View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2281_low_18 (Length: 330)

Name: NF2281_low_18
Description: NF2281
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2281_low_18
NF2281_low_18
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (17-312)||(35965520-35965815)
chr8 (17-313)||(45455367-45455663)
chr8 (17-312)||(43370758-43371053)
chr8 (17-312)||(7341070-7341365)
chr8 (17-312)||(30304385-30304680)
chr8 (17-312)||(32377683-32377978)
chr8 (17-312)||(32431640-32431935)
chr8 (17-312)||(43688946-43689241)
chr8 (17-310)||(39751805-39752098)
chr8 (17-312)||(1115763-1116058)
chr8 (17-312)||(8422631-8422926)
chr8 (17-312)||(7168891-7169177)
chr8 (17-312)||(2145774-2146060)
chr8 (22-172)||(22580899-22581049)
chr8 (256-312)||(22581058-22581114)
chr8 (37-141)||(44320872-44320976)
chr8 (37-143)||(17316471-17316577)
chr8 (37-141)||(45116258-45116362)
chr8 (37-143)||(17340021-17340127)
chr8 (37-183)||(14401676-14401824)
[»] chr2 (29 HSPs)
chr2 (17-312)||(436302-436597)
chr2 (17-312)||(24604864-24605159)
chr2 (21-312)||(27275135-27275426)
chr2 (17-312)||(41007755-41008050)
chr2 (17-312)||(12907267-12907562)
chr2 (17-312)||(24750649-24750944)
chr2 (17-312)||(212216-212511)
chr2 (17-312)||(3802341-3802636)
chr2 (17-312)||(10623229-10623524)
chr2 (17-312)||(11692590-11692884)
chr2 (17-312)||(5348158-5348453)
chr2 (17-308)||(39794961-39795252)
chr2 (17-312)||(43949057-43949352)
chr2 (17-312)||(41561003-41561298)
chr2 (17-312)||(28354677-28354972)
chr2 (17-312)||(38946754-38947049)
chr2 (55-312)||(45476387-45476643)
chr2 (17-307)||(34920562-34920842)
chr2 (64-312)||(9655194-9655442)
chr2 (17-310)||(17996949-17997242)
chr2 (17-228)||(7264023-7264234)
chr2 (122-312)||(1098601-1098791)
chr2 (17-128)||(1100042-1100153)
chr2 (37-141)||(9639183-9639287)
chr2 (17-66)||(9652182-9652231)
chr2 (75-139)||(28423423-28423487)
chr2 (275-312)||(7264229-7264266)
chr2 (37-146)||(21535200-21535309)
chr2 (85-130)||(24683458-24683503)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (17-312)||(37015905-37016200)
chr1 (17-312)||(29355463-29355758)
chr1 (17-312)||(41454828-41455123)
chr1 (18-312)||(50116538-50116832)
chr1 (17-312)||(38691714-38692009)
chr1 (17-312)||(46974155-46974450)
chr1 (17-312)||(3947236-3947531)
chr1 (17-312)||(3984104-3984399)
chr1 (17-308)||(13630407-13630698)
chr1 (17-312)||(44466573-44466868)
chr1 (17-312)||(5078926-5079221)
chr1 (17-312)||(20350447-20350742)
chr1 (17-312)||(38774890-38775185)
chr1 (17-312)||(21943139-21943434)
chr1 (17-312)||(13174772-13175067)
chr1 (17-312)||(51663249-51663544)
chr1 (17-285)||(44619905-44620173)
chr1 (17-312)||(12649354-12649647)
chr1 (17-228)||(7980071-7980282)
chr1 (29-312)||(26466045-26466328)
chr1 (17-232)||(16246609-16246821)
chr1 (29-312)||(32106418-32106698)
chr1 (37-141)||(36360466-36360570)
chr1 (37-140)||(18887570-18887673)
chr1 (37-141)||(45472363-45472467)
chr1 (37-141)||(7403629-7403733)
chr1 (37-141)||(28862901-28863005)
chr1 (29-143)||(25231305-25231419)
chr1 (273-312)||(19498238-19498277)
chr1 (100-146)||(39914011-39914057)
chr1 (37-143)||(25593679-25593785)
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (17-312)||(36816291-36816586)
chr3 (17-312)||(46992021-46992316)
chr3 (17-312)||(7838587-7838882)
chr3 (17-311)||(7841791-7842085)
chr3 (17-312)||(77795-78090)
chr3 (17-312)||(13746496-13746791)
chr3 (17-312)||(14399546-14399841)
chr3 (17-312)||(21955014-21955308)
chr3 (17-312)||(9428608-9428903)
chr3 (17-312)||(48249642-48249937)
chr3 (17-312)||(6741878-6742173)
chr3 (17-313)||(6504729-6505025)
chr3 (17-312)||(3949734-3950029)
chr3 (17-312)||(8159758-8160053)
chr3 (17-308)||(16445611-16445902)
chr3 (17-312)||(30946417-30946712)
chr3 (17-236)||(29930359-29930578)
chr3 (17-236)||(29979513-29979732)
chr3 (17-129)||(50954264-50954376)
chr3 (37-183)||(33399546-33399692)
chr3 (238-312)||(29908031-29908104)
chr3 (238-312)||(29949197-29949270)
chr3 (238-312)||(29998351-29998424)
chr3 (37-141)||(2285003-2285107)
chr3 (37-141)||(9556727-9556831)
chr3 (37-141)||(51548479-51548583)
chr3 (37-141)||(4120740-4120843)
chr3 (30-130)||(8263742-8263842)
chr3 (37-141)||(32426622-32426726)
chr3 (37-141)||(40468155-40468259)
chr3 (37-143)||(4510287-4510393)
chr3 (89-143)||(12491150-12491204)
chr3 (100-236)||(1275240-1275376)
chr3 (75-146)||(25059882-25059953)
chr3 (37-146)||(8117600-8117709)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (17-312)||(18537111-18537406)
chr5 (17-312)||(7799781-7800076)
chr5 (17-312)||(34078771-34079066)
chr5 (29-312)||(4202714-4202997)
chr5 (17-312)||(37819652-37819947)
chr5 (17-312)||(27866620-27866915)
chr5 (17-312)||(28885183-28885478)
chr5 (17-287)||(25895901-25896171)
chr5 (17-312)||(7020655-7020950)
chr5 (17-308)||(11032231-11032522)
chr5 (17-308)||(38858969-38859260)
chr5 (17-312)||(13566866-13567172)
chr5 (99-312)||(1036424-1036637)
chr5 (17-178)||(1035459-1035620)
chr5 (32-308)||(20286015-20286291)
chr5 (32-167)||(20286515-20286650)
chr5 (17-90)||(33994242-33994315)
chr5 (29-143)||(13157978-13158092)
chr5 (29-266)||(23028381-23028625)
chr5 (37-141)||(6552800-6552904)
chr5 (37-141)||(42343502-42343606)
chr5 (37-141)||(43295232-43295336)
chr5 (162-308)||(20287404-20287550)
chr5 (37-141)||(27013615-27013719)
chr5 (89-139)||(11819279-11819329)
chr5 (92-143)||(25048464-25048515)
chr5 (37-119)||(30617320-30617402)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (17-312)||(17060-17355)
[»] chr4 (23 HSPs)
chr4 (17-312)||(9891013-9891308)
chr4 (17-312)||(4976746-4977041)
chr4 (17-312)||(19072432-19072727)
chr4 (17-312)||(49565239-49565534)
chr4 (17-312)||(3404781-3405076)
chr4 (17-312)||(11502497-11502792)
chr4 (17-312)||(4978733-4979024)
chr4 (17-312)||(41024191-41024485)
chr4 (17-312)||(51643273-51643570)
chr4 (17-301)||(18580117-18580398)
chr4 (17-312)||(21471785-21472079)
chr4 (75-312)||(4769179-4769420)
chr4 (103-312)||(38463612-38463821)
chr4 (136-304)||(44049720-44049888)
chr4 (37-141)||(17916198-17916302)
chr4 (29-312)||(6182679-6182964)
chr4 (17-71)||(17140580-17140634)
chr4 (37-141)||(4617714-4617818)
chr4 (17-60)||(38463824-38463867)
chr4 (37-143)||(1590845-1590950)
chr4 (41-141)||(46517380-46517480)
chr4 (37-141)||(32716305-32716409)
chr4 (100-146)||(20971446-20971492)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (17-312)||(1872-2167)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (17-312)||(18106379-18106674)
chr7 (17-312)||(30787530-30787825)
chr7 (17-312)||(43622910-43623205)
chr7 (17-312)||(47061874-47062170)
chr7 (17-312)||(617524-617819)
chr7 (17-312)||(42500398-42500693)
chr7 (17-312)||(45764370-45764665)
chr7 (17-303)||(15060605-15060890)
chr7 (17-312)||(43827382-43827676)
chr7 (17-312)||(8400577-8400872)
chr7 (17-170)||(21800003-21800156)
chr7 (37-141)||(46791336-46791440)
chr7 (37-141)||(1296997-1297101)
chr7 (37-141)||(45172855-45172959)
chr7 (37-140)||(40445512-40445615)
chr7 (37-139)||(8194228-8194330)
chr7 (76-146)||(20908458-20908528)
chr7 (89-141)||(47867442-47867494)
chr7 (100-143)||(16794557-16794600)
chr7 (37-138)||(40793934-40794035)
chr7 (89-141)||(43379254-43379306)
chr7 (100-236)||(3761979-3762115)
chr7 (111-143)||(16796810-16796842)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (17-309)||(18606987-18607279)
chr6 (17-312)||(1611526-1611821)
chr6 (17-312)||(31147313-31147608)
chr6 (17-312)||(29287727-29288018)
chr6 (17-264)||(28250887-28251134)
chr6 (23-312)||(21358125-21358411)
chr6 (23-312)||(23962107-23962393)
chr6 (17-266)||(24220157-24220408)
chr6 (17-157)||(7362170-7362310)
chr6 (17-123)||(7362307-7362413)
chr6 (37-146)||(34111603-34111712)
chr6 (17-60)||(13387721-13387764)
chr6 (265-312)||(28357557-28357604)
chr6 (17-67)||(35243594-35243644)
chr6 (89-141)||(22864869-22864921)
chr6 (89-139)||(26684976-26685026)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (17-312)||(16132-16427)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (17-312)||(33800-34095)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (17-312)||(12253-12549)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (17-162)||(95-240)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (37-141)||(3847-3951)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 35965815 - 35965520
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965815 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 35965716  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35965715 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 35965616  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35965615 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 35965520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Original strand, 45455367 - 45455663
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45455367 caaaggaatggggattggacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccgactttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 45455466  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45455467 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaaaatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaataccatattgcatgacaaatgtgaag 45455566  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactatt 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45455567 caagtgtacaatcaacgtcaacaaatatgaaaggcaaatagaggtgacaaaaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactatt 45455663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 43370758 - 43371053
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43370758 caaaggaatggggtttgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagtcggctttagaaggacacattcttgccggtagactaaaggaggacga 43370857  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43370858 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 43370957  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43370958 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagctgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacagctat 43371053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 7341070 - 7341365
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341070 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 7341169  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  7341170 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 7341269  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7341270 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 7341365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30304680 - 30304385
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304680 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 30304581  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  30304580 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccatagaccacattgcatgacaaatgtgaag 30304481  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30304480 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 30304385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32377978 - 32377683
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377978 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 32377879  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  32377878 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 32377779  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32377778 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 32377683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32431935 - 32431640
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431935 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 32431836  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  32431835 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 32431736  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32431735 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 32431640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43689241 - 43688946
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43689241 caaaggaatggggatttaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagtcggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaagaggacga 43689142  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43689141 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttcgaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 43689042  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  43689041 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgataagaagccgttgcaatttctaatttcgaagttgggggagcacaactat 43688946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39752098 - 39751805
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39752098 caaatgaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcaatggaaccggctttagaatgacatatttatgccggtagattaaaggaggacga 39751999  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39751998 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 39751899  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaact 310  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39751898 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaaaccattgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaact 39751805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 1115763 - 1116058
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1115763 caaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatagagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 1115862  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  1115863 caagaagatagtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacaattgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaaa 1115962  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1115963 caaatgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 1116058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8422926 - 8422631
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422926 caaaggaatggggattaaacattcttaatggagttcacaactatcccatggagccggctttagaatgacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 8422827  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  8422826 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 8422727  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8422726 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 8422631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 7168891 - 7169177
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7168891 caaaggagtggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccgactttagaaggatacattcttgctagtagattaaaggaggacga 7168990  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  7168991 caagatgattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattccatgacaaatgtgaag 7169090  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  7169091 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtg---------cgttgcaatatataatctcaaagttggatgagcacaactat 7169177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 2146060 - 2145774
