View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2337-Insertion-2 (Length: 920)

Name: NF2337-Insertion-2
Description: NF2337
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2337-Insertion-2
NF2337-Insertion-2
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (372-901)||(33950654-33951205)
chr8 (372-913)||(33990118-33990689)
chr8 (644-920)||(33973299-33973575)
chr8 (8-305)||(33991025-33991321)
chr8 (9-305)||(33974106-33974401)
chr8 (8-285)||(33951525-33951801)
chr8 (372-594)||(33973577-33973800)
chr8 (644-856)||(33959346-33959573)
chr8 (9-134)||(33941128-33941253)
chr8 (12-130)||(33912393-33912511)
chr8 (427-620)||(33911721-33911914)
[»] chr7 (2 HSPs)
chr7 (380-498)||(8278802-8278920)
chr7 (11-166)||(8278607-8278766)
[»] scaffold0391 (2 HSPs)
scaffold0391 (432-739)||(10335-10660)
scaffold0391 (8-142)||(11325-11459)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 319; Significance: 1e-179; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 372 - 901
Target Start/End: Complemental strand, 33951205 - 33950654
Alignment:
Q  372 tgattctgtctaacacaccgctaattcaaacatgctttagaga-gccaaagaggatttatgacttacccttaactcgttcatcccaacaaagctttgtag 470  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| | | |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33951205 tgattctgtctaacacactgctaatccaaacatgcatgagataaggcaaaaaggatttatgacttaccattaacttcttcatcccaacaaagctttgtag 33951106  T
Q  471 ccaaagtggttttccccaatcctcctaaaccagttaagacaagtgtggagctaccacccctcagaagctccattttcaacatgctaaatggtatatccaa 570  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33951105 ccagagtggttttccccaatcctcctaaaccagtcaacacaagtgtggagctaccacccctcagaagctccattttcaacttgctaaatggtatatccaa 33951006  T
Q  571 cccaacagtgaattttggattttcaggaacatcgaaaggacgcttgaaaagttgtccatcttcattgaattcatggttgagaagctcaagaatttctctg 670  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33951005 cccaacagtgaatttttgattttcaggaacattgaaaggacgcttgaaaagttgtccatcttcattgaattcatggttgagaagctcaagaatttctctg 33950906  T
Q  671 gccttgtaaagtgtctcttcgacatcctttacaataagagattggttctcatcaacaa------cgtaggaatcattctcaaaagaagatttgcatgcac 764  Q
    | ||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||      | ||||||||||||||| ||||| || | |||||||    
T  33950905 gtcttataaagcgtctcttcaacatcatttacagtaagagattggttctcctcaacaacatagccataggaatcattctcagaagaacatgtacatgcac 33950806  T
Q  765 ---------------tttcttctatcaaactatttatttcttctctgggttgatccaagtgttcattgtaatgctttatatcttgtacaacgggagataa 849  Q
                   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33950805 tttctcctgcatcattttcttctatcagactatttatttcttctctggggtgatccaaatgatcattgtattgctttatatcttgtacaacgggagataa 33950706  T
Q  850 atcctttaagattaacctcaacaatagccttgcactttggttctttcgtgct 901  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||| |||||    
T  33950705 atcctttaagattaacctcaatgatcgccttgaactttggttcttttgtgct 33950654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 372 - 913
Target Start/End: Complemental strand, 33990689 - 33990118
Alignment:
Q  372 tgattctgtctaacacaccgctaattcaaacatgctttagagagccaaagaggatttatgacttacccttaactcgttcatcccaacaaagctttgtagc 471  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  33990689 tgattatgtctaacacaccgctaatccaaacatgcatgagagagccaaagaggatttatgacttaccattaacttcttgatcccaacaaagctttgtagc 33990590  T
Q  472 caaagtggttttccccaatcctcctaaaccagttaagacaagtgtggagctaccacccctcagaagctccattttcaacatgctaaatggtatatccaac 571  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33990589 caaagtggttttccctaatcctcctaagcccgtcaacacaagggtggagctaccatcccttataagctccattttcaacttgctaaatggtatatccaac 33990490  T
Q  572 ccaacagtgaattttggattttcaggaacatcgaaaggacgcttgaaaagttgtccatcttcattgaa---------------ttcatggttgagaagct 656  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  | ||||||||||               ||||| |||||||||||    
T  33990489 ccaacagtgaattttggattttcaggaacatcgaaaggacgcttgaaaggtggtttagcttcattgaatttgtgttcaaaagtttcatagttgagaagct 33990390  T
