View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2351_low_43 (Length: 211)

Name: NF2351_low_43
Description: NF2351
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2351_low_43
NF2351_low_43
[»] chr7 (69 HSPs)
chr7 (2-211)||(22072944-22073153)
chr7 (1-207)||(16219604-16219808)
chr7 (3-207)||(16056360-16056561)
chr7 (1-207)||(811018-811222)
chr7 (1-207)||(47831837-47832041)
chr7 (1-207)||(67775-67978)
chr7 (1-207)||(18005676-18005880)
chr7 (1-207)||(12901353-12901558)
chr7 (1-207)||(44014208-44014408)
chr7 (1-141)||(34200816-34200951)
chr7 (1-141)||(16495432-16495567)
chr7 (1-207)||(15754776-15754978)
chr7 (1-141)||(11995983-11996118)
chr7 (1-141)||(28505254-28505389)
chr7 (1-94)||(3564363-3564455)
chr7 (1-94)||(13647355-13647447)
chr7 (1-207)||(20220076-20220279)
chr7 (1-95)||(2280117-2280210)
chr7 (1-151)||(12255733-12255884)
chr7 (3-94)||(48273421-48273511)
chr7 (143-207)||(16324175-16324239)
chr7 (1-91)||(38227511-38227599)
chr7 (1-151)||(1867937-1868086)
chr7 (1-94)||(24275198-24275289)
chr7 (1-153)||(14044776-14044928)
chr7 (1-153)||(14354806-14354958)
chr7 (1-91)||(12698861-12698951)
chr7 (57-207)||(15113028-15113177)
chr7 (1-91)||(16386249-16386339)
chr7 (1-91)||(18456415-18456503)
chr7 (9-91)||(26212034-26212115)
chr7 (1-94)||(456348-456439)
chr7 (1-94)||(11393331-11393422)
chr7 (1-94)||(11972523-11972614)
chr7 (1-94)||(14949166-14949257)
chr7 (1-151)||(15008441-15008590)
chr7 (1-94)||(15376757-15376848)
chr7 (1-94)||(16232547-16232638)
chr7 (1-94)||(16410086-16410177)
chr7 (1-94)||(18640299-18640390)
chr7 (1-94)||(20385167-20385258)
chr7 (1-94)||(21189639-21189730)
chr7 (1-94)||(27216887-27216978)
chr7 (1-94)||(32125518-32125609)
chr7 (1-94)||(41522944-41523035)
chr7 (1-94)||(41525406-41525497)
chr7 (1-151)||(19486686-19486835)
chr7 (1-91)||(9509219-9509308)
chr7 (1-91)||(10589069-10589158)
chr7 (1-94)||(15144037-15144128)
chr7 (1-94)||(18430739-18430830)
chr7 (1-94)||(24702265-24702356)
chr7 (1-94)||(44116536-44116627)
chr7 (116-176)||(9389615-9389675)
chr7 (1-95)||(10063816-10063909)
chr7 (57-207)||(15116565-15116714)
chr7 (1-87)||(16213711-16213795)
chr7 (1-134)||(17061919-17062050)
chr7 (1-94)||(3386360-3386451)
chr7 (4-72)||(40443424-40443490)
chr7 (1-41)||(27847881-27847921)
chr7 (1-100)||(14036284-14036384)
chr7 (1-100)||(14346314-14346414)
chr7 (1-83)||(13869373-13869453)
chr7 (1-94)||(38898420-38898512)
chr7 (1-94)||(13831400-13831491)
chr7 (1-43)||(48991210-48991252)
chr7 (38-94)||(26356027-26356083)
chr7 (38-94)||(26358479-26358535)
[»] chr6 (67 HSPs)
chr6 (3-207)||(23019438-23019640)
chr6 (1-207)||(19668401-19668606)
chr6 (1-151)||(25644350-25644500)
chr6 (1-207)||(19652225-19652427)
chr6 (1-207)||(28496361-28496562)
chr6 (1-207)||(29808772-29808973)
chr6 (1-142)||(9098465-9098605)
chr6 (1-207)||(1561333-1561535)
chr6 (30-207)||(22080626-22080800)
chr6 (1-95)||(20109168-20109261)
chr6 (1-94)||(29060570-29060662)
chr6 (1-91)||(16496274-16496363)
chr6 (1-70)||(27333241-27333309)
chr6 (1-70)||(27393981-27394049)
chr6 (1-94)||(30676754-30676845)
chr6 (1-99)||(18409821-18409918)
chr6 (1-134)||(22782254-22782385)
chr6 (1-94)||(20593803-20593895)
chr6 (1-94)||(25629354-25629446)
chr6 (1-207)||(23076760-23076966)
chr6 (1-91)||(17287798-17287887)
chr6 (1-91)||(20360962-20361051)
chr6 (141-207)||(27333172-27333238)
chr6 (141-207)||(27393912-27393978)
chr6 (1-94)||(12742344-12742435)
chr6 (1-94)||(18334636-18334727)
chr6 (1-94)||(19005073-19005164)
chr6 (1-94)||(19303540-19303631)
chr6 (1-94)||(19858963-19859054)
chr6 (1-94)||(24422574-24422665)
chr6 (1-94)||(25656656-25656747)
chr6 (1-94)||(25688529-25688620)
chr6 (1-94)||(33861821-33861912)
chr6 (1-94)||(33864305-33864396)
chr6 (1-85)||(20076730-20076812)
chr6 (1-151)||(8227453-8227602)
chr6 (1-207)||(35008178-35008384)
chr6 (1-94)||(1540955-1541046)
chr6 (1-94)||(1595576-1595667)
chr6 (1-94)||(2291224-2291315)
chr6 (1-94)||(8055056-8055147)
chr6 (1-94)||(18456746-18456837)
chr6 (1-94)||(18461906-18461997)
chr6 (1-94)||(20556936-20557027)
chr6 (1-94)||(25754836-25754927)
chr6 (1-94)||(26924684-26924775)
chr6 (1-94)||(34963400-34963491)
chr6 (1-72)||(20638304-20638374)
chr6 (1-75)||(4185839-4185912)
chr6 (1-83)||(16448582-16448662)
chr6 (1-43)||(16920679-16920721)
chr6 (1-91)||(22780229-22780318)
chr6 (1-39)||(22831533-22831571)
chr6 (115-193)||(28103799-28103877)
chr6 (54-153)||(18696570-18696667)
chr6 (23-151)||(18706356-18706483)
chr6 (1-43)||(35245616-35245658)
chr6 (1-72)||(18821866-18821935)
chr6 (58-141)||(22949384-22949466)
chr6 (58-141)||(22953340-22953422)
chr6 (58-141)||(23871828-23871910)
chr6 (58-141)||(23875784-23875866)
chr6 (58-141)||(27325388-27325470)
chr6 (1-75)||(4186397-4186470)
chr6 (1-94)||(3852061-3852152)
chr6 (162-207)||(9098412-9098457)
chr6 (1-34)||(11185535-11185568)
[»] chr8 (68 HSPs)
chr8 (1-210)||(38855136-38855342)
chr8 (1-207)||(6520398-6520601)
chr8 (1-207)||(21285627-21285831)
chr8 (1-187)||(23760751-23760935)
chr8 (1-207)||(983289-983497)
chr8 (1-207)||(21673734-21673937)
chr8 (1-207)||(37116377-37116583)
chr8 (1-207)||(20498592-20498797)
chr8 (1-207)||(5866164-5866365)
chr8 (1-207)||(17266879-17267085)
chr8 (1-207)||(21491025-21491226)
chr8 (1-207)||(17140946-17141147)
chr8 (54-207)||(22364745-22364896)
chr8 (1-187)||(24353050-24353235)
chr8 (1-95)||(16092340-16092433)
chr8 (1-151)||(26355643-26355789)
chr8 (1-141)||(17439458-17439598)
chr8 (1-91)||(18818411-18818500)
chr8 (1-91)||(28649046-28649135)
chr8 (1-91)||(7372808-7372897)
chr8 (1-91)||(21919002-21919091)
chr8 (1-141)||(17612062-17612201)
chr8 (1-151)||(13508027-13508176)
chr8 (1-141)||(21249414-21249550)
chr8 (1-141)||(21255252-21255388)
chr8 (1-94)||(14409488-14409579)
chr8 (1-94)||(15203275-15203366)
chr8 (1-94)||(16413360-16413451)
chr8 (1-85)||(6759288-6759371)
chr8 (1-85)||(23406409-23406492)
chr8 (1-151)||(13597559-13597708)
chr8 (1-91)||(20536238-20536327)
chr8 (1-91)||(21923930-21924019)
chr8 (1-91)||(22626766-22626854)
chr8 (1-95)||(22875095-22875187)
chr8 (1-94)||(1484429-1484520)
chr8 (1-94)||(5853336-5853427)
chr8 (1-94)||(20403254-20403345)
chr8 (1-94)||(22001780-22001871)
chr8 (1-94)||(20046239-20046330)
chr8 (1-94)||(41598215-41598306)
chr8 (1-72)||(16199666-16199735)
chr8 (1-91)||(21395984-21396071)
chr8 (1-91)||(21790477-21790564)
chr8 (1-72)||(31971287-31971356)
chr8 (1-95)||(26219744-26219835)
chr8 (54-100)||(40492844-40492890)
chr8 (1-94)||(4483308-4483398)
chr8 (1-94)||(4542417-4542508)
chr8 (1-49)||(18879275-18879322)
chr8 (1-91)||(21389454-21389541)
chr8 (1-91)||(21778780-21778867)
chr8 (2-94)||(26223947-26224037)
chr8 (1-72)||(45131019-45131087)
chr8 (1-83)||(15070585-15070665)
chr8 (1-43)||(19154936-19154978)
chr8 (1-79)||(45290754-45290830)
chr8 (1-94)||(14823800-14823891)
chr8 (1-94)||(19801426-19801516)
chr8 (58-141)||(18862430-18862512)
chr8 (58-141)||(21383896-21383978)
chr8 (58-141)||(21387316-21387398)
chr8 (58-141)||(21411189-21411271)
chr8 (58-141)||(21805681-21805763)
chr8 (58-141)||(21827799-21827881)
chr8 (1-94)||(19896292-19896386)
chr8 (1-83)||(19937061-19937141)
chr8 (57-153)||(14103165-14103260)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-207)||(10557-10761)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-207)||(32566-32769)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (1-207)||(21329384-21329588)
chr5 (1-207)||(26011922-26012126)
chr5 (1-207)||(21502042-21502247)
chr5 (1-207)||(20026827-20027032)
chr5 (1-207)||(21565572-21565776)
chr5 (1-140)||(22959489-22959623)
chr5 (1-207)||(22178106-22178312)
chr5 (1-207)||(19660725-19660926)
chr5 (1-140)||(22144079-22144217)
chr5 (4-151)||(19668931-19669073)
chr5 (2-94)||(9077983-9078074)
chr5 (1-91)||(21729066-21729155)
chr5 (1-91)||(21808391-21808480)
chr5 (1-91)||(24529250-24529339)
chr5 (1-91)||(25431424-25431513)
chr5 (1-70)||(36314607-36314675)
chr5 (1-93)||(1096497-1096588)
chr5 (1-80)||(21997547-21997625)
chr5 (24-128)||(29448055-29448159)
chr5 (1-95)||(22412214-22412306)
chr5 (1-91)||(24493599-24493687)
chr5 (1-91)||(25421562-25421651)
chr5 (1-94)||(264812-264903)
chr5 (1-94)||(10732984-10733075)
chr5 (1-94)||(20902053-20902144)
chr5 (1-94)||(20909039-20909130)
chr5 (1-94)||(39363411-39363502)
chr5 (1-91)||(8286844-8286934)
chr5 (1-91)||(13025341-13025429)
chr5 (1-91)||(13095525-13095613)
chr5 (1-91)||(22075049-22075138)
chr5 (1-91)||(23390498-23390587)
chr5 (1-94)||(29329961-29330052)
chr5 (1-94)||(42245409-42245500)
chr5 (1-94)||(36154827-36154915)
chr5 (1-94)||(37723933-37724023)
chr5 (1-151)||(40725883-40726032)
chr5 (1-83)||(18319089-18319169)
chr5 (1-83)||(39245163-39245243)
chr5 (1-94)||(2154658-2154749)
chr5 (1-94)||(11581243-11581334)
chr5 (1-94)||(29346007-29346098)
chr5 (1-83)||(10775731-10775811)
chr5 (38-95)||(20766118-20766174)
chr5 (1-42)||(21293020-21293060)
chr5 (80-141)||(21741486-21741545)
chr5 (1-94)||(29348480-29348571)
chr5 (1-94)||(29350953-29351044)
chr5 (58-141)||(10753603-10753685)
chr5 (58-141)||(21871525-21871607)
chr5 (58-141)||(21875805-21875887)
chr5 (58-141)||(22120149-22120231)
chr5 (110-141)||(36314685-36314716)
chr5 (1-83)||(31061095-31061175)
chr5 (9-94)||(32027428-32027511)
chr5 (24-91)||(18356367-18356432)
[»] chr3 (80 HSPs)
chr3 (1-207)||(15470954-15471157)
chr3 (1-207)||(14234517-14234723)
chr3 (1-207)||(16097358-16097562)
chr3 (1-204)||(12174152-12174350)
chr3 (1-207)||(16103810-16104013)
chr3 (1-207)||(37251054-37251259)
chr3 (1-141)||(13210283-13210418)
chr3 (1-207)||(22110238-22110443)
chr3 (1-151)||(52523669-52523820)
chr3 (1-95)||(42386440-42386533)
chr3 (1-128)||(32307707-32307830)
chr3 (1-91)||(18438564-18438653)
chr3 (1-91)||(12399239-12399328)
chr3 (1-95)||(27165277-27165370)
chr3 (1-93)||(14972884-14972975)
chr3 (1-134)||(43925988-43926121)
chr3 (1-75)||(49668094-49668167)
chr3 (9-82)||(53301562-53301634)
chr3 (1-151)||(24340665-24340814)
chr3 (1-75)||(9512950-9513023)
chr3 (1-75)||(9520925-9520998)
chr3 (1-91)||(23083363-23083452)
chr3 (1-95)||(23274717-23274810)
chr3 (1-91)||(26686917-26687006)
chr3 (1-134)||(43550482-43550614)
chr3 (1-94)||(25476384-25476476)
chr3 (1-94)||(29172627-29172718)
chr3 (80-176)||(1465329-1465423)
chr3 (1-72)||(11424781-11424850)
chr3 (1-151)||(37642207-37642356)
chr3 (33-151)||(2051141-2051260)
chr3 (1-91)||(14572619-14572707)
chr3 (1-91)||(20698437-20698526)
chr3 (1-91)||(24153211-24153299)
chr3 (1-95)||(36166625-36166716)
chr3 (1-91)||(43840962-43841051)
chr3 (81-207)||(49389517-49389642)
chr3 (1-94)||(6469178-6469269)
chr3 (1-94)||(8899121-8899212)
chr3 (1-94)||(9707651-9707742)
chr3 (1-94)||(17446699-17446790)
chr3 (1-94)||(17463205-17463296)
chr3 (1-94)||(17672653-17672744)
chr3 (1-94)||(28848655-28848746)
chr3 (1-94)||(34159353-34159444)
chr3 (1-94)||(38961935-38962026)
chr3 (1-94)||(45606951-45607042)
chr3 (1-94)||(55476518-55476609)
chr3 (1-89)||(55500969-55501055)
chr3 (1-91)||(13442304-13442393)
chr3 (1-91)||(17487886-17487975)
chr3 (1-91)||(17499368-17499457)
chr3 (1-95)||(21618476-21618567)
chr3 (1-94)||(7781391-7781482)
chr3 (1-94)||(12567587-12567678)
chr3 (1-94)||(13544052-13544143)
chr3 (1-94)||(16454325-16454416)
chr3 (1-94)||(53070697-53070788)
chr3 (1-151)||(22147467-22147616)
chr3 (1-94)||(13151834-13151926)
chr3 (1-94)||(13154299-13154391)
chr3 (1-94)||(10247767-10247858)
chr3 (1-99)||(12377951-12378050)
chr3 (1-94)||(15977542-15977633)
chr3 (1-94)||(16282855-16282946)
chr3 (1-94)||(40213720-40213811)
chr3 (1-94)||(50242849-50242940)
chr3 (1-94)||(41123917-41124005)
chr3 (131-207)||(43927291-43927367)
chr3 (1-36)||(28194720-28194755)
chr3 (1-94)||(606324-606417)
chr3 (1-83)||(12119780-12119860)
chr3 (9-91)||(14576835-14576915)
chr3 (1-83)||(15412456-15412536)
chr3 (8-128)||(1644642-1644757)
chr3 (58-141)||(14501207-14501290)
chr3 (58-141)||(19776007-19776089)
chr3 (58-141)||(37439421-37439503)
chr3 (1-83)||(8499545-8499625)
chr3 (1-75)||(44494836-44494908)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-207)||(6010-6214)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (1-207)||(12288096-12288301)
chr4 (1-210)||(39706173-39706379)
chr4 (1-207)||(13737-13942)
chr4 (1-207)||(53082038-53082243)
chr4 (1-151)||(52243136-52243287)
chr4 (1-141)||(15551847-15551982)
chr4 (1-207)||(46640342-46640547)
chr4 (9-207)||(16596686-16596879)
chr4 (1-151)||(43198495-43198646)
chr4 (1-128)||(12774037-12774160)
chr4 (61-207)||(8846461-8846606)
chr4 (1-94)||(16377522-16377612)
chr4 (80-207)||(15099457-15099582)
chr4 (80-207)||(15190424-15190549)
chr4 (1-91)||(7798804-7798893)
chr4 (1-91)||(12902787-12902876)
chr4 (1-91)||(52873369-52873458)
chr4 (1-95)||(54798752-54798845)
chr4 (1-91)||(7088907-7088996)
chr4 (1-91)||(7893733-7893822)
chr4 (1-95)||(14280343-14280435)
chr4 (1-91)||(23374361-23374450)
chr4 (1-94)||(14038678-14038770)
chr4 (1-94)||(18215318-18215409)
chr4 (1-94)||(44928923-44929015)
chr4 (1-91)||(16270238-16270326)
chr4 (1-94)||(12351-12442)
chr4 (1-94)||(15118396-15118487)
chr4 (1-94)||(19618216-19618307)
chr4 (1-94)||(44773131-44773222)
chr4 (1-94)||(52312537-52312628)
chr4 (1-64)||(3096323-3096385)
chr4 (1-72)||(6190492-6190563)
chr4 (6-48)||(8846391-8846433)
chr4 (1-91)||(16239972-16240060)
chr4 (1-91)||(44052859-44052948)
chr4 (1-94)||(1837553-1837644)
chr4 (1-94)||(3515034-3515125)
chr4 (1-94)||(14970751-14970842)
chr4 (1-94)||(18239463-18239554)
chr4 (1-94)||(19242726-19242817)
chr4 (1-94)||(44615315-44615406)
chr4 (1-94)||(50222383-50222474)
chr4 (1-94)||(51463912-51464003)
chr4 (1-91)||(6899921-6900009)
chr4 (1-95)||(8574867-8574958)
chr4 (1-83)||(15355380-15355460)
chr4 (52-98)||(15464926-15464972)
chr4 (1-43)||(17046517-17046559)
chr4 (1-91)||(22636465-22636554)
chr4 (1-87)||(23803316-23803400)
chr4 (163-209)||(14164739-14164785)
chr4 (1-83)||(15367720-15367800)
chr4 (1-83)||(15370048-15370128)
chr4 (1-83)||(15371232-15371312)
chr4 (1-83)||(15373513-15373593)
chr4 (1-83)||(15402733-15402813)
chr4 (1-72)||(14053323-14053392)
chr4 (58-141)||(630728-630810)
chr4 (58-141)||(3331970-3332052)
chr4 (58-141)||(13812763-13812845)
chr4 (58-141)||(14953915-14953997)
chr4 (58-141)||(25690146-25690228)
chr4 (165-207)||(12774189-12774231)
chr4 (163-209)||(14158034-14158080)
chr4 (1-83)||(16223562-16223642)
chr4 (4-94)||(21815629-21815717)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (51-211)||(8094-8253)
scaffold0556 (1-207)||(6842-7043)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-207)||(12969-13173)
scaffold0138 (54-207)||(18124-18276)
[»] chr1 (50 HSPs)
chr1 (1-207)||(22921756-22921960)
chr1 (1-207)||(21861456-21861661)
chr1 (1-207)||(21896145-21896347)
chr1 (1-207)||(33681037-33681241)
chr1 (1-151)||(22237657-22237805)
chr1 (1-207)||(50614002-50614208)
chr1 (1-207)||(50621830-50622036)
chr1 (1-141)||(20918634-20918769)
chr1 (54-207)||(50686695-50686847)
chr1 (1-204)||(16368176-16368377)
chr1 (1-141)||(14295507-14295642)
chr1 (1-151)||(35261023-35261169)
chr1 (1-211)||(41049918-41050127)
chr1 (1-207)||(52927869-52928061)
chr1 (1-151)||(20248309-20248454)
chr1 (1-128)||(21754075-21754198)
chr1 (1-134)||(45574846-45574978)
chr1 (1-94)||(50210212-50210304)
chr1 (1-91)||(34509810-34509899)
chr1 (1-150)||(16758679-16758828)
chr1 (80-207)||(35981575-35981700)
chr1 (80-207)||(49261448-49261573)
chr1 (79-207)||(20636956-20637082)
chr1 (24-141)||(22130863-22130975)
chr1 (1-91)||(27250731-27250820)
chr1 (1-94)||(13988893-13988984)
chr1 (1-94)||(21475131-21475222)
chr1 (1-94)||(21840794-21840885)
chr1 (1-94)||(21923335-21923426)
chr1 (1-94)||(23593779-23593870)
chr1 (1-93)||(31612340-31612430)
chr1 (1-152)||(16093825-16093976)
chr1 (1-91)||(21026710-21026799)
chr1 (1-91)||(22532299-22532388)
chr1 (1-47)||(38801433-38801479)
chr1 (1-74)||(20847173-20847245)
chr1 (1-86)||(22123119-22123203)
chr1 (1-94)||(29298164-29298254)
chr1 (1-94)||(433039-433128)
chr1 (1-94)||(29776715-29776806)
chr1 (47-141)||(51130639-51130729)
chr1 (1-192)||(21161746-21161932)
chr1 (1-94)||(16361944-16362035)
chr1 (1-141)||(26064968-26065107)
chr1 (58-141)||(1924914-1924996)
chr1 (1-40)||(20454606-20454644)
chr1 (58-141)||(20923928-20924010)
chr1 (1-83)||(15860064-15860144)
chr1 (1-91)||(22468698-22468787)
chr1 (57-94)||(12271639-12271676)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (1-207)||(25175880-25176084)
chr2 (1-207)||(7619-7824)
chr2 (1-207)||(28406006-28406211)
chr2 (1-207)||(18786789-18786994)
chr2 (1-139)||(7679615-7679750)
chr2 (1-207)||(23791303-23791509)
chr2 (1-207)||(23207307-23207512)
chr2 (1-94)||(22105439-22105531)
chr2 (1-207)||(25108917-25109123)
chr2 (5-151)||(23708561-23708706)
chr2 (1-141)||(23071905-23072040)
chr2 (1-91)||(298816-298906)
chr2 (1-141)||(19671860-19671998)
chr2 (1-91)||(23060543-23060632)
chr2 (1-91)||(23076472-23076561)
chr2 (1-95)||(22337145-22337238)
chr2 (1-94)||(6726022-6726113)
chr2 (1-141)||(20520145-20520284)
chr2 (57-207)||(22459448-22459598)
chr2 (1-94)||(571424-571515)
chr2 (1-94)||(18808970-18809061)
chr2 (1-94)||(23130889-23130980)
chr2 (1-94)||(23133356-23133447)
chr2 (1-94)||(23135617-23135708)
chr2 (1-94)||(23709576-23709667)
chr2 (1-94)||(23712057-23712148)
chr2 (1-94)||(24367801-24367892)
chr2 (1-94)||(26505406-26505497)
chr2 (1-94)||(26507884-26507975)
chr2 (1-94)||(32214965-32215056)
chr2 (1-94)||(34402566-34402657)
chr2 (1-94)||(39682340-39682431)
chr2 (1-151)||(22413078-22413229)
chr2 (1-89)||(22731238-22731325)
chr2 (1-72)||(38136-38205)
chr2 (1-94)||(21155104-21155195)
chr2 (54-151)||(24697548-24697644)
chr2 (1-94)||(28577126-28577217)
chr2 (1-94)||(32039542-32039633)
chr2 (1-91)||(20309138-20309225)
chr2 (1-93)||(22134208-22134297)
chr2 (1-72)||(32451949-32452020)
chr2 (1-100)||(23004778-23004878)
chr2 (1-94)||(23103396-23103486)
chr2 (1-94)||(24898239-24898331)
chr2 (1-94)||(24900722-24900814)
chr2 (1-94)||(24903199-24903291)
chr2 (1-94)||(24905676-24905768)
chr2 (1-94)||(24908151-24908243)
chr2 (1-94)||(43137326-43137417)
chr2 (1-49)||(23285895-23285942)
chr2 (9-91)||(23660061-23660141)
chr2 (1-94)||(45029898-45029989)
chr2 (58-141)||(1283666-1283748)
chr2 (58-141)||(30344776-30344858)
chr2 (1-91)||(23654388-23654477)
chr2 (1-50)||(8946687-8946735)
chr2 (1-94)||(24529573-24529664)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-207)||(12796-13000)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-207)||(6565-6768)
scaffold0621 (1-207)||(8496-8703)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (1-207)||(922-1125)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-205)||(6641-6843)
scaffold0333 (1-205)||(14021-14223)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-207)||(19294-19498)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (1-207)||(100404-100608)
scaffold0023 (1-207)||(40061-40265)
scaffold0023 (1-94)||(17484-17575)
scaffold0023 (1-94)||(94438-94529)
scaffold0023 (1-44)||(119905-119948)
scaffold0023 (1-94)||(44481-44573)
scaffold0023 (1-48)||(101529-101576)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-207)||(5673-5876)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-207)||(62228-62429)
scaffold0028 (1-78)||(132688-132765)
scaffold0028 (1-94)||(134238-134329)
scaffold0028 (1-94)||(136707-136798)
scaffold0028 (1-94)||(139176-139267)
scaffold0028 (1-94)||(144114-144205)
scaffold0028 (1-94)||(141645-141736)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (3-207)||(10428-10630)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-204)||(2535-2736)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-207)||(1112-1316)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-207)||(129935-130139)
scaffold0010 (1-98)||(60710-60807)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-207)||(22561-22761)
scaffold0037 (1-94)||(82099-82190)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (1-207)||(7963-8165)
scaffold0218 (18-139)||(29238-29354)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-207)||(14584-14788)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (1-207)||(136254-136460)
scaffold0021 (1-207)||(144962-145168)
scaffold0021 (1-94)||(174796-174886)
scaffold0021 (1-41)||(121796-121835)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-207)||(160714-160917)
scaffold0001 (1-94)||(501111-501202)
scaffold0001 (1-83)||(85635-85715)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-207)||(12598-12802)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-207)||(6169-6375)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (29-204)||(2108-2281)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (1-207)||(128856-129061)
scaffold0022 (1-207)||(78352-78556)
scaffold0022 (1-95)||(116457-116548)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (1-151)||(159-307)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-151)||(45735-45883)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-207)||(38346-38552)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-207)||(2691-2897)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-207)||(53435-53640)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (1-207)||(97035-97241)
scaffold0006 (1-207)||(106313-106519)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (3-207)||(103525-103720)
[»] scaffold0046 (3 HSPs)
scaffold0046 (1-141)||(11322-11457)
scaffold0046 (1-207)||(2027-2228)
scaffold0046 (1-91)||(28444-28533)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (4-207)||(15694-15892)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (1-207)||(19771-19976)
scaffold0080 (1-91)||(39943-40031)
scaffold0080 (58-141)||(48939-49021)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-141)||(1025-1160)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (1-94)||(3185-3277)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (1-98)||(27744-27840)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (1-95)||(1062-1155)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (21-207)||(54-240)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (2-207)||(7945-8151)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (1-98)||(16095-16191)
scaffold0357 (1-96)||(13158-13252)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (1-95)||(44705-44798)
scaffold0122 (1-94)||(26064-26156)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-95)||(38700-38793)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (1-151)||(11494-11643)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-151)||(38198-38347)
scaffold0124 (58-141)||(24605-24690)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (1-141)||(25136-25275)
scaffold0123 (54-151)||(620-715)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-95)||(3149-3241)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (1-95)||(39507-39599)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-95)||(75213-75305)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (1-94)||(17214-17308)
scaffold0056 (1-94)||(79328-79419)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (1-91)||(4879-4968)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (1-141)||(34153-34288)
scaffold0175 (21-91)||(13141-13211)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-107)||(15763-15868)
scaffold0020 (162-207)||(15719-15764)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (1-207)||(580-784)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (1-207)||(267690-267895)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-91)||(13241-13330)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-75)||(23901-23974)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (1-91)||(51943-52032)
scaffold0011 (1-91)||(167980-168069)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (54-207)||(1684-1835)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (1-94)||(16599-16691)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (1-78)||(32128-32205)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (1-94)||(16143-16235)
scaffold0120 (1-91)||(32959-33047)
scaffold0120 (1-91)||(45958-46046)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (1-151)||(17969-18118)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (8-95)||(4544-4630)
scaffold0228 (8-95)||(12126-12212)
scaffold0228 (8-95)||(22078-22164)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-91)||(24304-24394)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-91)||(22913-23001)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (1-91)||(32972-33060)
scaffold0145 (1-91)||(38791-38879)
scaffold0145 (1-94)||(9776-9867)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (1-94)||(4721-4812)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (1-98)||(8509-8605)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-94)||(10800-10891)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (1-94)||(13419-13510)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-94)||(20774-20865)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (1-94)||(29959-30050)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (1-94)||(37848-37939)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-94)||(11315-11406)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-94)||(158494-158585)
scaffold0003 (1-94)||(339949-340038)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (7-91)||(20946-21030)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (29-151)||(225465-225585)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (1-91)||(1050-1139)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (1-91)||(3500-3589)
scaffold0292 (1-91)||(373-461)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-91)||(4554-4643)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (1-43)||(51612-51654)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-95)||(25926-26018)
scaffold0026 (1-95)||(39888-39980)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (1-91)||(1881-1970)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (1-94)||(13974-14065)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (1-94)||(16811-16902)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (1-91)||(8535-8620)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (1-91)||(10427-10514)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (1-41)||(1319-1359)
scaffold0106 (1-43)||(7296-7338)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (3-94)||(12293-12382)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (1-74)||(16312-16382)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (35-94)||(3529-3588)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (1-91)||(1982-2071)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (1-63)||(4742-4803)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (4-94)||(40430-40518)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-91)||(6123-6215)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (1-50)||(13527-13575)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (1-94)||(9269-9360)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (1-94)||(20423-20513)
scaffold0031 (46-91)||(128824-128869)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (1-72)||(11464-11534)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (1-72)||(15485-15554)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (1-83)||(4241-4321)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-94)||(4324-4415)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-42)||(32097-32137)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (1-75)||(2705-2780)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (1-37)||(5183-5219)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (1-48)||(28813-28861)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (47-141)||(2398-2488)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (1-41)||(47025-47065)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (3-94)||(135-224)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (23-94)||(12106-12176)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (58-141)||(6-88)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (1-43)||(1098-1140)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (53-95)||(27911-27953)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-94)||(161133-161225)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (57-153)||(602-697)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 69)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 211
Target Start/End: Original strand, 22072944 - 22073153
Alignment:
Q  2 catgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaa 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22072944 catgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaa 22073043  T
Q  102 acataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22073044 acataaactcatgtaatgtatatgcaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaacatcaagacaaacaac 22073143  T
Q  202 ttagttcctt 211  Q
    ||||||||||    
T  22073144 ttagttcctt 22073153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16219808 - 16219604
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  16219808 tcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcttaaacatca 16219710  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16219709 aacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 16219611  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  16219610 cttagtt 16219604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Original strand, 16056360 - 16056561
Alignment:
Q  3 atgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaa 102  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16056360 atgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgcaaa--caacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcaaa 16056457  T
Q  103 cataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaact 202  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  16056458 cataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatatcattcaggcttaccgaaacaacaacatcaagataaacaact 16056556  T
Q  203 tagtt 207  Q
    |||||    
T  16056557 tagtt 16056561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 811222 - 811018
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||    
T  811222 tcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcattaacatcataaacatca 811124  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  811123 aacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaactacaacagcaagataaataa 811025  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  811024 cttagtt 811018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 47831837 - 47832041
