View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2269_high_7 (Length: 341)

Name: NF2269_high_7
Description: NF2269
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2269_high_7
NF2269_high_7
[»] chr2 (39 HSPs)
chr2 (44-320)||(42445081-42445357)
chr2 (44-273)||(22100245-22100474)
chr2 (47-273)||(3586924-3587149)
chr2 (148-313)||(33905290-33905455)
chr2 (148-313)||(5734122-5734287)
chr2 (148-317)||(18806115-18806284)
chr2 (148-313)||(3872482-3872647)
chr2 (148-313)||(26322522-26322687)
chr2 (148-313)||(28323013-28323178)
chr2 (148-313)||(31516569-31516734)
chr2 (148-313)||(851633-851798)
chr2 (148-313)||(1481275-1481440)
chr2 (148-313)||(16065741-16065906)
chr2 (148-317)||(19383348-19383517)
chr2 (148-313)||(44946962-44947127)
chr2 (129-312)||(12516404-12516587)
chr2 (148-298)||(16588296-16588446)
chr2 (148-286)||(30266011-30266149)
chr2 (148-313)||(6174328-6174493)
chr2 (148-313)||(42938520-42938684)
chr2 (148-271)||(2178161-2178284)
chr2 (168-313)||(1679300-1679445)
chr2 (148-273)||(30419450-30419575)
chr2 (148-313)||(1110020-1110185)
chr2 (148-273)||(4231685-4231810)
chr2 (129-272)||(11707762-11707905)
chr2 (143-313)||(39463740-39463910)
chr2 (148-273)||(39636092-39636217)
chr2 (148-280)||(4016766-4016898)
chr2 (269-313)||(19900664-19900708)
chr2 (8-43)||(6605738-6605773)
chr2 (9-43)||(6605871-6605905)
chr2 (239-273)||(19900689-19900723)
chr2 (268-313)||(12517392-12517437)
chr2 (8-45)||(34455883-34455920)
chr2 (8-45)||(45408761-45408798)
chr2 (8-44)||(2818802-2818838)
chr2 (8-52)||(3116868-3116911)
chr2 (8-48)||(16705728-16705768)
[»] chr8 (44 HSPs)
chr8 (44-316)||(2320500-2320772)
chr8 (148-313)||(10830662-10830827)
chr8 (148-313)||(22259933-22260098)
chr8 (44-224)||(12848359-12848538)
chr8 (148-317)||(6143775-6143943)
chr8 (148-313)||(35117508-35117673)
chr8 (143-317)||(39222023-39222197)
chr8 (148-313)||(2041804-2041969)
chr8 (148-313)||(18595273-18595438)
chr8 (148-313)||(24112483-24112648)
chr8 (148-313)||(34841840-34842005)
chr8 (148-313)||(44804189-44804354)
chr8 (154-313)||(36494794-36494953)
chr8 (148-317)||(8022249-8022418)
chr8 (148-317)||(29939098-29939267)
chr8 (148-313)||(34678962-34679127)
chr8 (148-313)||(39207195-39207360)
chr8 (148-313)||(40116683-40116848)
chr8 (148-314)||(13110940-13111106)
chr8 (148-313)||(14423462-14423627)
chr8 (148-313)||(15730329-15730494)
chr8 (148-312)||(28639905-28640069)
chr8 (148-313)||(4036386-4036551)
chr8 (148-313)||(26782021-26782186)
chr8 (148-313)||(34998181-34998346)
chr8 (148-313)||(38166238-38166403)
chr8 (148-315)||(9807836-9808002)
chr8 (148-273)||(10836025-10836150)
chr8 (148-313)||(41576131-41576296)
chr8 (148-313)||(33286445-33286610)
chr8 (148-280)||(33279264-33279396)
chr8 (210-313)||(18684828-18684930)
chr8 (210-313)||(18730393-18730495)
chr8 (212-313)||(39219398-39219499)
chr8 (148-273)||(883334-883459)
chr8 (213-313)||(4716572-4716672)
chr8 (174-313)||(5015152-5015291)
chr8 (174-313)||(5321098-5321237)
chr8 (174-313)||(145042-145181)
chr8 (239-313)||(6082909-6082983)
chr8 (149-272)||(42572161-42572284)
chr8 (8-43)||(24211278-24211313)
chr8 (8-44)||(24211414-24211450)
chr8 (269-313)||(42572266-42572310)
[»] chr4 (77 HSPs)
chr4 (103-317)||(44547161-44547374)
chr4 (148-313)||(2480819-2480984)
chr4 (148-313)||(33704562-33704727)
chr4 (148-317)||(40428114-40428283)
chr4 (148-313)||(50053599-50053764)
chr4 (148-317)||(53408817-53408986)
chr4 (148-326)||(6687844-6688022)
chr4 (148-317)||(1756251-1756420)
chr4 (148-313)||(45423899-45424064)
chr4 (148-313)||(53716712-53716877)
chr4 (148-313)||(54190254-54190419)
chr4 (148-313)||(28031940-28032105)
chr4 (151-312)||(6610744-6610905)
chr4 (148-313)||(15669907-15670072)
chr4 (148-313)||(19912933-19913098)
chr4 (148-313)||(28361116-28361281)
chr4 (148-313)||(35490266-35490431)
chr4 (148-313)||(38055956-38056121)
chr4 (148-313)||(38070575-38070740)
chr4 (148-313)||(43289453-43289618)
chr4 (148-313)||(44784218-44784383)
chr4 (148-313)||(50354341-50354506)
chr4 (148-313)||(52139997-52140162)
chr4 (136-313)||(10687641-10687819)
chr4 (136-313)||(10901281-10901459)
chr4 (148-309)||(15240331-15240492)
chr4 (148-313)||(47632831-47632996)
chr4 (148-317)||(53353593-53353762)
chr4 (148-313)||(9595303-9595468)
chr4 (148-313)||(16704749-16704914)
chr4 (148-313)||(23702072-23702237)
chr4 (148-313)||(23775768-23775931)
chr4 (148-313)||(26088187-26088352)
chr4 (148-313)||(27583131-27583296)
chr4 (148-313)||(31970406-31970571)
chr4 (168-313)||(41852218-41852363)
chr4 (148-305)||(53876291-53876448)
chr4 (148-313)||(8590098-8590263)
chr4 (148-313)||(16701508-16701673)
chr4 (148-312)||(30172239-30172403)
chr4 (148-312)||(44377276-44377440)
chr4 (151-313)||(30423033-30423195)
chr4 (148-286)||(48748627-48748765)
chr4 (156-313)||(23261221-23261378)
chr4 (148-313)||(50055682-50055847)
chr4 (148-313)||(20877678-20877831)
chr4 (148-280)||(19164037-19164169)
chr4 (143-314)||(46035704-46035875)
chr4 (148-257)||(27535461-27535570)
chr4 (148-313)||(34617888-34618052)
chr4 (148-313)||(40679527-40679692)
chr4 (148-313)||(48910480-48910645)
chr4 (148-262)||(54413294-54413408)
chr4 (148-273)||(1617691-1617816)
chr4 (148-273)||(37968259-37968384)
chr4 (174-271)||(51780305-51780402)
chr4 (148-271)||(27488180-27488301)
chr4 (148-262)||(44378628-44378742)
chr4 (143-312)||(46256581-46256751)
chr4 (148-232)||(14988507-14988591)
chr4 (253-313)||(27531965-27532025)
chr4 (254-313)||(14988593-14988652)
chr4 (175-286)||(33704943-33705053)
chr4 (269-313)||(27488153-27488197)
chr4 (267-310)||(51780281-51780324)
chr4 (8-46)||(55107521-55107559)
chr4 (148-224)||(8931574-8931650)
chr4 (8-43)||(20435276-20435311)
chr4 (8-42)||(32318721-32318755)
chr4 (8-53)||(24915784-24915829)
chr4 (8-41)||(24969543-24969576)
chr4 (8-41)||(37525079-37525112)
chr4 (8-44)||(530805-530841)
chr4 (8-44)||(24969680-24969716)
chr4 (8-48)||(27434746-27434786)
chr4 (8-48)||(47465120-47465160)
chr4 (245-285)||(49143535-49143575)
[»] chr7 (46 HSPs)
chr7 (102-317)||(36847602-36847817)
chr7 (148-313)||(43407675-43407840)
chr7 (148-313)||(17754324-17754489)
chr7 (148-312)||(37004121-37004286)
chr7 (148-313)||(4476322-4476487)
chr7 (148-313)||(5281429-5281594)
chr7 (148-313)||(6395814-6395979)
chr7 (156-312)||(15648625-15648781)
chr7 (148-313)||(33358413-33358578)
chr7 (148-313)||(38867346-38867511)
chr7 (148-317)||(24791819-24791986)
chr7 (148-317)||(7164721-7164890)
chr7 (148-313)||(9453314-9453479)
chr7 (148-313)||(12097091-12097256)
chr7 (148-313)||(32042079-32042244)
chr7 (148-313)||(33845870-33846035)
chr7 (148-313)||(42205085-42205250)
chr7 (148-313)||(3512113-3512278)
chr7 (148-313)||(12100486-12100651)
chr7 (148-313)||(36890269-36890434)
chr7 (148-311)||(25749019-25749182)
chr7 (148-313)||(42674153-42674318)
chr7 (148-273)||(42964134-42964259)
chr7 (148-313)||(48866160-48866325)
chr7 (148-313)||(22648924-22649086)
chr7 (148-313)||(1803645-1803810)
chr7 (148-305)||(46133774-46133931)
chr7 (148-313)||(30180071-30180236)
chr7 (174-309)||(43067470-43067605)
chr7 (148-273)||(16893857-16893982)
chr7 (210-313)||(934104-934207)
chr7 (148-273)||(15656614-15656739)
chr7 (148-273)||(43157281-43157406)
chr7 (148-271)||(8631477-8631600)
chr7 (243-313)||(18120699-18120769)
chr7 (148-273)||(43021090-43021215)
chr7 (44-94)||(36848587-36848637)
chr7 (269-311)||(8631583-8631625)
chr7 (142-224)||(37722779-37722860)
chr7 (168-219)||(18120776-18120827)
chr7 (46-84)||(15652621-15652659)
chr7 (8-46)||(20184235-20184273)
chr7 (8-50)||(34052415-34052457)
chr7 (10-50)||(12142185-12142225)
chr7 (8-44)||(24836156-24836192)
chr7 (269-317)||(43021061-43021109)
[»] chr3 (48 HSPs)
chr3 (148-313)||(49129802-49129967)
chr3 (102-273)||(52922147-52922317)
chr3 (148-313)||(15521369-15521534)
chr3 (148-317)||(20699857-20700026)
chr3 (148-313)||(29784209-29784374)
chr3 (148-313)||(22175327-22175492)
chr3 (148-313)||(50529655-50529820)
chr3 (150-313)||(32360055-32360218)
chr3 (148-317)||(38934667-38934836)
chr3 (148-317)||(8043403-8043572)
chr3 (148-313)||(25493730-25493895)
chr3 (148-313)||(26000070-26000235)
chr3 (148-313)||(37697435-37697600)
chr3 (148-313)||(38856626-38856791)
chr3 (148-313)||(44608814-44608979)
chr3 (148-314)||(46451649-46451815)
chr3 (148-313)||(16355247-16355412)
chr3 (148-313)||(21581770-21581935)
chr3 (148-313)||(34700952-34701117)
chr3 (148-313)||(42307236-42307401)
chr3 (148-313)||(44689551-44689716)
chr3 (148-313)||(15517928-15518093)
chr3 (148-313)||(53028843-53029008)
chr3 (148-313)||(54869376-54869541)
chr3 (148-313)||(42103552-42103714)
chr3 (148-317)||(29785685-29785854)
chr3 (148-313)||(32244911-32245076)
chr3 (148-286)||(50528137-50528275)
chr3 (168-313)||(13697458-13697603)
chr3 (136-313)||(36787449-36787609)
chr3 (169-313)||(35227094-35227238)
chr3 (158-313)||(26123403-26123557)
chr3 (174-313)||(48924524-48924663)
chr3 (148-273)||(20841705-20841830)
chr3 (148-271)||(54533367-54533490)
chr3 (243-317)||(12116972-12117046)
chr3 (148-232)||(29446250-29446334)
chr3 (143-313)||(29624600-29624769)
chr3 (148-219)||(12117053-12117124)
chr3 (268-313)||(29446358-29446403)
chr3 (8-47)||(22101301-22101340)
chr3 (8-43)||(35368549-35368584)
chr3 (9-43)||(22176246-22176280)
chr3 (168-273)||(24835383-24835488)
chr3 (280-313)||(54533340-54533373)
chr3 (8-48)||(26976978-26977018)
chr3 (46-94)||(36787640-36787688)
chr3 (9-45)||(45712901-45712937)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (148-313)||(23323356-23323521)
chr1 (148-313)||(52697380-52697545)
chr1 (148-317)||(17592409-17592578)
chr1 (148-313)||(8078955-8079120)
chr1 (148-313)||(25897962-25898127)
chr1 (148-313)||(29079224-29079389)
chr1 (148-313)||(40093223-40093388)
chr1 (148-313)||(51358678-51358843)
chr1 (148-312)||(17586694-17586858)
chr1 (148-313)||(1168716-1168881)
chr1 (148-313)||(8121588-8121753)
chr1 (148-317)||(33510998-33511167)
chr1 (148-313)||(39259704-39259869)
chr1 (148-314)||(2348455-2348621)
chr1 (148-313)||(1171240-1171405)
chr1 (148-313)||(15718406-15718571)
chr1 (148-313)||(26663885-26664050)
chr1 (148-313)||(41927795-41927960)
chr1 (148-313)||(42369647-42369812)
chr1 (148-313)||(52752520-52752685)
chr1 (148-313)||(7146383-7146550)
chr1 (148-313)||(969855-970020)
chr1 (148-313)||(20097410-20097575)
chr1 (154-313)||(38829853-38830012)
chr1 (148-313)||(26579513-26579678)
chr1 (148-312)||(43906275-43906439)
chr1 (148-271)||(15203677-15203800)
chr1 (148-313)||(38172498-38172653)
chr1 (174-313)||(5678502-5678640)
chr1 (148-286)||(5216101-5216239)
chr1 (148-286)||(29699560-29699698)
chr1 (148-313)||(40150079-40150245)
chr1 (239-313)||(46761784-46761858)
chr1 (143-260)||(5216245-5216362)
chr1 (148-313)||(6766159-6766324)
chr1 (148-273)||(13995978-13996103)
chr1 (148-273)||(14004092-14004217)
chr1 (148-273)||(16052887-16053012)
chr1 (148-312)||(15553658-15553822)
chr1 (174-313)||(1940252-1940390)
chr1 (174-313)||(23318855-23318994)
chr1 (148-273)||(46409999-46410123)
chr1 (148-271)||(29288843-29288966)
chr1 (245-317)||(2478438-2478510)
chr1 (148-249)||(12683355-12683456)
chr1 (142-261)||(36523880-36523999)
chr1 (148-273)||(32672392-32672517)
chr1 (148-255)||(22887455-22887563)
chr1 (267-318)||(32672496-32672547)
chr1 (275-313)||(29288955-29288993)
chr1 (148-273)||(52088351-52088477)
chr1 (245-286)||(29699748-29699789)
chr1 (148-232)||(2474311-2474394)
chr1 (148-224)||(23499147-23499223)
chr1 (8-55)||(9978039-9978086)
chr1 (8-43)||(19954911-19954946)
chr1 (267-313)||(23499254-23499300)
chr1 (8-46)||(27926248-27926286)
chr1 (142-259)||(35218622-35218738)
chr1 (8-56)||(25297983-25298031)
chr1 (9-45)||(28243951-28243987)
chr1 (148-224)||(49146749-49146825)
[»] chr6 (26 HSPs)
chr6 (148-313)||(10550921-10551086)
chr6 (148-313)||(16306476-16306641)
chr6 (148-313)||(26946377-26946541)
chr6 (148-313)||(9460332-9460497)
chr6 (148-313)||(53627-53792)
chr6 (148-313)||(2838281-2838446)
chr6 (148-313)||(3955123-3955288)
chr6 (148-313)||(3346843-3347008)
chr6 (148-313)||(18614264-18614429)
chr6 (148-313)||(20727328-20727493)
chr6 (148-313)||(26703662-26703827)
chr6 (148-313)||(30692564-30692729)
chr6 (148-309)||(23073673-23073834)
chr6 (148-286)||(21894074-21894212)
chr6 (148-273)||(6085970-6086095)
chr6 (148-312)||(17260377-17260545)
chr6 (148-313)||(33465088-33465246)
chr6 (240-313)||(34887100-34887173)
chr6 (148-272)||(30692741-30692865)
chr6 (129-313)||(12835715-12835897)
chr6 (148-259)||(35198852-35198963)
chr6 (129-286)||(29734145-29734299)
chr6 (267-313)||(6085945-6085991)
chr6 (275-317)||(30691807-30691849)
chr6 (6-43)||(885519-885556)
chr6 (8-45)||(17367062-17367099)
[»] scaffold1827 (1 HSPs)
scaffold1827 (148-315)||(16-183)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (148-313)||(51-216)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (148-317)||(18257-18426)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (148-313)||(8373605-8373770)
chr5 (148-313)||(27678499-27678664)
chr5 (148-313)||(33991936-33992101)
chr5 (154-313)||(19360703-19360862)
chr5 (148-313)||(1165058-1165223)
chr5 (148-313)||(9007298-9007463)
chr5 (148-313)||(24104964-24105129)
chr5 (148-313)||(33490506-33490671)
chr5 (148-313)||(34708284-34708449)
chr5 (129-313)||(19515501-19515690)
chr5 (148-313)||(35419638-35419803)
chr5 (148-313)||(26602292-26602457)
chr5 (148-313)||(31883919-31884084)
chr5 (148-315)||(1579574-1579741)
chr5 (148-315)||(1605074-1605241)
chr5 (148-298)||(35782020-35782169)
chr5 (148-313)||(27421399-27421564)
chr5 (148-313)||(27025726-27025891)
chr5 (148-313)||(4121657-4121824)
chr5 (148-273)||(16070166-16070291)
chr5 (148-286)||(31413327-31413465)
chr5 (148-313)||(35419924-35420080)
chr5 (195-309)||(23765305-23765419)
chr5 (195-309)||(23815153-23815267)
chr5 (243-313)||(16736641-16736711)
chr5 (148-273)||(41818028-41818153)
chr5 (148-224)||(20988367-20988443)
chr5 (267-313)||(38597164-38597210)
chr5 (148-232)||(16736705-16736789)
chr5 (269-313)||(41818003-41818047)
chr5 (8-55)||(20476419-20476466)
chr5 (8-43)||(21259730-21259765)
chr5 (9-43)||(33629345-33629379)
chr5 (8-41)||(2255598-2255631)
chr5 (149-202)||(38597231-38597284)
chr5 (8-44)||(21591212-21591248)
chr5 (8-44)||(21595329-21595365)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (148-312)||(144652-144816)
[»] scaffold0444 (2 HSPs)
scaffold0444 (148-312)||(1718-1882)
scaffold0444 (148-262)||(415-529)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (168-313)||(10914-11061)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (254-317)||(481103-481165)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (8-45)||(45970-46007)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (8-49)||(26399-26440)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 39)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 44 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42445357 - 42445081
Alignment:
Q  44 atattttaatattgttctttttacacctttataatcgtggtgtaattccttnnnnnnnttgtggtttgattatctaatttaaaccaaaaacattttatca 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42445357 atattttaatattgttctttttacaactttataatcgtggtttaattccttaaaaaaattgtggtttgattctctaatttaaaccaaaaacattttatca 42445258  T
Q  144 tttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaaga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42445257 tttcataattgcttatataatgatacatccaaacacttcaatttacgtaagtattttttagtgtacacatccaaacttaaagagcttattgaatttaaga 42445158  T
Q  244 gcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacagggata 320  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42445157 gcttataatgtaaactctagtgttataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaaggata 42445081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22100474 - 22100245
Alignment:
Q  44 atattttaatattgttctttttacacctttataatcgtggtgtaattccttnnnnnnnttgtggtttgattatctaatttaaaccaaaaacattttatca 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||       ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22100474 atattttaatattgttctttttacaactttataatcgtgctttaattccttaaaaaaattgtggtttgattctctaatttaaatcaaaaatattttaaca 22100375  T
Q  144 tttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaaga 243  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| | |||||    
T  22100374 tttaataattacttatataatgacacatctaaacacttcattttacgtaagtactttttagcgtacatatccaaacataaagaacttattgagtataaga 22100275  T
Q  244 gcttatgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
     ||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  22100274 acttataatgtaagctctaattctataagc 22100245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 273
Target Start/End: Original strand, 3586924 - 3587149
Alignment:
Q  47 ttttaatattgttctttttacacctttataatcgtggtgtaattccttnnnnnnnttgtggtttgattatctaatttaaaccaaaaacattttatcattt 146  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||        |||||||||||| |||| || ||| |||||| |||| | |||||    
T  3586924 ttttaatattgttctttttacaactttataatcgtggtttaattccttaaaaaagctgtggtttgattctctatttgaaatcaaaaatatttaa-cattt 3587022  T
Q  147 cataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagct 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||| || ||||||| ||| |||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||   ||||||||    
T  3587023 cataattgcttatataatgacacattcaaacattttaatttacataaatactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttattgagaataagagct 3587122  T
Q  247 tatgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3587123 tatgatgtaagctctagtgctataagc 3587149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33905455 - 33905290
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  33905455 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 33905356  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33905355 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 33905290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 5734122 - 5734287
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  5734122 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 5734221  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  5734222 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 5734287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18806284 - 18806115
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  18806284 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 18806185  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    |||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18806184 atgatgtaagctttaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaacaggg 18806115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3872647 - 3872482
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  3872647 ataattgcttatggaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 3872548  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  3872547 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 3872482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26322687 - 26322522
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||  | | |||||||||    
T  26322687 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtagtttttagtgtacatatccaaacttaaatagcttatcaagtataagagctt 26322588  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||| || || ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  26322587 atgatgtaagctataatgttataagccctaatcctataagcatctatataagctgtttatccaaac 26322522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28323178 - 28323013
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| | | |||||||||    
T  28323178 ataattacttatgtaatgtcacatctaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttattaagtataagagctt 28323079  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28323078 atgatataagccctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 28323013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 31516734 - 31516569
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  31516734 ataattgcttatatattgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 31516635  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  31516634 atgatgtaagctctaatgtaataagtcctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 31516569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 851633 - 851798
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  851633 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacacatcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 851732  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  851733 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 851798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1481440 - 1481275
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  1481440 ataattgcttatgtaatgtcaaatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataccttatcaagtataagagctt 1481341  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  1481340 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagaatctatataagttgtttatccaaac 1481275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16065906 - 16065741
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | || ||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  16065906 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtattttttagtgtacatattcaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 16065807  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16065806 atgatgtaagctctaatgttataagttgtaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 16065741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 19383517 - 19383348
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| | |||||||  |||| |||||||  | | || ||||||    
T  19383517 ataattgcttatgtaatgtcacattcaaacaattcaatttctgtaagtactttttagtgtacaaatccaaatataaatagcttatcaagtataggagctt 19383418  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  19383417 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatccatataagttgtttatccaaacaggg 19383348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44947127 - 44946962
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| | |||||||| |||| | |||||  ||| |||||||||    
T  44947127 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatggaagtacttttttgtgtacatatccaaacataaataacttatcaaatataagagctt 44947028  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  44947027 atgatgtaagctctaatattataagccttaatgctataaacatctatataaactgtttatccaaac 44946962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12516587 - 12516404
