View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2327_high_1 (Length: 929)

Name: NF2327_high_1
Description: NF2327
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2327_high_1
NF2327_high_1
[»] chr1 (235 HSPs)
chr1 (374-910)||(45647767-45648300)
chr1 (9-375)||(1210663-1211029)
chr1 (9-375)||(30202128-30202494)
chr1 (9-376)||(34792346-34792713)
chr1 (9-373)||(49347393-49347757)
chr1 (9-375)||(8671838-8672202)
chr1 (9-376)||(9592652-9593019)
chr1 (9-375)||(22090012-22090380)
chr1 (9-374)||(51440764-51441129)
chr1 (16-375)||(51601983-51602340)
chr1 (12-375)||(32230959-32231315)
chr1 (9-372)||(43240380-43240745)
chr1 (13-376)||(696191-696555)
chr1 (14-375)||(4001453-4001814)
chr1 (81-375)||(4029112-4029406)
chr1 (13-375)||(15085856-15086206)
chr1 (461-910)||(45642830-45643281)
chr1 (13-375)||(32082754-32083105)
chr1 (13-375)||(8391694-8392056)
chr1 (16-375)||(38807669-38808031)
chr1 (109-375)||(25979229-25979495)
chr1 (13-371)||(37462878-37463231)
chr1 (9-338)||(9509236-9509565)
chr1 (175-375)||(37311753-37311953)
chr1 (9-358)||(9599409-9599758)
chr1 (154-375)||(39318193-39318412)
chr1 (208-373)||(52921197-52921362)
chr1 (22-375)||(27847798-27848155)
chr1 (12-370)||(39140434-39140794)
chr1 (13-373)||(18469082-18469440)
chr1 (121-372)||(52561590-52561841)
chr1 (14-375)||(32404525-32404890)
chr1 (92-375)||(48431397-48431687)
chr1 (79-373)||(2544587-2544875)
chr1 (255-375)||(4707219-4707338)
chr1 (241-374)||(32079176-32079307)
chr1 (67-375)||(38868858-38869166)
chr1 (215-375)||(41560353-41560513)
chr1 (263-375)||(24020265-24020377)
chr1 (55-374)||(36623884-36624184)
chr1 (12-375)||(6025526-6025889)
chr1 (79-375)||(3818854-3819150)
chr1 (198-376)||(4415455-4415634)
chr1 (284-375)||(44751677-44751768)
chr1 (291-376)||(29577452-29577537)
chr1 (284-376)||(44941773-44941865)
chr1 (94-375)||(5338727-5338997)
chr1 (79-369)||(40416359-40416649)
chr1 (19-238)||(43423645-43423866)
chr1 (284-373)||(42337749-42337838)
chr1 (13-272)||(34827205-34827462)
chr1 (255-373)||(46423216-46423331)
chr1 (9-375)||(26016355-26016721)
chr1 (121-374)||(8796239-8796492)
chr1 (238-375)||(10200304-10200441)
chr1 (106-375)||(478695-478965)
chr1 (281-375)||(28090692-28090786)
chr1 (227-372)||(29128919-29129065)
chr1 (272-373)||(40568410-40568511)
chr1 (244-375)||(52532614-52532745)
chr1 (9-160)||(1661344-1661499)
chr1 (274-375)||(34444539-34444640)
chr1 (298-373)||(28533674-28533749)
chr1 (34-141)||(52561843-52561950)
chr1 (221-375)||(11941578-11941732)
chr1 (79-373)||(36339804-36340097)
chr1 (274-375)||(6084158-6084259)
chr1 (9-346)||(40419557-40419893)
chr1 (121-365)||(7762445-7762689)
chr1 (41-368)||(19908040-19908371)
chr1 (243-375)||(19936612-19936744)
chr1 (214-375)||(28511795-28511960)
chr1 (301-373)||(38877343-38877415)
chr1 (288-375)||(5113940-5114027)
chr1 (274-373)||(25715326-25715425)
chr1 (54-373)||(35828562-35828869)
chr1 (187-373)||(50806765-50806949)
chr1 (305-375)||(3777258-3777328)
chr1 (283-373)||(21769711-21769801)
chr1 (121-350)||(28528385-28528614)
chr1 (294-375)||(32111987-32112068)
chr1 (262-375)||(43375596-43375709)
chr1 (38-191)||(51812472-51812625)
chr1 (214-372)||(8342885-8343040)
chr1 (92-284)||(37263332-37263523)
chr1 (311-375)||(41165502-41165566)
chr1 (312-375)||(4318843-4318906)
chr1 (9-155)||(14226047-14226191)
chr1 (121-375)||(16272820-16273073)
chr1 (274-375)||(7133300-7133401)
chr1 (300-372)||(4590533-4590605)
chr1 (126-370)||(42501143-42501387)
chr1 (83-375)||(52832037-52832329)
chr1 (29-246)||(39894722-39894934)
chr1 (320-375)||(43481796-43481851)
chr1 (305-375)||(2914121-2914191)
chr1 (193-375)||(26299187-26299352)
chr1 (274-376)||(45510830-45510932)
chr1 (13-159)||(4379927-4380081)
chr1 (287-372)||(22175341-22175426)
chr1 (306-375)||(37430418-37430487)
chr1 (247-375)||(42539210-42539339)
chr1 (288-373)||(50257767-50257852)
chr1 (274-365)||(109002-109092)
chr1 (300-371)||(15437130-15437201)
chr1 (214-369)||(19908388-19908543)
chr1 (214-369)||(29577147-29577301)
chr1 (285-371)||(1290033-1290119)
chr1 (221-338)||(8676897-8677017)
chr1 (13-148)||(19936444-19936571)
chr1 (93-284)||(27637720-27637913)
chr1 (219-357)||(29807984-29808122)
chr1 (298-375)||(17268987-17269064)
chr1 (288-369)||(27072491-27072572)
chr1 (326-375)||(38758018-38758067)
chr1 (298-375)||(50846769-50846846)
chr1 (298-371)||(52073050-52073123)
chr1 (239-372)||(52292188-52292320)
chr1 (298-366)||(2429636-2429704)
chr1 (92-244)||(13827699-13827851)
chr1 (16-160)||(18793201-18793345)
chr1 (298-374)||(30396728-30396804)
chr1 (275-375)||(31274399-31274499)
chr1 (305-373)||(43028808-43028876)
chr1 (235-334)||(16142019-16142118)
chr1 (297-375)||(27704156-27704235)
chr1 (214-372)||(44008702-44008859)
chr1 (276-375)||(50636266-50636365)
chr1 (300-375)||(51584953-51585028)
chr1 (211-309)||(8628150-8628248)
chr1 (121-267)||(9002382-9002528)
chr1 (213-375)||(12930309-12930471)
chr1 (18-156)||(17815402-17815537)
chr1 (293-375)||(26113437-26113519)
chr1 (204-347)||(27520233-27520378)
chr1 (91-309)||(41611806-41612024)
chr1 (321-375)||(52814292-52814346)
chr1 (298-375)||(1704834-1704911)
chr1 (318-375)||(10569069-10569126)
chr1 (274-375)||(11584180-11584281)
chr1 (246-375)||(44905354-44905483)
chr1 (298-367)||(49377508-49377577)
chr1 (217-369)||(8203138-8203290)
chr1 (325-373)||(12231592-12231640)
chr1 (298-370)||(16943362-16943434)
chr1 (136-368)||(30833982-30834214)
chr1 (299-375)||(39525973-39526049)
chr1 (9-89)||(52442788-52442868)
chr1 (100-370)||(990469-990732)
chr1 (91-365)||(10272259-10272530)
chr1 (300-375)||(14224294-14224368)
chr1 (298-369)||(14225840-14225911)
chr1 (150-373)||(33560858-33561081)
chr1 (319-373)||(4380188-4380241)
chr1 (262-370)||(15438800-15438904)
chr1 (274-375)||(40920526-40920628)
chr1 (136-373)||(50771555-50771792)
chr1 (83-160)||(52073675-52073753)
chr1 (310-372)||(52815094-52815155)
chr1 (334-375)||(8809499-8809540)
chr1 (278-375)||(15706969-15707066)
chr1 (322-375)||(49051174-49051227)
chr1 (325-370)||(50830637-50830682)
chr1 (323-375)||(7082536-7082588)
chr1 (92-160)||(8343071-8343139)
chr1 (96-160)||(13827930-13827994)
chr1 (22-157)||(17275137-17275262)
chr1 (275-375)||(35672869-35672969)
chr1 (302-370)||(39797212-39797280)
chr1 (16-88)||(40920822-40920894)
chr1 (321-373)||(43898439-43898491)
chr1 (299-371)||(43934332-43934404)
chr1 (262-350)||(48865730-48865818)
chr1 (329-372)||(853782-853825)
chr1 (298-361)||(7083097-7083160)
chr1 (311-370)||(7210930-7210989)
chr1 (274-349)||(14557751-14557826)
chr1 (13-160)||(16943097-16943243)
chr1 (334-373)||(29975442-29975481)
chr1 (298-353)||(37294128-37294183)
chr1 (17-100)||(41611098-41611181)
chr1 (213-344)||(52878328-52878459)
chr1 (262-333)||(52900682-52900753)
chr1 (309-375)||(2728847-2728913)
chr1 (274-332)||(39776936-39776994)
chr1 (288-370)||(52981410-52981492)
chr1 (334-375)||(6757462-6757503)
chr1 (321-375)||(7601361-7601411)
chr1 (333-370)||(8725812-8725849)
chr1 (16-85)||(16142172-16142241)
chr1 (16-160)||(16822235-16822376)
chr1 (334-375)||(21519167-21519208)
chr1 (298-375)||(39123367-39123443)
chr1 (274-375)||(39515866-39515967)
chr1 (322-367)||(49062469-49062514)
chr1 (14-86)||(51234537-51234610)
chr1 (334-375)||(52901039-52901080)
chr1 (274-358)||(7124324-7124408)
chr1 (321-373)||(14732334-14732386)
chr1 (302-374)||(17640066-17640138)
chr1 (223-368)||(17815611-17815753)
chr1 (298-366)||(37429906-37429974)
chr1 (274-375)||(48861373-48861476)
chr1 (274-374)||(51812692-51812792)
chr1 (298-369)||(2694423-2694494)
chr1 (332-375)||(3059554-3059597)
chr1 (340-375)||(7913781-7913816)
chr1 (340-375)||(7922074-7922109)
chr1 (227-330)||(11331247-11331350)
chr1 (227-330)||(11489268-11489371)
chr1 (328-375)||(22319837-22319884)
chr1 (340-375)||(22930642-22930677)
chr1 (340-375)||(30985306-30985341)
chr1 (117-152)||(31274578-31274613)
chr1 (334-373)||(37831616-37831655)
chr1 (16-207)||(39422209-39422398)
chr1 (102-157)||(44905548-44905603)
chr1 (328-371)||(46388612-46388654)
chr1 (18-84)||(4590813-4590879)
chr1 (99-157)||(7921843-7921901)
chr1 (151-233)||(9602204-9602286)
chr1 (25-168)||(19908573-19908718)
chr1 (299-373)||(34863648-34863722)
chr1 (325-375)||(37099760-37099810)
chr1 (300-365)||(37263566-37263632)
chr1 (293-375)||(41017215-41017296)
chr1 (306-371)||(43598923-43598989)
chr1 (107-185)||(46388392-46388470)
chr1 (340-373)||(4298323-4298356)
chr1 (128-177)||(10569263-10569312)
chr1 (346-375)||(11572405-11572434)
chr1 (300-361)||(30445314-30445375)
chr1 (334-371)||(45168483-45168520)
chr1 (328-369)||(46395056-46395096)
chr1 (340-373)||(51173925-51173958)
[»] chr4 (250 HSPs)
chr4 (9-373)||(31959814-31960178)
chr4 (9-375)||(436147-436513)
chr4 (9-375)||(52569513-52569879)
chr4 (9-375)||(48174091-48174457)
chr4 (9-375)||(4440773-4441137)
chr4 (9-375)||(33227127-33227493)
chr4 (9-374)||(56375208-56375573)
chr4 (9-376)||(33190845-33191212)
chr4 (9-373)||(48622543-48622905)
chr4 (9-374)||(1777016-1777379)
chr4 (9-375)||(53707712-53708078)
chr4 (9-375)||(43433836-43434208)
chr4 (9-373)||(23906297-23906665)
chr4 (9-375)||(46582824-46583188)
chr4 (9-375)||(28236103-28236466)
chr4 (22-375)||(37797783-37798135)
chr4 (9-375)||(47265193-47265566)
chr4 (13-375)||(39100534-39100893)
chr4 (13-373)||(27450180-27450533)
chr4 (9-347)||(50286889-50287217)
chr4 (70-366)||(39708412-39708708)
chr4 (13-374)||(27983122-27983476)
chr4 (115-375)||(8286455-8286723)
chr4 (12-356)||(37773468-37773811)
chr4 (83-370)||(20192025-20192311)
chr4 (79-372)||(26037506-26037799)
chr4 (110-374)||(32479057-32479321)
chr4 (13-370)||(1793382-1793741)
chr4 (187-375)||(21236954-21237142)
chr4 (13-375)||(45204838-45205208)
chr4 (25-374)||(51421666-51422013)
chr4 (11-373)||(20591306-20591662)
chr4 (219-375)||(6957726-6957882)
chr4 (16-309)||(41009414-41009707)
chr4 (219-375)||(12494791-12494947)
chr4 (16-374)||(20601651-20602003)
chr4 (16-375)||(1211390-1211747)
chr4 (9-135)||(12494668-12494794)
chr4 (142-323)||(50679556-50679736)
chr4 (13-375)||(35690226-35690555)
chr4 (12-369)||(54470128-54470485)
chr4 (219-375)||(21528416-21528572)
chr4 (122-372)||(53518325-53518571)
chr4 (219-368)||(7947065-7947214)
chr4 (21-371)||(16002857-16003206)
chr4 (9-159)||(31458946-31459098)
chr4 (263-375)||(19154861-19154973)
chr4 (209-372)||(4548140-4548303)
chr4 (268-375)||(19969358-19969465)
chr4 (136-375)||(31961264-31961503)
chr4 (125-375)||(20821002-20821255)
chr4 (149-374)||(28351617-28351842)
chr4 (9-375)||(56224983-56225352)
chr4 (75-373)||(46372008-46372306)
chr4 (12-373)||(42639020-42639381)
chr4 (143-375)||(2589124-2589356)
chr4 (75-373)||(31897428-31897724)
chr4 (79-375)||(35555648-35555941)
chr4 (9-150)||(49987346-49987487)
chr4 (212-368)||(50862764-50862908)
chr4 (293-375)||(19061933-19062015)
chr4 (9-374)||(7092218-7092583)
chr4 (30-375)||(10208977-10209318)
chr4 (209-373)||(51811280-51811442)
chr4 (9-191)||(33709837-33710024)
chr4 (15-335)||(21106908-21107236)
chr4 (12-153)||(44047568-44047709)
chr4 (262-375)||(55007917-55008030)
chr4 (75-370)||(31339521-31339803)
chr4 (178-375)||(31459093-31459278)
chr4 (300-374)||(49939733-49939807)
chr4 (55-200)||(28497452-28497598)
chr4 (128-375)||(13805263-13805510)
chr4 (264-375)||(34208267-34208378)
chr4 (220-375)||(37488220-37488375)
chr4 (101-375)||(42285701-42285972)
chr4 (13-366)||(34233031-34233393)
chr4 (309-375)||(50238613-50238679)
chr4 (309-375)||(50238699-50238765)
chr4 (214-374)||(2557670-2557831)
chr4 (274-375)||(25575007-25575108)
chr4 (98-283)||(26356626-26356811)
chr4 (13-375)||(29398741-29399088)
chr4 (13-200)||(50662311-50662497)
chr4 (214-375)||(53540413-53540574)
chr4 (259-375)||(5306464-5306580)
chr4 (9-160)||(17900398-17900549)
chr4 (300-375)||(32633404-32633479)
chr4 (9-199)||(51252635-51252823)
chr4 (235-372)||(26024851-26024988)
chr4 (298-375)||(45209203-45209280)
chr4 (9-232)||(25257722-25257943)
chr4 (20-173)||(41192763-41192918)
chr4 (312-375)||(30634104-30634167)
chr4 (220-375)||(31043201-31043356)
chr4 (22-374)||(44360014-44360369)
chr4 (56-304)||(50680704-50680953)
chr4 (16-355)||(55578956-55579295)
chr4 (244-373)||(28550455-28550584)
chr4 (275-375)||(20105516-20105616)
chr4 (279-375)||(25427860-25427956)
chr4 (20-160)||(38570960-38571099)
chr4 (303-375)||(50869878-50869950)
chr4 (300-375)||(7066497-7066571)
chr4 (288-375)||(12443292-12443379)
chr4 (11-373)||(25755237-25755598)
chr4 (9-157)||(31403234-31403384)
chr4 (300-371)||(34585691-34585762)
chr4 (239-370)||(37042667-37042798)
chr4 (116-355)||(47372676-47372915)
chr4 (214-373)||(49987531-49987690)
chr4 (122-370)||(17666053-17666294)
chr4 (15-221)||(2588905-2589120)
chr4 (306-375)||(15661870-15661939)
chr4 (298-375)||(32339766-32339843)
chr4 (292-369)||(36255526-36255603)
chr4 (298-375)||(40932922-40932999)
chr4 (274-375)||(51438628-51438729)
chr4 (274-371)||(55388213-55388310)
chr4 (279-371)||(1095633-1095725)
chr4 (9-141)||(10775654-10775786)
chr4 (314-374)||(15665324-15665384)
chr4 (274-374)||(41192244-41192344)
chr4 (323-375)||(46153940-46153992)
chr4 (68-191)||(1427466-1427589)
chr4 (298-377)||(3979127-3979206)
chr4 (298-373)||(8284346-8284421)
chr4 (274-373)||(29209175-29209274)
chr4 (9-84)||(43070053-43070128)
chr4 (298-373)||(49738550-49738625)
chr4 (224-370)||(13296566-13296712)
chr4 (325-375)||(56130404-56130454)
chr4 (94-374)||(22420716-22420993)
chr4 (274-371)||(22873601-22873698)
chr4 (302-375)||(44719359-44719432)
chr4 (215-288)||(55809075-55809148)
chr4 (76-168)||(30621409-30621501)
chr4 (321-373)||(38017319-38017371)
chr4 (320-375)||(1328612-1328667)
chr4 (320-375)||(4879107-4879162)
chr4 (17-88)||(25967552-25967623)
chr4 (79-373)||(40018189-40018477)
chr4 (13-168)||(45175930-45176083)
chr4 (310-373)||(46236708-46236771)
chr4 (298-369)||(49686900-49686971)
chr4 (301-375)||(6958237-6958310)
chr4 (305-371)||(21359227-21359293)
chr4 (165-374)||(21945644-21945846)
chr4 (231-309)||(41009283-41009361)
chr4 (62-160)||(46715585-46715678)
chr4 (230-375)||(56439568-56439714)
chr4 (298-367)||(7544537-7544605)
chr4 (224-357)||(8598957-8599090)
chr4 (272-329)||(41729494-41729551)
chr4 (16-160)||(50471453-50471595)
chr4 (293-374)||(50967027-50967108)
chr4 (321-373)||(28348287-28348339)
chr4 (221-373)||(31403034-31403186)
chr4 (12-79)||(18966474-18966541)
chr4 (220-375)||(20999129-20999284)
chr4 (300-375)||(35622674-35622749)
chr4 (300-375)||(36556758-36556833)
chr4 (300-375)||(39446908-39446983)
chr4 (321-376)||(44047367-44047422)
chr4 (213-371)||(45184135-45184291)
chr4 (302-373)||(47372915-47372986)
chr4 (105-160)||(47611741-47611796)
chr4 (333-375)||(8327143-8327185)
chr4 (300-370)||(13262421-13262491)
chr4 (55-157)||(36557246-36557347)
chr4 (320-373)||(813147-813200)
chr4 (298-367)||(1965639-1965708)
chr4 (329-374)||(6478662-6478706)
chr4 (302-371)||(17900691-17900760)
chr4 (304-373)||(32613643-32613712)
chr4 (320-373)||(54529647-54529700)
chr4 (98-205)||(20131167-20131274)
chr4 (311-375)||(26275014-26275078)
chr4 (293-373)||(36799657-36799737)
chr4 (311-375)||(38585249-38585313)
chr4 (56-168)||(38903925-38904036)
chr4 (105-185)||(45185215-45185295)
chr4 (333-373)||(49416949-49416989)
chr4 (321-373)||(50471757-50471809)
chr4 (298-375)||(56200153-56200234)
chr4 (300-375)||(883358-883433)
chr4 (340-375)||(26772535-26772570)
chr4 (79-206)||(38266134-38266261)
chr4 (214-368)||(47147496-47147648)
chr4 (340-375)||(49454477-49454512)
chr4 (217-328)||(50287988-50288099)
chr4 (288-375)||(54963648-54963734)
chr4 (321-371)||(8598898-8598948)
chr4 (135-201)||(20605241-20605307)
chr4 (14-157)||(45423542-45423681)
chr4 (293-375)||(54935351-54935433)
chr4 (15-160)||(934649-934793)
chr4 (20-157)||(1380296-1380433)
chr4 (311-360)||(14623243-14623292)
chr4 (340-373)||(26357008-26357041)
chr4 (262-355)||(28486092-28486185)
chr4 (325-370)||(32630495-32630540)
chr4 (274-371)||(34379586-34379682)
chr4 (340-373)||(38789623-38789656)
chr4 (318-375)||(42293263-42293320)
chr4 (338-375)||(48451071-48451108)
chr4 (320-369)||(52359963-52360012)
chr4 (76-157)||(55768717-55768798)
chr4 (76-157)||(55832973-55833054)
chr4 (327-371)||(20047670-20047714)
chr4 (319-375)||(25959225-25959281)
chr4 (334-370)||(32745831-32745867)
chr4 (107-159)||(44860862-44860914)
chr4 (92-160)||(49738817-49738885)
chr4 (340-375)||(3601417-3601452)
chr4 (321-372)||(4136744-4136795)
chr4 (324-371)||(8459056-8459103)
chr4 (332-367)||(10536580-10536615)
chr4 (9-242)||(11389638-11389875)
chr4 (311-373)||(11400444-11400507)
chr4 (311-373)||(11410171-11410234)
chr4 (332-375)||(23294023-23294066)
chr4 (298-373)||(27338387-27338462)
chr4 (302-353)||(28467649-28467700)
chr4 (340-375)||(35585854-35585889)
chr4 (332-375)||(43774098-43774141)
chr4 (320-375)||(46539109-46539164)
chr4 (340-375)||(49370043-49370078)
chr4 (340-375)||(51051453-51051488)
chr4 (300-371)||(51550251-51550322)
chr4 (332-375)||(52357924-52357967)
chr4 (321-359)||(1380600-1380638)
chr4 (293-375)||(1989785-1989867)
chr4 (315-373)||(6931722-6931780)
chr4 (329-371)||(10775473-10775515)
chr4 (321-375)||(20654868-20654922)
chr4 (243-333)||(30621241-30621331)
chr4 (94-152)||(42293470-42293528)
chr4 (333-375)||(44940738-44940780)
chr4 (341-375)||(49416204-49416238)
chr4 (301-375)||(51176784-51176858)
chr4 (343-377)||(51879747-51879781)
chr4 (341-375)||(53413941-53413975)
chr4 (311-369)||(53517725-53517783)
chr4 (262-375)||(26510559-26510671)
chr4 (328-373)||(28764374-28764419)
chr4 (14-71)||(40933198-40933255)
chr4 (298-375)||(51841196-51841273)
chr4 (272-373)||(55768500-55768600)
chr4 (272-373)||(55832756-55832856)
[»] chr3 (199 HSPs)
chr3 (9-375)||(52138718-52139084)
chr3 (9-375)||(28245355-28245721)
chr3 (9-375)||(54278938-54279303)
chr3 (9-375)||(51447715-51448073)
chr3 (13-375)||(21995-22356)
chr3 (13-375)||(5168750-5169116)
chr3 (14-373)||(47233596-47233955)
chr3 (9-373)||(25191297-25191659)
chr3 (74-373)||(35033129-35033428)
chr3 (9-374)||(54128296-54128662)
chr3 (9-274)||(33272122-33272392)
chr3 (124-375)||(48508268-48508519)
chr3 (16-375)||(53519511-53519864)
chr3 (79-373)||(38850108-38850403)
chr3 (203-375)||(12096703-12096875)
chr3 (11-375)||(43694769-43695127)
chr3 (16-375)||(19676079-19676447)
chr3 (33-373)||(45289091-45289434)
chr3 (30-375)||(49503566-49503897)
chr3 (38-371)||(39600683-39601016)
chr3 (9-265)||(45728064-45728324)
chr3 (92-374)||(50960636-50960914)
chr3 (55-367)||(38430807-38431129)
chr3 (230-375)||(52156082-52156227)
chr3 (25-373)||(48734147-48734481)
chr3 (13-363)||(19736918-19737255)
chr3 (21-363)||(19757829-19758158)
chr3 (79-240)||(38060419-38060580)
chr3 (98-338)||(48953454-48953697)
chr3 (107-364)||(39235154-39235409)
chr3 (13-372)||(26490239-26490596)
chr3 (95-375)||(42510014-42510292)
chr3 (9-309)||(27917490-27917788)
chr3 (235-373)||(38060858-38060996)
chr3 (269-375)||(47555330-47555436)
chr3 (245-375)||(53262295-53262425)
chr3 (29-296)||(3186707-3186973)
chr3 (61-374)||(31454224-31454537)
chr3 (81-373)||(54364976-54365268)
chr3 (79-371)||(30294125-30294418)
chr3 (236-373)||(49042081-49042219)
chr3 (55-373)||(54424959-54425289)
chr3 (262-375)||(311307-311420)
chr3 (284-375)||(7895878-7895969)
chr3 (67-331)||(52678892-52679154)
chr3 (260-375)||(2133610-2133725)
chr3 (225-361)||(17022684-17022820)
chr3 (285-375)||(48532151-48532242)
chr3 (244-373)||(15296060-15296189)
chr3 (9-370)||(49841529-49841895)
chr3 (116-311)||(19162650-19162842)
chr3 (300-373)||(31566161-31566234)
chr3 (13-373)||(2340717-2341074)
chr3 (300-375)||(40273203-40273278)
chr3 (102-356)||(37351418-37351672)
chr3 (278-373)||(30797822-30797917)
chr3 (274-373)||(40106620-40106719)
chr3 (308-375)||(45834598-45834665)
chr3 (225-374)||(45486848-45487000)
chr3 (13-233)||(50249303-50249529)
chr3 (19-156)||(344928-345065)
chr3 (262-375)||(29601063-29601176)
chr3 (106-373)||(36303994-36304248)
chr3 (274-375)||(39208791-39208892)
chr3 (305-370)||(41529975-41530040)
chr3 (215-375)||(27893213-27893373)
chr3 (9-160)||(36820174-36820323)
chr3 (298-374)||(46148235-46148311)
chr3 (92-332)||(21200551-21200787)
chr3 (284-375)||(33271908-33271999)
chr3 (9-88)||(38850012-38850091)
chr3 (280-375)||(45374475-45374570)
chr3 (285-375)||(52927846-52927936)
chr3 (55-168)||(3987011-3987124)
chr3 (300-373)||(24778609-24778682)
chr3 (262-363)||(40116348-40116449)
chr3 (77-206)||(41842678-41842806)
chr3 (107-371)||(659541-659805)
chr3 (298-374)||(37083291-37083367)
chr3 (13-368)||(46431684-46432031)
chr3 (274-373)||(14415260-14415358)
chr3 (13-368)||(23534576-23534929)
chr3 (274-373)||(40991614-40991713)
chr3 (218-373)||(11284120-11284270)
chr3 (284-362)||(24541343-24541421)
chr3 (275-373)||(48712075-48712173)
chr3 (79-256)||(11581432-11581609)
chr3 (92-373)||(42026536-42026817)
chr3 (214-373)||(29475811-29475968)
chr3 (214-375)||(41482141-41482298)
chr3 (302-373)||(7278675-7278746)
chr3 (301-372)||(21862742-21862813)
chr3 (13-148)||(31337751-31337884)
chr3 (311-373)||(52882662-52882724)
chr3 (298-375)||(388260-388337)
chr3 (55-159)||(29600863-29600968)
chr3 (298-375)||(31146907-31146983)
chr3 (325-374)||(39512777-39512826)
chr3 (281-374)||(39781917-39782009)
chr3 (311-372)||(45468795-45468856)
chr3 (278-370)||(32170592-32170684)
chr3 (13-85)||(45236778-45236850)
chr3 (300-375)||(3987543-3987618)
chr3 (300-375)||(20208207-20208282)
chr3 (9-152)||(29817422-29817565)
chr3 (13-88)||(30345445-30345520)
chr3 (279-375)||(35420455-35420552)
chr3 (279-370)||(49045023-49045114)
chr3 (253-373)||(54422837-54422963)
chr3 (309-371)||(31452963-31453025)
chr3 (222-336)||(40116505-40116619)
chr3 (321-375)||(50249607-50249661)
chr3 (9-54)||(47542031-47542076)
chr3 (214-370)||(45493695-45493851)
chr3 (298-370)||(46367390-46367462)
chr3 (313-373)||(53214871-53214931)
chr3 (279-374)||(4472386-4472481)
chr3 (300-375)||(30332558-30332633)
chr3 (9-88)||(46568034-46568113)
chr3 (313-371)||(21427586-21427644)
chr3 (334-376)||(48259947-48259989)
chr3 (13-75)||(48953694-48953756)
chr3 (215-284)||(26990337-26990406)
chr3 (299-376)||(31260964-31261040)
chr3 (306-371)||(35481143-35481208)
chr3 (298-375)||(39535399-39535475)
chr3 (327-376)||(44102953-44103002)
chr3 (306-371)||(49888402-49888467)
chr3 (311-375)||(344770-344834)
chr3 (69-160)||(31453151-31453242)
chr3 (225-376)||(34844569-34844721)
chr3 (335-375)||(35701093-35701133)
chr3 (14-86)||(38054624-38054696)
chr3 (321-377)||(49933436-49933492)
chr3 (298-373)||(7120790-7120865)
chr3 (340-375)||(23610930-23610965)
chr3 (334-373)||(27192466-27192505)
chr3 (328-375)||(35032764-35032811)
chr3 (274-368)||(36049309-36049401)
chr3 (311-374)||(37102807-37102870)
chr3 (311-374)||(40672366-40672429)
chr3 (225-376)||(43308696-43308847)
chr3 (340-375)||(43529295-43529330)
chr3 (333-375)||(237294-237336)
chr3 (302-368)||(6988113-6988179)
chr3 (302-372)||(21427995-21428065)
chr3 (24-150)||(26388414-26388540)
chr3 (298-372)||(34719081-34719155)
chr3 (96-150)||(37534429-37534483)
chr3 (98-160)||(39535653-39535715)
chr3 (293-375)||(53266893-53266975)
chr3 (338-375)||(829149-829186)
chr3 (119-168)||(3870649-3870698)
chr3 (328-369)||(8566670-8566711)
chr3 (321-370)||(26990442-26990491)
chr3 (288-357)||(27795996-27796065)
chr3 (187-373)||(31337560-31337741)
chr3 (32-112)||(33307087-33307165)
chr3 (320-369)||(34253689-34253738)
chr3 (320-373)||(35465758-35465811)
chr3 (266-367)||(41842529-41842630)
chr3 (301-370)||(46140617-46140686)
chr3 (321-370)||(54485767-54485816)
chr3 (301-361)||(7942864-7942924)
chr3 (327-375)||(24084320-24084368)
chr3 (333-373)||(43396082-43396122)
chr3 (333-369)||(52077473-52077509)
chr3 (320-375)||(7446274-7446329)
chr3 (320-375)||(7454416-7454471)
chr3 (340-375)||(21000720-21000755)
chr3 (340-375)||(36764934-36764969)
chr3 (322-373)||(40122645-40122696)
chr3 (340-375)||(41230513-41230548)
chr3 (92-159)||(44134044-44134111)
chr3 (328-371)||(44443208-44443250)
chr3 (343-374)||(48328200-48328231)
chr3 (300-375)||(50631879-50631954)
chr3 (274-374)||(55244461-55244565)
chr3 (330-364)||(944467-944501)
chr3 (329-375)||(4660165-4660211)
chr3 (340-374)||(21506270-21506304)
chr3 (329-375)||(34067137-34067183)
chr3 (94-160)||(36868437-36868503)
chr3 (298-371)||(37598171-37598245)
chr3 (9-51)||(42510333-42510375)
chr3 (299-373)||(44133845-44133918)
chr3 (292-362)||(53951956-53952026)
chr3 (345-374)||(21513070-21513099)
chr3 (317-354)||(24103420-24103457)
chr3 (345-374)||(26874857-26874886)
chr3 (296-373)||(32052395-32052472)
chr3 (322-375)||(34812775-34812828)
chr3 (329-366)||(37102989-37103026)
chr3 (332-373)||(41965819-41965860)
chr3 (298-367)||(41971277-41971345)
chr3 (298-371)||(47804666-47804738)
chr3 (332-373)||(49090632-49090673)
chr3 (13-86)||(50621647-50621720)
chr3 (322-375)||(53266818-53266871)
[»] chr7 (218 HSPs)
chr7 (9-376)||(37617862-37618230)
chr7 (9-375)||(11593878-11594244)
chr7 (12-373)||(34869341-34869702)
chr7 (9-375)||(12841273-12841639)
chr7 (9-375)||(49029194-49029559)
chr7 (9-366)||(35906208-35906565)
chr7 (13-375)||(39906370-39906730)
chr7 (9-375)||(33349804-33350170)
chr7 (9-375)||(44855172-44855536)
chr7 (9-371)||(46355858-46356219)
chr7 (13-375)||(45836480-45836840)
chr7 (9-320)||(13859061-13859372)
chr7 (56-375)||(6374833-6375152)
chr7 (11-375)||(36651914-36652276)
chr7 (15-375)||(43281600-43281958)
chr7 (9-375)||(31005141-31005489)
chr7 (14-372)||(35558994-35559353)
chr7 (91-375)||(31682600-31682884)
chr7 (56-375)||(29650349-29650668)
chr7 (13-375)||(43491230-43491592)
chr7 (13-375)||(38606927-38607276)
chr7 (77-375)||(2885720-2886018)
chr7 (94-375)||(22349623-22349904)
chr7 (92-375)||(36869235-36869525)
chr7 (9-247)||(33072872-33073108)
chr7 (16-372)||(23404343-23404697)
chr7 (14-373)||(36136687-36137046)
chr7 (204-375)||(38900070-38900240)
chr7 (101-375)||(15682184-15682458)
chr7 (22-370)||(28627936-28628284)
chr7 (208-373)||(40979928-40980093)
chr7 (130-375)||(32631615-32631848)
chr7 (164-371)||(31681022-31681226)
chr7 (142-374)||(7273151-7273383)
chr7 (13-330)||(47848596-47848912)
chr7 (149-375)||(24598186-24598411)
chr7 (226-373)||(48919247-48919394)
chr7 (248-374)||(27648937-27649063)
chr7 (26-373)||(8492236-8492580)
chr7 (242-374)||(21078068-21078200)
chr7 (13-203)||(7272961-7273151)
chr7 (213-375)||(9210702-9210864)
chr7 (147-374)||(1011103-1011329)
chr7 (109-375)||(38135211-38135476)
chr7 (13-133)||(32630517-32630636)
chr7 (267-374)||(33073105-33073212)
chr7 (94-375)||(12966025-12966300)
chr7 (278-375)||(28208326-28208423)
chr7 (263-372)||(34035155-34035264)
chr7 (9-209)||(36514371-36514569)
chr7 (13-245)||(25579205-25579431)
chr7 (9-375)||(36101775-36102129)
chr7 (16-256)||(43282330-43282574)
chr7 (214-370)||(45601599-45601755)
chr7 (55-195)||(46014359-46014498)
chr7 (13-296)||(7189296-7189593)
chr7 (16-375)||(48735899-48736256)
chr7 (55-375)||(26741892-26742215)
chr7 (9-367)||(5335840-5336193)
chr7 (16-200)||(39811882-39812066)
chr7 (221-375)||(42187572-42187725)
chr7 (269-370)||(47852265-47852366)
chr7 (9-88)||(36869574-36869653)
chr7 (238-372)||(14057625-14057759)
chr7 (238-372)||(14367653-14367787)
chr7 (300-374)||(31869101-31869175)
chr7 (13-158)||(42187393-42187537)
chr7 (13-198)||(19262609-19262791)
chr7 (226-372)||(34745882-34746028)
chr7 (263-375)||(42969870-42969982)
chr7 (266-374)||(47652722-47652830)
chr7 (10-106)||(24598409-24598509)
chr7 (296-371)||(24777166-24777241)
chr7 (9-375)||(14593679-14594036)
chr7 (278-372)||(24177628-24177721)
chr7 (9-160)||(30200176-30200323)
chr7 (309-375)||(40630652-40630718)
chr7 (10-159)||(28020883-28021032)
chr7 (79-159)||(27021906-27021986)
chr7 (248-375)||(28355322-28355450)
chr7 (274-373)||(33732017-33732114)
chr7 (92-200)||(40169650-40169758)
chr7 (138-345)||(1569063-1569270)
chr7 (235-370)||(40149016-40149150)
chr7 (265-375)||(33103100-33103210)
chr7 (262-375)||(27893561-27893674)
chr7 (306-375)||(28708596-28708665)
chr7 (303-376)||(31840442-31840515)
chr7 (224-373)||(37976368-37976517)
chr7 (211-375)||(44951274-44951439)
chr7 (126-375)||(48202701-48202949)
chr7 (274-373)||(34341395-34341494)
chr7 (253-373)||(40415169-40415295)
chr7 (9-160)||(16013202-16013357)
chr7 (188-374)||(19119423-19119608)
chr7 (293-375)||(25891090-25891172)
chr7 (9-199)||(1740715-1740909)
chr7 (298-375)||(4604754-4604831)
chr7 (235-336)||(36239833-36239934)
chr7 (298-375)||(48515482-48515559)
chr7 (311-375)||(5418294-5418358)
chr7 (311-371)||(6263479-6263539)
chr7 (300-372)||(34029677-34029749)
chr7 (277-357)||(34926538-34926618)
chr7 (224-372)||(38103616-38103762)
chr7 (97-374)||(7220750-7221039)
chr7 (262-373)||(8519046-8519157)
chr7 (300-375)||(16013484-16013559)
chr7 (9-376)||(24549686-24550051)
chr7 (278-373)||(30814125-30814220)
chr7 (92-163)||(38920795-38920866)
chr7 (147-374)||(1531372-1531587)
chr7 (114-248)||(6420615-6420749)
chr7 (301-375)||(33281097-33281170)
chr7 (274-375)||(2882734-2882835)
chr7 (298-375)||(41483694-41483771)
chr7 (55-160)||(41948480-41948585)
chr7 (301-373)||(20158671-20158743)
chr7 (262-373)||(28541943-28542055)
chr7 (311-375)||(29312209-29312273)
chr7 (315-375)||(29318793-29318853)
chr7 (311-375)||(47700054-47700117)
chr7 (320-375)||(20525050-20525105)
chr7 (224-375)||(47796150-47796301)
chr7 (92-282)||(18605237-18605427)
chr7 (328-374)||(21244282-21244328)
chr7 (145-375)||(33139208-33139437)
chr7 (92-190)||(35713696-35713794)
chr7 (9-160)||(40830146-40830292)
chr7 (293-370)||(36245259-36245336)
chr7 (300-373)||(45558539-45558611)
chr7 (301-361)||(17759483-17759543)
chr7 (311-371)||(30144975-30145035)
chr7 (300-373)||(38921086-38921161)
chr7 (298-370)||(39812145-39812217)
chr7 (10-168)||(40139124-40139279)
chr7 (81-157)||(45558352-45558428)
chr7 (304-375)||(1523856-1523927)
chr7 (300-375)||(6807700-6807775)
chr7 (224-327)||(21517426-21517529)
chr7 (300-375)||(35865912-35865987)
chr7 (321-372)||(39738446-39738497)
chr7 (298-373)||(40138948-40139023)
chr7 (299-374)||(41461318-41461393)
chr7 (218-353)||(43281958-43282092)
chr7 (38-150)||(47796359-47796473)
chr7 (22-88)||(1523747-1523813)
chr7 (92-282)||(18637563-18637753)
chr7 (92-282)||(18650997-18651187)
chr7 (293-371)||(24376025-24376103)
chr7 (293-375)||(48515373-48515455)
chr7 (314-375)||(17907722-17907783)
chr7 (262-375)||(25731472-25731585)
chr7 (302-375)||(28021146-28021219)
chr7 (298-375)||(40008429-40008506)
chr7 (83-206)||(5418071-5418195)
chr7 (321-365)||(6682583-6682627)
chr7 (331-375)||(20899411-20899455)
chr7 (16-88)||(27021991-27022063)
chr7 (92-296)||(28562443-28562647)
chr7 (323-375)||(30199965-30200017)
chr7 (274-373)||(32879192-32879292)
chr7 (335-375)||(43423989-43424029)
chr7 (275-334)||(6807388-6807447)
chr7 (214-345)||(22174123-22174254)
chr7 (262-333)||(31859046-31859117)
chr7 (340-375)||(35725569-35725604)
chr7 (244-351)||(40391845-40391952)
chr7 (220-371)||(40830331-40830481)
chr7 (214-336)||(44401164-44401284)
chr7 (298-365)||(45054311-45054378)
chr7 (21-148)||(45841206-45841332)
chr7 (340-375)||(47413713-47413748)
chr7 (274-376)||(3457544-3457645)
chr7 (145-223)||(26925264-26925342)
chr7 (109-199)||(30144793-30144883)
chr7 (298-372)||(30914503-30914577)
chr7 (340-374)||(33650869-33650903)
chr7 (298-368)||(33871479-33871549)
chr7 (321-375)||(45840994-45841048)
chr7 (330-375)||(12241684-12241728)
chr7 (300-373)||(25578069-25578142)
chr7 (320-373)||(25579103-25579156)
chr7 (81-158)||(30632958-30633035)
chr7 (303-375)||(475987-476059)
chr7 (94-198)||(3457368-3457471)
chr7 (339-375)||(3928344-3928380)
chr7 (298-374)||(19262457-19262533)
chr7 (321-377)||(26847836-26847892)
chr7 (303-375)||(27021723-27021795)
chr7 (333-373)||(35734691-35734731)
chr7 (333-373)||(41157897-41157937)
chr7 (214-374)||(42177018-42177177)
chr7 (121-168)||(9797909-9797956)
chr7 (93-152)||(27893769-27893828)
chr7 (92-167)||(30914674-30914749)
chr7 (29-88)||(35713617-35713676)
chr7 (245-368)||(35922407-35922530)
chr7 (67-134)||(37439580-37439647)
chr7 (334-372)||(635309-635347)
chr7 (340-374)||(5577498-5577532)
chr7 (9-83)||(29653844-29653918)
chr7 (340-370)||(30188512-30188542)
chr7 (313-375)||(35066744-35066805)
chr7 (332-374)||(38504695-38504737)
chr7 (13-154)||(40008636-40008777)
chr7 (320-374)||(41948724-41948778)
chr7 (333-371)||(48735683-48735721)
chr7 (92-160)||(6429156-6429225)
chr7 (79-148)||(23720829-23720898)
chr7 (30-87)||(25731639-25731696)
chr7 (55-160)||(25826683-25826788)
chr7 (306-347)||(37595891-37595932)
chr7 (60-133)||(42177255-42177328)
chr7 (338-371)||(43653184-43653217)
chr7 (340-369)||(44930960-44930989)
chr7 (321-362)||(47155183-47155224)
chr7 (297-374)||(47185807-47185883)
[»] chr8 (194 HSPs)
chr8 (9-376)||(36565238-36565605)
chr8 (9-375)||(36545065-36545433)
chr8 (9-372)||(36394949-36395314)
chr8 (57-375)||(11523721-11524040)
chr8 (9-375)||(40813240-40813608)
chr8 (9-375)||(39946775-39947132)
chr8 (13-375)||(42854002-42854364)
chr8 (93-370)||(12491141-12491418)
chr8 (9-372)||(2796473-2796838)
chr8 (13-374)||(18125097-18125454)
chr8 (38-375)||(21121105-21121429)
chr8 (13-373)||(45419161-45419517)
chr8 (13-375)||(37077687-37078033)
chr8 (165-375)||(42469725-42469935)
chr8 (63-370)||(8932676-8932982)
chr8 (14-373)||(29520583-29520931)
chr8 (13-373)||(8879446-8879800)
chr8 (192-375)||(2027631-2027814)
chr8 (241-374)||(25473402-25473535)
chr8 (23-375)||(32043522-32043871)
chr8 (111-373)||(26904908-26905168)
chr8 (218-375)||(14742080-14742234)
chr8 (13-251)||(18751998-18752233)
chr8 (9-374)||(39953263-39953628)
chr8 (262-373)||(44529396-44529507)
chr8 (264-375)||(44047530-44047641)
chr8 (94-338)||(43904700-43904947)
chr8 (116-375)||(30559718-30559982)
chr8 (100-375)||(32930970-32931244)
chr8 (83-349)||(29700268-29700534)
chr8 (253-375)||(15215410-15215532)
chr8 (262-375)||(490506-490619)
chr8 (14-285)||(10079995-10080264)
chr8 (181-372)||(35362651-35362842)
chr8 (9-371)||(16917102-16917462)
chr8 (102-375)||(35643606-35643872)
chr8 (149-369)||(12025847-12026058)
chr8 (243-374)||(45041315-45041445)
chr8 (11-157)||(13171865-13172011)
chr8 (13-367)||(16351312-16351653)
chr8 (219-375)||(23492163-23492318)
chr8 (239-372)||(25288912-25289045)
chr8 (239-372)||(25300247-25300380)
chr8 (9-194)||(30748377-30748560)
chr8 (220-373)||(35914601-35914754)
chr8 (13-309)||(45512558-45512856)
chr8 (214-373)||(2216411-2216568)
chr8 (15-185)||(6510616-6510784)
chr8 (13-375)||(5908564-5908930)
chr8 (42-191)||(7046285-7046434)
chr8 (214-375)||(43733330-43733490)
chr8 (284-376)||(10668494-10668586)
chr8 (9-85)||(12492130-12492206)
chr8 (301-376)||(1928584-1928659)
chr8 (213-375)||(28169514-28169675)
chr8 (127-375)||(42584407-42584642)
chr8 (175-371)||(7531646-7531842)
chr8 (122-315)||(9904940-9905132)
chr8 (214-375)||(30198264-30198425)
chr8 (214-375)||(30812814-30812975)
chr8 (299-375)||(32276893-32276969)
chr8 (295-375)||(32569708-32569788)
chr8 (274-370)||(44699649-44699745)
chr8 (43-158)||(9695583-9695698)
chr8 (263-375)||(31715992-31716106)
chr8 (9-229)||(39760572-39760788)
chr8 (25-160)||(44681252-44681387)
chr8 (60-161)||(12796912-12797011)
chr8 (263-373)||(26363660-26363768)
chr8 (229-375)||(39967497-39967643)
chr8 (15-168)||(2518597-2518749)
chr8 (298-375)||(27556300-27556377)
chr8 (13-154)||(30113416-30113557)
chr8 (9-105)||(25288820-25288916)
chr8 (9-105)||(25300155-25300251)
chr8 (213-372)||(3801995-3802154)
chr8 (298-373)||(12611704-12611779)
chr8 (13-88)||(15215556-15215631)
chr8 (284-375)||(8255529-8255622)
chr8 (239-372)||(14459043-14459177)
chr8 (274-375)||(3473753-3473854)
chr8 (79-374)||(13589474-13589762)
chr8 (311-376)||(35323993-35324058)
chr8 (321-369)||(26055651-26055699)
chr8 (9-206)||(36143287-36143480)
chr8 (288-372)||(36143538-36143622)
chr8 (9-144)||(30456441-30456575)
chr8 (298-373)||(35646930-35647005)
chr8 (220-347)||(38391919-38392046)
chr8 (320-375)||(41031418-41031473)
chr8 (320-375)||(41031524-41031579)
chr8 (9-143)||(42493536-42493668)
chr8 (188-302)||(5266027-5266140)
chr8 (96-206)||(10824331-10824441)
chr8 (326-375)||(1064955-1065004)
chr8 (274-375)||(21425229-21425330)
chr8 (298-375)||(30689942-30690019)
chr8 (13-374)||(30783041-30783400)
chr8 (311-376)||(39651025-39651090)
chr8 (298-370)||(1313771-1313843)
chr8 (13-133)||(13986416-13986536)
chr8 (219-375)||(14903689-14903845)
chr8 (14-154)||(39051065-39051205)
chr8 (298-375)||(41212068-41212147)
chr8 (274-376)||(43350728-43350827)
chr8 (300-375)||(36042407-36042482)
chr8 (300-375)||(38901817-38901892)
chr8 (79-160)||(2776442-2776524)
chr8 (94-160)||(18474173-18474239)
chr8 (32-241)||(25985462-25985668)
chr8 (211-293)||(28269759-28269840)
chr8 (302-367)||(18741843-18741908)
chr8 (302-367)||(18746807-18746872)
chr8 (263-372)||(36069774-36069883)
chr8 (216-375)||(39388907-39389070)
chr8 (214-375)||(41444337-41444501)
chr8 (322-374)||(4558207-4558259)
chr8 (215-375)||(16994442-16994602)
chr8 (222-338)||(17491689-17491805)
chr8 (300-372)||(18473973-18474045)
chr8 (220-375)||(79156-79310)
chr8 (320-375)||(12985919-12985974)
chr8 (217-373)||(23023351-23023509)
chr8 (321-376)||(31309583-31309638)
chr8 (324-375)||(35085135-35085186)
chr8 (320-375)||(40982894-40982949)
chr8 (55-206)||(44373740-44373891)
chr8 (311-374)||(45512443-45512506)
chr8 (39-160)||(78988-79112)
chr8 (274-376)||(10824186-10824288)
chr8 (278-356)||(16035744-16035822)
chr8 (334-375)||(24837934-24837975)
chr8 (332-373)||(30980058-30980099)
chr8 (325-373)||(4061897-4061945)
chr8 (321-373)||(9695815-9695867)
chr8 (323-375)||(16921451-16921503)
chr8 (92-160)||(25985813-25985880)
chr8 (92-152)||(41444547-41444607)
chr8 (13-160)||(41971991-41972134)
chr8 (300-371)||(2518400-2518471)
chr8 (269-372)||(3464172-3464274)
chr8 (321-376)||(5057596-5057651)
chr8 (332-375)||(9842361-9842404)
chr8 (303-374)||(12692239-12692310)
chr8 (321-364)||(14742847-14742890)
chr8 (340-375)||(16918494-16918529)
chr8 (237-296)||(25439471-25439530)
chr8 (332-375)||(32978115-32978158)
chr8 (321-375)||(1549389-1549443)
chr8 (235-373)||(4955335-4955473)
chr8 (16-86)||(16252860-16252930)
chr8 (197-375)||(24399788-24399965)
chr8 (274-376)||(30748646-30748748)
chr8 (154-256)||(38178377-38178479)
chr8 (125-370)||(3079609-3079850)
chr8 (338-371)||(5030418-5030451)
chr8 (55-146)||(33666726-33666814)
chr8 (301-374)||(35320399-35320472)
chr8 (300-369)||(39702163-39702232)
chr8 (302-375)||(42493428-42493501)
chr8 (311-375)||(1070279-1070343)
chr8 (321-373)||(3638335-3638387)
chr8 (298-374)||(5810277-5810353)
chr8 (321-373)||(16971772-16971824)
chr8 (274-362)||(18742034-18742122)
chr8 (274-362)||(18746998-18747086)
chr8 (13-88)||(29735728-29735804)
chr8 (14-314)||(33827816-33828116)
chr8 (18-86)||(36069570-36069638)
chr8 (320-371)||(1335555-1335606)
chr8 (79-158)||(6483245-6483324)
chr8 (95-134)||(7103274-7103313)
chr8 (55-206)||(11733711-11733862)
chr8 (340-375)||(16008393-16008428)
chr8 (298-369)||(16715480-16715551)
chr8 (217-372)||(27037761-27037915)
chr8 (83-154)||(34196064-34196135)
chr8 (329-375)||(4011484-4011530)
chr8 (298-375)||(5127299-5127377)
chr8 (329-371)||(5205413-5205455)
chr8 (332-373)||(14744522-14744564)
chr8 (18-84)||(25439394-25439460)
chr8 (298-368)||(26639233-26639303)
chr8 (98-160)||(29645044-29645106)
chr8 (300-338)||(30456329-30456367)
chr8 (329-375)||(39049825-39049871)
chr8 (340-373)||(2938342-2938375)
chr8 (79-160)||(23023231-23023312)
chr8 (340-373)||(25439552-25439585)
chr8 (332-373)||(27449183-27449224)
chr8 (340-373)||(32838891-32838924)
chr8 (262-375)||(33076295-33076408)
chr8 (332-373)||(40640609-40640650)
chr8 (333-374)||(41604656-41604697)
[»] chr6 (106 HSPs)
chr6 (9-375)||(28085294-28085660)
chr6 (9-375)||(32755837-32756205)
chr6 (13-370)||(30031178-30031535)
chr6 (17-375)||(5258146-5258506)
chr6 (13-373)||(35043441-35043801)
chr6 (13-372)||(608081-608442)
chr6 (13-373)||(9706698-9707052)
chr6 (13-375)||(20427634-20427996)
chr6 (63-375)||(12890556-12890859)
chr6 (13-374)||(9593709-9594072)
chr6 (14-333)||(5631741-5632064)
chr6 (9-375)||(14030724-14031079)
chr6 (37-373)||(21351837-21352171)
chr6 (13-245)||(10099987-10100217)
chr6 (102-375)||(30679417-30679680)
chr6 (214-375)||(34143763-34143924)
chr6 (214-375)||(34156379-34156540)
chr6 (93-330)||(33496963-33497198)
chr6 (9-375)||(28026827-28027189)
chr6 (261-373)||(34934830-34934942)
chr6 (259-375)||(31818999-31819115)
chr6 (213-373)||(5095956-5096116)
chr6 (20-338)||(6055806-6056123)
chr6 (140-268)||(7133795-7133923)
chr6 (140-268)||(7136718-7136846)
chr6 (163-334)||(5080912-5081083)
chr6 (254-375)||(3206457-3206578)
chr6 (214-375)||(34503-34664)
chr6 (97-373)||(2689646-2689915)
chr6 (13-124)||(5080777-5080888)
chr6 (242-375)||(10098894-10099025)
chr6 (92-373)||(31818533-31818813)
chr6 (12-375)||(10617232-10617586)
chr6 (9-160)||(33083976-33084127)
chr6 (13-229)||(26291700-26291917)
chr6 (99-338)||(24665818-24666058)
chr6 (300-371)||(30789076-30789147)
chr6 (253-375)||(5897619-5897741)
chr6 (19-179)||(9568588-9568750)
chr6 (295-373)||(1615223-1615301)
chr6 (214-374)||(8364679-8364839)
chr6 (138-375)||(579465-579702)
chr6 (81-375)||(7513387-7513683)
chr6 (253-371)||(7492551-7492669)
chr6 (279-375)||(4245870-4245966)
chr6 (302-373)||(12119642-12119714)
chr6 (274-374)||(12133901-12134001)
chr6 (9-89)||(33998288-33998368)
chr6 (300-375)||(38980-39055)
chr6 (13-251)||(25493972-25494210)
chr6 (67-185)||(2079317-2079434)
chr6 (99-375)||(6293390-6293660)
chr6 (301-370)||(21886314-21886383)
chr6 (302-375)||(30642980-30643053)
chr6 (320-373)||(33730194-33730247)
chr6 (94-154)||(8364575-8364635)
chr6 (298-370)||(21089604-21089676)
chr6 (300-375)||(1008050-1008124)
chr6 (276-375)||(9568884-9568982)
chr6 (302-373)||(18130814-18130885)
chr6 (214-372)||(33997545-33997703)
chr6 (18-154)||(6641628-6641764)
chr6 (298-374)||(32945455-32945531)
chr6 (13-101)||(33496106-33496194)
chr6 (12-87)||(5129123-5129198)
chr6 (274-365)||(5983814-5983905)
chr6 (298-374)||(7337192-7337270)
chr6 (302-373)||(23888478-23888549)
chr6 (333-376)||(24698854-24698897)
chr6 (306-365)||(32068635-32068694)
chr6 (298-376)||(9109506-9109584)
chr6 (9-159)||(12134115-12134265)
chr6 (320-374)||(29900275-29900329)
chr6 (298-375)||(586057-586134)
chr6 (234-375)||(1747944-1748084)
chr6 (13-107)||(2065018-2065116)
chr6 (315-372)||(5053750-5053807)
chr6 (34-131)||(5095816-5095913)
chr6 (83-147)||(21870299-21870363)
chr6 (300-363)||(10453272-10453335)
chr6 (323-374)||(29931068-29931119)
chr6 (298-353)||(32080676-32080731)
chr6 (298-365)||(32097944-32098011)
chr6 (99-376)||(43049-43326)
chr6 (288-334)||(1911577-1911623)
chr6 (320-373)||(6692696-6692749)
chr6 (9-168)||(7150526-7150682)
chr6 (321-370)||(21870069-21870118)
chr6 (327-368)||(29354741-29354782)
chr6 (300-357)||(33084138-33084195)
chr6 (13-77)||(2689578-2689642)
chr6 (339-375)||(3127274-3127310)
chr6 (288-347)||(413280-413339)
chr6 (320-375)||(2307854-2307909)
chr6 (340-375)||(4878295-4878330)
chr6 (9-52)||(6293690-6293733)
chr6 (322-373)||(7150311-7150362)
chr6 (288-355)||(7513008-7513075)
chr6 (93-375)||(31831857-31832139)
chr6 (333-375)||(451947-451989)
chr6 (298-368)||(2079488-2079558)
chr6 (262-332)||(14389202-14389272)
chr6 (341-375)||(21531802-21531836)
chr6 (333-375)||(27840048-27840090)
chr6 (340-374)||(31434441-31434475)
chr6 (181-242)||(3963889-3963950)
[»] chr5 (175 HSPs)
chr5 (9-375)||(12492382-12492751)
chr5 (17-375)||(4496308-4496668)
chr5 (9-374)||(24178428-24178793)
chr5 (9-374)||(1287578-1287953)
chr5 (9-375)||(28976857-28977221)
chr5 (9-371)||(2075475-2075838)
chr5 (9-375)||(10639215-10639586)
chr5 (9-375)||(1275183-1275548)
chr5 (56-366)||(38684932-38685242)
chr5 (13-373)||(3301766-3302126)
chr5 (13-373)||(16347380-16347738)
chr5 (94-372)||(20456776-20457054)
chr5 (39-375)||(14665658-14665996)
chr5 (9-375)||(34272940-34273297)
chr5 (149-375)||(2915494-2915719)
chr5 (22-375)||(26884687-26885040)
chr5 (222-375)||(29816513-29816666)
chr5 (180-376)||(13561383-13561579)
chr5 (123-369)||(38501422-38501668)
chr5 (187-371)||(14911268-14911452)
chr5 (55-326)||(14749271-14749542)
chr5 (235-373)||(16913882-16914021)
chr5 (13-374)||(27816-28165)
chr5 (271-375)||(30213755-30213859)
chr5 (79-375)||(79501-79797)
chr5 (9-333)||(36215418-36215730)
chr5 (55-376)||(7359258-7359577)
chr5 (55-375)||(6859345-6859665)
chr5 (83-368)||(2712936-2713213)
chr5 (264-374)||(5558314-5558424)
chr5 (29-364)||(6888931-6889267)
chr5 (79-375)||(14667751-14668055)
chr5 (38-284)||(31636009-31636253)
chr5 (13-341)||(32516480-32516805)
chr5 (244-375)||(28276391-28276522)
chr5 (12-309)||(17340500-17340798)
chr5 (69-373)||(43557833-43558133)
chr5 (262-375)||(418032-418145)
chr5 (13-374)||(7678402-7678760)
chr5 (9-370)||(11002424-11002785)
chr5 (94-375)||(43475243-43475523)
chr5 (98-373)||(1525651-1525923)
chr5 (220-375)||(11675658-11675814)
chr5 (302-377)||(408490-408565)
chr5 (102-356)||(30588460-30588712)
chr5 (214-361)||(9235172-9235316)
chr5 (9-371)||(10082747-10083102)
chr5 (22-154)||(15168721-15168855)
chr5 (14-242)||(21952274-21952508)
chr5 (285-374)||(38132531-38132619)
chr5 (234-374)||(2090556-2090696)
chr5 (282-374)||(18855798-18855890)
chr5 (295-375)||(42576214-42576294)
chr5 (300-375)||(28411885-28411960)
chr5 (216-375)||(29922409-29922568)
chr5 (252-375)||(39040917-39041040)
chr5 (253-375)||(2393039-2393160)
chr5 (288-370)||(7640510-7640592)
chr5 (214-372)||(12576861-12577019)
chr5 (215-364)||(15588399-15588546)
chr5 (274-375)||(32442124-32442224)
chr5 (288-376)||(9400708-9400796)
chr5 (76-256)||(15489609-15489789)
chr5 (259-375)||(20367061-20367177)
chr5 (82-374)||(38684471-38684763)
chr5 (300-371)||(3442873-3442944)
chr5 (241-311)||(2552932-2553002)
chr5 (46-251)||(42199243-42199446)
chr5 (9-98)||(20318905-20318989)
chr5 (301-374)||(42272687-42272760)
chr5 (40-168)||(418190-418318)
chr5 (128-375)||(9917458-9917695)
chr5 (305-373)||(27386554-27386622)
chr5 (92-160)||(33667217-33667285)
chr5 (293-375)||(5860036-5860118)
chr5 (293-375)||(11069160-11069242)
chr5 (229-374)||(5303582-5303730)
chr5 (92-375)||(18350900-18351189)
chr5 (92-256)||(28676596-28676760)
chr5 (299-375)||(32366186-32366262)
chr5 (275-375)||(38830504-38830603)
chr5 (298-373)||(28186782-28186857)
chr5 (276-374)||(2645175-2645273)
chr5 (11-85)||(28186956-28187030)
chr5 (320-374)||(36551375-36551429)
chr5 (262-375)||(41894237-41894357)
chr5 (227-373)||(42504247-42504393)
chr5 (9-134)||(219692-219817)
chr5 (304-373)||(9121078-9121147)
chr5 (118-231)||(15986879-15986992)
chr5 (218-371)||(33667562-33667715)
chr5 (298-375)||(36123180-36123257)
chr5 (298-375)||(41200344-41200421)
chr5 (121-356)||(23979976-23980209)
chr5 (217-373)||(27998567-27998723)
chr5 (300-368)||(28985292-28985360)
chr5 (102-355)||(29938126-29938374)
chr5 (311-375)||(39322077-39322141)
chr5 (213-372)||(25938091-25938250)
chr5 (300-371)||(27800037-27800108)
chr5 (311-373)||(218052-218114)
chr5 (193-307)||(15168873-15168987)
chr5 (118-244)||(36200769-36200894)
chr5 (320-373)||(3000968-3001021)
chr5 (320-373)||(9234115-9234168)
chr5 (22-159)||(31906592-31906729)
chr5 (299-373)||(41108727-41108803)
chr5 (20-88)||(5305545-5305613)
chr5 (214-374)||(6788190-6788349)
chr5 (128-232)||(11675547-11675651)
chr5 (305-377)||(43423492-43423563)
chr5 (320-371)||(10668569-10668620)
chr5 (111-206)||(21093772-21093867)
chr5 (305-375)||(32006161-32006232)
chr5 (147-286)||(33157918-33158057)
chr5 (14-113)||(34039960-34040059)
chr5 (149-332)||(43035039-43035222)
chr5 (320-369)||(8081967-8082017)
chr5 (277-375)||(21193650-21193748)
chr5 (302-372)||(30639717-30639787)
chr5 (11-73)||(36200702-36200764)
chr5 (278-375)||(683699-683796)
chr5 (306-375)||(4026326-4026395)
chr5 (332-373)||(10989085-10989126)
chr5 (334-375)||(13606995-13607036)
chr5 (277-362)||(15252755-15252840)
chr5 (325-373)||(7367172-7367220)
chr5 (213-309)||(14725640-14725736)
chr5 (95-159)||(37065533-37065597)
chr5 (274-366)||(41808105-41808197)
chr5 (320-375)||(4653481-4653536)
chr5 (334-373)||(10124388-10124427)
chr5 (325-372)||(16014485-16014532)
chr5 (340-375)||(29929303-29929338)
chr5 (254-373)||(31220546-31220664)
chr5 (315-374)||(35118321-35118380)
chr5 (55-110)||(42504446-42504501)
chr5 (300-362)||(1935402-1935464)
chr5 (317-375)||(24391022-24391080)
chr5 (11-53)||(27998343-27998385)
chr5 (301-370)||(2049271-2049339)
chr5 (320-373)||(19137907-19137960)
chr5 (340-373)||(32489295-32489328)
chr5 (330-375)||(34119859-34119904)
chr5 (247-375)||(37065632-37065761)
chr5 (92-269)||(38578625-38578802)
chr5 (334-375)||(42408698-42408739)
chr5 (293-365)||(12534414-12534486)
chr5 (329-373)||(21952600-21952644)
chr5 (140-244)||(27799892-27799996)
chr5 (289-373)||(39012776-39012860)
chr5 (83-160)||(41833795-41833874)
chr5 (340-375)||(3563413-3563448)
chr5 (328-375)||(3775072-3775119)
chr5 (19-86)||(34194783-34194850)
chr5 (293-375)||(1104706-1104787)
chr5 (81-179)||(4026529-4026627)
chr5 (16-78)||(6368220-6368282)
chr5 (335-373)||(15584252-15584290)
chr5 (321-371)||(30639301-30639351)
chr5 (333-375)||(32925105-32925147)
chr5 (340-370)||(34190971-34191001)
chr5 (292-375)||(39668904-39668991)
chr5 (288-374)||(41833656-41833742)
chr5 (321-362)||(3448776-3448817)
chr5 (9-46)||(5848403-5848440)
chr5 (334-375)||(7090314-7090355)
chr5 (334-371)||(10668648-10668685)
chr5 (334-367)||(18741227-18741260)
chr5 (102-159)||(27553842-27553899)
chr5 (342-375)||(31635927-31635960)
chr5 (92-149)||(38341641-38341698)
chr5 (298-371)||(39128269-39128342)
chr5 (311-372)||(39766741-39766802)
chr5 (15-52)||(43558135-43558172)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (9-375)||(31386-31752)
scaffold0018 (83-160)||(44081-44158)
[»] chr2 (176 HSPs)
chr2 (9-371)||(8180698-8181060)
chr2 (9-375)||(3865990-3866356)
chr2 (9-373)||(36183369-36183733)
chr2 (9-373)||(38452686-38453053)
chr2 (9-372)||(3243654-3244015)
chr2 (9-375)||(4807510-4807879)
chr2 (13-375)||(38429806-38430167)
chr2 (13-375)||(12734623-12734984)
chr2 (79-375)||(2610576-2610872)
chr2 (13-375)||(41197225-41197588)
chr2 (13-373)||(11992108-11992466)
chr2 (13-373)||(41763043-41763401)
chr2 (62-375)||(25834650-25834962)
chr2 (112-375)||(451646-451909)
chr2 (13-375)||(45367623-45367984)
chr2 (133-375)||(7326158-7326400)
chr2 (20-373)||(18424378-18424728)
chr2 (163-374)||(28508750-28508961)
chr2 (98-374)||(24583630-24583907)
chr2 (13-347)||(23997539-23997858)
chr2 (13-373)||(38434873-38435234)
chr2 (208-375)||(35643065-35643232)
chr2 (17-375)||(9556367-9556724)
chr2 (92-375)||(12141545-12141828)
chr2 (195-373)||(31959625-31959803)
chr2 (148-371)||(39029638-39029867)
chr2 (17-375)||(6237751-6238110)
chr2 (260-375)||(227358-227473)
chr2 (253-375)||(30306194-30306316)
chr2 (92-372)||(18958908-18959192)
chr2 (76-375)||(43751945-43752244)
chr2 (253-375)||(38328368-38328488)
chr2 (211-372)||(45543074-45543234)
chr2 (215-375)||(43573128-43573287)
chr2 (100-375)||(44437719-44437994)
chr2 (271-375)||(3635321-3635425)
chr2 (9-366)||(4598569-4598928)
chr2 (96-375)||(12882043-12882317)
chr2 (233-373)||(9996623-9996766)
chr2 (130-375)||(42543274-42543519)
chr2 (13-160)||(16097199-16097350)
chr2 (262-375)||(9496037-9496150)
chr2 (60-372)||(37481618-37481930)
chr2 (291-373)||(12474927-12475009)
chr2 (188-371)||(35755247-35755434)
chr2 (79-371)||(13149319-13149612)
chr2 (9-206)||(7825276-7825475)
chr2 (67-373)||(11412697-11412992)
chr2 (10-356)||(41545325-41545670)
chr2 (303-375)||(17670680-17670752)
chr2 (262-370)||(19336896-19337004)
chr2 (276-372)||(39709202-39709298)
chr2 (92-375)||(6218968-6219249)
chr2 (187-374)||(13443907-13444094)
chr2 (9-250)||(23714384-23714622)
chr2 (9-250)||(24102056-24102294)
chr2 (285-375)||(9531598-9531688)
chr2 (293-375)||(12520060-12520142)
chr2 (226-375)||(12489800-12489949)
chr2 (87-160)||(43238306-43238379)
chr2 (214-369)||(33504346-33504502)
chr2 (9-88)||(2610446-2610525)
chr2 (9-370)||(42092437-42092796)
chr2 (92-375)||(3481145-3481438)
chr2 (79-375)||(43832087-43832382)
chr2 (217-360)||(37470146-37470289)
chr2 (274-375)||(8197539-8197640)
chr2 (274-375)||(8202299-8202400)
chr2 (181-369)||(19234988-19235176)
chr2 (181-373)||(5758995-5759187)
chr2 (303-375)||(17626284-17626356)
chr2 (219-375)||(33287549-33287705)
chr2 (220-375)||(7431887-7432042)
chr2 (300-375)||(15025703-15025778)
chr2 (248-374)||(30743686-30743812)
chr2 (55-373)||(13240763-13241063)
chr2 (293-374)||(19863436-19863517)
chr2 (293-374)||(19867768-19867849)
chr2 (293-374)||(19872669-19872750)
chr2 (302-375)||(25384680-25384753)
chr2 (214-371)||(26670891-26671048)
chr2 (13-206)||(45077670-45077870)
chr2 (291-375)||(42549835-42549919)
chr2 (298-373)||(10516749-10516824)
chr2 (214-373)||(19855585-19855744)
chr2 (13-144)||(30743545-30743675)
chr2 (13-158)||(19337069-19337209)
chr2 (41-170)||(40759049-40759179)
chr2 (307-371)||(522445-522509)
chr2 (278-362)||(3720426-3720510)
chr2 (293-373)||(17429252-17429332)
chr2 (13-260)||(13592411-13592656)
chr2 (121-363)||(26784350-26784592)
chr2 (300-372)||(887065-887138)
chr2 (320-373)||(16521007-16521060)
chr2 (277-370)||(45077915-45078008)
chr2 (9-65)||(451930-451986)
chr2 (311-375)||(14444889-14444953)
chr2 (235-374)||(28960210-28960350)
chr2 (274-374)||(32402683-32402783)
chr2 (94-238)||(32443668-32443812)
chr2 (308-375)||(12470895-12470962)
chr2 (299-374)||(14397957-14398032)
chr2 (320-375)||(15775843-15775898)
chr2 (291-374)||(21281462-21281545)
chr2 (264-374)||(9394629-9394739)
chr2 (9-160)||(9647822-9647969)
chr2 (293-371)||(34931634-34931712)
chr2 (76-129)||(227307-227360)
chr2 (61-150)||(19024150-19024239)
chr2 (320-369)||(45482989-45483038)
chr2 (300-372)||(624687-624759)
chr2 (303-375)||(3305807-3305879)
chr2 (21-160)||(9578916-9579053)
chr2 (175-343)||(21834638-21834806)
chr2 (76-160)||(38860158-38860242)
chr2 (332-375)||(10403891-10403934)
chr2 (300-375)||(15015154-15015229)
chr2 (321-376)||(33971534-33971589)
chr2 (298-373)||(36993742-36993816)
chr2 (93-199)||(11017316-11017422)
chr2 (99-168)||(14197367-14197437)
chr2 (302-360)||(29968624-29968682)
chr2 (321-375)||(33393339-33393393)
chr2 (333-375)||(38429651-38429693)
chr2 (332-373)||(2073307-2073348)
chr2 (276-373)||(3030864-3030960)
chr2 (300-365)||(19024387-19024452)
chr2 (298-370)||(19224988-19225061)
chr2 (293-358)||(23915708-23915773)
chr2 (334-375)||(37520689-37520730)
chr2 (327-375)||(8560804-8560852)
chr2 (318-374)||(15222472-15222528)
chr2 (175-375)||(17581543-17581743)
chr2 (295-371)||(32364923-32364999)
chr2 (104-160)||(41858744-41858800)
chr2 (275-370)||(186135-186230)
chr2 (121-168)||(907710-907757)
chr2 (340-375)||(1648113-1648148)
chr2 (302-373)||(2515171-2515242)
chr2 (293-372)||(7615471-7615550)
chr2 (298-373)||(9647611-9647686)
chr2 (316-371)||(12026014-12026069)
chr2 (340-375)||(13188391-13188426)
chr2 (274-373)||(13474214-13474313)
chr2 (300-351)||(19334174-19334225)
chr2 (328-375)||(26566292-26566339)
chr2 (275-373)||(26850419-26850517)
chr2 (248-374)||(18790105-18790231)
chr2 (9-75)||(24583904-24583970)
chr2 (321-375)||(36819406-36819459)
chr2 (214-375)||(45436965-45437124)
chr2 (298-375)||(335710-335787)
chr2 (320-373)||(32706472-32706525)
chr2 (274-371)||(36366819-36366916)
chr2 (299-363)||(440924-440988)
chr2 (306-373)||(2901960-2902028)
chr2 (315-375)||(24214010-24214070)
chr2 (306-373)||(32443851-32443919)
chr2 (93-157)||(41330131-41330195)
chr2 (321-373)||(44415853-44415905)
chr2 (331-370)||(11414571-11414610)
chr2 (340-375)||(14530529-14530564)
chr2 (317-375)||(23354105-23354164)
chr2 (332-375)||(25284954-25284997)
chr2 (316-375)||(32395594-32395653)
chr2 (331-370)||(43970020-43970059)
chr2 (318-372)||(9078804-9078858)
chr2 (345-375)||(14520948-14520978)
chr2 (14-159)||(18188706-18188848)
chr2 (320-366)||(44877440-44877486)
chr2 (15-108)||(17581392-17581485)
chr2 (298-367)||(19015946-19016015)
chr2 (306-375)||(32541792-32541861)
chr2 (274-371)||(36650625-36650721)
chr2 (126-199)||(43260439-43260512)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (48-375)||(946-1271)
scaffold0570 (9-46)||(2597-2634)
[»] scaffold0024 (3 HSPs)
scaffold0024 (13-373)||(82643-83000)
scaffold0024 (282-370)||(48119-48207)
scaffold0024 (311-368)||(18943-19000)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (11-375)||(4278-4634)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (13-375)||(86607-86967)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (219-375)||(25530-25686)
scaffold0157 (9-135)||(25683-25809)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (200-373)||(16687-16860)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (133-375)||(11547-11787)
scaffold0113 (9-159)||(11810-11962)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (163-375)||(4708-4920)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (241-374)||(481-614)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (81-371)||(7431-7720)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (230-375)||(14722-14867)
scaffold0199 (106-159)||(14626-14678)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (283-375)||(28887-28979)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (214-375)||(58224-58385)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (235-372)||(160325-160462)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (262-373)||(25443-25554)
[»] scaffold1259 (1 HSPs)
scaffold1259 (227-375)||(1520-1665)
[»] scaffold0392 (1 HSPs)
scaffold0392 (288-374)||(6771-6857)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (285-371)||(16438-16524)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (302-367)||(3648-3713)
scaffold0491 (274-362)||(3839-3927)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (302-375)||(99284-99357)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (95-159)||(11802-11866)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (253-333)||(39481-39561)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (311-360)||(194086-194135)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (323-375)||(19149-19201)
[»] scaffold0179 (1 HSPs)
scaffold0179 (320-371)||(26049-26100)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (300-375)||(163192-163267)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (322-375)||(40610-40663)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 481; Significance: 0; HSPs: 235)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 481; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 374 - 910
Target Start/End: Original strand, 45647767 - 45648300
Alignment:
Q  374 tgcaccattggtggaaaagtgttttacacttaaaaacaaattagaacccaccgacataacaaataattgtgtaacttccnnnnnnnnaaaaccgtcaaac 473  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||    
T  45647767 tgcaccgttggtggaaaagtgttttacacttaaaaacaaattagaacccaccgacataacaaataattgtgtaacttccttttttt--aaaccgtcaaac 45647864  T
Q  474 atgattcgcaagattgaagatttgtgattggttcattggatgtcagtgtaaaataactttacagttacggtgcatattccattaatctcataacttacat 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45647865 atgattcgcaagattgaagatttgtgattggttcattggatgtcagtgtaaaataactttacagttacggtgcatattccattaatctcataacttacat 45647964  T
Q  574 tgaaccacctttttatgcatattttgtcggataagttgcttgtatttttatttttgaaaagagaatgcggcattctagttattagtactccttcaaaatg 673  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45647965 tgaaccacctttttatgcatattttgtaggataagttgcttgtatttttatttttgaaaagagaatgcggcattctagttattagtactccttcaaaatg 45648064  T
Q  674 gagagtacaatgtgaattgcctaagtaaactaatattgtcccttgttgcaggtgcccacggctcaaacgacttgttctgccggcttggaacagaattaaa 773  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45648065 gagagtacaatgtgaattgcctaagt-aactaatcttgtcccttgttgcaggtgcccacggctcaaacgccttgttctgccggcttggaacagaattaaa 45648163  T
Q  774 agtacaggaatgtgcaaggcaatccgttcctggaaagagctggagtctttgacaatgcctactatagaaaacgcgccatattttctagatgaaattgcaa 873  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45648164 agtacaggaatgtgcaaggcaatccgttcctggaaagagctggagtctttgacaatgcctactatagaaaacgcgccatattttctagatgaaattgcaa 45648263  T
Q  874 caaactgcaagaacttcagtgaactcaagattatggg 910  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45648264 caaactgcaagaacttcagtgaactcaagattatggg 45648300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 331; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 1210663 - 1211029
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1210663 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 1210762  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1210763 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 1210862  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210863 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 1210962  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1210963 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1211029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30202494 - 30202128
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30202494 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 30202395  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30202394 gaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaag 30202295  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202294 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 30202195  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30202194 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30202128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34792713 - 34792346
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34792713 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgaaaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 34792614  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34792613 gaaaagttggtagaaagtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 34792514  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34792513 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaac 34792414  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34792413 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgc 34792346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49347757 - 49347393
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  49347757 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtaggggtagcatctatagta 49347658  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49347657 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 49347558  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49347557 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 49347458  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49347457 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49347393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 8671838 - 8672202
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  8671838 agcagagataaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 8671935  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8671936 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 8672035  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8672036 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 8672135  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8672136 actatagcgtcatttgatccatatagccaaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 8672202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Original strand, 9592652 - 9593019
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9592652 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 9592751  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9592752 gaaaagtttgtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 9592851  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  9592852 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaac 9592951  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9592952 actatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttgc 9593019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 22090012 - 22090380
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatag 106  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  22090012 agcagagatgaggatgctgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 22090111  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22090112 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtca 22090211  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22090212 agttaaaaggggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 22090311  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22090312 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccactaagtgggataaggcttggttgttgttgttg 22090380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 51441129 - 51440764
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  51441129 agcagagatgaggatgttgcattggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagta 51441030  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  51441029 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaag 51440930  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51440929 ttaaaggaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 51440830  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51440829 actacggcgtcatttgattcatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 51440764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 16 - 375
Target Start/End: Original strand, 51601983 - 51602340
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  51601983 atgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaaagt 51602080  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602081 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 51602180  T
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  51602181 aggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatgg 51602280  T
Q  316 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602281 cgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 51602340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32231315 - 32230959
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32231315 agagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaa 32231216  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32231215 aaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 32231116  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32231115 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaagttggtctatgatagaacact 32231016  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt-gggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| || |||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32231015 atggtgtaatttgatccat--------ccccacttagtggggataaggcttggttgttgttgttg 32230959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43240745 - 43240380
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  43240745 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 43240646  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  43240645 tagaaaaattgatagaaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtta 43240546  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43240545 agttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 43240446  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43240445 acactatggcgtcatttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttagttgttgttg 43240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 696191 - 696555
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  696191 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 696290  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  696291 agttggtagaaaataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcatatggaggagagtcaggttaa 696390  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  696391 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacacta 696490  T
Q  313 -tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
     ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696491 ttggcgtcatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 696555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4001814 - 4001453
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4001814 agatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 4001715  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4001714 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 4001615  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  4001614 agaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaccctat 4001515  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4001514 gacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 4001453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 81 - 375
Target Start/End: Original strand, 4029112 - 4029406
Alignment:
Q  81 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaaga 180  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  4029112 agagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4029211  T
Q  181 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 280  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4029212 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 4029311  T
Q  281 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4029312 tggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 4029406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 15085856 - 15086206
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15085856 gagatgaggatgttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 15085955  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  15085956 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcagattaa 15086055  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||            |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||    
T  15086056 aagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagataggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacacta 15086143  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15086144 tgacgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 15086206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 461 - 910
Target Start/End: Original strand, 45642830 - 45643281
Alignment:
Q  461 aaaaccgtcaaacatgattcgcaagattgaagatttgtgattggttcattggatgtcagtgtaaaataactttacagttacggtgcatattccattaatc 560  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  ||||||||| ||||||     
T  45642830 aaaaccatcaaacatgattcgctagattgaagaattgtaatcggttcattggatgtcagtataaaataactttactcttacaatgcatattcaattaatt 45642929  T
Q  561 tcataacttacattgaaccacctttttatgc-atattttgtcggataagttgcttgtatttttatttttgaaaagagaatgcggcattc-----tagtta 654  Q
    || ||||||  ||||||||||||||| ||   || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||||||    
T  45642930 tcctaacttgaattgaaccaccttttcataagatgtttggtaggataagttgcttgtatttttatttttgaaaagagaatgcggcactccttgctagtta 45643029  T
Q  655 ttagtactccttcaaaatggagagtacaatgtgaattgcctaagtaaactaatattgtcccttgttgcaggtgcccacggctcaaacgacttgttctgcc 754  Q
    |||  |||   || ||||||||| | ||| ||| ||| | ||| ||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  45643030 ttaacact---tccaaatggagattgcaacgtggattacttaaataa-ctaatctcgccccttgttgtaggtgcccacatctcaaacgactggttctgcc 45643125  T
Q  755 ggcttggaacagaattaaaagtacaggaatgtgcaaggcaatccgttcctggaaagagctggagtctttgacaatgcctactatagaaaacgcgccatat 854  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  45643126 ggcttggaacagaattaaaagaacaggaatgtgcaaggcaatccgttgctggaaagagctagagtctctaacaatgcctagtatagcaaacccgccatat 45643225  T
Q  855 tttctagatgaaattgcaacaaactgcaagaacttcagtgaactcaagattatggg 910  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45643226 tttctagaggaaattgcaacaaactgcaagaacttcagtgaactcaagattatggg 45643281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32083105 - 32082754
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32083105 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 32083006  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32083005 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 32082906  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||    
T  32082905 aagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacacta 32082818  T
Q  313 tggc-gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  32082817 cggcagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttagtttttgttgttg 32082754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 8391694 - 8392056
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8391694 gagatgaagatgttgtgttggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 8391793  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  8391794 agttggtagaaaataggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaa 8391893  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || | | |||||||| ||||    
T  8391894 aggaggtatatgaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttttgatagaatacta 8391993  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||    
T  8391994 tggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtaggaaaagacttagtcgttgttgttg 8392056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 16 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38808031 - 38807669
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  38808031 atgaggatgttgtgttggat-agtggtaagaccagacgggatagaattagaaatgacaccattagagagagagagaatgggggtagcacctatagtagaa 38807933  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||   ||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | |    
T  38807932 aagttggtagaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaagaagagtagaccagatggaggagagtcagatca 38807833  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  38807832 aaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgatagaacact 38807733  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38807732 atggcgtaatttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 38807669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 109 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25979495 - 25979229
Alignment:
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  25979495 gaaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcagg 25979396  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  25979395 ttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac 25979296  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25979295 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 25979229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37463231 - 37462878
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  37463231 gagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattagag--agagttggggtagcacctatagtagaaa 37463134  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc-aagtta 211  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||||||||||   || |||| ||||  |||||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  |   |    
T  37463133 agacagtagaaaataggcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcaa 37463037  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||| |    
T  37463036 aaagaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgat-caaatatggtttatcatagaacatt 37462938  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37462937 atggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 37462878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 9509236 - 9509565
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9509236 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagta 9509335  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |||   ||||| ||||| ||||||||||||||      
T  9509336 gaaaagatggtaaaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggagagtcata 9509435  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||||| ||   |||||||| || |||||| |||| |||||| ||||    
T  9509436 ttagaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagttagagccaaatatggtttatgattgaac 9509535  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccga 338  Q
    | |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  9509536 attatggcgtaattcgatccatgtagccga 9509565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 175 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37311953 - 37311753
Alignment:
Q  175 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37311953 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 37311854  T
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37311853 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgtt 37311754  T
Q  375 g 375  Q
    |    
T  37311753 g 37311753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 9599758 - 9599409
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  9599758 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcattagagagagagttggagtaacacctatagta 9599659  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||  | ||||| | | |||  |||||| ||||| ||||||||||||||      
T  9599658 gaaaagatggtagaaaataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcaga 9599559  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||  |||||||| | |||||||| |||||| || |||| |||||||||||    
T  9599558 tcataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatccagatatggtttatgatagaac 9599459  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 358  Q
      |||||||| |||||||||||||||| || |  ||||||||||| ||||    
T  9599458 gttatggcgtaatttgatccatgtagctgaccttacttagtgggaaaagg 9599409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 154 - 375
Target Start/End: Original strand, 39318193 - 39318412
Alignment:
Q  154 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaa 253  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  39318193 agaagacccgtagatgc-gtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacca 39318291  T
Q  254 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  39318292 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccgcttagtggga 39318390  T
Q  354 taaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  39318391 taaggcttgtttgttgttgttg 39318412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 208 - 373
Target Start/End: Original strand, 52921197 - 52921362
Alignment:
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  52921197 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaa 52921296  T
Q  308 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52921297 cactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52921362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27848155 - 27847798
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  27848155 atgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggat-aggaataacaccattagagagagagttgtggtagcacctgtggtagaaaagatggtag 27848057  T
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 221  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||||  | | |||||||||    
T  27848056 aaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggtag 27847957  T
Q  222 aggaagacc-taggaaaactattagagaaacaatta-gaaag---gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 316  Q
    ||||||||| | | |||| ||| |||||||| | ||  ||||   ||||||||||| |||||||| | |  |||| |||| |||||| ||||| |||| |    
T  27847956 aggaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttgaaatatggtttatgatggaacattatgcc 27847857  T
Q  317 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27847856 gtaattttatccatgtagccgatctcacttagtgggataaggcttggtcattgttgttg 27847798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 370
Target Start/End: Original strand, 39140434 - 39140794
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa-------gattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  39140434 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaactggtaagactagatgagataggattaggaatgaaaccattacagagagagttggcgtagcacctat 39140533  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 204  Q
    |||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  39140534 agtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccgatacatgttgtagtacgaagagtagatcagatggatgagagt 39140633  T
Q  205 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 304  Q
    ||  ||| ||||||||||||||   |||  |||  |||  ||||||| ||||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |  ||||    
T  39140634 cagattagaagaggtagaggaa---ctaaaaaagttat--gagaaactattaggaaaaatttagaggttaattagttggatccaaatatggtttcagata 39140728  T
Q  305 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39140729 gaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 39140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18469440 - 18469082
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||| ||||||||||||| |    
T  18469440 gagatgacgatgctgcgttgtatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacacaattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaga 18469343  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || || ||||||||||| |||| | |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||  |||| |||||| ||||||   | ||    
T  18469342 agatgatagaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtcggatcaa 18469243  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| ||||| ||    
T  18469242 aagaggtagatgaagacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagttggatacaaatatagtttatgatcgaacatta 18469143  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| || ||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  18469142 tggtgtaatttggttcatgtagacgaccccacttagtgggataatgctttgatgttgttgt 18469082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561590
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 320  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  | ||||||| |||||||  |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52561590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32404890 - 32404525
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacat----gataggat--taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||     |||  |||  ||| || |||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  32404890 agatgaggatgttgcgttagatgcgtggtaagaatagacagctaagattagatattagaaacgacaacattcgagagtgagt-tgggtaacacctatagt 32404792  T
Q  108 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  |||||| || | ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||     
T  32404791 aaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaagatggaggatagtcat 32404692  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 307  Q
     | | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||    
T  32404691 atcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaacatggtttatgatataa 32404592  T
Q  308 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32404591 cataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc-tggttgttgttgttg 32404525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 92 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48431687 - 48431397
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||| |||||    
T  48431687 gggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatca 48431588  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggt-------caatgagttgga 284  Q
     |||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| |        |||||||||||    
T  48431587 gatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttgga 48431488  T
Q  285 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||| | ||||| ||||  ||||| | ||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48431487 tccaaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 48431397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 373
Target Start/End: Original strand, 2544587 - 2544875
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| || | ||||    
T  2544587 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaa 2544686  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||     ||| ||  |||||||    
T  2544687 ggagagtagatcagatggaggatagtcaaac-actagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactataaga-----tttggaaatcaatga 2544780  T
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| | |||| |||| ||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2544781 gttggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggtaaaaggcttggttgttgttgt 2544875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 255 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707219
Alignment:
Q  255 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 354  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggat 4707240  T
Q  355 aaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  4707239 aaggcttggttgttgttgttg 4707219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 241 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 32079307 - 32079176
Alignment:
Q  241 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc 340  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  32079307 attagagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatcgatgtagccgacc 32079210  T
Q  341 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32079209 ccacttggtgggataaggcttggttgttgttgtt 32079176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 375
Target Start/End: Original strand, 38868858 - 38869166
Alignment:
Q  67 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 166  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||  | |||||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38868858 aatgacaacattaaagagagggttggagtagcacctatcatagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaacactagtag 38868957  T
Q  167 atgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggattt 266  Q
    || || | |  || ||||| ||| | |||||||  |||||| | |  ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| |    
T  38868958 attctctagcgaggagagtagattagatggagggtagtcaaatcattagaggcagaagaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatct 38869057  T
Q  267 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 366  Q
    || | | |||| |||||||  | || |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  38869058 agcgattaatgggttggatagatatatggtatatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttg 38869157  T
Q  367 ttgttgttg 375  Q
     ||||||||    
T  38869158 ctgttgttg 38869166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 215 - 375
Target Start/End: Original strand, 41560353 - 41560513
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 314  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |   |||||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  41560353 gaggtagaagaagacctagaaaagctataagagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatg 41560452  T
Q  315 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41560453 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 41560513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 263 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020265
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataaggcttg 24020278  T
Q  363 gttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||    
T  24020277 gttgttgttgttg 24020265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 55 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36624184 - 36623884
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  36624184 gatagaattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagtacttgcagtagaaaagattgtagaaaataggcttaggtggttt-ggcatgtcgaga 36624086  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 254  Q
    ||||||| |||     ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||            ||||||||| ||    
T  36624085 gaagactggta-----tgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcagaagaggtagaggaagacc------------tagagaaactat 36624003  T
Q  255 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc-gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 353  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||||| || |  |||||||||||| ||| || |||||||||||    
T  36624002 tagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggtttaggatcgaacattatggctgtaa--tgatccatgtagtcgaccctacttagtggga 36623905  T
Q  354 taaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||| ||||| ||||||    
T  36623904 taaggctttgttgtcgttgtt 36623884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Original strand, 6025526 - 6025889
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||  |||| |||||| ||||| | ||||| ||||| |||  || |||||||||||||| ||    
T  6025526 agagacgaggatgttttgctggatgtttggcaagactagactggataagattagaaatgatagcattaaagagatagttgggttagcacctatagtaaaa 6025625  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    | | |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||   | ||| ||    |||| ||||| ||||| ||| |||  |||||| | |    
T  6025626 acgatggttgaaactaggcttagatgacttgggcatgtacagagaacacctatggatactccaataaggagagtagatcagatgtagggtagtcaaatca 6025725  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
      ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || | || ||| ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| | ||||||||||      
T  6025726 ctagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagatactagtaaaaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatg 6025825  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  6025826 atggcgtcatttgatccatgtagccgattccacttagtgggataatacttggttgtttttgttg 6025889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3819150 - 3818854
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||| | || ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||| || | ||||    
T  3819150 agagagagagttgaggtagcacctatggtagaaaagatggtggtaactagacttaagtggtttgggcatgtagaaagaagacttgtggattctctagtaa 3819051  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
      ||||| ||||| |||||||  | ||||   |  ||||  |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| | |||||    
T  3819050 agagagtagatcagatggagggtaatcaaaccactagagaaagaggaagaccttgaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaatga 3818951  T
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||  |||| |||| |||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3818950 gttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgcacttagtgggataaggcttggtcgttgttgttg 3818854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 198 - 376
Target Start/End: Original strand, 4415455 - 4415634
Alignment:
Q  198 ggagagtcaagttaaaaga-ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 296  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  4415455 ggagagtcaggttaaaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgat 4415554  T
Q  297 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
     | | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  4415555 tttttatagaacattatggcatcatttgatccatgtagccgactccatttagtggaaaaagacttggttgttgttgttgc 4415634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 284 - 375
Target Start/End: Original strand, 44751677 - 44751768
Alignment:
Q  284 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44751677 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44751768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Original strand, 29577452 - 29577537
Alignment:
Q  291 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29577452 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 29577537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 284 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941773
Alignment:
Q  284 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 44941773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 375
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5338997
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |    
T  5338727 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcaga 5338826  T
Q  194 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 293  Q
    ||||||| | |||  | |  ||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||           ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |    
T  5338827 tggaggatattcagatcactagaggcagaagtagacctagaaaaactataagagaaa-----------gatctagagattaatgagttggatcgaaatgt 5338915  T
Q  294 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | | ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  5338916 gatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggctcggttgttgttgttg 5338997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 369
Target Start/End: Original strand, 40416359 - 40416649
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||  ||| ||||    
T  40416359 agagagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagattttgtagtaa 40416458  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    | ||||| ||||| ||| |||| |||||  | |  | ||  ||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||  || ||| || || | |||||    
T  40416459 ggagagtagatcagatgcaggatagtcagatcaccaaagacagaagaagacctagaaaaactataagacaaactattaagaaagatctatagattaatga 40416558  T
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||| || || |||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  40416559 gttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatgtgatccctttagccgaccccacttagtgggttaaggtttggctgttg 40416649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 238
Target Start/End: Original strand, 43423645 - 43423866
Alignment:
Q  19 aggatgttgcgttggatgagtggt--aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagtt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |    
T  43423645 aggatgttgcgttggatgtgtgggggaagactagacaggataggattagaaatgaccacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagat 43423744  T
Q  117 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 216  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||  | |||||    |||||| | |  |||    
T  43423745 ggtggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagtagagtagactagatggatagtagtcaaatcactaga 43423844  T
Q  217 ggtagaggaagacctaggaaaa 238  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  43423845 ggtagaggaagacctagaaaaa 43423866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 284 - 373
Target Start/End: Original strand, 42337749 - 42337838
Alignment:
Q  284 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42337749 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42337838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 34827462 - 34827205
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   ||| |||||| ||||||   ||||   |||||||  ||||||| | ||||| || ||    
T  34827462 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgatataagattagaaatgact--attatgtagagagttggggtagcgcatatagaagtaa 34827365  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || |||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||   |||||||| | ||||||| ||| ||| | |||||||||||| | ||||     
T  34827364 agatggtagaaaataggcttctttggtttggacatgtaaagagaagaccgatagatgctctagtaagaaaagtagattagatggaggagagtaaggttag 34827265  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggt 272  Q
    || |  || |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  34827264 aaaaaataaaggaagacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt 34827205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 255 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423216
Alignment:
Q  255 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaaca---tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 46423235  T
Q  355 aaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  46423234 aaggctcggttgttgttgt 46423216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 26016355 - 26016721
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||  ||| |   |||||||||||||||  ||||| ||||||||  |    
T  26016355 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaggatataattataaataatggcattagagagagagttggggtaacacctatatga 26016454  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||   |  || |||| | ||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||      
T  26016455 gaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttgggtatgtagaaagaagacctatgcattctgtagcaaggagattagatcagatgaaggggagtcaga 26016554  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    | |  |||||||   | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   |||  |||| | || ||||||    
T  26016555 tcactagaggtaagagtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaatgatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttggtagaac 26016654  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | | ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||    
T  26016655 attgtggcgtcgtttgatacatgtagctgagcccacttagtggggtaagacttagttgttcttgttg 26016721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 374
Target Start/End: Original strand, 8796239 - 8796492
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |   || ||||| |||||  |||  |||||||| |||||  | |  ||||| |    
T  8796239 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcggatggaggatagtcagatcactagaggca 8796338  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 320  Q
    |||||||||| |  |||||| | |||||||| ||||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |    
T  8796339 gaggaagaccaataaaaactttaagagaaactattaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaa 8796438  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8796439 tttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 8796492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 238 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10200441 - 10200304
Alignment:
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 337  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  10200441 actatgagagagactattagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccg 10200342  T
Q  338 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  10200341 acctcacttaatgggataatgcttggttgttgttgttg 10200304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 375
Target Start/End: Original strand, 478695 - 478965
Alignment:
Q  106 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 205  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||  ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||     
T  478695 gtagaaaagttggtagaaaaaag-cttaggtggtttggacattcagatagaa-acttgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcagatgaaagagagtt 478792  T
Q  206 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 305  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||||  || | |||| ||||||||    
T  478793 aggtcaaaagagttagaggaagacctacaaaatctataagagaaactattaggaaagttttagaggttaatgagttggatggaagtatggt-tatgatag 478891  T
Q  306 aacactatggc-----gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || |||||| |      | |||||||| || ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  478892 aatactatgacataatttgatttgatctatttagccaat-ccacttagtgggataaagtttggttgttgttgttg 478965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 281 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28090786 - 28090692
Alignment:
Q  281 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28090786 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 28090692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 227 - 372
Target Start/End: Original strand, 29128919 - 29129065
Alignment:
Q  227 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 326  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| || || ||||    
T  29128919 gacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgat 29129018  T
Q  327 -ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29129019 cccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggtttttgttg 29129065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 272 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40568511 - 40568410
Alignment:
Q  272 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40568511 tcaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 40568412  T
Q  372 gt 373  Q
    ||    
T  40568411 gt 40568410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 244 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 52532745 - 52532614
Alignment:
Q  244 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 343  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  52532745 agagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgacccca 52532646  T
Q  344 cttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  52532645 cttagtgggaaaaggcttggttgttgtggttg 52532614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 1661344 - 1661499
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattag----gaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctat 104  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||  || ||||| ||||  ||||||||||||    ||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  1661344 agcagagatgaagatgttgtgttgaatgtctgataagactagatgtgataggattagaaatgaatgacaatatttgagagagagttggggtagcacctat 1661443  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1661444 agtagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagac 1661499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444640
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 34444638  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  34444639 tg 34444640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Original strand, 28533674 - 28533749
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28533674 tatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28533749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561843