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | | | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  47831837 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcatatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatca 47831935  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  47831936 aacataat-tcatataatgtatatacaattatataacattagcgacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaataa 47832034  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  47832035 cttagtt 47832041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 67775 - 67978
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||  ||||    
T  67775 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaat-atca 67872  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    | |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  67873 a-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggctcactgaaacaacaacagcaagataaaca 67970  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  67971 acttagtt 67978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 18005676 - 18005880
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||     
T  18005676 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtatg-gaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc- 18005773  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18005774 aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaaca 18005872  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  18005873 acttagtt 18005880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 12901353 - 12901558
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||  |  |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||| ||| ||||    
T  12901353 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacagcaacatcacaa-catc 12901451  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12901452 atacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaatcatataattcaagcttactgaaacaacaacaacaagataaaca 12901550  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  12901551 acttagtt 12901558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 44014208 - 44014408
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| ||   | |||||||||||| |||     
T  44014208 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa---atcaacatctcaaatatc- 44014302  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  44014303 aacat-aattcatataatgtatatacagttatataccattaaaaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga-taaca 44014400  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  44014401 acttagtt 44014408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 34200816 - 34200951
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  ||||    
T  34200816 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatca 34200911  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200912 aacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 34200951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 16495432 - 16495567
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||   |||||  ||||    
T  16495432 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatca 16495527  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
     || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495528 gac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 16495567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15754978 - 15754776
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||| || ||||||||   ||||| ||||    
T  15754978 tcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaac---tcaaatatca 15754883  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||    |||| ||||||| || |  |||||||||| |||||    
T  15754882 aacataag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagtcttactggaatattaacagcaagataaaca 15754784  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  15754783 acttagtt 15754776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 11996118 - 11995983
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||||||| |||||||   |||||| ||||    
T  11996118 tcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatattgaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatca 11996023  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996022 aac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 11995983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 28505389 - 28505254
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  || ||| ||| |||   |||||  ||||    
T  28505389 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcggatataaatcagcaa---ctcaattatca 28505294  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505293 aac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 28505254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3564455 - 3564363
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564455 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 3564363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 13647355 - 13647447
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13647355 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13647447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20220279 - 20220076
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||   ||||||||||    
T  20220279 tcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca---tctcaaacat 20220184  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||| ||||||||||| |||| || |    
T  20220183 catatataat-tcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactggaacaacaacagtaagataagc 20220085  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  20220084 aacttagtt 20220076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 2280210 - 2280117
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2280210 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 2280117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 12255884 - 12255733
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-t 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |    
T  12255884 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatctcaaacatt 12255785  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    || | || || ||| |||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  12255784 catatat-aattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacat 12255733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 48273421 - 48273511
Alignment:
Q  3 atgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48273421 atgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 48273511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 207
Target Start/End: Original strand, 16324175 - 16324239
Alignment:
Q  143 caacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16324175 caacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagatcaacaacttagtt 16324239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 38227511 - 38227599
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  38227511 tcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 38227599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 1868086 - 1867937
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||||||    
T  1868086 tcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaacaacatctcaaacat 1867989  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    || | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  1867988 catatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 1867937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 24275198 - 24275289
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24275198 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 24275289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 14044776 - 14044928
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagca--tgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaaca 97  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   ||||| |||   ||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||    
T  14044776 tcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaac-agctcctgatataacaatatcaa-tacaaatcaatcaacatctcaaaca 14044873  T
Q  98 tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 153  Q
    ||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14044874 tcatatataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacatta 14044928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 14354806 - 14354958
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagca--tgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaaca 97  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||   ||||| |||   ||||||||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||    
T  14354806 tcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagtacataaaac-agctcctgatataacaatatcaa-tacaaatcaatcaacatctcaaaca 14354903  T
Q  98 tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 153  Q
    ||| | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14354904 tcatatataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaaaaacatta 14354958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 12698861 - 12698951
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  12698861 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 12698951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 207
Target Start/End: Original strand, 15113028 - 15113177
Alignment:
Q  57 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagat 156  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   ||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  |  ||||| |  |    
T  15113028 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaatattcacatat-aactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaact 15113126  T
Q  157 tatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
     ||| || |||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  15113127 catataaatcagtcttactgaaacaataacagcaggataaacaacttagtt 15113177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16386339 - 16386249
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  16386339 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgtatttcatcaacatct 16386249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18456503 - 18456415
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18456503 tcatgcagcttagttaaataacgat-agcaacataggcagtatacaaaacaa-catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 18456415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 91
Target Start/End: Original strand, 26212034 - 26212115
Alignment:
Q  9 cttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  26212034 cttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 26212115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 456348 - 456439
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  456348 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 456439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11393422 - 11393331
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11393422 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 11393331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 11972523 - 11972614
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11972523 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 11972614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 14949257 - 14949166
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14949257 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 14949166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 15008590 - 15008441
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||  |||| |||  ||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||    
T  15008590 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatc-aatgcaaatcaacaacacctcaaacat 15008493  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    || | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  15008492 catatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacat 15008441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15376848 - 15376757
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15376848 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 15376757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 16232547 - 16232638
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16232547 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 16232638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 16410086 - 16410177
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16410086 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 16410177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 18640299 - 18640390
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18640299 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 18640390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20385258 - 20385167
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20385258 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 20385167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21189730 - 21189639
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21189730 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 21189639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 27216887 - 27216978
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27216887 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 27216978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 32125518 - 32125609
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32125518 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 32125609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 41522944 - 41523035
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41522944 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 41523035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 41525406 - 41525497
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41525406 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 41525497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19486835 - 19486686
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catc 99  Q
    ||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||  |||    
T  19486835 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 19486737  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    | | || || ||| || ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  19486736 acatat-aattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 19486686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 9509219 - 9509308
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  9509219 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 9509308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 10589069 - 10589158
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||| || || ||||||||||||    
T  10589069 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatcaattgcaattcaacaacatct 10589158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15144128 - 15144037
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  15144128 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatct-cagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaacatctcaa 15144037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 18430739 - 18430830
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18430739 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 18430830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 24702265 - 24702356
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24702265 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 24702356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 44116536 - 44116627
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  44116536 tcatgcagcttggttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 44116627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 9389675 - 9389615
Alignment:
Q  116 aatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||||||||    
T  9389675 aatgtatatacaattatataacattatcatcaatattagaatatacaatccaggcttactg 9389615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 10063909 - 10063816
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| || || |||||||||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||    
T  10063909 tcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaacatctcaaa 10063816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 207
Target Start/End: Original strand, 15116565 - 15116714
Alignment:
Q  57 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagat 156  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||   ||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||  || ||||| |  |    
T  15116565 gatataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaatattcacatat-aactcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaact 15116663  T
Q  157 tatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
     ||| |  |||| ||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||    
T  15116664 catatacatcagtcttactgaaacaataacagtaggataaacaacttagtt 15116714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 16213711 - 16213795
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 87  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  16213711 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatccaagtcaacaac 16213795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 17062050 - 17061919
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||  ||      
T  17062050 tcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatacaaaa-tagcatgacataataatatcaaatgcaagtcagcaacgtctcaattat-t 17061954  T
Q  101 aacata-aactcatgtaatgtatatacaattatat 134  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17061953 aacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 17061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 3386360 - 3386451
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| ||||| |||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3386360 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 3386451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 72
Target Start/End: Original strand, 40443424 - 40443490
Alignment:
Q  4 tgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  40443424 tgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 40443490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 27847921 - 27847881
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 41  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27847921 tcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagt 27847881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 14036284 - 14036384
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaaca 97  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||    
T  14036284 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaaca 14036381  T
Q  98 tca 100  Q
    |||    
T  14036382 tca 14036384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 14346314 - 14346414
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaaca 97  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   |||| |||  ||||||||||||||||| |||  || |||| ||||||||||||||    
T  14346314 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatc-aatacaaatcaatcaacatctcaaaca 14346411  T
Q  98 tca 100  Q
    |||    
T  14346412 tca 14346414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 13869373 - 13869453
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  13869373 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 13869453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 38898512 - 38898420
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  38898512 tcatgcagcttagttaaataac-aacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaa 38898420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 13831400 - 13831491
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||| || ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  13831400 tcatgcagcttagttaaataac-aacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13831491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 48991210 - 48991252
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 43  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  48991210 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtat 48991252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26356083 - 26356027
Alignment:
Q  38 cagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26356083 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 26356027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26358535 - 26358479
Alignment:
Q  38 cagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26358535 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 26358479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 67)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Original strand, 23019438 - 23019640
Alignment:
Q  3 atgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaa 102  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23019438 atgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaa 23019536  T
Q  103 cataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaact 202  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23019537 cataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacgacattagattatatagttcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaact 23019635  T
Q  203 tagtt 207  Q
    |||||    
T  23019636 tagtt 23019640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 19668401 - 19668606
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||    
T  19668401 tcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcacaa-cat 19668498  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || || |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19668499 catacgtaat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacactacatcatatacatcagacttactgaaacaacaacagcaagataaac 19668597  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  19668598 aacttagtt 19668606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 25644350 - 25644500
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-c 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  25644350 tcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatcaacatctcaaacattc 25644449  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    | | ||||  ||| ||||||  ||||||||||||| |||| || ||||||||    
T  25644450 atatataat-tcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacat 25644500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 19652225 - 19652427
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||     
T  19652225 tcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaacatc- 19652321  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19652322 aacataatc-catttaaagtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaataacagcaagataaacaa 19652420  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  19652421 cttagtt 19652427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 28496562 - 28496361
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||   |||||| ||||    
T  28496562 tcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatca 28496467  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||||    
T  28496466 aacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaa 28496368  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  28496367 cttagtt 28496361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 29808973 - 29808772
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||   |||||| ||||    
T  29808973 tcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaaatatca 29808878  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||||    
T  29808877 aacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaa 29808779  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  29808778 cttagtt 29808772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 9098605 - 9098465
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |  |||||||| || | ||||||    
T  9098605 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaacaacttcac-aacatc 9098507  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaa 142  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9098506 aaacat-aattcatgtaatgtatatataattatataacattaa 9098465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 1561333 - 1561535
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||   |||||| ||||    
T  1561333 tcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatca 1561428  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||| |||    |||| ||||||| || |  |||||||||| |||||    
T  1561429 aacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaaattcatatgcatcagtcttactggaatattaacagcaagataaaca 1561527  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  1561528 acttagtt 1561535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22080800 - 22080626
Alignment:
Q  30 aacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgta-agtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||||||||||   |||||  | || |||||||||||||     
T  22080800 aacataggcagtatgcaaaac-atcatgatataacaatatcgaatgcacag--aacaacatctcaaacatcgt-cataat-taatataatgtatatacat 22080706  T
Q  129 ttatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||    
T  22080705 ttatataacattaacaacatcattaggtcatatcaatttaggcttactgaaacaacaagagcaagataagcaacttagtt 22080626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 20109168 - 20109261
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20109168 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaa 20109261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 29060570 - 29060662
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060570 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 29060662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 16496274 - 16496363
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  16496274 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 16496363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 27333309 - 27333241
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27333309 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27333241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 27394049 - 27393981
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  27394049 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 27393981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 30676845 - 30676754
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  30676845 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 30676754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18409918 - 18409821
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 99  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18409918 tcatgcagctcagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaatcatc 18409821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 22782254 - 22782385
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||    
T  22782254 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 22782351  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 134  Q
    | |||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  22782352 acacat-aattcaagtaatgcatatacaattatat 22782385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 20593803 - 20593895
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20593803 tcatgcagctcagttaaataa-aaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 20593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 25629446 - 25629354
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |||| | ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25629446 tcatgcagcttagttaaattacaa-caggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 25629354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 23076760 - 23076966
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacc-agcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||  | |  ||||||| |||||||| ||  | ||||||||| || |||||||    
T  23076760 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaacaacttaaacatc 23076859  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    | | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  23076860 atatataat-tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagca 23076958  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    | ||||||    
T  23076959 aattagtt 23076966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 17287887 - 17287798
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  17287887 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 17287798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 20361051 - 20360962
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  20361051 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 20360962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27333238 - 27333172
Alignment:
Q  141 aacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  27333238 aacaacaacattggattatacaattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtt 27333172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27393978 - 27393912
Alignment:
Q  141 aacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  27393978 aacaacaacattggattatacaattcaggcttactgaaacagcaacatcaagataaacaatttagtt 27393912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 12742344 - 12742435
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12742344 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 12742435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18334727 - 18334636
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18334727 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 18334636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 19005073 - 19005164
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19005073 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19005164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19303631 - 19303540
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| ||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19303631 tcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacacaggaagtatacaaaacaa-catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 19303540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19859054 - 19858963
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19859054 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19858963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 24422574 - 24422665
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24422574 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 24422665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 25656656 - 25656747
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||| || ||| ||||||    
T  25656656 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagttaataacgtctcaa 25656747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 25688529 - 25688620