Alignment:
Q  129 aaaaacattttatcatttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagc 228  Q
    |||||||| ||| || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||| ||||||||||  ||| |||    
T  12516587 aaaaacatattaacaatttataattgcttatataatgacacatccaaacacttcaatttatgtaggtacttattagtgtaaacatccaaacgaaaaaagc 12516488  T
Q  229 ttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    ||||||| |  |||   ||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  12516487 ttattgagtacaagcaattatgatataagctctcatgttataagctctaatgctataagcatttgtataagctgtttatccaaa 12516404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16588446 - 16588296
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||  ||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  16588446 ataattgcttatgcaatgtcatatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 16588347  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataa 298  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  16588346 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataa 16588296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 30266149 - 30266011
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  30266149 ataattgcttatgtaatgacaaatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 30266050  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataa 286  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  30266049 atgatgtaaactctaatgttataagctctaatgctataa 30266011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6174493 - 6174328
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  6174493 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaattactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 6174394  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| | |||||| | ||||| |||||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  6174393 atgatgtaagctctaattctataaaccctaatactataagcatctatataaactatttatccaaac 6174328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 42938520 - 42938684
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||| || |||||||||||| || ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  42938520 ataattgcttatgtaatatcacatccaaacacttcaatatatgtaagtactttt-agtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 42938618  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  42938619 atgatgtaagctctaatgttataagttctaatgctataagcatctatataagctatttatccaaac 42938684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2178284 - 2178161
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  2178284 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtgcatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 2178185  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  2178184 atgatgtaagctctaatgctataa 2178161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 313
Target Start/End: Original strand, 1679300 - 1679445
Alignment:
Q  168 acatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgct 267  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||| | |||||||| || | |||||||  | | | |||||||||||||||||||||| || |    
T  1679300 acatccaaacacttcaatttatgtaggtactttttaatgtacatatccaaacatatatagcttataaagtatgagagcttatgatgtaagctctaatgtt 1679399  T
Q  268 ataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  1679400 ataaaccctaatgctataaacatctatataagatgtttatccaaac 1679445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 30419575 - 30419450
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  30419575 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatttaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 30419476  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30419475 atgatgtaagctctaatgctataagc 30419450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 1110020 - 1110185
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||  || | |||||||| |||| |||||||  | |  ||||||||    
T  1110020 ataattacttatgtaatgtcacatccaaacgcttcaatttatgtaagtactctttagtatacatatccaaacataaatagcttatcaagtacaagagctt 1110119  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    || |||||||||||| || ||||||| || ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1110120 ataatgtaagctctaatgttataagccctgatgttataagcatctatataagctgtttatccaaac 1110185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 4231810 - 4231685
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||| ||||    
T  4231810 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagggctt 4231711  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  4231710 atgatgtaagctctaatgatataagc 4231685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 11707905 - 11707762
Alignment:
Q  129 aaaaacattttatcatttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagc 228  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| | | || |||||||||| ||| |  ||||||| |||  |||    
T  11707905 aaaaatattttaacatttcataattgcttatgtaatgaaacatccaaacactttaattcatgcaaatactttttagtgtacatgtccaaacgtaagtagc 11707806  T
Q  229 ttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataag 272  Q
    ||||| | | | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11707805 ttattaagtattagagcttatgatgtaagctctaatgctataag 11707762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 313
Target Start/End: Original strand, 39463740 - 39463910
Alignment:
Q  143 atttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaag 242  Q
    |||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||| || |||   |||||||| |||| | |||||||| |  |||    
T  39463740 attttataaatgcttatataatgacatatccaaacacttcaatttgtgtaagtacttttaagtgtacttatccaaacgtaaaaatcttattgagtacaag 39463839  T
Q  243 agcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| | |||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||   ||||| ||||||||||||||    
T  39463840 agcttctaatgtaagctcttatgcaataagctctaatgctacaagcatatgtataacctgtttatccaaac 39463910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Original strand, 39636092 - 39636217
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | ||||| |||    
T  39636092 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacatttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagaactt 39636191  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39636192 atgatataagctctaatgctataagc 39636217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 280
Target Start/End: Original strand, 4016766 - 4016898
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | || ||||| |||| | |||||  | |  |||| |||    
T  4016766 ataattgcttatgtaatgtcaaatccaaacacttcaatttatgtaagtattttttagtgtacatattcaaacataaataacttatcaagtacaagaactt 4016865  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatg 280  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  4016866 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatg 4016898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19900708 - 19900664
Alignment:
Q  269 taagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  19900708 taagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 19900664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 6605773 - 6605738
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcc 43  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6605773 gaaaagcacataaggaattgtacctaagttttctcc 6605738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 43
Target Start/End: Original strand, 6605871 - 6605905
Alignment:
Q  9 aaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcc 43  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6605871 aaaagcacctaaagaattgtacctaagttttctcc 6605905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 239 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 19900723 - 19900689
Alignment:
Q  239 taagagcttatgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19900723 taagagcttatgatgtaagctctaatgctataagc 19900689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 313
Target Start/End: Original strand, 12517392 - 12517437
Alignment:
Q  268 ataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  12517392 ataagctctaatgctataagcatttgtataagctgtttatccaaac 12517437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 34455920 - 34455883
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccat 45  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34455920 gaaaagcacctaaggaattgtacctaagttttctccat 34455883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 45
Target Start/End: Original strand, 45408761 - 45408798
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccat 45  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45408761 gaaaagcacctaaggaattgtacctaagttttctccat 45408798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Original strand, 2818802 - 2818838
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcca 44  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2818802 gaaaaacacctaaagaattgtacctaagttttctcca 2818838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 3116911 - 3116868
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccatattttaa 52  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3116911 gaaaagcaccaaaagaattgtacctaagttttctcc-tattttaa 3116868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 16705768 - 16705728
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccatatt 48  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16705768 gaaaagcacctaaggaattgtacctaagttttctccttatt 16705728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 44)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 44 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 2320772 - 2320500
Alignment:
Q  44 atattttaatattgttctttttacacctttataatcgtggtgtaattccttnnnnnnnttgtggtttgattatctaatttaaaccaaaaacattttatca 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||       || |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2320772 atatttcaatattgttctttttacaactttataatcgtgggttaattccttacaaaaattatggtttaattctctaatttaaaccaaaaatattttatca 2320673  T
Q  144 tttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaaga 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  2320672 tttcataattgcttatataatgatacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaagagcttattgagtataaga 2320573  T
Q  244 gcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacagg 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||    
T  2320572 gcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgttataagcatcaatataagttatttatctaaacagg 2320500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10830827 - 10830662
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| | | |||||||||    
T  10830827 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttattaagtataagagctt 10830728  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  10830727 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataaactgtttatccaaac 10830662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22260098 - 22259933
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  22260098 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 22259999  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22259998 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 22259933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 12848538 - 12848359
Alignment:
Q  44 atattttaatattgttctttttacacctttataatcgtggtgtaattccttnnnnnnnttgtggtttgattatctaatttaaaccaaaaacattttatca 143  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||       ||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||| ||    
T  12848538 atattttgatattgatctttttacaactttataatcgtggtttaattccttaaaaaaattgtggtttgattctctaatttaaataaaaaatattttaaca 12848439  T
Q  144 tttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaa 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  12848438 tttcataattgcttatataatgaca-gtccaaacacttcaatttacgtatgtactttttagtgtacatatccaaacttaaa 12848359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 6143943 - 6143775
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| | | |||||||||    
T  6143943 ataattgcttatgtaatg-tagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttattaagtataagagctt 6143845  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6143844 atgacgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacaggg 6143775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35117673 - 35117508
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  35117673 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgcaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 35117574  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  35117573 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 35117508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 317
Target Start/End: Original strand, 39222023 - 39222197
Alignment:
Q  143 atttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaag 242  Q
    |||| ||||||| || | |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||| |||||||||||| || | ||||    
T  39222023 attttataattgtttctgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtacttttaagtgtacatatccaaacataaagagcttatcgagtataag 39222122  T
Q  243 agcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  39222123 agcttatgatgtaagctctaatgttataagccataatgctataagcatctatacaagctgtttatccaaacaggg 39222197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2041969 - 2041804
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  2041969 ataattgcttatgtaatatcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 2041870  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  2041869 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 2041804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 18595273 - 18595438
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  18595273 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 18595372  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18595373 atgatataagctctaatgtcataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 18595438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24112648 - 24112483
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||  | | |||||||||    
T  24112648 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagtttatcaagtataagagctt 24112549  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  24112548 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 24112483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34842005 - 34841840
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  34842005 ataattgcttattgaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtaaatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 34841906  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34841905 atgatgtaagctctaatgctataaaccctagtgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 34841840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44804354 - 44804189
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  44804354 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 44804255  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  44804254 atgatgtaagctctaatgttataagccctgatgctataagcatctatataagctgtttatctaaac 44804189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Original strand, 36494794 - 36494953
Alignment:
Q  154 gcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatg 253  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||  |||| |||||||  | | |||||||||||||||    
T  36494794 gcttatataatgctacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaagataaatagcttatcaagtataagagcttatgatg 36494893  T
Q  254 taagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||| || ||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  36494894 taagctctaatgttataagagctaatgctatacgcatctatataagctgtttatccaaac 36494953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Original strand, 8022249 - 8022418
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  8022249 ataattgcttatgtaatgtcatatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 8022348  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||||||||||| || ||||| | ||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8022349 atgatgtaagctctaatgttataaaccctaatgtcataagcatctatataagctgtttatccaaacaggg 8022418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Original strand, 29939098 - 29939267
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  29939098 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatcaaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 29939197  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  29939198 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgttataagcatctatataagttgtttatcaaaacaggg 29939267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34679127 - 34678962
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  34679127 ataattgcttatgtaatgtcatatcaaaacaattcaatttatgaaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaaatataagagctt 34679028  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34679027 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaac 34678962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 39207195 - 39207360
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  39207195 ataattgcttatgtaatgtcacatctaaacatttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaaatataagagctt 39207294  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||    
T  39207295 atgatgtaagctctaatgttataagcccttatgctataagcatctatataaattgtttatccaaac 39207360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40116848 - 40116683
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  40116848 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 40116749  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||    
T  40116748 atgatataagctctaatattataagctctaatgctataagcatctatataagttgttaatccaaac 40116683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 314
Target Start/End: Original strand, 13110940 - 13111106
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| | | |||||||||    
T  13110940 ataattgcttatgtaatgtgagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttattaagtataagagctt 13111039  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaaca 314  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||||||  |||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  13111040 atgacgtaagctctaatgttataagccctaatgtcataagcatctatataagttgtttatccaaaca 13111106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 14423462 - 14423627
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||  | | || ||||||    
T  14423462 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagtttatcaagtatacgagctt 14423561  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    || |||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14423562 ataatgtaagctctaatgttataagccttaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 14423627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 15730329 - 15730494
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | |  ||||| ||    
T  15730329 ataattgtttatgtaatgtcacatctaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtagaagagttt 15730428  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  15730429 atgatgtaagctctactgttataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 15730494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Original strand, 28639905 - 28640069
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  28639905 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtacttttttgtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 28640004  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||  ||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  28640005 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatattataagcatctatataagcagtttatccaaa 28640069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 4036386 - 4036551
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |  ||||  | | ||| |||||    
T  4036386 ataattgcttatataatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataagttataaagtataaaagctt 4036485  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4036486 atgttgtaagctctaatgttataagcactaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaac 4036551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26782186 - 26782021
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  26782186 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtattttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 26782087  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    | || |||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  26782086 acgaagtaaactctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 26782021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34998346 - 34998181
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||| ||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  34998346 ataattacttatgtaatgtcaaatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatacaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 34998247  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  34998246 atgatgtaagctctaatgttataaggtctaatgatataagcatctatataagttgtttatccaaac 34998181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38166403 - 38166238
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |  || | | |||||| |||| || ||||  | | |||||||||    
T  38166403 ataactgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtacttttttgtatacatagccaaacataaatagtttatcaagtataagagctt 38166304  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38166303 atgatgtaagctctaatgttataagtcctaatgctataaacatctatataagctgtttatccaaac 38166238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 315
Target Start/End: Original strand, 9807836 - 9808002
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||| | | |||||||||    
T  9807836 ataattgcttatgtaatgtcagatcaaaacacttcaatttatgtaagtattttttagtgta-atatccaaacataaataacttattaagtataagagctt 9807934  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacag 315  Q
    || | |||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9807935 ataacgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacag 9808002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 10836150 - 10836025
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| | | |||||||||    
