View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2327_high_12 (Length: 425)

Name: NF2327_high_12
Description: NF2327
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2327_high_12
NF2327_high_12
[»] chr4 (163 HSPs)
chr4 (9-373)||(31959814-31960178)
chr4 (9-373)||(436147-436511)
chr4 (9-373)||(33227127-33227491)
chr4 (9-373)||(52569515-52569879)
chr4 (9-373)||(33190848-33191212)
chr4 (9-373)||(48174093-48174457)
chr4 (9-373)||(56375208-56375572)
chr4 (9-361)||(4440773-4441123)
chr4 (9-373)||(53707712-53708076)
chr4 (9-374)||(48622542-48622905)
chr4 (9-373)||(1777017-1777379)
chr4 (9-375)||(23906295-23906665)
chr4 (9-373)||(43433836-43434206)
chr4 (22-373)||(37797783-37798133)
chr4 (9-373)||(46582826-46583188)
chr4 (13-375)||(27450178-27450533)
chr4 (9-373)||(28236103-28236464)
chr4 (13-373)||(39100536-39100893)
chr4 (13-380)||(27983122-27983482)
chr4 (9-373)||(47265195-47265566)
chr4 (9-332)||(50286889-50287202)
chr4 (70-366)||(39708412-39708708)
chr4 (12-327)||(37773497-37773811)
chr4 (115-373)||(8286455-8286721)
chr4 (13-377)||(1793382-1793748)
chr4 (79-372)||(26037506-26037799)
chr4 (110-373)||(32479057-32479320)
chr4 (83-327)||(20192025-20192269)
chr4 (11-326)||(20591353-20591662)
chr4 (16-309)||(41009414-41009707)
chr4 (25-373)||(51421666-51422012)
chr4 (187-373)||(21236954-21237140)
chr4 (16-332)||(20601693-20602003)
chr4 (13-373)||(45204840-45205208)
chr4 (9-135)||(12494668-12494794)
chr4 (142-323)||(50679556-50679736)
chr4 (219-373)||(6957726-6957880)
chr4 (219-373)||(12494791-12494945)
chr4 (21-330)||(16002857-16003165)
chr4 (16-373)||(1211392-1211747)
chr4 (9-159)||(31458946-31459098)
chr4 (122-331)||(53518365-53518571)
chr4 (219-373)||(21528416-21528570)
chr4 (13-373)||(35690226-35690553)
chr4 (12-369)||(54470128-54470485)
chr4 (219-368)||(7947065-7947214)
chr4 (125-308)||(20821073-20821255)
chr4 (136-373)||(31961266-31961503)
chr4 (9-373)||(56224983-56225350)
chr4 (75-377)||(31897424-31897724)
chr4 (9-150)||(49987346-49987487)
chr4 (79-373)||(35555650-35555941)
chr4 (75-375)||(46372008-46372308)
chr4 (9-304)||(7092290-7092583)
chr4 (9-191)||(33709837-33710024)
chr4 (15-308)||(21106908-21107209)
chr4 (12-153)||(44047568-44047709)
chr4 (209-374)||(51811279-51811442)
chr4 (149-381)||(28351617-28351849)
chr4 (12-319)||(42639074-42639381)
chr4 (212-298)||(50862764-50862851)
chr4 (143-373)||(2589124-2589354)
chr4 (55-200)||(28497452-28497598)
chr4 (209-372)||(4548140-4548303)
chr4 (263-373)||(19154863-19154973)
chr4 (268-373)||(19969358-19969463)
chr4 (98-283)||(26356626-26356811)
chr4 (13-200)||(50662311-50662497)
chr4 (9-160)||(17900398-17900549)
chr4 (9-199)||(51252635-51252823)
chr4 (30-369)||(10208977-10209312)
chr4 (56-304)||(50680704-50680953)
chr4 (9-232)||(25257722-25257943)
chr4 (20-173)||(41192763-41192918)
chr4 (262-373)||(55007917-55008028)
chr4 (75-370)||(31339521-31339803)
chr4 (20-160)||(38570960-38571099)
chr4 (13-240)||(29398741-29398967)
chr4 (9-157)||(31403234-31403384)
chr4 (22-338)||(44360014-44360333)
chr4 (16-332)||(55578956-55579272)
chr4 (215-302)||(55809061-55809148)
chr4 (291-373)||(19061935-19062017)
chr4 (13-338)||(34233059-34233393)
chr4 (15-221)||(2588905-2589120)
chr4 (220-313)||(31043201-31043294)
chr4 (101-373)||(42285703-42285972)
chr4 (214-373)||(2557671-2557831)
chr4 (9-141)||(10775654-10775786)
chr4 (68-191)||(1427466-1427589)
chr4 (9-84)||(43070053-43070128)
chr4 (244-374)||(28550454-28550584)
chr4 (231-309)||(41009283-41009361)
chr4 (11-199)||(25755237-25755425)
chr4 (76-168)||(30621409-30621501)
chr4 (17-88)||(25967552-25967623)
chr4 (13-168)||(45175930-45176083)
chr4 (298-373)||(49939734-49939809)
chr4 (292-370)||(13262413-13262491)
chr4 (178-370)||(31459093-31459273)
chr4 (62-160)||(46715585-46715678)
chr4 (295-372)||(3979124-3979201)
chr4 (128-373)||(13805265-13805510)
chr4 (264-373)||(34208269-34208378)
chr4 (220-373)||(37488220-37488373)
chr4 (272-329)||(41729494-41729551)
chr4 (16-160)||(50471453-50471595)
chr4 (122-294)||(17666122-17666294)
chr4 (214-330)||(53540413-53540529)
chr4 (12-79)||(18966474-18966541)
chr4 (274-373)||(25575007-25575106)
chr4 (105-160)||(47611741-47611796)
chr4 (217-328)||(50287988-50288099)
chr4 (259-373)||(5306464-5306578)
chr4 (55-157)||(36557246-36557347)
chr4 (235-372)||(26024851-26024988)
chr4 (285-373)||(883360-883448)
chr4 (98-205)||(20131167-20131274)
chr4 (165-309)||(21945702-21945846)
chr4 (297-373)||(32633406-32633482)
chr4 (56-168)||(38903925-38904036)
chr4 (105-185)||(45185215-45185295)
chr4 (309-373)||(50238615-50238679)
chr4 (309-373)||(50238701-50238765)
chr4 (239-370)||(37042667-37042798)
chr4 (79-206)||(38266134-38266261)
chr4 (135-201)||(20605241-20605307)
chr4 (79-161)||(40018395-40018477)
chr4 (14-157)||(45423542-45423681)
chr4 (214-328)||(49987531-49987645)
chr4 (15-160)||(934649-934793)
chr4 (20-157)||(1380296-1380433)
chr4 (296-373)||(7066499-7066575)
chr4 (219-371)||(10775473-10775623)
chr4 (274-371)||(22873601-22873698)
chr4 (292-373)||(50869880-50869961)
chr4 (274-371)||(55388213-55388310)
chr4 (76-157)||(55768717-55768798)
chr4 (76-157)||(55832973-55833054)
chr4 (262-314)||(26510559-26510611)
chr4 (277-373)||(29398990-29399086)
chr4 (228-332)||(36198953-36199056)
chr4 (107-159)||(44860862-44860914)
chr4 (92-160)||(49738817-49738885)
chr4 (9-242)||(11389638-11389875)
chr4 (226-332)||(6478724-6478830)
chr4 (288-338)||(6958273-6958323)
chr4 (224-338)||(8598976-8599090)
chr4 (262-332)||(28486092-28486162)
chr4 (94-152)||(42293470-42293528)
chr4 (215-309)||(47612518-47612611)
chr4 (320-373)||(1328614-1328667)
chr4 (251-332)||(28485842-28485923)
chr4 (243-332)||(30621242-30621331)
chr4 (320-373)||(30634106-30634159)
chr4 (300-373)||(32339768-32339841)
chr4 (300-369)||(36255526-36255595)
chr4 (14-71)||(40933198-40933255)
chr4 (300-373)||(45209205-45209278)
chr4 (129-161)||(21214792-21214824)
chr4 (107-179)||(29182498-29182570)
chr4 (116-332)||(47372676-47372892)
chr4 (230-330)||(56439614-56439714)
[»] chr1 (157 HSPs)
chr1 (9-373)||(1210663-1211027)
chr1 (9-373)||(30202130-30202494)
chr1 (9-373)||(34792349-34792713)
chr1 (9-374)||(49347392-49347757)
chr1 (9-373)||(8671838-8672200)
chr1 (9-373)||(9592652-9593016)
chr1 (9-373)||(22090012-22090378)
chr1 (9-373)||(51440765-51441129)
chr1 (12-330)||(32230997-32231315)
chr1 (16-373)||(51601983-51602338)
chr1 (13-373)||(696191-696552)
chr1 (14-373)||(4001455-4001814)
chr1 (9-372)||(43240380-43240745)
chr1 (13-373)||(15085856-15086204)
chr1 (13-332)||(8391694-8392013)
chr1 (13-373)||(32082756-32083105)
chr1 (81-373)||(4029112-4029404)
chr1 (16-373)||(38807671-38808031)
chr1 (109-373)||(25979231-25979495)
chr1 (9-338)||(9509236-9509565)
chr1 (175-373)||(37311755-37311953)
chr1 (13-371)||(37462878-37463231)
chr1 (9-332)||(9599435-9599758)
chr1 (208-377)||(52921197-52921366)
chr1 (154-373)||(39318193-39318410)
chr1 (22-373)||(27847800-27848155)
chr1 (12-370)||(39140434-39140794)
chr1 (121-372)||(52561590-52561841)
chr1 (13-314)||(18469141-18469440)
chr1 (14-373)||(32404527-32404890)
chr1 (92-373)||(48431399-48431687)
chr1 (79-375)||(2544587-2544877)
chr1 (19-300)||(43423645-43423928)
chr1 (13-294)||(34827182-34827462)
chr1 (198-373)||(4415455-4415631)
chr1 (79-373)||(3818856-3819150)
chr1 (55-298)||(36623959-36624184)
chr1 (12-373)||(6025526-6025887)
chr1 (215-373)||(41560353-41560511)
chr1 (241-373)||(32079177-32079307)
chr1 (106-326)||(478695-478912)
chr1 (9-160)||(1661344-1661499)
chr1 (255-373)||(4707221-4707338)
chr1 (67-373)||(38868858-38869164)
chr1 (255-375)||(46423214-46423331)
chr1 (9-332)||(26016355-26016678)
chr1 (79-314)||(40416359-40416594)
chr1 (34-141)||(52561843-52561950)
chr1 (9-319)||(40419557-40419867)
chr1 (94-373)||(5338727-5338995)
chr1 (79-374)||(36339803-36340097)
chr1 (263-373)||(24020267-24020377)
chr1 (227-372)||(29128919-29129065)
chr1 (38-191)||(51812472-51812625)
chr1 (54-206)||(35828717-35828869)
chr1 (92-284)||(37263332-37263523)
chr1 (9-155)||(14226047-14226191)
chr1 (121-332)||(16272862-16273073)
chr1 (121-375)||(28528385-28528642)
chr1 (83-330)||(52832037-52832284)
chr1 (121-314)||(7762496-7762689)
chr1 (121-373)||(8796239-8796491)
chr1 (93-314)||(27637690-27637913)
chr1 (238-373)||(10200306-10200441)
chr1 (29-246)||(39894722-39894934)
chr1 (272-374)||(40568409-40568511)
chr1 (13-159)||(4379927-4380081)
chr1 (235-332)||(16142021-16142118)
chr1 (284-373)||(44941776-44941865)
chr1 (214-372)||(8342885-8343040)
chr1 (283-375)||(21769709-21769801)
chr1 (281-373)||(28090694-28090786)
chr1 (121-316)||(9002382-9002577)
chr1 (204-332)||(27520248-27520378)
chr1 (211-309)||(8628150-8628248)
chr1 (13-148)||(19936444-19936571)
chr1 (243-373)||(19936612-19936742)
chr1 (300-374)||(28533676-28533750)
chr1 (91-309)||(41611806-41612024)
chr1 (244-370)||(52532619-52532745)
chr1 (300-373)||(29577461-29577534)
chr1 (284-373)||(44751677-44751766)
chr1 (92-244)||(13827699-13827851)
chr1 (16-160)||(18793201-18793345)
chr1 (193-289)||(26299187-26299283)
chr1 (284-376)||(42337749-42337841)
chr1 (274-373)||(34444539-34444638)
chr1 (262-373)||(43375598-43375709)
chr1 (136-374)||(50771554-50771792)
chr1 (18-156)||(17815402-17815537)
chr1 (274-376)||(25715323-25715425)
chr1 (219-357)||(29807984-29808122)
chr1 (305-373)||(3777260-3777328)
chr1 (221-373)||(11941580-11941732)
chr1 (213-373)||(12930311-12930471)
chr1 (41-368)||(19908040-19908371)
chr1 (214-338)||(28511836-28511960)
chr1 (187-374)||(50806765-50806950)
chr1 (9-89)||(52442788-52442868)
chr1 (274-373)||(6084158-6084257)
chr1 (227-330)||(11331247-11331350)
chr1 (227-330)||(11489268-11489371)
chr1 (288-375)||(50257767-50257854)
chr1 (83-160)||(52073675-52073753)
chr1 (300-373)||(10569071-10569144)
chr1 (301-374)||(38877342-38877415)
chr1 (276-373)||(50636266-50636363)
chr1 (92-160)||(8343071-8343139)
chr1 (96-160)||(13827930-13827994)
chr1 (22-157)||(17275137-17275262)
chr1 (136-332)||(30834018-30834214)
chr1 (16-88)||(40920822-40920894)
chr1 (246-314)||(44905415-44905483)
chr1 (100-309)||(990522-990732)
chr1 (221-296)||(8676942-8677017)
chr1 (13-160)||(16943097-16943243)
chr1 (17-100)||(41611098-41611181)
chr1 (214-373)||(51584867-51585026)
chr1 (213-308)||(52878364-52878459)
chr1 (285-371)||(1290033-1290119)
chr1 (91-269)||(10272259-10272436)
chr1 (262-370)||(15438800-15438904)
chr1 (274-332)||(39776936-39776994)
chr1 (262-332)||(52900683-52900753)
chr1 (16-85)||(16142172-16142241)
chr1 (16-160)||(16822235-16822376)
chr1 (14-86)||(51234537-51234610)
chr1 (295-371)||(15437130-15437206)
chr1 (321-373)||(37430420-37430472)
chr1 (126-338)||(42501143-42501355)
chr1 (217-284)||(8203223-8203290)
chr1 (25-88)||(19908655-19908718)
chr1 (290-361)||(30445304-30445375)
chr1 (117-152)||(31274578-31274613)
chr1 (16-207)||(39422209-39422398)
chr1 (102-157)||(44905548-44905603)
chr1 (18-84)||(4590813-4590879)
chr1 (300-338)||(5113952-5113990)
chr1 (99-157)||(7921843-7921901)
chr1 (151-233)||(9602204-9602286)
chr1 (300-370)||(16943364-16943434)
chr1 (286-332)||(19822083-19822129)
chr1 (288-338)||(27072522-27072572)
chr1 (311-373)||(41165502-41165564)
chr1 (107-185)||(46388392-46388470)
chr1 (262-332)||(48865748-48865818)
chr1 (316-373)||(4318845-4318902)
chr1 (275-372)||(4590533-4590630)
chr1 (128-177)||(10569263-10569312)
chr1 (214-307)||(19908450-19908543)
chr1 (287-372)||(22175341-22175426)
chr1 (320-373)||(43481798-43481851)
chr1 (92-160)||(23791857-23791925)
chr1 (214-314)||(29577202-29577301)
chr1 (79-135)||(29578163-29578218)
chr1 (131-282)||(46226380-46226532)
chr1 (214-370)||(52442532-52442687)
[»] chr3 (122 HSPs)
chr3 (9-373)||(52138718-52139082)
chr3 (9-373)||(28245355-28245719)
chr3 (13-373)||(21995-22354)
chr3 (9-365)||(54278938-54279294)
chr3 (9-373)||(51447717-51448073)
chr3 (13-373)||(5168750-5169114)
chr3 (14-376)||(47233593-47233955)
chr3 (74-374)||(35033129-35033429)
chr3 (9-373)||(25191297-25191659)
chr3 (9-274)||(33272122-33272392)
chr3 (16-373)||(53519511-53519862)
chr3 (9-373)||(54128296-54128661)
chr3 (124-373)||(48508268-48508517)
chr3 (79-338)||(38850108-38850368)
chr3 (11-373)||(43694771-43695127)
chr3 (33-374)||(45289090-45289434)
chr3 (9-265)||(45728064-45728324)
chr3 (203-373)||(12096705-12096875)
chr3 (16-373)||(19676081-19676447)
chr3 (30-373)||(49503568-49503897)
chr3 (98-338)||(48953454-48953697)
chr3 (79-240)||(38060419-38060580)
chr3 (55-309)||(38430807-38431066)
chr3 (38-330)||(39600724-39601016)
chr3 (9-309)||(27917490-27917788)
chr3 (13-245)||(19736918-19737150)
chr3 (107-338)||(39235154-39235384)
chr3 (21-245)||(19757829-19758053)
chr3 (25-374)||(48734146-48734481)
chr3 (13-372)||(26490239-26490596)
chr3 (92-369)||(50960641-50960914)
chr3 (29-296)||(3186707-3186973)
chr3 (230-373)||(52156084-52156227)
chr3 (95-373)||(42510016-42510292)
chr3 (55-316)||(54425022-54425289)
chr3 (79-314)||(30294180-30294418)
chr3 (245-373)||(53262295-53262423)
chr3 (81-376)||(54364973-54365268)
chr3 (67-331)||(52678892-52679154)
chr3 (235-373)||(38060858-38060996)
chr3 (236-373)||(49042081-49042219)
chr3 (61-373)||(31454225-31454537)
chr3 (262-373)||(311309-311420)
chr3 (116-296)||(19162664-19162842)
chr3 (102-338)||(37351418-37351654)
chr3 (244-374)||(15296060-15296190)
chr3 (9-370)||(49841529-49841895)
chr3 (269-373)||(47555332-47555436)
chr3 (13-233)||(50249303-50249529)
chr3 (19-156)||(344928-345065)
chr3 (260-373)||(2133612-2133725)
chr3 (9-160)||(36820174-36820323)
chr3 (92-332)||(21200551-21200787)
chr3 (9-88)||(38850012-38850091)
chr3 (13-159)||(2340928-2341074)
chr3 (55-168)||(3987011-3987124)
chr3 (225-338)||(17022707-17022820)
chr3 (291-376)||(31566158-31566243)
chr3 (77-206)||(41842678-41842806)
chr3 (274-376)||(40106617-40106719)
chr3 (79-256)||(11581432-11581609)
chr3 (13-148)||(31337751-31337884)
chr3 (253-316)||(54422900-54422963)
chr3 (291-373)||(40273205-40273287)
chr3 (284-373)||(7895880-7895969)
chr3 (55-159)||(29600863-29600968)
chr3 (13-85)||(45236778-45236850)
chr3 (215-366)||(27893213-27893364)
chr3 (262-373)||(29601063-29601174)
chr3 (9-152)||(29817422-29817565)
chr3 (13-88)||(30345445-30345520)
chr3 (106-375)||(36303994-36304250)
chr3 (274-373)||(39208791-39208890)
chr3 (222-309)||(40116532-40116619)
chr3 (278-375)||(30797820-30797917)
chr3 (9-54)||(47542031-47542076)
chr3 (285-373)||(48532151-48532240)
chr3 (214-377)||(29475811-29475972)
chr3 (275-375)||(48712073-48712173)
chr3 (13-332)||(23534611-23534929)
chr3 (274-373)||(40991614-40991713)
chr3 (9-88)||(46568034-46568113)
chr3 (13-75)||(48953694-48953756)
chr3 (215-284)||(26990337-26990406)
chr3 (280-373)||(45374477-45374570)
chr3 (225-373)||(45486849-45487000)
chr3 (69-160)||(31453151-31453242)
chr3 (278-370)||(32170592-32170684)
chr3 (214-369)||(33755348-33755501)
chr3 (14-86)||(38054624-38054696)
chr3 (262-338)||(40116373-40116449)
chr3 (218-374)||(11284120-11284271)
chr3 (274-372)||(21862742-21862840)
chr3 (24-150)||(26388414-26388540)
chr3 (96-150)||(37534429-37534483)
chr3 (98-160)||(39535653-39535715)
chr3 (266-332)||(41842564-41842630)
chr3 (92-374)||(42026535-42026817)
chr3 (119-168)||(3870649-3870698)
chr3 (302-375)||(7278675-7278748)
chr3 (274-375)||(14415258-14415358)
chr3 (284-373)||(33271910-33271999)
chr3 (32-112)||(33307087-33307165)
chr3 (305-370)||(41529975-41530040)
chr3 (308-373)||(45834600-45834665)
chr3 (298-374)||(24778608-24778684)
chr3 (281-373)||(39781918-39782009)
chr3 (263-307)||(44571599-44571643)
chr3 (285-369)||(52927852-52927936)
chr3 (214-327)||(41482183-41482298)
chr3 (92-159)||(44134044-44134111)
chr3 (107-185)||(659541-659619)
chr3 (279-373)||(4472387-4472481)
chr3 (284-362)||(24541343-24541421)
chr3 (94-160)||(36868437-36868503)
chr3 (9-51)||(42510333-42510375)
chr3 (295-373)||(46148232-46148310)
chr3 (281-374)||(6780662-6780755)
chr3 (263-332)||(19758059-19758128)
chr3 (320-373)||(31146928-31146981)
chr3 (13-86)||(50621647-50621720)
chr3 (187-316)||(31337617-31337741)
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (13-425)||(35043389-35043801)
chr6 (9-373)||(28085294-28085658)
chr6 (9-373)||(32755837-32756203)
chr6 (13-370)||(30031178-30031535)
chr6 (13-372)||(608081-608442)
chr6 (17-373)||(5258148-5258506)
chr6 (13-376)||(9706698-9707055)
chr6 (14-332)||(5631741-5632063)
chr6 (13-338)||(20427672-20427996)
chr6 (63-373)||(12890556-12890857)
chr6 (13-373)||(9593710-9594072)
chr6 (37-338)||(21351872-21352171)
chr6 (9-330)||(14030724-14031034)
chr6 (13-245)||(10099987-10100217)
chr6 (93-330)||(33496963-33497198)
chr6 (102-373)||(30679417-30679678)
chr6 (9-304)||(28026896-28027189)
chr6 (214-373)||(34143765-34143924)
chr6 (214-373)||(34156381-34156540)
chr6 (163-332)||(5080912-5081081)
chr6 (140-268)||(7133795-7133923)
chr6 (140-268)||(7136718-7136846)
chr6 (20-338)||(6055806-6056123)
chr6 (97-326)||(2689646-2689868)
chr6 (213-375)||(5095956-5096118)
chr6 (254-373)||(3206459-3206578)
chr6 (13-124)||(5080777-5080888)
chr6 (9-160)||(33083976-33084127)
chr6 (13-333)||(26291700-26292019)
chr6 (99-327)||(24665818-24666047)
chr6 (261-374)||(34934829-34934942)
chr6 (92-374)||(31818533-31818814)
chr6 (259-373)||(31818999-31819113)
chr6 (12-311)||(10617296-10617586)
chr6 (214-373)||(34505-34664)
chr6 (19-179)||(9568588-9568750)
chr6 (292-371)||(30789076-30789155)
chr6 (242-373)||(10098896-10099025)
chr6 (13-316)||(25493907-25494210)
chr6 (9-89)||(33998288-33998368)
chr6 (67-185)||(2079317-2079434)
chr6 (81-332)||(7513430-7513683)
chr6 (253-373)||(5897619-5897739)
chr6 (94-154)||(8364575-8364635)
chr6 (18-154)||(6641628-6641764)
chr6 (287-374)||(12119641-12119729)
chr6 (13-101)||(33496106-33496194)
chr6 (300-375)||(1615221-1615296)
chr6 (12-87)||(5129123-5129198)
chr6 (279-373)||(4245872-4245966)
chr6 (9-159)||(12134115-12134265)
chr6 (13-107)||(2065018-2065116)
chr6 (34-131)||(5095816-5095913)
chr6 (214-338)||(8364679-8364803)
chr6 (83-147)||(21870299-21870363)
chr6 (138-373)||(579465-579700)
chr6 (234-332)||(1747986-1748084)
chr6 (253-371)||(7492551-7492669)
chr6 (296-373)||(38976-39053)
chr6 (9-168)||(7150526-7150682)
chr6 (93-309)||(31831922-31832139)
chr6 (13-77)||(2689578-2689642)
chr6 (9-52)||(6293690-6293733)
chr6 (274-373)||(12133902-12134001)
chr6 (276-330)||(9568884-9568938)
chr6 (262-332)||(14389202-14389272)
chr6 (181-242)||(3963889-3963950)
chr6 (301-338)||(21886314-21886351)
chr6 (228-284)||(38900-38956)
chr6 (99-159)||(43266-43326)
chr6 (288-332)||(7513031-7513075)
chr6 (100-244)||(9749353-9749497)
chr6 (302-374)||(18130813-18130885)
[»] chr7 (158 HSPs)
chr7 (9-373)||(37617862-37618227)
chr7 (9-373)||(12841275-12841639)
chr7 (12-374)||(34869341-34869703)
chr7 (9-373)||(11593878-11594242)
chr7 (9-366)||(35906208-35906565)
chr7 (9-373)||(49029194-49029557)
chr7 (9-320)||(13859061-13859372)
chr7 (13-373)||(39906372-39906730)
chr7 (9-373)||(33349806-33350170)
chr7 (9-371)||(46355858-46356219)
chr7 (13-373)||(45836482-45836840)
chr7 (15-373)||(43281600-43281956)
chr7 (9-373)||(44855174-44855536)
chr7 (9-296)||(31005141-31005428)
chr7 (56-370)||(6374833-6375147)
chr7 (11-373)||(36651914-36652274)
chr7 (14-332)||(35559034-35559353)
chr7 (56-373)||(29650349-29650666)
chr7 (13-373)||(43491230-43491590)
chr7 (13-373)||(38606927-38607274)
chr7 (91-373)||(31682602-31682884)
chr7 (77-373)||(2885722-2886018)
chr7 (9-247)||(33072872-33073108)
chr7 (94-373)||(22349623-22349902)
chr7 (92-331)||(36869286-36869525)
chr7 (16-314)||(23404343-23404640)
chr7 (101-373)||(15682184-15682456)
chr7 (14-374)||(36136687-36137047)
chr7 (22-370)||(28627936-28628284)
chr7 (130-373)||(32631615-32631846)
chr7 (208-376)||(40979925-40980093)
chr7 (204-373)||(38900070-38900238)
chr7 (13-330)||(47848596-47848912)
chr7 (164-371)||(31681022-31681226)
chr7 (142-373)||(7273151-7273382)
chr7 (13-203)||(7272961-7273151)
chr7 (149-338)||(24598222-24598411)
chr7 (26-377)||(8492232-8492580)
chr7 (13-133)||(32630517-32630636)
chr7 (16-308)||(43282330-43282626)
chr7 (9-209)||(36514371-36514569)
chr7 (13-245)||(25579205-25579431)
chr7 (55-195)||(46014359-46014498)
chr7 (226-374)||(48919247-48919395)
chr7 (13-282)||(7189310-7189593)
chr7 (213-373)||(9210704-9210864)
chr7 (248-373)||(27648937-27649062)
chr7 (16-200)||(39811882-39812066)
chr7 (242-373)||(21078068-21078199)
chr7 (147-373)||(1011103-1011328)
chr7 (9-373)||(36101777-36102129)
chr7 (109-330)||(38135256-38135476)
chr7 (9-88)||(36869574-36869653)
chr7 (263-372)||(34035155-34035264)
chr7 (13-158)||(42187393-42187537)
chr7 (214-375)||(45601599-45601760)
chr7 (9-367)||(5335840-5336193)
chr7 (94-373)||(12966025-12966298)
chr7 (278-373)||(28208328-28208423)
chr7 (13-198)||(19262609-19262791)
chr7 (10-106)||(24598409-24598509)
chr7 (9-160)||(14593679-14593834)
chr7 (55-373)||(26741894-26742215)
chr7 (9-160)||(30200176-30200323)
chr7 (267-373)||(33073105-33073211)
chr7 (10-159)||(28020883-28021032)
chr7 (16-373)||(48735901-48736256)
chr7 (79-159)||(27021906-27021986)
chr7 (92-200)||(40169650-40169758)
chr7 (138-332)||(1569063-1569257)
chr7 (9-160)||(16013202-16013357)
chr7 (226-372)||(34745882-34746028)
chr7 (9-199)||(1740715-1740909)
chr7 (147-314)||(1531420-1531587)
chr7 (224-327)||(21517426-21517529)
chr7 (224-375)||(37976368-37976519)
chr7 (92-163)||(38920795-38920866)
chr7 (126-309)||(48202766-48202949)
chr7 (114-248)||(6420615-6420749)
chr7 (238-372)||(14057625-14057759)
chr7 (238-372)||(14367653-14367787)
chr7 (188-338)||(19119459-19119608)
chr7 (295-373)||(31869102-31869180)
chr7 (235-332)||(36239837-36239934)
chr7 (55-160)||(41948480-41948585)
chr7 (221-373)||(42187572-42187723)
chr7 (211-338)||(44951274-44951402)
chr7 (92-299)||(28562440-28562647)
chr7 (145-332)||(33139208-33139395)
chr7 (266-373)||(47652722-47652829)
chr7 (92-282)||(18605237-18605427)
chr7 (92-190)||(35713696-35713794)
chr7 (9-160)||(40830146-40830292)
chr7 (269-370)||(47852265-47852366)
chr7 (10-168)||(40139124-40139279)
chr7 (81-157)||(45558352-45558428)
chr7 (97-160)||(7220750-7220813)
chr7 (262-377)||(8519042-8519157)
chr7 (300-371)||(24777170-24777241)
chr7 (235-370)||(40149016-40149150)
chr7 (214-332)||(44401168-44401284)
chr7 (38-150)||(47796359-47796473)
chr7 (22-88)||(1523747-1523813)
chr7 (92-282)||(18637563-18637753)
chr7 (92-282)||(18650997-18651187)
chr7 (278-372)||(24177628-24177721)
chr7 (274-375)||(33732017-33732116)
chr7 (263-361)||(42969870-42969968)
chr7 (245-330)||(35922407-35922492)
chr7 (83-206)||(5418071-5418195)
chr7 (9-160)||(24549906-24550051)
chr7 (16-88)||(27021991-27022063)
chr7 (262-373)||(27893563-27893674)
chr7 (278-373)||(30814125-30814220)
chr7 (21-148)||(45841206-45841332)
chr7 (145-223)||(26925264-26925342)
chr7 (248-373)||(28355322-28355448)
chr7 (109-199)||(30144793-30144883)
chr7 (262-332)||(31859046-31859116)
chr7 (253-380)||(40415169-40415302)
chr7 (304-373)||(1523856-1523925)
chr7 (81-158)||(30632958-30633035)
chr7 (299-372)||(34029677-34029750)
chr7 (94-198)||(3457368-3457471)
chr7 (289-373)||(25891086-25891170)
chr7 (317-373)||(31005431-31005487)
chr7 (265-373)||(33103100-33103208)
chr7 (277-357)||(34926538-34926618)
chr7 (309-373)||(40630652-40630716)
chr7 (292-332)||(45558531-45558571)
chr7 (274-373)||(2882736-2882835)
chr7 (121-168)||(9797909-9797956)
chr7 (288-375)||(20158669-20158756)
chr7 (93-152)||(27893769-27893828)
chr7 (92-167)||(30914674-30914749)
chr7 (274-373)||(34341395-34341494)
chr7 (29-88)||(35713617-35713676)
chr7 (67-134)||(37439580-37439647)
chr7 (288-338)||(26332908-26332958)
chr7 (9-83)||(29653844-29653918)
chr7 (13-154)||(40008636-40008777)
chr7 (291-373)||(48515475-48515557)
chr7 (92-160)||(6429156-6429225)
chr7 (292-373)||(14593953-14594034)
chr7 (292-373)||(16013476-16013557)
chr7 (79-148)||(23720829-23720898)
chr7 (214-307)||(24549754-24549847)
chr7 (30-87)||(25731639-25731696)
chr7 (55-160)||(25826683-25826788)
chr7 (289-370)||(36245259-36245340)
chr7 (292-374)||(38921085-38921169)
chr7 (60-133)||(42177255-42177328)
chr7 (218-327)||(43281958-43282066)
chr7 (274-314)||(5577546-5577586)
chr7 (181-373)||(7220846-7221038)
chr7 (214-338)||(22174123-22174247)
chr7 (57-185)||(28858012-28858138)
chr7 (224-372)||(38103616-38103762)
[»] chr8 (133 HSPs)
chr8 (9-373)||(36545065-36545431)
chr8 (9-373)||(36565241-36565605)
chr8 (9-372)||(36394949-36395314)
chr8 (9-373)||(40813240-40813606)
chr8 (57-373)||(11523723-11524040)
chr8 (9-325)||(39946775-39947091)
chr8 (13-373)||(42854004-42854364)
chr8 (9-332)||(2796473-2796794)
chr8 (93-370)||(12491141-12491418)
chr8 (13-314)||(18125097-18125395)
chr8 (38-373)||(21121105-21121427)
chr8 (63-370)||(8932676-8932982)
chr8 (13-374)||(45419161-45419518)
chr8 (165-373)||(42469727-42469935)
chr8 (13-373)||(8879446-8879800)
chr8 (13-292)||(37077687-37077952)
chr8 (14-374)||(29520583-29520932)
chr8 (111-330)||(26904950-26905168)
chr8 (192-373)||(2027631-2027812)
chr8 (13-251)||(18751998-18752233)
chr8 (23-314)||(32043522-32043813)
chr8 (218-373)||(14742082-14742234)
chr8 (94-338)||(43904700-43904947)
chr8 (9-373)||(39953264-39953628)
chr8 (14-309)||(10079971-10080264)
chr8 (241-373)||(25473403-25473535)
chr8 (116-332)||(30559718-30559934)
chr8 (253-373)||(15215412-15215532)
chr8 (262-374)||(44529396-44529508)
chr8 (13-309)||(45512558-45512856)
chr8 (149-332)||(12025847-12026021)
chr8 (11-157)||(13171865-13172011)
chr8 (83-344)||(29700268-29700529)
chr8 (9-194)||(30748377-30748560)
chr8 (15-185)||(6510616-6510784)
chr8 (42-191)||(7046285-7046434)
chr8 (239-372)||(25288912-25289045)
chr8 (239-372)||(25300247-25300380)
chr8 (264-373)||(44047532-44047641)
chr8 (9-85)||(12492130-12492206)
chr8 (122-314)||(9904941-9905132)
chr8 (220-375)||(35914599-35914754)
chr8 (9-371)||(16917102-16917462)
chr8 (100-369)||(32930970-32931238)
chr8 (13-367)||(16351312-16351653)
chr8 (262-373)||(490506-490617)
chr8 (214-373)||(2216411-2216568)
chr8 (43-158)||(9695583-9695698)
chr8 (102-373)||(35643608-35643872)
chr8 (9-229)||(39760572-39760788)
chr8 (25-160)||(44681252-44681387)
chr8 (60-161)||(12796912-12797011)
chr8 (15-168)||(2518597-2518749)
chr8 (13-154)||(30113416-30113557)
chr8 (9-105)||(25288820-25288916)
chr8 (9-105)||(25300155-25300251)
chr8 (79-332)||(13589474-13589720)
chr8 (13-88)||(15215556-15215631)
chr8 (219-373)||(23492163-23492316)
chr8 (243-369)||(45041320-45041445)
chr8 (175-371)||(7531646-7531842)
chr8 (9-206)||(36143287-36143480)
chr8 (127-373)||(42584407-42584640)
chr8 (13-308)||(5908564-5908863)
chr8 (213-304)||(28169514-28169605)
chr8 (9-144)||(30456441-30456575)
chr8 (181-372)||(35362651-35362842)
chr8 (9-143)||(42493536-42493668)
chr8 (214-373)||(43733330-43733488)
chr8 (96-206)||(10824331-10824441)
chr8 (13-133)||(13986416-13986536)
chr8 (288-372)||(36143538-36143622)
chr8 (14-154)||(39051065-39051205)
chr8 (188-291)||(5266027-5266129)
chr8 (214-373)||(30812816-30812975)
chr8 (79-160)||(2776442-2776524)
chr8 (94-160)||(18474173-18474239)
chr8 (32-241)||(25985462-25985668)
chr8 (13-338)||(30783077-30783400)
chr8 (211-291)||(28269761-28269840)
chr8 (14-318)||(33827812-33828116)
chr8 (220-344)||(38391922-38392046)
chr8 (274-373)||(10824189-10824288)
chr8 (237-296)||(25439471-25439530)
chr8 (214-373)||(30198266-30198425)
chr8 (55-206)||(44373740-44373891)
chr8 (39-160)||(78988-79112)
chr8 (294-332)||(36042401-36042439)
chr8 (263-332)||(31715992-31716061)
chr8 (301-373)||(1928587-1928659)
chr8 (301-373)||(10668497-10668569)
chr8 (222-338)||(17491689-17491805)
chr8 (92-160)||(25985813-25985880)
chr8 (229-373)||(39967499-39967643)
chr8 (92-152)||(41444547-41444607)
chr8 (13-160)||(41971991-41972134)
chr8 (263-374)||(26363660-26363769)
chr8 (235-377)||(4955335-4955477)
chr8 (16-86)||(16252860-16252930)
chr8 (290-372)||(18473973-18474055)
chr8 (217-331)||(27037761-27037875)
chr8 (118-332)||(29735834-29736048)
chr8 (154-256)||(38178377-38178479)
chr8 (300-373)||(32569710-32569783)
chr8 (55-146)||(33666726-33666814)
chr8 (284-373)||(8255531-8255622)
chr8 (13-88)||(29735728-29735804)
chr8 (228-344)||(30456323-30456439)
chr8 (18-86)||(36069570-36069638)
chr8 (79-158)||(6483245-6483324)
chr8 (95-134)||(7103274-7103313)
chr8 (55-206)||(11733711-11733862)
chr8 (239-338)||(14459043-14459142)
chr8 (197-324)||(24399838-24399965)
chr8 (83-154)||(34196064-34196135)
chr8 (321-375)||(12611727-12611781)
chr8 (278-332)||(16035768-16035822)
chr8 (18-84)||(25439394-25439460)
chr8 (98-160)||(29645044-29645106)
chr8 (311-373)||(35323993-35324055)
chr8 (214-332)||(41444380-41444501)
chr8 (219-332)||(14903689-14903802)
chr8 (79-160)||(23023231-23023312)
chr8 (300-369)||(26055630-26055699)
chr8 (300-373)||(32276894-32276967)
chr8 (292-373)||(38901819-38901900)
chr8 (288-373)||(41031420-41031505)
chr8 (288-373)||(41031526-41031611)
chr8 (211-243)||(28255022-28255054)
chr8 (215-251)||(29709821-29709857)
chr8 (100-168)||(38689547-38689615)
chr8 (9-65)||(43732485-43732541)
chr8 (274-370)||(44699649-44699745)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (9-373)||(31386-31750)
scaffold0018 (83-160)||(44081-44158)
[»] chr5 (117 HSPs)
chr5 (9-373)||(12492384-12492751)
chr5 (9-373)||(24178428-24178792)
chr5 (17-373)||(4496308-4496666)
chr5 (9-365)||(1287587-1287953)
chr5 (9-373)||(28976859-28977221)
chr5 (9-373)||(1275183-1275546)
chr5 (13-374)||(3301766-3302127)
chr5 (9-371)||(2075475-2075838)
chr5 (56-366)||(38684932-38685242)
chr5 (9-373)||(10639215-10639584)
chr5 (13-375)||(16347378-16347738)
chr5 (39-373)||(14665658-14665994)
chr5 (9-373)||(34272940-34273295)
chr5 (94-372)||(20456776-20457054)
chr5 (22-373)||(26884689-26885040)
chr5 (149-373)||(2915496-2915719)
chr5 (180-373)||(13561386-13561579)
chr5 (55-326)||(14749271-14749542)
chr5 (222-373)||(29816513-29816664)
chr5 (187-371)||(14911268-14911452)
chr5 (123-369)||(38501422-38501668)
chr5 (9-332)||(36215418-36215729)
chr5 (13-373)||(27816-28164)
chr5 (235-374)||(16913881-16914021)
chr5 (38-314)||(31635979-31636253)
chr5 (13-327)||(32516480-32516791)
chr5 (12-309)||(17340500-17340798)
chr5 (29-332)||(6888931-6889234)
chr5 (55-373)||(7359261-7359577)
chr5 (98-373)||(1525651-1525923)
chr5 (55-373)||(6859345-6859663)
chr5 (14-309)||(21952274-21952573)
chr5 (83-284)||(2712936-2713137)
chr5 (244-373)||(28276391-28276520)
chr5 (9-332)||(10082786-10083102)
chr5 (22-154)||(15168721-15168855)
chr5 (102-344)||(30588460-30588700)
chr5 (79-373)||(79501-79795)
chr5 (264-373)||(5558314-5558423)
chr5 (69-374)||(43557832-43558133)
chr5 (9-151)||(11002645-11002785)
chr5 (271-373)||(30213755-30213857)
chr5 (79-373)||(14667751-14668053)
chr5 (13-373)||(7678402-7678759)
chr5 (76-256)||(15489609-15489789)
chr5 (94-373)||(43475243-43475521)
chr5 (46-251)||(42199243-42199446)
chr5 (9-98)||(20318905-20318989)
chr5 (40-168)||(418190-418318)
chr5 (92-160)||(33667217-33667285)
chr5 (274-373)||(32442126-32442224)
chr5 (227-373)||(42504247-42504393)
chr5 (121-316)||(23979976-23980169)
chr5 (92-256)||(28676596-28676760)
chr5 (92-338)||(18350937-18351189)
chr5 (213-372)||(25938091-25938250)
chr5 (220-373)||(11675658-11675812)
chr5 (193-307)||(15168873-15168987)
chr5 (11-85)||(28186956-28187030)
chr5 (252-338)||(39040917-39041003)
chr5 (9-134)||(219692-219817)
chr5 (214-338)||(9235172-9235294)
chr5 (118-231)||(15986879-15986992)
chr5 (262-338)||(418069-418145)
chr5 (241-311)||(2552932-2553002)
chr5 (128-285)||(9917538-9917695)
chr5 (259-373)||(20367061-20367175)
chr5 (118-244)||(36200769-36200894)
chr5 (253-375)||(2393039-2393163)
chr5 (254-375)||(31220546-31220666)
chr5 (22-159)||(31906592-31906729)
chr5 (300-373)||(32366187-32366260)
chr5 (300-373)||(38132545-38132618)
chr5 (20-88)||(5305545-5305613)
chr5 (128-232)||(11675547-11675651)
chr5 (213-309)||(14725640-14725736)
chr5 (302-373)||(408494-408565)
chr5 (234-373)||(2090556-2090695)
chr5 (292-371)||(3442873-3442952)
chr5 (282-373)||(18855798-18855889)
chr5 (111-206)||(21093772-21093867)
chr5 (102-294)||(29938126-29938314)
chr5 (147-286)||(33157918-33158057)
chr5 (14-113)||(34039960-34040059)
chr5 (82-373)||(38684471-38684762)
chr5 (288-370)||(7640510-7640592)
chr5 (11-73)||(36200702-36200764)
chr5 (253-373)||(28411838-28411958)
chr5 (265-373)||(36551320-36551428)
chr5 (95-159)||(37065533-37065597)
chr5 (55-110)||(42504446-42504501)
chr5 (214-372)||(12576861-12577019)
chr5 (215-364)||(15588399-15588546)
chr5 (11-53)||(27998343-27998385)
chr5 (216-373)||(29922409-29922566)
chr5 (218-371)||(33667562-33667715)
chr5 (92-269)||(38578625-38578802)
chr5 (8-84)||(9234986-9235062)
chr5 (140-244)||(27799892-27799996)
chr5 (83-160)||(41833795-41833874)
chr5 (19-86)||(34194783-34194850)
chr5 (247-338)||(37065632-37065723)
chr5 (149-332)||(43035039-43035222)
chr5 (81-179)||(4026529-4026627)
chr5 (16-78)||(6368220-6368282)
chr5 (9-46)||(5848403-5848440)
chr5 (311-380)||(9234106-9234175)
chr5 (305-374)||(27386554-27386623)
chr5 (102-159)||(27553842-27553899)
chr5 (92-149)||(38341641-38341698)
chr5 (300-373)||(42576219-42576292)
chr5 (15-52)||(43558135-43558172)
chr5 (46-86)||(2788583-2788623)
chr5 (214-338)||(6788190-6788314)
chr5 (277-373)||(21193652-21193748)
chr5 (262-298)||(41894237-41894273)
chr5 (301-373)||(42272687-42272759)
[»] chr2 (115 HSPs)
chr2 (9-373)||(3865990-3866354)
chr2 (9-371)||(8180698-8181060)
chr2 (13-373)||(38429806-38430165)
chr2 (9-375)||(38452684-38453053)
chr2 (9-373)||(36183369-36183733)
chr2 (9-372)||(3243654-3244015)
chr2 (9-373)||(4807510-4807877)
chr2 (13-373)||(12734623-12734982)
chr2 (13-374)||(11992107-11992466)
chr2 (13-373)||(41197227-41197588)
chr2 (13-373)||(41763043-41763401)
chr2 (79-373)||(2610576-2610870)
chr2 (13-373)||(45367625-45367984)
chr2 (62-373)||(25834650-25834960)
chr2 (20-374)||(18424377-18424728)
chr2 (112-373)||(451648-451909)
chr2 (133-373)||(7326160-7326400)
chr2 (98-373)||(24583631-24583907)
chr2 (163-378)||(28508750-28508965)
chr2 (13-332)||(23997539-23997843)
chr2 (13-373)||(38434873-38435234)
chr2 (17-373)||(9556369-9556724)
chr2 (17-314)||(6237812-6238110)
chr2 (148-332)||(39029638-39029822)
chr2 (208-373)||(35643065-35643230)
chr2 (195-374)||(31959625-31959804)
chr2 (92-373)||(12141545-12141826)
chr2 (76-338)||(43751982-43752244)
chr2 (9-366)||(4598569-4598928)
chr2 (13-160)||(16097199-16097350)
chr2 (253-373)||(30306194-30306314)
chr2 (92-372)||(18958908-18959192)
chr2 (100-373)||(44437721-44437994)
chr2 (271-373)||(3635323-3635425)
chr2 (233-374)||(9996622-9996766)
chr2 (260-373)||(227358-227471)
chr2 (211-372)||(45543074-45543234)
chr2 (9-206)||(7825276-7825475)
chr2 (10-326)||(41545325-41545640)
chr2 (96-373)||(12882045-12882317)
chr2 (215-373)||(43573130-43573287)
chr2 (79-371)||(13149319-13149612)
chr2 (60-372)||(37481618-37481930)
chr2 (9-250)||(23714384-23714622)
chr2 (9-250)||(24102056-24102294)
chr2 (130-373)||(42543274-42543517)
chr2 (87-160)||(43238306-43238379)
chr2 (9-88)||(2610446-2610525)
chr2 (262-373)||(9496037-9496148)
chr2 (188-371)||(35755247-35755434)
chr2 (253-373)||(38328370-38328488)
chr2 (92-373)||(6218968-6219247)
chr2 (181-369)||(19234988-19235176)
chr2 (9-285)||(42092437-42092711)
chr2 (13-206)||(45077670-45077870)
chr2 (67-373)||(11412697-11412992)
chr2 (55-191)||(13240927-13241063)
chr2 (226-373)||(12489802-12489949)
chr2 (13-144)||(30743545-30743675)
chr2 (13-158)||(19337069-19337209)
chr2 (219-373)||(33287549-33287703)
chr2 (41-170)||(40759049-40759179)
chr2 (13-316)||(13592354-13592656)
chr2 (262-370)||(19336896-19337004)
chr2 (276-372)||(39709202-39709298)
chr2 (300-375)||(12474925-12475000)
chr2 (187-373)||(13443908-13444094)
chr2 (248-373)||(30743686-30743811)
chr2 (9-65)||(451930-451986)
chr2 (181-373)||(5758995-5759187)
chr2 (285-373)||(9531600-9531688)
chr2 (289-373)||(12520062-12520146)
chr2 (94-238)||(32443668-32443812)
chr2 (9-160)||(9647822-9647969)
chr2 (303-373)||(17670680-17670750)
chr2 (235-380)||(28960204-28960350)
chr2 (76-129)||(227307-227360)
chr2 (61-150)||(19024150-19024239)
chr2 (92-206)||(3481145-3481256)
chr2 (21-160)||(9578916-9579053)
chr2 (292-344)||(19334181-19334233)
chr2 (214-338)||(26670891-26671015)
chr2 (214-369)||(33504346-33504502)
chr2 (76-160)||(38860158-38860242)
chr2 (93-199)||(11017316-11017422)
chr2 (99-168)||(14197367-14197437)
chr2 (295-373)||(15025698-15025776)
chr2 (300-374)||(17429259-17429333)
chr2 (175-316)||(21834638-21834779)
chr2 (193-297)||(4682253-4682357)
chr2 (104-160)||(41858744-41858800)
chr2 (121-168)||(907710-907757)
chr2 (217-332)||(37470174-37470289)
chr2 (9-75)||(24583904-24583970)
chr2 (277-370)||(45077915-45078008)
chr2 (289-373)||(19863432-19863516)
chr2 (289-373)||(19867764-19867848)
chr2 (289-373)||(19872665-19872749)
chr2 (93-157)||(41330131-41330195)
chr2 (274-373)||(8197541-8197640)
chr2 (274-373)||(8202301-8202400)
chr2 (214-309)||(45436965-45437060)
chr2 (303-373)||(17626284-17626354)
chr2 (14-159)||(18188706-18188848)
chr2 (214-376)||(19855585-19855747)
chr2 (274-328)||(36650625-36650679)
chr2 (213-315)||(37452284-37452386)
chr2 (288-373)||(3481351-3481436)
chr2 (15-108)||(17581392-17581485)
chr2 (126-199)||(43260439-43260512)
chr2 (278-338)||(3720450-3720510)
chr2 (79-159)||(12905082-12905162)
chr2 (291-331)||(23915735-23915775)
chr2 (274-314)||(28966260-28966300)
chr2 (94-166)||(44411715-44411787)
[»] scaffold0570 (2 HSPs)
scaffold0570 (48-373)||(948-1271)
scaffold0570 (9-46)||(2597-2634)
[»] scaffold0024 (2 HSPs)
scaffold0024 (13-374)||(82643-83001)
scaffold0024 (282-370)||(48119-48207)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (11-332)||(4322-4634)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (13-373)||(86609-86967)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (200-377)||(16687-16864)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (9-135)||(25683-25809)
scaffold0157 (219-373)||(25532-25686)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (9-159)||(11810-11962)
scaffold0113 (133-373)||(11549-11787)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (163-373)||(4708-4918)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (81-371)||(7431-7720)
[»] scaffold1318 (1 HSPs)
scaffold1318 (241-373)||(481-613)
[»] scaffold0199 (2 HSPs)
scaffold0199 (230-373)||(14722-14865)
scaffold0199 (106-159)||(14626-14678)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (283-373)||(28889-28979)
[»] scaffold0050 (1 HSPs)
scaffold0050 (214-338)||(58261-58385)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (95-159)||(11802-11866)
[»] scaffold0245 (1 HSPs)
scaffold0245 (285-371)||(16438-16524)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (235-372)||(160325-160462)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (253-332)||(39481-39560)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (274-373)||(99286-99386)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 163)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31960178 - 31959814
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31960178 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31960079  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31960078 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31959979  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  31959978 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaactattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 31959879  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31959878 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31959814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 436147 - 436511
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  436147 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtcgtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 436246  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  436247 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 436346  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  436347 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccactagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaac 436446  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  436447 actatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 436511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 33227127 - 33227491
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33227127 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 33227226  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  33227227 gaaaagttggtagaaaataggcttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaagagagtcaag 33227326  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  33227327 ttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 33227426  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||    
T  33227427 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacctagtggaataaggcttggttgtttttgt 33227491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 52569879 - 52569515
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52569879 agcagagatcaggatgttgtgttggatgaggggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 52569780  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  52569779 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 52569680  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  52569679 ttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 52569580  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  52569579 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52569515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33191212 - 33190848
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33191212 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagattagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 33191113  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  33191112 gaaaagttggtagaaaatagacttagattgtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagggtagatcaaatggagaagagtcaag 33191013  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||    
T  33191012 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaac 33190913  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  33190912 actatgacgtcatttgacccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgtttttgt 33190848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48174457 - 48174093
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  48174457 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagta 48174358  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48174357 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 48174258  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| |||    
T  48174257 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataaaac 48174158  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | |||| ||||||||||||||||| || ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  48174157 attatggcgtcatttgatccatgtagcagaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48174093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 56375208 - 56375572
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  56375208 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataagattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctataata 56375307  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  56375308 gaaaagttggtagaaaacaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaag 56375407  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  56375408 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtgaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 56375507  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   ||| ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  56375508 actatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataagacttggttgttgttgt 56375572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 9 - 361
Target Start/End: Original strand, 4440773 - 4441123
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  4440773 agcagagattaggatgttgcgttcgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatggcaccattagagagag--tgggggcagcacctatagta 4440870  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4440871 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatctagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 4440970  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  4440971 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 4441070  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||    
T  4441071 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 4441123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 53707712 - 53708076
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||    
T  53707712 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacatgataggactaggaatgacaccattagaaagagagtggaggtagcacctatagta 53707811  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  53707812 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggatagtcaag 53707911  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  53707912 ttaaaagaggtagaggaagaccgaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 53708011  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||   ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  53708012 actatgacgtcatttgatccatttagtcgacatcacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 53708076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48622905 - 48622542
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  48622905 agcagagatgaggatgttgctttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacccatagta 48622808  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  48622807 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaaaagaagatcaaatggaggagagtcaag 48622708  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  48622707 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatcattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaac 48622608  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  48622607 actatggcgtcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 48622542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1777379 - 1777017
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    ||||||||||||||    
T  1777379 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tggaaatagcacctatagta 1777282  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1777281 aaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatctagagagaagactcatagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 1777182  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  1777181 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 1777082  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | |||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  1777081 agtatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 1777017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23906665 - 23906295
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag------tgtgggtagcacct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      || |||||||||||    
T  23906665 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacct 23906566  T
Q  103 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 202  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23906565 atagtagaaaagtttgtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagagaagac--gtagatgccgtggtaagaagagtagattaaatggaggaga 23906468  T
Q  203 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttga 302  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  23906467 gtcaagttaaaaaaggtaaatgaagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 23906368  T
Q  303 tagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23906367 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 23906295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 43433836 - 43434206
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag------agagagtgtgggtagcacct 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||||    
T  43433836 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggcaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagagagagtgggggtagcacct 43433935  T
Q  103 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  43433936 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtaaatcaaatggaggaga 43434035  T
Q  203 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttga 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || | |  ||    
T  43434036 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattgaaaatgatttagaggtcaatgagtcggatccaaatttgatgtagga 43434135  T
Q  303 tagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||| | |||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43434136 tagaacactacggcgtcatttgatccatgtagtcgagcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 43434206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 22 - 373
Target Start/End: Original strand, 37797783 - 37798133
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37797783 atgttgcgttggatgagtgataagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagtagaaaagttggtag 37797882  T
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 221  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  |||    
T  37797883 aaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagattcgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggatgagagtcaggttaaaaga-ttag 37797981  T
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcat 321  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  37797982 aggaagatctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaagtcaatgagttgaatccaaatatggtttatgatagaacaatatgacgtcat 37798081  T
Q  322 ttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| |||| ||||| ||||  ||| | |||||||||||||| |||||||    
T  37798082 ttgatcaatgtagccgactccatttagtgggataaggcttggttattgttgt 37798133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 46583188 - 46582826
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  46583188 agcagagatgaggatgttgcattagagaagtggtaagactagacagcataggattaggaatgacaccattcgagagagagtggggatagcacctatagta 46583089  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacta-gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||   |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46583088 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagaga--agaccccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaa 46582991  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  46582990 gttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattggaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 46582891  T
Q  308 cactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  46582890 ccctatggcgtcatttgatccatgtagccta-cccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 46582826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27450533 - 27450178
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  27450533 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaat----aatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaa 27450440  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||||    
T  27450439 agttggtagaaaataggcttagatggttttgacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggagtagaatcaggttaa 27450340  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  27450339 aagaggtaaaggaagacctaagaaaatcattcgagaaaccattggaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatat-gattttgatagaacacta 27450241  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    || ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  27450240 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgctgttgtat 27450178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 28236103 - 28236464
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  28236103 agcagagattatgatgctgcattggatgaatggtaagattagatatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 28236200  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  28236201 gaaaagttggtggaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgtcgtcgtaagaagagttgatcaaatggcggagaatcaag 28236300  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||     
T  28236301 ttaaaa-tggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaatctttataaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaat 28236399  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | ||||  || |||||||| |||| |||||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  28236400 attatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28236464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39100893 - 39100536
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||    
T  39100893 gagatgaggatgttgcgccaaatgagtggtaagactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagaagaaa 39100796  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||    
T  39100795 agttgatagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagatccgtagatgc-gttgtaagaagagtagatcagatggaagatagtcaggttaa 39100697  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||    
T  39100696 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccaaatattgtttatcatagaacatta 39100597  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || ||| || | |||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39100596 tggcgtaatataatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 39100536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 380
Target Start/End: Original strand, 27983122 - 27983482
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||| ||| | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27983122 gagatgaggatattgtgctagatgagtggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaa 27983221  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||       ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  27983222 agttggtag-------gcttagatggtttgaacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaggttaa 27983314  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||| || ||||  ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  27983315 aagaggtagaggaagacataagaaaaccattcgataaacctttagaaaagatttagagttcaatgaattggatcaaaatatggatttttatagaacacta 27983414  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtatttgtt 380  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||  ||  | ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27983415 tgacgtcatttgatccatgtagccgatcccaattaatgggataaggtttggttgttgttgtttttgtt 27983482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 47265566 - 47265195
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  47265566 agcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataagattatgaatgacaccattatagagagagtgggggtaacacctatagta 47265467  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac---tagt----agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 201  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||    |||||| || ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  47265466 gaaaaggtagtagaaaataggtttagatgatttgggcatgtagagagaagacacgtagtccgtagatgccgtcgtaagaagagtagactaaatggaggag 47265367  T
Q  202 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttg 301  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||    
T  47265366 attctagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatctatg 47265267  T
Q  302 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||   || ||||||||||||| |||||   ||| ||| | |||||||||||||| |||||||    
T  47265266 atagaacactatagtgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttattgttgt 47265195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 9 - 332
Target Start/End: Original strand, 50286889 - 50287202
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||    ||||||||||    
T  50286889 agcagagatgaggaagttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag-----ggg----acctatagta 50286979  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  50286980 gaaaagttggtagaaaatagacttggatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcgaatggaggagagtcaag 50287079  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||    
T  50287080 ttaaaagaggtagaagaagacctatgaaaactattagagtaatcattataaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttgatgtatgatagaac 50287179  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||  | ||||||||||||||    
T  50287180 actatg-ggccatttgatccatgt 50287202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 70 - 366
Target Start/End: Original strand, 39708412 - 39708708
Alignment:
Q  70 gacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatg 169  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||   ||||||    
T  39708412 gacaccattagggagagagtgagggtagctcctgtagtataaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtatagagaagacacatagatg 39708511  T
Q  170 ctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttaga 269  Q
    | || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39708512 ccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttaga 39708611  T
Q  270 ggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||  |||| ||| | |||||| ||||||||    
T  39708612 ggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatgtcgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataagacttggttg 39708708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37773811 - 37773497
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||    
T  37773811 agagatgagaatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatagaattatgaatgataccattagagagagtaag-gggtagcacctatagtagaa 37773713  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||| ||   || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  37773712 aagtcggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagatagacgacccgtaaatatcgttgtaagtagagtagatcaaatggatgagagtcaattta 37773613  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  37773612 aaagaggtagatgaatacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttggaggtcaatgagttggatccagatttggtttatgatagaacact 37773513  T
Q  312 atgacgtcatttgatc 327  Q
    ||||| | ||||||||    
T  37773512 atgacataatttgatc 37773497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 115 - 373
Target Start/End: Original strand, 8286455 - 8286721
Alignment:
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8286455 ttggtagaaaataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatgaaatggaggagagtcaagttagaa 8286554  T
Q  215 ga--------ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataga 306  Q
    ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  8286555 gaggacaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataga 8286654  T
Q  307 acactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||   |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  8286655 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgcccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 8286721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 377
Target Start/End: Original strand, 1793382 - 1793748
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |  ||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  1793382 gagatgaggatgttgtgttggatgaacggtaagacttaacgggataagattaggaatgacaccattagggagagagcgggggtagcacctatagtaaaaa 1793481  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||  || ||||||| ||| ||||| |||||||||  ||   | ||    
T  1793482 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagacttgttgatgtcgtcgtaagaatagtagatcagatggaggag--tcgtatcaa 1793579  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac----aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  1793580 aagaggtagagaaagacctcgaaaaactataagagaaaccattaattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagagc 1793679  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtattt 377  Q
    |||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1793680 actatgacgtaatttgattcatgtagccgatctcacttagtgagataaggcttagttgttgtagtattt 1793748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 79 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26037799 - 26037506
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||  ||| |||| || ||||    
T  26037799 agagagagagtgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgatattatagagagaagacctgtaaatgccgtcgtaa 26037700  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||    
T  26037699 gaagagtagatcagatggaggagagtcaggttaaaagaggcagaggaaaacctaggaaaaccataagagaaactattaggaaagatttagaggtgaatga 26037600  T
Q  279 gttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  26037599 gttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattggatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 26037506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 110 - 373
Target Start/End: Original strand, 32479057 - 32479320
Alignment:
Q  110 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| || || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||    
T  32479057 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacctgtagaggccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaggt 32479156  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32479157 tgaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatcaaaatatggtttttgatagaaca 32479256  T
Q  310 ctatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |  | |||||||||||||||||||    
T  32479257 ctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggaaaaaggcttggttgttgttgt 32479320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Original strand, 20192025 - 20192269
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 182  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20192025 agagagtgggggtagcacttatagtagaaaagttgatagaaaataagcttagatagtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtggtaagaag 20192124  T
Q  183 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||    
T  20192125 agtatatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagtggaagacctgaaaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgggttg 20192224  T
Q  283 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatc 327  Q
    ||||||||| || | | |||||||||| |||||||| ||||||||    
T  20192225 gatccaaatttgatgtatgatagaacattatgacgttatttgatc 20192269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20591662 - 20591353
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||| | |||||| |||||   ||  ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20591662 cagatatgaggatgttgtgctggatgaatagtaagactagacggaattagattgagaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacttatagtaga 20591563  T
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 210  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||  |||| |||||||||||||||||     
T  20591562 aaagttggtagaaaataagattagatggtttgggcatgtagagagaagactcatagatgtcgt-gtaagaagagtatatcagatggaggagagtcaagt- 20591465  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
       ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  20591464 ---agaggtagaggaagacctaagaaaactataagagaccccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatgg-ttatgatagaacac 20591369  T
Q  311 tatgacgtcatttgat 326  Q
     ||||||| |||||||    
T  20591368 aatgacgtaatttgat 20591353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 16 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41009707 - 41009414
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  41009707 atgaggatgttgcgttggatgatcggtaagactagacatggtaggattagaaatgacatcattagggagataatgggggtagcacctatagtagaaaagt 41009608  T
Q  116 tggt-agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 214  Q
    |||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||| || ||||||| | | ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  41009607 tggtaaaaaaatagacttagatggtttgtgcatgtagaaagaagacatgttgatgcagtcgtaagaaaaatagatcagatggaggagagtcaggtcaaaa 41009508  T
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  41009507 gtggtagaggaagacct-ggaaaactataagagaaactattagaaatgatttagaagtcaatgagatggattcaaatatggtttatgatataaca 41009414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 25 - 373
Target Start/End: Original strand, 51421666 - 51422012
Alignment:
Q  25 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 124  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |  ||||||||| |||||||||  || || ||||||    
T  51421666 ttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattatgaatgacaccattagagagtg--ttggggtagcacatatagtagattagatgatagaaa 51421763  T
Q  125 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 224  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||  ||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||   ||||  | ||||||||||||||    
T  51421764 ataggcttaggtggtttgggcatatacagagaagaccggtagatgttgtaatacgaagagtagatcaaatggaggtttgtcagatcaaaagaggtagagg 51421863  T
Q  225 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttg 324  Q
    ||||  ||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  51421864 aagatttagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaaaatggtttatgatagaacattatgacgtaatttg 51421963  T
Q  325 atccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| ||| ||  ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  51421964 atccatgtagccaatctcacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 51422012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 187 - 373
Target Start/End: Original strand, 21236954 - 21237140
Alignment:
Q  187 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21236954 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 21237053  T
Q  287 caaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |  |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  21237054 caaatttggtatatgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggataaggattggttgttgttgt 21237140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 20602003 - 20601693
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||  | ||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||  | || ||| ||||||||||||||    
T  20602003 atgaggatgttgcgctggatgagcgctaagacaatacatgatagaattgagaatgacaccactagggagagagtggagataacacttatagtagaaaagt 20601904  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 215  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||  || | |||||||||||||| || |||||    
T  20601903 tggtagaaaataggattagatggtttgtgcatgtagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaagagtatataagatggaggagagtcaggtcaaaag 20601804  T
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatga 315  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||       ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  20601803 aggtagaagaagacct-tgaaaactataagagaaaccattagaaag-----tcaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaacattatga 20601710  T
Q  316 cgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  20601709 cgtaatttgattcatgt 20601693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 45205208 - 45204840
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag-tgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||  ||||||||||||    
T  45205208 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattaacgagagagttgggggtagtgcctatagtagaa 45205109  T
Q  112 aagttggtagaaaataggc--ttagatggtttgggcatgtagagagaagac---ta----gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 202  Q
    ||| ||||||||||||| |  |||| ||||||| ||| |||||||||||||   ||    ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  45205108 aagatggtagaaaatagacttttaggtggtttgtgcacgtagagagaagacctgtagtctgtagatgatgttgtacgaagagtagatcagatggaggaga 45205009  T
Q  203 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttga 302  Q
    | ||  | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  45205008 g-cagatcaaaagaggtggaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagtttaataagttggatccaaatatggtttatga 45204910  T
Q  303 tagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| || | ||| |||||||| |||| ||| |  | || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45204909 tagaacatta-ggcgtaatttgatctatgtagcccacccaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45204840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 135
Target Start/End: Original strand, 12494668 - 12494794
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12494668 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 12494767  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12494768 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 12494794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 323
Target Start/End: Original strand, 50679556 - 50679736
Alignment:
Q  142 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 241  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||   | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50679556 gggcatgtagaaagaaga-tcgtagatgtcatcgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 50679654  T
Q  242 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcattt 323  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  50679655 ttagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgataaaatactatgacgtcattt 50679736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 219 - 373
Target Start/End: Original strand, 6957726 - 6957880
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||||||    
T  6957726 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaacactatgacgt 6957825  T
Q  319 catttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6957826 catttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 6957880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 219 - 373
Target Start/End: Original strand, 12494791 - 12494945
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  12494791 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 12494890  T
Q  319 catttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| |||||||| || ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12494891 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12494945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 330
Target Start/End: Original strand, 16002857 - 16003165
Alignment:
Q  21 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggta 120  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || | |||||||| ||| |||||||| ||    
T  16002857 gatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgaaataggattaggaatgacaccattatagagtgagtgaggatggcacctatggtataaaagttgata 16002956  T
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||| ||||||||||||  |||||||| ||  ||||||| ||  |||| ||||| || ||| | || ||||||  ||    
T  16002957 gaaaatagtcttagatgg-ttgaacatttagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagggtaaatcagatggatgaaagttatgtcaaaagaaata 16003055  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtca 320  Q
    |||||| |||    |||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |    
T  16003056 gaggaataccgtaaaaaactataagagaaaccattagaaaaaatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgatttatgataaaacactatgacgtaa 16003155  T
Q  321 tttgatccat 330  Q
    ||| ||||||    
T  16003156 tttaatccat 16003165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1211747 - 1211392
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||| | | ||||||||||||| | ||||    
T  1211747 atgaggatgttgcactggatgagtggtaaaactagacatgatatgattaggaatgacaccatt--cgagagagtgggagcagcacctatagtaaacaagt 1211650  T
Q  116 tggtag--aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
    ||||||  || ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||   | |||    
T  1211649 tggtaggaaatatatgcttaaatggtttgggaatgtagagagaagacctatagatattgtcgtaagaagagtagatcagatggagtagagtcggatcaaa 1211550  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| |||  ||||||||  | |||||||||||||||||||||||  || |||||| | |||||||||||     
T  1211549 agagatagaggaagacataggagaactataagataaattattagaaa-aaattagaggtcaatgagttggatcc--atttggtttctcatagaacactaa 1211453  T
Q  314 gacgt-catttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | |||  ||||||| ||||| |||||  |||| ||  | |||||| |||||||||||||||    
T  1211452 ggcgtaaatttgattcatgtagccgaccccacttaatgggataagacttggttgttgttgt 1211392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 31458946 - 31459098
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag--agagtgtgggtagcacctatag 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||   ||||||||||||||    
T  31458946 agcacagatgaggatgttgcgttggttgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgataccattagagagacagagtcgaggtagcacctatag 31459045  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  31459046 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 31459098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 122 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 53518571 - 53518365
Alignment:
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 221  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||   |||||| | | |||||||||    
T  53518571 aaaataggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctgtggatgctgtagtacgaagagtagatcagatggag---agtcaaatcagaagaggtag 53518475  T
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcat 321  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| |||| | ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  53518474 aggaaggcctagaaaaactatgagaaaaactaataggaaagatttagaggttaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaat 53518375  T
Q  322 ttgatccatg 331  Q
    ||||||||||    
T  53518374 ttgatccatg 53518365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 219 - 373
Target Start/End: Original strand, 21528416 - 21528570
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgt 318  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  21528416 tagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacactatggtgg 21528515  T
Q  319 catttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21528516 catttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 21528570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 35690226 - 35690553
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||       
T  35690226 gagatgaggatgttgcgttggatgagtagtaagactagacgagataggattaggaatgacacctttaaagagagagttggggtagcacctatagtag--- 35690322  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
             ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||                     |||||||||| | |||||||| |||||  | ||    
T  35690323 ---------aaaataggcttaggtggtttgggcatgtagatagaag---------------------aagagtggattagatggaggaaagtcagatcaa 35690392  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||  |||||||||| |||||||| |||||||  | ||||| |||||||||| ||    
T  35690393 aagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattacgaaaaatttagaggttaatgagtttgatccaatcagggtttatgatagaacatta 35690492  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  35690493 tggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgt 35690553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 369
Target Start/End: Original strand, 54470128 - 54470485
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||   |||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  54470128 agagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgggatatgatttgaaataacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaa 54470227  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    ||| |||| |||| ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| ||  ||| ||||| |||||  |||||||||||   |||||| |||    
T  54470228 aagatggtggaaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtaaattatgtagtaaggagagtaaatcaaatggagagtagtcaaatta 54470327  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
      ||||| | | ||||||| || |||||||| |||||| | ||||  || | | ||||| | ||||||||||||  ||||||||| | |||  || || |    
T  54470328 ctagaggcaaaagaagaccaagaaaaactataagagaatctattaataaagttctagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgactgagcatt 54470427  T
Q  312 atgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttg 369  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  54470428 attgcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggattaggcttggttgttg 54470485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 219 - 368
Target Start/End: Original strand, 7947065 - 7947214
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgt 318  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||| | ||    
T  7947065 tagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccatttgaaaggatttagaggtcaatcagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatcatgt 7947164  T
Q  319 catttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgtt 368  Q
     ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  7947165 aatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 7947214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 125 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 20821255 - 20821073
Alignment:
Q  125 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||  |  ||| || ||| ||| | |||||| ||| |||  | |||||||||||| |    
T  20821255 ataggcttagatggtttaggcatgtagagagaagacctgtagatgccttcataacaaaagtagattagatggagcagaatcagatcaaaagaggtagatg 20821156  T
Q  225 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  20821155 aagacctaggaaaactataagagaaaca-ttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatgatttatgatagaac 20821073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31961503 - 31961266
Alignment:
Q  136 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| || || ||||||||| | ||||||  ||||||| | |  |||||||| || |||||||| |    
T  31961503 tggtttgggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagttaggagagtggattagatggagaggagtcaaatcactagaggtaggggtagacctagaa 31961404  T
Q  236 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggc 335  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||||||   | | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  31961403 aaactataagagaaactattaggaaagatctagagataaatgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgtcgtttgattcatgtagc 31961304  T
Q  336 cgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||   ||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31961303 cgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31961266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 56224983 - 56225350
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga---ttagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata 105  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||  |  || ||  |||||||    
T  56224983 agcagagatgatgatgttgtggtggatgagtggtaagacactaagacatgatatgattaggaatgacaccataagagaaag--ttgggataatacctata 56225080  T
Q  106 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 205  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||     |||||| ||| ||| | |||||  |||| |||||||||||||    
T  56225081 gtataaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgagtatgtagagagaaggaacatagatgttgtagtacgtagagtatatcatatggaggagagtc 56225180  T
Q  206 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaa--aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgat 303  Q
     | | || | || ||||| |||| |||  ||  |||||| || | ||| ||||  || | ||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||| ||    
T  56225181 taatcaagaaagttagagaaagatctaaaaagaaactataaggggaactattatgaaagttttagaggttaataaatttgatccaaatatggtattttat 56225280  T
Q  304 agaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||  |||| ||| | ||||||| | ||||||||||||    
T  56225281 agaacactatgatgtaatttgatccatgtggtcgaccccacttagtgggataaggatcggttgttgttgt 56225350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 31897724 - 31897424
Alignment:
Q  75 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 174  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||||  || ||| ||||     
T  31897724 cattagagagatagttggggtagcaccta--gtagaaaagatggtagaaactagacttgggtggtttgcgcatgtagagagcagacctgtggattctgta 31897627  T
Q  175 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
    || || ||||| ||| | ||||||| ||||||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  31897626 gttaggagagtcgattagatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataa 31897527  T
Q  275 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    ||||||||||   | | |||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||| |   ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  31897526 atgagttggagaaagacatggttgttgatagaacactatgacgccgtttgattcatgtagccaacctcacttagtgggataaggctcggttgttgttgta 31897427  T
Q  375 ttt 377  Q
    |||    
T  31897426 ttt 31897424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 150
Target Start/End: Original strand, 49987346 - 49987487
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||    
T  49987346 agcagagatgaggatgttgtgttgaatgtttagtaagactagacatgataggattagaaatgacaacattagatagagagtctgggtcacacctatagta 49987445  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 150  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  49987446 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggtcatgta 49987487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35555941 - 35555650
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  || ||| |||| || |    
T  35555941 agagagagagttcgggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatttagagagaagacctgtggattctgtagtta 35555842  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    | ||||| ||| | || |||||||||   || |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||   |||  | ||||| | |||||    
T  35555841 ggagagtagattagatagaggagagttgggtcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactatt---aagagtctagagataaatga 35555745  T
Q  279 gttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||   | | |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||  ||| | || |||||||||||||| ||||    
T  35555744 gttggagaaagacatggtttttgatagtacagtatggcgtcgtttgattcatgtagccgactccatttagtgggacaaggcttggttgtttttgt 35555650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 375
Target Start/End: Original strand, 46372008 - 46372308
Alignment:
Q  75 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 174  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||  | ||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  || ||| ||||     
T  46372008 cattagagatagagttggggtagcacctatagtcgaaaatattgtagaaactagacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagacatgtggattctgta 46372107  T
Q  175 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
     |||||||||  ||||| || |||| ||| ||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  46372108 ctaagaagagcagatcagatagaggggagccagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataa 46372207  T
Q  275 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    ||||||||||   | | |||||||||||||||||||  |  |||| |||||| ||||| || ||  |||| |||   | |||||||||||||||||||||    
T  46372208 atgagttggagaaagacatggtttttgatagaacaccgtagcgtcctttgattcatgtagctgaccccacttagttgggtaaggcttggttgttgttgta 46372307  T
Q  375 t 375  Q
    |    
T  46372308 t 46372308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 7092583 - 7092290
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||||   |||| |||||| |||||||  |||||||| |||||  |  ||||||||||||||    
T  7092583 agcagagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagtctagaagggatatgattag-aatgacatgattagagacagagttggaatagcacctatagta 7092485  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||  || ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||  ||||||| | | ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||      
T  7092484 gaaaatatgatagaaaataggtttaagtggtttgggcatatagagagaagacatgtagatgttatagtatgaagagtagatcagatggatgagagtcaga 7092385  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgata 304  Q
      | ||||||| |||||||||||||  ||| ||| || ||||  ||||  || ||||||||||| |||| ||| |||| ||||||| ||| |||||    
T  7092384 acataagaggtggaggaagacctagagaaa-tataagtgaaattattatgaaagatttagaggttaatgcgttagatctaaatatgatttatgata 7092290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 191
Target Start/End: Original strand, 33709837 - 33710024
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggat-----taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcaccta 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||     ||| |||| || |||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  33709837 agcagagatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgataggataggattagaaatggcaacattagagagagagttggggtaacaccta 33709936  T
