View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2324_low_18 (Length: 530)

Name: NF2324_low_18
Description: NF2324
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2324_low_18
NF2324_low_18
[»] chr3 (98 HSPs)
chr3 (1-510)||(32287164-32287686)
chr3 (1-510)||(54723573-54724089)
chr3 (1-510)||(2873396-2873912)
chr3 (1-510)||(50461396-50461911)
chr3 (1-510)||(7486402-7486919)
chr3 (77-514)||(16184610-16185054)
chr3 (1-502)||(538666-539174)
chr3 (9-510)||(11190358-11190866)
chr3 (1-510)||(53815660-53816177)
chr3 (106-510)||(2775313-2775726)
chr3 (106-510)||(2778556-2778969)
chr3 (31-510)||(24125331-24125815)
chr3 (31-510)||(24128608-24129092)
chr3 (1-510)||(30690568-30691083)
chr3 (106-502)||(45896220-45896625)
chr3 (77-510)||(43809411-43809851)
chr3 (47-510)||(8461382-8461849)
chr3 (106-510)||(43926667-43927079)
chr3 (31-510)||(6434655-6435140)
chr3 (106-510)||(49742869-49743282)
chr3 (106-510)||(29343824-29344237)
chr3 (1-510)||(47054757-47055273)
chr3 (113-510)||(3840348-3840754)
chr3 (1-502)||(47051335-47051843)
chr3 (122-510)||(52199745-52200141)
chr3 (106-510)||(25584519-25584921)
chr3 (104-502)||(17039970-17040376)
chr3 (106-510)||(16243705-16244117)
chr3 (122-510)||(11784597-11784994)
chr3 (106-510)||(27091726-27092138)
chr3 (115-506)||(9392570-9392969)
chr3 (106-507)||(20728597-20729006)
chr3 (104-510)||(28008019-28008432)
chr3 (47-509)||(35412348-35412811)
chr3 (122-514)||(55034822-55035226)
chr3 (47-510)||(10106494-10106961)
chr3 (47-510)||(10884690-10885157)
chr3 (113-510)||(10881312-10881717)
chr3 (122-514)||(54719799-54720199)
chr3 (104-514)||(22416782-22417200)
chr3 (1-395)||(18644613-18645016)
chr3 (103-514)||(34983800-34984219)
chr3 (104-510)||(12561182-12561596)
chr3 (105-514)||(30219954-30220375)
chr3 (3-395)||(23298462-23298863)
chr3 (126-509)||(48064005-48064396)
chr3 (176-510)||(19301534-19301867)
chr3 (176-510)||(19304718-19305051)
chr3 (105-499)||(35751297-35751686)
chr3 (105-514)||(46884780-46885185)
chr3 (176-510)||(15195331-15195664)
chr3 (104-514)||(17141236-17141654)
chr3 (183-510)||(32367165-32367491)
chr3 (108-510)||(41976847-41977243)
chr3 (106-395)||(31549118-31549416)
chr3 (104-502)||(25442807-25443214)
chr3 (205-513)||(22993756-22994063)
chr3 (182-467)||(18542426-18542711)
chr3 (175-514)||(3292987-3293327)
chr3 (104-502)||(17528709-17529111)
chr3 (213-510)||(28265712-28266005)
chr3 (1-320)||(18641617-18641945)
chr3 (248-510)||(52988237-52988498)
chr3 (105-514)||(22783420-22783847)
chr3 (105-514)||(22787784-22788211)
chr3 (47-346)||(54461010-54461316)
chr3 (104-395)||(17531604-17531897)
chr3 (105-385)||(17545812-17546102)
chr3 (122-328)||(55031962-55032181)
chr3 (3-252)||(28266006-28266264)
chr3 (249-395)||(282293-282439)
chr3 (106-260)||(52309565-52309728)
chr3 (354-508)||(31857650-31857804)
chr3 (345-510)||(52309754-52309920)
chr3 (1-169)||(6922701-6922868)
chr3 (282-476)||(27308157-27308349)
chr3 (279-514)||(27298594-27298828)
chr3 (431-514)||(17544444-17544526)
chr3 (279-372)||(27308717-27308809)
chr3 (431-509)||(6922579-6922657)
chr3 (104-229)||(52990812-52990946)
chr3 (106-157)||(10902133-10902184)
chr3 (1-73)||(12541146-12541219)
chr3 (104-169)||(37408862-37408927)
chr3 (431-510)||(11636666-11636743)
chr3 (430-513)||(22360275-22360357)
chr3 (104-159)||(32367078-32367133)
chr3 (1-62)||(3306057-3306119)
chr3 (1-62)||(28327652-28327714)
chr3 (1-62)||(28330977-28331039)
chr3 (405-513)||(22370178-22370285)
chr3 (313-395)||(6030758-6030840)
chr3 (176-217)||(31857847-31857888)
chr3 (105-157)||(3292908-3292959)
chr3 (106-154)||(18542750-18542798)
chr3 (1-65)||(19301114-19301178)
chr3 (104-168)||(22993644-22993708)
chr3 (343-395)||(55032183-55032235)
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (1-514)||(45155129-45155649)
chr8 (16-510)||(38248273-38248774)
chr8 (1-498)||(25230836-25231342)
chr8 (47-514)||(14421484-14421959)
chr8 (1-510)||(18824255-18824770)
chr8 (1-510)||(25591339-25591854)
chr8 (1-502)||(18825748-18826255)
chr8 (1-510)||(10663643-10664158)
chr8 (1-510)||(16953520-16954035)
chr8 (41-510)||(23643563-23644039)
chr8 (47-510)||(18721188-18721657)
chr8 (80-510)||(36710575-36711012)
chr8 (104-510)||(17930725-17931139)
chr8 (106-510)||(22173886-22174299)
chr8 (106-510)||(25594620-25595033)
chr8 (47-510)||(43681776-43682246)
chr8 (105-510)||(5980275-5980688)
chr8 (106-509)||(12582753-12583167)
chr8 (103-510)||(21279729-21280144)
chr8 (104-510)||(13196601-13197015)
chr8 (104-510)||(10498175-10498589)
chr8 (122-514)||(8911387-8911789)
chr8 (104-510)||(31284414-31284832)
chr8 (103-387)||(12516412-12516706)
chr8 (104-502)||(23619325-23619731)
chr8 (104-510)||(33419400-33419814)
chr8 (47-475)||(5538681-5539114)
chr8 (105-514)||(5613680-5614107)
chr8 (104-514)||(30784669-30785078)
chr8 (1-285)||(33883209-33883501)
chr8 (176-481)||(2560325-2560630)
chr8 (122-383)||(44027072-44027341)
chr8 (175-467)||(4868041-4868331)
chr8 (431-510)||(23613284-23613363)
chr8 (80-211)||(14589560-14589698)
chr8 (106-199)||(20887589-20887691)
chr8 (106-169)||(5584359-5584422)
chr8 (5-62)||(37681385-37681442)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (1-510)||(14281378-14281896)
chr6 (1-510)||(13004937-13005455)
chr6 (1-510)||(9953712-9954226)
chr6 (1-502)||(2378986-2379494)
chr6 (1-509)||(1125595-1126110)
chr6 (5-514)||(2846046-2846564)
chr6 (103-510)||(6513001-6513420)
chr6 (52-510)||(3596693-3597157)
chr6 (105-514)||(9839356-9839774)
chr6 (106-509)||(5738042-5738459)
chr6 (31-510)||(11402005-11402491)
chr6 (31-510)||(26942325-26942810)
chr6 (106-506)||(30655196-30655605)
chr6 (103-510)||(28107747-28108164)
chr6 (106-501)||(20185502-20185905)
chr6 (106-501)||(22150086-22150489)
chr6 (116-510)||(11125670-11126071)
chr6 (104-510)||(22561124-22561539)
chr6 (106-510)||(10289721-10290133)
chr6 (176-510)||(28111808-28112140)
chr6 (176-514)||(5259681-5260016)
chr6 (31-421)||(23384642-23385040)
chr6 (122-512)||(28230341-28230740)
chr6 (122-514)||(19475747-19476147)
chr6 (106-393)||(17106573-17106868)
chr6 (104-510)||(24399928-24400342)
chr6 (104-510)||(24410048-24410461)
chr6 (103-514)||(11247506-11247925)
chr6 (104-510)||(18855986-18856400)
chr6 (122-483)||(13946794-13947163)
chr6 (104-510)||(4512221-4512639)
chr6 (285-480)||(2372104-2372295)
chr6 (1-148)||(2372448-2372595)
chr6 (205-510)||(12988196-12988499)
chr6 (195-510)||(13021315-13021628)
chr6 (104-368)||(7128190-7128462)
chr6 (1-387)||(23007932-23008322)
chr6 (1-387)||(23780042-23780432)
chr6 (72-223)||(2372293-2372448)
chr6 (183-509)||(28848592-28848917)
chr6 (244-467)||(24371065-24371289)
chr6 (217-510)||(31072053-31072332)
chr6 (213-506)||(11192657-11192949)
chr6 (104-343)||(26896220-26896467)
chr6 (1-103)||(28107613-28107715)
chr6 (349-510)||(11188130-11188291)
chr6 (365-510)||(23388327-23388472)
chr6 (337-514)||(26898071-26898248)
chr6 (2-102)||(28111666-28111766)
chr6 (106-242)||(23847785-23847932)
chr6 (106-241)||(32109685-32109829)
chr6 (431-510)||(28665560-28665639)
chr6 (106-242)||(23842762-23842906)
chr6 (1-53)||(5260020-5260072)
chr6 (185-235)||(23667721-23667771)
chr6 (1-69)||(5737922-5737991)
chr6 (104-169)||(24155327-24155392)
chr6 (57-100)||(6514189-6514232)
chr6 (454-500)||(7918025-7918071)
chr6 (5-108)||(24371373-24371476)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (64-510)||(22020797-22021251)
chr2 (1-510)||(9185285-9185801)
chr2 (1-510)||(9188513-9189029)
chr2 (9-510)||(25959558-25960065)
chr2 (1-510)||(37279537-37280053)
chr2 (1-510)||(31427402-31427918)
chr2 (1-510)||(25870513-25871028)
chr2 (1-510)||(33310395-33310910)
chr2 (1-510)||(38015247-38015762)
chr2 (103-510)||(11347856-11348272)
chr2 (25-483)||(30274654-30275118)
chr2 (9-510)||(24234824-24235336)
chr2 (106-510)||(5105455-5105868)
chr2 (106-510)||(31585904-31586317)
chr2 (47-514)||(25138840-25139312)
chr2 (1-510)||(25873904-25874425)
chr2 (1-510)||(36808304-36808818)
chr2 (106-510)||(42368675-42369087)
chr2 (1-510)||(45456890-45457406)
chr2 (47-514)||(25820755-25821226)
chr2 (1-510)||(8888364-8888880)
chr2 (9-510)||(24238096-24238608)
chr2 (106-510)||(43207854-43208266)
chr2 (104-510)||(27266517-27266932)
chr2 (106-510)||(40781201-40781613)
chr2 (78-510)||(45493092-45493532)
chr2 (78-510)||(45500834-45501274)
chr2 (106-510)||(43723430-43723841)
chr2 (106-502)||(5666255-5666658)
chr2 (1-510)||(45453603-45454118)
chr2 (42-510)||(26365662-26366136)
chr2 (106-510)||(13971858-13972270)
chr2 (1-359)||(29440375-29440739)
chr2 (104-510)||(1386384-1386798)
chr2 (113-510)||(6826501-6826905)
chr2 (104-510)||(40259101-40259515)
chr2 (122-510)||(16178856-16179252)
chr2 (104-511)||(37937181-37937596)
chr2 (104-421)||(9966331-9966657)
chr2 (104-513)||(16790719-16791138)
chr2 (104-514)||(12219520-12219939)
chr2 (104-514)||(22630566-22630984)
chr2 (122-505)||(3875020-3875412)
chr2 (176-510)||(17876835-17877168)
chr2 (176-514)||(30926272-30926603)
chr2 (176-421)||(17874630-17874869)
chr2 (334-514)||(17876211-17876391)
chr2 (303-509)||(10600676-10600876)
chr2 (195-510)||(35521423-35521740)
chr2 (126-277)||(10600876-10601036)
chr2 (176-317)||(34682622-34682762)
chr2 (106-169)||(13137019-13137082)
chr2 (431-510)||(29440252-29440331)
chr2 (106-159)||(15470546-15470599)
chr2 (251-395)||(11187929-11188073)
chr2 (1-71)||(45499219-45499290)
chr2 (350-392)||(38427436-38427478)
chr2 (1-62)||(40677620-40677682)
[»] chr4 (76 HSPs)
chr4 (1-510)||(56195273-56195788)
chr4 (1-510)||(34017643-34018157)
chr4 (1-510)||(34319777-34320293)
chr4 (1-510)||(52530793-52531311)
chr4 (3-510)||(27014009-27014522)
chr4 (1-509)||(19859363-19859895)
chr4 (1-510)||(24150418-24150936)
chr4 (1-510)||(44808815-44809331)
chr4 (1-514)||(53094249-53094771)
chr4 (1-510)||(29324571-29325085)
chr4 (103-510)||(39501394-39501810)
chr4 (1-510)||(5672628-5673157)
chr4 (31-510)||(48637251-48637737)
chr4 (1-502)||(5670318-5670839)
chr4 (106-510)||(40903046-40903459)
chr4 (80-510)||(15812075-15812515)
chr4 (113-510)||(44164529-44164934)
chr4 (1-510)||(15431825-15432343)
chr4 (1-502)||(56198607-56199115)
chr4 (106-510)||(19820474-19820886)
chr4 (106-510)||(52006494-52006906)
chr4 (50-502)||(5681182-5681637)
chr4 (80-510)||(15405020-15405460)
chr4 (1-510)||(33926713-33927234)
chr4 (106-510)||(48415488-48415905)
chr4 (103-502)||(19864477-19864879)
chr4 (4-395)||(40616669-40617069)
chr4 (106-510)||(15429819-15430231)
chr4 (106-510)||(24044104-24044516)
chr4 (47-502)||(33408223-33408685)
chr4 (106-510)||(38283452-38283864)
chr4 (106-510)||(40794748-40795161)
chr4 (47-502)||(12238022-12238479)
chr4 (106-510)||(15436433-15436845)
chr4 (106-510)||(46955441-46955854)
chr4 (106-510)||(27677018-27677430)
chr4 (105-510)||(15163938-15164353)
chr4 (122-514)||(40493346-40493747)
chr4 (106-510)||(12782651-12783063)
chr4 (122-498)||(37103195-37103578)
chr4 (104-510)||(11195421-11195836)
chr4 (104-511)||(21419534-21419949)
chr4 (128-502)||(3718878-3719260)
chr4 (47-422)||(3797718-3798095)
chr4 (77-387)||(18911368-18911683)
chr4 (106-483)||(49270456-49270837)
chr4 (178-514)||(35509707-35510042)
chr4 (104-514)||(18673043-18673450)
chr4 (122-514)||(29544853-29545253)
chr4 (176-514)||(8874803-8875141)
chr4 (104-514)||(53009519-53009937)
chr4 (105-514)||(8877462-8877881)
chr4 (104-514)||(25961800-25962219)
chr4 (104-514)||(30392315-30392729)
chr4 (183-510)||(22172422-22172751)
chr4 (253-510)||(19827236-19827492)
chr4 (190-421)||(15446792-15447022)
chr4 (195-510)||(37739820-37740136)
chr4 (1-297)||(5706347-5706656)
chr4 (247-421)||(27679338-27679511)
chr4 (195-395)||(33493756-33493956)
chr4 (249-510)||(48014167-48014424)
chr4 (338-513)||(8448745-8448921)
chr4 (195-319)||(5677470-5677594)
chr4 (103-219)||(39498346-39498471)
chr4 (1-111)||(19864256-19864367)
chr4 (433-510)||(27691442-27691519)
chr4 (431-510)||(15438439-15438518)
chr4 (106-169)||(15445328-15445391)
chr4 (106-169)||(19827511-19827574)
chr4 (444-510)||(18911300-18911366)
chr4 (104-203)||(35510044-35510152)
chr4 (332-372)||(24410206-24410246)
chr4 (1-100)||(22172234-22172333)
chr4 (105-159)||(8871727-8871781)
chr4 (426-510)||(5677700-5677783)
[»] chr5 (50 HSPs)
chr5 (1-510)||(26752561-26753077)
chr5 (1-510)||(7624849-7625365)
chr5 (1-510)||(14015999-14016514)
chr5 (41-514)||(43491498-43491978)
chr5 (25-510)||(41306411-41306902)
chr5 (106-510)||(41876727-41877140)
chr5 (104-510)||(18952440-18952854)
chr5 (47-507)||(22936842-22937310)
chr5 (113-510)||(7270763-7271168)
chr5 (106-510)||(17664299-17664710)
chr5 (104-509)||(20055522-20055935)
chr5 (47-510)||(21332586-21333057)
chr5 (52-514)||(31863442-31863925)
chr5 (47-501)||(42062677-42063137)
chr5 (104-510)||(26895565-26895979)
chr5 (113-510)||(33551868-33552273)
chr5 (106-510)||(34831510-34831923)
chr5 (77-510)||(21335634-21336073)
chr5 (104-514)||(34132944-34133362)
chr5 (104-514)||(34143175-34143593)
chr5 (103-514)||(26907415-26907834)
chr5 (104-514)||(12087701-12088119)
chr5 (122-510)||(40582996-40583392)
chr5 (61-514)||(14375715-14376189)
chr5 (122-510)||(4099496-4099897)
chr5 (7-513)||(18239373-18239874)
chr5 (104-510)||(12058453-12058867)
chr5 (205-489)||(2837071-2837355)
chr5 (106-490)||(39192095-39192489)
chr5 (123-510)||(17748187-17748582)
chr5 (126-510)||(26292538-26292930)
chr5 (250-510)||(30066089-30066348)
chr5 (182-476)||(21914903-21915197)
chr5 (267-502)||(32837775-32838007)
chr5 (105-327)||(22131159-22131390)
chr5 (179-510)||(28787374-28787698)
chr5 (122-511)||(11959157-11959546)
chr5 (3-282)||(37215019-37215306)
chr5 (300-510)||(23043912-23044121)
chr5 (323-502)||(22130020-22130198)
chr5 (248-514)||(18765756-18766019)
chr5 (431-514)||(28441431-28441514)
chr5 (176-510)||(31575165-31575497)
chr5 (104-235)||(23044163-23044303)
chr5 (1-139)||(40916017-40916155)
chr5 (247-373)||(563372-563498)
chr5 (108-217)||(30066348-30066466)
chr5 (1-135)||(32838007-32838141)
chr5 (3-98)||(28441314-28441410)
chr5 (9-69)||(10629407-10629467)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (47-510)||(13449687-13450156)
chr7 (31-510)||(23224800-23225286)
chr7 (1-510)||(6603192-6603707)
chr7 (1-510)||(45286932-45287449)
chr7 (1-510)||(16165482-16165998)
chr7 (47-502)||(2441190-2441651)
chr7 (106-510)||(8276719-8277132)
chr7 (106-510)||(17730548-17730960)
chr7 (123-510)||(48645208-48645603)
chr7 (106-510)||(4595977-4596389)
chr7 (106-510)||(9864694-9865107)
chr7 (104-510)||(13842374-13842788)
chr7 (106-500)||(20594007-20594409)
chr7 (122-510)||(9132744-9133140)
chr7 (113-510)||(4546603-4547008)
chr7 (106-510)||(26557234-26557645)
chr7 (52-494)||(37415340-37415789)
chr7 (47-509)||(5242061-5242532)
chr7 (106-502)||(14683412-14683816)
chr7 (104-514)||(26136094-26136512)
chr7 (104-514)||(26144474-26144892)
chr7 (122-514)||(3067961-3068361)
chr7 (123-514)||(10468874-10469273)
chr7 (104-514)||(20080684-20081102)
chr7 (122-510)||(37166131-37166527)
chr7 (104-514)||(13809483-13809897)
chr7 (176-514)||(7227257-7227595)
chr7 (247-510)||(11398143-11398406)
chr7 (1-315)||(45290343-45290665)
chr7 (247-514)||(10344944-10345210)
chr7 (273-510)||(4695258-4695494)
chr7 (205-510)||(5796287-5796590)
chr7 (106-372)||(9271433-9271700)
chr7 (106-285)||(11919833-11920021)
chr7 (255-494)||(37423083-37423321)
chr7 (183-467)||(18562586-18562871)
chr7 (294-514)||(22611771-22611991)
chr7 (106-307)||(4542734-4542943)
chr7 (124-258)||(35961076-35961219)
chr7 (108-233)||(4695491-4695625)
chr7 (379-510)||(9273369-9273500)
chr7 (246-395)||(24918043-24918192)
chr7 (1-159)||(11397916-11398070)
chr7 (431-503)||(45290715-45290787)
chr7 (104-169)||(10345278-10345343)
chr7 (451-514)||(9080907-9080970)
chr7 (1-62)||(44017640-44017702)
chr7 (1-61)||(5826571-5826631)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (1-510)||(28110805-28111320)
chr1 (4-510)||(31204586-31205098)
chr1 (1-510)||(37183724-37184239)
chr1 (1-510)||(45960605-45961120)
chr1 (1-510)||(2793976-2794491)
chr1 (47-510)||(6070860-6071329)
chr1 (1-510)||(20398601-20399117)
chr1 (106-510)||(45941164-45941577)
chr1 (3-514)||(49498363-49498877)
chr1 (104-510)||(673031-673448)
chr1 (2-514)||(34732221-34732739)
chr1 (52-510)||(23021835-23022299)
chr1 (106-510)||(21107254-21107666)
chr1 (122-510)||(41058281-41058677)
chr1 (122-510)||(1950434-1950830)
chr1 (106-509)||(21018430-21018840)
chr1 (176-514)||(49853120-49853457)
chr1 (1-514)||(3796687-3797205)
chr1 (122-510)||(905664-906064)
chr1 (104-502)||(29643182-29643588)
chr1 (106-510)||(2405258-2405670)
chr1 (205-513)||(7635391-7635698)
chr1 (176-387)||(27355729-27355941)
chr1 (280-513)||(11668171-11668404)
chr1 (248-513)||(27331883-27332148)
chr1 (182-421)||(21434523-21434763)
chr1 (106-285)||(21111121-21111309)
chr1 (176-357)||(27354986-27355165)
chr1 (47-320)||(42022578-42022860)
chr1 (292-513)||(34066599-34066818)
chr1 (1-170)||(27536391-27536558)
chr1 (106-219)||(21114461-21114583)
chr1 (196-316)||(13431021-13431141)
chr1 (431-513)||(42022420-42022502)
chr1 (189-286)||(11667056-11667153)
chr1 (195-313)||(16055629-16055747)
chr1 (431-510)||(27536583-27536661)
chr1 (176-289)||(34065204-34065317)
chr1 (205-313)||(16056874-16056982)
chr1 (5-71)||(30938427-30938494)
chr1 (195-313)||(16061030-16061148)
chr1 (1-62)||(23441132-23441194)
chr1 (451-514)||(37907562-37907624)
chr1 (103-155)||(13430917-13430969)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (47-514)||(292766-293239)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (31-510)||(3678-4164)
[»] scaffold0381 (1 HSPs)
scaffold0381 (3-510)||(5261-5775)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (1-510)||(89516-90032)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (47-510)||(62264-62729)
scaffold0035 (104-514)||(63611-64020)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (103-510)||(19142-19558)
[»] scaffold0520 (3 HSPs)
scaffold0520 (106-510)||(8182-8594)
scaffold0520 (176-362)||(1590-1775)
scaffold0520 (342-510)||(4187-4355)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (47-514)||(3189-3661)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (104-502)||(57550-57957)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (106-490)||(197914-198306)
[»] scaffold0757 (1 HSPs)
scaffold0757 (106-515)||(5094-5511)
[»] scaffold0270 (3 HSPs)
scaffold0270 (80-510)||(3-439)
scaffold0270 (444-510)||(3733-3799)
scaffold0270 (444-510)||(10863-10929)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (176-510)||(67567-67900)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (103-386)||(1-293)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (122-510)||(30841-31238)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (103-514)||(2965-3391)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (5-513)||(118312-118824)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (123-514)||(58661-59062)
[»] scaffold2073 (1 HSPs)
scaffold2073 (1-274)||(725-1007)
[»] scaffold1755 (1 HSPs)
scaffold1755 (106-372)||(6-280)
[»] scaffold1208 (2 HSPs)
scaffold1208 (31-352)||(89-416)
scaffold1208 (375-464)||(1-90)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (176-514)||(19098-19429)
[»] scaffold0084 (2 HSPs)
scaffold0084 (104-510)||(29112-29526)
scaffold0084 (104-510)||(19042-19441)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (125-481)||(10185-10549)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (106-362)||(248413-248677)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (106-361)||(27005-27268)
scaffold0080 (441-510)||(26935-27004)
[»] scaffold1063 (1 HSPs)
scaffold1063 (51-364)||(2385-2713)
[»] scaffold0233 (1 HSPs)
scaffold0233 (182-513)||(9682-10014)
[»] scaffold1785 (2 HSPs)
scaffold1785 (176-514)||(1001-1329)
scaffold1785 (47-169)||(3-119)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (122-510)||(2052-2448)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (104-323)||(241434-241661)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (195-476)||(48464-48743)
[»] scaffold1809 (1 HSPs)
scaffold1809 (106-322)||(1-224)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (247-395)||(14101-14248)
[»] scaffold0690 (1 HSPs)
scaffold0690 (25-223)||(7596-7801)
[»] scaffold0191 (2 HSPs)
scaffold0191 (431-514)||(1489-1572)
scaffold0191 (122-169)||(4012-4059)
[»] scaffold0048 (2 HSPs)
scaffold0048 (104-235)||(15433-15573)
scaffold0048 (431-510)||(24568-24647)
[»] scaffold0996 (1 HSPs)
scaffold0996 (1-63)||(1780-1842)
[»] scaffold0126 (2 HSPs)
scaffold0126 (106-168)||(14282-14344)
scaffold0126 (461-509)||(1-49)
[»] scaffold0187 (1 HSPs)
scaffold0187 (451-514)||(31453-31515)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 98)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 32287164 - 32287686
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||     
T  32287164 ttaatatctaggatgtgtaaattattttagtgcccgaggcaatagttttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaagatt 32287263  T
Q  101 aggagagagagc----tgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgat 187  Q
    |||||||||||     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||    
T  32287264 aggagagagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgat 32287363  T
Q  188 agttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttta 287  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32287364 agttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagggccctcttctcaaactataatccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttta 32287463  T
Q  288 agtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 387  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  32287464 agtatgttaacctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggtta 32287563  T
Q  388 atagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataat 487  Q
     |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32287564 gtagtcattcattctcacgaaatcatgtttatatggtgtcaatatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaat 32287663  T
Q  488 aaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||| ||||||||| |||||||    
T  32287664 aaatagagtttcacatcaacatg 32287686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 54724089 - 54723573
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  54724089 ttaatatttaggatgtgtaaattattttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaagaat 54723990  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||    
T  54723989 aag---agagagatgagatcaggtcttccgaatcatctatgttcccataattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagt 54723893  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  54723892 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctatttccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgc 54723793  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  54723792 acgttaacctaatatcattaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagta 54723693  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54723692 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaa 54723593  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  54723592 tagagtttcacagcaacatg 54723573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 2873912 - 2873396
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||  ||    
T  2873912 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataa-cagaatataaagatagagttggaaagaat 2873814  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     | ||||||||||||    
T  2873813 aag-agagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatagt 2873715  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2873714 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagc 2873616  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  2873615 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcttagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagta 2873516  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2873515 gtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaa 2873416  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || |||||||||||||||||    
T  2873415 tagagtttcacaacaacatg 2873396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 50461396 - 50461911
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||     
T  50461396 ttaatatctatgatatgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtagttttgattgcataaatttaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaagac 50461493  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||     ||||||||||||||    
T  50461494 aaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagt 50461591  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||     
T  50461592 taacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagc 50461691  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  50461692 acattaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagta 50461791  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50461792 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaa 50461891  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || |||||||||||||||||    
T  50461892 tagagtttcacaacaacatg 50461911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 7486919 - 7486402
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattatttt--agtgcccgaggaagtagttttga-ttgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaag 97  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  |||  | ||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||      
T  7486919 ttaatatttaggatgtgtaaatttcttttaattgccctaggcagtagttttgggttgcataaaattaaataa-cagaatataaagatagagttggaaaga 7486821  T
Q  98 ataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgata 188  Q
    |||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||    
T  7486820 ataag---agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgata 7486724  T
Q  189 gttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaa 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7486723 gttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaa 7486624  T
Q  289 gtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaa 388  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||     
T  7486623 gaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcag 7486524  T
Q  389 tagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataata 488  Q
    |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7486523 tagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaata 7486424  T
Q  489 aataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  7486423 aatagagtttcacagcaacatg 7486402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 77 - 514
Target Start/End: Original strand, 16184610 - 16185054
Alignment:
Q  77 ataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||    
T  16184610 ataaagatagttttggaaaagaataggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaa 16184707  T
Q  173 tgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtct 267  Q
    ||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16184708 tgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacctttttcttaaactacagcccctaattccttaggtggtct 16184807  T
Q  268 aataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtc 367  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16184808 aataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaagattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtc 16184907  T
Q  368 taagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaa 467  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  16184908 taagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaacaacaattgaattgaataaaa 16185007  T
Q  468 actagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16185008 attagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttc 16185054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 539174 - 538666
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  539174 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgcccgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaagtat 539075  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||     ||||||     ||||||||||||||    
T  539074 aag---agagagatgagattaggtctttcgaatcatatatgtttccctaattggtatactacacctattcttataaatgattttctagttccacgatagt 538978  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  538977 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaatgttttaaga 538878  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||| | ||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  538877 acgttaacctaatatcactaacaaacgaatatccattgctagactaaacctgtttatttaaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagta 538778  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    || ||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  538777 gtaattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaa 538678  T
Q  491 taaagtttcaca 502  Q
    || |||||||||    
T  538677 tagagtttcaca 538666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 11190866 - 11190358
Alignment:
Q  9 taggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagag 107  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||||   ||    
T  11190866 taggatgtgtaaattattttaatgcccgaggcagttgttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaagaataag---ag 11190770  T
Q  108 agagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgata-----gttccacgatagttaacaaaa 198  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    |||||||      |||||||||||||||||||||    
T  11190769 agagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttcttgttccacgatagttaacaaaa 11190670  T
Q  199 tagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaac 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||    
T  11190669 tagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaacctacaacccctaattccttaggtggtctaataattcttgaaggttttatgcacgttaac 11190570  T
Q  299 ttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaa 398  Q
     |||||||||||| ||  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||       
T  11190569 ctaatatcactaacaagtgattatccattcctcgactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcg 11190470  T
Q  399 ttctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagttt 498  Q
    ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11190469 ttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagttt 11190370  T
Q  499 cacaacaacatg 510  Q
    |||| |||||||    
T  11190369 cacagcaacatg 11190358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 53816177 - 53815660
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagt-gcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaag 97  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||      
T  53816177 ttaatatttaggatgtgtaaatttcttttagttgcccgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagagttggaaaga 53816078  T
Q  98 ataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgata 188  Q
    |||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||    
T  53816077 ataag---agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgata 53815981  T
Q  189 gttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaa 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53815980 gttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaa 53815882  T
Q  289 gtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaa 388  Q
    | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||     
T  53815881 gaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcag 53815782  T
Q  389 tagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataata 488  Q
    |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  53815781 tagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaata 53815682  T
Q  489 aataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||| ||||| ||| |||||||    
T  53815681 aatagagttttacagcaacatg 53815660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 2775726 - 2775313
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  2775726 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 2775627  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2775626 aatagtcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 2775527  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  2775526 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 2775427  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  2775426 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 2775327  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  2775326 ttcacagcaacatg 2775313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 2778969 - 2778556
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  2778969 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 2778870  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2778869 aatagtcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 2778770  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  2778769 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 2778670  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  2778669 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 2778570  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  2778569 ttcacagcaacatg 2778556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24125815 - 24125331
Alignment:
Q  31 tgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcg 129  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||  |||||   |||||| |||||||| ||||||||    
T  24125815 tgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataa-cagaatataaagatagagttggaaagaataag---agagagatgagatcaggtctttcg 24125720  T
Q  130 aatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgag 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24125719 aatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgag 24125620  T
Q  221 ttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgatt 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24125619 ttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgatt 24125521  T
Q  321 atccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttata 420  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| |||||||    
T  24125520 atccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttata 24125421  T
Q  421 tggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  24125420 tttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 24125331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24129092 - 24128608
Alignment:
Q  31 tgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcg 129  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||  |||||||  |||||   |||||| |||||||| ||||||||    
T  24129092 tgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataa-cagaatataaagatagagttggaaagaataag---agagagatgagatcaggtctttcg 24128997  T
Q  130 aatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgag 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24128996 aatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgag 24128897  T
Q  221 ttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgatt 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24128896 ttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaacgatt 24128798  T
Q  321 atccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttata 420  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| |||||||    
T  24128797 atccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttata 24128698  T
Q  421 tggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  24128697 tttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 24128608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 30691083 - 30690568
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  30691083 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgcctgagacagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaagaat 30690984  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||    
T  30690983 aag---agagagataagatcaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagt 30690887  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  30690886 taacaaaataattctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaattacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagc 30690788  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  30690787 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattataacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagta 30690688  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||  |||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  30690687 gtcattcattctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacagtaaa 30690588  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  30690587 tagagtttcacagcaacatg 30690568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 106 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 45896625 - 45896220
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  45896625 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 45896526  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45896525 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 45896426  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  45896425 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaactcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 45896326  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  45896325 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 45896226  T
Q  497 ttcaca 502  Q
    ||||||    
T  45896225 ttcaca 45896220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 77 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 43809851 - 43809411
Alignment:
Q  77 ataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaa 172  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||    |||    
T  43809851 ataaagatagttttggaaaagaataggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctactcttatgaa 43809754  T
Q  173 tgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtct 267  Q
    ||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  43809753 tgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaccccctaattccttaggtggtct 43809654  T
Q  268 aataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtc 367  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43809653 aatattctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtc 43809554  T
Q  368 taagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaa 467  Q
    |||||  |||| |||||||| |||||||   ||| | | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  43809553 taagtcgaaagttatggtcagtagtcattcgttcacactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcatcaagaacaattgaattgaataaaa 43809454  T
Q  468 actagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  43809453 actagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 43809411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 47 - 510
Target Start/End: Original strand, 8461382 - 8461849
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccc 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||    
T  8461382 tttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaagataaagagaga----tgagattaggtctttcgaatcatctatgtttccc 8461477  T
Q  147 taattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctca 237  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | | ||||||||    
T  8461478 taattggtatactgcacctattcttgtgaatgattctatagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgatttagtatcctcttctca 8461577  T
Q  238 aactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaa 337  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8461578 aactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaaaaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaa 8461676  T
Q  338 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaa 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  |||||||    
T  8461677 ccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 8461776  T
Q  438 aaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  8461777 aagcattaagcacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 8461849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 43927079 - 43926667
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||| ||||||||||||    
T  43927079 agagagatgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaa 43926980  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  43926979 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 43926881  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  43926880 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 43926781  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  43926780 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaactgaattgaataaaaactagattgtcatttacaataaatagagt 43926681  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  43926680 ttcacagcaacatg 43926667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 510
Target Start/End: Original strand, 6434655 - 6435140
Alignment:
Q  31 tgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcg 129  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||  |||||   |||||| |||||| | ||||||||    
T  6434655 tgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagtttgaaagaataag---agagagatgagattaggtctttcg 6434751  T
Q  130 aatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgag 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6434752 aatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgag 6434851  T
Q  221 ttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgatt 320  Q
     ||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  6434852 atagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggatt 6434950  T
Q  321 atccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttata 420  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| |||||||    
T  6434951 attcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttata 6435050  T
Q  421 tggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  6435051 tttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 6435140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 49742869 - 49743282
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||  ||||         |||||||||||||||||||||    
T  49742869 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatttatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaacgattttctagttccacgatagttaacaa 49742968  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  49742969 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 49743068  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  49743069 acctaatatcactaacagacgattatccattcctaaactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 49743168  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  49743169 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 49743268  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  49743269 ttcacagcaacatg 49743282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 29343824 - 29344237
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  29343824 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 29343923  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29343924 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 29344023  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  29344024 acctaatatcactaataaaagattattcattcctagactaaccatgattattagaataattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 29344123  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||  | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  29344124 cattctaactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactggattgtcattcacaataaatagagt 29344223  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    || ||| |||||||    
T  29344224 ttgacagcaacatg 29344237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 47055273 - 47054757
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||||| || |  |||||||||   ||  ||||||  |||| |||||||||||||||||     
T  47055273 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcccaaggcagtaggttggtgtgcataaaaactaaagaacagaaaataa-gatagttttggaaaagac 47055175  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||    ||||||     ||||||||||||||    
T  47055174 aaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccataactagtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagt 47055077  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| |||     
T  47055076 taacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactaaagcccctaattccataggtggtctaataattctcgaaggtttaaagc 47054977  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  47054976 acgttaacctaatatcagtaacaaacggttatcctttcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagta 47054877  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||  |||||| | |||||| ||||||||     ||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47054876 gtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgaccaggatataaaaaacattaataacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaa 47054777  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  47054776 tagagtttcacagcaacatg 47054757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 113 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 3840754 - 3840348
Alignment:
Q  113 tgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtc 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||     ||||||     |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3840754 tgagatcaggtctttcgaatcatccatgttcccctaattgatatactacacctattcttataaatgattttctagttccacgatagttaacaaaacagtc 3840655  T
Q  204 ttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaat 303  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3840654 ctaatcaatcccttgagttagtaccctcttctcaaactacaacccctaattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaat 3840555  T
Q  304 atcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctc 403  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  3840554 atcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaataattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctc 3840455  T
Q  404 gcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaa 503  Q
     | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  3840454 actaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacag 3840355  T
Q  504 caacatg 510  Q
    |||||||    
T  3840354 caacatg 3840348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 47051843 - 47051335
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    ||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||  ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  47051843 ttaatatctagcatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtaggttggtgtgcataaaaagtaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaaga 47051746  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatag 189  Q
     || ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    ||||||     |||||||||||||    
T  47051745 caatgagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaactggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatag 47051648  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| |||    
T  47051647 ttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccataggtggtctaataattctcgaaggtttaaag 47051548  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  47051547 cacgttaacctaatatcagtaacaaacggttatcctttcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagt 47051448  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||||||  |||||| | |||||| ||||||||     ||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47051447 agtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgaccaggatataaaaaacattaataacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataa 47051348  T
Q  490 ataaagtttcaca 502  Q
    ||| |||||||||    
T  47051347 atagagtttcaca 47051335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 122 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 52200141 - 52199745
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  52200141 gtctttcgaatcattgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgataattaacaaaatagtcctaatcaat 52200042  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||     
T  52200041 cccttgaattaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaac 52199943  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | ||||||    
T  52199942 aaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatca 52199843  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
     ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  52199842 tgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 52199745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 25584921 - 25584519
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  25584921 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 25584822  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25584821 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 25584722  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||          
T  25584721 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctggactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagta------ 25584628  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
         || | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  25584627 -----tcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 25584533  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||||    
T  25584532 ttcacaacaacatg 25584519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 104 - 502
Target Start/End: Original strand, 17039970 - 17040376
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||    |||||||     |||| || ||||||||||    
T  17039970 agagagaaatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccttaattggtatacaacacttattcttatgaatgattctttagtttcatgatagttaac 17040069  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  17040070 aaaatagtcctaatcaatcccttaagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagatgatctaataatctttgaaggttt-aagcacgt 17040168  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17040169 taacctaatatcactaacaaacaattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggtcagtagtca 17040268  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17040269 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaatagtattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataaa 17040368  T
Q  495 gtttcaca 502  Q
    ||||||||    
T  17040369 gtttcaca 17040376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 16244117 - 16243705
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  16244117 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 16244018  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  16244017 aatagtcctaatcaatcccttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgttctaataatctttgaagg-tttaagcatgtta 16243919  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  16243918 acctaatatcactaacaaacgattatctattcctagactaaccctatttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 16243819  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtg-tcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaag 495  Q
     |||||| | |||||| |||||   | || |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  16243818 cattctcactaaatcatgttta-cggttgatcaggatataaaaatcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagag 16243720  T
Q  496 tttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||||||||||    
T  16243719 tttcacaacaacatg 16243705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 11784994 - 11784597
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  11784994 gtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagccctaataaat 11784895  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    |||||||||||||||| |||| ||  | || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  11784894 cccttgagttaggaccctcttatcggattacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggttttaagcacgttaatctaatatcactaat 11784795  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | ||||||    
T  11784794 aaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctaaggtcagtagtcattcgttctcactaaatca 11784695  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
      ||||||||   |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11784694 tatttatatgtgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatg 11784597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 27092138 - 27091726
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||     ||||||     ||||||||||||||||||||    
T  27092138 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttctcctaattggtatactgcacctattcttattaatgattttctagttccacgatagttaacaa 27092039  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27092038 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggacct-cttctcaaactacatcccctaatttcttaggcggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 27091940  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||     
T  27091939 accttttatcactaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaagttaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagttatt 27091840  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
      ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27091839 cgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaacaacaattgaattgaattaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 27091740  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  27091739 ttcacagcaacatg 27091726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 115 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 9392969 - 9392570
Alignment:
Q  115 agatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtctt 205  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    |||||||     |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  9392969 agatcaggtcttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacctatacttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcat 9392870  T
Q  206 aatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatat 305  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||    
T  9392869 aatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactctagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaaactaatat 9392771  T
Q  306 cactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgc 405  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| | ||| |||||||   ||||| |    
T  9392770 cactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaaatcaattagatctaagtcgaaagctaggatcagtagtcattcgttctcac 9392671  T
Q  406 gaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaaca 505  Q
     |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9392670 taaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaaca 9392571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 106 - 507
Target Start/End: Original strand, 20728597 - 20729006
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||     ||||| | |||| |||||||    
T  20728597 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttcgatgatatttaacaa 20728696  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  20728697 aatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacatta 20728795  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  20728796 acctaatatcactaacaaaagattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 20728895  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    | |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20728896 cattctcactaaatcatgtttatatttgataaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 20728995  T
Q  497 ttcacaacaac 507  Q
    |||||| ||||    
T  20728996 ttcacagcaac 20729006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Original strand, 28008019 - 28008432
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||  ||||         ||||| |||||||||||||    
T  28008019 agagagagatgagattaggtctttcgaatcatctatgttccccaaatttgtatactgcacctattcttatgaattattctctagtttcacgatagttaac 28008118  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  28008119 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaatgttgtaagtacgt 28008218  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
      |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |    
T  28008219 --atctattatcactaataaacgattatccattcctagactaaccatatttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggttagtagtta 28008316  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  28008317 tttgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaatttaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataga 28008416  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  28008417 gtttcacagcaacatg 28008432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 35412811 - 35412348
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||| |||    ||||||  |||||  | ||||||||| ||||| ||||||| |    
T  35412811 tttgattgcataaaattaaataaatagaaaataaggatagttttggaaaatatatatggagaga--tgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcctc 35412714  T
Q  147 taattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctca 237  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35412713 taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctca 35412614  T
Q  238 aactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaa 337  Q
     | || |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||      |||||||    
T  35412613 gattacagtccctaattccttaggttagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatcc------agactaa 35412520  T
Q  338 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaa 437  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  |||||||    
T  35412519 ccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 35412420  T
Q  438 aaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacat 509  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  35412419 aagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacat 35412348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 122 - 514
Target Start/End: Original strand, 55034822 - 55035226
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc--------gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaat 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||        |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55034822 gtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaat 55034921  T
Q  209 caatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcac 308  Q
    |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  55034922 caatcccttgagttagaatcctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtttagtaatctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcac 55035021  T
Q  309 taataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaa 408  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||    
T  55035022 taacaaacgattatccattcctagactaatcatgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaa 55035121  T
Q  409 atcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaaca 508  Q
    |||| ||||||||  ||   | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  55035122 atcatgtttatat-ttgatcagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaacaaatagagtttcacaacaaca 55035220  T
Q  509 tgtttc 514  Q
    ||||||    
T  55035221 tgtttc 55035226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 510
Target Start/End: Original strand, 10106494 - 10106961
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata-aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttccc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    |||||  | |||||| |||||||||||||| ||    
T  10106494 tttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaatatatatgagaga----tgagactaggtcttttgaatcatctatgtttcc 10106589  T
Q  146 ctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctc 236  Q
     ||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  10106590 -taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttctc 10106688  T
Q  237 aaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagacta 336  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  10106689 aaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatatttgaagg-tgtaagcacgttaacctaatatcactaacaaatgattatccattcctagacta 10106787  T
Q  337 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataa 436  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||  |||||| | |||||| | ||||||    |||  ||||||    
T  10106788 accctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgcttatatttgatcaggatataa 10106887  T
Q  437 aaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| | |||||||    
T  10106888 aaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatagagtttcatagcaacatg 10106961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 47 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 10885157 - 10884690
Alignment:
Q  47 tttgattgca-taaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttccc 145  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||   |   |||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  10885157 tttgattgcaataaaagtaaataa-cagaaaataaagatagttttggaaaatatatata---agagatgagactaggtctttcgaatcatctatgttccc 10885062  T
Q  146 ctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctc 236  Q
    |||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  10885061 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttctc 10884962  T
Q  237 aaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagacta 336  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  10884961 aaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagacta 10884863  T
Q  337 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataa 436  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    ||   |||| |    
T  10884862 accctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatatgatcgggatat-a 10884764  T
Q  437 aaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  10884763 aaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 10884690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 113 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 10881717 - 10881312
Alignment:
Q  113 tgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtc 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||| |||||||||||||||||     
T  10881717 tgagatcaagtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtt 10881618  T
Q  204 ttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaat 303  Q
     |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  10881617 ctaatcaatcctttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaat 10881519  T
Q  304 atcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctc 403  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| | |||||||  ||||||    
T  10881518 atcactaacaaacgattatccattcctagattaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtataaagctatggttagtagtcattcattctc 10881419  T
Q  404 gcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaa 503  Q
     | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  10881418 actaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacactaataacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacag 10881319  T
Q  504 caacatg 510  Q
    |||||||    
T  10881318 caacatg 10881312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 122 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 54720199 - 54719799
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||| |||||    |||||||     ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54720199 gtctttcgaatcatctatgtttccataattggtatattgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaat 54720100  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||     || |  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  54720099 cccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaat 54720001  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | ||||||    
T  54720000 aaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatca 54719901  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtt 512  Q
     ||||||||    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  54719900 tgtttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtt 54719801  T
Q  513 tc 514  Q
    ||    
T  54719800 tc 54719799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Original strand, 22416782 - 22417200
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||| ||     | |||  ||||||||||||    