T  10836150 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttattaagtataagagctt 10836051  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  10836050 atgatgtaagctctaatgttataagc 10836025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 41576131 - 41576296
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| | |||||||| | || |||||||  | | |||||||||    
T  41576131 ataattgcttatgcaatgtcacatccaaacacttcaattcatctaagtactttttagtgtacatatccaaacattaatagcttatcaagtataagagctt 41576230  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||    
T  41576231 atgatgtaagctctaatgctataagtcctaatgctataagcatctatataaactgtttatgcaaac 41576296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33286610 - 33286445
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |  || | |||||||| |||| |||||||  | | ||| || ||    
T  33286610 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtatgtacttttttgtatacatatccaaacataaatagcttatcaagtataaaagttt 33286511  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  33286510 atgatgtaagctctaatattataagccctaatgctataaacatctatataagttgtttatcaaaac 33286445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 280
Target Start/End: Original strand, 33279264 - 33279396
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  33279264 ataattgcttatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 33279363  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatg 280  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  33279364 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatg 33279396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Original strand, 18684828 - 18684930
Alignment:
Q  210 acatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatcc 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  18684828 acatccaaacataaagagcttattgagtataagagcttatgatgtaagctctagt-ctataagttttaatgctataagcatctctataagctatttatcc 18684926  T
Q  310 aaac 313  Q
    ||||    
T  18684927 aaac 18684930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Original strand, 18730393 - 18730495
Alignment:
Q  210 acatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatcc 309  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  18730393 acatccaaacataaagagcttattgagtataagagcttatgatgtaagctctagt-ctataagttttaatgctataagcatctctataagctatttatcc 18730491  T
Q  310 aaac 313  Q
    ||||    
T  18730492 aaac 18730495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 212 - 313
Target Start/End: Original strand, 39219398 - 39219499
Alignment:
Q  212 atccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaa 311  Q
    |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  39219398 atccaaacataaatagcttataaagtataagagcttatgatataagctctaatgctataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaa 39219497  T
Q  312 ac 313  Q
    ||    
T  39219498 ac 39219499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Original strand, 883334 - 883459
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  883334 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgaatatatctaaacataaataacttatcaagtataagagctt 883433  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  883434 atgatataagctctaatgctataagc 883459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 213 - 313
Target Start/End: Original strand, 4716572 - 4716672
Alignment:
Q  213 tccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    ||||||| |||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4716572 tccaaacataaatagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctcatgctataagcatctatataagctgtttatccaaa 4716671  T
Q  313 c 313  Q
    |    
T  4716672 c 4716672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 313
Target Start/End: Original strand, 5015152 - 5015291
Alignment:
Q  174 aaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||| |||| || | ||||  |||||||| |||||| || |  |||||||    
T  5015152 aaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaagagtttatcgagtataagtacttatgatataagctttaatattataagc 5015251  T
Q  274 tctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
      ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||    
T  5015252 cataatgctataagcatctatataaattgtttatccaaac 5015291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 174 - 313
Target Start/End: Original strand, 5321098 - 5321237
Alignment:
Q  174 aaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||  | | ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5321098 aaacacttcaatctatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagtttatcaagtataagaacttatgatgtaagctctaattctataagc 5321197  T
Q  274 tctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
     |||||  ||||| |||  ||||||| |||||||||||||    
T  5321198 cctaatattataagcatttatataagttgtttatccaaac 5321237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 313
Target Start/End: Original strand, 145042 - 145181
Alignment:
Q  174 aaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | || ||||| |||| |||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||| || ||||||     
T  145042 aaacacttcaatttatgtaagtacttttttgtgtacatattcaaacataaatagcttattaagtataagaacttatgatgtaaactctaatgttataagt 145141  T
Q  274 tctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
      ||||||||||| |||| |||||| |||| |||| ||||    
T  145142 cataatgctataaccatctatataaactgtgtatctaaac 145181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 239 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6082983 - 6082909
Alignment:
Q  239 taagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||    
T  6082983 taagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatttatataagctatttatccaaac 6082909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 272
Target Start/End: Original strand, 42572161 - 42572284
Alignment:
Q  149 taattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctta 248  Q
    ||||||||||| |||||  ||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||  |||| | |||||  | | ||||||||||    
T  42572161 taattgcttatgtaatgtcacattcaaatactttaatttatgtaagtactttttagtgtaaatattcaaatataaataacttatcaagtataagagctta 42572260  T
Q  249 tgatgtaagctctagtgctataag 272  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  42572261 tgatgtaagctctaatgctataag 42572284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 24211313 - 24211278
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcc 43  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24211313 gaaaagcacctaaagaattgtacctaagttttctcc 24211278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Original strand, 24211414 - 24211450
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcca 44  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24211414 gaaaagcacctaaggaattgtacctaagttttctcca 24211450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 313
Target Start/End: Original strand, 42572266 - 42572310
Alignment:
Q  269 taagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||    
T  42572266 taagctctaatgctataagtatctatataaactgtttatccaaac 42572310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 77)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 103 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 44547374 - 44547161
Alignment:
Q  103 tgtggtttgattatctaatttaaaccaaaaacattttatcatttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtacttttt 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44547374 tgtggtttgattatctaatttaaaccaaaaatattttatcatttcataattgcttatataatgatacatcaaaacacttcaatttacataagtacttttt 44547275  T
Q  203 agcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctg 302  Q
    || ||| | |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  44547274 agtgtacatatccaaacataaagagcttattgagcataagagcttatgatgtaagctctactgctataagttctaatgc-ataagcatcaatataagttg 44547176  T
Q  303 tttatccaaacaggg 317  Q
    |||||||||||||||    
T  44547175 tttatccaaacaggg 44547161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2480984 - 2480819
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  2480984 ataattgcttatataatgtcacatctaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 2480885  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2480884 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 2480819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 33704562 - 33704727
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  33704562 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 33704661  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33704662 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgatataagcatctatataagctgtttatccaaac 33704727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 40428283 - 40428114
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |  ||||  | | |||||||||    
T  40428283 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataaattatcaagtataagagctt 40428184  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40428183 atgatgtaagctctactgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaacaggg 40428114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 50053764 - 50053599
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  50053764 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 50053665  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  50053664 atgatgtaagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 50053599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Original strand, 53408817 - 53408986
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  53408817 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 53408916  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53408917 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaacaggg 53408986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6688022 - 6687844
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  6688022 ataattgcttatgtaatgtcatatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 6687923  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacagggatagtctct 326  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  6687922 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaacggggccagtctct 6687844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 1756420 - 1756251
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  1756420 ataattgcttatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 1756321  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1756320 atgatgtaagctctattgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacaggg 1756251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45424064 - 45423899
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||| ||    
T  45424064 ataattgcttatataatgtcacatccatacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagttt 45423965  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  45423964 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 45423899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 53716877 - 53716712
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  53716877 ataattgcttatatattgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtatatatccaaacataaataacttatcaagtataagagctt 53716778  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  53716777 atgatgtaagctctaatgtgataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 53716712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 54190254 - 54190419
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  54190254 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 54190353  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  54190354 atgatataagctctaatgttataagcactaatgctataaacatctatataagatgtttatccaaac 54190419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28032105 - 28031940
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  28032105 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 28032006  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||  || |||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28032005 atgatgtaagctcttatgttataagctcggatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 28031940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 151 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 6610905 - 6610744
Alignment:
Q  151 attgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatg 250  Q
    ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | ||| ||||||||    
T  6610905 attgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtattttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataaaagcttatg 6610806  T
Q  251 atgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    || ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6610805 atataagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaa 6610744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 15669907 - 15670072
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  15669907 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtacttattagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 15670006  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  15670007 atgatgtaaactctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 15670072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19913098 - 19912933
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  19913098 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtacttattagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 19912999  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  19912998 atgatgtaaactctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 19912933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 28361116 - 28361281
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||  |||| |||||||  ||| ||||| |||    
T  28361116 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaaatactttttagtgtacatatccaaatataaatagcttatcaaatataagaactt 28361215  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28361216 atgatgtaagctctaatattataagctctaatcctataagcatctatataagctgtttatccaaac 28361281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35490431 - 35490266
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  35490431 ataattgcttatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 35490332  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  35490331 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagttgtttatccaaac 35490266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 38055956 - 38056121
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  38055956 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatattcaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 38056055  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  38056056 atgatgtaagttctaatgttataagccctaatgctttaagcatctatataagctgtttatccaaac 38056121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38070740 - 38070575
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||  | | |||||| ||    
T  38070740 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagtttatcaagtataagagttt 38070641  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  38070640 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 38070575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 43289618 - 43289453
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  43289618 ataattgcttatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 43289519  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || |||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  43289518 atgatgtaagctctaatgttataagccctgatgccataagcatctatataagctgtttatccaaac 43289453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44784383 - 44784218
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  44784383 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 44784284  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  44784283 atgatgtaagctctaatgttataagtcttaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 44784218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 50354341 - 50354506
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  50354341 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatataagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataagagctt 50354440  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  50354441 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 50354506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 52139997 - 52140162
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  52139997 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtattttctagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 52140096  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  52140097 atgatgtaagctctaatgttataagacctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 52140162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10687819 - 10687641
Alignment:
Q  136 ttttatcatttc-ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattg 234  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | || ||||| |||| |||||||      
T  10687819 ttttttcatttcgataattacttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatttaagtactttttagtgtacatatacaaacataaatagcttatca 10687720  T
Q  235 aatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    | | |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  10687719 agtataagagcttatgatttaagctctaatggtataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 10687641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10901459 - 10901281
Alignment:
Q  136 ttttatcatttc-ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattg 234  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | || ||||| |||| |||||||      
T  10901459 ttttttcatttcgataattacttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatttaagtactttttagtgtacatatacaaacataaatagcttatca 10901360  T
Q  235 aatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    | | |||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  10901359 agtataagagcttatgatttaagctctaatggtataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 10901281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 15240492 - 15240331
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | ||||||| |||    
T  15240492 ataattgattatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtttaagaactt 15240393  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatcc 309  Q
    ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  15240392 atgatgtaagctctaatgttataaaccctaatgctataagcatctatataagttgtttatcc 15240331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 47632831 - 47632996
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||  |||| |||||||  | | |||||||||    
T  47632831 ataattgcttatgtaatgtcacattcaaacacttcaatttatgtaagtattttttagtgtacaaatccaaatataaatagcttatcaagtataagagctt 47632930  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  47632931 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatttatataagctgtttatccaaac 47632996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Original strand, 53353593 - 53353762
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |  ||||| | | |||||||||    
T  53353593 ataattgcttatttaatgtcagatccaaacacttcaatttatataagtactttttagtgtacatatccaaacataaatatgttattaagtataagagctt 53353692  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    |||| |||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53353693 atgacgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacaggg 53353762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9595468 - 9595303
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| | |||||  | | ||||| |||    
T  9595468 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatattcaaacataaataacttatcaagtataagaactt 9595369  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    || |||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  9595368 ataatgtaagctctattgttataagccctaatgctataagcatctatataagctatttatccaaac 9595303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 16704749 - 16704914
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||   |||||  | | |||||||||    
T  16704749 ataattacttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatttaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatgacttatcaagtataagagctt 16704848  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  16704849 atgatgtaagctctaatggtataagctctaatactataagcatctatataaactgtttatccaaac 16704914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23702237 - 23702072
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  23702237 ataattgcttatgtaatgtcacattcaaacactttaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 23702138  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  23702137 atgatgtaagctctaatattataagccataatgctataagcatctatataaactgtttatccaaac 23702072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23775931 - 23775768
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| | | | |||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  23775931 ataattgattatgtaatgtcacatccaaacacttcaattaatgtaagtactttttagtg-acatatccaaacataaatagcttatcaaatataagagctt 23775833  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||||||    
T  23775832 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagttg-ttatccaaac 23775768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26088352 - 26088187
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||| ||||| |||| | | ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  26088352 ataattacttatgtaataacaaatccaaacacttcaatttatggaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 26088253  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||| || || || |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26088252 atgatgtaaactttaatgttataagttctaatgctataagcatcaatataagttgtttatccaaac 26088187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27583296 - 27583131
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| | |||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  27583296 ataattgcttatgttatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatcaaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 27583197  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||    
T  27583196 atgatgtaaactctaatgttataagccctaatgctataagcatttatataagctttttatccaaac 27583131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 31970406 - 31970571
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||| ||    
