View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2357_high_3 (Length: 798)

Name: NF2357_high_3
Description: NF2357
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2357_high_3
NF2357_high_3
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (20-614)||(6330067-6330673)
chr8 (20-506)||(6319720-6320211)
chr8 (20-327)||(6350814-6351121)
chr8 (16-326)||(6361700-6362010)
chr8 (20-344)||(6422714-6423038)
chr8 (612-790)||(6329843-6330020)
chr8 (41-326)||(6273026-6273311)
chr8 (45-326)||(6287277-6287558)
chr8 (26-326)||(7469958-7470258)
chr8 (26-326)||(7457556-7457856)
chr8 (74-324)||(6408708-6408958)
chr8 (65-324)||(6389459-6389718)
chr8 (84-326)||(6368475-6368717)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (248-328)||(42691744-42691824)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 498; Significance: 0; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 20 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 6330673 - 6330067
Alignment:
Q  20 acacccaagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgagg 119  Q
    ||||| || |||||||| || |||||| | || ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6330673 acaccaaaaaatgataccctcactgaccttacgatcttagaggtcttatcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgagg 6330574  T
Q  120 cttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtc 219  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6330573 tttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttggctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgatgagtc 6330474  T
Q  220 attgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgagaaaggattgacttgcagaggcattcctaatagtatctcc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6330473 attgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgagaaaggattgacttgcagaggcattcctaatagtatctcc 6330374  T
Q  320 atctaaagaatttgatggtttgttgctttgctctgaataaaatgtgtgaagttgtcaaattccctcatcgtcatggtcttgttattatgtatgtttgttt 419  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6330373 atctaaagaatttgatggtatgttgctttgctctgaataaaatgtgtgaagttgtcaaattccctcatcgtcatggtcttgttattatgtatgtttgttt 6330274  T
Q  420 gtttgcttgcttttatgttttactttacatcaataagaagttcttaagatgtgtttacctcttgtatgtgtaatacatgtgatatgatattgaaatgcat 519  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6330273 gtttgcttgcttttatgttttactatacatcaataagaagttcttaagatgtgtttacctcttgtatgtgtaatacatgtgatatgataatgaaatgcat 6330174  T
Q  520 tagtttaagtttggaaaaaatgaattaatgaccccaaggttt------------tagtgcgatatggcatgataaaaagatgatagtgctgaaaaagtaa 607  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6330173 tagtttaagtttggaaaaaatgaattaatgaccccaaggtttgtgcaaacctagtagtgcgatatggcatgataaaaagatgatagtgctgaaaaagtaa 6330074  T
Q  608 tgtacaa 614  Q
    |||||||    
T  6330073 tgtacaa 6330067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 6320211 - 6319720
Alignment:
Q  20 acacccaagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgagg 119  Q
    ||||| || |||||||| || |||||| | || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6320211 acaccaaaaaatgataccctaactgaccttacaatcatagaggtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggtgagg 6320112  T
Q  120 cttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtc 219  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  6320111 cttggacttttgattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttggctgaaattgaggcaaagctcatcaaaaggaacaatgatgagtc 6320012  T
Q  220 attgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgagaaaggattgacttgcagaggcattcctaatagtatctcc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6320011 attgagaaaccgatacgggcctgtgaagatgccatacactctgctttatccttctagtgaggaaggattgactggcagaggcattcctaatagtatctcc 6319912  T
Q  320 atctaaagaatttgatggtttgttgctttgctctgaataaaatgtgtgaagttgtcaaattccctcatcgtcatggtcttgttattatgtatgtttgttt 419  Q
    || ||| || ||| || |||||||   ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  6319911 atttaatgagtttcattgtttgttctgttgctttaaataaaatgtgtgaagtagtcaaattacctca---tcatggtcatgttgttatgtttgtttgttt 6319815  T
Q  420 gtttgcttgct--------tttatgttttactttacatcaataagaagttcttaagatgtgtttacctcttgtatgtgtaatacatgtgatatga 506  Q
    ||||| ||| |        |||||| ||||||||||||||||||||| | || | ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  6319814 gtttgtttgtttgttggtatttatggtttactttacatcaataagaaatactcatgatgtgtgtacctcttgtatgtgttagacatgtgatatga 6319720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 20 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6351121 - 6350814
Alignment:
Q  20 acacccaagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgagg 119  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||| ||      
T  6351121 acaccaaagaatgatacacttactgacttgaccattatagaggtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggagatagaattgaaggtgaca 6351022  T
Q  120 cttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtc 219  Q
     |||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    || |||| | ||||||||||||| ||| |    
T  6351021 attggacttcagattcacaaccaaaagaagccttcaagaggtttggaaagaagttggctgaaattgaacagaaactcactcaaaggaacaatgatgagac 6350922  T
Q  220 attgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgagaaaggattgacttgcagaggcattcctaatagtatctcc 319  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6350921 attgagaaatcggtacggaccagtgaagatgccatatactctactttatccttctagtgaggaaggattgacttgccgaggcattcctaatagtatctcc 6350822  T
