View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2284_high_6 (Length: 370)

Name: NF2284_high_6
Description: NF2284
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2284_high_6
NF2284_high_6
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (1-354)||(19092527-19092884)
chr4 (10-354)||(5679437-5679782)
chr4 (49-341)||(14649140-14649432)
chr4 (59-341)||(19929245-19929527)
chr4 (4-341)||(22357048-22357384)
chr4 (5-322)||(8969248-8969565)
chr4 (88-306)||(22173150-22173368)
chr4 (3-342)||(13909100-13909439)
chr4 (3-322)||(7582563-7582883)
chr4 (4-185)||(17710086-17710267)
chr4 (4-230)||(17275910-17276136)
chr4 (20-354)||(17672224-17672561)
chr4 (18-189)||(13692280-13692451)
chr4 (3-191)||(15165164-15165352)
chr4 (18-183)||(11253305-11253471)
chr4 (10-177)||(4615121-4615285)
chr4 (97-183)||(25094936-25095022)
chr4 (91-188)||(11933817-11933914)
chr4 (205-312)||(40228050-40228158)
chr4 (5-118)||(5956423-5956536)
chr4 (104-177)||(17217162-17217235)
chr4 (3-166)||(17107011-17107175)
chr4 (273-342)||(19636392-19636461)
chr4 (19-139)||(25120759-25120880)
chr4 (274-321)||(17106858-17106905)
chr4 (4-77)||(17025896-17025969)
chr4 (273-322)||(17710019-17710068)
chr4 (273-329)||(17217080-17217136)
chr4 (10-57)||(17217374-17217421)
chr4 (179-348)||(19374505-19374674)
chr4 (88-146)||(20829422-20829480)
chr4 (273-322)||(19492496-19492545)
chr4 (3-55)||(17336560-17336612)
chr4 (4-44)||(25095160-25095200)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (5-354)||(39817-40165)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (5-354)||(24281506-24281855)
chr1 (5-354)||(25960685-25961033)
chr1 (5-354)||(18100531-18100881)
chr1 (11-344)||(33190918-33191251)
chr1 (3-322)||(21449343-21449662)
chr1 (3-337)||(14779798-14780132)
chr1 (46-306)||(25404055-25404315)
chr1 (20-322)||(24214797-24215088)
chr1 (3-189)||(15543551-15543737)
chr1 (4-145)||(16112178-16112320)
chr1 (11-342)||(15807542-15807875)
chr1 (4-178)||(14781405-14781579)
chr1 (18-274)||(16179317-16179573)
chr1 (4-171)||(26612595-26612762)
chr1 (4-185)||(21334301-21334482)
chr1 (4-225)||(22664522-22664743)
chr1 (19-342)||(28008349-28008670)
chr1 (210-340)||(9787601-9787731)
chr1 (53-342)||(12012379-12012669)
chr1 (210-354)||(16112053-16112197)
chr1 (3-185)||(18528775-18528957)
chr1 (4-146)||(21985542-21985684)
chr1 (4-183)||(727837-728017)
chr1 (4-175)||(18735788-18735960)
chr1 (89-191)||(15812756-15812858)
chr1 (4-189)||(29242835-29243019)
chr1 (20-140)||(16360317-16360437)
chr1 (271-354)||(22664439-22664523)
chr1 (92-184)||(26648644-26648736)
chr1 (10-189)||(15160060-15160239)
chr1 (94-185)||(18826023-18826114)
chr1 (18-175)||(25403644-25403802)
chr1 (4-177)||(16916486-16916657)
chr1 (4-131)||(9787479-9787606)
chr1 (88-176)||(23180172-23180260)
chr1 (94-183)||(22623271-22623360)
chr1 (18-146)||(34481379-34481506)
chr1 (289-342)||(21847824-21847877)
chr1 (4-176)||(24054355-24054527)
chr1 (88-145)||(44795811-44795868)
chr1 (5-57)||(15572945-15572997)
chr1 (3-348)||(17121020-17121363)
chr1 (274-342)||(17359407-17359475)
chr1 (157-270)||(21972061-21972173)
chr1 (179-263)||(32382700-32382784)
chr1 (10-116)||(51472768-51472875)
chr1 (272-322)||(18736031-18736081)
chr1 (288-337)||(16360119-16360168)
chr1 (4-77)||(21666401-21666474)
chr1 (273-322)||(29242772-29242821)
chr1 (274-322)||(9401771-9401819)
chr1 (5-69)||(20106631-20106695)
chr1 (94-146)||(21848020-21848072)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (4-354)||(3190577-3190927)
chr7 (10-348)||(3734834-3735172)
chr7 (5-354)||(9574638-9574974)
chr7 (67-354)||(10586605-10586891)
chr7 (110-354)||(7318506-7318751)
chr7 (12-260)||(1586290-1586538)
chr7 (67-322)||(17152729-17152984)
chr7 (52-354)||(6013824-6014125)
chr7 (4-341)||(15869841-15870179)
chr7 (10-230)||(18202733-18202952)
chr7 (4-342)||(16297357-16297695)
chr7 (10-146)||(1587972-1588108)
chr7 (4-342)||(17829812-17830151)
chr7 (3-322)||(8978519-8978839)
chr7 (4-189)||(11803398-11803583)
chr7 (13-120)||(8313012-8313119)
chr7 (4-185)||(8053646-8053827)
chr7 (3-177)||(8877763-8877937)
chr7 (3-322)||(39272689-39273009)
chr7 (4-183)||(17190753-17190932)
chr7 (210-354)||(4986825-4986970)
chr7 (210-354)||(4990923-4991068)
chr7 (48-177)||(13289007-13289136)
chr7 (4-185)||(18368563-18368744)
chr7 (10-140)||(4449379-4449510)
chr7 (4-183)||(22066784-22066964)
chr7 (4-173)||(20582602-20582771)
chr7 (87-183)||(16058634-16058730)
chr7 (10-189)||(13759488-13759667)
chr7 (12-131)||(17077497-17077616)
chr7 (88-241)||(5106987-5107138)
chr7 (18-185)||(1861292-1861459)
chr7 (88-239)||(2574281-2574431)
chr7 (20-118)||(6006469-6006568)
chr7 (94-176)||(13277880-13277962)
chr7 (93-191)||(19153684-19153782)
chr7 (93-191)||(20753083-20753181)
chr7 (10-146)||(1847834-1847970)
chr7 (4-306)||(9131190-9131483)
chr7 (268-348)||(1584438-1584518)
chr7 (4-115)||(2564290-2564402)
chr7 (4-146)||(4986950-4987089)
chr7 (4-146)||(4991048-4991187)
chr7 (276-348)||(7397379-7397451)
chr7 (92-176)||(13418865-13418949)
chr7 (274-351)||(2564053-2564131)
chr7 (79-113)||(21501736-21501770)
chr7 (21-146)||(22338945-22339069)
chr7 (18-118)||(31493383-31493483)
chr7 (4-76)||(4819354-4819426)
chr7 (18-118)||(18662901-18663000)
chr7 (88-142)||(1584981-1585035)
chr7 (288-342)||(5108810-5108864)
chr7 (302-354)||(4986763-4986816)
chr7 (302-354)||(4990861-4990914)
chr7 (226-303)||(8313137-8313214)
chr7 (4-57)||(10586452-10586505)
chr7 (273-322)||(11803335-11803384)
chr7 (210-251)||(17190875-17190916)
chr7 (273-322)||(20582523-20582572)
chr7 (4-76)||(4786310-4786382)
chr7 (69-113)||(5530547-5530591)
chr7 (274-322)||(16365972-16366020)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (13-342)||(34487877-34488206)
chr5 (35-347)||(24266506-24266818)
chr5 (35-347)||(24343137-24343449)
chr5 (5-312)||(24264989-24265296)
chr5 (5-312)||(24341620-24341927)
chr5 (54-321)||(20744234-20744503)
chr5 (4-212)||(18207783-18207991)
chr5 (4-183)||(24140816-24140994)
chr5 (4-172)||(19008096-19008264)
chr5 (4-177)||(20549257-20549430)
chr5 (4-185)||(24659566-24659747)
chr5 (4-189)||(34128966-34129152)
chr5 (5-185)||(17432214-17432394)
chr5 (177-342)||(22755766-22755931)
chr5 (4-191)||(20563669-20563856)
chr5 (11-189)||(15375480-15375658)
chr5 (5-140)||(24243553-24243688)
chr5 (4-181)||(16523113-16523293)
chr5 (54-175)||(17314700-17314821)
chr5 (88-247)||(18938083-18938241)
chr5 (4-147)||(23335984-23336127)
chr5 (19-111)||(36175606-36175697)
chr5 (87-171)||(20859066-20859150)
chr5 (18-146)||(17470805-17470932)
chr5 (270-354)||(18208034-18208118)
chr5 (10-131)||(28665195-28665317)
chr5 (18-146)||(17635717-17635844)
chr5 (67-146)||(22871106-22871185)
chr5 (4-70)||(20315036-20315102)
chr5 (4-312)||(25401853-25402160)
chr5 (273-329)||(34128896-34128952)
chr5 (277-322)||(23388644-23388689)
chr5 (273-322)||(24659765-24659814)
[»] chr6 (41 HSPs)
chr6 (10-353)||(22568071-22568415)
chr6 (4-348)||(15466603-15466947)
chr6 (4-354)||(21688368-21688717)
chr6 (11-342)||(19244820-19245151)
chr6 (4-341)||(6630207-6630544)
chr6 (4-306)||(11177214-11177516)
chr6 (65-342)||(21907679-21907957)
chr6 (121-342)||(28933292-28933513)
chr6 (10-189)||(27124089-27124268)
chr6 (161-354)||(8241504-8241696)
chr6 (20-140)||(8245372-8245492)
chr6 (5-172)||(20005456-20005624)
chr6 (63-312)||(14072360-14072610)
chr6 (4-172)||(22412596-22412768)
chr6 (4-342)||(4339978-4340318)
chr6 (4-191)||(22813280-22813468)
chr6 (3-307)||(20144618-20144923)
chr6 (3-307)||(22187916-22188221)
chr6 (4-342)||(1635207-1635546)
chr6 (4-183)||(23008946-23009125)
chr6 (4-183)||(23779239-23779418)
chr6 (3-189)||(9517114-9517302)
chr6 (4-191)||(11136273-11136460)
chr6 (13-250)||(18074942-18075178)
chr6 (4-331)||(9838610-9838937)
chr6 (4-131)||(17823290-17823416)
chr6 (269-354)||(9898744-9898829)
chr6 (3-128)||(14722389-14722514)
chr6 (94-139)||(17382416-17382461)
chr6 (274-342)||(24215718-24215786)
chr6 (269-348)||(24252021-24252100)
chr6 (276-342)||(14079245-14079311)
chr6 (273-342)||(22410116-22410186)
chr6 (212-251)||(17826806-17826845)
chr6 (79-141)||(2587148-2587210)
chr6 (67-113)||(14725882-14725928)
chr6 (48-115)||(5625108-5625176)
chr6 (3-76)||(14638064-14638137)
chr6 (89-146)||(20001990-20002047)
chr6 (88-148)||(24251840-24251900)
chr6 (276-312)||(27737477-27737513)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (49-341)||(167860-168152)
[»] chr3 (41 HSPs)
chr3 (10-354)||(17156022-17156365)
chr3 (18-354)||(2723375-2723704)
chr3 (3-185)||(12411479-12411661)
chr3 (10-183)||(19167778-19167951)
chr3 (11-132)||(8170280-8170401)
chr3 (186-342)||(12805592-12805748)
chr3 (19-348)||(8143850-8144180)
chr3 (13-140)||(16229568-16229695)
chr3 (219-348)||(31285747-31285877)
chr3 (88-339)||(19908556-19908808)
chr3 (4-342)||(21302163-21302500)
chr3 (201-329)||(38083814-38083942)
chr3 (10-183)||(8882676-8882850)
chr3 (88-176)||(3116019-3116107)
chr3 (48-342)||(21325583-21325878)
chr3 (94-176)||(4650613-4650695)
chr3 (10-126)||(19575782-19575898)
chr3 (4-132)||(20023092-20023219)
chr3 (18-118)||(12373501-12373603)
chr3 (86-191)||(5508730-5508835)
chr3 (214-354)||(8267163-8267304)
chr3 (94-167)||(8267267-8267340)
chr3 (79-148)||(8446257-8446326)
chr3 (268-348)||(18736455-18736535)
chr3 (4-119)||(16245244-16245361)
chr3 (268-353)||(21825651-21825736)
chr3 (94-146)||(8319403-8319455)
chr3 (79-139)||(27854126-27854186)
chr3 (277-340)||(7494904-7494967)
chr3 (88-175)||(16221770-16221857)
chr3 (59-118)||(21825399-21825458)
chr3 (59-118)||(23768592-23768651)
chr3 (179-321)||(41508632-41508773)
chr3 (4-70)||(19171379-19171445)
chr3 (276-322)||(20429965-20430011)
chr3 (268-342)||(21303135-21303209)
chr3 (273-342)||(7478139-7478208)
chr3 (150-191)||(8765479-8765520)
chr3 (277-322)||(12754709-12754754)
chr3 (8-44)||(2167220-2167256)
chr3 (274-342)||(17438216-17438284)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (4-342)||(25884978-25885316)
chr2 (24-353)||(20174175-20174503)
chr2 (12-260)||(29849654-29849902)
chr2 (67-341)||(29027742-29028016)
chr2 (4-347)||(23011277-23011624)
chr2 (5-182)||(23933170-23933347)
chr2 (4-176)||(18121804-18121976)
chr2 (4-185)||(30411999-30412180)
chr2 (4-189)||(17675215-17675400)
chr2 (10-183)||(26667678-26667851)
chr2 (4-181)||(29143288-29143465)
chr2 (3-189)||(27908704-27908890)
chr2 (4-341)||(28605688-28606031)
chr2 (4-185)||(17635361-17635542)
chr2 (216-354)||(32085694-32085832)
chr2 (65-191)||(13776730-13776856)
chr2 (13-183)||(25535643-25535813)
chr2 (4-183)||(24090476-24090656)
chr2 (87-186)||(19199767-19199866)
chr2 (13-175)||(22379069-22379232)
chr2 (4-177)||(17198244-17198418)
chr2 (54-306)||(28928923-28929176)
chr2 (4-115)||(12950571-12950683)
chr2 (88-183)||(25530818-25530913)
chr2 (18-131)||(23006763-23006876)
chr2 (10-103)||(25536311-25536404)
chr2 (277-342)||(31804695-31804760)
chr2 (4-70)||(15339758-15339824)
chr2 (59-177)||(17743118-17743236)
chr2 (9-59)||(29028114-29028164)
chr2 (24-322)||(25887437-25887737)
chr2 (67-132)||(25939583-25939648)
chr2 (274-342)||(12952207-12952275)
chr2 (268-348)||(17890174-17890254)
chr2 (274-342)||(27908904-27908972)
chr2 (274-342)||(29719018-29719086)
chr2 (18-114)||(45553599-45553694)
chr2 (10-111)||(25536009-25536110)
chr2 (276-312)||(17635562-17635598)
chr2 (290-342)||(17743278-17743330)
chr2 (268-312)||(21078408-21078452)
chr2 (67-151)||(26291503-26291587)
chr2 (273-321)||(30411933-30411981)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (4-341)||(55107-55442)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (10-339)||(42750-43078)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (33-354)||(7983812-7984122)
chr8 (112-354)||(14528372-14528613)
chr8 (88-334)||(19786985-19787231)
chr8 (4-228)||(25181979-25182203)
chr8 (4-185)||(18448127-18448308)
chr8 (26-189)||(17509567-17509730)
chr8 (10-185)||(24113876-24114051)
chr8 (3-185)||(24110255-24110437)
chr8 (11-185)||(25226467-25226641)
chr8 (21-185)||(24723192-24723357)
chr8 (88-185)||(17101575-17101672)
chr8 (10-140)||(17996935-17997064)
chr8 (210-348)||(24645077-24645216)
chr8 (5-72)||(14528608-14528675)
chr8 (10-183)||(19264412-19264586)
chr8 (83-145)||(24269969-24270031)
chr8 (4-146)||(23892751-23892894)
chr8 (88-185)||(6885359-6885457)
chr8 (10-146)||(34497556-34497694)
chr8 (10-145)||(26831914-26832050)
chr8 (88-146)||(28276396-28276454)
chr8 (18-148)||(30121686-30121815)
chr8 (88-238)||(37528359-37528508)
chr8 (201-342)||(34497359-34497500)
chr8 (274-342)||(13314779-13314847)
chr8 (274-342)||(26394485-26394553)
chr8 (10-77)||(18569335-18569402)
chr8 (271-342)||(25182210-25182281)
chr8 (287-348)||(30121955-30122016)
chr8 (122-181)||(16404284-16404343)
chr8 (273-307)||(14626283-14626317)
chr8 (272-322)||(24723394-24723444)
chr8 (273-322)||(24114068-24114117)
chr8 (273-322)||(25226401-25226450)
chr8 (4-115)||(13314510-13314622)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (4-183)||(812-991)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (4-182)||(76788-76966)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (3-322)||(72293-72613)
[»] scaffold0622 (2 HSPs)
scaffold0622 (206-354)||(959-1107)
scaffold0622 (48-335)||(1223-1511)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (5-185)||(70239-70418)
[»] scaffold1869 (1 HSPs)
scaffold1869 (89-185)||(57-153)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (10-185)||(21643-21819)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (179-322)||(35802-35945)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (88-185)||(103826-103923)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (268-348)||(89636-89716)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (82-215)||(51168-51298)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (89-176)||(163698-163785)
scaffold0019 (89-176)||(181305-181392)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (268-354)||(2599-2685)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (274-342)||(81615-81683)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (3-130)||(26269-26396)
[»] scaffold0263 (2 HSPs)
scaffold0263 (81-147)||(17374-17440)
scaffold0263 (107-185)||(15980-16058)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (48-110)||(27566-27628)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (81-132)||(96424-96475)
[»] scaffold0502 (1 HSPs)
scaffold0502 (212-341)||(394-523)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (277-342)||(11405-11470)
scaffold0134 (10-70)||(11656-11716)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (277-322)||(3779-3824)
[»] scaffold1156 (1 HSPs)
scaffold1156 (4-44)||(69-109)
[»] scaffold0756 (1 HSPs)
scaffold0756 (5-69)||(4545-4609)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 1 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 19092884 - 19092527
Alignment:
Q  1 atggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcatt----gcctttggaaacctaggaacgtcaatttaag 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19092884 atggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatggaaagaccttccggaacattggtcttcattaattgactttggaaacctaggaacgtcaatttaag 19092785  T
Q  97 tttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatca 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19092784 tttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcagtatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggataaacctagatca 19092685  T
Q  197 acaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcactt 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19092684 acaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaacaggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcactt 19092585  T
Q  297 gtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19092584 gtatagtctacttaagttaactaaacgcaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 19092527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 5679782 - 5679437
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5679782 tatgagtgtcctaagattcatagatgggaagaccttcgggaacactggcctttattgcctttggaaacctaggaacgccaatttaagtttatgtttcaat 5679683  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtat 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||||||| || || || |||||||||| | ||| || ||||||||||||||  ||||||||    
T  5679682 tacctttgaattatcaagaccccgcacgtaaggatcaccatgcgatcagtagctgtagttagccattggaggaattgacctagatcaacagggatagtat 5679583  T
Q  210 agaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctac-t 308  Q
    | |||  ||| |||| |||||   ||||||||  |||||||||||  || | ||| |  |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| |    
T  5679582 aaaccacgcatgtaaagatcactgtgcgatcagcaggtgcagcttaacacccgactagcttagaacgtcccaacaacctcattacttgtatagtctactt 5679483  T
Q  309 taagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5679482 taagataactaaacgcgacatgaatgttatttaattccaacaaaat 5679437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 14649432 - 14649140
Alignment:
Q  49 gaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcatt 148  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||     
T  14649432 gaacattggccctcattccctttggaaatcttggaacgccaattcaagtctatgttttaattacctttgaattagcaagaccccgcatataaggatcatc 14649333  T
Q  149 atgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtg 248  Q
     |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  14649332 gtgcgatcagtaggtgcagttagccatcggagggatatacctagatcaaccgagatagtatagaccccacacgtatggatcaccgtgcgatcaacaggtg 14649233  T
Q  249 cagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttattta 341  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  14649232 cagcttgacaactgactaggttagaacgtcccaacgacctcgtcacttgtatagtctagttaagataactaaacgcgactagaatgttattta 14649140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 341
Target Start/End: Original strand, 19929245 - 19929527
Alignment:
Q  59 cttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgag 158  Q
    |||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || | || ||||||  ||| || ||    
T  19929245 cttcattgcctttggaaatcttggaatctcaatttaagtatatgtttcaattacctttgaattagcaagacccgtcatggaaggatcatcgtgcaatcag 19929344  T
Q  159 caggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggca 258  Q
    ||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| |||  |||||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||   |||||||| ||| ||    
T  19929345 caggtgcagttagtcgtcggaggaatagacctagataaaccgagatagtatagaccatgcttgtaaggatcaacgtgcgatcggcaggtgcagtttgaca 19929444  T
Q  259 actgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttattta 341  Q
    || ||| | || ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19929445 accgactaggtcagaacatcccaaaggcctcatcacttgtatagtctacttaagataactaaacgcgacatgaatgttattta 19929527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 22357048 - 22357384
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |  ||||||||  ||||||||  |||||||| || |||||| |||||||| | |||||    
T  22357048 gtgtgctatgagtgtcccaagattcatagatgggccgacctacaagaacattgaccttcattggttttggaaatcttggaacgccaatttaattctatgt 22357147  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaaga 203  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||| | ||| || | |||||||||  ||||||||||||||| ||    |||    
T  22357148 gtcaattacctttgaattacaaagaccccgcacgtaaggatcatcatgcgatcaacag-tggatttagccatcagagggatagacctagaccagtcgaga 22357246  T
Q  204 tagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagt 303  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||| ||| | ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |    
T  22357247 tagtatagaccccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcaacaggtgcagcttgacaaccgactaggttagaatgtctcaacaatctcatcacttgtatatt 22357346  T
Q  304 ctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttattta 341  Q
    ||| ||||| ||||||||| | ||||| || |||||||    
T  22357347 ctatttaagataactaaacgcgacatggattttattta 22357384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 322
Target Start/End: Original strand, 8969248 - 8969565
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtt 104  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  8969248 tgtgctatgagtgtcctaagattcacagatgggaagatcttcaagaaaattggtcttcattgcctttagaaatctaggaacgccaattgaagtctatgtt 8969347  T
Q  105 tcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagat 204  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||   | |||| | ||||||||  ||||||| | ||||||| ||||| |||| |  |||     
T  8969348 tgaattacctttgaattagtaagaccccacacgtaaggatcaccgtacgatcaacaggtgcaactagccattggagggatatacctaaatcatctgagag 8969447  T
Q  205 agtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggc-aactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagt 303  Q
    |||| || ||| |||||||||||||||  || |||||| ||||||| |||| | ||| ||| | ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  8969448 agtaaag-ccccgcacgtaaggatcattgtgtgatcaacaggtgcaacttgacgaaccgactaggttagaacgtcccgacggcctcatcacgtgtatagt 8969546  T
Q  304 ctacttaagttaactaaac 322  Q
    |||||| || |||||||||    
T  8969547 ctacttcagataactaaac 8969565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 306
Target Start/End: Original strand, 22173150 - 22173368
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggataga 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||   ||||| | ||| ||  ||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  22173150 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagacctcgcacgtgtggatcactgtgcaatctgcagacgcaattagccatcgaagggataga 22173249  T
Q  188 cctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtc 287  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| |   |    
T  22173250 cctagatcaaccgagatagtatagaccctgcacgtaaggatcaccgtgcgatcaacatgtgcaacttgacaaccgacaaggttagaacgtcccagcaacc 22173349  T
Q  288 tcatcacttgtatagtcta 306  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22173350 tcatcacttgtatagtcta 22173368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 13909439 - 13909100
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  || |    |||||||||| ||||| | |||| ||||||   |||| ||| |||||||| || |    
T  13909439 ggtgtgctatgagtgtcctaagattcatagattggctgaacaaagggaacattggccttcagtaccttgggaaacactggaatgtcgatttaagtctacg 13909340  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaag 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| | | |||| ||||| |||| ||| | ||||||| ||||| ||||||  ||    
T  13909339 tttcaattacctttgaattaacaagaccccgcacgtaaggatcattatgtggtcagcaagtgcaattagacattggagggatatacctaaatcaacggag 13909240  T
Q  203 atagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatag 302  Q
    | |||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||  ||| ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  13909239 acagtatagaccccacacttaaggatcaccgtgcgatcaacaggtgcaacttgaaaaccgactaggttagaacgtcccaacggccttatcacttgtataa 13909140  T
Q  303 tctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    ||||| |||  ||| ||||||  ||||  |||||||||||    
T  13909139 tctacctaatataaataaacatgacatatatgttatttaa 13909100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7582883 - 7582563
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaa-acctaggaacgtcaatttaagtttat 101  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  || ||   |||||||||  |||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  7582883 ggtgtgctatgagtgtcctaagattcataaatgggttgaactaatggaacattgaccttcattgccttgggaataact-ggaacgccaatttaagtttat 7582785  T
Q  102 gtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta-gatcaacaa 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||      
T  7582784 gtttcaattaactttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcagcaggtgcaattagccatcggagggatagacctataatcaactg 7582685  T
Q  201 agatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttag-aacgtcccaacggtctcatcacttgta 299  Q
     || |||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||   || ||| | ||||| ||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  7582684 ggagagta-agaccccgcacgtaaggatcattgtgcgatcaacatgtgcaacttgatgaccgactaggttagaaacgtccgaacgacctcatctcttgta 7582586  T
Q  300 tagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    |||||||| |||| ||| |||||    
T  7582585 tagtctacctaagataaataaac 7582563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17710267 - 17710086
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||| ||||||   |||| || |||||||||||||||    
T  17710267 gtgtgttatgagtgtcctaagattcatatatgggcagacctaagggaaccttggccttcattgccttgggaaacactggaaagtaaatttaagtttatgt 17710168  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||   |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  17710167 ttcaattacctttgaattagcaagaccccgcacttaaggatcaccgtgcgatcaacaggtgcagttagccatcggagggata 17710086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17276136 - 17275910
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| || ||||||  ||||||||  |||||| |   |||||||| ||||||| |||| ||| | || |||| | |||||||||| |||||    
T  17276136 gtgtgctatgagtgtcttaagatatatagatggtcagacctacaaaaacattggccttcattaccttcggatatcttggaaagccaatttaagtctatgt 17276037  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaaga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||     |||| ||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||  |||    
T  17276036 ttcaattacctttgaattagcaagaccccgcacataaggatcaccgcacgatcagcagatgcagttagccatcagagggacagacatagatcaaccgaga 17275937  T
Q  204 tagtatagaccctgcacgtaaggatca 230  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||    
T  17275936 tagtatagacctcgcacgtaaggatca 17275910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17672561 - 17672224
Alignment:
Q  20 ctaagattcatagatgggaagacc-ttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtt-tatgtttcaattacctttg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||  || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  17672561 ctaagattcatggatgggaaaccccttgaggaacattggccttcattgcctttggaaatttaggaatgccaatataaggtctatgtttcaattacctttg 17672462  T
Q  118 aattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctg 217  Q
    |  | | ||||||||||| |||| ||||| | || ||  ||||||||||   |   || | ||||||| ||| | ||||||  |||||||||| ||||||    
T  17672461 aggtggtaagaccccacatgtaaggatcactgtgtgaccagcaggtgcaaccaaaaattggagggataaaccgaaatcaaccgagatagtatacaccctg 17672362  T
Q  218 cacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaac 317  Q
    ||||||| |||||   ||||||||  |||||||||||| |||  ||  | |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  17672361 cacgtaacgatcactgtgcgatcagcaggtgcagcttgacaatcgattaggttagagcgtcccaacgacctcatcacctgtatagtctatttaagataaa 17672262  T
Q  318 taaacacaacatgaatgttatttaa-atccaataaaat 354  Q
    ||||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  17672261 taaacgcgacatgactgttatttaatatccaacaaaat 17672224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 189
Target Start/End: Original strand, 13692280 - 13692451
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattaccttt 116  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||   ||||| |||| |||||||||| | |||||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13692280 tcctaagattcatagatggtcagacctaagggaaccttggccttcattgccatgggaaacactagaaa-gccaatttaagtttatgtttcaattaccttt 13692378  T
Q  117 gaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacc 189  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||   |||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13692379 gaattagcaagaccccgcacataaggatcaccgtgcgatcagtaggtggagttagccatcggagggatagacc 13692451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15165352 - 15165164
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  || |    ||||| |||| |||||||||||| | |||    |||| | |||||||| ||||||    
T  15165352 ggtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgtgctgaacaaatggaaccttggccttcattgccttggaaaaaactggaatgccaatttaattttatg 15165253  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||| |||||    
T  15165252 tttcaattacctttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatcatcgtgcgatcagcaggtgcagttaaccatctgagggataaaccta 15165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Original strand, 11253305 - 11253471
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatgtttcaattaccttt 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||||    ||| | |||| ||| | |||||| ||||||||||||    
T  11253305 tcctaagattcatatatgggcagacctacaggaaccttggccttcattgccttgggaaacactcgaaagccaatataaagattatgtctcaattaccttt 11253404  T
Q  117 gaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||| ||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  11253405 gaattagcaagatcccgcacgtaaggatcaccatgtgatcaacaggtgcagttagccatcggaggga 11253471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4615285 - 4615121
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||   ||||| |||  |||| ||||||| ||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4615285 tatgagtgtcctaagatttatagatgggcagacctaagggaaccttgaccttccttgccttgggaaacactggaaagccaatttaagtttatgtttcaat 4615186  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcg 177  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||| | | || | |  ||||||||||||||||    
T  4615185 tacctttgaattagc---accccgcacgtaaggatcattgttcaatcaacgagtgcagttagccatcg 4615121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25095022 - 25094936
Alignment:
Q  97 tttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  25095022 tttatattttaattacctttgaattagcaagaccccacacttaaggatcactgtgcgatcagcaggtgcagttagctatcggaggga 25094936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 11933914 - 11933817
Alignment:
Q  91 tttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagac 188  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||   |||||| | || |||||||||||||||| || |||||||    
T  11933914 tttaagttcatgcttcaattacctttgaattaacaagaccccgcacgtaaggatcacggtgcgatcaacaagtgcagttagccatcgcagagatagac 11933817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40228158 - 40228050
Alignment:
Q  205 agtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttag-aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagt 303  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| || || |||||||| |||| | |||||| | ||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  40228158 agtatagaccccacacgtaaggatcatcatgtgaccagtaggtgcaacttgacgactgactaggttagtaacgtcctaacggcctcatcaattgtatagt 40228059  T
Q  304 ctacttaag 312  Q
    |||| ||||    
T  40228058 ctacctaag 40228050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 5956536 - 5956423
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtt 104  Q
    |||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||||||| ||| ||||  |||| |||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  5956536 tgtgttatgagatacctaatattcatatatgggagaacctttaggaacattggccttaattgattttgaaaatttaggaatgtcaatttaagtttatgtt 5956437  T
Q  105 tcaattacctttga 118  Q
    |||||||| |||||    
T  5956436 tcaattacttttga 5956423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17217235 - 17217162
Alignment:
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcg 177  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  17217235 ttcaattacctttgaattagcaggaccccacacgtaaggatcatcgtgtgatcagcaggtgcaattagtcatcg 17217162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17107175 - 17107011
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| ||||| | |||||| |||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| |  | |||| | ||| | |||||||    
T  17107175 ggtgtgctatgaatgtcctaatattcgtagatgggctgacctactggaacattggtcttcattgccttgggaaaacctgaaacgccgattcaggtttatg 17107076  T
Q  103 -tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgca 166  Q
     ||||||||||||| ||    | |||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||    
T  17107075 ttttcaattaccttagagacggtaagaccccgcacgtaaggatcatcgtgcgatcagcaggtgca 17107011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 342
Target Start/End: Original strand, 19636392 - 19636461
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  19636392 aacgtcccaacgacctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaacacgacattactgttatttaa 19636461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Original strand, 25120759 - 25120880
Alignment:
Q  19 cctaagattcatagatgggaagacc-ttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttg 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||| ||||| |||||||||||   || ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25120759 cctaagattcatagatggggaaaccctttagaaacattggccttcagtgcctttggaagtttatgaatgtcaagttaagtctatgtttcaattacctttg 25120858  T
Q  118 aattagcaagaccccacacgta 139  Q
        || |||||||||||||||    
T  25120859 tggaagtaagaccccacacgta 25120880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 17106905 - 17106858
Alignment:
Q  274 acgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaa 321  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17106905 acgtcccaacgggctcatcacttgtatagtctacttaagataaataaa 17106858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 77
Target Start/End: Original strand, 17025896 - 17025969
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac 77  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    |||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  17025896 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggcagacctaagagaaccttggccttcattgccttgggaaac 17025969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17710068 - 17710019
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  17710068 aacgtcccaacggcctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaac 17710019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 17217136 - 17217080
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacat 329  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  17217136 aacgtcccaacgacctcatcacctgtatagtctacctaagataaataaacacaacat 17217080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 17217421 - 17217374
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattgg 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||    
T  17217421 tatgagtttcctaagattcatagatgtgtagacctactggaacattgg 17217374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 348
Target Start/End: Original strand, 19374505 - 19374674
Alignment:
Q  179 agggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggc-aactgacaaagttagaacgt 277  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| |||  || ||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||| |||  | ||| ||  | |||||||| |    
T  19374505 agggatagaccaaaatcaactaagagagtg-aggccccgcacgtaaggatgactgtgcgatcaataggtgcaacttaacgaaccgattaggttagaacat 19374603  T
Q  278 cccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaa 348  Q
    |||||| | ||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||    ||||||||||||||||| |||||    
T  19374604 cccaaccgactcctcacttagatagtctacttaggataactaaatgtgacatgaatgttatttaattccaa 19374674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 146
Target Start/End: Original strand, 20829422 - 20829480
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  20829422 caatttaagttcatgcttaaattacatttgaattaacaaaaccccacatgtaaagatca 20829480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Original strand, 19492496 - 19492545
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  19492496 aacgtcccaactgcctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaac 19492545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Original strand, 17336560 - 17336612
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacatt 55  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||    
T  17336560 ggtgtgttatgagtgtcctaagattcatagatgggtaaacctacaggaacatt 17336612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 25095200 - 25095160
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagacct 44  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25095200 gtgtgttatgagtgtcctaagattcatagatgggaaaacct 25095160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 40165 - 39817
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtt 104  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  40165 tgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggaagaccttcaggaacattgatcttcattgccttcggaaacctaggaacgccaatttaagtttatgtg 40066  T
Q  105 tcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagat 204  Q
    |||||||| ||| |||| |||||||||| ||| ||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| | |   |||    
T  40065 tcaattacatttcaatttgcaagaccccgcacataaggatcatcgtgcgatcagcaggtacagttagccatcgaagggatatacctagataacccgggat 39966  T
Q  205 agtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtc 304  Q
    ||| | ||||| | |||||||||||| | |||| |||  |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  39965 agt-tggaccccgtacgtaaggatcaccgtgcgctcagcaggtgcagcttgacaaccgactaggttagaacgtcccaacgaccacatcacttgtatagtc 39867  T
Q  305 tacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    |||||||| |||||||||  || |||||||| |||||| ||||| |||||    
T  39866 tacttaagataactaaacgtaagatgaatgtaatttaactccaacaaaat 39817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24281855 - 24281506
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtt 104  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  24281855 tgtgttatgagtgtcctaaaattcatagatgggaagaccttcgggaacattggccttcattgtctttggaaacctaggaacaccaatttaagtttatgtt 24281756  T
Q  105 tcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagat 204  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||||| || |||| |||||   || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||    
T  24281755 tcaattgcctttgagttagaaaaaccccgcatgtaaggatcaccgtgggatcagcaggtgcagttagccatcaaagggatagacctagatctaccgagat 24281656  T
Q  205 agtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtc 304  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||   ||||| ||  ||||| |||||| || | ||| | |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  24281655 agtatagaccccgcatgtaaggatcactgtgcgaccagcaggtggagcttgacacccgactaggttagaacgtcccaacagcctcatcacttgcatagtc 24281556  T
Q  305 tacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24281555 tacttaagataactaaacgggacatgaatgttatttaattccaacaaaat 24281506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 25960685 - 25961033
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtt 104  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||| | |||| |||| |||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  25960685 tgtgctatgagtgtcgtaagattcatagatgagaaaaacttcaggaaaatttaccttcattgcctttggaaacgtaggaacgtcaatttaagtctatgta 25960784  T
Q  105 tcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagat 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || | || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| || |||||||||  ||||    
T  25960785 tcaattacctttgaattagtaagaccccgcatgcaaggatcattgtgcgatcagcaggtgcagttagccatcagaaggatatacatagatcaactgagat 25960884  T
Q  205 agtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtc 304  Q
    | |||||||||  ||||||||||||  |||| |||||||||||| | |||| |||||||| |  |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25960885 aatatagaccccacacgtaaggatcgccatgtgatcaataggtgtaacttgacaactgactagattagaa-gtcccaacggcctcaacacttgtatagtc 25960983  T
Q  305 tacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  25960984 tacttaagataacgaaacacgacatgaatgttatttaattccaacaaaat 25961033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Original strand, 18100531 - 18100881
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtt 104  Q
    |||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  18100531 tgtgttataagtgtcctaagatttatagatgggaagaccttcaggaacattgaccttcattgcctttggaaaccttggaacgccgatttatgtttatgtt 18100630  T
Q  105 tcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagat 204  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||| |||||  ||| ||| |||||||||||   ||||    
T  18100631 tcaattaccactgaattaacaagaccccgcacgtaaggatcattgtgcgaccagcatgtgcagttatccatcagaggaataaacctagatcaatcgagat 18100730  T
Q  205 agtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtc 304  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||  ||||||| |||| ||||  |  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18100731 agtatagaccccgcacgtaaggatcaccgtgtgatcagcaggtgcaacttgacaaccaagtaggttagaacgtcccaacggcctcatcacttgtatagtc 18100830  T
Q  305 tacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa-atccaataaaat 354  Q
    |||||||| |||||||||   |||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  18100831 tacttaagataactaaacgtgacatgactgttatttaatatccaacaaaat 18100881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 33191251 - 33190918
Alignment:
Q  11 atgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaatt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33191251 atgagtgtcctaagattcatagatgggaagtccttaaaaagcattggccttcattgcctttggaaacctaggaacgccaatttaagtttatgttttaatt 33191152  T
Q  111 acctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtata 210  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| | ||||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  33191151 acttttgaattagcaagaccctgcacgtaaggatcaccatgcgatcaacaggtgttgttagccatcagagggataaacctagatcaaccgagatagtata 33191052  T
Q  211 gaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctactta 310  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| |  |||||||||||| |||  ||| | |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||  |||||||    
T  33191051 gaccctgcacgtaaggatcactgtgcgattagcaggtgcagcttgacaatcgactaggttaaaacgtcctaacgaactcatcacttgtataacctactta 33190952  T
Q  311 agttaactaaacacaacatgaatgttatttaaat 344  Q
    || ||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  33190951 agataactaaatgcgacatgaatgttattgaaat 33190918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21449662 - 21449343
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttat 101  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||   ||||| || | ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  21449662 ggtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgtgtcgacctaagggaaccttagccttcattgcctttggaaacactag-aacgccaatttaagtttat 21449564  T
Q  102 gtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaa 201  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||   ||| || ||||||||||||||||||| |  |||||| || |||||||||  |    
T  21449563 gtttcatttacctttgaattaacaagacccctcacataaggatcaccgtgcaattagcaggtgcagttagccattggtgggataaacatagatcaaccga 21449464  T
Q  202 gatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtata 301  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||| |||| ||| | |||||||||||||||| | || |||| |||||||    
T  21449463 gatagtatagaccccgcacgtaaggatcaccatgcgaccagcaggtgaagcttgacaaccgactaggttagaacgtcccaaccgccttatcatttgtata 21449364  T
Q  302 gtctacttaagttaactaaac 322  Q
    |||||| |||| ||| |||||    
T  21449363 gtctacctaagataaataaac 21449343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14780132 - 14779798
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||||||  |||||    |||| |||| |||||||||||| ||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  14780132 ggtgtgctatgagtgttctaagattcatagatgggtcgacctatgagaactttggccttcattgccttgggaaacactggaacgccaatttaagtttatg 14780033  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaag 202  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||    ||||| || ||||||| |||||||| | | || || ||||||||||||  ||    
T  14780032 tttcaattacctttgaattaacaagaccccacacgtaagaatcaccgcgcgatcagaaggtgcatttagccattggatggttaaacctagatcaaccgag 14779933  T
Q  203 atagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatag 302  Q
    |||||||||||||   || ||||||||| | ||||||||  |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  14779932 atagtatagaccccatacataaggatcaccgtgcgatcagcaggtgcagcttgacaaccgactaggttagaacgtcccaacggccttatcacttgtatag 14779833  T
Q  303 tctacttaagttaactaaacacaacatgaatgtta 337  Q
    ||||| | || ||| ||||| | ||||| ||||||    
T  14779832 tctacctgagataaataaacgcgacatgtatgtta 14779798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 46 - 306
Target Start/End: Original strand, 25404055 - 25404315
Alignment:
Q  46 ccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagat 144  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||  |||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||    
T  25404055 ccggaaccttggccttcattgccttgggaaaaactag-aatgccaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattaacaagaccccgcacgtagggat 25404153  T
Q  145 cattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaata 244  Q
    ||   |||||| | || |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||   ||||||||| |    
T  25404154 caccgtgcgatcaacatgtgcagttagccatcagagggatagacttagatcaaccaagatcatatagaccccgcacgtaaggatcactgtgcgatcaaca 25404253  T
Q  245 ggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtcta 306  Q
    ||||||||||| ||||  || | |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25404254 ggtgcagcttgacaaccaactaggttaaaacgtcccaacggccttatcacttgtatagtcta 25404315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 20 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24215088 - 24214797
Alignment:
Q  20 ctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaa 119  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |  ||||||||| | |||||||||||||||| || |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24215088 ctaagattcatagatgggtccacctacatgaacattggccatcattgcctttggaaatcttggaaagccaatttaagtctatgtttcaattacctttgaa 24214989  T
Q  120 ttagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgca 219  Q
    || |||||||||| ||||||| |||||| |||           ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  24214988 ttcgcaagacccctcacgtaaggatcatcatg-----------tgcagctagccatcggagggatagacctagatcaaccaagatagtatagaccccaca 24214900  T
Q  220 cgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaacta 319  Q
    |||||||  || | ||| ||||  |||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| || ||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  24214899 cgtaaggcccaccgtgcaatcagcaggtgcagcttgacaaccgactaggttagaacgtctcatcgacctcatcacttcaatagtctacttaagataacta 24214800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 15543551 - 15543737
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||||||| ||||||   ||||   |||||||||||||||    
T  15543551 ggtgtgctataagtgtcctaagattcatagatgggcagacttaatggaaccttggccttcattgccttgggaaactgtggaaatccaatttaagtttatg 15543650  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  15543651 tttcaattacctttgaattagcaagaacccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcagcaggtgcaattagccatcggagggatagacc 15543737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16112320 - 16112178
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccg-gaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16112320 gtgtgctaagagtgtcctaagattcatagatggtaagaccttcagagaacgttggcctttattgcctttggaaacctaggaacaccaatttaagtttatg 16112221  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatc 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16112220 tttcaattaccattgaattagcaagaccccgcacgtaaggatc 16112178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Original strand, 15807542 - 15807875
Alignment:
Q  11 atgagtttcctaagattcatagatgggaagacc-ttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtt-tatgtttcaa 108  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  || ||  | |||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| | |||| ||| || ||||||||||    
T  15807542 atgagtgtcctaagattcacagatgggaaacccctttagaaacattggtcttcatttcctctggaaatttaggaatgccaatataaattctatgtttcaa 15807641  T
Q  109 ttacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagta 208  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||   || ||  || | |||||  ||  ||| | ||||||| ||| | ||||||  ||||| ||    
T  15807642 ttacctttgaggtagtaagaccccacacgtgaggatcaccgtgtgaccagtatgtgcaactaaacattggagggataaaccaaaatcaaccgagatatta 15807741  T
Q  209 tagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctact 308  Q
    ||||||| ||| |||||||||| | || |||||  ||||||| |||| ||||  |  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15807742 tagaccccgcatgtaaggatcaccgtgtgatcagcaggtgcaacttgacaaccaattaggttagaacgtcccaacgacctcatcacttgtatagtctact 15807841  T
Q  309 taagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15807842 taagataactaaacacgacatgaatattatttaa 15807875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 14781405 - 14781579
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    |||| |||| ||||||||||||  |||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  14781405 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggaagacctaagagaaccttggccttcattgccttgagaaacactggaaagtcaatttaagtttatgt 14781504  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcga 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||| |   |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14781505 ttcaattacctttgaattagcaagaccccgcctgtaaggattaccgtgcgatcagcaagtgcagttagccatcga 14781579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16179573 - 16179317
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||   ||||  |||| |||||||||||| | |||    |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16179573 tcctaagattcatagatgggctgaactaatggaatcttggccttcattgccttggaaaaaactggaatgccaatttaagttcatgtttcaattaccttta 16179474  T
Q  118 aattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctg 217  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||| |  |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||| |||| |    
T  16179473 aattaacaagaccccgcacgtaaggatcgtcgtgcgatcagcagatgcagttagccatcagagggatagacctagatcaatcgagatagtatataccccg 16179374  T
Q  218 cacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaa 274  Q
    ||| ||||||||| | || ||||   |||||||||||| |||| ||| | |||||||    
T  16179373 cacataaggatcaccgtgtgatctgcaggtgcagcttgacaaccgactaggttagaa 16179317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 171
Target Start/End: Original strand, 26612595 - 26612762
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||  ||||||||||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  26612595 gtgtgctatgagtgttctgagattcatagatgggcagacctaagggaaccttggctttcattgccttgggaaacaccggaaagtcaatttaagtttatgt 26612694  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttag 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  26612695 ttcaattacctttgaattagcaagaccctgcacgtaaggatcaccatgcgatcagcatgtgcagttag 26612762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 21334301 - 21334482
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||||||| ||||||   ||||   |||||||| |||||||    
T  21334301 gtgtggtatgactgtcctaagattcatagatgggaagacctaagggaaccttggccttcattgccttgggaaacactggaaaaccaatttaaatttatgt 21334400  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||   |||||| | |||||||||||| |||||| |||||||    
T  21334401 ttcaattgcctttgaattagcaagaccccgcacataaggatcacagtgcgatcaacaggtgcagttatccatcggagggata 21334482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22664743 - 22664522
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||   |||||||||| |||||    
T  22664743 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatacgtgggtagacctacatgaacattggccttcattgcctttggaaatcttggaaaaccaatttaagtctatgt 22664644  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaaga 203  Q
    | ||||||| ||||||||||||| || |||||| ||| ||||| | |||||  | || ||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||  |||    
T  22664643 tacaattacttttgaattagcaaaactccacacataaggatcaatgtgcgaccaacatgtgaagttagctatttgagggatagacctagatcaactgaga 22664544  T
Q  204 tagtatagaccctgcacgtaag 225  Q
    ||||||| ||| |||| |||||    
T  22664543 tagtataaaccatgcatgtaag 22664522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28008670 - 28008349
Alignment:
Q  19 cctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttga 118  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| | ||||||||||  ||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28008670 cctaagattcatagatgggttggcctacaggaacattggaattcattgcctt-gaaaatcttggaacatcaatttaagtctatgtttcaattacctttga 28008572  T
Q  119 attagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgc 218  Q
      | | || |||||| || ||| ||||| | || ||| ||||||  || | |  ||| ||||| ||| ||| | |||||   |||||||||||||||  |    
T  28008571 ggtcgtaaaaccccatacataaggatcactgtgtgatcagcaggctcactcaaacattgaagg-ataaaccgaaatcaattgagatagtatagaccccac 28008473  T
Q  219 acgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaact 318  Q
    ||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||   |||| |||||||||| |||||||||| ||| |    
T  28008472 acgtaaggatcactgtgcgatcagcaggtgcagcttgacaaccgattaagttataacgtcccaacaacctcaccacttgtataatctacttaagataaat 28008373  T
Q  319 aaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||| | |||||| ||||||||||    
T  28008372 aaacgcgacatgactgttatttaa 28008349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 210 - 340
Target Start/End: Original strand, 9787601 - 9787731
Alignment:
Q  210 agaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctactt 309  Q
    |||||||| | |||||||| | | ||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  9787601 agaccctgaatgtaaggattaccgtgcgatcaacaggtgcagcttgacaaccgactaggttagaacgtcccaacggccttatcacttgtatagtctactt 9787700  T
Q  310 aagttaactaaacacaacatgaatgttattt 340  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  9787701 aaggtacttaaacacaacatgaatgttattt 9787731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 53 - 342
Target Start/End: Original strand, 12012379 - 12012669
Alignment:
Q  53 attggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatg 151  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||  ||||||   |||| ||| || ||||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||| ||||| | ||    
T  12012379 attggccttcatttcctttggaaatttaggaattgcaatataaagtctatgtttcaattacctttgagggagtaagaccccacatgtaaggatcactgtg 12012478  T
Q  152 cgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcag 251  Q
     ||  || |||||||  |   ||| | |||||||||||||  || ||  ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||  || |||      
T  12012479 tgactagtaggtgcaactcaacattggagggatagacctaagtcgaccgagataatatagacccctcacgtaaggatcatcgtgcgatcagcagatgcga 12012578  T
Q  252 cttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||| |||||||  | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||||||||||||    
T  12012579 cttgacaactgattaggttagcacgtcccaacggcctcatcacttgtatagtctacttaagataaataaacgtgacatgaatgttatttaa 12012669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 210 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 16112197 - 16112053
Alignment:
Q  210 agaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctactt 309  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||| | |||| |||||||| | ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  16112197 agaccccgcacgtaaggatctccgtgcgatcaacaggtgtaacttgacaactgactacgttagaatgtcccaacatcctcatcacttgtatagtctactt 16112098  T
Q  310 aagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16112097 aagataactaaactctacatgactgttatttaaatccaacaaaat 16112053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Original strand, 18528775 - 18528957
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||   ||||| |||| |||| || |||| ||||||   ||||   |||||||||||||||    
T  18528775 ggtgtgctatgagtgtcctaagattcatatatggttagacctaagggaactttggccttcgtttccttgggaaacagtggaaaaccaatttaagtttatg 18528874  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||| || |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  18528875 tttcaattacctttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatcaccgtgcaatcagcaggtgtagttagccatccgagggata 18528957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 21985542 - 21985684
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||  |||||||||||| ||||||   |||| |  |||||||||||||||    
T  21985542 gtgtgctataagtgtcctaagattcatagatgggcagacctaagggaaccttgaccttcattgccttgggaaacactggaaagcgaatttaagtttatgt 21985641  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  21985642 ttcaattacctttgaattagcaagaccccgcaagtaaggatca 21985684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 728017 - 727837
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatg 102  Q
    ||||| |||||||  |||||| |||||||||||| | ||||   ||||| |||  |||||||||||| |||||| | |||| | |||| ||| ||| |||    
T  728017 gtgtgttatgagtgccctaaggttcatagatgggcaaacctaagggaaccttgaccttcattgccttgggaaacattggaaagccaatataaagttcatg 727918  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  727917 tttcaattacctttgaattaacaagaccccgcacgtaaggatcaacgtgcgatcagcaggtgcagttaaccatcaaaggga 727837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Original strand, 18735788 - 18735960
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||   ||||| |||| ||||||||| || ||||||   |||| | |||| ||| |||||||    
T  18735788 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggcataactaagggaaccttggccttcattgcgttgggaaacactggaaagccaatataaagtttatg 18735887  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccat 175  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| | || ||||||||| ||||    
T  18735888 tttcaattatctttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatcatcgtgcgatcaacaagtgcagttatccat 18735960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 191
Target Start/End: Original strand, 15812756 - 15812858
Alignment:
Q  89 aatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagac 188  Q
    |||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||  |||| |||||||||||||||| ||||||| ||    
T  15812756 aatttaagttcatttttcaatcacctttgaattaacaagaccccacacgtaaagatcactgtgtgaccagcatgtgcagttagccatcggagggataaac 15812855  T
Q  189 cta 191  Q
    |||    
T  15812856 cta 15812858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29243019 - 29242835
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||  |||||||||||  |||||   |||  | |||||||| |||||||    
T  29243019 gtgtgatat-agtgtcctaagattcatagatgggtagacctaagggaaccttggctttcattgccttgtgaaacactggatagccaatttaaatttatgt 29242921  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacc 189  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| |||  |||||| || ||  ||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29242920 ttcaattacctttgaattgacgagatcccgtacgtaaggaccaccatgcgattagtaggtgcagttagccatcagagggatagacc 29242835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 16360437 - 16360317
Alignment:
Q  20 ctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaa 119  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  16360437 ctaagattcatagatgggaaaaccttcaaaaacattggtcttcattgcctttgaaaatctaagaacgcgaatttaagtctatatttcaattacttttgaa 16360338  T
Q  120 ttagcaagaccccacacgtaa 140  Q
      |  |||||||| |||||||    
T  16360337 agactaagaccccgcacgtaa 16360317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 271 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 22664523 - 22664439
Alignment:
Q  271 agaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa-atccaataaaat 354  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22664523 agaacgtcccaacggtctcattacttgtatagtctacctaagataactaaacatgacataaatgttatttaatatccaataaaat 22664439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 184