T  31970406 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataagagatt 31970505  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31970506 atgatataagctctaatgttataagcactagtgttataagcatcaatataaactgtttatccaaac 31970571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41852363 - 41852218
Alignment:
Q  168 acatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgct 267  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||  | | ||||||||||||| |||||||||| || |    
T  41852363 acatccaaacacttcaatttatgtaagtacttttttgtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagcttatgacgtaagctctaatgtt 41852264  T
Q  268 ataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  41852263 ataagccctaatgctataagcatctatataagctttttatccaaac 41852218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Original strand, 53876291 - 53876448
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||  | | |||||||||    
T  53876291 ataattgcttatgcaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagtttatcaagtataagagctt 53876390  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgttt 305  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  53876391 atgatgtaagctctaatattataagctctaatgctataagcatctatataagttgttt 53876448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8590263 - 8590098
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  8590263 ataattgcttttgtaatgtcacatccaaacacttcaacttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 8590164  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    || ||||||||||||    |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  8590163 ataatgtaagctctaacattataagctctaatgatataagcatctatataaactgtttatccaaac 8590098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 16701508 - 16701673
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   ||| | ||| |||| |||| | |||||  | | ||| |||||    
T  16701508 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttgatgtacatatctaaacataaataacttatcaagtataaaagctt 16701607  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  16701608 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 16701673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Original strand, 30172239 - 30172403
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || | ||| |||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  30172239 ataattgcttatgtaatgtaacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtatacatatcaaaacataaataacttatcaagtataagagctt 30172338  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  30172339 atgatttaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaa 30172403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Original strand, 44377276 - 44377440
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  44377276 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaaatactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 44377375  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||| ||  | | ||||||||||||    
T  44377376 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctacaagcatctattaatgttgtttatccaaa 44377440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 151 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30423195 - 30423033
Alignment:
Q  151 attgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatg 250  Q
    ||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||  || | |||||||| |||| || ||||  | | ||||||||||||    
T  30423195 attgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagcactttttagtatacatatccaaacataaatagtttatcaagtataagagcttatg 30423096  T
Q  251 atgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||| || |||| |||||    
T  30423095 atgtaagctctaatgctataagccctaatgctataagcatttatataagttggttattcaaac 30423033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 286
Target Start/End: Original strand, 48748627 - 48748765
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||  ||| |||||| ||    
T  48748627 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtattttttagtgtacatatccaaacataaatagtttatcaaatataagagttt 48748726  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataa 286  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  48748727 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataa 48748765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 156 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23261378 - 23261221
Alignment:
Q  156 ttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgta 255  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  ||| ||| | |||||||||||    
T  23261378 ttatataatgtcacatctaaacacttcaatttatataagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaaatataaaaacttatgatgta 23261279  T
Q  256 agctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||| || ||||| | |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  23261278 agctctaatgttataaaccctaatattataagcatctatataagctgtttatccaaac 23261221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 50055682 - 50055847
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  50055682 ataattgcttatgtaatctcagatccaaacacttcaatttatataagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaaatataagagctt 50055781  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||  |||| |||| |||||| || |||||||||||    
T  50055782 atgatgtaagctctaatattataagccctaatgtcataagcatctatataaactatttatccaaac 50055847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 20877678 - 20877831
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||            |||    
T  20877678 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttat------------ctt 20877765  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  20877766 atgatgtaagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 20877831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 19164169 - 19164037
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  ||| |||||| ||    
T  19164169 ataattgcttatgtaatgtcaaatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaaatataagagttt 19164070  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatg 280  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  19164069 atgatgtaagctctaatgttataagttctaatg 19164037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 314
Target Start/End: Original strand, 46035704 - 46035875
Alignment:
Q  143 atttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaag 242  Q
    |||| |||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||   ||| ||||  ||| |||||||||| | ||||    
T  46035704 attttataaatgcttatatcatgacacattcaaacacttcaatttatgtaagtactttttaatgtacttatctaaacgaaaaaagcttattgagtataag 46035803  T
Q  243 agcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaaca 314  Q
    ||||||||||||||| ||| || | |||| |||||||||||||| |||   | |||| ||||||||||||||    
T  46035804 agcttatgatgtaagttcttgttcaataaactctaatgctataagcatgtgtgtaagttgtttatccaaaca 46035875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27535570 - 27535461
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  ||| ||||| |||    
T  27535570 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaaatataagaactt 27535471  T
Q  248 atgatgtaag 257  Q
    ||||||||||    
T  27535470 atgatgtaag 27535461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 34617888 - 34618052
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| |  ||||  | | |||||||||    
T  34617888 ataattgcttatataatgtcaaatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatattcaaacataaataatttatcaagtataagagctt 34617987  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||  ||||||||| | |||  ||||||| |||||||||||||    
T  34617988 atgatgtaagctctaatattataagccataatgctat-agcatttatataagttgtttatccaaac 34618052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40679692 - 40679527
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||| | | ||| |||||    
T  40679692 ataattgcttatgtaatgtcatatccaaacactttaatttatgtaaatactttttagtgtacatatccaaacataaataacttattaagtataaaagctt 40679593  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||  ||||| |||  |||||| ||| ||||||||||    
T  40679592 atgatataagctctaatgttataagctctaatattataagcatttatataaactggttatccaaac 40679527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 48910480 - 48910645
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| || || | |  ||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  48910480 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatataagtacttttttgcatacatactcaaacataaataacttatcaagtataagagctt 48910579  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  48910580 atgatataagctctaatgttataaaccataatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 48910645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Original strand, 54413294 - 54413408
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  54413294 ataattgcttatgtaatatcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 54413393  T
Q  248 atgatgtaagctcta 262  Q
    ||||| |||||||||    
T  54413394 atgatataagctcta 54413408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Original strand, 1617691 - 1617816
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||| ||    
T  1617691 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtacttttttgtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagttt 1617790  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    || |||||||||||| || |||||||    
T  1617791 attatgtaagctctaatgttataagc 1617816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 37968384 - 37968259
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  || || ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||  | ||||  | | |||||||||    
T  37968384 ataattgcttatgtaatgtcacttccaaacatttcaatttatgaaagtactttttagtgtacatatccaaacataaattgtttatcaagtataagagctt 37968285  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||    
T  37968284 atgatgtaagctctaatgctataagc 37968259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 51780402 - 51780305
Alignment:
Q  174 aaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    | | |||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  51780402 aaacacttcaatttatgtaagtactttttaatacacatatccaaacataaagagcttatcaaatataagagcttatgatataagctctaatgctataa 51780305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27488301 - 27488180
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||||  ||||||||||  || ||| | |||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  27488301 ataattgcttatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatttaagtacttt--agtgtacatatccaaacataaatagcttatcaaatataagagctt 27488204  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||    
T  27488203 atgatgtaagctctaatgccataa 27488180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 44378742 - 44378628
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  44378742 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatattcaaacataaataacttatcaagtataagagctt 44378643  T
Q  248 atgatgtaagctcta 262  Q
    ||||||||| |||||    
T  44378642 atgatgtaatctcta 44378628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46256751 - 46256581
Alignment:
Q  143 atttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaa-acttaaagagcttattgaatttaa 241  Q
    |||| |||| ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||   |||||| ||  ||| |||||||||| | |||    
T  46256751 attttataaatgcttatatcatgacacattcaaacacttcaatttgtgtaagtactttttaatgtacttatccaacacgaaaaaagcttattgagtataa 46256652  T
Q  242 gagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    |||||||||||||||| | | || | ||||||||||||| || || |||   | |||||||||||||||||    
T  46256651 gagcttatgatgtaagtttttgttcaataagctctaatgttaaaagcatgtgtgtaagctgtttatccaaa 46256581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 232
Target Start/End: Original strand, 14988507 - 14988591
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttat 232  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||    
T  14988507 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcgatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttat 14988591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27532025 - 27531965
Alignment:
Q  253 gtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  27532025 gtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 27531965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 313
Target Start/End: Original strand, 14988593 - 14988652
Alignment:
Q  254 taagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14988593 taagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 14988652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 286
Target Start/End: Original strand, 33704943 - 33705053
Alignment:
Q  175 aacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagct 274  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||| |||| |||||||  ||| |||||  ||||||||||||||||| || ||||| |     
T  33704943 aacacttcaatttatgtaagtactttttaga-tacatatccaaacataaatagcttatcaaatataagaatttatgatgtaagctctaatgttataaacc 33705041  T
Q  275 ctaatgctataa 286  Q
    |||| |||||||    
T  33705042 ctaaagctataa 33705053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 269 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27488197 - 27488153
Alignment:
Q  269 taagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27488197 taagctctaatgccataaacatctatataagctgtttatccaaac 27488153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51780324 - 51780281
Alignment:
Q  267 tataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatcca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  51780324 tataagctctaatgctataaacatctatataagttgtttatcca 51780281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 55107559 - 55107521
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccata 46  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55107559 gaaaagcacataaggaattgtacctaagttttctccata 55107521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 8931650 - 8931574
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaa 224  Q
    |||||||||| | |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| | |||||||| ||||    
T  8931650 ataattgcttgtgtaatgtcacatccaaacacttcaatttaggtaagtaccttttagtgtacatatccaaacataaa 8931574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 43
Target Start/End: Original strand, 20435276 - 20435311
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcc 43  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20435276 gaaaagcacctaaagaattgtacctaagttttctcc 20435311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 32318755 - 32318721
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctc 42  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32318755 gaaaagcacataaggaattgtacctaagttttctc 32318721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 24915829 - 24915784
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccatattttaat 53  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24915829 gaaaagcacctaaggaattgtacctaagttttctccttcttttaat 24915784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 24969576 - 24969543
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttct 41  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24969576 gaaaagcacctaaagaattgtacctaagttttct 24969543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 41
Target Start/End: Original strand, 37525079 - 37525112
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttct 41  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37525079 gaaaagcacctaaagaattgtacctaagttttct 37525112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Original strand, 530805 - 530841
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcca 44  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  530805 gaaaagcacctaaggaattgtacctaagttttctcca 530841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Original strand, 24969680 - 24969716
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcca 44  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24969680 gaaaagcacctaaggaattgtacctaagttttctcca 24969716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 48
Target Start/End: Original strand, 27434746 - 27434786
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccatatt 48  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  27434746 gaaaagcacctaaggaattgtacttaagttttctccatatt 27434786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 48
Target Start/End: Original strand, 47465120 - 47465160
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccatatt 48  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  47465120 gaaaagcacctaaagaattgtacctaagttttgtccttatt 47465160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 49143575 - 49143535
Alignment:
Q  245 cttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctata 285  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  49143575 cttatgatgtaaactcttgtgctataagctctaatgttata 49143535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 46)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 102 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 36847817 - 36847602
Alignment:
Q  102 ttgtggtttgattatctaatttaaaccaaaaacattttatcatttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttt 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36847817 ttgtggtttgattctctaatttaaatcaaaaatattttatcatttcataattgcttatataataacacatccaaacacttcaatttacgtaagtactttt 36847718  T
Q  202 tagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagct 301  Q
    ||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  36847717 tagtgtacatattcaaacataaagagcttattgaatacaagagcttatgatgtaagctctagtgctataaactctaatgttataagcatcaatataagtt 36847618  T
Q  302 gtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||||||| ||||    
T  36847617 gtttatccaaataggg 36847602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 43407675 - 43407840
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| | |||||||||    
T  43407675 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaagttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacgtaaatagcttattgagtataagagctt 43407774  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43407775 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataagcatcaatataagctgtttatccaaac 43407840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 17754324 - 17754489
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  17754324 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 17754423  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17754424 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 17754489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37004286 - 37004121
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaac-ttaaagagcttattgaatttaagagct 246  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||||||| | ||||||||    
T  37004286 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaagttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacgttaaatagtttattgagtataagagct 37004187  T
Q  247 tatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  37004186 tatgatgtgagctctagtgctataagctctaatgctataagcatcaatataaactgtttatccaaa 37004121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4476487 - 4476322
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||| |||| |||||||| | | |||||||||    
T  4476487 ataattggttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatctaaacataaacagcttattaagtataagagctt 4476388  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  4476387 atgatgtaagctctaatgatataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 4476322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 5281429 - 5281594
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  5281429 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 5281528  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5281529 atgatgtaagttctaatgctataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 5281594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 6395814 - 6395979
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  6395814 ataattggttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtatatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 6395913  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6395914 atgatgtaatctctaatgatataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 6395979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 156 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15648781 - 15648625
Alignment:
Q  156 ttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgta 255  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || | ||| |||| |||| | |||||||| | |||||||||||||||||    
T  15648781 ttatgtaatgacacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtatacatatcaaaacgtaaatatcttattgagtataagagcttatgatgta 15648682  T
Q  256 agctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15648681 agctgtagtgctataagctctactgctataagcatcaatataagctgtttatccaaa 15648625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33358578 - 33358413
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  33358578 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 33358479  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  33358478 atgatataagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagatgtttatccaaac 33358413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 38867346 - 38867511
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  38867346 ataattgcttatgcaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 38867445  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  38867446 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 38867511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 24791986 - 24791819
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| |||||||||||  || ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  24791986 ataattgcttatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtacttt--agtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 24791889  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24791888 atgatgtaagctctaatgttataagctctaataccataaacatctatataagctgtttatccaaacaggg 24791819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Original strand, 7164721 - 7164890
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  7164721 ataattgcttatgtaatgtcagatccaaacatttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataagagctt 7164820  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7164821 atgatgtaagctctattgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacaggg 7164890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 9453314 - 9453479
