View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF2389_low_36 (Length: 236)

Name: NF2389_low_36
Description: NF2389
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF2389_low_36
NF2389_low_36
[»] chr7 (54 HSPs)
chr7 (5-221)||(18797421-18797637)
chr7 (1-221)||(7334888-7335107)
chr7 (5-221)||(27283838-27284054)
chr7 (6-221)||(31578916-31579131)
chr7 (5-217)||(37109970-37110184)
chr7 (5-221)||(10481699-10481915)
chr7 (5-217)||(15612610-15612822)
chr7 (5-221)||(30055621-30055837)
chr7 (6-220)||(32820905-32821119)
chr7 (6-207)||(9355678-9355879)
chr7 (5-217)||(17842435-17842649)
chr7 (6-221)||(11071300-11071512)
chr7 (5-221)||(6546613-6546829)
chr7 (43-221)||(38258639-38258817)
chr7 (8-221)||(5657335-5657548)
chr7 (5-221)||(24211835-24212052)
chr7 (5-221)||(41764929-41765145)
chr7 (5-220)||(23111285-23111502)
chr7 (6-221)||(10359066-10359282)
chr7 (12-221)||(15672617-15672829)
chr7 (5-207)||(46480980-46481182)
chr7 (6-207)||(37703350-37703551)
chr7 (6-221)||(32432546-32432761)
chr7 (6-221)||(48928149-48928364)
chr7 (5-219)||(12165848-12166053)
chr7 (12-221)||(21991730-21991934)
chr7 (5-221)||(8861379-8861595)
chr7 (6-221)||(44598760-44598973)
chr7 (9-221)||(33688117-33688329)
chr7 (85-221)||(37704251-37704387)
chr7 (7-221)||(37347116-37347329)
chr7 (5-221)||(4583013-4583229)
chr7 (5-221)||(25691395-25691611)
chr7 (25-221)||(43686134-43686330)
chr7 (5-221)||(22687333-22687541)
chr7 (5-196)||(26587943-26588126)
chr7 (5-167)||(35353256-35353418)
chr7 (7-221)||(31520594-31520791)
chr7 (6-221)||(43925196-43925404)
chr7 (5-221)||(29173634-29173832)
chr7 (63-221)||(48928473-48928631)
chr7 (87-201)||(27421313-27421427)
chr7 (25-139)||(38053637-38053751)
chr7 (5-221)||(12390500-12390697)
chr7 (5-139)||(32593057-32593191)
chr7 (7-139)||(26980482-26980614)
chr7 (5-121)||(44411391-44411507)
chr7 (130-221)||(44413355-44413446)
chr7 (8-110)||(37704387-37704489)
chr7 (5-102)||(34362029-34362126)
chr7 (146-217)||(26980421-26980492)
chr7 (146-200)||(38053593-38053647)
chr7 (8-72)||(27421219-27421283)
chr7 (159-219)||(32593194-32593254)
[»] chr8 (46 HSPs)
chr8 (1-221)||(37970371-37970591)
chr8 (5-221)||(43643451-43643667)
chr8 (7-221)||(1149490-1149704)
chr8 (1-221)||(23854283-23854503)
chr8 (5-217)||(16446731-16446943)
chr8 (5-221)||(31933742-31933958)
chr8 (5-217)||(7890813-7891025)
chr8 (5-221)||(16222981-16223197)
chr8 (1-217)||(35459563-35459779)
chr8 (8-221)||(6098372-6098590)
chr8 (8-214)||(4132545-4132750)
chr8 (5-221)||(5299802-5300018)
chr8 (6-221)||(1205045-1205260)
chr8 (12-221)||(36694829-36695038)
chr8 (9-221)||(10555062-10555274)
chr8 (5-221)||(33906330-33906546)
chr8 (5-217)||(11727146-11727358)
chr8 (5-221)||(38644096-38644312)
chr8 (6-221)||(27082695-27082910)
chr8 (5-217)||(8803672-8803885)
chr8 (7-217)||(9864270-9864480)
chr8 (12-221)||(12876227-12876437)
chr8 (5-221)||(30654438-30654655)
chr8 (5-217)||(34895089-34895296)
chr8 (6-221)||(1953845-1954062)
chr8 (5-220)||(465961-466166)
chr8 (5-198)||(40862560-40862753)
chr8 (8-221)||(39098978-39099191)
chr8 (5-145)||(1149776-1149912)
chr8 (82-221)||(41910921-41911060)
chr8 (5-221)||(44869615-44869831)
chr8 (25-221)||(13307741-13307936)
chr8 (134-221)||(1150090-1150177)
chr8 (82-217)||(43025824-43025959)
chr8 (5-113)||(35859160-35859268)
chr8 (5-157)||(24823250-24823394)
chr8 (5-109)||(12587812-12587916)
chr8 (8-189)||(18259233-18259410)
chr8 (5-112)||(34951913-34952020)
chr8 (147-221)||(41362633-41362707)
chr8 (6-74)||(33198067-33198135)
chr8 (146-220)||(34952028-34952102)
chr8 (146-217)||(7998416-7998488)
chr8 (63-139)||(7998478-7998554)
chr8 (102-157)||(12585298-12585353)
chr8 (9-38)||(41362723-41362752)
[»] chr4 (53 HSPs)
chr4 (5-221)||(25184232-25184448)
chr4 (8-221)||(879427-879640)
chr4 (5-221)||(37663617-37663833)
chr4 (5-221)||(55477767-55477983)
chr4 (5-207)||(47253873-47254075)
chr4 (8-220)||(50697361-50697574)
chr4 (5-221)||(1815420-1815636)
chr4 (6-221)||(28002863-28003078)
chr4 (5-221)||(19089329-19089545)
chr4 (5-217)||(19440524-19440736)
chr4 (5-221)||(33341517-33341733)
chr4 (6-221)||(6864154-6864369)
chr4 (19-220)||(35020925-35021126)
chr4 (8-221)||(17167832-17168045)
chr4 (12-221)||(17173409-17173618)
chr4 (5-218)||(3042741-3042954)
chr4 (5-217)||(32912455-32912668)
chr4 (5-207)||(7703642-7703844)
chr4 (7-221)||(36493567-36493780)
chr4 (5-221)||(42199848-42200066)
chr4 (5-221)||(49376086-49376302)
chr4 (5-220)||(37775787-37775993)
chr4 (6-221)||(55240982-55241196)
chr4 (7-220)||(17272084-17272297)
chr4 (5-217)||(34361367-34361580)
chr4 (5-221)||(23761191-23761406)
chr4 (6-221)||(25700933-25701149)
chr4 (5-221)||(29584076-29584292)
chr4 (6-207)||(46888035-46888235)
chr4 (5-221)||(32579565-32579781)
chr4 (25-213)||(38011981-38012169)
chr4 (5-217)||(34947971-34948185)
chr4 (5-207)||(30002517-30002710)
chr4 (8-221)||(27396735-27396948)
chr4 (6-221)||(5047843-5048057)
chr4 (5-221)||(33816392-33816625)
chr4 (6-220)||(32592213-32592418)
chr4 (5-221)||(50764849-50765055)
chr4 (63-221)||(4934136-4934294)
chr4 (6-221)||(9139364-9139563)
chr4 (61-207)||(35025528-35025674)
chr4 (5-201)||(37287865-37288063)
chr4 (5-215)||(4598117-4598317)
chr4 (5-198)||(46883990-46884177)
chr4 (6-143)||(7152081-7152218)
chr4 (85-221)||(54499193-54499330)
chr4 (5-142)||(26896285-26896423)
chr4 (12-108)||(4205216-4205312)
chr4 (5-112)||(39400236-39400343)
chr4 (5-74)||(35025442-35025511)
chr4 (134-200)||(39398049-39398115)
chr4 (8-69)||(23431826-23431887)
chr4 (5-34)||(38012568-38012597)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (1-221)||(46994507-46994727)
chr3 (1-221)||(4761494-4761715)
chr3 (5-221)||(48355051-48355267)
chr3 (5-221)||(42505925-42506141)
chr3 (8-220)||(46297615-46297827)
chr3 (5-218)||(26941110-26941323)
chr3 (8-221)||(52040775-52040988)
chr3 (5-221)||(7327332-7327548)
chr3 (5-219)||(33698265-33698479)
chr3 (5-217)||(40552109-40552321)
chr3 (5-223)||(32373578-32373796)
chr3 (5-217)||(22622568-22622780)
chr3 (5-221)||(44891607-44891823)
chr3 (5-221)||(54828551-54828767)
chr3 (6-221)||(33378636-33378851)
chr3 (6-217)||(53229003-53229214)
chr3 (7-217)||(34133049-34133259)
chr3 (5-221)||(22451078-22451294)
chr3 (5-217)||(39282766-39282978)
chr3 (5-221)||(24707965-24708183)
chr3 (5-217)||(21009651-21009864)
chr3 (5-221)||(2008043-2008258)
chr3 (6-220)||(29163929-29164134)
chr3 (6-221)||(11466934-11467142)
chr3 (5-221)||(47481632-47481849)
chr3 (5-218)||(3362366-3362581)
chr3 (5-221)||(3655050-3655268)
chr3 (25-220)||(43348368-43348563)
chr3 (7-201)||(25579869-25580063)
chr3 (8-221)||(37157817-37158031)
chr3 (5-221)||(54505917-54506134)
chr3 (5-221)||(4015570-4015785)
chr3 (5-221)||(11357231-11357430)
chr3 (16-221)||(45174615-45174821)
chr3 (6-217)||(24488813-24489024)
chr3 (8-221)||(37203177-37203391)
chr3 (6-197)||(1089827-1090018)
chr3 (5-220)||(29099466-29099672)
chr3 (8-121)||(51212624-51212737)
chr3 (5-213)||(38591816-38592024)
chr3 (5-218)||(21193719-21193933)
chr3 (5-221)||(22445915-22446130)
chr3 (5-220)||(14586530-14586735)
chr3 (5-217)||(36012251-36012465)
chr3 (5-217)||(43975742-43975950)
chr3 (130-221)||(51212956-51213047)
chr3 (16-221)||(11835494-11835694)
chr3 (5-221)||(44186367-44186567)
chr3 (49-174)||(20373138-20373263)
chr3 (82-221)||(35844436-35844575)
chr3 (7-139)||(40936165-40936297)
chr3 (5-221)||(27480208-27480445)
chr3 (99-221)||(53176164-53176286)
chr3 (6-121)||(50475021-50475136)
chr3 (35-145)||(11357030-11357140)
chr3 (159-218)||(20373300-20373359)
chr3 (18-126)||(53811597-53811701)
chr3 (146-221)||(40936101-40936175)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (1-219)||(19289187-19289405)
chr2 (5-221)||(31861971-31862187)
chr2 (5-221)||(43648113-43648329)
chr2 (6-221)||(41960959-41961174)
chr2 (5-221)||(31570602-31570818)
chr2 (5-200)||(2325246-2325441)
chr2 (5-221)||(4763750-4763966)
chr2 (5-221)||(37905827-37906045)
chr2 (12-221)||(3177058-3177267)
chr2 (5-221)||(11366248-11366465)
chr2 (5-214)||(35959023-35959227)
chr2 (5-217)||(41465624-41465836)
chr2 (5-221)||(44286068-44286284)
chr2 (6-221)||(33709101-33709316)
chr2 (15-221)||(33550865-33551070)
chr2 (5-221)||(44913782-44914002)
chr2 (5-221)||(29242013-29242222)
chr2 (5-221)||(4167041-4167257)
chr2 (57-221)||(17071657-17071821)
chr2 (5-220)||(27349816-27350022)
chr2 (5-221)||(4263944-4264161)
chr2 (5-221)||(19424510-19424712)
chr2 (5-213)||(26357704-26357912)
chr2 (5-221)||(18494149-18494364)
chr2 (5-221)||(19313970-19314182)
chr2 (35-221)||(45327839-45328025)
chr2 (5-221)||(4478488-4478700)
chr2 (5-218)||(13711586-13711794)
chr2 (57-217)||(17054016-17054176)
chr2 (1-217)||(43770712-43770919)
chr2 (5-220)||(33660245-33660451)
chr2 (5-139)||(7006806-7006940)
chr2 (63-221)||(36642105-36642265)
chr2 (5-220)||(5881659-5881864)
chr2 (5-221)||(39167237-39167447)
chr2 (49-199)||(18258199-18258349)
chr2 (82-221)||(41463795-41463934)
chr2 (87-219)||(33902187-33902319)
chr2 (5-145)||(19500783-19500923)
chr2 (6-59)||(41463459-41463512)
chr2 (159-221)||(7006943-7007005)
chr2 (6-74)||(41051169-41051237)
chr2 (5-55)||(18257406-18257456)
chr2 (159-221)||(19501762-19501823)
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (5-221)||(51128974-51129190)
chr1 (5-221)||(10922842-10923058)
chr1 (5-221)||(8222243-8222458)
chr1 (5-220)||(15383049-15383264)
chr1 (5-220)||(37451401-37451616)
chr1 (5-221)||(25160747-25160963)
chr1 (5-221)||(15752144-15752360)
chr1 (5-221)||(16415761-16415977)
chr1 (5-221)||(27227330-27227546)
chr1 (5-221)||(30326797-30327013)
chr1 (6-221)||(7078909-7079124)
chr1 (5-220)||(32216171-32216386)
chr1 (5-221)||(4330396-4330612)
chr1 (5-217)||(32267153-32267365)
chr1 (6-217)||(18422770-18422981)
chr1 (6-221)||(27267046-27267260)
chr1 (8-221)||(28769767-28769981)
chr1 (5-221)||(19899613-19899830)
chr1 (6-219)||(30254540-30254753)
chr1 (8-221)||(47279304-47279517)
chr1 (5-221)||(2959863-2960079)
chr1 (6-221)||(10181853-10182069)
chr1 (5-221)||(38823329-38823545)
chr1 (5-221)||(23999462-23999679)
chr1 (5-221)||(27532826-27533041)
chr1 (6-221)||(28564629-28564842)
chr1 (8-221)||(42721154-42721364)
chr1 (5-221)||(15168211-15168427)
chr1 (5-221)||(47682339-47682555)
chr1 (8-217)||(22170830-22171039)
chr1 (8-221)||(40884928-40885141)
chr1 (5-221)||(238358-238574)
chr1 (8-221)||(41926278-41926484)
chr1 (5-217)||(46931530-46931741)
chr1 (5-217)||(9902899-9903111)
chr1 (5-213)||(27563750-27563958)
chr1 (5-221)||(27763155-27763372)
chr1 (6-221)||(14758156-14758362)
chr1 (32-221)||(33725472-33725661)
chr1 (5-221)||(39393498-39393715)
chr1 (5-217)||(34012227-34012434)
chr1 (6-213)||(3535055-3535253)
chr1 (6-217)||(37618747-37618949)
chr1 (5-221)||(3309262-3309484)
chr1 (5-207)||(1547408-1547602)
chr1 (6-221)||(31621395-31621614)
chr1 (5-144)||(1359780-1359919)
chr1 (5-139)||(11742213-11742347)
chr1 (23-217)||(38759652-38759846)
chr1 (82-220)||(48620753-48620882)
chr1 (5-144)||(48353735-48353873)
chr1 (5-107)||(21289829-21289931)
chr1 (159-217)||(11742350-11742408)
chr1 (7-99)||(31962853-31962945)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (5-220)||(408279-408494)
scaffold0002 (5-221)||(253-463)
scaffold0002 (103-217)||(94331-94445)
scaffold0002 (6-111)||(93951-94056)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (5-221)||(8006-8222)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (5-217)||(22973922-22974134)
chr5 (5-221)||(22980912-22981128)
chr5 (5-200)||(5830032-5830227)
chr5 (5-221)||(38528077-38528293)
chr5 (5-220)||(7208704-7208919)
chr5 (1-219)||(27318325-27318541)
chr5 (5-220)||(31705452-31705667)
chr5 (5-221)||(12910474-12910690)
chr5 (5-221)||(31786486-31786702)
chr5 (5-221)||(35504484-35504700)
chr5 (5-217)||(699273-699485)
chr5 (5-221)||(17157871-17158087)
chr5 (5-221)||(25500766-25500982)
chr5 (5-221)||(19119978-19120194)
chr5 (5-217)||(22255305-22255517)
chr5 (5-217)||(8437089-8437300)
chr5 (1-221)||(24886223-24886426)
chr5 (1-221)||(43308496-43308708)
chr5 (5-221)||(27330423-27330639)
chr5 (5-221)||(36866881-36867097)
chr5 (6-221)||(23954636-23954845)
chr5 (5-221)||(35934014-35934231)
chr5 (5-221)||(15992380-15992596)
chr5 (33-221)||(23116090-23116278)
chr5 (5-221)||(33908352-33908567)
chr5 (6-221)||(5837674-5837889)
chr5 (5-218)||(13956202-13956415)
chr5 (68-221)||(14919431-14919584)
chr5 (5-221)||(30969164-30969380)
chr5 (5-217)||(35511322-35511529)
chr5 (6-201)||(35826327-35826520)
chr5 (5-217)||(40133508-40133720)
chr5 (5-220)||(22019752-22019958)
chr5 (5-221)||(8741725-8741942)
chr5 (12-221)||(21088613-21088822)
chr5 (5-217)||(32563272-32563475)
chr5 (5-220)||(9200353-9200559)
chr5 (5-221)||(39572938-39573146)
chr5 (5-220)||(7693350-7693556)
chr5 (6-217)||(15724611-15724822)
chr5 (5-220)||(42342851-42343056)
chr5 (12-221)||(36860542-36860752)
chr5 (5-192)||(2888285-2888472)
chr5 (5-126)||(25889584-25889705)
chr5 (5-221)||(1429002-1429201)
chr5 (13-221)||(6824329-6824535)
chr5 (5-221)||(14409181-14409383)
chr5 (5-189)||(25669737-25669911)
chr5 (82-221)||(26268193-26268332)
chr5 (98-221)||(5112247-5112369)
chr5 (130-217)||(28416492-28416579)
chr5 (8-221)||(8466863-8467058)
chr5 (6-74)||(28416392-28416460)
chr5 (5-74)||(26269075-26269144)
chr5 (95-146)||(11898148-11898199)
chr5 (5-39)||(43254156-43254190)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (5-217)||(12032-12244)
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (5-221)||(3879788-3880004)
chr6 (6-221)||(7234885-7235100)
chr6 (5-220)||(6091031-6091247)
chr6 (5-221)||(1945953-1946170)
chr6 (5-221)||(5627510-5627727)
chr6 (6-220)||(33892862-33893067)
chr6 (5-221)||(20768203-20768417)
chr6 (5-221)||(21016967-21017177)
chr6 (6-221)||(4318672-4318888)
chr6 (6-217)||(29182286-29182495)
chr6 (51-221)||(30353253-30353423)
chr6 (82-221)||(7055141-7055280)
chr6 (6-217)||(8513356-8513562)
chr6 (8-221)||(33618953-33619162)
chr6 (82-221)||(15491734-15491873)
chr6 (6-221)||(6089027-6089237)
chr6 (6-87)||(7054622-7054704)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (5-221)||(145865-146082)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (5-221)||(44076-44291)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (5-221)||(154496-154711)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (23-217)||(267407-267602)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (79-119)||(100948-100988)
scaffold0009 (159-196)||(100894-100931)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 54)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 18797637 - 18797421
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797637 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 18797538  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  18797537 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 18797438  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  18797437 tgagttgatgatactat 18797421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 7335107 - 7334888
Alignment:
Q  1 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  7335107 atttctgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttattgtcggaatctttaacattcaaact- 7335009  T
Q  101 agttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  7335008 agttgatgatattatctgataatcttaagtgttacactctgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaag 7334909  T
Q  201 cagatgagttgatgatactat 221  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  7334908 ctgatgagttgatgatactat 7334888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27284054 - 27283838
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27284054 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagtt 27283955  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  27283954 gataatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtatagtcttgttaatctga 27283855  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    | | ||||| |||||||    
T  27283854 taaattgataatactat 27283838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 31578916 - 31579131
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||| | |||||    
T  31578916 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagttg 31579015  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  31579016 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgat 31579115  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || |||||||||||||    
T  31579116 gaattgatgatactat 31579131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37110184 - 37109970
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  37110184 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagtt 37110085  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaagg--taggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatca 202  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  37110084 gatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatct 37109985  T
Q  203 gatgagttgatgata 217  Q
    ||||| |||||||||    
T  37109984 gatgaattgatgata 37109970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10481915 - 10481699
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10481915 ctgattaacgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacggatactattttattgttggaatctttgacatgcaaagagagtt 10481816  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  10481815 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagcgtagtcttgttaatctga 10481716  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  10481715 tgaattgatgatactat 10481699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 15612610 - 15612822
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  15612610 ctgattaatgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagtt 15612709  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  15612710 gctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctga 15612809  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  15612810 tgaattgatgata 15612822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30055837 - 30055621
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||    
T  30055837 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgtt 30055738  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  30055737 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 30055638  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| || ||||||||||    
T  30055637 tgaattaatgatactat 30055621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 220
Target Start/End: Original strand, 32820905 - 32821119
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32820905 tgatgaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttg 32821004  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  32821005 atgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaactaaattaactgtagtcttgttaatctaat 32821104  T
Q  206 gagttgatgatacta 220  Q
    || ||||||||||||    
T  32821105 gaattgatgatacta 32821119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 9355678 - 9355879
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||    
T  9355678 tgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttg 9355777  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  9355778 atgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgat 9355877  T
Q  206 ga 207  Q
    ||    
T  9355878 ga 9355879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 17842435 - 17842649
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  17842435 ctgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagtt 17842534  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaagg--taggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatca 202  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17842535 gatgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacgcttataacaaggtataggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatct 17842634  T
Q  203 gatgagttgatgata 217  Q
    ||||| |||||||||    
T  17842635 gatgaattgatgata 17842649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11071512 - 11071300
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| |||||||| || |   |||||||||||| |||| |||||    
T  11071512 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttg---tctttaacatgcgaacaaagttg 11071416  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||    
T  11071415 atgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtagtgttgttaatctgat 11071316  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || |||||||||||||    
T  11071315 gaattgatgatactat 11071300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6546829 - 6546613
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  | ||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  6546829 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcctcatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagtt 6546730  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||    
T  6546729 gctgatatcatgtgataatattaagtgttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctga 6546630  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  6546629 tgaattgatgatactat 6546613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 43 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38258817 - 38258639
Alignment:
Q  43 tcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgt 142  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  38258817 tcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgt 38258718  T
Q  143 ggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38258717 ggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 38258639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 5657335 - 5657548
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| |    
T  5657335 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgct 5657434  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    ||||| ||| |||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  5657435 gatatcatgcgatagtcttaagtattacactttgtgggctgttacacttaaaacaaagtaggataaaattaaattaagtgtatttttgttaatatgatga 5657534  T
Q  208 gttgatgatactat 221  Q
     |||||||||||||    
T  5657535 attgatgatactat 5657548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24212052 - 24211835
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||    
T  24212052 ctgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagt 24211953  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  24211952 tgatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtaggatgttacacttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctg 24211853  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    |||| |||||||||||||    
T  24211852 atgaattgatgatactat 24211835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 41764929 - 41765145
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||  |||| |||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||||| ||||    
T  41764929 ctgattaatgatcaataataattcatccagtaatgcttgcaaaatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 41765028  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  41765029 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagagtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 41765128  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  41765129 tgaattgatgatactat 41765145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 23111502 - 23111285
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  23111502 ctgatttatgatcaatagtaattcttctagtaatgctttcaacatctttgatttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacagagtt 23111403  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtagg--ataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatca 202  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  23111402 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaagtatgatataaaattagattaagtgtagtcttgttaatct 23111303  T
Q  203 gatgagttgatgatacta 220  Q
     |||| ||||||||||||    
T  23111302 aatgaattgatgatacta 23111285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 10359066 - 10359282
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||  |||| ||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  10359066 tgattaatgatcaatagtaaatcatttagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactaatttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttg 10359165  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaatta-aattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||    
T  10359166 atgttgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttaagtgtagtcttgttgatctga 10359265  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  10359266 tgaattgatgatactat 10359282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 15672617 - 15672829
Alignment:
Q  12 atgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactatt---ttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatg 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || |||||||| ||||||||   |||| || || ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15672617 atgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaggtactattattttatcgttggcatctttaacattcaaatagagttgatg 15672716  T
Q  109 atattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgag 208  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||     
T  15672717 atattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgatgaa 15672816  T
Q  209 ttgatgatactat 221  Q
    |||||||||||||    
T  15672817 ttgatgatactat 15672829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Original strand, 46480980 - 46481182
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||    
T  46480980 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagtt 46481079  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||| |||||||||||||| ||    
T  46481080 aatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatgagatgttacacttaaaacaatgtagaataaaattacatcaagtatagtcttgttaatctga 46481179  T
Q  205 tga 207  Q
    |||    
T  46481180 tga 46481182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 37703350 - 37703551
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||    
T  37703350 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttg 37703449  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| || ||| || |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||    
T  37703450 atgatattatgtgatagtcttaagtggtacactttgtgggatgttacacttaaaataagatatgataaaattagattaagtgtagtcttattaatctgat 37703549  T
Q  206 ga 207  Q
    ||    
T  37703550 ga 37703551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32432761 - 32432546
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||| |||||||||| ||||    
T  32432761 tgattcatgattaataataattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagtgttg 32432662  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || |||    
T  32432661 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattatattaactgtattcttgttagtctgat 32432562  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || |||||||||||||    
T  32432561 gaattgatgatactat 32432546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 48928149 - 48928364
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||| || || || || ||||||||||||||| |||||    
T  48928149 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactatttcatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttg 48928248  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    ||||||||||| |||| ||||||   ||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||    
T  48928249 atgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgat 48928348  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || ||||| |||||||    
T  48928349 gaattgataatactat 48928364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12166053 - 12165848
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  12166053 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagtt 12165954  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | ||||||||||||         | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  12165953 gctgatattatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 12165863  T
Q  205 tgagttgatgatact 219  Q
    ||| |||||||||||    
T  12165862 tgaattgatgatact 12165848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21991934 - 21991730
Alignment:
Q  12 atgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgata 111  Q
    |||||||||||||||||||||     || || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21991934 atgatcaatagtaattcatct-----tgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagttgctgata 21991840  T
Q  112 ttatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttg 211  Q
    | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  21991839 tcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattg 21991740  T
Q  212 atgatactat 221  Q
    ||||||||||    
T  21991739 atgatactat 21991730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8861595 - 8861379
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||    
T  8861595 ctgattaatgatcaatagtatttcatctagtaatgcatgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaagagagtt 8861496  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||  |||| | |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| ||    
T  8861495 gctgatatcatgtgatggtcttgagtgttacactttgcggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattgttgttaatctga 8861396  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    | | |||||||||||||    
T  8861395 ttaattgatgatactat 8861379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44598973 - 44598760
