaatagttataaacacaagccaaaagtagaaaatag 17319200  T
Q  123 cgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatag 219  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  17319199 cgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct-agggagagagcagccctccgttttactataa 17319101  T
Q  220 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17319100 tgatgagtaacttaacaaaagagatatcaat 17319070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 20 - 250
Target Start/End: Original strand, 17324500 - 17324734
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagcca-aaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17324500 tcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcagccataacaaagtgaatagaacaattataatcataagccagaaagtagaaa 17324597  T
Q  119 acagcgagagaa------agaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    ||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17324598 acagcgagagaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttc 17324697  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17324698 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaat 17324734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40134358 - 40134127
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatag--tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtaga 116  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  40134358 atcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgatataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatctcaagccaaaagtaga 40134263  T
Q  117 aaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||    
T  40134262 aaacaacgagagaaaaagaatagagaacacaaaagaatttgtttacctagtccggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccatccgtttcac 40134163  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40134162 tataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 40134127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 6995560 - 6995798
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  6995560 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaactataaacacaagccaaaagtagaaa 6995657  T
Q  119 aca---gcgagagaaa-------gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||    
T  6995658 acaacagcgagagaaaaagaagagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccg 6995757  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  6995758 tttcactata-tgatgagtaacgttataaaagagatgtcaat 6995798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18840002 - 18839761
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||||| || | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  18840002 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagtaatcgaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaactagaaa 18839905  T
Q  119 acagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| || ||||||||    
T  18839904 acagcgagagagaaaagaagagagaacacgaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaagagcagccctctgtttcact 18839805  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  18839804 ataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 18839761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Original strand, 28206934 - 28207164
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28206934 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaa 28207031  T
Q  120 ca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    ||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  28207032 caacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcac 28207131  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||   ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28207132 ta---tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 28207164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Original strand, 12302373 - 12302603
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  12302373 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggaaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaa 12302470  T
Q  120 cagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    || |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  12302471 caacgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctccgtttcacta 12302570  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  12302571 ta-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 12302603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 259
Target Start/End: Original strand, 6114989 - 6115210
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaag 135  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  6114989 acttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaataaaatgtatggaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaagacaacgagagaaaagaag 6115086  T
Q  136 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 235  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  6115087 agagaacacaaaataatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagtaattttac 6115186  T
Q  236 aaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  6115187 aaaagagatatcaattggttacaa 6115210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16429040 - 16428827
Alignment:
Q  45 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaaca 143  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16429040 tgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatagaa--gttataaacacaaaccaaaagtagaaaacatcgagagaaaagaagagagaaca 16428943  T
Q  144 caaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 243  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  16428942 caaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttcactaaaatgatgagtaaccttacaaaagaga 16428843  T
Q  244 tatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||| | ||||||    
T  16428842 tatcaatgggttacaa 16428827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 39462936 - 39462703
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  39462936 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaatcaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaattagaa 39462839  T
Q  118 aaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    ||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  39462838 aacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgtttc 39462739  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  39462738 actata-tgatgaataacttttcaaaagagatatcaa 39462703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 64 - 259
Target Start/End: Original strand, 50076583 - 50076779
Alignment:
Q  64 aagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 161  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50076583 aagcaactaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagttaaaagtagaaaacaacgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc 50076682  T
Q  162 tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50076683 cagttcggtccaaattgacatagtctg-gggagagagcagtcatccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatggattacaa 50076779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 50307409 - 50307644
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  50307409 atcacaccaataa--taaacttgatgtctggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 50307506  T
Q  118 aaca---gcgagagaaaga--agagagaacacaaaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgttt 211  Q
    ||||   |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  50307507 aacaacagcgagagaaaaataagagagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttt 50307606  T
Q  212 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  50307607 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 50307644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 38925350 - 38925585
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38925350 cacaccaataa--taaacttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacatttataaacacaagccaaaagtagaaa 38925447  T
Q  119 acagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||     
T  38925448 acaatgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgttttacta- 38925545  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  38925546 --tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 38925585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31490312 - 31490096
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag---aaa 131  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||   |||    
T  31490312 aaacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagggagagagaaaa 31490213  T
Q  132 gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 231  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||     
T  31490212 taagagagaacacaaaagaatttgttgatctagttcagtccaaattgacctagtctg-gggggagagcagccctccgtttcaccata-tgatgaataacc 31490115  T
Q  232 ttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31490114 ttacaaaagagatatcaat 31490096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 25248418 - 25248659
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||| ||||||||||||    
T  25248418 atcacaacaataaca--aacttgatgtgtggagtaaggaatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacaaaagtcaaaagtagaaa 25248515  T
Q  119 acagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||||||||| |   ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||| | |||||||||||    
T  25248516 acagcgagagacaccggaagataaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagggagcagtcctccgtttcact 25248615  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25248616 ataattatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 25248659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 27336804 - 27337046
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27336804 atcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 27336901  T
Q  118 aaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    ||||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |    
T  27336902 aacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcc 27337001  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  27337002 actata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 27337046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 15294697 - 15294941
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15294697 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 15294791  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  15294792 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 15294891  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  15294892 attcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 15294941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41647333 - 41647103
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||  |||||||| || |||||||| |||| |||  ||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||| |||||||||||||    
T  41647333 cacaccaataaca--aacttgatgtgcggagcaagtgataatcagacaaccaaaatcaaagtgtatgaaataattataaacacaagtcaaaagtagaaaa 41647236  T
Q  120 cagc--gagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  41647235 cagcaagagagaaaggaagagagaacacaagagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacatagtctgatggagagagcagccctccgtttcacta 41647136  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41647135 ta-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaat 41647103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23816303 - 23816060
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  23816303 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagtcaaaagtagaaa 23816207  T
Q  119 aca---gcgagagaaag----aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgttt 211  Q
    |||   ||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| || |||| |     
T  23816206 acaacagcgagagaaaagaaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcatccctccgatc 23816107  T
Q  212 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  23816106 cattata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 23816060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 27338995 - 27339237
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  27338995 atcacatcaataaca--aacttgatgtgtggaacaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaa 27339092  T
Q  118 aaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    ||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| | |    
T  27339093 aacaacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagatcagccctccgatcc 27339192  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  27339193 actata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 27339237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 84 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6756877 - 6756700
Alignment:
Q  84 atggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacct 182  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||    
T  6756877 atggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagaggaaagaagagagaacagaaaagaatttgttgatccagttcggtccaaactgacct 6756778  T
Q  183 ggtctgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  6756777 agtctggggggagagagcagtcttccgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaataggttacaa 6756700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 50248437 - 50248679
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  || ||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  50248437 atcacaccaataaca--aatttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaccacaagccaaaagttgaaa 50248534  T
Q  119 acagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagag--cagccttccgtttca 213  Q
    ||| ||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||  || || || ||||||    
T  50248535 acaacgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggaccaaattgacctagtctaggggagagagaacaaccatctgtttca 50248634  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  50248635 ctata-tgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaa 50248679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15823964 - 15823720
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| | || ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15823964 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaaggggtaatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataatcacaaggcaaaagtagaa 15823867  T
Q  118 aacagcga---gagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgttt 211  Q
    |||| | |   ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||     
T  15823866 aacaacaacaagagaaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgttc 15823767  T
Q  212 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  15823766 cactata-tgatgagtaacgttacaatagagatatcaatgggttacaa 15823720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 51750457 - 51750213
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  51750457 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 51750363  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  51750362 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 51750263  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  51750262 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 51750213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 2510205 - 2510432
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||| ||||||    
T  2510205 atcacaccaataaca---acttgatatgtgaagcaagagataatcaagcaacgaaaacaaagtgtatggaacaattaaaa--acaagtcaaaaatagaaa 2510299  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    ||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2510300 acaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccgtttcactata 2510392  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  2510393 -tgatgagtaactttacaagagagaaatcaatgggttacaa 2510432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 10399690 - 10399935
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  10399690 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 10399784  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  10399785 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 10399884  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  10399885 gatccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 10399935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 37 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15916786 - 15916564
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcgagagaaagaa- 134  Q
    ||||||| |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  15916786 acttgatgtgtggagcaagtaacaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaaacagcgagaaaaagaaa 15916689  T
Q  135 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 233  Q
    |||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  15916688 gagagaacgcacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgacgagtaacttt 15916590  T
Q  234 acaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||    
T  15916589 ataaaagagatatcaatgggttacaa 15916564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Original strand, 31735399 - 31735628
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||   ||||||         
T  31735399 aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaa-tagaaaacaacggcgagaagaac 31735495  T
Q  129 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 225  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  31735496 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 31735594  T
Q  226 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  31735595 gtatcgttacaaaagagaaatcaatggattacaa 31735628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Original strand, 28998128 - 28998351
