View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2281_low_39 (Length: 212)

Name: NF2281_low_39
Description: NF2281
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2281_low_39
NF2281_low_39
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (13-212)||(48249914-48250114)
chr3 (13-212)||(36816563-36816763)
chr3 (13-212)||(46992293-46992493)
chr3 (13-212)||(6505002-6505205)
chr3 (13-212)||(7842062-7842262)
chr3 (28-212)||(29930198-29930382)
chr3 (28-212)||(29979352-29979536)
chr3 (7-212)||(14399361-14399569)
chr3 (13-212)||(78067-78265)
chr3 (13-212)||(50954089-50954287)
chr3 (13-212)||(13746768-13746970)
chr3 (13-212)||(21955285-21955487)
chr3 (13-212)||(9428880-9429080)
chr3 (24-212)||(7838419-7838610)
chr3 (13-212)||(6741701-6741901)
chr3 (24-212)||(16445447-16445634)
chr3 (13-212)||(30946689-30946890)
chr3 (13-212)||(8160030-8160231)
chr3 (13-212)||(3949557-3949757)
chr3 (15-179)||(11389065-11389231)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (13-212)||(31097982-31098182)
chr5 (7-212)||(25896148-25896354)
chr5 (13-212)||(1035597-1035798)
chr5 (13-212)||(34078594-34078794)
chr5 (13-212)||(7800053-7800256)
chr5 (13-212)||(13567149-13567349)
chr5 (13-212)||(18537383-18537582)
chr5 (24-212)||(27866892-27867081)
chr5 (13-212)||(4202986-4203186)
chr5 (13-212)||(11032499-11032699)
chr5 (13-212)||(33994061-33994265)
chr5 (24-212)||(28885455-28885643)
chr5 (13-212)||(38859237-38859437)
chr5 (13-212)||(37819924-37820126)
chr5 (13-212)||(7020927-7021124)
chr5 (7-85)||(43178666-43178745)
chr5 (16-107)||(20285819-20285911)
chr5 (116-199)||(20286426-20286510)
chr5 (117-212)||(20285926-20286023)
chr5 (31-63)||(30353726-30353758)
[»] chr2 (22 HSPs)
chr2 (24-212)||(41008027-41008215)
chr2 (13-212)||(28354949-28355151)
chr2 (13-211)||(43949330-43949529)
chr2 (13-212)||(27275407-27275607)
chr2 (13-212)||(1100130-1100331)
chr2 (13-212)||(12907539-12907739)
chr2 (13-212)||(436126-436325)
chr2 (24-212)||(9652018-9652205)
chr2 (24-212)||(11692861-11693053)
chr2 (13-212)||(7263846-7264046)
chr2 (7-212)||(24605136-24605343)
chr2 (13-212)||(24750470-24750672)
chr2 (24-212)||(34920819-34921007)
chr2 (13-210)||(45476177-45476376)
chr2 (13-212)||(3802613-3802812)
chr2 (13-212)||(38946577-38946777)
chr2 (13-212)||(212488-212688)
chr2 (13-212)||(39794784-39794984)
chr2 (13-212)||(10623501-10623701)
chr2 (13-212)||(41560826-41561026)
chr2 (40-212)||(5348009-5348181)
chr2 (50-212)||(17997219-17997379)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (13-212)||(16884-17083)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (13-212)||(18606810-18607010)
chr6 (13-212)||(35243419-35243617)
chr6 (7-212)||(28250704-28250910)
chr6 (24-212)||(13387741-13387929)
chr6 (24-212)||(7362006-7362193)
chr6 (13-212)||(7362390-7362592)
chr6 (24-212)||(29287995-29288185)
chr6 (13-212)||(1611798-1611997)
chr6 (15-199)||(23985364-23985555)
chr6 (24-212)||(24219984-24220180)
chr6 (13-107)||(18347856-18347951)
chr6 (13-83)||(31147197-31147268)
chr6 (141-212)||(31147265-31147336)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (13-212)||(21471605-21471808)
chr4 (24-212)||(11502331-11502520)
chr4 (13-212)||(4976570-4976769)
chr4 (13-212)||(4979001-4979200)
chr4 (13-212)||(38463844-38464050)
chr4 (24-212)||(18580375-18580565)
chr4 (24-212)||(51643547-51643736)
chr4 (13-212)||(9890836-9891036)
chr4 (13-212)||(19072704-19072905)
chr4 (13-212)||(3404604-3404804)
chr4 (13-212)||(49565511-49565711)
chr4 (13-212)||(17140401-17140603)
chr4 (71-212)||(41024073-41024213)
chr4 (24-91)||(1088383-1088450)
chr4 (50-106)||(6182529-6182585)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (24-212)||(37015739-37015928)
chr1 (13-212)||(50116810-50117009)
chr1 (13-212)||(12649624-12649828)
chr1 (13-212)||(46973976-46974178)
chr1 (7-212)||(13174589-13174795)
chr1 (13-212)||(29355735-29355935)
chr1 (24-212)||(38691986-38692175)
chr1 (24-212)||(7980259-7980446)
chr1 (13-212)||(41454648-41454851)
chr1 (13-212)||(5078749-5078949)
chr1 (24-212)||(44620150-44620339)
chr1 (24-212)||(13630243-13630430)
chr1 (13-212)||(44466396-44466596)
chr1 (24-212)||(51663078-51663272)
chr1 (13-212)||(38775162-38775361)
chr1 (13-212)||(3947508-3947709)
chr1 (13-212)||(3983926-3984127)
chr1 (13-212)||(20350270-20350470)
chr1 (13-212)||(21943411-21943616)
chr1 (39-207)||(16246803-16246970)
chr1 (24-66)||(19498275-19498317)
chr1 (24-66)||(36075764-36075806)
chr1 (116-212)||(26466317-26466413)
[»] chr8 (17 HSPs)
chr8 (24-212)||(45455202-45455390)
chr8 (7-212)||(43370573-43370781)
chr8 (24-211)||(2146038-2146225)
chr8 (24-212)||(7168728-7168914)
chr8 (24-212)||(43689218-43689405)
chr8 (13-212)||(35965792-35965994)
chr8 (13-212)||(1115586-1115786)
chr8 (7-212)||(30304657-30304863)
chr8 (13-212)||(32377955-32378155)
chr8 (13-212)||(32431912-32432112)
chr8 (13-212)||(39752075-39752276)
chr8 (13-212)||(8422903-8423103)
chr8 (13-212)||(7340893-7341093)
chr8 (13-106)||(4867269-4867363)
chr8 (24-162)||(22578755-22578896)
chr8 (24-85)||(20547618-20547679)
chr8 (158-212)||(22580864-22580917)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (13-212)||(12074-12276)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (13-212)||(217-418)
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (13-212)||(47061695-47061897)
chr7 (13-212)||(617796-617997)
chr7 (13-212)||(18106200-18106402)
chr7 (13-212)||(30787353-30787553)
chr7 (13-212)||(43623182-43623382)
chr7 (13-212)||(42500222-42500421)
chr7 (13-212)||(45764192-45764393)
chr7 (13-212)||(15060428-15060627)
chr7 (13-212)||(43827653-43827851)
chr7 (24-211)||(8400414-8400599)
chr7 (24-107)||(21799824-21799907)
chr7 (117-211)||(21799931-21800025)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (13-212)||(16404-16605)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (13-212)||(1695-1895)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (13-212)||(33623-33823)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 48250114 - 48249914
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         
T  48250114 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccgaaaaa 48250015  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48250014 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 48249915  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  48249914 c 48249914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 36816763 - 36816563
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||         
T  36816763 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagtgccgaaaaa 36816664  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816663 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtggttgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 36816564  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  36816563 c 36816563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 46992493 - 46992293
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        
T  46992493 ataaggcgggatttacaatagttacacaaagatcaaacttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccggaaaa 46992394  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46992393 aaaaccaaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 46992294  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  46992293 c 46992293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6505205 - 6505002
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||          
T  6505205 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccaaaaaa 6505106  T
Q  112 nnnn---ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaac 208  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6505105 aaaaaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaac 6505006  T
Q  209 attc 212  Q
    ||||    
T  6505005 attc 6505002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7842262 - 7842062
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||         
T  7842262 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagatttatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagtgccgaaaaa 7842163  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7842162 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacatt 7842063  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  7842062 c 7842062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 29930198 - 29930382
Alignment:
Q  28 aattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagcatgcg 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||||||||| ||    
T  29930198 aattgttacacaaagatcaaacttgatcaatccaatgttctgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccgaaaaaaaaaccgaagcattcg 29930297  T
Q  128 agaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29930298 agaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 29930382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 212
Target Start/End: Original strand, 29979352 - 29979536
Alignment:
Q  28 aattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagcatgcg 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||||||||| ||    
T  29979352 aattgttacacaaagatcaaacttgatcaatccaatgttctgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccgaaaaaaaaaccgaagcattcg 29979451  T
Q  128 agaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29979452 agaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 29979536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 14399361 - 14399569
Alignment:
Q  7 aagaatataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgcc 105  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14399361 aagaaaataaggcgggatttaaaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagtgcc 14399460  T
Q  106 ggnnnnnnnn--ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggat 203  Q
    ||          |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399461 ggaaaaaaaaaaccgaagcatgcgagaacgggttgaagaaaatgtgggtgtttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggat 14399560  T
