View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2337_low_5 (Length: 473)

Name: NF2337_low_5
Description: NF2337
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2337_low_5
NF2337_low_5
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (11-473)||(30943239-30943701)
chr3 (11-473)||(8156558-8157019)
chr3 (11-473)||(3952777-3953238)
chr3 (11-473)||(6744889-6745349)
chr3 (11-462)||(13743328-13743776)
chr3 (11-462)||(9426666-9427115)
chr3 (11-462)||(2857545-2857994)
chr3 (11-473)||(4002054-4002528)
chr3 (11-462)||(50957242-50957704)
chr3 (11-473)||(36812887-36813361)
chr3 (11-473)||(48246462-48246921)
chr3 (11-421)||(46989614-46990036)
chr3 (15-440)||(21951882-21952305)
chr3 (11-469)||(6489383-6489853)
chr3 (11-466)||(14402568-14403012)
chr3 (11-284)||(2743678-2743965)
chr3 (142-460)||(7841158-7841474)
chr3 (11-442)||(66954-67393)
chr3 (218-473)||(600314-600567)
chr3 (218-473)||(42166182-42166433)
chr3 (218-473)||(47070518-47070771)
chr3 (218-393)||(36134053-36134226)
chr3 (218-392)||(50213588-50213760)
chr3 (218-462)||(16646944-16647185)
chr3 (223-473)||(52387848-52388097)
chr3 (218-473)||(2271406-2271658)
chr3 (299-473)||(2743448-2743619)
chr3 (220-405)||(9473721-9473903)
chr3 (306-473)||(4004896-4005059)
chr3 (444-473)||(1835254-1835283)
chr3 (444-473)||(2967919-2967948)
chr3 (428-469)||(7839479-7839520)
chr3 (444-473)||(35743576-35743605)
chr3 (444-473)||(41844278-41844307)
chr3 (444-473)||(42165213-42165242)
chr3 (444-473)||(46697761-46697790)
chr3 (444-473)||(49144450-49144479)
chr3 (444-473)||(50477230-50477259)
chr3 (445-473)||(9429844-9429872)
chr3 (445-473)||(34691675-34691703)
chr3 (445-473)||(41844359-41844387)
chr3 (445-473)||(42900261-42900289)
chr3 (445-473)||(46402334-46402362)
chr3 (445-473)||(49140940-49140968)
chr3 (445-473)||(54389747-54389775)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (11-473)||(41564053-41564515)
chr2 (11-473)||(5351294-5351755)
chr2 (11-466)||(209041-209495)
chr2 (11-462)||(10620034-10620484)
chr2 (11-473)||(7267007-7267467)
chr2 (11-473)||(24753587-24754047)
chr2 (11-472)||(39798003-39798461)
chr2 (11-473)||(3795387-3795860)
chr2 (146-473)||(18000282-18000608)
chr2 (11-440)||(41181493-41181920)
chr2 (11-465)||(28342581-28343033)
chr2 (114-462)||(38950232-38950565)
chr2 (11-462)||(1096630-1097093)
chr2 (11-464)||(45479384-45479834)
chr2 (11-467)||(24601695-24602161)
chr2 (11-467)||(24611953-24612419)
chr2 (11-473)||(43943739-43944211)
chr2 (11-473)||(9659603-9660078)
chr2 (11-469)||(41052676-41053143)
chr2 (13-462)||(12905584-12906037)
chr2 (11-420)||(439373-439792)
chr2 (11-473)||(41004578-41005046)
chr2 (11-473)||(81813-82285)
chr2 (218-473)||(10825268-10825521)
chr2 (11-200)||(1150594-1150783)
chr2 (223-473)||(25184606-25184853)
chr2 (218-473)||(39950941-39951192)
chr2 (11-117)||(38949749-38949855)
chr2 (218-405)||(32952849-32953033)
chr2 (218-392)||(29398040-29398208)
chr2 (191-297)||(3206971-3207077)
chr2 (345-473)||(7189848-7189974)
chr2 (13-299)||(25613424-25613710)
chr2 (443-473)||(3943185-3943215)
chr2 (444-473)||(28468691-28468720)
chr2 (444-473)||(43536152-43536181)
chr2 (445-473)||(3937945-3937973)
chr2 (445-473)||(15835172-15835200)
chr2 (445-473)||(22003396-22003424)
chr2 (445-473)||(23346830-23346858)
chr2 (445-473)||(41183219-41183247)
chr2 (445-473)||(43982151-43982179)
[»] chr1 (52 HSPs)
chr1 (11-473)||(3993405-3993866)
chr1 (11-473)||(3944024-3944485)
chr1 (11-473)||(38771679-38772141)
chr1 (13-473)||(20353500-20353958)
chr1 (11-462)||(29352294-29352743)
chr1 (11-473)||(44469574-44470034)
chr1 (11-462)||(30909592-30910041)
chr1 (11-442)||(13633435-13633865)
chr1 (11-473)||(9710628-9711087)
chr1 (11-473)||(50113357-50113831)
chr1 (11-367)||(5081927-5082283)
chr1 (11-363)||(6558047-6558411)
chr1 (153-473)||(15051053-15051371)
chr1 (11-462)||(8459019-8459467)
chr1 (11-402)||(37018959-37019347)
chr1 (11-469)||(7966037-7966498)
chr1 (11-440)||(51666229-51666656)
chr1 (11-362)||(12643369-12643715)
chr1 (29-462)||(19495101-19495544)
chr1 (11-425)||(13177689-13178109)
chr1 (197-468)||(46886137-46886406)
chr1 (11-473)||(1655643-1656112)
chr1 (11-392)||(25039644-25040023)
chr1 (11-304)||(38690126-38690418)
chr1 (13-462)||(4517959-4518427)
chr1 (14-299)||(36072584-36072879)
chr1 (11-425)||(46978797-46979233)
chr1 (13-392)||(5141435-5141811)
chr1 (11-291)||(33168133-33168423)
chr1 (218-464)||(52805330-52805573)
chr1 (218-473)||(470840-471093)
chr1 (217-462)||(22345818-22346055)
chr1 (331-473)||(23359230-23359372)
chr1 (218-467)||(31780025-31780270)
chr1 (218-456)||(94464-94700)
chr1 (218-405)||(22527465-22527649)
chr1 (218-392)||(16281828-16281999)
chr1 (217-405)||(19521715-19521900)
chr1 (222-405)||(21144405-21144585)
chr1 (339-473)||(38689981-38690114)
chr1 (221-405)||(50617321-50617503)
chr1 (381-462)||(12643291-12643372)
chr1 (179-256)||(1179878-1179955)
chr1 (391-473)||(6557965-6558046)
chr1 (408-473)||(36072419-36072483)
chr1 (444-473)||(3728785-3728814)
chr1 (444-473)||(8548663-8548692)
chr1 (408-473)||(29261464-29261528)
chr1 (444-473)||(29622418-29622447)
chr1 (445-473)||(19928806-19928834)
chr1 (349-401)||(47714986-47715037)
chr1 (445-473)||(48751405-48751433)
[»] chr7 (33 HSPs)
chr7 (11-473)||(30790569-30791031)
chr7 (11-473)||(45767423-45767884)
chr7 (11-462)||(43619740-43620190)
chr7 (11-473)||(603829-604289)
chr7 (11-472)||(15069913-15070373)
chr7 (11-442)||(18109356-18109786)
chr7 (11-472)||(42503401-42503861)
chr7 (11-462)||(47742552-47743001)
chr7 (17-469)||(34622553-34623002)
chr7 (11-473)||(19044343-19044816)
chr7 (11-473)||(20709820-20710293)
chr7 (210-462)||(40928715-40928965)
chr7 (13-473)||(10705298-10705765)
chr7 (223-473)||(29592593-29592841)
chr7 (15-324)||(12111412-12111729)
chr7 (11-184)||(29592839-29593012)
chr7 (11-288)||(47064857-47065148)
chr7 (218-405)||(17838405-17838589)
chr7 (220-473)||(34742168-34742418)
chr7 (218-462)||(5537907-5538147)
chr7 (218-405)||(13323485-13323669)
chr7 (218-299)||(10522285-10522366)
chr7 (331-392)||(12111332-12111393)
chr7 (443-473)||(20564123-20564153)
chr7 (440-473)||(16636198-16636231)
chr7 (440-473)||(17459407-17459440)
chr7 (440-473)||(17593774-17593807)
chr7 (444-473)||(34738414-34738443)
chr7 (444-473)||(35606839-35606868)
chr7 (445-473)||(15070405-15070433)
chr7 (445-473)||(17840885-17840913)
chr7 (445-473)||(18105423-18105451)
chr7 (445-473)||(48407282-48407310)
[»] chr4 (40 HSPs)
chr4 (11-473)||(49563890-49564352)
chr4 (11-473)||(3407802-3408263)
chr4 (11-473)||(19069237-19069710)
chr4 (13-462)||(37394768-37395229)
chr4 (11-465)||(10422971-10423421)
chr4 (18-469)||(44050650-44051111)
chr4 (11-473)||(38460476-38460935)
chr4 (11-320)||(10374240-10374549)
chr4 (216-473)||(15995772-15996026)
chr4 (11-464)||(4774167-4774627)
chr4 (11-439)||(18578706-18579142)
chr4 (107-424)||(50904822-50905137)
chr4 (11-287)||(24415392-24415680)
chr4 (218-473)||(51492121-51492374)
chr4 (218-462)||(50278593-50278836)
chr4 (114-364)||(51642165-51642423)
chr4 (218-473)||(37015948-37016201)
chr4 (11-185)||(11506657-11506831)
chr4 (218-462)||(44674199-44674440)
chr4 (39-304)||(6186865-6187140)
chr4 (337-440)||(24414917-24415020)
chr4 (71-291)||(30043046-30043275)
chr4 (443-473)||(26932634-26932664)
chr4 (444-473)||(1089578-1089607)
chr4 (444-473)||(15999793-15999822)
chr4 (444-473)||(21022882-21022911)
chr4 (444-473)||(30723224-30723253)
chr4 (444-473)||(30726735-30726764)
chr4 (444-473)||(31425312-31425341)
chr4 (444-473)||(37563194-37563223)
chr4 (444-473)||(39773527-39773556)
chr4 (444-473)||(40358274-40358303)
chr4 (444-473)||(41800931-41800960)
chr4 (444-473)||(54633929-54633958)
chr4 (445-473)||(6178203-6178231)
chr4 (445-473)||(37563275-37563303)
chr4 (445-473)||(39773454-39773482)
chr4 (445-473)||(41795449-41795477)
chr4 (445-473)||(49094036-49094064)
chr4 (445-473)||(54634010-54634038)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (11-462)||(1608353-1608804)
chr6 (11-473)||(13382679-13383151)
chr6 (11-462)||(29286264-29286712)
chr6 (11-462)||(31150628-31151076)
chr6 (11-462)||(25140668-25141117)
chr6 (153-473)||(18351348-18351666)
chr6 (11-473)||(23958940-23959400)
chr6 (11-459)||(7537250-7537710)
chr6 (11-438)||(18609796-18610221)
chr6 (17-473)||(2051078-2051545)
chr6 (11-473)||(28362280-28362754)
chr6 (11-439)||(29667386-29667822)
chr6 (220-473)||(11840022-11840273)
chr6 (11-268)||(2259338-2259594)
chr6 (71-299)||(34230701-34230930)
chr6 (218-473)||(31771510-31771764)
chr6 (190-392)||(26702454-26702653)
chr6 (218-462)||(3502434-3502676)
chr6 (46-391)||(20448386-20448728)
chr6 (247-390)||(8304570-8304711)
chr6 (266-440)||(2258368-2258540)
chr6 (196-298)||(20439753-20439855)
chr6 (210-291)||(19129204-19129285)
chr6 (196-298)||(20436045-20436147)
chr6 (444-473)||(27616765-27616794)
chr6 (444-473)||(29076317-29076346)
chr6 (444-473)||(29109850-29109879)
chr6 (444-473)||(29111290-29111319)
chr6 (444-473)||(31768803-31768832)
chr6 (445-473)||(6204779-6204807)
chr6 (445-473)||(11691746-11691774)
chr6 (445-473)||(13388703-13388731)
chr6 (445-473)||(26712098-26712126)
chr6 (445-473)||(27639535-27639563)
chr6 (445-473)||(28249935-28249963)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (11-473)||(7344119-7344580)
chr8 (11-473)||(8419454-8419915)
chr8 (11-473)||(32375701-32376162)
chr8 (11-431)||(30301225-30301645)
chr8 (11-462)||(39518-39967)
chr8 (11-473)||(31959610-31960084)
chr8 (11-457)||(23924032-23924475)
chr8 (11-473)||(35962357-35962817)
chr8 (11-440)||(43376842-43377283)
chr8 (127-462)||(20548938-20549270)
chr8 (11-473)||(43679447-43679906)
chr8 (11-440)||(2124260-2124704)
chr8 (12-322)||(22588006-22588316)
chr8 (108-439)||(39751144-39751473)
chr8 (11-299)||(7171880-7172178)
chr8 (70-438)||(4867415-4867791)
chr8 (11-304)||(22661137-22661430)
chr8 (223-462)||(41743925-41744162)
chr8 (218-473)||(34366961-34367214)
chr8 (11-184)||(41744160-41744333)
chr8 (250-473)||(23578485-23578705)
chr8 (219-402)||(41238970-41239150)
chr8 (345-462)||(1116110-1116226)
chr8 (399-473)||(17924232-17924306)
chr8 (93-304)||(30972519-30972730)
chr8 (17-116)||(39751659-39751758)
chr8 (337-460)||(7172498-7172623)
chr8 (78-135)||(31281198-31281255)
chr8 (444-473)||(184466-184495)
chr8 (444-473)||(22014375-22014404)
chr8 (444-473)||(26663027-26663056)
chr8 (444-473)||(36677842-36677871)
chr8 (445-473)||(184547-184575)
chr8 (445-473)||(486143-486171)
chr8 (445-473)||(22550860-22550888)
chr8 (445-473)||(41016464-41016492)
chr8 (445-473)||(42481611-42481639)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (11-473)||(37814632-37815092)
chr5 (11-473)||(25890044-25890504)
chr5 (11-462)||(27863464-27863913)
chr5 (11-473)||(7017562-7018008)
chr5 (11-462)||(13563702-13564151)
chr5 (11-472)||(38855766-38856225)
chr5 (11-459)||(28882058-28882498)
chr5 (11-472)||(11029059-11029517)
chr5 (78-469)||(34079761-34080150)
chr5 (11-473)||(34122574-34123048)
chr5 (11-469)||(1039355-1039824)
chr5 (11-405)||(7796696-7797087)
chr5 (11-240)||(14280541-14280770)
chr5 (11-473)||(33994712-33995171)
chr5 (11-439)||(24053237-24053673)
chr5 (11-424)||(24050125-24050548)
chr5 (69-473)||(25877671-25878082)
chr5 (240-473)||(28388311-28388542)
chr5 (317-473)||(14280767-14280923)
chr5 (11-245)||(4196792-4197024)
chr5 (13-172)||(28387821-28387979)
chr5 (218-473)||(7762013-7762267)
chr5 (11-410)||(30352541-30352940)
chr5 (218-473)||(38407197-38407449)
chr5 (11-135)||(43179428-43179552)
chr5 (61-304)||(6267691-6267933)
chr5 (218-405)||(41799539-41799722)
chr5 (331-440)||(4196637-4196746)
chr5 (179-462)||(43179631-43179902)
chr5 (444-473)||(8577024-8577053)
chr5 (444-473)||(19041111-19041140)
chr5 (444-473)||(27662260-27662289)
chr5 (444-473)||(28238189-28238218)
chr5 (445-473)||(511073-511101)
chr5 (445-473)||(19037563-19037591)
chr5 (445-473)||(27659990-27660018)
chr5 (445-473)||(31787570-31787598)
[»] scaffold0494 (4 HSPs)
scaffold0494 (11-472)||(4889-5349)
scaffold0494 (444-473)||(907-936)
scaffold0494 (445-473)||(881-909)
scaffold0494 (445-473)||(5381-5409)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (11-473)||(15518-15978)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (11-473)||(22453-22924)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (118-473)||(8249-8602)
[»] scaffold0219 (2 HSPs)
scaffold0219 (94-469)||(19743-20131)
scaffold0219 (11-96)||(19497-19582)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (15-405)||(21768-22144)
[»] scaffold0169 (2 HSPs)
scaffold0169 (11-161)||(10827-10977)
scaffold0169 (281-440)||(1517-1674)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (218-473)||(236006-236257)
[»] scaffold0199 (1 HSPs)
scaffold0199 (218-405)||(12522-12706)
[»] scaffold0794 (2 HSPs)
scaffold0794 (11-185)||(1314-1488)
scaffold0794 (445-473)||(5321-5349)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (442-473)||(36627-36658)
[»] scaffold0744 (1 HSPs)
scaffold0744 (444-473)||(417-446)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (444-473)||(7468-7497)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (445-473)||(717-745)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (445-473)||(50097-50125)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (445-473)||(232827-232855)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 443; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 443; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30943701 - 30943239
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943701 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 30943602  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943601 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 30943502  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943501 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 30943402  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943401 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacttttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 30943302  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30943301 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 30943239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 8157019 - 8156558
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8157019 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 8156920  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8156919 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 8156820  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8156819 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 8156720  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8156719 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttgg-aatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 8156621  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8156620 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactgccgaggtttt 8156558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 3952777 - 3953238
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3952777 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 3952876  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3952877 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 3952976  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3952977 aatgttttgatgaatttcaaacgtctatttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 3953076  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3953077 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatactta 3953175  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3953176 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactcccgaggtttt 3953238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 6744889 - 6745349
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6744889 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacgacggcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 6744988  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6744989 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 6745088  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745089 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 6745188  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745189 gtccgagtttcaatctt--gtatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 6745286  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6745287 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 6745349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 13743776 - 13743328
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743776 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 13743677  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743676 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 13743577  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13743576 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaa-tttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttgattat 13743478  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  13743477 gtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctagtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgttta 13743380  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13743379 gaattatgcagaacccactgtctacataatcagttttcctcggcagttaact 13743328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 9427115 - 9426666
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9427115 agagatgaatacgcatggaaaacggcaaactatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 9427016  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9427015 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 9426916  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9426915 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattat 9426816  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-tt 409  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  9426815 gtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgcttt 9426718  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    | |||||||||| |||  || |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9426717 ataattatgcag-acccactatctgcataatcagatttcctcggcatttaact 9426666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Original strand, 2857545 - 2857994
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  2857545 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaaaatggtggaaaataata 2857644  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2857645 tattatatatgtatgttcattccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 2857744  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2857745 aatgttaagatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattat 2857844  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-tt 409  Q
    |||| |||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2857845 gtccaagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgcttt 2857942  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    | |||||||||| ||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2857943 acaattatgcag-actcactgtctgcataatcagatatcctcggcagttaact 2857994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 4002054 - 4002528
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  4002054 agagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaaaatggtggaaaataata 4002153  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggaca------ 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||          
T  4002154 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttatttaattatggacacttagt 4002253  T
Q  205 --------ctttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4002254 tatagacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 4002353  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4002354 tttatcttgtttatgtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaacttgccgaaaaaatgg 4002451  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4002452 cttggaaatgtttagaattatgcagaacttgctgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactcccgaggtttt 4002528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Original strand, 50957242 - 50957704
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  50957242 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttttgtttcggaatatggtggaagataata 50957341  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50957342 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgg 50957441  T
Q  211 aatgt--------------tttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
    |||||              ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50957442 aatgttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtctgtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 50957541  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50957542 cttatcttcattatgtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctgatttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 50957639  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  50957640 cttggaaatgtttaaaattatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 50957704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 36813361 - 36812887
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  36813361 agagatgaatacgtgtggaaaacggcaagctatatgtctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaatataata 36813262  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggaca------ 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||          
T  36813261 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatataatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacaattaat 36813162  T
Q  205 --------ctttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
            |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36813161 tatggaaactttgtaatgttttaatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtataagatattgta 36813062  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |   |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36813061 tttatcttgtttatgtccgagtttcaatctt--gtatggattattttgcctttggaaatgctctggtttaactacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 36812964  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36812963 cttggaaatgtttagaattatgcagaatttgctgtctgcacaatcagttttcctcggcagtttactaccgaggtttt 36812887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 48246921 - 48246462
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48246921 agagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgctttggcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataata 48246822  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48246821 tattatatatgtatgtttgttccatatgcaactgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 48246722  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  48246721 aattttttgatgaatttcaaaagtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatattgcttat 48246622  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||| ||||||||||  |   |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||    
T  48246621 gtctgagtttcaatgtt--ttatgaattattttgcctttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccggaaaaatggcttgaaaatgttta 48246524  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||  ||   |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48246523 gaattatgca-cacacactgtctgcataaacagttttcctcggcagttaactaccgaggtttt 48246462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 11 - 421
Target Start/End: Complemental strand, 46990036 - 46989614
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  46990036 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatgacgacgtcggatttatgttttggaatatggtggaagataata 46989937  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac------- 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           
T  46989936 tattatatatgtatgttcgttccacatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaat 46989837  T
Q  204 -------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
           ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46989836 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaatgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 46989737  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  |||   |||||||||| || |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  46989736 tttatcttgtttatgtccgagtttca--catttgtatgaattattttgcctttgaaaatactttggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 46989639  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcag 421  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  46989638 cttggaaatgtttagaattatgcag 46989614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 15 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 21952305 - 21951882
Alignment:
Q  15 atgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatatt 114  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21952305 atgaatacgcatggaaaacggcaagctatgtgccttggcttattcgcgatgatagcgacgtcggatttaggtttcggaatatggtggaagatgatatatt 21952206  T
Q  115 atatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatg 214  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |    
T  21952205 atatttgtatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaactagggatttaatttaatgacgtgtaatgagttgtttaatcatggacacattgtaacg 21952106  T
Q  215 ttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtcc 314  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |    
T  21952105 ttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaatcaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgttc 21952006  T
Q  315 gagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaa 413  Q
    ||||||||||  |   ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||    
T  21952005 gagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcatttggaaatgctctggtttaattacaagtcaaaactggccg-aaaaatggcttggaattgttttagaa 21951909  T
Q  414 ttatgcagaacctgctgtctgcataat 440  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  21951908 ttctgcagaacctgctgtctgcataat 21951882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 6489853 - 6489383
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6489853 agagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgtcgtcggatttatatttcggaatatggtggaagataata 6489754  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacac----- 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||         
T  6489753 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaag 6489654  T
Q  206 ----------tttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgt 295  Q
              ||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  6489653 tatggacacttttgtaacgtttcaatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagataatgt 6489554  T
Q  296 atttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatg 395  Q
    |||| ||||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  6489553 atttttcttgtttatgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattagcggtaaaaactggccg-aaaaatg 6489457  T
Q  396 gcttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgagg 469  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  6489456 gcttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgttttcctcggcagttaactaccgagg 6489383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 466
Target Start/End: Original strand, 14402568 - 14403012
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  14402568 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataata 14402667  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggaca------ 204  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||          
T  14402668 tattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgacgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaat 14402767  T
Q  205 --------ctttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
            |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||                      |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14402768 tatagacactttgtaatgttttcatgaatttcaaacgtttgtttaatt----------------------taattatggacaattgtaaaagatattgta 14402845  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14402846 tttatcttgtttatgtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 14402943  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccg 466  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||   |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14402944 tttggaaatgtttagaattatgcagaactcactgt-tgcataatcagttttcctcggcagttaactaccg 14403012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 11 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 2743965 - 2743678
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2743965 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 2743866  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2743865 tattatatacgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatgaacactttgt 2743766  T
Q  211 aatgtt--------------ttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgta 284  Q
    ||||||              |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2743765 aatgttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgta 2743678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 142 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 7841474 - 7841158
Alignment:
Q  142 ttgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgttta 241  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  7841474 ttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagttgtttaattatggacactttgtaacgttttgatgaattttaaacgtttgtgta 7841375  T
Q  242 attttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattata 341  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||  |   ||||||||||     
T  7841374 attttaaccaaatgtcggtttaatttacttatggacaattgtaaaagatactgtatttatcttgtttatgtctgagtttcaatgtt--gtatgaattatt 7841277  T
Q  342 ttacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatc 441  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  7841276 ttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggtcgaaaaaatggcttggaaatgtttagaattatgcataacccactgtttgcataatc 7841177  T
Q  442 aaatttcctcggcagttaa 460  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  7841176 agttttcctcggcagttaa 7841158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 67393 - 66954
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||   ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  67393 agagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgtcttggcttattaaagacaatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataata 67294  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaattatg 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||          || |||||||||||    
T  67293 cattatatatgtatgttcgttccatatgtgattgcgttgaatgtaagtagggatttcatttaatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatg 67194  T
Q  201 gacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 300  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  67193 gacactatgtaccgttttgatgaatttcaaacttttgtgtagtttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttt 67094  T
Q  301 tcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttg 400  Q
     |||  ||||    |||||| |||  |   ||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  67093 acttgtttataagtgagtttaaatgtt--gtatgaattatattgcatttgggattgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccg-aaaaatggcttg 66997  T
Q  401 gaaatactt-agaattatgcagaacctgctgtctgcataatca 442  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  66996 gaaatgcttaacaattatgcagaacccactgtctgcataatca 66954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Original strand, 600314 - 600567
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  600314 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgtccgag 600413  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||   ||||||| |    