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28998128 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaa 28998227  T
Q  132 g------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 225  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||| ||| ||||||    
T  28998228 agaagaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccata-tgatga 28998326  T
Q  226 gtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||| || |||||||||| |||||    
T  28998327 gtaacgttgcaaaagagatgtcaat 28998351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Original strand, 29003844 - 29004067
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa---caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 131  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29003844 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaagaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaa 29003943  T
Q  132 g------aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 225  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||| ||| ||||||    
T  29003944 agaagaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagaacaaccctcagtttcaccata-tgatga 29004042  T
Q  226 gtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||| || |||||||||| |||||    
T  29004043 gtaacgttgcaaaagagatgtcaat 29004067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 23 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17324484 - 17324237
Alignment:
Q  23 caccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacag 122  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17324484 caccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccataacaaagtgtatgaaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaacag 17324387  T
Q  123 cgagagaaaga---agagagaac----------acaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 209  Q
     |||||| |||   ||||||||           ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||||||||||    
T  17324386 tgagagagagagagagagagaaaggaagagagaacacaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtcatggggagagaccagccttccgt 17324287  T
Q  210 ttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17324286 ttcactataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 17324237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25128273 - 25128046
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaga 133  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||| || |  || ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  25128273 aaacttgatgtgtagagcaaggaataatcaagcaaccaaaatcaaagtggatag--caattataatcacaaat-aaaagtagaaaacagcgagagaaaga 25128177  T
Q  134 a-----gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 228  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || || | |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  25128176 aaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcctaattgacctagtatgggagagagagcagccctccgtttcaatataatgatgagta 25128077  T
Q  229 actttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || |||||||||||||||||||  |||||||    
T  25128076 accttacaaaagagatatcaatgaattacaa 25128046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16432801 - 16432568
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  || ||||| |||||||||||  ||| ||| |||| ||||||| |||||||| ||  ||||||| || || |||||||||||||    
T  16432801 atcacaccaataaca--aatttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaatcaaaacacagtgtatgaaa--gttataaacataaaccaaaagtagaaa 16432706  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc-tgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    |     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16432705 aac---aga-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagtccgccgtttcactat 16432610  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16432609 aatgatgagtaacattacaaaagagatatcaatgggttacaa 16432568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39932494 - 39932247
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  39932494 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaa 39932399  T
Q  119 a----cagcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg-agagagcagccttc 206  Q
    |    | ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||| ||||||||||| ||    
T  39932398 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtatgggggaagagagcagccctc 39932299  T
Q  207 cgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  39932298 cgttccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 39932247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28841083 - 28840854
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 128  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  28841083 aacttgatgagtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 28840986  T
Q  129 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 225  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  28840985 acaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatga 28840887  T
Q  226 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  28840886 gtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 28840854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13762254 - 13762011
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13762254 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagaaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 13762160  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||    
T  13762159 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagaagccctccg 13762060  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  13762059 gtccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 13762011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2617934 - 2617690
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||   ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2617934 cacaccaataaca---acttgatgtgtgaagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaa 2617840  T
Q  120 ca---gcgagagaaa-------gaagagagaa-cacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||   ||||||||||       ||||||| || ||||||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  2617839 caacagcgagagaaaacacaatgaagagaaaaacacaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccg 2617740  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  2617739 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 2617690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 124 - 259
Target Start/End: Original strand, 50078793 - 50078928
Alignment:
Q  124 gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgat 223  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| ||||||| ||||    
T  50078793 gagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttaccaaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgttccactataatgat 50078892  T
Q  224 gagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  50078893 gaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 50078928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28842898 - 28842669
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagag---- 128  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||         
T  28842898 aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaaacaacggcgagaagaac 28842801  T
Q  129 --aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatga 225  Q
      |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||    
T  28842800 acaaagaagagaagaacacaatagaatttgttgacctagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagattagccctccgttccactata-tgatga 28842702  T
Q  226 gtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  28842701 gtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 28842669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13358992 - 13358787
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  13358992 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgaaa--gttataaatacaagccaaaagtagaa 13358898  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  13358897 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 13358798  T
Q  208 gtttcactata 218  Q
    | | |||||||    
T  13358797 gatccactata 13358787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 14183474 - 14183690
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  14183474 atcacaccaataaaata--cttgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagc-aaaagaagaaa 14183568  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||| |||||||            ||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
T  14183569 acaacgagagac-----------cacaaaaaaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctagtctgggggagagagcagccatccgttccactat 14183657  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14183658 aatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 14183690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 46431568 - 46431814
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  46431568 atcacaccaataaca---acttgatgtttggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 46431662  T
Q  119 aca---gcgagag-------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct--gagggagagagcagcctt 205  Q
    |||   ||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| |    
T  46431663 acaacggcgagaagaacacaaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggggagagagcagccct 46431762  T
Q  206 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  46431763 ccgatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 46431814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 47452045 - 47451825
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa- 117  Q
    |||||| ||||||||  || ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  47452045 atcacatcaataaca--aatttgatgtgtcgagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 47451948  T
Q  118 --aacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
      |||| |||||||||  ||||||||             | ||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | | |||||||    
T  47451947 gcaacaacgagagaaaaggaagagag-------------tggttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagtcattcgtttca 47451861  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  47451860 ctata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 47451825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 13447136 - 13447301
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  13447136 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 13447230  T
Q  119 aca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattga 179  Q
    |||   |||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13447231 acaacggcgagaaaaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattga 13447301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Original strand, 31422726 - 31422923
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataat-cacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||| |||| |||| |||||||| |||| | ||||||  |||||| |||||||||||    
T  31422726 atcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaatcaactaaaataaagtgtacggaataattataaaacacaagtcaaaagtagaa 31422823  T
Q  118 aacagcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    ||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || |||||||    
T  31422824 aacagcgagagagaaaagaagagatatcacaaaagaatttgttcacccagctcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctctgtttcac 31422923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 259
Target Start/End: Original strand, 3579589 - 3579723
Alignment:
Q  124 gagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 222  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  | ||||||||||  || |||    
T  3579589 gagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcaatcatccgtttcac--taatga 3579686  T
Q  223 tgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3579687 tgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 3579723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 259
Target Start/End: Original strand, 49495137 - 49495318
Alignment:
Q  76 caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa 174  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  49495137 caaagtgtatggaaga--tataatcacaaac-aaaagtaaaaaacagtgagagaaagaaagagggaatacataagaatttctttacctagttcggtctaa 49495233  T
Q  175 attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| | ||||  ||||||||  |||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  49495234 attgacatagtcttggggagagataagcccttcgtttcactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 49495318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 50078656 - 50078769
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  50078656 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 50078753  T
Q  119 acagcgagagaaagaa 134  Q
    ||| ||||||| ||||    
T  50078754 acaacgagagagagaa 50078769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 37 - 250
Target Start/End: Original strand, 18800458 - 18800671
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaa 134  Q
    ||||||| ||| ||||||   ||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||   ||    
T  18800458 acttgatgtgtagagcaaataataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaacaaa 18800555  T
Q  135 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc-aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 233  Q
     ||||||||||  | |||||||| |||  ||| ||||| ||| | |||| || || ||||||||||||   |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18800556 aagagaacacacga-aatttgtttaccctgtttggtccaaaactaacctagtttgggggagagagcagttctccgcttcactataatgatgagtaacttt 18800654  T
Q  234 acaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||||||||||||||    
T  18800655 acaaaagagatatcaat 18800671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 36 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 51757939 - 51757759
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag-----aaaaca---gcgaga 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||     ||||||   ||||||    
T  51757939 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattg-aat-acaagccaaaagtagggaaaaaaacaacggcgaga 51757842  T
Q  128 g------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
           |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51757841 agaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 51757759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 9459297 - 9459523
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9459297 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaa 9459391  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    ||| || | || |      ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | |||||||    
T  9459392 acaacg-gcgaga------agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata 9459484  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  9459485 -tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 9459523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 9463124 - 9463350
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9463124 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaa 9463218  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    ||| || | || |      ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||  | |||||||    
T  9463219 acaacg-gcgaga------agaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata 9463311  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  9463312 -tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 9463350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6823306 - 6823197
Alignment:
Q  140 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 239  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  6823306 aacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tgatgagtatcgttacaaaa 6823208  T
Q  240 gagatatcaat 250  Q
    |||| ||||||    
T  6823207 gagaaatcaat 6823197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Original strand, 3579452 - 3579558
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3579452 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaggcaaccaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaac 3579549  T
Q  121 agcgagaga 129  Q
    || ||||||    
T  3579550 agagagaga 3579558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 37 - 249
Target Start/End: Original strand, 13125346 - 13125555
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-- 134  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||      
T  13125346 acttgatgtgtggagcaaaa-ataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaagaaaa 13125440  T
Q  135 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 233  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||  | ||| ||||||| |  |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13125441 gagagaacacatga-aatttgtttacctagttcggtcctatactgacctagtaagggggggagagcaactctccgttccactataatgatgagtaacttt 13125539  T
Q  234 acaaaagagatatcaa 249  Q
    ||||||||||||||||    
T  13125540 acaaaagagatatcaa 13125555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20302860 - 20302633
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  20302860 atcacaccaataaca---acttgatgtctggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 20302766  T
Q  118 aacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    |||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || | |||| | ||||||    
T  20302765 aacaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagtagtcctccgatccactat 20302673  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
      ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  20302672 -ctgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 20302633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24326081 - 24325837
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||| |||    
T  24326081 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaagtaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaggtaaaaa 24325987  T
Q  119 acagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||| ||         | | |||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||    
T  24325986 acaacggtgagaagaacacaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtcaaaattgacttagtctgggggagagagcagccattcg 24325887  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  24325886 attcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaa 24325837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 30790269 - 30790508
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa--gtaga 116  Q
    ||||||||||||| |||  | |||| |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||  ||| |    
T  30790269 atcacaccaataaaata--cctgatgtgtgaagcaagtaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaaacaaaaatagtaaa 30790364  T
Q  117 aa-acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaattt-gttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||| | | |||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||| | ||| || ||    
T  30790365 aagacagcgagagaaagaa-agagagcacacacgaattttgtttatccagttcggtccaaaactgacctagtctg-ggaagagagcagtcatccattcca 30790462  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30790463 ctataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 30790508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 259
Target Start/End: Original strand, 8347161 - 8347380
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-g 135  Q
    |||||||  |||||| |||  ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||  ||||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8347161 acttgatgcgtggagtaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtatatgaaa--gttataaacataagc-aaaagtagaaaacagcgatagaaagaaag 8347256  T
Q  136 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 234  Q
    ||||||||||  | ||||||||  ||| ||||||||||||  |||||| ||||  |||| |||||| || |||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8347257 agagaacacacga-aatttgtttcccttgttcggtccaaaactgacctagtctaggggaaagagcatccctccgttccactataataatgagtaacttta 8347355  T
Q  235 caaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||||| | ||||||    
T  8347356 caaaagagatatcaatgggttacaa 8347380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20291875 - 20291631
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  20291875 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaatcaaggtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 20291781  T
Q  118 aaca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   |||||      | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || |||||||| || || |||    
T  20291780 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgatctagtgtgggggagagaacaaccctcc 20291681  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||| ||||||| | | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  20291680 gatccactata-tgatgagaatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 20291631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 259
Target Start/End: Original strand, 15669304 - 15669501
Alignment:
Q  62 tcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttga 159  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||| | ||||||| || |||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||| |    
T  15669304 tcaagcaatcaaaacaaagtgtatcgaa--gttataaacacaaac-aaaagtataacacagcgagagaaaagaaagagagaacacaacaaaatttgttta 15669400  T
Q  160 cctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattaca 258  Q
    |  ||||| ||| |||  |||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||| | |||||    
T  15669401 cacagttcagtctaaaactgacctagtctcggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtagctttacgagagagatatcaatgggttaca 15669500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 42922557 - 42922404
Alignment:
Q  107 caaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcct 204  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||| | || ||||||||| |     
T  42922557 caaaagtagaaaacaacgggagaaagaaagagataacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcc 42922459  T
Q  205 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  42922458 tccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 42922404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16561813 - 16561651
Alignment:
Q  87 gaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctgg 184  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| |    
T  16561813 gaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacggcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctag 16561716  T
Q  185 tctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||  ||||||||||| || |  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16561715 tctatgggagagagcaaccctttgttccactgtaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 16561651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23786258 - 23786014
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  23786258 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaaagtagaa 23786164  T
Q  118 aaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||      ||||||||   |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  23786163 aacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaggaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcc 23786064  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  23786063 gatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 23786014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 51752667 - 51752592
Alignment:
Q  129 aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  51752667 aaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 51752592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 121
Target Start/End: Original strand, 25860287 - 25860369
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 121  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25860287 aaacttgatgtgtggagcaagggatagtcaa----ccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaaca 25860369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 8348925 - 8349150
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||   ||||||||  |||||| ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||    
T  8348925 atcacaccaataa---aaacttgacgtgtggaacaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacacaaac-aaaagtagaaa 8349017  T
Q  119 acagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    |||   |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| |||  |||| | ||||  |||||||| || || ||  || |||||    
T  8349018 acaattagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtctaaaactgacatagtcttggggagagaacaaccctctattccacta 8349116  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8349117 taatgatgagtaacttaacaaaagagataccaat 8349150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16226587 - 16226396
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  16226587 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaa 16226493  T
Q  118 aaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    ||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16226492 aacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 16226396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 37 - 246
Target Start/End: Original strand, 13127576 - 13127782
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-- 134  Q
    ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||  ||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||      
T  13127576 acttgatgtgtggagcaaaa-ataatcaagcaaccaaaacaa-gtgggtg--acagttataaacacaagc-aaaaggagaaaacaatgagataaagaaaa 13127670  T
Q  135 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 233  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||||| | | |||| |||||  ||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  13127671 gagagaacacatga-aatttgtttacccggttcggtccaatactaacctagtctggaggagagagcagctctccgttctactataatgatgagtaacttt 13127769  T
Q  234 acaaaagagatat 246  Q
    |||||||||||||    
T  13127770 acaaaagagatat 13127782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27916840 - 27916681
Alignment:
Q  89 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga-aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtc 186  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||    | |||||||| ||| | |||||||||| | |||||| |||    
T  27916840 acagttataaacacaagt-aaaagtagaaaacaacgagagagaaaaaaagagaacatgtga-aatttgtttacccaattcggtccaatactgacctagtc 27916743  T
Q  187 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    || |||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27916742 tgggggagagagcagccctccgttccactataacgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 27916681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 249
Target Start/End: Original strand, 26613194 - 26613337
Alignment:
Q  108 aaaagtagaaaa-cagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcct 204  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| || | ||||||  |||| ||||||||| |||      
T  26613194 aaaagtagaaaaacaacgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtcaaatactgacctaatctgggggagagagaagctc 26613292  T
Q  205 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    || ||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  26613293 tctgttccactataatgattagtaactttccaaaagagatatcaa 26613337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16231982 - 16231792
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  16231982 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaa 16231888  T
Q  118 aaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    ||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16231887 aacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacc-agttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 16231792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 30780461 - 30780361
Alignment:
Q  20 tcacaccaataacataaacttgatatgtg--gagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||  ||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  |||||||||||    
T  30780461 tcacaccaataaca--aacttgatgtgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaaatcaaaagtagaa 30780364  T
Q  118 aac 120  Q
    |||    
T  30780363 aac 30780361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 259
Target Start/End: Original strand, 21948227 - 21948295
Alignment:
Q  190 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  21948227 gggagagagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 21948295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 47177781 - 47177683
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||    
T  47177781 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaa 47177687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 155949 - 155901
Alignment:
Q  190 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 238  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  155949 gggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 155901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 133 - 249
Target Start/End: Original strand, 30738609 - 30738727
Alignment:
Q  133 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagt--gatgagtaa 229  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||| |||| ||||||| | |||||| || || | ||||||||| || |||||||||||||| |  |||||||||    
T  30738609 aagagagaacacacga-aatttgtttaccaagtttggtccaatactgacctagtatgggtgagagagcatccctccgtttcactataatatgatgagtaa 30738707  T
Q  230 ctttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  30738708 ctttacaaaagagacatcaa 30738727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43104389 - 43104345
Alignment:
Q  205 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43104389 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 43104345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 47180132 - 47179942
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||| |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||    
T  47180132 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaatcaaaatcaaagcgtatggaataatta-aat-acaagccaaaagtagaa 47180038  T
Q  118 aaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    ||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  47180037 aacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagatatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctg-gggagagagcagcc 47179942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 51752764 - 51752696
Alignment:
Q  45 tgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtag 115  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  51752764 tgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatt-gaat-acaagccaaaagtag 51752696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 238
Target Start/End: Original strand, 21353342 - 21353434
Alignment:
Q  147 aagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 238  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| |||  |||||| ||||| |||||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||  |||||||||    
T  21353342 aagaatttgtttacccagttcggtctaaagatgacctagtctgggggagagagcagctctccgatccactataatgatgagtttctttacaaa 21353434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 145
Target Start/End: Original strand, 26520061 - 26520114
Alignment:
Q  94 tataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacaca 145  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  26520061 tataaacacaagctaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaagagagaacaca 26520114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 259
Target Start/End: Original strand, 31422930 - 31422980
Alignment:
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  31422930 tttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatgtcaatgggttacaa 31422980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 48665404 - 48665352
Alignment:
Q  206 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  48665404 ccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 48665352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 197
Target Start/End: Original strand, 4552637 - 4552681
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 197  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  4552637 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctactctgagggagaga 4552681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 205 - 241
Target Start/End: Original strand, 8213579 - 8213615
Alignment:
Q  205 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaaga 241  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8213579 tccgttccactataatgatgagtaactttacaaaaga 8213615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 212 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28279487 - 28279455
Alignment:
Q  212 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagat 244  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28279487 cactataatgatgagtaactttacaaaagagat 28279455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31659406 - 31659362
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagaga 197  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  31659406 ttgttgacccagttcggtccaacttgacctaatctgagggagaga 31659362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 56)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15073182 - 15072941
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa- 117  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  15073182 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 15073085  T
Q  118 --aacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||    
T  15073084 acaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccac 15072985  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15072984 tgta-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 15072941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41383132 - 41382901
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  41383132 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtttatggaacaattataaacacaagccagaagtagaaaac 41383035  T
Q  121 a---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    |   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  41383034 aacagcgagagaaaaggaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcact 41382935  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41382934 ata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 41382901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 14419057 - 14419296
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| | ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14419057 cacaccaataaca--aacttgatgtatggagcaagtgataatcaggaaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaac 14419154  T
Q  121 agcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  14419155 agcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatctgtttcactat 14419254  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||    
T  14419255 aatgatgagtaaccttacaaaagacatattaatgggttacaa 14419296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 259
Target Start/End: Original strand, 30480371 - 30480608
Alignment:
Q  22 acaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 121  Q
