View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2324_high_1 (Length: 950)

Name: NF2324_high_1
Description: NF2324
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2324_high_1
NF2324_high_1
[»] chr6 (50 HSPs)
chr6 (547-939)||(21894235-21894635)
chr6 (549-773)||(23648174-23648399)
chr6 (585-739)||(6104646-6104801)
chr6 (576-746)||(31099983-31100154)
chr6 (576-746)||(34232876-34233054)
chr6 (576-746)||(10856140-10856311)
chr6 (581-774)||(12140812-12141012)
chr6 (556-773)||(20563380-20563606)
chr6 (575-714)||(5301602-5301742)
chr6 (576-714)||(2442432-2442571)
chr6 (576-714)||(12297372-12297511)
chr6 (576-714)||(30811149-30811288)
chr6 (576-746)||(31451923-31452093)
chr6 (549-714)||(12432621-12432786)
chr6 (576-713)||(34439690-34439828)
chr6 (576-714)||(558367-558507)
chr6 (575-714)||(33540726-33540866)
chr6 (576-714)||(20804997-20805136)
chr6 (576-714)||(32731766-32731905)
chr6 (576-714)||(14227536-14227674)
chr6 (576-714)||(34685016-34685154)
chr6 (577-714)||(5942997-5943138)
chr6 (576-714)||(6709696-6709835)
chr6 (576-714)||(28076430-28076569)
chr6 (576-741)||(33453743-33453909)
chr6 (576-714)||(3108006-3108146)
chr6 (578-754)||(3636601-3636777)
chr6 (624-732)||(5893876-5893984)
chr6 (576-686)||(1806343-1806454)
chr6 (576-714)||(11015597-11015736)
chr6 (576-714)||(29823036-29823175)
chr6 (613-770)||(15591088-15591252)
chr6 (578-714)||(7317611-7317748)
chr6 (575-714)||(5681526-5681666)
chr6 (579-714)||(31049344-31049480)
chr6 (626-757)||(26561408-26561539)
chr6 (575-770)||(7292486-7292689)
chr6 (587-714)||(2970693-2970821)
chr6 (628-774)||(9896766-9896917)
chr6 (604-714)||(32563244-32563355)
chr6 (624-740)||(15131360-15131476)
chr6 (576-651)||(29414974-29415050)
chr6 (576-651)||(34903967-34904043)
chr6 (575-645)||(3832351-3832422)
chr6 (655-748)||(11443033-11443133)
chr6 (604-709)||(1225468-1225573)
chr6 (547-713)||(19415258-19415426)
chr6 (701-748)||(22756562-22756609)
chr6 (668-714)||(29414924-29414970)
chr6 (668-714)||(34904047-34904093)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (546-878)||(13969952-13970289)
chr8 (581-774)||(39746879-39747073)
chr8 (546-746)||(31688018-31688219)
chr8 (576-774)||(3427561-3427760)
chr8 (576-746)||(43276739-43276910)
chr8 (576-746)||(41313382-41313553)
chr8 (576-754)||(32099543-32099723)
chr8 (576-746)||(45141416-45141594)
chr8 (576-714)||(31581701-31581840)
chr8 (576-714)||(36681447-36681586)
chr8 (576-714)||(38780668-38780807)
chr8 (576-714)||(44827317-44827456)
chr8 (546-739)||(2855060-2855253)
chr8 (576-746)||(1893809-1893981)
chr8 (576-712)||(17081661-17081798)
chr8 (578-714)||(28716673-28716810)
chr8 (576-714)||(25023313-25023452)
chr8 (576-714)||(27781109-27781248)
chr8 (578-712)||(28709316-28709451)
chr8 (576-714)||(31478083-31478222)
chr8 (576-714)||(32541230-32541369)
chr8 (576-714)||(39702313-39702452)
chr8 (576-749)||(9210993-9211167)
chr8 (576-714)||(39871272-39871410)
chr8 (545-714)||(43849207-43849377)
chr8 (578-714)||(8270915-8271052)
chr8 (578-714)||(42142735-42142872)
chr8 (575-714)||(44157203-44157343)
chr8 (576-714)||(6338325-6338464)
chr8 (576-714)||(17115545-17115684)
chr8 (578-749)||(34395311-34395485)
chr8 (627-746)||(36112809-36112928)
chr8 (576-714)||(41693906-41694048)
chr8 (576-714)||(10618813-10618952)
chr8 (576-714)||(11298041-11298180)
chr8 (576-714)||(16422836-16422975)
chr8 (604-714)||(35243352-35243462)
chr8 (578-714)||(22877925-22878062)
chr8 (552-770)||(8436461-8436687)
chr8 (579-714)||(38171427-38171563)
chr8 (576-714)||(3511225-3511364)
chr8 (576-714)||(39320066-39320205)
chr8 (604-714)||(2642418-2642528)
chr8 (581-781)||(1363725-1363926)
chr8 (576-714)||(23676878-23677018)
chr8 (578-714)||(24652277-24652413)
chr8 (579-714)||(7378858-7378994)
chr8 (576-774)||(29189659-29189865)
chr8 (576-714)||(40223084-40223222)
chr8 (576-735)||(37587697-37587858)
chr8 (578-714)||(37560529-37560666)
chr8 (627-714)||(11741103-11741190)
chr8 (579-714)||(36590146-36590282)
chr8 (654-746)||(42203371-42203463)
chr8 (580-746)||(2732313-2732485)
chr8 (578-714)||(40045409-40045546)
chr8 (634-714)||(9370316-9370397)
chr8 (653-714)||(13888326-13888387)
chr8 (575-714)||(40551813-40551954)
chr8 (654-748)||(39677442-39677543)
chr8 (554-774)||(14649121-14649338)
chr8 (669-755)||(37801089-37801175)
chr8 (649-714)||(44263388-44263453)
chr8 (627-714)||(22957368-22957455)
chr8 (581-655)||(35151009-35151085)
chr8 (575-645)||(42203452-42203523)
chr8 (654-709)||(44318316-44318371)
chr8 (628-774)||(18410884-18411030)
chr8 (638-702)||(26293837-26293901)
chr8 (638-702)||(26307094-26307158)
chr8 (683-773)||(14171677-14171767)
chr8 (620-710)||(26036984-26037074)
[»] chr5 (84 HSPs)
chr5 (18-324)||(26358862-26359167)
chr5 (576-774)||(11100693-11100892)
chr5 (575-774)||(648537-648737)
chr5 (576-746)||(4221432-4221603)
chr5 (576-746)||(39246796-39246966)
chr5 (576-746)||(9587145-9587317)
chr5 (604-764)||(13936228-13936388)
chr5 (575-714)||(15530441-15530581)
chr5 (575-714)||(43402450-43402590)
chr5 (576-714)||(2236507-2236646)
chr5 (576-746)||(2671421-2671592)
chr5 (576-714)||(6603901-6604040)
chr5 (576-714)||(12774583-12774722)
chr5 (576-714)||(14647348-14647487)
chr5 (576-714)||(24793979-24794118)
chr5 (576-714)||(30299705-30299844)
chr5 (576-714)||(39744533-39744672)
chr5 (576-714)||(5381935-5382073)
chr5 (576-714)||(13228464-13228602)
chr5 (578-714)||(36685825-36685962)
chr5 (576-714)||(5997885-5998024)
chr5 (576-714)||(8023975-8024114)
chr5 (576-714)||(12713319-12713458)
chr5 (576-714)||(27130340-27130479)
chr5 (576-714)||(30412603-30412742)
chr5 (576-714)||(35235718-35235857)
chr5 (548-714)||(36027982-36028149)
chr5 (545-714)||(5521274-5521444)
chr5 (576-746)||(29392066-29392236)
chr5 (576-741)||(6893343-6893508)
chr5 (572-775)||(2497566-2497770)
chr5 (579-714)||(31168978-31169114)
chr5 (576-714)||(1711194-1711333)
chr5 (576-714)||(5591595-5591734)
chr5 (576-714)||(9160683-9160822)
chr5 (576-714)||(32381665-32381804)
chr5 (576-714)||(32382856-32382995)
chr5 (585-714)||(7651656-7651786)
chr5 (576-714)||(12363603-12363743)
chr5 (576-714)||(19347712-19347852)
chr5 (578-714)||(19525758-19525895)
chr5 (586-714)||(35639957-35640086)
chr5 (576-714)||(1174791-1174930)
chr5 (576-714)||(10697276-10697415)
chr5 (576-748)||(16474778-16474958)
chr5 (576-714)||(19956299-19956437)
chr5 (576-714)||(26699097-26699236)
chr5 (576-714)||(26968830-26968969)
chr5 (579-714)||(4379267-4379404)
chr5 (586-714)||(2178777-2178906)
chr5 (578-746)||(13156845-13157014)
chr5 (576-712)||(30774185-30774322)
chr5 (576-714)||(35236658-35236798)
chr5 (578-714)||(39275432-39275569)
chr5 (576-714)||(3670285-3670424)
chr5 (590-714)||(22977196-22977322)
chr5 (576-714)||(11062898-11063038)
chr5 (618-774)||(13921776-13921930)
chr5 (627-714)||(15443515-15443602)
chr5 (576-746)||(3669548-3669719)
chr5 (576-714)||(11663882-11664021)
chr5 (576-714)||(6280446-6280584)
chr5 (635-737)||(32321630-32321732)
chr5 (578-714)||(3037416-3037553)
chr5 (654-767)||(7896599-7896711)
chr5 (581-770)||(9627082-9627279)
chr5 (581-706)||(23920469-23920595)
chr5 (655-774)||(28812345-28812466)
chr5 (581-729)||(41471885-41472035)
chr5 (634-714)||(27005845-27005925)
chr5 (575-714)||(42323598-42323738)
chr5 (660-746)||(25872187-25872273)
chr5 (654-714)||(4657592-4657652)
chr5 (654-714)||(6349426-6349486)
chr5 (580-770)||(18480497-18480689)
chr5 (641-771)||(11780118-11780248)
chr5 (669-773)||(813769-813871)
chr5 (551-590)||(21773013-21773052)
chr5 (501-544)||(26364365-26364408)
chr5 (627-686)||(31407981-31408040)
chr5 (585-645)||(7896549-7896610)
chr5 (552-591)||(13515830-13515869)
chr5 (575-609)||(4657679-4657713)
chr5 (625-655)||(8645625-8645655)
[»] chr3 (98 HSPs)
chr3 (548-939)||(44946976-44947380)
chr3 (576-794)||(37489850-37490068)
chr3 (576-774)||(42217671-42217870)
chr3 (583-772)||(33897840-33898030)
chr3 (576-746)||(8872881-8873052)
chr3 (576-746)||(46247937-46248108)
chr3 (581-754)||(2598608-2598782)
chr3 (576-746)||(43525751-43525922)
chr3 (576-770)||(193405-193600)
chr3 (576-714)||(37088292-37088431)
chr3 (576-746)||(40479994-40480165)
chr3 (576-746)||(44748759-44748930)
chr3 (576-746)||(48942999-48943168)
chr3 (575-754)||(39876621-39876801)
chr3 (576-714)||(16127144-16127283)
chr3 (576-714)||(29081286-29081425)
chr3 (576-714)||(35499609-35499748)
chr3 (576-714)||(37528728-37528867)
chr3 (576-746)||(37713938-37714109)
chr3 (576-774)||(39719362-39719560)
chr3 (576-714)||(40563368-40563507)
chr3 (576-714)||(44845632-44845771)
chr3 (576-754)||(46318724-46318904)
chr3 (576-714)||(24536559-24536698)
chr3 (576-714)||(26540968-26541107)
chr3 (576-714)||(28676895-28677034)
chr3 (576-714)||(32026414-32026553)
chr3 (576-714)||(38185778-38185917)
chr3 (576-714)||(45345013-45345152)
chr3 (576-714)||(52794903-52795042)
chr3 (576-746)||(54541908-54542079)
chr3 (579-714)||(54672185-54672320)
chr3 (578-746)||(21707161-21707330)
chr3 (550-754)||(41246231-41246436)
chr3 (579-714)||(2579932-2580068)
chr3 (579-714)||(29718206-29718341)
chr3 (622-714)||(51003302-51003394)
chr3 (579-714)||(52857907-52858043)
chr3 (576-754)||(55305067-55305253)
chr3 (576-714)||(4240286-4240425)
chr3 (576-714)||(19948323-19948462)
chr3 (576-714)||(24628204-24628343)
chr3 (576-714)||(25570387-25570526)
chr3 (576-714)||(53779039-53779178)
chr3 (576-714)||(46627502-46627642)
chr3 (576-712)||(48378234-48378371)
chr3 (578-714)||(49853048-49853185)
chr3 (578-774)||(52595279-52595476)
chr3 (579-714)||(2121839-2121974)
chr3 (576-714)||(38891991-38892130)
chr3 (576-714)||(46972041-46972180)
chr3 (581-714)||(29203032-29203166)
chr3 (579-714)||(47897611-47897747)
chr3 (581-774)||(20450471-20450672)
chr3 (576-714)||(45368618-45368757)
chr3 (576-714)||(52166095-52166234)
chr3 (582-714)||(2851831-2851964)
chr3 (578-714)||(50317034-50317171)
chr3 (579-714)||(30864438-30864573)
chr3 (582-714)||(51709026-51709158)
chr3 (632-748)||(52868150-52868266)
chr3 (576-686)||(47173576-47173687)
chr3 (627-714)||(21603858-21603945)
chr3 (576-714)||(41518369-41518508)
chr3 (576-714)||(50499770-50499909)
chr3 (576-714)||(52225293-52225432)
chr3 (578-754)||(33391913-33392097)
chr3 (575-741)||(37713109-37713286)
chr3 (576-672)||(39469921-39470018)
chr3 (582-714)||(42497008-42497141)
chr3 (578-665)||(41785819-41785907)
chr3 (575-713)||(30548751-30548890)
chr3 (581-714)||(7041074-7041208)
chr3 (578-714)||(42465032-42465169)
chr3 (579-714)||(12063733-12063869)
chr3 (548-608)||(13285924-13285984)
chr3 (634-714)||(45693391-45693471)
chr3 (701-847)||(44810813-44810956)
chr3 (576-754)||(35100195-35100368)
chr3 (576-672)||(44545238-44545335)
chr3 (634-770)||(25146380-25146523)
chr3 (627-690)||(24350294-24350357)
chr3 (576-754)||(30814215-30814394)
chr3 (635-741)||(612120-612226)
chr3 (642-714)||(5506704-5506776)
chr3 (604-693)||(9338792-9338882)
chr3 (645-710)||(32982921-32982986)
chr3 (658-746)||(52931118-52931206)
chr3 (635-714)||(22257721-22257800)
chr3 (578-690)||(27446437-27446550)
chr3 (576-665)||(45693460-45693550)
chr3 (627-672)||(43740325-43740370)
chr3 (576-618)||(5505859-5505902)
chr3 (576-618)||(52788684-52788727)
chr3 (669-740)||(55118562-55118633)
chr3 (701-755)||(5506770-5506824)
chr3 (669-748)||(41538407-41538492)
chr3 (585-665)||(8133040-8133121)
[»] chr1 (92 HSPs)
chr1 (545-939)||(7780921-7781326)
chr1 (576-746)||(18347369-18347539)
chr1 (576-746)||(44718924-44719095)
chr1 (576-746)||(13121537-13121708)
chr1 (576-746)||(38967417-38967587)
chr1 (576-746)||(39826611-39826782)
chr1 (581-771)||(46056354-46056545)
chr1 (576-746)||(17046740-17046911)
chr1 (576-714)||(3270670-3270808)
chr1 (576-714)||(36301090-36301228)
chr1 (576-746)||(7710907-7711078)
chr1 (576-770)||(25134859-25135054)
chr1 (576-714)||(26843762-26843901)
chr1 (576-748)||(34086977-34087150)
chr1 (578-746)||(47134484-47134653)
chr1 (576-773)||(52703030-52703235)
chr1 (576-714)||(1918036-1918175)
chr1 (576-714)||(2497933-2498072)
chr1 (576-746)||(25601997-25602168)
chr1 (576-714)||(34318417-34318556)
chr1 (576-714)||(42064302-42064441)
chr1 (576-774)||(50540783-50540982)
chr1 (578-714)||(44909853-44909990)
chr1 (575-774)||(49240206-49240406)
chr1 (576-714)||(26204285-26204424)
chr1 (576-714)||(29586169-29586308)
chr1 (576-714)||(31150410-31150549)
chr1 (576-714)||(49220458-49220597)
chr1 (576-714)||(30721608-30721748)
chr1 (578-714)||(38676502-38676639)
chr1 (579-714)||(17499870-17500006)
chr1 (576-714)||(322876-323015)
chr1 (588-714)||(16085596-16085723)
chr1 (576-714)||(19898893-19899032)
chr1 (576-714)||(29374341-29374480)
chr1 (576-714)||(29704069-29704208)
chr1 (576-714)||(36838680-36838819)
chr1 (576-714)||(50351043-50351182)
chr1 (585-741)||(44956298-44956455)
chr1 (580-774)||(3391135-3391337)
chr1 (576-714)||(32368324-32368463)
chr1 (576-714)||(33524539-33524678)
chr1 (581-774)||(46087918-46088119)
chr1 (577-714)||(15348836-15348974)
chr1 (578-714)||(15313257-15313393)
chr1 (576-714)||(34319400-34319539)
chr1 (578-714)||(37703680-37703820)
chr1 (576-754)||(46369816-46370001)
chr1 (576-714)||(1507728-1507868)
chr1 (579-714)||(49185170-49185306)
chr1 (579-714)||(50171282-50171418)
chr1 (576-714)||(3660956-3661095)
chr1 (581-714)||(13570778-13570912)
chr1 (579-741)||(30495153-30495313)
chr1 (627-714)||(49822152-49822239)
chr1 (604-722)||(2028953-2029071)
chr1 (645-774)||(33151975-33152111)
chr1 (576-714)||(36043285-36043425)
chr1 (576-714)||(51422969-51423109)
chr1 (576-708)||(9769964-9770095)
chr1 (578-714)||(37672335-37672477)
chr1 (581-714)||(5697493-5697627)
chr1 (578-714)||(30774098-30774231)
chr1 (576-672)||(33561922-33562019)
chr1 (583-714)||(42614120-42614248)
chr1 (604-748)||(42963868-42964012)
chr1 (627-714)||(22098981-22099068)
chr1 (627-714)||(43727084-43727171)
chr1 (581-714)||(8221220-8221354)
chr1 (548-679)||(28429017-28429144)
chr1 (624-741)||(10628787-10628903)
chr1 (549-645)||(52071222-52071319)
chr1 (583-714)||(28868996-28869128)
chr1 (638-714)||(40887949-40888025)
chr1 (641-748)||(41004937-41005051)
chr1 (635-770)||(27659294-27659429)
chr1 (576-714)||(39583107-39583246)
chr1 (644-754)||(40719554-40719664)
chr1 (576-672)||(2479171-2479268)
chr1 (651-741)||(9169142-9169232)
chr1 (657-754)||(7024916-7025013)
chr1 (579-714)||(46928969-46929105)
chr1 (575-645)||(33632268-33632339)
chr1 (655-714)||(6814118-6814177)
chr1 (576-714)||(36379131-36379270)
chr1 (625-714)||(912714-912803)
chr1 (658-774)||(9894931-9895054)
chr1 (635-773)||(31259501-31259641)
chr1 (661-713)||(40935893-40935945)
chr1 (581-645)||(6814062-6814128)
chr1 (703-774)||(19715386-19715457)
chr1 (654-685)||(52071202-52071233)
[»] chr4 (118 HSPs)
chr4 (654-878)||(24954050-24954282)
chr4 (576-748)||(36196878-36197051)
chr4 (548-748)||(20511385-20511586)
chr4 (576-746)||(55495849-55496020)
chr4 (581-774)||(4465412-4465606)
chr4 (575-774)||(11050319-11050520)
chr4 (576-746)||(31678973-31679144)
chr4 (548-714)||(56270092-56270259)
chr4 (576-739)||(35777362-35777526)
chr4 (576-714)||(22430639-22430778)
chr4 (576-746)||(37115252-37115423)
chr4 (576-714)||(42116900-42117039)
chr4 (576-714)||(46895287-46895426)
chr4 (576-749)||(35580911-35581085)
chr4 (576-749)||(55829008-55829182)
chr4 (578-714)||(4517192-4517329)
chr4 (576-714)||(8829816-8829955)
chr4 (576-714)||(11151940-11152079)
chr4 (576-714)||(28307259-28307398)
chr4 (576-746)||(29663933-29664104)
chr4 (627-774)||(42085663-42085810)
chr4 (576-714)||(45906143-45906282)
chr4 (576-714)||(53407193-53407332)
chr4 (578-714)||(12233968-12234105)
chr4 (582-714)||(21369890-21370023)
chr4 (581-741)||(32101709-32101869)
chr4 (575-746)||(33114978-33115157)
chr4 (575-741)||(37047031-37047199)
chr4 (576-746)||(43225646-43225818)
chr4 (576-774)||(21633750-21633956)
chr4 (576-714)||(7706376-7706515)
chr4 (576-714)||(18582848-18582987)
chr4 (576-714)||(27397767-27397906)
chr4 (576-746)||(47417444-47417615)
chr4 (576-714)||(52669998-52670137)
chr4 (576-714)||(56372439-56372578)
chr4 (547-739)||(20148778-20148973)
chr4 (578-714)||(8941910-8942047)
chr4 (549-774)||(41864021-41864248)
chr4 (576-714)||(3009715-3009854)
chr4 (576-714)||(4355593-4355732)
chr4 (576-714)||(11600687-11600826)
chr4 (576-714)||(19513883-19514022)
chr4 (576-714)||(22038358-22038497)
chr4 (576-714)||(22892532-22892671)
chr4 (576-714)||(22944196-22944335)
chr4 (576-714)||(23867870-23868009)
chr4 (576-714)||(29413535-29413674)
chr4 (576-714)||(39087559-39087698)
chr4 (611-714)||(43078197-43078300)
chr4 (553-770)||(52707937-52708161)
chr4 (549-770)||(30562794-30563015)
chr4 (576-714)||(37970299-37970437)
chr4 (576-714)||(55764564-55764702)
chr4 (576-714)||(4391709-4391848)
chr4 (576-714)||(4939387-4939525)
chr4 (576-714)||(25440485-25440624)
chr4 (576-746)||(37831926-37832096)
chr4 (550-714)||(26826499-26826664)
chr4 (581-714)||(31338501-31338637)
chr4 (634-746)||(33005077-33005189)
chr4 (576-714)||(4392727-4392865)
chr4 (576-714)||(25235149-25235288)
chr4 (635-754)||(31435070-31435189)
chr4 (576-714)||(35190617-35190756)
chr4 (578-708)||(35468021-35468152)
chr4 (576-714)||(35822300-35822439)
chr4 (576-714)||(55684699-55684838)
chr4 (587-714)||(5465411-5465540)
chr4 (604-714)||(55358339-55358449)
chr4 (635-736)||(48056585-48056686)
chr4 (585-768)||(8716865-8717049)
chr4 (576-774)||(23113410-23113616)
chr4 (627-714)||(9031996-9032083)
chr4 (576-714)||(9043611-9043751)
chr4 (635-770)||(50502304-50502440)
chr4 (638-749)||(40497362-40497473)
chr4 (576-714)||(44442086-44442224)
chr4 (576-714)||(55856528-55856664)
chr4 (632-714)||(27185633-27185715)
chr4 (586-746)||(31953164-31953330)
chr4 (581-738)||(38048854-38049012)
chr4 (628-754)||(44525694-44525820)
chr4 (576-746)||(15635946-15636124)
chr4 (548-608)||(38489338-38489398)
chr4 (627-714)||(30366147-30366234)
chr4 (627-714)||(51011066-51011153)
chr4 (635-737)||(1031352-1031453)
chr4 (653-794)||(31011003-31011143)
chr4 (576-691)||(53273122-53273238)
chr4 (549-645)||(24954271-24954375)
chr4 (576-665)||(33005178-33005268)
chr4 (654-774)||(17715647-17715767)
chr4 (627-714)||(23162657-23162745)
chr4 (669-784)||(2320099-2320214)
chr4 (576-686)||(29656722-29656833)
chr4 (636-774)||(52713559-52713704)
chr4 (576-645)||(17715588-17715658)
chr4 (581-741)||(39068835-39068996)
chr4 (581-645)||(42124729-42124794)
chr4 (657-746)||(45780726-45780815)
chr4 (654-714)||(42124680-42124740)
chr4 (581-651)||(3932300-3932371)
chr4 (654-740)||(40119903-40119996)
chr4 (576-651)||(36008069-36008145)
chr4 (578-656)||(29656597-29656676)
chr4 (627-714)||(36486386-36486473)
chr4 (581-661)||(34032641-34032724)
chr4 (579-754)||(53224244-53224410)
chr4 (669-770)||(12928952-12929053)
chr4 (655-775)||(26443389-26443516)
chr4 (547-607)||(6902232-6902292)
chr4 (658-714)||(49239220-49239276)
chr4 (604-714)||(32948184-32948295)
chr4 (576-645)||(25199366-25199436)
chr4 (576-645)||(45780807-45780877)
chr4 (670-774)||(3932183-3932294)
chr4 (627-672)||(35842638-35842683)
[»] chr7 (71 HSPs)
chr7 (576-746)||(42375759-42375929)
chr7 (575-741)||(46757716-46757884)
chr7 (575-746)||(19831966-19832138)
chr7 (576-714)||(35587587-35587726)
chr7 (578-746)||(17192418-17192586)
chr7 (576-714)||(31511308-31511447)
chr7 (576-714)||(36246384-36246523)
chr7 (576-714)||(42587391-42587530)
chr7 (576-714)||(43254111-43254250)
chr7 (576-714)||(45686924-45687063)
chr7 (576-714)||(47470970-47471109)
chr7 (576-746)||(47587081-47587251)
chr7 (576-746)||(36436162-36436332)
chr7 (578-714)||(21254705-21254842)
chr7 (578-746)||(21313765-21313936)
chr7 (572-748)||(27869536-27869713)
chr7 (576-714)||(10312037-10312176)
chr7 (576-714)||(27089664-27089803)
chr7 (576-714)||(27188498-27188637)
chr7 (576-714)||(40637168-40637307)
chr7 (576-740)||(11466021-11466186)
chr7 (576-714)||(21741979-21742119)
chr7 (576-714)||(23029797-23029937)
chr7 (582-714)||(40106013-40106146)
chr7 (579-714)||(9485727-9485863)
chr7 (576-714)||(21374641-21374780)
chr7 (579-714)||(33026888-33027023)
chr7 (576-714)||(45222081-45222220)
chr7 (576-714)||(43134413-43134551)
chr7 (579-714)||(17844555-17844691)
chr7 (576-714)||(482990-483129)
chr7 (576-741)||(1342784-1342957)
chr7 (576-714)||(27655681-27655820)
chr7 (576-714)||(44743725-44743864)
chr7 (576-714)||(48832061-48832200)
chr7 (627-741)||(22642232-22642346)
chr7 (554-714)||(40893357-40893519)
chr7 (579-714)||(33203676-33203812)
chr7 (576-714)||(9487415-9487554)
chr7 (576-714)||(40258865-40259004)
chr7 (576-714)||(44596618-44596757)
chr7 (628-741)||(35000773-35000886)
chr7 (576-714)||(19757524-19757663)
chr7 (576-714)||(28425619-28425758)
chr7 (576-714)||(34709241-34709380)
chr7 (576-714)||(36407236-36407375)
chr7 (579-714)||(48313432-48313567)
chr7 (577-693)||(21316613-21316730)
chr7 (576-714)||(46879532-46879672)
chr7 (579-714)||(791341-791477)
chr7 (585-737)||(45672312-45672464)
chr7 (627-714)||(12345075-12345162)
chr7 (576-672)||(32168841-32168938)
chr7 (586-714)||(48590732-48590861)
chr7 (575-714)||(36612119-36612257)
chr7 (576-754)||(38481288-38481467)
chr7 (576-714)||(49148340-49148479)
chr7 (701-774)||(33609070-33609143)
chr7 (576-708)||(48620466-48620598)
chr7 (581-683)||(24170758-24170860)
chr7 (604-714)||(38531191-38531300)
chr7 (660-774)||(47584185-47584299)
chr7 (624-714)||(22621466-22621556)
chr7 (654-740)||(48729549-48729635)
chr7 (627-675)||(21358644-21358692)
chr7 (604-711)||(39229920-39230027)
chr7 (548-590)||(21358551-21358593)
chr7 (578-679)||(21740188-21740290)
chr7 (688-746)||(32168940-32168998)
chr7 (701-739)||(40893513-40893551)
chr7 (704-770)||(44072787-44072853)
[»] chr2 (82 HSPs)
chr2 (581-793)||(15250115-15250335)
chr2 (576-794)||(34884815-34885035)
chr2 (580-774)||(24019895-24020090)
chr2 (576-754)||(4385482-4385661)
chr2 (576-746)||(5039780-5039951)
chr2 (576-746)||(31616351-31616522)
chr2 (548-714)||(39167729-39167895)
chr2 (576-714)||(43507559-43507698)
chr2 (581-785)||(4055900-4056112)
chr2 (576-714)||(37356173-37356313)
chr2 (576-774)||(38842840-38843046)
chr2 (576-714)||(650777-650916)
chr2 (576-714)||(3377397-3377536)
chr2 (576-714)||(4453520-4453659)
chr2 (576-714)||(9886997-9887136)
chr2 (576-714)||(15521484-15521623)
chr2 (576-714)||(16486887-16487026)
chr2 (576-714)||(17263750-17263889)
chr2 (576-714)||(28382677-28382816)
chr2 (576-754)||(29514839-29515024)
chr2 (576-714)||(36712533-36712672)
chr2 (576-714)||(38579005-38579144)
chr2 (576-749)||(6760566-6760740)
chr2 (578-714)||(8815220-8815357)
chr2 (578-714)||(41322763-41322900)
chr2 (579-714)||(8688959-8689095)
chr2 (578-714)||(26911519-26911655)
chr2 (576-714)||(2266149-2266288)
chr2 (576-714)||(2546321-2546460)
chr2 (576-746)||(4038305-4038476)
chr2 (576-714)||(24402049-24402188)
chr2 (576-746)||(43135622-43135793)
chr2 (576-749)||(40869321-40869495)
chr2 (635-736)||(16669117-16669218)
chr2 (576-714)||(21865251-21865391)
chr2 (576-773)||(23356915-23357121)
chr2 (579-714)||(7400388-7400524)
chr2 (576-714)||(13111739-13111879)
chr2 (579-714)||(36999497-36999633)
chr2 (576-714)||(10393032-10393171)
chr2 (576-749)||(41796704-41796878)
chr2 (576-714)||(6232277-6232416)
chr2 (576-714)||(40024939-40025078)
chr2 (576-714)||(44275668-44275806)
chr2 (635-754)||(2758896-2759015)
chr2 (582-708)||(7213664-7213791)
chr2 (576-714)||(10839577-10839716)
chr2 (581-770)||(7823481-7823678)
chr2 (578-714)||(13527901-13528038)
chr2 (576-714)||(38880779-38880919)
chr2 (576-770)||(5520002-5520204)
chr2 (576-739)||(41877734-41877908)
chr2 (583-772)||(2221401-2221598)
chr2 (669-763)||(6807492-6807586)
chr2 (575-754)||(42132670-42132851)
chr2 (576-739)||(6222611-6222775)
chr2 (575-714)||(8070617-8070757)
chr2 (578-746)||(43285629-43285794)
chr2 (636-748)||(25071436-25071555)
chr2 (578-673)||(18212127-18212223)
chr2 (654-774)||(13761842-13761960)
chr2 (629-713)||(9053128-9053212)
chr2 (620-746)||(37674469-37674595)
chr2 (576-754)||(10727835-10728021)
chr2 (666-746)||(13351569-13351649)
chr2 (669-755)||(3337166-3337252)
chr2 (657-746)||(18710257-18710346)
chr2 (658-746)||(6153427-6153515)
chr2 (604-714)||(598925-599035)
chr2 (578-714)||(8339986-8340123)
chr2 (545-590)||(22375924-22375969)
chr2 (581-754)||(33850081-33850256)
chr2 (576-645)||(13761784-13761853)
chr2 (641-714)||(2047318-2047391)
chr2 (703-774)||(2757312-2757383)
chr2 (670-746)||(12738544-12738620)
chr2 (657-712)||(7569853-7569908)
chr2 (581-645)||(13351649-13351714)
chr2 (581-618)||(16664354-16664391)
chr2 (578-618)||(18710197-18710238)
chr2 (635-708)||(26411311-26411384)
chr2 (628-693)||(32627644-32627709)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (576-739)||(9237-9401)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (576-739)||(84262-84427)
scaffold0016 (548-714)||(93386-93552)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (576-714)||(22602-22741)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (576-714)||(126760-126899)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (579-746)||(30145-30313)
scaffold0197 (576-714)||(28076-28224)
[»] scaffold1632 (1 HSPs)
scaffold1632 (576-714)||(37-176)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (576-714)||(192020-192159)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (552-714)||(431241-431404)
scaffold0002 (635-714)||(119239-119318)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (576-714)||(12717-12856)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (627-746)||(52989-53108)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (554-714)||(72765-72927)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (575-714)||(63850-63990)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (576-714)||(7064-7203)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (638-749)||(4562-4673)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (627-746)||(5468-5586)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (576-686)||(27162-27274)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (581-693)||(8984-9096)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (638-706)||(10833-10901)
[»] scaffold1360 (2 HSPs)
scaffold1360 (581-651)||(1295-1366)
scaffold1360 (670-774)||(1178-1289)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (626-759)||(59134-59266)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (696-756)||(11850-11910)
[»] scaffold0027 (2 HSPs)
scaffold0027 (657-714)||(41765-41822)
scaffold0027 (576-645)||(41814-41884)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (549-609)||(50373-50433)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (576-609)||(36362-36395)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (708-741)||(32580-32613)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 267; Significance: 1e-148; HSPs: 50)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 547 - 939
Target Start/End: Original strand, 21894235 - 21894635
Alignment:
Q  547 tagggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttat 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||      ||||||||||||||| ||||    
T  21894235 tagggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaaaactctgtttg------tcttttcaccacgagattat 21894328  T
Q  645 agcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagct-------tatagcttatcatcttttcttccatttttaccc 737  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21894329 agcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacgc 21894428  T
Q  738 ttatcattttaattaaaactcacttttaccctttatatattaaaacacatttattacattttctatgttttccctctatacttttttgttcctacgtttc 837  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21894429 ttatcattttaattaaaacccactcttaccctttatatattaaaacacatttattacgttttctatgttttccctctatatttttttgttcctacgtttc 21894528  T
Q  838 cagttcctatatacttccaatttagtacaactcaac--------tactcttcaaataaataaataaaactactcgagcatattttttgagcatatttttc 929  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894529 cagttcctatatacttccaatttagtacaactcaactactcgagtactcttcaaataaata---aaaactactcgagcatattttttgagcatatttttc 21894625  T
Q  930 atatattcat 939  Q
    ||||||||||    
T  21894626 atatattcat 21894635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 549 - 773
Target Start/End: Original strand, 23648174 - 23648399
Alignment:
Q  549 gggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatag 646  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||    
T  23648174 gggtctgtttggtaagcccattaaatgagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctctctt-accacgagcttatag 23648272  T
Q  647 cttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   | |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23648273 cttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcttctgagcttatagctttttatcttttgttccatttttacccttattattt 23648372  T
Q  747 taattaaaactcacttttaccctttat 773  Q
    ||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  23648373 taactaaaagtcaaatttaccctttat 23648399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 585 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 6104801 - 6104646
Alignment:
Q  585 cttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgct 683  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  6104801 cttataagctcgtttgaccaaaaaagctctgtttggtaatggtctttcaccacgagcttatagcttatttcgcgagcttataagctatttttcagatact 6104702  T
Q  684 atttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccctt 739  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  6104701 atttcaagtagcgtttgagcttatagcttatcattttttctttcatctttaccctt 6104646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 31100154 - 31099983
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31100154 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 31100055  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31100054 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 31099983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 34233054 - 34232876
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34233054 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 34232955  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta-------tcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||       |||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  34232954 tcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcattttttcttccaattttacccttattattt 34232876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 10856140 - 10856311
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10856140 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 10856239  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||  | |||||||||||| ||||    
T  10856240 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttttaattttacccttattattt 10856311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 581 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 12141012 - 12140812
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagac 680  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  12141012 atagcttataagctcgtatgacaaaaaaactttgtttagtaatgctttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaa 12140913  T
Q  681 gctatttcaagtatagtttgagcttatagc-------ttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttat 773  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||       |||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  12140912 gctatttcaagtagcgtttgaacttatagcttatagcttattatcttttgttccttttttacccttattattttaactaaaattcatatttaccctttat 12140813  T
Q  774 a 774  Q
    |    
T  12140812 a 12140812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 556 - 773
Target Start/End: Original strand, 20563380 - 20563606
Alignment:
Q  556 tttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatagcttatt 652  Q
    ||||||||  |||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  20563380 tttggtaagtccattaaatgagcttatagtttataagcttgtttgataaaaaaaagctctgtttgataatgctctctt-accacgagcttatagcttatt 20563478  T
Q  653 tcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagc-------ttatcatcttttcttccatttttacccttatcatt 745  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||||||||||||       || | ||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  20563479 tcacgagcttataaactatttttcagaagctatttcaagtagcatctgagcttatagcttttagttttttatcttttgttccatttttacccttattatt 20563578  T
Q  746 ttaattaaaactcacttttaccctttat 773  Q
    |||| ||||| |||  ||||||||||||    
T  20563579 ttaactaaaagtcatatttaccctttat 20563606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 575 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 5301742 - 5301602
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5301742 gagcttatagcttataagctcgtatgacaaaaaaagttctgtttggtaatgttttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 5301643  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  5301642 ttcagaagctattccaagtagcgtttaagcttatagcttat 5301602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 2442432 - 2442571
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2442432 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 2442531  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  2442532 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 2442571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 12297372 - 12297511
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12297372 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 12297471  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  12297472 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 12297511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 30811288 - 30811149
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30811288 agcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 30811189  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  30811188 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 30811149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 31452093 - 31451923
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  31452093 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctgtttt 31451994  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31451993 tcagaagctattccaagtagtgtttgagctta-agcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 31451923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 549 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 12432786 - 12432621
Alignment:
Q  549 gggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagc 647  Q
    |||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||    
T  12432786 gggtctgtttggaaaa-ccaaaaaaagagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaatctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagc 12432688  T
Q  648 ttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  12432687 ttatttcacgagcttataagctatttttcagaagccattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 12432621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 713
Target Start/End: Original strand, 34439690 - 34439828
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaa-aactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34439690 agcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 34439789  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta 713  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  34439790 tcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagctta 34439828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 558367 - 558507
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  558367 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 558466  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  558467 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 558507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 575 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 33540866 - 33540726
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33540866 gagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatttcacgagcttataatctattt 33540767  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  33540766 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 33540726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 20804997 - 20805136
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20804997 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 20805096  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  20805097 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 20805136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 32731766 - 32731905
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32731766 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 32731865  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  32731866 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 32731905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 14227674 - 14227536
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14227674 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaagctttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 14227575  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  14227574 cagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 14227536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 34685154 - 34685016
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34685154 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacattttcac-atgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 34685056  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  34685055 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 34685016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 577 - 714
Target Start/End: Original strand, 5942997 - 5943138
Alignment:
Q  577 gcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac----tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5942997 gcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaaaaagttctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 5943096  T
Q  673 tttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  5943097 tttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttat 5943138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 6709835 - 6709696
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  6709835 agcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgaaattataaactatttt 6709736  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  6709735 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 6709696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 28076430 - 28076569
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||| ||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28076430 agcttatagcttataaactcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 28076529  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  28076530 tgagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 28076569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 576 - 741
Target Start/End: Original strand, 33453743 - 33453909
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33453743 agcttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 33453842  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttat 741  Q
    ||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||  ||||| ||||||| ||||    
T  33453843 tcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcacttttaattccaattttaccgttat 33453909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 3108146 - 3108006
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagctta-tttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3108146 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctatttggtaacactttttcaccatgagcttataacttaatttcacgagcttataagctattt 3108047  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  3108046 ttcagaagctatttcaaatagcgtttgagcttatagcttat 3108006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 578 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 3636777 - 3636601
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3636777 cttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 3636678  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    || |||||| ||||||   ||||| |||||||||| |||  |||  ||| | |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  3636677 gaagctattccaagtagcctttgaacttatagcttctcacttttaattctagttttacccttattattctaactaaa 3636601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 624 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 5893984 - 5893876
Alignment:
Q  624 gtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttc 723  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  5893984 gtcttttcaccacaagcttttagcttattttactagcttataacttattttccagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatcatctttta 5893885  T
Q  724 ttccatttt 732  Q
    |||||||||    
T  5893884 ttccatttt 5893876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 1806454 - 1806343
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1806454 agcttatagcttataagctcgtttgactaaaaaatctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 1806355  T
Q  675 tcagacgctatt 686  Q
    ||||| ||||||    
T  1806354 tcagaagctatt 1806343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 11015597 - 11015736
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaa-aactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  11015597 agcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaatactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttacaagctatttt 11015696  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  11015697 tgagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttat 11015736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 29823175 - 29823036
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||    
T  29823175 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacattttttcaccatgagctaatagcttattttgcgagcttataagttatttt 29823076  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| | ||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  29823075 tcaaaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagcttat 29823036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 613 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 15591252 - 15591088
Alignment:
Q  613 tgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctt 712  Q
    |||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||    
T  15591252 tgtttgataacggttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttataactt 15591153  T
Q  713 a-------tcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctt 770  Q
    |       |||  |||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  15591152 atagcgtgtcacttttaattccaattttacccttattattttaattaaaatccacttttaccctt 15591088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 7317748 - 7317611
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||||| |||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7317748 cttatagcttataagttcgtttcacagaaaaagctctgtttggtaacattttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 7317649  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  7317648 agaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttat 7317611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 575 - 714
Target Start/End: Original strand, 5681526 - 5681666
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||| |||||| |||||||||  ||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5681526 gagcttataacttataagttcttttgacaaaaaaagctctgtttggcaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 5681625  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  5681626 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttat 5681666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Original strand, 31049344 - 31049480
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||||| || |||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  31049344 ttatagcttataagttcgtctgacaaaaaaaactttgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttga 31049443  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  31049444 gaagctattccaaatagtgtttgagcttatagcttat 31049480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 626 - 757