Q  104 tagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||| ||||||| |||||||||   || ||| |||| ||||  |||||||||||    
T  33709937 tagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttaggcatgtggagagaagaactgtggattctgtagtaaagagagtggatca 33710024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 308
Target Start/End: Original strand, 21106908 - 21107209
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattaga----gagagagtgtgggtagcacctatagtaga 110  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||| ||||| |    ||||||||   ||||| | ||||||||||    
T  21106908 gatgaggatgttgggttcgatgtgtggtaagactagacgtgatagaattagaaatgacaacattatatatagagagagttgaggtagtatctatagtaga 21107007  T
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa---gactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa-atggaggagagtca 206  Q
    || | | || |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||   |||| ||||||  ||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||    
T  21107008 aaggatagttgaaaataggcttaggtagtttgggcatctagagagaagacgacttgtagattatgtagtaaggagagtggatcaagatggagggtagtca 21107107  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataga 306  Q
      | |   || | || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21107108 gatcactggatgcagcggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagttttagtgattaattagttggatccaaatatggtttatgataga 21107207  T
Q  307 ac 308  Q
    ||    
T  21107208 ac 21107209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 44047709 - 44047568
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||| |  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44047709 agagacgaggatgttgcattgaatgcgtggtaggattaggcgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaa 44047610  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 153  Q
    ||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  44047609 aaggtggtagaatctaggcttaggtggtttggacatgtagag 44047568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 209 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 51811442 - 51811279
Alignment:
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||  ||  ||||||  ||||||||   ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51811442 ttaaaagaagtagatgaagacctaagaaaatcatccgagaaatcattagaaaaagtttcgagctcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaac 51811343  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  51811342 actatgacgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggctt-gttgttgttgta 51811279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 381
Target Start/End: Original strand, 28351617 - 28351849
Alignment:
Q  149 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 248  Q
    ||||||||||||  |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  28351617 tagagagaagacctgtagactctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattacaagaggtagagaaagacctagaaaaactataagaga 28351716  T
Q  249 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctag 348  Q
    ||| ||||  || ||||||||| | | |||||||||||||||||| |||| |  ||||||  ||||   | ||||||||||||| |||||  |||| |||    
T  28351717 aactattacgaaagatttagagattattgagttggatccaaatatagtttatagtagaaccttatggaattatttgatccatgtagccgaccccacttag 28351816  T
Q  349 agagataaggcttggttgttgttgtatttgtta 381  Q
     | | |||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28351817 tggggtaaggcttggctgttgttgtttttgtta 28351849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 42639381 - 42639074
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||||| |||||  ||| ||||  |||||| | |||||  ||||||||||  |||  || | |||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  42639381 agagatgagaatgttatgtttgatgtatggtaacactagacgggataggattataaatagcaaccttagagagagagttagggttgcacctatagtagaa 42639282  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    ||| |||| ||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||||||  | ||| ||||||||||  | ||  || | ||||||| ||||||| | |    
T  42639281 aagatggtggaaaccaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttatggattctgtggtaaggggggtaaattagatggaggggagtcaaatca 42639182  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
      ||||||||||||| | |||| ||||||   |||||||| ||||  || ||| ||| | | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |    
T  42639181 ctagaggtagaggaatatctagaaaaactgcaagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggatagaaatatggtatttgatagaacatt 42639082  T
Q  312 atgacgtc 319  Q
    ||| ||||    
T  42639081 atggcgtc 42639074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 212 - 298
Target Start/End: Original strand, 50862764 - 50862851
Alignment:
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga-gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggttt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50862764 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaaagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggttt 50862851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 143 - 373
Target Start/End: Original strand, 2589124 - 2589354
Alignment:
Q  143 ggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 242  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||| |||| || || ||||| ||||||||||||| |||| || |||  |||||||||| | ||||||| ||||  ||    
T  2589124 ggcatgtagagagaaaacttgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagttaaattactagaggtagagcacgacctagaaaaagcat 2589223  T
Q  243 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattcc 342  Q
     |||||||| || |  | |||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||  |  ||    
T  2589224 aagagaaactatcaagatggatctagagattaatgagttggatgaaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagctaacccc 2589323  T
Q  343 acctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2589324 agttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2589354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 55 - 200
Target Start/End: Original strand, 28497452 - 28497598
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 152  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||| | || ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  28497452 gataggattagaaatgacaacatcagagagagagagttggggtagcacctttagtagaaaagattgtggaaaa-aggcttaggtggtttgggcatgtaga 28497550  T
Q  153 gagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 200  Q
    ||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  28497551 gagaagacttgtagattatgtagtaaggagagtagatcagatggagga 28497598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 209 - 372
Target Start/End: Original strand, 4548140 - 4548303
Alignment:
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||| ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  4548140 ttaaaaaaggcagaggaggacctacgaaaactattagagaaatcattagaaatattttagaggtcaataagttggatctaaatttggtttatgatagaac 4548239  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||| | ||| ||||||||||||| ||| |  | || ||| | ||||| |||||||||||||||    
T  4548240 actaaggcgtaatttgatccatgtagccaacccaacttagtgggataatgcttggttgttgttg 4548303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 263 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19154973 - 19154863
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||  |||| ||| | |||||||||||    
T  19154973 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgttatttgatccatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttg 19154874  T
Q  363 gttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||    
T  19154873 gttgttgttgt 19154863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 373
Target Start/End: Original strand, 19969358 - 19969463
Alignment:
Q  268 gaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||| ||||||    
T  19969358 gaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacgctatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgt 19969457  T
Q  368 tgttgt 373  Q
    ||||||    
T  19969458 tgttgt 19969463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 283
Target Start/End: Original strand, 26356626 - 26356811
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||  || | |  ||| ||||| ||||| ||||  |||||    
T  26356626 cacctatagtagaaaagatggtagaaaatagacttaggtggtttgggcacttagagagaagacatgtgggtattgtagtaaggagagtagatcggatgga 26356725  T
Q  198 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgg 283  Q
    || ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||  |||||| ||||| | ||||||||||    
T  26356726 ggggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactgttatgaaggatctagagattaatgagttgg 26356811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 50662311 - 50662497
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||||||| || |   ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||| | |||||||||||||||    
T  50662311 gagacgaggatgttgtgtaggatgtgtggtaagactatatgagataggattggaaatgacagcattagagagag--tttgggcaacacctatagtagaaa 50662408  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatgg-tttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 200  Q
    || |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| ||||| |||| |||| ||||    
T  50662409 agatggtggaaagtaggcttaggtggttttgggcatgtagagagaagacttgtagattctattgtaaggagagtagatctaatgaagga 50662497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 17900398 - 17900549
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||  ||||| ||||||  |||||||||  ||||  |||||||||||||||||    
T  17900398 agcagaaatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataaaattagaaatgacgacattagagacggagttggggtagcacctatagta 17900497  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||  |||||||| ||| || |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  17900498 gaaaagacggtagaaactagactcatgtggtttgggcacgtagagagaagac 17900549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 51252823 - 51252635
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||| || |||||| ||| ||| |||| || |||||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||| |||||    
T  51252823 agcagggaggaggattttgtgttagatgtgtcgtaagactagacgagataggattagaaatgactacattagagagag--ttggggtagcacctctagta 51252726  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 199  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  || ||| || ||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  51252725 gaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtatgggcatgtagagagaagacatgtggattctatggcaaggagagtaggtcaaatggagg 51252635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 369
Target Start/End: Original strand, 10208977 - 10209312
Alignment:
Q  30 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 129  Q
    ||||||| ||||||||| ||||   ||||| ||||| ||||||| ||||||||||    |  |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||      
T  10208977 ttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacaacattagagag----ttggggtagaacctatagtagaaaagatggcagaaactaaa 10209072  T
Q  130 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta--gaggaag 227  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||  ||  ||  | | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  | |  || ||||  | || ||    
T  10209073 cttagttggtttgggcatgtagcgagaagacctgtgaattttttagtaaggagagtagatcagatggaggagagtcatatgactagtggtagggggggag 10209172  T
Q  228 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatc 327  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | | |||||||||||||||||||  || |||| ||||||     
T  10209173 acctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacac--tggcgtcgtttgatt 10209270  T
Q  328 catgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttg 369  Q
    || || |||||  |||| ||| | |||||||| |||||||||    
T  10209271 caagtagccgaccccacttagtgggataaggcgtggttgttg 10209312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 304
Target Start/End: Original strand, 50680704 - 50680953
Alignment:
Q  56 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt-gggcatgtagaga 154  Q
    |||||||| | ||| ||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  50680704 ataggattggaaataacaacattagagagagagttagggcaacacctatagttgaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttatggcatgtagaga 50680803  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa-caa 253  Q
    |||| || |||||| | || ||||| ||||| |||| |||| |||| ||| |  | |  | ||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||  |     
T  50680804 gaaggcttgtagattccgtagtaaggagagtagatccaatgaaggatagttagatcactataggcagaggtagacctagaaaaactataagagaaattat 50680903  T
Q  254 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgata 304  Q
    ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  50680904 ttagaaa-gatctagagattaatgagttggatcggaatatggtttatgata 50680953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25257943 - 25257722
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||||||  ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |   |||| |||||| | ||    
T  25257943 agcaaagatgagcttgttgtgttggatgtgtagtaagactagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttgaggtaacacctacaata 25257846  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
     ||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||  |||     
T  25257845 taaaagatggtagaagctagacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtgaatgctgttgtaaggagagtagatcagatggaggggacacaaa 25257746  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagaccta 232  Q
    | |  |||||||| ||||||||||    
T  25257745 tcactagaggtaggggaagaccta 25257722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 173
Target Start/End: Original strand, 41192763 - 41192918
Alignment:
Q  20 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 117  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||  ||||||| | ||||||  |||||||  |||||||||||| |||||||||| ||    
T  41192763 ggatgttgcgttggatgtgtggtatgattagacaggatacaattataaatgacagcgttagagagagagagttggggtagcacctacagtagaaaagatg 41192862  T
Q  118 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgt 173  Q
    || |||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  41192863 gtggaaactagacttaggtgatttgtgcatgtagagagaagacctgtagattctgt 41192918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 373
Target Start/End: Original strand, 55007917 - 55008028
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||    
T  55007917 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagatcattatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 55008016  T
Q  362 ggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||    
T  55008017 ggttgttgttgt 55008028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 370
Target Start/End: Original strand, 31339521 - 31339803
Alignment:
Q  75 cattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtg 174  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| | ||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||     
T  31339521 cattagagagagagttggggtagaacctatggtagaaaaat-ggtcgaaactaagcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacttgtagattatgta 31339619  T
Q  175 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
    ||||| | ||| ||||||||| ||   |||||| | |  ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||    ||||       || ||||| | |    
T  31339620 gtaaggatagtagatcaaatgaagagtagtcaa-tcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatatgag----aatt-------atctagagatta 31339707  T
Q  275 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||||||||| ||||||||| |||| |||||||  ||||  |||| ||| | ||||||||||| |||||||    
T  31339708 atgagttggatcgaaatatggtacatgatagaacattatgacgtcgtttggtccatgtatccgaccccacttagtgggataaggcttgcttgttgt 31339803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38571099 - 38570960
Alignment:
Q  20 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 119  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  | |||||| ||||||||| | ||||||| |||| |||||||||   ||| ||||||||||||| ||||| | ||    
T  38571099 ggatgttgtgttggatgtgtggtac-actagacaagataggattggaaatgacaacatttgagagagagctggggaagcacctatagtacaaaagatagt 38571001  T
Q  120 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38571000 ggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaaagaagac 38570960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 240
Target Start/End: Original strand, 29398741 - 29398967
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    || ||||||  |||||||  ||||| || |||||   | |||||||||| |||||||    
T  29398741 gagatgaggatgttgc-ttggatttgtggtaagattagatggaattggattacaaatgacaatattagggaaagagttgcgatagcacctatggtagaaa 29398839  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || |||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||   ||||| |||| || || ||||| || |  || ||||| |||||| | |     
T  29398840 agatggtggaaaatatgcttatgtggtttgggcatgtagagagaagacctatagattctgtagtgaggagagtagaccggatagaggatagtcaaatcac 29398939  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaact 240  Q
     ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29398940 tagaggcagaggaagacctagaaaaact 29398967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31403384 - 31403234
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga----gtgtgggtagcacctat 104  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    ||  |||||||||||||    
T  31403384 agcagagatgatgatgttgagttgaatgtgtggtgagattagacgggataggattagaaatgacaacattagagacagatagagttggggtagcacctat 31403285  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||  |||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  31403284 agtagaaaa-atggtggaaactaggcttaggtgg-ttgggcatgtaaagagaa 31403234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 338
Target Start/End: Original strand, 44360014 - 44360333
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattaga----gagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 117  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||| |  ||||| ||||| |||||||  ||||||    ||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44360014 atgttgtgttggatgtgtggtaggactaggcgagatagaattagaaatgacaatattagatggagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatg 44360113  T
Q  118 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 217  Q
    ||||||| || | |||| | |||||||||||||||||||||||  || || | ||| ||||| | | | ||||| ||||||| ||| ||| | |  || |    
T  44360114 gtagaaacta-gattaggttgtttgggcatgtagagagaagacatgtggacgatgtagtaaggataatagatcatatggaggggaggcaaatcactagtg 44360212  T
Q  218 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacg 317  Q
       |  |||||| ||| |||||||||||||||||  | |  |||||| | |||| ||||||||||||   | | | ||||||||||||||||||||||||    
T  44360213 cctggagaagacttagaaaaactattagagaaactgtcaagaaggatcttgaggccaatgagttggagaaagacacggtttttgatagaacactatgacg 44360312  T
Q  318 tcatttgatccatgtggccga 338  Q
    || |||||| ||||| |||||    
T  44360313 tcgtttgattcatgtagccga 44360333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 16 - 332
Target Start/End: Original strand, 55578956 - 55579272
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||| |||| || ||||||||||  | ||  |||| ||||| ||||||||| |||  | |||||| || ||  || |||||||||| |||||    
T  55578956 atgaggatgttgtgttgaataagtggtaagaggaaacgagataagattatgaatgacactattttatagagagagttggaataacacctatagt-gaaaa 55579054  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
      |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||    || ||| ||| ||| |||||||  ||   ||||||||||||||| | |||    
T  55579055 aatggtagaaaatatgcttaggtggttcgggcatgtaaagagaagatatataaatgttgtagtatgaagagtaaatttgatggaggagagtcaaatcaaa 55579154  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | | |||| |||   || |||||| ||||  |||||||||||  ||| | ||||| ||||| |||| |||    
T  55579155 agaggtagaagaagacctagaaaaactataaaataaactattttgaaagatttaaaggttcatgagttggatttaaacaaggtttatgata-aacattat 55579253  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||  | |||||||||||||    
T  55579254 gatataatttgatccatgt 55579272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 215 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 55809148 - 55809061
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttga 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  55809148 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccagatatggtatttga 55809061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19062017 - 19061935
Alignment:
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  19062017 tatggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacctagtgggataaggcttggttgttgttgt 19061935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 34233393 - 34233059
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatagtag- 109  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||| || |||| ||||||||  |||||||  || |||||||||||||||     
T  34233393 gagatgatgatgttgtgttggatgtgtgataagactagatgtgataggattagaaacgacaacattagagatagagagttgggatagcacctatagtaga 34233294  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggctta-------gatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 202  Q
    |||||||||  |||||| ||||||       | |||||||| ||||||||||||  ||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||| | ||||||||      
T  34233293 aaaagttgg-ggaaaattggcttaggacttgggtggtttggacatgtagagagagaacatgtagattatgtagtaaggagagtagatgagatggaggatc 34233195  T
Q  203 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttga 302  Q
    ||||  | |  ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||   || ||  ||||| | |||||||| |||| ||||| ||||| |||    
T  34233194 gtcagatcactagaggcagaggaaaacctagaaaaactatcagagaaactattcataaagacctagagattaatgagttagatcaaaataaggtttatga 34233095  T
Q  303 tagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    ||||||| | |  ||| ||||||||||||| |||||    
T  34233094 tagaacattgtagcgtaatttgatccatgtagccga 34233059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 2588905 - 2589120
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg----------tagcacctat 104  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| | |||          ||| ||||||    
T  2588905 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaagggataggattagaaatgacaacattagggagggagggagggagggttggggtagtacctat 2589004  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 204  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||| || ||| |||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  2589005 agt-gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttaggcatgtagagagaaaacttgtggattctgtagttaggagagtagatcagatggaggggagt 2589103  T
Q  205 caagttaaaagaggtag 221  Q
     || |||  ||||||||    
T  2589104 taaattactagaggtag 2589120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 220 - 313
Target Start/End: Original strand, 31043201 - 31043294
Alignment:
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||||||||| ||  ||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31043201 agaggaagacccagataaactaaaagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgtgatagaacactat 31043294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42285972 - 42285703
Alignment:
Q  101 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||| || |||||||  |||| | ||||||     
T  42285972 ctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtatagagaagacctgtggattctgtagtcagaagagcagatc-agtggaggg 42285874  T
Q  201 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggttttt 300  Q
    ||||||  | |  |||||| | || |||||||| ||| ||||   |||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | | |||||||||    
T  42285873 gagtcagatcactagaggtgggggtagacctagaaaagctat--aagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggttttt 42285776  T
Q  301 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| |||||| | |  |||||| ||||| ||| |  |||| |||   |||||| |||||||||||||||    
T  42285775 gatagaatactatggcattgtttgattcatgtagccaaccccacttagttggataagacttggttgttgttgt 42285703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2557831 - 2557671
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| | |||||||| ||||  |||||| |  || | || |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  2557831 agaggtagaggaagatctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaggatctgaagattaacgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattat 2557732  T
Q  314 -gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     |  || ||||||||||||| ||| | ||||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2557731 tggtgtaatttgatccatgtagccaactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2557671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10775786 - 10775654
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||  ||||| || || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  10775786 agcagagatgatgatgttgtgttggatgcgtggcaggaccagacaggaaagaattagaaatgacaacattagagagagtgttggggtaacacctatagta 10775687  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt 141  Q
    |||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||    
T  10775686 gaaaagatggtagaaactagacataggtggttt 10775654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1427589 - 1427466
Alignment:
Q  68 atgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga 167  Q
    |||||| ||||||||||||||   |||||| || ||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  || ||    
T  1427589 atgacaacattagagagagagccagggtagaacatatagtagaaaacatggtggaaactaggcttagatggtttgagcatgtagagagaggacctgtgga 1427490  T
Q  168 tgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |  ||||||||| ||||| |||||    
T  1427489 ttttgtggtaaggagagtagatca 1427466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 43070128 - 43070053
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 84  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43070128 agcagagatgatcatgttgggttggatgtgtggtaagattagacaggataggattagaaatgacaacattagagag 43070053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28550584 - 28550454
Alignment:
Q  244 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattcca 343  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||   | |||||||| |||| || ||  |||    
T  28550584 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaaagctatgttataatttgatcaatgtagctgacccca 28550485  T
Q  344 cctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    | ||  | ||||||| |||||||||||||||    
T  28550484 cttattgggataaggtttggttgttgttgta 28550454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 231 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41009361 - 41009283
Alignment:
Q  231 taggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  41009361 taggtaaactataagagaaacaattagaaatgatttagaagtcaatgagttggattcaaatatgttttatgatataaca 41009283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 199
Target Start/End: Original strand, 25755237 - 25755425
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| | ||||| | || |||| | |||||  |||||||||||||  ||||    
T  25755237 cagagatgagaatgttgtgttagatgtgtggtaagactagacatgatatgattggaaatgaaaacaataga-aaagagttggggtagcacctatcttaga 25755335  T
Q  111 aaag-ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 199  Q
    ||||   ||| |||||| ||| |||||||||||| || |||||| ||||||   |||||  ||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  25755336 aaagaaaggtggaaaatcggcatagatggtttggacacgtagagcgaagacctatagattatgttgtaagtagagtagatcaaatggagg 25755425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 76 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 30621501 - 30621409
Alignment:
Q  76 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  30621501 attagagagggagttggggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggtttaggtgatttgggcacgtagagagaagatttgtagat 30621409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 17 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 25967623 - 25967552
Alignment:
Q  17 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  25967623 tgaggatgttgcgatggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgactacattagagagagag 25967552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Original strand, 45175930 - 45176083
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||  | |||||| ||||  ||||| |||||||   ||| |||||||||  ||||||  ||||| |||||||    
T  45175930 gagatgaggatgttgtcttggatgtgtggtagtactagacaagataatattagaaatgacaatgtta-agagagagttggggtagtgcctattgtagaaa 45176028  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    || |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45176029 agattcta-aaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagat 45176083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 298 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49939809 - 49939734
Alignment:
Q  298 tttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  49939809 tttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 49939734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 370
Target Start/End: Original strand, 13262413 - 13262491
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  13262413 atggtttttgatagaaaactatgacgtcgtttgattcatgtagccgactccacttagtgtgataaggcttagttgttgt 13262491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 178 - 370
Target Start/End: Original strand, 31459093 - 31459273
Alignment:
Q  178 agaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatg 277  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||           ||||| |||||||| | ||||    
T  31459093 agaagagtagatcatatgtaggagagtcagatcaaaagaggtaaaggaagacctagaaaaactattag-----------gaaag-atttagagattaatg 31459180  T
Q  278 agttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||| |||||||| | |||| ||||| |||| ||  | |||||||||||  ||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  31459181 agttggatcccaatatggtgtgtgattgaacattatggcggaacttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 31459273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 46715678 - 46715585
Alignment:
Q  62 ttaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| |     ||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  46715678 ttagaaatgacaacattagagagagagag-----agcacctattgtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtgtgggcatgtagagagaagac 46715585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 372
Target Start/End: Original strand, 3979124 - 3979201
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  3979124 gtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagcctactccacatagtgggataaggcttggttgttgttg 3979201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13805510 - 13805265
Alignment:
Q  128 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 227  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||  ||| | ||| ||| | ||||| ||||||||  ||||  | |  ||||| |||||||     
T  13805510 ggcttaggtggtttgggtatgtagagagaagacctttagattttgtagcaaggagactagatcacatggaggattgtcagatcactagaggcagaggaaa 13805411  T
Q  228 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatc 327  Q
    |||||| |||||||| |||||||| || |  || ||||| |||   ||| |||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||   | ||||||||    
T  13805410 acctagaaaaactataagagaaactatgaagaaagattttgagagtaataagttggacggaaatatggtttatgatagaacattatgggataatttgatc 13805311  T
Q  328 catgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| ||| |  |||| ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  13805310 catgtagccaaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttgt 13805265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 264 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34208378 - 34208269
Alignment:
Q  264 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttgg 363  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||  |||||||||||||   |||  || | ||  | ||||||||||||    
T  34208378 tttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgcaatttgatccatgtactcgaccccccttattgggataaggcttgg 34208279  T
Q  364 ttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||    
T  34208278 ttgttgttgt 34208269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 373
Target Start/End: Original strand, 37488220 - 37488373
Alignment:
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtc 319  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||  | ||| |||| |||| ||||||||||  ||||||| || |||| |||     
T  37488220 agaggtagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaataagtttgatcaaaatatggttaatgatagagcattatggcgta 37488319  T
Q  320 atttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37488320 atttgatccatgtagccagccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 37488373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41729551 - 41729494
Alignment:
Q  272 tcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcca 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||    
T  41729551 tcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtagtttgatcca 41729494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Original strand, 50471453 - 50471595
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    ||||| |||||| ||||||||  || ||||| | ||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||   |  |||||||||  ||||||||||||     
T  50471453 atgagaatgttgtgttggatgtttgctaagacttgacgtaataggattagagatgacaacattagagagac--tcggggtagcactaatagtagaaaaga 50471550  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||| |||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  50471551 tggtggaaactaggtttaagtggtttgggcatgtagagagaagac 50471595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17666294 - 17666122
Alignment:
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 221  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| ||  ||||||  ||| ||||||||||| ||| |||| ||| | |||||  ||| ||||| ||     
T  17666294 aaaataggtttaggtggtttggacatgtagagggaaaacatgtagattatgtagtaagaagagtagatgaaatagagaatagtcatattacaagagatat 17666195  T
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 294  Q
    | |||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||| |||||| || | |||||||| |||  |||||||    
T  17666194 atgaagacttagaaaaaatataagagaaactattagaaaagatttatagattaatgagttagatgaaaatatg 17666122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 330
Target Start/End: Original strand, 53540413 - 53540529
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || || || ||| | |||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||    
T  53540413 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagacttggagattaatgagttggacaaaaatatggtttatgatagaacattat 53540512  T
Q  314 gacgtcatttgatccat 330  Q
    | | | |||||||||||    
T  53540513 ggcataatttgatccat 53540529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 79
Target Start/End: Original strand, 18966474 - 18966541
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatta 79  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||    
T  18966474 agagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagattagacaaaataggattataaatgacaacatta 18966541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Original strand, 25575007 - 25575106
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||  || ||||||||||||| || ||  |||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25575007 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgtagcagaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25575106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 160
Target Start/End: Original strand, 47611741 - 47611796
Alignment:
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47611741 agtagaaaagatgatggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 47611796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 50288099 - 50287988
Alignment:
Q  217 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||  |||| ||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||| || |||||| |    
T  50288099 ggtagaggaagacttagaaaaactataagataaattattaaaaaagatttagaggtcaatgaattgaatgcaaatatgttttatgatataatactatgtc 50288000  T
Q  317 gtcatttgatcc 328  Q
    || |||| ||||    
T  50287999 gtaatttaatcc 50287988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 259 - 373
Target Start/End: Original strand, 5306464 - 5306578
Alignment:
Q  259 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataagg 358  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||| ||| ||||||||||| | ||  |  |||| | | | |||||||    
T  5306464 aaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatggcgtaatttgatccatatagctaaccccacttggtgggataagg 5306563  T
Q  359 cttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||    
T  5306564 cttggttgttgttgt 5306578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 36557347 - 36557246
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  36557347 gatagaattagaaatgacgatattggagagagagttggggcagcacccatagtagaaaagatggtagaaactagacttag-tggtttgggaatgtagaga 36557249  T
Q  155 gaa 157  Q
    |||    
T  36557248 gaa 36557246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26024988 - 26024851
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtgg 334  Q
    ||||||||  ||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| | | ||||||| |||||||||| ||||  || |||| |||||||| |    
T  26024988 aaaactatatgagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgagacatggtttatgatagaacattatggtgtaattttatccatgtag 26024889  T
Q  335 ccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||   ||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  26024888 ccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttg 26024851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 883448 - 883360
Alignment:
Q  285 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||  ||||  || || |||| |||||||| |||||||    
T  883448 tccaaatataatttttgatagaacactatgacatcatttaatccatgtagccgaccccactcagggatataatgcttggttattgttgt 883360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 20131274 - 20131167
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg-gcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 196  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||   ||||||| |||||||||| ||||| |   | ||| ||||||| ||||||||||    
T  20131274 cacctatagtagaaaaat-ggtagaaaatagacttagatgtttttttgcatgtaaagagaagactcgtagaagtcatagtatgaagagtagatcaaatgg 20131176  T
Q  197 aggagagtc 205  Q
    |||||||||    
T  20131175 aggagagtc 20131167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 21945846 - 21945702
Alignment:
Q  165 agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggat 264  Q
    |||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |  |||||  ||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || |||    
T  21945846 agattctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcacatcactagaggctgaggaagacctagaaaaactatcatagaaactattaggaaagat 21945747  T
Q  265 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    || ||  | |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||    
T  21945746 ttggaaattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaaca 21945702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 297 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32633482 - 32633406
Alignment:
Q  297 ttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |  |||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  32633482 ttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 32633406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 38904036 - 38903925
Alignment:
Q  56 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 155  Q
    |||||||||||||| |||  ||||  |||||| | ||||||||||| ||  |||||||| |||| |||| | ||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  38904036 ataggattaggaat-acaatattaccgagagactctgggtagcaccgatcatagaaaagatggtggaaactcggcttagttggtttgagcatgtggagag 38903938  T
Q  156 aagactagtagat 168  Q
    |||||| ||||||    
T  38903937 aagacttgtagat 38903925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 45185295 - 45185215
Alignment:
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 185  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||| |||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||    
T  45185295 agtagaaaagatggtggataataggcttaggtgatttgggcatatagagacaagacttgtagattttgtagtaagaagagt 45185215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 50238679 - 50238615
Alignment:
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  50238679 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 50238615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 50238765 - 50238701
Alignment:
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  50238765 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 50238701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 239 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37042798 - 37042667
Alignment:
Q  239 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    |||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | | ||||||||||  ||||| ||| |||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  37042798 ctataagagaaactattaagaaagatctagagattattgagttggatagaaatacggtatttgatagaacattatggtgtcgtttgatccatgtagccga 37042699  T
Q  339 ttccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
      | || ||| | |||||||||||||||||||    
T  37042698 cccgacttagtgggataaggcttggttgttgt 37042667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 206
Target Start/End: Original strand, 38266134 - 38266261
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||| | | |||| |||| || |||||| |||||||  ||||| |||| ||| || |||||||| ||| |||    
T  38266134 agagagagagttagggtagcacctataatagagaggatggtggaaactaagcttaggtggtttgaccatgttgagataagtcttgtagatgccgtgataa 38266233  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    | ||||| ||||  |||||||| |||||    
T  38266234 ggagagtagatcgtatggaggatagtca 38266261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 201
Target Start/End: Original strand, 20605241 - 20605307
Alignment:
Q  135 atggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||||    
T  20605241 atggtttgggcatgtagagagaagagctgtagattctgtggtaaggagagtatatcaagtggaggag 20605307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 40018477 - 40018395
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact 161  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| | ||||||  |||||||||||||  |||||||||||    
T  40018477 agagagagaattggggtagcacctatcgtaaaaaagatggtagaaacttggcttatgtggtttgggcatgccgagagaagact 40018395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 45423542 - 45423681
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| ||||    | |||||   ||||||||||||| |||||||    
T  45423542 agatgaggatgttgtgttggttgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacatt----atagagttgaggtagcacctataatagaaaa 45423637  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    | ||||||||| | | ||||  |||||| | |||||||| ||||    
T  45423638 gatggtagaaacttgacttacgtggttttgacatgtagaaagaa 45423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 328
Target Start/End: Original strand, 49987531 - 49987645
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || ||| | |||||| ||||||||| |||||||  ||||||| || |||    
T  49987531 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagacttggagataaatgagatggatccaactatggttcatgatagagcattat 49987630  T
Q  314 gacgtcatttgatcc 328  Q
    | ||| |||| ||||    
T  49987631 ggcgtaattttatcc 49987645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 934793 - 934649
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||| || |||  ||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| ||  ||||| |||||||  | ||||||    
T  934793 gatgaggttgttgcgttggctgtgtggtatgactaggtatgatagaattagaaatgataatattagagagagggttggggtatcacctatcat-gaaaag 934695  T
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
     ||||||||| |   ||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  934694 atggtagaaactcatcttaggtggtttgggcaagtagagaggagac 934649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 1380296 - 1380433
Alignment:
Q  20 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 119  Q
    ||||||||| ||||||| || || |||   |||| ||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||  || || ||||||  ||||||||  || |    
T  1380296 ggatgttgcattggatgtgttgttagacctgacacgatagaattagaatggacaacattagagagagagttgggataacacctaccgtagaaaacatgat 1380395  T
Q  120 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  1380396 agaaactcggcttaggtggtttgggcacgtagagagaa 1380433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7066575 - 7066499
Alignment:
Q  296 tttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7066575 tttttgatagaacactatg-cgtcatttgattcatgtagctgaccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 7066499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 219 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10775623 - 10775473
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgt 318  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||| || |  |||||| ||||   ||||||||||||   | | |||||||||||||||||||  |||| |    
T  10775623 tagaggaagacctaaaagaactattagagaaaccatcaagaaggatctagaaaacaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacac--tgacat 10775526  T
Q  319 catttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
      ||||||  |||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  10775525 tgtttgatttatgtcgccgaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 10775473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22873698 - 22873601
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||| |  |||  ||| | ||||||||||||| ||||||    
T  22873698 aatgagttggttccaaatatgggttatgatagaacattataacgtaatttaatccatgtagccaaccccatttagtgggataaggcttggtagttgtt 22873601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 50869961 - 50869880
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||  || ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  50869961 atggtttttggtagaacactatggcgtcgtttgattcatgcagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 50869880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 55388310 - 55388213
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||| | ||  || ||||||||||||| | |||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  55388310 aatgagttagatcgaaatatgatttatgatagaacattgtggtgtaatttgatccatgttgtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 55388213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 55768798 - 55768717
Alignment:
Q  76 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  55768798 attagagagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55768717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 76 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 55833054 - 55832973
Alignment:
Q  76 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||| |||||| | |||||| ||||||    
T  55833054 attagagagatagtaggggtagcacctatagtagaaaagatcatggaaaataggtttaggtggtttagacatgtaaagagaa 55832973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 314
Target Start/End: Original strand, 26510559 - 26510611
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  26510559 gatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttgcgatagaacattatg 26510611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 373
Target Start/End: Original strand, 29398990 - 29399086
Alignment:
Q  277 gagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| || ||  |||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  29398990 gagttggaacgaaataaggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagctgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 29399086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 332
Target Start/End: Original strand, 36198953 - 36199056
Alignment:
Q  228 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatc 327  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||   ||| |||| |||||||  | ||||||    
T  36198953 acctagaaaaactataagaaaaa-aattagaaaagatttagaggttattgagtttgattcaaatatggtttcaaataaaacattatgacgaaacttgatc 36199051  T
Q  328 catgt 332  Q
    |||||    
T  36199052 catgt 36199056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Original strand, 44860862 - 44860914
Alignment:
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44860862 tagaaaagatggtggaaaccaggcttagatggtttgggcatgtatagagaaga 44860914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 49738885 - 49738817
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||| || |||| || |||| |||||||||    
T  49738885 gggtagcacctattgtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtgatttgagcgtgtaaagagaagac 49738817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 242
Target Start/End: Original strand, 11389638 - 11389875
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatg--ataggattaggaatgacaccattaga--gagagagtgtgggtagcacctat 104  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| | |||||  |  |||||||||| ||||||| | |||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  11389638 agcagagatgaggatgttggattggatgtgtggtaaaactagacgggatataggattagaaatgacaactttagagcgagagagttagggtagcacctat 11389737  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 204  Q
      ||| |||  |||| |||| |  |||||| |||| ||| || || |||||||   | |||||| |||| ||||| ||||| ||| | |||||    |||    
T  11389738 tctagtaaatatggtggaaactctgcttaggtggtctggccacgtggagagaatctttgtagattctgtagtaaggagagtagataagatggaaagtagt 11389837  T
Q  205 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 242  Q
    ||| | |  |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11389838 caaatcactagaggtagaggaagacgtagaaaaactat 11389875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 226 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6478830 - 6478724
Alignment:
Q  226 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttga 325  Q
    |||||||| ||||| |  |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||   | | ||||||||||||| ||||||||  |||| |||||    
T  6478830 agacctagaaaaacgacaagagaaactattaggaaggatctagaggtaaatgagttagagaaagacatggtttttgatacaacactatagcgtcctttga 6478731  T
Q  326 tccatgt 332  Q
    | |||||    
T  6478730 ttcatgt 6478724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6958323 - 6958273
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||    
T  6958323 aaatatggttttggatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccga 6958273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 8599090 - 8598976
Alignment:
Q  224 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcattt 323  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| || | || |||||||| ||   ||||| ||| |||||||||||| |||| |||| |||    
T  8599090 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctaaatgttaatgagttagaaagaaataaggtatttgatagaacattatggcgtcgttt 8598991  T
Q  324 gatccatgtggccga 338  Q
    ||| ||||| |||||    
T  8598990 gattcatgtagccga 8598976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 332
Target Start/End: Original strand, 28486092 - 28486162
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||   || ||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  28486092 gatttagagattaatgagttggatccaaatatgatttacaattgaacaatatggcgtaatttgatccatgt 28486162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 42293528 - 42293470
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 152  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||| | ||||||| ||||||||| |||||||    
T  42293528 gtagcacctatagtagaaaagatgatggaaactcggcttaggtggtttgggtatgtaga 42293470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 309
Target Start/End: Original strand, 47612518 - 47612611
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||| |||||| | || || ||| | |||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  47612518 gaggtagagga-gacctagaaaaactagaagagaaactattagataagacttggagattaatgaggtggaccaaaatatggtttatgatagaaca 47612611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1328667 - 1328614
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||  ||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1328667 atttgatccatgtatccgatcctacctagtgggataaggcttggttgttgttgt 1328614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 332
Target Start/End: Original strand, 28485842 - 28485923
Alignment:
Q  251 caattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||| || ||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||  ||| |||||||||||||    
T  28485842 caattaggaaagattttgagattaatgagttggatccaaatacggtcttcaatagaacattattgcgtaatttgatccatgt 28485923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 243 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30621331 - 30621242
Alignment:
Q  243 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||| ||||  || ||||||||| | |||| |||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| | | | |||||||||||    
T  30621331 tagagaaactattaagaaagatttagagattaatgtgttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcttaacttgatccatgt 30621242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30634159 - 30634106
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  30634159 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30634106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Original strand, 32339768 - 32339841
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| | |||| |||| |||||||||||| | | |||| || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32339768 tgatagaaaattatggcgtcgtttgatccatgtagtctattctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 32339841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36255595 - 36255526
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttg 369  Q
    |||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||  |||| ||| | || |||||||||||||||    
T  36255595 tgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttg 36255526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 40933255 - 40933198
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatga 71  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||||||| ||||| |||||    
T  40933255 agatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagacaatacatgatagaattagaaatga 40933198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 45209278 - 45209205
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| | |||| |||  |||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45209278 tgatagaatattatggcgtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45209205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 21214824 - 21214792
Alignment:
Q  129 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagact 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21214824 gcttaggtggtttgggcatgtagagagaagact 21214792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 107 - 179
Target Start/End: Original strand, 29182498 - 29182570
Alignment:
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaag 179  Q
    |||||||| || || ||| || |||||| |||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||    
T  29182498 tagaaaagatgctacaaactaagcttaggtggtttaggcatgtagagagaaaaccggtagattctgtggtaag 29182570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 116 - 332
Target Start/End: Original strand, 47372676 - 47372892
Alignment:
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 215  Q
    |||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||  || |||  ||| | ||||||||| ||| | | |||||  |||||| | |  ||    
T  47372676 tggtggaaactagacttcgatggtttaggcatgtagagcgaagacccgtggattttgtaggaagaagagtagattagacggagggtagtcaaatcactag 47372775  T
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatga 315  Q
    ||| ||||| |||| |  ||||||||| |||||||| | ||  || |||  |||| | ||||||||||||  ||||||||| | | |||||||| ||||     
T  47372776 aggcagaggtagacttgagaaaactataagagaaactactaataaagatccagagattaatgagttggatagaaatatggtatattatagaacattatgg 47372875  T
Q  316 cgtcatttgatccatgt 332  Q
     ||| ||||||||||||    
T  47372876 agtcgtttgatccatgt 47372892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 230 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 56439714 - 56439614
Alignment:
Q  230 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcca 329  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||| ||  | ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||  ||| |||| |||||    
T  56439714 ctagaaaaactatcagagaaactattatgaaagatttggaaattaattagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatagcgtaatttaatcca 56439615  T
Q  330 t 330  Q
    |    
T  56439614 t 56439614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 157)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 1210663 - 1211027
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1210663 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 1210762  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1210763 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 1210862  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  1210863 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 1210962  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1210963 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 1211027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30202494 - 30202130
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30202494 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 30202395  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  30202394 gaaaggttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggacgagagtcaag 30202295  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  30202294 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 30202195  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  30202194 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30202130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34792713 - 34792349
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34792713 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgaaaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 34792614  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34792613 gaaaagttggtagaaagtaggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 34792514  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  34792513 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaac 34792414  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  34792413 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 34792349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 49347757 - 49347392
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  49347757 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattggagagagagtaggggtagcatctatagta 49347658  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49347657 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgcagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 49347558  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  49347557 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 49347458  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  49347457 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 49347392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 8671838 - 8672200
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  8671838 agcagagataaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 8671935  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8671936 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 8672035  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  8672036 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 8672135  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||  ||||||||||||||| | ||| |  |||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  8672136 actatagcgtcatttgatccatatagccaaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 8672200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 9592652 - 9593016
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9592652 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 9592751  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9592752 gaaaagtttgtagaaaataggcttagatgggttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 9592851  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| |||| | |||||||||    
T  9592852 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaacctattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttagatttaaatttggtgtatgatagaac 9592951  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  9592952 actatagcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 9593016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 22090012 - 22090378
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatag 106  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  22090012 agcagagatgaggatgctgtgttggatgagtggtaagactagacaggataggattatgaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 22090111  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22090112 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagggagaagacccgtagatgccgtggtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtca 22090211  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataga 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  22090212 agttaaaaggggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 22090311  T
Q  307 acactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||  || | ||||||||||||||||||||||    
T  22090312 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccactaagtgggataaggcttggttgttgttgt 22090378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51441129 - 51440765
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  51441129 agcagagatgaggatgttgcattggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtaacacctatagta 51441030  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  51441029 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccggagatgccgtggtaagaagagtagagcaaatggaggagagtcaag 51440930  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  51440929 ttaaaggaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 51440830  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| | ||||||||||| |||||  ||||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  51440829 actacggcgtcatttgattcatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 51440765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 12 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 32231315 - 32230997
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32231315 agagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaa 32231216  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32231215 aaattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 32231116  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||    
T  32231115 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaagttggtctatgatagaacact 32231016  T
Q  312 atgacgtcatttgatccat 330  Q
    |||  || |||||||||||    
T  32231015 atggtgtaatttgatccat 32230997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 51601983 - 51602338
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  51601983 atgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaaagt 51602080  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602081 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 51602180  T
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatga 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||  |||     
T  51602181 aggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaagggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacatcatgg 51602280  T
Q  316 cgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  51602281 cgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 51602338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 696191 - 696552
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  696191 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 696290  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  696291 agttggtagaaaataggcttagatggcttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcatatggaggagagtcaggttaa 696390  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  696391 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacacta 696490  T
Q  313 -tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     || |||||||||||| |||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  696491 ttggcgtcatttgatcaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 696552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4001814 - 4001455
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4001814 agatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacaaaataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaa 4001715  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  4001714 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 4001615  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4001614 agaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaccctat 4001515  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  4001514 gacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 4001455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 9 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 43240745 - 43240380
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  43240745 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacgccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 43240646  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  43240645 tagaaaaattgatagaaaataggcttagatagtttgagcatgtagagagaagacccgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtta 43240546  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataga 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  43240545 agttaaaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttatatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 43240446  T
Q  307 acactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||||   ||| ||| | |||||||||| ||||||||||    
T  43240445 acactatggcgtcatttgattcatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttagttgttgttg 43240380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 15085856 - 15086204
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15085856 gagatgaggatgttgcgctggacgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 15085955  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  15085956 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcagattaa 15086055  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||            |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15086056 aagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagataggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacacta 15086143  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15086144 tgacgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15086204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Original strand, 8391694 - 8392013
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8391694 gagatgaagatgttgtgttggatgagtggtaagactacacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 8391793  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  8391794 agttggtagaaaataggtttagattgtttggacatgtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcatgttaa 8391893  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    | |||||| | ||||||||| |||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8391894 aggaggtatatgaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagaaaagatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttttgatagaatacta 8391993  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    || |||||||||||||||||    
T  8391994 tggcgtcatttgatccatgt 8392013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32083105 - 32082756
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32083105 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacagggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 32083006  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  32083005 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgcagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 32082906  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||||| ||            |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32082905 aagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttttgatagaacacta 32082818  T
Q  313 tgac-gtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     | | |||||||||||||||| |||||  |||| ||| | || ||||||| ||| |||||||    
T  32082817 cggcagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttagtttttgttgt 32082756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 81 - 373
Target Start/End: Original strand, 4029112 - 4029404
Alignment:
Q  81 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaaga 180  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  4029112 agagagagtgggggtagcacctagagtagacaagttggtagaaaataggcttagaaggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaga 4029211  T
Q  181 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 280  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4029212 agaatagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagt 4029311  T
Q  281 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  4029312 tggatccaaatttggtgtatgatataacactatggcgacatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 4029404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38808031 - 38807671
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  38808031 atgaggatgttgtgttggat-agtggtaagaccagacgggatagaattagaaatgacaccattagagagagagagaatgggggtagcacctatagtagaa 38807933  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||   ||||||| || ||||||||||| || || ||||||||||||||  | |    
T  38807932 aagttggtagaaaatagacttagatggtttaggcatgtaaagagaagacccttagatgccgtcgtaagaagagtagaccagatggaggagagtcagatca 38807833  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38807832 aaagagctaggggaagacctaagaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgatagaacact 38807733  T
Q  312 atgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||| ||||| ||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38807732 atggcgtaatttgttccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38807671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 109 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25979495 - 25979231
Alignment:
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |    
T  25979495 gaaaagttagtagaaactaggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgctgttgtaaggagagtagatcgaatggaggagagtcagg 25979396  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25979395 ttaaaagaggtagaggaagacccatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaac 25979296  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25979295 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25979231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 338
Target Start/End: Original strand, 9509236 - 9509565
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9509236 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtgataagactagacaggatatgattagaaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagta 9509335  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| | |||   ||||| ||||| ||||||||||||||      
T  9509336 gaaaagatggtaaaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagaccggtatatgctttagtacttagagtagatcagatggaggagagtcata 9509435  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || |||||| ||   |||||||| || ||||||||||||| |||| ||||    
T  9509436 ttagaagaggtagaggaagacctagaaaaactataagataaactattaggaaagatttacagcctaatgagttagagccaaatatggtttatgattgaac 9509535  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    | |||| ||| ||| ||||||||| |||||    
T  9509536 attatggcgtaattcgatccatgtagccga 9509565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 175 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37311953 - 37311755
Alignment:
Q  175 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37311953 gtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggtagacctaggaaaaccatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtca 37311854  T
Q  275 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  37311853 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 37311755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37463231 - 37462878
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||    
T  37463231 gagatgaggatgtttcattggatgagtggtaagactagacaggttaggattaggaatgacaccattagag--agagttggggtagcacctatagtagaaa 37463134  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc-aagtta 211  Q
    ||   ||||||||||||||||| ||||||||||   || |||| ||||  |||||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||  |   |    
T  37463133 agacagtagaaaataggcttaggtggtttgggc---tatagagtagacatgtagatgccgtagtacgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcaa 37463037  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||| || || || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| | |||||||| |    
T  37463036 aaagaggtagaggattacctagaaaaactataagagaaacgatcaggaatgatttagaggttaatgagtttgat-caaatatggtttatcatagaacatt 37462938  T
Q  312 atgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  37462937 atggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 37462878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9599758 - 9599435
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  9599758 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacatcattagagagagagttggagtaacacctatagta 9599659  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || | ||| |||  | ||||| | | |||  |||||| ||||| ||||||||||||||      
T  9599658 gaaaagatggtagaaaataggcttaggtggttcgggcatataaatagatgacctgcagatgttatagtacaaagagtagatcagatggaggagagtcaga 9599559  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||  |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  9599558 tcataagaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaatatttagagtttaatgagtttgatccagatatggtttatgatagaac 9599459  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
      |||| ||| |||||||||||||    
T  9599458 gttatggcgtaatttgatccatgt 9599435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 208 - 377
Target Start/End: Original strand, 52921197 - 52921366
Alignment:
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52921197 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaa 52921296  T
Q  308 cactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtattt 377  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  52921297 cactattgcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtattt 52921366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 154 - 373
Target Start/End: Original strand, 39318193 - 39318410
Alignment:
Q  154 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaa 253  Q
    |||||||  |||||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  39318193 agaagacccgtagatgc-gtcgtaagaagagcagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaacca 39318291  T
Q  254 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagaga 353  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  || | ||| | ||    
T  39318292 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccga-cccgcttagtggga 39318390  T
Q  354 taaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  39318391 taaggcttgtttgttgttgt 39318410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 22 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27848155 - 27847800
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  27848155 atgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggat-aggaataacaccattagagagagagttgtggtagcacctgtggtagaaaagatggtag 27848057  T
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 221  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||  |||| ||||||||||||||  | | |||||||||    
T  27848056 aaaataagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctgtagtatgaagagtatatcagatggaggagagtcagctcagaagaggtag 27847957  T
Q  222 aggaagacc-taggaaaactattagagaaacaatta-gaaag---gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
    ||||||||| | | |||| ||| |||||||| | ||  ||||   ||||||||||| |||||||| | |  ||||||||||| |||| ||||| |||| |    
T  27847956 aggaagacctttgaaaaattataagagaaactactaccaaagatagatttagaggttaatgagtttggttgaaatatggtttatgatggaacattatgcc 27847857  T
Q  317 gtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || |||| |||||||| ||||||  ||| ||| | |||||||||||||  |||||||    
T  27847856 gtaattttatccatgtagccgatctcacttagtgggataaggcttggtcattgttgt 27847800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 370
Target Start/End: Original strand, 39140434 - 39140794
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaa-------gattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       || ||||   ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  39140434 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaactggtaagactagatgagataggattaggaatgaaaccattacagagagagttggcgtagcacctat 39140533  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 204  Q
    |||||||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   || ||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  39140534 agtagaaaagatggcaaaaaattggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccgatacatgttgtagtacgaagagtagatcagatggatgagagt 39140633  T
Q  205 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgata 304  Q
    ||  ||| ||||||||||||||   |||  |||  |||  ||||||| ||||| ||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  39140634 cagattagaagaggtagaggaa---ctaaaaaagttat--gagaaactattaggaaaaatttagaggttaattagttggatccaaatatggtttcagata 39140728  T
Q  305 gaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||  |||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  39140729 gaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttggttgttgt 39140794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 52561841 - 52561590
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||  ||| ||||||| ||||| |||||||||||| |  ||| ||||||||    
T  52561841 gaaaataggcttaggtggtttcggcatgtagagagaagaccgatagatgttgcagtacgaagagtagatcagatggaggagagttagattagaagaggta 52561742  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtca 320  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||| ||  |    
T  52561741 gaggaagacttagaaaaactataagagaaactgttaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttcgggtagaacattatggcgaaa 52561642  T
Q  321 tttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  52561641 tttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 52561590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 18469440 - 18469141
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |  ||||| ||||||||||||| |    
T  18469440 gagatgacgatgctgcgttgtatgagtggtaagactagacatgatatgattaggaatgacacaattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaga 18469343  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || || ||||||||||| |||| | |||||| ||| ||| ||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||  |||| |||||| ||||||   | ||    
T  18469342 agatgatagaaaataggattaggtagtttggacatatagtgagaagactggtagatgttgtagtacgaagagtaaatcagatggagaagagtcggatcaa 18469243  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||||||  |||| ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| ||    
T  18469242 aagaggtagatgaagacttagaaaaattataagagaaacttttaggaaatattaagaggtcaatgagttggatacaaatatagtttatgatcgaacatta 18469143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32404890 - 32404527
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacat----gataggat--taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt 107  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||     |||  |||  ||| || |||| |||| ||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  32404890 agatgaggatgttgcgttagatgcgtggtaagaatagacagctaagattagatattagaaacgacaacattcgagagtgagt-tgggtaacacctatagt 32404792  T
Q  108 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  |||||| || | ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||     
T  32404791 aaaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggatatgtagagagaagacctgtagattctatagtaaggagagtagagaagatggaggatagtcat 32404692  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
     | | ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||    
T  32404691 atcacaagaggtagaggaagacctacaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttaaatccaaacatggtttatgatataa 32404592  T
Q  308 cactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||  ||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||| |||||||||||||    
T  32404591 cataatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc-tggttgttgttgt 32404527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48431687 - 48431399
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||  ||||| |||||    
T  48431687 gggtagcccctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaagagagttgatca 48431588  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggt-------caatgagttgga 284  Q
     |||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| |        |||||||||||    
T  48431587 gatggaggatagtcggattacaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagatttatgaataatgagttgga 48431488  T
Q  285 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  ||| | | ||||||||| ||| || ||  |||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  48431487 tccaaatatggtttgtgataaaacatcatggcttaatttgatccttgtagctgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 48431399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 79 - 375
Target Start/End: Original strand, 2544587 - 2544877
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| || | ||||    
T  2544587 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaacagacttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctatagtaa 2544686  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||||   |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||     | ||||| ||  |||||||    
T  2544687 ggagagtagatcagatggaggatagtcaa-acactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactat-----aagatttggaaatcaatga 2544780  T
Q  279 gttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    |||||| | ||||||||||| | |||||||| |||| | | ||||||||||||| |||||  |||| ||| |  | |||||||||||||||||||||    
T  2544781 gttggagcgaaatatggtttataatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtggtaaaaggcttggttgttgttgtat 2544877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 300
Target Start/End: Original strand, 43423645 - 43423928
Alignment:
Q  19 aggatgttgcgttggatgagtggt--aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagtt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |    
T  43423645 aggatgttgcgttggatgtgtgggggaagactagacaggataggattagaaatgaccacattagagagagagttggggtaacacctatagtagaaaagat 43423744  T
Q  117 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 216  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||  | |||||    |||||| | |  |||    
T  43423745 ggtggaaactaggcttaggtggtttggccatgtagagagaagacttgtagattatgtagtaagtagagtagactagatggatagtagtcaaatcactaga 43423844  T
Q  217 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggttttt 300  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||  ||||| || ||||  || ||| ||||| | | ||||||||||  |||||||||||||    
T  43423845 ggtagaggaagacctagaaaaattacaagagagaccattaagaaagatctagagattagtgagttggatagaaatatggttttt 43423928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34827462 - 34827182
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   ||| |||||| ||||||   ||||   |||||||  ||||||| | ||||| || ||    
T  34827462 gagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgatataagattagaaatgact--attatgtagagagttggggtagcgcatatagaagtaa 34827365  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || |||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||   |||||||| | ||||||| ||| ||| | |||||||||||| | ||||     
T  34827364 agatggtagaaaataggcttctttggtttggacatgtaaagagaagaccgatagatgctctagtaagaaaagtagattagatggaggagagtaaggttag 34827265  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagagg-tcaatgagttggatccaaatatg 294  Q