    ||||||||||||  || ||||| ||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30480371 acaccaataaca--aatttgatgtgtggagtaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtagaaaaca 30480468  T
Q  122 gcgagaga---aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  30480469 gcgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccatttcactata 30480568  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  30480569 -tgatgactaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 30480608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25952988 - 25952759
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25952988 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagaaagtgataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaagcaattataaacacaatccaaaagtagaaaac 25952891  T
Q  121 agcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
     ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25952890 ggcgagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatttacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactata 25952791  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25952790 atgatgagtaattttacaaaagagatatcaat 25952759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 33541275 - 33541506
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33541275 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaataaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 33541372  T
Q  119 acagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
     |||||||||| |   |||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33541373 tcagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaagaaatttttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccttccgtttcact 33541472  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33541473 ata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaat 33541506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 246
Target Start/End: Original strand, 13858354 - 13858577
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  13858354 atcacaccaataaga--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaa 13858449  T
Q  119 acagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  13858450 acagtgagagaaagaaagggagaacacaaa-gaatttgtttacccagttctgtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactat 13858548  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatat 246  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||    
T  13858549 aatgatgagtaactttacaaaagagatat 13858577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36865995 - 36865765
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa 134  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36865995 aaacttgatgtgtggagcaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacaaaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaagaa 36865896  T
Q  135 -----gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 228  Q
         || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  36865895 aaaaagacagaacacaagagaatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtcttgggggagagagcagcattccgtttcactataatgatgagta 36865796  T
Q  229 actttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  36865795 actttacaaaagagatattaatgggttacaa 36865765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15956423 - 15956187
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| | ||| |||||||    
T  15956423 atcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatgaaa--gttataatcacaaacgaaa-gtagaaa 15956329  T
Q  119 acagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  15956328 acaacgagagaaaagaagagagaatacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattgacctaatctgagggagagagaaaccctccgtttcactat 15956229  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15956228 aatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 15956187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 28251431 - 28251663
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  28251431 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatcaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataatcacaagccacaagtagaaa 28251527  T
Q  119 aca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttca 213  Q
    |||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| | ||    
T  28251528 acaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgatcca 28251627  T
Q  214 ctatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  28251628 ctata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaat 28251663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15068452 - 15068211
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa- 117  Q
    |||||||||| ||||  |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||     
T  15068452 atcacaccaacaaca--aacttgatgtgtggaacaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattacaaacacaagccaaaagtagaaa 15068355  T
Q  118 --aacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
      ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||     
T  15068354 acaacagcgagagaaaagaagggtgaacacaaaagaatttgttggcccagttcagtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttccat 15068255  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15068254 tata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 15068211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 15185584 - 15185820
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || | |||||||||||    
T  15185584 atcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagtaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcataaac-aaaagtagaaa 15185678  T
Q  119 acagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||| | |||||||||||||    
T  15185679 acaacgagagaaagaaagagagaacaaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagaacagtcctccgtttcactat 15185778  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  15185779 aatgatgagtaaccttaaaaaagagatatcaatgggttacaa 15185820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Original strand, 27106769 - 27106990
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27106769 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcaca-gacaaaagtagaaaac 27106863  T
Q  121 agcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatag 219  Q
    | |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||     
T  27106864 aacgagagaaagaaagagaaaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctggaggagatagcagccctccgtttcactata- 27106962  T
Q  220 tgatgagtaactttacaaaagagatatc 247  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||    
T  27106963 tgatgagtaaccctacaaaagagatatc 27106990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14808231 - 14807981
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14808231 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaacggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 14808134  T
Q  119 acagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct----------gagggagagagcagcctt 205  Q
    ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||          | |||||||||||||| |    
T  14808133 acaacgagagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagggggagagagcagccct 14808034  T
Q  206 ccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  14808033 ccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 14807981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 2467998 - 2468226
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  2467998 atcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtagggaa--gttataatcacaaaacaaaattagaaa 2468093  T
Q  119 acagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    ||| |||||||||   |||||||||||||  | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  |||| | |||||||||||| ||  ||||||||    
T  2468094 acaacgagagaaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacctagttctgtccaaattgacctaatctgggagagagagcagccctctatttcacta 2468192  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2468193 taatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 2468226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 46 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41385192 - 41384983
Alignment:
Q  46 gtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaa-gtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--gaagagag 139  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||  ||||||||    
T  41385192 gtggagcaagggataatcaaacaaccaaaacaaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtataaaacaacagcgagagaaatggaagagag 41385093  T
Q  140 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 239  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41385092 aacagaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 41384994  T
Q  240 gagatatcaat 250  Q
    ||||| |||||    
T  41384993 gagatgtcaat 41384983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1225568 - 1225417
Alignment:
Q  88 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtc 186  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  1225568 aacaattataaacacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctagta 1225469  T
Q  187 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaa 239  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  1225468 tgagggagagagcggccatccgtttcactata-tgatgagtaacgttacaaaa 1225417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21482778 - 21482540
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaaca--aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtaga 116  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||    
T  21482778 atcacaccaataa--taaacttgatgtgtggagcaagtgataatgaagcaaccaaaaaataaagtgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagtaga 21482684  T
Q  117 aaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||      
T  21482683 aaacagcgagagaaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccctccgtttctt 21482585  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21482584 tataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 21482540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3874467 - 3874240
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3874467 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataaccaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 3874373  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    ||| ||   |  ||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |||||||    
T  3874372 acaacg---gcgagaaga----acacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactata 3874280  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  3874279 -tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 3874240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 37214131 - 37214319
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37214131 cacaccaataaca--aacttgatgtatggagtaagagataagcaagcaaccaaaacaaagtgtatagaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaac 37214228  T
Q  121 agcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    | ||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  37214229 aacgagagagaaaggaagagaaaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggtagagagcagccatccg 37214319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 35872323 - 35872545
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||| || ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  35872323 cacaccaataaca--aacttgatgtgtgaagtaagggataatcaagcaaccaaaataaagtgtatggaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaac 35872420  T
Q  121 -agcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatag 219  Q
     || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||             |||||||||||||| ||||||||||||||     
T  35872421 aagagaga-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaat-------------gggagagagcagccctccgtttcactata- 35872505  T
Q  220 tgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  35872506 tgatgagtaatgttacaaaagagatatcaatggcttacaa 35872545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43530589 - 43530354
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43530589 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 43530495  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   || |||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||| ||||    
T  43530494 acaatggcaagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggagagacagcagccctccg 43530395  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
     | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  43530394 atccactata-tgatgagtagcgttacaaaagagaaatcaat 43530354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 5372046 - 5372274
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5372046 atcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaatggatattcaagcaactaaaattaaaatgtatggaacagttataaactcaagccaaaagtagaa 5372143  T
Q  118 aacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct-gagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    ||||  |||||||||||   |||||| |||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| | || ||||||||||||    
T  5372144 aacaatgagagaaagaa---agaacagaaaataatttattgactcagttcggtccaaattgacctagtctggggggagagagtaaccctccgtttcacta 5372240  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  5372241 taatgatgagtaaccttacaaaaaagatatcaat 5372274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27827460 - 27827246
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  27827460 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaa 27827365  T
Q  119 aca---gcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   |||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27827364 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccg 27827265  T
Q  209 tttcactatagtgatgagta 228  Q
     | ||||||| |||||||||    
T  27827264 atccactata-tgatgagta 27827246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27829771 - 27829557
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||||||    
T  27829771 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-ataagtcaaaagtagaaa 27829676  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27829675 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 27829576  T
Q  209 tttcactatagtgatgagta 228  Q
     | ||||||| |||||||||    
T  27829575 atccactata-tgatgagta 27829557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15809692 - 15809448
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||    
T  15809692 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaaggcaaaaatagaaa 15809598  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |    
T  15809597 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctggggaagagagcagccctctg 15809498  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  15809497 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 15809448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 22684513 - 22684749
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  22684513 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaatcaaagtttatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 22684607  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||    
T  22684608 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagccctcc 22684707  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  22684708 gttccactata-tgatgagtaacgttacaatagagaaatcaat 22684749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21480958 - 21480732
Alignment:
Q  33 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaa 130  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| || | |||| |||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||    
T  21480958 ataaacttgatgtgtggagtaagtgacaatcaaacaaccaaaaaacaaagtgtatggaa--gttataatcacaaac-aaaagaagaaaacaacgagagaa 21480862  T
Q  131 ag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 228  Q
    |   |||||||||||||  | | ||| || ||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  21480861 aagaaagagagaacacacga-attttttttacccagttcgttccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagta 21480763  T
Q  229 actttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  21480762 actttacaaaagagatatcaatgggttacaa 21480732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4424493 - 4424248
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  4424493 atcacaccaataaca---acttggtgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 4424399  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  4424398 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctct 4424299  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||| ||||||||||  |||||||||| | |||||| | ||||||    
T  4424298 gatccactata-tgatgagtaatgttacaaaagataaatcaatgggttacaa 4424248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32339784 - 32339539
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||    
T  32339784 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggggcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaa 32339690  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    || |   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  32339689 aataacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttaacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 32339590  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32339589 gatccactata-tgatgagtatcgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 32339539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 28283082 - 28283304
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || |   ||||  ||||||||||||||||||    