Alignment:
Q  34 atgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 133  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||    
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctttagtagaaatgatgatagaaaataggctta 52561851  T
Q  134 gatggttt 141  Q
    | ||||||    
T  52561850 ggtggttt 52561843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11941732 - 11941578
Alignment:
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 320  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||| ||||||||| | | |||||||||||  | | |||| ||||||| |||| ||||||||      
T  11941732 gaggaagacctagaaaaacaataagagaagctattagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtat 11941633  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11941632 tttgatccatgtagtcggcctcacttagtgggatacggcttggttgttgttgttg 11941578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36340097 - 36339804
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||   |||||  ||| ||||    
T  36340097 agagagagagttggtgtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacctatagattttgtagtaa 36339998  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    |  | || ||||| |||||||| |   |  | |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||    
T  36339997 ggcgggttgatcagatggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagattt-gaaattaatga 36339899  T
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||   |||  ||||  |||||| |||| ||||  || |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36339898 gttggacagaaacatggttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgt 36339804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Original strand, 6084158 - 6084259
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6084158 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataaggcttggttgttattgt 6084257  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  6084258 tg 6084259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 346
Target Start/End: Original strand, 40419557 - 40419893
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| | ||||   ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || |||||||    
T  40419557 agcagagatgaggatggtgcgttgaatgtatggtaaaactagatgagatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacttatagta 40419656  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||| || |||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  || |||  ||| | ||| ||||| | ||| ||||||| |||| |      
T  40419657 gaatagatggtagtaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtggattatgtagcaaggagagtagttcagatggaggggagttaga 40419756  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    | |  |||||||| || |||| ||| ||| ||||   |||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||| |    
T  40419757 taactagaggtaggggtagacatagaaaatctatacaagaaactattatgaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatagatc 40419856  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 346  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||    
T  40419857 actatggcgtcgttt-attcatgtagccgaccccactt 40419893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7762689 - 7762445
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||| ||| |||  |||| ||| | ||| || |  | ||||||| ||    
T  7762689 gaaaatatgattagatggtttgggcatgtagagagaagaattgtagatgttatagtatgaaaagtaaatcatatgaaagagtgttagatcaaaagagata 7762590  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 320  Q
     |    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| ||||| || |    
T  7762589 aaaagggacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatggtgtaa 7762490  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 365  Q
    ||||||  ||||| ||| |  |||||| | |||||||||||||||    
T  7762489 tttgatttatgtaaccgtttacacttaataggataaggcttggtt 7762445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19908371 - 19908040
Alignment:
Q  41 gtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtt 140  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||  |||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||  ||||  | | |||| || ||    
T  19908371 gtaagactagacatgacagggttagaaatgacaaaattaaagagagagttgtggtagcacctatagtaaaaaagatgggggaaaccaagtttaggtgatt 19908272  T
Q  141 tgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa--- 237  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||| ||||| ||||   |||| |||||| | || ||  | |  | ||||||||| |||| ||| |||       
T  19908271 tgggcatgtagagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagcaaatcagatggag-atagccagatcagtaaaggtagaggtagacttagaaaatta 19908173  T
Q  238 --actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 335  Q
      ||||| ||||| || |||||||    ||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  19908172 taactataagagacacgattagaatttttttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagc 19908073  T
Q  336 cgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19908072 cgaccccacttagtgggataaggcttgattgtt 19908040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 243 - 375
Target Start/End: Original strand, 19936612 - 19936744
Alignment:
Q  243 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc 342  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  ||    
T  19936612 tagaaaaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactcc 19936711  T
Q  343 acttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19936712 gcttagtgggataagacttgattgttgttgttg 19936744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28511960 - 28511795
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  | ||| || || || ||| | ||||||||||| | |||  |||| |||||||||||| |||    
T  28511960 agaggcagagaaagacctagaaaaactattagagaaattactaggaaagacttggagattaatgagttggaccaaaacatggtttatgatagaacattat 28511861  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg----ataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||    
T  28511860 ggcgtaatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggatacataagacttggttgttgttgttg 28511795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877343
Alignment:
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataaggcttggttgtggttgt 38877343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 288 - 375
Target Start/End: Original strand, 5113940 - 5114027
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  5113940 aaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgacctcaattagtgggataacgtttggttgttgttgttg 5114027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25715425 - 25715326
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| | | |||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25715425 aatgagttgaaccgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25715326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35828869 - 35828562
Alignment:
Q  54 tgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 153  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  35828869 tgataagattagaaatgacaatattagagagagagtttgagtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagag 35828770  T
Q  154 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaa 253  Q
    |||||||   |||||  ||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||  |    ||||| ||||||||| || | ||||||||||| ||||  |    
T  35828769 agaagacctatagattatgtagtaaggagagaagatcatatggaggatagtcagatccctagaggcagaggaagatctggaaaaactattag-gaaa-ga 35828672  T
Q  254 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 353  Q
    || || |  |||        ||||||||||||  |||| |||| || ||||||||| ||||||   |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  35828671 tttgata--att--------aatgagttggatggaaatatggtttacgatagaacattatggcaatatttgatccatgtaaccgaccccgcttagtggga 35828582  T
Q  354 taaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  35828581 aaagacttggttgttgttgt 35828562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 373
Target Start/End: Original strand, 50806765 - 50806949
Alignment:
Q  187 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 286  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |  ||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||| || |  ||||||  |||| | |||| |||||||     
T  50806765 gatcaaatggaggggagtcaaatcactagaagtagatgaagacctagaaaaacaataagagaaactatcaagaaggat--agagattaatgcgttggata 50806862  T
Q  287 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     |||| |||| ||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50806863 aaaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgaccccatttagtggaataaggcttggttgttgttgt 50806949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3777328 - 3777258
Alignment:
Q  305 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  3777328 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtaggataatgcttggttgttgttgttg 3777258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 283 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21769801 - 21769711
Alignment:
Q  283 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||| |||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21769801 gatctaaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgt 21769711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 121 - 350
Target Start/End: Original strand, 28528385 - 28528614
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    |||| ||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |    ||| |||    
T  28528385 gaaactagacttaggtggtttcggcatgtcgggagaagacttgtggattctgtagtaaggacagtagatcaaatggaggggagtcaaatccctagaagta 28528484  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 320  Q
    | ||||||||||  |||||||| | |||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||| ||||||||||||     
T  28528485 ggggaagacctaaaaaaactataacagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaccactatggcgtcg 28528584  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtg 350  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  28528585 tttgattcatgtagccgaccccacttagtg 28528614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 294 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32112068 - 32111987
Alignment:
Q  294 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  32112068 ggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagccgaacccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttg 32111987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43375709 - 43375596
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| ||||  ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||    
T  43375709 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttagtgggataaagatt 43375610  T
Q  362 ggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||    
T  43375609 ggttgttgttgttg 43375596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 51812472 - 51812625
Alignment:
Q  38 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 137  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  | |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||    
T  51812472 gtggtaagattagacacgataagattagaaatgactactttagagagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtg 51812571  T
Q  138 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
     ||||||||||||||||||| | | ||||||  ||| ||||||| ||| |||||    
T  51812572 atttgggcatgtagagagaaaaattgtagattttgtagtaagaaaagtagatca 51812625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8343040 - 8342885
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| | || | |||| ||||| |||    
T  8343040 agagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaacaattaataaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagtatttgatggaacattat 8342941  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    | |||   |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8342940 gacgt---ttgatcaatgtatctgatcccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 8342885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 284
Target Start/End: Original strand, 37263332 - 37263523
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||| ||| || |||| || |||||| |||||  ||||    
T  37263332 gggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaaaacttgtggatgttgcggtaaggagagtaaatca 37263431  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 284  Q
     ||||||| | ||||| | |  |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || | | | ||| ||||| |||||||||||||    
T  37263432 gatggaggggtgtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaatactattagtgaaactatca-agaagatctagagatcaatgagttgga 37263523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 41165502 - 41165566
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41165502 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 41165566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4318906 - 4318843
Alignment:
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4318906 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 4318843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14226191 - 14226047
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||  |    |||||||||||  ||    
T  14226191 agcagatacgaggattttgtgttggatgtgtggtaaggctagacatgataggattagaaatggcaacattggagagag--ttgcagtagcacctatcata 14226094  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 155  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14226093 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagag 14226047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16273073 - 16272820
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||| |||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  16273073 gaaaataggtttaggtggtttgtacatttagagagaaaacttgtagattctatagtaagaagagtggatcaaatagaggataatcatattacaagaggta 16272974  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 320  Q
     || | ||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||  ||||| || | ||||||| | ||| || | |||| |||||||||||| |||| | |      
T  16272973 tagaacgacctagaagaactattagagaaattattatgaaatatttatagattaatgagtagtatctaattatggtttatgatagaacaatatgacatat 16272874  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||  | || |||||||||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  16272873 tttgatccatgtaatcaat-ccacttagtgggataatgtctggatgttgttgttg 16272820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7133401 - 7133300
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||| | |||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7133401 aatgagttggaccgaaatacggtgaatgatagaacattttggcctaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 7133302  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  7133301 tg 7133300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 300 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4590605 - 4590533
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4590605 tgatagaacaatatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 4590533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 370
Target Start/End: Original strand, 42501143 - 42501387
Alignment:
Q  126 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 225  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||  || ||| |||| | ||| ||||| | ||| |||||||  |||||| | |  ||||||||||||    
T  42501143 taggcttgggtggtttggacatgtagagaagagacccgtggattctgtagaaaggagagtagttcagatggagggtagtcaaatcattagaggtagagga 42501242  T
Q  226 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 325  Q
    | |||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| || || | ||||||||||||  |||| |||  |||||||||||| ||  ||||| ||| |    
T  42501243 aaacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctatagattaatgagttggatagaaatatggaatatgatagaacattacagcgtcgtttaa 42501342  T
Q  326 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||| ||||    
T  42501343 tccatgtagccgaccctacttagtgggataaagtttggttattgt 42501387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 375
Target Start/End: Original strand, 52832037 - 52832329
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 182  Q
    |||||||  |||||| | ||| |||||||||| || || ||||||   |||| ||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||| |||   ||    
T  52832037 agagagttggggtagtagctacagtagaaaagatgatacaaaataaatttaggtggtttgggcatgttaagagaagaccgatagatgttgttgtacagag 52832136  T
Q  183 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
    ||| ||| | |||||||||||||   ||| || ||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||  |||||||| |||||||||||  || |||||    
T  52832137 agtagataagatggaggagagtcgtattagaataggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaagtattagaaaagatttagaggttgataagttg 52832236  T
Q  283 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     || ||||| | || |  ||||||||| |||| ||| ||||||||||| |||  ||| | | ||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  52832237 aatacaaatattgtttcagatagaacattatgacgtaatttgatccatatagttgattcaatttagtaggataagatttggttgttgttgttg 52832329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 39894722 - 39894934
Alignment:
Q  29 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 128  Q
    ||||||| ||||| |||||||||   |||||||||| |||| |||| || | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  39894722 gttggataagtggcaagattagatgagataggattaagaataacactatcatagagagaat-tgggtagcccctatagtagaaaagatggga-aaaatag 39894819  T
Q  129 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 228  Q
       ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  || | ||   ||||||||   | |||||| ||||||||| |    
T  39894820 atctaggtggtttgggcatgtacggagaagacttgtagatgttgtggtacgaagagtaaattagat---ggagagtccgatcaaaagatgtagaggaaaa 39894916  T
Q  229 cctaggaaaactattaga 246  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  39894917 cctagaaaaactattaga 39894934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43481851 - 43481796
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43481851 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43481796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2914191 - 2914121
Alignment:
Q  305 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914191 gaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 2914121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 375
Target Start/End: Original strand, 26299187 - 26299352
Alignment:
Q  193 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 292  Q
    |||||||| |||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||| |     
T  26299187 atggaggatagtcagattaccagaggtagaggaaaacctaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgggtccaactg 26299286  T
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
                     ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26299287 -----------------ctatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgctgttgttg 26299352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 45510932 - 45510830
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || ||||||    
T  45510932 aatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggctgatgttgt 45510833  T
Q  374 tgc 376  Q
    |||    
T  45510832 tgc 45510830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Original strand, 4379927 - 4380081
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--------gggtagcacctat 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||        |||||||| ||||    
T  4379927 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagaaaagatatgattagaaatgacaacattagagagagagagtgagtgttggggtagcaactat 4380026  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||| |||| |||| || | |||| ||||||   |||||||||||||||    
T  4380027 agtagaaaagatggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 287 - 372
Target Start/End: Original strand, 22175341 - 22175426
Alignment:
Q  287 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22175341 caaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttggtgttg 22175426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37430487 - 37430418
Alignment:
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37430487 aacattatggcgtagtttgatccatatagccgatcccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttg 37430418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42539339 - 42539210
Alignment:
Q  247 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat-ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 345  Q
    ||||||||||| ||  | || ||| ||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||  || || || ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  42539339 gaaacaattaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaaaatttagtttatgatagaacatcattggtgtaatttgatccatgtagacgaccccact 42539240  T
Q  346 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  42539239 tagtgggaaaaggcttggttattgttgttg 42539210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 288 - 373
Target Start/End: Original strand, 50257767 - 50257852
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  50257767 aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaggcttcgttgttgttgt 50257852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 109092 - 109002
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 365  Q
    ||||||||||||  | || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  109092 aatgagttggataaatatatgatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagcctgtcccac-tagtgggataaagcttggtt 109002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15437201 - 15437130
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15437201 tgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccaaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 15437130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19908543 - 19908388
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |   ||||||| ||||||||| | || ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||   |||    
T  19908543 agaggcagaggtagacctagaaaaactttaagagacattgttagaaaagatttagagattaacgagttggattcaaatatggtttataatagaatcttat 19908444  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
     ||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19908443 tgcgtagtttgatccatgtacctgaccccacttagtgggataaggcttggtcgttg 19908388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29577301 - 29577147
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  | | |||| ||||  || ||| ||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  29577301 agaggtagaggaagacctagaaaaactacaacataaactattaagaaagatctagagattaatgagctggatcaaaatatggt-tatgatagaacattat 29577203  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    ||| | ||||  | ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29577202 ggcataatttatttcatgtagccaaccccacttagtgggatagtgcttggttgttg 29577147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1290119 - 1290033
Alignment:
Q  285 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  1290119 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 1290033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8677017 - 8676897
Alignment:
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg---tatgatagaacactatggcg 317  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||||   |||||||||| | ||||||     
T  8677017 gaggaaaacctaggaaatctataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtggtctatgatagaatattatggca 8676918  T
Q  318 tcatttgatccatgtagccga 338  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  8676917 taatttgatccatgtagccga 8676897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Original strand, 19936444 - 19936571
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||        ||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  19936444 gagatgagaatgttgtgttggatgagtggtaagactagatgggataggaataggaatgacacc--------gagagttagggtagcacctatagcaaaaa 19936535  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 148  Q
    || |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  19936536 agatggtagaaaataggtttatgtggtttgggcatg 19936571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27637913 - 27637720
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc-- 190  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||  || |||| ||| ||||| ||||| ||||      
T  27637913 ggtagcacctatagcagaaaagatgatagaaactagacttaggtgttttgggcatgtagagaaaagacatgtggatgttgtagtaaggagagtagatcat 27637814  T
Q  191 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 284  Q
    | ||||||  ||| ||| | |  |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| || |  |||||| ||| | |||||||||||||    
T  27637813 atatggagtggaggcaaatcactagaggtaggggaagacctaaaaaaacttttagagaaactatcaagaaggatctagtgatcaatgagttgga 27637720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 219 - 357
Target Start/End: Original strand, 29807984 - 29808122
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 318  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |  |||||| || |  | || |||||| ||  |||| |||| | ||||| ||||||||||||     
T  29807984 tagaagaagacctagaaaaactataagagaaacgatcaagaaggatctaaatattaacgagttgaataaaaatatggtttttgataaaacactatggcga 29808083  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 357  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29808084 catttgattcatgtagccgattccacttagtgggataag 29808122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17269064 - 17268987
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  17269064 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggaaaagtcttggttagtgttgttg 17268987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 27072572 - 27072491
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||    
T  27072572 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccatgcttagtgggaaaaggcttggttgttg 27072491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38758067 - 38758018
Alignment:
Q  326 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38758067 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 38758018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 50846769 - 50846846
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  50846769 tatgatagaacattatggcataatttgatctatgtagccgacaccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttg 50846846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 52073123 - 52073050
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  52073123 tatgatagaacattatggcggcgattgatccatgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgtt 52073050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 239 - 372
Target Start/End: Original strand, 52292188 - 52292320
Alignment:
Q  239 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 338  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || ||| | ||||||||||| |||| | | || |||||||||| | ||| | || |||||||||||||| || |    
T  52292188 ctataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttgga-ccaattattgtttatgatagaaaattattgagtaatttgatccatgtaaccaa 52292286  T
Q  339 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52292287 ccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52292320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 2429704 - 2429636
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 366  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  2429704 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggacaaagcttggttg 2429636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13827851 - 13827699
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||| | || |||||||| |||||||||||||||   |||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  13827851 gggtagtacctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtagatca 13827752  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 244  Q
     |||||  | |||||  | |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13827751 tatggaacatagtcagatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatta 13827699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18793345 - 18793201
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| | ||  ||||||  ||||| |||||| ||  |||||| || ||| |||||||||     
T  18793345 atgatgatgttgcgttggatgtgtggaaagactagacaggatagaactaaaaatgacgacattaaagagagggttggggtaggacttattgtagaaaaga 18793246  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||    
T  18793245 tggtagaaactagacttagttgattttggcatgcagagagaagac 18793201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30396804 - 30396728
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30396804 tatgatagaacattatggtggcgtttgatccgtgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgtt 30396728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 275 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31274499 - 31274399
Alignment:
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||| |||  |||| |||| ||||||| |||  |||||||| ||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31274499 atgagttagattgaaatatggtttatgatataacgttatggcgtaatttgatctgtgtagctgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgtt 31274400  T
Q  375 g 375  Q
    |    
T  31274399 g 31274399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 305 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43028876 - 43028808
Alignment:
Q  305 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43028876 gaacactatggtgtcgtttgattcatgtaagcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 43028808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 235 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16142118 - 16142019
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 334  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||| ||||||| | |||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  16142118 aaaactataagagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgtag 16142019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 375
Target Start/End: Original strand, 27704156 - 27704235
Alignment:
Q  297 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg-ataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| |||| ||||||||||||    
T  27704156 gtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaagacttgtttgttgttgttg 27704235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 372
Target Start/End: Original strand, 44008702 - 44008859
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| ||  |||||| || ||||| ||||||||||||||    |||| ||||||| ||||||  ||    
T  44008702 agaggcagaggaagacctagaaaaaatctaagagaaactatcgagaaag-atctagagatcaatgagttggatagggattttgtgtatggtagaacgtta 44008800  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    || || |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44008801 tg-cgccatttgatccatttagccgaacctacttagtgagatacggcttggttgttgttg 44008859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 375
Target Start/End: Original strand, 50636266 - 50636365
Alignment:
Q  276 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||  |||| |||| ||||||||| || |||| | |||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  50636266 tgagttggataaaaatatggtatatgatagagcattatgacatcatttgatcaatgtagtcgattctacttagcgggataaggcttgattgttgttgttg 50636365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 51584953 - 51585028
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| | |  |||||| |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  51584953 tgatagaacactatgacattgtttgattcatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 51585028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 309
Target Start/End: Original strand, 8628150 - 8628248
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||| |||| | || || |||||||||    
T  8628150 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaatatagtttacgatagaaca 8628248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 267
Target Start/End: Original strand, 9002382 - 9002528
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    ||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  9002382 gaaaataggtttaggtagtttggacatgtagagaaaaaacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcaaatagaggataatcatattagaagaggta 9002481  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggattta 267  Q
     || |||||||||  ||||||| ||| |||| ||| |||| ||||||    
T  9002482 tagaaagacctagagaaactatcagaaaaactatttgaaaagattta 9002528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12930471 - 12930309
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||  || |||||||||| ||| |||||||  ||||  ||  ||||| || | | |||||||||||||||| || | |||||||||| | ||    
T  12930471 aagaggtagagagaggcctaggaaaattataagagaaattattatgaaaaatttaaagattagtgagttggatccaaatatgatttatgatagaagatta 12930372  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || ||| ||||||||| ||||||| | |||||||||    |||||| ||||||||||||||||    
T  12930371 tgacgtaatttgatccgtgtagccaaccccacttagcaaaataaggattggttgttgttgttg 12930309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Original strand, 17815402 - 17815537
Alignment:
Q  18 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 117  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| || |||||  ||||| ||||| |||||||  |||||||||||| || || ||| || |||| | |||||| ||    
T  17815402 gaggatgttgtgttggatgtgtggta-gactagacgggatagcattagaaatgacaatattagagagaga-tgagg-taggacttataatggaaaagatg 17815498  T
Q  118 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 156  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17815499 gtggaaactaggcttagttggtttgggcatgtagagaga 17815537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26113519 - 26113437
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||   ||||||||||||    
T  26113519 tggtttatgatagaacattatggcttaatttgatccatgtagccgagctcacttagtgggataagactacattgttgttgttg 26113437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27520378 - 27520233
Alignment:
Q  204 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa--ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 301  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||  |||| |||||||| ||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||| || | ||||    
T  27520378 tcaagtcaaaagaggtaaaggaagacatataaaaaaactataagagaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatg 27520279  T
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 347  Q
    |||||||| ||||  || ||||||| ||||||| ||| | ||||||    
T  27520278 atagaacattatgatgtaatttgattcatgtagtcgacctcactta 27520233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 91 - 309
Target Start/End: Original strand, 41611806 - 41612024
Alignment:
Q  91 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 190  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||   ||||||| ||| ||| ||| ||| |||     
T  41611806 tgggtagcacttatattagaaaagatggtagaaaataggtttatgtggtttgagaatgtagagagaagatatgtagatgatgtagtacgaaaagtagatt 41611905  T
Q  191 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 290  Q
    |||| ||||   ||||    || ||||||||||||| | |||  |||| ||| ||||| |   ||||||| |||||||| || ||||||||| || ||||    
T  41611906 aaatagaggtttgtcagagcaagagaggtagaggaaaatctataaaaaatataagagatattgttagaaaagatttagatgttaatgagttgaattcaaa 41612005  T
Q  291 tttggtgtatgatagaaca 309  Q
    | |||| ||| ||||||||    
T  41612006 tatggtttatcatagaaca 41612024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 52814346 - 52814292
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  52814346 tttgatccatgtagcctatcccacttagtgggttaaggcttggttgtttttgttg 52814292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 1704834 - 1704911
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||  ||||| | ||||||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  1704834 tatgatagaacatcatggcataatttgatccatgttgctgaccccacttagtgtgataagacttggttgttgttgttg 1704911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10569126 - 10569069
Alignment:
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10569126 tcatttgatccatgtagccggttccacttaaagggataaggcttggttgttgttgttg 10569069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Original strand, 11584180 - 11584281
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||  | ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11584180 aatgaattggacccaaatatggtctatgataaaacattatggtataatttgatccatctaaccgactccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 11584279  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  11584280 tg 11584281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44905483 - 44905354
Alignment:
Q  246 agaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 345  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | |||||| | || | || || || | |    
T  44905483 agaaactataagaaatgatttataggttaatgagtttgatccaaatatggtttatcatagaacactatggcataatttgacctatttggctgaccctatt 44905384  T
Q  346 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||    
T  44905383 taataggataaggtttggttgttgttgttg 44905354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 367
Target Start/End: Original strand, 49377508 - 49377577
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  49377508 tatgatagaacattatggcggtgtttgatccatgtagccgactccagttagtgggataaggcttggttgt 49377577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8203290 - 8203138
Alignment:
Q  217 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 316  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||| | |||||||||||   |  | || |  | ||||||||| ||||||    
T  8203290 ggtagaagaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttggacggaggtatgatagaagatagaacattatggc 8203191  T
Q  317 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    ||   || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  8203190 gttgatttatccatgtagccgaccccacttagtgtgataagatttggttgttg 8203138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 373
Target Start/End: Original strand, 12231592 - 12231640
Alignment:
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12231592 atccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 12231640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 370
Target Start/End: Original strand, 16943362 - 16943434
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  16943362 tatgatagaacattatggcggcgtttgatccatgtagtcgaccccacctagtgagataatgcttggttgttgt 16943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 136 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 30834214 - 30833982
Alignment:
Q  136 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 235  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | |||| || |  |||| ||||| ||||| ||||| |  |||||| |  | ||||| |||||||||||||| |    
T  30834214 tggtttggtcgtgtagagagaagacttgcagattctataataaggagagtagatcagatggaaggtagtcaaatcgatagagggagaggaagacctagaa 30834115  T
Q  236 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 335  Q
    || |||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| | || | |||  ||||| | ||||||||||| | |||||||||    
T  30834114 aagctataagagaaactattacgaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagtatttgacggaacattgtggcgtcatttaaaccatgtagc 30834015  T
Q  336 cgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
     || | || || | ||||||||||||| |||||    
T  30834014 ggacctcattttgagggataaggcttgattgtt 30833982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 299 - 375
Target Start/End: Original strand, 39525973 - 39526049
Alignment:
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || || | |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39525973 atgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagctgaccctatttagtgggaccaggcttggttgttgttgttg 39526049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 52442868 - 52442788
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt 89  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||    
T  52442868 agcagacatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaagataagattagaaatgagaacattggagagagagt 52442788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 990732 - 990469
Alignment:
Q  100 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 199  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||   ||||| |||| | ||| ||||| ||| | |||||      
T  990732 cctatagtagaaaagatggtaggaaataggctcaggtggtttaggtatgtaaagagaagacatatagattctgtagcaaggagagtagattagatggaat 990633  T
Q  200 agagtcaagttaaaagaggtagaggaag-acctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 297  Q
    | |||||  | |    ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||     
T  990632 atagtcagatcactgtaggcagaggaagcacattggaaaactattagagaaactattgagata-gatctagagattaatgagttggatcaacatatggtt 990534  T
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||||||        | ||||||| |||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  990533 tatgatagaaca--------ttatttgattcatgtagccgacaccacttaacgggataaggcttggttgttgt 990469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 365
Target Start/End: Original strand, 10272259 - 10272530
Alignment:
Q  91 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 190  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |  |||||| ||||||||||||||||||  || ||| | || | ||| ||||  ||||    
T  10272259 tgggttgcacctgtagtagaaaagatggtagaaactagactaaagtggttttggcatgtagagagaagacctgtggattc-gtaggaaggagaggagatc 10272357  T
Q  191 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 290  Q
    | ||||| | ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||  |||||| ||||  | ||| ||| |||   | |    
T  10272358 agatggatgggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaacttataagagaaactattaagaaggatctagaaattaataagtaggagaaaca 10272457  T
Q  291 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 365  Q
      |||| | |||||||||||   || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  10272458 cctggtttttgatagaacac--cggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggaataaggtttggtt 10272530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 14224294 - 14224368
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14224294 tgatagaccactatggcgtcattt-attcatgcagccgaccctacttagtgggacaaggattggttgttgttgttg 14224368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14225911 - 14225840
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  14225911 tatgatagaacagtatggtgtcgtttgatccatgtagccggccccacttagtgggatatgaattggttgttg 14225840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33561081 - 33560858
Alignment:
Q  150 agagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaa 249  Q
    |||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||| |||   |||||||  |||||| | |  ||||| |||||||| ||||| |||||| | || |||    
T  33561081 agagagaagacctgtagattctgtagtaaggagagtagatatgatggagggtagtcaaatcactagaggcagaggaagtcctagaaaaactgtaagggaa 33560982  T
Q  250 acaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt 349  Q
    || ||||   | ||| ||||| | |  |||||||||  |||| |||| ||| | |||||| |||| | |  |||||||||||||||| | || |||||||    
T  33560981 actattaagtaagatctagagattagcgagttggatataaatatggtatatcagagaacattatgacattgtttgatccatgtagccaaccctacttagt 33560882  T
Q  350 gggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||    
T  33560881 gggataaggcttggctgttgttgt 33560858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 373
Target Start/End: Original strand, 4380188 - 4380241
Alignment:
Q  319 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4380188 cattttatccatgtagccga-cccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 4380241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15438904 - 15438800
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| |||| |||| |||||||||| |   || ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  15438904 gatttagagattaatgagttagatcaaaatatggtttatgatagaaaa---tgacgttatttgatgcatgtagccgaccccacttagt-agataaggctt 15438809  T
Q  362 ggttgttgt 370  Q
    |||||||||    
T  15438808 ggttgttgt 15438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40920628 - 40920526
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||||| | ||||| ||| |||||| ||||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  40920628 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagaatattatggtgtcttttgattcatgtagtcgacccccacttagtgggatcaggtttggttgttcttg 40920529  T
Q  373 ttg 375  Q
    |||    
T  40920528 ttg 40920526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 50771792 - 50771555
Alignment:
Q  136 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |    
T  50771792 tggtttgggc-tgtagagagaagacccatggattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatgactagaggtaggggaagacctagaa 50771694  T
Q  236 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg-tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 334  Q
    ||||||| || ||||| ||||  |||||  ||||| | ||| |||||||   | |  ||| | | | ||||||||| ||||| || || ||| |||| ||    
T  50771693 aaactataagcgaaactattaagaaggacctagagattaataagttggagaaagacatggttttttaatagaacaccatggcatcgttcgattcatgcag 50771594  T
Q  335 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50771593 ccaactccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 50771555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 52073753 - 52073675
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  52073753 agagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 52073675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 372
Target Start/End: Original strand, 52815094 - 52815155
Alignment:
Q  310 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52815094 ctatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttag-aggataaggcttggttgttgttg 52815155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8809540 - 8809499
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8809540 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 8809499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15707066 - 15706969
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||  |||| |||||| |||| ||||| |||| || | ||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15707066 agttggatagaaatatggtgtttgattgaacattatgacgccgtttgatccacgcagccgtccccacttagtgggataaggctttgttgttattgttg 15706969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 322 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 49051227 - 49051174
Alignment:
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  49051227 ttgatacatgtagccgatcccacttagtgggataaggttttgttgtcgttgttg 49051174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 325 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 50830682 - 50830637
Alignment:
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50830682 atccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgt 50830637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 375
Target Start/End: Original strand, 7082536 - 7082588
Alignment:
Q  323 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  7082536 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggctgggttgtggttgttg 7082588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8343139 - 8343071
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  8343139 gggtaacacctttagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggactgggcatgtagagagaagac 8343071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13827994 - 13827930
Alignment:
Q  96 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  13827994 agcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagac 13827930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 157
Target Start/End: Original strand, 17275137 - 17275262
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |          ||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||| | || |    
T  17275137 atgttgcgttggatgtgtggtaagactacacatgataggataa----------cattagagagagatttggggtagcttctatagtagaaaagattgtgg 17275226  T
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17275227 aaacttggcttaggtggtttgtgcatgtagagagaa 17275262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 375
Target Start/End: Original strand, 35672869 - 35672969
Alignment:
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||| ||| ||||| | || ||||||||||   ||||| || |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  35672869 atgagtttgatacaaatatagtttatgatagaatgttatggtgtaatttgatcgatgtagctgatctcgcttagtgggataagacttggttgatgttgtt 35672968  T
Q  375 g 375  Q
    |    
T  35672969 g 35672969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 370
Target Start/End: Original strand, 39797212 - 39797280
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  39797212 atagaacattatggcgtcatttgattcatgtaatcaattccacttagtggaataaggcttgattgttgt 39797280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 40920894 - 40920822
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  40920894 atgaagatgttgcattggatgtgtggtaagattagacgagataggattagaaattacaatattagagagagag 40920822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Original strand, 43898439 - 43898491
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43898439 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 43898491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 43934404 - 43934332
Alignment:
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43934404 atgatagaacattatggcggcgtttgttccatgtagctaaccccacttagtgggataaggtttggttgctgtt 43934332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 48865818 - 48865730
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtg 350  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| || |||| |||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  48865818 gatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccactcagtg 48865730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 329 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 853825 - 853782
Alignment:
Q  329 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  853825 atgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttg 853782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 361
Target Start/End: Original strand, 7083097 - 7083160
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||    
T  7083097 tatgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctgaccccgcttagtgggttaaagctt 7083160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7210989 - 7210930
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  7210989 tatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataagcctcggttgttgt 7210930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 349
Target Start/End: Original strand, 14557751 - 14557826
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt 349  Q
    ||||||||||| | |||| | || |||||||||||| ||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  14557751 aatgagttggaccgaaatgtagtttatgatagaacattatggcgtattttgatccacgtggccgatcccacttagt 14557826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Original strand, 16943097 - 16943243
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||| || ||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||  |||||  || |||  ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  16943097 gagatgagaatattgtgttggatgcgtgataagactagacgagataaaattagacattacaatattagggagagagttggggtagtacctatagtagaaa 16943196  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    || |||| |||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  16943197 agatggtggaaactagatttag-tggtttgggcgtgtagggagaagac 16943243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 334 - 373
Target Start/End: Original strand, 29975442 - 29975481
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29975442 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29975481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 37294183 - 37294128
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 353  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  37294183 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccatttagtggga 37294128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Original strand, 41611098 - 41611181
Alignment:
Q  17 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcac 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| | |||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||    
T  41611098 tgagaatgttgcgttggatgagtagtaagaatggacgggatatgattaggaatgacgctattagagagagtgttggggtagcac 41611181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 213 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 52878459 - 52878328
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |  | | |||||||||||  ||    
T  52878459 aagaggtataggaagacttaggaaaattataagagtaattattataaaagatttagaggttaatgagttgaatccaactacgatttatgatagaacttta 52878360  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 344  Q
    | | || ||||||| |||||| ||||| ||||    
T  52878359 tagtgtaatttgattcatgtaaccgataccac 52878328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 52900753 - 52900682
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 333  Q
    ||||||||| | |||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  52900753 gatttagagattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccatgta 52900682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 309 - 375
Target Start/End: Original strand, 2728847 - 2728913
Alignment:
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| || ||| |||||||||||    
T  2728847 actattgcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttactaggataatgcctggatgttgttgttg 2728913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39776994 - 39776936
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  39776994 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacacaatggcgtaatttgatcaatgt 39776936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 52981492 - 52981410
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  52981492 aaatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccttgtagccaaccccacttggtgggataacgattggttgttgt 52981410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Original strand, 6757462 - 6757503
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6757462 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgttg 6757503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 375
Target Start/End: Original strand, 7601361 - 7601411
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7601361 tttgatccatgtagccgacccca----gtgggataaggcttggttgttgttgttg 7601411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8725849 - 8725812
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8725849 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 8725812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16142241 - 16142172
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 85  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16142241 atgaagatgttatgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcaggaatgccaccattagagaga 16142172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16822376 - 16822235
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||  |||||  ||||  |  || ||| || ||  ||||| |||     
T  16822376 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaatactagataagataggattagaaatgacagtattagtaagag--ttaggatagaacttac-gtagacaaga 16822280  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16822279 tggtagaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 16822235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Original strand, 21519167 - 21519208
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21519167 gccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 21519208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39123443 - 39123367
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||  |||| || | ||||||||||||    
T  39123443 tatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga-cccccttagtggtgtaagactcgattgttgttgttg 39123367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39515967 - 39515866
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||| |||  |||| ||||||| |||||| |  ||||||| |||||||  | | || |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  39515967 aatgagttggatcaaaatatggattatggtagaacattatggcattgtttgatctatgtagctaaccacaattagtgagataagacttggttgttgttgt 39515868  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  39515867 tg 39515866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49062514 - 49062469
Alignment:
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  49062514 ttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggtttgattgt 49062469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Original strand, 51234537 - 51234610
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattaga-catgataggattaggaatgacaccattagagagag 86  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  51234537 agatgaggatgttgtgttggacgtgtggtaagactaaaacatgataggattagaaattacaacattagagagag 51234610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Original strand, 52901039 - 52901080
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52901039 gccgaccccacttagtgggataaggcttggtggttgttgttg 52901080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 358
Target Start/End: Original strand, 7124324 - 7124408
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 358  Q
    ||||| ||||||  |||| |||| || |||||| || ||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  7124324 aatgaattggatagaaatatggtataggatagagcattatggtgtcgtttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataagg 7124408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14732386 - 14732334
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  14732386 tttgattcatgtggcccatcccacttagtgggatacggcttggttgctgttgt 14732334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17640138 - 17640066
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  17640138 atagaacattatggcgtcgtttgattcatgttgtcaatccaacttagtgggataagacttagttgttattgtt 17640066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 223 - 368
Target Start/End: Original strand, 17815611 - 17815753
Alignment:
Q  223 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 321  Q
    ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||| || ||| | |  ||||||| |||  |||| |||| ||||||||| || | ||| ||| |    
T  17815611 ggaagacctagaaaaattataagagaaactatttagaaag-atctagtgattgatgagttagatagaaatatggtatatgatagagcattttggtgtcgt 17815709  T
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    |||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  17815710 ttgatccatgtag---atctcacttagtgagataaggcttggttgtt 17815753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 37429974 - 37429906
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 366  Q
    |||||||| ||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||    
T  37429974 tatgatagcacattgtggtgtaatttgatccatgtagccgaccccatttaatgggataagggttggttg 37429906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48861476 - 48861373
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtat--gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||  |||||| || |||| |||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || ||    
T  48861476 aatgagttggatagaaatatggtatatttgatagagcattatgacgtcgtttgattcatgtcgccgaccccacttagtgggataagacttcgtttttttt 48861377  T
Q  372 gttg 375  Q
    ||||    
T  48861376 gttg 48861373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 374
Target Start/End: Original strand, 51812692 - 51812792
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||| |||| |||| |||||||||| | |||| ||| |||| ||  || ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  51812692 aatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaatattatgccgtaatttaatatatatatacgaccccactaagtgggataaggcttggtttttgttgt 51812791  T
Q  374 t 374  Q
    |    
T  51812792 t 51812792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 2694494 - 2694423
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    |||||||||||| |||||  |  |||||||||| |||| || |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  2694494 tatgatagaacattatggtatagtttgatccatttagcagaccccacttagtgggatacggtttggttgttg 2694423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Original strand, 3059554 - 3059597
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3059554 tagccgactccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttg 3059597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7913816 - 7913781
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7913816 cccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 7913781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Original strand, 7922074 - 7922109
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7922074 cccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 7922109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11331350 - 11331247
Alignment:
Q  227 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 326  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||| ||||||  |||| ||||  || |||||||    
T  11331350 gacctagaaaaagtataagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgat 11331251  T
Q  327 ccat 330  Q
    ||||    
T  11331250 ccat 11331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11489371 - 11489268
Alignment:
Q  227 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 326  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||| ||||||  |||| ||||  || |||||||    
T  11489371 gacctagaaaaagtataagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgat 11489272  T
Q  327 ccat 330  Q
    ||||    
T  11489271 ccat 11489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22319884 - 22319837
Alignment:
Q  328 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  22319884 catgcagccgatcccacttagtgggataaagtttgtttgttgttgttg 22319837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Original strand, 22930642 - 22930677
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22930642 cccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttg 22930677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30985341 - 30985306
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30985341 cccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgttg 30985306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31274613 - 31274578
Alignment:
Q  117 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31274613 ggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaga 31274578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 334 - 373
Target Start/End: Original strand, 37831616 - 37831655
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37831616 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgt 37831655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39422398 - 39422209
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    ||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||| |   ||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||  | ||| ||| |||||||||||||     
T  39422398 atgagaatgttgtgttagatgtgtggtaggattatatgagatagaattagaaatgacaatattaga-agagagttggagtaacacatatagtagaaaaga 39422300  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
    | ||||||| ||| ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||  ||| || || ||| | ||||| ||||||| |||||||    
T  39422299 tagtagaaactagacttaggtgctt-ggacatgtagagagaagacatgtagattatgtagttaggagaatagatcatatggaggggagtcaa 39422209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44905603 - 44905548
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  44905603 tatagtagaaaagacggtagaaaatatgcttaggtggtttggacatgtaaagagaa 44905548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #218
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 371
Target Start/End: Original strand, 46388612 - 46388654
Alignment:
Q  328 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46388612 catgtagctgatcccactta-tgggataaggcttggttgttgtt 46388654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 4590879 - 4590813
Alignment:
Q  18 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 84  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  4590879 gaggatgttgcgttgaatgtgcggtgagactagacaagataggattagaaatgacaatattagagag 4590813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 99 - 157
Target Start/End: Original strand, 7921843 - 7921901
Alignment:
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  7921843 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttatgtggtttggacatgtagagagaa 7921901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #221
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 233
Target Start/End: Original strand, 9602204 - 9602286
Alignment:
Q  151 gagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctag 233  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||| || ||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||    
T  9602204 gagagaagactagtagattgtgtagtaagaagagaagatcagatagagggtagtcaaattgcaagaggcagaggaagacctag 9602286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 19908718 - 19908573
Alignment:
Q  25 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattag--agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 122  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||  |||||||||  ||| | |||||| || |||||||   || ||    
T  19908718 ttgcgttggatgtgttgtaagactagacatgatatgatttgtaatgacaacattagaaagagagagttcgggcaacacctaaagaagaaaagagagtgga 19908619  T
Q  123 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    ||  || ||||  ||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||    
T  19908618 aaccagacttaagtggtttgagcatgtatagagaaaacttgtagat 19908573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 299 - 373
Target Start/End: Original strand, 34863648 - 34863722
Alignment:
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| | ||| | |||||  |||||| ||||||||||||||    
T  34863648 atgatagaacattatggtatcatttcatccatgtagccaaccccgcctagtgaaataaggattggttgttgttgt 34863722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 325 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 37099810 - 37099760
Alignment:
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37099810 atccatgtagccggccccacttggtgggaaaaggcttggttattgttgttg 37099760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #225
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 300 - 365
Target Start/End: Original strand, 37263566 - 37263632
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttga-tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 365  Q
    |||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  37263566 tgatagaacactatggcgtcgtttaaattcacgtagccagccccacttagtgggataaggcttggtt 37263632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #226
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41017296 - 41017215
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||||||||| ||| || | ||||| || ||||||| ||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41017296 tggtttatgatagaacattatagcataatttggtcgatgtagc-gactccacttagtggaataagacttggttgttgttgttg 41017215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #227
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 306 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 43598989 - 43598923
Alignment:
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgtt 371  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  43598989 aacattatggcgtagtttgatccatgtagcagaccctacttactgggataaggctttggttgttgtt 43598923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #228
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 107 - 185
Target Start/End: Original strand, 46388392 - 46388470
Alignment:
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 185  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  46388392 tagaaaagatggtggaaactcggcttaggtagtttgcacatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagt 46388470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #229
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 373
Target Start/End: Original strand, 4298323 - 4298356
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4298323 cccacttagtgggataaggcctggttgttgttgt 4298356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #230
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10569312 - 10569263
Alignment:
Q  128 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggta 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||    
T  10569312 ggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctgtagta 10569263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #231
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 346 - 375
Target Start/End: Original strand, 11572405 - 11572434
Alignment:
Q  346 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11572405 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 11572434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #232
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 361
Target Start/End: Original strand, 30445314 - 30445375
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  30445314 tgatagaacaccatgacgtcgtttgattcatgtagccaactccacttagtgggataaagctt 30445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #233
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 45168520 - 45168483
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45168520 gccgatctcacttagtgggataaggcttgtttgttgtt 45168483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #234
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Original strand, 46395056 - 46395096
Alignment:
Q  328 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46395056 catgtagctgatcccactta-tgggataaggcttggttgttg 46395096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #235
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 373
Target Start/End: Original strand, 51173925 - 51173958
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51173925 cccacttagcgggataaggcttggttgttgttgt 51173958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 329; Significance: 0; HSPs: 250)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31960178 - 31959814
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31960178 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31960079  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31960078 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31959979  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31959978 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 31959879  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31959878 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31959814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 436147 - 436513
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  436147 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 436246  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  436247 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 436346  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  436347 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaac 436446  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436447 actatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 436513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 52569879 - 52569513
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52569879 agcagagatcaggatgttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 52569780  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52569779 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 52569680  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52569679 ttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 52569580  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52569579 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 52569513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48174457 - 48174091
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48174457 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagta 48174358  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48174357 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 48174258  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48174257 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaac 48174158  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48174157 attatggcgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 48174091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 4440773 - 4441137
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  4440773 agcagagattaggatgttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattagagagag--tgggggcagcacctatagta 4440870  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4440871 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 4440970  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4440971 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 4441070  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  4441071 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgtcgtcgttgttg 4441137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 33227127 - 33227493
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33227127 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 33227226  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33227227 gaaaagttggtagaaaataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaagagagtcaag 33227326  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33227327 ttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 33227426  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  33227427 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacctagtggaataaggcttggttgtttttgttg 33227493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 374
Target Start/End: Original strand, 56375208 - 56375573
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  56375208 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctataata 56375307  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  56375308 gaaaagttggtagaaaacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaag 56375407  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56375408 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 56375507  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  56375508 actatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 56375573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 33191212 - 33190845
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33191212 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagattagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 33191113  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  33191112 gaaaagttggtagaaaatagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaag 33191013  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33191012 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaac 33190913  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33190912 actatgacgtcatttgacccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgtttttgttgc 33190845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48622905 - 48622543
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  48622905 agcagagatgaggatgttgctttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacccatagta 48622808  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  48622807 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaag 48622708  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  48622707 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaac 48622608  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48622607 actatggcgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48622543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1777379 - 1777016
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    ||||||||||||||    
T  1777379 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tggaaatagcacctatagta 1777282  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1777281 aaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 1777182  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1777181 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 1777082  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1777081 agtatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgtt 1777016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 53707712 - 53708078
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  53707712 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattagaaagagagtggaggtagcacctatagta 53707811  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  53707812 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggatagtcaag 53707911  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53707912 ttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 53708011  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53708012 actatgacgtcatttgatccatttagtcgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 53708078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 43433836 - 43434208
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag------agagagtgtgggtagcacct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||    
T  43433836 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacct 43433935  T
Q  103 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43433936 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggaga 43434035  T
Q  203 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  43434036 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtagga 43434135  T
Q  303 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43434136 tagaacactacggcgtcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43434208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23906665 - 23906297
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag------tgtgggtagcacct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      || |||||||||||    
T  23906665 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacct 23906566  T
Q  103 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23906565 atagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaagaagagtagattaaatggaggaga 23906468  T
Q  203 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 302  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23906467 gtcaagttaaaaaaggtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 23906368  T
Q  303 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23906367 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 23906297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46583188 - 46582824
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  46583188 agcagagatgaggatgttgcattagagaagtggtaagactagacagcataggattaggaatgacaccattcgagagagagtggggatagcacctatagta 46583089  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacta-gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46583088 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagaga--agaccccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaa 46582991  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46582990 gttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 46582891  T
Q  308 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46582890 ccctatggcgtcatttgatccatgtagccta-cccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 46582824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 28236103 - 28236466
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  28236103 agcagagattatgatgctgcattggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 28236200  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  28236201 gaaaagttggtggaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaag 28236300  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  28236301 ttaaaat-ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaat 28236399  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28236400 attatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 28236466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 22 - 375
Target Start/End: Original strand, 37797783 - 37798135
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37797783 atgttgcgttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtag 37797882  T
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||    
T  37797883 aaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttag 37797981  T
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 321  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  37797982 aggaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcat 37798081  T
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37798082 ttgatcaatgtagccgactccatttagtgggataaggcttggttattgttgttg 37798135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47265566 - 47265193
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  47265566 agcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagagagagtgggggtaacacctatagta 47265467  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac---tagt----agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 201  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||    |||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  47265466 gaaaaggtagtagaaaataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgtcgtaagaagagtagactaaatggaggag 47265367  T
Q  202 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 301  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  47265366 attctagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatctatg 47265267  T
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47265266 atagaacactatagtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttattgttgttg 47265193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39100893 - 39100534
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||    
T  39100893 gagatgaggatgttgcgccaaatgagtggtaagactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagaagaaa 39100796  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  39100795 agttgatagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatgc-gttgtaagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaa 39100697  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||    
T  39100696 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaaatattgtttatcatagaacatta 39100597  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39100596 tggcgtaatataatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 39100534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27450533 - 27450180
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  27450533 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaat----aatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaa 27450440  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||    
T  27450439 agttggtagaaaataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggagtagaatcaggttaa 27450340  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||    
T  27450339 aagaggtaaaggaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgat-tttgatagaacacta 27450241  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27450240 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgctgttgt 27450180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 9 - 347
Target Start/End: Original strand, 50286889 - 50287217
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||    ||||||||||    
T  50286889 agcagagatgaggaagttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag-----ggg----acctatagta 50286979  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  50286980 gaaaagttggtagaaaatagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaag 50287079  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  50287080 ttaaaagaggtagaagaagacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgtatgatagaac 50287179  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 347  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  50287180 actatgg-gccatttgatccatgtagtcgaccccactta 50287217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 70 - 366
Target Start/End: Original strand, 39708412 - 39708708
Alignment:
Q  70 gacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatg 169  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||    
T  39708412 gacaccattagggagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatg 39708511  T
Q  170 ctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttaga 269  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39708512 ccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttaga 39708611  T
Q  270 ggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 366  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39708612 ggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataagacttggttg 39708708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Original strand, 27983122 - 27983476
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27983122 gagatgaggatattgtgctagatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaa 27983221  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  27983222 agttggtag-------gcttagatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaggttaa 27983314  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||  | | |||||||||||    
T  27983315 aagaggtagaggaagacataagaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaattggatcaaaatatggatttttatagaacacta 27983414  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  27983415 tgacgtcatttgatccatgtagccgatcccaattaatgggataaggtttggttgttgttgtt 27983476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 115 - 375
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286723
Alignment:
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  215 ga--------ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 306  Q
    ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataga 8286654  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286655 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 8286723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37773811 - 37773468
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  37773811 agagatgagaatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaattatgaatgataccattagagagagtaag-gggtagcacctatagtagaa 37773713  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||   || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  37773712 aagtcggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatcaaatggatgagagtcaattta 37773613  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37773612 aaagaggtagatgaatacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccagatttggtttatgatagaacact 37773513  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 356  Q
    ||| | | |||||||| || ||||||| ||| |||| || |||||    
T  37773512 atgacataatttgatctatatagccgaccccgcttaatgagataa 37773468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192311
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 182  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  183 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggttg 20192224  T
Q  283 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  20192225 gatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgat-caagtagccgaccctacttagtgggataaagcttggttgttgt 20192311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 79 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26037799 - 26037506
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||  ||| |||| || ||||    
T  26037799 agagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaa 26037700  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  26037699 gaagagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatga 26037600  T
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26037599 gttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 26037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 173; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 110 - 374
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479321
Alignment:
Q  110 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 309  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaaca 32479256  T
Q  310 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32479257 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgtt 32479321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 370
Target Start/End: Original strand, 1793382 - 1793741
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |  ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  1793382 gagatgaggatgttgtgttggatgaacggtaagacttaacgggataagattaggaatgacaccattagggagagagcgggggtagcacctatagtaaaaa 1793481  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||| ||| ||||| |||||||||  ||   | ||    
T  1793482 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagatggaggag--tcgtatcaa 1793579  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac----aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |    
T  1793580 aagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagc 1793679  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  1793680 actatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgt 1793741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 165; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 187 - 375
Target Start/End: Original strand, 21236954 - 21237142
Alignment:
Q  187 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21236954 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 21237053  T
Q  287 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21237054 caaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggattggttgttgttgttg 21237142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45205208 - 45204838
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt-gtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||  ||||||||||||    
T  45205208 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattaacgagagagttgggggtagtgcctatagtagaa 45205109  T
Q  112 aagttggtagaaaataggctt--agatggtttgggcatgtagagagaagac---tagt----agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 202  Q
    ||| ||||||||||||| |||  || ||||||| ||| |||||||||||||   ||||    ||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  45205108 aagatggtagaaaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtagatcagatggaggaga 45205009  T
Q  203 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 302  Q
    | ||  | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  45205008 g-cagatcaaaagaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatccaaatatggtttatga 45204910  T
Q  303 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45204909 tagaacatta-ggcgtaatttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 45204838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Original strand, 51421666 - 51422013
Alignment:
Q  25 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| |||||||||  || || ||||||    
T  51421666 ttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattatgaatgacaccattagagagtg--ttggggtagcacatatagtagattagatgatagaaa 51421763  T
Q  125 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 224  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||   ||||  | ||||||||||||||    
T  51421764 ataggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagagg 51421863  T
Q  225 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 324  Q
    ||||  ||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| |||| ||| |||||    
T  51421864 aagatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaatttg 51421963  T
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51421964 atccatgtagccaatctcacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 51422013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20591662 - 20591306
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| | |||||| |||||   ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20591662 cagatatgaggatgttgtgctggatgaatagtaagactagacggaattagattgagaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacttatagtaga 20591563  T
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||     
T  20591562 aaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatagatgtcgt-gtaagaagagtatatcagatggaggagagtcaagt- 20591465  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 310  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  20591464 ---agaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggt-tatgatagaacac 20591369  T
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||| ||| ||||||| ||| ||  ||| ||   ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20591368 aatgacgtaatttgattcatatattcgaccctttttagtgggataagacttgattgttgttgt 20591306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957882
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgt 6957825  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6957826 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 6957882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41009707 - 41009414
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  41009707 atgaggatgttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagataatgggggtagcacctatagtagaaaagt 41009608  T
Q  116 tggt-agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 214  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||| || ||||||| | | ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  41009607 tggtaaaaaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaa 41009508  T
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 309  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| ||||    
T  41009507 gtggtagaggaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattcaaatatggtttatgatataaca 41009414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494947
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 12494890  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12494891 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12494947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 16 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20602003 - 20601651
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||  | ||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||  | || ||| ||||||||||||||    
T  20602003 atgaggatgttgcgctggatgagcgctaagacaatacatgatagaattgagaatgacaccactagggagagagtggagataacacttatagtagaaaagt 20601904  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||  || | |||||||||||||| || |||||    
T  20601903 tggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggagagtcaggtcaaaag 20601804  T
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 315  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||       ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||     
T  20601803 aggtagaagaagacct-tgaaaactataagagaaaccattagaaag-----tcaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacattatga 20601710  T
Q  316 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||| ||||||| |||||| | || ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  20601709 cgtaatttgattcatgtaactgaacccacttagtgggataagagttaattgttgttgtt 20601651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1211747 - 1211390
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| | | ||||||||||||| | ||||    
T  1211747 atgaggatgttgcactggatgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacaccatt--cgagagagtgggagcagcacctatagtaaacaagt 1211650  T
Q  116 tggtag--aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
    ||||||  || ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||   | |||    
T  1211649 tggtaggaaatatatgcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaagaagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaa 1211550  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||     
T  1211549 agagatagaggaagacataggagaactataagataaattattagaaa-aaattagaggtcaatgagttggatcc--atttggtttctcatagaacactaa 1211453  T
Q  314 ggcgt-catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  1211452 ggcgtaaatttgattcatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgttgttgttg 1211390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 135
Target Start/End: Original strand, 12494668 - 12494794
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12494668 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 12494767  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12494768 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 142 - 323
Target Start/End: Original strand, 50679556 - 50679736
Alignment:
Q  142 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 241  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||   | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50679556 gggcatgtagaaagaaga-tcgtagatgtcatcgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 50679654  T
Q  242 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 323  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  50679655 ttagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 35690226 - 35690555
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||       
T  35690226 gagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgacacctttaaagagagagttggggtagcacctatagtag--- 35690322  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
             ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||                     |||||||||| | |||||||| |||||  | ||    
T  35690323 ---------aaaataggcttaggtggtttgggcatgtagatagaag---------------------aagagtggattagatggaggaaagtcagatcaa 35690392  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||  |||||||||| |||||||| |||||||    ||| |||||||||||| ||    
T  35690393 aagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacatta 35690492  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  35690493 tggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgttg 35690555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 54470128 - 54470485
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||   |||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  54470128 agagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgggatatgatttgaaataacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaa 54470227  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    ||| |||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||| |||||  |||||||||||   |||||| |||    
T  54470228 aagatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtaaattatgtagtaaggagagtaaatcaaatggagagtagtcaaatta 54470327  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
      ||||| | | ||||||| || |||||||| |||||| | ||||  || | | ||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||||  || || |    
T  54470328 ctagaggcaaaagaagaccaagaaaaactataagagaatctattaataaagttctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgactgagcatt 54470427  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54470428 attgcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggattaggcttggttgttg 54470485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Original strand, 21528416 - 21528572
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 318  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| |     
T  21528416 tagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtgg 21528515  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21528516 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 21528572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 122 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 53518571 - 53518325
Alignment:
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||   |||||| | | |||||||||    
T  53518571 aaaataggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctgtggatgctgtagtacgaagagtagatcagatggag---agtcaaatcagaagaggtag 53518475  T
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 321  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| |||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  53518474 aggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 53518375  T
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  53518374 ttgatccatgcag-cgaccccacttagtgggataggactcggttgttgttg 53518325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 219 - 368
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947214
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 318  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgt 7947164  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7947165 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 7947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 371
Target Start/End: Original strand, 16002857 - 16003206
Alignment:
Q  21 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggta 120  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||| ||| |||||||| ||    
T  16002857 gatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattatagagtgagtgaggatggcacctatggtataaaagttgata 16002956  T
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||||  |||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| || ||| | || ||||||  ||    
T  16002957 gaaaatagtcttagatgg-ttgaacatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatggatgaaagttatgtcaaaagaaata 16003055  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 320  Q