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2146060 caaatgaatggagattgaacatttttaatggagttcacaaccatgcgatggagccgactttagaaggacatattcttgccggtagattaaaggaggacga 2145961  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||              | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2145960 caagaagattgtac--------------aacaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagatcacattgcatgacaaatgtgaag 2145875  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggca-----aatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaacta 311  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2145874 caagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatataatagaggtgacaagaagttgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaacta 2145775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 22 - 172
Target Start/End: Original strand, 22580899 - 22581049
Alignment:
Q  22 gaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaaga 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22580899 gaatggggattgaacattcttaatggagtttacaaccatgcgatggagccgactttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaaga 22580998  T
Q  122 agattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttga 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22580999 agattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttga 22581049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 256 - 312
Target Start/End: Original strand, 22581058 - 22581114
Alignment:
Q  256 agaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22581058 agaggtgacaagaatccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 22581114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 44320872 - 44320976
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44320872 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagataaacggaggacgacaagaagattgtacatgact 44320971  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  44320972 tgacc 44320976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Original strand, 17316471 - 17316577
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||   ||   |||||| || ||| |||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17316471 attcttaatggaattcacaaccatgagatgtttccatatttagatgggcaccttcttgcaagaagattaatggaggacgacaagaagattgtacgtgact 17316570  T
Q  137 tgaccaa 143  Q
    |||||||    
T  17316571 tgaccaa 17316577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 45116258 - 45116362
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| ||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  45116258 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttctttccggaagattaatggaggatgacaagaagattgtacatgact 45116357  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  45116358 tgacc 45116362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Original strand, 17340021 - 17340127
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||||  | |   |||||| || ||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17340021 attcttaatggaattcacaaccatgagatgttgtcatatttagatgggcaccttcttgcaagaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 17340120  T
Q  137 tgaccaa 143  Q
    |||||||    
T  17340121 tgaccaa 17340127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14401824 - 14401676
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtac--gtga 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   ||| |||   ||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||| || ||||||||||||||||   |||    
T  14401824 attcttaatggagttcacaaccatgaattggtgccaagtttagaatggcacattcttgcaggaagattaagggatgatgacaagaagattgtacatatga 14401725  T
Q  135 cttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaag 183  Q
    ||||||||||||   | |||  |||| ||||||||||||  ||||||||    
T  14401724 cttgaccaagagtttggtgccaccaaaaaatattttgatgaatttgaag 14401676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 29)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 436302 - 436597
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436302 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 436401  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  436402 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 436501  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  436502 caattgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacatctat 436597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24605159 - 24604864
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24605159 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaagtacacattcttgtcggtagactaaaggaggacga 24605060  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24605059 caagaaaattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 24604960  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24604959 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatagggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 24604864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 21 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27275426 - 27275135
Alignment:
Q  21 ggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaag 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275426 ggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaag 27275327  T
Q  121 aagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaag 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275326 aagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaag 27275227  T
Q  221 tgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27275226 tgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 27275135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41008050 - 41007755
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41008050 caaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatgtagccggctttagaatgacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 41007951  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41007950 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 41007851  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    ||||| || ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41007850 caagtctaaaatgaacgtcaacaaatatgtaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 41007755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12907562 - 12907267
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12907562 caaaggaatggagattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 12907463  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12907462 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattctgatacatttgaataacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 12907363  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12907362 caagtgtacaatgaaagtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttcaaatttcgaagttggaggagcacaactat 12907267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 24750649 - 24750944
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24750649 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggatttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggatga 24750748  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24750749 caagaagattgtacatgaattgaccgagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 24750848  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24750849 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 24750944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 212511 - 212216
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212511 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 212412  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  212411 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 212312  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  212311 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 212216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3802636 - 3802341
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802636 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 3802537  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3802536 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaataaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 3802437  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  3802436 caagtgtacaatgaacttcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttgaaggagcacaactat 3802341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 10623524 - 10623229
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623524 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 10623425  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  10623424 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 10623325  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10623324 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 10623229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11692884 - 11692590
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692884 caaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgtgatcgagccgactttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 11692785  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11692784 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaag-acaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 11692686  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11692685 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagttgacaagaagccgttgcaatatttaatctcgaaattggaggagcacaactat 11692590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 5348158 - 5348453
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348158 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacagccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 5348257  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  5348258 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 5348357  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5348358 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 5348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Original strand, 39794961 - 39795252
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39794961 caaaagaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaagggcacattcttgccggtagattaaaggaggacga 39795060  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39795061 caagaagattgtacgtgacttgacaaaaagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 39795160  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaa 308  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39795161 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaa 39795252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43949352 - 43949057
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  43949352 caaaggaatggggattgaacattattaatggagttcacaaccatgcgaaggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgg 43949253  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43949252 caagaagattgtacatgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 43949153  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  43949152 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatataggtgacaagaagccgttgcgttatctaatctcgaagttagaggagcacaactat 43949057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 41561003 - 41561298
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561003 caaaggaataaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 41561102  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  41561103 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 41561202  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41561203 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 41561298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28354972 - 28354677
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28354972 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcataaccatgcgatggagcctgctttagaatgacacattcttgctggtagactaaaggaggacga 28354873  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  28354872 caagaagattgtacgtgacttgaccatgagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaataaaagaccacatttcatgacaaatgtgaag 28354773  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28354772 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagtcaaatataggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 28354677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 38946754 - 38947049
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38946754 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacaa 38946853  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  38946854 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccatgaaatattttgatacacttgaagaactagagaccacatttcatgacaaatgtgaag 38946953  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38946954 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 38947049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 55 - 312
Target Start/End: Original strand, 45476387 - 45476643
Alignment:
Q  55 aaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgc 154  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476387 aaccatgcgatggatccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgc 45476486  T
Q  155 ttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaa 254  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  45476487 ttacaagaaatattttgatacgtttgaagaacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaac-aatatggaaggcaaa 45476585  T
Q  255 tagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45476586 tagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 45476643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 34920842 - 34920562
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||          |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34920842 caaaggaatggagattgaacattcttaatggagttcacaac----------agccggctttagaaggacacattcttaccggtaaattaaaggaggacga 34920753  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34920752 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 34920653  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcaca 307  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34920652 caagtgtacaatgaaattcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatttcgaagttggaggagcaca 34920562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 64 - 312
Target Start/End: Original strand, 9655194 - 9655442
Alignment:
Q  64 atggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaa 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9655194 atggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagactaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttaaccaagagcaagatgcttccaagaa 9655293  T
Q  164 atattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtga 263  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9655294 atattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgaaaaatgtgaagtaagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtga 9655393  T
Q  264 caagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  9655394 caagaagtcgttgcaatatctaatgtcgaagttgaaggagcacaactat 9655442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 17 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17997242 - 17996949
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17997242 caaaggaatggagattgaacattcttcatgaagttcgcaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacatgcttgctggtagattaaaggaggatga 17997143  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || |||||||||| ||||| | |||    
T  17997142 taagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaaggtgcttccaagaaatattttgataaatttgaagagcaaaagacaacattgcatgccaaatatcaag 17997043  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaact 310  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| | | ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17997042 caagtatacaatgaacgtcaacaaatatggaagtcaaatagaggtgacaagacgatgttgtagtttctaatctcaaagttggaggagcacaact 17996949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 7264023 - 7264234
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264023 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatctcatggaaccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 7264122  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7264123 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatggttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaattgtgaag 7264222  T
Q  217 caagtgtacaat 228  Q
    ||||||| ||||    
T  7264223 caagtgtgcaat 7264234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 122 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1098791 - 1098601
Alignment:
Q  122 agattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagt 221  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098791 agattgtacgtgacttgaccgagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagt 1098692  T
Q  222 gtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1098691 gtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 1098601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1100153 - 1100042
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1100153 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagatggacacattcttgccgatagattaaaggaggacga 1100054  T
Q  117 caagaagattgt 128  Q
    ||||||||||||    
T  1100053 caagaagattgt 1100042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9639287 - 9639183
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9639287 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcactttcttgctggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 9639188  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  9639187 tgacc 9639183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 66
Target Start/End: Original strand, 9652182 - 9652231
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatg 66  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9652182 caaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgtgatg 9652231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 75 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 28423487 - 28423423
Alignment:
Q  75 tttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttga 139  Q
    ||||| ||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28423487 tttagcagggcaccttcttgcgggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgacttga 28423423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 312
Target Start/End: Original strand, 7264229 - 7264266
Alignment:
Q  275 tgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7264229 tgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 7264266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 146
Target Start/End: Original strand, 21535200 - 21535309
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||| ||||  |||   ||||||||| ||| ||||||  || ||||||| | | ||||||||||||||| ||| |||||    
T  21535200 attcttaattgtgttcacaaccatgagatgttgccatatttagaagggcaccttcttgtgggaagattaatgaatgacgacaagaagattatacatgact 21535299  T
Q  137 tgaccaagag 146  Q
    ||| ||||||    
T  21535300 tgatcaagag 21535309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 130
Target Start/End: Original strand, 24683458 - 24683503
Alignment:
Q  85 cacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtac 130  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24683458 cacattcttgcgggaagattaatggaggatgacaagaagattgtac 24683503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 37015905 - 37016200
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37015905 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagctggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 37016004  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37016005 caagaagattgtgcgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 37016104  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37016105 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 37016200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29355758 - 29355463
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355758 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 29355659  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29355658 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 29355559  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29355558 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 29355463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 41454828 - 41455123
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41454828 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 41454927  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41454928 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 41455027  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41455028 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 41455123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 18 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 50116832 - 50116538
Alignment:
Q  18 aaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgac 117  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116832 aaaggaatggagattgaacattcttaatggagttcactaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgac 50116733  T
Q  118 aagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagc 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50116732 aagaagattgttcgtgacttgaccaagagttagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagc 50116633  T
Q  218 aagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  50116632 aagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatgtcgaagttggaggagcacaactat 50116538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38692009 - 38691714
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38692009 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccgactttagaaggacacgttcttgccggtaaattaaaggaggacga 38691910  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38691909 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaataacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 38691810  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38691809 caagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagagatgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgatgttggaggagcacaactat 38691714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 46974155 - 46974450
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46974155 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagtttacaaccatgcgatggagccgactttagaaggacacattcttgccggtacattaaaggaggacga 46974254  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  46974255 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttaaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaaa 46974354  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  46974355 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcaaagttggaggagcacaactat 46974450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3947531 - 3947236
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947531 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 3947432  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  3947431 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 3947332  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3947331 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 3947236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 3984104 - 3984399
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984104 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 3984203  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  3984204 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 3984303  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3984304 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 3984399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Original strand, 13630407 - 13630698
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13630407 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattctttccggtagattaaaggaggacga 13630506  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13630507 caagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaacaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 13630606  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaa 308  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13630607 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaa 13630698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 44466573 - 44466868
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466573 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 44466672  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  44466673 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 44466772  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44466773 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 44466868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 5078926 - 5079221
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5078926 caaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgg 5079025  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5079026 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttaatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 5079125  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5079126 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcagataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 5079221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 20350447 - 20350742
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350447 caaaggaatggggattaaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 20350546  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  20350547 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 20350646  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20350647 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 20350742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38775185 - 38774890
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38775185 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 38775086  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  38775085 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 38774986  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38774985 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatatgggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 38774890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21943434 - 21943139
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21943434 caaaggaatggggattgaacattctcaatggagttcacaaccatgggatggagccgggtttagaaggacacattcttaccggtagattaaaggaggacga 21943335  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  21943334 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgataaatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtcaaa 21943235  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21943234 caagtgtacaataaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggcgacaagaaactgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 21943139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 13174772 - 13175067
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13174772 caaaggaatgtggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttaggaggacacattctcgctggtagattaaaggaggacga 13174871  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13174872 caagaagattgttcgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaataaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 13174971  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  13174972 caagtgtacaatgaaaatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatttcaaagttggaggagcacaactat 13175067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 51663249 - 51663544
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  51663249 caaaagaatggggattgaacattcttaatggagctcacaaccatgcgatgaagccggctttagaatgacacattcttgctggtagattaaaggaggagga 51663348  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51663349 caagaagattgtacgcgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 51663448  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51663449 caagtgtacattgaacgtcaacaaaaatggaaggcaaatagaggtgacaataagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 51663544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 17 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 44620173 - 44619905
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620173 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 44620074  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44620073 caagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 44619974  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatcta 285  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44619973 caagtgtgcaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatcta 44619905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12649647 - 12649354