T  600414 tttcaatgtt--gtatgaattattttgcctttaaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaatca 600510  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||| |   ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  600511 tgcagagctcactgcctgcatgatcagatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 600567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Original strand, 42166182 - 42166433
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    |||| |||||||||| |  || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42166182 tgataaatttcaaacattagtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 42166281  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||| | || |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |    
T  42166282 tttcaatgtt--gtatgaattgttttgcctttcaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaa-ggcttggaaatgttttagaatga 42166378  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||| |   ||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42166379 tgcagagctcactgcctgc--aatcaaatttcctcggcagttaactaccgaagtttt 42166433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 47070771 - 47070518
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  47070771 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaacgtcggtttgatttaattatggacaattggaaaagatattgtatttatcttgtttatgttcgag 47070672  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||||| |    
T  47070671 tttcaatgtt--gtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactagccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaatca 47070575  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    || ||| |   ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||    
T  47070574 tgtagagctcactgactgcataatcagattttctcggcagttaactacggatgtttt 47070518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 393
Target Start/End: Original strand, 36134053 - 36134226
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36134053 tgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 36134152  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaa 393  Q
    |||||||  |   |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36134153 tttcaatgtt--gtatgaattattttgcctttcgaaatgctctgatttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaa 36134226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 50213760 - 50213588
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  50213760 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgcatttttcttgtttatgtccgag 50213661  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaa 392  Q
    |||||||  |   |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50213660 tttcaatgtt--gtatgaattattttgcctttcgaaatgctctgctttaattacaggtaaaaactggccgaaaaa 50213588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 218 - 462
Target Start/End: Original strand, 16646944 - 16647185
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||    
T  16646944 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttaaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaatcgtaaaagatattatatttatctt-tttatgtctgag 16647042  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||   ||||||| |    
T  16647043 tttcaatgtt--gtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtttaattacagataaaaattggccg-gaaaatggcttggaaatgttttagaatca 16647139  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||| |   ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16647140 tgcagagctcactgcctgcataattagatttcctcggcagttaact 16647185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 223 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 52388097 - 52387848
Alignment:
Q  223 aatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttca 322  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  52388097 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggtcaattgtaaaagatattgtatttatattgtttatgtccgagtttca 52387998  T
Q  323 atcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaattatgcag 421  Q
    ||  |   ||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||    
T  52387997 atgtt--gtatgaattggtttgcctttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaa-ggcttggaaatgttttagaatgatgcag 52387901  T
Q  422 aac---ctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    | |   || ||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52387900 agctcactactgcctgc--aatcagatttcctcggcagttaactaccgaagtttt 52387848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 2271658 - 2271406
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta-tttatcttcattatgtccga 316  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| |    
T  2271658 tgatgaattttaaacgtttgtctaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattttatcttgtttatgtccaa 2271559  T
Q  317 gtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatt 415  Q
    ||||||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||     
T  2271558 gtttcaatgtt--gtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaa-ggcttgaaaatgttttagaatg 2271462  T
Q  416 atgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||  ||| |   ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2271461 atcaagagctcactgcctgc--aatcagatttcctcggcagttaactcccgaggtttt 2271406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 299 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 2743619 - 2743448
Alignment:
Q  299 tatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggct 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2743619 tatcttcattatgtccgagtttcaatcttg--tatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaaatggct 2743522  T
Q  399 tggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    | |||||  ||| | |||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2743521 tcgaaatgtttacatttatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactcccgaggtttt 2743448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 405
Target Start/End: Original strand, 9473721 - 9473903
Alignment:
Q  220 atgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtt 319  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  9473721 atgaatttcaaacgtttgtgtaacttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggataattgtaatagatattgtatttatattgtttatgtccgagtt 9473820  T
Q  320 tcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat 405  Q
    |||||  |   |||||||| | || ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9473821 tcaatgtt--gtatgaattgttttgcctttcgaaatgatctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaa-ggcttggaaat 9473903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 306 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 4005059 - 4004896
Alignment:
Q  306 attatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat 405  Q
    |||||||||||||||||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4005059 attatgtccgagtttcaatgttg--tatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtttaattacatgtaaaaactggccgaaaaaat-gcttggaaat 4004963  T
Q  406 -acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
       ||||||| ||||||| |   ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4004962 gttttagaatgatgcagagctcactgcctgc--aatcagatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 4004896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 1835254 - 1835283
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1835254 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 1835283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 2967919 - 2967948
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2967919 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 2967948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 428 - 469
Target Start/End: Original strand, 7839479 - 7839520
Alignment:
Q  428 ctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgagg 469  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||    
T  7839479 ctgtctgcataattagttttcctcggcagttaactaccgagg 7839520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 35743576 - 35743605
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35743576 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 35743605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 41844307 - 41844278
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41844307 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 41844278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 42165242 - 42165213
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42165242 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 42165213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 46697790 - 46697761
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46697790 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 46697761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 49144450 - 49144479
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49144450 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 49144479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 50477259 - 50477230
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50477259 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 50477230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 9429844 - 9429872
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9429844 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 9429872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 34691703 - 34691675
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34691703 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 34691675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 41844359 - 41844387
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41844359 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 41844387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 42900289 - 42900261
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42900289 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 42900261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 46402334 - 46402362
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46402334 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 46402362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 49140968 - 49140940
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49140968 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 49140940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 54389747 - 54389775
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54389747 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 54389775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 41564053 - 41564515
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41564053 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 41564152  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41564153 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 41564252  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41564253 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 41564352  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41564353 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 41564452  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41564453 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttccttggccgttaactaccgaggtttt 41564515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 5351294 - 5351755
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5351294 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 5351393  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5351394 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 5351493  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5351494 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 5351593  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5351594 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttgg-aatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 5351692  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5351693 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 5351755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 209495 - 209041
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209495 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 209396  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209395 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtatggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 209296  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209295 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 209196  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209195 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttgg-aatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 209097  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccg 466  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  209096 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccg 209041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 424; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 10620484 - 10620034
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10620484 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 10620385  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10620384 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 10620285  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10620284 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 10620185  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10620184 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttgg-aatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 10620086  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10620085 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 10620034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 7267007 - 7267467
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7267007 agagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatacctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 7267106  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7267107 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 7267206  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7267207 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtaggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattat 7267306  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-tt 409  Q
    ||||||||||||||| |   ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  7267307 gtccgagtttcaatctt--gtataaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgcttt 7267404  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    | |||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7267405 acaattatgcag-acccactgtctgcataatcagatttcctcggcagttaactaccgagatttt 7267467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 24753587 - 24754047
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  24753587 agagatgaatacgtatggaaaacggcaagctatatgcttttgcttattcgcgacgacggcgacatcgtatttatgtttcggaatatggtggaaaataata 24753686  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24753687 tattatatatgtatgtttgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 24753786  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  24753787 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaaaaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttat 24753886  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    |||| |||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24753887 gtcccagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgttta 24753984  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  24753985 gaattatgcagaacttgctgtctgcataatcagttttcctcggcagtttattaccgaggtttt 24754047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 472
Target Start/End: Original strand, 39798003 - 39798461
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39798003 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 39798102  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39798103 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatgg--actttgt 39798200  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcatta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39798201 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgcatttatcttgatta 39798300  T
Q  310 tgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactt 409  Q
    || ||||||||||||  |   |||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  39798301 tgaccgagtttcaatatt--gtatgaattatttaacctttggaaattgtctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgtct 39798398  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggttt 472  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39798399 agaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactgccgaagttt 39798461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3795860 - 3795387
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  3795860 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgtgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataata 3795761  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795760 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 3795661  T
Q  211 aatgtt--------------ttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
    ||||||              |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795660 aatgttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 3795561  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  3795560 cttatcttcattatgtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccaaaaaaatgg 3795463  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||    
T  3795462 cttggaaatgtttagaattatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaacttccaaggtttt 3795387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 146 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18000608 - 18000282
Alignment:
Q  146 attgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattt 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18000608 attgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattt 18000509  T
Q  246 taaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattac 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18000508 taaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattac 18000409  T
Q  346 ctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaat 445  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18000408 ctttgg-aatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaat 18000310  T
Q  446 ttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18000309 ttcctcgccagttaactaccgaggtttt 18000282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 41181920 - 41181493
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41181920 agagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggcttatacgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 41181821  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41181820 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 41181721  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  41181720 aacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgtatttttcttagttat 41181621  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-tt 409  Q
    | ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||    
T  41181620 gaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaact-gcccaaaaaatggcttggaaatgcatt 41181524  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataat 440  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  41181523 agaattatgcataacccactgtctgcataat 41181493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 28343033 - 28342581
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgttt-cggaatatggtggaagacaat 109  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  28343033 agagacgaatacacatgtaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgttttcggaatatggtggaagataat 28342934  T
Q  110 atattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  28342933 atattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgaattgtttaattatgaacactttg 28342834  T
Q  210 taatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcatta 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  28342833 taacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgttta 28342734  T
Q  310 tgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-t 408  Q
    || ||||||||||||  |   ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||| | |    
T  28342733 tgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgttctggtttaattacagataaaaactggccg-aaaaatagtttggaaattctt 28342637  T
Q  409 tagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactacc 465  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  28342636 tagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgttttcctcggcagttaactacc 28342581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 114 - 462
Target Start/End: Original strand, 38950232 - 38950565
Alignment:
Q  114 tatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38950232 tatatatgtatgttcgttccatatgtaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaat 38950331  T
Q  214 gttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtc 313  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38950332 gttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtc 38950431  T
Q  314 cgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaa 413  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             | |||||||||| ||||||||||||||    
T  38950432 cgagtttcaatctt--gtatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacag-------------gtaaaaatggctcggaaatacttagaa 38950516  T
Q  414 ttatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38950517 ttatgcagaacccactgtctgcataatcagatttcctcggcagttaact 38950565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 1097093 - 1096630
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1097093 agagacgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgcttgggcttatttgcgacgatagcgacgtcgaatttatgtttcggaatatggtggaagataata 1096994  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaat-------------- 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||                  
T  1096993 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttgtttaattatgaacacttaat 1096894  T
Q  197 tatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  1096893 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtagtttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatactgta 1096794  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||  |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1096793 tttatcttgtttatgtccgagttttaatgtt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 1096696  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1096695 cttggaaatgtttagaattatgcataacccactgtcttcataatcagttttcctcggcagttaact 1096630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 464
Target Start/End: Original strand, 45479384 - 45479834
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  45479384 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatatcggcgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataata 45479483  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  45479484 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgtgttgtttaattatggacactatgt 45479583  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    || ||||||||||||||||||| | | | || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||    
T  45479584 aacgttttgatgaatttcaaacttttttgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattttacttgtttat 45479683  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-tt 409  Q
    | | |||||| |||  |   ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||| |||| | ||    
T  45479684 gactgagtttaaatgtt--gtattagttatattgcctttggaaatgctctggttaaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatagcttgaaaatgcttt 45479780  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactac 464  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  45479781 agaattatgcagaacccactgtctgcataatc-aattttctcggcaattaactac 45479834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 24602161 - 24601695
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24602161 agagacgaatacggatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcaacgtcggatttatttttcggaatatggtggaagataata 24602062  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac------- 203  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           
T  24602061 tattatatat--atgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaat 24601964  T
Q  204 -------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
           ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24601963 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtctgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 24601864  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  24601863 tttttcttgtttatgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactgaccg-aaaaatgg 24601767  T
Q  397 cttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccga 467  Q
    ||||||||| | || |||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24601766 cttggaaatgcttttgaattatgtagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccga 24601695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 11 - 467
Target Start/End: Original strand, 24611953 - 24612419
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24611953 agagacgaatacggatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcaacgtcggatttatttttcggaatatggtggaagataata 24612052  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt--------------ttaat 196  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||              |||||    
T  24612053 tattatatat--atgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaat 24612150  T
Q  197 tatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24612151 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtctgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 24612250  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||    
T  24612251 tttttcttgtttatgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactgaccg-aaaaatgg 24612347  T
Q  397 cttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccga 467  Q
    ||||||||| | || |||||||| |||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  24612348 cttggaaatgcttttgaattatgtagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccga 24612419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 43944211 - 43943739
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43944211 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggcttattcgcgatgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataata 43944112  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaattatg 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          || |||||   |||    
T  43944111 taatatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgaattgtaatgtgttgtttatgcatg 43944012  T
Q  201 gacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  43944011 gacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttttgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttt 43943912  T
Q  301 tcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattata--ttacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggct 398  Q
    ||||  ||||| |||||||| |||  |   ||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  43943911 tcttgtttatgaccgagttttaatgtt--gtatgatttatattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccg-aaaaatggct 43943815  T
Q  399 tggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||   | ||||||||||    |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43943814 tggaaatgctttagaattatgcataacccattctctgcataattgtttttcctcggcagttaactaccgagttttt 43943739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 9659603 - 9660078
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9659603 agagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgacgtcgagtttatgtttcggaatatggtggaagataata 9659702  T
Q  111 tattatatat--gtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt- 207  Q
    |||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  9659703 tattttatatttgtatgttcgttcaatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggtatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactta 9659802  T
Q  208 -------------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattg 294  Q
                 ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9659803 attatggacactgtgtaacgttttgatgaatttcaagcgtttgtgtaattttaaccaaatgtcgttttgatttaattatggacaattgtaaaagatattg 9659902  T
Q  295 tatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaat 394  Q
    ||||| ||||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  9659903 tatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattaaaggtaaaaactggccg-aaaaat 9659999  T
Q  395 ggcttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||   ||||||||||||| ||||  |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  9660000 ggcttggaaatgttttagaattatgcataacccactgtctgcataat-tgttttcctcggcaattaactaccaaggtttt 9660078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 41053143 - 41052676
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41053143 agagacgaatacgcattgaaaacgccaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 41053044  T
Q  111 ta-ttatatatgtatgttcgttcc--atatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaa-----tttaatga--tgtgtaatga--gtagtttaatta 198  Q
    || |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||     | ||||||  ||| |||| |  |    |||||||    
T  41053043 tatttatatatgtgtgttcgttccatatatgcaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatgatgtgtaatgaattgtttaattatggacacttaatta 41052944  T
Q  199 tggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatt 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41052943 tggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 41052844  T
Q  299 tatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggct 398  Q
    | ||||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  41052843 tttcttgtttatgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatactctggtttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatggct 41052747  T
Q  399 tggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgagg 469  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||| |||||| ||||||    
T  41052746 tggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-tattttcctcggcaattaactgccgagg 41052676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 13 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 12906037 - 12905584
Alignment:
Q  13 agatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 112  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12906037 agatgaatacgcatggaaaacaacaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatata 12905938  T
Q  113 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaattatgga 202  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||          || |||||||||| ||    
T  12905937 ttatatatgtatgtttgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtacggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattattga 12905838  T
Q  203 cactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatc 302  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |    
T  12905837 cactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaatatattgtattttac 12905738  T
Q  303 ttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttgga 402  Q
    ||  ||||| | |||||| |||  |   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||||||| || ||||||||||||||    
T  12905737 ttgtttatgactgagtttaaatgtt--gtatgagttatattgcctttggaaatgctctggttaaatta---gtaaaaactggtcg-aaaaatggcttgga 12905644  T
Q  403 aatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    ||| | |||||||||||||||||   |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  12905643 aatgctttagaattatgcagaactcactgtctgcataa-ccagttttctcggcagttaact 12905584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 420
Target Start/End: Original strand, 439373 - 439792