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  44598973 tgattaatgatcaatagt--ttcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacatgtattattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagttg 44598876  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
     |||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||    
T  44598875 ttgatatcatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgat 44598776  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || || ||||||||||    
T  44598775 gaatttatgatactat 44598760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 33688117 - 33688329
Alignment:
Q  9 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatg 108  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||  | |  ||||||||| |||||||||||||| ||    
T  33688117 ttaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagttgctg 33688216  T
Q  109 atattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgag 208  Q
    |||| || ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||     
T  33688217 atatcatatgatagtcttgaatgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaagtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaa 33688316  T
Q  209 ttgatgatactat 221  Q
    |||||||||||||    
T  33688317 ttgatgatactat 33688329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37704387 - 37704251
Alignment:
Q  85 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaa 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37704387 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaa 37704288  T
Q  185 gtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  37704287 gtgtagtcttgttaatctgataaattgatgatactat 37704251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37347329 - 37347116
Alignment:
Q  7 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  |||| ||||||||  |||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||    
T  37347329 gattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagttga 37347230  T
Q  107 tgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatg 206  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||     
T  37347229 tgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcctgttaatttaata 37347131  T
Q  207 agttgatgatactat 221  Q
    | |||||||||||||    
T  37347130 aattgatgatactat 37347116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4583229 - 4583013
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| ||||  |||||||| || ||||| || || |  ||||||||||| |||||| ||||    
T  4583229 ctgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattatttgatcgttgacatctttaacatacaaacatagtt 4583130  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||    
T  4583129 gatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctga 4583030  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  4583029 tgaattgttgatactat 4583013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 25691395 - 25691611
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||  ||||||| ||  |||||||| ||    ||||||||| |||||||||||||    
T  25691395 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttgaacttacatgtgttattttatcgttaacatctttaacgtgcaaacagagtt 25691494  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||  ||    
T  25691495 gctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtatttttgttaatatga 25691594  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  25691595 tgaattgataatactat 25691611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43686330 - 43686134
Alignment:
Q  25 attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatc 124  Q
    ||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||| || |||||||| || |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |     
T  43686330 attcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgatattatgtgatagtt 43686231  T
Q  125 ttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||    
T  43686230 ttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctgatgaattgttgatactat 43686134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22687541 - 22687333
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || ||| ||||||        |||||    
T  22687541 ctgattaatgatcaatagtaattcatctattaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatccttaaca--------gagtt 22687450  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| ||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||    
T  22687449 gttgatatcatgagatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattattgttaatctga 22687350  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  22687349 tgaattgatgatactat 22687333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 26587943 - 26588126
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||| |||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||        |||||    
T  26587943 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcctgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaaca--------gagtt 26588034  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 196  Q
    | |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  26588035 gttgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgt 26588126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35353418 - 35353256
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||| | |||||||||||| || |  |||||||||||||||| | ||||    
T  35353418 ctgattaatgatcaatagtgattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatatagtt 35353319  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggta 167  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  35353318 gatgatattatgagatagtcttaagtgttacattttctggggtgttacacttaaaacaaggta 35353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 31520594 - 31520791
Alignment:
Q  7 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||    
T  31520594 gattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttga 31520693  T
Q  107 tgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatg 206  Q
    ||||||||||||||| ||||||                 |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||    
T  31520694 tgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatg 31520776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 43925404 - 43925196
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||      ||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  43925404 tgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac------gtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttg 43925311  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||||||||||||  | |||| | ||| || ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| || |||    
T  43925310 atgatattatgtgattgtattaagtattaaacgttgtgaggtgttgcacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattattgttagtctgat 43925211  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
     |||||||||||||||    
T  43925210 -agttgatgatactat 43925196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29173832 - 29173634
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||  ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  29173832 ctgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagtt 29173734  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||                 |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |  ||    
T  29173733 gatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgtaacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttagtttga 29173651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 63 - 221
Target Start/End: Original strand, 48928473 - 48928631
Alignment:
Q  63 gtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataaca 162  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||   ||||||||| || ||||||||||||| || |    
T  48928473 gtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagcattacactttctgaggtgttacacttaaaata 48928572  T
Q  163 aggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    | |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  48928573 atgtaggataaaattagattaagtgcaatcttgttaatctgatgaattgataatactat 48928631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 201
Target Start/End: Original strand, 27421313 - 27421427
Alignment:
Q  87 taacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagt 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  27421313 taacatgcaaacagagttgctgatatcatacgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagt 27421412  T
Q  187 gtagtcttgttaatc 201  Q
    ||| |||||||||||    
T  27421413 gtattcttgttaatc 27421427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 25 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38053751 - 38053637
Alignment:
Q  25 attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatc 124  Q
    ||||||| | |||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  38053751 attcatcaaataatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgttggaatctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagtc 38053652  T
Q  125 ttaaatgttacactt 139  Q
    |||| ||||||||||    
T  38053651 ttaagtgttacactt 38053637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 12390500 - 12390697
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||||||| | |||||    
T  12390500 ctgattaatgataaatagtaattcatctagtaatggttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatgcaagctgagtt 12390599  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||  | ||||||                 |||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  12390600 gatgatattatgtg--agtcttaa-----------------gtgttacacttaaaagaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 12390680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 32593057 - 32593191
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||| |||| |||||||| |||||||||||  || |  |||||||||||||||||| ||||    
T  32593057 ctgattaatgatccatagtaatttatctagtaatatttgtaacatcttggacttacatgtactattttaacgttgacatctttaacatgcaaacatagtt 32593156  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactt 139  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  32593157 gatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactt 32593191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 7 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26980614 - 26980482
Alignment:
Q  7 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttga 106  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||| |||||||     
T  26980614 gattaatgatcaacaataattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgc 26980515  T
Q  107 tgatattatgtgataatcttaaatgttacactt 139  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  26980514 tgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 26980482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 121
Target Start/End: Original strand, 44411391 - 44411507
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||  || |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  44411391 ctgattaatggtcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagataatattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagtt 44411490  T
Q  105 gatgatattatgtgata 121  Q
    |||||||||||||||||    
T  44411491 gatgatattatgtgata 44411507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 130 - 221
Target Start/End: Original strand, 44413355 - 44413446
Alignment:
Q  130 tgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  44413355 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagccttgttaatttgatgaattgaagatactat 44413446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 37704489 - 37704387
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||| ||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  37704489 attaatgatcaatagtaattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgat 37704390  T
Q  108 gat 110  Q
    |||    
T  37704389 gat 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 102
Target Start/End: Original strand, 34362029 - 34362126
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagag 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||    
T  34362029 ctgattaatgatcaaaagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgatatttttaacatgcaaacagag 34362126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 26980492 - 26980421
Alignment:
Q  146 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgata 217  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
T  26980492 gtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgata 26980421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 38053647 - 38053593
Alignment:
Q  146 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38053647 gtgttacacttataacaaagtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 38053593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Original strand, 27421219 - 27421283
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactatttt 72  Q
    |||||||||||||| || ||||||| ||||  ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  27421219 attaatgatcaatattatttcatcttgtaacatttgcaacatcttggacttacatgtactatttt 27421283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 219
Target Start/End: Original strand, 32593194 - 32593254
Alignment:
Q  159 aacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatact 219  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || ||| ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  32593194 aacaaggtatgataaaattagattaaatgcagttttgataatctgatgaattgatgatact 32593254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 46)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 37970371 - 37970591
Alignment:
Q  1 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  37970371 atttctgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtaaggatctttaacatgcaaacag 37970470  T
Q  101 agttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37970471 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 37970570  T
Q  201 cagatgagttgatgatactat 221  Q
    || |||| |||||||||||||    
T  37970571 catatgaattgatgatactat 37970591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 43643451 - 43643667
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43643451 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagtt 43643550  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  43643551 gataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctga 43643650  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  43643651 tgagttgatgatactat 43643667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 1149490 - 1149704
Alignment:
Q  7 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1149490 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagttga 1149589  T
Q  107 tgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatg 206  Q
    | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1149590 taatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatg 1149689  T
Q  207 agttgatgatactat 221  Q
    |||||||||||||||    
T  1149690 agttgatgatactat 1149704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 23854283 - 23854503
Alignment:
Q  1 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23854283 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagcag 23854382  T
Q  101 agttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  23854383 agttgatgatattatgtgattgtcttaagtgttacactttatgcggtgttacacttataactaggtaagataaaattagattaattgtagtattgttaat 23854482  T
Q  201 cagatgagttgatgatactat 221  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  23854483 ctaatgagttgatgatactat 23854503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 16446731 - 16446943
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| ||    
T  16446731 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagattt 16446830  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16446831 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctga 16446930  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  16446931 tgaattgatgata 16446943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 31933742 - 31933958
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||    
T  31933742 ctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtctgcaatatcttagacttacaagtactattttattgttggaatccttaacatgcaaacagactt 31933841  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  31933842 gatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtgcggtattatgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcgga 31933941  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  31933942 tgaattgatgatactat 31933958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 7890813 - 7891025
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  7890813 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaccagagtt 7890912  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||    
T  7890913 gatgatattatgtgataatcttaagtgttacacgttgtggggtgttacgcttataacaaagtaagataaaactagattgagtgtagtcttgttaatctga 7891012  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  7891013 tgaattgatgata 7891025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16223197 - 16222981
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16223197 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcattggaatctttaaaatgcaaacaaagtt 16223098  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16223097 gatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttttggggtgttacgtttaaaacaaggaaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcgga 16222998  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  16222997 tgaattgatgatactat 16222981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 35459563 - 35459779
Alignment:
Q  1 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  35459563 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcgaaatctttaacatacaaacag 35459662  T
Q  101 agttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35459663 aattgatgatattatgtaatagtcttaagtgttataatctgtgggatgttacatttataacaaagtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 35459762  T
Q  201 cagatgagttgatgata 217  Q
    | |||||||||||||||    
T  35459763 ctgatgagttgatgata 35459779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 6098372 - 6098590
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtc-----ggaatctttaacatgcaaacagag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||      || |||||||||||||||||||||    
T  6098372 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattgtattgtatcgttggcatctttaacatgcaaacagag 6098471  T
Q  103 ttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatca 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  6098472 ttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatct 6098571  T
Q  203 gatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||| |||| ||||||||    
T  6098572 gatgaattgacgatactat 6098590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Original strand, 4132545 - 4132750
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||    
T  4132545 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgat 4132644  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  4132645 gatattatgtgatagtcttatgtgttacactttgtggggtgttacactta-aacaaggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatga 4132743  T
Q  208 gttgatg 214  Q
     ||||||    
T  4132744 attgatg 4132750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 5299802 - 5300018
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| | ||    
T  5299802 ctgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgttatctttaacatgcaaacaaaatt 5299901  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  5299902 gctgatatcatttgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 5300001  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  5300002 tgaattgatgatactat 5300018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1205260 - 1205045
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||    
T  1205260 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttaaaatctttaacatgcaaacagagttg 1205161  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||    
T  1205160 atgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtaatcttgttaatatgat 1205061  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    ||  ||||||||||||    
T  1205060 gaactgatgatactat 1205045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 36694829 - 36695038
Alignment:
Q  12 atgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgata 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| |||| || ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36694829 atgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggatttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgata 36694928  T
Q  112 ttatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttg 211  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||| |||    
T  36694929 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattg 36695028  T
Q  212 atgatactat 221  Q
    ||||||||||    
T  36695029 atgatactat 36695038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 221
Target Start/End: Original strand, 10555062 - 10555274
Alignment:
Q  9 ttaatgatcaatagt--aattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttga 106  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10555062 ttaatgatcaatagtgtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaaagttga 10555161  T
Q  107 tgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatg 206  Q
    ||||||||||||||| ||  || ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10555162 tgatattatgtgatagtc--aagtgttacgttttgtgaggtgttgcgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatg 10555259  T
Q  207 agttgatgatactat 221  Q
    | |||||||||||||    
T  10555260 aattgatgatactat 10555274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33906546 - 33906330
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||    
T  33906546 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtt 33906447  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||  |||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  33906446 gatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttttggaatgttacccttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 33906347  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  33906346 tgaattgatgatactat 33906330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 11727358 - 11727146
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||    
T  11727358 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacattcaaacaaagtt 11727259  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||    
T  11727258 gttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatttga 11727159  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  11727158 tgaattgatgata 11727146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38644312 - 38644096
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||  | |  ||||||||| |||||||||||||    
T  38644312 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattgacatctttaacttgcaaacagagtt 38644213  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| || ||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  38644212 gctgatatcatatgatagtcttgagtgttacactttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 38644113  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  38644112 tgaattgatgatactat 38644096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 27082695 - 27082910
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||     
T  27082695 tgattaatgataagtagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttt 27082794  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  27082795 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgcggggtgttagacttaaaacatggtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgat 27082894  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || |||||||||||||    
T  27082895 gaattgatgatactat 27082910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 8803672 - 8803885
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  8803672 ctgattaatgatcaatagtatattcatctggtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagt 8803771  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  8803772 tgatgatattatgtgatagtattaagtgttacactttttagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctg 8803871  T
Q  204 atgagttgatgata 217  Q
    || | |||||||||    
T  8803872 ataaattgatgata 8803885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9864480 - 9864270
Alignment:
Q  7 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttga 106  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||||| || |||| ||||  ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||    
T  9864480 gattcatgattactagttattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaaattga 9864381  T
Q  107 tgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatg 206  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||    
T  9864380 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatg 9864281  T
Q  207 agttgatgata 217  Q
    | |||||||||    
T  9864280 aattgatgata 9864270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12876437 - 12876227
Alignment:
Q  12 atgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgata 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  |  ||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12876437 atgataaatagtaattcatctagtaatgcctgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgatgata 12876338  T
Q  112 ttatgtgataatc-ttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagtt 210  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| ||||| ||    
T  12876337 ttatgtgatagtctttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtatccttcttaatctgatgaatt 12876238  T
Q  211 gatgatactat 221  Q
    |||||||||||    
T  12876237 gatgatactat 12876227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 30654438 - 30654655
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||||    
T  30654438 ctgattaatgatcaataatatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatttttaacatgcaaatagagt 30654537  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  30654538 ttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttaaaacaatgtatggtaaaattaaattaagtgtagtcttgttaacctg 30654637  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    ||||  ||||||||||||    
T  30654638 atgaagtgatgatactat 30654655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34895296 - 34895089
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||  ||||||| |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||    
T  34895296 ctgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttttcgttggcatctttaacatgcaaacagattt 34895197  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |      ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  34895196 gatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 34895102  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  34895101 tgaattgatgata 34895089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 1953845 - 1954062
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  |||| || ||||| |||||||||||| || |  | ||||||||||||||||||||||    
T  1953845 tgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggatttacaggtactattttatcgttgacaactttaacatgcaaacagagttg 1953944  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtgggg-tgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||    
T  1953945 atgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagatttagtgtagtcatattaatctga 1954044  T
Q  205 tgagttgat-gatactat 221  Q
    ||| ||||| ||||||||    
T  1954045 tgaattgatagatactat 1954062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 466166 - 465961
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  466166 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtattattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagtt 466067  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | ||||| ||||||         | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  466066 gctgata-tatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 465977  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  465976 tgaattgatgatacta 465961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40862753 - 40862560
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| |||||| ||||    
T  40862753 ctgatttatgacaaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagtt 40862654  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgtta 198  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  40862653 gataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttagaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgtta 40862560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 39098978 - 39099191
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||||  ||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||| |    
T  39098978 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacatatactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttgct 39099077  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    ||||| ||| |||| |||||| ||| | |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  39099078 gatatcatgcgatagtcttaagtgtgatactttgtgggatgttacacttaaaacagggtaagataaaattagattaagtgtatttttgttaatctgatga 39099177  T
Q  208 gttgatgatactat 221  Q