Target Start/End: Original strand, 26561408 - 26561539
Alignment:
Q  626 cttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttctt 725  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |  |||||||  |||| ||    
T  26561408 ctttttacaacgagcttatagtttatttcaggagcttataacttatttttcaaacgctatttcaagtagcgtttgagcttttcacttatcactttttatt 26561507  T
Q  726 ccatttttacccttatcattttaattaaaact 757  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26561508 ttatttttacccttatcattttaattaaaact 26561539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 575 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 7292689 - 7292486
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||||| |  |||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  7292689 gagcttatagcttataagctcgtcggataaaaaaagctctgtttgataacgcttttttacaatgagcttatagcttatttcagaagcttataagctattt 7292590  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta-------tcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttac 766  Q
    |||| | |||| ||||||||  ||||||||||||||||||       |||  |||  ||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  7292589 ttcataagctacttcaagtaacgtttgagcttatagcttatagcgtctcacttttaattccagttttactcttattattttaattaaaatccacttttac 7292490  T
Q  767 cctt 770  Q
    ||||    
T  7292489 cctt 7292486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 587 - 714
Target Start/End: Original strand, 2970693 - 2970821
Alignment:
Q  587 tataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctat 685  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||  |||| |||    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  2970693 tataagctcgtttgacaaaaaaagctcaatttggtaacacttttttaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataatctatttttcagaagctat 2970792  T
Q  686 ttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | ||||||  |||||||||||||||||||    
T  2970793 tccaagtagcgtttgagcttatagcttat 2970821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 628 - 774
Target Start/End: Original strand, 9896766 - 9896917
Alignment:
Q  628 tttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttg-------agcttatagcttatcatctt 720  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||       ||||||||||||||||  ||    
T  9896766 tttcaccacgagcttatagtttatttcacaagcttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcgtttgagttaatagcttatagcttatca--tt 9896863  T
Q  721 ttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    || ||||| |||||||| |||  ||||| |||||| ||  ||||||||||||||    
T  9896864 tttttccaattttacccatattgttttatttaaaattcttttttaccctttata 9896917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 604 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 32563355 - 32563244
Alignment:
Q  604 aaaaaactctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgag 702  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  32563355 aaaaaactctgtttggtaacgatctttccacaacgagcttataacttatttcagaagcttataatttatttttcagacgctatttcaaatagtgtttgag 32563256  T
Q  703 cttatagcttat 714  Q
     ||||| |||||    
T  32563255 attataacttat 32563244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 624 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 15131476 - 15131360
Alignment:
Q  624 gtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttc 723  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| || | ||||||   |||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||| | ||||     
T  15131476 gtcttttcatcacgagcttataacttattttactaacttatagcttatttttcagacgctatttcaagtagcatttaagcatatagcttatctttttttt 15131377  T
Q  724 ttccatttttaccctta 740  Q
    || ||  ||||||||||    
T  15131376 tttcaaatttaccctta 15131360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 576 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 29415050 - 29414974
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttat 651  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||    
T  29415050 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 29414974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 576 - 651
Target Start/End: Original strand, 34903967 - 34904043
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttat 651  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||    
T  34903967 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 34904043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 3832422 - 3832351
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgac-caaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttata 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  3832422 gagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctatttggtaatggtctttcaccacgagcttata 3832351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 655 - 748
Target Start/End: Original strand, 11443033 - 11443133
Alignment:
Q  655 acgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagctta-------tagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcatttt 747  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||       || |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  11443033 acgagcttataacctattttccagactctatttcaagtagcgtttgagcttatatcttttaacttatcatcttttcttccatttatatccttattatttt 11443132  T
Q  748 a 748  Q
    |    
T  11443133 a 11443133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 604 - 709
Target Start/End: Original strand, 1225468 - 1225573
Alignment:
Q  604 aaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagc 703  Q
    |||||| ||||||||||||    |||||| || |||||||||  ||||||||| || |||||| |||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||    
T  1225468 aaaaaaatctgtttgataacactttttcatcaagagcttatattttatttcacaagtttataagctattttttagaagttatttcaagtagcgtttgagc 1225567  T
Q  704 ttatag 709  Q
    ||||||    
T  1225568 ttatag 1225573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 547 - 713
Target Start/End: Original strand, 19415258 - 19415426
Alignment:
Q  547 tagggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataat-gtcttttcaccacgagcttat 644  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||  | | |||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||  ||||| |   ||  |||||||    
T  19415258 tagggtctgtttggtaaggcctgtaaattaacctatagcttataagctcgtatgtccaaaaaagctccgtttggtaaacgtcttcttgtcagaagcttat 19415357  T
Q  645 agcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta 713  Q
    ||| | |||||||||||| |    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  19415358 agcgtttttcacgagcttgttgcttatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagtttatagctta 19415426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 701 - 748
Target Start/End: Original strand, 22756562 - 22756609
Alignment:
Q  701 agcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcatttta 748  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  22756562 agcttatagtctatcatcttttcttccatttatacccttattatttta 22756609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 668 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 29414970 - 29414924
Alignment:
Q  668 ctatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  29414970 ctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttat 29414924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 668 - 714
Target Start/End: Original strand, 34904047 - 34904093
Alignment:
Q  668 ctatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  34904047 ctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 34904093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 546 - 878
Target Start/End: Original strand, 13969952 - 13970289
Alignment:
Q  546 ttagggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttat 644  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  13969952 ttagggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgatcaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccacgagcttat 13970051  T
Q  645 agcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcat 744  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13970052 agcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattcgaagtagcgtttgagcttatagcttatcatattttcttccatttttacccttatcat 13970151  T
Q  745 tttaattaaaactcacttttaccctttatatattaaaacacatttattacattttctatgttttccctctatacttttttgttcctacgtttccagttcc 844  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13970152 tttaattaaaacccacttttaccctttatatattaacacacatttattacgttttctatgttttccctctatatttttttgttcctacgtttccagttcc 13970251  T
Q  845 tatatacttccaat----ttagtacaactcaactactc 878  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  13970252 tatatacttccaatttaattagtacaactcaactactc 13970289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 581 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 39747073 - 39746879
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39747073 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaagctctgtttggtaatgttttttcaccacgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcaga 39746974  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
     |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||  |||||  ||||| ||  ||||||||||||||    
T  39746973 tgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttataattttttcttccaattttacccttattgttttatctaaaattcttttttaccctttata 39746879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 546 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 31688219 - 31688018
Alignment:
Q  546 ttagggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttat 644  Q
    |||||||||||||||| || ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||    
T  31688219 ttagggtctgtttggttaaccccaaaaaagagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttat 31688120  T
Q  645 agcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcat 744  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||    
T  31688119 agcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattat 31688020  T
Q  745 tt 746  Q
    ||    
T  31688019 tt 31688018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 576 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 3427760 - 3427561
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3427760 agcttataggttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcaccatgaccttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 3427661  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    | ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||    
T  3427660 ttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcaatatttcttccatttttacccttaatattttatctaaaattcatttttatcctttata 3427561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 43276910 - 43276739
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43276910 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 43276811  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43276810 tcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 43276739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 41313382 - 41313553
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41313382 agcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 41313481  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41313482 tcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 41313553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 576 - 754
Target Start/End: Original strand, 32099543 - 32099723
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32099543 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaatctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 32099642  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    |||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  32099643 ttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcacttttaattccagttttacccttattattctaactaaa 32099723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 45141594 - 45141416
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45141594 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 45141495  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta-------tcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||       ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  45141494 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcaccttttcttccaattttacccttattattt 45141416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 31581701 - 31581840
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31581701 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 31581800  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  31581801 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 31581840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 36681586 - 36681447
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36681586 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 36681487  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  36681486 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 36681447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 38780668 - 38780807
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38780668 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttgacaatgatttttcaccacgaacttataacttattttacgagcttataaactatttt 38780767  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  38780768 tcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 38780807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 44827456 - 44827317
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44827456 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 44827357  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  44827356 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 44827317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 546 - 739
Target Start/End: Original strand, 2855060 - 2855253
Alignment:
Q  546 ttagggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttat 644  Q
    ||||||||||||||||||   ||  ||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||  |||| ||| || |||||||||||||    
T  2855060 ttagggtctgtttggtaagcacactaaatgagcttataacttataagttcgtttgacaaaaaagttctgtttggcaatgatctctt-accacgagcttat 2855158  T
Q  645 agcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccctt 739  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||    
T  2855159 agcttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttattattttttcctccatctttaccctt 2855253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 1893981 - 1893809
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac--tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1893981 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 1893882  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1893881 ttcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 1893809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 576 - 712
Target Start/End: Original strand, 17081661 - 17081798
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17081661 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 17081760  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctt 712  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  17081761 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 17081798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 28716673 - 28716810
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28716673 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 28716772  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  28716773 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 28716810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 25023313 - 25023452
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25023313 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 25023412  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  25023413 ttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 25023452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 27781109 - 27781248
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27781109 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 27781208  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| | |||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  27781209 tcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 27781248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 578 - 712
Target Start/End: Original strand, 28709316 - 28709451
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28709316 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 28709415  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctt 712  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  28709416 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 28709451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 31478083 - 31478222
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31478083 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 31478182  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| | |||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  31478183 tcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 31478222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 32541230 - 32541369
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32541230 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 32541329  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| | |||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  32541330 tcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 32541369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 39702313 - 39702452
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39702313 agcttatagcttataagctcgtttgacataaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 39702412  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  39702413 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 39702452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 576 - 749
Target Start/End: Original strand, 9210993 - 9211167
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||| |||||||||    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9210993 agcttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaagctccgtttgataacactttttgaccatgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttt 9211092  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaa 749  Q
    ||||| |||||  ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  9211093 tcagaagctatcccaagtagcgtttgagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaa 9211167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 39871272 - 39871410
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39871272 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaagctctatttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 39871371  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  39871372 cagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttat 39871410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 545 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 43849377 - 43849207
Alignment:
Q  545 cttagggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagctta 643  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  || ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    |||| || |||||||||    
T  43849377 cttagggtctgtttggtaagcccatttaatgagcttataacttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaattttttacaacgagctta 43849278  T
Q  644 tagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  43849277 tagcttattttatgagcttataagctatttttcagatgctattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 43849207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 8270915 - 8271052
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8270915 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 8271014  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  8271015 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 8271052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 42142872 - 42142735
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42142872 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 42142773  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  42142772 agaagctattccaaatagtgtttgagcttatagcttat 42142735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 575 - 714
Target Start/End: Original strand, 44157203 - 44157343
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44157203 gagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaattctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 44157302  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  44157303 ttgagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 44157343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 6338325 - 6338464
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6338325 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 6338424  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  6338425 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 6338464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 17115545 - 17115684
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17115545 agcttatagcttataagctcgtttgaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 17115644  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  17115645 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttat 17115684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 578 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 34395485 - 34395311
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaacta-tttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  34395485 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaactctgtttgataacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 34395386  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaa 749  Q
    ||||| ||||||  |||||  |||||| |||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  34395385 tcagaagctattcaaagtagcgtttgaacttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaa 34395311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 627 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 36112928 - 36112809
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttc 726  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  36112928 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttc 36112829  T
Q  727 catttttacccttatcattt 746  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  36112828 caattttacccttattattt 36112809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 41694048 - 41693906
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaa----aactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactat 671  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||     | ||||||||| |||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41694048 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaatttttagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctat 41693949  T
Q  672 ttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  41693948 ttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 41693906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 10618813 - 10618952
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactct-gtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| | | ||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10618813 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 10618912  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  10618913 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 10618952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 11298180 - 11298041
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11298180 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacattttttcatcatcagcttatagcttatttcacgagcttataagatatttt 11298081  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  11298080 tcagaagctattccaaataacgtttgagcttatagcttat 11298041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 16422836 - 16422975
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422836 agcttatagcctataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttagtaacactttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 16422935  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  16422936 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 16422975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 604 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 35243462 - 35243352
Alignment:
Q  604 aaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagc 703  Q
    ||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  35243462 aaaaagctctgtttagtgatgtcttttcaccacgagcttatatcttatttcacgagcttataagttatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagc 35243363  T
Q  704 ttatagcttat 714  Q
    |||||||||||    
T  35243362 ttatagcttat 35243352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 22878062 - 22877925
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22878062 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 22877963  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| ||||||   ||||  |||||||||||||||||||    
T  22877962 agaagctattctcagtagcgtttgagcttatagcttat 22877925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 552 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 8436687 - 8436461
Alignment:
Q  552 tctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagctta 650  Q
    |||||||| |||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |  |||| || |||| |||||||||||    
T  8436687 tctgtttgataagcccatctaatgagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttgataacgattttttacaacgaacttatagctta 8436588  T
Q  651 tttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagc-------ttatcatcttttcttccatttttacccttatca 743  Q
    ||| | ||||||||||  ||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||||||       ||||||| |||| |||||||| |||||||| ||    
T  8436587 ttttatgagcttataagttatttttcagatgctattacaaatatcgtttgaacttatagcttatagcttatcatgttttattccatttatacccttacca 8436488  T
Q  744 ttttaattaaaactcacttttaccctt 770  Q
     ||||| |||||| ||  |||||||||    
T  8436487 ctttaactaaaacccatgtttaccctt 8436461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 38171563 - 38171427
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  38171563 ttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttgttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttgtttttca 38171464  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  38171463 gaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 38171427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 3511225 - 3511364
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||| ||||| |||||  ||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3511225 agcttatagcttataagttcgtctgacgaaaaaaactcagtttggtaatgctttttagccatgagcttgtagcttatttcacgagcttataagctatttt 3511324  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  3511325 tcagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagcttat 3511364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 39320205 - 39320066
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39320205 agcttatagcttataaattcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 39320106  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||    
T  39320105 tcagaagctattccaagtagcgttcgagcttataacttat 39320066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 604 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 2642528 - 2642418
Alignment:
Q  604 aaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagc 703  Q
    ||||| ||||||||| |||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  2642528 aaaaagctctgtttggtaatattttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagc 2642429  T
Q  704 ttatagcttat 714  Q
    |||||||||||    
T  2642428 ttatagcttat 2642418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 581 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 1363926 - 1363725
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||| | |||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  1363926 atagcttataagcttgtttgactaaaaaatttctgtttggtaatatttttttaccatgagcttataacttatttcacgagtttataagctattattcaga 1363827  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttatatatta 779  Q
    |||||||  |||||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |  ||||| |||||| ||||||  |||||  || ||||| ||||| || ||||    
T  1363826 cgctattctaagtagcgtttgaacttatagcttaacattttttctttccattttatccttattattttatctaaaatacatttttatcctttttaaatta 1363727  T
Q  780 aa 781  Q
    ||    
T  1363726 aa 1363725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 23676878 - 23677018
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac--tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||| |||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23676878 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctctttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgaacttataagctattt 23676977  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  23676978 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 23677018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 24652277 - 24652413
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  24652277 cttatagcttataagctcgtttgacaaagaaagttctgtttggtaaca-cttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagccatttttt 24652375  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  24652376 agaagctatttcaagtagcatttgagcttatagcttat 24652413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Original strand, 7378858 - 7378994
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||||||||||| |||| |||| ||| || ||||||||| ||| |  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7378858 ttatagcttataagttcgtctgacaaaagaagctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttca 7378957  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7378958 gaagctacttcaagtagtgtttgagcttatagcttat 7378994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 576 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 29189865 - 29189659
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  | |||| ||||||||  ||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  29189865 agcttatagcttataaactcgtttgataagaaaagctctgtttagtaacggttttttactacgagcttatagcttatttcacgagcttatatgttatttt 29189766  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgag-------cttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttacc 767  Q
    | ||| |||||| ||||||  |||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  || |||||||    
T  29189765 taagaagctattccaagtagcgtttgagcttacagcttatagcttctcatcttttcttccatttttacccttattattttatctaaaatccaattttacc 29189666  T
Q  768 ctttata 774  Q
    | |||||    
T  29189665 cattata 29189659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 40223222 - 40223084
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa---ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||| |||     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40223222 agcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaaagctctgtttggtaacac--tttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttat-aactatt 40223126  T
Q  673 tttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  40223125 tttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 40223084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 576 - 735
Target Start/End: Complemental strand, 37587858 - 37587697
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac--tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  37587858 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttattt 37587759  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttac 735  Q
    |||||| | |||| ||||||  |||||||||| |||||| |||  ||||||| || ||||||    
T  37587758 ttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttttagcttctcactttttctttcaattttac 37587697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 37560666 - 37560529
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||    |||| | || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37560666 cttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgatcatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 37560567  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  37560566 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 37560529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 627 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 11741190 - 11741103
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  11741190 tttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaatctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 11741103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Original strand, 36590146 - 36590282
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac--tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||   |||||||| |||    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36590146 ttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaaaattctgtttggtaacacttttttaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttc 36590245  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  36590246 agaagctattccaagtagcgtttgagctt-tagcttat 36590282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 654 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 42203463 - 42203371
Alignment:
Q  654 cacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42203463 cacgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttctcacattttcttccaattttacccttattattt 42203371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 580 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 2732485 - 2732313
Alignment:
Q  580 tatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactc-tgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatagcttatt----tcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||| | || |||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||    | || || |||| |  |||||    
T  2732485 tatagtttataagtttgtttgacaaaaataatcctgtttgataacggtcttttcaccacgaacttataacttattaattttacaagtttattacttattt 2732386  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||||||| ||||||||||   |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  2732385 ttcagacgttatttcaagtggtgtttgaacttatatcttatcatcttttattccatttttacccttattattt 2732313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 40045409 - 40045546
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataa-tgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaact-atttt 674  Q
    |||||||||||||||||| |  ||| |||||| | ||||||| ||| ||| |||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||| || |||||    
T  40045409 cttatagcttataagctcataggactaaaaaagccctgtttggtaactgt-ttttcatcaagagcttatagctttttt-actagcttataagcttatttt 40045506  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40045507 tcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 40045546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 634 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 9370397 - 9370316
Alignment:
Q  634 cacgagcttatagctt-atttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9370397 cacgagcttataactttatttcacgagcttataagctatttttcaaaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 9370316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 653 - 714
Target Start/End: Original strand, 13888326 - 13888387
Alignment:
Q  653 tcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  13888326 tcacgagcttataaactatttttcagacgctattccaagtagcgtttaagcttatagcttat 13888387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 575 - 714
Target Start/End: Original strand, 40551813 - 40551954
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactc---tgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactat 671  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||      | |||| |||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  40551813 gagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaataaaattatttggtaacattttttcaccatgagtttatagcttatttcatgagcttat-agctat 40551911  T
Q  672 ttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||| ||||    
T  40551912 ttttcagaagctatttcagatagcgtttgagcttatagtttat 40551954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 654 - 748
Target Start/End: Original strand, 39677442 - 39677543
Alignment:
Q  654 cacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagct-------tatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39677442 cacgagcttataagctatttttcaaaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttcttccatttatacccttattattt 39677541  T
Q  747 ta 748  Q
    ||    
T  39677542 ta 39677543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 554 - 774
Target Start/End: Original strand, 14649121 - 14649338
Alignment:
Q  554 tgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataat-gtcttttcaccacgagcttatagcttat 651  Q
    |||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| | | ||||| |||  |||||||||  |||||  |||| |||||    
T  14649121 tgtttggtaaggccaggaagctagcttatagcttataagctcgtttgatgaaaaaagcccagtttggtaacagtcttttcataacgagggtataacttat 14649220  T
Q  652 ttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaatt 751  Q
    ||  ||||||||||   || |||| ||||| |||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||     |||| |||||||||    
T  14649221 tttgcgagcttatagcttagtttttagacgttatttcaaatagcgtttgaacttatagcttattatcttttgttctatttt-----ttattattttaatt 14649315  T
Q  752 aaaactcacttttaccctttata 774  Q
    |||| |||  |||| ||||||||    
T  14649316 aaaattcatatttatcctttata 14649338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 669 - 755
Target Start/End: Complemental strand, 37801175 - 37801089
Alignment:
Q  669 tatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaa 755  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||    
T  37801175 tatttttcatacgctattacaagcagtgtttgaacttataacttatcatcttttattccatttctacccttattattttaactaaaa 37801089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 649 - 714
Target Start/End: Original strand, 44263388 - 44263453
Alignment:
Q  649 tatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44263388 tatttcaggagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 44263453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 714
Target Start/End: Original strand, 22957368 - 22957455
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||| ||||    
T  22957368 tttttaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagttatttttcagaagctattctaagtagtgtttgagtttatagtttat 22957455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 581 - 655
Target Start/End: Original strand, 35151009 - 35151085
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttca 655  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35151009 atagcctataagctcgtatgaacaaaaaaacctctgtttggtaatattttttcaccacgagcttataacttatttca 35151085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 42203523 - 42203452
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttata 645  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    |||||||||||||||||||    
T  42203523 gagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccacgagcttata 42203452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 654 - 709
Target Start/End: Original strand, 44318316 - 44318371
Alignment:
Q  654 cacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatag 709  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||    
T  44318316 cacgagcttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcatttgagcttatag 44318371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 628 - 774
Target Start/End: Original strand, 18410884 - 18411030
Alignment:
Q  628 tttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttcc 727  Q
    ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||   |||||| || | |||||||||| |    ||||| |||||| ||||| || |||| ||      
T  18410884 tttcatcacgagcttatatttaatttcacgagcttatagcttattttccatatgctatttcaaatggcatttgaccttataacttataattttttatttt 18410983  T
Q  728 atttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    | || |||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  18410984 acttctacccttaccattttaactaaaactcatgtttaccctttata 18411030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 638 - 702
Target Start/End: Original strand, 26293837 - 26293901
Alignment:
Q  638 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgag 702  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||    
T  26293837 agcttatagcttatttcacaaatttataagctatttttcagacactattccaagtagcgtttgag 26293901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 638 - 702
Target Start/End: Original strand, 26307094 - 26307158
Alignment:
Q  638 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgag 702  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||    
T  26307094 agcttatagcttatttcacaaatttataagctatttttcagacactattccaagtagcgtttgag 26307158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 683 - 773
Target Start/End: Original strand, 14171677 - 14171767
Alignment:
Q  683 tatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttat 773  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||| | |||| ||||||  |||||  || ||| |||||||||    
T  14171677 tattttaagtagcgtttgagcttatagcttatcattttttattctatttttatctttattattttatctaaaatccattttcaccctttat 14171767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 620 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 26037074 - 26036984
Alignment:
Q  620 taatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagc 710  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||||||| | |||| |||||   ||||||| |||||||    
T  26037074 taatgtttttttaccacgagtttatagtttatttcatgagtttataagttatttttcagatgttattccaagttgcgtttgagtttatagc 26036984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 84)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 18 - 324
Target Start/End: Original strand, 26358862 - 26359167
Alignment:
Q  18 agatcttgtttcgaacttggaaatttcgattttggtgtgttgaagttgttgttggttggttctgtttcgatgtgtatgagggtttgttttatatagaatt 117  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  26358862 agatcttgtttcgagcttcgaaatttcgattttagtgtgttgtagttgttgttggttggttctgtttcgatgtgtatgagggtttgtt--atatagaatt 26358959  T
Q  118 tgagaagataaatgatttgccgttggattaggtggtgatccgtgtgaaggacatattcgatgatatgaaccgttggattaaaaatgattggct-gaaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  26358960 tgagaagataaatgatttgccgttggattgggtggtgatccgtgtgaaggacatattcgatgatatgaaccgttggattacaaatgattggctggaaagg 26359059  T
Q  217 gtgtcacgcggatcgccagcgtggctttcaattttcggaatggcgctaagcaattttgaagtactatcacttaccgctcaggtttatctccaaaataaga 316  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26359060 gtgtcacgcggatcgccagcgtggttttcaattttcggaatggcgctgagcaattttgaagtactatcacttaccgctcaggtttatctccaaaataaaa 26359159  T
Q  317 tttggttg 324  Q
    ||||||||    
T  26359160 tttggttg 26359167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 576 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 11100892 - 11100693
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11100892 agcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgtctttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 11100793  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  11100792 tcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatcattttttcttccatctttacccttattattttaactaaaacccatatttaccctttata 11100693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 648537 - 648737
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  648537 gagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 648636  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttat 773  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||  || ||||| |||||||    