Target Start/End: Original strand, 26648644 - 26648736
Alignment:
Q  92 ttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggat 184  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26648644 ttaagttcacgtttcaattacctttgaattaacaagaccccacgcgtaaagatcactgtgtgaccagcaggtgcagttagccatcggagggat 26648736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Original strand, 15160060 - 15160239
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    ||||||| |||||| ||||||| || || ||||||   ||||| || | ||||||||||||  |||||    ||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  15160060 tatgagtgtcctaacattcatatataggcagacctaagggaaccttagccttcattgccttgagaaacactcgaaagtcaatttaattttatatttcaat 15160159  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacc 189  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||  || ||| | |||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  15160160 tacctttgaattaacaagatcccgcacgtaaggatcatcgtgtgatcaacaggtgaagttagccatcggagagatagacc 15160239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18826114 - 18826023
Alignment:
Q  94 aagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||   ||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  18826114 aagtttatgtttcaattacctttgaattaacaagacctcgcacgtaaggatcaccgtgcaatcaacaggtgcagttagccatcgaagggata 18826023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 175
Target Start/End: Original strand, 25403644 - 25403802
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaa-gtttatgtttcaattacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||  ||||||||||| |||||| |||| || || ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25403644 tcctaagattcatagatgggtagacctgagggaactttggcattcattgccttgggaaacactagaaa-gtaaatataaagtttatgtttcaattacctt 25403742  T
Q  116 tgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccat 175  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||   || ||| |||| ||| ||||||||||    
T  25403743 tgaattagcaagaccctgcacgtaaggatcaccgtgtgatcagcatgtgtagttagccat 25403802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Original strand, 16916486 - 16916657
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||   ||| |  | |||||||||||||| ||||||   |||| | ||||||||||||  ||    
T  16916486 gtgtgatatgaatgtcctaagattcatagatggacagacctaagggatcccttgtcttcattgccttgggaaacactggaaagccaatttaagttt--gt 16916583  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcg 177  Q
     |||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||   |||||| | || ||||||||||||||||    
T  16916584 ctcaattacctttgaattagcaagaccctgcatgtaaggatcaccgtgcgatcaacatgtgcagttagccatcg 16916657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 9787479 - 9787606
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttgg-aaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||| |  ||||| ||  || |||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  9787479 gtgtgttatgagtgtcctaagattcatagttaggctgacctactagaacactgacctgcattgcctttggaaaaccta-gaacgccaatttaagtctatg 9787577  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccc 131  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9787578 tttcaattacctttcaattagcaagaccc 9787606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 23180260 - 23180172
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatc 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||   |||||| || ||||| |||||||||||    
T  23180260 caatttaagtttatgtttcaattaccattgaattaaaaagaccccacacgtaaggatcaccgtgcgatcagtaggtgtagttagccatc 23180172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22623360 - 22623271
Alignment:
Q  94 aagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||| |  |||  ||||||||||||| |||||    
T  22623360 aagtttatgtttcaattacctttgaattataaagaccccgcacgtaaggatcattgtgcgattaataggcccagttagccatcggaggga 22623271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34481506 - 34481379
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttg 117  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| | ||||  ||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||    
T  34481506 tcctaagattcatatatgggaaaacctttaggaacattgggcatcata-cctttggaaatttaggaacgccaacttaagtttatgtttcaattacccgtg 34481408  T
Q  118 aattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    |   || |||||||||||| ||| |||||    
T  34481407 agagagtaagaccccacacataaggatca 34481379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 289 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21847877 - 21847824
Alignment:
Q  289 catcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21847877 catcacttgtatagtctacttaagataactaaacgcgacatgaatgttatttaa 21847824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 24054527 - 24054355
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | | || |   ||||| |||  |||||||||||| ||||||   |||| | |||| ||| |||||||    
T  24054527 gtgtgctatgagtgtcctaagattcattgatgagcatacttaagggaaccttgaccttcattgccttgggaaacactggaaagccaatataaagtttatg 24054428  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatc 176  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || || || ||||   |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24054427 tttcatttatctttgaattagcaagaccccgcatgt-aatatcaccgtgcgatcagcaggtgcagttagccatc 24054355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44795868 - 44795811
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatc 145  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44795868 caatttaagttcatgcttcaattacctttgaattaacaagaccccacacataaagatc 44795811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Original strand, 15572945 - 15572997
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattgg 57  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15572945 tgtgatatgagtatcctaagattcatagatgggaagacctttaggaacattgg 15572997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 3 - 348
Target Start/End: Original strand, 17121020 - 17121363
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagacc-ttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttat 101  Q
    |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||  | |    
T  17121020 ggtgtgctatgagatacctaagattcatagatgggaaaaccatttaggaaaactggccttcattgcctttggaaatttaggaatgtcaagttaag--tct 17121117  T
Q  102 gtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaa 201  Q
    ||||||||||| |||||   || |||||||  || |||| |||||   || ||  || ||||| |  |   ||| | ||||||||| | | |||||| ||    
T  17121118 gtttcaattacatttgatggagtaagaccctgcatgtaaggatcagcgtgtgaccagtaggtgaaacttaacattggagggatagaacaaaatcaactaa 17121217  T
Q  202 gatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggc-aactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtat 300  Q
    || |||| |||||| |||| ||| ||| |||||| |||||  | ||||| |||| | ||| ||| | ||||||| |||||||||  ||||||||||  ||    
T  17121218 gaaagta-agaccccgcacataaagattatcatgtgatcagca-gtgcaacttgacgaaccgactaggttagaatgtcccaacgacctcatcacttagat 17121315  T
Q  301 agtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaa 348  Q
    | |||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  17121316 aatctacttaagataagtaaacgcgacatgaatgttatttaattccaa 17121363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17359475 - 17359407
Alignment:
Q  274 acgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||    
T  17359475 acgtcccaacagcctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaacgcgacatgattgttatttaa 17359407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 157 - 270
Target Start/End: Original strand, 21972061 - 21972173
Alignment:
Q  157 agcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta-gatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||   || |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||    
T  21972061 agcaggtgcagttagccatcgaaaggatagacctataattaac-tggagagta-agaccctgcacgtaaggatcaccctgcgatcagcaggtgcaacttg 21972158  T
Q  256 gcaactgacaaagtt 270  Q
     | |||||| |||||    
T  21972159 acgactgactaagtt 21972173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 263
Target Start/End: Original strand, 32382700 - 32382784
Alignment:
Q  179 agggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactga 263  Q
    ||||||||||||  || |||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||  || ||||||||| |||||||    
T  32382700 agggatagaccttaatgaaccgagatagtatagaccccgcacgtaatgatcaccgtgcgatcagcagatgcagcttgacaactga 32382784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Original strand, 51472768 - 51472875
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttgg-aaacctaggaacgtcaatttaagtttatg-tttca 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| |  ||||||||  ||||||||||||||| |||  | |||| |||||||||||| |||| |||||    
T  51472768 tatgagtgtcctaagattcatagatggtagg-cctacatgaacattgaccttcattgcctttggaaaatattggaatgtcaatttaagtctatgctttca 51472866  T
Q  108 attaccttt 116  Q
    |||||||||    
T  51472867 attaccttt 51472875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 322
Target Start/End: Original strand, 18736031 - 18736081
Alignment:
Q  272 gaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  18736031 gaacatcccaacggcctcatcacttatatagtctacttaagataaataaac 18736081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 16360168 - 16360119
Alignment:
Q  288 tcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgtta 337  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||    
T  16360168 tcattacttgtatagtctacttaagataactaaacatggcatgaatgtta 16360119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 77
Target Start/End: Original strand, 21666401 - 21666474
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac 77  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |   ||||| || | |||||||||||| ||||||    
T  21666401 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggcagacatgagggaaccttcgccttcattgccttgggaaac 21666474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 29242821 - 29242772
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  29242821 aacgtcccaacgacctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaac 29242772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9401819 - 9401771
Alignment:
Q  274 acgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    
T  9401819 acgtcccaacagcctcatcactcgtatagtctacttaagataaataaac 9401771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20106695 - 20106631
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcct 69  Q
    |||| ||||||| || ||||||||||||||||  ||||||   ||||| ||||||||||||||||    
T  20106695 tgtgctatgagtgtcttaagattcatagatggatagacctaagggaaccttggtcttcattgcct 20106631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 21848072 - 21848020
Alignment:
Q  94 aagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    |||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||    
T  21848072 aagtatatgtttcaattacctttgagggagtaagaccccacacgtaaggatca 21848020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Original strand, 3190577 - 3190927
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  3190577 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggaagacattcgggaacattggtcttcaattcctttggcaacctaggaacaccaatctaagttcatgt 3190676  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaaga 203  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||  ||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||    
T  3190677 ttcagctacctttgaattagcaagaccccaaacgtaaggctcatcgtgcaatcagcgggtgcagttagccatcggagggatagacctagataaatcgaga 3190776  T
Q  204 tagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagt 303  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  || ||||| ||| |||| ||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3190777 tagtatagaccccacacgtaaggattatcgtgcgatcagcagatgcagtttgacaaccgaccaggttagaacttcccatcggcctcatcacttgtatagt 3190876  T
Q  304 ctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    ||||||||| ||||||||    |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  3190877 ctacttaagataactaaatgtgacatgactgttatttaaatccaacaaaat 3190927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 3735172 - 3734834
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  3735172 tatgagtgtcctaagattcatagatcggaagaccttcggaaacattggccttcattgcctttgtaaacctaggaactccaatttaagtttatgtttcaat 3735073  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtat 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||  |||||||||    
T  3735072 tacctttgagttagcaagaccctgcacgtaaggatcaccgtgcgatcagcaggtgcagttagctattggagagatagacctagatcaaccgagatagtat 3734973  T
Q  210 agaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctactt 309  Q
    ||  |||||| || |||||||    |||||||||||||||| |||| || | |||   ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3734972 aggtcctgcatgttaggatcagtgcgcgatcaataggtgcaacttgacacccgactgtgttagaacgtctcaacagcctcatcacttgtatagtctactt 3734873  T
Q  310 aagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaa 348  Q
    ||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  3734872 aaaataactaaacatgacatgaatgttatttaattccaa 3734834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9574974 - 9574638
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtt 104  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9574974 tgtgttataagtgtcctaagattcatagatgggaagaccttcgagaacattggccttcattgcctttggaaacctaggaacgacaatttaagtttatgtt 9574875  T
Q  105 tcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagat 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||  || ||| | || ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||  ||||    
T  9574874 tcaactacctttgaattagcaagaccccgcacataaggatcatcgtgtgatcaacatgtgcagttaaccatcggagggacaaacctagatcaaccgagat 9574775  T
Q  205 agtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtc 304  Q
    ||||||||||| ||             | ||||||||| | ||||| ||||||||| ||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  9574774 agtatagaccccgc-------------cgtgcgatcaacatgtgcatcttggcaaccgactatgttagaacgtctcaatggtctcatcactt-tatagtc 9574689  T
Q  305 tacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa-atccaataaaat 354  Q
    |||||||| |||| |||| | |||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  9574688 tacttaagataacaaaacgcgacatgattgttatttaatatccaacaaaat 9574638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 67 - 354
Target Start/End: Original strand, 10586605 - 10586891
Alignment:
Q  67 cctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgca 166  Q
    ||||||||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||  |||||| | || |||||    
T  10586605 cctttggaaatttaggcacaccaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaaaaccccgcatgtaaggatcatcgtgcgatcaacatgtgca 10586704  T
Q  167 gttagccat-cgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgaca 265  Q
    || |||||| |||| |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||     
T  10586705 gtaagccattcgaaaggatagacctagataaaccgagatagtatagcccccgcacgtaaggatcaccatgcgatcaataggtgcaacttgacaaccgact 10586804  T
Q  266 aagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa-atccaataaaat 354  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||  || ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10586805 aagttagaacgtcccaac---ctcatcctttttatagtctacttaagataactaaacgcgacatgaatgttatttaatatccaacaaaat 10586891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 110 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7318751 - 7318506
Alignment:
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaag-atcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagta 208  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||   |||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  7318751 tacctttgaattagcaagtccccgcacgtaagggatcaccgtgcgatcagcaggtgcagttagtcatctgagggatagacctagatcaaccgagatagta 7318652  T
Q  209 tagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctact 308  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||||||  | |||||||||| |||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7318651 tagaccccgcacgtatggatcaccgtgcgatcagcaagtgcagcttgacaaccgactaggttataacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctact 7318552  T
Q  309 taagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7318551 taagataactaaacgcaacatgaatgttatttaattccaacaaaat 7318506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 1586538 - 1586290
Alignment:
Q  12 tgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaatta 111  Q
    ||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1586538 tgagtgtcataatatttatagatgggaagaccttcaagaacattggccttcattgcccttggaaacctaggaacatcaatttaagtctatgtttcaatta 1586439  T
Q  112 cctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatag 211  Q
    |||||| |||| ||| | ||| ||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||| | |||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1586438 cctttggattaacaaaatcccgcacgtaaggatcatcgtgtgatcagcaggtgcagttatctatccgagggatagacctaaatcaacgaagatagtatag 1586339  T
Q  212 accctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaac 260  Q
    |||| ||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||||    
T  1586338 accccgcacgtaaggatcaatgtgtgatcaataggtgcagcttgacaac 1586290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 67 - 322
Target Start/End: Original strand, 17152729 - 17152984
Alignment:
Q  67 cctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgca 166  Q
    ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||   |||||| ||||||||||    
T  17152729 cctttggaaatttaggaacaccaatttaagtttatgtttcaattacatttgaattagttagaccccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcagcaggtgca 17152828  T
Q  167 gttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaa 266  Q
    |||||| |||  ||||||| |||||||| |||  |||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||| ||| |    
T  17152829 gttagctatcagagggataaacctagataaactgagatggtatagaccccgcatgtaaggatcattgtgcgatcaataggtgcagattgacaaccgacta 17152928  T
Q  267 agttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
     ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17152929 ggttagaatgtctcaacggcctcatcacttgtatagtctacttaagataactaaac 17152984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 6014125 - 6013824
Alignment:
Q  52 cattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatg 151  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||| ||||||        
T  6014125 cattggacttcatttcctttggaaatccaggaatgccaatttaagtatatgtttcaattacctttaaattagaaagaccccgcatgtaaggatcatcgca 6014026  T
Q  152 cgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcag 251  Q
     | | | || |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| || ||||     
T  6014025 aggtcaacatgtgcagttaggcatcggagtgatagacctagatcaacca-gatattatagaccttgcacgtaaggatcaccgtgcgatcaacagatgcaa 6013927  T
Q  252 cttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataa 351  Q
    |||   ||| ||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  6013926 cttaaaaaccgactaggttagaacgtcccaacgtcctcatcacttgtatagtctatttatgataactaaacgggacatgaatgttatttaaatccaacaa 6013827  T
Q  352 aat 354  Q
    |||    
T  6013826 aat 6013824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 15870179 - 15869841
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||| | |||||  ||||| | |||| |||   ||| |||||| ||||||| || |||||  |||||||||| |||||    
T  15870179 gtgtgctatgagtgtcctaatattcaaaaatgggccgacctacaggaagatttaccttgattgccattggaaatcttggaactccaatttaagtctatgt 15870080  T
Q  104 tt-caattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaag 202  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||   | |||| |  |||| || |||||||||| |||||||  ||||||||||   ||    
T  15870079 tttcaattacctttgaattagcaagactccgcacgtaaggatcaccgtacgatcaataggtacaattagccatcggagggatattcctagatcaaacgag 15869980  T
Q  203 atagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatag 302  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||| || ||| | |  ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||    
T  15869979 atagtatagacccaacacgtaaggatcaccatgcgatcagcaggtgcatcttgacacctgtctagtttagaacgttccaacgacctcatcacttgcatag 15869880  T
Q  303 tctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttattta 341  Q
    |||||||||| ||||||||||| || | ||| |||||||    
T  15869879 tctacttaagataactaaacacgacgttaattttattta 15869841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 18202733 - 18202952
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |   ||||||| ||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18202733 tatgagtgtcctaagattcatagatgggaaaaccttcgagaacatggacattcattgtctttggaaactaagcaacgccaatttaagtttatgtttcaat 18202832  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtat 209  Q
    ||||||| ||||||||| |  |  ||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  18202833 tacctttaaattagcaaca-tctgcacgtaaggatcactgtgcgatcagcagatgcagttagccattgaaggaatagacctagatcaaccaatatagtat 18202931  T
Q  210 agaccctgcacgtaaggatca 230  Q
    | |||| |||||||| |||||    
T  18202932 aaaccccgcacgtaatgatca 18202952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 16297357 - 16297695
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaattta-agtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | |||| || ||  | ||    
T  16297357 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggaaatcctttaggaacattggccttcattgcctttggaaatttaggaatgccaatatatagcctttg 16297456  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaag 202  Q
    ||||||||| ||||||  ||| |||| ||||||||||| |||||   || ||  |  |||||||  ||  ||| | ||||||||||| | ||||||  ||    
T  16297457 tttcaattaactttgaggtagtaagatcccacacgtaaggatcaccgtgtgacaaataggtgcaactaaacattggagggatagaccgaaatcaaccgag 16297556  T
Q  203 atagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatag 302  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || |  |||||||||||| |||| ||  | ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  16297557 atagtatcgaccc-gcacgtaaggatcaccgtgcaatgagcaggtgcagcttgacaaccgattaggttagaacgtcccaatggcctcgtcacttgtatag 16297655  T
Q  303 tctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||||||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||    
T  16297656 tctacttaaggtaaataaacgcgacatgactgttatttaa 16297695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1588108 - 1587972
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  1588108 tatgagtgtcctaatattcatagatgggaagacctttaggaacactggacttcattgccattggaaaattaggaacgtcaatttaagtttatgttttagt 1588009  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  1588008 tacctttgaattagacagaccccacacgtaaggatca 1587972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17830151 - 17829812
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagac-cttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttat 101  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||  | |||  |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| | |||| ||| || |||    
T  17830151 gtgtgctatgagtgtccaaagattcatatatgggaaacctctttaggaacattgaccttcattgcctttggaaatttaggaatgccaatataaagtctat 17830052  T
Q  102 gtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaa 201  Q
    |||||||||||||||||   || |||| |||||||||| ||||||   || ||  || |||||||  |   ||| | ||||||| |||||| ||||| ||    
T  17830051 gtttcaattacctttgagggagtaagaacccacacgtatagatcaccgtgtgaccagtaggtgcaactcaacattggagggatatacctag-tcaaccaa 17829953  T
Q  202 gatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtata 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||  |||||| |||| |||| ||  | |||||||||| ||||||   ||||||||||||||    
T  17829952 gatagtatagaccctgcacgtaaggatcaccgtgtgatcaactggtgcaacttgacaaccgattaggttagaacgtaccaacgacttcatcacttgtata 17829853  T
Q  302 gtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    ||||||||||  ||| ||||||  |||||||| ||||||||    
T  17829852 gtctacttaacataaataaacatgacatgaattttatttaa 17829812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 322
Target Start/End: Original strand, 8978519 - 8978839
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||| |||||  || ||   ||||||||   ||||||||| || |||||    |||||| |||||||||||||||    
T  8978519 ggtgtgctatgagtgtcataagattcataaatgggttgaactaatggaacattaaccttcattgcgttgggaaaaactggaacgccaatttaagtttatg 8978618  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta-gatcaacaaa 201  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||       
T  8978619 tttcaagtaactttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcagcaggtgcaattagccatcggagggatagacctataatcaactgg 8978718  T
Q  202 gatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttag-aacgtcccaacggtctcatcacttgtat 300  Q
    || ||||  ||||| ||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| | || ||| | ||||| ||||||| ||||  |||||| |||||||    
T  8978719 gagagta-cgaccccgcatgtaaggatcattgtgcgatcaacatgtgcaacttgacgaccgactaggttagaaacgtccgaacgacctcatctcttgtat 8978817  T
Q  301 agtctacttaagttaactaaac 322  Q
    ||||||| |||| ||| |||||    
T  8978818 agtctacctaagataaataaac 8978839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 11803583 - 11803398
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||| ||||||   |||| | |||||||||||||| |    
T  11803583 gtgtgctattagtgtcctaagattcatagatgggcagacctaagggaaccttggccttcattgccttgggaaacactggaaagccaatttaagtttatat 11803484  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacc 189  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||   |||||| |||| ||||| |||||||| | |||||||||||    
T  11803483 ttcaattacctttgaattagaaagaccccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcagcaagtgcaattagccattggagggatagacc 11803398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Original strand, 8313012 - 8313119
Alignment:
Q  13 gagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattac 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8313012 gagtgtcctaagattcatagatgggaagaccttggggatcattagccttcattgcctttgtaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattag 8313111  T
Q  113 ctttgaat 120  Q
    ||||||||    
T  8313112 ctttgaat 8313119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 8053646 - 8053827
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | ||||   ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  8053646 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagataggcaaacctaagggaaccttggccttcattgccttgggaaacactagaaa-gtcaatttaagtttatg 8053744  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||   || ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8053745 tttcaattacctttgaattggtaagaccccgcacgtaaggatcacagtgtgatcagtaggtgcagttacccatcaaagggata 8053827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8877937 - 8877763
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||| ||||||| |||| ||||||   |||| | |||||||||||||||    
T  8877937 ggtgtgctttgagtgtcctaagattcatagatcggaagacctaagggaaccttggccttcatttccttgggaaacactggaaggccaatttaagtttatg 8877838  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcg 177  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||   |||| | | |||||| ||||||||||||    
T  8877837 tttcaattacctttgaattaataagaccccacacgtaaggatcaccgtgcggtcatcaggtgtagttagccatcg 8877763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 322
Target Start/End: Original strand, 39272689 - 39273009
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| ||||||| | ||  ||||||||||||||  |||||   ||||| |||| |||||||||||| |||||    |||||| | | ||   ||||||    
T  39272689 ggtgtgttatgagtgttctgtgattcatagatgggccgacctaatggaactttggccttcattgccttgggaaaaactggaacgccgactttgatttatg 39272788  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta-gatcaacaaa 201  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||  ||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  |||||| |     
T  39272789 tttcaattaccattgaattaacaagaccccgcacgtaaggatcaccatgtgatcaacaggtgcagttagccgtcggagggataaacctataatcaactag 39272888  T
Q  202 gatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttag-aacgtcccaacggtctcatcacttgtat 300  Q
    || ||| ||||||  |||||||||||||| | || |||||  ||||||| |||| | || ||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  39272889 gacagt-tagacctcgcacgtaaggatcaccgtgtgatcagcaggtgcaacttgacgaccgactaggttagaaacgtctcaacggcctcatcacttgtat 39272987  T
Q  301 agtctacttaagttaactaaac 322  Q
    ||||||| |||| ||| |||||    
T  39272988 agtctacctaagataaataaac 39273009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 17190753 - 17190932
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||  |||||||||||| ||||||   |||| |  |||||||||||||||    
T  17190753 gtgtgctatgagtgtcataagattcatagatgggcagacctaagggaaccttgaccttcattgccttgggaaacagtggaaagaaaatttaagtttatgt 17190852  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||   |||||| |  |||||||||||||||||| |||||    
T  17190853 ttcaattacctttgaattagcaagaccctgcacgtagggatcaccgtgcgatcaataggtgcagttagccatcggaggga 17190932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 210 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 4986970 - 4986825
Alignment:
Q  210 agaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctactt 309  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||| || | || |||| |||| ||| | |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  4986970 agaccccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcaacagatacaacttgacaaccgactaggttagaacgttccaacgacctcatcacttatatagtctactt 4986871  T
Q  310 aagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa-atccaataaaat 354  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4986870 aagataactaaacgcgacatgaatgttatttaatatccaacaaaat 4986825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 210 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 4991068 - 4990923