Q  657 caagaatttctctggccttgtaaagtgtctcttcgacatcctttacaataagagattggttctcatcaacaacgtaggaatcattctcaaaagaagattt 756  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33990389 caagaatttctctggccttataaagtgtctcttcaacatcatttacaataagagattggttctcatcaacaacataggaatcattctcagaagaacattt 33990290  T
Q  757 gcatgcactttcttct--atc-------------aaactatttatttcttctctgggttgatccaagtgttcattgtaatgctttatatcttgtacaacg 841  Q
    ||||||||||||||||  |||             | | | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||     
T  33990289 gcatgcactttcttctgcatcattttcttctaatagagtcttgatttcttctctgggatgatccaaatgttcattgtattgctttatgtcttgaaccaca 33990190  T
Q  842 ggagataaatcctttaagattaacctcaacaatagccttgcactttggttctttcgtgctgtttcaactatt 913  Q
     ||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33990189 agagttaaatccttcaagattgacctcaacaattgccttgcactttggtgctttcgtgctgtttcaactatt 33990118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 644 - 920
Target Start/End: Complemental strand, 33973575 - 33973299
Alignment:
Q  644 tggttgagaagctcaagaatttctctggccttgtaaagtgtctcttcgacatcctttacaataagagattggttctcatcaacaacgtaggaatcattct 743  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33973575 tggttgagaagctcaagaatttctctggccttgtaaagtgtctcttcgacatcatttacaataagagattggttctcatcaacaacgtaggaatcattct 33973476  T
Q  744 caaaagaagatttgcatgcactttcttctatcaaactatttatttcttctctgggttgatccaagtgttcattgtaatgctttatatcttgtacaacggg 843  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33973475 caaaagaagatttgcatgcactttcttctatcaaactatttatttcttctctgggttgatccaagtgttcattgtaatgctttatatcttgtacaacggg 33973376  T
Q  844 agataaatcctttaagattaacctcaacaatagccttgcactttggttctttcgtgctgtttcaactattacagata 920  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33973375 agataaatcctttaagattaacctaaacaatagccttgaactttggttctttcgtgctgtttcaactatttcagata 33973299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33991321 - 33991025
Alignment:
Q  8 agcatcttcatcactttgaaactcaggcactggatattcacaatgttcaattattctctctacaatagtcttcaacatgggtgtttttgagaaggtgaga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33991321 agcatcttcatcactttgaaactcaggcactggatatccgcaatgttcaattattctctctacaatagtcttcaacatgggtgtttttgagaaggtgaca 33991222  T
Q  108 actataatgttttccttgaatttacctgttaaaaccaaagacagtttgtcagacaaaaattaattaatgtcctgtacatttaacatgcacaactaaatga 207  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||| || | |||||||||||||| |||||||||||    
T  33991221 aatataatgttttccttgaatttacctagtaaaaccaaagacagattgtaagacaaaaa-tagttaatctcttttacatttaacatgctcaactaaatga 33991123  T
Q  208 acagttaacagaaaagaaaattaatcaatccaattcaaaggaaaatgcttctttaatatcttaaatcagcatttgcagttaatataagatgcctacaa 305  Q
    ||| || |||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||    
T  33991122 acacttgacagaaaagaaggttaattaatctaattcaaagaaaaatgcttctttaatatgttaaatcaacatttgcagagaatagaagatgcctacaa 33991025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 33974401 - 33974106
Alignment:
Q  9 gcatcttcatcactttgaaactcaggcactggatattcacaatgttcaattattctctctacaatagtcttcaacatgggtgtttttgagaaggtgagaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  33974401 gcatcttcatcactttgaaactcaggcactgaatatccacaatgttgatgtattctctctacaatagtcttcagcatgggtgtttttgagaaggtgacaa 33974302  T
Q  109 ctataatgttttccttgaatttacctgttaaaaccaaagacagtttgtcagacaaaaattaattaatgtcctgtacatttaacatgcacaactaaatgaa 208  Q
     |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||  | |||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33974301 atataatgttttccttgaatttacctagtaaaaccaaagacagattgtaagacaaaaa-aagttaatgtcttttacatttaatatgctcaactaaatgaa 33974203  T
Q  209 cagttaacagaaaagaaaattaatcaatccaattcaaaggaaaatgcttctttaatatcttaaatcagcatttgcagttaatataagatgcctacaa 305  Q
    || || |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||   ||| |||||||||||||    
T  33974202 cacttgacagaaaagaaagttaattaatctaattcaaagaaaaatgcttctttaatatgttaaatcaacatttgcagaggatagaagatgcctacaa 33974106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 8 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 33951801 - 33951525