Q  204 tgaacattc 212  Q
    |||||||||    
T  14399561 tgaacattc 14399569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 78265 - 78067
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||         
T  78265 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttgcgcctagtgcgtgaaaggagtggtgctcacaaagtgccg--aaa 78168  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  78167 aaaaccgaagcatgcgacaacgggctcaagaaaatgtgagtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 78068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 50954089 - 50954287
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||         
T  50954089 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaatgttccg--aaa 50954186  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50954187 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 50954286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13746970 - 13746768
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||        
T  13746970 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaatatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagttccggaaaa 13746871  T
Q  112 nnnn--ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 209  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746870 aaaaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 13746771  T
Q  210 ttc 212  Q
    |||    
T  13746770 ttc 13746768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21955487 - 21955285
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccg--gnn 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||  |      
T  21955487 ataaggcgggatttacaattgttatacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtttcgaagaa 21955388  T
Q  110 nnnnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 209  Q
          || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21955387 aaaaaaccaaagcatgcgaaaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagtaaacaaaggaatggggattgaaca 21955288  T
Q  210 ttc 212  Q
    |||    
T  21955287 ttc 21955285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 9429080 - 9428880
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||         
T  9429080 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacatggttccgaaaaa 9428981  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428980 aaaaccgaagcatgcgaggacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 9428881  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  9428880 c 9428880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Original strand, 7838419 - 7838610
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnn---ccgaa 120  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||           | |||    
T  7838419 ttacagttgttacacaaaaatcaagcttgatcaatcaaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgtcggaaaaaaaaaaactgaa 7838518  T
Q  121 gcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838519 gcatgcaagaacgagctcaagaaaatgtggatgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 7838610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 6741701 - 6741901
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  6741701 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 6741800  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6741801 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 6741900  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  6741901 c 6741901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Original strand, 16445447 - 16445634
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagca 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||         ||||||||    
T  16445447 ttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagtttcg-aaaaaaaaccgaagca 16445545  T
Q  124 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445546 tgcgagaacggggtcaagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 16445634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30946890 - 30946689
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||        
T  30946890 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccggaaaa 30946791  T
Q  112 nnnn-ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
         |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946790 aaaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 30946691  T
Q  211 tc 212  Q
    ||    
T  30946690 tc 30946689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8160231 - 8160030
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  8160231 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 8160132  T
Q  112 nnnn-ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
         |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8160131 aaaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 8160032  T
Q  211 tc 212  Q
    ||    
T  8160031 tc 8160030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 3949557 - 3949757
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||          
T  3949557 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccagctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccaaaaaa 3949656  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949657 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 3949756  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  3949757 c 3949757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11389231 - 11389065
Alignment:
Q  15 aaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccgg-nnnnn 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||          
T  11389231 aaggcgggatttacaattgttacacaaaaatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagcttacaaagtgccggaaaaaa 11389132  T
Q  113 nnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaa 179  Q
       |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11389131 aaaccgaagcatgtgagaacgggctcaagaaaatgcgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaa 11389065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31098182 - 31097982
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||        
T  31098182 ataaggcgggattgacaattgttacacaaagatcaagtttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgctggaaaa 31098083  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31098082 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 31097983  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  31097982 c 31097982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25896354 - 25896148
Alignment:
Q  7 aagaatataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgcc 105  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||     
T  25896354 aagaaaataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagtgct 25896255  T
Q  106 ggnnnnnnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattg 205  Q
    |         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25896254 gaaaaaaaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattg 25896155  T
Q  206 aacattc 212  Q
    |||||||    
T  25896154 aacattc 25896148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1035798 - 1035597
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||        
T  1035798 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagtgccggaaaa 1035699  T
Q  112 nnnn-ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1035698 aaaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 1035599  T
Q  211 tc 212  Q
    ||    
T  1035598 tc 1035597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 34078594 - 34078794
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||         
T  34078594 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaacttacaaagtgccgaaaaa 34078693  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078694 aataccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 34078793  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  34078794 c 34078794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7800256 - 7800053
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||        
T  7800256 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctaatgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccggaaaa 7800157  T
Q  112 nnnn---ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaac 208  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7800156 aaaaaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgggaattgaac 7800057  T
Q  209 attc 212  Q
    ||||    
T  7800056 attc 7800053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13567349 - 13567149
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||        
T  13567349 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagttccggaaaa 13567250  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13567249 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaacgtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 13567150  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  13567149 c 13567149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18537582 - 18537383
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatta-caattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||        
T  18537582 ataaggcgggatttgcaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccacctagtgtgtgaaacgagtggagctcacaaagtggcggaaaa 18537483  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18537482 aaa-ccgaagcatgcgagaacgggctcaaaaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagaaaacaaaggaatggggattgaacatt 18537384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27867081 - 27866892
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnn-ccgaagc 122  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||          |||||||    
T  27867081 ttacaattgtaacacaaatatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagtgccgaaaaaaaataccgaagc 27866982  T