Alignment:
Q  210 agaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctactt 309  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||| || | || |||| |||| ||| | |||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  4991068 agaccccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcaacagatacaacttgacaaccgactaggttagaacgttccaacgacctcatcacttatatagtctactt 4990969  T
Q  310 aagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa-atccaataaaat 354  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4990968 aagataactaaacgcgacatgaatgttatttaatatccaacaaaat 4990923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 177
Target Start/End: Original strand, 13289007 - 13289136
Alignment:
Q  48 ggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcat 147  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13289007 ggaaccttggacttcattgccttgggaaacactggaaagccaatttaagtttatgtttcaattacctttaaattagcaagaccccgcacgtaaggatcat 13289106  T
Q  148 tatgcgatgagcaggtgcagttagccatcg 177  Q
      |||||| | || ||||||||| ||||||    
T  13289107 cgtgcgatcaacatgtgcagttaaccatcg 13289136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 18368563 - 18368744
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||   |||||||||||| |||||    |||| | ||| ||| ||||| ||    
T  18368563 gtgtgctatgagtgtcataagattcatagatgggaagacctaagggaaccttaaccttcattgccttgggaaatactggaaagccaaattaggtttacgt 18368662  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||| |||||| |||||||    
T  18368663 ttcaattacctttgaattagcaagaccctgcacgtaaggatcaccatgcgatcaggaggtgaagttaaccatcggagggata 18368744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 4449510 - 4449379
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaa-gtttatgtttca 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| || | |||| ||| ||||||||||||    
T  4449510 tatgagtgtcctaagattcatagatgggcagacctaagggaaccttggccttcattgccttgggaaacactagaaa-gccaatataaagtttatgtttca 4449412  T
Q  108 attacctttgaattagcaagaccccacacgtaa 140  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4449411 attacctttaaattagcaagaccccacacgtaa 4449379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 22066784 - 22066964
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaat-ttaagtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||| ||||||   |||| | |||| | |||| ||||    
T  22066784 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggcagacctaagggaaccttggccttcattgccttgggaaacactggaaagccaatataaagtctatg 22066883  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||| || ||   |||||||||||||||| |||||    
T  22066884 tctcaattacctttgaattagcaagacgccacacgtaaggatcaccgtgcaatcagtttgtgcagttagccatcggaggga 22066964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 20582771 - 20582602
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| ||| ||   ||||| |||  |||||||||||| | ||||    ||| | ||||||||||||||||    
T  20582771 gtgtgctatgagtatcataagattcatggatgggtagatctaagggaaccttgaccttcattgccttggaaaacacttgaaagacaatttaagtttatgt 20582672  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagcc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||   |||||| |||||||||||||||||    
T  20582671 ttcaattacctttgaattagcaagacccggcatgtaaggatcaccgtgcgatcagcaggtgcagttagcc 20582602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 183
Target Start/End: Original strand, 16058634 - 16058730
Alignment:
Q  87 tcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16058634 tcaatttaagtttatttttcaattacctttgaattagtaagaccccgcacgtaagggtcaccgtgcgatcagcaggtgcagttagccatcggaggga 16058730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Original strand, 13759488 - 13759667
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaa 108  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||  ||||   ||||| |||| ||||| |||||| |||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  13759488 tatgagtgtcctaagattcatatataggataacctaagggaaccttggccttcagtgccttgggaaacactaa-aacgccaatttaagtttatgtttcaa 13759586  T
Q  109 ttacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacc 189  Q
    |||||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  13759587 ttacctttcaattaacaagaccttgcacgtcaagatcactgtgcgatcaacatgtgtagttagccatcagagggatagacc 13759667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17077616 - 17077497
Alignment:
Q  12 tgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaatta 111  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||  |||||||||||| ||||||   |||    ||||||||||||||||||||||||    
T  17077616 tgagtgtcataagattcatagatgggcagacctaagggaaccttgaacttcattgccttgggaaacactggacaaccaatttaagtttatgtttcaatta 17077517  T
Q  112 cctttgaattagcaagaccc 131  Q
    || |||||||||||||||||    
T  17077516 ccgttgaattagcaagaccc 17077497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5107138 - 5106987
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggataga 187  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||   |  ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5107138 caatttaagtccatgcttcaattacctttgaattaacaagaccctacaagtaaagatcaccgtatgaccagcaagtgcagttagccatcggagggataga 5107039  T
Q  188 cctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatca 241  Q
    | |  |||||| | || |||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  5107038 ctttaatcaactaggagagta-agaccc-ggacgtaatgatcatcatgcgatca 5106987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1861459 - 1861292
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatgtttcaattaccttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||   |||||||||||| ||||||    ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  1861459 tcctaagattcatagatgggaagacctaagggaacctttaccttcattgccttcggaaacactcgaaagccaatataaagtttatgtttcaattaccttt 1861360  T
Q  117 gaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    |||| |||||||||||    |||| |||||    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1861359 gaatcagcaagacccc-gttgtaatgatcaccgcgcgatcagcaggtgctgttagccatcggagggata 1861292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 239
Target Start/End: Original strand, 2574281 - 2574431
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggataga 187  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||    ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||      
T  2574281 caatttaagtccatgcttcaattacctttgaattaacaagaccccgcacataaggatcaccgcgcgattagcaggtgctgttagccatcaaagggataag 2574380  T
Q  188 cctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgat 239  Q
    |||| |||||   ||| |||| |||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  2574381 cctaaatcaattgagagagta-agacctcgcacgtaaggatcaccgtgcgat 2574431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 20 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 6006568 - 6006469
Alignment:
Q  20 ctaagattcatagatgggaagacc-ttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttga 118  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||| |||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  6006568 ctaagattcatagatgggaaaaccctttagtaacattggccttcattgcctttggacatttaggaatgccaatttaagtctacgtttcaattacctttga 6006469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13277962 - 13277880
Alignment:
Q  94 aagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatc 176  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   || ||| || ||||||||||| |||||    
T  13277962 aagtttatgtctcaattacctttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatcaccgtgtgatcagtaggtgcagttaaccatc 13277880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19153782 - 19153684
Alignment:
Q  93 taagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta 191  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  ||  ||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19153782 taagttcatgcttcaattacctttgaattaacaagatcacacacgtaaagatcaccatctgaccagcagatgcagttagccatcggatggatagaccta 19153684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20753181 - 20753083
Alignment:
Q  93 taagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta 191  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  ||  ||  ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20753181 taagttcatgcttcaattacctttgaattaacaagatcacacacgtaaagatcaccatctgaccagcagatgcagttagccatcggatggatagaccta 20753083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Original strand, 1847834 - 1847970
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttg-gaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaa 108  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  || ||   ||||| |||| |||||||||||| |  ||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1847834 tatgagtgtcctaatattcatagatgggccgatctaatggaaccttggccttcattgccttggaaaaaacta-gaacgacaatttaattttatgtttcaa 1847932  T
Q  109 ttacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    |||||||| || |||||||||| | ||||||| |||||    
T  1847933 ttacctttaaaatagcaagacctcgcacgtaaggatca 1847970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9131483 - 9131190
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg- 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||  |||||||  |||          |||| |||| ||||| | ||||     
T  9131483 gtgtgctatgagtgtcctaagatttatagatgggtagacctacaggaacattgaccttcattatctt----------ggaaagtcagtttaattctatga 9131394  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaag 202  Q
    ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| |||||   || || |||||| ||||   |  ||| | ||||||| |||||| |||||  ||    
T  9131393 tttcaattacctttgaggtggtaagaccccacacgtaaggatcaccgtgtgacgagcagatgcaaccaaacattggagggataaacctag-tcaactgag 9131295  T
Q  203 atagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttag-aacgtcccaacggtctcatcacttgtata 301  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| | || |||||  ||||| |||||| | |||||| | ||||| ||||||||||  | |||||||||||||||    
T  9131294 atagtatagatcccacacgtaaggatcaccgtgtgatcagcaggtgtagcttgacgactgactaggttagtaacgtcccaatagcctcatcacttgtata 9131195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 1584518 - 1584438
Alignment:
Q  268 gttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaa 348  Q
    ||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  1584518 gttagaaagtcccaacaaccttatcacttgtatagtctacttaagataactaaacgcgatatgaatgttatttaattccaa 1584438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 2564402 - 2564290
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg- 102  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| | |||||  |||  ||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||||     
T  2564402 gtgtgttatgagtgtcctaacattcatagatcggaaaacctacaggaaccatggctttcattgccttaggaaatcttggaaagccaatttaagtttatgc 2564303  T
Q  103 tttcaattacctt 115  Q
    |||||||||||||    
T  2564302 tttcaattacctt 2564290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4987089 - 4986950
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||  | ||| |||||  ||||||| | |||||||| || | ||| | |||   ||| |||||    
T  4987089 gtgtgttatgagtgtcctaagattcgtagatgggccggccaacaggagcattgaccttcattacttttggaaatcttgaaacattaat---agtctatgt 4986993  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4986992 ttcaattacctttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatca 4986950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 4991187 - 4991048
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||  | ||| |||||  ||||||| | |||||||| || | ||| | |||   ||| |||||    
T  4991187 gtgtgttatgagtgtcctaagattcgtagatgggccggccaacaggagcattgaccttcattacttttggaaatcttgaaacattaat---agtctatgt 4991091  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  4991090 ttcaattacctttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatca 4991048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 7397451 - 7397379
Alignment:
Q  276 gtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaa 348  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||    
T  7397451 gtcccaatagtctcaacacttgtatagtctacttaagataactaatcgccacatgaatgttatttaattccaa 7397379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 92 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13418949 - 13418865
Alignment:
Q  92 ttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatc 176  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| ||||    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  13418949 ttaagtttatatttcaattacctttgaattaccaagacctcgcacataaggatctccgtgcgatcagcaggtgaagttagccatc 13418865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2564131 - 2564053
Alignment:
Q  274 acgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa-atccaataa 351  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  2564131 acgtcccaacgaccgcatcacttgtatagtctacctaagataaataaacgcaacatgacagttatttaatatccaataa 2564053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21501770 - 21501736
Alignment:
Q  79 taggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21501770 taggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacc 21501736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 146
Target Start/End: Original strand, 22338945 - 22339069
Alignment:
Q  21 taagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaat 120  Q
    |||||||||||||||| || |||||  |||||| ||| | ||||  ||||||| ||  || ||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||      
T  22338945 taagattcatagatggaaaaacctttaggaacactggccatcata-cctttgggaatttatgaacaccaatttaagtctatgtttcaattacccttgagg 22339043  T
Q  121 tagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
     || |||||||||||||||| |||||    
T  22339044 gagtaagaccccacacgtaaggatca 22339069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 31493483 - 31493383
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagaccttcc-ggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattaccttt 116  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| | ||||  ||||||||||  ||| |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31493483 tcctaagattcatagatgggaaaacctttcaggaacactggccatcata-cctttggaaatttagaaactccaacttaagtctatgtttcaattaccttt 31493385  T
Q  117 ga 118  Q
    ||    
T  31493384 ga 31493383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 4819426 - 4819354
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaa 76  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||| |  |||| |||| |||||||| ||| |||||    
T  4819426 gtgtgatatgattgtcctaagattcatagatgggtagacctacaagaaccttggccttcattgtcttaggaaa 4819354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 18663000 - 18662901
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |  |||  ||||||||||  |||||||||| | |||| | ||||||||||||||| |||    
T  18663000 tcctaagattcatagatgggaaaacctttaggaacactggccaccata-cctttggaaatttaggaacgtctacttaactatatgtttcaattacccttg 18662902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1585035 - 1584981
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaag 142  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1585035 caatttaagtccatgcttccattacctttgaattaacaagaccccacatgtaaag 1584981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 5108864 - 5108810
Alignment:
Q  288 tcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  5108864 tcatcacttgtatagtctatctaagataaataaacacgacatgaattttatttaa 5108810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 4986816 - 4986763
Alignment:
Q  302 gtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa-atccaataaaat 354  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4986816 gtctacttaagataactaaacgcgacatgaatgttatttaatatccaacaaaat 4986763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 4990914 - 4990861
Alignment:
Q  302 gtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa-atccaataaaat 354  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4990914 gtctacttaagataactaaacgcgacatgaatgttatttaatatccaacaaaat 4990861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 303
Target Start/End: Original strand, 8313137 - 8313214
Alignment:
Q  226 gatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagt 303  Q
    ||||| || |||||||| ||| || ||||| |||| ||| |  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  8313137 gatcaccacgcgatcaacaggagccgcttgacaaccgactagattagaatgtcccaacggcctcatcacttgtatagt 8313214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 57
Target Start/End: Original strand, 10586452 - 10586505
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattgg 57  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  10586452 gtgtgctatgagtgtcctaagattcataaatgggaaaacctttaggaacattgg 10586505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 11803384 - 11803335
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  11803384 aacgtcccaatggcctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaac 11803335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 251
Target Start/End: Original strand, 17190875 - 17190916
Alignment:
Q  210 agaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcag 251  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  17190875 agaccctgcacgtagggatcaccgtgcgatcaataggtgcag 17190916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20582572 - 20582523
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  20582572 aacgtcccaacgacctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaac 20582523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 4786382 - 4786310
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaa 76  Q
    ||||| ||||| | || ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||| ||| |||||    
T  4786382 gtgtgctatgattgtcgtaagattcatagatgggtagacctacaggaaccttggccttcattgtcttaggaaa 4786310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 69 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5530591 - 5530547
Alignment:
Q  69 tttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacc 113  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5530591 tttggaaatttaggaacgccaatttaagtttatgttttaattacc 5530547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16366020 - 16365972
Alignment:
Q  274 acgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  16366020 acgtcccaactgcctcatcacttgtatattctacttaagataaataaac 16365972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34488206 - 34487877
Alignment:
Q  13 gagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattac 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  34488206 gagtgtcctaagattcatagatgggaagaccttcaggaacattggccttcattgtctttggaaatctaggaacaccaatttaagtttatgtatcaattac 34488107  T
Q  113 ctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtataga 212  Q
    |||| ||||||||||| | | ||| ||| |||||   |||||| | || ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  34488106 ctttaaattagcaagatcacgcacataaggatcaccgtgcgatcatcaagtgcaattagccatcggagggatagaccaagatcaaccgagatagtataga 34488007  T
Q  213 ccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaag 312  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||| ||  ||||| |||||| |||| ||| |  ||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  34488006 ccccgtacgtaaggatcatcgtgcgaacagcaggtgtagcttgacaaccgactagattagaacgttccaacggccccatcacttgaatagtctacttaag 34487907  T
Q  313 ttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  34487906 ataactaaaagcaacatgaatgttatttaa 34487877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Original strand, 24266506 - 24266818
Alignment:
Q  35 gggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccac 134  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |    
T  24266506 gggaagaccttcaggaacattggcctttattgccttttgaaatctaggaatgtcaatttaagtctatgtttcaattacctttgaggtagtaagaccctgc 24266605  T
Q  135 acgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcat 234  Q
    | |||||||||||  |||||| ||||| ||||  ||  ||||  ||||||||||| | ||||||  ||| |||| || | ||||||||| |||||||| |    
T  24266606 atgtaaagatcatcgtgcgatcagcagatgcaactaaacatcagagggatagaccaaaatcaactgagagagta-aggcactgcacgtagggatcatcgt 24266704  T
Q  235 gcgatcaataggtgcagcttggc-aactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaat 333  Q
    ||||||||||  |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  24266705 gcgatcaataaatgcaacttgacgaactgactaagttagaacgtcccaacggcctcatcacttatatagtctacttaagataactaaacatgacatgaat 24266804  T
Q  334 gttatttaaatcca 347  Q
    || |||||| ||||    
T  24266805 gtcatttaattcca 24266818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 347
Target Start/End: Original strand, 24343137 - 24343449
Alignment:
Q  35 gggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccac 134  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||  |    
T  24343137 gggaagaccttcaggaacattggcctttattgccttttgaaatctaggaatgtcaatttaagtctatgtttcaattacctttgaggtagtaagaccctgc 24343236  T
Q  135 acgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcat 234  Q
    | |||||||||||  |||||| ||||| ||||  ||  ||||  ||||||||||| | ||||||  ||| |||| || | ||||||||| |||||||| |    
T  24343237 atgtaaagatcatcgtgcgatcagcagatgcaactaaacatcagagggatagaccaaaatcaactgagagagta-aggcactgcacgtagggatcatcgt 24343335  T
Q  235 gcgatcaataggtgcagcttggc-aactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaat 333  Q
    ||||||||||  |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  24343336 gcgatcaataaatgcaacttgacgaactgactaagttagaacgtcccaacggcctcatcacttatatagtctacttaagataactaaacatgacatgaat 24343435  T
Q  334 gttatttaaatcca 347  Q
    || |||||| ||||    
T  24343436 gtcatttaattcca 24343449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 312
Target Start/End: Original strand, 24264989 - 24265296
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtt 104  Q
    |||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||    
T  24264989 tgtgctatgagtgtcttaatattcatagatgggaagaccttcgagaacattggccttcattgcctttggaaacataggaatgcaaatttaagtatatgtt 24265088  T
Q  105 tcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagat 204  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||  ||||   | | |  ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||    
T  24265089 tcaattaccattgaattagaaaaaccctgcacgtaagaatcaccgtccaagcagcaggtgcagttagccatcagagggatagacatagatcaactgagat 24265188  T
Q  205 agtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtc 304  Q
    |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||  | |||||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  24265189 agtatagaacccgcacgtaaggatcaccgtgcaatcagcatgtgcaggttgacaaccgactaggttagaacgtccaaacgacctcatcacttgtatagtc 24265288  T
Q  305 tacttaag 312  Q
    ||||||||    
T  24265289 tacttaag 24265296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 312
Target Start/End: Original strand, 24341620 - 24341927
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtt 104  Q
    |||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| ||||||    
T  24341620 tgtgctatgagtgtcttaatattcatagatgggaagaccttcgagaacattggccttcattgcctttggaaacataggaatgcaaatttaagtatatgtt 24341719  T
Q  105 tcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagat 204  Q
    ||||||||| ||||||||| || ||||  |||||||  ||||   | | |  ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||  ||||    
T  24341720 tcaattaccattgaattagaaaaaccctgcacgtaagaatcaccgtccaagcagcaggtgcagttagccatcagagggatagacatagatcaactgagat 24341819  T
Q  205 agtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtc 304  Q
    |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||  | |||||| ||| |||| ||| | |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  24341820 agtatagaacccgcacgtaaggatcaccgtgcaatcagcatgtgcaggttgacaaccgactaggttagaacgtccaaacgacctcatcacttgtatagtc 24341919  T
Q  305 tacttaag 312  Q
    ||||||||    
T  24341920 tacttaag 24341927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 321
Target Start/End: Original strand, 20744234 - 20744503
Alignment:
Q  54 ttggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcg 153  Q
    |||| |||||||||||| |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||||    
T  20744234 ttggccttcattgccttgggaaaaactggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattaacaagaccccacacgtaacgatcaccgtgcg 20744333  T
Q  154 atgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta-gatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagc 252  Q
    || || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||  ||| ||||  | ||| |||| | ||||||||| ||||||||  ||||||| |    
T  20744334 atcagaaggtgtagttagccatcggagggatggacctataatcaactgagagagtaaggcccccgcacatcaggatcatcgtgcgatcagaaggtgcaac 20744433  T
Q  253 ttggcaactgacaaagttagaa-cgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaa 321  Q
    ||| | ||  || | |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  20744434 ttgacgacatactaggttagaagtgtcccaacggcctcatcacttgtataatctacctaagataaataaa 20744503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 212
Target Start/End: Original strand, 18207783 - 18207991
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| || | |||||||||| |||||    
T  18207783 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagacgggaaaaccttcgggaacattggccttcattgcctttggaaatctagaaatgccaatttaagtctatgt 18207882  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaaga 203  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| || |||| ||| |   || ||| |||| | ||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||  |||    
T  18207883 ttcagttacctttgaattcgtaagaccccgcatgtaaggattaccgtgtgatcagcaagagcaattagccattgaatggatatacctaaatcaactgaga 18207982  T
Q  204 tagtataga 212  Q
    |||||||||    
T  18207983 tagtataga 18207991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24140994 - 24140816
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |   |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| | |  ||||||||||||||     
T  24140994 gtgtgttatgagtgtcctaagattcatatatgggcagacttaagggaacattggccttcattgccttgggaaacactagaagc--caatttaagtttatc 24140897  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||   || ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24140896 tttcaattagctttgaattagcaagaccccacacgtaaggatcaccgtgtgatcagcaggtgcagttagccatcggaggga 24140816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Original strand, 19008096 - 19008264
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||| ||||||    ||| | ||||||||||||||||    
T  19008096 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggcagacctaagggaaccttggccttcattgccttgggaaacaccagaaagccaatttaagtttatgt 19008195  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagc 172  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||   | |||| ||||||||||||||||    
T  19008196 ttcaattatctttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatcaccgtccgatcagcaggtgcagttagc 19008264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Original strand, 20549257 - 20549430
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| |||||||| ||| |||||| |||| ||   |||||||||||||||    
T  20549257 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggaagacctaagggaaccttggccttcattgtcttgggaaacactagaaatc-caatttaagtttatg 20549355  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcg 177  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |  | ||||||||||||||||    
T  20549356 tttcgattacccttgaattagcaagaccccacacgtaaggatcactgtgcgatcaataagtgcagttagccatcg 20549430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 24659566 - 24659747
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||   ||||| |||  |||||||||||| |||||| |||| || | ||||||||| |||||    
T  24659566 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggcacacctaagggaaccttgtccttcattgccttgggaaacactagaaa-gacaatttaagcttatg 24659664  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||   |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24659665 tttcaattacctttgaattaacaagaccccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcatcaggtgcagttagccatcggagggata 24659747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 34129152 - 34128966
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaattt-aagtttatg 102  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||| ||||||   |||| | |||| | |||||||||    
T  34129152 gtgtgctataagtgtcctaagattcatagatgggcagacctaagggaaccttggccttcattgccttgggaaacactggaaagccaatatgaagtttatg 34129053  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||   |||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  34129052 tttcaattacctttgaattagcaagaccccgcacataaggatcaccgtgcgaccagcaagtgcagttagccatcggagggatagacc 34128966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17432394 - 17432214
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttgg-aaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    |||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||||   |||||  ||| |||||||||||| || ||| |||| || |||||||||||||||||     
T  17432394 tgtgctatgagtgtcgtaaaattcatagatgggaagacctaatggaaccatggccttcattgccttggggaaaactagaaa-gtcaatttaagtttatgc 17432296  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||  |||||| | | ||||||||||||||||  |||||||    
T  17432295 ttcaattacctttgaattagcaagaccccgcacgtatggatcatcgtgcgatcaactggtgcagttagccatcagagggata 17432214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22755931 - 22755766
Alignment:
Q  177 gaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacg 276  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||| ||| ||||||||| |||||||  | |||| ||||    
T  22755931 gaagggataaacctaaatcgactgagatagtatagaccccacacgtaaggatcaccgtgcaatcagtagatgcagcttgacaactgattaggttaaaacg 22755832  T