Alignment:
Q  8 agcatcttcatcactttgaaactcaggcactggatattcacaatgttcaattattctctctacaatagtcttcaacatgggtgtttttgagaaggtgaga 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  33951801 agcatcttcatcactttgaaactcaggcactggatatccacaatgttgatgtattctctctacaatagtcttcagcatgggtgtttttgagaaggtgaca 33951702  T
Q  108 actataatgttttccttgaatttacctgttaaaaccaaagacagtttgtcagacaaaaattaattaatgtcctgtacatttaacatgcacaactaaatga 207  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||  | |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  33951701 aatataatgttttccttgaatttacctagtaaaaccaaagacagattgtaagac-aaaagaagttaatgtcttttacatttaacatgctcaactaaatga 33951603  T
Q  208 acagttaacagaaaagaaaattaatcaatccaattcaaaggaaaatgcttctttaatatcttaaatcagcatttgcag 285  Q
    ||| || |||||||||||  ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  33951602 acacttgacagaaaagaaggttaattaatctaattcaaagaaaaatgcttctttaatatgttaaatcgtcatttgcag 33951525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 372 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 33973800 - 33973577
Alignment:
Q  372 tgattctgtctaacacaccgctaattcaaacatgctttagaga-gccaaagaggatttatgacttacccttaactcgttcatcccaacaaagctttgtag 470  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| | | |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33973800 tgattctgtctaacacactgctaatccaaacatgcatgagataaggcaaaaaggatttatgacttaccattaacttcttcatcccaacaaagctttgtag 33973701  T
Q  471 ccaaagtggttttccccaatcctcctaaaccagttaagacaagtgtggagctaccacccctcagaagctccattttcaacatgctaaatggtatatccaa 570  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33973700 ccagagtggttttccccaatcctcctaaaccagtcaacacaagtgtggagctaccacccctcagaagctccattttcaacttgctaaatggtatatccaa 33973601  T
Q  571 cccaacagtgaattttggattttc 594  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  33973600 cccaacagtgaattttggattttc 33973577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 644 - 856
Target Start/End: Complemental strand, 33959573 - 33959346
Alignment:
Q  644 tggttgagaagctcaagaatttctctggccttgtaaagtgtctcttcgacatcctttacaataagagattggttctcatcaacaacgtaggaatcattct 743  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33959573 tggttgagaagctcaagaatttctcttggcttataaagtgtttcttcaacatcatttacaataagagattggttctcatcaacaacataggaatcattct 33959474  T
Q  744 caaaagaagatttgcatgcact---------------ttcttctatcaaactatttatttcttctctgggttgatccaagtgttcattgtaatgctttat 828  Q
    || ||||| |||||||||||||               ||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||    
T  33959473 cagaagaacatttgcatgcactttctcctgcatcattttcttctattagactatttatttcctctctggggtgatccaaatgatcattgtattgctttat 33959374  T
Q  829 atcttgtacaacgggagataaatccttt 856  Q
     ||||| || || |||||||||||||||    
T  33959373 gtcttgaaccacaggagataaatccttt 33959346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 33941253 - 33941128
Alignment:
Q  9 gcatcttcatcactttgaaactcaggcactggatattcacaatgttcaattattctctctacaatagtcttcaacatgggtgtttttgagaaggtgagaa 108  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | |||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  33941253 gcatcttcatcactttggtactcaggcaccggatatccgcaatgttcaaataatctctctacaataatcttcagcatgggtgtttttgagaaggttacaa 33941154  T
Q  109 ctataatgttttccttgaatttacct 134  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  33941153 atataatgttttccttgaatttacct 33941128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 33912511 - 33912393
Alignment:
Q  12 tcttcatcactttgaaactcaggcactggatattcacaatgttcaattattctctctacaatagtcttcaacatgggtgtttttgagaaggtgagaacta 111  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| || ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  33912511 tcttcgtcactttgatactcaggcaccggatatccaccatgttcaaatagtctctgtaccataatcttcaacatgggtgtttttgagaaggttacaaata 33912412  T
Q  112 taatgttttccttgaattt 130  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33912411 taatgttttccttgaattt 33912393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 427 - 620