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  439373 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccctggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaagtaata 439472  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt--------------ttaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||              |||||    
T  439473 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaaggagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgtttaattatgaacacttaat 439572  T
Q  197 tatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  439573 tatggatactttgtaacgctttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 439672  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||  ||||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  439673 tt--tcttgtttatgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgcgctggtttaattacaggtaaaaactgaccg-aaaaatgg 439767  T
Q  397 cttggaaatac-ttagaattatgca 420  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    
T  439768 cttggaaatgctttagaattatgca 439792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 41005046 - 41004578
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||| || || |  |||    
T  41005046 agagatgaatacgcatggaaaacgacaagctacatgccctggcttattaaagacgattgggacgtcagatttatgtttcagaatatgttgaaaaattata 41004947  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt----------ttaattatg 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||          |||||||||    
T  41004946 tattatatatgtatgttcattccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagtgatttaatataatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatg 41004847  T
Q  201 gacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||     
T  41004846 gacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttaaaccaaatgttggtttgatttaattatagacaattgtaaaagatattatatttt 41004747  T
Q  301 tcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttg 400  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||     
T  41004746 tcttgtttatgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgtctttggaaatgcttcggtttaattacaggtaaaaactgaccg--aaaatggcttt 41004651  T
Q  401 gaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41004650 gaaatgctttagaattatgcagaatccactgtctgcataat-atttttcctcggcagttaactaccgaagtttt 41004578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 81813 - 82285
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||   |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  81813 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatcccttgacttattaaagacgataacgacgtcggatttatgtttcggaatatggttgaaaataata 81912  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt--------------ttaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||| ||              |||||    
T  81913 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatgcatttaatataatcatgtgtaatgagttgtttaattatgcacacttaat 82012  T
Q  197 tatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  82013 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaa-tatggacaattgtaaaagatattgta 82111  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||| ||||  ||||| || |||||  ||  |    |||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||    
T  82112 tttttcttgtttatgaccaagttttgatgtt--ggatgatttatactgcctttagaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccg-aaaaatgg 82208  T
Q  397 cttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
     ||| |||| | |||||||||||||||||    ||||||||||||    ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  82209 tttgaaaatgctttagaattatgcagaactcattgtctgcataat-tgttttcctcagcagttaactacggaggtttt 82285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 10825521 - 10825268
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  10825521 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtctgtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtctgag 10825422  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| |    
T  10825421 tttcaatgtt--gtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaat-gcttggaaatgttttagaatga 10825325  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||| |   ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  10825324 tgcagagctcactgcctgcataatcagattttctcggcagttaactgccgaggtttt 10825268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Original strand, 1150594 - 1150783
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||| | |||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||    
T  1150594 agagataaatacgcatggaaaacggcaaactatacgccttggtttatttgtgacgatagcgacgtcggatttatgttttggaatatgatggaagatacta 1150693  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  1150694 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaatttcattgaatgtaagtagtgatttaatttaatgatgtgtaatgaattgtttaattatg 1150783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 223 - 473
Target Start/End: Original strand, 25184606 - 25184853
Alignment:
Q  223 aatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttca 322  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  25184606 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatatcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttca 25184705  T
Q  323 atcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaattatgcag 421  Q
    ||  |   ||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||| |||    
T  25184706 atgtt--gtatgatttatattgcctttgaaaatactctggtttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaattatacag 25184802  T
Q  422 aacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||  |||| | ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25184803 aacccactgtttacataat-tgttttcctcggcagttaactaccgaggtttt 25184853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Original strand, 39950941 - 39951192
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39950941 tgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 39951040  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||||| |    
T  39951041 tttcaatgtt--gtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtttaattacagataaaaactggtcgaaaaaa-ggcttggaaatgttttagaatga 39951137  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||| |   |||  |||  ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||    
T  39951138 tgcagagctcactgcttgc--aatcagatttcctcgacaattaactaccgaggtttt 39951192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Original strand, 38949749 - 38949855
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38949749 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 38949848  T
Q  111 tattata 117  Q
    |||||||    
T  38949849 tattata 38949855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 218 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 32953033 - 32952849
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  | ||||| |||    
T  32953033 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttttcttgttgatgtctgag 32952934  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat 405  Q
    |||||||  |   |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  32952933 tttcaatgtt--gtatgaattattttgcctttcgaaatgctctgctttaattacaggtaaaaactgaccg-aaaaatggcttgaaaat 32952849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 218 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29398208 - 29398040
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||    |||||||||||    
T  29398208 tgatgaatttcaaacatttgtgtaatttgaactaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttttc----ttatgtccgag 29398113  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaa 392  Q
    |||||||  |   |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29398112 tttcaatgtt--gtatgaattattttgcctttcgaaatgctctgctttaattacaggtaaaaactggccgaaaaa 29398040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 191 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3207077 - 3206971
Alignment:
Q  191 tttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagat 290  Q
    |||||||||||||||  || || ||||||||||||||||||| | ||| || ||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  3207077 tttaattatggacaccatgcaacgttttgatgaatttcaaacttttgtatactttgaactaaatgtcggtttgatttaattatagacaattgtaaaagat 3206978  T
Q  291 attgtat 297  Q
    | |||||    
T  3206977 aatgtat 3206971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 473
Target Start/End: Original strand, 7189848 - 7189974
Alignment:
Q  345 cctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaa 443  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||| |   ||| ||||  |||||     
T  7189848 cctttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattggccgaaaaaa-ggcttggaaatgttttagaatgatgcagagctcactgcctgc--aatcag 7189944  T
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7189945 atttcctcggcagttaactaccgaagtttt 7189974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 25613710 - 25613424
Alignment:
Q  13 agatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 112  Q
    ||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||  |||||||| |||||  |||||||  |||||||||||  ||||||  |  |||| ||||||    
T  25613710 agatgaagacatgtggaaaacggcgagctatgtgccttgacttattcgtgacgatagcgacgtaggatttatgtttatgaatataattaaagataatata 25613611  T
Q  113 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaa 212  Q
    |||||| | | |||||||||||| || |  ||||| |||||| | |||  |||| || ||||||| ||||||| || | ||||||    | |||   |||    
T  25613610 ttatatctttgtgttcgttccatctgcatgtgcatagaatgtcaatagagattttatgtaatgatatgtaatgtgttgattaatttcaaatactcattaa 25613511  T
Q  213 tgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattt 299  Q
    | |||||||||||||||||| |   | |||||| ||| ||||| | | || |||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||    
T  25613510 tattttgatgaatttcaaacattcttgtaatttaaacaaaatgcctgattgatttaattttggtcaattgtaaaagattatgtattt 25613424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 443 - 473
Target Start/End: Original strand, 3943185 - 3943215
Alignment:
Q  443 aatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3943185 aatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 3943215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 28468720 - 28468691
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28468720 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 28468691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 43536181 - 43536152
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43536181 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 43536152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3937973 - 3937945
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3937973 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 3937945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 15835172 - 15835200
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15835172 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 15835200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 22003396 - 22003424
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22003396 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 22003424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 23346858 - 23346830
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23346858 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 23346830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 41183219 - 41183247
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41183219 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 41183247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 43982151 - 43982179
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43982151 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 43982179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 439; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 439; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 3993405 - 3993866
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3993405 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 3993504  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3993505 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 3993604  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3993605 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 3993704  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3993705 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttgg-aatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 3993803  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3993804 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 3993866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3944485 - 3944024
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3944485 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 3944386  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3944385 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 3944286  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3944285 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 3944186  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3944185 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttgg-aatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 3944087  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3944086 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 3944024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 431; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 38772141 - 38771679
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38772141 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttatccgcgacgacggtgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 38772042  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38772041 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 38771942  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38771941 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaggatattgtatttatcttcattat 38771842  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38771841 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 38771742  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38771741 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactcccgaggtttt 38771679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 473
Target Start/End: Original strand, 20353500 - 20353958
Alignment:
Q  13 agatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353500 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 20353599  T
Q  113 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353600 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtataatgagtagtttaattatggacactttgtaa 20353699  T
Q  213 tgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgt 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20353700 tgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttgtcttcattatgt 20353799  T
Q  313 ccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttaga 412  Q
    ||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20353800 ccgagtttcaatctt--gtatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttaga 20353897  T
Q  413 attatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20353898 attatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaagtttt 20353958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 29352743 - 29352294
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29352743 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 29352644  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29352643 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 29352544  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29352543 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 29352444  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  29352443 gtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttgcaaatgctctggtttaattacaagtaaaaattggccgaaaaaatggtttggaaatgttta 29352346  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||||| |||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29352345 gaattatgtagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 29352294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 44469574 - 44470034
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44469574 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 44469673  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44469674 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 44469773  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  44469774 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttgattat 44469873  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  44469874 gtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttgaaaatgctctggttcaattacaggtaaaaactgaccgaaaaaatggcttggaaatgttta 44469971  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44469972 gaattatgcagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactcccgaggtttt 44470034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Original strand, 30909592 - 30910041
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30909592 agagatgaatacgcatggaaaacagcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 30909691  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30909692 tattatatatgtatgttcgtttcatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtactttaattatggacactttgt 30909791  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30909792 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaacgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatgttcattat 30909891  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  | |    
T  30909892 gtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaattgttca 30909989  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30909990 gaattatgcagaaccctctgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 30910041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 11 - 442
Target Start/End: Original strand, 13633435 - 13633865
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13633435 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgatgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 13633534  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13633535 tattatatatgtatgtttgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttattgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 13633634  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcatta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13633635 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggttaaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgatta 13633734  T
Q  310 tgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactt 409  Q
    || ||||||||||||  |   |||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  13633735 tgaccgagtttcaatatt--gtatgaattatttagcctttggaaattgtctggtttaattacaggtaaaaactggccggaaaaatggcttggaaatgtct 13633832  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatca 442  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  13633833 agaattatgcagaacccactgtctgcataatca 13633865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 9711087 - 9710628
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9711087 agagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaagataata 9710988  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9710987 tattatatatgtatgttctttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 9710888  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9710887 aacattttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcagtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttat 9710788  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    |||| |||||||||  |   |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||    
T  9710787 gtcctagtttcaatgtt--gtatgaattattttacctttggaaatactcttgtttaattacaggtaaaaactgaccg-aaaaatggcttggaaatgttta 9710691  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9710690 gaattatgcagaacccactgtctgcataattcgttttcctcggcagttaactcccgaagtttt 9710628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 50113831 - 50113357
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50113831 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataata 50113732  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacact---- 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||        
T  50113731 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaataatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 50113632  T
Q  207 ----------ttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
              |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  50113631 tatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 50113532  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||   |   |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50113531 tttatcttgtttatgtctgagtttcaacgtt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactagccgaaaaaatgg 50113434  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
     ||| ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  50113433 attgaaaatgtttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagtttttctcggcagttaactaccgagatttt 50113357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 367
Target Start/End: Original strand, 5081927 - 5082283
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5081927 agagatgaatacgcatggaaaacgacaaggtatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 5082026  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5082027 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaaatatggatttaatttaatgatgtgtaaggagtactttaattatggacactttgt 5082126  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5082127 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatctttattat 5082226  T
Q  311 gtc--cgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaa 367  Q
    |||   ||||||||||| |   |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  5082227 gtctgagagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttgaaaatgctctggtttaa 5082283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6558411 - 6558047
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6558411 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataata 6558312  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6558311 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 6558212  T
Q  211 aatgtt--------------ttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
    ||||||              |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6558211 aatgttttgagtggtttaatttgatgaatttcaaacatttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 6558112  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggt 363  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6558111 cttatcttcattatgtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggt 6558047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 153 - 473
Target Start/End: Original strand, 15051053 - 15051371
Alignment:
Q  153 gtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaa 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15051053 gtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaa 15051152  T
Q  253 atgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttgga 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||    
T  15051153 atgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttgga 15051250  T
Q  353 aatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||  ||    
T  15051251 aatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgtttagaattatgcagaactcactgtctgcataatcagatttcgccg 15051350  T
Q  453 gcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15051351 gcagttaactaccgaggtttt 15051371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 8459467 - 8459019
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||    
T  8459467 agagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcaaaatatggtagaagataata 8459368  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8459367 tattatacatgtatgttcgttctatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttttt 8459268  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  8459267 aacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttat 8459168  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-tt 409  Q
    | || |||||||||  |   ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||    
T  8459167 gaccaagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctatggtttaattacaggtaaaaactggtcg-aaaaatggcttagaaatgcttt 8459071  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  8459070 agaattatgcagaacccactgtctgcataat-tgttttcctcggcagttaact 8459019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 402
Target Start/End: Original strand, 37018959 - 37019347
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37018959 agagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacataggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 37019058  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37019059 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 37019158  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  37019159 aacattttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttat 37019258  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttgga 402  Q
     |||||||||||||  |   |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||| |||||||    
T  37019259 atccgagtttcaatgtt--gtatgaattattttacctttgaaaatactctggtttaattacag-taaaatttgaccgaaaaaatagcttgga 37019347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 11 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 7966498 - 7966037
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7966498 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctt-gcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataata 7966400  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgt------gtaatgagtagtttaattatggaca 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||||| || |||||||||||||||    
T  7966399 tattacatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaaatgtaatgtgttgtttaattatggaca 7966300  T
Q  205 ctttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgt-aaaagatattgtatttatct 303  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  7966299 ctatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaaagatattgtattttact 7966200  T
Q  304 tcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaa 403  Q
    |  ||||| | |||||| |||  |   ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7966199 tgtttatgactgagtttaaatgtt--gtataagttatattgcctttggaaatgctctggttaaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaa 7966103  T
Q  404 atac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgagg 469  Q
     | | |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  7966102 gtgctttagaattatgcagaactcactgtctgcataatc-aattttctcagcagttaactacagagg 7966037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 51666229 - 51666656
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  51666229 agagatgaatacacatggaacacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcgaatttatgtttcggaatatggtggaaaataata 51666328  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51666329 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 51666428  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||  |||||||||||||||||| | | | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||    
T  51666429 aactttttgatgaatttcaaacttttatgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaatatattgtatttttcttgtttat 51666528  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-tt 409  Q
    | ||||||||||||  |   ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||  ||| | ||    
T  51666529 gaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctttggtttaattacaggtaaaaattggccg-aaaaatggcttgagaatgcttt 51666625  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataat 440  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  51666626 agaattatgcagaacccactgtgtgcataat 51666656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 12643715 - 12643369
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  12643715 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaaaataata 12643616  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  12643615 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacact---t 12643519  T
Q  211 aatgttttga---tgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcat 307  Q
    ||| | | ||   | ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  12643518 aat-tatagacacttaatt--aaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtt 12643422  T
Q  308 tatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctgg 362  Q
    |||||| ||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12643421 tatgtctgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctgg 12643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 29 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 19495544 - 19495101
Alignment:
Q  29 aaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttc 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19495544 aaaacggcaagctatatgccttggcttattcgagacgatagcgacgttggatttatgtttcggaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttc 19495445  T
Q  129 gttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaattatggacactttgtaa---tgt 215  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          || ||||||||||||||||| |||||          
T  19495444 gttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgacttgtaatgtgttgtttaattatggacactatgtaacacgcg 19495345  T
Q  216 tttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccg 315  Q
    ||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |    
T  19495344 tttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttatttatgactg 19495245  T
Q  316 agtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactt-agaat 414  Q
    ||||| |||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||    
T  19495244 agtttaaatgtt--gtatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatagcttggaaatgcttaacaat 19495148  T
Q  415 tatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||    
T  19495147 tatgcagaacccactgtctgcataat-agtttttctcggcagttaact 19495101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 425
Target Start/End: Original strand, 13177689 - 13178109
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13177689 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatggcttggcttaatcgcaacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 13177788  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaattatg 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||          || |||||| ||||    
T  13177789 tattatatatgtatgttcattccatatgcaattgcattgaaagtaagtagggatttaatttaataatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaactatg 13177888  T
Q  201 gacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 300  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  13177889 gacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattatatttt 13177988  T
Q  301 tcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttg 400  Q
     |||  ||||| | |||||| |||     |||| | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  13177989 acttgtttatgactgagtttaaat----aatataagttatattgcctttggaaatgctctggttaaattacaggtaaaaactggtc-aaaaaatggcttg 13178083  T
Q  401 gaaatac-ttagaattatgcagaacc 425  Q
    ||| | | ||| ||||||||||||||    
T  13178084 gaagtgctttataattatgcagaacc 13178109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 197 - 468
Target Start/End: Original strand, 46886137 - 46886406
Alignment:
Q  197 tatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46886137 tatggacactttgtaatgtttcgatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 46886236  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||  |   |||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  46886237 tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgtt--gtatgaattattttgcctttggaaaggctctggtttaattacaggtaaaaactagccgaaaaaatgg 46886334  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgag 468  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  46886335 cttggaaatgtttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgag 46886406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 1655643 - 1656112