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  9453314 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 9453413  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  9453414 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagtatctatataagttgtttattcaaac 9453479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12097256 - 12097091
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||| ||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  12097256 ataattacttatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 12097157  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12097156 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaac 12097091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 32042079 - 32042244
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||| ||||    
T  32042079 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagggctt 32042178  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  32042179 aagatgtaagctctaatgttataagctctaatgatataagcatctatataagttgtttatccaaac 32042244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33846035 - 33845870
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||  ||||||  | | |||||||||    
T  33846035 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaattgcttatcaagtataagagctt 33845936  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33845935 atgatataagctctaatgtcataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 33845870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 42205085 - 42205250
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  ||  |||||||||    
T  42205085 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacactttaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaaaaataagagctt 42205184  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  42205185 atgatgtaagctctaatgttataagccccaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 42205250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 3512113 - 3512278
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||| |||| || ||||  ||| |||||||||    
T  3512113 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtatacatatccaaacataaatagtttatcaaatataagagctt 3512212  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||    
T  3512213 atgatgtaagctctaatattataagccctaatgctataagcgtctatataagttgtttatccaaac 3512278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12100651 - 12100486
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | ||||| |||    
T  12100651 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagaactt 12100552  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||  ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12100551 atgatataagctctaatgttataagtactaattctataagcatctatataagctgtttatccaaac 12100486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36890434 - 36890269
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||  ||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  ||| |||||||||    
T  36890434 ataattgcttatgcaatgtcatatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatatcttatcaaatataagagctt 36890335  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  36890334 atgatgtaagctctaatgctgtaagccctaatggtataagcatctatataagttgtttatccaaac 36890269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 311
Target Start/End: Original strand, 25749019 - 25749182
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  25749019 ataattgcttatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 25749118  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaa 311  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||    
T  25749119 atgatgtaagccctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagttgtttatccaa 25749182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 42674153 - 42674318
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  ||| |||||| ||    
T  42674153 ataattgcttatataatgtcacgtctaaacacttcaatttatgttagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaaatataagagttt 42674252  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  42674253 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatttatataaactgtttatccaaac 42674318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 42964259 - 42964134
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  42964259 ataattgcttatgtaatgtcacatcgaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaaatataagagctt 42964160  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  42964159 atgatgtaagctctaatgttataagc 42964134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 48866160 - 48866325
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  ||| |||||||||    
T  48866160 ataattgcttatgtaatgtcagatccaaacacttcactttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaaatataagagctt 48866259  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| | ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  48866260 atgatgtaagctctaatattataaaccctaatgccataaacacctatataagctgtttatccaaac 48866325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 22649086 - 22648924
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | |   |||||||    
T  22649086 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagt---agagctt 22648990  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  22648989 atgatgtaagctctaatattataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 22648924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 1803645 - 1803810
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| | |||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  1803645 ataattgcttatgtgatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaactactttttagtgtacatatccaaacctaaatagcttatcaagtataagagctt 1803744  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    || |||||||||||| || ||||||| || ||||||||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  1803745 ataatgtaagctctaatgttataagcccttatgctataagcatttgtataagctgtttatccaaac 1803810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 46133931 - 46133774
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  46133931 ataattgcttatgaaatgtcacatccaaacactttaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 46133832  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgttt 305  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||  |||||||||||||    
T  46133831 atgatgtaagctctaatgctataggccctaatgatataagcatttatataagctgttt 46133774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 30180236 - 30180071
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  30180236 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatttaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataagagctt 30180137  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||| | || |||  ||||||| |||||||||||||    
T  30180136 atgatataagctctaatggtataaactctaatgcaacaagcatgtatataagttgtttatccaaac 30180071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 43067605 - 43067470
Alignment:
Q  174 aaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  43067605 aaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacgtatccaaacataaatagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 43067506  T
Q  274 tctaatgctataaacatcaatataagctgtttatcc 309  Q
     ||||| | |||| |||| |||||| ||||||||||    
T  43067505 cctaataccataagcatctatataaactgtttatcc 43067470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 16893982 - 16893857
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||| ||    
T  16893982 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagttt 16893883  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  16893882 atgatgtaagctctaatgttataagc 16893857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 313
Target Start/End: Original strand, 934104 - 934207
Alignment:
Q  210 acatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatcc 309  Q
    |||||||||| |||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  934104 acatccaaacataaatagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataaactgtttatcc 934203  T
Q  310 aaac 313  Q
    ||||    
T  934204 aaac 934207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Original strand, 15656614 - 15656739
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | ||||| |||    
T  15656614 ataattgcttatataatgtcacatctaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataagaactt 15656713  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||    
T  15656714 atgatgtaaactctaatgttataagc 15656739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Original strand, 43157281 - 43157406
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||| |||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  43157281 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaaatactttttagtgtacatatcgaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 43157380  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  43157381 atgatgtaaactctaatgctataagc 43157406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 271
Target Start/End: Original strand, 8631477 - 8631600
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || ||| | |||||||| |||| |||||||  | | ||||| |||    
T  8631477 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatttaagtacttttcagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagaactt 8631576  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataa 271  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||    
T  8631577 atgttgtaagctctaatgctataa 8631600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 243 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18120769 - 18120699
Alignment:
Q  243 agcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18120769 agcttatgatgtaagctctaatgtgataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 18120699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 43021215 - 43021090
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||| || | | |||||  | | |||||||||    
T  43021215 ataattgcttatgtaatgtcgcatccaaacacttcaatttatggaagtactttttagtgtacatatccaaacatatataacttatcaagtataagagctt 43021116  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43021115 atgatgtaagccctaatgctataagc 43021090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 36848637 - 36848587
Alignment:
Q  44 atattttaatattgttctttttacacctttataatcgtggtgtaattcctt 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  36848637 atattttaatattgttctttttacaactttatgatcgtggtttaattcctt 36848587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 311
Target Start/End: Original strand, 8631583 - 8631625
Alignment:
Q  269 taagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaa 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  8631583 taagctctaatgctataaacatctatataagttgtttatccaa 8631625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 224
Target Start/End: Original strand, 37722779 - 37722860
Alignment:
Q  142 catttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaa 224  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||    
T  37722779 cattttataattgtttatataatgatatatataaacacttcaatttatgtaagt-ctttttagtgtatatatcaaaacctaaa 37722860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18120827 - 18120776
Alignment:
Q  168 acatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaac 219  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  18120827 acatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaac 18120776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15652659 - 15652621
Alignment:
Q  46 attttaatattgttctttttacacctttataatcgtggt 84  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15652659 attttaatattgttctttttacaactttaaaatcgtggt 15652621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 20184273 - 20184235
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccata 46  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20184273 gaaaagcacctaaggaattgtacctaagttttctccata 20184235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 50
Target Start/End: Original strand, 34052415 - 34052457
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccatatttt 50  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34052415 gaaaagcacctaaggaattgtacctaagttttctccttatttt 34052457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 12142225 - 12142185
Alignment:
Q  10 aaagcacataaagaattgtacctaagttttctccatatttt 50  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12142225 aaagcacgtaaggaattgtacctaagttttctccatctttt 12142185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Original strand, 24836156 - 24836192
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcca 44  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24836156 gaaaagcacctaaggaattgtacctaagttttctcca 24836192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 269 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 43021109 - 43021061
Alignment:
Q  269 taagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||| |||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  43021109 taagccctaatgctataagcatttatataagttgtttatccaaacaggg 43021061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 48)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 49129802 - 49129967
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||| |||||||||    
T  49129802 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaagttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacgtaaatagcttattgaatataagagctt 49129901  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49129902 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataagcatcaatataagctgtttatccaaac 49129967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 102 - 273
Target Start/End: Original strand, 52922147 - 52922317
Alignment:
Q  102 ttgtggtttgattatctaatttaaaccaaaaacattttatcatttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttt 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  52922147 ttgtggtttgattctctaatttaaatcaaaaatattttaacatttcataattgcttatataatgacacatc-aaacacttcaatttacgtaagtactttt 52922245  T
Q  202 tagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||| | || ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  52922246 tagcgtacatattcaaacataaagagcttattgagtataagagcttataatgtaagctctaatgctataagc 52922317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 15521369 - 15521534
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  15521369 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 15521468  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15521469 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 15521534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Original strand, 20699857 - 20700026
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  20699857 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 20699956  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20699957 atgatgtcagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaacaggg 20700026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29784374 - 29784209
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | ||||| |||    
T  29784374 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagaactt 29784275  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29784274 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataaacatctatataagctgtttatccaaac 29784209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 22175327 - 22175492
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||| ||    
T  22175327 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagttt 22175426  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  22175427 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 22175492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 50529655 - 50529820
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  50529655 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 50529754  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
     |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  50529755 gtgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 50529820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 313
Target Start/End: Original strand, 32360055 - 32360218
Alignment:
Q  150 aattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttat 249  Q
    |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||||    
T  32360055 aattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagcttat 32360154  T
Q  250 gatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32360155 gatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataaacatctatataagctgtttatccaaac 32360218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Original strand, 38934667 - 38934836
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  38934667 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 38934766  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  38934767 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaacaggg 38934836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Original strand, 8043403 - 8043572
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  8043403 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 8043502  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  8043503 atgatataagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaacaggg 8043572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 25493895 - 25493730
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  25493895 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaaatataagagctt 25493796  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  25493795 atgatgtaagctctaatgttataagtcataatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 25493730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 26000070 - 26000235
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  26000070 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaaatataagagctt 26000169  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||    
T  26000170 atgatataagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataaaatgtttatccaaac 26000235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 37697600 - 37697435
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  37697600 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 37697501  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  37697500 atgatataagctctaatgtcataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 37697435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 38856626 - 38856791
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  38856626 ataattgcttatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 38856725  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  38856726 atgatgtaagctctattgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaac 38856791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 44608979 - 44608814
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||| ||    
T  44608979 ataattgcttatataatgtcacatctaaacacttcaatttatataagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagttt 44608880  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  44608879 atgatgtaagctctaatattataagttctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 44608814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 148 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 46451815 - 46451649
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  46451815 ataattgcttatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 46451716  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaaca 314  Q
    ||||||||||||||  || ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  46451715 atgatgtaagctctgatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaaca 46451649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 16355247 - 16355412
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  16355247 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacactttaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 16355346  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  16355347 atgatgtaagctataatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 16355412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 21581770 - 21581935
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||  | | |||||| ||    
T  21581770 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtatacatccaaacataaataacttatcaagtataagagttt 21581869  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  21581870 atgatataagctctaatattataagcactaatgctataagtatctatataagctgtttatccaaac 21581935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 34700952 - 34701117
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  34700952 ataattgtttatgtaatgtcacattcaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 34701051  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  34701052 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 34701117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42307401 - 42307236
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  42307401 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataagagctt 42307302  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  42307301 atgatataagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagatgtttatccaaac 42307236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 44689551 - 44689716
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  44689551 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 44689650  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  44689651 atgatgtaagctctaatgttataagccctaaggctataagcatctatataagttgtttatccaaac 44689716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 15518093 - 15517928
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  15518093 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacactttaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataagagctt 15517994  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  15517993 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatggtataagcacctatataagctgtttatccaaac 15517928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 53028843 - 53029008