     |||| ||||||||    
T  39099178 attgacgatactat 39099191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 1149776 - 1149912
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1149776 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagtt 1149875  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggg 145  Q
    ||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||    
T  1149876 gatgatattatgtg----tcttaagtgttacactttgtggg 1149912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Original strand, 41910921 - 41911060
Alignment:
Q  82 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaat 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  41910921 atctttaacatgcaaacagagttggtgatatcatgtgatagtattaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagat 41911020  T
Q  182 taagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41911021 taaatgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat 41911060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44869831 - 44869615
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||   |||||||||||| || |  |||||||||||| ||||| ||||    
T  44869831 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttatcggtactattttatcgttgacatctttaacatggaaacaaagtt 44869732  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    | |||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||| |    
T  44869731 gctgatatcatttgatagtcttaagtgttacactttgtgggg-acaacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattattgttaatctg 44869633  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    || | |||||||||||||    
T  44869632 ataaattgatgatactat 44869615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13307936 - 13307741
Alignment:
Q  25 attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatc 124  Q
    |||||||| |||||| || |||| ||||  ||||||  |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  13307936 attcatcttgtaatgcttgcaacatcttgaacttacgggtactattttatcgttgacat-tttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtc 13307838  T
Q  125 ttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  13307837 ttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgctaatctgatgaattgataatactat 13307741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 221
Target Start/End: Original strand, 1150090 - 1150177
Alignment:
Q  134 acactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1150090 acactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactat 1150177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43025959 - 43025824
Alignment:
Q  82 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaat 181  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||    
T  43025959 atctttaacatgcaatcagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacattttgtggggtgttacagttaaaataaggtaggataaaattagat 43025860  T
Q  182 taagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgata 217  Q
    ||| |||| |||| ||| || ||||| |||||||||    
T  43025859 taaatgtattcttcttagtctgatgaattgatgata 43025824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 35859268 - 35859160
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||   |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||    
T  35859268 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaacatctcgaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagattt 35859169  T
Q  105 gatgatatt 113  Q
    |||||||||    
T  35859168 gatgatatt 35859160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 157
Target Start/End: Original strand, 24823250 - 24823394
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || ||||||        |||||||||    
T  24823250 ctgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttt--------aacagagtt 24823341  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacactta 157  Q
    | |||||| ||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24823342 gttgatatcatgtgataatcttgagtattatactttgtggggtgttacactta 24823394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 12587916 - 12587812
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||| |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||| ||||||    
T  12587916 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatctttgacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagtt 12587817  T
Q  105 gatga 109  Q
    |||||    
T  12587816 gatga 12587812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18259410 - 18259233
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    |||| ||||||| | ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| || |  || |||||||||||||   | ||| |    
T  18259410 attactgatcaacaataattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaattaaattgct 18259311  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgta 189  Q
    |||||  |||||    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18259310 gatatcttgtga----cttaggtgttacactttgtgggatgttacacttaaaataaggtatgataaaattaaattaaatgta 18259233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Original strand, 34951913 - 34952020
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||   || |||| ||||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  34951913 ctgattaatgatcaatagtaattcatgtagtaagacttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagtt 34952012  T
Q  105 gatgatat 112  Q
    | ||||||    
T  34952013 gctgatat 34952020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 147 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41362707 - 41362633
Alignment:
Q  147 tgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  41362707 tgttacacttaaaacaaggtatgataaaattatatcaagtttagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 41362633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 33198135 - 33198067
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttat 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  33198135 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttat 33198067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 220
Target Start/End: Original strand, 34952028 - 34952102
Alignment:
Q  146 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatacta 220  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||    
T  34952028 gtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatttgatgaattgatgatacta 34952102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7998488 - 7998416
Alignment:
Q  146 gtgttacacttataacaaggtaggataaaa-ttaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgata 217  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||    
T  7998488 gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgtattgatgata 7998416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 63 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7998554 - 7998478
Alignment:
Q  63 gtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactt 139  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  7998554 gtactattttatcgttggcatctttaatatagaaacagagttgttgatattatgtgatagtattaagtgttacactt 7998478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12585353 - 12585298
Alignment:
Q  102 gttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacactta 157  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12585353 gttgatgatgttatgtgatagtattaagtgttagattttgtggggtgttacactta 12585298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 9 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 41362752 - 41362723
Alignment:
Q  9 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaat 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41362752 ttaatgatcaatagtaattcatctagtaat 41362723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 53)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25184448 - 25184232
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25184448 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcggaatttttaacatgcaaacagagtt 25184349  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  25184348 gataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagatcaagtgtagtcttgttaatctga 25184249  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  25184248 tgagttgatgatactat 25184232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 879427 - 879640
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  879427 attaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacaaagttgat 879526  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  879527 gatattatgtgatagtcttaaatgttacactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattatgtgtagtcttgttaatctgatga 879626  T
Q  208 gttgatgatactat 221  Q
    ||||||||||||||    
T  879627 gttgatgatactat 879640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 37663617 - 37663833
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||    
T  37663617 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgtt 37663716  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  37663717 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 37663816  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  37663817 tgaattgatgatactat 37663833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 55477767 - 55477983
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  55477767 ctgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtt 55477866  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  55477867 gatgatattatgtgatagtcttcagtgttacacgttgtggggtgttacacttataacaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 55477966  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  55477967 tgaattgatgatactat 55477983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 47254075 - 47253873
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  47254075 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 47253976  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  47253975 gctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctga 47253876  T
Q  205 tga 207  Q
    |||    
T  47253875 tga 47253873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 50697574 - 50697361
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacat-gcaaacagagttga 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| || ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50697574 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggaattacaggtactattttatcgttggaatctttaacattgcaaacagagttga 50697475  T
Q  107 tgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatg 206  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  50697474 tgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtgtggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatg 50697375  T
Q  207 agttgatgatacta 220  Q
    | ||||||||||||    
T  50697374 aattgatgatacta 50697361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1815636 - 1815420
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1815636 ctgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagtt 1815537  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||    
T  1815536 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacccttaaaacaaggtaggataaaattagagtaaatgtagtcttgttaatatga 1815437  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  1815436 tgaattgatgatactat 1815420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 28002863 - 28003078
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||    
T  28002863 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttagcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttg 28002962  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  28002963 atgatattatgtgatagttttaagtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatccgat 28003062  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || |||||||||||||    
T  28003063 gaattgatgatactat 28003078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 19089329 - 19089545
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||| ||||  |||    
T  19089329 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcgaacaacgtt 19089428  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19089429 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcatatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 19089528  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  19089529 tgaattgatgatactat 19089545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 19440524 - 19440736
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19440524 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagtt 19440623  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19440624 gatgatattatgttataaacttaagggttacacgttgtggggtgttacgcttataacaagctaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 19440723  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  19440724 tgaattgatgata 19440736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33341733 - 33341517
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  33341733 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagtt 33341634  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||    
T  33341633 gctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtatattcttgttaatctga 33341534  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  33341533 tgaattgatgatactat 33341517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6864369 - 6864154
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||  |||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||    
T  6864369 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaaatattattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaagttg 6864270  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  6864269 atgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtatgataaaattaaattaaatgtagtcttgttaatctgat 6864170  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
     | |||||||||||||    
T  6864169 aaattgatgatactat 6864154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 220
Target Start/End: Original strand, 35020925 - 35021126
Alignment:
Q  19 atagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35020925 atagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtg 35021024  T
Q  119 ataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatac 218  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  35021025 atagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctaatgaattgatgatac 35021124  T
Q  219 ta 220  Q
    ||    
T  35021125 ta 35021126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17168045 - 17167832
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  17168045 attaatgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttgat 17167946  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || |||||    
T  17167945 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatga 17167846  T
Q  208 gttgatgatactat 221  Q
     || ||||||||||    
T  17167845 attaatgatactat 17167832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 17173618 - 17173409
Alignment:
Q  12 atgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgata 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17173618 atgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatgata 17173519  T
Q  112 ttatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttg 211  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||| ||     
T  17173518 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaatta 17173419  T
Q  212 atgatactat 221  Q
    ||||||||||    
T  17173418 atgatactat 17173409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3042954 - 3042741
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  3042954 ctgattaataatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatgttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacaagcaaacaaagtt 3042855  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||    
T  3042854 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataataaggtatgataaaattatattaagtgtaatcttgttaatatga 3042755  T
Q  205 tgagttgatgatac 218  Q
    ||| ||||||||||    
T  3042754 tgaattgatgatac 3042741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 32912455 - 32912668
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||    
T  32912455 ctgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatacaaatagagt 32912554  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  32912555 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctg 32912654  T
Q  204 atgagttgatgata 217  Q
    || | |||||||||    
T  32912655 ataaattgatgata 32912668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7703844 - 7703642
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||    
T  7703844 ctgattaatgataaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacgtgcaaacagagtt 7703745  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  7703744 gctgatatcatgtgatagtcttaagtgtgacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 7703645  T
Q  205 tga 207  Q
    |||    
T  7703644 tga 7703642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 221
Target Start/End: Original strand, 36493567 - 36493780
Alignment:
Q  7 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||  |||||||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  36493567 gattaatgatcaatagtaattcatcgagtaatgcttgcaatatcttagacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttga 36493666  T
Q  107 tgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatg 206  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||    
T  36493667 tgatattatgtggtagtcttaagtgttacactttgtggagt-ttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttaatg 36493765  T
Q  207 agttgatgatactat 221  Q
    | |||||||||||||    
T  36493766 aattgatgatactat 36493780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42200066 - 42199848
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaag-tactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagag 102  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  42200066 ctgattaatgaacagtagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaggtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagag 42199967  T
Q  103 ttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatca 202  Q
    || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  42199966 tttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatct 42199867  T
Q  203 gatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  42199866 gatgaattgatgatactat 42199848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 49376302 - 49376086
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| |||||| ||||    
T  49376302 ctgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacaaagtt 49376203  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||| | ||||| || ||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||    
T  49376202 gatgatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaatcaaggcagaataaaattagatcaagcgtaatcttgttaatctga 49376103  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  49376102 tgaattgatgatactat 49376086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37775993 - 37775787
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  37775993 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacaaagtt 37775894  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||         | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  37775893 gctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 37775803  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  37775802 tgaattgatgatacta 37775787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 55240982 - 55241196
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  55240982 tgattaatgattaatagtaatttatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttg 55241081  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
     ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| || ||| |||    
T  55241082 ctgacatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttctt-atctgat 55241180  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
     | |||||||||||||    
T  55241181 aaattgatgatactat 55241196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 17272297 - 17272084
Alignment:
Q  7 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||     
T  17272297 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgaaatctttaatatgcaaatagagttgc 17272198  T
Q  107 tgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatg 206  Q
    |||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||    
T  17272197 tgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctgatg 17272098  T
Q  207 agttgatgatacta 220  Q
    | ||||||||||||    
T  17272097 aattgatgatacta 17272084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 34361367 - 34361580
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  34361367 ctgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagt 34361466  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| | |    
T  34361467 tgatgatattatgtgatagctttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtaattttgttaaccgg 34361566  T
Q  204 atgagttgatgata 217  Q
    |||| |||||||||    
T  34361567 atgaattgatgata 34361580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23761406 - 23761191
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| | |||| ||||||| || || ||||||||| |||||||||||||    
T  23761406 ctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttataggtacaattttatcgttggtatctttaacgtgcaaacagagtt 23761307  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  23761306 gctgatatcatgcgatagtcttaaatgtgacactttatgaggtgttacacttaaaacaaggta-gataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 23761208  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  23761207 tgaattgatgatactat 23761191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 25700933 - 25701149
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||  ||||||| ||||   ||||||||||| || |   ||||||||||||||||| |||||    
T  25700933 tgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaaaatcttagatttacggatactattttatcgttgacttctttaacatgcaaacaaagttg 25701032  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtgggg-tgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| ||    
T  25701033 atgatgttatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttagtgtagtcctgttaatctga 25701132  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  25701133 tgaattgatgatactat 25701149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 29584076 - 29584292
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  29584076 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagtt 29584175  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||    
T  29584176 gctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgtaacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctga 29584275  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  29584276 tgaattgatgatactat 29584292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 207
Target Start/End: Original strand, 46888035 - 46888235
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| || ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||    
T  46888035 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttg 46888134  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  46888135 atgatattatgtgatagtc-taagtgttacgttttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctgat 46888233  T
Q  206 ga 207  Q
    ||    
T  46888234 ga 46888235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 32579781 - 32579565
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  || ||||||||||||||| ||||    
T  32579781 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacatagtt 32579682  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    |||||||||||  |||| ||||||  |||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||| ||    
T  32579681 gatgatattataagatagtcttaagagttacactttctgaggtcttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtacagtcatgttaatctga 32579582  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    |||  |||| |||||||    
T  32579581 tgaactgataatactat 32579565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38012169 - 38011981
Alignment:
Q  25 attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatc 124  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| || || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  38012169 attcatctagtaatatttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatttttaacgtgcaaacatagttgatgatattatgtgatagtc 38012070  T
Q  125 ttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgat 213  Q
    ||||  |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  38012069 ttaagcgttacactttctgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgat 38011981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 34947971 - 34948185
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  34947971 ctgattaacgatcaatagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 34948070  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaa--atgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatca 202  Q
    | |||||| |||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||      
T  34948071 gttgatatcatgtgatagtcttaagtacgttacactttgtggggtgttgcactttaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatat 34948170  T
Q  203 gatgagttgatgata 217  Q
    ||||| |||||||||    
T  34948171 gatgaattgatgata 34948185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Original strand, 30002517 - 30002710
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| | |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  30002517 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttaaatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagtt 30002616  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||         | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  30002617 gctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 30002707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27396948 - 27396735
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || |||||| | |||| | ||||| || |  ||||||||||||||||||| |||| |    
T  27396948 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataggtaccactttatcgttgacatctttaacatgcaaacagcgttgct 27396849  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    ||||| ||| |||  |||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27396848 gatatcatgcgatggtcttaagtgtgacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatctgatga 27396749  T
Q  208 gttgatgatactat 221  Q
     |||||||||||||    
T  27396748 attgatgatactat 27396735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 5047843 - 5048057
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||   || |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||     
T  5047843 tgattactgatcaataataatttatctagtaaaacttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttt 5047942  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    ||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||  ||    
T  5047943 atgatatcatgtgatagtcttaagtgttacattttg-cgggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgcagtcttgttaatctcat 5048041  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || |||||||||||||    
T  5048042 gaattgatgatactat 5048057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 33816392 - 33816625
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | |||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||    
T  33816392 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgaactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtt 33816491  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttg-----------------tggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtg 187  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||                 |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33816492 gatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtg 33816591  T
Q  188 tagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
     | ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  33816592 caatcttgttaatctgataaattgatgatactat 33816625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32592418 - 32592213
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||    
T  32592418 tgattaacgatcaatagtaattcatttagtaatgctttcaacatcttgaacttacaggtactattttatcgtagacatctttaacatgcaaacaaagttg 32592319  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
     ||| || || |||          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  32592318 ctgaaatcatatgag---------tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgat 32592228  T
Q  206 gagttgatgatacta 220  Q
    || ||||||||||||    
T  32592227 gaattgatgatacta 32592213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 50765055 - 50764849
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| || |  ||||||||| |||||||| ||||    
T  50765055 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacttgcaaacatagtt 50764956  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||          |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||  |    
T  50764955 gctgatatcatgtgataatattgagtgtttcactttgtggggtgttacac----------gtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctaa 50764866  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  50764865 tgaattgatgatactat 50764849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 221
Target Start/End: Original strand, 4934136 - 4934294
Alignment:
Q  63 gtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataaca 162  Q
    |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||    
T  4934136 gtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttggacttaaaaca 4934235  T
Q  163 aggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  4934236 aggtagaataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaaatgatgatactat 4934294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 9139563 - 9139364
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||  |||| || || |||||||||||||||||||||||     
T  9139563 tgattaatgatcaatagtaattcgtctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactacgttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttt 9139464  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    ||                ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  9139463 at----------------cttaagtgttacactttgtagggtgttacagttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgat 9139380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 61 - 207
Target Start/End: Original strand, 35025528 - 35025674
Alignment:
Q  61 aagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataa 160  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  35025528 aagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgtgacacttaaaa 35025627  T
Q  161 caaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||    
T  35025628 caagataggataaaattatattaaatgcagtcttgttaatctgatga 35025674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 37288063 - 37287865
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || ||||| |||||||||||| ||||    
T  37288063 ctgattaatgctcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatcttcaacatgcaaacaaagtt 37287964  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattaaattaagtgtagtcttgttaatc 201  Q
    | |||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  37287963 gctgatatcatgtgctagtcttaagtgttacattttgtgggggcgttacacttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgttaatc 37287865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 4598317 - 4598117
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| |||| || ||| | ||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||    
T  4598317 ctgattaatgatcaatagtaattaatctaataatgcttgcaacatcttggatttaaatgtattattttatcgttggcatctttaacatgaaaacagagtt 4598218  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  4598217 gctgatatcatgtgag---------tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaagc-aggataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatga 4598128  T
Q  205 tgagttgatga 215  Q
    ||| |||||||    
T  4598127 tgaattgatga 4598117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 198
Target Start/End: Original strand, 46883990 - 46884177
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||   ||||||||  |||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| | ||    
T  46883990 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatc--ggacttaca--tactattttatctttggaatttttaacatgcaaacaaaatt 46884085  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgtta 198  Q
     |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| | |||||  ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  46884086 tatgatattatgtgatagt-ttaagtgttacattttgtgagatgtta-gcttataacaagatatgataaaattagattaagtgtagtctcgtta 46884177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 6 - 143
Target Start/End: Original strand, 7152081 - 7152218
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||  |||| |||||||| |||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||    
T  7152081 tgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaaaatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagttg 7152180  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtg 143  Q
    ||||| |||||||||| | |||| ||||| ||||||||    
T  7152181 atgatgttatgtgatagtattaagtgttatactttgtg 7152218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 221
Target Start/End: Original strand, 54499193 - 54499330
Alignment:
Q  85 tttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattaaatta 183  Q
    ||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  54499193 tttaacatggaaacagagttactaatatcatgtgatagtcttaaaagttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaaattagatta 54499292  T
Q  184 agtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  54499293 agtatattcttgttaatatgatgaattgatgatactat 54499330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26896423 - 26896285
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttag-acttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagag 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||| |||     
T  26896423 ctgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgtttgcaacattttcggacttacaagtactattttatcgttgaaat-tttaacatgcaaatagac 26896325  T
Q  103 ttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgt 142  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  26896324 ttgatcatattatgcgatagtcttaagtgttacactttgt 26896285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4205312 - 4205216
Alignment:
Q  12 atgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatg 108  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  4205312 atgataaatagtaattcatctagtgatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgatg 4205216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 39400343 - 39400236
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||  ||||| | |||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  39400343 ctgattaatgatcaatagtcattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaaggtaccattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 39400244  T
Q  105 gatgatat 112  Q
    | ||||||    
T  39400243 gctgatat 39400236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Original strand, 35025442 - 35025511
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttat 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  35025442 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttat 35025511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 39398115 - 39398049
Alignment:
Q  134 acactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  39398115 acactttgtggggtgttacacttaaaataaggcaggataaaattagattaagtgtattcttgttaat 39398049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23431887 - 23431826
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactat 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| |||||||| |||||||    
T  23431887 attaatgatcaatagtaattcatctactaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactat 23431826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 34
Target Start/End: Complemental strand, 38012597 - 38012568
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctag 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38012597 ctgattaatgatcaatagtaattcatctag 38012568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 46994507 - 46994727
Alignment:
Q  1 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  46994507 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttagcatgcaaacat 46994606  T
Q  101 agttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46994607 aattgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggcgttacacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 46994706  T
Q  201 cagatgagttgatgatactat 221  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  46994707 catatgagttgatgatactat 46994727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 4761494 - 4761715
Alignment:
Q  1 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| | || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  4761494 atttctgattaatgattaatagtaattcatctggtaatgtttgcaacattttggacttataggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaatat 4761593  T
Q  101 agttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4761594 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgggggtgttatacttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaa 4761693  T
Q  200 tcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  4761694 tcagatgagttgatgatactat 4761715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48355267 - 48355051
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48355267 ctgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacagatactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 48355168  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  48355167 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggtatgttacatttataacaaggtaggataaaattagactaagtgtagtcttgttaatctga 48355068  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  48355067 tgagttgatgatactat 48355051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 42505925 - 42506141
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||    
T  42505925 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgtt 42506024  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  42506025 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 42506124  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  42506125 tgaattgatgatactat 42506141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 8 - 220
Target Start/End: Original strand, 46297615 - 46297827
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  46297615 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgat 46297714  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||  ||||    
T  46297715 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagtttgattaagtgtagttttgttaatctaatga 46297814  T
Q  208 gttgatgatacta 220  Q
     ||||||||||||    
T  46297815 attgatgatacta 46297827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 26941110 - 26941323
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26941110 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtt 26941209  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26941210 gatgatattatatgatagttttaagtgttacactttatgaggtattacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 26941309  T
Q  205 tgagttgatgatac 218  Q
    ||| || |||||||    
T  26941310 tgaattaatgatac 26941323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Original strand, 52040775 - 52040988
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  52040775 attaatgatcaataatcattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttgat 52040874  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  52040875 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 52040974  T
Q  208 gttgatgatactat 221  Q
     |||||||||||||    
T  52040975 attgatgatactat 52040988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 7327332 - 7327548
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||    
T  7327332 ctgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagtt 7327431  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7327432 gttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactagaaagaaggtaggataaaaataaattaagtgtattcttgttaatccga 7327531  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  7327532 tgaattgatgatactat 7327548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33698479 - 33698265
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  33698479 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 33698380  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    |  ||||| ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  33698379 gccgatatcatgcgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 33698280  T
Q  205 tgagttgatgatact 219  Q
    ||| |||||||||||    
T  33698279 tgaattgatgatact 33698265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 40552109 - 40552321
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| || | |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  40552109 ctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcatggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtt 40552208  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  40552209 gatgatattatgtgacaatcctaagtgttacacgttgtgggatgttacgcttataacaagctaagataaaattaaattaagtgtagtgttgttaatctga 40552308  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  40552309 tgaattgatgata 40552321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32373796 - 32373578
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||| ||||||||||||||    
T  32373796 ctgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttgacatctttaatatgcaaacagagtt 32373697  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||    
T  32373696 gctgatatcatgtgatagtcttaagtgtcacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatga 32373597  T
Q  205 tgagttgatgatactattg 223  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  32373596 tgaattgatgataccattg 32373578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 22622568 - 22622780
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||    
T  22622568 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatccaaacagattt 22622667  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  22622668 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacgctttgtggggtgttacacttgaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatctga 22622767  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  22622768 tgaattgatgata 22622780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44891823 - 44891607
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||  | |||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||    
T  44891823 ctgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgtaggtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagtt 44891724  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  44891723 gctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 44891624  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    | | |||||||||||||    
T  44891623 ttaattgatgatactat 44891607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 54828551 - 54828767
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||| |||||| ||||    
T  54828551 ctgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatagttggaatttttaacatacaaacatagtt 54828650  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||    
T  54828651 gatgatattatttgatagttttaagtgttacactttgtgggatgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttcatatga 54828750  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  54828751 tgaattgatgatgctat 54828767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 33378636 - 33378851
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||    
T  33378636 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttg 33378735  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||| |||||| |||| |||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  33378736 atgagattatgcgatagtcttaagtattacacttcttggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgat 33378835  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || ||||| |||||||    
T  33378836 gaattgataatactat 33378851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Original strand, 53229003 - 53229214
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||  ||||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||    
T  53229003 tgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttg 53229102  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  53229103 atgatactatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggagttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaactgtagtcttgttaatctgat 53229202  T
Q  206 gagttgatgata 217  Q
    || |||||||||    
T  53229203 gaattgatgata 53229214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 7 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34133259 - 34133049
Alignment:
Q  7 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttga 106  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||||    
T  34133259 gattcatgattactagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaaattga 34133160  T
Q  107 tgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatg 206  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||    
T  34133159 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattatattaagtgtattcttattagtctgatg 34133060  T
Q  207 agttgatgata 217  Q
    | |||||||||    
T  34133059 aattgatgata 34133049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22451294 - 22451078
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||    
T  22451294 ctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacatagtt 22451195  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    |||||||||||  |||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||    
T  22451194 gatgatattatacgatagtgttaaatgttacacttactggggtgttacacttaaaacaaggtaaggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatga 22451095  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  22451094 tgaattgatgatactat 22451078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39282978 - 39282766
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| | || || |||||  |||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| | ||    
T  39282978 ctgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggatttacagatactattttattgttgacatctttaacaggcaaacatattt 39282879  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  39282878 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 39282779  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| | |||||||    
T  39282778 tgaatggatgata 39282766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 24707965 - 24708183
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||    
T  24707965 ctgattaatgattaatagtaatttatctaataatgcttgcaacttcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaattt 24708064  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaat--taagtgtagtcttgttaatca 202  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||     
T  24708065 gatgatattatgtgattgttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagatcaaaagtgtagtcttgttaatct 24708164  T
Q  203 gatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  24708165 gatgaattgatgatactat 24708183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 21009651 - 21009864
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |  ||    
T  21009651 ctgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatattgt 21009750  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||  |||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  21009751 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaagttatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctg 21009850  T
Q  204 atgagttgatgata 217  Q
    |||| |||||||||    
T  21009851 atgaattgatgata 21009864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2008258 - 2008043
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  2008258 ctgattaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacagagtt 2008159  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||    
T  2008158 gctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtg-tacacttaaaacgaggtaggataaaattagattaagtatattcttgttaatctga 2008060  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||| ||||    
T  2008059 tgaattgatgatgctat 2008043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29164134 - 29163929
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  29164134 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttagacttacaagtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagttg 29164035  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
     |||||| |||||         | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| |||    
T  29164034 ctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctgat 29163944  T
Q  206 gagttgatgatacta 220  Q
    || ||||||||||||    
T  29163943 gaattgatgatacta 29163929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11467142 - 11466934
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       || |||| |||||||||| || |||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  11467142 tgattaatgatcaatagtaattcatcta-------ttgcaacatcttagacttgcaggtactattttgtcgttggtatcttaaacatgcaaacagagttg 11467050  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
     |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  11467049 ttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 11466950  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || |||||||||||||    
T  11466949 gaattgatgatactat 11466934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47481849 - 47481632
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||  |||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||| |||||    
T  47481849 ctgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacaagtactattttatcgttgaaatctttaatatgcaaatagagt 47481750  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||   |    
T  47481749 ttatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaataaggtataataaaattatattaagtgtagtcttgttaacatg 47481650  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    |||| |||||||||||||    
T  47481649 atgaattgatgatactat 47481632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3362581 - 3362366
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| | || |||||  |||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  3362581 ctgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatattggacttctaagtacaattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagtt 3362482  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaatta--agtgtagtcttgttaatca 202  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||       
T  3362481 gatgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgtttcacttaaaataaggtaggataaaattagattaatagtgtagtcttgttaacat 3362382  T
Q  203 gatgagttgatgatac 218  Q
    ||||| ||||||||||    
T  3362381 gatgaattgatgatac 3362366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 3655050 - 3655268
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcat--ctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagag 102  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| || |||| |||| |||||| | ||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  3655050 ctgattaataatcaatagtaattcatatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtgttattttatcgatggaatctttaacatgcaaacagag 3655149  T
Q  103 ttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatca 202  Q
     ||||||||| |||||||| | |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  3655150 ctgatgatatcatgtgatagttttaagtgttacattttgtggtgtgttacgcttctaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatct 3655249  T
Q  203 gatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  3655250 gatgaattgatgatactat 3655268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 43348563 - 43348368
Alignment:
Q  25 attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatc 124  Q
    |||||| |||||||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||    
T  43348563 attcatttagtaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaatagagttgttgatatcatgtgatagtc 43348464  T
Q  125 ttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatacta 220  Q
    |||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43348463 ttaagtgtcacactttatgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 43348368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25580063 - 25579869
Alignment:
Q  7 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||| ||| | ||||  |||||| || || ||||||||||||||||||||||||     
T  25580063 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttagatttataggtacagttttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttgc 25579964  T
Q  107 tgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatc 201  Q
    |||||| |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  25579963 tgatatcatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacactaaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatc 25579869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37158031 - 37157817
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag-agttga 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | || | || |||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||| ||||||  | ||||    
T  37158031 attaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgacatattggacttacatgtactattttatcattggcatctttaacatacaaacaatatttga 37157932  T
Q  107 tgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatg 206  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||     
T  37157931 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttata 37157832  T
Q  207 agttgatgatactat 221  Q
    | |||||||||||||    
T  37157831 aattgatgatactat 37157817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 54506134 - 54505917
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| | || |||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||| | |||    
T  54506134 ctgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttataaatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaataaagt 54506035  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
     ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  54506034 agatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacccg 54505935  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    |||  || ||||||||||    
T  54505934 atgtatttatgatactat 54505917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4015785 - 4015570
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||  || || |||||||||||||||||| ||||    
T  4015785 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttaccgttggcatctttaacatgcaaaca-agtt 4015687  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||  ||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| | || ||||||||||  ||    
T  4015686 gttgatacaatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagactaattatattcttgttaatatga 4015587  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  4015586 tgaattgatgatactat 4015570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 11357231 - 11357430
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  11357231 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggtatctttaacatgcaaacagagtt 11357330  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| ||||||                 |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  11357331 gatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatctga 11357413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45174821 - 45174615
Alignment:
Q  16 tcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||   ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  45174821 tcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgttactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctgatatcat 45174722  T
Q  116 gtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatg 214  Q
     | ||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  45174721 attatagtcttaagtgttacactttgtagagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattaaattaaatgtattcttgttaatctgatgaattgatg 45174622  T
Q  215 atactat 221  Q
    |||||||    
T  45174621 atactat 45174615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Original strand, 24488813 - 24489024
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| || |||| ||||  ||||||    ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||    
T  24488813 tgattcatgattaatagtaatgcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttactgacactattttattgttggcatctttaacatgcaaatagagttg 24488912  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| || |||    
T  24488913 atgatattgtgtgatagtcttaagtgttacaccttgtgaggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttagtctgat 24489012  T
Q  206 gagttgatgata 217  Q
    || |||||||||    
T  24489013 gaattgatgata 24489024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37203391 - 37203177
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag-agttga 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |  | || |||||||| ||||||||||||  | |  ||||||||||| ||||||  | ||||    
T  37203391 attaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcgatatattggacttacaggtactattttatcattgacatctttaacatacaaacaatatttga 37203292  T
Q  107 tgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatg 206  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  37203291 tgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgatacactaaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatcttatg 37203192  T
Q  207 agttgatgatactat 221  Q
    | |||||||||||||    
T  37203191 aattgatgatactat 37203177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 1090018 - 1089827
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||| || ||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||    
T  1090018 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggattta-atgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagttg 1089920  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtgggg-tgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgtt 197  Q
     |||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||    
T  1089919 ttgatgttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagatttaatgtagtcctgtt 1089827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 29099672 - 29099466