T  22416782 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacttattcttgtgaaagagtcactcgttttacgatagttaac 22416881  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  22416882 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 22416980  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  22416981 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtca 22417080  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||| | ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  22417081 ttcgttctcactaaattatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataga 22417180  T
Q  495 gtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  22417181 gtttcacagcaacatgtttc 22417200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 395
Target Start/End: Original strand, 18644613 - 18645016
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  18644613 ttaatatctaagatgtgtaaatttcttttaatgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaata 18644712  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatag 189  Q
    ||    ||||||  |||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||    
T  18644713 tatatggagaga--tgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatag 18644810  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  18644811 ttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctcagattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaag 18644910  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |    
T  18644911 cacgttaacctaatatcactaacaaacgattgtccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagctaaggtcagt 18645010  T
Q  390 agtcat 395  Q
    ||||||    
T  18645011 agtcat 18645016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 103 - 514
Target Start/End: Original strand, 34983800 - 34984219
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    ||||||||| |||| | | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||    |||||||     ||||| |||||||||||    
T  34983800 gagagagagatgagtttaggtctttcgaatgatctatgttcccctgattggtataccgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaa 34983899  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||     
T  34983900 caaaagagtcataatcaatcccttgagttaggaccatcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcact 34983998  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||  |||||    
T  34983999 ttaacctaatatcactaataaatgattatccattcttagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagttagagtcggtagtc 34984098  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  34984099 attcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 34984198  T
Q  494 agtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  34984199 agtttcacaacaacatgtttc 34984219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Original strand, 12561182 - 12561596
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    ||| ||     |||||  ||||||||||||    
T  12561182 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattgatatactgcacctattcttgtgaaagagtccctagttttacgatagttaac 12561281  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  12561282 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 12561380  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  12561381 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtca 12561480  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  12561481 ttcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattcaataaaaactagattgtcattcacaaataataga 12561580  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  12561581 gtttcacagcaacatg 12561596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Original strand, 30219954 - 30220375
Alignment:
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaaca 195  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||    |||||||     |||| ||||||||||||||    
T  30219954 gagagagatgagatcatgtctttcgaatcatctaagttcccctaattggtcaactgcacctattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaaca 30220053  T
Q  196 aaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtac--- 292  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||  | | |  |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||         
T  30220054 aaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttcatagattgtaacccctaattccttaggtggtctaatattctttgaagcttttaagttgata 30220153  T
Q  293 gttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  30220154 gttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtttaagttgaaagctatggtcagtagt 30220253  T
Q  393 catcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaata 492  Q
    |||  | |||| | ||||||  |||||||    | |  ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30220254 cattcactctcaccaaatcatctttatatttgataaggatataaagagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaata 30220353  T
Q  493 aagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
     ||||||||| |||||||||||    
T  30220354 tagtttcacagcaacatgtttc 30220375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 395
Target Start/End: Original strand, 23298462 - 23298863
Alignment:
Q  3 aatatctaggatttgtaaatta-ttttagt-gcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||  ||    
T  23298462 aatatttaggatgtgtaaatttcttttagttgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttggaaagaat 23298561  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||| |||||    ||||||     |||||||||||||||    
T  23298562 aag---agagagatgagattaggtctttcgaatcatctaagttcccttaattggtatgctgcacctattcttatgaatgactttctagttccacgatagt 23298658  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||     
T  23298659 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaagaatctttcaaggttttaaga 23298758  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    || ||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  23298759 acattaacctaatatcaccaacaaacgattatccattcctagactaacgatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtcagta 23298858  T
Q  391 gtcat 395  Q
    |||||    
T  23298859 gtcat 23298863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 126 - 509
Target Start/End: Original strand, 48064005 - 48064396
Alignment:
Q  126 ttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatccct 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    ||||||     |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48064005 ttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccct 48064104  T
Q  217 tgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaac 316  Q
    |||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  48064105 tgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaag 48064203  T
Q  317 gattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtt 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||| | |||||| |||    
T  48064204 gattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtt 48064303  T
Q  417 tatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacat 509  Q
    |||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||    
T  48064304 tatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactatattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacat 48064396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 176 - 510
Target Start/End: Original strand, 19301534 - 19301867
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19301534 tagttctacgatagttaacaaaatagttctaataaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaatttcttaggtggtttaataatct 19301633  T
Q  276 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaa 375  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  19301634 ttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaaagattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattatgtctaagttga 19301732  T
Q  376 aagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagatt 475  Q
    |||||| ||||  |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  || |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19301733 aagctagggtctgtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatttaaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagatt 19301832  T
Q  476 gtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  19301833 gtcattcacaataaatagagtttcacatcaacatg 19301867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 176 - 510
Target Start/End: Original strand, 19304718 - 19305051
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19304718 tagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccctgagttacgaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatct 19304817  T
Q  276 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaa 375  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  19304818 ttgaagg-tttaagcacgttaacctaacatcattaacaaatgattatccattcctatactaaccatgttcattagaacaattcatttatgtctaagttga 19304916  T
Q  376 aagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagatt 475  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  || |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19304917 aagctagggtcaatagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatttaaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagatt 19305016  T
Q  476 gtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  19305017 gtcattcacaataaatagagtttcacatcaacatg 19305051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 105 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 35751686 - 35751297
Alignment:
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaaca 195  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||    ||||||     ||||| |||||||||||||    
T  35751686 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaatttgtatactgcaccttttcgtattaatgattttctagttctacgatagttaaca 35751587  T
Q  196 aaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtt 295  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  35751586 aaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagattttaagcacgtt 35751487  T
Q  296 aacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 395  Q
    ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||    
T  35751486 aacctaatatcattaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaactcaattaggtctaagttgaaagctagactcagtagtcat 35751387  T
Q  396 caattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaag 495  Q
       ||              |||||||    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  35751386 ttgtt--------------tttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagag 35751301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 46885185 - 46884780
Alignment:
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaaca 195  Q
    ||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||| |     ||||| |||||||||| ||    
T  46885185 gagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgcttttctagttc-acgatagttagca 46885087  T
Q  196 aaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtt 295  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||     || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  46885086 aaatagtcctaatcaatcccttgagttgggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtgttctaataacctttgaaggttt-aagcacgtt 46884988  T
Q  296 aacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 395  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  46884987 aacctaatatcactaataaaggattatccatttctagaccaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagtagtcat 46884888  T
Q  396 caattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaag 495  Q
       ||||| | |||||| ||||           ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  46884887 tcgttctcactaaatcatgttt-----------atatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagag 46884799  T
Q  496 tttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  46884798 tttcacagcaacatgtttc 46884780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 176 - 510
Target Start/End: Original strand, 15195331 - 15195664
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||   |||| |  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15195331 tagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagataggaccctcttctaggactacaacctctaattccttaggtggtctaataatct 15195430  T
Q  276 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaa 375  Q
    | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  15195431 tcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaagattatccattcctagactaaccatgtttattagcacaattcaattaggtctaagtcga 15195529  T
Q  376 aagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagatt 475  Q
    |||||| ||||| |||||||   ||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15195530 aagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttaatcaggatataaaaagcaataagaacaattgaattgaataaaaactagatt 15195629  T
Q  476 gtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||    
T  15195630 gtcattcacaataaatagagtttcatagcaacatg 15195664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 17141654 - 17141236
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||    
T  17141654 agagagagatgagcttaggtcttttgaattatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattcgctagttccacgatagttaac 17141555  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || |  ||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||||| ||  ||||    
T  17141554 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaaccccaaatttcttaggtggtctaataaccgttaaaggttt-aatcacgt 17141456  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||    
T  17141455 taacctaatatcactaataaaggatcatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtca 17141356  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  17141355 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaataga 17141256  T
Q  495 gtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  17141255 gtttcacaataacatgtttc 17141236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 183 - 510
Target Start/End: Original strand, 32367165 - 32367491
Alignment:
Q  183 acgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32367165 acgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaagg 32367264  T
Q  283 ttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctat 382  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32367265 ttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctat 32367363  T
Q  383 ggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattc 482  Q
    ||||| |||||||   ||||| | ||||||  |||||||    |||  ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32367364 ggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatacaaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattc 32367463  T
Q  483 ataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    | ||  |||| ||||||||| |||||||    
T  32367464 acaaataatagagtttcacagcaacatg 32367491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 108 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 41977243 - 41976847
Alignment:
Q  108 agagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaa 198  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  41977243 agagatgagatcagatctttcgaatcatctgtgttctcctaattggtatactgcacttattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaa 41977144  T
Q  199 tagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaac 298  Q
    ||||| ||||||||||||              |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||    
T  41977143 tagtcataatcaatccct--------------cttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcatgttaac 41977059  T
Q  299 ttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaa 398  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||| ||  |    
T  41977058 ctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaatcatgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagttattca 41976959  T
Q  399 ttctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagttt 498  Q
    ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  41976958 ttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagagcaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagttt 41976859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 106 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 31549416 - 31549118
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| | |||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||         |||||||||||||||||||||    
T  31549416 agagagataagatcaggtcttttgaatcatctaagtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaa 31549317  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  31549316 aatagtcataatcaatcccttgacttaggaccctcttctaaaactacagaccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaatgtta 31549217  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 395  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  31549216 acctattatcactaataaacgattatccatttctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcat 31549118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 104 - 502
Target Start/End: Original strand, 25442807 - 25443214
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||||    ||||||     |||||  ||||||||||||    
T  25442807 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatttatgttcccctaattggtatattgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaac 25442906  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaa-taatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || ||||||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||| ||| |||    
T  25442907 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaaataaccgtcgaatgttt-aagcacg 25443005  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  25443006 ttaagctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtc 25443105  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||     
T  25443106 attcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatag 25443205  T
Q  494 agtttcaca 502  Q
    |||||||||    
T  25443206 agtttcaca 25443214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 205 - 513
Target Start/End: Original strand, 22993756 - 22994063
Alignment:
Q  205 taatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaata 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||    
T  22993756 taatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaattacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggtttttagaacgttaacctagta 22993855  T
Q  305 tcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcg 404  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | ||||     
T  22993856 tcacaaataaacgattatccattcctaaacttaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcactctca 22993955  T
Q  405 cgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaac 504  Q
    |||| ||| ||||||||    | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||| ||| |    
T  22993956 cgaattcatgtttatatctgataagtatataaaaaacattaagaaaaattgaattgaat-aaaactagattgatattcacaataaatagagttttacagc 22994054  T
Q  505 aacatgttt 513  Q
    |||||||||    
T  22994055 aacatgttt 22994063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 182 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 18542711 - 18542426
Alignment:
Q  182 cacgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaa 280  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  18542711 cacgatggttaactaaaatagtcctaatcaatcccttgacttaagaccttcttctcagattacagtccctaatttcttaggtgatctaatattctttgaa 18542612  T
Q  281 ggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagct 380  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18542611 ggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagtt 18542512  T
Q  381 atggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaa 467  Q
    ||||||| |||||||  |||||| | || ||| | |||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  18542511 atggtcattagtcattcattctcacaaattcatg-ttatatgtgatcagtatataaaaatcattaagaacaattgaattgaataaaa 18542426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 175 - 514
Target Start/End: Original strand, 3292987 - 3293327
Alignment:
Q  175 atagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatc 274  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||  ||||||  | || |  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3292987 atagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaagacccacttctccgattacaacccctaattccttaggtggtctaatattc 3293086  T
Q  275 tttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaa-taaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3293087 tttgaaggttttaagaacgttaacttaatataaaaaaataaacgattattcattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagtt 3293186  T
Q  374 aaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtc-aatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactag 472  Q
     || |||| ||| | |||||||   ||||| |||||||| ||||||||  || | |  ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  3293187 gaaggctagggttagtagtcattcgttctcacgaaatcatgtttatat-ttgactaggatataaaaagcattaagaacatttgagttgaataaaaactag 3293285  T
Q  473 attgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  3293286 attgtcattcacaatagatagagtttcacatcaacatgtttc 3293327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 104 - 502
Target Start/End: Original strand, 17528709 - 17529111
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    ||||||     |||||  |||||||||||     
T  17528709 agagagagatgagattaggtcgttcgaatcatctatgttcccctaattgatatactgcacatattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaat 17528808  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || |  | ||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| || |    
T  17528809 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaaccactaattccttaggtggtttaataaccgttgaaggttt-aagcacat 17528907  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||    
T  17528908 taacctaatatcactaataaaggattat----tcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagagtcaatagtca 17529003  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   || || | |||||| ||||||||    |||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |    
T  17529004 ttcgttatcactaaatcatgtttatatttgatcaaaatataaaaagtattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgacattcacaataaataga 17529103  T
Q  495 gtttcaca 502  Q
    ||||||||    
T  17529104 gtttcaca 17529111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 213 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 28266005 - 28265712
Alignment:
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||    
T  28266005 cccttgagatagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagaacgttaacctagtatcactaat 28265907  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||   ||| ||   ||||| | ||||||    
T  28265906 aaaagattatccattcctagactaatcatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtc---agtaattcgttctcactaaatca 28265810  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
     ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  28265809 tgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 28265712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 320
Target Start/End: Original strand, 18641617 - 18641945
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  18641617 ttaatatctaagatgtgtaaatttcttttaatgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaata 18641716  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatag 189  Q
    ||    ||||||  |||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||    
T  18641717 tatatggagaga--tgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatag 18641814  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  18641815 ttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctcagattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaag 18641914  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgatt 320  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  18641915 cacgttaacctaatatcactaacaaacgatt 18641945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 248 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 52988498 - 52988237
Alignment:
Q  248 cctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttat 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52988498 cctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaagttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttat 52988400  T
Q  348 tagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaag 447  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| |||||||    
T  52988399 tagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaag 52988300  T
Q  448 aaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||    
T  52988299 aacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatg 52988237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 22783847 - 22783420
Alignment:
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaaca 195  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||  |||||||||    |||||||     |||| ||||||||||||||    
T  22783847 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcctctgt-ttcccctaattggcacacatcacatattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaaca 22783749  T
Q  196 aaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaa--gtccctaattccttaggtggtctaataatcttt-gaaggttttaagtac 292  Q
     ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| | || |  | ||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||    
T  22783748 taatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcccctaattccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaac 22783649  T
Q  293 gttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaa-------caattcaattaggtctaagttaaaagctatggt 385  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||    
T  22783648 gttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatacctagaataaccatgtttatttgaattttgaacaattcaattaagtctaagttgaaagttgtggt 22783549  T
Q  386 caatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcata 485  Q
    ||  ||||||  |||||| |||||||| ||||||||    | |   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22783548 cagcagtcattcattctcacgaaatcatgtttatatttgataagggtataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcatccaca 22783449  T
Q  486 ataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22783448 ataaatagagtttcacatcaacatgtttc 22783420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 22788211 - 22787784
Alignment:
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaaca 195  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||  |||||||||    |||||||     |||| ||||||||||||||    
T  22788211 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcctctgt-ttcccctaattggcacacatcacatattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaaca 22788113  T
Q  196 aaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaa--gtccctaattccttaggtggtctaataatcttt-gaaggttttaagtac 292  Q
     ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| | || |  | ||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||    
T  22788112 taatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcccctaattccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaac 22788013  T
Q  293 gttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaa-------caattcaattaggtctaagttaaaagctatggt 385  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||    
T  22788012 gttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatacctagaataaccatgtttatttgaattttgaacaattcaattaagtctaagttgaaagttgtggt 22787913  T
Q  386 caatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcata 485  Q
    ||  ||||||  |||||| |||||||| ||||||||    | |   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  22787912 cagcagtcattcattctcacgaaatcatgtttatatttgataagggtataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcatccaca 22787813  T
Q  486 ataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22787812 ataaatagagtttcacatcaacatgtttc 22787784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 47 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 54461316 - 54461010
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaa--agataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcc 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| |||||||    |||||  | ||||||||| ||||| |||||||    
T  54461316 tttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaactatatatggagaga----tgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcc 54461221  T
Q  145 cctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttct 235  Q
    || ||| |||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  54461220 ccaaatgggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataattcatcccttgagttaggaccctcttct 54461121  T
Q  236 caaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagact 335  Q
    || | || ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||    
T  54461120 catattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactagtaaaggattatacattcctagact 54461021  T
Q  336 aaccatgttta 346  Q
    |||||||||||    
T  54461020 aaccatgttta 54461010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 395
Target Start/End: Original strand, 17531604 - 17531897
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    ||||||     |||||  ||||||||||||    
T  17531604 agagagagatgagtttaggtcgttcgaatcatctatgttcctctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaac 17531703  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || |  |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  ||||    
T  17531704 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaagg-tttaaacacgt 17531802  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  17531803 taacctaatatcactaataaa-gattatccattcctagactaaccatgtttatt-----aattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtca 17531896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 105 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17546102 - 17545812
Alignment:
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc-----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| ||||      |||||||     |||| |||||| ||||||    
T  17546102 gagagagatgagatcagatctttcgaatcttctg-gttcccctaattggtatactgcacctatttcttatgaatgattctctagtttcacgatggttaac 17546004  T
Q  195 -aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
     ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | || | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  17546003 taaaatagccctaatcaatcccttgacttatgaccctcttctcagattacaatccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacg 17545904  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggt 385  Q
    ||||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17545903 ttaacctagtatcataaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaataattcaattaggtctaagttgaaaactatggt 17545812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 122 - 328
Target Start/End: Original strand, 55031962 - 55032181
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc--------gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaat 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||        |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55031962 gtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaat 55032061  T
Q  209 caatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcac 308  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||    
T  55032062 caatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacatcccctgattccttaggtggtctagtaatctttgaagcttttatgcacgttaacctaatatcac 55032161  T
Q  309 taataaacgattatccattc 328  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  55032162 tgacaaacgattatccattc 55032181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28266264 - 28266006
Alignment:
Q  3 aatatctaggatttgtaaatta-ttttagt-gcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||  ||    
T  28266264 aatatttaggatgtgtaaatttcttttagttgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttggaaagaat 28266165  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatatt----cgaatga-----tagttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     ||||||     |||||||||||||||    
T  28266164 aag---agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacgatagt 28266068  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaa 252  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| || ||||||    
T  28266067 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagatagaaccctcttctcaaactacagcccctaa 28266006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 249 - 395
Target Start/End: Original strand, 282293 - 282439
Alignment:
Q  249 ctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttatt 348  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  282293 ctaattccttaggtgatctaatattcttcgaaggttttaagaacgttgacataatatcaccaataaacaattatccattcctagactaaccatgtttatt 282392  T
Q  349 agaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 395  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  282393 cgaacaattcaattaggtctaagtcaaaagttagggtcagtagtcat 282439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 260
Target Start/End: Original strand, 52309565 - 52309728
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  52309565 agagagatgagatcaggtctttcgaatcaactatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 52309664  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  52309665 aatagtcttaatcaatcccttgagctaggaccatcttctcaaactacaacccctaattccttag 52309728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 354 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 31857804 - 31857650
Alignment:
Q  354 aattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaat 453  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||  |||||||    |||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  31857804 aattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatctttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaat 31857705  T
Q  454 tgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaaca 508  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  31857704 tgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaaca 31857650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 345 - 510
Target Start/End: Original strand, 52309754 - 52309920
Alignment:
Q  345 tattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaac-cat 443  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  | |||||||  |||    
T  52309754 tatttgaacaattcaattaggtctaagtagaaaactattgtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggaaataaaaaagcat 52309853  T
Q  444 taagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  52309854 taagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 52309920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6922868 - 6922701
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagt-gcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  | ||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||| |||  |    
T  6922868 ttaatatttaggatgtgtaaattattttgtttgcgtgaggtagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttgaaaagaa 6922769  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc 169  Q
    ||   |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  6922768 ta---agagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattc 6922701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 282 - 476
Target Start/End: Original strand, 27308157 - 27308349
Alignment:
Q  282 gttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagcta 381  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| | || |||    
T  27308157 gttttaagaacgttaacctaataacacaaataaacgattatctattccttgattaaccttgtttatttgaacaattcaattaggtcttagtcataaacta 27308256  T
Q  382 tggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattg 476  Q
      |||| |||||||    |||  | || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27308257 gagtcagtagtcattcgatcttaccaattcaag-ttatatagtgtcaatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaat-aaaactagattg 27308349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 279 - 514
Target Start/End: Original strand, 27298594 - 27298828
Alignment:
Q  279 aaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaag 378  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||   || | ||||||| ||||||| ||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||    
T  27298594 aaggttttaagaacgttaacataatatcacaggtatatgattatctattcataaactaaccgtatttatttgaacaattcaattatgtctaagttgtaag 27298693  T
Q  379 ctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatat-aaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgt 477  Q
    ||| ||||| || ||||    |||  | || | | | |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  27298694 ctagggtcagtaatcatttgatcttaccaatttaag-ttatatagtgtcaatatataaaaaagcattaagaacaattgaattgaat-aaaactagattga 27298791  T
Q  478 cattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
     ||||| ||  |||| ||||||||| | |||||||||    
T  27298792 tattcacaagcaatagagtttcacagccacatgtttc 27298828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 17544526 - 17544444
Alignment:
Q  431 atataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17544526 atataaaaaacattaagatcaattgaattgaataaaa-ctagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatgtttc 17544444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 279 - 372
Target Start/End: Original strand, 27308717 - 27308809
Alignment:
Q  279 aaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 372  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27308717 aaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataagcgattatctattcctagact-accatgtttatttgaacaactcaattaggtctaagt 27308809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 6922657 - 6922579
Alignment:
Q  431 atataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacat 509  Q
    ||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  6922657 atataaaaagcattaagcacaatcgaattgaataaaaactaaattgtcattcataataaatagagtttcacatcaacat 6922579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52990946 - 52990812
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    ||||||     |||||  |||||| |||||    
T  52990946 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgagtctctagttttacgataattaac 52990847  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggacct 229  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  52990846 aaaatagtcgtaatcaatccattgagttaggacct 52990812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10902184 - 10902133
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtata 157  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10902184 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtata 10902133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Original strand, 12541146 - 12541219
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagtttt-gattgcataaaattaaataaacag 73  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12541146 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacag 12541219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 37408927 - 37408862
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc 169  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  37408927 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattc 37408862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 11636743 - 11636666
Alignment:
Q  431 atataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||    
T  11636743 atataaaaagcattaagaacaattgaattgaat-aaaactagattgatattcacaat-aatagagtttcacagcaacatg 11636666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 430 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 22360357 - 22360275
Alignment:
Q  430 tatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgttt 513  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||| || ||||  ||||||||| ||||||||||    
T  22360357 tatataaaaaacattaagaacaattgaattgaatataaa-tagattgatattcacaagaaattgagtttcacatcaacatgttt 22360275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 159
Target Start/End: Original strand, 32367078 - 32367133
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatact 159  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32367078 agagagagatgagtttaagtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatact 32367133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 3306119 - 3306057
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagtttt-gattgcataaaat 62  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  3306119 ttaatatctaggatgtgtaaattattttaatgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaat 3306057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 28327714 - 28327652
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagtttt-gattgcataaaat 62  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  28327714 ttaatatttaggatgtgtaaattattttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaat 28327652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 28331039 - 28330977
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagtttt-gattgcataaaat 62  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  28331039 ttaatatttaggatgtgtaaattattttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaat 28330977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 22370285 - 22370178
Alignment:
Q  405 cgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaac 504  Q
    |||| ||| |||||||||   ||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||||  | ||||  |||||||||||    
T  22370285 cgaattcatgtttatatgtgatcattatacaaaaaacattaagaacaattgaattgaatataaa-tagattgatattcacgagaaattgagtttcacaac 22370187  T
Q  505 aacatgttt 513  Q
    |||||||||    
T  22370186 aacatgttt 22370178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 6030840 - 6030758
Alignment:
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 395  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| |||||||||| | ||||| || |||||| || ||||| ||||||| | |||||||||||    
T  6030840 aaacaattattcattcctagactgaccatgtttaattgaacagttaaattagatccaagttgaaagctaagatcaatagtcat 6030758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 31857888 - 31857847
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatccctt 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  31857888 tagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaattcctt 31857847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 157
Target Start/End: Original strand, 3292908 - 3292959
Alignment:
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtata 157  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3292908 gagagagatgagatcaggtcttttgaatcatctgt-ttcccctaattggtata 3292959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 106 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18542798 - 18542750
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggt 154  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||    
T  18542798 agagagatgagatcatgtctttcgaatcctctgagttcccctatttggt 18542750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 19301114 - 19301178
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaa 65  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||  | ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  19301114 ttaatattcaggatgtgtaaattattttgattcccgaggcagtagatttgatggcataaaattaa 19301178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 104 - 168
Target Start/End: Original strand, 22993644 - 22993708
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatatt 168  Q
    |||||||| |||||  | |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  22993644 agagagagatgagactaggtctttcgaatcctctaagttcccctaattggtacactgcacctatt 22993708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 395
Target Start/End: Original strand, 55032183 - 55032235
Alignment:
Q  343 tttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 395  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  55032183 tttattagaacagttcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcat 55032235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Original strand, 45155129 - 45155649
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45155129 ttaatatctaggatgtgtaaattattttagtgcccgaggcagtagttttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaagata 45155228  T
Q  101 aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagtt 191  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    |||||||     |||| | ||||||||    
T  45155229 aggagagag--ctgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattctctagtttcgcgatagtt 45155326  T
Q  192 aacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagta 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45155327 aacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctcaaactaaaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagta 45155426  T
Q  292 cgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatag 391  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  45155427 cgttaacctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttaatagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtag 45155526  T
Q  392 tcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaat 491  Q
    ||||  |||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45155527 tcattcatttccacgaaatcatgtttatatggtgtcaatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat 45155626  T
Q  492 aaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    | ||||||||| |||||||||||    
T  45155627 agagtttcacagcaacatgtttc 45155649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 16 - 510
Target Start/End: Original strand, 38248273 - 38248774
Alignment:
Q  16 tgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaaca-gatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  38248273 tgtaaattattttagtgcccgatgcagtagttttgattgcataaaattaaataaacaagaaaataaagatagttttggaaaagataaagagagaga--tg 38248370  T
Q  115 agatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtctt 205  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    |||||||     ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  38248371 cgatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacatattcttatgaatgattctctagttccacgatagctaacaaaatagtcct 38248470  T
Q  206 aatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatat 305  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  38248471 aatcaatctcttgagttaggacattcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagtttta-gtacgttaacctaatat 38248569  T
Q  306 cactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgc 405  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||  |||||| |    
T  38248570 cactaataaacgattatccaaacctagactatctatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgtaagctatggtcagtagtcattcattctcac 38248669  T
Q  406 gaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaaca 505  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||    
T  38248670 gaaatcatgtttatatggtgtcaatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagca 38248769  T
Q  506 acatg 510  Q
    |||||    
T  38248770 acatg 38248774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 25231342 - 25230836
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 100  Q
    ||||||| ||||||   |||||||||| | |||| || | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  25231342 ttaatatttaggatggataaattatttcaatgcctgaagcagtagtttagattgcataaagttaaataaacagaaaataaagataattttggaaaagata 25231243  T
Q  101 aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagtt 191  Q
    | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||||    
T  25231242 aagagagagagttgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagtt 25231143  T
Q  192 aacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagta 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  25231142 aacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactaaagcctctaattccttgggtgttctaataatatttgaaggttttaagta 25231043  T
Q  292 cgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatag 391  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||    
T  25231042 tgttaacctaatatcactaataaacgattatccattcctaagctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttacggtcagtag 25230943  T
Q  392 tcatcaattctcgcgaaatcacgt-ttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    ||||  |||||| ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25230942 tcattcattctcacgaaatcatatattatacggtgt-gatatataaaaagtattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaa 25230844  T
Q  491 taaagttt 498  Q
    || |||||    
T  25230843 tagagttt 25230836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 47 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 14421959 - 14421484
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccc 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14421959 tttgattgcataaaattaaataa-caggaaataa-gatagttttggaaaagataaagagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccc 14421862  T
Q  147 taattggtatactacacatattc-----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctc 236  Q
    |||||| |||||| ||| |||||     |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14421861 taattgatatactgcacctattcttactgaatgattttttagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 14421762  T
Q  237 aaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagacta 336  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14421761 aaactacagcccctaattccttaggtggtctgataatctttgaaggttttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcatagacta 14421662  T
Q  337 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataa 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||    
T  14421661 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatctttatatttgatcaggatataa 14421562  T
Q  437 aaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  14421561 aaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaattaatagagtttcacagcaacatgtttc 14421484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 18824255 - 18824770
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||     
T  18824255 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtagttttgattgcataaatttaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaagaa 18824352  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||||||||||  |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||     ||||||||||||||    
T  18824353 aaggagagaga--tgagatcaggtatttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgatcttctagttccacgatagt 18824450  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||     
T  18824451 taacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagc 18824550  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  18824551 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagta 18824650  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18824651 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaa 18824750  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  18824751 tagagtttcacagcaacatg 18824770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 25591339 - 25591854
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25591339 ttaatatttaggatgtgtaaattattttagtgcctgaggtagtagttttgatttgcataaaaagtaaataaacagaatataaagatagttttggaaaaga 25591438  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatag 189  Q
      | ||||||    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     |||||||     |||| ||||||||    
T  25591439 ataagagaga----tgagatcaggtgtttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagtttcacgatag 25591534  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25591535 ttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagactctcttctcaaactacagcccctaattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaag 25591634  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |    
T  25591635 aacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattttgtctaag-taaaagctatggtcagt 25591733  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25591734 agtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcataatataaaaaacattaagaacaagtgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa 25591833  T
Q  490 ataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  25591834 atagagtttcacagcaacatg 25591854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Original strand, 18825748 - 18826255
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||     
T  18825748 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcctgaggcagtaattttgattgtataaatttaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaagaa 18825845  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||     ||||||||||||||    
T  18825846 aaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgatcttctagttccacgatagt 18825943  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||     
T  18825944 taacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagc 18826043  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  18826044 acgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagta 18826143  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18826144 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaa 18826243  T
Q  491 taaagtttcaca 502  Q
    || |||||||||    
T  18826244 tagagtttcaca 18826255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 10664158 - 10663643
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||     
T  10664158 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaa-gaa 10664060  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    || ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||||     ||||| | ||||||    
T  10664059 aaagagagaga--tgagatcaggtctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattctctagttctatgatagt 10663962  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  10663961 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaaga 10663863  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    || ||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||    
T  10663862 acattaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagta 10663763  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10663762 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcatgatataaaaatcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcagaataaa 10663663  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  10663662 tagagtttcacagcaacatg 10663643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 16954035 - 16953520
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  16954035 ttaatatttaggatgtgtaaattattttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataa-cagaatataaagatagttttggaaagaat 16953937  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||    
T  16953936 aag---agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagt 16953840  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||     
T  16953839 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggcggtctaataattctcgaaggtttaaagc 16953740  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| | ||    
T  16953739 acattaacctaatatcattaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttataagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtaagta 16953640  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||  |||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16953639 gtcattcattctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaa 16953540  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  16953539 tagagtttcacagcaacatg 16953520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 41 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 23644039 - 23643563
Alignment:
Q  41 agtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatg 140  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||| ||||||||||| |||    
T  23644039 agtagatttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaagataaggagagaga--tgatatcaggtcgttcgaatcatcgatg 23643942  T
Q  141 ttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttc 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | || | ||||         |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| ||    
T  23643941 ttcccctaattggtatactgcacttctttgtatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatctcttgagttatgaccctc 23643842  T
Q  232 ttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcata 331  Q
    |||||| | || || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  23643841 ttctcagattacagcctctaattccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattccta 23643742  T
Q  332 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaata 431  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||   ||||| | || ||| |||||| |  | |||  |    
T  23643741 gactaaacatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaagtcatgtttattttttatcagga 23643642  T
Q  432 tataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  23643641 tataaacagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcagaataaatacagtttcacagcaacatg 23643563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 47 - 510
Target Start/End: Original strand, 18721188 - 18721657
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccc 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||   |   |||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  18721188 tttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagtgttggaaaatatatata---agagatgagactaggtctttcgaatcatctatgttcccc 18721284  T
Q  147 taattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctca 237  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  18721285 taattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgactctcttctca 18721384  T
Q  238 aactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaa 337  Q
     |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  18721385 tactacagcccctaatttcttagttggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaa 18721484  T
Q  338 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaa 437  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    ||| ||||||||    
T  18721485 ccatgtttattagaataattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagtatataaa 18721584  T
Q  438 aaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  18721585 aagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 18721657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 80 - 510
Target Start/End: Original strand, 36710575 - 36711012
Alignment:
Q  80 aagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatga 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    |||||    
T  36710575 aagatagttttggaaaagacaaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatga 36710672  T
Q  176 t-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaat 270  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  36710673 ttttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaat 36710772  T
Q  271 aatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaa 370  Q
    |||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36710773 aattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtccaa 36710872  T
Q  371 gttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaact 470  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| | ||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36710873 gtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgcttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaact 36710972  T
Q  471 agattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36710973 agattgtcattaataataaatagagtttcacaacaacatg 36711012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 17931139 - 17930725
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||    
T  17931139 agagagagatgagattaggtctttcgaatcatcgatgtttccgtaattggtatattgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaac 17931040  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17931039 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttacgaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgt 17930941  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    | |  | |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  17930940 tgatcttatatcactaacaaacgattatccattcctatactaaccatgtttactagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtca 17930841  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  17930840 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataga 17930741  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||||||    
T  17930740 gtttcacaacaacatg 17930725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 22173886 - 22174299
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | || |         || ||| ||| ||||||||||    
T  22173886 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactacacctatttgtattaattattctctaattcaacgttagttaacaa 22173985  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22173986 aatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 22174085  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  22174086 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaatttaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcatt 22174185  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
      ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||    
T  22174186 cgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagcatataaaaagcattaagaataattgaattgaataaaaactagatggtcattaataataaatagagt 22174285  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  22174286 ttcacagcaacatg 22174299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 25594620 - 25595033
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||||    
T  25594620 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatcttcccctaattagtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 25594719  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25594720 aatagtcctaatcaatcccttgagttaagactctcttctcaaactacagcccataattccttagatggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 25594819  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  25594820 acctaatatcagtaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaaatcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 25594919  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| |||||||     |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  25594920 cattctcactaaatcatgtttatacttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 25595019  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  25595020 ttcacagcaacatg 25595033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 510
Target Start/End: Original strand, 43681776 - 43682246
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||    ||||||  |||||  | ||||||||| || || | |||||||    
T  43681776 tttgattgcataaaattaaataaatagaaaataaagatagttttgaaaaatatatatggagaga--tgagactaggtctttcgagtcttcaaggttcccc 43681873  T
Q  147 taattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctca 237  Q
    ||||||||||||||||| |||||    |||||||     |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43681874 taattggtatactacacttattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctca 43681973  T
Q  238 aactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaa 337  Q
     | || ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43681974 tattacagtccctaattccgtaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcatgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaa 43682073  T
Q  338 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaa 437  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||   ||||| | ||||||  |||||||    |||  |||||||    
T  43682074 ccatgtttattagaacatttcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcggtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaa 43682173  T
Q  438 aaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  43682174 aagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaataaaatttcacaacaacatg 43682246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 105 - 510
Target Start/End: Original strand, 5980275 - 5980688
Alignment:
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaaca 195  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    | |||||     |||||||| ||||||||||    
T  5980275 gagagagatgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccttaattggtatactacacctattcttatggatgattttctagttccacaatagttaaca 5980374  T
Q  196 aaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtt 295  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  5980375 aaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagtccgtaatttcttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtt 5980473  T