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1655643 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 1655742  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaattatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||          || |||||   |||    
T  1655743 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaatgatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttatgcatg 1655842  T
Q  201 gacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 300  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||| || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  1655843 gatactatgtaacgatttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtccgtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttt 1655942  T
Q  301 tcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttg 400  Q
     |||  ||||| |  | ||| |||  |   ||| | ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  1655943 acttgtttatgactaaatttaaatgtt--gtataagttatattgcctttggaaatgctctgattaaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatggcttg 1656039  T
Q  401 gaaatactt-agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
     || | ||| | ||||||||||||||  ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1656040 aaagtgcttaacaattatgcagaacccactgtctgcataa-atgttttcctcggcagttaactaccgaggtttt 1656112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 392
Target Start/End: Original strand, 25039644 - 25040023
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25039644 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatacgccttggcttattcgcgtcgataacgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 25039743  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||| |||    
T  25039744 tattatatgtgtatgttcgttccatatacaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgtgttgtttatgcatggacactatgt 25039843  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    || | |||||||||||| |||| | ||| || ||| |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||    
T  25039844 aacgatttgatgaattttaaacttttgtgtattttgaaccaaatatcagtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattttacttgtttat 25039943  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaa 392  Q
    | | |||||| |||  |   ||  | |||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  25039944 gactgagtttaaatgtt--gtacaagttatattgtctttggaaatgttctggttaaattacaggtaaaaactggccgaaaaa 25040023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 38690418 - 38690126
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||| | ||||    
T  38690418 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcaaaatatggtggaaaataata 38690319  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  38690318 tattatatatgtatgtttgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagga-tttaatataatgatgtgtaatgtgttgtttaattatggacactttgt 38690220  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatctt 304  Q
    || ||||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38690219 aacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaactatggacaattgtaaaagatattgtatttttctt 38690126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 462
Target Start/End: Original strand, 4517959 - 4518427
Alignment:
Q  13 agatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 112  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||    
T  4517959 agatgaatacgcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttattaaagactatagcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtgaaaaataatata 4518058  T
Q  113 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaattatgga 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||          || |||||||||||||    
T  4518059 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatt--atataatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatgga 4518156  T
Q  203 cac--------------tttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaag 288  Q
    |||              ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4518157 cacttaattatggacattttgtaacgttctgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaag 4518256  T
Q  289 atattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccga 388  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||     
T  4518257 atattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctttggtttaattacaggtaaaaactggccg- 4518353  T
Q  389 aaaaatggcttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    ||||||||||||||||||    
T  4518354 aaaaatggcttgaaaatgctttagaattatgcagaacctactgtctccataat-tgttttcctcggcagttaact 4518427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36072879 - 36072584
Alignment:
Q  14 gatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatat 113  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||| |||   || ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36072879 gatgaatacgcatggaaaacaacaagctatatgccttggctaattgaagatgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatatat 36072780  T
Q  114 tatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaattatggac 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||          || ||||||| ||||||    
T  36072779 tatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtaatatgttgtttaatcatggac 36072680  T
Q  204 actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattt 299  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36072679 actatctaatgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattt 36072584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 425
Target Start/End: Original strand, 46978797 - 46979233
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  46978797 agagatgaatacacatggaaaacgacaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcgaaatatggtggaaaataata 46978896  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaatta-- 198  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| |||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||          || |||||||||      
T  46978897 tattatatatgtatgttcgttcctaatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgtgtaatgaattgtaatgtgttgtttaattatg 46978996  T
Q  199 ------------tggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaa 286  Q
                |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  46978997 gacacttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaatcaaatgtctgtttgatttaattatggacaattgtaaa 46979096  T
Q  287 agatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggcc 386  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||    
T  46979097 agatattctatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctctgatttaattacaagtaaaaactgacc 46979194  T
Q  387 gaaaaaatggcttggaaat-acttagaattatgcagaacc 425  Q
    | |||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  46979195 g-aaaaatagcttgaaaatgttttagaattatgcagaacc 46979233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 13 - 392
Target Start/End: Original strand, 5141435 - 5141811
Alignment:
Q  13 agatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  5141435 agatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcgttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatgtatgtttcggaatatgatggaagataatata 5141534  T
Q  113 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaa 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||  ||||||||||| ||| | ||||| || |||||||||| |||||| | |||    
T  5141535 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgtagaatgtcagtagagatttaatttaacgatatataatgtgttgtttaattattgacactatttaa 5141634  T
Q  213 tgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgt 312  Q
     ||||| ||||||||||||| |  |  |||||  ||||   ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||| || ||||  |||||     
T  5141635 cgttttaatgaatttcaaacattcgagtaattcgaaccccttgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagata-tgtaattttcttgtttatgc 5141733  T
Q  313 ccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaa 392  Q
    | |||| | |||  |   ||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  5141734 ctgagtataaatgtt--gtatgagttatattgcctttggaaatgttctgctttaattacaggtaaaaactgaccgaaaaa 5141811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 33168423 - 33168133
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||  ||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  33168423 agagatgaatacgcatggaaaacaacaagctatatgccttgacttattttagacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataata 33168324  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaattatg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||          || |||||||||||    
T  33168323 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgagtgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatg 33168224  T
Q  201 gacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagata 291  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||| |  || || ||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33168223 gacactatgtaacgttttgatgattttcaaactttcgtgtactttgaactaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagata 33168133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 218 - 464
Target Start/End: Original strand, 52805330 - 52805573
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||    
T  52805330 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttatttatgtcagag 52805429  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattat 417  Q
    |||||||  |  ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  52805430 tttcaatgtt--atatgaattattttgcctttggaaatactctggtttaattacaggtaaaagctgaccg-aaaaatggcttggaaatgtttagaatcat 52805526  T
Q  418 gcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactac 464  Q
    ||||| ||  |||||||||||||    ||||||||||| ||||||||    
T  52805527 gcagagcccactgtctgcataatttgttttcctcggcaattaactac 52805573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Original strand, 470840 - 471093
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  470840 tgatgaatttcaaacgtttgtataatttgaaccaaatgtcggtttgattaaattatgaacaatggtaaaagatattgtacttatcttgtttatgtccgag 470939  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||||   ||||||| |    
T  470940 tttcaatgtt--gtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaa-gacctggaaatgttttagaatga 471036  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||| |   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  471037 tgcagagctcactgcctgcataatcagatttcctcggcagttacataccgaagtttt 471093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 217 - 462
Target Start/End: Original strand, 22345818 - 22346055
Alignment:
Q  217 ttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccga 316  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||      ||||||    
T  22345818 ttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttacttatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttg-----gtccga 22345912  T
Q  317 gtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-ttagaatt 415  Q
    ||||||||  |   ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22345913 gtttcaatgttg--tatgatttatattgcctttggaaatgctctggcttaattacaggtaaaaactggtcg-aaaaatggcttggaaatgcattagaatt 22346009  T
Q  416 atgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  22346010 atgcagaacccactgtctgcataat-tgttttcctcggcagttaact 22346055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 331 - 473
Target Start/End: Original strand, 23359230 - 23359372
Alignment:
Q  331 tatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattatgcagaacctgctg 430  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||    
T  23359230 tatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgtttagaattatgcagaacttgctg 23359329  T
Q  431 tctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23359330 tctgtataatcagttttcctcggcagtttactaccgaggtttt 23359372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 31780270 - 31780025
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31780270 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacctaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 31780171  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaata-cttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||| | || || || |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |    
T  31780170 tttcaatgtt--gtatgaattgttttgccattcgaaatgctctggcttaattacaggtaaaaattggccgaaaaaat-gcttggaaatattttagaatga 31780074  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccga 467  Q
    |||||| |   ||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  31780073 tgcagagctcactgcctgc--aatcagatttcctcggcagttaactgccga 31780025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 94700 - 94464
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  94700 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 94601  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||| | |||||||||   ||||||| |    
T  94600 tttcaatgtt--gtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctgctttaattacaggtaaaaactggtc-aaaaaaagccttggaaatgttttagaatga 94504  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcag 456  Q
    |||||| |    || ||||||||||| |||||||||||||    
T  94503 tgcagagctcaatgcctgcataatcagatttcctcggcag 94464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 405
Target Start/End: Original strand, 22527465 - 22527649
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22527465 tgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaacatattgtatttatcttgtttatgtccgag 22527564  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat 405  Q
    |||||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22527565 tttcaatgtt--gtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactagccgaaaaaa-ggcttggaaat 22527649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 218 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16281999 - 16281828
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16281999 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccagatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttttcttgtttatgtccgag 16281900  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaa 392  Q
    ||| |||  |   |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16281899 ttttaatgtt--gtatgaattattttgcctttcgaaatgctctgctttaattacag-taaaaactgaccgaaaaa 16281828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 217 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 19521900 - 19521715
Alignment:
Q  217 ttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccga 316  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  19521900 ttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatagacaattgtaaaagatatagtatttttcttgtttatgtccga 19521801  T
Q  317 gtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat 405  Q
    ||||||||  |   |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||| || || ||||||||||||||||||    
T  19521800 gtttcaatgct--gtatgaattattttgcctttcgaaatgctctgctttaattgcaggtaaaaagtgacc-aaaaaatggcttggaaat 19521715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 222 - 405
Target Start/End: Original strand, 21144405 - 21144585
Alignment:
Q  222 gaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttc 321  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||    
T  21144405 gaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatagacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgttcgagtttc 21144504  T
Q  322 aatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat 405  Q
    |||  |   |||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21144505 aatgtt--gtatgaattattttgcctttcgaaattctctgctttacttacagataaaaactggccg-aaaaatggcttggaaat 21144585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 339 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 38690114 - 38689981
Alignment:
Q  339 atattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcat 437  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  38690114 atattgcctttggaaatcctctggtttaattacagataaaaactggccga-aaaatggcttggaaatgctttagaattatgtagaaaccactgtctgcat 38690016  T
Q  438 aatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38690015 aat-tgttttcctcggcagttaactaccgaggtttt 38689981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 221 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 50617503 - 50617321
Alignment:
Q  221 tgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgt-atttatcttcattatgtccgagtt 319  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||  ||| | ||  ||||||| |||||    
T  50617503 tgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaaatatggacaattgtaaaaaatattgtgtttttttttgtttatgtcagagtt 50617404  T
Q  320 tcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat 405  Q
    |||||  |   |||||||||| || |||||  ||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  50617403 tcaatgtt--gtatgaattattttgcctttcaaaatgttgtgctttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatggcttgaaaat 50617321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 381 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 12643372 - 12643291
Alignment:
Q  381 ctggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  12643372 ctggccgaaaaaatggcttgaaaatgtttagaattatgcagaacaaactgtctgcataatcagttttcctcagcagttaact 12643291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1179955 - 1179878
Alignment:
Q  179 tgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgt 256  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||| ||||||    
T  1179955 tgtaatgtgttgtttaattgtggacactctttaatgttttgatgaatttcaaacattcgtgtaattttaacgaaatgt 1179878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 391 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6558046 - 6557965
Alignment:
Q  391 aaatggcttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6558046 aaatggcttgaaaatgtttagaattatgcagacccat-tgtctgcataatcagtttttctcggcagttaactaccgagatttt 6557965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 408 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 36072483 - 36072419
Alignment:
Q  408 ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  36072483 ttagaattatgcagaatccactgtctgcataatcagttttt-tcggcagttaactaccgaggtttt 36072419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3728814 - 3728785
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3728814 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 3728785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 8548663 - 8548692
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8548663 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 8548692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 408 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29261528 - 29261464
Alignment:
Q  408 ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | ||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  29261528 ttagaattatgcagaacccgctgtctccataat-tagttttctcgacagttaactactgaggtttt 29261464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 29622418 - 29622447
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29622418 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 29622447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 19928806 - 19928834
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19928806 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 19928834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 349 - 401
Target Start/End: Original strand, 47714986 - 47715037
Alignment:
Q  349 tggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttgg 401  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  47714986 tggaaatgctctggttgaattataggtaaaaactagccg-aaaaatggcttgg 47715037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 48751405 - 48751433
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48751405 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 48751433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 435; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 30790569 - 30791031
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790569 agagatgaatacgcatggaaaacagcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 30790668  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790669 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 30790768  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30790769 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattctatttatcttcattat 30790868  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790869 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaaatggccgaaaaaatggcttggaaatactta 30790968  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30790969 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 30791031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 45767423 - 45767884
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45767423 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 45767522  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45767523 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 45767622  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45767623 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 45767722  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45767723 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttgg-aatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 45767821  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45767822 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 45767884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 43620190 - 43619740
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43620190 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 43620091  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43620090 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 43619991  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43619990 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 43619891  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43619890 gtctgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttgg-aatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 43619792  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43619791 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 43619740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 604289 - 603829
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  604289 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 604190  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  604189 tattatatatgtatgtttgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 604090  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  604089 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcgatttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 603990  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    || |||||||||||| |   |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  603989 gttcgagtttcaatctt--gtatgaattattttacctttggaaatgttctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 603892  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  603891 gaattatgcagaacccactgtctgcataatcagatttccttggcagtttactaccaaggtttt 603829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 472
Target Start/End: Original strand, 15069913 - 15070373
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15069913 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 15070012  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070013 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 15070112  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcatta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15070113 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgatta 15070212  T
Q  310 tgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactt 409  Q
    || ||||||||||||| |   |||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  15070213 tgaccgagtttcaatctt--gtatgaattatttagcctttggaaatgctctggtttatttacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgtct 15070310  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggttt 472  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  15070311 agaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcngcagttaactgccgaagttt 15070373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 442
Target Start/End: Original strand, 18109356 - 18109786
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18109356 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 18109455  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18109456 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 18109555  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcatta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18109556 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgatta 18109655  T
Q  310 tgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactt 409  Q
    || ||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  18109656 tgaccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacagataaaaactggccgaaaaaatggtttggaaatgttt 18109753  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatca 442  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  18109754 agaattatgcagaacccactgtctgcattatca 18109786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 11 - 472
Target Start/End: Original strand, 42503401 - 42503861
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42503401 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctacatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 42503500  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42503501 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 42503600  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcatta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42503601 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgttggtttaatttaatcatgaacaattataaaagatattgtatttatcttgatta 42503700  T
Q  310 tgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactt 409  Q
    || ||||||||||||| | |  ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |    
T  42503701 tgaccgagtttcaatcttgc--atgaattatttagcctttggagatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatagcttggaaatgtct 42503798  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggttt 472  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  42503799 agaattatgcagaactcactgtctgcataatcagttttcctcgacagttaactgccgaagttt 42503861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Original strand, 47742552 - 47743001
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47742552 agagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggcttattcgcgacgatggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 47742651  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  47742652 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 47742751  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||  || |    
T  47742752 aacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgttggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgcatttatcttgttttt 47742851  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||  ||||||||  |   |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||    
T  47742852 gtccatgtttcaatgtt--gtatgaattattttgcctttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccaaaaaaatggcttggaaatgttta 47742949  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  47742950 gaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcgacagttaact 47743001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 17 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 34623002 - 34622553
Alignment:
Q  17 gaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattat 116  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34623002 gaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatgatggaagataatatattat 34622903  T
Q  117 atatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgtt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34622902 atatgtatgttcgtttcatatgcaattgcgttgaatgtaagtagaagtttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgtaacgtt 34622803  T
Q  217 ttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccga 316  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||||    
T  34622802 ttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaatatattgtatttttcttatttatgaccga 34622703  T
Q  317 gtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-ttagaatt 415  Q
    ||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  34622702 gtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacatgtaaaaactgaccg-aaaaatggcttggaaatgctttagaatt 34622606  T
Q  416 atgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgagg 469  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    |||||| ||| ||||||||||||||    
T  34622605 atgcagaacccactgtctgcataat-tgttttccttggctgttaactaccgagg 34622553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 19044816 - 19044343
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19044816 agagaagaatatgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcgaaatatggtggaagataata 19044717  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac------- 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||           
T  19044716 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgatttgtttaattatggacacttaat 19044617  T
Q  204 -------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19044616 tatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgta 19044517  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||| ||||  ||||| || | |||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  19044516 tttttcttggttatgacccaatttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaattctctggtttaattacaggtaaaaactagccg-aaaaatgg 19044420  T
Q  397 cttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||  || ||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19044419 cttggaaatgcattagaattatgcaaaacccactatctgcataat-tgttttcctcggcagttaactaccgaagtttt 19044343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 20709820 - 20710293
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  20709820 agagaagaatatgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcgaaatatggtggaagataata 20709919  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt--------------ttaat 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||              |||||    
T  20709920 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtaatgatttgtttaattatggacacttaat 20710019  T
Q  197 tatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20710020 tatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgta 20710119  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||| ||||  ||||| || | |||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  20710120 tttttcttggttatgacccaatttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaattctctggtttaattacaggtaaaaactagccg-aaaaatgg 20710216  T
Q  397 cttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||  || ||||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20710217 cttggaaatgcattagaattatgcaaaacccactatctgcataat-tgttttcctcggcagttaactaccgaagtttt 20710293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 210 - 462
Target Start/End: Original strand, 40928715 - 40928965
Alignment:
Q  210 taatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcatta 309  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40928715 taatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgatta 40928814  T
Q  310 tgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactt 409  Q
    || ||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40928815 tgaccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgttt 40928912  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  40928913 agaattatgcagaactcactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 40928965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 10705765 - 10705298