T  648637 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatcaaaatttcttccatttttacccttaatattttatctaaaatccatttttatcctttat 648736  T
Q  774 a 774  Q
    |    
T  648737 a 648737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 4221603 - 4221432
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4221603 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 4221504  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4221503 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 4221432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 39246966 - 39246796
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39246966 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaaca-cttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 39246868  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  39246867 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacacttattattt 39246796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 9587317 - 9587145
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac--tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9587317 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagttctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 9587218  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  9587217 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttattccaattttacccttattattt 9587145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 604 - 764
Target Start/End: Original strand, 13936228 - 13936388
Alignment:
Q  604 aaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagc 703  Q
    ||||| ||||||||| ||| |  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  13936228 aaaaagctctgtttggtaacggttttttacaacgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagacgctatttcaagtagcatttgagc 13936327  T
Q  704 ttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcactttt 764  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13936328 ttatagcttatcactttttattccattattacccttattattttaattaaaacccactttt 13936388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 575 - 714
Target Start/End: Original strand, 15530441 - 15530581
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530441 gagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 15530540  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  15530541 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 15530581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 575 - 714
Target Start/End: Original strand, 43402450 - 43402590
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43402450 gagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 43402549  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  43402550 ttcaaaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 43402590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 2236646 - 2236507
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2236646 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 2236547  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  2236546 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 2236507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 2671421 - 2671592
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2671421 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttt 2671520  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||   ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  2671521 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcgctttttctttcaattttacccttattattt 2671592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 6604040 - 6603901
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6604040 agcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 6603941  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6603940 tcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 6603901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 12774583 - 12774722
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12774583 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 12774682  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  12774683 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 12774722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 14647487 - 14647348
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14647487 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 14647388  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  14647387 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 14647348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 24793979 - 24794118
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24793979 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 24794078  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  24794079 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 24794118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 30299705 - 30299844
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30299705 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 30299804  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  30299805 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 30299844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 39744672 - 39744533
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39744672 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttttgtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 39744573  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  39744572 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 39744533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 5382073 - 5381935
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  5382073 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccacgagcttataacttatttcatgagcttataagctattttt 5381974  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  5381973 cagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 5381935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 13228602 - 13228464
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13228602 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 13228503  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  13228502 cagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 13228464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 36685825 - 36685962
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36685825 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 36685924  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  36685925 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 36685962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 5998024 - 5997885
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5998024 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 5997925  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  5997924 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 5997885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 8024114 - 8023975
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8024114 agcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 8024015  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  8024014 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 8023975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 12713319 - 12713458
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12713319 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 12713418  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  12713419 tcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttat 12713458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 27130340 - 27130479
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27130340 agcttatagcttataagctcttttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 27130439  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  27130440 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 27130479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 30412742 - 30412603
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30412742 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 30412643  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  30412642 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 30412603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 35235857 - 35235718
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35235857 agcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 35235758  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  35235757 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 35235718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 548 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 36028149 - 36027982
Alignment:
Q  548 agggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatag 646  Q
    ||||||||||||||||  ||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||    
T  36028149 agggtctgtttggtaacacctaaaaaagagcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatag 36028050  T
Q  647 cttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  36028049 cttattttacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 36027982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 545 - 714
Target Start/End: Original strand, 5521274 - 5521444
Alignment:
Q  545 cttagggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagctta 643  Q
    |||||||||||||||||||  ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||    
T  5521274 cttagggtctgtttggtaacacccaaaaaagagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagctta 5521373  T
Q  644 tagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||  ||||||| |||||||||||    
T  5521374 tagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagtttatagcttat 5521444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 29392236 - 29392066
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29392236 agcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 29392137  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
     | | |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  29392136 taaaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 29392066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 576 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 6893508 - 6893343
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6893508 agcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactagtttt 6893409  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttat 741  Q
    |||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||  ||| | ||||||||||||    
T  6893408 cagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcatttttaattctagttttacccttat 6893343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 572 - 775
Target Start/End: Original strand, 2497566 - 2497770
Alignment:
Q  572 aacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaacta 670  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || |||||  |||| |||| |||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  2497566 aacgagcttatagcttataagctcgtctaacaaaaaatgctctatttggtaatgctttttcaccatgagattataacttatttcacgagcttataagtta 2497665  T
Q  671 tttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctt 770  Q
    ||||||| | ||||||  || ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  2497666 tttttcaaaagctattctaaatagcgtttgagcttataacttatcatcttttattaaatttttaccgttattattttaattaaattccacttttaccctt 2497765  T
Q  771 tatat 775  Q
     ||||    
T  2497766 aatat 2497770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 31169114 - 31168978
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31169114 ttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaaactctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 31169015  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  31169014 gaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 31168978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 1711333 - 1711194
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1711333 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacaagcttataagctatttt 1711234  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  1711233 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 1711194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 5591595 - 5591734
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  5591595 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttt 5591694  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  5591695 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 5591734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 9160822 - 9160683
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9160822 agcttttaacttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 9160723  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  9160722 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 9160683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 32381804 - 32381665
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32381804 agcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 32381705  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  32381704 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 32381665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 32382856 - 32382995
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32382856 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 32382955  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  32382956 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 32382995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 585 - 714
Target Start/End: Original strand, 7651656 - 7651786
Alignment:
Q  585 cttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgct 683  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  7651656 cttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataatctatttttcagaagct 7651755  T
Q  684 atttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7651756 atttcaagtagtgtttgagcttatagcttat 7651786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 12363743 - 12363603
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac--tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12363743 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctattt 12363644  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  12363643 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 12363603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 19347712 - 19347852
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19347712 agcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 19347811  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  19347812 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 19347852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 19525758 - 19525895
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19525758 cttatagtttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 19525857  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||    
T  19525858 agaagctattccaagcagcgtttgagcttatagcttat 19525895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 586 - 714
Target Start/End: Original strand, 35639957 - 35640086
Alignment:
Q  586 ttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgcta 684  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  35639957 ttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttgataatactttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagcta 35640056  T
Q  685 tttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||||    
T  35640057 ttccaagtagcgtttgagcttatagcttat 35640086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 1174791 - 1174930
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1174791 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 1174890  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  1174891 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 1174930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 10697276 - 10697415
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10697276 agcttatagcttataagctcatttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 10697375  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  10697376 tcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttat 10697415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 748
Target Start/End: Original strand, 16474778 - 16474958
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  16474778 agcttatagcttataaactcgtttgacaaaaatagctctgtttggtaatggtctctt-accacgagcttatagtttatttcacgagattataagctattt 16474876  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttg-------agcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcatttta 748  Q
    || ||| |||||| ||||||  |||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16474877 tttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttcttccatttatacccttattatttta 16474958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 19956437 - 19956299
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  19956437 agcttatagcttataagctcgtttaacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagcta-ttt 19956339  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  19956338 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 19956299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 26699236 - 26699097
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26699236 agcttataggttataagctcgtttgacaaataaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttt 26699137  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  26699136 tcagaggctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 26699097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 26968969 - 26968830
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  26968969 agcttataggttataagctcgtttgacaaataaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttt 26968870  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  26968869 tcagaggctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 26968830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Original strand, 4379267 - 4379404
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||  ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4379267 ttatagcttattagttcgtttgacaaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 4379366  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  4379367 agaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 4379404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 586 - 714
Target Start/End: Original strand, 2178777 - 2178906
Alignment:
Q  586 ttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgcta 684  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  2178777 ttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagcta 2178876  T
Q  685 tttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||||    
T  2178877 ttccaagtagcgtttgagcttatagcttat 2178906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 578 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 13157014 - 13156845
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||    |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13157014 cttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccattaacttatagcttatttcacgagtttataagctatttttc 13156915  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||| |||||| ||||||   |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13156914 agaagctattccaagtagcttttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 13156845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 576 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 30774322 - 30774185
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30774322 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccataagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 30774223  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctt 712  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  30774222 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 30774185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 35236798 - 35236658
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35236798 agcttatagcttataagctcgtttcataaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 35236699  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  35236698 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 35236658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 39275432 - 39275569
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  39275432 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttt 39275531  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  39275532 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 39275569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 3670285 - 3670424
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||| |||    |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3670285 agcttatagcttatgagctcgtttcacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttgaccatgcgcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 3670384  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  3670385 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 3670424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 590 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 22977322 - 22977196
Alignment:
Q  590 aagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctattt 687  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  22977322 aagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataaactatttttcataagctattc 22977223  T
Q  688 caagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||    
T  22977222 caagtagcgtttgagcttatagcttat 22977196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 11063038 - 11062898
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  11063038 agcttatagcttataagctcgtttggcaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcatgagcttataagctattt 11062939  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  11062938 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagtttat 11062898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 618 - 774
Target Start/End: Original strand, 13921776 - 13921930
Alignment:
Q  618 gataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcat 717  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||    
T  13921776 gataatgtttttt-accacgaacttataacttatttcacgagcttaaaagctatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgaacttataacttatcat 13921874  T
Q  718 cttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
     |||||||| | ||||| ||||||  |||||  ||||| ||  ||||||||||||||    
T  13921875 tttttcttctaattttatccttattgttttatctaaaattc-tttttaccctttata 13921930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 627 - 714
Target Start/End: Original strand, 15443515 - 15443602
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  15443515 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttat 15443602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 3669548 - 3669719
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||    |||| ||||  | ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3669548 agcttatagtttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccataaacttgtagcttatttcatgagcttataagctatttt 3669647  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3669648 tcagaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 3669719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 11664021 - 11663882
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||    |||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  11664021 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccataagtttatagcttatttcacgagcttataagttatttt 11663922  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  11663921 tcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttat 11663882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 6280584 - 6280446
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| | |  |||||| || |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  6280584 agcttatagtttataaattcgttcgacaaaaaaactctgtttgatgacgctttttcatcatgagcttatagtttatttcacgggtttataaactattttt 6280485  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || | | |||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  6280484 cataagttatttcaagtagcatttaagcttatagcttat 6280446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 635 - 737
Target Start/End: Complemental strand, 32321732 - 32321630
Alignment:
Q  635 acgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccattttta 734  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  32321732 acgagcttatagcttatttcacgaacttacaacttatttttcagactctatttcaaataacgtttgagcttatagcttataattttttattccatattta 32321633  T
Q  735 ccc 737  Q
    |||    
T  32321632 ccc 32321630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 3037553 - 3037416
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac-tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||  | |||||| |||    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3037553 cttatagcttataagcttgtttgataaaaaaaggtatgtttggtaacacttttttaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 3037454  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  3037453 aaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 3037416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 654 - 767
Target Start/End: Original strand, 7896599 - 7896711
Alignment:
Q  654 cacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaa 753  Q
    ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||    
T  7896599 cacgagcttataagctatttt-caaacgctatttcaaatagcgtttgagtttatagcttataatcttttcttctatttttacccttattattttatctaa 7896697  T
Q  754 aactcacttttacc 767  Q
    || ||| |||||||    
T  7896698 aattcaattttacc 7896711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 581 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 9627279 - 9627082
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||    |||| || | |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  9627279 atagcttataagctcgtcggacaaaaaaaactgtgtttgataacacttttttacaatgagcttatagcttatttcagaagcttataagctatttttcaga 9627180  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta-------tcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctt 770  Q
     |||| ||||||||  ||||||||||||| ||||       |||  |||  ||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  9627179 agctacttcaagtagcgtttgagcttataacttatagtgtctcacttttaattccaattttactcttattattttaattaaaatccacttttaccctt 9627082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 581 - 706
Target Start/End: Original strand, 23920469 - 23920595
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataa-tgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 678  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||| | ||||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23920469 atagcttataagttcgtatgacaaaaatagctctgtttggtaactatcttt-caccaggagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcag 23920567  T
Q  679 acgctatttcaagtatagtttgagctta 706  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||||    
T  23920568 acgctattccaagtagtgtttgaactta 23920595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 655 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 28812466 - 28812345
Alignment:
Q  655 acgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatc--ttttcttccatttttacccttatcattttaatta 752  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  28812466 acgagattataacttatttttcagacgctatttaaaataacgtttgagcttataacttatcattatttttcttccattttaacccatatcattttaatta 28812367  T
Q  753 aaactcacttttaccctttata 774  Q
    ||||| |  |||||| ||||||    
T  28812366 aaacttatgtttaccttttata 28812345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 581 - 729
Target Start/End: Complemental strand, 41472035 - 41471885
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataat-gtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 678  Q
    ||||||||||| ||| | |||| |||||| ||||||||| |||  |||||||||| || | ||| |||||||||||| |||||| ||   |||||| |||    
T  41472035 atagcttataaactcatctgacaaaaaaagctctgtttggtaacagtcttttcacaacaaacttgtagcttatttcaggagcttttagcttattttccag 41471936  T
Q  679 acgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccat 729  Q
    |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  41471935 acgctatttcaaatagtgtttgagcttatagcttattattttttcttccat 41471885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 634 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 27005925 - 27005845
Alignment:
Q  634 cacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27005925 cacgaacttatagcttatttcaagagcttataacttattttccaaacgctatttcaagtaacgtttgagcttatagcttat 27005845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 575 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 42323738 - 42323598
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||  |||||| | ||||||| |||||| ||| |||||  | |||||| | ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  42323738 gagcttatagcttataaattcgtctgataaaaaaagttctgtttggtaatgtttttgcaccataaccttataacatattttacgagtttataagctattt 42323639  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  42323638 ttcagacgctattctaagtagtgtttgagcttatagcttat 42323598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 660 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 25872273 - 25872187
Alignment:
Q  660 cttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  25872273 cttataatttatttttcagaagctattccaagtagagtttgagcttatagcttctcaccttttcttctaattttacccttattattt 25872187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 654 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 4657652 - 4657592
Alignment:
Q  654 cacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4657652 cacgagcttataagctatttttcagaaactatttcaagtagagtttgagcttatagcttat 4657592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 654 - 714
Target Start/End: Original strand, 6349426 - 6349486
Alignment:
Q  654 cacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  6349426 cacgagcttataaactatttttcagacgctattctaagtagcgtttgagcttatagcttat 6349486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 580 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 18480689 - 18480497
Alignment:
Q  580 tatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataat-gtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||||||||  ||  ||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||   ||||||| |    
T  18480689 tatagcttataagctcgtatgactaaaaatgttctgtttgataaacgttattttactacgagcttatatcttatttcacaagcttatagtttatttttta 18480590  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctt 770  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||||||| | |||  |||  || || ||||| |||||| |||||||| | ||  |||||||||||||    
T  18480589 gacgctatctcaagtagcatttgagcttatagcgtctcacttttaatttcagttttatccttattattttaatgacaatccacttttaccctt 18480497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 641 - 771
Target Start/End: Original strand, 11780118 - 11780248
Alignment:
Q  641 ttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccctta 740  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||  |||||||||||||| |||| || |||| |  ||||||||||||||    
T  11780118 ttatagcttttttcgtgagcttataaactattttttagactttattttaagtaacgtttgagcttatagtttataattttttgtctcatttttaccctta 11780217  T
Q  741 tcattttaattaaaactcacttttacccttt 771  Q
    | | ||||| |||||  |  |||||||||||    
T  11780218 ttactttaactaaaatccgattttacccttt 11780248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 669 - 773
Target Start/End: Original strand, 813769 - 813871
Alignment:
Q  669 tatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccc 768  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |  |||||||    
T  813769 tatttttcatacgctatttcaagtag-gtttaaacttataacttat-attttttcttccaattttacccttatcatattaattaaaatttatgtttaccc 813866  T
Q  769 tttat 773  Q
    |||||    
T  813867 tttat 813871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 551 - 590
Target Start/End: Complemental strand, 21773052 - 21773013
Alignment:
Q  551 gtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttata 590  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21773052 gtctgtttggtaaagccatcaaacgaacttatagcttata 21773013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 544
Target Start/End: Original strand, 26364365 - 26364408
Alignment:
Q  501 aaatgatagctctttcattccatagtacatgtagcggatattgg 544  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26364365 aaatgatagctctttcattctatagtacatgtagcggttattgg 26364408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 627 - 686
Target Start/End: Original strand, 31407981 - 31408040
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatt 686  Q
    |||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31407981 ttttcagcacgagttaataacttatttcacgagcttataagctatttgtcagacgctatt 31408040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 585 - 645
Target Start/End: Original strand, 7896549 - 7896610
Alignment:
Q  585 cttataagctcgtttgaccaaaaaactc-tgtttgataatgtcttttcaccacgagcttata 645  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7896549 cttataagtttgtttgaccaaaaaagttatgtttgataatgttttttcaccacgagcttata 7896610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 552 - 591
Target Start/End: Original strand, 13515830 - 13515869
Alignment:
Q  552 tctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataa 591  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13515830 tctgtttggtaaggccatcaaacgaacttatagcttataa 13515869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 575 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 4657713 - 4657679
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa 609  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4657713 gagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa 4657679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 625 - 655
Target Start/End: Complemental strand, 8645655 - 8645625
Alignment:
Q  625 tcttttcaccacgagcttatagcttatttca 655  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8645655 tcttttcaccacgagcttatagcttatttca 8645625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 98)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 548 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 44947380 - 44946976
Alignment:
Q  548 agggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttata-------agctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgag 639  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  44947380 agggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccacgag 44947281  T
Q  640 cttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat-------catcttttcttccatttt 732  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||    
T  44947280 cttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagcagtgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttcttccatttt 44947181  T
Q  733 tacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttatatattaaaacacatttattacattttctatgttttccctctatacttttttgttcctac 832  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||             ||||||||||||||    
T  44947180 tacccttatcattttaattaaaacccacttttaccctttatatattaaaacacatttattacgttttctatgt-------------ttttttgttcctac 44947094  T
Q  833 gtttccagttcctatatacttccaat----ttagtacaactcaac--------tactcttcaaataaataaataaaactactcgagcatattttttgagc 920  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||        ||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  44947093 gtttccagttcctatatacttccaatttaattagtacaactcaactactcgagtactcttcaaataaa-aaaaaaaattactagagcatattttttgagc 44946995  T
Q  921 atatttttcatatattcat 939  Q
    |||||||||||||||||||    
T  44946994 atatttttcatatattcat 44946976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 576 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 37490068 - 37489850
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37490068 agctgatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctatttgttaaagattttccaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 37489969  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    |||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||| |    
T  37489968 tcagacactattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcattttttcttccattttaacccttatcattttaattaaaac-caactttaacctttaaa 37489870  T
Q  775 tattaaaacacatttattac 794  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  37489869 tattaaaacacctttattac 37489850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 576 - 774
Target Start/End: Original strand, 42217671 - 42217870
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42217671 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 42217770  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  42217771 tcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttctcatattttatctcatttttacccttattattttaattaaaatccatgtttaccctttata 42217870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 583 - 772
Target Start/End: Complemental strand, 33898030 - 33897840
Alignment:
Q  583 agcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacg 681  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33898030 agcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagacg 33897931  T
Q  682 ctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttacccttta 772  Q
    ||||| ||| ||  |||||| |||||| |||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||||  |||||  || ||||||||||||    
T  33897930 ctattccaaatagcgtttgaacttataacttatcattttttcttcctattgtacccttattattttatctaaaatccatttttacccttta 33897840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 8872881 - 8873052
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8872881 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctatgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 8872980  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  8872981 tcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttctttcaattttacccttattattt 8873052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 46248108 - 46247937
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46248108 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 46248009  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  46248008 tcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 46247937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 581 - 754
Target Start/End: Original strand, 2598608 - 2598782
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaa-aactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2598608 atagcttataagctcgtttgatcaaaaaaactctgtttggtaatgttttttcaccacaaacttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcaga 2598707  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
     | |||| ||||||  ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  2598708 agttattccaagtagcgtttgagcttataacttatgatcttttattctatttttacccttattagtttaattaaa 2598782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 43525751 - 43525922
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43525751 agcttatagcttataagctcatttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 43525850  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  43525851 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacctttattattt 43525922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 770
Target Start/End: Original strand, 193405 - 193600
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||    |||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  193405 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaatagctctgtttggtaacaattttttacaacgagcttatagcttattttatgagcttataagctatttt 193504  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctt 770  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||  |||||||||    
T  193505 tcagatgctattacaagtagcgtttgagcttatagcttatcatgttttattccatttatacccttaccactttaactaaaacccatgtttaccctt 193600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 37088292 - 37088431
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37088292 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 37088391  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  37088392 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 37088431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 40480165 - 40479994
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  40480165 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattttacgagcttataagctatttt 40480066  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  40480065 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 40479994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 44748930 - 44748759
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44748930 agcttatagcttataaacttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 44748831  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44748830 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 44748759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 48942999 - 48943168
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48942999 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa-tctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 48943097  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  48943098 cagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttatccttattattt 48943168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 575 - 754
Target Start/End: Original strand, 39876621 - 39876801
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39876621 gagcttatagcttataagttcgtttgactaaaaaagctctgtttgataacactttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 39876720  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  39876721 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcacttttaattccaattttacccttattattctaactaaa 39876801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 16127283 - 16127144
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16127283 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 16127184  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  16127183 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 16127144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 29081425 - 29081286
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29081425 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 29081326  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  29081325 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 29081286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 35499609 - 35499748
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35499609 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaatctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 35499708  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  35499709 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 35499748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 37528867 - 37528728
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37528867 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 37528768  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  37528767 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 37528728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 37714109 - 37713938
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37714109 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 37714010  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  37714009 tcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttctttcaattttacccttattattt 37713938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 774