Q  296 aacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 395  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  5980474 aacctaatatcactaacaaacgattatccatatctagactaaacttgtttattagaacaagtcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcat 5980573  T
Q  396 caattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaag 495  Q
       ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |     
T  5980574 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaatttaattgaataaaaactagattgacattcacaataaatagat 5980673  T
Q  496 tttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||| |||||||    
T  5980674 tttcacagcaacatg 5980688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 106 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 12583167 - 12582753
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcat---ctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||| |    
T  12583167 agagagatgagaccaggtctttcgaatcatgatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttga 12583068  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||    
T  12583067 caaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtgtaataatctttgaagg-tttaagaacg 12582969  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  12582968 ttaacctaatatcactaacaaacaattatctattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtc 12582869  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  12582868 attcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatag 12582769  T
Q  494 agtttcacaacaacat 509  Q
    ||||||||| ||||||    
T  12582768 agtttcacagcaacat 12582753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 103 - 510
Target Start/End: Original strand, 21279729 - 21280144
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| || |||||||||    
T  21279729 gagagagagatgtgatcgggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttacatgatagttaa 21279828  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  21279829 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagactctcttcttaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatg 21279927  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || || ||||| |||||    
T  21279928 ttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagaccaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgagagttagggtcagtagtc 21280027  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||   ||||| | |||||| ||||||||    | |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     
T  21280028 attcgttctcactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaacaataaatag 21280127  T
Q  494 agtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||| |||||||    
T  21280128 agtttcacagcaacatg 21280144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 13197015 - 13196601
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    ||||| || |||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||| ||||||||||    
T  13197015 agagatagatgagatcaggtctttcaaatcatctatgttctcttaattggtatactgcacttattcttatgaatgattttctagttccaagatagttaac 13196916  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||    
T  13196915 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcgaactacaacccctaatttcttaggtagtctaataatctttgaagg-tttgagcacgt 13196817  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||  ||||||    
T  13196816 taacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagttatggtcggtagtca 13196717  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| |||| |||    |||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  13196716 ttcgttctcactaaatcatgtttttatttgatcaggatataaaaagtattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcgttcacaataaatata 13196617  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  13196616 gtttcacagcaacatg 13196601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Original strand, 10498175 - 10498589
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||||     |||||  ||||||||||||    
T  10498175 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaac 10498274  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  10498275 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagtacgt 10498373  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||     
T  10498374 taacctaatatcactaataaaggattatccattccaagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatgatcagtagtcg 10498473  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||| |  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  10498474 ttcgttctcactaaattatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgacttgaataaaaactagattgtcattcacaaataataga 10498573  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  10498574 gtttcacagcaacatg 10498589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 122 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 8911789 - 8911387
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  8911789 gtctttcgaatcctctgagttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctatgatagttaacaaaatagtcctaataaat 8911690  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaacta-aagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaa 311  Q
    |||| |||||  |||| ||||||    ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8911689 ccctcgagtttagaccctcttctagggctacaaccccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttttaagcacgttaacataatatcactaa 8911590  T
Q  312 taaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatc 411  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||| | |||||    
T  8911589 taaaggattatgcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatc 8911490  T
Q  412 acgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgt 511  Q
    |  |||||||    |||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8911489 atatttatatttgatcaggatataaaaagcattaaaaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgt 8911390  T
Q  512 ttc 514  Q
    |||    
T  8911389 ttc 8911387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 31284832 - 31284414
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    ||||||     |||||| | ||||||||||    
T  31284832 agagagagatgagtttaggtcattcgaatcatctatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgagtccctagttctatgatagttaac 31284733  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || |  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||    
T  31284732 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacatcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgt 31284634  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  31284633 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattacaacaattcaattaggtctaagtcgaaggctatggtcagtagtca 31284534  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtca----atatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  31284533 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataa 31284434  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  31284433 tagagtttcacagcaacatg 31284414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 103 - 387
Target Start/End: Original strand, 12516412 - 12516706
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc-----gaatgat-----agttccacgatagtta 192  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||     ||||| |     ||||||||||||||||    
T  12516412 gagagagagatgaaatcaggtctttcgaatcatctatattcccctaattggtatactgcacctattcttttggaatggttttctagttccacgatagtta 12516511  T
Q  193 acaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtac 292  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | | || | ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  12516512 acaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttcttagattacaatccctaattccttagttgatctaatattctttgaaggttttatgcac 12516611  T
Q  293 gttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 387  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12516612 tttaacataatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 12516706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 104 - 502
Target Start/End: Original strand, 23619325 - 23619731
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||| ||     |||||  ||||||||||||    
T  23619325 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaac 23619424  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||  |||||||| | ||||||||| ||| ||||||     | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  23619425 aaaatagttctaatcaattcattgagttagaaccctcttctagggttgaagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 23619523  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  23619524 taacctaatttcactaataaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtca 23619623  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  23619624 ttcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataga 23619723  T
Q  495 gtttcaca 502  Q
    ||||||||    
T  23619724 gtttcaca 23619731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 33419814 - 33419400
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||    
T  33419814 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatttatgttcccctaatttgtatactgcacctattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaac 33419715  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||     || |  ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | ||    
T  33419714 aaaatattcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttatgtggtctaataacctttgaaggttt-aagcatgt 33419616  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    | |  |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  33419615 ttatctaatatcactaataaaggattatacattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattcggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtca 33419516  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  33419515 ttcattctcactaaatcatgtttatatttgatcatgatataaagagctttaagaacaattaaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataga 33419416  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  33419415 gtttcacagcaacatg 33419400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 47 - 475
Target Start/End: Original strand, 5538681 - 5539114
Alignment:
Q  47 tttgattgca-taaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttccc 145  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||||||| ||| |||||||    |||||  | |||||| |||||||  ||||||||    
T  5538681 tttgattgcaataaaagtaaataa-cagaaaataaagatatgtttggaaaatatatggagaga----tgagactaggtcttttgaatcattgatgttccc 5538775  T
Q  146 ctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctc 236  Q
    | |||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  5538776 caaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttgcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgagttagaaccctcttctc 5538875  T
Q  237 aaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagacta 336  Q
    |||||| |  |||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  5538876 aaactacaacccctaattccgtaggtggtttagtgatctttgaaggttttatgcacattaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagacta 5538975  T
Q  337 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataa 436  Q
    | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| |  |||||  |||||||    ||| |||||||    
T  5538976 atcatgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcacttaatcatttttatatttgatcagtatataa 5539075  T
Q  437 aaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagatt 475  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5539076 aaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagatt 5539114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Original strand, 5613680 - 5614107
Alignment:
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaaca 195  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||| | ||  |||||||||    |||||||     |||| ||||||||||||||    
T  5613680 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcctctgt-ttcccctaattggcacacatcacatattcttatgaatgattctctagtttcacgatagttaaca 5613778  T
Q  196 aaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaa--gtccctaattccttaggtggtctaataatcttt-gaaggttttaagtac 292  Q
     ||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||| | || |  | ||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||| ||    
T  5613779 taatagtcctaataaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatatagcccctaattccttaggtggtataatatttttttgaaggttttaagaac 5613878  T
Q  293 gttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgttta-------ttagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggt 385  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| ||||||||||||       || |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||    
T  5613879 gttaacttaatatcacaaataaacgattatgcatacctagaataaccatgtttatttgaattttgaacaattcaattaagtctaagttgaaagttgtggt 5613978  T
Q  386 caatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcata 485  Q
    ||  ||||||  |||||| |||||||| ||||||||    | |   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  5613979 cagcagtcattcattctcacgaaatcatgtttatatttgataagggtataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcatccaca 5614078  T
Q  486 ataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5614079 ataaatagagtttcacatcaacatgtttc 5614107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 30785078 - 30784669
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatatt-----cgaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |  || ||||     ||||||||     |||| ||||||||||||    
T  30785078 agagagaggtgagatcaggtctttcgaatcctctaagttcccctaattggtatattgtacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatagttaa 30784979  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||||  | |||||||||| | ||  ||||||| |||||||  | || |||| ||||||||||||||| | |||   ||| ||||||||||| | |||    
T  30784978 caaaataaccctaatcaatccatggacgtaggaccctcttctcggattacagtctctaattccttaggtgatttaaagttctctgaaggttttacgaacg 30784879  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| ||||||||| |           ||||||| |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30784878 ttaacctaatatcacaa-----------tccattcctagattattcatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcaatagtc 30784790  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||  |||||| |||| ||| ||||||||    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  30784789 attcattctcacgaattcatgtttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 30784690  T
Q  494 agtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  30784689 agtttcacatcaacatgtttc 30784669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Original strand, 33883209 - 33883501
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||| ||| ||||| || |  || ||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33883209 ttaatatataggatgtgtaaatttcttttagtgcccaaggtagtaggttggtgtgtataaaaagtaaataa-cagaaaataaagatagttttggaaaaga 33883307  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatag 189  Q
    |||  |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||    
T  33883308 taa--agagagaggtgagtttaagtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatag 33883405  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 285  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33883406 ttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 33883501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 176 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 2560630 - 2560325
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagtt-aggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||  |||||||| | || |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  2560630 tagttccacgatagttaacaaaatagccataatcaatcacttgagtttaagactctcttctcagattacac-ccataattccttaggtggtctaataatc 2560532  T
Q  275 tttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtta 374  Q
    |||||||| |||||| |||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||      
T  2560531 tttgaaggctttaagcacgttaaactaatatcattaataaaggattatccattcctagactaaccatctgtattagaacaattcagttaggtctaagtcg 2560432  T
Q  375 aaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagat 474  Q
    ||| | ||||||| |||||||   || || | |||||| ||||||||    |||  |||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  2560431 aaaaccatggtcagtagtcattcgttatcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaggattataaacaattgaattgaataaaaactagat 2560332  T
Q  475 tgtcatt 481  Q
    | |||||    
T  2560331 tttcatt 2560325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 122 - 383
Target Start/End: Original strand, 44027072 - 44027341
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    |||||||     ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44027072 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattgatataatgcacatattcttgtgaatgattaactagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaat 44027171  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||     || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||| |||| ||||||||    
T  44027172 cccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggtttaaac-acgttaacctaatgtcactaat 44027270  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatg 383  Q
    ||| |||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  44027271 aaatgattattcattcctaacctaatcatgtttattagaaaaattcaattaagtctaagtcaaaaactatg 44027341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 175 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 4868331 - 4868041
Alignment:
Q  175 atagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatc 274  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||  | || ||| | |||||||||||||| ||||||| ||    
T  4868331 atagtttcacgatggttaactaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcggattacagttcataattccttaggtgatctaatattc 4868232  T
Q  275 tttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtta 374  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||     |||||| |||||||||||||||| |||||||     
T  4868231 tttgaaggttttaagaacgttcacctaatatcacaaataaaaaattatccattcctagactaa-----tttatttgaacaattcaattaggcctaagttg 4868137  T
Q  375 aaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtca--atat-ataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaa 467  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||| |||| |||  |||||||    |||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  4868136 aaagttatggtcaatagtcattcattctcacgaattcatctttatatttgatcaggatataataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaa 4868041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 23613363 - 23613284
Alignment:
Q  431 atataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  23613363 atataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatg 23613284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 211
Target Start/End: Original strand, 14589560 - 14589698
Alignment:
Q  80 aagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatga 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    |||||    
T  14589560 aagatagttttggaaaagacaaggagagaga--tgagattaggtatttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatga 14589657  T
Q  176 -----tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaa 211  Q
         |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  14589658 ttttctagttccacgatcgttaacaaaatagccctaatcaa 14589698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20887691 - 20887589
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||||     |||||||||||||||||||||    
T  20887691 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 20887592  T
Q  197 aat 199  Q
    |||    
T  20887591 aat 20887589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 169
Target Start/End: Original strand, 5584359 - 5584422
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc 169  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5584359 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattc 5584422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 62
Target Start/End: Original strand, 37681385 - 37681442
Alignment:
Q  5 tatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat 62  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  37681385 tatctaggatgtgtaaattattttagtgttcgaggcggtagttttgattgcataaaat 37681442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 322; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 14281378 - 14281896
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  14281378 ttaatatctaggatgtgtaaattattttagtgcccaacgcagtagttttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaagaaa 14281477  T
Q  101 aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgata-----gttccacgatagtt 191  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    |||||||      ||| ||||||||||    
T  14281478 aggagagagagatgacatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattgggatactgcacctattcttatgaatgattctcttgtttcacgatagtt 14281577  T
Q  192 aacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagta 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14281578 aacaaaatagtcctaatcaatcccttaagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagta 14281677  T
Q  292 cgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatag 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||| |||    
T  14281678 cgttaacctaatatcactaataaacgattatcaattcctagactaaccatgtttattagaacaattgaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtag 14281777  T
Q  392 tcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaat 491  Q
    ||||  |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  14281778 tcattcattctaacgaaatcatgtttatatggtgtcaatatataaaaagcaataagaacaattgaattgaataaaaactagattgttattcaaaataaat 14281877  T
Q  492 aaagtttcacaacaacatg 510  Q
    | |||||||||||||||||    
T  14281878 agagtttcacaacaacatg 14281896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 13005455 - 13004937
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 100  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  13005455 ttaatatctaggatgtttaaattatttatttgcctgaggcagtagttttgattgcagaaaattaaataaacagaaaataaaaatagttttggaaaagata 13005356  T
Q  101 aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagtt 191  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||||    
T  13005355 aggagagagagatgagatcaggtctttcaaatcatctatgttcccctaattggtatacttcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagtt 13005256  T
Q  192 aacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagta 291  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13005255 aacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttatgaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaattttttaagta 13005156  T
Q  292 cgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatag 391  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||    
T  13005155 cgttaacctaatatcactaataaacgattatctattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggccagtag 13005056  T
Q  392 tcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaat 491  Q
    ||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  13005055 tcattcattctcacgaaatcatgtttatatggtgtcaatatataaaaaggatcaagaacaattaaattcaataaaaactagattgtcatttacaataaat 13004956  T
Q  492 aaagtttcacaacaacatg 510  Q
    | |||||||||||||||||    
T  13004955 agagtttcacaacaacatg 13004937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 9954226 - 9953712
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  9954226 ttaatatttaggatgtgtaaattattttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaaagaa 9954127  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagt 190  Q
     | ||||||    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||         || ||||||||||||    
T  9954126 taagagaga----tgagatcagctctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctaattccacgatagt 9954031  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  9954030 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagc 9953932  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  9953931 acgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagta 9953832  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9953831 gtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaacaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaa 9953732  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || |||||||||||||||||    
T  9953731 tagagtttcacaacaacatg 9953712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 2379494 - 2378986
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  2379494 ttaatatttaagatgtgtaaattattttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaagaat 2379395  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||    
T  2379394 aag---agagagatgagatcaggtctttcaaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagt 2379298  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2379297 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcctgtaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaaga 2379198  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  2379197 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagta 2379098  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2379097 gtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaa 2378998  T
Q  491 taaagtttcaca 502  Q
    || |||||||||    
T  2378997 tagagtttcaca 2378986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 509
Target Start/End: Original strand, 1125595 - 1126110
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1125595 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaaaga 1125694  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatag 189  Q
      | ||||||    ||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||    |||||||     |||| ||||||||    
T  1125695 acaagagaga----tgagagcatgtctttcgaatcatttatgttctcctaattggtatactggacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatag 1125790  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1125791 ttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 1125890  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |    
T  1125891 aacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagt 1125990  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||| ||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1125991 agttattccttctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaatga 1126090  T
Q  490 ataaagtttcacaacaacat 509  Q
    ||| ||||||||| ||||||    
T  1126091 atagagtttcacagcaacat 1126110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 5 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 2846564 - 2846046
Alignment:
Q  5 tatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataagga 104  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| | |||| ||||| |||||||| |||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2846564 tatctaggatgtgtaaattattttggtgtctgaggcagtagatttgattgtataaaattaatttaccagaaaataaagatagttttggaaaagataagga 2846465  T
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatatt-----cgaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    || |||  |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||| ||||     ||||||||     |||| |||||| ||||||    
T  2846464 gataga--tgagatcaagtctttcgaatcctctaagtccccctaattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatggttaac 2846367  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaa-gtacg 293  Q
    ||||||| | |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||    
T  2846366 aaaatagccataatcaatcccttgacataggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaaagaacg 2846267  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  2846266 ttaacttaatatcacaaataaaagattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagtagtc 2846167  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||  ||| || |||||||| ||||||||  | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||     
T  2846166 attcattatcacgaaatcatgtttatattttatcatgatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgttattcacaatatatag 2846067  T
Q  494 agtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  2846066 agtttcacaacaacatatttc 2846046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 103 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 6513420 - 6513001
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||||||    
T  6513420 gagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatattcccctaattgatatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaa 6513321  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6513320 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggactctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 6513221  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  6513220 ttaacctaatatcactaataaacgattattcattcgtagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtc 6513121  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtt----tatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||  ||||||  ||||||| |||    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  6513120 attcattctcatgaaatcatgtttatatatatggtgtcaatatataaaaagtattaagaacaattgaattgagtaaaaactagattgtcattcacaataa 6513021  T
Q  490 ataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||  |||||||||||||    
T  6513020 atagag-gtcacaacaacatg 6513001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 52 - 510
Target Start/End: Original strand, 3596693 - 3597157
Alignment:
Q  52 ttgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaatt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||   |||||||  |||||   |||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3596693 ttgcataaaattaaataaacagaatgtaaagatatagttggaaagaataag---agagagatgagattaggtctttcgaatcatttatgttcccctaatt 3596789  T
Q  152 ggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaacta 242  Q
    |||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3596790 ggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaacta 3596889  T
Q  243 aagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatg 342  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  3596890 cagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctg 3596989  T
Q  343 tttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaacca 442  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||    
T  3596990 tttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatttattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagca 3597089  T
Q  443 ttaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  3597090 ttaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcaaaataaatagagtttcacagcaacatg 3597157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Original strand, 9839356 - 9839774
Alignment:
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaaca 195  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| ||||||||||||||    
T  9839356 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaaca 9839455  T
Q  196 aaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtt 295  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||    
T  9839456 aagtagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagtccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaagttttacgaacgtt 9839555  T
Q  296 aacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 395  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||    
T  9839556 aacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatatttatttgaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatagtcagtagtcat 9839655  T
Q  396 caattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaag 495  Q
      |||||| | |||||| ||||||||    | |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9839656 tcattctcactaaatcatgtttatatttgataaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaatagag 9839755  T
Q  496 tttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  9839756 tttcacagcaacatgtttc 9839774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 106 - 509
Target Start/End: Original strand, 5738042 - 5738459
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgtt-----cccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagtt 191  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||||    
T  5738042 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagtt 5738141  T
Q  192 aacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagta 291  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5738142 aacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaa 5738241  T
Q  292 cgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatag 391  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||    
T  5738242 cgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtag 5738341  T
Q  392 tcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaat 491  Q
    ||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5738342 tcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaat 5738441  T
Q  492 aaagtttcacaacaacat 509  Q
    | ||||||||| ||||||    
T  5738442 agagtttcacagcaacat 5738459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 31 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 11402491 - 11402005
Alignment:
Q  31 tgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcg 129  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||  |||||   |||||| |||||||| ||||||||    
T  11402491 tgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttggaaagaataag---agagagatgagatcaggtctttcg 11402395  T
Q  130 aatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgag 220  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||||         |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11402394 attcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgtttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgag 11402295  T
Q  221 ttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgatt 320  Q
    |||||||| |||||| | |||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  11402294 ttaggaccctcttcttatactatatcccctaattccttaggtgttctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgatt 11402195  T
Q  321 atccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttata 420  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| |||||||    
T  11402194 atccattcctagattaaccctgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttata 11402095  T
Q  421 tggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  11402094 tttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 11402005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 31 - 510
Target Start/End: Original strand, 26942325 - 26942810
Alignment:
Q  31 tgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcg 129  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||  |||||   |||||| |||||||| ||||||||    
T  26942325 tgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacaaaatataaagatagagttggaaagaataag---agagagatgagatcaggtctttcg 26942421  T
Q  130 aatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgag 220  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26942422 attcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcctatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgag 26942521  T
Q  221 ttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgatt 320  Q
    |||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26942522 ttaggaccctcttctcaaattacagcccctaattccttaggtggtctaataaactttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgatt 26942620  T
Q  321 atccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttata 420  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| |||||||    
T  26942621 atccattcctagactaaccttgtttatcaaaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttata 26942720  T
Q  421 tggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  26942721 tttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaacgagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 26942810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 106 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 30655605 - 30655196
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||  |||||||||||    
T  30655605 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacttattcttatgaatgattctctagttccataatagttaacaa 30655506  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30655505 aatagtcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 30655406  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| |||||||     
T  30655405 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcatt 30655306  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    ||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  30655305 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcgggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 30655206  T
Q  497 ttcacaacaa 506  Q
    ||||||||||    
T  30655205 ttcacaacaa 30655196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 103 - 510
Target Start/End: Original strand, 28107747 - 28108164
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    |||||||     |||||||| ||||||||    
T  28107747 gagagagagatgatatcaggtatttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacagctattcttatgaatgattttctagttccacaatagttaa 28107846  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataat---ctttgaaggttttaagt 290  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||||||||   |||||||||||| ||||    
T  28107847 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaatttcttacgtggtctaataatattctttgaaggttt-aagt 28107945  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||    
T  28107946 acgttaacctaatatgactaataatcgattatccattccatgactaaccgtgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaa-gctatgatcatta 28108044  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||  |||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28108045 gtcattcattctctctaaatcatgtttatatagtgtcaatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcatagtaaa 28108144  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || |||||||||||||||||    
T  28108145 tagagtttcacaacaacatg 28108164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 106 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 20185905 - 20185502
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||||    
T  20185905 agagagataagatcaggtttttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 20185806  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  20185805 aatagtcataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaatgtta 20185707  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  20185706 acctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 20185607  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  20185606 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaatcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 20185507  T
Q  497 ttcac 501  Q
    |||||    
T  20185506 ttcac 20185502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 106 - 501
Target Start/End: Original strand, 22150086 - 22150489
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||||    
T  22150086 agagagataagatcaggtttttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 22150185  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  22150186 aatagtcataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaatgtta 22150284  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  22150285 acctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 22150384  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22150385 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaatcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 22150484  T
Q  497 ttcac 501  Q
    |||||    
T  22150485 ttcac 22150489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 116 - 510
Target Start/End: Original strand, 11125670 - 11126071
Alignment:
Q  116 gatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaa 207  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||    ||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  11125670 gatcaagtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctga 11125769  T
Q  208 tcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatca 307  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||    
T  11125770 tcagtcccttgagttaggaccctcttcacaaactaaagcccatattttcttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaaccaaatatca 11125868  T
Q  308 ctaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcga 407  Q
     ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   || || | |    
T  11125869 gtaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttttcacta 11125968  T
Q  408 aatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaac 507  Q
    ||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11125969 aatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataaagtttcacaacaac 11126068  T
Q  508 atg 510  Q
    |||    
T  11126069 atg 11126071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Original strand, 22561124 - 22561539
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgata-----gttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||      ||| ||||||||| |||    
T  22561124 agagagagatgagatcaggtctttcaaatcatctacgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctggtttcacgatagtcaac 22561223  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  22561224 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatctcataatctttgaaggttttacgaacgt 22561323  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||| || | ||||||    
T  22561324 taacttaatatcagaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaaatcaattaggtctaagtagaaagctattgttagtagtca 22561423  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |    
T  22561424 ttcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtccttcacaataaataga 22561523  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  22561524 gtttcacagcaacatg 22561539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 10290133 - 10289721
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||         |||||||||||||||||||||    
T  10290133 agagagataagatcaggtctttcgaatcatctatgttccccgaattggtatactgcacttattcttatgaattattttttagttccacgatagttaacaa 10290034  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  10290033 aatagtcctaatcaatcctttaacttaggaccttcttctcaaattacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacatta 10289935  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  10289934 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 10289835  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  10289834 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaaatgtattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 10289735  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  10289734 ttcacagcaacatg 10289721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 176 - 510
Target Start/End: Original strand, 28111808 - 28112140
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28111808 tagttctacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatct 28111907  T
Q  276 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaa 375  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |      
T  28111908 ttgaagg-tttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattcttcattcctagactaaccatgtttattagatcaattcaatttggtctaag-tcg 28112005  T
Q  376 aagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagatt 475  Q
    |||||||||| | |||||||  | |||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  28112006 aagctatggttagtagtcattcaatctcactaaatcatgtttatatagtgttaatatataaaaagcattaagaacaattgacttgaataaaaactagttt 28112105  T
Q  476 gtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  28112106 gtcattcacagtaaatagagtttcacaacaacatg 28112140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 176 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 5260016 - 5259681
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||    ||||| || |||||||||||||||| |||    
T  5260016 tagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttcttaaaatac---ccctattttcttaggtggtctaatactct 5259920  T
Q  276 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaa 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  5259919 ttgaaggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattacccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttga 5259820  T
Q  376 aagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagatt 475  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||  |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5259819 aagctatggtcagtagtcattcattcttacagaatcatgtttatatggtgtcaatatctaaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagatt 5259720  T
Q  476 gtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  5259719 gtcattcacaatagatagagtttcacaacaacatgtttc 5259681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 421
Target Start/End: Original strand, 23384642 - 23385040
Alignment:
Q  31 tgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcg 129  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||  |||||   |||||| |||||| | ||||||||    
T  23384642 tgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttggaaagaataag---agagagatgagattaggtctttcg 23384738  T
Q  130 aatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgag 220  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||         |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23384739 attcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgtttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgat 23384838  T
Q  221 ttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgat- 319  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||     
T  23384839 ttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagttgttctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaataaacgatt 23384937  T
Q  320 -tatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgttta 418  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| |||||    
T  23384938 atatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgttta 23385037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 122 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 28230740 - 28230341
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgtt-cccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    ||| ||     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28230740 gtctttcgaatcatttatgttacccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaa 28230641  T
Q  212 tcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaa 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  28230640 tcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaa 28230542  T
Q  312 taaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatc 411  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||| | |||||    
T  28230541 taaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaaatcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatc 28230442  T
Q  412 acgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgt 511  Q
    |  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||    
T  28230441 atatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatgt 28230342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 122 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 19476147 - 19475747
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||||     |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  19476147 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtctctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaatcagt 19476048  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||     || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  19476047 cccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttttaac-acgttaacctactatcactaat 19475949  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||| |   ||||| | ||||||    
T  19475948 aaaggattatccattcctaggctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaaactatggtcagtagtcgttcgttctcactaaatca 19475849  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtt 512  Q
      |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||    
T  19475848 tatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaaatgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataaagtttcacagcaacatgtt 19475749  T
Q  513 tc 514  Q
    ||    
T  19475748 tc 19475747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 106 - 393
Target Start/End: Original strand, 17106573 - 17106868
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  17106573 agagagatgagatcaagtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 17106672  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17106673 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 17106771  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  17106772 acctaatatcactaaaaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtc 17106868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24400342 - 24399928
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    ||| |||     ||||| ||||||||||||    
T  24400342 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtgaacgattcactagttctacgatagttaac 24400243  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| || |   || |  ||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||| ||| ||||    
T  24400242 aaattagtcctaatcaatcccttaagtgaggaccctctcctaaggttacaacccctaattcctcaggtggtctaataaccgtcgaaggttt-aagcacgt 24400144  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  24400143 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggttagtagtca 24400044  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  24400043 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataga 24399944  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  24399943 gtttcacagcaacatg 24399928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24410461 - 24410048
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    ||| |||     ||||| ||||||||||||    
T  24410461 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtgaacgattcactagttctacgatagttaac 24410362  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || |   || || |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| ||| ||||    
T  24410361 aaataagtcctaatcaatcccttgagtcaggaccctctcctaaggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgtcggaggttt-aagcacgt 24410263  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  24410262 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtca 24410163  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||  ||   | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |    
T  24410162 ttcgttctcactaaatcatgtttatat-ttgatcagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcaccataaataga 24410064  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  24410063 gtttcacagcaacatg 24410048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 103 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 11247925 - 11247506
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatatt-----cgaatgat-----agttccacgatagtta 192  Q
    ||||||||| ||||||||  | ||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||||     ||||||||     |||| || ||| ||||    
T  11247925 gagagagagatgagatcagttttttcgaatcctctg-gttcccctaatttgtatactacacttatttcttacgaatgattctctagtttcatgatggtta 11247827  T
Q  193 acaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtac 292  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||  |||| ||| | || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11247826 acaaaatatccttaatcaatcccttgacttagaactctcttatcagattacag-ccctaattccttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaac 11247728  T
Q  293 gttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11247727 gttaacttaatatcacaaataaacgattattcattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattatgtctaagttgaaagctatggtcagtagt 11247628  T
Q  393 catcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaata 492  Q
    |||  |||||| || ||||| ||||||||    | |  ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  11247627 cattcattctcacgtaatcatgtttatatttgattaggatataaaaagcattaagaacaattgaatttaataaaaactagattatcattcacaatagata 11247528  T
Q  493 aagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
     | ||||||| |||||||||||    
T  11247527 gactttcacagcaacatgtttc 11247506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Original strand, 18855986 - 18856400
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||| ||     |||||   |||||||||||    
T  18855986 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttgcgatagttaac 18856085  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||     || |   ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||| ||||    
T  18856086 aatatagtcctaatcaatcccttgagttaggaacctcttctagggttacaactcctaatttcttaggtggtctgctaacctttgaaggttt-aagcacgt 18856184  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  18856185 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtca 18856284  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  18856285 ttcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataga 18856384  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  18856385 gtttcacagcaacatg 18856400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 122 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 13947163 - 13946794
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||||     |||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  13947163 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaaatagtcctaattaat 13947064  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    ||||||||||| |||| |||||      || |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||    
T  13947063 cccttgagttatgaccctcttcgagggttacaacccctaattccttaggtggtttaataacctttgaaggttt-aagcacgttaatctaatatcactaat 13946965  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||||   ||||| | ||||||    
T  13946964 aaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtcatttgttctcactaaatca 13946865  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattca 483  Q
      |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13946864 tatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattca 13946794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 4512639 - 4512221
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||| |||||    
T  4512639 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcattagttccacgataattaac 4512540  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaa----agtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||     ||     || |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||     
T  4512539 aaaatagtcataatcaatccattgagttcggaccctcttctagggttacttgtagcccctaattccttaggtggtctactaacttttgaaggttt-aagc 4512441  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    | |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  4512440 atgttaacctaatatcactaataaatgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattcagtctaagtcgaaagctagggtcagta 4512341  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  | |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4512340 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcacgagataaaaagtattaagaacaattgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaa 4512241  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  4512240 tagagtttcacagcaacatg 4512221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 285 - 480
Target Start/End: Complemental strand, 2372295 - 2372104
Alignment:
Q  285 ttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatgg 384  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |    
T  2372295 ttaaatacgttaacctaatatcactaataaacgattattcattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagc----g 2372200  T
Q  385 tcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcat 480  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2372199 tcagtagtcatcaattctcacgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaacattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtcat 2372104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2372595 - 2372448
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2372595 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgtccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 2372496  T
Q  101 aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttccccta 148  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2372495 aggagagagagttgagatcatctctttcgaatcatctatgttccccta 2372448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 205 - 510
Target Start/End: Original strand, 12988196 - 12988499
Alignment:
Q  205 taatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaata 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || | || |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||| ||| |||| |||||    
T  12988196 taatcaatcccttgacttaggaccctcttcgcatattacagtccctaattccttaggtgatctaatattcttagaagatttgaagaacgctaacctaata 12988295  T
Q  305 tcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcg 404  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||     
T  12988296 tcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattatgtctaagttgaaagttatggtcagtagtcattcattctca 12988395  T
Q  405 cgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaac 504  Q
    |||||||| ||||||||    |||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| || |||||| |    
T  12988396 cgaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaaatattgaattgaat-aaaactagattgatattcacaat-aatagagcttcacagc 12988493  T
Q  505 aacatg 510  Q
    ||||||    
T  12988494 aacatg 12988499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 195 - 510
Target Start/End: Original strand, 13021315 - 13021628
Alignment:
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| |||| ||| ||| || |    
T  13021315 aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattatagtccctaactccttaagtgatctaatattcttagaagatttgaagaacat 13021414  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||    
T  13021415 taacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaacgatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagttatgatcagtagtca 13021514  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |  |||||  |||||||| ||||||||    |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| |    
T  13021515 ttcattcttacgaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaaatattgaattgaat-aaaactagattgatattcacaat-aataga 13021612  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    | ||||||||||||||    
T  13021613 gcttcacaacaacatg 13021628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 104 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 7128462 - 7128190
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||     ||| ||     |||||  ||||||||||||    
T  7128462 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtataatgcacatattattgtgaaagagtcactagttttacgatagttaac 7128363  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||    
T  7128362 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacatttgaaggttt-aagcacgt 7128264  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtct 368  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7128263 taacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcagttaggtct 7128190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23008322 - 23007932
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||  | ||| ||||||| ||||||| ||||||| || |  ||||||||   |||||||||  ||    
T  23008322 ttaatatttaggatgtgtaaattattttgatgcccaagacaatagatttgattccataaaagtaaataa-cataaaataaagatttgtttggaaaa--ta 23008226  T
Q  101 aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagtt 191  Q
    || |||||||  |||||||| |||||||||||| |||  ||| || ||||||||  || |||| |||||    |||||||     |||| ||||||||||    
T  23008225 agaagagaga--tgagatcaagtctttcgaatcctctgagtttccataattggtccacaacacctattcttgtgaatgattctttagtttcacgatagtt 23008128  T
Q  192 aacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagta 291  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | || || | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  23008127 aacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagattacagcctctaattccttaggtggtctaatattctttaaaggttttaagaa 23008028  T
Q  292 cgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 387  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23008027 cgttaacctgatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacagttcagttaggtctaagttgaaagttatggtca 23007932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 387
Target Start/End: Original strand, 23780042 - 23780432
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 100  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||  | ||| ||||||| ||||||| ||||||| || |  ||||||||   |||||||||  ||    
T  23780042 ttaatatttaggatgtgtaaattattttgatgcccaagacaatagatttgattccataaaagtaaataa-cataaaataaagatttgtttggaaaa--ta 23780138  T
Q  101 aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagtt 191  Q
    || |||||||  |||||||| |||||||||||| |||  ||| || ||||||||  || |||| |||||    |||||||     |||| ||||||||||    
T  23780139 agaagagaga--tgagatcaagtctttcgaatcctctgagtttccataattggtccacaacacctattcttgtgaatgattctttagtttcacgatagtt 23780236  T
Q  192 aacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagta 291  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | || || | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  23780237 aacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagattacagcctctaattccttaggtggtctaatattctttaaaggttttaagaa 23780336  T
Q  292 cgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtca 387  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23780337 cgttaacctgatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacagttcagttaggtctaagttgaaagttatggtca 23780432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 2372448 - 2372293
Alignment:
Q  72 agatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc-- 169  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||      
T  2372448 agatgataaagatagttttgaaaaagataaggagagagagctgagatcatctctttcgaatcatctatgttcccctagttggtatactgcacatattctt 2372349  T
Q  170 --gaatgatagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagtta 223  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2372348 atgaatgatagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagtta 2372293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 183 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 28848917 - 28848592
Alignment:
Q  183 acgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaag 281  Q
    ||||| |||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  28848917 acgatggttaactaaaatagtcctgataaatcccttgacttagggccctcttctcaaattacagtccctaattccttaggtgatctgatattctttgaag 28848818  T
Q  282 gttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagcta 381  Q
    ||||| || |||||||| || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  28848817 gttttgagaacgttaacctattatcacaaataaacgattatctattcctagactaaccttgtttatttgaacaattcaattaggtctgagttgaaagcta 28848718  T
Q  382 tggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtt-tatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcat 480  Q
    || |||  ||||||  |||||| |||| ||| ||| ||||||   ||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||||  ||    
T  28848717 tgttcagcagtcattcattctcacgaattcaggttatatatg--atcagtatataaaaaacattaagaacagttgaattgaat-aaacctatattgatat 28848621  T
Q  481 tcataataaataaagtttcacaacaacat 509  Q
    |||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  28848620 tcatatgaaacagagtttcacaacaacat 28848592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 244 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 24371289 - 24371065
Alignment:
Q  244 agtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgt 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  24371289 agtccctaattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacattaacctattatcacaaataaacgattatccattcctagactaacccggt 24371190  T
Q  344 ttattagaac-aattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaacca 442  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||   | |||| ||||||||    |||  ||||||||| ||    
T  24371189 ttatttgaacaaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcattatatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagca 24371090  T
Q  443 ttaagaaaaattgaattgaataaaa 467  Q
    ||||||| |||||||||||||||||    
T  24371089 ttaagaacaattgaattgaataaaa 24371065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 217 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 31072332 - 31072053
Alignment:
Q  217 tgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaac 316  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||||              ||||    
T  31072332 tgagttagggctctcttctcaaactacagcccctaattttttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgttaac--------------aaac 31072247  T
Q  317 gattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtt 416  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| |||    
T  31072246 gattatccattcctagaccagccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtt 31072147  T
Q  417 tatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||    
T  31072146 tatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcgcagcaacatg 31072053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 506
Target Start/End: Original strand, 11192657 - 11192949
Alignment:
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    ||||||| ||| |||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||    
T  11192657 cccttgacttaagactctcttctcagactacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaat 11192756  T
Q  313 aaacgattatccattcatagac----taaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt-taaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcga 407  Q
    ||||||||||||| || |||||    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||    |||||| |||    
T  11192757 aaacgattatccaatcctagactaattaaccctgtttatttgaacatttcaattaggtctaagtgtgaaacctatggtcagtagtc----attctcacga 11192852  T
Q  408 aatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaa 506  Q
    ||||| ||||||||    | |  ||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  11192853 aatcatgtttatatttgattagcatatagaaagcattaagaacaattaaattgaat-aaaactagattgatattcacaat-aatagagtttcacaacaa 11192949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 104 - 343
Target Start/End: Original strand, 26896220 - 26896467
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||| ||| |||||    
T  26896220 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttccacaataattaac 26896319  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||  |||| ||||||     || || |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |    
T  26896320 aaaatagccataatcaatccattgagtttagaccctcttctagggttacagcccctaatttcttaggtggtctcataacctttgaaggttt-aagcacat 26896418  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgt 343  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  26896419 taacctaatatcactaataaaggattatccattcgtagagtaaccatgt 26896467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 28107613 - 28107715
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    
T  28107613 ttaatatctaggatgtgtaaattattttagtgccctaggttgtagttttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaatata 28107712  T
Q  101 agg 103  Q
    |||    
T  28107713 agg 28107715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 349 - 510
Target Start/End: Original strand, 11188130 - 11188291
Alignment:
Q  349 agaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaaga 448  Q
    ||||||||||||||  || |||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||    
T  11188130 agaacaattcaattctgtttaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaaga 11188229  T
Q  449 aaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  11188230 acaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 11188291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 365 - 510
Target Start/End: Original strand, 23388327 - 23388472
Alignment:
Q  365 gtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaata 464  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  23388327 gtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaata 23388426  T
Q  465 aaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  23388427 aaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 23388472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 337 - 514
Target Start/End: Original strand, 26898071 - 26898248
Alignment:
Q  337 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataa 436  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||   || || | |||||| ||||| ||    |||  ||||||    
T  26898071 accatgtttattagaacaacttaattaggtctaattcgaaagctagggtcagtagtcattcgttgtcactaaatcatgtttaaatttgatcaggatataa 26898170  T
Q  437 aaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
     || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26898171 caagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatatagtttcacagcaacatgtttc 26898248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 102
Target Start/End: Original strand, 28111666 - 28111766
Alignment:
Q  2 taatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataa 101  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||    
T  28111666 taatatctaggatgcgtaaattattttagtgccctaggcagtagttttgattgcataaaattaaataaacataaaataaagatagttttggaaaatataa 28111765  T
Q  102 g 102  Q
    |    
T  28111766 g 28111766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23847932 - 23847785
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatct---atgttcccctaattggtatactacacatattc---gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||     |||||||| |||||||||    
T  23847932 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatcttttatattcccctaattggtatactgcacctattctatgaatgattttctagttccacaatagttaac 23847833  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaacta 242  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  23847832 aaaatagtcttaatcaatctcttgagttaggtctctcttctcaaacta 23847785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 32109829 - 32109685
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||| |||||    |||||||     |||||||||||| |||||||    
T  32109829 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatcaatgttcccctaatttgtatgctgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgataattaacaa 32109730  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaact 241  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  32109729 aatagttctaatcaatcccttgagttatgaccctcttctcaaact 32109685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 28665560 - 28665639
Alignment:
Q  431 atataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  28665560 atataaaaaatattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 28665639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 242
Target Start/End: Original strand, 23842762 - 23842906
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||     ||||||     |||| |||||||||||||||    
T  23842762 agagagatgagatcagttctttcgaat-atctatgttcccctaattgttatattgcacttattcttataaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 23842860  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaacta 242  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23842861 aatagtcctaatcaatcctttgagttaggaccctcttctcaaacta 23842906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 5260072 - 5260020
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt 53  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5260072 ttaatatctaggatgtgtaaattattttagtgcccgaggcagtagttttgatt 5260020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 235
Target Start/End: Original strand, 23667721 - 23667771
Alignment:
Q  185 gatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttct 235  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23667721 gatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttct 23667771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 5737922 - 5737991
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagtttt-gattgcataaaattaaataa 69  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5737922 ttaatatctaggatgtgtaaattattttaatgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataa 5737991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 169
Target Start/End: Original strand, 24155327 - 24155392
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc 169  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24155327 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatatatgttcccctaattggtatactgcacctattc 24155392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 6514232 - 6514189
Alignment:
Q  57 taaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 100  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6514232 taaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaagata 6514189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 454 - 500
Target Start/End: Original strand, 7918025 - 7918071
Alignment:
Q  454 tgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttca 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||    
T  7918025 tgaattgaataaaaactagattgccattcataatagatagagtttca 7918071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24371476 - 24371373
Alignment:
Q  5 tatctaggatttgtaaattattttagt-gcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataagg 103  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  | |||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||   ||||||||| ||| ||    
T  24371476 tatctaagatgtgtaaattattttgtttgccctaggcagtagatttgattgcataaaagtaaat-aacagaaaataaagatttgtttggaaaatatatgg 24371378  T
Q  104 agaga 108  Q
    |||||    
T  24371377 agaga 24371373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 64 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 22021251 - 22020797
Alignment:
Q  64 aaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacac 163  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22021251 aaataaacagaaaataaagatagttttggtaaagataaggagagagagatgagataaggtctttcgaatcatctatgttaccctaattggtatactgcac 22021152  T
Q  164 atattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaatt 254  Q
     |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||    
T  22021151 ctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacaacccctaatt 22021052  T
Q  255 ccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaaca 354  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22021051 ccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagtacgttaacctaatatcactaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaaca 22020952  T
Q  355 attcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaatt 454  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22020951 attcaattaggtctaagtcaaaagctatggtcagtagtcattcattctcacgaaatcatgtttatatggtgtcaatatataaaaagcattaagaacaatt 22020852  T
Q  455 gaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||    
T  22020851 gagttgaataaaaactagattgtcattcacaat-aatagagtttcacagcaacatg 22020797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 9185285 - 9185801
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  9185285 ttaatatttaggatgtgtaaattattttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaagaat 9185384  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||     ||||||||||||||    
T  9185385 aag---agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagt 9185481  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9185482 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagtctctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaaga 9185581  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  9185582 acgttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagta 9185681  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9185682 gtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaa 9185781  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  9185782 tagagtttcacagcaacatg 9185801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 9188513 - 9189029
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||    
T  9188513 ttaatatttaggatgtgtaaattattttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatgtaaagatagttttggaaagaat 9188612  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||    
T  9188613 aag---agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagt 9188709  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9188710 caacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattacttaggtggtctaataatctttgaaggttttaaga 9188809  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| ||    
T  9188810 acgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaatctatggtcagta 9188909  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9188910 gtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 9189009  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  9189010 tagagtttcacaacatcatg 9189029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 510
Target Start/End: Original strand, 25959558 - 25960065
Alignment:
Q  9 taggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagag 107  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||||    
T  25959558 taggatgtgtaaattattttagtgcttgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaaagaataagagag 25959657  T
Q  108 agagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaa 198  Q
    |    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  25959658 a----tgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaa 25959753  T
Q  199 tagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaac 298  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25959754 tagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcagactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttaaaggttttaagaacgttaac 25959853  T
Q  299 ttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaa 398  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |    
T  25959854 ctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattca 25959953  T
Q  399 ttctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagttt 498  Q
    ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25959954 ttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagttt 25960053  T
Q  499 cacaacaacatg 510  Q
    |||| |||||||    
T  25960054 cacagcaacatg 25960065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 37279537 - 37280053
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  37279537 ttaatatttaggatgtgtaaattattttagtgcctgaggcagtatttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaagaat 37279636  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||    
T  37279637 aag---agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagt 37279733  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  37279734 taacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaactacagcccctaattccttacgtggtctaataatctttgaaggttttaaga 37279833  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  37279834 atgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagta 37279933  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||  |||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37279934 gtcattcattctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaa 37280033  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||  |||||||    
T  37280034 tagagtttcacggcaacatg 37280053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 31427402 - 31427918
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  31427402 ttaatatttaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtggttttgattgcataaaaagtaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaaga 31427499  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatag 189  Q
     |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||     | |||||||||||    
T  31427500 caaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatag 31427597  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31427598 ttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaagtggtctaataatctttgaaggttttaag 31427697  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  31427698 aacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagt 31427797  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31427798 agtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtcattaataataa 31427897  T
Q  490 ataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  31427898 atagagtttcacagcaacatg 31427918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 25871028 - 25870513
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  25871028 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaac-gaaaataaagataattttggaaaagat 25870930  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    || ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||    |||||||     ||||||||||||||    
T  25870929 aaagagagaga--tgagatcaggtctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatgctacacctattcttgtgaatgattctctagttccacgatagt 25870832  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  25870831 taacaaaatagttttaatcaatcccttgagttaggaccgtcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagc 25870733  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  25870732 acgttaacctaatatcactaacaaacaattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaagtctgtctaagtagaaagctatggtcagta 25870633  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25870632 gtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtaattcacaataaa 25870533  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  25870532 tagagtttcacagcaacatg 25870513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 33310910 - 33310395
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||     
T  33310910 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtagttttgattgcataaatttaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaagac 33310813  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagt 190  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||  || |         |||||||||| ||||    
T  33310812 aaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcaactattcatattaataattttctagttccacggtagt 33310715  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||     
T  33310714 taacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagc 33310615  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  33310614 aagttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaactatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtccaaagctagggtcagta 33310515  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33310514 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaa 33310415  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  33310414 tagagtttcacagcaacatg 33310395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 38015762 - 38015247
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  || | |||||||||||||||||     
T  38015762 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtagttttgattgcataaatttaaataa-cagaaaatga-gatagttttggaaaagac 38015665  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||||    ||||||     ||||||||||||||    
T  38015664 aaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattgatatactgaacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagt 38015567  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||     
T  38015566 taacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagc 38015467  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    || ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||    
T  38015466 accttaacctaatatcactaacaaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtcaaagtcgaaagctagggtcagta 38015367  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38015366 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcatgatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaa 38015267  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  38015266 tagagtttcacagcaacatg 38015247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 103 - 510
Target Start/End: Original strand, 11347856 - 11348272
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    |||||||     |||||||||||||||||    
T  11347856 gagagatagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaa 11347955  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11347956 caaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacg 11348055  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  11348056 ttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtc 11348155  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11348156 attcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataa 11348255  T
Q  494 agtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||| |||||||    
T  11348256 agtttcacagcaacatg 11348272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 25 - 483
Target Start/End: Original strand, 30274654 - 30275118
Alignment:
Q  25 ttttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgt 123  Q
    |||||||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||    ||||| |||||    
T  30274654 ttttagtgactgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaaagaataagagaga----tgagagcatgt 30274749  T
Q  124 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcc 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30274750 ctttcgaatcatctatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcc 30274849  T
Q  215 cttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataa 314  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  30274850 cttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactgataa 30274949  T
Q  315 acgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacg 414  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| |    
T  30274950 aggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatg 30275049  T
Q  415 tttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattca 483  Q
    |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30275050 tttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattca 30275118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24235336 - 24234824
Alignment:
Q  9 taggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttg-----attgca-taaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataag 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     |||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||| |  ||| |||  |||||    
T  24235336 taggatgtgtaaattattttagtgcccgaggcagtagttttggtttgattgcaataaaagtaaataa-cagaaaataaagatcgaattgaaaagaataag 24235238  T
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
       ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||||||    
T  24235237 ---agaaagatgagatcaggtctttcgaattatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatttcctagttccacgatagttaa 24235141  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24235140 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacg 24235041  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  24235040 ttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattataacaattcaattctgtctaagtagaaagatatggtcagtagtc 24234941  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24234940 attcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 24234841  T
Q  494 agtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||| |||||||    
T  24234840 agtttcacagcaacatg 24234824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 5105868 - 5105455
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  5105868 agagagatgagatcaggtctttcaaattatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcatatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 5105769  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5105768 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 5105669  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  5105668 acctaatatcactaataaaggattatccattcctatactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 5105569  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||| | ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  5105568 cattctcactaaattatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 5105469  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||||    
T  5105468 ttcacaacaacatg 5105455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 31585904 - 31586317
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  31585904 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 31586003  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31586004 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 31586103  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| | |||||||     
T  31586104 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggttagtagtcatt 31586203  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| | ||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  31586204 cattctcactaaatcatgattatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaatcaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 31586303  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||||    
T  31586304 ttcacaacaacatg 31586317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 47 - 514
Target Start/End: Original strand, 25138840 - 25139312
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccc 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||   ||||||||| |||||   |||||| |||||||| ||||||||||| ||| || || |||    
T  25138840 tttgattgcataaaattaaataa-cataaaataaagatttgtttggaaaatataag---agagagatgagatcaggtctttcgaattatcgatatttccc 25138935  T
Q  147 taattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctca 237  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    ||| |||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25138936 taattggtatactgcacctattcttatgaacgattttcaagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctca 25139035  T
Q  238 aactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaa 337  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  25139036 aactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaa 25139135  T
Q  338 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaa 437  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||| ||    |||  |||||||    
T  25139136 ccatgattatgagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttacatttgatcaggatataaa 25139235  T
Q  438 aaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25139236 aagcattaggaacaattaaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttc 25139312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 25874425 - 25873904
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || | |||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||| ||||||    
T  25874425 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgtctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaac-gaaaataaagataattttggtaaagat 25874327  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    || ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||||     ||||||||||||||    
T  25874326 aaagagagaga--tgagatcaggtctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagt 25874229  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaa------ttccttaggtggtctaataatctttgaaggtt 284  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25874228 taacaaaatagttttaatcaatcccttgagttaggaccgtcttctcaaactacatcccctaaccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtt 25874129  T
Q  285 ttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatgg 384  Q
    | ||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| |||||    
T  25874128 t-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacaattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaagtctgtctaagtagaaagttatgg 25874030  T
Q  385 tcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcat 484  Q
    ||| |||||||  |||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  25874029 tcagtagtcattcattctcactaaatcatatttatatttgatcagaatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtaattcac 25873930  T
Q  485 aataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||    
T  25873929 aataaatagagtttcacaccaacatg 25873904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 36808304 - 36808818
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | ||||   |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  36808304 ttaatatctaggatgtgtaaattttataagtgattgaggcagtaggtttgtgtgcataaaattaaataaacagaaaataaa-atagttttggaaaagata 36808402  T
Q  101 aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagtt 191  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||| |||| | || |||||||||||||||| ||| ||| |||||    |||||||     |||||||| ||||||    
T  36808403 aggagagaga--tgagatcaggtctttcaaatcctttaagttcccctaattggtacactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacaatagtt 36808500  T
Q  192 aacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagta 291  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |    
T  36808501 aacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaagaccctcttcttaaactacagaccctaattctttaggtggtctaataatctttgaaagttt-aagca 36808599  T
Q  292 cgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatag 391  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  36808600 cgttaacctaatattactaataaacgattatacattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtag 36808699  T
Q  392 tcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaat 491  Q
    ||||  |||||  | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  36808700 tcattcattcttactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaattagattgtcattcacaataaat 36808799  T
Q  492 aaagtttcacaacaacatg 510  Q
    | ||||||||| |||||||    
T  36808800 agagtttcacagcaacatg 36808818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 42368675 - 42369087
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  42368675 agagagataagatcaggtctttcaaatcatttatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 42368774  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  42368775 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 42368873  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  42368874 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 42368973  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  42368974 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 42369073  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||||    
T  42369074 ttcacaacaacatg 42369087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 45457406 - 45456890
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||  ||||| || |  |||||||||  ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  45457406 ttaatatctaggatgtgtaaatttgttttagtgcctgagacagtaggttggtgtgcataaaaagtaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaaga 45457309  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatag 189  Q
     |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||    ||||||     |||||||||||||    
T  45457308 caaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatctaagttcccctaattgttatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatag 45457211  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||    
T  45457210 ttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataataatagaaggtttaaag 45457111  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |    
T  45457110 aacgttaacctaatatcactaaaaaaagattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaaactagggtcagt 45457011  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||||||   ||||  | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  45457010 agtcattcgttctaactaaatcatgtttatatttaatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattggataaaaactagattgtcattaataataa 45456911  T
Q  490 ataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  45456910 atagagtttcacaacaacatg 45456890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 47 - 514
Target Start/End: Original strand, 25820755 - 25821226
Alignment:
Q  47 tttgattgca-taaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttccc 145  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||||||| ||| |||||||    |||||  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  25820755 tttgattgcaataaaagtaaataa-cagaaaataaagatatgtttggaaaatatatggagaga----tgagactaggtctttcgaatcatcgatgttccc 25820849  T
Q  146 ctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctc 236  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25820850 ctaattgatatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 25820949  T
Q  237 aaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagacta 336  Q
    |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25820950 aaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctagtatcactaacaaacgattatccattcctagacta 25821048  T
Q  337 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataa 436  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||    
T  25821049 accatgtttattagaacaattcaattaggtataagttgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataa 25821148  T
Q  437 aaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25821149 aaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatagagtttcacaacaacatgtttc 25821226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 8888880 - 8888364
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagt-gcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    ||||||| |||||| |||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| |  ||||||||||  |||||||  |    
T  8888880 ttaatatttaggatgtgtaaatt-tcttagttgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaatcaacataatataaagatagagttggaaagaa 8888782  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatag 189  Q
    ||||   |||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||    
T  8888781 taag---agagagatgagattaggtctttcaaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatag 8888685  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8888684 ttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaag 8888586  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |    
T  8888585 catgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagt 8888486  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaacca-ttaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataata 488  Q
    ||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8888485 agtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcatttaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaata 8888386  T
Q  489 aataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  8888385 aatagagtttcacagcaacatg 8888364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 9 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24238608 - 24238096
Alignment:
Q  9 taggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttg-----attgca-taaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataag 102  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||     |||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||| |  |||||||  |||||    
T  24238608 taggatgtgtaaattattttagtgcccgagacagtagttttggtttgattgcaataaaagtaaataa-cagaaaataaagatcgaattggaaagaataag 24238510  T
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
       ||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||||||    
T  24238509 ---agaaagatgagatcaggtctttcgaattatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatttcctagttccacgatagttaa 24238413  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  24238412 caaaatatacctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagattttaagaacg 24238313  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| ||| |    
T  24238312 ttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagatatggtcagtagcc 24238213  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  24238212 attcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 24238113  T
Q  494 agtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||| |||||||    
T  24238112 agtttcacagcaacatg 24238096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 43207854 - 43208266
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  43207854 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 43207953  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  43207954 aatagtcctaatcaatcccttgagt-aggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaatagtctttgaaggttgtaagaacgtta 43208052  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  43208053 acctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 43208152  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  43208153 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 43208252  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  43208253 ttcacagcaacatg 43208266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 27266932 - 27266517
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||    ||||||     |||||||||||||||||||    
T  27266932 agagagagatgagatcaggtctttcaaatcatctatgttcccctaattggtataatgcagctattcttatgaatgactttctagttccacgatagttaac 27266833  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27266832 aaaatagtcctaataaattccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagtacgt 27266733  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||  ||||||    
T  27266732 taacctattatcactaataaacgattatccattcttagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaatctatggtcggtagtca 27266633  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27266632 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaatttaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataga 27266533  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  27266532 gtttcacatcaacatg 27266517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 40781613 - 40781201
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  40781613 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 40781514  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  40781513 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttg 40781415  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||| |||||| |||||||     
T  40781414 acctaatattactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctgtggtcagtagtcatt 40781315  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  40781314 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 40781215  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||| | |||||||    
T  40781214 ttcagagcaacatg 40781201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 78 - 510
Target Start/End: Original strand, 45493092 - 45493532
Alignment:
Q  78 taaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaat 173  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    ||||    
T  45493092 taaagataattttggaaaagataaagagagagagatgagatcaggtttttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaat 45493191  T
Q  174 gat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtcta 268  Q
    |||     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  45493192 gattctctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtcta 45493291  T
Q  269 ataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtct 368  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45493292 ataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtat 45493390  T
Q  369 aagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaa 468  Q
    ||||  |||| || ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45493391 aagtcgaaagttagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaactgaataaaaa 45493490  T
Q  469 ctagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  45493491 ctaaattatcattcacaataaatagagttttacagcaacatg 45493532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 78 - 510
Target Start/End: Original strand, 45500834 - 45501274
Alignment:
Q  78 taaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaat 173  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    ||||    
T  45500834 taaagataattttggaaaagataaagagagagagatgagatcaggtttttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaat 45500933  T
Q  174 gat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtcta 268  Q
    |||     ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  45500934 gattctctagttctacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtcta 45501033  T
Q  269 ataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtct 368  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45501034 ataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtat 45501132  T
Q  369 aagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaa 468  Q
    ||||  |||| || ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45501133 aagtcgaaagttagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaactgaataaaaa 45501232  T
Q  469 ctagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||    
T  45501233 ctaaattatcattcacaataaatagagttttacagcaacatg 45501274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 43723841 - 43723430
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  43723841 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 43723742  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||| || | |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  43723741 aatagtcataatcaatcctttaacttaggaccctcgtctcaaactatagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgcta 43723643  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  43723642 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacagttcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 43723543  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||  ||   | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  43723542 cattctcactaaatcatgtttatat-ttgatcagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgttattcacaataaatagagt 43723444  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||||    
T  43723443 ttcacaacaacatg 43723430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 106 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 5666658 - 5666255
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||     ||||||| ||||||||||||    
T  5666658 agagagatgagatcaggtctttcgaat-atctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccaagatagttaacaa 5666560  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5666559 aatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgtta 5666461  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |     
T  5666460 acctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaactattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcgtt 5666361  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
      ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  5666360 cgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 5666261  T
Q  497 ttcaca 502  Q
    ||||||    
T  5666260 ttcaca 5666255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 45454118 - 45453603
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||| || |  |||||||||  ||||||| ||||  |||| |||||||||| ||||||    
T  45454118 ttaatatctaggatgtgtaaatttgttttagtgcctgaggcagtaggttggtgtgcataaaaagtaaataa-cagaaaataa-gatagttttgaaaaaga 45454021  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatag 189  Q
     |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| || ||| | |||||||||||| | ||| ||||||    ||||||     ||||||| |||||    
T  45454020 caaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatataagtttctctaattggtataatgcacctattcgtattaatgattttctagttccatgatag 45453923  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||    
T  45453922 ttaacaaaatagcactaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaag 45453823  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  45453822 cacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagt 45453723  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||||||   ||||| | |||||| | ||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45453722 agtcattcgttctcactaaatcatg-ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataa 45453624  T
Q  490 ataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  45453623 atagagtttcacagcaacatg 45453603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 42 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 26366136 - 26365662
Alignment:
Q  42 gtagttttgattgca-taaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata-aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctat 139  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    |||||  | |||||| |||| ||||||    
T  26366136 gtagatttgattgcaataaaagtaaataa-cagaaaataaagatagttttggaaaatatatatgagaga----tgagactaggtcttttgaattatctat 26366042  T
Q  140 gttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggacctt 230  Q
    |||||||||||||||||| |  || |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  26366041 gttcccctaattggtatagtgtacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccct 26365942  T
Q  231 cttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcat 330  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  26365941 cttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcct 26365842  T
Q  331 agactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaat 430  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| || ||||| |||| ||   ||||| | |||||| ||||||||    |||      
T  26365841 aaactaaccatgtttattagaaaaattcaattaggtataagtcgaaagttagggtcagtagtaattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagg 26365742  T
Q  431 atataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  26365741 atataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 26365662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 13971858 - 13972270
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  13971858 agagagatgatatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 13971957  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  13971958 aatagtcataatcaatcccttaacttaggacactcttctcaaaataaaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 13972056  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  13972057 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgttttttagaaaaatccaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 13972156  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |||    
T  13972157 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcatgatataaaaaacattaagaacagttgaattgaataataactatattgtcaatcacaataaatagagt 13972256  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  13972257 ttcacagcaacatg 13972270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 29440739 - 29440375
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||     
T  29440739 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaa-gaa 29440641  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    || ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||    
T  29440640 aaagagagaga--tgagatcaggtctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagt 29440543  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  29440542 taacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaaga 29440444  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattca 359  Q
    |||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29440443 acgttaagctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattca 29440375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Original strand, 1386384 - 1386798
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||||     |||||  ||||||||||||    
T  1386384 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacttattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaac 1386483  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  1386484 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 1386582  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||     
T  1386583 taacctaatatcactaataaaggattatccatttctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcg 1386682  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  1386683 ttcgttctcactaaatcatatttatatttgatcatgatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataga 1386782  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  1386783 gtttcacagcaacatg 1386798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 113 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 6826905 - 6826501
Alignment:
Q  113 tgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtc 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||     |||||||     ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6826905 tgagatcaggtctttcgaatcatctatgctcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacgat-gttaacaaaatagtc 6826807  T
Q  204 ttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaat 303  Q
     ||||||| ||||||| ||||||   ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  6826806 ctaatcaaacccttgacttaggattctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatttttgaaggttt-aagcacgttaacctaat 6826708  T
Q  304 atcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctc 403  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||| |||||||  ||| ||    
T  6826707 atcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctttctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattttc 6826608  T
Q  404 gcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaa 503  Q
     | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  6826607 actaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacag 6826508  T
Q  504 caacatg 510  Q
    |||||||    
T  6826507 caacatg 6826501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Original strand, 40259101 - 40259515
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||||     |||||  ||||||||||||    
T  40259101 agagagagatgagtttaggtcgttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaac 40259200  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     || ||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  40259201 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttatagggttacagcgcctaattccttaggtggtataataatcgttgaaggttt-aagcacgt 40259299  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  40259300 taacctaatatcactaataaatgattatccattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaaactatggtcagtagtca 40259399  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  40259400 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataga 40259499  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||||||    
T  40259500 gtttcacaacaacatg 40259515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 122 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 16179252 - 16178856
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    |||||||     |||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  16179252 gtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcatatattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagctctaatcaat 16179153  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||   | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16179152 cccttgagttaggaccctcttctaggattacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaat 16179054  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||||||   ||||| | ||||||    
T  16179053 aatggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttagggtcagtagtcattcgttctcactaaatca 16178954  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
      |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  16178953 tatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 16178856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 104 - 511
Target Start/End: Original strand, 37937181 - 37937596
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||    |||||||     ||||| ||||||||||||    
T  37937181 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaac 37937280  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  37937281 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccccaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggttt-aagcacgt 37937379  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  37937380 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctaaactaaccatgtttattagaataattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtcagtagtca 37937479  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  37937480 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattcaataaaaactagattgtcattcacaataaataga 37937579  T
Q  495 gtttcacaacaacatgt 511  Q
    |||||||| ||||||||    
T  37937580 gtttcacagcaacatgt 37937596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 104 - 421
Target Start/End: Original strand, 9966331 - 9966657
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||  ||||         ||||| |||||||||||||    
T  9966331 agagagagatgagatcaagtcttttgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaattattttctagtttcacgatagttaac 9966430  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  9966431 aaaatagtcataatcaaacccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaacgt 9966530  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  9966531 taacttaacatcacaaataaatgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagtaggaagctatggtcagtagtca 9966630  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatat 421  Q
    |  |||||| | |||||| ||||||||    
T  9966631 ttcattctcactaaatcatgtttatat 9966657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 104 - 513
Target Start/End: Original strand, 16790719 - 16791138
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     ||| ||     ||||   ||||||||||||    
T  16790719 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattattgtgaaagagtcactagtcttacgatagttaac 16790818  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    ||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  16790819 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggctacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 16790917  T
Q  295 --taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 392  Q
      |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||    
T  16790918 gttaacctaatatcactaacaaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagccgaaagctatggtcagtagt 16791017  T
Q  393 catcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaata 492  Q
    |||   |||||   ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  16791018 cattcgttctcattaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataata 16791117  T
Q  493 aagtttcacaacaacatgttt 513  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  16791118 gagtttcacaacaacatgttt 16791138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 168; E-Value: 8e-90
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 12219939 - 12219520
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||| |     |||||||||||||||| |    
T  12219939 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgtttttctagttccacgatagttagc 12219840  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || |   | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  12219839 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttatatctcttaattccttatgtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 12219741  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatag-tc 393  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  12219740 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagctagggtcagtagttc 12219641  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||   ||||| | |||| |  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  12219640 attcgttctcactaaatgatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 12219541  T
Q  494 agtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  12219540 agtttcacagcaacatgtttc 12219520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 22630984 - 22630566
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||    
T  22630984 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatttatgttcccttaattggtatactgcacctattcttatgaatgattccctagttccacgatagttaac 22630885  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||     || || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| | ||    
T  22630884 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccattttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcatgt 22630786  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||    
T  22630785 taacctaatatcaataataaaatattatccattcttagactaacaatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggttagtagtca 22630686  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |    
T  22630685 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacagttgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaataga 22630586  T
Q  495 gtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  22630585 gtttcacagcaacatgtttc 22630566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 122 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 3875412 - 3875020
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg-----aatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaa 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||      ||| ||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3875412 gtctttcgaatcacctatgttcccctaattggtatactgcacatattctttattaataattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaa 3875313  T
Q  212 tcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaa 311  Q
    ||||||||||||||||  ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  3875312 tcccttgagttaggacactcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccattgaaggttt-aatcacgttaacctaatatcactaa 3875214  T
Q  312 taaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatc 411  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| ||   ||||| | |||||    
T  3875213 taaaggattatccattcctatactaaccatgtttattagaaaaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcggtagtaattcgttctcactaaatc 3875114  T
Q  412 acgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaaca 505  Q
    | ||||||||    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  3875113 atgtttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaacacagtttcacaaca 3875020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 176 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 17877168 - 17876835
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    | || |  || ||||| |||||| | ||||| |||||    
T  17877168 tagttccatgatagttaacaaaatagccaaaatcaatcccttgagttaggactttcttcgaggattacaacccttaattacttaggggctctaacaatct 17877069  T
Q  276 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaa 375  Q
    ||||| || | ||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  17877068 ttgaacgtat-aagcacgttatcctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcga 17876970  T
Q  376 aagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagatt 475  Q
    |||||| ||||| |||| ||   ||||| | |||||| ||||||||     ||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17876969 aagctagggtcagtagtaattcgttctcactaaatcatgtttatatttgaccaggatataaaaagaattaagaacaattgaattgaataaaaactagatt 17876870  T
Q  476 gtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  17876869 gtcattcataataaatagagtttcacagcaacatg 17876835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 176 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 30926603 - 30926272
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattcctta----ggtggtctaata 271  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| |  | |  |||||||||||||    ||||||||||||    
T  30926603 tagtttcacgatggttagcaaaatagtcctaatcaatccattgacttaggaccctcttctcagatgacaacccctaattccttaattaggtggtctaata 30926504  T
Q  272 atctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaag 371  Q
     ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||           |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30926503 ctctttgaaggttttatgaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatcca-----------accatgtttatttgaacaattcaattaggtctaag 30926415  T
Q  372 ttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaacta 471  Q
    || ||||||||||| |  ||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30926414 ttgaaagctatggttagcagtcattcattctcacaaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaacta 30926315  T
Q  472 gattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  30926314 gattgacattcacaatagatagagtttcacaacaacatgtttc 30926272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 176 - 421
Target Start/End: Original strand, 17874630 - 17874869
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||     || |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17874630 tagttctacgatgattaacaaaatagtcttagtcaatcccttaagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaata-tct 17874728  T
Q  276 -ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtta 374  Q
     |||||||||      |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||      
T  17874729 gttgaaggtt------acgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtgtattagaacaattcaattaagtctaagtcg 17874822  T
Q  375 aaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatat 421  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    
T  17874823 aaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatat 17874869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 334 - 514
Target Start/End: Original strand, 17876211 - 17876391
Alignment:
Q  334 ctaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatata 433  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  |||    
T  17876211 ctaaccatgtgtattagaacaattcaattaagtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggata 17876310  T
Q  434 taaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  17876311 taaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacgataaatagagtttcacagcaacatgtttc 17876391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 303 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 10600876 - 10600676
Alignment:
Q  303 tatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattct 402  Q
    ||||||||| |||||||||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||    
T  10600876 tatcactaacaaacgattatcca------gactaatcatgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattct 10600783  T
Q  403 cgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcaca 502  Q
    | | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10600782 cactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaatctagattgtcattcacaataaatagagtttcaca 10600683  T
Q  503 acaacat 509  Q
     ||||||    
T  10600682 gcaacat 10600676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 195 - 510
Target Start/End: Original strand, 35521423 - 35521740
Alignment:
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||  |||||||  | |||| |||||||| |||||||| | || | ||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||     
T  35521423 aaaatagttctaatcaactcattgacttaggaccctcttctcagattacaatccctaatttcttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagagcgc 35521522  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatcc----attcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||| | ||||||| ||||||| |||||||    |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||    
T  35521523 taaccttatatcacaaataaacaattatccatatattcctagactaaccatgtttatttgaacaaatcaattaggtctaagttgaaagctaggatcagta 35521622  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    ||| |  |||||| |||| ||| | ||||||  | ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |  || |  |||    
T  35521623 gtctttcattctcacgaattcatg-ttatatattatcagtatataaaatacattaagaacaattgaattgagt-aaaactagattgatacccacatgaaa 35521720  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || |||||||||||||||||    
T  35521721 tagagtttcacaacaacatg 35521740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10601036 - 10600876
Alignment:
Q  126 ttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatccct 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||     |||||||     |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10601036 ttcgaatcatcgatgttcccctaattgatatactgcacctatttttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaataatcctaatcaatccct 10600937  T
Q  217 tgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatcttt 277  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10600936 tgagttagaaccctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctagtaatcttt 10600876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 34682762 - 34682622
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatc 274  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  34682762 tagtttcacgatggttaaccaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggactctcttctcagattacagtccctaattcctaaggtgatctaatattc 34682663  T
Q  275 tttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacg 317  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||    
T  34682662 tttg--ggttttaagaacgttaacctgatatcacaaataaacg 34682622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13137082 - 13137019