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  25688529 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtcaacaacgtctcaa 25688620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 33861821 - 33861912
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33861821 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 33861912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 33864305 - 33864396
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  33864305 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 33864396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 20076730 - 20076812
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 85  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  20076730 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaaca 20076812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 8227602 - 8227453
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catc 99  Q
    ||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||  |||    
T  8227602 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 8227504  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    | | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  8227503 acatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 8227453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 35008178 - 35008384
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacc-agcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||  | |  ||||||| |||||||| ||  | |||| |||| || |||||||    
T  35008178 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaaaaacaacttaaacatc 35008277  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    | | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||| ||||| |||| || ||    
T  35008278 atatataat-tcatgtaatgaatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaataacagtaagataagca 35008376  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  35008377 acttagtt 35008384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 1541046 - 1540955
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1541046 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 1540955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 1595576 - 1595667
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  1595576 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacgtctcaa 1595667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 2291315 - 2291224
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2291315 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 2291224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 8055056 - 8055147
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8055056 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaaa-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 8055147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 18456746 - 18456837
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18456746 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 18456837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 18461906 - 18461997
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18461906 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 18461997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20557027 - 20556936
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20557027 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 20556936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 25754836 - 25754927
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  25754836 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaa 25754927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26924775 - 26924684
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26924775 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 26924684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 34963400 - 34963491
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34963400 tcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 34963491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 20638374 - 20638304
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  20638374 tcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 20638304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 4185912 - 4185839
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 75  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  4185912 tcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatg 4185839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 16448662 - 16448582
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  16448662 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 16448582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 16920721 - 16920679
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16920721 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtat 16920679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22780318 - 22780229
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||| |||| ||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  22780318 tcatgcagcttagttaaataac-aacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 22780229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 22831533 - 22831571
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831533 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggca 22831571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28103877 - 28103799
Alignment:
Q  115 taatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 193  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28103877 taatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaaga 28103799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 153
Target Start/End: Original strand, 18696570 - 18696667
Alignment:
Q  54 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 153  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||| ||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||||    
T  18696570 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctccaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatta 18696667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 151
Target Start/End: Original strand, 18706356 - 18706483
Alignment:
Q  23 aaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgt 120  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||| |||||||| | || || ||||||||||     
T  18706356 aaacagcaacataggcaatatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatcttaaacatcatatat-aattcatgtaatgc 18706452  T
Q  121 atatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  18706453 atatacatttatatgacattattaacaacat 18706483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 35245616 - 35245658
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 43  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  35245616 tcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtat 35245658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 18821935 - 18821866
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||  |||||||||||||    
T  18821935 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa 18821866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 22949384 - 22949466
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22949384 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22949466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 22953340 - 22953422
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22953340 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22953422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 23871828 - 23871910
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  23871828 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 23871910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 23875784 - 23875866
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  23875784 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 23875866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 27325470 - 27325388
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || | ||| ||| |||||| |||||||||||||||    
T  27325470 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattaatgcaatatatatataattatataacatta 27325388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 4186397 - 4186470
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 75  Q
    ||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  4186397 tcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatg 4186470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3852152 - 3852061
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |   ||||| ||||| |||||||| || | ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  3852152 tcatgcagcttagtttaataacaa-cagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 3852061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 162 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 9098457 - 9098412
Alignment:
Q  162 aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||    
T  9098457 aattcaggcttactgaaacaataactgcaagataaacaaattagtt 9098412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 34
Target Start/End: Original strand, 11185535 - 11185568
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacat 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185535 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacat 11185568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 68)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38855342 - 38855136
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  38855342 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 38855244  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38855243 a-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 38855146  T
Q  201 cttagttcct 210  Q
    ||||||||||    
T  38855145 cttagttcct 38855136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 6520398 - 6520601
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  6520398 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatca 6520496  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  6520497 a-cataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaataa 6520594  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  6520595 cttagtt 6520601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 21285627 - 21285831
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  21285627 tcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 21285725  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |    
T  21285726 aacatagt-tcatgtaatgtatatacaattatatatcattaacaacaatattagattatataattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaagca 21285824  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  21285825 cttagtt 21285831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 23760935 - 23760751
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||  |||  || |||||||||||||||| |||     
T  23760935 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg-taaatcatcatgatataacaatattgaattcaaatcaacaacatctcaaatatc- 23760838  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaaca 187  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||    
T  23760837 aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatatttattcaggcttactgaaacaacaaca 23760751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 983497 - 983289
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| |||    
T  983497 tcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaa-caagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaacaacatcacaa-cat 983400  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaa---gaca 195  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||  || ||| ||||||| |||||||||||||||||| |||   || |    
T  983399 caaacataat-tcatgtaatgtatatacagctatataacattatcaacaacattcaatcatataattcagacttactgaaacaacaacaacaacatgata 983301  T
Q  196 aacaacttagtt 207  Q
    ||||||||||||    
T  983300 aacaacttagtt 983289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 21673734 - 21673937
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  21673734 tcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 21673832  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    |  ||||  | || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  21673833 at-ataattt-atttaatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaagcttactgaaacaacaacaacaaga-taaca 21673929  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  21673930 acttagtt 21673937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 37116377 - 37116583
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  37116377 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 37116475  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  37116476 catatataat-tcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagc 37116574  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  37116575 aacttagtt 37116583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 20498592 - 20498797
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-c 99  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  20498592 tcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattc 20498690  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    | | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  20498691 atatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtcttaccgaaacatcaacatcaagataaaca 20498789  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  20498790 acttagtt 20498797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5866365 - 5866164
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  ||||    
T  5866365 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatca 5866270  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||||    
T  5866269 aacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaa 5866171  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  5866170 cttagtt 5866164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17267085 - 17266879
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   |||||    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17267085 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 17266986  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    | | ||||  || ||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||    
T  17266985 atatataat-tcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggctcactgaaacaacaacagtaagataagca 17266887  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  17266886 acttagtt 17266879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 21491025 - 21491226
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||| ||||||||   ||||  ||||    
T  21491025 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatattgaatgtaaatcaacaac---tcaattatca 21491120  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||||    
T  21491121 aacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataggcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaa 21491219  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  21491220 cttagtt 21491226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 17140946 - 17141147
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||    
T  17140946 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaat-ccatcatgacataataatatcgaatgtaaatcatcaac---tcaattatca 17141041  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||||    
T  17141042 aacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaa 17141140  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  17141141 cttagtt 17141147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Original strand, 22364745 - 22364896
Alignment:
Q  54 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 153  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| || |||  |||||||| |    
T  22364745 catgatataacaatatcaaa-gaaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcactttattaacaacatca 22364842  T
Q  154 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
     || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  22364843 aatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtt 22364896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 24353050 - 24353235
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  24353050 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaacat 24353147  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaaca 187  Q
    |  | | ||  |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24353148 cgtatacaat-tcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaaca 24353235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 16092433 - 16092340
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16092433 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 16092340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26355789 - 26355643
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  ||||     
T  26355789 tcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcacgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcagccatc- 26355693  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26355692 aacatattc-catttaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 26355643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17439598 - 17439458
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17439598 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 17439500  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    || | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17439499 catatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacatta 17439458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 18818500 - 18818411
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  18818500 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaagtcaacatcatct 18818411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 28649135 - 28649046
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28649135 tcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 28649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 7372808 - 7372897
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  7372808 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 7372897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21919091 - 21919002
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  21919091 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 21919002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 17612201 - 17612062
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catc 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||  |||    
T  17612201 tcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 17612103  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    | | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17612102 acatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacatta 17612062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13508176 - 13508027
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tc 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||||||||| | ||    
T  13508176 tcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattc 13508078  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    | | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13508077 acatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13508027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 21249414 - 21249550
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||    
T  21249414 tcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattc-atcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatc 21249509  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249510 aaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21249550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 21255252 - 21255388
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaac-agcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||  | | |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||    
T  21255252 tcatgcagcttagttaaataaaaaaatagcaacataagcagtatgcaattc-atcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatc 21255347  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255348 aaacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 21255388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 14409579 - 14409488
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14409579 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 14409488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15203366 - 15203275
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15203366 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaacgtctcaa 15203275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16413451 - 16413360
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16413451 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 16413360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 6759288 - 6759371
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  6759288 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 6759371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 23406409 - 23406492
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaaca 85  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || |||||||||    
T  23406409 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 23406492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 13597708 - 13597559
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tc 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| ||||||||| |||| | ||    
T  13597708 tcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatcccaaatattc 13597610  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    | | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  13597609 acatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 13597559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 20536238 - 20536327
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  20536238 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 20536327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21924019 - 21923930
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||| || | |||||||| || |||||||||||||||    
T  21924019 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaattgcaagtcaacaacatct 21923930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 22626766 - 22626854
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  22626766 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatacaaatcaacaacatct 22626854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 22875095 - 22875187
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22875095 tcatgcagcttagttaaatagcag-cagcaacacaggcagtatacaaaacaa-catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22875187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 1484429 - 1484520
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1484429 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 1484520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 5853427 - 5853336
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  5853427 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 5853336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 20403254 - 20403345
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20403254 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 20403345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 22001780 - 22001871
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22001780 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 22001871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20046330 - 20046239
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20046330 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 20046239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 41598215 - 41598306
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41598215 tcatgcagcttagttgaataacaa-cagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 41598306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 16199735 - 16199666
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  || ||||| |||| ||||||||    
T  16199735 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa--caacatgacataataatatcaa 16199666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21396071 - 21395984
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||||||  || ||| ||||||||    
T  21396071 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21395984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21790564 - 21790477
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||||||  || ||| ||||||||    
T  21790564 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa---cagcatgagataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21790477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 31971287 - 31971356
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  31971287 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaa 31971356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 26219744 - 26219835
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| |||||  || |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26219744 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacag-cagtatacaaaat-agtatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 26219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 40492890 - 40492844
Alignment:
Q  54 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40492890 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatca 40492844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 4483308 - 4483398
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4483308 tcatgcagcttagttaa-taacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 4483398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 4542508 - 4542417
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |   || || ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4542508 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaacaag-atacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 4542417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 18879322 - 18879275
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa 49  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  18879322 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 18879275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21389541 - 21389454
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  |||||||||  || ||| ||||||||    
T  21389541 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21389454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21778867 - 21778780
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||   |||||||| ||||  |||||||||  || ||| ||||||||    
T  21778867 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatct 21778780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 26223947 - 26224037
Alignment:
Q  2 catgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| | || || ||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26223947 catgcagcttaattaaataacaa-cagcaataaag-caatatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 26224037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 45131087 - 45131019
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  45131087 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 45131019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 15070585 - 15070665
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15070585 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15070665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 19154978 - 19154936
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 43  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19154978 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat 19154936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 45290830 - 45290754
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaag 79  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  45290830 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaag 45290754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 14823800 - 14823891
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14823800 tcatgcagcaaagttaaataacaa-caacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 14823891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19801516 - 19801426
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  19801516 tcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacacaa-cagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtctcaa 19801426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18862512 - 18862430
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  18862512 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 18862430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 21383896 - 21383978
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21383896 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaaatatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21383978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 21387316 - 21387398
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21387316 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21387398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 21411189 - 21411271
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21411189 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21411271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 21805681 - 21805763
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21805681 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21805763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21827881 - 21827799
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21827881 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 21827799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 19896292 - 19896386
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatga---tataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  | |||| ||||| ||||||||    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19896292 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19896386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 19937141 - 19937061
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||| |||||||    
T  19937141 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataagatcaaatgcaagtcaa 19937061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14103260 - 14103165
Alignment:
Q  57 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 153  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  14103260 gatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacatta 14103165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 10557 - 10761
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||     
T  10557 tcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaacatcg 10655  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10656 aacataat-tcatgtaatgtatatacaattatatgacattaacaacaacattagattatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaa 10754  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  10755 cttagtt 10761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 32566 - 32769
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  32566 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacatca 32663  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  32664 aacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaaaaacattagattatataattcaggcttactgaaacaataacaacaagataaacaa 32762  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  32763 cttagtt 32769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21329588 - 21329384
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||  |||||| |||||||  ||||||||    
T  21329588 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-atcataatataacaatatcgaattcaagtcatcaacatcataaacatca 21329490  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21329489 aacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaa 21329391  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  21329390 cttagtt 21329384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26012126 - 26011922
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26012126 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaagcaa-catgatataacaatatcaaatgtgaatcaacaacatctcaaacatca 26012028  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  26012027 aacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatcagattatatagttcaggcttactgaaacaacaataacaagataaacaa 26011929  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  26011928 cttagtt 26011922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21502247 - 21502042
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||| ||||||||    
T  21502247 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaatc-agcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcatcatcttaaacatca 21502149  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21502148 aacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaaca 21502050  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  21502049 acttagtt 21502042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20027032 - 20026827
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| |||    
T  20027032 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaac-agttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaacatcacaa-cat 20026935  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  20026934 caaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatatagcattatcaacaacattaaaacatataattcaggcttactgaaacaactacaacaagataaac 20026836  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  20026835 aacttagtt 20026827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 21565572 - 21565776
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||| ||||    
T  21565572 tcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatttcaaatatca 21565670  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  21565671 aacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactagaacaacaacaacaagataaacaa 21565769  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  21565770 cttagtt 21565776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22959623 - 22959489
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||| || |||||||   |||||| ||||    
T  22959623 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatca 22959528  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatt 140  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959527 aacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatt 22959489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22178312 - 22178106
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22178312 tcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 22178214  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||   || ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||| || |    
T  22178213 catatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatccaatcatataatttaggtttactgaaacaacaacagtaagataagc 22178115  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  22178114 aacttagtt 22178106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19660926 - 19660725
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||   ||||  ||||    
T  19660926 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcttgatataatgatatcgaatataaatcaacaac---tcaattatca 19660831  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||||    
T  19660830 aacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagtcttactggaacattaacagcaaggtaaacaa 19660732  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  19660731 cttagtt 19660725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 22144079 - 22144217
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-c 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |    
T  22144079 tcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacatctcaaacattc 22144177  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatt 140  Q
    | | ||||  ||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  22144178 atatataat-tcaagtaatgcatatacaattatatcacatt 22144217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 151
Target Start/End: Original strand, 19668931 - 19669073
Alignment:
Q  4 tgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaac 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || | ||||||||||||||| |||| || |||||||   |||||| |||||||    
T  19668931 tgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcgtgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatcaaac 19669026  T
Q  104 ataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    || || || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  19669027 at-aagtcctgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat 19669073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 9077983 - 9078074
Alignment:
Q  2 catgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  9077983 catgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacatctcaa 9078074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21729155 - 21729066
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  21729155 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 21729066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 21808480 - 21808391
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  21808480 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 21808391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 24529250 - 24529339
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  24529250 tcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaatgcaagtcaacaacatct 24529339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 25431424 - 25431513
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  25431424 tcatgcatcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 25431513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 36314607 - 36314675
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  36314607 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 1096497 - 1096588
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctca 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| || ||| | |||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  1096497 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 1096588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21997625 - 21997547
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagt 80  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  21997625 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 128
Target Start/End: Original strand, 29448055 - 29448159
Alignment:
Q  24 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgta 121  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || | || |||||||||| |    
T  29448055 aacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatacgt-aattcatgtaatgca 29448152  T
Q  122 tatacaa 128  Q
    |||||||    
T  29448153 tatacaa 29448159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 22412214 - 22412306
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22412214 tcatgtagcttagttaaataacgataa-caacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22412306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 24493599 - 24493687
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24493599 tcatgcagcttggttaagtaacaat-agcaacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 24493687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 25421562 - 25421651
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  25421562 tcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacagcatct 25421651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 264903 - 264812
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  264903 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 264812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 10733075 - 10732984
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10733075 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 10732984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20902144 - 20902053
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  20902144 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacgtctcaa 20902053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 20909039 - 20909130
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20909039 tcatgcagcttagttaaataacaaa-agcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 20909130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 39363411 - 39363502
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39363411 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 39363502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 8286934 - 8286844
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  8286934 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 8286844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 13025341 - 13025429
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  13025341 tcatgcagcatagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaac-agcatgacatattgatatcaaatgcaagtcaacaacatct 13025429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 13095525 - 13095613
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||   |||||||||| |||||||||||||||    
T  13095525 tcatgcagcatagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaac-agcatgacatattgatatcaaatgcaagtcaacaacatct 13095613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 22075049 - 22075138
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  22075049 tcattcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 22075138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23390587 - 23390498
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  23390587 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 23390498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 29329961 - 29330052
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29329961 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 29330052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 42245500 - 42245409
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  42245500 tcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 42245409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 36154915 - 36154827
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  36154915 tcatgcagcttagttaaataacaa----caacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 36154827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 37723933 - 37724023
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |  |||||||||  || ||| |||||||||||    
T  37723933 tcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattaaattcatcaacatctcaa 37724023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 40725883 - 40726032
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catc 99  Q
    ||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||  |||    
T  40725883 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgc-aaagcatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 40725981  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    | | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  40725982 acatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 40726032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 18319169 - 18319089
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  18319169 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 18319089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 39245163 - 39245243
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  39245163 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 39245243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 2154749 - 2154658
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  2154749 tcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagtcaacaacgtctcaa 2154658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11581334 - 11581243
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  11581334 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaataacgtctcaa 11581243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 29346007 - 29346098
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29346007 tcatacagcttagttaaataacaa-cagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 29346098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 10775811 - 10775731
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||| || ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  10775811 tcatgcagcttagttaaataacga-cagcgacacag-cagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 10775731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766118
Alignment:
Q  38 cagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20766174 cagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 20766118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Complemental strand, 21293060 - 21293020
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 42  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21293060 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 21293020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21741545 - 21741486
Alignment:
Q  80 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21741545 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacatta 21741486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 29348480 - 29348571
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29348480 tcatacagcttagttaaataagaa-cagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 29348571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 29350953 - 29351044
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29350953 tcatacagcttagttaaataagaa-cagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 29351044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 10753603 - 10753685
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  10753603 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 10753685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21871607 - 21871525
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21871607 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacat-aattcatgcaatatatatcgaattatataacatta 21871525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21875887 - 21875805
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  21875887 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaagcatcaaacat-aattcatgcaatatatatcgaattatataacatta 21875805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22120231 - 22120149
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  22120231 atataacaattacaaatgaacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 22120149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 141
Target Start/End: Original strand, 36314685 - 36314716
Alignment:
Q  110 tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314685 tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 36314716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 31061095 - 31061175
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  31061095 tcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaaaacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 31061175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 94
Target Start/End: Original strand, 32027428 - 32027511
Alignment:
Q  9 cttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  32027428 cttagttaaataacaa-caacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatccaagtcaacaacgtctcaa 32027511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 91
Target Start/End: Original strand, 18356367 - 18356432
Alignment:
Q  24 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||||    
T  18356367 aacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatct 18356432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 6e-73; HSPs: 80)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 15470954 - 15471157
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15470954 tcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaacatca 15471052  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15471053 aacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaac-ttagatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaacaa 15471150  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  15471151 cttagtt 15471157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 14234517 - 14234723
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  14234517 tcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatca 14234615  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactga--aacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||     
T  14234616 aacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattaaacaattcaggcttactgaacaacaacaacaacaagataaat 14234714  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  14234715 aacttagtt 14234723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 16097358 - 16097562
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  16097358 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatca 16097456  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16097457 aacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaa 16097555  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  16097556 cttagtt 16097562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12174350 - 12174152
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| ||   ||||||| |||||| ||||    
T  12174350 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa---aacaacaactcaaatatca 12174255  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||    |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  12174254 aacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatt-gattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagcaagctaaaca 12174157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 16103810 - 16104013
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  16103810 tcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaaatatca 16103907  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| |  | |||    | || ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16103908 aacat-aattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaattcatatggattagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaa 16104006  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  16104007 cttagtt 16104013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37251259 - 37251054
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  37251259 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa-cat 37251162  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  37251161 cataaataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcagacttactggaacaacaacagtaagataaac 37251063  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  37251062 aacttagtt 37251054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13210418 - 13210283
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||   || ||| ||||    
T  13210418 tcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaa---cttaaatatca 13210323  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210322 aacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 13210283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22110443 - 22110238
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |||    
T  22110443 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagcatctcaa-cat 22110346  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | | ||  ||||||||||  |||||| |||||| ||||||  |||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  22110345 catatagaat-tcatgtaatgcgtatacatttatatcacattattaacaacttcaaatcatacaattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagc 22110247  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  22110246 aacttagtt 22110238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 52523820 - 52523669
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  52523820 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 52523722  T
Q  99 -caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
     || | ||||  ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52523721 tcatatataat-tcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52523669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 42386440 - 42386533
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42386440 tcatgcagtttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 42386533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 32307707 - 32307830
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||  |||     
T  32307707 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaacaacatctcaattatc- 32307803  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaa 128  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  32307804 aacataatc-catttaatgtatatacaa 32307830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 18438564 - 18438653
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18438564 tcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 18438653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 12399239 - 12399328
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  12399239 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacatct 12399328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 27165277 - 27165370
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  27165277 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaa-caacatgatataccaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaa 27165370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 14972884 - 14972975
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctca 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14972884 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctca 14972975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 43925988 - 43926121
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| |||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43925988 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 43926086  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 134  Q
    || | |  || |||||||||| ||||||| ||||||    
T  43926087 catata-caattcatgtaatgcatatacatttatat 43926121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 49668167 - 49668094
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  49668167 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 49668094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 53301634 - 53301562
Alignment:
Q  9 cttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtca 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53301634 cttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtca 53301562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24340814 - 24340665
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tc 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| || || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||||||||| | ||    
T  24340814 tcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattc 24340716  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    | | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  24340715 acatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 24340665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 9512950 - 9513023
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 75  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  9512950 tcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9513023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 9520925 - 9520998
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 75  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  9520925 tcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 9520998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23083452 - 23083363
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  23083452 tcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 23083363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 23274717 - 23274810
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| ||||||||||||||    
T  23274717 tcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaa 23274810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 26686917 - 26687006
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  26686917 tcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 26687006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 43550614 - 43550482
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tc 99  Q
    |||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||    
T  43550614 tcatgcagcttagttaaataatga-cagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattc 43550516  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatat 134  Q
    | | || || ||| |||||||||||||||||||||    
T  43550515 acatat-aattcaagtaatgtatatacaattatat 43550482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 25476476 - 25476384
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25476476 tcatgtagcttagttaaaaaacaa-cagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 25476384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 29172718 - 29172627
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29172718 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 29172627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 1465423 - 1465329
Alignment:
Q  80 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactg 176  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  1465423 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatgtaatgtatatacaattgtataacattatcatcaacattagaataaacaatccaggcttactg 1465329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 11424850 - 11424781
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  11424850 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataacaatatcaa 11424781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 37642356 - 37642207
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catc 99  Q
    ||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||  |||    
T  37642356 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 37642258  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    | | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  37642257 acatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 37642207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 2051260 - 2051141
Alignment:
Q  33 ataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatatacaat 129  Q
    |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||||    
T  2051260 ataggcagtatgcaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatatacaat 2051163  T
Q  130 tatataacattaacaacaacat 151  Q
    ||||| ||||||  ||||||||    
T  2051162 tatatcacattataaacaacat 2051141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 14572619 - 14572707
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||||||    
T  14572619 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatagacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgagagtcaacaacatct 14572707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 20698526 - 20698437
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  20698526 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaattgcaattcatcaacatct 20698437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 24153299 - 24153211
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24153299 tcatgcagcttagttaaataacgat-agcaacataggtagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 24153211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 36166625 - 36166716
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36166625 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacag-cagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 36166716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 43840962 - 43841051
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  43840962 tcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 43841051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 81 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 49389642 - 49389517
Alignment:
Q  81 caacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaac 180  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||    
T  49389642 caacaacatctcaactatcaaacataat-tcatttaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaac 49389544  T
Q  181 aacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||    
T  49389543 aacaacaacaagataaacaacttagtt 49389517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 6469269 - 6469178
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6469269 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 6469178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 8899121 - 8899212
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  8899121 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 8899212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 9707742 - 9707651
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  9707742 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatacaagtcaacaacgtctcaa 9707651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17446790 - 17446699