Q  123 atgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27866981 atgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattc 27866892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4203186 - 4202986
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         
T  4203186 ataaggcgggatttataattgttacacaaagatcaaacttgatcaatctaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccgaaaaa 4203087  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  4203086 aaaaccgaaacatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaaagatgattgaacatt 4202987  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  4202986 c 4202986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11032699 - 11032499
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| | ||        
T  11032699 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgactagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttctggaaaa 11032600  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11032599 aaaaccgaagcatgcgggaacggggtcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaagaatggggattgaacatt 11032500  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  11032499 c 11032499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 33994061 - 33994265
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctag----tgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccgg 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  33994061 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagtttcatcaatcaaatgttccgcctagctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccga 33994160  T
Q  108 nnnnnnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaa 207  Q
            ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33994161 aaaaaaaaccgaagcatccgagaacgagctcaagaaaatatgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaacgaggattgaa 33994260  T
Q  208 cattc 212  Q
    |||||    
T  33994261 cattc 33994265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28885643 - 28885455
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagca 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         ||||||||    
T  28885643 ttacaattgtcacacaaagatcaagcttaatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaaaaaaccgaagca 28885544  T
Q  124 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28885543 tgcgagaacgggctcaagaaaatgctgttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagaaaacaaaggaatggggattgaacattc 28885455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38859437 - 38859237
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  38859437 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 38859338  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  38859337 aaaaccgaagcatgcgggaacggggtcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaagaatggagattgaacatt 38859238  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  38859237 c 38859237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 37820126 - 37819924
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||         
T  37820126 ataaggcgggatttaaaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggttagtgtgtaaaaggagtggaactcacatagttccgaaaaa 37820027  T
Q  112 nnnn--ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 209  Q
          |||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37820026 aaaaaaccgaagcatgcgaggacgggctcaagaaaatgcagttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 37819927  T
Q  210 ttc 212  Q
    |||    
T  37819926 ttc 37819924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7021124 - 7020927
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||          
T  7021124 ataaggcgggatttacaattgtcacacaatgatcaagcttgatcaatccaatgttccggttagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagttccaaaaaa 7021025  T
Q  112 nnnn-ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7021024 aaaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtggttgcttattcat----agtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacat 7020929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 85
Target Start/End: Original strand, 43178666 - 43178745
Alignment:
Q  7 aagaatataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaagg 85  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||    
T  43178666 aagaaaataaggcgagatttacaattgttatacaaagatcaagtttgatcaatccaatggtacaactagtgtgtgaaagg 43178745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 107
Target Start/End: Original strand, 20285819 - 20285911
Alignment:
Q  16 aggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccgg 107  Q
    |||||||||| ||| |||| | ||||||||| || ||||||||||||||| |    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20285819 aggcgggatttacatttgtgatacaaagatccagtttgatcaatccaatggtgaaactagtatgtgaaaggagtggagctcataaagtgccgg 20285911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 199
Target Start/End: Original strand, 20286426 - 20286510
Alignment:
Q  116 ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcat-gattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgg 199  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||| | | ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  20286426 ccgaaacatgagacaacgggctcaagaaaatgtgggtgtatgttcatgggtaagtggatatcttagtaggcaaacaaatgaatgg 20286510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 212
Target Start/End: Original strand, 20285926 - 20286023
Alignment:
Q  117 cgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtg--cttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    |||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||  | |||||||||    
T  20285926 cgaagcatgggacaacaggctcaagaaaatgtgggtgtatatgttcatggtaagtggatatcttagtaggcaaacaaatgaatggaaactgaacattc 20286023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 30353758 - 30353726
Alignment:
Q  31 tgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaat 63  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30353758 tgttacacaaagatcaaacttgatcaatccaat 30353726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 22)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 41008215 - 41008027
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||||||||    
T  41008215 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatcaaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccggaaaaaaaaccgaagca 41008116  T
Q  124 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41008115 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattc 41008027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28355151 - 28354949
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        
T  28355151 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttctgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccggaaaa 28355052  T
Q  112 nnnn--ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 209  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355051 aaaaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 28354952  T
Q  210 ttc 212  Q
    |||    
T  28354951 ttc 28354949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 43949529 - 43949330
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||          
T  43949529 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttctgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccaaaaaa 43949430  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949429 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 43949330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27275607 - 27275407
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |         
T  27275607 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagtgctgaaaaa 27275508  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27275507 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattaatggatatcaaagtaagcaaacaagggaatggggattgaacatt 27275408  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  27275407 c 27275407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1100331 - 1100130
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||        
T  1100331 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttggtcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcagaaagtgccggaaaa 1100232  T
Q  112 nnnn-ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
         || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1100231 aaaaaccaaagcatgtgagaatgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 1100132  T
Q  211 tc 212  Q
    ||    
T  1100131 tc 1100130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12907739 - 12907539
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||        
T  12907739 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttcatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagatca-aaagtgccggaaaa 12907641  T
Q  112 nnnn-ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12907640 aaaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggagattgaacat 12907541  T
Q  211 tc 212  Q
    ||    
T  12907540 tc 12907539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 436126 - 436325
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||          
T  436126 ataaggcgggatttacaattgctacacaaagatcaagcttgatcaattcaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgcca-aaaa 436224  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436225 aaaactgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggttatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 436324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Original strand, 9652018 - 9652205
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||         |  |||||    
T  9652018 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaagaagtggagctcacaaagtgccgaaaaaaaatca-aagca 9652116  T
Q  124 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9652117 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattc 9652205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 11693053 - 11692861