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc 169  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13137082 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacctattc 13137019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 29440331 - 29440252
Alignment:
Q  431 atataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  29440331 atataaaaagcattaagaacaattaaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 29440252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15470599 - 15470546
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatact 159  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470599 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatact 15470546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11188073 - 11187929
Alignment:
Q  251 aattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattag 350  Q
    |||| |||||||| ||| ||| | || ||||||||| || | |||||  || | |||| | |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |      
T  11188073 aatttcttaggtgctctcatattgttcgaaggtttttagaatgttaatatattctcacaattaaacggttatccattcctagactaaccatgtttaatta 11187974  T
Q  351 aacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 395  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||  |||| |||||||    
T  11187973 aacaattcaattaggtataagttgaaagttaatgtcagtagtcat 11187929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 45499219 - 45499290
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagtttt-gattgcataaaattaaataaac 71  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  45499219 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaac 45499290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 392
Target Start/End: Original strand, 38427436 - 38427478
Alignment:
Q  350 gaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 392  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38427436 gaacaatttaattagatctaagttaaaagctatggtcaatagt 38427478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 40677620 - 40677682
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagtttt-gattgcataaaat 62  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  40677620 ttaatatttaggatgtgtaaattattttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaat 40677682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 76)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 56195788 - 56195273
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||     
T  56195788 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtagttttgattgcataaatttaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaagac 56195691  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||     ||||||||||||||    
T  56195690 aaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagt 56195593  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  56195592 taacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagc 56195493  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  56195492 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagta 56195393  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  56195392 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaa 56195293  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  56195292 tagagtttcacagcaacatg 56195273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 34017643 - 34018157
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||  ||    
T  34017643 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataa-cagaatataaagatagttt-ggaaagaat 34017740  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgata-----gttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||      |||||||||||||    
T  34017741 aag---agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctggttccacgatagt 34017837  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34017838 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaaga 34017937  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  34017938 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagta 34018037  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  34018038 gtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagactgtcattcacaataaa 34018137  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  34018138 tagagtttcacagcaacatg 34018157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 34319777 - 34320293
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  34319777 ttaatatttaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgagacagtagttttgattgcataaaaagtaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaaga 34319874  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatag 189  Q
     |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    ||||||     | |||||||||||    
T  34319875 caaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccttaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatag 34319972  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34319973 ttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactaaagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaag 34320072  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  34320073 aacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagt 34320172  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34320173 agtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataa 34320272  T
Q  490 ataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  34320273 atagagtttcacagcaacatg 34320293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 52530793 - 52531311
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagt--gcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaag 97  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  |||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||      
T  52530793 ttaatatctaagatgtgtaaatttcttttagtttgccctaggcagtagttttgattgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttggaaaga 52530892  T
Q  98 ataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgata 188  Q
    |||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     | ||||||||||    
T  52530893 ataag---agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgata 52530989  T
Q  189 gttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaa 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52530990 gttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaa 52531089  T
Q  289 gtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaa 388  Q
    |   |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  52531090 gagtgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtaaaaagctatggtcaa 52531189  T
Q  389 tagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataata 488  Q
    |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52531190 tagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattcagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaata 52531289  T
Q  489 aataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  52531290 aatagagtttcacagcaacatg 52531311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 3 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 27014522 - 27014009
Alignment:
Q  3 aatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataa 101  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |    
T  27014522 aatatttaggatgtataaattattttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacaaaatataaagatagttttggaaaagaata 27014423  T
Q  102 ggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagtta 192  Q
     ||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||    
T  27014422 agagaga----tgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagtta 27014327  T
Q  193 acaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtac 292  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27014326 acaaaatagtcctaatcaatcctttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaac 27014227  T
Q  293 gttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 392  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  27014226 gttagcctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagt 27014127  T
Q  393 catcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaata 492  Q
    |||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27014126 cattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaata 27014027  T
Q  493 aagtttcacaacaacatg 510  Q
     | |||||||||||||||    
T  27014026 gattttcacaacaacatg 27014009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 509
Target Start/End: Original strand, 19859363 - 19859895
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga- 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||     
T  19859363 ttaatatctaggatgtgtaaattattttagtgtctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaaaatagttttggaaaagaa 19859462  T
Q  99 taag---------------gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga-------- 175  Q
    ||||               ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||            
T  19859463 taagagagagagagagagagagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgatcccctaattggtatactgcacatattcttatgaattatttt 19859562  T
Q  176 -tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatc 274  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859563 ctagttccacgataattaataaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatc 19859662  T
Q  275 tttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtta 374  Q
    ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||      
T  19859663 tttgaaggttt-aagcatgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaacttaattaagtttaagtag 19859761  T
Q  375 aaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagat 474  Q
    ||||||||||||| |||| ||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  19859762 aaagctatggtcagtagttattcattctcactaaatcatgtttatatggtgtcaatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaga- 19859860  T
Q  475 tgtcattcataataaataaagtttcacaacaacat 509  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  19859861 tgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacat 19859895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24150936 - 24150418
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagt-gcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaag 97  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||   |||||||||  |||||||      
T  24150936 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagttgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaatagaatgtaaagatagagttggaaaga 24150837  T
Q  98 ataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgata 188  Q
    ||   ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||    
T  24150836 at---gagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctgtgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgata 24150740  T
Q  189 gttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaa 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24150739 gttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaa 24150640  T
Q  289 gtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaa 388  Q
    | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||     
T  24150639 gaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctggactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcag 24150540  T
Q  389 tagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataata 488  Q
    |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24150539 tagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaata 24150440  T
Q  489 aataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||| ||||||||| |||||||    
T  24150439 aatagagtttcacagcaacatg 24150418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 44808815 - 44809331
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  44808815 ttaatatttaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtagttttgattgcataaaaagtaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaaga 44808912  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatag 189  Q
     ||||||| |||  ||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||    ||||||     |||||||||||||    
T  44808913 caaggagaaaga--tgagatcagatctttcgaatcatcgatgttctcctaattggtatattgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatag 44809010  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44809011 ttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 44809110  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  44809111 aacgttaacctaatatcactaacaaacgatcatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagt 44809210  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44809211 agtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaatgaaattgaataaaaactagattgtcattaataataa 44809310  T
Q  490 ataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  44809311 atagagtttcacagcaacatg 44809331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 53094771 - 53094249
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||    
T  53094771 ttaatatataggatgtgtaaattattttagtgtctgagacagtagtttttattgcataaaattaaataaacagaaaataaatatatttttggaaaagata 53094672  T
Q  101 aggagagagagctgagatcatgtcttt-cgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatatt-----cgaatgat-----agttccacgatag 189  Q
    ||||||||||  |||||||| |||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||     ||||||||     |||| ||||||      
T  53094671 aggagagaga--tgagatcaggtcttttcaaatcctctaagttcccctaattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcacgatga 53094574  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |  |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  53094573 ttaacaaaataggcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcatagtacaacccctaactccttaggtggtctaatactctttgaatgttttatg 53094474  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |    
T  53094473 aacgttaacttaatatcagaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaaactatggtcagt 53094374  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||| ||   ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  53094373 agtaattcgttctcacgaaatcatgtttatatggtgtcaatatataaaaagcattaagaacaatttaattgaataaaaattagattgtcattcacaatag 53094274  T
Q  490 ataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  53094273 atagagtttcacagcaacatgtttc 53094249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 29325085 - 29324571
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||     
T  29325085 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtagttttgattgcataaatttaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaagac 29324988  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |||||     ||||||     ||||||||||||||    
T  29324987 aaggagagagatc--agatcaggtctttcgaatcatcgatgttccc-taattggtatattgcacctattcatattaatgattttctagttccacgatagt 29324891  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||     
T  29324890 taacaaaatagccctaatcaatcccttgagttatgaccattttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagc 29324791  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  29324790 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagta 29324691  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29324690 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaa 29324591  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |  ||||||||| |||||||    
T  29324590 tcgagtttcacagcaacatg 29324571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 103 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 39501810 - 39501394
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||||||    
T  39501810 gagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaa 39501711  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39501710 caaaatagtcctaatcaatcctttgagttaggaccctcttatcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacg 39501611  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  39501610 ttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtc 39501511  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  39501510 attcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 39501411  T
Q  494 agtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||| |||||||    
T  39501410 agtttcacagcaacatg 39501394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 5673157 - 5672628
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||  ||    
T  5673157 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttggaaagaat 5673058  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||| |     ||||||||||||||    
T  5673057 aag---agagagatgcgatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttgtgaatgcttttctagttccacgatagt 5672961  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5672960 taacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaaga 5672861  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||||||||| ||    
T  5672860 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaaactatggtcagta 5672761  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatca-----------cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtc- 478  Q
    |||||  |||||| | ||||||            ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  5672760 gtcattcattctcactaaatcatcactaaatcttgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtca 5672661  T
Q  479 -attcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  5672660 tattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 5672628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 31 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 48637737 - 48637251
Alignment:
Q  31 tgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcg 129  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |  |||||   |||||| |||||||| ||||||||    
T  48637737 tgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatgtaaagatagagttggagagaataag---agagagatgagatcaggtctttcg 48637641  T
Q  130 aatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgag 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |    |||||||     | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48637640 aatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctatgcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgag 48637541  T
Q  221 ttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataa-tctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgat 319  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  48637540 ttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataaatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgat 48637442  T
Q  320 tatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttat 419  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||    
T  48637441 tatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttat 48637342  T
Q  420 atggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  48637341 atttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 48637251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 5670839 - 5670318
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||  ||    
T  5670839 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttggaaagaat 5670740  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||| |     ||||||||||||||    
T  5670739 aag---agagagatgcgatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttgtgaatgcttttctagttccacgatagt 5670643  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5670642 taacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaaga 5670543  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||||||||| ||    
T  5670542 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaatttaattctgtctaagtagaaaactatggtcagta 5670443  T
Q  391 gtcatcaattc-----------tcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtc- 478  Q
    |||||  ||||           || | |||||  ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  5670442 gtcattcattctttctaaatcatcactaaatcttgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtca 5670343  T
Q  479 -attcataataaataaagtttcaca 502  Q
     ||||| |||||||| |||||||||    
T  5670342 tattcacaataaatagagtttcaca 5670318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 40903046 - 40903459
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  40903046 agagagatgagatcaggtctttagaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 40903145  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40903146 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggactctcttctcaaactacagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 40903245  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  40903246 acctaatatcactaataaaggattatcaattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 40903345  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  40903346 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 40903445  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  40903446 ttcacagcaacatg 40903459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 80 - 510
Target Start/End: Original strand, 15812075 - 15812515
Alignment:
Q  80 aagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatga 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    |||||    
T  15812075 aagatagttttggaaaagacaaggagagaga--tgagatcaggtctttcgatacatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatga 15812172  T
Q  176 t-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaa-tcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaa 269  Q
    |     ||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15812173 ttttctagttctacaatagttaacaaaatagtcctaaatcaatctcttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaa 15812272  T
Q  270 taatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtcta 369  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15812273 taatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaaaaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtcta 15812372  T
Q  370 agttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaac 469  Q
    |||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15812373 agtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaac 15812472  T
Q  470 tagattgtcatt--cataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||   |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15812473 tagattgtcattaatataataaatagagtttcacagcaacatg 15812515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 113 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 44164934 - 44164529
Alignment:
Q  113 tgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtc 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||     |||||||||||||||||||||||||||    
T  44164934 tgagatcaagtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcttatgaatgattttatagttccacgatagttaacaaaatagtc 44164835  T
Q  204 ttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaat 303  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||    
T  44164834 ataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacaatccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcaggttaacctaat 44164736  T
Q  304 atcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctc 403  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| |||||||  ||||||    
T  44164735 atcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatagtcagtagtcattcattctc 44164636  T
Q  404 gcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaa 503  Q
     | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||     
T  44164635 actaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaaacattaagaacaattgaaataaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacag 44164536  T
Q  504 caacatg 510  Q
    |||||||    
T  44164535 caacatg 44164529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15432343 - 15431825
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-----gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaa 95  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||     |||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||    
T  15432343 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgcctgaggcagtagttttgatttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatttgtttggaaa 15432244  T
Q  96 agataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacga 186  Q
    |  |||  |||||||  |||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||| ||||||    
T  15432243 a--taataagagaga--tgagactaggtctttcgagtcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagtaccacga 15432148  T
Q  187 tagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 286  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15432147 tagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-ttt 15432049  T
Q  287 aagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtc 386  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||    
T  15432048 aagcacgttaatctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatgatc 15431949  T
Q  387 aatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataa 486  Q
    | |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15431948 agtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattaataa 15431849  T
Q  487 taaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| ||||||||| |||||||    
T  15431848 taaatagagtttcacagcaacatg 15431825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 56199115 - 56198607
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||| || |  |||||||||  |||||||  |||  |||| |||||||||||||||||    
T  56199115 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgagacagtaggttggtgtgcataaaaagtaaataat-agaaaataa-gatagttttggaaaaga 56199018  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatag 189  Q
     |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| | || |         |||||| | |||||    
T  56199017 caaggagagaga--tgaaatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctatttgtattaatcattttctagttctaagatag 56198920  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56198919 ttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctctaactacaacccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 56198820  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  56198819 catgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagt 56198720  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  56198719 agtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaattagattgtcattaataataa 56198620  T
Q  490 ataaagtttcaca 502  Q
    ||| |||||||||    
T  56198619 atagagtttcaca 56198607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 19820886 - 19820474
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  19820886 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctttgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 19820787  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||    
T  19820786 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatctta 19820688  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||| |||| |||||||     
T  19820687 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatagtcagtagtcatt 19820588  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  19820587 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 19820488  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  19820487 ttcacagcaacatg 19820474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 52006494 - 52006906
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  52006494 agagagatgagaccaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 52006593  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |    
T  52006594 aatagtcataatcaatcccttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtca 52006692  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  52006693 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaacctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 52006792  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  52006793 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaaaacattaagaacaatcgaattgaataaaaactagattgtcattcacaatagatagagt 52006892  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  52006893 ttcacagcaacatg 52006906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 50 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 5681637 - 5681182
Alignment:
Q  50 gattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaa 149  Q
    |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||  | ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  5681637 gattgcataaaattaaataa-cataaaataaagatagttttggaaaagataaggagaga----tgagactaggtctttcgaatcatcgatgttcccttaa 5681543  T
Q  150 ttggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaac 240  Q
    ||||||||||  |  |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5681542 ttggtatactgaaactattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaac 5681443  T
Q  241 taaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaacca 340  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||    
T  5681442 tacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctagtatcactaacaaacgattatccattcctacactaacca 5681344  T
Q  341 tgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaac 440  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   || | || |||||| ||||||||    |||  |||||||||     
T  5681343 tgcttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttatggctaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaa 5681244  T
Q  441 cattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcaca 502  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  5681243 cattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaattgagtttcaca 5681182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 80 - 510
Target Start/End: Original strand, 15405020 - 15405460
Alignment:
Q  80 aagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatga 175  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||| |||| |    |||||    
T  15405020 aagatagttttggaaaagacaaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatctaagttcccctaattgatatactgcacctatttgtattaatga 15405117  T
Q  176 t-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaat 270  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15405118 ttttctagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaatccattgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaat 15405217  T
Q  271 aatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatcc---attcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtc 367  Q
    |||  | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15405218 aattctcgaaggtttaaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattcggtc 15405317  T
Q  368 taagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaa 467  Q
    |||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15405318 taagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcacgatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaa 15405417  T
Q  468 actagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15405418 actagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatg 15405460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 33927234 - 33926713
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||  ||||||| || |  |||| |||||||||||||||||    
T  33927234 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtaggttggtgtgcataaaaagtaaataa-cataaaataa-gatagttttggaaaaga 33927137  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatag 189  Q
     |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||     |||||||||||||    
T  33927136 caaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatag 33927039  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||| |||    
T  33927038 ttaacaaaatagccataatcaatcccttgagttaggaccctcttctaaaactacagcccctaattcctcaggtggtctaataattctcaaaggtttaaag 33926939  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |    
T  33926938 cacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaatcatgtttattagaacagttcaattagatctaagtcgaaagctagggtcagt 33926839  T
Q  390 agtca--tca---attctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcat 484  Q
    |||||  |||    ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  33926838 agtcaagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcatcaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattaat 33926739  T
Q  485 aataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  33926738 aataaatagagtttcacaacaacatg 33926713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 48415488 - 48415905
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctat----gttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagtta 192  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    |||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||| ||||||||    
T  48415488 agagagatgagatcaggtctttcgaattatctatatatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagtta 48415587  T
Q  193 acaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtac 292  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48415588 acaaaatagtcctaatcaatcccttgagtcaggactctcttctcaaactacagctcctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaac 48415687  T
Q  293 gttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 392  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  48415688 gttaacctaatatcaataataaatgattatccattcctagactaaccattattattagaaaaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagt 48415787  T
Q  393 catcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaata 492  Q
    |||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48415788 cattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaata 48415887  T
Q  493 aagtttcacaacaacatg 510  Q
     ||||||||| |||||||    
T  48415888 gagtttcacagcaacatg 48415905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 103 - 502
Target Start/End: Original strand, 19864477 - 19864879
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||    ||||||||    
T  19864477 gagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgatcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttc----atagttaa 19864572  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |    
T  19864573 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttagatggtctaataatctttgaaggttt-aagcatg 19864671  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||  ||||||||||||| ||||     
T  19864672 ttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaacttaattaagtttaagtagaaagctatggtcagtagtt 19864771  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||  |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||     
T  19864772 attcattctcactaaatcatgtttatatggtgtcaatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaattaga-tgtcattcacaataaatag 19864870  T
Q  494 agtttcaca 502  Q
    |||||||||    
T  19864871 agtttcaca 19864879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 4 - 395
Target Start/End: Original strand, 40616669 - 40617069
Alignment:
Q  4 atatctaggatttgtaaatta-ttttagt-gcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 100  Q
    |||| |||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||  |||    
T  40616669 atatttaggatgtgtaaatttcttttagttgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttggaaagaata 40616768  T
Q  101 aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagtt 191  Q
    ||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||         ||||||||||||||||    
T  40616769 ag---agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgcttttctagttccacgatagtt 40616865  T
Q  192 aacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagta 291  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40616866 aacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaa 40616965  T
Q  292 cgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatag 391  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||| |||    
T  40616966 cgttaacctaaaatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctctctaagtagaaagctatggtcagtag 40617065  T
Q  392 tcat 395  Q
    ||||    
T  40617066 tcat 40617069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 15429819 - 15430231
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  15429819 agagagatgagatcaggtcttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 15429918  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  15429919 aatagtcttaatccatcccttgacttgggacccacttctcaaactactgcccctaattccttaggtggtctaattatctttgaagg-tttaagcacgtta 15430017  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| ||||| |     
T  15430018 acctaatatcactaaaaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcgtt 15430117  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     ||| ||   |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  15430118 cattttcattaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagatagtcattcacaataaatagagt 15430217  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||||    
T  15430218 ttcacaacaacatg 15430231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 24044104 - 24044516
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  24044104 agagagatgagatcaggtctttgaaattatctatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 24044203  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||    
T  24044204 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggacactcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttaaagg-tttaaacacgtta 24044302  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| | |||| ||     
T  24044303 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtaagtagtaatt 24044402  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  24044403 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 24044502  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  24044503 ttcacagcaacatg 24044516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 47 - 502
Target Start/End: Original strand, 33408223 - 33408685
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  |||| | | |||||||||||| |||| |||||||    
T  33408223 tttgattgcataaaattaaataaacataaaataaagatagttttggaaaatatatggagagtga--tgagtttaggtctttcgaatcctctaagttcccc 33408320  T
Q  147 taattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctca 237  Q
    |||| |||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  33408321 taatcggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatggttaataaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctca 33408420  T
Q  238 aactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaa 337  Q
    ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||    
T  33408421 aactataacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttacgaacgttaacttaatatcacaaataactgattatctattcctagactaa 33408520  T
Q  338 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaa 437  Q
    | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  |||||||    
T  33408521 caatgtttatttgaacaactcaattaggtctaagtagacagctatggtcagtaatcattcattctcactaaatcatgtttatatctgatcaggatataaa 33408620  T
Q  438 aaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcaca 502  Q
    || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33408621 aagcattaagaacaattgagttgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcaca 33408685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 38283452 - 38283864
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    |||||||     ||||||| |||||| |||||    
T  38283452 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattttctagttccatgatagtaaacaa 38283551  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  38283552 aatagtcataatcaatcccttgagttaggactctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt-agcacgtta 38283650  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    | | |||  ||||||||||||| |||||||     
T  38283651 acctaatatcactaacaaaggattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaatattctatcagtagaaagctatggtcagtagtcatt 38283750  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  38283751 cattctcactaaatcaggtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 38283850  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  38283851 ttcacagcaacatg 38283864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 40795161 - 40794748
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||||     |||| ||||||||||||||     
T  40795161 agagagataagatcaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttacacgatagttaacag 40795062  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| | |||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40795061 aatagtcctgatcaattccttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 40794962  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||  |||| |||||||| |||||||     
T  40794961 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtttaagtagaaagttatggtcagtagtcatt 40794862  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  40794861 cattctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaatcgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatagagt 40794762  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  40794761 ttcacagcaacatg 40794748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 47 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 12238479 - 12238022
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata-aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttccc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    |||||  | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  12238479 tttgattgcataaaattaaataa-cataaaataaagatagttttggaaaatatatatgagaga----tgagactaggtctttcgagtcatcaatgttccc 12238385  T
Q  146 ctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctc 236  Q
    |||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  12238384 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctcttctc 12238285  T
Q  237 aaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagacta 336  Q
    | | || |||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  12238284 agattacagtctctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagacta 12238185  T
Q  337 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtca--atatat 434  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  | ||||    
T  12238184 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggagatat 12238085  T
Q  435 aaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcaca 502  Q
    ||||| |||||||||      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12238084 aaaaagcattaagaa-----caattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataaagtttcaca 12238022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 15436433 - 15436845
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  15436433 agagagatgagatcaggtcttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 15436532  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  15436533 aatagtcttaatccatcccttgacttgggacccacttctcaaactactgcccctaattccttaggtggtctaattatctttgaagg-tttaagcacgtta 15436631  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| ||||| |     
T  15436632 acctaatatcaataaaaaacgattatacattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcgtt 15436731  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     ||| ||   |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||    
T  15436732 cattttcattaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagatagtcattcacaataaatagagt 15436831  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||||    
T  15436832 ttcacaacaacatg 15436845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 46955441 - 46955854
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |    ||||||     | ||| ||||||||||||||    
T  46955441 agagagatgagattaggtcttttgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctatttgtattaatgattctctaattcaacgatagttaacaa 46955540  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    |||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  46955541 aatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggactaataatctttgaatgttttaaaaacgtta 46955640  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||| |||||||     
T  46955641 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaaatcgaaagttatggtcagtagtcatt 46955740  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
      ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  46955741 cgttctcactaaatcatgtttatatttgatcataatataaaaagcattaagaacaattaaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagt 46955840  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  46955841 ttcacagcaacatg 46955854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 27677018 - 27677430
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||| | |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||| |||||||||||    
T  27677018 agagagatgagataaggtctatcgaatcatttatgttcctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccaccatagttaacaa 27677117  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27677118 aatagtcctaatcaatcccttgacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 27677216  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  27677217 acctaatatcgctaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttattagaataatttaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 27677316  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
      ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27677317 cgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaacaaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 27677416  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  27677417 ttcacatcaacatg 27677430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 105 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15164353 - 15163938
Alignment:
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaaca 195  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | | | |||||    |||||||     ||||||| |||||||||||    
T  15164353 gagagagatgagatcgggtctttcgaatcatcgatattcctctaattggtatattgcccctattcttatgaatgattatctagttccatgatagttaaca 15164254  T
Q  196 aaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtt 295  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  15164253 aaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttcttaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcagatt 15164154  T
Q  296 aacttaatatcactaataaacgattatcca-ttcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  15164153 aacctaatatcactaacaaacgattatccatttcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctaaggtcagtagtca 15164054  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| | ||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |    
T  15164053 ttcgttctcactaaatcatgattatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaatagaattgaataaaaactagattgtaattcacaataaataga 15163954  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  15163953 gtttcacagcaacatg 15163938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 514
Target Start/End: Original strand, 40493346 - 40493747
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    |||||||     ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40493346 gtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtataccacacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaaaaaaatagtcctaatcaat 40493445  T
Q  213 cccttga-gttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaa 311  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||     || |  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  40493446 cccttgaagttacgaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaa 40493544  T
Q  312 taaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatc 411  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||    
T  40493545 taaaggattatacattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatc 40493644  T
Q  412 acgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgt 511  Q
    | ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  40493645 atgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgt 40493744  T
Q  512 ttc 514  Q
    |||    
T  40493745 ttc 40493747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 12783063 - 12782651
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||     ||||||     |||| ||  | |||||||||    
T  12783063 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcctctaattggtatactgcacctattcttataaatgattttctagtttcattagagttaacaa 12782964  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12782963 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggacccttttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgtta 12782865  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  12782864 acctaatatccctaacaaacgattatccattcatagactaaccctgtttattagaacaattcaattccgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 12782765  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     ||| |  | |||||| ||||||||    |||  |||||||||  |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||    
T  12782764 catttttactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagtattaagaacaactgaaatgaataaaaacaagattgtcactcacaataaatagagt 12782665  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||||    
T  12782664 ttcacaacaacatg 12782651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 498
Target Start/End: Original strand, 37103195 - 37103578
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37103195 gtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaat 37103294  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    || |||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||     
T  37103295 cctttgacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattcctttggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaac 37103393  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
T  37103394 aaacgattatccattcctagactaacc-tgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 37103492  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagttt 498  Q
     ||||||||     ||  ||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  37103493 tgtttatatttgaccaggatatataaagcattaataacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagttt 37103578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 11195836 - 11195421
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||     ||||||||||||||||||    
T  11195836 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaac 11195737  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||    
T  11195736 aaaacagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaatttcttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aggcacgt 11195638  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| || ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  11195637 taacctattatcactaataaatgattattcattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaagtaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtca 11195538  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |    
T  11195537 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcatgatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaaccagattgtcactcacaataaataga 11195438  T
Q  495 g-tttcacaacaacatg 510  Q
    | ||||||| |||||||    
T  11195437 gttttcacagcaacatg 11195421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 104 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 21419949 - 21419534
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    |||||||     ||||| ||||||||||||    
T  21419949 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtataccacacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaac 21419850  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||     || |   ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||    
T  21419849 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctagggttacatcacctaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgt 21419751  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||     
T  21419750 taacctaatatcactaataaaagattatccattcctagactaaccatgcttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcg 21419651  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
        ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  21419650 ctcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataga 21419551  T
Q  495 gtttcacaacaacatgt 511  Q
    |||||||| ||||||||    
T  21419550 gtttcacagcaacatgt 21419534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 128 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 3719260 - 3718878
Alignment:
Q  128 cgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttg 218  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3719260 cgaatcatccatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgatttgctagttccacaatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttg 3719161  T
Q  219 agttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacga 318  Q
      |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3719160 gcttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaa-gatttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacga 3719062  T
Q  319 ttatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgttta 418  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || ||||  |||||| | |||||| |||||    
T  3719061 ttatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagctatggtcagtaatcattcattctcactaaatcatgttta 3718962  T
Q  419 tatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcaca 502  Q
    |||    |||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  3718961 tatttgatcaggatataaaaagtattaagaacaattgaattgaataaaaactagattttcattcacaataaatagagtttcaca 3718878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 47 - 422
Target Start/End: Original strand, 3797718 - 3798095
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccc 146  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||||    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3797718 tttgattgcataaaattaaataa-cagaaaataac-atagttttggaaaagata----gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccc 3797811  T
Q  147 taattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctca 237  Q
    ||||||||||||| ||| |||||     ||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3797812 taattggtatactgcacctattcttattaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagaccctcttctca 3797911  T
Q  238 aactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaa 337  Q
     |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||    
T  3797912 cactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagattaa 3798010  T
Q  338 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatg 422  Q
    || ||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||||  ||||||   |||||| |||||||||    
T  3798011 ccctgtttattagaacaattcaattctgtctaaatagaaagctatggtcagtagtcattcattctcattaaatcatgtttatatg 3798095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 77 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 18911683 - 18911368
Alignment:
Q  77 ataaagatagttttggaaaagata-aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----ga 171  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||    
T  18911683 ataaagatagttttggaaaatatatatgagaga----tgagactaggtcttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatga 18911588  T
Q  172 atgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtc 266  Q
    |||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18911587 atgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtc 18911488  T
Q  267 taataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggt 366  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18911487 taataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctattatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggt 18911389  T
Q  367 ctaagttaaaagctatggtca 387  Q
    ||||||  ||||||| |||||    
T  18911388 ctaagtcgaaagctagggtca 18911368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 106 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 49270837 - 49270456
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    |||||||     ||||| ||||||||||||||    
T  49270837 agagagatgagatca-gtctttcgaatcatctatattctcctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattatctagttcaacgatagttaacaa 49270739  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||    
T  49270738 aatagtcctaatcaatcc-ttgagttaggaccctcttctcaaactacagtccctaattccctaggtggtctaataat---tgaaggttttaagaatgtta 49270643  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||     
T  49270642 acctaatatcactaacaaacgattattcattcatatactaaccatgtttatgagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatgatcagtagtcatt 49270543  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaag---aaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattca 483  Q
      ||||| | |||||| |||||||   | | |  ||||||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49270542 cgttctcactaaatcatgtttata---tttgagaatataaaaagcattaagaacaataattgaattgaataaaaactagattgtcattca 49270456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 178 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 35510042 - 35509707
Alignment:
Q  178 gttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatcttt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35510042 gttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataaccatt 35509943  T
Q  278 gaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaa 377  Q
     ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  35509942 aaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaacgatgtttattagaacaattcaattaggtctaattcgaaa 35509844  T
Q  378 gctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgt 477  Q
    |||| ||||| |||||||   ||||  | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  35509843 gctagggtcagtagtcattcgttcttactaaatcatgtttatatttaatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattat 35509744  T
Q  478 cattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  35509743 cattcacaataaatagagtttcacatcaacatgtttc 35509707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Original strand, 18673043 - 18673450
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||| ||     |||||  ||||||||||||    
T  18673043 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaac 18673142  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  18673143 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 18673241  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  18673242 taacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattacgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtca 18673341  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||           |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  18673342 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcatt-----------aattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataga 18673430  T
Q  495 gtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  18673431 gtttcacagcaacatgtttc 18673450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 122 - 514
Target Start/End: Original strand, 29544853 - 29545253
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||| ||||     |||||||     ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29544853 gtctttcgaatcatcgatgttcctctaattggtatattgcacctattattgtgaatgattaactagttccacgatagttaacaaaatagccctaatcaat 29544952  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    ||||||||||| |||  |||| |     || |  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||    
T  29544953 cccttgagttatgactctcttatagggttacaacccctaattccttaggaggtctaataacctttgaaggttt-aagcacattaacctaatatcactaat 29545051  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||||   ||||| | ||||||    
T  29545052 aaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtgtaagtcaaaagttagggccagtagtcattcgttctcactaaatca 29545151  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtt 512  Q
     ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29545152 tgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatgtt 29545251  T
Q  513 tc 514  Q
    ||    
T  29545252 tc 29545253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 176 - 514
Target Start/End: Original strand, 8874803 - 8875141
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||| | |||||||||  |||| |||| ||| |||||||  | || || ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8874803 tagtttcaagatggttaacaaaatagccataatcaatcgattgacttagaaccctcttctccgattacagcccctaattccttaggtggtctaatattct 8874902  T
Q  276 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaa 375  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  8874903 ttgaaggttttaagaacattaacttaatataacaaataaacgactatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttga 8875002  T
Q  376 aagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagatt 475  Q
    |||||||||||  |||||||  |||||| | |||| | ||||||||    ||||   ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8875003 aagctatggtcggtagtcattcattctcactaaattatgtttatatttgatcaagtgataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagatt 8875102  T
Q  476 gtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  8875103 gtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatttttc 8875141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Original strand, 53009519 - 53009937
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||    
T  53009519 agagagagatgagtttaggtcttttgaatcgtctatgttcccctaattagtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttccacgatagttaac 53009618  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||     || || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||    
T  53009619 aaaatagtcctaattaatctcttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaatttcttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgt 53009717  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  53009718 taacctaatatcactaataaatggttataaattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtca 53009817  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |    
T  53009818 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagtattaagaacaattgaattgaataaaacctagattatcattcacaataaataga 53009917  T
Q  495 gtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  53009918 gtttcacagcaacatgtttc 53009937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 105 - 514
Target Start/End: Original strand, 8877462 - 8877881
Alignment:
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc-----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||| ||| ||||      ||||||     ||||| |||||| ||||||    
T  8877462 gagagagatgagatcaggtctttcaaatcatctaagttcccctatttagtatactgcacctatttcttatgaatgactctctagtttcacgatggttaac 8877561  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||||  |  | |  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  8877562 aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggactctcttctccgatcacaacccctaatttcttaggtggtctaatattctttgaaggttttaagaatgt 8877661  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8877662 taacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaaatctaagttgaaagctatggtcagtagtca 8877761  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |  |||| | | |||||| ||||||||    | |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  | |||| ||| |    
T  8877762 ttcattcccactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaacttgattgtcatctacaatagataga 8877861  T
Q  495 gtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  8877862 gtttcacagcagcatgtttc 8877881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 25962219 - 25961800
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||||    |||||||     ||||| ||||||||||||    
T  25962219 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatcgatgttctcctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaac 25962120  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaa-taatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || ||||||||||||||||||||||| ||| | | ||| |||| ||| |||    
T  25962119 aaaatattcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaaataaccgtcgaatgttt-aagcacg 25962021  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  25962020 ttaagctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtc 25961921  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||   |||||   ||||||  |||||||    |||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     
T  25961920 attcgttctcattaaatcatttttatatttgatcaggatataaaaagctttaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaattaatat 25961821  T