Alignment:
Q  13 agatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 112  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||   |||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  10705765 agatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggctaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagatgatata 10705666  T
Q  113 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgag----------tagtttaattatgga 202  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||          | |||||||||||||    
T  10705665 ttatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagagatttaatttattgatgtgtaatgagttgtaatgtattgtttaattatgga 10705566  T
Q  203 cactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatc 302  Q
    |||| |||||  ||||||||||||| |||| | ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  10705565 cactatgtaacattttgatgaattttaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattttac 10705466  T
Q  303 ttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttgga 402  Q
    ||  ||||| | |||||| |||  |   ||| | ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  |||||| || ||| ||||||| ||||||    
T  10705465 ttgtttatgactgagtttaaatgtt--gtataagttatattgcctttagaaatgctttggttaaattacatgtaaaaattgaccg-aaaaatgacttgga 10705369  T
Q  403 aatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    | | | ||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||    
T  10705368 agtgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataatc-agttttctcggcagttaactcccaaggtttt 10705298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 223 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 29592841 - 29592593
Alignment:
Q  223 aatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttca 322  Q
    ||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  29592841 aatttcaaaagtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttatcttgtttatgtccgagtttca 29592742  T
Q  323 atcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattatgcaga 422  Q
    ||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||    
T  29592741 atcttg--tatgaattatttttcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggtttggaaatgtttaaaattatgcaga 29592644  T
Q  423 acctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    | |  |||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  29592643 atccactgtctgcataatcagttttcttcgacagttaactaccgaagtttt 29592593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 12111729 - 12111412
Alignment:
Q  15 atgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatatt 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||   || ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||  |    
T  12111729 atgaatacacatggaaaacgacaagctatatgccttggtttattaaagatgatagcgacgtcggatttatatttcggaatatggtggaaaataatat--t 12111632  T
Q  115 atatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgag----------tagtttaattatggaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||          | |||||||||||||||    
T  12111631 atatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttgtaatgtattgtttaattatggaca 12111532  T
Q  205 ctttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatctt 304  Q
     ||| ||| |||||||||||||| |||| |  || |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  12111531 atttataacgttttgatgaattttaaactttggtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattataaaagatattgtatttttctt 12111432  T
Q  305 cattatgtccgagtttcaat 324  Q
      ||||| ||||||||||||    
T  12111431 gtttatgaccgagtttcaat 12111412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29593012 - 29592839
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29593012 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagttatatgccttggcttattcgcaacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataata 29592913  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaat 184  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29592912 cattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaat 29592839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 288
Target Start/End: Original strand, 47064857 - 47065148
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||   || ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  47064857 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggtttattaaagatgatagcgacgtcaaatttatgtttcgaaatatggtggaaaataata 47064956  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac------- 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||           
T  47064957 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacatttaat 47065056  T
Q  204 -------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaag 288  Q
           |||||||||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  47065057 tatggatactttgtaacattttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttaaatcaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaag 47065148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 405
Target Start/End: Original strand, 17838405 - 17838589
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17838405 tgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 17838504  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat 405  Q
    |||||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17838505 tttcaatgtt--gtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtttaattacaagtaaatactggccgaaaaaa-ggcttggaaat 17838589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 220 - 473
Target Start/End: Original strand, 34742168 - 34742418
Alignment:
Q  220 atgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtt 319  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  34742168 atgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcgatttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgtccgagtt 34742267  T
Q  320 tcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaattatg 418  Q
    |||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||   ||||||| |||    
T  34742268 tcaatgtt--gtatgaatt-ttttgcctttcgaaatgctctactttaattacaggtaaaaactgaccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaatcatg 34742363  T
Q  419 cagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||     |||||||||||||    |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34742364 cagagttcactgtctgcataatttgttttcctcgacagttaacttccgaggtttt 34742418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 218 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 5538147 - 5537907
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||  |||||||||||    
T  5538147 tgatgaatttcaaacgtttgtataatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtataagatattttatttttcttgtttatgtccgag 5538048  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||| ||| |||||||||||| ||||   ||||||| |    
T  5538047 tttcaatgtt--gtatgaattattttccctttcgaaatgctctgctttaattac--gtaaaaactgaccg-aaaaatggcttgaaaatgttttagaatca 5537953  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||| |   |||||| ||||||    ||||||||||||||||||    
T  5537952 tgcagagctcactgtctacataatttgttttcctcggcagttaact 5537907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 218 - 405
Target Start/End: Original strand, 13323485 - 13323669
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||  ||    
T  13323485 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacgaaatgccggtttaatttaattatggaaaattgtaaaaaatattgtatttttcttgttaatgtctcag 13323584  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat 405  Q
    ||||||   |   |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13323585 tttcaacgtt--gtatgaattattttacctttcgaaatgctctgctttaattacaggtaaaaactgcccg-aaaaatggcttggaaat 13323669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 218 - 299
Target Start/End: Original strand, 10522285 - 10522366
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattt 299  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10522285 tgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattt 10522366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 331 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12111393 - 12111332
Alignment:
Q  331 tatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaa 392  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  12111393 tatgatttatattgcctttgaaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactgactgaaaaa 12111332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 443 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 20564153 - 20564123
Alignment:
Q  443 aatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20564153 aatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 20564123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 473
Target Start/End: Original strand, 16636198 - 16636231
Alignment:
Q  440 tcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16636198 tcaattttcctcggcagttaactaccgaggtttt 16636231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 17459440 - 17459407
Alignment:
Q  440 tcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17459440 tcaattttcctcggcagttaactaccgaggtttt 17459407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 473
Target Start/End: Original strand, 17593774 - 17593807
Alignment:
Q  440 tcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17593774 tcaattttcctcggcagttaactaccgaggtttt 17593807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 34738443 - 34738414
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34738443 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 34738414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 35606868 - 35606839
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35606868 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 35606839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 15070433 - 15070405
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070433 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 15070405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 17840885 - 17840913
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17840885 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 17840913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18105451 - 18105423
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18105451 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 18105423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 48407282 - 48407310
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48407282 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 48407310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 435; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 435; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 49564352 - 49563890
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49564352 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 49564253  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49564252 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 49564153  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49564152 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaatatattgtatttatcttcattat 49564053  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49564052 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 49563953  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  49563952 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaattttctcggccgttaactaccgaggtttt 49563890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 3407802 - 3408263
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3407802 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 3407901  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407902 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 3408001  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcatta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3408002 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgatta 3408101  T
Q  310 tgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactt 409  Q
    || ||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3408102 tgaccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgttt 3408199  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  3408200 agaattatgcagaacccactgtctacataatcagttttcctcggcaagttactaccgaggtttt 3408263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 19069710 - 19069237
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19069710 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcgggtttatgtttcggaatatggtggaagataata 19069611  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19069610 tattatacatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagtagtttaattatggacactttgt 19069511  T
Q  211 aatgtt--------------ttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
    ||||||              |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19069510 aatgttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatatttta 19069411  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19069410 cttatcttcattatgtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggtcgaaaaaatgg 19069313  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19069312 cttggaaatgtttacaattatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgaggtttt 19069237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 13 - 462
Target Start/End: Original strand, 37394768 - 37395229
Alignment:
Q  13 agatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37394768 agatgaatacgcatggaaaacggcaagttgtatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatata 37394867  T
Q  113 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt--------------ttaatta 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||              |||||||    
T  37394868 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaatta 37394967  T
Q  199 tggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatt 298  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37394968 tggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 37395067  T
Q  299 tatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggct 398  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||  |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37395068 tatcttgtttatgtccgagtttcaatgtt--gtatgaattatttttcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggct 37395165  T
Q  399 tggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    || ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  37395166 tgaaaatgtttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcaattaact 37395229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 11 - 465
Target Start/End: Original strand, 10422971 - 10423421
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10422971 agagacgaatacacatggaaaacgacaagctatatgtcttggcttattcgcggcgattgcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 10423070  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10423071 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatctaatgatatgtaatgagttgtttaattatggacacattgt 10423170  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||    
T  10423171 aacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacctaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagata-tgtatttttcttgtttat 10423269  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-tt 409  Q
    | ||||||||||||  |   ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||    
T  10423270 gaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaattgcttt 10423366  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactacc 465  Q
    ||| ||||||| ||||  |||||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  10423367 agatttatgcaaaacccactgtctgcataat-tgttttcctcggcagttaactacc 10423421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 18 - 469
Target Start/End: Original strand, 44050650 - 44051111
Alignment:
Q  18 aatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattata 117  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||  || |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44050650 aatacgcatggaaaacaacaagctatatgt-ttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataatatattata 44050748  T
Q  118 tatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt--------------ttaattatggac 203  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||              ||||||||||||    
T  44050749 tatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgcaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggac 44050848  T
Q  204 actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatct 303  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  44050849 actttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttct 44050948  T
Q  304 tcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaa 403  Q
    |  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44050949 tgtttatgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaa 44051045  T
Q  404 atac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgagg 469  Q
    || | ||||||||||||||||||  |||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  44051046 atgctttagaattatgcagaacccactgtttgcataat-tgttttcctcggcagttaactaccgagg 44051111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 38460935 - 38460476
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||  |||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  38460935 agagatgaatgcgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgttggatttatgtttcagaatatggtggaaaataata 38460836  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||   |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38460835 tattatatatgtatgtttgttgcatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 38460736  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||    
T  38460735 aacattttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattatatttttcttgtttat 38460636  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-tt 409  Q
    | ||||||||||||  |   ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||    
T  38460635 gaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgaccg-aaaaatggcttggaaatgcttt 38460539  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||  ||| |||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38460538 agaattatgcagaacccactgactgcataat-tgttttcctcggcagttaattaccgaggtttt 38460476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 11 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10374549 - 10374240
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  10374549 agagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacatcagatttatgtttcgaaatatggtggaagataata 10374450  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10374449 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacaccttgt 10374350  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||  ||||    
T  10374349 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttcatttaattatggacaactgtaaaaggtattgtatttttcttggttat 10374250  T
Q  311 gtccgagttt 320  Q
    | ||||||||    
T  10374249 gaccgagttt 10374240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 216 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 15996026 - 15995772
Alignment:
Q  216 tttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccg 315  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15996026 tttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccg 15995927  T
Q  316 agtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaatt 415  Q
    | |||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15995926 actttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgtttagaatt 15995829  T
Q  416 atgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15995828 atgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgaggtttt 15995772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 464
Target Start/End: Original strand, 4774167 - 4774627
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4774167 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatggcttggcttatttgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 4774266  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaattatg 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          || |||||   |||    
T  4774267 tgttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgcatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttatgcatg 4774366  T
Q  201 gacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 300  Q
    |||||| ||||| | ||| ||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  4774367 gacactatgtaacgatttaatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatggacaattgtaaatgatattgtatttt 4774466  T
Q  301 tcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttg 400  Q
     |||  ||||| | |||||| |||  |   ||| | |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || ||||||||||||    
T  4774467 acttgcttatgactgagtttaaatgtt--gtataagttatattggctttggaaatgctctggttaaattacaggtaaaaactagtcg-aaaaatggcttg 4774563  T
Q  401 gaaatactt-agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactac 464  Q
    ||||| ||| | |||||||||||| |  |||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  4774564 gaaatgcttaacaattatgcagaaaccactgtctgcataat-tgttttcctcggcagttaactac 4774627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 18579142 - 18578706
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||   |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18579142 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggctaattgaagacgatagcgacgtcgaatttatgtttcggaatatggtagaagataata 18579043  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaattatg 200  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||          || |||||||||||    
T  18579042 tattatatatgtatgttagttctatatgcaattgcgttgaatgtaagaagtgatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatg 18578943  T
Q  201 gacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 300  Q
    |||||| |||||  |||||||||||||||||| | ||| || ||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  18578942 gacactatgtaacattttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaatcaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttt 18578843  T
Q  301 tcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttg 400  Q
     |||  |||||   |||||| |||  |   ||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||  |||||||| |||| ||||||||||||    
T  18578842 acttgtttatgagtgagtttaaatgtt--gtataagttatattgcctttggaaatactctggttgaattacaagtaaaaactagccg-aaaaatggcttg 18578746  T
Q  401 gaaatactt-agaattatgcagaacctgctgtctgcataa 439  Q
    ||||| ||| | |||||||||||| |  ||||||||||||    
T  18578745 gaaatgcttaacaattatgcagaatccactgtctgcataa 18578706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 107 - 424
Target Start/End: Original strand, 50904822 - 50905137
Alignment:
Q  107 aatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacact 206  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  50904822 aatatattatatttgtatgtttgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgaaatgaattgtttaattatgaacact 50904921  T
Q  207 ttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttca 306  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||||      
T  50904922 ttgtatcgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatttcatatttttcttgt 50905021  T
Q  307 ttatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaata 406  Q
    |||||| |||||||||||  |   ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  50905022 ttatgttcgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcatttagaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattggccg-aaaaatggcttggaaatg 50905118  T
Q  407 c-ttagaattatgcagaac 424  Q
    | |||||||||||||||||    
T  50905119 cattagaattatgcagaac 50905137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 24415680 - 24415392
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatat--gcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||   |||||  |||||||   ||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  24415680 agagatgaatacacatggaaaacgacaagctatatatgccttgacttattgaagacgatagcgacgttgcatttatgtttcggaatatgatggaaaataa 24415581  T
Q  109 tatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaatta 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||          || |||||||||    
T  24415580 tatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttgtaatgtgttgtttaatta 24415481  T
Q  199 tggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaa 287  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24415480 tggacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaa 24415392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 51492374 - 51492121
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||    
T  51492374 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtacttatcttgtttatgttcgag 51492275  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    ||| |||  |   |||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   ||||||| |    
T  51492274 ttttaatgttg--tatgaattattttgcctttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaatctggctgaaaaaa-ggcttggaaatgttttagaatga 51492178  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||| |   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51492177 tgcagagctcactgcctgcataatcagatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 51492121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 218 - 462
Target Start/End: Original strand, 50278593 - 50278836
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  50278593 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttcaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaataattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgtccgag 50278692  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaata-cttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||  ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||  ||||||| |    
T  50278693 tttcaatgtt--gtatagattattttgcctttcgaaatgctctgttttaattacaggtaaaaactgatcgaaaaaatggcttgaaaatattttagaatca 50278790  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||| |   |||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  50278791 tgcagagctcactgtctgcataatttgttttcctcggcagttaact 50278836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 114 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 51642423 - 51642165
Alignment:
Q  114 tatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt----------ttaattatggac 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||| ||          ||||||||||||    
T  51642423 tatatatgtatgttcgttctatatgtaattgtgatgaatgtaagttgggatttaacttaatgatatgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatggac 51642324  T
Q  204 actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatct 303  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  51642323 aatttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttct 51642224  T
Q  304 tcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtt 364  Q
    |  |||||  |||||||||||  |   ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  51642223 tgtttatgatcgagtttcaatatt--gtatgatttatattgcctttgaaaatgctctggtt 51642165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 37016201 - 37015948
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| | | |||||| || |||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37016201 tgatgaatttcaaacgtttctgtaatttgaatcaaacgtcagtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 37016102  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    ||||||| ||   |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||| ||||   ||||||| |    
T  37016101 tttcaatgat--gtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggctgaaaaaa-gacttgaaaatgttttagaatga 37016005  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||| |   ||| || |||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  37016004 tgcagagctcactgcctccataattagatttcctgggcagttaactaccgaagtttt 37015948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 11506657 - 11506831
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||| |  |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | ||||    
T  11506657 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttgacttattaaagacaatagcgacgtcggatttatgttttgaaatatggtggaaaataata 11506756  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  11506757 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatggatttaatataatgatgtgtaatg 11506831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 218 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 44674440 - 44674199
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    |||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  44674440 tgatgaattttaaatgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtacttatcttgtttatgtccgag 44674341  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||| |||||||||||   |||||||||| |||||| |||||||||||   ||||||| |    
T  44674340 tttcaatgtt--gtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctgatttaattacag-ggaaaactggcc-aaaaaaaggcttggaaatgttttagaatga 44674245  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||| |   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44674244 tgcagagctcactgcctgcataatcagatttcctcggcagttaact 44674199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6187140 - 6186865
Alignment:
Q  39 gctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatg 138  Q
    ||||| || ||| |||||||| ||||||  ||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6187140 gctatgtgtcttggcttattcacgacgatagcgacattggatttatgtttagcaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatg 6187041  T
Q  139 taattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgat----------gtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttc 228  Q
     || ||| | |||||| |||||  |||||||||||||||           ||||||| || ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  6187040 caaatgcgtagaatgtcagtagagatttaatttaatgatatgtaatatgttgtaatgtgttgtttaattatggacaccctttaatgttttgatgaatttc 6186941  T
Q  229 aaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatctt 304  Q
    |||| |  || |||||||||| ||||||||| || ||||||||||  || | | ||||||||| ||||||| ||||    
T  6186940 aaacatacgtgtaattttaacgaaatgtcggattgatttaattattgactactataaaagataatgtatttttctt 6186865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 337 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 24415020 - 24414917
Alignment:
Q  337 ttatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgc 435  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24415020 ttatattatctttggaaatgttctggtttaattacaggtaaaaactgtccg-ataaatggcttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgc 24414922  T
Q  436 ataat 440  Q
    |||||    
T  24414921 ataat 24414917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 71 - 291
Target Start/End: Original strand, 30043046 - 30043275
Alignment:
Q  71 gacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatt 170  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| || || | ||| |||||| |  ||  |||| |||    
T  30043046 gacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatttgtattttcgttccatttgcaacttcatagaatgtcaccagagatttcatt 30043145  T
Q  171 taatgatgtgtaa----------tgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggt 260  Q
    ||| ||| |||||          || || |||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||   | |||||     
T  30043146 taacgatatgtaatgtgttgtagtgtgttgtttaattatgg-cactctttaatgttttgataaatttcaaacatccgtgtaattttaactctacgtcgga 30043244  T
Q  261 ttaatttaattatgaacaattgtaaaagata 291  Q
    || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  30043245 ttgatttaattatggataattgtaaaagata 30043275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 443 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26932664 - 26932634
Alignment:
Q  443 aatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26932664 aatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 26932634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 1089578 - 1089607