T  28283082 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaaaaa--ataaatacaagccaaaagtagaaa 28283176  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  28283177 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccg 28283275  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaa 238  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  28283276 atccactata-tgatgagtaacgttacaaa 28283304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 14477720 - 14477520
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||||  | |||    
T  14477720 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtgataatcagacaaccaaaacaaagtgtatgaaacaatcataaacacaagccaaaa-aaaaaa 14477624  T
Q  119 acagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacc-tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    | ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||| || | |||| |||| ||||||||||    
T  14477623 aaagcgagagagaaaagaagaaagaacacaaaagaatttgttgaccgcagttcgatccaaattgacctagtctggggtaaagagtagccatccgtttcac 14477524  T
Q  215 tata 218  Q
    ||||    
T  14477523 tata 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31162680 - 31162448
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  31162680 atcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaagtaataattaagtaaccaaaacaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaa 31162585  T
Q  119 acagcgagagaaag---aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgaggg--agagagcagccttccgtttc 212  Q
    ||| |||||||||    || ||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| |||  ||||||||||| || ||| |    
T  31162584 acaacgagagaaaagaaaaaagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggggggagagagcagccctctgttcc 31162486  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31162485 actataatgatgagtaattttacaaaagagatatcaat 31162448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 609197 - 608964
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcg--------- 124  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||             
T  609197 aacttgatgcgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaaaacaaagtgtatgaaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacggcaagaaga 609100  T
Q  125 agagaaagaagaga-gaacacaaaa-gaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 222  Q
    | | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||| |||    
T  609099 acacaaagaagagaagaacacaaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacttagtctgggggagagagcagccctccgatccactata-tga 609001  T
Q  223 tgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  609000 tgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 608964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 3005505 - 3005737
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||  |||||    ||    
T  3005505 atcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaagtaataatcaaacaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaatacaag--aaaaggtacaa 3005597  T
Q  119 acagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||| ||||||||  ||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  3005598 acaacgagagaagaaagggagaacacaa--gaatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagagcacccctccgttccactat 3005695  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3005696 aatgatgagcaactttacaaaagagatatcaatggattacaa 3005737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18811182 - 18810968
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  18811182 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 18811088  T
Q  118 a---acagcgag------agaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    |   ||||||||      | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||| |||    
T  18811087 aacgacagcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggttcaaattgacctaatctgggggagagagcagccctcc 18810988  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagta 228  Q
      | ||||||| |||||||||    
T  18810987 aatccactata-tgatgagta 18810968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18813356 - 18813142
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  18813356 atcacaccaataaca---acttgatatgtagagcaagagataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 18813262  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    |||    ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| |||    
T  18813261 aacgacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctaatatgggggagagagcagccctcc 18813162  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagta 228  Q
      | ||||||| |||||||||    
T  18813161 aatccactata-tgatgagta 18813142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 181901 - 181798
Alignment:
Q  67 caaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagt 165  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  181901 caaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacaacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagt 181802  T
Q  166 tcgg 169  Q
    ||||    
T  181801 tcgg 181798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27911367 - 27911253
Alignment:
Q  134 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 233  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27911367 agagagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctg-gggagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaacttt 27911270  T
Q  234 acaaaagagatatcaat 250  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27911269 acaatagagatatcaat 27911253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27957786 - 27957672
Alignment:
Q  134 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 233  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27957786 agagagagcacaaaagaattttttgacccagttcggtccaaattgacttagtctg-gggagagagcaaccctccgtttcactata-tgatgagtaacttt 27957689  T
Q  234 acaaaagagatatcaat 250  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27957688 acaatagagatatcaat 27957672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 44721317 - 44721074
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  44721317 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaataatta-aat-acaagtcaaaagtagaaa 44721223  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||     
T  44721222 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctcca 44721123  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  44721122 atccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 44721074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 31035522 - 31035358
Alignment:
Q  86 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 183  Q
    |||||| ||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | ||||||     
T  31035522 ggaacaattaaaaacacaagc-aaaactagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgaccta 31035425  T
Q  184 --gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
      ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31035424 tagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 31035358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 249
Target Start/End: Original strand, 31578216 - 31578373
Alignment:
Q  88 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtc 186  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||   |||||| ||| |||||||||| | | |||||| |||    
T  31578216 aacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaga-gagagcacacaaaa---tttgtttacccagttcggtcctatactgacctagtc 31578310  T
Q  187 tgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |  ||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31578311 taggggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 31578373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 6376354 - 6376229
Alignment:
Q  124 gagagaaaga-agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtg 221  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||    
T  6376354 gagagaaagagagagagaacacacaa-aatttgtttactaagttcggtccaatactgacctagtctgagggagagagcagccttctgttccactataatg 6376256  T
Q  222 atgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||    
T  6376255 atgagtaactttac-aaagagatatcaa 6376229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43082447 - 43082258
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  43082447 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaaa 43082353  T
Q  119 aca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |||    |||||      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43082352 acaacgtcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 43082258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43080076 - 43079887
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  43080076 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaatggataattaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagtcaaaagtagaaa 43079982  T
Q  119 aca---gcgaga-----gaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |||   ||||||      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43079981 acaacggcgagaagaacaaaagaagaacaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 43079887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16833854 - 16833779
Alignment:
Q  184 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16833854 gtctgtgggagagagcagcctttcgttccactataatgttgagtaactttacaaaagagatatcaaatgattacaa 16833779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Original strand, 3883470 - 3883553
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 121  Q
    |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3883470 aacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaca 3883553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27911547 - 27911441
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||| | | | ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27911547 atcacaccaataaaa--aacttgatgtgtggagcaagtgataatta-gaaactaaaacaaagtgt-tggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 27911452  T
Q  119 acagcgagaga 129  Q
    ||| |||||||    
T  27911451 acaacgagaga 27911441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 27957966 - 27957860
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||| | | | ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  27957966 atcacaccaataaaa--aacttgatgtgtggagcaagtgataatta-gaaactaaaacaaagtgt-tggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 27957871  T
Q  119 acagcgagaga 129  Q
    ||| |||||||    
T  27957870 acaacgagaga 27957860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 3896121 - 3896063
Alignment:
Q  190 gggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 248  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3896121 gggagagagcagccatccgttctactttaatgatgagtaactttacaaaagagatatca 3896063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14419786 - 14419732
Alignment:
Q  192 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatat 246  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14419786 gagagagcagccatccgttttactataatgatgagtaaccttacaaaagagatat 14419732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Original strand, 24873059 - 24873158
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaacc-aaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtaga 116  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||  ||||||||||| |||||    
T  24873059 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaaggtaga 24873153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 174
Target Start/End: Original strand, 31566493 - 31566578
Alignment:
Q  88 aacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa 174  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||| ||||||||||||    
T  31566493 aacaattataaacacaagc-agaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaactcacga-aatttgtttacccagttcggtccaa 31566578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19752487 - 19752438
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||||    
T  19752487 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagc 19752438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 28228714 - 28228669
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacct 182  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28228714 agaacacaaaagaatgtgtttacctagttcggtccaatattgacct 28228669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 69)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9020378 - 9020135
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  9020378 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagagataatcagacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtagaaa 9020281  T
Q  119 aca---gcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    |||   ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||    
T  9020280 acaacagcgagagaaaagggaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagccccccgtttc 9020181  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9020180 actata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 9020135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 24338315 - 24338552
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  24338315 atcacatcaataaca--aacttgatgtgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaa 24338412  T
Q  119 acagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||| |||||| |||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24338413 acaacgagagaaaagaagagataacacaaaaatatttgtttacctagttcggtccaaattgacatagtct--gggggagagcagccctccgtttcactat 24338510  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  24338511 aatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 24338552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Original strand, 30728689 - 30728913
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  30728689 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaaacaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaatacaagtcaaaagtagaaa 30728786  T
Q  119 acagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||||||||   || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30728787 acagcgagagagaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagccttccgttccact 30728886  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagaga 243  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  30728887 ataat-atgagtaactttacaaaagaga 30728913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 3629733 - 3629969
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagcc-aaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3629733 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaaagtagaaaa 3629830  T
Q  120 cagcgagag-aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactata 218  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || |||||||||||    
T  3629831 caacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtatg-gggagagagcagccctcagtttcactata 3629929  T
Q  219 gtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3629930 -ttattagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 3629969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 3631806 - 3632043
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    |||||||||||||  |||||||  ||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  3631806 cacaccaataaca--aacttgacgtgtggagcaagtgataattaggcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaac 3631903  T
Q  121 agcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    | |||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  3631904 atcgagagaaaaaggaagagataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct--gggacagagcagccctccgtttcactat 3632001  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  3632002 aatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 3632043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 11982892 - 11983134
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11982892 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaaggaataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattacaatcacaagccaaaagtagaaa 11982988  T
Q  119 aca---gcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    |||   ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | |    
T  11982989 acaacagcgagagaaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcc 11983088  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  11983089 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 11983134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15346793 - 15346556
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15346793 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggaacaagtgataatcaagcaaccaaaacaaagtatatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 15346696  T
Q  119 acagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactat 217  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15346695 acaacaagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctttccgtttcactat 15346597  T
Q  218 agtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  15346596 a-tgatgaataactttacaatagagatatcaatgggttacaa 15346556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 259
Target Start/End: Original strand, 1069609 - 1069824
Alignment:
Q  47 tggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga---aagaagagagaaca 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  1069609 tggagcaagggatagtcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagcaaaaagtagaaaacagcgagagagaaaagaagagagaaca 1069708  T
Q  144 caaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagaga 243  Q
     |||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1069709 taaaagaatttgttgattcagttcggtccaaattgacctagtatggggaagagagcagccctccgtttctctataatgatgagtaaccttacaaaagaga 1069808  T
Q  244 tatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||| | ||||||    