Target Start/End: Original strand, 39719362 - 39719560
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  39719362 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacgtttttt-acaacaagcttatagcttatttcacgagcttataagttattat 39719460  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
      ||| |||||| ||| ||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  || |||||||| |||||    
T  39719461 gaagaagctattccaaatagcgtttgagtttatagctttttatcttttcttccatttttacccttattattttatctaaaatccaattttacccattata 39719560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 40563507 - 40563368
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40563507 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 40563408  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  40563407 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 40563368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 44845632 - 44845771
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44845632 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 44845731  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  44845732 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 44845771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 576 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 46318904 - 46318724
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46318904 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaagctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 46318805  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||   |||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  46318804 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcacttttaactccaattttacccttattattctaactaaa 46318724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 24536698 - 24536559
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24536698 agcttagagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 24536599  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  24536598 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 24536559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 26540968 - 26541107
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26540968 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 26541067  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  26541068 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttacagcttat 26541107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 28677034 - 28676895
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28677034 agcttatagcttataagctcgtttgaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 28676935  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  28676934 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 28676895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 32026553 - 32026414
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  32026553 agcttatagcttataagttcgttcgacaaaaaaagctctgtttgataatggtttttcaccacgagcttatagtttatttcacaagcttataagctatttt 32026454  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  32026453 tcagatgctattccaagtagcgtttgagcttataacttat 32026414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 38185778 - 38185917
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38185778 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 38185877  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  38185878 tcagaagctattccaagtagcgtttgaacttatagcttat 38185917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 45345152 - 45345013
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45345152 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 45345053  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| | |||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  45345052 tcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 45345013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 52794903 - 52795042
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52794903 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttccccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 52795002  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  52795003 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 52795042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 54542079 - 54541908
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactct-gtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||| |||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54542079 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttttgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 54541980  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| | |||| ||||||  |||||||||||||  || |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  54541979 tcagaagttattccaagtagcgtttgagcttataatttctcactttttcttccaattttacccttattattt 54541908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 54672320 - 54672185
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 678  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54672320 ttatagcttataagctcgtttgagaaaaaagctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 54672221  T
Q  679 acgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  54672220 aagctattccaagtagcgtttgagcttataccttat 54672185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 746
Target Start/End: Original strand, 21707161 - 21707330
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21707161 cttatagcttataagctcgtttaacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagattatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 21707260  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||| |||||| ||||||   |||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21707261 agaagctattccaagtagcttttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 21707330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 550 - 754
Target Start/End: Original strand, 41246231 - 41246436
Alignment:
Q  550 ggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagct 648  Q
    ||||||||||||||  ||   ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | || |||| |||    ||||||||| ||||||||||||    
T  41246231 ggtctgtttggtaacacccaaaaaagagcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagttctatttggtaacactttttcaccatgagcttatagct 41246330  T
Q  649 tatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcatttta 748  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  41246331 tatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcacttttaattccagttttacccttattattcta 41246430  T
Q  749 attaaa 754  Q
    | ||||    
T  41246431 actaaa 41246436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 2580068 - 2579932
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2580068 ttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 2579969  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  2579968 gaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 2579932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 29718341 - 29718206
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29718341 ttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaaca-cttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 29718243  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  29718242 gaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 29718206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 622 - 714
Target Start/End: Original strand, 51003302 - 51003394
Alignment:
Q  622 atgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  51003302 atgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 51003394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Original strand, 52857907 - 52858043
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52857907 ttatagcttataagctcgttttacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 52858006  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  52858007 gaagctattccaagtatcgtttgagcttatagcttat 52858043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 576 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 55305253 - 55305067
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55305253 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 55305154  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta-------tcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    |||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||       |||  |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  55305153 tcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattttatttaaa 55305067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 4240286 - 4240425
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4240286 agcttataacttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 4240385  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  4240386 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 4240425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 19948462 - 19948323
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19948462 agcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 19948363  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  19948362 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 19948323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 24628343 - 24628204
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24628343 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttt 24628244  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||   ||||| ||||||||||||    
T  24628243 tcagaagctattccaagtaacatttgaacttatagcttat 24628204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 25570387 - 25570526
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  25570387 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttt 25570486  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  25570487 ttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 25570526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 53779039 - 53779178
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53779039 agcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 53779138  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  53779139 tcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttat 53779178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 46627642 - 46627502
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac--tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  46627642 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgaggttataagctaatt 46627543  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  46627542 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 46627502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 576 - 712
Target Start/End: Original strand, 48378234 - 48378371
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac-tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||  | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48378234 agcttatagcttataagctcatttgacaaaaaaaaatctgtttggtaacattttttcaccacgagtctatagcttatttcacgagcttataagctatttt 48378333  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctt 712  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  48378334 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctt 48378371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 49853185 - 49853048
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  || | |||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49853185 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaggctatctttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 49853086  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  49853085 agaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 49853048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 578 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 52595476 - 52595279
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactc-tgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |  |||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  52595476 cttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagttatgtttggtaatgttttttcaccatgagtttatagcttatttcacaagattataagctatttttc 52595377  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    ||| |||||| ||||||  ||| ||||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||  || ||||| ||||||||    
T  52595376 agaagctattccaagtagcgttggagcttataacttctcaaaatttcttccatttttacccttaatattttatctaaaatccatttttatcctttata 52595279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Original strand, 2121839 - 2121974
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 678  Q
    ||||||||||||   | ||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2121839 ttatagcttatagatttgtttgacaaaaaagctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 2121938  T
Q  679 acgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  2121939 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 2121974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 38892130 - 38891991
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38892130 agcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcctataagctatttt 38892031  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||  ||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  38892030 tcagaaactattccaagtagcatttgagcttatagcttat 38891991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 46972041 - 46972180
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactc-tgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |  |||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46972041 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaatttatgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 46972140  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  46972141 tcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 46972180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 581 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 29203166 - 29203032
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| ||| |  |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29203166 atagcttataagttcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaacggttttttacaacgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcaga 29203067  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  29203066 cgctatttcaagtagcatttgagcttatagcttat 29203032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 47897747 - 47897611
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||  |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47897747 ttatagcttataaactcatttgacaaaaaaagctctgtttagtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 47897648  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  47897647 gaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 47897611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 581 - 774
Target Start/End: Original strand, 20450471 - 20450672
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||    |||| || || || ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20450471 atagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacagttttttacaacaagtttataacttatttcacgagcttataagttatttttcaga 20450570  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttg-------agcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttacccttta 772  Q
    ||||||| ||||||  |||||       | ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  20450571 cgctattgcaagtagcgtttgtgcttataacttatagtttatcatcttttattccatttctacccttattattttaattaaaacttatatttacccttta 20450670  T
Q  773 ta 774  Q
    ||    
T  20450671 ta 20450672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 45368618 - 45368757
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |  |||| || || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45368618 agctgatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacaagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttt 45368717  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  45368718 tcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 45368757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 52166234 - 52166095
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52166234 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaatctctgtttggcaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 52166135  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  52166134 tcagaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttat 52166095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 582 - 714
Target Start/End: Original strand, 2851831 - 2851964
Alignment:
Q  582 tagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagac 680  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  2851831 tagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagaa 2851930  T
Q  681 gctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  2851931 gctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 2851964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 50317171 - 50317034
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||  ||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  50317171 cttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggcaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttt 50317072  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  50317071 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 50317034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Original strand, 30864438 - 30864573
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30864438 ttatagcttataagct-gtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccattagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 30864536  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  30864537 gaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 30864573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 582 - 714
Target Start/End: Original strand, 51709026 - 51709158
Alignment:
Q  582 tagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacg 681  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||| |||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  51709026 tagcttataaactcgtttcacaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaaa 51709125  T
Q  682 ctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  51709126 ctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 51709158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 632 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 52868266 - 52868150
Alignment:
Q  632 accacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccattt 731  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||  | |||||||||| ||    
T  52868266 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttgagaagctatttcaagtagtgtttgagcttataacttattgttttttcttccactt 52868167  T
Q  732 ttacccttatcatttta 748  Q
    |||||||| | ||||||    
T  52868166 ttacccttgttatttta 52868150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 576 - 686
Target Start/End: Original strand, 47173576 - 47173687
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47173576 agcttataggttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttgataacgctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 47173675  T
Q  675 tcagacgctatt 686  Q
    ||||| ||||||    
T  47173676 tcagaagctatt 47173687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 627 - 714
Target Start/End: Original strand, 21603858 - 21603945
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  21603858 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctacttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 21603945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 41518369 - 41518508
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||  |||||| || | |||| ||| |  |||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41518369 agctgatagcttataagctcgtctgataaaaaaagctttctttggtaacgcttttttacaatgagcttatagcttatttcaagagcttataaactatttt 41518468  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41518469 tcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 41518508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 50499770 - 50499909
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactct-gtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | | ||||| |||    |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  50499770 agcttatagtttataagctcgtttgataaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccataagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttt 50499869  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  50499870 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 50499909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 52225293 - 52225432
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | |||| | ||||||| |||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  52225293 agctcatagcttataagctcgtttgacaacaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttt 52225392  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  52225393 tcagaagctattcaaagtagcgtttgagcttatagcttat 52225432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 578 - 754
Target Start/End: Original strand, 33391913 - 33392097
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33391913 cttagagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagtttatttcatgagcttataagctatttttc 33392012  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta-------tcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    ||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||       |||  |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  33392013 agaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttatagtttttcactttttcttccaattttacccttattatttcaattaaa 33392097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 575 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 37713286 - 37713109
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttga-taatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||| |  |||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37713286 gagcttatggcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttgagtaacggttttttacaacgagcttatagtttattttacgagcttataaactatt 37713187  T
Q  673 tttcagacgctatttcaagtatagtttgagct---------tatagcttatcatcttttcttccatttttacccttat 741  Q
    ||| ||| | ||||  |||||  |||||||||         |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37713186 tttaagaagttattctaagtagcgtttgagcttatataacttatagcttctcatcttttcttccatttttacccttat 37713109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 576 - 672
Target Start/End: Original strand, 39469921 - 39470018
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39469921 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatt 39470018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 582 - 714
Target Start/End: Original strand, 42497008 - 42497141
Alignment:
Q  582 tagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagac 680  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| | || ||| ||||    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  42497008 tagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctatttaataacactttttcatcatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaa 42497107  T
Q  681 gctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  42497108 gctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 42497141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 578 - 665
Target Start/End: Original strand, 41785819 - 41785907
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttata 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41785819 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataatactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttata 41785907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 575 - 713
Target Start/End: Original strand, 30548751 - 30548890
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactc-tgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||||||||||||||  || |||||| |||||| |  |||||| |||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  30548751 gagcttatagcttataaattcatttgacaaaaaaaattatgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctattt 30548850  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta 713  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  30548851 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagctta 30548890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 581 - 714
Target Start/End: Original strand, 7041074 - 7041208
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||| | ||||||| ||| |  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  7041074 atagcttataagttcgtctgacaaaaaaagttctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcaga 7041173  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
     |||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||    
T  7041174 agctacttcaagtagcgtttaagcttatagtttat 7041208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 42465169 - 42465032
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactc-tgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||  | |||||  || |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  42465169 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaattatgtttggtaacattttttcggcatgagcttatagcttatttcacaagtttataagctatttttc 42465070  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| ||||||  |||||  ||||||| |||||||||||    
T  42465069 agaagctattctaagtagcgtttgagattatagcttat 42465032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 12063869 - 12063733
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||| |||    |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12063869 ttatagcttataaacttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttgaccataagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 12063770  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||  ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  12063769 gaaactattccaagtagcgtttgagcttatatcttat 12063733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 548 - 608
Target Start/End: Original strand, 13285924 - 13285984
Alignment:
Q  548 agggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaa 608  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13285924 agggtctgtttggtaaagtcatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgatcaaaaa 13285984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 634 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 45693471 - 45693391
Alignment:
Q  634 cacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  45693471 cacgaacttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 45693391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 701 - 847
Target Start/End: Complemental strand, 44810956 - 44810813
Alignment:
Q  701 agcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttatatattaaaacacatttattacattttc 800  Q
    ||||| || ||||| || |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  44810956 agcttttaacttataattttttattccaattttacgcttataattttaattaaaacccacctttaccctttatatattaaaacacactcattacgttttc 44810857  T
Q  801 tatgttttccctctatacttttttgttcctacgtttccagttcctat 847  Q
     ||| ||| || ||||  |||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  44810856 aatgctttgccactat--tttttttttcct-cgtttccagttgctat 44810813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 576 - 754
Target Start/End: Original strand, 35100195 - 35100368
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac---tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||    | |||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||         |||    
T  35100195 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcc--------att 35100286  T
Q  673 tttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    ||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  35100287 tttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatcatttttaattccaattttacccttattattctaactaaa 35100368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 576 - 672
Target Start/End: Original strand, 44545238 - 44545335
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44545238 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatt 44545335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 634 - 770
Target Start/End: Original strand, 25146380 - 25146523
Alignment:
Q  634 cacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcat------ctttt-cttc 726  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||      |||||  |||    
T  25146380 cacgagcttataacttatttcaccaacttataacttatttttctgacgctatttcaagtaacgtttgaacttataacttataatttttcacttttaattc 25146479  T
Q  727 catttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctt 770  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||    
T  25146480 catttttacccttactattttaattaaaatccacttttaccctt 25146523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 627 - 690
Target Start/End: Complemental strand, 24350357 - 24350294
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaa 690  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24350357 ttttcaccacgagcttatagtttatttcacgagtttataaattatttttcagacgctgtttcaa 24350294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 576 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 30814394 - 30814215
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactct-gtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| | | ||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||    
T  30814394 agcttatagcttttaagctcgtttgacaaaaaaagttttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagatatttt 30814295  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    || ||  ||||| ||||||  |||||| |||||| ||| |||  |||  ||||| |||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  30814294 tcggaaactattccaagtagcgtttgaacttataacttttcacttttaattccaattttactcttattattctaactaaa 30814215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 635 - 741
Target Start/End: Original strand, 612120 - 612226
Alignment:
Q  635 acgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccattttta 734  Q
    |||||||||||| || ||| |  |||||||||  |||||| || |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||    
T  612120 acgagcttatagtttcttttagaagcttataacttattttccatacgccatttcaagtagcgtttgagcttatagcttataatcttttgtcccattttta 612219  T
Q  735 cccttat 741  Q
    || ||||    
T  612220 cctttat 612226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 642 - 714
Target Start/End: Original strand, 5506704 - 5506776
Alignment:
Q  642 tatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  5506704 tatagcttattttatgagcttataagctatttttcagatactattacaagtagcgtttgagcttatagcttat 5506776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 604 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 9338882 - 9338792
Alignment:
Q  604 aaaaaactctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagta 693  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| | | |||||||||||||    
T  9338882 aaaaaactttgtttgataacgatctttttacaacgagcttatagcttatttcataagcttataacttattttttaaatgctatttcaagta 9338792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 645 - 710
Target Start/End: Complemental strand, 32982986 - 32982921
Alignment:
Q  645 agcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagc 710  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||  | |||||||||||||    
T  32982986 agcttattttacgagcttataagctatttttcggaagctatttcaagtaatgcttgagcttatagc 32982921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 658 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 52931206 - 52931118
Alignment:
Q  658 agcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  52931206 agcttataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttaagcttatagcttctcactttttctttcaattttacccttattattt 52931118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 635 - 714
Target Start/End: Original strand, 22257721 - 22257800
Alignment:
Q  635 acgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||    ||||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22257721 acgaccttatagcttatttcataagcttattgcttatttttcaaatgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 22257800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 578 - 690
Target Start/End: Original strand, 27446437 - 27446550
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactc-tgtttgataatgtcttttcaccacgagctt-atagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |  |||||| |||    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  27446437 cttatagcttataagctcgttcgacaaaaaaagttatgtttggtaacactttttcac-atgagctttatagcttatttcacgagtttatatgctattttt 27446535  T
Q  676 cagacgctatttcaa 690  Q
    |||| ||||||||||    
T  27446536 cagaagctatttcaa 27446550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 45693550 - 45693460
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttata 665  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || | |||| |||    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  45693550 agcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaaactttatttggtaacactttttcaccatgagcttatagtttatttcacgaacttata 45693460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 627 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 43740370 - 43740325
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43740370 ttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatt 43740325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 618
Target Start/End: Original strand, 5505859 - 5505902
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttg 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5505859 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttg 5505902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 576 - 618
Target Start/End: Original strand, 52788684 - 52788727
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttg 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  52788684 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttg 52788727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 669 - 740
Target Start/End: Original strand, 55118562 - 55118633
Alignment:
Q  669 tatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccctta 740  Q
    |||||| |||||||||||| |||||  ||||||| ||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||    
T  55118562 tattttacagacgctattttaagtagcgtttgagtttatagcatattgttttttcttccacttttaccctta 55118633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 701 - 755
Target Start/End: Original strand, 5506770 - 5506824
Alignment:
Q  701 agcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaa 755  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  5506770 agcttatagcttatcatgttttattccatttatacccttaccactttaactaaaa 5506824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 669 - 748
Target Start/End: Original strand, 41538407 - 41538492
Alignment:
Q  669 tatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagctta------tagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcatttta 748  Q
    |||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||       ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  41538407 tattttccagacgttatttcaagtagtgtttgagctttaacttgtagcttatcattttttcttccaattttacccttattatttta 41538492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 585 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 8133121 - 8133040
Alignment:
Q  585 cttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataa-tgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttata 665  Q
    ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||  |||||||||  |||| ||| |||||||||| | |||||||||    
T  8133121 cttataaactcgtctaacaaaaaaactctgtttgataagcgtcttttcataacgaacttttagcttattttaggagcttata 8133040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 92)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 545 - 939
Target Start/End: Complemental strand, 7781326 - 7780921
Alignment:
Q  545 cttagggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttata-------agctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccac 636  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||  |||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  7781326 cttagggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtactgtcttttcaccac 7781227  T
Q  637 gagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat-------catcttttcttccat 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||       ||||||||||| |||    
T  7781226 gagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttctttcat 7781127  T
Q  730 ttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttatatattaaaacacatttattacattttctatgttttccctctatacttttttgttcc 829  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||             |||||||||||    
T  7781126 ttttacccttatcattttaattaaaacccacttttaccctttatatattaaaacacatttattacgttttctatgt-------------ttttttgttcc 7781040  T
Q  830 tacgtttccagttcctatatacttccaat----ttagtacaactcaac--------tactcttcaaataaataaataaaactactcgagcatattttttg 917  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||        |||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7781039 tacgtttccagtttctatatacttccaatttaattagtacaactcaactactcgagtactcttcaaata---aaaaaaaactactggagcatattttttg 7780943  T
Q  918 agcatatttttcatatattcat 939  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7780942 agcatatttttcatatattcat 7780921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 18347539 - 18347369
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18347539 agcttatagcttataagtttgtttgacaaaaaagctctgtttggtaatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacaagcttataagctattttt 18347440  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18347439 cagacactattccaagtagtgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 18347369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 44719095 - 44718924
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44719095 agcttatagcttataagcttgtttggcaaaaaaagctctgtttggtaatgtcttttcaccacgagcttatagcttattttacgagcttataaactatttt 44718996  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |||  ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  44718995 tcagacgctatttcaagtagcgtttaagcttataacttctcactttttctttcaattttacccttattattt 44718924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 13121708 - 13121537
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13121708 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 13121609  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13121608 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatcactttttcttccaattttacccttattattt 13121537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 38967587 - 38967417
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38967587 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 38967488  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38967487 cagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 38967417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 39826611 - 39826782
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39826611 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 39826710  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  39826711 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcacattttcttccaattttacccttattattt 39826782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 581 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 46056545 - 46056354
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  46056545 atagcttataagttcgttcgactaaaaaaattctatttgataatgttttttcaccacgaacttatagtttatttcacgagcttataagatatttttcaga 46056446  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttacccttt 771  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||    
T  46056445 cgctatttcaagtagcatttaagcttatagcttattatcttttgtttcatttttaccctcatcactttaattaaaatccatttttacccttt 46056354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 17046740 - 17046911
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17046740 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 17046839  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17046840 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 17046911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 3270670 - 3270808
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3270670 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaatctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 3270769  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3270770 cagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 3270808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 36301228 - 36301090
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36301228 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaagctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 36301129  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  36301128 cagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 36301090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 7711078 - 7710907
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7711078 agcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 7710979  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7710978 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 7710907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 770
Target Start/End: Original strand, 25134859 - 25135054
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| |||    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25134859 agctaatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagttctgtttggtaacagttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 25134958  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctt 770  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||  |||| || |||| ||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25134959 tcagacgctattttaagtagtgtttgagcttatagcttatcactttttatttcattattatccttactattttaattaaaacccacttttgccctt 25135054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 26843762 - 26843901
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26843762 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctatttgataatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 26843861  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||    
T  26843862 tcagaagctatttcaagtagcgtttgagtttatagcttat 26843901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 576 - 748
Target Start/End: Original strand, 34086977 - 34087150
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  34086977 agcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagctaatttcacgagcttataagctatttt 34087076  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcatttta 748  Q
    | ||| |||||| || |||  ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  34087077 tgagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttattattttttcttccacttttacccttgttatttta 34087150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 578 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 47134653 - 47134484
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  47134653 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttttc 47134554  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||| ||||    
T  47134553 agaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttatcactttttcttctaattttacccttattattt 47134484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 576 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 52703235 - 52703030