    || |  || |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  34827264 aaaaaataaaggaagacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtttaatcagttgaatccaaatatg 34827182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 198 - 373
Target Start/End: Original strand, 4415455 - 4415631
Alignment:
Q  198 ggagagtcaagttaaaaga-ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggt 296  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4415455 ggagagtcaggttaaaaaaaggtagaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatctaaatatgat 4415554  T
Q  297 ttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |  | ||| |||||||||||||||    
T  4415555 tttttatagaacattatggcatcatttgatccatgtagccgactccatttagtggaaaaagacttggttgttgttgt 4415631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 79 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3819150 - 3818856
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||   |||||||||||| ||||||||| |||| | || ||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||| || ||| || | ||||    
T  3819150 agagagagagttgaggtagcacctatggtagaaaagatggtggtaactagacttaagtggtttgggcatgtagaaagaagacttgtggattctctagtaa 3819051  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
      ||||| ||||| |||||||  | ||||   |  ||||  |||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| | |||||    
T  3819050 agagagtagatcagatggagggtaatcaaaccactagagaaagaggaagaccttgaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaatga 3818951  T
Q  279 gttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||  ||||||||||| |||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||||| | ||| ||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  3818950 gttgaatagaaatatggtttatgatggaacattatgtcgccatttgatccatgtagccgactgcacttagtgggataaggcttggtcgttgttgt 3818856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36624184 - 36623959
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |  |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  36624184 gatagaattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagtacttgcagtagaaaagattgtagaaaataggcttaggtggttt-ggcatgtcgaga 36624086  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 254  Q
    ||||||| |||     ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||   | | ||||||||||||||||||            ||||||||| ||    
T  36624085 gaagactggta-----tgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcggatcagaagaggtagaggaagacc------------tagagaaactat 36624003  T
Q  255 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggttt 298  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  36624002 tagaaaagatttagaggctaatgagttggatccaaatatggttt 36623959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 373
Target Start/End: Original strand, 6025526 - 6025887
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||| |||||||||  | ||||||  ||| |||| |||||  |||| |||||| ||||| | ||||| ||||| |||  || |||||||||||||| ||    
T  6025526 agagacgaggatgttttgctggatgtttggcaagactagactggataagattagaaatgatagcattaaagagatagttgggttagcacctatagtaaaa 6025625  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    | | |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||   | ||| ||    |||| ||||| ||||| ||| |||  |||||| | |    
T  6025626 acgatggttgaaactaggcttagatgacttgggcatgtacagagaacacctatggatactccaataaggagagtagatcagatgtagggtagtcaaatca 6025725  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
      ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| || | || ||| ||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||      
T  6025726 ctagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagatactagtaaaaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatggtatctgatagaacatg 6025825  T
Q  312 atgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||  |||||||||| ||||    
T  6025826 atggcgtcatttgatccatgtagccgattccacttagtgggataatacttggttgtttttgt 6025887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 215 - 373
Target Start/End: Original strand, 41560353 - 41560511
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| |   |||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  41560353 gaggtagaagaagacctagaaaagctataagagaaactattaggatacatttagagattaatgagttggatccaaatatgggttatgatagaacattatg 41560452  T
Q  315 acgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41560453 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41560511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 241 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32079307 - 32079177
Alignment:
Q  241 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgatt 340  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  || |||||||||||| |||| |||||      
T  32079307 attagagaaaccatcagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatctggtttatgatagaacac--tggcgtcatttgatcgatgtagccgacc 32079210  T
Q  341 ccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| | | | ||||||||||||||||||||||    
T  32079209 ccacttggtgggataaggcttggttgttgttgt 32079177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 106 - 326
Target Start/End: Original strand, 478695 - 478912
Alignment:
Q  106 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 205  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||  ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||     
T  478695 gtagaaaagttggtagaaaaaag-cttaggtggtttggacattcagatagaa-acttgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcagatgaaagagagtt 478792  T
Q  206 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 305  Q
    | || ||||||| ||||||||||||||  ||| |||| |||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||||  || ||||| || ||||||    
T  478793 aggtcaaaagagttagaggaagacctacaaaatctataagagaaactattaggaaagttttagaggttaatgagttggatggaagtatgg-ttatgatag 478891  T
Q  306 aacactatgacgtcatttgat 326  Q
    || |||||||| | |||||||    
T  478892 aatactatgacataatttgat 478912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 1661344 - 1661499
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattag----gaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctat 104  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||  || ||||| ||||  ||||||||||||    ||||||||  ||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  1661344 agcagagatgaagatgttgtgttgaatgtctgataagactagatgtgataggattagaaatgaatgacaatatttgagagagagttggggtagcacctat 1661443  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  1661444 agtagaaaagatggtggaaaataggctcagatggtttgagcatgtagagagaagac 1661499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4707338 - 4707221
Alignment:
Q  255 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagat 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||  |||| ||| | |||    
T  4707338 tagaaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggat 4707240  T
Q  355 aaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4707239 aaggcttggttgttgttgt 4707221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 67 - 373
Target Start/End: Original strand, 38868858 - 38869164
Alignment:
Q  67 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 166  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||  | |||||||||||  |||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38868858 aatgacaacattaaagagagggttggagtagcacctatcatagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaacactagtag 38868957  T
Q  167 atgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggattt 266  Q
    || || | |  || ||||| ||| | |||||||  |||||| | |  ||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| |    
T  38868958 attctctagcgaggagagtagattagatggagggtagtcaaatcattagaggcagaagaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatct 38869057  T
Q  267 agaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttg 366  Q
    || | | |||| |||||||  | ||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||  |||| ||| | || || |||||||||    
T  38869058 agcgattaatgggttggatagatatatggtatatgatagaacattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaatgcttggttg 38869157  T
Q  367 ttgttgt 373  Q
     ||||||    
T  38869158 ctgttgt 38869164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 46423331 - 46423214
Alignment:
Q  255 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagat 354  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||    
T  46423331 tagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgattgaac---atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggat 46423235  T
Q  355 aaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  46423234 aaggctcggttgttgttgtat 46423214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 332
Target Start/End: Original strand, 26016355 - 26016678
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||  ||| |   |||||||||||||||  ||||| ||||||||  |    
T  26016355 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaggatataattataaataatggcattagagagagagttggggtaacacctatatga 26016454  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| ||||||| |||||||   |  || |||| | ||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||      
T  26016455 gaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttgggtatgtagaaagaagacctatgcattctgtagcaaggagattagatcagatgaaggggagtcaga 26016554  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    | |  |||||||   | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||| | |||||||| ||   ||| |||||||||| ||||||    
T  26016555 tcactagaggtaagagtagacctagaaaaactataagagaaactattaggaatgatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttggtagaac 26016654  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    | | || |||| |||||| |||||    
T  26016655 attgtggcgtcgtttgatacatgt 26016678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 314
Target Start/End: Original strand, 40416359 - 40416594
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||  ||| ||||    
T  40416359 agagagagagttggagtagcacctatagtagaaaagatggtggaaacgaggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagaactgtagattttgtagtaa 40416458  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    | ||||| ||||| ||| |||| |||||  | |  | ||  ||| |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||  || ||| || || | |||||    
T  40416459 ggagagtagatcagatgcaggatagtcagatcaccaaagacagaagaagacctagaaaaactataagacaaactattaagaaagatctatagattaatga 40416558  T
Q  279 gttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  40416559 gttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatg 40416594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 52561950 - 52561843
Alignment:
Q  34 atgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 133  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | || |||||||||||||||    
T  52561950 atgagtggtaagactagacgggatatgattaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctttagtagaaatgatgatagaaaataggctta 52561851  T
Q  134 gatggttt 141  Q
    | ||||||    
T  52561850 ggtggttt 52561843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 319
Target Start/End: Original strand, 40419557 - 40419867
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||| | ||||   ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| || |||||||    
T  40419557 agcagagatgaggatggtgcgttgaatgtatggtaaaactagatgagatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacttatagta 40419656  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||| || |||||| || ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||  || |||  ||| | ||| ||||| | ||| ||||||| |||| |      
T  40419657 gaatagatggtagtaactagacttaagtggtttgggcatgtagagagaagacatgtggattatgtagcaaggagagtagttcagatggaggggagttaga 40419756  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    | |  |||||||| || |||| ||| ||| ||||   |||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | | ||||||||||||||| |    
T  40419757 taactagaggtaggggtagacatagaaaatctatacaagaaactattatgaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatagatc 40419856  T
Q  309 actatgacgtc 319  Q
    |||||| ||||    
T  40419857 actatggcgtc 40419867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 373
Target Start/End: Original strand, 5338727 - 5338995
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |    
T  5338727 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactgagcttaggtggtttgggcatgcagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagagtagatcaga 5338826  T
Q  194 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatat 293  Q
    ||||||| | |||  | |  ||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||           ||| ||||| | ||||||||||||| |||| |    
T  5338827 tggaggatattcagatcactagaggcagaagtagacctagaaaaactataagagaaa-----------gatctagagattaatgagttggatcgaaatgt 5338915  T
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | ||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| |   ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  5338916 gatttattatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggctcggttgttgttgt 5338995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36340097 - 36339803
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| | |||| |||||||||||   |||||  ||| ||||    
T  36340097 agagagagagttggtgtagcacctatattagaaaagatggtggaaaataggtttaggtggtttagacatggagagagaagacctatagattttgtagtaa 36339998  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    |  | || ||||| |||||||| |   |  | |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||    
T  36339997 ggcgggttgatcagatggaggatacctagatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagattt-gaaattaatga 36339899  T
Q  279 gttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    ||||||   ||| ||||||  ||||| |||| ||||| || ||||||||||||| || || ||||| ||| | || || |||||||||||||||||    
T  36339898 gttggacagaaacatggttaatgataaaacattatgaagtaatttgatccatgtagctgactccacttagtgggaaaatgcttggttgttgttgta 36339803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24020377 - 24020267
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |  |||| | | | |||||||||||    
T  24020377 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgcagccaaccccactttgtgggataaggcttg 24020278  T
Q  363 gttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||    
T  24020277 gttgttgttgt 24020267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 227 - 372
Target Start/End: Original strand, 29128919 - 29129065
Alignment:
Q  227 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgat 326  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  || || ||||    
T  29128919 gacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaacaagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatatgat 29129018  T
Q  327 -ccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
     |||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  29129019 cccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggtttttgttg 29129065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 191
Target Start/End: Original strand, 51812472 - 51812625
Alignment:
Q  38 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 137  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||  | |||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||    
T  51812472 gtggtaagattagacacgataagattagaaatgactactttagagagagagttggggtaacaactatagtagaaaagatggtggaaactaggcttatgtg 51812571  T
Q  138 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
     ||||||||||||||||||| | | ||||||  ||| ||||||| ||| |||||    
T  51812572 atttgggcatgtagagagaaaaattgtagattttgtagtaagaaaagtagatca 51812625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 35828869 - 35828717
Alignment:
Q  54 tgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 153  Q
    ||||| |||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||||    
T  35828869 tgataagattagaaatgacaatattagagagagagtttgagtagcacctatggtagaaaagatggtggaaaatagggttaggtggtttggacgtgtagag 35828770  T
Q  154 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    |||||||   |||||  ||| ||||| ||||  ||||| |||||||| |||||    
T  35828769 agaagacctatagattatgtagtaaggagagaagatcatatggaggatagtca 35828717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 284
Target Start/End: Original strand, 37263332 - 37263523
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||   |||||||||||||||||||||| ||| || |||| || |||||| |||||  ||||    
T  37263332 gggtagcacctatagtagaaaagatagtagaaactagacttcagtggtttgggcatgtagagagaaaacttgtggatgttgcggtaaggagagtaaatca 37263431  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 284  Q
     ||||||| | ||||| | |  |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || | | | ||| ||||| |||||||||||||    
T  37263432 gatggaggggtgtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaatactattagtgaaactatca-agaagatctagagatcaatgagttgga 37263523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14226191 - 14226047
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||| | |||||| ||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| || |||| |||||||  |    |||||||||||  ||    
T  14226191 agcagatacgaggattttgtgttggatgtgtggtaaggctagacatgataggattagaaatggcaacattggagagag--ttgcagtagcacctatcata 14226094  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 155  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14226093 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagag 14226047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16273073 - 16272862
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||| ||||||||| ||| |||||| || | |||||||||||||||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  16273073 gaaaataggtttaggtggtttgtacatttagagagaaaacttgtagattctatagtaagaagagtggatcaaatagaggataatcatattacaagaggta 16272974  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtca 320  Q
     || | ||||||| | ||||||||||||||  ||||  ||  ||||| || | ||||||| | ||| || |||||||| |||||||||| |||||| |      
T  16272973 tagaacgacctagaagaactattagagaaattattatgaaatatttatagattaatgagtagtatctaattatggtttatgatagaacaatatgacatat 16272874  T
Q  321 tttgatccatgt 332  Q
    ||||||||||||    
T  16272873 tttgatccatgt 16272862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 375
Target Start/End: Original strand, 28528385 - 28528642
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    |||| ||| ||||| |||||| ||||||| | ||||||||| || ||| |||| ||||| | ||| ||||||||||||| ||||||| |    ||| |||    
T  28528385 gaaactagacttaggtggtttcggcatgtcgggagaagacttgtggattctgtagtaaggacagtagatcaaatggaggggagtcaaatccctagaagta 28528484  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtca 320  Q
    | ||||||||||  |||||||| | |||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | | ||||||||||||||| ||||||| ||||     
T  28528485 ggggaagacctaaaaaaactataacagaaactattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaccactatggcgtcg 28528584  T
Q  321 tttgatccatgtggccgattccacctagagagat---aaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    |||||| ||||| |||||  |||| ||| ||  |   |||||||||||||||||||||    
T  28528585 tttgattcatgtagccgaccccacttagtgatcttccaaggcttggttgttgttgtat 28528642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 330
Target Start/End: Original strand, 52832037 - 52832284
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 182  Q
    |||||||  |||||| | ||| |||||||||| || || ||||||   |||| ||||||||||||||  |||||||||   |||||| ||| |||   ||    
T  52832037 agagagttggggtagtagctacagtagaaaagatgatacaaaataaatttaggtggtttgggcatgttaagagaagaccgatagatgttgttgtacagag 52832136  T
Q  183 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
    ||| ||| | |||||||||||||   ||| || ||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||  |||||||| |||||||||||  || |||||    
T  52832137 agtagataagatggaggagagtcgtattagaataggtagaggaatacctagaaaaaccaaaagagaaagtattagaaaagatttagaggttgataagttg 52832236  T
Q  283 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccat 330  Q
     || ||||||| ||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  52832237 aatacaaatattgtttcagatagaacattatgacgtaatttgatccat 52832284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 7762689 - 7762496
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | | ||| ||| |||  |||| ||| | ||| || |  | ||||||| ||    
T  7762689 gaaaatatgattagatggtttgggcatgtagagagaagaattgtagatgttatagtatgaaaagtaaatcatatgaaagagtgttagatcaaaagagata 7762590  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
     |    ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||    
T  7762589 aaaagggacctagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagatgttaatgagttggatctaaatatggtttataatagaacattatg 7762496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 121 - 373
Target Start/End: Original strand, 8796239 - 8796491
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||| |||||  |||| |   || ||||| |||||  |||  |||||||| |||||  | |  ||||| |    
T  8796239 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagataagacatgtaggtttcgtagtaaggagagtaaatcggatggaggatagtcagatcactagaggca 8796338  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtca 320  Q
    |||||||||| |  |||||| | |||||||| ||||  || ||| ||||  | ||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |    
T  8796339 gaggaagaccaataaaaactttaagagaaactattaagaaagatctagatattaatgacttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaa 8796438  T
Q  321 tttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| |||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  8796439 tttaatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 8796491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 93 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 27637913 - 27637690
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc-- 190  Q
    |||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| |||||  || |||| ||| ||||| ||||| ||||      
T  27637913 ggtagcacctatagcagaaaagatgatagaaactagacttaggtgttttgggcatgtagagaaaagacatgtggatgttgtagtaaggagagtagatcat 27637814  T
Q  191 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 290  Q
    | ||||||  ||| ||| | |  |||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||| || |  |||||| ||| | |||||||||||||   | |    
T  27637813 atatggagtggaggcaaatcactagaggtaggggaagacctaaaaaaacttttagagaaactatcaagaaggatctagtgatcaatgagttggagaaaga 27637714  T
Q  291 tatggtttttgatagaacactatg 314  Q
     |||||||||||||||| ||||||    
T  27637713 catggtttttgatagaatactatg 27637690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 238 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10200441 - 10200306
Alignment:
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccg 337  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||  || ||||||||||||| ||||    
T  10200441 actatgagagagactattagaaaagatttagagatcgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatcatggtgtaatttgatccatgtagccg 10200342  T
Q  338 attccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |   ||| ||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  10200341 acctcacttaatgggataatgcttggttgttgttgt 10200306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 246
Target Start/End: Original strand, 39894722 - 39894934
Alignment:
Q  29 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 128  Q
    ||||||| ||||| |||||||||   |||||||||| |||| |||| || | ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||    
T  39894722 gttggataagtggcaagattagatgagataggattaagaataacactatcatagagagaat-tgggtagcccctatagtagaaaagatggga-aaaatag 39894819  T
Q  129 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 228  Q
       ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||  || | ||   ||||||||   | |||||| ||||||||| |    
T  39894820 atctaggtggtttgggcatgtacggagaagacttgtagatgttgtggtacgaagagtaaattagat---ggagagtccgatcaaaagatgtagaggaaaa 39894916  T
Q  229 cctaggaaaactattaga 246  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  39894917 cctagaaaaactattaga 39894934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 272 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 40568511 - 40568409
Alignment:
Q  272 tcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||| |  |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  40568511 tcaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaaaactatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgtt 40568412  T
Q  372 gta 374  Q
    |||    
T  40568411 gta 40568409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Original strand, 4379927 - 4380081
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--------gggtagcacctat 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| | |||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||        |||||||| ||||    
T  4379927 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagaaaagatatgattagaaatgacaacattagagagagagagtgagtgttggggtagcaactat 4380026  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||| |||| |||| || | |||| ||||||   |||||||||||||||    
T  4380027 agtagaaaagatggtggaaactaaggttaggtggtttatacatgtagagagaaga 4380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 235 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16142118 - 16142021
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| | ||| |||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16142118 aaaactataagagaaaccattagaaaagatttagagtttaataagttagatccaattatggtttatgatcgaacaatatgacgtaatttgatccatgt 16142021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 284 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 44941865 - 44941776
Alignment:
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44941865 atccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44941776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8343040 - 8342885
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||||| || |||||| ||||| |||    
T  8343040 agagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaacaattaataaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagtatttgatggaacattat 8342941  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||   ||||||| ||||  | ||| |||| ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  8342940 gacg---tttgatcaatgtatctgatcccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 8342885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 283 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 21769801 - 21769709
Alignment:
Q  283 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21769801 gatctaaatatggtttgtgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgtgataaggcttggttgttgttgtat 21769709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 281 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28090786 - 28090694
Alignment:
Q  281 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  28090786 tggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 28090694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 121 - 316
Target Start/End: Original strand, 9002382 - 9002577
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    ||||||||| |||| | |||||| |||||||||| || ||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||| | |||  ||| ||||||||    
T  9002382 gaaaataggtttaggtagtttggacatgtagagaaaaaacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcaaatagaggataatcatattagaagaggta 9002481  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
     || |||||||||  ||||||| ||| |||| ||| |||| |||||| || | ||| | ||| ||| |||||| ||||  ||||||||| ||||||    
T  9002482 tagaaagacctagagaaactatcagaaaaactatttgaaaagatttatagattaataaattgaatctaaatatagtttaagatagaacattatgac 9002577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 204 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 27520378 - 27520248
Alignment:
Q  204 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa--ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttg 301  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||  |||| |||||||| ||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||| ||| ||    
T  27520378 tcaagtcaaaagaggtaaaggaagacatataaaaaaactataagagaaactattagaaaaaatttagagattaatgagctggatccaaatatgatttatg 27520279  T
Q  302 atagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| |||||    
T  27520278 atagaacattatgatgtaatttgattcatgt 27520248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 211 - 309
Target Start/End: Original strand, 8628150 - 8628248
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||  |||||||||    
T  8628150 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaatttgatcaaaatatagtttacgatagaaca 8628248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Original strand, 19936444 - 19936571
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||||||||        ||||||  ||||||||||||||| | |||    
T  19936444 gagatgagaatgttgtgttggatgagtggtaagactagatgggataggaataggaatgacacc--------gagagttagggtagcacctatagcaaaaa 19936535  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 148  Q
    || |||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  19936536 agatggtagaaaataggtttatgtggtttgggcatg 19936571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 243 - 373
Target Start/End: Original strand, 19936612 - 19936742
Alignment:
Q  243 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattcc 342  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||| || | ||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  19936612 tagaaaaactattaggaaagatttagatgttaatgagttagatccaaatatggttaatgatagaacattacggcgtaatttgatccatgtagccgactcc 19936711  T
Q  343 acctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     | ||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  19936712 gcttagtgggataagacttgattgttgttgt 19936742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Original strand, 28533676 - 28533750
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  28533676 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgta 28533750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 309
Target Start/End: Original strand, 41611806 - 41612024
Alignment:
Q  91 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 190  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||| | ||||||||||||||   ||||||| ||| ||| ||| ||| |||     
T  41611806 tgggtagcacttatattagaaaagatggtagaaaataggtttatgtggtttgagaatgtagagagaagatatgtagatgatgtagtacgaaaagtagatt 41611905  T
Q  191 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 290  Q
    |||| ||||   ||||    || ||||||||||||| | |||  |||| ||| ||||| |   ||||||| |||||||| || ||||||||| || ||||    
T  41611906 aaatagaggtttgtcagagcaagagaggtagaggaaaatctataaaaaatataagagatattgttagaaaagatttagatgttaatgagttgaattcaaa 41612005  T
Q  291 tatggtttttgatagaaca 309  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  41612006 tatggtttatcatagaaca 41612024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 244 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 52532745 - 52532619
Alignment:
Q  244 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattcca 343  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||  | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |||||  |||    
T  52532745 agagaaactattaggaaagatttagaaattaatgagttggaacaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgattcatgtagccgacccca 52532646  T
Q  344 cctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    | ||| | || ||||||||||||||||    
T  52532645 cttagtgggaaaaggcttggttgttgt 52532619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Original strand, 29577461 - 29577534
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29577461 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29577534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 284 - 373
Target Start/End: Original strand, 44751677 - 44751766
Alignment:
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||   ||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44751677 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44751766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13827851 - 13827699
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||| | || |||||||| |||||||||||||||   |||||| |||| ||||| ||||| |||||    
T  13827851 gggtagtacctatagtagaaaagacggtggaaactagggtaaggtggtttggacatgtagagagaagaagtgtagattctgtagtaaggagagtagatca 13827752  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 244  Q
     |||||  | |||||  | |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  13827751 tatggaacatagtcagatcactagaggcagaggaagacctagaaaaactatta 13827699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18793345 - 18793201
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| | ||  ||||||  ||||| |||||| ||  |||||| || ||| |||||||||     
T  18793345 atgatgatgttgcgttggatgtgtggaaagactagacaggatagaactaaaaatgacgacattaaagagagggttggggtaggacttattgtagaaaaga 18793246  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||| ||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||    
T  18793245 tggtagaaactagacttagttgattttggcatgcagagagaagac 18793201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 193 - 289
Target Start/End: Original strand, 26299187 - 26299283
Alignment:
Q  193 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaa 289  Q
    |||||||| |||||  |||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26299187 atggaggatagtcagattaccagaggtagaggaaaacctaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttgggtccaa 26299283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 284 - 376
Target Start/End: Original strand, 42337749 - 42337841
Alignment:
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtatt 376  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  42337749 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtatt 42337841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Original strand, 34444539 - 34444638
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||  || |||||||| |||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34444539 aatgagttggatccaaatatggtttataataaaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 34444638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43375709 - 43375598
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| || |||| ||| | ||||| | ||    
T  43375709 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggttcatgatagaacattatgacataatttgatccatgtagccaatcccacttagtgggataaagatt 43375610  T
Q  362 ggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||    
T  43375609 ggttgttgttgt 43375598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 136 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 50771792 - 50771554
Alignment:
Q  136 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |    
T  50771792 tggtttgggc-tgtagagagaagacccatggattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatgactagaggtaggggaagacctagaa 50771694  T
Q  236 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgg-tttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtgg 334  Q
    ||||||| || ||||| ||||  |||||  ||||| | ||| |||||||   | | |||| ||||| ||||||||| ||| | || || ||| ||||  |    
T  50771693 aaactataagcgaaactattaagaaggacctagagattaataagttggagaaagacatggttttttaatagaacaccatggcatcgttcgattcatgcag 50771594  T
Q  335 ccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    || | ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50771593 ccaactccacttagtgagataaggcttggttgttgttgta 50771554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 156
Target Start/End: Original strand, 17815402 - 17815537
Alignment:
Q  18 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 117  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| || |||||  ||||| ||||| |||||||  |||||||||||| || || ||| || |||| | |||||| ||    
T  17815402 gaggatgttgtgttggatgtgtggta-gactagacgggatagcattagaaatgacaatattagagagaga-tgagg-taggacttataatggaaaagatg 17815498  T
Q  118 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 156  Q
    || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17815499 gtggaaactaggcttagttggtttgggcatgtagagaga 17815537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 25715425 - 25715323
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| | | ||||||||||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25715425 aatgagttgaaccgaaatatggtttatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25715326  T
Q  374 att 376  Q
    |||    
T  25715325 att 25715323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 219 - 357
Target Start/End: Original strand, 29807984 - 29808122
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgt 318  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||| || |  |||||| || |  | || |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||| ||     
T  29807984 tagaagaagacctagaaaaactataagagaaacgatcaagaaggatctaaatattaacgagttgaataaaaatatggtttttgataaaacactatggcga 29808083  T
Q  319 catttgatccatgtggccgattccacctagagagataag 357  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||||||    
T  29808084 catttgattcatgtagccgattccacttagtgggataag 29808122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 305 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3777328 - 3777260
Alignment:
Q  305 gaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||   ||||| ||||||||||||||||    
T  3777328 gaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtaggataatgcttggttgttgttgt 3777260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11941732 - 11941580
Alignment:
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtca 320  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| | |||||||| ||||||||| | | |||||||||||  | |||||||| ||||| |||| |||| |||      
T  11941732 gaggaagacctagaaaaacaataagagaagctattagaaaagatttagagattattgagttggatcggagtatggtttatgataaaacattatggcgtat 11941633  T
Q  321 tttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| | ||    ||| ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  11941632 tttgatccatgtagtcggcctcacttagtgggatacggcttggttgttgttgt 11941580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12930471 - 12930311
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||  || |||||||||| ||| |||||||  ||||  ||  ||||| || | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | ||    
T  12930471 aagaggtagagagaggcctaggaaaattataagagaaattattatgaaaaatttaaagattagtgagttggatccaaatatgatttatgatagaagatta 12930372  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||| |  |||| |||  | |||||| ||||||||||||||    
T  12930371 tgacgtaatttgatccgtgtagccaaccccacttagcaaaataaggattggttgttgttgt 12930311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19908371 - 19908040
Alignment:
Q  41 gtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtt 140  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||| |||||||  |||| |||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||  ||||  | | |||| || ||    
T  19908371 gtaagactagacatgacagggttagaaatgacaaaattaaagagagagttgtggtagcacctatagtaaaaaagatgggggaaaccaagtttaggtgatt 19908272  T
Q  141 tgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa--- 237  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||  ||| ||||| ||||   |||| |||||| | || ||  | |  | ||||||||| |||| ||| |||       
T  19908271 tgggcatgtagagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagcaaatcagatggag-atagccagatcagtaaaggtagaggtagacttagaaaatta 19908173  T
Q  238 --actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggc 335  Q
      ||||| ||||| || |||||||    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||  ||| |||| |||||||| ||    
T  19908172 taactataagagacacgattagaatttttttagagattaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacattattgcgtaattttatccatgtagc 19908073  T
Q  336 cgattccacctagagagataaggcttggttgtt 368  Q
    |||  |||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  19908072 cgaccccacttagtgggataaggcttgattgtt 19908040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28511960 - 28511836
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  | ||| || || || ||| | ||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||| |||    
T  28511960 agaggcagagaaagacctagaaaaactattagagaaattactaggaaagacttggagattaatgagttggaccaaaacatggtttatgatagaacattat 28511861  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    | ||| |||||||| |||| |||||    
T  28511860 ggcgtaatttgatcaatgtagccga 28511836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 374
Target Start/End: Original strand, 50806765 - 50806950
Alignment:
Q  187 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 286  Q
    ||||||||||||| ||||||| | |  ||| ||||| |||||||||| ||||| || |||||||| || |  |||||  ||||| | |||| |||||||     
T  50806765 gatcaaatggaggggagtcaaatcactagaagtagatgaagacctagaaaaacaataagagaaactatcaagaagga--tagagattaatgcgttggata 50806862  T
Q  287 caaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||| |||  |||||| |||||  ||||  |||  ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  50806863 aaaatatggtttatgataaaacactatggcgttgtttgattcatgtaaccgaccccatttagtggaataaggcttggttgttgttgta 50806950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 52442868 - 52442788
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt 89  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||    
T  52442868 agcagacatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaagataagattagaaatgagaacattggagagagagt 52442788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Original strand, 6084158 - 6084257
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||    |||  ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  6084158 aatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtaatttgatccatgtatttgatctcacttagtgggataaggcttggttgttattgt 6084257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11331350 - 11331247
Alignment:
Q  227 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgat 326  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||  |||| ||||| || |||||||    
T  11331350 gacctagaaaaagtataagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgat 11331251  T
Q  327 ccat 330  Q
    ||||    
T  11331250 ccat 11331247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 227 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 11489371 - 11489268
Alignment:
Q  227 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgat 326  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||| ||||  |||| ||||| || |||||||    
T  11489371 gacctagaaaaagtataagagaaactatttgaaaagatttagaggttaataagttggatttaaatatggtttatgatgaaacattatgatgtaatttgat 11489272  T
Q  327 ccat 330  Q
    ||||    
T  11489271 ccat 11489268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 375
Target Start/End: Original strand, 50257767 - 50257854
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||| |  |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  50257767 aaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaggcttcgttgttgttgtat 50257854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 52073753 - 52073675
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  52073753 agagagttggggtagcacctattgtagaaaagatggtaaaaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 52073675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10569144 - 10569071
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  10569144 tgatagaacattataatatcatttgatccatgtagccggttccacttaaagggataaggcttggttgttgttgt 10569071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 301 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38877415 - 38877342
Alignment:
Q  301 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||| ||||||    
T  38877415 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaacccacttagtgggataaggcttggttgtggttgta 38877342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 373
Target Start/End: Original strand, 50636266 - 50636363
Alignment:
Q  276 tgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||||| || |||||| |||||||||| |||| | |||||| || ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  50636266 tgagttggataaaaatatggtatatgatagagcattatgacatcatttgatcaatgtagtcgattctacttagcgggataaggcttgattgttgttgt 50636363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8343139 - 8343071
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  8343139 gggtaacacctttagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggactgggcatgtagagagaagac 8343071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 13827994 - 13827930
Alignment:
Q  96 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  13827994 agcacctatagtagaaaagatggtggaaactagggttaggtggtttgaacatgtagagagaagac 13827930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 157
Target Start/End: Original strand, 17275137 - 17275262
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |          ||||||||||||| |  |||||||  |||||||||||||| | || |    
T  17275137 atgttgcgttggatgtgtggtaagactacacatgataggataa----------cattagagagagatttggggtagcttctatagtagaaaagattgtgg 17275226  T
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    ||| | ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17275227 aaacttggcttaggtggtttgtgcatgtagagagaa 17275262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 30834214 - 30834018
Alignment:
Q  136 tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagga 235  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | |||| || |  |||| ||||| ||||| ||||| |  |||||| |  | ||||| |||||||||||||| |    
T  30834214 tggtttggtcgtgtagagagaagacttgcagattctataataaggagagtagatcagatggaaggtagtcaaatcgatagagggagaggaagacctagaa 30834115  T
Q  236 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    || |||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||||| || |||||  ||||| | || |||||||| | ||||||    
T  30834114 aagctataagagaaactattacgaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatagtatttgacggaacattgtggcgtcatttaaaccatgt 30834018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 40920894 - 40920822
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    |||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||  |||||||||||||    
T  40920894 atgaagatgttgcattggatgtgtggtaagattagacgagataggattagaaattacaatattagagagagag 40920822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44905483 - 44905415
Alignment:
Q  246 agaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  44905483 agaaactataagaaatgatttataggttaatgagtttgatccaaatatggtttatcatagaacactatg 44905415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 990732 - 990522
Alignment:
Q  100 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 199  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||   ||||| |||| | ||| ||||| ||| | |||||      
T  990732 cctatagtagaaaagatggtaggaaataggctcaggtggtttaggtatgtaaagagaagacatatagattctgtagcaaggagagtagattagatggaat 990633  T
Q  200 agagtcaagttaaaagaggtagaggaag-acctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtt 297  Q
    | |||||  | |    ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||||    
T  990632 atagtcagatcactgtaggcagaggaagcacattggaaaactattagagaaactattgagata-gatctagagattaatgagttggatcaacatatggtt 990534  T
Q  298 tttgatagaaca 309  Q
    | ||||||||||    
T  990533 tatgatagaaca 990522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 8677017 - 8676942
Alignment:
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggt 296  Q
    |||||| |||||||||| |||| |||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||| | |||||||||    
T  8677017 gaggaaaacctaggaaatctataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggt 8676942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Original strand, 16943097 - 16943243
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||| || ||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||||  |||||  || |||  ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  16943097 gagatgagaatattgtgttggatgcgtgataagactagacgagataaaattagacattacaatattagggagagagttggggtagtacctatagtagaaa 16943196  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    || |||| |||| |||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  16943197 agatggtggaaactagatttag-tggtttgggcgtgtagggagaagac 16943243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Original strand, 41611098 - 41611181
Alignment:
Q  17 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcac 100  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| | |||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||  |||||||||    
T  41611098 tgagaatgttgcgttggatgagtagtaagaatggacgggatatgattaggaatgacgctattagagagagtgttggggtagcac 41611181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Original strand, 51584867 - 51585026
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  | |||| | ||  | |||||| ||||   | | || |||||||||||||||||||    
T  51584867 agaggtaggggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagagggatctggacattaatgagctggagaaagacattgtttttgatagaacactat 51584966  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| |  |||||| ||||| || ||  |||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  51584967 gacattgtttgattcatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 51585026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 52878459 - 52878364
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||| |||| ||  |||| ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| || | ||| |||||||||    
T  52878459 aagaggtataggaagacttaggaaaattataagagtaattattataaaagatttagaggttaatgagttgaatccaactacgatttatgatagaac 52878364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1290119 - 1290033
Alignment:
Q  285 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  ||||  ||   |||||||||| |||||||||    
T  1290119 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 1290033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 269
Target Start/End: Original strand, 10272259 - 10272436
Alignment:
Q  91 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 190  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |  |||||| ||||||||||||||||||  || ||| | || | ||| ||||  ||||    
T  10272259 tgggttgcacctgtagtagaaaagatggtagaaactagactaaagtggttttggcatgtagagagaagacctgtggattc-gtaggaaggagaggagatc 10272357  T
Q  191 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttaga 269  Q
    | ||||| | ||||||| | |  |||||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||  |||||| ||||    
T  10272358 agatggatgggagtcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaacttataagagaaactattaagaaggatctaga 10272436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15438904 - 15438800
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    ||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    ||||||| ||||||| ||||| |||||  |||| |||  |||||||||||    
T  15438904 gatttagagattaatgagttagatcaaaatatggtttatgatagaa---aatgacgttatttgatgcatgtagccgaccccacttag-tagataaggctt 15438809  T
Q  362 ggttgttgt 370  Q
    |||||||||    
T  15438808 ggttgttgt 15438800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 39776994 - 39776936
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  39776994 aatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacacaatggcgtaatttgatcaatgt 39776936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 52900753 - 52900683
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||| | |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  52900753 gatttagagattaatgagttggactgaaatatggtttatgatagaacactatggcggaatttgatccatgt 52900683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 16142241 - 16142172
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 85  Q
    |||| ||||||  |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16142241 atgaagatgttatgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcaggaatgccaccattagagaga 16142172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16822376 - 16822235
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||  |||||  ||||  |  || ||| || ||  ||||| |||     
T  16822376 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaatactagataagataggattagaaatgacagtattagtaagag--ttaggatagaacttac-gtagacaaga 16822280  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16822279 tggtagaaactcggcttaggtggtttggacatgtagagagaagac 16822235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Original strand, 51234537 - 51234610
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattaga-catgataggattaggaatgacaccattagagagag 86  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||| || | |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  51234537 agatgaggatgttgtgttggacgtgtggtaagactaaaacatgataggattagaaattacaacattagagagag 51234610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15437206 - 15437130
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||| |  |||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  15437206 gtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccaaccccacatagtgggataaggcttggttgttgtt 15437130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 37430472 - 37430420
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| | |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37430472 tttgatccatatagccgatcccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 37430420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 338
Target Start/End: Original strand, 42501143 - 42501355
Alignment:
Q  126 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 225  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||  ||||  || ||| |||| | ||| ||||| | ||| |||||||  |||||| | |  ||||||||||||    
T  42501143 taggcttgggtggtttggacatgtagagaagagacccgtggattctgtagaaaggagagtagttcagatggagggtagtcaaatcattagaggtagagga 42501242  T
Q  226 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttga 325  Q
    | |||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| || || | ||||||||||||  ||||||||  | |||||||||| ||   |||| ||| |    
T  42501243 aaacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctatagattaatgagttggatagaaatatggaatatgatagaacattacagcgtcgtttaa 42501342  T
Q  326 tccatgtggccga 338  Q
    ||||||| |||||    
T  42501343 tccatgtagccga 42501355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8203290 - 8203223
Alignment:
Q  217 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 284  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||| | |||||||||||    
T  8203290 ggtagaagaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatctagagattaatgagttgga 8203223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 19908718 - 19908655
Alignment:
Q  25 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||| | ||||||| ||||||| ||||||    
T  19908718 ttgcgttggatgtgttgtaagactagacatgatatgatttgtaatgacaacattagaaagagag 19908655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 361
Target Start/End: Original strand, 30445304 - 30445375
Alignment:
Q  290 atatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||| | ||||| ||| | ||||| ||||    
T  30445304 atatggtttttgatagaacaccatgacgtcgtttgattcatgtagccaactccacttagtgggataaagctt 30445375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31274613 - 31274578
Alignment:
Q  117 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31274613 ggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaga 31274578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39422398 - 39422209
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    ||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||| |   ||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||  | ||| ||| |||||||||||||     
T  39422398 atgagaatgttgtgttagatgtgtggtaggattatatgagatagaattagaaatgacaatattaga-agagagttggagtaacacatatagtagaaaaga 39422300  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
    | ||||||| ||| ||||| || || || ||||||||||||||||  ||||||  ||| || || ||| | ||||| ||||||| |||||||    
T  39422299 tagtagaaactagacttaggtgctt-ggacatgtagagagaagacatgtagattatgtagttaggagaatagatcatatggaggggagtcaa 39422209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44905603 - 44905548
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  44905603 tatagtagaaaagacggtagaaaatatgcttaggtggtttggacatgtaaagagaa 44905548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 4590879 - 4590813
Alignment:
Q  18 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 84  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  4590879 gaggatgttgcgttgaatgtgcggtgagactagacaagataggattagaaatgacaatattagagag 4590813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 338
Target Start/End: Original strand, 5113952 - 5113990
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  5113952 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccga 5113990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 157
Target Start/End: Original strand, 7921843 - 7921901
Alignment:
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| |||| |||  |||||||| |||||||||||||    
T  7921843 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttatgtggtttggacatgtagagagaa 7921901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 233
Target Start/End: Original strand, 9602204 - 9602286
Alignment:
Q  151 gagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctag 233  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||  ||||| || ||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||    
T  9602204 gagagaagactagtagattgtgtagtaagaagagaagatcagatagagggtagtcaaattgcaagaggcagaggaagacctag 9602286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 300 - 370
Target Start/End: Original strand, 16943364 - 16943434
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||| |||| || | |||||||||||| | |||  |||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16943364 tgatagaacattatggcggcgtttgatccatgtagtcgaccccacctagtgagataatgcttggttgttgt 16943434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 286 - 332
Target Start/End: Original strand, 19822083 - 19822129
Alignment:
Q  286 ccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  19822083 ccaaatatggtttatgatagaacattacgacgtaatttgatccatgt 19822129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27072572 - 27072522
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  27072572 aaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 27072522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 373
Target Start/End: Original strand, 41165502 - 41165564
Alignment:
Q  311 tatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  41165502 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 41165564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 185
Target Start/End: Original strand, 46388392 - 46388470
Alignment:
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 185  Q
    |||||||| |||| |||| | ||||||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  46388392 tagaaaagatggtggaaactcggcttaggtagtttgcacatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagt 46388470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 48865818 - 48865748
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||| |||||||| | ||||  || |||||||||||||    
T  48865818 gatttagaggttaatgaattagatccagatatggtttatgatagaatattatggtgtaatttgatccatgt 48865748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 316 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4318902 - 4318845
Alignment:
Q  316 cgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  4318902 cgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 4318845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4590630 - 4590533
Alignment:
Q  275 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||  | ||||| | | |||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||| |||||||||||||    
T  4590630 atgagttggatagatatatgatatgtgatagaacaatatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttg 4590533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10569312 - 10569263
Alignment:
Q  128 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggta 177  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||    
T  10569312 ggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctgtagta 10569263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 19908543 - 19908450
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| | ||||| |   ||||||| ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  19908543 agaggcagaggtagacctagaaaaactttaagagacattgttagaaaagatttagagattaacgagttggattcaaatatggtttataatagaa 19908450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 372
Target Start/End: Original strand, 22175341 - 22175426
Alignment:
Q  287 caaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||     ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||| |||||    
T  22175341 caaatatggtttatgatagaacattatggtagaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttggtgttg 22175426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43481851 - 43481798
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43481851 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 43481798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23791925 - 23791857
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||| ||| || ||||||||| ||||||| | ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  23791925 gggtaggacccatggtagaaaagatggtagatactaaacttaggtggtttgtgcatgtagagagaagac 23791857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 29577301 - 29577202
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  | | |||| ||||  || ||| ||||| | |||||| |||||| |||||||| || |||||||||| |||    
T  29577301 agaggtagaggaagacctagaaaaactacaacataaactattaagaaagatctagagattaatgagctggatcaaaatatgg-ttatgatagaacattat 29577203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 29578218 - 29578163
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 135  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||    
T  29578218 agagagagagt-tggctagcacctatagtagaaaaaatggtggaaaatgggcttaga 29578163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 131 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 46226532 - 46226380
Alignment:
Q  131 ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca-agttaaaagaggtagaggaagac 229  Q
    |||| |||||||| | ||||||||||| || | |||||| ||||||| ||||||| ||||| || |||  |||||| |   |||||||||||| ||||||    
T  46226532 ttaggtggtttggacttgtagagagaatacaaatagatgatgtggtatgaagagtagatcatatagagaggagtcagatcaaaaagaggtagaagaagac 46226433  T
Q  230 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
     ||| ||||| || || ||||| ||||  ||  ||||| |||| |||||||||    
T  46226432 ttagaaaaaccataagtgaaactattatgaaatatttataggttaatgagttg 46226380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 52442687 - 52442532
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| || |  |||||| |||| || ||||||||||||  | | || ||||||| ||||||| |||    
T  52442687 agaggtagaggaagacctagaacaaatataagagaaactatcaagaaggatctagatgttaatgagttggataaagacatagtttttg-tagaacaatat 52442589  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    || | | |||||| | ||| |||||  |||| ||| | |||||| |||| |||||||    
T  52442588 gatgccgtttgattcttgtagccgaccccacttagcgggataagtcttgattgttgt 52442532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 122)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 52138718 - 52139082
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52138718 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 52138817  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  52138818 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagaatagattaaatggaggagagtcaag 52138917  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  52138918 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 52139017  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  52139018 actatgacgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 52139082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 28245355 - 28245719
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28245355 agcaaagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagcctggataggattaggaatgacatcattagagagagagtgggggtagcacctatagta 28245454  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28245455 gaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaaaacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcaaatggaggagagtcaag 28245554  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||    
T  28245555 ttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaacgattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataatagaac 28245654  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  28245655 actatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgagataaggcttgattgctgttgt 28245719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 21995 - 22354
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21995 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 22094  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||    
T  22095 agttggtagaaa-taggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagattaaatggaggagagtcgggttaa 22193  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22194 aagaggtagaggaagacttaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 22293  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || |||||||||||| |||| |||||  |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  22294 tggcgtcatttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 22354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Original strand, 54278938 - 54279294
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54278938 agcagagatgaggatgttgcgttggataagtggtaagactagacaagatagaattaggaatgacaccattagagagagagtaggggtagcacctatagta 54279037  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54279038 gaaaagttggtagaaaataggcttagacggtttgggcacgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaaaaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 54279137  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  54279138 ttaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 54279237  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggtt 365  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||| ||   ||||||| |||||||    
T  54279238 actatggcgtcatttgatcaatgtagccgatcccacttaataagataagacttggtt 54279294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51448073 - 51447717
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  51448073 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagta-gggtagcacctatagta 51447975  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51447974 gaaaagttggtagaaaataggcttagatagtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 51447875  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  51447874 ttaaaaga-------gaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 51447782  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||   |||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  51447781 actatggcgtcatttgattcatgtagccggccccatttagtgggataaggcttggttgttgttgt 51447717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 5168750 - 5169114
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| |||    
T  5168750 gagatgaggatgttgcgctggatgataggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatggta 5168849  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  5168850 gaaaagttggtagaaaatacgcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtctag 5168949  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5168950 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttataggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 5169049  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  5169050 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 5169114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 47233955 - 47233593
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  47233955 agatgaggatattgcgttggatgagtggtaagactagacatgataagattagaaatgacaccattagagagagaatggaggtagcacctatagtagaaaa 47233856  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  47233855 gttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaa 47233756  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47233755 agatgttgaagaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggaattagaggtcaatgaattagatccaaatatggtttttgatagaacactat 47233656  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtatt 376  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||  |||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  47233655 ggcgtcatttgattcatgtagccgaccccagttagtgggataaggcttggttgttgttgtatt 47233593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 74 - 374
Target Start/End: Original strand, 35033129 - 35033429
Alignment:
Q  74 ccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgt 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |    
T  35033129 ccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttatatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccat 35033228  T
Q  174 ggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtc 273  Q
     |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35033229 tgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtc 35033328  T
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||   || |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35033329 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgttatttgatccatgtagccgacctcatctagtgggataaggcttggttgttgttgt 35033428  T
Q  374 a 374  Q
    |    
T  35033429 a 35033429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 25191297 - 25191659
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  25191297 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatatgattaagaatgacatcattagagagaa--tgggggtagcacctatagta 25191394  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||  ||||||||||||||||| |  |    
T  25191395 gaaaaattggaagaaaatagacttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagataccgttgtaagaagagaagatcaaatggaggagagcccgg 25191494  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||  ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  25191495 ttaaaagaggtagaggaagaactaagaaaatcatttgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgaattagatcaaaatatggtttttgatagaac 25191594  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||| |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  25191595 actatggcgtcatttgatccatgtagctgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 25191659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 33272392 - 33272122
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctata- 105  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||     
T  33272392 agcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatat 33272293  T
Q  106 ---gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggaga 202  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  33272292 atagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-gtagatgccgtggtaagaagtgtatatcaaatggaggaga 33272194  T
Q  203 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  33272193 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtca 33272122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Original strand, 53519511 - 53519862
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata------gtag 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||      ||||    
T  53519511 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaatactagacaggataggattaagaatgacaccattagacagagagtgggggtagcacctatatatatagtag 53519610  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  53519611 aaaagttggtagaaaataggcttagatgttttggacatgaatagagaagaaccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgt 53519710  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||            |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53519711 taaaagaggtagaggaagacctaaga------------aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaataaggtttttgatagaaca 53519798  T
Q  310 ctatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53519799 ctatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 53519862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 54128296 - 54128661
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  54128296 agcagagatgaggatgttgcgtttgatgagtggtaaaactagacgcgataggattatgaatgacaccattagagagagtgttggggtagcacctatagta 54128395  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||  ||| | ||||| ||||| |||||||  |||||      
T  54128396 gaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagaaaagacctgtagatgatgcagtacgtagagtagatcagatggaggttagtcaga 54128495  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatt-agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  54128496 tcgaaagaggtagaggaagacctagaaaaactattaagagaaactataaggaaagatttagaggtcaatgagttggacccaaatatggtttatgatagaa 54128595  T
Q  308 cactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || |||| | | ||||||||||||| | |||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  54128596 cattatggcataatttgatccatgtaggcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 54128661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 124 - 373
Target Start/End: Original strand, 48508268 - 48508517
Alignment:
Q  124 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  48508268 aataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagag 48508367  T
Q  224 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcattt 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  48508368 gaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaattt 48508467  T
Q  324 gatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  48508468 gatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48508517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 79 - 338
Target Start/End: Original strand, 38850108 - 38850368
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  || ||||    
T  38850108 agagagagagagagagtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagagaagatcagtagaggtcgtcgtaa 38850207  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattag-aaaggatttagaggtcaatg 277  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||| |||||||    
T  38850208 gaagagtagatcgaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaattattagataaaccattagaaaaggatctagaagtcaatg 38850307  T
Q  278 agttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    | ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38850308 aattgaattcaaatttggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccga 38850368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43695127 - 43694771
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatga-----taggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg-tagcacctat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||     |||||||||||||||||      ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  43695127 cagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaccagacatgacatgataggattaggaatgaca------gagagagagtggggggtagcacctat 43695034  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||| | ||||||||| |||         
T  43695033 agtagaaaagttggtagaaaatttgcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgtcgtcgtaagaagattagatcaaatgaagg----- 43694939  T
Q  205 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgata 304  Q
     ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  ||||||| |||   ||||| |||||    
T  43694938 -aagttaaaagaggtagaggaaaatctaggaaaactattagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatggattggatctaaactaggtttatgata 43694840  T
Q  305 gaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||| | |||  |||  ||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  43694839 gaacaatacgacgtcatttgatctatgtagtcgaccccatttagtgggataaagctgggttgttgttgt 43694771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 33 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45289434 - 45289090
Alignment:
Q  33 gatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctat--agtagaaaagttggtagaaaatag 128  Q
    |||| ||| ||||| |||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||    
T  45289434 gatgtgtgataagactagacgggataagattagaaatgacac-attagagagagagagttggggtagcacctattcagtagaaaagatggtggaaaatag 45289336  T
Q  129 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 228  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| |  ||| ||||| ||||||||||    
T  45289335 gcttaggtggtttgggcacgtagagagaacacttgtagattttgtagtaagaagagtagatcagatggaggatagttagattacaagagatagaggaaga 45289236  T
Q  229 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcc 328  Q
     ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | | |||||||||    
T  45289235 tctatgaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatcc 45289136  T
Q  329 atgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    |||| ||| |  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45289135 atgtcgccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 45289090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 265
Target Start/End: Original strand, 45728064 - 45728324
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt-agagagagagtgtgggtagcacctatagt 107  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||   |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45728064 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagacgagacgaaataggattagaaatgacatcatttagagagagagtgggggtagcacatatagt 45728163  T
Q  108 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag-aagactagtagatgctgtggtaagaagag--tggatcaaatggaggagagt 204  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| | ||||||||||| || ||   ||||||  || ||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  45728164 agaaaagttggtagaaagtaggatcagatggttttgacatgtagagagaaaaacccatagatgtcgttgtaagaagagtatatatcaaatggaggagagt 45728263  T
Q  205 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatt 265  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45728264 catgttaaaagagatagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatt 45728324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 203 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12096875 - 12096705
Alignment:
Q  203 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||    
T  12096875 gtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatga 12096776  T
Q  303 tagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12096775 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12096705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19676447 - 19676081
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag--------tgt--gggtagcacctata 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||   |||| |||||||| ||||||||||||||||||||        |||  ||||||||||||||    
T  19676447 atgaggatgttgcattggatgagcggtaagactagatgggataagattaggagtgacaccattagagagagagagagagagtgttggggtagcacctata 19676348  T
Q  106 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 205  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  |||||  ||||| || ||||||||||    
T  19676347 gtacaaaagatgatagaaaattggcttaggtggtattggcatgtagagagaagacctgtagatgctgtagtacaaagagaagatcagatagaggagagtc 19676248  T
Q  206 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 305  Q
    |  | |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||    
T  19676247 agatcaaaagaggta-aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatgctgtatgatag 19676149  T
Q  306 aacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | || |||| ||| ||||||||||||| || ||  |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  19676148 agcattatggcgtgatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttattgt 19676081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 49503897 - 49503568
Alignment:
Q  30 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49503897 ttggatgagtggtaagactagacgagataggattgggaatgacaccattagagagagagttcaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaatagg 49503798  T
Q  130 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 229  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||  ||  || ||| ||||| ||||||| |||||   ||| |||| ||||||||||||    
T  49503797 cttaggtggtttgggcatgtagagagaagaccaatagatgttgtaatacaaacagtagatcagatggaggggagtctgattagaagatgtagaggaagac 49503698  T
Q  230 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcca 329  Q
    ||||  |||||||||| ||||           ||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| || | |||| ||| ||||||||||    
T  49503697 ctag--aaactattag-gaaa-----------gatttaacggttaatgagttgggtccaaatatggttttggatataatattatggcgtaatttgatcca 49503612  T
Q  330 tgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| |||||  | || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  49503611 tgtagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 49503568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 98 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 48953697 - 48953454
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa-gactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||| |||  | ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  48953697 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataaacttagatgatttgggcatgtaaagagaaagacccgcagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgg 48953598  T
Q  197 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttaga--ggtcaatgagttggatccaaatatg 294  Q
    |||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||| | ||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  48953597 aggagagtcgggtcaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactataagagaaatcattaaaaagaacttataaaggtcaatgagttggatccaaatatg 48953498  T
Q  295 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  48953497 atttatgatagaacactatgacgtaatttaatccatgtagccga 48953454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 79 - 240
Target Start/End: Original strand, 38060419 - 38060580
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||    
T  38060419 agagagagagtgggggtagcacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgccgtcgtaa 38060518  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact 240  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38060519 gaagagtagattaaatggaggagagtcaggttaaaaaaggtagagggagacctaggaaaact 38060580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 55 - 309
Target Start/End: Original strand, 38430807 - 38431066
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagag-----agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgt 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  38430807 gataggattaggaatgacaccattagagcgtttagagcgttgaggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggttgattgggcatgt 38430906  T
Q  150 agagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaa 249  Q
    ||||||| |||  | ||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  38430907 agagagacgacctgcagatgttgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaagacttagaaaaactacaagagaa 38431006  T
Q  250 acaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    || |||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38431007 actattgtggaagg-tttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaaca 38431066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 38 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 39601016 - 39600724
Alignment:
Q  38 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 137  Q
    ||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | |||||| ||    
T  39601016 gtggtaagactagatgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacaagcttaggtg 39600917  T
Q  138 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 237  Q
    |||| |||||||| |||||||||  |||||| |||| |  || ||||| ||||| || ||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  39600916 gttttggcatgtaaagagaagacctgtagattctgtagcgaggagagtagatcagatcgaggatagtcagattgcaagaggtagaggaagacctagaaaa 39600817  T
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccat 330  Q
    ||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||  || |||||||||||    
T  39600816 actataagagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatctggtttacgatagaacattatggtgtaatttgatccat 39600724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 309
Target Start/End: Original strand, 27917490 - 27917788
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||  |||  ||||||||||||| |||||||||| ||  |  |||||||||||||||||    