Target Start/End: Complemental strand, 33911914 - 33911721
Alignment:
Q  427 ttatgacttacccttaactcgttcatcccaacaaagctttgtagccaaagtggttttccccaatcctcctaaaccagttaagacaagtgtggagctacca 526  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| || | ||| || || ||||||    
T  33911914 ttatgacttacccttaacttgttgatccaaacacagctttgtagccaaagtggtttttcccattccacctaaaccagtcaacaaaagagtagatctacca 33911815  T
Q  527 cccctcagaagctccattttcaacatgctaaatggtatatccaacccaacagtgaattttggattttcaggaacatcgaaaggacgcttgaaaa 620  Q
     |||| ||||| ||||| |||  | |  | ||| |   |||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| | ||||||| ||| ||||    
T  33911814 tccctgagaagttccatcttcggcttaatcaattgcgaatccaaaccaacagtaaattcaggattttcaggaacaccaaaaggacccttaaaaa 33911721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 95; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 380 - 498
Target Start/End: Original strand, 8278802 - 8278920
Alignment:
Q  380 tctaacacaccgctaattcaaacatgctttagagagccaaagaggatttatgacttacccttaactcgttcatcccaacaaagctttgtagccaaagtgg 479  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8278802 tctaacacactgctaatccaaacatgcatgagagagccaaagaggatttatcacttacccttaacttgttcatcccaacaaagctttgtagccaaagtgg 8278901  T
Q  480 ttttccccaatcctcctaa 498  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8278902 ttttccccaatcctcctaa 8278920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 166
Target Start/End: Original strand, 8278607 - 8278766
Alignment:
Q  11 atcttcatcactttgaaactcaggcactggatattcacaatgttcaat-tattctctctacaatagtcttcaacatgggtgtttttgagaaggtgagaac 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||   |||  |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||     
T  8278607 atcttcatcactttgaaactcaggcactggatatccacagtgttcatcatatcttctctacaatagtcttcaacgtgggcatttttgagaaggtgacaaa 8278706  T
Q  110 tataa---tgttttccttgaatttacctgttaaaaccaaagacagtttgtcagacaaaaa 166  Q
    |||||   |||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8278707 tataataatgttttccatggatttacctagtaaaaccaaagacagtttgtcagacaaaaa 8278766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 90; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 432 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 10660 - 10335
Alignment:
Q  432 acttacccttaactcgttcatcccaacaaagctttgtagccaaagtggttttccccaatcctcctaaaccagttaagacaagtgtggagctaccacccct 531  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||| | ||    
T  10660 acttacccttgatttgttcatcccaacaaagattggtagccagagtggtttttcccaaccctcccaaaccagtcaacacaagggttgagcttccatctct 10561  T
Q  532 cagaagctccattttcaacatgctaaatggtatatccaacccaacagtgaattttggattttcaggaacatcgaaaggacgcttgaaaa---gttgtcca 628  Q
    ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| |||||| | ||||||| |||||| |   || |||||    
T  10560 caatagctccattttcaacttgctaaatggtatatcaatcccaacaatgaattctggattttctggaacaccaaaaggacccttgaatattggtggtcca 10461  T
Q  629 tcttcattgaa---------------ttcatggttgagaagctcaagaatttctctggccttgtaaagtgtctcttcgacatcctttacaataagagatt 713  Q
    | |||||| ||               ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||    
T  10460 ttttcattaaatttctgttcaaaattttccttgttaagaagttcaagaatttctctggccttgtaaagtgtctctttaacatcatttaccgtaagagatt 10361  T
Q  714 ggttctcatcaacaacgtaggaatca 739  Q
    |||| |||||||| || |||||||||    
T  10360 ggttatcatcaacgacataggaatca 10335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 11459 - 11325
Alignment:
Q  8 agcatcttcatcactttgaaactcaggcactggatattcacaatgttcaattattctctctacaatagtcttcaacatgggtgtttttgagaaggtgaga 107  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |    
T  11459 agcatcttcatctctttgaaattcaggccctggatatccacaatgttcaaatagtctctctacaatagtcttcaacatgggtgttttcgataaggtgaca 11360  T
Q  108 actataatgttttccttgaatttacctgttaaaac 142  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11359 aatataatattttccttgaattttcctgttaaaac 11325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University