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  53028843 ataattgcttatgtaatgtcatatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtatacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 53028942  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  53028943 atgacgtaaactctaatgttataagccctaatgctataaacatctatataagttgtttatccaaac 53029008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54869541 - 54869376
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  ||| |||||||||    
T  54869541 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaagttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacgtaaataacttatcaaatataagagctt 54869442  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  54869441 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatggtataagcacctatataaactgtttatccaaac 54869376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42103714 - 42103552
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  42103714 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaaatataagagctt 42103615  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| |||||||   || |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  42103614 atgatataagctc---tgttataagccataatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 42103552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Original strand, 29785685 - 29785854
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| | |||| || ||||  | | |||||||||    
T  29785685 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaagcataaatagtttatcaagtataagagctt 29785784  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    |||||||||| |||| || |||||||  ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  29785785 atgatgtaagatctaatgttataagccttaatgctataagcatctagataagttgtttatccaaacaggg 29785854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 32244911 - 32245076
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | |||| ||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  32244911 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttaatgtacatatccgaacataaatagcttatcaagtataagagctt 32245010  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  32245011 atgatgtaagctctaatgttataaaccctaatgctataagtatctatataagctgtttatccaaac 32245076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 50528275 - 50528137
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||  | | |||||||||    
T  50528275 ataattgcttatgtaatgtcacaaccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacttaaatagcttatcaagtataagagctt 50528176  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataa 286  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  |||||||||||    
T  50528175 atgatgtaagctctaatgttataagccataatgctataa 50528137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 313
Target Start/End: Original strand, 13697458 - 13697603
Alignment:
Q  168 acatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgct 267  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||  || |||| |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| || |    
T  13697458 acatccaaacacttcaatttatgtaagtaattttttgtatatatgtctaaacataaatagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagctctaatgtt 13697557  T
Q  268 ataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  13697558 ataagccctaatgttataagcatctatataagctgtttatccaaac 13697603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 136 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 36787609 - 36787449
Alignment:
Q  136 ttttatcatttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattga 235  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| ||||||||||    
T  36787609 ttttaacattttataattgcttatgcaatgacacatccaaacacttcaatttacgtaagtactttttagtgtacatattcaaacgtaaatagcttattga 36787510  T
Q  236 atttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  36787509 -----------------gtaagctctagtgctataagctctaatgctataagcatcaatataagctgtttattcaaac 36787449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 169 - 313
Target Start/End: Original strand, 35227094 - 35227238
Alignment:
Q  169 catcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgcta 268  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |  || | |  ||||| |||| |||||||  | | |||||||||||||||||||||||| || ||    
T  35227094 catccaaacacttcaatttatgtaagtacttttttgtatacatagtcaaacataaatagcttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgtta 35227193  T
Q  269 taagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  35227194 taagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 35227238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 158 - 313
Target Start/End: Original strand, 26123403 - 26123557
Alignment:
Q  158 atataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaag 257  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| || ||||  | | |||||||||||||||||||    
T  26123403 atataatg-tacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgcatatattcaaacataaatagtttatcaagtataagagcttatgatgtaag 26123501  T
Q  258 ctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| || ||||||| |||||| ||||| |||| | ||||| |||||||| ||||    
T  26123502 ctctaatgttataagccctaatgttataagcatctacataagttgtttatctaaac 26123557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 48924663 - 48924524
Alignment:
Q  174 aaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| | |||| || ||||  | | |||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  48924663 aaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaccataaatagtttatcaagtataagagcttatgatgtgagctctaatgttataagc 48924564  T
Q  274 tctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
     ||||||  |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  48924563 cctaatgtcataagcatctatataatctgtttatccaaac 48924524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20841830 - 20841705
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||| |||| || ||||  | | |||||||||    
T  20841830 ataattgcttacataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtatacatatccaaacataaatagtttatcaagtataagagctt 20841731  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  20841730 atgatgtaagctctaatgttataagc 20841705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 54533490 - 54533367
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  54533490 ataattggttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatattcaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 54533391  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataa 271  Q
    |||||||||||||||  |||||||    
T  54533390 atgatgtaagctctaaggctataa 54533367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12117046 - 12116972
Alignment:
Q  243 agcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    |||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12117046 agcttatgatataagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaacaggg 12116972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 232
Target Start/End: Original strand, 29446250 - 29446334
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttat 232  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  29446250 ataattgcttatatattgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtatatatccaaacataaatagcttat 29446334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 313
Target Start/End: Original strand, 29624600 - 29624769
Alignment:
Q  143 atttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaag 242  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||| || |||   |||||||  |||| |||||||||| |  |||    
T  29624600 attttataaatgcttatataatgacacatccaaacatttcaatttctgtaagtacttttaagtgtacttatccaaatgtaaaaagcttattgagtacaag 29624699  T
Q  243 agcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| | ||| |||||||  | | |||||||||||||||| || |||   |||||| | |||||||||||    
T  29624700 agcttctaatgcaagctcttatac-ataagctctaatgctacaagcatatgtataagttatttatccaaac 29624769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12117124 - 12117053
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaac 219  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  12117124 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaac 12117053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 313
Target Start/End: Original strand, 29446358 - 29446403
Alignment:
Q  268 ataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  29446358 ataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 29446403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 47
Target Start/End: Original strand, 22101301 - 22101340
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccatat 47  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22101301 gaaaagctcataaggaattgtacctaagttttctccatat 22101340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 35368584 - 35368549
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcc 43  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35368584 gaaaagcacataaggaattgtacctaagttttctcc 35368549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 43
Target Start/End: Original strand, 22176246 - 22176280
Alignment:
Q  9 aaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcc 43  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22176246 aaaagcacataaggaattgtacctaagttttctcc 22176280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 24835488 - 24835383
Alignment:
Q  168 acatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgct 267  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | ||||||||||| || ||||| ||| || |    
T  24835488 acatccaaacacttcaatttatgtaattatcttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagcttataatataagccctaatgtt 24835389  T
Q  268 ataagc 273  Q
    ||||||    
T  24835388 ataagc 24835383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 54533373 - 54533340
Alignment:
Q  280 gctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54533373 gctataaacatctatataagctgtttatccaaac 54533340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 48
Target Start/End: Original strand, 26976978 - 26977018
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccatatt 48  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26976978 gaaaaacacctaaagaattgtacctaagttttgtccatatt 26977018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 46 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 36787688 - 36787640
Alignment:
Q  46 attttaatattgttctttttacacctttataatcgtggtgtaattcctt 94  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  36787688 attttaatatcgttctttttacaactttaaaatcgtggtttgattcctt 36787640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 45712937 - 45712901
Alignment:
Q  9 aaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccat 45  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45712937 aaaagcacctaaggaattgtacctaagttttctccat 45712901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 23323356 - 23323521
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||    
T  23323356 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacttaaatagcttatcaaatataagagctt 23323455  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  23323456 atgatgtaagctctaatgttataagctttaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 23323521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 52697380 - 52697545
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| | |||||  | | ||||| |||    
T  52697380 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtatatatccaaacataaataacttatcaagtataagaactt 52697479  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  52697480 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 52697545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Original strand, 17592409 - 17592578
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  17592409 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 17592508  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  17592509 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaacaggg 17592578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8079120 - 8078955
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||  | | |||||||||    
T  8079120 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaacttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagtttatcaagtataagagctt 8079021  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  8079020 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 8078955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 25897962 - 25898127
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  25897962 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtctacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 25898061  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25898062 atgatataagctctaatgttataagcactaatgctataaacatctatataagctgtttatccaaac 25898127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 29079224 - 29079389
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  29079224 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 29079323  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  29079324 atgatataagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 29079389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 40093223 - 40093388
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  40093223 ataattgcttatgtaatgttacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 40093322  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  40093323 atgatgtaagctctaatgttataagctccaatgctataagtatctatataagttgtttatccaaac 40093388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 51358843 - 51358678
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||| |||| |||||||  ||| ||||| |||    
T  51358843 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaatacttcaatttatgtaagtactttttagtgtgcatatccaaacataaatagcttatcaaatataagaactt 51358744  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  51358743 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 51358678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17586858 - 17586694
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  17586858 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtgcatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 17586759  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  17586758 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaa 17586694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1168881 - 1168716
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  1168881 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 1168782  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  1168781 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgttataagcatctatataagttgtttatccaaac 1168716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 8121588 - 8121753
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||  ||| ||||| |||    
T  8121588 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaggtactttttagtgtacatatccaaacataaatagtttatcaaatataagaactt 8121687  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  8121688 atgatgtaagctctaatgttataagccttaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 8121753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Original strand, 33510998 - 33511167
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||| ||||| |||||  | ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  33510998 ataatttcttatgtaatgtcagatccaaacactttaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 33511097  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33511098 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacaggg 33511167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 39259869 - 39259704
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  39259869 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataagagctt 39259770  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  39259769 atgatataagctctaatgttataagcactaatgttataagcatctatataagctgtttatccaaac 39259704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 314
Target Start/End: Original strand, 2348455 - 2348621
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| | |||| || ||||  | | |||||||||    
T  2348455 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaccataaatagtttatcaagtataagagctt 2348554  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaaca 314  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||    
T  2348555 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctacataagctgcttatccaaaca 2348621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 1171240 - 1171405
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | ||||||||     
T  1171240 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaacttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctc 1171339  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  1171340 atgatgtaagctttaatgttataagctataatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 1171405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 15718406 - 15718571
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||  | | ||||| |||    
T  15718406 ataattgcttatgtaatgtcacatcaaaacactttaatttatgtaagtacttttttgtgtatatatccaaacataaatagcttatcaagtataagaactt 15718505  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15718506 atgatgtaagctctaatgttataagccataatgttataagcatctatataagctgtttatccaaac 15718571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 26663885 - 26664050
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||  ||    
T  26663885 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagaattt 26663984  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  26663985 atgatgtaagctctaatgttataagtcctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 26664050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41927960 - 41927795
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | ||| | |||    
T  41927960 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataaaaactt 41927861  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41927860 atgatgtaaactctaatgttataagctataatactataagcatctatataagctgtttatccaaac 41927795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 42369812 - 42369647
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| || ||| | |||||||  |||| |||||||  | | |||||||||    
T  42369812 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgcaagtacttttcagtgtacatatccaaatataaatagcttatcaagtataagagctt 42369713  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  42369712 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 42369647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 52752685 - 52752520
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  52752685 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataagagctt 52752586  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  52752585 atgatataagctctaatgttataagcactaatattataagcatctatataagctgtttatccaaac 52752520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 7146383 - 7146550
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacat--ccaaacttaaagagcttattgaatttaagagc 245  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||  |||||| |||| |||||||| | | |||||||    
T  7146383 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtacttttttttgtatacatatccaaacataaatagcttattaagtataagagc 7146482  T
Q  246 ttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||| |||||| | || ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  7146483 ttatgatgaaagctccaatgttataagccctaatactataagcatctatataagctgtttatccaaac 7146550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 970020 - 969855
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  970020 ataattgcttatgtaatatcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataagagctt 969921  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  969920 atgatataagctctaatgttataaacactaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 969855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 20097410 - 20097575
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  20097410 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaaaacttcaatttatgtaaatactttttagtgtacatatccaaacataaataacttataaagtataagagctt 20097509  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  20097510 atgatataagctctaatgttataagcactaatgttataagcatctatataagctgtttatccaaac 20097575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Original strand, 38829853 - 38830012
Alignment:
Q  154 gcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatg 253  Q
    |||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || ||| | ||| |||| |||| |||||||  | | |||||||||||||||    
T  38829853 gcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatttaagtacttttcagtgtacatatctaaacataaatagcttatcaagtataagagcttatgatg 38829952  T
Q  254 taagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  38829953 taaactctaatggtataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 38830012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26579678 - 26579513
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | ||| |||||    
T  26579678 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacattttaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataaaagctt 26579579  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |  ||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  26579578 atgatgtaagctctaatattataaaccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 26579513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Original strand, 43906275 - 43906439
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  43906275 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtatttttttgtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 43906374  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    ||||||||| || || || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  43906375 atgatgtaatctttaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaa 43906439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 148 - 271
Target Start/End: Original strand, 15203677 - 15203800
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  15203677 ataattgcttatgtaataacacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 15203776  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataa 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  15203777 atgatgtaagctctaatgctataa 15203800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 38172498 - 38172653