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  12649647 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtaaattaa--gagcacga 12649550  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12649549 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaaaaataaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 12649450  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||    
T  12649449 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatatctatgttggaggagcacaactat 12649354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7980282 - 7980071
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7980282 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcaatgcagtcggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggatga 7980183  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7980182 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 7980083  T
Q  217 caagtgtacaat 228  Q
    ||||||||||||    
T  7980082 caagtgtacaat 7980071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 29 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26466328 - 26466045
Alignment:
Q  29 gattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgt 128  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26466328 gattaaacattcttaatggagttcacaaccatgagatggagccggctttagaatgacacatgcttgcgggtagattaaaggaggatgataagaagattgt 26466229  T
Q  129 acgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaat 228  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| || | |||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  26466228 acgtgacttgaccaagactaaggtgcttccaagaaatattttgttaaatttgaagaacaaaaaacaagattgcatgacaaatatcaagcaagtatacaat 26466129  T
Q  229 caacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
     |||||||  ||||||||||| || | |||||| | || | |  |||||| | ||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  26466128 gaacgtcaataaatatggaagtcatacagaggttaaaaaacggtgttgcagtttctaatctcaaagttgaaggagcacaactat 26466045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16246821 - 16246609
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  16246821 caaatgaatggagattgaa-attgttaatgaagttcacaaccatgcgatggagccgactttagaaggacacatgcttaccggtagattaaaagaggatga 16246723  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||||||   |||| || | ||||||| |||||| | |||    
T  16246722 caagaagattgtacgtgactt-accaaaagcaaggtgcatccaag-aatattttgttaaatttgaagagaaaaagacaagattgcataacaaatatcaag 16246625  T
Q  217 caagtgtacaatcaac 232  Q
    ||| | | ||||||||    
T  16246624 caattatgcaatcaac 16246609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32106698 - 32106418
Alignment:
Q  29 gattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgt 128  Q
    ||||||| ||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||   |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  32106698 gattgaatattcttaa--gagttcacaatcatgagatggagccaagtttagaaggacacatgattgctggtagattaaaggagaatgacaaaaagcttgt 32106601  T
Q  129 acgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaat 228  Q
    | ||||||||||||||||   | |||||  || |||||  ||| || ||||||||  ||||| || | |||||| ||||||| | |||||||| | ||||    
T  32106600 atgtgacttgaccaagagtttggtgctttgaaaaaata-gttgttaaatttgaagagcaaaagacaagattgcaagacaaatatcaagcaagtatgcaat 32106502  T
Q  229 caacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
     ||| ||| |||||||||||| | || ||||||||||||| |  | |||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32106501 taacatcaacaaatatggaagtcgaacagaggtgacaagacgatgatgcattatataatctcaaagttggaggagcacaactat 32106418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36360570 - 36360466
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36360570 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcagtatgtagcaggacacattcttgtcggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 36360471  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  36360470 tgacc 36360466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18887673 - 18887570
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18887673 attcttaatggtgttcacaaccatgagatggtgccgtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 18887574  T
Q  137 tgac 140  Q
    ||||    
T  18887573 tgac 18887570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 45472363 - 45472467
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |  |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45472363 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgtggtatgtagtagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 45472462  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  45472463 tgacc 45472467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 7403629 - 7403733
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| || ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  7403629 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcactttattgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtatatgact 7403728  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  7403729 tgacc 7403733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 28862901 - 28863005
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||  || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  28862901 attcttaatggcgttcacaaccatgagatgatgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatgaaggacgacaagaagattgtacatgact 28863000  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  28863001 tgacc 28863005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 143
Target Start/End: Original strand, 25231305 - 25231419
Alignment:
Q  29 gattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgt 128  Q
    ||||||| ||| | ||||||||| |||||| || || | ||||   ||| ||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||   ||||||||||||    
T  25231305 gattgaatattttcaatggagttcacaaccgtgagacgaagccaagtttggaaggacacatgcttgcaggtagatcaagggaggataccaagaagattgt 25231404  T
Q  129 acgtgacttgaccaa 143  Q
    |||||||||||||||    
T  25231405 acgtgacttgaccaa 25231419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19498277 - 19498238
Alignment:
Q  273 gttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19498277 gttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 19498238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 146
Target Start/End: Original strand, 39914011 - 39914057
Alignment:
Q  100 agattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagag 146  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39914011 agattaatgaaggatgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagag 39914057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Original strand, 25593679 - 25593785
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||  ||||  |||   ||||| ||| ||| ||||||| || | ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  25593679 attcttaatggtgttcacaaccataagatgttgccatatttagcagggcaccttcttgcgggaatattaatggaggacgacaaggcgattgtatgtgact 25593778  T
Q  137 tgaccaa 143  Q
    |||||||    
T  25593779 tgaccaa 25593785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36816586 - 36816291
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816586 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 36816487  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36816486 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 36816387  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36816386 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 36816291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 46992316 - 46992021
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46992316 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 46992217  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46992216 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaattttttgatacatttgaagaacaaaataccacattgcatgacaaatatgaag 46992117  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  46992116 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctttatgttggaggagcacaactat 46992021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 7838587 - 7838882
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  7838587 caaaggaatggggattgaacattcttagtggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattctttccggtagactaaaggaggacga 7838686  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7838687 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaatatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 7838786  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838787 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtggcaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 7838882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7842085 - 7841791
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7842085 caaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatgaagccggctttagaaggacacattcttgcctgtagattaaaggaggacga 7841986  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7841985 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 7841886  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaacta 311  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7841885 caagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaacta 7841791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 78090 - 77795
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  78090 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatttgatggagccggctttagaaggacacattattgccggtagattaaaggaagacga 77991  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77990 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 77891  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  77890 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatgaaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 77795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13746791 - 13746496
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746791 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 13746692  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13746691 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 13746592  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13746591 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 13746496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 14399546 - 14399841
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  14399546 caaaggaatggggattgaacattctaaatggagttcacaaccatgccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaagaaggatga 14399645  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14399646 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 14399745  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14399746 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaatttggaggagcacaactat 14399841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21955308 - 21955014
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21955308 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctctagaaggacacattattgccggtagattaaaggaggacga 21955209  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21955208 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 21955109  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21955108 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatat-taatctcgaagttggaggaccacaactat 21955014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 9428903 - 9428608
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428903 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 9428804  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9428803 caagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 9428704  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9428703 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 9428608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 48249937 - 48249642
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249937 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttataaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 48249838  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48249837 caagaagactgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaaaaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 48249738  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  48249737 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctctatgttggatgagcacaactat 48249642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 6741878 - 6742173
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6741878 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 6741977  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6741978 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 6742077  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6742078 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 6742173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 6505025 - 6504729
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6505025 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaatgacacattcttgccggtagactaaaggaggacga 6504926  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6504925 aaagaagattgtacatgacttgaccaagaacaagatgtttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 6504826  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactatt 313  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6504825 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcacatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaacctcgaagttggaggagcacaactatt 6504729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 3949734 - 3950029
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949734 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 3949833  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  3949834 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 3949933  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3949934 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 3950029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 8160053 - 8159758
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8160053 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 8159954  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  8159953 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 8159854  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8159853 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 8159758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Original strand, 16445611 - 16445902
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16445611 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattctttccggtagattaaaggaggacga 16445710  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16445711 caagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaacaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 16445810  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaa 308  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16445811 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaa 16445902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30946712 - 30946417