T  27917490 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagcctagacgagatttgattaggaatgaccccattagagaaag--ttggggtagcacctatagta 27917587  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||  ||  |||| | |||||||||||||| | |||      
T  27917588 gaaaagatggtaggaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacttgtagatgttgtattagaaagaatagatcaaatggaggacaatcaga 27917687  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    | | || ||||||| |||||||||  |||||||| ||||| |||| |||||| |||||  |||| |||   ||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  27917688 tcataataggtagacgaagacctataaaaactataagagagacaactagaaaagattttaaggttaattcattggatctaaatatggtttacgatagaac 27917787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Original strand, 19736918 - 19737150
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt-gtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  19736918 gagatgatgatgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaa 19737017  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    ||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  || |     
T  19737018 aagatggtagaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt-tagatc 19737116  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 245  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19737117 aaaaaggttgaggaagacctagaaaaactattag 19737150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 107 - 338
Target Start/End: Original strand, 39235154 - 39235384
Alignment:
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  39235154 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatggaggaaagtca 39235253  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataga 306  Q
      | |||||||||||||||||||| |  ||||||||  || |||| ||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  39235254 gatcaaaagaggtagaggaagacccaaaaaaactataggataaactattaggaaagatttagaagttaatgagttggatctaaatatggtttacgataga 39235353  T
Q  307 acactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    ||| |||| ||| | ||||||||||| |||||    
T  39235354 acattatgtcgtga-ttgatccatgtagccga 39235384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Original strand, 19757829 - 19758053
Alignment:
Q  21 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt-gtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||| |||||| | ||| | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19757829 gatgttgtgttggatgagtggtaagactacacgagatacgattagaagtgaaatcattagagagagagttgggggcagcacctatagtagaaaagatggt 19757928  T
Q  120 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 219  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  || | ||| ||||    
T  19757929 agaaaataggtttaggtggtttgagcatgcagagagaagacctgtagatgttgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagt-tagatcaaaaaggt 19758027  T
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattag 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  19758028 agaggaagacctagaaaaactattag 19758053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 48734481 - 48734146
Alignment:
Q  25 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 124  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |  |||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |  ||||||| | |||||||||| || |||||||||    
T  48734481 ttgcgttggatgagtggtaaaactaggcgggataagattatgaatgacaccattagagagtg--ttggggtagcgcgtatagtagaacagatggtagaaa 48734384  T
Q  125 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg 224  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||   ||| |  | ||||||||||||||    
T  48734383 ataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagaactgtagaggctgtagtacgaagagtagatcagatggagattagttagatcaaaagaggtagagg 48734284  T
Q  225 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttg 324  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||            |||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| | |||    
T  48734283 aaggccttgaaaaactattagagaa------------gatttaaaggtcaacgagttgggtccaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaagttg 48734196  T
Q  325 atccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    |||||||| || ||  |||| ||| | ||||||||||| |||||||||||    
T  48734195 atccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgta 48734146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Original strand, 26490239 - 26490596
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||||| ||||||  ||||||| ||||  |   ||||||||||||||||||||    
T  26490239 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagacaagacgggatatgattagcaatgacgtcattagacagag--ttgaggtagcacctatagtagaaa 26490336  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||   | |||| ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||| |||  |||     
T  26490337 agatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagataaaagaccgttggatgttgtagtacgaagagtagatcagatagaggagaatcatattag 26490436  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    | |||| || ||||||  ||| |||||||  |||||||| |||||||| |||||||||   |||||||| ||||||||| || |||   |||||| | ||    
T  26490437 atgaggcagtggaagatatagaaaaactagaagagaaactattagaaaagatttagagactaatgagtttgatccaaatgtgatttcatatagaatatta 26490536  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    || ||| ||||||||||| | | |||| |||| |||  ||||||| |||| |||||||||    
T  26490537 tggcgtaatttgatccatatagtcgatcccacttagtaagataagacttgattgttgttg 26490596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 50960914 - 50960641
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      ||| ||| | ||||||||| |||||    
T  50960914 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac----ctatgttgtagaaagaagagtagatca 50960819  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
     |||||||||||||   |  ||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||| || | ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50960818 gatggaggagagtcggatcgaaagagggagaggaagacctagaaaaaatttaagagaaactattaggaaaggtttagagattaatgagttggatccaaat 50960719  T
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttg 369  Q
    ||||| | | ||||| || ||||  || ||||||||||| | ||| |  |||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  50960718 atggtgtatcatagaccattatggtgtaatttgatccatttagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 50960641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 29 - 296
Target Start/End: Original strand, 3186707 - 3186973
Alignment:
Q  29 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 128  Q
    |||||||||| ||||||| | | |  |||| ||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3186707 gttggatgagcggtaagacttggcgggataagattaggaatgacaccattatggaaagagtggtggtagcacctatagtgggaaagttggtagaaaatag 3186806  T
Q  129 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 228  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||   | ||||||| | | ||||| || ||| | ||||| || ||||||||| ||| || |    
T  3186807 gc-tagatgatttgggcatgtagagagaagatttgtagatgtcattgtaagaaaaatagatcagattgagaaaagtcaggtcaaaagaggtggagaaata 3186905  T
Q  229 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggt 296  Q
    |||| ||||||||| ||| |||  ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3186906 cctaagaaaactataagaaaaatcattagaaagaatttaaaggtcaatgagttagatccaaatatggt 3186973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 230 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 52156227 - 52156084
Alignment:
Q  230 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcca 329  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  52156227 ctaggaaaactattagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatctgatcca 52156128  T
Q  330 tgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| |||||  |||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  52156127 tgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 52156084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 95 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42510292 - 42510016
Alignment:
Q  95 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||   |||||  ||||||||| ||||| ||||| ||    
T  42510292 tagcacctatagtagaaaagatagtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagaga--agacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagat 42510195  T
Q  195 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 294  Q
    |||||| |||||  | |  ||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||||||||| | |||||||    
T  42510194 ggaggatagtcagatcactagaggcaaaggaagacctagaaaaactatcagagaaaccattaggaaagatttggaaataaatgagttggaccaaaatatg 42510095  T
Q  295 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||||| || ||||||||| |||||||||    
T  42510094 gtttatgattgaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagagggaaaaggcttggctgttgttgt 42510016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 55 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 54425289 - 54425022
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| || || || ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||  ||||||| ||    
T  54425289 gataggattatgaatgacaccattaggaagagagtgagg-tatcatctataatagaaaagtttgtagaaaatagacttagaagatttgaacatgtaggga 54425191  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaag-------agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 247  Q
    ||||||  | |||||| || ||||| ||       ||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  54425190 gaagacctgcagatgccgttgtaagtaggatttagagtagatcagatggaggagattcaggtcaaaagaggtagaggaagacctaagaaagctataagag 54425091  T
Q  248 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
      || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  54425090 ggaccattaaaaaggatttagaggtcaatgggttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgac 54425022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 30294418 - 30294180
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat---gtagagagaagactagtagatgctgtgg 175  Q
    |||||||||| | | ||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||    |    
T  30294418 agagagagagagagagtagcacatatactaaaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgagcatattgtagagagaagacttgtagatgccaccg 30294319  T
Q  176 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaa 275  Q
    ||||||||||  || | ||  |||||||||  || ||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| |||| |||| ||| |||||| |||||||    
T  30294318 taagaagagtaaattagattaaggagagtcgggtcaaaagaggtagaggaagacctagaagaactataagataaactattaaaaaagatttataggtcaa 30294219  T
Q  276 tgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    ||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||    
T  30294218 tgagttggatctaagtatgatttatgataaaacactatg 30294180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 373
Target Start/End: Original strand, 53262295 - 53262423
Alignment:
Q  245 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccac 344  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  ||||    
T  53262295 gagaaaccattagaagagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgaccccac 53262394  T
Q  345 ctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  53262395 ttagtgggataaggcttggttgttgttgt 53262423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 81 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 54365268 - 54364973
Alignment:
Q  81 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga--agactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  | ||  |||||| || |  |||    
T  54365268 agagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggcggaaaatag-cttaggtggtttgggcatgtagagagagaatacctgtagattctattataa 54365170  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    | ||||| ||||||||| |||| |||||    |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||| | ||||     
T  54365169 ggagagtagatcaaatgaaggatagtcagaccacgagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgt 54365070  T
Q  279 gttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccac-ctagagagataaggcttggttgttgttgtatt 376  Q
    ||| || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| |||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  54365069 gttagaccaaaatatggtttatgatagaacactatgacgtaatttgatccatgtagccga--ccacactagtgggataaggcttggctgttgttgtatt 54364973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 52679154 - 52678892
Alignment:
Q  67 aatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagt 164  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||   ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||  | || ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  52679154 aatgacaccattagaaagagagagtggaaatagcatctatagcagaaaagttggaagaaaataggctctggtgatttggacatgtagagagaagacttgt 52679055  T
Q  165 agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggat 264  Q
    |||||   ||||||||| | | ||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||  || |||    
T  52679054 agatg--ttggtaagaaaaatagatcggatggaggagagtcgggttaaaagatgtagaagaagacctaggaaaacta--agagaaactattatgaaagat 52678959  T
Q  265 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatg 331  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||||| ||  ||||| || | |||  ||| ||||||||||||    
T  52678958 ttagaggttaatgagttgaattcaaatatgattcatgatataatattatagcgtaatttgatccatg 52678892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 235 - 373
Target Start/End: Original strand, 38060858 - 38060996
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtgg 334  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |    
T  38060858 aaaactattagagaaaccattagaaaggttttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaccatggcgtaatttgatccatgtag 38060957  T
Q  335 ccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||  |||| ||| | ||||||  ||||||||||||||    
T  38060958 ccgaccccacttagtgggataagaattggttgttgttgt 38060996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 236 - 373
Target Start/End: Original strand, 49042081 - 49042219
Alignment:
Q  236 aaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttt-tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtgg 334  Q
    ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  49042081 aaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatccaaatatggttttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtag 49042180  T
Q  335 ccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||  |||| | | ||||||||||||||||||||||||    
T  49042181 ccgaccccacttggtgagataaggcttggttgttgttgt 49042219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 61 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31454537 - 31454225
Alignment:
Q  61 attaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||     
T  31454537 attagaaatgacaacattagagagagtgt-tggttagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagactt-ggtggtttgtgcatgtagagagaagaa 31454440  T
Q  161 tagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa--gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattaga 258  Q
      |  ||| |||| || || ||||| ||||| ||||||| |||||||   || | ||| |||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||      
T  31454439 atgcggattctgtagttaggagagtagatcagatggaggggagtcaaatctttagagatgtaggggatgacctagaaaaactataagggaaactattaat 31454340  T
Q  259 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataagg 358  Q
     ||||| ||||  | ||||| |||||   | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||  |||| ||| | |||||||    
T  31454339 taggatctagatattaatgaattggagaaagacatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatttagccgaccccacttagtgggataagg 31454240  T
Q  359 cttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||    
T  31454239 cttggttgttgttgt 31454225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 262 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 311420 - 311309
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||    
T  311420 gatttagaggtcaattagttggatccagatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 311321  T
Q  362 ggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||    
T  311320 ggttgttgttgt 311309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19162842 - 19162664
Alignment:
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 215  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||| || | ||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||||| || |||||    
T  19162842 tggtagaaaaaag-cttaggtggtttggacacgcagatagaa-acttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatgaaggagagtcaggtcaaaag 19162745  T
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggt 296  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||    
T  19162744 agttagaggaagacctaggaaatctataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaagtatggt 19162664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 338
Target Start/End: Original strand, 37351418 - 37351654
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||   |||||||||||||| |||||||| |  ||  |||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |    
T  37351418 tatagtagaaaagatggtagaaactagacttgagtggtttgggcatgtggagagaagtcatgtgaatgcggtagtaaggagagtagatcagatggaaggg 37351517  T
Q  202 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttg 301  Q
    || ||| | |  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |  || ||| ||||| | |||||| ||||   | ||||||||||||    
T  37351518 aggcaaatcactagaggtaggggaagacctagaaaaactattagagaaacaatcaagaaagatctagagattaatgagatggagaaagatatggtttttg 37351617  T
Q  302 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
     |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||    
T  37351618 ttagaacactacgacgtcgtttgattcatgtagccga 37351654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 244 - 374
Target Start/End: Original strand, 15296060 - 15296190
Alignment:
Q  244 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattcca 343  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||  |||    
T  15296060 agagaaactattaggaaagatttagaggttaatgaattggatccaaatatgatttcggatagaacattatggtgtaatttgatccatgtggccgacccca 15296159  T
Q  344 cctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15296160 cttagtgggataaggcttggttgttgttgta 15296190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 370
Target Start/End: Original strand, 49841529 - 49841895
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--------tagcac 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  | || |||||| ||||||| |||||| ||||||| || ||        ||||||    
T  49841529 agcatagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgaggtaagattagaaatgacaacattagtgagagagagttggggtagccgtagcac 49841628  T
Q  101 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 200  Q
    ||||| |||||||| |||| |||| ||| || || |||||||||| |||||||||||||| | |   | || | ||||| |||||  |||| ||| |||     
T  49841629 ctatattagaaaagatggtggaaactagactaaggtggtttgggcgtgtagagagaagac-attgacttctttagtaaggagagtaaatcagatgaaggg 49841727  T
Q  201 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggttttt 300  Q
     |||||| |||  |||||||||||||||||   |||||  || |||||||| ||||  || ||| || || | ||||||||||||| ||||||||| | |    
T  49841728 tagtcaaattactagaggtagaggaagacca--gaaaaaaataagagaaactattaacaaagatctaaagattaatgagttggatcgaaatatggtatat 49841825  T
Q  301 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||| |||| | | ||||||||||||| || ||  |||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  49841826 gatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacatagcgaggtaaggcttggttgttgt 49841895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 269 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 47555436 - 47555332
Alignment:
Q  269 aggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgtt 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  47555436 aggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgtt 47555337  T
Q  369 gttgt 373  Q
    |||||    
T  47555336 gttgt 47555332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 50249303 - 50249529
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggat---taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag 109  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||  ||||||||   ||| ||||| | |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||    
T  50249303 gagatgatgatgtttcgttggatgtgtggtaggactagacgagataggatgattagaaatgataacattagagagagagttggggtagcgcgtatagtag 50249402  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggctta---gatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||| |||| |||| ||| ||||   | |||||||||||||||||| ||||||  |||||| || | ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||    
T  50249403 aaaagatggtggaaactagacttaggtggtggtttgggcatgtagagtgaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatcagatgggggatagtca 50249502  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctag 233  Q
      | |  ||||||||||||||||||||    
T  50249503 tatcaccagaggtagaggaagacctag 50249529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 345065 - 344928
Alignment:
Q  19 aggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttgg 118  Q
    ||||||||  |||||||  ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||     
T  345065 aggatgttatgttggatttgtggtaagactagacgagataggattagaaatgatgacattagagagagagttggggtagcacttatagtagaaaagatgt 344966  T
Q  119 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 156  Q
    |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  344965 tagaaaataggcttaagtagtttggtcatgtagagaga 344928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 260 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2133725 - 2133612
Alignment:
Q  260 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggc 359  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||   |||  |||| ||| | ||||||||    
T  2133725 aggatgtagaggtcaatgagttgaatccaaatatagtttatgatagaacactatggcgtgatttgatccatgtactcgaccccacttagtgggataaggc 2133626  T
Q  360 ttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||    
T  2133625 ttggttgttgttgt 2133612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36820323 - 36820174
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||  |||||||||||||| ||    
T  36820323 agcaaagataaggttgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgagataggattagaaatgacgacattagag--agagttggggtagcacctatatta 36820226  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    | |||| |||| |||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||    
T  36820225 gcaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttagacatgtaaagagaagac 36820174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 332
Target Start/End: Original strand, 21200551 - 21200787
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||  ||||| ||||| |||||    
T  21200551 gggtagcaccta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagattctgcagtaaggagagtagatca 21200648  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac-aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 290  Q
     ||||||   |||||| | |  || || |||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||  | ||||||||||||  |||    
T  21200649 catggagagtagtcaaatcactagggggagaggaagacctagaaaaactattagacaaactatttagaaa-gatctagatattaatgagttggatagaaa 21200747  T
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||||| ||  ||||| || |||| |||| |||||| |||||    
T  21200748 tatggtatt--atagagcattatggcgtcgtttgatgcatgt 21200787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 38850012 - 38850091
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  38850012 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagtagtaagactagacatgatatgattaggaatgacatcatgagagagagag 38850091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2341074 - 2340928
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | ||  ||||||||||  | |||||||    
T  2341074 gagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatgatagaattagaaatgaaaacattagagagggtgttggggtagcaccattcgtagaaa 2340975  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    || |||| ||||||   ||||  ||||||| ||||||||||| ||||    
T  2340974 agatggtggaaaatcatcttacgtggtttgagcatgtagagaaaaga 2340928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 168
Target Start/End: Original strand, 3987011 - 3987124
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||| ||||| ||||||   ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  3987011 gatagaattagaaatgacgatattggagagagagttggggtatcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagaga 3987110  T
Q  155 gaagactagtagat 168  Q
    ||||||| ||||||    
T  3987111 gaagactggtagat 3987124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 225 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17022820 - 17022707
Alignment:
Q  225 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttg 324  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||| | ||||  |||||||     
T  17022820 aagacctaggaaagctattagagaaaccattaaaaaggaattagaggtcaatgagttggatccaattttagtttatgatagaatattatggtgtcattta 17022721  T
Q  325 atccatgtggccga 338  Q
    || ||||| |||||    
T  17022720 attcatgtagccga 17022707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 31566243 - 31566158
Alignment:
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtatt 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  31566243 tatggtttttgatagaacactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtatt 31566158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 77 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41842806 - 41842678
Alignment:
Q  77 ttagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggt 176  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| ||    
T  41842806 ttagagagaaagt-tgggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaccagtcttaggtggtttgggtatgtagagagaagagcggtagattctgtagt 41842708  T
Q  177 aagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||  ||||| |||||||||||||| |||||    
T  41842707 aatgagagtagatcaaatggaggatagtca 41842678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40106719 - 40106617
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||| |||| |  ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  40106719 aatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacataatttgatcaatgtagtggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 40106620  T
Q  374 att 376  Q
    |||    
T  40106619 att 40106617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 256
Target Start/End: Original strand, 11581432 - 11581609
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  ||  ||  ||| ||||    
T  11581432 agagagagagttagggtagaacctacaatagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggtatgtagagagaagacatgtgaattatgtagtaa 11581531  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 256  Q
    |||||||  |||| ||| ||| ||||||| | |  |||||||   |||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  11581532 gaagagtacatcagatgtaggtgagtcaaatcactagaggtatgagaagacctagaaaaactataagagaaactatta 11581609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 31337884 - 31337751
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||   ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  31337884 gagataaggatcttgtgttggatgtgtgataagactagatgggataggattaa-aatgacagcattagagagaaagt-tgggtagcacctatagtagaaa 31337787  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 148  Q
    || |||| |||| ||||||||  ||||||| |||||    
T  31337786 agatggttgaaactaggcttaagtggtttgagcatg 31337751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 54422963 - 54422900
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  54422963 attaaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttattatagaaaactatgac 54422900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40273287 - 40273205
Alignment:
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | || |||| ||||||||||||||    
T  40273287 tatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggtttggttgttgttgt 40273205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 284 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7895969 - 7895880
Alignment:
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  7895969 atccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 7895880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Original strand, 29600863 - 29600968
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagag 153  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    ||| | | ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29600863 gatatgattagaaatgacaacattagagagagagttgtcgtaacgcttatagtaaaaaagatggtagaaaataggttttagatggtttgggcatgtagag 29600962  T
Q  154 agaaga 159  Q
    ||||||    
T  29600963 agaaga 29600968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 85
Target Start/End: Original strand, 45236778 - 45236850
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 85  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45236778 gagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacaccattagagaga 45236850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 366
Target Start/End: Original strand, 27893213 - 27893364
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| ||||||  ||||| | |||||||||||   | | ||| ||||||| |||||||||||    
T  27893213 gaggtagaggaagacctagaaagactataagagaaactattaaaaaggacctagagattaatgagttggagaaagacatgatttttgaaagaacactatg 27893312  T
Q  315 acgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttg 366  Q
     | |  |||||| ||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| ||||    
T  27893313 gcattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggctttgttg 27893364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 373
Target Start/End: Original strand, 29601063 - 29601174
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| || ||  |||| ||| | |||| |||||    
T  29601063 gatttagagattaatgagttggattcaaatatagtttatgatagaacattatgatgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggatacggctt 29601162  T
Q  362 ggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||||||    
T  29601163 ggttcttgttgt 29601174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 152
Target Start/End: Original strand, 29817422 - 29817565
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||  || | | |||||||||  ||||||||||||||   |||| | ||| |  | |||||||||||||||    
T  29817422 agcaaagatgaggatgttgcgttggataagtgacaaaactggacatgatataattaggaatgacactgatagaaatagaattggtgtagcacctatagta 29817521  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 152  Q
    |||||| | ||||||| || | |||| |||||||| ||||||||    
T  29817522 gaaaagattgtagaaagtaagtttaggtggtttggacatgtaga 29817565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Original strand, 30345445 - 30345520
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||    
T  30345445 gagatgaggatgttgtgttggatgagcggtaagattggacatgatagaattatgaatgacactatttaagagagag 30345520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 375
Target Start/End: Original strand, 36303994 - 36304250
Alignment:
Q  106 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 205  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||| ||| | ||||| || ||||  ||||    
T  36303994 gtagaaaagatggtggaaactagg-ttagatgggttgggcatgtagagagaagacctgtagatgctttagtaaggagaatagatcagatagagggtagtc 36304092  T
Q  206 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 305  Q
    |  |||  ||||| ||  | |||||||| ||||||||||           |||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36304093 agattactagaggcagttgtagacctagtaaaactatta-----------agaaag-atctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatag 36304180  T
Q  306 aacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
     ||| |||| ||| ||||||||||||| |||||  ||||  |  | || |||||| ||||||||||||||    
T  36304181 gacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactcaatgtgacaaggctcggttgttgttgtat 36304250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Original strand, 39208791 - 39208890
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||  |||  ||| | |||| |||||||||||||||||    
T  39208791 aatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatccatgtagaggaccccagttagtgggatatggcttggttgttgttgt 39208890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 40116619 - 40116532
Alignment:
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  40116619 aggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggatagatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaaca 40116532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 30797917 - 30797820
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  30797917 agttggatccaaatttagtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgtaaccgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgtat 30797820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 47542076 - 47542031
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacat 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47542076 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacat 47542031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 373
Target Start/End: Original strand, 48532151 - 48532240
Alignment:
Q  285 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcc-atgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  48532151 tccaaattttgtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccaatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 48532240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 377
Target Start/End: Original strand, 29475811 - 29475972
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||  ||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  |||||| |||| |||||||| |||||    
T  29475811 agaggcagaggaagacctagaaaagctataaga--aactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaatattgtttatgatagaaaactat 29475908  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtattt 377  Q
    | ||| |||||| |||| | ||| | ||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  29475909 ggcgtaatttgacccatctagccaactccagttagtgggataaggtttggttgttgttgtattt 29475972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 48712173 - 48712073
Alignment:
Q  275 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| | |||| |||||||| |  ||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  48712173 atgagttggattcaaatatggtttatgatataacattatgacattatttcatccatgtagttgatcccacttagtgggataatgcttggttgttgttgta 48712074  T
Q  375 t 375  Q
    |    
T  48712073 t 48712073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 23534929 - 23534611
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  || ||| | ||||   |||| |||||| |||||||  |||||||||||  || ||||||||  ||||||| |||    
T  23534929 gagaagaggatgttgcgttagatgtttgataaaactagatcagataagattagaaatgacaatattagagagagt-tgggggtagcatttatagtaaaaa 23534831  T
Q  113 agttggtagaaaatag--gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 210  Q
    || ||||||| ||||   |||||||||||||||  |||||||||  ||||  || | |  ||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||| |  |     
T  23534830 agatggtagataatataagcttagatggtttggatatgtagaga--agacccgtgggttatgtagtaaggagagtagatcagatggatgatagttagatc 23534733  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |  ||||||||||||||||| |  |||| ||| | |||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||    |||||| ||| ||||||||||     
T  23534732 actagaggtagaggaagacccaaaaaaattataacagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggactgtaatatgatttatgatagaacat 23534633  T
Q  311 tatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||| ||| |||||||||||||    
T  23534632 tatggcgtaatttgatccatgt 23534611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Original strand, 40991614 - 40991713
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||| || ||  |||| ||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  40991614 aatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggctgttgttgt 40991713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 46568034 - 46568113
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||  ||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  46568034 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtgttaagactagaccagattgaattagaaatgacaacattagagagagag 46568113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 48953756 - 48953694
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacacc 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||    
T  48953756 gagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagattggatgagataggattaagaatgacacc 48953694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 284
Target Start/End: Original strand, 26990337 - 26990406
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 284  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  26990337 gaggtaggggaagacctagaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctagagatcaatgagttgga 26990406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 280 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 45374570 - 45374477
Alignment:
Q  280 ttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||| |||| ||| |||| |||||||| || ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45374570 ttggatccaactatggtttcggatagaacattatggcgtaatttaatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45374477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 225 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 45487000 - 45486849
Alignment:
Q  225 aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaata---tggtttttgatagaacactatgacgtcat 321  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || || || ||| | ||||| ||||| |||||||   |||||| |||||||||| |||| | | ||    
T  45487000 aagacctagaaaaactataagagaaactattatgaaagactttgagattaatgacttggaaccaaataatatggtttatgatagaacattatggcataat 45486901  T
Q  322 ttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| ||||   |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  45486900 ttgatccatgtagccggccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 45486849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 31453242 - 31453151
Alignment:
Q  69 tgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta-gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||| ||||||| |||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  31453242 tgacaacattaga-agagagttggggcagcacctatagtaagaaaagatggtagaaactagacttaggttgttttggcatgtagagagaagac 31453151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 370
Target Start/End: Original strand, 32170592 - 32170684
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||  ||||||||| | ||||| |||| |||||| | ||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  32170592 agttggatagaaatatggtctatgatataacattatgacataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 32170684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 33755501 - 33755348
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| ||  | |||||| | ||||||||||| | | ||||||  |||||  ||||| |||    
T  33755501 agaggcagaggaaaacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaaacttagagattaatgagttggaccaagatatgg--tttgagtgaacattat 33755404  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttg 369  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |  |||| ||| |||||| |||| ||||||||    
T  33755403 gacgtaatttgatcgatgtagccaaccccacttagtgagatagggctcggttgttg 33755348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 38054696 - 38054624
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 86  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  38054696 agatgagaatgttgcgttgaatgggtggtaagactagacgggataggattagaaatgataacattagagagag 38054624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 40116449 - 40116373
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||| || |||||    
T  40116449 gatttagagattaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccacgtagccga 40116373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 374
Target Start/End: Original strand, 11284120 - 11284271
Alignment:
Q  218 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacg 317  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||     ||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||| |||  |     
T  11284120 gtagaggaagacctag-aaaactataagagaaactattaa----gatgtagagattaatgagttggatataaatatggtatatgattgaacattattgca 11284214  T
Q  318 tcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    || |||||||||||| ||| |  || | ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  11284215 tcgtttgatccatgtagccaaccccgcttagtgagataaggcttgcttgttgttgta 11284271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21862840 - 21862742
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||| ||||||  ||||||| | || ||||||| | ||||  |||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21862840 aatgaattggatagaaatatgatattggatagaagaatatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgcttgttgttg 21862742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 150
Target Start/End: Original strand, 26388414 - 26388540
Alignment:
Q  24 gttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaa 123  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||    ||| |||||| ||| | ||||||||| | |||||   | | ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26388414 gttgcgttggatgtgtggttagactagattatatatgattagaaattaaaccattagacatagagttgagatggcacctataatagaaaagatggtagaa 26388513  T
Q  124 aataggcttagatggtttgggcatgta 150  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||    
T  26388514 aataggtttaggtgatttgggcatgta 26388540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37534483 - 37534429
Alignment:
Q  96 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 150  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  37534483 agcaccgatagtagaaaagatggtggaaaataggcttacctggtttgggcatgta 37534429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 39535715 - 39535653
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||   ||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  39535715 cacctatagtagaaaagatggtagaaacccggcttaggtggtttaggcaagtagagagaagac 39535653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41842630 - 41842564
Alignment:
Q  266 tagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||    
T  41842630 tagaggttaatgagttagattgaaatatggtttttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgt 41842564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42026817 - 42026535
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||  | ||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||  | | ||||| ||||| |||||    
T  42026817 gggtagcactcacagtagaaaagagggtggaaactaggcttaggtggtttgagcttgtagagagaaaacttgtagattatttagtaaggagagtagatca 42026718  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
     | |||||| | |||  |    ||||| ||||||||||| |  ||| |||| |||||||| ||||  |  ||| ||| | | |||||||| |||  ||||    
T  42026717 gacggaggataatcacatccctagaggcagaggaagaccaatcaaagctataagagaaactattaagattgatatagggattaatgagttagatagaaat 42026618  T
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    ||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||| ||| | |||||  |||| ||  | |||||| ||||||| ||||||||    
T  42026617 atggtatatgatagaacattatggcgttatttgattcatttagccgaccccacatactgtgataagacttggttcttgttgta 42026535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 119 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 3870698 - 3870649
Alignment:
Q  119 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3870698 tagaaacttggcttagatggttttggcatgtagagagaagacttgtagat 3870649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 375
Target Start/End: Original strand, 7278675 - 7278748
Alignment:
Q  302 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||    
T  7278675 atagaacattataacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaagcttagttgttgttgtat 7278748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14415358 - 14415258
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||| |||| | | ||||||| ||||| |||||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  14415358 aatgagttggacccacatatggtttatgatataacattatggcataatttgat-catgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 14415260  T
Q  374 at 375  Q
    ||    
T  14415259 at 14415258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33271999 - 33271910
Alignment:
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||| ||   |||||| |||| |||||||||||    
T  33271999 atccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgtcatttgatctatgtagccaaccccacttaataagataaagcttagttgttgttgt 33271910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 32 - 112
Target Start/End: Original strand, 33307087 - 33307165
Alignment:
Q  32 ggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||||| || |||| ||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33307087 ggatgtgtggtaagactaaacatgataagattagaaacgacaacatt--agagagagttggggtagcacctatagtagaaa 33307165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 370
Target Start/End: Original strand, 41529975 - 41530040
Alignment:
Q  305 gaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  41529975 gaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 41530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 308 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 45834665 - 45834600
Alignment:
Q  308 cactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45834665 cactatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 45834600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24778684 - 24778608
Alignment:
Q  298 tttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    |||||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  24778684 tttgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggctgttgttgta 24778608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 281 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39782009 - 39781918
Alignment:
Q  281 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||  ||||  || | |||||||||||| |||||||||    
T  39782009 tggatccaaatacggtttatgataga-cattatggcgtaatttgatcaatgtggccgaccccactcagtgggataaggcttgggtgttgttgt 39781918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 307
Target Start/End: Original strand, 44571599 - 44571643
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44571599 atttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 44571643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 52927936 - 52927852
Alignment:
Q  285 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttg 369  Q
    ||||||||||||||  || |||||| |||| | | ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  52927936 tccaaatatggtttacgacagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 52927852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 41482298 - 41482183
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactatt-agagaaacaatta-gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||| |||| |||||  ||| ||| | ||||||||| | | |||| |||||| |||||||||| |    
T  41482298 agaggcagaggaagacctagaaaaacttttaagagaaactattaggaaagactttggagattaatgagttgaaccaaaatctggtttatgatagaacatt 41482199  T
Q  312 atgacgtcatttgatc 327  Q
    ||| ||| ||||||||    
T  41482198 atggcgtaatttgatc 41482183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44134111 - 44134044
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    ||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| ||| |||| ||||||    
T  44134111 gggtagcgcctctagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggacatctagatagaaga 44134044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 185
Target Start/End: Original strand, 659541 - 659619
Alignment:
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 185  Q
    |||||||| | ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||| |||||    
T  659541 tagaaaagatagtagaaacttagcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatttgtagattctgtagtaagcagagt 659619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4472481 - 4472387
Alignment:
Q  279 gttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||  || | ||||||||||| ||||| | ||| |||   ||||| ||||||||||||||||    
T  4472481 gttggattcaaatatgatttataatagaacactatggtgtaacttgatccatgtagccgactacacttagttcgataaagcttggttgttgttgt 4472387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 24541421 - 24541343
Alignment:
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttg 362  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||  |||| ||| | |||||||||||    
T  24541421 atccaaatatggtttaggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtacccgaccccacttagtgggataaggcttg 24541343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 36868503 - 36868437
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||| || | |||||||    
T  36868503 gtagcacctatggtagagaagatggtggaaagtaggcttaggtggtttgggcatatataaagaagac 36868437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 42510375 - 42510333
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattaga 51  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  42510375 agcagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaagactaga 42510333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 295 - 373
Target Start/End: Original strand, 46148232 - 46148310
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |  |||||||||||||||||||    
T  46148232 gtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggtcaaggcttggttgttgttgt 46148310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6780755 - 6780662
Alignment:
Q  281 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||   ||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||    
T  6780755 tggatccaaatatgatttcagatagaacgttatgacgtaatttgatccctgtagccgaccacacttagtgagaaaaggtttggctgttgttgta 6780662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 332
Target Start/End: Original strand, 19758059 - 19758128
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||   | |||||||||||||    
T  19758059 atttagagattaatgagttggatctcaatatggtttatgatagaacattatggtataatttgatccatgt 19758128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 373
Target Start/End: Original strand, 31146928 - 31146981
Alignment:
Q  320 atttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  31146928 atttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 31146981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 50621720 - 50621647
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 86  Q
    |||||||| ||||||| || |||  ||||||||| ||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  50621720 gagatgagaatgttgcatttgatatgtggtaagactatgaatgataggattagaaatgacaacattagagagag 50621647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31337741 - 31337617
Alignment:
Q  187 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 286  Q
    ||||||||| |||  |||||||| |  ||||  ||||||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||| || |||||    |||||||||||     
T  31337741 gatcaaatgaagggcagtcaagtgactagagtcagaggaaaacctagaaaaactataacagaaactataagaaag-atctagag----atgagttggata 31337647  T
Q  287 caaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  31337646 gaaatatggtatttgatagaacattatgac 31337617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 35043801 - 35043389
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  35043801 gagatgaagatgttgcgctggatgattggtaagattagacatgataggattatgaatgacaccattagagggagagtgagggtagtacctaaagtagaaa 35043702  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  35043701 agttggttgaaaataggcttagattgtttggacatgtagagagaatacccgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggacgagagtcaggttaa 35043602  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35043601 aagaagtagatgaagacctaagaaaaccattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgtgttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 35043502  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtatttgttaaaaattaagaagtctcacatagatgaaataa 412  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35043501 tgacgtcatttgatcaatgtagctgatcccacttaaagagataaggcttggttgttgttgtatttgttaaaaattaagaagtctcacatagatgaaataa 35043402  T
Q  413 taaaataataaaa 425  Q
    |||||||| ||||    
T  35043401 taaaataaaaaaa 35043389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 28085294 - 28085658
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28085294 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattacgaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 28085393  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28085394 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccatgtagagagaagacccgtaaataaagtggtaagaagagtagatcaaatggagtagagtcaag 28085493  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  28085494 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 28085593  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||  |||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28085594 actatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28085658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 32755837 - 32756203
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatag 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  32755837 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataatattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 32755936  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  | |||||  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32755937 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggtcatgtagagggaagacccgaagatgtcgtaataagaagagtagatcaaatggaggagagtca 32756036  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataga 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  32756037 agttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 32756136  T
Q  307 acactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | | |||| ||||| |||||||||    
T  32756137 acactatggcgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtggggtaagacttggatgttgttgt 32756203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 370
Target Start/End: Original strand, 30031178 - 30031535
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30031178 gagatgaggttgttgtgttggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgtcaccattagagagggagtgggggtagcacctatagtagaaa 30031277  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  30031278 agttggtagaaaataggcttagatgagttggacatgtagagagaagacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 30031377  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  30031378 aagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtttatgatagaacacta 30031477  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||   ||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  30031478 tggcgtaatttgatccatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgt 30031535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 372
Target Start/End: Original strand, 608081 - 608442
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||    
T  608081 gagatgaggatgttccgttggatgagtggtaagactagataggataggattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtatcacctatagtagaaa 608178  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  608179 agttgatagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacctgtagatgcctttgtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcagattaa 608278  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctag----gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||| || |||||||||     |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  608279 aagaggttgatgaagacctaattaagaaaactattcgagaaaccattagaaaagatttagagttcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaat 608378  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  | || ||| | |||||| ||||||||||||||    
T  608379 actatgacgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttg 608442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5258506 - 5258148
Alignment:
Q  17 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaag 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  5258506 tgagaatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattatgaatgacaccgttagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 5258407  T
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  5258406 ttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagattccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcatgttaaaa 5258307  T
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||  |||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  5258306 gaggtagagaaagacctaagaaaaccattcgagaaatcattagacaagatttagaggtcaatgagctagatccaaatatggtttttgattaaacactatg 5258207  T
Q  315 acgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     |||||||||||||| || |||||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  5258206 gcgtcatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataagtcttggttgttgttgt 5258148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 376
Target Start/End: Original strand, 9706698 - 9707055
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  9706698 gagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctattgtagaaa 9706797  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||   |||| || || || |||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  9706798 agttggtagaaaataggcttagatggtttg------tagagagaagacccatagaagccgttgttagaagagtagatcaaatggagaagagtcaggttaa 9706891  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||  |||||  ||| | |||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9706892 aagaggtacgggaagggctaagtaaaccattagataaaccgttaggaaggatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 9706991  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtatt 376  Q
    || | ||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  9706992 tggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtatt 9707055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 332
Target Start/End: Original strand, 5631741 - 5632063
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagtag 109  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5631741 agatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagaccggatatgattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtaacacctatagtag 5631840  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |    
T  5631841 aaaagttggtagaaaatatgcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccttcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcagat 5631940  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    ||||||||  | |||||||| || |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5631941 taaaagagacaaaggaagacttaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataaca 5632040  T
Q  310 ctatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  5632041 ctatgacgtcatttgatccatgt 5632063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20427996 - 20427672
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20427996 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaggacaagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 20427897  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||||  |||||||| || |||||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||     
T  20427896 agttggtagaaaataggcttagatggtttgaacgtgtatagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtaaatcaaatagaggggagtcaggttac 20427797  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20427796 aagaggttgaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaa-aatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaatacta 20427698  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    || || ||||| ||| |||| |||||    
T  20427697 tggcgacatttaatcaatgtagccga 20427672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 63 - 373
Target Start/End: Original strand, 12890556 - 12890857
Alignment:
Q  63 taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacta 162  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |            
T  12890556 taggaatgacaccattagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttacatggtttgggcatgtaccca-------- 12890647  T
Q  163 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 262  Q
     ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  12890648 -tagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaaggtcaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaagg 12890746  T
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttg 362  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||    
T  12890747 atttagacgtcaatgagttagatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 12890846  T
Q  363 gttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||    
T  12890847 gttgttgttgt 12890857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9594072 - 9593710
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtg------ggtagcacctatag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |      |||||||||  |||    
T  9594072 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacgggataggattaggaatgacaccattagagagagagagggagttggggtagcaccattag 9593973  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9593972 tagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtagatgctgtagtaagaagagtagatcagatggaggagagtca 9593873  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataga 306  Q
    | |   ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| || || |||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  9593872 aat--caagaggtagaggaagacctagaaaaattataagagaaactattaggaaagacttagagattaatgagttggatcccaatatggtttatgataga 9593775  T
Q  307 acactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||||  || ||||||||||| | || ||   ||| ||| |  |||||||||||||||||||||    
T  9593774 acattatg--gtaatttgatccatatagctgaccacacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 9593710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 37 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21352171 - 21351872
Alignment:
Q  37 agtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagat 136  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21352171 agtggtaagactagatatgataggattaggaataacatcgttagagagag--tggaggtagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagat 21352074  T
Q  137 ggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaa 236  Q
    | ||||| ||||||||||||||||  || |||||  | || |||||| | || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21352073 gatttggacatgtagagagaagacctgtcgatgccattgttagaagaatagaacaaatggagaagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaa 21351974  T
Q  237 aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggcc 336  Q
    ||| | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  21351973 aaccaatagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagctggatccaaatatgatttttgatagaacactatgacgttaattgatccatgtagcc 21351874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 9 - 330
Target Start/End: Original strand, 14030724 - 14031034
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggt-aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt 107  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14030724 agcagagatgaggatgttgcgatggatgagtggttaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagatagtgggggtagcacctatagt 14030823  T
Q  108 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||| | ||||||||      
T  14030824 agaaaagttggtagataataggcttaaatggtttggacatgtatagagaagacatgtaaatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagtggagagtcgg 14030923  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
     ||||||||||||||||||||||||           ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14030924 attaaaagaggtagaggaagaccta-----------agaaaaac-attagaaaagatttagaggtcaatgggttagatccaaatatgatttttgatagaa 14031011  T
Q  308 cactatgacgtcatttgatccat 330  Q
     ||||| ||||||||||||||||    
T  14031012 tactataacgtcatttgatccat 14031034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 10100217 - 10099987
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||||||    
T  10100217 gagatgaggatgttgcgttagatgagtggtaagactagacaatatatgattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtcgcacatatagtagaaa 10100120  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||    
T  10100119 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatgtagagagaagactcgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcagtttaa 10100020  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10100019 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 10099987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 93 - 330
Target Start/End: Original strand, 33496963 - 33497198
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||| ||||||||||  |||||    
T  33496963 ggtagcacctatggtagaaaagttagtagaaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacc-gtaaacgctgtcgtaagaagagaagatca 33497061  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
    |||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33497062 aatgaaggag--tcaagttaaaagaggtagagggagatctagaaaaactattagagaaacctttagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaat 33497159  T
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccat 330  Q
    ||| ||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||    
T  33497160 atgatttatgatataacactatagcgtaatttgatccat 33497198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 102 - 373
Target Start/End: Original strand, 30679417 - 30679678
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||  || ||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  30679417 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagaggagacccgtagatgtcgtcgtaagaatagtagatcaaatggagtag 30679516  T
Q  202 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttg 301  Q
    |||||||||| ||||||||          |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||| | ||    
T  30679517 agtcaagttataagaggta----------taggaagactattagagaaaccattaaaaaggatttagaagtcaataagttggatccaaattcggtctatg 30679606  T
Q  302 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||| |||| ||  | |||||| |||||||||||||||    
T  30679607 atagaacattataacgtcatttgatctatgtagccgatcccacttaatgggataagacttggttgttgttgt 30679678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 9 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 28027189 - 28026896
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||  | ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  28027189 agcagagacgaggatgttatgttggatgagtggtaagactagatggcataggattaggaatgacgtcgttagatagagaatg-gggtagcacctatagta 28027091  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||  ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| || ||  |||||||| || ||| |||||||  |||| ||||||||||||||      
T  28027090 gaaaatgtggtagaaaataggcttgg-tggtttggacatgtagagataacacctgtagatgcggtagtacgaagagtatatcagatggaggagagtcaga 28026992  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgata 304  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||  || |||||| |||| ||||| ||| || |||||||||||| |||||    
T  28026991 ttagaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagaaaaaccattatgaaagatttacaggttaatgatttgtattcaaatatggtttatgata 28026896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34143924 - 34143765
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34143924 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34143825  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | ||||||||||||||||| | |||  |||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  34143824 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgt 34143765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34156540 - 34156381
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  34156540 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattacaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactat 34156441  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | ||||||||||||||||| | |||  |||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  34156440 ggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttattgggataaggcttggttgttgttgt 34156381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 163 - 332
Target Start/End: Original strand, 5080912 - 5081081
Alignment:
Q  163 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||  |||      
T  5080912 gtagatgctgtcgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtctcgttaaaagagatagatgaagacctaggaaaactattagagaaatcattcaaaatt 5081011  T
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5081012 atttagaggtcaatgagttggatacaaatatgatttatgatagaacactataacgtcatttgatccatgt 5081081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 268
Target Start/End: Original strand, 7133795 - 7133923
Alignment:
Q  140 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 239  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7133795 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7133894  T
Q  240 tattagagaaacaattagaaaggatttag 268  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7133895 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7133923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 140 - 268
Target Start/End: Original strand, 7136718 - 7136846
Alignment:
Q  140 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 239  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7136718 ttgggcatgtagagagaagacccgaagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagaaaaac 7136817  T
Q  240 tattagagaaacaattagaaaggatttag 268  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7136818 tattagagaaaccattagaaatgatttag 7136846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6056123 - 6055806
Alignment:
Q  20 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt-tgg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||||||   |      
T  6056123 ggatgttgcgttggatgagtggtaagactagaaaggatgtgattaagaatgacaccattagagagag--ttggggtaacacctatagtagaaaaaaatta 6056026  T
Q  119 tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagagg 218  Q
    ||| ||||||| ||   ||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||| ||   || ||| ||||| ||||| ||||||||| | |||| |||    
T  6056025 taggaaataggttttagtggtttgagcatgtagagagaagagttgtagatgttgtagtgcaaatagtagatcagatggaagagagtcaaataaaaaaagg 6055926  T
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgt 318  Q
    ||||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || | | |||||||| || |||||    
T  6055925 tagaggaagacctataaaaactttaagagaaactattatgaaagatttagaggttaatgagttagatccaaatatagtgtataatagaacattacgacgt 6055826  T
Q  319 catttgatccatgtggccga 338  Q
     ||||||| ||||| |||||    
T  6055825 aatttgatgcatgtagccga 6055806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 97 - 326
Target Start/End: Original strand, 2689646 - 2689868
Alignment:
Q  97 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgg 196  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||| || |    
T  2689646 gcacctatagttgaaaagtttgtagaaaataggcttagatgatttgagcatgtagagagaagacatgtagatgccgtcataagaagagtagatcagatag 2689745  T
Q  197 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggt 296  Q
    || ||||||| || |||||||||      |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||  || |||||| ||||||| ||    
T  2689746 agtagagtcatgtcaaaagaggt------agacctagaaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcagcgaattggatgcaaatattgt 2689839  T
Q  297 ttttgatagaacactatgacgtcatttgat 326  Q
    || | |||||| |||||||||| |||||||    
T  2689840 ttat-atagaatactatgacgtaatttgat 2689868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 213 - 375
Target Start/End: Original strand, 5095956 - 5096118
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||  |||| || ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  5095956 aagaggtagaggaagacctagaaaaactagaagagaaactcttaggaaagatttagtggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacatta 5096055  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    || ||| |||||||| |||| |||||| |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  5096056 tggcgtaatttgatctatgtagccgatcccacttagtgggataaggtttggttgttgttgtat 5096118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 254 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3206578 - 3206459
Alignment:
Q  254 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagaga 353  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||    
T  3206578 ttagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttaatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggga 3206479  T
Q  354 taaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||||||| |||||||    
T  3206478 taagacttggttattgttgt 3206459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Original strand, 5080777 - 5080888
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  5080777 gagatgaggatgttgcgctggataactggtaagattagacataataagattaggaatgacaccattagagaacgagtgggggtatcacctatagtagaaa 5080876  T
Q  113 agttggtagaaa 124  Q
    ||||||||||||    
T  5080877 agttggtagaaa 5080888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 33083976 - 33084127
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||   ||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  33083976 agcagaaatgaggatgctgcgttggatgtgtggtaagactagatgggatagaattagaaatgacgatattagagagagagttggggtagcacctatggta 33084075  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  33084076 gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggaatgtagagagaagac 33084127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 333
Target Start/End: Original strand, 26291700 - 26292019
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtag-cacctatagtag 109  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||  ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||  |||||||  |||||| |||||||| |||    
T  26291700 gagatgatgatgttgtgttgaatgtgtggtaagtctagacttgatagtattaggaatgatactattagagatagagagttagggtagacacctataatag 26291799  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 209  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||  |||||| |||| ||||| ||||||||||||    |    
T  26291800 aaaatatggtagaaaatagacttaggtggttt--gcatgtagagagaagacttatagatgttgcagtaagatgagtagatcagatggaggagagtgtgat 26291897  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
     |||||| ||||||||||||  |  ||||||||  ||||||  ||||  || ||||||||| |  |||||||| ||  ||||||||||| ||||| ||||    
T  26291898 caaaagacgtagaggaagactaaaaaaaactat--gagaaattattatgaaagatttagagattcatgagttgaataaaaatatggtttatgatataaca 26291995  T
Q  310 ctatgacgtcatttgatccatgtg 333  Q
     ||| || | ||||||| ||||||    
T  26291996 ttataacataatttgattcatgtg 26292019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 327
Target Start/End: Original strand, 24665818 - 24666047
Alignment:
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga-tgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 197  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |  ||| ||||| ||||| ||||| ||| |    
T  24665818 acctatagtagaaaatatggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctgtagatttttgtagtaaggagagtagatcagatgaa 24665917  T
Q  198 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtt 297  Q
    | | ||||   | |  ||||| |||||||| | ||| | |||||  |||||||| ||||  ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24665918 gcatagtcggatcaccagaggcagaggaagtcatagaataactacaagagaaactattaagaaatatttagaggtcaatgagttggatcgaaatatggtt 24666017  T
Q  298 tttgatagaacactatgacgtcatttgatc 327  Q
    | |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  24666018 tatgatagaacattatgacttaatttgatc 24666047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 261 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34934942 - 34934829
Alignment:
Q  261 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggct 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||    
T  34934942 ggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcctcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggct 34934843  T
Q  361 tggttgttgttgta 374  Q
    ||||||||||||||    
T  34934842 tggttgttgttgta 34934829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 92 - 374
Target Start/End: Original strand, 31818533 - 31818814
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| ||||| |||||| | ||||  ||||||||||  || ||| |||  ||||| | ||| |||||    
T  31818533 gggtagcacctatagtacaaaaaatggtggaaaatagacttaggtggttttg-catgatgagagaagacctgttgattctgcagtaaggaaagtagatca 31818631  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
     |||||||  ||| |  | |  | ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||| ||| | ||||||||||||| || |    
T  31818632 tatggagggtagtgagatcactaaaggtaggagaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttggagattaatgagttggatcaaagt 31818731  T
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | || || |||||||||||||||||    
T  31818732 atggtttatgatagaacattatgtcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagcgggaaaaagcttggttgttgttgta 31818814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 259 - 373
Target Start/End: Original strand, 31818999 - 31819113
Alignment:
Q  259 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataagg 358  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||| |    
T  31818999 aagggtttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataatg 31819098  T
Q  359 cttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| |||||    
T  31819099 cttggttgtggttgt 31819113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10617586 - 10617296
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||   |||| ||||| |||||||     |||| ||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  10617586 agagatgaggat-ttgcgttggatgtgtgttaagactagacgaaatagaattagaaatgaca-----agagcgagagttggggtagcacttatagtagaa 10617493  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    |||  | |||||| ||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||  || | | |||   |||| |||||  |||||||||||| ||||||| | |    
T  10617492 aagacg-tagaaactagacttaggtggtttgagcatgtagaaagaagacctgtggtttctgcattaaggagagt--atcaaatggaggggagtcaaatca 10617396  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
      ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | | ||||||||||||||||||||    
T  10617395 ctagaggtagaagaaaacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacact 10617296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34664 - 34505
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| || || | ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||    
T  34664 agaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctaaagattaatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattat 34565  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | ||| ||||||||||||| || ||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  34564 ggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 34505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 179
Target Start/End: Original strand, 9568588 - 9568750
Alignment:
Q  19 aggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagtt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| |  |||||   |||||||| ||||||||||||| |    
T  9568588 aggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacatgatagaattataaatgacaacattagagcgccagtgttgaggtagcacttatagtagaaaagat 9568687  T
Q  117 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaag 179  Q
    | | |||||| | |||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||  |||||||||    
T  9568688 gatggaaaatggacttagatggtttgggcaactagagggaagacatgtagattatgtggtaag 9568750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30789155 - 30789076
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  30789155 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgatcctacttagtgggataaggcttggttgttgtt 30789076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 242 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10099025 - 10098896
Alignment:
Q  242 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattc 341  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||   |||  |    
T  10099025 ttagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatttaaatatggtgtatgatagaacacta--acgtcatttgatccatgtaatcgaccc 10098928  T
Q  342 cacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  10098927 cacttagtgggataagacttgattgttgttgt 10098896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 25494210 - 25493907
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggt-aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||   |||| |||||| |||| || ||||  || || |||  ||||||||||||||||| ||    
T  25494210 gagatggggatgttgcgttggatgtgtggtgaatattagatgggataagattagaaatggcaacattgtagggatagttggggtagcacctatagtataa 25494111  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    |  || || ||||||| | |||| |||||||| |||||| |||||| ||  |||||| || | |||| | |||| |||||||| ||||| |||||  |||    
T  25494110 atatt-gtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagattctatagtaaaacgagtagatcaaatagaggatagtcatatta 25494012  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
     |||||||| | |||||||||| | |||||| |||||||| || || ||   |||| || | ||||||||| ||  |||||||||||  |||| |||| |    
T  25494011 caagaggtacaagaagacctagaagaactataagagaaactatcaggaaaagtttatagattaatgagttgaatttaaatatggtttacgataaaacaat 25493912  T
Q  312 atgac 316  Q
    |||||    
T  25493911 atgac 25493907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 33998368 - 33998288
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagt 89  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  33998368 agcagagatgaagatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataggattagaaatgactacattagagagagagt 33998288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 185
Target Start/End: Original strand, 2079317 - 2079434
Alignment:
Q  67 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 166  Q
    |||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||  |||||| || |||||||||||||| | ||||    
T  2079317 aatgacaatattagagagggagt-tgggtagcatctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaagtggtttaggtatgtagagagaagatttgtag 2079415  T
Q  167 atgctgtggtaagaagagt 185  Q
    ||  ||| ||||| |||||    
T  2079416 attatgtagtaaggagagt 2079434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 81 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7513683 - 7513430
Alignment:
Q  81 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga-ctagtagatgctgtggtaag 179  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||||||| ||||||||  ||| ||||| ||||||||||||| | |||||| | |  || |||  ||| |||||    
T  7513683 agagagagttcggggagcacctataatagaaaagatggtagaacctagacttaggtggtttgggcatgcaaagagaaaaacccgtggattatgtagtaag 7513584  T
Q  180 aagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagg-aagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    ||||||  |||| || |||| ||||||| | |  ||||| || || ||||||| |  ||||||| ||||||||  |||| |||||| ||||| | |||||    
T  7513583 aagagtcaatcagattgaggggagtcaaatcactagaggcagggggaagacctggataaactataagagaaacttttaggaaggatctagagatgaatga 7513484  T
Q  279 gttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||   | | ||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||    
T  7513483 gttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggcgttgtttgattcatgt 7513430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 253 - 373
Target Start/End: Original strand, 5897619 - 5897739
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagag 352  Q
    |||||||| ||||||||  | |||| |||||||| ||||||||| | || ||||| | |||||||| ||||||||||||| || ||| |||| ||| | |    
T  5897619 attagaaaagatttagatattaatgtgttggatcaaaatatggtatatggtagaatattatgacgtaatttgatccatgtagcggatcccacttagtggg 5897718  T
Q  353 ataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  5897719 ataaggcttgattgttgttgt 5897739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 154
Target Start/End: Original strand, 8364575 - 8364635
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8364575 gtagcaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagaga 8364635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6641764 - 6641628
Alignment:
Q  18 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttg 117  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||||| ||||   |||| |||| | |||||||  |||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||    
T  6641764 gaggatgttgcgttcgatgttttgtaagactagatgggataagattggaaatgacaatattagagatagagttggggtatcacctatagtagaaaagatg 6641665  T
Q  118 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||||| ||| ||| | | |||||||||| ||||||    
T  6641664 gtagaaactagacttgggttgtttgggcatctagaga 6641628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 287 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12119729 - 12119641
Alignment:
Q  287 caaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga-ttccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  12119729 caaatatgatttttaatagaacattatgacgtcatttgatccatgtagccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttattgta 12119641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 101
Target Start/End: Original strand, 33496106 - 33496194
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacc 101  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| | | |||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||    
T  33496106 gagatgatgatgttgcattggatgaatggtaagattaaataggataagattagaaatgacaccattacagagatagtaggggtagcacc 33496194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1615296 - 1615221
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||  ||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  1615296 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtagccgacctcatttagtgggataagacttggttgttgttgtat 1615221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 5129198 - 5129123
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga 87  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  5129198 agagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagattcgatgtgatcggattagaaatgacaatattagagagaga 5129123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4245966 - 4245872
Alignment:
Q  279 gttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||| || |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  4245966 gttggataaaaatatggtatttgatagaacattatgacatcgtttgatccaagtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttttgt 4245872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12134265 - 12134115
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||  |||    |||| ||||| |||||||  |||||||||||| |   ||||  ||||||||||    
T  12134265 agcagagatgagaatgttgtgttggatgtgtggcaagacaagatgatatagaattagaaatgacaatattagagagagaattgaggtacgacctatagta 12134166  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||| |||| |||||||||||||   ||||| |||| ||||||| ||||    
T  12134165 gaaaagatggtggaaaataggcttacggggtttcggcacgtagagaaaaga 12134115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 2065116 - 2065018
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattag----agagagagtgtgggtagcacctatagt 107  Q
    |||||||||||| | |  |||||||| ||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2065116 gagatgaggatgctaccctggatgagcggtaagactacatatgataggattagtaatgacaccattagaaaaagagagagtgggggaagcacctatagt 2065018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Original strand, 5095816 - 5095913
Alignment:
Q  34 atgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 131  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  5095816 atgagtggtaagactggaagggataggattaggaatgactacattagagggagtgttgggatatcacctatagtagaatagatggtagaaaataggct 5095913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 338
Target Start/End: Original strand, 8364679 - 8364803
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||  | ||| |||||||   ||| ||||||| |||||||||| |||    
T  8364679 agaggaagatgaagacctaaaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagaaattaataagttggactgaaacatggtttatgatagaacattat 8364778  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||    
T  8364779 ggcgtaatttgatccatgtagccga 8364803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 21870363 - 21870299
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 147  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  21870363 agagagttggggtagcacctgtagtagaaaagatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcat 21870299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 373
Target Start/End: Original strand, 579465 - 579700
Alignment:
Q  138 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 237  Q
    ||||| ||||||||||||||| || ||||||  | | ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||   | |  ||||| |||| |||||||   |||    
T  579465 gtttgagcatgtagagagaaggcttgtagattatatagtaaggagagttgatcagatggaggatagtctgatcactagaggcagagaaagacctcaaaaa 579564  T
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccg 337  Q
    ||| | |||||||| ||||  || ||| ||||  | | ||| ||| ||| ||||||||||| |||  ||| | |||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  579565 actgtaagagaaactattaagaaagatatagaaattagtgacttgaatcaaaatatggtttctgaaggaaaattatggcgtaatttgatctatgtagccg 579664  T
Q  338 attccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  579665 atcccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 579700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 1748084 - 1747986
Alignment:
Q  234 gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||||||||||||||||| | ||  ||  |||||||| | ||||||||||||  |||||| || | |||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  1748084 gaaaactattagagaaactactaagaaaaatttagagattaatgagttggatagaaatatagtatatgatagaacattacgacgtcgtttgatccatgt 1747986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 371
Target Start/End: Original strand, 7492551 - 7492669
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagag 352  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||  ||| |||||  ||| || |||||  |||| ||| | |    
T  7492551 attaggaaagatttagaggttaatgagttttatccaaatatggtttcggatagaacattatagcgttatttgtaccaagtagccgaccccacttagtggg 7492650  T
Q  353 ataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  7492651 ataaggattggttgttgtt 7492669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 296 - 373
Target Start/End: Original strand, 38976 - 39053
Alignment:
Q  296 tttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||| |||||  || | ||||||||| ||||||||||||    
T  38976 tttttgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgagtccactaagtgggataaggctcggttgttgttgt 39053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 7150682 - 7150526
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| |||| || | ||||||||||||    |||||| | |||||  ||    
T  7150682 agcagagatgctaatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgagataggatttggaacgaaaacattagagagagt---tgggtaactcctatcata 7150586  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
     ||||  |||| |||| | || |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  7150585 aaaaatatggtggaaactcggattaggtggtttgggcatggggagagaagacttgtagat 7150526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 31832139 - 31831922
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 192  Q
    |||||||||||||||| || || |||| |  | ||||||||  |||||||| ||||||||||||||    | ||||  | | | ||| ||||| |||||     
T  31832139 ggtagcacctatagtaaaatagatggtgggtattaggcttaagtggtttggacatgtagagagaaggtccggagattatatagcaagtagagtagatcag 31832040  T
Q  193 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaata 292  Q
    |||||||| |||||  | |  |||  ||||||||  ||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | | ||||||||||||||| |    
T  31832039 atggaggatagtcagatcatcagaaatagaggaaagcctagaaaaactatcagagaaactattaagaaagatctagagattactgagttggatccaaaca 31831940  T
Q  293 tggtttt-tgatagaaca 309  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  31831939 tggttttatgatagaaca 31831922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 77
Target Start/End: Original strand, 2689578 - 2689642
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccat 77  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||  |||||| || | | |||||||||||||||||||||||    
T  2689578 gagatgaggatgttgtgatggatgagcagtaagactaaataggataggattaggaatgacaccat 2689642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 6293733 - 6293690
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagac 52  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  6293733 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaaaattagac 6293690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12134001 - 12133902
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||| || ||  | |||||||| |||| | | || |||||||||| |||||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  12134001 aatgagttggatcgaaatgtgattcataatagaacattatggcataatctgatccatgtagccgaccccacttagtgagaaaaggcttggttgttgttgt 12133902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 276 - 330
Target Start/End: Original strand, 9568884 - 9568938
Alignment:
Q  276 tgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||| ||| |||||||||||    
T  9568884 tgagttggatccaaatatggtttatgatagaccgttatggcgtaatttgatccat 9568938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 14389272 - 14389202
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| || | ||| |||||||||||||    
T  14389272 gatttagagattaataagttagatccaaatatggtttatgatataacattagggcgtaatttgatccatgt 14389202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 242
Target Start/End: Original strand, 3963889 - 3963950
Alignment:
Q  181 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat 242  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| | |  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3963889 agagtggatcagaaggaggggagtcaaatcaccagaggtagaggaagacctagaaaaactat 3963950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 338
Target Start/End: Original strand, 21886314 - 21886351
Alignment:
Q  301 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  21886314 gatagaacacaatgacgtcatttgatccatgtagccga 21886351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 284
Target Start/End: Original strand, 38900 - 38956
Alignment:
Q  228 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttgga 284  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||    
T  38900 acctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttgga 38956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43326 - 43266
Alignment:
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  43326 acctataatagaaaaaatggtggaaactaggcttaggtggtctggccatgtagagagaaga 43266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7513075 - 7513031
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  7513075 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgatctatgt 7513031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9749497 - 9749353
Alignment:
Q  100 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 199  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||| | || |||| |||||| || ||||||||||||| |  ||||||  | | ||||||||||| |||||||  ||||    
T  9749497 cctatcgtagaaaagaaggtggaaacttggtttaggtggtttagggatgtagagagaagtcatgtagattttatagtaagaagagtagatcaaacagagg 9749398  T
Q  200 agagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 244  Q
      |||||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  9749397 gtagtcaaatcattagaggcagaggaagatctagaaaaactatta 9749353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 302 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18130885 - 18130813
Alignment:
Q  302 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    |||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||  |||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  18130885 atagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacctaatgggataaggcttagttgttgttgta 18130813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 158)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 37617862 - 37618227
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37617862 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 37617961  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaa-taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37617962 gaaaagttggtagaaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaa 37618061  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  37618062 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 37618161  T
Q  308 cactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37618162 cactatggtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 37618227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12841639 - 12841275
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12841639 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaaaactagacatgataggattaggaatgaccccattagagagagagtggaggtagcacctatagta 12841540  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12841539 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 12841440  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  12841439 ttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtatccaaatttggtttatgatagaac 12841340  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12841339 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12841275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 12 - 374
Target Start/End: Original strand, 34869341 - 34869703
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34869341 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaa 34869440  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||    
T  34869441 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatccaatggtggagagtcaagtta 34869540  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  34869541 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 34869640  T
Q  312 atgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||  | |  ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  34869641 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccctaattagtgggataaggcttggttgttgttgta 34869703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 11593878 - 11594242
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11593878 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcacctatagta 11593977  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11593978 gaaaagttggtagaaaatacggttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 11594077  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  11594078 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 11594177  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  11594178 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 11594242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 9 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 35906565 - 35906208
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35906565 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtggaggtagcacctatagta 35906466  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  35906465 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtatatcatatggaggagagtcaag 35906366  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  35906365 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttcgaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 35906266  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttg 366  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||    
T  35906265 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttg 35906208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 49029194 - 49029557
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  49029194 agcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 49029293  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  49029294 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagacgaatagatcaaatggaggagagtcaag 49029393  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  49029394 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 49029493  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | |||| ||| |||||||||||||    
T  49029494 actatggcgtcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggatacggc-tggttgttgttgt 49029557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13859372 - 13859061
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13859372 agcagagatgaggatgttgcgttggacgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 13859273  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13859272 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 13859173  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13859172 ttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggccaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaac 13859073  T
Q  309 actatgacgtca 320  Q
    |||||| |||||    
T  13859072 actatggcgtca 13859061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39906730 - 39906372
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39906730 gagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgagggtagcacctatagtagaaa 39906631  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  39906630 agttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccatagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggag--gagtcaagttaa 39906533  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  39906532 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgacttggatccaaatttggtgtatgatagaacacta 39906433  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  39906432 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 39906372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33350170 - 33349806
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33350170 agcagagatgaggatgttgccttggatgagtggtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagta 33350071  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33350070 gaaaagttgctagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 33349971  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||    
T  33349970 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatagtagaac 33349871  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||   ||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  33349870 actatagcgtcatttgatccatgtagccgacctcacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 33349806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 46356219 - 46355858
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  46356219 agcagagatg-ggatgttgcgttgaatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccatcagagagagaatgggggtagcacctatagta 46356121  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46356120 gaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgttgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 46356021  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  46356020 ttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggatccaaatctggtgtatgatagaac 46355921  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  46355920 actatgccatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgtt 46355858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 45836840 - 45836482
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45836840 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagagtagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 45836741  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||      
T  45836740 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagttaggtt-- 45836643  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45836642 atgaggtagagggagacctaggacaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacacta 45836543  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  45836542 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 45836482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 373
Target Start/End: Original strand, 43281600 - 43281956
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  43281600 gatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactagacaatataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaaag 43281697  T
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  43281698 ttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaa 43281797  T
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43281798 gaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 43281897  T
Q  315 acgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  43281898 gcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgt 43281956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 44855536 - 44855174
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  44855536 agcagagatcaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggatagtacctatagta 44855437  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44855436 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 44855337  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||    
T  44855336 ttaaaagaagtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgat--aac 44855239  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44855238 actatggcgtaatttggtccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44855174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 296
Target Start/End: Original strand, 31005141 - 31005428
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31005141 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaataacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31005240  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31005241 gaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31005340  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggt 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31005341 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatttgaaaggattcagagatcaatgagttggatccaaatttggt 31005428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 56 - 370
Target Start/End: Original strand, 6374833 - 6375147
Alignment:
Q  56 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6374833 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgagcatgtagagag 6374932  T
Q  156 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 255  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  6374933 aagaccagtagatgctgtggtaagaagggtagatcaaatgtaggagaatcaagttaaaagaggtagaggaagatctaggaaaactattagagaaaccatt 6375032  T
Q  256 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagata 355  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||    
T  6375033 agaaagaatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 6375132  T
Q  356 aggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||||    
T  6375133 aggcttggttgttgt 6375147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 11 - 373
Target Start/End: Original strand, 36651914 - 36652274
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |  |||| ||| | ||||||||    
T  36651914 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagaggg--taggggtggcatccatagtaga 36652011  T
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  36652012 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttcagcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcaagtt 36652111  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||    
T  36652112 aaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggattcagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtgtatgatagaacac 36652211  T
Q  311 tatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||    
T  36652212 tatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgctgttgt 36652274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 14 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35559353 - 35559034
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacct-atagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  35559353 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatcagatttgataggattaggaatgacaccatttgagagagagtgggggtagcaccttatagtagaaa 35559254  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||   ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35559253 agttggtagaaaataggcttagatgatttggacatttagtgagaagacccctagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaa 35559154  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || ||||||| ||    
T  35559153 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttagtttatggtagaacatta 35559054  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |  | |||||||||||||||    
T  35559053 tagcatcatttgatccatgt 35559034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 56 - 373
Target Start/End: Original strand, 29650349 - 29650666
Alignment:
Q  56 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29650349 ataggattaggaatgacaccattcgagagagagtgggggcagcacctatagtagaaaaattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 29650448  T
Q  156 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 255  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||| ||||||| |||    
T  29650449 aagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtaaaggaaaacctaagaaaaccattcgagaaaccatt 29650548  T
Q  256 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagata 355  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||    
T  29650549 agaaaagatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttttgatagaacactaaggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 29650648  T
Q  356 aggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29650649 aggcttggttgttgttgt 29650666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 43491230 - 43491590
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||| ||||||||||| |||    
T  43491230 gagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagattagatgggatatgattaggaatgacaccattggggagagagtaggggtaacacctatagtataaa 43491329  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||    
T  43491330 aattggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagagtcaggtcaa 43491429  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  43491430 aagaggtagaggaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaacacta 43491529  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| || |||| |||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43491530 tgatgtaatttcatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 43491590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 38606927 - 38607274
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38606927 gagatgataatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaacatta-agagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 38607025  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  38607026 ggttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtagatcaaatggaggagagtcacgttag 38607125  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||| ||||||||||||| ||            |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38607126 aagagggagaggaagacctaaga------------aaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 38607213  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||| | | ||||||||||||||||||||    
T  38607214 tggcgtcgtttgatccatgtagccgactccacttagtgggttaaggcttggttgttgttgt 38607274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 91 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31682884 - 31682602
Alignment:
Q  91 tgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 190  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  31682884 tgggtagcacatatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggtatgtagagagaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatc 31682785  T
Q  191 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 290  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  31682784 aaatggaggagagtcaagttagaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgaattggatccata 31682685  T
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31682684 tttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31682602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 77 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2886018 - 2885722
Alignment:
Q  77 ttagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggt 176  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || ||    
T  2886018 ttagggagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtagatgccgttgt 2885919  T
Q  177 aagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaat 276  Q
    | ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  2885918 acgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaagaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaatgatttagtggtcaat 2885819  T
Q  277 gagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2885818 gagttggacccaaatatggtttatgatagaacactatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2885722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 9 - 247
Target Start/End: Original strand, 33072872 - 33073108
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  33072872 agcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 33072969  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  33072970 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaag 33073069  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33073070 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatcagag 33073108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 94 - 373
Target Start/End: Original strand, 22349623 - 22349902
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||   ||||||||||||| |||||||    
T  22349623 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttttggcatgtagagagaagacccgtaattgtcatggtaagaagagtagatcaaa 22349722  T
Q  194 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatat 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  22349723 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaactaggaaaactattagagaaaccattaaaaaggatttaaaggtcaataagttggatccaaattt 22349822  T
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||  |||| ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  22349823 ggtatatgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 22349902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 92 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 36869525 - 36869286
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||| |||||    
T  36869525 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttggtcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcagaagaagagtagatca 36869426  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  36869425 aatggaggagagtcaagttagaataggtagaggaagacctgggaaaactattaaagaaaccattagaaaggatttagatgtcaatgagttagattcaaat 36869326  T
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatg 331  Q
     || ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36869325 ttgatttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatg 36869286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 16 - 314
Target Start/End: Original strand, 23404343 - 23404640
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  23404343 atgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactatacatgataggattaggaatgacaccattagggagagagtgggggtaacacttatagtagaaaagt 23404442  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 215  Q
    ||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||||||| |||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  23404443 tgggagaaaataggcttagacagttt-ggcatgtagattgaagactcgtagatgtcgtcataagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggtcaaaag 23404541  T
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| |||| ||   ||||| || |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  23404542 aggtagaagaagacctaggaaaattataaaagaaaccattacaattaatttatagatcaatgagtttgatccaaatatggtgtatgatagaacattatg 23404640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 101 - 373
Target Start/End: Original strand, 15682184 - 15682456
Alignment:
Q  101 ctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  15682184 ctatagtagaaaagttggtaggaaataggcttagatggtttaggcaggtagagagaagatccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaattgagga 15682283  T
Q  201 gagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggttttt 300  Q
     |||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  15682284 aagtcaagtcaaaagaggtggagaaaaacctaggaaaactataagagaaatcattagaaaggatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttat 15682383  T
Q  301 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||| |  |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||    
T  15682384 gatagaacactatggcgtactttgatccatgtagccaaccccacttagtgagataaagcttggtagttgttgt 15682456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 374
Target Start/End: Original strand, 36136687 - 36137047
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36136687 agatgagaatgttgtgttggatgggtggtaagactagaagggataggtttaggaatgacaccattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaa 36136786  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
    | ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| ||   |||||| ||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||  | | |    
T  36136787 gatggtagaaaatagtcttaggttgtttgggcatatagagagaatacctatagatgttgtagtacgaagagcagatcagatggaggagagtcagatcaga 36136886  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| | || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  36136887 agaagtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactatttggaaagatttagatgttaatgaattggatccaaatatggtttatgatagaacattat 36136986  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
       || |||||||  || |  |||||  | | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  36136987 agggtaatttgatttatttaaccgatcgcgcttagtgggataaggcttggttgttgttgta 36137047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28628284 - 28627936
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||  | ||  ||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||| | |||| |    
T  28628284 atgttgccttggatgtatggtaagaccatacgggatgggattagaaattacaacattagagagggagttggagtagcacctagagtagaaatgatggtgg 28628185  T
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 221  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||||  |||||||| |||||| | | |||||||||    
T  28628184 aaaattggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaaacctgtagattatgtagtaaggagagtagatccgatggaggatagtcaaatcacaagaggtag 28628085  T
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcat 321  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||    
T  28628084 aggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaatgagttggatgcaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaat 28627985  T
Q  322 ttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  28627984 ttgatccatgtagccgactccacttagtgggataaggcttagttgttgt 28627936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 130 - 373
Target Start/End: Original strand, 32631615 - 32631846
Alignment:
Q  130 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32631615 cttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggatagtcaggttaaaagaggtagaggaagac 32631714  T
Q  230 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcca 329  Q
    ||| |||||| |||||| ||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |    
T  32631715 ctaagaaaaccattagaaaa------------gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacgctatggcgtcatttgatcta 32631802  T
Q  330 tgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32631803 tgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 32631846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 208 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 40980093 - 40979925
Alignment:
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40980093 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaa 40979994  T
Q  308 cactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtatt 376  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  40979993 cactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtatt 40979925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 204 - 373
Target Start/End: Original strand, 38900070 - 38900238
Alignment:
Q  204 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgat 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||    
T  38900070 tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgat 38900169  T
Q  304 agaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38900170 tgaacactatggcgtcatttgatccatgtagccga-cccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38900238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 330
Target Start/End: Original strand, 47848596 - 47848912
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||||||| || | ||| | |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  47848596 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataggatcagaagtgataacattagagagagagttggggtagcgcctatagtagaaa 47848695  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| || ||||  |||| ||||| ||||| |||||||| ||||   | |     
T  47848696 agatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtcgagagaagacttgtaaattctgtactaaggagagtagatcagatggaggatagtctgatcac 47848795  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
     ||||| ||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||||| |||| | | | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  47848796 tagaggcagaggaagaactagaaaaactataagagaaactattggaaag-atttggggattaatgagctggatccaaatatggtttatgatagaacatta 47848894  T
Q  313 tgacgtcatttgatccat 330  Q
    ||   | |||||||||||    
T  47848895 tggtttaatttgatccat 47848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 164 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31681226 - 31681022
Alignment:
Q  164 tagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagga 263  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  31681226 tagatgccgtcgtaagaagagttgatcaaatggaagagagtcagtttaaaacaggtagagggagacctaggaaaa---ttagagaaaccattagaaagga 31681130  T
Q  264 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttgg 363  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | || |||||||||    
T  31681129 tttaagggtcaatgagttggatccaaatatggcttatgatagaatactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttgg 31681030  T
Q  364 ttgttgtt 371  Q
    ||||||||    
T  31681029 ttgttgtt 31681022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 142 - 373
Target Start/End: Original strand, 7273151 - 7273382
Alignment:
Q  142 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaacta 241  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| || ||| | ||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7273151 gggcatgtagagagaagatccgtaggtgccgtcgtatgtagagtagattggatggaggagagtcaggtcaaaagaggtagaggaagacctatgaaaacta 7273250  T
Q  242 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattc 341  Q
    | |||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||  |    
T  7273251 taagagaaaccattagaaaatattcagaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgatatagcactatgacgtaatttgatccatgtagccgaccc 7273350  T
Q  342 cacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  7273351 cacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 7273382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 7272961 - 7273151
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||  | | ||| |||||||||||||||    
T  7272961 gagatgaggatgttgtgctggatgagcggtaagactacacgggataggattaggaatgacacctttagggagagaacgggagtatcacctatagtagaaa 7273060  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagag 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |  ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  7273061 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtacagagaagacctgtagatgccgccgtatgaagagtagatcagatggaggagag 7273151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 149 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24598411 - 24598222
Alignment:
Q  149 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 248  Q
    ||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||    
T  24598411 tagagagcagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatgaaggtgagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaatcattcgaga 24598312  T
Q  249 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | || | ||||||||||||||| |||||    
T  24598311 aaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttttgatagaatattttggcatcatttgatccatgtagccga 24598222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8492580 - 8492232
Alignment:
Q  26 tgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaa 125  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  8492580 tgcgttggatgagtggcaagactagacgggataggattacgaatgacaccattagggagagatttggggtaacacctatagtaaaaatgatggtagaaaa 8492481  T
Q  126 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 225  Q
    |||||| || |||||||  | |||||||| |||||| ||||||| ||| |||  |||||| ||||| ||||||||| || |  ||| ||||||||||| |    
T  8492480 taggctaaggtggtttgaacttgtagagaaaagacttgtagatgttgtagtacaaagagtagatcagatggaggagggtgagattagaagaggtagagaa 8492381  T
Q  226 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttga 325  Q
    ||||| | |||||  |||| |  |||  |||| || ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | | ||||||    
T  8492380 agacc-acgaaaa--attataataactgttaggaaagatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttga 8492284  T
Q  326 tccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtattt 377  Q
    || ||||  |  |  |||| ||| ||||||||||| |  |||||||||||||    
T  8492283 tcaatgtaactaaccccacttagtgagataaggctcgactgttgttgtattt 8492232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 32630517 - 32630636
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32630517 gagatgaggatgttgagctggatgagtggtaagactagacatgataggattagga-tgataccattggagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 32630615  T
Q  113 agttggtagaaaataggctta 133  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32630616 agttggtagaaaataggctta 32630636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 308
Target Start/End: Original strand, 43282330 - 43282626
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt---agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||   |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43282330 atgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagtctagacatgatatgattagaaatgacaacatttagagagagagagttggggtagcacctatagtagaaa 43282429  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||| ||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||| ||| | |||||||| |||||  | |     
T  43282430 agtcggtggaaactaggcttaggtgaattgggcatgtagagagaagacttgcagattctgtaggaaggagagtagat-agatggaggatagtcagatcac 43282528  T
Q  213 aagag--gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||   | | | | ||||| | ||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  43282529 aagaggtgtagaggatgacctagaaaaactataagagaaactattaagtaagttcttgaggttattgagttggatcgaaatatggtttattatagaac 43282626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 36514569 - 36514371
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||  ||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  36514569 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactaaacgggatagaattagaaaggacaacattagagagag--ttggggtagcacctatagta 36514472  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||| | ||||| ||||| || |||| ||||||||    
T  36514471 gaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagacgacttgtggattctgtagtatggagagtagatcagatagaggggagtcaag 36514372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25579431 - 25579205
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||     ||||||||| ||||||  |||||||||||| | | | |||||||| |||| |||||    
T  25579431 gagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaatactaga-----taggattagaaatgaccacattagagagagtggg-gagtagcacccatagcagaaa 25579338  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |  |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||| | |     
T  25579337 aaatggtggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacatgtagattctgtggtaagaagagtagattagatggaggatagtcaaatcac 25579238  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 245  Q
    ||||| || | |||||||||| |||||||||||    
T  25579237 aagagttaaatgaagacctagaaaaactattag 25579205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 46014498 - 46014359
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  46014498 gataagattagaaatgacaccattagagagagagtgggggttgcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgg-ttggacatgtagaga 46014400  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatg 195  Q
    ||||||   ||||||| ||  |||||||||| |||||||||    
T  46014399 gaagacccatagatgccgtcctaagaagagtagatcaaatg 46014359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 226 - 374
Target Start/End: Original strand, 48919247 - 48919395
Alignment:
Q  226 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttga 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||    
T  48919247 agacctaggaaaactattagaaaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagtttgatccaaatatggtttatgataaaccactatggcgtcatttga 48919346  T
Q  326 tccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    ||||||| | |||  |||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  48919347 tccatgtagtcgaccccacttaatgggataaggcttggttgttgttgta 48919395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7189593 - 7189310
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga--------gtgtgggtagcacctat 104  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||        ||  |||| ||||||||    
T  7189593 gagatgaggatgttgtgttgaatgaccggtaagattagacgagataggat-atgaatgacaccattagagagagaaagagagagttggggtcgcacctat 7189495  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat------gctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 198  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    |||||      | ||| ||| ||||||| ||||| ||||||    
T  7189494 agtagaaaagatggtagaaaataagcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaatcgatagatgttgtagttgtagtatgaagagtagatcagatggag 7189395  T
Q  199 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac-aattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
    ||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  7189394 gagagtcatattagaagatgtagaggaagacctagaaaaactataagggaagctaattagaaaagatttagaggttaaggagttg 7189310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 213 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9210864 - 9210704
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||    
T  9210864 aagaggttgaggaagacctaggaaaactataagagaaacttttaggaaaaatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatacaacatta 9210765  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || ||| ||||||||||||| || ||  |||| ||| | |||||||||| |||||||||||    
T  9210764 tggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttgt 9210704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 248 - 373
Target Start/End: Original strand, 27648937 - 27649062
Alignment:
Q  248 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccaccta 347  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||    
T  27648937 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactgtggcgtaatttgatccatgtagccgaccccactta 27649036  T
Q  348 gagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | | ||||||||||||||||||||||    
T  27649037 gtgggataaggcttggttgttgttgt 27649062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Original strand, 39811882 - 39812066
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||  |||||||      
T  39811882 atgaggatgttgctttggatgtgtggtaagactagacgtgataggattagaaatgacaacattagagagagagttggggcagcacctatcatagaaaaaa 39811981  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagga 200  Q
    ||||  ||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||   |||||| || | ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  39811982 tggtgaaaactcggcttaggtagtttgggcatgtagagagaagagatgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagga 39812066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 242 - 373
Target Start/End: Original strand, 21078068 - 21078199
Alignment:
Q  242 ttagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattc 341  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |     
T  21078068 ttagagaaaccattagtaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgactt 21078167  T
Q  342 cacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21078168 catttagtgggataaggcttggttgttgttgt 21078199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 373
Target Start/End: Original strand, 1011103 - 1011328
Alignment:
Q  147 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 246  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  1011103 tgtagagagaagacatctagatgttgtagtacgaagagtagatcagataaaggagagtcagatcaaaagaggtagaggaagacctagaaaaattatgaga 1011202  T
Q  247 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacct 346  Q
    ||||  ||||| ||  ||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||  || |||||||| |||| |||||  |||| |    
T  1011203 gaaattattaggaaatatttaaaggttaatgatttggatcc-aatatggtttaggatagaacattatggtgtaatttgatctatgtagccgaccccactt 1011301  T
Q  347 agagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || | ||||||||||||||||||||||    
T  1011302 agtgggataaggcttggttgttgttgt 1011328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36102129 - 36101777
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||| ||||   |||  |||||| ||||||| |||| |||  ||||||  ||||||||||||| ||    
T  36102129 agcagagatgaaaatgttgagttcgatgtgtggtaagactagatgggatgagattagaaatgacaacatttgaggaagagtgaaggtagcacctataata 36102030  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| || | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   |||||  |||   | | ||||| ||||| |||||| | |||||      
T  36102029 gaaaagatgttggaaaataggcttaggtggtttggggatgtagagagaagacctatagattttgtaacagggagagtagatcatatggagaatagtcaga 36101930  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    | |  ||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||           |||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36101929 tcactagaggcagaggaagacctagaaaaattatta-tgaaa-----------gatttatagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaac 36101842  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | |||||||| ||||||||||||| |  ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36101841 attatgacgtaatttgatccatgtagttgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36101777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 38135476 - 38135256
Alignment:
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||      
T  38135476 gaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggacatgtagacagaagaccagtagattttgtagtaaggaga-tagatcagatggaggatagtcaga 38135378  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    | |  ||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||| | |||||||| || ||||||||     
T  38135377 tcattagaggcagatgaagacctagaaaaagtataagagaaactattaaaaaagatttagagattaatgagttggaccgaaatatgggttatgatagaat 38135278  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccat 330  Q
    | |||| ||| |||||||||||    
T  38135277 attatggcgtaatttgatccat 38135256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 36869653 - 36869574
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36869653 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactggacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 36869574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 263 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34035264 - 34035155
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttg 362  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||| |||||||    
T  34035264 atttagagatcaatgagttggatccaaatatggttcatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggattaggcttg 34035165  T
Q  363 gttgttgttg 372  Q
    ||||||||||    
T  34035164 gttgttgttg 34035155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Original strand, 42187393 - 42187537
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  ||||  ||||| |||| || ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  42187393 gagatgaggatgttgtgttggatgtgtagtaagactagacgggatat-attagaaatggcagcattagaaagagagtcggggtagcacctataatagaaa 42187491  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 158  Q
    || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  42187492 agatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaag 42187537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 214 - 375
Target Start/End: Original strand, 45601599 - 45601760
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  45601599 agaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaaccattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatgatttatgatagaacactat 45601698  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    |  || ||||||||||||| || ||   ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  45601699 ggtgtaatttgatccatgtagctgaactcacttagtgggataaggcttggttgttgtggtat 45601760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 367
Target Start/End: Original strand, 5335840 - 5336193
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  ||   ||||| ||||| | ||||  |||||||||  |||||||| ||||||||    
T  5335840 agcagagatgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagacagaatgcaattagaaatgataacatt--agagagagttggggtagcatctatagta 5335937  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    | |||| |||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||   || ||| |||| || || ||||| ||| | ||||||| |||||||     
T  5335938 ggaaagatggtcgaaactagacttaggtggtttgggcatatagagagaagaactgtggattctgtagttaggagagtagattagatggaggggagtcaaa 5336037  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    | |   ||||||| |||| |||| | ||||||||  |||| || ||||  || ||| ||||| | |||||||||||   | | |||||||||||| |||     
T  5336038 tcactcgaggtaggggaaaaccttgaaaaactat--gagatactattaagaatgatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgattgaat 5336135  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgt 367  Q
    |||||| |||| |||||| ||||| |||||  |||| ||| | |||||| |||||||||    
T  5336136 actatggcgtcgtttgattcatgtagccga-cccacatagtgggataagacttggttgt 5336193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 373
Target Start/End: Original strand, 12966025 - 12966298
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||| ||||| ||||| ||||||     
T  12966025 gtagcacctatagaagaaaagatggtggaaactatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacccgtaaattctgtagtaaggagagtagatcaag 12966124  T
Q  194 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatat 293  Q
    || ||   |||||| | |       ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  ||  |||||||| | ||||| ||||||  ||||||    
T  12966125 tgaagactagtcaaatca------ctagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaatatttagagattaatgatttggatagaaatat 12966218  T
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| | ||||| | || |||| | |  |||||| ||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12966219 ggtatatgataaatcattatgccattgtttgattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12966298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 278 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28208423 - 28208328
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28208423 agttggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28208328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 19262791 - 19262609
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||| |||  |||  ||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||  |||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||    
T  19262791 gagatgaggatgttacgtgtgatatgtggtaatactagacatgatagagttagaaatgacaatattagagagag--ttggggtagcacctattgtagaaa 19262694  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 198  Q
    || ||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  19262693 agatggtagaaacttggcttaggtggtttgagcatgtagagagaagacctgtagat-ttgtagtaagaagagtagatcagatggag 19262609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24598509 - 24598409
Alignment:
Q  10 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt----agagagagagtgtgggtagcacctata 105  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||||||||| ||||| ||||||||    
T  24598509 gcagagacgaggatgttgtgttggatgagtggtaagtttagacatgataggattaggaatgacaccattatagaaagagagagtgggggtatcacctata 24598410  T
Q  106 g 106  Q
    |    
T  24598409 g 24598409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 14593679 - 14593834
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtg----tgggtagcacctat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |  | ||||| ||||||| ||||||||||||||||     ||||  |||||||    
T  14593679 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccgaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctat 14593778  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||  ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  14593779 agtagaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagac 14593834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26742215 - 26741894
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt-gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagag 153  Q
    ||||||||||| ||||| |  || |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  26742215 gataggattagaaatgataatatcagagagtgagagttgggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggattaggtggtttgaacatgtagag 26742116  T
Q  154 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactat--tagagaaac 251  Q
    | | |||   |||||  ||||||||| ||||| ||||| || ||| | |||||  | |  ||||| |||||||||| ||| ||||||||   ||| ||||    
T  26742115 aaacgacctatagattttgtggtaaggagagtagatcagatagagaatagtcagatcactagaggcagaggaagacgtagaaaaactatcaaagataaac 26742016  T
Q  252 aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagaga 351  Q
     ||||| ||  |||| ||  | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||  || || |||| ||| |     
T  26742015 tattaggaaatatttggaaataaatgagttggaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatcaatgtaaccaatcccacttagtgc 26741916  T
Q  352 gataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     | || ||||||||||||||||    
T  26741915 aaaaatgcttggttgttgttgt 26741894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 30200323 - 30200176
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   |||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||    |||| |||||||||||    
T  30200323 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgggatatgattagaaatgacaacattagagagttag----ggtaacacctatagta 30200228  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||| || ||| |||||||| | |||||||    
T  30200227 gaaaagatggtggaaactaggcttaggtgattttggcatgtaaatagaagac 30200176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 267 - 373
Target Start/End: Original strand, 33073105 - 33073211
Alignment:
Q  267 agaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||||||||    
T  33073105 agaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtataataaaacaatatgacgtcatttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttg 33073204  T
Q  367 ttgttgt 373  Q
    || ||||    
T  33073205 ttattgt 33073211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 159
Target Start/End: Original strand, 28020883 - 28021032
Alignment:
Q  10 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag 109  Q
    ||||||| || |||||||| || |||| ||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||| | ||||||||| |||||  ||||||||| ||| ||||    
T  28020883 gcagagaggaagatgttgcattagatgtgtgataagactggacatgatatgattcgaaatgataacattagagaaagagttggggtagcacttatcgtag 28020982  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28020983 aaaagatggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 28021032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48736256 - 48735901
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagt 115  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||||  ||||| ||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||     
T  48736256 atgaggatgttgcgttgaatgtgtggtaagactagatgagataaaattagaaatgacgacattatagagagagttggggtagcacctacagtagaaaaga 48736157  T
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 215  Q
    ||| ||||| ||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||  || |||  ||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||  | |  ||    
T  48736156 tgggagaaactagacttaggtggtttgctcatgtagagcgaagacctgtggattatgtagttaggagagtagatcaaatggagg-gagtcagatcactag 48736058  T
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatga 315  Q
    |||||| |  |||||| | |||||||| |||||  | ||||| | || | ||||| | |||||||| ||   | | ||||||| ||| |||| ||||||     
T  48736057 aggtagggctagaccttgaaaaactataagagaggctattagtagggttctagagataaatgagtttgagaaagacatggtttatga-agaatactatgg 48735959  T
Q  316 cgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||||| ||||| ||| |  |||| ||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  48735958 cgtcgtttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggtttggttgttgttgt 48735901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27021986 - 27021906
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27021986 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagttggtgaaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 27021906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 200
Target Start/End: Original strand, 40169650 - 40169758
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||  ||| ||||| |||||    
T  40169650 gggtagcacttatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagataagacacgtagattttgtgtgaaggagagtagatca 40169749  T
Q  192 aatggagga 200  Q
    |||||||||    
T  40169750 aatggagga 40169758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 138 - 332
Target Start/End: Original strand, 1569063 - 1569257
Alignment:
Q  138 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 237  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  ||||||| ||| | ||| ||||| ||||| |||||||| |||||  ||   ||||| ||||| || ||||| |||    
T  1569063 gtttgagcatgtagagagaagtcgtgtagatgttgtagaaaggagagtagatcagatggaggatagtcagattgctagaggcagaggtagtcctagaaaa 1569162  T
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||| |||| ||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || | ||| |||||||| ||||    
T  1569163 actataagagtaactattaagaaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgatagaacattacggcgtaatttgatcgatgt 1569257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 16013202 - 16013357
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtg----tgggtagcacctat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |    ||||| ||||||| ||||||||||||||||     ||||  |||||||    
T  16013202 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacggaaccaaattagaaatgacaacattagagagagagtgagctggggtgacacctat 16013301  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||| ||||  ||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  16013302 agtacaaaaaatggtagaaactagacttaggtgatttgggcatgtagtgagaagac 16013357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 226 - 372
Target Start/End: Original strand, 34745882 - 34746028
Alignment:
Q  226 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttga 325  Q
    |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| || || | |||||||||||   ||| ||||||||||||||||| ||||| |||  |||||    
T  34745882 agacctagaaaaaccataagagaaactattaggaaggatctaaagataaatgagttggagaaaaacatggtttttgatagaacgctatggcgttgtttga 34745981  T
Q  326 tccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    | ||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  34745982 ttcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 34746028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 1740715 - 1740909
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt----agagagagagtgtgggtagcacctat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    | || |||||| ||||| | ||||    ||||||||||| ||||||||| |||     
T  1740715 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtagtaagactaggtggggtaagattagaaatgagaacattagagagagagagagtttgggtagcatctac 1740814  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 199  Q
    |||||||||  |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| | || |||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  1740815 agtagaaaatatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtatgtagataggagaattgtggattttgtagtaaggagagtagatcagatggagg 1740909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 1531587 - 1531420
Alignment:
Q  147 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 246  Q
    ||||||||||||||   |||||| ||| ||| ||| ||| ||||| ||  ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||  |||||||| ||     
T  1531587 tgtagagagaagacctctagatgttgtagtacgaatagtagatcagataaaggagagccagatcaaaagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagc 1531488  T
Q  247 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
     |||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  1531487 aaaattattaggaaaaatttagaggttaatgagttggacccaaatatggtttgggatagaacattatg 1531420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21517529 - 21517426
Alignment:
Q  224 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcattt 323  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| |||| |||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||||    
T  21517529 gaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaatatttagagattaataagttggatccaaatatgatttatgatataacattatgacgtaattt 21517430  T
Q  324 gatc 327  Q
    ||||    
T  21517429 gatc 21517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 224 - 375
Target Start/End: Original strand, 37976368 - 37976519
Alignment:
Q  224 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcattt 323  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| | ||  || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |   |||     
T  37976368 gaagacctagaaaaactataagtgaaactaatatgaaagatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggctaaatta 37976467  T
Q  324 gatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    ||||||||| ||| |  || | |||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  37976468 gatccatgtagccaaccccgcttagcaagataaggtttggttgttgttgtat 37976519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 163
Target Start/End: Original strand, 38920795 - 38920866
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactag 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38920795 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagagagatgactag 38920866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 48202949 - 48202766
Alignment:
Q  126 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagagga 225  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||| | |  | ||| ||||||    
T  48202949 taggcttaggtggtttgcgcatgtagagagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagatcatatggtggatagtcaaatcattataggcagagga 48202850  T
Q  226 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    || ||||| |||||||| ||||| |   |||  || | | ||||| | ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||    
T  48202849 aggcctagaaaaactataagagagatcgttaagaaagttgtagagtttaatgagttggattgaaatatggtttatgttagaaca 48202766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 114 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6420749 - 6420615
Alignment:
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||| | || |||||  | |      
T  6420749 gttggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtagatactgtagtaaggagagtagatcagatgaatgatagtcagatcact 6420650  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 248  Q
    ||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  6420649 agaggcagaggtagacctataaaaactataagaga 6420615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 372
Target Start/End: Original strand, 14057625 - 14057759
Alignment:
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccg 337  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||     
T  14057625 actataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagcca 14057724  T
Q  338 attccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |  |||| |||   |||||||||| ||||||||||    
T  14057725 accccacttagtaggataaggcttagttgttgttg 14057759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 238 - 372
Target Start/End: Original strand, 14367653 - 14367787
Alignment:
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccg 337  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||     
T  14367653 actataagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgcgttcgattcaaatatggtttatgatagaacattatggggtaatttgatccatgtagcca 14367752  T
Q  338 attccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |  |||| |||   |||||||||| ||||||||||    
T  14367753 accccacttagtaggataaggcttagttgttgttg 14367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19119608 - 19119459
Alignment:
Q  188 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 287  Q
    |||| ||||||||||||||| | |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |  | |||| ||||| |||||||||| ||       
T  19119608 atcagatggaggagagtcaaatcactagaggtagtggaagacctag-aaaactattagagaaactatcaagatggatctagagatcaatgagtttgagaa 19119510  T
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    | | |||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  19119509 agacatggcttttgatacaacactatgacgtcgtttgattcatgtagccga 19119459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 31869180 - 31869102
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31869180 gtttttgatagaacactctggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31869102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 235 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 36239934 - 36239837
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  |||||||| | || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  36239934 aaaactataagagaaactattaggaaaaatttagagattaacgagttggatccaaatatgctttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgt 36239837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 55 - 160
Target Start/End: Original strand, 41948480 - 41948585
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||  | ||||||| || | |||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41948480 gatacgattagaaatgacaacattagagtgagagttggcgtagcacttacaatagaaaagatggtggaaactaggcttaagtggtttgggcatgtagaga 41948579  T
Q  155 gaagac 160  Q
    ||||||    
T  41948580 gaagac 41948585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 221 - 373
Target Start/End: Original strand, 42187572 - 42187723
Alignment:
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact-atgacgtc 319  Q
    ||||||||||||  |||| ||| |||||||| ||||| ||  |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||| |||     
T  42187572 gaggaagacctaa-aaaattataagagaaactattaggaaatatttagagattaattagttggatccaaat-tggtttatgatagaacatttatggcgta 42187669  T
Q  320 atttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||| |||||||||||    
T  42187670 atttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctttgttgttgttgt 42187723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 338
Target Start/End: Original strand, 44951274 - 44951402
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||  |||||||  ||||| | |||||| | || ||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  44951274 aaaagaggtagaggaagatctaggaaaattacaaagagaaacctttagaaaatatttaaaagtcaattacttagattcaaatattatttatgatagaaca 44951373  T
Q  310 ctatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  44951374 ctatgacgtaatttgatccatgtagccga 44951402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 92 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28562647 - 28562440
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||| || ||||| |||||   || |||||||| ||||| |||| || ||||  |||||||||||  | ||||  ||| ||||||||| | |||||    
T  28562647 gggtagcatctctagtaaaaaagaatgtggaaaatagacttaggtggtatgcgcatacagagagaagacatgcagattttgtagtaagaagattagatca 28562548  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
     || ||| | ||| |  ||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||| | || ||||||||||| |||    
T  28562547 gatagagaatagttagattacaagaggtagaggatgacctagaaaaaatataagagaaactattatgaaagatttagagattaacgagttggatcctaat 28562448  T
Q  292 atggtttt 299  Q
    ||||||||    
T  28562447 atggtttt 28562440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 145 - 332
Target Start/End: Original strand, 33139208 - 33139395
Alignment:
Q  145 catgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatta 244  Q
    ||||||||||||||||  | |||||| || ||||||| |||  | || |||||| ||||| |||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||| |  |    
T  33139208 catgtagagagaagacccgcagatgccgttgtaagaaaagtataacagatggagaagagttaagtcaaaagagatagagtaagacataggaaaaccacaa 33139307  T
Q  245 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||||||| ||| ||| ||||| ||||| |||||  || |  ||||||| |||| ||||| | || ||||| || |||||||||||||    
T  33139308 gagaaacacttaaaaatgatttcgaggttaatgaactgaagtcaaatatagtttatgatacaccattatgatgtaatttgatccatgt 33139395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 266 - 373
Target Start/End: Original strand, 47652722 - 47652829
Alignment:
Q  266 tagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggtt 365  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| | ||||||| ||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||    
T  47652722 tagaggttaataagtttgatccaaatatggtttcggatagaacattatggcgtaacttgatccctgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 47652821  T
Q  366 gttgttgt 373  Q
    ||||||||    
T  47652822 gttgttgt 47652829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 18605427 - 18605237
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18605427 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18605328  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18605327 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaactacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18605237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 190
Target Start/End: Original strand, 35713696 - 35713794
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 190  Q
    |||||| || |||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||| ||||| ||||| ||||    
T  35713696 gggtaggacatatagttgaaaaaatggtggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacttgtacattttgtagtaaggagagtagatc 35713794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Original strand, 40830146 - 40830292
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||  || ||| | |||||||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||    |||||||||||||| | |    
T  40830146 agcagagataaggatgttgtgttgaatg--tgctaaaagtagacatgatagaattagaaatgacaatattagaaagagt---tgggtagcacctattgaa 40830240  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||| ||||||||| |   ||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  40830241 gaaaagatggtagaaactctacttaggtggtttgggcatgaagagagaagac 40830292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 370
Target Start/End: Original strand, 47852265 - 47852366
Alignment:
Q  269 aggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgtt 368  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| | | |||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  47852265 aggttaatgagttggatccaaatgtggtgtatcatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagggggataaggcttggctgtt 47852364  T
Q  369 gt 370  Q
    ||    
T  47852365 gt 47852366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 40139279 - 40139124
Alignment:
Q  10 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag 109  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| || |||| ||||||||||||     ||||  ||||||||||||    
T  40139279 gcagagacgaggatgttgtgtgggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaaagacaacattagagagagtc---gggtttcacctatagtag 40139183  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    ||||  |||| |||| | ||||||| || | ||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  40139182 aaaatatggtggaaactgggcttaggtgatctgggcatgtagggagaagatttgtagat 40139124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 157
Target Start/End: Original strand, 45558352 - 45558428
Alignment:
Q  81 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  45558352 agagagagttggggtaccacctatagtagaaaagttggtagaaactcgacttaggtggtttgtgcacgtagagagaa 45558428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 160
Target Start/End: Original strand, 7220750 - 7220813
Alignment:
Q  97 gcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||| ||||||||| || |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7220750 gcacctattgtagaaaagatgatagaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 7220813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 8519157 - 8519042
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| | | |||||||| ||||  |  |  |||| ||| |||||||||||     
T  8519157 gatttagaggttaacgagttggatccatatatggtttatgatagaaaactatggcataatttgatcaatgtaactaaccccacttagtgagataaggctc 8519058  T
Q  362 ggttgttgttgtattt 377  Q
    | ||||||||||||||    
T  8519057 gattgttgttgtattt 8519042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 300 - 371
Target Start/End: Original strand, 24777170 - 24777241
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | || ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  24777170 tgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgatcctacttagtgggataaagcttggttgttgtt 24777241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40149150 - 40149016
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtgg 334  Q
    |||||||| |||||||| | ||| || || || |||  |||||||||||| | |||||||||| | ||||||||| |||| ||  |||||||| |||| |    
T  40149150 aaaactataagagaaactactaggaaagacttggagagcaatgagttggaccaaaatatggttat-gatagaacattatggcgcaatttgatctatgtag 40149052  T
Q  335 ccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  40149051 ccgaatccacttagtgggataaggcttggttgttgt 40149016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 44401284 - 44401168
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| ||| |||||||| ||||  || ||||||||| | || |||||  ||| ||||||| ||| |||||||||| |||    
T  44401284 agaggtggaggatgacctagaaaaattataagagaaactattaagaaagatttagagattaacgagtt--atcaaaatatgttttatgatagaacattat 44401187  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  44401186 gacgtaatttgatccatgt 44401168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 47796473 - 47796359
Alignment:
Q  38 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg--tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga 135  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||  |||||| |||||| || ||  || || |||||||||||||| |||| |||||||||| |||     
T  47796473 gtggtaagactagatgggataggattagaaatgacaatattagatagagagagttggagtaccaactatagtagaaaaggtggttgaaaataggcgtagg 47796374  T
Q  136 tggtttgggcatgta 150  Q
    |||||||||||||||    
T  47796373 tggtttgggcatgta 47796359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 88
Target Start/End: Original strand, 1523747 - 1523813
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||| |||||||  |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  1523747 atgttgcgttgcatgagtgacaagactagacgtgataggattattaatgacaccattagagagagag 1523813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 282
Target Start/End: Original strand, 18637563 - 18637753
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18637563 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18637662  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18637663 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaaatacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18637753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 282
Target Start/End: Original strand, 18650997 - 18651187
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  18650997 gggtagcacctatattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattatatagttaggagattagatca 18651096  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||  || |||||||| |||| ||  |||||||| ||||  |||||||||||  | |||||||||    
T  18651097 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtatgggtagacctagaaaaaatacaagagaaactattatgaaggatttagaaataaatgagttg 18651187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24177721 - 24177628
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |  |||| |||   ||||| |||||||||||||||    
T  24177721 agttgggtccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtca-ttgatccatgtagccaaccccacttagtaggataaagcttggttgttgttg 24177628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 375
Target Start/End: Original strand, 33732017 - 33732116
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||| |   ||||||||||||| |||| | |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  33732017 aatgagtgagatcgaaatatggtttatgatagaacattatggca--atttgatccatgtagccggtcccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 33732114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 263 - 361
Target Start/End: Original strand, 42969870 - 42969968
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    | ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||    
T  42969870 atttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgattgaacattatcgtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 42969968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 330
Target Start/End: Original strand, 35922407 - 35922492
Alignment:
Q  245 gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccat 330  Q
    ||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  35922407 gagaaactattaagaaagatttagaggttaatgagttgaatctaaatatgatttatgatagaacattatgacctaatttgatccat 35922492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 206
Target Start/End: Original strand, 5418071 - 5418195
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggc-ttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaa 181  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||  || ||| |||| ||||| |    
T  5418071 agagagttggggtagcacctcttgtagaaaatatggtggaaaataggctttagattgtttgtgcatgtagaaagaagacctgttgattctgtagtaagta 5418170  T
Q  182 gagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    |||| |||||  ||||||| |||||    
T  5418171 gagtagatcaggtggaggatagtca 5418195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 24550051 - 24549906
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |  ||| |||||| ||||| | |||||||| ||||     |||| ||||||||       
T  24550051 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgttgtaagactagatagaatatgattagaaatgataacattagagtgagatctatggtatcacctata--- 24549955  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
       ||| || | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24549954 ---aagatgatggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 24549906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27022063 - 27021991
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  27022063 atgagaatgttgcattggatgtgtgataagactagacaggataggattaaaaatgacaacattagagagagag 27021991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 262 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27893674 - 27893563
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    ||||||||| | |||||| |||| | ||||||| ||| |||||||||| |||| | | ||||||| ||||| |||||  | || ||| | ||||||||||    
T  27893674 gatttagagattaatgagctggaccgaaatatgttttatgatagaacattatggcataatttgattcatgtagccgaccctacttagtgcgataaggctt 27893575  T
Q  362 ggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||    
T  27893574 ggttgttgttgt 27893563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30814220 - 30814125
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||  ||||||||| ||||||||    
T  30814220 agttggatcgaaatatgttttatgatagaacattatcacgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaagaggcttggtagttgttgt 30814125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 45841332 - 45841206