Q  277 tcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  22755831 ttccaacgacctcatcacttgtatagtctacttaagataaataaacatgacatgaatgttatttaa 22755766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 20563669 - 20563856
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||   ||||   |||||||||| |||||||||||| ||||||   |||| | |||||||||| |||||    
T  20563669 gtgtgctatgactgtcctaagattcaaagatgggcgaacctaagggaacattggccttcattgccttgggaaacactggaaagccaatttaagtctatgt 20563768  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta 191  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||   | |||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20563769 ttaaattacctttgaattaggaaaaccccacacgtaaggatcaccgtacgatcaacaggtgcagttagccatcggagggaaagaccta 20563856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Original strand, 15375480 - 15375658
Alignment:
Q  11 atgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||| ||||| || |||  ||||| |||| || | |||||||||||||| ||| |||    
T  15375480 atgagtttcctaagattcatagataggaagacctaagggatcattggccttcaatgtcttgtgaaacactagaaa-gccaatttaagtttatttttaaat 15375578  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacc 189  Q
    |||| ||||  |||||||||||| ||||||| |||||   |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15375579 taccattgatatagcaagaccccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcatcaggtgcagttagccatcggagggatagacc 15375658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 140
Target Start/End: Original strand, 24243553 - 24243688
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtt 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||   ||||| |||| |||| ||||||| ||||||   |||| | |||||||||||||| ||    
T  24243553 tgtgctatgagtttcctaagattcatagatgggtcggcctaagggaaccttggacttccttgccttgggaaacactggaatgccaatttaagtttatatt 24243652  T
Q  105 tcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24243653 tcaattacctttgaattagcaagaccccgcacgtaa 24243688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Original strand, 16523113 - 16523293
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||   ||||| |||| |||||||||||| |||||    |||| | |||||||||| |||||    
T  16523113 gtgtgttatgagtgtcctaagattcatagataggcagacctaagggaaccttggccttcattgccttgggaaatactggaaagccaatttaagtctatgt 16523212  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaa---gaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagg 181  Q
    | |||||||||||||||||||||   |||||| || |||| ||| |   |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16523213 tacaattacctttgaattagcaattagaccccgcatgtaaggataaccgtgcgatcagcaggtgcagttagccatcaaagg 16523293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 175
Target Start/End: Original strand, 17314700 - 17314821
Alignment:
Q  54 ttggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcg 153  Q
    |||| |||||||||||| ||||||   |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||  ||||    
T  17314700 ttggccttcattgccttgggaaacaccggaaagccaatttaagtttatgtctcaattacctttgaattaacaagaccccgcatgtaaggatcatcgtgcg 17314799  T
Q  154 atgagcaggtgcagttagccat 175  Q
    || ||||||||||| |||||||    
T  17314800 atcagcaggtgcagctagccat 17314821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18938241 - 18938083
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggataga 187  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||| || ||  || ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  18938241 caatttaagttcatgcttcaattacctttgaattaacaagaccttacacgtaaagaccattgtgtgaccagtaggtgcagttagccatcaaagggat-ga 18938143  T
Q  188 cc-tagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggt 247  Q
    || || ||||||  ||| |||| |||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  18938142 ccttaaatcaactgagagagta-agaccccgcacgtaaggatcattgtgcgatcagtaggt 18938083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 23336127 - 23335984
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg- 102  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||| ||||||| |||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||     
T  23336127 gtgtgatattagtgtcctaagattcatagatggccagacctactggaacattggccttcatt-ccttgggaaaacctggaacgccaatttaagtttatgc 23336029  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcat 147  Q
    ||||||||||||| |||  | |||||| |||||||||| ||||||    
T  23336028 tttcaattaccttagaaacaacaagacgccacacgtaaggatcat 23335984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 36175697 - 36175606
Alignment:
Q  19 cctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaatta 111  Q
    |||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36175697 cctaagattcatagatggaaa-actttcaggaacattggccttcattgtctttgaaaatctagaaacgtcaatttaagtctatgtttcaatta 36175606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 20859150 - 20859066
Alignment:
Q  87 tcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttag 171  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||   |||||| || ||||||||||||    
T  20859150 tcaattaaagtttatgtttcaattacctttgaattagtaagaccagacacgtaaggatcaccgtgcgatcagtaggtgcagttag 20859066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 17470805 - 17470932
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttg 117  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |  || | ||||||||||  || ||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  17470805 tcctaagattcatagatgggaaaacctttaggaacattggccacca-tacctttggaaatttaagaatgccaacttaagtttatgtttcaattacccttg 17470903  T
Q  118 aattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    |   ||||| |||||||| |||| |||||    
T  17470904 agggagcaaaaccccacatgtaaggatca 17470932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 270 - 354
Target Start/End: Original strand, 18208034 - 18208118
Alignment:
Q  270 tagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18208034 tagaacgtcccaacgaccttatcacttgtatagtcaacttaggctaaataaacgcgacatgaatgttatttaattccaacaaaat 18208118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 28665317 - 28665195
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatgtttcaa 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||| |||||| || ||| | ||||   |||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  28665317 tatgagtgtcataagattcatagatgggcagacctaagggaaccttgatcttcaatgtcttggaaaacactggaaagccaatataaagtttatgtttcaa 28665218  T
Q  109 ttacctttgaattagcaagaccc 131  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  28665217 taacctttgaattagcaagaccc 28665195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 17635844 - 17635717
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttg 117  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||  |||| | ||  |||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||    
T  17635844 tcctaagattcatagatggtaaaacctttaggaacaccggtcattata-ccttcggaaatttaggaacgtcaacttaagtttatgtttcaattatccctg 17635746  T
Q  118 aattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    |  ||  |||||||||||||||| |||||    
T  17635745 aggtattaagaccccacacgtaaggatca 17635717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22871185 - 22871106
Alignment:
Q  67 cctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    ||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||   || |||||||||||||||| |||||    
T  22871185 cctttggaaatttaggaacgccaacttaagtttatgtttcaattacccctgagggagtaagaccccacacgtaaggatca 22871106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 70
Target Start/End: Original strand, 20315036 - 20315102
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctt 70  Q
    ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  20315036 gtgtgttatgagtgtcctaggattcatagatgggcagacctaagggaacattggccttcattgcctt 20315102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 312
Target Start/End: Original strand, 25401853 - 25402160
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  || | |||| |||||||||||| | |||  | ||||   |||| ||| || ||||    
T  25401853 gtgtgttatgagtgtcctaagattcatagatgggtagacctacatgatccttggccttcattgccttggtaaatattggaaatccaatataatgtctatg 25401952  T
Q  103 -tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaa 201  Q
     ||||||||||||||||  | | |||||||||||||||| |||||   |   |  ||||||||||   |  ||| | ||||||| |||||| ||||| ||    
T  25401953 ctttcaattacctttgaggtggtaagaccccacacgtaaggatcaccgtttaactagcaggtgcaaccaaacattggagggatatacctag-tcaactaa 25402051  T
Q  202 gatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttag-aacgtcccaacggtctcatcacttgtat 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| | |   ||||  |||||||| |||   |  ||| | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  25402052 gatagtatagaccccacacgtaaggatcaccgt---atcagcaggtgcagattgatgatcgactaggttagtaacgtcccaacgacctcatcacttgtat 25402148  T
Q  301 agtctacttaag 312  Q
    ||||||| ||||    
T  25402149 agtctacctaag 25402160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34128952 - 34128896
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacat 329  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||    
T  34128952 aacgtcccaacgacctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaacacgacat 34128896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 322
Target Start/End: Original strand, 23388644 - 23388689
Alignment:
Q  277 tcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  23388644 tcccaacggcctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaac 23388689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Original strand, 24659765 - 24659814
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  24659765 aacgtcccaacgacctcatcacttgtatagtctacataagataaataaac 24659814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 41)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 22568415 - 22568071
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  22568415 tatgagtttcataagattcatagatgggaagaccttcaagaatattggccttcatttcctttggaaacctaggaataccaatttaagtttatgtttcaat 22568316  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacc--tagatcaacaaagatagt 207  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||  |||||| | || |||||||| ||||||| || ||||||||  ||||||||   |||||||    
T  22568315 tacctttgaattataaaga-cccacacgtaaggatcatcgtgcgatcaacatgtgcagttggccatcggagagatagacctatagatcaattgagatagt 22568217  T
Q  208 atagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctac 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |  | ||||| |||  || | ||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  22568216 atagaacctgcacgtaaggatcaccatacgattagcatgtgcaactttacacccgactaggttagaacatcccaacgacctcatcacttgtatattctac 22568117  T
Q  308 ttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaa 353  Q
    ||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22568116 ttaagataactaaatgcaacataaatgttatttaaatccaacaaaa 22568071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15466947 - 15466603
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| | ||||||||| || ||| |||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||    
T  15466947 gtgtgctatgagtgttctaagattcgtatatgagaagaccttcaggaacattgaccttcatttcctttggaaatctaggaacaccaatttaagtcaatgt 15466848  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaaga 203  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    |||||| |||||||||| |||| |||| |||||||| || || ||||||  |||    
T  15466847 ttcaattacatttgaattaccaagaccccgcacgtaaggatcgccgtgcgatcagcaggtgcatttagacatcaaagggatatacttaaatcaaccgaga 15466748  T
Q  204 tagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagt 303  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||| ||  | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15466747 tagtatagaccctacacgtaaggatcatcatgcgatcagtatgtgcatcttaacaaccgagtaggttaggacgtcccaacggcctcatcatttgtatagt 15466648  T
Q  304 ctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaa 348  Q
    ||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||| |||||    
T  15466647 ctacttaagataactaaacgtgacataaatgttatttaattccaa 15466603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 354
Target Start/End: Original strand, 21688368 - 21688717
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||| |||||    
T  21688368 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagttggaaagaccttcaggaacattggccttcatttcctttggcaatataggaacgataatttaagtctatgt 21688467  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaaga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||   |||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  21688468 ttcaattacctttgaattagcaagacgatgcacgtaagcatcaccgtgcgatcagcaggtccagctagccatcggagggatagacctagatcaaccgaga 21688567  T
Q  204 tagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagt 303  Q
    ||||||| ||||  ||| ||||| ||| | ||||||||| |||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  21688568 tagtatataccccacacataagggtcaccgtgcgatcaacaggtgcagcttgacaaccgacttggttagaacgtcccaatagacttatcacttgtatagt 21688667  T
Q  304 ctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    ||||||||| | ||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  21688668 ctacttaagatgactaaacgcgacatgaat-ttatttaattccaacaaaat 21688717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19245151 - 19244820
Alignment:
Q  11 atgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaatt 110  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||  ||||| ||| ||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19245151 atgagtgtcctaagatttatagatgggaggatcttcgtgaacactggccttcattacctttgaaagcctaggaacgccaatttaagtttatgtttcaatt 19245052  T
Q  111 acctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtata 210  Q
    ||| ||||||| | |||||||| ||| ||| ||||||  |||||| | || |||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  19245051 acccttgaattggtaagaccccgcacataaggatcatcgtgcgatcaacatgtgcagttagtcatcagagggatatacctagatcaaccaagttagtata 19244952  T
Q  211 gaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctactta 310  Q
    ||||| ||||||| |||||| | ||||||||  |||||||||||| | || ||| | |||||||||||| ||| | ||||||||||||||| || |||||    
T  19244951 gaccccgcacgtagggatcaccgtgcgatcagcaggtgcagcttgacgaccgactaggttagaacgtcctaacagcctcatcacttgtatactcaactta 19244852  T
Q  311 agttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    || ||||||||||  || ||||||||||||||    
T  19244851 agataactaaacatgacgtgaatgttatttaa 19244820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 6630207 - 6630544
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||| ||| ||||| |||||||||||| |  ||||| |  ||||||||  ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  6630207 gtgtgctattagtatcctatgattcatagatgagctgacctacaagaacattgtccttcattgcctttgggaatcttggaacgtcaatttaagtttatgt 6630306  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaaga 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||   | ||||| |||| |||||||  |||    
T  6630307 ttcaattacctttaaattagcaagactccgcacataaggatcattgtgcgatcagcaggtgcaattagccattagaaggatatacctggatcaaccgaga 6630406  T
Q  204 tagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagt 303  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||| ||  | ||||||| ||| |||||  | |||||||||||||||    
T  6630407 tagtataaacctttcacgtaaggatcatcgtgcgatcagctggtgcagcttgacaaccgagtaggttagaatgtctcaacgtacccatcacttgtatagt 6630506  T
Q  304 ctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttattta 341  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||    
T  6630507 ctacttaagataacaaaacgcgacatgaatgttattta 6630544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11177516 - 11177214
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| | |||||||  ||||| | | |||||||| |||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||| |||||    
T  11177516 gtgtgttatgagtgtcctaagattaacagatgggctgacctactgcaacattggccttcattgcctttggaaaacctggaatgccaatttaagtatatgt 11177417  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaaga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||   || |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||  |||    
T  11177416 ttcaattacctttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatcactgtgcgatcgtcaagtgcagttagccatcagagggataaacctaaatcaaccgaga 11177317  T
Q  204 tagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagt 303  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||   |||||| |  ||||||| |||| |||| ||  | | ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  11177316 tagtatagaccccacacgtaaggatcactgtgcgataagcaggtgcaacttgacaaccgattaggctagaatgtcccaacaatctcatcacttgtatagt 11177217  T
Q  304 cta 306  Q
    |||    
T  11177216 cta 11177214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 65 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21907957 - 21907679
Alignment:
Q  65 tgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtg 164  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| |||||   |||||| | || |||    
T  21907957 tgccattggaaaactaggaacgtcaatttaagtctatgtttcaattacttttgaattagtaagaccctgcacgtaaggatcaccgtgcgatcatcatgtg 21907858  T
Q  165 cagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtataga-ccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactga 263  Q
    || |||||||||| | |||||||||||||||||   ||||||||| || ||| |||| |||||||||   ||  ||||  |||||||||||| |||| ||    
T  21907857 cacttagccatcggatggatagacctagatcaatcgagatagtattgacccccgcacataaggatcactgtgtcatcagcaggtgcagcttgacaaccga 21907758  T
Q  264 caaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    | | |||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21907757 ctaggttagaacgtaccaacaacctcatcacttgtatagtctacttaagataactaaacacgacatgaatgttatttaa 21907679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 121 - 342
Target Start/End: Original strand, 28933292 - 28933513
Alignment:
Q  121 tagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcac 220  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||   |||||| | || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||  |||    
T  28933292 tagcaagaccccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcaacaagtgcagttagccatcggagggataaacctagatcaatcgagatagtatagaccccacac 28933391  T
Q  221 gtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaa 320  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||| || | ||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  28933392 gtaaggatcaccgtgcgatcaacaggtgcagcttgacacccgactaggttagaacatcccaacgacctcatcacttgtatagtctacttaatataactaa 28933491  T
Q  321 acacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |    |||||||||||||||||    
T  28933492 atgtgacatgaatgttatttaa 28933513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 189
Target Start/End: Original strand, 27124089 - 27124268
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |   ||||| |||| |||| ||||||| ||||||   | || ||||| ||||||||||||||||||    
T  27124089 tatgagtgtcctaagattcattgatgggaagacttaagggaaccttggccttcgttgccttgggaaacactgaaaagtcaacttaagtttatgtttcaat 27124188  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacc 189  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  27124189 tacctttgaattagcaagaccctgcacgtaaagatcaccgtgcgatcagcaggtgcagttagccatcaaagagatagacc 27124268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8241696 - 8241504
Alignment:
Q  161 ggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaac 260  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||  |||    
T  8241696 ggtgcagttagccattggagggatatacctagatcaaccgagatagtatagaccttgcacgtaaggatca-ctagcgatcagcaggtgaagcttgaaaac 8241598  T
Q  261 tgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    |||  | |||||||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  8241597 tgaataggttagaacatcgcaacgccctcatcacttgtattgtctacttaagataaataaacgcgacatgaatgttatttaattccaacaaaat 8241504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8245492 - 8245372
Alignment:
Q  20 ctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaa 119  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8245492 ctaagattcatggatgggaagaccttcagaaacattggtcttcattgccttcagaaacctaggaacaccaatttaagtctatgtttcaattacttttgaa 8245393  T
Q  120 ttagcaagaccccacacgtaa 140  Q
    | ||||||||||| |||||||    
T  8245392 taagcaagaccccgcacgtaa 8245372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 172
Target Start/End: Original strand, 20005456 - 20005624
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaa-gtttatg 102  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||  ||| |||||||||||| |||||| |||| || |||||| ||| |||||||    
T  20005456 tgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggaagacctaagggaaccatggccttcattgccttgggaaacactagaaa-gtcaatataaagtttatg 20005554  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagc 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| || | ||||||||||||||    
T  20005555 tttcaattacctttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatcatcgtgcaatcaacaggtgcagttagc 20005624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 14072610 - 14072360
Alignment:
Q  63 attgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcagg 162  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||   || ||| ||||||    
T  14072610 attgcctttggaaaacttggaacaccaatttaagtttatatttcaattacctttgaattaaaaagaccccgcacgtaaggatcaccgtgtgattagcagg 14072511  T
Q  163 tgcagttagccatcgaagggatagaccta-gatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaact 261  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  || |||   || | || ||||||  ||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||| | ||     
T  14072510 tgcagttagccgtcggagggatagacctataatgaactgggagaata-agaccccacacgtattgatcattgtgcgatcagcaggtgcaacttgacgacc 14072412  T
Q  262 gacaaagttag-aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaag 312  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14072411 gactaggttagaaacgtcccaacgggctcatcacttgtatagtctacctaag 14072360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 172
Target Start/End: Original strand, 22412596 - 22412768
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctag---gaacgtcaatttaagttt 99  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| ||||||||| || |||||| ||||   ||| | ||||||||||||    
T  22412596 gtgtgttatgagtgtcataagattcatagatgggaagacctaagggaaccttggacttcattgcattgggaaacactagctagaaagccaatttaagttt 22412695  T
Q  100 atgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagc 172  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||   | |||| ||||||||||||||||    
T  22412696 atatttcaattacctttgaattagcaagaccctgcacgtaaggatcaccgtccgatcagcaggtgcagttagc 22412768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 4340318 - 4339978
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagacc-ttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttat 101  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||   ||||||||  |||||||| |||||||||  |||||| | |||| ||| || |||    
T  4340318 gtgtgttatgagtgtcctaagattcattgatgggaaacccctttaagaacattgaccttcattgtctttggaaatttaggaatgccaatataaagtctat 4340219  T
Q  102 gtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaa 201  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||||||| |  |||||  ||||   || ||  ||||||||||   |  ||| | ||||||||||| | ||||||  |    
T  4340218 gtttcaattacctttgaggtagtaagaccctatgcgtaagaatcaccgtgtgaccagcaggtgcaaccaaacattggagggatagaccgaaatcaaccga 4340119  T
Q  202 gatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtata 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| ||||| || ||||||||| || ||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4340118 gatagtatagaccccgcacgtaagaatcattgtgcaatcaacagatgcagcttgacagctgattagattagaacgtcccaacggcctcatcacttatata 4340019  T
Q  302 gtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    ||||| ||||| ||| ||||    |||||| ||||||||||    
T  4340018 gtctatttaagataaataaatgtgacatgactgttatttaa 4339978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Original strand, 22813280 - 22813468
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||| |||| ||||||   |||| | ||||  || ||||| |    
T  22813280 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggtagatctaagggaacattggtcttcatttccttgggaaacactggaaagccaatacaaagtttacg 22813379  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||   |||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  22813380 tttcaattacctttgaattaacaagaccccgcaggtaaggatcaccgtgcgatcagcaggtgcagttggccattggagggataaaccta 22813468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 307
Target Start/End: Original strand, 20144618 - 20144923
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  ||  |   ||||| |||  |||||||||||| |||||   | ||| | |||||||| ||||||    
T  20144618 ggtgtgctatgagttacctaagatttatagatgggctgaaataatggaaccttgtccttcattgccttcggaaaaacaagaatgccaatttaattttatg 20144717  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta-gatcaacaaa 201  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||   ||| || ||| ||| || |||||||||| || ||||||||||  ||||||       
T  20144718 tttcaattacctttgaaataacaagaccccgcacgtaaggatcaccgtgccatcagccggtccaattagccatcggagcgatagacctataatcaactgg 20144817  T
Q  202 gatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttag-aacgtcccaacggtctcatcacttgtat 300  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||| || |||||||  |||| || |||| | || ||| | ||||| ||||||||||||  |||||||||||||     
T  20144818 gataata-agaccccgcacgtaaggatcaccaagcgatcagaaggttcaacttgacgaccgactaggttagaaacgtcccaacgacctcatcacttgtac 20144916  T
Q  301 agtctac 307  Q
    |||||||    
T  20144917 agtctac 20144923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 22188221 - 22187916
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  ||  |   ||||| |||  |||||||||||| |||||   | ||| | |||||||| ||||||    
T  22188221 ggtgtgctatgagttacctaagatttatagatgggctgaaataatggaaccttgtccttcattgccttcggaaaaacaagaatgccaatttaattttatg 22188122  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta-gatcaacaaa 201  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||   ||| || ||| ||| || |||||||||| || ||||||||||  ||||||       
T  22188121 tttcaattacctttgaaataacaagaccccgcacgtaaggatcaccgtgccatcagccggtccaattagccatcggagcgatagacctataatcaactgg 22188022  T
Q  202 gatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttag-aacgtcccaacggtctcatcacttgtat 300  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||| || |||||||  |||| || |||| | || ||| | ||||| ||||||||||||  |||||||||||||     
T  22188021 gataata-agaccccgcacgtaaggatcaccaagcgatcagaaggttcaacttgacgaccgactaggttagaaacgtcccaacgacctcatcacttgtac 22187923  T
Q  301 agtctac 307  Q
    |||||||    
T  22187922 agtctac 22187916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1635546 - 1635207
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg- 102  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||| | |||||||||| | ||     
T  1635546 gtgtgatacgagtgtcctaagattcatagatgggtagacctacaggaaccttggccttcattgccttgggaaatcttggaaagccaatttaagtatttgc 1635447  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaag 202  Q
    ||||||||||||||||    | || |||| ||| |||| |||||   || ||| |||||||||| | || | | | |||||||||||||| |||||  ||    
T  1635446 tttcaattacctttgagacggtaataccctacatgtaaggatcaccgtgtgatcagcaggtgcaatcagacttaggagggatagacctag-tcaactgag 1635348  T
Q  203 atagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttag-aacgtcccaacggtctcatcacttgtata 301  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||||| |||| |||||  | ||||| |||| | || | | | ||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||    
T  1635347 atagtatagacctcacacgtaaagatcaccatgtgatcagcaagtgcaacttgacgaccggctaggttagaaacgtctcaacgacctcatcacttttata 1635248  T
Q  302 gtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||| |||  ||  ||||||| |||||| || |||||||    
T  1635247 gtctacctaaaatagataaacacgacatgactgctatttaa 1635207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 23008946 - 23009125
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    ||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  23008946 gtgtgctattagtgtcctatgattcataggtgggcagacctaagggaaccttggccttcattgccttgggaaacactagaaa-gccaatttaagtttatg 23009044  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||   || ||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23009045 tttcaattacctttgaattagcgagaccttgcacgtaaggatcaccgtgagatcagcagctgcagttagccatcggaggga 23009125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23779418 - 23779239
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    ||||| ||| ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| || | |||||||||||||||    
T  23779418 gtgtgctattagtgtcctatgattcataggtgggcagacctaagggaaccttggccttcattgccttgggaaacactagaaa-gccaatttaagtttatg 23779320  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| |||||   || ||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23779319 tttcaattacctttgaattagcgagaccttgcacgtaaggatcaccgtgagatcagcagctgcagttagccatcggaggga 23779239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 9517302 - 9517114
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgccttt--ggaaac-ctaggaacgtcaatttaagttt 99  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   ||||   ||||| |||  |||||||| ||||  |||||| |||| || | ||||||||||||    
T  9517302 ggtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggccaacctaagggaaccttgtccttcattgtcttttgggaaacactag-aatgccaatttaagttt 9517204  T
Q  100 atgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacc 189  Q
    || |||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9517203 atttttcaattacctgtgaattagaaagaccctgcgcgtaaggatcatggtgcgatcaacaggtgcagttagccatcggagggatagacc 9517114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 11136460 - 11136273
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| || |||||| |||||||||  ||||||   ||||| |||| ||||||||| || ||||||   ||||   |||| ||| |||||||    