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  52703235 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaatgctctctt-accacgagcttatagcttatttcacgagcttataagttattt 52703137  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttata-------gcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttac 766  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||       |||| | ||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  |||||    
T  52703136 ttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttttagctttttatcttttatttcatttttacccttattattttaactaaaagtcatatttac 52703037  T
Q  767 cctttat 773  Q
    |||||||    
T  52703036 cctttat 52703030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 1918036 - 1918175
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1918036 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 1918135  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  1918136 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 1918175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 2497933 - 2498072
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2497933 agcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 2498032  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  2498033 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 2498072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 25601997 - 25602168
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||     |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25601997 agcttataggttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtatcacttttttaccatgaccttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 25602096  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25602097 tcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 25602168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 34318417 - 34318556
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  34318417 agcttatagcttataagcttgttcgacaaaaaaagctctgtttggtaatggtttttcaccacgagcttatagcttattttacgagcttataagctatttt 34318516  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  34318517 tcagatgctattccaagtagtgtttgagcttatagcttat 34318556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 42064441 - 42064302
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42064441 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 42064342  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  42064341 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 42064302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 774
Target Start/End: Original strand, 50540783 - 50540982
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||||| ||||   |||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  50540783 agcttatagcttataaactcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccataaacttatagcttatttcacgagtttataagctatttt 50540882  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||    
T  50540883 tcagaagctattacaagtagcgtttgagcttatagcttctcatattttatctcatttttacccttattattttaattaaaatccatgtttaccctttata 50540982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 44909853 - 44909990
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44909853 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 44909952  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  44909953 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 44909990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 49240406 - 49240206
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  49240406 gagcttatagcttataagttcgtatgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcactatgaacttatagcttatttcatgagcttataagctattt 49240307  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttat 773  Q
    |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||    ||||||||||||||||||||  ||||||  |||||  || ||||| |||||||    
T  49240306 ttcagaagctatttcaaatagcgtttgagcttatagcttctcaaaagttcttccatttttacccttaatattttatctaaaatccatttttatcctttat 49240207  T
Q  774 a 774  Q
    |    
T  49240206 a 49240206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 26204285 - 26204424
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26204285 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 26204384  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  26204385 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 26204424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 29586169 - 29586308
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29586169 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 29586268  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  29586269 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 29586308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 31150549 - 31150410
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31150549 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttgggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 31150450  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  31150449 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 31150410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 49220597 - 49220458
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49220597 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttacagcttatttcacgagcttataagctatttt 49220498  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  49220497 tcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 49220458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 30721748 - 30721608
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30721748 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctattt 30721649  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  30721648 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 30721608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 38676502 - 38676639
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  38676502 cttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttc 38676601  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38676602 agaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 38676639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 17500006 - 17499870
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17500006 ttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 17499907  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  17499906 gaagctattccaagtagcgtttaagcttatagcttat 17499870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 322876 - 323015
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  322876 agcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 322975  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  322976 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 323015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 588 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 16085723 - 16085596
Alignment:
Q  588 ataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatt 686  Q
    |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16085723 ataagctcgtttgaacaaaaaagttctgtttgataatgttttttcaccacgatcttatagtctattttacgagcttataagctatttttcagatgctatt 16085624  T
Q  687 tcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16085623 tcaagtagcgtttgagcttatagcttat 16085596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 19899032 - 19898893
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19899032 agcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 19898933  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  19898932 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 19898893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 29374341 - 29374480
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||   |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  29374341 agcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcaagagcttataagctatttt 29374440  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29374441 tcagaagctattccaagtagagtttgagcttatagcttat 29374480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 29704208 - 29704069
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  29704208 agcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttt 29704109  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  29704108 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 29704069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 36838819 - 36838680
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36838819 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttctccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 36838720  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  36838719 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 36838680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 50351043 - 50351182
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50351043 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttaaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 50351142  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  50351143 tcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagcttat 50351182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 585 - 741
Target Start/End: Original strand, 44956298 - 44956455
Alignment:
Q  585 cttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgct 683  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| | | ||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||    
T  44956298 cttatatgctcgtttgacaaaaaaagttccgtttggtaatggttttttaccatgagcttatagcttatttaacgagattataagttatttttcagatgct 44956397  T
Q  684 atttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttat 741  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  44956398 attccaagtagagtttgagcttataacttatcatattttcttccatttttacgcttat 44956455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 580 - 774
Target Start/End: Original strand, 3391135 - 3391337
Alignment:
Q  580 tatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 678  Q
    ||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||| ||||   ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3391135 tatagcttataagtttgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgaacttatagtttatttcacgagcttataaactatttttcag 3391234  T
Q  679 acgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta-------tcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttacccttt 771  Q
    | |||||| ||||||  |||| |||||||||||||       |||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  3391235 aagctattccaagtaacgtttaagcttatagcttatagcttctcatattttatcccatttttacccttattattttaattaaaatccatgtttacccttt 3391334  T
Q  772 ata 774  Q
    |||    
T  3391335 ata 3391337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 32368463 - 32368324
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  32368463 agcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttatatgctatttt 32368364  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  32368363 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 32368324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 33524539 - 33524678
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33524539 agcttatagcttataagcttgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 33524638  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  33524639 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagtttat 33524678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 581 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 46088119 - 46087918
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    |||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  46088119 atagtttataagctcgtttgactagaaaagctctgtttgataatgttttttcgccacgagcttataacttatttcacgagtttataagctatttttcaga 46088020  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttg-------agcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttacccttta 772  Q
    || |||| ||||||   ||||       ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  |||||  | ||| ||  ||||||||||||    
T  46088019 cgttattccaagtaatatttgagcttgtagcttatagcttatcattttttcttccaattttactcttattgttttatcttaaattcttttttacccttta 46087920  T
Q  773 ta 774  Q
    ||    
T  46087919 ta 46087918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 577 - 714
Target Start/End: Original strand, 15348836 - 15348974
Alignment:
Q  577 gcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15348836 gcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaaactatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaattattttt 15348935  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  15348936 cagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagtttat 15348974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 15313257 - 15313393
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15313257 cttatagcttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaaca-cttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttc 15313355  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  15313356 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 15313393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 34319400 - 34319539
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||    |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34319400 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccatgaccttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 34319499  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  34319500 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 34319539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 37703680 - 37703820
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa----ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37703680 cttatagcttataagctggtttgacaaaaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 37703779  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  37703780 ttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttataacttat 37703820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 576 - 754
Target Start/End: Original strand, 46369816 - 46370001
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa---ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||    
T  46369816 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagc---taagctatt 46369912  T
Q  673 tttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta-------tcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||       |||  |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  46369913 tttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattttatttaaa 46370001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 1507868 - 1507728
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1507868 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaagaagctctgtttggtaacactttttcaccattagtttatagcttatttcacgagcttataagctattt 1507769  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  1507768 ttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttat 1507728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 49185306 - 49185170
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||||| |||    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  49185306 ttatagtttataaactcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccataagcttatagcttatttcacaagcttataaactatttttca 49185207  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  49185206 gaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttat 49185170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 50171418 - 50171282
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||   ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  50171418 ttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacacctttttaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttca 50171319  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  50171318 gaagctattccaagtagcatttgagcttatagcttat 50171282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 3660956 - 3661095
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||| | ||||||| |||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3660956 agcttatagcttataagctcatttgacaacaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatatcttatttcacgagcttataagctatttt 3661055  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  3661056 tcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 3661095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 581 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 13570912 - 13570778
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 678  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  13570912 atagcttataaactcgtctgacaaaaaaaactctgtttagtaatgatcttttcac-acgagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttttcag 13570814  T
Q  679 acgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||    
T  13570813 acgctattccaaatagcgtttgaacttatagcttat 13570778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 579 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 30495313 - 30495153
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 678  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||   |||| |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||    
T  30495313 ttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaact--gtttggtaatactttttgaccatgagcttatagcttatttctagagtttataagctatttttcag 30495216  T
Q  679 acgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttat 741  Q
    | |||||||||||||  |||| |||||||||||| |||  |||  ||||| ||||||||||||    
T  30495215 aagctatttcaagtagcgtttcagcttatagcttctcacttttaattccagttttacccttat 30495153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 627 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 49822239 - 49822152
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  49822239 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttttagaagttatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 49822152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 604 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 2029071 - 2028953
Alignment:
Q  604 aaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagc 703  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||     
T  2029071 aaaaaactctgtttaataatgatttttcagtacaagcttatagtttatttaacgagtttataaactatttttcagacgctatttcaagtaccgtttaaga 2028972  T
Q  704 ttatagcttatcatctttt 722  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  2028971 ttataacttatcatctttt 2028953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 645 - 774
Target Start/End: Original strand, 33151975 - 33152111
Alignment:
Q  645 agcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagctt-------atagcttatcatcttttcttccatttttaccc 737  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||       ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33151975 agcttatttcacgagcttataagctatttttaagaagctatttcaagtagcgtttgagcttgtaacttatagcttctcatcttttcttccatttttaccc 33152074  T
Q  738 ttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    |||| ||||||  ||||| ||| |||||||| |||||    
T  33152075 ttattattttatctaaaattcaattttacccattata 33152111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 36043425 - 36043285
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac--tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||   |||||||| |||    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  36043425 agcttatagcatataagttcgtttgacaaaaaaaaattctgtttggtaacagtttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataagctattt 36043326  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  36043325 ttcagatgctattctaagtagcgtttgagcttatagcttat 36043285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 51423109 - 51422969
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac--tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||  ||||||   ||||||||||||    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51423109 agcttatagcttataagtttgtttgataaaaaaaagttctgtttgataacactttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagtttataaactattt 51423010  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  51423009 tttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 51422969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 576 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 9770095 - 9769964
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9770095 agctcatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaccc-gtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 9769997  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttata 708  Q
    || | |||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  9769996 caaaagctattccaaataacgtttgagcttata 9769964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 37672477 - 37672335
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa------ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactat 671  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||      ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37672477 cttatagcttataagctggtttgacaaaaaaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctat 37672378  T
Q  672 ttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  37672377 ttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttataacttat 37672335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 581 - 714
Target Start/End: Original strand, 5697493 - 5697627
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||| |||| |||| |||    |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5697493 atagcttataagttcgtctgacaaaaaaaactctatttggtaacagttttttacaatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaga 5697592  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  5697593 cgctattccaagtagcgtttgagcttataccttat 5697627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 30774098 - 30774231
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    ||| ||||||||| |||    |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30774098 cttatagcttataagttcgtttgat---aaagctctgtttggtaacactttttcaccataagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 30774194  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  30774195 gaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 30774231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 576 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 33562019 - 33561922
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33562019 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 33561922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 583 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 42614248 - 42614120
Alignment:
Q  583 agcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgc 682  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||   ||||||| |||  | ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  42614248 agcttttaagctcgtttgacaaaaaa---ctgtttggtaacattttttcaccatgagcttctagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagc 42614152  T
Q  683 tatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  42614151 tattccaagtagcgtttgaggttatagcttat 42614120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 604 - 748
Target Start/End: Original strand, 42963868 - 42964012
Alignment:
Q  604 aaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagc 703  Q
    ||||| || |||||||||||   ||||||| | |||||||||  |||||| ||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  42963868 aaaaagctttgtttgataatactttttcactatgagcttataatttattttacgagtttataagctatttttgagaagctatttcaagtagcgtttgagc 42963967  T
Q  704 ttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcatttta 748  Q
    ||| |||||||  | |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  42963968 ttacagcttattgttttttcttccacttttacccttattatttta 42964012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 627 - 714
Target Start/End: Original strand, 22098981 - 22099068
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  22098981 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 22099068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 627 - 714
Target Start/End: Original strand, 43727084 - 43727171
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  43727084 ttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataaactatttttcagaagttattccaagtagcgtttgaacttatagcttat 43727171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 581 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 8221354 - 8221220
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  8221354 atagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacggttttttacaacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcaaa 8221255  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
      ||||| ||| ||  ||||||  |||||||||||    
T  8221254 aactattccaaatagcgtttgaatttatagcttat 8221220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 548 - 679
Target Start/End: Original strand, 28429017 - 28429144
Alignment:
Q  548 agggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagc 647  Q
    ||||||||||||||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||  ||||||    ||| |||||||| |||    ||||||||| |||||||||||    
T  28429017 agggtctgtttggtaagcccactaaatgagcttatagcttataagcttatttgac----aaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagc 28429112  T
Q  648 ttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28429113 ttatttcacgagcttataagctatttttcaga 28429144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 624 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 10628903 - 10628787
Alignment:
Q  624 gtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttc 723  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||     
T  10628903 gtcttttcac-acgagcttatagtttattttactagcttataacttatttttcagacattatttcaagtagcgtttgagcttataacttatcacctttta 10628805  T
Q  724 ttccatttttacccttat 741  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  10628804 ttctatttttacctttat 10628787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 549 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 52071319 - 52071222
Alignment:
Q  549 gggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttata 645  Q
    |||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  52071319 gggtctgtttggtaagaccctcaaatgagcttatagcttataagctcatttgacaaaaaaagctctgtttggtaatggtttttcaccacgagcttata 52071222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 583 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 28869128 - 28868996
Alignment:
Q  583 agcttataagctcgtttgaccaaaaaac-tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacg 681  Q
    |||||||||||||||||||| || |||  |||||||| ||| |  |||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||      
T  28869128 agcttataagctcgtttgacaaagaaatatctgtttggtaaaggttttttacaacgagtttatagtttatttcacgagcttataaattatttttaagaaa 28869029  T
Q  682 ctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
     |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  28869028 ttatttcaagtaacgtttgagcttatagcttat 28868996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 638 - 714
Target Start/End: Original strand, 40887949 - 40888025
Alignment:
Q  638 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  40887949 agcttatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 40888025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 641 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 41005051 - 41004937
Alignment:
Q  641 ttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta-------tcatcttttcttccattttt 733  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||    
T  41005051 ttatagcttatttcatgagcttataagttatttttaagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagcttatagcttctcatcttttcttccattttt 41004952  T
Q  734 acccttatcatttta 748  Q
    |||||||| ||||||    
T  41004951 acccttattatttta 41004937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 635 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 27659429 - 27659294
Alignment:
Q  635 acgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccattttta 734  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||| |||||   |||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||    
T  27659429 acgaacttataacttatttcaggagtttatagtttattttccaaacgctatttcaagtagcgtttgagcttataacttatcatcttttatcttattttta 27659330  T
Q  735 cccttatcattttaattaaaactcacttttaccctt 770  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||  |||||||||    
T  27659329 cccttattattttgaataaaactcatgtttaccctt 27659294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 39583107 - 39583246
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  39583107 agcttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttaacgagtttataagctatttt 39583206  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  39583207 tcagaagctattccaagtagcgtttgagtttataccttat 39583246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 644 - 754
Target Start/End: Original strand, 40719554 - 40719664
Alignment:
Q  644 tagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatca 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||||| |||  |||  || || |||||||||||| |    
T  40719554 tagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagttatttcaagtagcgtttgagtttatagcttctcacttttaatttcagttttacccttatta 40719653  T
Q  744 ttttaattaaa 754  Q
    || ||| ||||    
T  40719654 ttctaactaaa 40719664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 576 - 672
Target Start/End: Original strand, 2479171 - 2479268
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    |||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2479171 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttatcatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatt 2479268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 651 - 741
Target Start/End: Original strand, 9169142 - 9169232
Alignment:
Q  651 tttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttat 741  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||    
T  9169142 tttcaccaacttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctccctttttcttccaattttacccttat 9169232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 657 - 754
Target Start/End: Original strand, 7024916 - 7025013
Alignment:
Q  657 gagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||  ||||| |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  7024916 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcacttttaattccagttttacccttattattctaactaaa 7025013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 46929105 - 46928969
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||| |||||| |||||||||  |||||| | |||||| |||   | ||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  46929105 ttatagtttataaactcgtttgataaaaaaagttctgtttaatatcattttttcactaagaacttatagcttattttacgagcttataagctatttttca 46929006  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || ||||||  || ||  ||||| |||||||||||||    
T  46929005 gaagctattctaattagcgtttgtgcttatagcttat 46928969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 575 - 645
Target Start/End: Original strand, 33632268 - 33632339
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgac-caaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttata 645  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||    
T  33632268 gagcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaatgctttttcaccatgagcttata 33632339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 655 - 714
Target Start/End: Original strand, 6814118 - 6814177
Alignment:
Q  655 acgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  6814118 acgaacttataagttatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 6814177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 36379270 - 36379131
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| | || || |||||    |||| || | ||| |||||| |||||||| ||| ||||||  ||||||    
T  36379270 agcttatagtttataaactcgtttgacaaaaaaagttctattcgataacacttttttacgatgagtttatagtttatttcatgagtttataagttatttt 36379171  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  36379170 tcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 36379131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 625 - 714
Target Start/End: Original strand, 912714 - 912803
Alignment:
Q  625 tcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||  |||| ||||||||| ||   |||||||||||| |||||    
T  912714 tctttttacaacgagcttataacttatttcaggagcttatatcctattttctagacactatttcaaataacatttgagcttataacttat 912803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 658 - 774
Target Start/End: Original strand, 9894931 - 9895054
Alignment:
Q  658 agcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagc-------ttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaat 750  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||       ||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||       
T  9894931 agcttataagctatttttcagacgctattcaaagtagcgtttgagcttatagtttatagcttgtcattttttctttcaattttacccttattattttttg 9895030  T
Q  751 taaaactcacttttaccctttata 774  Q
    ||||| |||  |||||||||||||    
T  9895031 taaaattcatatttaccctttata 9895054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 635 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 31259641 - 31259501
Alignment:
Q  635 acgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatca--tcttttcttccatttt 732  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||   ||||||  | ||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||     
T  31259641 acgagcttatagtttatttcaggagcttttagcttattttctaaacgttatttcaaatagcgtttgagcttatagcttatcattttttttcttctatttc 31259542  T
Q  733 tacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttat 773  Q
    ||||||| | ||||||  |||||  || |||||||| ||||    
T  31259541 tacccttgttattttatctaaaatccatttttacccattat 31259501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 661 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 40935945 - 40935893
Alignment:
Q  661 ttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta 713  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  40935945 ttataaactatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagctta 40935893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 645
Target Start/End: Original strand, 6814062 - 6814128
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgac--caaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttata 645  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||    
T  6814062 atagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaactctgtttgataacgactttttacaacgaacttata 6814128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 703 - 774
Target Start/End: Original strand, 19715386 - 19715457
Alignment:
Q  703 cttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||||  ||||| ||  ||||||||||||||    
T  19715386 cttatagcttatcatttttacttccaatttcacccttattattttatctaaaattcttttttaccctttata 19715457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 654 - 685
Target Start/End: Complemental strand, 52071233 - 52071202
Alignment:
Q  654 cacgagcttataaactatttttcagacgctat 685  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52071233 cacgagcttataaactatttttcagacgctat 52071202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 1e-86; HSPs: 118)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 654 - 878
Target Start/End: Complemental strand, 24954282 - 24954050
Alignment:
Q  654 cacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat-------catcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24954282 cacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttgttccatttttacccttatcattt 24954183  T
Q  747 taattaaaactcacttttaccctttatatattaaaacacatttattacattttctatgttttccctctatacttttttgttcctacgtttcc-agttcct 845  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  24954182 taattaaaacccacttttaccctttatatattaaaacacatttattacgttttctatgttttccctctatatttttttgttcctgcgtttccaagttcct 24954083  T
Q  846 atatacttccaatttagtacaactcaactactc 878  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24954082 atatacttccaatttagtacaactcaactactc 24954050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 576 - 748
Target Start/End: Original strand, 36196878 - 36197051
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataat-gtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36196878 agcttatagtttataagctcgtttgacaaaaatagctctgtttgataattgtctctt-accacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 36196976  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcatttta 748  Q
    |||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  36196977 ttcagaagctattctaagtagtgtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttatacccttattatttta 36197051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 548 - 748
Target Start/End: Original strand, 20511385 - 20511586
Alignment:
Q  548 agggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaa-actctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatag 646  Q
    |||||||||||||||| | |   ||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    |||| || ||||||||||||    
T  20511385 agggtctgtttggtaaggtccctaaatgagcttatagcttataagttcgtctgaccaaaaacactctgtttgataacagttttttacaacgagcttatag 20511484  T
Q  647 cttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20511485 cttatttcatgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttataacttatcatcttttcttccatttatacccttattattt 20511584  T
Q  747 ta 748  Q
    ||    
T  20511585 ta 20511586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 55496020 - 55495849
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  55496020 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 55495921  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  55495920 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 55495849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 581 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 4465606 - 4465412
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaactc-tgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    |||||||||||| | || |||| |||||| |  |||||| ||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4465606 atagcttataagtttgtctgacaaaaaaagttatgtttggtaacgtctttttacaatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 4465507  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    |||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| ||  |||||||||||||    
T  4465506 cgctgttccaagtagcgtttgagcttgtagcttatcatcttttcttccacctttacccttattattttaaataaaacccatatttaccctttata 4465412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 575 - 774
Target Start/End: Original strand, 11050319 - 11050520
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| |||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11050319 gagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaagctctgtttggtaatgctttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatt 11050418  T
Q  673 tttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttacccttta 772  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||   || ||||||||||||||||||  ||||||  |||||  || ||||| ||||||    
T  11050419 tttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctcaaaattccttccatttttacccttaatattttatctaaaatccatttttatccttta 11050518  T
Q  773 ta 774  Q
    ||    
T  11050519 ta 11050520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 31678973 - 31679144
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31678973 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 31679072  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31679073 tcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 31679144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 548 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 56270259 - 56270092
Alignment:
Q  548 agggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatag 646  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||  | |||| |||| ||||||||||    
T  56270259 agggtctgtttggtaaatccaaaaaaagagcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaaactctgtttggtaacattttttgaccatgagcttatag 56270160  T
Q  647 cttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  56270159 cttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttttagcttat 56270092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 35777526 - 35777362
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35777526 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 35777427  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccctt 739  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||||||||    
T  35777426 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttataccttctcactttttcttccaattttaccctt 35777362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 22430639 - 22430778
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22430639 agcttatagcttataagctcgttcgataaaaaaagctctatttgataatggtttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 22430738  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  22430739 tcagatgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 22430778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 37115423 - 37115252
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37115423 agcttatagcatataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 37115324  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37115323 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 37115252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 42116900 - 42117039
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42116900 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 42116999  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42117000 tcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 42117039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 46895287 - 46895426
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46895287 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 46895386  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  46895387 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 46895426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 576 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 35581085 - 35580911
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35581085 agcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataaactatttt 35580986  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaa 749  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  35580985 tcagaggctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaa 35580911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 576 - 749
Target Start/End: Original strand, 55829008 - 55829182
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  55829008 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttt 55829107  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaa 749  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  55829108 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaa 55829182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 4517329 - 4517192
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4517329 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 4517230  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  4517229 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 4517192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 8829955 - 8829816
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8829955 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 8829856  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  8829855 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 8829816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 11152079 - 11151940
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11152079 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 11151980  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  11151979 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 11151940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 28307259 - 28307398