Alignment:
Q  21 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggta 120  Q
    ||||||| |||| ||| |||||||| |||||   |||| | |||| ||||||| ||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||||||||  |||     
T  45841332 gatgttgtgttgaatgtgtggtaagcttagaagagatacggttagaaatgacaacattagatagagagt-tgagtaacacctataatagaaaagacggtg 45841234  T
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatg 148  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  45841233 gaaactaggtttagttggtttgggcatg 45841206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 223
Target Start/End: Original strand, 26925264 - 26925342
Alignment:
Q  145 catgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagag 223  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||| | || ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  26925264 catgcagagagaagactcgtagatgatgtagtaagaagagtagattagatagaggatagtcgaattaaaagaggtagag 26925342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 373
Target Start/End: Original strand, 28355322 - 28355448
Alignment:
Q  248 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt-ggccgattccacct 346  Q
    |||| ||||| || |||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||| |||| ||  |||||||||| || | | ||  |||| |    
T  28355322 aaactattaggaaagatttataggttaatgaggtggatcaaaatatggtttatgataaaacattatggcggaatttgatccacgtagtctgaccccactt 28355421  T
Q  347 agagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || | ||||||||||||||||||||||    
T  28355422 agtgggataaggcttggttgttgttgt 28355448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 199
Target Start/End: Original strand, 30144793 - 30144883
Alignment:
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 199  Q
    |||||| |||||||||   ||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  30144793 gaaaagatggtagaaatccggcttaggtagtttgggcaggtagagagaagacttgtagattctatagtacgaagagtagatcagatggagg 30144883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 332
Target Start/End: Original strand, 31859046 - 31859116
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  31859046 gatttagaagtcaatgagttggatccaaatttaatttataatagaacactatgacataatttgattcatgt 31859116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 380
Target Start/End: Original strand, 40415169 - 40415302
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga------ttccacct 346  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||  | | ||||||||||||| |||||      ||  || |    
T  40415169 attaggaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatgttttatgattgaaccctatagcttaatttgatccatgtagccgaccccacttatactt 40415268  T
Q  347 agagagataaggcttggttgttgttgtatttgtt 380  Q
    || | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40415269 agtgggataaggcttggttgttgttgtaattgtt 40415302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 373
Target Start/End: Original strand, 1523856 - 1523925
Alignment:
Q  304 agaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |   ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1523856 agaacactatgacgtaatttgattcatgtagccaacctcacttagggagataaggcttggttgttgttgt 1523925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 81 - 158
Target Start/End: Original strand, 30632958 - 30633035
Alignment:
Q  81 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 158  Q
    |||||||||  |||||||||||||  || ||||  |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30632958 agagagagtcggggtagcacctatcataaaaaaaatggtggaagctcggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 30633035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 299 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34029750 - 34029677
Alignment:
Q  299 ttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  34029750 ttgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccaccaagtgggataaggcttggttgttgttg 34029677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 198
Target Start/End: Original strand, 3457368 - 3457471
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    ||||||| |||||||||||||   || |||| |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||| ||||  ||||||||||| |    
T  3457368 gtagcacttatagtagaaaagactgt-gaaactaggtttaggtggtttgggcattcagagagaagacatgtagatgttgtagtaatgagagtggatcaga 3457466  T
Q  194 tggag 198  Q
    |||||    
T  3457467 tggag 3457471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 373
Target Start/End: Original strand, 25891086 - 25891170
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| | |||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||  |||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  25891086 aatatggtttataatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtacgataaggcttggttgttgttgt 25891170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 373
Target Start/End: Original strand, 31005431 - 31005487
Alignment:
Q  317 gtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31005431 gtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31005487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 373
Target Start/End: Original strand, 33103100 - 33103208
Alignment:
Q  265 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggt 364  Q
    |||||| | ||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| |||||  |||| |||   ||||||||||||     
T  33103100 ttagagattaatgagttgaatcggaatatggtttatgatagaacaccatagcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggc 33103199  T
Q  365 tgttgttgt 373  Q
    || ||||||    
T  33103200 tgatgttgt 33103208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34926618 - 34926538
Alignment:
Q  277 gagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataag 357  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||    
T  34926618 gagttggatcgaaatatggtttatgatagaacttaatggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagcgggataag 34926538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 373
Target Start/End: Original strand, 40630652 - 40630716
Alignment:
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  40630652 actatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 40630716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 332
Target Start/End: Original strand, 45558531 - 45558571
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  45558531 atggtttttgatagaacactatggcgtcatttgattcatgt 45558571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2882835 - 2882736
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||| || | || ||   ||| ||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  2882835 aatgagttggatcgaaacatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatctatttagctgacctcacttagtgagaaaaggcttggtggttgttgt 2882736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 9797956 - 9797909
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  9797956 gaaaattggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagat 9797909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20158756 - 20158669
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||| | || ||||||||||||| || ||  | || ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20158756 aaatattgtttaagatagaacactatcaagtaatttgatccatgtagctgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 20158669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27893828 - 27893769
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 152  Q
    |||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  27893828 ggtaacacctatagtagaatagatggtggaaaataggcttaggtggtttgaacatgtaga 27893769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30914749 - 30914674
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtaga 167  Q
    |||||| |||||| ||||||||  ||||||||| | ||||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  30914749 gggtagtacctattgtagaaaaaatggtagaaactcggctttggtggtttgggcatgtaacgagaagacttgtaga 30914674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 34341494 - 34341395
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| | |||| |||||  |||  ||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  34341494 aatgagttggattgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaccaatgtagccgaccccatttagtggaataaggcttgtttgttgttgt 34341395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 88
Target Start/End: Original strand, 35713617 - 35713676
Alignment:
Q  29 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||    
T  35713617 gttggatgtgtggtaaggttagatatgataggattagaaatgaaaatattagagagagag 35713676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 37439647 - 37439580
Alignment:
Q  67 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 134  Q
    ||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||    
T  37439647 aatgacaacattagagagagagttggagtagcacctatggtagaaaagatgatgtaaaataggcttag 37439580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 26332958 - 26332908
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||||    
T  26332958 aaatatggtttatgatagaatattatgacgtaatttgatccatgtagccga 26332908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 29653918 - 29653844
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagaga 83  Q
    |||||||||  || |||||||||||||| ||||||| | |||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  29653918 agcagagatacggctgttgcgttggatgtgtggtaacactagacgggatagaattagaaatgacatcattagaga 29653844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40008777 - 40008636
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggt-agcacctatagtagaa 111  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| ||||||| | ||||||  | || ||||| ||||||| ||||||||||||  || || | | |||||||   ||||    
T  40008777 gagatgaagatgttgcgtaggatgtgtggtaaaactagacaaaaaagaattagaaatgacaacattagagagag-ttggggataaacacctatcaaagaa 40008679  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||| |||| |||| | || |||| |||||||||||||||||||    
T  40008678 aagatggtggaaactcggattaggtggtttgggcatgtagaga 40008636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 291 - 373
Target Start/End: Original strand, 48515475 - 48515557
Alignment:
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||| ||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  48515475 tatgatttatgatagtacactatgacgtaatttgatccgtgtagccgaccccacttagtgggataagacttggtttttgttgt 48515557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6429225 - 6429156
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagtt-ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||  |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  6429225 gggtagcacctatagtagaaaaggcaggtgaaaaataggtttaggtggtttgggcatgccgagagaagac 6429156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Original strand, 14593953 - 14594034
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| | | || ||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14593953 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 14594034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Original strand, 16013476 - 16013557
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||| | | || ||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16013476 atggtttttgatagaacactacggtgtcgtataattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 16013557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 148
Target Start/End: Original strand, 23720829 - 23720898
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatg 148  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||  || | ||| ||||| |||||||||||||    
T  23720829 agagagagagttagggttgcacctatagtagaaaagatggcggagactagccttaggtggtttgggcatg 23720898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24549847 - 24549754
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    ||||||||| ||||||||   | |||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  24549847 agaggtagaagaagacctgaaagaactataagagaaactattaagaaagatctagagattaatgagttggattgaaatatggtatttgatagaa 24549754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 25731696 - 25731639
Alignment:
Q  30 ttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga 87  Q
    |||||||| |||||||| |||||  || ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  25731696 ttggatgaatggtaagactagacgagaaaggattaagaatgacacctttagagagaga 25731639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25826788 - 25826683
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||   ||| | | |||| ||||||||| ||||||||| | ||||| | ||||||| | |||| ||||    
T  25826788 gataggattagaaatgaaaacattagagagggagttgcggttgaaactattgtagaaaagatggtagaaactcggcttgggtggtttgcgaatgtggaga 25826689  T
Q  155 gaagac 160  Q
    ||||||    
T  25826688 gaagac 25826683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 289 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 36245340 - 36245259
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||||||| || | |||| |||| |||   ||||||||||| |||||||    
T  36245340 aatatggtatatgatagaacattatgacgtcgtttgatccacgtagtcgatcccacatagttggataaggcttgtttgttgt 36245259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 38921169 - 38921085
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt--ggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||  | ||||  |||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  38921169 atggtttttgatagaaggctatggcgtcatttgattcatgtaggaccgaccccacttagggggaaaaggcttggttgttgttgta 38921085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 42177328 - 42177255
Alignment:
Q  60 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctta 133  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  42177328 gattagaaatgacaatattagagagagagttgaggtatcacctatagtagaaaagatggtgaaaactaggctta 42177255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 327
Target Start/End: Original strand, 43281958 - 43282066
Alignment:
Q  218 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacg 317  Q
    |||||||| ||||||| |||||  | |||||||||||||   | ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||| |||| ||    
T  43281958 gtagaggatgacctagaaaaaccgtaagagaaacaattaagtaagatctagagattaatgagttggatcaaaatatggtttatgacaaaaca-tatggcg 43282056  T
Q  318 tcatttgatc 327  Q
    | ||||||||    
T  43282057 taatttgatc 43282066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 5577586 - 5577546
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||    
T  5577586 aatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatg 5577546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 181 - 373
Target Start/End: Original strand, 7220846 - 7221038
Alignment:
Q  181 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 280  Q
    ||||| ||| | |||||||| |||||| |||  ||||| |||| ||||||||  ||||| || || ||||  ||||  || ||||||||| | |||| ||    
T  7220846 agagtagattagatggaggatagtcaaattactagaggcagagtaagacctataaaaaccataagtgaaattattaacaaagatttagagattaatgtgt 7220945  T
Q  281 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||  | ||||  | | |||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| |  |||| ||| |   ||||||||||||||||||||    
T  7220946 tggataaagatataatatgtgatagaaaattatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtggtgtaaggcttggttgttgttgt 7221038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 338
Target Start/End: Original strand, 22174123 - 22174247
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||| || |  || ||| ||||| | ||||| || |||  ||||||||| | |||||||||| |||    
T  22174123 agaggcagaggaaaacgtagaaaaactataagagaaactataaacaaagatctagagattaatgaattagatagaaatatggtatgtgatagaacattat 22174222  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    | |||  |||||||||||| |||||    
T  22174223 ggcgttgtttgatccatgtagccga 22174247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 185
Target Start/End: Original strand, 28858012 - 28858138
Alignment:
Q  57 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga 156  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||| || |||| |||||||| ||||||||  ||||||||| |    |||| ||||||||||||||||| |||    
T  28858012 taggattagaaatgacaacattagtgagaga-tg-gggtggcacctattgtagaaaacatggtagaaactcaagttaggtggtttgggcatgtagaaaga 28858109  T
Q  157 agactagtagatgctgtggtaagaagagt 185  Q
     |||  || ||| || | |||||||||||    
T  28858110 tgacctgtggattctatagtaagaagagt 28858138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 224 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 38103762 - 38103616
Alignment:
Q  224 gaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcattt 323  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | | |||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||  || ||||    
T  38103762 gaaggcctagaaaaactataagagagactattaggaaatactaagagattaatgagttggatccaaatattgtttatgata-aacattatggtgtaattt 38103664  T
Q  324 gatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||| ||| |||||  |||  ||| | |||||| ||||||||||||||    
T  38103663 gatcc-tgtagccgaccccagttagtgggataagacttggttgttgttg 38103616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 133)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 36545065 - 36545431
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatag 106  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||    
T  36545065 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtaacacctatag 36545164  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36545165 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggatagtca 36545264  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataga 306  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  36545265 agttaaaagacgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgataga 36545364  T
Q  307 acactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  36545365 acactatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 36545431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 36565605 - 36565241
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36565605 agcagagatgaggatgatgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 36565506  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  36565505 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaatacccgtagatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaag 36565406  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  36565405 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 36565306  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  36565305 actatggcgttatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctcggttgttgttgt 36565241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 9 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 36395314 - 36394949
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36395314 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 36395215  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36395214 gaaaagttggtagaaaataggctttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggaaagtcaa 36395115  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  36395114 gttaaaagaggtataggaagacctaggaaaactatttgagaaaccgttagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatttggtgtatgatagaa 36395015  T
Q  308 cactatgacgtca-tttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||   | || |||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||| ||||||||||    
T  36395014 cactattgtggcattttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgttg 36394949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 40813240 - 40813606
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatag 106  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  40813240 agcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacataataggattaagaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatag 40813339  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40813340 tagaaaagttggtagaaaataggtttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtca 40813439  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataga 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  40813440 agttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttggtgtgtgataga 40813539  T
Q  307 acactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||| |  |||| ||| | |||||  ||| |||||||||||    
T  40813540 acactatgacatcatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggataaaacttcgttgttgttgt 40813606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 57 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11524040 - 11523723
Alignment:
Q  57 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagag 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11524040 taggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagttaataggctttagatggtttgggcatgtagagag 11523941  T
Q  156 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 255  Q
    |||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11523940 aagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 11523841  T
Q  256 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagata 355  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||    
T  11523840 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 11523741  T
Q  356 aggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11523740 aggcttggttgttgttgt 11523723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 9 - 325
Target Start/End: Original strand, 39946775 - 39947091
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  39946775 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattatagaaagagtgggggtagcacctatagta 39946874  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  39946875 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagaaagaagacctgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagactcaag 39946974  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  39946975 ttagaagaggtagaggacgacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttgaatccaaatttggtttatgatagaac 39947074  T
Q  309 actatgacgtcatttga 325  Q
     ||||| ||||||||||    
T  39947075 gctatggcgtcatttga 39947091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42854364 - 42854004
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |    
T  42854364 gagatgacgatgttgcgctggataagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccatcagagagagagtgggggtaacacctatagcagaga 42854265  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  42854264 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 42854165  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42854164 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatataacacta 42854065  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || ||||||||||||||||| |||||  |||  ||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  42854064 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccatttagtgggataaggtttggtggttgttgt 42854004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 9 - 332
Target Start/End: Original strand, 2796473 - 2796794
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagatta--gacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatag 106  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  2796473 agcaaagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagactatagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcgcctatag 2796572  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||  | |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  2796573 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaga---ct-gtagatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaggagagtca 2796668  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataga 306  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||    
T  2796669 tgttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaattagttgaactcaaatttggtttttgataga 2796768  T
Q  307 acactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||| |||| ||| ||||||| |||||    
T  2796769 acagtatggcgtaatttgattcatgt 2796794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 93 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12491418 - 12491141
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12491418 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaa 12491319  T
Q  193 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaata 292  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12491318 atgaaggagagtcaagttaaaagaggtagatgaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatt 12491219  T
Q  293 tggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||| ||||||||    
T  12491218 tggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttagttgttgt 12491141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Original strand, 18125097 - 18125395
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  18125097 gagatgagcatgttgcgctggatgagtgacaagacgagacatgataggattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaa 18125194  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||| |    
T  18125195 agttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaatagtagatcaaatggaggagagtcgggtt-a 18125293  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  18125294 aagaggtagagggagacctagaaaaactattagagaaaccattagaaaagatttaaaagtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaatacta 18125393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 38 - 373
Target Start/End: Original strand, 21121105 - 21121427
Alignment:
Q  38 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 137  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||            |||| |||||||    
T  21121105 gtggtaagactagacgggataggattagaaatggcaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtacaaaa------------taggtttagatg 21121192  T
Q  138 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  21121193 gtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggacgagagttaggttaaaagaggtagagggagacctaagaaa 21121292  T
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccg 337  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  21121293 tctattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatcctaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgat-catgtagccg 21121391  T
Q  338 attccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |  |||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  21121392 accccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttgt 21121427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 63 - 370
Target Start/End: Original strand, 8932676 - 8932982
Alignment:
Q  63 taggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacta 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||       
T  8932676 taggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacatacagtagaaaagttggtagaaaatagatttagatggtttggacatgtagaaagaagatcc 8932773  T
Q  163 gt-agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaag 261  Q
    || | ||||  | |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||     
T  8932774 gttaaatgccattgtaagaagagtaaatcaaatggaagagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaa 8932873  T
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| ||| || |||| ||||    
T  8932874 gatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggcttttgataaaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgaaataaagctt 8932973  T
Q  362 ggttgttgt 370  Q
    |||||||||    
T  8932974 ggttgttgt 8932982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Original strand, 45419161 - 45419518
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  45419161 gagatgaagatgttgcgttggattagtggtaagactagaagggataagattaggaatgacaccattagagaga-attg-gggtagcacctatagtagaaa 45419258  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||  | ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |       
T  45419259 agatggtataaaatagacttaggtggtttgggcatgtagagataagacctgtagaggc--tagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcagatctg 45419356  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||| |    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  45419357 aagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaaggtttaaatcataatgagtttgatccaaatttggtttatgatagaacatta 45419456  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    ||  || ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  45419457 tggtgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 45419518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 165 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42469935 - 42469727
Alignment:
Q  165 agatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggat 264  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||    
T  42469935 agatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagat 42469836  T
Q  265 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggt 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||| ||  | |||||||||||||    
T  42469835 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttattgggataaggcttggt 42469736  T
Q  365 tgttgttgt 373  Q
    |||||||||    
T  42469735 tgttgttgt 42469727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8879800 - 8879446
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||| |||||||  | ||| |||||||||| | |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  8879800 gagatgagaatgttgcacttgataagtggtaagactggactagataggattaggaatgacacaattagagagagaatgggggaagcacctatagtagaaa 8879701  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  |    ||| || ||||||||||| ||||| ||||||||| |||  ||  |    
T  8879700 agttggtagaaaatagacttagatgatttgggtatgtagagagaagacccg----tgccgtcgtaagaagagttgatcagatggaggagggtcgggtcca 8879605  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||      
T  8879604 aagagcttgagggagacgtaggaaaactataagagaaaccattaaaaatgatttagaagtcaataagttgaatccaaatatggtttatgatataacac-- 8879507  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||    ||||| ||||||||||||||||    
T  8879506 tgacgtaatttaatccatgtagccgactccacttattaggataaagcttggttgttgttgt 8879446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 292
Target Start/End: Original strand, 37077687 - 37077952
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||            |||    
T  37077687 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaaaactagacgagataggattaggaatgacaccattcggaagagagtgagggtag------------aaa 37077774  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||    
T  37077775 agttggtagaaaatagacttagatggtttgggcatgtagagag--gacccatagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcgggtcaa 37077872  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaata 292  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37077873 aataggtagatgaagacctaggaaaattataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaata 37077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 374
Target Start/End: Original strand, 29520583 - 29520932
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa- 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||     
T  29520583 agatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgggataggattagaaatgataccattagagagagagttggggtggcatctatagtagaaat 29520682  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |  |||| ||||           |||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| | |     
T  29520683 aaatggtggaaa-----------tggtttgggcatgtagagagaagacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcac 29520771  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  29520772 aagaggtagaggaag-cctagaaaaactataagagaaactgttaggaacgatttagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacatta 29520870  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    || ||| ||||||||||||| ||| |  |||  ||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  29520871 tggcgtaatttgatccatgtagcccaccccatttagtgggataatgcttggttgttgttgta 29520932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26905168 - 26904950
Alignment:
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||  || |||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |     
T  26905168 aaagttggtagaaaataggcttagatgatttagatatgtagagagaaaactcatacatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaagagagtcagata 26905069  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||| |||||    
T  26905068 aaaagaggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaagatttagaggtcaataagttgga-ccaaatatagtttataataaaacac 26904970  T
Q  311 tatgacgtcatttgatccat 330  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  26904969 tatgtcgtaatttgatccat 26904950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 373
Target Start/End: Original strand, 2027631 - 2027812
Alignment:
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||    
T  2027631 aatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttatattcaaat 2027730  T
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga-ttccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |   |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2027731 atggtttatgatagaacactatgacgccatttgatcc-tgtagccaacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 2027812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18752233 - 18751998
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18752233 gagatgagaatgttgcgctgaatgagtgttaagactagacataataggattagggatgacaccattagag--agagtgggggtagcacctatagtagaaa 18752136  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||    ||||||| || || | ||||||||||||||||||  | ||| |  ||||    
T  18752135 agttggtagaaaata-gcttagatggtttggacatgtagagagaggatccatagatgccgttgttaaaagagtggatcaaatggaaaatagttagattaa 18752037  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac 251  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||| ||||| |||||    
T  18752036 aagaggtagaggaatacctaaaaaaaccattagcgaaac 18751998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 314
Target Start/End: Original strand, 32043522 - 32043813
Alignment:
Q  23 tgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtaga 122  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  32043522 tgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgacaacattagagagagagttggggtatcacctatagtacaaaagatggtaga 32043621  T
Q  123 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 222  Q
    || ||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| ||||| ||| | ||||| ||||||| | ||||| | |  ||||||||     
T  32043622 aactagactttggtggtttggccatgtagagagaagacctgtggatgttgtagtaaggagaatagatcagatggaggggtgtcaaatcactagaggtagg 32043721  T
Q  223 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| || |  |||||| || || |||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||    
T  32043722 ggaagacctaaaaaaactattagagaaactatcaagaaggatctaaagatcaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatg 32043813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 218 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14742234 - 14742082
Alignment:
Q  218 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacg 317  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||    
T  14742234 gtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaagtcaatgagttggatccaaata---tttttgatagaacactatggcg 14742138  T
Q  318 tcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14742137 tcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 14742082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43904947 - 43904700
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag---gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 190  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||    |||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||||| | ||||    
T  43904947 gtagcatctatagtagaaaagatggaggaaaataataagcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagatgttgtagtaagaagaatagatc 43904848  T
Q  191 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaa 290  Q
    | |||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||  |||  |  ||||||||| | ||||||||||||| |||    
T  43904847 agatggaggatagtcaaattacaagaggtacaggaagacctagaaatactataagagaaacggttatgagagatttagagattaatgagttggatctaaa 43904748  T
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    |||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  43904747 tatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 43904700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39953628 - 39953264
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||| |   |||||||||||||||  || |||||||||||  |    
T  39953628 agcagagatgagaatgttgcgttggatgtgtggtaagattaaacatgatataattagaaataatgacattagagagagagttgggatagcacctatatga 39953529  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||||||| |||  |||| |||||| |||||||||||||  |||   | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||| ||| || |||      
T  39953528 gaaaagatggtagaaactagatttaggtggtttaggcatgtagagaggtgacctatggattatgtagtaaggagagtagatcagatgaaggcgaatcaga 39953429  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    | |  |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||| ||   ||| |||||||||||| | ||    
T  39953428 tcactagaggtaggggtagacctaggaaaactaaaagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttagagaaaaacatggtttttgatgggac 39953329  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||  ||  |||||| ||||| |||||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  39953328 actatggagttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 39953264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 10080264 - 10079971
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||    
T  10080264 agatgatgatgttgcgttgggtgtttggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagagagttgaggtagcatcta-agtagaaaa 10080166  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
    | |||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |  |||  ||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| | |      
T  10080165 gatggtggaaactaggcct-gatggtttgggcatgtagagagaagacctgaggattttgtagtaaggagagtagatcaaatgaaggggagtcaaatcact 10080067  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||||  |||  || ||| ||||| | ||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||    
T  10080066 agaggtagaggaagacctagagaaactataagaaaaactgttaagaaagatctagagattaatgagttggatagaaatatgatatttgatagaaca 10079971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 241 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25473535 - 25473403
Alignment:
Q  241 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgatt 340  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||      
T  25473535 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagtttgatccaaatttggtgtatgatagaacactatagcgtcatttgatccatgtagccgacc 25473436  T
Q  341 ccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25473435 ccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25473403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 332
Target Start/End: Original strand, 30559718 - 30559934
Alignment:
Q  116 tggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaag 215  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||  ||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||   | |  ||    
T  30559718 tggtcgaaaataggcttaggtggtttgggcatttagagagaagacatgtagattttgtagtaaggacagtggatcagatggaggatagtcggatcactag 30559817  T
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatga 315  Q
    || |||| |||||| ||  |||||||| |||||||| || || || ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  30559818 agatagatgaagacttaaaaaaactataagagaaactatcaggaaagatttagagattaatgagttggatccatatatggtttatgatagaacattatga 30559917  T
Q  316 cgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||| |||||||||||||    
T  30559918 cgtaatttgatccatgt 30559934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 253 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15215532 - 15215412
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagag 352  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||| |||   |    
T  15215532 attagaaaagatttagagatcaatgagtttgatccaaatatggtttttaatagaacactatgacgtcatatgatccatgtagccgaccccacttagtagg 15215433  T
Q  353 ataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15215432 ataaggcttggttgttgttgt 15215412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 262 - 374
Target Start/End: Original strand, 44529396 - 44529508
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||    
T  44529396 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 44529495  T
Q  362 ggttgttgttgta 374  Q
    |||||||||||||    
T  44529496 ggttgttgttgta 44529508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 45512856 - 45512558
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||| | | |||| |||| ||||| |  |||| |||||| | ||  |||||||||||||||||||    
T  45512856 gagatgagaatgtttcgttggatgtgtggtaagactagatagg-tagggttagaaatgaaaatattaaagagagggagttggggtagcacctatagtaga 45512758  T
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 210  Q
    |||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    ||||| | || ||||| ||||| ||| | ||||  || |||||| |     
T  45512757 aaagatgatggaaaataagcttagatggtttgggcatataaagagaagatctctagattcggtagtaagcagagtagattagatggcagatagtcaaatc 45512658  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || ||| | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  45512657 actagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttggagattaatgagttcgatccaaaatatggtttatgatagaaca 45512558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 332
Target Start/End: Original strand, 12025847 - 12026021
Alignment:
Q  149 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 248  Q
    |||||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||| |    
T  12025847 tagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatagagaagagtcaggttaaaagaggtaaatgaagacctaagaaaaccattagaaa 12025946  T
Q  249 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatga---cgtcatttgatccatgt 332  Q
    |            ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12025947 a------------gatttagaggtcaataagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcgtcatttgatccatgt 12026021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13172011 - 13171865
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| || |||||| |||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  13172011 cagagatgagaatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggataggattagaaatgacaagattagagagagagttggggaagcacctatagtaga 13171912  T
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||    
T  13171911 aaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatataaagagaa 13171865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 344
Target Start/End: Original strand, 29700268 - 29700529
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 182  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| | | ||| |||| ||||| ||    
T  29700268 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggaggaaagttggcttaggtggtttgggcatatagagaaaagaccattggattctgtagtaaggag 29700367  T
Q  183 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
    ||| ||| | |||||||| |||||  | |  |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| | ||| || || || ||| | ||||||| |    
T  29700368 agtagattagatggaggatagtcatatcactagaggtagaggaagacctagaaaaactaaaagagaaactaataggaaagacttggagataaatgagtcg 29700467  T
Q  283 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccac 344  Q
    || | |||| | |||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||||| |||||    
T  29700468 gaccaaaattttgtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgactccac 29700529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Original strand, 30748377 - 30748560
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||| ||| |||||  |||||    
T  30748377 agcagatatgaggatgtttcgttggatgtgtggttagattagacatgataggattagaaatgacaacattacagagag-ttgt-ggtcgcaccagtagta 30748474  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaat 194  Q
    |||||| |||| |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || | ||||| | ||| ||||||||    
T  30748475 gaaaagatggtggaatcaaggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtagattctatagtaagcaaagtagatcaaat 30748560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 6510784 - 6510616
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    ||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| | |  ||||||||||| ||||||||    
T  6510784 gatgatgatgttgtgttggataagtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaccattgaagagagagagcg--tagcacctataatagaaaag 6510687  T
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagt 185  Q
    ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| || |||||||||||    
T  6510686 ttggtagaaaacaaatttagatggtttgggcatgtagagagaagatctgtagatgccgtcgtaagaagagt 6510616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 191
Target Start/End: Original strand, 7046285 - 7046434
Alignment:
Q  42 taagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggttt 141  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||| |||| |||  | ||||||| ||||||    
T  7046285 taagactagacatgataggattagaaatgacaacattagagagagaggctgggtagcaccaatcgtagaaaagatggtggaacctcggcttagctggttt 7046384  T
Q  142 gggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| | |||| ||||| ||||| |||||    
T  7046385 gggcatgtagagagaaaacacgtagcttctgtagtaaggagagtagatca 7046434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 239 - 372
Target Start/End: Original strand, 25288912 - 25289045
Alignment:
Q  239 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| | |||||||| || | || ||    
T  25288912 ctataagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataactctatgacataatttgatctatttagctga 25289011  T
Q  339 ttccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
      |||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  25289012 ccccacctagtggtataaggcttggttgttgttg 25289045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 239 - 372
Target Start/End: Original strand, 25300247 - 25300380
Alignment:
Q  239 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||| |||| || ||    
T  25300247 ctataagagaaacctttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatataacactatgacataatttgatctatgtagctga 25300346  T
Q  339 ttccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
      |||||||| |  | |||||||||| |||||||    
T  25300347 ccccacctagtggaacaaggcttggtggttgttg 25300380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 264 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 44047641 - 44047532
Alignment:
Q  264 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttgg 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  44047641 tttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttgg 44047542  T
Q  364 ttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||    
T  44047541 ttgttgttgt 44047532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 12492206 - 12492130
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 85  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12492206 agcagatatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattatgaatgacaccattagagaga 12492130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 122 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 9905132 - 9904941
Alignment:
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtag 221  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| || | | |||||   | ||||||||||| | |||||||||||    
T  9905132 aaaataggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacttgtagatgttgtagtaaaaaaa-tagatcacgggaaggagagtcaaatcaaaagaggtag 9905034  T
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    | |||||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||||||||  | ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||    
T  9905033 atgaagacctagaaaaactacaagagaaactattaataaagatttagaaattaatgatttggatcaaaataaggtttatgataaaacattatg 9904941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 220 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 35914754 - 35914599
Alignment:
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtc 319  Q
    |||||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || || ||  || | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| |||     
T  35914754 agaggaagacatagaaaaactataagagaaactattaggaaagacttgaagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgta 35914655  T
Q  320 atttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    ||||||||||||| || ||  |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35914654 atttgatccatgtagctgaccccacttagtgagataagacttggttgttgttgtat 35914599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 16917102 - 16917462
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |  ||||||||| | | |  ||||||||||  ||||||| |||||| || | |||  |||||| ||| | ||||    
T  16917102 agcagagatgagaatgttgcgttgactttgtggtaagactcggctggataggattaaaaatgacaacattagtgataaagttggggtagtaccgaaagta 16917201  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||     
T  16917202 gaaaagatggtgcaaactaggcttaggtggtttgggcatgtaaagagaaggcttgtagat-ttgtagtaaggagagtagatcagattgaggatagtcaaa 16917300  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    | |  | ||||||| |||||||||| ||| ||||  | ||||| || |   | ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  16917301 tcactacaggtagaagaagacctagaaaagctataggtgaaactatcaaggaagatttagagattaatgagttggatagaaatatggtatatgatagaac 16917400  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    | | ||||  | |||||||||||| ||||   |||| ||| | |||||| ||||||| |||||    
T  16917401 a-tttgactgcttttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataagacttggttattgtt 16917462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 100 - 369
Target Start/End: Original strand, 32930970 - 32931238
Alignment:
Q  100 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga-ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 198  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||| || ||||| |||||||| |||| | ||| ||||| |||| ||||| ||| | ||||| ||||||    
T  32930970 cctatagtagaaaaggtggcagaaaacatgcttaggtgatttggacatgtagaaagaaaatcta-tagattctgtagtaaggagactagatcagatggag 32931068  T
Q  199 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggttt 298  Q
    || |||||  | |  ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||||||||| | ||||||||| |    
T  32931069 gatagtcatatcactagaggcagaggaagacctaaaaaaactatcagagaaactattaggaaagattttgaaattaatgagttgga-cgaaatatggtgt 32931167  T
Q  299 ttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttg 369  Q
     |||||||||| |||| | | ||||||||||||| |||||  |||| ||| | || ||| |||||||||||    
T  32931168 atgatagaacattatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggaaaagccttggttgttg 32931238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 367
Target Start/End: Original strand, 16351312 - 16351653
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||   ||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  16351312 gagatgaagatgttgcgttggatatgtggtaagactagacggaatagagttagaaatgacaacattagagagagaattagggtagcacctatagtagaaa 16351411  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
                 ||| ||| | |||||| ||||||||||||||| |||  | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |     
T  16351412 c------------tagacttgggtggtttaggcatgtagagagaaaacttttggatcatgtagtaaggagagtagatcagatggaggggagtcaagtcac 16351499  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
      ||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||| ||   | | ||||||||| |||||||||||    
T  16351500 ttgagataggagaagacctagaaaaactattagagaaactattaagaaggatctagagattaatgagtt-gagaaagacatggtttttaatagaacacta 16351598  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgt 367  Q
    || | || |||||| ||||| | |||  |||| ||| |  |||||||||||||||    
T  16351599 tggcatcgtttgattcatgtagacgaccccacttagtggaataaggcttggttgt 16351653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 373
Target Start/End: Original strand, 490506 - 490617
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||    
T  490506 gatttagagattgatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggctt 490605  T
Q  362 ggttgttgttgt 373  Q
    | ||||||||||    
T  490606 gtttgttgttgt 490617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Original strand, 2216411 - 2216568
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  || |||||||| ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||    
T  2216411 agaggtagaggaagacctagaaaaaacataagagaaactattaagaag-atttagagatcaatgagttggatcctaatatg-tttatgatagaacattat 2216508  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
       || ||||||||||||| |||||  ||||  || ||||||||||||||| ||||||||    
T  2216509 agtgtaatttgatccatgtagccgaccccactcagtgagataaggcttggtggttgttgt 2216568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 158
Target Start/End: Original strand, 9695583 - 9695698
Alignment:
Q  43 aagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttg 142  Q
    |||| |||||| ||||| ||||| ||||||| ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||| |||||||    
T  9695583 aagactagacaggatagaattagaaatgacaacattatagagatatttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactcggcttaggtggtttg 9695682  T
Q  143 ggcatgtagagagaag 158  Q
    ||||||||||||||||    
T  9695683 ggcatgtagagagaag 9695698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 35643872 - 35643608
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa----tgga 197  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||         |||| ||| | ||||||     ||||    
T  35643872 tatagtagaaaagatggtggaaaatatgcttaggtggtttgggcatgtagagagaagacatgtag---------taaggagaatagatcaatcagctgga 35643782  T
Q  198 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtt 297  Q
    ||| |||||  |||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  35643781 ggatagtcagattactagaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaattattaagaaagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggtt 35643682  T
Q  298 tttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | |||||||||||  || | |  |||||||||||| ||| |  |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  35643681 tatgatagaacac--tgccatattttgatccatgtagcctaccccacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 35643608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 39760788 - 39760572
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||  || |||||||||| |||    
T  39760788 agcagagatgaggatgttgtgttggatgtgtggtaggattagacaagataggagtagaaatgataacattagagacagagttgggttagcacctatcgta 39760689  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||   || |||| |    |||| |||||||||||| |||||| |||| | |||||| | ||  |||| ||||| ||||| |||||||  ||||||     
T  39760688 gaaaagaatgtggaaact----ttaggtggtttgggcatatagagaaaagagttgtagattccgtaataaggagagtagatcatatggagggtagtcaaa 39760593  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagac 229  Q
    |    ||||||||||||||||    
T  39760592 tcgctagaggtagaggaagac 39760572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 25 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44681387 - 44681252
Alignment:
Q  25 ttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaa 124  Q
    |||| ||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||   ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  44681387 ttgcattggatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacaacattagagagacagttgtggtagcacctataatagaaaagatggtggaaa 44681288  T
Q  125 ataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||    
T  44681287 ataagcttagaaggtttggaaatctagagagaagac 44681252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 12797011 - 12796912
Alignment:
Q  60 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||  ||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  12797011 gattaggaataacaccattagaaagag--tggaggtaacacctatagaagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttaggcatgcagagagaaga 12796914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 2518749 - 2518597
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    |||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||| |||||||  |||||||||| | |  |||||||||||  ||||||||||    
T  2518749 gatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagatgagataggattagaaatgacaa-attagagagaaaattggggtagcacctcaagtagaaaag 2518651  T
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
     |||| ||||||||| |||| |||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  2518650 atggtggaaaataggtttaggtggtttgattatgtagagagaagacttgtagat 2518597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 30113557 - 30113416
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||| |||||| | | ||||  || ||||| |||| |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||    
T  30113557 gagatgagaatgttgtgctagatgtttgttaagaatagatatgataagattatgaatgacattattagagagagagtcggggtaacacatatagtagaaa 30113458  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    || |||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  30113457 agatggtagaaaataggtttaattggtttgggcatatagaga 30113416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 25288820 - 25288916
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata 105  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25288820 agcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25288916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 25300155 - 25300251
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctata 105  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  25300155 agcagatatgaggatgttgagctggattagtggtaagactagatgagataggattaggaaggacaccattagagagagtgtgggggtagcacctata 25300251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 332
Target Start/End: Original strand, 13589474 - 13589720
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||   |||||| |||||| |||||||  |||||||||||| | |||| |||||||  ||||| ||||||||||   |||||| ||| |||     
T  13589474 agagagagagttgaggtagcgcctataatagaaaatatggtagaaaatatgattaggtggtttgaacatgttgagagaagaccgatagatgttgtagtac 13589573  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    ||||||| ||| | |||||||| | |        |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| || | |||||    
T  13589574 gaagagtagattatatggaggacaat-------gaagaggtagatgaagacttagaaaaactataagagaaactattagaaaagatttaaagattaatga 13589666  T
Q  279 gttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||| ||| ||||||| ||||  |||||||| |||| ||  |||||||| ||||    
T  13589667 gttgaatcaaaatatgattttaaatagaacaatatggcgcaatttgatctatgt 13589720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15215631 - 15215556
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15215631 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactatacaggataggattagaaatgacaccattagagagagag 15215556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 373
Target Start/End: Original strand, 23492163 - 23492316
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacg 317  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||||| || ||| | | ||||||||||||  ||||||| | | |||||||||||||||  |    
T  23492163 tagaggaagacctag-aaaactattagagaaactactcagaaag-atgtagcgattaatgagttggatagaaatatgatatatgatagaacactatggtg 23492260  T
Q  318 tcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| |||||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23492261 tcatttaatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgtttgttgttgt 23492316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 243 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 45041445 - 45041320
Alignment:
Q  243 tagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattcc 342  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||  || |||| ||| ||||||||||||| || ||  ||    
T  45041445 tagagaaactattaggaaagatttagaggttaatgagttggatcc-aatatggtttatgatagcgcattatggcgtaatttgatccatgtagctgacccc 45041347  T
Q  343 acctagagagataaggcttggttgttg 369  Q
    || ||| | ||||||||||||||||||    
T  45041346 acttagtgggataaggcttggttgttg 45041320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 175 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 7531842 - 7531646
Alignment:
Q  175 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||  | |  |||||||  || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  7531842 gtaaggagagtagatcagatggaggggagtcagatcactagaggtaagggtagacctagaaaaactatacgagaaactattaggaaggatctagagataa 7531743  T
Q  275 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||| |||||   ||| |||   ||||||||||||||||||||    
T  7531742 atgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttggttgttgtt 7531646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Original strand, 36143287 - 36143480
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||| ||||   ||||||||||| || || |  |||||||||    |   |||||||||||||| |    
T  36143287 agcagagatgaggatgttgtgttggtcgtgtggtaagactagatgagataggattagaaaggaaaagattagagag----tcgaggtagcacctatagca 36143382  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||| || |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||   ||||| |||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||    
T  36143383 gaatagatggtggaaaatagacttaggtggtttgggcatttagagaaaagacctatagattctgtagtatggagagtagatcaaatggaggatagtca 36143480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 373
Target Start/End: Original strand, 42584407 - 42584640
Alignment:
Q  127 aggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaa 226  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||| |||   ||||  | ||||||||||||  ||    
T  42584407 aggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaaacctgtagatgttgtagtacgaagagtagatcagatgaaggtttgtcagatcaaaagaggtagataaa 42584506  T
Q  227 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgat 326  Q
    ||||||| |||||||| ||           ||||| || || |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  42584507 gacctagaaaaactataag-----------gaaag-atctataggttaatgatttggatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 42584594  T
Q  327 ccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     | ||| |||||  |||| ||| | |||||| |||| ||||||||||    
T  42584595 -cttgtagccgaccccacttagtgggataagacttgattgttgttgt 42584640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 308
Target Start/End: Original strand, 5908564 - 5908863
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||| || ||| ||||||| ||   |||| |||||  |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  5908564 gagatgaggctgctgccttggatgtgtttcaagactagacgggataagattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagaacctatagtagaaa 5908663  T
Q  113 agttgg------tagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    || |||      | |||| ||| ||||| ||||||||  || ||||||||||||  ||||||  ||| ||||| ||||| |||||  |||||||  ||||    
T  5908664 agatggttgaaatggaaactagacttagttggtttgg--atatagagagaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcaggtggaggatggtca 5908761  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataga 306  Q
      | |  ||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||| |||  |  | | ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  5908762 gatcactagagacataggaagacctagaaaaactataagagaaactattaaaaaagatccaaggattaatgagttggatcaaaatatgatttatgataga 5908861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 304
Target Start/End: Original strand, 28169514 - 28169605
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgata 304  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28169514 aagaggtagaggaagacctaaaaaaactataagagaaactattaggaaagattttgagattaatgagttggattcaaatatggtttatgata 28169605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 30456575 - 30456441
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |   ||||| ||||| ||||||  ||||||||||| |||  | || ||||||||||||    
T  30456575 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagacca-atgggatagaattagaaatgacgacattagagagatagttcgagttgcacctatagta 30456477  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggg 144  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||    
T  30456476 gaaaagatggtagaaactagacttatgtggtttggg 30456441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 181 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 35362842 - 35362651
Alignment:
Q  181 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 280  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |    | ||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||| || ||||| ||  | |||||||    
T  35362842 agagtagatcaaatggaggatagtcaaatccctataggcagaggaagacctagaaaaactatcggagaaactattaggaaagatttggaaattaatgagt 35362743  T
Q  281 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||   ||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||  ||| |  |||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  35362742 tggactgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgcagccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 35362651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42493668 - 42493536
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||| |||||   ||||||| ||||   ||||||||  ||||| |||||||||||    
T  42493668 agcaaagatgaggatgttgcgttggttgtgtggtaagattagtcaagattggattgtaaatgacaacatt--ggagagagttggggtaacacctatagta 42493571  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg 143  Q
    |||||| | || |||| ||||||||| ||||||||    
T  42493570 gaaaagattgtggaaactaggcttaggtggtttgg 42493536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Original strand, 43733330 - 43733488
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||    |||||| ||||| | ||||||||||||  |||| || |||| |||||||||||||    
T  43733330 agaggtagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactatcgagaaggatctagagattaatgagttggataaaaatgtg-ttttggatagaacactat 43733428  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | |||| ||| || ||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||| | ||||||    
T  43733429 ggcgtcgtttcattcatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggtggctgttgt 43733488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 10824441 - 10824331
Alignment:
Q  96 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatg 195  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||  |||||  ||| ||| | ||||| |||||||||    
T  10824441 agcacctaaagtagaaaagatggtcgaaaataggcttaggtggtttgggtatttagagaaaagactcatagattttgtagtatggagagtagatcaaatg 10824342  T
Q  196 gaggagagtca 206  Q
    ||||| |||||    
T  10824341 gaggatagtca 10824331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 13986416 - 13986536
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||  ||||  ||||||||||||| ||||| |||| || |  ||||||||||||||||| |||    
T  13986416 gagatgaggatgttacactggatgagtggtaatactagacgagatataattaggaatgacatcattaaagagggatttggggtagcacctatagtacaaa 13986515  T
Q  113 agttggtagaaaataggctta 133  Q
    |  ||||||||||||| ||||    
T  13986516 atatggtagaaaatagactta 13986536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 288 - 372
Target Start/End: Original strand, 36143538 - 36143622
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||  ||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  36143538 aaatatggtttatgatagaacattatgacgtcatctgatccatgtagccgaccccacctagtcggaaaaggcttggttgttgttg 36143622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 39051065 - 39051205
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||  || || |||||||  | |||||    
T  39051065 agatgaggatgttgtgttagatgtgtggtaagacaagacatgatagaattagaaatgacaatattcgagagagagttgggataacacctatcattgaaaa 39051164  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    | ||| ||||| | || |||| ||||||||| |||||||||    
T  39051165 gatggcagaaactcggtttaggtggtttgggtatgtagaga 39051205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 291
Target Start/End: Original strand, 5266027 - 5266129
Alignment:
Q  188 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 287  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||  |||| || |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5266027 atcaaacggaggagagt-aagtcagaagaggtagagaaagacctagaaaaactatcatagaaatcattataatggatttggaggtcaatgagttgaatcc 5266125  T
Q  288 aaat 291  Q
    ||||    
T  5266126 aaat 5266129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30812975 - 30812816
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||   ||||||  |||| |||||| ||||| | |||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||    
T  30812975 agaggtaggggtagacctagaaaaactatacaagaaactgttaggaaggatctagagataaatgagttggaaaaagacatggtttttgatagaacactat 30812876  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |  ||| |||||| ||||| |||||  |||| ||| | || |||||||||| ||||||||    
T  30812875 ggtgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgt 30812816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 2776524 - 2776442
Alignment:
Q  79 agagagagag-tgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2776524 agagagagagctgggggtagcacctatcgtagaaatgatggtagaaactcggcttaggtggtttgggcatgttgagagaagac 2776442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18474239 - 18474173
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18474239 gtagcacctatagtagaaatgatggtggaaactaggcttagttggtttgagcatgtagagagaagac 18474173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 241
Target Start/End: Original strand, 25985462 - 25985668
Alignment:
Q  32 ggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggct 131  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  25985462 ggatgtgtggtaagacaagacaggatagaattagaaacgacaacattagagagag--ttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagact 25985559  T
Q  132 tagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacct 231  Q
    |   || ||| ||||||| ||||||||||  ||  ||  ||  ||||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  25985560 tgcgtgattttggcatgt-gagagaagacatgtgaattttgaagtaaggagactagatcagatgtaggggagtcaaatcactagaggtagaggaagacct 25985658  T
Q  232 aggaaaacta 241  Q
    || |||||||    
T  25985659 agaaaaacta 25985668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 30783400 - 30783077
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag-----agagagtgtgggtagca-cctatag 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| ||||||||     |||||||  || ||||| |||||||    
T  30783400 gagatgaggatcttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagaggggagagagagttgggatagcaacctatag 30783301  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||| | ||| ||||   ||||||| | |||||||| |||||||| |||||  ||||||  ||| ||||  ||||| |||     |||||| |||||    
T  30783300 tagaaaaat-ggtggaaac--ggcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattttgtagtaaagagagtagat-----ggaggatagtca 30783209  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 305  Q
      | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||| |||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| | |||     
T  30783208 gatcactagaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaag-atctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataataa 30783110  T
Q  306 aacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||| |||||    
T  30783109 aacattatgaggtagtttgatccatgtagccga 30783077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28269840 - 28269761
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28269840 aaaagaggtatatgaagacctagaaaaattataagagaaactattagcaag-atttagaggttaatgagttggatccaaat 28269761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 33828116 - 33827812
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | |||| | |||| | |||| || ||| ||||||| ||||| ||||| |||  ||||| || ||||||||  |||    
T  33828116 agatgaggatgttgtgttggatgtctagtaaaactagataagataagactagaaatgacaacattatagagatagttggggtaacaactatagtattaaa 33828017  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaa 213  Q
      | || ||||| | |||||| || |||| |||| |||||| |||||  ||||||    | |||||| |||| |||||||| || || |   |  ||| |    
T  33828016 tattgtggaaaacatgcttaggtgatttgagcatatagagataagacgtgtagatttcatagtaagatgagtagatcaaatagaagataaaaagattaca 33827917  T
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||||||  ||||||| ||  |||||||| |||||||| |||| |||  ||||| || | ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  33827916 agaggtacgggaagacgtataaaaactataagagaaactattaaaaaatatttatagattaatgaattggatctaaatatggtttatgatagaacaatat 33827817  T
Q  314 gacgt 318  Q
    |||||    
T  33827816 gacgt 33827812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 38392046 - 38391922
Alignment:
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtc 319  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||  || ||| || || | ||||||| ||||| ||||||||| | |||||||| | |||| |||     
T  38392046 agaggaagacctagaaaaactatatgagaaaccattaagaaagatctacagattaatgagtgggatcgaaatatggtatatgatagaatattatggcgta 38391947  T
Q  320 atttgatccatgtggccgattccac 344  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||    
T  38391946 atttcatccatgtggccgatcccac 38391922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10824288 - 10824189
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||  || |||||   || |||||||||||||||||||    
T  10824288 aatgaattggaccaaaatatggtttttgatagaacattatgaagtaagttgatccatgtagccgaccccgcctagtcggaaaaggcttggttgttgttgt 10824189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 296
Target Start/End: Original strand, 25439471 - 25439530
Alignment:
Q  237 aactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggt 296  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25439471 aactataagagaaaccattcgaaaggatttagagatcaatgagttggattcaaatatggt 25439530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30198425 - 30198266
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||||||  ||||  || ||| | ||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||||| | |||    
T  30198425 agaggcagaggtagacttagaaaaactataagagaaattattaagaaagatattgagattaatgagttggatcggaatatggtttatgatagaatattat 30198326  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |  ||  ||||||| |||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  30198325 ggtgtagtttgatctatgttgccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 30198266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 206
Target Start/End: Original strand, 44373740 - 44373891
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||||     
T  44373740 gataggattagaaatgaaaatattagagtgagagttggagtagcacctaaagtagaaaagatggtggaaaataggcttgagtggtttgagcatgtagagt 44373839  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
     |||||   |||||  ||| ||||  ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  44373840 aaagacctatagattttgtagtaaagagagtagatcaaatagaggatagtca 44373891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 160
Target Start/End: Original strand, 78988 - 79112
Alignment:
Q  39 tggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaata---ggcttaga 135  Q
    |||||||| |||||  ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||  |  ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| ||   |||||||     
T  78988 tggtaagactagacgggataggattagaaacaacaacattagagagagcattcgggtaacacctacagtagaaatgatggtagaaattactaggcttagg 79087  T
Q  136 tggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  79088 tggtttgggcatgtatagagaagac 79112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 294 - 332
Target Start/End: Original strand, 36042401 - 36042439
Alignment:
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36042401 ggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 36042439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 332
Target Start/End: Original strand, 31715992 - 31716061
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||||||    
T  31715992 atttagagattaattagttggatccaaatatggtttaagatagaacattatggcgtaatttgatccatgt 31716061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1928659 - 1928587
Alignment:
Q  301 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1928659 gatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 1928587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10668569 - 10668497
Alignment:
Q  301 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||   ||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  10668569 gatagaacactatgaggtcatttgatcgatgtagccgacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 10668497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 17491805 - 17491689
Alignment:
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcat 321  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||  || || || ||| | ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||| |||       
T  17491805 aggaagacctagaaaaactgtaagagaaactattaagaaagacttggagattaatgagttggaccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtatg 17491706  T
Q  322 ttgatccatgtggccga 338  Q
    ||||||||||| |||||    
T  17491705 ttgatccatgtagccga 17491689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 25985880 - 25985813
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||||||| |||| ||||||||||||    
T  25985880 gggtagcacctatagtagaaaagtttgtagaaactagactta-ttggtttgtgcatttagagagaagac 25985813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39967643 - 39967499
Alignment:
Q  229 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcc 328  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||| | | ||||||||||||  | |||| |||| || ||||||| |||| |||  ||||||||    
T  39967643 cctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagcgattaatgagttggattgagatatagtttatgttagaacattatggcgtagtttgatcc 39967544  T
Q  329 atgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| |||||| |||| ||  | ||||| ||||||||||||||||    
T  39967543 atgtagccgatcccacttattgtgataatgcttggttgttgttgt 39967499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41444607 - 41444547
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaga 152  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||||||| ||||||||    
T  41444607 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggtttaggtggtttggacatgtaga 41444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41972134 - 41971991
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||   | ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||  |  ||||| |||||| ||||||||    
T  41972134 gagatgaggatgttgtattggatgtgtgataagattaatga-gatagaattagaaatgagaatattagagagag--ttagggtaacaccta-agtagaaa 41972039  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    || |||| ||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41972038 agatggtggaaaataagtttaggtggtttggacatgtagagagaagac 41971991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 374
Target Start/End: Original strand, 26363660 - 26363769
Alignment:
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttg 362  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |   || ||||||||||||| | |||  ||||  || | |||||| ||||    
T  26363660 atttagaggtcaa-gagttggatctaaatatggtttatgatagaacact-tagtgtaatttgatccatgtagtcgaccccactcagtgggataagacttg 26363757  T
Q  363 gttgttgttgta 374  Q
    ||||||||||||    
T  26363758 gttgttgttgta 26363769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 377
Target Start/End: Original strand, 4955335 - 4955477
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtgg 334  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||| || |||||  | |||||||| |||  ||||||| ||| | ||| |||| || ||||| |||||||  |||| |    
T  4955335 aaaattattagagaaactattaaaaaagacttagaaattaatgagtttgatttaaatatgatttataataaaacattacgacgtaatttgatttatgtag 4955434  T
Q  335 ccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtattt 377  Q
     ||||  ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4955435 tcgatctcacttagtgagataaggtttggttgttgttgtattt 4955477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Original strand, 16252860 - 16252930
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 86  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  16252860 atgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagatgagataaaattagaaatgacaacattagagagag 16252930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18474055 - 18473973
Alignment:
Q  290 atatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| || |||||| ||||| |||||  |||| ||| | |||||| ||||||||||||||    
T  18474055 atatggtatttgatagaacattatgacttcgtttgattcatgtagccgacaccacttagtgggataagacttggttgttgttg 18473973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 331
Target Start/End: Original strand, 27037761 - 27037875
Alignment:
Q  217 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||  || |||| ||||| || ||| || || | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | |||| |    
T  27037761 ggtagagaaagacctagtaaaactatacgataaactattaggaaagatataaagattaatgagttggatagaaatatggtatttgatagaatattatggc 27037860  T
Q  317 gtcatttgatccatg 331  Q
    ||  |||||||||||    
T  27037861 gttttttgatccatg 27037875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 332
Target Start/End: Original strand, 29735834 - 29736048
Alignment:
Q  118 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 217  Q
    |||||||||| | |||| | |||| | |||||| |||||| ||   |||||||| |  || ||||||||||||| || || ||||||||  | | |||||    
T  29735834 gtagaaaatatgtttaggtagtttcgacatgtacagagaataccgatagatgctataatacgaagagtggatcagatagacgagagtcagatcagaagag 29735933  T
Q  218 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacg 317  Q
     |||||||||| |||| |||||||| ||| || | |||||||| || |||  | | ||  ||||| ||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||    
T  29735934 atagaggaagatctagaaaaactataagaaaagctattagaaaagacttaatgattaacaagttgaatccaaatatgatttatgattgaactttatgacg 29736033  T
Q  318 tcatttgatccatgt 332  Q
    | ||||||| |||||    
T  29736034 taatttgattcatgt 29736048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 38178479 - 38178377
Alignment:
Q  154 agaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaa 253  Q
    |||||||  ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  38178479 agaagacctgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcaaatcgctagaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaacta 38178380  T
Q  254 tta 256  Q
    |||    
T  38178379 tta 38178377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32569783 - 32569710
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  |||  ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  32569783 tgatagaacactatgacgtcatttgatttatgtagccgaccccatttagtgggataagacttggttgttgttgt 32569710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 33666814 - 33666726
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca 146  Q
    |||||||||| ||||||||   | |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |   |||| ||||||||||||    
T  33666814 gataggattaagaatgaca---taagagagagagttggggtagcacctatcgtagaaaagatggtagaaactctacttaaatggtttgggca 33666726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 284 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8255622 - 8255531
Alignment:
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattc--cacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||||| |||||  |  ||| ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  8255622 atccaaatatggtttatgatagaccaatatggcgtaatttgatccatgtagccgagacaccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 8255531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Original strand, 29735728 - 29735804
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacacca-ttagagagagag 88  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||  || || |||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  29735728 gagatgaggatgttgtgttggatgaatggtaagactagacgagaaagaattaagaataacaccatttagagagagag 29735804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 228 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 30456439 - 30456323
Alignment:
Q  228 acctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatc 327  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||  | | | |||| ||   | |||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  30456439 acctagaaaaactataagagaaactattagaaatgatctagatataactaagttcgagaaagatattgtttttgatagaacactatggcgtcgtttgatt 30456340  T
Q  328 catgtggccgattccac 344  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  30456339 catgtagccgactccac 30456323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Original strand, 36069570 - 36069638
Alignment:
Q  18 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 86  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  36069570 gaggatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacgggataagattagaaacgacaacattagagagag 36069638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 158
Target Start/End: Original strand, 6483245 - 6483324
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 158  Q
    |||||||||||  |||||||   |||||||||||||  ||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  6483245 agagagagagttggggtagctggtatagtagaaaagagggtggaaacttggcttaggtggtttgggcatgtagagggaag 6483324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 134
Target Start/End: Original strand, 7103274 - 7103313
Alignment:
Q  95 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 134  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  7103274 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactaggcttag 7103313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 206
Target Start/End: Original strand, 11733711 - 11733862
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  || || |||||||  ||||| || |||| |||| |||  |||  |||||||  | ||| ||||    
T  11733711 gataggattagaaatgacaacattagagaaagagttgggataacacctatgatagaatagatggtggaaactagagttaagtggtttgatcttgttgaga 11733810  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| |||||  ||||||| |||||    
T  11733811 gaagatttgtagatgttgtagtaaggagagtagatcacgtggaggatagtca 11733862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 239 - 338
Target Start/End: Original strand, 14459043 - 14459142
Alignment:
Q  239 ctattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||| ||| | |||||||| || | ||||||||||| |||| ||||| ||||  || ||||||||||||| |||||    
T  14459043 ctataagagaaactattaggaaagatttggagattaatgagttagaccaaaatatggtttatgatggaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga 14459142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24399965 - 24399838
Alignment:
Q  197 aggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggt 296  Q
    |||| |||||| |||  ||||| |||| || || ||| |||| ||| |||||||| ||||  |||||| | ||| | ||||||||||||  |||||||||    
T  24399965 aggatagtcaaattactagaggcagagcaaaacttagaaaaattataagagaaactattaagaaggatctcgagattaatgagttggattgaaatatggt 24399866  T
Q  297 ttttgatagaacactatgacgtcatttg 324  Q
    || |||||||| | ||||| ||||||||    
T  24399865 ttatgatagaatattatgatgtcatttg 24399838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 154
Target Start/End: Original strand, 34196064 - 34196135
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  34196064 agagagttggggtagcacctatagtagaaaaaacagtagaaactagacttatgtggtttgggcatgtagaga 34196135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 321 - 375
Target Start/End: Original strand, 12611727 - 12611781
Alignment:
Q  321 tttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    |||||||||||| |||||| |||  ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12611727 tttgatccatgtagccgatcccaattagtgggataaggcttggttgttgttgtat 12611781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16035822 - 16035768
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  16035822 agttggatcgaaatatggtttatggtagaacattatgacgtaatttgattcatgt 16035768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 84
Target Start/End: Original strand, 25439394 - 25439460
Alignment:
Q  18 gaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 84  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||   ||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  25439394 gaggatgttgcgctggattagtggtaagactagatgagataggaataggaacgataccattagagag 25439460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 98 - 160
Target Start/End: Original strand, 29645044 - 29645106
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||  |||||||| |||||| |||||||||    
T  29645044 cacctatagtataaaagatggtggaaaataggtttaattggtttggacatgtaaagagaagac 29645106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 373
Target Start/End: Original strand, 35323993 - 35324055
Alignment:
Q  311 tatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| |||||||||| || |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35323993 tatgacgtaatttgatccacgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 35324055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41444501 - 41444380
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaa--ctattagagaaacaatta-gaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||| |||| | ||||||| | |||| ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||     
T  41444501 agaggcagaggaagacctagaaaaaaactataagagaaactattaagaaaaggtttagagattaatgggtttgatcaaaatatggtttatgatataacat 41444402  T
Q  311 tatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||  |||| |||||| ||||||    
T  41444401 tacaacgtaatttgaaccatgt 41444380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 219 - 332
Target Start/End: Original strand, 14903689 - 14903802
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgt 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| || ||| | ||  |||||||    |||||||| || | ||||| ||||| |||||| ||| |||| |||    
T  14903689 tagaggaagacctagaaaaactataagagagactattgggaaatatttagaaagtaatgagttagaccaaaataaggtttatgataggacattatggcgt 14903788  T
Q  319 catttgatccatgt 332  Q
     |||||||||||||    
T  14903789 aatttgatccatgt 14903802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 160
Target Start/End: Original strand, 23023231 - 23023312
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||| |||  |||| ||||||||| | |||||   |||||||||||||||    
T  23023231 agagagagagttcgggtagcacttattgtagaaaagatgggggaaactaggcttaggtagtttgattatgtagagagaagac 23023312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 369
Target Start/End: Original strand, 26055630 - 26055699
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttg 369  Q
    |||| ||||| ||||| | | |||||||||||| |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  26055630 tgattgaacattatgatggcgtttgatccatgtagccgatcccacttagtgggataaggcttggttgttg 26055699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Original strand, 32276894 - 32276967
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| | |||  |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  32276894 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagacgaacccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 32276967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38901900 - 38901819
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || ||  |||  ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  38901900 atggtttttgatataacactatggcggcatttgattcatgtagcggaccccatatagtgggataaggcttgattgttgttgt 38901819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41031505 - 41031420
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| | | |||||| |||||  | ||||||||||| | |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41031505 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41031420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41031611 - 41031526
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| | | |||||| |||||  | ||||||||||| | |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41031611 aaatatggtttatcacagaacattatgagataatttgatccatatagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41031526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28255054 - 28255022
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactatt 243  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28255054 aaaagaggtagaggaagacctagaaaaactatt 28255022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 215 - 251
Target Start/End: Original strand, 29709821 - 29709857
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  29709821 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagagaaac 29709857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 168
Target Start/End: Original strand, 38689547 - 38689615
Alignment:
Q  100 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||| | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  38689547 cctattgtagaaaagatggtagaaactcagcttaggtggttttgacatctagagagaagacttgtagat 38689615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Original strand, 43732485 - 43732541
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattag 65  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||||    
T  43732485 agcagaaatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagactagatgtgatagaattag 43732541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 370
Target Start/End: Original strand, 44699649 - 44699745
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||| || | |||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| || ||  |||| ||| | || ||||||||||||||||    
T  44699649 aatgagttagaccgaaatatggtgcatgatagaacactatggcgtaatttgatccctgtagcagaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgt 44699745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 31386 - 31750
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31386 agcagagattaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 31485  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31486 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccatggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 31585  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  31586 ttaaaagatgtagaggaagacccaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 31685  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  31686 actgtgaagtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 31750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44158 - 44081
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44158 agagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggcggaaaataggcttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 44081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 117)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12492751 - 12492384
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcaccta---ta 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||    
T  12492751 agcagagatgaggatgttacgttggatgagtggtaagactagacaggataagattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctactata 12492652  T
Q  106 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12492651 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtgttaagaagagtagatcaaatggaggagagtc 12492552  T
Q  206 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  12492551 aagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatag 12492452  T
Q  306 aacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12492451 aacactatggcgtcatttgatgcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12492384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 24178428 - 24178792
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24178428 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactatacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 24178527  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24178528 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtggagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 24178627  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || | |||||||||    
T  24178628 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagagttcaatgagttggatccaaatttagtgtatgatagaac 24178727  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| | |||||||||| |||| |||||  |||| ||  || |||||||||||||||||||||    
T  24178728 actatggcatcatttgatctatgtagccgaccccacttaatgaaataaggcttggttgttgttgt 24178792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Original strand, 4496308 - 4496666
Alignment:
Q  17 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacat--gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaag 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4496308 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacacaggataggattaggaatgacacctttagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaag 4496407  T
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 214  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4496408 ctggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 4496507  T
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  4496508 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatg 4496607  T
Q  315 acgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     | ||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4496608 gcatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 4496666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 9 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 1287953 - 1287587
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----------tgtgggtagc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||          || |||||||    
T  1287953 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacatcattagagagagagagagagagagtgggggtagc 1287854  T
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  1287853 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggag 1287754  T
Q  199 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggttt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  1287753 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 1287654  T
Q  299 ttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggtt 365  Q
     |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||    
T  1287653 atgatagtacactatggcgtcagttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggtt 1287587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28977221 - 28976859
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  28977221 agcagagatgagtatgttgtgttggatgagtggtaaaactagaaatgataggattaggaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 28977124  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  28977123 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtatatgccgtggtaagaagggtagatcaaatggaggagagtcaag 28977024  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  28977023 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 28976924  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28976923 actatggcgtcatttgattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28976859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 1275183 - 1275546
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1275183 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatggtaggattaggaatgacaccattagagagagagtg-gggtagcacctatagta 1275281  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1275282 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagatccgtaaatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 1275381  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  1275382 ttaacaggggtagaggaagacctagaaaaactattagagaaaccattataaaggatttagaggttaatcagttgaatccaaatttggtgtttgatagaac 1275481  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||| | |||||||||||    
T  1275482 attatgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatagttgttgttgt 1275546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Original strand, 3301766 - 3302127
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  3301766 gagatggggatgttgcgcttgatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgtcaccattagagagagagtgagggtagcccctatagtagaaa 3301865  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  3301866 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagaatgaatcaaatggaggagagtcaggttaa 3301965  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3301966 aagaggtagaggaagacctaagaaaaccattagagaaaccattataaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 3302065  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
     | ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  3302066 cggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 3302127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 2075838 - 2075475
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  2075838 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagttgtaagactagacaagataggattaggaatgacaacattagagagagagtgggggtaacacctacagta 2075739  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2075738 gaaaagttggtagacaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 2075639  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattag-aaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  2075638 ttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagagaaaccattagaaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 2075539  T
Q  308 cactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
     |||||| ||||||||||| ||||| ||| |  |||| ||| | ||||||||||| ||||||||    
T  2075538 tactatggcgtcatttgattcatgtagccaaccccacttagtgggataaggcttgattgttgtt 2075475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 56 - 366
Target Start/End: Original strand, 38684932 - 38685242
Alignment:
Q  56 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38684932 ataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagag 38685031  T
Q  156 aagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt 255  Q
    |||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38685032 aagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccatt 38685131  T
Q  256 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagata 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||    
T  38685132 agaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacaatatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggata 38685231  T
Q  356 aggcttggttg 366  Q
    |||||||||||    
T  38685232 aggcttggttg 38685242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 10639215 - 10639584
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatag-- 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||      
T  10639215 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacagaataggattaggaatgacaccattagagagagagtggggctagcacctatagac 10639314  T
Q  107 -----tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 201  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10639315 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgaattgggcatgtagagagaagacctgtagatgccatggtaagaagagtagaacaaatggaggag 10639414  T
Q  202 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttg 301  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||    
T  10639415 --tcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatg 10639512  T
Q  302 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| | | | ||||||||||||||||||||||    
T  10639513 atagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccactttgtgggataaggcttggttgttgttgt 10639584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 13 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16347738 - 16347378
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||  ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16347738 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacaatatatgattaaaaatgaaaccattagagagagagcgggggtagcacctatagtagaaa 16347639  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  16347638 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgcctttgcaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 16347539  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||      
T  16347538 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattaaagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgatttggatacaaatatggtttatgatagaacac-- 16347441  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    || ||||||||||||||||| |||||  | || ||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  16347440 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataagacttggttgttgttgtat 16347378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 39 - 373
Target Start/End: Original strand, 14665658 - 14665994
Alignment:
Q  39 tggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttag 134  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14665658 tggtaagcctagacatgataggattagaaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcacctatagtagagaagttgatagaaaataggcttag 14665757  T
Q  135 atggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctagg 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  14665758 atggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggagcagagtcaggttaaaagaggtagagggagacctagg 14665857  T
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtgg 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| || ||| |||||||| |||| |    
T  14665858 aaaactattagagaaaccattaggaagaatttagaagtcaatgagttggatccaaatatggtttatgataga--actctggcgtaatttgatctatgtag 14665955  T
Q  335 ccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  14665956 ccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 14665994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 34272940 - 34273295
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----------tgtgggtagc 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||          || |||||||    
T  34272940 agcagagatgaggatgttgcattggatgagtggtaagactagaca-----ggattaggaatgacaccattagagagagagagagagagagtgggggtagc 34273034  T
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggag 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||||||                  
T  34273035 acctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgcagatgtcgtggtaagaagag-------------- 34273120  T
Q  199 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggttt 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  34273121 gagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgt 34273220  T
Q  299 ttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |   ||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  34273221 atgatagaacactatgacgtcattcgatccatgtagccaacctcacttagtgagataaggcttagttgttgttgt 34273295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 94 - 372
Target Start/End: Original strand, 20456776 - 20457054
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  20456776 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaa 20456875  T
Q  194 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatat 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |    
T  20456876 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctacgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaataagttgaatctaaattt 20456975  T
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    | | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||| |||||||||    
T  20456976 gatgtatgatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttg 20457054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 22 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26885040 - 26884689
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtag-aaaagttggta 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26885040 atgttgcgttggatgagtggtaaaactagacgggataggattaggaataacaccattagaaagagagtgagggtagcacctatagcaggaaaagttggta 26884941  T
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| | ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  26884940 gaaaataggcttaggcggtttggacatgtagagataagatttgtagatgttgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtcgggtcaaaagaggta 26884841  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaacactatgacgtc 319  Q
    ||||| || ||||||||||||  ||| |||| ||||| || ||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||      
T  26884840 gaggatgagctaggaaaacta--agaaaaactattaggaaagatttagaggttaatgggtcggatccaaaatatgatttatgatagaacactacgacgca 26884743  T
Q  320 atttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| ||| |  |||||||||| ||||||||||    
T  26884742 atttgatccatgtagccgaccccacttagtggaataaggcttgattgttgttgt 26884689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 149 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2915719 - 2915496
Alignment:
Q  149 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 248  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2915719 tagagagaagacccgtagatgccttggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggataactattagaga 2915620  T
Q  249 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctag 348  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| |||    
T  2915619 aaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttgg-ttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttag 2915521  T
Q  349 agagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     | |||||||||||||| |||||||    
T  2915520 tgggataaggcttggttattgttgt 2915496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 180 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13561579 - 13561386
Alignment:
Q  180 aagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgag 279  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13561579 aagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgag 13561480  T
Q  280 ttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  13561479 ttggatccaactatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgtttgttgttgt 13561386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 55 - 326
Target Start/End: Original strand, 14749271 - 14749542
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14749271 gataggattagaaatgaaaacattagagagagagttggtgtagcacctatagtagaaaaattggtagaaactagacttagatggtttggacatgtagaga 14749370  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 254  Q
    ||||||  || ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  | ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  14749371 gaagacctgtggattctgttgtaaggagagtcgatcagatggaggggagtcaaatcactaaaggcagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 14749470  T
Q  255 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgat 326  Q
     |  |||||| ||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14749471 caagaaggatctagagattaacgagttggatagaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgat 14749542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 222 - 373
Target Start/End: Original strand, 29816513 - 29816664
Alignment:
Q  222 aggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcat 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||    
T  29816513 aggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcat 29816612  T
Q  322 ttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29816613 ttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 29816664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 187 - 371
Target Start/End: Original strand, 14911268 - 14911452
Alignment:
Q  187 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 286  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14911268 gatcaaatgaaggagagtcgggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggttaatgagttggatc 14911367  T
Q  287 caaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||  |  |||||| ||||||||||||    
T  14911368 caaatatgatttttgatagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggtttggttgttgtt 14911452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 38501668 - 38501422
Alignment:
Q  123 aaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtaga 222  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||||||   | ||||||| | ||    
T  38501668 aaataggtttagatggtttggacatgtaaagagaagacttgtagatgccgtcgtaagaagagtagattagatggaggagagtcggatcaaaagagatgga 38501569  T
Q  223 ggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatt 322  Q
     |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||   || ||     
T  38501568 tgaagacctaggagaactataaaagaaactattagaaagtatttagaggtcaataagttggatccaaatatgatttatgatagaaaactatagtgtaata 38501469  T
Q  323 tgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttg 369  Q
    ||||| |||| |||||| |||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  38501468 tgatcgatgtagccgatcccacttagtgggataagacttggttgttg 38501422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 332
Target Start/End: Original strand, 36215418 - 36215729
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||  |||| | |||| |||||| ||||| |||||||  |||||| |||||||||  ||||||| ||||||||    
T  36215418 agcagagatgagtatgttgcgctagatgagcagtaaaactagatatgatatgattatgaatgac--cattagggagagagtggaggtagcatctatagta 36215515  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||| |||  || | ||||||||| ||||  |||||||||||||| |    
T  36215516 gaaaagttggtaggaaatatgcttagatggtttcggcacgtagaaagaaaactcgtatatgtcgttgaaagaagagtagatcggatggaggagagtcagg 36215615  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    | |||||||||||          ||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||| | ||| ||||||| |||  || |||||||||    
T  36215616 tcaaaagaggtag----------aggaaaactataagagaaaccattaaaaaagatttagaggtcaattaattgaatccaaacatgacttatgatagaac 36215705  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||| || ||||||| |||||    
T  36215706 actatgatgtgatttgattcatgt 36215729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 27816 - 28164
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||| |||| ||||| ||||||||||||| || | |||||  |||||||||||||||||||||    
T  27816 gagatgaggatgttgcattagatgagtggtaaaacta-acaagatatgattatgaatgacaccatttgaaaaagagttagggtagcacctatagtagaaa 27914  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || || | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||  || ||| | ||||         || ||||||| ||||| |||   ||||||||  | ||    
T  27915 agatgatggaaaataggcttaggtggtttgagc--gtaggtaggagatttgtag---------tacgaagagtagatcagatgcgtgagagtcagatcaa 28003  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28004 aagaggttgaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagaggttaataagttggatccaaatatgatttctgatagaacacta 28103  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || | | ||||||| ||||| || ||  |||  |||  ||||||| ||||||| |||||||    
T  28104 tggcataatttgatacatgtagctgaccccatttagttagataagacttggtttttgttgt 28164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 235 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16914021 - 16913881
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtgg 334  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  16914021 aaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttacgatagaacaccatggcgtcatttgatccatgtag 16913922  T
Q  335 ccga-ttccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    ||||   |||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16913921 ccgacccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgta 16913881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 38 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 31636253 - 31635979
Alignment:
Q  38 gtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatg 137  Q
    ||||||||| |||||  ||||| ||||  ||||||| ||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||    
T  31636253 gtggtaagactagactggatagaattataaatgacagcattagagaaag--ttggggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtg 31636156  T
Q  138 gtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaa 237  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||| ||| ||||| ||||| ||| | |||| || ||||||| | |  |||| ||| |||||| |||| |||    
T  31636155 gtttgggcatgtagagagaagacccgtggatgttgtagtaaggagagtagattagatggtggggagtcaaatcactagagataggggaagatctagaaaa 31636056  T
Q  238 actattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||||||||||| || |  |||||| ||||| |||||||||||||   | | |||||||||| ||||||||||||    
T  31636055 actattagagaaactatcaagaaggatatagagatcaatgagttggagaaacacatggtttttggtagaacactatg 31635979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 327
Target Start/End: Original strand, 32516480 - 32516791
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||||  |  | ||| ||| |||||||||||    
T  32516480 gagatgatgatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaggatagacttagaaatgacaacattagagagag--ttggagtaacacttatagtagaaa 32516577  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||| | | |||| ||| || ||  |||||| |||| ||| | ||||| ||||  ||| |||| | |||  |||     
T  32516578 agatggtggaaaataggcttaggtggtttagacttgtaaagaaaatacatgtagattctgtagtatggagagtagatcggatgaaggataatcagattac 32516677  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||   ||||||||| | ||  |||||||| |||||||||||| |||||||| | ||    
T  32516678 aagaggtagaggaagacctaa-aaaactataagagaaactattagagcagatttagagattaacaagttggattcaaatatggtttatgatagaatatta 32516776  T
Q  313 tgacgtcatttgatc 327  Q
    |||||| ||||||||    
T  32516777 tgacgtaatttgatc 32516791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 17340798 - 17340500
Alignment:
Q  12 agagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacct-atagtaga 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||   | || ||| | ||||||||    
T  17340798 agagataaggatgttgcgttggatgagtggtaaaactagaagaaatgtgattaggaatgacaccattagagagagggttgagataacactttatagtaga 17340699  T
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt 210  Q
    ||  ||  |||||||||||||||| |||||| | |||||  |||||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  17340698 aacattattagaaaataggcttaggtggttttgacatgttaagagaaaactcgcagatgatgtagtatgaagagtagatcagatggaggagagtcaggtc 17340599  T
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    ||||  |||||| |||||| ||| |||| ||| |  | ||| ||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17340598 aaaaagggtagatgaagacttagaaaaattataattgtaactattaagaaagatttagaggttaatgagtttgatccaaatatggtttatgatataaca 17340500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 332
Target Start/End: Original strand, 6888931 - 6889234
Alignment:
Q  29 gttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatag 128  Q
    |||||||| ||||||||| ||||   |||| |||||| |||||||  |||| ||| |||||  ||||||||| |||||  |||||| |||| ||||||||    
T  6888931 gttggatgtgtggtaagactagatgagatatgattagaaatgacaatattacagaaagagttggggtagcacgtatagaggaaaagatggtggaaaatag 6889030  T
Q  129 gcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaaga 228  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||| | | |  || | |||||||| ||||||   |   |||| ||||||||     
T  6889031 gcttaagtggtttggacatgtagagagaagacttgtggattatgtggtaaggacaataaattagatggaggatagtcaaaccacttgaggaagaggaagg 6889130  T
Q  229 cctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcc 328  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| | ||| ||||||  | ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  6889131 cctagaaaaactataagagaaactattaggaaagatttagagattaattagttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttaatcc 6889230  T
Q  329 atgt 332  Q
    ||||    
T  6889231 atgt 6889234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 55 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7359577 - 7359261
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||| ||||| |||||||   |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  7359577 gatagaattagaaatgacaatgttagagagagagttcaggtaacacctatagtagaaaatatggtggaaaataggtttaggtggttt-ggcatgtagaga 7359479  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac-aa 253  Q
    |||||   |||||| |||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |  ||||| |||||||  ||||| ||||| || |||||||| |     
T  7359478 gaagatatgtagattctgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtcatatcactagaggcagaggaaagcctagaaaaaccataagagaaactat 7359379  T
Q  254 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagaga 353  Q
    |||||||  || ||||| | ||| ||||||||| |||||||||||  |||| |||| |||||||| ||||||||||||| || ||  |||| ||| | ||    
T  7359378 ttagaaa-aatctagagattaataagttggatcgaaatatggtttacgata-aacattatgacgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagtggga 7359281  T
Q  354 taaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||| |||||||||||||||    
T  7359280 caagacttggttgttgttgt 7359261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 98 - 373
Target Start/End: Original strand, 1525651 - 1525923
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 197  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||  ||  || |||  || || ||||| ||||| |||||    
T  1525651 cacctattgtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggcttggacatgtagagagaagacccgtgaattctgcagttaggagagtagatcagatgga 1525750  T
Q  198 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtt 297  Q
    |||||||||  | |  |||||||| || |||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||  |||| | |||||||||||   | | ||||||    
T  1525751 ggagagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaggaaggatccagagataaatgagttggagaaagacatggtt 1525850  T
Q  298 tttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||| |||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1525851 tttgatagaacgctatggcgttgtttgattcatgtagccga--cca-ttagtgagataaggcttggttgttgttgt 1525923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 373
Target Start/End: Original strand, 6859345 - 6859663
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    |||| |||||| |||||||  |||||| |||||||  ||||||||||||||||  | ||| |||| ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||    
T  6859345 gatatgattagaaatgacaatattagacagagagttggggtagcacctatagtgaagaagatggtggaaaacaggcataggtggtttggacacgtagaga 6859444  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaat 254  Q
    ||||||| || ||| |||| |||||  || |  || | |||||||| ||||||   |  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  6859445 gaagacttgtggattctgtagtaaggggaataaattagatggaggatagtcaaaccactagaggaagaggaagacctagaaaaactataagagaaactat 6859544  T
Q  255 tagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagat 354  Q
    ||| || |||||| || | | | | ||||  | ||||||||||| |||||||||| |||| | | |||| |||||||| || ||  |||| ||| | |||    
T  6859545 taggaaagatttacagattagttacttgggccaaaatatggtttatgatagaacattatggcataattttatccatgttgctgaccccacttagtgggat 6859644  T
Q  355 aaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  6859645 aaggcttggtagttgttgt 6859663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 309
Target Start/End: Original strand, 21952274 - 21952573
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcac----ctatagt 107  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| |||    |||||||    
T  21952274 agatgaggatgttgcgttgcatgtgtggtaagactagacgagataagattagaaatgacagcattaaagagagagggttggggtaacacacacctatagt 21952373  T
Q  108 agaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
    ||||||| ||| ||||| ||| || || |||||||| |||||||||||||| |  || ||| || | ||||| ||| | ||||| ||||||| |||||||    
T  21952374 agaaaagatggcagaaactagactcaggtggtttggacatgtagagagaagtcctgtggattctatagtaaggagaatagatcagatggaggggagtcaa 21952473  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
     | |  |||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |||   |||||| ||||| | |||| ||||||   | | ||||||||||||||||    
T  21952474 atcactagaggtaggggaagacctagaaaaactat--gagaaactattgagaaggatctagagattaatgggttggagaaagacatggtttttgatagaa 21952571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 284
Target Start/End: Original strand, 2712936 - 2713137
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaag 182  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||   ||| ||    
T  2712936 agagagttggggtagcacctatagtctaaaagatggtagagactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagacctgtggattctgtatgaaggag 2713035  T
Q  183 agtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttg 282  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| | |  ||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||    
T  2713036 agtagatcagatggaggagagtcaaatcactagagtcaggggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaggatctagagatgaatgagttg 2713135  T
Q  283 ga 284  Q
    ||    
T  2713136 ga 2713137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 244 - 373
Target Start/End: Original strand, 28276391 - 28276520
Alignment:
Q  244 agagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattcca 343  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||  || ||||||||||||| ||| | ||||    
T  28276391 agagaaaccattagaaagaatttagaggtcaataagttggattcaaatattgtttatgatagaaaactatggtgtaatttgatccatgtagccaactcca 28276490  T
Q  344 cctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28276491 cttagcgggataaggcttggttgttgttgt 28276520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10083102 - 10082786
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||  |  ||||| |||||||||||    
T  10083102 agcagggatgaggatgttgctttg-atgtgtggtaagactagacgggatagaattagaaatgagaacattagggagagcattggggtatcacctatagta 10083004  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||  ||||| |||      |||| |||||||     
T  10083003 gaaaagatggtagaaactagacttaagtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtagtaaagagagtagat------gaggggagtcaaa 10082910  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    | |  |||| ||| | ||||||||| |||||||| |||||||| | ||  |||||| ||||| | |||||||||||   | | |||||||||| ||  ||    
T  10082909 tcaccagagatagggtaagacctagaaaaactataagagaaactagtaacaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgttaacac 10082810  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||||| | |||| |||||    
T  10082809 actatgacgtcgtctgattcatgt 10082786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 154
Target Start/End: Original strand, 15168721 - 15168855
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggta--agattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 119  Q
    |||||||||| ||||||||| |  |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15168721 atgttgcgttagatgagtggcacaagattagacgagataggattaagaatgacaccattagagggagttggggggtagcacctatagtagaaaagatggt 15168820  T
Q  120 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||    
T  15168821 agaaaataggctaaggtggtttggacatgttgaga 15168855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 344
Target Start/End: Original strand, 30588460 - 30588700
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 201  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||| |||  |||||||||||| |   ||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| |||  |||||||||     
T  30588460 tataatagaaaagatggtggaaaataggtttaagtggtttgggcatattcggagaagacttgtagattctgtagtaaggagagtagat--aatggaggat 30588557  T
Q  202 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttg 301  Q
    ||||| || |  ||||  | |||||||||||| |||||||| |||||||   |||  || ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  30588558 agtcaggtcacgagagacataggaagacctagaaaaactataagagaaattgttaagaaagatctagagatgaatgagttggatcgaaatatggtttata 30588657  T
Q  302 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccac 344  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||| |||||    
T  30588658 atagaacattatgacgtgatatgatccatgtagccgactccac 30588700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 373
Target Start/End: Original strand, 79501 - 79795
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |   |||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||| ||||    
T  79501 agagagagagttggggtagtacctatagtagaaaagatggtggaaaacataattaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagtaa 79600  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||   | | ||||||  ||||||||||||| |||||||| ||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||    
T  79601 ggagagtcgatcaaatggaggatggtcggatcacaagaggctgaggaagacctagaaaaactatcagataaactattaggaatgatttggaaattaatga 79700  T
Q  279 gttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | |||| | |||||||||   ||||||| || |||| ||| |||| |||||||| || |   |||| ||| | || |||||||||| ||||||||    
T  79701 gctggaccgaaatatggtgcatgatagaccattatggcgtgatttcatccatgtagctggccccacttagtgggaaaaggcttggtggttgttgt 79795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 264 - 373
Target Start/End: Original strand, 5558314 - 5558423
Alignment:
Q  264 tttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttgg 363  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||    
T  5558314 tttagaggtcaatgagtaggatccaaatatggtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttgg 5558413  T
Q  364 ttgttgttgt 373  Q
    |||| |||||    
T  5558414 ttgtcgttgt 5558423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 69 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 43558133 - 43557832
Alignment:
Q  69 tgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 166  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||||| |||||||| |||| |||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  43558133 tgacaacattagagagagagagttagggtagcatctataatagaaaagatggtggaaactaagcttaggtggtttgggcatatagagagaagacttgtag 43558034  T
Q  167 atgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggattt 266  Q
    ||||||  ||||||||||| ||| | ||  | ||  ||||  | |  |||  | || || ||||||| |||||||| ||||||||     | || |||||    
T  43558033 atgctgcagtaagaagagtagattagataaatgatggtcatatcactaga--tggatgatgacctagaaaaactataagagaaac----cgtaaagattt 43557940  T
Q  267 agaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttg 366  Q
     ||| | | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | | |||||| |||| |||||  |||| ||| | |||||||| ||||||    
T  43557939 ggagattattgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacttaagttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataaggcctggttg 43557840  T
Q  367 ttgttgta 374  Q
    ||||||||    
T  43557839 ttgttgta 43557832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 11002785 - 11002645
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||   ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |  |||||||||||| ||||    
T  11002785 agcagagatgaggatgttgcgctggatgtgtggtaagacgagatgggatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttcgggtagcacctacagta 11002688  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtag 151  Q
    |||||  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11002687 gaaaacatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtag 11002645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 373
Target Start/End: Original strand, 30213755 - 30213857
Alignment:
Q  271 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||| |    
T  30213755 gtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgtttt 30213854  T
Q  371 tgt 373  Q
    |||    
T  30213855 tgt 30213857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 79 - 373
Target Start/End: Original strand, 14667751 - 14668053
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatgg--------tttgggcatgtagagagaagactagtagatgc 170  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||        ||||||||||||||||||||||  ||| ||      
T  14667751 agagagagagttggggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaatagacttaggtggtttggggctttgggcatgtagagagaagacatgtacatta 14667850  T
Q  171 tgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagag 270  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||  | ||| |  | |  ||||| || ||||  ||||| |||||||| |||||| | | ||  || ||| |||||    
T  14667851 tgtagtaaggagagtagatcagatggattatagttatatcactagaggcagcggaaatcctagaaaaactataagagaagctactaagaaagatctagag 14667950  T
Q  271 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
     | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||  || |||||||||||||  ||||  |||| ||| | |||||| ||||||||| ||    
T  14667951 attaatgagttggatccaagtatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataagacttggttgtagt 14668050  T
Q  371 tgt 373  Q
    |||    
T  14668051 tgt 14668053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 7678402 - 7678759
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatta-----gagagagagtgtgggtagc-acctatag 106  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||     ||||||||||  || |||| ||||||||    
T  7678402 gagatgaggatgttgcgttggatctgtggcaagactagataggataggattagaaatgacaacattagaggggagagagagttgggatagcaacctatag 7678501  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    |||||||  |||| ||||   ||||||| | |||||||| |||||||| |||||  |||||| |||| ||||| |||||     | |||||||| |||||    
T  7678502 tagaaaa-atggtggaaa--cggcttaggttgtttgggcttgtagagaaaagacatgtagattctgtagtaaggagagt-----agatggaggatagtca 7678593  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaac-aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatag 305  Q
      | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| || |||||||| | ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||| ||||| | |||     
T  7678594 gatcactagaggcagaggaagatctagtaaaaccataagagaaactatttagaaa-gatctagagattaatgagttggatcgaaatacggtttataata- 7678691  T
Q  306 aacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||||| ||  |||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||  |||||||||||||||    
T  7678692 aacattatgaggtagtttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaaacttggttgttgttgt 7678759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15489789 - 15489609
Alignment:
Q  76 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtgg 175  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||      
T  15489789 attagagagagagttggggtagtacctattgtagaaaagatggttgaaactcagcttagatggtttgggcatgtagagagaagatttgtagattttgtat 15489690  T
Q  176 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 256  Q
    |||| ||||| ||| | |||||||| |||  | | |  ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  15489689 taaggagagtagattagatggaggatagttgaatcactagaggcagaggaagacctagaaaaacaataagagaaactatta 15489609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 373
Target Start/End: Original strand, 43475243 - 43475521
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||  ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |    
T  43475243 gtagcacctatagtagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggtattcagagagaagacctgtagatgttgtagtaaggagagtagatcaga 43475342  T
Q  194 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatat 293  Q
    ||||||| |||||  | |  | ||| | | | | || ||| |||||| | |||||||| ||||  || |||  |||| | ||||||||||||| ||||||    
T  43475343 tggaggatagtcagatcactataggaaaaagtaaacatagaaaaact-taagagaaactattaagaaagatccagagattaatgagttggatcgaaatat 43475441  T
Q  294 ggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | ||| || ||||||  ||||  || |||||||||| || ||| | ||||| ||  | ||||||||||||||||||||||    
T  43475442 gatttatggtagaacgttatggtgtaatttgatccacgtagccaactccacttaatgggataaggcttggttgttgttgt 43475521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 251
Target Start/End: Original strand, 42199243 - 42199446
Alignment:
Q  46 attagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggc 145  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||  | ||| ||||||| |  ||||||||| ||  ||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  42199243 attagacgggataggattagaaatgacgacgttacagagagaattggggtagcactta--gtagaaaagatggtggaaactagacttaggtggtttgggc 42199340  T
Q  146 atgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattag 245  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||   |||||| | |  || || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  42199341 atgtagagagaagacatgtagattctgtagtaaggagagtagatcacatggagagtagtcaaatcactagggggagagaaagacctagaaaaactattag 42199440  T
Q  246 agaaac 251  Q
    | ||||    
T  42199441 acaaac 42199446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 98
Target Start/End: Original strand, 20318905 - 20318989
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20318905 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggta-----agactggataggattaggaatgacaccattagagaaagagtgggggtagc 20318989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 418318 - 418190
Alignment:
Q  40 ggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttaga--tg 137  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||  |  ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||||  ||    
T  418318 ggtaagacgagacatgatagaattagaaatgacaacattagagagag--ttggggtagcacctatggtagaaaagatggcagaaatttggcttagacctg 418221  T
Q  138 gtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  418220 gtttgggcatgtagagagaatacttgtagat 418190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Original strand, 33667217 - 33667285
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33667217 gggtagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttaggtggtttgggcatgtagagagaagac 33667285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32442224 - 32442126
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||    
T  32442224 aatgagttggatccaaatatggttttggatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtgggataa-gcttggttattgttgt 32442126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 227 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 42504393 - 42504247
Alignment:
Q  227 gacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgat 326  Q
    ||||||| |||||||| ||||||   | || |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  42504393 gacctagaaaaactataagagaagtcaataaaaaggatttagatgtcaatgagttatatccaaatatggtttatgatagaacattatgacgtaatttgat 42504294  T
Q  327 ccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | | || |  |||| ||||||| |   || |||||||||||||||||    
T  42504293 caacgtagttgatttcacctagtggtctagggcttggttgttgttgt 42504247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 121 - 316
Target Start/End: Original strand, 23979976 - 23980169
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggta 220  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||  |  |||||| || | ||||||||||| ||||| || ||  | |||||  ||| ||||||||    
T  23979976 gaaaataggtttaggtggtttggacatgtagagagaaaccctgtagattctatagtaagaagagtagatcagataga--aaagtcatattacaagaggta 23980073  T
Q  221 gaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
     ||| |||||||| | ||| || |||||||| |||   || |||||| || | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23980074 taggcagacctagaagaacaataagagaaactattgagaatgatttatagattaatgagttggatctaaatatggtttatgatagaacaatatgac 23980169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 256
Target Start/End: Original strand, 28676596 - 28676760
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||   || ||  ||| ||||| | | |  || |    
T  28676596 gggtagcagctatagtagaaaagatggtggaaaatagtcttaggtggtttcggcatgtagagagaagacctttaaattatgtcgtaaggataatatatta 28676695  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatta 256  Q
     ||||||||  ||||  ||| |||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  28676696 gatggaggattgtcagattacaagaggtagaagaagacctataaaaactataagagaaacaatta 28676760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 18351189 - 18350937
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggca-tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatc 190  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  ||   |||| ||||| ||||    
T  18351189 gggtagcacctatagtagaaaatatggtagaaactaggcttaggtggtttgggcattgtagagagaagacctgtagattatgcaataaggagagtagatc 18351090  T
Q  191 aaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaa------aggatttagaggtcaatgagttgg 283  Q
    ||| |||||  | |||| | |  ||||| ||||||| | ||| |||| |||| |||||||| ||| ||||      ||  | ||||| | ||||||||||    
T  18351089 aaaaggagggtaatcaaatcactagagg-agaggaacatcta-gaaagctataagagaaactattaagaaaaatctagactatagagattaatgagttgg 18350992  T
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18350991 atagaaatatggtatttgttagaacattatgacgtcgtttgatccatgtagccga 18350937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 213 - 372
Target Start/End: Original strand, 25938091 - 25938250
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||| ||||| ||||||   |||||| |||||||| ||||||||   ||||||| ||| ||||||| || ||||||| |||| ||| | |||||||    
T  25938091 aagaggtaaaggaatacctagactaactataagagaaactattagaaattttttagagatcactgagttgaattcaaatatagtttatgacataacacta 25938190  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
     |  || ||||||| ||||| ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25938191 cgttgtaatttgattcatgtagccgactccacatagtgagataagacttggttgttgttg 25938250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 220 - 373
Target Start/End: Original strand, 11675658 - 11675812
Alignment:
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc-aaatatggtttttgatagaacactatgacgt 318  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||| |  ||||||||| | ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| |||| |||    
T  11675658 agaggaagacctgtaaaaactataagagaaactattaggacagatttagagattaatgagttggattttaaatatggtttatgatagaacattatggcgt 11675757  T
Q  319 catttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
      ||| |||||||| |||||  |||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  11675758 agtttaatccatgtagccgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 11675812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 193 - 307
Target Start/End: Original strand, 15168873 - 15168987
Alignment:
Q  193 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaata 292  Q
    |||||||||||| |  ||| |||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||  |||| ||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||    
T  15168873 atggaggagagtgagattagaagaggtagaggacaacctagaaaaactataagagaaactgttaggaaaaatttagaggttaataagttggatccagata 15168972  T
Q  293 tggtttttgatagaa 307  Q
    |||||| ||||||||    
T  15168973 tggtttatgatagaa 15168987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 28187030 - 28186956
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagaga 85  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  28187030 cagagatgagaatgttgcattggatgtgtggtaagactagacatggtaggattagaaatgacaacattagagaga 28186956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 338
Target Start/End: Original strand, 39040917 - 39041003
Alignment:
Q  252 aattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||| |||||    
T  39040917 aattagaaaagatttagaggtcaataagttgcatctaaatatggtttttgatataacaccatagtgtcatttgatccatgtagccga 39041003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 219817 - 219692
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||  |||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  219817 agcaaagatgagaatgttgcgttggatgcgtgttaagacaagacgagataagattacgaatgacaacattggagagagagttggggtagcacctatcgtt 219718  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttag 134  Q
    |||||| |||| |||| | |||||||    
T  219717 gaaaaggtggtggaaacttggcttag 219692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 338
Target Start/End: Original strand, 9235172 - 9235294
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  9235172 agaggcagaggaagacctagaaaaacta--agagaaactattaagaaagatatagagattaatgagctggatcgaaatatggtttatgatagaacattat 9235269  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    | | | ||||||||||||| |||||    
T  9235270 ggcataatttgatccatgtagccga 9235294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 118 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15986992 - 15986879
Alignment:
Q  118 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 217  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||   |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| |||||  | | |||||    
T  15986992 gtagaaaataggtttaggtggtttgggcgtgtagagagaagatatgtagattctatagtaaggagagtggatcaaatggaggatagtcagatcacaagag 15986893  T
Q  218 gtagaggaagacct 231  Q
    ||| | ||||||||    
T  15986892 gtaaatgaagacct 15986879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 262 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 418145 - 418069
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  418145 gatttagagattaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccga 418069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 241 - 311
Target Start/End: Original strand, 2552932 - 2553002
Alignment:
Q  241 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  2552932 attagagaaagcattaaaaaggatttagatgtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacact 2553002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9917695 - 9917538
Alignment:
Q  128 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 227  Q
    ||||||| ||||||| || |||| |||||||||  || |||  ||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||| | | |||||  |||||| |    
T  9917695 ggcttagttggtttgtgcgtgtaaagagaagacatgttgattttgtagtaaagagagtcgatcagatggaggatagtcaaatcacaagagacagaggatg 9917596  T
Q  228 acctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgagttggat 285  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  9917595 acctagaaaaactattagagaaactatttagaaag-atatagagatcaatgagttggat 9917538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 373
Target Start/End: Original strand, 20367061 - 20367175
Alignment:
Q  259 aaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataagg 358  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  |||| | |   |||||||    
T  20367061 aaggatctagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgacataacattatgacgtaatttgatccatatagccaaccccacttggtaggataagg 20367160  T
Q  359 cttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||    
T  20367161 cttggttgttgttgt 20367175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 244
Target Start/End: Original strand, 36200769 - 36200894
Alignment:
Q  118 gtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagag 217  Q
    |||||||||| | |||| ||||||  |||||||||||||| || |||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||  | ||||     
T  36200769 gtagaaaatatgattaggtggttttagcatgtagagagaaaaccagtaaatgatgtagtatgaagagtagatcagatagaggagagtaaag-aagaagat 36200867  T
Q  218 gtagaggaagacctaggaaaactatta 244  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  36200868 gtagaggaagacctagaaaaactatta 36200894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 375
Target Start/End: Original strand, 2393039 - 2393163
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagag 352  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||| | |||||| ||||||   ||||||||||||||| |||||| |||| ||  | |    
T  2393039 attagaaaagatttagaggtcaatgaattagacccaaatatagtttctaatagaatactatggtatcatttgatccatgtagccgatcccacttaatggg 2393138  T
Q  353 ataaggcttg--gttgttgttgtat 375  Q
    |||| |||||  |||||||||||||    
T  2393139 ataaagcttgttgttgttgttgtat 2393163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 375
Target Start/End: Original strand, 31220546 - 31220666
Alignment:
Q  254 ttagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagaga 353  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | | ||||| |||||||||||||| | | |||| | |  ||  ||||    
T  31220546 ttagaaaagattttgagatcaatgagttggatctaaatatgatttttgatag-atattatgatgtcatttgatccatatagtcgatcctatttaatgaga 31220644  T
Q  354 taaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  31220645 taaggtttggttgttgttgtat 31220666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 159
Target Start/End: Original strand, 31906592 - 31906729
Alignment:
Q  22 atgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtag 121  Q
    |||||||||| |||||  ||||| | |||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||  |||||| | ||||||||||||| |    
T  31906592 atgttgcgttcgatgaacggtaaaactagacggaataggattaggaatgacatcattagggagagagtgagagtgacacctacaatagaaaagttggtcg 31906691  T
Q  122 aaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
     |||||  ||||||| |||| | |||||||| ||||||    
T  31906692 gaaatattcttagatagtttagacatgtagatagaaga 31906729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Original strand, 32366187 - 32366260
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||  ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  32366187 tgatagaacattatgacgtcatttgatccatgtggccaaccccatgtagtgggataaggcttggttgttgttgt 32366260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Original strand, 38132545 - 38132618
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  38132545 tgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtggccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 38132618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 20 - 88
Target Start/End: Original strand, 5305545 - 5305613
Alignment:
Q  20 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||    
T  5305545 ggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacaagatagaattagaaataacaacattagagagagag 5305613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 128 - 232
Target Start/End: Original strand, 11675547 - 11675651
Alignment:
Q  128 ggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaag 227  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||| ||||| ||||| ||||| | |||||| |||||  | |||||| ||||||||||    
T  11675547 ggcttaggtggtttgggcatgttgagagaaggcctgtagattctgtagtaaggagagtagatcatagggaggatagtcagatcaaaagatgtagaggaag 11675646  T
Q  228 accta 232  Q
    |||||    
T  11675647 accta 11675651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 309
Target Start/End: Original strand, 14725640 - 14725736
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    |||||||||||||| | |||| |||| ||| ||| |||| |||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  14725640 aagaggtagaggaaaagctagaaaaattataagataaactattataaaagatttaaaggttaatgagttggatcaaaatatggtttatgatcgaaca 14725736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 408565 - 408494
Alignment:
Q  302 atagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  408565 atagaatactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 408494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 373
Target Start/End: Original strand, 2090556 - 2090695
Alignment:
Q  234 gaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtg 333  Q
    ||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||  |||| |||| ||| |||||||||||||     
T  2090556 gaaaactataagagaaaatattaggaaagatttagaggttaatgagcttgatccaaatatagtttatgatccaacattatggcgtaatttgatccatgta 2090655  T
Q  334 gccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||||  |||   || | |||||||||| |||||||||||    
T  2090656 cccgaccccattgagtgggataaggctttgttgttgttgt 2090695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 3442952 - 3442873
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||    
T  3442952 atggtttttgatagaacactatggcgtcgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggcataaggcttggttgttgtt 3442873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 282 - 373
Target Start/End: Original strand, 18855798 - 18855889
Alignment:
Q  282 ggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||  | | ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||| |||||||||||||||    
T  18855798 ggatccaaatatggtttatgatagaacattatagcataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataagacttggttgttgttgt 18855889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 206
Target Start/End: Original strand, 21093772 - 21093867
Alignment:
Q  111 aaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||| ||||  ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  21093772 aaagttggtggaaaataggcttaggtagtttgggcatgtagagggaagacttggagattttgtagtaaagagagtagatcagatggaggatagtca 21093867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 294
Target Start/End: Original strand, 29938126 - 29938314
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag 201  Q
    |||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  || | ||||||||||||  |||||| | |||||||| | ||| |||   ||| ||||     
T  29938126 tataatagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttaagcctatagagagaagacctgtagattcggtggtaaggacagtagattggatgaaggat 29938225  T
Q  202 agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 294  Q
    |||||  | | ||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||| ||||| || ||||||  | | ||||||||||||  |||||||    
T  29938226 agtcagatcacaagaggtagaggaagacctagaaaaact----gagaaactattaggaatgatttaatgattaatgagttggattgaaatatg 29938314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33158057 - 33157918
Alignment:
Q  147 tgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattaga 246  Q
    ||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||| |||| |||||||| | |||||||||| ||| |||| |||    
T  33158057 tgtagagagaaaacatgtagattctgtagtaagaagagtagatcaaatataagatagtcatgttacaagaggtataagaagacctagaaaacctataaga 33157958  T
Q  247 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 286  Q
    ||||| | || |||  ||||| || | |||||||||||||    
T  33157957 gaaactactaaaaaatatttatagattaatgagttggatc 33157918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 113
Target Start/End: Original strand, 34039960 - 34040059
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||   ||||||  ||||||||||||    
T  34039960 agatgaggatgtcgcgttggatgaatgataaaactagatatgataggattaaaaattacaccattagagagagaatgaatgtagcatgtatagtagaaaa 34040059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 373
Target Start/End: Original strand, 38684471 - 38684762
Alignment:
Q  82 gagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaa 181  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| || || |||| |||| ||  |||| |||||||  |||||||||||||||||  ||  || || | ||||| |    
T  38684471 gagagagtcagggtagcacctatagtataatagatggtggaaactaaacttaaatggtttcagcatgtagagagaagacctgtgtattctatagtaagga 38684570  T
Q  182 gagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagtt 281  Q
    ||||  || | ||||||| || || | | |  ||| ||| |||||||||||| |||||||  ||||||||  |||  || ||| ||||| | ||| ||||    
T  38684571 gagtatattagatggaggggattccaatcactagatgtaaaggaagacctagaaaaactacaagagaaacttttaagaaagatctagagattaattagtt 38684670  T
Q  282 ggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||  |||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| |  ||  |||| ||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  38684671 ggatagaaatatggtacttgatagaacattatggcgttatttgattcatgtagttgaccccacttagtggaataaagcttggttgttgttgt 38684762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7640592 - 7640510
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||| |||||||||    
T  7640592 aaatatggtttatgatagaacactacggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggaataaggctcggttgttgt 7640510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 73
Target Start/End: Original strand, 36200702 - 36200764
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgaca 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | | |||| ||||||||||||||    
T  36200702 cagagatgaggatgttgcgttggatgagcggtaagactaaataggataagattaggaatgaca 36200764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 373
Target Start/End: Original strand, 28411838 - 28411958
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagag 352  Q
    ||||| |||||| ||||| | ||||| |||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||| |||  |||||| ||||| |||||  |||| ||| | |    
T  28411838 attaggaaggatctagagataaatgacttggagaaaaacatgttttctgatagaacactatggcgttgtttgattcatgtagccgaccccacttagtggg 28411937  T
Q  353 ataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  28411938 ataaggcttggttgttgttgt 28411958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 373
Target Start/End: Original strand, 36551320 - 36551428
Alignment:
Q  265 ttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggt 364  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||| |  |||| || || |   | ||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||    
T  36551320 ttagagattaatgagttgcatccaaatatggtttgtattagatcattacggtataatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggt 36551419  T
Q  365 tgttgttgt 373  Q
    |||||||||    
T  36551420 tgttgttgt 36551428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 159
Target Start/End: Original strand, 37065533 - 37065597
Alignment:
Q  95 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  37065533 tagcacctatagtagaaaagatggtagaaactagacttgggtcatttgggcatgtagagagaaga 37065597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 42504501 - 42504446
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtaga 110  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42504501 gatatgattaggaatgacatcatcagagagagagtgggggtagcacttatagtaga 42504446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 12577019 - 12576861
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||  ||| |||| ||||  || ||| ||||| | ||||||||| ||  ||||||||| | ||||||| || |||    
T  12577019 agaggcagaggaagacctagaaaaactacaagataaactattaagaaagatctagagattaatgagttgaatagaaatatggtatatgatagaccattat 12576920  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |  ||||||| || ||||| |||||  |||  ||| | ||||| |||||||||||||||    
T  12576919 ggtgtcattttatacatgtagccgaccccaattagtgggataaagcttggttgttgttg 12576861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15588546 - 15588399
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||  |||||||||   ||||||||||||  ||| ||||| | ||| |||||| ||||    
T  15588546 gaggcagaggacgacctagaaaaactataagagaaactattataa--gatttagagagaaatgagttggataaaaacatggtatatgacagaacattatg 15588449  T
Q  315 acgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggt 364  Q
     |||| ||||||| |||| |||||  | || ||| | |||||||||||||    
T  15588448 gcgtcgtttgatctatgtagccgaccctacttagtgggataaggcttggt 15588399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 53
Target Start/End: Original strand, 27998343 - 27998385
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagaca 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27998343 cagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagaca 27998385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 216 - 373
Target Start/End: Original strand, 29922409 - 29922566
Alignment:
Q  216 aggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatga 315  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||  || ||||||||| | ||  |||||||   |||  ||||||  ||||||||| ||||     
T  29922409 aggtagaggaagatctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatttagagattaacaagttggactgaaacctggtttacgatagaacattatgg 29922508  T
Q  316 cgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||||||||||||| ||| |   ||| | | | |||||| |||||||||||||||    
T  29922509 cgtaatttgatccatgtagccaacctcacttggtgggataagccttggttgttgttgt 29922566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 371
Target Start/End: Original strand, 33667562 - 33667715
Alignment:
Q  218 gtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacg 317  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||   ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   | | |||||||||||||||||||| || ||    
T  33667562 gtaggggaagacctagaaaaactataagagaagttattaagaaggatctagagattaatgagttggagaaagacatggtttttgatagaacactttggcg 33667661  T
Q  318 tcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |  |||||| | ||| ||| |  |||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  33667662 ttgtttgattcgtgtagccaaccccacttattgggataaggcttggttgttgtt 33667715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 92 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38578802 - 38578625
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||  ||||||  | | || || ||| | |||||    
T  38578802 gggtagcacctctattataaaagatggtagaaactaaacttaggtggtttgagcatgtaaagagaagacatgtagattatatagttagcagattagatca 38578703  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttaga 269  Q
     || |||||||||||| | |  ||| |||| || |||||||| |||||||  |||||||| ||||  |||||| ||||    
T  38578702 gatcgaggagagtcaaatcactagatgtaggggtagacctagaaaaactacaagagaaactattatgaaggatctaga 38578625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 84
Target Start/End: Original strand, 9234986 - 9235062
Alignment:
Q  8 gagcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagag 84  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  9234986 gagcagagatggaaatgttgcattggatgtgtggtaagactagacgggataggattataaatgacaacattagagag 9235062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 244
Target Start/End: Original strand, 27799892 - 27799996
Alignment:
Q  140 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaac 239  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||| ||||   | |  ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  27799892 ttgggcatgtagagagaagagatgtagatgttgtagtaagaagattagatcatatggaggatagtcggatcactagaggcagagtaagacctagaaaaac 27799991  T
Q  240 tatta 244  Q
    |||||    
T  27799992 tatta 27799996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 41833874 - 41833795
Alignment:
Q  83 agagagtgtgggtagcacctatagta--gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||  |||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41833874 agagagttggggtagcacctatggtatagaaaagatggtggaacatatgcttaggtggtttgggcatgtagagacaagac 41833795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 34194850 - 34194783
Alignment:
Q  19 aggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 86  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||| ||||  | ||||||||||||    
T  34194850 aggatgttgtgttggatgtgtggtaaaactagacaggataggattagaaatgtaaacattagagagag 34194783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 338
Target Start/End: Original strand, 37065632 - 37065723
Alignment:
Q  247 gaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | | ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||| |||||    
T  37065632 gaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatagagcactatgaagtcgtttgattcatgtagccga 37065723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 149 - 332
Target Start/End: Original strand, 43035039 - 43035222
Alignment:
Q  149 tagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagaga 248  Q
    ||||||||||||   ||||| |||| ||| | ||||| |||||||| ||||| |||||| | |  ||||| ||||||||| |||| ||||| ||  ||||    
T  43035039 tagagagaagacgtctagattctgtagtagggagagtagatcaaatcgaggatagtcaactcactagaggcagaggaagaactagaaaaaccatctgaga 43035138  T
Q  249 aacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||| ||||| ||  |||| ||  |  |||||||||| | ||||||||| | |||||||||| |||| |||  ||| ||||||||    
T  43035139 aactattaggaaaaatttggaaatttatgagttggaccgaaatatggtgtatgatagaacattatggcgttttttaatccatgt 43035222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4026627 - 4026529
Alignment:
Q  81 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaag 179  Q
    |||||||||  ||||| ||| || |||| ||||| |||| |||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||  |||||| |||| |||||    
T  4026627 agagagagttggggtaacacgtaaagtaaaaaagatggtggaaactagtcttaggtggtttggacatgtagagaggagacctgtagattctgtagtaag 4026529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 6368282 - 6368220
Alignment:
Q  16 atgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccatt 78  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| ||||    
T  6368282 atgaggatgttgcgttagatgtgtggtaagaatagacgagatagaattagaaatgacaacatt 6368220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 5848440 - 5848403
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 46  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5848440 agcagagatgaggatgttgcattggatgtgtggtaaga 5848403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 380
Target Start/End: Original strand, 9234106 - 9234175
Alignment:
Q  311 tatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtatttgtt 380  Q
    |||||| | |||||||||||||  ||||  |||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9234106 tatgacataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgggataaggcttgattgttgttgtatttgtt 9234175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 374
Target Start/End: Original strand, 27386554 - 27386623
Alignment:
Q  305 gaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  27386554 gaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcatggttgttgttgta 27386623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 159
Target Start/End: Original strand, 27553842 - 27553899
Alignment:
Q  102 tatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    ||||||||||||  || || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27553842 tatagtagaaaatatgatataaaataagcttaggtggtttgagcatgtagagagaaga 27553899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 38341698 - 38341641
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgt 149  Q
    |||||||| ||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38341698 gggtagcagctatagtagaaaagacagtggaaaataggcttaggtggtttgggtatgt 38341641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 373
Target Start/End: Original strand, 42576219 - 42576292
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||  | || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42576219 tgatagaacataatggcgtaatttgatccatgtagccgacccgacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42576292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 43558172 - 43558135
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagac 52  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  43558172 gatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagac 43558135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 86
Target Start/End: Original strand, 2788583 - 2788623
Alignment:
Q  46 attagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag 86  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||    
T  2788583 attagacatgatagaattaggaatgataacattagagagag 2788623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 338
Target Start/End: Original strand, 6788190 - 6788314
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||| || || || ||  | |||||||||||   ||||||| ||| |||||||||| |||    
T  6788190 agaggcagaggaagacctagaaaaactatcaaaggaactattaggaaagacttggaaattaatgagttggactgaaatatgatttatgatagaacattat 6788289  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
      ||| ||||||| ||||| |||||    
T  6788290 agcgtaatttgattcatgtagccga 6788314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21193748 - 21193652
Alignment:
Q  277 gagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||| |||||  ||||  |||| ||| |  ||||||||||||| |||||||    
T  21193748 gagttggatagaaatatggtttatgatagatcattatgacataatttgattcatgtatccgaccccacgtagtggaataaggcttggttattgttgt 21193652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 262 - 298
Target Start/End: Original strand, 41894237 - 41894273
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggttt 298  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41894237 gatttagagattaatgagttggatccaaatatggttt 41894273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 301 - 373
Target Start/End: Original strand, 42272687 - 42272759
Alignment:
Q  301 gatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || ||  |||| ||| | |||||||||  |||||||||||    
T  42272687 gatagaacattatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggctaagttgttgttgt 42272759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 115)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 3865990 - 3866354
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3865990 agcagagatgatgatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattggagagagagtgggggtagcacctatagta 3866089  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  3866090 aaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgtgcatgtagagagaagacccgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagacaaa 3866189  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  3866190 ttaaaagaggtagaggaaaacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 3866289  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  |||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  3866290 actatgacatcatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 3866354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 9 - 371
Target Start/End: Original strand, 8180698 - 8181060
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8180698 agcagagatgaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 8180797  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8180798 gaaaagttggtagaaaataagcttagatggtttgggcatgtagagagaagacctgtggatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaag 8180897  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  8180898 ttaaaagcggtagaggaagacataggaaaactattagataaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaac 8180997  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||   |||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||| |||||||||    
T  8180998 actatagtgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttcgttgttgtt 8181060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 38429806 - 38430165