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1089578 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 1089607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 15999793 - 15999822
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15999793 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 15999822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 21022882 - 21022911
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21022882 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 21022911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 30723253 - 30723224
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30723253 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 30723224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 30726735 - 30726764
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30726735 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 30726764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 31425312 - 31425341
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31425312 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 31425341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 37563223 - 37563194
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37563223 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 37563194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 39773527 - 39773556
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39773527 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 39773556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 40358274 - 40358303
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40358274 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 40358303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 41800931 - 41800960
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41800931 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 41800960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 54633958 - 54633929
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54633958 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 54633929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6178231 - 6178203
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6178231 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 6178203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 37563275 - 37563303
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37563275 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 37563303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 39773482 - 39773454
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39773482 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 39773454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 41795477 - 41795449
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41795477 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 41795449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 49094036 - 49094064
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49094036 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 49094064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 54634010 - 54634038
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54634010 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 54634038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 432; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 432; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 1608804 - 1608353
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608804 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 1608705  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608704 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 1608605  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608604 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 1608505  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608504 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacttttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 1608405  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1608404 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 1608353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 13383151 - 13382679
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13383151 agagatgaatacgcatggaaaacgtcaagttatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 13383052  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13383051 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagtagtttaattatggacactttgt 13382952  T
Q  211 aatgtt--------------ttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
    ||||||              |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13382951 aatgttttgagtagtttaatttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 13382852  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| | |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  13382851 gttatctttattatgtccgagtttcaaactt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggtcg-aaaaatgg 13382755  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13382754 cttggaaatgtttacaattatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgaggtttt 13382679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 29286712 - 29286264
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29286712 agagacgaatacacatagaaaacggcaaactatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 29286613  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29286612 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagaggtttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 29286513  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||     
T  29286512 aacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttaa 29286413  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-tt 409  Q
    | |||||||||||   |   ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  29286412 gaccgagtttcaacgtt--gtatgatttatattgcctttgaaaatgctctggtttaattacaagtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgcttt 29286316  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||||    
T  29286315 agaattatgcagaacctactgtctgcataat-tgttttcctcggcagttaact 29286264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Original strand, 31150628 - 31151076
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  31150628 agagatgaatacgcttggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgttttagaatatggtggaagataata 31150727  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||| | || ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31150728 tattatatatgtatgtttgatcgatatgcaattgcgttgaatgtatgtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 31150827  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  31150828 aacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattggaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttaccttgtttat 31150927  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||  |   |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  31150928 gtccgagtttcaatgtt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggattaattataggtaaaaactgggcg-aaaaatggcttggaaatattta 31151024  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||    |||||| |||||||||||    
T  31151025 gaattatgcagaacccacagtctgcataatttgttttccttggcagttaact 31151076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Original strand, 25140668 - 25141117
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25140668 agagacgaatacacatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgacgtcgcatttatgtttcggaatatggtgaaagataata 25140767  T
Q  111 tattatata-tgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttg 209  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25140768 tattatataatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttg 25140867  T
Q  210 taatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcatta 309  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||    
T  25140868 taacgtgttgatgaatttcaaacgtttgtttaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaatgatattgtatttttcttgttta 25140967  T
Q  310 tgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-t 408  Q
    || ||||||||||||  |   ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||| |||| | |    
T  25140968 tggccgagtttcaatatt--gtatgatttatattgcctttggaaatgttctggtttaattacaggtaaaacttggccg-aaaaatggcttgaaaatgctt 25141064  T
Q  409 tagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||    ||||||||||||||||||    
T  25141065 tagaattatgcagaacccactgtctccataat-tgttttcctcggcagttaact 25141117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 153 - 473
Target Start/End: Original strand, 18351348 - 18351666
Alignment:
Q  153 gtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaa 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18351348 gtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaataagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaa 18351447  T
Q  253 atgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttgga 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||| || |||||| |    
T  18351448 atgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattatgtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttgaa 18351545  T
Q  353 aatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcg 452  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||    
T  18351546 aatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggctcggaaatgtttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagatttcttcg 18351645  T
Q  453 gcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  18351646 gcagttaactaccgaggtttt 18351666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 23959400 - 23958940
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23959400 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcacgacgatagcgacgttggatttatgtttcggaatatggtgtaagataata 23959301  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  23959300 tattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgtgttgtttaattatggacactatgt 23959201  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||  |||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  ||||    
T  23959200 aacattttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaaaatattgtattttacttgtttat 23959101  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-tt 409  Q
    | | |||||| |||  |   ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||    
T  23959100 gactgagtttaaatgtt--gtataagttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaatctggtcg-aaaaatggcttggaaatgcttt 23959004  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23959003 agaattatgcagaatccactgtctgcataaccagtttttctcggcagttaactaccgaggtttt 23958940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 11 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 7537710 - 7537250
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7537710 agagacgaatacgcatggaaaacagcaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 7537611  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac------- 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||           
T  7537610 tattatatatgtatgttcgttccatatgcatttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgatttgtttaattatggacacttaat 7537511  T
Q  204 -------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
           |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7537510 tatggacactttgtaatgtttagatgaatttcaaacgtttgtgtaattttaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 7537411  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7537410 tttttcttgtttatgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatgg 7537314  T
Q  397 cttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagtta 459  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||    |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7537313 cttggaaatgctttagaattatgcagaattcactgtctgcataatcagttttcctcggcagtta 7537250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 438
Target Start/End: Original strand, 18609796 - 18610221
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||| ||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||   |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  18609796 agagataaatatgcatggaaaacgacaagttatatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaattata 18609895  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18609896 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 18609995  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  18609996 aacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaattcgaaccagatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttat 18610095  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-tt 409  Q
    | ||||||||||||  |   ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||    
T  18610096 gaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttgaaaatgctctggtttaattacatgtaaaaactgaccg-aaaaatggcttggaaatgcttt 18610192  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcata 438  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||||    
T  18610193 agaattatgcagaacccactatctgcata 18610221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 17 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 2051545 - 2051078
Alignment:
Q  17 gaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattat 116  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  2051545 gaatacgcatggaaaacggcaagttatatgtcttggcttattcgcgacgatggcgacgtcggatttatgtttcgaaatatggtggaagataatatattat 2051446  T
Q  117 atatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatg--------------ga 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||               |    
T  2051445 atatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatgaacacttaattattaa 2051346  T
Q  203 cactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatc 302  Q
    |||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||    
T  2051345 cactttttatcgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaactgtaaaagatattgtatttttc 2051246  T
Q  303 ttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttgga 402  Q
    ||  |||||  |||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  2051245 ttggttatgatcgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctctgttttaattacagataaaaactggccg-aaaaattgcttgaa 2051149  T
Q  403 aatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||||||    ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2051148 aatgcattagaattatgcataacccactgtctgcataat-tgttttcctctgcagataactaccgaggtttt 2051078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 28362280 - 28362754
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28362280 agagatgaataagcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttatttgcgatgatagcgacgtcgaatttatgtttcagaatatggtggaagataata 28362379  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggaca------ 204  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| |||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||          
T  28362380 tattatatatgtatgttcgatcgatatgcaattgtgtagaatgtatgtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaatgatggacatttaat 28362479  T
Q  205 --------ctttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
            |||||||| |||||| |||||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  28362480 tatgaacactttgtaacgttttgttgaatttcaatcggttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattttagacaactgtaaaagatattgta 28362579  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||||||  |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  28362580 tttttcttgtttatgaccgagtttcaatgtt--atatgatttatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatgg 28362676  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat-caaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||   ||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28362677 cttggaaatgtttagaattatgcagaacacactgcctgcataatccagatttcctctgcagttaactatcgaggtttt 28362754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 11 - 439
Target Start/End: Original strand, 29667386 - 29667822
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  29667386 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgatgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagttaata 29667485  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaattatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||          || |||||||||||    
T  29667486 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatg 29667585  T
Q  201 gacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 300  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  29667586 gacactgtgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttt 29667685  T
Q  301 tcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttg 400  Q
     |||  ||||| | |||||| ||  |    ||| | ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  29667686 acttgtttatgactgagtttaaa--agttgtataagttatattgcctttgaaaatgctctggttaaattacagataaaaactggccg-aaaaatggcttg 29667782  T
Q  401 gaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataa 439  Q
    ||| | | || |||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  29667783 gaagtgctttggaattatgcaaaacccactgtctgcataa 29667822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 9e-71
Query Start/End: Original strand, 220 - 473
Target Start/End: Original strand, 11840022 - 11840273
Alignment:
Q  220 atgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtt 319  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  11840022 atgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgttcgagtt 11840121  T
Q  320 tcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaattatg 418  Q
    |||||  |   |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||    
T  11840122 tcaatgttg--tatgaattattttgcctttggaaatgttctggtttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgttttagaattatg 11840218  T
Q  419 cagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||| |   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11840219 cagagctcactgcctgcataatcagatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 11840273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 2259594 - 2259338
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||| || |||||||   |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||    
T  2259594 agagatgaatacgcatagaaaacgacaagctatatgcattggcttattaaagacgaaagcgacgtcagatttatgtttcgaaatatggtggaaaataata 2259495  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||| || | | ||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  2259494 tattatatatgcatgtttgttccatatgcaa-tacgttgaatgtaagtaaggatttaatttaataagttgtaatgtgttgtttaattatggacactatgt 2259396  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaattta 268  Q
    || |||||||||||||||||   | |||  | ||| |||||||||||||||| |||||    
T  2259395 aacgttttgatgaatttcaacattttgtgcattttgaaccaaatgtcggtttcattta 2259338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 71 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34230930 - 34230701
Alignment:
Q  71 gacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatt 170  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||  | |||||| |||||  ||||||||    
T  34230930 gacgtccgatttatgttttagaatatggtagaagataatatattatatatgtatgttcgttccatctgcaactgtgtagaatgttagtagagatttaatt 34230831  T
Q  171 taatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaa-cgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaa 269  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |   | |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  34230830 taacgatgtgtaatgtgttgtttaattatggacactctttaatgttttgatgaatttcaaagcattcatgtaattttaacgaaatgtcggtttgatttaa 34230731  T
Q  270 ttatgaacaattgtaaaagatattgtattt 299  Q
    ||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  34230730 ttatagacaattgtaaaagataatgtattt 34230701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Original strand, 31771510 - 31771764
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  31771510 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaaaatattgtatttttcttgtttatgtccgag 31771609  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||||| || ||||| |||||| |||  |||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||   ||||||| |    
T  31771610 tttcaatgtt--gtatgaattattttgcctttcgaaatgatctactttaattaaaggtaaaaaatggctgaaaaaatggcttggaaatgttttagaatca 31771707  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    || |||      ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31771708 tgaagagttcattgtctgcataatttattttcctcggcaattaactaccgagatttt 31771764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 392
Target Start/End: Original strand, 26702454 - 26702653
Alignment:
Q  190 gtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaaga 289  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  26702454 gtttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggttt-atttaattatggacaattgtaaaaga 26702552  T
Q  290 tattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaa 389  Q
    |||||||||| ||||  ||||| |||| |||| ||  |   ||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||    
T  26702553 tattgtatttttcttgtttatgaccgaatttctatgtt--gtatgatttatactgcctttggaaatgctctgatttaattacatgtaaaaattggtcgaa 26702650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 218 - 462
Target Start/End: Original strand, 3502434 - 3502676
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||    
T  3502434 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatggccaag 3502533  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| | |||| ||||   ||||||| |    
T  3502534 tttcaatgtt--gtatgaattgttttgccttttgaaatgctctggtgtaattacaggtaaaaactagccgaaaaaa-gacttgtaaatgttttagaatga 3502630  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||| |    || ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  3502631 tgcagagctcattgcctgcataatcagatttcctcagcagttaact 3502676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 46 - 391
Target Start/End: Original strand, 20448386 - 20448728
Alignment:
Q  46 gcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgc 145  Q
    ||||| ||||||||| |||||  |||||||   |||||||||| || ||||| || |||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| || || ||     
T  20448386 gccttggcttattcgtgacgatagcgacgtttcatttatgtttaggtatatgttg-aagataatatattatatatgtgtgtttgttacatttgcaaatgt 20448484  T
Q  146 attgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattt 245  Q
     | ||||||   |||  |||| || ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |   | ||||||    
T  20448485 gtagaatgtcgatagatattttatgtaatgatatgaaatgtgttgtttaattatggacactctttaatgtttttatgaatttcaaacattcctctaattt 20448584  T
Q  246 taaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattac 345  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||  ||||  ||||| |  ||| | |||  |   ||||| ||||||| |    
T  20448585 taacgaaatgtcggattgatttaattatggacaactgtaaaagataatgtattcttcttgtttatgactaagtataaatggt--gtatgagttatattgc 20448682  T
Q  346 ctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaa 391  Q
    || || ||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||    
T  20448683 ctctgtaaatgctctggttgaattacagataaaaataggccgaaaa 20448728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 247 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 8304711 - 8304570
Alignment:
Q  247 aaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacc 346  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| | ||||   |||  |   |||||  ||||||  |    
T  8304711 aaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagataatgtatttttcttgtttatgactgagtgcaaatgtt--gtatgaggtatattggc 8304614  T
Q  347 tttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaa 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8304613 tttggaaatgctctggtttaattacatgtaaaaactggccgaaa 8304570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2258540 - 2258368
Alignment:
Q  266 ttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggttt 365  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||| |||  |   ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  2258540 ttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgactgagtttaaatgttg--tatgagttatattgcctttgaaaatgctctggttt 2258443  T
Q  366 aattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 440  Q
    |||||||  ||||| ||| | | ||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  2258442 aattacaagtaaaatctgactg-aaaaatgacttgaaaattctttagaattatgcagaattcactgtctgcataat 2258368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Original strand, 20439753 - 20439855
Alignment:
Q  196 ttatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgt 295  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |   | |||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  20439753 ttatggacactctttaatgttttcatgaatttcaaacattcctgtaattttaacaaaatgtcggattgatttaattatggacaactgtaaaagataatgt 20439852  T
Q  296 att 298  Q
    |||    
T  20439853 att 20439855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 19129285 - 19129204
Alignment:
Q  210 taatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagata 291  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || |||||| ||| ||||||| | || ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19129285 taatgttttgatgaatttcaaacattcgtgtaatttcaacgaaatgtcagattgatttaattatggacaactgtaaaagata 19129204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 298
Target Start/End: Original strand, 20436045 - 20436147
Alignment:
Q  196 ttatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgt 295  Q
    ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||| |   | |||||||||  ||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||| |||    
T  20436045 ttatgaacactctttaatgttttcatgaatttcaaacattcatgtaattttaataaaatgtcggattgatttaatcatggacaactgtaaaagataatgt 20436144  T
Q  296 att 298  Q
    |||    
T  20436145 att 20436147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 27616794 - 27616765
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27616794 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 27616765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 29076317 - 29076346
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29076317 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 29076346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 29109850 - 29109879
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29109850 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 29109879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 29111290 - 29111319
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29111290 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 29111319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 31768832 - 31768803
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31768832 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 31768803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 6204779 - 6204807
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6204779 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 6204807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 11691746 - 11691774
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11691746 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 11691774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 13388703 - 13388731
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13388703 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 13388731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26712126 - 26712098
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26712126 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 26712098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 27639535 - 27639563
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27639535 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 27639563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 28249963 - 28249935
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28249963 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 28249935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 427; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 427; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 7344119 - 7344580
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344119 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcaacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 7344218  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344219 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 7344318  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7344319 aatgttttgatgaatttcaaacgtctatttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 7344418  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7344419 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatactta 7344517  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7344518 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactcccgaggtttt 7344580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 8419915 - 8419454
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419915 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 8419816  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419815 tattatatatgtacgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 8419716  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419715 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 8419616  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419615 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttgg-aatgctctggtttaattacagataaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 8419517  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8419516 gaattatgcagaacttattgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 8419454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 419; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 32376162 - 32375701
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32376162 agagatgaatacgcatgggaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgatggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 32376063  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32376062 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 32375963  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32375962 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcgatttaatttaattattaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 32375863  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32375862 gttcgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttgg-aatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 32375764  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32375763 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 32375701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 30301645 - 30301225
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30301645 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 30301546  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30301545 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 30301446  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30301445 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 30301346  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30301345 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 30301246  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgt 431  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30301245 gaattatgcagaacctgctgt 30301225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 39967 - 39518