Q  320 atctaaag 327  Q
    ||||||||    
T  6350821 atctaaag 6350814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6362010 - 6361700
Alignment:
Q  16 aataacacccaagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  6362010 aataacacccaagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggagagagaattgaaggt 6361911  T
Q  116 gaggcttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacg 215  Q
    ||    |||||||| ||||||||||||  |||  | || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| |    
T  6361910 gatctctggacttctgattcacagccaaaagagtcctttaagaggtttggaaagaagttggctgaaattgagcaaaaactcattcaaaggaacaatgatg 6361811  T
Q  216 agtcattgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgagaaaggattgacttgcagaggcattcctaatagtat 315  Q
    || || |||| || ||  |||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  6361810 agacactgaggaatcgtaacggaccagtgaagatgccttacactctgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggcattcccaacagtgt 6361711  T
Q  316 ctccatctaaa 326  Q
    ||| |||||||    
T  6361710 ctctatctaaa 6361700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 20 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 6423038 - 6422714
Alignment:
Q  20 acacccaagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgagg 119  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| ||      
T  6423038 acacccaagagtgatacccttacagaccttaccattattgaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggggagagaatcgaaggtgatc 6422939  T
Q  120 cttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtc 219  Q
     ||||||||| ||| ||||||||  ||| || | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||  || ||||||||  |||||||||    
T  6422938 tttggacttctgatgcacagccaaaagaggcctacaagaagtttgcaaggaagttggctgaaattgaggaaaagctagttaaaaggaacgctgacgagtc 6422839  T
Q  220 attgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgagaaaggattgacttgcagaggcattcctaatagtatctcc 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| || ||| | |||    
T  6422838 attgagaaaccgatacgggcctgtgaagatgccatacactctgctttatccttctagtgaagaaggattgactttcagaggcattcccaacagtgtttcc 6422739  T
Q  320 atctaaagaatttgatggtttgttg 344  Q
    ||||| | ||| | |||||||||||    
T  6422738 atctagaaaatgtcatggtttgttg 6422714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 612 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 6330020 - 6329843
Alignment:
Q  612 caaaaagtaataacagttaaagtgaattatattttaccttaatgctttagtttcagtcttttacatcaaacaattttaaactatgactagagatcatggt 711  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6330020 caaaaagtaataacagttaaagtgaattatattttaccttaatgctttagtttcgaccttttacatcaaacaattttaaactatgactagaaatcatggt 6329921  T
Q  712 gccttcaagttgttacactgaccattattaggtagagcac--atatttccatgaaaattccgccatcgatcggttcatctc 790  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6329920 gccttcaagttgttacactgacc---attaggtagagcacatatatttccatgaaaattccgccatcgatcggttcttctc 6329843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 41 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6273311 - 6273026
Alignment:
Q  41 actgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgaggcttggacttcagattcacagc 140  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||| |||||||| |    
T  6273311 actgacttgaccattatagaggtcttgtcaagacatgcttctgatgaacaataccttggacagagaattgaaggtgatctttggacttctgattcacaac 6273212  T
Q  141 cattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtcattgagaaaccgatacgggcc 240  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||  |||||| ||||||||||   ||| |||| | ||||||||||||| ||| |  | || || ||||| || ||    
T  6273211 cattagaggctttcaagagattcggaacaaagttggctgaaattgaacaaaaactcactcaaaggaacaatgatgagactctaaggaatcgatatggacc 6273112  T
Q  241 tgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgagaaaggattgacttgcagaggcattcctaatagtatctccatctaaa 326  Q
     ||||| ||||| || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6273111 agtgaagatgccgtatactttgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggcattcctaacagtatctccatctaaa 6273026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6287558 - 6287277
Alignment:
Q  45 acttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgaggcttggacttcagattcacagccatt 144  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||| |||||||| |||      
T  6287558 acttgactgttatagaagtcttgtcaagacatgcttctgatgaacaataccttggacagagaattgaaggtgataattggacttctgattcacaaccaaa 6287459  T
Q  145 agaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtcattgagaaaccgatacgggcctgtg 244  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  ||| |||| | |||||||||| || ||| || |||| || || || || || |||    
T  6287458 agaggctttcaagaggtttggaaagaagctggctgaaattgagaaaaaactcactcaaaggaacaacgatgagacactgaggaatcgttatggaccagtg 6287359  T
Q  245 aatatgccatacactctgctttatccttctagtgagaaaggattgacttgcagaggcattcctaatagtatctccatctaaa 326  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6287358 aagatgccatatactttgctttatccttctagtgaggaaggattgacttgcagaggcattcccaatagtatctccatctaaa 6287277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7470258 - 7469958
Alignment:
Q  26 aagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgaggcttgga 125  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||    ||||    
T  7470258 aagaatgatacccttactaacttgaccatcttagaggtcttgtcaaggcatgcttctgatgaacaataccttggagagagaattgaaggtgatctctgga 7470159  T