T  1069809 tatcaatgggttacaa 1069824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15367478 - 15367240
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15367478 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcatgtgataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 15367381  T
Q  119 acagcgagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg-gagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    |   |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  15367380 aatacgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaattgacctagtctggggagagagagcagccttccgtttcacta 15367282  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  15367281 ta-tgatgaataactttacaatagagatattaatgggttacaa 15367240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13057639 - 13057403
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||||   | |||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  13057639 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaaaggataatcaagcaaccaata-aaagtgg--gcaacaattataatcacaaac-aaaagtagaaa 13057546  T
Q  119 acagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    ||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  13057545 acagatagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgaccgagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagtagccctccgtttcacta 13057446  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13057445 taatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 13057403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 250
Target Start/End: Original strand, 12186000 - 12186168
Alignment:
Q  83 tatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacc 181  Q
    ||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  12186000 tatggaacaattataaacacaaggaaaaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacaaaataatttgtttacccagttcggttcaaattgacc 12186099  T
Q  182 tggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    | ||| |||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12186100 tagtccgaggcagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 12186168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 28241182 - 28241426
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28241182 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 28241276  T
Q  119 acagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||| ||         | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  28241277 acaacggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccg 28241376  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  28241377 attcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 28241426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 15541010 - 15541245
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||   | ||||||||||||||||| | |||| ||||||    
T  15541010 atcaaaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagaaaccaaaacaagttg---gtaacagttataatcacaaac-aaaattagaaa 15541103  T
Q  119 acagcgagaga--aagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  15541104 acaacgagagagaaaaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagtccaaattaacctagtctggaggagagagcagctttctgtttcacta 15541203  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15541204 ta-tgatgaataactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 15541245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14466771 - 14466541
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| | |||||||||||    
T  14466771 atcacaccaataa--taaatttgatgtgtgcagcaagtgatagtcaagcaaccaaaacaaaatgtatgaaa--gttataatcacaaac-aaaagtagaaa 14466677  T
Q  119 acagc---gagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    |||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||| | ||||| | |||| |||||    
T  14466676 acagcagcgagagaaagaaagagagaacacaagagaatttgctgacccagttcggtccaaattgacctagtatgggggaaacagcagtcatccggttcac 14466577  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14466576 tataatgatgaataaccttacaaaagagatatcaat 14466541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 107 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13040117 - 13039963
Alignment:
Q  107 caaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 204  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  13040117 caaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtctaaattgacctagtctaggggagagagcagccc 13040018  T
Q  205 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  13040017 tccgtttcactataatgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 13039963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 14507037 - 14507280
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14507037 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 14507131  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  14507132 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 14507231  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||| |||| |||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  14507232 attcactata-tgataagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 14507280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 32280443 - 32280205
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||| |||||||  |||||||| | ||||| ||| |||| |||||||||||| ||||   ||  | |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  32280443 atcacacaaataaca--aacttgatgtatggagtaagtgataatcaagcaaccaatacaa---gtgggtaacaattataaatacaagccaaaagtagaaa 32280349  T
Q  119 acagc--gagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    | | |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  32280348 ataacatgagagaaaggaagagagaacacaagagaattttttgaccaagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttttact 32280249  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32280248 ataacgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 32280205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26065435 - 26065231
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26065435 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacagttataatcacatgccaaaagtagaa 26065339  T
Q  118 ---aacagcgaga-----gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 209  Q
       |||||| |||      |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  26065338 aacaacagcaagaagaacaaaagaatagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccga 26065240  T
Q  210 ttcactata 218  Q
    | |||||||    
T  26065239 tccactata 26065231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26085404 - 26085200
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26085404 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacagttataatcacatgccaaaagtagaa 26085308  T
Q  118 ---aacagcgaga-----gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgt 209  Q
       |||||| |||      |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  26085307 aacaacagcaagaagaacaaaagaatagagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccga 26085209  T
Q  210 ttcactata 218  Q
    | |||||||    
T  26085208 tccactata 26085200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 1230109 - 1230354
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |  || |||||||||||| |||    
T  1230109 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggatcaagagataatcaagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattaaataca-aagccaaaagtataaa 1230204  T
Q  119 aca---gcgagagaaa------gaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||  ||      ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1230205 acaacggcgagaagaacacaatgaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccatccg 1230304  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  1230305 ttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 1230354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 4816091 - 4816336
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  4816091 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagtcaaaagtagaaa 4816185  T
Q  119 a----cagcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    |    | ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  4816186 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 4816285  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
      | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  4816286 aatccactata-tgatgagtaccgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 4816336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30967654 - 30967410
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  30967654 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagtaaccaaaacaaagtgcatggaataatta-aat-acaagtcaaaagtagaaa 30967560  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||  ||||    
T  30967559 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtttgggggagagagcagctctccg 30967460  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  30967459 atccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 30967410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 2628746 - 2628990
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||    
T  2628746 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaa 2628840  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  2628841 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 2628940  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  2628941 gatccactata-tgatgagtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 2628990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 250
Target Start/End: Original strand, 3233605 - 3233826
Alignment:
Q  39 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca---gcgagagaaa--g 132  Q
    ||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||||| ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||   ||||||||||  |    
T  3233605 ttgatgtgtggagtaagtgataatcaggcaaccaaaatcaaagtgcatgaaacaattataaacacaaaccaaaagtagaaaacaacagcgagagaaaagg 3233704  T
Q  133 aagagagaacacaaaagaatttgttgacc-----tagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagt 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||    
T  3233705 aagagagaacacaaaagaatttgttgacccagttcagttcggtcaaaattgacctagtgtgggggagagagcagccctccgtttcactata-cggtgagt 3233803  T
Q  228 aactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||| ||||||||||||| |||||    
T  3233804 aacgttacaaaagagatgtcaat 3233826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 259
Target Start/End: Original strand, 14458643 - 14458872
Alignment:
Q  38 cttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcga-gagaa----- 130  Q
    |||||| ||||||| ||  |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||         
T  14458643 cttgatgtgtggagtaatggataatcaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaaacaacgacgagaagaaca 14458740  T
Q  131 ---agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgag 226  Q
       |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || | | ||||||| |||||||    
T  14458741 caaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctctgatccactata-tgatgag 14458839  T
Q  227 taactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  14458840 taacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 14458872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3390713 - 3390588
Alignment:
Q  134 agagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 233  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3390713 agagagatcacaaaagaatttgttgacccaatttggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctccgtttcactgtaatgatgagtaacttt 3390614  T
Q  234 acaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  3390613 acaaaagagatatcaatgggttacaa 3390588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15720074 - 15719851
Alignment:
Q  33 ataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaac-aaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 131  Q
    ||||||||||| ||||||   || ||||||||||||| |||||  |||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  15720074 ataaacttgatgtgtgga---agtgatagtcaagcaatcaaaaataaagtgtatggaa--gttataatcacaaacaaaaa-tagaaaacagcgagagaaa 15719981  T
Q  132 g--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagta 228  Q
       |||||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||| | |||||| |  || ||||||||||| |||||||||    
T  15719980 agaaagagagaacacatga-aatttgtttaccaagttcggtccaaattgacctagtatggggggaaagagcaactctctgtttcactataatgatgagta 15719882  T
Q  229 actttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15719881 actttacaaaagagatatcaatgggttacaa 15719851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 259
Target Start/End: Original strand, 3027740 - 3027959
Alignment:
Q  39 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gag 137  Q
    ||||| |||||||||||  ||| || ||||||||||  |||||||||||||  |||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3027740 ttgatgtgtggagcaagtaataatcgagcaaccaaat-aaagtgtatggaa--gttataaatacaagtcaaaagtagaaaacaacgagagaaagaaagag 3027836  T
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgaggg-agagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 235  Q
    ||||||||  | |||||||| | | ||||||||| |||  |||||| ||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3027837 agaacacacga-aatttgtttatccagttcggtcaaaaactgacctagtctggggggaaagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac 3027935  T
Q  236 aaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  3027936 aaaagagatatcaatgggttacaa 3027959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 19704424 - 19704673
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa--caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtaga 116  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  19704424 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaaatcaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtaga 19704518  T
Q  117 aaaca-----gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 204  Q
    ||| |     ||||||       |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  19704519 aaaaacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaataatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccc 19704618  T
Q  205 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa-agagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||  | ||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  19704619 tccaatccactata-tgatgagtaccgttacaaagagagaaatcaatgggttacaa 19704673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Original strand, 15532674 - 15532786
Alignment:
Q  145 aaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagat 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15532674 aaaagaatttgttgacctagttcagtcaaaattgacctagtct-agggatagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactttacaaaagagat 15532771  T
Q  245 atcaattgattacaa 259  Q
    |||||| | ||||||    
T  15532772 atcaatgggttacaa 15532786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 10584340 - 10584227
Alignment:
Q  124 gagagaaag-aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  10584340 gagagaaaggaagagagaacacaaaaaaatttgttgacacagttcggtccaaattgacctagtctggaggagagagcagccctccgtttcactataatga 10584241  T
Q  223 tgagtaactttaca 236  Q
    |||||||| |||||    
T  10584240 tgagtaaccttaca 10584227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19696884 - 19696649
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| || || |||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  19696884 atcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaa-ag-taatcaagcaaccgaaacaaagtgggtg--acagttataaacacaaac-aaaagtagaaa 19696792  T
Q  119 a-cagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||||| | |||||||||||  || ||| ||||    
T  19696791 aacagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagtctgggagagagagcagctatctgttccact 19696693  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19696692 ataatgatgaataactttacaaaagagatatcaaaggattacaa 19696649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 259
Target Start/End: Original strand, 12161502 - 12161662
Alignment:
Q  100 cacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa---gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagag 196  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||| || | ||||||||    
T  12161502 cacaagacaaaagtagaaaacagcgagagagaaaggaagagagaacacaaaataatttgttgattcagttcggtccaaattaacctagt-ttagggagag 12161600  T
Q  197 agcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  12161601 aacagccatccattttactata-tgatgagtaaccttacaaaagagatatcaatgggttacaa 12161662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 30034466 - 30034708
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  |||||| |||||||||||    
T  30034466 atcacaccaataaca---acttgatgtatggagcaag-gataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaa--gttataaatacaagctaaaagtagaaa 30034558  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagagag-aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||    
T  30034559 acaatggcgagaagaacacaaagaagataataacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacccagtctgggggagagagcagccctccg 30034658  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | | ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  30034659 atccgctata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 30034708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 91 - 238
Target Start/End: Original strand, 22857891 - 22858038
Alignment:
Q  91 agttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctg 188  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| |||||    