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28307259 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctcggtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 28307358  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  28307359 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 28307398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 29663933 - 29664104
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  29663933 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttt 29664032  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| || |||  ||||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  29664033 tcagaagctattccaggtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcatccaattttacccttattattt 29664104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 627 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 42085810 - 42085663
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttc 726  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  42085810 ttttcaccacgaacttatagcttatttcacgagcttataagctttttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatcattttttcttt 42085711  T
Q  727 catttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    || |||||||||||  ||||    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  42085710 caattttacccttaatatttattctaaaattcagttttaccctttata 42085663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 45906143 - 45906282
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45906143 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 45906242  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  45906243 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 45906282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 53407193 - 53407332
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53407193 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 53407292  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  53407293 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 53407332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 12234105 - 12233968
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12234105 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 12234006  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  12234005 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 12233968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 582 - 714
Target Start/End: Original strand, 21369890 - 21370023
Alignment:
Q  582 tagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagac 680  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  21369890 tagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaa 21369989  T
Q  681 gctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  21369990 gctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 21370023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 581 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 32101869 - 32101709
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| | || |||| ||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  32101869 atagcttataagctcgtctgacaaaaaagccctatttggtaacggtctttt-accacgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttctaaga 32101771  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttat 741  Q
    || |||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  32101770 cgttattccaagtagcgtttgagcttatagcttattatcttttcttccaattttacccttat 32101709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 575 - 746
Target Start/End: Original strand, 33114978 - 33115157
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33114978 gagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 33115077  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta-------tcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  33115078 ttcagaagctatttcaagtatcgtttgagcttatagcttatagcttctcaccttttcttccaattttacccttattattt 33115157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 575 - 741
Target Start/End: Original strand, 37047031 - 37047199
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac--tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||   |||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  37047031 gagcatatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaagttctgtttgataacgcttttttacaacgagcttatagcttattttaggagcttataagctatt 37047130  T
Q  673 tttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttat 741  Q
    ||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37047131 tttcagaagctacttcaaatagcgtttgagcttatagcttatcatattttcttccatttttatccttat 37047199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 43225818 - 43225646
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||  ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43225818 agcttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 43225719  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  43225718 ttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 43225646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 21633956 - 21633750
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactct-gtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | | ||||| ||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21633956 agcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttttgtttggtaatgttctcttaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 21633857  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagc-------ttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttacc 767  Q
    ||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||  || |||||||    
T  21633856 tcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttcttccatttatacccttattattttatctaaaaaccaattttacc 21633757  T
Q  768 ctttata 774  Q
    | |||||    
T  21633756 cattata 21633750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 7706376 - 7706515
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7706376 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 7706475  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  7706476 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 7706515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 18582848 - 18582987
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18582848 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttt 18582947  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  18582948 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 18582987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 27397906 - 27397767
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27397906 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 27397807  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  27397806 tcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 27397767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 47417615 - 47417444
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  47417615 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatctt 47417516  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||| | |||||| |||| |  ||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  47417515 tcataagctattccaagcagcgtttgagcttataacttctcactttttcttccaattttacccttattattt 47417444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 52669998 - 52670137
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52669998 agcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 52670097  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  52670098 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 52670137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 56372439 - 56372578
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  56372439 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 56372538  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| |||| |  |||||||||||||||||||    
T  56372539 tcagaagctattccaagcagcgtttgagcttatagcttat 56372578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 547 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 20148973 - 20148778
Alignment:
Q  547 tagggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa---ctctgtttgataatg-tcttttcaccacgagctt 642  Q
    |||||||||||||||||  |||  ||| || ||||||  ||||||| ||||||||  ||||||   ||||||||| ||||| ||| ||  ||| ||||||    
T  20148973 tagggtctgtttggtaagcccactaaatgaacttataatttataagttcgtttgataaaaaaaaagctctgtttggtaatggtctcttg-ccatgagctt 20148875  T
Q  643 atagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccctt 739  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20148874 atagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttatcattttttcttccatctttaccctt 20148778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 8941910 - 8942047
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  8941910 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttattttacgagcttataagctatttttc 8942009  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  8942010 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 8942047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 549 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 41864248 - 41864021
Alignment:
Q  549 gggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatag 646  Q
    |||||||||||||||   ||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |  |||| || |||  | |||||    
T  41864248 gggtctgtttggtaagctcactaaatgagcttataacttataagctcgtttgacaaaaaaaaactctgtttgataacggttttttacaacggacctatag 41864149  T
Q  647 cttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41864148 cttattttacgaacttataagctatttttaagaagctattccaaatagcgtttaagtttatagcttctcatcttttcttccatttttacccttattattt 41864049  T
Q  747 taattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    ||  |||||  || |||||||| |||||    
T  41864048 tatctaaaatccaattttacccattata 41864021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 3009715 - 3009854
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||  | |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3009715 agcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacatttttttaccttgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 3009814  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  3009815 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 3009854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 4355732 - 4355593
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4355732 agcttatagcttataaattcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 4355633  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  4355632 tcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 4355593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 11600687 - 11600826
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11600687 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttt 11600786  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  11600787 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 11600826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 19514022 - 19513883
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19514022 agcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 19513923  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  19513922 tcagaagctattccaagtagcgttttagcttatagcttat 19513883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 22038497 - 22038358
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  22038497 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttctcgagcttataggctatttt 22038398  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  22038397 tcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttat 22038358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 22892532 - 22892671
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22892532 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 22892631  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  22892632 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 22892671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 22944196 - 22944335
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22944196 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 22944295  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  22944296 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 22944335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 23868009 - 23867870
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23868009 agcttatagcttataagctcttttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 23867910  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  23867909 ttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 23867870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 29413535 - 29413674
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29413535 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgaacttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 29413634  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  29413635 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 29413674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 39087698 - 39087559
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  39087698 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttt 39087599  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| | |||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  39087598 tcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 39087559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 611 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 43078300 - 43078197
Alignment:
Q  611 tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagc 710  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  43078300 tctgtttggtaatgttttttcgccacgagcttataacttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtagcatttgagcttatagc 43078201  T
Q  711 ttat 714  Q
    ||||    
T  43078200 ttat 43078197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 553 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 52708161 - 52707937
Alignment:
Q  553 ctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgacc-aaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttat 651  Q
    |||||||||||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| |  |||| || |||||||||||||||||    
T  52708161 ctgtttggtaagccaatccaatgagcttatagcttataagctcgtttgatagaaaaaactctgtttggtaacgattttttacaacgagcttatagcttat 52708062  T
Q  652 ttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatag-------cttatcatcttttcttccatttttacccttatcat 744  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |  ||||||||||||       |||||||| |||| |||||||| |||||||| ||     
T  52708061 ttcacgagcttataaactatttttcagatgttattacaagta-acgttgagcttatagcttatatcttatcatgttttattccatttatacccttaccac 52707963  T
Q  745 tttaattaaaactcacttttaccctt 770  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||    
T  52707962 tttaactaaaacccatgtttaccctt 52707937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 549 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 30563015 - 30562794
Alignment:
Q  549 gggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactc-tgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagc 647  Q
    |||||| ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| ||| |  |||| || |||| |||||| |    
T  30563015 gggtctctttggtaagcccatctaatgagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttatgtttggtaacgattttttacaacgaacttataac 30562916  T
Q  648 ttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcatttt 747  Q
    |||||| | ||||  |||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || |||    
T  30562915 ttattttatgagca-ataagctatttttcagatgctattacaagtagcgtttaagcttatagcttatcatgttttattccatttatacccttaccacttt 30562817  T
Q  748 aattaaaactcacttttaccctt 770  Q
    || |||||||||  |||||||||    
T  30562816 aactaaaactcatgtttaccctt 30562794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 37970299 - 37970437
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||    |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  37970299 agcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaactctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctattttt 37970398  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  37970399 cagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 37970437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 55764564 - 55764702
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55764564 agcttatagcttataagctcgtttcaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 55764663  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  55764664 cagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 55764702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 4391848 - 4391709
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4391848 agctgatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttt 4391749  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4391748 tcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 4391709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 4939525 - 4939387
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||   ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4939525 agcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaaca-ctttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 4939427  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  4939426 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 4939387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 25440624 - 25440485
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25440624 agcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 25440525  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  25440524 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 25440485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 37831926 - 37832096
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37831926 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacacttttttaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 37832025  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||| || |||  ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  37832026 tcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagtttctcactttttcttcca-ctttacccttattattt 37832096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 550 - 714
Target Start/End: Original strand, 26826499 - 26826664
Alignment:
Q  550 ggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagct 648  Q
    ||||||||||| ||| ||   ||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||| | ||||||||| ||    
T  26826499 ggtctgtttggaaaaccccaaaaaagagcttatagcttataagtttgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcacgatgagcttataact 26826598  T
Q  649 tatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  26826599 tatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 26826664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 581 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 31338637 - 31338501
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataa--tgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||  |||  | | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31338637 atagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttagtaacattttttttcaccatgagcttatagcttatttcacgggcttataagctatttttca 31338538  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  31338537 gaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 31338501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 634 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 33005189 - 33005077
Alignment:
Q  634 cacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccattttt 733  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  33005189 cacgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagaagctattccaagtaacgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaatttt 33005090  T
Q  734 acccttatcattt 746  Q
    |||||||| ||||    
T  33005089 acccttattattt 33005077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 4392865 - 4392727
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  4392865 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagcta-ttt 4392767  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  4392766 tcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 4392727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 25235149 - 25235288
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||| ||| |  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  25235149 agctgatagcttataagttcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttt 25235248  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  25235249 tcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 25235288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 635 - 754
Target Start/End: Original strand, 31435070 - 31435189
Alignment:
Q  635 acgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccattttta 734  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31435070 acgagcttatagcttatttcacgagtttataagttatttttcatacgctattccaagtagcgtttgaggttataacttatcatcttttattccattttta 31435169  T
Q  735 cccttatcattttaattaaa 754  Q
    || |||| | ||||||||||    
T  31435170 cctttattagtttaattaaa 31435189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 35190756 - 35190617
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |  |||| || ||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  35190756 agcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactctgtttggtaacgcttttttacaacgagtttgtagcttatttcaggagcttataagctatttt 35190657  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35190656 tcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 35190617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 578 - 708
Target Start/End: Original strand, 35468021 - 35468152
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac-tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35468021 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaatctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 35468120  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttata 708  Q
    ||| |||||| ||| ||  |||||||||||||    
T  35468121 agaagctattccaaatagcgtttgagcttata 35468152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 35822439 - 35822300
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35822439 agcttataacttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttacaacttatttcacgagattataagctatttt 35822340  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  35822339 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 35822300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 55684699 - 55684838
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||| |||||  |||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  55684699 agctgatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctttgtttggtaatgcttttttacaacgagcttctagcttatttcaggagcttataagctatttt 55684798  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  55684799 tcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 55684838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 587 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 5465540 - 5465411
Alignment:
Q  587 tataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgcta 684  Q
    |||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5465540 tataagctcgtttgataaaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagcta 5465441  T
Q  685 tttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || ||||||  |||||||||||||||||||    
T  5465440 ttccaagtagcgtttgagcttatagcttat 5465411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 604 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 55358449 - 55358339
Alignment:
Q  604 aaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagc 703  Q
    |||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  55358449 aaaaaactctgtttgataacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagc 55358350  T
Q  704 ttatagcttat 714  Q
    |||||||||||    
T  55358349 ttatagcttat 55358339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 635 - 736
Target Start/End: Complemental strand, 48056686 - 48056585
Alignment:
Q  635 acgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccattttta 734  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48056686 acgaacttatagtttatttcacgaacttataagttatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatcatcttttattccattttta 48056587  T
Q  735 cc 736  Q
    ||    
T  48056586 cc 48056585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 585 - 768
Target Start/End: Complemental strand, 8717049 - 8716865
Alignment:
Q  585 cttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataat-gtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgct 683  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| |||  ||||||| |  | || ||||||||||||||||  ||||||||   |||||| |||| |||    
T  8717049 cttataagctcatttgacaaaaaaaatctgcttggtaacagtctttttataaggaacttatagcttatttcaaaagcttatagtttattttccagaggct 8716950  T
Q  684 atttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccc 768  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||||    
T  8716949 atttcaagtagtgtttgagcttatagtttatcattttttcttccatttctacccttattattttatctaaaattcatttttaccc 8716865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 576 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 23113616 - 23113410
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||| || || ||| ||||   ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23113616 agcttatagtttataagctcgtttgataaaaaaaactttgattggtaatactttttcgccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 23113517  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgag-------cttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttacc 767  Q
    ||||| | |||| ||||||  |||||||       |||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||    
T  23113516 tcagaagttattccaagtagcgtttgagtttataacttataacttctcatattttatcccatttttacccttattattttaattaaaatccatatttacc 23113417  T
Q  768 ctttata 774  Q
    |||||||    
T  23113416 ctttata 23113410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 627 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 9032083 - 9031996
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  9032083 ttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttat 9031996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 9043751 - 9043611
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactc-tgtttgataatgtcttttc-accacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9043751 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttatgtttggtaacactttttccaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctattt 9043652  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  9043651 ttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttat 9043611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 635 - 770
Target Start/End: Original strand, 50502304 - 50502440
Alignment:
Q  635 acgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccattttta 734  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| | |||| |   ||||||||| || ||    
T  50502304 acgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagtgtttgagcttatggattattaatatttcttccacttcta 50502403  T
Q  735 cccttatca-ttttaattaaaactcacttttaccctt 770  Q
    ||||||| | |||| || ||||| |||||||||||||    
T  50502404 cccttattattttttatcaaaacccacttttaccctt 50502440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 638 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 40497473 - 40497362
Alignment:
Q  638 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccc 737  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||    
T  40497473 agcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcattttttgtctcatttttaccc 40497374  T
Q  738 ttatcattttaa 749  Q
    |||||| |||||    
T  40497373 ttatcaatttaa 40497362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 44442086 - 44442224
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  44442086 agcttataatttataagttcgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttattgcttatctcacgagctta-aaactatttt 44442184  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44442185 tcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 44442224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 55856664 - 55856528
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||   |||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55856664 agcttatagcttataagtttgtttgat--aaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 55856567  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
     ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  55856566 tagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 55856528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 632 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 27185715 - 27185633
Alignment:
Q  632 accacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  27185715 accatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 27185633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 586 - 746
Target Start/End: Original strand, 31953164 - 31953330
Alignment:
Q  586 ttataagctcgtttgaccaaaaaactc-tgtttgataatgtcttttca-----ccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||||||||     |||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    
T  31953164 ttataagttcgtttgacaaaaaaagttatgtttgacaatgtcttttcagttcaccacaaacttatagcttatttcacgactttataaactattttttaga 31953263  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |  |||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  31953264 cattatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacctttattattt 31953330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 581 - 738
Target Start/End: Complemental strand, 38049012 - 38048854
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaac-tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||| || |||||| ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38049012 atagtttataagttcgtttgaccaaaaaaaatttgtttgttaacgttttttcatcacgaacttataatttatttcacgagtttataaactatttttcaga 38048913  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccct 738  Q
    ||||||| ||| ||   |||||| |||||||||||||| | ||||| || |||| ||||    
T  38048912 cgctattccaaatagcatttgagtttatagcttatcatttcttctttcaattttgccct 38048854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 628 - 754
Target Start/End: Original strand, 44525694 - 44525820
Alignment:
Q  628 tttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttcc 727  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||  ||||    
T  44525694 tttcactatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctcacttttaattcc 44525793  T
Q  728 atttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    | |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  44525794 aattttacccttattattctaactaaa 44525820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 15635946 - 15636124
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  |||||| || |||||| |||    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15635946 agcttatagcttataaacttgtttgataaaaaaagctttgtttggtaacactttttcactatgagtttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 15636045  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttg-------agcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||       |||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15636046 tcagaagctattccaagtagcgtttgattttatagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 15636124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 548 - 608
Target Start/End: Original strand, 38489338 - 38489398
Alignment:
Q  548 agggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaa 608  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38489338 agggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgatcaaaaa 38489398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 627 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 30366234 - 30366147
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  30366234 ttttcatcatgagcttatatcttatttcacgagcttataaactatttttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttat 30366147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 627 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 51011153 - 51011066
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  51011153 ttttcaccataagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 51011066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 635 - 737
Target Start/End: Original strand, 1031352 - 1031453
Alignment:
Q  635 acgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccattttta 734  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||    
T  1031352 acgagcttatagcttattttacgagtttataacttatttt-cagacgctatttcagatattgtttgagcttacagcttatcatcttttctacaattttta 1031450  T
Q  735 ccc 737  Q
    |||    
T  1031451 ccc 1031453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 653 - 794
Target Start/End: Original strand, 31011003 - 31011143
Alignment:
Q  653 tcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaatta 752  Q
    |||||||||||||| |||| ||| | |  |||||  || ||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31011003 tcacgagcttataagctatattttaaaatctattctaaatatcgtttaagcttataacttctcattttttcttccatatttacccttatcattttaatta 31011102  T
Q  753 aaactcacttttaccctttatatattaaaacacatttattac 794  Q
    |||||||  |||| || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  31011103 aaactcagctttaacc-ttaaatattaaaacacctttattac 31011143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 576 - 691
Target Start/End: Original strand, 53273122 - 53273238
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||| |||    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  53273122 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctatttggtaacactttttcaccatgaacttataacttatttcacgagcttataagctatttt 53273221  T
Q  675 tcagacgctatttcaag 691  Q
    ||||| |||||| ||||    
T  53273222 tcagaagctattccaag 53273238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 549 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 24954375 - 24954271
Alignment:
Q  549 gggtctgtttggtaaagccatcaaacgagctt-------atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagc 640  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| || ||||||||||||||||||    
T  24954375 gggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagtttatagcttataagctcgtttgatcaaaaaagcaatgtttggtactgtcttttcaccacgagc 24954276  T
Q  641 ttata 645  Q
    |||||    
T  24954275 ttata 24954271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 576 - 665
Target Start/End: Complemental strand, 33005268 - 33005178
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttata 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33005268 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttata 33005178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 654 - 774
Target Start/End: Original strand, 17715647 - 17715767
Alignment:
Q  654 cacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaa 753  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||||  | |||||||||| |||| ||||||  | ||||  |||    
T  17715647 cacgagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagattatagcttattgttttttcttccacttttgcccttactaatttatctaa 17715746  T
Q  754 aactcacttttaccctttata 774  Q
    ||  | |||||||||||||||    
T  17715747 aatccccttttaccctttata 17715767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 627 - 714
Target Start/End: Original strand, 23162657 - 23162745
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttg-agcttatagcttat 714  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||   |||| ||||||||||||||    
T  23162657 ttttccccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcttttgaagcttatagcttat 23162745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 669 - 784
Target Start/End: Original strand, 2320099 - 2320214
Alignment:
Q  669 tatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccc 768  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||  |||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||| |    
T  2320099 tatttttcagacgataattcaaatagcgtttgaccttataacttatcactttttcttcaatttttatccttatcattttaatcaaaactcatgtttactc 2320198  T
Q  769 tttatatattaaaaca 784  Q
    ||||||  ||||||||    
T  2320199 tttataatttaaaaca 2320214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 576 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 29656833 - 29656722
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||| |||    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  29656833 agcttatagcttataagctcgtttgacagaaaaagttctgtttgttaacactttttcgccatgagcttatagcttatttcacgagctaataatttatttt 29656734  T
Q  675 tcagacgctatt 686  Q
    ||||| ||||||    
T  29656733 tcagaagctatt 29656722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 636 - 774
Target Start/End: Original strand, 52713559 - 52713704
Alignment:
Q  636 cgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat-------catcttttcttcca 728  Q
    |||||||||| |||||||||| | |||||||  ||||||| |||| |||||  |||||  |||||||||||||||||||       ||||||||||||||    
T  52713559 cgagcttataacttatttcacaaacttataagttatttttaagacactattctaagtagcgtttgagcttatagcttataacttctcatcttttcttcca 52713658  T
Q  729 tttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||| |||  ||||||| |||||    
T  52713659 tttttacccttattattttatctaaaattcaactttacccattata 52713704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Original strand, 17715588 - 17715658
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttata 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  17715588 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaatggtttttcaccacgagcttata 17715658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 581 - 741
Target Start/End: Original strand, 39068835 - 39068996
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaactc-tgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    |||| |||||| | |||||||  ||||||| | |||||| || |||| ||| || | ||||||||| ||||||||| ||| ||||||  |||||||||||    
T  39068835 atagattataaacccgtttgataaaaaaacccatgtttggtactgtccttttacaatgagcttataacttatttcaggagtttataacttatttttcaga 39068934  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttat 741  Q
    || |||||||||||  |||||| |||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||||    
T  39068935 cgatatttcaagtaacgtttgatcttataacttattgttttttcgtccacttttacccttat 39068996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 581 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 42124794 - 42124729
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttata 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  42124794 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaagctatgtttggtaatgttttttcaccacgagcttata 42124729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 657 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 45780815 - 45780726
Alignment:
Q  657 gagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  45780815 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttctttcaattttacccttattattt 45780726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 654 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 42124740 - 42124680
Alignment:
Q  654 cacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  42124740 cacgagcttataaactatctttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 42124680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 3932371 - 3932300
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttat 651  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  3932371 atagcttataagctcgtttgatcaaaaaagctctgtttggtaatgttttttcaccacgggcttacagcttat 3932300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 654 - 740
Target Start/End: Original strand, 40119903 - 40119996
Alignment:
Q  654 cacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagct-------tatagcttatcatcttttcttccatttttaccctta 740  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||       ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  40119903 cacgagcttataaactatttttcagacgctattccaagtagcatttgagcttgtagcctatagcttatcatattttcttccacttttaccctta 40119996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 576 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 36008145 - 36008069
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgac-caaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttat 651  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||    
T  36008145 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttat 36008069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 578 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 29656676 - 29656597
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcac 656  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29656676 cttatagcttttaagctcgtttgacaagaaaagctctgtttggtaacactttttcaccacgagcttatagcttatttcac 29656597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 627 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 36486473 - 36486386
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||| ||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  36486473 ttttcaccatgaatttatagtttattttatgagcttataaactatttttcataagctattttaagtaacgtttgaacttatagcttat 36486386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 581 - 661
Target Start/End: Original strand, 34032641 - 34032724
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa---ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagct 661  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||   ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  34032641 atagcttataagctcgtttaacaaaaaaaaaactccgtttgataatggtttttcaccacgagtttataacttatttcacaagct 34032724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 579 - 754
Target Start/End: Original strand, 53224244 - 53224410
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 678  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||   ||||||| || |||||||         ||||||| |||||| ||||||||||     
T  53224244 ttatagcttataagctcgtttgacaaaaaagctatgtttggtaaca-cttttcatcatgagcttac--------tcacgagtttataagctatttttcaa 53224334  T
Q  679 acgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    | |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||  |||||  ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  53224335 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcacttttaattccagatttacccttattattctaactaaa 53224410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 669 - 770
Target Start/End: Original strand, 12928952 - 12929053
Alignment:
Q  669 tatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccc 768  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |   |||||||||||| |||||||   ||||||||| || ||||||||| ||||| |  ||||| |||||||||||    
T  12928952 tatttttcagacactattttaagcaatatttgagcttataacttatcaatatttcttccacttctacccttattatttttagcaaaacccacttttaccc 12929051  T
Q  769 tt 770  Q
    ||    
T  12929052 tt 12929053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 655 - 775
Target Start/End: Original strand, 26443389 - 26443516
Alignment:
Q  655 acgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta-------tcatcttttcttccatttttacccttatcatttt 747  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  |||| |||||||| ||||       |||  |||  ||||| ||||||| |||| |||||    
T  26443389 acgagcttataaactatttttcaaaagctacttcaagtaacgtttaagcttataacttacaacgtctcacttttaattccaattttacctttattatttt 26443488  T