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnn----ccga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||            ||||    
T  11693053 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccaactagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccggaaaaaaaaaaaaccga 11692954  T
Q  120 agcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11692953 agcatgcgacaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacattc 11692861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 7263846 - 7264046
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||         
T  7263846 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacatagttccgaaaaa 7263945  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7263946 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 7264045  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  7264046 c 7264046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24605343 - 24605136
Alignment:
Q  7 aagaatataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgcc 105  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24605343 aagaaaataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttaattaatccaatgttccgcctggtgtgtgaaaggagtggagctcacaaaatgcc 24605244  T
Q  106 ggnnnnnnnn-ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggatt 204  Q
    |          |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24605243 gaaaaaaaaaaccgaagcatgcgagaaagggctcaagaaaatgtggatgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggatt 24605144  T
Q  205 gaacattc 212  Q
    ||||||||    
T  24605143 gaacattc 24605136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 24750470 - 24750672
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||          
T  24750470 ataaggcgggatttaaaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagtgccaaaaaa 24750569  T
Q  112 nnnn--ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 209  Q
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750570 aaaaaaccgaagcatgcaagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 24750669  T
Q  210 ttc 212  Q
    |||    
T  24750670 ttc 24750672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 34921007 - 34920819
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagca 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||||         ||||| ||    
T  34921007 ttacaattgttacacaaaaatcaagcttaatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaataagtagagctcacaaagtgccgaaaaaaaaaccgaaaca 34920908  T
Q  124 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34920907 tgcgacaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggagattgaacattc 34920819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 45476177 - 45476376
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||         
T  45476177 ataaggcgggatttacaattgttgcacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttctgccttgtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccgaaaaa 45476276  T
Q  112 nnnnc-cgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
          ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45476277 aaaaaacgaagcatgcgagaacgggcttaagaaaatgtgggttcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggtgattgaacat 45476376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3802812 - 3802613
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| || |||         
T  3802812 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtatgtgaaaggagtggaactcacaatgttccgaaaaa 3802713  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802712 aaatc-gaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtggttgcttattcatgattattggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 3802614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 38946577 - 38946777
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||         
T  38946577 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttcaggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacatagttccgaaaaa 38946676  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38946677 aaaaccgaagcatgcgaagacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 38946776  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  38946777 c 38946777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 212688 - 212488
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  212688 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 212589  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212588 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 212489  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  212488 c 212488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 39794784 - 39794984
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  39794784 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 39794883  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39794884 aaaaccgaagcatgcgggaacggggtcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaagaatggggattgaacatt 39794983  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  39794984 c 39794984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 10623701 - 10623501
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||         
T  10623701 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagtttcgaaaaa 10623602  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623601 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 10623502  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  10623501 c 10623501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 41560826 - 41561026
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  41560826 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 41560925  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41560926 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaataaggattgaacatt 41561025  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  41561026 c 41561026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 212
Target Start/End: Original strand, 5348009 - 5348181
Alignment:
Q  40 aagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagcatgcgagaacgggctca 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         |||||||||||||  |||||||||    
T  5348009 aagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaaaaaaccgaagcatgcgaacacgggctca 5348108  T
Q  140 agaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348109 agaaaatgcggttgcttattcatgattagcggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 5348181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 17997379 - 17997219
Alignment:
Q  50 ttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtg 149  Q
    ||||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||           ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  17997379 ttgatcaatccaatggtgcgactactgtgtgaaaggagtgaagctcacaaagtgcc--aaaaaaaatcgaagcatgagtcaacgggctcaagacaatgtg 17997282  T
Q  150 ggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||| | |||||| | ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17997281 ggttcatgttcaaggttagtggatatcttagtagacaaacaaaggaatggagattgaacattc 17997219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 16884 - 17083
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         
T  16884 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccg-aaaa 16982  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16983 aaaaccgaagcatgcgagaacggactcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatagggattgaacatt 17082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 18606810 - 18607010
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         
T  18606810 ataaggcgggatttaaaattgttacacaaagatcaaacttgatcaatcaaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccgaaaaa 18606909  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18606910 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 18607009  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  18607010 c 18607010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 35243419 - 35243617
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||         
T  35243419 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagagtgtgaaaggagtagagctcacaaagtgccg--aaa 35243516  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35243517 aaaaccgaagcatgcgagaactggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaatgaatggggattgaacatt 35243616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 28250704 - 28250910
Alignment:
Q  7 aagaatataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgcc 105  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  28250704 aagaaaataaggcgggatttacaattgacacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagttcc 28250803  T
Q  106 ggnnnnnnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattg 205  Q
    |          |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28250804 gaaaaaaaaatcgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattg 28250903  T
Q  206 aacattc 212  Q
    |||||||    
T  28250904 aacattc 28250910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13387929 - 13387741
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagca 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||         ||||||||    
T  13387929 ttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagttccgaaaaaaaaaccgaagca 13387830  T
Q  124 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13387829 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtggttgcttattcatgattcgtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 13387741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Original strand, 7362006 - 7362193
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagca 123  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||         ||||||||    
T  7362006 ttacaattgttacacaaagattaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagcggagctcacaaagtgtcg-aaaaaaaaccgaagca 7362104  T
Q  124 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7362105 tgcgataacgggctcaagaaaatgtggatgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgtggattgaacattc 7362193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7362592 - 7362390
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||        
T  7362592 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcatagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgtcgggaaa 7362493  T
Q  112 nnnn--ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 209  Q
          | |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7362492 aaaaaactgaagcatgcgagaacgggcttaagaaaatgtggatggttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaaca 7362393  T
Q  210 ttc 212  Q
    |||    
T  7362392 ttc 7362390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29288185 - 29287995
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccgg---nnnnnnnnccgaa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           |||||    
T  29288185 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccggaaaaaaaaaaaccgaa 29288086  T
Q  121 gcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29288085 gcatgcgagaacgaactcaagaaaatgtggatgtttgttcatgattag-ggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 29287995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 1611997 - 1611798
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  1611997 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccg-aaaa 1611899  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611898 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 1611799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23985555 - 23985364
Alignment:
Q  15 aaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccgg------ 107  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||          
T  23985555 aaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaattttccgcctagtgtgtgaaaggagtggtgctcacaaagtgccggaaaaaa 23985456  T
Q  108 nnnnnnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgg 199  Q
            || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23985455 aaaaaaaaccaaagcatgcgacaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatggttagtggatatcaaagtaggcaaacaaaagaatgg 23985364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Original strand, 24219984 - 24220180
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccgg--------nnnnnnnn 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||                    
T  24219984 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttgcgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccggaaaaaaaaaaaaaaaa 24220083  T
Q  116 ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24220084 ccgaagcatgcgacaacggactcaagaaaatgtgggtgcttgtccatggttagtggatatcttagtaggaaaacaaatgaatggggattgaaaattc 24220180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Original strand, 18347856 - 18347951
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccgg 107  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||    
T  18347856 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacatagttccgg 18347951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 83
Target Start/End: Original strand, 31147197 - 31147268
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaa 83  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31147197 ataaggcgggatttacaattgttacacatagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaa 31147268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 212
Target Start/End: Original strand, 31147265 - 31147336
Alignment:
Q  141 gaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  31147265 gaaaatgtgggtggttgttcatgattagtggatatcaaagtaaggtaacaaaggaatgaggattgaacattc 31147336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 21471605 - 21471808
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||        
T  21471605 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagattgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaagagtggagctcacaaagtgccggaaaa 21471704  T
Q  112 nnnn---ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaac 208  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21471705 aaaaaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaac 21471804  T
Q  209 attc 212  Q
    ||||    
T  21471805 attc 21471808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Original strand, 11502331 - 11502520
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnn-ccgaagc 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||          |||||||    
T  11502331 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgttaaaggagtggagctcacaaagtgccgaaaaaaaaaaccgaagc 11502430  T
Q  123 atgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  11502431 atgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgagtattgaacattc 11502520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 4976570 - 4976769
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||        
T  4976570 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtg-cggaaaa 4976668  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||| ||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4976669 aaacccgaagcatgtgagaacgggctcacgtaaaagtggatgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 4976768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 4979200 - 4979001
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||         
T  4979200 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatctaatgttccgcctagtgtgttaaaggagtggagctcacaaagtgccg-aaaa 4979102  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4979101 aaaaccaaagcatccgagaacgggctcaagaaaatgtggatgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 4979002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38464050 - 38463844
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||        
T  38464050 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatattccgcctagtgtgtgaaacgagtgaagctcacaaagtgccggaaaa 38463951  T
Q  112 nnnn------ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattg 205  Q
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38463950 aaaaaaaaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattg 38463851  T
Q  206 aacattc 212  Q
    |||||||    
T  38463850 aacattc 38463844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 18580565 - 18580375
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnc--cgaag 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           |||||    
T  18580565 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccggaaaaaaaaaatcgaag 18580466  T
Q  122 catgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  18580465 catgcaacaacgggatcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattaaacattc 18580375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 51643736 - 51643547
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnn-ccgaagc 122  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||         |||||||    
T  51643736 ttacaattgttacacaaatatcaagcttgatcaattcaatgttccgcctaatgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccggaaaaaaaaaccgaagc 51643637  T
Q  123 atgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  51643636 atgtgagaacgggctcaaaaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaattgagattgaacattc 51643547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 9890836 - 9891036
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| | |         
T  9890836 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttctgaaaaa 9890935  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9890936 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 9891035  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  9891036 c 9891036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19072905 - 19072704
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||        
T  19072905 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccagctagtttgtgaaaggagtggaacttacaaagttccggaaaa 19072806  T
Q  112 nnnn-ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072805 aaaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgtttgctttttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 19072706  T
Q  211 tc 212  Q
    ||    
T  19072705 tc 19072704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 3404604 - 3404804
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||         
T  3404604 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagtttgatcaatccaatgttccagctagtgtgtgaaaggagtggaactcacatagttccgaaaaa 3404703  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3404704 aaaaccaaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgcgattgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 3404803  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  3404804 c 3404804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 49565711 - 49565511
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  49565711 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 49565612  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565611 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 49565512  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  49565511 c 49565511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 17140401 - 17140603
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccgg--nn 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||        
T  17140401 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttgcgtctagtgtgtgaaaggaatggagctcacaaagtgtcggaaaa 17140500  T
Q  110 nnnnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 209  Q
          | |||||||||   ||||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17140501 aaaaaactgaagcatgcatcaacggactcaagaaaatgtggatgtttgttcatggttagtggatatcaaagtaggcaaacaaaggaatggggattgaaca 17140600  T