    |||||| |||    |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||| ||||||||| ||| |    
T  16003056 gaggaataccgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgatttatgataaaacactatgacgtaa 16003155  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||| |||||| ||  |||||||| ||| | |||||   |||||||||||||    
T  16003156 tttaatccatataagcgatcccatttaataggatataacttggttgttgtt 16003206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 31458946 - 31459098
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag--agagtgtgggtagcacctatag 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||   ||||||||||||||    
T  31458946 agcacagatgaggatgttgcgttggttgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagagacagagtcgaggtagcacctatag 31459045  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31459046 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 263 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154861
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttg 19154874  T
Q  363 gttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||    
T  19154873 gttgttgttgttg 19154861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 209 - 372
Target Start/End: Original strand, 4548140 - 4548303
Alignment:
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4548140 ttaaaaaaggcagaggaggacctacgaaaactattagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaac 4548239  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4548240 actaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgggataatgcttggttgttgttg 4548303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 268 - 375
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969465
Alignment:
Q  268 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgt 19969457  T
Q  368 tgttgttg 375  Q
    ||||||||    
T  19969458 tgttgttg 19969465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 136 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31961503 - 31961264
Alignment:
Q  136 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || || ||||||||| | ||||||  ||||||| | |  |||||||| || |||||||| |    
T  31961503 tggtttgggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagttaggagagtggattagatggagaggagtcaaatcactagaggtaggggtagacctagaa 31961404  T
Q  236 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc 335  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||||||   | |  ||||   ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  31961403 aaactataagagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagc 31961304  T
Q  336 cgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31961303 cgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31961264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821002
Alignment:
Q  125 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |  ||| || ||| ||| | |||||| ||| |||  | |||||||||||| |    
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatg 20821156  T
Q  225 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac----actatggcgtca 320  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||    |||||  | | |    
T  20821155 aagacctaggaaaactataagagaaaca-ttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacgaacactatatcataa 20821057  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || |||||||||||| ||||  |||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  20821056 ttcgatccatgtagctgatcttacttagtaagataaggtttggttattgttgttg 20821002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 149 - 374
Target Start/End: Original strand, 28351617 - 28351842
Alignment:
Q  149 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 248  Q
    ||||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  28351617 tagagagaagacctgtagactctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagaga 28351716  T
Q  249 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttag 348  Q
    ||| ||||  || ||||||||| | | |||||||||||||||| | || |||  ||||||  |||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28351717 aactattacgaaagatttagagattattgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccacttag 28351816  T
Q  349 tgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||    
T  28351817 tggggtaaggcttggctgttgttgtt 28351842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 56224983 - 56225352
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga---ttagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata 105  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |  || ||  |||||||    
T  56224983 agcagagatgatgatgttgtggtggatgagtggtaagacactaagacatgatatgattaggaatgacaccataagagaaag--ttgggataatacctata 56225080  T
Q  106 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 205  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||     |||||| ||| ||| | |||||  |||| |||||||||||||    
T  56225081 gtataaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgagtatgtagagagaaggaacatagatgttgtagtacgtagagtatatcatatggaggagagtc 56225180  T
Q  206 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaa--aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 303  Q
     | | || | || ||||| |||| |||  ||  |||||| || | ||| ||||  || | ||||||||| ||| | || ||||||||| |||| | | ||    
T  56225181 taatcaagaaagttagagaaagatctaaaaagaaactataaggggaactattatgaaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttat 56225280  T
Q  304 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  56225281 agaacactatgatgtaatttgatccatgtggtcgaccccacttagtgggataaggatcggttgttgttgttg 56225352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 75 - 373
Target Start/End: Original strand, 46372008 - 46372306
Alignment:
Q  75 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 174  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||     
T  46372008 cattagagatagagttggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgta 46372107  T
Q  175 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
     |||||||||  ||||| || |||| ||| ||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  46372108 ctaagaagagcagatcagatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataa 46372207  T
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||   | |  |||| | |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  46372208 atgagttggagaaagacatggtttttgatagaacaccgtagcgtcctttgattcatgtagctgaccccacttagttgggtaaggcttggttgttgttgt 46372306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42639381 - 42639020
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||||| |||||  ||| ||||  |||||| | |||||  ||||||||||  |||  || | |||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  42639381 agagatgagaatgttatgtttgatgtatggtaacactagacgggataggattataaatagcaaccttagagagagagttagggttgcacctatagtagaa 42639282  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    ||| |||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  | ||  || | ||||||| ||||||| | |    
T  42639281 aagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttatggattctgtggtaaggggggtaaattagatggaggggagtcaaatca 42639182  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
      ||||||||||||| | |||| ||||||   |||||||| ||||  || ||| ||| | | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||||| |    
T  42639181 ctagaggtagaggaatatctagaaaaactgcaagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggatagaaatatggtatttgatagaacatt 42639082  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| | | || ||||||||| | ||| |||||||||||||||| || ||||||||||    
T  42639081 atggcgtcgtgtaattcatgtagccaaccccgcttagtgggataaggcatgcttgttgttgt 42639020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 143 - 375
Target Start/End: Original strand, 2589124 - 2589356
Alignment:
Q  143 ggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 242  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| |||| || || ||||| ||||||||||||| |||| || |||  |||||||||| | ||||||| ||||  ||    
T  2589124 ggcatgtagagagaaaacttgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagttaaattactagaggtagagcacgacctagaaaaagcat 2589223  T
Q  243 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc 342  Q
     |||||||| || |  | |||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  | |||    
T  2589224 aagagaaactatcaagatggatctagagattaatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaacccc 2589323  T
Q  343 acttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2589324 agttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 2589356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31897724 - 31897428
Alignment:
Q  75 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 174  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || ||| ||||     
T  31897724 cattagagagatagttggggtagcaccta--gtagaaaagatggtagaaactagacttgggtggtttgcgcatgtagagagcagacctgtggattctgta 31897627  T
Q  175 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
    || || ||||| ||| | ||||||| ||||||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  31897626 gttaggagagtcgattagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataa 31897527  T
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||   | |  ||||   ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31897526 atgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctcacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 31897428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 79 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35555941 - 35555648
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||| || |    
T  35555941 agagagagagttcgggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacctgtggattctgtagtta 35555842  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    | ||||| ||| | || |||||||||   || |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||   |||  | ||||| | |||||    
T  35555841 ggagagtagattagatagaggagagttgggtcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactatt---aagagtctagagataaatga 35555745  T
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||   | |  |||| | |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35555744 gttggagaaagacatggtttttgatagtacagtatggcgtcgtttgattcatgtagccgactccatttagtgggacaaggcttggttgtttttgttg 35555648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 150
Target Start/End: Original strand, 49987346 - 49987487
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  49987346 agcagagatgaggatgttgtgttgaatgtttagtaagactagacatgataggattagaaatgacaacattagatagagagtctgggtcacacctatagta 49987445  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 150  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  49987446 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggtcatgta 49987487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 212 - 368
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862908
Alignment:
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga-gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt-------------t 50862850  T
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    || || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50862851 taaggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 50862908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 293 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19062015 - 19061933
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19062015 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgttgttgttg 19061933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7092583 - 7092218
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||   |||| |||||| |||||||  |||||||| |||||  |  ||||||||||||||    
T  7092583 agcagagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagtctagaagggatatgattag-aatgacatgattagagacagagttggaatagcacctatagta 7092485  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||  || ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | | ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||      
T  7092484 gaaaatatgatagaaaataggtttaagtggtttgggcatatagagagaagacatgtagatgttatagtatgaagagtagatcagatggatgagagtcaga 7092385  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg--ataga 306  Q
      | ||||||| |||||||||||| || || ||| || ||||  ||||  || ||||||||||| |||| ||| |||| |||| || | ||||  |||||    
T  7092384 acataagaggtggaggaagaccta-gagaaatataagtgaaattattatgaaagatttagaggttaatgcgttagatctaaatatgatttatgatataga 7092286  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    | | ||| || | | || |||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||||| | ||||||||    
T  7092285 atattatagcataaattaatccatgtaaacgaccccacttagtagcataaggcttggatattgttgtt 7092218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Original strand, 10208977 - 10209318
Alignment:
Q  30 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 129  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| ||||| ||||||| ||||||||||    |  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||      
T  10208977 ttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattagagag----ttggggtagaacctatagtagaaaagatggcagaaactaaa 10209072  T
Q  130 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta--gaggaag 227  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||  ||  | | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || ||||  | || ||    
T  10209073 cttagttggtttgggcatgtagcgagaagacctgtgaattttttagtaaggagagtagatcagatggaggagagtcatatgactagtggtagggggggag 10209172  T
Q  228 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatc 327  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |||||||||||  ||||||| ||||||     
T  10209173 acctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacac--tggcgtcgtttgatt 10209270  T
Q  328 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  10209271 caagtagccgaccccacttagtgggataaggcgtggttgttgctgttg 10209318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 209 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51811442 - 51811280
Alignment:
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||  ||||||||   ||| ||| |||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  51811442 ttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaatcatccgagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaac 51811343  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51811342 actatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggctt-gttgttgttgt 51811280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 33709837 - 33710024
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggat-----taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcaccta 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     ||| |||| || |||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  33709837 agcagagatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgataggataggattagaaatggcaacattagagagagagttggggtaacaccta 33709936  T
Q  104 tagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||   || ||| |||| ||||  |||||||||||    
T  33709937 tagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaagaactgtggattctgtagtaaagagagtggatca 33710024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 335
Target Start/End: Original strand, 21106908 - 21107236
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattaga----gagagagtgtgggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |    ||||||||   ||||| | ||||||||||    
T  21106908 gatgaggatgttgggttcgatgtgtggtaagactagacgtgatagaattagaaatgacaacattatatatagagagagttgaggtagtatctatagtaga 21107007  T
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa---gactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa-atggaggagagtca 206  Q
    || | | || |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||   |||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||    
T  21107008 aaggatagttgaaaataggcttaggtagtttgggcatctagagagaagacgacttgtagattatgtagtaaggagagtggatcaagatggagggtagtca 21107107  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 306  Q
      | |   || | || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||||| | | ||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21107108 gatcactggatgcagcggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagttttagtgattaattagttggatccaaatatggtttatgataga 21107207  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagc 335  Q
    ||  |||||| |  ||||||| |||||||    
T  21107208 actttatggcttagtttgatctatgtagc 21107236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44047709 - 44047568
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44047709 agagacgaggatgttgcattgaatgcgtggtaggattaggcgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaa 44047610  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 153  Q
    ||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44047609 aaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagag 44047568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Original strand, 55007917 - 55008030
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  55007917 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 55008016  T
Q  362 ggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||    
T  55008017 ggttgttgttgttg 55008030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 370
Target Start/End: Original strand, 31339521 - 31339803
Alignment:
Q  75 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 174  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||     
T  31339521 cattagagagagagttggggtagaacctatggtagaaaaat-ggtcgaaactaagcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacttgtagattatgta 31339619  T
Q  175 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
    ||||| | ||| ||||||||| ||   |||||| | |  ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||    |||       | ||||| | |    
T  31339620 gtaaggatagtagatcaaatgaagagtagtcaa-tcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatatgagaa----tta-------tctagagatta 31339707  T
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31339708 atgagttggatcgaaatatggtacatgatagaacattatgacgtcgtttggtccatgtatccgaccccacttagtgggataaggcttgcttgttgt 31339803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 178 - 375
Target Start/End: Original strand, 31459093 - 31459278
Alignment:
Q  178 agaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatg 277  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||           ||||| |||||||| | ||||    
T  31459093 agaagagtagatcatatgtaggagagtcagatcaaaagaggtaaaggaagacctagaaaaactattag-----------gaaag-atttagagattaatg 31459180  T
Q  278 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |||||||  | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31459181 agttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtcgttg 31459278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 49939807 - 49939733
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49939807 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgtt 49939733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 200
Target Start/End: Original strand, 28497452 - 28497598
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 152  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28497452 gataggattagaaatgacaacatcagagagagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtaga 28497550  T
Q  153 gagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 200  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28497551 gagaagacttgtagattatgtagtaaggagagtagatcagatggagga 28497598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 128 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13805510 - 13805263
Alignment:
Q  128 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||  ||| | ||| ||| | ||||| ||||||||  ||||  | |  ||||| |||||||     
T  13805510 ggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctttagattttgtagcaaggagactagatcacatggaggattgtcagatcactagaggcagaggaaa 13805411  T
Q  228 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatc 327  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |  || ||||| |||   ||| |||||||   |||| |||| |||||||||||| |||||  | ||||||||    
T  13805410 acctagaaaaactataagagaaactatgaagaaagattttgagagtaataagttggacggaaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatc 13805311  T
Q  328 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13805310 catgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttg 13805263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 264 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208267
Alignment:
Q  264 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 363  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataaggcttgg 34208279  T
Q  364 ttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||    
T  34208278 ttgttgttgttg 34208267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 220 - 375
Target Start/End: Original strand, 37488220 - 37488375
Alignment:
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 319  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||  | ||| |||| |||| |||| ||||  |||||||| || ||||||||     
T  37488220 agaggtagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgta 37488319  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37488320 atttgatccatgtagccagccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 37488375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42285972 - 42285701
Alignment:
Q  101 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||| || |||||||  |||| | ||||||     
T  42285972 ctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagacctgtggattctgtagtcagaagagcagatc-agtggaggg 42285874  T
Q  201 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 300  Q
    ||||||  | |  |||||| | || |||||||| ||| ||||   |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |    
T  42285873 gagtcagatcactagaggtgggggtagacctagaaaagctat--aagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggttttt 42285776  T
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  42285775 gatagaatactatggcattgtttgattcatgtagccaaccccacttagttggataagacttggttgttgttgttg 42285701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34233393 - 34233031
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||| || |||| ||||||||| |||| || ||  ||||||||||||||||    
T  34233393 gagatgatgatgttgtgttggatgtgtgataagactagatgtgataggattagaaacgacaacattagagatagagagttgggatagcacctatagtaga 34233294  T
Q  111 aaa-gttggtagaaaataggcttaga-------tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 202  Q
    ||| |||||  |||||| |||||||        |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||||||      
T  34233293 aaaagttggg-gaaaattggcttaggacttgggtggtttggacatgtagagagagaacatgtagattatgtagtaaggagagtagatgagatggaggatc 34233195  T
Q  203 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 302  Q
    ||||  | |  ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||   || ||  ||||| | |||||||| |||| ||||  ||| |||||    
T  34233194 gtcagatcactagaggcagaggaaaacctagaaaaactatcagagaaactattcataaagacctagagattaatgagttagatcaaaataaggtttatga 34233095  T
Q  303 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 366  Q
    ||||||| | | |||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||    
T  34233094 tagaacattgtagcgtaatttgatccatgtagccgacgccactcagtgggacaatgcttggttg 34233031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 309 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50238679 - 50238613
Alignment:
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50238679 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 50238613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 309 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50238765 - 50238699
Alignment:
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50238765 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 50238699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 214 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2557831 - 2557670
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||||  |||||| |  || | || |||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  2557831 agaggtagaggaagatctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaggatctgaagattaacgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattat 2557732  T
Q  314 -ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
     || || ||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2557731 tggtgtaatttgatccatgtagccaactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 2557670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Original strand, 25575007 - 25575108
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25575007 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25575106  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  25575107 tg 25575108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 283
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356811
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||| ||||  |||||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagacatgtgggtattgtagtaaggagagtagatcggatgga 26356725  T
Q  198 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgg 283  Q
    || ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||  |||||| ||||| | ||||||||||    
T  26356726 ggggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactgttatgaaggatctagagattaatgagttgg 26356811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 29398741 - 29399088
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    || ||||||  |||||||  ||||| || |||||   | |||||||||| |||||||    
T  29398741 gagatgaggatgttgc-ttggatttgtggtaagattagatggaattggattacaaatgacaatattagggaaagagttgcgatagcacctatggtagaaa 29398839  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || |||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| || || ||||| || |  || ||||| |||||| | |     
T  29398840 agatggtggaaaatatgcttatgtggtttgggcatgtagagagaagacctatagattctgtagtgaggagagtagaccggatagaggatagtcaaatcac 29398939  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||  |||           |||| | ||| ||  | || |||||||| | ||||  ||| |||||||||||| ||    
T  29398940 tagaggcagaggaagacctagaaaaact--tag-----------gaaatgtttt-gaaattaacgagttggaacgaaataaggtttatgatagaacatta 29399025  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29399026 tggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 29399088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 50662311 - 50662497
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||||||| || |   ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||    
T  50662311 gagacgaggatgttgtgtaggatgtgtggtaagactatatgagataggattggaaatgacagcattagagagag--tttgggcaacacctatagtagaaa 50662408  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatgg-tttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 200  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  50662409 agatggtggaaagtaggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagacttgtagattctattgtaaggagagtagatctaatgaagga 50662497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 214 - 375
Target Start/End: Original strand, 53540413 - 53540574
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || || || ||| | |||||||||||   |||| |||| |||||||||||| |||    
T  53540413 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatagaacattat 53540512  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||| | ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  53540513 ggcataatttgatccatatagccaaccccactgagtgggataagacttggttgttattgttg 53540574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 259 - 375
Target Start/End: Original strand, 5306464 - 5306580
Alignment:
Q  259 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 358  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||||| ||||  | ||||||| |||||||||||    
T  5306464 aaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccacttggtgggataagg 5306563  T
Q  359 cttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||    
T  5306564 cttggttgttgttgttg 5306580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 17900398 - 17900549
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||  ||||| ||||||  |||||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  17900398 agcagaaatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataaaattagaaatgacgacattagagacggagttggggtagcacctatagta 17900497  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||  |||||||| ||| || |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  17900498 gaaaagacggtagaaactagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagac 17900549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32633479 - 32633404
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32633479 tgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 32633404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 51252823 - 51252635
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||| || |||||| ||| ||| |||| || |||||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||| |||||    
T  51252823 agcagggaggaggattttgtgttagatgtgtcgtaagactagacgagataggattagaaatgactacattagagagag--ttggggtagcacctctagta 51252726  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 199  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  || ||| || ||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  51252725 gaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatgggcatgtagagagaagacatgtggattctatggcaaggagagtaggtcaaatggagg 51252635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 235 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26024988 - 26024851
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 334  Q
    ||||||||  ||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| | |  |||| |||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  26024988 aaaactatatgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtag 26024889  T
Q  335 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26024888 ccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttg 26024851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45209280 - 45209203
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45209280 tatgatagaatattatggcgtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 45209203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25257943 - 25257722
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |   |||| |||||| | ||    
T  25257943 agcaaagatgagcttgttgtgttggatgtgtagtaagactagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttgaggtaacacctacaata 25257846  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
     ||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||  |||     
T  25257845 taaaagatggtagaagctagacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtgaatgctgttgtaaggagagtagatcagatggaggggacacaaa 25257746  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaccta 232  Q
    | |  |||||||| ||||||||||    
T  25257745 tcactagaggtaggggaagaccta 25257722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 173
Target Start/End: Original strand, 41192763 - 41192918
Alignment:
Q  20 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||  ||||||| | ||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||| ||    
T  41192763 ggatgttgcgttggatgtgtggtatgattagacaggatacaattataaatgacagcgttagagagagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatg 41192862  T
Q  118 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgt 173  Q
    || |||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  41192863 gtggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtagattctgt 41192918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30634167 - 30634104
Alignment:
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30634167 atggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30634104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 220 - 375
Target Start/End: Original strand, 31043201 - 31043356
Alignment:
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 319  Q
    ||||||||||| ||  ||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| || |     
T  31043201 agaggaagacccagataaactaaaagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactattgcata 31043300  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| || ||| || |||||||||||  |||| |||| ||| |||||||||    
T  31043301 atttgatccttgcagctgaccccacttagtgcaataaagcttagttattgttgttg 31043356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 374
Target Start/End: Original strand, 44360014 - 44360369
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattaga----gagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||| |  ||||| ||||| |||||||  ||||||    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44360014 atgttgtgttggatgtgtggtaggactaggcgagatagaattagaaatgacaatattagatggagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatg 44360113  T
Q  118 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 217  Q
    ||||||| |||  |||| | |||||||||||||||||||||||  || || | ||| ||||| | | | ||||| ||||||| ||| ||| | |  || |    
T  44360114 gtagaaactaga-ttaggttgtttgggcatgtagagagaagacatgtggacgatgtagtaaggataatagatcatatggaggggaggcaaatcactagtg 44360212  T
Q  218 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 317  Q
       |  |||||| ||| |||||||||||||||||  | |  |||||| | |||| ||||||||||||   | |   ||| | ||||||||||||||| ||    
T  44360213 cctggagaagacttagaaaaactattagagaaactgtcaagaaggatcttgaggccaatgagttggagaaagacacggtttttgatagaacactatgacg 44360312  T
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    || |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||    
T  44360313 tcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataggataaggcttgtttattgttgtt 44360369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 56 - 304
Target Start/End: Original strand, 50680704 - 50680953
Alignment:
Q  56 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt-gggcatgtagaga 154  Q
    |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  50680704 ataggattggaaataacaacattagagagagagttagggcaacacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagaga 50680803  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa-caa 253  Q
    |||| || |||||| | || ||||| ||||| |||| |||| |||| ||| |  | |  | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||  |     
T  50680804 gaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatgaaggatagttagatcactataggcagaggtagacctagaaaaactataagagaaattat 50680903  T
Q  254 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 304  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||  ||| |||| |||||||    
T  50680904 ttagaaa-gatctagagattaatgagttggatcggaatatggtttatgata 50680953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 355
Target Start/End: Original strand, 55578956 - 55579295
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||  | ||  |||| ||||| ||||||||| |||  | |||||| || ||  || |||||||||| |||||    
T  55578956 atgaggatgttgtgttgaataagtggtaagaggaaacgagataagattatgaatgacactattttatagagagagttggaataacacctatagt-gaaaa 55579054  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
      |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||    || ||| ||| ||| |||||||  ||   ||||||||||||||| | |||    
T  55579055 aatggtagaaaatatgcttaggtggttcgggcatgtaaagagaagatatataaatgttgtagtatgaagagtaaatttgatggaggagagtcaaatcaaa 55579154  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | | |||| |||   || |||||| ||||  |||||||||||  |||   ||| ||||||| |||| |||    
T  55579155 agaggtagaagaagacctagaaaaactataaaataaactattttgaaagatttaaaggttcatgagttggatttaaacaaggtttatgata-aacattat 55579253  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 355  Q
    |   | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||    
T  55579254 gatataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgtgata 55579295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 244 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28550584 - 28550455
Alignment:
Q  244 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 343  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||||||  |||||   | |||||||| ||||||| || ||||    
T  28550584 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgacccca 28550485  T
Q  344 cttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28550484 cttattgggataaggtttggttgttgttgt 28550455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 275 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20105616 - 20105516
Alignment:
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||   |||| |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  20105616 atgagttggactgaaatatggtatatgataggacattatggcgtcatttgatccatgtagccaatctcacttagtaggacaaggcttggtggttgttgtt 20105517  T
Q  375 g 375  Q
    |    
T  20105516 g 20105516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 279 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25427956 - 25427860
Alignment:
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || || |||||||||||||| |||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  25427956 gttggatctaaatttggtctatgattgaacactacggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttaatgagataagacttggttgttgttgttg 25427860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38571099 - 38570960
Alignment:
Q  20 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 119  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  | |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||| | ||    
T  38571099 ggatgttgtgttggatgtgtggtac-actagacaagataggattggaaatgacaacatttgagagagagctggggaagcacctatagtacaaaagatagt 38571001  T
Q  120 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38571000 ggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaaagaagac 38570960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50869950 - 50869878
Alignment:
Q  303 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50869950 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 50869878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7066571 - 7066497
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7066571 tgatagaacactatg-cgtcatttgattcatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 7066497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 375
Target Start/End: Original strand, 12443292 - 12443379
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||    
T  12443292 aaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgatcccaaatcgtaggataaggcttggttgttgttgttg 12443379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Original strand, 25755237 - 25755598
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| | || |||| | |||||  |||||||||||||  ||||    
T  25755237 cagagatgagaatgttgtgttagatgtgtggtaagactagacatgatatgattggaaatgaaaacaataga-aaagagttggggtagcacctatcttaga 25755335  T
Q  111 aaag-ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 209  Q
    ||||   ||| |||||| ||| |||||||||||| || |||||| ||||||   |||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||    |||| |    
T  25755336 aaagaaaggtggaaaatcggcatagatggtttggacacgtagagcgaagacctatagattatgttgtaagtagagtagatcaaatggagggtgatcaaat 25755435  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 309  Q
        ||||| | |||||||| || |||||| || |||||||| ||||   | || || | | | ||||||||||||    || || | ||| ||||||||    
T  25755436 cgttagaggcaaaggaagacgta-gaaaaccataagagaaactattaagtaagacttggggattaatgagttggatagggatatgatatatcatagaaca 25755534  T
Q  310 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||| | ||||||||||||||| || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25755535 ttatagtgtcatttgatccatgaagtcgatcccatttaatgggataaggcttggttgtttttgt 25755598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31403384 - 31403234
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga----gtgtgggtagcacctat 104  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    ||  |||||||||||||    
T  31403384 agcagagatgatgatgttgagttgaatgtgtggtgagattagacgggataggattagaaatgacaacattagagacagatagagttggggtagcacctat 31403285  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||  |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  31403284 agtagaaaa-atggtggaaactaggcttaggtgg-ttgggcatgtaaagagaa 31403234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Original strand, 34585691 - 34585762
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34585691 tgataaaacattatggcgtcatttgatccatgtagcttaacccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 34585762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 239 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37042798 - 37042667
Alignment:
Q  239 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 338  Q
    |||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | | ||||||||||  ||||  ||| | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37042798 ctataagagaaactattaagaaagatctagagattattgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccga 37042699  T
Q  339 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37042698 cccgacttagtgggataaggcttggttgttgt 37042667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 355
Target Start/End: Original strand, 47372676 - 47372915
Alignment:
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 215  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||  ||| | ||||||||| ||| | | |||||  |||||| | |  ||    
T  47372676 tggtggaaactagacttcgatggtttaggcatgtagagcgaagacccgtggattttgtaggaagaagagtagattagacggagggtagtcaaatcactag 47372775  T
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 315  Q
    ||| ||||| |||| |  ||||||||| |||||||| | ||  || |||  |||| | ||||||||||||  |||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  47372776 aggcagaggtagacttgagaaaactataagagaaactactaataaagatccagagattaatgagttggatagaaatatggtatattatagaacattatgg 47372875  T
Q  316 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 355  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47372876 agtcgtttgatccatgtagcccatcccacttagtgggata 47372915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Original strand, 49987531 - 49987690
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || ||| | |||||| ||||||||| | ||||  |||||||| || |||    
T  49987531 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagacttggagataaatgagatggatccaactatggttcatgatagagcattat 49987630  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| |||| |||| | |||  || |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  49987631 ggcgtaattttatccttctagttgaccccacttagttggataaggtttggttgttgttgt 49987690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17666294 - 17666053
Alignment:
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 221  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| ||| | |||||  ||| ||||| ||     
T  17666294 aaaataggtttaggtggtttggacatgtagagggaaaacatgtagattatgtagtaagaagagtagatgaaatagagaatagtcatattacaagagatat 17666195  T
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 321  Q
    | |||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| || | |||||||| |||  |||       |||||||||||| |||| |||  |    
T  17666194 atgaagacttagaaaaaatataagagaaactattagaaaagatttatagattaatgagttagatgaaaa-------tatgatagaacaatatgacgtatt 17666102  T
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  17666101 tcgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataatgtttggttattgt 17666053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 2588905 - 2589120
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg----------tagcacctat 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| | |||          ||| ||||||    
T  2588905 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaagggataggattagaaatgacaacattagggagggagggagggagggttggggtagtacctat 2589004  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 204  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  2589005 agt-gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaaaacttgtggattctgtagttaggagagtagatcagatggaggggagt 2589103  T
Q  205 caagttaaaagaggtag 221  Q
     || |||  ||||||||    
T  2589104 taaattactagaggtag 2589120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15661939 - 15661870
Alignment:
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15661939 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgtcgttg 15661870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 32339766 - 32339843
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32339766 tatgatagaaaattatggcgtcgtttgatccatgtagtctattctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32339843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36255603 - 36255526
Alignment:
Q  292 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36255603 ttggtgaatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttg 36255526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40932999 - 40932922
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40932999 tatgatagaacattatggcggcgtttgatgcatgtagccgaccccacttggtgggataaggcttgattgttgttgttg 40932922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Original strand, 51438628 - 51438729
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||   |||| |||| ||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51438628 aatgagttggaatgaaatatggtttataatataacattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgt 51438727  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  51438728 tg 51438729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 55388310 - 55388213
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||| |||| |||| || | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55388310 aatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 55388213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 371
Target Start/End: Original strand, 1095633 - 1095725
Alignment:
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1095633 gttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgttatttgatcgatgtacccgaccccgtttagtgggataaggcttggttgttgtt 1095725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10775786 - 10775654
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||  ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  10775786 agcagagatgatgatgttgtgttggatgcgtggcaggaccagacaggaaagaattagaaatgacaacattagagagagtgttggggtaacacctatagta 10775687  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt 141  Q
    |||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  10775686 gaaaagatggtagaaactagacataggtggttt 10775654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 314 - 374
Target Start/End: Original strand, 15665324 - 15665384
Alignment:
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15665324 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 15665384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 374
Target Start/End: Original strand, 41192244 - 41192344
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||    
T  41192244 aatgagttggatagaaatatggtatatggtagaacattatggcttcgttcgatccatgtagccgacccgacatagttggataaggcttggttgttgttgt 41192343  T
Q  374 t 374  Q
    |    
T  41192344 t 41192344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 323 - 375
Target Start/End: Original strand, 46153940 - 46153992
Alignment:
Q  323 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46153940 tgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 46153992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1427589 - 1427466
Alignment:
Q  68 atgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga 167  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||    
T  1427589 atgacaacattagagagagagccagggtagaacatatagtagaaaacatggtggaaactaggcttagatggtttgagcatgtagagagaggacctgtgga 1427490  T
Q  168 tgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |  ||||||||| ||||| |||||    
T  1427489 ttttgtggtaaggagagtagatca 1427466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 377
Target Start/End: Original strand, 3979127 - 3979206
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 377  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3979127 tatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcctactccacatagtgggataaggcttggttgttgttggtgca 3979206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Original strand, 8284346 - 8284421
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  8284346 tatgatagatcattatggcgtcatttgatccatatagccgatcctacttagtgggattaggcttgattgatgttgt 8284421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 29209274 - 29209175
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  29209274 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagagcattatggcgttgtttgatcaatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgtttttgt 29209175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 43070128 - 43070053
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 84  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43070128 agcagagatgatcatgttgggttggatgtgtggtaagattagacaggataggattagaaatgacaacattagagag 43070053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49738625 - 49738550
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49738625 tatgacagaacattatggcggtgtttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49738550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 370
Target Start/End: Original strand, 13296566 - 13296712
Alignment:
Q  224 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||||| ||  | ||||||||||| | ||||  |||||||| |  |||| ||| |||| ||||    
T  13296566 gaagacctaggaaagctattagagatactattagacaagatttggaaattaatgagttggaccgaaatacggtgtatggttaaacattatagcgtaattt 13296665  T
Q  324 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||| |||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  13296666 gatgcatgcagccgacctcacttagtgggaaaatgcttggttgttgt 13296712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 325 - 375
Target Start/End: Original strand, 56130404 - 56130454
Alignment:
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56130404 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 56130454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22420993 - 22420716
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    |||||| || |||| |||||| |||| |||  ||||||||| || ||||| |||||||||||||||   | ||||  |||  |||||||||| ||| | |    
T  22420993 gtagcaactgtagtggaaaagatggtggaagctaggcttaggtgatttggacatgtagagagaagatctgaagattttgtaataagaagagtagataaga 22420894  T
Q  194 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 293  Q
    ||||| | | |||| | |  ||||| |  ||||||  ||| |||||||| |||  ||| || |||||| || ||||| | ||||||||||||  | || |    
T  22420893 tggagaatattcaaatcactagaggcaagggaagatttagaaaaactataaga--aactataagaaag-atctagagattaatgagttggatagagatat 22420797  T
Q  294 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||  |||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22420796 ggtaaatgatagagcattatggcgttgtttgatctatgtagttgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 22420716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22873698 - 22873601
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| |||  ||| |||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  22873698 aatgagttggttccaaatatgggttatgatagaacattataacgtaatttaatccatgtagccaaccccatttagtgggataaggcttggtagttgtt 22873601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44719432 - 44719359
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44719432 atagagcattatggtgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 44719359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 215 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809075
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcca 288  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatcca 55809075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30621501 - 30621409
Alignment:
Q  76 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  30621501 attagagagggagttggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaagatttgtagat 30621409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Original strand, 38017319 - 38017371
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38017319 tttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttgggtgttgttgt 38017371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1328667 - 1328612
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1328667 atttgatccatgtatccgatcctacctagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1328612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4879162 - 4879107
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4879162 atttgatccatgtagccgacctcacttactgggataaggcttggttgttgttgttg 4879107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 25967623 - 25967552
Alignment:
Q  17 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  25967623 tgaggatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgactacattagagagagag 25967552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40018477 - 40018189
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||| || || | |||     
T  40018477 agagagagaattggggtagcacctatcgtaaaaaagatggtagaaacttggcttatgtggtttgggcatgccgagagaagacttgtatattctatagta- 40018379  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
         || ||||| ||| |||  |||||| | |  ||||| | |  ||||| ||| |||||||| ||| ||||  |||  || ||| ||||| |||||||    
T  40018378 -----gtagatcagatgaagggtagtcaaatcactagaggcaaataaagacttagaaaaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagatcaatga 40018284  T
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||    || || | |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||    
T  40018283 gttggatagggatatgatatatgatagaacattacggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaaacttgtttgctgttgt 40018189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 45175930 - 45176083
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||  | |||||| ||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||  ||||||  ||||| |||||||    
T  45175930 gagatgaggatgttgtcttggatgtgtggtagtactagacaagataatattagaaatgacaatgtta-agagagagttggggtagtgcctattgtagaaa 45176028  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    || |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45176029 agattcta-aaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagat 45176083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 310 - 373
Target Start/End: Original strand, 46236708 - 46236771
Alignment:
Q  310 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  46236708 ctatggcgtactttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggtggttgttgt 46236771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 369
Target Start/End: Original strand, 49686900 - 49686971
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    |||||| ||| | ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49686900 tatgatggaatattatggcgtcgtttgaaccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttg 49686971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6958310 - 6958237
Alignment:
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  6958310 gatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgggataa-cattggttgttgttgttg 6958237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21359293 - 21359227
Alignment:
Q  305 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21359293 gaacattatggcgtaatttgattcatgcagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgtt 21359227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21945846 - 21945644
Alignment:
Q  165 agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggat 264  Q
    |||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |  |||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||    
T  21945846 agattctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcacatcactagaggctgaggaagacctagaaaaactatcatagaaactattaggaaagat 21945747  T
Q  265 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 364  Q
    || ||  | |||||||||||   |||| |||| |||||||||||   |||||||  |||||||||||||||| | |||    ||||||| || |||||||    
T  21945746 ttggaaattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaac---atggcgtattttgatccatgtagccaacccc----agtgggaaaaagcttggt 21945654  T
Q  365 tgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||    
T  21945653 tgttgttgtt 21945644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 231 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41009361 - 41009283
Alignment:
Q  231 taggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 309  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||    
T  41009361 taggtaaactataagagaaacaattagaaatgatttagaagtcaatgagttggattcaaatatgttttatgatataaca 41009283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 46715678 - 46715585
Alignment:
Q  62 ttaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |     ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  46715678 ttagaaatgacaacattagagagagagag-----agcacctattgtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtgtgggcatgtagagagaagac 46715585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 56439714 - 56439568
Alignment:
Q  230 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 329  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||  | ||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||| |||| |||| |||||    
T  56439714 ctagaaaaactatcagagaaactattatgaaagatttggaaattaattagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatagcgtaatttaatcca 56439615  T
Q  330 tgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgttg 375  Q
    | ||||| | ||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||    
T  56439614 tatagccaaccccacttagtgcgaaaaggctttgcttgttgttgttg 56439568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 7544605 - 7544537
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    |||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  7544605 tatgatagaacattatagcga-atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagccttggttgt 7544537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8599090 - 8598957
Alignment:
Q  224 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 323  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| || | || |||||||| ||   ||||  ||| | |||||||||| ||||||||| |||    
T  8599090 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctaaatgttaatgagttagaaagaaataaggtatttgatagaacattatggcgtcgttt 8598991  T
Q  324 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 357  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8598990 gattcatgtagccgacgccacttagtgggataag 8598957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729494
Alignment:
Q  272 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 329  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtagtttgatcca 41729494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Original strand, 50471453 - 50471595
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    ||||| |||||| ||||||||  || ||||| | ||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||   |  |||||||||  ||||||||||||     
T  50471453 atgagaatgttgtgttggatgtttgctaagacttgacgtaataggattagagatgacaacattagagagac--tcggggtagcactaatagtagaaaaga 50471550  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||| |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  50471551 tggtggaaactaggtttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 50471595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 50967108 - 50967027
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| ||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  50967108 tggtatatgaaagaaaattatgtcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtggaataaagcttggttgttgttgtt 50967027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Original strand, 28348287 - 28348339
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28348287 tttgaaccatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28348339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31403186 - 31403034
Alignment:
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 320  Q
    |||||||| ||||  ||||||| ||| |||| ||||  || ||| ||||| | ||| ||||||||  |||| |||| ||||||||| || ||||| ||      
T  31403186 gaggaagatctagagaaactataagaaaaactattatgaaagatctagagattaattagttggatagaaatgtggtatatgatagagcattatggtgttg 31403087  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  31403086 cttgatccatgtagacgaccccacttagtaggataaaacttggttgttgttgt 31403034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 79
Target Start/End: Original strand, 18966474 - 18966541
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatta 79  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||    
T  18966474 agagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagattagacaaaataggattataaatgacaacatta 18966541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 375
Target Start/End: Original strand, 20999129 - 20999284
Alignment:
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 319  Q
    |||||||||||||| |||||||| | | |||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||  | || |||  |||| |||| || |||| ||||    
T  20999129 agaggaagacctagaaaaactataatataaactattaagaaagatctagagtttaatgagttgaataaatatatggcatatggtagagcattatgacgtc 20999228  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  20999229 gtttgatccttgtagccgaccccactcagtgggataaagcttgattgttattgttg 20999284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35622749 - 35622674
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| ||| ||| || |||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35622749 tgatagaacgctagggcatcgtttgattcaggtagctgaccccacttagtgggataaggcttggtcgttgttgttg 35622674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36556833 - 36556758
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| | |||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  36556833 tgataggacactatggcgttgtttgattcgtgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttg 36556758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39446983 - 39446908
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  39446983 tgattgaacactatggcgttgtttaattcatgtaaccgaccccacttaatgggataaggcttggttgtggttgttg 39446908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44047422 - 44047367
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44047422 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttgc 44047367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 45184291 - 45184135
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  ||| ||||  || |||  |||| | ||||||||| ||  |    |||| ||| ||| |||| ||    
T  45184291 aagaggtagaggaagacctagaaaaactataaga--aactattatgaaagataaagagattaatgagttgaatttactcatggtttataataaaacatta 45184194  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    || ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45184193 tgacgtaattcgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgtt 45184135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Original strand, 47372915 - 47372986
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||| | || | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47372915 atagaacattatgacatcgtctgatccatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 47372986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 47611741 - 47611796
Alignment:
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47611741 agtagaaaagatgatggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 47611796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Original strand, 8327143 - 8327185
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8327143 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 8327185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 370
Target Start/End: Original strand, 13262421 - 13262491
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  13262421 tgatagaaaactatgacgtcgtttgattcatgtagccgactccacttagtgtgataaggcttagttgttgt 13262491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 36557347 - 36557246
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  36557347 gatagaattagaaatgacgatattggagagagagttggggcagcacccatagtagaaaagatggtagaaactagacttag-tggtttgggaatgtagaga 36557249  T
Q  155 gaa 157  Q
    |||    
T  36557248 gaa 36557246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Original strand, 813147 - 813200
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  813147 atttgatccatgtagcagaccccgcttagtggaataaggcttggttgttgttgt 813200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 298 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 1965708 - 1965639
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  1965708 tatgatagaataatatggcgtaatttgatccacgtagccgatcccatttagtgggaaaagatttggttgt 1965639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6478706 - 6478662
Alignment:
Q  329 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6478706 atgtagccga-cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 6478662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 371
Target Start/End: Original strand, 17900691 - 17900760
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17900691 atagagcactatggcgttgtttgattcatttagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 17900760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 373
Target Start/End: Original strand, 32613643 - 32613712
Alignment:
Q  304 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  32613643 agaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccaatcacacttaatgggatatggcttgattgttgttgt 32613712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Original strand, 54529647 - 54529700
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54529647 atttgatccatgtagccggacccatttagtgggataagacttggttgttgttgt 54529700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20131274 - 20131167
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg-gcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 196  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||   ||||||| |||||||||| ||||| |   | ||| ||||||| ||||||||||    
T  20131274 cacctatagtagaaaaat-ggtagaaaatagacttagatgtttttttgcatgtaaagagaagactcgtagaagtcatagtatgaagagtagatcaaatgg 20131176  T
Q  197 aggagagtc 205  Q
    |||||||||    
T  20131175 aggagagtc 20131167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26275078 - 26275014
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  26275078 tatggcctaatttgatccatgtatccgaccccatttagttggaaaaggcttggttgttgttgttg 26275014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36799737 - 36799657
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||||| ||||| ||| || | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  36799737 tggtttatgattgaacaatatcgcataatttgatccatgtagacgaccccacttagtgggataaagcttaattgttgttgt 36799657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38585313 - 38585249
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  38585313 tatggcgtaatttgatccatttagctgagcccacttagtggaataaggcttagttgttattgttg 38585249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 38904036 - 38903925
Alignment:
Q  56 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 155  Q
    |||||||||||||| |||  ||||  |||||| | ||||||||||| ||  |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  38904036 ataggattaggaat-acaatattaccgagagactctgggtagcaccgatcatagaaaagatggtggaaactcggcttagttggtttgagcatgtggagag 38903938  T
Q  156 aagactagtagat 168  Q
    |||||| ||||||    
T  38903937 aagacttgtagat 38903925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 45185295 - 45185215
Alignment:
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 185  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  45185295 agtagaaaagatggtggataataggcttaggtgatttgggcatatagagacaagacttgtagattttgtagtaagaagagt 45185215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 373
Target Start/End: Original strand, 49416949 - 49416989
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49416949 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49416989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Original strand, 50471757 - 50471809
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50471757 tttgatccatgtaatcgaccccacttagtgggataacgcttggttgttgttgt 50471809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 56200153 - 56200234
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatcc----atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||    |||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  56200153 tatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatccatgtagccgaacccaatcaatgggataaggcttgtttgttgttgttg 56200234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 883433 - 883358
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| || |  |||| |||||||| |||||||||    
T  883433 tgatagaacactatgacatcatttaatccatgtagccgaccccactcagggatataatgcttggttattgttgttg 883358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26772570 - 26772535
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772570 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 26772535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 206
Target Start/End: Original strand, 38266134 - 38266261
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||| | | |||| |||| || |||||| |||||||  ||||| |||| ||| || |||||||| ||| |||    
T  38266134 agagagagagttagggtagcacctataatagagaggatggtggaaactaagcttaggtggtttgaccatgttgagataagtcttgtagatgccgtgataa 38266233  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    | ||||| ||||  |||||||| |||||    
T  38266234 ggagagtagatcgtatggaggatagtca 38266261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 368
Target Start/End: Original strand, 47147496 - 47147648
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||   |||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  | || || | |||||||||||| |||    
T  47147496 agaggcagaggaagacctagaaaaactatagaagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggat--agatatgatatatgatagaacattat 47147593  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    ||| |  ||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||  |||||||    
T  47147594 ggcattgtttgatccatgtaaccatccccaattagtgggataaggcccggttgtt 47147648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 49454512 - 49454477
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49454512 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 49454477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 217 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 50288099 - 50287988
Alignment:
Q  217 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 316  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||| ||| || ||||| || | ||||||| || |||||| |    
T  50288099 ggtagaggaagacttagaaaaactataagataaattattaaaaaagatttagaggtcaatgaattgaatgcaaatatgttttatgatataatactatgtc 50288000  T
Q  317 gtcatttgatcc 328  Q
    || |||| ||||    
T  50287999 gtaatttaatcc 50287988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 288 - 375
Target Start/End: Original strand, 54963648 - 54963734
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||| | || || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  54963648 aaatatggtatatgatagaaca-tatggcctaattttatccatgtacctgacccaacttagtgggataagacttagttgttgttgttg 54963734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8598948 - 8598898
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  8598948 tttgattcatgtagccgatcccacttaatgggataagactttgttgttgtt 8598898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 201
Target Start/End: Original strand, 20605241 - 20605307
Alignment:
Q  135 atggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  20605241 atggtttgggcatgtagagagaagagctgtagattctgtggtaaggagagtatatcaagtggaggag 20605307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 45423542 - 45423681
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| ||||    | |||||   ||||||||||||| |||||||    
T  45423542 agatgaggatgttgtgttggttgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacatt----atagagttgaggtagcacctataatagaaaa 45423637  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    | ||||||||| | | ||||  |||||| | |||||||| ||||    
T  45423638 gatggtagaaacttgacttacgtggttttgacatgtagaaagaa 45423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 375
Target Start/End: Original strand, 54935351 - 54935433
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||||||||| |||  | | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||    
T  54935351 tggtttatgatagaacattataacataatttgatccatgtagcctaccccacttggtgggacagggcttggttgttattgttg 54935433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 934793 - 934649
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||| || |||  ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| ||  ||||| |||||||  | ||||||    
T  934793 gatgaggttgttgcgttggctgtgtggtatgactaggtatgatagaattagaaatgataatattagagagagggttggggtatcacctatcat-gaaaag 934695  T
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
     ||||||||| |   ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  934694 atggtagaaactcatcttaggtggtttgggcaagtagagaggagac 934649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 1380296 - 1380433
Alignment:
Q  20 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 119  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||   |||| ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||  || || ||||||  ||||||||  || |    
T  1380296 ggatgttgcattggatgtgttgttagacctgacacgatagaattagaatggacaacattagagagagagttgggataacacctaccgtagaaaacatgat 1380395  T
Q  120 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1380396 agaaactcggcttaggtggtttgggcacgtagagagaa 1380433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14623292 - 14623243
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 360  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  14623292 tatggtgtcatttgatccatgtagccaatcccacctagtggaataaggct 14623243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 373
Target Start/End: Original strand, 26357008 - 26357041
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26357008 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 26357041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 355
Target Start/End: Original strand, 28486092 - 28486185
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 355  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| || | ||  || ||||| |||||||| |||||||||||||||| || | |  |||||||||||    
T  28486092 gatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgtagctgacctcggttagtgggata 28486185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 325 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32630540 - 32630495
Alignment:
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32630540 atccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgt 32630495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 371
Target Start/End: Original strand, 34379586 - 34379682
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| || ||| ||||| |||||| ||||    
T  34379586 aatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaacttgat-catgtagccgaccccactttgttggaaaaggcgtggttgctgtt 34379682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38789656 - 38789623
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38789656 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38789623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42293320 - 42293263
Alignment:
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42293320 tcatttaatctatgtagccggccccacttagtggaataaggcctggttgttgttgttg 42293263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48451108 - 48451071
Alignment:
Q  338 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48451108 atcccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttg 48451071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 52360012 - 52359963
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    |||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  52360012 atttgatccatgtagcagaccccactttgtggggtaaggcttggttgttg 52359963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 55768798 - 55768717
Alignment:
Q  76 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  55768798 attagagagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55768717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 55833054 - 55832973
Alignment:
Q  76 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  55833054 attagagagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55832973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 371
Target Start/End: Original strand, 20047670 - 20047714
Alignment:
Q  327 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20047670 ccatgtagccggccccacttagtgggataagacttggttgttgtt 20047714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25959281 - 25959225
Alignment:
Q  319 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||||||| | | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25959281 catttgatccttgtagccaacctcacctagtgggataagacttggttgttgttgttg 25959225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 334 - 370
Target Start/End: Original strand, 32745831 - 32745867
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32745831 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 32745867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Original strand, 44860862 - 44860914
Alignment:
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44860862 tagaaaagatggtggaaaccaggcttagatggtttgggcatgtatagagaaga 44860914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 49738885 - 49738817
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| || |||| || |||| |||||||||    
T  49738885 gggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtgatttgagcgtgtaaagagaagac 49738817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3601452 - 3601417
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3601452 cccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgttg 3601417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4136795 - 4136744
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  4136795 tttgatccatgtagccgaccctacttagtgagataaaacttggttgttgttg 4136744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 324 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8459103 - 8459056
Alignment:
Q  324 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8459103 gatccatgtagccaaccccatttagtgggataagacttggttgttgtt 8459056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 367
Target Start/End: Original strand, 10536580 - 10536615
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10536580 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgt 10536615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 11389638 - 11389875
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatg--ataggattaggaatgacaccattaga--gagagagtgtgggtagcacctat 104  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||  |  |||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  11389638 agcagagatgaggatgttggattggatgtgtggtaaaactagacgggatataggattagaaatgacaactttagagcgagagagttagggtagcacctat 11389737  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 204  Q
      ||| |||  |||| |||| |  |||||| |||| ||| || || |||||||   | |||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||    |||    
T  11389738 tctagtaaatatggtggaaactctgcttaggtggtctggccacgtggagagaatctttgtagattctgtagtaaggagagtagataagatggaaagtagt 11389837  T
Q  205 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 242  Q
    ||| | |  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11389838 caaatcactagaggtagaggaagacgtagaaaaactat 11389875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11400507 - 11400444
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11400507 tatggtgtaatttcatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggctttggttgtcgttgt 11400444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11410234 - 11410171
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11410234 tatggtgtaatttcatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggctttggttgtcgttgt 11410171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Original strand, 23294023 - 23294066
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23294023 tagccgaccctacttagtgggataaggcgtggttgttgttgttg 23294066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27338462 - 27338387
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  27338462 tatgatagaacattatgacgtagttggatccatgtagccgaccctccttagtgggatgagactttgttgttgttgt 27338387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 353
Target Start/End: Original strand, 28467649 - 28467700
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 353  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  28467649 atagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcggaccccgcttagtggga 28467700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Original strand, 35585854 - 35585889
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35585854 cccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35585889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Original strand, 43774098 - 43774141
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43774098 tagccgaccccatttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 43774141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46539164 - 46539109
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| ||||||| | | ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  46539164 atttgattcatgtaggcaaccccacttagtgggataaggtttgcttgttgttgttg 46539109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Original strand, 49370043 - 49370078
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49370043 cccacttagtgggatatggcttggttgttgttgttg 49370078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 51051488 - 51051453
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51051488 cccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 51051453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 51550322 - 51550251
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||   |||||| ||   |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51550322 tgatagaacattatgtcgtcatttgatttttgtagctgactgcacttagtgggataaggcttagttgttgtt 51550251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #231
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Original strand, 52357924 - 52357967
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52357924 tagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgctgttgttg 52357967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #232
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 359
Target Start/End: Original strand, 1380600 - 1380638
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 359  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1380600 tttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggc 1380638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #233
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 375
Target Start/End: Original strand, 1989785 - 1989867
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||| |||| | |||||| ||||||| |||| |  ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  1989785 tggtttatgataaaacattttggcgtaatttgattcatgcaatcgaccccacttattgcgataaggcttggtggttgttgttg 1989867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #234
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 315 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 6931780 - 6931722
Alignment:
Q  315 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  6931780 gcgtcgtttgatccttgtagatgatcccgcttagtgggataaagcttcgttgttgttgt 6931722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #235
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10775515 - 10775473
Alignment:
Q  329 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10775515 atgtcgccgaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 10775473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #236
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 375
Target Start/End: Original strand, 20654868 - 20654922
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  20654868 tttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttagttgttgttgttg 20654922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #237
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 243 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30621331 - 30621241
Alignment:
Q  243 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 333  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||| | |||| |||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||| | | ||||||||||||    
T  30621331 tagagaaactattaagaaagatttagagattaatgtgttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcttaacttgatccatgta 30621241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #238
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 42293528 - 42293470
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 152  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  42293528 gtagcacctatagtagaaaagatgatggaaactcggcttaggtggtttgggtatgtaga 42293470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #239
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Original strand, 44940738 - 44940780
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44940738 agccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgtggttg 44940780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #240
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 375
Target Start/End: Original strand, 49416204 - 49416238
Alignment:
Q  341 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49416204 ccacgtagtgggataaggcttggttgttgttgttg 49416238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #241
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Original strand, 51176784 - 51176858
Alignment:
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| || | ||||||||||   |||||||||| || |||||||    
T  51176784 gatagaacattatggcataatttgatccatgtagcggaccacacttagtggtgaaaggcttggtggtggttgttg 51176858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #242
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 51879781 - 51879747
Alignment:
Q  343 acttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51879781 acttagtgggataaggcttggtttttgttgttgca 51879747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #243
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 375
Target Start/End: Original strand, 53413941 - 53413975
Alignment:
Q  341 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53413941 ccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 53413975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #244
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 311 - 369
Target Start/End: Original strand, 53517725 - 53517783
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  53517725 tatggtgtcgtttaatccatgtagccgaccctacttagtggaataagacttggttgttg 53517783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #245
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Original strand, 26510559 - 26510671
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| ||||| || | | |||| |||||| ||| || ||| | ||||||||| |||    
T  26510559 gatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgcgatagaacattatggtgtaagtagatcaatgtagtcga-cctactgaatgggataagactt 26510657  T
Q  362 ggttgttgttgttg 375  Q
      ||||||||||||    
T  26510658 cattgttgttgttg 26510671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #246
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 328 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28764419 - 28764374
Alignment:
Q  328 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  28764419 catgtagccgacctcatttggtgggataaggcttggttgttgttgt 28764374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #247
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 40933255 - 40933198
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatga 71  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||| ||||| |||||    
T  40933255 agatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagacaatacatgatagaattagaaatga 40933198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #248
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 51841273 - 51841196
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||| |||||||   |||||||||| |||| || ||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  51841273 tatgatacaacattatggcggtgtttgatccatatagctgaccccgcttagtgggatgaagcttggttgttgctgttg 51841196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #249
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 55768600 - 55768500
Alignment:
Q  272 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||| | || || ||| || ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  55768600 tcaatgagttggatcaaagtatggtgtatgatagaacattatagcgcaatttaatcaacgtggctgataccgctt-gtgggacaatgcttggttgttgtt 55768502  T
Q  372 gt 373  Q
    ||    
T  55768501 gt 55768500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #250
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 55832856 - 55832756
Alignment:
Q  272 tcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||  |||| ||| | || || ||| || ||| |||||| || ||||||||||||||    
T  55832856 tcaatgagttggatcaaagtatggtgtatgatagaacattatagcggaatttaatcaacgtggctgataccgctt-gtgggacaatgcttggttgttgtt 55832758  T
Q  372 gt 373  Q
    ||    
T  55832757 gt 55832756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 319; Significance: 1e-179; HSPs: 199)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 52138718 - 52139084
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52138718 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 52138817  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  52138818 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaag 52138917  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52138918 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 52139017  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52139018 actatgacgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 52139084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 28245355 - 28245721
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28245355 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcattagagagagagtgggggtagcacctatagta 28245454  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28245455 gaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaag 28245554  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28245555 ttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaac 28245654  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  28245655 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgagataaggcttgattgctgttgttg 28245721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 54278938 - 54279303
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54278938 agcagagatgaggatgttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctatagta 54279037  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54279038 gaaaagttggtagaaaataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 54279137  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54279138 ttaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 54279237  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||| |||||||||    
T  54279238 actatggcgtcatttgatcaatgtagccgatcccacttaataagataagacttggtt-ttgttgttg 54279303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 51448073 - 51447715
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  51448073 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagta-gggtagcacctatagta 51447975  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51447974 gaaaagttggtagaaaataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 51447875  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51447874 ttaaaaga-------gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 51447782  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51447781 actatggcgtcatttgattcatgtagccggccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 51447715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 21995 - 22356
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21995 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 22094  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||    
T  22095 agttggtagaaa-taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggttaa 22193  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  22194 aagaggtagaggaagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 22293  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22294 tggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 22356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 5168750 - 5169116
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| |||    
T  5168750 gagatgaggatgttgcgctggatgataggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatggta 5168849  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5168850 gaaaagttggtagaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtctag 5168949  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  5168950 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 5169049  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5169050 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 5169116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 47233955 - 47233596
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  47233955 agatgaggatattgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggaggtagcacctatagtagaaaa 47233856  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  47233855 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 47233756  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  47233755 agatgttgaagaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatggtttttgatagaacactat 47233656  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47233655 ggcgtcatttgattcatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgt 47233596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 25191297 - 25191659
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  25191297 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 25191394  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||| |  |    
T  25191395 gaaaaattggaagaaaatagacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccgg 25191494  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| |||| | |||||||||    
T  25191495 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaac 25191594  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25191595 actatggcgtcatttgatccatgtagctgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 25191659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 74 - 373
Target Start/End: Original strand, 35033129 - 35033428
Alignment:
Q  74 ccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgt 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |    
T  35033129 ccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccat 35033228  T
Q  174 ggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtc 273  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35033229 tgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtc 35033328  T
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35033329 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcatctagtgggataaggcttggttgttgttgt 35033428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 374
Target Start/End: Original strand, 54128296 - 54128662
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  54128296 agcagagatgaggatgttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagagagtgttggggtagcacctatagta 54128395  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||  ||| | ||||| ||||| |||||||  |||||      
T  54128396 gaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcaga 54128495  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatt-agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 307  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  54128496 tcgaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaaatatggtttatgatagaa 54128595  T
Q  308 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    || |||||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54128596 cattatggcataatttgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 54128662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33272392 - 33272122
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctata- 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||     
T  33272392 agcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatat 33272293  T
Q  106 ---gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 202  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  33272292 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-gtagatgccgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggaga 33272194  T
Q  203 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33272193 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 124 - 375
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508519
Alignment:
Q  124 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  224 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  324 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 48508519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 375
Target Start/End: Original strand, 53519511 - 53519864
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata------gtag 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||      ||||    
T  53519511 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaatactagacaggataggattaagaatgacaccattagacagagagtgggggtagcacctatatatatagtag 53519610  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  53519611 aaaagttggtagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgt 53519710  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||            |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  53519711 taaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttgatagaaca 53519798  T
Q  310 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53519799 ctatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttg 53519864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 79 - 373
Target Start/End: Original strand, 38850108 - 38850403
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  || ||||    
T  38850108 agagagagagagagagtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaa 38850207  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattag-aaaggatttagaggtcaatg 277  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||    
T  38850208 gaagagtagatcgaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatg 38850307  T
Q  278 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  38850308 aattgaattcaaatttggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaaacttagttgttgttgt 38850403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 203 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12096875 - 12096703
Alignment:
Q  203 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12096875 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 12096776  T
Q  303 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12096775 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12096703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43695127 - 43694769
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatga-----taggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg-tagcacctat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||     |||||||||||||||||      ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43695127 cagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaccagacatgacatgataggattaggaatgaca------gagagagagtggggggtagcacctat 43695034  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||| | ||||||||| ||||        
T  43695033 agtagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagatcaaatgaagga---- 43694938  T
Q  205 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 304  Q
      |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| ||| | ||| |||||||    
T  43694937 --agttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaaactaggtttatgata 43694840  T
Q  305 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| || | |||||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43694839 gaacaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtgggataaagctgggttgttgttgttg 43694769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 16 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19676447 - 19676079
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag--------tgt--gggtagcacctata 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||||        |||  ||||||||||||||    
T  19676447 atgaggatgttgcattggatgagcggtaagactagatgggataagattaggagtgacaccattagagagagagagagagagtgttggggtagcacctata 19676348  T