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  39967 agagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgtctttgcttattcgcaacgacggcgatgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataata 39868  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39867 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 39768  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  39767 aatgttttgatgaatttcaaatgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttat 39668  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||| ||| ||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  39667 gtctgaggttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattggccgaaaaaatggcttggaaatgttta 39570  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39569 gaattatgcagaactcactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaact 39518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 31959610 - 31960084
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  31959610 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgttttggaatatggtggaaaataata 31959709  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaa--------------t 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||              |    
T  31959710 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtatggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacaattaat 31959809  T
Q  197 tatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31959810 tatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtgggtttaatttaatcatgaacaattgtaaaagatattgta 31959909  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31959910 tttatcttgtttatgtccgagtttcaatctt--atatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 31960007  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31960008 cttgcaaatgtttagaattatgcagaacttgctgtctgcataatcagttttcctcgacagtttactaccgaggtttt 31960084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 11 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 23924475 - 23924032
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23924475 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataata 23924376  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23924375 tattatatatgtatgttcgttccatatgcagttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 23924276  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  23924275 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttttttat 23924176  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||    
T  23924175 gtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctagtttaattacaggtaaaaactgaccg-aaaaatggcttgaaaatgttta 23924079  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagt 457  Q
    |||||||||| || |   ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23924078 gaattatgcataatccattgtctgcataatcagttttcctcggcagt 23924032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 35962817 - 35962357
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35962817 agagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 35962718  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  35962717 tattatatacgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgcaatgagttgtttaattatgcacactttgt 35962618  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  35962617 aacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatttcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttat 35962518  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
     ||||||||| |||  |   |||||||||| || ||||| | ||| ||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  35962517 atccgagttttaatgtt--gtatgaattattttgccttttgtaatactctggtataattacacgtaaaaattggccgaaaaaatggcttgaaaatgttta 35962420  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35962419 gaattatgcagaacccactgcctgcataatcagttttcctcggcagttaactcccgaggtttt 35962357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Original strand, 43376842 - 43377283
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43376842 agagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcattggtttattcgcgacgatagtgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataata 43376941  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattat----------- 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||               
T  43376942 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaat 43377041  T
Q  200 ---ggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43377042 taaggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaacttgaaccaaatttcggtttcatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 43377141  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  43377142 tttttcttgtttatgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatgg 43377238  T
Q  397 cttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 440  Q
    ||||||||| | ||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  43377239 cttggaaatgctttagaattatgtagaacccactgtctgcataat 43377283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 127 - 462
Target Start/End: Original strand, 20548938 - 20549270
Alignment:
Q  127 tcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatt 226  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20548938 tcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaaggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatt 20549037  T
Q  227 tcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatca 326  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||     
T  20549038 tcaaacgtttgtttaattttaaccaaatttcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatatccgagtttcaatct 20549137  T
Q  327 tacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattatgcagaacct 426  Q
    |   |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||| |    
T  20549138 t--gtatgaattattttgtctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccg-aatgatggcttggaaatgtttagaattatgcagaactt 20549234  T
Q  427 gctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  20549235 gctgtctgcataatcagttttcctcggtagttaact 20549270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 43679906 - 43679447
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||   |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  43679906 agagatgaacacgcatggaaaacgacaagttatatgccttgacttattaaagacgatagagacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataata 43679807  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  43679806 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagcagggatttaatataatgatgtgtaatgagttgtttaattatgaacactttgt 43679707  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    || |||||||||||||| |||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  43679706 aacgttttgatgaattttaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttat 43679607  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-tt 409  Q
    | ||||||||||||  |   ||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||  |||||||| | ||    
T  43679606 gaccgagtttcaat--tttgtatgatttatattgcctttggaaatattttggtttaattacatgtaaaaattagcc-aaaaaatgatttggaaatgcttt 43679510  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||| |||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43679509 agaattatgcaaaacccactgtctgtataat-tattttcttcggcagttaactaccgaggtttt 43679447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 2124704 - 2124260
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2124704 agagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacaatagcgactttggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 2124605  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggac------- 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           
T  2124604 tattatatatgtattttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggacttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaat 2124505  T
Q  204 -------actttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
           ||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||    
T  2124504 tatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaatgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaactatggacaactgtaaaagatattata 2124405  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggttta---attacagttaaaaactggccgaaaaaa 393  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||| |||||| |||||| |||||    
T  2124404 tttttcttggttatgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaaatattccaggtaaaaagtggccg-aaaaa 2124308  T
Q  394 tggcttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 440  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2124307 tggcttggaaatgcattagaattatgcagaacccactgtctgcataat 2124260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 322
Target Start/End: Original strand, 22588006 - 22588316
Alignment:
Q  12 gagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatat 111  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||   |||||  |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  22588006 gagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgtcttggctaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgttttgaaatatggtggaagataatat 22588105  T
Q  112 attatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgta 211  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22588106 attatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgta 22588205  T
Q  212 atgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatg 311  Q
    | |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  22588206 acgttttgatcaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacctaatgtcggtttgatttaattatggataattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatg 22588305  T
Q  312 tccgagtttca 322  Q
      |||||||||    
T  22588306 atcgagtttca 22588316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 108 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 39751473 - 39751144
Alignment:
Q  108 atatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39751473 atatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattacgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactt 39751374  T
Q  208 tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcat 307  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||||  |    
T  39751373 tgtaacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcagtttgatttaattacggacaactgtaaaagatattgtatttttcttggt 39751274  T
Q  308 tatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac 407  Q
    |||| ||||||||||||  |   ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  39751273 tatgaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgtctttggaaatgctctggtttaattatagttaaaaactggcc-aaaaaatagcttggaaatgc 39751177  T
Q  408 -ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataa 439  Q
     ||| || ||||||||| |  ||||||||||||    
T  39751176 attataaatatgcagaatccactgtctgcataa 39751144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 299
Target Start/End: Original strand, 7171880 - 7172178
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  7171880 agagatgaatacgcatggaaaatggcaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataata 7171979  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatg----------tgtaatgagtagtttaattatg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||          ||||||| || |||||||||||    
T  7171980 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaagtagagatttaatttaatgatgtgtactgagttgtaatgtgttgtttaattatg 7172079  T
Q  201 gacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattt 299  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||||||||||| | ||| || ||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7172080 gacactatgtaacgttttcatgaatttcaaacttttgtgtattttgaacaaaatgtgggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattt 7172178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 70 - 438
Target Start/End: Original strand, 4867415 - 4867791
Alignment:
Q  70 cgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaat 169  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4867415 cgacgtcggatttatgtttcggattatggtggaaaataatatattatatacgtatgttcgttccatatccaattgcgttgaatgtaagtagggatttaat 4867514  T
Q  170 ttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcgg 259  Q
    ||||||||  |||||||          || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||| || ||||||| ||    
T  4867515 ttaatgataagtaatgagttgtaatctgttgtttaattatggagactatgtaatgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttaaatcaaatgttgg 4867614  T
Q  260 tttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctc 359  Q
    ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||| |||  |   ||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4867615 tttgatttaattatggacaatggtgaaagatattgtatttttcttgtttatgactgagtttaaatgtt--gtatgagttatattgcctttggaaatgctc 4867712  T
Q  360 tggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcata 438  Q
    | |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4867713 tagtttaattacaagtaaaaactggcc-aaaaaatggcttggaaatgctttagaattatgcaaaacccactgtctgcata 4867791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 304
Target Start/End: Original strand, 22661137 - 22661430
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22661137 agagatgaatatgcatggaaaacggcaagccatatgccttggcttattcacgacgatagcgacgtcgggtctatgtttcggaatatggtggaagatgata 22661236  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||   |||||| |||||  ||||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||| | |    
T  22661237 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaactgcgcagaatgtcagtagagatttaatttaacgatatgtaatgtgttgtttaattatggacactcttt 22661336  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatctt 304  Q
    ||||||||||||||| |||||| |  || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  22661337 aatgttttgatgaatctcaaacattcgtgtaattttaacgaaatatcggtttgatttaattatggacaaccgtaaaagataatgtatttttctt 22661430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 223 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 41744162 - 41743925
Alignment:
Q  223 aatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttca 322  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  41744162 aatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaatcatggacaattgtaaaaaatattgtatttatcttgtttatgttcgagtttca 41744063  T
Q  323 atcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattatgcaga 422  Q
    ||| |  |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  41744062 atcttgtata--aattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacatgtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgtttaaaattatgcaga 41743965  T
Q  423 acctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||  ||||||||||||| |  |||| |||||||||||||    
T  41743964 acccactgtctgcataattagttttcttcggcagttaact 41743925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 34367214 - 34366961
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34367214 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 34367115  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |    
T  34367114 tttcaatgct--gtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaa-ggcttggaaatgttttagaatga 34367018  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||| |   ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34367017 tgcagagctcactgcctgcataatcagatttcatcggcagttaactaccgaggtttt 34366961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 41744333 - 41744160
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  |||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  41744333 agagatgaatacgcatggaaaacgacaagttatatgccttggcttattcatgacgatagcgacgtcggatttatatttcggaatatggtggaagataata 41744234  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaat 184  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41744233 tattatatatgtatattcgctccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggacttaatttaatgatgtgtaat 41744160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 250 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 23578705 - 23578485
Alignment:
Q  250 caaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattaccttt 349  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||||||  |  |||  | ||||||| |||||    
T  23578705 caaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgacagagtttcaatgttgtata--atttatattgccttt 23578608  T
Q  350 ggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttc 448  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||    ||||    
T  23578607 ggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggctg-aaaaatggtttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataat-ttttttc 23578510  T
Q  449 ctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||| |||||||| || |||||||    
T  23578509 ctcggtagttaactgccaaggtttt 23578485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 219 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 41239150 - 41238970
Alignment:
Q  219 gatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagt 318  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||     
T  41239150 gatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttgatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttgtcttgtttatgtccgaga 41239051  T
Q  319 ttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttgga 402  Q
    ||||||  |   |||||||||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||| | | ||||||||||||||    
T  41239050 ttcaatgtt--gtatgaattattttgcatttcgaaatgctctgctttaattacaggttaaaactgactg-aaaaatggcttgga 41238970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 345 - 462
Target Start/End: Original strand, 1116110 - 1116226
Alignment:
Q  345 cctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaa 444  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||      
T  1116110 cctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaa-ctggccgaaaaaatggcttggaattgtttagaattatgcagaaccctctgtctgcataatcagt 1116208  T
Q  445 tttcctcggcagttaact 462  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  1116209 ttttctcggcagttaact 1116226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 399 - 473
Target Start/End: Original strand, 17924232 - 17924306
Alignment:
Q  399 tggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17924232 tggaaatacttagaattatgcaggacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 17924306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 304
Target Start/End: Original strand, 30972519 - 30972730
Alignment:
Q  93 atatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtt 192  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| || |  ||| | ||||||   |||  |||| || ||||||||||||||| || |||    
T  30972519 atatggttgaagataatatattatatatgtgtgtttgttccatttgcacatgcgtagaatgtcgatagatattttatgtaatgatgtgtaatgtgttgtt 30972618  T
Q  193 taattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatat 292  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||| |||||| |  || ||||||||||  ||||  ||||||||||     
T  30972619 taattatgtatactctgtaatgttttgatgaatttcaaacattcgtgtaattttaacgaaatgttgaattgatttaattatcgacaaccgtaaaagataa 30972718  T
Q  293 tgtatttatctt 304  Q
    ||||||| ||||    
T  30972719 tgtatttttctt 30972730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 39751758 - 39751659
Alignment:
Q  17 gaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattat 116  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39751758 gaatacgcatggaaaacggcaaactatatgtcttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtagaagataatatattat 39751659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 460
Target Start/End: Original strand, 7172498 - 7172623
Alignment:
Q  337 ttatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaa--ctggccgaaaaaatggcttggaaatactt-agaattatgcagaacctgctgtct 433  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  | ||  ||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  7172498 ttatattgcctttgaaaatgctctggtttaattacaagtaaaaaaacaggttgaaaaac-ggcttggaaatgctttagaattatgcagaagccactgtct 7172596  T
Q  434 gcataatcaaatttcctcggcagttaa 460  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  7172597 gcataatcagtttttctcggcagttaa 7172623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 78 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 31281255 - 31281198
Alignment:
Q  78 gatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccat 135  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31281255 gatttatgtttcagaatatggttgaagataatatattatatctttatgttcgttccat 31281198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 184495 - 184466
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  184495 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 184466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 22014404 - 22014375
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22014404 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 22014375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 26663027 - 26663056
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663027 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 26663056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 36677871 - 36677842
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36677871 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 36677842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 184547 - 184575
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  184547 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 184575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 486171 - 486143
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  486171 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 486143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 22550860 - 22550888
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22550860 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 22550888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 41016492 - 41016464
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41016492 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 41016464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 42481639 - 42481611
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42481639 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 42481611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 356; Significance: 0; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 37815092 - 37814632
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37815092 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcacgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 37814993  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37814992 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaaagtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 37814893  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37814892 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattat 37814793  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  37814792 gtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccggaaaaatggcttggaaatgttta 37814695  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  37814694 gaactatgcagaacccactgtctgcattatcagatttcttcggcagttaactaccaaggtttt 37814632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25890504 - 25890044
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  25890504 agagatgaatacgcgtggaaaacagcaagcgatatgcctttgcttattcgcgacgacgtcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaaaataata 25890405  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25890404 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatgaacactttgt 25890305  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  25890304 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtataagatattgtatttatcttgtttat 25890205  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  25890204 gtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgttta 25890107  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25890106 gaattatgcagaacttgttgtctgcataatcagttttcctcggcagtttactaccgaggtttt 25890044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 27863913 - 27863464
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  27863913 agagatgaatacgcatgaaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacagcgacgtcggatttatgttttggaatatggtggaagataata 27863814  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27863813 tattatatatgtatgttcgttccatttgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 27863714  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27863713 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttgattat 27863614  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||| |   | |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  27863613 gtccgagtttcaatctt--gtgtgaattattttgcctttggaaatgttctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttgaaaatgttta 27863516  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27863515 gaattatgcagaacccactatctgcataatcagttttcctcggcagttaact 27863464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 7018008 - 7017562
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             ||||||||||||| ||||    
T  7018008 agagatgaatacacatggaaaatggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcaga-------------atatggtggaagataata 7017922  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7017921 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 7017822  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7017821 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattat 7017722  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  7017721 gtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacagataaaaactggccgaaaaaatggcttgaaaatgttta 7017624  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7017623 gaattatgcag-acccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgaggtttt 7017562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 13564151 - 13563702
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13564151 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcttatttgcgatgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 13564052  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13564051 tattatatatgtatgttcgatccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 13563952  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13563951 aatgttttaatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttcattat 13563852  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  13563851 gtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactagccgaaaaaatggcttggaaatgttta 13563754  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
     ||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  13563753 taattatgcagaacccactgtctgcataatcagttctcctcggcagttaact 13563702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 11 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 38856225 - 38855766
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38856225 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 38856126  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38856125 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggattgaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 38856026  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcatta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38856025 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggtttaatttaattacgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgatta 38855926  T
Q  310 tgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactt 409  Q
    || ||||||||||||  |   |||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||   |    
T  38855925 tgaccgagtttcaatatt--gtatgaattatttagcctttggaaattgtctggtttaattacaggtaaaaactgaccg-aaaaatggcttggaaatgtct 38855829  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggttt 472  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  38855828 agaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactgccgaagttt 38855766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 11 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 28882498 - 28882058
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28882498 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcatttgcttatttgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 28882399  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28882398 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtggggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 28882299  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28882298 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaacgaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgattat 28882199  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    | ||||||||||||| |  || |        || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28882198 gaccgagtttcaatcttgtatgt--------ttgcctttgtaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgctta 28882107  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagtta 459  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||    
T  28882106 gaattatgtagaacctactggctgcataattagttttcctcggcagtta 28882058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 11 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 11029517 - 11029059
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11029517 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 11029418  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  11029417 tattatatatgtatgttcgtttcatatgtaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtgatgagtagtttaattatgg--actttgt 11029320  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcatta 309  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11029319 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaatgttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgcatttatcttgatta 11029220  T
Q  310 tgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactt 409  Q
    || ||||||||||||  |   |||||||||| |  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |    
T  11029219 tgaccgagtttcaatatt--gtatgaattatttagcctttggaaattgtctggtttaattacaggtaaaaactggtcgaaaaaatggcttggaaatgtct 11029122  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggttt 472  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  11029121 agaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactgccgaagttt 11029059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 78 - 469
Target Start/End: Original strand, 34079761 - 34080150
Alignment:
Q  78 gatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgat 177  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34079761 gatttatgtttcagaatatggtggaagataatatattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtaaggatttaatttaatgat 34079860  T
Q  178 gtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaac 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079861 gtgtaatgagttgtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaac 34079960  T
Q  278 aattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaa 377  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34079961 aattgtaaaagatattgtacttatcttgattatgtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaa 34080058  T
Q  378 aaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgagg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  34080059 aaactggccgaaaaaatggcttggaaatgtttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctctgcagttaactgccgagg 34080150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 34123048 - 34122574
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  34123048 agagatgaatacgcatggaaaacggtaagttatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcagaatatggtggaagataata 34122949  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacact---- 206  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        
T  34122948 tattatatatatatgttcgttccatatgcaattgcattgaatgtaagtatgaatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaat 34122849  T
Q  207 ----------ttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