Q  210 ttc 212  Q
    |||    
T  17140601 ttc 17140603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 212
Target Start/End: Original strand, 41024073 - 41024213
Alignment:
Q  71 ctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtg 170  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41024073 ctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagttccgaaaaaaaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtggttgcttattcatgattagtg 41024172  T
Q  171 gatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41024173 gatatcaaagtaagcaaacaaaggaat-gggattgaacattc 41024213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 91
Target Start/End: Original strand, 1088383 - 1088450
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtgga 91  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  1088383 ttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatctaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtgga 1088450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 106
Target Start/End: Original strand, 6182529 - 6182585
Alignment:
Q  50 ttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccg 106  Q
    ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  6182529 ttgatcaatccaatgttgcaactattgtgtgaaaggagtggtgatcacaaagtgccg 6182585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Original strand, 37015739 - 37015928
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnn-ccgaagc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||         |||||||    
T  37015739 ttacaattgttacacaaagatcaggcttgatcaatccaatgttctgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccggaaaaaaaaaccgaagc 37015838  T
Q  123 atgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37015839 atgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 37015928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 50117009 - 50116810
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         
T  50117009 ataaggcgggatttacaattgttacacaaatatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccg-aaaa 50116911  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  50116910 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaataaaggaatggagattgaacatt 50116811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 12649828 - 12649624
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||        
T  12649828 ataaggcgggatttacaattgtgacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagtgccggaaaa 12649729  T
Q  112 nnnn----ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaa 207  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649728 aaaaaaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtgggtatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaa 12649629  T
Q  208 cattc 212  Q
    |||||    
T  12649628 cattc 12649624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 46973976 - 46974178
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||        
T  46973976 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaacggagtggatctcacaaagtgccggaaaa 46974075  T
Q  112 nnnn--ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 209  Q
          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46974076 aaaaaaccgaagcatgcgagaacaggctcaagaaaatgtgggtgtttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 46974175  T
Q  210 ttc 212  Q
    |||    
T  46974176 ttc 46974178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 13174589 - 13174795
Alignment:
Q  7 aagaatataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgcc 105  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13174589 aagaaaataaggtgggatttacaattattactcaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcataaagtgcc 13174688  T
Q  106 ggnnnnnnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattg 205  Q
    |         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13174689 gaaaaaaaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattaatggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgtggattg 13174788  T
Q  206 aacattc 212  Q
    |||||||    
T  13174789 aacattc 13174795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 29355935 - 29355735
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||         
T  29355935 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacatagttccgaaaaa 29355836  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355835 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 29355736  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  29355735 c 29355735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38692175 - 38691986
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnn-ccgaagc 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||           |||||||    
T  38692175 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttgcgcctagtgtgtgaaaggagtagagctcacaaagtgccaaaaaaaaaaaccgaagc 38692076  T
Q  123 atgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38692075 atgcgagaacgagctcaagaaaatgtgggtgtttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 38691986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7980446 - 7980259
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagca 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||         ||||||||    
T  7980446 ttacaattgttacacaaagttcaagcttgatcaatctaatgttcctcctagtgtgtgaaaagagtgtagctcacaaagtgccg-aaaaaaaaccgaagca 7980348  T
Q  124 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980347 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgtttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 7980259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 41454648 - 41454851
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||        
T  41454648 ataaggcgggatttagaattgacacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagttccgggaaa 41454747  T
Q  112 nnnn---ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaac 208  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41454748 aaaaacaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaac 41454847  T
Q  209 attc 212  Q
    ||||    
T  41454848 attc 41454851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 5078749 - 5078949
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||         
T  5078749 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacatagttccgaaaaa 5078848  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5078849 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgcggttgtttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacatt 5078948  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  5078949 c 5078949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 44620339 - 44620150
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnn-ccgaagc 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||         |||||||    
T  44620339 ttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccggaaaaaaaaaccgaagc 44620240  T
Q  123 atgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620239 atgcgagaacggggtcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 44620150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Original strand, 13630243 - 13630430
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagca 123  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| |||  ||         ||||||||    
T  13630243 ttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagtttcg-aaaaaaaaccgaagca 13630341  T
Q  124 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630342 tgcgagaacggggtcaagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 13630430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 44466396 - 44466596
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  44466396 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 44466495  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466496 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 44466595  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  44466596 c 44466596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Original strand, 51663078 - 51663272
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgc-cggnnnnnnnn----ccg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||            |||    
T  51663078 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgtacggaaaaaaaaaaaaccg 51663177  T
Q  119 aa-gcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51663178 aaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatatgtgtgcttgttcatgattagtgaatatcaaagtaagcaaacaaaagaatggggattgaacattc 51663272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 38775361 - 38775162
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  38775361 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 38775262  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38775261 aaaaccgaagcatgcgaacacgg-ctcaagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 38775163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 3947709 - 3947508
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||        
T  3947709 ataaggcgggatttatcattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccggaaaa 3947610  T
Q  112 nnnn-ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
         |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947609 aaaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 3947510  T
Q  211 tc 212  Q
    ||    
T  3947509 tc 3947508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 3983926 - 3984127
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||        
T  3983926 ataaggcgggatttatcattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccggaaaa 3984025  T
Q  112 nnnn-ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
         |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984026 aaaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 3984125  T