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  38172498 ataattgcttatataatgttacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttt----------atccaaacataaataacttatcaagtataagagctt 38172587  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  38172588 atgatgtaagctctaatgttataaaccctaatgctataagcatctatataagatgtttatccaaac 38172653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 313
Target Start/End: Original strand, 5678502 - 5678640
Alignment:
Q  174 aaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| || | |||||||  |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  5678502 aaacacttcaatttatgtaaatactttttagcatacatatccaaatataaagaacttattgagtataagagcttatgatgtaagttctagt-ttataagc 5678600  T
Q  274 tctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||| |||   ||| |||| |||||||||||    
T  5678601 tctaatgctataagcatttctatgagctatttatccaaac 5678640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 286
Target Start/End: Original strand, 5216101 - 5216239
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  5216101 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttggtgtacatatccaaacataaataccttatcaagtataagagctt 5216200  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataa 286  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||||    
T  5216201 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataa 5216239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 286
Target Start/End: Original strand, 29699560 - 29699698
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||| | || |||||||  | | ||| |||||    
T  29699560 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatttaagtactttttagtgtacatatccaaacatgaatagcttatcaagtataaaagctt 29699659  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataa 286  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||    
T  29699660 atgatgtaagctctaatgatatatgctctaatgctataa 29699698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 40150079 - 40150245
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtacttttta-gcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagct 246  Q
    |||||||||||| |||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||| | |||||||| |||| |||||||  | | ||||||||    
T  40150079 ataattgcttatgtaatgtcacttccaaacacttcaatttatgtaagtactttttttgtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagct 40150178  T
Q  247 tatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||  ||||| |||  ||||||| |||||||||||||    
T  40150179 tatgatgtaagctctaatgttataagccctaatattataagcatttatataagttgtttatccaaac 40150245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 239 - 313
Target Start/End: Original strand, 46761784 - 46761858
Alignment:
Q  239 taagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  46761784 taagagcttatgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataaacatctatataaactgtttatccaaac 46761858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5216362 - 5216245
Alignment:
Q  143 atttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaag 242  Q
    |||| ||||||| |||| || | | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  5216362 attttataattgtttatgtagtaacacatccaaatacttcaatttacgtaagtactttttagtgtacatattcaaacataaagagcttattgagtataag 5216263  T
Q  243 agcttatgatgtaagctc 260  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5216262 agcttatgatgtaagctc 5216245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 6766159 - 6766324
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||||||   ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  6766159 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaatacttcaattagtgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataagagctt 6766258  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||| || || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||  ||||||| |||||    
T  6766259 atgatgtaagctataatgttataagccctaatgctataagcatctatataaattgtttattcaaac 6766324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13996103 - 13995978
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  13996103 ataattgcttatgtaatatcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 13996004  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  13996003 atgatgtaagctctaatgttataagc 13995978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 14004217 - 14004092
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  14004217 ataattgcttatgtaatatcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 14004118  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  14004117 atgatgtaagctctaatgttataagc 14004092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Original strand, 16052887 - 16053012
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  16052887 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 16052986  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    |||||||||||| || || |||||||    
T  16052987 atgatgtaagctataatgttataagc 16053012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 15553822 - 15553658
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  15553822 ataattgtttatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatattcaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 15553723  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||   |||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  15553722 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatatcataagcatctatataagctacttatccaaa 15553658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1940390 - 1940252
Alignment:
Q  174 aaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  1940390 aaacacttcaatttatgtaagtactttt-agtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagcttatgatgtaaactctaatgttataagc 1940292  T
Q  274 tctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
     ||||||  |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  1940291 cctaatgtcataagcatctatataagttgtttatccaaac 1940252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 23318994 - 23318855
Alignment:
Q  174 aaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    | | |||||||| ||| || |||||  | | |||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23318994 aaacacttcaatttatgtaagtactttttaatacacatatccaaacataatgaacttatcaagtataagagcttatgatgtaagctctaatgttataagc 23318895  T
Q  274 tctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||| ||||    
T  23318894 tctaatgctataagcatctatataaattgtttatcaaaac 23318855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Original strand, 46409999 - 46410123
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  46409999 ataattgcttatgtaatgtcacatc-aaacacttcaatttatgtatgtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 46410097  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  46410098 atgatataagctctaatgctataagc 46410123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 271
Target Start/End: Original strand, 29288843 - 29288966
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  29288843 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 29288942  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataa 271  Q
    || || ||||| ||| ||||||||    
T  29288943 ataatataagcactaatgctataa 29288966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 317
Target Start/End: Original strand, 2478438 - 2478510
Alignment:
Q  245 cttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  2478438 cttatgatgtaagctctaatgctataagccttaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaacaggg 2478510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Original strand, 12683355 - 12683456
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| |||||||  ||| |||||||||    
T  12683355 ataattacttatgtaatgttacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatattcaaacataaatagcttatcaaatataagagctt 12683454  T
Q  248 at 249  Q
    ||    
T  12683455 at 12683456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 261
Target Start/End: Original strand, 36523880 - 36523999
Alignment:
Q  142 catttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaa 241  Q
    ||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| | || ||| ||||||| |  |||| ||||||| |||| |||    
T  36523880 cattttatatttgtttatacaatgacacatccaaacacttcaatttatgtaagtacttataagtgtaaacatccataagtaaaaagcttatcgaatataa 36523979  T
Q  242 gagcttatgatgtaagctct 261  Q
    |  |||||||| ||||||||    
T  36523980 gcacttatgatataagctct 36523999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Original strand, 32672392 - 32672517
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |  ||| | |||||||  |||| |||||||  | | |||||||||    
T  32672392 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatttaagtacttttcaatgtacatatccaaatataaatagcttatcaagtataagagctt 32672491  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  32672492 atggtataagctctaatgctataagc 32672517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22887563 - 22887455
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaa-tttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagct 246  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | | || ||||| |||| |||||||  |||  |||||||    
T  22887563 ataattgcttatgtaatgtcacatctaaacacttcaaatttatgtaagtactttttagtgaaaatattcaaacataaatagcttatcaaatacaagagct 22887464  T
Q  247 tatgatgta 255  Q
    |||||||||    
T  22887463 tatgatgta 22887455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 318
Target Start/End: Original strand, 32672496 - 32672547
Alignment:
Q  267 tataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggga 318  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  32672496 tataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaacgggga 32672547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 313
Target Start/End: Original strand, 29288955 - 29288993
Alignment:
Q  275 ctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29288955 ctaatgctataaacatctatataagctgtttatccaaac 29288993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Original strand, 52088351 - 52088477
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaa-tttaagagct 246  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | ||| |||| |||| || ||||  || | ||||| ||    
T  52088351 ataattgcttatgtaatgtcacatccatacacttcaatttatgtaaatactttttagtgtacatatctaaacataaaaagtttatcaaagtataagaact 52088450  T
Q  247 tatgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||    
T  52088451 tatgatgtaaactctaatgttataagc 52088477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 286
Target Start/End: Original strand, 29699748 - 29699789
Alignment:
Q  245 cttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataa 286  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  29699748 cttatgatgtaagctctaatgatataagctctaatgctataa 29699789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 232
Target Start/End: Original strand, 2474311 - 2474394
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttat 232  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||    
T  2474311 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaa-ttatgtaagtactttttggtgtacatatccaaacataaatagcttat 2474394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Original strand, 23499147 - 23499223
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaa 224  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||    
T  23499147 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacatttcaatttatctaagtactttttagtgtacatatccaaacataaa 23499223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 9978086 - 9978039
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccatattttaatat 55  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  9978086 gaaaagcacataaggaattgtacctaaattttctccatttttttatat 9978039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 19954946 - 19954911
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcc 43  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19954946 gaaaagcacataaggaattgtacctaagttttctcc 19954911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 313
Target Start/End: Original strand, 23499254 - 23499300
Alignment:
Q  267 tataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  23499254 tataagctctaatgttataagcatctatataaactgtttatccaaac 23499300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 27926286 - 27926248
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccata 46  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27926286 gaaaagcacataaggaattatacctaagttttctccata 27926248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 259
Target Start/End: Original strand, 35218622 - 35218738
Alignment:
Q  142 catttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaa 241  Q
    ||||| |||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||||| | ||| | ||||||  ||| |  ||||||| |||| | |||||||| | |||    
T  35218622 cattttataattgcttatgtaataacatatccaaacacttcaatttatgcaagcattttttaatgtacatgtccaaacataaa-aacttattgagtataa 35218720  T
Q  242 gagcttatgatgtaagct 259  Q
    | ||||||||||||||||    
T  35218721 gcgcttatgatgtaagct 35218738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 56
Target Start/End: Original strand, 25297983 - 25298031
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccatattttaatatt 56  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25297983 gaaaaacacctaaggaattgtacctaagttttctccatatatttatatt 25298031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 9 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 28243987 - 28243951
Alignment:
Q  9 aaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccat 45  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28243987 aaaagcacatagagaattgtacctaagttttgtccat 28243951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Original strand, 49146749 - 49146825
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaa 224  Q
    |||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| | |||||||| ||||    
T  49146749 ataattgcttatgtaatatcacatccaaacacttcaatttatgtaagtattttttaatgtacatatccaaacataaa 49146825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 26)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 10550921 - 10551086
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  10550921 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 10551020  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  10551021 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 10551086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16306641 - 16306476
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  16306641 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatctagtataagagctt 16306542  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16306541 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 16306476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26946541 - 26946377
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||| | |||||||||    
T  26946541 ataattgcttatgtaatgtcaaatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacgtaaatagcttattgagtataagagctt 26946442  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  26946441 atgatataagctc-agtgctataagctctaatgctataagtatcaatataagctgtttatccaaac 26946377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 9460332 - 9460497
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||| |||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  9460332 ataatcgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtaaatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 9460431  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9460432 atgatgtaagctctaatattataagctctgatgctataaacatctatataagctgtttatccaaac 9460497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 53627 - 53792
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  53627 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 53726  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  53727 atgatataagctctaatgtcataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 53792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 2838281 - 2838446
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  2838281 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 2838380  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| |||| |||| || ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2838381 atgatataagttctaatgttataaacactaatgctataaacatctatataagctgtttatccaaac 2838446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3955288 - 3955123
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | | |||||||    
T  3955288 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtatgagagctt 3955189  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  3955188 atgatataagctctaatgttataagcactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 3955123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 3347008 - 3346843
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  3347008 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 3346909  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  3346908 atgatataagctctaatgttataaaccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 3346843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 18614264 - 18614429
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||||||  |||| |||||||  | | |||||||||    
T  18614264 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtacttttcagtgtacatatccaaatataaatagcttatcaagtataagagctt 18614363  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  18614364 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 18614429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 20727328 - 20727493
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  20727328 ataattgtttatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 20727427  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  20727428 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagttgtttatccaaac 20727493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26703827 - 26703662
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  26703827 ataattgcttatataatatcaaatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 26703728  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    || || ||||||||| || ||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  26703727 atcatataagctctaatgttataagcactaatgctataagcacctatataagctgtttatccaaac 26703662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 30692564 - 30692729
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  30692564 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 30692663  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||  || ||||||| |||||| | ||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  30692664 atgatataagctctgatgttataagcactaatgttttaagcatctatataagttgtttatccaaac 30692729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23073834 - 23073673
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||| |||| || ||||  | | |||||||||    
T  23073834 ataattgcttatgtaatgtcaaatccaaacacttcaatttatgtaaatactttttagtgtatatatccaaacataaatagtttatcaagtataagagctt 23073735  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatcc 309  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  23073734 atgatataaactctaatgttataaactctaatgttataagcatctatataagttgtttatcc 23073673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 148 - 286
Target Start/End: Original strand, 21894074 - 21894212
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  21894074 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtacttttttgtgtacatatccaaacataaatagcttataaagtataagagctt 21894173  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataa 286  Q
    ||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||    
T  21894174 atgatgtaagctctaatgttataaatcctaatgctataa 21894212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 6086095 - 6085970
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||| | | |||||||||    
T  6086095 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttattaagtataagagctt 6085996  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||    
T  6085995 atgatataagctctaatgttataagc 6085970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 17260545 - 17260377
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatt----tacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaaga 243  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||||||    ||  |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||    
T  17260545 ataattacttatgtaatgtcacatccaaacacttcaattaatttatttaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataaga 17260446  T
Q  244 gcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| ||||    
T  17260445 gcttatgatgtaagctctaatggtataagctctaattctataagcatctttataagctgtttatacaaa 17260377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 33465088 - 33465246
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |       || |||| |||||||  | | |||||| ||    
T  33465088 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtattttttagtgtaca-------acataaatagcttatcaagtataagagttt 33465180  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||    
T  33465181 atgatgtaagctctaatgttataagttctaatgctataagcatctatataagttgtttattcaaac 33465246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 240 - 313
Target Start/End: Original strand, 34887100 - 34887173
Alignment:
Q  240 aagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  34887100 aagagcttatggtgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 34887173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 30692865 - 30692741
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||||| |||| | |||||  | | ||| |||||    
T  30692865 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtacttttttgtgtacatatccaaacgtaaataacttatcaagtataaaagctt 30692766  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataag 272  Q
    ||||||||||||||| || ||||||    
T  30692765 atgatgtaagctctaatgttataag 30692741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 313
Target Start/End: Original strand, 12835715 - 12835897
Alignment:
Q  129 aaaaacattttatcatttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagc 228  Q
    ||||| || ||| ||||| ||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| | || |||||||||| |||| | |    