Q  106 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 205  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||  ||||| || ||||||||||    
T  19676347 gtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatcagatagaggagagtc 19676248  T
Q  206 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 305  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19676247 agatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatgctgtatgatag 19676149  T
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19676148 agcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttattgttg 19676079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 33 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 45289434 - 45289091
Alignment:
Q  33 gatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctat--agtagaaaagttggtagaaaatag 128  Q
    |||| ||| ||||| |||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  45289434 gatgtgtgataagactagacgggataagattagaaatgacac-attagagagagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaatag 45289336  T
Q  129 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 228  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||| ||||| ||||||||||    
T  45289335 gcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaaga 45289236  T
Q  229 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 328  Q
     ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| || | |||||||||    
T  45289235 tctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatcc 45289136  T
Q  329 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45289135 atgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45289091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 49503897 - 49503566
Alignment:
Q  30 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49503897 ttggatgagtggtaagactagacgagataggattgggaatgacaccattagagagagagttcaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaatagg 49503798  T
Q  130 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||  || ||| ||||| ||||||| |||||   ||| |||| ||||||||||||    
T  49503797 cttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccaatagatgttgtaatacaaacagtagatcagatggaggggagtctgattagaagatgtagaggaagac 49503698  T
Q  230 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 329  Q
    ||||  |||||||||| ||||           ||||||  ||| |||||||||| ||||||| |||| |  |||| || | |||||||| ||||||||||    
T  49503697 ctag--aaactattag-gaaa-----------gatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatcca 49503612  T
Q  330 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49503611 tgtagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 49503566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 39601016 - 39600683
Alignment:
Q  38 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 137  Q
    ||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||    
T  39601016 gtggtaagactagatgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtg 39600917  T
Q  138 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 237  Q
    |||| |||||||| |||||||||  |||||| |||| |  || ||||| ||||| || ||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  39600916 gttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaa 39600817  T
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 337  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||     
T  39600816 actataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccatctaacca 39600717  T
Q  338 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    | ||||||| |||||||||| ||||||| |||||    
T  39600716 accccactttgtgggataagacttggtttttgtt 39600683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 45728064 - 45728324
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt-agagagagagtgtgggtagcacctatagt 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||   |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45728064 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatgacatcatttagagagagagtgggggtagcacatatagt 45728163  T
Q  108 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag-aagactagtagatgctgtggtaagaagag--tggatcaaatggaggagagt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| | ||||||||||| || ||   ||||||  || ||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  45728164 agaaaagttggtagaaagtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaagaagagtatatatcaaatggaggagagt 45728263  T
Q  205 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatt 265  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45728264 catgttaaaagagatagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatt 45728324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 92 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 50960914 - 50960636
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      ||| ||| | ||||||||| |||||    
T  50960914 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacct----atgttgtagaaagaagagtagatca 50960819  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
     |||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||| || | ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50960818 gatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatccaaat 50960719  T
Q  292 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
     |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50960718 atggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgctgtt 50960636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 367
Target Start/End: Original strand, 38430807 - 38431129
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagag-----agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  38430807 gataggattaggaatgacaccattagagcgtttagagcgttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgt 38430906  T
Q  150 agagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaa 249  Q
    ||||||| |||  | ||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  38430907 agagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaa 38431006  T
Q  250 acaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca-----ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 343  Q
    || |||  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||      || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  38431007 actattgtggaagg-tttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattacgttacggcgtaatttgatccatgtagtcgacccca 38431105  T
Q  344 cttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    || ||| |||| ||||||||||||    
T  38431106 ctaagtaggatgaggcttggttgt 38431129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 230 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 52156227 - 52156082
Alignment:
Q  230 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 329  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52156227 ctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatcca 52156128  T
Q  330 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52156127 tgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 52156082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48734481 - 48734147
Alignment:
Q  25 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 124  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |  ||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  48734481 ttgcgttggatgagtggtaaaactaggcgggataagattatgaatgacaccattagagagtg--ttggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaa 48734384  T
Q  125 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||   ||| |  | ||||||||||||||    
T  48734383 ataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatggagattagttagatcaaaagaggtagagg 48734284  T
Q  225 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 324  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||            |||||| ||||||| ||||||| ||||||  |||| |||||||||||| |||||||| | |||    
T  48734283 aaggccttgaaaaactattagagaa------------gatttaaaggtcaacgagttgggtccaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaagttg 48734196  T
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48734195 atccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 48734147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 363
Target Start/End: Original strand, 19736918 - 19737255
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt-gtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  19736918 gagatgatgatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaa 19737017  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |     
T  19737018 aagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt-tagatc 19737116  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||            |||||||| | |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||| |    
T  19737117 aaaaaggttgaggaagacctagaaaaactattag-gaaa-----------tatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgataaaacatt 19737204  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 363  Q
    ||||  | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19737205 atggtataatttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19737255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Original strand, 19757829 - 19758158
Alignment:
Q  21 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt-gtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19757829 gatgttgtgttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggt 19757928  T
Q  120 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 219  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  || | ||| ||||    
T  19757929 agaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt-tagatcaaaaaggt 19758027  T
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 319  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||            |||||||| | |||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| |||||  |     
T  19758028 agaggaagacctagaaaaactattag-gaaa-----------tatttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgatagaacattatggtata 19758115  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 363  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19758116 atttgatccatgtag-cgaccccacttagtgggataaggcttgg 19758158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Original strand, 38060419 - 38060580
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||    
T  38060419 agagagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaa 38060518  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact 240  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38060519 gaagagtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaact 38060580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 98 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48953697 - 48953454
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa-gactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| |||  | ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  48953697 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgg 48953598  T
Q  197 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagga--tttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 294  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| |  | || ||||||||||||||||||||||| ||    
T  48953597 aggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcattaaaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaatatg 48953498  T
Q  295 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 338  Q
     | ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  48953497 atttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccga 48953454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 107 - 364
Target Start/End: Original strand, 39235154 - 39235409
Alignment:
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  39235154 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtca 39235253  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 306  Q
      | |||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||| |||| || ||||||    
T  39235254 gatcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgataga 39235353  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 364  Q
    ||| |||| ||| | ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  39235354 acattatgtcgtga-ttgatccatgtagccga-ccctcttagtaggataaggcttggt 39235409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Original strand, 26490239 - 26490596
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||| ||||||  ||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||    
T  26490239 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattagacagag--ttgaggtagcacctatagtagaaa 26490336  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||   | |||| ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| |||  |||     
T  26490337 agatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcagatagaggagaatcatattag 26490436  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    | |||| || ||||||  ||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||| || | |   |||||| | ||    
T  26490437 atgaggcagtggaagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatgtgatttcatatagaatatta 26490536  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||    
T  26490537 tggcgtaatttgatccatatagtcgatcccacttagtaagataagacttgattgttgttg 26490596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 95 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42510292 - 42510014
Alignment:
Q  95 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||   |||||  ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  42510292 tagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagat 42510195  T
Q  195 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 294  Q
    |||||| |||||  | |  ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||||||||| | |||| ||    
T  42510194 ggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatg 42510095  T
Q  295 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  42510094 gtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagagggaaaaggcttggctgttgttgttg 42510014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 309
Target Start/End: Original strand, 27917490 - 27917788
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||  ||||||||||||| |||||||||| ||  |  |||||||||||||||||    
T  27917490 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagcctagacgagatttgattaggaatgaccccattagagaaag--ttggggtagcacctatagta 27917587  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  |||| | |||||||||||||| | |||      
T  27917588 gaaaagatggtaggaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacttgtagatgttgtattagaaagaatagatcaaatggaggacaatcaga 27917687  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    | | || ||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| |||||| |||||  |||| |||   ||||||| |||| |||| || ||||||||    
T  27917688 tcataataggtagacgaagacctataaaaactataagagagacaactagaaaagattttaaggttaattcattggatctaaatatggtttacgatagaac 27917787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 38060858 - 38060996
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  38060858 aaaactattagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtag 38060957  T
Q  335 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  38060958 ccgaccccacttagtgggataagaattggttgttgttgt 38060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555330
Alignment:
Q  269 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 47555337  T
Q  369 gttgttg 375  Q
    |||||||    
T  47555336 gttgttg 47555330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 375
Target Start/End: Original strand, 53262295 - 53262425
Alignment:
Q  245 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 344  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  53262295 gagaaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccac 53262394  T
Q  345 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53262395 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 53262425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 296
Target Start/End: Original strand, 3186707 - 3186973
Alignment:
Q  29 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 128  Q
    |||||||||| ||||||| | | |  |||| ||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3186707 gttggatgagcggtaagacttggcgggataagattaggaatgacaccattatggaaagagtggtggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaatag 3186806  T
Q  129 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 228  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||   | ||||||| | | ||||| || ||| | ||||| || ||||||||| ||| || |    
T  3186807 gc-tagatgatttgggcatgtagagagaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcagattgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaata 3186905  T
Q  229 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 296  Q
    |||| ||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  3186906 cctaagaaaactataagaaaaatcattagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaatatggt 3186973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31454537 - 31454224
Alignment:
Q  61 attaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||     
T  31454537 attagaaatgacaacattagagagagtgt-tggttagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgg-tggtttgtgcatgtagagagaagaa 31454440  T
Q  161 tagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt--taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattaga 258  Q
      |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||| |  | | ||| |||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||      
T  31454439 atgcggattctgtagttaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatctttagagatgtaggggatgacctagaaaaactataagggaaactattaat 31454340  T
Q  259 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 358  Q
     ||||| ||||  | ||||| |||||   | |  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31454339 taggatctagatattaatgaattggagaaagacatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataagg 31454240  T
Q  359 cttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||    
T  31454239 cttggttgttgttgtt 31454224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 81 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 54365268 - 54364976
Alignment:
Q  81 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga--agactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||  |||||| || |  |||    
T  54365268 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctattataa 54365170  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    | ||||| ||||||||| |||| |||||    |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||| | ||||     
T  54365169 ggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgt 54365070  T
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| || | |||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  54365069 gttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccacac-tagtgggataaggcttggctgttgttgt 54364976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 79 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30294418 - 30294125
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat---gtagagagaagactagtagatgctgtgg 175  Q
    |||||||||| | | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||    |    
T  30294418 agagagagagagagagtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccg 30294319  T
Q  176 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaa 275  Q
    ||||||||||  || | ||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  30294318 taagaagagtaaattagattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaa 30294219  T
Q  276 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||| || | || | ||||||| |||||||||||   ||||| || ||||| || | |  ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30294218 tgagttggatctaagtatgatttatgataaaacactatggc--aatttgttctatgtaaccaaccttacttagtgggataaaacttggttgttgtt 30294125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 373
Target Start/End: Original strand, 49042081 - 49042219
Alignment:
Q  236 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt-atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 334  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49042081 aaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtag 49042180  T
Q  335 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  49042181 ccgaccccacttggtgagataaggcttggttgttgttgt 49042219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 54425289 - 54424959
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||| ||    
T  54425289 gataggattatgaatgacaccattaggaagagagtgagg-tatcatctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgtaggga 54425191  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaag-------agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 247  Q
    ||||||  | |||||| || ||||| ||       ||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  54425190 gaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcagatggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctataagag 54425091  T
Q  248 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt------catttgatccatgtagccgatcc 341  Q
      || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| | |       ||||||||||| |||| || ||    
T  54425090 ggaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgaccc 54424991  T
Q  342 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| | ||||| || |||||||    
T  54424990 cacttagtgggatgatgcttgattattgttgt 54424959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 311420 - 311307
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  311420 gatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 311321  T
Q  362 ggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||    
T  311320 ggttgttgttgttg 311307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 284 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7895969 - 7895878
Alignment:
Q  284 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7895969 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 7895878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 52679154 - 52678892
Alignment:
Q  67 aatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagt 164  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  52679154 aatgacaccattagaaagagagagtggaaatagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgt 52679055  T
Q  165 agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggat 264  Q
    |||||   ||||||||| | | ||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||  || |||    
T  52679054 agatg--ttggtaagaaaaatagatcggatggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaacta--agagaaactattatgaaagat 52678959  T
Q  265 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatg 331  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||| || |  |||||| || | ||| |||| ||||||||||||    
T  52678958 ttagaggttaatgagttgaattcaaatatgattcatgatataatattatagcgtaatttgatccatg 52678892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 260 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2133725 - 2133610
Alignment:
Q  260 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 359  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  2133725 aggatgtagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataaggc 2133626  T
Q  360 ttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||    
T  2133625 ttggttgttgttgttg 2133610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 225 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17022820 - 17022684
Alignment:
Q  225 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| | ||||| |||||||     
T  17022820 aagacctaggaaagctattagagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtcattta 17022721  T
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    || ||||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  17022720 attcatgtagccgacctcatttagtgggataaggctt 17022684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 285 - 375
Target Start/End: Original strand, 48532151 - 48532242
Alignment:
Q  285 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca-tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48532151 tccaaattttgtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 48532242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 244 - 373
Target Start/End: Original strand, 15296060 - 15296189
Alignment:
Q  244 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 343  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| || | |  ||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  15296060 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgacccca 15296159  T
Q  344 cttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15296160 cttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15296189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 370
Target Start/End: Original strand, 49841529 - 49841895
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--------tagcac 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  | || |||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||        ||||||    
T  49841529 agcatagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgaggtaagattagaaatgacaacattagtgagagagagttggggtagccgtagcac 49841628  T
Q  101 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 200  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| ||| || || |||||||||| |||||||||||||| | |   | || | ||||| |||||  |||| ||| |||     
T  49841629 ctatattagaaaagatggtggaaactagactaaggtggtttgggcgtgtagagagaagac-attgacttctttagtaaggagagtaaatcagatgaaggg 49841727  T
Q  201 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 300  Q
     |||||| |||  |||||||||||||||||   |||||  || |||||||| ||||  || ||| || || | ||||||||||||| |||| |||| |||    
T  49841728 tagtcaaattactagaggtagaggaagacca--gaaaaaaataagagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatatggtatat 49841825  T
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||| | | |||||||||||||||||    
T  49841826 gatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacatagcgaggtaaggcttggttgttgt 49841895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19162842 - 19162650
Alignment:
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 215  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| || | ||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  19162842 tggtagaaaaaag-cttaggtggtttggacacgcagatagaa-acttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaag 19162745  T
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||  |||||||||||||    
T  19162744 agttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaagtatggt-aatgatagaacact 19162650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31566234 - 31566161
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31566234 tgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31566161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2341074 - 2340717
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | ||  ||||||||||  | |||||||    
T  2341074 gagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatgatagaattagaaatgaaaacattagagagggtgttggggtagcaccattcgtagaaa 2340975  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga-ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    || |||| ||||||   ||||  ||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||  ||| ||    ||||| || ||||| ||||  |||||| | |    
T  2340974 agatggtggaaaatcatcttacgtggtttgagcatgtagagaaaagatcta-tagattatgtagt---gagagtagagcaaatagagggtagtcaaatca 2340879  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
      | || ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||| |||        || | |||||||||||| |    
T  2340878 ctaaagctagagaaagacctaggaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagtcggagagggtaatgatatatgatagaacatt 2340779  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||  ||||||||||| |||| | |||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  2340778 atggcgttgtttgatccatgaagccaaccccacttagttgtataaggattggttgttgttgt 2340717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40273278 - 40273203
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40273278 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgttg 40273203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 356
Target Start/End: Original strand, 37351418 - 37351672
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||   |||||||||||||| |||||||| |  ||  |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |    
T  37351418 tatagtagaaaagatggtagaaactagacttgagtggtttgggcatgtggagagaagtcatgtgaatgcggtagtaaggagagtagatcagatggaaggg 37351517  T
Q  202 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 301  Q
    || ||| | |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||| ||||| | |||||| ||||   | || |||| | ||    
T  37351518 aggcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactattagagaaacaatcaagaaagatctagagattaatgagatggagaaagatatggtttttg 37351617  T
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 356  Q
     |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  37351618 ttagaacactacgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggaataa 37351672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30797917 - 30797822
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30797917 agttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 30797822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106620
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40106620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 308 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45834665 - 45834598
Alignment:
Q  308 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45834665 cactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 45834598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 225 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45487000 - 45486848
Alignment:
Q  225 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt---tggtgtatgatagaacactatggcgtcat 321  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || ||| | ||||| ||||| ||||||    |||| |||||||||||| |||||| | ||    
T  45487000 aagacctagaaaaactataagagaaactattatgaaagactttgagattaatgacttggaaccaaataatatggtttatgatagaacattatggcataat 45486901  T
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45486900 ttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 45486848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 50249303 - 50249529
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggat---taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag 109  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||  ||||||||   ||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  50249303 gagatgatgatgtttcgttggatgtgtggtaggactagacgagataggatgattagaaatgataacattagagagagagttggggtagcgcgtatagtag 50249402  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggctta---gatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||| |||| |||| ||| ||||   | |||||||||||||||||| ||||||  |||||| || | ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  50249403 aaaagatggtggaaactagacttaggtggtggtttgggcatgtagagtgaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatcagatgggggatagtca 50249502  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctag 233  Q
      | |  ||||||||||||||||||||    
T  50249503 tatcaccagaggtagaggaagacctag 50249529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 345065 - 344928
Alignment:
Q  19 aggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttgg 118  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||     
T  345065 aggatgttatgttggatttgtggtaagactagacgagataggattagaaatgatgacattagagagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgt 344966  T
Q  119 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 156  Q
    |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  344965 tagaaaataggcttaagtagtttggtcatgtagagaga 344928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Original strand, 29601063 - 29601176
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||    
T  29601063 gatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggatacggctt 29601162  T
Q  362 ggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||||||    
T  29601163 ggttcttgttgttg 29601176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 373
Target Start/End: Original strand, 36303994 - 36304248
Alignment:
Q  106 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 205  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||| | ||||| || ||||  ||||    
T  36303994 gtagaaaagatggtggaaactagg-ttagatgggttgggcatgtagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagaatagatcagatagagggtagtc 36304092  T
Q  206 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 305  Q
    |  |||  ||||| ||  | |||||||| ||||||||||           |||||| || ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  36304093 agattactagaggcagttgtagacctagtaaaactatta-----------agaaag-atctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatag 36304180  T
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || || |||||| ||||||||||||    
T  36304181 gacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactcaatgtgacaaggctcggttgttgttgt 36304248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208892
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||  || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggatatggcttggttgttgttgt 39208890  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  39208891 tg 39208892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 305 - 370
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530040
Alignment:
Q  305 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 41530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 215 - 375
Target Start/End: Original strand, 27893213 - 27893373
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 314  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| | |||||||||||   | |  || | | ||| |||||||||||    
T  27893213 gaggtagaggaagacctagaaagactataagagaaactattaaaaaggacctagagattaatgagttggagaaagacatgatttttgaaagaacactatg 27893312  T
Q  315 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  27893313 gcattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggctttgttgatgctgttg 27893373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36820323 - 36820174
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||  |||||||||||||| ||    
T  36820323 agcaaagataaggttgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattagag--agagttggggtagcacctatatta 36820226  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    | |||| |||| |||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||    
T  36820225 gcaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagac 36820174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Original strand, 46148235 - 46148311
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46148235 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgtt 46148311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 332
Target Start/End: Original strand, 21200551 - 21200787
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||| ||||| |||||    
T  21200551 gggtagcaccta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaaggagagtagatca 21200648  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac-aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 290  Q
     ||||||   |||||| | |  || || |||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||  |||    
T  21200649 catggagagtagtcaaatcactagggggagaggaagacctagaaaaactattagacaaactatttagaaa-gatctagatattaatgagttggatagaaa 21200747  T
Q  291 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 332  Q
    | ||  |||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||    
T  21200748 tatg--gtattatagagcattatggcgtcgtttgatgcatgt 21200787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 284 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33271999 - 33271908
Alignment:
Q  284 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| |  ||||| |||| |||||||||||||    
T  33271999 atccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccacttaataagataaagcttagttgttgttgttg 33271908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 38850012 - 38850091
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38850012 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtagtaagactagacatgatatgattaggaatgacatcatgagagagagag 38850091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 280 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45374570 - 45374475
Alignment:
Q  280 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| | |||| |  ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45374570 ttggatccaactatggtttcggatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 45374475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 285 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 52927936 - 52927846
Alignment:
Q  285 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||| || || |||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52927936 tccaaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgatgttg 52927846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 168
Target Start/End: Original strand, 3987011 - 3987124
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  3987011 gatagaattagaaatgacgatattggagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagaga 3987110  T
Q  155 gaagactagtagat 168  Q
    ||||||| ||||||    
T  3987111 gaagactggtagat 3987124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24778682 - 24778609
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24778682 tgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggctgttgttgt 24778609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 40116449 - 40116348
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  40116449 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccgacctcgcttagtgggataaggctt 40116350  T
Q  362 gg 363  Q
    ||    
T  40116349 gg 40116348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 77 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41842806 - 41842678
Alignment:
Q  77 ttagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggt 176  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| ||    
T  41842806 ttagagagaaagt-tgggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagt 41842708  T
Q  177 aagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  41842707 aatgagagtagatcaaatggaggatagtca 41842678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 107 - 371
Target Start/End: Original strand, 659541 - 659805
Alignment:
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    |||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||| ||||| || || | ||||   ||| |    
T  659541 tagaaaagatagtagaaacttagcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatttgtagattctgtagtaagcagagttgaccagagggagagtagtga 659640  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 306  Q
    | | |  ||||| | |||||||||||| |||||| | |||||||| || |  | | ||||| || | ||||||||||||    || |  | |||||||||    
T  659641 aatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactgtaagagaaaccatcaagatgtatttacagattaatgagttggatagggatattatatatgataga 659740  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||| ||||||    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  659741 acattatggcagtgtttgatccatgtagccgaccccacttagtggggtaaggcttggttgttgtt 659805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37083367 - 37083291
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37083367 tatgatcgaacattatggcgtaatttggtccttgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 37083291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 46432031 - 46431684
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||  ||| ||| |||   |  ||||||| | | | |||||||    
T  46432031 gagatggggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacaggatagggttagaaatgactacatcagatagac--ttggggtagcgcttcttgtagaaa 46431934  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||    | |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||  ||   |||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||||| | |||| | |     
T  46431933 agacaatggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagag--gatctgtagattctgtagtaaggagagtagataagatggaggatactcaaatcac 46431836  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
     ||||| |||| |    |||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||| | ||||||||||||  | || |  | |||||| ||||| |     
T  46431835 tagaggcagagaa----ctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttggatagagatattatatatgatggaacattg 46431740  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
     |||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46431739 aggcgtcgtttgatccatgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 46431684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14415358 - 14415260
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| ||| || |||| ||||||| |||| |||||| | |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14415358 aatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgatc-atgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 14415260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23534929 - 23534576
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  || ||| | ||||   |||| |||||| |||||||  |||||||||||  || ||||||||  ||||||| |||    
T  23534929 gagaagaggatgttgcgttagatgtttgataaaactagatcagataagattagaaatgacaatattagagagagt-tgggggtagcatttatagtaaaaa 23534831  T
Q  113 agttggtagaaaatag--gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 210  Q
    || ||||||| ||||   |||||||||||||||  |||||||||  ||||  || | |  ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |  |     
T  23534830 agatggtagataatataagcttagatggtttggatatgtagaga--agacccgtgggttatgtagtaaggagagtagatcagatggatgatagttagatc 23534733  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 310  Q
    |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| | |||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||    ||| || | ||||||||||||     
T  23534732 actagaggtagaggaagacccaaaaaaattataacagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggactgtaatatgatttatgatagaacat 23534633  T
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||    
T  23534632 tatggcgtaatttgatccatgtagtcgacctcactttgt-ggataaggcttggttgtt 23534576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991713
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggctgttgttgt 40991713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 373
Target Start/End: Original strand, 11284120 - 11284270
Alignment:
Q  218 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||     ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| ||| ||     
T  11284120 gtagaggaagacctag-aaaactataagagaaactattaa----gatgtagagattaatgagttggatataaatatggtatatgattgaacattattgca 11284214  T
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11284215 tcgtttgatccatgtagccaaccccgcttagtgagataaggcttgcttgttgttgt 11284270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 284 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24541421 - 24541343
Alignment:
Q  284 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    |||||||| |||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24541421 atccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttg 24541343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48712173 - 48712075
Alignment:
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||| |||| |||| | | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48712173 atgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 48712075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 256
Target Start/End: Original strand, 11581432 - 11581609
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||  ||  ||| ||||    
T  11581432 agagagagagttagggtagaacctacaatagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagacatgtgaattatgtagtaa 11581531  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 256  Q
    |||||||  |||| ||| ||| ||||||| | |  |||||||   |||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11581532 gaagagtacatcagatgtaggtgagtcaaatcactagaggtatgagaagacctagaaaaactataagagaaactatta 11581609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42026817 - 42026536
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||  | ||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||  | | ||||| ||||| |||||    
T  42026817 gggtagcactcacagtagaaaagagggtggaaactaggcttaggtggtttgagcttgtagagagaaaacttgtagattatttagtaaggagagtagatca 42026718  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
     | |||||| | |||  |    ||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||  |  ||| ||| | | |||||||| |||  ||||    
T  42026717 gacggaggataatcacatccctagaggcagaggaagaccaatcaaagctataagagaaactattaagattgatatagggattaatgagttagatagaaat 42026618  T
Q  292 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     |||| |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| || || |||||| ||||||| |||||||    
T  42026617 atggtatatgatagaacattatggcgttatttgattcatttagccgaccccacatactgtgataagacttggttcttgttgt 42026536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Original strand, 29475811 - 29475968
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||  ||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| | || |||||||||| |||||    
T  29475811 agaggcagaggaagacctagaaaagctataaga--aactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaatattgtttatgatagaaaactat 29475908  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29475909 ggcgtaatttgacccatctagccaactccagttagtgggataaggtttggttgttgttgt 29475968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41482298 - 41482141
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaagga-tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||| || || ||| ||| | ||||||||| | | |||| |||| |||||||||||| |    
T  41482298 agaggcagaggaagacctagaaaaacttttaagagaaactattaggaaagactttggagattaatgagttgaaccaaaatctggtttatgatagaacatt 41482199  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| ||||||||      ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41482198 atggcgtaatttgatc------gccaaccccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttg 41482141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Original strand, 7278675 - 7278746
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7278675 atagaacattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttagttgttgttgt 7278746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 301 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21862813 - 21862742
Alignment:
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  21862813 gatagaagaatatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgcttgttgttg 21862742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31337884 - 31337751
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||   ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31337884 gagataaggatcttgtgttggatgtgtgataagactagatgggataggattaa-aatgacagcattagagagaaagt-tgggtagcacctatagtagaaa 31337787  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 148  Q
    || |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  31337786 agatggttgaaactaggcttaagtggtttgagcatg 31337751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 52882724 - 52882662
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52882724 tatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggagaaggcttggttgttgttgt 52882662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 388337 - 388260
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| || |||| ||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  388337 tatgatagagcattatgacgtaatttgatcaatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtcgttgttg 388260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Original strand, 29600863 - 29600968
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagag 153  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    ||| | | ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29600863 gatatgattagaaatgacaacattagagagagagttgtcgtaacgcttatagtaaaaaagatggtagaaaataggttttagatggtttgggcatgtagag 29600962  T
Q  154 agaaga 159  Q
    ||||||    
T  29600963 agaaga 29600968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 31146907 - 31146983
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31146907 tatgataaaaca-tatggtgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 31146983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 325 - 374
Target Start/End: Original strand, 39512777 - 39512826
Alignment:
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39512777 atccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 39512826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39782009 - 39781917
Alignment:
Q  281 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39782009 tggatccaaatacggtttatgataga-cattatggcgtaatttgatcaatgtggccgaccccactcagtgggataaggcttgggtgttgttgtt 39781917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 372
Target Start/End: Original strand, 45468795 - 45468856
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45468795 tatggcgtcgtttgatctatgtaaccgatcccacttagtggaataaggcttggttgttgttg 45468856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 370
Target Start/End: Original strand, 32170592 - 32170684
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||  |||| |||| ||||||| |||| |||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32170592 agttggatagaaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 32170684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 45236778 - 45236850
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 85  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45236778 gagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacaccattagagaga 45236850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 3987543 - 3987618
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  3987543 tgataggacactatggcgttgtttgattcatgtacccgaccccactttgtgggataagacttggttgttgttgttg 3987618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 20208207 - 20208282
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  20208207 tgatagaactttatggcatcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataacgcttggttaatgttgttg 20208282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 152
Target Start/End: Original strand, 29817422 - 29817565
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||  || | | |||||||||  ||||||||||||||   |||| | ||| |  | |||||||||||||||    
T  29817422 agcaaagatgaggatgttgcgttggataagtgacaaaactggacatgatataattaggaatgacactgatagaaatagaattggtgtagcacctatagta 29817521  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 152  Q
    |||||| | ||||||| || | |||| |||||||| ||||||||    
T  29817522 gaaaagattgtagaaagtaagtttaggtggtttggacatgtaga 29817565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Original strand, 30345445 - 30345520
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  30345445 gagatgaggatgttgtgttggatgagcggtaagattggacatgatagaattatgaatgacactatttaagagagag 30345520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 375
Target Start/End: Original strand, 35420455 - 35420552
Alignment:
Q  279 gttggatccaaatttggtgt--atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||| ||||||  | ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35420455 gttggatcgaaatatggtgtgcacgatagaacattatggcgtaatttggtccatgtagc-gaccccatttagtgggataaggcttggttgttattgttg 35420552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 370
Target Start/End: Original strand, 49045023 - 49045114
Alignment:
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||   |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  49045023 gttggatccaaatatagtttatgacagaacattatggccgaatttaatccatgtagccgaccccactcagtgggacaaggcttggttgttgt 49045114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 54422963 - 54422837
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt------catttgatccatgtagccgatcccactt 346  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| |||||| | |       ||||||||||| |||| || |||||||    
T  54422963 attaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgacataatttcaatttgatccatctagctgaccccactt 54422864  T
Q  347 agtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| | ||||| || |||||||    
T  54422863 agtgggatgatgcttgattattgttgt 54422837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 309 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31453025 - 31452963
Alignment:
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31453025 actatggcgtcgtttgattcatgtagcagaccccacttagtggaataaggcttggttgttgtt 31452963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 222 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 40116619 - 40116505
Alignment:
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 321  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| | |||||| ||    
T  40116619 aggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattgtggcgtaat 40116520  T
Q  322 ttgatccatgtagcc 336  Q
    | |||| | ||||||    
T  40116519 tcgatctacgtagcc 40116505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 321 - 375
Target Start/End: Original strand, 50249607 - 50249661
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50249607 tttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggatacggcttggttgttgttgttg 50249661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 47542076 - 47542031
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacat 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47542076 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacat 47542031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 45493851 - 45493695
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||| | ||||||  ||||||| | |||||| ||||  || |||  |||||| |||||| |||||  |||  |||| ||||||||| || |||    
T  45493851 agaggcagagggatacctagataaactataaaagaaactattaagaaagatccagaggttaatgagctggatagaaacatggtatatgatagagcattat 45493752  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  45493751 ggcgccattcaatccatgtagccgaccccacttagtaggataaagcgtggttgttgt 45493695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 46367462 - 46367390
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  46367462 tatgatagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagcctaccccacttaattggataaagcttggttgttgt 46367390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 313 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 53214931 - 53214871
Alignment:
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53214931 tggcgtaatttgatccatgcagccgaccccatttagtcggataaggcttggttgttgttgt 53214871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4472481 - 4472386
Alignment:
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||||   ||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  4472481 gttggattcaaatatgatttataatagaacactatggtgtaacttgatccatgtagccgactacacttagttcgataaagcttggttgttgttgtt 4472386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30332633 - 30332558
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||| | |||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30332633 tgatagaacattatggcataatttgatccaggcagcctaccccacctagtgggatacggcttggttgttgttgttg 30332558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 46568034 - 46568113
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  46568034 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtgttaagactagaccagattgaattagaaatgacaacattagagagagag 46568113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21427644 - 21427586
Alignment:
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21427644 tggcgtcgtttgatccatgtagtcaatcctacttagtgggataagacttggttgttgtt 21427586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 376
Target Start/End: Original strand, 48259947 - 48259989
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48259947 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 48259989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 48953756 - 48953694
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacacc 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  48953756 gagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagattggatgagataggattaagaatgacacc 48953694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 284
Target Start/End: Original strand, 26990337 - 26990406
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 284  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  26990337 gaggtaggggaagacctagaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctagagatcaatgagttgga 26990406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31261040 - 31260964
Alignment:
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    ||||||||||||| || | ||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31261040 atgatagaacactgtgacatcatttgattcatgc-gccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgtttttgttgc 31260964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 371
Target Start/End: Original strand, 35481143 - 35481208
Alignment:
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35481143 aacattatgacgtaatttgattcatttagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgtt 35481208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39535475 - 39535399
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| ||||| | | ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39535475 tatgatagaacattatggtggcgtttgatccatgtaaccgg-cccacttagtgggataaagcatggttgttgttgttg 39535399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 327 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 44103002 - 44102953
Alignment:
Q  327 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  44103002 ccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttattgc 44102953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 371
Target Start/End: Original strand, 49888402 - 49888467
Alignment:
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  49888402 aacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagttggaaaaggtttggttgttgtt 49888467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 344834 - 344770
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  344834 tatggtgtaatttcatcgatgtagccgacccaacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 344770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31453242 - 31453151
Alignment:
Q  69 tgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta-gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  31453242 tgacaacattaga-agagagttggggcagcacctatagtaagaaaagatggtagaaactagacttaggttgttttggcatgtagagagaagac 31453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 34844721 - 34844569
Alignment:
Q  225 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 324  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | || ||| | |||||| |||| |  |||   || |||||||||||| |||||  | || ||    
T  34844721 aagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaaacttggagattaatgaggtggaccagaatactgtttatgatagaacattatggtataatatg 34844622  T
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34844621 atccatgtagccgaccccactaagtaggataaggctttggttgttattgttgc 34844569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 375
Target Start/End: Original strand, 35701093 - 35701133
Alignment:
Q  335 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35701093 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35701133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38054696 - 38054624
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 86  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  38054696 agatgagaatgttgcgttgaatgggtggtaagactagacgggataggattagaaatgataacattagagagag 38054624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 49933492 - 49933436
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 377  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49933492 tttggtccatgtagccgacctcacttagtgggataaagcttgattgttgttgttgca 49933436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Original strand, 7120790 - 7120865
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| || | |||| ||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  7120790 tatgataaaatattatgacgtaatttgatccatataaccgataccacttagtgggatatggcctggttgttgttgt 7120865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23610965 - 23610930
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23610965 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 23610930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 334 - 373
Target Start/End: Original strand, 27192466 - 27192505
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27192466 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 27192505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35032811 - 35032764
Alignment:
Q  328 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  35032811 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttattgatgttg 35032764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 36049401 - 36049309
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    ||||| ||||||| |||| |||  ||||||  |||||||| |||| |||||||  |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36049401 aatgaattggatcaaaatatggcctatgattaaacactatagcgtaatttgat--atgtagccggccccacttagtgggatagggcttggttgtt 36049309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37102870 - 37102807
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  37102870 tatggtgtaatttgatccatgtagcctaccccacttcgtgggataaggcatgtttgttgttgtt 37102807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40672429 - 40672366
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| | |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  40672429 tatggcataatttgatccatgtagctgacctcacttagtgggataaggcttggttatagttgtt 40672366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 225 - 376
Target Start/End: Original strand, 43308696 - 43308847
Alignment:
Q  225 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 324  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||| ||||  ||  || ||||| | ||| ||||||||  | || || | ||||||||||||  || ||| |  |||    
T  43308696 aagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaaaatctagagattaatcagttggatagagatatgatatatgatagaacataattgcgccggttg 43308795  T
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  43308796 atccatgtagccaaccccactttgtgggatgaggcttggtttttgttgttgc 43308847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Original strand, 43529295 - 43529330
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43529295 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43529330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 237336 - 237294
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  237336 agccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 237294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 368
Target Start/End: Original strand, 6988113 - 6988179
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  6988113 atagatcattatggcgtcatttgatcaatgtagccgactccttttagtgggataaggcttagttgtt 6988179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21428065 - 21427995
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||    
T  21428065 atagaacattatggcgtaatttgatccatgtagtcgactccatttattgggataaggattggtagttgttg 21427995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 150
Target Start/End: Original strand, 26388414 - 26388540
Alignment:
Q  24 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 123  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||    ||| |||||| ||| | ||||||||| | |||||   | | ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26388414 gttgcgttggatgtgtggttagactagattatatatgattagaaattaaaccattagacatagagttgagatggcacctataatagaaaagatggtagaa 26388513  T
Q  124 aataggcttagatggtttgggcatgta 150  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||    
T  26388514 aataggtttaggtgatttgggcatgta 26388540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34719155 - 34719081
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||| || |||||| || |||||| | ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34719155 tatgatagagcattatggcttcgtttgattcttgtggctgaccccacttagggggataaggcttggttgttgttg 34719081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37534483 - 37534429
Alignment:
Q  96 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 150  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37534483 agcaccgatagtagaaaagatggtggaaaataggcttacctggtttgggcatgta 37534429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 39535715 - 39535653
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  39535715 cacctatagtagaaaagatggtagaaacccggcttaggtggtttaggcaagtagagagaagac 39535653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 293 - 375
Target Start/End: Original strand, 53266893 - 53266975
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||||||   ||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  53266893 tggtttatgatagaatgttatggtgtaatttaatccatgtagccgatctcacttagtgagataagggttggtggttattgttg 53266975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 375
Target Start/End: Original strand, 829149 - 829186
Alignment:
Q  338 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  829149 atcccacttagttggataaggcttggttgttgttgttg 829186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3870698 - 3870649
Alignment:
Q  119 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3870698 tagaaacttggcttagatggttttggcatgtagagagaagacttgtagat 3870649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 328 - 369
Target Start/End: Original strand, 8566670 - 8566711
Alignment:
Q  328 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8566670 catgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttg 8566711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 370
Target Start/End: Original strand, 26990442 - 26990491
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26990442 tttgattcacgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgt 26990491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27796065 - 27795996
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 357  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||| | |||||||    
T  27796065 aaatttggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatgtacccaaccccacttattaggataag 27795996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31337741 - 31337560
Alignment:
Q  187 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 286  Q
    ||||||||| |||  |||||||| |  ||||  ||||||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||| || |||||    |||||||||||     
T  31337741 gatcaaatgaagggcagtcaagtgactagagtcagaggaaaacctagaaaaactataacagaaactataagaaag-atctagag----atgagttggata 31337647  T
Q  287 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     |||| |||| | |||||||||| |||| | |  ||||||| || || |||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31337646 gaaatatggtatttgatagaacattatgacattgtttgatctatttaaccgacctcacttagtggtataaagcttggttgttgttgt 31337560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 112
Target Start/End: Original strand, 33307087 - 33307165
Alignment:
Q  32 ggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||||| || |||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33307087 ggatgtgtggtaagactaaacatgataagattagaaacgacaacatt--agagagagttggggtagcacctatagtagaaa 33307165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 369
Target Start/End: Original strand, 34253689 - 34253738
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||    
T  34253689 atttgatccatgtagccgaccccatttagtgggacagggcttggttgttg 34253738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Original strand, 35465758 - 35465811
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  35465758 atttgatccatgtagctgacctcacttaatgggataaggattggttgttgttgt 35465811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41842630 - 41842529
Alignment:
Q  266 tagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 365  Q
    ||||||| |||||||| |||  |||| |||| | |||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | | || |||||| | ||||||||||||    
T  41842630 tagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagtcaacctcatttagtgagctaaggcttggtt 41842531  T
Q  366 gt 367  Q
    ||    
T  41842530 gt 41842529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 370
Target Start/End: Original strand, 46140617 - 46140686
Alignment:
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  46140617 gatagaacattatggagttgtttgatccatgtagtcgaccccactttgtgagataaggtttggttgttgt 46140686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 370
Target Start/End: Original strand, 54485767 - 54485816
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  54485767 tttgatctatgtagccgatcccgcctagtcggataaggcttggttgttgt 54485816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 301 - 361
Target Start/End: Original strand, 7942864 - 7942924
Alignment:
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||| ||||| ||  || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  7942864 gatagaacattatggtgttgttcgatccatgtagtcgataccacttagtgggataaggctt 7942924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 327 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24084368 - 24084320
Alignment:
Q  327 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24084368 ccatgtaaccgactccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 24084320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43396122 - 43396082
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43396122 agccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 43396082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 52077509 - 52077473
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52077509 agccgatcccacttagtgggacaaggcttggttgttg 52077473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Original strand, 7446274 - 7446329
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  7446274 atttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaaggctcggttgctgttgttg 7446329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Original strand, 7454416 - 7454471
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  7454416 atttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaaggctcggttgctgttgttg 7454471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Original strand, 21000720 - 21000755
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21000720 cccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 21000755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Original strand, 36764934 - 36764969
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36764934 cccacttagtggtataaggcttggttgttgttgttg 36764969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 373
Target Start/End: Original strand, 40122645 - 40122696
Alignment:
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||| |||||    
T  40122645 ttgatccatgtagccgaccccacttagttggataaaacttggttgtcgttgt 40122696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41230548 - 41230513
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41230548 cccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 41230513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44134111 - 44134044
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||    
T  44134111 gggtagcgcctctagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggacatctagatagaaga 44134044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44443250 - 44443208
Alignment:
Q  328 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44443250 catgtagctgatcccactta-tgggataaggcttggttgttgtt 44443208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48328231 - 48328200
Alignment:
Q  343 acttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48328231 acttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 48328200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 50631954 - 50631879
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| |||| | |  |||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50631954 tgatagaacattatgccattgtttgattcatgcagccaaccccacttagtgggataaagattggttgttgttgttg 50631879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 374
Target Start/End: Original strand, 55244461 - 55244565
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag----ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||    || | ||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  55244461 aatgagttggatagaaatatggtatatgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgaagctgaccaaccccgcttagtgggataagacttggctgttg 55244560  T
Q  370 ttgtt 374  Q
     ||||    
T  55244561 ctgtt 55244565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 330 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 944501 - 944467
Alignment:
Q  330 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 364  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  944501 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggt 944467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4660211 - 4660165
Alignment:
Q  329 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4660211 atgtagccgactccaattagtggaataaggcttggttgttgttgttg 4660165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 340 - 374
Target Start/End: Original strand, 21506270 - 21506304
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21506270 cccacttagtgggatatggcttggttgttgttgtt 21506304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 375
Target Start/End: Original strand, 34067137 - 34067183
Alignment:
Q  329 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34067137 atgtagccaaccccacgtagtggaataaggcttggttgttgttgttg 34067183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36868503 - 36868437
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||| || | |||||||    
T  36868503 gtagcacctatggtagagaagatggtggaaagtaggcttaggtggtttgggcatatataaagaagac 36868437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37598245 - 37598171
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcc-cacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | | || || |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37598245 tatgatagaacattatggcgtcatttgactcatgtagtcaaccctcatttagtgggataaagcttgattgttgtt 37598171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 42510375 - 42510333
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattaga 51  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  42510375 agcagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 42510333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 299 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 44133918 - 44133845
Alignment:
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  44133918 atgatagagcattatggcgt-atttgatccatgtagtcgatcttatttagtggtataaagtttggttgttgttgt 44133845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 362
Target Start/End: Original strand, 53951956 - 53952026
Alignment:
Q  292 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    ||||| |||||||||| | || || | | |||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53951956 ttggtatatgatagaatattacggtgccgtttgatccatatagccgaccccacatagtgggataaggcttg 53952026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21513099 - 21513070
Alignment:
Q  345 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21513099 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21513070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24103457 - 24103420
Alignment:
Q  317 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 354  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  24103457 gtcatttgatccatgtaaccgatcccacttagagggat 24103420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 345 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 26874886 - 26874857
Alignment:
Q  345 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26874886 ttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 26874857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32052472 - 32052395
Alignment:
Q  296 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||   | |||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||    
T  32052472 tgtatgatagaacattattgcgtcatttggtccatgtagttcaccccacttagcaggacaagacttggttggtgttgt 32052395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 375
Target Start/End: Original strand, 34812775 - 34812828
Alignment:
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| | ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  34812775 ttgatccatgtaactgactccacttagtgggataaagcttggttggtgttgttg 34812828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 329 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 37103026 - 37102989
Alignment:
Q  329 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 366  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  37103026 atgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttg 37102989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Original strand, 41965819 - 41965860
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41965819 tagccgactccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 41965860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 41971345 - 41971277
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41971345 tatgatagaacattatgacgttgtttgatccatgtagccaactccacttagt-ggataaggctttgttgt 41971277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 47804738 - 47804666
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||| |||| ||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  47804738 tatgatagaacattatggcattgtttcatccttgttgccgatcccactttgtaggataa-gcttggttgttgtt 47804666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Original strand, 49090632 - 49090673
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  49090632 tagccgaccccacttaatgggaaaaggcttggttgttgttgt 49090673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 50621720 - 50621647
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 86  Q
    |||||||| ||||||| || |||  ||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50621720 gagatgagaatgttgcatttgatatgtggtaagactatgaatgataggattagaaatgacaacattagagagag 50621647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 53266871 - 53266818
Alignment:
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||    
T  53266871 ttgatccatgtagccggtctcacttagtgagatgaggcttggtggttattgttg 53266818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 218)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Original strand, 37617862 - 37618230
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37617862 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 37617961  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37617962 gaaaagttggtagaaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaa 37618061  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37618062 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 37618161  T
Q  308 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37618162 cactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 37618230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 11593878 - 11594244
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11593878 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcacctatagta 11593977  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11593978 gaaaagttggtagaaaatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 11594077  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11594078 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 11594177  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11594178 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 11594244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 12 - 373
Target Start/End: Original strand, 34869341 - 34869702
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34869341 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaa 34869440  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  34869441 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagtta 34869540  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869541 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 34869640  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34869641 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccctaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 34869702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12841639 - 12841273
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12841639 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccccattagagagagagtggaggtagcacctatagta 12841540  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12841539 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 12841440  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12841439 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtatccaaatttggtttatgatagaac 12841340  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12841339 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12841273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 49029194 - 49029559
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49029194 agcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 49029293  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  49029294 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaag 49029393  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49029394 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 49029493  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  49029494 actatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatacggc-tggttgttgttgttg 49029559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 9 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35906565 - 35906208
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35906565 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagta 35906466  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  35906465 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcatatggaggagagtcaag 35906366  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35906365 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 35906266  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  35906265 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 35906208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39906730 - 39906370
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39906730 gagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaa 39906631  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  39906630 agttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggag--tcaagttaa 39906533  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906532 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 39906433  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39906432 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 39906370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33350170 - 33349804
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33350170 agcagagatgaggatgttgccttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagta 33350071  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33350070 gaaaagttgctagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 33349971  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  33349970 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatagtagaac 33349871  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33349870 actatagcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 33349804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44855536 - 44855172
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  44855536 agcagagatcaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggatagtacctatagta 44855437  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44855436 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 44855337  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||    
T  44855336 ttaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgat--aac 44855239  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44855238 actatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44855172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 46356219 - 46355858
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  46356219 agcagagatg-ggatgttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagagagaatgggggtagcacctatagta 46356121  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46356120 gaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 46356021  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  46356020 ttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaac 46355921  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46355920 actatgccatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgtt 46355858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45836840 - 45836480
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45836840 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 45836741  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||      
T  45836740 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaggtt-- 45836643  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  45836642 atgaggtagagggagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacacta 45836543  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45836542 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttg 45836480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 9 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13859372 - 13859061
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13859372 agcagagatgaggatgttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 13859273  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13859272 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 13859173  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13859172 ttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaac 13859073  T
Q  309 actatggcgtca 320  Q
    ||||||||||||    
T  13859072 actatggcgtca 13859061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 56 - 375
Target Start/End: Original strand, 6374833 - 6375152
Alignment:
Q  56 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6374833 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagag 6374932  T
Q  156 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6374933 aagaccagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccatt 6375032  T
Q  256 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 355  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6375033 agaaagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 6375132  T
Q  356 aggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  6375133 aggcttggttgttgtcgttg 6375152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Original strand, 36651914 - 36652276
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |  |||| ||| | ||||||||    
T  36651914 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaggg--taggggtggcatccatagtaga 36652011  T
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  36652012 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcaagtt 36652111  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36652112 aaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacac 36652211  T
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  36652212 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgctgttgttg 36652276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 375
Target Start/End: Original strand, 43281600 - 43281958
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  43281600 gatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaag 43281697  T
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  43281698 ttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaa 43281797  T
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  43281798 gaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 43281897  T
Q  315 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43281898 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttg 43281958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 31005141 - 31005489
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31005141 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31005240  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31005241 gaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31005340  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||              
T  31005341 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagttggatccaaatttggtgt---------- 31005430  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
            |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31005431 --------gtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31005489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 14 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35559353 - 35558994
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacct-atagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35559353 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcaccttatagtagaaa 35559254  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||   ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35559253 agttggtagaaaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaa 35559154  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||    
T  35559153 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttagtttatggtagaacatta 35559054  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    | || |||||||||||||||||| || | || |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  35559053 tagcatcatttgatccatgtagcggacctcatttagtaagataaggcttagttgttgttg 35558994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 91 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31682884 - 31682600
Alignment:
Q  91 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 190  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  31682884 tgggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatc 31682785  T
Q  191 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31682784 aaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccata 31682685  T
Q  291 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31682684 tttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31682600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 56 - 375
Target Start/End: Original strand, 29650349 - 29650668
Alignment:
Q  56 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29650349 ataggattaggaatgacaccattcgagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 29650448  T
Q  156 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 255  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||    
T  29650449 aagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccatt 29650548  T
Q  256 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29650549 agaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 29650648  T
Q  356 aggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29650649 aggcttggttgttgttgttg 29650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 43491230 - 43491592
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||| |||    
T  43491230 gagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagattagatgggatatgattaggaatgacaccattggggagagagtaggggtaacacctatagtataaa 43491329  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  43491330 aattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagagtcaggtcaa 43491429  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  43491430 aagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaacacta 43491529  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43491530 tgatgtaatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43491592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 38606927 - 38607276
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38606927 gagatgataatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacatta-agagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 38607025  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  38607026 ggttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcacgttag 38607125  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||| ||||||||||||| ||            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  38607126 aagagggagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 38607213  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38607214 tggcgtcgtttgatccatgtagccgactccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 38607276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 77 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2886018 - 2885720
Alignment:
Q  77 ttagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggt 176  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||    
T  2886018 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgt 2885919  T
Q  177 aagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaat 276  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  2885918 acgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaat 2885819  T
Q  277 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2885818 gagttggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 2885720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 94 - 375
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349904
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||   ||||||||||||| |||||||    
T  22349623 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaa 22349722  T
Q  194 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22349723 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaattt 22349822  T
Q  294 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22349823 ggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 22349904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 92 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36869525 - 36869235
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| |||||    
T  36869525 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagatca 36869426  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  36869425 aatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattcaaat 36869326  T
Q  292 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatc-------catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36869325 ttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 36869235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 33072872 - 33073108
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  33072872 agcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 33072969  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33072970 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaag 33073069  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33073070 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatcagag 33073108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 16 - 372
Target Start/End: Original strand, 23404343 - 23404697
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  23404343 atgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagggagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagt 23404442  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 215  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||||| |||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  23404443 tgggagaaaataggcttagacagttt-ggcatgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaag 23404541  T
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 315  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||   ||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  23404542 aggtagaagaagacctaggaaaattataaaagaaaccattacaattaatttatagatcaatgagtttgatccaaatatggtgtatgatagaacattatgg 23404641  T
Q  316 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
     || |||| |||| | ||||||| |||||||  | |||||||| || ||||||||||    
T  23404642 tgtaattttatccgtatagccga-cccacttgataggataaggtttagttgttgttg 23404697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 36136687 - 36137046
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36136687 agatgagaatgttgtgttggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaa 36136786  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
    | ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| ||   |||||| ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||  | | |    
T  36136787 gatggtagaaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagatcaga 36136886  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  36136887 agaagtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaacattat 36136986  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     | || |||||||  || || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36136987 agggtaatttgatttatttaaccgatcgcgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36137046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 204 - 375
Target Start/End: Original strand, 38900070 - 38900240
Alignment:
Q  204 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38900070 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 38900169  T
Q  304 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38900170 tgaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 38900240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 101 - 375
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682458
Alignment:
Q  101 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  201 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtat 300  Q
     |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaagcttggtagttgttgttg 15682458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 22 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28628284 - 28627936
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||  | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||| | |||| |    
T  28628284 atgttgccttggatgtatggtaagaccatacgggatgggattagaaattacaacattagagagggagttggagtagcacctagagtagaaatgatggtgg 28628185  T
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||| | | |||||||||    
T  28628184 aaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccgatggaggatagtcaaatcacaagaggtag 28628085  T
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 321  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  28628084 aggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaat 28627985  T
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28627984 ttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggcttagttgttgt 28627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 208 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40980093 - 40979928
Alignment:
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40980093 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 40979994  T
Q  308 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40979993 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40979928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 130 - 375
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631848
Alignment:
Q  130 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  230 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 329  Q
    ||| |||||| |||||| ||            |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  32631715 ctaagaaaaccattagaaaa------------gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatcta 32631802  T
Q  330 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32631803 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32631848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 164 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31681226 - 31681022
Alignment:
Q  164 tagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagga 263  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  31681226 tagatgccgtcgtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaa---ttagagaaaccattagaaagga 31681130  T
Q  264 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 363  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  31681129 tttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttgg 31681030  T
Q  364 ttgttgtt 371  Q
    ||||||||    
T  31681029 ttgttgtt 31681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 142 - 374
Target Start/End: Original strand, 7273151 - 7273383
Alignment:
Q  142 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 241  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| || ||| | ||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7273151 gggcatgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaacta 7273250  T
Q  242 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcc 341  Q
    | |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  7273251 taagagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccc 7273350  T
Q  342 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7273351 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 7273383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 330
Target Start/End: Original strand, 47848596 - 47848912
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| || | ||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  47848596 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcagaagtgataacattagagagagagttggggtagcgcctatagtagaaa 47848695  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||  |||| ||||| ||||| |||||||| ||||   | |     
T  47848696 agatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaaggagagtagatcagatggaggatagtctgatcac 47848795  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
     ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| | | | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  47848796 tagaggcagaggaagaactagaaaaactataagagaaactattggaaa-gatttggggattaatgagctggatccaaatatggtttatgatagaacatta 47848894  T
Q  313 tggcgtcatttgatccat 330  Q
    |||  | |||||||||||    
T  47848895 tggtttaatttgatccat 47848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 149 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598186
Alignment:
Q  149 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 248  Q
    ||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  249 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttag 348  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || | | |||||||| | | |||| ||||||||||||||||||||| | || |||     
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccga-ctcatttaa 24598213  T
Q  349 tgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24598212 tgggataagacttggttgttgttgttg 24598186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 226 - 373
Target Start/End: Original strand, 48919247 - 48919394
Alignment:
Q  226 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  48919247 agacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttga 48919346  T
Q  326 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48919347 tccatgtagtcgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 48919394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 248 - 374
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649063
Alignment:
Q  248 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 347  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 27649036  T
Q  348 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27649037 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 27649063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8492580 - 8492236
Alignment:
Q  26 tgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 125  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8492580 tgcgttggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccattagggagagatttggggtaacacctatagtaaaaatgatggtagaaaa 8492481  T
Q  126 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 225  Q
    |||||| || |||||||  | |||||||| |||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||| ||||||||| || |  ||| ||||||||||| |    
T  8492480 taggctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagacttgtagatgttgtagtacaaagagtagatcagatggaggagggtgagattagaagaggtagagaa 8492381  T
Q  226 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 325  Q
    ||||| | |||||  |||| |  |||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| | ||||||    
T  8492380 agacc-acgaaaa--attataataactgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttga 8492284  T
Q  326 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || ||||| |  | ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||    
T  8492283 tcaatgtaactaaccccacttagtgagataaggctcgactgttgttgt 8492236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 242 - 374
Target Start/End: Original strand, 21078068 - 21078200
Alignment:
Q  242 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcc 341  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       
T  21078068 ttagagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgactt 21078167  T
Q  342 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21078168 catttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21078200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 7272961 - 7273151
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | | ||| |||||||||||||||    
T  7272961 gagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgacacctttagggagagaacgggagtatcacctatagtagaaa 7273060  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |  ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  7273061 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaagagtagatcagatggaggagag 7273151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 213 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9210864 - 9210702
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||    
T  9210864 aagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacatta 9210765  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9210764 tggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttgttg 9210702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 147 - 374
Target Start/End: Original strand, 1011103 - 1011329
Alignment:
Q  147 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 246  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  1011103 tgtagagagaagacatctagatgttgtagtacgaagagtagatcagataaaggagagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgaga 1011202  T
Q  247 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 346  Q
    ||||  ||||| ||  ||||| |||| ||||| |||||||||| | |||| || ||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||| |||||||    
T  1011203 gaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatccaa-tatggtttaggatagaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccactt 1011301  T
Q  347 agtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1011302 agtgggataaggcttggttgttgttgtt 1011329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38135476 - 38135211
Alignment:
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||      
T  38135476 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagacagaagaccagtagattttgtagtaaggaga-tagatcagatggaggatagtcaga 38135378  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    | |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||| | |||| |||  ||||||||||     
T  38135377 tcattagaggcagatgaagacctagaaaaagtataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaat 38135278  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | |||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38135277 attatggcgtaatttgatccatctagctgaccccacttggtgggacaaggcttggttgttattgttg 38135211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 32630517 - 32630636
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32630517 gagatgaggatgttgagctggatgagtggtaagactagacatgataggattagga-tgataccattggagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 32630615  T
Q  113 agttggtagaaaataggctta 133  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32630616 agttggtagaaaataggctta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 267 - 374
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073212
Alignment:
Q  267 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 33073204  T
Q  367 ttgttgtt 374  Q
    || |||||    
T  33073205 ttattgtt 33073212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 375
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966300
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||| ||||||     
T  12966025 gtagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaag 12966124  T
Q  194 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 293  Q
    || ||   |||||| | |       ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||  |||||||| | ||||| ||||||  |||| |    
T  12966125 tgaagactagtcaaatcac------tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatgatttggatagaaatat 12966218  T
Q  294 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||| ||||||| | || |||| | |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12966219 ggtatatgataaatcattatgccattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12966300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208326
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28208326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 263 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035155
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggattaggcttg 34035165  T
Q  363 gttgttgttg 372  Q
    ||||||||||    
T  34035164 gttgttgttg 34035155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36514569 - 36514371
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  36514569 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattagagagag--ttggggtagcacctatagta 36514472  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||| | ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  36514471 gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagacgacttgtggattctgtagtatggagagtagatcagatagaggggagtcaag 36514372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25579431 - 25579205
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||     ||||||||| ||||||  |||||||||||| | | | |||||||| |||| |||||    
T  25579431 gagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaatactaga-----taggattagaaatgaccacattagagagagtggg-gagtagcacccatagcagaaa 25579338  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| | |     
T  25579337 aaatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacatgtagattctgtggtaagaagagtagattagatggaggatagtcaaatcac 25579238  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 245  Q
    ||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  25579237 aagagttaaatgaagacctagaaaaactattag 25579205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36102129 - 36101775
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||| ||||   |||  |||||| ||||||| |||| |||  ||||||  ||||||||||||| ||    
T  36102129 agcagagatgaaaatgttgagttcgatgtgtggtaagactagatgggatgagattagaaatgacaacatttgaggaagagtgaaggtagcacctataata 36102030  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||  |||   | | ||||| ||||| |||||| | |||||      
T  36102029 gaaaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacctatagattttgtaacagggagagtagatcatatggagaatagtcaga 36101930  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    | |  ||||| |||||||||||||| |||| |||||            ||||| ||||| || | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  36101929 tcactagaggcagaggaagacctagaaaaattattat-----------gaaag-atttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaac 36101842  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36101841 attatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 36101775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 256
Target Start/End: Original strand, 43282330 - 43282574
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt---agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43282330 atgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagtctagacatgatatgattagaaatgacaacatttagagagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 43282429  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||| ||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||| ||| | |||||||| |||||  | |     
T  43282430 agtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagacttgcagattctgtaggaaggagagtagat-agatggaggatagtcagatcac 43282528  T
Q  213 aagag--gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 256  Q
    |||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  43282529 aagaggtgtagaggatgacctagaaaaactataagagaaactatta 43282574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 214 - 370
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601755
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactat 45601698  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    || || |||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45601699 ggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataaggcttggttgttgt 45601755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 46014498 - 46014359
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  46014498 gataagattagaaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgg-ttggacatgtagaga 46014400  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatg 195  Q
    ||||||   ||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  46014399 gaagacccatagatgccgtcctaagaagagtagatcaaatg 46014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7189593 - 7189296
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga--------gtgtgggtagcacctat 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||        ||  |||| ||||||||    
T  7189593 gagatgaggatgttgtgttgaatgaccggtaagattagacgagataggat-atgaatgacaccattagagagagaaagagagagttggggtcgcacctat 7189495  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat------gctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 198  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    |||||      | ||| ||| ||||||| ||||| ||||||    
T  7189494 agtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatcgatagatgttgtagttgtagtatgaagagtagatcagatggag 7189395  T
Q  199 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac-aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 296  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||| ||  |||||||||    
T  7189394 gagagtcatattagaagatgtagaggaagacctagaaaaactataagggaagctaattagaaaagatttagaggttaaggagttgaatataaatttggt 7189296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48736256 - 48735899
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||||  ||||| ||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||     
T  48736256 atgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagatgagataaaattagaaatgacgacattatagagagagttggggtagcacctacagtagaaaaga 48736157  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 215  Q
    ||| ||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||  || |||  ||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||  | |  ||    
T  48736156 tgggagaaactagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttaggagagtagatcaaatggagg-gagtcagatcactag 48736058  T
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 315  Q
    |||||| |  |||||| | |||||||| |||||  | ||||| | || | ||||| | |||||||| ||   | |  |||| ||||| |||| |||||||    
T  48736057 aggtagggctagaccttgaaaaactataagagaggctattagtagggttctagagataaatgagtttgagaaagacatggtttatga-agaatactatgg 48735959  T
Q  316 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48735958 cgtcgtttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttgttg 48735899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26742215 - 26741892
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt-gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 153  Q
    ||||||||||| ||||| |  || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  26742215 gataggattagaaatgataatatcagagagtgagagttgggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagag 26742116  T
Q  154 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga--aac 251  Q
    | | |||   |||||  ||||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | |  ||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||  |||    
T  26742115 aaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagatagagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaac 26742016  T
Q  252 aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgg 351  Q
     ||||| ||  |||| ||  | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||     
T  26742015 tattaggaaatatttggaaataaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccacttagtgc 26741916  T
Q  352 gataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     | || ||||||||||||||||||    
T  26741915 aaaaatgcttggttgttgttgttg 26741892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 367
Target Start/End: Original strand, 5335840 - 5336193
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||   ||||| ||||| | ||||  |||||||||  |||||||| ||||||||    
T  5335840 agcagagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagacagaatgcaattagaaatgataacatt--agagagagttggggtagcatctatagta 5335937  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    | |||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||| |||| || || ||||| ||| | ||||||| |||||||     
T  5335938 ggaaagatggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaagaactgtggattctgtagttaggagagtagattagatggaggggagtcaaa 5336037  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    | |   ||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| || ||||  || ||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |||| |||     
T  5336038 tcactcgaggtaggggaaaaccttgaaaaactat--gagatactattaagaatgatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgattgaat 5336135  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  5336136 actatggcgtcgtttgattcatgtagccga-cccacatagtgggataagacttggttgt 5336193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 39811882 - 39812066
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||      
T  39811882 atgaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagagagagttggggcagcacctatcatagaaaaaa 39811981  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 200  Q
    ||||  ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||   |||||| || | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  39811982 tggtgaaaactcggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagagatgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagga 39812066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 221 - 375
Target Start/End: Original strand, 42187572 - 42187725
Alignment:
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact-atggcgtc 319  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||| ||  |||||||| | ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||     
T  42187572 gaggaagacctaa-aaaattataagagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaatt-ggtttatgatagaacatttatggcgta 42187669  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42187670 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgttgttg 42187725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 269 - 370
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852366
Alignment:
Q  269 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataaggcttggctgtt 47852364  T
Q  369 gt 370  Q
    ||    
T  47852365 gt 47852366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 36869653 - 36869574
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36869653 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 36869574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 372
Target Start/End: Original strand, 14057625 - 14057759
Alignment:
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 337  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  14057625 actataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagcca 14057724  T
Q  338 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14057725 accccacttagtaggataaggcttagttgttgttg 14057759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 238 - 372
Target Start/End: Original strand, 14367653 - 14367787
Alignment:
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 337  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  14367653 actataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagcca 14367752  T
Q  338 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    | |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  14367753 accccacttagtaggataaggcttagttgttgttg 14367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31869175 - 31869101
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31869175 tgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 31869101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Original strand, 42187393 - 42187537
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  ||||  ||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  42187393 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgggatat-attagaaatggcagcattagaaagagagtcggggtagcacctataatagaaa 42187491  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 158  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42187492 agatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaag 42187537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19262791 - 19262609
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||| |||  |||  ||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||    
T  19262791 gagatgaggatgttacgtgtgatatgtggtaatactagacatgatagagttagaaatgacaatattagagagag--ttggggtagcacctattgtagaaa 19262694  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 198  Q
    || ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  19262693 agatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtagat-ttgtagtaagaagagtagatcagatggag 19262609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 226 - 372
Target Start/End: Original strand, 34745882 - 34746028
Alignment:
Q  226 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 325  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| || || | |||||||||||   |||  |||| | ||||||||| |||||||||  |||||    
T  34745882 agacctagaaaaaccataagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttga 34745981  T
Q  326 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34745982 ttcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 34746028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 375
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969982
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttt 42969969  T
Q  363 gttgttgttgttg 375  Q
    ||| ||| |||||    
T  42969970 gttattgatgttg 42969982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 266 - 374
Target Start/End: Original strand, 47652722 - 47652830
Alignment:
Q  266 tagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 365  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  47652722 tagaggttaataagtttgatccaaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 47652821  T
Q  366 gttgttgtt 374  Q
    |||||||||    
T  47652822 gttgttgtt 47652830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24598509 - 24598409
Alignment:
Q  10 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt----agagagagagtgtgggtagcacctata 105  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24598509 gcagagacgaggatgttgtgttggatgagtggtaagtttagacatgataggattaggaatgacaccattatagaaagagagagtgggggtatcacctata 24598410  T
Q  106 g 106  Q
    |    
T  24598409 g 24598409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 296 - 371
Target Start/End: Original strand, 24777166 - 24777241
Alignment:
Q  296 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24777166 tgtatgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataaagcttggttgttgtt 24777241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 14593679 - 14594036
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtg----ggtagcacctat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |  | ||||| ||||||| |||||||||||||||| |    |||  |||||||    
T  14593679 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccgaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctat 14593778  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 204  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||       | ||| ||||| || |||  ||||    
T  14593779 agtagaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagacctgtggattctgtat-----atagtagatcagatagagaggagt 14593873  T
Q  205 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 304  Q
    ||| | |  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||| |  ||||| |    |||  |||  ||    |||| | |||||    
T  14593874 caaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaagaacctagagattg--gagaagga--ca----tggtttttgata 14593965  T
Q  305 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| || ||| | | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14593966 gaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14594036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24177721 - 24177628
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24177721 agttgggtccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatt-gatccatgtagccaaccccacttagtaggataaagcttggttgttgttg 24177628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30200323 - 30200176
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   |||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||    |||| |||||||||||    
T  30200323 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacattagagagttag----ggtaacacctatagta 30200228  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||| || ||| |||||||| | |||||||    
T  30200227 gaaaagatggtggaaactaggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagac 30200176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 309 - 375
Target Start/End: Original strand, 40630652 - 40630718
Alignment:
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40630652 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 40630718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 159
Target Start/End: Original strand, 28020883 - 28021032
Alignment:
Q  10 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag 109  Q
    ||||||| || |||||||| || |||| ||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||| | ||||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||    
T  28020883 gcagagaggaagatgttgcattagatgtgtgataagactggacatgatatgattcgaaatgataacattagagaaagagttggggtagcacttatcgtag 28020982  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28020983 aaaagatggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 28021032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27021986 - 27021906
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27021986 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 248 - 375
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355450
Alignment:
Q  248 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc-gatcccactt 346  Q
    |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||| | || |||||||    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggatcaaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccactt 28355421  T
Q  347 agtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355422 agtgggataaggcttggttgttgttgttg 28355450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Original strand, 33732017 - 33732114
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||  |||| |||| |||| |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33732017 aatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatggca--atttgatccatgtagccggtcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33732114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 200
Target Start/End: Original strand, 40169650 - 40169758
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||  ||| ||||| |||||    
T  40169650 gggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagattttgtgtgaaggagagtagatca 40169749  T
Q  192 aatggagga 200  Q
    |||||||||    
T  40169750 aatggagga 40169758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 345
Target Start/End: Original strand, 1569063 - 1569270
Alignment:
Q  138 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 237  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| | ||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||   ||||| ||||| || ||||| |||    
T  1569063 gtttgagcatgtagagagaagtcgtgtagatgttgtagaaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattgctagaggcagaggtagtcctagaaaa 1569162  T
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 337  Q
    ||||| |||| ||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||    
T  1569163 actataagagtaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatcgatgtagtcg 1569262  T
Q  338 atcccact 345  Q
    | ||||||    
T  1569263 accccact 1569270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 235 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40149150 - 40149016
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 334  Q
    |||||||| |||||||| | ||| || || || |||  |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||    
T  40149150 aaaactataagagaaactactaggaaagacttggagagcaatgagttggaccaaaatatggt-tatgatagaacattatggcgcaatttgatctatgtag 40149052  T
Q  335 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40149051 ccgaatccacttagtgggataaggcttggttgttgt 40149016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 265 - 375
Target Start/End: Original strand, 33103100 - 33103210
Alignment:
Q  265 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 364  Q
    |||||| | ||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||     
T  33103100 ttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggc 33103199  T
Q  365 tgttgttgttg 375  Q
    || ||||||||    
T  33103200 tgatgttgttg 33103210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27893674 - 27893561
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||| | |||||| |||| | |||| || | |||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  27893674 gatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataaggctt 27893575  T
Q  362 ggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||    
T  27893574 ggttgttgttgttg 27893561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 306 - 375
Target Start/End: Original strand, 28708596 - 28708665
Alignment:
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28708596 aacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgttg 28708665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 303 - 376
Target Start/End: Original strand, 31840442 - 31840515
Alignment:
Q  303 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31840442 tagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagcctaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 31840515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 224 - 373
Target Start/End: Original strand, 37976368 - 37976517
Alignment:
Q  224 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 323  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| | ||  || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||   |||     
T  37976368 gaagacctagaaaaactataagtgaaactaatatgaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaatta 37976467  T
Q  324 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  37976468 gatccatgtagccaaccccgcttagcaagataaggtttggttgttgttgt 37976517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 211 - 375
Target Start/End: Original strand, 44951274 - 44951439
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 309  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||  |||||||  ||||| | |||||| | || ||| ||||| |  | ||||||||||||    
T  44951274 aaaagaggtagaggaagatctaggaaaattacaaagagaaacctttagaaaatatttaaaagtcaattacttagattcaaatattatttatgatagaaca 44951373  T
Q  310 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  44951374 ctatgacgtaatttgatccatgtagccgacaatacttagtggtataaggtttggttgttgttgttg 44951439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48202949 - 48202701
Alignment:
Q  126 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 225  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||| | |  | ||| ||||||    
T  48202949 taggcttaggtggtttgcgcatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagatcatatggtggatagtcaaatcattataggcagagga 48202850  T
Q  226 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 325  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |   |||  || | | ||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||| | ||| |  ||||||    
T  48202849 aggcctagaaaaactataagagagatcgttaagaaagttgtagagtttaatgagttggattgaaatatggtttatgttagaacattgtggtgcaatttga 48202750  T
Q  326 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| || | | ||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  48202749 tccatgcagtc-aacccccttggttggataaggtttggttgttgttgttg 48202701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341395
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtggaataaggcttgtttgttgttgt 34341395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 253 - 373
Target Start/End: Original strand, 40415169 - 40415295
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc------actt 346  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| || | |||||| |||| |||| || | ||||||||||||||||||| |||      ||||    
T  40415169 attaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttatactt 40415268  T
Q  347 agtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  40415269 agtgggataaggcttggttgttgttgt 40415295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 16013202 - 16013357
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtg----tgggtagcacctat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |    ||||| ||||||| ||||||||||||||||     ||||  |||||||    
T  16013202 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccaaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctat 16013301  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||| ||||  ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  16013302 agtacaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagac 16013357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 188 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19119608 - 19119423
Alignment:
Q  188 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 287  Q
    |||| ||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |  | |||| ||||| |||||||||| ||       
T  19119608 atcagatggaggagagtcaaatcactagaggtagtggaagacctag-aaaactattagagaaactatcaagatggatctagagatcaatgagtttgagaa 19119510  T
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    | |  |||  | ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||   || ||||||||||||    
T  19119509 agacatggcttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaaaatttgttgttgttgtt 19119423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 293 - 375
Target Start/End: Original strand, 25891090 - 25891172
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25891090 tggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttggttgttgttgttg 25891172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 1740715 - 1740909
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt----agagagagagtgtgggtagcacctat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    | || |||||| ||||| | ||||    ||||||||||| ||||||||| |||     
T  1740715 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtagtaagactaggtggggtaagattagaaatgagaacattagagagagagagagtttgggtagcatctac 1740814  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 199  Q
    |||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| | || |||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  1740815 agtagaaaatatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtatgtagataggagaattgtggattttgtagtaaggagagtagatcagatggagg 1740909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 4604754 - 4604831
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  4604754 tatgatagaacattatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataagacttggttcttgttgttg 4604831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36239934 - 36239833
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 334  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||| | || ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  36239934 aaaactataagagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 36239835  T
Q  335 cc 336  Q
    ||    
T  36239834 cc 36239833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 48515482 - 48515559
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  48515482 tatgatagtacactatgacgtaatttgatccgtgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgttg 48515559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 5418294 - 5418358
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5418294 tatggcgtaatttgatccatgtagtcgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 5418358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 371
Target Start/End: Original strand, 6263479 - 6263539
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6263479 tatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 6263539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 300 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34029749 - 34029677
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  34029749 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccaccaagtgggataaggcttggttgttgttg 34029677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34926618 - 34926538
Alignment:
Q  277 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 357  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34926618 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagcgggataag 34926538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 38103762 - 38103616
Alignment:
Q  224 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 323  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||| | || ||||||| |||| ||||| || ||||    
T  38103762 gaaggcctagaaaaactataagagagactattaggaaatactaagagattaatgagttggatccaaatattgtttatgata-aacattatggtgtaattt 38103664  T
Q  324 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38103663 gatcc-tgtagccgaccccagttagtgggataagacttggttgttgttg 38103616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 374
Target Start/End: Original strand, 7220750 - 7221039
Alignment:
Q  97 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac------tagtagatgctgtggtaaga------agag 184  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||      | |||||| |||| |||  |      ||||    
T  7220750 gcacctattgtagaaaagatgatagaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacgtgtacttgtagattctgtagtattagtatggagag 7220849  T
Q  185 tggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 284  Q
    | ||| | |||||||| |||||| |||  ||||| |||| ||||||||  ||||| || || ||||  ||||  || ||||||||| | |||| ||||||    
T  7220850 tagattagatggaggatagtcaaattactagaggcagagtaagacctataaaaaccataagtgaaattattaacaaagatttagagattaatgtgttgga 7220949  T
Q  285 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |  | || |  | | |||||||| | |||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7220950 taaagatataatatgtgatagaaaattatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtggtgtaaggcttggttgttgttgtt 7221039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8519157 - 8519046
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| | |||||||| ||||| |  | ||||||||||| |||||||||     
T  8519157 gatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttagtgagataaggctc 8519058  T
Q  362 ggttgttgttgt 373  Q
    | ||||||||||    
T  8519057 gattgttgttgt 8519046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 16013484 - 16013559
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||| || ||| | | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16013484 tgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 16013559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24550051 - 24549686
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |  ||| |||||| ||||| | |||||||| ||||     |||| ||||||||       
T  24550051 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgttgtaagactagatagaatatgattagaaatgataacattagagtgagatctatggtatcacctata--- 24549955  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga-tgctgt--gg--taagaagagtggatcaaatggaggagag 203  Q
       ||| || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || || |  |||  ||  |||| |||||   ||| ||||||| ||     
T  24549954 ---aagatgatggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtggactattgttaggactaaggagagtaagtcagatggaggggat 24549858  T
Q  204 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 303  Q
    |||| | |  ||||||||| ||||||||   | |||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| | ||||    
T  24549857 tcaaatcactagaggtagaagaagacctgaaagaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaatatggtatttgat 24549758  T
Q  304 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    ||||   ||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||    
T  24549757 agaatcttattgcgtcgttt-atccatgtagcagatcccacttagtaggattaggcatggttgttgttgttgc 24549686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814125
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| |||| || | |||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaagaggcttggtagttgttgt 30814125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 163
Target Start/End: Original strand, 38920795 - 38920866
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactag 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38920795 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagagatgactag 38920866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1531587 - 1531372
Alignment:
Q  147 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 246  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||| ||| ||| ||| ||||| ||  ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||     
T  1531587 tgtagagagaagacctctagatgttgtagtacgaatagtagatcagataaaggagagccagatcaaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagc 1531488  T
Q  247 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt 346  Q
     |||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |  ||||||||| ||||| |            ||||||||| |||||||    
T  1531487 aaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatatggtttgggatagaacattatggtg------------tgtagccgaccccactt 1531400  T
Q  347 agtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1531399 agtgggattaggcttggttgttgttgtt 1531372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6420749 - 6420615
Alignment:
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||| | || |||||  | |      
T  6420749 gttggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatactgtagtaaggagagtagatcagatgaatgatagtcagatcact 6420650  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 248  Q
    ||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  6420649 agaggcagaggtagacctataaaaactataagaga 6420615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 375
Target Start/End: Original strand, 33281097 - 33281170
Alignment:
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33281097 gatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccggacc-acttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 33281170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2882835 - 2882734
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||| || | ||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  2882835 aatgagttggatcgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatttagctgacctcacttagtgagaaaaggcttggtggttgttgt 2882736  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  2882735 tg 2882734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 41483694 - 41483771
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  41483694 tatggtagaactttatggtgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgttg 41483771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 160
Target Start/End: Original strand, 41948480 - 41948585
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||  | ||||||| || | |||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41948480 gatacgattagaaatgacaacattagagtgagagttggcgtagcacttacaatagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagaga 41948579  T
Q  155 gaagac 160  Q
    ||||||    
T  41948580 gaagac 41948585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20158743 - 20158671
Alignment:
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20158743 gatagaacactatcaagtaatttgatccatgtagctgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 20158671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28542055 - 28541943
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc-acttagtgggataaggct 360  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||| |  |||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  28542055 gatttagagattaatgagttggattgaactatggtttatgatagaacatcatggcatagtttgatccgtgtagccgacccccacttagttggataaggct 28541956  T
Q  361 tggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||    
T  28541955 tggttgttgttgt 28541943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 29312209 - 29312273
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29312209 tatggcgtaatttgatccatgaagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29312273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29318853 - 29318793
Alignment:
Q  315 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29318853 gcgtaatttgatccatgtagccgacccagcttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29318793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47700117 - 47700054
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  47700117 tatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccacttggtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 47700054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20525105 - 20525050
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20525105 atttgatccatgtagccgaccccacttagcgggataaggctcggttgttgttgttg 20525050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 224 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47796301 - 47796150
Alignment:
Q  224 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 323  Q
    ||||||| || |||| ||| |||||| | ||||| || ||||||||  | ||| |||||||   |||| |||| |||||||||| | |||||||| ||||    
T  47796301 gaagaccgagaaaaattataagagaacctattaggaaagatttagaaattaataagttggactgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaattt 47796202  T
Q  324 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||  ||||||||||||    
T  47796201 gatccatgcagccgatcccgcttagtcggaaaagccttctttgttgttgttg 47796150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18605427 - 18605237
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18605427 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18605328  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18605327 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaactacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18605237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21244328 - 21244282
Alignment:
Q  328 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21244328 catgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 21244282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 145 - 375
Target Start/End: Original strand, 33139208 - 33139437
Alignment:
Q  145 catgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 244  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| || ||||||| |||  | || |||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |  |    
T  33139208 catgtagagagaagacccgcagatgccgttgtaagaaaagtataacagatggagaagagttaagtcaaaagagatagagtaagacataggaaaaccacaa 33139307  T
Q  245 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 344  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||  || |  ||||| | || ||||||| | || ||||  || |||||||||||||| | |||||||     
T  33139308 gagaaacacttaaaaatgatttcgaggttaatgaactgaagtcaaatatagtttatgatacaccattatgatgtaatttgatccatgtaactgatcccat 33139407  T
Q  345 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
      |||||||||| | || |||||||||||||    
T  33139408 gaagtgggataa-gatttgttgttgttgttg 33139437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 190
Target Start/End: Original strand, 35713696 - 35713794
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 190  Q
    |||||| || |||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||| ||||    
T  35713696 gggtaggacatatagttgaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtacattttgtagtaaggagagtagatc 35713794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 40830146 - 40830292
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||  || ||| | |||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||    |||||||||||||| | |    
T  40830146 agcagagataaggatgttgtgttgaatg--tgctaaaagtagacatgatagaattagaaatgacaatattagaaagagt---tgggtagcacctattgaa 40830240  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||| ||||||||| |   ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40830241 gaaaagatggtagaaactctacttaggtggtttgggcatgaagagagaagac 40830292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36245336 - 36245259
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  36245336 tggtatatgatagaacattatgacgtcgtttgatccacgtagtcgatcccacatagttggataaggcttgtttgttgt 36245259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Original strand, 45558539 - 45558611
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45558539 tgatagaacactatggcgtcatttgattcatgtagttgaccccgcttagt-ggataaggtttggttgttgttgt 45558611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 301 - 361
Target Start/End: Original strand, 17759483 - 17759543
Alignment:
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17759483 gatagaacactatggtgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 17759543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 371
Target Start/End: Original strand, 30144975 - 30145035
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  30144975 tatggtgtcatttgatccatgcagccaatcccacttagtgtgataaggcttggttgctgtt 30145035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38921161 - 38921086
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag--ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  38921161 tgatagaaggctatggcgtcatttgattcatgtaggaccgaccccacttagggggaaaaggcttggttgttgttgt 38921086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 370
Target Start/End: Original strand, 39812145 - 39812217
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812145 tatgatagaacattatgatgtcgtttgatccatgtagttggccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 39812217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40139279 - 40139124
Alignment:
Q  10 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag 109  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| || |||| ||||||||||||     ||||  ||||||||||||    
T  40139279 gcagagacgaggatgttgtgtgggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaaagacaacattagagagagtc---gggtttcacctatagtag 40139183  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    ||||  |||| |||| | ||||||| || | ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  40139182 aaaatatggtggaaactgggcttaggtgatctgggcatgtagggagaagatttgtagat 40139124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 157
Target Start/End: Original strand, 45558352 - 45558428
Alignment:
Q  81 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  45558352 agagagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttaggtggtttgtgcacgtagagagaa 45558428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 375
Target Start/End: Original strand, 1523856 - 1523927
Alignment:
Q  304 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| | | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  1523856 agaacactatgacgtaatttgattcatgtagccaacctcacttagggagataaggcttggttgttgttgttg 1523927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 6807700 - 6807775
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| |||||||  || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6807700 tgatagaacattatggcgtcgtatgattcatgtaggtgaccccacttagtgggataagatttggttgttgttgttg 6807775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21517529 - 21517426
Alignment:
Q  224 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcattt 323  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||  |||||||| | ||| |||||||||||||| || | ||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  21517529 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaattt 21517430  T
Q  324 gatc 327  Q
    ||||    
T  21517429 gatc 21517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 35865912 - 35865987
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  35865912 tgataaaacactatggcgtcgtttggttcatgtagccaaccccacttagtgggacagggcttgcttgttgttgttg 35865987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39738497 - 39738446
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39738497 tttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 39738446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40139023 - 40138948
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||    
T  40139023 tatgatagaatattatgacgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgcgataagacttggctgttattgt 40138948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Original strand, 41461318 - 41461393
Alignment:
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||| || |||||||||  |||||||||| |||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41461318 atgatagaccattatggcgtcggttgatccatgcagccaaccccggttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 41461393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 353
Target Start/End: Original strand, 43281958 - 43282092
Alignment:
Q  218 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 317  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||   | ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||| |||||||    
T  43281958 gtagaggatgacctagaaaaaccgtaagagaaacaattaagtaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgacaaaaca-tatggcg 43282056  T
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 353  Q
    | |||||||| || ||||||| | ||||||||||||    
T  43282057 taatttgatctatctagccgacctcacttagtggga 43282092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 47796473 - 47796359
Alignment:
Q  38 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 135  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||  |||||| |||||| || ||  || || |||||||||||||| |||| |||||||||| |||     
T  47796473 gtggtaagactagatgggataggattagaaatgacaatattagatagagagagttggagtaccaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcgtagg 47796374  T
Q  136 tggtttgggcatgta 150  Q
    |||||||||||||||    
T  47796373 tggtttgggcatgta 47796359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Original strand, 1523747 - 1523813
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1523747 atgttgcgttgcatgagtgacaagactagacgtgataggattattaatgacaccattagagagagag 1523813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 282
Target Start/End: Original strand, 18637563 - 18637753
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18637563 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18637662  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18637663 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaaatacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18637753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 282
Target Start/End: Original strand, 18650997 - 18651187
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18650997 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18651096  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18651097 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaaatacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18651187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24376103 - 24376025
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||| || |||||||||    
T  24376103 tggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcgcttagtgggacaaggttttgttgttgtt 24376025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 375
Target Start/End: Original strand, 48515373 - 48515455
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| || ||||||||||  || |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  48515373 tggtttatgatagaacattatggcgtaattttattcatgtagccgccccaacttagtgggataaggctcggtggttattgttg 48515455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 314 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17907783 - 17907722
Alignment:
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  17907783 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagcaggataagacttggttgttgttgttg 17907722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25731585 - 25731472
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    |||||| |||| ||| | |||||||||||| |||| |   |||||||| |||||||| |||||||| ||||||| || | |  ||| ||||||||| |||    
T  25731585 gatttacaggttaataaattggatccaaatatggtttcgaatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtagcagacctcgtttaatgggataagactt 25731486  T
Q  362 ggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||    
T  25731485 ggttgttgttgttg 25731472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Original strand, 28021146 - 28021219
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| ||||  ||| ||||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28021146 atagaacattatgaggtcgtttgacccatgtagcctactccacttggtgggataaggcttggttgttgttgttg 28021219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40008506 - 40008429
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||| || | |||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  40008506 tatgatagaacattatgtcgttgtttgatccatgtagctgacctcacttaatgagataagacttggttgttgttgttg 40008429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 206
Target Start/End: Original strand, 5418071 - 5418195
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc-ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaa 181  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||  || ||| |||| ||||| |    
T  5418071 agagagttggggtagcacctcttgtagaaaatatggtggaaaataggctttagattgtttgtgcatgtagaaagaagacctgttgattctgtagtaagta 5418170  T
Q  182 gagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    |||| |||||  ||||||| |||||    
T  5418171 gagtagatcaggtggaggatagtca 5418195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 365
Target Start/End: Original strand, 6682583 - 6682627
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 365  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6682583 tttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 6682627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 375
Target Start/End: Original strand, 20899411 - 20899455
Alignment:
Q  331 gtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20899411 gtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 20899455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27022063 - 27021991
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  27022063 atgagaatgttgcattggatgtgtgataagactagacaggataggattaaaaatgacaacattagagagagag 27021991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 28562647 - 28562443
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||| || ||||| |||||   || |||||||| ||||| |||| || ||||  |||||||||||  | ||||  ||| ||||||||| | |||||    
T  28562647 gggtagcatctctagtaaaaaagaatgtggaaaatagacttaggtggtatgcgcatacagagagaagacatgcagattttgtagtaagaagattagatca 28562548  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
     || ||| | ||| |  ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||| | || ||||||||||| |||    
T  28562547 gatagagaatagttagattacaagaggtagaggatgacctagaaaaaatataagagaaactattatgaaagatttagagattaacgagttggatcctaat 28562448  T
Q  292 ttggt 296  Q
     ||||    
T  28562447 atggt 28562443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30200017 - 30199965
Alignment:
Q  323 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30200017 tgatctatgtagccggccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30199965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32879292 - 32879192
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtat-gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  ||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  32879292 aatgagttggatccaaatatggttaaaagatggaacattagggcgtaatttgatccttgtagccgaccctgcttagttggataaggcttggttggtgttg 32879193  T
Q  373 t 373  Q
    |    
T  32879192 t 32879192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43424029 - 43423989
Alignment:
Q  335 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43424029 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43423989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 334
Target Start/End: Original strand, 6807388 - 6807447
Alignment:
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 334  Q
    ||||||| |||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6807388 atgagttagatagaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtag 6807447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 345
Target Start/End: Original strand, 22174123 - 22174254
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||| || |  || ||| ||||| | ||||| || |||  |||| |||| | |||||||||| |||    
T  22174123 agaggcagaggaaaacgtagaaaaactataagagaaactataaacaaagatctagagattaatgaattagatagaaatatggtatgtgatagaacattat 22174222  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 345  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  22174223 ggcgttgtttgatccatgtagccgaccccact 22174254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 262 - 333
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859117
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgta 31859117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35725604 - 35725569
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35725604 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35725569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 244 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 40391952 - 40391845
Alignment:
Q  244 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 343  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||  | ||| ||||||| | |||| |||  |||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| ||||    
T  40391952 agagaaactagtaggaatgatttagaaattaataagttggaccgaaatatggcttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctaaccgacccca 40391853  T
Q  344 cttagtgg 351  Q
    ||||||||    
T  40391852 cttagtgg 40391845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 220 - 371
Target Start/End: Original strand, 40830331 - 40830481
Alignment:
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||| ||||  | ||||||||| ||   | | || | |||||||||||| || || | |    
T  40830331 agaggaagacctagaaaatctataagagaaactattaagaaggatctagaaattaatgagttgtatatga-tatgatatatgatagaacattacggaggc 40830429  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
     |||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40830430 gtttgatccatgtagccaacccctcctagtgggataaggcttgattgttgtt 40830481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 44401284 - 44401164
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||| | || |||||  ||| |||| || | |||||||||||| |||    
T  44401284 agaggtggaggatgacctagaaaaattataagagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtt--atcaaaatatgttttatgatagaacattat 44401187  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagcc 336  Q
    | ||| |||||||||||||||||    
T  44401186 gacgtaatttgatccatgtagcc 44401164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 45054378 - 45054311
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 365  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  45054378 tatgatagaatattatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttggttggataatgcttggtt 45054311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 45841332 - 45841206
Alignment:
Q  21 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggta 120  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| |||||   |||| | |||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||  |||     
T  45841332 gatgttgtgttgaatgtgtggtaagcttagaagagatacggttagaaatgacaacattagatagagagt-tgagtaacacctataatagaaaagacggtg 45841234  T
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatg 148  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  45841233 gaaactaggtttagttggtttgggcatg 45841206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 47413748 - 47413713
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47413748 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 47413713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Original strand, 3457544 - 3457645
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||| | || ||||||| |||| |||||| | |||||||| ||||   ||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3457544 aatgagttggatcaaaatattgtttatgataaaacattatggcataatttgatcaatgtgagcga-cctacttagtgggataaggctttgttgttgctgt 3457642  T
Q  374 tgc 376  Q
    |||    
T  3457643 tgc 3457645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 145 - 223
Target Start/End: Original strand, 26925264 - 26925342
Alignment:
Q  145 catgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 223  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  26925264 catgcagagagaagactcgtagatgatgtagtaagaagagtagattagatagaggatagtcgaattaaaagaggtagag 26925342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 199
Target Start/End: Original strand, 30144793 - 30144883
Alignment:
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 199  Q
    |||||| |||||||||   ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  30144793 gaaaagatggtagaaatccggcttaggtagtttgggcaggtagagagaagacttgtagattctatagtacgaagagtagatcagatggagg 30144883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30914577 - 30914503
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||  ||||||  | |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30914577 tatgatagaactttatggcagcgtttgatccatattgccaaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 30914503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33650903 - 33650869
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33650903 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 33650869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 368
Target Start/End: Original strand, 33871479 - 33871549
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||   || |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  33871479 tatgatagaacattatggcgtaatttcatccatgtaattgagcccagttagtgggataagacttggttgtt 33871549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45841048 - 45840994
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45841048 tttgatccatgtagctgaccccaattagtggtataagacttggttgttgttgttg 45840994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12241728 - 12241684
Alignment:
Q  330 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12241728 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt-ttgttgttg 12241684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Original strand, 25578069 - 25578142
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| |||||||||||||  || ||| | ||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25578069 tgataaaacactatggcgttgttagattcgtgtagccaaacctacttagtgggataaggattggttgttgttgt 25578142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25579156 - 25579103
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  25579156 atttgatccatgtcgccgaccccactcagtggtataaggcttagttgttgttgt 25579103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 158
Target Start/End: Original strand, 30632958 - 30633035
Alignment:
Q  81 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 158  Q
    |||||||||  |||||||||||||  || ||||  |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30632958 agagagagtcggggtagcacctatcataaaaaaaatggtggaagctcggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 30633035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Original strand, 475987 - 476059
Alignment:
Q  303 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||||||   ||||||||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  475987 tagaacattatggcgctgtttgatccaagtagtggattctacttagtgggataaggcttggttgtttttgttg 476059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 198
Target Start/End: Original strand, 3457368 - 3457471
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    ||||||| |||||||||||||   || |||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||| ||||  ||||||||||| |    
T  3457368 gtagcacttatagtagaaaagactgt-gaaactaggtttaggtggtttgggcattcagagagaagacatgtagatgttgtagtaatgagagtggatcaga 3457466  T
Q  194 tggag 198  Q
    |||||    
T  3457467 tggag 3457471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3928380 - 3928344
Alignment:
Q  339 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3928380 tcccacttagtgggataaggcttggatgttgttgttg 3928344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19262533 - 19262457
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||| |||||| ||||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  19262533 tatgatagaacattatggcggtgtttgattcatgtaaccgacgccacttggtgggatatggcttagttgttgttgtt 19262457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 377
Target Start/End: Original strand, 26847836 - 26847892
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 377  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  26847836 tttgatccacgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggctgttttcgttgca 26847892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27021795 - 27021723
Alignment:
Q  303 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| ||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||| | ||||||    
T  27021795 tagaacattatggcacaatttgatccatgttgccgaccccacttagtgggataggacttggttgatattgttg 27021723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #191
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35734731 - 35734691
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35734731 agccgaccccacttagcgggataaggcttggttgttgttgt 35734691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #192
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 333 - 373
Target Start/End: Original strand, 41157897 - 41157937
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41157897 agccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 41157937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #193
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42177177 - 42177018
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||| |||| |||||| | ||||  || ||| ||||| | ||||||||  ||  |||| |||| |||||| ||||| |||    
T  42177177 agaggtggaggaagacgtagaaaacctataagagaatctattaagaaagatctagagataaatgagtttcataaaaatatggtatatgattgaacattat 42177078  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    | |||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  42177077 gacgtcgtttgatctatgtaatcga-cccacttagtgggatatagtttgattgttgttgtt 42177018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #194
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9797956 - 9797909
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9797956 gaaaattggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 9797909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #195
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27893828 - 27893769
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 152  Q
    |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27893828 ggtaacacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga 27893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #196
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30914749 - 30914674
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga 167  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  30914749 gggtagtacctattgtagaaaaaatggtagaaactcggctttggtggtttgggcatgtaacgagaagacttgtaga 30914674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #197
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Original strand, 35713617 - 35713676
Alignment:
Q  29 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  35713617 gttggatgtgtggtaaggttagatatgataggattagaaatgaaaatattagagagagag 35713676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #198
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 368
Target Start/End: Original strand, 35922407 - 35922530
Alignment:
Q  245 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccac 344  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||| ||| |||| || | |||||||||||| |||| | | ||||||||||| || ||  ||| |     
T  35922407 gagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacattatgacctaatttgatccatataaccattcctat 35922506  T
Q  345 ttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    ||||||||||| |  |||||||||    
T  35922507 ttagtgggatatgatttggttgtt 35922530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #199
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37439647 - 37439580
Alignment:
Q  67 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||    
T  37439647 aatgacaacattagagagagagttggagtagcacctatggtagaaaagatgatgtaaaataggcttag 37439580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #200
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 334 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 635347 - 635309
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  635347 gccgaccccacttagtgggataaggcttggatgttgttg 635309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #201
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 340 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5577532 - 5577498
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5577532 cccacttagtcggataaggcttggttgttgttgtt 5577498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #202
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 29653918 - 29653844
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagaga 83  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  29653918 agcagagatacggctgttgcgttggatgtgtggtaacactagacgggatagaattagaaatgacatcattagaga 29653844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #203
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 340 - 370
Target Start/End: Original strand, 30188512 - 30188542
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30188512 cccacttagtgggataaggcttggttgttgt 30188542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #204
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 313 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35066805 - 35066744
Alignment:
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  35066805 tggcgtaatttgatccatgttgccaaccacacttagtgagataaggcttggtt-ttgttgttg 35066744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #205
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Original strand, 38504695 - 38504737
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38504695 tagccgaccccacttagcgggataaggcttggctgttgttgtt 38504737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40008777 - 40008636
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggt-agcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||  | || ||||| ||||||| ||||||||||||  || || | | |||||||   ||||    
T  40008777 gagatgaagatgttgcgtaggatgtgtggtaaaactagacaaaaaagaattagaaatgacaacattagagagag-ttggggataaacacctatcaaagaa 40008679  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||| |||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||    
T  40008678 aagatggtggaaactcggattaggtggtttgggcatgtagaga 40008636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 320 - 374
Target Start/End: Original strand, 41948724 - 41948778
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  41948724 atttcatccatgtagccaaccccacttagtggggtaatgtttggttgttgttgtt 41948778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 333 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 48735721 - 48735683
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48735721 agccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 48735683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6429225 - 6429156
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagtt-ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||  |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  6429225 gggtagcacctatagtagaaaaggcaggtgaaaaataggtttaggtggtttgggcatgccgagagaagac 6429156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 148
Target Start/End: Original strand, 23720829 - 23720898
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 148  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  || | ||| ||||| |||||||||||||    
T  23720829 agagagagagttagggttgcacctatagtagaaaagatggcggagactagccttaggtggtttgggcatg 23720898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 25731696 - 25731639
Alignment:
Q  30 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga 87  Q
    |||||||| |||||||| |||||  || ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25731696 ttggatgaatggtaagactagacgagaaaggattaagaatgacacctttagagagaga 25731639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25826788 - 25826683
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||   ||| | | |||| ||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  25826788 gataggattagaaatgaaaacattagagagggagttgcggttgaaactattgtagaaaagatggtagaaactcggcttgggtggtttgcgaatgtggaga 25826689  T
Q  155 gaagac 160  Q
    ||||||    
T  25826688 gaagac 25826683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 347
Target Start/End: Original strand, 37595891 - 37595932
Alignment:
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 347  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  37595891 aacattatggcgtcatttgatccatgtagtcgatcctactta 37595932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #214
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 42177328 - 42177255
Alignment:
Q  60 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 133  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  42177328 gattagaaatgacaatattagagagagagttgaggtatcacctatagtagaaaagatggtgaaaactaggctta 42177255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #215
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 338 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 43653217 - 43653184
Alignment:
Q  338 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43653217 atcccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 43653184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #216
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 369
Target Start/End: Original strand, 44930960 - 44930989
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44930960 cccacttagtgggataaggcttggttgttg 44930989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #217
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 47155224 - 47155183
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  47155224 tttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttg 47155183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #218
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 47185883 - 47185807
Alignment:
Q  297 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||| |||| | |  ||||||| || ||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  47185883 gtatgatagaacattatgacattgtttgatctat-tagccgaccccacttaatgagataagacttggttgttgttgtt 47185807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 312; Significance: 1e-175; HSPs: 194)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 9 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 36565605 - 36565238
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36565605 agcagagatgaggatgatgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 36565506  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36565505 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaag 36565406  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36565405 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 36565306  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36565305 actatggcgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgttgc 36565238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 36545065 - 36545433
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatag 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  36545065 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtaacacctatag 36545164  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36545165 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtca 36545264  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36545265 agttaaaagacgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 36545364  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36545365 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 36545433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 36395314 - 36394949
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36395314 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 36395215  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36395214 gaaaagttggtagaaaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaaagtcaa 36395115  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36395114 gttaaaagaggtataggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatttggtgtatgatagaa 36395015  T
Q  308 cactatggcgtca-tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36395014 cactattgtggcattttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttg 36394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 57 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11524040 - 11523721
Alignment:
Q  57 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11524040 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagag 11523941  T
Q  156 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 255  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11523940 aagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 11523841  T
Q  256 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11523840 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 11523741  T
Q  356 aggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11523740 aggcttggttgttgttgttg 11523721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 40813240 - 40813608
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatag 106  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  40813240 agcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 40813339  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40813340 tagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtca 40813439  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40813440 agttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttggtgtgtgataga 40813539  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40813540 acactatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaaacttcgttgttgttgttg 40813608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 39946775 - 39947132
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39946775 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattatagaaagagtgggggtagcacctatagta 39946874  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  39946875 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaag 39946974  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  39946975 ttagaagaggtagaggacgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtttatgatagaac 39947074  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     |||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39947075 gctatggcgtcatttg--------agccga-cccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 39947132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42854364 - 42854002
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  42854364 gagatgacgatgttgcgctggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccatcagagagagagtgggggtaacacctatagcagaga 42854265  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  42854264 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 42854165  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||    
T  42854164 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacacta 42854065  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  42854064 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggtttggtggttgttgttg 42854002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 93 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491141
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  193 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 292  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgt 12491141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 9 - 372
Target Start/End: Original strand, 2796473 - 2796838
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatta--gacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatag 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2796473 agcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcgcctatag 2796572  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||  | |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2796573 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga---ct-gtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtca 2796668  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| | |||||||    
T  2796669 tgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagttgaactcaaatttggtttttgataga 2796768  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa----ggcttggttgttgttg 372  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  2796769 acagtatggcgtaatttgattcatgtagacgaccccacttagtgggataaggatggcttggttgttgttg 2796838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Original strand, 18125097 - 18125454
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  18125097 gagatgagcatgttgcgctggatgagtgacaagacgagacatgataggattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaa 18125194  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| |    
T  18125195 agttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggtt-a 18125293  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||||||| ||||    
T  18125294 aagaggtagagggagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttaaaagtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaatacta 18125393  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||| || |||||||| |||||| | | || ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  18125394 tggtgt-atttgatcaatgtagtcaacccgacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 18125454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 38 - 375
Target Start/End: Original strand, 21121105 - 21121429
Alignment:
Q  38 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 137  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||            |||| |||||||    
T  21121105 gtggtaagactagacgggataggattagaaatggcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtacaaaa------------taggtttagatg 21121192  T
Q  138 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21121193 gtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtagagggagacctaagaaa 21121292  T
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 337  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  21121293 tctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccg 21121391  T
Q  338 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21121392 accccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 21121429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 45419161 - 45419517
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  45419161 gagatgaagatgttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattagagaga-attg-gggtagcacctatagtagaaa 45419258  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |       
T  45419259 agatggtataaaatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggc--tagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagatctg 45419356  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||| |    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45419357 aagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaacatta 45419456  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45419457 tggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45419517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 37077687 - 37078033
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||            |||    
T  37077687 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacaccattcggaagagagtgagggtag------------aaa 37077774  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||    
T  37077775 agttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcgggtcaa 37077872  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    || | ||||||||||      
T  37077873 aataggtagatgaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatactttggaagatagaacac-- 37077970  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || ||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  37077971 tgacgtaatttgatccatgcagccgaccccacttaatgggataaaacttggttgttgttgttg 37078033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 165 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42469935 - 42469725
Alignment:
Q  165 agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggat 264  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||    
T  42469935 agatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagat 42469836  T
Q  265 ttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  42469835 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataaggcttggt 42469736  T
Q  365 tgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||    
T  42469735 tgttgttgttg 42469725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 63 - 370
Target Start/End: Original strand, 8932676 - 8932982
Alignment:
Q  63 taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||       
T  8932676 taggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatcc 8932773  T
Q  163 gt-agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaag 261  Q
    || | ||||  | |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  8932774 gttaaatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaa 8932873  T
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||    
T  8932874 gatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgaaataaagctt 8932973  T
Q  362 ggttgttgt 370  Q
    |||||||||    
T  8932974 ggttgttgt 8932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Original strand, 29520583 - 29520931
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa- 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||     
T  29520583 agatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgataccattagagagagagttggggtggcatctatagtagaaat 29520682  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |  |||| ||||           |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | |     
T  29520683 aaatggtggaaa-----------tggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcac 29520771  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  29520772 aagaggtagaggaag-cctagaaaaactataagagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatta 29520870  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29520871 tggcgtaatttgatccatgtagcccaccccatttagtgggataatgcttggttgttgttgt 29520931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8879800 - 8879446
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||| |||||||  | ||| |||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  8879800 gagatgagaatgttgcacttgataagtggtaagactggactagataggattaggaatgacacaattagagagagaatgggggaagcacctatagtagaaa 8879701  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  |    ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||  |    
T  8879700 agttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagagagaagacccg----tgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagggtcgggtcca 8879605  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||      
T  8879604 aagagcttgagggagacgtaggaaaactataagagaaaccattaaaaatgatttagaagtcaataagttgaatccaaatatggtttatgatataacac-- 8879507  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || ||| |||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  8879506 tgacgtaatttaatccatgtagccgactccacttattaggataaagcttggttgttgttgt 8879446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 192 - 375
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027814
Alignment:
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  292 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     |||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc-tgtagccaacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 2027814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 241 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25473535 - 25473402
Alignment:
Q  241 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  25473535 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgacc 25473436  T
Q  341 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25473435 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 25473402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 375
Target Start/End: Original strand, 32043522 - 32043871
Alignment:
Q  23 tgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  32043522 tgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtaga 32043621  T
Q  123 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 222  Q
    || ||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| ||||| ||| | ||||| ||||||| | ||||| | |  ||||||||     
T  32043622 aactagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaaggagaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtagg 32043721  T
Q  223 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 322  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || |  |||||| || || |||||||||||||   | |  |||| | |||||||||||||||||  | ||    
T  32043722 ggaagacctaaaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctaaagatcaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggc--cgtt 32043819  T
Q  323 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32043820 tgattcatgta-ctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 32043871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 111 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904908
Alignment:
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||  || |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | || ||| ||| |||||    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaacac 26904970  T
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||  ||| ||| |||||| |||| |||||||||    
T  26904969 tatgtcgtaatttgatccatatagtcgaccccgtttaatggaataaggtttgg-tgttgttgt 26904908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 218 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14742234 - 14742080
Alignment:
Q  218 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 317  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |  |   ||||||||||||||||||    
T  14742234 gtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaatatttt---tgatagaacactatggcg 14742138  T
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742137 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14742080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18752233 - 18751998
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18752233 gagatgagaatgttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaa 18752136  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    ||||||| || || | ||||||||||||||||||  | ||| |  ||||    
T  18752135 agttggtagaaaata-gcttagatggtttggacatgtagagagaggatccatagatgccgttgttaaaagagtggatcaaatggaaaatagttagattaa 18752037  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac 251  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||    
T  18752036 aagaggtagaggaatacctaaaaaaaccattagcgaaac 18751998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39953628 - 39953263
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||| |   |||||||||||||||  || |||||||||||  |    
T  39953628 agcagagatgagaatgttgcgttggatgtgtggtaagattaaacatgatataattagaaataatgacattagagagagagttgggatagcacctatatga 39953529  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||||||| |||  |||| |||||| |||||||||||||  |||   | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||| ||| || |||      
T  39953528 gaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttaggcatgtagagaggtgacctatggattatgtagtaaggagagtagatcagatgaaggcgaatcaga 39953429  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    | |  |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||| ||   |||  |||| | |||| | ||    
T  39953428 tcactagaggtaggggtagacctaggaaaactaaaagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttgatgggac 39953329  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39953328 actatggagttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 39953263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 262 - 373
Target Start/End: Original strand, 44529396 - 44529507
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44529396 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 44529495  T
Q  362 ggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||    
T  44529496 ggttgttgttgt 44529507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 264 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047530
Alignment:
Q  264 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgg 44047542  T
Q  364 ttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||    
T  44047541 ttgttgttgttg 44047530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43904947 - 43904700
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag---gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 190  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  43904947 gtagcatctatagtagaaaagatggaggaaaataataagcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatc 43904848  T
Q  191 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 290  Q
    | |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||  |||  |  ||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  43904847 agatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctagaaatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaa 43904748  T
Q  291 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 338  Q
    | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43904747 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 43904700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 116 - 375
Target Start/End: Original strand, 30559718 - 30559982
Alignment:
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 215  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||   | |  ||    
T  30559718 tggtcgaaaataggcttaggtggtttgggcatttagagagaagacatgtagattttgtagtaaggacagtggatcagatggaggatagtcggatcactag 30559817  T
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 315  Q
    || |||| |||||| ||  |||||||| |||||||| || || || ||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||     
T  30559818 agatagatgaagacttaaaaaaactataagagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatga 30559917  T
Q  316 cgtcatttgatcc-----atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||| |||||||||     |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30559918 cgtaatttgatccatgtaatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30559982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 375
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931244
Alignment:
Q  100 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga-ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 198  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||| || ||||| |||||||| |||| | ||| ||||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||    
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatcta-tagattctgtagtaaggagactagatcagatggag 32931068  T
Q  199 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 298  Q
    || |||||  | |  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||||||||| | |||| ||||||    
T  32931069 gatagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgt 32931167  T
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  32931168 atgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagccttggttgttgatgttg 32931244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 349
Target Start/End: Original strand, 29700268 - 29700534
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 182  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | | ||| |||| ||||| ||    
T  29700268 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggaggaaagttggcttaggtggtttgggcatatagagaaaagaccattggattctgtagtaaggag 29700367  T