T  22857891 agttataaacacaagc-aaaagtacaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacga-aatttgtttacacagttcggtccaatactgacctagtctg 22857988  T
Q  189 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaa 238  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22857989 ggggagagagcagccatccgttccactataatgatgagtaactttacaaa 22858038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 29754569 - 29754813
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||||    
T  29754569 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acgagccaaaaagtagaa 29754663  T
Q  118 aaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||      ||||||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  29754664 aacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcc 29754763  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  29754764 gatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 29754813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26945539 - 26945362
Alignment:
Q  73 aaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggt 170  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| |||  | |||||||| ||| ||||||||    
T  26945539 aaacaaagtgtaaggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaaagaaagagagaagacacga-aatttgtttacccagttcggt 26945443  T
Q  171 ccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||  |||| |  |||| ||| |||||| ||| | ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26945442 ccaaacctgacataatctgggggggagagctgcccttcgttctactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 26945362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 249
Target Start/End: Original strand, 25465524 - 25465686
Alignment:
Q  86 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctg 183  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||| |     
T  25465524 ggaacaattataaactcaagc-aaaagtagaaaacagcgagagaaagaaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacata 25465621  T
Q  184 gtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    || || | |||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25465622 gtatgggagagagagcagtcctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatatcaa 25465686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 133 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 25477616 - 25477519
Alignment:
Q  133 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaac 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  25477616 aagagagaatacaaaagaatttgttgacccatttcggtccaaattgacctagtatgggggagagagcagccctctgtttcactataatgatgagtaac 25477519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 26068255 - 26068499
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  26068255 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaaagtagaa 26068349  T
Q  118 aaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||    
T  26068350 aacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctcc 26068449  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||  ||||||| ||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  26068450 gatccactat-ttgatgagcaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 26068499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33309310 - 33309066
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  33309310 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 33309216  T
Q  118 aaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  33309215 aacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcc 33309116  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  33309115 gatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 33309066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 3394800 - 3394708
Alignment:
Q  38 cttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 129  Q
    |||||| ||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3394800 cttgatgtgtggagaaatggataatcaagcaaccaaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagaga 3394708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 25480309 - 25480217
Alignment:
Q  39 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa 131  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25480309 ttgatgtgtagagtaagggatagtcgagcaaccaaaataaagtgtatgaaacaattataatcacaagtcaaaagtagaaaacagcgagagaaa 25480217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33311579 - 33311335
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  33311579 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 33311485  T
Q  118 aaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||| ||||||| |||    
T  33311484 aacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagaaagcagccctcc 33311385  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  33311384 gatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 33311335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 200
Target Start/End: Original strand, 26932423 - 26932609
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa- 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| ||||||     
T  26932423 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaggtagaaa 26932517  T
Q  118 ---aacagcgag------agaaagaagagagaacacaaaag-aatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagca 200  Q
       ||| |||||      | |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||    
T  26932518 aacaacggcgagaagaacacaaagaaga-agaacacaaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagca 26932609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22491059 - 22490917
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  ||||| || |||||||| |  |||| |||||||||||||||||   ||  | |||| |||||| || | ||||||||||||||    
T  22491059 atcacaccaataaca--aacttaatgtgtggagctaaggataatcaagcaaccaaaacaa---gtgggtaacaattataaacataggccaaaagtagaaa 22490965  T
Q  119 acagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagt 165  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22490964 acaacgagagaaagaaagagagagcacaaaagaatttgttgacctagt 22490917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 26065981 - 26066228
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  26065981 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaacaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaaagtagaa 26066075  T
Q  118 aaca---gcgagag-----aaagaagag-----agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcct 204  Q
    ||||   ||||||      ||||||||      ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||     
T  26066076 aacaactgcgagaagaacaaaagaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccc 26066175  T
Q  205 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| | ||||||  |||| |||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  26066176 tccgatccactat-ttgataagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 26066228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17012466 - 17012258
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag-aag 135  Q
    ||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  17012466 acttgatgtgtggagcaaataataatcaagcaaccaaaacaaagtgtat-gaac-gtta-aaacacaagccaaaagtagaaaatagtgagagaaagaaag 17012370  T
Q  136 agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttta 234  Q
    |||||| |  |   |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||  | |  |  | ||| |||||  ||||||||||||||    
T  17012369 agagaatatga---aatttgtttacctagttcggtccaatactgacctagtctgggggagagatgatctctatg-ttccctataacgatgagtaacttta 17012274  T
Q  235 caaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||||||||||||    
T  17012273 caaaagagatatcaat 17012258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 36 - 259
Target Start/End: Original strand, 20915231 - 20915460
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa-cagcga-gagaa--- 130  Q
    |||||||| ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||       
T  20915231 aacttgatgtgtggggcaaggggtaatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaataatta-aat-acaagccaaaagtagaaaaacaacgacgagaagaa 20915328  T
Q  131 -----agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatg 224  Q
         |||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||  | ||||||| |||||    
T  20915329 cacaaagaagagaagaacacaga-gaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccactata-tgatg 20915426  T
Q  225 agtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  20915427 agtaccgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 20915460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 249
Target Start/End: Original strand, 28078067 - 28078291
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| | ||| |||||||||||| | ||| |||   |||| | |||||| ||||||| ||||||||||    
T  28078067 atcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaaaa-ataatcaagcaaccaatatcaacgtg---ggaagaattataaacacaagc-aaaagtagaa 28078159  T
Q  118 aacagcgagagaaagaaga-gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaa-ttgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    | ||||||||||||||| | |||||||||  | |||||||| |||  |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||| |||    | ||||    
T  28078160 a-cagcgagagaaagaaaaagagaacacacga-aatttgtttaccctgttcggtctaaaattgacctagtatgagggagagagcagtcttataatccact 28078257  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28078258 ataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 28078291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 5273076 - 5273266
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||   || |||  |||||||||||||||||    
T  5273076 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagtgtatgtaat--ttttaaatacaagccaaaagtagaa 5273170  T
Q  118 aaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    ||||   ||||||      ||||||||   |||||||  |  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5273171 aacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacactgagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 5273266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 259
Target Start/End: Original strand, 12937126 - 12937298
Alignment:
Q  86 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaatt-gacct 182  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||   |||| |||||||| || |||||||| |||  ||||| ||||||   |||||    
T  12937126 ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaaaacaacgagagaaaagaaagatagaacacacaa-aatttgtttacccggttcgttccaaaacagacct 12937223  T
Q  183 ggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  12937224 agtctg-gggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatattaaatggttacaa 12937298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 249
Target Start/End: Original strand, 16455421 - 16455521
Alignment:
Q  150 aatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatca 248  Q
    |||||||| ||  |||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16455421 aatttgtttactcagttcggtccaatactgacctagtatgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaattttacaaaagagatatca 16455520  T
Q  249 a 249  Q
    |    
T  16455521 a 16455521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 86 - 249
Target Start/End: Original strand, 28037659 - 28037825
Alignment:
Q  86 ggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaa-agaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctg 183  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || | ||| | |||||||| ||| || ||||||||||  ||||||     
T  28037659 ggaacaattataaacacaaga-aaaagtagaaa-cagcgagagaaagaaaagaaaaaaaaaacacaatttgtttacccagctcggtccaaaactgaccta 28037756  T
Q  184 gtctgagggagagagcagccttccgt---ttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    | ||| |||||||||||||||| |||   | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28037757 gactgggggagagagcagcctttcgtccgtccactattatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 28037825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 12195374 - 12195565
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  12195374 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagaa 12195468  T
Q  118 aaca---gcgag------agaaagaaga--gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    ||||   |||||      | ||||||||   ||||||||||  || ||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12195469 aacaacggcgagaagaacacaaagaagaagaagaacacaaagaaacttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 12195565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 249
Target Start/End: Original strand, 25078529 - 25078653
Alignment:
Q  124 gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtga 222  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| | ||| || ||| ||||| | |||||| |||| || |||    
T  25078529 gagaaaaagaagagagaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaatactgacctagactg-ggaagaaagcagtcctccgttccactgtaatga 25078626  T
Q  223 tgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  25078627 cgagtaactttacaaaagagatatcaa 25078653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 259
Target Start/End: Original strand, 12911471 - 12911551
Alignment:
Q  178 gacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||    
T  12911471 gacctagtctgggggagagagcagccctccgttccactataatgatgagtaactttac-aaagagatattaaatggttacaa 12911551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18322546 - 18322482
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatg 86  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18322546 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg 18322482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 30445801 - 30445743
Alignment:
Q  191 ggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30445801 ggagagagcagttctccgttccactataatgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 30445743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 146
Target Start/End: Original strand, 15530084 - 15530156
Alignment:
Q  78 aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagc----gagagaaagaagagagaacacaa 146  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||||||||    
T  15530084 aagtgtatggaacaattataaatacaagccaaaagtagaaaacaacagcagagaaaaagaagagagaacacaa 15530156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 196 - 250
Target Start/End: Original strand, 15530166 - 15530219
Alignment:
Q  196 gagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15530166 gagcagccctccgttccactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaat 15530219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 172
Target Start/End: Original strand, 17904287 - 17904368
Alignment:
Q  89 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc 172  Q
    |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| | | || ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  17904287 acagttataaacacaagc-aaaattagaaaacaacgagagaga-atgaaagaacacaaaataatttgtttacctagttctgtcc 17904368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3833541 - 3833495
Alignment:
Q  204 ttccgtttcactatagtgatgagt-aactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3833541 ttccgttccactataatgatgagttaactttacaaaagagatatcaa 3833495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 75
Target Start/End: Original strand, 8717215 - 8717268
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa 75  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  8717215 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaa 8717268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 30443652 - 30443532
Alignment:
Q  107 caaaagtagaaaacagcgagagaaagaa---gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagc 202  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||   |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | | |||| ||||  |||||||||||||    
T  30443652 caaaaatagaaaacaacgaaagaaagaaagagagaaaacacacaaaaatttgtttacccagttcggtccaatacttacctagtctcggggagagagcagc 30443553  T
Q  203 cttccgtttcactatagtgat 223  Q
      |||||| ||||||| ||||    
T  30443552 tctccgttacactataatgat 30443532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11262793 - 11262678
Alignment:
Q  133 aagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaact 231  Q
    |||||||||||||  | |||||||| |||  ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||   |||||| || |||| ||||||||  ||    
T  11262793 aagagagaacacacga-aatttgtttaccccgttcggtccaatactgacctagtctgggggagagagcagttctccgttacaatataatgatgagtttct 11262695  T
Q  232 ttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11262694 ttac-aaagagatatcaa 11262678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20527081 - 20527025
Alignment:
Q  192 gagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20527081 gagagagcagctctccgttccactataatgatgaataactttac-aaagagatatcaa 20527025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 153 - 202
Target Start/End: Original strand, 31936591 - 31936640
Alignment:
Q  153 ttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagc 202  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||||||    
T  31936591 ttgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagc 31936640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 22611119 - 22610999
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    ||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| |  || |||||||||||| | |||||||   |||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  22611119 atcacaccaataaaata--cttgatgtgtggagcaaaa--taatcaagcaaccaatatcaaagtg---ggaacaattataaacacaagc-aaaagtagaa 22611028  T
Q  118 aacagcgagagaaag-aagagagaacaca 145  Q
    ||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  22611027 aacaatgagaaaaagaaagagagaacaca 22610999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 14250 - 14487