              ||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34122848 tatgaacaccttgtaaccttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 34122749  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||  |   |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34122748 tttatcttgtttatgtccgagtttcaatgtt--gtatgaattattttgcctttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatgg 34122651  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34122650 cttgaaaatatttagaattatgcagaatccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgagctttt 34122574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 11 - 469
Target Start/End: Original strand, 1039355 - 1039824
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  1039355 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacatcggatttatgttt-ggaatatggtggaaaataata 1039453  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtt--------------taat 196  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||              ||||    
T  1039454 tgttatatatgtatgttcgtaccatatgcagttgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatatgtaatgagttgttaaattattgacacttaat 1039553  T
Q  197 tatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1039554 tatagacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 1039653  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    |||||| |  ||||||||||||||||||| |   |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  1039654 tttatcgtgtttatgtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttgaaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactgacccaaaaaatgg 1039751  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgagg 469  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  1039752 cttggaaatatttaggattatgcagaactcactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactgccgagg 1039824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 11 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 7797087 - 7796696
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7797087 agagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgctttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 7796988  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7796987 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 7796888  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  7796887 aacgttttgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattataaaagatattgtatttttcttgtttat 7796788  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat 405  Q
      ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7796787 aaccgagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatagcttggaaat 7796696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 14280541 - 14280770
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280541 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 14280640  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280641 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 14280740  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgttt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280741 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgttt 14280770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 33994712 - 33995171
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  33994712 agagatgaatacgcatggacaacggcaaactatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtcggatttatgtttcttaatatggtggaagataata 33994811  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||| |||    
T  33994812 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgtgttgtttatgcatggacactatgt 33994911  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    || | ||||| ||||||||||| | | | || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||    
T  33994912 aacgatttgaagaatttcaaacttttttgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattttacttgtttat 33995011  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactt- 409  Q
    | | |||||| |||  |   ||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  33995012 gactgagtttaaatgtt--gtataagttatattgcctttggaaatgttctggttaaattacatgtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgctta 33995108  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    | ||||||||| ||||  ||||||||||||     |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33995109 acaattatgcataacccactgtctgcataa-atgttttcctcggcagttaactcccgaggtttt 33995171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 24053673 - 24053237
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||   |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24053673 agagatgaatacgcatggaaaacgacaagctatatgccttggcgaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataata 24053574  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaattatg 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||          || |||||||||||    
T  24053573 tattatatatgtatgttctttctatatgcaattgcgttgaatgtaattagggatataatttaatgatgtgtaatgagttgtaatatgttgtttaattatg 24053474  T
Q  201 gacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 300  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  24053473 gacactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatgtaattatggacaattgtaaaagatattgtatttt 24053374  T
Q  301 tcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttg 400  Q
     |||  ||||| | |||||| |||  |   ||| | ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  24053373 acttgtttatgactgagtttaaatgtt--gtataagttatattgcctttgaaaatgctctggttaaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatggcttg 24053277  T
Q  401 gaaatactt-agaattatgcagaacctgctgtctgcataa 439  Q
     |||| ||| | |||||||||||||   ||||||||||||    
T  24053276 aaaatgcttgacaattatgcagaactcactgtctgcataa 24053237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 24050548 - 24050125
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||   |||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24050548 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttggcgaattgaagacgatagcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaagataata 24050449  T
Q  111 tat--tatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatga----------gtagtttaatta 198  Q
    |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||          || |||||||||    
T  24050448 tatattatatatgtatgttcgttctatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatataatttaatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaatta 24050349  T
Q  199 tggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatt 298  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24050348 tggatactatgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatt 24050249  T
Q  299 tatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggct 398  Q
    |  |||  ||||| | || ||| |||  |   ||| | ||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  | ||||||||||| ||||||||||    
T  24050248 ttacttgtttatgactgaatttaaatgtt--gtataagttatatttcctttggtaatgctctggttaaattacatgtgaaaactggccg-aaaaatggct 24050152  T
Q  399 tggaaatactt-agaattatgcagaac 424  Q
    ||||||| ||| | |||||||||||||    
T  24050151 tggaaatgcttaacaattatgcagaac 24050125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 69 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 25878082 - 25877671
Alignment:
Q  69 gcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaa 168  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||   ||  |||||||||| ||||||    
T  25878082 gcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaaaataatatattatatatgtatgtttgttccatatgcaattgtgatg--tgtaagtagggatttaa 25877985  T
Q  169 tttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt--------------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaat 254  Q
    | |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||              ||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  25877984 tataatcacgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaattatggacactttgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaat 25877885  T
Q  255 gtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaa 354  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || |||||||||  |   ||||| ||||||| | |||| |||    
T  25877884 gtcggtt--atttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccaagtttcaatgtt--gtatgatttatattgcttttgaaaa 25877789  T
Q  355 tgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcgg 453  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||||     |||||||||    
T  25877788 tgctctggtttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatggcttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataa-atgttttcctcgg 25877691  T
Q  454 cagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  25877690 cagttaactaccgaagtttt 25877671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 240 - 473
Target Start/End: Original strand, 28388311 - 28388542
Alignment:
Q  240 taattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaatta 339  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||| |   |||||||||    
T  28388311 taatttgaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaaaatattgtatttattttgtttatgtccgaatttcaatcttg--tatgaatta 28388408  T
Q  340 tattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataa 439  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  28388409 ttttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgtttaaaattatgcagaacccactgtctgcataa 28388508  T
Q  440 tcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28388509 tcagttttcttcggcagttaactaccgaggtttt 28388542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 317 - 473
Target Start/End: Original strand, 14280767 - 14280923
Alignment:
Q  317 gtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaatta 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280767 gtttcaatcatacatatgaattatattacatttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaatta 14280866  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14280867 tgcagaacctgctgtctgcataattaaatttcctcggccgttaactaccgaggtttt 14280923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 4197024 - 4196792
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||   |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  4197024 agagatgaatatgcatggaaaacgacaagctacatgccttggcttattaaagacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtcgaaaataata 4196925  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4196924 tattatatatgtat--tcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatcatatgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 4196827  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattt 245  Q
    || ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  4196826 aacgttttgatgaataccaaacgtttgtgtaattt 4196792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Original strand, 28387821 - 28387979
Alignment:
Q  13 agatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatata 112  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28387821 agatgaatacacatggaaaacgacaagttatatgcctttg-ttattcacgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagataatata 28387919  T
Q  113 ttatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaattta 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  28387920 ttatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgattgtaagtagggatttaattta 28387979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Original strand, 7762013 - 7762267
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||    
T  7762013 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatctatcttgtttatgttcgag 7762112  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||| | || |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||   ||||||| |    
T  7762113 tttcaatgtt--gtatgaattgttttgcctttcaaaatgctttggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaaaggcttgaaaatgttttagaatga 7762210  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||| |   ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7762211 tgcagagctcactgcctgcataatcaattttcctcggcagttaactcctgaggtttt 7762267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 30352940 - 30352541
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||   |||||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  30352940 agagatgaatatgcatgaaaaacggcaagttatatgccttggcttgttaaagacgatagcgacgtcgtatttatgtttcggaatattgtggaaaataata 30352841  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagt----------agtttaattatg 200  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||           |||||||||||    
T  30352840 tattatatatgtatgttttttccatatgcaattgcattgaatgtaagtaaagatttaatttattgatatgtaatgagttgtaatgtgctgtttaattatg 30352741  T
Q  201 gacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtattta 300  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||||  ||||| ||||||||||| |||     ||||||||||||||||     
T  30352740 gacactgtgtaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtattttgaaccaaatgctggtttgatttaattatggaca-----aaaagatattgtatttt 30352646  T
Q  301 tcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttg 400  Q
    ||||  ||||| | |||||| |||  |   ||||  ||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||  || ||||||||||||    
T  30352645 tctt--ttatgactgagtttaaatgtt--gtatggcttatattgcatttggaaatgctctgatttatttacagataaaaactgatcg-aaaaatggcttg 30352551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 38407449 - 38407197
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||    
T  38407449 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgccggtttgatttaattatggacaattctaaaagatattgtatttttcttgtttatgtctgag 38407350  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||||| || ||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||| |    
T  38407349 tttcaatgtt--gtatgaattattttgcctttcgaaatgttctgctttaattacaggtaaaaactggccg--aaaatggcttggaaatgttttagaatca 38407254  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||| |   |||||| ||||||    |||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38407253 tgcagagctcactgtctacataatttgttttcttcggcagttaactaccgatgtttt 38407197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 135
Target Start/End: Original strand, 43179428 - 43179552
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43179428 agagatgaacacgcatggaaaacggtaagctatatgccttggcttattcgcgacgatagcgacgtttgatttatgtttcggaatatggtggaagataata 43179527  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccat 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  43179528 tattatatatgtatgttcgttccat 43179552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 6267933 - 6267691
Alignment:
Q  61 cgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtag 160  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||| || || ||| | |||||| |||||    
T  6267933 cgacgatggcgacgtcgaatttatgtt-cggaatatgatggaagataatatattatatatgtatttttgttccatctgcaactgcgtagaatgtcagtag 6267835  T
Q  161 gaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggt 260  Q
      ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |   |  ||||||||  |||||||||     
T  6267834 agatttaatttaatgatatgtaatgtgttgtttaattatggacactctttaatgttatgatgaatttcaaacattcttgcaattttaatgaaatgtcgga 6267735  T
Q  261 ttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatctt 304  Q
    || ||||||||||| | ||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  6267734 ttgatttaattatggataacggtaaaagataatgtatttttctt 6267691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 218 - 405
Target Start/End: Original strand, 41799539 - 41799722
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||  |||||||| ||    
T  41799539 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaatcaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaa-aaattgtatttttcttgtttatgtccaag 41799637  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat 405  Q
    |||||||  |   |||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  41799638 tttcaatgtt--gtatgaattattttgcctttcgaaatgctctgctttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatggcttgaaaat 41799722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 4196746 - 4196637
Alignment:
Q  331 tatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgct 429  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||  ||    
T  4196746 tatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattgaccg-aaaaatagcttggaaatgctttagaattatgcagaacccact 4196648  T
Q  430 gtctgcataat 440  Q
    |||||||||||    
T  4196647 gtctgcataat 4196637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 179 - 462
Target Start/End: Original strand, 43179631 - 43179902
Alignment:
Q  179 tgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaaca 278  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||| |||||| || ||   ||||||||| |||    
T  43179631 tgtaatgtgttgtttaattatggacactctttaacgttttgatgaatttcaaacattcgtgtaattttaacgaaatgttggattgtattaattatggaca 43179730  T
Q  279 attgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaa 378  Q
    | ||||||||||| | ||||| ||||  || || |||||| | |||  |   || || |  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43179731 agtgtaaaagataatatatttttcttgtttttgaccgagtataaatgtt--gtacgactagtattgcctttgaaaatgctctggttgaattacaggtaaa 43179828  T
Q  379 aactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaact 462  Q
    ||||| |||  ||||||||||||       |  ||||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  43179829 aactgaccg--aaaatggcttgg-------ttcaattatgcagaacccactgtctgcataat-atctttcctcggcagttaact 43179902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 8577053 - 8577024
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8577053 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 8577024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 19041111 - 19041140
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19041111 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 19041140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 27662289 - 27662260
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27662289 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 27662260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 28238218 - 28238189
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28238218 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 28238189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 511073 - 511101
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  511073 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 511101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 19037591 - 19037563
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19037591 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 19037563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 27660018 - 27659990
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27660018 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 27659990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 31787598 - 31787570
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31787598 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 31787570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 472
Target Start/End: Original strand, 4889 - 5349
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4889 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcggaatatggtggaagataata 4988  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4989 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 5088  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaacc-aaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcatta 309  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5089 aatgttttcatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttgatta 5188  T
Q  310 tgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactt 409  Q
    || ||||||||||||| |   |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  5189 tgaccgagtttcaatctt--gtatgaattatttagcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgtct 5286  T
Q  410 agaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggttt 472  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5287 agaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagttaactgccgaagttt 5349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 936 - 907
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  936 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 909 - 881
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  909 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 5409 - 5381
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5409 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 5381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 336; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Original strand, 15518 - 15978
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  15518 agagatgaatacgtatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggggacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaaaataata 15617  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15618 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgt 15717  T
Q  211 aatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15718 aatgttttgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaactaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttat 15817  T
Q  311 gtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatactta 410  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||    
T  15818 gtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaacaaatggcttagaaatgttta 15915  T
Q  411 gaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15916 gaattatgcagaactcactgtctgcataatcagttttcctcggaagttaactaccgaggtttt 15978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 11 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 22924 - 22453
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | | ||    
T  22924 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttatttgcgacgacggcgacgtcggatttatgtttcagaatatggtggaaaatatta 22825  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactt--- 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  22824 tattatatatgtatgttcgttccatttgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacacttaat 22725  T
Q  208 -----------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgta 296  Q
               ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22724 tatgaacactttgtaatgttttgatgaatttcaa-cgtttgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatggacaattgtaaaagatattgta 22626  T
Q  297 tttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatgg 396  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22625 tttatcttgattatgtccgagtttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaattggccgaaaaaatgg 22528  T
Q  397 cttggaaatacttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||   |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22527 cttggaaatgtttagaattatgcagaactcactg--tgcataatcagttttcctcggcagttaactaccgagatttt 22453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 118 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 8602 - 8249
Alignment:
Q  118 tatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagtttaattatggacactttgtaatgttt 217  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8602 tatgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgtaatgagttgtttaattatggacactttgtaatgttt 8503  T
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  8502 tgatgaatttcaaacgtttgtttaattttaaccaaatgttggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtacttatcttgattatgcccgag 8403  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatacttagaattat 417  Q
    |||||||| |   |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8402 tttcaatctt--gtatgaattattttgcctttggaaatgctttggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaatgtttagaattat 8305  T
Q  418 gcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8304 gcagaacccactgtctgcataatcagttttccttggcagttaactaccgaggtttt 8249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 94 - 469
Target Start/End: Original strand, 19743 - 20131
Alignment:
Q  94 tatggtggaagacaatatattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagttt 193  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  19743 tatggtggaagataatatattatatatgtatgctcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagggatttaatttaatgatgtgcaatgagttgttt 19842  T
Q  194 aattatggacactt--------------tgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaa 279  Q
    ||||||| ||||||              ||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19843 aattatgaacacttaattacggccactttgtaacgttttgatgaattttaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaa 19942  T
Q  280 ttgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaa 379  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19943 ttgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttg--tatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaa 20040  T
Q  380 actggccgaaaaaatggcttggaaatac-ttagaattatgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgagg 469  Q
    |||| |||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  20041 actgaccgaaaaaaaagcttggaaatgctttagaattatgcagaacccactgtctgcataatcagttttcctcggcagtaaactaccgagg 20131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 19497 - 19582
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatat 96  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19497 agagacgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgctttggcttattcgcgacgatagcgacgtcagatttatgtttcggaatat 19582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 15 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 22144 - 21768
Alignment:
Q  15 atgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaatatatt 114  Q
    |||||||| ||||||||| | |||| |||||| ||| |||||||   ||| |  ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |             
T  22144 atgaatacgcatggaaaatgacaagttatatgtcttggcttattaaagacaatagcgacgtcgaatttatgttttggaatatggtggaaaa--------- 22054  T
Q  115 atatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatgagtagt----------ttaattatggaca 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||          |||||||||||||    
T  22053 atatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtagggatttaatataatgatgtgtaatgagttgtaatgtgttgtttaattatggaca 21954  T
Q  205 ctttgtaatgttttgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatctt 304  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||         
T  21953 ctttttaacgttttgatgaatttcaaacttttgtgtaatttgaaccaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtattt----- 21859  T
Q  305 cattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaa 404  Q
           | |||||||||||  |   ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21858 -------ttcgagtttcaatatt--gtatgatttatattgcttttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccg-aaaaatggcttagaaa 21769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0169
Description:

Target: scaffold0169; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Original strand, 10827 - 10977
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10827 agagatgaatacgcatggaaaacagcaagctatatgccttggcttattcgtgacgatagcgacgtcagatttatgtttcagaatatggtggaagataata 10926  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtagg 161  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10927 tattatatttgtatgttcgttccatatgcaattgcgttgaatgtaagtagg 10977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0169; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 281 - 440
Target Start/End: Original strand, 1517 - 1674
Alignment:
Q  281 tgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgagtttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaa 380  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||  |   ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1517 tgtaaaagatattgtatttttcttgtttatgaccgagtttcaatgttg--tatgatttatattgcctttggaaatgctctggtttaattacaggtaaaaa 1614  T
Q  381 ctggccgaaaaaatggcttggaaatact-tagaattatgcagaacctgctgtctgcataat 440  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1615 ctggccg-aaaaatggcttggaaatgctatagaattatgcagaacccactgtctgcataat 1674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 218 - 473
Target Start/End: Original strand, 236006 - 236257
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    
T  236006 tgatgaatttcaaacgtttgtgtaatttgaaccaaatgtcgatttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtctgag 236105  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat-acttagaatta 416  Q
    |||||||  |   |||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||   ||||||| |    
T  236106 tttcaatatt--gtatgaattgttttgcctttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggtcgaaaaaa-ggtttggaaatgttttagaatga 236202  T
Q  417 tgcagaacctgctgtctgcataatcaaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||| |   ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  236203 tgcagagctcactgtctgc--aatcagatttcctcggcagttaactaccgaagtttt 236257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0199 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0199
Description:

Target: scaffold0199; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 218 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12706 - 12522
Alignment:
Q  218 tgatgaatttcaaacgtctgtttaattttaaccaaatgtcggtttaatttaattatgaacaattgtaaaagatattgtatttatcttcattatgtccgag 317  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12706 tgatgaattttaaacgtttgtgtaatttaaacaaaatgtcggtttgatttaattatggacaattgtaaaagatattgtatttatcttgtttatgtccgag 12607  T
Q  318 tttcaatcatacatatgaattatattacctttggaaatgctctggtttaattacagttaaaaactggccgaaaaaatggcttggaaat 405  Q
    |||||||  |   |||||||| | || | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12606 tttcaatgtt--gtatgaattgttttgcttttcgaaatgctctggtttaattacaggtaaaaactggccgaaaaaa-ggcttggaaat 12522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0794 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0794
Description:

Target: scaffold0794; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 1314 - 1488
Alignment:
Q  11 agagatgaatacacatggaaaacggcaagctatatgcctttgcttattcgcgacgacggcgacgtcagatttatgtttcggaatatggtggaagacaata 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||| |  |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | ||||    
T  1314 agagatgaatacgcatggaaaacggcaagctatatgccttgacttattaaagacaatagcgacgtcggatttatgttttgaaatatggtggaaaataata 1413  T
Q  111 tattatatatgtatgttcgttccatatgtaattgcattgaatgtaagtaggaatttaatttaatgatgtgtaatg 185  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  1414 tattatatatgtatgttcgttccatatgcaattgtgatgaatgtaagtatggatttaatataatgatgtgtaatg 1488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0794; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 5349 - 5321
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5349 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 5321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 36658 - 36627
Alignment:
Q  442 aaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36658 aaatttcctcggcagttaactaccgaggtttt 36627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0744 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0744
Description:

Target: scaffold0744; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Original strand, 417 - 446
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  417 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 444 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 7497 - 7468
Alignment:
Q  444 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7497 atttcctcggcagttaactaccgaggtttt 7468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 717 - 745
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  717 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 50125 - 50097
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50125 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 50097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 445 - 473
Target Start/End: Original strand, 232827 - 232855
Alignment:
Q  445 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  232827 tttcctcggcagttaactaccgaggtttt 232855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University