Q  183 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
    ||| ||| | |||||||| |||||  | |  |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||| || || || ||| | ||||||| |    
T  29700368 agtagattagatggaggatagtcatatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactaaaagagaaactaataggaaagacttggagataaatgagtcg 29700467  T
Q  283 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt 349  Q
    || | |||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  29700468 gaccaaaattttgtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgactccacttagt 29700534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 253 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15215532 - 15215410
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 352  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  15215532 attagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtagg 15215433  T
Q  353 ataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15215432 ataaggcttggttgttgttgttg 15215410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Original strand, 490506 - 490619
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  490506 gatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 490605  T
Q  362 ggttgttgttgttg 375  Q
    | ||||||||||||    
T  490606 gtttgttgttgttg 490619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 10080264 - 10079995
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||    
T  10080264 agatgatgatgttgcgttgggtgtttggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagagagttgaggtagcatcta-agtagaaaa 10080166  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
    | |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |  |||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| | |      
T  10080165 gatggtggaaactaggcct-gatggtttgggcatgtagagagaagacctgaggattttgtagtaaggagagtagatcaaatgaaggggagtcaaatcact 10080067  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 285  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||  |||  || ||| ||||| | ||||||||||||    
T  10080066 agaggtagaggaagacctagagaaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagattaatgagttggat 10079995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 181 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35362842 - 35362651
Alignment:
Q  181 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 280  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |    | ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||    
T  35362842 agagtagatcaaatggaggatagtcaaatccctataggcagaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagt 35362743  T
Q  281 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||   |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35362742 tggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 35362651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 16917102 - 16917462
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||| | | |  ||||||||||  ||||||| |||||| || | |||  |||||| ||| | ||||    
T  16917102 agcagagatgagaatgttgcgttgactttgtggtaagactcggctggataggattaaaaatgacaacattagtgataaagttggggtagtaccgaaagta 16917201  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  16917202 gaaaagatggtgcaaactaggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcttgtagat-ttgtagtaaggagagtagatcagattgaggatagtcaaa 16917300  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    | |  | ||||||| |||||||||| ||| ||||  | ||||| || |   | ||||||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  16917301 tcactacaggtagaagaagacctagaaaagctataggtgaaactatcaaggaagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaac 16917400  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    | | || |  | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16917401 a-tttgactgcttttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataagacttggttattgtt 16917462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35643872 - 35643606
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa----tgga 197  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||         |||| ||| | ||||||     ||||    
T  35643872 tatagtagaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtag---------taaggagaatagatcaatcagctgga 35643782  T
Q  198 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 297  Q
    ||| |||||  |||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| ||||     
T  35643781 ggatagtcagattactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtt 35643682  T
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||  | | |  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35643681 tatgatagaacact--gccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttg 35643606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 149 - 369
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026058
Alignment:
Q  149 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 248  Q
    |||||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| |    
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaagaaaaccattagaaa 12025946  T
Q  249 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat---ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccact 345  Q
    |            ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||| || |||    
T  12025947 a------------gatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgtaaccgaccctact 12026034  T
Q  346 tagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    |||||| |||||| ||||||||||    
T  12026035 tagtggaataaggtttggttgttg 12026058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 243 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45041445 - 45041315
Alignment:
Q  243 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc 342  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||  || |||||||| |||||||||||||||| || |||    
T  45041445 tagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaa-tatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccc 45041347  T
Q  343 acttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45041346 acttagtgggataaggcttggttgttgatgtt 45041315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13172011 - 13171865
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || |||||| |||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  13172011 cagagatgagaatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggataggattagaaatgacaagattagagagagagttggggaagcacctatagtaga 13171912  T
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||    
T  13171911 aaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatataaagagaa 13171865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Original strand, 16351312 - 16351653
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||   ||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  16351312 gagatgaagatgttgcgttggatatgtggtaagactagacggaatagagttagaaatgacaacattagagagagaattagggtagcacctatagtagaaa 16351411  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
                 ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||  | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |     
T  16351412 c------------tagacttgggtggtttaggcatgtagagagaaaacttttggatcatgtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaagtcac 16351499  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
      ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||| ||   | |  |||| | | |||||||||||    
T  16351500 ttgagataggagaagacctagaaaaactattagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagtt-gagaaagacatggtttttaatagaacacta 16351598  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    |||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16351599 tggcatcgtttgattcatgtagacgaccccacttagtggaataaggcttggttgt 16351653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Original strand, 23492163 - 23492318
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| || ||| | | ||||||||||||  |||| || | |||||||||||||||||| |    
T  23492163 tagaggaagacctag-aaaactattagagaaactactcagaaag-atgtagcgattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtg 23492260  T
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23492261 tcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgtttgttgttgttg 23492318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 239 - 372
Target Start/End: Original strand, 25288912 - 25289045
Alignment:
Q  239 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 338  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||| || |||| ||    
T  25288912 ctataagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctga 25289011  T
Q  339 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25289012 ccccacctagtggtataaggcttggttgttgttg 25289045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 239 - 372
Target Start/End: Original strand, 25300247 - 25300380
Alignment:
Q  239 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 338  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| | | |||||||| ||||||| ||    
T  25300247 ctataagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctga 25300346  T
Q  339 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
     ||||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  25300347 ccccacctagtggaacaaggcttggtggttgttg 25300380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Original strand, 30748377 - 30748560
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||  |||||    
T  30748377 agcagatatgaggatgtttcgttggatgtgtggttagattagacatgataggattagaaatgacaacattacagagag-ttgt-ggtcgcaccagtagta 30748474  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaat 194  Q
    |||||| |||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||| | ||| ||||||||    
T  30748475 gaaaagatggtggaatcaaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctatagtaagcaaagtagatcaaat 30748560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35914754 - 35914601
Alignment:
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 319  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||  || | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||     
T  35914754 agaggaagacatagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgta 35914655  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35914654 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgt 35914601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 45512856 - 45512558
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| | | |||| |||| ||||| |  |||| |||||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  45512856 gagatgagaatgtttcgttggatgtgtggtaagactagatagg-tagggttagaaatgaaaatattaaagagagggagttggggtagcacctatagtaga 45512758  T
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 210  Q
    |||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    ||||| | || ||||| ||||| ||| | ||||  || |||||| |     
T  45512757 aaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaagatctctagattcggtagtaagcagagtagattagatggcagatagtcaaatc 45512658  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaaca 309  Q
    |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||| | |||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  45512657 actagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaaatatggtttatgatagaaca 45512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Original strand, 2216411 - 2216568
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || | |||||||||||| |||    
T  2216411 agaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactattaagaag-atttagagatcaatgagttggatcctaatatgtt-tatgatagaacattat 2216508  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     | || ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  2216509 agtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtgagataaggcttggtggttgttgt 2216568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6510784 - 6510616
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  6510784 gatgatgatgttgtgttggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaccattgaagagagagagcg--tagcacctataatagaaaag 6510687  T
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 185  Q
    ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||||||||    
T  6510686 ttggtagaaaacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaagagt 6510616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 5908564 - 5908930
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| ||   |||| |||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  5908564 gagatgaggctgctgccttggatgtgtttcaagactagacgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacctatagtagaaa 5908663  T
Q  113 agttggtagaaaa------taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    || |||| ||||       ||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||  ||||||  ||| ||||| ||||| |||||  |||||||  ||||    
T  5908664 agatggttgaaatggaaactagacttagttggtttgg--atatagagagaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcaggtggaggatggtca 5908761  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 306  Q
      | |  ||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||  |  | | ||||||||||||| |||| || | |||||||||    
T  5908762 gatcactagagacataggaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatccaaggattaatgagttggatcaaaatatgatttatgataga 5908861  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||  ||| |||| ||| |||||||||||  |  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5908862 accttattgcgtaattggatccatgtagttggacccaattagtggaataaggcttggttgttgttgttg 5908930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 7046285 - 7046434
Alignment:
Q  42 taagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||| |||  | ||||||| ||||||    
T  7046285 taagactagacatgataggattagaaatgacaacattagagagagaggctgggtagcaccaatcgtagaaaagatggtggaacctcggcttagctggttt 7046384  T
Q  142 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| | |||| ||||| ||||| |||||    
T  7046385 gggcatgtagagagaaaacacgtagcttctgtagtaaggagagtagatca 7046434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 375
Target Start/End: Original strand, 43733330 - 43733490
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||    |||||| ||||| | ||||||||||||  |||| || | |  |||||||||||||    
T  43733330 agaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactatcgagaaggatctagagattaatgagttggataaaaatgtgttttg-gatagaacactat 43733428  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43733429 ggcgtcgtttcattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtggctgttgttg 43733490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 284 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10668586 - 10668494
Alignment:
Q  284 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10668586 atccatatttggtgtacgatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 10668494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 12492206 - 12492130
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12492206 agcagatatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattagagaga 12492130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 301 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928584
Alignment:
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 1928584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 375
Target Start/End: Original strand, 28169514 - 28169675
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| || | ||    
T  28169514 aagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatatggtttatgataaaatatta 28169613  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||| || |||| |||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  28169614 tggtgtaattttatccatataaccaaccccacttagt-ggataaggcttggttgatgttgttg 28169675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 375
Target Start/End: Original strand, 42584407 - 42584642
Alignment:
Q  127 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaa 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||| |||   ||||  | ||||||||||||  ||    
T  42584407 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatgaaggtttgtcagatcaaaagaggtagataaa 42584506  T
Q  227 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 326  Q
    ||||||| |||||||| ||           ||||| || || |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  42584507 gacctagaaaaactataag-----------gaaag-atctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 42584594  T
Q  327 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  42584595 ct-tgtagccgaccccacttagtgggataagacttgattgttgttgttg 42584642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 175 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7531842 - 7531646
Alignment:
Q  175 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  | |  |||||||  || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  7531842 gtaaggagagtagatcagatggaggggagtcagatcactagaggtaagggtagacctagaaaaactatacgagaaactattaggaaggatctagagataa 7531743  T
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||   | |  |||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7531742 atgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttggttgttgtt 7531646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 122 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 9905132 - 9904940
Alignment:
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 221  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || | | |||||   | ||||||||||| | |||||||||||    
T  9905132 aaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgttgtagtaaaaaaa-tagatcacgggaaggagagtcaaatcaaaagaggtag 9905034  T
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 315  Q
    | |||||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||||||||  | ||||| ||||||| ||||  ||| ||||||| |||| |||||    
T  9905033 atgaagacctagaaaaactacaagagaaactattaataaagatttagaaattaatgatttggatcaaaataaggtttatgataaaacattatgg 9904940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30198425 - 30198264
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| | ||| | |||||||||||||  ||| |||| |||||||||| | |||    
T  30198425 agaggcagaggtagacttagaaaaactataagagaaattattaagaaagatattgagattaatgagttggatcggaatatggtttatgatagaatattat 30198326  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || ||  ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30198325 ggtgtagtttgatctatgttgccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 30198264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30812975 - 30812814
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||   ||||||  |||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||||||||||    
T  30812975 agaggtaggggtagacctagaaaaactatacaagaaactgttaggaaggatctagagataaatgagttggaaaaagacatggtttttgatagaacactat 30812876  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  30812875 ggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgttg 30812814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 299 - 375
Target Start/End: Original strand, 32276893 - 32276969
Alignment:
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32276893 atgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 32276969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 295 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32569788 - 32569708
Alignment:
Q  295 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32569788 gtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataagacttggttgttgttgttg 32569708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 274 - 370
Target Start/End: Original strand, 44699649 - 44699745
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44699649 aatgagttagaccgaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 44699745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 43 - 158
Target Start/End: Original strand, 9695583 - 9695698
Alignment:
Q  43 aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttg 142  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||    
T  9695583 aagactagacaggatagaattagaaatgacaacattatagagatatttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttg 9695682  T
Q  143 ggcatgtagagagaag 158  Q
    ||||||||||||||||    
T  9695683 ggcatgtagagagaag 9695698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 375
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716106
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagc--cgatcccacttagtgggataaggct 360  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |    ||||||||||||||||||||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagcgtcaccaccacttagtgggataaggct 31716091  T
Q  361 tggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||    
T  31716092 tggttgttgttgttg 31716106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39760788 - 39760572
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||  || |||||||||| |||    
T  39760788 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaggattagacaagataggagtagaaatgataacattagagacagagttgggttagcacctatcgta 39760689  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||   || |||| |    |||| |||||||||||| |||||| |||| | |||||| | ||  |||| ||||| ||||| |||||||  ||||||     
T  39760688 gaaaagaatgtggaaact----ttaggtggtttgggcatatagagaaaagagttgtagattccgtaataaggagagtagatcatatggagggtagtcaaa 39760593  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagac 229  Q
    |    ||||||||||||||||    
T  39760592 tcgctagaggtagaggaagac 39760572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44681387 - 44681252
Alignment:
Q  25 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 124  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  44681387 ttgcattggatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagacagttgtggtagcacctataatagaaaagatggtggaaa 44681288  T
Q  125 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  44681287 ataagcttagaaggtttggaaatctagagagaagac 44681252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12797011 - 12796912
Alignment:
Q  60 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||  ||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  12797011 gattaggaataacaccattagaaagag--tggaggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgcagagagaaga 12796914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 263 - 373
Target Start/End: Original strand, 26363660 - 26363768
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  26363660 atttagaggtcaa-gagttggatctaaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataagacttg 26363757  T
Q  363 gttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||    
T  26363758 gttgttgttgt 26363768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 229 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39967643 - 39967497
Alignment:
Q  229 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 328  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||| | | ||||||||||||  | || | || |||| ||||||| ||||||||  ||||||||    
T  39967643 cctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggattgagatatagtttatgttagaacattatggcgtagtttgatcc 39967544  T
Q  329 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  39967543 atgtagccgatcccacttattgtgataatgcttggttgttgttgttg 39967497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2518749 - 2518597
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |  |||||||||||  ||||||||||    
T  2518749 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcacctcaagtagaaaag 2518651  T
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
     |||| ||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  2518650 atggtggaaaataggtttaggtggtttgattatgtagagagaagacttgtagat 2518597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27556377 - 27556300
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  27556377 tatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggttaaagcttggttgttgttgttg 27556300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 30113557 - 30113416
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||| |||||| | | ||||  || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  30113557 gagatgagaatgttgtgctagatgtttgttaagaatagatatgataagattatgaatgacattattagagagagagtcggggtaacacatatagtagaaa 30113458  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    || |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  30113457 agatggtagaaaataggtttaattggtttgggcatatagaga 30113416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 25288820 - 25288916
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata 105  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25288820 agcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25288916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 25300155 - 25300251
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata 105  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25300155 agcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25300251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 213 - 372
Target Start/End: Original strand, 3801995 - 3802154
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||| |||||||||||| ||  ||||| |  ||||| || ||||  || |||||| |||| |||||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||    
T  3801995 aagatgtagaggaagacatacaaaaacaacaagagagactattatgaaagatttaaaggttaatgagttggattcaaacatggtatatgatcgaacacta 3802094  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||| || |||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3802095 tggagtaatttgattaatgtagtcgaacccatttagtgggataaggctttgttgttgttg 3802154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Original strand, 12611704 - 12611779
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611704 tatgttagaactttatggtgtcgtttgatccatgtagccgatcccaattagtgggataaggcttggttgttgttgt 12611779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15215631 - 15215556
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15215631 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgacaccattagagagagag 15215556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 284 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8255622 - 8255529
Alignment:
Q  284 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc--gatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8255622 atccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccgagacaccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 8255529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 239 - 372
Target Start/End: Original strand, 14459043 - 14459177
Alignment:
Q  239 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 338  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| || | |||| |||| |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  14459043 ctataagagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga 14459142  T
Q  339 -tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
      ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  14459143 cccccactttgtgggataagccttggttgttgttg 14459177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Original strand, 3473753 - 3473854
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||| ||| | |||||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3473753 aatgagttggaccggaatttggtttatgattgaatattatggcgaaatttaatccatttagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgttgt 3473852  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  3473853 tg 3473854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 374
Target Start/End: Original strand, 13589474 - 13589762
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||   |||||| |||||| |||||||  |||||||||||| | |||| |||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||| |||     
T  13589474 agagagagagttgaggtagcgcctataatagaaaatatggtagaaaatatgattaggtggtttgaacatgttgagagaagaccgatagatgttgtagtac 13589573  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    ||||||| ||| | |||||||| | |        |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| || | |||||    
T  13589574 gaagagtagattatatggaggacaat-------gaagaggtagatgaagacttagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttaaagattaatga 13589666  T
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| ||| |||| || | |   |||||||| |||||||  |||||||| |||||||| | || || |  || |||||| |||| |||||||||||    
T  13589667 gttgaatcaaaatatgattttaaatagaacaatatggcgcaatttgatctatgtagccaaccctacattatgagataagacttgattgttgttgtt 13589762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 376
Target Start/End: Original strand, 35323993 - 35324058
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35323993 tatgacgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 35324058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 321 - 369
Target Start/End: Original strand, 26055651 - 26055699
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26055651 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 26055699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Original strand, 36143287 - 36143480
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||   ||||||||||| || || |  |||||||||    |   |||||||||||||| |    
T  36143287 agcagagatgaggatgttgtgttggtcgtgtggtaagactagatgagataggattagaaaggaaaagattagagag----tcgaggtagcacctatagca 36143382  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||   ||||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||    
T  36143383 gaatagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatcaaatggaggatagtca 36143480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 372
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143622
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagtcggaaaaggcttggttgttgttg 36143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 30456575 - 30456441
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |   ||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||  | || ||||||||||||    
T  30456575 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagacca-atgggatagaattagaaatgacgacattagagagatagttcgagttgcacctatagta 30456477  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 144  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  30456476 gaaaagatggtagaaactagacttatgtggtttggg 30456441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35647005 - 35646930
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  35647005 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacttagtgtaacaaggcttggttgttgttgt 35646930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 220 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 38392046 - 38391919
Alignment:
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 319  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||| || || | ||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| | ||||||||     
T  38392046 agaggaagacctagaaaaactatatgagaaaccattaagaaagatctacagattaatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatggcgta 38391947  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccactta 347  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38391946 atttcatccatgtggccgatcccactta 38391919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41031473 - 41031418
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41031473 atttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 41031418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41031579 - 41031524
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41031579 atttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 41031524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42493668 - 42493536
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||| |||||   ||||||| ||||   ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  42493668 agcaaagatgaggatgttgcgttggttgtgtggtaagattagtcaagattggattgtaaatgacaacatt--ggagagagttggggtaacacctatagta 42493571  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg 143  Q
    |||||| | || |||| ||||||||| ||||||||    
T  42493570 gaaaagattgtggaaactaggcttaggtggtttgg 42493536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 302
Target Start/End: Original strand, 5266027 - 5266140
Alignment:
Q  188 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 287  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||  |||| || |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5266027 atcaaacggaggagagt-aagtcagaagaggtagagaaagacctagaaaaactatcatagaaatcattataatggatttggaggtcaatgagttgaatcc 5266125  T
Q  288 aaatttggtgtatga 302  Q
    |||||| || |||||    
T  5266126 aaatttagtttatga 5266140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10824441 - 10824331
Alignment:
Q  96 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatg 195  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||  |||||  ||| ||| | ||||| |||||||||    
T  10824441 agcacctaaagtagaaaagatggtcgaaaataggcttaggtggtttgggtatttagagaaaagactcatagattttgtagtatggagagtagatcaaatg 10824342  T
Q  196 gaggagagtca 206  Q
    ||||| |||||    
T  10824341 gaggatagtca 10824331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 326 - 375
Target Start/End: Original strand, 1064955 - 1065004
Alignment:
Q  326 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1064955 tccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1065004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Original strand, 21425229 - 21425330
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||| || | ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||| || || ||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  21425229 aatgagttggatcgaaatatgatttatgatagaccattatggcataatttgatccatgtagcagaccctacttagtggaatatggcttggttattgttgt 21425328  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  21425329 tg 21425330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 30689942 - 30690019
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  30689942 tatgatataacattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggtttttattgttg 30690019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30783400 - 30783041
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag-----agagagtgtgggtagca-cctatag 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||     |||||||  || ||||| |||||||    
T  30783400 gagatgaggatcttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagaggggagagagagttgggatagcaacctatag 30783301  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||| | ||| ||||   ||||||| | |||||||| |||||||| |||||  ||||||  ||| ||||  ||||| |||     |||||| |||||    
T  30783300 tagaaaaat-ggtggaaac--ggcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattttgtagtaaagagagtagat-----ggaggatagtca 30783209  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 305  Q
      | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||| ||| |||     
T  30783208 gatcactagaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaag-atctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataa 30783110  T
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| ||||  ||  |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  30783109 aacattatgaggtagtttgatccatgtagccgaccccatctagtgggataaaacttgactgttgttgtt 30783041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 39651090 - 39651025
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    ||||| || ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39651090 tatggtgtaatttgatccatatacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 39651025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 370
Target Start/End: Original strand, 1313771 - 1313843
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1313771 tatgatagaacattatggcgtaattttatccatgtagttgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 1313843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 13986416 - 13986536
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||  ||||  ||||||||||||| ||||| |||| || |  ||||||||||||||||| |||    
T  13986416 gagatgaggatgttacactggatgagtggtaatactagacgagatataattaggaatgacatcattaaagagggatttggggtagcacctatagtacaaa 13986515  T
Q  113 agttggtagaaaataggctta 133  Q
    |  ||||||||||||| ||||    
T  13986516 atatggtagaaaatagactta 13986536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Original strand, 14903689 - 14903845
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||  |||||||    |||||||| || | ||||  ||| |||||||| ||| ||||||||    
T  14903689 tagaggaagacctagaaaaactataagagagactattgggaaatatttagaaagtaatgagttagaccaaaataaggtttatgataggacattatggcgt 14903788  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     ||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||    
T  14903789 aatttgatccatgtagcttaccccacttagtggggaaaaacttggttgttgttgttg 14903845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 39051065 - 39051205
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||  || || |||||||  | |||||    
T  39051065 agatgaggatgttgtgttagatgtgtggtaagacaagacatgatagaattagaaatgacaatattcgagagagagttgggataacacctatcattgaaaa 39051164  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    | ||| ||||| | || |||| ||||||||| |||||||||    
T  39051165 gatggcagaaactcggtttaggtggtttgggtatgtagaga 39051205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 41212068 - 41212147
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta--gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41212068 tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatctatagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgttg 41212147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 43350827 - 43350728
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||    ||| || |||||||||| |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  43350827 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaact---tggtgtaatttgatccaagtagccgaccccgctaagtgggataaggcttggttgttgttgt 43350731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 36042407 - 36042482
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||||    
T  36042407 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagcggaccccaattaatgggaaaagatttggttgttgttgttg 36042482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38901892 - 38901817
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38901892 tgatataacactatggcggcatttgattcatgtagcggaccccatatagtgggataaggcttgattgttgttgttg 38901817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2776524 - 2776442
Alignment:
Q  79 agagagagag-tgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2776524 agagagagagctgggggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagac 2776442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18474239 - 18474173
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18474239 gtagcacctatagtagaaatgatggtggaaactaggcttagttggtttgagcatgtagagagaagac 18474173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 241
Target Start/End: Original strand, 25985462 - 25985668
Alignment:
Q  32 ggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 131  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  25985462 ggatgtgtggtaagacaagacaggatagaattagaaacgacaacattagagagag--ttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagact 25985559  T
Q  132 tagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacct 231  Q
    |   || ||| ||||||| ||||||||||  ||  ||  ||  ||||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  25985560 tgcgtgattttggcatgt-gagagaagacatgtgaattttgaagtaaggagactagatcagatgtaggggagtcaaatcactagaggtagaggaagacct 25985658  T
Q  232 aggaaaacta 241  Q
    || |||||||    
T  25985659 agaaaaacta 25985668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 28269840 - 28269759
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 293  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28269840 aaaagaggtatatgaagacctagaaaaattataagagaaactattagcaag-atttagaggttaatgagttggatccaaattt 28269759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 367
Target Start/End: Original strand, 18741843 - 18741908
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18741843 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 18741908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 367
Target Start/End: Original strand, 18746807 - 18746872
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18746807 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 18746872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 372
Target Start/End: Original strand, 36069774 - 36069883
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    |||||||| | |||||||||| |  |||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||| |||||    
T  36069774 atttagagattaatgagttgggtagaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatccatatagccaaacccacttactggaataatgcttg 36069873  T
Q  363 gttgttgttg 372  Q
     |||||||||    
T  36069874 attgttgttg 36069883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 375
Target Start/End: Original strand, 39388907 - 39389070
Alignment:
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg---tgtatgatagaacact 311  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||| ||||| | ||||||||||||  ||||  |    | | || ||||| | |    
T  39388907 aggtagaggaggacctagaaaaactataaagagaaactattaggaaagatctagagattaatgagttggatagaaataagaaactatttggtagaagatt 39389006  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39389007 atggcgtcgtttgatccatgtggccaaccccacttagtgggataaagcttggtttttgttgttg 39389070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41444501 - 41444337
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctag--gaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 310  Q
    ||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||| | |||| ||| |||| |||| |||| ||||||| ||||     
T  41444501 agaggcagaggaagacctagaaaaaaactataagagaaactattaagaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataacat 41444402  T
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||   ||| |||||| |||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  41444401 tacaacgtaatttgaaccatgtagccaaacccacttaatggaataatgcttggtcgttgttgttg 41444337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 322 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4558259 - 4558207
Alignment:
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4558259 ttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 4558207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16994602 - 16994442
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 314  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||||||||| | | ||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||    
T  16994602 gaggaagaggaagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaatgatttagagattattgagttggattgagatatgatgtataatagaacgttatg 16994503  T
Q  315 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
      ||  |||| | ||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||    
T  16994502 atgttgtttggtacatgtagccgaacccacttagtcagataaagcttggttgtcgttgttg 16994442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17491805 - 17491689
Alignment:
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 321  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||  || || || ||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||       
T  17491805 aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaagacttggagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtatg 17491706  T
Q  322 ttgatccatgtagccga 338  Q
    |||||||||||||||||    
T  17491705 ttgatccatgtagccga 17491689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18474045 - 18473973
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||| |||| | || |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18474045 tgatagaacattatgacttcgtttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttg 18473973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 375
Target Start/End: Original strand, 79156 - 79310
Alignment:
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 319  Q
    |||||||| | ||| || ||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||| |||||  |||| |||  | ||||||||||  ||||||||    
T  79156 agaggaaggcttagaaacactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagctggatagaaatatggcctgtgatagaacataatggcgtc 79255  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     ||||||||||||| |||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||||    
T  79256 gtttgatccatgtacccgaccccacttagtgtactaaggctt-gttgttgttgttg 79310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Original strand, 12985919 - 12985974
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12985919 atttgatccatgaagccgagcccatttagcgggataaggcttggttgttgttgttg 12985974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 373
Target Start/End: Original strand, 23023351 - 23023509
Alignment:
Q  217 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||  || ||| || || | ||||||||||||   ||  || | |||||||||| | |||| |    
T  23023351 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactactaagaaagatctacagattaatgagttggataggaacatgatatatgatagaatattatgac 23023450  T
Q  317 gtcatttgatccatgtagccgatcccact--tagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| || ||||||| ||||||    
T  23023451 gtcgtttgatccatgtaaccgaccccacttatagtgggatatggtttggttgatgttgt 23023509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Original strand, 31309583 - 31309638
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31309583 tttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttgttgc 31309638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35085186 - 35085135
Alignment:
Q  324 gatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  35085186 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataagggttagttgttgttgttg 35085135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40982949 - 40982894
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40982949 atttgatccatgttgccgaccccatttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 40982894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 206
Target Start/End: Original strand, 44373740 - 44373891
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||     
T  44373740 gataggattagaaatgaaaatattagagtgagagttggagtagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggcttgagtggtttgagcatgtagagt 44373839  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
     |||||   |||||  ||| ||||  ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  44373840 aaagacctatagattttgtagtaaagagagtagatcaaatagaggatagtca 44373891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45512506 - 45512443
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  45512506 tatggcataatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggatgaggcttggttgttgctgtt 45512443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 160
Target Start/End: Original strand, 78988 - 79112
Alignment:
Q  39 tggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata---ggcttaga 135  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||  |  ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||   |||||||     
T  78988 tggtaagactagacgggataggattagaaacaacaacattagagagagcattcgggtaacacctacagtagaaatgatggtagaaattactaggcttagg 79087  T
Q  136 tggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  79088 tggtttgggcatgtatagagaagac 79112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10824288 - 10824186
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| ||||| | |||| |||| | |||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10824288 aatgaattggaccaaaatatggtttttgatagaacattatgaagtaagttgatccatgtagccgaccccgcctagtcggaaaaggcttggttgttgttgt 10824189  T
Q  374 tgc 376  Q
    |||    
T  10824188 tgc 10824186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16035822 - 16035744
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 356  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| ||||||| |||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||    
T  16035822 agttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggataa 16035744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Original strand, 24837934 - 24837975
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24837934 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 24837975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Original strand, 30980058 - 30980099
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30980058 tagccgatcccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgt 30980099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 373
Target Start/End: Original strand, 4061897 - 4061945
Alignment:
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4061897 atccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgt 4061945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Original strand, 9695815 - 9695867
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9695815 tttgatccatgtaaccgaccccgcttagtgggataaggcttgattgttgttgt 9695867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 323 - 375
Target Start/End: Original strand, 16921451 - 16921503
Alignment:
Q  323 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16921451 tgatccatgtagccgaccgtacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 16921503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25985880 - 25985813
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  25985880 gggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactta-ttggtttgtgcatttagagagaagac 25985813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41444607 - 41444547
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 152  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  41444607 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41972134 - 41971991
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||   | ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  |  ||||| |||||| ||||||||    
T  41972134 gagatgaggatgttgtattggatgtgtgataagattaatga-gatagaattagaaatgagaatattagagagag--ttagggtaacaccta-agtagaaa 41972039  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    || |||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41972038 agatggtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagagaagac 41971991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2518471 - 2518400
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  2518471 tgatagaacattatggcataatttgatccttgtagctgaccccacttagtaagataaggtttggttgttgtt 2518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 269 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3464274 - 3464172
Alignment:
Q  269 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    |||||||||||||||| |||||| |  | |||||||||||| |||||  |  |||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  3464274 aggtcaatgagttgga-ccaaatataatttatgatagaacattatggtatagtttgatccatatagtcgattccacttaatgggataagacttgattgtt 3464176  T
Q  369 gttg 372  Q
    ||||    
T  3464175 gttg 3464172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Original strand, 5057596 - 5057651
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  5057596 tttgatccatgtaactgatcctacttagtgggataaggcttgattgttattgttgc 5057651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Original strand, 9842361 - 9842404
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9842361 tagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgttgttg 9842404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12692310 - 12692239
Alignment:
Q  303 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||| |||| |||| ||| ||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12692310 tagaacattatgccgtcgtttaatccacgcagccgattccaattagtgggataaggcttggttgtttttgtt 12692239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 321 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14742890 - 14742847
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 364  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14742890 tttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggt 14742847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16918529 - 16918494
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16918529 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 16918494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 237 - 296
Target Start/End: Original strand, 25439471 - 25439530
Alignment:
Q  237 aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 296  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  25439471 aactataagagaaaccattcgaaaggatttagagatcaatgagttggattcaaatatggt 25439530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Original strand, 32978115 - 32978158
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32978115 tagccgacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32978158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1549443 - 1549389
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  1549443 tttgatccatgtaacggaccccacttagtgggatatggcttggtggttgttgttg 1549389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 4955335 - 4955473
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 334  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||| || |||||  | |||||||| |||  |||| || | ||| ||| |||| || | ||| |||||||  ||||||    
T  4955335 aaaattattagagaaactattaaaaaagacttagaaattaatgagtttgatttaaatatgatttataataaaacattacgacgtaatttgatttatgtag 4955434  T
Q  335 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4955435 tcgatctcacttagtgagataaggtttggttgttgttgt 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Original strand, 16252860 - 16252930
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 86  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16252860 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgagataaaattagaaatgacaacattagagagag 16252930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 197 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24399965 - 24399788
Alignment:
Q  197 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 296  Q
    |||| |||||| |||  ||||| |||| || || ||| |||| ||| |||||||| ||||  |||||| | ||| | ||||||||||||  |||| ||||    
T  24399965 aggatagtcaaattactagaggcagagcaaaacttagaaaaattataagagaaactattaagaaggatctcgagattaatgagttggattgaaatatggt 24399866  T
Q  297 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     |||||||||| | ||||  |||||||| || |||||||| | | |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||    
T  24399865 ttatgatagaatattatgatgtcatttgttctatgtagccaaccacacttagtggaataa-gtttggttgttgtagttg 24399788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Original strand, 30748646 - 30748748
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||  |||| || | ||| || ||||| ||||  ||||||||||||||||||| || |||||| || ||| |||| ||| |||||||||||    
T  30748646 aatgagttggatagaaatatgatatataattgaacattatgatgtcatttgatccatgtagctgaccccactaagcgggttaagacttagttgttgttgt 30748745  T
Q  374 tgc 376  Q
    |||    
T  30748746 tgc 30748748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 38178479 - 38178377
Alignment:
Q  154 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaa 253  Q
    |||||||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  38178479 agaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcgctagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaacta 38178380  T
Q  254 tta 256  Q
    |||    
T  38178379 tta 38178377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3079850 - 3079609
Alignment:
Q  125 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 224  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   | |||  |||| |||| | ||| ||||| ||| ||| |||| || | |  ||||||| |||    
T  3079850 ataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacctat-gattttgtgataaggaaagtagatcagatgaaggggagtgaaatcactagaggtaaagg 3079752  T
Q  225 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttg 324  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||| ||||  || ||| | | | |  ||||||||||| || || |||| | ||||||| || ||||  ||  ||||    
T  3079751 aagacctag-ataactataagagaaactattaagaaagatctggggattgatgagttggatacacatatggtatttgataga-cattatgaagtggtttg 3079654  T
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  3079653 atccatgtagccga-cccacttaatgggacatggcttggttgttgt 3079609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 338 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 5030451 - 5030418
Alignment:
Q  338 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5030451 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 5030418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33666814 - 33666726
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca 146  Q
    |||||||||| ||||||||   | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||    
T  33666814 gataggattaagaatgaca---taagagagagagttggggtagcacctatcgtagaaaagatggtagaaactctacttaaatggtttgggca 33666726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 35320472 - 35320399
Alignment:
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||| |||||| | |||| ||  ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  35320472 gatagaacattatggcttaatttaattaatgtagctgaccccacttagtgggataaagcttggttattgttgtt 35320399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 369
Target Start/End: Original strand, 39702163 - 39702232
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||| | || ||||||||||||  |||||||||||    
T  39702163 tgatagaacattatggtatcatttgatctatgtagccgaccacatttagtgggataaaacttggttgttg 39702232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42493501 - 42493428
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| |||||||| || ||||||| |||||||| | |||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  42493501 atagaaaactatggcatcgtttgatctatgtagccaaccccatttagtaggacaaggcttggttgttggtgttg 42493428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 1070279 - 1070343
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||| ||| | |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  1070279 tatggcatcatttgatccatgtagctaatctcacctggtgggataagacttgattgttgttgttg 1070343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3638387 - 3638335
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3638387 tttgttccatggagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgatgttgt 3638335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5810353 - 5810277
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||  |||| | || || ||||||||||||| | | |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5810353 tatgatagaactttatgtcatcgttcgatccatgtagccaacctcacttaatgggatgaggcttggttgttgttgtt 5810277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16971824 - 16971772
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  16971824 tttgatccatgtagccgacccaatttagtgggattaggcttcgttgttgttgt 16971772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18742122 - 18742034
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  18742122 aatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggatatggcttg 18742034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 18747086 - 18746998
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  18747086 aatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggatatggcttg 18746998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Original strand, 29735728 - 29735804
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacacca-ttagagagagag 88  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||  || || |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  29735728 gagatgaggatgttgtgttggatgaatggtaagactagacgagaaagaattaagaataacaccatttagagagagag 29735804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 33828116 - 33827816
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||| | |||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||  ||||| || ||||||||  |||    
T  33828116 agatgaggatgttgtgttggatgtctagtaaaactagataagataagactagaaatgacaacattatagagatagttggggtaacaactatagtattaaa 33828017  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
      | || ||||| | |||||| || |||| |||| |||||| |||||  ||||||    | |||||| |||| |||||||| || || |   |  ||| |    
T  33828016 tattgtggaaaacatgcttaggtgatttgagcatatagagataagacgtgtagatttcatagtaagatgagtagatcaaatagaagataaaaagattaca 33827917  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    |||||||  ||||||| ||  |||||||| |||||||| |||| |||  ||||| || | ||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  33827916 agaggtacgggaagacgtataaaaactataagagaaactattaaaaaatatttatagattaatgaattggatctaaatatggtttatgatagaacaatat 33827817  T
Q  314 g 314  Q
    |    
T  33827816 g 33827816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Original strand, 36069570 - 36069638
Alignment:
Q  18 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 86  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  36069570 gaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaacgacaacattagagagag 36069638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 371
Target Start/End: Original strand, 1335555 - 1335606
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  1335555 atttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataggacttagttgttgtt 1335606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 158
Target Start/End: Original strand, 6483245 - 6483324
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 158  Q
    |||||||||||  |||||||   |||||||||||||  ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6483245 agagagagagttggggtagctggtatagtagaaaagagggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagggaag 6483324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 134
Target Start/End: Original strand, 7103274 - 7103313
Alignment:
Q  95 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7103274 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactaggcttag 7103313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 206
Target Start/End: Original strand, 11733711 - 11733862
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  || || |||||||  ||||| || |||| |||| |||  |||  |||||||  | ||| ||||    
T  11733711 gataggattagaaatgacaacattagagaaagagttgggataacacctatgatagaatagatggtggaaactagagttaagtggtttgatcttgttgaga 11733810  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| |||||  ||||||| |||||    
T  11733811 gaagatttgtagatgttgtagtaaggagagtagatcacgtggaggatagtca 11733862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16008428 - 16008393
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16008428 cccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 16008393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 369
Target Start/End: Original strand, 16715480 - 16715551
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16715480 tatgatagaacattatggcggtgtttgatccacgtagccgaccctgcttagtgggattaggcttgattgttg 16715551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 372
Target Start/End: Original strand, 27037761 - 27037915
Alignment:
Q  217 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || |||| ||||| || ||| || || | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||| | ||||||    
T  27037761 ggtagagaaagacctagtaaaactatacgataaactattaggaaagatataaagattaatgagttggatagaaatatggtatttgatagaatattatggc 27037860  T
Q  317 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||  |||||||||||  | |   ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  27037861 gttttttgatccatg-ggacagccccacttagtgagatagggctttgttgttgttg 27037915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 154
Target Start/End: Original strand, 34196064 - 34196135
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  34196064 agagagttggggtagcacctatagtagaaaaaacagtagaaactagacttatgtggtttgggcatgtagaga 34196135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 375
Target Start/End: Original strand, 4011484 - 4011530
Alignment:
Q  329 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4011484 atgtagccgaccccactaagtgggataaggcttagttgtttttgttg 4011530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5127377 - 5127299
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc-ttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||| ||||||| |  | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5127377 tatgatagaacattacggcgtaatttgacccatgtaactaaccccacttggtgggataaggctttggtggttgttgttg 5127299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 371
Target Start/End: Original strand, 5205413 - 5205455
Alignment:
Q  329 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5205413 atgtaggcgaccccacttagtgggataagacttggttgttgtt 5205455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Original strand, 14744522 - 14744564
Alignment:
Q  332 tagccgatcccactt-agtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14744522 tagccgaccccactttagtgggataaggcttggttgttgttgt 14744564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
Target Start/End: Original strand, 25439394 - 25439460
Alignment:
Q  18 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 84  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||   ||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  25439394 gaggatgttgcgctggattagtggtaagactagatgagataggaataggaacgataccattagagag 25439460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 368
Target Start/End: Original strand, 26639233 - 26639303
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    ||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||| |||| || |||||||| |||| | ||||||||||    
T  26639233 tatgatagatcattatggtgtcgtttgatccatgtatccgacccaacttagtgagatatgacttggttgtt 26639303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 98 - 160
Target Start/End: Original strand, 29645044 - 29645106
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  29645044 cacctatagtataaaagatggtggaaaataggtttaattggtttggacatgtaaagagaagac 29645106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 300 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30456367 - 30456329
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 338  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  30456367 tgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccga 30456329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 329 - 375
Target Start/End: Original strand, 39049825 - 39049871
Alignment:
Q  329 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  39049825 atgtagccgaccccacttagtgggataaagctttattgttgttgttg 39049871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 373
Target Start/End: Original strand, 2938342 - 2938375
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2938342 cccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgt 2938375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 23023231 - 23023312
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| | |||||   |||||||||||||||    
T  23023231 agagagagagttcgggtagcacttattgtagaaaagatgggggaaactaggcttaggtagtttgattatgtagagagaagac 23023312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 373
Target Start/End: Original strand, 25439552 - 25439585
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25439552 cccacttagtgggatatggcttggttgttgttgt 25439585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27449224 - 27449183
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27449224 tagccgaccccacttagtgggataaagcttggctgttgttgt 27449183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32838924 - 32838891
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32838924 cccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 32838891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Original strand, 33076295 - 33076408
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||| | ||||||||| | | |||| |||| ||| |||||| | ||||  || |||||||||||||||     ||||||||||||||||||  ||    
T  33076295 gatttagagattaatgagttgtaccaaaatatggtttataatagaatattatgatgtaatttgatccatgtagttatccccacttagtgggataagattt 33076394  T
Q  362 ggttgttgttgttg 375  Q
    | ||||||||||||    
T  33076395 gattgttgttgttg 33076408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40640650 - 40640609
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  40640650 tagccgagcccacttagttggataagtcttggttgttgttgt 40640609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 333 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 41604697 - 41604656
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41604697 agccgaccccgcttagtggggtaaggcttggttgttgttgtt 41604656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 106)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 28085294 - 28085660
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28085294 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 28085393  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28085394 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaag 28085493  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28085494 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 28085593  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28085594 actatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28085660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 32755837 - 32756205
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatag 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  32755837 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 32755936  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32755937 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggagagtca 32756036  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32756037 agttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 32756136  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  32756137 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggggtaagacttggatgttgttgttg 32756205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 370
Target Start/End: Original strand, 30031178 - 30031535
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30031178 gagatgaggttgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagagggagtgggggtagcacctatagtagaaa 30031277  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30031278 agttggtagaaaataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 30031377  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  30031378 aagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatagaacacta 30031477  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30031478 tggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 30031535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5258506 - 5258146
Alignment:
Q  17 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaag 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  5258506 tgagaatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 5258407  T
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5258406 ttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaa 5258307  T
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 314  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||||  |||||||||    
T  5258306 gaggtagagaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatccaaatatggtttttgattaaacactatg 5258207  T
Q  315 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5258206 gcgtcatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgttgttg 5258146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35043801 - 35043441
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  35043801 gagatgaagatgttgcgctggatgattggtaagattagacatgataggattatgaatgacaccattagagggagagtgagggtagtacctaaagtagaaa 35043702  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  35043701 agttggttgaaaataggcttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtcaggttaa 35043602  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  35043601 aagaagtagatgaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 35043502  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || |||||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  35043501 tgacgtcatttgatcaatgtagctgatcccacttaaagagataaggcttggttgttgttgt 35043441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Original strand, 608081 - 608442
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  608081 gagatgaggatgttccgttggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtatcacctatagtagaaa 608178  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  608179 agttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaa 608278  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctag----gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||| || |||||||||     |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||     
T  608279 aagaggttgatgaagacctaattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaat 608378  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  608379 actatgacgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttg 608442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 9706698 - 9707052
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  9706698 gagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctattgtagaaa 9706797  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||   |||| || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  9706798 agttggtagaaaataggcttagatggtttg------tagagagaagacccatagaagccgttgttagaagagtagatcaaatggagaagagtcaggttaa 9706891  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||||  |||||  ||| | |||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  9706892 aagaggtacgggaagggctaagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 9706991  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9706992 tggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 9707052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20427996 - 20427634
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20427996 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 20427897  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||| || |||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||     
T  20427896 agttggtagaaaataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaaatcaaatagaggggagtcaggttac 20427797  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||||    
T  20427796 aagaggttgaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaa-aatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaatacta 20427698  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat-aaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20427697 tggcgacatttaatcaatgtagccgacccgacttagtgggataaagacttggttgttgttgttg 20427634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 63 - 375
Target Start/End: Original strand, 12890556 - 12890859
Alignment:
Q  63 taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacta 162  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |            
T  12890556 taggaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgtaccca-------- 12890647  T
Q  163 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 262  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12890648 -tagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaagg 12890746  T
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12890747 atttagacgtcaatgagttagatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 12890846  T
Q  363 gttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||    
T  12890847 gttgttgttgttg 12890859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9594072 - 9593709
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtg------ggtagcacctatag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |      |||||||||  |||    
T  9594072 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcaccattag 9593973  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9593972 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagtca 9593873  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 306  Q
    | |   ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  9593872 aat--caagaggtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggtttatgataga 9593775  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||| ||||  || ||||||||||| |||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9593774 acattatg--gtaatttgatccatatagctgaccacacttagtggcataaggcttggttgttgttgtt 9593709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 333
Target Start/End: Original strand, 5631741 - 5632064
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagtag 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5631741 agatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtaacacctatagtag 5631840  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |    
T  5631841 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcagat 5631940  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 309  Q
    ||||||||  | |||||||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  5631941 taaaagagacaaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataaca 5632040  T
Q  310 ctatggcgtcatttgatccatgta 333  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  5632041 ctatgacgtcatttgatccatgta 5632064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 14030724 - 14031079
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggt-aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14030724 agcagagatgaggatgttgcgatggatgagtggttaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagtgggggtagcacctatagt 14030823  T
Q  108 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||      
T  14030824 agaaaagttggtagataataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagtggagagtcgg 14030923  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||           ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| || | | ||||||||    
T  14030924 attaaaagaggtagaggaagaccta-----------agaaaaac-attagaaaagatttagaggtcaatgggttagatccaaatatgatttttgatagaa 14031011  T
Q  308 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     |||||  ||||||||||||||| || |||| || | |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  14031012 tactataacgtcatttgatccatataaccgaccctatttagtgggataaagtttggttgttgttgttg 14031079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 37 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21352171 - 21351837
Alignment:
Q  37 agtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagat 136  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21352171 agtggtaagactagatatgataggattaggaataacatcgttagagagag--tggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagat 21352074  T
Q  137 ggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaa 236  Q
    | ||||| ||||||||||||||||  || |||||  | || |||||| | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21352073 gatttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttagaagaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaa 21351974  T
Q  237 aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagcc 336  Q
    ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || | | ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  21351973 aaccaatagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagcc 21351874  T
Q  337 gatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || | || |||||| |||||| ||| || ||||||||    
T  21351873 gacctcagttagtgagataagacttcgtcgttgttgt 21351837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10100217 - 10099987
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||||||    
T  10100217 gagatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtcgcacatatagtagaaa 10100120  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||    
T  10100119 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaa 10100020  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10100019 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 10099987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 102 - 375
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679680
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||  || ||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  202 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 301  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||          |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  30679517 agtcaagttataagaggtataggaagac----------tattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataagacttggttgttgttgttg 30679680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 214 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143763
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34143825  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34143824 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttg 34143763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 214 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156379
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34156441  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34156440 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgttg 34156379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 93 - 330
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497198
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||  |||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacc-gtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33497062 aatgaaggag--tcaagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  292 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccat 330  Q
     || | ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgatccat 33497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28027189 - 28026827
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  28027189 agcagagacgaggatgttatgttggatgagtggtaagactagatggcataggattaggaatgacgtcgttagatagagaatg-gggtagcacctatagta 28027091  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || ||  |||||||| || ||| |||||||  |||| ||||||||||||||      
T  28027090 gaaaatgtggtagaaaataggcttgg-tggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatcagatggaggagagtcaga 28026992  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||  || |||||| |||| ||||| ||| || ||||| |||| ||||||  |||    
T  28026991 ttagaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaatatggtttatgat--aac 28026894  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt-gggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | || ||||| |||||| | |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  28026893 attacggcgtaatttga-caatgtagccgaccccacttattgggggtaaggcttgcttgttgttgttg 28026827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 261 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34934942 - 34934830
Alignment:
Q  261 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34934942 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 34934843  T
Q  361 tggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||    
T  34934842 tggttgttgttgt 34934830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 259 - 375
Target Start/End: Original strand, 31818999 - 31819115
Alignment:
Q  259 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31818999 aagggtttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatg 31819098  T
Q  359 cttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| |||||||    
T  31819099 cttggttgtggttgttg 31819115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 213 - 373
Target Start/End: Original strand, 5095956 - 5096116
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||| || ||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||    
T  5095956 aagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacatta 5096055  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5096056 tggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaggtttggttgttgttgt 5096116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6056123 - 6055806
Alignment:
Q  20 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt-tgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||   |      
T  6056123 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaaatta 6056026  T
Q  119 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagagg 218  Q
    ||| ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||   || ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||| |||    
T  6056025 taggaaataggttttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtgcaaatagtagatcagatggaagagagtcaaataaaaaaagg 6055926  T
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 318  Q
    ||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||||||| || | |||    
T  6055925 tagaggaagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgt 6055826  T
Q  319 catttgatccatgtagccga 338  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  6055825 aatttgatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 268
Target Start/End: Original strand, 7133795 - 7133923
Alignment:
Q  140 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 239  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7133795 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7133894  T
Q  240 tattagagaaacaattagaaaggatttag 268  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7133895 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 268
Target Start/End: Original strand, 7136718 - 7136846
Alignment:
Q  140 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 239  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7136718 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7136817  T
Q  240 tattagagaaacaattagaaaggatttag 268  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7136818 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7136846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 163 - 334
Target Start/End: Original strand, 5080912 - 5081083
Alignment:
Q  163 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||      
T  5080912 gtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcattcaaaatt 5081011  T
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 334  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5081012 atttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgtag 5081083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 254 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206457
Alignment:
Q  254 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 353  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3206479  T
Q  354 taaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||| |||||||||    
T  3206478 taagacttggttattgttgttg 3206457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 214 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34503
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| || || | ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||| |||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 34565  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34564 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 34503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 97 - 373
Target Start/End: Original strand, 2689646 - 2689915
Alignment:
Q  97 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 196  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||| || |    
T  2689646 gcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatag 2689745  T
Q  197 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt 296  Q
    || ||||||| || |||||||||      |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| ||||| | ||    
T  2689746 agtagagtcatgtcaaaagaggt------agacctagaaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcagcgaattggatgcaaatattgt 2689839  T
Q  297 gtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||| |||||| |||||| ||| ||||||| ||| ||  ||| |  |||||||  ||||| | ||||||||||||||    
T  2689840 ttat-atagaatactatgacgtaatttgattcatataatcgaccttacttagtatgataatgtttggttgttgttgt 2689915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 5080777 - 5080888
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5080777 gagatgaggatgttgcgctggataactggtaagattagacataataagattaggaatgacaccattagagaacgagtgggggtatcacctatagtagaaa 5080876  T
Q  113 agttggtagaaa 124  Q
    ||||||||||||    
T  5080877 agttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 242 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10099025 - 10098894
Alignment:
Q  242 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcc 341  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||| ||    
T  10099025 ttagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgtaatcgaccc 10098928  T
Q  342 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  10098927 cacttagtgggataagacttgattgttgttgttg 10098894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 373
Target Start/End: Original strand, 31818533 - 31818813
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||||||||||  || ||| |||  ||||| | ||| |||||    
T  31818533 gggtagcacctatagtacaaaaaatggtggaaaatagacttaggtggttttg-catgatgagagaagacctgttgattctgcagtaaggaaagtagatca 31818631  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
     |||||||  ||| |  | |  | ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||| | ||||||||||||| || |    
T  31818632 tatggagggtagtgagatcactaaaggtaggagaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagt 31818731  T
Q  292 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  31818732 atggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagcgggaaaaagcttggttgttgttgt 31818813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10617586 - 10617232
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||   |||| ||||| |||||||     |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  10617586 agagatgaggat-ttgcgttggatgtgtgttaagactagacgaaatagaattagaaatgaca-----agagcgagagttggggtagcacttatagtagaa 10617493  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    |||  | |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  || | | |||   |||| |||||  |||||||||||| ||||||| | |    
T  10617492 aagacg-tagaaactagacttaggtggtttgagcatgtagaaagaagacctgtggtttctgcattaaggagagt--atcaaatggaggggagtcaaatca 10617396  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
      ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||||||||    
T  10617395 ctagaggtagaagaaaacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacact 10617296  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     ||||||  ||||||  |||||||||  |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  10617295 ttggcgttgtttgatttatgtagccggccccacttagtgggatccggcttggtggttgttgttg 10617232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 33083976 - 33084127
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   ||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  33083976 agcagaaatgaggatgctgcgttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacgatattagagagagagttggggtagcacctatggta 33084075  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33084076 gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 33084127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 229
Target Start/End: Original strand, 26291700 - 26291917
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtag-cacctatagtag 109  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||  |||||| |||||||| |||    
T  26291700 gagatgatgatgttgtgttgaatgtgtggtaagtctagacttgatagtattaggaatgatactattagagatagagagttagggtagacacctataatag 26291799  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 209  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||| |||| ||||| ||||||||||||    |    
T  26291800 aaaatatggtagaaaatagacttaggtggttt--gcatgtagagagaagacttatagatgttgcagtaagatgagtagatcagatggaggagagtgtgat 26291897  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagac 229  Q
     |||||| ||||||||||||    
T  26291898 caaaagacgtagaggaagac 26291917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 338
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24666058
Alignment:
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga-tgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 197  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| ||| |    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagatttttgtagtaaggagagtagatcagatgaa 24665917  T
Q  198 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 297  Q
    | | ||||   | |  ||||| |||||||| | ||| | |||||  |||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  24665918 gcatagtcggatcaccagaggcagaggaagtcatagaataactacaagagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtt 24666017  T
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga 338  Q
    |||||||||||| |||| | | ||||||||  |||||||||    
T  24666018 tatgatagaacattatgacttaatttgatctgtgtagccga 24666058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30789147 - 30789076
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30789147 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttggttgttgtt 30789076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 253 - 375
Target Start/End: Original strand, 5897619 - 5897741
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 352  Q
    |||||||| ||||||||  | |||| |||||||| |||| |||| |||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5897619 attagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttagtggg 5897718  T
Q  353 ataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  5897719 ataaggcttgattgttgttgttg 5897741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 9568588 - 9568750
Alignment:
Q  19 aggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagtt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |  |||||   |||||||| ||||||||||||| |    
T  9568588 aggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgatagaattataaatgacaacattagagcgccagtgttgaggtagcacttatagtagaaaagat 9568687  T
Q  117 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaag 179  Q
    | | |||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||  |||||||||    
T  9568688 gatggaaaatggacttagatggtttgggcaactagagggaagacatgtagattatgtggtaag 9568750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 295 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1615301 - 1615223
Alignment:
Q  295 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1615301 gtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttgt 1615223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 374
Target Start/End: Original strand, 8364679 - 8364839
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||  | ||| |||||||   |||  |||| |||||||||||| |||    
T  8364679 agaggaagatgaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattat 8364778  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  8364779 ggcgtaatttgatccatgtagccgaccccgcttagtgggaaaaggctttattgttgttgtt 8364839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 375
Target Start/End: Original strand, 579465 - 579702
Alignment:
Q  138 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 237  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  | | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||   | |  ||||| |||| |||||||   |||    
T  579465 gtttgagcatgtagagagaaggcttgtagattatatagtaaggagagttgatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagagaaagacctcaaaaa 579564  T
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccg 337  Q
    ||| | |||||||| ||||  || ||| ||||  | | ||| ||| ||| |||| |||| | |||  ||| | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  579565 actgtaagagaaactattaagaaagatatagaaattagtgacttgaatcaaaatatggtttctgaaggaaaattatggcgtaatttgatctatgtagccg 579664  T
Q  338 atcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  579665 atcccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 579702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 81 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7513683 - 7513387
Alignment:
Q  81 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga-ctagtagatgctgtggtaag 179  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| | |||||| | |  || |||  ||| |||||    
T  7513683 agagagagttcggggagcacctataatagaaaagatggtagaacctagacttaggtggtttgggcatgcaaagagaaaaacccgtggattatgtagtaag 7513584  T
Q  180 aagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg-aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    ||||||  |||| || |||| ||||||| | |  ||||| || || ||||||| |  ||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||| | |||||    
T  7513583 aagagtcaatcagattgaggggagtcaaatcactagaggcagggggaagacctggataaactataagagaaacttttaggaaggatctagagatgaatga 7513484  T
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||   | |  |||| | |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||||| |  ||| |||||||||||||| ||||||    
T  7513483 gttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagctgatctcacttggcaggacaaggcttggttgtttttgttg 7513387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 371
Target Start/End: Original strand, 7492551 - 7492669
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 352  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||| |  ||||||||| ||| |||| |||||  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  7492551 attaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtggg 7492650  T
Q  353 ataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  7492651 ataaggattggttgttgtt 7492669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 279 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4245966 - 4245870
Alignment:
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||  |||| |||| | |||||||||| |||| | || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4245966 gttggataaaaatatggtatttgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgttg 4245870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12119714 - 12119642
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccc-acttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12119714 atagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 12119642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12134001 - 12133901
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||| || |  || |||||||| |||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  12134001 aatgagttggatcgaaatgtgattcataatagaacattatggcataatctgatccatgtagccgaccccacttagtgagaaaaggcttggttgttgttgt 12133902  T
Q  374 t 374  Q
    |    
T  12133901 t 12133901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 33998368 - 33998288
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt 89  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  33998368 agcagagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataggattagaaatgactacattagagagagagt 33998288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 38980 - 39055
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38980 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgagtccactaagtgggataaggctcggttgttgttgttg 39055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25494210 - 25493972
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggt-aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   |||| |||||| |||| || ||||  || || |||  ||||||||||||||||| ||    
T  25494210 gagatggggatgttgcgttggatgtgtggtgaatattagatgggataagattagaaatggcaacattgtagggatagttggggtagcacctatagtataa 25494111  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    |  || || ||||||| | |||| |||||||| |||||| |||||| ||  |||||| || | |||| | |||| |||||||| ||||| |||||  |||    
T  25494110 atatt-gtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagattctatagtaaaacgagtagatcaaatagaggatagtcatatta 25494012  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac 251  Q
     |||||||| | |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  25494011 caagaggtacaagaagacctagaagaactataagagaaac 25493972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 185
Target Start/End: Original strand, 2079317 - 2079434
Alignment:
Q  67 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 166  Q
    |||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| | ||||    
T  2079317 aatgacaatattagagagggagt-tgggtagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaagatttgtag 2079415  T
Q  167 atgctgtggtaagaagagt 185  Q
    ||  ||| ||||| |||||    
T  2079416 attatgtagtaaggagagt 2079434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6293660 - 6293390
Alignment:
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 198  Q
    |||||||||| ||||  |||| |||| |||| | || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||  |||  |||| |||||  |||| ||| ||    
T  6293660 acctatagtacaaaatatggtggaaactaggttcaggtggtttgggcatgtagagagaacacctgtagattatgtaataaggagagtaaatcagatgaag 6293561  T
Q  199 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 298  Q
    || |||||| | |       |||||||||| |||| |||||||  | |||||| ||||| ||  || ||||  | |||||||| |||  |||| |||| |    
T  6293560 gatagtcaaatcac------tagaggaagatctagaaaaactaaaatagaaactattaggaaatatctagatattaatgagttagatagaaatatggtat 6293467  T
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| || ||||||  | |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6293466 atgatagagcattatggcaacgtttggtcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgcggttgttg 6293390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 370