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  14250 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 14346  T
Q  119 acagcgagag---aaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcact 215  Q
    ||||||||||   || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14347 acagcgagagagaaaggaagagagaacac--aagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctaggggagagagcagccctccgttccact 14444  T
Q  216 atagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14445 ata-tgatgagtaacgttacaaaagagatatcaatgggttacaa 14487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 89 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15369 - 15202
Alignment:
Q  89 acagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgaga-gaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 187  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||||||||||||||||| |  |    
T  15369 acagttataatcacaa-acaaaagtagaaaacaacatgataaaagaagagagaacac--aagaatttgttgagtcagttcggtccaaattgacctagcat 15273  T
Q  188 gagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15272 gggggagacagcagccttccgttccactata-tgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 15202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 85653 - 85413
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  85653 atcacaccaataaca--atcttaatgtgtggagcaagagataatcaaacaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataaacacaagtcaaaagtagaa 85556  T
Q  118 aacagcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  85555 aacaacgagagaaaagaagagagaacacaaaagaatttgtttacctggttcagttcaaattgacctagtctgggggagagagcagtcatccgttccacta 85456  T
Q  217 tagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  85455 taatgatgagtaactttacgaaagagatatcaatgggttacaa 85413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 79611 - 79368
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  79611 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataattaggcaaccaaaatcaaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtagaa 79514  T
Q  118 aacagc-----gagagaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttc 212  Q
    |||| |     |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  79513 aacaacagcaagagaaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgttcc 79414  T
Q  213 actatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  79413 actata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 79368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4403 - 4179
Alignment:
Q  35 aaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa-ga 133  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||  |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4403 aaacttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaatcaaaatgaagtgtatagaataattataaacacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaatca 4304  T
Q  134 agag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactt 232  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4303 agagaagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctg-gggagagagcagccctccgtttcactata-tgatgagtaactt 4206  T
Q  233 tacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||    
T  4205 tacaaaagagatatcaatgggttacaa 4179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 183502 - 183746
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  183502 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccgaaacaaaatgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 183596  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  183597 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgagggagagagcagccctccg 183696  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  183697 tttcactata-tgatgagtaacattacaaaagagaaatcaatgggttacaa 183746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 52436 - 52203
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  52436 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 52339  T
Q  119 ac----agcgagagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg--gagagagcagccttccgttt 211  Q
    ||    || |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  52338 acaactagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagtttggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgttt 52241  T
Q  212 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  52240 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 52203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 50437 - 50235
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  50437 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaagtagaaa 50340  T
Q  119 ac----agcgagagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagg--gagagagcagccttccgttt 211  Q
    ||    || |||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||| |||||||    
T  50339 acaactagagagaaaaagaagagaagaacac--aagaatttgttgacccagttaggtccaaattgacctagtctgggggagagagagcagccctccgttt 50242  T
Q  212 cactata 218  Q
    |||||||    
T  50241 cactata 50235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 80283 - 80051
Alignment:
Q  21 cacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaa 119  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  80283 cacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagtaataatcaggcaacgaaaatcaaagtgtatggaaaaattataaacacaagccaaaagtagaaaa 80186  T
Q  120 ca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcac 214  Q
    ||   ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  80185 caacagcgagagaaaaggaagagagatcacaaaagaatttgttgacccagttcaatccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccgtttcac 80086  T
Q  215 tatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaat 250  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  80085 tata-tgatgagtaacgttacaaaagagatgtcaat 80051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 41344 - 41588
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41344 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 41438  T
Q  119 acagcg---------agagaaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||| ||         | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  41439 acaacggcgaaaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattcacctagtctgggggagagagcagccctccg 41538  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  41539 attcactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 41588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 11335 - 11578
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaaca--aagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtaga 116  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||| |||  ||| | ||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11335 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagtaaggaataattaagcaacgaaaaaataaagtgtatggaacaattataatcacaagccaaaagtaga 11431  T
Q  117 aaaca---gcgagagaaa--gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgttt 211  Q
    |||||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||  |     
T  11432 aaacaacagcgagagaaaaagaagagagaacacaaaagaatttgttgacccggttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccaatc 11531  T
Q  212 cactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||    
T  11532 cactata-tgatgagtaacgttacaaaagagaaatcaatgggttacaa 11578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 36016 - 35817
Alignment:
Q  22 acaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaac 120  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  36016 acaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggatagtcaagcaaccaaaaacaaagtgtatgaaacaattataaacacaagccaaaactcgaaaac 35919  T
Q  121 a---gcgagagaaa-gaagagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcacta 216  Q
    |   |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  35918 aacagcgagagaaaagaagagagaacacaaaataatttgttgacccaattcggtccaaattgacctagtctaaggaagagagcagccctccgttccacta 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 69152 - 69396
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  69152 atcacaccaataaca--aacttgatgtgtggagcaagggataatcaggcaaccaaaacaaaatgtatggaa--gttataaatacaagccaaaagtagaaa 69247  T
Q  119 aca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    |||   ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||    
T  69248 acaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccg 69347  T
Q  209 tttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
     | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  69348 atccactata-tgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 69396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Original strand, 1313 - 1557
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1313 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatgtaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 1407  T
Q  119 a----cagcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    |    | ||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  1408 aacaacggcgagaagatcacaaagaagagaagaacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctcc 1507  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  1508 gatccactata-tgatgagtatcgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 1557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 259
Target Start/End: Original strand, 1529 - 1748
Alignment:
Q  39 ttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaag--aaga 136  Q
    ||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||    
T  1529 ttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatggaa--gttataaacacaagccaaaagtagaaaacaatgagagaaaagaaaga 1625  T
Q  137 gagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaat-tgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttac 235  Q
    |||||||||  | |||||||| ||| ||||||||| |||  |||||| || || |||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1626 gagaacacacga-aatttgtttacccagttcggtcaaaaactgacctagtatgggggagagagcagccctacgttccactataatgatgagtaactttac 1724  T
Q  236 aaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  1725 aaaagagatatcaatgggttacaa 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29597 - 29384
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||    
T  29597 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaatcaaaacaaagtgtatggaacaatta-aataa-aagccaaaagtagaaa 29503  T
Q  119 acagcg-agagaa--------agaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccg 208  Q
    ||| || ||||||        | |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29502 acaacggagagaagaacacaaaaaagagaagaacacaaacgaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccg 29403  T
Q  209 tttcactatagtgatgagta 228  Q
     | ||||||| |||||||||    
T  29402 atccactata-tgatgagta 29384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 187
Target Start/End: Original strand, 1312 - 1485
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1312 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagaaaaagataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 1406  T
Q  119 aca---gcgag------agaaagaag-agagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtct 187  Q
    |||   |||||      | ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  1407 acaacggcgagaagaacacaaagaagaaaaggacacaaaagaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtct 1485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 259
Target Start/End: Original strand, 16536 - 16756
Alignment:
Q  37 acttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaa--gaa 134  Q
    ||||||| |||||||||||  ||| |||||||| | |||||||||| |||||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||| |||||||||   ||    
T  16536 acttgatgtgtggagcaagtaataatcaagcaa-ctaaacaaagtgcatgga--agttataaatacaag-caaaaatagaaaacaacgagagaaaagaaa 16631  T
Q  135 gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtcc-aaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaacttt 233  Q
    |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||  | || |  ||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16632 gagaaaacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaaaactgacctggtctgggggagagataaaccctttgtcccactataatgatgagtaacttt 16730  T
Q  234 acaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||    
T  16731 acaaaagagatatcaatgggttacaa 16756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 107 - 259
Target Start/End: Original strand, 15774 - 15927
Alignment:
Q  107 caaaagtagaaaacagcgagagaaagaa-gagagaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctgagggagagagcagcct 204  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||||| || |||||||| ||| |||||||||||| | |||||| ||| | || ||||||||| |     
T  15774 caaaagtagaaaacaacgggagaaagaaagagataacacacaa-aatttgtttacccagttcggtccaacactgacctagtcgggggcagagagcagtcc 15872  T
Q  205 tccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15873 tccgttccactctaatgatgagtaactttacaaaagagatatcaatgggttacaa 15927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6626 - 6383
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |   ||||  |||||||||||||||||    
T  6626 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaata---ataaatacaagccaaaagtagaa 6533  T
Q  118 aaca---gcgagag-----aaagaagag--agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttcc 207  Q
    ||||   ||||||      ||||||||   ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  6532 aacaacggcgagaagaacaaaagaagaagaagaacacaaagaaatttgttgactcagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcc 6433  T
Q  208 gtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaattgattacaa 259  Q
    | | ||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||    
T  6432 gatccactat-ttgatgagtaacgttac-aaagagaaatcaatgggttacaa 6383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 453 - 279
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  453 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaa 359  T
Q  118 aacagcgagagaaagaagag-agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    ||       | || |  ||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  358 aa-------acaacggcgagaagaacacaaagaaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagcc 279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22418 - 22319
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  22418 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttacaa 22320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24693 - 24594
Alignment:
Q  138 agaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaa 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||| ||||||    
T  24693 agaacacaaaggaatttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatccactat-ttgatgagtaacgttacaa 24595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 24819 - 24751
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaa-caaagtgtatggaa 89  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  24819 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataattaagcaaccaaaatcaaagcgtatggaa 24751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 121
Target Start/End: Original strand, 12749 - 12832
Alignment:
Q  36 aacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaaaca 121  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  12749 aacttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaaacaaagtgtatg--aaagttataaatacaagccaaaagtagacaaca 12832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3117
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaa-gtagaa 117  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||  ||||| ||||| ||||||    
T  3306 atcacaccaataaca---acttgatgtgtggagcaagggataatcaagcaaccaaa-caaagtgtatgaaa--gttataaatacaagtcaaaaagtagaa 3213  T
Q  118 aaca---gcgagag------aaagaagaga-gaacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    ||||   ||||||       |||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||    
T  3212 aacaacggcgagaagaacacaaagaagagaagaacacaaaatattttgttgactcagttcggtccaaattgacctagtctcggggagatagcagcc 3117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0891
Description:

Target: scaffold0891; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 140 - 203
Target Start/End: Original strand, 4666 - 4729
Alignment:
Q  140 aacacaaaagaatttgttgacctagttcggtccaaattgacctggtctgagggagagagcagcc 203  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4666 aacacaaaggaatttgttgatccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagcc 4729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0891; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 121
Target Start/End: Original strand, 4538 - 4635
Alignment:
Q  19 atcacaccaataacataaacttgatatgtggagcaagagatagtcaagcaaccaaaacaaagtgtatggaacagttataatcacaagccaaaagtagaaa 118  Q
    |||||||||||||||   | ||||| ||||||| ||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4538 atcacaccaataaca---atttgatgtgtggagtaagggataatcaagcaacaaagtcaaagcgtatggaacaatta-aat-acaagccaaaagtagaaa 4632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 249
Target Start/End: Original strand, 57367 - 57524
Alignment:
Q  91 agttataatcacaagccaaaagtagaaaacagcgagagaaagaagagagaacacaaaagaatt-tgttgacctagttcggtccaa-attgacctggtctg 188  Q
    |||||||| ||||| | |||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||   || || | || ||||||||| |||||| | |||||| |||||    
T  57367 agttataaacacaatcaaaagatagaaaacagtgagagaaaga-gagagaacacac--gatttgtttttacctagttccgtccaatactgacctagtctg 57463  T
Q  189 agggagagagcagccttccgtttcactatagtgatgagtaactttacaaaagagatatcaa 249  Q
     |||||||||||||  || ||| || |||| | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  57464 ggggagagagcagctctctgttccattatattaatgagtaactttacaaaatagatatcaa 57524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University