Q  494 agtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  25961820 agtttcacagcaacatgtttc 25961800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 30392729 - 30392315
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||     |||||||     ||||||||||||||||||    
T  30392729 agagagagatgagtttaggtctttccaatcatatatgttcccctaattggtatattgcacctatttttatgaatgattcgctagttccacgatagttaac 30392630  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    |||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||||||     || |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30392629 aaaataatcctaatcaatcccttgaattaggaccctcttctagggttacaacccctaattcctaaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgt 30392531  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||    
T  30392530 taacctaatatcactaataaagtattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaattcaaaagctagggtcagtagtca 30392431  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | ||||||  |||||||    | || ||||||||| ||||    | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30392430 ttcgttctcactaaatcatatttatatttgattaagatataaaaagcatt----acaattgagatgaataaaaactagattgtcattcataataaataga 30392335  T
Q  495 gtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  30392334 gtttcacagcaacatgtttc 30392315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 183 - 510
Target Start/End: Original strand, 22172422 - 22172751
Alignment:
Q  183 acgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaag 281  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||||| |||| ||||    
T  22172422 acgatagttaactaaaatagccataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacagtccctaattccttaggtgaactaatattcttcgaag 22172521  T
Q  282 gttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagcta 381  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22172522 gttttaagaacgttaacctaatatcgcaaataaacgattatccattcatagactaaccctgtttatttgaacaattcaataaggtctaagttgaaagcta 22172621  T
Q  382 tggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcatt 481  Q
    |||||| || ||||  |||||| |||| ||| | |||||||   ||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||  |||    
T  22172622 tggtcagtaatcattcattctcacgaattcatg-ttatatgtgatcagtatataaaaatcattaataacaattgaattgaatcaaaactatattgatatt 22172720  T
Q  482 cata-at-aaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||| || ||| | |||||||||||||||||    
T  22172721 catatatgaaacagagtttcacaacaacatg 22172751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 253 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 19827492 - 19827236
Alignment:
Q  253 ttccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaa 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19827492 ttccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaa 19827394  T
Q  353 caattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaa 452  Q
    |||||| |||  ||||||||  ||||||||||| | |||||||  |||||| | |||||| |||| |||    |||  ||||||||| ||||||||| ||    
T  19827393 caattccattcagtctaagtagaaagctatggttagtagtcattcattctcactaaatcatgtttgtatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaa 19827294  T
Q  453 ttgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  19827293 ttgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 19827236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 190 - 421
Target Start/End: Original strand, 15446792 - 15447022
Alignment:
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  15446792 ttaaccaaatagttataatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtccaataatcttagaaggttt-aag 15446890  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| |||||||| |    
T  15446891 cacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagactaaccctgtttattagaacaattcaattcagtctaagtagaaagttatggtcagt 15446990  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatat 421  Q
    ||| ||  |||||| | |||||| ||||||||    
T  15446991 agtaattcattctcactaaatcatgtttatat 15447022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 195 - 510
Target Start/End: Original strand, 37739820 - 37740136
Alignment:
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |    
T  37739820 aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttatcagattactgtccctaattccttaggtgatctaataatctttgaaggttttacaaacat 37739919  T
Q  295 taac---ttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatag 391  Q
    ||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||    
T  37739920 taacctaataatatcacaaataaacgattatccattcatagattaacccagtttatttgaaaaattcgattaggtctaagttgaaagctatggttagtag 37740019  T
Q  392 tcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaat 491  Q
    ||||  |||||| |||||||| ||||||||    | |  ||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||| |||    
T  37740020 tcattcattctcacgaaatcatgtttatatttgattagaatataaaaagcattaacaacaattgaattgaat-aaaactagattaatattcacaat-aat 37740117  T
Q  492 aaagtttcacaacaacatg 510  Q
    | |||||||||||||||||    
T  37740118 agagtttcacaacaacatg 37740136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5706656 - 5706347
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||| |||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  5706656 ttaatatctaagatgtgtaaatttcttttaatgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaata 5706557  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatag 189  Q
    ||    ||||||  |||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||    
T  5706556 tatatggagaga--tgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatag 5706459  T
Q  190 ttaacaaaata-gtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataa-tctttg-aaggtttt 286  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||    
T  5706458 ttaacaaaataagtcctaatcaatcccttgagttaggacactcttctcagattacagtccctaattccttaggtgagctaataattctttgtaaggtttt 5706359  T
Q  287 aag-tacgttaa 297  Q
    ||| ||||||||    
T  5706358 aagctacgttaa 5706347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 247 - 421
Target Start/End: Original strand, 27679338 - 27679511
Alignment:
Q  247 ccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgttta 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  27679338 ccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgttta 27679436  T
Q  347 ttagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatat 421  Q
    ||||||||||||||||  || |||||  ||||||||| ||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    
T  27679437 ttagaacaattcaattctgtataagtagaaagctatgttcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatat 27679511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 195 - 395
Target Start/End: Original strand, 33493756 - 33493956
Alignment:
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| || | ||| |||| | |||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||    
T  33493756 aaaatagtcctatttaattccttaacttaggaccatcttctcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaatgtttaaagaacgt 33493855  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| || |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||    
T  33493856 taacatattatcacaaataaacgattatctattcctagactaactctgtttatttgaacaattcaattaggtctaaattgtaagctatggtcagtagtca 33493955  T
Q  395 t 395  Q
    |    
T  33493956 t 33493956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 249 - 510
Target Start/End: Original strand, 48014167 - 48014424
Alignment:
Q  249 ctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttatt 348  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  48014167 ctaattccttaggtgatctaatattatttgaaggttttaagaacgttaacctaatgtcacaaataaacgattatccattcctaaactaaccctgtttatt 48014266  T
Q  349 agaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaaga 448  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |||| ||  |||||| |||| |||  |||||||    |||    ||||||| ||||||||    
T  48014267 tgaacaattcaattaggtcaaagttgaaagttatggtcagtagttattcattctcacgaattcatatttatatttgatca--ggataaaaagcattaaga 48014364  T
Q  449 aaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||  ||| | ||| |||| ||||||||| |||||||    
T  48014365 acaattgaattgaat-aaaactagattgatattgacaat-aatatagtttcacagcaacatg 48014424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 338 - 513
Target Start/End: Original strand, 8448745 - 8448921
Alignment:
Q  338 ccatgtttattagaacaattcaatt-aggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataa 436  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||  |||||||||  || |||||||  |||||  |||||| | ||||||||    |||| ||||||    
T  8448745 ccatgtttatttgagcaattcaatttaggtctaagtagaaagctatgaccagtagtcattcattcttacgaaatgatgtttatatttgatcaagatataa 8448844  T
Q  437 aaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgttt 513  Q
    ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8448845 aaagcattaacaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacatcaacatgttt 8448921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 195 - 319
Target Start/End: Original strand, 5677470 - 5677594
Alignment:
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  5677470 aaaatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccatcttctcagattacagtccctaattccttaagtgatctaatattctttgaaggttttaaggacgt 5677569  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgat 319  Q
    |||| |  |||||| |||| |||||    
T  5677570 taaccttgtatcacaaatatacgat 5677594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 103 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39498471 - 39498346
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaa 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||||     ||||||||||||||||||    
T  39498471 gagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctaagttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaa 39498372  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttga 219  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  39498371 caaaatagtcctaatcaatcccttga 39498346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 111
Target Start/End: Original strand, 19864256 - 19864367
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagtttt-gattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||     
T  19864256 ttaatatctaggatgtgtaaattattttagtgccagaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaaaatagttttggaagagag 19864355  T
Q  100 aaggagagagag 111  Q
    |  |||||||||    
T  19864356 agagagagagag 19864367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 433 - 510
Target Start/End: Original strand, 27691442 - 27691519
Alignment:
Q  433 ataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  27691442 ataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 27691519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15438518 - 15438439
Alignment:
Q  431 atataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  15438518 atataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatg 15438439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 169
Target Start/End: Original strand, 15445328 - 15445391
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc 169  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15445328 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattc 15445391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19827574 - 19827511
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc 169  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19827574 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtataatgcacatattc 19827511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18911366 - 18911300
Alignment:
Q  444 taagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  18911366 taagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 18911300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 104 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 35510152 - 35510044
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||     |||||||||| ||||||||    
T  35510152 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatattcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattcactagttccacgttagttaac 35510053  T
Q  195 aaaatagtc 203  Q
    |||||||||    
T  35510052 aaaatagtc 35510044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 332 - 372
Target Start/End: Original strand, 24410206 - 24410246
Alignment:
Q  332 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 372  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24410206 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 24410246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 22172234 - 22172333
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagta-gttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||  |||||| || ||  ||||||||  |||||||||||||    
T  22172234 ttaatatgtaggatgtgtaaattattttagtgcccgaggcagtatgttttgtgtgcataaatgtaaatagacggaaaataaagat-tttttggaaaagat 22172332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 159
Target Start/End: Original strand, 8871727 - 8871781
Alignment:
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatact 159  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  8871727 gagagagatgagatcaggtctttcaaatcatctaagttcccttaattggtatact 8871781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 426 - 510
Target Start/End: Original strand, 5677700 - 5677783
Alignment:
Q  426 tcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| | ||||||||||||  ||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  5677700 tcaatatataaaaagcattaagaacagatgaattgagt-aaaactagattgatattcacaggaaatagagtttcacaacaacatg 5677783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 50)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 26752561 - 26753077
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||  ||    
T  26752561 ttaatatctaagatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggtagtggttttgattgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttggaaagaat 26752660  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||    |||||||     ||||||||||||||    
T  26752661 aag---agagagatgagatcaggtctttcgaatcatttatgttcccctaattggtatactgcaccttttcttatgaatgattttctagttccacgatagt 26752757  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26752758 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaaga 26752857  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  26752858 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagta 26752957  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    || ||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26752958 gtaattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaa 26753057  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  26753058 tagagtttcacagcaacatg 26753077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 7625365 - 7624849
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  7625365 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtagttttgattgcataaaaagtaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaaga 7625268  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatag 189  Q
     |||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    ||||||     |||||||||||||    
T  7625267 caaggagagaga--tgagatcaggtctttcaaatcatcgatgttcccctaattggtatactacacctatttgtattaatgattttctagttccacgatag 7625170  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||    
T  7625169 ttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggactctcttctcaaactacagcctctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaag 7625070  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  7625069 cacgttaacctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagt 7624970  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7624969 agtcatttgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataa 7624870  T
Q  490 ataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  7624869 atagagtttcacagcaacatg 7624849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 14015999 - 14016514
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||     
T  14015999 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtagttttgattgcataaatttaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaagac 14016096  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||    ||||||     ||||||||| ||||    
T  14016097 aaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatagtgcacctattcgtattaatgattttctagttccacggtagt 14016194  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||| |||||||||| |||||||  | |||||||| |||     
T  14016195 taacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaatttcttaggtggtttaataattctcgaaggtttaaagc 14016294  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  14016295 actttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagta 14016394  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14016395 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaa 14016494  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  14016495 tagagtttcacagcaacatg 14016514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 41 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 43491978 - 43491498
Alignment:
Q  41 agtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatg 140  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43491978 agtagttttgattgcataaaattaaataaatagaaaataaagatagttttggaaaagaataagagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatctatg 43491881  T
Q  141 ttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttc 231  Q
    |||||||||| |||||| | ||  ||||     |||||||     ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  43491880 ttcccctaatcggtatattgcatctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttagaaccctc 43491781  T
Q  232 ttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcata 331  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  43491780 ttctcaaactagaccccctaattccttaggtggtttaataatctttgaagattttatgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattccta 43491681  T
Q  332 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaata 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||| | ||||||  |||||||    |||  |    
T  43491680 gactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcagga 43491581  T
Q  432 tataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43491580 tataaaaagcattaataacaattgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatgtttc 43491498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 25 - 510
Target Start/End: Original strand, 41306411 - 41306902
Alignment:
Q  25 ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtc 124  Q
    |||||||||  |||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||  |||    
T  41306411 ttttagtgcgtgaggcagtaggttggtttgcataaaattaaataaacagaaaataaagataattttggaaaagataaagagagaga--taagatcgggtc 41306508  T
Q  125 tttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatccc 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41306509 tttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccc 41306608  T
Q  216 ttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaa 315  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||| |||    
T  41306609 ttgagttaggaccctcttttcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcatgttaacctaatatcactaacaaa 41306707  T
Q  316 cgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgt 415  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||    |||||| ||    
T  41306708 cgattatccatacctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattcttattaaatcatgt 41306807  T
Q  416 ttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  41306808 ttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaattagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 41306902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 41876727 - 41877140
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||         |||||||||||||||||||||    
T  41876727 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaa 41876826  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41876827 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 41876926  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  41876927 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 41877026  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
      ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  41877027 ctttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaaaaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 41877126  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  41877127 ttcacagcaacatg 41877140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 18952854 - 18952440
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||     ||||||||||||||||||    
T  18952854 agagagagatgagatcaaatctttcaaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaac 18952755  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  18952754 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgt 18952656  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  18952655 taacctaatatcactaacaaacaattatccattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaagtcgaaagctatggtcattagtca 18952556  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  18952555 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaaaaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataga 18952456  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  18952455 gtttcacagcaacatg 18952440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 47 - 507
Target Start/End: Original strand, 22936842 - 22937310
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatga-taaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttccc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||    ||||||  |||||  | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  22936842 tttgattgcataaaattaaataaacagaaaaataaagatagttttggaaaatatatatggagaga--tgagactaggtctttcgagtcatcaatgttccc 22936939  T
Q  146 ctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctc 236  Q
    |||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22936940 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatccctttagttaggaccctcttctc 22937039  T
Q  237 aaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagacta 336  Q
    | | || ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22937040 agattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagacta 22937139  T
Q  337 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataa 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||    
T  22937140 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataa 22937239  T
Q  437 aaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaac 507  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  22937240 aatgcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaac 22937310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 113 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 7271168 - 7270763
Alignment:
Q  113 tgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtc 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||| ||||||||||||||||||     
T  7271168 tgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagtt 7271069  T
Q  204 ttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaat 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||| |  |||    
T  7271068 ctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctgataatctttgaagg-tttaaacacgttagcccaat 7270970  T
Q  304 atcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctc 403  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  7270969 atcactaacaaacgattatccattcatagactaaccatgtttgttagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctc 7270870  T
Q  404 gcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaa 503  Q
     | |||||| ||||||||     ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7270869 actaaatcatgtttatatttgaccaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaatagaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaa 7270770  T
Q  504 caacatg 510  Q
    |||||||    
T  7270769 caacatg 7270763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 17664710 - 17664299
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcga---atgat-----agttccacgatagttaacaaa 197  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |   |||||     |||||||||||||||||||||    
T  17664710 agagagatgagatcaggtcttttgaattatctatgttcccctaattggtatactgcacctattctatgtatgattcactagttccacgatagttaacaaa 17664611  T
Q  198 atagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaa 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | | || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17664610 atagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctaagattacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaa 17664512  T
Q  298 cttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatca 397  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||      
T  17664511 cctaatatcactaataaaggattatcgattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattc 17664412  T
Q  398 attctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtt 497  Q
     ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  17664411 gttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtt 17664312  T
Q  498 tcacaacaacatg 510  Q
    ||||| |||||||    
T  17664311 tcacagcaacatg 17664299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 104 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 20055935 - 20055522
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||    
T  20055935 agagagatatgagatgaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaac 20055836  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  20055835 aaaataatcctaatcaatcccgtgagttaggaccgtcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-ttaaagcacgt 20055737  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  20055736 taacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtca 20055637  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |    
T  20055636 ttctttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaacttgattgtcattcacgataaataga 20055537  T
Q  495 gtttcacaacaacat 509  Q
    |||||||| ||||||    
T  20055536 gtttcacagcaacat 20055522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 47 - 510
Target Start/End: Original strand, 21332586 - 21333057
Alignment:
Q  47 tttgattgca-taaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttccc 145  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||  | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21332586 tttgattgcaataaaagtaaataa-cagaaaataaagatagttttggaaaggaataagagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatctatgttccc 21332682  T
Q  146 ctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctc 236  Q
    |||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||| |||| ||| |||||||    
T  21332683 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaataaaatagtcctaatcaattcattgacttagaaccctcttctc 21332782  T
Q  237 aaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagacta 336  Q
    |||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21332783 aaactacagcccctaattccttagatgatctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcatagacta 21332881  T
Q  337 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca--cgtttatatggtgtcaatatat 434  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |||||||  |||||| | ||||||    |||||||    |||  ||||    
T  21332882 accctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatagtcagtagtcatttattctcactaaatcatctttttatatttgatcatgatat 21332981  T
Q  435 aaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21332982 aaaaagcattaagagcaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatg 21333057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 52 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 31863925 - 31863442
Alignment:
Q  52 ttgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaatt 151  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||  |||||||  |||||   |||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31863925 ttgcataaaattaaataaacataatataaagatagagttggaaagaataag---agagagatgagactaggtctttcgaatcatctatgttcccctaatt 31863829  T
Q  152 ggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaacta 242  Q
    | |||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31863828 gatatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggatcctcttctcaaacta 31863729  T
Q  243 aagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaac--------------gattatccattc 328  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||              ||||||||||||    
T  31863728 tagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgatcactaacaaatgattatccattc 31863629  T
Q  329 atagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtca 428  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||    
T  31863628 ctagactaaccatgtttattagaataattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatca 31863529  T
Q  429 atatataaaaacca-ttaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
      ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31863528 ggatataaaaagcatttaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataaagtttcacagcaacatgtttc 31863442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 47 - 501
Target Start/End: Complemental strand, 42063137 - 42062677
Alignment:
Q  47 tttgattgca-taaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata-aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcc 144  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    |||||  | |||||| |||||||||||||| |    
T  42063137 tttgattgcaataaaagtaaataa-cagaaaataaagatagttttggaaaatatatatgagaga----tgagactaggtcttttgaatcatctatgtttc 42063043  T
Q  145 cctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttct 235  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42063042 cctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatctcttgagttaggaccctcttct 42062943  T
Q  236 caaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagact 335  Q
    || | || ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  42062942 catattacagtccctaattccttaggtgaactaatattctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagact 42062843  T
Q  336 aaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatata 435  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    | |  |||||    
T  42062842 aaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgattaggatata 42062743  T
Q  436 aaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcac 501  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  42062742 aaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcac 42062677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Original strand, 26895565 - 26895979
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| |||||    |||||||     ||||| |||||| |||||    
T  26895565 agagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatgttgcacctattcttatgaatgattttttagttcaacgataattaac 26895664  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  26895665 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaagactctcttctcaaactacagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgt 26895763  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  26895764 taacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtca 26895863  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
        ||||| | |||||| ||||||||    |||| ||||||||| ||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| |    
T  26895864 atcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaactgaattaaatagaaactagattgtcattcacaataaataga 26895963  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  26895964 gtttcacagcaacatg 26895979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 113 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 33552273 - 33551868
Alignment:
Q  113 tgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtc 203  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     | |||||||||||||||||||||||||    
T  33552273 tgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatagttaacaaaatagtc 33552174  T
Q  204 ttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaat 303  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||    
T  33552173 ataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaagtggtcta-taatctttgaaggttt-aagcacattaacctaat 33552076  T
Q  304 atcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctc 403  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||| ||    
T  33552075 atcactaacaaacgattatccattcctagactgaccatatttgttagaacaattcaattaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattatc 33551976  T
Q  404 gcgaaatcacgtttatatggtg-tcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcaca 502  Q
     | |||||| ||||||||  || |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33551975 actaaatcatgtttatattttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatagagtttcaca 33551876  T
Q  503 acaacatg 510  Q
     |||||||    
T  33551875 gcaacatg 33551868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 34831923 - 34831510
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||| | |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||| |||||  ||||         |||||||||||||||||||||    
T  34831923 agagagatgagattaggtctttcgaatcttctgagttcccctaattggtataatgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaa 34831824  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  34831823 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 34831725  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  34831724 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 34831625  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatat-aaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaag 495  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  34831624 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggaaataaaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagag 34831525  T
Q  496 tttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||| |||||||    
T  34831524 tttcacagcaacatg 34831510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 77 - 510
Target Start/End: Original strand, 21335634 - 21336073
Alignment:
Q  77 ataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaa 172  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | | ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    |||    
T  21335634 ataaagatagttttggaaaggaataagcgagaga--tgagaccaagtctttcgaatcatctatgttcccctaatttgtatactgcacctattcttatgaa 21335731  T
Q  173 tgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtct 267  Q
    ||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  21335732 tgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcctttgacttagaaccgtcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatct 21335831  T
Q  268 aataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtc 367  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21335832 aataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccatttatagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtc 21335930  T
Q  368 taagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaa 467  Q
    |||||  |||| ||| |||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||    
T  21335931 taagtagaaagttatagtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagagcaattgaattgaattaaa 21336030  T
Q  468 actagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  21336031 actatattgttattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 21336073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Original strand, 34132944 - 34133362
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||| ||     |||||  ||||||||||||    
T  34132944 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaac 34133043  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  34133044 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 34133142  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  34133143 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtca 34133242  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  34133243 ttcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataaa 34133342  T
Q  495 gtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  34133343 gtttcacagcaacatgtttc 34133362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Original strand, 34143175 - 34143593
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||| ||     |||||  ||||||||||||    
T  34143175 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaac 34143274  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  34143275 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 34143373  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  34143374 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtca 34143473  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  34143474 ttcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataaa 34143573  T
Q  495 gtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  34143574 gtttcacagcaacatgtttc 34143593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 103 - 514
Target Start/End: Original strand, 26907415 - 26907834
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||| |||||||||||    
T  26907415 gagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcattagttctacgatagttaa 26907514  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || |  |  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||    
T  26907515 caaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacctgtaattccttaggtggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacg 26907613  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  26907614 ttaacctaatatcaccaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaagtctaagtcgaaagctagggtcagtagtc 26907713  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||   ||||| | |||||| ||||||||    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  26907714 attcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaattaaaactagattgtcattcacaataaatag 26907813  T
Q  494 agtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26907814 agtttcacaacaacatgtttc 26907834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 12088119 - 12087701
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||| ||     |||||  ||||||||||||    
T  12088119 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaac 12088020  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  12088019 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 12087921  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  12087920 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctatggtcagtagtca 12087821  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||    
T  12087820 ttcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataaa 12087721  T
Q  495 gtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  12087720 gtttcacagcaacatgtttc 12087701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 122 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 40583392 - 40582996
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40583392 gtctttcgaatcctcgatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctataattccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaat 40583293  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||     
T  40583292 cccttgagttatgaccctcttcttaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaag 40583194  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||| | ||||||    
T  40583193 aaacgattatctattcctagactaaccatctttattagaacaatttaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatca 40583094  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
      |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  40583093 tatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 40582996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 61 - 514
Target Start/End: Original strand, 14375715 - 14376189
Alignment:
Q  61 attaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatacta 160  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||    ||||||  |||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  14375715 attaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaatatatatggagaga--tgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaattggtatactg 14375812  T
Q  161 cacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggacctt-------------cttctcaa 238  Q
    ||| ||||     |||||||     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||             || |||||    
T  14375813 cacctatttttatgaatgattttctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccttgagttaggaccctctactcaa 14375912  T
Q  239 actaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaac 338  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  14375913 actacagaccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactagcaaacgattatccattcctagactaac 14376011  T
Q  339 catgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaa 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  |||||| |    
T  14376012 catgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaca 14376111  T
Q  439 accattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtt--tcacaacaacatgtttc 514  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  14376112 agcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcgcaataaataaagtttctcacagcaacatgtttc 14376189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 122 - 510
Target Start/End: Original strand, 4099496 - 4099897
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  4099496 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttgcacgatagttagcaaaatagtcataatcaat 4099595  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||     
T  4099596 cccttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattctttaggtggtctaataatatttgaagattt-aagcacgttaacctaatatcactaac 4099694  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
T  4099695 aaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtataagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 4099794  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaa-----aaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaac 507  Q
     ||||||||    |||  ||||||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  4099795 tgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaac 4099894  T
Q  508 atg 510  Q
    |||    
T  4099895 atg 4099897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 513
Target Start/End: Original strand, 18239373 - 18239874
Alignment:
Q  7 tctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggaga 106  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||           
T  18239373 tctaggatgtgtaaattattttggtgcctaaggcagtagatttgattgcataaaatgaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaagat------- 18239465  T
Q  107 gagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatatt-----cgaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
           |||| || |||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| ||| ||||     ||||||||     |||| ||||||| |||||||    
T  18239466 -------gagaacaggtctttcgaatcctctgagttcccctaattggtgtactgcacctatttctttcgaatgattctctagtttcacgataattaacaa 18239558  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||| ||| | ||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18239559 aatagccctaatcaatcccttgacttaggacccccttgtcagagtaaaacccctaatttcttaggtggtctaatactctttgaaggttttaagaacgtta 18239658  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||     
T  18239659 acttaatattacatataaacgattatccattcctagactagccttgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttcaaagctatggtcagtagtcatt 18239758  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| |||||||| ||||||||  ||  |  ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||    
T  18239759 cattctcacgaaatcatgtttatat-ttgataggatataaaaagcatgaagaacaattgaatttaataaaaagtagattttcattcacaatagatagagt 18239857  T
Q  497 ttcacaacaacatgttt 513  Q
    ||||||| |||||||||    
T  18239858 ttcacaataacatgttt 18239874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Original strand, 12058453 - 12058867
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||| ||     |||||  ||||||||||||    
T  12058453 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtccctagttttacgatagttaac 12058552  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  12058553 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 12058651  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  12058652 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtttaagtcgaaagctatggtcagtagtca 12058751  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | ||||||  |||||||     ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||| |    
T  12058752 ttcgttctcactaaatcatatttatatttgaccaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagaatgtcattcacaaataataga 12058851  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  12058852 gtttcacagcaacatg 12058867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 205 - 489
Target Start/End: Complemental strand, 2837355 - 2837071
Alignment:
Q  205 taatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaata 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||    
T  2837355 taatcaatcccttgatttaggaccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttatgaacgttaacctatta 2837256  T
Q  305 tcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcg 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||      
T  2837255 tcactaataaacgattatccattcataaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtcattcattctga 2837156  T
Q  405 cgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    | |||||| ||||||||    ||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2837155 ctaaatcatgtttatatttgatcgggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa 2837071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 106 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 39192489 - 39192095
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-------agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | ||| |||||    |||||||       |||| |||||||||||||    
T  39192489 agagagatgagatcagatctttcgaatcatcaatgttcccctaattgatataatgcacgtattcttatgaatgattctctctagttgcacgatagttaac 39192390  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || |    
T  39192389 aaaatagtcataatcaatcccttgagttaagaccctcttcttaaactacaacccctaattccttaggtggtataataatctttcaaggttt-aagcacat 39192291  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  39192290 taacctaatatcactaacaaacgattatctattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattagatctaggtcgaaagctatggtcaatagtca 39192191  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |   |||||   ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  39192190 tttgttctcattaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaattagattatcattcacaataaa 39192095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 123 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 17748582 - 17748187
Alignment:
Q  123 tctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatc 213  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||     ||||||     |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17748582 tcttccgaatcatctatgttcccctaattggtataccgcacctatttttgtgaatgagtccctagtttaacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatc 17748483  T
Q  214 ccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaata 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||     || || |||||||| |||| ||| |||||||| | | |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17748482 ccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaatttcttaagtgatctaataaccgtcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaata 17748384  T
Q  314 aacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcac 413  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||| | ||||||     
T  17748383 aaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattagttctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcat 17748284  T
Q  414 gtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||    
T  17748283 gtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacagcaacatg 17748187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 126 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 26292930 - 26292538
Alignment:
Q  126 ttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatccct 216  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||     ||||||     ||||||| |||||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  26292930 ttcgaatcatctatgctcctctaattggtatactgcacctattcttatcaatgattcgctagttccatgatagttaaccaaatagtccgaaccaatccct 26292831  T
Q  217 tgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaac 316  Q
    ||||||| |||| |||| |     || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  26292830 tgagttacgaccctcttatagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaag 26292732  T
Q  317 gattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtt 416  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||   ||||| | |||||| |||    
T  26292731 gattatacattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcggtagtcattcgttctcactaaatcatgtt 26292632  T
Q  417 tatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||    |||  ||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  26292631 tatatttgatcaggatataaatagtattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatg 26292538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 250 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 30066348 - 30066089
Alignment:
Q  250 taattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttatta 349  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||    
T  30066348 taattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagaacgttaacctaatatctctaacaaacgattatccactcctagactaaccatgtttgtta 30066250  T
Q  350 gaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaa 449  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||   |||||| ||||||||    |||| ||||||||| |||||||||    
T  30066249 gaacaattcatttaggtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcattaaatcatgtttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaa 30066150  T
Q  450 aaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  30066149 taattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 30066089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 182 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 21915197 - 21914903
Alignment:
Q  182 cacgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaa 280  Q
    |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  21915197 cacgatggttaactaaaatagccctaatcaatcccttgacttatgaccctcttctcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattctttgaa 21915098  T
Q  281 ggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagct 380  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21915097 ggtttgaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattattcattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagct 21914998  T
Q  381 atggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattg 476  Q
    ||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||||    |||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21914997 atggtcagtagtcattcattctcacgaaatcatgtttatatttgatcaggctataaaaatcattaagaacaattgaattgaat-aaaactagattg 21914903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 267 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 32838007 - 32837775
Alignment:
Q  267 taataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggt 366  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32838007 taataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggt 32837908  T
Q  367 ctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaa 466  Q
    ||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||    
T  32837907 ctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcac-aaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcatt--gaacaattgaattgaataaa 32837811  T
Q  467 aactagattgtcattcataataaataaagtttcaca 502  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32837810 aactagattgtcattcataataaatagagtttcaca 32837775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 105 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22131390 - 22131159
Alignment:
Q  105 gagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaaca 195  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||         |||||| |||||||||||||    
T  22131390 gagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtatgaatgattctctagttctacgatagttaaca 22131291  T
Q  196 aaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtt 295  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  22131290 aaatattcctaatcaatctcttgagttaggaccctcttctcaaactacaacacctaattccttaggtggtttaataatccttgaaggttttaagcacgtt 22131191  T
Q  296 aacttaatatcactaataaacgattatccatt 327  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131190 aacctaatatcactaataaacgattatccatt 22131159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 179 - 510
Target Start/End: Original strand, 28787374 - 28787698
Alignment:
Q  179 ttccacgatagttaacaaaatagtcttaat--caatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctt 276  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||||||        
T  28787374 ttccacaatagttaacaaaatagtcttaatttcaatcccttgacttag-accctcttctcaaactacaacccataattccttagctggtctaataa---- 28787468  T
Q  277 tgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaa 376  Q
         | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||    
T  28787469 -----ggtttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccttgtttattagaacaattcaattatgtccaagtagaa 28787563  T
Q  377 agctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca-cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagatt 475  Q
    | ||||||||| |||||||  |||||| | ||||||  ||||||||    | |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28787564 aactatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatagtttatatttgattaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagatt 28787663  T
Q  476 gtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||| |||||||    
T  28787664 gtcattcacaataaatagactttcacagcaacatg 28787698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 122 - 511
Target Start/End: Original strand, 11959157 - 11959546
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    ||||||     |||||| | ||||||||||    ||||  ||||||||    
T  11959157 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtataccgcacctattcttgtgaatgagtccctagttctatgatagttaac----tagttataatcaat 11959252  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    || ||||||||| ||| ||||||     || || ||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  11959253 cctttgagttagaaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtgtaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaat 11959351  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaatta-ggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatc 411  Q
    ||| |||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||| | |||||||   ||||| | |||||    
T  11959352 aaaggattatc--tt--tagactaaccatgtttattagaacaattcaattaaggtctaagtcgaacgctatggttagtagtcattcgttctcactaaatc 11959447  T
Q  412 acgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgt 511  Q
    | ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  11959448 atgtttatatttgatcag-atataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttaacagcaacatgt 11959546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37215306 - 37215019
Alignment:
Q  3 aatatctaggatttgtaaatta-ttttagt-gcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||  ||    
T  37215306 aatatttaggatgtgtaaatttcttttagttgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttggaaagaat 37215207  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| ||| || | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||    
T  37215206 aag---agagagatgaaattaggtctttcgaatcatctaagttccc-taattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagt 37215111  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg 282  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37215110 taacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg 37215019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 300 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 23044121 - 23043912
Alignment:
Q  300 taatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaat 399  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || || |||||||   |    
T  23044121 taatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggccagtagtcattcgt 23044022  T
Q  400 tctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttc 499  Q
    |||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||    
T  23044021 tctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataga-tttc 23043923  T
Q  500 acaacaacatg 510  Q
    | |||||||||    
T  23043922 ataacaacatg 23043912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 323 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 22130198 - 22130020
Alignment:
Q  323 ccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatg 422  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||  |||||||  | |||| | |||||| ||||||||     
T  22130198 ccattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgctagggtccgtagtcattcaatctcacaaaatcatgtttatatt 22130099  T
Q  423 gtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcaca 502  Q
       |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22130098 tgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattg-ataaaaactagattgtcattcataataaatagagtttcaca 22130020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 248 - 514
Target Start/End: Original strand, 18765756 - 18766019
Alignment:
Q  248 cctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttat 347  Q
    |||||||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||| |||||||    
T  18765756 cctaattccttaagtggtctaacattcttcgaaggttttaagagcgttaacctaatatcacaaataaatgattatttattcctagactaaccctgtttat 18765855  T
Q  348 tagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaag 447  Q
    | ||||||||||| |||||||||||   |||||| | | | |||||||  | |||  | || |||   |||||| ||||||||||||||||| ||||||     
T  18765856 ttgaacaattcaaataggtctaagtcgtaagctaggattagtagtcattca-tcttaccaattca-aattatatagtgtcaatatataaaaagcattaaa 18765953  T
Q  448 aaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||   || || ||  |||||||||||||| | |||||||||    
T  18765954 aacaattgaattgaat-aaaactagattaatatgcacaagcaataaagtttcacagccacatgtttc 18766019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 431 - 514
Target Start/End: Original strand, 28441431 - 28441514
Alignment:
Q  431 atataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28441431 atataaaaaatattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatgtttc 28441514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 31575497 - 31575165
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatccctt-gagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataat 273  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||   ||||||||||||| || || ||||  |||||||||| || |||| |||||||| |||||  ||||||| |    
T  31575497 tagtttcacgatggttaactaaaatagctctaatcaatccctttgacttgggactctcttctcaaattacagtctctaattccctaggtaatctaatatt 31575398  T
Q  274 ctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattag--gtctaag 371  Q
    |||||||| |   ||| | |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  31575397 ctttgaag-taaaaagaaagttaacctaatatcacaaataaacgaatatccattctcagaataaccctgtttatttgaacaattcaattaggtgtctaag 31575299  T
Q  372 ttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaacta 471  Q
    || |||||||   | | |||| ||  |||||| |||| | | | |||||||   ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  31575298 ttgaaagcta---taattagtaattcattctctcgaatttatg-ttatatgtgatcagtatataaaaagcattatgaacaattgaattaaat-aaaacta 31575204  T
Q  472 gattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||  ||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  31575203 gattgatattcacatgaaatagagtttcacaacaacatg 31575165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23044303 - 23044163
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||    
T  23044303 agagagagatgagtttaggtcttttgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattcagtagtttcacgatagttaac 23044204  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttct 235  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23044203 aaaataatcttaatcaatgccttgagttaggaccctcttct 23044163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 40916017 - 40916155
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||    
T  40916017 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgccggagacaatagttttggtttgcataaaattaaataaac-gaaaataaagataattttggaaaagat 40916115  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctat 139  Q
    || ||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||    
T  40916116 aaagagagagagatgagatcaggtctttcaagtcatctat 40916155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 373
Target Start/End: Original strand, 563372 - 563498
Alignment:
Q  247 ccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgttta 346  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||  |||||||| |   | ||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  563372 ccctaattctttaggtgatctaatattcttcaaaggttttcaaagcattaacataatatcacaattaaacgattattcattcctagactaaccttgttta 563471  T
Q  347 ttagaacaattcaattaggtctaagtt 373  Q
     | ||||||||||||||||||||||||    
T  563472 gttgaacaattcaattaggtctaagtt 563498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 108 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30066466 - 30066348
Alignment:
Q  108 agagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaacaaaa 198  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||||     ||||||| |||||||||||||||    
T  30066466 agagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccgcgatagttaacaaaa 30066367  T
Q  199 tagtcttaatcaatccctt 217  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  30066366 tagtgctaatcaatccctt 30066348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 32838141 - 32838007
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattatt---ttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaa 96  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||   |||||||| || | |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  32838141 ttaatatttaggatgtgtaaattattattttagtgcctgaagcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaatatagttttggaaaa 32838042  T
Q  97 gataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcat 135  Q
    ||  |    |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  32838041 gaata----agagagatgagatcaggtctttcgaatcat 32838007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 98
Target Start/End: Original strand, 28441314 - 28441410
Alignment:
Q  3 aatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    ||||| |||||| | |||| ||||||  ||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  28441314 aatatttaggatgtataaaatattttgatgcccgagggagttgatttgatttgcataaaattaaataaacagaatataaatatagttttggaaaaga 28441410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 10629467 - 10629407
Alignment:
Q  9 taggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataa 69  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10629467 taggatgtgtaaattattttaatgcctaaggcagtagatttgattgcataaaattaaataa 10629407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 47 - 510
Target Start/End: Original strand, 13449687 - 13450156
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccc 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||| |||||    
T  13449687 tttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaagacaaggagagaga--tgagaacaggtctttcgaatcatcgatggtcccc 13449784  T
Q  147 taattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctca 237  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    ||||||     |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13449785 taattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctca 13449884  T
Q  238 aactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaa 337  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13449885 aactaaagcccttaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaa 13449984  T