Q  748 aattaaaactcacttttaccctttatat 775  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  26443489 aattaaaatccacttttacccttaatat 26443516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 547 - 607
Target Start/End: Complemental strand, 6902292 - 6902232
Alignment:
Q  547 tagggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaa 607  Q
    |||||||||||||| ||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6902292 tagggtctgtttggcaagcccactaaatgagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaa 6902232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 658 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 49239276 - 49239220
Alignment:
Q  658 agcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||    
T  49239276 agcttataaactatttttcagacgctattataagtaacgtttgaacttatagtttat 49239220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 32948295 - 32948184
Alignment:
Q  604 aaaaaactctgtttgataatgtctttt-caccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgag 702  Q
    |||||||||||||||||||   ||||| || || ||| ||||| ||||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||||  || ||  |||||||    
T  32948295 aaaaaactctgtttgataacaactttttcatcatgagtttatatcttattttatgatattataaagtatttttcagacgctattctaaatagcgtttgag 32948196  T
Q  703 cttatagcttat 714  Q
    ||||||| ||||    
T  32948195 cttatagtttat 32948184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 25199436 - 25199366
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttata 645  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||    
T  25199436 agcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttata 25199366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 45780877 - 45780807
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttata 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||    ||||||||| |||||||||    
T  45780877 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctatttggtaacactttttcaccatgagcttata 45780807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 670 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 3932294 - 3932183
Alignment:
Q  670 atttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat-------catcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcactt 762  Q
    |||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||       ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||  || ||    
T  3932294 atttttcaaacgttatttcaagtagcatttgagcttatagcttatagcttatcatattttctttcatttttacccttattattttatctaaaatccaatt 3932195  T
Q  763 ttaccctttata 774  Q
    |||||| |||||    
T  3932194 ttacccattata 3932183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 627 - 672
Target Start/End: Complemental strand, 35842683 - 35842638
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  35842683 ttttcaccatgagcttatagattatttcgcgagcttataagctatt 35842638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 103; Significance: 9e-51; HSPs: 71)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 42375929 - 42375759
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42375929 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 42375830  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42375829 cagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 42375759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 575 - 741
Target Start/End: Original strand, 46757716 - 46757884
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||| ||| |  |||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  46757716 gagcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttataacttatttcatgagcttataagctatt 46757815  T
Q  673 tttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttat 741  Q
    ||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  46757816 tttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatcatattttcttccatttttatccttat 46757884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 575 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 19832138 - 19831966
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19832138 gagcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 19832039  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19832038 ttcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 19831966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 35587587 - 35587726
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35587587 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 35587686  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  35587687 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 35587726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 578 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 17192586 - 17192418
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||   |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17192586 cttatagtttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaaca-cttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 17192488  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  17192487 agaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 17192418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 31511308 - 31511447
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31511308 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 31511407  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  31511408 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 31511447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 36246523 - 36246384
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36246523 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 36246424  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  36246423 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 36246384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 42587530 - 42587391
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42587530 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 42587431  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  42587430 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 42587391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 43254111 - 43254250
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43254111 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 43254210  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  43254211 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 43254250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 45687063 - 45686924
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45687063 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 45686964  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  45686963 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 45686924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 47471109 - 47470970
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47471109 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 47471010  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| | |||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  47471009 tcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 47470970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 47587251 - 47587081
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47587251 agcttatagcttataaactcgtctgataaaaaaaactctgtttggtaaca-cttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 47587153  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  47587152 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 47587081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 36436162 - 36436332
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36436162 agcttatatcttataagctcgtttgacaaaaaagctatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 36436261  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||| |||||| ||| ||  ||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  36436262 cagaagctattccaaatagcgtttgagcttataacttctcactttttcttccaattttacccttattattt 36436332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 21254842 - 21254705
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21254842 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcactatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 21254743  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21254742 agaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 21254705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 578 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 21313936 - 21313765
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa---ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21313936 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttt 21313837  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||| | |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21313836 tcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 21313765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 572 - 748
Target Start/End: Complemental strand, 27869713 - 27869536
Alignment:
Q  572 aacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactc-tgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaacta 670  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||  |||||   |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  27869713 aacgagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagtcctgtttagtaatggtctttcaccacccgcttataacttatttcacgagcttataagcta 27869614  T
Q  671 tttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcatttta 748  Q
    |||||| |||| |||| ||||||  ||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27869613 tttttcggacgttattccaagtagcgtttgagtttatagcttattgttttttcttccattattacccttattatttta 27869536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 10312176 - 10312037
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10312176 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 10312077  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  10312076 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatatcttat 10312037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 27089803 - 27089664
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27089803 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 27089704  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  27089703 tcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttat 27089664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 27188498 - 27188637
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27188498 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 27188597  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  27188598 tcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttat 27188637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 40637307 - 40637168
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40637307 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggcaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 40637208  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  40637207 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 40637168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 576 - 740
Target Start/End: Complemental strand, 11466186 - 11466021
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11466186 agcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatactttttaaccatgagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttt 11466087  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccctta 740  Q
    | ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||    
T  11466086 ttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttattgttttttcttccacttttaccctta 11466021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 21741979 - 21742119
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac--tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21741979 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaaattctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttaaaagctattt 21742078  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  21742079 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 21742119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 23029797 - 23029937
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaa--aactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||  | || |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23029797 agcttatagcttataagctcgtctgacgaaaattagctttgtttggtaatgctttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatta 23029896  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  23029897 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 23029937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 582 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 40106146 - 40106013
Alignment:
Q  582 tagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagac 680  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  40106146 tagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagaa 40106047  T
Q  681 gctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||| ||||    
T  40106046 gctattccaagtaacgtttgagcttatagtttat 40106013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Original strand, 9485727 - 9485863
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9485727 ttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaaactctctttgataacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 9485826  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
     | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9485827 aaagctatttcaagtatcatttgagcttatagcttat 9485863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 21374641 - 21374780
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21374641 agcttatagcttataagcttgtttgacaaaaaaaattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 21374740  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  21374741 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 21374780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Original strand, 33026888 - 33027023
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 678  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33026888 ttatagtttataagctcctttgacaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 33026987  T
Q  679 acgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  33026988 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 33027023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 45222220 - 45222081
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45222220 agcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacaccttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 45222121  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||| ||||||||    
T  45222120 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttttagcttat 45222081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 43134413 - 43134551
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43134413 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 43134512  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  43134513 cagaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttat 43134551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Original strand, 17844555 - 17844691
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17844555 ttatagtttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaatgctatttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 17844654  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || ||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  17844655 gaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttat 17844691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 483129 - 482990
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  483129 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctttgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 483030  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  483029 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 482990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 741
Target Start/End: Original strand, 1342784 - 1342957
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |  |||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  1342784 agcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcagaagcttataagctatttt 1342883  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagct-------tatagcttatcatcttttcttccatttttacccttat 741  Q
    ||||| |||| ||||||||  |||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1342884 tcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatgttttcttccatttttatccttat 1342957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 27655820 - 27655681
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||   |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  27655820 agcttttagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaatacttttttaccatgagcttatagcttatttcaagagcttataagctatttt 27655721  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  27655720 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 27655681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 44743725 - 44743864
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44743725 agcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 44743824  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||   |||||| |||||||||||    
T  44743825 tcagaagctattccaagtagcatttgagtttatagcttat 44743864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 48832200 - 48832061
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48832200 agcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 48832101  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  48832100 tcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 48832061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 627 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 22642346 - 22642232
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttc 726  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||  |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22642346 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagtttataagctattttttaaacgctattctaagtagcatttgagcttatagcttatcatattttcttc 22642247  T
Q  727 catttttacccttat 741  Q
     ||||||||||||||    
T  22642246 tatttttacccttat 22642232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 554 - 714
Target Start/End: Original strand, 40893357 - 40893519
Alignment:
Q  554 tgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatagcttat 651  Q
    ||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  40893357 tgtttggtaaacccactaaattagtttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaatgatctctttaccacgagcttatagcttat 40893456  T
Q  652 ttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40893457 ttcacaagcttataagctattttttagaacctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 40893519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 33203812 - 33203676
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33203812 ttatagtttataagttcctttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 33203713  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  33203712 gaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttat 33203676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 9487415 - 9487554
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||| |||    |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9487415 agcttatagcttataagctcgtctgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttactatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 9487514  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  9487515 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 9487554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 40258865 - 40259004
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||| |||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  40258865 agcttatagcttataagcttgtttgacagaaaaagctatgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttt 40258964  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  40258965 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 40259004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 44596618 - 44596757
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||| | ||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44596618 agcttatagtttataagctcgtttcacaaaaaaaattctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 44596717  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  44596718 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 44596757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 628 - 741
Target Start/End: Original strand, 35000773 - 35000886
Alignment:
Q  628 tttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttcc 727  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  35000773 tttcatcaggagcttatagcttatttcacaagtttataaactatttttcagatgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttattgttttttcttcc 35000872  T
Q  728 atttttacccttat 741  Q
    | ||||||||||||    
T  35000873 acttttacccttat 35000886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 19757663 - 19757524
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||| |  |||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  19757663 agctaatagcttataagctcgtctgacaaaaaaaactatgtttgataacgcttttttacaacgagcttatagcttaattcaggagcttataagctatttt 19757564  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19757563 tcaaaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 19757524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 28425758 - 28425619
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactct-gtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||  | | ||||| |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  28425758 agcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaatgttttgtttggtaactttttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttt 28425659  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  28425658 tcataagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttat 28425619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 34709241 - 34709380
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| || |||    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  34709241 agcttttagcttataagtttgtttgactaaaaaagctctgtctggtaacactttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttt 34709340  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  34709341 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 34709380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 36407236 - 36407375
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || |||||| | ||||||| |||    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  36407236 agcttatagcttataagttcgtttcacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctatttt 36407335  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  36407336 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 36407375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 48313567 - 48313432
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 678  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  48313567 ttatagtttataagttcgtttgacaaaaaagctctgattggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttttcag 48313468  T
Q  679 acgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | |||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  48313467 aagctattccaagtagcttttgagcttatagcttat 48313432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 577 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 21316730 - 21316613
Alignment:
Q  577 gcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  21316730 gcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaaactctgtttggtaacactttttcactatgagcttatagcttatttcataagcttataagctattttt 21316631  T
Q  676 cagacgctatttcaagta 693  Q
    |||| |||||| ||||||    
T  21316630 cagaagctattccaagta 21316613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 46879672 - 46879532
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||| || ||| |  |||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  46879672 agctgatagcttataagttcgtctgacaaaaaaaagctctgtctggtaacgcttttttacaacgagcttatagcttatttcaggagcttataagctattt 46879573  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  46879572 ttcagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 46879532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 791477 - 791341
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| |  |||| || |||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  791477 ttatagtttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttgataacgattttttacaacgaacttatagcttattttatgagcttataagctatttttca 791378  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  791377 gatgctattacaagtagcgtttgaacttatagcttat 791341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 585 - 737
Target Start/End: Original strand, 45672312 - 45672464
Alignment:
Q  585 cttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgcta 684  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| || ||||  |||    |||| || |||| ||||||  |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  45672312 cttataagcttgtttgacaaaaaaattcagtttcgtaacaattttttacaacgaacttataatttattttacgaacttataagctatttttcagacgtta 45672411  T
Q  685 tttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccc 737  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45672412 tttcaagtagcgtttgagcttatagtttatcatcttttattccatttttaccc 45672464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 627 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 12345162 - 12345075
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  12345162 ttttcacgaagagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctatttcaagtagcatttgagcttatagcttat 12345075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 576 - 672
Target Start/End: Original strand, 32168841 - 32168938
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32168841 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 32168938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 586 - 714
Target Start/End: Original strand, 48590732 - 48590861
Alignment:
Q  586 ttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgcta 684  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||    
T  48590732 ttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttttcaaaagcta 48590831  T
Q  685 tttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  48590832 ttcaaagtagcgtttgagcttatagcttat 48590861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 575 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 36612257 - 36612119
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | |||||| ||| |  |||| || |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  36612257 gagcttatagcttataagctcgtctgac-aaaaagttatgtttggtaacgcttttttacaacgagcttttagcttatttcaggagtttataagctatttt 36612159  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36612158 ttagaagctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 36612119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 576 - 754
Target Start/End: Original strand, 38481288 - 38481467
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||    ||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  38481288 agcttatagcttataagttcgtttgacaaaaacagctctgtttggtaacactttttcaccatgaatttatagcttatttcacgagtctataagctatttt 38481387  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    ||| | |||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||  |||  ||||| ||||| |||||| ||| ||| ||||    
T  38481388 tcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttctcacttttaattccagttttatccttattattctaactaaa 38481467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 49148340 - 49148479
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||  |||    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  49148340 agctaatagcttataagcttttttgacaaaaaaagctctgtttagtaacacttttccaccatgagcttatagcttatttcacgagcttatgagctatttt 49148439  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| |||| |  |||||||||||||| ||||    
T  49148440 tcagaagctattccaagcagcgtttgagcttatagtttat 49148479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 701 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 33609143 - 33609070
Alignment:
Q  701 agcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  33609143 agcttatagcttatcatcttttgtcccatttttacccttattattttaattaaaacccatgtttaccctttata 33609070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 576 - 708
Target Start/End: Original strand, 48620466 - 48620598
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgacc-aaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||  |||||||| |||||| |||   ||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48620466 agcttatagtttataaacttgtttgacggaaaaaactttgtttggtaaca-cttttcatcatgagtttatagtttatttcacgagcttataaactatttt 48620564  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttata 708  Q
    |||||  ||||||||||||  |||||||| ||||    
T  48620565 tcagaaactatttcaagtagcgtttgagcatata 48620598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 581 - 683
Target Start/End: Original strand, 24170758 - 24170860
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagac 680  Q
    |||| ||||||| || |||||| |||||  | || ||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24170758 atagtttataagttcatttgacaaaaaagttttgcttggtaatgttttttcaccatgagtttatagcttatttcatgagcttataagctatttttcagac 24170857  T
Q  681 gct 683  Q
    |||    
T  24170858 gct 24170860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 604 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 38531300 - 38531191
Alignment:
Q  604 aaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagc 703  Q
    ||||||||||||||| |||    ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||  ||||||||    
T  38531300 aaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgatctaatagcttattttacgagcttataagctatttttcagaagtta-ttcaagtagcgtttgagc 38531202  T
Q  704 ttatagcttat 714  Q
    |||||||||||    
T  38531201 ttatagcttat 38531191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 660 - 774
Target Start/End: Original strand, 47584185 - 47584299
Alignment:
Q  660 cttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactca 759  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||| ||  ||||||| ||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||  ||    
T  47584185 cttataaactatttttcagaagttattccaaatagcgtttgagtttatagcttctcatattttatcccatttttacccttattattttaattcaaatcca 47584284  T
Q  760 cttttaccctttata 774  Q
      |||||||||||||    
T  47584285 tgtttaccctttata 47584299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 624 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 22621556 - 22621466
Alignment:
Q  624 gtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||| || ||||| |||||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||||||| |||||    
T  22621556 gtctttttacaacgagattatagtttatttcaggagctcataacttatttttcagacattatttcaagcagcgtttgagcttataacttat 22621466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 654 - 740
Target Start/End: Original strand, 48729549 - 48729635
Alignment:
Q  654 cacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccctta 740  Q
    ||||||||||||   ||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||  | |||||||||| |||||||||||    
T  48729549 cacgagcttatatcttattttctagacgctatttcaagtagcatttgagcttataacttattgttttttcttccacttttaccctta 48729635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 627 - 675
Target Start/End: Original strand, 21358644 - 21358692
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21358644 tttttaccacaaacttatagcttatttcacgagtttataaactattttt 21358692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 604 - 711
Target Start/End: Original strand, 39229920 - 39230027
Alignment:
Q  604 aaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagc 703  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||| || ||  | ||||||||| | |||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||| || ||  ||||||||    
T  39229920 aaaaaactcagtttggtaaagtcattccattaggagcttataacctatttcacgaacttataacttatttttcagatactattttaaatagtgtttgagc 39230019  T
Q  704 ttatagct 711  Q
    ||||||||    
T  39230020 ttatagct 39230027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 548 - 590
Target Start/End: Original strand, 21358551 - 21358593
Alignment:
Q  548 agggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttata 590  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  21358551 agggtctgtttggtaaggctatcaaacgagcttataacttata 21358593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 578 - 679
Target Start/End: Complemental strand, 21740290 - 21740188
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||| || | |||  |||||| ||||||||| ||| |  |||| || || ||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  21740290 cttatagcttataagttcatctgataaaaaaagctctgtttggtaacgcttttttacaacaagcttatagcttatttcagaagtttataagctatttttc 21740191  T
Q  677 aga 679  Q
    |||    
T  21740190 aga 21740188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 688 - 746
Target Start/End: Original strand, 32168940 - 32168998
Alignment:
Q  688 caagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  32168940 caagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 32168998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 701 - 739
Target Start/End: Original strand, 40893513 - 40893551
Alignment:
Q  701 agcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccctt 739  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40893513 agcttatagcttatcattttttcttccatctttaccctt 40893551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 704 - 770
Target Start/End: Original strand, 44072787 - 44072853
Alignment:
Q  704 ttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctt 770  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  44072787 ttatagtttatcattttttattacatttttactcttattattttaatgaaaatccacttttaccctt 44072853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 103; Significance: 9e-51; HSPs: 82)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 581 - 793
Target Start/End: Original strand, 15250115 - 15250335
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaac-tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  15250115 atagcttataagttcgtttgacaaaaaaaaatctgtttgataatggtctttcaccacgagcttatagcttatttctcgagcttataagttatttttcaga 15250214  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagc-------ttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttacccttta 772  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||       ||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||    
T  15250215 cgctattccaagtagcgtttgagcttatagtttatagcttgtcatgttttgttccatttctacccttatcattttaattaaaacccacatttacccctta 15250314  T
Q  773 tatattaaaacacatttatta 793  Q
    |||||| ||||||| ||||||    
T  15250315 tatatttaaacacacttatta 15250335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 576 - 794
Target Start/End: Original strand, 34884815 - 34885035
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaa-aactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |  ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  34884815 agctgatagattataagcttgtttgacaaaaaaaactctgtttgataaaggttttccaccacgagtttatagtttatttcacgagcttatagcctatttt 34884914  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttcca-tttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttat 773  Q
    |||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |  |||| ||||||     
T  34884915 tcagactctattccaagtagtgtttcagcttatagcttctcattttttcttccattttttacccttataattttaattaaaacctaactttaacctttaa 34885014  T
Q  774 atattaaaacacatttattac 794  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  34885015 atattaaaacacctttattac 34885035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 580 - 774
Target Start/End: Original strand, 24019895 - 24020090
Alignment:
Q  580 tatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 678  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||   | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24019895 tatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctttgtttggtaatgatctctaaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcag 24019994  T
Q  679 acgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    | |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||  |||||  || |||||||| |||||    
T  24019995 aagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatcatcttttattccatttataccattattattttatctaaaaaccaattttacccattata 24020090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 576 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 4385661 - 4385482
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4385661 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 4385562  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    |||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  4385561 tcagaaactatttcaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattatttcaattaaa 4385482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 5039780 - 5039951
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5039780 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccgtgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 5039879  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5039880 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 5039951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 31616522 - 31616351
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31616522 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctttgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 31616423  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31616422 tcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 31616351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 548 - 714
Target Start/End: Original strand, 39167729 - 39167895
Alignment:
Q  548 agggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatag 646  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||    
T  39167729 agggtctgtttgggaaa-ccaaaaaaagagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatag 39167827  T
Q  647 cttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  39167828 cttatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 39167895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 43507698 - 43507559
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43507698 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacattttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 43507599  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  43507598 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 43507559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 581 - 785
Target Start/End: Original strand, 4055900 - 4056112
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaactc-tgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||| |  ||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4055900 atagcttataagttcgtttgacaaaaaaaattatgtttgataatggtcatccaccacgagcttatagcttatttcacgagcttattagctatttttcaga 4055999  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttg-------agcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttacccttta 772  Q
    | ||||| ||| ||  |||||       ||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||    
T  4056000 cactattccaaatagcgtttgaacttatagcttatagcttatcatgttttatttcatttttacctttatcattttaattaaaacccacatttgcccttta 4056099  T
Q  773 tatattaaaacac 785  Q
    |||||||||||||    
T  4056100 tatattaaaacac 4056112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 37356173 - 37356313
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37356173 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 37356272  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  37356273 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 37356313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 576 - 774
Target Start/End: Original strand, 38842840 - 38843046
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaa-aactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||||   ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38842840 agcttatagtttataagttcgtttgataaaaaaaactctgtttggtaatactttttcaccatgagtttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 38842939  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta-------tcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttacc 767  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||       |||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||  ||||||    
T  38842940 tcagaagctatttcaagtagcgtttgaacttatagcttataacttctcatattttatcccatttttacccatattattttaattaaaattcatgtttacc 38843039  T
Q  768 ctttata 774  Q
    |||||||    
T  38843040 ctttata 38843046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 650916 - 650777
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  650916 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 650817  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  650816 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 650777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 3377397 - 3377536
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3377397 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 3377496  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  3377497 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 3377536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 4453659 - 4453520
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4453659 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 4453560  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  4453559 tcagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttat 4453520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 9886997 - 9887136
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9886997 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 9887096  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9887097 tcataagctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 9887136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 15521484 - 15521623
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15521484 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaaaactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 15521583  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  15521584 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 15521623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 16486887 - 16487026
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16486887 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 16486986  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  16486987 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 16487026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 17263889 - 17263750
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17263889 agcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacatgttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 17263790  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  17263789 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 17263750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 28382816 - 28382677
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28382816 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 28382717  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  28382716 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 28382677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 754
Target Start/End: Original strand, 29514839 - 29515024