Q  211 tc 212  Q
    ||    
T  3984126 tc 3984127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 20350270 - 20350470
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||||        
T  20350270 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccggaaaa 20350369  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        | ||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20350370 aaaacagaagcatgcaaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattaaacatt 20350469  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  20350470 c 20350470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21943616 - 21943411
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgt-tccgtctagt---gtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccgg 107  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  21943616 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatcccatgtgtccgcctagtactgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgtcga 21943517  T
Q  108 nnnnnnnn-ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattga 206  Q
             ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21943516 aaaaaaaaaccgaagcatgcgacaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgtttatggttagtggatatcaaagtaggcaaacaaaggaatggggattga 21943417  T
Q  207 acattc 212  Q
    ||||||    
T  21943416 acattc 21943411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 39 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16246970 - 16246803
Alignment:
Q  39 aaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagcatgcgagaacgggctc 138  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||          | |||| ||| || |||||||||    
T  16246970 aaagatctagtttgatcaatcctatggtgcgactagtgtgtgaaagaagtggagctcacaaagtgcca-aaaaaaaactgaagaatgagacaacgggctc 16246872  T
Q  139 aagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaa 207  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||   ||| ||||||||| |||||| |||||||    
T  16246871 aagaaaatgtgggtgtatgttcatggttagtgaatatctgtgtaggcaaacaaatgaatggagattgaa 16246803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 19498317 - 19498275
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgtt 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19498317 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatcccatgtt 19498275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 36075806 - 36075764
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgtt 66  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36075806 ttacaattgttacacaaagatcaatcttgatcaatccaatgtt 36075764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 26466413 - 26466317
Alignment:
Q  116 ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||  |||||||  || |||||||||  |||| ||||||||| || ||| |||| |||||||    
T  26466413 ccgaagcatgagacaacaggctcaagaaaatgtaggtgtatgttcattgttcgtggatatcttagtaggcaaacaaatgattggagattaaacattc 26466317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 17)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Original strand, 45455202 - 45455390
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||          |||||||    
T  45455202 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggaatggagctcacaaagtgccgaaaaaaaaatcgaagca 45455301  T
Q  124 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45455302 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattggacattc 45455390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Original strand, 43370573 - 43370781
Alignment:
Q  7 aagaatataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgcc 105  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||| |||||    
T  43370573 aagaaaataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaataagtggagctcacaatgtgcc 43370672  T
Q  106 ggnnnnnnnnc--cgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggat 203  Q
    ||           |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43370673 ggaaaaaaaaaatcgaagcatgcgaaaacgggctcaagaaaatgtggatgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggtt 43370772  T
Q  204 tgaacattc 212  Q
    |||||||||    
T  43370773 tgaacattc 43370781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 2146225 - 2146038
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagca 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||         |||||||     
T  2146225 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaagaagtggagctcacaaagtgccgaaaaaaaaaccgaagcg 2146126  T
Q  124 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2146125 tgcgagaacggactcaagaaaatgtggatgcttgttcgtgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaatgaatggagattgaacatt 2146038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Original strand, 7168728 - 7168914
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagca 123  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||         | |||| |    
T  7168728 ttacaactgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccg--aaaaaaactgaagta 7168825  T
Q  124 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7168826 tgcgacaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatggttagtggatatcaaagtaggcaaacaaaggagtggggattgaacattc 7168914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43689405 - 43689218
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagca 123  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |          | ||||||    
T  43689405 ttacaattattacacaaagatcaaacttgatcaatccaatgttccgccaagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgtca-aaaaaaaactgaagca 43689307  T
Q  124 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43689306 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggatttaacattc 43689218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 35965994 - 35965792
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||         
T  35965994 ataaggcgggatttacaattattacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgtctcgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtttcgagaaa 35965895  T
Q  112 nnnn--ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 209  Q
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965894 aaaaaactgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtggatgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 35965795  T
Q  210 ttc 212  Q
    |||    
T  35965794 ttc 35965792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 1115586 - 1115786
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||         
T  1115586 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagattgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacatagttccgaaaac 1115685  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1115686 aaaaccgaagcatgcgagaacgagctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacatt 1115785  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  1115786 c 1115786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 30304863 - 30304657
Alignment:
Q  7 aagaatataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgcc 105  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||    
T  30304863 aagaaaataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttcc 30304764  T
Q  106 ggnnnnnnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattg 205  Q
    |         |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304763 gaaaaaaaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattg 30304664  T
Q  206 aacattc 212  Q
    |||||||    
T  30304663 aacattc 30304657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32378155 - 32377955
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  32378155 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 32378056  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32378055 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 32377956  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  32377955 c 32377955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 32432112 - 32431912
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  32432112 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 32432013  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32432012 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 32431913  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  32431912 c 32431912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 39752276 - 39752075
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||  ||         
T  39752276 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagattaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaatggagtggagctcataaagtatcgaaaaa 39752177  T
Q  112 nnnn-ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
         |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39752176 aaaaaccgaagcatgcgagaacgtgctcaagaaaatgtggatgtttgttcatgattggtggatatcaaagtaagcaaacaaatgaatggggattgaacat 39752077  T
Q  211 tc 212  Q
    ||    
T  39752076 tc 39752075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8423103 - 8422903
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  8423103 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 8423004  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8423003 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattaaacatt 8422904  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  8422903 c 8422903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 7340893 - 7341093
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| ||          
T  7340893 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccagctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccaaaaaa 7340992  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7340993 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 7341092  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  7341093 c 7341093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 4867269 - 4867363