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30946712 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggatga 30946613  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  30946612 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 30946513  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30946512 caagtgtacaatgaaagtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 30946417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Original strand, 29930359 - 29930578
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29930359 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatgatgccggctttagaaggacacattcttggcggtagattaaaggaggacga 29930458  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29930459 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagacatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 29930558  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtca 236  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  29930559 caaatgtacaatgaacgtca 29930578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 236
Target Start/End: Original strand, 29979513 - 29979732
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29979513 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatgatgccggctttagaaggacacattcttggcggtagattaaaggaggacga 29979612  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29979613 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagacatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 29979712  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtca 236  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  29979713 caaatgtacaatgaacgtca 29979732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 129
Target Start/End: Original strand, 50954264 - 50954376
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50954264 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 50954363  T
Q  117 caagaagattgta 129  Q
    |||||||||||||    
T  50954364 caagaagattgta 50954376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 183
Target Start/End: Original strand, 33399546 - 33399692
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||| | |    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  33399546 attcttaatggagttcacaaccaagagatgtaacgaagtttagaaagacacatgcttgcgggtagattaaaggaggatggcaagaagcttgtacgtgact 33399645  T
Q  137 tgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaag 183  Q
    ||||||||||   | ||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  33399646 tgaccaagagtttggtgcttccaaaaaatattttgttaaatttgaag 33399692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 312
Target Start/End: Original strand, 29908031 - 29908104
Alignment:
Q  238 caaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  29908031 caaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttaga-gagcacaactat 29908104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 312
Target Start/End: Original strand, 29949197 - 29949270
Alignment:
Q  238 caaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  29949197 caaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttaga-gagcacaactat 29949270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 312
Target Start/End: Original strand, 29998351 - 29998424
Alignment:
Q  238 caaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  29998351 caaatatggaaggcaaataaaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttaga-gagcacaactat 29998424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2285107 - 2285003
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2285107 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagtagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 2285008  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  2285007 tgacc 2285003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9556831 - 9556727
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9556831 attcttaatggtgttcacaaccatgagatggtgcagtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggagggcgacaagaagattgtacatgact 9556732  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  9556731 tgacc 9556727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 51548583 - 51548479
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    |||||||| || ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51548583 attcttaacggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcaggacaccttcttgccgaaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 51548484  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  51548483 tgacc 51548479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 4120843 - 4120740
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||  | ||| ||| ||| | |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4120843 attcttaatggtgttcacaaccatgagatggtgccgtatgtagcagggcacct-cttgacggaagattaacggaggacgacaagaagattgtacatgact 4120745  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  4120744 tgacc 4120740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 8263742 - 8263842
Alignment:
Q  30 attgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgta 129  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  8263742 attgaccattcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggatgacaagaagattgta 8263841  T
Q  130 c 130  Q
    |    
T  8263842 c 8263842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 32426622 - 32426726
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  |  || ||| ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32426622 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgcagcagggcaccttcttaccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 32426721  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  32426722 tgacc 32426726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 40468259 - 40468155
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| |||  || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  40468259 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggtaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacattact 40468160  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  40468159 tgacc 40468155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Original strand, 4510287 - 4510393
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| | ||||| ||||  ||||| ||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  4510287 attctttatggtgttcacaaccacgagatggtgccgtttttagcagggcaccttcttgcgggaagattaatggaggacgacaagaaaattatacatgact 4510386  T
Q  137 tgaccaa 143  Q
    |||||||    
T  4510387 tgaccaa 4510393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 143
Target Start/End: Original strand, 12491150 - 12491204
Alignment:
Q  89 ttcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaa 143  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12491150 ttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacacgacttgaccaa 12491204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 1275376 - 1275240
Alignment:
Q  100 agattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacatt 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||   ||||   |||| ||||||||||| | |||| ||| | |||| || | | |    
T  1275376 agattaatggaggacgacaagaagattgtacatgacttgaccaatagttcgatgaaaccaaaaaatattttgacaaatttaaagaaaaaaagacaagagt 1275277  T
Q  200 gcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtca 236  Q
     ||||| |||| | |||||||| |||||| |||||||    
T  1275276 ccatgaaaaatatcaagcaagtctacaatgaacgtca 1275240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 75 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 25059953 - 25059882
Alignment:
Q  75 tttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagag 146  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  25059953 tttagcagggcacattcttgcggaaagattaatgaaggacgacaaggagattatatgtgacttgaccaagag 25059882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 146
Target Start/End: Original strand, 8117600 - 8117709
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||   ||||| ||| ||| ||||||| || | ||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |    
T  8117600 attcttaatggtgttcacaaccatgagatgttgccatgtttagcagggcaccttcttgcaggaaaattaatgaaggacgacaaagagattgtacgtgatt 8117699  T
Q  137 tgaccaagag 146  Q
    |||| |||||    
T  8117700 tgactaagag 8117709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18537406 - 18537111
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537406 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgattgagccagctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 18537307  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18537306 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagtgagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 18537207  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18537206 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 18537111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7800076 - 7799781
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  7800076 caaaggaatgggaattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgtcggtagactaaaggaggacga 7799977  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7799976 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaaaaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 7799877  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7799876 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 7799781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 34078771 - 34079066
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078771 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcaaaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 34078870  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34078871 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 34078970  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34078971 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 34079066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 29 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4202997 - 4202714
Alignment:
Q  29 gattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4202997 gattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacactcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgt 4202898  T
Q  129 acgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaat 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4202897 acgtgacttgatcaagagcaagatgcttccaagtaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgataaatgtgaagcaagtgtacaat 4202798  T
Q  229 caacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4202797 gaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 4202714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 37819947 - 37819652
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37819947 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattgttgccggtagattaaaggaggacga 37819848  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37819847 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 37819748  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37819747 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 37819652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27866915 - 27866620
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866915 caaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 27866816  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27866815 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 27866716  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27866715 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaaacctttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 27866620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 28885478 - 28885183
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885478 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggatagattcttgccggtagattaaaggaggacga 28885379  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28885378 caagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 28885279  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28885278 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 28885183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 17 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 25896171 - 25895901
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25896171 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 25896072  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25896071 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaaaaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 25895972  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaat 287  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895971 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaat 25895901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 7020950 - 7020655
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020950 caaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 7020851  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7020850 caagaagattgtatgtgacttgaccaagaggaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 7020751  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7020750 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacatctat 7020655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11032522 - 11032231
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032522 caaaagaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaatgacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 11032423  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11032422 caagaagattgtacgtgacttgacaaaaagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 11032323  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaa 308  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11032322 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaa 11032231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 38859260 - 38858969
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38859260 caaaagaatggagattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 38859161  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38859160 caagaagattgtacgtgacttgacaaaaaacaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 38859061  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaa 308  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38859060 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaa 38858969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 13567172 - 13566866