Q  338 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaa 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  |||||||    
T  13449985 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagct-gggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 13450083  T
Q  438 aaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13450084 aagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacaacaacatg 13450156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 31 - 510
Target Start/End: Original strand, 23224800 - 23225286
Alignment:
Q  31 tgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcg 129  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||  ||   ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23224800 tgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatgtaaagatagagttggaaagaat---gagagagagatgagatcaggtctttcg 23224896  T
Q  130 aatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgag 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23224897 aatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgag 23224996  T
Q  221 ttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgatt 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23224997 ttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgatt 23225096  T
Q  321 atccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttata 420  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| |||||||    
T  23225097 atccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttata 23225196  T
Q  421 tggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  23225197 tttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 23225286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 6603707 - 6603192
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||     
T  6603707 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgtccgaggcagtagttttgattgcataaatttaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaagac 6603610  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    ||||| | |||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||     ||||||||||||||    
T  6603609 aaggacaaaga--tgagatcaagtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagt 6603512  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||| |||     
T  6603511 taacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagc 6603412  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  6603411 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcaata 6603312  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6603311 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaa 6603212  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  6603211 tagagtttcacagcaacatg 6603192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 45286932 - 45287449
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagt-gcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaag 97  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||      
T  45286932 ttaatatttaggatgtgtaaatttcttttagttgcccgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagagttggaaaga 45287031  T
Q  98 ataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgata 188  Q
    |||||   |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||    
T  45287032 ataag---agagagatgagattaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgata 45287128  T
Q  189 gttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaa 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45287129 gttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaa 45287227  T
Q  289 gtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaa 388  Q
    | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||     
T  45287228 gaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcag 45287327  T
Q  389 tagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataata 488  Q
    |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45287328 tagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaata 45287427  T
Q  489 aataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  45287428 aataaagtttcacagcaacatg 45287449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 16165998 - 16165482
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||  ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  16165998 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtagattggtgtgcataaaaagtaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaaga 16165901  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatag 189  Q
     |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| |    ||||||     | ||| |||||||    
T  16165900 caaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctatttgtattaatgattctctaattcaacgatag 16165803  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16165802 ttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcagattacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 16165703  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  16165702 aacgttaacctaatatcactaacaaacgattacccattcctagattaaccatgtttattagaataattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagt 16165603  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16165602 agtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataa 16165503  T
Q  490 ataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  16165502 atagagtttcacagcaacatg 16165482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 47 - 502
Target Start/End: Original strand, 2441190 - 2441651
Alignment:
Q  47 tttgattgca-taaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttccc 145  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  2441190 tttgattgcaataaaagtaaataa-cagaaaataaagatagttttggaaaa-ataaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttctc 2441285  T
Q  146 ctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctc 236  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    ||||||     | ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2441286 ctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattctacgatagttaacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 2441385  T
Q  237 aaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagacta 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  2441386 aaactacagtccctaattccttaggtggtttaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagacta 2441485  T
Q  337 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataa 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||| |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||    
T  2441486 accatgtttattagaacaattcaattatgtctaagtcgaaagctagggtcagtagtctttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataa 2441585  T
Q  437 aaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcaca 502  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2441586 aaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattgataataaataaagtttcaca 2441651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 8277132 - 8276719
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  8277132 agagagatgagatcaggtctttcgaagcatctatgttcccctaattggtataatgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 8277033  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8277032 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactatagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 8276933  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  8276932 acctaatatcactaacaaacgattatcaattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 8276833  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  8276832 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaacaataaatagagt 8276733  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  8276732 ttcacagcaacatg 8276719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 17730960 - 17730548
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  17730960 agagagatgagatcatgtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 17730861  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  17730860 aatagtcctaatcaatcccttaacttaggaccctcttctcaaactatagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 17730762  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  17730761 acctaatatcattaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 17730662  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     ||| || | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||    
T  17730661 cattttcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaatcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataagtagagt 17730562  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  17730561 ttcacagcaacatg 17730548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 123 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 48645603 - 48645208
Alignment:
Q  123 tctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatc 213  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  48645603 tctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatggttaacaaaatagccctaatcaatc 48645504  T
Q  214 ccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaata 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||| |    
T  48645503 ccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagaacgttaacctaatatcagtaaca 48645405  T
Q  314 aacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcac 413  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||   || || | ||||||     
T  48645404 aacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagctatggtcagtagtcattcgttatcactaaatcat 48645305  T
Q  414 gtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  48645304 gtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgatttgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatg 48645208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 4595977 - 4596389
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||     ||||||||||||||||| ||    
T  4595977 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatacttcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaaaaa 4596076  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4596077 aatagtcataatcaatcccttgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagttggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 4596175  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| |||||||||||||||||     
T  4596176 acctaatatcactaacaaacaattattcattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaaactatggtcaatagtcatt 4596275  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    | |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  4596276 cattctcactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagt 4596375  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||| | |||||||    
T  4596376 ttcagagcaacatg 4596389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 9864694 - 9865107
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    ||||||     ||||||||||||||||||||    
T  9864694 agagagatgagatcaggtctttcaaatcatctatgtatccctaattggtatactacacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagttaacaa 9864793  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| ||||||    
T  9864794 aatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacaacccataattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagcacgtta 9864893  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||     
T  9864894 acttaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcatt 9864993  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
      ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  9864994 cgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcaataagaacaattgaattgaataaaaactacattgtcattaataataaatagagt 9865093  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  9865094 ttcacagcaacatg 9865107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 13842788 - 13842374
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||    ||||||     | ||||||||||||||||    
T  13842788 agagagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatattcccgtaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaac 13842689  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13842688 aaaatagccctaatcaatcccttgaattaggaccctctcctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgt 13842590  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||    
T  13842589 taacctaatatcactaacaaacgattatctattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgagagctagggtcagtagtca 13842490  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  13842489 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaataga 13842390  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  13842389 gtttcacagcaacatg 13842374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 106 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 20594409 - 20594007
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||||    
T  20594409 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacgtattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 20594310  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20594309 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 20594211  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||     
T  20594210 acctaatatcactaaaaaacgattatccattcttacactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagttatggtcagtagtcatt 20594111  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||    
T  20594110 cattctcactaaatcatatttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataagaactagaatgtcattcacaataaatagagt 20594011  T
Q  497 ttca 500  Q
    ||||    
T  20594010 ttca 20594007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 510
Target Start/End: Original strand, 9132744 - 9133140
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9132744 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaat 9132843  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  9132844 cccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaat 9132942  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | ||||||    
T  9132943 aaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattccattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatca 9133042  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
     ||||||||    |||  ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  9133043 tgtttatatttgatcaggatatagaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 9133140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 113 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 4547008 - 4546603
Alignment:
Q  113 tgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtc 203  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||||||||||||| ||    
T  4547008 tgagatcaggtctttcgaatcatctatgtttccctaattgatatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaataatc 4546909  T
Q  204 ttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaat 303  Q
     ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  4546908 ctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaat 4546810  T
Q  304 atcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctc 403  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||| |||||||  ||||||    
T  4546809 atcactaacaaacaattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagcaatggtcagtagtcattcattctc 4546710  T
Q  404 gcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaa 503  Q
     | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||     
T  4546709 actaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaatgaaaactagattgtaattcacaataaatagagtttcacag 4546610  T
Q  504 caacatg 510  Q
    |||||||    
T  4546609 caacatg 4546603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 26557645 - 26557234
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  26557645 agagagatgagatcaggtctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 26557546  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  26557545 aatagtcctaatcaatcccttgacatagaaccctcttctcaaactacagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 26557447  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  26557446 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctaaactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 26557347  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    | |  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||    
T  26557346 cattctcactaaatcatgtttatatttgattaggatat-aaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacattaaatagagt 26557248  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  26557247 ttcacagcaacatg 26557234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 52 - 494
Target Start/End: Original strand, 37415340 - 37415789
Alignment:
Q  52 ttgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaatt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||  |||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37415340 ttgcataaaattaaataaacagaatgtaaagatagagttggaaagaataag---agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaatt 37415436  T
Q  152 ggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaacta 242  Q
    |||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37415437 ggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccatgatagttaacaaaatagtcctaatcaatctcttgagttagaaccctcttctcaaacta 37415536  T
Q  243 aagtccctaattcc--ttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaacca 340  Q
     || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  37415537 cagcccctaattccccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaacca 37415635  T
Q  341 tgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaac 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || ||| | |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  |||||||||     
T  37415636 tgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagttagggttagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaa 37415735  T
Q  441 cattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37415736 cattaaaaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaataaa 37415789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 47 - 509
Target Start/End: Original strand, 5242061 - 5242532
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccc 146  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||||||| |||  ||||||     
T  5242061 tttgattgcacaaaattaaataaacataaaataaagatagttttggcaaaaataaagagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcttctgagttccct 5242158  T
Q  147 taattggtatactacacatatt-----cgaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctc 236  Q
    ||||||||||||| ||| ||||     ||||||||     |||| ||| || ||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||||||| | |||||    
T  5242159 taattggtatactgcacctatttcttacgaatgattctctagtttcactatggttaacaaaatatccataaccaatcccttgacttaggaccctattctc 5242258  T
Q  237 aaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaa-gtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagact 335  Q
    | |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| | ||||    
T  5242259 agactacagcccctaattccttaggtggtctaatattctttgaagattttaaagaacgttaacttaatatcacaaataaatgagtatccattcttggact 5242358  T
Q  336 aaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatata 435  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||  ||| || |||||||| ||||||||  | |||  |||||    
T  5242359 aaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagcagtcattcattatcacgaaatcatgtttatattctatcaggatata 5242458  T
Q  436 aaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacat 509  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  5242459 aaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaatagatagagtttcacaacaacat 5242532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 106 - 502
Target Start/End: Original strand, 14683412 - 14683816
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  14683412 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaa 14683511  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||   | || || |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||    
T  14683512 aatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctaggattacagcccctaattccataggtggtctaatagttattgaaggttt-aagcacgtta 14683610  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||     
T  14683611 acctaatatcactaataaatgattatgcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcaaaagttatggtcactagtcatt 14683710  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
      ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  14683711 cgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacagtaaataaagt 14683810  T
Q  497 ttcaca 502  Q
    ||||||    
T  14683811 ttcaca 14683816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Original strand, 26136094 - 26136512
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||| ||     |||||  ||||||||||||    
T  26136094 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaac 26136193  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  26136194 aaaatagtcctaatcaatcccttcagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 26136292  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  26136293 taacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattacgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtca 26136392  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  26136393 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataga 26136492  T
Q  495 gtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  26136493 gtttcacagcaacatgtttc 26136512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Original strand, 26144474 - 26144892
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||| ||     |||||  ||||||||||||    
T  26144474 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaac 26144573  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||    
T  26144574 aaaatagtcctaatcaatcccttcagttaggaccctcttctagggttaaagcccctaattccttaggtggtctagtaacctttgaaggttt-aagcacgt 26144672  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  26144673 taacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattacgtctaagtcgaaagctatggtcagtagtca 26144772  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  26144773 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataga 26144872  T
Q  495 gtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  26144873 gtttcacagcaacatgtttc 26144892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 122 - 514
Target Start/End: Original strand, 3067961 - 3068361
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    ||||||     |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3067961 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattgttatactgcacctattcttgtgaatgactcactagttctatgatagttaacaaaatagtcctaatcaat 3068060  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||     || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||    
T  3068061 cccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggttt-aagcacattaacctaatatcactaat 3068159  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||| | ||||||    
T  3068160 aaaagattatccattcctagactaaccatgtatattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatca 3068259  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtt 512  Q
     | ||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3068260 tgattatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgttattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtt 3068359  T
Q  513 tc 514  Q
    ||    
T  3068360 tc 3068361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 123 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 10469273 - 10468874
Alignment:
Q  123 tctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||   |||         |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  10469273 tctttcgaatcatctatgttcccctaattagtacactgcacctattcttgtgaattcttttctagttccatgatagttaaaaaaatagtcctaatcaatc 10469174  T
Q  214 ccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaata 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||     || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10469173 ccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaata 10469075  T
Q  314 aacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcac 413  Q
    || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| ||||||||     
T  10469074 aaggattatctattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcacgaaatcat 10468975  T
Q  414 gtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgttt 513  Q
    ||||||||    |||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  10468974 gtttatatttgatcaggatataaaaagcattaaaaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgttt 10468875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Original strand, 20080684 - 20081102
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||||     |||||| ||||||||||||    
T  20080684 agagagagatgagtttaagtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttctgaatgagtcactagttcaacgatagttaac 20080783  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||     || || |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||    
T  20080784 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggacccccttctagggttatagaccctaatttcttaggtggtctaataatcgctgaaggttt-aagcacgt 20080882  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||| ||    
T  20080883 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaactcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagcca 20080982  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  20080983 ttcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaattagattatcattcacaataaataga 20081082  T
Q  495 gtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  20081083 gtttcacagcaacttgtttc 20081102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 122 - 510
Target Start/End: Original strand, 37166131 - 37166527
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||||     |||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37166131 gtctttcgaatcatttatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaacaaagtagtcctaatcaat 37166230  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    |||||||||||||||  ||||||     || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  37166231 cccttgagttaggactctcttctagggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaatgttt-aagcacgttaacctaatatcactaat 37166329  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |   ||||| | ||||||    
T  37166330 aaatgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcgttcgttctcactaaatca 37166429  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
      |||||||    |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  37166430 tatttatatttgatcaagatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcgttcacaataaatagagtttcacagcaacatg 37166527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Original strand, 13809483 - 13809897
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatatt-----cgaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||| |||   ||||| ||||||||||||| ||| ||||     ||||||||     |||| |||||| |||||    
T  13809483 agagagagatgagatcaagtctttcgaatcctctga-ttcccttaattggtatactgcacctatttattacgaatgattctctagtttcacgatggttaa 13809581  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||||| | | ||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |  | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||    
T  13809582 caaaatagccctgatcaatcccttgacttaggaccctcttctcatattacaacctctaattccttatgtggcctaatactctttgaaggttttaagaacg 13809681  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||     ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  13809682 ttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaa-----caattaggtctgagttgaaagctatggccaatagtc 13809776  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||  ||||||  ||||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||     
T  13809777 attcattctcatgaaatcatgtttatatttgatcataatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaatagatag 13809876  T
Q  494 agtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  13809877 agtttcacatcaacatgtttc 13809897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 176 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 7227595 - 7227257
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||| | ||||| || || || | |||||||||||  || ||||||| |||    
T  7227595 tagtttcacgatggttaacaaaataaccataatcaatcccttgacttaggaccctattctccaattacagcctctaattccttatatgatctaatattct 7227496  T
Q  276 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaa 375  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  7227495 ttgaaggttttacgaacgttaacttaatatctcaaataaacgattatccattgctaggctagccatgtttatttgaacaactcaattaggtctaagttga 7227396  T
Q  376 aagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagatt 475  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||| |||||| | ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  7227395 aagctatggtcagtagtcattcattctcacgaaataatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaatt 7227296  T
Q  476 gtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  7227295 gtcattcacaataaatagagtttcatagcaacatgtttc 7227257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 247 - 510
Target Start/End: Original strand, 11398143 - 11398406
Alignment:
Q  247 ccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgttta 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  11398143 ccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccactcttagactaaccatgttta 11398242  T
Q  347 ttagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| |||| |    
T  11398243 ttagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaaacattca 11398342  T
Q  447 gaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11398343 gaacaattgaactgaacaaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatg 11398406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 7e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 315
Target Start/End: Original strand, 45290343 - 45290665
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagt-gcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaag 97  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||      
T  45290343 ttaatatttaggatgtgtaaatttcttttagttgcccgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagagttggaaaga 45290442  T
Q  98 ataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgata 188  Q
    |||||   |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||    
T  45290443 ataag---agagagatgagattaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgata 45290539  T
Q  189 gttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaa 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45290540 gttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaa 45290638  T
Q  289 gtacgttaacttaatatcactaataaa 315  Q
    | |||||||| || |||||||||||||    
T  45290639 gaacgttaacctagtatcactaataaa 45290665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 247 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 10345210 - 10344944
Alignment:
Q  247 ccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgttta 346  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10345210 ccctaattccttagatggtctaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacttaatatcactaataaaggattatccattcttagactaaccatgttta 10345112  T
Q  347 ttagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||    
T  10345111 ttagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcagtcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaa 10345012  T
Q  447 gaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||    
T  10345011 gaacaattgaatggaataaaaactagattatcattcacaataagtagagtttcaaagcaacatgtttc 10344944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 273 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 4695494 - 4695258
Alignment:
Q  273 tctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 372  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  4695494 tctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaaatgtgtctaagt 4695396  T
Q  373 taaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactag 472  Q
      ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  4695395 agaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaataacaattgaattgaataaaaactag 4695296  T
Q  473 attgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  4695295 attgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 4695258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 205 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 5796590 - 5796287
Alignment:
Q  205 taatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaata 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||| | || | || ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  5796590 taatcaatcccttgacttaggaccctcttatcatattacaatctctaattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacattata 5796491  T
Q  305 tcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcg 404  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||  ||||||     
T  5796490 tcacaaataaacgattattcattcatagactaaccctttttatttgaaaaactcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagcaggtattcattctca 5796391  T
Q  405 cgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaac 504  Q
    | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||| |    
T  5796390 caaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaataattgaattgaat-aaaactagattgttattcataatagat-gagtttcacagc 5796293  T
Q  505 aacatg 510  Q
    ||||||    
T  5796292 aacatg 5796287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 106 - 372
Target Start/End: Original strand, 9271433 - 9271700
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||| ||    
T  9271433 agagagatgagaacaggtatttagaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaagaa 9271532  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  9271533 aatactcctaatcaatcccttgagttaggtccctcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 9271631  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 372  Q
    ||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9271632 accaaatatcactaacaaacgattatccattcctag-------ttgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 9271700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 106 - 285
Target Start/End: Original strand, 11919833 - 11920021
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    |||||||     ||||||||||||| ||||||    
T  11919833 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctagttccacgataggtaacaa 11919932  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 285  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11919933 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 11920021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 255 - 494
Target Start/End: Original strand, 37423083 - 37423321
Alignment:
Q  255 ccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaaca 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37423083 ccttaggtggtctaataatctttgaaggttt-aagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaaca 37423181  T
Q  355 attcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaatt 454  Q
    |||||||||||| |||||  |||| || ||| | |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| |||||| || ||||    
T  37423182 attcaattaggtataagtcgaaagttagggttagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaaaaacaatt 37423281  T
Q  455 gaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  37423282 gaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaataaa 37423321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 183 - 467
Target Start/End: Original strand, 18562586 - 18562871
Alignment:
Q  183 acgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaag 281  Q
    |||||||||||| ||||||| | | || ||||| |||| |||||||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||  |||||| | || ||||    
T  18562586 acgatagttaactaaaatagccctgattaatcctttgacttaggactctcttctcatattacagtccctaattccttaggtgagctaatattattcgaag 18562685  T
Q  282 gttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagcta 381  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18562686 gttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttaattgaacaattcaattaggtctaagttgaaagcta 18562785  T
Q  382 tggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaa 467  Q
    |||||| |||||||  ||||||   ||| || ||||||||  | | |  ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  18562786 tggtcagtagtcattcattctcaataaaacatgtttatattttataaggatataaaaagcattaagaacaactgaattgaataaaa 18562871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 294 - 514
Target Start/End: Original strand, 22611771 - 22611991
Alignment:
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| |||||    
T  22611771 ttaacctaatatcactaataaaggattattcattcctagactaaccatgtttattagaataattcaattaggtgtaagtcgaaagctagggtcagtagtc 22611870  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||   ||||| | |||||| ||||||||    |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  22611871 attcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaaaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatag 22611970  T
Q  494 agtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  22611971 agtttcgcaacaacatgtttc 22611991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 106 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 4542943 - 4542734
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  4542943 agagagatgagatcaggtcttccgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 4542844  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    |||| |  |||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4542843 aataattctaatcaatcccttgacctagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagttggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 4542745  T
Q  297 acttaatatca 307  Q
    || ||||||||    
T  4542744 acctaatatca 4542734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 124 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 35961219 - 35961076
Alignment:
Q  124 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcc 214  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35961219 ctttcgaatcatctatgttcctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagtcaacaaaatagtcctaatcaatcc 35961120  T
Q  215 cttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattcctt 258  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  35961119 cttgatttaggaccctcttctcaaactatagcccctaattcctt 35961076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4695625 - 4695491
Alignment:
Q  108 agagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaacaaaa 198  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||     ||||||     ||||||||||||||||||||||    
T  4695625 agagatgagaccaggtctttcgaatcatctatattcccctaattggtatactgcacctattcttatcaatgattttctagttccacgatagttaacaaaa 4695526  T
Q  199 tagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttctt 233  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4695525 tagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctctt 4695491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 379 - 510
Target Start/End: Original strand, 9273369 - 9273500
Alignment:
Q  379 ctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtc 478  Q
    |||||||||| ||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  9273369 ctatggtcaacagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaatattaagaacaattgaattgaataaaaactagatagtc 9273468  T
Q  479 attcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  9273469 attcacaataaatatagtttcacagcaacatg 9273500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 24918192 - 24918043
Alignment:
Q  246 tccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgttt 345  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||| |    |||||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||| | || |||||    
T  24918192 tccctaattccttatgtggtctaatattccctgaaagttttcaaagtgttaacctaatattacaattaaacgattatccattcatagacaagccctgttt 24918093  T
Q  346 attagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 395  Q
    | | ||||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  24918092 aattgaacaatccaattatgtctaagttgaaagctttggtcagtagtcat 24918043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 11397916 - 11398070
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||  | |  |||||||||  ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||     
T  11397916 ttaatatctaggatgtgtaaatt-tcttagtgcccgaggcagtaggatggtgtgcataaaaagtaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaagac 11398012  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatact 159  Q
    || ||||||||  |||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11398013 aatgagagaga--tgagattaggtctttcgattcatcgatgttcccctaattggtatact 11398070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 431 - 503
Target Start/End: Original strand, 45290715 - 45290787
Alignment:
Q  431 atataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaa 503  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||| ||||    
T  45290715 atataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaagagagttttacaa 45290787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10345343 - 10345278
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc 169  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  10345343 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattc 10345278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 451 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 9080970 - 9080907
Alignment:
Q  451 aattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||| ||||    
T  9080970 aattgaattgaataaaaactagattgtcattgacaataaatagagtttcacggcaacatctttc 9080907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 44017640 - 44017702
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagtttt-gattgcataaaat 62  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  44017640 ttaatatttaggatgtgtaaattattttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaat 44017702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 5826571 - 5826631
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaa 61  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||| ||||  |||||||||    
T  5826571 ttaatatctaggatgtgtaaattttttaagtgcctgaggcagtaggtttgtgtgcataaaa 5826631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 28111320 - 28110805
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||    
T  28111320 ttaatatttaggatgtgtaaattattttagtgtctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaagaat 28111221  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||   |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||    
T  28111220 aag---agagagatgagatcagatctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagt 28111124  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28111123 taacaaaacagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaaga 28111024  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||    
T  28111023 acattaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctatactaaccctatttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagta 28110924  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||  ||||||   |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28110923 gtcattcattctcattaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaa-cattaagaacaattgaattaaataaaaactagattgtcattcacaataaa 28110825  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  28110824 tagagtttcacagcaacatg 28110805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 4 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 31205098 - 31204586
Alignment:
Q  4 atatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataag 102  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| |||    
T  31205098 atatctatgatttgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtagttttgattgcataaatttaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaagacaag 31205001  T
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||     | |||||||||||||||    
T  31205000 gagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctaattccacgatagttaa 31204903  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||  |||    
T  31204902 caaaatatccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacatcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaaacacg 31204803  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  31204802 ttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtc 31204703  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  31204702 attcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatag 31204603  T
Q  494 agtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||||||||||||    
T  31204602 agtttcacaacaacatg 31204586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 37183724 - 37184239
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||     
T  37183724 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtagttttgattgcataaatttaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaagac 37183821  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||     ||||||||||||||    
T  37183822 aatgagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcgtattaatgattttctagttccacgatagt 37183919  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||     
T  37183920 taacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagc 37184019  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||| ||    
T  37184020 acgttaacctaatatcactaacaaacggttatccattcctagactaactatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctaggatcagta 37184119  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37184120 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaa 37184219  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  37184220 tagagtttcacagcaacatg 37184239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Original strand, 45960605 - 45961120
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||     
T  45960605 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtagttttgattgcataaatttaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaagac 45960702  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    ||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||| |    ||||||     |||| |||||||||    
T  45960703 aagaagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtataatgcacctatttgtattaatgattttctagtttcacgatagt 45960800  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||     
T  45960801 taacaaaatagctctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttaaagc 45960900  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  45960901 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagta 45961000  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45961001 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaa 45961100  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || |||||||||||||||||    
T  45961101 tagagtttcacaacaacatg 45961120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 2794491 - 2793976
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| || | |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||     
T  2794491 ttaatatttaggatgtgtaaattattttaatgtctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaa-gaa 2794393  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    || ||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||    
T  2794392 aaagagagaga--tgagatcaggtctttcgagtcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagt 2794295  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  2794294 taacaaaatagtcataatcaatcccttgagttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaaga 2794196  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    |||||||  || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||    
T  2794195 acgttaagctagtatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctagggtcagta 2794096  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2794095 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaa 2793996  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  2793995 tagagtttcacagcaacatg 2793976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 47 - 510
Target Start/End: Original strand, 6070860 - 6071329
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaa-ttaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttccc 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  6070860 tttgattgcataaaaattaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaagacaaggagcgaga--tgagatcaggtttttcgaatcatcgatgttccc 6070955  T
Q  146 ctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctc 236  Q
    |||||||||||| | ||| ||||||    ||||||     | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6070956 ctaattggtatattgcacctattcgtattaatgattttctatttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 6071055  T
Q  237 aaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagacta 336  Q
    |||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  6071056 aaactacatcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagacta 6071155  T
Q  337 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataa 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    ||| |||||||    
T  6071156 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcagtatataa 6071255  T
Q  437 aaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6071256 aaggcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatg 6071329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 20399117 - 20398601
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||| || |  ||||||||||  |||||||  |    
T  20399117 ttaatatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataa-cataaaataaagatagagttggaaagaa 20399019  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatag 189  Q
    ||||   |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||    
T  20399018 taag---agagagatgagatcaggtctttcgagtcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatag 20398922  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20398921 ttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctcagactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttaaag 20398822  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||| |    
T  20398821 cacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtcaaagtagaaagctatggtcagt 20398722  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||| ||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20398721 agtgattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataa 20398622  T
Q  490 ataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||||||||| |||||||    
T  20398621 atagagtttcacagcaacatg 20398601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 45941577 - 45941164
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||||    
T  45941577 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 45941478  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45941477 aatagtcctaatcaatcccttgagttaggacccttttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgtta 45941378  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  45941377 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 45941278  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||    
T  45941277 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcatttacaataaatagggt 45941178  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  45941177 ttcacagcaacatg 45941164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 514
Target Start/End: Original strand, 49498363 - 49498877
Alignment:
Q  3 aatatctaggatttgtaaatta-ttttagt-gcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    ||||| |||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||        
T  49498363 aatatttaggatgtgtaaatttcttttagttgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttggaaa---- 49498458  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagt 190  Q
         ||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||    
T  49498459 -----gagagagatgagattaggtctttcgaatcatctaagttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttatagttccacgatagt 49498553  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  49498554 taacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagc 49498652  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtc-taagttaaaagctatggtcaat 389  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||||| |    
T  49498653 acgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtcttaagtagaaagctatggtcagt 49498752  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||||||  ||| || | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  49498753 agtcattcattatcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataa 49498852  T
Q  490 ataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  49498853 atagagtttcacagcaacatgtttc 49498877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Original strand, 673031 - 673448
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||     ||||||     |||||||||||||||||     
T  673031 agagagagatgagatcatgtatttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacctattcttgtaaatgattttctagttccacgatagttaaa 673130  T
Q  195 aaaa--tagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtac 292  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  673131 aaaaaatagtctcaatcaatcccttgagttaataccctcttctcaaactacaacccctaattttttaggtggtctaataatctttgaagggtttaagtac 673230  T
Q  293 gttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 392  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  673231 gttaacataatatcactaataaacgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcaatagt 673330  T
Q  393 catcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaata 492  Q
    |||  |||||| | |||||| ||||||||  | |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  673331 cattcattctcactaaatcatgtttatattttatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaata 673430  T
Q  493 aagtttcacaacaacatg 510  Q
     ||||||||| |||||||    
T  673431 gagtttcacagcaacatg 673448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 2 - 514
Target Start/End: Original strand, 34732221 - 34732739
Alignment:
Q  2 taatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataa 101  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||| |||   | |||||||||||| ||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  34732221 taatatataggatgtgtaaattattttagtgctcgaaacactagttttgattgaataaaattaaataagaagaaaataaagatagttttggaaaagataa 34732320  T
Q  102 ggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatatt-----cgaatgat-----agttccacgatagtt 191  Q
    ||||||| |  ||||||||  ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||  ||||     ||||||||     |||| |||||| |||    
T  34732321 ggagagata--tgagatcagttctttcgaatcctctgagttcccctaattggtatactgcaattatttcttacgaatgattctctagtttcacgatggtt 34732418  T
Q  192 aacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagta 291  Q
    |||||||||| | || |||||||||||| |||||||| |||||||||| || |  ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  34732419 aacaaaatagcccta-tcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaagtacatcccctaatttgttaggtggtctaatactctttgaaggttttaagaa 34732517  T
Q  292 cgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatag 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||    
T  34732518 cgttaacttaatatcacaaataaacgattattcattcctagactaactatgtttatttgaacaattcaattaggtttaagttgaaagttatggtcagtag 34732617  T
Q  392 tcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaat 491  Q
    ||||  ||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||    
T  34732618 tcattcattctcaggaaatcatgtttatatcgtgtcaataaataaaaa-aattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaatagat 34732716  T
Q  492 aaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    | ||||||||| |||||| ||||    
T  34732717 agagtttcacagcaacatatttc 34732739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 52 - 510
Target Start/End: Original strand, 23021835 - 23022299
Alignment:
Q  52 ttgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaatt 151  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||  |||||   | |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23021835 ttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagagttggaaagaataag---atagagatgagattaggtctttcgaatcatctaagttcccctaatt 23021931  T
Q  152 ggtatactacacatattc----gaatgata-----gttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaacta 242  Q
    |||||||| ||| |||||    ||||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | || |    
T  23021932 ggtatactgcacctattcttatgaatgatattctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttcttagacca 23022031  T
Q  243 aagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatg 342  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  23022032 cagcccctaattccttaggtgatcaaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctg 23022131  T
Q  343 tttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaacca 442  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    | |  |||||||||  |    
T  23022132 tttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaaagta 23022231  T
Q  443 ttaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  23022232 ttaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 23022299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 21107254 - 21107666
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||||    
T  21107254 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcacctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 21107353  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21107354 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttagatggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 21107452  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| ||||||| |||||||     
T  21107453 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattttgtctaagtagaaagcaatggtcagtagtcatt 21107552  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  21107553 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaatttaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagagt 21107652  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    || ||| |||||||    
T  21107653 ttgacagcaacatg 21107666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 122 - 510
Target Start/End: Original strand, 41058281 - 41058677
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41058281 gtctttcgaatcatctatgttcctctaattggtatgctgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcataatcaat 41058380  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||     
T  41058381 cccttgatttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtagtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctattatcactaac 41058479  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
T  41058480 aaacaattatccattcctagactaaccctatttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 41058579  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
     ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  41058580 tgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaacaacatg 41058677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 122 - 510
Target Start/End: Original strand, 1950434 - 1950830
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1950434 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaaaatagtcctaatcaat 1950533  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    ||||||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||     
T  1950534 cccttgacttagaaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatcttcgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaac 1950632  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | ||||||    
T  1950633 aaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaatacaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatca 1950732  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
      |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  1950733 tatttatatatgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatcattcacaataaatagagtttcacatcaacatg 1950830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 106 - 509
Target Start/End: Original strand, 21018430 - 21018840
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||  ||||         |||||||||||||||||||||    
T  21018430 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaatttgtatactgaacctattcttatgaatggttttttagttccacgatagttaacaa 21018529  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21018530 aatagtcctaatcaatcccttgacttatgaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 21018628  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  21018629 acctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattaaaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 21018728  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||| ||| ||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  21018729 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaagata-aaaaagcgttaagaacagttgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatagagt 21018827  T
Q  497 ttcacaacaacat 509  Q
    |||||| ||||||    
T  21018828 ttcacagcaacat 21018840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 176 - 514
Target Start/End: Original strand, 49853120 - 49853457
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49853120 tagttccacgacagttaacaaaatagtcctaatcaatcacttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatct 49853219  T
Q  276 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaa 375  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  |    
T  49853220 ttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcaataacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtaga 49853318  T
Q  376 aagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagatt 475  Q
    |||||||||| | |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49853319 aagctatggttagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagatt 49853418  T
Q  476 gtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  49853419 gtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttc 49853457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 514
Target Start/End: Original strand, 3796687 - 3797205
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || ||||||||  ||||||| || |  |||| |||||  |||||||  |    
T  3796687 ttaatatttaggatgtgtaaattattttagtgcatgaggcagtagttttggtttgcataaaaagtaaataa-cataaaataa-gatagagttggaaagaa 3796784  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatag 189  Q
    ||||   |||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||| ||     |||||  |||||||    
T  3796785 taag---agagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgcgaaagagtcactagttttacgatag 3796881  T
Q  190 ttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaag 289  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3796882 ttaacaaaatagtcataatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aag 3796980  T
Q  290 tacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaat 389  Q
     |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  3796981 cacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctaaactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagt 3797080  T
Q  390 agtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataa 489  Q
    ||||||   ||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  3797081 agtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaata 3797180  T
Q  490 ataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||    
T  3797181 atagagtttcacagcaacatgtttc 3797205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 122 - 510
Target Start/End: Original strand, 905664 - 906064
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  905664 gtctttcgaatcatctatgtttccctaattggtatactgcacttattcttatgaatgattcactagttccacgatagttaacaaaatagttttaatcaat 905763  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatat----cac 308  Q
    |||||||||||||||| ||||||     || |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||    |||    
T  905764 cccttgagttaggaccctcttctatggttacaacccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatatatcac 905862  T