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4867269 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagattgatcaatccaatgttgcgcctagtgtgtgaaaggagtggagttcacaaagtgccg 4867363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 162
Target Start/End: Original strand, 22578755 - 22578896
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccgg---nnnnnnnnccgaa 120  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||           |||||    
T  22578755 ttacaattgttacacaaatattaagtttgatcaatccaatgttctgcctggtgtgtgaaaggagtggagctcacgaagtgccggaaaaaaaaaacccgaa 22578854  T
Q  121 gcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcat 162  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22578855 gcatgcgacaacgggctcaagaaaatttgggtgcttgttcat 22578896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 85
Target Start/End: Original strand, 20547618 - 20547679
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaagg 85  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20547618 ttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccagctagtgtgtgaaagg 20547679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 158 - 212
Target Start/End: Original strand, 22580864 - 22580917
Alignment:
Q  158 ttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacattc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22580864 ttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaa-gaatggggattgaacattc 22580917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 12074 - 12276
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||         
T  12074 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaagaagtggaactcacaaagtgccgaaaaa 12173  T
Q  112 nnnnc--cgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 209  Q
        |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174 aaaacaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 12273  T
Q  210 ttc 212  Q
    |||    
T  12274 ttc 12276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 418 - 217
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        
T  418 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccggaaaa 319  T
Q  112 nnnncc-gaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
         | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  318 aaaaactgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggtgattgaacat 219  T
Q  211 tc 212  Q
    ||    
T  218 tc 217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 47061695 - 47061897
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccgg--nn 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        
T  47061695 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgcctagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccggaaaa 47061794  T
Q  110 nnnnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 209  Q
          | |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47061795 aaaaaactgaagcatgcgaggacagactcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaaca 47061894  T
Q  210 ttc 212  Q
    |||    
T  47061895 ttc 47061897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 617997 - 617796
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||        
T  617997 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacatagttccggaaaa 617898  T
Q  112 nnnn-ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
         |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617897 aaaaaccgaagcatgcgaagacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 617798  T
Q  211 tc 212  Q
    ||    
T  617797 tc 617796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 18106200 - 18106402
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||        
T  18106200 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagtttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacatagttccggaaaa 18106299  T
Q  112 nnnn--ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 209  Q
          |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106300 aaaaaaccgaagcatgcgagaacgggctaaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaaca 18106399  T
Q  210 ttc 212  Q
    |||    
T  18106400 ttc 18106402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 30787353 - 30787553
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  30787353 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 30787452  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787453 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 30787552  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  30787553 c 30787553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43623382 - 43623182
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  43623382 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 43623283  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623282 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 43623183  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  43623182 c 43623182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 42500222 - 42500421
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| | | |||         
T  42500222 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacataattccg-aaaa 42500320  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42500321 aaaaccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgcagttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggagattgaacatt 42500420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 45764192 - 45764393
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  45764192 ataaggcgggatttaccattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 45764291  T
Q  112 nnnn-ccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
         |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764292 aaaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 45764391  T
Q  211 tc 212  Q
    ||    
T  45764392 tc 45764393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 15060428 - 15060627
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| | ||| |||         
T  15060428 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcatatagttccgaaaaa 15060527  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15060528 aaaaccgaagcatgcgagaacggggtcaagaaaatgcagttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgggg-ttgaacatt 15060626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 43827851 - 43827653
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||        
T  43827851 ataaggcgggatttacaattgttagacaaagatcaagtttgatcaatctattgttgcgactagtgtgtgaaaggagtggagctcataaagtgccggaaaa 43827752  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
         ||||||||| |  || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43827751 aaa--cgaagcatgagtcaatgggcttaagaaaatgtgggtgtttgttcatggttagtggatatcttagtagacaaacaaaggaatggggattgaacatt 43827654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 211
Target Start/End: Original strand, 8400414 - 8400599
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnnnnnnccgaagca 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |        |||||||     
T  8400414 ttacaattgttatacaaagatcaagctcaaccaatccaatgttgcgactagtgtgtgaaaggagtggaactcacaaagtgccagaaaaaa--ccgaagcg 8400511  T
Q  124 tgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
    ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8400512 tgcgtcaatgggctaaagaaaatgtgggtgcttgttcatggttagtggatatcttagtaggcaaacaaaagaatggggattgaacatt 8400599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 24 - 107
Target Start/End: Original strand, 21799824 - 21799907
Alignment:
Q  24 ttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccgg 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21799824 ttacaattgttacacaaagatcaaatttgatcaatccaatagtacgactagtgtgtgaaaggagtggagctcacaaagtgccgg 21799907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 211
Target Start/End: Original strand, 21799931 - 21800025
Alignment:
Q  117 cgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||| | |||||||| ||||| |||||||||||    
T  21799931 cgaagcatgagacaacgggctcaagaaaatgtgggtgcatgttcatggttagtggatatcttagtaggaaaacaaagcaatggagattgaacatt 21800025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 16605 - 16404
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||        
T  16605 ataaggcgggatttacaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaactcacaatgttccggaaaa 16506  T
Q  112 nnnnccg-aagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacat 210  Q
         || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16505 aaaaacggaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatgaggattgaacat 16406  T
Q  211 tc 212  Q
    ||    
T  16405 tc 16404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 1695 - 1895
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  1695 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 1794  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1795 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 1894  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  1895 c 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 33623 - 33823
Alignment:
Q  13 ataaggcgggatt-acaattgttacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccgtctagtgtgtgaaaggtgtggagctcacaaagtgccggnnnn 111  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| ||| |||         
T  33623 ataaggcgggatttacaattgtcacacaaagatcaagcttgatcaatccaatgttccggctagtgtgtgaaaggagtggaagtcacatagttccgaaaaa 33722  T
Q  112 nnnnccgaagcatgcgagaacgggctcaagaaaatgtgggtgcttgttcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 211  Q
        |||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33723 aaaaccgaagcatgcgaacacgggctcaagaaaatgcggttgcttattcatgattagtggatatcaaagtaagcaaacaaaggaatggggattgaacatt 33822  T
Q  212 c 212  Q
    |    
T  33823 c 33823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University