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13567172 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccagctttagaaggacacattcttgccggtagattaaagaaggacga 13567073  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaa-----------gtacaaaataccacattgcatga 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           | || ||| ||||||||||||||    
T  13567072 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaagcaagtgtgaaccaaagaccacattgcatga 13566973  T
Q  206 caaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagca 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13566972 caaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagca 13566873  T
Q  306 caactat 312  Q
    |||||||    
T  13566872 caactat 13566866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 99 - 312
Target Start/End: Original strand, 1036424 - 1036637
Alignment:
Q  99 tagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1036424 tagattaaaggaggacgacaagaatattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacat 1036523  T
Q  199 tgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttgg 298  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1036524 tgcatgacaaatgtgacacaagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggaaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttgg 1036623  T
Q  299 aggagcacaactat 312  Q
    ||||||||||||||    
T  1036624 aggagcacaactat 1036637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1035620 - 1035459
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1035620 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 1035521  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatt 178  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1035520 caagaatattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatt 1035459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 32 - 308
Target Start/End: Original strand, 20286015 - 20286291
Alignment:
Q  32 tgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacg 131  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  20286015 tgaacattcttaatggagttcacaaccatgtgatggagccggctttagaaggacacatgcttgcgggtagattaaaggaggatgacaagaagattgtatg 20286114  T
Q  132 tgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaa 231  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||| || | |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||    
T  20286115 tgacttaaccaagagtaaggtgcttccaagaaatattttgttaaatttgaagagcaaaagacaagattgcatgacaaatatcaagcaagtatacaatgaa 20286214  T
Q  232 cgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaa 308  Q
    | ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||    | |||| | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  20286215 catcaacaaatatggaagtcaaacagaggtgacaagactgtggtgcagtttctaatctcaaagttggaggagcacaa 20286291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 167
Target Start/End: Original strand, 20286515 - 20286650
Alignment:
Q  32 tgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacg 131  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||     
T  20286515 tgaacattcttaatggagtttacaaccatgtgatggagccggctttagaaggacacatgcttgcgggtagattaaaggaggatgacaaaaagattgtaca 20286614  T
Q  132 tgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatat 167  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  20286615 tgacttgaccaagagtaaggtgcatccaagaaatat 20286650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 90
Target Start/End: Original strand, 33994242 - 33994315
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacatt 90  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33994242 caaaggaacgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcaatggagccggctttagaaggacacatt 33994315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 13158092 - 13157978
Alignment:
Q  29 gattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |   |||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  13158092 gattgaacattcttaatggagttcacaaccatgaaatggagtcaaatttaaaaggacgcatgcttgcgggtagattaaaggaggatgacaagaaacttgt 13157993  T
Q  129 acgtgacttgaccaa 143  Q
    | ||||||| |||||    
T  13157992 atgtgacttcaccaa 13157978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23028625 - 23028381
Alignment:
Q  29 gattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgt 128  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||| || |   |||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23028625 gattgaatattattaatggagttcacaaccatgagatgaaggcaagtttagaagaacacatgcttgcgggtagattaagggaggatgacaagaagattgt 23028526  T
Q  129 ac-------gtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagt 221  Q
    ||       ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||  || ||||||||   |||| |  | | |||||||||||| | | ||||||    
T  23028525 acatgattggtgacttgaccaagagtttgatgctttcaaaaaatattttattaaatttgaagagaaaaagaaaagagtgcatgacaaatatcatgcaagt 23028426  T
Q  222 gtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 266  Q
     |||||| ||||| |  ||||||  ||| |||| |||||||||||    
T  23028425 atacaatgaacgtaaaaaaatattcaagtcaaacagaggtgacaa 23028381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 6552800 - 6552904
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6552800 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtgtgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 6552899  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  6552900 tgacc 6552904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 42343502 - 42343606
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42343502 attcttaatggtgttcataaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 42343601  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  42343602 tgacc 42343606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 43295232 - 43295336
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  43295232 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcaggccaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgatt 43295331  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  43295332 tgacc 43295336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 308
Target Start/End: Original strand, 20287404 - 20287550
Alignment:
Q  162 aaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggt 261  Q
    |||||||||| || ||||||||  ||||| || | |||| ||||||||| | |||||||| || ||| |||||||  ||||||| ||| |||| ||||||    
T  20287404 aaatattttgttaaatttgaagagcaaaagacaagattgtatgacaaatatcaagcaagtatataatgaacgtcaataaatatgaaagtcaaacagaggt 20287503  T
Q  262 gacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaa 308  Q
    ||||||| |  ||| || | ||||||||  |||||||||||||||||    
T  20287504 gacaagacggggttccagtttctaatctcaaagttggaggagcacaa 20287550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 27013719 - 27013615
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    |||||||||||  || ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27013719 attcttaatggcattcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccgaaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 27013620  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  27013619 tgacc 27013615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 139
Target Start/End: Original strand, 11819279 - 11819329
Alignment:
Q  89 ttcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttga 139  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11819279 ttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgacttga 11819329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 143
Target Start/End: Original strand, 25048464 - 25048515
Alignment:
Q  92 ttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaa 143  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  25048464 ttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtatatgacttgaccaa 25048515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 30617402 - 30617320
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaa 119  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  30617402 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaa 30617320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 17060 - 17355
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17060 caaaggaatagggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagactaaaggaggacga 17159  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  17160 caagaagattgtaagtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgaaaaatgtgaag 17259  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17260 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgaaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 17355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 23)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 9891013 - 9891308
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891013 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 9891112  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9891113 caagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 9891212  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9891213 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 9891308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 4976746 - 4977041
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4976746 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagtttgcaaccatgcgatggagccggctttagaaagacacattcttgccggtagactaaaggaggacga 4976845  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4976846 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 4976945  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4976946 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaatgcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcaaagttggaggagcacaactat 4977041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19072727 - 19072432
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072727 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccattctatggagtctgctttataaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 19072628  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19072627 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaaaaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 19072528  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19072527 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 19072432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 49565534 - 49565239
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  49565534 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccgatagattaaaggaggacga 49565435  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  49565434 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 49565335  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49565334 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 49565239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 3404781 - 3405076
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3404781 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagttggctttagaaggacacattcttgccagtagattaaaggaggacga 3404880  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3404881 caagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgataaatgtgaag 3404980  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3404981 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 3405076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 11502497 - 11502792
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  11502497 caaaggaatgagtattgaacattcttaatggagttcacacccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcatgccggtagattaaaggaagacga 11502596  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  11502597 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgataaatgtgaag 11502696  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  11502697 caagtaaacaatgaacgtcaacaaatatggaagacaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaagagcacaactat 11502792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4979024 - 4978733
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||    
T  4979024 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcccaaccatgcgatggagccgactttagaaggacacattcttgccagcagactaaaggatgacga 4978925  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4978924 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 4978825  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4978824 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaa----aggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcaaagttggaggagcacaactat 4978733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 41024191 - 41024485
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41024191 caaaggaatggg-attgaacattcttaatggaattcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgcaggtagattaaaggaggacga 41024289  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41024290 aaagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 41024389  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41024390 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaaaaagtcgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 41024485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 51643570 - 51643273
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagtta-acaaccatgcgatggagcc-ggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggac 114  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51643570 caaaggaattgagattgaacattcttaatggagtttcacaaacatgcgatggagcccggctttataaggacacattcttgccagtagattaaaggaggac 51643471  T
Q  115 gacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtga 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  51643470 gacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaaaatgctttcaaaaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtaa 51643371  T
Q  215 agcaagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51643370 agcaagtgtacgatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagagttgacaagacgccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 51643273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18580398 - 18580117
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18580398 caaaggaatgaggattaaacattcttaatggagttcacaaccatgcaatgaagccggctttagaatgacacattcttgccgatagattaaaggaggacga 18580299  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18580298 caagaagattgtatgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaactaaagacctcattgcatgacaaatgtgaag 18580199  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggagg 301  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  18580198 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatgga---caaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatttaatctcgaagtttgagg 18580117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 21471785 - 21472079