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| | |||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  29099672 ctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaacagagtt 29099573  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||         || ||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  29099572 gctgatatcatgtg---------aaagttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcacgataaaattaaattaagtgtattcttgttaatatga 29099482  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  29099481 tgaattgatgatacta 29099466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 121
Target Start/End: Original strand, 51212624 - 51212737
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51212624 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 51212723  T
Q  108 gatattatgtgata 121  Q
    ||||||||||||||    
T  51212724 gatattatgtgata 51212737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38592024 - 38591816
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||  | || ||||| || |||| |||| || |||||| |||| |||||| || |  |||||| ||||||||| ||| ||    
T  38592024 ctgattaatgatcaatagtaatttgtttaataatgcttgcaacatcttggatttacaaatacttttttatcgttgtcatctttgacatgcaaatagattt 38591925  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  38591924 gatgatattatgtgatagtcttaagtgtcacgttttgtggggtattacacttgaaacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 38591825  T
Q  205 tgagttgat 213  Q
    |||||||||    
T  38591824 tgagttgat 38591816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21193933 - 21193719
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||  ||||||   ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21193933 ctgattaataatcaatagtaattcatttagtaatggttgcaacatcttgaacttacggctactattttatcgtgagaatctttaacatgcaaacagagtt 21193834  T
Q  105 gatgatattatgtgataatc-ttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    | |||||| || ||||| || |||| |||||  |||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |    
T  21193833 gctgatatcatatgatagtctttaagtgttatcctttatggagtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctg 21193734  T
Q  204 atgagttgatgatac 218  Q
    |||| || |||||||    
T  21193733 atgaattaatgatac 21193719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 22445915 - 22446130
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| | || |||||| | |||||||||||| || || |||||||| ||||||| | ||||    
T  22445915 ctgattaatgatcaatagtaattcatccagtaatacttgcaacattttggacttaaaggtactattttatcgttggtatctttaatatgcaaaaatagtt 22446014  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||| | ||||| || |||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || ||  ||    
T  22446015 gatgatattatatgatagtcttgagtgttatacattgt-gagtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttatttatatga 22446113  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  22446114 tgaattgatgatactat 22446130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 14586530 - 14586735
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||  |||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  14586530 ctgattaatgatcagtagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacc-gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 14586628  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| ||  ||          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  14586629 gttgatatcatacgag---------tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaagtgtattcttgttaatctga 14586719  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  14586720 tgaattgatgatacta 14586735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36012465 - 36012251
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaaca-gagt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | | || ||||||   |||||||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||    
T  36012465 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcagcattttggacttatcggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacaagagt 36012366  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattaaattaagtgtagtcttgttaatca 202  Q
    || |||||| || ||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||     
T  36012365 tgctgatatcatttgatagtcttaagtgttacattttgtgggatgttacactgaaaacaaggtaggataaaaattagattaggtgtattcttgttcatct 36012266  T
Q  203 gatgagttgatgata 217  Q
    ||||| |||||||||    
T  36012265 gatgaattgatgata 36012251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 43975742 - 43975950
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgca---aacaga 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |   |||| |    
T  43975742 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatgcttgcaaaatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacaacata 43975841  T
Q  102 gttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatc 201  Q
    ||||||||||||||| |||       | ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||| | | |||||||||    
T  43975842 gttgatgatattatgcgat-------agtgttacactttctggggtgttacacttaaaacaagataagataaaattagattaagtgcaattttgttaatc 43975934  T
Q  202 agatgagttgatgata 217  Q
     ||||| |||||||||    
T  43975935 tgatgaattgatgata 43975950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 130 - 221
Target Start/End: Original strand, 51212956 - 51213047
Alignment:
Q  130 tgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51212956 tgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatctgatgagttgatgatactat 51213047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 221
Target Start/End: Original strand, 11835494 - 11835694
Alignment:
Q  16 tcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattat 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||    |||      ||||||| |||||||||||||| ||    
T  11835494 tcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcgttaacatc------atgcaaatagagttgatgatatcat 11835587  T
Q  116 gtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaa-attaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatg 214  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||  ||| | ||||||    
T  11835588 gtgatagtcttaattgttacactttgtaggttgttacacttaaaacaaggtaggataaatattagattaagtgtatttttgttaatatgataaattgatg 11835687  T
Q  215 atactat 221  Q
    |||||||    
T  11835688 atactat 11835694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 44186367 - 44186567
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| | ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||    
T  44186367 ctgattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttagaggtactattttatcattggcatctttaacatgcaaacagagtt 44186466  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| ||||||||                 ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||  ||    
T  44186467 gttgatatcatgtgata----------------gttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatttga 44186550  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  44186551 tgaattgatgatactat 44186567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Original strand, 20373138 - 20373263
Alignment:
Q  49 tcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtg 148  Q
    |||| |||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||| |     
T  20373138 tcttggacttatatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttatgggata 20373237  T
Q  149 ttacacttataacaaggtaggataaa 174  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  20373238 ttacgcttataacaaggtaggataaa 20373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35844575 - 35844436
Alignment:
Q  82 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattaaa 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |    
T  35844575 atctttaacatggaaacaaagttactgatatcatgtgata-tcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaactaggtaggataaaaattaga 35844477  T
Q  181 ttaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  35844476 ttaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat 35844436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 40936297 - 40936165
Alignment:
Q  7 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttga 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||     
T  40936297 gattaatgatcaatagtaatttatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagttgc 40936198  T
Q  107 tgatattatgtgataatcttaaatgttacactt 139  Q
    | |||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  40936197 taatatcatgtgatagtcttaagtgttacactt 40936165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 27480208 - 27480445
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttt----tcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    | ||| | || |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||     
T  27480208 ctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgtttgtaattaacattttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacat 27480307  T
Q  101 a----gttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacacttt---gtg----------gggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaatta 183  Q
    |    ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    |||          |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27480308 atatagttgatgatattatgcgatagtcttaagtgttacacttctgggtgttacacttctgggtgttacacttaaaacaatgtaggataaaattagatta 27480407  T
Q  184 agtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  27480408 agtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactat 27480445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 53176286 - 53176164
Alignment:
Q  99 agagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgtta 198  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| | ||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  53176286 agagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggagtgttatatttaaaatgaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgtta 53176187  T
Q  199 atcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||| ||||| |||||||||||||    
T  53176186 atctgatgaattgatgatactat 53176164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 50475136 - 50475021
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| ||||||||  | |  |||||||| ||||||||||| |||    
T  50475136 tgattaatgatcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtattattttatccttgacatctttaatatgcaaacagatttg 50475037  T
Q  106 atgatattatgtgata 121  Q
    |||||||||| |||||    
T  50475036 atgatattatatgata 50475021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 145
Target Start/End: Original strand, 11357030 - 11357140
Alignment:
Q  35 taatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgtta 134  Q
    ||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||||||  | || || |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||    
T  11357030 taatgcttgcaacatcttggacttacaaatactattttatcattggcatatttaacatacaaccagagttgatgatattatatgatagtcttgagtgtta 11357129  T
Q  135 cactttgtggg 145  Q
    |||||||||||    
T  11357130 cactttgtggg 11357140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 218
Target Start/End: Original strand, 20373300 - 20373359
Alignment:
Q  159 aacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatac 218  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  20373300 aacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttgatgaattgatgatac 20373359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 126
Target Start/End: Original strand, 53811597 - 53811701
Alignment:
Q  18 aatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgt 117  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||| |||| ||||||| |||| |||||||| || || |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  53811597 aatagtaattcatctaggaatgcctgcaacatcttggacttacgagtattattttatcgttggtatctttaacatgcaa----agttgatgatattatgt 53811692  T
Q  118 gataatctt 126  Q
    |||| ||||    
T  53811693 gatagtctt 53811701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40936175 - 40936101
Alignment:
Q  146 gtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    |||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||    
T  40936175 gtgttacacttaaaaaaagtt-ggataaaattatattaagtgtattcttgttaatctgatgaatagatgatactat 40936101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 19289187 - 19289405
Alignment:
Q  1 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19289187 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtattattttattgtcggaatctttaacatgcacacag 19289286  T
Q  101 agttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19289287 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgttacatttataacaatgtaggataaaattagattaagtgtagtcttattaat 19289386  T
Q  201 cagatgagttgatgatact 219  Q
    | |||||||||||||||||    
T  19289387 ctgatgagttgatgatact 19289405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 31862187 - 31861971
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31862187 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtctacaatatcttggacttacaagtactattttattgtcggaatccttaacatgcaaacagactt 31862088  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  31862087 gatgatattatgtgataattttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaatgtatgttaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 31861988  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  31861987 tgaattgatgatactat 31861971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 43648113 - 43648329
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||| ||||| ||||    
T  43648113 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcgacatcttggacttacaagtgctattttatcgttgaaatctttaacatggaaacaaagtt 43648212  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  43648213 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttatactttgtgtggtgttacacttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 43648312  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  43648313 tgagttgatgatactat 43648329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41961174 - 41960959
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||    
T  41961174 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaaccgatttg 41961075  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  41961074 atgatattatgtgataatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgat 41960975  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || |||||||||||||    
T  41960974 gaattgatgatactat 41960959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 31570602 - 31570818
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||    
T  31570602 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttaaacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgtaaacagagtt 31570701  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  31570702 gttgatatcatgtgacagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 31570801  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| || ||||||||||    
T  31570802 tgaattcatgatactat 31570818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 200
Target Start/End: Original strand, 2325246 - 2325441
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| || ||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| | ||    
T  2325246 ctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgtaatctttaacatgcaaacaaattt 2325345  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2325346 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 2325441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4763966 - 4763750
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  |||| |||||||| |||||||||||| ||  | |||||||||||||||| ||| ||    
T  4763966 ctgattaatgatcaatagtaattcaactagtaatgcttgcaatatcttggacttacaggtactattttatcgttagcatctttaacatgcaaaaagaatt 4763867  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  4763866 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgctacacttgaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtagttttgttaatctga 4763767  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| ||||| |||||||    
T  4763766 tgaattgattatactat 4763750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37906045 - 37905827
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||| |||| |||||||| ||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  37906045 ctgattaatgatcaatagtaattcatccagtaattcttgcaacatcttggacttacatgtgttattttatcattggaatctttaacatgcaaacagagtt 37905946  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgt--ggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatca 202  Q
     ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||     
T  37905945 aatgatattatgcgatagttttaagtgttacactttgtggggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatct 37905846  T
Q  203 gatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  37905845 gatgaattgatgatactat 37905827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3177267 - 3177058
Alignment:
Q  12 atgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgata 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||  |||| |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3177267 atgataaatagtaattcatctagtaatgcttgtaatatcttggacttacatgtactattttatagttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgata 3177168  T
Q  112 ttatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttg 211  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||| || ||||| |||    
T  3177167 ttatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttcttagtctgatgaattg 3177068  T
Q  212 atgatactat 221  Q
    ||||||||||    
T  3177067 atgatactat 3177058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 11366248 - 11366465
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||    
T  11366248 ctgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagt 11366347  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||   ||| |||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||| | |    
T  11366348 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgtttagaacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttgttaacctg 11366447  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    |||| |||||||||||||    
T  11366448 atgaattgatgatactat 11366465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 35959227 - 35959023
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| |    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||    
T  35959227 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacat----gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagtt 35959132  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||  ||    
T  35959131 gatgatattatgtgatagtcttaactgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggat-aaattatattaagtgcagtcttgttaatatga 35959033  T
Q  205 tgagttgatg 214  Q
    ||| ||||||    
T  35959032 tgaattgatg 35959023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 41465836 - 41465624
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||    
T  41465836 ctgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacataatt 41465737  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| ||||  |    
T  41465736 gatgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagttcagtcttgtgaatctaa 41465637  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  41465636 tgaattgatgata 41465624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44286284 - 44286068
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||| ||||    
T  44286284 ctgattaatgatcaatagtaattcatctaacaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttagcatatttaacatgcaaacaaagtt 44286185  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||    
T  44286184 gttgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattattgttaatctga 44286085  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| || ||||||||||    
T  44286084 tgaatttatgatactat 44286068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 33709101 - 33709316
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| || ||||||||||||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||    
T  33709101 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaagtactattttatcattgacatctttaacatgcaaacagagttg 33709200  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
     |||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||     
T  33709201 ctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagcgtattcttgttaatctgaa 33709300  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
     | |||||||||||||    
T  33709301 tatttgatgatactat 33709316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 15 - 221
Target Start/End: Original strand, 33550865 - 33551070
Alignment:
Q  15 atcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatatta 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||| | || ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33550865 atcaatagttattcatctagtaatgcttgcaacatattggactttcaagtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacatagttgatgatatta 33550964  T
Q  115 tgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatg 214  Q
    |  | || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  33550965 tacg-tagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaacaacgtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatg 33551063  T
Q  215 atactat 221  Q
    |||||||    
T  33551064 atactat 33551070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44914002 - 44913782
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcat---ctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaga 101  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||   ||| ||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  44914002 ctgattcatgattaatagtaattcattttctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaga 44913903  T
Q  102 gttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |    
T  44913902 gttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggggtgttacacttaaaacaatgtatgataaaattagattaagtgtattcttgttagt 44913803  T
Q  201 cagatgagttgatgatactat 221  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  44913802 ctgatgaattgatgatactat 44913782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 29242013 - 29242222
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||   |||| |||||||| |||||||| ||| || |  ||||||||||| ||| |||||||    
T  29242013 ctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaat----tca---tcttggacttacaggtactattgtatcgttgacatctttaacatacaaccagagtt 29242105  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  29242106 gatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagttttgttaatctga 29242205  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  29242206 tgaattgatgatactat 29242222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4167257 - 4167041
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||| || |||||||| || |  ||||||||||| |||||| ||||    
T  4167257 ctgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagtt 4167158  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||    
T  4167157 gatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctga 4167058  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  4167057 tgaattgttgatactat 4167041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 57 - 221
Target Start/End: Original strand, 17071657 - 17071821
Alignment:
Q  57 ttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacactt 156  Q
    ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17071657 ttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgctt 17071756  T
Q  157 ataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17071757 aaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 17071821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 27349816 - 27350022
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||    
T  27349816 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttggaatctttaacttgcaaacagagtt 27349915  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
      |||||| |||||         | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  27349916 cctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggttggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 27350006  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  27350007 tgaattgatgatacta 27350022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 4263944 - 4264161
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||||  ||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4263944 ctgatcaatgatcaatattatttcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttatatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 4264043  T
Q  105 gatgatattatgt-gataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    | |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||  |    
T  4264044 gctgatatcatgttgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttaaacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttcttaatatg 4264143  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  4264144 atgaattgataatactat 4264161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 19424510 - 19424712
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||              |||||||||||||||||||||    
T  19424510 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttgcaggtactat--------------ctttaacatgcaaacagagtt 19424595  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||    
T  19424596 gctgatatcatgtgatagtcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcttgttaatctga 19424695  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  19424696 tgaattgatgatactat 19424712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 26357912 - 26357704
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||    
T  26357912 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaaatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacacattt 26357813  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||| ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  ||    
T  26357812 gataatattatgtgatagttttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtgatcttgttaatatga 26357713  T
Q  205 tgagttgat 213  Q
    ||| |||||    
T  26357712 tgaattgat 26357704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 18494149 - 18494364
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||     
T  18494149 ctgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttacaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtc 18494248  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || |||| ||    
T  18494249 gttgatatcatgtgatagtcttaagtgtgactctttgtgaggt-ttacacttaatacaaggtaggataaaattagatcaagtgtattctagtgaatctga 18494347  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  18494348 tgaattgatgatactat 18494364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19314182 - 19313970
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaa---gtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacaga 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| ||   |||||||||||| |  |  |||||||||||||||||| |    
T  19314182 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttataacatgtactattttatcgctgacatctttaacatgcaaacata 19314083  T
Q  102 gttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatc 201  Q
    |||| |||||| |||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  19314082 gttgctgatatcatgtgatagt-------gttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattcgattaagtgtattcttgttaatc 19313990  T
Q  202 agatgagttgatgatactat 221  Q
     ||||| |||||||||||||    
T  19313989 tgatgaattgatgatactat 19313970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45328025 - 45327839
Alignment:
Q  35 taatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgtta 134  Q
    ||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||  |||||    
T  45328025 taatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtttatgatattatgcgatagtcttatgtgtta 45327926  T
Q  135 cactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45327925 cactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgatgaattgatgatactat 45327839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4478700 - 4478488
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| |||||||   |||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||    
T  4478700 ctgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccgatactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagtt 4478601  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    | |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||     |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  4478600 ggtgatatcatgtgatagacttaagtgttacacttt-----gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctg 4478506  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    |||| |||||||||||||    
T  4478505 atgaattgatgatactat 4478488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13711794 - 13711586
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||    
T  13711794 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtattgtttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgctggcatctttaacatgcatacagagtt 13711695  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||| ||| |||||| | ||| ||||| |||||||||||||||| |||     | |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||    
T  13711694 gctgatatcatgtcatagtcttaactattatactttatggggtgttacacttaaaac-----atgataaaattagattaaatgtattcttgttaatctga 13711600  T
Q  205 tgagttgatgatac 218  Q
    ||| ||||||||||    
T  13711599 tgaattgatgatac 13711586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 57 - 217
Target Start/End: Original strand, 17054016 - 17054176
Alignment:
Q  57 ttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacactt 156  Q
    ||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17054016 ttacaggtactattttatcgttggaacctttaacatgcaaacaaatttgatgatattatgtgatagtnttaagtgttacactttgtggggtgttacgctt 17054115  T
Q  157 ataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgata 217  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17054116 aaaataaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctgatgaattgatgata 17054176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 43770712 - 43770919
Alignment:
Q  1 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag 100  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||  ||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  43770712 atttctaattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttaaagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacag 43770811  T
Q  101 agttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    ||||| |||||| |||||         | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  43770812 agttgctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattaaattaagtatattcttgttaat 43770902  T
Q  201 cagatgagttgatgata 217  Q
    | ||||| |||||||||    
T  43770903 ctgatgaattgatgata 43770919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 33660245 - 33660451
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||    
T  33660245 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatctcagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaagtt 33660344  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||           |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  |    
T  33660345 gctgatatcatgtggg---------tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcctgttaatctaa 33660435  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  33660436 tgaattgatgatacta 33660451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 7006806 - 7006940
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  7006806 ctgattaatgatcaatagaaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 7006905  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactt 139  Q
    | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  7006906 gctgatatcatgtgatattcttaagtgttacactt 7006940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 63 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36642265 - 36642105
Alignment:
Q  63 gtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataaca 162  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36642265 gtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttgctggtatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaaca 36642166  T
Q  163 aggtaggat--aaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  36642165 aggtaggataaaaaattagattaagtgtattcttgttaatttgatgaattgatgatactat 36642105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5881864 - 5881659
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||    
T  5881864 ctgaataatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaaatt 5881765  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||         | |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||  ||    
T  5881764 gttgatatcatgtg---------agtgttacactttgtgaggtattacacttaaaacaaggtatgat-aaattagattaaatgtattcttgttaatatga 5881675  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  5881674 tgaattgatgatacta 5881659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 39167237 - 39167447
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||| |  ||||   || |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||||||    
T  39167237 ctgattcataattaatagtaattcatctagtaatgctagcaacaatttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaacagagtt 39167336  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||||| |||||||| ||  |    
T  39167337 gatgatattatgtgatagt------tgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtataataaaattagaataagtgtattcttgttactctaa 39167430  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  39167431 tgaattgatgatactat 39167447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Original strand, 18258199 - 18258349
Alignment:
Q  49 tcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtg 148  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  18258199 tcttagacttgcagttactattttatcgttgggatctttaacatgcaaagagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtg 18258298  T
Q  149 ttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaa 199  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  18258299 ttacacttaaaaaaatgtaggataaaattagattaagtttattcttgttaa 18258349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Original strand, 41463795 - 41463934
Alignment:
Q  82 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaat 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| ||    
T  41463795 atctttaacatgcaaacagagttgttgatatcatgtgatagtcttaaatgttacattttgtgaggtgttacaattaaaacaaagtatgataaaattatat 41463894  T
Q  182 taagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    |||  ||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  41463895 taaaagtattcttgttaatatgatgaattgatgatactat 41463934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33902319 - 33902187
Alignment:
Q  87 taacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagt 186  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  ||||| |    
T  33902319 taacatggaaacagagttaatgatattatgtgatactattaagtgttacactttgtggggtgctacccttaaaacaaggtaggataaaattcgattaaat 33902220  T
Q  187 gtagtcttgttaatcagatgagttgatgatact 219  Q
     |||||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  33902219 atagtcttgttaatctgatgaactgatgatact 33902187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 19500783 - 19500923
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||  | ||||| |||||||||||| ||    |||||||||||| ||| ||||||    
T  19500783 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttgaaattacatgtactattttatcgttaacatctttaacatgtaaatagagtt 19500882  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggg 145  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19500883 gataatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggg 19500923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 59
Target Start/End: Original strand, 41463459 - 41463512
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagactta 59  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  41463459 tgattaatgatcaatagtaatttatctattaatgtttacaacatcttagactta 41463512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 221
Target Start/End: Original strand, 7006943 - 7007005
Alignment:
Q  159 aacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||  || | |||||||||||||    
T  7006943 aacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatcttataaattgatgatactat 7007005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 74
Target Start/End: Original strand, 41051169 - 41051237
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttat 74  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||| ||||  ||||||| ||||||||||||    
T  41051169 tgattaatgatcaataacaattcatctagcaatgcttacaacatcttgaacttacaggtactattttat 41051237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Original strand, 18257406 - 18257456
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttaga 55  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  18257406 ctgattaatgataaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttaga 18257456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 221
Target Start/End: Original strand, 19501762 - 19501823
Alignment:
Q  159 aacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  19501762 aacaaagtagaataaaattagattaaatgtagt-ttgttaatctgatgaattgatgatactat 19501823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 51129190 - 51128974
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  51129190 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagtt 51129091  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  51129090 gatgatattatgtgatagttttaattgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatga 51128991  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  51128990 tgaattgatgatactat 51128974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 10923058 - 10922842
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10923058 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacagatactattttattgtcagaatctttaacatgcaaacagagtt 10922959  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  10922958 gatgatattatgtgacagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacccttataacaaggtatgataaaataagattaagtgtagtcttgttaatctga 10922859  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    |||||||||||||||||    
T  10922858 tgagttgatgatactat 10922842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8222458 - 8222243
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  8222458 ctgattaatgatcaata-taattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtt 8222360  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||    
T  8222359 gatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttgttaatatga 8222260  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  8222259 tgaattgatgatactat 8222243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 15383264 - 15383049
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| || ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15383264 ctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcatacatagtt 15383165  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  15383164 gatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 15383065  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  15383064 tgaattgatgatacta 15383049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 37451616 - 37451401
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  37451616 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtt 37451517  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  37451516 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttttgaggtgttacacttataacaaggtcagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatga 37451417  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    | | ||||||||||||    
T  37451416 taaattgatgatacta 37451401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25160963 - 25160747
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25160963 ctgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacaaagtt 25160864  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||  |    
T  25160863 gatgatattatgtgatagttttaagtgttatactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagtcttattaatctaa 25160764  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  25160763 tgaattgatgatactat 25160747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15752360 - 15752144
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||| ||| |||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15752360 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaaaattgcaacttcttggacttacatgtattattttgtcgttggaatttttaacatgcaaacagagtt 15752261  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  15752260 aatgatattatgtgatactcttaagtgttacactttatggggtgttacgcttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 15752161  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  15752160 tgaattgatgatactat 15752144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16415977 - 16415761
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  16415977 ctgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 16415878  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  16415877 gatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatatgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctaa 16415778  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  16415777 tgaattgatgatactat 16415761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 27227330 - 27227546
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||    
T  27227330 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtt 27227429  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  27227430 gatgatatcatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctga 27227529  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  27227530 tgaattgatgatactat 27227546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 30326797 - 30327013
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30326797 ctgattgatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagtt 30326896  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||    
T  30326897 gatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaggataaaatgagattaagtgtagttttgttaatctga 30326996  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  30326997 tgaattgatgatactat 30327013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 7078909 - 7079124
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  7078909 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaatatcttagacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttg 7079008  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
     |||||| |||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||    
T  7079009 ttgatatcatgtgatagtcttaagtcttatactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatttgat 7079108  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || |||||||||||||    
T  7079109 gaattgatgatactat 7079124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 32216386 - 32216171
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  32216386 ctgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtt 32216287  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||  |    
T  32216286 tatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatttgattaagtttagttttgttaatctaa 32216187  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  32216186 tgaattgatgatacta 32216171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4330612 - 4330396
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| | || |||||||||||||||||||||  | |  |||||||||||||||| ||||||    
T  4330612 ctgattaatgatcaattgtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacaagtactattttatctttgacatctttaacatgcaaaaagagtt 4330513  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  4330512 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 4330413  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    | | |||||||||||||    
T  4330412 taaattgatgatactat 4330396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32267365 - 32267153
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||| |||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  32267365 ctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacctacaggtactattttatagttggaatatttaacatgcaaacaaagtt 32267266  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  32267265 gatgatattatgtgatagtcttgagtgttacactttgtggagtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctga 32267166  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    || ||||||||||    
T  32267165 tgggttgatgata 32267153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18422981 - 18422770
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||| |||||||| || || |||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18422981 tgattaatgatcaatagtaattcatctagcaatgcttgcaacatcttggacttacatgtgcttttttatcgttggaatctttaacatgcaaacggaggtg 18422882  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  18422881 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcatataacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgat 18422782  T
Q  206 gagttgatgata 217  Q
    || |||||||||    
T  18422781 gaattgatgata 18422770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 27267046 - 27267260
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||  ||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  27267046 tgattaattatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagttg 27267145  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  27267146 atgatattatgtgatagtcttaagtgttgcactttgtggggtgttacactcaaaacaaggta-gattaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgat 27267244  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || |||||||||||||    
T  27267245 gaattgatgatactat 27267260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 28769981 - 28769767
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  28769981 attaatgatcaatagtaattcatctagcaatgtttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagaggtgat 28769882  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatg 206  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  28769881 gatattatgtgatagtcttaagcgttacactttgtgggggtgttacgtttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgatg 28769782  T
Q  207 agttgatgatactat 221  Q
    | |||||||||||||    
T  28769781 aattgatgatactat 28769767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 19899613 - 19899830
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  19899613 ctgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagt 19899712  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  19899713 tggtgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaatgtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctg 19899812  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    |||| |||||||||||||    
T  19899813 atgaattgatgatactat 19899830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30254753 - 30254540
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  30254753 tgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttg 30254654  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||    
T  30254653 atgttattatgtgacagtcttaagtgttacactttatagggtgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtctagtcttgttaatctgat 30254554  T
Q  206 gagttgatgatact 219  Q
    || |||||||||||    
T  30254553 gaattgatgatact 30254540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 47279517 - 47279304
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |    
T  47279517 attaatgatcaatagtaattcatctaataatgtttgcaacatcttggacttacagatactattttattgttggcatctttaacatgcaaacatagttgtt 47279418  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  47279417 gatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggatgttacaattaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatga 47279318  T
Q  208 gttgatgatactat 221  Q
     |||||||||||||    
T  47279317 attgatgatactat 47279304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2960079 - 2959863
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||    
T  2960079 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatattt 2959980  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  2959979 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacaatttgtgggatgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtggtcttgttaatctga 2959880  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  2959879 tgaattgatgacactat 2959863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 10181853 - 10182069
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaag-tactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| | || |||||||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||| ||| |||||||    
T  10181853 tgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaggtactattgtattgttgtcatctttaacatacaaccagagtt 10181952  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  10181953 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctga 10182052  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||| ||||||||    
T  10182053 tgaattgacgatactat 10182069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38823545 - 38823329
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||| ||| |||||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  38823545 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacaggtattattttatcgttggcatctctaacatgcaaacagagtt 38823446  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  38823445 gctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgttgggtgttacacttaaaataaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 38823346  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  38823345 tgaattgatgatactat 38823329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23999679 - 23999462
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||    
T  23999679 ctgattaatgatcaatagtatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagt 23999580  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  23999579 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctg 23999480  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  23999479 atgaattgataatactat 23999462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 27532826 - 27533041
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| ||    
T  27532826 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttgcaaacagaatt 27532925  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||    
T  27532926 gctgatatcatgtgatagtcttgagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaatt-gattaagtgtattcttgttaatctga 27533024  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  27533025 tgaattgatgatactat 27533041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 28564629 - 28564842
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||| |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  28564629 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttg 28564728  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||||||||||  |||||||||  |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  28564729 atgatattatgtgata--gttaagtgttacactttacggggtgttatgcttataacaaggcatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgat 28564826  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || |||||||||||||    
T  28564827 gaattgatgatactat 28564842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 42721364 - 42721154
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||| |||| |||||||| ||| |||||||| || |   ||||||||||||||||| |||||||    
T  42721364 attaatgatcaatagtaattaatctagtaataattgcaacatcttggacttacatgtaatattttatcgttg---tctttaacatgcaaacaaagttgat 42721268  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  42721267 gatattacgtgataatcttaagtgttatactttgtggggtattacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctgatga 42721168  T
Q  208 gttgatgatactat 221  Q
     |||||||||||||    
T  42721167 attgatgatactat 42721154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15168427 - 15168211
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||  ||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||    
T  15168427 ctgattaatgatcaatagtaattcatctaataatgcttgcaacatcttgtacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtt 15168328  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||    
T  15168327 gatgatattatgcgatagccttaagtgttacactttctgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaactgcagtcttgttaatctga 15168228  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  15168227 tgaattgatgatactat 15168211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 47682339 - 47682555
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||| || ||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||    
T  47682339 ctgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtt 47682438  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||  |||| |||||||||||||||| ||    
T  47682439 gatgatattatatgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaggcagaataaaattagtttaaatgtagtcttgttaatctga 47682538  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  47682539 tgaattgatgatactat 47682555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22171039 - 22170830
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||    
T  22171039 attaatgatcaatagtaatttatctaataatgtttgcaacatcttagacttacaagaattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgat 22170940  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||  ||||    
T  22170939 gatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttgaaacaaggtaggatgaaattagattaagtgtagtgttattaatctaatga 22170840  T
Q  208 gttgatgata 217  Q
     |||||||||    
T  22170839 attgatgata 22170830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40885141 - 40884928
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  40885141 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcatcggcatctttaacatgcaaacatagttgat 40885042  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||  ||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| | ||||||||||| |||||    
T  40885041 gatattatgcgatagtcttaagtgttacacttttcggaatgttacacttaaaacaagataggataaaactagattaagtgcaatcttgttaatctgatga 40884942  T
Q  208 gttgatgatactat 221  Q
     |||| ||||||||    
T  40884941 attgaagatactat 40884928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 238358 - 238574
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||  || |||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||    
T  238358 ctgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatattattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagtt 238457  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||    
T  238458 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattcttgttagtctga 238557  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    | | ||| |||||||||    
T  238558 ttaattgttgatactat 238574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41926484 - 41926278
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||  |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  41926484 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttg-aatatcttggacttacaagtactattttattgttggcatctttaacatgcaaacagagttgat 41926386  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    |||||||| | |      ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41926385 gatattatttaa------taagtgttacactttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctgatga 41926292  T
Q  208 gttgatgatactat 221  Q
     |||||||||||||    
T  41926291 attgatgatactat 41926278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 46931741 - 46931530
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||    
T  46931741 ctgattaatgatcaataatatattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagt 46931642  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||   ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  46931641 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgct--gaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctg 46931544  T
Q  204 atgagttgatgata 217  Q
    |||| |||||||||    
T  46931543 atgaattgatgata 46931530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 9902899 - 9903111
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || || | |||| |||||||  |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| | ||    
T  9902899 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtagtgcttgcagcatcttggacttactggtactattttatcgttgtcatctttaacatgcaaacaaattt 9902998  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  9902999 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaatgtaagataaaattagattaagtgtagtcttgttaatttga 9903098  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  9903099 tgaattgatgata 9903111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 213
Target Start/End: Original strand, 27563750 - 27563958
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  27563750 ctgattaatgatcaatattaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatatactattttatcgtttgcatctttaacatgcaaacagagtt 27563849  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| |||| | ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  27563850 gatgaaattatatgatagtcttaagtgttcctctttgtggggtattatacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 27563949  T
Q  205 tgagttgat 213  Q
    ||| |||||    
T  27563950 tgaattgat 27563958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 27763155 - 27763372
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||  |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  27763155 ctgattaatgatcaatagtatatttatctagtaatgcttgcaacatcttgaacttacagatactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagt 27763254  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  27763255 tgattatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttacgcttagaactaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaacctg 27763354  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    || | |||||||||||||    
T  27763355 ataaattgatgatactat 27763372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14758362 - 14758156
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||    
T  14758362 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagttg 14758263  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    ||||||||||| |||| ||||||         ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||    
T  14758262 atgatattatgcgatagtcttaa---------tttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctaat 14758172  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || ||||||| |||||    
T  14758171 gaattgatgaaactat 14758156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 221
Target Start/End: Original strand, 33725472 - 33725661
Alignment:
Q  32 tagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatg 131  Q