T  12835715 aaaaatatattaacattttatattttcttaaataatgaaacatccaaacacttcaatttatataagtacttattaacataaacatccaaacgtaaaaaac 12835814  T
Q  229 ttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
     |||||| | ||||  |||||||| ||||||||  | |||||| |||||||| ||||| ||||  |||||  |||||||||||||    
T  12835815 atattgagtataagcacttatgatataagctctgatactataaactctaatgttataagcatctgtataa--tgtttatccaaac 12835897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 148 - 259
Target Start/End: Original strand, 35198852 - 35198963
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||  |||| |||||||  | | | |||||||    
T  35198852 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttaatgtacatatccaaatataaatagcttatcaagtatgagagctt 35198951  T
Q  248 atgatgtaagct 259  Q
    ||||||||||||    
T  35198952 atgatgtaagct 35198963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 29734299 - 29734145
Alignment:
Q  129 aaaaacattttatcatttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagc 228  Q
    ||||| |||||| ||||||||| |||||||| || ||| |  |  ||||| |||||||||  |||||||||||||  ||| | || ||||| |||| ||     
T  29734299 aaaaatattttaacatttcatatttgcttatgtagtgacattttcaaacatttcaatttatataagtactttttaatgtacatattcaaacataaaaagt 29734200  T
Q  229 ttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataa 286  Q
    ||||||| | |||||||||   |||||||||||||| |||||| |||||||| |||||    
T  29734199 ttattgagtataagagctt---atgtaagctctagttctataaactctaatgttataa 29734145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6085991 - 6085945
Alignment:
Q  267 tataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  6085991 tataagctctaatgttataagcatctatataagctgtttatccaaac 6085945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 30691849 - 30691807
Alignment:
Q  275 ctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30691849 ctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaacaggg 30691807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 43
Target Start/End: Original strand, 885519 - 885556
Alignment:
Q  6 aggaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcc 43  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  885519 aggaaaagcacctaaggaattgtacctaagttttctcc 885556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 17367099 - 17367062
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccat 45  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17367099 gaaaagaacataaggaattgtacctaagttttctccat 17367062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1827 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1827
Description:

Target: scaffold1827; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 148 - 315
Target Start/End: Original strand, 16 - 183
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  16 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 115  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacag 315  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  116 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataaacatctatataagctgtttatccaaacag 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 51 - 216
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  51 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 150  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  151 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagctgtttatccaaac 216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 148 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 18426 - 18257
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  18426 ataattgcttatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 18327  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18326 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacaggg 18257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8373770 - 8373605
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  8373770 ataattgcttatgtaatgtcaaatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttataaagtataagagctt 8373671  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  8373670 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgatataagcatctatataagttgtttatccaaac 8373605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27678664 - 27678499
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  27678664 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatcgaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 27678565  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27678564 atgatataagctctaatgttataagcactaatgctataaacatctatataagttgtttatccaaac 27678499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 33991936 - 33992101
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||  | | |||||||||    
T  33991936 ataattgcttatgtaatgtcaaattcaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagtttatcaagtataagagctt 33992035  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33992036 atgatgtaagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 33992101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 313
Target Start/End: Original strand, 19360703 - 19360862
Alignment:
Q  154 gcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatg 253  Q
    |||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  || | |||||||| |||| |||||||  ||| |||||||||||||||    
T  19360703 gcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtatacatatccaaacataaatagcttatcaaatataagagcttatgatg 19360802  T
Q  254 taagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||    
T  19360803 taagctctaatgttataagctctaatgctataagcatctatataaattgtttatccaaac 19360862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1165223 - 1165058
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |  ||||  ||| |||||||||    
T  1165223 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataatttatcaaatataagagctt 1165124  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  1165123 atgatgtaagctctaatgttataagccataatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 1165058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9007463 - 9007298
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  9007463 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 9007364  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  9007363 atgatataagctctaatgttataagccctaatactataagcatctatataagttgtttatccaaac 9007298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24105129 - 24104964
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  24105129 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 24105030  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  24105029 atgatataagctctaatgtcataagcactaatgctataagcatctatataaactgtttatccaaac 24104964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33490671 - 33490506
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  33490671 ataattgcgtatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 33490572  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33490571 atgatataagctctaatgttataaacactaatgctataagcatctatataagctgtttatccaaac 33490506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 34708449 - 34708284
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| || ||||| | | |||||||||    
T  34708449 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagtttattaagtataagagctt 34708350  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
     |||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  34708349 gtgatataagctctaatgttataagcactaatactataagcatctatataagctgtttatccaaac 34708284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 129 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19515690 - 19515501
Alignment:
Q  129 aaaaacattttatcatttcataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgta---tac--atccaaacttaa 223  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||   |||  |||||||| |||    
T  19515690 aaaaatattttaatatttcataattacttatataatgataaattcaaacactttaatttatgtaagtactttttagtgtagagtacatatccaaacataa 19515591  T
Q  224 agagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||  ||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| |||||||||||    
T  19515590 agaatttattgcgtataagaacttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataagcacctgtataagctatttatccaaac 19515501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35419803 - 35419638
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  35419803 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacatttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatgaagtataagagctt 35419704  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  35419703 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgttataagcatctatataaactgtttatccaaac 35419638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 26602457 - 26602292
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| |  ||||    | |||||||||    
T  26602457 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatattcaaacataaataatttatcacgtataagagctt 26602358  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  26602357 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataagttgtttatccaaac 26602292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 31883919 - 31884084
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  31883919 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtacttgttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataagagctt 31884018  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  31884019 atgatttaagctctaatgttataagttctaatgctataagcatttatataagctgtttatccaaac 31884084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 315
Target Start/End: Original strand, 1579574 - 1579741
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||| || |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  1579574 ataattgctcatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 1579673  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacag 315  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||  ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1579674 atgatgtaagctctaattttattagtcctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacag 1579741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 148 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 1605241 - 1605074
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||| || |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  1605241 ataattgctcatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 1605142  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacag 315  Q
    ||||||||||||||| |  ||| ||  ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1605141 atgatgtaagctctaattttattagtcctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaacag 1605074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35782169 - 35782020
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  35782169 ataattgcttatataatgtcacatccaaacacttcaatttatg-aagtactttttagtgtacatatccaaacataaataacttatcaagtataagagctt 35782071  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataa 298  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  35782070 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctataagcatctatataa 35782020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 27421399 - 27421564
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||| |||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  27421399 ataattgcttatgtaatgtcagatccaaaaacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatctaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 27421498  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  27421499 atgatgtaagctctaatattataagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatctaaac 27421564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 27025726 - 27025891
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||| |||| |||||||  ||| ||| | |||    
T  27025726 ataattgcgtatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatacccaaacataaatagcttatcaaatataaaaactt 27025825  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    || ||| || ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  27025826 ataatgcaaactctaatattataagccctaatgctataaacatctatataagctgtttattcaaac 27025891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Original strand, 4121657 - 4121824
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaattta--agagc 245  Q
    |||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | ||  |||||    
T  4121657 ataattgcttatgtaatgtcacatccgaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagagc 4121756  T
Q  246 ttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  4121757 ttatgatataagctctaatattataagccctaatactataatcatctatataagttgtttatccaaac 4121824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Original strand, 16070166 - 16070291
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  16070166 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 16070265  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||||||||||||||| || |||||||    
T  16070266 atgatgtaagctctaatgttataagc 16070291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 286
Target Start/End: Original strand, 31413327 - 31413465
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  31413327 ataattgcttatgcaatgtcacatccaaacaattcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatcctaacataaatagcttatcaagtataagagctt 31413426  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataa 286  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  31413427 atgatgtaaactctaatgctataagccctaatgttataa 31413465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 148 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 35420080 - 35419924
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||| ||||||| |||||  | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  35420080 ataaatgcttatgtaatgtcagatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 35419981  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||         ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  35419980 atgatgtaagct---------taagccctaatgccataagcatctatataagctgtttatccaaac 35419924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23765419 - 23765305
Alignment:
Q  195 tactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaat 294  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| | || |||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  23765419 tactttttagtgtacatatccaaacattaatagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagttctaatgttataagtcctaatgctataaacatctat 23765320  T
Q  295 ataagctgtttatcc 309  Q
    ||||| |||||||||    
T  23765319 ataagttgtttatcc 23765305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23815267 - 23815153
Alignment:
Q  195 tactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaat 294  Q
    |||||||||| ||| | |||||||| | || |||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  23815267 tactttttagtgtacatatccaaacattaatagcttatcaaatataagagcttatgatgtaagttctaatgttataagtcctaatgctataaacatctat 23815168  T
Q  295 ataagctgtttatcc 309  Q
    ||||| |||||||||    
T  23815167 ataagttgtttatcc 23815153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 243 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 16736711 - 16736641
Alignment:
Q  243 agcttatgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||||||||||    
T  16736711 agcttatgatgtaagctctaatgttataagccctaatgccataagcacctatataagctgtttatccaaac 16736641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 41818153 - 41818028
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| ||||    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| | |||||||| ||||||||||||  | | ||||| |||    
T  41818153 ataattgcttatgtaatagctcatccaaacacttcaatttaagtaaatactttttactgtacatatccaaacataaagagcttatcaagtataagaactt 41818054  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagc 273  Q
    ||| ||||||||||| || |||||||    
T  41818053 atgttgtaagctctaatgttataagc 41818028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 148 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 20988443 - 20988367
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaa 224  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| | |||||||| ||||    
T  20988443 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatttaagtacttttcagcgtacatatccaaacataaa 20988367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 38597210 - 38597164
Alignment:
Q  267 tataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38597210 tataagccctaatgctataaacatctaaataagctgtttatccaaac 38597164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16736789 - 16736705
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttat 232  Q
    |||||||||||| ||||   | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||| |||| |||||||    
T  16736789 ataattgcttatgtaatatcatatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttaatgtacatatccaaacataaatagcttat 16736705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 269 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 41818047 - 41818003
Alignment:
Q  269 taagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaac 313  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  41818047 taagctctaatgttataagcatctatataagctgtttatccaaac 41818003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 20476466 - 20476419
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccatattttaatat 55  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20476466 gaaaagcatctagagaattgtacctaagttttctccttattttaatat 20476419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 8 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 21259765 - 21259730
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcc 43  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21259765 gaaaagcacataaagaattgtacgtaagttttctcc 21259730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 33629379 - 33629345
Alignment:
Q  9 aaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcc 43  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33629379 aaaagcacataaggaattgtacctaagttttctcc 33629345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 41
Target Start/End: Original strand, 2255598 - 2255631
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttct 41  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2255598 gaaaagcacctaaagaattgtacctaagttttct 2255631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38597284 - 38597231
Alignment:
Q  149 taattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtacttttt 202  Q
    ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38597284 taattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaaatacttttt 38597231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 21591248 - 21591212
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcca 44  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21591248 gaaaagcacttaaggaattgtacctaagttttctcca 21591212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 21595365 - 21595329
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctcca 44  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21595365 gaaaagcacttaaggaattgtacctaagttttctcca 21595329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 144816 - 144652
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  ||| |||| ||||    
T  144816 ataattgcttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtattttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaaatataagggctt 144717  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    ||||| ||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  144716 atgatataaactctaatgttataagccttaatgttataaacatctatataagctgtttatccaaa 144652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 148 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1882 - 1718
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    |||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  | | |||||||||    
T  1882 ataattgcttatgtaatgtcgcatccaaacacttcaatttatgtaaatactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaagtataagagctt 1783  T
Q  248 atgatgtaagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaa 312  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||| ||  | | ||||||||||||    
T  1782 atgatgtaagctctaatgttataagccctaatgctacaagcatctattaatgttgtttatccaaa 1718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 262
Target Start/End: Original strand, 415 - 529
Alignment:
Q  148 ataattgcttatataatgatacatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagctt 247  Q
    ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| |||| | |||||  | | |||||||||    
T  415 ataattgtttatgtaatgtcacatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatattcaaacataaataacttatcaagtataagagctt 514  T
Q  248 atgatgtaagctcta 262  Q
    ||||||||| |||||    
T  515 atgatgtaatctcta 529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 168 - 313
Target Start/End: Original strand, 10914 - 11061
Alignment:
Q  168 acatcgaaacacttcaatttacgtaagtactttttagcgtatacatccaaacttaaagagcttattgaatttaagagcttatgatgtaagctctagtgct 267  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||  ||| |||||| ||| ||||||| ||||| |  |    
T  10914 acatccaaacacttcaatttatgtaagtactttttagtgtacatatccaaacataaatagcttatcaaatataagagtttacgatgtaatctctaatatt 11013  T
Q  268 ataagctctaatgctataaacatc--aatataagctgtttatccaaac 313  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||    
T  11014 ataagctctaatgctataagcatctatatataagttgtttatccaaac 11061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 254 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 481165 - 481103
Alignment:
Q  254 taagctctagtgctataagctctaatgctataaacatcaatataagctgtttatccaaacaggg 317  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||| |||||||||    
T  481165 taagctctagt-ctataagctctaatgctataagcataagtataaactatttatgcaaacaggg 481103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 45
Target Start/End: Original strand, 45970 - 46007
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccat 45  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45970 gaaaagcacctaaggaattgtacctaagttttctccat 46007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 26440 - 26399
Alignment:
Q  8 gaaaagcacataaagaattgtacctaagttttctccatattt 49  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  26440 gaaaagcacctaaggaattgtacctaagttttctccttattt 26399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University