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  38429806 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggcagcacctatagtagaaa 38429905  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  38429906 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtatatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 38430005  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38430006 aagaagtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 38430105  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38430106 tggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttgg-tgttgttgt 38430165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 9 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38453053 - 38452684
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctat 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||    
T  38453053 agcagacatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatcataggattaggaatgacaccattagagagagagagagtgggggtagcatctat 38452954  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||    
T  38452953 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaaga-tagatcaaatggaggaaagt 38452855  T
Q  205 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgata 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||    
T  38452854 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgata 38452755  T
Q  305 gaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
     |||||||||  |||||| ||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38452754 aaacactatggtgtcattcgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 38452684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 36183369 - 36183733
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36183369 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacacaattagagagagagtaggggtagcacctatagta 36183468  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  36183469 gaaaagttggtagaaaataatcttagttggtttcggcatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagataaaatggaggagagtcaag 36183568  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | | |||||||||    
T  36183569 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaagtcaatgagttggatccaaatttgatgtatgatagaac 36183668  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||  | |||||||||||||| |||||  |||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  36183669 actatggtgccatttgatccatgtagccgaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgt 36183733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 9 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3244015 - 3243654
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  3244015 agcagagataaggatgttgcgttggatgagtagtaagactacacatgataggattatgaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagta 3243918  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
     |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3243917 aaaaagttgatggaaaataggcttagatggtttgggaatgtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagaatagatcaaatggaggagagtcaag 3243818  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaac 308  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||    
T  3243817 ttaaaagaggcagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaagtttggtgtatgatagaac 3243718  T
Q  309 actatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  3243717 actatggcgtcatttgatccaggtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttg 3243654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 9 - 373
Target Start/End: Original strand, 4807510 - 4807877
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag----tgtgggtagcacctat 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    || |||||||||||||    
T  4807510 agcagagatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagaatagacatgataggattatgaatgacatcattagagagagagagagtgggggtagcacctat 4807609  T
Q  105 agtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagt 204  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  4807610 agtagaaaagttggtagaaa-taggcttagatagtttcggcatatagagagaagactcgtagatgtcgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagt 4807708  T
Q  205 caagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgata 304  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||    
T  4807709 caagttaaaagaggtagatgaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagtatttagaggtcaatgagttggatccaaattcggtgtacgata 4807808  T
Q  305 gaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  4807809 gaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 4807877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 12734623 - 12734982
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  12734623 gagatgaggatgttgtgctggatgagtggtaagactagacgggataggattagaaatgacaccattagagagag--tgggggtagcacctatagtagaaa 12734720  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12734721 aattggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 12734820  T
Q  213 aagagg-tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12734821 aagagggtagagggagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacact 12734920  T
Q  312 atgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||  || ||||||||||||| | |||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12734921 atggtgtaatttgatccatgtagtcgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12734982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11992466 - 11992107
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  11992466 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaatactagacatgataagattaggaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaa 11992369  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  11992368 agttggtagaaaataagcttagatggtttggacatatagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagagtggatcaaatggaggagagtcgggttaa 11992269  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  11992268 aagaggtaaaggaagacctaagaaaaccattagggaaatcattagaaaggatttagaggtcaatgagttagatccaaatatgatttttgatagaacatta 11992169  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    || ||| ||||||||||||| || ||  |||| ||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  11992168 tggcgttatttgatccatgtagctgaccccacttagtggaataaggcttggttgttgttgta 11992107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41197588 - 41197227
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41197588 gagatgaggatgttgcgctagatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagatagagtgagggtagcacctataatagaaa 41197489  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtt-a 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  41197488 agttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaagatccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 41197389  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    ||| |||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  41197388 aaaaaggtagagaaagacctaagaaaaccatttgagaaaccattataaaagatttagaggtcaacgagttggatcccaatatggtttttgatagaacatt 41197289  T
Q  312 atgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||||||||||||||||| | |||  |||| |   | ||||||||||||||||||||||    
T  41197288 atggcgtcatttgatccatgtagtcgaccccacttgatgggataaggcttggttgttgttgt 41197227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 41763401 - 41763043
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41763401 gagatgaggatgttgcgatggatgagtggtaagactagacaagataggattaggaatgacaccattagagagagagtg-gggtaacacctatagtagaaa 41763303  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41763302 agttggtagaaaataggcttaggtggtttggacatgcagagagaagacctgtagatgccgttgtaagaaaagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 41763203  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    || ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  41763202 aaaaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaaaattta-aggtcaattagttggatccaaatatgttttttgatagaacaccc 41763104  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     | ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  41763103 gggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 41763043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 79 - 373
Target Start/End: Original strand, 2610576 - 2610870
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||    
T  2610576 agagagagagtgggggtagcacctatagtggaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacacgtagatgtcgtggtaa 2610675  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga 278  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2610676 gaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctatgaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatga 2610775  T
Q  279 gttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2610776 gttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgttatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgt 2610870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 45367984 - 45367625
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  45367984 gagatgatgatgttgcgctggatgaatggtaagactagacaagataggattaagaatgacaccattagagagagtggg-gggtagcacctatagtagaaa 45367886  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  45367885 agttggtagaaaataaccttagatggtttggacatgtagagagaagacccgtagatgccgttgttagaagggtagatcaaatggaggagagtctagttaa 45367786  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45367785 aagaggtagaggaagactcaagaaaaccattagagaaatcattagaaaggatttagaggtaaatgagttggatccaaatatgatttttgatagaacacta 45367686  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||  |||| ||||||||||    
T  45367685 tgacgtcatttgatccatgtcgccgaccccacttagtgggataaaacttgtttgttgttgt 45367625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 62 - 373
Target Start/End: Original strand, 25834650 - 25834960
Alignment:
Q  62 ttaggaatgacaccattagag--agagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25834650 ttaggaatgacaccattagagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagaaga 25834749  T
Q  160 ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaa 259  Q
    |  || ||||| || ||||||||||| ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  25834750 cctgtggatgccgttgtaagaagagtagatcaaatggag--gagttaggttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaact-ttaaagaaaccattagaa 25834846  T
Q  260 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||    
T  25834847 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacactgtggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 25834946  T
Q  360 ttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||    
T  25834947 ttggttgttgttgt 25834960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18424728 - 18424377
Alignment:
Q  20 ggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggt 119  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  18424728 ggatgttacgtcggatgagtggtaagactagatatgatatgattaagaatgataccattagagagagtgggtg--tagcatctatagtagaaaagttggt 18424631  T
Q  120 agaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||| |  ||||||||| | |||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  18424630 agaaaataggcttagatggtttggacatgtagagagacgacccgtagatgccgacgtaagaagattagatcaattggatgagagtcaggttaaaagaggt 18424531  T
Q  220 agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtc 319  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18424530 agaggaagacataggaaaactattagagaaaccattataaaggatttagagatcaataagtttgatccgaatatggtttatgatagaacactatgacgtc 18424431  T
Q  320 atttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    |||||||||||||  |||   |||| ||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  18424430 atttgatccatgt-accgtccccacttagtgggataagacttggttgttgttgta 18424377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 112 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 451909 - 451648
Alignment:
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  451909 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagaaaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaagtta 451810  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | ||||||||||||    
T  451809 aaaaaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcagtgagttggatccaaatttagtgtatgatagaacact 451710  T
Q  312 atgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | || |||||||||||||||||||    
T  451709 atggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggacaaggcttggttgttgttgt 451648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 133 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 7326400 - 7326160
Alignment:
Q  133 agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7326400 agatggtttgggcatgtagagagaagacctgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatgaaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacata 7326301  T
Q  233 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7326300 ggaaaactattagagaaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgt 7326201  T
Q  333 ggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||| |  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  7326200 agccaaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 7326160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 98 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24583907 - 24583631
Alignment:
Q  98 cacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatgga 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24583907 cacctataatagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagacccgtagatgctgtcgtaagaagagtagatcaaatgga 24583808  T
Q  198 ggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg-gt 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||  |  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  24583807 ggagagtcaagttaaaagagatagatgaagacaaaaaaaaactaatagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat-caaatttgagt 24583709  T
Q  297 ttt-tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||| ||| |||| |||||  |||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  24583708 tttgtgatagcacactatgacgtaatttaatcaatgttgccgaccccacttaatgagataaggcttggttgttgttgt 24583631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 163 - 378
Target Start/End: Original strand, 28508750 - 28508965
Alignment:
Q  163 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 262  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28508750 gtagatgccgtggtaataagagtagatcaaatggaggagagtcaagttaaaagatgtagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaagg 28508849  T
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttg 362  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||    
T  28508850 atttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttg 28508949  T
Q  363 gttgttgttgtatttg 378  Q
    ||||||||||| ||||    
T  28508950 gttgttgttgtttttg 28508965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 13 - 332
Target Start/End: Original strand, 23997539 - 23997843
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||   |||    
T  23997539 gagatgaagatgttgcgctggatgagtggtaagactagacatgatcggattaggaatgacaccattagagatagagtgggtgtagcacctatag---aaa 23997635  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||  |||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23997636 atttggtagaaaatagccttagatggttttgacatgtagaaagaagacccgtagatgtcgttgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 23997735  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||||| || ||||||||| ||            |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23997736 aagaggtggaagaagacctaaga------------aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataaaacacta 23997823  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    || ||| ||||||| |||||    
T  23997824 tggcgttatttgattcatgt 23997843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Original strand, 38434873 - 38435234
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||  || | |||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  38434873 gagatgaggatgttgcattggatgcgtggtaaaactagacgagagaagattagaaatgacaacattagagagagaattggggtagcacctatagtagaaa 38434972  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttaga-tggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagtta 211  Q
    || |||| |||| ||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||  | |    
T  38434973 agatggtggaaactagactttgggtggtttgggcatgtaaagagaagacttgtagatgctttagtaaggagagtagatcatatggaggatagtcagatca 38435072  T
Q  212 aaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
      ||||| ||||| |||||||| |||||||  |||||||| ||||  || ||| ||||| | |||| |||||||| |||| |||||| |||| ||||| |    
T  38435073 ctagaggcagaggtagacctagaaaaactacaagagaaactattaagaaagatctagagattaatgtgttggatcgaaatttggtttatgattgaacatt 38435172  T
Q  312 atgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| |  |||||||||||||||||||||    
T  38435173 atggcgtaatttgatccatgtagccgatcccacttagtggcataaggcttggttgttgttgt 38435234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 17 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9556724 - 9556369
Alignment:
Q  17 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagtt 116  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||| |||||||||||| |     
T  9556724 tgaggatgttgtgttggatgtgtggtaagattagacgggatatgattagaaatgacaacattagagagaaagttggggtaacacttatagtagaaaaat- 9556626  T
Q  117 ggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaaga 216  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||  |||| |||||||| ||||||  ||  |||    
T  9556625 ggtggaaaataggcttaggtggtttaggcatgtagagagaagacaagtagattctgtagtaagaaaagtatatcagatggaggatagtcaaactactaga 9556526  T
Q  217 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
    || | |||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||  || ||| ||| | | ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| || |      
T  9556525 ggcaaaggaagaccttgaaaaactataagataaactattaagaaagatctagtgattaatgagttggatcaagatatggtttatgatagaacattagggt 9556426  T
Q  317 gtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    || ||||||| ||||| ||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  9556425 gtaatttgatacatgtagccgactccacttagtgggatgaggcttggttgttgttgt 9556369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 6238110 - 6237812
Alignment:
Q  17 tgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta--gaaaag 114  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||    ||||||||| |  |  || |||    
T  6238110 tgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacatgatagaattaggaatgacaccaatgg-gagagagtggacatagcacctaaaaaaaagataag 6238012  T
Q  115 ttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaa 214  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| | |  || ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||    
T  6238011 ttggtagaaaacatgcttagatggtttggacatgtagagagtagacccgtaaacgtcgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagacatgtcaaaa 6237912  T
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6237911 gaggtagagtaagacctagaaaaactagaagataaaccattagaaatgatttagaggtcaatcagttggattcaaatatagtttatgatagaacactatg 6237812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 148 - 332
Target Start/End: Original strand, 39029638 - 39029822
Alignment:
Q  148 gtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 247  Q
    |||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||    
T  39029638 gtagagaggagacccgtagatgccgttgtaagaagagtagatcaattggaggaaagtcaggtaaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaacattcgag 39029737  T
Q  248 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  39029738 aaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacattatggcgtcatttgatccatgt 39029822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 208 - 373
Target Start/End: Original strand, 35643065 - 35643230
Alignment:
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  35643065 gttaaaagaggtagagaaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaa 35643164  T
Q  308 cactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35643165 cactatgacatcatttaatacatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 35643230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 195 - 374
Target Start/End: Original strand, 31959625 - 31959804
Alignment:
Q  195 ggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 294  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31959625 ggaggagagtcaggtcaaaagagttaggcgaagacctaggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatg 31959724  T
Q  295 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    |||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||  |||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  31959725 gtttatgatagaacactatggcataatttgatccatgtagcagaccccacttagtaggataaggcttggttgttgttgta 31959804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 92 - 373
Target Start/End: Original strand, 12141545 - 12141826
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||| || | ||||| ||||| |||||    
T  12141545 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaagaggcttaggtggtttgggcacgtagaaagaagacctgtagattctctagtaaggagagtagatca 12141644  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
     || ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||| || || |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  12141645 gattgaggatagtcaaattacaagaggtagaggaagacctagaaaagctataggagaaactattaggaaagacttagagattaatgacttggatccaaat 12141744  T
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| | |||||||||| |||| | | |||||||| |||| ||| |  |||  ||| | | ||||||||| ||||||||||    
T  12141745 atggtatatgatagaacattatggcatgatttgatcgatgtagccaaccccatttagtggggtaaggcttgattgttgttgt 12141826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 76 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 43752244 - 43751982
Alignment:
Q  76 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtgg 175  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||   |||||  ||| |    
T  43752244 attagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaaggtggtagaaaataggcttaggtgatttggacatgtagagagaagacctatagattatgtag 43752145  T
Q  176 taagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaa 275  Q
    || | ||||| ||||| |||||||| | |||  | |   |||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||  | ||    
T  43752144 tagggagagtagatcagatggaggatactcagatcactggaggcataggaagacctagaaaaactatcagagaaactattaggaaagatttggaaattaa 43752045  T
Q  276 tgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    ||||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  43752044 tgagttggaccgaaagatggtgtatgatagaacactatgttgtaatttgatccatgtggccga 43751982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 4598928 - 4598569
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatag 106  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |||   ||||||  |||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  4598928 agcagaaatgatgatgttgcgttggatgtgtggtaagactagacgggatagaattcaaaatgacgacattagagagagagagttggggtagcacctatag 4598829  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    ||| |||| ||||||||| ||| ||| | |||||||| ||| |||| |||||||| ||  ||  ||| ||||| | |   ||| ||||||||| ||||||    
T  4598828 tagtaaagatggtagaaactagactttggtggtttggacatatagaaagaagacttgtgaattttgtagtaagtataacagataaaatggaggggagtca 4598729  T
Q  207 agttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgataga 306  Q
     || |  |||||||| || | |||||| ||||||||  ||||| | ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | | || | ||||||||||    
T  4598728 ggtcactagaggtagtggtaaacctagaaaaactatacgagaagctattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatagattttgataga 4598629  T
Q  307 acactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttg 366  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  4598628 acactatggcgtcatttgattcatgtaaccgattccacttagcgggataaggcttggttg 4598569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 16097350 - 16097199
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagag----agtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||   |||| |||||| ||||||||| ||||||||||    |||| |||||||||||||| ||    
T  16097350 gagatgaggatgttgcactggatgagtggtaagactagatgggatatgattagaaatgacaccgttagagagagttagagtgggggtagcacctataata 16097251  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16097250 gaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttggacatgtagagagaagac 16097199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 253 - 373
Target Start/End: Original strand, 30306194 - 30306314
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagag 352  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |    
T  30306194 attagaaaggatttagaggtcattgagttggatccaaatttggtttatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 30306293  T
Q  353 ataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30306294 ataaggcttggttgttgttgt 30306314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 372
Target Start/End: Original strand, 18958908 - 18959192
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgg----gcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtgg 187  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    ||||| |||||||||||  | || |  ||| ||||| ||||| |    
T  18958908 gggtagcacctatagtagaaaagatggtggaaaataggcttaggtggtttggttgggcatgcagagagaagacctgcagcttttgtagtaaggagagtag 18959007  T
Q  188 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatcc 287  Q
    |||| |||||||| |||||  | |  ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||| || || || || || ||| | |||||||||||||     
T  18959008 atcagatggaggatagtcagatcatcagaggcagaggaagacctagaaaaactacaagagaaactataaggaaagacttggagattaatgagttggatca 18959107  T
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| | | ||||||||||||| || ||  |||| ||| | |||||||||||||| ||||||    
T  18959108 aaatatggtctatgatagaacattatggcataatttgatccatgtagctgaccccacttagtgggataaggcttggttattgttg 18959192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 44437994 - 44437721
Alignment:
Q  100 cctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||  |||| ||  | ||| | |||||||    
T  44437994 cctatagtagaaaagatggtagaaactagacataggtggtttcggcatgtagagagaagacttgtggattctgtaataaggagtatagatgagatggagg 44437895  T
Q  200 agagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttt 299  Q
     ||||||  | |  |||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||| ||||  |||||| ||||| | |||||||||||   ||| ||||||||    
T  44437894 ggagtcagatcactagaggtaggggtagacctagaaaaactatatgagaaactattaagaaggatctagagataaatgagttggagaaaaacatggtttt 44437795  T
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||| |||  ||| || ||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44437794 tgatagaacactatggcgttgtttaattcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 44437721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 271 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3635425 - 3635323
Alignment:
Q  271 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  3635425 gtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgt 3635326  T
Q  371 tgt 373  Q
    |||    
T  3635325 tgt 3635323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 233 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9996766 - 9996622
Alignment:
Q  233 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | | |||||||||||||    
T  9996766 ggaaaactataagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaacgagttggatccaaatatggtttatgattaaacactatggcataatttgatccatgt 9996667  T
Q  333 ggccgattccacct---agagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
     |||||  |||| |   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  9996666 agccgaccccacttagaagagggataaggcttggttgttgttgta 9996622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 260 - 373
Target Start/End: Original strand, 227358 - 227471
Alignment:
Q  260 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggc 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||    
T  227358 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggc 227457  T
Q  360 ttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||||    
T  227458 ttggttgttgttgt 227471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 211 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 45543234 - 45543074
Alignment:
Q  211 aaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacac 310  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||     
T  45543234 aaaagaggtagaggaagacctggaaaaactataagagaaactattagaaaagatttagaggt-aatgagttcgatccaaatatggtttatgatagaacat 45543136  T
Q  311 tatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||| |||  ||||||| |||| |||||  |||| ||| | ||||| ||||| |||||||||    
T  45543135 tatggcgtactttgatctatgtagccgaccccacttagtgggataatgcttgcttgttgttg 45543074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Original strand, 7825276 - 7825475
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgt--gggtagcacctatag 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  7825276 agcagagattaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactggatatgattagaaatgacactattagagagagagtgttggagtagcacctatag 7825375  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtca 206  Q
    | | |||  ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||| || | || || ||||| ||| | |||||||| |||||    
T  7825376 ttgtaaatatggtgaaaaataagcttagttggtttgagcatgtagagagaagacatgtagattctatagtcaggagagtagatgagatggaggatagtca 7825475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 326
Target Start/End: Original strand, 41545325 - 41545640
Alignment:
Q  10 gcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagt-a 108  Q
    ||||||||  |||||||  |||||||||  |||| |||||||   | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| | |    
T  41545325 gcagagatcgggatgttatgttggatgaacggtatgattagatgaggtaggattaagaatgacaccattagggagagagcgagggtaacacctataataa 41545424  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagact-agtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaa 207  Q
     |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||| ||  |||||||  || ||   ||||||  |||| ||||||||  |||||    
T  41545425 aaaaagttggtagaaaatatgcttaaatagtttgagcatgtagaaagaagtctctgtagatgtcgttgt---aagagtatatcagatggaggattgtcaa 41545521  T
Q  208 gttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaa 307  Q
    |  |||||||     |||||| | || |||||||| |||||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  41545522 gccaaaagagacgacggaagagcaagaaaaactataagagaaaccattataaaagatgtagaggtccatgagttgaattcaaatatggtttatgatagaa 41545621  T
Q  308 cactatgacgtcatttgat 326  Q
    ||||||||| | |||||||    
T  41545622 cactatgacttaatttgat 41545640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12882317 - 12882045
Alignment:
Q  96 agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga---gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 192  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||   | |||   ||||||||||| ||  ||||||| |||||     
T  12882317 agcacctatactagaaaagatggtagaaaataggcttaggtggtttgggca-gaggagacctgtagat--gtagatgctgtcgttcgaagagtagatcag 12882221  T
Q  193 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaata 292  Q
    |||||||||| || |  ||||||   | ||||||||||||  ||| |||| |||||||| | ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12882220 atggaggagattcta--taaaag---ttgaggaagacctataaaagctataagagaaactactaggaaatatttagaggttaatgagttggatccaaata 12882126  T
Q  293 tggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| |||||||||| | || ||| ||||||||||||| ||| |   ||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12882125 tggtttgtgatagaacattttggcgtaatttgatccatgtagcctacctcacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12882045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 215 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 43573287 - 43573130
Alignment:
Q  215 gaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||||    
T  43573287 gaggtagaggaagacctagaaaaactataagaaaaacaactaggaaagattta-aggttaatgagttggatccaaatatgatttatgatcgaacgttatg 43573189  T
Q  315 acgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  43573188 gcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 43573130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 371
Target Start/End: Original strand, 13149319 - 13149612
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaa 178  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||   |||||| || |||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||| |       
T  13149319 agagagtgagttggggtagcacctataaacgaaaagatgatagaaaatagacttcggtggtctggccatgtagagagaagacatgtaaatgatgtagctc 13149418  T
Q  179 gaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggt-agaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatg 277  Q
    ||||||| ||| | |||||||| |||||  | | |||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||| ||||    
T  13149419 gaagagtagataagatggaggaaagtcagatcagaagatgttagaggaagacttaggaaaactataagagaaactattatgaaagatttagaggttaatg 13149518  T
Q  278 agttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||| | |||||||||| |||  |||||||||| |||||| | ||||||||||| | ||||||  ||  ||  |||||||| |||||||||||||    
T  13149519 agtagaatccaaatatcgttgatgatagaacattatgacataatttgatccatatagccgatctcaattaatgagataagacttggttgttgtt 13149612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 60 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 37481930 - 37481618
Alignment:
Q  60 gattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||||||| ||||| |||| |||  ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  37481930 gattagaaatgacaacattagagagagagttggggtagttcctatagtaaaaaagatggttgaacctaggcttaggtggtttgagcatgtagagagaaga 37481831  T
Q  160 ctagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaa 259  Q
    || ||  ||  ||| || || ||||| ||||| ||||||| |||| |  | |   |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |    
T  37481830 cttgtgaattttgtagttaggagagtagatcagatggaggggagttagatcactggaggtagatgaagaccaagaaaaactattagagaaactattaaga 37481731  T
Q  260 aggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggc 359  Q
    | ||| ||| | | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||  ||| |||||| ||| | | |||  |||| |||   ||||||||    
T  37481730 aagatctagcgataaatgagttggataaaaatatggtatttgatagaaaattatggtgtcttttgattcatctagtcgaccccacgtagtcggataaggc 37481631  T
Q  360 ttggttgttgttg 372  Q
     ||||||||||||    
T  37481630 gtggttgttgttg 37481618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23714622 - 23714384
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||||| ||||    |||||||||| |||||||    
T  23714622 agcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagt---tgggtagcacatatagta 23714526  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| |||| |||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||| ||||| |||||||||| || |||||||     
T  23714525 gaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaaa 23714426  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa 250  Q
    | |  ||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23714425 tcactagacgtagatgaagacttagaaaaactataagagaaa 23714384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24102294 - 24102056
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||  ||||||  ||||||| ||||    |||||||||| |||||||    
T  24102294 agcagagattagaatgttgtgttggatgtgtggtaagactagacaaaataggattaaaaatgacgacattagatagagt---tgggtagcacatatagta 24102198  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| |||| |||| ||| ||||  | |||| ||||||||||||||||||| || |||  ||| ||||| ||||| |||||||||| || |||||||     
T  24102197 gaaaagatggtggaaactagacttatgtagtttaggcatgtagagagaagacttgtggattatgtagtaaggagagtagatcaaatggtggggagtcaaa 24102098  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaa 250  Q
    | |  ||| ||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  24102097 tcactagacgtagatgaagacttagaaaaactataagagaaa 24102056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 130 - 373
Target Start/End: Original strand, 42543274 - 42543517
Alignment:
Q  130 cttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagac 229  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||| || || ||||| ||||||||||||| ||||||  | |  |||||||| || ||||    
T  42543274 cttaggtggtttgggcatgtacagagaagacctgtggattctgtagttaggagagtagatcaaatggaggggagtcagatcactagaggtaggggtagac 42543373  T
Q  230 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcca 329  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | |  || ||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||    
T  42543374 ctagaaaaactataagagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacgtgctttttgatagaacgctatggcgttgtttgattca 42543473  T
Q  330 tgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||||   |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42543474 tgtagccggccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 42543517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 43238379 - 43238306
Alignment:
Q  87 agtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43238379 agtgggggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtaaagagaagac 43238306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 2610446 - 2610525
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagag 88  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2610446 agcagagatgaggatgctgcgttggatgagtggtaagactagacaggacaggattaggaatgacaccattagagagagag 2610525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 262 - 373
Target Start/End: Original strand, 9496037 - 9496148
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| |  |||| ||| | || |||||||    
T  9496037 gatttagaggttaatgagttggatccaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaaccccacttagtgggacaaggctt 9496136  T
Q  362 ggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||    
T  9496137 ggttgttgttgt 9496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 188 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 35755434 - 35755247
Alignment:
Q  188 atcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatga----gttgg 283  Q
    |||| |||||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||| || ||||||||||| ||| |    |||||    
T  35755434 atcagatggaggaaagtcatatcaaaagagggagaggaaggcctagaaaaactataacagaaactattaggaaagatttagaggttaattaatgggttgg 35755335  T
Q  284 atccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || ||| ||||||||||||  |||||  | || ||| | ||||||||||||||||||||    
T  35755334 atccaaatatggtttatgatagaacattgtgccgtaatttgatccatgcagccgaccctacttagtgggataaggcttggttgttgtt 35755247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 253 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 38328488 - 38328370
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagag 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||  |||| ||| | |    
T  38328488 attagaaaggatttagaggtcaatgaa--ggatccaaatttggtgcatgatagaacactatggcttcatttgatccatgtagccgaccccacttagtggg 38328391  T
Q  353 ataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  38328390 ataaggcttggttgttgttgt 38328370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 373
Target Start/End: Original strand, 6218968 - 6219247
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | || || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||   ||||||  ||| ||||| ||||  |||||    
T  6218968 gggtagcacttatagtagaaaagatagtggataataggcttaggtggtttggacatgtagagaggagatatgtagattatgtagtaaggagaggtgatca 6219067  T
Q  192 aatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaat 291  Q
    ||||||||| |||    | |   |||| |||| |||||||  | ||||||| | | |||| ||||| || ||||||||| | | ||||||||| | ||||    
T  6219068 aatggaggatagtgggatcactggaggcagagaaagaccttag-aaactataatataaac-attaggaaagatttagagattagtgagttggaccgaaat 6219165  T
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||| |  ||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  6219166 atggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccaaccccacctagttggataaggcttggttgttattgt 6219247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 181 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19235176 - 19234988
Alignment:
Q  181 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaatt-agaaaggatttagaggtcaatgag 279  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| | |  |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| |||||| || ||||| | |||||     
T  19235176 agagtagatcagatggaggggagtcaaatcactagagatagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattgagaaag-atctagagattaatgat 19235078  T
Q  280 ttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttg 369  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||| | || |||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||| | |||||||||| |||||||    
T  19235077 ttggatagaaatatggtatttgatagaacattctgtcgtcgtttaatccatgtagccaactccacttagtgggataaggcttagttgttg 19234988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 285
Target Start/End: Original strand, 42092437 - 42092711
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||| |||||  |||| |||||| |||||||  ||   |||||||||  ||||||| |||||| ||    
T  42092437 agcagagatgatgatgttgcattggatgtgtagtaagactagacgggatatgattagaaatgaca--atgttagagagagttggggtagcgcctatacta 42092534  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaag 208  Q
    |||||| ||||||||| || | |||| || | |||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||| ||||| ||| | |||||||  ||||||     
T  42092535 gaaaagatggtagaaactaagattaggtgatctgggcatgtagagagaaggcttgtagattttgtagtaaggagagtagattagatggagggtagtcaat 42092634  T
Q  209 ttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggat 285  Q
    | |  | ||  | ||| |||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| ||| ||||| | ||| ||||||||    
T  42092635 tcactatagagacaggtagacctagaaaaactataggagaaactattaaaaaagatgtagagattaattagttggat 42092711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 206
Target Start/End: Original strand, 45077670 - 45077870
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagag----agagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||| ||||  | | ||||||    ||||||| || |||||| ||||||||    
T  45077670 gagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagactagatagaattagaaatgtgaactttagagggagagagagtttgagtagcatctatagta 45077769  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggctt---agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtc 205  Q
    |||||| |||| || | ||| |||   || |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  45077770 gaaaagatggtggagagtagacttgggaggtggttttggcatgtagagagaaaacttgtagattttgtagtaaggagagtagatcagatggaggatagtc 45077869  T
Q  206 a 206  Q
    |    
T  45077870 a 45077870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 67 - 373
Target Start/End: Original strand, 11412697 - 11412992
Alignment:
Q  67 aatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 166  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||   ||||    
T  11412697 aatgacaacattagagagagagttggggtagcacctatagtagaaaatatggtggaaaataggcttaggttgtttgggcatttagagataagaactgtag 11412796  T
Q  167 atgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggag-agtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatt 265  Q
    || |||| |||   ||||| ||||| ||||||| | |||||  | |  ||||  ||||||| |||||| |||||||||||           |||||   |    
T  11412797 attctgtagtag--agagtagatcagatggaggggtagtcagatcactagagccagaggaaaacctagaaaaactattag-----------gaaaga--t 11412881  T
Q  266 tagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttga---tagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttg 362  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||   ||| |||   |||||||||||    
T  11412882 tagagattaatgagttggatccaaatatggtttatgatagtagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccgaactcacttagtaggataaggcttg 11412981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13241063 - 13240927
Alignment:
Q  55 gataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagaga 154  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  | ||||||  |||  |||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13241063 gataggattagaaatgacaacattagagagagaattggagtagcaagtatgttagaaaagatggtggaaactaggcttaggtggtttgggcatgtagaga 13240964  T
Q  155 gaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    ||||||  |||||| || | ||||| ||||| |||||    
T  13240963 gaagacatgtagattctttagtaaggagagtagatca 13240927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 226 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12489949 - 12489802
Alignment:
Q  226 agacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttga 325  Q
    |||||||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||| | |||||||||||   | | ||||||||||||| |||||| || |||| |||||    
T  12489949 agacctagaaaaactatatgagaaactattaggaaggatctagagataaatgagttggagaaagacatggtttttgatataacactttggcgtcgtttga 12489850  T
Q  326 tccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | ||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12489849 ttcatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12489802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 30743545 - 30743675
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  30743545 gagatgaggatgttgcgcatgatgagtgctaagactagacgggataggattgggaatgtcaccgttaggaagagagtg-gggtagcacttatggtagaaa 30743643  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttggg 144  Q
    | |||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  30743644 aattggtagaaattagaattagatggtttggg 30743675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19337209 - 19337069
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga-ttagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaa 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||||  ||||| | ||||||||||||  |  |||||||||||||||||| |    
T  19337209 gagatgaggatgttacgttggatgtgtggtaagacttaggcaggataggattataaatgagaacattagagagag--ttggggtagcacctatagtagta 19337112  T
Q  112 aagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaag 158  Q
    ||| |||| ||||||| |||||    | |||||||||||||||||||    
T  19337111 aagatggtggaaaataagctta----ggttgggcatgtagagagaag 19337069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 219 - 373
Target Start/End: Original strand, 33287549 - 33287703
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgt 318  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||  | |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  33287549 tagaggaagacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagaaattaatgagttagatcgaaatatggtttatgatagaacattatgacat 33287648  T
Q  319 catttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
      |||||||| ||| ||| | ||||| ||| | || ||| |||||||||||||||    
T  33287649 agtttgatccttgtagccaactccacttagtgggacaagacttggttgttgttgt 33287703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 41 - 170
Target Start/End: Original strand, 40759049 - 40759179
Alignment:
Q  41 gtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggt-agcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggt 139  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||  |||| |||| |||  |||| ||||    
T  40759049 gtaagactagacaagataagattagaaatgacaacattagagagagaggttgggttagcacttatagtagaaaaaatggtggaaactagagttaggtggt 40759148  T
Q  140 ttgggcatgtagagagaagactagtagatgc 170  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||    
T  40759149 ttgtgcatgtagagagaagacttttagatgc 40759179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 13592656 - 13592354
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||| | ||||||   |||| |||||| |||| || ||||  || || |||  ||||||||||||||||| |||    
T  13592656 gagatggggatgttgtgttggatgtgtggtgatattagatgggataagattagaaatggcaacattgtagggatagttggggtagcacctatagtataaa 13592557  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
      ||| | ||||||||  |||| |||||||| |||||| |||||| ||  ||||||  | | ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||      
T  13592556 tattg-tggaaaatagt-ttaggtggtttggacatgtatagagaaaacatgtagatattatagtaagaagagtagatcaaatagaggatagtcatatttc 13592459  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagga-tttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacact 311  Q
    |||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||| || |||||  | |||| || | ||  ||||| ||  ||||||||||| |||||||||| |    
T  13592458 aagaggtataggaagacctagaagaactataagagaaactatcagaaaaaagtttatagattaagaagttgaatttaaatatggtttatgatagaacaat 13592359  T
Q  312 atgac 316  Q
    |||||    
T  13592358 atgac 13592354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 262 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19337004 - 19336896
Alignment:
Q  262 gatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggctt 361  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| || |||| ||  | ||||| ||||    
T  19337004 gatttagagattaatgagttggatcgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagccaatcccacttattgggataaagctt 19336905  T
Q  362 ggttgttgt 370  Q
    |||||||||    
T  19336904 ggttgttgt 19336896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 39709298 - 39709202
Alignment:
Q  276 tgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  39709298 tgagttggatcaaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggatatggcttggttgttgttg 39709202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 300 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 12475000 - 12474925
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtat 375  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12475000 tgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtat 12474925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 187 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 13444094 - 13443908
Alignment:
Q  187 gatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatc 286  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||| ||| |||| |||||||  |||  |||   ||||||  | |||||| |||  |    
T  13444094 gatcagatggaggagagtcaaatcaaaagaggtagaggaaaacttagaaaatctatgagagaaattattgaaaaaattttagatattaatgagatgggcc 13443995  T
Q  287 caaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||  |||  ||| | |||||||||| ||| |||||||    
T  13443994 caaatatggtttattatagaacattatggcgtcatttgatcgatgtagccgaccccatttagtgggataaggcttagttattgttgt 13443908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 373
Target Start/End: Original strand, 30743686 - 30743811
Alignment:
Q  248 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccaccta 347  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |||| | | ||||||||| ||  | |||   ||| ||    
T  30743686 aaaccattagaaatgatttagaggtcaatgagttgaatccaaatatgatttataatagaacaatatgtcataatttgatccttgcagtcgaactcactta 30743785  T
Q  348 gagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | |||||||||||| |||||||||||    
T  30743786 gtgagataaggctttgttgttgttgt 30743811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 451986 - 451930
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattag 65  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  451986 agcagagatgagtatgttgcgttagatgagtggtaagactagacatgataggattag 451930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5759187 - 5758995
Alignment:
Q  181 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 280  Q
    ||||| ||||| ||||||| || |||| | |  |||||||| | || |||||| ||||||||||||||||| |  |  |||||| ||||| |||||||||    
T  5759187 agagtagatcagatggaggggaatcaaatcactagaggtagggaaatacctagaaaaactattagagaaactaccaagaaggatctagagatcaatgagt 5759088  T
Q  281 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||   | | |||||||||||||||||||||||  ||| |||||| || || || ||  |||| |||   ||||||||||||||||||||||    
T  5759087 tggagaaagacatggtttttgatagaacactatggtgtcgtttgattcaggtagctgaccccacttagttggataaggcttggttgttgttgt 5758995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 285 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9531688 - 9531600
Alignment:
Q  285 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  9531688 tccaaatatggtttatgatggaacattatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 9531600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 289 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12520146 - 12520062
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12520146 aatatggtttatgataaaacactatggcgtaatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 12520062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 238
Target Start/End: Original strand, 32443668 - 32443812
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaa 193  Q
    ||||||||||||  || |||  || ||||||||| |||| | |||||||   |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| | |    
T  32443668 gtagcacctataaaaggaaatatgatagaaaatatgctttggtggtttgaaaatgtagagagaaaacttgtagatgttgtagtacgaagagtggataaga 32443767  T
Q  194 tggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaa 238  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  32443768 tggaggatagtcagattaaaagaggtagtggaagatctagaaaaa 32443812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9647969 - 9647822
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||| |||||| |||| || ||||    | |||||  ||| || ||||||||||    
T  9647969 agcagagatgaggatgttgcgttggatgtgtggtaagactagatgtgataagattagaaatgtcaacatt----atagagttggggcagtacctatagta 9647874  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||| | |||| |||| |||  |||| |||||||| |||||| | |||||||    
T  9647873 gaaatgatggtggaaactagctttaggtggtttggacatgtaaaaagaagac 9647822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 373
Target Start/End: Original strand, 17670680 - 17670750
Alignment:
Q  303 tagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17670680 tagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 17670750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 28960350 - 28960204
Alignment:
Q  235 aaaactatta-gagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtg 333  Q
    |||||||||| |||||||  |||  |||||| ||||| | |||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||     
T  28960350 aaaactattaagagaaactgttaagaaggatctagagataaatgagttggagaaagatatggtttttgatagagcactatggtgtcgtttgattcatgta 28960251  T
Q  334 gccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtatttgtt 380  Q
    | ||| ||||  ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28960250 gtcgactccatttagtgggataaggcttggttgttgttgtttttgtt 28960204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 129
Target Start/End: Original strand, 227307 - 227360
Alignment:
Q  76 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaatagg 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  227307 attagagagagagtgggggtagcacctatggtagaaaagtttgtagaaaatagg 227360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 150
Target Start/End: Original strand, 19024150 - 19024239
Alignment:
Q  61 attaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgta 150  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||| |||| || |||||| |||||||| ||||||    
T  19024150 attagaaatgacaacattagagagagggtttgggtagcacctatatttgaaaagatggtggaaagtaagcttaggtggtttggacatgta 19024239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 206
Target Start/End: Original strand, 3481145 - 3481256
Alignment:
Q  92 gggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatca 191  Q
    |||||||||||||||||   ||| |||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||   ||||| |||| | ||| ||||| |||||    
T  3481145 gggtagcacctatagta---aagatggtggaaaacaggcttaggtggtttggacatgtagagagaagacctatagattctgtagcaaggagagtagatca 3481241  T
Q  192 aatggaggagagtca 206  Q
     |||||||| |||||    
T  3481242 gatggaggatagtca 3481256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 9579053 - 9578916
Alignment:
Q  21 gatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggta 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||  |||||||  ||   |||||||||  ||||  ||| |||||||| |||| || |     
T  9579053 gatgttgcgttggatgtgtggtaagaatagatatgatagaattaaaaatgaca--atgttagagagagttggggtgacacatatagtagtaaagatgatg 9578956  T
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
     ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9578955 taaaatagacttaggtggtttggacatgtagagagaagac 9578916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 292 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 19334233 - 19334181
Alignment:
Q  292 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccac 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  19334233 atggtttttgatagaacactatgacgtcatttgattcatgtagccgactccac 19334181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 338
Target Start/End: Original strand, 26670891 - 26671015
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||  || ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| |  ||    
T  26670891 agaggtagaggaagacctacaaaaactataaaagaaactattaagaaagatttagagattaatgagttggaccaaaatatgatttatgatagaatataat 26670990  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    |  || ||||||||||||| |||||    
T  26670991 ggtgtaatttgatccatgtagccga 26671015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 369
Target Start/End: Original strand, 33504346 - 33504502
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtc-aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    ||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||| ||||  || ||| ||||| |  ||| ||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||    
T  33504346 agaggcagagaaaaacctagaaaaactataagagaaactattaagaaagatctagagatttaataagttggattgaaatatggtatatgatagaacatta 33504445  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttg 369  Q
    || ||| ||||||||||| | |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  33504446 tggcgtaatttgatccatctagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttg 33504502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 160
Target Start/End: Original strand, 38860158 - 38860242
Alignment:
Q  76 attagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||| | || |||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||    
T  38860158 attagatagagagtgggggcagcacccatagtagaaaagattgtggaaaataggcttaggtggtttaggcatttagaaagaagac 38860242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 199
Target Start/End: Original strand, 11017316 - 11017422
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||  ||||||  ||| || ||||| || ||||||    
T  11017316 ggtagcacctatagtagaaaagatcgtggaaactcggcttaagtggtttgggtatgtggagagaagacccgtagattttgtagttagaagggtagatcaa 11017415  T
Q  193 atggagg 199  Q
    |||||||    
T  11017416 atggagg 11017422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 14197437 - 14197367
Alignment:
Q  99 acctatagtagaaaagttggtagaaaataggctt-agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14197437 acctatagtagaaaagatggtggaaactaggctttaggtggtttgggcatgtagagtgaagacttgtagat 14197367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 295 - 373
Target Start/End: Original strand, 15025698 - 15025776
Alignment:
Q  295 gtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15025698 gtttttgatagaacactatggcatcgtttgattcatgtagccgatgcaacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 15025776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 374
Target Start/End: Original strand, 17429259 - 17429333
Alignment:
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||| ||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17429259 tgatagaacattatgacataatttgattcatgtagccgaccccacttagtgagataaggcttggttgttgttgta 17429333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 316
Target Start/End: Original strand, 21834638 - 21834779
Alignment:
Q  175 gtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtca 274  Q
    |||||||||||  ||||||| || || || ||  ||| |||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||| ||||| ||  ||||| || | |    
T  21834638 gtaagaagagtaaatcaaatagaagatagacatattacaagaggtatagaaagatctagaaaaactataagataaactattaggaaatatttatagatta 21834737  T
Q  275 atgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
    |||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  21834738 atgagttggatctaaatttggtttatgatagaacaatatgac 21834779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 4682357 - 4682253
Alignment:
Q  193 atggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaata 292  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||  |||| |||| |||||||| |||||||   | |  || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4682357 atggaggagagacatatcaaaagaggtagatcaagatctagaaaaactataagagaaattttcatgaaagatttagaggttaatgagttggatccaaata 4682258  T
Q  293 tggtt 297  Q
    |||||    
T  4682257 tggtt 4682253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 104 - 160
Target Start/End: Original strand, 41858744 - 41858800
Alignment:
Q  104 tagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagac 160  Q
    ||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41858744 tagtagaaaagatggtggaaactgggcttagatggtttggacatgtagagagaagac 41858800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 168
Target Start/End: Original strand, 907710 - 907757
Alignment:
Q  121 gaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagat 168  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  907710 gaaaatagccttagatggtttgggcatgtagagagaagagttgtagat 907757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37470289 - 37470174
Alignment:
Q  217 ggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgac 316  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||| |  ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||      
T  37470289 ggtagaggaagacctgaaaaaactataagagaaactattaggacagatctagagattaatgagttggatcgaaatatggcatatgatagaacattatggt 37470190  T
Q  317 gtcatttgatccatgt 332  Q
    ||  ||||||||||||    
T  37470189 gtagtttgatccatgt 37470174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24583970 - 24583904
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacacc 75  Q
    ||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  24583970 agcagagatgaagatgttgtgcgggatgagtggtaagactaaacatgatatgattaagaatgacacc 24583904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 370
Target Start/End: Original strand, 45077915 - 45078008
Alignment:
Q  277 gagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||  ||| | | |||||||||||||  ||||  |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  45077915 gagttggatcgaaatatagtttatgatagaacataatggcataatttgatccatgtaaccgaccccacttagtgagataaagcttggttgttgt 45078008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 373
Target Start/End: Original strand, 19863432 - 19863516
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||   |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  19863432 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 19863516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 373
Target Start/End: Original strand, 19867764 - 19867848
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||   |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  19867764 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 19867848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 373
Target Start/End: Original strand, 19872665 - 19872749
Alignment:
Q  289 aatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| | | ||||||||||||| ||||   |||| ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  19872665 aatatggtttatgatagaacattatggcatgatttgatccatgtagccgtccccacttagtgggataaagcttggttgttgttgt 19872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Original strand, 41330131 - 41330195
Alignment:
Q  93 ggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaa 157  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41330131 ggtaacacctttagtagaaaagatgatcaaaaataggcttagatggtttgaacatgtagagagaa 41330195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8197640 - 8197541
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||  ||||||| | | |||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||  | || ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  8197640 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 8197541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8202400 - 8202301
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||||||  ||||||| | | |||||||| | |||| |||| |||||||||||| |||||  | || ||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  8202400 aatgagttggatagaaatatgatatatgatagaatattatggcgtcgtttgatccatgtagccgaccctacttagtgggataatgcttggttgttgttgt 8202301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 309
Target Start/End: Original strand, 45436965 - 45437060
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| ||| |||||| | |  || || ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45436965 agaggcagaggaagacctataaaaattataagagaatctagcaggaaagatttagagattaatgcattggatccaaatatggtatttgatagaaca 45437060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 373
Target Start/End: Original strand, 17626284 - 17626354
Alignment:
Q  303 tagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||  | || | | | ||||||||||||||||||||||    
T  17626284 tagaacactatggcgtcatttgttccatgtagccgaaccaactttgtgggataaggcttggttgttgttgt 17626354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 159
Target Start/End: Original strand, 18188706 - 18188848
Alignment:
Q  14 agatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaa 113  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||  |||| ||| || ||||||| |||| |||||||  |  ||||||||||| |  |||||||    
T  18188706 agatgaggatgttgtgttggatgtgtg-taaggctagacgggatatgatcagaaatgacaacattggagagag--ttggggtagcacctcttctagaaaa 18188802  T
Q  114 gttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    | |||| |||  | | ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18188803 gatggtggaagctcgacttaggtggtttgggcatgtaaagagaaga 18188848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 376
Target Start/End: Original strand, 19855585 - 19855747
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||| ||||  || |||  |||||| |||||| |||||  ||| ||||| | ||||||| || |||    
T  19855585 agaggcagaggaagacctagataaactataaaagaaactattaagaaagatccagaggttaatgagctggatagaaacatggtatatgatagagcattat 19855684  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtatt 376  Q
    | || ||||  |||||||| |||||  |||| |||   ||||| || ||||||||||||||||    
T  19855685 ggcgccattcaatccatgtagccgaccccacttagtaggataaagcgtggttgttgttgtatt 19855747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 274 - 328
Target Start/End: Original strand, 36650625 - 36650679
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcc 328  Q
    |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36650625 aatgagttagatcaaaatatagtttatgatagaacactataacgtaatttgatcc 36650679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 37452386 - 37452284
Alignment:
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||| | | ||||  || || |||||| | |||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||    
T  37452386 aagaggaagaggaagacctagaaaaattataagaggagctattaagaaagaattagagattaatgagttggacagaaatatggtttatgatagaacatta 37452287  T
Q  313 tga 315  Q
    |||    
T  37452286 tga 37452284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 373
Target Start/End: Original strand, 3481351 - 3481436
Alignment:
Q  288 aaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || ||  |||| |||   || |||||||||||||||||||    
T  3481351 aaatatggtctatgatagaacattatggcgtaatttgatccatgtagctgaccccacttagttggaaaaggcttggttgttgttgt 3481436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 108
Target Start/End: Original strand, 17581392 - 17581485
Alignment:
Q  15 gatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    |||| |||||||  |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||   ||||||||||||||||    
T  17581392 gatggggatgttttgttggatgtgtggtaagactagatatgataagattaaaaatgacaacattgtagagatagttaaggtagcacctatagta 17581485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 199
Target Start/End: Original strand, 43260439 - 43260512
Alignment:
Q  126 taggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggagg 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||| |||||| || | ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  43260439 taggcttaggtggtttgggcatgtgaagaaaagacttgtagattctatagtaaggagagtagatcagatggagg 43260512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 278 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 3720510 - 3720450
Alignment:
Q  278 agttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||  || ||||||||||||| |||||    
T  3720510 agttggatcgaaaaatggtttatgatagaacattatggtgtaatttgatccatgtagccga 3720450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Original strand, 12905082 - 12905162
Alignment:
Q  79 agagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| | ||||||  |||  |||| | |||||  |||||||||||||||    
T  12905082 agagagagagttggggtagcacctatagcagaaaagattgtagaagctagaattaggtagtttgaacatgtagagagaaga 12905162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 291 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23915775 - 23915735
Alignment:
Q  291 tatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatg 331  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  23915775 tatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccatg 23915735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 28966300 - 28966260
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatg 314  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28966300 aatgagttggatacaaatatggtgtttgatagaacattatg 28966260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 166
Target Start/End: Original strand, 44411715 - 44411787
Alignment:
Q  94 gtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtag 166  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||   |||||| | |||||  |||||||||| ||||    
T  44411715 gtagcacctatagtaggaaagatggtggaaaataggcttccgtggttttgacatgtttagagaagacttgtag 44411787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 48 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1271 - 948
Alignment:
Q  48 tagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcat 147  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1271 tagacaggataggattatgaatgacaccattagagagag--tgagggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttggccat 1174  T
Q  148 gtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 247  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1173 gtagagagaagacccgtagatgccgtggtaagaagagtagatcaaatggagaagagtcaaattaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagag 1074  T
Q  248 aaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccaccta 347  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  |||  ||    
T  1073 aaaccattaaaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagctgaccccattta 974  T
Q  348 gagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    | | ||||||||||||||||||||||    
T  973 gtgggataaggcttggttgttgttgt 948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 2634 - 2597
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaaga 46  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  2634 agcagagatgaggatgtttcattggatgagtggtaaga 2597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 374
Target Start/End: Original strand, 82643 - 83001
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  82643 gagatgaggatgttgcactggatgagtagtaagactagacatgataggattaagaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagtagaaa 82742  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||    ||||||| || |||||||| ||  |||||||||||||||||   |||||    
T  82743 agttggtagaaaatgggcttagatgatttggacatatagagagaagatccatagatgcagtcgtaagaagggtatatcaaatggaggagagt--ggttaa 82840  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  82841 gagaggtagaggaagacctaggaaaacta-tagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatgatttatgatagaacacta 82939  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgta 374  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||  |  ||||||||||||||||||||||    
T  82940 tgacgtcatttgatccatgtagccgaccccacttaatggaataaggcttggttgttgttgta 83001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 282 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 48207 - 48119
Alignment:
Q  282 ggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgt 370  Q
    |||| |||||||||| | |||||||| | |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||   ||| |||||| ||||||||    
T  48207 ggattcaaatatggtgtatgatagaatattatggcgtaatttgatccatgtagccgactccacttagtaggattaggcttagttgttgt 48119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 4634 - 4322
Alignment:
Q  11 cagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtggg-tagcacctatagtag 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||    
T  4634 cagatatgaggatgttgcgttggatgaatggtaagactagacatgataggattataaatgacaccattagagagagagagtggggtggcacctatagtag 4535  T
Q  110 aaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagt 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4534 aaaagttggtaaaaaataggcttagatagtttgggcatgtagaaagaagactcgtagaagctgtggtaagaagagtagatcaaatggaggagaatcaagt 4435  T
Q  210 taaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaaca 309  Q
    |||||||||||          ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||    
T  4434 taaaagaggta----------taggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatctaaatttggtttataatagaaca 4345  T
Q  310 ctatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  4344 ctatgacgttatttgatccatgt 4322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 86967 - 86609
Alignment:
Q  13 gagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagtagaaa 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| | | | || |   | ||||||||    
T  86967 gagatgaggatgttgcgctggatgagtggtaagaccagaaaggataagattagaaatgacaccattagagagagagagagag-ag-agagagagtagaaa 86870  T
Q  113 agttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaa 212  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  86869 agttggtagaaaatagtcttagatagtttggacatgtaaagagaagacccgtagatgccgtcgtaagaagagtagatcaaatggaggagagtcaggttaa 86770  T
Q  213 aagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacacta 312  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  86769 aagaggtagatggagacctaggaaaactgttagagaaaccactagaaaggatttagaggtcgacaggttggatccaaatatgatgtatgatagaacacta 86670  T
Q  313 tgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||||| ||||||||||||| | ||  ||||| ||| | |||| | |||| ||||||||||    
T  86669 tgacgtaatttgatccatgtagtcggctccacttagtgggatacgacttgtttgttgttgt 86609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 200 - 377
Target Start/End: Original strand, 16687 - 16864
Alignment:
Q  200 agagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttt 299  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16687 agagtcaggttaaaagaggtagaggaagacctaagaaaaccattcgagaaaccattagaaaagatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttt 16786  T
Q  300 tgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgtattt 377  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  16787 tgatagaacactatggcgtcatttgatctatgtagccgactccacttagtgggataaggcttggttgttgttgtattt 16864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 25809 - 25683
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgtgggtagcacctatagta 108  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25809 agcagagattaggatgttgtgttggatgagtggtaagactagacatgataggattaggaatgacaccattagagagagagtgggggtagcacctatagta 25710  T
Q  109 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25709 gaaaagttggtagaaaataggcttaga 25683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 219 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25686 - 25532
Alignment:
Q  219 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  25686 tagaggaagacctaggaaaactattagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatttggtgtatgatagaacactatgacgt 25587  T
Q  319 catttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||| |||||||| || ||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25586 catttaatccatgtagcggaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 25532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11962 - 11810
Alignment:
Q  9 agcagagatgaggatgttgcgttggatgagtggtaagattagacatgataggattaggaatgacaccattagagagaga--gtgtgggtagcacctatag 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  11962 agcagagatgaggatgttgcgctggatgagcggtaagactagacataataggattaggaatgacaccatcagagagagatagtgggggtagcacctatag 11863  T
Q  107 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11862 tagaaaagttggtagaaaataggcttagatgatttgggcatgtagacagaaga 11810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 133 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11787 - 11549
Alignment:
Q  133 agatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagaccta 232  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  11787 agatgatttgggcatgtagagcgaagacccgtagatgccgtcataagaagagtagatcaaatggatgagagtcaagttagaagaggtagacgaataccta 11688  T
Q  233 ggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11687 ggaaaactattagagaaatcgttagaaagaatttagaagtcaattggttggatccaaatttgg--tttgatagagtactatgacgtcatttgatccatgt 11590  T
Q  333 ggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
     |||||  |||| |||   ||||||| ||||||| ||||||    
T  11589 agccgaccccacttagtaggataaggtttggttgctgttgt 11549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 163 - 373
Target Start/End: Original strand, 4708 - 4918
Alignment:
Q  163 gtagatgctgtggtaagaagagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaagg 262  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||| |||| | ||||||||| || |||||||| ||||||||||    
T  4708 gtagatgccgtcgtaagaagagtagatcagatggaggagagtaagattaaaagaggtagatgaaggcgtaggaaaaccataagagaaaccattagaaagg 4807  T
Q  263 atttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttg 362  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||  |||| | | | ||||| |||||    
T  4808 atttagacgtcaatgagttaaatccaaatatggtttatgatagaacactatggcgtaatttgatccgtgtagccgaccccactttgtgggataacgcttg 4907  T
Q  363 gttgttgttgt 373  Q
    |||||||||||    
T  4908 gttgttgttgt 4918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 371
Target Start/End: Original strand, 7431 - 7720
Alignment:
Q  81 agagagagtgtgggtagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaagactagtagatgctgtggtaaga 180  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| ||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||   |  |||||    
T  7431 agagagagtctgggtagcacgtaaagtacaaaagtttgtagaaaacacgcttagttggtttgggcatgtagagagaaggcatgtagatgtcttcataaga 7530  T
Q  181 agagtggatcaaatggaggagagtcaagttaaaagaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagt 280  Q
    |||||  |||| |||||||||||| |||| |||||| ||  |  ||||| || ||||||||| ||| |||| |||||||| |||| |||||||| | |||    
T  7531 agagtatatcagatggaggagagtgaagtcaaaaga-gtgtatcaagacataagaaaactataagataaactattagaaaagattcagaggtcatttagt 7629  T
Q  281 tggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||   ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||    
T  7630 tggattcaaatatggttcacgatagaacactatggcgtaatttgatccatgcagccatctccacttagtgggataaagcttggttgttgtt 7720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1318 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1318
Description:

Target: scaffold1318; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 241 - 373
Target Start/End: Original strand, 481 - 613
Alignment:
Q  241 attagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgatt 340  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||      
T  481 attagagaaaccattagaaaggatttagaggtcaatgagttgtacccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgacc 580  T
Q  341 ccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    |||| ||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  581 ccacttagtgggataaggcttgattgttgttgt 613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 230 - 373
Target Start/End: Original strand, 14722 - 14865
Alignment:
Q  230 ctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatcca 329  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  14722 ctaggaaaactttaagagaaaccattagaaaggatttaaaggtcaatgagttggattcaaatatggtttatgattgaacactatggcgtaatttgatcca 14821  T
Q  330 tgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||| ||| |  |||| ||| | |||||  |||||||||||||||    
T  14822 tgtagccaaccccacgtagtgggataaatcttggttgttgttgt 14865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 159
Target Start/End: Original strand, 14626 - 14678
Alignment:
Q  106 gtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  14626 gtagaaaagtaggtagaaaata-gcttagatggtcggggtatgtagagagaaga 14678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 283 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28979 - 28889
Alignment:
Q  283 gatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttgt 373  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||| ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  28979 gatccaaatttggtgtatgatagaacactatggcgtcatttgatccatgtagccgaccccacttagtgggataaggcttggttgttgttgt 28889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 58385 - 58261
Alignment:
Q  214 agaggtagaggaagacctaggaaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactat 313  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||  | || ||| ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||| |||    
T  58385 agaggcagaggaagacctagaaaaacgataagagaaactgttaggaaaaacttggagatcaatgagttggaccaagatatggtttatgatagaacattat 58286  T
Q  314 gacgtcatttgatccatgtggccga 338  Q
    | ||| ||||||||||||| |||||    
T  58285 gtcgtaatttgatccatgtagccga 58261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 159
Target Start/End: Original strand, 11802 - 11866
Alignment:
Q  95 tagcacctatagtagaaaagttggtagaaaataggcttagatggtttgggcatgtagagagaaga 159  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11802 tagcacctattgtagaaaagatggtaggaactcggcttaggtggtttgggcatgtagagagaaga 11866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0245 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0245
Description:

Target: scaffold0245; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16438
Alignment:
Q  285 tccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgtt 371  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||  ||||  ||   |||||||||| |||||||||    
T  16524 tccaaatatggtttatgatagaacattatggcataatttgatccatgtggccgaccccactcagttggataaggcttagttgttgtt 16438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 235 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 160462 - 160325
Alignment:
Q  235 aaaactattagagaaacaattagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgtgg 334  Q
    |||||||  |||||||| ||||| || |||| |||  | |||||||| || | ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||  ||||| |    
T  160462 aaaactacaagagaaactattaggaaagattaagaaattaatgagttcgaccgaaatatggtttatgatagaacattatggcgtaatttgaatcatgtag 160363  T
Q  335 ccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    || |  |||| ||| | || ||||||||||||||||||    
T  160362 ccaaccccacttagtgggaaaaggcttggttgttgttg 160325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 332
Target Start/End: Original strand, 39481 - 39560
Alignment:
Q  253 attagaaaggatttagaggtcaatgagttggatccaaatatggtttttgatagaacactatgacgtcatttgatccatgt 332  Q
    ||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||| ||| |||| ||||||||    
T  39481 attaggaaagatttagatggtaatgagttggatccaaatgtggtttatgatagaacatgatggcgtaatttaatccatgt 39560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 274 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 99386 - 99286
Alignment:
Q  274 aatgagttggatccaaatatggtttttg-atagaacactatgacgtcatttgatccatgtggccgattccacctagagagataaggcttggttgttgttg 372  Q
    |||||||||||  || | |||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||  ||||| |||||  |||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  99386 aatgagttggagacagacatggtttttgtatagaacgctatggtgtcgtttgaatcatgtagccgacaccacatagtgggataaggcttggttgttgttg 99287  T
Q  373 t 373  Q
    |    
T  99286 t 99286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University