    ||||||||||| |||| | || | |||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  33725472 tagtaatgtttgcaacattttggtcttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagttgatgatattatgcgatagtcttaaatg 33725571  T
Q  132 ttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  33725572 ttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtagggtaaaattagattaagtgcagtcttgttaatatgatgaattgatgatactat 33725661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39393715 - 39393498
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||  ||||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||    
T  39393715 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggatttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagtt 39393616  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    | | |||| || ||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||| |    
T  39393615 gctaatatcatatgatagtcttaagtgttacactttgtaggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagatgaagtgtattcttgttaatctg 39393516  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    |||| || ||||||||||    
T  39393515 atgaatttatgatactat 39393498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 34012227 - 34012434
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||  |||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||    
T  34012227 ctgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagattt 34012326  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |      ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  34012327 gatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtaatcttgttaatctga 34012421  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  34012422 tgaattgatgata 34012434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 3535253 - 3535055
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| | |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  3535253 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagttg 3535154  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
     |||||| |||         ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||    
T  3535153 ctgatatcatg---------taagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggcaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatctgat 3535063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Original strand, 37618747 - 37618949
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  37618747 tgattaatggtcaatactaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagttg 37618846  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||||||| ||         | ||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||    
T  37618847 atgatattatatg---------agtgttacactttatgggatgttatgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtattgttaatctgat 37618937  T
Q  206 gagttgatgata 217  Q
    || |||||||||    
T  37618938 gaattgatgata 37618949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 3309484 - 3309262
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||| |||||||  |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  3309484 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacgggtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacagagtt 3309385  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacact-----ttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattaaattaagtgtagtcttgtta 198  Q
    | |||||| || ||||| |||||| |||||||||     | ||| ||||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3309384 gctgatatcatttgatagtcttaagtgttacacttagtgtagtgaggtgttacatttaaaacaaagtaggttaaaaattagattaagtgtattcttgtta 3309285  T
Q  199 atcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||| ||||| |||||||||||||    
T  3309284 atctgatgaattgatgatactat 3309262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1547602 - 1547408
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||        |||||    
T  1547602 ctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggtatctttaaca--------gagtt 1547511  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||    
T  1547510 gttgatatcatgtgatagttttgagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtatttttgttaatctga 1547411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 31621395 - 31621614
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatct-----ttaacatgcaaacag 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||| | ||  ||||||| |||||||||||| || || ||||     ||||||||||||||     
T  31621395 tgattaatgatcaatagtagttcatctactaatgcttgcaacatattgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacat 31621494  T
Q  101 agttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||| ||| |||| || |||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31621495 agttgttgatattatgcgatagtcttaagtgtcacac-ttctggggtattgcacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaat 31621593  T
Q  201 cagatgagttgatgatactat 221  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  31621594 ctgatgaattgatgatactat 31621614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Original strand, 1359780 - 1359919
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||| | ||  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1359780 ctgattaatgatcgatagtaattcatccagtaatgcttgcaacattttgaacttacaggtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacatagtt 1359879  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtgg 144  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1359880 gatgatattatatgataatcttaagtgttacactttgtgg 1359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 11742213 - 11742347
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  ||||||||||| |||| ||||||    
T  11742213 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatacaaagagagtt 11742312  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactt 139  Q
    | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  11742313 gctgatatcatgtgatagtcttaattgttacactt 11742347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38759846 - 38759652
Alignment:
Q  23 taattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataa 122  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| |||| || |||||  || |||||||| || |  | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||     
T  38759846 taattaatctagtaatgcttgcaacatcttggagttacatatattattttatagttgacacctttaacatgcaaacatagttggtgatattatctgatag 38759747  T
Q  123 tcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgata 217  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||| |||||| || |||||  ||||| |||||||||    
T  38759746 tctcaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataagatatgataaaattaaattaaatgtagttttattaatatgatgaattgatgata 38759652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 48620882 - 48620753
Alignment:
Q  82 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaat 181  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||          |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  48620882 atctttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgag---------tgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagat 48620792  T
Q  182 taagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatacta 220  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  48620791 taagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgatacta 48620753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 48353873 - 48353735
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  |||| ||||||||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  48353873 ctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaatatcttggacttacagatactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagtt 48353774  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtgg 144  Q
    | |||||| |||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  48353773 gctgatatcatgtgatagtctt-agtgttacactttgtgg 48353735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 21289931 - 21289829
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||  |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  21289931 ctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttataagtgttattttatcgttggcatctttaatatgcaaacagagtt 21289832  T
Q  105 gat 107  Q
    |||    
T  21289831 gat 21289829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 217
Target Start/End: Original strand, 11742350 - 11742408
Alignment:
Q  159 aacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgata 217  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11742350 aacaaggtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatccgatgaattgatgata 11742408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 31962945 - 31962853
Alignment:
Q  7 gattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaaca 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||| ||||| |||||||  || |||||||| || |   |||||||||||||||||    
T  31962945 gattaatgatcaatagtagttcatctaataatgcttgcaacatcttaaacttacatatattattttatcgttgatttctttaacatgcaaaca 31962853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 408279 - 408494
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  408279 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtt 408378  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  408379 gatgatattgtgtgatagtcttaagtgttccactttgtgaggtgttacgcttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 408478  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  408479 tgaattgatgatacta 408494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 463 - 253
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||      |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  463 ctgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggac------gtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 370  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||    
T  369 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttatggggtgttacacttaaaataagataggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctga 270  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  269 tgaattgatgatactat 253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 103 - 217
Target Start/End: Original strand, 94331 - 94445
Alignment:
Q  103 ttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatca 202  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  94331 ttgatgatattatgtaatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaagctagaataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatct 94430  T
Q  203 gatgagttgatgata 217  Q
     |||| |||||||||    
T  94431 catgaattgatgata 94445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 6 - 111
Target Start/End: Original strand, 93951 - 94056
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| | |||    
T  93951 tgattaatgatcaatagcaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacaaatttg 94050  T
Q  106 atgata 111  Q
    ||||||    
T  94051 atgata 94056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8222 - 8006
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||  |||    
T  8222 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcgaacaacgtt 8123  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  8122 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttatagcaagttaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 8023  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  8022 tgaattgatgatactat 8006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 22973922 - 22974134
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22973922 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgtcgaaatctttaacatgcaaacagagtt 22974021  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  22974022 gataatattatgtaatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacgcttataacaagataggataaaattagattaagtgtagtcttgttattctga 22974121  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    |||||||||||||    
T  22974122 tgagttgatgata 22974134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22981128 - 22980912
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  22981128 ctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgattgcaacatcttggacttacatatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 22981029  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22981028 tatgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 22980929  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  22980928 tgaattgatgatactat 22980912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 5 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5830227 - 5830032
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  5830227 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtt 5830128  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  5830127 gatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataacaaggtaagataaaatgagattaagtgtagtcttgttaat 5830032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 38528077 - 38528293
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||| ||| ||    
T  38528077 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgatatctttaacatgtaaatagattt 38528176  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  38528177 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaagataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 38528276  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  38528277 tgaattgatgatactat 38528293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 7208704 - 7208919
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||||  ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  7208704 ctgattaatgatcaataataattcatctagtaatacttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaacagagtt 7208803  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  7208804 gaaaatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacgtttataacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 7208903  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  7208904 tgaattgatgatacta 7208919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 27318325 - 27318541
Alignment:
Q  1 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||   |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  27318325 atttttgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgtttgcaacatcttaaacttat--gtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacag 27318422  T
Q  101 agttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27318423 agttgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 27318522  T
Q  201 cagatgagttgatgatact 219  Q
      ||||| |||||||||||    
T  27318523 atgatgaattgatgatact 27318541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 31705452 - 31705667
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31705452 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttatatgtactattttatctttggaatctttaacatgcaaacagagtt 31705551  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  31705552 gatgatattatgtgatggtcttaagtgttacattttgtgagatgttacgcttataacaaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 31705651  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  31705652 tgaattgatgatacta 31705667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12910690 - 12910474
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||| |||| |||||| || ||||||||||| ||| |||||||    
T  12910690 ctgattaatgttcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtattattgtattgttggcatctttaacatacaaccagagtt 12910591  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||    
T  12910590 gatgatattatgtgatagtcttaggtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcatgttaatctga 12910491  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||| ||||||||    
T  12910490 tgaattgacgatactat 12910474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 31786486 - 31786702
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||| || ||||| |||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||    
T  31786486 ctgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggatttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaatcagagtt 31786585  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  31786586 gatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 31786685  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  31786686 tgaattgatgatactat 31786702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35504700 - 35504484
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||    
T  35504700 ctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatacttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagattt 35504601  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  35504600 gataatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacgcttataatatggtaggataaaattatattaagtgtagtcttgttaatatga 35504501  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  35504500 tgaattgatgatactat 35504484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 699485 - 699273
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||    
T  699485 ctgattaataatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacatagtt 699386  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  699385 gatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtggagtgttacacttaaaataaggtatgataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 699286  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  699285 tgaattgatgata 699273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 17157871 - 17158087
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| |||||| |||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||    
T  17157871 ctgattaatgatcaataataattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttatcgttgaaatctttatcatgcaaacagagtt 17157970  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  17157971 gataatattatgtgatggtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttataataaggtaagatacaattatactaagtgtagtcttgttaatctga 17158070  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| || ||||||||||    
T  17158071 tgaattaatgatactat 17158087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 25500766 - 25500982
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||  ||| | ||||    
T  25500766 ctgattaatgatcaacagtatttcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatctaaagaaagtt 25500865  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  25500866 gctgatatcatgtgatgatcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattaaattaagtttattcttgttaatctga 25500965  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  25500966 tgaattgatgatactat 25500982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19120194 - 19119978
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||  | |||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||    
T  19120194 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagactttgaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacggagtt 19120095  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||| ||    
T  19120094 gctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttatacttaaaacaaggtaggataaaattagagtaagtttattcttgttaatctga 19119995  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| ||||||| |||||    
T  19119994 tgaattgatgacactat 19119978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22255517 - 22255305
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22255517 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaaggcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggaatatttaacatgcaaacatagtt 22255418  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  22255417 gatgatattatgtaatagttttaagtgttacactttgtgtggtgttacgcttataacaaaataggctaaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 22255318  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  22255317 tgaattgatgata 22255305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8437300 - 8437089
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  8437300 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacattcaaacagagtt 8437201  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||  |||| |||| |||| ||    
T  8437200 gatcatattatgtgataatcttaagtgttacacattgtggggtgtataacttaaaacaaggcaggataaaattagattaagcatagttttgtaaatctga 8437101  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    || ||||||||||    
T  8437100 tg-gttgatgata 8437089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24886426 - 24886223
Alignment:
Q  1 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24886426 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggaatctttaacatgcaaacag 24886327  T
Q  101 agttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||                 ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24886326 agttgatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttataataaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaat 24886244  T
Q  201 cagatgagttgatgatactat 221  Q
      |||||||||||||||||||    
T  24886243 atgatgagttgatgatactat 24886223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 43308496 - 43308708
Alignment:
Q  1 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  43308496 atttctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttcgacttacaggtactattttattgtcggaatctttaacatgcaagaag 43308595  T
Q  101 agttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaat 200  Q
    ||||||||||        ||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||     
T  43308596 agttgatgat--------atagtcttaagtgttacacttttcagggtgttacacttataacaaggtaagataaaattagattaagtatagttttgttaag 43308687  T
Q  201 cagatgagttgatgatactat 221  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  43308688 ctgatgagttgatgatactat 43308708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 27330639 - 27330423
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  27330639 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtaccattttattgttgaaatctttaacatgcaaatagagtt 27330540  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||    
T  27330539 gctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacacttcatggggtgttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgtattctcattaatctga 27330440  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  27330439 tgaattgatgatactat 27330423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36867097 - 36866881
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||| || |||||||| || |  ||||||||||| |||||| ||||    
T  36867097 ctgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgtttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagtt 36866998  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||    
T  36866997 gatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctga 36866898  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| ||| |||||||||    
T  36866897 tgaattgttgatactat 36866881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 23954636 - 23954845
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||     | ||||  |||||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||||    
T  23954636 tgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgtt-----catcttgcacttacaaatattattttatcgttggcat-tttaacatgcaaacagagttg 23954729  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  23954730 atgatattatgtgatagtcttaagtgttacattttgtgaggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatatgat 23954829  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || |||||||||||||    
T  23954830 gaattgatgatactat 23954845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35934231 - 35934014
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||  ||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||    
T  35934231 ctgattaatgatcaataataattcaactagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttattgttgacatctttaacatggaaacaaagtt 35934132  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    | |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||| ||||||||||| |    
T  35934131 gctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaactagattaagtgtattcttgttaatctg 35934032  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    |||| |||||||||||||    
T  35934031 atgaattgatgatactat 35934014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 15992380 - 15992596
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||  |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  15992380 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttaccggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 15992479  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
      |||||| ||| |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||| ||    
T  15992480 cctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttgcactcaaatcaaggtagaataaaattagatcaagtgtattcttgttaatctga 15992579  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  15992580 tgaattgatgatactat 15992596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 33 - 221
Target Start/End: Original strand, 23116090 - 23116278
Alignment:
Q  33 agtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgt 132  Q
    ||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  23116090 agtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagatttgatgatattatgtgatagtcttaagtgt 23116189  T
Q  133 tacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  23116190 tacactttgtggggtgttacacttgaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtaatattgttaatctgatgaattgatgatactat 23116278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33908567 - 33908352
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || ||||||||||| |||||| ||||    
T  33908567 ctgattaatgatcaatagtaatt-atctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagtt 33908469  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    || ||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  33908468 gacgatattatgcgatagtcttaagtgttacactttctggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 33908369  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
      | |||||||||||||    
T  33908368 ataattgatgatactat 33908352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5837889 - 5837674
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||| || |||||||||| | || |  |||||||||||||||| |||||||    
T  5837889 tgattaatgatcaacagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttgcaggtactattttgtcgttgtcatctttaacatgcaaagagagttg 5837790  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
     |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||  |||    
T  5837789 ctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtattacacttaaaacaatgtaggattaaattagattaagtgtattcttgttaatatgat 5837690  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || |||||||||||||    
T  5837689 gaattgatgatactat 5837674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 218
Target Start/End: Original strand, 13956202 - 13956415
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||| ||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | ||    
T  13956202 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactaacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaattt 13956301  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||  |||||| ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||    
T  13956302 gatgatattatatgatagtcttaagtgttacgctttgtagggtgttacacttgaaacaagataaaataaaattagattaagtgaagttttgttaatctga 13956401  T
Q  205 tgagttgatgatac 218  Q
    ||| ||||||||||    
T  13956402 tgaattgatgatac 13956415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 68 - 221
Target Start/End: Original strand, 14919431 - 14919584
Alignment:
Q  68 attttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggta 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14919431 attttattgttggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgatagtcttaagtattacaatttgtgaggtgttacacttataataaggta 14919530  T
Q  168 ggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14919531 ggataaaattagattaagtgtagttttgttaatatgatgagttgatgatactat 14919584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 30969164 - 30969380
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||  || || | ||||  ||||| |  |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||    
T  30969164 ctgattaatgattaatagtaactcatctagtaatacttgcagcatcttgaacttatagatactattttattgttgacatctttaacatgcaaacaaagtt 30969263  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  30969264 gctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgaggtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 30969363  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  30969364 tgaattgatgatactat 30969380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Original strand, 35511322 - 35511529
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||  ||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||    
T  35511322 ctgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacatcttgaacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagattt 35511421  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |      ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  35511422 gatgatattatgtgatagt-----gtgttacattttgtggggtgttacacttgaaacaaggttggataaaattagattaagtgtagtcttgttaatctga 35511516  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| ||| |||||    
T  35511517 tgaattggtgata 35511529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 201