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886383
Alignment:
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtggtataaggcttagttgttgt 21886383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Original strand, 30642980 - 30643053
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30642980 atagaacattatggagtaatttgatctatgtagccgaccccacttagcgggttaaggcttggttgttgttgttg 30643053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Original strand, 33730194 - 33730247
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33730194 atttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33730247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 154
Target Start/End: Original strand, 8364575 - 8364635
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8364575 gtagcaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 370
Target Start/End: Original strand, 21089604 - 21089676
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21089604 tatgatagaacattatggcattgtttgatccatgtagctgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 21089676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1008124 - 1008050
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1008124 tgatagaacattatggcgtaatttgatccaggtagca-accccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgttg 1008050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 375
Target Start/End: Original strand, 9568884 - 9568982
Alignment:
Q  276 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||    
T  9568884 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccatatagcc-aacccacttaatgggatagagcttgtttgttgttgttg 9568982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18130885 - 18130814
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  18130885 atagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacctaatgggataaggcttagttgttgttgt 18130814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 33997703 - 33997545
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta-gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| |||| |  | |||| | ||||||||||||  |||| ||||  ||||| ||||| ||    
T  33997703 agaggcagaggaagaccttggaaaactataagagaaactattaagaaaagcct-agagattaatgagttggatagaaatatggtacatgattgaacatta 33997605  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||||||||| |||   || | | ||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33997604 tggcgtcatttgatctatgcgaccaaccacacttagtgggataatgcttgattgttgttg 33997545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6641764 - 6641628
Alignment:
Q  18 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 117  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||||| ||||   |||| |||| | |||||||  |||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6641764 gaggatgttgcgttcgatgttttgtaagactagatgggataagattggaaatgacaatattagagatagagttggggtatcacctatagtagaaaagatg 6641665  T
Q  118 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||||| ||| ||| | | |||||||||| ||||||    
T  6641664 gtagaaactagacttgggttgtttgggcatctagaga 6641628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Original strand, 32945455 - 32945531
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  32945455 tatgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccgacatcacttagttgaataaggcttggttgtcgttgtt 32945531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 101
Target Start/End: Original strand, 33496106 - 33496194
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacc 101  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  33496106 gagatgatgatgttgcattggatgaatggtaagattaaataggataagattagaaatgacaccattacagagatagtaggggtagcacc 33496194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 5129198 - 5129123
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga 87  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  5129198 agagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagattcgatgtgatcggattagaaatgacaatattagagagaga 5129123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 365
Target Start/End: Original strand, 5983814 - 5983905
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 365  Q
    ||||| ||||||| |||| |||| |  |||||||||  || |||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5983814 aatgaattggatcgaaatatggtttgcgatagaacatgatagcgtaatttgatccacgtagccgaccccactcagtgggataaggcttggtt 5983905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7337270 - 7337192
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt--agtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||  || ||||||| |||||||||||||||||    
T  7337270 tatgatagaatattatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttagagggggataaagcttggttgttgttgtt 7337192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23888549 - 23888478
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  23888549 atagaacattatggtgtaatttgatccatgtagcagaccccacctaatgggataaggcttagttgttgttgt 23888478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 333 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 24698897 - 24698854
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24698897 agccgatcccatttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 24698854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 306 - 365
Target Start/End: Original strand, 32068635 - 32068694
Alignment:
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 365  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  32068635 aacattatggcgtaatttgatacatgtagccgatcccacttagtgggataaagtttggtt 32068694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 9109584 - 9109506
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||||||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  9109584 tatgatagaatactatgaagtagtttgatccatgtagccgaccccagttagtgagataatgcttagttgttgttgttgc 9109506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12134265 - 12134115
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||  |||    |||| ||||| |||||||  |||||||||||| |   ||||  ||||||||||    
T  12134265 agcagagatgagaatgttgtgttggatgtgtggcaagacaagatgatatagaattagaaatgacaatattagagagagaattgaggtacgacctatagta 12134166  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||| |||| |||||||||||||   ||||| |||| ||||||| ||||    
T  12134165 gaaaagatggtggaaaataggcttacggggtttcggcacgtagagaaaaga 12134115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 374
Target Start/End: Original strand, 29900275 - 29900329
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  29900275 atttgatccatgtagccgacccctcttagtgggataaggattggttcttgttgtt 29900329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Original strand, 586057 - 586134
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  586057 tatgatagaacattatgacgtcatttgattcatggagccgacctcacttaatgggataaaccttgattgttgttgttg 586134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 234 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1748084 - 1747944
Alignment:
Q  234 gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 333  Q
    |||||||||||||||||| | ||  ||  |||||||| | ||||||||||||  |||| | || |||||||||||| || | |||| |||||||||||||    
T  1748084 gaaaactattagagaaactactaagaaaaatttagagattaatgagttggatagaaatatagtatatgatagaacattacgacgtcgtttgatccatgta 1747985  T
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |  || || |||| ||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  1747984 gttga-cctacttggtgcgataagacttggttgctgttgttg 1747944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 2065116 - 2065018
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattag----agagagagtgtgggtagcacctatagt 107  Q
    |||||||||||| | |  |||||||| ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2065116 gagatgaggatgctaccctggatgagcggtaagactacatatgataggattagtaatgacaccattagaaaaagagagagtgggggaagcacctatagt 2065018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 315 - 372
Target Start/End: Original strand, 5053750 - 5053807
Alignment:
Q  315 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5053750 gcgtcgtttgatcaatgtagccgaccccatttagtaggataaggcttggttgttgttg 5053807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Original strand, 5095816 - 5095913
Alignment:
Q  34 atgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 131  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5095816 atgagtggtaagactggaagggataggattaggaatgactacattagagggagtgttgggatatcacctatagtagaatagatggtagaaaataggct 5095913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21870363 - 21870299
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 147  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  21870363 agagagttggggtagcacctgtagtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcat 21870299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 363
Target Start/End: Original strand, 10453272 - 10453335
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 363  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |   |||| |||||||||||||||    
T  10453272 tgatagaacactatggcgtcttttgattcatgtagccgaccatgcttactgggataaggcttgg 10453335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 323 - 374
Target Start/End: Original strand, 29931068 - 29931119
Alignment:
Q  323 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  29931068 tgatccatgtagccgaccccgcttagtaggataaggcttggttcttgttgtt 29931119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 353
Target Start/End: Original strand, 32080676 - 32080731
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 353  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  32080676 tatgatataacattatggcgtaatttgatacatgtagtcgatcccacttagtggga 32080731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 365
Target Start/End: Original strand, 32097944 - 32098011
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 365  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  32097944 tatgatataacattatggcgtaaattgatacatgtagccgattccacttagtgggataaagtttggtt 32098011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 43326 - 43049
Alignment:
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 198  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| |  |||||  ||| |  |||||||| |||||  || ||    
T  43326 acctataatagaaaaaatggtggaaactaggcttaggtggtctggccatgtagagagaagatttatagattttgtagcgagaagagtagatcaggtg-ag 43228  T
Q  199 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 297  Q
    || |||||  |    ||||| || ||||||||||| | |||| ||| ||||||| ||||  || ||| |||||   ||||||||||||| |||| | ||     
T  43227 gatagtcagatctctagaggcagcggaagacctagaacaacttttaagagaaactattaataaagatctagagagtaatgagttggatcaaaatatagtt 43128  T
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||||||||  | ||||| || |||| ||||||||| ||   | |||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  43127 tatgatagagtattatggtgtaattttatccatgtatccagcctcacttagtgggataagacttggtttttattgttgc 43049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 334
Target Start/End: Original strand, 1911577 - 1911623
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 334  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  1911577 aaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtag 1911623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 6692749 - 6692696
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  6692749 atttgattcatgtagtcgaccccacttggtgggaaaaggcttggttgttgttgt 6692696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7150682 - 7150526
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||| || | ||||||||||||    |||||| | |||||  ||    
T  7150682 agcagagatgctaatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgagataggatttggaacgaaaacattagagagagt---tgggtaactcctatcata 7150586  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
     ||||  |||| |||| | || |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  7150585 aaaaatatggtggaaactcggattaggtggtttgggcatggggagagaagacttgtagat 7150526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21870118 - 21870069
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21870118 tttgatccatgcagccgacctcacttagtgggataaggtttggttgttgt 21870069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 327 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 29354782 - 29354741
Alignment:
Q  327 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29354782 ccatgtagcctatctcacttagtgggataaggcttggttgtt 29354741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 357
Target Start/End: Original strand, 33084138 - 33084195
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataag 357  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  33084138 tgatagaatactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataag 33084195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 2689578 - 2689642
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccat 77  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  |||||| || | | |||||||||||||||||||||||    
T  2689578 gagatgaggatgttgtgatggatgagcagtaagactaaataggataggattaggaatgacaccat 2689642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3127310 - 3127274
Alignment:
Q  339 tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3127310 tcccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgttg 3127274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Original strand, 413280 - 413339
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 347  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  413280 aaatatggtatatgatagaagattatagtgtcatttgatcaatgtagccgatcccactta 413339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Original strand, 2307854 - 2307909
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  2307854 atttgatcaatatagccgatcccacttaatggaataagactttgttgttgttgttg 2307909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4878330 - 4878295
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4878330 cccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgttg 4878295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 6293733 - 6293690
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagac 52  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  6293733 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaaaattagac 6293690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7150362 - 7150311
Alignment:
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7150362 ttgatccatgtagccgagcctatgtagtgggattaggcttggttgttgttgt 7150311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7513075 - 7513008
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 355  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  7513075 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtagttgaccccacttagtgggata 7513008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31832139 - 31831857
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 192  Q
    |||||||||||||||| || || |||| |  | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||    | ||||  | | | ||| ||||| |||||     
T  31832139 ggtagcacctatagtaaaatagatggtgggtattaggcttaagtggtttggacatgtagagagaaggtccggagattatatagcaagtagagtagatcag 31832040  T
Q  193 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 292  Q
    |||||||| |||||  | |  |||  ||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | | |||||||||||||||      
T  31832039 atggaggatagtcagatcatcagaaatagaggaaagcctagaaaaactatcagagaaactattaagaaagatctagagattactgagttggatccaaaca 31831940  T
Q  293 tgg-tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||| | |||||||||||| | | | |  ||||||| |||| || ||| || |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  31831939 tggttttatgatagaacattgtaggggaatttgattcatgcagtcgaccctacttagtgagataagg-ttggttgtttttgttg 31831857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 451989 - 451947
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  451989 agccgaccccacttggtgggataaggcttggttgttgtcgttg 451947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 298 - 368
Target Start/End: Original strand, 2079488 - 2079558
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    ||||||||| || ||| |||| |||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||| |||||||||    
T  2079488 tatgatagagcattatagcgtaatttaatccatgtagccgactcgacttagtggggtaaggtttggttgtt 2079558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14389272 - 14389202
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||| | ||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  14389272 gatttagagattaataagttagatccaaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 341 - 375
Target Start/End: Original strand, 21531802 - 21531836
Alignment:
Q  341 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21531802 ccacttagtgggataaggcttggttgttattgttg 21531836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27840090 - 27840048
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27840090 agccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgttg 27840048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 340 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31434475 - 31434441
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31434475 cccacttagtgggataagtcttggttgttgttgtt 31434441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 242
Target Start/End: Original strand, 3963889 - 3963950
Alignment:
Q  181 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 242  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3963889 agagtggatcagaaggaggggagtcaaatcaccagaggtagaggaagacctagaaaaactat 3963950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 304; Significance: 1e-170; HSPs: 175)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12492751 - 12492382
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcaccta---ta 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  12492751 agcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctactata 12492652  T
Q  106 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12492651 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 12492552  T
Q  206 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492551 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 12492452  T
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12492451 aacactatggcgtcatttgatgcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12492382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Original strand, 4496308 - 4496668
Alignment:
Q  17 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacat--gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4496308 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacacaggataggattaggaatgacacctttagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 4496407  T
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496408 ctggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 4496507  T
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496508 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 4496607  T
Q  315 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496608 gcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 4496668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 294; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 374
Target Start/End: Original strand, 24178428 - 24178793
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24178428 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 24178527  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24178528 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 24178627  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24178628 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttagtgtatgatagaac 24178727  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  24178728 actatggcatcatttgatctatgtagccgaccccacttaatgaaataaggcttggttgttgttgtt 24178793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1287953 - 1287578
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----------tgtgggtagc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          || |||||||    
T  1287953 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagagagagagagagagagtgggggtagc 1287854  T
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1287853 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggag 1287754  T
Q  199 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1287753 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 1287654  T
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1287653 atgatagtacactatggcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttattgatgtt 1287578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28977221 - 28976857
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  28977221 agcagagatgagtatgttgtgttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 28977124  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28977123 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaag 28977024  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28977023 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 28976924  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28976923 actatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28976857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2075838 - 2075475
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  2075838 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagagagagtgggggtaacacctacagta 2075739  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2075738 gaaaagttggtagacaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 2075639  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattag-aaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2075638 ttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 2075539  T
Q  308 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2075538 tactatggcgtcatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 2075475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 10639215 - 10639586
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatag-- 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||      
T  10639215 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggctagcacctatagac 10639314  T
Q  107 -----tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 201  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10639315 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggaggag 10639414  T
Q  202 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 301  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10639415 --tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 10639512  T
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10639513 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataaggcttggttgttgttgttg 10639586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 1275183 - 1275548
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1275183 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtg-gggtagcacctatagta 1275281  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1275282 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 1275381  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  1275382 ttaacaggggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaac 1275481  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  1275482 attatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatagttgttgttgttg 1275548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 56 - 366
Target Start/End: Original strand, 38684932 - 38685242
Alignment:
Q  56 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38684932 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 38685031  T
Q  156 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 255  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38685032 aagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 38685131  T
Q  256 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38685132 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 38685231  T
Q  356 aggcttggttg 366  Q
    |||||||||||    
T  38685232 aggcttggttg 38685242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 3301766 - 3302126
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3301766 gagatggggatgttgcgcttgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgagggtagcccctatagtagaaa 3301865  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  3301866 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaa 3301965  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  3301966 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 3302065  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3302066 cggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3302126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16347738 - 16347380
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16347738 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagagagagcgggggtagcacctatagtagaaa 16347639  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16347638 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 16347539  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||      
T  16347538 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatacaaatatggtttatgatagaacac-- 16347441  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16347440 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgt 16347380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 94 - 372
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457054
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20456776 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 20456875  T
Q  194 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  20456876 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaattt 20456975  T
Q  294 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20456976 gatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 20457054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 39 - 375
Target Start/End: Original strand, 14665658 - 14665996
Alignment:
Q  39 tggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 134  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14665658 tggtaagcctagacatgataggattagaaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttag 14665757  T
Q  135 atggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagg 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14665758 atggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctagg 14665857  T
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||    
T  14665858 aaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgataga--actctggcgtaatttgatctatgtag 14665955  T
Q  335 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14665956 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14665996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 34272940 - 34273297
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----------tgtgggtagc 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||          || |||||||    
T  34272940 agcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagaca-----ggattaggaatgacaccattagagagagagagagagagagtgggggtagc 34273034  T
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||                  
T  34273035 acctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaagaagag-------------- 34273120  T
Q  199 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34273121 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 34273220  T
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  34273221 atgatagaacactatgacgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggcttagttgttgttgttg 34273297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 183; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 149 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915494
Alignment:
Q  149 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 248  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  249 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttag 348  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggt-tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 2915521  T
Q  349 tgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2915520 tgggataaggcttggttattgttgttg 2915494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 22 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26885040 - 26884687
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag-aaaagttggta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26885040 atgttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggataggattaggaataacaccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggta 26884941  T
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  26884940 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 26884841  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 319  Q
    ||||| || ||||||||||||  ||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| || |||||| |||| || | ||||||||||||||| | ||      
T  26884840 gaggatgagctaggaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgca 26884743  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26884742 atttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttgattgttgttgttg 26884687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 222 - 375
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816666
Alignment:
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 29816612  T
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29816613 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29816666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 180 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561383
Alignment:
Q  180 aagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgag 279  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  280 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13561479 ttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgttgc 13561383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 123 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 38501668 - 38501422
Alignment:
Q  123 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 222  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||||||   | ||||||| | ||    
T  38501668 aaataggtttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatgga 38501569  T
Q  223 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatt 322  Q
     |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || | |||||||||| ||||| | || ||     
T  38501568 tgaagacctaggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaata 38501469  T
Q  323 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38501468 tgatcgatgtagccgatcccacttagtgggataagacttggttgttg 38501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 187 - 371
Target Start/End: Original strand, 14911268 - 14911452
Alignment:
Q  187 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 286  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14911268 gatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttggatc 14911367  T
Q  287 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||| || | | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  14911368 caaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggtttggttgttgtt 14911452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 55 - 326
Target Start/End: Original strand, 14749271 - 14749542
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14749271 gataggattagaaatgaaaacattagagagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagaga 14749370  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 254  Q
    ||||||  || ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  14749371 gaagacctgtggattctgttgtaaggagagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 14749470  T
Q  255 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 326  Q
     |  |||||| ||||| | || |||||||||  |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  14749471 caagaaggatctagagattaacgagttggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16914021 - 16913882
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16914021 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtag 16913922  T
Q  335 ccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16913921 ccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16913882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Original strand, 27816 - 28165
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||| |||| ||||| ||||||||||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||    
T  27816 gagatgaggatgttgcattagatgagtggtaaaacta-acaagatatgattatgaatgacaccatttgaaaaagagttagggtagcacctatagtagaaa 27914  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || || | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||  || ||| | ||||         || ||||||| ||||| |||   ||||||||  | ||    
T  27915 agatgatggaaaataggcttaggtggtttgagc--gtaggtaggagatttgtag---------tacgaagagtagatcagatgcgtgagagtcagatcaa 28003  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||| || | | |||||||||||||    
T  28004 aagaggttgaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacacta 28103  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| | ||||||| |||||||| || |||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  28104 tggcataatttgatacatgtagctgaccccatttagttagataagacttggtttttgttgtt 28165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 271 - 375
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213859
Alignment:
Q  271 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttt 30213854  T
Q  371 tgttg 375  Q
    |||||    
T  30213855 tgttg 30213859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 79 - 375
Target Start/End: Original strand, 79501 - 79797
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |   |||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||| ||||    
T  79501 agagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaa 79600  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||   | | ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||    
T  79601 ggagagtcgatcaaatggaggatggtcggatcacaagaggctgaggaagacctagaaaaactatcagataaactattaggaatgatttggaaattaatga 79700  T
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | |||| | |||| ||||| |||||||| || |||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  79701 gctggaccgaaatatggtgcatgatagaccattatggcgtgatttcatccatgtagctggccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgttg 79797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 333
Target Start/End: Original strand, 36215418 - 36215730
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||  |||| | |||| |||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  36215418 agcagagatgagtatgttgcgctagatgagcagtaaaactagatatgatatgattatgaatgac--cattagggagagagtggaggtagcatctatagta 36215515  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||| |||  || | ||||||||| ||||  |||||||||||||| |    
T  36215516 gaaaagttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaagagtagatcggatggaggagagtcagg 36215615  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    | |||||||||||          ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||  ||   |||||||||||    
T  36215616 tcaaaagaggtag----------aggaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaattaattgaatccaaacatgacttatgatagaac 36215705  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgta 333  Q
    ||||||  || ||||||| ||||||    
T  36215706 actatgatgtgatttgattcatgta 36215730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 7359577 - 7359258
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||| ||||| |||||||   |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  7359577 gatagaattagaaatgacaatgttagagagagagttcaggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggtttgg-catgtagaga 7359479  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 254  Q
    |||||   |||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |  ||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||||| ||    
T  7359478 gaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactat 7359379  T
Q  255 t-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 353  Q
    | |||||  || ||||| | ||| ||||||||| |||| |||| || |||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  7359378 ttagaaaa-atctagagattaataagttggatcgaaatatggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtggga 7359281  T
Q  354 taaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
     ||| ||||||||||||||||||    
T  7359280 caagacttggttgttgttgttgc 7359258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 375
Target Start/End: Original strand, 6859345 - 6859665
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||    
T  6859345 gatatgattagaaatgacaatattagacagagagttggggtagcacctatagtgaagaagatggtggaaaacaggcataggtggtttggacacgtagaga 6859444  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 254  Q
    ||||||| || ||| |||| |||||  || |  || | |||||||| ||||||   |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  6859445 gaagacttgtggattctgtagtaaggggaataaattagatggaggatagtcaaaccactagaggaagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 6859544  T
Q  255 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 354  Q
    ||| || |||||| || | | | | ||||  | |||| |||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  6859545 taggaaagatttacagattagttacttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccacttagtgggat 6859644  T
Q  355 aaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  6859645 aaggcttggtagttgttgttg 6859665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 368
Target Start/End: Original strand, 2712936 - 2713213
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 182  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||   ||| ||    
T  2712936 agagagttggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtggattctgtatgaaggag 2713035  T
Q  183 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| | |  ||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||    
T  2713036 agtagatcagatggaggagagtcaaatcactagagtcaggggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagatgaatgagttg 2713135  T
Q  283 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    ||   |||      |   |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2713136 ga--gaaa------gacagatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgagcccacttagtgggataaggcttggttgtt 2713213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 264 - 374
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558424
Alignment:
Q  264 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 363  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgg 5558413  T
Q  364 ttgttgttgtt 374  Q
    |||| ||||||    
T  5558414 ttgtcgttgtt 5558424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 364
Target Start/End: Original strand, 6888931 - 6889267
Alignment:
Q  29 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 128  Q
    |||||||| ||||||||| ||||   |||| |||||| |||||||  |||| ||| |||||  ||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||    
T  6888931 gttggatgtgtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaatattacagaaagagttggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaatag 6889030  T
Q  129 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 228  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||| | | |  || | |||||||| ||||||   |   |||| ||||||||     
T  6889031 gcttaagtggtttggacatgtagagagaagacttgtggattatgtggtaaggacaataaattagatggaggatagtcaaaccacttgaggaagaggaagg 6889130  T
Q  229 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc 328  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||| ||||||  | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  6889131 cctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcc 6889230  T
Q  329 atgtagccgatcccactt-agtgggataaggcttggt 364  Q
    ||||||| || | || || |||||||||| |||||||    
T  6889231 atgtagctgaactcatttaagtgggataaagcttggt 6889267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 79 - 375
Target Start/End: Original strand, 14667751 - 14668055
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg--------catgtagagagaagactagtagatgc 170  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||        ||||||||||||||||  ||| ||      
T  14667751 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggggctttgggcatgtagagagaagacatgtacatta 14667850  T
Q  171 tgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagag 270  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||| |  | |  ||||| || ||||  ||||| |||||||| |||||| | | ||  || ||| |||||    
T  14667851 tgtagtaaggagagtagatcagatggattatagttatatcactagaggcagcggaaatcctagaaaaactataagagaagctactaagaaagatctagag 14667950  T
Q  271 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
     | |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  14667951 attaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgtagt 14668050  T
Q  371 tgttg 375  Q
    |||||    
T  14668051 tgttg 14668055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 31636253 - 31636009
Alignment:
Q  38 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 137  Q
    ||||||||| |||||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||    
T  31636253 gtggtaagactagactggatagaattataaatgacagcattagagaaag--ttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtg 31636156  T
Q  138 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||| ||||| ||| | |||| || ||||||| | |  |||| ||| |||||| |||| |||    
T  31636155 gtttgggcatgtagagagaagacccgtggatgttgtagtaaggagagtagattagatggtggggagtcaaatcactagagataggggaagatctagaaaa 31636056  T
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 284  Q
    |||||||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  31636055 actattagagaaactatcaagaaggatatagagatcaatgagttgga 31636009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 341
Target Start/End: Original strand, 32516480 - 32516805
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||  |  | ||| ||| |||||||||||    
T  32516480 gagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaatgacaacattagagagag--ttggagtaacacttatagtagaaa 32516577  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||| | | |||| ||| || ||  |||||| |||| ||| | ||||| ||||  ||| |||| | |||  |||     
T  32516578 agatggtggaaaataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattac 32516677  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||   ||||||||| | ||  |||||||| ||||| |||| |||||||||| | ||    
T  32516678 aagaggtagaggaagaccta-aaaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatatta 32516776  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcc 341  Q
    || ||| |||||||| || || |||||||    
T  32516777 tgacgtaatttgatcgatataaccgatcc 32516805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 244 - 375
Target Start/End: Original strand, 28276391 - 28276522
Alignment:
Q  244 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 343  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |  |||    
T  28276391 agagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactcca 28276490  T
Q  344 cttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28276491 cttagcgggataaggcttggttgttgttgttg 28276522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17340798 - 17340500
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacct-atagtaga 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   | || ||| | ||||||||    
T  17340798 agagataaggatgttgcgttggatgagtggtaaaactagaagaaatgtgattaggaatgacaccattagagagagggttgagataacactttatagtaga 17340699  T
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 210  Q
    ||  ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  17340698 aacattattagaaaataggcttaggtggttttgacatgttaagagaaaactcgcagatgatgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtc 17340599  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 309  Q
    ||||  |||||| |||||| ||| |||| ||| |  | ||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  17340598 aaaaagggtagatgaagacttagaaaaattataattgtaactattaagaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataaca 17340500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 69 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43558133 - 43557833
Alignment:
Q  69 tgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 166  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43558133 tgacaacattagagagagagagttagggtagcatctataatagaaaagatggtggaaactaagcttaggtggtttgggcatatagagagaagacttgtag 43558034  T
Q  167 atgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggattt 266  Q
    ||||||  ||||||||||| ||| | ||  | ||  ||||  | |  |||  | || || ||||||| |||||||| ||||||||     | || |||||    
T  43558033 atgctgcagtaagaagagtagattagataaatgatggtcatatcactaga--tggatgatgacctagaaaaactataagagaaac----cgtaaagattt 43557940  T
Q  267 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 366  Q
     ||| | | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| | | | |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43557939 ggagattattgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcctggttg 43557840  T
Q  367 ttgttgt 373  Q
    |||||||    
T  43557839 ttgttgt 43557833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 418145 - 418032
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||    
T  418145 gatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttggtgggatatggctt 418046  T
Q  362 ggttgttgttgttg 375  Q
    |  |||||||||||    
T  418045 gaatgttgttgttg 418032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Original strand, 7678402 - 7678760
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag-----agagagtgtgggtagca-cctatag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||     |||||||  || ||||| |||||||    
T  7678402 gagatgaggatgttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagaggggagagagagttgggatagcaacctatag 7678501  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||| | ||| ||||   ||||||| | |||||||| |||||||| |||||  |||||| |||| ||||| ||||| |||     |||||| |||||    
T  7678502 tagaaaaat-ggtggaaac--ggcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagat-----ggaggatagtca 7678593  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 305  Q
      | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||  ||| ||| |||     
T  7678594 gatcactagaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaag-atctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataata- 7678691  T
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| ||||  ||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7678692 aacattatgaggtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaaacttggttgttgttgtt 7678760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 11002785 - 11002424
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||   ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||| ||||    
T  11002785 agcagagatgaggatgttgcgctggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttcgggtagcacctacagta 11002688  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtgg--taagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    |||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||   || ||  |||| |  | ||  |||| ||||| ||| ||| ||||||    
T  11002687 gaaaacatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtaggtagaagatctgtggactctgtagttttaggggagtagatcagatgtaggggagtca 11002588  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 306  Q
      | |  |||||| | || |||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||| ||||| | |||||||||||   |    | || | |||||||    
T  11002587 gatcactagaggttggggtagacctagaaaaactataagacaaactattagtaacgatctagagataaatgagttggagaaaggcatagtttttgataga 11002488  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||| |  |||||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11002487 acactatggcattgtttgattcatgtagtcgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgt 11002424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 375
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475523
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |    
T  43475243 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcaga 43475342  T
Q  194 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt 293  Q
    ||||||| |||||  | |  | ||| | | | | || ||| |||||| | |||||||| ||||  || |||  |||| | ||||||||||||| |||| |    
T  43475343 tggaggatagtcagatcactataggaaaaagtaaacatagaaaaact-taagagaaactattaagaaagatccagagattaatgagttggatcgaaatat 43475441  T
Q  294 ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | | |||| ||||||  ||||| || |||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43475442 gatttatggtagaacgttatggtgtaatttgatccacgtagccaactccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 43475523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 98 - 373
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525923
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 197  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||  || |||  || || ||||| ||||| |||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatgga 1525750  T
Q  198 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtg 297  Q
    |||||||||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||  |||| | |||||||||||   | |  ||||     
T  1525751 ggagagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaggatccagagataaatgagttggagaaagacatggtt 1525850  T
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | ||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1525851 tttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccga--cca-ttagtgagataaggcttggttgttgttgt 1525923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 220 - 375
Target Start/End: Original strand, 11675658 - 11675814
Alignment:
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 318  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||||   |||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  11675658 agaggaagacctgtaaaaactataagagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgt 11675757  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
      ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11675758 agtttaatccatgtagccgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgttg 11675814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 302 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408490
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 377  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 408490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 102 - 356
Target Start/End: Original strand, 30588460 - 30588712
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 201  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||| |   ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||  |||||||||     
T  30588460 tataatagaaaagatggtggaaaataggtttaagtggtttgggcatattcggagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagat--aatggaggat 30588557  T
Q  202 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 301  Q
    ||||| || |  ||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||   |||  || ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||     
T  30588558 agtcaggtcacgagagacataggaagacctagaaaaactataagagaaattgttaagaaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttata 30588657  T
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 356  Q
    |||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30588658 atagaacattatgacgtgatatgatccatgtagccgactccacttagtgggataa 30588712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 361
Target Start/End: Original strand, 9235172 - 9235316
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||| |||||| |||| |||| |||||||||||| |||    
T  9235172 agaggcagaggaagacctagaaaaacta--agagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattat 9235269  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9235270 ggcataatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggctt 9235316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10083102 - 10082747
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||  |  ||||| |||||||||||    
T  10083102 agcagggatgaggatgttgctttg-atgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgagaacattagggagagcattggggtatcacctatagta 10083004  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||| |||      |||| |||||||     
T  10083003 gaaaagatggtagaaactagacttaagtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagtaaagagagtagat------gaggggagtcaaa 10082910  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    | |  |||| ||| | ||||||||| |||||||| |||||||| | ||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | || ||  ||    
T  10082909 tcaccagagatagggtaagacctagaaaaactataagagaaactagtaacaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgttaacac 10082810  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||| |||| | |||| |||||||| || ||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  10082809 actatgacgtcgtctgattcatgtagctgaccctgcttattgtgataaggcttggttgttgtt 10082747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 22 - 154
Target Start/End: Original strand, 15168721 - 15168855
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggta--agattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 119  Q
    |||||||||| ||||||||| |  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15168721 atgttgcgttagatgagtggcacaagattagacgagataggattaagaatgacaccattagagggagttggggggtagcacctatagtagaaaagatggt 15168820  T
Q  120 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  15168821 agaaaataggctaaggtggtttggacatgttgaga 15168855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 21952274 - 21952508
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcac----ctatagt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| |||    |||||||    
T  21952274 agatgaggatgttgcgttgcatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacagcattaaagagagagggttggggtaacacacacctatagt 21952373  T
Q  108 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||| |  || ||| || | ||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||    
T  21952374 agaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaagtcctgtggattctatagtaaggagaatagatcagatggaggggagtcaa 21952473  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 242  Q
     | |  |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21952474 atcactagaggtaggggaagacctagaaaaactat 21952508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 285 - 374
Target Start/End: Original strand, 38132531 - 38132619
Alignment:
Q  285 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38132531 tccaaatgtggt-tatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 38132619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 374
Target Start/End: Original strand, 2090556 - 2090696
Alignment:
Q  234 gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 333  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||| | || ||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2090556 gaaaactataagagaaaatattaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgta 2090655  T
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
     |||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2090656 cccgaccccattgagtgggataaggctttgttgttgttgtt 2090696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 282 - 374
Target Start/End: Original strand, 18855798 - 18855890
Alignment:
Q  282 ggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18855798 ggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 18855890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 295 - 375
Target Start/End: Original strand, 42576214 - 42576294
Alignment:
Q  295 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42576214 gtgtatgatagaacataatggcgtaatttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 42576294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 28411885 - 28411960
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28411885 tgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28411960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 216 - 375
Target Start/End: Original strand, 29922409 - 29922568
Alignment:
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgg 315  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| | ||  |||||||   |||  |||| || ||||||||| |||||    
T  29922409 aggtagaggaagatctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaacaagttggactgaaacctggtttacgatagaacattatgg 29922508  T
Q  316 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||| ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  29922509 cgtaatttgatccatgtagccaacctcacttggtgggataagccttggttgttgttgttg 29922568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 252 - 375
Target Start/End: Original strand, 39040917 - 39041040
Alignment:
Q  252 aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgg 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| | ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  39040917 aattagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgg 39041016  T
Q  352 gataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||    
T  39041017 gataagacttgattgttgtagttg 39041040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 375
Target Start/End: Original strand, 2393039 - 2393160
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 352  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||| | || | | |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2393039 attagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 2393138  T
Q  353 ataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||| |||||||||||||    
T  2393139 ataaagctt-gttgttgttgttg 2393160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 288 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7640592 - 7640510
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7640592 aaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggaataaggctcggttgttgt 7640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12577019 - 12576861
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||| ||||||||| || |||    
T  12577019 agaggcagaggaagacctagaaaaactacaagataaactattaagaaagatctagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattat 12576920  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    || ||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12576919 ggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataaagcttggttgttgttg 12576861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 215 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15588546 - 15588399
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 314  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||   ||||||||||||  |||  |||| ||||| |||||| ||||    
T  15588546 gaggcagaggacgacctagaaaaactataagagaaactattataa--gatttagagagaaatgagttggataaaaacatggtatatgacagaacattatg 15588449  T
Q  315 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggt 364  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  15588448 gcgtcgtttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttggt 15588399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442124
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataa-gcttggttattgttgt 32442126  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  32442125 tg 32442124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 376
Target Start/End: Original strand, 9400708 - 9400796
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  9400708 aaatttggtttatgatataatactatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccatttagtgggattaggcttggttattgttgttgc 9400796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15489789 - 15489609
Alignment:
Q  76 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtgg 175  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||      
T  15489789 attagagagagagttggggtagtacctattgtagaaaagatggttgaaactcagcttagatggtttgggcatgtagagagaagatttgtagattttgtat 15489690  T
Q  176 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 256  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||| |||  | | |  ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  15489689 taaggagagtagattagatggaggatagttgaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaacaataagagaaactatta 15489609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 259 - 375
Target Start/End: Original strand, 20367061 - 20367177
Alignment:
Q  259 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 358  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||| || ||||||||    
T  20367061 aaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccacttggtaggataagg 20367160  T
Q  359 cttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||    
T  20367161 cttggttgttgttgttg 20367177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 82 - 374
Target Start/End: Original strand, 38684471 - 38684763
Alignment:
Q  82 gagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaa 181  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||| |||| ||  |||| |||||||  |||||||||||||||||  ||  || || | ||||| |    
T  38684471 gagagagtcagggtagcacctatagtataatagatggtggaaactaaacttaaatggtttcagcatgtagagagaagacctgtgtattctatagtaagga 38684570  T
Q  182 gagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 281  Q
    ||||  || | ||||||| || || | | |  ||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||  |||  || ||| ||||| | ||| ||||    
T  38684571 gagtatattagatggaggggattccaatcactagatgtaaaggaagacctagaaaaactacaagagaaacttttaagaaagatctagagattaattagtt 38684670  T
Q  282 ggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||  |||| ||||   |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  38684671 ggatagaaatatggtacttgatagaacattatggcgttatttgattcatgtagttgaccccacttagtggaataaagcttggttgttgttgtt 38684763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 3442944 - 3442873
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3442944 tgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 3442873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Original strand, 2552932 - 2553002
Alignment:
Q  241 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2552932 attagagaaagcattaaaaaggatttagatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 2553002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 251
Target Start/End: Original strand, 42199243 - 42199446
Alignment:
Q  46 attagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggc 145  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||  | ||| ||||||| |  ||||||||| ||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  42199243 attagacgggataggattagaaatgacgacgttacagagagaattggggtagcactta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggc 42199340  T
Q  146 atgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 245  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||   |||||| | |  || || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  42199341 atgtagagagaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagatcacatggagagtagtcaaatcactagggggagagaaagacctagaaaaactattag 42199440  T
Q  246 agaaac 251  Q
    | ||||    
T  42199441 acaaac 42199446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 98
Target Start/End: Original strand, 20318905 - 20318989
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20318905 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggta-----agactggataggattaggaatgacaccattagagaaagagtgggggtagc 20318989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 301 - 374
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272760
Alignment:
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctaagttgttgttgtt 42272760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 418318 - 418190
Alignment:
Q  40 ggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga--tg 137  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||  ||    
T  418318 ggtaagacgagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttggggtagcacctatggtagaaaagatggcagaaatttggcttagacctg 418221  T
Q  138 gtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  418220 gtttgggcatgtagagagaatacttgtagat 418190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 128 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9917695 - 9917458
Alignment:
Q  128 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 227  Q
    ||||||| ||||||| || |||| |||||||||  || |||  ||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||| | | |||||  |||||| |    
T  9917695 ggcttagttggtttgtgcgtgtaaagagaagacatgttgattttgtagtaaagagagtcgatcagatggaggatagtcaaatcacaagagacagaggatg 9917596  T
Q  228 acctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 326  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||  | |       |||||||||||| |||  | || |||||     
T  9917595 acctagaaaaactattagagaaactatttagaaag-atatagagatcaatgagttggatagaga-------tatgatagaacagtataacatcgtttga- 9917505  T
Q  327 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
      |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9917504 --atgtagccgaccccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 9917458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 305 - 373
Target Start/End: Original strand, 27386554 - 27386622
Alignment:
Q  305 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27386554 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatggttgttgttgt 27386622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Original strand, 33667217 - 33667285
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33667217 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 33667285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 293 - 375
Target Start/End: Original strand, 5860036 - 5860118
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5860036 tggtttatgatagaccattatggcgtaatttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 5860118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 293 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11069242 - 11069160
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11069242 tggtatatgatagaacattatggcgtaatttgatccatatagctgaccccacatagtgggatatggcttggttgttgttgttg 11069160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 229 - 374
Target Start/End: Original strand, 5303582 - 5303730
Alignment:
Q  229 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaattt--ggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga- 325  Q
    ||||| |||||| | |||||||| |||  ||| ||||||||| | ||||||||||||  |||| |  ||| |||||||||| | ||||||||  ||| |     
T  5303582 cctagaaaaactgtaagagaaactattgaaaaagatttagagtttaatgagttggatagaaatatatggtatatgatagaatattatggcgttgttttaa 5303681  T
Q  326 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5303682 tccatgtagccgatcccacttagtgggataagtcctggttgttgttgtt 5303730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18351189 - 18350900
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca-tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 190  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||   |||| ||||| ||||    
T  18351189 gggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagattatgcaataaggagagtagatc 18351090  T
Q  191 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaa------aggatttagaggtcaatgagttgg 283  Q
    ||| |||||  | |||| | |  ||||| ||||||| | ||| |||| |||| |||||||| ||| ||||      ||  | ||||| | ||||||||||    
T  18351089 aaaaggagggtaatcaaatcactagagg-agaggaacatcta-gaaagctataagagaaactattaagaaaaatctagactatagagattaatgagttgg 18350992  T
Q  284 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||  |||| |||| | || ||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| | ||| | ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  18350991 atagaaatatggtatttgttagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccgacctcacatggtgggatgagacttggatgttgttgttg 18350900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676760
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||   || ||  ||| ||||| | | |  || |    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacctttaaattatgtcgtaaggataatatatta 28676695  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 256  Q
     ||||||||  ||||  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  28676696 gatggaggattgtcagattacaagaggtagaagaagacctataaaaactataagagaaacaatta 28676760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 299 - 375
Target Start/End: Original strand, 32366186 - 32366262
Alignment:
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32366186 atgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtggccaaccccatgtagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32366262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 275 - 375
Target Start/End: Original strand, 38830504 - 38830603
Alignment:
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38830504 atgagttggaccgaaatatgatgtatgatagaacattatagcgtaatt-gatccatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgtt 38830602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28186857 - 28186782
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  28186857 tatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgcagccgaccctactcaatgggataaggcttggttgttgttgt 28186782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 374
Target Start/End: Original strand, 2645175 - 2645273
Alignment:
Q  276 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||  |||| |||| | ||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2645175 tgagttggatagaaatgtggtatttgataaaacattatagcatcgtttgatccatgtagccggccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 2645273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 28187030 - 28186956
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 85  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28187030 cagagatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgacaacattagagaga 28186956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 374
Target Start/End: Original strand, 36551375 - 36551429
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36551375 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgtt 36551429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Original strand, 41894237 - 41894357
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga-------tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 354  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||||       || |||| ||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  41894237 gatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgaattatgatacaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggat 41894336  T
Q  355 aaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  41894337 aagactttgttgttgttgttg 41894357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42504393 - 42504247
Alignment:
Q  227 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 326  Q
    ||||||| |||||||| ||||||   | || |||||||||||| |||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  42504393 gacctagaaaaactataagagaagtcaataaaaaggatttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 42504294  T
Q  327 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | | ||||  |||  ||| ||||||  || |||||||||||||||||    
T  42504293 caacgtagttgatttcacctagtggtctagggcttggttgttgttgt 42504247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 219817 - 219692
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||  |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  219817 agcaaagatgagaatgttgcgttggatgcgtgttaagacaagacgagataagattacgaatgacaacattggagagagagttggggtagcacctatcgtt 219718  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttag 134  Q
    |||||| |||| |||| | |||||||    
T  219717 gaaaaggtggtggaaacttggcttag 219692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 304 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9121147 - 9121078
Alignment:
Q  304 agaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| || |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9121147 agaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgtcgttgt 9121078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15986992 - 15986879
Alignment:
Q  118 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 217  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||   |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||  | | |||||    
T  15986992 gtagaaaataggtttaggtggtttgggcgtgtagagagaagatatgtagattctatagtaaggagagtggatcaaatggaggatagtcagatcacaagag 15986893  T
Q  218 gtagaggaagacct 231  Q
    ||| | ||||||||    
T  15986892 gtaaatgaagacct 15986879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 371
Target Start/End: Original strand, 33667562 - 33667715
Alignment:
Q  218 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcg 317  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||   ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | |||||||||||| |||||    
T  33667562 gtaggggaagacctagaaaaactataagagaagttattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactttggcg 33667661  T
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |  |||||| | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33667662 ttgtttgattcgtgtagccaaccccacttattgggataaggcttggttgttgtt 33667715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36123257 - 36123180
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36123257 tatgatagaacattatggtggcgtttgatccatgtaatcggtcccacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 36123180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41200421 - 41200344
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | | |||||||||||    
T  41200421 tatgatagaacgttatggcatcatttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataaggccttgctgttgttgttg 41200344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 356
Target Start/End: Original strand, 23979976 - 23980209
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  |  |||||| || | ||||||||||| ||||| || ||  | |||||  ||| ||||||||    
T  23979976 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagagaaaccctgtagattctatagtaagaagagtagatcagataga--aaagtcatattacaagaggta 23980073  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 320  Q
     ||| |||||||| | ||| || |||||||| |||   || |||||| || | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||| | |      
T  23980074 taggcagacctagaagaacaataagagaaactattgagaatgatttatagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgacatat 23980173  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 356  Q
    ||  |||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  23980174 ttcaatccatgtaatcaaccccacttagtgggataa 23980209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 373
Target Start/End: Original strand, 27998567 - 27998723
Alignment:
Q  217 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 316  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||  || ||| || || | |||||||| |||   ||  || | |||||||||| | |||| |    
T  27998567 ggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactactaagaaagatctacagattaatgagttagataggaacatgatatatgatagaatattatgac 27998666  T
Q  317 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  27998667 gtcgtttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggatatggtttggttgatgttgt 27998723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 300 - 368
Target Start/End: Original strand, 28985292 - 28985360
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    |||||||||| ||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28985292 tgatagaacattatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgtt 28985360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 355
Target Start/End: Original strand, 29938126 - 29938374
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 201  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||  |||||| | |||||||| | ||| |||   ||| ||||     
T  29938126 tataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttaagcctatagagagaagacctgtagattcggtggtaaggacagtagattggatgaaggat 29938225  T
Q  202 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 301  Q
    |||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||||| || ||||||  | | ||||||||||||  |||| || | ||||    
T  29938226 agtcagatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaact----gagaaactattaggaatgatttaatgattaatgagttggattgaaatatgatttatg 29938321  T
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggata 355  Q
     ||||||| | ||| || | ||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  29938322 -tagaacattttggtgtaagttggtccatgtagccgaccccactcagttggata 29938374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 39322141 - 39322077
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||||||    
T  39322141 tatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagactggctagttgttgttg 39322077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 372
Target Start/End: Original strand, 25938091 - 25938250
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||| ||||| ||||||   |||||| |||||||| ||||||||   ||||||| ||| ||||||| || ||||| | || ||||| | |||||||    
T  25938091 aagaggtaaaggaatacctagactaactataagagaaactattagaaattttttagagatcactgagttgaattcaaatatagtttatgacataacacta 25938190  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
     |  || ||||||| |||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25938191 cgttgtaatttgattcatgtagccgactccacatagtgagataagacttggttgttgttg 25938250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Original strand, 27800037 - 27800108
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||| |||||  | ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27800037 tgatagaacattatggtataatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 27800108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 218114 - 218052
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  218114 tatggcgtcattagatccatgtagccgaccccacctagtgggataagacttggttgttattgt 218052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 307
Target Start/End: Original strand, 15168873 - 15168987
Alignment:
Q  193 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 292  Q
    |||||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||| ||     
T  15168873 atggaggagagtgagattagaagaggtagaggacaacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaaaatttagaggttaataagttggatccagata 15168972  T
Q  293 tggtgtatgatagaa 307  Q
    |||| ||||||||||    
T  15168973 tggtttatgatagaa 15168987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 244
Target Start/End: Original strand, 36200769 - 36200894
Alignment:
Q  118 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 217  Q
    |||||||||| | |||| ||||||  |||||||||||||| || |||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||  | ||||     
T  36200769 gtagaaaatatgattaggtggttttagcatgtagagagaaaaccagtaaatgatgtagtatgaagagtagatcagatagaggagagtaaag-aagaagat 36200867  T
Q  218 gtagaggaagacctaggaaaactatta 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36200868 gtagaggaagacctagaaaaactatta 36200894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Original strand, 3000968 - 3001021
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3000968 atttgatggatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 3001021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Original strand, 9234115 - 9234168
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9234115 atttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 9234168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 159
Target Start/End: Original strand, 31906592 - 31906729
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    |||||||||| |||||  ||||| | |||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||  |||||| | ||||||||||||| |    
T  31906592 atgttgcgttcgatgaacggtaaaactagacggaataggattaggaatgacatcattagggagagagtgagagtgacacctacaatagaaaagttggtcg 31906691  T
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
     |||||  ||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  31906692 gaaatattcttagatagtttagacatgtagatagaaga 31906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41108803 - 41108727
Alignment:
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta--gtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  41108803 atgatagtacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgtgggataaggcttgattgttgttgt 41108727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Original strand, 5305545 - 5305613
Alignment:
Q  20 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  5305545 ggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaagatagaattagaaataacaacattagagagagag 5305613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 374
Target Start/End: Original strand, 6788190 - 6788349
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||| || || || ||  | |||||||||||   |||| || | |||||||||||| |||    
T  6788190 agaggcagaggaagacctagaaaaactatcaaaggaactattaggaaagacttggaaattaatgagttggactgaaatatgatttatgatagaacattat 6788289  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
     |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  6788290 agcgtaatttgattcatgtagccgacctcacttagtagga-aagacttggtggttgttgtt 6788349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 128 - 232
Target Start/End: Original strand, 11675547 - 11675651
Alignment:
Q  128 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 227  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||| ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||  | |||||| ||||||||||    
T  11675547 ggcttaggtggtttgggcatgttgagagaaggcctgtagattctgtagtaaggagagtagatcatagggaggatagtcagatcaaaagatgtagaggaag 11675646  T
Q  228 accta 232  Q
    |||||    
T  11675647 accta 11675651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 305 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 43423563 - 43423492
Alignment:
Q  305 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgca 377  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43423563 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccttttagtgggataaggctt-gttgttgttgttgca 43423492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 320 - 371
Target Start/End: Original strand, 10668569 - 10668620
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10668569 atttgatcaatgtagccgaccccacttattgggataaggcttggttgttgtt 10668620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 206
Target Start/End: Original strand, 21093772 - 21093867
Alignment:
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21093772 aaagttggtggaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagggaagacttggagattttgtagtaaagagagtagatcagatggaggatagtca 21093867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32006232 - 32006161
Alignment:
Q  305 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactt-agtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32006232 gaacattaaggcgtaatttgatccatgtagccaaacccagttcagtgggataaggcttggttgttgttgttg 32006161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33158057 - 33157918
Alignment:
Q  147 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 246  Q
    ||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||| |||| |||    
T  33158057 tgtagagagaaaacatgtagattctgtagtaagaagagtagatcaaatataagatagtcatgttacaagaggtataagaagacctagaaaacctataaga 33157958  T
Q  247 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 286  Q
    ||||| | || |||  ||||| || | |||||||||||||    
T  33157957 gaaactactaaaaaatatttatagattaatgagttggatc 33157918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 113
Target Start/End: Original strand, 34039960 - 34040059
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||   ||||||  ||||||||||||    
T  34039960 agatgaggatgtcgcgttggatgaatgataaaactagatatgataggattaaaaattacaccattagagagagaatgaatgtagcatgtatagtagaaaa 34040059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 149 - 332
Target Start/End: Original strand, 43035039 - 43035222
Alignment:
Q  149 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 248  Q
    ||||||||||||   ||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||| |||||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||    
T  43035039 tagagagaagacgtctagattctgtagtagggagagtagatcaaatcgaggatagtcaactcactagaggcagaggaagaactagaaaaaccatctgaga 43035138  T
Q  249 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||| ||||| ||  |||| ||  |  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||    
T  43035139 aactattaggaaaaatttggaaatttatgagttggaccgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgttttttaatccatgt 43035222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 8082017 - 8081967
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatccc-acttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8082017 atttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttg 8081967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21193748 - 21193650
Alignment:
Q  277 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||  |||| |||| ||||||||| || |||| | | ||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21193748 gagttggatagaaatatggtttatgatagatcattatgacataatttgattcatgtatccgaccccacgtagtggaataaggcttggttattgttgttg 21193650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 30639787 - 30639717
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30639787 atagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggattggtagttgttg 30639717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 36200702 - 36200764
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgaca 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | | |||| ||||||||||||||    
T  36200702 cagagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagactaaataggataagattaggaatgaca 36200764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 683796 - 683699
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||| |||| |||| |||||||||||| ||||  ||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
T  683796 agttgtatcaaaatatggtttatgatagaacattatgttgtagtttgatccatgtagccaaccccacttagcgggataagactttgtttttgttgttg 683699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 306 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4026395 - 4026326
Alignment:
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4026395 aacattatgacgtcgtttgatccatgtagccgagttcactttgtgggatcaggcttggttgttgttgttg 4026326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10989126 - 10989085
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989126 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10989085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13607036 - 13606995
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13607036 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 13606995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 15252840 - 15252755
Alignment:
Q  277 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    |||||||||| ||||  ||| |||||||||||| ||||  ||  ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15252840 gagttggatcgaaatagggtttatgatagaacattatgatgtagtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 15252755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 325 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7367220 - 7367172
Alignment:
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7367220 atccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttattgt 7367172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 14725640 - 14725736
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 309  Q
    |||||||||||||| | |||| |||| ||| ||| |||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||    
T  14725640 aagaggtagaggaaaagctagaaaaattataagataaactattataaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatcgaaca 14725736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 159
Target Start/End: Original strand, 37065533 - 37065597
Alignment:
Q  95 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  37065533 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggtcatttgggcatgtagagagaaga 37065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 366
Target Start/End: Original strand, 41808105 - 41808197
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 366  Q
    ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| |||| | || |||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| | ||||||||    
T  41808105 aatgagttggatataaatatgatgtatgatagaacattatgacatcgtttgatccatgtagtcgatctgacttagtaggataggacttggttg 41808197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Original strand, 4653481 - 4653536
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4653481 atttgattcatgtatccgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgttg 4653536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 334 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10124427 - 10124388
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10124427 gccgaacccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10124388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 325 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16014532 - 16014485
Alignment:
Q  325 atccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  16014532 atccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagggttggttgttgttg 16014485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Original strand, 29929303 - 29929338
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29929303 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 29929338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 373
Target Start/End: Original strand, 31220546 - 31220664
Alignment:
Q  254 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggga 353  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | | |||||||  | ||||  |||||||||||||| ||| |||||| | ||| || ||    
T  31220546 ttagaaaagattttgagatcaatgagttggatctaaatatgatttttgatagat-attatgatgtcatttgatccatatagtcgatcctatttaatgaga 31220644  T
Q  354 taaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  31220645 taaggtttggttgttgttgt 31220664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 315 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 35118380 - 35118321
Alignment:
Q  315 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| |||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35118380 gcgtaatttgatccatgtacccgacctcatttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 35118321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 42504501 - 42504446
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42504501 gatatgattaggaatgacatcatcagagagagagtgggggtagcacttatagtaga 42504446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 362
Target Start/End: Original strand, 1935402 - 1935464
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1935402 tgatagaacactctggcgttgtttgattcatatagccgaccccacttagtggaataaggcttg 1935464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24391080 - 24391022
Alignment:
Q  317 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24391080 gtcatttaatccaagtagcagaccccacttagtgggataaggcttgcttgctgttgttg 24391022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Original strand, 27998343 - 27998385
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagaca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27998343 cagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaca 27998385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 370
Target Start/End: Original strand, 2049271 - 2049339
Alignment:
Q  301 gatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||| || |||||| | |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2049271 gatagaccattatggcatgatttgatccatgtagccgactgcactta-tgggataaggcttggttgttgt 2049339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19137960 - 19137907
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19137960 atttgatccatgcagccaaccccacttagtgggataagggttggttgtcgttgt 19137907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 340 - 373
Target Start/End: Original strand, 32489295 - 32489328
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32489295 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 32489328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Original strand, 34119859 - 34119904
Alignment:
Q  330 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  34119859 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgatttttgttgttg 34119904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 375
Target Start/End: Original strand, 37065632 - 37065761
Alignment:
Q  247 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca-ct 345  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||||| |||||||  ||| |||||| ||||||||||| |||| ||    
T  37065632 gaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatagagcactatgaagtcgtttgattcatgtagccgaccccagct 37065731  T
Q  346 tagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  37065732 tagtgggataagactaggtcgttgttgttg 37065761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38578802 - 38578625
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  38578802 gggtagcacctctattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtaaagagaagacatgtagattatatagttagcagattagatca 38578703  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttaga 269  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||| || |||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||| ||||    
T  38578702 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattatgaaggatctaga 38578625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42408739 - 42408698
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42408739 gccgatcctacttagtgggataaggcttgattgttgttgttg 42408698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 365
Target Start/End: Original strand, 12534414 - 12534486
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 365  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||  || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  12534414 tggtttataatagaacattatggcgtaatttgatccatttagttgaccccagttagtgggatacggcttggtt 12534486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 373
Target Start/End: Original strand, 21952600 - 21952644
Alignment:
Q  329 atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21952600 atgtagccgaccccacttagtgggaaaaggctcggttgttgttgt 21952644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 244
Target Start/End: Original strand, 27799892 - 27799996
Alignment:
Q  140 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 239  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||   | |  ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27799892 ttgggcatgtagagagaagagatgtagatgttgtagtaagaagattagatcatatggaggatagtcggatcactagaggcagagtaagacctagaaaaac 27799991  T
Q  240 tatta 244  Q
    |||||    
T  27799992 tatta 27799996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 289 - 373
Target Start/End: Original strand, 39012776 - 39012860
Alignment:
Q  289 aatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |  ||||||| ||| | ||||| | |||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  39012776 aatttagtttatgatagaacactatggtgcaatttgattcatattgccgacctcacttagtgaaataagggttggttgttgttgt 39012860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41833874 - 41833795
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagta--gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||  |||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41833874 agagagttggggtagcacctatggtatagaaaagatggtggaacatatgcttaggtggtttgggcatgtagagacaagac 41833795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3563448 - 3563413
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3563448 cccacttaatgggataaggcttggttgttgttgttg 3563413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 328 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3775119 - 3775072
Alignment:
Q  328 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  3775119 catgtagccgaccccacttagtgggataaagcctgattgttgttgttg 3775072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 34194850 - 34194783
Alignment:
Q  19 aggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 86  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  34194850 aggatgttgtgttggatgtgtggtaaaactagacaggataggattagaaatgtaaacattagagagag 34194783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1104787 - 1104706
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||| || ||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  1104787 tggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcaatg-agtcgaccccacttagtggattaaggctagattgttgttgttg 1104706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 81 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4026627 - 4026529
Alignment:
Q  81 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaag 179  Q
    |||||||||  ||||| ||| || |||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||    
T  4026627 agagagagttggggtaacacgtaaagtaaaaaagatggtggaaactagtcttaggtggtttggacatgtagagaggagacctgtagattctgtagtaag 4026529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 6368282 - 6368220
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt 78  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  6368282 atgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagaatagacgagatagaattagaaatgacaacatt 6368220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 335 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15584290 - 15584252
Alignment:
Q  335 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  15584290 ccgatcccacttggtggtataaggcttggttgttgttgt 15584252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30639351 - 30639301
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||||||| | | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30639351 tttgatccatgtagtcaaccctacttagtgggataagacttggttgttgtt 30639301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Original strand, 32925105 - 32925147
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32925105 agccgaccccgcttagtgggacaaggcttggttgttgttgttg 32925147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 340 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 34191001 - 34190971
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34191001 cccacttagtgggataaggcttggttgttgt 34190971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 375
Target Start/End: Original strand, 39668904 - 39668991
Alignment:
Q  292 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcc----atgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    |||||| | | ||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39668904 ttggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtatgtagactaccccgcatagtgggataatgcttggttgtttttgttg 39668991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 41833742 - 41833656
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| |||| |||||||||||| | ||| || |||| ||||||||||| || ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||||    
T  41833742 aaatatggtttatgatagaacattttggtgtaatttaatccatgtagctgaccccgcttagtgggattatgcctggttattgttgtt 41833656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3448817 - 3448776
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3448817 tttgatccatgttgccgaccccactgagtgggataaggcttg 3448776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 5848440 - 5848403
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 46  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5848440 agcagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaaga 5848403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Original strand, 7090314 - 7090355
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  7090314 gccgaccccacttagtgggatagggcttggttgtcgttgttg 7090355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 371
Target Start/End: Original strand, 10668648 - 10668685
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10668648 gccgaccccacttattgggataaggcttggttgttgtt 10668685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18741260 - 18741227
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18741260 gccgatcccacttagtgggataagacttggttgt 18741227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 159
Target Start/End: Original strand, 27553842 - 27553899
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    ||||||||||||  || || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27553842 tatagtagaaaatatgatataaaataagcttaggtggtttgagcatgtagagagaaga 27553899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31635960 - 31635927
Alignment:
Q  342 cacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31635960 cacttggtgggataaggcttggttgttgttgttg 31635927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 38341698 - 38341641