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17446790 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 17446699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 17463205 - 17463296
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17463205 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 17463296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 17672653 - 17672744
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  17672653 tcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaa 17672744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 28848746 - 28848655
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  28848746 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 28848655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 34159353 - 34159444
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34159353 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 34159444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 38962026 - 38961935
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  38962026 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 38961935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 45607042 - 45606951
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  45607042 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 45606951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 55476518 - 55476609
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  55476518 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 55476609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 55500969 - 55501055
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  55500969 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 13442304 - 13442393
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  13442304 tcatgcagcttagttaaataacaa-cggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 13442393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 17487886 - 17487975
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  17487886 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 17487975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 17499368 - 17499457
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  17499368 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 17499457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 21618476 - 21618567
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21618476 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacaa-cagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 21618567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7781482 - 7781391
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  7781482 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaa 7781391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 12567587 - 12567678
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12567587 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 12567678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 13544052 - 13544143
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13544052 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13544143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16454416 - 16454325
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16454416 tcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 16454325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 53070788 - 53070697
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| || || || |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  53070788 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataa-cagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 53070697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22147616 - 22147467
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catc 99  Q
    ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||  |||    
T  22147616 tcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaac-atcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 22147518  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    | | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  22147517 acatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 13151926 - 13151834
Alignment:
Q  1 tcatgcagctt-agttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13151926 tcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13151834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 13154391 - 13154299
Alignment:
Q  1 tcatgcagctt-agttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13154391 tcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13154299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 10247858 - 10247767
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10247858 tcatacagcttagttaaataacaa-cagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 10247767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 12377951 - 12378050
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||||  |||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||    
T  12377951 tcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaat-agctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacaacttaaacat 12378049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 15977542 - 15977633
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15977542 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaat-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 15977633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16282946 - 16282855
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||    
T  16282946 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgcaagtcaacaacgtctcaa 16282855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 40213811 - 40213720
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||||| || |||||| || || || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40213811 tcatgtagcttagttaaataacaa-catcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 40213720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 50242849 - 50242940
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  50242849 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaa 50242940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 41123917 - 41124005
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||    ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  41123917 tcatgcagcttagttaaataacaa----caacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 41124005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 131 - 207
Target Start/End: Original strand, 43927291 - 43927367
Alignment:
Q  131 atataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
    |||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  43927291 atatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtt 43927367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Original strand, 28194720 - 28194755
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28194720 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 606417 - 606324
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgca-aaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  || ||| |||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  606417 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagca--cataaatcagttcatgatataacaatatc-aatgcaattcaacaacatctcaa 606324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 12119860 - 12119780
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  12119860 tcatgcagctttgttaaataacaa-cagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 12119780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 14576915 - 14576835
Alignment:
Q  9 cttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  | ||| ||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  14576915 cttagttaaataacaa-cagcaacatagacagtataaacaac-agcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 14576835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 15412456 - 15412536
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15412456 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15412536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 1644757 - 1644642
Alignment:
Q  8 gcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataa 107  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||  || ||||||| |||||||  ||| |||||||    
T  1644757 gcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatgc-aaatcatcattatataacaatatcgaatacaa-tcaacaatatctcaattatc-aacataa 1644662  T
Q  108 actcatgtaatgtatatacaa 128  Q
     | ||| ||||||||||||||    
T  1644661 tc-catttaatgtatatacaa 1644642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 14501207 - 14501290
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||| |||||  ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||    
T  14501207 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaatcataatttcatgcaacatatatccaattatataacatta 14501290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 19776007 - 19776089
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  19776007 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 19776089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 37439503 - 37439421
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  37439503 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 37439421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 8499545 - 8499625
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  8499545 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 44494836 - 44494908
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 75  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| |||||| | |||| |||||||||||    
T  44494836 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatg 44494908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6214 - 6010
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||    
T  6214 tcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcattaacatcataaacatca 6116  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||    
T  6115 aacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaataacagcaagataaataa 6017  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  6016 cttagtt 6010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 134; Significance: 6e-70; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12288301 - 12288096
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||    
T  12288301 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatcacaa-cat 12288204  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12288203 caaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaccaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaac 12288105  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  12288104 aacttagtt 12288096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 39706379 - 39706173
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||  ||||||||    
T  39706379 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatgaacatcataaacatca 39706281  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  39706280 a-cataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatcatataattcaggcttactaaaacaacaacagcaagataaacaa 39706183  T
Q  201 cttagttcct 210  Q
    |||| |||||    
T  39706182 cttaattcct 39706173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13942 - 13737
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tc 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  13942 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattc 13844  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    | | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||||| |||| |||||  |||| |||||    
T  13843 atatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacataaagataaaca 13745  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  13744 acttagtt 13737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 53082243 - 53082038
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  53082243 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacat 53082146  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  53082145 catatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagc 53082047  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  53082046 aacttagtt 53082038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 52243287 - 52243136
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  52243287 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatc-agttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaacaacatctcaaacat 52243189  T
Q  99 -caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
     || | |||| | || |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  52243188 tcatatataatc-caagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 52243136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 15551847 - 15551982
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||   ||||  ||||    
T  15551847 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaat-ccatcatgatataataatatcgaaggtaaatcaacaac---tcaattatca 15551942  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551943 aacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 15551982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46640547 - 46640342
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||    
T  46640547 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataacatctcaa-cat 46640450  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| |||| |  |||||||| | || ||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||| || |    
T  46640449 catatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaatcatataattcaggtttactgaaacaataacagtaagataagc 46640351  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  46640350 aacttagtt 46640342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 207
Target Start/End: Original strand, 16596686 - 16596879
Alignment:
Q  9 cttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||     
T  16596686 cttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcatcaac---tcaattatcaaacttaag 16596781  T
Q  109 ctcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||    |||| ||||||  ||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  16596782 -tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaatttataagcatcagtcttacttgaacattaacagcaaggtaaacaacttagtt 16596879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 43198646 - 43198495
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-t 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| | |    
T  43198646 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaatatt 43198547  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    || | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  43198546 catatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacat 43198495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 12774037 - 12774160
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||  || |||||||||||||||  |||     
T  12774037 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatacaa-tcaacaacatctcaattatc- 12774133  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaa 128  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  12774134 aacataatc-catttaatgtatatacaa 12774160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Original strand, 8846461 - 8846606
Alignment:
Q  61 taacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata 160  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    
T  8846461 taacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcata 8846559  T
Q  161 caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
        |||| ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  8846560 tgcatcagtcttactggaacaacaactacaagataaacaacttagtt 8846606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16377612 - 16377522
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16377612 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 16377522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Original strand, 15099457 - 15099582
Alignment:
Q  80 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  15099457 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 15099554  T
Q  180 caacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||    
T  15099555 tgacaacatcaaggtaaataacttagtt 15099582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Original strand, 15190424 - 15190549
Alignment:
Q  80 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  15190424 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 15190521  T
Q  180 caacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||    
T  15190522 tgacaacatcaaggtaaataacttagtt 15190549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 7798804 - 7798893
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||    
T  7798804 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcatcaacatct 7798893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 12902787 - 12902876
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  12902787 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgtaattcatcaacatct 12902876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 52873458 - 52873369
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  52873458 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 52873369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 54798845 - 54798752
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54798845 tcatgcagcttagttgaataacaa-cagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 54798752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 7088907 - 7088996
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  7088907 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 7088996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 7893733 - 7893822
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  7893733 tcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 7893822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 14280343 - 14280435
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14280343 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacac-ggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 14280435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23374450 - 23374361
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| || || ||||||||||||    
T  23374450 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatct 23374361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 14038678 - 14038770
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14038678 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 14038770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18215409 - 18215318
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18215409 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 18215318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 44929015 - 44928923
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  44929015 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaatgcaagtcaataacatctcaa 44928923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16270326 - 16270238
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16270326 tcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatct 16270238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 12442 - 12351
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12442 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 12351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15118487 - 15118396
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15118487 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 15118396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19618307 - 19618216
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19618307 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19618216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 44773222 - 44773131
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  44773222 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 44773131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 52312537 - 52312628
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  52312537 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 52312628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 3096323 - 3096385
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataac 64  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  3096323 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatgtaac 3096385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 6190492 - 6190563
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 72  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6190492 tcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 6190563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 48
Target Start/End: Original strand, 8846391 - 8846433
Alignment:
Q  6 cagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 48  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8846391 cagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 8846433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16240060 - 16239972
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||| |||| |||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16240060 tcatgcaacttaattaaataacaat-agcaaaataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 16239972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 44052859 - 44052948
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  44052859 tcatgcagctcagttaaataacaa-catcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 44052948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 1837644 - 1837553
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  1837644 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 1837553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 3515034 - 3515125
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3515034 tcatgcagcttagttaaaaaacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 3515125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 14970842 - 14970751
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | || || ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14970842 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 14970751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18239554 - 18239463
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18239554 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 18239463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 19242726 - 19242817
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19242726 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 19242817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 44615315 - 44615406
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  44615315 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 44615406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 50222474 - 50222383
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  || ||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  50222474 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 50222383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 51464003 - 51463912
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  51464003 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaa 51463912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 6899921 - 6900009
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6899921 tcatgcatcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaacaa-catagcataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 6900009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8574958 - 8574867
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| |||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8574958 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacaa-cagtatacaaaacaa-catgacataataatatcaaatgtaattcaacaacatctcaaa 8574867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 15355460 - 15355380
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15355460 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15355380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15464972 - 15464926
Alignment:
Q  52 agcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15464972 agcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 15464926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 17046517 - 17046559
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17046517 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat 17046559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 22636465 - 22636554
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  22636465 tcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 22636554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 23803400 - 23803316
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaac 87  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||    
T  23803400 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaac 23803316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 163 - 209
Target Start/End: Original strand, 14164739 - 14164785
Alignment:
Q  163 attcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttcc 209  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14164739 attcaggcttactagaacaacaacagcaagataaacaacttagttcc 14164785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 15367720 - 15367800
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15367720 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15367800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 15370048 - 15370128
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15370048 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15370128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 15371232 - 15371312
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15371232 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15371312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 15373513 - 15373593
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15373513 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 15402733 - 15402813
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  15402733 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15402813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14053392 - 14053323
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 72  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||    
T  14053392 tcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaa 14053323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 630810 - 630728
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  630810 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aatgcatgcaatatatatccaattatataacatta 630728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 3331970 - 3332052
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  3331970 atataacaattacaaatgcatgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 3332052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 13812845 - 13812763
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  13812845 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 13812763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14953997 - 14953915
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  14953997 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 14953915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 25690146 - 25690228
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  25690146 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 25690228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 207
Target Start/End: Original strand, 12774189 - 12774231
Alignment:
Q  165 tcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12774189 tcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 12774231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 209
Target Start/End: Original strand, 14158034 - 14158080
Alignment:
Q  163 attcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttcc 209  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14158034 attcaggcttactagaacaacaacagcaagataaaaaacttagttcc 14158080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 16223562 - 16223642
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||||    
T  16223562 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatctaatgcaagtcaa 16223642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21815717 - 21815629
Alignment:
Q  4 tgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |  | |||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  21815717 tgcagcttagttaaataacga-cagcaacacaa-ctgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 21815629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 133; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 51 - 211
Target Start/End: Original strand, 8094 - 8253
Alignment:
Q  51 cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8094 cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 8192  T
Q  151 ttagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagttcctt 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8193 ttagattatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaggataaacaacttagttcctt 8253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 6842 - 7043
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  |||| || |||||||   |||||| ||||    
T  6842 tcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaacaa---ctcaaatatca 6937  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  | |||    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  6938 aacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacattaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaa 7036  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  7037 cttagtt 7043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 131; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 12969 - 13173
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  12969 tcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-agcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatca 13067  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  13068 aacataat-tcgtgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagattatccaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaataa 13166  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  13167 cttagtt 13173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18276 - 18124
Alignment:
Q  54 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 153  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  18276 catgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatca 18178  T
Q  154 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
     |  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||    
T  18177 aaacatataattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagcaacttagtt 18124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 128; Significance: 2e-66; HSPs: 50)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22921960 - 22921756
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||     
T  22921960 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc- 22921863  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22921862 aaca-aaattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaaca 22921764  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  22921763 acttagtt 22921756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21861661 - 21861456
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-c 99  Q
    ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  21861661 tcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattc 21861563  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    | | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  21861562 atatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcatatcataatattcaggcttactgaaacaacaatagcaagataaaca 21861464  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  21861463 acttagtt 21861456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21896347 - 21896145
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-c 99  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  21896347 tcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattc 21896249  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    | | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||  |||||||||||||||||||||||   ||||| |||||    
T  21896248 atatataat-tcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataatattcaggcttactgaaacaacaa---caagataaaca 21896153  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  21896152 acttagtt 21896145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 33681037 - 33681241
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||| ||||    
T  33681037 tcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcgtcaacatctcaaatatca 33681135  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  33681136 aacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactagaacaacaacaacaagataaacaa 33681234  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  33681235 cttagtt 33681241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 22237657 - 22237805
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  22237657 tcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatca 22237755  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  22237756 aacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacat 22237805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 50614208 - 50614002
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  50614208 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 50614110  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    |    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||  |||||| | |||||||||    
T  50614109 cttttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacggtaagacaaac 50614011  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  50614010 aacttagtt 50614002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 50622036 - 50621830
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  50622036 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 50621938  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    |    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| | || ||| |||||||||||||||||  |||||| | |||||||||    
T  50621937 cttttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaagtaacaacggtaagacaaac 50621839  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  50621838 aacttagtt 50621830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 20918634 - 20918769
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  ||||    
T  20918634 tcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatca 20918729  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918730 aacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 20918769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Original strand, 50686695 - 50686847
Alignment:
Q  54 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 153  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||      
T  50686695 catgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcg 50686793  T
Q  154 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  50686794 gatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagcaacttagtt 50686847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16368377 - 16368176
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| |  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  16368377 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaa-catc 16368280  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
        ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16368279 gtttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataaaca 16368181  T
Q  200 actta 204  Q
    |||||    
T  16368180 actta 16368176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 14295642 - 14295507
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||   |||||  ||||    
T  14295642 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatca 14295547  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
     || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295546 gac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 14295507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 35261169 - 35261023
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tc 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||| ||    
T  35261169 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacatctcaaacattc 35261074  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    | |||| || ||| |||||| ||||||||||| || ||||||  ||||||||    
T  35261073 atacat-aattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacat 35261023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 41050127 - 41049918
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||    
T  41050127 tcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaat-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa-cat 41050030  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | ||||  ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| | | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||      
T  41050029 catatataat-tcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataaga 41049931  T
Q  199 aacttagttcctt 211  Q
    ||| |||||||||    
T  41049930 aacctagttcctt 41049918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 52928061 - 52927869
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||            ||||||||| ||||    
T  52928061 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat------------catctcaaatatca 52927975  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||    
T  52927974 aacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaatagcaagataaacaa 52927876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 20248309 - 20248454
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||   || ||| ||||    
T  20248309 tcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaa---cttaaatatca 20248404  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  20248405 aacat-aagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacat 20248454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 21754075 - 21754198
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||     
T  21754075 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaattatc- 21754171  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaa 128  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  21754172 aacataatc-catttaatgtatatacaa 21754198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 45574978 - 45574846
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||  ||      
T  45574978 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat-t 45574881  T
Q  101 aacata-aactcatgtaatgtatatacaattatat 134  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||    
T  45574880 aacatataattcaagtaatgcatatacaattatat 45574846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 50210304 - 50210212
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50210304 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 50210212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 34509810 - 34509899
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  34509810 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaatgcaagtcaacaacatct 34509899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 16758679 - 16758828
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||   |    
T  16758679 tcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaacaacatcacaacatt 16758777  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaaca 150  Q
    || | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  16758778 catatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaaca 16758828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35981700 - 35981575
Alignment:
Q  80 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  35981700 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataat-tcatataatgtatatgcaattatataacattatcatcaacattagaatatacaatccaggcttactggaa 35981603  T
Q  180 caacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
      |||||| ||||| ||| |||||||||    
T  35981602 tgacaacatcaagataaataacttagtt 35981575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 207
Target Start/End: Original strand, 49261448 - 49261573
Alignment:
Q  80 tcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaa 179  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  49261448 tcaacaacatctcaaatatcaa-cataattt-atataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattagaatatacaattccggcttactggaa 49261545  T
Q  180 caacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
      |||||| ||||  ||| |||||||||    
T  49261546 ggacaacatcaaggtaaataacttagtt 49261573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 207
Target Start/End: Original strand, 20636956 - 20637082
Alignment:
Q  79 gtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaa 178  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||| |    
T  20636956 gtcaacaacatcccaaata-caaacataat-tcatataatgtatatacaattatataacattatcatcaacattaaaaaatacaattcaggcttactgga 20637053  T
Q  179 acaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
    |  |||||| ||||  ||| |||||||||    
T  20637054 atgacaacatcaaggtaaataacttagtt 20637082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22130975 - 22130863
Alignment:
Q  24 aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtata 123  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  ||||||| |||  |||||||||| |||    
T  22130975 aacagcaacataggcagtatccaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtaatgcata 22130881  T
Q  124 tacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22130880 tacaattatataacatta 22130863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 27250820 - 27250731
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  27250820 tcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 27250731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 13988893 - 13988984
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13988893 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13988984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21475222 - 21475131
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21475222 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 21475131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 21840794 - 21840885
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21840794 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 21840885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21923426 - 21923335
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  21923426 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 21923335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23593870 - 23593779
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23593870 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 23593779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 31612340 - 31612430
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctca 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31612340 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctca 31612430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16093976 - 16093825
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaaaca 97  Q
    ||||||| | |||||||  |||||| |||||||||||||||||  ||||| |||  |||||||||||||||||| || || |||| ||||||||||||||    
T  16093976 tcatgcaacatagttaataaacaaatagcaacataggcagtatagaaaac-agctcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaaacaacatctcaaaca 16093879  T
Q  98 tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatt 152  Q
    ||| |  |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  16093878 tcataggtaat-tcatgtaatgtatatacaaatatatcacattaaaatcaacatt 16093825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 21026710 - 21026799
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  |||  ||||||| || || ||||||||||||    
T  21026710 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaattgcaattcaacaacatct 21026799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 22532299 - 22532388
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| | || || ||||||||||||    
T  22532299 tcatgcaatttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatccattgcaattcaacaacatct 22532388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 38801479 - 38801433
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaa 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38801479 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa 38801433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20847245 - 20847173
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 74  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||  |||||||||    
T  20847245 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatcaaat 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 22123203 - 22123119
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaa 86  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22123203 tcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacaca-acagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 22123119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 29298164 - 29298254
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29298164 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 29298254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 433039 - 433128
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||| ||||| || || || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  433039 tcatgcagcttagttaaataacg----gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 433128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 29776715 - 29776806
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29776715 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 29776806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Original strand, 51130639 - 51130729
Alignment:
Q  47 aaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51130639 aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcagacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 51130729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 21161746 - 21161932
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| | | | ||||||||||||||| |||| || ||| |||| ||  |  |||||    
T  21161746 tcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaacaaaa-cagtatgcaaatc-atcgtgatataacaatatcgaatgcaattcatcaacttcatat-catca 21161842  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaag 192  Q
    | |||||| ||||  ||||| |||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||| |||| | ||||| |||| |||| ||||||||||    
T  21161843 a-cataaa-tcatacaatgtttatacacttatataacatcaacgacatcattggattaaacaaattaggctcactggaacatcaacagcaag 21161932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 16361944 - 16362035
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16361944 tcatgcagcttagttaaataacga-cagcaacacaa-cagtatataaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 16362035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 26064968 - 26065107
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacca-gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 99  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||   ||||  |  ||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||| |||    
T  26064968 tcatgcagcttagttgataaacaaacagcaacataggcagtacataaaataattcatgatataacaata-ccaatgcaaatcaacaacatctcaaagatc 26065066  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    | | || || ||| |||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  26065067 atatat-aattcaagtaatacatatacaaatatatcacatta 26065107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 1924996 - 1924914
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  1924996 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 1924914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Complemental strand, 20454644 - 20454606
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcag 40  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20454644 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20924010 - 20923928
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  20924010 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 20923928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 15860144 - 15860064
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  15860144 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatattaaatgcaagtcaa 15860064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 22468787 - 22468698
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  | ||| | |||||||| || | |||||||| || || ||||||||||||    
T  22468787 tcatgcaacttagttaaataacaat-agcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaattgcaattcaacaacatct 22468698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 57 - 94
Target Start/End: Original strand, 12271639 - 12271676
Alignment:
Q  57 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12271639 gatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa 12271676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 25175880 - 25176084
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||     
T  25175880 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc- 25175977  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25175978 aacat-aattcatataacgtatatataattatataacattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaaca 25176076  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  25176077 acttagtt 25176084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7824 - 7619
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-c 99  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |    
T  7824 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattc 7726  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    | | ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  7725 atatataat-tcaagtaatgtatatacaattatatcacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaacatgataaaca 7627  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  7626 acttagtt 7619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 28406006 - 28406211
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  28406006 tcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 28406105  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    |   | || ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  28406106 a--cttaattcataaaatgtatatacaattatataccattaacaacaacaatagatcatattaaattaggcttactaaaacaacaacagcaagataaaca 28406203  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  28406204 acttagtt 28406211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 18786994 - 18786789
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||| |||    
T  18786994 tcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaa-ccagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaacaacgtcacaa-cat 18786897  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  || ||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  18786896 caaacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaataacattcaatcatataatttaggcttactgaaacaacaacagcatgataaac 18786798  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  18786797 aacttagtt 18786789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 7679615 - 7679750
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  7679615 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc-aatgtaagtcatcaacatcataaacatca 7679712  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacat 139  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7679713 aacat-aattcatgtaatgtatatataattatataacat 7679750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 23791303 - 23791509
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    ||||| |||||||||||  | |||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23791303 tcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 23791401  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
     | | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  23791402 tatatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaac 23791500  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  23791501 aacttagtt 23791509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 23207307 - 23207512
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||    
T  23207307 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgacatctcaa-cat 23207404  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
     | | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |    
T  23207405 tataaataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttacttgaacaacaacagtaagataagc 23207503  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  23207504 aacttagtt 23207512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 22105439 - 22105531
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22105439 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacttctcaa 22105531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 25108917 - 25109123
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||||||||   ||||  ||  ||||||||||||||||||||   || ||||||| |||||||||||    
T  25108917 tcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaat-agttcatgatataacaatatcaaagcaaaatcaacaatatctcaaacat 25109015  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| | ||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  25109016 catatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcatattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagc 25109114  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  25109115 aacttagtt 25109123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23708706 - 23708561
Alignment:
Q  5 gcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaac 103  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||| |||||     
T  23708706 gcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaat 23708608  T
Q  104 ataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  23708607 at-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 23708561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 23072040 - 23071905
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| ||| ||| ||||   ||||  ||||    
T  23072040 tcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatataaatcagcaac---tcaattatca 23071945  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23071944 aacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacatta 23071905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 298906 - 298816
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||  ||||||| || || ||||||||||||    
T  298906 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaattcaacaacatct 298816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 19671860 - 19671998
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||||||||   |||    
T  19671860 tcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaatattca 19671958  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
     | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19671959 catat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacatta 19671998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 23060543 - 23060632
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  23060543 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 23060632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 23076472 - 23076561
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||||||| ||||    
T  23076472 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaatatct 23076561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 22337145 - 22337238
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22337145 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagacaacaacatctcaaa 22337238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 6726022 - 6726113
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6726022 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaagtcaacaacgtctcaa 6726113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 20520284 - 20520145
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||   ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  20520284 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaacat 20520187  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    || | || || ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  20520186 catatat-aattcaagtaatgcatatacaaatatatcacatta 20520145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 57 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22459598 - 22459448
Alignment:
Q  57 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattaga 155  Q
    |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| | ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |      
T  22459598 gatataacaacatcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatat-aactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaac 22459500  T
Q  156 ttatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
    |  || |  |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22459499 tcgtatacatcagtcttactgaaacaataacagcaagataaacaacttagtt 22459448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 571424 - 571515
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  571424 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 571515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 18808970 - 18809061
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18808970 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 18809061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 23130889 - 23130980
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23130889 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 23130980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 23133356 - 23133447
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23133356 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 23133447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 23135617 - 23135708
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23135617 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 23135708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23709667 - 23709576
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23709667 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 23709576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23712148 - 23712057
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23712148 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 23712057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 24367801 - 24367892
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24367801 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 24367892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 26505406 - 26505497
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26505406 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 26505497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 26507884 - 26507975
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||  ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  26507884 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 26507975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 32215056 - 32214965
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32215056 tcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 32214965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 34402657 - 34402566
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34402657 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 34402566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 39682340 - 39682431
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39682340 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 39682431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22413229 - 22413078
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataaca--atatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaac 96  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  22413229 tcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aac 22413132  T
Q  97 atcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    |||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  22413131 atcataaat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 22413078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22731325 - 22731238
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacat 89  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||    
T  22731325 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 22731238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 38205 - 38136
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  38205 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 38136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21155195 - 21155104