T  11136460 gtgtgctatgagtgtcataagatacatagatggacagacctaagggaaccttggccttcattgctttgggaaacactggaaaaccaatataaagtttatg 11136361  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  11136360 tttcaattacctttgaatta-caagaccccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcagcaggtgcagttagccatcggagggttaggccta 11136273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Original strand, 18074942 - 18075178
Alignment:
Q  13 gagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg-tttcaatta 111  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||| |  ||||| ||  ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  18074942 gagtatcctaagattcacagatggta-gacctacatgaacactgtccttcattgcctttggaaatattggaatgtcaatttaagtctatgctttcaatta 18075040  T
Q  112 cctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatag 211  Q
    ||||| || | | |||||||||||||||| ||||| |    ||  ||||||||||   |  ||| | |||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  18075041 cctttcaagtggtaagaccccacacgtaaggatcactgcatgaccagcaggtgcaaccaaacattggagggatagacctag-ttaacagagatagtatag 18075139  T
Q  212 accctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgca 250  Q
    ||||  ||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  18075140 accccacacgtaaggatcatcgtgtgatcaacaggtgca 18075178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9838937 - 9838610
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatggg-aagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaat-ttaagtttat 101  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||  ||||| || |||||||||  |||||| | |||| | |||| |||    
T  9838937 gtgtgctatgagtgttctaagattcatagatgggaaacccctttaggaacattgtccttcagtgtctttggaaatttaggaatgccaatataaagtctat 9838838  T
Q  102 gtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaa 201  Q
    |||||||||||||||||   || ||||||| |||||||| ||| |   || ||  || |||||||  |   ||| | |||||||||||||| |||||  |    
T  9838837 gtttcaattacctttgagggagtaagaccctacacgtaatgattaccctgtgaccagtaggtgcaactcaacattggagggatagacctag-tcaaccga 9838739  T
Q  202 gatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtata 301  Q
    | ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||  |||| |   | ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  9838738 gttagtatagaccccacacgtaaggatcatcgtgcgatcggcaggtgcagcttaacaaccgcttatgtt-gaacttcccaacgacctcatcacttgtata 9838640  T
Q  302 gtctacttaagttaactaaacacaacatga 331  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||    
T  9838639 gtctaattaagataaataaacacgacatga 9838610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 131
Target Start/End: Original strand, 17823290 - 17823416
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| | ||||| |||| ||||  || |||| | ||||||||||||||||    
T  17823290 gtgtgctatgagtgttctaagattcatagatgggaagacctaatggaaccttggccatcatttccttgggaacact-ggaaagccaatttaagtttatgt 17823388  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccc 131  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||    
T  17823389 ttcaattacctttgaattactaagaccc 17823416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 269 - 354
Target Start/End: Original strand, 9898744 - 9898829
Alignment:
Q  269 ttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    |||||| ||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9898744 ttagaatgtctcaaaggcctcgtcacttgtatagtctacttaagataactaaacgcgacatgaatgttatttaactccaacaaaat 9898829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 14722514 - 14722389
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||  || |    ||||| |||  |||||||| ||| ||||||   |||| |||||||| ||||||||    
T  14722514 ggtgtgctatgaatgtcctaagattcatagatgggctgaacaaagggaaccttgaccttcattgtcttgggaaacactggaatgtcaatttgagtttatg 14722415  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaaga 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  14722414 tttcaattacctttgaattaacaaga 14722389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17382461 - 17382416
Alignment:
Q  94 aagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgta 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17382461 aagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccgcacgta 17382416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24215786 - 24215718
Alignment:
Q  274 acgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24215786 acgtcccaacgaactcatcacttaaatagtccacttaagataactgaacgcaacatgaatgttatttaa 24215718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 348
Target Start/End: Original strand, 24252021 - 24252100
Alignment:
Q  269 ttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaa 348  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||   ||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  24252021 ttagaacgtcccaacagactcatcacttagatagtctacttagaataattaaacgcgacatgaatgttatttaattccaa 24252100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 342
Target Start/End: Original strand, 14079245 - 14079311
Alignment:
Q  276 gtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  14079245 gtcccaacggcctcataacttgtatagtctaccaaagataaataaacacgacatgactgttatttaa 14079311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 342
Target Start/End: Original strand, 22410116 - 22410186
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtcta-cttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||  | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22410116 aacgtcccaacagcctcatcacttgtatagtctatgtaaagataaataaacacaacatgactgttatttaa 22410186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 251
Target Start/End: Original strand, 17826806 - 17826845
Alignment:
Q  212 accctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcag 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  17826806 accctgcacgtaaggatcatcatgggatcaacaggtgcag 17826845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2587210 - 2587148
Alignment:
Q  79 taggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaa 141  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||   || ||||||||||| |||||    
T  2587210 taggaacgccaacttaagtttatgtttcaattaccattgagggagtaagaccccacaggtaaa 2587148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 14725928 - 14725882
Alignment:
Q  67 cctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacc 113  Q
    |||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  14725928 cctttggaaatctaggaactctaatttaagtttatgtttcaattacc 14725882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 5625176 - 5625108
Alignment:
Q  48 ggaacattggtcttcattgcctt-tggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg-tttcaattacctt 115  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5625176 ggaaccttggtcttcattgccttgtgaaaacct-ggaacaccaatttaagtttatgttttcaattacctt 5625108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 14638137 - 14638064
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaa 76  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||   ||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  14638137 ggtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggatgaactaatggaaccttggctttcattgccttgggaaa 14638064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 146
Target Start/End: Original strand, 20001990 - 20002047
Alignment:
Q  89 aatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||| || |||||||    
T  20001990 aatttaagttcatgcttcaattacctttgaattaacaaggccacacatgtcaagatca 20002047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 148
Target Start/End: Original strand, 24251840 - 24251900
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcatt 148  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  24251840 caatttaactctatgtttcaattacctttgaggtagttagaccccacgcgtaaggatcatt 24251900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 312
Target Start/End: Original strand, 27737477 - 27737513
Alignment:
Q  276 gtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaag 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27737477 gtcccaacggcctcatcacttgtatagtctacgtaag 27737513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 49 - 341
Target Start/End: Original strand, 167860 - 168152
Alignment:
Q  49 gaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcatt 148  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||     
T  167860 gaacattggccctcattccctttggaaatcttggaacgccaattcaagtctatgttttaattacctttgaattagcaagaccccgcatataaggatcatc 167959  T
Q  149 atgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtg 248  Q
     |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  167960 gtgcgatcagtaggtgcagttagccatcggagggatatacctagatcaaccgagatagtatagaccccacacgtatggatcaccgtgcgatcaacaggtg 168059  T
Q  249 cagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttattta 341  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||    
T  168060 cagcttgacaactgactaggttagaacgtcccaacgacctcgtcacttgtatagtctagttaagataactaaacgcgactagaatgttattta 168152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 41)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 17156365 - 17156022
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  17156365 tatgagtgtcttaagattcatagatgggaaaaccttcaagaacattggccttcattgcctttggaaatcgaggaacgccaatgtaagtctatctttcaat 17156266  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtat 209  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||   |||||| | || ||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  17156265 tacctttgaattaggaagaccccgcatgtaaggatcaccttgcgatcaacaagtgtatttagccatcgga-ggatagacctagatcaaccgagatagtat 17156167  T
Q  210 agaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctactt 309  Q
    | || |||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||||  |||  |  | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17156166 atacactgcacataaggatcatcgtgcgataagtaggtgcagcttgagaacccattaggttagaatatcccaacggcctcatcacttgtatagtctactt 17156067  T
Q  310 aagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    ||| | |||||||   ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17156066 aagattactaaacgtgacatgaatgttatttaattccaacaaaat 17156022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 18 - 354
Target Start/End: Original strand, 2723375 - 2723704
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttg 117  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2723375 tcctaagattcatatatcggaagaccttcaagaacattgactttcattgcctttggaaatctaggaatgccaatttaagtctatgtttcaattacctttg 2723474  T
Q  118 aattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctg 217  Q
    |||| | ||||| |||||||||| |||||   |||||| | || ||  |||||| ||  | ||||||| || || ||||||  ||||||||||||||| |    
T  2723475 aattggtaagacgccacacgtaacgatcaccgtgcgatcaacatgtatagttagacaatggagggataaacatatatcaaccgagatagtatagaccccg 2723574  T
Q  218 cacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaac 317  Q
    ||||||||||||| | |||| | |  |||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||       ||||| ||||    
T  2723575 cacgtaaggatcaccgtgcggtaagcaggtgcagcttggcaacaaactaagttacaacgtcccaacggccgcatcacttgtat-------ttaagataac 2723667  T
Q  318 taaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    ||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  2723668 taaatgcgacatgaatgttatttaattccaacaaaat 2723704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12411661 - 12411479
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| | ||||| |||||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||| |||||||||||| | |||    |||| | ||| |||||||||||    
T  12411661 ggtgtgctttgagtgtcctaagattcacagatgggccgacctaatggaaccttggccttcattgccttggaaaaaactggaaagccaaattaagtttatg 12411562  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12411561 tttcaattacctttgaattagcaagacctcgcacgtaaggatcactacgcgatcagcaggtgcagttggccatcggagggata 12411479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19167951 - 19167778
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  || ||   ||||| || | |||||||||||| ||||||   |||| | |||||||||||||||||| | |    
T  19167951 tatgagtgtcctaagattcatagatgggcggaactaagggaacctttgccttcattgccttgggaaacactggaaagccaatttaagtttatgttttagt 19167852  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  19167851 tacctttgaattagcaagaccacacacgtaaggatcaccgtgcgatcaacaggtgcagttagccatcggaggga 19167778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 8170401 - 8170280
Alignment:
Q  11 atgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaatt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||| | ||||   |||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  8170401 atgagtgtcctaagattcatagatgggcagacctaagggaaccttggccttcattgccttggtaaacactggaaagcaaatttaagtttatgtttcaatt 8170302  T
Q  111 acctttgaattagcaagacccc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8170301 acctttgaattagcaagacccc 8170280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 186 - 342
Target Start/End: Original strand, 12805592 - 12805748
Alignment:
Q  186 gacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacgg 285  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| |||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||  | ||||||||  |||||||     
T  12805592 gacctagatcaactgagataatatacaccccgcacataaggatcattgtgtgatcaataggtgcagcttgacaaccgaatacgttagaacagcccaacga 12805691  T
Q  286 tctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
     |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  12805692 cctcatcacttatatagtctacttaatataaataaacgcgacatgaatgttatttaa 12805748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8144180 - 8143850
Alignment:
Q  19 cctaagattcatagatgggaagacct-tccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |   ||||| |||  ||||||||| |||||||  ||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8144180 cctaagattcatagatgggaaaaccagttaagaacactggctttcattgcccttggaaatttaggaattccaatttaagtctatgtttcaattacctttg 8144081  T
Q  118 aattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctg 217  Q
    |   || |||||| ||||||||| ||||| | || ||  || ||||| |  |   ||| | ||||||||||||| ||||||  ||| |||| || ||| |    
T  8144080 agagagtaagacctcacacgtaaggatcactgtgtgactagtaggtgaaactcaacattggagggatagacctaaatcaactgagaaagta-aggccccg 8143982  T
Q  218 cacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggc-aactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaa 316  Q
    || |||| ||||||| ||||||||| | ||||| ||||   ||| ||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  8143981 catgtaaagatcatcgtgcgatcaacatgtgcaacttgatgaaccgactagcttagaacgtcccaacgacctcatcacttatatagtctacttaagataa 8143882  T
Q  317 ctaaacacaacatgaatgttatttaaatccaa 348  Q
     ||||| ||||||||| |||| |||| |||||    
T  8143881 ataaacgcaacatgaacgttacttaattccaa 8143850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Original strand, 16229568 - 16229695
Alignment:
Q  13 gagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattac 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| ||||||| |||| ||||||   |||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  16229568 gagtgtcctaagattcatagatgggcagacataagggaaccttggccttcatttccttgggaaacactggaaagccaatttaaatttatgtttcaattac 16229667  T
Q  113 ctttgaattagcaagaccccacacgtaa 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16229668 ctttgaattagcaagaccccacatgtaa 16229695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 348
Target Start/End: Original strand, 31285747 - 31285877
Alignment:
Q  219 acgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggc-aactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaac 317  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| | ||| ||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  31285747 acgtaaggatcatcctgcaatcaacaggtgcaacttgacgaaccgactaggttagaacgtcccaatggcctcatcacttgtatagtctacttaagataaa 31285846  T
Q  318 taaacacaacatgaatgttatttaaatccaa 348  Q
    |||||   ||||||||||||||||| |||||    
T  31285847 taaacgtgacatgaatgttatttaattccaa 31285877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19908808 - 19908556
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggataga 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||| ||| || ||||||||||||| |||| | |||||||    
T  19908808 caatttaagtttatctttcaattacctttgaattacaaagaccccgcacgtaaggatcatcatgtgatcagtaggtgcagttagcaatcggaaggataga 19908709  T
Q  188 ccta-gatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttag-aacgtcccaacgg 285  Q
    ||||  ||||||   || |||| || ||| |||||||||||||| | ||||||||  | ||  | |||| | || ||  | ||||| ||||||||||| |    
T  19908708 cctattatcaactgggagagta-agcccccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcagcaagtataacttgacgaccgattaggttagaaacgtcccaacag 19908610  T
Q  286 tctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatt 339  Q
     |||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||| | |||||||    
T  19908609 cctcaacacttgtatagtctacctaagataaataaacgcgacattactgttatt 19908556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21302500 - 21302163
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg- 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| ||||| |||||| | ||| || |||| | |||||||||| ||||     
T  21302500 gtgtgatatgagtgtcctaagattcatagatgggaagacctacaagaaccttggccttcactgccttggaaaatcttggaaagccaatttaagtctatgc 21302401  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaag 202  Q
    ||||||||||||| ||  | | |||||||||||||||| |||||   || ||| ||||||| ||   || | | | |||||||||||||| | |||  ||    
T  21302400 tttcaattaccttagagatggtaagaccccacacgtaaggatcaccgtgtgattagcaggtacaaccagacttaggagggatagacctag-ttaaccgag 21302302  T
Q  203 atagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttag-aacgtcccaacggtctcatcacttgtata 301  Q
    ||  |||||||||  ||||||||||||| | || |||||  |||||||||||  |||    | | |||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21302301 at-ttatagaccccacacgtaaggatcaccgtgtgatcagcaggtgcagctt-tcaatcttctaggttagtcacgtcccaacggcctcatcacttgtata 21302204  T
Q  302 gtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||| |||| | | ||||  | |||||| ||||||||||    
T  21302203 gtctacctaagattaataaatgcgacatgactgttatttaa 21302163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 201 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 38083942 - 38083814
Alignment:
Q  201 agatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtat 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||  || |||||||||  ||| ||| | ||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  38083942 agatagtatagaccccgcacgtaaggatcaccgtgcaatcagcagatgcagcttgataaccgactaggttagaatgtctcaacggcatcatcacttgtat 38083843  T
Q  301 agtctacttaagttaactaaacacaacat 329  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38083842 agtctacttaagataactaaacgcaacat 38083814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Original strand, 8882676 - 8882850
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatgtttcaa 108  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||   ||||| |||  ||||||||| || |||||| | |||| | |||| ||| ||||||||| |||    
T  8882676 tatgagtggcctaagattcatagatgggcatacctaagggaaccttgaccttcattgcattgggaaacattggaaagccaatataaagtttatgttacaa 8882775  T
Q  109 ttacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    |||||||| ||| |||||||| || ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||| || |||||    
T  8882776 ttacctttaaataagcaagacgccgcacgtaaggatcattgtgcgatcagtaggtgcagttagccagcggaggga 8882850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 176
Target Start/End: Original strand, 3116019 - 3116107
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatc 176  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||  | ||||||||||||||||||    
T  3116019 caatttaagttcatgcttcaattacctttgaattaacaagaccccacacgtaaagatcatcgtgtgaccaccaggtgcagttagccatc 3116107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 21325878 - 21325583
Alignment:
Q  48 ggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| | |||| ||| || ||||||||||||||||||||  | | ||||||||| | |||| ||||     
T  21325878 ggaacattggtcttcattgcctttgaaaatttaggaatgccaatataaagtctatgtttcaattacctttgaggtggtaagaccccataggtaacgatcg 21325779  T
Q  147 ttatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaatagg 246  Q
       || ||  | ||||||||   |   || | ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||   || |||||| | |    
T  21325778 cggtgtgaccaacaggtgcaaccaaatattggagggatagaccgaaatcaaccgagatagtatagaccccgcacgtaaggatcactgtgtgatcaacatg 21325679  T
Q  247 tgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||| |||| ||||  |  | |||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||  | |||||| ||||||||||    
T  21325678 tgcaacttgacaaccaattaggttaaaacgtcccaacgacctcatcgcttgtatagtcaacttaagataaataaaagcgacatgactgttatttaa 21325583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4650695 - 4650613
Alignment:
Q  94 aagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||   |||||| | ||||||||||||||||||    
T  4650695 aagtttatgtttcaattacctttgaattaccaagaccccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcaacaggtgcagttagccatc 4650613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 126
Target Start/End: Original strand, 19575782 - 19575898
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   || || |||| |||||||||||| || |||   |||| |  ||||||| |||||||||||||    
T  19575782 tatgagtgtcctaagattcatagatgagaagacctaaggggaccttggccttcattgccttggggaacactggaaagctaatttaattttatgtttcaat 19575881  T
Q  110 tacctttgaattagcaa 126  Q
    |||||||||||||||||    
T  19575882 tacctttgaattagcaa 19575898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 20023092 - 20023219
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||   ||||| |     |||| |||||| ||||||  ||||| | ||||||||||||||||    
T  20023092 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgtgcagacctaagggaacctcaactttcactgccttgggaaacacaggaa-gccaatttaagtttatgt 20023190  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagacccc 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20023191 ttcaattacctttgaattagcaagacccc 20023219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 118
Target Start/End: Original strand, 12373501 - 12373603
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagacc-ttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaat-ttaagtttatgtttcaattacctt 115  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||| || |||||||||  ||| || | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12373501 tcctaagattcatagatgggaaaaccctttaggaacattgatcttcagtggctttggaaatttagtaatgccaatattaagtttatgtttcaattacctt 12373600  T
Q  116 tga 118  Q
    |||    
T  12373601 tga 12373603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5508835 - 5508730
Alignment:
Q  86 gtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    ||||||||||||  | | ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||  ||  ||  | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  5508835 gtcaatttaagtccacgcttcaattacctttgaattaacaatacaacacacgtaaagatcaccatatgaccaacaggtgcagttagccatcggagggata 5508736  T
Q  186 gaccta 191  Q
     |||||    
T  5508735 taccta 5508730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 8267304 - 8267163
Alignment:
Q  214 cctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagt 313  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||   ||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||| |||||  ||||||| ||| |||||||| |||||     
T  8267304 cctgcacgtaaagatcaccttgcgatcagcgggtgcagcttgacaaccgactaggtaggaacgtcacaacgacctcatcagttgcatagtctatttaaga 8267205  T
Q  314 taactaaacacaacatgaatgttatttaa-atccaataaaat 354  Q
    ||| |||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8267204 taattaaacgtgacatgaatgttatttaatatccaacaaaat 8267163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8267340 - 8267267
Alignment:
Q  94 aagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcag 167  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||   |||||| ||| |||||||    
T  8267340 aagtctatgtttcaattacctttgaattagcaagatcctgcacgtaaagatcaccttgcgatcagcgggtgcag 8267267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 8446326 - 8446257
Alignment:
Q  79 taggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcatt 148  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||||    
T  8446326 taggaatgccaatttaagtctatgtttcaattacctttgagggagtaagaccccacacgtaaggatcatt 8446257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 268 - 348
Target Start/End: Original strand, 18736455 - 18736535
Alignment:
Q  268 gttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaa 348  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||  | |||||||| |||||||| |||||    
T  18736455 gttagaacgtcccaacgacctcatcacgtagatagtctacttaagataactaaatgcgacatgaatattatttaattccaa 18736535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 119
Target Start/End: Original strand, 16245244 - 16245361
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaat-ttaagtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||| ||| |||||  | | || | |||| | |||||||||    
T  16245244 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggtagacctaaaggaaccttggccttcattgtcttgggaaattttgaaaagccaatgtaaagtttatg 16245343  T
Q  103 -tttcaattacctttgaa 119  Q
     |||||||||||||||||    
T  16245344 ttttcaattacctttgaa 16245361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 353
Target Start/End: Original strand, 21825651 - 21825736
Alignment:
Q  268 gttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaa 353  Q
    ||||||||||||| |  | ||||||||||  |||||||||||| | ||||||||  || |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21825651 gttagaacgtcccgattgactcatcacttagatagtctacttacgataactaaatgcagcatgaatgttatttaattccaacaaaa 21825736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8319455 - 8319403
Alignment:
Q  94 aagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||    
T  8319455 aagtctatgtttcaattacctttgaattagcaagatcctgcacgtaaggatca 8319403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 139
Target Start/End: Original strand, 27854126 - 27854186
Alignment:
Q  79 taggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgta 139  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||   || || ||||||||||||    
T  27854126 taggaaagtcaatttaagtttatgtttcaattacctctgagagagtaaaaccccacacgta 27854186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 340
Target Start/End: Original strand, 7494904 - 7494967
Alignment:
Q  277 tcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttattt 340  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||| ||||||||    
T  7494904 tcccaacggcttcatcacttgtatagtctacctaagataaataaacgcgacatgactgttattt 7494967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16221857 - 16221770
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccat 175  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||| | || ||  |||| ||||||||||||||    
T  16221857 caattgaagttcatgctttaattatctttgaattaacaagaccccatacataaagatcaatgtgtgaccagcaagtgcagttagccat 16221770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 118
Target Start/End: Original strand, 21825399 - 21825458
Alignment:
Q  59 cttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttga 118  Q
    ||||||||||| ||||||  || ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21825399 cttcattgcctatggaaatttatgaatgtcaagttaagtctatgtttcaattacctttga 21825458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 59 - 118
Target Start/End: Original strand, 23768592 - 23768651
Alignment:
Q  59 cttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttga 118  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  23768592 cttcattgcatttggaaatttaggagtgtcaatttaagcatatgtttcaattacctttga 23768651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 41508773 - 41508632
Alignment:
Q  179 agggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttag-aacgt 277  Q
    |||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||  ||||||||||||| | || |||||| || ||||||||||| || ||  | ||||| |||||    
T  41508773 agggatagacctagct-aactgagataatatagaccca-cacgtaaggatcaccgtgtgatcaacagatgcagcttggcgaccgattaggttagtaacgt 41508676  T
Q  278 cccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaa 321  Q
    | |||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  41508675 cacaacggcctcgtcacttgtataatctacctaagataaataaa 41508632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 70
Target Start/End: Original strand, 19171379 - 19171445
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctt 70  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |  |||| |||| ||||||||||||    
T  19171379 gtgtgatatgagtgccctaagattcatagaagggtagacctacaagaaccttggccttcattgcctt 19171445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20430011 - 20429965
Alignment:
Q  276 gtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20430011 gtcctaacggcctcatcacttgtatagtctacttaagataaataaac 20429965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 268 - 342
Target Start/End: Original strand, 21303135 - 21303209
Alignment:
Q  268 gttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | || |||||||    
T  21303135 gttagaatgtcccaacaacctcatcacttatatagtctacttaaggtaaataaacacgacattactgctatttaa 21303209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 342
Target Start/End: Original strand, 7478139 - 7478208
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||| | ||||||||||    
T  7478139 aacgtcccaacgacttcatcacttgtatagtctacctaagataaataaacgcgacataactgttatttaa 7478208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 8765520 - 8765479
Alignment:
Q  150 tgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta 191  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8765520 tgcgatcagcaagtgcagttagccatcggagggatagaccta 8765479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 322
Target Start/End: Original strand, 12754709 - 12754754
Alignment:
Q  277 tcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  12754709 tcccaacggactcatcacttgtatagtctacctaagataaataaac 12754754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 44
Target Start/End: Original strand, 2167220 - 2167256
Alignment:
Q  8 gatatgagtttcctaagattcatagatgggaagacct 44  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  2167220 gatatgagtgtcctaagattcatagatgggtagacct 2167256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 342
Target Start/End: Original strand, 17438216 - 17438284
Alignment:
Q  274 acgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| | ||||||  |||||||||    
T  17438216 acgtcccaacgacctcatcacttgcatagtctacctaagataaataaacgcgacatgaccgttatttaa 17438284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 4 - 342
Target Start/End: Original strand, 25884978 - 25885316
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25884978 gtgtgctatgagtgccctaagattcatagatgggaaaaccttcaggaacattgaccttcactgcctttggaaatctaggaacgtcaatttaagtctatgt 25885077  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaaga 203  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||   |||||| | |||||||||||||||||   ||||||| || ||||| | |  |||    
T  25885078 ttcaattacctttaaattagcaagaccctacatgtaaagatcaccgtgcgatcaacaggtgcagttagccattagagggataaacatagattatctgaga 25885177  T
Q  204 tagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagt 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||  || ||||||||  ||||  ||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25885178 tagtatagaccatgcacgtaaggatcaccgtgcgatcagcagttgcagctttacaaccaaccgggttagaacatcccaacggcctcatcacttgtatagt 25885277  T
Q  304 ctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
      ||| ||| ||||||||  |  ||| ||||||||||||    
T  25885278 taactaaagataactaaatgcggcataaatgttatttaa 25885316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 24 - 353
Target Start/End: Original strand, 20174175 - 20174503
Alignment:
Q  24 gattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattag 123  Q
    ||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  20174175 gattcatagatgggtcgaccttcagaaacattggccttcattgcctttggaaatctaggaacacaaatttaattctatgtttcaattacctttgaattag 20174274  T
Q  124 caagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgta 223  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||    
T  20174275 caagaccccacacgtaaggctcattgtgcgatcggcatgtgcagatagccatcggagggatagacctagatcaaccgagatagtatagaccttacacgta 20174374  T
Q  224 aggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaaca 323  Q
    |||||||   ||| ||||  |||| || |||| |||| ||| | |||| || ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||       
T  20174375 aggatcactgtgcaatcagcaggtacaacttgacaaccgactaggttaaaatgtcccaagggcctcatcacatgtatagtctacttaagat-actaattg 20174473  T
Q  324 caacatgaatgttatttaaatccaataaaa 353  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20174474 cgacatgaatgttatttaattccaaaaaaa 20174503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 29849902 - 29849654
Alignment:
Q  12 tgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaatta 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29849902 tgagtgtcctaagattcatagatgggaagacattcatgaacattggccttcatttcctctggaaacctaggaacgtcgatttaagtttatgtttcaatta 29849803  T
Q  112 cctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatag 211  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |   |||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  29849802 cctttgaatttgcaagaccccgcacgtaaggattaccgtgcgatcagcaagtgtagttagccatcggagggatagacctagatcaaccgagatagcatag 29849703  T
Q  212 accctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaac 260  Q
    ||||  |||||||||| || | ||||||||| | || ||||||| ||||    
T  29849702 accccacacgtaaggagcaccgtgcgatcaacatgtacagcttgacaac 29849654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 67 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 29028016 - 29027742
Alignment:
Q  67 cctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgca 166  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||| ||||||  | | || ||||||||||    
T  29028016 cctttggaaatttaggaacgccaatttaagtctatgtttcaattacctttaatttaacaagaccccgcacgtaaggatcatcgtacaatcagcaggtgca 29027917  T
Q  167 gttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaa 266  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| || | ||| |    
T  29027916 gttagccatcagagggataaacctatatcaaccgagatagtatagacctcgcacgtattgatcatcgtgcgatcaacaggtgcagcttgacacccgacta 29027817  T
Q  267 agttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttattta 341  Q
     |||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  29027816 ggttagaacgtcccaacgacgccatcacttttatagtctacttaagataactaaacgcgacatgaatgttattta 29027742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Original strand, 23011277 - 23011624
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaa----gaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagttt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    |||| || |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |    
T  23011277 gtgtgatatgagtgtcctaagattcatagatgggaattaagaccctcaggaacattggccttcattgcctttggaaatctaggaacgtcaatttaaccct 23011376  T
Q  100 atgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaaca 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||  ||||| | | |||| | ||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||     
T  23011377 atgtttcaattacctttgaattagaaaaaccctgcacgtatggatcactgttcgatcaacagatgcagttagccatcaaagtgatatacctagatcaacc 23011476  T
Q  200 aagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgta 299  Q
     ||||||||||||||| | || |||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||  |   |||    |||||| || ||||||| | |||||||||||    
T  23011477 gagatagtatagaccccgaacataagaatcaccgtgcgatcaacaggtgtagcttgagattcgacttgattagaatgttccaacggccccatcacttgta 23011576  T
Q  300 tagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatcca 347  Q
    || |||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  23011577 taatctacttaaaaaaaataaacgcaacatgaatggtatttaattcca 23011624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 182
Target Start/End: Original strand, 23933170 - 23933347
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtt 104  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23933170 tgtgctatgattgtcctaagattcatagatgggaagaccttcggaaacattcgctttcattgcctttggaaacctaggaacgccaatttaagtttatgtt 23933269  T
Q  105 tcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggg 182  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23933270 tcaattacctttgaattagaaagaccccgcacgtaaggatcatcgtgcgatcagcaggtgcagttagccatcggaggg 23933347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 176
Target Start/End: Original strand, 18121804 - 18121976
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||  |||||   ||||   ||||||||||||||||    
T  18121804 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggcagacctaagggaacattggccttcattgccttgagaaacactggaaaaccaatttaagtttatgt 18121903  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatc 176  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| | |||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  18121904 ttcaattacctttgaattagcaagaccccgcatgtaaggatcactgtgcgattagcaggtgctgttaggcatc 18121976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 30412180 - 30411999
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||| ||| ||||||   |||| | ||||||||||||||||    
T  30412180 gtgtgttatgagtatcctaagattcatagatgggcagacctaagggaaccttggccttcattgtcttgggaaacactggaaagccaatttaagtttatgt 30412081  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||| | |||||||| ||||  |||||| |||||||    
T  30412080 ttcagttacctttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatcaccgtgcgttcagcaggtgtagttgtccatcggagggata 30411999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 189
Target Start/End: Original strand, 17675215 - 17675400
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    ||||| ||||| | || |||||||||||||||||  |||||   ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  17675215 gtgtggtatgattgtcttaagattcatagatgggctgacctaagggaaccttggccttcattgccttgggaaacactag-aacgccaatttaagtttatg 17675313  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacc 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||  ||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17675314 tttccattacctttgaattagcaagacgccgcacctaaggatcaccatgtgatcagcagatgcagttagtcatcggagggatagacc 17675400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 26667851 - 26667678
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||  | ||||    |||| |||| |||||||| ||| ||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  26667851 tatgagtgtcctaagatccatagatggacaaacctaagagaaccttggccttcattgtcttgggaaacactggaaagccaatttaagtttatgtttcaat 26667752  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||||||||| |||||    
T  26667751 tacctttgagttagcaagaccccgcacgtaaggatcactgtgcgatcagtaggtgcagttagccatcggaggga 26667678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 29143465 - 29143288
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||   ||||| ||||  ||||||||| | | |||  | |||| | ||||||||||||||||    
T  29143465 gtgtgttatgagtgtcctaagattcatagatggacagacctaagggaaccttggctttcattgccctagaaaatattggaaagccaatttaagtttatgt 29143366  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagg 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |   |||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  29143365 ttcaattacctttgaattagcaagactccacacgtaaggattaccgtgcgatcagtaggtgcggttagccatcgaagg 29143288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 27908704 - 27908890
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||   |||||   ||||| |||| ||||||| |||| | |||    |||||| |||||||||||||||    
T  27908704 ggtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatggaccgacctaatggaaccttggccttcatttccttggaaaaaactggaacgccaatttaagtttatg 27908803  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacc 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    ||  || ||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27908804 tttcaattacctttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatcgccgtgtaatcagcaggtgcagttaggcatcagagggatagacc 27908890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Original strand, 28605688 - 28606031
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |  || ||   |||||||| | || |||| |||||||||| || |||||| ||||||| || ||||     
T  28605688 gtgtgctatgagtgttctaagattcatagatgagctgatctataggaacatttgcctgcattacctttggaaatcttggaacgccaatttatgtctatgg 28605787  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgc------gatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaa 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||||   |||      ||| | |||||  | || || |||| | ||||| | ||| |||||    
T  28605788 ttcaattacctttgaattagcaaggccccgcatgtaaggatcaccgtgcccgtgcgatcaacaggtataatttgcgatcgcatggataaaactaaatcaa 28605887  T
Q  198 caaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttg 297  Q
    |  |||||||||| |||||||| ||||||||||   ||||||||| |||| |||||||||||||| | |  ||||||| || |||||  ||||| |  ||    
T  28605888 ccgagatagtatataccctgcatgtaaggatcacagtgcgatcaacaggttcagcttggcaactgcctagcttagaacatctcaacgacctcattatctg 28605987  T
Q  298 tatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttattta 341  Q
    ||||||||||||||| |||||||||   |||| |||||||||||    
T  28605988 tatagtctacttaagataactaaacgtgacataaatgttattta 28606031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 17635361 - 17635542
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| ||   || ||||||||||||    
T  17635361 gtgtggtatgattgtcctaagattcatagatgggatgacctaagggaaccttggccttcattgccttgggaaacactag-aagaccagtttaagtttatg 17635459  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||  ||| ||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  17635460 tttccattacctttgaattagcaagacgccgcacctaaggatcaccatgtgatcagcagatgcagttagtcatcggagggata 17635542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 216 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 32085832 - 32085694
Alignment:
Q  216 tgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagtta 315  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||  ||  |||   || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  32085832 tgcacgtaaggatcaccgtgcgatcagcaagtgcagcttgaaaatcgacttggtcagaacgtcacaacggtctcatcacttgtattgtctacttaagata 32085733  T
Q  316 actaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32085732 actaaacgcgacatgaatgttatttaaatccaacaaaat 32085694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13776856 - 13776730
Alignment:
Q  65 tgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtg 164  Q
    |||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||  || |||||    
T  13776856 tgcctttggaaatcttggaaagccaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattaacaagaccccacacgtaaggatcactgtgtgaccagtaggtg 13776757  T
Q  165 cagttagccatcgaagggatagaccta 191  Q
      ||||||||||  |||| ||||||||    
T  13776756 tggttagccatcagaggggtagaccta 13776730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25535813 - 25535643
Alignment:
Q  13 gagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattac 112  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||   ||||| ||||  ||||||||||| ||||||   ||||   |||||||||||||||| ||||||||    
T  25535813 gagtgtcctaagattcatagatggacagacctaagggaaccttggcattcattgccttgggaaacactggaaacccaatttaagtttatgtctcaattac 25535714  T
Q  113 ctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||  | |||   || ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25535713 ctttaaattagcaagaccccgcacgtacggttcaacgtgtgatcaacaggtgcagttagccatcgaaggga 25535643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Original strand, 24090476 - 24090656
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagttt-atg 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||   |||||| ||| ||||||| |||| ||||||   |||| |   || ||| ||| |||    
T  24090476 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgagaagacctaagggaacactggccttcatttccttgggaaacactggaaagctgatataaattttatg 24090575  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||| |||| ||||| |||| ||||| |||||    
T  24090576 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacataaggatcaccgtgcgatcagcatgtgcaattagtcatcggaggga 24090656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 186
Target Start/End: Original strand, 19199767 - 19199866
Alignment:
Q  87 tcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatag 186  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | || ||  |||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  19199767 tcaatttaagttcatgtttcaattacctttgaactaacaagaccccacacgtaaagatcactgtgtgaccagcatgtgcaattagccatcggagggatag 19199866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 22379069 - 22379232
Alignment:
Q  13 gagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaat-ttaagtttatgtttcaatta 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||| |||||||||||| ||||||   |||| | |||| | ||||||||||||||||||    
T  22379069 gagtgtcctaagattcatagatgggcagacctaacggaaccttggccttcattgccttgggaaacactggaaagccaatataaagtttatgtttcaatta 22379168  T
Q  112 cctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccat 175  Q
    ||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||||   || ||| | || ||||||||||||||    
T  22379169 cctttcaattaacaagacctcgcacgtaaggatcaccgtgtgatcaacatgtgcagttagccat 22379232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17198418 - 17198244
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacc-taggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||   ||||   ||| |||||||| ||| ||||| | | |||| | |||||||||||||||    
T  17198418 gtgtgttatgagtgtcctaagattcatagatgggcaaccctaagggaatcgtggccttcattgtcttgggaaaacattggaaagccaatttaagtttatg 17198319  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcg 177  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  ||| || |||||| | || ||||||||||||||||    
T  17198318 tttcaattacctttgaattaacaagaccccgtacgtaagaatcgttgtgcgatcaacatgtgcagttagccatcg 17198244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28929176 - 28928923
Alignment:
Q  54 ttggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcg 153  Q
    |||| |||||||||||| |||||  | | |||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  |||||| ||||| | ||||    
T  28929176 ttggacttcattgccttgggaaaaattgcaacgccaatttaaatctatatttcaattacctttgaattaataagatcccgtacgtaaggatcactgtgcg 28929077  T
Q  154 atgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta-gatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagc 252  Q
    || |||| ||||||||||||  || || |||| |||||  ||||||  ||| |||| ||||||  ||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |    
T  28929076 atcagcatgtgcagttagcccccggagagataaacctataatcaactgagagagta-agaccccacacgtaaggatcaccgtgcgatcagcaggtgcaac 28928978  T
Q  253 ttggcaactgacaaagttag-aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtcta 306  Q
    |||   ||  || | ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28928977 ttgatgaccaactaggttagaaacgtcccaacgacctcatcacttgtatagtcta 28928923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Original strand, 12950571 - 12950683
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg- 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||| ||||| |  |||| | |||||||||| ||||     
T  12950571 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggaagacctacaagaaccttggccttcattgccttaggaaatcatggaaagccaatttaagtgtatgc 12950670  T
Q  103 tttcaattacctt 115  Q
    |||||||||||||    
T  12950671 tttcaattacctt 12950683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 25530913 - 25530818
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||   |||||| || ||||||| |||||||||| |||||    
T  25530913 caatttaagtttatgtctcaattacctttgaattagaaagaccccgcacataaggatcaccgtgcgatcagtaggtgcatttagccatcggaggga 25530818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 131
Target Start/End: Original strand, 23006763 - 23006876
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttg 117  Q
    ||||||||| |||||||   |||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||   ||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  23006763 tcctaagatccatagatacaaagaccttcaagaacattggccttcattgcctttgaaaatctaggaacaaaaatttaattatatatttcaattacctttg 23006862  T
Q  118 aattagcaagaccc 131  Q
    |||||  |||||||    
T  23006863 aattaaaaagaccc 23006876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 25536404 - 25536311
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||| |||||||||||| ||||||   |||| | |||||||| |||||||    
T  25536404 tatgagtatcctaagattcatagatgggaagacataagggaaccttggccttcattgccttgggaaacactggaaagccaatttaaatttatgt 25536311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 342
Target Start/End: Original strand, 31804695 - 31804760
Alignment:
Q  277 tcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||    
T  31804695 tcccaacggcctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaacgcgacatgattgttatttaa 31804760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 15339824 - 15339758
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctt 70  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |  |||| |||| ||||||||||||    
T  15339824 gtgtgatataagtgtcctaagattcatagatgggtagacctacatgaaccttggccttcattgcctt 15339758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 177
Target Start/End: Original strand, 17743118 - 17743236
Alignment:
Q  59 cttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgag 158  Q
    |||||||||||| |||||    |||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  || ||| |||| |  |||||| |     
T  17743118 cttcattgccttgggaaaaactggaatgccaatttaattttatgtttcaactacctttgaattaacaagacctcgtacataaggatcgtcgtgcgatcat 17743217  T
Q  159 caggtgcagttagccatcg 177  Q
    || ||||||||||||||||    
T  17743218 caagtgcagttagccatcg 17743236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 29028164 - 29028114
Alignment:
Q  9 atatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtc 59  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  29028164 atatgagtgtcctaagattcatagatgggaaaacctttaggaacattggtc 29028114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 322
Target Start/End: Original strand, 25887437 - 25887737
Alignment:
Q  24 gattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatg-tttcaattacctttgaatt 121  Q
    |||||||| |||| ||||||| |  ||||||||| |||||||| | ||||||| || | || | |||| ||| || |||| ||||||||||||||||  |    
T  25887437 gattcatatatggaaagacctacatgaacattggccttcattgtcgttggaaatcttgaaaagccaatataaagtctatgctttcaattacctttgaggt 25887536  T
Q  122 agcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacg 221  Q
     | |||||||||||||||| |||||   || ||  || |||||||   |  ||| | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |  ||||    
T  25887537 ggtaagaccccacacgtaaggatcaccgtgtgaccagtaggtgcaaccaaacattggagggatagacctag-tcaattgagatagtatagacaccacacg 25887635  T
Q  222 taaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaa-cgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaa 320  Q
    ||||||||| | ||  ||||  |||||||| ||| |||||||  | ||||| | | ||||||| | ||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||    
T  25887636 taaggatcaccgtgtaatcagcaggtgcaggttgacaactgattaggttagtagcatcccaacagcctcatcacttgtataatctacctaagataaataa 25887735  T
Q  321 ac 322  Q
    ||    
T  25887736 ac 25887737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25939648 - 25939583
Alignment:
Q  67 cctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagacccc 132  Q
    ||||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||    
T  25939648 cctttggaaatttaggaatgctaatttaagtttatgtttcaattacctttgagtgagtaagacccc 25939583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 342
Target Start/End: Original strand, 12952207 - 12952275
Alignment:
Q  274 acgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||| |||||  ||||||||||    
T  12952207 acgtcccaacgacctcatcacttgtatagtctacctaagataaatacacacgacatgcctgttatttaa 12952275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 17890254 - 17890174
Alignment:
Q  268 gttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaa 348  Q
    |||||||||||  || || ||||||||||   |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  17890254 gttagaacgtcggaatggactcatcacttaggtagtatacttaagataactaaacacgaaatgaatgttatttaattccaa 17890174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 342
Target Start/End: Original strand, 27908904 - 27908972
Alignment:
Q  274 acgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||| | ||||| ||||    
T  27908904 acgtcccaacggcttcatcacttgtatagtctacctaagataaataaacgcaacattattgttacttaa 27908972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 342
Target Start/End: Original strand, 29719018 - 29719086
Alignment:
Q  274 acgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||| | ||||||||||    
T  29719018 acgtcccaacgacctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaacgcgacattactgttatttaa 29719086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 45553694 - 45553599
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacct 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| |  |||  ||||||||||  |||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  45553694 tcctaagattcatagatgggaaaacctttaggaacactggccaccata-cctttggaaatttaggaacgccgtattaagtttatgtttcaattacct 45553599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 25536110 - 25536009
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |   ||||| ||||  |||||| |||| ||||||   | || | |||||||||||||||| |||||    
T  25536110 tatgagtatcctaagattcatagatgggcagacataagggaaccttggctttcattcccttgggaaacactgaaaagccaatttaagtttatgtctcaat 25536011  T
Q  110 ta 111  Q
    ||    
T  25536010 ta 25536009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 312
Target Start/End: Original strand, 17635562 - 17635598
Alignment:
Q  276 gtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaag 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17635562 gtcccaacggcctcatcacttgtatagtctacctaag 17635598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 342
Target Start/End: Original strand, 17743278 - 17743330
Alignment:
Q  290 atcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  17743278 atcacttgcatagtctacttaagataactaaacgcaacattgttgttatttaa 17743330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 268 - 312
Target Start/End: Original strand, 21078408 - 21078452
Alignment:
Q  268 gttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaag 312  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  21078408 gttagaacgtcccgacggactcatcacttagatagtctacttaag 21078452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 67 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26291587 - 26291503
Alignment:
Q  67 cctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatg 151  Q
    ||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||| |||||||  | |  ||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26291587 cctttggaaatttaggaactctaatttaagtttatgttttaattacccctaaggtagtaagaccccacacgtaaggatcactatg 26291503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 30411981 - 30411933
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaa 321  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  30411981 aacgtcccaacgatcccatcacttgtatagtctacctaagataaataaa 30411933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 131; Significance: 7e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 55442 - 55107
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||  || || | |||| ||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||||| ||| ||| |    
T  55442 gtgtgttatgagtatccaaagattcatagatgggttgatctacaggaatattggccttcattgcctttggaaatcttggatcgccaattttagtctatat 55343  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaaga 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||    
T  55342 ttcaattacctttgaattagcaagaccccgcatgtacggatcattgtgcgatcagaaggtgcagttagccatcgaaaggatagacctaaatcaactgaga 55243  T
Q  204 tagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagt 303  Q
    || |||||||||||   |||| |||||   ||||| ||| ||||||| |||| |||| ||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  55242 taatatagaccctg--tgtaacgatcaaagtgcgaccaacaggtgcatcttgacaaccgactaggttaggacgtcccaacggcctcatcacttgtatagt 55145  T
Q  304 ctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttattta 341  Q
     |||||| | | ||||||| | ||||||||||||||||    
T  55144 atacttaggatgactaaacgcgacatgaatgttattta 55107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 339
Target Start/End: Original strand, 42750 - 43078
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| | |||||| ||| ||||||| |||||| ||| || |||| | |||||||||| |||||||||||    
T  42750 tatgagtgtcctaagattcatagatgggttgtcctacaggaacactggccttcatttcctttgaaaatcttggaatgccaatttaagtctatgtttcaat 42849  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| | |||||||| ||||||||| |   |||| | | ||||||||  ||||| |||    
T  42850 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaggatcaccgtgcgatcatcaggtgcaattagccatc-agtagataaatcgagatcaaccgagataatat 42948  T
Q  210 agaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctactt 309  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||  || | |||||||| ||||||| | ||||||| ||  ||| |||||||    
T  42949 agaccccgcacgtaaggatcgtcatgcaatcaacaggtgcagtttgacaaccaactaggttagaacttcccaacagcctcatcagttacataatctactt 43048  T
Q  310 aagttaactaaacacaacatgaatgttatt 339  Q
    ||| |||||||||   ||||||||||||||    
T  43049 aagataactaaacttgacatgaatgttatt 43078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 7984122 - 7983812
Alignment:
Q  33 atgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagacccc 132  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  7984122 atggaaagaccttccggaacatcggccttcatttcctttggaaacctaggaacgccaatttaagtttatgtttcaatcacctttgaattagcaagacccg 7984023  T
Q  133 acacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatc 232  Q
    |||||||| ||||| | |||||| |  |||||||||||| ||||| ||||||| ||| || |||||  | ||| ||||||||| ||||||||||||||      
T  7984022 acacgtaaggatcactgtgcgatca-taggtgcagttagacatcggagggataaaccaagttcaaccgatataatatagaccccgcacgtaaggatcact 7983924  T
Q  233 atgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaa 332  Q
     ||| ||||  |||| ||||||| |||| ||| | || |||||| |        || |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  7983923 gtgcaatcagcaggt-cagcttgacaaccgactaggtaagaacgac--------ctaatcatttgtatagtctacataagataactaaacacaacatgaa 7983833  T
Q  333 tgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    |||| ||||||||||| |||||    
T  7983832 tgtt-tttaaatccaacaaaat 7983812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 112 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14528613 - 14528372
Alignment:
Q  112 cctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatag 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| | |||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14528613 cctttgaattagcaagaccccgcacttaaggatcaatgtgcgatcagcaggtgcagttatccatcagagggatagacctagatcaaccgagatagtatag 14528514  T
Q  212 accctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaa 311  Q