Q  126 cttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtcattgag 225  Q
    |||| ||||||||||||  | | || | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||||    
T  7470158 cttctgattcacagccaaaacaggcctacaagaagtttggaaagaagttgtctgaaattgagaaaaacctcattcaaaggaacaatgatgagacactgag 7470059  T
Q  226 aaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgagaaaggattgacttgcagaggcattcctaatagtatctccatctaa 325  Q
     || ||| | || |||||||| ||| |||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||| |||| ||||||    
T  7470058 gaatcgaaatggacctgtgaagatgtcatatacactgctttatcctactagtgaggaaggattgacttccagaggcattcccaacagtgtctctatctaa 7469959  T
Q  326 a 326  Q
    |    
T  7469958 a 7469958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 7457856 - 7457556
Alignment:
Q  26 aagaatgatactcttactgacttgaccattatagaagtcttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgaggcttgga 125  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||    ||||    
T  7457856 aagaatgatacccttactaacttgaccatcttagaggtcttgtcaaggcatgcttctgatgaacaataccttggagagagaattgaaggtgatctctgga 7457757  T
Q  126 cttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtcattgag 225  Q
    |||| |||||||| |||  | | || | ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |||  ||| |||||| ||||||||||||| ||| || ||||    
T  7457756 cttctgattcacaaccaaaacaggcctacaagaagtttggaaagaagttggctgaaatcgagaaaaacctcattcaaaggaacaatgatgagacactgag 7457657  T
Q  226 aaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgagaaaggattgacttgcagaggcattcctaatagtatctccatctaa 325  Q
     || ||| | || |||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  7457656 gaatcgaaatggacctgtgaagatgccatatacactgctttatcctactagtgaggaaggattgacttccagaggcattcccaacagtgtctccatctaa 7457557  T
Q  326 a 326  Q
    |    
T  7457556 a 7457556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 74 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6408958 - 6408708
Alignment:
Q  74 catgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgaggcttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagt 173  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||   ||||||||  |||||| ||||| |||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  6408958 catgtttctgatgagcaatacattggacacagaatcgaaggtgatctttggacttacgattcagagccagtagaggccttcaagaagtttggaaagaagt 6408859  T
Q  174 tgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtcattgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttc 273  Q
    || |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  6408858 tggctgaaattgagcaaaagctcattgaaaggaacaacgatgaatcattgagaaacaggaatgggcctgtgaagatgccatacactgtgctctatccttc 6408759  T
Q  274 tagtgagaaaggattgacttgcagaggcattcctaatagtatctccatcta 324  Q
     ||||||  ||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  6408758 aagtgagccaggattgactttcagaggcattcccaacagtgtctccatcta 6408708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 65 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6389718 - 6389459
Alignment:
Q  65 ttgtcaaggcatgcttctgatgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgaggcttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttg 164  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||   ||||||||  |||||| ||||| |||| || ||||||| |||||    
T  6389718 ttgtcaacacatgtttctgatgagcaatacattggacacagaatcgaaggtgatctttggacttacgattcagagccagtagaggccttcaagaagtttg 6389619  T
Q  165 gaaggaagttgtctgaaattgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtcattgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgct 264  Q
    ||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |  | ||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  6389618 gaaagaagttggctgaaattgagcaaaagctcattgaaaggaacaacgatgaatcattgagaaacaggaatgggccagtgaagatgccatacactgtgct 6389519  T
Q  265 ttatccttctagtgagaaaggattgacttgcagaggcattcctaatagtatctccatcta 324  Q
     |||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  6389518 ctatccttcaagtgagccaggattgactttcagaggcattcccaacagtgtctccatcta 6389459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6368717 - 6368475
Alignment:
Q  84 atgagcaataccttggacagagaaatgaaggcgaggcttggacttcagattcacagccattagaagctttcaagaggtttggaaggaagttgtctgaaat 183  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||| ||   ||||||||| ||| || ||||| ||||||| | ||| | ||||| || ||| |||  ||||||    
T  6368717 atgaggaataccttggacaaagaactgaaggtgatctttggacttctgatccaaagccagtagaagcctacaaaaagtttgcaaagaaattgattgaaat 6368618  T
Q  184 tgaggtaaagctcattgaaaggaacaatgacgagtcattgagaaaccgatacgggcctgtgaatatgccatacactctgctttatccttctagtgagaaa 283  Q
    ||||| | || ||||| ||||||||||| | |||||||||| |||| | || |||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||    |    
T  6368617 tgaggaagagttcattcaaaggaacaataatgagtcattgaaaaacaggtatgggcctgtgaagtttccatacactcttctttatccttccagtggacca 6368518  T
Q  284 ggattgacttgcagaggcattcctaatagtatctccatctaaa 326  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||||||    
T  6368517 ggattgactggcagagggattcccaacagtgtctccatctaaa 6368475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 42691824 - 42691744
Alignment:
Q  248 atgccatacactctgctttatccttctagtgagaaaggattgacttgcagaggcattcctaatagtatctccatctaaaga 328  Q
    ||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  42691824 atgccttatactttgcttcatccttctagtgaggaaggactaacttttagaggaattcctaatagtatctctatctgaaga 42691744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University