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21155195 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacgtctcaa 21155104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 54 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 24697644 - 24697548
Alignment:
Q  54 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| | |  || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  24697644 catgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaacttcatata-caattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 24697548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 28577126 - 28577217
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||  |  |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  28577126 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacgcaa-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaagccaacaacgtctcaa 28577217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 32039633 - 32039542
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  32039633 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagtaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 32039542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 20309138 - 20309225
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||||||  || ||| ||||||||    
T  20309138 tcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatcaaattcaattcatcaacatct 20309225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 22134297 - 22134208
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctca 93  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||| |||| || |||| |||||||||    
T  22134297 tcatgcagcttagttaaatatcaa-cagcaacataggcagtatgc-aaatcatcataatataacaatatcgaatgcaa-tcaataacatctca 22134208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 32452020 - 32451949
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 72  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||    
T  32452020 tcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa 32451949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 23004778 - 23004878
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||   ||||  ||  || ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23004778 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaat-agttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 23004876  T
Q  99 ca 100  Q
    ||    
T  23004877 ca 23004878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23103486 - 23103396
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |  |||||||||  || ||| |||||||||||    
T  23103486 tcatgcagcttagttaaataa-aaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacatgattatatcaaattcaattcatcaacatctcaa 23103396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24898331 - 24898239
Alignment:
Q  1 tcatgcagctt-agttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24898331 tcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 24898239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24900814 - 24900722
Alignment:
Q  1 tcatgcagctt-agttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24900814 tcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 24900722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24903291 - 24903199
Alignment:
Q  1 tcatgcagctt-agttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24903291 tcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 24903199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24905768 - 24905676
Alignment:
Q  1 tcatgcagctt-agttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24905768 tcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 24905676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24908243 - 24908151
Alignment:
Q  1 tcatgcagctt-agttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24908243 tcatgcagctttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 24908151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 43137326 - 43137417
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43137326 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagtaa-tatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 43137417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 23285895 - 23285942
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa 49  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23285895 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 23285942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 91
Target Start/End: Original strand, 23660061 - 23660141
Alignment:
Q  9 cttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  23660061 cttagttaaacaacaa-cagcaacataggcagtatacgaaac-aggatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacatct 23660141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 45029989 - 45029898
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |  || ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  45029989 tcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 45029898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 1283666 - 1283748
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  1283666 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 1283748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 30344858 - 30344776
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  30344858 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 30344776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23654477 - 23654388
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||  || ||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  23654477 tcatgcagcttagttaaataac-aacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 23654388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 8946687 - 8946735
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac 50  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  8946687 tcatgcagcttagttagataac-aatagcaacataggcagtatacaaaac 8946735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24529664 - 24529573
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  24529664 tcatgcagcatagttaaataac-aacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaagttaacaacgtctcaa 24529573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 123; Significance: 2e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 12796 - 13000
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  12796 tcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatca 12894  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |    
T  12895 aacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaataacaacattagatcatataattcaggcttactggaacaacaacagcaagataaacca 12993  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  12994 cttagtt 13000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 6565 - 6768
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||     
T  6565 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc- 6662  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  6663 aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga-taaca 6760  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  6761 acttagtt 6768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 8496 - 8703
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  8496 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattc 8594  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatataca--attatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaa 197  Q
    | | || || ||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||||| |  | ||| |  |||| ||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  8595 atatat-aattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaattcatatacatcagtcttactggaacaacatcagcaagataaa 8693  T
Q  198 caacttagtt 207  Q
    ||||||||||    
T  8694 caacttagtt 8703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 119; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1125 - 922
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | | | ||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  1125 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgcagatc-atcatgatataacaacatcgaatgcaagtcatcaacatcataaacatca 1027  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  1026 aacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattagcaacaacattagatt-tacaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaataa 929  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  928 cttagtt 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 6641 - 6843
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| |||| |||| | || |||   ||||||||    
T  6641 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatg-atgatataacaatatcgaatgcaagttatcatcattataaacatca 6739  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6740 aacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagcttactaaaacaacaacagcaagataaacaa 6838  T
Q  201 cttag 205  Q
    |||||    
T  6839 cttag 6843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 205
Target Start/End: Original strand, 14021 - 14223
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  | |||||||||||||||| |||| |||| | || |||   ||||||||    
T  14021 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatcatg-atgatataacaatatcgaatgcaagttatcatcattataaacatca 14119  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14120 aacataat-tcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatataattcaagcttactaaaacaacaacagcaagataaacaa 14218  T
Q  201 cttag 205  Q
    |||||    
T  14219 cttag 14223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 116; Significance: 3e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 19294 - 19498
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||     
T  19294 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc- 19391  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  19392 aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaaatcagggttactgaaacaacaacatcaagataaaca 19490  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  19491 acttagtt 19498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 116; Significance: 3e-59; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 100404 - 100608
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| ||      
T  100404 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatat-t 100501  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  100502 aacat-aattcatataatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatcatattaatttaggcttactgaaacaacaacaacaagataaaca 100600  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  100601 acttagtt 100608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40265 - 40061
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||     
T  40265 tcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc- 40168  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  40167 aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacataagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacatcaaggtaaaca 40069  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  40068 acttagtt 40061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17575 - 17484
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17575 tcatgcagcttagttaaataacaat-agcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 17484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 94438 - 94529
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  94438 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 94529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 119905 - 119948
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119905 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatg 119948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 44481 - 44573
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44481 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 44573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 101529 - 101576
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 48  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  101529 tcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 112; Significance: 8e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 5673 - 5876
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||     
T  5673 tcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtatg-aaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc- 5770  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |    
T  5771 aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacaacaacaagataaa-a 5868  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  5869 acttagtt 5876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 62228 - 62429
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||| |||| |   ||||||||||||||| ||||    
T  62228 tcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgaaaaac-atcatggtataataatatcgaatgca---caacaacatctcaaatatca 62323  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    | |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62324 a-cataat-tcatataatgtatatacaattatataacattaacaacatcattagttcataacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaaca 62421  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  62422 acttagtt 62429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 132688 - 132765
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaa 78  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||    
T  132688 tcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaatgtaa 132765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 134238 - 134329
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  134238 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 134329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 136707 - 136798
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  136707 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 136798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 139176 - 139267
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  139176 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 139267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 144114 - 144205
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  144114 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 144205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 141645 - 141736
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  141645 tcatgtagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 141736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10630 - 10428
Alignment:
Q  3 atgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  10630 atgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatcaaa 10532  T
Q  103 cataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaact 202  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||    
T  10531 cat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacaacaagataaacaact 10433  T
Q  203 tagtt 207  Q
    |||||    
T  10432 tagtt 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2736 - 2535
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| || |||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |||     
T  2736 tcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtatg-taaatcatcatgttataacaatattgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc- 2639  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  2638 aacat-aattcatataatgtatatacaattatataccattaacaacaacattagatcatattaattcaggcttactgaaacaacatcagcaagataaaca 2540  T
Q  200 actta 204  Q
    |||||    
T  2539 actta 2535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 1112 - 1316
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||  | |||| |||||| ||||||||||    
T  1112 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcgaatacaggtcatcaacatttcaaacatca 1210  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||| |  |||| ||||||| |||||||||| ||||| ||| ||    
T  1211 aacataat-tcatggaatgtatatacaactatataacattaacaacaacatcaaatcatatacatcagtcttactggaacaacaacaacaagataaaaaa 1309  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  1310 cttagtt 1316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 99; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 129935 - 130139
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  129935 tcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatca 130033  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |  | |||    |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  130034 aacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaattcatatgcatcagtcttactggaacaacaacagcaagataaacaa 130132  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  130133 cttagtt 130139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 60807 - 60710
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  60807 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagctcatgatataccaatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaacat 60710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 97; Significance: 7e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22761 - 22561
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||    
T  22761 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaatatca 22663  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   | ||| ||  |||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  22662 aacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacat--caatatgca--tcagtcttactggaacagcaacatcaagacaaacaa 22568  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  22567 cttagtt 22561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 82099 - 82190
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  82099 tcatgaagcttagttaaataacaa-cagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaa 82190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8165 - 7963
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| |||    
T  8165 tcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaa-ccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaacaacatcacaa-cat 8068  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  8067 catatataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaac---aacagcaagataaac 7972  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  7971 aacttagtt 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 18 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 29354 - 29238
Alignment:
Q  18 ataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| | | |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  |||||||     
T  29354 ataacaaacagcaacataggtagtattcaaa-ctatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatgtac 29260  T
Q  118 tgtatatacaattatataacat 139  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29259 tgtatatacaattatataacat 29238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14788 - 14584
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||  |||||| |||| || |||||||||||||||| |||     
T  14788 tcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagtaag-aaaatcatcatgatatagtaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatc- 14691  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    ||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  14690 aacat-aattcatataatgtatatactattatataccattaacaaaaacattagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagatataca 14592  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  14591 acttagtt 14584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 136460 - 136254
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||    
T  136460 tcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcacat-cat 136363  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaa 197  Q
    |  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  136362 cgtacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaa 136264  T
Q  198 caacttagtt 207  Q
    ||||||||||    
T  136263 caacttagtt 136254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 145168 - 144962
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  |||    
T  145168 tcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatcacat-cat 145071  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagatt-atacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaa 197  Q
    |  ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  145070 cgtacataat-tcatgtaatgtatatacaactatataacattaacaacaacattaaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaa 144972  T
Q  198 caacttagtt 207  Q
    ||||||||||    
T  144971 caacttagtt 144962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 174796 - 174886
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| || |  |||||||||  || |||||||||||||||    
T  174796 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattcaattcaacaacatctcaa 174886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 121796 - 121835
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 41  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  121796 tcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 160714 - 160917
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||    
T  160714 tcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaacaacatgtcaaatatca 160811  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||| |  | |||    |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  160812 aacat-aagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaattcatatgcatcagtcttaccgaaacaacaacaacaagataaacaa 160910  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  160911 cttagtt 160917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 501111 - 501202
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  501111 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 501202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 85715 - 85635
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  85715 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 85635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 92; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 12598 - 12802
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tc 99  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |     
T  12598 tcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatactt 12696  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    | | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || |||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12697 atatat-aattca-gtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaataatacacattagacttactgaaacaacaacagcaagataaaca 12794  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  12795 acttagtt 12802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 6375 - 6169
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6375 tcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 6277  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| || |    
T  6276 catatataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtgagataagc 6178  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  6177 aacttagtt 6169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 89; Significance: 4e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2108
Alignment:
Q  29 caacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaa 128  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||||  |||| ||||||||||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaatc-atcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatcag-cataat-tcatataatgtatatacaa 2185  T
Q  129 ttatataacattaacaacaacattagattatac-aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaactta 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2184 ttatataccattaacaacaacattggatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaactta 2108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 129061 - 128856
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatc 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| |  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  129061 tcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatc 128963  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    | | ||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  128962 atatataat-tcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctaaatcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagca 128864  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  128863 acttagtt 128856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 78352 - 78556
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||    
T  78352 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaac-agttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaa-cat 78448  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    |    ||||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  78449 cgtttataat-tcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagc 78547  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  78548 aacttagtt 78556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 116457 - 116548
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |  |||||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  116457 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcgacacaa-cagtatacaaaac-agcatgacataatcatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 116548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 159 - 307
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| ||||    
T  159 tcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 257  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  258 aacat-aattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacat 307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 45883 - 45735
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||    
T  45883 tcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaagtcatcaacatctcaattatca 45785  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45784 aacat-aattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacat 45735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 38346 - 38552
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38346 tcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaaacat 38444  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | ||||  |||||||||| |||||||  ||||| |||||||   |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  38445 catatataat-tcatgtaatgcatatacatatatatcacattaatctcaacatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagtaagataagc 38543  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  38544 aacttagtt 38552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 2897 - 2691
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||    
T  2897 tcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatatca 2799  T
Q  101 ----aa--cataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattata-caattcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 193  Q
        ||  ||||||   |||| || ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2798 gcttaattcataaa---atgt-atatatatacaat--tataccattaacaacaacaatagatcatattaaatcaggcttactgaaacaacaacagcaaga 2705  T
Q  194 caaacaacttagtt 207  Q
     |||||||||||||    
T  2704 taaacaacttagtt 2691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 53640 - 53435
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tc 99  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||    
T  53640 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattc 53542  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaaca 199  Q
    | | || || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| ||||||| |||| |||||  |||| |||||    
T  53541 atatat-aattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcataaacatcagtcttactggaacatcaacataaagataaaca 53443  T
Q  200 acttagtt 207  Q
    ||||||||    
T  53442 acttagtt 53435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 97035 - 97241
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  97035 tcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 97133  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  97134 catatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagaaaagc 97232  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  97233 aacttagtt 97241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 106313 - 106519
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  106313 tcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat 106411  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | || || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | || ||  |  |||||||||||||||||||||||| |||| || |    
T  106412 catatat-aattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatctatatcaggcttactgaaacaacaacagtaagaaaagc 106510  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  106511 aacttagtt 106519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 77; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 103720 - 103525
Alignment:
Q  3 atgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag-catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaa 101  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||  ||||| |  |||||||||||||||||||||| ||   |||||||      ||||||     
T  103720 atgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtataaaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaa---aacaaca------acatcat 103630  T
Q  102 acataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaac 201  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||    
T  103629 acataat-tcatgtaatgtatatacaactacataacattaacaacaacattaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacaggaagataaagaac 103531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 11322 - 11457
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  ||||    
T  11322 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatca 11417  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11418 aacttaag-tcatgtaatgtatatactattatataacatta 11457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 2027 - 2228
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  ||||    
T  2027 tcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgcaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatca 2122  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaa 200  Q
    ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||    |||| ||||||| ||||  |||||||||  ||||||    
T  2123 aacttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattaattcataagcatcagacttactggaacattaacagcaaggtaaacaa 2221  T
Q  201 cttagtt 207  Q
    |||||||    
T  2222 cttagtt 2228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 28444 - 28533
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  28444 tcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 207
Target Start/End: Original strand, 15694 - 15892