Target Start/End: Original strand, 35826327 - 35826520
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||    
T  35826327 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacagagttg 35826426  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatc 201  Q
    |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  35826427 atgatatta--tgataatcttaagggttacactttgtggagtgttacgcttaaaacaatgtagaataaaattagattaaatgtggtattgttaatc 35826520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40133720 - 40133508
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||| || |||||||| || |  ||||||||||| |||||| ||||    
T  40133720 ctgattcatgattaatagtaattcatccagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagtt 40133621  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| || ||    
T  40133620 gatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttagtctga 40133521  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| ||| |||||    
T  40133520 tgaattgttgata 40133508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22019958 - 22019752
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||| ||||||    
T  22019958 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttagacttacaagtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaatagagtt 22019859  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||         | ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||    
T  22019858 gctgatatcatgtg---------agtgttatactttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatatga 22019768  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    |||  |||||||||||    
T  22019767 tgaagtgatgatacta 22019752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 8741725 - 8741942
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||| | || |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  8741725 ctgattaatgatcaatagtatttcatctagtgatgcttgcaacattttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagtt 8741824  T
Q  105 gatgatatt-atgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    | | ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||| |||| ||||||||||  |    
T  8741825 gctcataatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacacttaaaacaaggtatgacaaaattagattaattgtattcttgttaatttg 8741924  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    |||| |||||||||||||    
T  8741925 atgaattgatgatactat 8741942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Original strand, 21088613 - 21088822
Alignment:
Q  12 atgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgata 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||| |||| || |||||  |  |||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21088613 atgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaacatcttggatttacagatgttattttatcgttggcatctttaacatacaaacatagttgatgata 21088712  T
Q  112 ttatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| |  ||||| |||    
T  21088713 ttatgtgataatcttaagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaagttagattaaatgtattcttgttagtatgatgaattg 21088812  T
Q  212 atgatactat 221  Q
     |||||||||    
T  21088813 ttgatactat 21088822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 32563475 - 32563272
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || |||| ||||||||||||| |||||||||||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  32563475 ctgattaatgatcaataataatttatctagtaattcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctataacatgcaaacagagtt 32563376  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| ||||||          |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  32563375 gctgatatcatgtgag---------tgttacactttgtgggctgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 32563285  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  32563284 tgaattgatgata 32563272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 9200559 - 9200353
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  9200559 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttatagatactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 9200460  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||         | |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||    
T  9200459 gctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggaatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtattcttgttaatatga 9200369  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  9200368 tgaattgatgatacta 9200353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 39573146 - 39572938
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| ||||||||||||  | || ||||||||||        |||||    
T  39573146 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcattggcatctttaaca--------gagtt 39573055  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| |||||||| |||  | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  39573054 gttgatatcatgtgatagtctcgagtgttacactttgtgggatgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 39572955  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| || ||||||||||    
T  39572954 tgaatttatgatactat 39572938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 7693556 - 7693350
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  7693556 ctgattaatgaacaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacaagtattattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagtt 7693457  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | | |||| |||||         | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||| || ||||||||  |    
T  7693456 gctaatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttacacttaaaacaaggtaagataaaattagattaagcgtattcatgttaatctaa 7693366  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  7693365 tgaattgatgatacta 7693350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15724822 - 15724611
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  | || ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||| ||||| |||||    
T  15724822 tgattaatgattaatagtaattcatctagtaatgcttacaatattttggacttacaagtactattttatagttgacatctttaacatgtaaacaaagttg 15724723  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
     |||||| || ||||| |||||| || ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    
T  15724722 ttgatatcatatgatagtcttaattgatacactttggggcgtgttatacttaaaataaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgat 15724623  T
Q  206 gagttgatgata 217  Q
    || |||||||||    
T  15724622 gaattgatgata 15724611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 42343056 - 42342851
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| || ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  42343056 ctgattaatgatcaatggtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtcctattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagtt 42342957  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    |||||||| |||||         | ||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  42342956 gatgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggtgtattacacttaaaacaa-gtaagataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 42342867  T
Q  205 tgagttgatgatacta 220  Q
    ||| ||||||||||||    
T  42342866 tgaattgatgatacta 42342851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 36860752 - 36860542
Alignment:
Q  12 atgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgata 111  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||| || |||| |||| ||||||||| || |||||||| || |  ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  36860752 atgattaatagtaattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacaaatattattttatcgttgacatctttaacatacaaacatagttgatgata 36860653  T
Q  112 ttatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacactt-ataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagtt 210  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||| |  ||||| ||    
T  36860652 ttatgtgatagttttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaaaaaaggtaggataaaattagattaaatgtactcttgttagtatgatgaatt 36860553  T
Q  211 gatgatactat 221  Q
    | |||||||||    
T  36860552 gttgatactat 36860542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Original strand, 2888285 - 2888472
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| | ||    
T  2888285 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgtaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatattt 2888384  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtc 192  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||  |||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  2888385 gatgatattatctgatagtcttaagtgttacactttatggaatgttaaacttgaaacaaggtaaaataaaattagattaagtgtagtc 2888472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 25889705 - 25889584
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  25889705 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgctttcaacatcttggatttacaggtactattttattgttggtatctttaacatgcaaacagagtt 25889606  T
Q  105 gatgatattatgtgataatctt 126  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  25889605 gatgatattatgtcataatctt 25889584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 1429002 - 1429201
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||| | ||||    
T  1429002 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaataaagtt 1429101  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
     |||||||||||||||| ||||||                 |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||    
T  1429102 tatgatattatgtgatagtcttaa-----------------gtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaaatgtagtcttgttaatttga 1429184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 221
Target Start/End: Original strand, 6824329 - 6824535
Alignment:
Q  13 tgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatat 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||| || |||| ||||||||||||| ||| | ||||||  | |  |||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  6824329 tgatcaatagtatctcatctagtgatgcttgcaacatcttagacttacatgtattgttttatctt-gacatctttaacatgcaaacagagttgct-atat 6824426  T
Q  113 tatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttga 212  Q
      ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| | ||||    
T  6824427 cttgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgataaattga 6824526  T
Q  213 tgatactat 221  Q
    |||||||||    
T  6824527 tgatactat 6824535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 14409181 - 14409383
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||    
T  14409181 ctgaataatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacatagtt 14409280  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    |||||||||||| |||| ||||||              | |  |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  14409281 gatgatattatgcgatagtcttaa--------------gagtagttacacttaaaacaaggtagaataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctga 14409366  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  14409367 tgaattgatgatactat 14409383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 25669911 - 25669737
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  25669911 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttagacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagtt 25669812  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgta 189  Q
    |||||||| |||||         | |||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25669811 gatgatatcatgtg---------agtgttacac-ttgtggagtgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaagtgta 25669737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 26268332 - 26268193
Alignment:
Q  82 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaat 181  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||    
T  26268332 atctttaacatgcaaacatagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgcggtgttacacttaaaacaaggtatgataaaatttgat 26268233  T
Q  182 taagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26268232 taattgtattcttgttaatctgatgaattgatgatactat 26268193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 98 - 221
Target Start/End: Original strand, 5112247 - 5112369
Alignment:
Q  98 cagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgtt 197  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  5112247 cagagttgatgatattatgtgaaagtcttaagtgttgtactttgtggggt-ttacacttaaaacatggtatgataaaattagattaagtatagtcttgtt 5112345  T
Q  198 aatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    |||   |||| |||||||||||||    
T  5112346 aatttaatgaattgatgatactat 5112369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 217
Target Start/End: Original strand, 28416492 - 28416579
Alignment:
Q  130 tgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgata 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  28416492 tgttacactttgtggggtgttacacttaaaataaggcagaataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgatgaattgatgata 28416579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 8467058 - 8466863
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||||| || |||||||| ||   |  |||||| ||| ||||||||||| |    
T  8467058 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacattttggacttacaaataatattttatcgttacac-ctttaatatgtaaacagagttggt 8466960  T
Q  108 gatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatga 207  Q
    ||||| || ||||| ||||||                 |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  8466959 gatatcatatgatagtcttaa-----------------gtgttacatttaaaacaaggtagaataaaattaaattaagtgtattcttgttaatttgatga 8466877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 6 - 74
Target Start/End: Original strand, 28416392 - 28416460
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttat 74  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  28416392 tgattaatgatcaatagtaattcatcaagtaatgcttgcaacatcttggacttaaaagtactattttat 28416460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 26269144 - 26269075
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttat 74  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  26269144 ctgattaatgatcagtagtaatttatctagtattgcttacaacatcttaaacttacaggtactattttat 26269075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11898199 - 11898148
Alignment:
Q  95 aaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtgggg 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  11898199 aaacagagttgatgatgttatgtgatattcttaagggttacactttgtgggg 11898148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 5 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 43254190 - 43254156
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 39  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43254190 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatg 43254156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12244 - 12032
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  12244 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacatgcaaacagagtt 12145  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    | |||||| ||| |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||    
T  12144 gctgatatcatgcgatagtcttaagtgtgacactttgtggggtgttacacttaaaacaagataggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctga 12045  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  12044 tgaattgatgata 12032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 3879788 - 3880004
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  3879788 ctgattcatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaagtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacagagtt 3879887  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| || ||    
T  3879888 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagaataagtatattcttgttagtctga 3879987  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  3879988 tgaattgatgatactat 3880004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 7234885 - 7235100
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||| || || || ||||||||||||||| |||||    
T  7234885 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggcatttttaacatgcaaacatagttg 7234984  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  7234985 atgatattatgcgatagtcttaagcgttacactttctggggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatctgat 7235084  T
Q  206 gagttgatgatactat 221  Q
    || ||||| |||||||    
T  7235085 gaattgataatactat 7235100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 220
Target Start/End: Original strand, 6091031 - 6091247
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  6091031 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgtttgaatctttaatatgcaaacagagtt 6091130  T
Q  105 gatgatattatgtgataatc-ttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||      
T  6091131 gatgatattatgtgatagtctttaagtgttacactttgttgggtgttacgcttaaaacaaggtatgataaaattagattaagtgtagttttgttaatcta 6091230  T
Q  204 atgagttgatgatacta 220  Q
    |||| ||||||||||||    
T  6091231 atgaattgatgatacta 6091247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1946170 - 1945953
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  1946170 ctgattaatgatcaatagtatattcatctaataatgcttgtaacatcttggacttacatgtactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagt 1946071  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |    
T  1946070 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttacgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacttg 1945971  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    |||| || ||||||||||    
T  1945970 atgaattcatgatactat 1945953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 5627727 - 5627510
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||    
T  5627727 ctgattaatgatcaatagtatattcacctagtaatgcttgcaacatcttggacttacaggtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaatagagt 5627628  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  5627627 tgatgatattatgtgatagtcttaagtattacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctg 5627528  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    |||| ||||| |||||||    
T  5627527 atgaattgataatactat 5627510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 6 - 220
Target Start/End: Original strand, 33892862 - 33893067
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  33892862 tgattaatgatcaatagtaattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacatgtactattttattgttggcatctttaacatgcaaactgagttg 33892961  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagat 205  Q
     |||||| |||||         | |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||    
T  33892962 ctgatatcatgtg---------agtgttacactttgtggggtgttatacataaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtattcttgttaatctgat 33893052  T
Q  206 gagttgatgatacta 220  Q
    || ||||||||||||    
T  33893053 gaattgatgatacta 33893067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 20768417 - 20768203
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||| |||||||||||| || |  |||||||||||||||||| | ||    
T  20768417 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacaccttggacttacatgtactattttatcgttgacatctttaacatgcaaacataatt 20768318  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||    
T  20768317 gatgatattatgcgatgatcttaagtgttacactttatgggatgttacacttaaaacaaagtaggataaaattagattaa--gtaatcttgttaatctga 20768220  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| || ||||||||||    
T  20768219 tgaattaatgatactat 20768203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 21016967 - 21017177
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||      |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  21016967 ctgattcatgattaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttagac------gtactattttatcgttgacatatttaacatgcaaacagagtt 21017060  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||    
T  21017061 gatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtggggtgttacacttaaaataacgtaggataaaattagattaagtttattcttgttagtctga 21017160  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  21017161 tgaattgatgatactat 21017177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Original strand, 4318672 - 4318888
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||| ||||| |  ||||||||| || || |  |||||||||||| |||||||||||    
T  4318672 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatcttggactttcccgtactatttcatcgttgacatctttaacatgaaaacagagttg 4318771  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
     |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||  |    
T  4318772 ctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatagggtgttacacttaaaacaaggtaggataaaaattagattaagtgtattcttgttaatctaa 4318871  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  4318872 tgaattgatgatactat 4318888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 29182495 - 29182286
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||| |||||||    
T  29182495 tgattaatgatca---gtaattcatctagtaatacttgcaacatcttagacttacaagtactattttatcgttggcatctttaacctgcaaatagagttg 29182399  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgt-ggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
     |||||| |||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||    
T  29182398 ctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttatgggggtgttacacttaaaatatggtaggataaaattagattaagtgtattcttattaatctga 29182299  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  29182298 tgaattgatgata 29182286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 51 - 221
Target Start/End: Original strand, 30353253 - 30353423
Alignment:
Q  51 ttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgtt 150  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  30353253 ttagacttacatgtactattttatcgttgacatttttaacatgcaaacagagttgctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtgggatgtt 30353352  T
Q  151 acacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  30353353 acacttaaaacaaggcatgataaaattagattaagtgtattcttgtttatatgatgaattgatgatactat 30353423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Original strand, 7055141 - 7055280
Alignment:
Q  82 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaat 181  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  7055141 atctttaacatccaaatagagttgatgatattatgtgatagttttaagtgttacactttgtagcgtgttacacttagaacaaggtatgataaaattatat 7055240  T
Q  182 taagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  7055241 taagtgtagtcttgttaacctgatgaattgatgatactat 7055280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 6 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8513562 - 8513356
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  | || |||||||  ||||||||||||  | || |||||||||||| |||||||||||    
T  8513562 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaagattttggacttaccggtactattttatcattggcatctttaacatggaaacagagttg 8513463  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
     |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||      ||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||  ||    
T  8513462 ctgatatcatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtg------ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaagtgtattcttgttaatatga 8513369  T
Q  205 tgagttgatgata 217  Q
    ||| |||||||||    
T  8513368 tgaattgatgata 8513356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 33619162 - 33618953
Alignment:
Q  8 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatct-----ttaacatgcaaacagag 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| | || |||||||| |||||||||||| || || ||||     |||||||||||||| ||    
T  33619162 attaatgatcaatagtaattcatctagtaatgcttgcaacatattggacttacatgtactattttatcgttggcatctttaacttaacatgcaaacatag 33619063  T
Q  103 ttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatca 202  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| ||| |||| || | ||||||||||||        ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  33619062 ttgatgatattatgcgatactcttaagtgtcacac-ttctagggtgttacact--------ggtaggataaaattagattaagtgcagtcttgttaatct 33618972  T
Q  203 gatgagttgatgatactat 221  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  33618971 gatgaattgatgatactat 33618953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15491873 - 15491734
Alignment:
Q  82 atctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaat 181  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  15491873 atctttaacatccaaacagaattgctgatatcatgtgatatttttaagtgttacattttgtggggtgttacacttaaaataaggtaggataaaattagat 15491774  T
Q  182 taagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgatactat 221  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15491773 taagtgcattcttgttaatctgatgaattgatgatactat 15491734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6089237 - 6089027
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttg 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| | || |||||||  |||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||    
T  6089237 tgattaatgatcaatagtaattcatatagtaatgcttgcaacattttggacttactggtactattttatcgttggcatctttaacatggaaacagagttg 6089138  T
Q  106 atgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggat-aaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
     |||||| |||||||| |||||| ||||| || |||| | |||      ||| ||||||||||||| ||||||| || |||  || ||||||||||| ||    
T  6089137 ctgatatcatgtgatagtcttaagtgttataccttgtagagtg------ttaaaacaaggtaggataaaaattagatcaaggatattcttgttaatctga 6089044  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  6089043 tgaattgatgatactat 6089027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 87
Target Start/End: Original strand, 7054622 - 7054704
Alignment:
Q  6 tgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatcttt 87  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||  ||||||||||| || |||||||||    
T  7054622 tgattaatgatcaatagtatattcatttagtaatgtttgcaacatcttggacttacagttactattttatcgttggaatcttt 7054704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 145865 - 146082
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagta-attcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagt 103  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| || |||| |||| ||||||||   |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  145865 ctgattaatgatcaattgtatattcatttagtaatgcttgcaacatcttggacttacagacactattttatcgttggaatctttaacatgcaaatagagt 145964  T
Q  104 tgatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcag 203  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |    
T  145965 tgatgatattatgtgatagtcttaagtgttacactttgtagggtgttatgcttagaacaaggtatgataaaattatattaagtgtagtcttgttaacctg 146064  T
Q  204 atgagttgatgatactat 221  Q
    |||| |||||||||||||    
T  146065 atgaattgatgatactat 146082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 44291 - 44076
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||  ||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||    
T  44291 ctgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagtt 44192  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||    
T  44191 gatgatattatgtgat-agcttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctga 44093  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  44092 tgaattgatgatactat 44076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 221
Target Start/End: Original strand, 154496 - 154711
Alignment:
Q  5 ctgattaatgatcaatagtaattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagtt 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||  ||| |||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| ||||    
T  154496 ctgattaatgatcaatagtaattcattcagtaatgcttgcaacaacttggacttacatgtactattttatcgttgaaatctttaacatgcaaacaaagtt 154595  T
Q  105 gatgatattatgtgataatcttaaatgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcaga 204  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||    
T  154596 gatgatattatgtgat-agcttaagtgttacactttgtggggtgttaagcttataacaagatatgataaaattatattaaatgtagtcttattaatctga 154694  T
Q  205 tgagttgatgatactat 221  Q
    ||| |||||||||||||    
T  154695 tgaattgatgatactat 154711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 267602 - 267407
Alignment:
Q  23 taattcatctagtaatgttttcaacttcttagacttacaagtactattttattgtcggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtgataa 122  Q
    ||||||||||||||||  || || | |||| |||||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  267602 taattcatctagtaattcttgcagcatcttggacttacatgtattattttatcgttggcatctttaacatgcaaacaaagttgatgatattatgtgatag 267503  T
Q  123 tcttaaa-tgttacactttgtggggtgttacacttataacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgttaatcagatgagttgatgata 217  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||    
T  267502 tctttaagtgttacactttgtgggatgttacatttaaaacaaggtaggataaaattagattaagtgtagtcttgctaatctaatgaattgatgata 267407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 100988 - 100948
Alignment:
Q  79 ggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtga 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100988 ggaatctttaacatgcaaacagagttgatgatattatgtga 100948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 100931 - 100894
Alignment:
Q  159 aacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  100931 aacaaggtaggataaaattaaattaagtgtagtcttgt 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University