Q  309 taataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaa 408  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   ||||| | ||    
T  905863 taataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaa 905962  T
Q  409 atcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaaca 508  Q
    |||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  905963 atcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacaataaca 906062  T
Q  509 tg 510  Q
    ||    
T  906063 tg 906064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 104 - 502
Target Start/End: Original strand, 29643182 - 29643588
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||    
T  29643182 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaactagtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaac 29643281  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||   | || |  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  29643282 aaaatagccctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctaggattacaacctctaattccttaggtggtctaataatcttcgaaggttt-aagcatgt 29643380  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||||    
T  29643381 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttagggtcagtagtca 29643480  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||| | | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  29643481 ttcgttcacactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaatttaattgaataaaaactaaattgtcattcaaaataaataga 29643580  T
Q  495 gtttcaca 502  Q
    ||||||||    
T  29643581 gtttcaca 29643588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 2405670 - 2405258
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||| ||||||||||||||    
T  2405670 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttttcctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattccctagttctacgatagttaacaa 2405571  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatcttt-gaaggttttaagtacgtt 295  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||     || |  || |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||| |||||    
T  2405570 aatagtcctaatcaatcaattgagttaggaccctctcctagggttacatcccttaattccttaggtggtctaata-tctgtcgaaggttt-aagcacgtt 2405473  T
Q  296 aacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 395  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||    
T  2405472 aacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaacgttatggtcagtagtcat 2405373  T
Q  396 caattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaag 495  Q
       ||||| | |||||| ||||||||    |||  |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  2405372 tcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatatgaaaatcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaattgag 2405273  T
Q  496 tttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||||||||||    
T  2405272 tttcacaacaacatg 2405258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 205 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 7635698 - 7635391
Alignment:
Q  205 taatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaata 304  Q
    |||||||| |||||| |||||||| |||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  ||    
T  7635698 taatcaataccttgacttaggaccctcttctcagattacagtccataattccttaggtgatctaatattctttgaaggttttaagaacgttaacctctta 7635599  T
Q  305 tcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcg 404  Q
    | || |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||  ||||||     
T  7635598 ttacaaataaacgattatctattcctagactgaccctgtttatttgaacaattcaatcaggtctaagttgaaagttatgatcaatagtcattcattctca 7635499  T
Q  405 cgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaac 504  Q
    |||| ||| || ||||||   |||  ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||| |    
T  7635498 cgaattcatgtatatatgtgatcagcatataaaaagcactaagaacaattgaattgaat-aaaactagattgatattcataagaaatagagtttcacatc 7635400  T
Q  505 aacatgttt 513  Q
    |||||||||    
T  7635399 aacatgttt 7635391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 176 - 387
Target Start/End: Original strand, 27355729 - 27355941
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatc 274  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |||||||||||| ||||||| ||||||| |     
T  27355729 tagtttcacgatggttaactaaaataggcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcatattacagtccctaattcattaggtgatctaatattt 27355828  T
Q  275 tttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtta 374  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  27355829 tttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttg 27355928  T
Q  375 aaagctatggtca 387  Q
    |||||||||||||    
T  27355929 aaagctatggtca 27355941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 280 - 513
Target Start/End: Original strand, 11668171 - 11668404
Alignment:
Q  280 aggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagc 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  11668171 aggttttaagaacgttaacttaatatcacaaataaacgattatccattcctagagtaaccatatttatttgaaaaattcaattcggtctaagttgaaagc 11668270  T
Q  380 tatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtca 479  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | |||||| ||||||||    ||   ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11668271 tatggtcagtagtcattaattctcacaaaatcatgtttatatttgatcgggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattatca 11668370  T
Q  480 ttcataataaataaagtttcacaacaacatgttt 513  Q
    |||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  11668371 ttcacaatagatagagtttcacagcaacatgttt 11668404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 248 - 513
Target Start/End: Original strand, 27331883 - 27332148
Alignment:
Q  248 cctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatcca-ttcatagactaaccatgttta 346  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  27331883 cctaattcattaggtgatctaatattttttgaaggttttaacaacgttaacctaatatcacaaataaacgattattcaattcctagactaaccatgttta 27331982  T
Q  347 ttagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaa 446  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||  ||||||  ||| ||| |||||||||   ||| |||||||||| ||||||    
T  27331983 tttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagttatggtcagtagtcattcattctcatgaattcatgtttatatgtgatcagtatataaaaagcattaa 27332082  T
Q  447 gaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgttt 513  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||    
T  27332083 taacaattgaattgaat-aaaactagattgatattcacaagaaataaagtttcatagcaacatgttt 27332148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 182 - 421
Target Start/End: Original strand, 21434523 - 21434763
Alignment:
Q  182 cacgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaa 280  Q
    ||||| ||||||| ||||||| | |||||||||| |||| ||| |||  |||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  21434523 cacgacagttaactaaaatagccataatcaatccattgacttaagacactcttctcagattacagtccctaattccttaggtgatctaatattatttgaa 21434622  T
Q  281 ggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagct 380  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21434623 ggttttaagaacgttaacctaatataacaaataaacgattattcattcctagactaaccctgtttatttgaacaattcaattaggtataagttgaaagct 21434722  T
Q  381 atggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatat 421  Q
    ||||||| |||||||  |||||| | ||| || ||||||||    
T  21434723 atggtcagtagtcattcattctcactaaaacatgtttatat 21434763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 106 - 285
Target Start/End: Original strand, 21111121 - 21111309
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||||||    
T  21111121 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 21111220  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 285  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21111221 aatagtcttaatcaatcccttaacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttt 21111309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 176 - 357
Target Start/End: Original strand, 27354986 - 27355165
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27354986 tagttccacgatagttaacaaaatagtcataaccaatcccttgagttaggaccctcttcttaaactaca-accctaattccttaggtggtctattaatct 27355084  T
Q  276 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaatt 357  Q
    | ||||| |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  27355085 tcgaagg-tttaaacacgttaacctaatatcactaacaaacgattatctattcctacactaaccatgtttattagaacaatt 27355165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42022860 - 42022578
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccc 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |  ||||||||||| |||  ||||| |    
T  42022860 tttgattgcataaaattaaataaacataaaataaatatagttttggaaaagataaggagagagagatgagactagatctttcgaatcctctgagttcctc 42022761  T
Q  147 taattggtatactacacatattc----gaatga-----------tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttc 231  Q
    ||||  |||| || ||| |||||    ||||||           ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42022760 taatcagtatgctgcacctattcttatgaatgaataagaatttctagttccactatagttaacaaaatagttttaatcaatcccttgagttaggaccctc 42022661  T
Q  232 ttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgatt 320  Q
    ||||||||||| |  ||||||     |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  42022660 ttctcaaactataacccctaa-----taggtgatctaataatttttgaaggttttaattacgttatcctaatatcact-ataaacgatt 42022578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 292 - 513
Target Start/End: Original strand, 34066599 - 34066818
Alignment:
Q  292 cgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatag 391  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||  |||||||||| | |||    
T  34066599 cgttaacttgatatcacaaataagcagttatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaatcaaattaggtataagttgtaagctatggttagtag 34066698  T
Q  392 tcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaat 491  Q
    ||||  | ||| ||  | ||| | ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||    
T  34066699 tcattcaatcttgccgattca-gattatatggtgttaatatataaaaagcatcaagaacaattgaattgaat-aaaactagattgatattcacaagaaat 34066796  T
Q  492 aaagtttcacaacaacatgttt 513  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  34066797 agagtttcacaacaacatgttt 34066818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 27536391 - 27536558
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaaga 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  27536391 ttaatatttaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtagttttgattgcataaaaagtaaataa-cagaaaataa-gatagttttggaaaaga 27536488  T
Q  99 taaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg 170  Q
     |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27536489 caaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcg 27536558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 219
Target Start/End: Original strand, 21114461 - 21114583
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    ||||||     ||||| |||||||||||||||    
T  21114461 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttctcctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagttaacaa 21114560  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttga 219  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21114561 aatagtcttaatcaatcccttga 21114583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 316
Target Start/End: Original strand, 13431021 - 13431141
Alignment:
Q  196 aaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtt 295  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||  |||||||| | || |||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| | |||||    
T  13431021 aaatagccctaatcaatcccttgacttaggactctcttctcatattacagtctctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttacgaacgtt 13431120  T
Q  296 aacttaatatcactaataaac 316  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  13431121 aacttaatatcacaaataaac 13431141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 431 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 42022502 - 42022420
Alignment:
Q  431 atataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgttt 513  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  42022502 atataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagaatttcacagcaatatgttt 42022420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 286
Target Start/End: Original strand, 11667056 - 11667153
Alignment:
Q  189 gttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggtttt 286  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| | |||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  11667056 gttaacaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggatcctcttctcagattacagcccctaattccttaggtggtctaatattatttgaaggtttt 11667153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 195 - 313
Target Start/End: Original strand, 16055629 - 16055747
Alignment:
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |  |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| | ||    
T  16055629 aaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacaacccctaaatccttaggtgatctaatattctttgaaggtttgaagaatgt 16055728  T
Q  295 taacttaatatcactaata 313  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  16055729 taacctaatatcacaaata 16055747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Original strand, 27536583 - 27536661
Alignment:
Q  431 atataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaa-actagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  27536583 atataaaaagcattaagaacaattgaattaaataaaaaactagattgtcattaataataaat--agtttcacaacaacatg 27536661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 289
Target Start/End: Original strand, 34065204 - 34065317
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||| ||| | |||||||| || ||||| | || |||| ||||| |||| |||| |||||||||||    
T  34065204 tagtttcacgatggttaaccaaatagccctaatcaatctcttaacttaggaccctcctctcatattacagtctctaatacctttggtgatctaataatct 34065303  T
Q  276 ttgaaggttttaag 289  Q
    ||||||||||||||    
T  34065304 ttgaaggttttaag 34065317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 313
Target Start/End: Original strand, 16056874 - 16056982
Alignment:
Q  205 taatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaata 304  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||   |||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||| ||  |||||||| |||||    
T  16056874 taatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattacgatccctaattccttaggtgatctaatatactttaaaggtttgaataacgttaacctaata 16056973  T
Q  305 tcactaata 313  Q
    |||| ||||    
T  16056974 tcacaaata 16056982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 71
Target Start/End: Original strand, 30938427 - 30938494
Alignment:
Q  5 tatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaa-ttaaataaac 71  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||    
T  30938427 tatctaggatgtgtaaattattttactgcccgaggcagtaggtttgtgtgcataaaagttaaataaac 30938494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 313
Target Start/End: Original strand, 16061030 - 16061148
Alignment:
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| ||||||   |||||||| | || | |||||||||||||||||| |||||||  ||||  |||||| ||| || |    
T  16061030 aaaatagccctaatcaatccattgacttaggattctcttctcatattacaatccctaattccttaggtgatctaatatactttataggtttgaagaacat 16061129  T
Q  295 taacttaatatcactaata 313  Q
    |||| ||||||||| ||||    
T  16061130 taacctaatatcacaaata 16061148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 23441132 - 23441194
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagtttt-gattgcataaaat 62  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  23441132 ttaatatttaggatgtgtaaattattttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaat 23441194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 514
Target Start/End: Original strand, 37907562 - 37907624
Alignment:
Q  451 aattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||    
T  37907562 aattgaattgaataaaa-ctagattgatattcataagcaatatagtttcacaaccacatgtttc 37907624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 155
Target Start/End: Original strand, 13430917 - 13430969
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggta 155  Q
    ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  13430917 gagagagagatgagatcagggctttcgaatcctctgagttcccctaattggta 13430969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 47 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 293239 - 292766
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccc 146  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  293239 tttgattgtatataattaaataaacagaaaataaagataattttggaaaagataaagagagaga--tgagatcaagtctttcgaatcatctatgttcccc 293142  T
Q  147 taattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctca 237  Q
    ||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  293141 taattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctca 293042  T
Q  238 aactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaa 337  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  293041 aactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgttaacctagtatcactaataaaggattatccattcctatactaa 292943  T
Q  338 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaa 437  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  |||||||    
T  292942 ccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatcgtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaa 292843  T
Q  438 aaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  292842 aagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatagaatttcacagcaacatgtttc 292766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 31 - 510
Target Start/End: Original strand, 3678 - 4164
Alignment:
Q  31 tgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcg 129  Q
    ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||||  |||||   |||||| |||||||| ||||||||    
T  3678 tgccctaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacagaatgtaaagatagagttggaaagaataag---agagagatgagatcaggtctttcg 3774  T
Q  130 aatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgag 220  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3775 aatcatctatgttaccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgag 3874  T
Q  221 ttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgatt 320  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  3875 ttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacattaacctaatatcactaacaaacgatt 3974  T
Q  321 atccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttata 420  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| |||||||    
T  3975 atccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattatgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttata 4074  T
Q  421 tggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |    |||  ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  4075 tttgatcaggatataaaaagcattaagaacagttgaattgaataaaaactagattttcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 4164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0381 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0381
Description:

Target: scaffold0381; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 3 - 510
Target Start/End: Original strand, 5261 - 5775
Alignment:
Q  3 aatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataa 101  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  |    
T  5261 aatatttaggatgtataaattattttagtgcctgaggcagtagttttggtttgcataaaattaaataaacaaaatataaagatagttttggaaaagaata 5360  T
Q  102 ggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagtta 192  Q
     ||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||| |||||||||||    
T  5361 agagaga----tgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagtttcacgatagtta 5456  T
Q  193 acaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtac 292  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  5457 acaaaatagtcctaatcaatcctttgagttaagaccctcttctcaaactacagcccctgattccttaggtggtctaataatctttgaaagttttaagaac 5556  T
Q  293 gttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagt 392  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  5557 gttagcctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgattattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagt 5656  T
Q  393 catcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaat-aaaaactagattgtcattcataataaat 491  Q
    |||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  5657 cattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaaactagattgtcatttacaataaat 5756  T
Q  492 aaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |  |||||||| |||||||    
T  5757 agggtttcacagcaacatg 5775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 90032 - 89516
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagat 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||||| || |  |||||||||   ||  ||||||  |||| ||||||||||||||| |     
T  90032 ttaatatctaggatgtgtaaatttgttttagtgcctgaggcagtaggttggtgtgcataaaaagcaaataacagaaaataa-gatagttttggaaaacac 89934  T
Q  100 aaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatgat-----agttccacgatagt 190  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||     ||||||||||||||    
T  89933 aaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatctaagttcccctaattggtatactgcacatattcgtattaatgattttctagttccacgatagt 89836  T
Q  191 taacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagt 290  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||     
T  89835 taacaaaatagccctaatcaatcccttgagttaggactctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataattctcgaaggtttgaagc 89736  T
Q  291 acgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaata 390  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||    
T  89735 acgttaacttaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaattcaattaggtctaagtcaaaagttagggtcagta 89636  T
Q  391 gtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
    |||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  89635 gtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattaataataaa 89536  T
Q  491 taaagtttcacaacaacatg 510  Q
    || ||||||||| |||||||    
T  89535 tagagtttcacagcaacatg 89516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 47 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 62729 - 62264
Alignment:
Q  47 tttgattgca-taaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttccc 145  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  62729 tttgattgcaataaaagtaaataa-cagaaaataaagatagttttggaaa-gaaaaagagagagag-----atcaggtctttcgaatcatctatgttccc 62637  T
Q  146 ctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctc 236  Q
    |||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  62636 ctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctc 62537  T
Q  237 aaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagacta 336  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  62536 aaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagacta 62438  T
Q  337 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataa 436  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||    
T  62437 accctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataa 62338  T
Q  437 aaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  62337 aaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 62264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 104 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 64020 - 63611
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||    ||||| |     |||||||| |||||||||    
T  64020 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaatcggtatactgcacctattcttgtgaatgcttttctagttccacaatagttaac 63921  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |     || || ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| ||||    
T  63920 aaaatagtctgaatcaatcccttgagttaggaccctcttatagggttatagcccctaattccttaggtggtataataaccttcgaaggttt-aagcacgt 63822  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||    
T  63821 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaatacaattaggtctaa-tcgaaagctagggtcagtagtca 63723  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | |||||| ||||||||        |  || |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |    
T  63722 ttcgttctcactaaatcatgtttatat--------ttgatcaggagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagaatgtcattcacaataaataga 63631  T
Q  495 gtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  63630 gtttcacagcaacatgtttc 63611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 103 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 19558 - 19142
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||||||    
T  19558 gagagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcctctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattctctagttccacgatagttaa 19459  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  19458 caaaatagtcataatcaatcccttgagttagaactctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataaactttgaaggttttaagaacg 19359  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  19358 ttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtc 19259  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  19258 attcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatag 19159  T
Q  494 agtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||| |||||||    
T  19158 agtttcacagcaacatg 19142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 3)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 106 - 510
Target Start/End: Original strand, 8182 - 8594
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||||     | ||||||||||||||||||    
T  8182 agagagataagatcaggtctttcgaatcatttatgtttccctaattggtatactacacctattcttatgaatgattttctatttccacgatagttaacaa 8281  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8282 aatagtcctaatcgatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 8380  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  8381 acctaatatcacaaacaaacgattatccattcctagactaaccaagtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 8480  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    | |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  8481 cattctcactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaaagcattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagtgt 8580  T
Q  497 ttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| |||||||    
T  8581 ttcacatcaacatg 8594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 176 - 362
Target Start/End: Original strand, 1590 - 1775
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1590 tagttacacaatagttaacaaaatagtcataatcaatcccttgacttaggaccgtcttctcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatct 1689  T
Q  276 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 362  Q
    || || | |||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  1690 ttaaaag-tttaagcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaataattcaatt 1775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 342 - 510
Target Start/End: Original strand, 4187 - 4355
Alignment:
Q  342 gtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaacc 441  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    | |  ||||||||| |    
T  4187 gtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaaagc 4286  T
Q  442 attaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||    
T  4287 tttaagaataattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagtgtttcacatcaacatg 4355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 47 - 514
Target Start/End: Original strand, 3189 - 3661
Alignment:
Q  47 tttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata-aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttccc 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| | ||||||    |||||  | ||||||||| ||||| ||||||||    
T  3189 tttgattgcataaaattaaataaacagaaaataaagatagttttggaaaatatatatgagaga----tgagactaggtctttcgagtcatcaatgttccc 3284  T
Q  146 ctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctc 236  Q
     ||||||||||| | ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3285 ataattggtataatgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttagaaccctcttctc 3384  T
Q  237 aaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagacta 336  Q
    | | || ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||    
T  3385 atattacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaaggttttaagcatgtttacctaatatcactaacaaacgattatccattcctaggtta 3484  T
Q  337 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataa 436  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||    
T  3485 accatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataa 3584  T
Q  437 aaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  3585 aaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactag-ttgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacttgtttc 3661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 104 - 502
Target Start/End: Original strand, 57550 - 57957
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||| |||||  ||||         ||||| |||||||||||||    
T  57550 agagagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcacataattggtatattgcacctattcttatgaacgattttctagtttcacgatagttaac 57649  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||    
T  57650 aaaatagtcctaatctatccattgagttagggccctcttctcaaactacatcccctgattgcttaggtggtctaatactctttgaaggttttacgaacgt 57749  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  57750 taacttaatatcactaataaacgattatccatttctagactaaccatttttattagaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtca 57849  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  57850 ttcattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaaaaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaataga 57949  T
Q  495 gtttcaca 502  Q
    ||||||||    
T  57950 gtttcaca 57957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 198; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 106 - 490
Target Start/End: Complemental strand, 198306 - 197914
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||         |||||||||||||||||||||    
T  198306 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaataattttctagttccacgatagttaacaa 198207  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  198206 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactatagcctctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 198108  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  198107 acctaatatcactaacaaatgattatccattcctagactattcctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 198008  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaa 490  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  198007 cattctcactaaatcatgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcataataaa 197914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0757 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0757
Description:

Target: scaffold0757; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 106 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5511 - 5094
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||| |||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  5511 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatattcccctaattgatatagtgcacctattcttatgaatgattttttagttccacgatagttaacaa 5412  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  5411 aatagtcctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagaacgtta 5313  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatc 396  Q
    || |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||||||||||||| |||||||     
T  5312 acctaatatcactaacaaacgatcatccattcctagactaaccctatttattagaacaatttaattctgtctaagtagaaagctatggtcagtagtcatt 5213  T
Q  397 aattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagt 496  Q
     |||||| | |||||| ||||||||    | |  ||||||||| |||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  5212 cattctcactaaatcatgtttatatttgataaggatataaaaagcattaaaaacagttgaattgaataaaaactatattgtcattcacaataaatagagt 5113  T
Q  497 ttcacaacaacatgtttct 515  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  5112 ttcacaacaacatggttct 5094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 3)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 80 - 510
Target Start/End: Original strand, 3 - 439
Alignment:
Q  80 aagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcg----aatga 175  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    |||||    
T  3 aagatagttttggaaaa-ataaggagagaga--tgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccttaattggtatactgcacctattcgtattaatga 99  T
Q  176 t-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaat 270  Q
    |     | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  100 ttttctaattccacgatagttaacaaaatagccctaataaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggcggtctaat 199  T
Q  271 aatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaa 370  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  200 aatctttcaaggtttttagaacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccatgtttatcagaacaattcaattatatctaa 299  T
Q  371 gttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaact 470  Q
    ||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | || ||| ||||||||    |||  ||||||| | || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  300 gtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaattcatgtttatatttgatcaggatataaagagcaataagaacaattgaattgaataaaaact 399  T
Q  471 agattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    | ||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  400 aaattgtaattaataataaatatagtttcacagcaacatg 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 510
Target Start/End: Original strand, 3733 - 3799
Alignment:
Q  444 taagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3733 taagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatg 3799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 444 - 510
Target Start/End: Original strand, 10863 - 10929
Alignment:
Q  444 taagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  10863 taagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacatg 10929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 176 - 510
Target Start/End: Original strand, 67567 - 67900
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  67567 tagtaccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttcttaaactacaactcctaattccttaggtggtctaataatct 67666  T
Q  276 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaa 375  Q
    | |||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  67667 tcgaaggttt-aagcatgttaacttaatatcactaacaaacgattatatattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttga 67765  T
Q  376 aagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagatt 475  Q
    |||||||||||  |||||||   ||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  67766 aagctatggtcggtagtcattcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagatt 67865  T
Q  476 gtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  67866 gtcattcataataaatagagtttcacagcaacatg 67900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 103 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 293 - 1
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     |||||||||||||||||    
T  293 gagagagagatgagatcaagtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaa 194  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  193 caaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaatttcttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacg 94  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtc 386  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  93 ttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaaccctgtttattagaacaattcaattctgtctaagtagaaagctatggtc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 178; Significance: 9e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 122 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 31238 - 30841
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgtt-cccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaa 211  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    ||| ||     |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31238 gtctttcgaatcatttatgttacccctaattggtatactgcacctattcttgtgaaagagtcactagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaa 31139  T
Q  212 tcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaa 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||     || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  31138 tcccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttaggtggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaa 31040  T
Q  312 taaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatc 411  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||   ||||| | |||||    
T  31039 taaaggattatacattcctagactaaccatgtttattagaacaaatcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcattcgttctcactaaatc 30940  T
Q  412 acgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    |  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  30939 atatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacaacaacatg 30841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 103 - 514
Target Start/End: Original strand, 2965 - 3391
Alignment:
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    ||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||| ||||||||||     
T  2965 gagagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttac 3064  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||     || |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |    
T  3065 caaaatagtcctaatcaatccattgagttaggaccctcttctagtgttacaacccctaattccttaggtggtctaataatcgttgaaggttt-aagcatg 3163  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||    
T  3164 ttaacctaatatcactaataaaggattatccattcgtagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtc 3263  T
Q  394 a----tca---attctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataa 486  Q
    |    |||    ||||| | |||||| ||||||||    | |  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3264 agtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatatttgattaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaa 3363  T
Q  487 taaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3364 taaatagagtttcacagcaacatgtttc 3391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 513
Target Start/End: Original strand, 118312 - 118824
Alignment:
Q  5 tatctaggatttgtaaatta-ttttagtgcccgaggaagtagttttgat-tgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataag 102  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||  |||| | ||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||||| |||||||||| ||    
T  118312 tatctaggatgtgtaaatttcttttagtgcccgaggcagtatgtttgttatgcataaaagtaaataa-cagaaaataa-gatagttctggaaaagatgag 118409  T
Q  103 gagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaa 193  Q
    ||||||    ||| |||| |||||||||||| ||| | ||||| ||||||||  ||| ||| |||||    |||||||     |||| || |||||||||    
T  118410 gagaga----tgatatcaggtctttcgaatcctctgt-ttcccttaattggtccactgcacctattcttatgaatgattcgctagtttcaggatagttaa 118504  T
Q  194 caaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacg 293  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| |||||||| ||||| |    || ||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||  | ||    
T  118505 caaaatagcactaatcaatcccttgacttaggaccctcttcgcgggttacagtctataattccttagatgatctaatattctttgaaggttttacatgcg 118604  T
Q  294 ttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtc 393  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  118605 ttaacctaatatcacaaataaacgattatccattcctagactaaccatgtttatttgaacaattcaattaggtctaagttgaaagctatggtcagtagtc 118704  T
Q  394 atcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataa 493  Q
    ||  |||||| |||| ||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||     
T  118705 attcattctcacgaattcatgtttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactaaattgtcattcacaataaatag 118804  T
Q  494 agtttcacaacaacatgttt 513  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  118805 agtttcacagcaacatgttt 118824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 123 - 514
Target Start/End: Original strand, 58661 - 59062
Alignment:
Q  123 tctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatc 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||    ||||| |     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  58661 tctttcgaatcatctatgttcccctaatttgtatactgcacctattcttgtgaatgcttttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatc 58760  T
Q  214 ccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaata 313  Q
    ||||||||||||||| ||||||     || || ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  58761 ccttgagttaggaccctcttctagggttacagcccctaattccttatgcagtctaataacctttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaata 58859  T
Q  314 aacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaa--ttcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatc 411  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||  |||| || ||| | |||||||   ||||| | |||||    
T  58860 aaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaaaaaaattcaattaggtctaagtcgaaagttagggttagtagtcattcgttctcactaaatc 58959  T
Q  412 acgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgt 511  Q
    | ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  58960 atgtttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgt 59059  T
Q  512 ttc 514  Q
    |||    
T  59060 ttc 59062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2073 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold2073
Description:

Target: scaffold2073; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 725 - 1007
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagata 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||    
T  725 ttaatatctaggatgtgtaaattattttagtgctcgaggcagtagttttgattgcataaaattaaataaatagaaaataaaggtagttttggaaaagata 824  T
Q  101 aggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagtt 191  Q
    |||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    ||||||     ||||||||||||||||    
T  825 aggagagatagatgatatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattatctagttccacgatagtt 924  T
Q  192 aacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatc 274  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  925 aacaaaatagtcctaatcaatcccttgggttaggaccctcttttcaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatc 1007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1755 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold1755
Description:

Target: scaffold1755; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 106 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 280 - 6
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  280 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatatatgttcccctaattggtatactgcacatattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 181  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  180 catagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaacttcagtccctaattgcttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 82  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagt 372  Q
    || |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81 acctaatatcactaacaaaggattatccattcctagactaaccctatttattagaacaattcaattaggtctaagt 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 416 - 89
Alignment:
Q  31 tgcccgaggaagtagttttgatt-gcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcg 129  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||     |||||||  |||||||    
T  416 tgcccgaggcagttgatttgatttgcataaaattaaataaacagaatataaagatagttttggaaaagaataagagagac----gagatcagatctttcg 321  T
Q  130 aatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgag 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  320 aatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgaatgattttctagttttacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgag 221  T
Q  221 ttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgatt 320  Q
    ||| |||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  220 ttaagactctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagaacgttaacctaatatcactaataaaggatt 121  T
Q  321 atccattcatagactaaccatgtttattagaa 352  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  120 attcattcctagactaaccatgattagtagaa 89  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 375 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 90 - 1
Alignment:
Q  375 aaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaata 464  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||| ||||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  90 aaagctatggtcagtagtcattcattctcactaaatcatgtttatatttgatcagaatataaaaagcattaagaacaattgaattgaata 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 176 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 19429 - 19098
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19429 tagttccacgatagttaacaaaatagttctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtgatctaataatct 19330  T
Q  276 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaa 375  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||  |    
T  19329 ttgaaggttttatgcacgttaacctaatatcactaacaaacgattatccattcctagactaacca-------tagaacaattcaattaggtctcagtcga 19237  T
Q  376 aagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaat-aaaaactagat 474  Q
    ||| |||||||| |||||||   ||||| | |||||| | ||||||    |||| |||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19236 aagttatggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatg-ttatatttgatcaagatataacaagcattatgaacaattgaattgaataaaaaactagat 19138  T
Q  475 tgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19137 tgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttc 19098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 29526 - 29112
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||    ||||||     |||||  ||||||||||||    
T  29526 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaatttttatactgcacctattcttgtgaatgagtccctagttttacgatagttaac 29427  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||     || |  ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||    
T  29426 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagggttacaacccctaattcctcacgtggtctaataacttttgaaggttt-aagcacgt 29328  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| |||||     
T  29327 taacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagttatggtcagtagtct 29228  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  29227 ttcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataga 29128  T
Q  495 gtttcacaacaacatg 510  Q
    |||||||| |||||||    
T  29127 gtttcacagcaacatg 29112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 104 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 19441 - 19042
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||    ||||||     |||||  ||||||||||||    
T  19441 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcacctcattggtatactgcacctattcttgtgaatgactccctagttttacgatagttaac 19342  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |  || |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  19341 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttctagagttacaacccctaattccttagatggtctaataacctttgaaggttt-aagcacgt 19243  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| |||||||||||||||| | |||               | |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| |||||     
T  19242 taacctaatatcactaataaaggttta---------------agcatgtttattagaacaattcaattaggtataagtcgaaagctatggtcagtagtcg 19158  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaa 494  Q
    |   ||||| | ||||||  |||||||    |||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |    
T  19157 ttcgttctcactaaatcatatttatatttgatcaggatataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataataga 19058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 125 - 481
Target Start/End: Complemental strand, 10549 - 10185
Alignment:
Q  125 tttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatccc 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||    |||||||     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10549 tttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctattcttgtgaatgattcactagttctacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatccc 10450  T
Q  216 ttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaa 315  Q
    ||||||||||||| ||||||     || |  |||||||| |||||| || ||||||| | |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  10449 ttgagttaggaccatcttctagggttacaacccctaatttcttaggcggactaataaccgttgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaa 10351  T
Q  316 cgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgt 415  Q
     |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||  ||    
T  10350 ggattatccattccttgactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcctgt 10251  T
Q  416 ttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcatt 481  Q
    ||||||    |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10250 ttatatttgatcaggatataaaaaacattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcatt 10185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 106 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 248677 - 248413
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattcgaatga---------tagttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||         ||||||||||| |||||||||    
T  248677 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctattcttatgagtgattttctagttccacgacagttaacaa 248578  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||    
T  248577 aatagtcataatcaatcccttgacttaggaccctcttcacaaactacaacccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaatcatgtta 248479  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 362  Q
    || |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  248478 acctaatatcactaacaaacgattattcattcctagactaaccatgtttattagaacaattcaatt 248413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27268 - 27005
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    |||||||     ||||||| ||||||||||||    
T  27268 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcatctattcttatgaatgattctctagttccatgatagttaacaa 27169  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27168 aatagtcctaatcaatccattgacttaagaccctcttctcaaactacagcccctaattccttaggtggtgtaataatctttgaagg-tttaagcacgtta 27070  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaat 361  Q
    || ||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  27069 acctaatatcacgaacaaacgattatccattcctagactaaccctatttattagaacaattcaat 27005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 441 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 27004 - 26935
Alignment:
Q  441 cattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  27004 cattaagaacaattgaattaaacaaaaactagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 26935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1063 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold1063
Description:

Target: scaffold1063; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2713 - 2385
Alignment:
Q  51 attgcataaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaat 150  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||| |||    ||||||  |||||  | ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2713 attgcacaaaattaaataaacagaaaataaaaatagtattagaaaatatatatggagaga--tgagactaggtctttcgagtcatcaatgttcccctaat 2616  T
Q  151 tggtatactacacatattc----------gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttct 235  Q
    ||||||||| ||| |||||          |||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2615 tggtatactgcacctattcttattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccctcttct 2516  T
Q  236 caaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagac- 334  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  2515 catactacagtccctaattccttaggtgagctaatattctttgaacgttttaagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagact 2416  T
Q  335 -taaccatgtttattagaacaattcaattag 364  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2415 ataaccatgtttattagaacaattcagttag 2385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0233 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0233
Description:

Target: scaffold0233; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 182 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 10014 - 9682
Alignment:
Q  182 cacgatagttaac-aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaa 280  Q
    |||||| |||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |||||||||||||||| ||| | ||||| | ||||||    
T  10014 cacgatggttaaccaaaatagccctaatcaatcccttgacttaggaccctcttctcagattagagtccctaattccttatgtgttataatattatttgaa 9915  T
Q  281 ggttttaagtacgttaac-ttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagc 379  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||     
T  9914 ggttttaagaaagttaaccttaatatcacaaataaacaattaccaattcctagactaactctgtttattcgatcaattcaattaggtctaagttgaaagt 9815  T
Q  380 tatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtca 479  Q
    ||||||||||| ||||  |||||| |||| ||| |||| ||||   |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  |    
T  9814 tatggtcaataatcattcattctcacgaattcatgtttttatgtgatcaatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaat-aaaactatattgata 9716  T
Q  480 ttcataataaataaagtttcacaacaacatgttt 513  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  9715 ttcataagaaatagagtttcacagcaacatgttt 9682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold1785
Description:

Target: scaffold1785; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 176 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 1329 - 1001
Alignment:
Q  176 tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatct 275  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |     || || ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1329 tagttccacaatagttaacaaaatagtctgaatcaatcccttgagttaggaccctcttatagggttatagcccctaattccttaggtggtataataacct 1230  T
Q  276 ttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaa 375  Q
    | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  |    
T  1229 tcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgtttattaaaacaatacaattaggtctaa-tcga 1132  T
Q  376 aagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagatt 475  Q
    |||||| ||||| |||||||   ||||| | |||||| ||||||||        |  || |  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  1131 aagctagggtcagtagtcattcgttctcactaaatcatgtttatat--------ttgatcaggagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagaat 1040  T
Q  476 gtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1039 gtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatgtttc 1001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1785; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 119 - 3
Alignment:
Q  47 tttgattgca-taaaattaaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttccc 145  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||| || || |||||||||     |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  119 tttgattgcaataaaagtaaataa-cagaaaataaagatagttttggaaa-gaaaaagagagagag-----atcaggtctttcgaatcatctatgttccc 27  T
Q  146 ctaattggtatactacacatattc 169  Q
    |||||||||||||| ||| |||||    
T  26 ctaattggtatactgcacctattc 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 122 - 510
Target Start/End: Original strand, 2052 - 2448
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaat 212  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||||| | ||| |||||    |||||||     | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  2052 gtctttagaatcatctatgttctccgaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctaattccacgatacttaacaaaatagccctaatcaat 2151  T
Q  213 cccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaat 312  Q
    |||||||||| ||||  ||||||   | || || || ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  2152 cccttgagttgggactctcttctaggattacagcccgtaatttcttaggtggtctaataatcttcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaat 2250  T
Q  313 aaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcatcaattctcgcgaaatca 412  Q
    ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || || |||| ||   |||||   ||||||    
T  2251 aaaggattatccattcctagattaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagtcgaaatctagggccagtagtaattcgttctcaataaatca 2350  T
Q  413 cgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
      |||||||    |||  ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  2351 tatttatatttgatcaggatgcaaaaagcattaagaacaattgaattgaataaacattagattgtcattcacaataaatagagtttcacagcaacatg 2448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 104 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 241661 - 241434
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||     |||||||     ||||||||||||||||||    
T  241661 agagagatatgagatcagatctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactgcacctatttttatgaatgattctctagttccacgatagttaac 241562  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  241561 aaaatagtcgtaatcaatcccttgagttaggaccctcttctcaaactgcaggccctaattccttaggtggtctaataatctttgaagg-tttaagcacat 241463  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatc 323  Q
    |||| || ||||||||| ||| |||||||    
T  241462 taacctagtatcactaacaaatgattatc 241434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 195 - 476
Target Start/End: Original strand, 48464 - 48743
Alignment:
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgt 294  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | | ||    
T  48464 aaaatagtcataatcaatcccttgacgtaggaccctcttctcagattacggtccctaattccttaggtgatccaatattctttgaaggttttatgaatgt 48563  T
Q  295 taacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgtttattagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtca 394  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||    
T  48564 taacataatatcacaaataaacgattatccattcctaggctaaccttgtttacttgaacaattcaattaggtcaaagttgtaagctagggtcagtagtca 48663  T
Q  395 tcaattctcgcgaaatcacgtttatatggtgtcaatatataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattg 476  Q
    |  | |||  |  | | | |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  48664 ttcaatcttaccgattta-gactatatggtgtcaatatataaaaagcattaagaacaattgaattgaat-aaaactagattg 48743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1809 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold1809
Description:

Target: scaffold1809; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 224 - 1
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatgat-----agttccacgatagttaacaa 196  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    |||||||     ||||||||||||||||||||    
T  224 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatatatgttcccctaattggtatactacac-tgttcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaa 126  T
Q  197 aatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttctcaaactaaagtccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgtta 296  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| | ||||    
T  125 aatagtcctaatcagtcccttgacttaggaccctattctcaaactacaacccctaatttcttaggtggtcaaataatctttgaaag-tttaagcatgtta 27  T
Q  297 acttaatatcactaataaacgattat 322  Q
    || |||||||||||| ||||||||||    
T  26 acctaatatcactaacaaacgattat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 247 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 14248 - 14101
Alignment:
Q  247 ccctaattccttaggtggtctaataatctttgaaggttttaagtacgttaacttaatatcactaataaacgattatccattcatagactaaccatgttta 346  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14248 ccctaattccttaggtgatctaataaccgtcgaaggttt-aagcacgttaacctaatatcactaataaaggattatccattcctagactaaccatgttta 14150  T
Q  347 ttagaacaattcaattaggtctaagttaaaagctatggtcaatagtcat 395  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  14149 ttagaacaattcaattaggtctaagtcgaaagctatggtcagtagtcat 14101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0690 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0690
Description:

Target: scaffold0690; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Original strand, 7596 - 7801
Alignment:
Q  25 ttttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaat-taaataaacagatgataaagatagttttggaaaagataaggagagagagctgagatcatgt 123  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |  |||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||||| ||    
T  7596 ttttagtgcccgaggcagtaggttggtgtgcataaaaagtaaataa-cagaaaataaagatagttttgaaaaagaataggagagaga--tgagatcaggt 7692  T
Q  124 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaacaaaatagtcttaatcaatcc 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||    ||||||     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7693 ctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatattgcacctattcttatgaatgattttctagttccacgatagttaacaaaatagtcctaatcaatcc 7792  T
Q  215 cttgagtta 223  Q
    |||||||||    
T  7793 cttgagtta 7801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 431 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 1572 - 1489
Alignment:
Q  431 atataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  1572 atataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcatacacaataaatagagtttcacagcaacatgtttc 1489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 4059 - 4012
Alignment:
Q  122 gtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc 169  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||    
T  4059 gtctttcgaatcatctatgtttctctaattggtatactgcacctattc 4012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 104 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15573 - 15433
Alignment:
Q  104 agagagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatattc----gaatga-----tagttccacgatagttaac 194  Q
    |||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    ||||||     |||||  ||||||||||||    
T  15573 agagagagatgagtttaggtctttcgaatcatctatgttcccctaattgggatactgcacctattcttgtgaatgagtcgctagttttacgatagttaac 15474  T
Q  195 aaaatagtcttaatcaatcccttgagttaggaccttcttct 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15473 aaaatagtcctaatcaatcccttgagttaggaccctcttct 15433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 431 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 24647 - 24568
Alignment:
Q  431 atataaaaaccattaagaaaaattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatg 510  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||    
T  24647 atataaaaagcattaagaacaattgaattgaataaaaactagattgtcattcacaaataatagagtttcacaacaacatg 24568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0996 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0996
Description:

Target: scaffold0996; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 1780 - 1842
Alignment:
Q  1 ttaatatctaggatttgtaaattattttagtgcccgaggaagtagttttgattgcataaaatt 63  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  1780 ttaatatctaggatgtgtaaattattttagtgcccgagccagtagttttgatggcataaaatt 1842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 168
Target Start/End: Original strand, 14282 - 14344
Alignment:
Q  106 agagagctgagatcatgtctttcgaatcatctatgttcccctaattggtatactacacatatt 168  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  14282 agagagatgagatcaggtctttcgaatcatcgatgttcccctaattggtatactgcacctatt 14344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 461 - 509
Target Start/End: Original strand, 1 - 49
Alignment:
Q  461 aataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacat 509  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1 aataaaaactagattgtcattaataataaatagagtttcacagcaacat 49  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 451 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 31515 - 31453
Alignment:
Q  451 aattgaattgaataaaaactagattgtcattcataataaataaagtttcacaacaacatgtttc 514  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||    
T  31515 aattgaattgaataaaa-ctagattgatattcataagcaatatagtttcacaaccacatgtttc 31453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University