Alignment:
Q  4 tgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaac 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  |||||||    
T  15694 tgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaa-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatcaaac 15789  T
Q  104 ataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaactt 203  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||  | |||  | |||| ||||||| | ||  |||||||||  |||||||||    
T  15790 ttaag-tcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacattatttcataagaatcagtcttactggatcattaacagcaaggtaaacaactt 15888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 74; Significance: 4e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 19976 - 19771
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||    
T  19976 tcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcag-cat 19879  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | |||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||  || ||||| | || ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||| || |    
T  19878 cataaataa-ctcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaataacatcaaatcatataattcatgcttactggaacaacaacagtaagataagc 19780  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  19779 aacttagtt 19771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 39943 - 40031
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| | ||||| |||||||    
T  39943 tcatgcagcttaattaaataac-aatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcatgtcaataacatct 40031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 49021 - 48939
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  49021 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 48939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 71; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 1160 - 1025
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||   |||||  ||||    
T  1160 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---ctcaattatca 1065  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
     || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1064 gac-ttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacatta 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3277 - 3185
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3277 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgtaattcaacaacatctcaa 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 27840 - 27744
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27840 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaac-agcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaacat 27744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 1062 - 1155
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||    
T  1062 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacatctcaaa 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 54 - 240
Alignment:
Q  21 acaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  54 acaaacagcaacataggcagtacataaaac-agttcatgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacatcatatataat-tcatgtaat 151  T
Q  119 gtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
    | ||||||| |||||||||||||  |||||||| | || ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||    
T  152 gcatatacatttatataacattattaacaacatcaaatcatttaatttaggcttactgaaacaacaacagtaagatatgcaacttagtt 240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8151 - 7945
Alignment:
Q  2 catgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagc--atgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat- 98  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||     
T  8151 catgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatc-agctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatcttaaacatt 8053  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | ||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||| | || ||| |  |||| || |||| ||||||| |||||||| ||||    
T  8052 catatataat-tcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatatacatcagtctcactggaacaacatcagcaagataaac 7954  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  7953 aacttagtt 7945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 16191 - 16095
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16191 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaacaa-catgatataacaatatcaaatgtaaatcaacaacatctcaaacat 16095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Original strand, 13158 - 13252
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaac 96  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  13158 tcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctgaaac 13252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 44798 - 44705
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44798 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 44705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26156 - 26064
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26156 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaattcaacaacgtctcaa 26064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 63; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 38793 - 38700
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  38793 tcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaatatctcaaa 38700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 11494 - 11643
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catc 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||  |||    
T  11494 tcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 11592  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    | | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  11593 acatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 11643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 38347 - 38198
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa-catc 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||  | |||||| ||||||||||||||  |||    
T  38347 tcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatc 38249  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    | | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  38248 acatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 38198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 24690 - 24605
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatata--caattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  24690 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacataatttcatgcaatatatatatccaattatataacatta 24605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 25136 - 25275
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  25136 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaacaacatctcaaacat 25233  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    || | || || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  25234 catatat-aattcatgtaatgtatatacaaatatatcacatta 25275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 151
Target Start/End: Original strand, 620 - 715
Alignment:
Q  54 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||| | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  ||||||||    
T  620 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacatcatatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacat 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 3241 - 3149
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3241 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaacaa-catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 3149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 39507 - 39599
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39507 tcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 39599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 59; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 75305 - 75213
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  75305 tcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 75213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 57; Significance: 5e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17308 - 17214
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac--cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17308 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 17214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 79419 - 79328
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||  |||| |||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  79419 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacac-gacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 79328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 4879 - 4968
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  4879 tcatgcagattagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaaatgcaattcaacaacatct 4968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 34153 - 34288
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||   ||||  ||||    
T  34153 tcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaac-ccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac---tcaattatca 34248  T
Q  101 aacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||| |||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34249 aacttaag-tcaagtaatatatatacaattatataacatta 34288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 13141 - 13211
Alignment:
Q  21 acaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  13141 acaaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15868 - 15763
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |||| |||||| || ||||  | ||||||    
T  15868 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatgatgatataacaatatcgaatgcaagtcatcatcatcatatacatca 15770  T
Q  101 aacataa 107  Q
    |||||||    
T  15769 aacataa 15763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15764 - 15719
Alignment:
Q  162 aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15764 aattcaggcttactgaaacaacaacagcaagataaacaacttagtt 15719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 580 - 784
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||| |||    
T  580 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaac-agttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatcccaa-cat 676  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | ||||  |||||||||| ||||||| | |||| | ||||   | || || | || ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||    
T  677 catatataat-tcatgtaatgcatatacattaatatcatattatttaaaagatcaaatcatataattcaggcttactgaaacaacaacagttagataaac 775  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  776 aacttagtt 784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 54; Significance: 3e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 207
Target Start/End: Original strand, 267690 - 267895
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| |||||    
T  267690 tcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaac-agttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaatatctc-aacat 267787  T
Q  99 caaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacattagattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaac 198  Q
    || | || || |||||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||| ||| | || |||  || ||||||||||||||||||| ||| |||  || |    
T  267788 catatat-aattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaatcatatcatccaggcttactgaaacaacagcagtaagctaagc 267886  T
Q  199 aacttagtt 207  Q
    |||||||||    
T  267887 aacttagtt 267895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 13241 - 13330
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  13241 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 13330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 23974 - 23901
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatg 75  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  23974 tcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatg 23901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 51943 - 52032
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  51943 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 52032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 168069 - 167980
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  168069 tcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 167980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1835 - 1684
Alignment:
Q  54 catgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 153  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| | || || | |||||||| ||||||| |||||| ||||||  |||||| | |    
T  1835 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctc-aacatcatatat-aatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtca 1738  T
Q  154 gattatacaattcaggcttactgaaacaacaacagcaagacaaacaacttagtt 207  Q
     || ||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| |  ||||||||||    
T  1737 aatcatataattcaggcttactggaacaacaatagtaagataggcaacttagtt 1684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16691 - 16599
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16691 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaaatggaagtcaacagcatctcaa 16599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 32128 - 32205
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaa 78  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  32128 tcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaa 32205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 16143 - 16235
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  16143 tcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacatcatctcaa 16235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 33047 - 32959
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  33047 tcatgcagcttagttaattaacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 32959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 45958 - 46046
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  45958 tcatgcagcttagttaattaacaa-cagcaacacaggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 46046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18118 - 17969
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaaca-tc 99  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||| || || |||||||||| |||||| || | |||| |||||||||||||| | ||    
T  18118 tcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaacatctcaaatattc 18020  T
Q  100 aaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacat 151  Q
    | | || || ||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  18019 acatat-aattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 17969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 95
Target Start/End: Original strand, 4544 - 4630
Alignment:
Q  8 gcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4544 gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 4630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 95
Target Start/End: Original strand, 12126 - 12212
Alignment:
Q  8 gcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12126 gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 12212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 95
Target Start/End: Original strand, 22078 - 22164
Alignment:
Q  8 gcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22078 gcttagttaaataacaa-cagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 22164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 24394 - 24304
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac-cagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  24394 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatct 24304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 22913 - 23001
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22913 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacac-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 23001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 32972 - 33060
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  32972 tcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaagttaacaacatct 33060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 38791 - 38879
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||| || | ||||||||||    
T  38791 tcatgcagcttaattaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaac-agcatgacataataatatcaaatgcaaataaacaacatct 38879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 9776 - 9867
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  9776 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaagtgcaagtcaacaacgtctcaa 9867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 4721 - 4812
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  4721 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 4812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 8509 - 8605
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  8509 tcatgcagcttggttaaataacaat-agcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaacat 8605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 10800 - 10891
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10800 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 13419 - 13510
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13419 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 13510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 20774 - 20865
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20774 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 20865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 29959 - 30050
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29959 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacgtctcaa 30050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 37848 - 37939
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  37848 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 37939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 11315 - 11406
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11315 tcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 11406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 158585 - 158494
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  158585 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 158494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 340038 - 339949
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  340038 tcatgcagcttagttaaataac--acaacaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaat-caagtcaacaacatctcaa 339949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 45; Significance: 8e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 91
Target Start/End: Original strand, 20946 - 21030
Alignment:
Q  7 agcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||| |||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  20946 agcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaacatct 21030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 151
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225585
Alignment:
Q  29 caacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacat-caaacataaactcatgtaatgtatataca 127  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| || | ||||  ||| |||||| |||||||    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaac-agcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataat-tcaagtaatgcatataca 225561  T
Q  128 attatataacattaacaacaacat 151  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||    
T  225562 attatatcacattataaacaacat 225585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 1139 - 1050
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  1139 tcatgcagcttagttaaataacaa-caacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 1050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 3500 - 3589
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  3500 tcatgtagcttagttaaataactaa-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 3589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 373 - 461
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||  |||||||  ||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  373 tcatgcagcttagttaaataac-aacaataacataggcagtatacaaaa-tagcatgacgtaataatatcaattggaagtcaacaacatct 461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 4554 - 4643
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4554 tcatgcaacttagttaaataacaa-caacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatct 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 51612 - 51654
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 43  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51612 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 51654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 25926 - 26018
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25926 tcatgaagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaa 26018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Original strand, 39888 - 39980
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  39888 tcatgaagcttagttaaataacaat-agcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacatctcaaa 39980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 1881 - 1970
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || ||| ||||||||    
T  1881 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 1970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 13974 - 14065
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13974 tcatgcagcttagataaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 14065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 16811 - 16902
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16811 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 16902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 8620 - 8535
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||| |||||    
T  8620 tcatgcagcttagttaaat----aacagcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatct 8535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 10514 - 10427
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||| |||| |||||||| |  || ||||||||||||    
T  10514 tcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatct 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 1319 - 1359
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 41  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1319 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 1359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 7296 - 7338
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7296 tcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtat 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 12382 - 12293
Alignment:
Q  3 atgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||||| |||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12382 atgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 12293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 16312 - 16382
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaat 74  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||   |||||||| ||||  |||||||||    
T  16312 tcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatcaaat 16382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3529
Alignment:
Q  35 aggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaa 3529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 1982 - 2071
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||  ||||||| || || ||||||||||||    
T  1982 tcatgcagcttagttaattaacaa-cagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaattgcaattcaacaacatct 2071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 4742 - 4803
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataa 63  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  4742 tcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataa 4803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Original strand, 40430 - 40518
Alignment:
Q  4 tgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  40430 tgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 40518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 6215 - 6123
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataaca--aacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||||| || || ||| ||||||||    
T  6215 tcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaattgcaattcatcaacatct 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 50
Target Start/End: Original strand, 13527 - 13575
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaac 50  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13527 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaac 13575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 9269 - 9360
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||  |||| || ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9269 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 9360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20513 - 20423
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||| |||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20513 tcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacat-cagtatacaaaacaa-catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 20423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 91
Target Start/End: Original strand, 128824 - 128869
Alignment:
Q  46 aaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatct 91  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  128824 aaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatct 128869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 11534 - 11464
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  11534 tcatgcagcttagttaaataac-aacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15554 - 15485
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaa 72  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  15554 tcatgcagcttagttaaataac-aagagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaa 15485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Original strand, 4241 - 4321
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa 83  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||| ||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||    
T  4241 tcatgcaacttagttaaataacga-cagcgacacag-cagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 4321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 4324 - 4415
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || |||||||| ||||||    
T  4324 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaaatcaacaacgtctcaa 4415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 42
Target Start/End: Original strand, 32097 - 32137
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagta 42  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32097 tcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 32137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 2705 - 2780
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccag--catgatataacaatatcaaatg 75  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  2705 tcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatg 2780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 5219 - 5183
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagg 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5219 tcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacatagg 5183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 28861 - 28813
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaa-acagcaacataggcagtatgcaaa 48  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28861 tcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2488 - 2398
Alignment:
Q  47 aaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||   ||||  ||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2488 aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcagcaac---tcaattatcaaacttaag-tcatttaatgtatatacaattatataacatta 2398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 47025 - 47065
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagt 41  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47025 tcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagt 47065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Original strand, 135 - 224
Alignment:
Q  3 atgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  135 atgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacaat-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaatcaacaacgtctcaa 224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 23 - 94
Target Start/End: Original strand, 12106 - 12176
Alignment:
Q  23 aaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaa 94  Q
    ||||||||||| || |||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12106 aaacagcaacacag-cagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaa 12176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 141
Target Start/End: Original strand, 6 - 88
Alignment:
Q  58 atataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacatta 141  Q
    ||||||||||  |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  6 atataacaattacaaatgcacgtcatcaacatctcaatcatcaaacat-aattcatgcaatatatatctaattatataacatta 88  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 1140 - 1098
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 43  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  1140 tcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtat 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Original strand, 27911 - 27953
Alignment:
Q  53 gcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaa 95  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaa 27953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 161225 - 161133
Alignment:
Q  1 tcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaaccagcatgatataacaatatcaaatgtaagtcaa-caacatctcaa 94  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||| | ||||||| ||||| ||  |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  161225 tcatgcagcttagttaaatatc-aacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaa 161133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 697 - 602
Alignment:
Q  57 gatataacaatatcaaatgtaagtcaacaacatctcaaacatcaaacataaactcatgtaatgtatatacaattatataacattaacaacaacatta 153  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||| || || |||||||| | ||||  ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  697 gatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatataat-tcatgtaatgcgtatacaattatatcacattaatatcaacatta 602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University