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |  ||||| || ||||||||||||  | |||| |||||||||||||    
T  21471785 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatacaatggagacaactttaaaaagacacattcttgaagatagaataaaggaggacga 21471884  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  21471885 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgatgaacaaaagaccacattggat-aaaaatgtgaag 21471983  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21471984 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatttaatctcgaagttggaggagcacaactat 21472079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 75 - 312
Target Start/End: Original strand, 4769179 - 4769420
Alignment:
Q  75 tttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgata 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4769179 tttagaaggacacattcttaccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgctttcaagaaatattttgata 4769278  T
Q  175 ----catttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaag 270  Q
         |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769279 aattgatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaatgtctacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaag 4769378  T
Q  271 ccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  4769379 ccgttgcaatttctgatttcgaagttggaggagcacaactat 4769420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 103 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 38463821 - 38463612
Alignment:
Q  103 ttaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgca 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  38463821 ttaaaggaggacgacaagaagattgcacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaaaaaatattttgatacatttgaaggacaaaagaccacactgca 38463722  T
Q  203 tgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggagga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38463721 tgacaaatgtgaagcaagtgtacaatgaacgtcaacaaatacggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgcaatatctaatctcgaagttggagga 38463622  T
Q  303 gcacaactat 312  Q
    ||||||||||    
T  38463621 gcacaactat 38463612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 136 - 304
Target Start/End: Original strand, 44049720 - 44049888
Alignment:
Q  136 ttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtc 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  44049720 ttgaccaatagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaacgaacgtc 44049819  T
Q  236 accaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagc 304  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44049820 aacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagctgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagc 44049888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 17916198 - 17916302
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17916198 attcttaatggtgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 17916297  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  17916298 tgacc 17916302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 312
Target Start/End: Original strand, 6182679 - 6182964
Alignment:
Q  29 gattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgt 128  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||   |||||||||||| || |||||  ||| ||||| ||| |  |||||||| |||||    
T  6182679 gattgaatattcttgatggagttcacaaccatgagatgaagccaagtttagaaggacatatgcttgcaagtatattaagggatggtgacaagaaaattgt 6182778  T
Q  129 acgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaa--atgtgaagcaagtgtaca 226  Q
    || |||||||||||||||   | ||||| ||| |||||||||| || |||| |||   |||| || | | ||||||||||  ||   || ||| | ||||    
T  6182779 acatgacttgaccaagagtttggtgctttcaaaaaatattttgttaaattttaagagaaaaagacaagagtgcatgacaaacatcaaaaacaaatataca 6182878  T
Q  227 atcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    || ||| |||  ||||||  ||| |||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||  || |||||||| |||||||||    
T  6182879 atgaacatcaaaaaatattcaagtcaaacagaggtgacaagacggtgatgcaatatctaatctcaaaattggaggaacacaactat 6182964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Original strand, 17140580 - 17140634
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagcc 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17140580 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatgaagcc 17140634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 4617714 - 4617818
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||  | ||| ||   || ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4617714 attcttaatggtgttcacaaccatgagatggtgccgtatgtagcagagaaccttcttgctggaagattaacggaggacgacaagaagattgtacatgact 4617813  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  4617814 tgacc 4617818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 38463867 - 38463824
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccat 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38463867 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccat 38463824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Original strand, 1590845 - 1590950
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |  |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1590845 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgtggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgac-agaagattgtacatgact 1590943  T
Q  137 tgaccaa 143  Q
    |||||||    
T  1590944 tgaccaa 1590950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 41 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 46517480 - 46517380
Alignment:
Q  41 ttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgac 140  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46517480 ttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatatagcagggcaccttcttgctagaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgacttgac 46517381  T
Q  141 c 141  Q
    |    
T  46517380 c 46517380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 32716305 - 32716409
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||  || |  | ||| ||| ||| || || |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32716305 attcttaatggcgttcacaaccatgagatgatgcggtatgtagcagggcaccttattaccggaagattaatggaggacgacaaaaagattgtacatgact 32716404  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  32716405 tgacc 32716409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20971492 - 20971446
Alignment:
Q  100 agattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagag 146  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20971492 agattaatggagaacgacaaggagattgtacgtgacttgactaagag 20971446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 248; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 1872 - 2167
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1872 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 1971  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1972 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 2071  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2072 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 2167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 18106379 - 18106674
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18106379 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgcaggtagattaaaggaggacga 18106478  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18106479 caagaagattgtacgtgacttgacaaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 18106578  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18106579 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 18106674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 30787530 - 30787825
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787530 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 30787629  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  30787630 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagataccacattgcatgacaaatgtgaag 30787729  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30787730 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaagcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 30787825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43623205 - 43622910
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623205 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 43623106  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  43623105 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 43623006  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43623005 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 43622910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 47061874 - 47062170
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47061874 caaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccgacttttgaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 47061973  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47061974 caaaaagattgtatgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 47062073  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagagg-tgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  47062074 caagtgtacgatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggttgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaagagcacaactat 47062170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 617819 - 617524
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617819 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 617720  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  617719 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 617620  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  617619 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaaaccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 617524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 42500398 - 42500693
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500398 caaaggaatggagattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggaaacattcttgccggtagattaaaggaggacga 42500497  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42500498 caagaagattgtacgtgacttgacaaagatcaagatgctttcaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 42500597  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42500598 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 42500693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 45764370 - 45764665
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764370 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaatgacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 45764469  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||| ||||    
T  45764470 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgcgaag 45764569  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45764570 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 45764665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 303
Target Start/End: Original strand, 15060605 - 15060890
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060605 caaaggaatgggg-ttgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 15060703  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15060704 caagaagattgtaagtgacttgacaaagagcaagatgcttccaaggaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 15060803  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggag 303  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15060804 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggag 15060890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 43827676 - 43827382
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43827676 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgaaggagccagctttagaatgacacattcttaccggtagattaaaggaggacga 43827577  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  43827576 aaagaagattgtacgtgacttgaccaagtgcaagatgcttccaagaaatattttgataaatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatatcaag 43827477  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||    
T  43827476 caagtgtacaatgaacgtcagcaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatct-atctcgaagttgaatgagcacaactat 43827382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 8400577 - 8400872
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  8400577 caaaagaatggggattgaacattttcaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgctggtacattaaaggaggatga 8400676  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| | |||    
T  8400677 caagaagattgtaggtgacttgaccaagagcaagatgttaccaaaaaatattttgataaatttgaagaacaaaagaccacattggatgacaaatatcaag 8400776  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8400777 caagtgtacattgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagacggcgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 8400872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 170
Target Start/End: Original strand, 21800003 - 21800156
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  |    
T  21800003 caaagcaatggagattgaacattgttaatggagttcacaaccatgcgatggagtcggctttagaaggacacatgtttgtcggtagattaaaggaggataa 21800102  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatatttt 170  Q
    |||||| ||| |||||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  21800103 caagaaaattatacgtgacttaatcaagagcaaggtgcatccaaaaaatatttt 21800156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 46791336 - 46791440
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  46791336 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 46791435  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  46791436 tgacc 46791440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 1296997 - 1297101
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1296997 attcttaatggtgttaataaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttgccggaagattaatggaggacgacgagaagattgtacatgact 1297096  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  1297097 tgacc 1297101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 45172959 - 45172855
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| ||| ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45172959 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggcaccttcttaccggaagattaacggaggacgacaagaagattgtacatgact 45172860  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  45172859 tgacc 45172855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40445615 - 40445512