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29514839 agcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccaagagcttatagcttatttcacgagcttataagctattttt 29514938  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta-------tcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    |||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||       |||  |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  29514939 cagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattttatttaaa 29515024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 36712672 - 36712533
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36712672 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 36712573  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  36712572 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 36712533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 38579144 - 38579005
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38579144 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 38579045  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  38579044 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 38579005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 576 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 6760740 - 6760566
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6760740 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacaagcttataagctatttt 6760641  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaa 749  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  6760640 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaa 6760566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 8815220 - 8815357
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8815220 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 8815319  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  8815320 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 8815357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 41322763 - 41322900
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41322763 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttc 41322862  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  41322863 agaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 41322900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 8689095 - 8688959
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8689095 ttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 8688996  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  8688995 gaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 8688959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 26911519 - 26911655
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26911519 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaactctctttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 26911618  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  26911619 gaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttat 26911655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 2266288 - 2266149
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2266288 agcttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 2266189  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  2266188 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 2266149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 2546460 - 2546321
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2546460 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacaaattttaaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 2546361  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  2546360 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 2546321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 4038476 - 4038305
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| | ||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  4038476 agcttatagcttacaagctcgtttgataaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttt 4038377  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  4038376 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 4038305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 24402188 - 24402049
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24402188 agcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 24402089  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  24402088 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 24402049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 746
Target Start/End: Original strand, 43135622 - 43135793
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43135622 agcttatagcttataagttcgtttgataaaaaaagctctgtttgataacactttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 43135721  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||  | |||||||||||| ||||    
T  43135722 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttctttgaattttacccttattattt 43135793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 576 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 40869495 - 40869321
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  40869495 agcttatagtttataagctcatttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttt 40869396  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaa 749  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  40869395 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaa 40869321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 635 - 736
Target Start/End: Original strand, 16669117 - 16669218
Alignment:
Q  635 acgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccattttta 734  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16669117 acgagcttatagcttatttcaggagcttataagctatttttcagacgctattccaagtagcgtttgagcttatagcttatcatcttttattccattttta 16669216  T
Q  735 cc 736  Q
    ||    
T  16669217 cc 16669218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 21865251 - 21865391
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21865251 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 21865350  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| | |||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  21865351 ttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 21865391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 576 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 23357121 - 23356915
Alignment:
Q  576 agcttatag-cttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  23357121 agcttataggcttataagctcgtttgacaaaaaaagctatgtttggtaatgctctctt-accacgagcttatagcttatttcacgagcttatatgctatt 23357023  T
Q  673 tttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttata-------gcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcactttta 765  Q
    ||||||| |||||||||||||  || ||||||||||       |||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||  ||||    
T  23357022 tttcagaagctatttcaagtagcgtctgagcttatagcttttagctttttatcttttgttccatttttacccttattattttaactaaaagtcaaattta 23356923  T
Q  766 ccctttat 773  Q
    ||||||||    
T  23356922 ccctttat 23356915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 7400524 - 7400388
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7400524 ttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 7400425  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  7400424 gaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 7400388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 13111879 - 13111739
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgttt-gataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13111879 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 13111780  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  13111779 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 13111739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 579 - 714
Target Start/End: Original strand, 36999497 - 36999633
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36999497 ttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttca 36999596  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    || |||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  36999597 gaagctattccaagtagcgtttgagcttataacttat 36999633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 10393171 - 10393032
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  10393171 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagcttataagctatttt 10393072  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  10393071 tcagaagctattccaagtagcgtttgagtttatagcttat 10393032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 749
Target Start/End: Complemental strand, 41796878 - 41796704
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||  |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41796878 agcttatagtttataagctcgttttataaaaaaagctctgtttcgtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 41796779  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaa 749  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  41796778 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcattttttgtctcatttttacccttatcaatttaa 41796704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 6232416 - 6232277
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaa-actctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6232416 agcttataacttataagctcgtttgacaaaaaatattctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttt 6232317  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6232316 tcagaagatatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 6232277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 40025078 - 40024939
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40025078 agcttatagcatataagctcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 40024979  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  40024978 tcagaagctattccaagtagcctttgagcttatagcttat 40024939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 44275668 - 44275806
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattttt 675  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||| |||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44275668 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaattatgtttggtaacactttttgaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataatctattttt 44275767  T
Q  676 cagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||| | |||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  44275768 cagaagttattccaattagcgtttgagcttatagcttat 44275806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 635 - 754
Target Start/End: Original strand, 2758896 - 2759015
Alignment:
Q  635 acgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccattttta 734  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  2758896 acgagcttataacttatttcatgagcttataagctattttttagacgctattccaagtagcgtttgagcttataatttatcatcttttattccattttta 2758995  T
Q  735 cccttatcattttaattaaa 754  Q
    ||||||| | ||||| ||||    
T  2758996 cccttattagtttaactaaa 2759015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 582 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 7213791 - 7213664
Alignment:
Q  582 tagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagac 680  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  7213791 tagcttataagctcgtttgataaaaaaaactctgtttgataatactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagaa 7213692  T
Q  681 gctatttcaagtatagtttgagcttata 708  Q
    |||||| ||||||  ||||| |||||||    
T  7213691 gctattccaagtagcgtttgtgcttata 7213664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 10839716 - 10839577
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10839716 agcttatagcttataaactcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatatcttatttcactagcttataagctatttt 10839617  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  10839616 tcaaaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 10839577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 581 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 7823678 - 7823481
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||| ||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  7823678 atagcttataaactcgtctgacaaaaaaaattctgcttgataatggctttttacaacgagcttgtagcttatttcacgagcttataagctattttttata 7823579  T
Q  680 cgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat--catc-----ttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctt 770  Q
     |||| ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||     |||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  7823578 agctacttcaagtagcgtttgagcttatagcttatagcatctcacttttaattctagttttacccttattattttaattaaaatccacttttaccctt 7823481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 13528038 - 13527901
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||   |||||||||| ||| ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||    
T  13528038 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgttcggtaacaccttttcaccatgagtttataacttatttcacaagtttataagctatttttc 13527939  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  13527938 agaagctatttcaagtaacgtttgaacttatagcttat 13527901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 38880919 - 38880779
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac--tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||   |||||||| |||    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38880919 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaaagttctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctattt 38880820  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  38880819 ttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 38880779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 576 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 5520204 - 5520002
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttg-accaaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||| |  |||| || ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  5520204 agcttatagcttataagctcgtttgtaaaaaaaaactctgtttagtaacgattttttacaacgagcttatagcttattttatgagtttataagctatttt 5520105  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagctta-------tagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttacc 767  Q
    ||||| |||||| ||| ||  |||||||||||       ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||| ||||||    
T  5520104 tcagatgctattacaaatagcgtttgagcttatagcatatagcttatcatattttattccatttatacccttaccactttaagtaaaacccacgtttacc 5520005  T
Q  768 ctt 770  Q
    |||    
T  5520004 ctt 5520002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 576 - 739
Target Start/End: Original strand, 41877734 - 41877908
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatagcttattt----------cacgagctta 663  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||   |||||          ||||||||||    
T  41877734 agcttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaatggtctctt-accacgagcttataaactatttttcagaagttcacgagctta 41877832  T
Q  664 taaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccctt 739  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  41877833 taaactatttttcagaagctatttcaagtagtgtttgagcttatagcttatcattttttcttcaatctttaccctt 41877908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 583 - 772
Target Start/End: Original strand, 2221401 - 2221598
Alignment:
Q  583 agcttataagctcgtttgaccaaa-aaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacg 681  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||  | |||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2221401 agcttataagctcgtttgataaaagaagttttgtttggtaatgtcttttcaccatgagtttatagtttatttcacgagcttctaagctatttttcagacg 2221500  T
Q  682 ctatttcaagtatagtttg-------agcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttacccttta 772  Q
    ||||| ||||||  |||||       | |||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||  || ||||||||||||    
T  2221501 ctattccaagtaacgtttgaacttataacttataacttatcattttttcttcctattttacccttattattttatctaaaatccatttttacccttta 2221598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 669 - 763
Target Start/End: Original strand, 6807492 - 6807586
Alignment:
Q  669 tatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttt 763  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||| ||||||    
T  6807492 tatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttatcattttttcttccaattttacccttattattttatctaaaacccacttt 6807586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 575 - 754
Target Start/End: Original strand, 42132670 - 42132851
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac--tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||   |||||||| |||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42132670 gagcttatagcttataaacttgtttgataaaaaaaagttctgtttggtaacaccttttcatcatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatt 42132769  T
Q  673 tttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    ||||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||  |||  || || |||||||||||| ||| ||| ||||    
T  42132770 tttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttctcacttttaattacagttttacccttattattctaactaaa 42132851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 576 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 6222775 - 6222611
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactct-gtttgataat-gtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| | | |||||||||| |||| || |||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6222775 agcttatggcttataagttcgtttgacaaaaaaagttttgtttgataatagtctctt-accacgaaactatagcttatttcacgagcttataagctattt 6222677  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccctt 739  Q
    |||||| ||||||||||| |   ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||    
T  6222676 ttcagaagctatttcaagcagcatttgaacttatagcttatcatttttgctttcatctttaccctt 6222611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 575 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 8070757 - 8070617
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||| |||    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8070757 gagcttctagcttataaactcgtttgacaaaaaaaactttgtttggtaacactttttcaccatgagcttataacttatttcacgagcttataagctattt 8070658  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| ||||||  |||||  |||||||||||||| ||||    
T  8070657 ttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagtttat 8070617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 578 - 746
Target Start/End: Original strand, 43285629 - 43285794
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    |||||||||||||||||    |||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  43285629 cttatagcttataagct----tgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcatgagtttataagctatttttc 43285724  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||||| |||  |||||||| | |||||||||||| ||||    
T  43285725 agaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttctacttttacccttattattt 43285794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 636 - 748
Target Start/End: Original strand, 25071436 - 25071555
Alignment:
Q  636 cgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttg-------agcttatagcttatcatcttttcttcca 728  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||  |||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25071436 cgagcttatagtttatttcacgagcttataagctatttttcagaaactattccaagtagcgtttgagcttatagcttatagcttatcatcttttcttcca 25071535  T
Q  729 tttttacccttatcatttta 748  Q
    ||| ||||||||| ||||||    
T  25071536 tttatacccttattatttta 25071555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 578 - 673
Target Start/End: Original strand, 18212127 - 18212223
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18212127 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 18212223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 654 - 774
Target Start/End: Original strand, 13761842 - 13761960
Alignment:
Q  654 cacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaa 753  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | ||   ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||    
T  13761842 cacgagcttataagctatttttcagaagttac--caagtagcgtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttatacccttattattttatctaa 13761939  T
Q  754 aactcacttttaccctttata 774  Q
    ||  || |||||||| |||||    
T  13761940 aaaccaattttacccattata 13761960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 629 - 713
Target Start/End: Complemental strand, 9053212 - 9053128
Alignment:
Q  629 ttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctta 713  Q
    ||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9053212 ttcaccatgaactaatagtttatttcacgagcttataaactattcttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttatagctta 9053128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 620 - 746
Target Start/End: Original strand, 37674469 - 37674595
Alignment:
Q  620 taatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatct 719  Q
    |||||| ||| | ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||  |    
T  37674469 taatgtttttccgccacgagtttataatttatttcacgagcttgtaaactatattttagacgctattccaagtagcgtttgagtttatagcttctcactt 37674568  T
Q  720 tttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  37674569 tttcttccacttttatccttattattt 37674595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 576 - 754
Target Start/End: Original strand, 10727835 - 10728021
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||  |||||| | |||||||||||    |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  10727835 agcttatagcttattagcccgtttgataaaaaaagttctgtttgataacactttttcatcataagcttatagcttatttcacgaacttataagctatttt 10727934  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgag-------cttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    ||| |  ||||| ||||||  |||||||       |||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  10727935 tcaaaaactattccaagtagcgtttgagcttataacttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattttatttaaa 10728021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 666 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 13351649 - 13351569
Alignment:
Q  666 aactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  13351649 aactatttttcagacgctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttcttattttttctttcaattttacccttattattt 13351569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 669 - 755
Target Start/End: Original strand, 3337166 - 3337252
Alignment:
Q  669 tatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaa 755  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  3337166 tatttttcagacgttatttcaaataatatttgagcttatagcttatcatcttttatttcattttcacccttatcactttaactaaaa 3337252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 657 - 746
Target Start/End: Original strand, 18710257 - 18710346
Alignment:
Q  657 gagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18710257 gagcttataagctattttttagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttccaattttacccttattattt 18710346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 658 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 6153515 - 6153427
Alignment:
Q  658 agcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  6153515 agcttataagctatttttcagaagttattccaagtagtgtttgagcttatagcttctcattttttctttcaattttacccttattattt 6153427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 604 - 714
Target Start/End: Original strand, 598925 - 599035
Alignment:
Q  604 aaaaaactctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagc 703  Q
    ||||||||||| ||| ||| |  |||| || ||||| |||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||    
T  598925 aaaaaactctgcttggtaacgcttttttacaacgagtttatagtttatttcaaaagcttataagctatttttcagaagctacttcaagtagcgtttgagc 599024  T
Q  704 ttatagcttat 714  Q
    |||||| ||||    
T  599025 ttatagtttat 599035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 578 - 714
Target Start/End: Original strand, 8339986 - 8340123
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttc 676  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||    |||||| || |||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||||    
T  8339986 cttatagtttataagttcgtttgacgaaaaaagttctgtttggtaacactttttcatcatgagcttatagtttattttacgaatttataagctatttttc 8340085  T
Q  677 agacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | | |||||| ||||||  ||||||||||| |||||||    
T  8340086 aaaagctattccaagtagcgtttgagcttaaagcttat 8340123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 545 - 590
Target Start/End: Original strand, 22375924 - 22375969
Alignment:
Q  545 cttagggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttata 590  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22375924 cttagggtctatttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttata 22375969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 581 - 754
Target Start/End: Complemental strand, 33850256 - 33850081
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataat-gtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcag 678  Q
    |||||||||||| || | || |||||||| |||||||||||||  ||||| |   || ||||||||||| |||||||| || |||||   |||| | ||     
T  33850256 atagcttataagttcctatgtccaaaaaagctctgtttgataaacgtcttcttgtcatgagcttatagcgtatttcactagtttatagcttattctccat 33850157  T
Q  679 acgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaa 754  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||  | |||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||    
T  33850156 acgctatttcaagtagcgtttgagtttatagcttattgttttttcttccacttttaaccttactattttgattaaa 33850081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Original strand, 13761784 - 13761853
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttgataat-gtcttttcaccacgagcttata 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||    
T  13761784 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaagctctgtttggtaatggtctctt-accacgagcttata 13761853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 641 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 2047391 - 2047318
Alignment:
Q  641 ttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  2047391 ttatagcttatttcatgagtttataagctatttttcagaagttattctaagtagcgtttgagcttatagcttat 2047318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 703 - 774
Target Start/End: Original strand, 2757312 - 2757383
Alignment:
Q  703 cttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcacttttaccctttata 774  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||| |||||    
T  2757312 cttataacttatcattttttctttcatttttacccttattattttatctaaaattcacttatacccattata 2757383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 670 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 12738620 - 12738544
Alignment:
Q  670 atttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    |||||||| ||||||||| |||||   |||||| ||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  12738620 atttttcatacgctattttaagtagcatttgagtttataacttaccattttttattccatttttacccttattattt 12738544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 657 - 712
Target Start/End: Original strand, 7569853 - 7569908
Alignment:
Q  657 gagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagctt 712  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  7569853 gagcttataagctatttttcagaagttattttaagtaacgtttgagcttatagctt 7569908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 581 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 13351714 - 13351649
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttata 645  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  13351714 atagcttataagctcgtttgattaaaaaagttctgtttggtaatgtttttccaccacgagtttata 13351649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 581 - 618
Target Start/End: Original strand, 16664354 - 16664391
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaactctgtttg 618  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16664354 atagcttataagctcgtttgacaaaaaaactatgtttg 16664391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 578 - 618
Target Start/End: Original strand, 18710197 - 18710238
Alignment:
Q  578 cttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttg 618  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  18710197 cttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttg 18710238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 635 - 708
Target Start/End: Original strand, 26411311 - 26411384
Alignment:
Q  635 acgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttata 708  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||   | |||| | ||||| ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  26411311 acgagcttatagcttatttcactagcttaaggattattctccagacactatttcaaatagcgtttgagcttata 26411384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 628 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 32627709 - 32627644
Alignment:
Q  628 tttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagta 693  Q
    ||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||   ||||||| |||| ||||||||||||    
T  32627709 tttcatcacgaacttataatttatttcacgagcttatatcttatttttaagacactatttcaagta 32627644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 102; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 576 - 739
Target Start/End: Original strand, 9237 - 9401
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9237 agcttataccttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttgttaatggtctctt-accacgagctcatagcttatttcacgagcttataaactattt 9335  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccctt 739  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9336 ttcagaagctatttcaagtagtgtttgagcttatagcttatcattttttcttccatctttaccctt 9401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 88; Significance: 8e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 576 - 739
Target Start/End: Original strand, 84262 - 84427
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 672  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| ||||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  84262 agcttatagcatataagttcgtttgacaaaaaaaaactctgtttggtaatggtctctt-atcacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatt 84360  T
Q  673 tttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccctt 739  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  84361 tttcagaagctatttcaagtagcgtttgagcttataacttatcattttttcttccatctctaccctt 84427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 548 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 93552 - 93386
Alignment:
Q  548 agggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatag 646  Q
    |||||||||||||| || |||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    ||   |||| ||||||||||    
T  93552 agggtctgtttggttaacccaaaaaa-gagcttttagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacactttaaaaccatgagcttatag 93454  T
Q  647 cttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  93453 cttatttcacgagcttataagctatttttcataagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 93386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 22602 - 22741
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  22602 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagttatttt 22701  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  22702 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 22741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 126899 - 126760
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  126899 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 126800  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  126799 tcagaagctattccaagtagcgcttgagcttatagcttat 126760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 77; Significance: 3e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 579 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 30313 - 30145
Alignment:
Q  579 ttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttca 677  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30313 ttatagtttataagctcgtttgacaaaaaaaactctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttca 30214  T
Q  678 gacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattt 746  Q
    || | |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||| || |||||||||||| ||||    
T  30213 gaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcacattttctttcaattttacccttattattt 30145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 28224 - 28076
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagctta---------tttcacgagcttata 665  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||         |||||| ||||||||    
T  28224 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttgataacactttttcaccatgagcttatagcttataagctatttttcacaagcttata 28125  T
Q  666 aactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  28124 agctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 28076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1632 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1632
Description:

Target: scaffold1632; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 176 - 37
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  176 agcttatagcttataagctcgtttcacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttgaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 77  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  76 tcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 192020 - 192159
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  192020 agcttatagcttataagctcgtatgacaaaaaaagctctgtttggtaatactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 192119  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | ||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||    
T  192120 tgagaagctattccaagtagcttttgagcttatagcttat 192159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 552 - 714
Target Start/End: Original strand, 431241 - 431404
Alignment:
Q  552 tctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagctta 650  Q
    ||||||||| ||| |||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||    
T  431241 tctgtttgggaaacccaaaaaaagagcttttagcttataagttcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagctta 431340  T
Q  651 tttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||||||||||||    
T  431341 tttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaaatagcgtttgagcttatagcttat 431404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 635 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 119318 - 119239
Alignment:
Q  635 acgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  119318 acgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttttcagatcctattccaagtagagtttgagcttatagcttat 119239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 12856 - 12717
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  12856 agcttatagcttataagctcgtttgataaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttgacgagcttataagctatttt 12757  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||||||    
T  12756 tcagaagctattccaagtagcgtttgaggttatagcttat 12717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 72; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 627 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 53108 - 52989
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttc 726  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  53108 ttttcaccatgagcttatagcctatttcacgagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttc 53009  T
Q  727 catttttacccttatcattt 746  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  53008 caattttacccttattattt 52989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 71; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 554 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 72927 - 72765
Alignment:
Q  554 tgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatg-tcttttcaccacgagcttatagcttat 651  Q
    ||||||||||| |||  |||  || |||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  72927 tgtttggtaaacccactaaattagtttatagcttataagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaatgatctctttaccacgagcttatagcttat 72828  T
Q  652 ttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  72827 ttcacaagcttataagctattttttagaacctatttcaagtagcgtttgagcttatagcttat 72765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 69; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 575 - 714
Target Start/End: Original strand, 63850 - 63990
Alignment:
Q  575 gagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaac-tctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||  |||||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  63850 gagcttatagctcttaagctcgtttgacaaaaaaagatctgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 63949  T
Q  674 ttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||||    
T  63950 ttcagaagctattctaagtagcgtttgagcttatagcttat 63990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 576 - 714
Target Start/End: Original strand, 7064 - 7203
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaact-ctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttt 674  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7064 agcttatagcttttaagttcgtttgacaaaaaaagttctgtttggtaacacttttttaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctatttt 7163  T
Q  675 tcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    | ||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  7164 ttagaagctattccaagtagtgtttgagcttatagcttat 7203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 638 - 749
Target Start/End: Original strand, 4562 - 4673
Alignment:
Q  638 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttaccc 737  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||||||||    
T  4562 agcttataacttatttcacgagcttataagctatttttcagaagttattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcattttttgtctcatttttaccc 4661  T
Q  738 ttatcattttaa 749  Q
    |||||| |||||    
T  4662 ttatcaatttaa 4673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 627 - 746
Target Start/End: Original strand, 5468 - 5586
Alignment:
Q  627 ttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttcttc 726  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  5468 tttttaccatgagcttata-cttatttcacgagcttataagttatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttctcactttttcttc 5566  T
Q  727 catttttacccttatcattt 746  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  5567 caattttacccttattattt 5586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 58; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 576 - 686
Target Start/End: Complemental strand, 27274 - 27162
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa--ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactattt 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || |||||| |||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27274 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaataaagctatgtttggtaacactttttcaccatgagcttatagcttatttcacgagcttataagctattt 27175  T
Q  674 ttcagacgctatt 686  Q
    |||||| ||||||    
T  27174 ttcagaagctatt 27162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 581 - 693
Target Start/End: Complemental strand, 9096 - 8984
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcaga 679  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  9096 atagcttataagcttatttgatcaaaaaagctctgtttggtaatgggttttcaccacgagcttatagtttatttcacaagtttataagctatttttcaga 8997  T
Q  680 cgctatttcaagta 693  Q
    | || |||||||||    
T  8996 cact-tttcaagta 8984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 638 - 706
Target Start/End: Original strand, 10833 - 10901
Alignment:
Q  638 agcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagctta 706  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||    
T  10833 agcttatagcttatttcacgagtttataagctatttttcagacgctattccaaatagcgtttgagctta 10901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1360
Description:

Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 581 - 651
Target Start/End: Complemental strand, 1366 - 1295
Alignment:
Q  581 atagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttatagcttat 651  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  1366 atagcttataagctcgtttgatcaaaaaagctctgtttggtaatgttttttcaccacgggcttacagcttat 1295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 670 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 1289 - 1178
Alignment:
Q  670 atttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat-------catcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaactcactt 762  Q
    |||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||       ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||  || ||    
T  1289 atttttcaaacgttatttcaagtagcatttgagcttatagcttatagcttatcatattttctttcatttttacccttattattttatctaaaatccaatt 1190  T
Q  763 ttaccctttata 774  Q
    |||||| |||||    
T  1189 ttacccattata 1178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 626 - 759
Target Start/End: Complemental strand, 59266 - 59134
Alignment:
Q  626 cttttcaccacgagcttatagcttatttcacgagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttatcatcttttctt 725  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||| ||||||| |||||| || ||   ||| ||||||||||||||||| |||| |     
T  59266 cttttcatcacgagcttataacttatttcactagcttatagtttattattcagacactattttaaatagcatttaagcttatagcttatcat-ttttatc 59168  T
Q  726 ccatttttacccttatcattttaattaaaactca 759  Q
     ||||||||||||| | |||| || |||||||||    
T  59167 tcatttttacccttgtaatttaaactaaaactca 59134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 696 - 756
Target Start/End: Original strand, 11850 - 11910
Alignment:
Q  696 gtttgagcttatagcttatcatcttttcttccatttttacccttatcattttaattaaaac 756  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11850 gtttgagcttataacttatcattttttattccatttttatccttatcatttttattaaaac 11910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 657 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 41822 - 41765
Alignment:
Q  657 gagcttataaactatttttcagacgctatttcaagtatagtttgagcttatagcttat 714  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  41822 gagcttataagctatttttcagaagctattccaagtagcgtttgagcttatagcttat 41765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 576 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 41884 - 41814
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa-ctctgtttgataatgtcttttcaccacgagcttata 645  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    ||||||||| |||||||||    
T  41884 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaagctctgtttggtaacactttttcaccatgagcttata 41814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 549 - 609
Target Start/End: Original strand, 50373 - 50433
Alignment:
Q  549 gggtctgtttggtaaagccatcaaacgagcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa 609  Q
    |||||||||||||||  ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50373 gggtctgtttggtaagacctgaaaatgagcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa 50433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 576 - 609
Target Start/End: Original strand, 36362 - 36395
Alignment:
Q  576 agcttatagcttataagctcgtttgaccaaaaaa 609  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36362 agcttatagcttataagctcgtttgacaaaaaaa 36395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 708 - 741
Target Start/End: Original strand, 32580 - 32613
Alignment:
Q  708 agcttatcatcttttcttccatttttacccttat 741  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32580 agcttatcatcttttattccatttttacccttat 32613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University