    ||||  ||||||||| ||| | ||||| ||  |||||||||||| |||| ||| | |||| || |||||||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  14528513 acccctcacgtaaggttcaccgtgcgaccagcaggtgcagcttgacaaccgactaggttaaaatgtcccaatagcctcatcacttgtatagtctatttaa 14528414  T
Q  312 gttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    | ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  14528413 gataactaaacgcgacatgaat-ttatttaaatccaacaaaat 14528372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 88 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19787231 - 19786985
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggataga 187  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||| || |||| |||||   ||| || |||| || ||||||||||||| ||||||| |    
T  19787231 caatttaagtctatgtttcaattacctttgaattgacaagatcccgcatgtaaggatcaccgtgcaatcagcatgtacagttagccatcggagggataaa 19787132  T
Q  188 cctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtc 287  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||  ||||||| |||| ||||  || | |||||||| ||||||||| |    
T  19787131 cctagatcaactgagatagtatagaccccgtacgtaaggatcgtcgtgcgatcagcaggtgcatcttgacaaccaactaggttagaacatcccaacggcc 19787032  T
Q  288 tcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatg 334  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  19787031 tcatcacctgtatagtcgacttaagataactaaacgcgacatgaatg 19786985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Original strand, 25181979 - 25182203
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   |||||   |||||||||| |||||||| |||||||||    |||||  | |||| ||| |||||    
T  25181979 gtgtgttattagtgtcctaagattcatagatggactgacctaatggaacattggccttcattgtctttggaaaatctggaacaactattttagtctatgt 25182078  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaaga 203  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||    
T  25182079 ttaaattacctttgaattaacaagacctcacacataaagatcatcttgcgatcagctggtgctgttagccatcaaagtgatagacctagatcaaccgaga 25182178  T
Q  204 tagtatagaccctgcacgtaaggat 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||    
T  25182179 tagtatagaccccgcacgtaaggat 25182203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 185
Target Start/End: Original strand, 18448127 - 18448308
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||   ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  18448127 gtgtgatatgagtgtcctaagattcctcgatgggaagaactaagggaaccttggccttcattgccttaggaaacactagaaa-gtcaatttaagtttatg 18448225  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||| |||||||||||||| |||||  |||||||    
T  18448226 tttcacttgcctttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatcaccgtgcgatcagcaggtgcagttaaccatcagagggata 18448308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17509730 - 17509567
Alignment:
Q  26 ttcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagca 125  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| |||  |||||||||||| ||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17509730 ttcatagatgggaagacctaagggaaccttgaccttcattgccttgggaaacactggaaagccaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattaaca 17509631  T
Q  126 agaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacc 189  Q
    ||||||  || |||| |||||   ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17509630 agaccctgcatgtaaggatcaccgtgcaatcagcaggtgcagttagccatcgtagggatagacc 17509567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Original strand, 24113876 - 24114051
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||   ||| |   |||||||||  |||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24113876 tatgagtgtcctaagcttcatagatggactgacttattggaacattgaccttcattgccttgggaaaaattggaacgccaatttaagtttatgtttcaat 24113975  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || ||||  ||||  ||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  24113976 tacctttgaattaacaagaccccgcatgtaagaatcaccatgcgatcagcaggtgtagttagccatcagagggata 24114051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 185
Target Start/End: Original strand, 24110255 - 24110437
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||   ||||| |||| |||||||| | | |||||    |||||| |||||||||||||||    
T  24110255 ggtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgtgttgacctaatggaaccttggacttcattgtcgtgggaaaaactggaacgccaatttaagtttatg 24110354  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||| || |||| ||||||||||| || | |||||||    
T  24110355 tttcaattacctttaaattagcaagaccccacacatatggatcactatgcaatcagcatgtgcagttagctataggagggata 24110437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25226641 - 25226467
Alignment:
Q  11 atgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaat 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |   ||||| |||   |||||||| || |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25226641 atgagtgtcctaagattcatagatgggaagaattaagggaaccttgactttcattgcattgggaaacactagaaa-gtcaatttaagtttatgtttcaat 25226543  T
Q  110 tacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||| |||||||| | ||||| |||| |||||||    
T  25226542 taccttttaattagcaagaccccgcacgtaaggatcactgtgtgatcagcaggtgaaattagctatcggagggata 25226467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 185
Target Start/End: Original strand, 24723192 - 24723357
Alignment:
Q  21 taagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaa-gtttatgtttcaattacctttga 118  Q
    |||||||| |||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||  || | |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24723192 taagattcctagatgggcagacctaagggaaccttggacttcattgccttgggaaacactataaa-gccaatataaagtttatgtttcaattacctttga 24723290  T
Q  119 attagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||   |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  24723291 attagcaagaccccagacgtaaggatcaccgtgcgatcagcaggtgtagttagccatcggagggata 24723357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 185
Target Start/End: Original strand, 17101575 - 17101672
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  17101575 caatttaagtttatgtttcaattatctttgaattagcaagaccccgcacgtaaggatcactgtgcgatcagcagatgcagttagccatcagagggata 17101672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17997064 - 17996935
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaa 108  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | || |   ||||| |||| |||||||||||| |||||| |||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  17997064 tatgagtgtcctaagattcatagatggacaaacttaagggaaccttggccttcattgccttgggaaacactagaagc--caatttaagtttatgtttcaa 17996967  T
Q  109 ttacctttgaattagcaagaccccacacgtaa 140  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17996966 ttacctttgaattagcaagaccccgcacgtaa 17996935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 210 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24645216 - 24645077
Alignment:
Q  210 agaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggc-aactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctact 308  Q
    |||||| |||||||| ||||| | ||| |||| |||||||| |||| | ||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  24645216 agaccccgcacgtaaagatcaccgtgcaatcattaggtgcaacttgacgaaccgattaggttagaacgtcccaacggcctcatcacttgtatagtatact 24645117  T
Q  309 taagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaa 348  Q
    |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||    
T  24645116 taagataactaaacgcgacatgaaagttatttaattccaa 24645077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14528675 - 14528608
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttg 72  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14528675 tgtgctatgagtgtcctaagatttatagatgggaagaccttcgggaacattggtcttcattgcctttg 14528608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19264586 - 19264412
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatgtttcaa 108  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| |||||||| ||| ||||||   ||||    ||  ||| |||||||||||||    
T  19264586 tatgagtgtcttaagattcatagatgggcagacctaagggaaccttggccttcattgtcttgggaaacaatggaaaacaaacataaagtttatgtttcaa 19264487  T
Q  109 ttacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||   |||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  19264486 ttacctttgaattaacaaaaccccgcacgtaagaatcaccgtgcgatcatcaggtgcagttagccatcgaaggga 19264412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 83 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24270031 - 24269969
Alignment:
Q  83 aacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatc 145  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24270031 aacgccaatttaagtttatatttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaggatc 24269969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Original strand, 23892751 - 23892894
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtc-aatttaagtttatg 102  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||   ||||| |||| |||||||||||| ||||||   |||| | | || | |||||| ||    
T  23892751 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagatgggcatacctaagggaaccttggccttcattgccttgggaaacactggaaagccaaaataaagtttctg 23892850  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  23892851 tttcaattacctttgaattagcaagatcccgcatgtaaggatca 23892894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6885457 - 6885359
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacg-taaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||  || ||  ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6885457 caatttaagttcatgcttcaattacctttgaattaacaagagcccacacgttaaagatcatcgtgtgactagcaggtgcagttagccatctgagggata 6885359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34497694 - 34497556
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatggg-aagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaat-ttaagtttatgtttca 107  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||  || ||| |||||| | |||| |||||||||    
T  34497694 tatgagtgtcctaagattcatagatgggaaacccctttaggaacattagtcttcattgcctttagaaatttaagaatgtcaatataaagtctatgtttca 34497595  T
Q  108 attacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    |||||||||||   || | |||||||||||||| |||||    
T  34497594 attacctttgagggagtatgaccccacacgtaaggatca 34497556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Original strand, 26831914 - 26832050
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac-ctaggaacgtcaatttaa-gtttatgtttca 107  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||  |||||||| || |||||| |||| || | |||| ||| ||||||||||||    
T  26831914 tatgagtgtcctaagattcatagataggcagacctaagggaaccttggctttcattgctttgggaaacactagaaa-gccaatataatgtttatgtttca 26832012  T
Q  108 attacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatc 145  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  26832013 attacctttgaattagcaagacgccgcacgtaaggatc 26832050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 146
Target Start/End: Original strand, 28276396 - 28276454
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  28276396 caatttaagttcatgcttcaattacctttgaatttacaagaccccacacgtaaagatca 28276454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 148
Target Start/End: Original strand, 30121686 - 30121815
Alignment:
Q  18 tcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttg 117  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||| | |||||| |||  |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  30121686 tcctaaaattcatagatgggaaaacctttaagaacattggtcatca-tacctttgaaaatttaggaacgccaatttaagtctatgtttcaactaccattg 30121784  T
Q  118 aattagcaagaccccacacgtaaagatcatt 148  Q
    |   || ||||||| |||||||| |||||||    
T  30121785 agagagtaagaccctacacgtaaggatcatt 30121815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 238
Target Start/End: Original strand, 37528359 - 37528508
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggataga 187  Q
    |||||||||||| || | || |||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  37528359 caatttaagtttgtggt-cagttacctttgaattaacaagatctcgcacgtaaagatcatcgtgcgatcaacaggtgcagttagcaatcagagggataga 37528457  T
Q  188 cctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcga 238  Q
    | || ||||||  | ||| ||||||||    |||||||||||||| |||||    
T  37528458 cgtaaatcaactgaaataatatagacctcatacgtaaggatcatcgtgcga 37528508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 201 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 34497500 - 34497359
Alignment:
Q  201 agatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtat 300  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||  | ||||| |||| |||  ||  | |||||||||||||||||  ||||||| || |||    
T  34497500 agatagtatagaccccacacgtaaggatcatcgtgtgatcagcatgtgcatcttgacaatcgattaggttagaacgtcccaacgacctcatcaattttat 34497401  T
Q  301 agtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    ||| |||||||| ||| ||||    |||||||||||||||||    
T  34497400 agtttacttaagataaataaatgtgacatgaatgttatttaa 34497359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 342
Target Start/End: Original strand, 13314779 - 13314847
Alignment:
Q  274 acgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  13314779 acgtcccaacgaccttatcacttgtatagtctacctaagataaataaacgcgacatgaatgttatttaa 13314847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 342
Target Start/End: Original strand, 26394485 - 26394553
Alignment:
Q  274 acgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||| | ||||||||||    
T  26394485 acgtcccaacggcctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaacgcgacattactgttatttaa 26394553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 18569402 - 18569335
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaac 77  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||   ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  18569402 tatgagtgtcctatgattcatagatgggaatacctaagggaaccttggccttcattgcctttggaaac 18569335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 342
Target Start/End: Original strand, 25182210 - 25182281
Alignment:
Q  271 agaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    ||||||||||||||  || || | |||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||    
T  25182210 agaacgtcccaacgaccttattatttgtatagtctacttaagataactaaacgtgacatgaatgttatttaa 25182281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 348
Target Start/End: Original strand, 30121955 - 30122016
Alignment:
Q  287 ctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaa 348  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| |||||    
T  30121955 ctcatcacttagatagtctacttaagataactaaacacgacataaaagttatttaattccaa 30122016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16404343 - 16404284
Alignment:
Q  122 agcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagg 181  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16404343 agcaagacctcgcacgtaaggatcatcgtgcgatcaacaggtgcagttagccatcgaagg 16404284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 14626317 - 14626283
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctac 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14626317 aacgtcccaacggactcatcacttgtatagtctac 14626283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 322
Target Start/End: Original strand, 24723394 - 24723444
Alignment:
Q  272 gaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  24723394 gaacatcccaacggcctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaac 24723444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Original strand, 24114068 - 24114117
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  24114068 aacgtcccaatggcctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaac 24114117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 25226450 - 25226401
Alignment:
Q  273 aacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  25226450 aacgtcccaacgacctcatcacttatatagtctacctaagttaaataaac 25226401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 115
Target Start/End: Original strand, 13314510 - 13314622
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg- 102  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | |||| | ||||| ||   |||||||||| | ||||| ||  ||| | |||||||||| ||||     
T  13314510 gtgtgctatgagtgtcctaagattcatagataggcaaacctacaggaaccttaaccttcattgccctaggaaatcttagaaagccaatttaagtctatgc 13314609  T
Q  103 tttcaattacctt 115  Q
    |||||||||||||    
T  13314610 tttcaattacctt 13314622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 991 - 812
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||| ||||||||| || |||||| |  ||| | ||||||||||||||||    
T  991 gtgtgatatgagtgtcctaagattcatagatgggcagacctaagggaaccttggccttcattgcattgggaaacattagaaagccaatttaagtttatgt 892  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggga 183  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  891 ttcaattacctttgaactagcaagaccccgcacgtaaggatcatcgtgcgatcagcaggtgcagttagccatcgaaggga 812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 4 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 76966 - 76788
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgt 103  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| |||  | |||||||||| ||||||   |||| | |||||||||| |||||    
T  76966 gtgtgctacgagtgtcctaagattcatagatgggcagacctaagggaaccttgagcctcattgccttgggaaacactggaaagccaatttaagtctatgt 76867  T
Q  104 ttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaaggg 182  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||   |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  76866 ttcaattacttttgaattagcaagaccccgtacgtaaggatcaccgtgcgatcagcaggtgcagttagccatcggaggg 76788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 72613 - 72293
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||  |   ||||| |||  |||||||||||| |||||   | ||| | |||||||| ||||||    
T  72613 ggtgtgctatgagtttcctaagatttatagatgggctgaaataatggaaccttgtccttcattgccttcggaaaaacaagaatgccaatttaattttatg 72514  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagaccta-gatcaacaaa 201  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||  |||| | |||||| ||| ||| || ||| ||||||||||||||||| ||  ||||||       
T  72513 tttcaattacctttgaaataacaagaccccgcacgtaagaatcactgtgcgatcagcgggtccaattacccatcgaagggatagacttataatcaactgg 72414  T
Q  202 gatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttag-aacgtcccaacggtctcatcacttgtat 300  Q
    |||| || |||||| |||||| ||||||| || || ||||  ||||||| |||| | || ||| | ||||| ||||||||||||| || || |||||||     
T  72413 gataata-agaccccgcacgttaggatcaccaagcaatcagaaggtgcaacttgacgaccgactaggttagaaacgtcccaacggccttataacttgtac 72315  T
Q  301 agtctacttaagttaactaaac 322  Q
    |||||||| ||| ||| |||||    
T  72314 agtctactgaagataaataaac 72293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 206 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 1107 - 959
Alignment:
Q  206 gtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtct 305  Q
    |||||||||| |||||||||||||  | || ||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  1107 gtatagaccccgcacgtaaggatcgccgtgtgatcagtaggttcagcttgacaaccgactaagttagaacgtctcaatgatctcatcacttttatagtct 1008  T
Q  306 acttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    | ||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  1007 aattaagataattaaacgcgacatgaatgttatttaattccaacaaaat 959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 335
Target Start/End: Original strand, 1223 - 1511
Alignment:
Q  48 ggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatca 146  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| | |||| ||| || ||||||||||||||||||||    | |||||||||||||||| |||||    
T  1223 ggaacattggccttaattgcctttggaaatttaggaatgccaatataaagtctatgtttcaattacctttgagggcgtaagaccccacacgtaaggatca 1322  T
Q  147 ttatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaatagg 246  Q
    |  |  ||  || ||||| |  |   |||   ||||||||||||| ||| |   ||||| |||||||||  ||| ||||||||| ||||| ||||| | |    
T  1323 tcgtatgaccagtaggtggaactcaacattagagggatagacctaaatcgatcgagataatatagaccccacacataaggatcaccatgcaatcaacaag 1422  T
Q  247 tgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgt 335  Q
    |||||||||| |||| |  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  1423 tgcagcttggaaacttattaagttagaacggcccaacgacctcatcacttgtacagtctacttaagataaataaatacgacatgaatgt 1511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 70418 - 70239
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtt 104  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||||||||  |||| |   ||||| |||| |||||||||||| ||||||   |||| | ||||||||||||| | |    
T  70418 tgtgttatgagtgtcctaag-ttcatagatggacagacttaagggaaccttggccttcattgccttaggaaacactggaaagccaatttaagtttacgct 70320  T
Q  105 tcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||    
T  70319 tcaattgcatttgaattagcaagaccccgcacataaggatcactatgcgatcagcaggtgcacttagccattggagggata 70239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1869 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1869
Description:

Target: scaffold1869; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 185
Target Start/End: Original strand, 57 - 153
Alignment:
Q  89 aatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||   ||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  57 aatttaagtttatgtttcaattacgtttgaattagaaagaccttgcacgtaaggatcaccatgcgatgagcaggtgcatttagccatcggagggata 153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 21819 - 21643
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaa-gtttatgtttcaa 108  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||   ||||| |||  |||||||||||| ||||||   |||| | || | ||| |||||||||||||    
T  21819 tatgagtgtcctaagattcataaacgggaagacctaagggaaccttgtccttcattgccttgggaaacaatggaaagccattataaagtttatgtttcaa 21720  T
Q  109 ttacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||  |||||| |||||||||||| || ||||  |||||||    
T  21719 ttacctttgaattagcaagaccctgtacgtaaggatcatcgtgcgatcagcaggtgcagtgagtcatcagagggata 21643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 179 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 35945 - 35802
Alignment:
Q  179 agggatagacctagatcaacaaagatagtatagaccctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttag-aacgt 277  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||   | | |  | ||||| |||||    
T  35945 agggatagacctag-tcaactgagatagtatagaccccgcacataaggatcattatgcgatcaacaggtgcagcttgatgattaattaggttagtaacgt 35847  T
Q  278 cccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    ||||| || || |||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  35846 cccaatggcctaatcacttgtatagtctacctaagataaataaac 35802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 185
Target Start/End: Original strand, 103826 - 103923
Alignment:
Q  88 caatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || | || |||||   |||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  103826 caatttaagtttatatttcaattacctttgaattagcacgaccccgcatgcaaggatcaccgtgcgattagcaagtgtagttagccatcggagggata 103923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 268 - 348
Target Start/End: Original strand, 89636 - 89716
Alignment:
Q  268 gttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaa 348  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  89636 gttagaacgtcccaacgacctcatcacttagatagtctacttaagataactaaatgcgacatgaatgttatttaattccaa 89716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 51298 - 51168
Alignment:
Q  82 gaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagg 181  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||   |||||| | || ||||| |||||||||   ||    
T  51298 gaacatcaatttaagtatatgtttcaattaactttgaattaacaagaccccacacataaggatcaccgtgcgatcaacaagtgcaattagccatcagtgg 51199  T
Q  182 gatagacctagatcaacaaagatagtatagaccc 215  Q
    |||||||   ||||||   |||||||||||||||    
T  51198 gatagac---gatcaattgagatagtatagaccc 51168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 176
Target Start/End: Original strand, 163698 - 163785
Alignment:
Q  89 aatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatc 176  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||    
T  163698 aatttaagttcatgcttcaattacctttgaattaacaagaccacacacgttaagatcattttgtgaccagcatgtgcatttagccatc 163785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 176
Target Start/End: Original strand, 181305 - 181392
Alignment:
Q  89 aatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatc 176  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||  || ||  |||| ||||| |||||||||    
T  181305 aatttaagttcatgcttcaattacctttgaattaacaagaccacacacgttaagatcatcgtgtgaccagcatgtgcaattagccatc 181392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 354
Target Start/End: Original strand, 2599 - 2685
Alignment:
Q  268 gttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaaatccaataaaat 354  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  2599 gttagaacgtcctaacggcctcatcatttgtacagtctactaaagataactaaacgcgacctgaatgttatttaattccaacaaaat 2685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 81683 - 81615
Alignment:
Q  274 acgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  81683 acgtcccaacggcctcatcacttgtatagtttaccaaagataaataaacacaacatgactgttatttaa 81615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26396 - 26269
Alignment:
Q  3 ggtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatg 102  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||   | ||   ||||| |||| ||||||| |||| |||||    |||| | |||||||||||||||    
T  26396 ggtgtgctatgagcgtcctaagattcatagatgggctaaactaatggaaccttggccttcatttccttgggaaaaactggaatgccaatttaagtttatg 26297  T
Q  103 tttcaattacctttgaattagcaagacc 130  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  26296 tttcaattacctttaaattaacaagacc 26269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 81 - 147
Target Start/End: Original strand, 17374 - 17440
Alignment:
Q  81 ggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcat 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| ||| ||||||    
T  17374 ggaacgtcaatttaagtctatgtttcaattacctttgaattaacaaaatccctcacataaggatcat 17440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16058 - 15980
Alignment:
Q  107 aattacctttgaattagcaagaccccacacgtaaagatcattatgcgatgagcaggtgcagttagccatcgaagggata 185  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || ||   |||||| | || |||||||||||||||| |||||||    
T  16058 aattacctttgaattagcaaaaccctgcacgtaaggaccaccgtgcgatcaacatgtgcagttagccatcggagggata 15980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 48 - 110
Target Start/End: Original strand, 27566 - 27628
Alignment:
Q  48 ggaacattggtcttcattgcctttggaaacctaggaacgtcaatttaagtttatgtttcaatt 110  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27566 ggaaccttggccttcattgccttgggaaacattggaacgccaatttaagtttatgtttcaatt 27628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 132
Target Start/End: Original strand, 96424 - 96475
Alignment:
Q  81 ggaacgtcaatttaagtttatgtttcaattacctttgaattagcaagacccc 132  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  96424 ggaacgccaatttaagtctatatttcaattacctttgaattaacaagacccc 96475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0502 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0502
Description:

Target: scaffold0502; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 212 - 341
Target Start/End: Original strand, 394 - 523
Alignment:
Q  212 accctgcacgtaaggatcatcatgcgatcaataggtgcagcttggcaactgacaaagttagaacgtcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaa 311  Q
    |||| |||||||||||||| | || |||||  |||||||||||| |||| ||| | |||| |||||| |||||  |||||||||  |||| | |||||||    
T  394 accccgcacgtaaggatcaccgtgtgatcagaaggtgcagcttgacaaccgactaggttaaaacgtctcaacgaactcatcactaatatattttacttaa 493  T
Q  312 gttaactaaacacaacatgaatgttattta 341  Q
    | ||  ||||||| | ||||||| ||||||    
T  494 gatagataaacacgatatgaatgctattta 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11470 - 11405
Alignment:
Q  277 tcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaacacaacatgaatgttatttaa 342  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||| | |||||| ||||||||||    
T  11470 tcccaacggcctcatcacttgtatagtttacccaagataaataaacgcgacatgactgttatttaa 11405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 11716 - 11656
Alignment:
Q  10 tatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcctt 70  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |  |||| |||| ||||||||||||    
T  11716 tatgagtgtcctaagattcatagatgggcggacctacatgaaccttggccttcattgcctt 11656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3824 - 3779
Alignment:
Q  277 tcccaacggtctcatcacttgtatagtctacttaagttaactaaac 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  3824 tcccaacggcctcatcacttgtatagtctacctaagataaataaac 3779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1156 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1156
Description:

Target: scaffold1156; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 109 - 69
Alignment:
Q  4 gtgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagacct 44  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  109 gtgtgctatgagtgtcctaagatttatagatgggaagacct 69  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0756 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0756
Description:

Target: scaffold0756; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 69
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4609
Alignment:
Q  5 tgtgatatgagtttcctaagattcatagatgggaagaccttccggaacattggtcttcattgcct 69  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||   ||||| |||| |||||||||||    
T  4545 tgtgctatgagtgtcctaagattcatagatggacagacctaagggaaccttggccttcattgcct 4609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University