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| || |  | ||| |||  || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40445615 attcttaatggcgttcacaaccatgagatggtgcggtatgtagcagggaaccttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 40445516  T
Q  137 tgac 140  Q
    ||||    
T  40445515 tgac 40445512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8194330 - 8194228
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| | ||  ||| | ||| ||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8194330 attcttaatggtgttcacaaccatgagatggtggcgtattttgcagggcaccttcttgcgggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 8194231  T
Q  137 tga 139  Q
    |||    
T  8194230 tga 8194228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20908528 - 20908458
Alignment:
Q  76 ttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagag 146  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20908528 ttagaagggcacattcttgcaggaagattaagggaggatgacaagaagattgtgcgtgactttaccaagag 20908458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 47867494 - 47867442
Alignment:
Q  89 ttcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacc 141  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47867494 ttcttgccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacatgacttgacc 47867442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16794600 - 16794557
Alignment:
Q  100 agattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaa 143  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16794600 agattaatggaggacgacaagaagattgtacatgacttgaccaa 16794557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 138
Target Start/End: Original strand, 40793934 - 40794035
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||  || |  | ||| ||| ||| ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40793934 attcttaatggcgttcacaaccatgagatgatgcggtatgtagtagggcaccttcttgcaggaaaattaatggaggacgacaagaagattgtacatgact 40794033  T
Q  137 tg 138  Q
    ||    
T  40794034 tg 40794035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 43379306 - 43379254
Alignment:
Q  89 ttcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacc 141  Q
    |||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43379306 ttcttgccggaagattaacagagtacgacaagaagattgtacatgacttgacc 43379254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 236
Target Start/End: Original strand, 3761979 - 3762115
Alignment:
Q  100 agattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacatt 199  Q
    ||||||| ||| || ||||| |||||| || || |||||||||||||   |||||  |||| ||||||||||||  ||||||||   |||| || | | |    
T  3761979 agattaagggaagatgacaaaaagattctaggtaacttgaccaagagtttgatgcagccaaaaaatattttgatgaatttgaagggaaaaagacaagagt 3762078  T
Q  200 gcatgacaaatgtgaagcaagtgtacaatcaacgtca 236  Q
    ||||||||||||| ||| |||  |||||| |||||||    
T  3762079 gcatgacaaatgtaaagaaagcatacaatgaacgtca 3762115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16796842 - 16796810
Alignment:
Q  111 ggacgacaagaagattgtacgtgacttgaccaa 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16796842 ggacgacaagaagattgtacatgacttgaccaa 16796810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 241; Significance: 1e-133; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 309
Target Start/End: Original strand, 18606987 - 18607279
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18606987 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccgactttagaaggacacattcttgtcgatagattaaaggaggacga 18607086  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18607087 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaataacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 18607186  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaac 309  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18607187 caagtgtacaatgaacatcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgataagaagccgttgcaatatctaatttttaagttggaggagcacaac 18607279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1611821 - 1611526
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611821 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 1611722  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  1611721 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 1611622  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1611621 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 1611526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 31147313 - 31147608
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  31147313 caaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccgactttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggagaatga 31147412  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  31147413 caagaagattgtacgtgacttgatcaagagcaagatgcttccaagtaatatttttatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgataaatttgaag 31147512  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31147513 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 31147608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29288018 - 29287727
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29288018 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagtcggctttataaggacacattcttgccggtagactaaaggaggacga 29287919  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  29287918 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgaaaaatgtgaag 29287819  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29287818 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagtcgttgc----tctaatatcgaagttggaggagcacaactat 29287727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 264
Target Start/End: Original strand, 28250887 - 28251134
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28250887 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccagctttagaaggacacattcttgccgatagattaaaggaggacga 28250986  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28250987 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 28251086  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgac 264  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28251087 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgac 28251134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 23 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21358411 - 21358125
Alignment:
Q  23 aatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaa 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21358411 aatggggattgaacattctcaatgaagttcacaaccaggcgatgaagttggctttagaaggacacattcttgccgatagattaaaggaggacgacaagaa 21358312  T
Q  123 gattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  21358311 gattgtacatgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaaggtcaagcaagcg 21358212  T
Q  223 tacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    || ||| |   |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21358211 taaaatga---tagacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttcgaggagcacaactat 21358125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 23 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 23962393 - 23962107
Alignment:
Q  23 aatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaa 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23962393 aatggggattgaacattctcaatgaagttcacaaccaggcgatgaagttggctttagaaggacacattcttgccgatagattaaaggaggacgacaagaa 23962294  T
Q  123 gattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaagcaagtg 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  23962293 gattgtacatgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaaggtcaagcaagcg 23962194  T
Q  223 tacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    || ||| |   |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23962193 taaaatga---tagacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatctcgaagttcgaggagcacaactat 23962107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 266
Target Start/End: Original strand, 24220157 - 24220408
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24220157 caaatgaatggggattgaaaattcttaatgcagttcacaaccatgcgatggagtcggctttagaaggacacattcttgtcggtagattaaaggaggacga 24220256  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagc--aagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtga 214  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |    
T  24220257 caagaaaattatacgtgacttgaccaagagcataagatgcttccaagaaatattttgataaatttgaaaaacaaaagaccacattgcatgacaaatatca 24220356  T
Q  215 agcaagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 266  Q
    || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24220357 agtaagtgtaaaataaacgtcaacaaatatggaaggcaaatagaggtgacaa 24220408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 157
Target Start/End: Original strand, 7362170 - 7362310
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7362170 caaaggaatgtggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagtcgactttagaatgacacattcttgccggtagactaaaggaggacga 7362269  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttc 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7362270 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttc 7362310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 17 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 7362413 - 7362307
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7362413 caaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagtcgactttagaatgacacattcttgccggtagactaaaggaggacga 7362314  T
Q  117 caagaag 123  Q
    |||||||    
T  7362313 caagaag 7362307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34111712 - 34111603
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    ||||||||  | |||||||| || ||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  34111712 attcttaatggagttcacaaccatgagatggcgccaaagttagaagggaaaattcttgcaggaagattaaaggaagatgactagaagattgtacgtgact 34111613  T
Q  137 tgaccaagag 146  Q
    ||||||||||    
T  34111612 tgaccaagag 34111603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 13387764 - 13387721
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccat 60  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13387764 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccat 13387721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 312
Target Start/End: Original strand, 28357557 - 28357604
Alignment:
Q  265 aagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28357557 aagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 28357604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 67
Target Start/End: Original strand, 35243594 - 35243644
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatgg 67  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35243594 caaatgaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatgtgatgg 35243644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 89 - 141
Target Start/End: Original strand, 22864869 - 22864921
Alignment:
Q  89 ttcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttgacc 141  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22864869 ttcttgccggaagattaatggaggaggacaagaagattgtacatgacttgacc 22864921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26685026 - 26684976
Alignment:
Q  89 ttcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgacttga 139  Q
    ||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26685026 ttcttgcgggaagattaatggaggacgacaagacgattgtacatgacttga 26684976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16427 - 16132
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16427 caaaggaatgaggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggaaga 16328  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16327 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaaccaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 16228  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16227 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaacgcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 16132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 33800 - 34095
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33800 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcacaaccatcccatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 33899  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||    
T  33900 caagaagatcgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacacttgaagaaccagagaccacattgcatgacaaatgtgaag 33999  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatatggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34000 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatggaaggcaaataggggtgacaagaagccgttgcaatttctaatctcgaagttggaggagcacaactat 34095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 17 - 312
Target Start/End: Original strand, 12253 - 12549
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12253 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttcaaaaccatgccatggagctggctttagaaggacacattctttccggtagattaatggaggacga 12352  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagtacaaaataccacattgcatgacaaatgtgaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12353 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagaaagatgcttccaagaaatattttgatacatttgaagaacaaaagaccacattgcatgacaaatgtgaag 12452  T
Q  217 caagtgtacaatcaacgtcaccaaatat-ggaaggcaaatagaggtgacaagaagccgttgcaatatctaatcttgaagttggaggagcacaactat 312  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12453 caagtgtacaatgaacgtcaacaaatatcgaaaggcaaatagaggtgacaagaagctgttgcaatatctaatctcgaagttggaggagcacaactat 12549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 17 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 240 - 95
Alignment:
Q  17 caaaggaatggggattgaacattcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacga 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||    
T  240 caaaggaatggtgattgaacattcttaatggagttcacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttacgagtagactaaaggagaacga 141  T
Q  117 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaaga 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  140 caagaagattgtacgtgacttgaccaagagcaagatgcttccaaga 95  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 37 - 141
Target Start/End: Original strand, 3847 - 3951
Alignment:
Q  37 attcttaatggagttaacaaccatgcgatggagccggctttagaaggacacattcttgccggtagattaaaggaggacgacaagaagattgtacgtgact 136  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    | ||| ||| ||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3847 attcttaatggagttcacaaccatgagatggtgcgttatgtagcagggcaccttcttaccggaagattaatggaggacgacaagaagattgtacataact 3946  T
Q  137 tgacc 141  Q
    |||||    
T  3947 tgacc 3951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University