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgt 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38341698 gggtagcagctatagtagaaaagacagtggaaaataggcttaggtggtttgggtatgt 38341641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 371
Target Start/End: Original strand, 39128269 - 39128342
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  39128269 tatgatacaacattatggcgccgtttgatacatgtagccgacctaacttagtgggatatggtttgattgttgtt 39128342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 372
Target Start/End: Original strand, 39766741 - 39766802
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| | |||||| || || |||| |||||||||||||    
T  39766741 tatggcgtaattttatccatgtagccgacctcacttactgagaaaagggttggttgttgttg 39766802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 43558172 - 43558135
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagac 52  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43558172 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagac 43558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 299; Significance: 1e-167; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 299; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 31386 - 31752
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31386 agcagagattaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31485  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31486 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31585  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31586 ttaaaagatgtagaggaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 31685  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31686 actgtgaagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 31752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44158 - 44081
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44158 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 44081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 295; Significance: 1e-165; HSPs: 176)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 8180698 - 8181060
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8180698 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 8180797  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8180798 gaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 8180897  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8180898 ttaaaagcggtagaggaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 8180997  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8180998 actatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgtt 8181060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 3865990 - 3866356
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3865990 agcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagagagagtgggggtagcacctatagta 3866089  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  3866090 aaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaa 3866189  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3866190 ttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 3866289  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3866290 actatgacatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgttg 3866356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 36183369 - 36183733
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36183369 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtaggggtagcacctatagta 36183468  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  36183469 gaaaagttggtagaaaataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaag 36183568  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36183569 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaac 36183668  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36183669 actatggtgccatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 36183733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38453053 - 38452686
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctat 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||    
T  38453053 agcagacatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcatctat 38452954  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  38452953 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaaga-tagatcaaatggaggaaagt 38452855  T
Q  205 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38452854 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 38452755  T
Q  305 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38452754 aaacactatggtgtcattcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38452686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3244015 - 3243654
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  3244015 agcagagataaggatgttgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 3243918  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3243917 aaaaagttgatggaaaataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaag 3243818  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3243817 ttaaaagaggcagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaac 3243718  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3243717 actatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 3243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Original strand, 4807510 - 4807879
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||||    
T  4807510 agcagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagagagagagagtgggggtagcacctat 4807609  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4807610 agtagaaaagttggtagaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagt 4807708  T
Q  205 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  4807709 caagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagttggatccaaattcggtgtacgata 4807808  T
Q  305 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4807809 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 4807879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 38429806 - 38430167
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38429806 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggcagcacctatagtagaaa 38429905  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38429906 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 38430005  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  38430006 aagaagtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 38430105  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38430106 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgg-tgttgttgttg 38430167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Original strand, 12734623 - 12734984
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  12734623 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaa 12734720  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12734721 aattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 12734820  T
Q  213 aagagg-tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  12734821 aagagggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacact 12734920  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12734921 atggtgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12734984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 79 - 375
Target Start/End: Original strand, 2610576 - 2610872
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||    
T  2610576 agagagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaa 2610675  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2610676 gaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatga 2610775  T
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2610776 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgttg 2610872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41197588 - 41197225
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41197588 gagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagatagagtgagggtagcacctataatagaaa 41197489  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt-a 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  41197488 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 41197389  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| | |||||||||| |    
T  41197388 aaaaaggtagagaaagacctaagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgatagaacatt 41197289  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  41197288 atggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttgatgggataaggcttggttgttgttgttg 41197225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11992466 - 11992108
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  11992466 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaa 11992369  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11992368 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaa 11992269  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | | |||||||||| ||    
T  11992268 aagaggtaaaggaagacctaagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacatta 11992169  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11992168 tggcgttatttgatccatgtagctgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgt 11992108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41763401 - 41763043
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41763401 gagatgaggatgttgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtg-gggtaacacctatagtagaaa 41763303  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41763302 agttggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 41763203  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| || | | |||||||||||      
T  41763202 aaaaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaatatgttttttgatagaacaccc 41763104  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41763103 gggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41763043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 62 - 375
Target Start/End: Original strand, 25834650 - 25834962
Alignment:
Q  62 ttaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25834650 ttaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaaga 25834749  T
Q  160 ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaa 259  Q
    |  || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  25834750 cctgtggatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggag--ttaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact-ttaaagaaaccattagaa 25834846  T
Q  260 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25834847 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 25834946  T
Q  360 ttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||    
T  25834947 ttggttgttgttgttg 25834962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 112 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451646
Alignment:
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacact 451710  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  451709 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgttg 451646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45367984 - 45367623
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  45367984 gagatgatgatgttgcgctggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtggg-gggtagcacctatagtagaaa 45367886  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  45367885 agttggtagaaaataaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagatcaaatggaggagagtctagttaa 45367786  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||    
T  45367785 aagaggtagaggaagactcaagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacacta 45367686  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  45367685 tgacgtcatttgatccatgtcgccgaccccacttagtgggataaaacttgtttgttgttgttg 45367623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 133 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7326400 - 7326158
Alignment:
Q  133 agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7326400 agatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacata 7326301  T
Q  233 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7326300 ggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 7326201  T
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7326200 agccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 7326158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18424728 - 18424378
Alignment:
Q  20 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 119  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18424728 ggatgttacgtcggatgagtggtaagactagatatgatatgattaagaatgataccattagagagagtgggtg--tagcatctatagtagaaaagttggt 18424631  T
Q  120 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||| |  ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  18424630 agaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaagattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggt 18424531  T
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18424530 agaggaagacataggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtc 18424431  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18424430 atttgatccatgta-ccgtccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 18424378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 163 - 374
Target Start/End: Original strand, 28508750 - 28508961
Alignment:
Q  163 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 262  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28508750 gtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagg 28508849  T
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28508850 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 28508949  T
Q  363 gttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||    
T  28508950 gttgttgttgtt 28508961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 98 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583630
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgga 24583808  T
Q  198 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg-- 295  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||       
T  24583807 ggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc-aaatttgagt 24583709  T
Q  296 tgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    | | |||||| |||||||| ||| |||| ||| |||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  24583708 tttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataaggcttggttgttgttgtt 24583630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Original strand, 23997539 - 23997858
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||   |||    
T  23997539 gagatgaagatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccattagagatagagtgggtgtagcacctatag---aaa 23997635  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23997636 atttggtagaaaatagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 23997735  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||||| || ||||||||| ||            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||    
T  23997736 aagaggtggaagaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaaacacta 23997823  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 347  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  23997824 tggcgttatttgattcatgtatccgaccccactta 23997858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 38434873 - 38435234
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||  || | |||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  38434873 gagatgaggatgttgcattggatgcgtggtaaaactagacgagagaagattagaaatgacaacattagagagagaattggggtagcacctatagtagaaa 38434972  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttaga-tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    || |||| |||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |    
T  38434973 agatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagtcagatca 38435072  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 311  Q
      ||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| |    
T  38435073 ctagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggtttatgattgaacatt 38435172  T
Q  312 atggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38435173 atggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 38435234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 140; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 208 - 375
Target Start/End: Original strand, 35643065 - 35643232
Alignment:
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643065 gttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 35643164  T
Q  308 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35643165 cactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 35643232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9556724 - 9556367
Alignment:
Q  17 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagtt 116  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| |     
T  9556724 tgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaacacttatagtagaaaaat- 9556626  T
Q  117 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 216  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||  |||| |||||||| ||||||  ||  |||    
T  9556625 ggtggaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtcaaactactaga 9556526  T
Q  217 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 316  Q
    || | |||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  || ||| ||| | | ||||||||||||| | || |||| |||||||||||| || ||     
T  9556525 ggcaaaggaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaagatatggtttatgatagaacattagggt 9556426  T
Q  317 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9556425 gtaatttgatacatgtagccgactccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgttg 9556367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 92 - 375
Target Start/End: Original strand, 12141545 - 12141828
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||| || | ||||| ||||| |||||    
T  12141545 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatca 12141644  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
     || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| || || |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  12141645 gattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatccaaat 12141744  T
Q  292 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     |||| |||||||||||| |||||| | |||||||| |||||||| | |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12141745 atggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaaggcttgattgttgttgttg 12141828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 195 - 373
Target Start/End: Original strand, 31959625 - 31959803
Alignment:
Q  195 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttg 294  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31959625 ggaggagagtcaggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 31959724  T
Q  295 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31959725 gtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 31959803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 148 - 371
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029867
Alignment:
Q  148 gtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 247  Q
    |||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  248 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca------tgtagccgatcc 341  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||| ||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtaggtgtagccgaccc 39029837  T
Q  342 cacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39029838 cacttagtgggataaggcttggttgttgtt 39029867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 6238110 - 6237751
Alignment:
Q  17 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta--gaaaag 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||    ||||||||| |  |  || |||    
T  6238110 tgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacatgatagaattaggaatgacaccaatgg-gagagagtggacatagcacctaaaaaaaagataag 6238012  T
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 214  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| | |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  6238011 ttggtagaaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtcaaaa 6237912  T
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 314  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| | || |||||||||||||||||    
T  6237911 gaggtagagtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacactatg 6237812  T
Q  315 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |  | |||||||| || ||| ||| |||||||| ||| | || ||||  ||||||||||||    
T  6237811 ggatgatttgatctatatagtcgaccccacttaatggaagaaagcttaattgttgttgttg 6237751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 260 - 375
Target Start/End: Original strand, 227358 - 227473
Alignment:
Q  260 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  227358 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 227457  T
Q  360 ttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||    
T  227458 ttggttgttgttgttg 227473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 253 - 375
Target Start/End: Original strand, 30306194 - 30306316
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 352  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30306194 attagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 30306293  T
Q  353 ataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30306294 ataaggcttggttgttgttgttg 30306316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 372
Target Start/End: Original strand, 18958908 - 18959192
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg----gcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtgg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||  | || |  ||| ||||| ||||| |    
T  18958908 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagtag 18959007  T
Q  188 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 287  Q
    |||| |||||||| |||||  | |  ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| || || || || || ||| | |||||||||||||     
T  18959008 atcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatca 18959107  T
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18959108 aaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 18959192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 76 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43752244 - 43751945
Alignment:
Q  76 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtgg 175  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||   |||||  ||| |    
T  43752244 attagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtag 43752145  T
Q  176 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaa 275  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| | |||  | |   |||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||    
T  43752144 tagggagagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaa 43752045  T
Q  276 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||    
T  43752044 tgagttggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgatccatgtggccgacctcacttagttggaaaaggctcagttgttgttgttg 43751945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 253 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38328488 - 38328368
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggg 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38328488 attagaaaggatttagaggtcaatgaa--ggatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 38328391  T
Q  353 ataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  38328390 ataaggcttggttgttgttgttg 38328368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 211 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 45543234 - 45543074
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacac 310  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||     
T  45543234 aaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacat 45543136  T
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  45543135 tatggcgtactttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgcttgttgttg 45543074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 215 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573128
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||| || | |||||| ||||  ||||    
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatg 43573189  T
Q  315 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43573188 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 43573128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 44437994 - 44437719
Alignment:
Q  100 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||  |||| ||  | ||| | |||||||    
T  44437994 cctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtatagatgagatggagg 44437895  T
Q  200 agagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgta 299  Q
     ||||||  | |  |||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   |||  |||| |     
T  44437894 ggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggagaaaaacatggtttt 44437795  T
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44437794 tgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 44437719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 271 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635321
Alignment:
Q  271 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3635326  T
Q  371 tgttg 375  Q
    |||||    
T  3635325 tgttg 3635321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4598928 - 4598569
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatag 106  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||   ||||||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  4598928 agcagaaatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattcaaaatgacgacattagagagagagagttggggtagcacctatag 4598829  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||| |||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||  ||| ||||| | |   ||| ||||||||| ||||||    
T  4598828 tagtaaagatggtagaaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagacttgtgaattttgtagtaagtataacagataaaatggaggggagtca 4598729  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 306  Q
     || |  |||||||| || | |||||| ||||||||  ||||| | ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  | |  | |||||||    
T  4598728 ggtcactagaggtagtggtaaacctagaaaaactatacgagaagctattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatagattttgataga 4598629  T
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 366  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4598628 acactatggcgtcatttgattcatgtaaccgattccacttagcgggataaggcttggttg 4598569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 96 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12882317 - 12882043
Alignment:
Q  96 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga---gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 192  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||   | |||   ||||||||||| ||  ||||||| |||||     
T  12882317 agcacctatactagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggca-gaggagacctgtagat--gtagatgctgtcgttcgaagagtagatcag 12882221  T
Q  193 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 292  Q
    |||||||||| || |  ||||||   | ||||||||||||  ||| |||| |||||||| | ||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  12882220 atggaggagattcta--taaaag---ttgaggaagacctataaaagctataagagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaata 12882126  T
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| | |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12882125 tggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcctacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12882043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 233 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9996766 - 9996623
Alignment:
Q  233 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  9996766 ggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgt 9996667  T
Q  333 agccgatcccactt---agtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| |||||||   || ||||||||||||||||||||||||    
T  9996666 agccgaccccacttagaagagggataaggcttggttgttgttgt 9996623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 375
Target Start/End: Original strand, 42543274 - 42543519
Alignment:
Q  130 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 229  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||  | |  |||||||| || ||||    
T  42543274 cttaggtggtttgggcatgtacagagaagacctgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagac 42543373  T
Q  230 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 329  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  || | | ||||||||| |||||||||  |||||| ||    
T  42543374 ctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacgtgctttttgatagaacgctatggcgttgtttgattca 42543473  T
Q  330 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42543474 tgtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 42543519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16097350 - 16097199
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag----agtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    |||| |||||||||||||| ||    
T  16097350 gagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacaccgttagagagagttagagtgggggtagcacctataata 16097251  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16097250 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagac 16097199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 262 - 375
Target Start/End: Original strand, 9496037 - 9496150
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  9496037 gatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggacaaggctt 9496136  T
Q  362 ggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||    
T  9496137 ggttgttgttgttg 9496150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 60 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 37481930 - 37481618
Alignment:
Q  60 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37481930 gattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagttcctatagtaaaaaagatggttgaacctaggcttaggtggtttgagcatgtagagagaaga 37481831  T
Q  160 ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaa 259  Q
    || ||  ||  ||| || || ||||| ||||| ||||||| |||| |  | |   |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  37481830 cttgtgaattttgtagttaggagagtagatcagatggaggggagttagatcactggaggtagatgaagaccaagaaaaactattagagaaactattaaga 37481731  T
Q  260 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggc 359  Q
    | ||| ||| | | ||||||||||||  |||| |||| | |||||||| | ||||| ||| |||||| ||| ||| ||| ||||| |||| |||||||||    
T  37481730 aagatctagcgataaatgagttggataaaaatatggtatttgatagaaaattatggtgtcttttgattcatctagtcgaccccacgtagtcggataaggc 37481631  T
Q  360 ttggttgttgttg 372  Q
     ||||||||||||    
T  37481630 gtggttgttgttg 37481618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 291 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12475009 - 12474927
Alignment:
Q  291 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12475009 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12474927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 188 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35755434 - 35755247
Alignment:
Q  188 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga----gttgg 283  Q
    |||| |||||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||| |    |||||    
T  35755434 atcagatggaggaaagtcatatcaaaagagggagaggaaggcctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgggttgg 35755335  T
Q  284 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35755334 atccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgtt 35755247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 371
Target Start/End: Original strand, 13149319 - 13149612
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||   |||||| || |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |       
T  13149319 agagagtgagttggggtagcacctataaacgaaaagatgatagaaaatagacttcggtggtctggccatgtagagagaagacatgtaaatgatgtagctc 13149418  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt-agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatg 277  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||  | | |||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||    
T  13149419 gaagagtagataagatggaggaaagtcagatcagaagatgttagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatg 13149518  T
Q  278 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||| | |||||||| | ||  ||||||||||| |||| | | ||||||||||| ||||||||| || ||| || |||||| |||||||||||||    
T  13149519 agtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacataatttgatccatatagccgatctcaattaatgagataagacttggttgttgtt 13149612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Original strand, 7825276 - 7825475
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatag 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  7825276 agcagagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacactattagagagagagtgttggagtagcacctatag 7825375  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    | | |||  ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| || | || || ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  7825376 ttgtaaatatggtgaaaaataagcttagttggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattctatagtcaggagagtagatgagatggaggatagtca 7825475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 373
Target Start/End: Original strand, 11412697 - 11412992
Alignment:
Q  67 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 166  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||   ||||    
T  11412697 aatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttaggttgtttgggcatttagagataagaactgtag 11412796  T
Q  167 atgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag-agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatt 265  Q
    || |||| |||   ||||| ||||| ||||||| | |||||  | |  ||||  ||||||| |||||| |||||||||||           |||||   |    
T  11412797 attctgtagtag--agagtagatcagatggaggggtagtcagatcactagagccagaggaaaacctagaaaaactattag-----------gaaaga--t 11412881  T
Q  266 tagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag---aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||   |||| ||||| || ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  11412882 tagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttg 11412981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 356
Target Start/End: Original strand, 41545325 - 41545670
Alignment:
Q  10 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt-a 108  Q
    ||||||||  |||||||  |||||||||  |||| |||||||   | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| | |    
T  41545325 gcagagatcgggatgttatgttggatgaacggtatgattagatgaggtaggattaagaatgacaccattagggagagagcgagggtaacacctataataa 41545424  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-agtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
     |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||  || ||   ||||||  |||| ||||||||  |||||    
T  41545425 aaaaagttggtagaaaatatgcttaaatagtttgagcatgtagaaagaagtctctgtagatgtcgttgt---aagagtatatcagatggaggattgtcaa 41545521  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 307  Q
    |  |||||||     |||||| | || |||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  41545522 gccaaaagagacgacggaagagcaagaaaaactataagagaaaccattataaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaa 41545621  T
Q  308 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa 356  Q
    ||||||| | | |||||||  || ||||||||| |||||| || |||||    
T  41545622 cactatgacttaatttgatttatttagccgatctcacttaatgagataa 41545670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670752
Alignment:
Q  303 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 17670752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 262 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19337004 - 19336896
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19337004 gatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccacttattgggataaagctt 19336905  T
Q  362 ggttgttgt 370  Q
    |||||||||    
T  19336904 ggttgttgt 19336896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 276 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709202
Alignment:
Q  276 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttg 39709202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 92 - 375
Target Start/End: Original strand, 6218968 - 6219249
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||||  ||| ||||| ||||  |||||    
T  6218968 gggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagaggagatatgtagattatgtagtaaggagaggtgatca 6219067  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
    ||||||||| |||    | |   |||| |||| |||||||  |||| |||| | | ||||| |||| || ||||||||| | | ||||||||| | ||||    
T  6219068 aatggaggatagtgggatcactggaggcagagaaagaccttagaaa-ctataatataaaca-ttaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaat 6219165  T
Q  292 ttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
     |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  6219166 atggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacctagttggataaggcttggttgttattgttg 6219249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13444094 - 13443907
Alignment:
Q  187 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 286  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||||  |||  |||   ||||||  | |||||| |||  |    
T  13444094 gatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaaaacttagaaaatctatgagagaaattattgaaaaaattttagatattaatgagatgggcc 13443995  T
Q  287 caaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  13443994 caaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttagttattgttgtt 13443907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23714622 - 23714384
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||||| ||||    |||||||||| |||||||    
T  23714622 agcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagt---tgggtagcacatatagta 23714526  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| |||| |||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||| ||||| |||||||||| || |||||||     
T  23714525 gaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaaa 23714426  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa 250  Q
    | |  ||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23714425 tcactagacgtagatgaagacttagaaaaactataagagaaa 23714384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24102294 - 24102056
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||||| ||||    |||||||||| |||||||    
T  24102294 agcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagt---tgggtagcacatatagta 24102198  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| |||| |||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||| ||||| |||||||||| || |||||||     
T  24102197 gaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaaa 24102098  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa 250  Q
    | |  ||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24102097 tcactagacgtagatgaagacttagaaaaactataagagaaa 24102056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 285 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 9531688 - 9531598
Alignment:
Q  285 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9531688 tccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 9531598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 293 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12520142 - 12520060
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12520142 tggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12520060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 226 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12489949 - 12489800
Alignment:
Q  226 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttga 325  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  |||| | ||||| |||||| ||||||| |||||    
T  12489949 agacctagaaaaactatatgagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatataacactttggcgtcgtttga 12489850  T
Q  326 tccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12489849 ttcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 12489800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 43238379 - 43238306
Alignment:
Q  87 agtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43238379 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagac 43238306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 214 - 369
Target Start/End: Original strand, 33504346 - 33504502
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtc-aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    ||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| |  ||| ||||||||  |||| |||| |||||||||||| ||    
T  33504346 agaggcagagaaaaacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagatttaataagttggattgaaatatggtatatgatagaacatta 33504445  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33504446 tggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 33504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 2610446 - 2610525
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2610446 agcagagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagagagag 2610525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 370
Target Start/End: Original strand, 42092437 - 42092796
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||  |||| |||||| |||||||  ||   |||||||||  ||||||| |||||| ||    
T  42092437 agcagagatgatgatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggatatgattagaaatgaca--atgttagagagagttggggtagcgcctatacta 42092534  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||||||| || | |||| || | |||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||| ||||| ||| | |||||||  ||||||     
T  42092535 gaaaagatggtagaaactaagattaggtgatctgggcatgtagagagaaggcttgtagattttgtagtaaggagagtagattagatggagggtagtcaat 42092634  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 308  Q
    | |  | ||  | ||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| ||| ||||| | ||| ||||||||    ||  | | |||||||||      
T  42092635 tcactatagagacaggtagacctagaaaaactataggagaaactattaaaaaagatgtagagattaattagttggatagtgatacgatatatgatagagg 42092734  T
Q  309 actatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    | | ||||||  ||||||||||||||| || || ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42092735 attgtggcgttgtttgatccatgtagctgaccctacttagtaggattaggcttggttgttgt 42092796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 92 - 375
Target Start/End: Original strand, 3481145 - 3481438
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||| | ||| ||||| |||||    
T  3481145 gggtagcacctatagta---aagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaaggagagtagatca 3481241  T
Q  192 aatggaggagagtca-------agttaaa-----agaggtagaggaagacctaggaaaactatt-agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
     |||||||| |||||       ||| | |     ||||| |||||||||||||| ||||  | | |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||  |    
T  3481242 gatggaggatagtcagatggacagtcagatcactagaggaagaggaagacctagaaaaaaaaatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaacaa 3481341  T
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||   |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3481342 gttggacagaaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgttg 3481438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 375
Target Start/End: Original strand, 43832087 - 43832382
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||  || | |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||| ||  || |||  ||| || |    
T  43832087 agagagagagttggggtatcacctatagtaaaaaatatg-tggaaactaggcttaggtgatttgggcatgtacagagaaaacatgtggattatgtagtta 43832185  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    | ||||| ||||| ||||||   | |||| | |  ||| | |||||||||||||   ||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||    
T  43832186 ggagagtagatcagatggagagtaatcaaatcagtagacgcagaggaagacctaaacaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatga 43832285  T
Q  279 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||    || || ||||| |||||||| |||| || ||||||||||||||||| || || |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  43832286 gttggataaggatatgatgtattatagaacattatgacggcatttgatccatgtagctgacccaacttagtttgataaggcttggttgttgttgttg 43832382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37470289 - 37470146
Alignment:
Q  217 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggc 316  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||| |  ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||     
T  37470289 ggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaaactattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggt 37470190  T
Q  317 gtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 360  Q
    ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37470189 gtagtttgatccatgtagctaatcccacttagtgggataaggct 37470146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8197640 - 8197539
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8197640 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 8197541  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  8197540 tg 8197539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8202400 - 8202299
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||  |||| || | |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8202400 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 8202301  T
Q  374 tg 375  Q
    ||    
T  8202300 tg 8202299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 181 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19235176 - 19234988
Alignment:
Q  181 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgag 279  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||| || ||||| | |||||     
T  19235176 agagtagatcagatggaggggagtcaaatcactagagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattgagaaag-atctagagattaatgat 19235078  T
Q  280 ttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    ||||||  |||| |||| | |||||||||| | || |||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19235077 ttggatagaaatatggtatttgatagaacattctgtcgtcgtttaatccatgtagccaactccacttagtgggataaggcttagttgttg 19234988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 181 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5759187 - 5758995
Alignment:
Q  181 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 280  Q
    ||||| ||||| ||||||| || |||| | |  |||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |  |  |||||| ||||| |||||||||    
T  5759187 agagtagatcagatggaggggaatcaaatcactagaggtagggaaatacctagaaaaactattagagaaactaccaagaaggatctagagatcaatgagt 5759088  T
Q  281 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||   | |  |||| | |||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5759087 tggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcaggtagctgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 5758995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Original strand, 17626284 - 17626356
Alignment:
Q  303 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17626284 tagaacactatggcgtcatttgttccatgtagccgaaccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgttg 17626356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Original strand, 33287549 - 33287705
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||  | |||||||| |||| |||| |||| |||||||||||| |||| | |    
T  33287549 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacat 33287648  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
      |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33287649 agtttgatccttgtagccaactccacttagtgggacaagacttggttgttgttgttg 33287705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 220 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 7432042 - 7431887
Alignment:
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtc 319  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||  |||||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||| ||| ||||| ||  |||| |||    
T  7432042 agaggaaaacctagaaaaactattggagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttgaataaaaatatggtatataatagatcataatggtgtc 7431943  T
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  7431942 atttgatccatgcaaccgacctcacttagtgggataaagcttagttgttgttgttg 7431887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 15025703 - 15025778
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15025703 tgatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgatgcaacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 15025778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 374
Target Start/End: Original strand, 30743686 - 30743812
Alignment:
Q  248 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 347  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| |||| | | ||||||||| || || ||| | ||||||    
T  30743686 aaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatccttgcagtcgaactcactta 30743785  T
Q  348 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30743786 gtgagataaggctttgttgttgttgtt 30743812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13241063 - 13240763
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||||||  |||  |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13241063 gataggattagaaatgacaacattagagagagaattggagtagcaagtatgttagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaga 13240964  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 254  Q
    ||||||  |||||| || | ||||| ||||| ||||      | || || || || |  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||        
T  13240963 gaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatc------atgatagccaggtcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatta-agaaa---- 13240875  T
Q  255 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggat 354  Q
           ||| ||||| | || |||||| ||| ||||||||| ||||||| | || |||| |||  |||||||| ||| ||||| ||  |||||||||||    
T  13240874 -------gatctagagattaacgagttgaatcgaaatttggtttatgataaaccattatgccgttgtttgatccgtgtcgccgacccagcttagtgggat 13240782  T
Q  355 aaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  13240781 aaggcttggttattgttgt 13240763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 293 - 374
Target Start/End: Original strand, 19863436 - 19863517
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19863436 tggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19863517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 293 - 374
Target Start/End: Original strand, 19867768 - 19867849
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19867768 tggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19867849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 293 - 374
Target Start/End: Original strand, 19872669 - 19872750
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19872669 tggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgtt 19872750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Original strand, 25384680 - 25384753
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25384680 atagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgggataaggcttggtggttgttgttg 25384753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 214 - 371
Target Start/End: Original strand, 26670891 - 26671048
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||  || ||||||||| | ||||||||||| | |||| || | |||||||||| |  ||    
T  26670891 agaggtagaggaagacctacaaaaactataaaagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttggaccaaaatatgatttatgatagaatataat 26670990  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    || || |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  26670991 ggtgtaatttgatccatgtagccgacactgcttagtgggataagacttggttattgtt 26671048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 45077670 - 45077870
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||  | | ||||||    ||||||| || |||||| ||||||||    
T  45077670 gagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactagatagaattagaaatgtgaactttagagggagagagagtttgagtagcatctatagta 45077769  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggctt---agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 205  Q
    |||||| |||| || | ||| |||   || |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  45077770 gaaaagatggtggagagtagacttgggaggtggttttggcatgtagagagaaaacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtc 45077869  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  45077870 a 45077870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 42549919 - 42549835
Alignment:
Q  291 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42549919 tttggtttatgatagaacatcatggcgtaatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgttg 42549835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10516824 - 10516749
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| || | |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10516824 tatgataaaatattatggcgtaatttgatccatgtagctgatctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10516749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Original strand, 19855585 - 19855744
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||  || |||  |||||| |||||| |||||  |||  |||| ||||||||| || |||    
T  19855585 agaggcagaggaagacctagataaactataaaagaaactattaagaaagatccagaggttaatgagctggatagaaacatggtatatgatagagcattat 19855684  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  19855685 ggcgccattcaatccatgtagccgaccccacttagtaggataaagcgtggttgttgttgt 19855744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 30743545 - 30743675
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  30743545 gagatgaggatgttgcgcatgatgagtgctaagactagacgggataggattgggaatgtcaccgttaggaagagagtg-gggtagcacttatggtagaaa 30743643  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttggg 144  Q
    | |||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  30743644 aattggtagaaattagaattagatggtttggg 30743675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19337209 - 19337069
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga-ttagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||  ||||| | ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |    
T  19337209 gagatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagacttaggcaggataggattataaatgagaacattagagagag--ttggggtagcacctatagtagta 19337112  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 158  Q
    ||| |||| ||||||| |||||    | |||||||||||||||||||    
T  19337111 aagatggtggaaaataagctta----ggttgggcatgtagagagaag 19337069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 41 - 170
Target Start/End: Original strand, 40759049 - 40759179
Alignment:
Q  41 gtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggt-agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggt 139  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||  |||| |||| |||  |||| ||||    
T  40759049 gtaagactagacaagataagattagaaatgacaacattagagagagaggttgggttagcacttatagtagaaaaaatggtggaaactagagttaggtggt 40759148  T
Q  140 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgc 170  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  40759149 ttgtgcatgtagagagaagacttttagatgc 40759179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 307 - 371
Target Start/End: Original strand, 522445 - 522509
Alignment:
Q  307 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  522445 acactatggcgtcatttgatccatgtagcagatcacacttaatgggataaggctttgttgttgtt 522509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 278 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3720510 - 3720426
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    ||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3720510 agttggatcgaaaaatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggagaaggcttg 3720426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 373
Target Start/End: Original strand, 17429252 - 17429332
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||||||||||| |||| | | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17429252 tggtatatgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 17429332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13592656 - 13592411
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||   |||| |||||| |||| || ||||  || || |||  ||||||||||||||||| |||    
T  13592656 gagatggggatgttgtgttggatgtgtggtgatattagatgggataagattagaaatggcaacattgtagggatagttggggtagcacctatagtataaa 13592557  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
      ||| | ||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||| ||  ||||||  | | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||      
T  13592556 tattg-tggaaaatagt-ttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagatattatagtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcatatttc 13592459  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaa 260  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||    
T  13592458 aagaggtataggaagacctagaagaactataagagaaactatcagaaa 13592411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26784592 - 26784350
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    |||| ||||||||| | ||||| |||| |||||||||||   || |||  ||| ||||| || || ||| | |||||||  |||||| | |  ||||| |    
T  26784592 gaaactaggcttaggttgtttgtgcatttagagagaagatatgtggattttgtagtaaggagggtagataagatggagggtagtcaaatcactagaggca 26784493  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtca 320  Q
    ||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||  |||| |||| ||||||| |||| | |||  | |    
T  26784492 gagaaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatatagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgataaaacattttggtttaa 26784393  T
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 363  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  26784392 tttgatccatgtagccaatctcacttagtaggataagacttgg 26784350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 887138 - 887065
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataa-ggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  887138 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttggtgggataatggcttggttgttgttg 887065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16521060 - 16521007
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16521060 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 16521007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 370
Target Start/End: Original strand, 45077915 - 45078008
Alignment:
Q  277 gagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||| |||| | || ||||||||||||  ||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45077915 gagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 45078008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 451986 - 451930
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattag 65  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  451986 agcagagatgagtatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgataggattag 451930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 375
Target Start/End: Original strand, 14444889 - 14444953
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14444889 tatggcgtactttgatccatgtagccatccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14444953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 235 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28960350 - 28960210
Alignment:
Q  235 aaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 333  Q
    |||||||||| |||||||  |||  |||||| ||||| | |||||||||||   | || |||| | ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  28960350 aaaactattaagagaaactgttaagaaggatctagagataaatgagttggagaaagatatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatgta 28960251  T
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    | |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28960250 gtcgactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 28960210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 374
Target Start/End: Original strand, 32402683 - 32402783
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||  ||||  ||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32402683 aatgagttggatagaaataaggtatatgatagaacattatggtttcatttgatccacgtagacgatcctgcttagtgggataagacttggctgttgttgt 32402782  T
Q  374 t 374  Q
    |    
T  32402783 t 32402783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 238
Target Start/End: Original strand, 32443668 - 32443812
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    ||||||||||||  || |||  || ||||||||| |||| | |||||||   |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| | |    
T  32443668 gtagcacctataaaaggaaatatgatagaaaatatgctttggtggtttgaaaatgtagagagaaaacttgtagatgttgtagtacgaagagtggataaga 32443767  T
Q  194 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa 238  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  32443768 tggaggatagtcagattaaaagaggtagtggaagatctagaaaaa 32443812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12470962 - 12470895
Alignment:
Q  308 cactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12470962 cactatggcgtcgtttgcttcatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttggtggttgttgttg 12470895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14398032 - 14397957
Alignment:
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14398032 atgatagaacattatggtgtcatttgttccacatagctgatcctacttagtgggataagacttggttgttgttgtt 14397957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15775898 - 15775843
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15775898 atttggtccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgttg 15775843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21281545 - 21281462
Alignment:
Q  291 tttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21281545 tttggtttacgatagaacattatggcttaatttgatccatgcagccaaccccaattagtgggataaggcttggtagttgttgtt 21281462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 264 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9394739 - 9394629
Alignment:
Q  264 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 363  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||| |||| ||| ||||| || |||||| | |||| |||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||| |    
T  9394739 tttaaaggttaatgagttggatccgaatatggtttataatagagcattatggcttaattttatccatgtagccaaccccacttggtaggataagactttg 9394640  T
Q  364 ttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||    
T  9394639 ttgttgttgtt 9394629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9647969 - 9647822
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||| |||| || ||||    | |||||  ||| || ||||||||||    
T  9647969 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataagattagaaatgtcaacatt----atagagttggggcagtacctatagta 9647874  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||| | |||| |||| |||  |||| |||||||| |||||| | |||||||    
T  9647873 gaaatgatggtggaaactagctttaggtggtttggacatgtaaaaagaagac 9647822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 371
Target Start/End: Original strand, 34931634 - 34931712
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34931634 tggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatatagccgaccgtacttagtgggacaaggcttggttgttgtt 34931712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 129
Target Start/End: Original strand, 227307 - 227360
Alignment:
Q  76 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  227307 attagagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaatagg 227360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 150
Target Start/End: Original strand, 19024150 - 19024239
Alignment:
Q  61 attaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 150  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||    
T  19024150 attagaaatgacaacattagagagagggtttgggtagcacctatatttgaaaagatggtggaaagtaagcttaggtggtttggacatgta 19024239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45483038 - 45482989
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 369  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45483038 atttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 45482989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 624759 - 624687
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||| ||||||  |  |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  624759 tgatagaacgctatggtatagtttgattcatgtagccgaccccgcttagtgggataaggcttggttgttgttg 624687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 303 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 3305879 - 3305807
Alignment:
Q  303 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  3305879 tagaacattatggcgtcgtttgatccatatagtggatcccactttgtgggataaggcttggttattgatgttg 3305807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9579053 - 9578916
Alignment:
Q  21 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggta 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||  ||   |||||||||  ||||  ||| |||||||| |||| || |     
T  9579053 gatgttgcgttggatgtgtggtaagaatagatatgatagaattaaaaatgaca--atgttagagagagttggggtgacacatatagtagtaaagatgatg 9578956  T
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
     ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9578955 taaaatagacttaggtggtttggacatgtagagagaagac 9578916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 175 - 343
Target Start/End: Original strand, 21834638 - 21834806
Alignment:
Q  175 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
    |||||||||||  ||||||| || || || ||  ||| |||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||| ||||| ||  ||||| || | |    
T  21834638 gtaagaagagtaaatcaaatagaagatagacatattacaagaggtatagaaagatctagaaaaactataagataaactattaggaaatatttatagatta 21834737  T
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatccca 343  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | |  |||| ||||||||| ||| ||||    
T  21834738 atgagttggatctaaatttggtttatgatagaacaatatgacatattttggtccatgtagtcgacccca 21834806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 76 - 160
Target Start/End: Original strand, 38860158 - 38860242
Alignment:
Q  76 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||    
T  38860158 attagatagagagtgggggcagcacccatagtagaaaagattgtggaaaataggcttaggtggtttaggcatttagaaagaagac 38860242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10403934 - 10403891
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10403934 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 10403891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Original strand, 15015154 - 15015229
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15015154 tgatagaacactctggtttcgtttgattcatgtagccgacgcaacttagtgggataaggcttggttgctgttgttg 15015229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 376
Target Start/End: Original strand, 33971534 - 33971589
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttgc 376  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33971534 tttgatccatgtagccgaccccacctagtgggatatggcatggttgttgttgttgc 33971589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Original strand, 36993742 - 36993816
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||  ||| |||| ||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36993742 tatgatatcacattatgacgtaatttgatccatgtagccta-ccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36993816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Original strand, 11017316 - 11017422
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||  ||| || ||||| || ||||||    
T  11017316 ggtagcacctatagtagaaaagatcgtggaaactcggcttaagtggtttgggtatgtggagagaagacccgtagattttgtagttagaagggtagatcaa 11017415  T
Q  193 atggagg 199  Q
    |||||||    
T  11017416 atggagg 11017422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14197437 - 14197367
Alignment:
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14197437 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggctttaggtggtttgggcatgtagagtgaagacttgtagat 14197367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29968682 - 29968624
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 360  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29968682 atagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgactccacttagtgggataaggct 29968624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 375
Target Start/End: Original strand, 33393339 - 33393393
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33393339 tttgatccatgtaaccgaccccacttactgggataaagcttggttgttgttgttg 33393393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Original strand, 38429651 - 38429693
Alignment:
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38429651 agccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 38429693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2073348 - 2073307
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2073348 tagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2073307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 276 - 373
Target Start/End: Original strand, 3030864 - 3030960
Alignment:
Q  276 tgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| ||| | |  ||||||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  3030864 tgagttggatcccaatatagattatgatacaacattatggcataattttatccatgtagc-gaccccacttagtgggataagccttggtcgttgttgt 3030960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 365
Target Start/End: Original strand, 19024387 - 19024452
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtt 365  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  19024387 tgatagaactttatggcgtcgtttgatctatatagccgaccccactcagtgggataaggcttggtt 19024452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 298 - 370
Target Start/End: Original strand, 19224988 - 19225061
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt-gggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||| |||||||||    
T  19224988 tatgatagaacactatgatgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtcggaaaaaggctcggttgttgt 19225061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 23915773 - 23915708
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataagg 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | || ||||||||    
T  23915773 tggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagccgaccccacatggtcggataagg 23915708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 334 - 375
Target Start/End: Original strand, 37520689 - 37520730
Alignment:
Q  334 gccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37520689 gccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 37520730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 327 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8560852 - 8560804
Alignment:
Q  327 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8560852 ccatgtagccgacccaacttagtgggataagacttggttgttgttgttg 8560804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 374
Target Start/End: Original strand, 15222472 - 15222528
Alignment:
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15222472 tcatttgatccatgtagccaaccccacctagtaggataagacttggttgttgttgtt 15222528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 375
Target Start/End: Original strand, 17581543 - 17581743
Alignment:
Q  175 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
    ||||||| |||  ||||||| ||||| |||||  ||  |||||||| || ||||||||| |||||||| ||||| || ||||  || |||||| |  |      
T  17581543 gtaagaaaagtatatcaaatagaggatagtcatattttaagaggtatagaaagacctagaaaaactataagagagactattacgaaagatttacatattt 17581642  T
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||| ||| |||| || | |||||||||||| |||| | |  || | || |||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  17581643 atgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacaatatgacatatttcggtctatgtagtcgatcccacttagtaggataaagtttggtggttgttgtt 17581742  T
Q  375 g 375  Q
    |    
T  17581743 g 17581743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32364999 - 32364923
Alignment:
Q  295 gtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||| || | |||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  32364999 gtgtatgatagaacattatggtgtaatttgatcaatgtagctgacctcacttaataggaaaaggcttggttgttgtt 32364923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 41858744 - 41858800
Alignment:
Q  104 tagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41858744 tagtagaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 186230 - 186135
Alignment:
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||||||  ||| | | ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  186230 atgagttggatccaaataaagtttaagatagaacatcatgtcataatttgattcatgtggccgacctcacttagtgggataaagcttggttgttgt 186135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 168
Target Start/End: Original strand, 907710 - 907757
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  907710 gaaaatagccttagatggtttgggcatgtagagagaagagttgtagat 907757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Original strand, 1648113 - 1648148
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1648113 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 1648148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2515242 - 2515171
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| | ||||||||  ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2515242 atagaatattatggcgtactttgatctatctagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgtcgttgt 2515171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 293 - 372
Target Start/End: Original strand, 7615471 - 7615550
Alignment:
Q  293 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||    
T  7615471 tggtatatgataaaacattatgtcgtcatttgatccgtctatccgataccaattagtgggataaggcctgattgttgttg 7615550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9647686 - 9647611
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||| |||| | ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||    
T  9647686 tatgatggaacattatggcatcgtttgattcatgcaaccgatcccatttaatgagataaggcttggttgttgttgt 9647611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 316 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 12026069 - 12026014
Alignment:
Q  316 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  12026069 cgtcgtttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaagtttggttgttgtt 12026014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Original strand, 13188391 - 13188426
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13188391 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 13188426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13474313 - 13474214
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||||||  ||| |||||| | |||||||| ||  || |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13474313 aatgagttggatcggaatatggtttatgataatacattatggcataatttgatctattgagtcgactccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 13474214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 300 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19334225 - 19334174
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgg 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  19334225 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgactccacttagtgg 19334174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 328 - 375
Target Start/End: Original strand, 26566292 - 26566339
Alignment:
Q  328 catgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26566292 catgtagccaaccccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgttg 26566339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 275 - 373
Target Start/End: Original strand, 26850419 - 26850517
Alignment:
Q  275 atgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt-agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| | |||| |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| || |||| |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26850419 atgagttgga-cgaaatatggtttatgataaaacattatggcgtaatttgttcgatgttagccaaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgt 26850517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18790231 - 18790105
Alignment:
Q  248 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 347  Q
    |||| ||||||| ||||| | ||||||||||  | ||||||||| || | ||||||| | ||  ||| |||  ||| |||||||| ||||| |||| |||    
T  18790231 aaaccattagaatggattcataggtcaatgaaatagatccaaatatgatttatgatataccatcatgtcgtactttcatccatgtcgccgaccccattta 18790132  T
Q  348 gtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  18790131 gtgggagaaggcttagttgttgttgtt 18790105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24583970 - 24583904
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacacc 75  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24583970 agcagagatgaagatgttgtgcgggatgagtggtaagactaaacatgatatgattaagaatgacacc 24583904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 321 - 375
Target Start/End: Original strand, 36819406 - 36819459
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  36819406 tttgatccatatagccga-cccacttagtgggataaagcttggttattgttgttg 36819459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 375
Target Start/End: Original strand, 45436965 - 45437124
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||| | |  || || ||||||||| | ||||  |||||||||||| |||| | |||||||||| ||     
T  45436965 agaggcagaggaagacctataaaaattataagagaatctagcaggaaagatttagagattaatgcattggatccaaatatggtatttgatagaacattac 45437064  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || || |||||||| |||||||| | | |||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||    
T  45437065 ggtgtaatttgatctatgtagccaacctcactcagtggg--aaggcatggttgctgttgttg 45437124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 298 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 335787 - 335710
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  335787 tatgatagaacattacggcataatttgatccatatagcaggccccacttagtaggatatagcttggttgttgttgttg 335710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Original strand, 32706472 - 32706525
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||  |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32706472 atttgatggatgtagtcgattccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 32706525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 371
Target Start/End: Original strand, 36366819 - 36366916
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || | |||| ||||||| |  | ||||||||||||||    
T  36366819 aatgagttggaccgaaatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtatccaaccccatttagtggtaataagcttggttgttgtt 36366916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 363
Target Start/End: Original strand, 440924 - 440988
Alignment:
Q  299 atgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttgg 363  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||| |||||||| |||||    
T  440924 atgatacaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgactccacttagagggataagacttgg 440988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2902028 - 2901960
Alignment:
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagcc-gatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||||| || ||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2902028 aacattatggtgtaatttgatccttgtagcccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgt 2901960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 315 - 375
Target Start/End: Original strand, 24214010 - 24214070
Alignment:
Q  315 gcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24214010 gcgtaatttaatccatgtagccgaccccaccttgtgggataagatttggttgttgttgttg 24214070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 373
Target Start/End: Original strand, 32443851 - 32443919
Alignment:
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagt-gggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  32443851 aacattatggcataatttgatccatgtagccgactccacttagtggggataagacttagttgttgttgt 32443919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Original strand, 41330131 - 41330195
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41330131 ggtaacacctttagtagaaaagatgatcaaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaa 41330195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Original strand, 44415853 - 44415905
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44415853 tttgatccatgttgccaaccctgcttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44415905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Original strand, 11414571 - 11414610
Alignment:
Q  331 gtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11414571 gtagccgacaccacttagtgggataaggcttggttgttgt 11414610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 340 - 375
Target Start/End: Original strand, 14530529 - 14530564
Alignment:
Q  340 cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14530529 cccacttagtgggataatgcttggttgttgttgttg 14530564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 375
Target Start/End: Original strand, 23354105 - 23354164
Alignment:
Q  317 gtcatttgatccatgtagccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  23354105 gtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaagattgattgttggtgttg 23354164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25284997 - 25284954
Alignment:
Q  332 tagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25284997 tagccgactccacttactgggataaggcttggttgttgttgttg 25284954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 316 - 375
Target Start/End: Original strand, 32395594 - 32395653
Alignment:
Q  316 cgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  32395594 cgtcgtttgatgcatgtagccgaccccatttagttggataaagtttggttgttgttgttg 32395653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 370
Target Start/End: Original strand, 43970020 - 43970059
Alignment:
Q  331 gtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43970020 gtagccgatctcacttagttggataaggcttggttgttgt 43970059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 318 - 372
Target Start/End: Original strand, 9078804 - 9078858
Alignment:
Q  318 tcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  9078804 tcatatgatccatgtagccgagcccacttagtgggattagatttggttgtcgttg 9078858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 345 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14520978 - 14520948
Alignment:
Q  345 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14520978 ttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 14520948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Original strand, 18188706 - 18188848
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||  |||| ||| || ||||||| |||| |||||||  |  ||||||||||| |  |||||||    
T  18188706 agatgaggatgttgtgttggatgtgtg-taaggctagacgggatatgatcagaaatgacaacattggagagag--ttggggtagcacctcttctagaaaa 18188802  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    | |||| |||  | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18188803 gatggtggaagctcgacttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 18188848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 320 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 44877486 - 44877440
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 366  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  44877486 atttggtccatgtagccgaccccacttcgtgggataaggcttagttg 44877440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 108
Target Start/End: Original strand, 17581392 - 17581485
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||   ||||||||||||||||    
T  17581392 gatggggatgttttgttggatgtgtggtaagactagatatgataagattaaaaatgacaacattgtagagatagttaaggtagcacctatagta 17581485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 367
Target Start/End: Original strand, 19015946 - 19016015
Alignment:
Q  298 tatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    |||||| ||||| |||| | || |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  |||||||||    
T  19015946 tatgattgaacaatatgacatcgtttgatccatgtagccgacctcacttagcgggataaaacttggttgt 19016015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 32541861 - 32541792
Alignment:
Q  306 aacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| |  ||||||  ||| ||||||||||||    
T  32541861 aacactatggggtcgtttgattcatgtagccgaccccacttaataagataagaattgattgttgttgttg 32541792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 371
Target Start/End: Original strand, 36650625 - 36650721
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||| |||| |||| | || ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  36650625 aatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataacgtaatttgatccgtgtagctgactccatttagt-ggataagacttggtttttgtt 36650721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 43260439 - 43260512
Alignment:
Q  126 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||| |||||| || | ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  43260439 taggcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagg 43260512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 48 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1271 - 946
Alignment:
Q  48 tagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 147  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1271 tagacaggataggattatgaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccat 1174  T
Q  148 gtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 247  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1173 gtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 1074  T
Q  248 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccactta 347  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  1073 aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccattta 974  T
Q  348 gtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  973 gtgggataaggcttggttgttgttgttg 946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 2634 - 2597
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 46  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2634 agcagagatgaggatgtttcattggatgagtggtaaga 2597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 82643 - 83000
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  82643 gagatgaggatgttgcactggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 82742  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||    ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||   |||||    
T  82743 agttggtagaaaatgggcttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaagaagggtatatcaaatggaggagagt--ggttaa 82840  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  82841 gagaggtagaggaagacctaggaaaacta-tagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacacta 82939  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  82940 tgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggcttggttgttgttgt 83000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 282 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 48207 - 48119
Alignment:
Q  282 ggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  48207 ggattcaaatatggtgtatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtaggattaggcttagttgttgt 48119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19000 - 18943
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgtt 368  Q
    ||||| ||| |||||||||| || ||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  19000 tatggtgtcgtttgatccatataaccgatgccaactagtgggataaggcttggttgtt 18943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4634 - 4278
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg-tagcacctatagtag 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4634 cagatatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagactagacatgataggattataaatgacaccattagagagagagagtggggtggcacctatagtag 4535  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4534 aaaagttggtaaaaaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaagt 4435  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaaca 309  Q
    |||||||||||          ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  4434 taaaagaggta----------taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttggtttataatagaaca 4345  T
Q  310 ctatggcgtcatttgatccatgtagccga-tcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  4344 ctatgacgttatttgatccatgtaggcgacccccatttaatgggataaggcttggttcttgttgttg 4278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 86967 - 86607
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | | | || |   | ||||||||    
T  86967 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgacaccattagagagagagagagag-ag-agagagagtagaaa 86870  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  86869 agttggtagaaaatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 86770  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 312  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  86769 aagaggtagatggagacctaggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgatagaacacta 86670  T
Q  313 tggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  86669 tgacgtaatttgatccatgtagtcggctccacttagtgggatacgacttgtttgttgttgttg 86607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 219 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25530
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 25587  T
Q  319 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25586 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 25530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25809 - 25683
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25809 agcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 25710  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25709 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 200 - 373
Target Start/End: Original strand, 16687 - 16860
Alignment:
Q  200 agagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgta 299  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |     
T  16687 agagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttt 16786  T
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16787 tgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 124; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 133 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11547
Alignment:
Q  133 agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 232  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  233 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||  || |||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttg--gtttgatagagtactatgacgtcatttgatccatgt 11590  T
Q  333 agccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||    
T  11589 agccgaccccacttagtaggataaggtttggttgctgttgttg 11547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11962 - 11810
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga--gtgtgggtagcacctatag 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  11962 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcagagagagatagtgggggtagcacctatag 11863  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11862 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 121; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 163 - 375
Target Start/End: Original strand, 4708 - 4920
Alignment:
Q  163 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 262  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| |||| | ||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  4708 gtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaagg 4807  T
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  4808 atttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataacgcttg 4907  T
Q  363 gttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||    
T  4908 gttgttgttgttg 4920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 241 - 374
Target Start/End: Original strand, 481 - 614
Alignment:
Q  241 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  481 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacc 580  T
Q  341 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  581 ccacttagtgggataaggcttgattgttgttgtt 614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 100; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 81 - 371
Target Start/End: Original strand, 7431 - 7720
Alignment:
Q  81 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaaga 180  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||   |  |||||    
T  7431 agagagagtctgggtagcacgtaaagtacaaaagtttgtagaaaacacgcttagttggtttgggcatgtagagagaaggcatgtagatgtcttcataaga 7530  T
Q  181 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 280  Q
    |||||  |||| |||||||||||| |||| ||||||| |  |  ||||| || ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||| | |||    
T  7531 agagtatatcagatggaggagagtgaagtcaaaagag-tgtatcaagacataagaaaactataagataaactattagaaaagattcagaggtcatttagt 7629  T
Q  281 tggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatc-ccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||| ||||| ||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7630 tggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagcc-atctccacttagtgggataaagcttggttgttgtt 7720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 230 - 375
Target Start/End: Original strand, 14722 - 14867
Alignment:
Q  230 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatcca 329  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14722 ctaggaaaactttaagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatcca 14821  T
Q  330 tgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| | ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14822 tgtagccaaccccacgtagtgggataaatcttggttgttgttgttg 14867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Original strand, 14626 - 14678
Alignment:
Q  106 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  14626 gtagaaaagtaggtagaaaata-gcttagatggtcggggtatgtagagagaaga 14678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 283 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 28979 - 28887
Alignment:
Q  283 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28979 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 214 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 58385 - 58224
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||  | || ||| ||||||||||||| | | || |||| |||||||||||| |||    
T  58385 agaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattat 58286  T
Q  314 ggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  58285 gtcgtaatttgatccatgtagccgacccaacttagtgggataaggcttcattattgttgttg 58224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 54; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 235 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 160462 - 160325
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtag 334  Q
    |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||  | |||||||| || | |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||    
T  160462 aaaactacaagagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtag 160363  T
Q  335 ccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 372  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  160362 ccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 160325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 262 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25554 - 25443
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggctt 361  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  ||||  | | ||||||| |||| |||||| || ||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  25554 gatttagagattaatgagttggatagaaataagttatatgataaaacattatggcttcgtttgatctatgtagtcaatcccactttgtgggataaggctt 25455  T
Q  362 ggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||    
T  25454 ggttgttgttgt 25443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1259 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1259
Description:

Target: scaffold1259; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 227 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1665 - 1520
Alignment:
Q  227 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgat 326  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||  |   |||| |  ||||||||| |||| ||| |||||||    
T  1665 gacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttaaaggttaatgagttagatctga---tggtatgagatagaacattatgacgtaatttgat 1569  T
Q  327 ccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    | ||||||| || |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  1568 caatgtagctgaccccacttattaagataaagcttggttgttgttgttg 1520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0392 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0392
Description:

Target: scaffold0392; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6857 - 6771
Alignment:
Q  288 aaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtt 374  Q
    |||| |||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  6857 aaatatggtatatgatataacattatggcataatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggctgttattgtt 6771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16438
Alignment:
Q  285 tccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||    
T  16524 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 16438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 367
Target Start/End: Original strand, 3648 - 3713
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgt 367  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  3648 atagaacattatgacgtaatttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgt 3713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3927 - 3839
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttg 362  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||||| ||||| || ||| | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  3927 aatgagttggattaaaatatggtttatgattgaacattaaggcttaatttgatcaatgtagtcgaccccaattagtgggatatggcttg 3839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 99357 - 99284
Alignment:
Q  302 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  99357 atagaacgctatggtgtcgtttgaatcatgtagccgacaccacatagtgggataaggcttggttgttgttgttg 99284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 95 - 159
Target Start/End: Original strand, 11802 - 11866
Alignment:
Q  95 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11802 tagcacctattgtagaaaagatggtaggaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 11866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 333
Target Start/End: Original strand, 39481 - 39561
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgta 333  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  39481 attaggaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacatgatggcgtaatttaatccatgta 39561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 360
Target Start/End: Original strand, 194086 - 194135
Alignment:
Q  311 tatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggct 360  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  194086 tatggtgtcatttgatccatgtagccaatcccacctagtggaataaggct 194135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 375
Target Start/End: Original strand, 19149 - 19201
Alignment:
Q  323 tgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  19149 tgatccacgtagccgaccccacttagtgagataaagtttggttgttgttgttg 19201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0179 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0179
Description:

Target: scaffold0179; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 371
Target Start/End: Original strand, 26049 - 26100
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  26049 atttgagccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttgcttgttgtt 26100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 163267 - 163192
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| ||| |||||||  ||| ||||||| ||||  |||| ||||||||||||    
T  163267 tgatagaacactatgacgtcgtttgattcatatagccgactccatttagtggaataaaacttgattgttgttgttg 163192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 322 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 40663 - 40610
Alignment:
Q  322 ttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgttg 375  Q
    ||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  40663 ttgattcatgtagccgatctcatttagtgggataatgtttggttgtcgttgttg 40610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University